JPS6219086A - ヒトのβ−アクチン遺伝子を含むDNAフラグメント - Google Patents
ヒトのβ−アクチン遺伝子を含むDNAフラグメントInfo
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- JPS6219086A JPS6219086A JP15584985A JP15584985A JPS6219086A JP S6219086 A JPS6219086 A JP S6219086A JP 15584985 A JP15584985 A JP 15584985A JP 15584985 A JP15584985 A JP 15584985A JP S6219086 A JPS6219086 A JP S6219086A
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- C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- C07K14/435—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
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- C07K14/4701—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans from vertebrates from mammals not used
- C07K14/4716—Muscle proteins, e.g. myosin, actin
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Abstract
(57)【要約】本公報は電子出願前の出願データであるた
め要約のデータは記録されません。
め要約のデータは記録されません。
Description
【発明の詳細な説明】
〔発明の利用分野〕
本発明は、ヒトのβ−アクチン遺伝子を含むDNAフラ
グメントに関する。
グメントに関する。
アクチンは真核細胞中綴も多量に存在する蛋白質である
。を推動物のアクチンには少くとも6種のイソタイプが
知られており、4種の筋肉型アクチン(骨格筋アクチン
、心筋アクチン、大動脈平滑筋アクチン、胃平滑筋アク
チン)と2種の非筋肉型アクチン(細胞質β−アクチン
及び同γ−アクチン)がある。筋肉型アクチンは組織特
異性があり、411能的に筋肉の収縮に関与している。
。を推動物のアクチンには少くとも6種のイソタイプが
知られており、4種の筋肉型アクチン(骨格筋アクチン
、心筋アクチン、大動脈平滑筋アクチン、胃平滑筋アク
チン)と2種の非筋肉型アクチン(細胞質β−アクチン
及び同γ−アクチン)がある。筋肉型アクチンは組織特
異性があり、411能的に筋肉の収縮に関与している。
他方、細胞質アクチンはあらゆる細胞に存在し、多種の
細胞機能に関与している。β−アクチンは鼻筋性の代表
的細胞質アクチンとして知られ、脳や肝臓といった組織
及び培養細胞等に於て主要構造蛋白質の一つとして存在
する。
細胞機能に関与している。β−アクチンは鼻筋性の代表
的細胞質アクチンとして知られ、脳や肝臓といった組織
及び培養細胞等に於て主要構造蛋白質の一つとして存在
する。
アクチンは、一般に、筋肉収縮運動を掌とる主要構造蛋
白質として知られているが、また、他の20種類以上も
の調節蛋白質と作用して夫々異なった働きを示す等、多
岐にわたる機能をもったユニークな蛋白質である。それ
故、アクチンは細胞の発生分化に伴う細胞形態、運動性
、細胞間相互作用などの変化にも中心的役割を担ってい
るものと考えられており、また、一方では、細胞の分化
、癌化とアクチンのイソタイプの交換に相関性があるこ
とも知られてきている。
白質として知られているが、また、他の20種類以上も
の調節蛋白質と作用して夫々異なった働きを示す等、多
岐にわたる機能をもったユニークな蛋白質である。それ
故、アクチンは細胞の発生分化に伴う細胞形態、運動性
、細胞間相互作用などの変化にも中心的役割を担ってい
るものと考えられており、また、一方では、細胞の分化
、癌化とアクチンのイソタイプの交換に相関性があるこ
とも知られてきている。
従って、アクチンの遺伝子の構造及び編成を解明するこ
とは、その発現の制御機構1分化の問題を始めとして、
その異常発現の疾病に於ける役割、発癌の機構、等の究
明に多大な寄与をもたらすことは必定であり、その解明
が待たれていた。
とは、その発現の制御機構1分化の問題を始めとして、
その異常発現の疾病に於ける役割、発癌の機構、等の究
明に多大な寄与をもたらすことは必定であり、その解明
が待たれていた。
本発明は、−ヒ記した如き現状に鑑みなされたもので、
アクチンの遺伝子の構造及び編成を解明することにより
、その発現の制御機構、疾病に於ける役割、分化、発癌
の機構等を究明するべく、ヒト細胞質β−アクチン遺伝
子を含むDNAフラグメントを提供することにより、こ
れを達せしめんとするものである。
アクチンの遺伝子の構造及び編成を解明することにより
、その発現の制御機構、疾病に於ける役割、分化、発癌
の機構等を究明するべく、ヒト細胞質β−アクチン遺伝
子を含むDNAフラグメントを提供することにより、こ
れを達せしめんとするものである。
本発明は、エクソン及びイントロン、並びに該エクソン
に隣接した5°末端側約250個の核酸塩基配列を含ん
で成るヒトβ−アクチン遺伝子を含むDNAフラグメン
トの発明である。
に隣接した5°末端側約250個の核酸塩基配列を含ん
で成るヒトβ−アクチン遺伝子を含むDNAフラグメン
トの発明である。
本発明者らは、遺伝子組換えの手法を用いて、これまで
、鋭意アクチン遺伝子の構造についての研究を重ねてき
たが、今般、ヒトのβ−アクチンの遺伝子をクローニン
グすることに成功し1本発明を完成するに到った。
、鋭意アクチン遺伝子の構造についての研究を重ねてき
たが、今般、ヒトのβ−アクチンの遺伝子をクローニン
