PL180760B1 - Sekwencje kwasu nukleinowego, zdefektowany wirus rekombinacyjny i kompozycja farmaceutyczna - Google Patents
Sekwencje kwasu nukleinowego, zdefektowany wirus rekombinacyjny i kompozycja farmaceutycznaInfo
- Publication number
- PL180760B1 PL180760B1 PL94312213A PL31221394A PL180760B1 PL 180760 B1 PL180760 B1 PL 180760B1 PL 94312213 A PL94312213 A PL 94312213A PL 31221394 A PL31221394 A PL 31221394A PL 180760 B1 PL180760 B1 PL 180760B1
- Authority
- PL
- Poland
- Prior art keywords
- nucleic acid
- acid sequence
- seq
- sequence
- virus
- Prior art date
Links
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K16/00—Immunoglobulins [IG], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies
- C07K16/08—Immunoglobulins [IG], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from viruses
- C07K16/081—DNA viruses
- C07K16/084—Papillomaviridae (F); Polyomaviridae (F), e.g. SV40, BK virus or JC virus
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P35/00—Antineoplastic agents
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P37/00—Drugs for immunological or allergic disorders
- A61P37/02—Immunomodulators
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K16/00—Immunoglobulins [IG], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K16/00—Immunoglobulins [IG], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies
- C07K16/08—Immunoglobulins [IG], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from viruses
- C07K16/10—RNA viruses
- C07K16/112—Retroviridae (F), e.g. leukemia viruses
- C07K16/114—Lentivirus (G), e.g. human immunodeficiency virus [HIV], feline immunodeficiency virus [FIV] or simian immunodeficiency virus [SIV]
- C07K16/1147—Regulatory proteins, e.g. trans-activator of transcription [TAT], rev or vacuolar protein targeting [VPT]
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K16/00—Immunoglobulins [IG], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies
- C07K16/18—Immunoglobulins [IG], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K16/00—Immunoglobulins [IG], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies
- C07K16/18—Immunoglobulins [IG], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans
- C07K16/32—Immunoglobulins [IG], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans against translation products of oncogenes
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K38/00—Medicinal preparations containing peptides
Landscapes
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Immunology (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Virology (AREA)
- Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
- Oncology (AREA)
- General Chemical & Material Sciences (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- Pharmacology & Pharmacy (AREA)
- Animal Behavior & Ethology (AREA)
- Public Health (AREA)
- Veterinary Medicine (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Medicines That Contain Protein Lipid Enzymes And Other Medicines (AREA)
- Peptides Or Proteins (AREA)
- Medicines Containing Material From Animals Or Micro-Organisms (AREA)
- Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
- Medicines Containing Antibodies Or Antigens For Use As Internal Diagnostic Agents (AREA)
- Pharmaceuticals Containing Other Organic And Inorganic Compounds (AREA)
- Saccharide Compounds (AREA)
- Preparation Of Compounds By Using Micro-Organisms (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
Abstract
1. Sekwencja kwasu nukleinowego zawierajaca gen kodujacy polipeptyd o sekwencji zdefiniowanej jako SEQ ID nr 1 lub SEQ ID nr 2. 6. Zdefektowany wirus rekombinacyjny wybrany sposród retrowirusów, adenowiru- sów, wirusów adenopochodnych, wirusa ospy i wirusa HSV, znamienny tym, ze wirus ten zawiera w swoim genomie co najmniej jedna sekwencje kwasu nukleinowego zdefinio- wana jako SEQ ID nr 1 lub SEQ E D nr 2. 10. Kompozycja farmaceutyczna do terapii genowej zwiazanej z produkcja prze- ciwcial lub aktywnych peptydów obejmujaca kwasy nukleinowe lub geny kodujace aktyw- ne terapeutycznie czynniki oraz farmaceutycznie dopuszczalny nosnik, znamienna tym, ze zawiera co najmniej jedna sekwencje kwasu nukleinowego zdefiniowana jako SEQ E D nr 1 lub SEQ ID nr 2 bedaca pod kontrola funkcjonujacego w komórkach ssaczych promo- tora wybranego z grupy promotorów CMV, SV40, E1a, MLP, LTR lub villiny albo co najmniej jeden zdefektowany rekombinacyjny wirus zawierajacy ta sekwencje, w postaci dawkowej od 104 do 101 4 pfu/ml oraz dopuszczalne farmaceutycznie nosniki. PL PL PL PL PL PL PL PL PL
Description
Przedmiotem wynalazku jest sekwencja kwasu nukleinowego, zdefektowany wirus rekombinacyjny i kompozycja farmaceutyczna. Wynalazek dotyczy zwłaszcza sekwencji kwasów nukleinowych, zawierających gen kodujący wewnątrzkomórkowe białko wiążące (WBW). Geny te, ewentualnie włączone do odpowiednich wektorów ekspresyjnych można zastosować w terapii genowej.
180 760
Terapia genowa polega na korygowaniu braku lub nieprawidłowości (mutacji, nieprawidłowej ekspresji, etc.) przez wprowadzenie informacji genetycznej do dotkniętej chorobą komórki lub narządu. Ta informacja genetyczna może być wprowadzona albo in vitro do komórki wyodrębnionej z narządu, która to zmodyfikowana komórka jest następnie z powrotem wprowadzana do organizmu, albo bezpośrednio in vivo do odpowiedniej tkanki. W literaturze opisano służące do tego celu różne techniki transfekcji i transferu genów (patrz Roemer i Friedman, Eur. J. Biochem. 208 (1992), 211). Znane dotychczas ze stanu techniki sposoby podejścia do terapii genowej polegają na przeniesieniu genów kodujących aktywne polipeptydy zaangażowane w choroby genetyczne (hormony, czynniki wzrostu, etc.), geny antysensowne lub peptydy antygenowe dla wytworzenia szczepionek. Wynalazek niniejszy dotyczy nowego podejścia do terapii genowej, polegającego na przeniesieniu i ekspresji w komórce (lub w tkance) docelowej peptydu wewnątrzkomórkowego zdolnego do interakcji ze składnikami komórkowymi oraz do oddziaływania na funkcje komórkowe. Wynalazek mniejszy opiera się w szczególności na stwierdzeniu, że możliwa jest ekspresja in vivo przeciwciał modyfikowanych, które pozostają w przedziale wewnątrzkomórkowym i które mogą kontrolować niektóre fhnkcje komórkowe. Wynalazek opiera się także na stwierdzeniu, że dla zastosowania w terapii genowej możliwe jest klonowanie sekwencji DNA, kodujących te przeciwciała wewnątrzkomórkowe w wektorach, zwłaszcza wirusowych.
Zastosowanie przeciwciał w terapii ludzkiej pozwala generalnie na lokalizowanie i zobojętnianie kompleksów biologicznych krążących i/lub umiejscowionych na powierzchni komórek, co pociąga za sobą kaskadę zdarzeń kierowanych przez układ immunologiczny, która prowadzi do ich eliminacji. Jednakże w wielu przypadkach, jak rak lub choroby powodowane na przykład przez wirusy, podejście to jest nieskuteczne, ponieważ antygen odpowiedzialny za deregulację dotkniętych chorobą komórek jest niedostępny dla wstrzykiwanych przeciwciał.
Wynalazek niniejszy oferuje nowe, szczególnie korzystne podejście terapeutyczne, polegające na spowodowaniu produkcji w sposób ciągły i wewnątrzkomórkowy przeciwciał lub środków terapeutycznych, których wiązanie z epitopem zmniejsza i/lub usuwa deregulację.
Możliwość ekspresji przeciwciał przy użyciu metod rekombinacyjnych została już opisana w literaturze. Tak więc w opisie patentowym EP 88994 opisano ekspresję in vitro i oczyszczanie regionów zmiennych łańcuchów ciężkich i lekkich przeciwciał. Podobnie w opisie patentowym USA 4946778 opisano ekspresję in vitro sekwencji DNA, kodujących zmodyfikowane przeciwciała, składające się z regionów zmiennych łańcucha ciężkiego i lekkiego przeciwciała, połączonych za pomocą łącznika. Jednakże przeciwciała opisane w tym opisie patentowym są nieaktywne i są generalnie syntetyzowane w postaci nierozpuszczalnych ciał inkluzyjnych. W celu wyodrębnienia aktywności przeciwciała muszą więc być oczyszczane, a następnie poddane obróbkom chemicznym (denaturacja, renaturacje, etc.). Sekwencja według niniejszego wynalazku dostarcza możliwości zastosowania takich sekwencji DNA do bezpośredniej ekspresji in vivo aktywnych przeciwciał wewnątrzkomórkowych. Dostarcza to także możliwości zastosowania takich sekwencji DNA kodujących przeciwciała wewnątrzkomórkowe, znajdujących się pod kontrolą regionów umożliwiających ich ekspresję w komórkach ssaczych, do terapii genowej, zwłaszcza u człowieka. To nowe podejście pozwala na ukierunkowanie tych sekwencji do takich elementów komórkowych, które są niedostępne klasycznymi metodami szczepienia. Ponadto podejście to nie implikuje powstawania odpowiedzi immunologicznej, ale działa wewnątrzkomórkowo.
Przedmiotem wynalazku jest zatem sekwencja kwasu nukleinowego zawierająca gen kodujący polipeptyd o sekwencji zdefiniowanej jako SEQ ID nr 1 lub SEQ ID nr 2. Korzystnie sekwencja kwasu nukleinowego zawiera sekwencję zdefiniowaną jako SEQ ID nr 1 lub SEQ ID nr 2. Bardziej korzystnie sekwencja ta jest pod kontrolą funkcjonującego w komórkach ssaczych promotora wybranego z grupy promotorów CMV, SV40, E1a, MLP LTR lub villiny. Sekwencja ta, korzystnie jest włączona do wektora. Może nim być korzystnie wektor wirusowy.
Przedmiotem wynalazku jest także wirus rekombinacyjny wybrany spośród retrowirusów, adenowirusów, wirusów adenopochodnych, wirusa ospy i wirusa HSV, charakteryzujący się tym, że wirus ten zawiera w swoim genomie co najmniej jedną sekwencję kwasu nukle4
180 760 inowego zdefiniowaną jako SEQ ID nr 1 lub SEQ ID nr 2. Korzystnie zdefektowany wirus według wynalazku zawiera sekwencję, która jest pod kontrolą funkcjonującego w komórkach ssaczych promotora wybranego z grupy promotorów CMV, SV40, Ela, MLP, LTR lub villiny. Bardziej korzystnie zawarta w nim sekwencja jest włączona do wirusowego wektora. Kolejnym przedmiotem wynalazku jest kompozycja farmaceutyczna do terapii genowej związanej z produkcją, przeciwciał lub aktywnych peptydów obejmująca kwasy nukleinowe lub geny kodujące aktywne terapeutycznie czynniki oraz farmaceutycznie dopuszczalny nośnik, charakteryzujący się tym, że zawiera co najmniej jedną sekwencję kwasu nukleinowego zdefiniowaną, jako sEq ID nr 1 lub SEQ ID nr 2 będącą pod kontrolą funkcjonującego w komórkach ssaczych promotora wybranego z grupy promotorów CMV, SV40, Ela, MLP, LTR lub villiny albo co najmniej jeden zdefektowany rekombinacyjny wirus zawierający tą sekwencję, w postaci dawkowej od 104 do 1014 pfu/ml oraz dopuszczalne farmaceutycznie nośniki. Korzystnie kompozycja farmaceutyczna zawiera sekwencję kwasu nukleinowego włączoną do wektora, a najbardziej korzystnie zawiera sekwencję kwasu nukleinowego włączoną do wirusowego wektora. Korzystnie zdefektowany wirus wybrany jest z grupy adenowirusów, retrowirusów i adenopodobnych wirusów. Kompozycja farmaceutyczna korzystnie zawiera sekwencję kwasu nukleinowego w postaci dawkowej od 106 do 10ω pfu/ml.
