PL182052B1 - Sposób oczyszczania i wyodrebniania 2’-deoksy-2’, 2’-difluoronukleozydów PL PL PL PL PL PL PL - Google Patents

Sposób oczyszczania i wyodrebniania 2’-deoksy-2’, 2’-difluoronukleozydów PL PL PL PL PL PL PL

Info

Publication number
PL182052B1
PL182052B1 PL95320634A PL32063495A PL182052B1 PL 182052 B1 PL182052 B1 PL 182052B1 PL 95320634 A PL95320634 A PL 95320634A PL 32063495 A PL32063495 A PL 32063495A PL 182052 B1 PL182052 B1 PL 182052B1
Authority
PL
Poland
Prior art keywords
mixture
formula
acid
nucleoside
reaction mixture
Prior art date
Application number
PL95320634A
Other languages
English (en)
Other versions
PL320634A1 (en
Inventor
Ta-Sen Chou
Laurie M Poteet
Douglas P Kjell
Original Assignee
Lilly Co Eli
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Family has litigation
First worldwide family litigation filed litigation Critical https://patents.darts-ip.com/?family=23335711&utm_source=google_patent&utm_medium=platform_link&utm_campaign=public_patent_search&patent=PL182052(B1) "Global patent litigation dataset” by Darts-ip is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License.
Application filed by Lilly Co Eli filed Critical Lilly Co Eli
Publication of PL320634A1 publication Critical patent/PL320634A1/xx
Publication of PL182052B1 publication Critical patent/PL182052B1/pl

Links

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07HSUGARS; DERIVATIVES THEREOF; NUCLEOSIDES; NUCLEOTIDES; NUCLEIC ACIDS
    • C07H19/00Compounds containing a hetero ring sharing one ring hetero atom with a saccharide radical; Nucleosides; Mononucleotides; Anhydro-derivatives thereof
    • C07H19/02Compounds containing a hetero ring sharing one ring hetero atom with a saccharide radical; Nucleosides; Mononucleotides; Anhydro-derivatives thereof sharing nitrogen
    • C07H19/04Heterocyclic radicals containing only nitrogen atoms as ring hetero atom
    • C07H19/06Pyrimidine radicals
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07HSUGARS; DERIVATIVES THEREOF; NUCLEOSIDES; NUCLEOTIDES; NUCLEIC ACIDS
    • C07H19/00Compounds containing a hetero ring sharing one ring hetero atom with a saccharide radical; Nucleosides; Mononucleotides; Anhydro-derivatives thereof
    • C07H19/02Compounds containing a hetero ring sharing one ring hetero atom with a saccharide radical; Nucleosides; Mononucleotides; Anhydro-derivatives thereof sharing nitrogen
    • C07H19/04Heterocyclic radicals containing only nitrogen atoms as ring hetero atom
    • YGENERAL TAGGING OF NEW TECHNOLOGICAL DEVELOPMENTS; GENERAL TAGGING OF CROSS-SECTIONAL TECHNOLOGIES SPANNING OVER SEVERAL SECTIONS OF THE IPC; TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC CROSS-REFERENCE ART COLLECTIONS [XRACs] AND DIGESTS
    • Y02TECHNOLOGIES OR APPLICATIONS FOR MITIGATION OR ADAPTATION AGAINST CLIMATE CHANGE
    • Y02PCLIMATE CHANGE MITIGATION TECHNOLOGIES IN THE PRODUCTION OR PROCESSING OF GOODS
    • Y02P20/00Technologies relating to chemical industry
    • Y02P20/50Improvements relating to the production of bulk chemicals
    • Y02P20/55Design of synthesis routes, e.g. reducing the use of auxiliary or protecting groups

Landscapes

  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Saccharide Compounds (AREA)
  • Cephalosporin Compounds (AREA)

Abstract

1. Sposób oczyszczania i wyodrebniania 2'-deoksy-2',2'-difluoronukleozydów wzbogaconych w anomer ß, znamienny tym, ze: a) sporzadza sie mieszanine zawierajaca R" i wzbogacony w anomer ß nukleozyd o wzorze w którym kazdy X jest niezaleznie wybrany sposród grup zabezpieczajacych hydroksyl, a R' oznacza ugrupowanie. PL PL PL PL PL PL PL