グすることに成功し1本発明を完成するに到った。
本発明に係るヒトβ−アクチン遺伝子のヌクレオチド配
列から推定されるアミノ酸配列は、ヒト線維芽細胞のβ
−アクチンのアミノ酸配列と完全に一致する。
列から推定されるアミノ酸配列は、ヒト線維芽細胞のβ
−アクチンのアミノ酸配列と完全に一致する。
本発明に係るヒトβ−アクチン遺伝子は、6個のエクソ
ン(遺伝情報をコードした領域)と5個のイントロン
(介在配列)を含む。即ち、第1エクソンに続いて1つ
の大きなイントロンが存在し、第2エクソンはATG開
始コドンの上流に6つの5′非翻訳領域ヌクレオチドが
存在し、4つのイントロンが41/42番目、 121
/122番[1、267番目、327/328番目のア
ミノ酸に相当するコーディング領域に存在する。また、
本発明のβ−アクチン遺伝子は、第1エクソンに隣接し
た5゛末端側に約250個の核酸塩基配列を含む。アミ
ノ酸をコードする領域は第2〜第6までのエクソンに存
在し、非翻訳領域は第1、第2及び第6エクソンに存在
する。
ン(遺伝情報をコードした領域)と5個のイントロン
(介在配列)を含む。即ち、第1エクソンに続いて1つ
の大きなイントロンが存在し、第2エクソンはATG開
始コドンの上流に6つの5′非翻訳領域ヌクレオチドが
存在し、4つのイントロンが41/42番目、 121
/122番[1、267番目、327/328番目のア
ミノ酸に相当するコーディング領域に存在する。また、
本発明のβ−アクチン遺伝子は、第1エクソンに隣接し
た5゛末端側に約250個の核酸塩基配列を含む。アミ
ノ酸をコードする領域は第2〜第6までのエクソンに存
在し、非翻訳領域は第1、第2及び第6エクソンに存在
する。
本発明のヒトβ−アクチン遺伝子には、ヒト心筋アクチ
ン遺伝子、大動脈平滑筋アクチン遺伝子及び胃平滑筋ア
クチン遺伝子などとは反対に。
ン遺伝子、大動脈平滑筋アクチン遺伝子及び胃平滑筋ア
クチン遺伝子などとは反対に。
成熟蛋白のN末端アミノ酸のコドンとATG開始コドン
との間に存在する(4sコドンがない。本発明のヒトβ
−アクチン遺伝子に於けるコーディング領域、及び3°
非翻訳領域、並びに第一エクソンとそれに続く5°末端
側フランキング領域のCCAATボックスとTATAボ
ックスとの間(ODNA塩基配列は、ラットβ−アクチ
ン及びニワトリβ−アクチン遺伝子のDNA塩基配列と
非常に相補性が高い。また、特筆に値することとして、
本発明のヒトβ−アクチン遺伝子のイントロン■の塩基
配列は、ラットβ−アクチン遺伝子のイントロンのそれ
と高い相補性を示す。
との間に存在する(4sコドンがない。本発明のヒトβ
−アクチン遺伝子に於けるコーディング領域、及び3°
非翻訳領域、並びに第一エクソンとそれに続く5°末端
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ックスとの間(ODNA塩基配列は、ラットβ−アクチ
ン及びニワトリβ−アクチン遺伝子のDNA塩基配列と
非常に相補性が高い。また、特筆に値することとして、
本発明のヒトβ−アクチン遺伝子のイントロン■の塩基
配列は、ラットβ−アクチン遺伝子のイントロンのそれ
と高い相補性を示す。
本発明のヒトβ−アクチン遺伝子を含むDNAフラグメ
ントは概路次のようにして得られる。
ントは概路次のようにして得られる。
即ち、薬剤処理により株化したヒト由来の培養細胞HU
T −14(J、 Biol、 Cham、、 25
5. lB50−1881(11380))のDNAを
EcoRIで部分分解したものを入ファージに組み込み
、ヒトの遺伝子ライブラリーを作製する。次いで、既に
得られているβ−アクチン偽偽造遺伝子The Jou
rnal of CellBiology、 Vol、
95. November p、223a (198
2))のコーディング領域の一部であるca O,3k
bp Hinf 1フラグメントと、同遺伝子の3”末
端側の非コーディング領域の一部であるca O,2k
bp Hinf Iフラグメントをプローブとして、B
entonとDavisの方法 (Science、
198.180−182 (11177))によりl5
itu プラークハイブリダイゼーションを行い、ス
クリーニングすると20〜30種のポジティブなりロー
ンが単離される。
T −14(J、 Biol、 Cham、、 25
5. lB50−1881(11380))のDNAを
EcoRIで部分分解したものを入ファージに組み込み
、ヒトの遺伝子ライブラリーを作製する。次いで、既に
得られているβ−アクチン偽偽造遺伝子The Jou
rnal of CellBiology、 Vol、
95. November p、223a (198
2))のコーディング領域の一部であるca O,3k
bp Hinf 1フラグメントと、同遺伝子の3”末
端側の非コーディング領域の一部であるca O,2k
bp Hinf Iフラグメントをプローブとして、B
entonとDavisの方法 (Science、
198.180−182 (11177))によりl5
itu プラークハイブリダイゼーションを行い、ス
クリーニングすると20〜30種のポジティブなりロー
ンが単離される。
これらのクローンは当然のことながら、β−アクチンの
偽造遺伝子やイソタイプのアクチン遺伝子を含むものな
ど様々である。そこでβ−アクチン遺伝子と他のイソア
クチン及び関連遺伝子とを区別するために、β−アクチ
ン遺伝子に特異的な核酸塩g配列CTGACCATGG
ATGATGATATCGCC(Mol。
偽造遺伝子やイソタイプのアクチン遺伝子を含むものな
ど様々である。そこでβ−アクチン遺伝子と他のイソア
クチン及び関連遺伝子とを区別するために、β−アクチ
ン遺伝子に特異的な核酸塩g配列CTGACCATGG
ATGATGATATCGCC(Mol。
Ce11. Biol、、 3.787−795 (1
883))を化学合成した合成りNAフラグメントをプ
ローブとして、各ファージから単離したDNAをCon
nerらの方法(Proc、 Natl、 Acad、
Sci、、 80.278−282 (+983))
