PL187408B1 - Osteoprotegeryna-OPG oraz jej multimery, kwas nukleinowy kodujący polipeptyd mający co najmniej jedną z aktywności biologicznych osteoprotegeryny, wektor ekspresji obejmujący taki kwas nukleinowy, komórka-gospodarz transformowana lub transfekowana wektorem ekspresji obejmującym taki kwas nukleinowyoraz transgeniczny ssak nie-człowiek z takim kwasem nukleinowym, sposób wytwarzania OPG na drodze biotechnologicznej, przeciwciało lub część przeciwciała, które specyficznie wiąże się z OPG, sposób wykrywania obecności OPG w próbkach biologicznych, kompozycja farmaceutyczna oraz zastosowanie polipeptydu obejmującego OPG i - Google Patents

Osteoprotegeryna-OPG oraz jej multimery, kwas nukleinowy kodujący polipeptyd mający co najmniej jedną z aktywności biologicznych osteoprotegeryny, wektor ekspresji obejmujący taki kwas nukleinowy, komórka-gospodarz transformowana lub transfekowana wektorem ekspresji obejmującym taki kwas nukleinowyoraz transgeniczny ssak nie-człowiek z takim kwasem nukleinowym, sposób wytwarzania OPG na drodze biotechnologicznej, przeciwciało lub część przeciwciała, które specyficznie wiąże się z OPG, sposób wykrywania obecności OPG w próbkach biologicznych, kompozycja farmaceutyczna oraz zastosowanie polipeptydu obejmującego OPG i

Info

Publication number
PL187408B1
PL187408B1 PL96321938A PL32193896A PL187408B1 PL 187408 B1 PL187408 B1 PL 187408B1 PL 96321938 A PL96321938 A PL 96321938A PL 32193896 A PL32193896 A PL 32193896A PL 187408 B1 PL187408 B1 PL 187408B1
Authority
PL
Poland
Prior art keywords
seq
opg
figures
polypeptide
amino acid
Prior art date
Application number
PL96321938A
Other languages
English (en)
Other versions
PL321938A1 (en
Inventor
William J Boyle
David L Lacey
Frank J Calzone
Ming-Shi Chang
Original Assignee
Amgen Inc
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Priority claimed from US08/577,788 external-priority patent/US6613544B1/en
Application filed by Amgen Inc filed Critical Amgen Inc
Publication of PL321938A1 publication Critical patent/PL321938A1/xx
Publication of PL187408B1 publication Critical patent/PL187408B1/pl

Links

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09Recombinant DNA-technology
    • C12N15/11DNA or RNA fragments; Modified forms thereof; Non-coding nucleic acids having a biological activity
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K14/00Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • C07K14/435Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
    • C07K14/705Receptors; Cell surface antigens; Cell surface determinants
    • C07K14/70578NGF-receptor/TNF-receptor superfamily, e.g. CD27, CD30, CD40, CD95
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K38/00Medicinal preparations containing peptides
    • A61K38/16Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • A61K38/17Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P19/00Drugs for skeletal disorders
    • A61P19/08Drugs for skeletal disorders for bone diseases, e.g. rachitism, Paget's disease
    • A61P19/10Drugs for skeletal disorders for bone diseases, e.g. rachitism, Paget's disease for osteoporosis
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P43/00Drugs for specific purposes, not provided for in groups A61P1/00-A61P41/00
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K14/00Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • C07K14/435Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
    • C07K14/705Receptors; Cell surface antigens; Cell surface determinants
    • C07K14/715Receptors; Cell surface antigens; Cell surface determinants for cytokines; for lymphokines; for interferons
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N5/00Undifferentiated human, animal or plant cells, e.g. cell lines; Tissues; Cultivation or maintenance thereof; Culture media therefor
    • C12N5/10Cells modified by introduction of foreign genetic material
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • GPHYSICS
    • G01MEASURING; TESTING
    • G01NINVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N33/00Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
    • G01N33/48Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
    • G01N33/50Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A01AGRICULTURE; FORESTRY; ANIMAL HUSBANDRY; HUNTING; TRAPPING; FISHING
    • A01KANIMAL HUSBANDRY; AVICULTURE; APICULTURE; PISCICULTURE; FISHING; REARING OR BREEDING ANIMALS, NOT OTHERWISE PROVIDED FOR; NEW BREEDS OF ANIMALS
    • A01K2217/00Genetically modified animals
    • A01K2217/05Animals comprising random inserted nucleic acids (transgenic)
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K38/00Medicinal preparations containing peptides
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K48/00Medicinal preparations containing genetic material which is inserted into cells of the living body to treat genetic diseases; Gene therapy
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K2319/00Fusion polypeptide

Landscapes

  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Cell Biology (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Gastroenterology & Hepatology (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Public Health (AREA)
  • Pharmacology & Pharmacy (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Animal Behavior & Ethology (AREA)
  • Physical Education & Sports Medicine (AREA)
  • Toxicology (AREA)
  • Veterinary Medicine (AREA)
  • Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
  • Urology & Nephrology (AREA)
  • Rheumatology (AREA)
  • Orthopedic Medicine & Surgery (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • General Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Analytical Chemistry (AREA)
  • Hematology (AREA)
  • Plant Pathology (AREA)
  • Epidemiology (AREA)
  • Food Science & Technology (AREA)

Abstract

1. W yodrebniony kwas nukleinowy kodujacy polipeptyd majacy, co najmniej jedna z aktywnosci biologicznych OPG, wybrany z grupy obejmujacej: a) kwasy nukleinowe przedstawione na rysunkach fig. 2B-2C (SEQ ID NO: 120), fig. 9A-9B (SEQ ID NO:122) i fig. 9C-9D (SEQ ID NO:124) lub ich kom plem en- tarne nici; b) kwasy nukleinowe, które hybrydyzuja w scislych warunkach z obszarem kodu- jacym polipeptyd jak na rysunkach fig. 2B-2C (SEQ ID NO: 120), fig. 9A-9B (SEQ ID NO: 122), i fig. 9C-9D (SEQ ID NO: 124), c) kwasy nukleinowe, które hybrydyzuja w scislych warunkach z nukleotydami od 148 do 337 wlacznie, jak na rysunku fig. 1 A; oraz d) kwas nukleinowy, który jest degenerowany do kwasów nukleinowych wskaza- nych w punktach (a), (b) i (c), przy czym scisle warunki hybrydyzacji to: 5xSSC, 50% formamid i tem peratura 42°C lub warunki im równowazne. PL PL PL PL PL

Description

Dziedzina wynalazku
Niniejszy wynalazek dotyczy w ogólności polipeptydów związanych z regulacją metabolizmu kości. W szczególności, wynalazek dotyczy nowego polipeptydu, zwanego osteoprotegeryna, który należy do superrodziny receptora czynnika martwicy nowotworów (TNFR). Polipeptyd jest stosowany do leczenia chorób kości cechujących się zwiększoną utratą kości, takich jak osteoporoza. Wynalazek obejmuje także multimery osteoprotegeryny, kwas nukleinowy kodujący polipeptyd mający co najmniej jedną z aktywności biologicznych osteoprotegeryny, wektor ekspresji obejmujący taki kwas nukleinowy, komórkę-gospodarza transformowaną lub transfekowaną wektorem ekspresji obejmującym kwas nukleinowy, kodujący polipeptyd mający, co najmniej jedną z aktywności biologicznych OPG, transgenicznego ssaka nie-człowieka, z kwasem nukleinowym, kodującym polipeptyd mający, co najmniej jedną z aktywności biologicznych OPG, sposób wytwarzania OPG na drodze biotechnologicznej, przeciwciało lub część przeciwciała, które specyficznie wiąże się z OPQ sposób wykrywania obecności OPG w próbkach biologicznych, kompozycję farmaceutyczną oraz zastosowanie polipeptydu obejmującego OPG i oraz kwasu nukleinowego kodującego polipeptyd obejmujący OPG.
Stan techniki
Polipeptydowe czynniki wzrostu i cytokiny są wydzielanymi czynnikami sygnalizującymi szeroki zakres zmian wzrostu komórki, różnicowania i metabolizmu, przez specyficzne wiązanie do dyskretnych receptorów związanych z powierzchnią. Jako klasa protein, receptory różnią się co do budowy i trybu przetwarzania sygnałów. Charakteryzują się one występowaniem pozakomórkowej domeny zaangażowanej we wiązanie ligandu i domeny cytoplazmowej transmitującej odpowiedni sygnał wewnątrzkomórkowy'. Schematy ekspresji receptorów ostatecznie określają, które komórki będą odpowiadać na dany ligand, podczas gdy budowa danego receptora dyktuje odpowiedź komórkową indukowaną przez wiązanie ligandu.
187 408
Wykazano, że receptory transmitują sygnały wewnątrzkomórkowe przez ich domeny cytoplazmowe poprzez aktywowanie tyrozyny w proteinie, lub fosforylację seryny/treoniny w proteinie (np. receptor czynnika wzrostu pochodzącego z płytek krwi (PDGFR) lub przekształcenie receptora-I czynnika wzrostu β (TGFβR-I), przez stymulowanie aktywacji proteiny G (np., receptora β-adrenergicznego) i przez modulowanie asocjacji z proteinami przetwarzającymi sygnał cytoplazmowy (np. TNFR-1 i Fas/APO) (Heldin, Cell 80, 213-223, (1995)).
Superrodzina receptora czynnika martwicy nowotworów (TNFR) jest grupą protein transbłonowych typu I posiadających zachowany motyw bogaty w cysteinę powtarzany trzy do sześciu razy w domenie pozakomórkowej (Smith, et al. Cell 76, 953-962 (1994)). Zbiorczo, te powtarzające się jednostki tworzą domeny wiążące ligandy tych receptorów (Chen et al., Chemistry 270, 2874-2878 (1995)). Ligandami dla tych receptorów jest strukturalnie związana grupa protein homologicznych z TNFa (Coeddel et al. Cold Spring Harbor Symp. Quart. Biol. 51, 597-609 (1986); Nagata et al. Science 267, 1449-1456 (1995)). TNFα wiąże się z różnymi, lecz ściśle związanymi receptorami, TNFR-1 i TNFR-2. TNFa wytwarza wiele reakcji biologicznych w komórkach zawierających receptory, włączając w to proliferację, różnicowanie, cytotoksyczność i apoptozę (Beutler et al. Ann. Rev. Biochem. 57, 505-518 (1988)).
Uważa się, ze TNFa pośredniczy w ostrych i chronicznych reakcjach zapalnych (Beutler et al. Ann. Rev. Biochem. 57, 505-508 (1988)). Ogólnoustrojowe podawanie TNFa wywołuje szok toksyczny i rozległą martwicę tkanek. Wskutek tego, TNFa może być odpowiedzialny za poważne pogorszenia i śmiertelność związaną z rozmaitymi chorobami zakaźnymi, włączając w to posocznicę. Mutacje w FasL, ligandzie pokrewnego TNFR receptora Fas/Aro (Suda et al. Celi 75, 1169-1178 (1993)), są związane z autoimmunizacją (Fisher i in. Cell 81, 935-946 (1995)), podczas gdy nadprodukcja FasL może być związana z żółtaczką polekową. Zatem, ligandy odpowiadające rozmaitym białkom pokrewnym TNFR często pośredniczą w poważnych skutkach wielu stanów chorobowych, co sugeruje że czynniki, które neutralizują aktywność tych ligandów miałyby wartość terapeutyczną. Rozpuszczalne receptory TNFR-1 i przeciwciała, które wiążą TNFa, zbadano pod względem ich zdolności do neutralizowania obecnego w ustroju TNFa (Loetscher i in. Cancer Cells 3(6), 221-226 (1991)). Naturalnie występującą formę mRNA wydzielanego TNFR-1 ostatnio sklonowano i produkt zbadano na zdolność do neutralizacji aktywności TNFa in vitro i in vivo (Kohno i in., PNAS USA 87, 8331-8335 (1990)). Zdolność tej proteiny do neutralizowania TNFa sugeruje, że rozpuszczalne receptory TNF wiążą i usuwają TNF, tym samym blokując wpływ cytotoksyczny na komórki będące nośnikiem TNFR.
Celem wynalazku jest zidentyfikowanie nowych członów superrodziny TNFR. Przewiduje się, że nowe człony rodziny mogą być transbłonowymi proteinami lub ich rozpuszczalnymi formami obejmującymi pozakomórkowe domeny i pozbawionymi domen transbłonowych i cytoplazmowych. Zidentyfikowaliśmy nowy człon superrodziny TNFR, który koduje wydzielaną proteinę, ściśle pokrewną w stosunku do TNFR-2. Przez analogię do rozpuszczalnego TNFR-1, proteina pokrewna TNFR-2 może negatywnie regulować aktywność jej ligandu, a zatem może być przydatna w leczeniu pewnych chorób u ludzi.
Istota wynalazku
Zidentyfikowano nowy człon superrodziny receptora czynnika martwicy nowotworów (TNFR) z biblioteki cDNA jelit płodu szczura. Otrzymano i zsekwencjonowano pełnej długości klon cDNA. Ekspresja cDNA szczura u transgenicznej myszy ujawniła widoczny wzrost gęstości kości, zwłaszcza kości długich, kości miednicy i kręgów. Polipeptyd kodowany przez cDNA został określony terminem osteprotegeryna (OPG) i odgrywa rolę w promowaniu akumulacji kości.
Wynalazek zapewnia kwasy nukleinowe kodujące polipeptyd mający, co najmniej jedną z aktywności biologicznych OPG. Są również zapewnione kwasy nukleinowe, które hybrydyzują do kwasów nukleinowych kodujących mysi, szczurzy lub ludzki OPG jak podano na fig. 2B-2C (SEQ ID NO: 120), 9A-9B (SEQ ID NO:122), i 9C-9D (SEQ ID NO:124). Korzystnie, OPG jest otrzymana z organizmu ssaka, a bardziej korzystnie jest ludzką OPG Wektory rekombinacyjne i komórki gospodarza ekspresjonujące OPG są również zapewnione, podobnie
187 408 jak sposoby wytwarzania rekombinacyjnej OPG Przeciwciała lub ich fragmenty, które specyficznie wiążą polipeptyd są również ujawnione.
Wynalazek obejmuje także zastosowania OPG i kwasów nukleinowych kodujących OPG do wytwarzania środków leczniczych. Polipeptydy według wynalazku są przydatne w zapobieganiu resorpcji kości i mogą być stosowane do leczenia każdego stanu powodującego utratę kości, takiego jak osteoporoza, hiperkalcemia, choroba Pageta kości i utrata kości wskutek reumatoidalnego zapalenia stawów lub zapalenia szpiku itp. Choroby kości można także leczyć terapią antysensowną lub genową stosując kwasy nukleinowe według wynalazku. Wynalazek obejmuje także farmaceutyczne kompozycje zawierające kwasy nukleinowe i polipeptydy OPG
Wynalazek obejmuje wyodrębniony kwas nukleinowy kodujący polipeptyd mający, co najmniej jedną z aktywności biologicznych OPG, wybrany z grupy obejmującej:
a) kwasy nukleinowe przedstawione na rysunkach fig. 2B-2C (SEQ ID NO: 120), fig. 9A-9B (SEQ ID NO:122) i fig. 9C-9D (SEQ ID NO:124) lub ich komplementarne nici;
b) kwasy nukleinowe, które hybrydyzują w ścisłych warunkach z obszarem kodującym polipeptyd jak na rysunkach fig. 2B-2C (SEQ ID NO: 120), fig. 9A-9B (SEQ ID NO: 122), i fig. 9C-9D (SEQ ID NO: 124),
c) kwasy nukleinowe, które hybrydyzują w ścisłych warunkach z nukleotydami od 148 do 337 włącznie, jak na rysunku fig. 1 A; oraz
d) kwas nukleinowy, który jest degenerowany do kwasów nukleinowych wskazanych w punktach (a), (b) i (c), przy czym ścisłe warunki hybrydyzacji to: 5xSSC, 50% formamid i temperatura 42°C lub warunki im równoważne.
Wskazanym kwasem nukleinowym jest korzystnie cDNA, genomiczny DNA, syntetyczny DNA lub RNA.
Korzystnie, powyższy kwas nukleinowy obejmuje jeden lub więcej znanych kodonów korzystnych do ekspresji przez Escherichia coli.
Korzystnie powyższy kwas nukleinowy ma przyłączony wykrywalny znacznik, taki jak znacznik enzymatyczny, fluorescencyjny, przejawiający powinowactwo lub izotopowy, zwłaszcza znacznik radioaktywny, taki jak 32P lub 3H.
Kwas nukleinowy obejmuje obszar kodujący polipeptyd jak na rysunkach fig. 2B-2C (SEQ ID NO: 120), fig. 9A-9B (SEQ ID NO:122) lub fig. 9C-D (SEQ ID NO: 124).
Korzystnie, kwas nukleinowy obejmuje sekwencję jak na rysunku fig. 9C-D (SEQ ID NO:124) z nukleotydów 158-1297.
Wynalazek obejmuje także polipeptyd kodowany kwasem nukleinowym, kodującym polipeptyd mający, co najmniej jedną z aktywności biologicznych OPG, wybranym z grupy obejmującej:
a) kwasy nukleinowe przedstawione na rysunkach fig. 2B-2C (SEQ ID NO: 120), fig. 9A-9B (SEQ ID NO: 122) i fig. 9C-9D (SEQ ID NO: 124) lub ich komplementarne nici;
b) kwasy nukleinowe, które hybrydyzują w ścisłych warunkach z obszarem kodującym polipeptyd jak na rysunkach fig. 2B-2C (SEQ ID NO: 120), fig. 9A-9B (SEQ ID NO: 122), i fig. 9C-9D (SEQ ID NO: 124),
c) kwasy nukleinowe, które hybrydyzują w ścisłych warunkach z nukleotydami od 148 do 337 włącznie, jak na rysunku fig. 1A; oraz
d) kwas nukleinowy, który jest degenerowany do kwasów nukleinowych wskazanych w punktach (a), (b) i (c), przy czym ścisłe warunki hybrydyzacji to: 5xSSC, 50% formamid i temperatura 42°C lub warunki im równoważne.
Wynalazek dotyczy także wektora ekspresji obejmującego kwas nukleinowy kodujący polipeptyd mający, co najmniej jedną z aktywności biologicznych OPG wybrany z grupy obejmującej:
a) kwasy nukleinowe owedstawione na rysunkach fig. 2B-2C (SEQ ID NO: 120): fig. 9A-9B (SEQ ID NO: 122) i fig. 9C-9D (SEQ ID NO: 124) lub ich komplementarne nici;
187 408
b) kwasy nukleinowe, które hybrydyzują w ścisłych warunkach z obszarem kodującym polipeptyd jak na rysunkach fig. 2B-2C (SEQ ID NO:120), fig. 9A-9B (SEQ ID NO: 122), i fig. 9C-9D (SEQ ID NO: 124),
c) kwasy nukleinowe, które hybrydyzują w ścisłych warunkach z nukleotydami od 148 do 337 włącznie, jak na rysunku fig. 1A; oraz
d) kwas nukleinowy, który jest degenerowany do kwasów nukleinowych wskazanych w punktach (a), (b) i (c), przy czym ścisłe warunki hybrydyzacji to: 5xSSC, 50% formamid i temperatura 42°C lub warunki im równoważne.
W korzystnym wektorze ekspresji według wynalazku kwas nukleinowy obejmuje obszar kodujący polipeptyd jak na rysunku fig. 9C-D (SEQ ID NO:124).
Wynalazek dotyczy również komórki-gospodarza transformowanej lub transfekowanej wektorem ekspresji obejmującym kwas nukleinowy, kodujący polipeptyd mający, co najmniej jednąz aktywności biologicznych OPG, wybrany z grupy obejmującej:
a) kwasy nukleinowe przedstawione na rysunkach fig. 2B-2C (SEQ ID NO: 120), fig. 9A-9B (SEQ ID NO:122) i fig. 9C-9D (SEQ ID NO:124) lub ich komplementarne nici;
b) kwasy nukleinowe, które hybrydyzują w ścisłych warunkach z obszarem kodującym polipeptyd jak na rysunkach fig. 2B-2C (SEQ ID NO:120), fig. 9A-9B (SEQ ID NO:122), i fig. 9C-9D (SEQ ID NO: 124),
c) kwasy nukleinowe, które hybrydyzują w ścisłych warunkach z nukleotydami od 148 do 337 włącznie, jak na rysunku fig. 1 A; oraz
d) kwas nukleinowy, który jest degenerowany do kwasów nukleinowych wskazanych w punktach (a), (b) i (c), przy czym ścisłe warunki hybrydyzacji to: 5xSSC, 50% formamid i temperatura 42°C lub warunki im równoważne.
Korzystnie komórka-gospodarz według wynalazku jest komórką eukariotyczną, w szczególności wybraną z grupy obejmującej komórki CHO, COS, 293, 3T3, CV-1 i BHK.
Alternatywnie, komórka-gospodarz według wynalazku jest komórką prokariotyczną, w szczególności Escherichia coli.
Wynalazkiem objęty jest również transgeniczny ssak nie-człowiek, z kwasem nukleinowym, kodującym polipeptyd mający, co najmniej jedną z aktywności biologicznych OPG, wybranym z grupy obejmującej:
a) kwasy nukleinowe przedstawione na rysunkach fig. 2B-2C (SEQ ID NO: 120), fig. 9A-9B (SEQ ID NO: 122) i fig. 9C-9D (SEQ ID NO: 124) lub ich komplementarne nici;
b) kwasy nukleinowe, które hybrydyzują w ścisłych warunkach z obszarem kodującym polipeptyd jak na rysunkach fig. 2B-2C (SEQ ID NO: 120), fig. 9A-9B (SEQ ED NO: 122), i fig. 9C-9D (SEQ ID NO: 124),
c) kwasy nukleinowe, które hybrydyzują w ścisłych warunkach z nukleotydami od 148 do 337 włącznie, jak na rysunku fig. 1 A; oraz
d) kwas nukleinowy, który jest degenerowany do kwasów nukleinowych wskazanych w punktach (a), (b) i (c), zintegrowanym z jego genomem i funkcjonalnie związanym z elementami kontroli ekspresji polipeptydu kodowanego przez ten kwas nukleinowy, przy czym w wyniku regulowanej ekspresji tego polipeptydu poziom OPG oraz gęstość kości ssaka transgenicznego są zwiększone w porównaniu z poziomem OPG i gęstością kości takiego samego ssaka nietransgenicznego.
Korzystnie, transgeniczny ssak według wynalazku jest gryzoniem, w szczególności myszą.
Sposób wytwarzania OPG na drodze biotechnologicznej, według wynalazku polega na tym, że w odpowiednich pożywkach prowadzi się hodowlę komórek gospodarzy transformowanych lub transfekowanych kwasem nukleinowym, kodującym polipeptyd mający, co najmniej jednąz aktywności biologicznych OPG, wybranym z grupy obejmującej:
a) kwasy nukleinowe owedstawione na rysunrach fig. 2B-2C (SEQ ID NO: 120), fig. 9A-9B (SEQ ID NO:122) i fig. 9C-9D (SEQ ID NO:124) lub ich komplementarne sici;
187 408
b) kwasy nukleinowe, które hybrydyzująw ścisłych warunkach z obszarem kodującym polipeptyd jak na rysunkach fig. 2B-2C (SEQ ID NO:120), fig. 9A-9B (SEQ ID NO:122), i fig. 9C-9D (SEQ ID NO: 124),
c) kwasy nukleinowe, które hybrydyzują w ścisłych warunkach z nukleotydami od 148 do 337 włącznie, jak na rysunku fig. 1 A; oraz
d) kwas nukleinowy, który jest degenerowany do kwasów nukleinowych wskazanych w punktach (a), (b) i (c), a następnie wyodrębnia się polipeptydowe produkty ekspresji tych kwasów nukleinowych i ewentualnie oczyszcza się polipeptyd obejmujący OPG
Wynalazek obejmuje oczyszczony i wyodrębniony polipeptyd obejmujący OPQ przejawiający aktywność w zakresie podwyższania gęstości kości lub hamowania resorpcji kości, obejmujący sekwencję aminokwasów wybraną z grupy obejmującej jedną lub więcej spośród następujących sekwencji:
a) sekwencja aminokwasów pokazana na rysunku fig. 2B-2C (SEQ ID No: 1121), fig. 9A-9B (SEQ ID No: 123) lub fig. 9C-9D (SEQ ID No:125),
b) sekwencja aminokwasów posiadająca co najmniej 85% zbieżności (identyczności) z sekwencją aminokwasów określoną w pkt. a) i pokazaną na rysunku fig. 2B-2C (SEQ ID No:121), fig. 9A-9B (SEQ ID No:123) lub fig. 9C-9D (SEQ ID No:125),
c) sekwencja aminokwasów stanowiąca fragment sekwencji zdefiniowanych w pkt. a) lub b).
