KR20200078200A - 크리스퍼 연관 단백질 및 엑소뉴클레아제를 포함하는 변형된 크리스퍼 연관 단백질 - Google Patents
크리스퍼 연관 단백질 및 엑소뉴클레아제를 포함하는 변형된 크리스퍼 연관 단백질 Download PDFInfo
- Publication number
- KR20200078200A KR20200078200A KR1020180167870A KR20180167870A KR20200078200A KR 20200078200 A KR20200078200 A KR 20200078200A KR 1020180167870 A KR1020180167870 A KR 1020180167870A KR 20180167870 A KR20180167870 A KR 20180167870A KR 20200078200 A KR20200078200 A KR 20200078200A
- Authority
- KR
- South Korea
- Prior art keywords
- leu
- lys
- glu
- ala
- ile
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Ceased
Links
Images
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
- C12N9/14—Hydrolases (3)
- C12N9/16—Hydrolases (3) acting on ester bonds (3.1)
- C12N9/22—Ribonucleases [RNase]; Deoxyribonucleases [DNase]
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/10—Processes for the isolation, preparation or purification of DNA or RNA
- C12N15/102—Mutagenizing nucleic acids
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/11—DNA or RNA fragments; Modified forms thereof; Non-coding nucleic acids having a biological activity
- C12N15/113—Non-coding nucleic acids modulating the expression of genes, e.g. antisense oligonucleotides; Antisense DNA or RNA; Triplex- forming oligonucleotides; Catalytic nucleic acids, e.g. ribozymes; Nucleic acids used in co-suppression or gene silencing
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/87—Introduction of foreign genetic material using processes not otherwise provided for, e.g. co-transformation
- C12N15/90—Stable introduction of foreign DNA into chromosome
- C12N15/902—Stable introduction of foreign DNA into chromosome using homologous recombination
- C12N15/907—Stable introduction of foreign DNA into chromosome using homologous recombination in mammalian cells
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K2319/00—Fusion polypeptide
- C07K2319/01—Fusion polypeptide containing a localisation/targetting motif
- C07K2319/09—Fusion polypeptide containing a localisation/targetting motif containing a nuclear localisation signal
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K2319/00—Fusion polypeptide
- C07K2319/20—Fusion polypeptide containing a tag with affinity for a non-protein ligand
- C07K2319/21—Fusion polypeptide containing a tag with affinity for a non-protein ligand containing a His-tag
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N2310/00—Structure or type of the nucleic acid
- C12N2310/10—Type of nucleic acid
- C12N2310/20—Type of nucleic acid involving clustered regularly interspaced short palindromic repeats [CRISPR]
Landscapes
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Zoology (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Plant Pathology (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Cell Biology (AREA)
- Mycology (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Crystallography & Structural Chemistry (AREA)
- Peptides Or Proteins (AREA)
Abstract
Description
도 2는 SpCas9 및 SpCas9-RecJ에 의한 원형 dsDNA 분해를 확인한 것이다. 선형 dsDNA는 DNA 전기 영동에서 뚜렷하고 두꺼운 dsDNA 크기를 보였다. SpCas9/gRNA C apoproteins를 배양한 후, SpCas9은 시간에 상관없이 단일의 선명하고 두꺼운 dsDNA를 나타내었다. 그러나, SpCas9-RecJ/gRNA C는 60-180분 배양 후에 흐릿하며, 약하고, 얇은, 꼬리가 끌리는 dsDNA형태를 나타내었는데, 이는 DNA 분해를 의미한다.
도 3은 반응 시간에 따른 유전자 편집 효율을 나타낸 것이다. 이는 T7E1 엔도뉴클레아제 활성의 산물이며, 삽입(insertion)-결실률(deletion)(% indel)과 비교하여 측정하였다.
도 4는 CCR5 및 DHCR7에 대한 SpyCas9, SpyCas9-RecJ 및 SpyCas9-T5 간의 HDR 효율을 비교하여 나타낸 것이다. CCR5 및 DHCR7 유전자자리(locus)에서 SpyCas9, SpyCas9-RecJ 및 SpyCas9-T5의 HDR 효율을 나타낸 것이다.
도 5 및 도 6은 유전자 편집 효율을 확인하기 위하여, HEK293 세포에서 SpCas9 및 SpCas9-RecJ의 In vitro 절단 에세이를 수행한 결과를 나타낸다.
도 7은 Cas9 및 Cas9-RecJ이 인간 PD-1 및 CCR5의 유전자에 미치는 온-타겟 효과를 나타낸 것이다.
도 8은 인간 CCR5에 대한 Cas9 및 Cas9-RecJ의 오프 타겟 효과를 확인한 것이다.
도 9는 5개의 오프 타겟팅된 유전자의 In vitro 절단 에세이를 나타낸 것이다.
도 10은 선형 dsDNA를 이용한 In vitro 절단 에세이를 통하여, FnCpf1, FnCpf1-RecJ 및 SpCas9이 가지고 있는 엑소뉴클레아제 기능을 확인한 것이다.
도 11은 선형 dsDNA를 이용하여 FnCpf1 또는 FnCpf1-RecJ 엑소뉴클레아제에 의한 In vitro 절단 에세이 결과를 나타낸 것이다.
도 12는 RecJ를 포함하는 변형된 크리스퍼 연관 단백질의 구조를 나타낸 것이다. A는 SpyCas9 또는 FnCpf1의 C 말단에 RecJ가 융합된 형태이다. B는 SpyCas9 또는 FnCpf1의 N 말단에 RecJ가 결합된 형태이다. C는 SpyCas9 또는 FnCpf1의 C 말단에는 RecJ가 N 말단에는 DBP(DNA Binding Protein)이 결합된 형태이다. 이때, His tag은 6개의 His로 구성되며, BPNLS는 핵 위치화 시그널(nuclear localization signal)을 의미한다.
도 13은 CCR5 및 DHCR7에 대한 SpyCas9의 sgRNA 결합 사이트를 나타낸 것이다. 인간 CCR5(A) 및 인간 DHCR7(B)에 대한 SpyCas9의 sgRNA 결합 영역을 각각 노란색과 핑크색으로 나타낸 것이다. PAM 서열은 녹색으로 표시하였다. 화살표는 뉴클레아제 절단 위치를 나타낸다.
도 14는 CCR5 및 DHCR7에 대한 FnCpf1의 crRNA 결합 사이트를 나타낸 것이다. 인간 CCR5(A) 및 인간 DMNT1(B)에 대한 FnCpf1의 crRNA 결합 영역을 각각 붉은색과 오렌지색으로 나타낸 것이다. PAM 서열은 파란색으로 표시하였다. 화살표는 뉴클레아제 절단 위치를 나타낸다.