Description

Przedmiotem wynalazku jest sposób oczyszczania i wyodrębniania 2'-deoksy-2',2'-difluoronukleozydów wzbogaconych w anomer β.
Stałe zainteresowanie syntezą 2'-deoksynukleozydów i ich analogów znajduje odbicie w ich udanym zastosowaniu jako środków terapeutycznych w chorobach wirusowych i nowotworowych. Krytycznym etapem syntezy 2'-deoksynukleozydów jest oczyszczanie i wyodrębnianie żądanego nukleozydu w postaci anomeru β. Jest on krytyczny ponieważ procesy syntezy 2'-deoksynukleozydów są zazwyczaj niestereoselektywne i powstaje w nich mieszanina nukleozydów a i β.
W publikacjach Vorbruggen i inni, J. Org. Chem., 41, 2084 (1976), M. Hofer, Chem. Ber, 93, 2777 (1960), Walker i inni, Nucleic Acid Research, 12, 6827 (1984), R. P. Hodge i inni, J. Org. Chem., 56, 1553 (1991), Tann i inni, J. Org. Chem., 50, 3644 (1985), Howell i inni, J. Org. Chem., 53, 85 (1988) i US 4965374, Chou i inni, doniesiono o różnych syntezach mieszanin anomerów a i β deoksynukleozydów.
Pomimo udoskonalenia procesów syntezy nukleozydów nadal istnieje zapotrzebowanie na proces umożliwiający skuteczne oczyszczenie i wyodrębnienie 2'-deoksy-2',2'-difluoronukleozydów wzbogaconych w anomer β ze zwiększoną wydajnością, przy czym chodzi tu o difluoronukleozydy wytwarzane bez udziału katalizatora.
Obecnie opracowano sposób zapewniający skuteczne oczyszczenie i wyodrębnienie 2'-deoksy-2',2'-difluoronukleozydów wzbogaconych w anomer β.
Tak więc zgodny z wynalazkiem sposób oczyszczania i wyodrębniania nukleozydu wzbogaconego w anomer β, polega na tym, że:
a) sporządza się mieszaninę zawieraj ącąR i wzbogacony w anomer β nukleozyd o wzorze
\ 7
Hj---Ή
XO F (IB)
182 052 w którym każdy X jest niezależnie wybrany spośród grup zabezpieczających hydroksyl, a R' oznacza nukleozasadę o wzorze
w którym W oznacza grupę zabezpieczającą grupę aminową, a R oznacza nukleozasadę o wzorze
NHW’
w którym W1 oznacza grupę zabezpieczającą grupę aminową lub atom wodoru, w wysokowrzącym rozpuszczalniku;
b) rozcieńcza się mieszaninę rozpuszczalnikiem organicznym wybranym z grupy obejmującej etery, estry i nitryle,
c) rozcieńczoną mieszaninę reakcyjną dodaje się do wodnego roztworu kwasu i
d) tak otrzymaną mieszaninę kwasową pozostawia się w temperaturze 70 - 100°C do wytrącenia się produktu o wzorze IB, w którym W oznacza teraz W.
Korzystnie, mieszaninę reakcyjną rozcieńcza się acetonitrylem, octanem etylu lub tetrahydrofuranem, a zwłaszcza acetonitrylem.
Korzystnie, jako wodny roztwór kwasu stosuje się kwas solny o stężeniu IN - 6N.
Korzystnie, mieszaninę kwasową miesza się w trakcie wytrącania się produktu.
Oczyszczony produkt o wzorze IB ewentualnie odbezpiecza się z wytworzeniem nukleozydu stanowiącego 1 -(2'-deoksy-2',2'-difluoro-D-rybofuranozylo-4-aminopirymidyn-2-on.
W całym opisie wszystkie wartości temperatury podano w stopniach Celsjusza, wszystkie proporcje, udziały procentowe itp. podano wagowo, a składy wszystkich mieszanin wyrażono objętościowo, o ile nie wskazano inaczej. Składy mieszanin anomerycznych wyrażono jako stosunek wagowo/wagowy lub poprzez udziały procentowe. Stosowane tu określenie „alkil” występujące pojedynczo lub w połączeniach odnosi się do alifatycznych grup węglowodorowych o łańcuchach prostoliniowych, cyklicznych lub rozgałęzionych, które korzystnie zawierają do 7 atomów węgla, takich jak metyl, etyl, n-propyl, izopropyl, n-butyl, t-butyl, n-pentyl, n-heksyl, 3-metylopentyl itp., względnie podstawionych alifatycznych grup węglowodorowych o łańcuchach prostoliniowych, cyklicznych lub rozgałęzionych, takich jak chloroetyl, 1,2-dichloroetyl itp. Określenie „podstawiony” występujące samodzielnie lub w połączeniach odnosi się do podstawienia jedną lub większą liczbą grup wybranych z grupy obejmującej grupę cyjanową, atom chlorowca, karboalkoksyl, toluil, grupę nitrową,
182 052 alkoksyl, alkil i grupę dialkiloaminową. Określenie „wzbogacony w anomer” występujące pojedynczo lub w połączeniach odnosi się do mieszaniny anomerycznej, w której stosunek określonego anomeru jest większy niż 1:1, i obejmuje czysty anomer.
Grupy X zabezpieczające hydroksyl to znane grupy zabezpieczające, opisane w rozdziale 3 „Protective Grups in Organie Chemistry”, McOmie Ed., Plenum Press, Nowy Jork (1973) i rozdziale 2 „Protective Grups in Organie Chemistry”, Green, John, J. Wiley and Sons, Nowy Jork (1981). Korzystnymi grupami zabezpieczającymi hydroksyl są grupy tworzące ugrupowania estrów, takie jak formyl, acetyl, podstawiony acetyl, propionyl, butynyl, piwaloil, 2-chloroacetyl, benzoil, podstawiony benzoil, fenoksykarbonyl i metoksyacetyl, ugrupowania będące pochodnymi węglanowymi, takie jak fenoksykarbonyl, etoksykarbonyl, t-butoksykarbonyl, winyloksykarbonyl, 2,2,2-trichloroetoksykarbonyl i benzyloksykarbonyl, grupy tworzące ugrupowania eterów alkilowych, takich jak benzyl, difenylometyl, trifenylometyl, t-butyl, metoksymetyl, tetrahydropiranyl, allil, tetrahydrotienyl i 2-metoksyetoksymetyl, oraz ugrupowania karbaminianów, takich jak N-fenylokarbaminiany i N-imidazoilokarbaminiany; przy czym korzystne są zwłaszcza benzoil, monopodstawiony benzoil i dipodstawiony benzoil, acetyl, piwaloil i ugrupowania eterów trifenylometylowych, a najkorzystniejszy jest benzoil.
Grupy W zabezpieczające grupę aminową są wybrane spośród grup tworzących ugrupowania sililoamin, takich jak trialkilosilil, w tym trimetylosilil, izopropylodialkilosilil, alkilodiizopropylosilil, triizopropylosilil, 1,1,3,3-tetraizopropylodisiloksanyl, t-butylodialkilosilil i t-butylodiarylosilil, ugrupowania karbaminianów, takie jak t-butoksykarbonyl, benzyloksykarbonyl, 4-metoksybenzyloksykarbonyl i 4-nitrobenzyloksykarbonyl, formyl, acetyl, benzoil, grupa piwalamidowa, oraz grup tworzących ugrupowania eterów, takich jak metoksymetyl, t-butyl, benzyl, allil i tetrahydropiranyl, przy czym korzystną grupą zabezpieczającą grupę aminowąjest trimetylosilil.
Pierwszy etap sposobu według wynalazku to sporządzenie mieszaniny zawierającej R i wzbogacony w anomer β nukleozyd o wzorze
XO F (IB) w którym każdy X jest niezależnie wybrany spośród grup zabezpieczających hydroksyl, a R' oznacza ugrupowanie nukleozasady o wzorze
182 052 w którym W oznacza grupę zabezpieczającą grupę aminową, a R oznacza ugrupowanie nukleozasady o wzorze
NHW'
w którym W oznacza grupę zabezpieczającą grupę aminową lub atom wodoru, w wysokowrzącym rozpuszczalniku.