Korzystnie, polipeptyd według wynalazku jest OPG pochodzącą od ssaka, w szczególności ludzką OPG zwłaszcza mającą sekwencję aminokwasową jak pokazano na rysunku fig. 2B-2C (SEQ ID NO: 121), fig. 9A-9B (SEQ ID NO: 123) lub fig. 9C-9D (SEQ ID NO: 125) lub jego pochodna, a korzystnie sekwencję aminokwasową jak pokazano na rysunku fig. 9C-9D (SEQ ID NO: 125) z reszt 22-401 włącznie, korzystniej sekwencję aminokwasową jak pokazano na rysunku fig. 9C-9D (SEQ ID nO: 125) z reszt 32-401 włącznie.
Korzystnie, polipeptyd według wynalazku jest zasadniczo wolnym od innych ludzkich protein.
Korzystnie, polipeptyd według wynalazku jest produktem ekspresji egzogenicznej sekwencji dNa, przy czym DNA jest cDNA, genomicznym DNA lub syntetycznym DNA.
Korzystnie, polipeptyd według wynalazku ma przyłączony polimer rozpuszczalny w wodzie, przy czym korzystnym rozpuszczalnym w wodzie polimerem jest glikol polietylenowy, zwłaszcza o ciężarze cząsteczkowym w zakresie od około 1 kDa do około 100 kDa.
Wynalazek obejmuje w szczególności polipeptyd posiadający:
- sekwencję aminokwasową, o co najmniej około 164 aminokwasach, obejmującą cztery bogate w cysteinę domeny charakterystyczne dla bogatych w cysteinę zewnątrzkomórkowych domen receptora czynnika martwicy nowotworów (TNFR) oraz
- aktywność w zakresie podwyższania gęstości kości.
Korzystny polipeptyd według wynalazku posiada sekwencję aminokwasów jak pokazana na rysunku fig. 2B-2C (SEQ ID NO: 121), fig. 9A-9B (SEQ ID NO: 123) lub fig. 9C-9D (SEQ ID NO:125), ma koniec amino przy reszcie 22, a od 1-216 aminokwasów jest usuniętych z końca karboksylowego, a w szczególności posiada sekwencję aminokwasów z reszt 22-185, 22-189, 22-194 lub 22-201 włącznie, ewentualnie posiadający ponadto obszar Fc ludzkiej IgGl rozciągający się od końca karboksylowego.
Korzystny polipeptyd według wynalazku posiada sekwencję aminokwasów jak pokazana na rysunku fig. 2B-2C (SEQ ID NO: 121), fig. 9A-9B (SEQ ID NO: 123) lub fig. 9C-9D (SEQ ID NO: 125), ma koniec amino przy reszcie 22, a od 1-10 aminokwasów jest usuniętych z końca amino i - ewentualnie - od 1-216 aminokwasów jest usuniętych z końca karboksylowego, a w szczególności posiada sekwencję aminokwasów z reszt 27-185, 27-189, 27-194, 27-401 lub 32-401 włącznie, ewentualanie posiadający obszar Fc ludzkiej IgGl rozciągający się od końca karboksylowego.
Korzystny polipeptyd według wynalazku posiada sekwencję aminokwasów huOPG, jak pokazana na rysunku fig. 9C-9D (SEQ ID No:125) i wybrany jest z grupy obejmującej:
187 408 huOPG[22-201]-Fc huOPG[22-401]-Fc huOPG[22-180]-Fc huOPG met[22-401]-Fc huOPG Fc-met[22-401] huOPG met[22-185] huOPG met[22-189] huOPG met[22-194] huOPG met[27-185] huOPG met[27-189] huOPG met[27-194] huOPG met[32-401] huOPG met-lys [22-401] huOPG met[22-401] huOPG met[22-401]-Fc (P25A) huOPG met[22-401] (P25A) huOPG met[22-401] (P26A) huOPG met[22-401] (P26D) huOPG met[22-194] (P25A) huOPG met[22-194] (P26A) huOPG met met-(lys)3 [22-401] huOPG met met-arg-gly-serAhisL [22-401],
Korzystny kwas nukleinowy według wynalazku koduje polipeptyd posiadający sekwencję aminokwasów huOPG, jak pokazana sa rysunku fig. 9C-9D (SEq ID No: 125) i wybrany z grupy obejmującej:
huOPG[22-201]-Fc huOPG[22-401]-Fc huOPG[22-180]-Fc huOPG met[22-401]-Fc huOPG Fc-met[22-401] huOPG met[22-185] huOPG met[22-189] huOPG met[22-194] huOPG met[27-185] huOPG met[27-189] huOPG met[27-194] huOPG met[32-401] huOPG met-lys [22-401] huOPG met[22-401] huOPG met[22-401]-Fc (P25A) huOPG met[22-401] (P25A) huOPG met[22-401] (P26A) huOPG met[22-401] (P26D) huOPG met[22-194] (P25A) huOPG met[22-194] (P26A) huOPG met mer-(lys)3 [22-401] huOPG met met-arg-gly-ser-(his)() [22-401]
Obecny wynalazek obejmuje także multimer osteoprotegeryny, przejawiający aktywność w zakresie zwiększania gęstości kości lub hamowania resorpcji kości, zbudowany z monomerów pollseptadu obejmującego OPG, o sekwencji aminokwasów wybranej z grupy obejmującej jedsą lub więcej spośród następujących sekwencji:
187 408
a) sekwencja aminokwasów pokazana na rysunku fig. 2B-2C (SEQ ID No: 121), fig. 9A-9B (SEQ ID No: 123) lub fig. 9C-9D (SEQ ID No: 125),
b) sekwencja aminokwasów posiadająca co najmniej 85% zbieżności (identyczności) z sekwencją aminokwasów określoną w pkt. a) i pokazaną na rysunku fig. 2B-2C (SEQ ID No: 121), fig. 9A-9B (SEQ ID No:123) lub fig. 9C-9D (SEQ ID No:125),
c) sekwencja aminokwasów stanowiąca fragment sekwencji zdefiniowanych w pkt. a) lub b).
Korzystnym multimerem według wynalazku jest dimer.
Multimer według wynalazku korzystnie powstał przez międzyłańcuchowe wiązania dwusiarczkowe, bądź asocjację obszarów Fc pochodzących z ludzkiej IgGl.
Korzystnie multimer według wynalazku jest zasadniczo wolny od monomerów osteoprotegeryny i nieaktywnych multimerów.
Korzystnie w multimerze według wynalazku monomery obejmują sekwencję aminokwasową jak pokazana na rysunku fig. 9C-9D (SEQ ID NO: 125) z reszt 22-401 lub jej pochodną, a zwłaszcza sekwencję aminokwasową jak pokazana na rysunku fig. 9C-9D (SEQ ID NO: 125) z reszt 22-194.
Jak wspomniano wyżej wynalazek obejmuje również przeciwciało lub część przeciwciała, które specyficznie wiąże się z OPG, posiadającą sekwencję aminokwasów wybraną z grupy obejmującej jedną lub więcej spośród następujących sekwencji:
a) sekwencja aminokwasów pokazana na rysunku fig. 2B-2C (SEQ ID No: 121), fig. 9A-9B (SEQ ID No: 123) lub fig. 9C-9D (SEQ ID No:125),
b) sekwencja aminokwasów posiadająca co najmniej 85% zbieżności (identyczności) z sekwencją aminokwasów określoną w pkt. a) i pokazaną na rysunku fig. 2B-2C (SEQ ID No: 121), fig. 9A-9B (SEQ ID No: 123) lub fig. 9C-9D (SEQ ID No: 125),
c) sekwencja aminokwasów stanowiąca fragment sekwencji zdefiniowanych w pkt. a) lub b).
Korzystnie, przeciwciało według wynalazku jest przeciwciałem monoklonalnym.
Sposób wykrywania obecności OPG w próbkach biologicznych, według wynalazku polega na tym, że obejmuje:
- inkubowanie próbki z przeciwciałem lub częścią przeciwciała, które specyficznie wiąże się z OPG posiadającą sekwencję aminokwasów wybraną z grupy obejmującej jedną lub więcej spośród następujących sekwencji:
a) sekwencja aminokwasów pokazana na rysunku fig. 2B-2C (SEQ ID No: 121), fig. 9A-9B (SEQ ID No: 12 3) lub fig. 9C-9D (SEQ ID No:125),
b) sekwencja aminokwasów posiadająca co najmniej 85% zbieżności (identyczności) z sekwencją aminokwasów określoną w pkt. a) i pokazaną na rysunku fig. 2B-2C (SEQ ID No:121), fig. 9A-9B (SEQ ID No:123) lub fig. 9C-9D (SEQ ID No:125),
c) sekwencja aminokwasów stanowiąca fragment sekwencji zdefiniowanych w pkt. a) lub b), w warunkach pozwalających na związanie tego przeciwciała z OPG oraz
- wykrywanie związanego przeciwciała znanymi metodami.
Sposób ustalania zdolności badanej substancji do wiązania się z OPG według wynalazku polega na tym, że obejmuje:
- inkubowanie OPG z badaną substancją w warunkach pozwalających na ich związanie oraz
- pomiar związanej substancji.
Według wynalazku kompozycja farmaceutyczna zawierająca substancję aktywną oraz farmaceutycznie dopuszczamy nośnik, adjuwant, środek ułatwiający rozpuszczanie, stabilizator i/lub pr/eciw-utleniacz, cechuje się tym, że jako substancję aktywną, zawiera osteoprotegerynę OPG korzystnie ludzką OPG a zwłaszcza sekwencję aminokwasową jak pokazana na rysunku fig. 9B.
Wynalazek dotyczy także zastosowania polipeptydu obejmującego OPG o sekwencji aminokwasów wybranej z grupy obejmującej jedną, lub więcej spośród następujących sekwencji:
187 408
a) sekwencja aminokwasów pokazana na rysunku fig. 2B-2C (SEQ ID No: 121), fig. 9A-9B (SEQ ID No: 123) lub fig. 9C-9D (SEQ ID No: 125),
b) sekwencja aminokwasów posiadająca co najmniej 85% zbieżności (identyczności) z sekwencją aminokwasów określoną w pkt. a) i pokazaną na rysunku fig. 2B-2C (SEQ ID No: 121), fig. 9A-9B (SEQ ID No: 123) lub fig. 9C-9D (SEQ ID No: 125),
c) sekwencja aminokwasów stanowiąca fragment sekwencji zdefiniowanych w pkt. a) lub b) jako środka leczniczego do leczenia chorób kości, w szczególności chorób związanych z nadmiernym zanikiem kości, zwłaszcza chorób wybranych z grupy obejmującej osteoporozę, chorobę kości typu Pageta, hiperkalcemię, nadczynność przytarczyc, osteopenię indukowaną przez podawanie steroidów, zanik kości na skutek przewlekłego postępującego gośćca stawowego, zanik kości w następstwie zapalenia szpiku, przerzuty osteolityczne oraz zanik kości przyzębia.
Korzystnie, zastosowanie to dotyczy polipeptydu będącego ludzką OPG.
Korzystnie, w zastosowaniu według wynalazku środek leczniczy jest przewidziany do stosowania łącznie z terapeutycznie skuteczną ilością substancji wybranych z grupy obejmującej: proteiny kostno morfogeniczne BMP-1 do BMP-12, człony rodziny TGF-β, inhibitory IL-1, inhibitory TNFa, hormon przytarczyc i jego analogi, proteina związana z hormonem przytarczyc oraz jej analogi, prostaglandyny serii E, bisfosfoniany oraz minerały wzmacniające kości.
Zastosowanie kwasu nukleinowego kodującego polipeptyd mający, co najmniej jedną z aktywności biologicznych OPG wybrany z grupy obejmującej:
a) kwasy nukleinowe przedstawione na rysunkach fig. 2B-2C (SEQ ID NO: 120), fig. 9A-9B (SEQ ID NO: 122) i fig. 9C-9D (SEQ ID NO: 124) lub ich komplementarne nici;
b) kwasy nukleinowe, które hybrydyzują w ścisłych warunkach z obszarem kodującym polipeptyd jak na rysunkach fig. 2B-2C (SEQ ID NO: 120), fig. 9A-9B (SEQ ID NO:122), i fig. 9C-9D (SEQ ID NO: 124),
c) kwasy nukleinowe, które hybrydyzują w ścisłych warunkach z nukleotydami od 148 do 337 włącznie, jak na rysunku fig. 1 A; oraz
d) kwas nukleinowy, który jest degenerowany do kwasów nukleinowych wskazanych w punktach (a), (b) i (c), do wytwarzania środka do regulowania poziomu OPG u zwierząt, zwłaszcza u ssaków, na drodze modyfikacji genetycznej.
Korzystnie, zastosowanie to dotyczy kwasu nukleinowego sprzyjającego wzrostowi poziomu OPG w tkankach.
Opis rysunków
Figura 1. A. Analiza FASTA nowego EST LORF. Przedstawiono uzyskaną sekwencję aminokwasową FRI-1 zestawioną z sekwencją ludzkiego TNFR-2.
B. Przedstawiona analiza profilu nowego EST LORF to uzyskana sekwencja aminokwasową FRI-1 zestawiona z profilem TNFR.
C. Widok struktury superrodziny TNFR wskazujący obszar, który jest homologiczny z nowym FRI-1.
Figura 2. Struktura i sekwencja pełnej długości szczurzego genu OPQ nowego członu superrodziny TNFR.
A. Mapa insertu pMOB-Bl.l. Ramka wskazuje pozycję LORF w obrębie sekwencji cDNA (gruba linia). Czarna ramka wskazuje peptyd sygnałowy, a szare elipsy wskazują pozycję powtarzających się sekwencji bogatych w cysteinę.
B, C. Sekwencja kwasu nukleinowego i proteiny szczurzego cDNA OPG Przewidywany peptyd sygnałowy podkreślono, a potencjalne miejsca N-glikozylacji wskazano grubymi, podkreślonymi literami.
D. E. Warstwowe porównanie sekwencji (Wisconsin GCG Package, Version 8.1) OPG z innymi członami superrodziny TNFR, fas (SEQ ID NO: 128); tnfrl (SEQ ID NO: 129); sfu-t2 (SEQ ID NO:130); tnfr2 (SEQ ID NO:131); cd40 (SEQ ID NO:132); osteo (SEQ ID NO: 133); ngfr (SEQ ID NO: 134); ox40 (SEQ ID NO: 135); 41bb (SEQ ID NO: 136).
187 408
Figura 3. Analiza PepPlot (Wisconsin GCG Package, Version 8.1) przewidywanej sekwencji proteinowej OPG szczura.
A. Schematyczne przedstawienie szczurzego OPG uwidaczniające aminokwasy hydrofobowe (góra) i hydrofilowe (dół). Pokazano także aminokwasy zasadowe (góra) i kwasowe (dół).
B. Przedstawienie reszt aminokwasowych, które tworzą arkusze beta (góra) i zrywają arkusze beta (dół), jak określili: Chou i Fasman (Adv. Enz. 47, 45-147 (1948)).
C. Przedstawienie miary skłonności do helisy alfa i arkusza beta (Chou i Fasman, ibid). Krzywe powyżej 1.00 przedstawiają skłonności do struktury helisy alfa i arkusza beta. Struktura może się kończyć w obszarach proteiny, gdzie krzywe spadają poniżej 1.00.
D. Przedstawienie reszt, które tworzą alfa (góra) lub zrywają alfa (dół).
E. Uwidocznienie części sekwencji proteiny przypominających sekwencje w typowym przypadku występujące na końcu aminowym struktur alfa i beta (Chou i Fasman, ibid).
F. Uwidocznienie części sekwencji proteiny przypominających sekwencje w typowym przypadku występujące na końcu karboksylowym struktur alfa i beta (Chou i Fasman, ibid).
G. Części sekwencji protein przypominających sekwencje w typowym przypadku występujące w zwojach (Chou i Fasman, ibid).
H. Uwidocznienie helisowego momentu hydrofobowego (Eisenberg i in. Proc. Natl. Acad. Sei. USA 81, 140-144 (1984)) w każdej pozycji w sekwencji.
I. Uwidocznienie średniej hydropatii oparte na: Kyte i Doolittle (J. Mol. Biol. 157, 105-132 (1982)) i Goldman i in. (przegląd dokonany w: Ann. Rev. Biophys. Biophys. Chem. 15,321-353 (1986)).
Figura 4. Szablony ekspresji mRNA dla cDNA OPG w tkankach ludzkich. Bioty Northern sondowano przy użyciu znaczonego 32P insertu szczurzego cDNA (A, lewe dwa panele), lub insertu ludzkiego cDNA (B, prawy panel).
Figura 5. Tworzenie transgenicznych myszy ekspresjonujących cDNA OPG whepatocytach. Ekspresja biotu Northern transgenu HE-OPG w wątrobie myszy/.
Figura 6. Wzrost gęstości kości u transgenicznych myszy OPG. Panel A-F - myszy kontrolne. G-J - myszy ekspresjonujące OPG. Przy nekropsji, wszystkie zwierzęta poddano radiografii i wykonano fotografie. Dla A-F, przedstawiono radiografię zwierząt kontrolnych i jednego transgenicznego nieekspresora (#28). Należy zauważyć, że kości mają jasno określoną korę i przezroczystą centralną jamę szpikową. Natomiast, zwierzęta OPG (G-J) mają słabo określoną korę i zwiększoną gęstość w strefie szpiku.
Figura 7. Wzrost kości beleczkowatej u myszy transgenicznych OPG
A-D. Przykładowe fotomikrografie kości zwierząt kontrolnych. W A i B, przedstawiono obrazy w małym powiększeniu (4X, 10X) kości udowej (barwienie Masson Trichrome). Barwienie na fosfatazę kwaśną, odporną na winian (TRAP) wykazuje osteoklasty (patrz strzałki) resorbujące chrząstkę (C) i kość beleczkowatą (D). Należy zauważyć spłaszczony wygląd osteoklastów na kości beleczkowatej.
E-H. Przykładowe fotomikrografie kości zwierząt ekspresjonujących OPG. W E i F, przedstawiono obrazy w małym powiększeniu (4X, 10X) kości udowej (barwienie Masson Trichrome).
Jasny obszar to chrząstka płytki wzrostu, obszar zabarwiony na niebiesko to kość, a czerwony obszar to szpik. Należy zauważyć, że w przeciwieństwie do prób kontrolnych, kość beleczkowata nie była resorbowana, co spowodowało brak typowej jamy szpikowej. Uzyskane beleczki mają różnorodny wygląd i obejmują obszary niebieskie i jasne. Obszary jasne to resztki chrząstki płytki wzrostu, które nie były nigdy remodelowane. W oparciu o barwienie TRAP, zwierzęta te mają osteoklasty (patrz strzałki) w miejscu płytki wzrostu (G), które mogą być zredukowane, co do liczby. Jednak, powierzchnie beleczek z dala od miejsca płytki wzrostu są praktycznie pozbawione osteoklastów (H), spostrzeżenie kontrastujące z obserwacjami czynionymi dla zwierząt kontrolnych (patrz D).
Figura 8. Ekspresory HE-OPG nie mają defektu w rozwoju monocytu-makrofagu. Jedną przyczyną osteopetrozy u myszy jest defektywne wytwarzanie M-CSF wskutek mutacji punktowej w genie M-CSF. To powoduje wyraźny deficyt makrofagów cyrkulujących
187 408 i tkankowych. Ekspresory OPG krwi obwodowej zawierały monocyty jak oceniono stosując analizę h1e. Aby potwierdzić obecność makrofagów tkankowych wykonano badanie immunohistochemiczne stosując przeciwciała F480, które rozpoznają antygen powierzchni komórki na makrofagach mysich.
A i C przedstawiają fotomikrografie w małym powiększeniu (4X) śledziony od zwierząt normalnych i nadekspresorów CR1. Należy zauważyć, że obie grupy zwierzęta mają liczne komórki F480 pozytywne. Monocyto-makrofagi były także obecne w szpiku zwierząt normalnych (B) i nadekspresorów HE-OPG (D) (40X).
Figura 9. Struktura i sekwencje klonów cDNA OPG mysiego i ludzkiego.
A, B. Mysi cDNA i sekwencja proteiny.
C, D. Ludzki cDNA i NNkwencja psotuiny. Przywidywane paptydy sagaałows podkreślono i potencjalne miejsca N-glikozylacji wskazano grubym drukiem.
E, F. Zestawieme scPsv εης]ί e porówpunia: mysiej i li^i^zki^j zkRwesicki eminokwasowych OPG
Figura 10. Porównanie zachowanych sekwencji w pozakomórkowej domenie TNFR-1 i ludzkiego OPG PrettyPlot (WSscopsSp CCC Package, Version 8.1) zestawienia TNFR1 i OPG opisanego w przykładzie 6. Linia górna, sekwencje ludzkiego TNFR1 kodującego domeny 1-4. Linia dolna, ludzkie sekwencje OPG kodujące domeny 1-4. Zachowane reszty zaznaczono przez prostokątne ramki.
Figura 11. Trójwymiarowk przedstawienie ludzkiego OPG Widok z boku obrazu Molescript przewidywanej 3-wamSurowej struktury reszt ludzkiego OPG 25 do 163, (szeroka linia), wssółkrastaliyowupego z ludzkim TNFP (cienka ISpSu). Dla orientacji, grube strzałki wzdłuż szkieletu polipeptydu OPG wskazują kierunek od końca N do końca C. Miejsca poszczególnych łańcuchów bocznych reszty castkipowej wstawiono wzdłuż szkieletu polipeptydu, by ltsikS przedstawić oddzielne domeny bogate w cysteinę. Cząsteczkę TNFP zestawiono jak opisali Banner i in. (1993).
Figura 12. Struktura bogatych w cysteinę domen OPG Zestawienie ludzkiej (linia górna SEQ ID NO: 136) i mysiej (linia dolna) sekwencji aminokwasowych OPG z wyróżnioną przewidywaną strukturą domeny OPG Polipeptyd podzielony na dwie połowy; koniec N (A) i koniec C (B). Przewidziano, że połowa N-końcowa zawiera cztery domeny bogate w cysteinę (oznaczone 1-4). Przewidywane wewnątrzłańcuchowe wiązania dwusiurczkowk wskazano grubymi liniami oznaczonymi „SS1”, „SS2”, lub „SS3”. Przewiduje się, że tyrozyna 28 i Wstydy^ 75 (podkreślona) oddziałują na siebie jonowo. Jest spodziewane, że te aminokwasy mogą oddziaływać z ligandem OPG; wskazano je pogrubionymi kropkami powyżej odpowiedniej reszty. Reszty castkipowe umikjscowiope w połowie C-końcowej OPG zaznaczono przez prostokątne ramki.