도 15 및 도 16은 SpyCas9과 SpyCas9의 C 말단에 다양한 단백질이 결합된 변형된 SpyCas9 사이의 편집 효율을 비교한 것이다. SpyCas9의 C 말단에 GFP, hTdT, 및 엑소뉴클레아제로 알려진 RecJ, RecE, lambda, mungbean, and T5가 결합된 형태이다. 도면에서 나타낸 바와 같이 Knock-out 및 Knock-in 효율이 서로 상이하다.
도 17은 SpyCas9과 SpyCas9-RecJ의 Knock-out 편집 효율을 비교한 것이다. A는 SpyCas9-RecJ의 구조를 나타낸 것이다. B는 대조군, SpyCas9 및 SpyCas9-RecJ 간의 유전자 편집 효율을 나타낸 것이다. C는 CCR5 및 DHCR7 유전자의 편집 정도를 확인하여, SpyCas9 대비 SpyCas9-RecJ의 편집 효율 변화를 백분율로 나타낸 것이다.
도 18은 SpyCas9과 SpyCas9-RecJ의 Knock-in 편집 효율을 비교한 것이다. A는 SpyCas9-RecJ의 구조를 나타낸 것이다. B는 대조군, SpyCas9 및 SpyCas9-RecJ 간의 유전자 편집 효율을 나타낸 것이다. C는 CCR5 및 DHCR7 유전자의 편집 정도를 확인하여, SpyCas9 대비 SpyCas9-RecJ의 편집 효율 변화를 백분율로 나타낸 것이다.
도 19는 및 20은 SpyCas9과 SpyCas9의 N 말단 또는 N/C 양말단에 다양한 단백질이 결합된 변형된 SpyCas9 사이의 편집 효율을 비교한 것이다. 변형된 SpyCas9은 SpyCas9의 N 말단에 RecJ, RecE, GFP, 단일 가닥 DNA 결합 단백질(single stranded DNA binding protein, SSB) 및 이중 가닥 DNA 결합 단백질(double stranded DNA binding protein, DSB)이 결합되어 있다. 또한, 변형된 SpyCas9은 SpyCas9의 C 말단에 RecJ가 결합되어 있고, N 말단에 SSB 또는 DSB이 결합되어 있다. 도면에서 나타낸 바와 같이 Knock-out 및 Knock-in 효율은 서로 상이하다.
도 21은 SpyCas9과 RecJ-SpyCas9 간의 Knock-out 편집 효율을 비교한 것이다. A는 RecJ-SpyCas9의 구조를 나타낸 것이다. B는 대조군, SpyCas9 및 RecJ-SpyCas9의 유전자 편집 효율을 나타낸 것이다. C는 DHCR7 유전자의 편집 정도를 확인하여, SpyCas9 대비 RecJ-SpyCas9의 편집 효율 변화를 백분율로 나타낸 것이다.
도 22는 SpyCas9과 RecJ-SpyCas9의 Knock-in 편집 효율을 비교한 것이다. A는 RecJ-SpyCas9의 구조를 나타낸 것이다. B는 대조군, SpyCas9 및 RecJ-SpyCas9 간의 유전자 편집 효율을 나타낸 것이다. C는 DHCR7 유전자의 편집 정도를 확인하여, SpyCas9 대비 RecJ-SpyCas9의 편집 효율 변화를 백분율로 나타낸 것이다.
도 23은 SpyCas9과 SSB-SpyCas9-RecJ의 Knock-out 편집 효율을 비교한 것이다. A는 SSB-SpyCas9-RecJ의 구조를 나타낸 것이다. B는 대조군, SpyCas9 및 SSB-SpyCas9-RecJ의 유전자 편집 효율을 나타낸 것이다. C는 DHCR7 유전자의 편집 정도를 확인하여, SpyCas9 대비 SSB-SpyCas9-RecJ의 편집 효율 변화를 백분율로 나타낸 것이다.
도 24는 SpyCas9과 DSB-SpyCas9-RecJ 간의 Knock-out 편집 효율을 비교한 것이다. A는 DSB-SpyCas9-RecJ의 구조를 나타낸 것이다. B는 대조군, SpyCas9 및 DSB-SpyCas9-RecJ 간의 유전자 편집 효율을 나타낸 것이다. C는 DHCR7 유전자의 편집 정도를 확인하여, SpyCas9 대비 DSB-SpyCas9-RecJ의 편집 효율 변화를 백분율로 나타낸 것이다.
도 25 및 도 26은 FnCpf1과 FnCpf1의 C 말단에 다양한 단백질이 결합된 변형된 FnCpf1 사이의 편집 효율을 비교한 것이다. FnCpf1의 C 말단에 GFP, hTdT, 및 엑소뉴클레아제로 알려진 RecJ, RecE, lambda, mungbean, 및 T5가 결합된 형태이다. 도면에서 나타낸 바와 같이 Knock-out 및 Knock-in 효율은 서로 상이하다.
도 27은 FnCpf1 및 FnCpf1-RecJ의 Knock-out 편집 효율을 비교한 것이다. A는 FnCpf1-RecJ의 구조를 나타낸 것이다. B는 대조군, FnCpf1 및 FnCpf1-RecJ의 유전자 편집 효율을 나타낸 것이다. C는 CCR5 및 DNMT1 유전자의 편집 정도를 확인하여, FnCpf1 대비 FnCpf1-RecJ의 편집 효율 변화를 백분율로 나타낸 것이다.
도 28은 FnCpf1 및 FnCpf1-RecJ의 Knock-in 편집 효율을 비교한 것이다. A는 FnCpf1-RecJ의 구조를 나타낸 것이다. B는 대조군, FnCpf1 및 FnCpf1-RecJ 간의 유전자 편집 효율을 나타낸 것이다. C는 CCR5 및 DNMT1 유전자의 편집 정도를 확인하여, FnCpf1 대비 FnCpf1-RecJ의 편집 효율 변화를 백분율로 나타낸 것이다.