Sekwencja kwasów nukleinowych, według wynalazku zawiera gen kodujący wewnątrzkomórkowe białko wiążące (WBW), będący pod kontrolą regionów umożliwiających jego ekspresję w komórkach ssaczych.
Zdefiniowana powyżej sekwencja kwasu nukleinowego może być zawarta w wektorze. W szczególności wektory te są pochodzenia wirusowego, tak jak retrowirusy, adenowirusy, wirusy adenopodobne, wirus opryszczki, wirus ospy, wirus HSV, etc.
Sekwencja kwasu nukleinowego lub wektory mogą służyć do otrzymywania środków farmaceutycznych o przeznaczeniu chirurgicznym i/lub terapeutycznym i działające na organizm ludzki lub zwierzęcy.
W rozumieniu niniejszego wynalazku określenie wewnątrzkomórkowe białko wiążące (WBW) oznacza każde białko lub fragment białka, zdolny do rozpoznawania składnika komórki w którym jest wyrażane, oraz do oddziaływania z tym składnikiem w sposób selektywny i łączenia się z nim. Może tu chodzić o oddziaływania chemiczne kowalencyjne lub niekowalencyjne. Oddziaływanie ze składnikiem komórkowym (białka, lipidy, aminokwasy, mRNA, tRNA, rRNA, DNA, etc) pozwala na oddziaływanie na funkcję komórkową, w którą jest zaangażowany wspomniany składnik, a także na regulowanie (stymulowanie, spowalnianie, hamowanie) tej funkcji.
Korzystnie białka WBW zgodnie z wynalazkiem stanowią cząsteczki pochodne przeciwciał lub mające zdolność wiązania porównywalną z przeciwciałami. W szczególności chodzi o białka mające selektywność i powinowactwo wystarczające do umożliwienia interakcji in vivo, której skutkiem jest zobojętnienie antygenu. Ze względu na swoje właściwości i lokalizację cząsteczki te są określane jako przeciwciała wewnątrzkomórkowe.
Przeciwciała, cząsteczki należące do nadgodziny immunoglobulin, są syntetyzowane w sposób naturalny (głównie przez limfocyty B) w postaci białek wydzielniczych. Są one następnie uwalniane do przedziałów zewnątrzkomórkowych (układ krążenia), gdzie wywierają swoją aktywność (rozpoznawanie i wiązanie antygenów nieswoistych). Obecnie wykazano, że możliwa jest ekspresja in vivo genów zmodyfikowanych, kodujących przeciwciała wewnątrzkomórkowe bez wpływu na specyficzność i powinowactwo przeciwciał,. Sekwencja kwasu nukleinowego według wynalazku, kodująca przeciwciała wewnątrzkomórkowe, zawiera zatem gen kodujący przeciwciała, zmodyfikowany w taki sposób, że przeciwciało to nie będzie wydzielane. W szczególności gen kodujący przeciwciało jest generalnie zmodyfikowany przez delecję lub mutację sekwencji odpowiedzialnych za sekrecję. Białko WBW może być utworzone przez fragmenty przeciwciał, na przykład przez fragmenty FAB lub F(ab)'2, noszące domeny wiązania antygenu. Zastosowanie tego typu przeciwciał wewnątrzkomórkowych pociąga za sobajednakże ekspresję sekwencji kwasów nukleinowych, zawierającej kilka genów kodujących odpowiednio regiony ciężkie i lekkie tych fragmentów, co pociąga za sobą także to, że łańcuchy te łączą się prawidłowo in vivo. Z tego powodu przeciwciało wewnątrzkomórkowe
180 760 utworzone na oparciu o sekwencję według wynalazku w szczególnie korzystnej postaci składa się z peptydu odpowiadającego miejscu wiązania regionu zmiennego łańcucha lekkiego przeciwciała, połączonego łącznikiem peptydowym w peptydem odpowiadającym miejscu wiązania regionu zmiennego łańcucha ciężkiego przeciwciała. Zastosowanie tego typu przeciwciała wewnątrzkomórkowego, oznaczonego ScFv, jest interesujące, ponieważ są one wyrażane przez jedyny gen. Konstrukcja sekwencji kwasów nukleinowych kodujących takie zmodyfikowane przeciwciała jest zilustrowana w przykładach.
Z drugiej strony sekwencje kwasów nukleinowych kodujące przeciwciała wewnątrzkomórkowe mogą być również modyfikowane na drodze chemicznej, enzymatycznej lub genetycznej w celu wytworzenia przeciwciał wewnątrzkomórkowych stabilizowanych i/lub wielofunkcyjnych, i/lub o zmniejszonej wielkości, i/lub w celu uprzywilejowania ich lokalizacji w tym lub innym przedziale wewnątrzkomórkowym. Sekwencja kwasu nukleinowego według wynalazku może również zawierać sekwencje kodujące peptydy sygnałowe lokalizacji jądrowej (NLS). W szczególności możliwa jest fuzja sekwencji według wynalazku z sekwencją kodującą NLS wirusa SV40, której sekwencja peptydowa jest następująca: MPKKKRK (Kalderon i współpr., Celi 39 (1984) 499).
Jak wskazano powyżej, sekwencja kwasu nukleinowego według wynalazku zawiera sekwencje umożliwiające ekspresję genu lub genów kodujących WBW w komórkach ssaczych. Generalnie geny WBW są zatem umiejscowione pod kontrolą regionów promotorowych transkrypcji i translacji, funkcjonujących w komórce ssaczej, w której ma następować ekspresja. Mogą to być sekwencje homologiczne w stosunku do wspomnianej komórki, to jest sekwencje odpowiedzialne naturalnie za ekspresję genów we wspomnianej komórce. Mogą to być również sekwencje innego pochodzenia, to jest sekwencje odpowiedzialne za ekspresję białek innych typów komórek, sekwencję odpowiedzialne za ekspresję przeciwciał w warunkach naturalnych, wirusowe sekwencje ekspresji, na przykład obecne w wektorze, do którego włączona jest sekwencja według wynalazku lub sekwencje syntetyczne albo semisyntetyczne.
Jeśli chodzi o stosowanie u ludzi, to w literaturze opisano wiele promotorów funkcjonalnych, takie jak na przykład promotory wirusowe CMV, SV40, Ela, MLP, LTR, ect. Promotory komórkowe, takie jak na przykład promotory genu kosmówczaka są interesujące ze względu na to, że umożliwiają ekspresję tkankowo-specyficzną (w przypadku kosmówczaka organiczną do jelita).
Z drugiej strony sekwencje ekspresyjne mogą być również modyfikowane, na przykład w celu przystosowania ich do ekspresji w szczególnym rodzaju wektora lub komórki, w celu zmniejszenia ich wielkości, w celu zwiększenia ich aktywności promotora transkrypcji, w celu generowania promotorów indukowalnych, poprawienia poziomu ich regulacji lub zmiany natury ich regulacji. Takie modyfikacje mogą być przeprowadzane na przykład przez mutagenezę in vitro, przez wprowadzenie dodatkowych elementów kontrolnych lub sekwencji syntetycznych lub przez delecje albo substytucje oryginalnych elementów kontrolnych. Szczególnie korzystne jest zastosowanie promotorów tkankowo-specyficznych, w celu skierowania ekspresji WBW do jednego typu tkanki.
Z drugiej strony, jeśli sekwencje kwasów nukleinowych nie zawierają sekwencji ekspresyjnych, to sekwencje te mogą być włączone do wektora ekspresji poniżej takiej sekwencji.
W celu otrzymania wektora według wynalazku przeprowadza się najpierw identyfikację funkcji komórkowej, na przykład zaangażowanej w patologię lub odpowiedzialnej za tę patologię, na którą zamierza się oddziaływać. Następnie przeprowadza się identyfikację odpowiedniego składnika komórkowego, zaangażowanego w tę funkcję, po czym ustala się, który WBW wydaje się być najbardziej przystosowany do tego składnika (przeciwciało, pochodne, etc.) pod względem jego lokalizacji, roli, natury, etc. Po wyselekcjonowaniu WBW odpowiadająca sekwencja kwasów nukleinowych może być otrzymana za pomocą technik biologii molekularnej (synteza chemiczna, klonowanie, modyfikacja enzymatyczna, etc.) i wprowadzona do odpowiedniego wektora zgodnie z metodologią opisaną w przykładach.
Następnym przedmiotem wynalazku jest kompozycja farmaceutyczna, zawierająca co najmniej jedną sekwencję kwasów nukleinowych lub wektor, takie jak zdefiniowano poprzednio.
180 760
Sekwencje według wynalazku mogą być zastosowane jako takie, na przykład przez wstrzyknięcie człowiekowi lub zwierzęciu w celu indukowania ekspresji wewnątrzkomórkowej WBW w zamiarze wpływania na ustaloną funkcję komórkową W szczególności sekwencje )e mogą być wstrzykiwane w formie DNA za pomocą techniki opisanej w publikacji zgłoszenia międzynarodowego WO 90/11092. Mogą być one także podawane w postaci skompleksowanej, na przykład z podłożem DEAE-dekstran (Pagano i współpr., J. Virol. 1 (1967) 891), z białkami jądrowymi (Kaneda i współpr., Science 243 (1989) 375), z lipidami (Feigner i współpr., PNAS 84 (1987) 7413), w postaci lipozomów (Fraley i współpr., J. Biol. Chem. 255 (1980) 10431), ect.
W korzystnym sposobie realizacji wynalazku sekwencje nukleinowe takie jak zdefiniowano poprzednio są wprowadzone do wektora. Zastosowanie takich wektorów pozwala na uprzywilejowanie wnikania do komórek, zwiększenie oporności na enzymy i zwiększenie stabilności oraz poziomów ekspresji wewnątrzkomórkowej,. Wektory takie mogą być wektorami plazmidowymi lub wirusowymi. Korzystnie są to wektory wirusowe.
W korzystnym sposobie realizacji wynalazek dotyczy zatem sekwencji kwasów nukleinowych takich jak zdefiniowane poprzednio, wprowadzonych do wektora wirusowego, Wynalazek dotyczy także każdego wirusa rekombinacyjnego, zawierającego wprowadzoną do jego genomu co najmniej jedną sekwencję kwasów nukleinowych kodującąWHW.
Jak wskazano powyżej, jako wektory do transferu i ekspresji in vivo genów obejmujące sekwencje według wynalazku mogą być zastosowane różne wirusy. Przykładowo można wymienić retrowirusy (RSV, HMS, MMS, etc.), wirusy HSV, wirusy adenopodobne, adenowirusy, wirus ospy, etc.
Wirus rekombinacyjny według wynalazku jest wirusem zdefektowanym. Określenie „wirus zdefektowany” oznacza wirus niezdolny do replikacji w komórce celowej. Generalnie genom wirusów zdefektowanych stosowanych w zakresie wynalazku jest zatem pozbawiony co najmniej sekwencji niezbędnych do replikacji wspomnianego wirusa w zainfekowanej komórce. Regiony te mogą być bądź eliminowane (w całości lub części), uczynione niefunkcjonalnymi, bądź zastąpione przez inne sekwencji, a zwłaszcza przez sekwencje kwasów nukleinowych według wynalazku. Korzystnie zdefektowany wirus ma zachowane co najmniej sekwencje swojego genomu, niezbędne do opłaszczania cząstek wirusowych.
Zdefektowane wirusy rekombinacyjne pochodzące od retrowirusów, wirusów adenopodobnych, wirusa HSV (wirus opryszczki zwykłej) lub adenowirusów sąjuż opisane w literaturze [Roemer i Friedman, Eur. J. Biochem. 208 (1992) 211; Dobson i współpr., Neuron 5 (1990); Chiocca i współpr., New Biol. 2 (1990) 739; Miyanohara i współpr., New Biol. 4 (1992) 238; WO 91/18088; Akli i współpr., Nature Genetics 3 (1993) 224; StratfordPerricaudet i współpr., Human Gene Therapy 1 (1990) 241; EP 185573, Levrero i współpr., Gene 101 (1991) 195; EP 243204)].