Figura 13. Ekspresja i wydzielanie mysich protein fuzyjnych OPG-Fc (pełnej długości i obciętych).
A. Mapa wskazująca punkty fuzji do domeny Fc ludzkiego IgG1 jako groty strzałek.
B. Barwienie srebrem żelu IDS-polSukrylumidu kondacSonowuPkS pożywki otrzymane z komórek ekspresjopującach wektory ekspresji proteiny fayajpej F1.Fc (pełnej długości OPG poddany fuzji do Fc przy leucanik 401) lub CT.Fc (OPG z obciętym końcem karboksy poddany fuzji do Fc przy treoninik 180). Pas 1, linia komórkowa wektora ekspresji macierzystego pCEP4; Pas 2, linia komórkowa wektora F1.Fc; Pas 3, linia komórkowa wektora CT.Fc.
C. Blot typu Western kopdacSowupych pożywek otrzymany z wektorów ekspresji proteiny fUyajPeS cF1.Fc i CT.Fc sondowanych domeną Fc anty-ludzkiego IgG1 (Pierce). Pas 1, linia komórkowa wektora ekspresji macierzystego pCEP4; Pas 2, linia komórkowa wektora F1.Fc; Pas 3, linia komórkowa wektora CT.Fc.
Figura 14. Ekspresja ludzkiego OPG w E. coli.
A. Budowa baPteryjnega wekowa ekspreski. LOSZF ludzkiego genu OPG Ozmo^^iono przez PCR, a następnie złączono z fragmentem linkem oligonaeleotadu (górna nić to SEQ ID NO: 137; dolna nić to SEQ ID NO: 127), linowupo w DNA wektora pAMG21. Uzyskany wektor jest zdolny do ekspresji reszt OPG 32-401 pułąozopach z N-końcową resztą metioniny.
187 408
B. Analiza Udu-PAGE zieDdukowhnej i indukosvhnej oSecnośei w bakteria plrzmidu 32-401 zawierającego pAMG21-lhdzku OPG Pas 1, wzorce MW; pas 2, bakterie sieindukowane; pas 3, indukcja 30°C; pas 4, indukcja 37°C; pas 5, lizat całej komórki z indukcji 37°C; pas 6, rozpuszczalna frakcja lizatu całej komórki; pas 7, nierozpuszczalna frakcja lizatu całej komórki; pas 8, oczyszczone ciała iskluzyjne otrzymane z lizatu całej komórki.
Figura 15. Analiza rekombinαcajnego mysiego OPG wytworzonego w komórkach CHO przez SDS-PAGE i blot typu Western. Równą ilość ośrodka kosdacjonowasego w CHO naniesiono sa każdy z podanych pasów i przygotowano przez działanie próbnym buforem redukującym (lewy pas) lub próbnym buforem sieredukującym (prawy pas). Po elektroforezie, rozdzielone proteiny przeniesiono na membranę nylonową, a sastępsie sondowano przeciwciałami asty-C>PG. Względne pozycje form: 55 kd monomerycznej i 100 kd dimerycznej wskazano przez strzałki.
Figura 16. Analiza „ścigania” impulsów rekombisacyjsego mysiego OPG wytworzonego w komórkach CHO. Komórki CHO znaczono impulsowo 35S-metiosisą/cysteiną. a następnie „ścigano” przez wskazany czas. Metabolicznie znaczone hodowle podzielono na kondacjonownuć pożywki i komórki, i z każdego klarowanego, a sastępsie immusowytrącasego przeciwciałami anty-OPG wytworzono ekstrakty detergentowe.
Immusoosady rozdzielono przez SDS-PAGE i wystawiono sa działanie błony. Górse panele lewy i prawy: próbki poddane analizie w warunkach nieredhkującach. Górne pasele lewy i prawy; próbki poddane analizie w warunkach redukujących. Lewe panele - górny i dolny: Ekstrakty komórkowe. Prawe pasele - górsy i dolny; Kondycjonom^ ekstrakty pożywki. Względną ruchliwość form OPG: 55 kd monomerycznej i 100 kd dimerycznej wskazano przez strzałki.
Figura 17. Ekspresja OPG w linii komórkowej CTLL-2. Pozbawione surowicy kondycjononuse pożywki z komórek CTLL-2 i trascfekonusych komórek CHO-mu OPG[ 1-401] wytworzono, zatężoso, poddano analizie przez sieredukhjąca SDS-PAGE oraz Western Blottisg. Lewy pas; pożywki kondycjosowane CTLL-2. Prawy pas; pożywki kondycjosowane CHO-muOPG Względną ruchliwość form OPG: 55 kd monomeryczsej i 100 kd dimerycznej wskazano przez strzałki.
Figura 18. Wykrywanie ekspresji OPG w próbkach surowicy i wyciągach z wątroby uzyskanych z myszy kontrolnych i transgenicznych OPG Myszy transgesiczne uzyskano jak opisano w przykładzie 4. Ekspresję OPG wizualizowano po SDS-PAGE, a następnie Western blotting stosując przeciwciała anty-OPG
Figura 19. Wpływ proteiny fuzyjsej huOPG[22-401]-Fc na tworzenie osteoklucth in vitro. Próbę tworzenia osteoklacth wykonano jak opisano w przykładzie 11A w nieobecności (próba kostrolsa) lub w obecności wskazanych ilości fuzji huOPG[22-401]-Fc. Tworzenie osteoklastów wizualizowano przez wybarwlunle histochemiczse na fosfatazę kwaśną odporną sa wisian (TRAP).
A. OPG dodasy do 100 ng/ml.
D. OPG dodany do 0,1 ng/ml.
E. OPG dodany do 0,01 ng/ml.
F. OPG dodasy do 0,001 sg/ml.
G. Próbka kontrolna. Nie dodano OPG
Figura 20. Obniżenie aktywności hodowli osteoklastów TRAP wraz ze wzrostem OPG Wskazane stężenia proteiny fuzyjsej huOPG[22-401]-Fc dodano do próby tworzenia osteoklastów i aktywność TRAP zmierzono jak opisano w przykładzie 11 A.
Figura 21. Wpływ OPG sa końcowy etap różnicowania osteoklastów. Fuzję huOPG[22-401]-Fc dodano do próby tworzenia osteoklastów podczas pośredniego etapu dojrzewania osteoklastów (dni 5-6; OPG-CTL) lub podczas końcowego etapu dojrzewania osteoklastów (dsi 7-15; CtL-OPG). Aktywność TRAP zmierzono i porównano z aktywnością obserwowaną w nieobecności oPg (CTL-CTL) cały czas w obecności OPG (OPG-OPG)
Figura 22. Wpływ IL-1P, IL-1a i OPG na jony wapnia we krwi u myszy. Poziomy jonów nussiu we krwi monitorowano po isjekcji samego iL-1(3, IL-1a, IL-Ιβ plus muOPG[22-401]-Fc, IL-1a plus muOPG[22-401]-Fc, i samego muOPG[22-401]-Fc. Myszy kontrolne
187 408 otrzymały jedynie injekcje roztworu soli buforowanego fosforanem (PBS). Eksperyment IL-Ιβ przedstawiono na A; Eksperyment IL-la przedstawiono na B.
Figura 23. Wpływ OPG na osteoklasty sklepienia czaszki u 30 myszy kontrolnych i poddanych działaniu ILI. Metody histologiczne analizy próbek mysich kości sklepienia czaszki opisano w przykładzie 11B. Strzałki wskazują osteoklasty obecne u myszy w 2 dniu podawania. Próbki sklepienia czaszki myszy otrzymujących cztery injekcje PBS dziennie (A), jedną, injekcję IL-1, trzy injekcje PBS dziennie (B), jedną injekcję PBS i trzy injekcje OPG dziennie (C), jedną injekcję IL-li trzy injekcje OPG dziennie.
Figura 24. Analiza radiograficzna narastania kości w jamie szpikowej normalnych myszy. Myszom wstrzyknięto podskórnie roztwór soli (A) fuzję mu-OPG[22-401]-Fc (5 mg/kg/dzień) przez 14 dni (B) i gęstość kości określono jak opisano w przykładzie 11C.
Figura 25. Histomorfometryczna analiza narastania kości w jamie szpikowej normalnych myszy. Eksperymenty injekcyjne i histologię kości wykonano jak opisano w przykładzie 11C.
Figura 26. Histologiczna analiza narastania kości w jamie szpikowej normalnych myszy. Eksperymenty injekcyjne i histologię kości wykonano jak opisano w przykładzie 11C.
A. Injekcja roztworu soli.
B. Injekcja fuzji muOPG[22-401]-Fc.
Figura 27. Aktywność OPG podawanego szczurom z wyciętymi jajnikami. W tym dwutygodniowym eksperymencie tendencja do zmniejszonej gęstości kości wydaje się być blokowana przez OPG lub inne terapie antyresorpcyjne. Pomiary DEXA przeprowadzono w czasie wycięcia jajników i w 1 tygodniu i 2 tygodniu podawania. Wyniki wyrażono jako % zmiany początkowej gęstości kości (Średnia +/- błąd stand, pomiaru).
Figura 28. Gęstość kości w przynasadzie kości udowej, zmierzona metodą histomorfometryczną, ma tendencję do niższych wartości u szczurów z wyciętymi jajnikami (OVX) niż u pozornie operowanych zwierząt (SHAM) 17 dni po wycięciu jajników. Efekt ten zablokowano przez OPG-Fc, przy czym szczury z wyciętymi jajnikami, którym podawano OPG-Fc (OVX+OPG) miały znacząco wyższą gęstość kości niż szczury z wyciętymi jajnikami, którym podawano zaróbkę (OVX). (Średnia +/- błąd stand, pomiaru).
Szczegółowy opis wynalazku
Nowy człon superrodziny receptora czynnika martwicy nowotworów (TNFR) zidentyfikowano jako poddany ekspresji marker sekwencji (EST) wyodrębniony z biblioteki cDNA jelit płodu szczura. Struktury klonów pełnej długości cDNA szczura i odpowiadające temu mysie i ludzkie klony cDNA określono jak to opisano w przykładach I i VI. Szczurze, mysie i ludzkie geny przedstawiono odpowiednio na rysunkach fig. 2B-2C (SEQ ID NO: 120), 9A-9B (SEQ ID NO:122) oraz 9C-9D (SEQ ID NO:124). Wszystkie trzy sekwencje wykazały silne podobieństwo do pozakomórkowych domen członów rodziny TNRF. Żaden z wyodrębnionych klonów pełnej długości cDNA nie kodował domen transbłonowych i cytoplazmowych spodziewanych w przypadku receptorów związanych z błoną, sugerując, że powyższe cDNA kodują rozpuszczalne wydzielane proteiny raczej niż receptory powierzchni komórki. Część ludzkiego genu obejmującą nukleotydy 1200-1353, przedstawioną na rysunku fig. 9D, złożono w bazie danych Genebank dnia 22 listopada 1995 roku pod numerem dostępu 17188769.
Dystrybucję tkankową szczurzego i ludzkiego mRNA określono jak opisano w przykładzie II. U szczura ekspresję mRNA wykryto w nerkach, wątrobie, łożysku i sercu, przy najwyższej ekspresji w nerkach. Ekspresję wykryto także w mięśniach szkieletowych i trzustce. U ludzi ekspresję wykryto w tych samych tkankach oraz w węźle limfatycznym, grasicy, śledzionie i w wyrostku robaczkowym.
cDNA szczura poddano ekspresji u transgenicznych myszy (przykład III) stosując wątrobo-specyficzny ApoE promotor układu ekspresji. Analiza ekspresorów wykazała widoczny wzrost gęstości kości, zwłaszcza w przypadku kości długich (kości udowe), kręgów i kości płaskich (miednica). Analiza histologiczna zabarwionych przekrojów kości wykazała ostrą osteopetrozę (patrz przykład IV) wskazując na widoczną nierównowagę pomiędzy tworzeniem kości i resorpcją, która prowadzi do widocznej akumulacji kości i chrząstek. Obniżenie
187 408 liczby beleczkowatych osteoklastów w kościach zwierząt z ekspresorem OPG wskazuje, że znacząca część aktywności białka pokrewnego TNFR może zapobiegać resorpcji kości, procesowi przebiegającemu za pośrednictwem osteoklastów. Ze względu na aktywność w ekspresorach transgenicznych proteiny pokrewne TNFR opisane w niniejszym zgłoszeniu zwane sąOPGs.
Stosując sekwencję cDNA szczura wyodrębniono mysie i ludzkie klony cDNA (przykład V). Ekspresję mysiej OPG w komórkach 293 i ludzkiej OPG w E. coli opisano w przykładach VII i VIII. Mysią OPG wytworzono jako fuzję Fc, który oczyszczono chromatograficznie na zasadzie powinowactwa do Proteiny A. W przykładzie VII opisano także ekspresję polipeptydów OPG pełnej długości oraz obciętego polipeptydu ludzkiego i mysiego w CHO i komórkach 293 jako polipeptydów fuzji do obszaru Fc ludzkiej IgG1, lub jako polipeptydów nie poddanych fuzji. Ekspresję pełnej długości i obciętych ludzkich i mysich OPG w E. coli jako polipetydów fuzji Fc lub jako polipetydów nie poddanych fuzji opisano w przykładzie VIII. Oczyszczanie OPG rekombinacyjnie wytworzonego w organizmie ssaka i bakterii opisano w przykładzie X.
Biologiczną aktywność OPG określono stosując próbę dojrzewania osteoklastu in vitro, model in vivo hiperkalcemii wywołanej przez interleukinę-1 (IL-1) i badania injekcyjne gęstości kości u normalnych myszy (patrz przykład XI). Następujące rekombinacyjne proteiny OPG wytworzone w CHA lub komórkach 293 wykazały aktywność w próbie dojrzewania osteoklastu E. coli; mu-OPG[22-185]-Fc, muOPG[22-194]-Fc, muOPG[22-401]-Fc, muOPG[22-401], huOPG[22-201]-Fc, huOPG[22-401]-Fc. Wytworzone w komórkach CHO muOPG[22-180]-Fc i huOPG met[32-401] wytworzone w E. coli nie wykazały aktywności w próbie in vitro.
OPG z szeregu źródeł wytworzono jako dimer i w pewnym stopniu jako wyższy multimer. Szczurza OPG[22-401] wytworzona u transgenicznych myszy, muOPG[22-401] oraz huOPG[22-401] wytworzona jako rekombinacyjny polipeptyd w komórkach CHO i OPG poddana ekspresji jako naturalnie występujący produkt z cytotoksycznej linii komórkowej T były przeważnie dimerami i trimerami, gdy poddano je analizie na nieredukujących żelach SDS (patrz przykład IX). Obcięte polipeptydy OPG mające delecje w obszarze aminokwasów 186-401 (np. OPG[1-185] i OPG[1-194]) były przeważnie monomeryczne, co sugeruje, ze obszar 186-401 może być związany z samoasocjacją polipeptydów OPG Jednakże huOPG met[32-401] wytworzone w E. coli były w znacznej mierze monomeryczne.
OPG może być ważna w regulowaniu resorpcji kości. Proteina zdaje się działać jako rozpuszczalny receptor rodziny TNF i może zapobiegać oddziaływaniu receptor-ligand związanemu ze szlakiem osteolitycznym. Jednym z aspektów regulacji zdaje się być redukcja liczby osteoklastów.
Kwasy nukleinowe
Wynalazek dostarcza wyodrębniony kwas nukleinowy kodujący polipeptyd mający, co najmniej jedną z aktywności biologicznych OPG. Jak opisano w niniejszym zgłoszeniu aktywności biologiczne OPG obejmują (lecz nie są ograniczone do) jakąkolwiek aktywność związaną z metabolizmem kości i w szczególności obejmują podwyższanie gęstości kości. Kwasy nukleinowe według wynalazku wybrane są z następujących:
a) sekwencje kwasu nukleinowego jak podano na rysunkach fig. 2B-2C (SEQ ID NO: 120), fig. 9A-9B (SEQ ID NO: 122), i fig. 9C-9D (SEQ ID NO:124), lub ich komplementarne nici;
b) kwasy nukleinowe, które hybrydyzują w ścisłych warunkach z obszarem kodującym polipeptyd na rysunkach fig. 2B-2C (SEQ ID NO: 120), fig. 9A-9B (SEQ ID NO: 122), i fig. 9C-9D (SEQ ID NO: 124);
c) kwasy nukleinowe, które hybrydyzują w ścisłych warunkach z nukleotydami od 148 do 337 włącznie, jak to przedstawiono na rysunku fig. 1 A;
d) sekwencje kwasu nukleinowego, które ulegają degeneracji do sekwencji wskazanych w (a) i (b).
Wynalazek dostarcza kwasy nukleinowe, które kodują szczurze, mysie i ludzkie OPG oraz sekwencje kwasu nukleinowego hybrydyzujące do nich, które kodują polipeptyd mający,
187 408 co najmniej jedną z aktywności biologicznych OPG Dostarczone są także kwasy nukleinowe, które hybrydyzują do szczurzego OPG EST obejmującego nukleotydy od 148 do 337, jak podano na rysunku fig 1A. Warunki hybrydyzacji są zasadniczo wysoce ścisłe, takie jak 5 x SSC, 50% formamid oraz temperatura 42°C opisane w przykładzie I opisu. Równoważną ścisłość tych warunków można łatwo osiągnąć przez dobranie stężenia soli, organicznego rozpuszczalnika i temperatury. Kwasy nukleinowe w (b) obejmują sekwencje kodujące polipeptydy pokrewne OPG które nie podlegają wykrywalnej hybrydyzacji z innymi znanymi członami superrodziny receptora TNF. W korzystnym wykonaniu, kwasami nukleinowymi są kwasy podane na rysunkach fig. 2B-2C (SeQ ID NO: 120), fig. 9A-9B (SEQ ID nO: 122) i fig. 9C-9D (SEQ ID NO: 124).
Długość hybrydyżujących kwasów nukleinowych wynalazku może być zmienna, ponieważ hybrydyzacja może wystąpić w części lub całości obszarów kodujących polipeptyd, jak podano na rysunkach fig. 2B-2C (SEQ DD NO:120), fig. 9A-9B (SEQ ID NO:122) i fig. 9C-9D (SEQ ID NO: 124), a może także wystąpić w pobliskich obszarach niekodujących. Zatem, hybrydyzujące kwasy nukleinowe mogą być obcięciami lub rozszerzeniami sekwencji przedstawionych na rysunkach fig. 2B-2C (SEQ ID NO: 120), fig. 9A-9B (SEQ ID NO: 122) i fig 9C-9D (SEQ ID NO: 124). Obcięte lub rozszerzone kwasy nukleinowe są objęte wynalazkiem pod warunkiem, że zachowują jedną lub więcej z biologicznych właściwości OPG. Hybrydyzujące kwasy nukleinowe mogą także obejmować pobliskie obszary niekodujące, które są 5' i/lub 3' względem obszaru kodującego OPG Obszary niekodujące obejmują obszary regulacyjne związane z ekspresją OPG takie jak promotory, enhansery, miejsca inicjowania translacji, miejsca zakończenia transkrypcji itp.
Warunki hybrydyzacji dla kwasów nukleinowych zostały opisane, Sambrook i in. Molecular Cloning; A Laboratory Manual, 2nd ed., Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor, New York (1989).
DNA kodujący szczurzą OPG dostarczono w plazmidzie pMO-Bl.l, złożonym w American Type Culture Collection, Rockville, MD, 27 grudnia 1995 roku pod numerem dostępu ATCC 69970. DNA kodujący mysią OPG dostarczono w plazmidzie pRcCMV-mysia OPG złożonym w American Type Culture Collection, Rockville, MD, 27 grudnia 1995 roku pod numerem dostępu 69971. DNA kodujący ludzką OPG dostarczono w plazmidzie pRcCMV-ludzka OPG złożonym w American Type Culture Collection, Rockville, MD, 29 grudnia 1995 roku, pod numerem dostępu 69969. Kwasy nukleinowe według wynalazku będą hybrydyzować w ścisłych warunkach do insertów DNA o numerach dostępu ATCC: 69969, 69970 i 69971, i mają co najmniej jednąz aktywności biologicznych OPG.
Także dostarczone przez wynalazek są pochodne sekwencji kwasu nukleinowego, jak podano na rysunkach fig. 2B, 9A i 9B. W znaczeniu stosowanym w niniejszym zgłoszeniu, pochodne obejmują sekwencje kwasu nukleinowego mające addycję, podstawienie, insercję lub delecję jednej lub więcej reszt taką, że uzyskane sekwencje kodują polipeptydy mające jedną lub więcej reszt aminokwasowych, które dodano, poddano delecji, insercji lub podstawieniu, a uzyskany polipeptyd ma aktywność OPG. Pochodne kwasu nukleinowego mogą być naturalnie występującymi, takimi jak uzyskane przez zmianę splotu lub polimorfizm, lub mogą być zbudowane przy użyciu techniki mutagenezy ukierunkowanej na określone miejsce, dostępnej dla specjalisty. Przykładem naturalnie występującej odmiany OPG jest kwas nukleinowy kodujący zmianę lys na asn przy reszcie 3 w obrębie sekwencji prowadzącej (patrz przykład V). Przyjmuje się, że pochodne kwasu nukleinowego będą kodować zmiany aminokwasów w obszarach cząsteczki, które w najmniejszym stopniu mogą spowodować zakłócenie aktywności biologicznej. Inne pochodne obejmują kwas nukleinowy kodujący związaną z błoną formę OPG mającą domenę zewnątrzkomórkową, jak podano na rysunkach fig. 2B-2C (SEQ ID NO: 120), fig. 9A-9B (SEQ ID NO:122) i fig. 9C-9D (SEQ ID NO: 124) wraz z domenami transbłonowymi i cytoplazmowymi.
W jednym wykonaniu, pochodne OPG obejmują kwasy nukleinowe kodujące obcięte formy OPG mające jeden lub więcej aminokwasów poddanych delecji z końca karboksylowego. Kwasy nukleinowe kodujące OPG mogą mieć od 1 do 216 aminokwasów poddanych delecji z końca karboksylowego. Ewentualnie, obszar Fc przeciwciała może sięgać od nowego
187 408 końca karboksylowego dając biologicznie aktywny polipeptyd fuzji OPG-Fc (patrz przykład XI). W korzystnych wykonaniach, kwasy nukleinowe kodują OPG mające sekwencję aminokwasową z reszt 22-185, 22-189, 22-194 lub 22-201 (stosując numerację z rysunku fig. 9E-F) i ewentualnie, kodujące obszar Fc ludzkiego IgG
Włączone są także kwasy nukleinowe kodujące obcięte formy OPG mające jeden lub więcej aminokwasów poddanych delecji z końca aminowego. Obcięte formy obejmują te pozbawione części lub wszystkich 21 aminokwasów obejmujących sekwencję prowadzącą. Ponadto, wynalazek dostarcza kwasy nukleinowe kodujące OPG mające od 1 do 10 aminokwasów poddanych delecji z dojrzałego końca aminowego (przy reszcie 22) i, ewentualnie, mające od 1 do 216 aminokwasów poddanych delecji z końca -karboksylowego (przy reszcie 401). Ewentualnie, kwasy nukleinowe mogą kodować resztę metioniny przy końcu amino. Przykłady takich obciętych polipeptydów OPG opisano w przykładzie VIII.