도 29 및 30은 FnCpf1과 FnCpf1의 N 말단 또는 N/C 양말단에 다양한 단백질이 결합된 변형된 FnCpf1 사이의 편집 효율을 비교한 것이다. 변형된 FnCpf1은 FnCpf1의 N 말단에 RecJ, RecE, GFP, 단일 가닥 DNA 결합 단백질(single stranded DNA binding protein, SSB) 및 이중 가락 DNA 결합 단백질(double stranded DNA binding protein, DSB)이 결합되어 있다. 또한, 변형된 FnCpf1은 FnCpf1의 C 말단에 RecJ가 결합되어 있고, N 말단에 SSB가 결합되어 있다. 도면에서 나타낸 바와 같이 Knock-out 및 Knock-in 효율은 서로 상이하다.
도 31은 FnCpf1 및 RecJ-FnCpf1의 Knock-out 편집 효율을 비교한 것이다. A는 RecJ-FnCpf1의 구조를 나타낸 것이다. B는 대조군, RecJ-FnCpf1 간의 유전자 편집 효율을 나타낸 것이다. C는 CCR5 및 DNMT1 유전자의 편집 정도를 확인하여, FnCpf1 대비 RecJ-FnCpf1의 편집 효율 변화를 백분율로 나타낸 것이다.
도 32는 FnCpf1 및 RecJ-FnCpf1 간의 Knock-in 편집 효율을 비교한 것이다. A는 RecJ-FnCpf1의 구조를 나타낸 것이다. B는 대조군, RecJ-FnCpf1의 유전자 편집 효율을 나타낸 것이다. C는 CCR5 및 DNMT1 유전자의 편집 정도를 확인하여, FnCpf1 대비 RecJ-FnCpf1의 편집 효율 변화를 백분율로 나타낸 것이다.
도 33은 FnCpf1과 SSB-FnCpf1-RecJ의 Knock-out 편집 효율을 비교한 것이다. A는 SSB-FnCpf1-RecJ의 구조를 나타낸 것이다. B는 대조군, FnCpf1 및 SSB-FnCpf1-RecJ의 유전자 편집 효율을 나타낸 것이다. C는 CCR5 및 DNMT1 유전자의 편집 정도를 확인하여, FnCpf1 대비 SSB-FnCpf1-RecJ의 편집 효율 변화를 백분율로 나타낸 것이다.
도 34는 FnCpf1과 SSB-FnCpf1-RecJ의 Knock-in 편집 효율을 비교한 것이다. A는 SSB-FnCpf1-RecJ의 구조를 나타낸 것이다. B는 대조군, FnCpf1 및 SSB-FnCpf1-RecJ의 유전자 편집 효율을 나타낸 것이다. C는 CCR5 및 DNMT1 유전자의 편집 정도를 확인하여, FnCpf1 대비 SSB-FnCpf1-RecJ의 편집 효율 변화를 백분율로 나타낸 것이다.
도 35a, 도 35b 및 도 35c는 SpyCas9 및 SpyCas9의 C 말단에 단백질이 결합된 변형된 SpyCas9에 유도되는 비상동적인 말단 연결에 있어서, ssODN 및 노코다졸(nocodazole)이 미치는 영향을 확인한 것이다. 도 35a는 ssODN 및 노코다졸이 처리되지 않았을 때의 비상동적인 말단 연결 효율을 나타낸다. 도 35b는 ssODN 및 노코다졸이 처리되었을 때의 비상동적인 말단 연결 효율을 나타낸다. 도 35c는 ssODN 및 노코다졸의 존재 유무에 따른 효율을 비교한 것이다. ssODN 및 노코다졸은 Knock-out의 경우, SpyCas9 및 변형된 SpyCas9의 효율에는 큰 영향이 없음을 확인하였다.
도 36a, 도 36b 및 도 36c는 SpyCas9 및 SpyCas9의 N 말단 또는 N/C 양말단에 단백질이 결합된 변형된 SpyCas9에 유도되는 비상동적인 말단 연결에 있어서, ssODN 및 노코다졸이 미치는 영향을 확인한 것이다. 도 36a는 ssODN 및 노코다졸이 처리되지 않았을 때의 비상동적인 말단 연결 효율을 나타낸다. 도 36b는 ssODN 및 노코다졸이 처리되었을 때의 비상동적인 말단 연결 효율을 나타낸다. 도 36c는 ssODN 및 노코다졸의 존재 유무에 따른 효율을 비교한 것이다. ssODN 및 노코다졸은 Knock-out의 경우, SpyCas9 및 변형된 SpyCas9의 효율에는 큰 영향이 없음을 확인하였다.
도 37a, 도 37b 및 도 37c는 FnCpf1 및 FnCpf1의 C 말단에 단백질이 결합된 변형된 FnCpf1에 유도되는 비상동적인 말단 연결에 있어서, ssODN 및 노코다졸(nocodazole)이 미치는 영향을 확인한 것이다. 도 37a는 ssODN 및 노코다졸이 처리되지 않았을 때의 비상동적인 말단 연결 효율을 나타낸다. 도 37b는 ssODN 및 노코다졸이 처리되었을 때의 비상동적인 말단 연결 효율을 나타낸다. 도 37c는 ssODN 및 노코다졸의 존재 유무에 따른 효율을 비교한 것이다. ssODN 및 노코다졸은 Knock-out의 경우, FnCpf1 및 변형된 FnCpf1의 효율을 향상 시킨다는 점을 확인하였다.
도 38a, 도 38b 및 도 38c는 FnCpf1 및 FnCpf1의 N 말단 또는 N/C 양말단에 단백질이 결합된 변형된 FnCpf1에 유도되는 비상동적인 말단 연결에 있어서, ssODN 및 노코다졸이 미치는 영향을 확인한 것이다. 도 38a는 ssODN 및 노코다졸이 처리되지 않았을 때의 비상동적인 말단 연결 효율을 나타낸다. 도 38b는 ssODN 및 노코다졸이 처리되었을 때의 비상동적인 말단 연결 효율을 나타낸다. 도 38c는 ssODN 및 노코다졸의 존재 유무에 따른 효율을 비교한 것이다. ssODN 및 노코다졸은 Knock-out의 경우, FnCpf1 및 변형된 FnCpf1의 효율에는 큰 영향이 없음을 확인하였다.
도 39a 및 도 39b는 각각의 실험에 대한 타당성을 나타낸 것이다. 최상단에는 on-target 서열을 나타낸 것이며, 미스매치된 핵산은 다른 색으로 표시하였다. GFLAS01은 음성대조군이며; GFLAS02 및 GFLAS05는 SpyCas9이며; GFLAS03, GFLAS04, GFLAS06 및 GFLAS07은 Cas9-RecJ를 이용하여 실험한 결과를 나타낸다.
