KR20220080682A - 현미부수체 지역의 서열 길이의 변동계수를 이용한 현미부수체 불안정성 진단방법 - Google Patents
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Abstract
본원은 계산이 단순한 변동계수(CV)를 이용하기 때문에 기존의 NGS 기반 검사보다 현미부수체 불안정성 진단에 걸리는 시간을 줄일 수 있어 더욱 효과적인 환자 치료 전략 구축에 용이하다.
Description
도 2는, 현미부수체 지역의 서열 길이의 변동계수를 이용한 샘플의 짝비교 현미부수체 불안정성 진단방법을 나타낸 도면이다.
도 3은, 현미부수체 지역의 서열 길이의 변동계수를 이용한 현미부수체 불안정성 진단방법의 기본 원리를 나타낸 도면이다.
도 4는, 현미부수체 지역의 서열 길이의 변동계수를 이용한 현미부수체 불안정성 진단방법과 기존 진단방법의 현미부수체 불안정성 결과수치를 비교한 결과를 나타낸 도면이다.
도 5는, 현미부수체 지역의 서열 길이의 변동계수를 이용한 현미부수체 불안정성 진단방법과 기존 진단방법의 현미부수체 불안정성 계산 속도를 비교한 결과를 나타낸 도면이다.
Claims (4)
- (a) 현미부수체 지역을 탐색하는 단계;
(b) 타겟 현미부수체 지역을 선택하는 단계;
(c) 단일 샘플 현미부수체 지역에 정렬된 서열을 검출하는 단계;
(d) 각각의 지역에서 검출된 서열 중 현미부수체를 담고 있는 서열을 선택하는 단계;
(e) 선택된 서열들 속 현미부수체의 구성 및 길이를 계산하는 단계;
(f) 각각의 현미부수체 지역에서 검출된 현미부수체들의 길이에 대한 변동계수(CV)를 계산하는 단계; 및
(g) 계산된 변동계수를 이용하여 현미부수체 불안정성을 진단하는 단계를 포함하는, 현미부수체 불안정성 진단 방법.
- 제 1항에 있어서,
상기 변동계수(CV)는 현미부수체들 길이의 표준편차를 현미부수체들 길이의 평균값으로 나눈 값을 의미하는 것인, 현미부수체 불안정성 진단 방법.
- (a) 현미부수체 지역을 탐색하는 단계;
(b) 타겟 현미부수체 지역을 선택하는 단계;
(c) 정상샘플과 암 샘플에서 동일한 현미부수체 지역에 정렬된 서열을 검출하는 단계;
(d) 짝 샘플의 동일한 현미부수체 지역에서 검출된 서열을 병합하는 단계;
(e) 각각의 지역에서 검출된 서열 중 현미부수체를 담고 있는 서열을 선택하는 단계;
(f) 선택된 서열들 속 현미부수체의 구성 및 길이를 계산하는 단계;
(g) 각각의 현미부수체 지역에서 검출된 현미부수체들의 길이에 대한 변동계수(CV)를 계산하는 단계; 및
(h) 계산된 변동계수를 이용하여 현미부수체 불안정성을 진단하는 단계를 포함하는, 현미부수체 불안정성 진단 방법.
- 제 3항에 있어서,
상기 변동계수(CV)는 현미부수체들 길이의 표준편차를 현미부수체들 길이의 평균값으로 나눈 값을 의미하는 것인, 현미부수체 불안정성 진단 방법.
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