Przykłady kwasów nukleinowych według wynalazku obejmują cDNA, genomowy DNA, syntetyczny DNA i RNA. cDNA otrzymuje się z bibliotek wytworzonych z mRNA wyodrębnionego z rozmaitych tkanek ekspresjonujących OPG. U ludzi źródła tkankowe dla OPG obejmują nerki, wątrobę, łożysko i serce. Genomowy DNA kodujący OPG otrzymuje się z genomowych bibliotek, które są dostępne handlowo z rozmaitych gatunków. Syntetyczny DNA otrzymuje się przez syntezę chemiczną nakładających się fragmentów oligonukleotydowych, a następnie zestawienie fragmentów z rekonstrukcją części lub całości obszaru kodującego i sekwencji flankujących (patrz Patent USA nr 4,695,623 opisujący syntezę chemiczną genów interferonu). RNa otrzymuje się najłatwiej przez wektory ekspresji prokariotycznej, które kierują wysokiego poziomu syntezą mRNA, takie jak wektory stosujące Promotory T7 i polimerazę RNA.
Sekwencje kwasu nukleinowego według wynalazku stosuje się do wykrycia sekwencji OPG w próbkach biologicznych, aby określić, które komórki i tkanki realizują ekspresję OPG mRNA. Sekwencji tych można także użyć do skrinowania cDNA i bibliotek genomowych na sekwencje pokrewne OPG. Taki skrining mieści się w obrębie umiejętności specjalisty z tej dziedziny techniki stosującego odpowiednie warunki hybrydyzacji, by wykryć sekwencje homologiczne. Kwasy nukleinowe są również przydatne w modulowaniu poziomów ekspresji OPG przez terapię antysensowną lub genową. Kwasy nukleinowe są również stosowane do opracowywania zwierząt transgenicznych, które mogą być stosowane do wytwarzania polipeptydu i badania aktywności biologicznej (patrz przykład III).
Wektory i komórki gospodarza
Wektory ekspresji zawierające sekwencje kwasu nukleinowego kodującego OPG komórki gospodarza przekształcane przez wspomniane wektory i sposoby wytwarzania OPG są również dostarczone przez wynalazek. Przegląd ekspresji protein rekombinacyjnych znajduje się w Methods of Enzymology v.185, Goeddel, D.V. ed. Academic Press (1990).
Komórki gospodarza do wytwarzania OPG obejmują prokariotyczne komórki gospodarza, takie jak komórki gospodarza E. coli, drożdże, komórki roślinne, owadzie i z organizmu ssaka. Szczepy E. coli takie jak HB101 lub JM101 nadają się do ekspresji. Korzystne komórki gospodarza z organizmu ssaka obejmują komórki COS, CHOd-, 293, CV-1, 3T3, komórki nerek nowo-narodzonych chomików (BHK) i inne. Komórki gospodarza z organizmu ssaka są korzystne, gdy post-translacyjne modyfikacje, takie jak glikozylowanie i przetwarzanie polipeptydu, są ważne dla aktywności OPG Ekspresja w komórkach z organizmu ssaka pozwala na wytwarzanie wydzielanych polipeptydów, które mogą być pozyskane z pożywki.
Wektory ekspresji OPG zawierają, co najmniej sekwencje wymagane dla propagacji wektora i ekspresji sklonowanego insertu. Te sekwencje obejmują miejsce startowe replikacji, marker selekcji, promotor, miejsce wiązania rybosomu, sekwencje enhansera, miejsce splatanie RNA i miejsce zakończenia transkrypcji. Wektory odpowiednie dla ekspresji w uprzednio wspomnianych komórkach gospodarza są łatwo dostępne i kwasy nukleinowe według wynalazku są wstawione w wektory przy zastosowaniu standardowych technik rekombinacyjnych DNA. Wektory dla tkankowo-specyficznej ekspresji OPG są również włączone. Takie wektory obejmują promotory, które działają specyficznie w wątrobie,
187 408 nerkach lub innych narządach dla wytwarzania u myszy, i wektory wirusowe ekspresji OPG w docelowych komórkach ludzkich.
Stosując odpowiedni układ wektor-gospodarz, OPG wytwarza się rekombinacyjnie przez hodowlę komórki gospodarza przekształconej przez wektor ekspresji zawierający sekwencje kwasu nukleinowego kodujące OPG w warunkach takich, że wytwarza się OPG i wyodrębnia się produkt ekspresji. OPG wytwarza się w roztworze sklarowanym transfekowanych komórek z organizmu ssaka lub w ciałach inkluzyjnych transformowanych bakteryjnych komórek gospodarza. Tak wytworzone OPG można oczyścić stosując procedury znane specjaliście w tej dziedzinie techniki jak opisano poniżej. Ekspresję OPG w układach gospodarza - organizmu ssaka i bakteryjnym, opisano w przykładach VII i VIH. Wektory ekspresji dla gospodarza - organizmu ssaka egzemplifikują plazmidy takie jak pDSRa opisane w międzynarodowym zgłoszeniu PCT nr 90/14363. Wektory ekspresji bakteryjnych komórek gospodarza egzemplifikują plazmidy pAMG21 i pAMG22-His opisane w przykładzie VIII. Plazmid pAMG21 złożono w American Type Culture Collection, Rockville, MD, 24 lipca 1996 roku pod numerem dostępu 98113. Plazmid pAMG22-His złożono w American Type Culture Collection, Rockville, MD, 24 lipca 1996 roku pod numerem dostępu 98112. Przyjmuje się, że specyficznie wskazane plazmidy i komórki gospodarza służą, w celach ilustracji i że inne dostępne plazmidy i komórki gospodarza można by także użyć do ekspresji polipeptydów.
Wynalazek dostarcza także ekspresji OPG z endogennych kwasów nukleinowych przez zjawiska rekombinacji in vivo lub ex vivo umożliwiając modulację OPG z chromosomu gospodarza. Ekspresja OPG przez wprowadzenie egzogennych sekwencji regulacyjnych (np. promotorów lub enhanserów) zdolnych do kierowania wytwarzaniem OPG z endogennych obszarów kodujących OPG jest także przewidziana. Stymulowanie endogennych sekwencji regulacyjnych zdolnych do kierowania wytwarzaniem OPG (np. przez wystawienie na działanie czynników zwiększania transkrypcji) jest także dostarczona przez wynalazek.
Polipeptydy
Wynalazek dostarcza OPG, nowy człon superrodziny receptora TNF, mającą aktywność inhibitowania resorpcji kości, a tym samym zwiększania gęstości kości. OPG odnosi się do polipeptydu mającego sekwencję aminokwasową mysiej, szczurzej lub ludzkiej OPG lub ich pochodnej mającej, co najmniej jedną z aktywności biologicznych OPG Sekwencje aminokwasowe szczurzej, mysiej i ludzkiej OPG przedstawiono odpowiednio na rysunkach fig. 2B-2C (SEQ ID NO: 121), 9A-9B (SEQ ID NO: 123) i fig. 9C-9D (SEQ ID NO: 125). Pochodna OPG odnosi się do polipeptydu mającego addycję, delecję, insercję lub podstawienie jednego lub więcej aminokwasu takiego, że uzyskany polipeptyd ma, co najmniej jedną z aktywności biologicznych OPG Aktywności biologiczne OPG obejmują, (lecz nie są ograniczone do) aktywności związane z metabolizmem kości. Korzystnie, polipeptydy będą mieć aminokwasową sekwencję prowadzącą o usuniętych 21 aminokwasach.
Polipeptydy OPG ujęte w wynalazku obejmują polipeptydy: szczurzy [1-401], szczurzy [22-180], szczurzy [22-401]-Fc fuzja, szczurzy [1-180]-Fc fiizja, mysi [1-401], mysi [1-180], mysi [22-401], ludzki [1-401], mysi [22-180], ludzki [22-401], ludzki [22-180], ludzki [1-180], ludzki [22-180]-Fc fuzja i ludzki met-32-401. Numeracja aminokwasów jest taka, jak podano w SEQ ID NO:121 (szczurzy), w SEQ ID NO:123 (mysi) i w SEQ ID NO:125 (ludzki). Ujęte są także pochodne polipetydowe mające delecję lub karboksykońcowe obcięcia części lub wszystkich reszt aminokwasowych 180-401 w OPG; jedną lub więcej zmian aminokwasów w resztach 180-401; delecję części lub całości domeny bogatej w cysteinę OPG, w szczególności delecję odległej (karboksykońcowej) domeny bogatej w cysteinę; i jedną lub więcej zmian aminokwasów w domenie bogatej w cysteinę, w szczególności w odległej (karboksykońcowej) domenie bogatej w cysteinę. W jednym wykonaniu OPG ma od 1 do około 216 aminokwasów poddanych delecji z końca karboksylowego. W innym wykonaniu OPG ma od 1 do około 10 aminokwasów poddanych delecji z dojrzałego końca amino (w którym dojrzały koniec amino jest przy reszcie 22) i, ewentualnie, ma od 1 do około 216 aminokwasów poddanych delecji z końca karboksylowego.
Dodatkowe polipeptydy OPG ujęte w wynalazku obejmują: ludzki [22-180]-Fc fuzja, ludzki [22-201]-Fc fuzja, ludzki [22-401]-Fc fiizja, mysi [22-185]-Fc fuzja, mysi [22-194]-Fc
187 408 fuzja. Polipeptydy te wytworzono w komórkach gospodarzach z organizmu ssaka, takich jak CHO lub 293. Dodatkowe polipeptydy OPG ujęte w wynalazku, które są ekspresjonowane w priokariotycznych komórkach gospodarza obejmują następujące: ludzki met[22-401], Fc-ludzki met[22-401] fuzja (obszar Fc poddano fuzji przy końcu amino sekwencji kodującej OPG o pełnej długości, jak opisano w przykładzie VIII), ludzki met[22-401]-Fc (obszar Fc poddano fuzji z pełnej długości sekwencją OPG), Fc-mysi met[22-401] fuzja, mysi met[22-401]-Fc fuzja, ludzki met[27-401], ludzki met[22-185], ludzki met[22-189], ludzki met[22-194], ludzki met[22-194] (P25A), ludzki met[22-194] (P26A), ludzki met[27-185], ludzki met[27-189], ludzki met[27-194], ludzki met-arg-gly-ser-(his)6[22-401], ludzki met-lys [22-401], ludzki met-(lys)3-[22-401 ], ludzki met[22-401]-Fc (P25A), ludzki met[22-401] (P25A), ludzki met[22-401] (P26A), ludzki met[22-401] (P26D), mysi met[22-401], mysi met[27-401], mysi met[32-401], mysi met[27-180], mysi met[22-189], mysi met[22-194], mysi met[27-189], mysi met[27-194], mysi met-lys[22-401], mysi HEK[22-401](A45T), mysi met-lys-(his)7[22-401], mysi met-lys[2^^4^01]^(Fii^)7 oraz mysi met[27-401] (P33E, G36s, A45P). Należy rozumieć, że powyższe polipeptydy OPG wytworzone w prokariotycznych komórkach gospodarza mają amino -końcową resztę metioniny, jeśli takiej reszty nie wskazano. W konkretnych przykładach fuzję OPG-Fc wytworzono stosując obszar 227-aminokwasowy ludzkiej nIgG1-1 mający sekwencję jak podano w: Ellison i in. (Nuc. Acids Res. 10, 4071-4079 (1982)). Jednakże można także użyć odmian obszaru Fc ludzkiej IgG.
Analiza aktywności biologicznej karboksykońcowych obcięć OPG poddanych fuzji do obszaru Fc ludzkiego IgG1 wskazuje na część OPG o około 164 aminokwasach, która jest wymagana dla aktywności. Ten obszar obejmuje aminokwasy 22-185, korzystnie te z rysunku fig. 9C-9D (SEQ ID NO: 125), i zawiera cztery bogate w cysteinę domeny charakterystyczne dla bogatych w cysteinę zewnątrz komórkowych domen TNFR.
Stosując homologię między OPG i zewnątrzkomórkowymi wiążącymi ligand domenami członów rodziny receptora TNF, wytworzono trójwymiarowy model OPG opierając się na znanej strukturze krystalicznej zewnątrzkomórkowej domeny TNFR-I (patrz przykład VI). Model ten użyto do identyfikacji tych reszt w obrębie OPG które mogą być ważne dla aktywności biologicznej. Zidentyfikowano reszty cysteinowe związane z utrzymywaniem struktury czterech domen bogatych w cysteinę. Następujące wiązania dwusiarczkowe zidentyfikowano w modelu: Domena 1: cys41 do cys54, cys44 do cys62, tyr23 i his66 mogą działać stabilizująco na strukturę tej domeny; Domena 2: cys65 do cys80, cys83 do cys98, cys87 do cysl05; Domena 3: cysl07 do cysll8, cysl24 do cysl42; Domena 4: cysl45 do cys160, cys166 do cys185. Zidentyfikowano także reszty, które są w bezpośredniej bliskości do TNFP jak podano na rysunkach fig. 11 oraz fig. 12A-12B. W tym modelu zakłada się, że OPG wiąże się z odpowiadającym ligandem; TNFe użyto jako ligand modelowy symulując oddziaływanie OPG ze swoim ligandem. Opierając się na tym modelowaniu, następujące reszty w OPG można uznać za ważne dla wiązania ligandu: glu34, lys43, pro66 do gln91 (w szczególności, pro66, his68, tyr69, tyr70, thr71, asp72, ser73, his76, ser77, asp78, gly79, leu81, tyr82, pro85, val86, lys88, glu90 oraz gln91), glu153 oraz ser155.
Zmiany w tych resztach aminokwasowych, pojedynczo lub w kombinacji, mogą zmienić aktywność biologiczną OPG. Na przykład zmiany konkretnych reszt cysternowych mogą zmienić strukturę poszczególnych domen bogatych w cysteinę, podczas gdy zmiany reszt ważnych dla wiązania ligandu mogą wpłynąć na fizyczne oddziaływania OPG z ligandem. Modele strukturalne mogą pomóc w identyfikacji analogów, które mają bardziej pożądane właściwości, takie jak zwiększona aktywność biologiczna, większa trwałość lub większa łatwość formulacji.
Wynalazek dostarcza także multimer OPG obejmujący monomery OPG OPG wydaje się być aktywna jako multimer (np. dimer, trimer lub o wyższej liczbie monomerów). Korzystnie, multimery OPG są dimerami lub trimerami. Multimery OPG mogą obejmować monomery mające sekwencję aminokwasową OPG wystarczającą by sprzyjać tworzeniu multimeru lub mogą obejmować monomery mające sekwencje heterologicznie takie jak obszar Fc przeciwciała. Analizy karboksy-końcowych delecji OPG sugerują że co najmniej część obszaru 186-401 jest związana z asocjacją polipeptydów OPG Podstawienie części lub całości
187 408 obszaru aminokwasów 186-401 OPG sekwescją aminokwasową zdolsą do samoasocjacji jest także objęte wynalazkiem. Alternatywnie, polipeptydy OPG lub ich pochodne można zmodyfikować, aby tworzyć dimery lub multimery przez mutagenezę ukierunkowaną na określone miejsce, by utworzyć niespurowune reszty cysteisowe dla wykonania międzyłańcuchowego wiązania dwusiarczkowego, przez sieciowanie fotochemiczne, takie jak wystawienie sa światło nadfioletowe, lub przez sieciowasie chemiczne dwufuskcyjnymi cząsteczkami linkera, takimi jak dwhfhnkcajna glikol polietylenowy itp.
Modyfikacje solipeptadón OPG są objęte przez wynalazek i obejmują post-translacajne modyfikacje (np. N-łączone lub O-łączone łańcuchy węglowodanowe, przetwarzanie N-końcowych lub C-końcowych końców), przyłączenie ugrupowań chemicznych do szkieletu amisokwuconego, chemiczne modyfikacje N-łączosych lub O-łączosych łańcuchów węglowodanowych, i addycję N-końcowej reszty metioniny w wyniku ekspresji srokuriotaczneC komórki gospodarza. Poliseptyda można także zmodyfikować wykrywalnym znacznikiem, takim jak znacznik enzymatyczny, fluoroscencyjny, izotopowy lub przejawiający powinowactwo, by umożliwić wykrycie i wyodrębnienie proteiny.
Dalsze modyfikacje OPG obejmują proteiny chimeryczne, w których OPG jest poddana fuzji z heterologiczną sekwescją aminokwasową. Heterologiczna sekwencja może być jakąkolwiek sekwencją, która pozwala na uzyskanie proteiny fuzyjnej, zachowującej aktywność OPG. Sekwencje heterologiczne obejmują sp. fuzje immunoglobuliny, takie jak fuzje Fc, które mogą pomóc w oczyszczaniu proteiny. Korzystna jest sekwencja heterologiczną, która sprzyja asocjacji monomerów OPG w dimery, trimery i isne wyższe multimeryczse formy.
Polisestada według wynalazku są wyodrębnione i oczyszczane z isnych polipeptydów obecnych w tkaikach, liniach komórkowych i transformowanych komórkach gospodarza ekspresjosujacach OPG, lub oczyszczane ze składników w hodowlach komórkowych zawierających wydzielaną proteinę. W jednym wykonaniu polipeptyd jest wolny od asocjacji z innymi ludzkimi proteinami, takich jak produkt ekspresji bakteryjnej komórki gospodarza.
Dostarczane przez wynalazek są także chemicznie zmodyfikowane pochodne OPG, które mogą zapewnić dodatkowe korzyści, takie jak zwiększoną trwałość i czas cyrklowania solipestadh, lub zmniejszoną immusogesność (patrz Patest USA Nr 4,179,337). Ugrupowania chemiczne dla dekatyzacji mogą być wybrane spośród rozpuszczalnych w wodzie polimerów, takich jak glikol polietylenowy, kopolimery, glikol etylenowy/glikol propylenowy, kurboksametalocelulozα, dekstran, alkohol poliwinylowy itp. Polisestyda mogą być modyfikowane w losowych pozycjach w obrębie cząsteczki lub we wstępnie ustalonych pozycjach w obrębie cząsteczki i mogą obejmować jedso, dwa, trzy lub więcej przyłączonych ugrupowań chemicznych.
Polimer może mieć dowolny ciężar cząsteczkowy i może być rozgałęziony lub sierozgałęziony. W przypadku glikolu polietylenowego korzystny ciężar cząsteczkowy wynosi między około 1 kDa i około 100 kDa (określenie „około” wskazuje, że w preparatach glikolu polietylenowego, pewne cząsteczki będą ważyć więcej, pewne mniej, siż podany ciężar cząsteczkowy) dla łatwości operowania i wytwarzania. Mogą być stosowane isne wielkości zależnie od żądanego profilu terapeutycznego (sp. żądanego czasu trwania powolnego uwalniania, wpływu, jeśli ma miejsce, sa aktywność biologiczną, łatwości posługiwania się, stopnia lub braku astygesności i isnych znanych wpływów glikolu polietylenowego sa terapeutyczne proteiny lub analogi).
Cząsteczki glikolu polietylenowego (lub insych ugrupowań chemicznych) powinny być przyłączone do proteiny przy rozpatrzeniu wpływu na funkcyjne lub antygenowe domeny proteiny. Istnieje pewsa liczba metod przyłączenia dostępnych specjalistom z tej dziedziny techniki, np. EP 0 401 384, włączony do niniejszego zgłoszenia jako odsyłacz (sprzęganie PEG z G-CSF), patrz także Malik i is., Exp. Hematol. 20.: 1028-1035 (1992) (opisuje segalonanie GM-CSF przy zastosowaniu chlorku tresylu). Na przykład glikol polietylenowy może być kowalencyjnie związany przez reszty aminokwasowe poprzez grupę reaktywną, taką jak wolna grupa aminowa lub grupa karboksylowa. Reaktywne grupy są takimi, do których może być związana aktywowana cząsteczka glikolu polietylenowego. Reszty aminokwasowe mające wolsą grupę aminową mogą obejmować reszty
187 408 lizynowe i N-końcowe reszty aminokwasowe; te mające wolną grupę karboksylową mogą obejmować reszty kwasu asparginowego i reszty kwasu glutaminowego i C-końcowe reszty aminokwasowe. Sulfhydrylowe grupy można także użyć jako grupę reaktywną dla przyłączenia cząsteczki (cząsteczek) glikolu polietylenowego. Dla celów terapeutycznych korzystne jest przyłączenie przy grupie aminowej, takie jak przyłączenie przy N-końcu lub grupie lizynowej.
Można specyficznie żądać proteiny chemicznie modyfikowanej N-końcowo. Stosując glikol polietylenowy jako ilustrację obecnych kompozycji, można wybierać spośród rozmaitych cząsteczek glikolu polietylenowego (według ciężaru cząsteczkowego, rozgałęzienia, itp.), stosunku ilościowego cząsteczek glikolu polietylenowego do cząsteczek proteiny (lub peptydu) w mieszaninie reakcyjnej, typu reakcji pegylowania, którą należy wykonać i metody otrzymywania wybranej N-końcowo pegylowanej proteiny. Metoda otrzymywania N-końcowo pegylowanego preparatu (tzn. oddzielenie tego ugrupowania od innego monopegylowanego ugrupowania, jeśli jest to niezbędne) może polegać na oczyszczaniu N-końcowo pegylowanego materiału z populacji pegylowanych cząsteczek protein. Selektywne N-końcowe chemicznie modyfikowane można wykonać przez redukcyjne alkilowanie, które wykorzystuje zróżnicowaną reaktywność różnych typów pierwszorzędowych grup aminowych (lizyna versus N-koniec) dostępnych dla derywatyzacji w konkretnej proteinie. W odpowiednich warunkach reakcji, osiąga się zasadniczo selektywną derywatyzację proteiny przy N-końcu polimerem zawierającym grupę karbonylową.
Syntetyczne dimery OPG można wytworzyć przez rozmaite procedury sieciowania chemicznego. Monomery OPG można chemicznie wiązać w każdy sposób, który zachowuje lub zwiększa aktywność biologiczną OPG. Można stosować rozmaite chemiczne środki sieciujące zależnie od tego, które właściwości dimeru proteiny są pożądane. Na przykład środki sieciujące mogą być krótkie i względnie sztywne lub dłuższe i bardziej giętkie, mogą być biologicznie odwracalne i mogą nadawać zmniejszoną immunogenność lub dłuższy, farmakokinetyczny okres półtrwania.
W jednym przykładzie, cząsteczki OPG są wiązane przez koniec amino w dwuetapowej syntezie (patrz przykład XII). W pierwszym etapie, OPG jest chemicznie modyfikowana przy końcu amino dla wprowadzenia zabezpieczonego tiolu, który po oczyszczaniu jest odbezpieczany i stosowany jako punkt przyłączenia specyficznego względem miejsca sprzężenia przez rozmaite środki sieciujące z drugą cząsteczką OPG Amino-końcowe wiązania poprzeczne obejmują (lecz nie są ograniczone do) wiązania dwusiarczkowe, wiązania tioeterowe stosujące krótkołańcuchowe, dwufunkcyjne alifatyczne środki sieciujące i wiązania tioeterowe do środków sieciujących będących dwufunkcyjnym glikolem polietylenowym, o zmiennej długości („hantle” PEG). Przez syntezę „hantla” PEG z dimerów OPG objęty jest produkt uboczny takiej syntezy, zwany „monohantel”. Monohantel OPG składa się z monomeru sprzężonego z liniowym dwufunkcyjnym PEG o wolnym końcu polimerycznym. Alternatywnie, OPG można sieciować bezpośrednio za pomocą szeregu amino-specyficznych homobifunkcyjnych technik sieciowania, które obejmują reagenty takie jak: dwubezwodnik dwuetylenotrójaminopięciooctowy (DTPA), p-benzochinon (pBQ) lub suberynian bis(sulfobursztynianu) (BS3), i inne znane w tej dziedzinie techniki. Jest także możliwe bezpośrednie tiolowanie OPG reagentami takimi jak iminotiolan w obecności rozmaitych dwufunkcyjnych, tiolospecyficznych środków sieciujących, takich jak PEG-bismaleimid i osiągnięcie dimeryzacji i/lub hantli w procesie jednoetapowym.
Sposób oczyszczania OPG ze źródła naturalnego i z transfekowanych komórek gospodarza jest także objęty wynalazkiem. Proces oczyszczania może wykorzystywać jeden lub więcej standardowych etapów oczyszczania protein w odpowiednim porządku, by otrzymać oczyszczoną proteinę.