도 40은 Cas9 및 Cas9-RecJ간의 오프-타겟팅 효율을 비교한 것이다. 5개의 인간 CCR5로 오프-타겟을 테스트하였다. A는 CCR5에 대한 오프-타겟 후보 서열을 나타낸 것이다. B는 딥 시퀀싱(deep sequencing)을 하기 위한 증폭물을 나타낸 것이다.
도 41은 Cas9 및 Cas9-RecJ의 증폭물의 딥 시퀀싱 결과를 나타낸 것이다. Cas9-RecJ은 KCNJ6, CNTPNA2, 및 Ch.5에서는 Cas9에 비해 오프-타겟이 나타나는 비율이 낮다는 것을 확인하였다.
도 42는 SpyCas9의 단백질 서열 및 핵산 서열을 도식화한 것이다.
도 43은 SpyCas9-RecJ의 단백질 서열 및 핵산 서열을 도식화한 것이다.
도 44는 RecJ-SpyCas9의 단백질 서열 및 핵산 서열을 도식화한 것이다.
도 45는 SSB-SpyCas9-RecJ의 단백질 서열 및 핵산 서열을 도식화한 것이다.
도 46은 DSB-SpyCas9-RecJ의 단백질 서열 및 핵산 서열을 도식화한 것이다.
도 47은 FnCpf1의 단백질 서열 및 핵산 서열을 도식화한 것이다.
도 48은 FnCpf1-RecJ의 단백질 서열 및 핵산 서열을 도식화한 것이다.
도 49는 RecJ-FnCpf1의 단백질 서열 및 핵산 서열을 도식화한 것이다.
도 50은 SSB-FnCpf1-RecJ의 단백질 서열 및 핵산 서열을 도식화한 것이다.
도 51은 변형된 크리스퍼 연관 단백질 및 sgRNA를 이용하여 식물체의 유전자를 편집하는 실험 방법의 개요를 나타낸 것이다.
도 52는 유전자 편집을 하기 위해 준비된 식물체를 나타낸 것이다.
도 53은 식물체의 타겟 위치를 도식화한 것이다.
도 54는 차세대 염기서열 분석법(Next-Generation Sequencing, NGS)을 통해 유전자 편집 후의 식물체의 핵산 서열을 분석한 것이다.
도 55는 변형된 크리스퍼 연관 단백질의 삽입-결실 효율을 나타낸 것이다.
도 56은 변형된 크리스퍼 연관 단백질의 삽입-결실 효율을 나타낸 것이다.
| name | sequence | size | function |
| RecJF1 | GCGGCCGCACTCGACctgcagGTGAAACAACAGATACAACTTCGT | 45 | RecJ full-length in back |
| RecJR1 | ccggcctttttcgtggccgccggccttttctgcagAATTGGCCAGATATTGTCGATGATA | 60 | RecJ full-length in back |
| RecJR2 | TCAGTGGTGGTGGTGGTGGTGctttttcttttttgcctggccggcctttttcgtggccgc | 60 | RecJ full-length in back |
| MungbeanF1 | CGGCCGCACTCGACctgcagATGCAAACGTTACAGATGAGT | 41 | Mungbean Nuclease in back |
| MungbeanR1 | cgtggccgccggccttttctgcagACCATTGTAAGAGATAGGTC | 44 | Mungbean Nuclease in back |
| T5exonuF1 | CGGCCGCACTCGACctgcagATGGCTTCCCGTCGTAATCTAATG | 44 | T5 exonuclease in back |
| T5exonuR5 | gtggccgccggccttttctgcagTTGTTCTGCAATCTCCAAAATA | 45 | T5 exonuclease in back |
| SSBF1 | GCGGCaGCACTCGACctgcagATGGCCAGCAGAGGCGTAAACAAGG | 46 | SSB isolation in back |
| SSBR1 | tcgtggccgccggccttttctgcagACGACCACCCAGCATCTGCATGGT | 49 | SSB isolation in back |
| RecEF1 | GCGGGCGCACTCGACctgcagATGAGCACAAAACCACTCTTCC | 43 | RecE in back |
| RecER1 | ttcgtggccgccggccttttctgcagGTCATTTGCATATTCCTTAGCCCA | 50 | RecE in back |
| DSBF1 | AGCGGCCGCACTCGACctcgagATGGCTAAAAAAGAAATGGTTGAATT | 21 | with DSBR1 in back |
| DSBR1 | ctttttcgtggccgccggccttttctcgagTTTAGAGAAAACTGTGTCA | 37 | with DSBF1 in back |
| T5exoF5 | GGTGGACAGCAAATGGGTCGCGGATCCATGGCTTCCCGTCGTAATCTAA | 49 | T5 full-length in back |
| T5exoR5 | GCTTGTCGACGGAGCTCGAATTCGGATCCTTGTTCTGCAATCTCCAAA | 48 | T5 full-length in back |
| pAGROF2 | gtctcagctgggaggcgacgaaATGAGTAAAGGAGAAGAACTTTT | 45 | GFP in back |
| pAGROR2 | gcggaggggttggatcaaagtgaaAATAACCTCTCCTTCTTTTTC | 45 | GFP in back |
| HsTdTF2 | GCGGCCGCACTCGACctcgagATGGATCCACCACGAGCGTCCCAC | 45 | HsTdT full length in back |
| HsTdTR2 | ttcgtggccgccggccttttctcgagGGCATTTCTTTCCCACGGTTCAATAT | 52 | HsTdT full length in back |
| name | sequence | size | function |
| RecJF2 | GGACAGCAAATGGGTCGCGGATCCGTGAAACAACAGATACAACTTCGT | 45 | RecJ full-length in front |
| RecJR2 | TTGTCGACGGAGCTCGAATTCGGATCCAATTGGCCAGATATTGTCGATGATA | 60 | RecJ full-length in front |
| MungbeanF2 | GGACAGCAAATGGGTCGCGGATCCATGCAAACGTTACAGATGAGT | 41 | Mungbean Nuclease in front |
| MungbeanR2 | TTGTCGACGGAGCTCGAATTCGGATCCACCATTGTAAGAGATAGGTC | 44 | Mungbean Nuclease in front |
| T5exonuF2 | GGACAGCAAATGGGTCGCGGATCCATGGCTTCCCGTCGTAATCTAATG | 44 | T5 exonuclease in front |