によりハイブリダイゼーションアッセイする。そうする
と、強くポジティブなシグナルを出すクローン1個が得
られる。そのファージから単離したDNAを常法に従っ
て制限酵素で分解して、挿入されているEcoRIフラ
グメントの制限酵素地図を作成し、更に、Maxamと
G11bertの方法(Proc、 Natl、 Ac
ad、 Sci、、 74.560−584 (197
?))により全核酸塩基配列を決定する。
883))を化学合成した合成りNAフラグメントをプ
ローブとして、各ファージから単離したDNAをCon
nerらの方法(Proc、 Natl、 Acad、
Sci、、 80.278−282 (+983))
によりハイブリダイゼーションアッセイする。そうする
と、強くポジティブなシグナルを出すクローン1個が得
られる。そのファージから単離したDNAを常法に従っ
て制限酵素で分解して、挿入されているEcoRIフラ
グメントの制限酵素地図を作成し、更に、Maxamと
G11bertの方法(Proc、 Natl、 Ac
ad、 Sci、、 74.560−584 (197
?))により全核酸塩基配列を決定する。
本発明のヒトβ−アクチン遺伝子は、当然予想されるこ
とではあるが、他のイソタイプアクチン遺伝子と強い相
同性を示す。即ち、アクチン蛋白をコードする領域では
80%以上が同一で、遺伝子全体の構造も6個のエクソ
ンから成るなどの類似性を有する。従って、本発明のヒ
トβ−アクチン遺伝子を含むDNAフラグメントは、他
のイソタイプのアクチン遺伝子や異種アクチン遺伝子の
クローニングやmRNAの定量等にアクチン特異的プロ
ーブとして広く利用できるものである。また1本発明の
ヒトβ−アクチン遺伝子を含むDNAフラグメントは、
遺伝子発現のコントロールとしても極めて有用であり、
細胞の分化や発癌の機構等を解明する上に於ても必要不
可欠のものである。更に、本発明によりβ−アクチン遺
伝子のDNA塩基配列が決定されたことからプロモータ
ーに続く5°末端上流に公知のコンセンサスシーフェン
ス (TATAボックス、CCAA↑ボックス等)の存
在が判り、β−アクチン遺伝子のプロモーター及びフラ
ンキングシーフェンスの設定ができたことも今後の研究
に寄与するところが大きい。
とではあるが、他のイソタイプアクチン遺伝子と強い相
同性を示す。即ち、アクチン蛋白をコードする領域では
80%以上が同一で、遺伝子全体の構造も6個のエクソ
ンから成るなどの類似性を有する。従って、本発明のヒ
トβ−アクチン遺伝子を含むDNAフラグメントは、他
のイソタイプのアクチン遺伝子や異種アクチン遺伝子の
クローニングやmRNAの定量等にアクチン特異的プロ
ーブとして広く利用できるものである。また1本発明の
ヒトβ−アクチン遺伝子を含むDNAフラグメントは、
遺伝子発現のコントロールとしても極めて有用であり、
細胞の分化や発癌の機構等を解明する上に於ても必要不
可欠のものである。更に、本発明によりβ−アクチン遺
伝子のDNA塩基配列が決定されたことからプロモータ
ーに続く5°末端上流に公知のコンセンサスシーフェン
ス (TATAボックス、CCAA↑ボックス等)の存
在が判り、β−アクチン遺伝子のプロモーター及びフラ
ンキングシーフェンスの設定ができたことも今後の研究
に寄与するところが大きい。
以下、実施例により本発明を更に詳細に説明する。
(1)材料及び方法
fil材料
制限酵素はBethesda Re5earch La
boratories。
boratories。
の
Inc 、製のもの及びNew England Bi
olabs製のべ使用。T4ポリヌクレオチドキナーゼ
とDNAポリメラーゼ■ラージフラグメント(Klen
ow断片)はBiihringer Mannheim
製のものを使用。
olabs製のべ使用。T4ポリヌクレオチドキナーゼ
とDNAポリメラーゼ■ラージフラグメント(Klen
ow断片)はBiihringer Mannheim
製のものを使用。
牛胸腺ターミナルトランスフェラーゼはP−LBioc
hemical、s製のもの、ジーン・スクリーン・プ
ラス膜はNew England Nuclear製の
もの、″P放射性ヌクレオチドはAmersham R
adiochemicals製のものを夫々使用した。
hemical、s製のもの、ジーン・スクリーン・プ
ラス膜はNew England Nuclear製の
もの、″P放射性ヌクレオチドはAmersham R
adiochemicals製のものを夫々使用した。
また、オリゴヌクレオチド CTCACCATGGAT
GATGATATCGCCは、ヒトβ−アクチア m
RN Aに対応するcDNAの塩基配列データに基づい
てCraativeBioMoleculesで合成さ
れたものをT4ポリヌクレオチドキナーゼを用いて5°
末端をラベルして、β−アクチン遺伝子に特異的なプロ
ーブとして用いた。
GATGATATCGCCは、ヒトβ−アクチア m
RN Aに対応するcDNAの塩基配列データに基づい
てCraativeBioMoleculesで合成さ
れたものをT4ポリヌクレオチドキナーゼを用いて5°
末端をラベルして、β−アクチン遺伝子に特異的なプロ
ーブとして用いた。
ヒト遺伝子ライブラリーは、化学発癌剤で株化した細胞
株1(UT−14をEcoRIで部分的に切断して得た
DNAを入77−ジ(Sharon 4A)に組込み作
製した。
株1(UT−14をEcoRIで部分的に切断して得た
DNAを入77−ジ(Sharon 4A)に組込み作
製した。
アクチン遺伝子検索のためのプローブは、本発明者らが
先に分離したβ−アクチンの偽造遺伝子のコーディング
領域及び3°非翻訳領域から夫々分離された0、3kb
p Hint I断片及び0.2kbp Hinf I
断片をラベルして作製した。
先に分離したβ−アクチンの偽造遺伝子のコーディング
領域及び3°非翻訳領域から夫々分離された0、3kb
p Hint I断片及び0.2kbp Hinf I
断片をラベルして作製した。
上述ヒト遺伝子ライブラリーのスクリーニングは、Be
ntonとDavisの方法(Science、 1f