Etapy chromatograficzne mogą obejmować wymianę jonów, filtrację żelową, oddziaływanie hydrofobowe, użycie odwróconych faz, chromatofokusację, chromatografię na zasadzie powinowactwa przy zastosowaniu przeciwciała anty-OPG lub kompleksu powinowactwa biotyna-streptawidyna, itp.
187 408
Przeciwciała
Przez wynalazek objęte są także przeciwciała speoafioypik wiążące się z OPG Antygenami dla twnryknSa przeciwciał mogą być pełnej dłGnnści polipeptydy lub peptydy obejmujące część sekwencji OZm. Procedury immunologiczne tworzenia polSelonalnaoh lub mopoklonalnych przeciwciał reaktywnych z OPG są znane spkojuliście z tej dziedziny techniki (patrz, np., Harlow i Lane, AptSbodSes·; A Luborutora Manual Cold Spring Harbor Luboratnra Press, Cold Spring Harbor N.Y. (1988)). Przeciwciała tak wytworzone charakteryzują się specyficznością wiązania i rozpoznaniem epitopu przy yactosnwamG standardowych prób związanego z enzymem immuposorbentG. Przeciwciała także obejmują chimeryczne przeciwciała mające zmienne i stałe obszary domen pochodzących z różnych gatunków. W jednym wakopunSu, chimeryczne przciwciała są przeciwciałami mającymi zmienne domeny mysie lub szczurze i stałe domeny ludzkie. Wynalazkiem także objęte są obszary określające knmplemeptumuść syczkpinpk do ludzkiej ramy (tzw. przeciwciała szczepione do CDR). Przeciwciała chimeryczne i szczepione do CDR są wykonane metodami rekombinacyjpamS znanymi specSaliśoit z tej dziedziny techniki. Przewidziane są także ludzkie przeciwciała waknnane u myszy·
Przeciwciała anta-OPm według wynalazku można stosować jako odczynnik pnwipowactwa do oczyszczania OPG z próbek biologicznych (patrz przykład X). W Skdpam sposobie, przeciwciało Smmobiliyowape na Sepharose aktywowanej CnBr i kolumnę knniugutu przkciwciałn-Skphurnse stncujk się by usunąć OPG z ciekłych próbek. Przeciwciała są również stosowane jako reagenty diagnostyczne, aby wykryć i ująć ilnśoinwo OPG w próbkach biologioypaoh metodami opisanymi poniżeś.
Kompozycie farmaceutyczne
Wynalazek dostarcza także knmpnyacSk farmaceutyczne obkSmuSące terapeutycznie skuteczną ilość polipeptydu według wynalazku wraz z farmaceutycznie dopuszczalnym rozoikńozalpieiem, nośnikiem, sulubfiiyerem, emulgatorem, konserwantem i/lub adjuwantem. Określenie „tkrupkutyoypik skuteczna ilość” oznacza ilość, która pozwala osiągnąć terapeutyczny efekt w specyficznych warunkach i spnsnbie podawania. Kompozycja może występować w postaci ciekłej bądź liofilizowanej formie i obeSmuSe rozcieńczalnik (bufory Tris, octanowy lub fosforanowy) o różnych wartościach pH i różnej mocy jonowej, snlubilizer taki jak Tween lub Pohsorbute, nośniki takie jak ludzka albumina surowicy lub żelatyna, konserwanty takie jak thimerosal lub alkohol benzylowy, i uptyGtlkPiucye takie jak kwas ucknrbipowy lub kwaśny mktusiarczap sodu. Ujęte są także knmpozaoSe obejmująoe OPG modyfikowaną rozpuszczalnymi w wodzie polimerami, aby zwiększyć rozpuszczalność lub trwałość. Kompozycje mogą obejmować również włączenie OPG do lipozomów, mikrokmulsSi, micelli lub pęcherzyków w okla zapewnienia kontrolowanego podawania przez wydłużony okres czasu. Specyficznie, kompuzaoje OPG mogą obkSmnwuć włączenie do pnlimeracynach matryc takich jak hydrożele, ^Ιϊ^^, polietyleny, kopolimery etylen-octan winylu lub polimery biodegradowulpk. Przykłady hydrożeli obejmują pnlihadrnkcyulkSlometukralapa (p-HEMA), poliakryloamid, pohmetukralumid, poliwinylnpSrnlSdnp, alkohol poliwinylowy, oraz różne kompleksy pulieleetrolitów. Przykłady zdolnych do biodegradacji polimerów obejmują kwas polSmlkkowa (PLA), kwas pohglieolowy (PGA), kopolimery PLA i PGA, puhumida i kopolimery poliamidów oraz poliestry. Inne formy leków o kontrolowanym uwalnianiu obeSmują mikrueussułei, mikrosfery, makromolekularne kompleksy i perełki polimerowe, które mogą być podawane przez injekcję.
Wybór eonkrktnach kompozycji będzie zależał od szeregu czynników, nbejmującaoh stan podlkgąjąoa leczeniu, drogi podawania i żądane parametry furmuknkSnetycyne. Bardziej rozległy przegląd składników odpowiednich do farmaceutycznych kompnyaoji znajdaSe się w Remington^ Pharmaceutical Sciences, 18th ed. A.R. Gennaro, ed. Mack, Euctnn, PA (1980).
KumpozacSk według wynalazku mogą być podawane przez ipSekoję, a więc albo podskórnie, dożylnie lub domięśniowo, bądź doustnie, do nosa, dopłGopie lub dnodbatpiozu. Droga podawania ostatecznie zależeć będzie od szeregu czynników i może ją ustalić jedynie spkoSalistu w tej dziedzinie.
187 408
Wynalazek dostarcza także farmaceutyczne kompozycje zawierające terapeutycznie skuteczne ilości kwasów nukleinowych według wynalazku wraz z farmaceutycznie dopuszczalnym adjuwantem. Kompozycje zawierające kwas nukleinowy będą użyteczne dla dostarczania części lub całości obszaru kodującego OPG do komórek i tkanek jako części reżimu terapii antysensowej lub genowej.
Zastosowania terapeutyczne
Tkanka kości zapewnia wsparcie dla ciała ludzkiego i składa się ze składników mineralnych (głównie z wapnia i fosforu), istoty podstawnej protein kolagenowych i niekolagenowych oraz komórek. Trzy rodzaje komórek znajdujących się w kościach, osteocyty, osteoblasty i osteoklasty, włączone są w dynamiczny proces, dzięki któremu kości są w sposób ciągły budowane i resorbowane. Osteoblasty prowadzą tworzenie tkanki kostnej, podczas gdy osteoklasty związane są z resorpcją. Resorpcja, czyli rozkład istoty podstawnej kości i składników mineralnych, jest szybkim i wydajnym procesem w porównaniu do budowania kości i może uwalniać duże ilości składników mineralnych z kości. Osteoklasty związane są z regulacją normalnej przebudowy tkanki szkieletowej i z resorpcją indukowaną hormonalnie. Na przykład, resorpcja jest stymulowana przez wydzielanie hormonu przytarczycowego w odpowiedzi na obniżenie stężenia jonów wapniowych w płynach zewnątrzkomórkowych. Natomiast inhibitowanie resorpcji jest głównym zadaniem kalcytoniny. Ponadto, metabolity witaminy D zmieniają odpowiedź kości na działanie hormonu przytarczycowego i kalcytoniny.
Po osiągnięciu dojrzałości szkieletu, ilość tkanki kostnej w szkielecie odpowiada równowadze (lub nierównowadze) tworzenia kości i resorpcji kości. Największa masa kości występuje po osiągnięciu dojrzałości szkieletu, przed czwartą dekadą wieku człowieka. Między czwartą, a piątą dekadą równowaga przesuwa się i dominuje resorpcja kości. Nieuniknione obniżenie masy kości z biegiem łat rozpoczyna się wcześniej u kobiet niż mężczyzn i jest wyraźnie przyspieszone po menopauzie u niektórych kobiet (głównie u kobiet białych i azjatek).
Osteopenia jest stanem dotyczącym zasadniczo jakiegokolwiek obniżenia masy kości poniżej normalnego poziomu. Taki stan może powstać z obniżenia szybkości syntezy kości lub w wyniku wzrostu szybkości rozkłady kości, bądź obu tych zjawisk. Najpowszechniejszą postacią osteopenii jest pierwotna osteoporoza, zwana także jako osteoporoza postmenopauzalna oraz osteoporoza starcza. Ta forma osteoporozy jest wynikiem powszechnego ubywania kości wraz z wiekiem i jest zwykle rezultatem wzrostu resorpcji kości w porównaniu do normalnej szybkości budowania kości. U około 25 do 30 procent wszystkich białych kobiet w Stanach Zjednoczonych rozwija się osteoporoza objawowa. Istnieje prosta zależność między osteoporozą a złamaniem stawu biodrowego, szyjki kości udowej, szyji i międzykrętarzowym u kobiet 45-letnich i starszych. U starszych mężczyzn rozwija się osteoporoza objawowa występująca między 50 a 70 rokiem życia, lecz choroba w pierwszym rzędzie atakuje kobiety.
Przyczyna występowania osteoporozy postmenopauzalnej i starczej nie jest znana. Zidentyfikowano kilka czynników mających wpływ na ten stan. Obejmują one zmianę w poziomie hormonów towarzyszącym wiekowi i nieodpowiednie przyswajanie wapnia przypisywane zmniejszonej absorbcji w jelitach wapnia i innych składników mineralnych. Leczenie polega zwykle na terapii hormonalnej lub na uzupełnianiu pożywienia aby spowodować opóźnianie tego procesu. Jak dotąd, jednakże, nie istnieje skuteczne leczenie zaniku kości.
Obecnie dostępny stał się sposób leczenia zaburzeń chorobowych kości polegający na stosowaniu terapeutycznie skutecznych ilości OPG Zaburzenia chorobowe kości mogą być dowolnymi zaburzeniami charakteryzującymi się utratą kości netto (osteopenia lub osteoliza). Zasadniczo, leczenie za pomocą OPG jest zalecane, kiedy jest konieczne ograniczenie szybkości resorpcji kości. Zatem leczenie można przeprowadzić dla zmniejszenia szybkości resorpcji kości, gdy szybkość resorpcji jest wyższa od normalnej lub dla zmniejszenia resorpcji kości poniżej normalnego poziomu, aby skompensować pozostający poniżej normalnego poziom tworzenia kości.
187 408
Przypadki, które nadają się do leczenia za pomocą OPG, obejmują następujące schorzenia:
Osteoporoza, jak osteoporoza pierwotna, osteoporoza endokrynna (nadczynność tarczycy, nadczynność przytarczyc, zespół Cushing'a, i akromegalia), dziedziczne i wrodzone formy osteoporozy (osteogeneza niezupełna, homocystynuria, zespół Menkesa, i zespół Rileya-Daya), i osteoporozy będące następstwem unieruchomienia kończyn.
Choroba kości typu Pageta (deformujące zapalenie kości) u dorosłych i młodzieży.
Zapalenie szpiku lub infekcyjne uszkodzenie kości prowadząca do ubytku kości.
Hiperkalcemia pochodząca z litych guzów (piersi, płuca i nerki) i hematologicznych nowotworów złośliwych (szpiczak mnogi, ziarnica złośliwa i białaczka), samoistna hiperkalcemia i hiperkalcemia związana z nadczynnością tarczycy i z zaburzeniami funkcji nerek.
Występująca po operacji osteopenia, indukowana przez podawanie steroidów i związana z zaburzeniami jelita cienkiego i grubego oraz z chronicznymi chorobami wątroby i nerek.
Osteonekroza lub śmierć komórek kości, związana z urazami i obrażeniami lub bezurazową martwicą związaną z chorobą Gauchera, niedokrwistością sierpowatokrwinkową, układowym liszajem rumieniowatym i innymi warunkami.
Zanik kości na skutek przewlekłego postępującego gośćca stawowego.
Zanik kości przyzębia.
Przerzuty osteolityczne.
Jest zrozumiałe, że OPG może być stosowana samodzielnie lub w połączeniu z innymi czynnikami do leczenia zaburzeń kości. W jednym wykonaniu, osteoprotegerynę stosuje się w połączeniu z terapeutycznie skuteczną ilością czynnika stymulującego formowanie kości. Czynniki takie zawierają (lecz nie są do tego ograniczone) czynniki kostno-morfogeniczne BMP-1 do BMP-12, transformujący czynnik-β wzrostu (TGF-β) i elementy rodziny TGF-β inhibitory interleukiny-1, inhibitory TNFa, hormon przytarczyc i jego analogi, proteiny związane z przytarczycami i ich analogi, prostaglandyny serii E, dwufosfoniany (taki jak alendronian i inne) oraz minerały wzmacniające kości, takie jak fluorki i wapń.
Poniższe przykłady zamieszczono dla pełniejszego zilustrowania wynalazku. Nie stanowią one ograniczenia zakresu wynalazku.
Przykład I
Identyfikacja i wyodrębnienie szczurzego cDNA OPG
Materiały i sposoby klonowania cDNA i analizy opisano w: Maniatis et al, ibid. Łańcuchowe reakcje przy użyciu polimerazy (PCR) przeprowadzono stosując termocykler typu Perkina-Elmera 9600 przy użyciu mieszaniny reakcyjnej PCR (Boehringer-Mannheim), i stężenia primera określone przez producenta. Ogólnie, 25-50 pl reakcje denaturowano w 94°C, następnie w 20-40 cyklach po 5 sekund w 94°C, w 50-60°C przez 5 sekund i w 72°C przez 3-5 minut. Następnie reakcje poddano działaniu 72°C przez 3-5 minut. Następnie reakcje poddano analizie metodą elektroforezy na żelu, jak to opisano przez Maniatis et al., ibid.
Bibliotekę cDNA sporządzono przy użyciu mRNA wyodrębnionego z embrionowego jelita d20 dla analizy EST (Adams i in., Science 252, 1651-1656 (1991)). Szczurze embriony rozcinano i wyjmowano całe rozwijające się małe i duże jelito i przemywano w PBS. Całe komórkowe RNA oczyszczono metodą kwasowej ekstrakcji mieszaniną, tiocyjanianofenolan guanidyny-chloroform, (Chomczyński i Sacchi, Anal. Biochem. 162. 156-159, (1987)). Frakcje mRNA poly (A+) otrzymano z całego preparatu RNA przez adsorpcję do i wymycie z, przy użyciu urządzenia typu Dynabeads Oligo (dT)25 (Dynal Corp), stosując procedurę zalecaną przez producenta. Bibliotekę losowo prymowanego cDNA utworzono posługując się metodą Superscript Plasmid System (Gibco BRL, Gaithersburg, Md). Losowy primer cDNA zawierający wewnętrzne miejsce restrykcyjne Not I, który użyto do zapoczątkowania syntezy pierwszej nici, miał następującą sekwencję:
5'- A A AGGA AGGAAAAAAGCGGCCGCTACANNNNNNNNT-3' (SEQ ID NO:1)
Not I
187 408
Dla syntezy pierwszej nici trzy oddzielne reakcje połączono tak, ze zawierały 2,5 pg poly (A) RNA i 120 ng, 360 ng lub 1,080 ng losowego primeru. Po syntezie drugiej nici produkty reakcji oddzielnie ekstrahowano mieszaniną o składzie: fenol:chloroform:alkohol izoamylowy (w proporcji 25:24:1), a następnie wytrącono etanolem. Dwuniciowe (ds) produkty cDNA z trzech reakcji połączono i ligowano do następującego adaptera oligonukleotydowego ds:
5'-TCGACCCACGCGTCCG-3' (SEQ ID NO:2)
3'-GGGTGCGCAGGCp-5' (SEQ ID NO:3)
Po ligacji cDNA wytrawiono całkowicie stosując Not I, ekstrahowano mieszaniną, fenol:chloroform:alkohol izoamylowy (w proporcji 25:24:1) i wytrącono etanolem. Ponownie przeprowadzony w stan zawiesiny cDNA poddano następnie frakcjonowaniu pod względem wielkości na żelu filtracyjnym, stosując uprzednio przygotowane kolumny z Superscript Plasmid System (Gibco BRL, Gaithersburg, Md), jak zaleca producent. Dwie frakcje zawierające największe produkty cDNA połączono, wytrącono etanolem a następnie w sposób ukierunkowany ligowano na wytrawiony w NotI i SalI wektor pMOB DNA. (Strathmann i in., 1991). Ligowane cDNA wprowadzono do kompetentnego szczepu ElectroMAX DH10B E. coli (Gibco BRL, Gaithersburg, MD) metodą elektroporowania. W celu wykonania automatycznej analizy sekwencyjnej około 10.000 transformantów umieszczono na płytkach agarowych o wymiarach 20 cm x 20 cm zawierających pożywką LB wzbogaconą ampicyliną. Hodowle które wyrosły zebrano i ułożono w 96 wgłębieniach płytek do mikroanalizy (typu microtiter) zawierających 200 ml brzeczki L, 7,5% gliceryny i 50 pg/ml ampicyliny. Hodowle wzrastały przez noc w temperaturze 37°C, wytworzono duplikat zestawu płytek (typu microtiter) przy użyciu sterylnego narzędzia do replikacji o 96 ostrzach, po czym oba zestawy przechowywano w temperaturze -80°C dla dalszych analiz. Dla klonowania cDNA o pełnej długości umieszczono około jeden milion transformantów na 96 płytkach bakteryjnych z ampicyliną, zawierających około 10.000 klonów każda. Plazmidowy DNA z każdej porcji umieszczono oddzielnie przy użyciu zestawu Qiagen Plasmid Maxi Kit (Qiagen Corp., Germany), i rozmieszczono w 96 płytkach typu microtiter dla analizy PCR.
W celu sekwencjonowania klonów cDNA pochodzących z dowolnego płodowego jelita szczurzego, rozmrożono glicerynowe zasoby, i niewielkie próbki rozcieńczono 1:25 w wodzie destylowanej. Około 3,0 ml rozcieńczonych hodowli bakterii dodano do mieszaniny reakcyjnej PCR (Boehringer-Mannheim) zawierającej następujące oligonukleotydy:
'-TGTAAAACGACGGCCAGT-3' (SEQ ID NO:4)
5'-CAGGAAACAGCTATGACC-3' (SEQ ID NO:5)
Reakcje inkubowano w termocyklerze (Perkin-Elmer 9600) przy następujących warunkach cykli: w temperaturze 94°C przez 2 minuty; 30 cykli w 94°C przez 5 sekund, 50°C przez 5 sekund i 72°C przez 3 minuty; 72°C przez 4 minuty. Po inkubacji w termocyklerze reagenty rozcieńczono 2,0 ml wody. Amplifikowane fragmenty DNA poddano dalszemu oczyszczaniu przy użyciu kolumn Centricon (Princeton Separations) stosując się do zaleceń producenta. Produkty reakcji PCR sekwencjonowano przy użyciu urządzenia Applied Biosystems 373A do automatycznego sekwencjonowania DNA przy użyciu primera T3 (oligonukleotyd 353-23):
5'-CAATTAACCCTCACTAAAGG-3* (SEQ ID NO:6), z barwnym wskazaniem końca reakcji (Applied Biosystems) w myśl zalecanej przez producenta procedury.
Wynikową sekwencję 5'-nukleotydową otrzymaną z dowolnie wybranych klonów cDNA, poddano translacji i następnie porównano z istniejącymi bazami danych znanych sekwencji proteinowych przy użyciu modyfikowanej wersji programu FASTA (Pearson i inni.,
187 408
Meth. Enzymol. 183, (1990)). Poddane translacji sekwencje były również analizowane na obecność specyficznego, bogatego w cysteinę motywu proteiny występującego we wszystkich znanych członach superrodziny receptora czynnika martwicy nowotworów - TNFR (Smith i inni., Celi 76, 959-962 (1994)), przy użyciu metody profilu sekwencji Gribskov'a i in. (Proc. Natl. Acad Sci. USA 83, 4355-4359 (1987)), w modyfikacji Luethy'ego i in. (Protein Science 3, 139-146 (1994)).
Stosując FASTA oraz wyszukane dane dotyczące profilu, EST, FRI-1 (jelito płodu szczurzego -1) zidentyfikowano jako noeżliwyy nowy) człon ?^L^]o«rrrc^<J:iTr^y INIFR . FRl·) zawierał insert o około 600 parach zasad z LORF o około 150 aminokwasach. Najbliższym związkiem porównawczym z bazy danych był ludzki TNFR typu (TNFR-2). Porównany obszar wykazał około 43% homologię pomiędzy TNFR-2 i FRI-1 ponad ten 150 aminokwasowy LORF. Analiza profilu przy użyciu pierwszego i drugiego bogatego w cysteinę powtórzenia z superrodziny TNFR dała wynik dla Z wynoszący około 8, wskazując, że gen FRI-1 prawdopodobnie koduje nowy człon rodziny. W celu określenia struktury produktu FRI-1, bibliotekę cDNA z jelita płodu szczura poddano skriningowi na obecność klonów o pełnej długości. Następujące oligonukleotydy otrzymano z początkowej sekwencji FRI-1:
Ó^GCATTATGACCCAGAAACCGGAC^’ (SEQ ID NO:7)
5'-AGGTAGCGCCCTTCCTCACATTC-3' (SEQ ID NO:8)
Primery powyższe stosowano w reakcjach PCR do skriningu 96 zbiorników plazmidu DNA, z których każdy zawiera plazmid DNA z 10.000 niezależnych klonów cDNA. Około 1 pg zbiornika plazmidu DNA amplifikowano w mieszaninie reakcyjnej PCR (Boehringer-Mannheim), stosując termiczny cykler o 96 wgłębieniach typu Perkin-Elmer, o następujących parametrach cykli: 2 minuty w temperaturze 94°C, 1 cykl; 15 sekund w 94°C, a następnie sekund w 65°C, 30 cykli; 7 minut w 65°C, 1 cykl. Produkty reakcji PCR analizowano metodą elektroforezy na żelu. 13 z 96 zbiorników plazmidów DNA dało wzrost amplifikowanych produktów DNA o oczekiwanej względnej masie cząsteczkowej.
DNA z jednego pozytywnego zbiornika użyto do transformowania kompetentnego szczepu ElectroMAX DH10B E. coli (Gibco BRL, Gaithersburg, MD), jak opisano powyżej. Około 40.000 transformantów umieszczono na sterylnych filtrach nitrocelulozowych (BA-85, Schleicher i Schuell), po czym prowadzono skrining przez hybrydyzację kolonii przy użyciu znakowanej 32P-dCTP wersji produktu PCR otrzymanego powyżej. Filtry były prehybrydyzowane w 5X SSC, 50% dejonizowanego formamidu, 5X roztwór Denhardt'a, 0,5% SDS i w 100 pg/ml denaturowanego DNA spermy łososia przez 2-4 godziny w temperaturze 42°C. Filtry następnie hybrydyzowano w 5X SSC, w 50% dejonizowanego formamidu, 2X roztwór Denhardfa, 0,1% SDS, 100 pg/ml denaturowanego DNA spermy łososia i około 5 ng/ml znaczonej sondy przez około 18 godzin w 42°C. Filtry następnie przemyto w 2X SSC w ciągu 10 minut w temperaturze pokojowej, 1X SSC przez 10 minut w temperaturze 55°C i na koniec w 0,5X SSC przez 10-15 minut w 55°C. Hybrydyzowane klony wykryto następnie metodą autoradiografii, po czym ponownie umieszczono na filtrach nitrocelulozowych dla ponownego skriningu. Po drugim skriningu wyizolowano klon plazmidowy (pB1.1), a następnie amplifikowano w pożywce z brzeczką L, zawierającej ampicylinę w ilości 100 pg/ml i otrzymany plazmid DNA. Obie nici insertu 2,4 kb pB1.1 sekwencjonowano.