| T5exonuR6 | TTGTCGACGGAGCTCGAATTCGGATCCTTGTTCTGCAATCTCCAAAATA | 45 | T5 exonuclease in front |
| SSBF2 | GGACAGCAAATGGGTCGCGGATCCATGGCCAGCAGAGGCGTAAACAAGG | 46 | SSB isolation in front |
| SSBR2 | TTGTCGACGGAGCTCGAATTCGGATCCACGACCACCCAGCATCTGCATGGT | 49 | SSB isolation in front |
| RecEF2 | GGACAGCAAATGGGTCGCGGATCCATGAGCACAAAACCACTCTTCC | 43 | RecE in front |
| RecER2 | TTGTCGACGGAGCTCGAATTCGGATCCGTCATTTGCATATTCCTTAGCCCA | 50 | RecE in front |
| DSBF2 | GGACAGCAAATGGGTCGCGGATCCATGGCTAAAAAAGAAATGGTT | 21 | with DSBR1 in front |
| DSBR2 | TTGTCGACGGAGCTCGAATTCGGATCCTTTAGAGAAAACTGTGT | 37 | with DSBF1 in front |
| pAGROF3 | gtctcagctgggaggcgacgaaATGAGTAAAGGAGAAGAACTTTT | 45 | GFP in front |
| pAGROR3 | TTGTCGACGGAGCTCGAATTCGGATCCAATAACCTCTCCTTCTTTTTC | 45 | GFP in front |
| HsTdTF3 | GCGGCCGCACTCGACctcgagATGGATCCACCACGAGCGTCCCAC | 45 | HsTdT full length in front |
| HsTdTR3 | TTGTCGACGGAGCTCGAATTCGGATCCGGCATTTCTTTCCCACGGTTCAATAT | 52 | HsTdT full length in front |
| RecJF1 | GCGGCCGCACTCGACctgcagGTGAAACAACAGATACAACTTCGT | 45 | RecJ full-length in back |
| RecJR1 | ccggcctttttcgtggccgccggccttttctgcagAATTGGCCAGATATTGTCGATGATA | 60 | RecJ full-length in back |
| RecJR2 | TCAGTGGTGGTGGTGGTGGTGctttttcttttttgcctggccggcctttttcgtggccgc | 60 | RecJ full-length in back |
| MungbeanF1 | CGGCCGCACTCGACctgcagATGCAAACGTTACAGATGAGT | 41 | Mungbean Nuclease in back |
| MungbeanR1 | cgtggccgccggccttttctgcagACCATTGTAAGAGATAGGTC | 44 | Mungbean Nuclease in back |
| T5exonuF1 | CGGCCGCACTCGACctgcagATGGCTTCCCGTCGTAATCTAATG | 44 | T5 exonuclease in back |
| T5exonuR5 | gtggccgccggccttttctgcagTTGTTCTGCAATCTCCAAAATA | 45 | T5 exonuclease in back |
| SSBF1 | GCGGCaGCACTCGACctgcagATGGCCAGCAGAGGCGTAAACAAGG | 46 | SSB isolation in back |
| SSBR1 | tcgtggccgccggccttttctgcagACGACCACCCAGCATCTGCATGGT | 49 | SSB isolation in back |
| RecEF1 | GCGGGCGCACTCGACctgcagATGAGCACAAAACCACTCTTCC | 43 | RecE in back |
| RecER1 | ttcgtggccgccggccttttctgcagGTCATTTGCATATTCCTTAGCCCA | 50 | RecE in back |
| DSBF1 | AGCGGCCGCACTCGACctcgagATGGCTAAAAAAGAAATGGTTGAATT | 21 | with DSBR1 in back |
| DSBR1 | ctttttcgtggccgccggccttttctcgagTTTAGAGAAAACTGTGTCA | 37 | with DSBF1 in back |
| T5exoF5 | GGTGGACAGCAAATGGGTCGCGGATCCATGGCTTCCCGTCGTAATCTAA | 49 | T5 full-length in back |
| T5exoR5 | GCTTGTCGACGGAGCTCGAATTCGGATCCTTGTTCTGCAATCTCCAAA | 48 | T5 full-length in back |
| pAGROF2 | gtctcagctgggaggcgacgaaATGAGTAAAGGAGAAGAACTTTT | 45 | GFP in back |
| pAGROR2 | gcggaggggttggatcaaagtgaaAATAACCTCTCCTTCTTTTTC | 45 | GFP in back |
| HsTdTF2 | GCGGCCGCACTCGACctcgagATGGATCCACCACGAGCGTCCCAC | 45 | HsTdT full length in back |
| HsTdTR2 | ttcgtggccgccggccttttctcgagGGCATTTCTTTCCCACGGTTCAATAT | 52 | HsTdT full length in back |
| Proteins | Genes | Adapter primer sequences (5’-3’) |
| SpyCas9 | CCR5 | TCGTCGGCAGCGTCAGATGTGTATAAGAGACAGGGAGGGCAACTAAATACATTCT (서열번호 81) |
| GTCTCGTGGGCTCGGAGATGTGTATAAGAGACAGGAACACCAGTGAGTAGAGCGG (서열번호 82) | ||
| DHCR7 | TCGTCGGCAGCGTCAGATGTGTATAAGAGACAGGGTTTGAGCAACAGTTCTCC (서열번호 83) | |
| GTCTCGTGGGCTCGGAGATGTGTATAAGAGACAGTGACGATGTCCACCACAG (서열번호 84) | ||
| FnCpf1 | CCR5 | TCGTCGGCAGCGTCAGATGTGTATAAGAGACAGGGTATTTCTGTTCAGATCAC (서열번호 85) |
| GTCTCGTGGGCTCGGAGATGTGTATAAGAGACAGGCCCATCAATTATAGAAAGCC (서열번호 86) | ||
| DNMT1 | TCGTCGGCAGCGTCAGATGTGTATAAGAGACAGCTGCACACAGCAGGCCTTTG (서열번호 87) | |