18.180−182 (197?))に従って、1回
目は0.3kbpの旧nf工断片を、2回目は0.2k
bpの旧nfI断片をプローブとして、 in 5it
u プラークハイブリダイゼーションを行なった。
ntonとDavisの方法(Science、 1f
18.180−182 (197?))に従って、1回
目は0.3kbpの旧nf工断片を、2回目は0.2k
bpの旧nfI断片をプローブとして、 in 5it
u プラークハイブリダイゼーションを行なった。
(11)制限酵素地図、サザン・ブロッティング及びD
NA塩基配列の決定 上述スクリーニングから得られたファージからDNAを
抽出し、ファージDNAを制限酵素で切断して0.7%
アガロースゲルで電気泳動し、サザンの方法(J、 M
o1. Bio+、、 138.503−517(19
75))に従ってサザンブロッティングを行い、各組換
えファージにβ−アクチン関連遺伝子がいかに組込まれ
ているかを調べた。サザンブロッティングのプローブと
しては、上記0.2kbp Hint I断片のほか、
新たにβ−アクチン偽偽造伝子のコーディング領域の5
“末端から分離した0、2kbp Taq I断片を用
いた。その結果をもとにファージに組込まれたアクチン
遺伝子を含むDNA断片の制限酵素地図を作成した。H
UT−14細胞のDNAは制限酵素で切断し、アガロー
スゲルで電気泳動後、上述のプローブを用いサザンブロ
ツテイング4こよって検出した。
NA塩基配列の決定 上述スクリーニングから得られたファージからDNAを
抽出し、ファージDNAを制限酵素で切断して0.7%
アガロースゲルで電気泳動し、サザンの方法(J、 M
o1. Bio+、、 138.503−517(19
75))に従ってサザンブロッティングを行い、各組換
えファージにβ−アクチン関連遺伝子がいかに組込まれ
ているかを調べた。サザンブロッティングのプローブと
しては、上記0.2kbp Hint I断片のほか、
新たにβ−アクチン偽偽造伝子のコーディング領域の5
“末端から分離した0、2kbp Taq I断片を用
いた。その結果をもとにファージに組込まれたアクチン
遺伝子を含むDNA断片の制限酵素地図を作成した。H
UT−14細胞のDNAは制限酵素で切断し、アガロー
スゲルで電気泳動後、上述のプローブを用いサザンブロ
ツテイング4こよって検出した。
1n基配列決定は、ト述制限酵素地図に従い、Maxa
mとG11bertの方法(Proc、 Natl、
Acad、 Sci。
mとG11bertの方法(Proc、 Natl、
Acad、 Sci。
USA、 74.580−584 (197?))に従
って行った。塩基配列データは、Wi 1burとLi
pmanの作成したプログラム (Proc、 Nat
l、 Acad、 USA、、 80.728−730
(1983))を使い分析した。
って行った。塩基配列データは、Wi 1burとLi
pmanの作成したプログラム (Proc、 Nat
l、 Acad、 USA、、 80.728−730
(1983))を使い分析した。
組換えファージを含む実験は、全て、NIH組換えDN
A指針に従ってこれを行った。
A指針に従ってこれを行った。
(2)結果
(1)クローンの分離と制限地図
β−アクチン遺伝子のヌクレオチド配列が他の7クチン
遺伝子のものと非常によく似ていることと、細胞質アク
チンに関連した遺伝子(大部分偽造遺伝子のようである
が、)が複数存在することが最近の知見により示唆され
ていることから、他のアクチン・イソフオーム遺伝子及
び偽造遺伝子から機能的β−アクチン遺伝子を分けるの
に3段階のスクリーニングを行った。
遺伝子のものと非常によく似ていることと、細胞質アク
チンに関連した遺伝子(大部分偽造遺伝子のようである
が、)が複数存在することが最近の知見により示唆され
ていることから、他のアクチン・イソフオーム遺伝子及
び偽造遺伝子から機能的β−アクチン遺伝子を分けるの
に3段階のスクリーニングを行った。
先ず始めに、β−アクチン偽偽造伝子のコーディング領
域由来のプローブで、ヒトのDNAライブラリーをスク
リーニングしたところ、多数のポジティブなりローンが
得られた。次に、これらのクローンなβ−アクチン遺伝
子により特異的な3′非翻訳債域由来の第2のプローブ
を用いてスクリーニングした。厳密に相補的なりNA塩
基配列を検出するような条件の下で第2のプローブとD
NAの相補的な結合により25個のクローンを検出した
。更に、この25個のクローンのファージDNAを制限
酵素で切断し、第2のプローブのほか新たにβ−アクチ
ン偽偽造伝子の5′末端側のコーディング領域由来の0
.2kbp (Taq I断片)のプローブを用いてハ
イブリダイゼーション分析した結果、25個のクローン
を8種の異なるβ−アクチン関連遺伝子群に分類するこ
とができた。
域由来のプローブで、ヒトのDNAライブラリーをスク
リーニングしたところ、多数のポジティブなりローンが
得られた。次に、これらのクローンなβ−アクチン遺伝
子により特異的な3′非翻訳債域由来の第2のプローブ
を用いてスクリーニングした。厳密に相補的なりNA塩
基配列を検出するような条件の下で第2のプローブとD
NAの相補的な結合により25個のクローンを検出した
。更に、この25個のクローンのファージDNAを制限
酵素で切断し、第2のプローブのほか新たにβ−アクチ
ン偽偽造伝子の5′末端側のコーディング領域由来の0
.2kbp (Taq I断片)のプローブを用いてハ
イブリダイゼーション分析した結果、25個のクローン
を8種の異なるβ−アクチン関連遺伝子群に分類するこ
とができた。
第3のプローブとしては、5゛非翻訳領域の6ヌクレオ
チド、ATG開始コドンとそれに統〈β−ド GTGA
CCATGGAT利ATGATATCGCCをプローブ
として、Cannet等の方法(Proc、 Natl
、 Acad、 Sci。
チド、ATG開始コドンとそれに統〈β−ド GTGA
CCATGGAT利ATGATATCGCCをプローブ
として、Cannet等の方法(Proc、 Natl
、 Acad、 Sci。