Sekwencję insertu pB1.1 użyto w poszukiwaniach FASTA w publicznych bazach danych w celu wykrycia jakiejkolwiek sekwencji zgodnej i/lub podobnej. Żadnej zgodności ze znanymi genami lub EST nie stwierdzono, jakkolwiek ustalono około 45% podobieństwo do ludzkich i mysich genów TNFR-2. Startowy kodon metioninowy znaleziono przy parze zasad 124 sekwencji nukleotydowej, za którym następuje LORF kodujący 401 reszt aminokwasowych zakończony przy parze zasad 1327. Przewidziano, że produkt o 401 resztach aminokwasowych ma hydrofobowy peptyd sygnałowy o około 31 resztach przy jego N-końcu i 4 potencjalne miejsca N-glikozylacji. Nie stwierdzono żadnych międzybłonowych wiązań sekwencji przy użyciu programu PepPlot (Wisconsin GCG package, wersja 8.1). Wykrytą
187 408 sekwencję 401 aminokwasową użyto następnie do poszukiwań w proteinowych bazach danych. Ponownie, nie było żadnych istniejących zgodnych związków, jakkolwiek okazało się, że jest silne podobieństwo do wielu członów superrodziny TNFR, a najbardziej do ludzkiego i mysiego TNFR-2. Spasowanie sekwencji tej nowej proteiny ze znanymi członami superrodziny otrzymano stosując program Pileup, modyfikowany następnie przez PrettyPlot (Wisconsin GCG package, wersja 8.1). Zestrojenie to wykazuje wyraźną homologię pomiędzy produktem genu FRI-1 o pełnej długości i wszystkimi innymi członami rodziny TNFR. Homologiczne obszary obejmują zewnątrzkomórkowe domeny członów rodziny TNFR i odpowiadają trzem lub czterem bogatym w cysteinę powtórzeniom znalezionym we wiążącej ligand domenie tych protein. To sugerowało, że gen FRI-1 kodował nowy człon rodziny TNFR. Ponieważ nie stwierdzono żadnych transbłonowych wiążących obszarów przewidywaliśmy, że może to być wydzielony receptor, podobny do receptorów rozpuszczalnych pochodnych TNFR-1 (Kohno i in., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 87, 8331-8335 (1990). Wskutek przejawianej biologicznej aktywności genu FRI-1, (patrz niżej), produkt nazwano Osteoprotegeryną (OPG).
Przykład II
Wzorce ekspresji mRNA OPG w tkankach
Szereg biotów typu Northern tkanki ludzkiej (Clontech) sondowano znakowanym 32p-dCTP produktem PCR FRI-1 w celu określenia rozmiarów transkryptu ludzkiego i wzorców ekspresji. Bioty Northern wstępnie hybrydyzowano w 5X SSPE, '50% formamidu, 5X roztwór Denhardt'a, 0,5% SDS, i 100 pg/ml denaturowanego DNA spermy łososia, przez 2-4 godziny w temperaturze 42°C. Bioty następnie hybrydyzowano w 5X SSPE, 50% formamidu, 2X roztwór Denhardt’a, 0,1% SDS i 100 pg/ml denaturowanego DNA spermy łososia, i 5 ng/ml znakowanej sondzie, przez 18-24 godziny w temperaturze 42°C. Bloty następnie przemyto w 2X SSC w ciągu 10 minut w temperaturze pokojowej, 1X SSC przez 10 minut w 50°C, a następnie w 0,5X SSC przez 10-15 minut.
Przy użyciu sondy pochodzącej z genu szczura, wykryto dominujące typy mRNA o względnej masie cząsteczkowej około 2,4 kb w kilku tkankach, obejmujących nerki, wątrobę, łożysko i serce. Największe poziomy wykryto w nerkach. Duży fragment mRNA o Mr 4,5 i 7,5 kb wykryto w mięśniach szkieletowych i trzustce. W tkankach ludzkiego płodu stwierdzono, że w nerkach występuje ekspresja stosunkowo wysokiego poziomu mRNA o 2,4 kb. Przy użyciu ludzkiej sondy (patrz niżej), wykryto tylko transkrypt o 2,4 kb w tych samych tkankach. W dodatku, stosunkowo wysoki poziom transkryptu o 2,4 kb wykryto w węzłach limfatycznych, grasicy, śledzionie i wyrostku robaczkowym. Wielkość transkryptu wykrytego przez oba geny: szczurzej i ludzkiej osteoprotegeryny, była prawie identyczna z długością szczurzego insertu pB1.1 FRI-1, sugerując, że był to o pełnej długości klon cDNA.
Przykład III
Systemowe dostarczanie OPG w transgenicznych
Klony pB1.1 szczurzego OPG stosowano jako szablon aby amplifikować PCR kodowany obszar do subklonowania w specyficznym ApoE-wątrobowym wektorze ekspresji (Simonet i inni., J. Clin. Invest. 94, 1310-1319 (1994) i zgłoszenie PCT Nr US94/11675 oraz współzgłaszane U.S. Serial Nr 08/221,767). Następujące primery oligonukleotydów 5’ i 3’ zastosowano odpowiednio dla amplifikacji PCR:
5'-GACTAGTCCCACAATGAACAAGTGGCTGTC-3’ (SEQ ID NO:9)
5'-ATAAGAATGCGGCCGCTAAACTCTGAAACAGCCCAGTGACCATTC-3' (SEQ ID NO: 10)
Mieszaninę reakcyjną PCR (Boehringer-Mannheim) poddano następującej obróbce: w temperaturze 94°C przez 1 minutę, 1 cykl; 94°C przez 20 sekund, w 62°C przez 30 sekund i w 74°C przez 1 minutę, 25 cykli. Po amplifikacji, próbki oczyszczono przy użyciu kolumn typu Qiagen PCR i trawiono przez noc restrykcy’nymi enzymami SpeI i NotI. Wytrawione produkty ekstrahowano i wytrącono oraz subklonowano do wektora ekspresji promotora ApoE. Przed mikroinjekcją otrzymanego klonu, HE-OPG, był on sekwencjonowany by
187 408 stwierdzić, że jest wolny od mutantów.
Plazmid HE-OPG oczyszczono w dwóch etapach odwirowania z gradientem stężenia CsCl. Oczyszczony plazmid DNA wytrawiono z XhoI i Asel, a transgesiczny issert o 3,6 kb oczyszczono metodą elektroforezy żelowej. Oczyszczony fragment rozcieńczono do zasobowego roztworu injekcyjsego 1 pg/ml w 5 mM Tris o pH = 7,4 i 0,2 mM EDTA. Jednokomórkowe embriony myszy BDF1 x BDF1 wstrzyknięto, jak to opisano (Brisster i is., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 82, 4338 (1985)), z wyjątkiem tego, że igły injekcyjne były ścięte skośnie i ^Ekonomne przed użyciem. Embriony poddano hodowli przez noc w inkubatorze w atmosferze CO2 i 15 do 20 dwukomórkowych embrionów przeniesiono do jajowodów pseudociążowej mysiej samicy CD1.
Po zakończeniu ciąży, otrzymano 49 potomków z implantacji embrionów po mikroinjekcji. Potomstwo skrinisgowano przez amplifikację PCR integrowanego w genomicznych próbkach DNA. Docelowym obszarem dla amplifikacji był obszar 369 bp ludzkiego istrosu ApoE, który był włączony w wektor ekspresji. Oligomerami użytymi dla amplifikacji PCR były:
5'-GCC TCT AGAAAG AGC TGG GAC-3' (SEQ ID NO: 11)
5'-CGC CGT GTT CCA TTT ATG AGC-3' (SEQ ID NO: 12)
Warunki PCR były następujące: 94°C przez 2 minuty, 1 cykl; 94°C przez 1 minutę, 63°C przez 20 sekund i 72°C przez 30 sekund, 30 cykli. Spośród 49 oryginalnych potomków, 9 zidentyfikowano jako pozytywne PCR transgesiczne zwierzęta.
Pięć trass-esiczsych zwierząt w wieku 8-10 tygodni (oznaczonych numerami 2, 11, 16, 17 i 28), oraz pięć kontrolnych (oznaczonych numerami 1, 12, 15, 18 i 30) uśmiercono i poddano analizom patologicznym. Wątrobę wyodrębniono z pozostałych 4 zwierząt transgesicznych przez częściową hepatektomię. W celu wykonania częściowej hepatektomii myszy znieczulono i usuwano im płat wątroby operacyjnie. Z komórek wątrób wszystkich trassgesicznych zwierząt wyodrębniono RNA oraz z 5 negatywnych kontrolnych zwierząt z tych samych miotów, jak to opisano (McDonald i isni., Meth. Enzymol. 152, 219 (1987)). Analizę biotów typu Northern przeprowadzono na tych próbkach, aby oszacować poziom transgesicznej ekspresji. Około 10 pg całego RNA z wątroby każdego zwierzęcia rozdzielono metodą żelowej elektroforezy denaturującej (Ogdes i isni., Meth. Eszymol 152. 61 (1987)), po czym przeniesiono sa nylonową membranę HYBOND-N (Amersham) i sondowano znaczonym 32P dCTP pB1.1 insertem DNA. Hybrydyzację przeprowadzono przez noc w temperaturze 42°C w roztworze zawierającym 50% formamid, 5X SSPE, 0,5% SDS, 5X roztwór Deshardt’a, 100 pg/ml denaturowanego DNA spermy łososia i 2-4 x 106 cpm znaczonej sondzie/ml hybrydyzacyjsego buforu. Po hybrydyzacji bioty przemyto dwukrotnie po 5 misut w roztworze 2 xSSC, 0,1% SDS w temperaturze pokojowej, a sastępsie dwukrotnie, po 5-10 minut, w 0,1 x SSC, 0,1% SDS w temperaturze 55°C. Ekspresję u zwierząt transgesiczsach i kontrolnych zwierząt określono następnie metodą αhtoradiograficzną.
Dane z Nothem Blot wskazują, że 7 z trunsgenlcznach zwierząt wydziela wykrywalne poziomy transgesicznego mRNA (zwierzęta 2,11,16,17,22, 33 i 45). Negatywna grupa kontrolna myszy i jedno ze zwierząt trasgesicznych nie wydzielało mRNA pokrewnego transgesowi. Ponieważ przewiduje się, że OPG ma być wydzielaną proteiną, sadekcpresCα mRNA transgesicznego powinna odpowiadać poziomowi produktu genowego dostarczanego układowo. Z PCR oraz prób Nothem Blot pozytywnych myszy, zwierzęta 2, 17 i 22 wykazały się najwyższymi poziomami transgenicznego mRNA i mogą przejawiać bardziej ekstensywne biologiczne efekty sa komórki gospodarza i w tkanki.
Przykład IV
Biologiczna aktywność OPG
Pięć spośród trassgenicznych myszy (zwierzęta 2, 11, 16, 17 i 28) i 5 osobników kontrolnych z tego samego miotu (zwierzęta 1, 12, 15, 18 i 30) uśmiercono i poddano analizie patologicznej, stosując następującą procedurę: Przed uśmierceniem, numery idestyfikacyjse wszystkich zwierząt zweryfikowano, po czym zwierzęta zważono, znieczulono i upuszczono
187 408 im krew. Krew przechowywano zarówno jako surowicę, jak i w postaci pełnej krwi w celu kompletnej analizy chemicznej i hematologicznej surowicy. Radiografię przeprowadzono natychmiast po ostatnim znieczuleniu przez letalną inhalacją CO2, a przed głównym cięciem. Następnie usunięto tkanki i utrwalono w roztworze formaliny buforowanej 10%-Zn, dla badań histologicznych. Zebrane tkanki obejmowały: wątrobę, śledzionę, trzustkę, żołądek, dwunastnicę, jelito cienkie, jelito grube, nerki, organy rozrodcze, gruczoły skórne i mleczne, kości, mózg, serce, płuco, grasicę, tchawicę, przełyk, tarczycę, jelito czcze, jelito ślepe, odbytnicę, nadnercza, pęcherz moczowy, i mięśnie szkieletowe. Przed utrwaleniem określono ciężary całych organów: wątroby, żołądka, nerek, nadnerczy, śledziony i grasicy. Po utrwaleniu tkanki zachowano w blokach parafinowych i sporządzono sekcje skrawki 3 jm. Tkankę kostną odwapniono przy użyciu roztworu kwasu mrówkowego i wszystkie skrawki wybarwiono za pomocą hematoksyliny i eozyny. Ponadto, wykonano barwienia niektórych tkanek retikuliną Gomoriego i Masson's trichrome. Następnie wykonano enzymatyczne badania histochemiczne by określić ekspresję fosfatazy odpornej na kwas winowy (TRAP), enzymu wydzielanego w znacznych ilościach przez osteoklasty, wielojądrowe komórki resorbujące kości z rodziny monocyty-makrofagi. Badania immunohistochemiczne dla antygenu powierzchni monocyty-makrofagi BrdU i F480 również przeprowadzono, aby wykryć komórki replikujące się i komórki z rodziny monocyty-makrofagi, odpowiednio. W celu wykrycia ekspresji antygenu powierzchniowego F480, utrwalone w formalinie i umieszczone w parafinie skrawki 4 jm pozbawiono parafiny i uwodniono dejonizowaną wodą. Skrawki poddano działaniu 3% roztworu wody utlenionej, zablokowano preparatem Proteine Block (Lipshaw, Pittsburgh, PA), i inkubowano w szczurzym monoklonalnym anty-mysim F480 (Harlan, Indianapolis, IN). Przeciwciało to wykryto przez biotynylowane immunoglobuliny anty-szczurze królika, streptawidynę skoniugowaną z peroksydazą (BioGenex San Ramon, CA), z DAB jako chromagenem (BioTek, Santa Barbara, CA). Skrawki były barwione kontrastowo hematoksyliną.
Po sekcji i obejrzeniu tkanek trzewnych nie znaleziono żadnych anomalii w ekspresorach transgenicznych ani w grupie zwierząt kontrolnych z tego samego miotu. Analiza wagi organów wskazuje, że rozmiary śledziony zwiększyły się o około 38% w przypadku transgenicznych myszy w stosunku do zwierząt kontrolnych. Wystąpiło również niewielkie zwiększenie wielkości płytek krwi i podwyższenie ilości niezabarwionych komórek w krążeniu u transgenicznych ekspresorów. Zaobserwowano marginalne zmniejszenie ilości płytek u transgenicznych ekspresorów. Ponadto, u transgenicznych ekspresorów obniżył się poziom kwasu moczowego w surowicy, azotu w moczu i alkalicznej fosfatazy. U tych zwierząt stwierdzono wzrost radiogęstości szkieletu, w tym kości długich (udowych), kręgów i kości płaskich (miednica). Względne rozmiary kości udowych u ekspresorów nie różniły się od tych z grupy myszy kontrolnych.
Histologiczne analizy wybarwionych skrawków kości od ekspresorów OPG wykazały ostrą osteopetrozę z obecnością pozostałości chrząstki z pierwotnej kości beleczkowatej zaobserwowanej w kostnych beleczkach w trzonie kości udowej. Nie można było zidentyfikować wyraźnie zdefiniowanej kory w sekcjach uda. U normalnych zwierząt centralny trzon jest wypełniony szpikiem kostnym. Skrawki kręgów również wykazują osteopetrotyczne zmiany co oznacza, ze zmiany szkieletowe indukowane przez OPG były układowe. Resztkowy szpik kostny wykazał przeważnie elementy białokrwinkowe (myeloidowe). Megakariocyty były obecne. Barwienie na retikulinę nie wykazywało dowodu na osadzanie się retikuliny. Badania immunohistochemiczne na F480, antygen powierzchniowy komórki ekspresjonowany przez komórki pochodne monocytów-makrofagów u myszy, wykazały obecność F480-pozytywnych komórek w jamach szpikowych. Ogniskowe spłaszczone, F480-pozytywne, komórki mogły być widoczne jako bezpośrednio sąsiadujące z powierzchnią kości beleczkowatych.
Mesenchymalne komórki stanowiące pokrycie kości beleczkowatych były spłaszczone i wyglądały na nieaktywne. Opierając się na barwieniach H&E i TRAP, osteoklasty były rzadko spotykane na powierzchni kości beleczkowatych w ekspresorach OPG. Natomiast osteoklasty i/lub chondroklasty były widoczne w obszarze resorbującej chrząstki płytki wzrostu, ale ich ilość może być zredukowana w porównaniu do zwierząt kontrolnych. Również, osteoklasty były obecne na powierzchni kory przynasady, gdzie modelu34
187 408 jące działanie jest zwykle silne. Dominująca różnica pomiędzy grupą ekspresorów a grupą kontrolną polegała na głębokim zmniejszeniu osteoklastów beleczkowatych, tak w kręgach, jak i kościach udowych. Zakres kumulacji tkanki kostnej był bezpośrednio skorelowany z poziomem mRNA transgenicznego OPG stwierdzonym metodą Northern Blotting całego RNA wątroby.
Śledziony z ekspresorów OPG miały wzrost ilości czerwonej miazgi, co wynikało ze wzrostu hematopoezy. Reprezentowane są wszystkie rodziny hematopoetyczne. Komórki F480-pozytywne były obecne w czerwonej miazdze zarówno u zwierząt kontrolnych jak i u zwierząt ekspresorowych. Dwa z ekspresorów (2 i 17) miały ogniska hematopoezy pozaszpikowej w obrębie wątroby, a wynika to prawdopodobnie z osteopetrotycznego szpiku.
Nie stwierdzono anomalii w grasicy, węzłach chłonnych, przewodzie żołądkowo-jelitowym, układzie oddechowym, układzie rozrodczym, i płciowo-moczowym, na skórze, w układzie nerwowym, w sercu, aorcie, piersiach, mięśniach szkieletowych i tłuszczu.
Przykład V
Wyodrębnienie mysiego i ludzkiego OPG cDNA
Klon cDNA odpowiadający końcowi 5'- mysiego OPG mRNA wydzielono z biblioteki cDNA mysich nerek (Clontech) przez amplifikację PCR. Oligonukleotydy uzyskano z sekwencji szczurzego cDNA OPG i przedstawiono poniżej:
5'-ATCAAAGGCAGGGCATACTTCCTG-3' (SEQ ID NO: 13)
5'-GTTGCACTCCTGTTTCACGGTCTG-3' (SEQ ID NO: 14)
5'-CAAGACACCTTGAAGGGCCTGATG-3' (SEQ ID NO: 15)
5'-TAACTTTTACAGAAGAGCATCAGC-3' (SEQ ID NO: 16)
5'-AGCGCGGCCGCATGAACAAGTGGCTGTGCTGCG-3' (SEQ ID NO: 17)
5'-AGCTCTAGAGAAACAGCCCAGTGACCATTCC-3' (SEQ ID NO: 18)
Produkty o częściowej i pełnej długości cDNA otrzymane w tym procesie były sekwencjonowane. Produkt o pełnej długości trawiono Not I i Xba I, po czym w sposób ukierunkowany klonowano do wektora plazmidu pRcCMV (Invitrogen). Otrzymany plazmid nazwano pRcCMV-Mu-OPG. Sekwencję nukleotydu klonowanego produktu porównano z sekwencją szczurzego cDNA OPG W obszarze ponad 1300 par zasad obejmującym OPG LORF, sekwencje szczurzego i mysiego cDNA były w około 88% identyczne. Stwierdzono, że sekwencja mysiego cDNA zawierająca LORF o 401 aminokwasach, którą porównano z sekwencją szczurzej proteiny OPG, jest w około 94% identyczna, bez luk. Wskazuje to, że sekwencja wydzielonego mysiego cDNA koduje mysią proteinę OPG oraz, że sekwencja i struktura były w najwyższym stopniu zachowane w ciągu ewolucji. Sekwencja mysiej proteiny OPG zawiera identyczne domniemane peptydy sygnałowe przy jej N-końcach i wszystkie 4 potencjalne miejsca N-glikozylacji są zachowane.
Częściowy ludzki cDNA OPG klonowano z biblioteki cDNA ludzkich nerek, przy użyciu następujących szczurzych-specyficznych oligonukleotydów:
5'-GTG AAG CTG TGC AAG AAC CTG ATG-3' (SEQ ID NO: 19)
5'-ATC AAA GGC AGG GCA TAC TTC CTG-3' (SEQ ID NO:20)
Ten produkt PCR sekwencjonowano i stosowano do projektowania primerów dla amplifikacji końca 3'- ludzkiego cDNA, przy użyciu ludzkiego klonu genomowego OPG w lambda jako szablonu:
5'-TCCGTAAGAAACAGCCCAGTGACC-3' (SEQ ID NO:29) 5'-CAGATCCTGAAGCTGCTCAGTTTG-3’ (SEQ ID NO:21)
187 408
AmplSfsenwupy produkt PCR seewepoSnpuwanu i razem z sekwencją końca 5' użyto do zaprojektowania 5' i 13' ludzkich-specyficznych primerów, przydatnych dla amplifikowania całych sekwencji kodujących ludzkiego cDNA OPG:
5'-kGCGCGGCCGCGGGmACCACAATmkACAAGTTG-3' (SEQ ID NO:22)
I'-AGCTCTAGkATTGTGAGGAkACAmCTCkATGmC-I' (SEQ ID NO:23)
Ludzki produkt PCR o pełnej długości był skewkpojonnwana, a następnie w sposób ukikruneowupa klonowany do wektora plazmidu pRcCMV (InyStrogen) przy użyciu NotI i XbaI. Otrzymany plazmid nazwano pRoCMV-ludyeS OPG. Sekwencję nuelentadnwą elnpuwupegn produktu porównano z sekwencjami szczurzego i mysiego OPG cDNA. W obszarze ponad 1300 par zasad nbejmuSącym OPG LORF, ckkwkpcjk syozarykgn i masSkgn DNA były w około 78-88% identyczne z ludzkim cDNA OPG Sekwencja ludzkiego OPG cDNA również zawierała LORF o 401 umipnkwucaoh, i była porównana z sekwkposami proteiny szczurzej i mysiej. Przewidywana ludzka proteina OPG jest identyczna odpowiednio w około 85% i w około 90% ze szczurzą i mysią proteinami. Porównanie sekwencji szczurzych, mysich i ludzkich protein wskazuje, że były one w pujważsyam stopniu zachnwunk podczas ewolucji. Przewiduje się, że ludzka proteina posiada N-końcowy peptyd sygnałowy oraz 5 potkncSulpach mieSsc N-glikozylaoSi, z których 4 są zachowane między szczurzymi i mysimi proteinami OPG.
Sekwencję DNA i przewidywaną sekwencję aminokwasów mysiego OPG pokazano na rasapkaoh fig. 9A i 9B (SEQ ID NO: 122). Sekwencję DNA i przewidywaną sekwencję aminokwasów ludzkiego OPG pokazano na rysunkach fig. 9C i 9D (SEQ ID NO: 124). Porównanie sekwencji aminokwasów szczurzego, masikgn i ludzkiego OPG pokazano na rysunkach fig. 9E i 9F.
Wyodrębnienie dodatkowych klonów ludzkiego cDNA OPG ujawniło nbkonnść zmiany zasad „G” na „C” w pnyaoji 103 sekwencji DNA, pokazanej na rysunku fig. 9C. Wypiei tych zmian w nukleotadzie powoduje podstawienie uspurugipa w mikjsce lizyny w pnzyosl „3” seewenoSi umipnewasowęj pokazanej na rysunku fig. 9C. Poynstułu część sekwencji w klonach posiadających tę zmianę była identyczna z przedstawionymi na rysunkach fig. 9C i 9D.