| GTCTCGTGGGCTCGGAGATGTGTATAAGAGACAGCCCAATAAGTGGCAGAGTGC (서열번호 88) |
| Target | Gene | Spacer sequence |
| On | CCR5 | TGACATCAATTATTATACAT (서열번호 89) |
| off#1 | ADCY5 | TGACATCAATTATTATAgAT (서열번호 90) |
| off#2 | KCNJ6 | TGACATCAcTTATTATgCAT (서열번호 91) |
| off#3 | CNTNAP2 | TGACATaAATTATTcTACAT (서열번호 92) |
| off#4 | Chr. 5 N/A | TGAaATCAATTATcATAgAT (서열번호 93) |
| Gene | Target specific primer sequences | Adapter primer sequences |
| ADCY5 | GTCCCATGACAGGCGTGTAT | TCGTCGGCAGCGTCAGATGTGTATAAGAGACAGCAAGAGTGTAGAGGAGGACAG |
| GCTCCCACCTTAGTGCTCTG | GTCTCGTGGGCTCGGAGATGTGTATAAGAGACAGGAAAAGGAGATGCTTGGCAC | |
| KCNJ6 | TGGAGCCATTGGTTTGCATC | TCGTCGGCAGCGTCAGATGTGTATAAGAGACAGAAGACCAAAAAACCTCATGGAT |
| GCCTGGCCAAGTTTCAGTTA | GTCTCGTGGGCTCGGAGATGTGTATAAGAGACAGTTTTGAGGAAGACAAGTCATGT | |
| CNTNAP2 | TGCAGTGCAGACTCTTTCCA | TCGTCGGCAGCGTCAGATGTGTATAAGAGACAGTGCAGACTCTTTCCATACTGT |
| AAGGACACAGGGCAACTGAA | GTCTCGTGGGCTCGGAGATGTGTATAAGAGACAGAAAATCAAATTTCATGTGTCCA | |
| Chr. 5 N/A | TGTGGAACGAGTGGTGACAG | TCGTCGGCAGCGTCAGATGTGTATAAGAGACAGGCAGAAGTTCCTGAAATTATCC |
| GACCAAACCACATTCTTCTCAC | GTCTCGTGGGCTCGGAGATGTGTATAAGAGACAGACATGAGAGATAGTGATATGT |
| Proteins | Genes | ssODN donor sequences (5’-3’) |
| SpyCas9 | CCR5 | TGGAACAAGATGGATTATCAAGTGTCAAGTCCAATCTATGACATCAATTATTAT (서열번호 94) ACATATGCATCGGAGCCCTGCCAAAAAATCAATGTGAAGCAAATCGCAGCCC (서열번호 95) |
| DHCR7 | ATGGGCCCCAGTGTGACTGCCTGCATCCGTCCTCGCAGGGAGGTGGACTGGT (서열번호 96) TTTGAATTCCACTGGCGAGCGTCATCTTCCTACTGCTGTTCGCCCCCTTCATCG (서열번호 97) |
|
| FnCpf1 | CCR5 | AATTCTCTGAGGCTTTCTTTTAAATATACATAAGGAACTTTCGGAGTGAAGGG (서열번호 98) AGAGTTTCATATGGTCAATAACTTGATGCATGTGAAGGGGAGATAAAAAGGTT (서열번호 99) |
| DNMT1 | TGGCCCTGGGGCCGTTTCCCTCACTCCTGCTCGGTGAATTTGGCTCAGCAGGC (서열번호 100) ACCTGCCGAATTCTCAGCTGCTCACTTGAGCCTCTGGGTCTAGAACCCTCTGG (서열번호 101) |
| 종자 파종 배지 | 1 L |
| 1/2 MS Powder | 2.2 g |
| Sucrose | 10 g |
| Plant agar | 7 g |
| pH | 5.7 (1N NaOH 또는 1N HCl 로 측정함) |
| Enzyme Solution | 20 mL |
| 1.0% Cellulase R10 | 200 mg |
| 0.5% Macerozyme R10 | 100 mg |
| 0.4 M Mannitol | 10 mL (0.8 M Mannitol Stock solution) |
| 20 mM MES, pH 5.7 | 4 mL (100 mM MES Stock solution, pH 5.7) |
| 20 mM KCl | 200 μL (2 M KCl Stock solution) |
| 위 시약들 조합한 후 60도에서 10분간 배양한 후 아래 시약을 조합한다. | |
| 10 mM CaCl2·2H2O | 200 μL (1 M CaCl2·2H2O Stock solution) |
| 0.1 % BSA | 200 μL (10% BSA Stock solution) |
| MMG Solution | 10 mL |
| 0.4 M Mannitol | 5 mL (0.8 M Mannitol Stock solution) |
| 4 mM MES, pH 5.7 | 400 μL (0.1 M MES Stock solution, pH5.7) |
| 15 mM MgCl2 | 150 μL (1 M MgCl2 Stock solution) |
| Nuclease-free water | 4.45 mL |
| PEG Solution | 5 mL |
| 0.2 M Mannitol | 1.25 mL (0.8 M Mannitol Stock solution) |
| 40%W/V PEG-4000 | 2 g (Polyethylene glycol 4000) |
| 100 mM CaCl2·2H2O | 500 μL (1 M CaCl2*?*2H2O Stock solution) |
| Nuclease-free water | 1.5 mL |
| W5 Solution | 50 mL |
| 154 mM NaCl | 3.85 mL (2 M NaCl Stock solution) |
| 125 mM CaCl2·2H2O | 6.25 mL (1 M CaCl2·2H2O Stock solution) |
| 5 mM KCI | 125 μL (2 M KCl Stock solution) |
| 2 mM MES, pH 5.7 | 500 μL (0.1 M MES Stock solution) |
| Nuclease-free water | 39.275 mL |
| SgRNA | 2.5ug | 5ug | 10ug |
| Cas9 | 10ug | 20ug | 30ug |
| 10x NEB buffer (3.1) | 2 μL | 2 μL | 2 μL |
| Nuclease-free water | Up to 20 μL | ||
Claims (22)
- 크리스퍼 연관 단백질 및 엑소뉴클레아제인 RecJ를 포함하는 크리스퍼 플러스 단백질.