USA、 80.278−282 (11383))4
.:従ッテハイフリダイゼーション分析を行った。その
結果、λHa 180と名付けられたクローン1個だけ
が、フィルターを0、I X 5SC(0,015M
NaC110,0015Nクエン酸ナトリウム、 pH
7)などの洗浄液で85℃で洗うという苛酷な条件でも
、このオリゴヌクレオチドと強くハイブリダイズした。
.:従ッテハイフリダイゼーション分析を行った。その
結果、λHa 180と名付けられたクローン1個だけ
が、フィルターを0、I X 5SC(0,015M
NaC110,0015Nクエン酸ナトリウム、 pH
7)などの洗浄液で85℃で洗うという苛酷な条件でも
、このオリゴヌクレオチドと強くハイブリダイズした。
(11)コーディング領域の塩基配列
λHa 180に組込まれたβ−アクチン遺伝子を含む
DNA断片とその制限酵素地図を第1図(a)。
DNA断片とその制限酵素地図を第1図(a)。
(b)に示す。第1図(b)に従って決定されたDNA
塩基配列は第2図に示す。第2図(a)、(b)に示し
たβ−アクチンのコーディング領域の塩基配列から推論
されるアミノ酸配列は、本発明者らが既に報告したヒト
β−アクチンのアミノ酸配列と同一であった(Ce11
.22.893−899 (1980)) 、まlま た、公知のヒトβ−アクチンmRNAのものと完全に一
致した(Nucleic ActdsRes、、 12
. t887−1898(1984))。第1図(c)
に本発明に係る遺伝子を図式的に示した。図より明らか
な如く核酸塩基−779/−6と、41/42番目、1
21/122番目、267番目、 327/328番目
のコーディング領域を中断する4個のイントロンと計
5個のイントロンが存在する。エクソン・イントロン境
界配列は、スプライシングサイトのGT−AGルールに
一致する。
塩基配列は第2図に示す。第2図(a)、(b)に示し
たβ−アクチンのコーディング領域の塩基配列から推論
されるアミノ酸配列は、本発明者らが既に報告したヒト
β−アクチンのアミノ酸配列と同一であった(Ce11
.22.893−899 (1980)) 、まlま た、公知のヒトβ−アクチンmRNAのものと完全に一
致した(Nucleic ActdsRes、、 12
. t887−1898(1984))。第1図(c)
に本発明に係る遺伝子を図式的に示した。図より明らか
な如く核酸塩基−779/−6と、41/42番目、1
21/122番目、267番目、 327/328番目
のコーディング領域を中断する4個のイントロンと計
5個のイントロンが存在する。エクソン・イントロン境
界配列は、スプライシングサイトのGT−AGルールに
一致する。
以上の結果は、入Ha 180が機能的ヒトβ−アクチ
ン遺伝子を完全に含むことを示している。
ン遺伝子を完全に含むことを示している。
本発明に係るβ−アクチン遺伝子には、ラット及びニワ
トリのβ−アクチン遺伝子同様、成熟蛋白のN末端アミ
ノ酸のコドンとATG開始コドンとの間に存在するCy
sコドンが無いことも特徴の一つである。
トリのβ−アクチン遺伝子同様、成熟蛋白のN末端アミ
ノ酸のコドンとATG開始コドンとの間に存在するCy
sコドンが無いことも特徴の一つである。
(iiil 5 ’非翻訳領域
ヒトβ−アクチン遺伝子のヌクレオチド配列とヒトβ−
アクチンcDNAクローンのそれ(Nucleic A
c1ds Res、、 12.1ftB?−In2 (
1984))を比較すると、大きなイントロンがATG
開始コドンの上流の6つ目のヌクレオチドから始まり、
−773の位置まで続いて存在していることが判る(第
2図(a))。Goldberg−Hogne+sボッ
クス (Ann。
アクチンcDNAクローンのそれ(Nucleic A
c1ds Res、、 12.1ftB?−In2 (
1984))を比較すると、大きなイントロンがATG
開始コドンの上流の6つ目のヌクレオチドから始まり、
−773の位置まで続いて存在していることが判る(第
2図(a))。Goldberg−Hogne+sボッ
クス (Ann。
Rev、 BiocheIl、、 50.349−38
3 (1981)他)に相当するTATAAAA配列は
ヌクレオチド −879(下線部)で確認され、CCA
ATC配列(Nucleic Ac1dsRes、、
8.127−142 (11180))はTATAボ
ックスの1−流のヌクレオチド61番目の位置に確認さ
れた。
3 (1981)他)に相当するTATAAAA配列は
ヌクレオチド −879(下線部)で確認され、CCA
ATC配列(Nucleic Ac1dsRes、、
8.127−142 (11180))はTATAボ
ックスの1−流のヌクレオチド61番目の位置に確認さ
れた。
また、二つの推定−ヒのキャップ位置配列CACは、T
ATAボックスの下流の25番目と28番目のヌクレオ
チドの位置に存在した。従って、第一エクソンに隣接し
た5′末端側約250個の核酸塩基配列はフランキング
シーフェンスと推定される。
ATAボックスの下流の25番目と28番目のヌクレオ
チドの位置に存在した。従って、第一エクソンに隣接し
た5′末端側約250個の核酸塩基配列はフランキング
シーフェンスと推定される。
rn/13’非翻訳領域
ヒトβ−アクチン遺伝子の3°非翻訳領域のヌクレオチ
ド配列(第2図(b)参照)は、既知のヒトβ−アクチ
アCDNAのそれ(Nucleic Ac1dsRes
、、 12.1887−18118 (11384))
と完全に一致した。従って、ヒトβ−アクチン遺伝子の
3°非翻訳領域には、イントロンは存在しない、想定上
のポリアゾニレ−ジョン暗号 AATAAA (Nat
ure、 283゜211−214 (II3?fり)
はヌクレオチド 2480に位置する (第2図(b)
)。cDNAのポリ(A)鎖はポリアゾニレ−ジョン暗
号の下流の19番目のヌクレオチドにあると報告されて
いる (Nucleic Ac1dsRes、、 12
.1887−18118 (111184))が、遺伝
子DNAでは5個のA残基がこの位置に存在している。