Szczególnie korzystne jest zastosowanie sekwencji nukleinowych według wynalazku w formie włączonej do zdefektowanego adenowirusa rekombinacyjnego.
Istnieją różne serotypy adenowirusów, które różnią się nieco strukturą i właściwościami, ale nie są patogenne dla człowieka, a zwłaszcza dla osób o nieobniżonej odporności immunologicznej. Z drugiej strony wirusy te nie integrują się z genomem komórek, które infekcją i mogą mieć włączone ważne fragmenty DNA zewnątrzpochodnego. Wśród różnych serotypów korzystne jest stosowanie adenowirusów typu 2 lub 5 (Ad 2 lub Ad 5). W przypadku adenowirusa Ad 5 sekwencjami niezbędnymi do replikacji są regiony E1A i E1B.
Z drugiej strony mała wielkość genów kodujących przeciwciała wewnątrzkomórkowe według wynalazku pozwala na jednoczesne włączenie do tego samego wektora kilku genów kodujących przeciwciała wewnątrzkomórkowe, skierowanych przeciwko różnym regionom jednego lub kilku celowych składników komórkowych,. Korzystny sposób realizacji wynalazku stanowi zatem wektor, zwłaszcza wirusowy, zawierający co najmniej dwie sekwencje kwasów nukleinowych, kodujących wewnątrzkomórkowe białka wiążące skierowane przeciwko różnym epitopom.
Zdefektowane wirusy rekombinacyjne według wynalazku mogą być otrzymane przez homologiczną rekombinację między zdefektowanym wirusem a plazmidem przenoszącym między innymi sekwencję kwasów nukleinowych taką jak zdefiniowana poprzednio (Levrero
180 760 i współpr., Gene 101 (1991) 195; Graham, EMBO J. 3 (12) (1984) 2917). Homologiczna rekombinacja ma miejsce w następstwie ko-transfekcji wspomnianych wirusów i plazmidu w odpowiedniej linii komórkowej. Zastosowana linia komórkowa powinna korzystnie (i) być transformowalna przez wspomniane elementy, i (ii) przenosić sekwencje zdolne do uzupełniania części genomu zdefektowanego wirusa, korzystnie w formie zintegrowanej w celu uniknięcia ryzyka rekombinacji. Przykładowo jako linię odpowiednią do otrzymywania zdefektowanych adenowiiusóąw rekombinacyjnych można wymienić linię nerki zarodka ludzkiego 293 (Graham i współpr., J. Gen. Virol. 36 (1977) 59), która zawiera zwłaszcza, zintegrowaną w swoim genomie, część lewą genomu adenowirusa Ad5 (12%). Jako linię mającą zastosowanie do otrzymywania zdefektowanych retuowiussów rekombinacyjnych można wymienić przykładowo linię CRIP (Danos i Mulligan, PNAS 85 (1988) 6460).
Następnie zmultiplikowane wirusy wyodrębnia się i oczyszcza za pomocą klasycznych technik biologii molekularnej.
Wynalazek dotyczy ponadto także kompozycji farmaceutycznej do terapii genowej, zawierającej co najmniej jeden zdefektowany wirus rekombinacyjny taki jak zdefiniowano poprzednio.
Kompozycja farmaceutyczna według wynalazku może mieć formę odpowiednią do podawania miejscowego, drogą doustną, pozajelitową, donosową, dożylną, domięśniową, podskórną, dooczną, etc.
Korzystnie, kompozycja farmaceutyczna według wynalazku zawiera dopuszczalne farmaceutycznie nośniki do preparatu iniekcyjnego. Mogą to być w szczególności jałowe, izotoniczne roztwory soli (fosforan jednosodowy, fosforan disodowy, chlorek sodu, chlorek potasu, wapnia lub magnezu, etc., albo mieszaniny takich soli), albo środki suche, zwłaszcza liofilizowane, które po dodaniu, zależnie od przypadku, jałowej wody lub surowicy fizjologicznej, pozwalają na rozpuszczenie substancji przeznaczonych do iniekcji.
Dawki podawanych kwasów nukleinowych (sekwencja lub wektor) mogą być dobrane zależnie od różnych parametrów, a zwłaszcza zależnie od zastosowanego sposobu podawania, rodzaju schorzenia, wyrażanego genu lub czasu trwania leczenia,. Generalnie zdefektowane wirusy rekombinacyjne według wynalazku są formułowane i podawane w formie dawek zawartych między 104 a 1014 pfu/ml, a korzystnie 106 do 1010 pfu/ml. Określenie pfu („plaque forming unit”) odpowiada mocy zakaźnej roztworu wirusa i jest oznaczane przez zakażenie odpowiedniej hodowli komórkowej i pomiar, zwykle po 48 godzinach, liczby łysinek zainfekowanych komórek. Techniki oznaczania miana pfu roztworu wirusa są dobrze udokumentowane w literaturze.
Powyżej zdefiniowana sekwencja kwasów nukleinowych może być zawarta w każdej komórce rekombinacyjnej.
Sekwencja według wynalazku, ewentualnie włączona do wektora, oraz zawierające je środki farmaceutyczne, mogą być zastosowane do leczenia różnych patologii, Mogą one więc być zastosowane do transferu i ekspresji genów in vivo we wszystkich rodzajach tkanek. Obróbka taka może być dobrana zależnie od leczonej patologii (transfer do poziomu danej tkanki może być zwłaszcza wywołany poprzez dobór wektora, a ekspresja przez dobór szczególnego promotora). Sekwencje lub wektory według wynalazku korzystnie stosuje się do wytwarzania u człowieka lub zwierzęcia, in vivo i wewnątrz komórki, białek zdolnych do oddziaływania w specyficzny sposób na różne funkcje komórkowe, takie jak proliferacja komórek, synteza metabolitów, synteza białek, replikacja i/lub transkrypcja dNa, etc. Wynalazek pozwala także na leczenie w sposób specyficzny, miejscowy i efektywny, wielu zaburzeń funkcjonowania komórek, będących przyczyną lub rezultatem różnych patologii, a w szczególności raka, chorób wirusowych i bakteryjnych, lub generalnie, wszelkich patologii, w których może być zidentyfikowany mediator komórkowy.
Zastosowanie do leczenia patologii związanych z proliferacją komórkową.
W szczególnie korzystnym sposobie realizacji sekwencja kwasu nukleinowego według wynalazku zawiera geny kodujące WBW, zdolne do oddziaływania i interferowania z aktywnością czynników zaangażowanych w proliferację komórkową. W proliferacji komórkowej odgrywa rolę wiele czynników, takich jak receptory membranowe (białka G), onkogeny, enzymy
180 760 (kroazy białkowe, famezylotransferazy, fosfolipazy, etc.), nukleozydy (ATP, AMP, GDP, GTP, etc.), czynniki aktyWacyjne (czynniki wymiany guanozyn (GFR, GAP, etc.), czynniki transkrypcyjne, etc. Wewnątrzkomórkowa ekspresja WBW zdolnych do wiązania i zobojętniania takich czynników pozwala na regulowanie procesu proliferacji komórkowej. Jest to szczególnie interesujące w sytuacjach, w których proliferacja komórkowa wymyka się naturalnym mechanizmom regulacji, co prowadzi na przykład do powstawania guzów. Z tymi zjawiskami deregulacji proliferacji komórkowej związane są liczne czynniki (produkty genów onkogennych i czynników zaangażowanych w sygnalizowanie skutku tych produktów). Także 90% raków gruczołowych trzustki posiada w dwunastym kodonie zmutowany onkogen Ki-ras (Almoguera i współpr., Celi 53 (1988) 549). Podobnie wykazano obecność zmutowanego genu ras w rakach gruczołowych okrężnicy i rakach tarczycy (50%) oraz w rakach płuc i białaczkach szpikowych (30%, Boss, J. L. Cancer Res. 49 (1989) 4682). Zidentyfikowano obecnie wiele innych onkogenów (myc, fos, jun, ras, myb, erb, etc.), których zmutowane formy wydają się odpowiedzialne za deregulację proliferacji komórkowej.
Ekspresja białek WBW, zdolnych do wiązania się z tymi czynnikami komórkowymi (korzystnie z ich formą onkogenną) i przez to spowalniania lub hamowania ich skutków oferuje możliwość nowego podejścia do terapii raka.
W szczególności korzystnym wariancie realizacji wynalazek niniejszy dotyczy wektorów, zawierających sekwencję kwasu nukleinowego, zawierającą gen kodujący przeciwciało zdolne do oddziaływania z produktem ekspresji onkogenu lub z czynnikiem zaangażowanym w drogę sygnalizowania onkogenu.
Spośród onkogenów celowych można wymienić onkogeny ras, fos, jun, myc, myb, etc.
Spośród czynników zaangażowanych w drogę sygnalizowania onkogenu można wymienić zwłaszcza receptory membranowe, które mogą być celem na poziomie swoich domen wewnątrzkomórkowych (białka G, kinazy (przykład: kinaza tyrozynowa), fosforylazy, famezylotransferazy), czynniki wymiany nukleozydowej (czynniki GAP, GRF, etc.), etc.
Wynalazek dotyczy w szczególności wektorów, zwłaszcza pochodzenia wirusowego, zawierających sekwencję kwasu nukleinowego, kodującą przeciwciało wewnątrzkomórkowe, skierowane przeciwko onkogenowi lub czynnikowi zaangażowanemu w drogę sygnalizowania onkogenu, składające się z peptydu odpowiadającego miejscu wiązania regionu zmiennego łańcucha lekkiego przeciwciała, powiązanego łącznikiem peptydowym z peptydem odpowiadającym miejscu wiązania regionu zmiennego łańcucha ciężkiego przeciwciała.
W szczególności wynalazek dotyczy defektowanych wirusów rekombinacyjnych, wyrażających przeciwciało wewnątrzkomórkowe skierowane przeciwko czynnikowi zależnej od ras drogi sygnalizowania.
Jak pokazano w przykładach, ekspresja przeciwciał 15 wewnątrzkomórkowych antyp21 (produkt ekspresji genu ras), anty-GAP lub anty-p53 pozwala na odwrócenie fenotypu transformującego komórkę nowotworową.
Zastosowanie w leczeniu chorób wirusowych
Sekwencja nukleinowa według wynalazku może być jeszcze sekwencją kodującą przeciwciała wewnątrzkomórkowe, zdolne do oddziaływania na cykl zakaźny wirusa patogennego (HIV, wirus brodawczaka, etc.).
W szczególności w przypadku wirusa HTV środki przeciwwirusowe będące aktualnie w dyspozycji lub w protokołach zaawansowanych badań klinicznych nie umożliwiają blokowania multiplikacji wirusa, ale jedynie spowolnienie postępu choroby. Jednym z głównych powodów tego jest to, że pojawiają się szczepy oporne na te środki przeciwwirusowe. Przy opracowaniu skutecznej szczepionki pojawiają się liczne przeszkody: zmienność genetyczna HIV nie pozwala na zdefiniowanie stabilnej struktury antygenowej jako podstawy humoralnej lub komórkowej odpowiedzi immunologicznej przeciwko różnym istniejącym szczepom. Tak jak w przypadku środków przeciwwirusowych, kiedy S wirus nabiera oporności na drodze selekcji poprzez krzyżowe mutacje punktowe, w przypadku testowanych obecnie szczepień wirus zdaje się uciekać układowi immunologicznemu.