Przykład VI
Mndelnwanik trójwymiuroweS struktury OPG
Amino-końcowa część OPG wykayuSe hnmulogię do zewnątrzkomórkowej części wszystkich znanych członów superrodyina TNFR (rysunek 1C). Najbardziej wybitnym motywem w tym obszarze genów pnerewpach TNFR jest powtarzana, o oknłn 40 amipnkwasach, sekwencja bogata w cysteinę, która składa się w wyraźne struktury (Banner i inni., Cell 73, 431-445 (1993)). Motyw ten jest zwykle przedstawiany w postaci czterech (przedział 3-6) powtórzeń tandemowych (patrz fig. 1C) i wSadnmn, że jest związany zwiεyapiem ligandu (Beutler i van Huffel Science 264, 667-663 (1994)). Każde powtórzenie zawiera zwykle sześć rozdzielonych reszt cysteSnnwyoh, które są związane z tworzeniem trzech wewnątrzdomepuwach wiązań dwusiarczkowych określanych SS1, SS2 i SS3 (Banner i inni, ibid). W przypadku niektórych receptorów, takich jak TNFR2, CD30 i CD40, niektóre z powtarzanych domen zawierają tylko dwa wewpątrzłańoaohnwe wiązania dwusiurczenwk (SS1 i SS3).
Sekwencja proteiny ludzkiej OPG została przyłożona do profilu domeny zewnątrzkomórenwej TNFR1 przy zastosowaniu metod opisanych przez Laetha'kgo i innych, ibid, a wyniki przedstawiono graficznie przy użyciu programu ZrettyPlot z Wiscopsip Package, Versiop 8.1 (GkPetios Computer Group, Madison, WI; fig. 10). poróppupie wskazuje wyraźne zachowanie reszt oastkipowaoh, związanych z twurzepSkm domen 1-4. Przyłożenia tego użyto następnie do skonstruowania trójwymiarowego modelu N-końcowej domeny ludzkiego OPG, przy użyciu znanej tróSwamSurowej struktury ykwnątryeomórknweS domeny TNFR1 p55 (Banner i inni, ibid) jako wzorca. W celu wykupunia tego współrzędne atomowe szkieletu pkptadowkgn i łańcucha bocznego identycznych reszt sknpiowupn ze współrzędnych struktury krystalicznej TNFR1. Następnie pozostałe współrzędne dla wstawek oraz różnych
187 408 łańcuchów bocznych wyprowadzono przy użyciu programu LOOK (Molecular Applications Group, Palo Alto, CA). Następnie model trójwymiarowy ulepszono przez minimalizację jego energii konformacyjnej przy użyciu programu LOOK.
Przez analogię z innymi członami rodziny TNFR, zakłada się, ze OPG wiąże się z ligandem. W celu modelowania oddziaływań OPG z jej ligandem, zastosowano strukturę krystaliczną TNF-β dla symulowania trójwymiarowego przedstawienia „ligandu OPG”. Dane te przedstawiono graficznie (patrz fig. 11) przy użyciu Molscript (Kraulis, J. Appl. Cryst. 24. 946-950, 1991). Skonstruowano model kompleksu OPG/ligand z 3 TNIfo i 3 cząsteczkami OPG gdzie względne pozycje OPG są identyczne jak TNFR1 w strukturze krystalicznej. Następnie model ten użyto do znalezienia reszt OPG które mogłyby oddziaływać z jej ligandem, stosując następujące podejście: obliczono dostępną dla rozpuszczalnika powierzchnię wszystkich reszt w kompleksie i jeden pojedynczy model OPG. Reszty, które mają inną dostępność w kompleksie aniżeli w monomerze mogą oddziaływać z ligandem.
Sekwencje aminokwasowe OPG ludzkie i mysie ponownie przyłożono stosując tę informację do wyróżnienia sekwencji zawierających każdą z domen bogatych w cysteinę 1-4 (fig. 12A i 12B). Każda z domen ma indywidualne cechy strukturalne, które można przewidzieć:
Domena 1
Zawiera 4 cysteiny związane z wiązaniami dwusiarczkowymi SS2 (C41 do C54) oraz SS3 (C44 do C62). Jakkolwiek żadne wiązanie SS1 nie jest w sposób widoczny oparte na mostkach dwusiarczkowych, zachowana tyrozyna w pozycji 28 jest homologiczna do Y20 w TNFR1, o którym wiadomo, że jest zaangażowane w oddziaływanie z H66, by wspomóc tworzenie domeny. OPG ma homologiczną histydynę w pozycji 75, co sugeruje, że Y28 i H75 w OPG są ustawione jedna nad drugą w rodzimej proteinie, jak to jest w przypadku homologicznych reszt TNFR1. Przeto, obie z tych reszt mogą być w istocie ważne dla aktywności biologicznej, a obcięcia N-końcowe OPG do i poza Y28 mogą dawać zmienioną aktywność. Ponadto, co do reszt E34 i K43 przewiduje się w oparciu o nasz model trójwymiarowy, że oddziałują ze związanym ligandem.
Domena 2
Zawiera sześć cystein i przewiduje się, że zawiera wiązania dwusiarczkowe SS1 (C65 do C80), SS2 (C83 do C98) i SS3 (C87 do C105). Ten obszar OPG zawiera również obszar rozciągający się od P66 do Q91, który porównuje się do części domeny 2 TNFR1, która tworzy ścisłe połączenia z TNF|3 (patrz wyżej) i może oddziaływać z ligandem OPG W szczególności przewiduje się w oparciu o nasze dane strukturalne, że reszty P66, H68, Y69, Y70, T71, D72, S73, H75, T76, S77, D78, E79, L81, Y82, P85, V86, K88, E89, L90 i Q91 oddziałują ze związanym ligandem.
Domena 3
Zawiera 4 cysteiny związane z wiązaniami dwusiarczkowymi SS1 (C107 do C118) i SS3 (C124 do C142), lecz nie z wiązaniem SS2. W oparciu o nasze dane strukturalne przewiduje się, że reszty E115, L118 i K119 oddziałują z ligandem OPG
Domena 4
Zawiera 4 cysteiny związane z wiązaniami dwusiarczkowymi SS1 (C145 do C160) i SS3 (C166 do C185), lecz nie z wiązaniem SS2, podobnie do domeny 3. Nasze dane strukturalne przc'^'i<^i^uj^7 ze E153 i S155 oddzialująz ligandem OPG.
Przeto, przewidywany model strukturalny OPG identyfikuje pewną liczbę wysoko zachowanych reszt, które prawdopodobnie są ważne dla jego aktywności biologicznej.
Przykład VII
Wytwarzanie rekombinacyjnie wydzielanej proteiny OPG w komórkach organizmów ssaków
W celu określenia, czy OPG jest rzeczywiście proteiną wydzielansą cDNA OPG myszy poddano fuzji do ludzkiej domeny IgG1 Fc jako znacznika (Capon i in., Nature 337, 525-531 (1989)) i poddano ekspresji w ludzkich fibroblastach 293. Fuzje Fc przeprowadzono stosując wektor pFc-A3. pFc-A3 zawiera obszar kodujący część Fc ciężkiego łańcucha ludzkiej immunoglobuliny IgG-1 (Ellison i inni, ibid), od pierwszego aminokwasu zawiasowej domeny
187 408 (Glu-99) do końca karboksylowego, i ograniczony przez miejsce fuzyjne 5'-NotI oraz miejsca 3'-SalI i XbaI. Plazmid skonstruowano przez amplifikacje PCR biblioteki cDNA ludzkiej śledziony (Clontech).
Reakcje PCR miały w końcowej objętości 100 pl wykorzystywały 2 jednostki polimerazy DNA typu Vent (New England Biolabs) w 20 mM Tris-HCl (pH = 8,8), 10 mM KCl, 10 pM (NH42SO4, 2 mM MgSO4, 0,1% Triton X-100 z 400 pM każdego dNTP i 1 ng z biblioteki cDNA do amplifikacji razem z 1 pM każdego primera. Reakcje zainicjowano przez denaturację w 95°C przez 2 minuty, a następnie 30 cykli w 95°C po 30 sekund, 55°C przez 30 sekund, i 73°C przez 2 minuty. Primer 5':
5'IATAGCGGCCGCTGAGCCCAAATCTTGTGACAAAACTCAC-β' (SEQ ID NO:24) włączył miejsce NotI bezpośrednio 5' do pierwszej reszty (Glu-99) zawiasowej domeny IgG-g1. Primer 3':
5'-TCTAGAGTCGACTTATCATTTACCCGGAGACAGGGAGAGGCTCTTT-3' (SEQ ID NO:25) włączył miejsca SalI i XbaI. Produkt PCR o 717 parach zasad trawiono z NotI i SalI, wyodrębniono elektroforetycznie przy użyciu 1% agarozy (FMC Corp.), oczyszczono w myśl procedury Geneclean (BIO 101, Inc) i klonowano do wektora pBluescript II KS (Stratagene) wytrawionego z NotI i SalI. Insert w uzyskanym plazmidzie, pFc-A3, poddano sekwencjonowaniu by potwierdzić wierność reakcji PCR.
Klonowany cDNA myszy w plazmidzie pRcCMV-MuOPG amplifikowano przy użyciu następujących dwóch zbiorów par primerów:
Para 1:
5'ICCTCTGAGCTCAAGCTTCCGAGGACCACAATGAACAAGI3, (SEQ ID NO:26)
S^CCTCTGCGGCCGCTAAGCAGCTTATTTTCACGGATTGAACCTGG' (SEQ ID NO:27)
Para 2:
5'-CCTCTGAGCTCAAGCTTCCGAGGACCACAATGAACAAGI3’ (SEQ ID NO:28)
5,ICCTCTGCGGCCGCTGTTGCATTTCCTTTCTGIβ’ (SEQ ID NO:30)
Pierwsza para amplifikuje cały LORF OPG, i tworzy miejsce restrykcyjne NotI, które jest zgodne z miejscem NotI „w ramce” w wektorze fuzyjnym Fc pFcA3. Wektor pFcA3 wytworzono przez wbudowanie miejsca restrykcyjnego 5' NotI do reszty kwasu asparaginowego 216 ludzkiego cDNA IgG1 Fc. Konstrukt ten wprowadza linker, który koduje dwa nieistotne aminokwasy, które spinają połączenie pomiędzy proteiną OPG i obszarem IgG Fc. Produkt ten, jeżeli jest przyłączony do części Fc, mógłby kodować wszystkie 401 reszty OPG następujące bezpośrednio po wszystkich 227 resztach aminokwasowych obszaru (F1.Fc) ludzkiego IgG1 Fc. Druga para primerów amplifikuje sekwencje DNA kodujące pierwsze 180 reszt aminokwasowych OPG, które obejmują domniemaną domenę wiązania ligandu. Tak jak wyżej, primer 3' tworzy sztuczne miejsce restrykcyjne NotI, które poddaje fuzji C-końcowo obcięty LORF OPG w pozycji treoniny 180, bezpośrednio do domeny IgG1 Fc (CT.fc).
Sekwencję aminokwasową łączącą resztę 401 OPG i resztę 221 kwasu aseptycznego obszaru ludzkiego Fc, można zmodyfikować jak następuje: Kodujące DNA reszty 216-220 obszaru Fc ludzkiego można usunąć jak to opisano poniżej lub resztę cysteinową odpowiadającą C220 obszaru Fc ludzkiego można zmutować do seryny lub alaniny. Proteina fuzyjna OPG-Fc kodowana przez te zmodyfikowane wektory może być transfekowana do komórek 293 ludzkich lub komórek CHO, a rekombinacyjną proteinę fuzyjną OPG-Fc można oczyszczać, jak opisano poniżej.
187 408
Oba produkty w sposób ukierunkowany klonowano do wektora plazmidu pCEP4 (Invitrogen). pCEP4 zawiera źródło replikacji wirusa Epsteina-Barra, i jest zdolne do episomalnej replikacji w komórkach 293-EBNA-1. Macierzysty pCEP4 oraz wektory pCEP4-Fl.Fc i pCEP4-CT.Fc były lipofekowane do komórek 293-EbNa-1 przy zastosowaniu metod zalecanych przez producenta. Transfekowane komórki były następnie wyselekcjonowane w 100 pg/ml hygromycyny w celu wyodrębnienia dla ekspresji wektora i otrzymane masy hodowli odporne na lek rozrosły się do zlania. Komórki poddano następnie hodowli w pożywce wolnej od surowicy przez 72 godziny, a kondycjonowane pożywki usunięto i zanalizowano metodą SDS-PAGE. Wybarwianie srebrem żelu poliakryloamidowego wykrywa główne proteiny kondycjonowanych pożywek wytwarzane przez odporne na lek hodowle 293. W pożywkach kondycjonowanych pCEP4-Fl.Fc ipCEP4-CT.Fc niepowtarzalnie pasma domniemanych rozmiarów pojawiły się obficie (patrz fig. 13B i 13C). Proteina fuzyjna Fc o pełnej długości nagromadziła się w wysokim stężeniu, co wskazuje, że może być trwała. Obydwie proteiny fuz.yjne Fc wykryto za pomocą przeciwciał anty-ludzkiego IgG1-Fc (Pierce) na biotach typu Western, co wskazuje, że są to rekombinacyjne produkty OPG
Proteinę fuzyjna OPG-Fc o pełnej długości oczyszczono za pomocą chromatografii kolumnowej typu Protein-A (Pierce), stosując procedurę zalecaną przez wytwórcę. Proteinę poddano następnie analizie sekwencyjnej od N-końca metodą automatycznej degradacji Edmana, jak to zasadniczo opisano przez Matsudaira i innych (J. Biol. Chem. 262. 10-35 (1987). Odczytano następującą sekwencję aminokwasową po 19 cyklach:
NH2-EEL.LPKYLHYDPETGHQL L-C02H (SEQ ED NO:31)
Sekwencja ta była identyczna do przewidywanej sekwencji aminokwasowej mysiej OPG zaczynającej się przy reszcie aminokwasowej 22 i sugerując, że naturalne wiodące miejsce rozszczepienia w organizmach ssaków znajduje się pomiędzy resztami aminokwasowymi Q21-E22, a nie pomiędzy Y31-D32, jak pierwotnie przewidywano. Eksperymenty ekspresji wykonane w komórkach 293-EBNA z pCEP4-Fl.Fc i pCEP4-CL.Fc wykazują, że OPG jest proteiną wydzielaną i może działać układowo by wiązać swój ligand.
Procedury podobne do użytych do skonstruowania i do ekspresji fuzji muOPG[22-180]-Fc i muOPG[22-401]-Fc zastosowano do jeszcze innych protein fuzyjnych OPG-Fc ludzkich i mysich.
cDNA mysiej OPG kodujący aminokwasy 1-185, który uległ fuzji do obszaru Fc ludzkiego IgG1 [muOPG Ct(185).Fc] skonstruowano jak następuje. cDNA mysiej OPG z plazmidu pRcCMV Muosteoprotegeryny (opisanego w przykładzie V) amplifikowano stosując następującą parę primerów w reakcji łańcuchowej polimerazy (PCR), opisanej wyżej:
1333-82:
5’-LCC CTT GCC CLG ACC ACL CLL-3' (SEQ ID NO:32)
1333-80:
5'-CCL CTG CGG CCG CAC AGA CGT TGT CAT GTG LGG C-3' (SEQ ID NO:33)
La para primerów wzmacnia obszar cDNA mysiej OPG kodujący reszty aminokwasowe 63-185 (odpowiadający parom zasad 278-645) ramki odczytu OPG jak pokazano na rysunku fig. 9A. Primer 3' zawiera miejsce restrykcyjne NotI, które jest zgodne z miejscem NotI w ramce wektora fuzji pFcA3. Produkt obejmuje również niepowtarzalne miejsce restrykcyjne EcoRI umiejscowione przy parze zasad 436. Amplifikowany produkt PCR oczyszczono, rozszczepiono z NotI i EcoRI i otrzymany fragment restrykcyjny EcoRI-NotI oczyszczono. Wektor pCEP4 zawierający fuzyjny insert 1-401 mysiej OPG-Fc rozszczepiono z EcoRI i NotI, oczyszczono i poddano ligacji do wytworzonego wyżej produktu PCR. Uzyskany wektor ekspresji oparty na pCEP-4 kodował reszty OPG 1-185 po których bezpośrednio następują wszystkie 227 reszty aminokwasowe obszaru ludzkiej IgG1-Fc. Wektor fuzyjny 1-185.Fc
187 408 mysiej OPG transfekowano do komórek 293, dokonano selekcji przy użyciu leku, a kosdycjonowaae pożywki wytworzono jak opisano wyżej. Uzyskany wydzielony produkt fuzyjny l-185.Fc mysiej OPG oczyszczono za pomocą chromatografii kolumnowej typu Proteis-A (Pierce), stosując procedurę zalecaną przez wytwórcę.
DNA mysiej OPG kodujący reszty amisokwasowe 1-194, który uległ fuzji do obszaru Fc ludzkiej IgG1 (muOPG Ct(194).Fc) skonstruowano jak następuje. cDNA mysiej OPG z plazmidu pRcCMv Mu-Osteoprotegeryna amplifikowano przy użyciu następujących par primerów:
1333-82:
5'-TCC CTT GCC CTG ACC ACT CTT-3' (SEQ ID NO:34)
1333-81:
5'-CCT CTG CGG CCG CCT TTT GCG TGG CTT CTC TGT T-3' (SEQ ID NO:35)
Ta para primerów wzmacnia obszar cDNA mysiej OPG kodujący reszty αmlnokwucowe 70-194 (odpowiadający parom zasad 298-672) ramki odczytu OPG Primer 3' zawiera miejsce restrykcyjne Notl, które jest zgodne z miejscem Notl w ramce wektora fuzyjsego Fc pFcA3. Produkt zawiera również niepowtarzalne miejsce restrykcyjne EcoRI umiejscowione przy 436 parze zasad. Amplifikowany produkt PCR klonowano do wektora fuzyjsego mysiej OPG[1-401]-Fc, jak opisano wyżej. Uzyskany wektor ekspresji oparty na pCEP4 koduje reszty OPG 1-194 po których bezpośrednio następują wszystkie 227 reszty aminokwasowe obszaru ludzkiego IgG1 Fc. Wektor fuzyny 1-194.Fc mysiej OPG transfekowano do komórek 293, wyselekcjonowano przy użyciu leku i wytworzono kondycjonowaną pożywkę. Uzyskany wydzielony produkt fuzji oczyszczono przy użyciu chromatografii kolumnowej Proteis-A (Pierce), stosując procedurę zalecaną przez wytwórcę.
DNa ludzkiej OPG kodujący aminokwasy 1-401, który uległ fuzji do obszaru Fc ludzkiego IgG1 skonstruowano jak następuje: DNA ludzkiej OPG w plazmidzie pRcCMV-hu osteosrotegerana (opisany w przykładzie V) amplifikowano stosując następujące primery oligonukleotydowe:
1254-90:
5'-CCT CTG AGC TCAAGC TTG GTT TCC GGG GAC CAC AAT G-3' (SEQ ID NO:36)
1254-95:
5'-CCT CTG CGG CCG CTA AGC AGC TTA TTT TTA CTG AAT GG-3' (SEQ ID NO:37)
Uzyskasy produkt PCR koduje proteinę ludzkiej OPG o pełsej długości i tworzy miejsce restrykcyjne Notl, które jest zgodne z miejscem Notl w ramce wektora fuzyjsego FcA3. Produkt PCR klonowano w sposób ukierunkowany do wektora plazmidu pCEP4, jak opisano wyżej. Uzyskany wektor ekspresji koduje reszty 1-401 ludzkiej OPG, po których bezpośrednio następuje 227 reszt amisokwasowych ludzkiego obszaru IgG1-Fc. Wytworzono kondycjonowane pożywki z transfekowanych i wyselekcjonowanych przy pomocy leku komórek i produkt fuzji huOPG F1.Fc oczyszczono przy użyciu chromatografii kolumnowej typu Protein-A (Pierce), stosując procedurę zalecaną przez wytwórcę.
DNA ludzkiej OPG kodujący reszty aminokwasowe 1-201, który uległ fuzji do obszaru Fc ludzkiej IgG1 [huOPG Ct(201).Fc], skonstruowano jak następuje. Sklonowany cDNA ludzkiej OPG z plazmidu pRrCMV-hu osteoprotegeryna, amplifikowano przez PCR, stosując następującą parę primerów oligosukleotydowych:
1254-90:
5-CCT CTG AGC TCAAGC TTG GTT TCC GGG GAC CAC AAT G-3' (SEQ ID NO:38)
187 408
1254-92:
5'-CCT CTG CGG CCG CCA GGG TAA CAT CTATTC CAC-3' (SEQ ED NO:39)
Ta para primerów wzmacnia obszar cDNA ludzkiej OPG kodujący reszty aminokwasowe 1-201 ramki odczytu OPG i tworzy miejsce restrykcyjne NotI przy końcu 3', które jest zgodne z miejscem NotI w ramce wektora fuzyjnego Fc FcA3. Produkt ten, kiedy jest przyłączony do części Fc, koduje reszty 1-201 OPG, po których bezpośrednio następują wszystkie 221 reszt aminokwasowych obszaru ludzkiego IgGI Fc. Uzyskany produkt pCr klonowano w sposób ukierunkowany do wektora plazmidu pCEP4, jak opisano wyżej. Wytworzono kondycjonowane pożywki z transfekowanych i wyselekcjonowanych przy pomocy leku komórek, a produkty fuzyjne hu-OPG Ct(201) oczyszczono metodą chromatografii kolumnowej typu Protein-A (Pierce), stosując procedurę zalecaną przez wytwórcę.
Następujące procedury użyto do skonstruowania i ekspresji mysiej i ludzkiej OPG, których nie poddano fuzji.
Plazmid do ekspresji w komórkach ssaka mysiej OPG o pełnej długości (reszty 1-401) wytworzono przez amplifikację PCR insertu cDNA mysiej OPG zpRcCMV Mu-osteoprotegeryna i subklonowano do wektora ekspresji pDSRa (DeClerck i inni., J. Biol. Chem. 266, 3893 (1991)). Stosowano następujące primery oligonukleotydowe:
1295-26:
5'-CCG AAG CTT CCA CCA TGA AGA AGT GGC TGT GCT GC-3' (SEQ ID NO:40)
1295-27:
5'-CCT CTG TCG ACT ATT ATA AGC AGC TTA TTT TCA CGG ATT G-3' (SEQ ID NO:41)
Pełnej długości ramkę odczytu mysiej OPG amplifikowano przez PCR, jak opisano wyżej. Produkt PCR oczyszczono i wytrawiono restrykcyjnymi endonukleazami Hind III i Xba I (Boehringer Mannheim, Indianapolis, IN), zgodnie z zaleceniami producenta, po czym ligowano do pDSRa wytrawionego Hind III i Xba I. Rekombinacyjne klony wykryto przez wytrawienie endonukleazą restrykcyjną, a następnie sekwencjonowano, by upewnić się, że nie wytworzono żadnych mutacji podczas etapów amplifikacji PCR.
Otrzymany plazmid pDSRa-muOpG wprowadzono do komórek jajnika chińskiego chomika (CHO) przez transfekcję z pośrednictwem wapnia (Wigier i inni., Cell 11, 233 (1997)). Wyselekcjonowano osobne kolonie w oparciu o ekspresję genu reduktazy dwuhydrofolianowej (DHFR) w wektorze plazmidu i wydzielono kilka klonów. Ekspresję rekombinacyjnej proteiny mysiej OPG monitorowano metodą Western Blot pożywki kondycjonowanej komórkami CHO. Wysoko ekspresjonujące komórki wyodrębniono, a ekspresję OPG dodatkowo amplifikowano przez działanie metotreksatem, jaik opisali DeClerck i inni., ibid. Kondycjonowaną pożywkę z linii komórkowej CHO otrzymano przez dalsze oczyszczanie rekombinacyjnej, wydzielanej proteiny mysiej OPG.