ド配列(第2図(b)参照)は、既知のヒトβ−アクチ
アCDNAのそれ(Nucleic Ac1dsRes
、、 12.1887−18118 (11384))
と完全に一致した。従って、ヒトβ−アクチン遺伝子の
3°非翻訳領域には、イントロンは存在しない、想定上
のポリアゾニレ−ジョン暗号 AATAAA (Nat
ure、 283゜211−214 (II3?fり)
はヌクレオチド 2480に位置する (第2図(b)
)。cDNAのポリ(A)鎖はポリアゾニレ−ジョン暗
号の下流の19番目のヌクレオチドにあると報告されて
いる (Nucleic Ac1dsRes、、 12
.1887−18118 (111184))が、遺伝
子DNAでは5個のA残基がこの位置に存在している。
従って、ポリアゾニレ−ジョンはこれらの残基のどれに
でも、また全てにでも起り得る。
でも、また全てにでも起り得る。
Mヒトβ−アクチン遺伝子のサザンプロット分析
機能的β−アクチン遺伝子の数を、β−アクチン遺伝子
中最大のイントロンであるイントロンI及びイントロン
■をプローブとして用いて検索した。
中最大のイントロンであるイントロンI及びイントロン
■をプローブとして用いて検索した。
第1のプローブ、即ち、イントロン■の一部と、5°非
翻訳領域の6塩基を含む0.3kbp X5aI−Ne
o I断片は、ヒト遺伝子DNAをどの制限酵素で切断
した場合でも単一の強いバンドを生じた。
翻訳領域の6塩基を含む0.3kbp X5aI−Ne
o I断片は、ヒト遺伝子DNAをどの制限酵素で切断
した場合でも単一の強いバンドを生じた。
プローブにハイブリダイズしたバンドのDNA分子サイ
ズは、クローニングしたDNAの制限酵素地図から予測
されたサイズと一致した(Sma I切断では0.3k
bp、 EcoRI切断では14.5kbp、 Eco
RI −BamHに型切断では8.5kbp)。
ズは、クローニングしたDNAの制限酵素地図から予測
されたサイズと一致した(Sma I切断では0.3k
bp、 EcoRI切断では14.5kbp、 Eco
RI −BamHに型切断では8.5kbp)。
第2のプローブ、即ち、イントロン■の一部を含む0.
2kbp Hinf I断片も、各制限酵素切断DNA
に対し単一バンドを生じた。
2kbp Hinf I断片も、各制限酵素切断DNA
に対し単一バンドを生じた。
ハイブリダイズしたバンドの分子サイズは、クローン化
したDNAの制限酵素地図から予測されたサイズと一致
した(Sma I切断では9.0kbp)。
したDNAの制限酵素地図から予測されたサイズと一致
した(Sma I切断では9.0kbp)。
以」−の結果から、ヒト遺伝子のβ−アクチンには一個
の機能的遺伝子しか存在しないことが判った。
の機能的遺伝子しか存在しないことが判った。
また、イントロンエと5゛非翻訳領域の大部分を含む0
.8kbp X+*aI断片を使用したところ、一つの
大きなバンドの他に少なくとも一個の弱いバンドが認め
られた。公知のβ−アクチン偽偽造遺伝子、いずれも5
゛非翻訳領域に相同的な短い配列を有することから、こ
れらの余分のバンドはこのプロ 0−ブのβ−アクチン偽偽造遺伝子の弱いハイブリダイ
ゼーション能力によるものと推測される。
.8kbp X+*aI断片を使用したところ、一つの
大きなバンドの他に少なくとも一個の弱いバンドが認め
られた。公知のβ−アクチン偽偽造遺伝子、いずれも5
゛非翻訳領域に相同的な短い配列を有することから、こ
れらの余分のバンドはこのプロ 0−ブのβ−アクチン偽偽造遺伝子の弱いハイブリダイ
ゼーション能力によるものと推測される。
(3)入Ha IEIOが機能的なβ−アクチン遺伝子
を含んでいることの証明としては、入Ha 1130の
塩基配列上の次の掲げる四つの特徴が挙げられる。
を含んでいることの証明としては、入Ha 1130の
塩基配列上の次の掲げる四つの特徴が挙げられる。
■コーディング領域の核酸塩基配列から想定されるアミ
ノ酸配列が公知のヒトのβ−アクチンのアミノ酸配列に
完全に一致する。
ノ酸配列が公知のヒトのβ−アクチンのアミノ酸配列に
完全に一致する。
■エクソンとイントロンの境界核酸塩基配列が全てGT
−ACルールに従っている。
−ACルールに従っている。
■第1エクソン上流に見られるTATAボックスとCC
AATボックスの配列の相対的位置か他の7クチン遺伝
子のそれとよく一致する。
AATボックスの配列の相対的位置か他の7クチン遺伝
子のそれとよく一致する。
■ポリアゾニレージョン暗号が3′非翻訳領域中に存在
する。
する。
以上述べた如く、本発明は機能的ヒトβ−アクチン遺伝
子(偽造遺伝子ではない)を含むDNAフラグメントを
初めて提供するものであり、本発明のヒトβ−アクチン
遺伝子を含むDNAフラグメントは、他のイソタイプの
アクチン遺伝子や異種アクチン遺伝子のクローニングに
、またmRNAの定量に、アクチン特異的プローブとし
て広く使用し得るものであると共に、遺伝子発現のコン
トロールとしても極めて有用であり、細胞の分化や発癌
の機構等を解明する上に於ても必要且つ欠くべからざる
ものであって、斯業に貢献するところ甚だ大なる発明で
ある。
子(偽造遺伝子ではない)を含むDNAフラグメントを
初めて提供するものであり、本発明のヒトβ−アクチン
遺伝子を含むDNAフラグメントは、他のイソタイプの
アクチン遺伝子や異種アクチン遺伝子のクローニングに
、またmRNAの定量に、アクチン特異的プローブとし
て広く使用し得るものであると共に、遺伝子発現のコン
トロールとしても極めて有用であり、細胞の分化や発癌
の機構等を解明する上に於ても必要且つ欠くべからざる
ものであって、斯業に貢献するところ甚だ大なる発明で
ある。
第1図は本発明に係るヒトβ−アクチン遺伝子の構造地
図であり、(a)はファージ入Ha160DNAに組込
まれたヒトβ−アクチン遺伝子の制限酵素地図を示し、
(b)はファージ入Ha 180に組込まれたヒトβ−
アクチン遺伝子を含むDNAの詳細な制限酵素地図であ
る。但し、 (a) 、 (b)に於てAIはAVaI
、AはAVaII、BはBa+mH1,EはEcoRI
