KR20200025430A - 디지털 정보를 dna 분자에 저장하는 방법 및 그 장치 - Google Patents
디지털 정보를 dna 분자에 저장하는 방법 및 그 장치 Download PDFInfo
- Publication number
- KR20200025430A KR20200025430A KR1020180102771A KR20180102771A KR20200025430A KR 20200025430 A KR20200025430 A KR 20200025430A KR 1020180102771 A KR1020180102771 A KR 1020180102771A KR 20180102771 A KR20180102771 A KR 20180102771A KR 20200025430 A KR20200025430 A KR 20200025430A
- Authority
- KR
- South Korea
- Prior art keywords
- dna
- value
- information
- digital information
- dna fragment
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Granted
Links
Images
Classifications
-
- G—PHYSICS
- G16—INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS
- G16B—BIOINFORMATICS, i.e. INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR GENETIC OR PROTEIN-RELATED DATA PROCESSING IN COMPUTATIONAL MOLECULAR BIOLOGY
- G16B20/00—ICT specially adapted for functional genomics or proteomics, e.g. genotype-phenotype associations
-
- G—PHYSICS
- G16—INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS
- G16B—BIOINFORMATICS, i.e. INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR GENETIC OR PROTEIN-RELATED DATA PROCESSING IN COMPUTATIONAL MOLECULAR BIOLOGY
- G16B5/00—ICT specially adapted for modelling or simulations in systems biology, e.g. gene-regulatory networks, protein interaction networks or metabolic networks
-
- G—PHYSICS
- G16—INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS
- G16B—BIOINFORMATICS, i.e. INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR GENETIC OR PROTEIN-RELATED DATA PROCESSING IN COMPUTATIONAL MOLECULAR BIOLOGY
- G16B50/00—ICT programming tools or database systems specially adapted for bioinformatics
Landscapes
- Physics & Mathematics (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Evolutionary Biology (AREA)
- Theoretical Computer Science (AREA)
- Spectroscopy & Molecular Physics (AREA)
- Bioinformatics & Computational Biology (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Biophysics (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Medical Informatics (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Physiology (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Bioethics (AREA)
- Databases & Information Systems (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
- Apparatus Associated With Microorganisms And Enzymes (AREA)
Abstract
Description
도 2는 기존 방법과 본 발명에 따른 방법을 비교하기 일 예시도를 나타낸 것이다.
도 3은 DNA 절편을 연결하는 과정을 설명하기 위한 일 예시도를 나타낸 것이다.
도 4는 허프만 코드를 이용한 디지털 정보를 DNA 분자에 저장하는 일 예시도를 나타낸 것이다.
도 5는 본 발명의 일 실시예에 따른 DNA 분자 기반 정보 저장 장치에 대한 구성을 나타낸 것이다.
Claims (14)
- 디지털 정보를 수신하는 단계; 및
디지털 데이터의 제1 값과 제2 값에 대응하는 미리 합성된 일정 길이의 DNA 절편(fragment)을 이용하여 상기 수신된 디지털 정보를 저장하는 단계
를 포함하는 DNA 분자 기반 정보 저장 방법.
- 제1항에 있어서,
상기 제1 값과 제2 값에 대응하는 DNA 절편을 합성하는 단계
를 더 포함하고,
상기 DNA 절편은
상기 DNA 절편의 전기적 속성이 달라지도록 상기 제1 값과 제2 값 각각에 대응하는 미리 설정된 서열 패턴을 포함하는 것을 특징으로 하는 DNA 분자 기반 정보 저장 방법.
- 제1항에 있어서,
상기 저장하는 단계는
루프 구조를 포함하는 프라이머(primer)를 사용하여 상기 DNA 절편을 연결함으로써, 상기 DNA 절편을 이용하여 상기 디지털 정보를 저장하는 것을 특징으로 하는 DNA 분자 기반 정보 저장 방법.
- 제1항에 있어서,
상기 저장하는 단계는
상기 DNA 절편의 DNA 서열이 가지는 전기적 특성을 이용하여 상기 디지털 정보를 저장하는 것을 특징으로 하는 DNA 분자 기반 정보 저장 방법.
- 제1항에 있어서,
상기 DNA 절편은
상기 DNA 절편의 시작을 나타내는 스타트(start) 서열 패턴, 상기 제1 값과 상기 제2 값 중 어느 하나의 값에 대응하는 값 서열 패턴, 상기 DNA 절편의 끝을 나타내는 엔드(end) 서열 패턴 및 리게이션 어세이(ligation assay)를 위한 링커 서열 패턴을 포함하는 것을 특징으로 하는 DNA 분자 기반 정보 저장 방법.