Taką mieszaninę można sporządzić na wiele różnych sposobów. Sposoby syntezy takich mieszanin opisano i zastrzeżono w europejskim zgłoszeniu patentowym nr 93304817.5. Zastosowawszy niektóre ze sposobów (bez użycia katalizatora, z użyciem nadmiaru nukleozasady R, str. 9, EP 93304817.5, i z użyciem wysokowrzącego rozpuszczalnika, str. 10, wiersz 13-17) opisane w europejskim zgłoszeniu patentowym nr 93304817.5, można otrzymać wzbogacony anomerem β nukleozyd o stosunku anomerów a do β od większego niż 1:1 do mniejszego lub równego 1:9. Dla otrzymania takich większych stosunków potrzebny jest nadmiar R. Nadmiar R oddziela się od pożądanego produktu sposobem według wynalazku.
Wysokowrzący rozpuszczalnik ma temperaturę wrzenia powyżej 70°C. Ten wysokowrzący rozpuszczalnik jest umiarkowanie polarny, trwały w środowisku kwasowym i nienukleofilowy. Typowymi wysokowrzącymi rozpuszczalnikami są aromatyczne chlorowcoalkile, alkoksyi chlorowco-podstawione rozpuszczalniki organiczne oraz ich mieszaniny. Korzystnymi wysokowrzącymi rozpuszczalnikami są 1,2-dichloroetan, 1,2,2-trichloroetan, 1,2-dimetoksyetan, eter bis(2-metoksyetylowy), toluen, ksyleny, metylobenzen, dichlorobromoetan, chlorobenzen, dibromochlorometan, tribromometan, dibromometan, acetonitryl, propionitryl, dioksan i ich mieszaniny, przy czym szczególnie korzystny jest metoksybenzen.
Gdy mieszanina zawierająca R i opisany wzbogacony w anomer β nukleozyd jest gotowa, proces realizowany sposobem według wynalazku przebiega następująco. Najpierw mieszaninę reakcyjną rozcieńcza się rozpuszczalnikiem organicznym o temperaturze wrzenia powyżej 60°C. Dopuszczalnymi rozpuszczalnikami są etery, estry i nitryle, a ich korzystnymi przykładami są acetonitryl, octan etylu i tetrahydrofuran. Rozcieńczanie prowadzi się w podwyższonej temperaturze, którą może być temperatura reakcji. Rozpuszczalnik organiczny należy także ogrzać do podwyższonej temperatury, przy czym temperatura zarówno mieszaniny reakcyjnej, jak i rozpuszczalnika powinna wynosić 70 - 110°C. Najkorzystniejszym rozpuszczalnikiem jest acetonitryl.
Ilość dodanego rozpuszczalnika organicznego wynosi 1 - 5 ml na 1 g użytej R (zabezpieczonej lub nie zabezpieczonej cytozyny). Nie ma żadnego wymaganego okresu utrzymywania mieszaniny po rozcieńczeniu mieszaniny reakcyjnej, toteż rozcieńczonej mieszaniny można użyć niezwłocznie w następnym etapie. Rozcieńczoną mieszaninę reakcyjną dodaje się do dużej ilości wodnego roztworu kwasu w podwyższonej temperaturze. Zadaniem wodnego roztworu kwasu jest rozpuszczenie nadmiaru R' (zabezpieczonej lub nie zabezpieczonej cytozyny), której użyto w reakcji glikozylowania opisanej na str. 9 EP 93304817.5. Tak więc ilość i kwasowość wodnego roztworu kwasu zależy od samej nadmiarowej ilości R (zabezpieczonej lub nie zabezpieczonej cytozyny) użytej w reakcji. Ponadto ilość wodnego roztworu kwasu zależy także od doboru substancji kwasowej użytej do przygotowania tego wodnego roztworu kwasu.
182 052
Najkorzystniejszy jest kwas solny użyty w stężeniu IN - 6N, najkorzystniej 4N. Gdy użyje się kwasu o takim stężeniu, a nadmiarowa ilość R (zabezpieczonej lub nie zabezpieczonej cytozyny) jest od pięcio- do dwudziestokrotna, ilość wodnego roztworu kwasu solnego wynosi 3 - 5 ml na 1 g użytej R’ (zabezpieczonej lub nie zabezpieczonej cytozyny).
W różnych okolicznościach można jednak stosować i mogą być korzystne inne roztwory wodne kwasów mineralnych i inne warunki. Przykładowo prowadzący proces może zastosować taki kwas mineralny jak kwas siarkowy, kwas siarkawy, kwas fosforowy, kwas azotowy lub kwas fosfonowy. Stężenie kwasu może zmieniać się w szerokim zakresie, w przybliżeniu odwrotnie proporcjonalne do całkowitej objętości dopuszczalnej w całym etapie wyodrębniania. Ogólnie stężenie roztworu kwasu może wynosić od IN do 10%. Optymalizację doboru danej objętości wodnego roztworu kwasu trzeba zbadać doświadczalnie dla każdego kwasu i jego ilości w mieszaninie reakcyjnej. Konieczne doświadczenia są bardzo proste i wymagają od prowadzącego jedynie kolejnego dobierania stężenia kwasu i ilości dla danej mieszaniny reakcyjnej i obserwowania rozpuszczalności R (zabezpieczonej lub nie zabezpieczonej cytozyny) w każdym przypadku.
Wodny roztwór kwasu nie musi być gorący, gdy łączy się go z mieszaniną reakcyjną. Wodny roztwór kwasu może mieć temperaturę otoczenia, o ile całą mieszaninę ogrzeje się do temperatury 70 - 100°C. Ciało reakcji może być wystarczające dla ogrzania mieszaniny do tej temperatury, względnie konieczne może się okazać ogrzewanie z zewnątrz. W pewnych przypadkach ciepło reakcji może spowodować wzrost temperatury do ponad 100°C i mieszaninę reakcyjną trzeba chłodzić tak, by utrzymać jej temperaturę poniżej 100°C. Należy tak postąpić ponieważ ważne jest, aby temperatura wodnego roztworu kwasu nie była na tyle podwyższona, by przedwczesnemu odszczepieniu uległa w tym etapie procesu którakolwiek z grup zabezpieczających. Gdy jako rozpuszczalnika organicznego używa się acetonitrylu, najkorzystniejsza temperatura wynosi 70 - 80°C.
Kwasową mieszaninę powstałą w wyniku dodania rozcieńczonej mieszaniny reakcyjnej do wodnego roztworu kwasu pozostawia się, korzystnie przy umiarkowanym mieszaniu, na pewien okres czasu. Zmiany fizyczne zachodzące w tym okresie odstawienia to rozpuszczanie się nadmiaru R (zabezpieczonej lub nie zabezpieczonej cytozyny) w warstwie wodnego roztworu kwasu i wytrącanie się pożądanego β-nukleozydu. Wytrącenie się jest selektywne, a niepożądany α-nukleozyd pozostaje w dużej części rozpuszczony w warstwie organicznej. Tak więc mieszanina kwasowa musi być utrzymywana w stałej temperaturze dopóki te dwie zmiany fizyczne nie zajdą. Na ogół wystarcza okres czasu od 10 minut do 1 godziny.
Po wystarczającym okresie odstawienia wytrącony β-nukleozyd oddziela się od dwu ciekłych warstw przez odsączenie lub odwirowanie i przemywa dodatkową ilością wodnego roztworu kwasu. Sączenie lub wirowanie powinno się prowadzić w temperaturze w przybliżeniu stałej aby zapobiec wytrącaniu się z roztworu rozpuszczonej R’ (zabezpieczonej lub nie zabezpieczonej cytozyny).
Tak wyodrębniony i oczyszczony β-nukleozyd może ciągle zawierać grupę zabezpieczającą grupę aminową (W), względnie grupa zabezpieczająca grupę aminową może ulec odszczepieniu z zastąpieniem jej atomem wodoru. β-Nukleozyd wyodrębniony i oczyszczony w powyższy sposób ma wyższą czystość pod względem zawartości α-nukleozydu, R (zabezpieczonej lub nie zabezpieczonej cytozyny) i innych zanieczyszczeń, a ponadto stwierdzono, że żądany produkt powstaje z większą wydajnością.