Wynalazek niniejszy pozwala na nowe podejście do leczenia infekcji HIV, polegające na blokowaniu wirusa w czasie jego cyklu replikacji przez ekspresję WBW, a zwłaszcza
180 760 przeciwciał wewnątrzkomórkowych. Wynalazek niniejszy pozwala w szczególności na uwolnienie się od problemu zmienności genetycznej wirusa, w przeciwieństwie do podejść polegających na stosowaniu szczepionek i środków antywirusowych. W przypadku klasycznego szczepienia widoczne odpowiedzi immunologiczne mają zasadniczo miejsce w stosunku do regionów zmiennych. W przeciwieństwie do tego zastosowanie przeciwciał wewnątrzkomórkowych pozwala na wybranie nie tylko epitopu zachowywanego, ale również niezbędnego do funkcji białka wirusowego. Przeciwciało wewnątrzkomórkowe może być skierowane przeciwko epitopowi o wielkości wystarczającej do powstrzymania nabywania przez wirusa oporności i przystosowywania się przez krzyżowe mutacje punktowe. Z drugiej strony mała wielkość genu kodującego przeciwciało wewnątrzkomórkowe pozwala w sposób korzystny na celowanie do różnych regionów (jednego lub większej ilości białek) wychodząc z jednego wektora terapii genowej.
Dwa podstawowe wirusowe białka regulacyjne, tat i rev, są celami o podstawowej ważności dla stosowania wynalazku. Te dwa białka są niezbędne dla replikacji wirusowej. Ponadto ekspresja RNA informacyjnych anty-sensu lub rybozymów skierowanych na tat lub rev RNA informacyjnego wstrzymuje replikację wirusową. Mechanizm działania tych białek jest stosunkowo dobrze udokumentowany; tat jest czynnikiem transaktywacji transkrypcji, podczas gdy rev zapewnia przejście między fazami wczesną i późną cyklu replikacji. Te dwa białka wywierają swoje działanie łącząc się z wirusowymi informacyjnymi RNA, a region białkowy niezbędny do tego połączenia, konieczny dla ich funkcjonowania, jest stosunkowo dobrze oznaczony. Ponadto wykazano, że nadekspresja miejsca ich złączenia z RNA (region TAR dla tat i RRE dla rev) hamuje ich funkcje w ekspresji wirusowej.
W tych warunkach realizacja wynalazku polega na tym, że stosuje się sekwencję DNA kodującą przeciwciało wewnątrzkomórkowe skierowane przeciwko białkom tat lub rev i zdolne do zobojętniania ich aktywności. Korzystnie takie przeciwciała są skierowane przeciwko regionowi tat lub rev, odpowiedzialnemu za ich wiązanie z RNA.
Przeciwciała wewnątrzkomórkowe skierowane przeciwko tym epitopom mogą być otrzymane według metodologii opisanej w przykładach. W szczególności, odnośnie przeciwciał anty-tat, mogą być one otrzymane przez modyfikację genetyczną z przeciwciała monoklonalnego T-B (12) (Hybridolab).
Innym białkiem celowym ważnym w replikacji HIV, którego funkcja może być łatwo hamowana przez przeciwciało wewnątrzkomórkowe jest białko nukleokapsydu NCP7. Białko to odgrywa istotną rolę w retrotranskrypcji (faza wczesna), w integracji i w fazie później, ale co najmniej równie ważnej: opłaszczania. Ta wielofimkcyjność może być objaśniona przez fakt, że ma ono rolę strukturalną enzymatycznie aktywną Opisane ono zostało jako hybrydaza, która umożliwia kompleksowanie wirusowych kwasów nukleinowych: RNA/DNA i DNA/DNA podczas retrotranskrypcji oraz RNA/RNA i RNA/lys-3tRNA na poziomie opłaszczania. NCP7 wydaje się być niezbędny do wytwarzania wirusów zakaźnych.
Ekspresja cytoplazmatyczna przez terapię genową, przeciwciał wewnątrzkomórkowych skierowanych przeciwko NCP7, hamujących jego funkcję w dimeryzacji wirusowego RNA i opłaszczaniu stanowi inny szczególnie korzystny wariant realizacji wynalazku.
Przeciwciała wewnątrzkomórkowe skierowane przeciwko epitopom zobojętniającym tego białka mogą być otrzymane według metodologii opisanej w przykładach.
Cel terapii genowej, przy zastosowaniu kompozycji farmaceutycznej według wynalazku, mogą stanowić również inne składniki wirusów, a zwłaszcza: miejsce wiązania cząsteczki CD4 (przykład: glikoproteina otoczki (gpl20/gp41), region multimeryzacji otoczki, miejsce rozszczepienia gpl20/gp41, proteaza, integraza, a ogólnie wszystkie białka wirusowe. Domeny te ogólnie nie są dostępne kiedy otoczka jest w swojej formie natywnej. Z tego powodu są one bardzo mało immunogenne i szczepienie przy ich użyciu jest niemożliwe. Niniejszy wynalazek pozwala na dokładne ukierunkowanie składnika aktywnego kompozycji według wynalazku na składniki wirusowe i posiada także doskonałe możliwości terapeutyczne. Między innymi, tak jak wskazano powyżej, mała wielkość genów kodujących przeciwciało wewnątrzkomórkowe pozwala korzystnie na jednoczesną ekspresję, w tym samym wektorze, kilku przeciwciał wewnątrzkomórkowych skierowanych przeciwko różnym regionom jednego lub kilku celów.
180 760
Sekwencjami nukleinowymi według wynalazku mogą być również sekwencje kodujące WBW, zdolne do oddziaływania i interferowania z aktywnością czynników zaangażowanych w syntezę metabolitów, w syntezę białkową lub w replikację i/lub transkrypcję DNA.
Niniejszy wynalazek zostanie bardziej dokładnie opisany za pomocą poniższych przykładów.
Objaśnienie figur
Figura 1: (A) Mapa restrykcyjna ScFv-ras. (B) Mapa restrykcyjna ScFv-Gap. (C) Wpływ zobojętniający ekspresji tymczasowej przeciwciała wewnątrzkomórkowego według wynalazku na moc transformującą onkogenu ras lub Her2. Py = komórki kontrolne; ScFv = komórki transfekowane tylko plazmidem psv2 · ScFv · ras, VAL = komórki transfekowane wektorem wyrażającym ras onkogeniczny Ha-ras Val 12; VAL + ScFv = komórki ko-transfekowane plazmidem psv2 · ScFv · ras i Ha-ras VA112; HER2 = komórki transfekowane wektorem wyrażającym onkogeniczny Her2; HER2 + ScFv = komórki ko-transfekowane plamidem psv2 · ScFv · ras i Her2.
Ogólne techniki biologii molekularnej
Klasyczne metody stosowane w biologii molekularnej, takie jak preparatywne ekstrakcje plazmidowego DNA, wirowanie DNA plazmidowego w gradiencie chlorku cezu, elektroforeza na żelu agarozowym lub akryloamidowym, oczyszczanie fragmentów DNA przez elektroelucję, ekstrakcja białek fenolem lub mieszaniną fenol-chloroform, wytrącanie DNA ze środowiska solanki etanolem lub izopropanolem, transformacja w Escherichia coli, etc., są dobrze znane specjalistom i są dokładnie opisane w literaturze [Maniatis T. i współpr., „Molecular Cloning, A Laboratory Manual”, Cold Spring Harbor Laboratory, Cold Spring Harbor, N.Y., 1982; Ausubel F.M. i współpr. (wyd.), „Current Protocols in Molecular Biology”, John Wiley and Sons, New York, 1987].
Plazmidy typu pBR322, pUC i fagi serii M13 są pochodzenia handlowego (Bethesda Research Laboratories).
W celu ligowania fragmenty DNA mogą być rozdzielone według wielkości za pomocą elektroforezy na żelach agarozowych lub akryloamidowych, ekstrahowane fenolem lub mieszaniną fenol/chloroform, strącane etanolem, po czym inkubowane w obecności ligazy DNA faga T4 (Biolabs) zgodnie z zaleceniami dostawcy.
Wypełnianie wystających końców 5' może być przeprowadzone za pomocą fragmentu Klenowa polimerazy DNA I E. coli (Biolabs) zgodnie z opisem dostawcy. Obcinanie wystających końców 3' przeprowadza się w obecności polimerazy DNA faga T4 (Biolabs), zgodnie z zaleceniami dostawcy. Obcinanie wystających końców 5' przeprowadza się przez łagodne działanie nukleazą S1.
Mutegeneza ukierunkowana in vitro przy użyciu obgodeoksynukleotydów syntetycznych może być przeprowadzona zgodnie z metodą opracowaną przez Taylora i współpr. [Nucleic Acids Res. 13 (1985) 8749-8764] przy użyciu zestawu sprzedawanego przez Amersham.
Enzymatyczna amplifikacja fragmentów DNA za pomocą techniki zwanej PCR [katalizowana polimerazą reakcja łańcuchowa, R.K. Saiki i współpr., Science 230 (1985) 1350-1354; K.B. Mullis i F.A. Faloona, Meth. Enzym. 155 (1987) 335-350] może być przeprowadzona przy użyciu urządzenia „DNA thermal cycler” (Perkin Elmer Cetus) zgodnie z zaleceniami producenta.
Weryfikacja sekwencji nukleotydowych może być przeprowadzona metodą opracowaną przez Sangera i współpr. [Proc. Natl. Acad. Sei. USA, 74 (1977) 5463-5467] przy użyciu zestawu sprzedawanego przez Amersham.
Przykład 1. Klonowanie i ekspresja sekwencji DNA kodującej przeciwciało wewnątrzkomórkowe anty-ras
Przykład ten opisuje klonowanie i ekspresję sekwencji kwasów nukleinowych kodującej wewnątrzkomórkowe białko wiążące, odtwarzające właściwości przeciwciała monoklonalnego Y13-259. Przeciwciało Y13-259 jest skierowane przeciwko białkom ras (nr ref. ATCC CRL 1742) (J. Virol. 43, 294-304, 1982) i jest przeciwciałem działającym zobojętniająco na funkcje onkogennych białek Ras po wstrzyknięciu do komórek [Smith i współpr., (1986) Nature, 320, 540-543; Kung i współpr., Exp. Cell Res. (1986) 162, 363-371].
180 760
1.1 Otrzymywanie sekwencji DNA
Sekwencję DNA kodującą przeciwciało wewnątrzkomórkowe (fragment ScFv) otrzymano zgodnie z techniką opisaną. w opisie patentowym US 4946778. Sekwencja ta została następnie umieszczona pod kontrolą promotora funkcjonalnego w komórkach ssaczych.
Poli A RNA izolowano z hybrydowej hodowli komórkowej wydzielającej przeciwciało Y13-259 zgodnie z techniką opisaną przez S.H. Chirguina i współpr. [Biochemistry 18, 5294 (1979)]. Te RNA wykorzystano do reakcji odwrotnej transkrypcji za pomocą starterów utworzonych z losowych heksanukleotydów. Otrzymane RNA służyły jako matryca dla dwóch reakcji PCR:
- jednej przeznaczonej do amplifikacji fragmentu zmiennego łańcucha ciężkiego (VH) Y13-259 ze specyficznymi starterami mysich VH,
- drugiej pozwalającej na otrzymanie fragmentu VL przy użyciu mieszaniny 10 starterów otrzymanych z sekwencji mysich.
Otrzymano także fragmenty o długości 340 pz i 325 pz i połączono je następnie za pomocą łącznika, który pozwala na prawidłowe umiejscowienie cDNA VH w stosunku do końca 5' cDNA VL. Łącznik ten koduje 15 aminokwasów, tworzących trzy powtórzenia motywu (Gly), Ser [R. Orlandi i współpr., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 86, 3833-3837 (1979)]. Sekwencja przeciwciała wewnątrzkomórkowego jest przedstawiona w sekwencji Nr id 1 (reszty 28 do 270). Sekwencja ta nadaje fuzji VH-VL wystarczający stopień swobody do umożliwienia ich połączenia w orientacji równoległej i zapewnienia prawidłowego powinowactwa do antygenu.
Połączona sekwencja kwasów nukleinowych VH-łącznik-VL jest następnie włączana do fagemidu, który umożliwia ekspresję przeciwciała wewnątrzkomórkowego (fragment ScFv) na powierzchni faga M13 (figura 1A). Ekspresja ta umożliwia łatwą identyfikację i selekcję przeciwciał wewnątrzkomórkowych, które rozpoznają prawidłowo antygen.