- 제1항에 있어서,
상기 저장하는 단계는
디코딩을 위한 인코딩 정보를 상기 DNA 절편에 추가적으로 저장하는 것을 특징으로 하는 DNA 분자 기반 정보 저장 방법.
- 제1항에 있어서,
상기 디지털 정보가 저장된 DNA 절편을 증폭 프라이머를 이용하여 증폭하는 단계
를 더 포함하는 것을 특징으로 하는 DNA 분자 기반 정보 저장 방법.
- 디지털 정보를 수신하는 수신부; 및
디지털 데이터의 제1 값과 제2 값에 대응하는 미리 합성된 일정 길이의 DNA 절편(fragment)을 이용하여 상기 수신된 디지털 정보를 저장하는 저장부
를 포함하는 DNA 분자 기반 정보 저장 장치.
- 제8항에 있어서,
상기 제1 값과 제2 값에 대응하는 DNA 절편을 합성하는 합성부
를 더 포함하고,
상기 DNA 절편은
상기 DNA 절편의 전기적 속성이 달라지도록 상기 제1 값과 제2 값 각각에 대응하는 미리 설정된 서열 패턴을 포함하는 것을 특징으로 하는 DNA 분자 기반 정보 저장 장치.
- 제8항에 있어서,
상기 저장부는
루프 구조를 포함하는 프라이머(primer)를 사용하여 상기 DNA 절편을 연결함으로써, 상기 DNA 절편을 이용하여 상기 디지털 정보를 저장하는 것을 특징으로 하는 DNA 분자 기반 정보 저장 장치.
- 제8항에 있어서,
상기 저장부는
상기 DNA 절편의 DNA 서열이 가지는 전기적 특성을 이용하여 상기 디지털 정보를 저장하는 것을 특징으로 하는 DNA 분자 기반 정보 저장 장치.
- 제8항에 있어서,
상기 DNA 절편은
상기 DNA 절편의 시작을 나타내는 스타트(start) 서열 패턴, 상기 제1 값과 상기 제2 값 중 어느 하나의 값에 대응하는 값 서열 패턴, 상기 DNA 절편의 끝을 나타내는 엔드(end) 서열 패턴 및 리게이션 어세이(ligation assay)를 위한 링커 서열 패턴을 포함하는 것을 특징으로 하는 DNA 분자 기반 정보 저장 장치.
- 제8항에 있어서,
상기 저장부는
디코딩을 위한 인코딩 정보를 상기 DNA 절편에 추가적으로 저장하는 것을 특징으로 하는 DNA 분자 기반 정보 저장 장치.
- 제8항에 있어서,
상기 디지털 정보가 저장된 DNA 절편을 증폭 프라이머를 이용하여 증폭하는 증폭부
를 더 포함하는 것을 특징으로 하는 DNA 분자 기반 정보 저장 장치.
Priority Applications (2)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| KR1020180102771A KR102236439B1 (ko) | 2018-08-30 | 2018-08-30 | 디지털 정보를 dna 분자에 저장하는 방법 및 그 장치 |
| PCT/KR2019/011070 WO2020046009A1 (ko) | 2018-08-30 | 2019-08-29 | 디지털 정보를 dna 분자에 저장하는 방법 및 그 장치 |
Applications Claiming Priority (1)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| KR1020180102771A KR102236439B1 (ko) | 2018-08-30 | 2018-08-30 | 디지털 정보를 dna 분자에 저장하는 방법 및 그 장치 |
Publications (2)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| KR20200025430A true KR20200025430A (ko) | 2020-03-10 |
| KR102236439B1 KR102236439B1 (ko) | 2021-04-06 |
Family
ID=69645210
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| KR1020180102771A Active KR102236439B1 (ko) | 2018-08-30 | 2018-08-30 | 디지털 정보를 dna 분자에 저장하는 방법 및 그 장치 |
Country Status (2)
| Country | Link |
|---|---|
| KR (1) | KR102236439B1 (ko) |
| WO (1) | WO2020046009A1 (ko) |
Cited By (3)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| KR20230028016A (ko) * | 2021-08-20 | 2023-02-28 | 광주과학기술원 | Dna 정보저장장치를 이용한 전기차 충방전 데이터 관리 시스템 |
| WO2024076044A1 (ko) * | 2022-10-06 | 2024-04-11 | 이근우 | Dna 인코딩 및 디코딩 방법 및 장치 |
| US12131057B2 (en) | 2022-01-28 | 2024-10-29 | Western Digital Technologies, Inc. | Encoding and integrity markers for molecular storage applications |
Families Citing this family (1)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| US20230161995A1 (en) * | 2021-11-23 | 2023-05-25 | International Business Machines Corporation | Dna data storage using composite fragments |
Citations (3)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| KR20150016572A (ko) * | 2012-06-01 | 2015-02-12 | 유럽피안 몰레큘러 바이올로지 래보러토리 | Dna 디지털 정보의 고-용량 저장 |
| US20160371434A1 (en) * | 2015-06-16 | 2016-12-22 | Microsoft Technology Licensing, Llc | Relational DNA Operations |
| US20170187390A1 (en) * | 2014-03-28 | 2017-06-29 | Thomson Licensing | Methods for storing and reading digital data on a set of dna strands |
-
2018
- 2018-08-30 KR KR1020180102771A patent/KR102236439B1/ko active Active
-
2019
- 2019-08-29 WO PCT/KR2019/011070 patent/WO2020046009A1/ko not_active Ceased