Po przesączeniu mieszaniny kwasowej dla oddzielenia stałego produktu, warstwy organiczną i wodną rozdziela się. Nadmiar R (zabezpieczonej lub nie zabezpieczonej cytozyny) znajduje się w warstwie wodnej i może być z niej usunięty i zawrócony do procesu. R (zabezpieczoną lub nie zabezpieczoną cytozynę) można odzyskać po prostu przez ochłodzenie warstwy wodnej i odsączenie wytrąconej R (zabezpieczonej lub nie zabezpieczonej cytozyny) lub przez zalkalizowanie warstwy wodnej, ochłodzenie zasadowego roztworu i przesączenie go w celu zebrania wytrąconej R (zabezpieczonej lub nie zabezpieczonej cytozyny). Odzyskaną cytozynę z powyższego procesu zazwyczaj zawraca się do procesu wytwarzania mieszaniny
182 052 opisanego w EP nr 93304817.5. Tak więc zastrzegany sposób umożliwia ekonomiczne zagospodarowanie zawracanej do obiegu R’ (zabezpieczonej lub nie zabezpieczonej cytozyny), co jest zaletą tego sposobu.
Ostatnią fazą procesu jest usunięcie grup zabezpieczających X i wszelkich pozostałych grup W w oczyszczonym, stałym nukleozydzie o wzorze IB. Po usunięciu grup zabezpieczających otrzymuje się taki sam stosunek anomerów w nie zabezpieczonym nukleozydzie.
Większość sililowych grup zabezpieczających grupę aminową ulega odszczepieniu pod działaniem rozpuszczalnika protonowego, takiego jak woda lub alkohol. Większość sililowych grup zabezpieczających grupę aminową ulega odszczepieniu w zetknięciu z kwasem mineralnym. Acylowe grupy zabezpieczające, takie jak benzoil, i acylowe grupy zabezpieczające grupę aminową usuwa się drogą hydrolizy z użyciem mocnej zasady w temperaturze 0 - 100°C. Mocne lub umiarkowanie mocne zasady odpowiednie w tej reakcji to zasady o pKa 8,5 - 20,0 (w temperaturze 25°C). Do takich zasad należą wodorotlenki metali alkalicznych, takie jak wodorotlenek sodowy lub potasowy, alkoholany metali alkalicznych, takie jak metanolan sodowy lub t-butanolan potasowy, amidki metali alkalicznych, aminy, takie jak dietyloaminą hydroksyloamina, amoniak itp., a także inne powszechnie stosowane zasady, takie jak hydrazyna itp. Co najmniej i równoważnik zasady jest potrzebny dla każdej grupy zabezpieczającej.
Acylowe grupy zabezpieczające można także usunąć z użyciem katalizatorów kwasowych, takich jak kwas metanosulfonowy, kwas solny, kwas bromowodorowy, kwas siarkowy lub kwasowe żywice jonowymienne. Korzystne jest prowadzenie takiej hydrolizy w stosunkowo wysokiej temperaturze, takiej jak temperatura wrzenia mieszaniny w warunkach powrotu skroplin, jednak w przypadku użycia szczególnie mocnych kwasów reakcje można prowadzić w stosunkowo niskiej temperaturze, takiej jak temperatura otoczenia. Należy zwrócić uwagę, aby acylowych grup zabezpieczających nie odszczepić przedwcześnie we wcześniejszych etapach sposobu według wynalazku.
Usuwanie eterowych grup zabezpieczających realizuje się znanymi sposobami, np. z użyciem etanotiolu i chlorku glinu.
Dla usunięcia t-butylodimetylosililowych grup zabezpieczających wymagane są warunki kwasowe, takie jak kontakt z gazowym chlorowcowodorem.
Usuwanie grup zabezpieczających można wygodnie prowadzić w rozpuszczalniku alkoholowym, zwłaszcza w wodnych roztworach alkanów, takich jak metanol. Jednakże reakcje odszczepiania grup zabezpieczających można także prowadzić w dowolnym dogodnym rozpuszczalniku, takim jak piliole, w tym glikol etylenowy, etery, takie jak tetrahydrofuran, ketony, takie jak aceton i keton metylowoetylowy, lub dimetylosulfotlenek.
W korzystnym wariancie reakcja odszczepiania grupy zabezpieczającej polega na użyciu amoniaku do usuwania benzoilowej grupy zabezpieczającej hydroksyl w temperaturze 10°C. W tej reakcji korzystne jest jednak użycie nadmiaru zasady, przy czym użyta nadmiarowa ilość zasady nie ma decydującego znaczenia.
Powstały wzbogacony w anomer β nukleozyd o wzorze
HO F
182 052 lub jego addycyjną sól z kwasem organicznym lub nieorganicznym można wyekstrahować i/lub wydzielić z mieszaniny reakcyjnej sposobem opisanym w US 4965374.
Następujący przykład ilustruje sposób według wynalazku, przy czym nie stanowi on w jakimkolwiek stopniu jego ograniczenia i nie powinien być tak traktowany.
Przykład. Wytwarzanie, oczyszczanie i wyodrębnianie wzbogaconego w anomer β 1 -(2'-deoksy-2',2'-difluoro-3',5'-di-O-benzoilo-D-rybofiiranozylo)-4-aminopirymidyn-2-onu z użyciem 22,5 równoważnika bis-trimetylosililocytozyny
W kolbie trójszyjnej o pojemności 250 ml umieszczono 30 g cytozyny, 25 mg siarczanu amonowego i 150 ml heksametylodisilazanu, po czym powstałą mieszaninę ogrzano do 125°C i utrzymywano ją w tej temperaturze przez 30 minut po rozpuszczeniu wszystkich substancji stałych. Następnie temperaturę podwyższono do 145°C i utrzymywano ją aż do zakończenia wrzenia, a potem mieszaninę reakcyjną utrzymywano w temperaturze 120°C pod próżnią do chwili rozpoczęcia tworzenia się substancji stałej nad poziomem cieczy w kolbie. Mieszaninę ochłodzono do 105°C i dodano 25 ml metoksybenzenu.
W innej kolbie o pojemności 125 ml połączono 10 ml metoksybenzenu i 5,75 g 2-deoksy-2,2-difluoro-3,5-dibenzoilo-D-rybofuranozylu-l-a-metanosulfonianu, a otrzymaną mieszaninę ogrzewano do powstania jednorodnej cieczy. Ciecz tę dodano w stałej temperaturze do mieszaniny z cytozyną i połączoną mieszaninę utrzymywano w temperaturze 100°C przez 24 godziny.
W kolbie o pojemności 500 ml umieszczono 133 ml 4N kwasu solnego. Do mieszaniny reakcyjnej dodano 31,3 ml acetonitrylu i rozcieńczoną mieszaninę reakcyjną wlano do kwasu w trakcie stałego mieszania zawartości kolby, którą umieszczono w łaźni chłodzącej. Połączoną mieszaninę mieszano w temperaturze 70°C przez 10 minut, a następnie przesączono w stałej temperaturze. Mokry placek substancji stałej mieszano przez 10 minut w postaci zawiesiny w 25 ml 4N kwasu solnego w temperaturze 70°C, a potem poddano ponownemu sączeniu. Placek filtracyjny ponownie mieszano przez 10 minut w temperaturze 70°C w postaci zawiesiny w 25 ml wody zdejonizowanej, a po przesączeniu mokry placek ponownie mieszano w postaci zawiesiny w 50 ml zdejonizowanej wody w temperaturze 70°C. Wartość pH wodnej zawiesiny zwiększono do 7 z użyciem wodorowęglanu sodowego, po czym mieszaninę mieszano przez 10 minut w temperaturze 50°C lub wyższej i znowu przesączono. Placek filtracyjny ponownie mieszano w ciągu 10 minut w postaci zawiesiny w 50 ml zdejonizowanej wody w temperaturze 70°C przez okres 10 minut, a po przesączeniu placek filtracyjny wysuszono i poddano analizie. Ważył on 3,98 g, co odpowiadało wydajności wyodrębniania 61% procent i zawartości niepożądanego α-anomeru poniżej 1%.
Niniejszy wynalazek przedstawiono szczegółowo, łącznie z korzystnymi postaciami. Należy jednak wziąć pod uwagę, że fachowcy w tej dziedzinie po zapoznaniu się z niniejszym ujawnieniem mogą dokonać zmian i/lub ulepszeń tego wynalazku objętych jego zakresem i istotą wynikającą z następujących zastrzeżeń patentowych.
182 052
Departament Wydawnictw UP RP. Nakład 60 egz.
Cena 2,00 zł.