1.2 Badanie funkcjonalne zmodyfikowanego przeciwciała wewnątrzkomórkowego
Sekwencja DNA, która koduje zmodyfikowane przeciwciało wewnątrzkomórkowe (VH-łącznik-VL) jest izolowana z fagemidu przez restrykcję, następnie wprowadzana do wektora sv2 pod kontrolą pary wzmacniacz-promotor wczesny z SV40 (Schweighoffer i współpr., Science, 256, 825-827, 1992) w celu zbadania jego zdolności do antagonizowania efektów onkogennego Ras. Otrzymany plazmid oznaczono psv2 · ScFv · ras. Ocenę funkcjonalną przeprowadzono za pomocą kilku testów:
a) Przejściowa transfekcja komórek ssaczych
W celu oceny przez przejściową transfekcję komórek ssaczych plazmid psv2 · ScFv · ras ko-transfekowano w komórkach NIH 3T3 zgodnie z protokołem opisanym przez Schweighoffera i współpr. [Science, 256, 825-827 (1992)] za pomocą wektora, który umożliwia ekspresję genu Ha-ras Val 12. Stan aktywacji badanej drogi sygnałowej rejestrowano przez pomiar aktywności enzymatycznej, otrzymanej przy użyciu genu reporterowego „acetylotransferazy chloramfenikolowej (CAT)” umieszczonego pod kontrolą promotora zawierającego jednakowo kotransfekowane elementy promotorowe odpowiadające „trans” na działanie również kotransfekowanego Ras (RRE): te elementy RRE są utworzone przez promotor hybryda TK-wzmacniacz poziomu (Wasylyk i współpr., EMBO J., 7,2475,1988).
Otrzymane rezultaty przedstawiono na figurze 1C. Analiza uzyskanych aktywności CAT wskazuje na zdolność zmodyfikowanego przeciwciała wewnątrzkomórkowego, otrzymanego z przeciwciała Y13-259, do antagonizowania aktywności onkogennego Ras.
Plazmid psv2 · ScFv · ras, ko-tranfekowany plazmidem pozwalającym na ekspresję onkogenu posiadającego aktywność kinazy tyrozynowej, onkogenu HER2 (ludzki czynnik wzrostowy naskórka typu II), blokuje również jego aktywność w tekście na plazmidzie „CAT” (figura 1).
b) Tworzenie ognisk transformowanych komórek: Komórki rakowe posiadają właściwość tworzenia ognisk transformacji, a szczególnie fibroblasty NIH 3T3 wyrażające onkogenny Ras (Barlat i współpr., Oncogene (1993), B, 215-218).
Komórki NIH 3T3 hodowano tak jak w poprzednim teście w pożywce Dulbecc zmodyfikowanej przez Eagle’a (DMEM), zawierającej 10% cielęcej surowicy płodowej, w 37°C w otoczeniu wilgotnym zawierającym 5% CO2. Komórki te następnie ko-transfekowano onkogennym Ras: Ha-ras Va1 12, plazmid psv2 · ScFv · ras (patrz a) powyżej) oraz 10-krotnym
180 760 nadmiarem genu oporności na neomycynę, za pomocą techniki transfekcji do lipidów kationowych (Schweighoffer i współpr., Science, 256, 825-827, 1992). Na każdej płytce transfekowano taką samą łączną ilość DNA.
godziny po transfekcji transfekowane komórki powstające w każdej płytce Petriego o wielkości 100 mm podzielono w stosunku 1 do 10 i hodowano w tej samej pożywce, ale w obecności G418 (GIBCO/BRL) w ilości 0,4 mg na ml pożywki. Liczbę otrzymanych ognisk transformacji na pg transfekowanego DNA obliczano po 14 dniach hodowli.
Otrzymane rezultaty przedstawiono w poniższej tabeli. Są one średnia z czterech niezależnych prób.
Tabela
Transformacja komórek NIH 3T3 przez Ha-ras Val 12 w obecności przeciwciała wewnątrzkomórkowego anty-ras
| Transfekowane plazmidy | Liczba ognisk na pg transfekowanego DNA |
| Ha-ras Val 12 | 110 |
| psv2 · ScFv · ras | 2 |
| Ha-ras Val 12 + psv2 · ScFv · ras | 30 |
Otrzymane rezultaty wskazują wyraźnie, że przeciwciało wewnątrzkomórkowe anty-ras zmniejsza bardzo silnie moc transfomrującąonkogennego genu ras.
Z drugiej strony biorąc pod uwagę rezultaty otrzymane w a), ekspresja tego fragmentu ScFv przeciwciała Y13-159 powinna również nie dopuścić do transformacji przez inne onkogeny, takie jak HER1, HER2, ułatwiające aktywację komórkowych białek Ras.
Zrozumiałe jest, że specjalista może na podstawie wyników opisanych w mniejszym zgłoszeniu odtworzyć wynalazek z sekwencjami kwasów nukleinowych, kodującymi przeciwciała wewnątrzkomórkowe (takie jak fragmenty ScFv), skierowane przeciwko innym składnikom komórkowym. Mogą być one otrzymane ze znanych przeciwciał skierowanych przeciwko składnikom komórkowym, albo przez zidentyfikowanie zobojętnianego antygenu, immunizację za pomocą tego antygenu lub jego preferowanego epitopu, a następnie wytworzenie przeciwciała wewnątrzkomórkowego wychodząc od przeciwciała, jego RNA lub otrzymanej hybrydy. Celem mogą być także inne składniki zaangażowane w procesy transformacji komórkowej. Na przykład zgodnie z tą samą metodologią mogą być otrzymane inne sekwencje DNA, kodujące wewnątrzkomórkowe przeciwciała wiążące anty-ras, wychodząc z hybryd M38, M8, M70, M90 i M30 (ATCC HB 9158), których przeciwciała są skierowane odpowiednio przeciwko resztom 1 do 23,24 do 69,90 do 106,107 do 130 i 131 do 152 białka Ha-ras. Ponadto, jak wskazano powyżej, korzystnie mogą być otrzymane wektory przenoszące jednocześnie kilka sekwencji kodujących różne przeciwciała wewnątrzkomórkowe, w celu nadania doskonałej aktywności zobojętniającej.
Przykład 2. Klonowanie i ekspresja sekwencji DNA kodującej przeciwciało wewnątrzkomórkowe anty-GAP
Przykład ten opisuje klonowanie i ekspresję sekwencji kwasów nukleinowych kodujących wewnątrzkomórkowe białko wiążące odtwarzające właściwości przeciwciała monoklonalnego skierowanego przeciwko białku GAP.
Białko GAP (białko aktywujące GTPazę) jest zaangażowane w zależną od ras drogę sygnalizowania. Oddziaływuje ono z białkami ras w sposób katalityczny i zwiększa 100 do 200krotnie szybkość hydrolizy GTP mierzoną in vitro dla normalnego białka p21. Różne prace wykazały, że domena katalityczna tego białka mająca około 1044 aminokwasów jest usytuowana w regionie karboksy-terminalnym (reszty 702-1044) i że region ten jest odpowiedzialny za interakcję białka GAP z białkami ras (patrz WO 91/02749).
Obecnie wykazano, że przeciwciało monoklonalne skierowane przeciwko domenie nazwanej „SH3” białka GAP neutralizuje funkcje onkogennych białek Ras w zarodku Xenopus (Duchesne i współpr., Science, 259, 525-528,1993).
Przy użyciu metodologii opisanej w 1.1 możliwe jest zsyntetyzowanie sekwencji DNA kodującej przeciwciało wewnątrzkomórkowe (fragment ScFv), odpowiadające temu przeciw180 760 ciału (Sekw. nr id. 2. reszty 11 do 250, figura IB). Taka sekwencja, włączona do wektora, może umożliwić hamowanie siły transformującej onkogennego genu ras w komórkach nowotworowych.
Z drugiej strony zgłaszający zidentyfikował również dokładniej epitopy rozpoznawane przez to przeciwciało. Epitopy te następnie zsyntetyzowano sztucznie i mogą być one wykorzystane do wytworzenia nowych przeciwciał zobojętniających, które mogą służyć do realizacji wynalazku.
a) Dokładniejsza identyfikacja:
Identyfikacji dokonano za pomocą techniki „skanowania epitopu”. Technika ta oparta jest na zasadzie, że dane przeciwciało może reagować z peptydami od 5 do 15 aminokwasów. Dzięki temu identyfikacja sekwencji epitopów może być przeprowadzona przez wytworzenie pełnego zestawu peptydów pokrywających, o 5-15 aminokwasach, odpowiadających pełnej sekwencji rozważanego antygenu. Technikę tę wykorzystano do oznaczenia epitopów funkcjonalnych domeny „SH3” GAP. W tym celu całość tej domeny przebadano przez sekwencje pokrywania, syntezując dekapeptyd co 2 aminokwasy.
-Synteza peptydów pokrywających peptydów pokrywających całość fragmentu z figury zsyntetyzowano chemicznie. Syntezę przeprowadzono podwójnie na 2 niezależnych nośnikach, stosując metodę Fmoc/tbutyl w fazie stałej (zestaw Cambridge Research Chemicals).
-Potwierdzenie epitopów funkcjonalnych
Epitopy funkcjonalne rozpoznawane przez przeciwciało Ac200 wykryto za pomocą testu ALISA przy użyciu króliczego przeciwciała antykoziego sprzężonego z peroksydazą. Jako substrat chromogeniczny enzymu zastosowano amino-di(3-etylobenzotiazodyno sulfonian) (ABTS).
Otrzymane rezultaty wykazują, że epitopy rozpoznawane przez to przeciwciało są następujące:
- PVEDRRRVRAI
- EISF
- EDGWVM
Epitopy te mogą być zastosowane przy użyciu klasycznych technik znanych specjalistom do wytworzenia przeciwciała zobojętniającego efekty ras. Przeciwciało to lub produkujące je hybrydy stosuje się następnie do wytworzenia sekwencji kwasów nukleinowych i wektorów według wynalazku, przy użyciu metodologii opisanej poprzednio.
Przykład 3. Otrzymywanie sekwencji kwasów nukleinowych kodującej przeciwciało wewnątrzkomórkowe anty-ras z ekstraktów RNA ze śledzion myszy immunizowanych peptydami pochodzącymi z części hiperzmiennych Ki-Ras (2A i 2B).
Przykład ten opisuje otrzymywanie sekwencji kwasów nukleinowych, kodującej przeciwciała wewnątrzkomórkowe (takie jak fragmenty ScFv) według wynalazku poprzez identyfikację zobojętnianego antygenu, immunizację za pomocą tego antygenu lub jego preferowanego epitopu, następnie wytworzenie sekwencji kwasów nukleinowych wychodząc z przeciwciała, jego RNA lub otrzymanej hybrydy.
Przykład ten wykazuje możliwość zastosowania wynalazku do dowolnego żądanego antygenu lub epitopu, nawet jeśli nie dysponuje się żadnym przeciwciałem monoklonalnym skierowanym przeciwko wspomnianemu antygenowi lub epitopowi.
Antygenem celowym w tym przykładzie jest białko Ki-ras. W szczególności antygeny zastosowane do immunizacji są peptydami o długości 24 i 25 aminokwasów, odpowiadającymi poniższym odcinkom końcowym białek Ki-Ras 2 A i 2B:
- peptyd 2A: QYRLKKISKEEKTPGCVKIKKCIIM
- peptyd 2B: KYREKNSKDGKKKKKKSKTKCIIM
Po immunizacji myszy tymi peptydami, zgodnie z klasycznymi technikami immunologii, wycięto śledziony i wytworzono DNA wychodząc z RNA. Następnie sklonowano DNA kodujące regiony zmienne, co doprowadziło do utworzenia banku fagów wyrażających ScFv odpowiadające całemu zbiorowi użytych myszy. Następnie zidentyfikowano i wyizolowano przeciwciała wewnątrzkomórkowe (fragmenty ScFv), rozpoznające peptydy 2A i 2B, stosując
180 760 kolejne etapy selekcji przez powinowactwo do kolumny i płytki do mikromiareczkowania.