、 Fは旧nfI、HはHpall、NはNcol、
PはPvul[、RはRsal、Sは5aTI、XはX
o+aIを夫々表わす。 また、(C)はβ−アクチン遺伝子の構造を図式化した
ものであり、囲った部分はエクソンを示し、そのうち白
い部分は非翻訳領域を示し、黒い部分はβ−アクチンの
コーディング領域を示す。 また、細い線の部分はイントロン及びそれに続くDNA
部分を示す。 第2図は本発明に係るヒトβ−アクチン遺伝子の核酸配
列であり、(a)は5°非翻訳領域、(b)はコーディ
ング領域及び3°非翻訳領域を夫々表わす。核酸はAT
G開始コドンのAから数えた番号〆つけられている。ヒ
トβ−アクチンのアミノ酸配列は核酸配列の上部に示さ
れている。CCAATボックス、TATAボックス、キ
ャップ位置及びポリアゾニレ−ジョン暗号に係る推定上
の配列には下線を施した。斜線はエクソンとイントロン
との接合点を示している。 特許出願人 和光純薬工業株式会社 第2図(a) GCCCAGCACCCCAAC;GCCGCCAAC
CCCAAAACTCTCCCTCCTCCTCTTC
CTCAATCTCCCTCTCGCTCTTTTmT
TTTcGCAAAACGAGCCCAGA105O;
CTAAAAAAATGCTCCACTG丁CCCGC
CAACCCCGTGACTGAGCGGccnccc
ccaTccAcAcccccccyCTcacccc
cAccc弱cccaズ詰Tα℃CαZAACCGCA
CCGCCGTCCGGCGCGCGGG AGA A
GCCCCTCccCCTCCC;C;AG A TO
(&GCA CACCCCA COCCAII;TTC
CCACCCll: COAGOCCCCCCTCCC
GCCGCCGCGCTCCCCGCC丁GCCGCT
CTCGGCGCCCGGOCAACCGCCGGCG
TCTTTCTCTGACCCCCGCTCTTCCC
AATGGGGATCGCACG(iTGWC(icc
CcGTAccccccGTCAGCCCCccTOC
GO(iCTCCCGCC;CCATCCOCCTGC
ll:CCCTCCTCCTTTCGcCCCTAAC
TCCCTCCC;Cf:CTcccAATTWCCC
TAATTGCGCOTOCCCCCT(X:CACT
CAATGGCCCTAATCGCGC(:TGCOT
TCT(:CCGCCCGCcCCCTTCCGCCA
CnCCTGCCCGACCCGCTGGCGCCCC
;ACGCTCTGGCCCCTGCGTCCGCGC
CCGCCACCCCGTCCC丁CTrTCAACC
CGGCGGAGGCCCCGCTC;GCCCCCG
CTTGGCACCCCCTTGGGCC(W;CTT
CCTGCCGCOCOCCGCGGCGACGCCT
CCOACCAC丁CTTTC;CCTmATCGTA
ATAACGCC;GCα刀CCα℃C゛ロ’CC’ロ
°7Q7に(C(,177ctlAcccccccα:
cccccccccy−150−1o。 QCCCCCCTAAGOACTOCCCCCC;CC
C;CAAGTCcCCAGceCICCGACTTC
OO口’CACAGCGCCCCCWCTAη’CTC
GCA(: / CTCACCATC1q
辷 J!Ju
h−亡 5女 ご >D −戸図面の浄
書(内容に変更なし) 第2図(b3) ^TGACTTA(iTTCCGTTACACCCTT
TCTTCACAAAACCT八^CTTGCCCAC
^^^^CAACATCACATTGCへATGCCA
CCTTAAAAATCAmCCAAGTGTCACT
TTOiccvctcccrcccvvcccccc^
ccxcAcccia手続補正書補正側 昭和60年11月 7日 l 事件の表示 昭和60年特許願第155849号 2 発明の名称 ヒトのβ−アクチン遺伝子を含むDNAフラグメント3
補正をする者 事件との関係 特許出願人 連絡装置 01270−8571 4 補正命令の日付 (発送日) 昭和60年10月29日 5、補正の対象 明細書の図面の簡単な説明の欄、及び図面。 6、補正の内容 (1) 明細書20頁7行目に記載の「(b)は」を
r (bl)−(ba)は」と補正する。 (2) 明細書20頁8行目から同頁9行目にかけて
記載の「夫々表わす。」を「夫々表わす(但し、(b2
)は(bl)のつづきであり、(b3)は(b2)のつ
づきである)。」と補正する。 (3)第2図(b)を別紙のとおり第2図(bl)〜(
b3)と補正する。 以上
図であり、(a)はファージ入Ha160DNAに組込
まれたヒトβ−アクチン遺伝子の制限酵素地図を示し、
(b)はファージ入Ha 180に組込まれたヒトβ−
アクチン遺伝子を含むDNAの詳細な制限酵素地図であ
る。但し、 (a) 、 (b)に於てAIはAVaI
、AはAVaII、BはBa+mH1,EはEcoRI
、 Fは旧nfI、HはHpall、NはNcol、
PはPvul[、RはRsal、Sは5aTI、XはX
o+aIを夫々表わす。 また、(C)はβ−アクチン遺伝子の構造を図式化した
ものであり、囲った部分はエクソンを示し、そのうち白
い部分は非翻訳領域を示し、黒い部分はβ−アクチンの
コーディング領域を示す。 また、細い線の部分はイントロン及びそれに続くDNA
部分を示す。 第2図は本発明に係るヒトβ−アクチン遺伝子の核酸配
列であり、(a)は5°非翻訳領域、(b)はコーディ
ング領域及び3°非翻訳領域を夫々表わす。核酸はAT
G開始コドンのAから数えた番号〆つけられている。ヒ
トβ−アクチンのアミノ酸配列は核酸配列の上部に示さ
れている。CCAATボックス、TATAボックス、キ
ャップ位置及びポリアゾニレ−ジョン暗号に係る推定上
の配列には下線を施した。斜線はエクソンとイントロン
との接合点を示している。 特許出願人 和光純薬工業株式会社 第2図(a) GCCCAGCACCCCAAC;GCCGCCAAC
CCCAAAACTCTCCCTCCTCCTCTTC
CTCAATCTCCCTCTCGCTCTTTTmT
TTTcGCAAAACGAGCCCAGA105O;
CTAAAAAAATGCTCCACTG丁CCCGC
CAACCCCGTGACTGAGCGGccnccc