Claims (6)

  1. Zastrzeżenia patentowe
    1. Sposób oczyszczania i wyodrębniania 2'-deoksy-2',2'-difluoronukleozydów wzbogaconych w anomer β, znamienny tym, że:
    a) sporządza się mieszaninę zawierającą R i wzbogacony w anomer β nukleozyd o wzorze
    IB w którym każdy X jest niezależnie wybrany spośród grup zabezpieczających hydroksyl, a R' oznacza ugrupowanie nukleozasady o wzorze
    w którym W oznacza grupę zabezpieczającą grupę aminową, a R oznacza nukleozasadę o wzorze
    NHW'
    w którym W' oznacza grupę zabezpieczającą grupę aminową lub atom wodoru, w wysokowrzącym rozpuszczalniku;
    182 052
    b) rozcieńcza się mieszaninę rozpuszczalnikiem organicznym wybranym z grupy obejmującej etery, estry i nitryle,
    c) rozcieńczoną mieszaninę reakcyjną dodaje się do wodnego roztworu kwasu i,
    d) tak otrzymaną mieszaninę kwasową pozostawia się w temperaturze 70 - 100°C do wytrącenia się produktu o wzorze IB, w którym W oznacza teraz W'.
  2. 2. Sposób według zastrz. 1, znamienny tym, że mieszaninę reakcyjną rozcieńcza się acetonitrylem, octanem etylu lub tetrahydrofuranem.
  3. 3. Sposób według zastrz. 2, znamienny tym, że mieszaninę reakcyjną rozcieńcza się acetonitrylem.
  4. 4. Sposób według zastrz. 1, znamienny tym, żejako wodny roztwór kwasu stosuje się kwas solny o stężeniu IN - 6N.
  5. 5. Sposób według zastrz. 1, znamienny tym, że mieszaninę kwasową miesza się w trakcie wytrącania się produktu.
  6. 6. Sposób według zastrz. 1, znamienny tym, że oczyszczony produkt o wzorze IB odbezpiecza się z wytworzeniem nukleozydu stanowiącego l-(2'-deoksy-2',2'-difluoro-Drybofuranozylo-4-aminopirymidyn-2-on.
    * * *
PL95320634A 1994-11-17 1995-11-01 Sposób oczyszczania i wyodrebniania 2’-deoksy-2’, 2’-difluoronukleozydów PL PL PL PL PL PL PL PL182052B1 (pl)