Następnie te ScFv badano funkcjonalnie zgodnie z protokołem opisanym w przykładzie 1.
Strategia opracowana w tym przykładzie pozwala na selekcjonowanie w korzystny sposób przeciwciał wewnątrzkomórkowych swoistych dla onkogenów Ki-Ras, które nie wpływają na inne protoonkogenne Ras. Selektywność takich narzędzi nie jest zatem wyłącznie komórkowa (z powodu odprzężenia dróg transdukcji w komórkach transformowanych przez ras), ale również cząsteczkowa.
Przykład 4. Otrzymywanie sekwencji kwasów nukleinowych kodującej przeciwciało wewnątrzkomórkowe przeciwko zmutowanym anty-p53.
Przykład ten opisuje otrzymywanie sekwencji kwasów nukleinowych, kodującej przeciwciała wewnątrzkomórkowe (takie jak fragmenty ScFv) skierowane przeciwko zmutowanym białkom p53. Te przeciwciała wewnątrzkomórkowe otrzymuje się wychodząc z różnych przeciwciał monoklonalnych, skierowanych przeciwko wspomnianym zmutowanym białkom p53.
Gen kodujący białko p53 jest zmieniony w wielkiej liczbie komórek nowotworowych (Caron de Fromentel i Souss, Genes, 4, 1-15, 1992). Zmutowane białko p53 nie ma takiej samej konformacji jak białko p53 typu dzikiego (Lane i Benchimol, Genes Dev. 4, 1-8, 1990). Ta zmiana konformacji może być wykryta przez przeciwciała monoklonalne (Milner i Cook, Virology, 154, 21-30, 1986; Milner, Nature, 310,143-145,1984).
Przeciwciała pAB240 rozpoznają zmutowane formy białek p53.
Ekspresja wewnątrzkomórkowa fragmentu ScFv przeciwciał swoistych dla zmutowanego p53 lub białek oddziaływujących specyficznie z tymi zmutowanymi białkami p53 powinna wywierać korzystne działanie na nowotwory obecne w zmutowanym p53.
Przykład 5. Klonowanie i ekspresja sekwencji DNA kodującej przeciwciało wewnątrzkomórkowe przeciwko wirusowi brodawczaka
Przykład ten opisuje klonowanie i ekspresję sekwencji DNA kodującej przeciwciało wewnątrzkomórkowe (fragment ScFv), skierowane przeciwko białku ludzkiego wirusa brodawczaka (HPV).
Celowym białkiem wirusowym jest białko E6. Białko to jest wytwarzane przez wirusy HPV 16 i 18, które są odpowiedzialne za 90% raków szyjki macicy u kobiet i które zidentyfikowano w przedrakowych uszkodzeniach nabłonka (Riou i współpr., Lancet 335 (1990) 117). Produkt genu E6 prowadzi do tworzenia guzów, zmniejszając silnie ilość anty-onkogenu, dzikiego p53, w komórkach HPV-pozytywnych (Wrede i współpr., Mol. Carcinog. 4 (1991) 171). W innych guzach p53 jest hamowany przez różne mechanizmy: mutacja (patrz przykład 4) lub asocjacja z białkami, takimi jak MDM2.
Sekwencja białka E6 została opisana w literaturze (Hawley-Nelson i współpr., EMBO J. 8(1989) 3905; Munger i współpr., J. Virol. 63 (1989) 4417). Szczególne regiony tego białka mogą być zidentyfikowane przez „skanowanie epitopu” (patrz przykład 2), po czym wykorzystane do immunizacji myszy zgodnie z protokołem opisanym w przykładzie 3. Następnie wytwarza się sekwencję DNA kodującą przeciwciało wewnątrzkomórkowe (fragment ScFv) skierowane przeciwko białku E6 ludzkiego wirusa brodawczaka (HPV), stosując opisaną poprzednio metodologię. Funkcjonalność tej sekwencji została wykazana po ekspresji in vivo, przez pomiar:
- zwiększenia zawartości p53 dzikiego w komórkach wyrażających E6
- rewersji morfologicznej komórek transformowanych przez HPV,
- blokady wpływu E6 na transaktywację p53, i
- hamowania transformacji przez E6 keratynocytów i fibroblastów ludzkich.
Przykład 6. Otrzymywanie sekwencji kwasów nukleinowych, kodującej przeciwciało wewnątrzkomórkowe anty-HIV, wychodząc z ekstraktów RNA śledzion myszy immunizowanych peptydami otrzymanymi z regionów aktywnych białek tat, rev i NCP7.
Przykład ten opisuje otrzymywanie sekwencji kwasów nukleinowych kodującej przeciwciała wewnątrzkomórkowe według wynalazku (takie jak fragmenty ScFv) przez identyfikację zobojętnianego antygenu, immunizację za pomocą tego antygenu lub jego korzystnego
180 760 epitopu, następnie otrzymywanie sekwencji kwasów nukleinowych wychodząc z przeciwciała, jego RNA lub otrzymanych hybryd.
Przykład ten wykazuje także możliwość zastosowania mniejszego wynalazku do każdego żądanego antygenu lub epitopu, nawet jeśli w stanie techniki nie zostało opisane żadne przeciwciało monoklonalne skierowane przeciwko wspomnianemu antygenowi lub epitopowi.
Antygenami celowymi w tym przykładzie są białka tat, rev i NCP7 wirusa HIV. W szczególności antygeny zastosowane do immunizacji sąpeptydami złożonymi z 6, 9 i 16 aminokwasów, odpowiadającymi regionom tych białek, odpowiedzialnym za ich interakcję z RNA (dla tat i rev) lub dimeryzację RNA (dla NCP7):
- peptyd tat: RKKRRQRRR
- peptyd rev: RQARRNRRRWRERQR
-peptyd NCP7: RAPRKK
Po immunizacji myszy tymi peptydami przy użyciu klasycznych technik immunologicznych wycięto śledziony i wytworzono DNA, wychodząc z RNA. Następnie sklonowano DNA kodujące dla regionów zmiennych, co doprowadziło do utworzenia banku fagów wyrażających ScFv odpowiadającego całemu zbiorowi użytych myszy. Następnie zidentyfikowano i wyizolowano przeciwciała wewnątrzkomórkowe (fragmenty ScFv), rozpoznające peptydy tat, rev i NCP7, stosując kolejne etapy selekcji przez powinowactwo do kolumny i płytki do mikromiareczkowania.
Następnie ScFv zbadano funkcjonalnie na jego zdolność blokowania cyklu replikacji wirusa HTV.
180 760
SEKW. Nr ID 1
1/1 31/11 lider PelB tCA AGG AGA CAG TCT ATA AGA AAT ACC TAT TCG ACG GCA GCC GCT GGA TTG CCA CCA CTC
| ser arg | arg | gln | ser | ile | arg | asn | thr | tyo | ser thr ala | ala | ala gly | leu | leu | leu | leu |
| 61/21 | Sfi | NcoI | 91/31 Pstl | ||||||||||||
| GcG gCC | CAG | CCG | GCC | ATG | _GCC | CAG | GCG | TAT | CCG CAG CAG | CCA | GGA CCA | GGC | CCA GCG CAG | ||
| ala ala | gln | pro | ala | met | ala | gln | val | lys | leu gln gln | ser | gly gly gly leu val gln | ||||
| 121/41 | 151/51 | CD£>1 | |||||||||||||
| CCT GGA | AGG | TCC | CTG | AAA | CTC | TCC | TCT | GTA | GCC TCT GGA | TTC | ACT TTC | AGT | AAC | CAT | CCA |
| pro gly | arg | ser | leu | lys | leu | ser | cys | val | val ser gly phe | tho phe | ser | asn tyr gly | |||
| 181/61 | 211/71 | ||||||||||||||
| ATG AAC | TGG | ATT | CGC | CAG | ACT | CCA | CG^G | AAG | GGA CTG GAG | TGG | GTC GCA | TAG | ACT AGC AGC | ||
| met asn | trp | ile | arg | gin | thr | pro | gly | lys | gly leu glu tira | val ala | tyr | ile ser ser | |||
| 241/81 | 271/91 | ||||||||||||||
| GGT AGC | AGT | TAC | CTC | TAC | TAT | GCA | GAA ACG | GTG AAG (GGC | CGA | CCC ACC | ACC | TCC AGA GAC | |||
| gly ser | ser | tyr | leu | tyr | t}y | ala glu thr val lys gly arg phe thr | ser arg asp | ||||||||
| 301/101 | 331/111 | ||||||||||||||
| AAT GCC | AAG | AAC | ACC | ccg | TAC | CCG | CAA ACG ACC AGC CCG | AGG | CCC GAG | GAG | AGC GCC CCG | ||||
| asn ala | lys | asn | thr | leu tyr | leu gln met | thr ser leu | aog | ser glu | asp | tho | ala | leu | |||
| 361/121 | 391/131 | Styl | |||||||||||||
| TAT TAC | TGT | GCA | AGA | GAC | GAG | GGT | ACG | GGC | ACC GAC (CCC | ΤΆΑ | GAC 'AAC | TGG | GGC (CAA GGG | ||
| tyr tyr | cys | ala | arg | his glu gly thr gly thr asp phe phe | asp tyr | tio? | gly gln gly | ||||||||
| 421/141 | BstEII | 451/15T. | Łącznik | ||||||||||||
| ACC ACG | GTC | ACC | GTC | TCC | TCCA | GGT | GCGA AGC | GGT TCA GGC | GGA GGT GGC | TCT | (GGC | GGT | G<^<C | ||
| thr thr | val | thr | val | ser | ser | gly gly gly gly ser gly gly gly gly | ser | gyy gyy gyy | |||||||
| 481/161 | SacI | 511/171 | |||||||||||||
| GGA TCG | (ACC | GCA | GAG | CTC | ACC | CAG | T(CC | CCA | CAT TCC CTG | TCT | GCA TCT | CCG | GGA GAA ACT | ||
| gly ser | asp | val | glu | leu | thr gin | ser | pro | his ser leu | ser | ala ser | leu | gly glu thr | |||
| 541/181 | 571/191 | ||||||||||||||
| GTC TCC | ATC | GAA | TCT | CCA | G(CA AGT | GAG | GGC | ATT TCC AAT | TAT | CCA GCG | T(^G | TAT CAG CAG | |||