- 제1항에 있어서,
상기 크리스퍼 플러스 단백질은 하기 구조식 1 내지 4에서 선택되는 어느 하나의 구조를 갖는 것인, 크리스퍼 플러스 단백질로서,
<구조식 1>
크리스퍼 연관 단백질-RecJ
<구조식 2>
크리스퍼 연관 단백질-링커 1-RecJ
<구조식 3>
RecJ-크리스퍼 연관 단백질
<구조식 4>
RecJ-링커 1-크리스퍼 연관 단백질
상기 링커 1은 1 내지 20개의 아미노산으로 구성된 것일 수 있다. - 제2항에 있어서,
상기 링커 1은 서열번호 17, 18 , 19, 20, 21, 22, 23 또는 24의 아미노산 서열을 가지는 것인, 크리스퍼 플러스 단백질. - 제1항에 있어서,
추가적으로 DNA 결합 단백질(DNA binding protein, DBP)를 더 포함하는 것인, 크리스퍼 플러스 단백질. - 제4항에 있어서,
상기 DBP는 SSB(single stranded binding protein) 또는 DSB(double stranded binding protein)인 것인, 크리스퍼 플러스 단백질. - 제1항에 있어서,
상기 RecJ는 크리스퍼 연관 단백질의 N 말단 또는 C 말단에 결합되는 것인, 크리스퍼 플러스 단백질. - 제4항에 있어서,
상기 크리스퍼 플러스 단백질는 하기 구조식 5 내지 7에서 선택되는 어느 하나의 구조를 갖는 것인, 크리스퍼 플러스 단백질로서,
<구조식 5>
DBP-크리스퍼 연관 단백질-RecJ
<구조식 6>
DBP-링커 2-크리스퍼 연관 단백질-RecJ
<구조식 7>
DBP-링커 2-크리스퍼 연관 단백질-링커 1-RecJ
이때, DBP는 SSB 또는 DSB이며,
상기 링커 1은 1 내지 20개의 아미노산으로 구성된 것일 수 있으며,
상기 링커 2는 1 내지 20개의 아미노산으로 구성된 것일 수 있다. - 제1항에 있어서,
추가적으로 핵 위치화 시그널( nuclear localization signal)을 더 포함하는 것인, 크리스퍼 플러스 단백질. - 제8항에 있어서,
상기 핵 위치화 시그널은 융합 단백질의 C 말단에 위치하는 것인, 크리스퍼 플러스 단백질. - 제1항에 있어서,
추가적으로 His tag을 포함하는 것인, 크리스퍼 플러스 단백질. - 제1항에 있어서,
상기 크리스퍼 연관 단백질은 Cas1, Cas1B, Cas2, Cas3, Cas4, Cas5, Cas6, Cas7, Cas8, Cas9, Cas10, Cas12a, Cas12b, Cas12c, Cas12d, Cas12e, Cas13a, Cas13b, Cas13c, Cas13d, Csy1, Csy2, Csy3, Cse1, Cse2, Csc1, Csc2, Csa5, Csn2, Csm2, Csm3, Csm4, Csm5, Csm6, Cmr1, Cmr3, Cmr4, Cmr5, Cmr6, Csb1, Csb2, Csb3, Csx17, Csx14, Csx10, Csx16, CsaX, Csx3, Csx1, Csx15, Csf1, Csf2, Csf3 및 Csf4로 구성된 군으로부터 선택되는 어느 하나인 것인, 크리스퍼 플러스 단백질. - 제1항에 있어서,
상기 RecJ는 서열번호 1, 3, 5, 7, 9, 11, 13 또는 15로 이루어진 군에서 선택되는 어느 하나의 아미노산 서열을 가지는 것인, 크리스퍼 플러스 단백질. - 제1항 내지 제12항에 있어서,
상기 크리스퍼 플러스 단백질은 서열번호 31, 41, 49, 53, 57, 71 또는 77로 구성된 군에서 선택되는 어느 하나의 아미노산 서열을 가지는 것인, 크리스퍼 플러스 단백질. - 제12항의 크리스퍼 플러스 단백질을 코딩하는 폴리뉴클레오티드.
- 제14항에 있어서,
상기 폴리뉴클레오티드는 서열번호 32, 42, 50, 54, 58, 72 또는 78로 구성된 군에서 선택되는 어느 하나의 핵산 서열을 가지는 것인, 폴리뉴클레오티드. - 제14항의 폴리뉴클레오티드가 적재된 벡터.
- 제16항에 있어서,
상기 벡터는 플라스미드인, 벡터. - 제16항의 벡터가 도입된 숙주 세포.
- 제1항 내지 제12항의 크리스퍼 플러스 단백질 및 crRNA가 결합된 RNP 복합체.
- 제19항의 RNP 복합체를 포함하는 유전자 편집용 조성물.
- 제1항 내지 제12항의 크리스퍼 플러스 단백질 및 crRNA를 유효성분으로 포함하는 유전자 편집용 키트.
- 제19항에 있어서,
상기 crRNA는 표적 유전자에 상보적으로 결합 가능한 10 내지 30개의 뉴클레오티드로 구성된, 유전자 편집용 키트.
Priority Applications (1)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| KR1020180167870A KR20200078200A (ko) | 2018-12-21 | 2018-12-21 | 크리스퍼 연관 단백질 및 엑소뉴클레아제를 포함하는 변형된 크리스퍼 연관 단백질 |
Applications Claiming Priority (1)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| KR1020180167870A KR20200078200A (ko) | 2018-12-21 | 2018-12-21 | 크리스퍼 연관 단백질 및 엑소뉴클레아제를 포함하는 변형된 크리스퍼 연관 단백질 |
Publications (1)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| KR20200078200A true KR20200078200A (ko) | 2020-07-01 |
Family
ID=71602096
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| KR1020180167870A Ceased KR20200078200A (ko) | 2018-12-21 | 2018-12-21 | 크리스퍼 연관 단백질 및 엑소뉴클레아제를 포함하는 변형된 크리스퍼 연관 단백질 |
Country Status (1)
| Country | Link |
|---|---|
| KR (1) | KR20200078200A (ko) |
Cited By (1)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| CN118531031A (zh) * | 2024-06-12 | 2024-08-23 | 河南农业职业学院 | 单链DNA结合蛋白介导的体外CRISPR/Cas9基因编辑方法及其应用 |
-
2018
- 2018-12-21 KR KR1020180167870A patent/KR20200078200A/ko not_active Ceased
Non-Patent Citations (1)
| Title |
|---|
| B. Zetsche, et al., Cpf1 is a single RNA-guided endonuclease of a class 2 CRISPR-Cas system, Cell, 2015, 163, 759-771. |
Cited By (1)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| CN118531031A (zh) * | 2024-06-12 | 2024-08-23 | 河南农业职业学院 | 单链DNA结合蛋白介导的体外CRISPR/Cas9基因编辑方法及其应用 |
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| KR102613296B1 (ko) | 신규한 crispr 효소 및 시스템 | |
| KR102339365B1 (ko) | 키메라 게놈 조작 분자 및 방법 | |
| AU2018330197B2 (en) | Nuclease systems for genetic engineering | |
| KR101897213B1 (ko) | Cpf1을 포함하는 유전체 교정용 조성물 및 그 용도 | |
| CN110418647B (zh) | Rna指导的核酸修饰酶及其使用方法 | |
| KR102787119B1 (ko) | 유전자 편집에 의한 인간 디스트로핀 유전자의 교정을 위한 치료용 표적 및 사용 방법 | |
| KR101659101B1 (ko) | 박테리아 [2Fe-2S] 다이하이드록시산 탈수효소의 동정 및 용도 | |
| KR20230111189A (ko) | 재프로그램 가능한 iscb 뉴클레아제 및 이의 용도 | |
| KR20210089629A (ko) | Rna-가이드된 뉴클레아제 및 그의 활성 단편 및 변이체 및 사용 방법 | |
| CN107849581A (zh) | 用于植物中的特异性核酸编辑的方法和构建体 | |
| CN114921439A (zh) | CRISPR-Cas效应子蛋白、其基因编辑系统及应用 | |
| KR20240021218A (ko) | 신규 유형 v rna 프로그래밍가능 엔도뉴클레아제 시스템 | |
| CN112301050A (zh) | 一种构建高产谷胱甘肽重组菌株的方法及应用 | |
| KR20240006496A (ko) | Omni 90-99, 101, 104-110, 114, 116, 118-123, 125, 126, 128, 129, 및 131-138 crispr 뉴클레아제 | |