Applications Claiming Priority (2)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US08/340,972 US5606048A (en) 1992-06-22 1994-11-17 Stereoselective glycosylation process for preparing 2'-Deoxy-2', 2'-difluoronucleosides and 2'-deoxy-2'-fluoronucleosides
PCT/US1995/014086 WO1996016072A1 (en) 1994-11-17 1995-11-01 Process for purifying and isolating 2'-deoxy-2',2'-difluoronucleosides

Publications (2)

Publication Number Publication Date
PL320634A1 PL320634A1 (en) 1997-10-13
PL182052B1 true PL182052B1 (pl) 2001-10-31

Family

ID=23335711

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
PL95320634A PL182052B1 (pl) 1994-11-17 1995-11-01 Sposób oczyszczania i wyodrebniania 2’-deoksy-2’, 2’-difluoronukleozydów PL PL PL PL PL PL PL

Country Status (34)

Country Link
US (1) US5606048A (pl)
EP (1) EP0712860B1 (pl)
JP (1) JPH10509170A (pl)
KR (1) KR100424990B1 (pl)
CN (1) CN1044119C (pl)
AR (1) AR001045A1 (pl)
AT (1) ATE210142T1 (pl)
AU (1) AU702588B2 (pl)
BG (1) BG62737B1 (pl)
BR (1) BR9509904A (pl)
CA (1) CA2205350C (pl)
CO (1) CO4600741A1 (pl)
CZ (1) CZ292013B6 (pl)
DE (1) DE69524365T2 (pl)
DK (1) DK0712860T3 (pl)
ES (1) ES2164745T3 (pl)
HU (1) HU219019B (pl)
IL (1) IL115854A (pl)
MX (1) MX9703548A (pl)
MY (1) MY115183A (pl)
NO (1) NO308305B1 (pl)
NZ (1) NZ296712A (pl)
PE (1) PE50196A1 (pl)
PL (1) PL182052B1 (pl)
PT (1) PT712860E (pl)
RO (1) RO118296B1 (pl)
RU (1) RU2161622C2 (pl)
SI (1) SI0712860T1 (pl)
SK (1) SK283160B6 (pl)
TW (1) TW377356B (pl)
UA (1) UA53614C2 (pl)
WO (1) WO1996016072A1 (pl)
YU (1) YU49446B (pl)
ZA (1) ZA959321B (pl)