| val ser | ile | glu | oys | leu | a!.a | ier | glu gly ile ser asn | tyr | leu ala | trr> | tyr | gln gln | |||
| 601/201 | 631/211 | ||||||||||||||
| AAG CCA | GGG | AAA | act | ACC | CCA | ICC | CCC | ATC | GAT GCT GCA AGT | AGC TCG | CAG | GAC | GGG GTC | ||
| lys pro gly | lyy | ier | Apo | C1u | ile | ile | iiy | lyr lyr ala | ser | seo leu gln | asp | gly val | |||
| 661/221 | 691/231 | ||||||||||||||
| CCA TCA | CGG | CCC | AGT? | GGC | AGT | GCGA | TCT | GGC | ACA CAG TCCC | TCT? | GCC TAG | ATC | AGC | KAC ATG | |
| pro ser | arg | phe | ser | gly | sse | gly | ser | gly thr gln phe | ser | leu lys | iiy | s^e | isn met | ||
| 721/241 | 751/251 | ||||||||||||||
| CAA CCT | (AGA | (AAT | GAA | GGG | GTC? | GAT | AAC | GCG | CCA CCA GCC TAC ATC TAC CCC CCC ACG | Tac | |||||
| gin pro | glu | asp | glu | gly | val | tyr | tyr | cys( gln gln a].a lyr | lys tyr | pro | sse | Cłu | phe | ||
| 781/261 | 811/271 Notl | ||||||||||||||
| GGA GCT | GGC | ACC | AAG | CCG | GAA | ATA | ΛΑΑ | C(G3 | GCG GCC GCA | GTjG AAA | CTC | ACC | TCA GGA | ||
| gly ala | giy | tiar | lys | leu | glu | ile | lyS | arą | ala ala a!a | G1u gln lys | leu | ile | ser glu |
CTG JAAT leu asn
TTAA TCA GGALTTę ACT GGC OCH OCH glu phe thr gly
GAG GAT glu asp
180 760
SEKW. Nr ID 2
1/1 lider Pe1B
31/11
Pstl
| TTA TTA | CTC | GCG | GCC | CAG | CCG | GCC | ATG | GCCT | CAG | GTC | CAA CTC | CAG | GAG | TCA | TCA | CCT | AAC |
| leu leu | leu | sla | ala | gln | Aro | Ale | see | sIuI | gin av1 sin lee sin siu | sse | _lu _rr _iu | ||||||
| 61/21 | 91/31 | ||||||||||||||||
| CTA GGG | CAG! | _CC | GGA | AGC | GCT | TCC | ATA | ACC | STC | ACA GTC | TCT | GGT | CTC | TCA | TTA AGT | ||
| leu gly | gln | pro | ala | gln | ser | eii | ese | Aie | A hr | cys | thr val | ser | gly | piie | ser | leu | ser |
| 121/41 | CDR1 | 151/51 | |||||||||||||||
| AGC TAT | GGT | STA | SAC | TGG | ATT | TCC | CCA | TCT | CCA | (AAC | AAG GGT | CTG | GAG | TGG | CTG | GGA | lGCA |
| ser tyr gly val | his | trp | val | aeg | gin | s er | pro qly | lys gly | leu | glu | trp | leu | gly ( val | ||||
| 181/61 | CDR2 | 211/71 | |||||||||||||||
| ATA TGG | AGA | (GG | AGA | AGC | ACA | CAG | TAC | AAT | GCA | GCC | CTC ATG | TCC | AGA | CTG | AGC | ATC | ACC |
| ile trp | arg gly gly gly hr asp | tyr | s as | ala | ala phe met | ser | arg | leu | ser | ile | thr | ||||||
| 241/81 | 271/91 | ||||||||||||||||
| AAG GAC | TAC | _CC | AAG | AGC | AAA | ATG | TTC | TTT CTTC | TTC | AAC AGT | CTG | CAA | CCT | GAT | GAC | ACT | |
| lys asp | asn | ser | lys | ser | gln val phe phe lys | leu | asn ser | leu | gln | pro | asp | asp | thr | ||||
| 301/101 | 331/111 | CDR3 | |||||||||||||||
| GCC ATG | TAC | AAC | AGT | GCC | AAA | AGG | GGT | GGC | CCG | GGG | TAT sec | GAT | GTC | TGG | GGC | CAA | GTC |
| ala met | tyr | syr | Ala | Aur | Aag aIu g1u Pp° A1u Str (ph | ais av1 | srr _iu gin _iu | ||||||||||
| 361/121 | BstEII | 391/131 | łącznik | ||||||||||||||
| ACC ACG | GTC | ACC | ATC | TCC | ACA | CAA | GTG | GGG | GGT | TTC | GGG GGA | ^Τ | GGC | TCT | AGC | GGC | GGC |
| thr thr | val | ttir | val | see | Aer | ery giy 9iy | ser | gly gly gly gly | ser | ser | gly gly | ||||||
| 421/141 | VK-> | SacI | 451/151 | ||||||||||||||
| GGA tcg | GAC | ATT | GAG | CTC | ACC | CAG | TCT | CCA | GCC | TCC | CTA TCT | GCA TCT | GTG | CCA GAr. ACT | |||
| gly ser | asp | ile | glu | leu | thr | gln ser pro | ala | ser | leu ser | ala | ser | val | gly glu thr | ||||
| 481/161 | CDR1 | 511/171 | |||||||||||||||
| GTC ACC | ATG | ACA | S^T | CGA | GCA AAT | GAG | AAA | ATT | TACA | AGT TArr | CTA GCA. | AGG | TAT | CAG | CAG | ||
| val thr | met | Str | syr | Aag | Ala | ner | rin aas | l ie | tts: | ser asn | leu | ala | trp | tm gln gln | |||
| 541/181 | 571/191 | CDR2 | |||||||||||||||
| AAA CAG | GGA | AAG | ACT | ACT | AAG | CTC | CTC | AGT | AAT | gct | GCA ACA lTTC | CCA | (GGA aat | AGT | GTG | ||
| lys gln | gil | Aut | sse | Aro | Aln | leu | le u | v v1 | Itr | ala | ala thr | lys pro gly | asn | gly val | |||
| 601/201 | 631/211 | PstI | |||||||||||||||
| CCA TCA | AGG | TTC | AGT | GGC | AGT | GGA | TCA | GGC | ACA | CAA | TTT TCT | CTC | AAG | ATC AAC AGC | CTC | ||
| pro ser | arg | phe | ser | gly | ser | gly | ser | gly thr gln phe ser | leu lys | ile asn ser | leu | ||||||
| 661/221 | CDR3 | ||||||||||||||||
| CAG CCT | GGA | AAT | CTT | AGG | AAC | TAT | TAC | TGT | CCT | srA | ACT aat | GGG | ACT | CCG | TAT AGG | TCC | |
| gln pro | glu | ssp | Ale | iu | Asn | syt | tyr | cys | l ee | Sin phe lyr | gly thr pro | tyr arg | phe | ||||
| 721/241 | 7751251 | Not II | |||||||||||||||
| GGC GGG | GGC | ACC | AAG | CTC | GAA ACG | AAA | CGG GCG GCC GCA GAA | CAA AAA CTC ATC TCA GAA | |||||||||
| gly gly gly | thr | lys | Ueu | glu thr | lys | arg | ala | ala ala glu gln lys | leu | ile | ser | glu | |||||
| 781/261 | EcoRI |
CTG ΑΑΤ leu asn
TAA TAA GAĄ _CTC ACT GGC OCH OCH glu phe thr gly
GAG GAT glu asp
180 760
Fig. 1Α
Fig. 1B
180 760
AKTYWACJA
HER2+ScFv
Fig. 1C
Departament Wydawnictw UP RP. Nakład 70 egz.
Cena 4,00 zł.
Claims (14)
- Zastrzeżenia patentowe1. Sekwencja kwasu nukleinowego zawierająca gen kodujący polipeptyd o sekwencji zdefiniowanej jako SEQ ID nr 1 lub SEQ ID nr 2.
- 2. Sekwencja kwasu nukleinowego według zastrz. 1, znamienna tym, że zawiera sekwencję kwasu nukleinowego zdefiniowanąjako SEQ ID nr 1 lub SEQ ID nr 2.
- 3. Sekwencja kwasu nukleinowego według zastrz. 1 albo 2, znamienna tym, że sekwencja jest pod kontrolą funkcjonującego w komórkach ssaczych promotora wybranego z grupy promotorów CMV, SV40, E1a, MLP, LTR lub villiny.
- 4. Sekwencja kwasu nukleinowego według zastrz. 1 albo 2, znamienna tym, że sekwencja ta jest włączona do wektora.
- 5. Sekwencja kwasu nukleinowego według zastrz. 4, znamienna tym, że sekwencja ta jest włączona do wirusowego wektora.
- 6. Zdefektowany wirus rekombinacyjny wybrany spośród retrowirusów, adenowirusów, wirusów adenopochodnych, wirusa ospy i wirusa HSV, znamienny tym, że wirus ten zawiera w swoim genomie co najmniej jedną sekwencję kwasu nukleinowego zdefiniowaną jako SEQ ID nr 1 lub SEQ ID nr 2.
- 7. Zdefektowany wirus według zastrz. 6, znamienny tym, że zawarta w nim sekwencja jest pod kontrolą funkcjonującego w komórkach ssaczych promotora wybranego z grupy promotorów CMV, SV40, E1a, MLP, LTR lub villiny.
- 8. Zdefektowany wirus według zastrz. 7, znamienny tym, że zawarta w nim sekwencja jest włączona do wektora.
- 9. Zdefektowany wirus według zastrz. 8, znamienny tym, że zawarta w nim sekwencja jest włączona do wirusowego wektora.
- 10. Kompozycja farmaceutyczna do terapii genowej związanej z produkcją przeciwciał lub aktywnych peptydów obejmująca kwasy nukleinowe lub geny kodujące aktywne terapeutycznie czynniki oraz farmaceutycznie dopuszczalny nośnik, znamienna tym, że zawiera co najmniej jedną sekwencję kwasu nukleinowego zdefiniowanąjako SEQ ID nr 1 lub SEQ ID nr 2 będącą pod kontrolą funkcjonującego w komórkach ssaczych promotora wybranego z grupy promotorów CMV, SV40, Ela, MLP, LTR lub villiny albo co najmniej jeden zdefektowany rekombinacyjny wirus zawierający tą sekwencję, w postaci dawkowej od 104 do 1014 pfu/ml oraz dopuszczalne farmaceutycznie nośniki.
- 11. Kompozycja farmaceutyczna według zastrz. 10, znamienna tym, że zawiera sekwencję kwasu nukleinowego włączoną do wektora.
- 12. Kompozycja farmaceutyczna według zastrz. 11, znamienna tym, że zawiera sekwencję kwasu nukleinowego włączoną do wirusowego wektora.
- 13. Kompozycja farmaceutyczna według zastrz. 10 albo 11, albo 12, znamienna tym, że zdefektowany wirus wybrany jest z grupy adenowirusów, retrowirusów i adenopodobnych wirusów.
- 14. Kompozycja farmaceutyczna według zastrz. 10 albo 11, albo 12, znamienna tym, że zawiera sekwencję kwasu nukleinowego w postaci dawkowej od 106 do 1010 pfu/ml.