Patent Citations (3)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| KR20150016572A (ko) * | 2012-06-01 | 2015-02-12 | 유럽피안 몰레큘러 바이올로지 래보러토리 | Dna 디지털 정보의 고-용량 저장 |
| US20170187390A1 (en) * | 2014-03-28 | 2017-06-29 | Thomson Licensing | Methods for storing and reading digital data on a set of dna strands |
| US20160371434A1 (en) * | 2015-06-16 | 2016-12-22 | Microsoft Technology Licensing, Llc | Relational DNA Operations |
Non-Patent Citations (8)
| Title |
|---|
| BMC Genomics (2015) 16:327 * |
| BORNHOLT 등, "A DNA-Based Archival Storage System", In: ASPLOS '16, Atlanta, GA, USA (2016.04.02.-06.) * |
| Genomics & Informatics (2018.12.28.) 16(4):e30 * |
| Journal of Applied Physics (2005) 97:104317* * |
| Limbachiya 등, "Natural Data Storage: A Review on sending Information from now to then via Nature", ArXiv abs/1505.04890 (2015) * |
| Nano Letters (2018.05.30.) 18:4040-4045 * |
| Nature (2013) 494:77-80 * |
| Nature Nanotechnology (2016) 11:645-651* * |
Cited By (3)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| KR20230028016A (ko) * | 2021-08-20 | 2023-02-28 | 광주과학기술원 | Dna 정보저장장치를 이용한 전기차 충방전 데이터 관리 시스템 |
| US12131057B2 (en) | 2022-01-28 | 2024-10-29 | Western Digital Technologies, Inc. | Encoding and integrity markers for molecular storage applications |
| WO2024076044A1 (ko) * | 2022-10-06 | 2024-04-11 | 이근우 | Dna 인코딩 및 디코딩 방법 및 장치 |
Also Published As
| Publication number | Publication date |
|---|---|
| WO2020046009A1 (ko) | 2020-03-05 |
| KR102236439B1 (ko) | 2021-04-06 |
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| JP7586880B2 (ja) | 核酸ベースのデータ記憶 | |
| AU2024201484B2 (en) | High- Capacity Storage of Digital Information in DNA | |
| US11227219B2 (en) | Compositions and methods for nucleic acid-based data storage | |
| KR102236439B1 (ko) | 디지털 정보를 dna 분자에 저장하는 방법 및 그 장치 | |
| US20230308275A1 (en) | Nucleic acid storage for blockchain and non-fungible tokens | |
| Milenkovic et al. | DNA-based data storage systems: A review of implementations and code constructions | |
| Wang et al. | Oligo design with single primer binding site for high capacity DNA-based data storage | |
| CN116564424A (zh) | 基于纠删码与组装技术的dna数据存储方法、读取方法及终端 | |
| US20240404593A1 (en) | Fixed point number representation and computation circuits | |
| HK40123768A (en) | High-capacity storage of digital information in dna | |
| 최영재 | High Information Capacity and Low Cost DNA-based Data Storage through Additional Encoding Characters | |
| HK1208937B (en) | High-capacity storage of digital information in dna | |
| HK40015249A (en) | Nucleic acid-based data storage | |
| HK40015249B (en) | Nucleic acid-based data storage |
Legal Events
| Date | Code | Title | Description |
|---|---|---|---|
| A201 | Request for examination | ||
| PA0109 | Patent application |
St.27 status event code: A-0-1-A10-A12-nap-PA0109 |
|
| PA0201 | Request for examination |
St.27 status event code: A-1-2-D10-D11-exm-PA0201 |
|
| P22-X000 | Classification modified |
St.27 status event code: A-2-2-P10-P22-nap-X000 |
|
| P22-X000 | Classification modified |
St.27 status event code: A-2-2-P10-P22-nap-X000 |
|
| P22-X000 | Classification modified |
St.27 status event code: A-2-2-P10-P22-nap-X000 |
|
| PG1501 | Laying open of application |
St.27 status event code: A-1-1-Q10-Q12-nap-PG1501 |
|
| E902 | Notification of reason for refusal | ||
| PE0902 | Notice of grounds for rejection |