Families Citing this family (45)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US6326507B1 (en) 1998-06-19 2001-12-04 Trustees Of Dartmouth College Therapeutic compounds and methods of use
MY164523A (en) * 2000-05-23 2017-12-29 Univ Degli Studi Cagliari Methods and compositions for treating hepatitis c virus
EP1736478B1 (en) * 2000-05-26 2015-07-22 IDENIX Pharmaceuticals, Inc. Methods and compositions for treating flaviviruses and pestiviruses
US7435755B2 (en) * 2000-11-28 2008-10-14 The Trustees Of Dartmouth College CDDO-compounds and combination therapies thereof
US7176237B2 (en) * 2002-01-15 2007-02-13 The Trustees Of Dartmouth College Tricyclic-bis-enone derivatives and methods of use thereof
NZ537662A (en) * 2002-06-28 2007-10-26 Idenix Cayman Ltd 2'-C-methyl-3'-O-L-valine ester ribofuranosyl cytidine for treatment of flaviviridae infections
CN1678326A (zh) * 2002-06-28 2005-10-05 埃迪尼克斯(开曼)有限公司 用于治疗黄病毒感染的2'-c-甲基-3'-o-l-缬氨酸酯核糖呋喃基胞苷
US7608600B2 (en) * 2002-06-28 2009-10-27 Idenix Pharmaceuticals, Inc. Modified 2′ and 3′-nucleoside prodrugs for treating Flaviviridae infections
WO2004041203A2 (en) * 2002-11-04 2004-05-21 Xenoport, Inc. Gemcitabine prodrugs, pharmaceutical compositions and uses thereof
LT1576138T (lt) 2002-11-15 2017-06-26 Idenix Pharmaceuticals Llc 2`-šakoti nukleozidai derinyje su interferonu ir flaviviridae mutacija
AU2003300901A1 (en) * 2002-12-12 2004-06-30 Idenix (Cayman) Limited Process for the production of 2'-branched nucleosides
CA2571675A1 (en) * 2004-06-23 2006-01-05 Idenix (Cayman) Limited 5-aza-7-deazapurine derivatives for treating infections with flaviviridae
US7214791B2 (en) * 2004-07-01 2007-05-08 Shenzhen Hande Technology Co., Ltd. Method for preparation of 2′-deoxy-2′, 2′-difluoro-β-cytidine or pharmaceutically acceptable salts thereof by using 1,6-anhydro-β-d-glucose as raw material
KR20070073958A (ko) * 2004-12-08 2007-07-10 시코르, 인크. 디플루오로뉴클레오시드 및 이의 제조 방법
BRPI0514718A (pt) * 2004-12-30 2008-07-01 Hanmi Pharm Ind Co Ltd método para a preparação de 2'-desoxi-2', 2'-diflúor-citidina
WO2006070985A1 (en) 2004-12-30 2006-07-06 Hanmi Pharm. Co., Ltd. METHOD FOR THE PREPARATION OF 2#-DEOXY-2#,2#-DIFLUOROCYTIDINE
KR20070112774A (ko) * 2005-03-04 2007-11-27 다브르 파마 리미티드 베타―아노머가 많은21데옥시,21,21-디플루오로-d-리보푸라노실뉴클레오시드의 제조를 위한 중간체 및 제조 방법
JP4516863B2 (ja) * 2005-03-11 2010-08-04 株式会社ケンウッド 音声合成装置、音声合成方法及びプログラム
AU2011202539B2 (en) * 2005-06-03 2012-07-05 Scinopharm Taiwan, Ltd. Process of making an alpha-anomer enriched 2-deoxy-2,2-difluoro-d-ribofuranosyl sulfonate and use thereof for making a beta nucleoside
CA2610283C (en) * 2005-06-03 2011-08-30 Scinopharm Taiwan, Ltd. Process of making an alpha-anomer enriched 2-deoxy-2,2-diflouro-d-ribofuranosyl sulfonate and use thereof for making a beta nucleoside
EP1940859A1 (en) * 2005-10-28 2008-07-09 Arch Pharmalabs Limited An improved process for preparation of gemcitabine hydrochloride
ES2422290T3 (es) * 2005-12-23 2013-09-10 Idenix Pharmaceuticals Inc Procedimiento para preparar un producto intermedio sintético para la preparación de nucleósidos ramificados
US20090069557A1 (en) * 2006-02-06 2009-03-12 Dr. Reddy's Laboratories Ltd. Preparation of gemcitabine
EP2094651A1 (en) * 2006-11-17 2009-09-02 Trustees Of Dartmouth College Synthesis and biological activities of new tricyclic-bis-enones (tbes)
US8921340B2 (en) 2006-11-17 2014-12-30 Trustees Of Dartmouth College Methods for using synthetic triterpenoids in the treatment of bone or cartilage diseases or conditions
US8299046B2 (en) * 2006-11-17 2012-10-30 Trustees Of Dartmouth College Synthetic triterpenoids and tricyclic-bis-enones for use in stimulating bone and cartilage growth
EP2139884B1 (en) * 2007-03-23 2013-12-04 Dongwoo Syntech Co., Ltd. Process for preparing of 2'-deoxy-2'2'-difluorocytidine
CN100475832C (zh) 2007-05-31 2009-04-08 南京卡文迪许生物工程技术有限公司 一种新颖的高立体选择性合成吉西他滨工艺及中间体
WO2009023845A2 (en) * 2007-08-15 2009-02-19 The Board Of Regents Of The University Of Texas System Combination therapy with synthetic triterpenoids and gemcitabine
EP2050757A1 (en) 2007-10-10 2009-04-22 Cilag AG Method of producing 2' -deoxy-5-azacytidine (Decitabine)
JO2778B1 (en) 2007-10-16 2014-03-15 ايساي انك Certain Compounds, Compositions and Methods
BRPI0907423A2 (pt) 2008-01-11 2020-10-27 Reata Pharmaceuticals, Inc. composto triterpenoide sintético para uso em um método de melhoria da função renal em um indivíduo, e uso do referido composto
KR101713140B1 (ko) 2008-04-18 2017-03-08 리타 파마슈티컬스 잉크. C-환에서 포화된 산화방지성 염증 조절제 올레아놀산 유도체
US8071632B2 (en) * 2008-04-18 2011-12-06 Reata Pharmaceuticals, Inc. Antioxidant inflammation modulators: novel derivatives of oleanolic acid
JP5529851B2 (ja) 2008-04-18 2014-06-25 リアタ ファーマシューティカルズ インコーポレイテッド 抗酸化炎症モジュレーター:c−17においてアミノ改変およびその他の改変を加えたオレアノール酸誘導体
MX2010011439A (es) 2008-04-18 2011-01-25 Reata Pharmaceuticals Inc Moduladores de inflamacion antioxidantes: derivados del acido oleanolico homologacion c-17.
WO2009146218A2 (en) 2008-04-18 2009-12-03 Reata Pharmaceuticals, Inc. Compounds including an anti-inflammatory pharmacore and methods of use
EP2309860B1 (en) 2008-07-22 2014-01-08 Trustees of Dartmouth College Monocyclic cyanoenones and methods of use thereof
US8609631B2 (en) 2009-04-06 2013-12-17 Eisai Inc. Compositions and methods for treating cancer
AR076263A1 (es) * 2009-04-06 2011-06-01 Eisai Inc Composiciones y metodos para tratar cancer. uso.
AU2010234637B2 (en) * 2009-04-06 2016-05-12 Taiho Pharmaceutical Co., Ltd. (2 ' -deoxy-ribofuranosyl) -1,3,4, 7-tetrahydro- (1,3) iazepin-2-0ne derivatives for treating cancer
AU2010234562B2 (en) * 2009-04-06 2016-05-12 Taiho Pharmaceutical Co., Ltd. Combination of cytidine-based antineoplastic drugs with cytidine deaminase inhibitor and use thereof in the treatment of cancer
CN108686203A (zh) 2012-04-04 2018-10-23 哈洛齐梅公司 使用抗透明质酸剂和肿瘤靶向紫杉烷的组合疗法
US8921419B2 (en) 2012-05-08 2014-12-30 Trustees Of Dartmouth College Triterpenoids and compositions containing the same
US20190351031A1 (en) 2018-05-16 2019-11-21 Halozyme, Inc. Methods of selecting subjects for combination cancer therapy with a polymer-conjugated soluble ph20