Applications Claiming Priority (2)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| FR9307241A FR2706486B1 (fr) | 1993-06-16 | 1993-06-16 | Séquences nucléiques, vecteurs les contenant, compositions pharmaceutiques et utilisations thérapeutiques. |
| PCT/FR1994/000714 WO1994029446A2 (fr) | 1993-06-16 | 1994-06-15 | Proteines intracellulaires de liaison (pil) et leurs utilisations |
Publications (2)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| PL312213A1 PL312213A1 (en) | 1996-04-01 |
| PL180760B1 true PL180760B1 (pl) | 2001-04-30 |
Family
ID=9448183
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| PL94312213A PL180760B1 (pl) | 1993-06-16 | 1994-06-15 | Sekwencje kwasu nukleinowego, zdefektowany wirus rekombinacyjny i kompozycja farmaceutyczna |
Country Status (24)
| Country | Link |
|---|---|
| US (1) | US6159947A (pl) |
| EP (1) | EP0703980B1 (pl) |
| JP (1) | JP4384260B2 (pl) |
| KR (1) | KR100342233B1 (pl) |
| CN (1) | CN1076052C (pl) |
| AT (1) | ATE231916T1 (pl) |
| AU (1) | AU7076394A (pl) |
| BR (1) | BR9407512A (pl) |
| CA (1) | CA2165458C (pl) |
| CZ (1) | CZ289039B6 (pl) |
| DE (1) | DE69432075T2 (pl) |
| DK (1) | DK0703980T3 (pl) |
| ES (1) | ES2191031T3 (pl) |
| FI (1) | FI120311B (pl) |
| FR (1) | FR2706486B1 (pl) |
| HU (1) | HU219138B (pl) |
| NO (1) | NO319466B1 (pl) |
| NZ (1) | NZ268038A (pl) |
| PL (1) | PL180760B1 (pl) |
| RU (1) | RU2218400C2 (pl) |
| SK (1) | SK285169B6 (pl) |
| UA (1) | UA46709C2 (pl) |
| WO (1) | WO1994029446A2 (pl) |
| ZA (1) | ZA944303B (pl) |
Families Citing this family (23)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| US6790633B1 (en) * | 1990-04-18 | 2004-09-14 | Michael S. Brown | Method of inhibiting a farnesyl transferase enzyme |
| US8003342B1 (en) | 1990-04-18 | 2011-08-23 | Board Of Regents, The University Of Texas System | Method for identifying farnesyl transferase inhibitors |
| FR2724320B1 (fr) * | 1994-09-13 | 1996-12-20 | Transgene Sa | Nouvel implant pour le traitement des maladies acquises |
| US5518042A (en) * | 1994-09-16 | 1996-05-21 | Huyck Licensco, Inc. | Papermaker's forming fabric with additional cross machine direction locator and fiber supporting yarns |
| FR2738151B1 (fr) * | 1995-09-04 | 1997-09-26 | Rhone Poulenc Rorer Sa | Antagonistes de l'activite oncogenique de la proteine mdm2, et leur utilisation dans le traitement des cancers |
| US7008776B1 (en) * | 1996-12-06 | 2006-03-07 | Aventis Pharmaceuticals Inc. | Compositions and methods for effecting the levels of high density lipoprotein (HDL) cholesterol and apolipoprotein AI very low density lipoprotein (VLDL) cholesterol and low density lipoprotein (LDL) cholesterol |
| US6395530B1 (en) | 1996-12-06 | 2002-05-28 | Aventis Pharmaceuticals Inc. | LLG polypeptides of the triacylglycerol lipase family, and compositions and methods for their use in enzymatic hydrolysis, and protein and gene therapies |
| FR2758569B1 (fr) * | 1997-01-20 | 1999-04-02 | Centre Nat Rech Scient | Materiel biologique pour le traitement d'un mammifere par transfert de gene d'anticorps et composition pharmaceutique le concernant |
| WO2000050089A2 (en) * | 1999-02-26 | 2000-08-31 | Mindset Biopharmaceuticals (Usa) Ltd. | Regulation of the stability of recombinant proteins and antiboodies |
| FR2794771B1 (fr) | 1999-06-11 | 2001-08-10 | Aventis Pharma Sa | Adenovirus recombinants codant pour le transporteur specifique de l'iode (nis) |
| GB0018307D0 (en) | 2000-07-26 | 2000-09-13 | Aventis Pharm Prod Inc | Polypeptides |
| PT1290023E (pt) | 2000-03-31 | 2011-01-05 | Aventis Pharma Inc | Factor indutor do factor nuclear kb |
| US20030104402A1 (en) * | 2001-01-23 | 2003-06-05 | University Of Rochester | Methods of producing or identifying intrabodies in eukaryotic cells |
| RU2317330C2 (ru) * | 2006-01-16 | 2008-02-20 | Федеральное государственное учреждение науки "Государственный научный центр вирусологии и биотехнологии "Вектор" Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека" | РЕКОМБИНАНТНАЯ ПЛАЗМИДНАЯ ДНК pcL37, КОДИРУЮЩАЯ ПОЛИПЕПТИД СО СВОЙСТВАМИ ЛЕГКОЙ ЦЕПИ АНТИТЕЛА ЧЕЛОВЕКА ПРОТИВ ВИРУСА ОСПОВАКЦИНЫ, РЕКОМБИНАНТНАЯ ПЛАЗМИДНАЯ ДНК pcH37, КОДИРУЮЩАЯ ПОЛИПЕПТИД СО СВОЙСТВАМИ ТЯЖЕЛОЙ ЦЕПИ УКАЗАННОГО АНТИТЕЛА, И ИХ ПРИМЕНЕНИЕ |
| WO2012162628A2 (en) | 2011-05-25 | 2012-11-29 | The United States Of America, As Represented By The Secretary, Department Of Health And Human Services | Lipopeptide inhibitors of ras oncoproteins |
| KR101602876B1 (ko) * | 2014-07-22 | 2016-03-11 | 아주대학교산학협력단 | 완전한 이뮤노글로불린 형태의 세포질 침투능을 갖는 항체를 이용하여 세포내 활성화된 ras를 억제하는 방법 및 그의 이용 |
| KR101602870B1 (ko) | 2014-07-22 | 2016-03-21 | 아주대학교산학협력단 | 완전한 이뮤노글로불린 형태의 항체를 세포막을 투과하여 세포질에 위치시키는 방법 및 그의 이용 |
| US20180072815A1 (en) | 2014-10-23 | 2018-03-15 | Singh Biotechnology, Llc | Single Domain Antibodies Directed Against Intracellular Antigens |
| US20160115247A1 (en) * | 2014-10-23 | 2016-04-28 | Singh Biotechnology, Llc | Single domain antibodies directed against intracellular antigens |
| TWI746473B (zh) | 2015-11-02 | 2021-11-21 | 美商辛分子醫藥有限公司 | 針對細胞內抗原之單域抗體 |
| MX2018014554A (es) | 2016-05-27 | 2019-09-09 | Orum Therapeutics Inc | Anticuerpo penetrante de citosol y uso del mismo. |
| US10787487B2 (en) | 2018-06-21 | 2020-09-29 | Orum Therapeutics Inc. | Cell/tissue-specific cell-penetrating antibodies |
| CN110981943B (zh) * | 2019-12-02 | 2021-08-03 | 清华大学 | 多肽及其在制备药物中的用途和药物 |
Family Cites Families (7)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| US4946778A (en) * | 1987-09-21 | 1990-08-07 | Genex Corporation | Single polypeptide chain binding molecules |
| DE3915952A1 (de) * | 1989-05-12 | 1990-12-06 | Peter Werner | Wirkstoff/medikament/biotechnologisches verfahren zur behandlung von erkrankungen, die mit exo- oder endogenen intrazellulaeren proteinen (onkogene etc.) assoziert sind |
| EP0556197A4 (en) * | 1990-09-25 | 1994-05-18 | Univ Connecticut | Prolonging expression of polynucleotides introduced into a cell |
| CA2072249C (en) * | 1991-06-28 | 2003-06-17 | Saiko Hosokawa | Human monoclonal antibody specifically binding to surface antigen of cancer cell membrane |
| WO1993007286A1 (en) * | 1991-09-30 | 1993-04-15 | The United States Of America, Represented By The Secretary, Department Of Health And Human Services | Recombinant immunotoxins |
| EP0618970A1 (en) * | 1991-12-10 | 1994-10-12 | Dana Farber Cancer Institute | Reactive neutralizing human anti-gp120 recombinant antibody, dna coding the same and use thereof |
| AU687010B2 (en) * | 1992-07-17 | 1998-02-19 | Dana-Farber Cancer Institute | Method of intracellular binding of target molecules |
-
1993
- 1993-06-16 FR FR9307241A patent/FR2706486B1/fr not_active Expired - Lifetime
-
1994
- 1994-06-15 BR BR9407512A patent/BR9407512A/pt not_active Application Discontinuation
- 1994-06-15 PL PL94312213A patent/PL180760B1/pl not_active IP Right Cessation
- 1994-06-15 HU HU9503615A patent/HU219138B/hu not_active IP Right Cessation
- 1994-06-15 AT AT94919711T patent/ATE231916T1/de active
- 1994-06-15 RU RU96100240/13A patent/RU2218400C2/ru not_active IP Right Cessation
- 1994-06-15 KR KR1019950705716A patent/KR100342233B1/ko not_active Expired - Fee Related
- 1994-06-15 AU AU70763/94A patent/AU7076394A/en not_active Abandoned
- 1994-06-15 DK DK94919711T patent/DK0703980T3/da active
- 1994-06-15 DE DE69432075T patent/DE69432075T2/de not_active Expired - Lifetime
- 1994-06-15 CA CA2165458A patent/CA2165458C/fr not_active Expired - Fee Related
- 1994-06-15 CZ CZ19953295A patent/CZ289039B6/cs not_active IP Right Cessation
- 1994-06-15 ES ES94919711T patent/ES2191031T3/es not_active Expired - Lifetime
- 1994-06-15 JP JP50143495A patent/JP4384260B2/ja not_active Expired - Lifetime
- 1994-06-15 NZ NZ268038A patent/NZ268038A/en not_active IP Right Cessation
- 1994-06-15 US US08/564,164 patent/US6159947A/en not_active Expired - Lifetime
- 1994-06-15 CN CN94192443A patent/CN1076052C/zh not_active Expired - Fee Related
- 1994-06-15 WO PCT/FR1994/000714 patent/WO1994029446A2/fr not_active Ceased
- 1994-06-15 UA UA95125274A patent/UA46709C2/uk unknown
- 1994-06-15 EP EP94919711A patent/EP0703980B1/fr not_active Expired - Lifetime
- 1994-06-15 SK SK1568-95A patent/SK285169B6/sk not_active IP Right Cessation
- 1994-06-16 ZA ZA944303A patent/ZA944303B/xx unknown
-
1995
- 1995-12-11 NO NO19955011A patent/NO319466B1/no not_active IP Right Cessation
- 1995-12-15 FI FI956057A patent/FI120311B/fi not_active IP Right Cessation
Also Published As
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| PL180760B1 (pl) | Sekwencje kwasu nukleinowego, zdefektowany wirus rekombinacyjny i kompozycja farmaceutyczna | |
| KR101944263B1 (ko) | 에이치비브이 감염 및 관련 질병의 치료를 위한 폴리펩타이드 및 항체 | |
| US20040063140A1 (en) | Methods for diagnosis of cancer using erbB-3 | |
| EP1021464B1 (en) | Cellular receptor for hiv-1 vpr essential for g2/m phase transition of the cell cycle | |
| KR100304333B1 (ko) | 재조합의사람화된항-사람면역결핍바이러스항체 | |
| HUT51296A (en) | Process for producing hn env-coded peptide for producing antibodies for inhibiting human hiv virus in mammalian | |
| Boyle et al. | Antibodies to the evolutionarily conserved amino-terminal region of the v-myb-encoded protein detect the c-myb protein in widely divergent metazoan species. | |
| Giovane et al. | Targetting of the N‐terminal domain of the human papillomavirus type 16 E6 oncoprotein with monomeric scFvs blocks the E6‐mediated degradation of cellular p53 | |
| CN118255888A (zh) | 一种Anti-CXCR4膜蛋白抗体及其制备方法和应用 | |
| WO1997021809A1 (en) | Dna sequence encoding the tumor suppressor ing1 | |
| US6949337B2 (en) | Cellular receptor for HIV-1 Vpr essential for G2/M phase transition of the cell cycle | |
| JPH022352A (ja) | 抗hiv抗体可変領域をコードする遺伝子断片およびこれらを用いて発現された抗hivキメラ抗体ならびにその製法 | |
| US6469155B1 (en) | HIgR and related domain which binds glycoprotein D of herpes simplex virus | |
| AU682304B2 (en) | Analogous peptides of the internal image of a viral protein | |
| JPH02211881A (ja) | HIVに対する中和抗体を誘発するかまたはかかる抗体によって認識され得る免疫原配列を含むHBsAg抗原の形態学的特徴を有する組換えハイブリッドHBsAg粒子、かかる粒子をコードするヌクレオチド配列及び核粒子を含むワクチン | |
| Heintges et al. | Characterization and Binding of Intracellular Antibody Fragments to the Hepatitis C Virus Core Protein1, 2 | |
| Montero et al. | Broadly reactive antibodies against a gp120 V3 loop multi-epitope polypeptide neutralize different isolates of human immunodeficiency virus type 1 (HIV-1) | |
| AU722702B2 (en) | Intracellular binding proteins and use thereof | |
| JP3832847B2 (ja) | 標的分子の細胞内結合方法 | |
| ITMI950676A1 (it) | Vaccini polinucleotidici |
Legal Events
| Date | Code | Title | Description |
|---|---|---|---|
| LAPS | Decisions on the lapse of the protection rights |
Effective date: 20130615 |