ccaTccAcAcccccccyCTcacccc
cAccc弱cccaズ詰Tα℃CαZAACCGCA
CCGCCGTCCGGCGCGCGGG AGA A
GCCCCTCccCCTCCC;C;AG A TO
(&GCA CACCCCA COCCAII;TTC
CCACCCll: COAGOCCCCCCTCCC
GCCGCCGCGCTCCCCGCC丁GCCGCT
CTCGGCGCCCGGOCAACCGCCGGCG
TCTTTCTCTGACCCCCGCTCTTCCC
AATGGGGATCGCACG(iTGWC(icc
CcGTAccccccGTCAGCCCCccTOC
GO(iCTCCCGCC;CCATCCOCCTGC
ll:CCCTCCTCCTTTCGcCCCTAAC
TCCCTCCC;Cf:CTcccAATTWCCC
TAATTGCGCOTOCCCCCT(X:CACT
CAATGGCCCTAATCGCGC(:TGCOT
TCT(:CCGCCCGCcCCCTTCCGCCA
CnCCTGCCCGACCCGCTGGCGCCCC
;ACGCTCTGGCCCCTGCGTCCGCGC
CCGCCACCCCGTCCC丁CTrTCAACC
CGGCGGAGGCCCCGCTC;GCCCCCG
CTTGGCACCCCCTTGGGCC(W;CTT
CCTGCCGCOCOCCGCGGCGACGCCT
CCOACCAC丁CTTTC;CCTmATCGTA
ATAACGCC;GCα刀CCα℃C゛ロ’CC’ロ
°7Q7に(C(,177ctlAcccccccα:
cccccccccy−150−1o。 QCCCCCCTAAGOACTOCCCCCC;CC
C;CAAGTCcCCAGceCICCGACTTC
OO口’CACAGCGCCCCCWCTAη’CTC
GCA(: / CTCACCATC1q
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書(内容に変更なし) 第2図(b3) ^TGACTTA(iTTCCGTTACACCCTT
TCTTCACAAAACCT八^CTTGCCCAC
^^^^CAACATCACATTGCへATGCCA
CCTTAAAAATCAmCCAAGTGTCACT
TTOiccvctcccrcccvvcccccc^
ccxcAcccia手続補正書補正側 昭和60年11月 7日 l 事件の表示 昭和60年特許願第155849号 2 発明の名称 ヒトのβ−アクチン遺伝子を含むDNAフラグメント3
補正をする者 事件との関係 特許出願人 連絡装置 01270−8571 4 補正命令の日付 (発送日) 昭和60年10月29日 5、補正の対象 明細書の図面の簡単な説明の欄、及び図面。 6、補正の内容 (1) 明細書20頁7行目に記載の「(b)は」を
r (bl)−(ba)は」と補正する。 (2) 明細書20頁8行目から同頁9行目にかけて
記載の「夫々表わす。」を「夫々表わす(但し、(b2
)は(bl)のつづきであり、(b3)は(b2)のつ
づきである)。」と補正する。 (3)第2図(b)を別紙のとおり第2図(bl)〜(
b3)と補正する。 以上
Claims (1)
- エクソン及びイントロン、並びに該エクソンに隣接した
5′末端側約250個の核酸塩基配列を含んで成るヒト
のβ−アクチン遺伝子を含むDNAフラグメント。
Priority Applications (1)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| JP15584985A JPS6219086A (ja) | 1985-07-15 | 1985-07-15 | ヒトのβ−アクチン遺伝子を含むDNAフラグメント |
Applications Claiming Priority (1)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| JP15584985A JPS6219086A (ja) | 1985-07-15 | 1985-07-15 | ヒトのβ−アクチン遺伝子を含むDNAフラグメント |
Publications (1)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| JPS6219086A true JPS6219086A (ja) | 1987-01-27 |
Family
ID=15614843
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| JP15584985A Pending JPS6219086A (ja) | 1985-07-15 | 1985-07-15 | ヒトのβ−アクチン遺伝子を含むDNAフラグメント |
Country Status (1)
| Country | Link |
|---|---|
| JP (1) | JPS6219086A (ja) |
Cited By (1)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| US5686773A (en) * | 1994-06-20 | 1997-11-11 | Nippondenso Co., Ltd. | Alternator with generally triangular engine-mounting stays |
-
1985
- 1985-07-15 JP JP15584985A patent/JPS6219086A/ja active Pending
Cited By (1)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| US5686773A (en) * | 1994-06-20 | 1997-11-11 | Nippondenso Co., Ltd. | Alternator with generally triangular engine-mounting stays |
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