Family Cites Families (20)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US3282921A (en) * 1964-06-04 1966-11-01 Syntex Corp Halo-deoxynucleosides and processes for the preparation thereof
US3721664A (en) * 1970-01-27 1973-03-20 Hoffmann La Roche Preparation of 5-cytosine nucleosides
DE2628202A1 (de) * 1976-06-23 1977-12-29 Max Planck Gesellschaft Verfahren zur herstellung von 2'-substituierten-d-ribofuranosylpurinderivaten
DE2721466A1 (de) * 1977-05-12 1978-11-16 Robugen Gmbh Verfahren zur herstellung von 2'-desoxyribofuranosylnucleosiden
US4211773A (en) * 1978-10-02 1980-07-08 Sloan Kettering Institute For Cancer Research 5-Substituted 1-(2'-Deoxy-2'-substituted-β-D-arabinofuranosyl)pyrimidine nucleosides
FR2531962B1 (fr) * 1982-08-17 1986-11-14 Sandoz Sa Nouveaux derives de la desoxyuridine, leur preparation et leur utilisation comme medicaments
US4526988A (en) * 1983-03-10 1985-07-02 Eli Lilly And Company Difluoro antivirals and intermediate therefor
US4625020A (en) * 1983-11-18 1986-11-25 Bristol-Myers Company Nucleoside process
CA1295998C (en) * 1985-07-29 1992-02-18 Sai P. Sunkara Nucleosides and their use as antineoplastic agents
US4751221A (en) * 1985-10-18 1988-06-14 Sloan-Kettering Institute For Cancer Research 2-fluoro-arabinofuranosyl purine nucleosides
US5223608A (en) * 1987-08-28 1993-06-29 Eli Lilly And Company Process for and intermediates of 2',2'-difluoronucleosides
US4965374A (en) * 1987-08-28 1990-10-23 Eli Lilly And Company Process for and intermediates of 2',2'-difluoronucleosides
EP0339161A1 (en) * 1988-04-01 1989-11-02 Merrell Dow Pharmaceuticals Inc. Novel fluorophosphonate nucleotide derivatives
JPH0232093A (ja) * 1988-06-08 1990-02-01 Merrell Dow Pharmaceut Inc 抗レトロウィルスジフルオロ化ヌクレオシド類
HU906976D0 (en) * 1989-11-13 1991-05-28 Bristol Myers Squibb Co Process for producing 2', 3'-didesoxy-2'-fluoarabinonucleoside analogues
US5175267A (en) * 1990-03-02 1992-12-29 University Of Georgia Research Foundation, Inc. Stereoselective glycosylation of hetercyclic bases
UA41261C2 (uk) * 1992-06-22 2001-09-17 Елі Ліллі Енд Компані Спосіб одержання збагачених бета-аномером нуклеозидів
US5426183A (en) * 1992-06-22 1995-06-20 Eli Lilly And Company Catalytic stereoselective glycosylation process for preparing 2'-deoxy-2',2'-difluoronucleosides and 2'-deoxy-2'-fluoronucleosides
US5401838A (en) * 1992-06-22 1995-03-28 Eli Lilly And Company Stereoselective fusion glycosylation process for preparing 2'-deoxy-2',2'-difluoronucleosides and 2'-deoxy-2'-fluoronucleosides
US5371210A (en) * 1992-06-22 1994-12-06 Eli Lilly And Company Stereoselective fusion glycosylation process for preparing 2'-deoxy-2',2'-difluoronucleosides and 2'-deoxy-2'-fluoronucleosides

Also Published As

Publication number Publication date
CA2205350C (en) 2007-09-04
EP0712860A3 (en) 1996-09-25
AU702588B2 (en) 1999-02-25
ZA959321B (en) 1997-05-05
HU219019B (hu) 2001-01-29
CN1165519A (zh) 1997-11-19
DE69524365T2 (de) 2002-08-14
DK0712860T3 (da) 2002-03-04
NO308305B1 (no) 2000-08-28
AU4139396A (en) 1996-06-17
NO972214L (no) 1997-05-14
PE50196A1 (es) 1996-11-30
NO972214D0 (no) 1997-05-14
CA2205350A1 (en) 1996-05-30
SK283160B6 (sk) 2003-03-04
US5606048A (en) 1997-02-25
MY115183A (en) 2003-04-30
CN1044119C (zh) 1999-07-14
KR970707143A (ko) 1997-12-01
AR001045A1 (es) 1997-09-24
PL320634A1 (en) 1997-10-13
BG62737B1 (bg) 2000-06-30
KR100424990B1 (ko) 2004-05-20
CO4600741A1 (es) 1998-05-08
PT712860E (pt) 2002-05-31
HUT77926A (hu) 1998-11-30
CZ148197A3 (en) 1997-08-13
WO1996016072A1 (en) 1996-05-30
YU70995A (sh) 1998-09-18
EP0712860A2 (en) 1996-05-22
DE69524365D1 (de) 2002-01-17
IL115854A (en) 2000-07-16
TW377356B (en) 1999-12-21
CZ292013B6 (cs) 2003-07-16
RU2161622C2 (ru) 2001-01-10
BG101485A (en) 1998-03-31
YU49446B (sh) 2006-03-03
UA53614C2 (uk) 2003-02-17
SK48597A3 (en) 1997-11-05
NZ296712A (en) 1999-01-28
ATE210142T1 (de) 2001-12-15
RO118296B1 (ro) 2003-04-30
ES2164745T3 (es) 2002-03-01
SI0712860T1 (en) 2002-04-30
MX9703548A (es) 1997-08-30
BR9509904A (pt) 1997-10-14
JPH10509170A (ja) 1998-09-08
EP0712860B1 (en) 2001-12-05
IL115854A0 (en) 1996-01-31

Similar Documents

Publication Publication Date Title
PL182052B1 (pl) Sposób oczyszczania i wyodrebniania 2’-deoksy-2’, 2’-difluoronukleozydów PL PL PL PL PL PL PL
MXPA97003548A (es) Proceso para purificar y aislar 2'-desoxi-2',2'-difluoronucleosidos
CA2421040C (en) Methods for synthesizing nucleosides, nucleoside derivatives and non-nucleoside derivatives
EP2567964B1 (en) Monomer compositions for the synthesis of RNA, methods of synthesis, and methods of deprotection
EP1874792B1 (en) Activators for oligonucleotide and phosphoramidite synthesis
EP1792909A1 (en) Synthesis of polynucleotides
US20110245327A1 (en) Oligonucleotide Analogues
EP0577304B1 (en) Stereoselective anion glycosylation process
CA2210031C (en) Solid phase synthesis of oligonucleotides
EP0316017A2 (en) 2',3'-Dideoxy-2'-fluoronucleosides
US20030060622A1 (en) Process for the preparation of 2'-halo-beta-L-arabinofuranosyl nucleosides
EP0611075A1 (en) Modified oligodeoxyribonucleotides, their preparation and their therapeutic use
US8680262B2 (en) Purification of oligonucleotides
US6531589B1 (en) Base protecting groups and synthons for oligonucleotide synthesis
JP2008515968A (ja) 2’−デオキシ−2’,2’−ジフルオロシチジンの製造方法
JP3983691B2 (ja) オリゴヌクレオチドの化学的合成法
US20020146737A1 (en) Nucleoside derivatives with photolabile protective groups