| WO2004033633A2 (en) | Compatible host/vector systems for expression of dna | |
| KR20200078200A (ko) | 크리스퍼 연관 단백질 및 엑소뉴클레아제를 포함하는 변형된 크리스퍼 연관 단백질 | |
| KR20230127308A (ko) | 신규 핵산-가이드 뉴클레아제 | |
| CN114207125B (zh) | 通过抑制条件性必需基因进行反向选择 | |
| CN111394320B (zh) | 表达人组织因子融合蛋白的重组痘苗病毒及其应用 | |
| EP4444888A2 (en) | Methods and compositions for genetically modifying human gut microbes | |
| JP3688118B2 (ja) | 遺伝子トラップ用ベクターと、このベクターを用いた遺伝子トラップ方法 | |
| RU2832308C2 (ru) | Новые ферменты и системы crispr | |
| KR102468650B1 (ko) | T7 RNA 중합효소 및 mRNA 캡핑 효소를 유도 발현하는 재조합 벡터 및 이의 용도 | |
| RU2792654C2 (ru) | Новые ферменты и системы crispr | |
| AU2021336262A9 (en) | Miniaturized cytidine deaminase-containing complex for modifying double-stranded dna |
Legal Events
| Date | Code | Title | Description |
|---|---|---|---|
| PA0109 | Patent application |
St.27 status event code: A-0-1-A10-A12-nap-PA0109 |
|
| PN2301 | Change of applicant |
St.27 status event code: A-3-3-R10-R13-asn-PN2301 St.27 status event code: A-3-3-R10-R11-asn-PN2301 |
|
| PG1501 | Laying open of application |
St.27 status event code: A-1-1-Q10-Q12-nap-PG1501 |
|
| N231 | Notification of change of applicant | ||
| PN2301 | Change of applicant |
St.27 status event code: A-3-3-R10-R13-asn-PN2301 St.27 status event code: A-3-3-R10-R11-asn-PN2301 |
|
| PN2301 | Change of applicant |
St.27 status event code: A-3-3-R10-R13-asn-PN2301 St.27 status event code: A-3-3-R10-R11-asn-PN2301 |
|
| R18-X000 | Changes to party contact information recorded |
St.27 status event code: A-3-3-R10-R18-oth-X000 |
|
| PN2301 | Change of applicant |
St.27 status event code: A-3-3-R10-R13-asn-PN2301 St.27 status event code: A-3-3-R10-R11-asn-PN2301 |
|
| R18-X000 | Changes to party contact information recorded |
St.27 status event code: A-3-3-R10-R18-oth-X000 |
|
| A201 | Request for examination | ||
| E13-X000 | Pre-grant limitation requested |
St.27 status event code: A-2-3-E10-E13-lim-X000 |
|
| P11-X000 | Amendment of application requested |
St.27 status event code: A-2-2-P10-P11-nap-X000 |
|
| P13-X000 | Application amended |
St.27 status event code: A-2-2-P10-P13-nap-X000 |
|
| PA0201 | Request for examination |
St.27 status event code: A-1-2-D10-D11-exm-PA0201 |
|
| R18-X000 | Changes to party contact information recorded |
St.27 status event code: A-3-3-R10-R18-oth-X000 |
|
| R18-X000 | Changes to party contact information recorded |
St.27 status event code: A-3-3-R10-R18-oth-X000 |
|
| R18-X000 | Changes to party contact information recorded |
St.27 status event code: A-3-3-R10-R18-oth-X000 |
|
| R18-X000 | Changes to party contact information recorded |
St.27 status event code: A-3-3-R10-R18-oth-X000 |
|
| D13-X000 | Search requested |
St.27 status event code: A-1-2-D10-D13-srh-X000 |
|
| D14-X000 | Search report completed |
St.27 status event code: A-1-2-D10-D14-srh-X000 |
|
| E902 | Notification of reason for refusal | ||
| PE0902 | Notice of grounds for rejection |
St.27 status event code: A-1-2-D10-D21-exm-PE0902 |
|
| T11-X000 | Administrative time limit extension requested |
St.27 status event code: U-3-3-T10-T11-oth-X000 |
|
| T11-X000 | Administrative time limit extension requested |
St.27 status event code: U-3-3-T10-T11-oth-X000 |
|
| T11-X000 | Administrative time limit extension requested |
St.27 status event code: U-3-3-T10-T11-oth-X000 |
|
| E601 | Decision to refuse application | ||
| PE0601 | Decision on rejection of patent |
St.27 status event code: N-2-6-B10-B15-exm-PE0601 |
|
| R18-X000 | Changes to party contact information recorded |
St.27 status event code: A-3-3-R10-R18-oth-X000 |
|
| T11-X000 | Administrative time limit extension requested |
St.27 status event code: U-3-3-T10-T11-oth-X000 |
|
| T13-X000 | Administrative time limit extension granted |
St.27 status event code: U-3-3-T10-T13-oth-X000 |
|
| R18-X000 | Changes to party contact information recorded |
St.27 status event code: A-3-3-R10-R18-oth-X000 |
|
| R18 | Changes to party contact information recorded |
Free format text: ST27 STATUS EVENT CODE: A-3-3-R10-R18-OTH-X000 (AS PROVIDED BY THE NATIONAL OFFICE) |
|
| R18-X000 | Changes to party contact information recorded |
St.27 status event code: A-3-3-R10-R18-oth-X000 |
|
| R18-X000 | Changes to party contact information recorded |
St.27 status event code: A-3-3-R10-R18-oth-X000 |