St.27 status event code: A-1-2-D10-D21-exm-PE0902 |
|
| T11-X000 | Administrative time limit extension requested |
St.27 status event code: U-3-3-T10-T11-oth-X000 |
|
| T11-X000 | Administrative time limit extension requested |
St.27 status event code: U-3-3-T10-T11-oth-X000 |
|
| T11-X000 | Administrative time limit extension requested |
St.27 status event code: U-3-3-T10-T11-oth-X000 |
|
| T11-X000 | Administrative time limit extension requested |
St.27 status event code: U-3-3-T10-T11-oth-X000 |
|
| E13-X000 | Pre-grant limitation requested |
St.27 status event code: A-2-3-E10-E13-lim-X000 |
|
| P11-X000 | Amendment of application requested |
St.27 status event code: A-2-2-P10-P11-nap-X000 |
|
| P13-X000 | Application amended |
St.27 status event code: A-2-2-P10-P13-nap-X000 |
|
| N231 | Notification of change of applicant | ||
| PN2301 | Change of applicant |
St.27 status event code: A-3-3-R10-R13-asn-PN2301 St.27 status event code: A-3-3-R10-R11-asn-PN2301 |
|
| E701 | Decision to grant or registration of patent right | ||
| PE0701 | Decision of registration |
St.27 status event code: A-1-2-D10-D22-exm-PE0701 |
|
| GRNT | Written decision to grant | ||
| PR0701 | Registration of establishment |
St.27 status event code: A-2-4-F10-F11-exm-PR0701 |
|
| PR1002 | Payment of registration fee |
St.27 status event code: A-2-2-U10-U11-oth-PR1002 Fee payment year number: 1 |
|
| PG1601 | Publication of registration |
St.27 status event code: A-4-4-Q10-Q13-nap-PG1601 |
|
| PN2301 | Change of applicant |
St.27 status event code: A-5-5-R10-R11-asn-PN2301 |
|
| PN2301 | Change of applicant |
St.27 status event code: A-5-5-R10-R14-asn-PN2301 |
|
| PN2301 | Change of applicant |
St.27 status event code: A-5-5-R10-R11-asn-PN2301 |
|
| PN2301 | Change of applicant |
St.27 status event code: A-5-5-R10-R14-asn-PN2301 |
|
| PN2301 | Change of applicant |
St.27 status event code: A-5-5-R10-R11-asn-PN2301 |
|
| PN2301 | Change of applicant |
St.27 status event code: A-5-5-R10-R14-asn-PN2301 |
|
| PR1001 | Payment of annual fee |
St.27 status event code: A-4-4-U10-U11-oth-PR1001 Fee payment year number: 4 |
|
| PR1001 | Payment of annual fee |
St.27 status event code: A-4-4-U10-U11-oth-PR1001 Fee payment year number: 5 |
|
| PN2301 | Change of applicant |
St.27 status event code: A-5-5-R10-R11-asn-PN2301 |
|
| R11 | Change to the name of applicant or owner or transfer of ownership requested |
Free format text: ST27 STATUS EVENT CODE: A-5-5-R10-R11-ASN-PN2301 (AS PROVIDED BY THE NATIONAL OFFICE) |
|
| PN2301 | Change of applicant |
St.27 status event code: A-5-5-R10-R14-asn-PN2301 |
|
| R14 | Transfer of ownership recorded |
Free format text: ST27 STATUS EVENT CODE: A-5-5-R10-R14-ASN-PN2301 (AS PROVIDED BY THE NATIONAL OFFICE) |
|
| PR1001 | Payment of annual fee |
St.27 status event code: A-4-4-U10-U11-oth-PR1001 Fee payment year number: 6 |
|
| U11 | Full renewal or maintenance fee paid |
Free format text: ST27 STATUS EVENT CODE: A-4-4-U10-U11-OTH-PR1001 (AS PROVIDED BY THE NATIONAL OFFICE) Year of fee payment: 6 |
|
| R18 | Changes to party contact information recorded |
Free format text: ST27 STATUS EVENT CODE: A-5-5-R10-R18-OTH-X000 (AS PROVIDED BY THE NATIONAL OFFICE) |
|
| R18-X000 | Changes to party contact information recorded |
St.27 status event code: A-5-5-R10-R18-oth-X000 |