Plazmid do ekspresji w komórkach ssaka ludzkiej OPG o pełnej długości (aminokwasy 1-401) wytworzono przez subklonowanie insertu cDNA z pRcCMV-hu osteoprotegeryna bezpośrednio do wektora pDSRa (DeClerck i inni., ibid). Plazmid pRcCMV-OPG wytrawiono całkowicie z Notl, tępo zakończono z Klenow, po czym wytrawiono całkowicie z Xba I. Wektor DNA wytrawiono z Hind III, tępo zakończono z Klenow, po czym wytrawiono z Xba I, a następnie ligowano do insertu OPG. Rekombinacyjne plazmidy następnie sekwencjonowano w celu potwierdzenia właściwej orientacji cDNA ludzkiej OPG.
Otrzymany plazmid pDSRa-huOPG wprowadzono do komórek jajnika chińskiego chomika (CHO), jak opisano wyżej. Wyselekcjonowano osobne kolonie w oparciu o ekspresję genu reduktazy dwuhydrofolianowej (DHFR) w wektorze plazmidu, i wydzielono kilka klonów?. Ekspresję rekombinacyjnej proteiny ludzkiej OPG monitorowano metodą Western Blot
187 408 pożywki kondycjonowanej komórkami CHO. Wysoko ekspresjonujące klony wyodrębniono, a ekspresję OPG następnie amplifikowano przez działanie metotreksatem. Otrzymano kondycjonowaną pożywkę z linii komórkowej CHO ekspresjonującej ludzką OPG dla oczyszczania proteiny'.
Wektory ekspresji kodujące reszty 1-185 mysiej OPG konstruowano jak następuje. cDNA mysiej OPG z pRcCMV-Mu OPG amplifikowano przy użyciu następujących primerów oligonukleotydowych:
1333-82:
5'-TCC CTT GCC CTG ACC ACT CTT-3' (SEQ ID NO:42)
1356-12:
5'-CTT CTG TCG ACT TAA CAC ACG TTG TCA TGT GTT GC-3' (SEQ ID NO:43)
Ta para primerów wzmacnia obszar cDNA mysiej OPG kodujący aminokwasy 63-185 ramki odczytu OPG (pary zasad 278-654), i zawiera sztuczny stop-kodon bezpośrednio po kodonie cysteiny (C185), po którym następuje sztuczne miejsce endonukleazy restrykcyjnej SalI. Przewidywany produkt zawiera wewnętrzne miejsce restrykcyjne Eco RI, przydatne dla subklonowania do wstępnie istniejącego wektora. Po amplifikacji PCR otrzymany oczyszczony produkt rozszczepiono z endonukleazami restrykcyjnymi Eco RI i SalI, a duży fragment oczyszczono na żelu. Oczyszczony produkt następnie subklonowano do dużego fragmentu restrykcyjnego pBluescript-muOPG F1.Fc wytrawionego Eco RI oraz SalI, jak opisano wyżej. Otrzymany plazmid wytrawiono z Hind III oraz Xho I, a mały fragment oczyszczono na żelu. Fragment ten, który zawiera otwartą ramkę odczytu kodującą reszty 1-185 następnie subklonowano do wektora ekspresji pCEP4 wytrawionego Hind III oraz Xho I. Otrzymany wektor, pmuOPG[l-185], koduje obcięty polipeptyd OPG zakończony resztą cysternową w pozycji 185. Kondycjonowane pożywki z transfekowanych i wyselekcjonowanych za pomocą leku komórek otrzymano jak opisano powyżej.
1333-82:
5'-TCC CTT GCC CTG ACC ACT CTT-3' (SEQ ID NO:44)
1356-13:
5'-CCT CTG TCG ACT TAC TTT TGC GTG GCT TCT CTG TT-3' SEQ ID NO:45)
Powyższa para primerów amplifikuje obszar cDNA mysiej OPG kodujący aminokwasy 70-194 ramki odczytu OPG (pary zasad 298-672) i zawiera sztuczny stop-kodon bezpośrednio po kodonie lizyny (K194), po którym następuje sztuczne miejsce endonukleazy restrykcyjnej SalI. Przewidywany produkt zawiera wewnętrzne miejsce restrykcyjne Eco RI, przydatne dla subklonowania do wstępnie istniejącego wektora. Po amplifikacji PCR otrzymany oczyszczony produkt rozszczepiono z endonukleazami restrykcyjnymi Eco RI i SalI i duży fragment oczyszczono na żelu. Oczyszczony produkt następnie subklonowano do dużego fragmentu restrykcyjnego pBluescript-muOPG F1.Fc wytrawionego Eco RI oraz SalI, jak opisano wyżej. Otrzymany plazmid wytrawiono z Hind III oraz Xho I, imały fragment oczyszczono na żelu. Fragment ten, który zawiera otwartą ramkę odczytu kodującą reszty 1-185 następnie subklonowano do wektora ekspresji pCEP4 wytrawionego Hind III oraz Xho I. Otrzymany wektor, pmuOPG[1-185], koduje obcięty polipeptyd OPG zakończony lizyną w pozycji 194. Kondycjonowane pożywki z transfekowanych i wydzielonych za pomocą leku komórek otrzymano jak opisano powyżej.
Wygenerowano kilka mutacji przy końcu 5' genu hu-OPG[22-401]-Fc wprowadzającego albo podstawienie lub delecje (usunięcie) aminokwasów z OPG pomiędzy resztami od 22 do 32. Wszystkie mutacje były otrzymane przy użyciu „QuickChange™ Site-Directed Mutagenesis Kit” (Stratagene, San Diego, CA), w warunkach zalecanych przez producenta. Krótko mówiąc, mieszaninę reakcyjną zawierającą szablon plazmidu huOPG[22-401]-Fc DNA i mutageniczne primery zadano polimerazą Pfu w obecności dezoksynukleotydów, po czym
187 408 amplifikowano w termocyklerze, jak opisano wyżej. Próbkę reakcji następnie transfekowano do kompetentnego E. coli XLI-Blue przez szok termiczny (gwałtowne ogrzanie), po czym płytkowano. Plazmid DNA z transormantow następnie sekwencjonowano by sprawdzić mutacje.
Następujące pary primerów użyto do usunięcia reszt 22-26 z genu ludzkiej OPG, z wytworzeniem w rezultacie proteiny fuzyjnej huOPG[27I401]-Fc,
1436-11:
5'-TGG ACC ACC CAG AAG TCA CTT CAT TAT GAC-3' (SEQ ID NO: 140)
1436-12:
5'-GTC ATA ATG AAG GTA CTT CTG GGT GGT CCA-3' (SEQ ID NO: 141)
Następujące pary primerów użyto do usunięcia reszt 22-28 z genu ludzkiej OPG, z wytworzeniem w rezultacie proteiny fuzyjnej huOPG[29I401]IFc·.
1436-17:
5'-GGA CCA CCC AGC TTC ATT ATG ACG AAG AAA C-3' (SEQ ID NO: 142) 1436-18:
5'-GTT TCT TCG TCA TAA TGA AGC TGG GTG GTC C-3' (SEQ ID NO: 143)
Następujące pary primerów użyto do usunięcia reszt 22-31 genu ludzkiej OPG, z wytworzeniem w rezultacie proteiny fuzyjnej huOPG[32-401]-Fc:
1436-27:
5'-GTG GAC CAC CCA GGA CGAAGAAAC CTC TC-3' (SEQ ID NO: 144) 1436-28:
5'-GAG AGG TTT CTT CGT CCT GGG TGG TCC AC-3' (SEQ ID NO: 145)
Następujące pary primerów użyto do zmiany kodonu reszty tyrozynowej 28 na fenyloalaninę w genie ludzkiej OPG, z wytworzeniem w rezultacie proteiny fuzyjnej huOPG[22-401]-Fc Y28F:
1436-29:
5'-CGT TCC CTC CAAAGT TCC TTC ATT ATG AC-3' (SEQ ID NO: 146)
1436-30:
5-GTC ATA ATG AAG GAA CTT TGG AGG AAACG-3' (SEQ ID NO:147)
Następujące pary primerów użyto do zmiany kodonu reszty prolinowej 26 na alaninę w genie ludzkiej OPG, w rezultacie czego otrzymano proteinę fuzyjną huOPG[22-401]-Fc P26A:
1429-83:
5'-GGA AAC GTT TCC TGC AAA GTA CCT TCA TTA TG-3' (SEQ ID NO: 148)
1429-84:
5'-CAT AAT GAA CCT ACT TTG CAG GAA ACG TTT CC-3' (SEQ ED NO:149)
Każdy otrzymany plazmid muOPG[22-401]-Fc zawierający odpowiednią mutację był następnie transfekowany do ludzkich komórek 293, a zmutowaną proteinę fuzyjną OPG-Fc oczyszczono z kondycjonowanej pożywki jak opisano powyżej. Aktywność biologiczną każdej proteiny oszacowano in vitro w próbce wytworzonego osteoklastu, jak opisano w przykładzie X3.
187 408
Przykład VIII
Ekspresja OPG w E. coli
A. Bakteryjne wektory ekspresji pAMG21
Plazmid ekspresji pAMG21 można uzyskać z wektora ekspresji Amgen pCFM1656 (ATCC #69576), który z kolei może być wyprowadzony z systemu wektorowego ekspresji Amgen, opisanego w Patencie USA Nr 4,710,473. Plazmid pCFM1656 można uzyskać z opisanego plazmidu pCFM836 (Patent nr 4,710,473) przez: (a) zniszczenie dwóch endogennych miejsc restrykcyjnych NdeI przez wypełnienie końców enzymem polimerazy T4, po którym następuje ligowanie ostrych zakończeń; (b) zastąpienie sekwencji DNA pomiędzy niepowtarzalnymi miejscami restrykcyjnymi AatII i ClaI zawierającymi syntetyczny promotor Pl, z podobnym fragmentem uzyskanym z plazmidu pCMF636 (Patent nr 4,710,473) zawierającym promotor Pl.
AatII
5' CTAATTCCGCTCTCACCTACCAAACAATGCCCCCCTGCAAAAAAAAkTTCA3' TGCAGATTAAGGCGAGAGTGGATGGTTTGGTACGGGGGGGCGGTTTTTATTTAkGT-TATAAAAACATACAGATAACCATCTGCGGTGATA^TTATCTCTGGCGGTGTTGAC-ATATTTTTTTTATAGATATTGTTTCACGCCAGTATTrCTAΓAGAGTCCTCGACTTCTT-ATT.ATTACGAGTTTCTTTTATACTGAGGAGAT 3 ' (SEQ ID NO :53) _TATTTATTGTTAGGGCCACTATTAGAGGAGTATC 5'(SEQ ID NO O 55)
ClaI a następnie (c) podstawienie małej sekwencji DNA pomiędzy niepowtarzalne miejsca restrykcyjne ClaI i KpnI następującym oligonukleotydem:
5' GTCAΠGCAAGTAGACGTAGTCTΓAAGAΓAΓGGTTAAGTCGAΓGGACAAGTTTCG 3' (SEQ ID NO:48)
3' TAAACTAAGATCTTCCTCCTTATTGTATACCAATTGCGCAACCTTAAGC 5' (SEQ ID NO:49)
ClaI KpnI
Plazmid ekspresji pAMF21 może być następnie uzyskany z pCFM1656 przez wykonanie szeregu zmian zasad ukierunkowanych na miejsce przez mutagenezę oligomerów nakładających się na PCR i podstawień sekwencji DNA. Zaczynając z miejsca BglII (plazmid bp # 180) bezpośrednio w pozycji 5' względem promotora replika bp # 180) bezpośrednio w pozycji 5' względem promotora replikacji plazmidu PcopB, i postępując w kierunku genów replikacji plazmidu, zmiany pary zasad są takie, jak następuje:
187 408
pAMG22 bp # bp w pCMF1656 Zmiana par zasad w nAMG22
# 204 L/A C/G
# 428 A/T G/C
# 509 G/C A/T
# 617 insert dwóch G/C bp
# 679 G/C T/A
# 980 L/A C/G
# 994 G/C A/T
# 1004 A/L C/G
# 1007 C/G L/A
# 1028 A/L T/A
#1047 C/G L/A
# 1178 G/C L/A
# 1466 G/C L/A
#2028 G/C usunięcie bp
#2187 C/G L/A
#2480 A/L T/A
#2499 AGLG GLCA
- 2502 TCAC CAGL
#^^42 TCCGAGC AGGCTCG usunięcie 7 bp
#3435 G/C A/T
#3446 G/C A/L
#3643 A/L T/A
Sekwencja DNA pomiędzy niepowtarzalnymi miejscami restrykcyjnymi AatII (pozycja #4364 wpCFM1656) i SacII (pozycja #4585 wpCFM1656) jest podstawiona następującą sekwencją:
[lepki koniec AatII] 5· <GX5TJACGTATC£ATGGTCTCC(pozycja #4358 w pCMG21) 3’ TGGCCCGGCCGGATACGTACCAGAGG-CGCCGGGCGCGCCGGGAACTGCCACGG::ATCGCCCrJCCCC:G2CCCGG:GCAGTCGACA.GACT-'GGTCCGCTCTGATCCCTCGACGGTCCGTAGTTTATTCCGCTCTCCGCGTCAGCTTTCTGA187 408
GGGCCTTTCGTTTTATCTGTTGTTTGTCGGTGAACGCTCTCCTGAGTAGGACAAATCCGCCCCGGAAAGCAAAATAGACAACAAACAGCCACTTGCGAGAGGACTCATCCTGTTTAGGCG-CGGGAGCGGATTTGAACGTTGCGAAGCAACGGCCCGGAGGGTGGCGGGCAGGACGCCCGC-GCCCTCGCCTAAACTTGCAACGCTTCGTTGCCGGGCCTCCCACCGCCCGTCCTGCGGGCG-cataaactgccaggcatcaaattaagcagaaggccatcctgacggatggcctttttgcgt-GTATTTGACGGTCCGTAGTTTAATTCGTCTTCCGGTAGGACTGCCTACCGGAAAAACGCAAatll
-TTCTACAAACTCTTTTGTTTATTTTTCTAAATACATTCAAATATGGACGTCGTACTTAAC-AAGATGTTTGAGAAAACAAATAAAAAGATTTATGTAAGTTTATACCTGCAGCATGAATTG-TTTTAAAGTATGGGCAATCAATTGCTCCTGTTAAAATTGCTTTAGAAATACTTTGGCAGC-AAAATTTCATACCCGTTAGTTAACGAGGACAATTTTAACGAAATCTTTATGAAACCGTCG-GGTTTGTTGTATTGAGTTTCATTTGCGCATTGGTTAAATGGAAAGTGACCGTGCGCTTAC-CCAAACAACATAACTCAAAGTAAACGCGTAACCAATTTACCTTTCACTGGCACGCGAATG-TACAGCCTAATATTTTTGAAATATCCCAAGAGCTTTTTCCTTCGCATGCCCACGCTAAAC-ATGTCGGATTATAAAAACTTTATAGGGTTCTCGAAAAAGGAAGCGTACGGGTGCGATTTG-ATTCTTTTTCTCTTTTGGTTAAATCGTTGTTTGATTTATTATTTGCTATATTTATTTTTC-TAAGAAAAAGAGAAAACCAATTTAGCAACAAACTAAATAATAAACGATATAAATAAAAAG-GATAATTATCAACTAGAGAAGGAACAATTAATGGTATGTTCATACACGCATGTAAAAATA-CTATTAATAGTTGATCTCTTCCTTGTTAATTACCATACAAGTATGTGCGTACATTTTTAT-AACTATCTATATAGTTGTCTTTCTCTGAATGTGCAAAACTAAGCATTCCGAAGCCATTAT-TTGATAGATATATCAACAGAAAGAGACTTACACGTTTTGATTCGTAAGGCTTCGGTAATA-TAGCAGTATGAATAGGGAAACTAAACCCAGTGATAAGACCTGATGATTTCGCTTCTTTAA-ATCGTCATACTTATCCCTTTGATTTGGGTCACTATTCTGGACTACTAAAGCGAAGAAATT-TTACATTTGGAGATTTTTTATTTACAGCATTGTTTTCAAATATATTCCAATTAATCGGTG-AATGTAAACCTCTAAAAAATAAATGTCGTAACAAAAGTTTATATAAGGTTAATTAGCCAC-AATGATTGGAGTTAGAATAATCTACTATAGGATCATATTTTATTAAATTAGCGTCATCAT-TTACTAACCTCAATCTTATTAGATGATATCCTAGTATAAAATAATTTAATCGCAGTAGTA-AATATTGCCTCCATTTTTTAGGGTAATTATCCAGAATTGAAATATCAGATTTAACCATAG-TTATAACGGAGGTAAAAAATCCCATTAATAGGTCTTAACTTTATAGTCTAAATTGGTATC-AATGAGGATAAATGATCGCGAGTAAATAATATTCACAATGTACCATTTTAGTCATATCAG-TTACTCCTATTTACTAGCGCTCATTTATTATAAGTGTTACATGGTAAAATCAGTATAGTC-ataacgcattgattaatatcattattgcttctacaggctttaattttattaattattctgt-TATTCGTAACTAATTATAGTAATAACGAAGATGTCCGAAATTAAAATAATTAATAAGACA-AAGTGTCGTCGGCATTTATGTCTTTCATACCCATCTCTTTATCCTTACCTATTGTTTGTC-TTCACAGCAGCCGTAAATACAGAAAGTATGGGTAGAGAAATAGGAATGGATAACAAACAG-GCAAGTTTTGCGTGTTATATATCATTAAAACGGTAATAGATTGACATTTGATTCTAATAA-CGTTCAAAACGCACAATATATAGTAATTTTGCCATTATCTAACTGTAAACTAAGATTATT-ATTGGATTTTTGTCACACTATTATATCGCTTGAAATACAATTGTTTAACATAAGTACCTG-TAACCTAAAAACAGTGTGATAATATAGCGAACTTTATGTTAACAAATTGTATTCATGGAC46
187 408
-TAGGATCGTACAGGTTTACGCAAGAAAATGGTTTGTTATAGTCGATTAATCGATTTGATT-ATCCTAGCATGTCCAAATGCGTTCTTTTACCAAACAATATCAGCTAATTAGCTAAACTAA-CTAGATTTGTTTTAACTAATTAAAGGAGGAATAACATATGGTTAACGCGTTGGAATTCGA-GATCTAAACAAAATTGATTAATTTCCTCCTTATTGTATACCAATTGCGCAACCTTAAGCTSacII
-GCTCACTAGTGTCGACCTGCAGGGTACCATGGAAGCTTACTCGAGGATCCGCGGAAAGAA-CGAGTGATCACAGCTGGACGTCCCATGGTACCTTCGAATGAGCTCCTAGGCGCCTTTCTT-GAAGAAGAAGAAGAAAGCCCGAAAGGAAGCTGAGTTGGCTGCTGCCACCGCTGAGCAATA-CTTCTTCTTCTTCTTTCGGGCTTTCCTTCGACTCAACCGACGACGGTGGCGACTCGTTAT-ACTAGCATAACCCCTTGGGGCCTCTAAACGGGTCTTGAGGGGTTTTTTGCTGAAAGGAGG-tgatcgtattggggaaccccggagatttgcccagaactccccaaaaaacgactttcctcc-AACCGCTCTTCACGCTCTTCACGC 3' [lepki koniec SacII] (SEQ ID NO:50)
-TTGGCGAGAAGTGCGAGAAGTG 5’ (pozycja #5904 w pAMG21) (SEQ ID NO:46)
Podczas ligowania lepkich końców tej podstawianej sekwencji DNA, ulegają zniszczeniu zewnętrzne miejsca AatII i SacII. W podstawionym DNA są niepowtarzalne miejsca AatII i SacII.
pAMG22-His
Plazmid ekspresji pAMG22-His można wyprowadzić z wektora ekspresji Amgen pAMG22 przez podstawienie małej sekwencji DNA pomiędzy niepowtarzalne miejsca restrykcyjne NdeI (#4795) i EcoRI (#4818) pAMG22 następującym duplexem oligonukleotydowym:
NdeI NheI EcoRI
5' TATGAAACATCATCACCATCACCATCATGCTAGCGTTAACGCGTTGG 3' (SEQ ID NO:51)
3' ACTTTGTAGTAGTGGTAGTGGTAGTACGATCGCAArrGCGCAACCTTAA 5' (SEQ ID NO:52)
MetLysHisHisHisHisHisHisHisAlaSerValAsnAlaLeuGlu (SEQ ID NO: 168)
PAMG22
Plazmid ekspresji pAMG22 można wyprowadzić z wektora ekspresji Amgen pCFM1656 (ATCC #69576), który może być z kolei wyprowadzony z systemu wektorowego ekspresji Amgen, opisanego w patencie USA nr 4,710,473, udzielonym 1 grudnia 1987 roku. Plazmid pCFM1656 można uzyskać z opisanego plazmidu pCFM836 (Patent nr 4,710,473) przez: (a) zniszczenie dwóch endogennych miejsc restrykcyjnych NdeI przez wypełnienie końców enzymem polimerazy T4, po którym następuje ligowanie tępych końców; (b) zastąpienie sekwencji DNA pomiędzy niepowtarzalnymi miejscami restrykcyjnymi AatII i ClaI zawierającymi syntetyczny promotor Pl, z podobnym fragmentem uzyskanym z plazmidu pCMF636 (Patent nr 4,710,473) zawierającym promotor Pl:
187 408
AatII
5' CTAATTCCGCTCTCACCTACCCAAACTATGCCCCCCTGCAAAAAAATALttCAT3' TGTAGAGGAAGGCGAGAGTGGATGGTTTGTTACGGGGGGGTTGTTTTTATTTAAGTA—
-ATAAAATATATATAGATAATTATTTGTGGTGATAAATGATTGTTGGTGGGGTGGACAT_TATTTTTTGGATGTCTATTGGTAGATGCCATTATTTTATAGAGACCGCCACAACTGTA-AATTACCATGGGTGGTGATATGGAGTACAT 3' (SEQ ID NO: 55) _TGTATGGTGACTGCCACTATGACTCGTGTAGCT' (SEQ ID NO:55)
ClaI a następnie (c) podstawienie małej sekwencji DNA pomiędzy nSkpnwturzulne miejsca restrykcyjne ClaI i KpnI następującym oligonaelkotydem:
5' cGAmGAIτcΊAGAAmmAmGAAIAAcAEA(mmτyAc<mcmτ<mJAAΓΓcmmIΆc 3' (SEQ ID NO:55)
3' TAAACTAAmArCTTCCTCC'ΠΆTTmTATΛCCAATTGCGCΛACCTTAAGC 5' (SEQ ID NO:56)
ClaI KpnI
Plazmid ekspresji pAMF22 może być następnie uzyskany z pCFM1656 przez waennanik szeregu zmian zasad ukSerunkowupaoh na mlejsoe przez mutugkneyę nlignmkrów nakładaSąoach się na PCR i podstawień skkwenoSS DNA. Zaczynając z mSkjscu BglII (plazmid bp # 180) bezpośrednio w pozycji 5' względem promotora replikacji plazmidu PonpB, i postępuSąo w kierunku genów replikacji plazmidu, zmiany pary zasad są tueik, jak następuje:
77 PAMG22 bp # bo w pCMF1656 Zmiana par zasad w PAMG22
# 204 T/A C/G
# 428 A/T G/C
# 509 G/C A/T
# 617 insert dwóch G/C bp
# 679 G/C T/A
# 980 T/A C/G
# 994 G/C A/T
# 1004 A/T C/G
# 1007 C/G T/A
# 1028 A/T T/A
# 1047 C/G T/A
# 1178 G/C T/A
# 1466 G/C T/A
#2028 G/C usunięcie bp
#2187 C/G T/A
#2480 A/T T/A
#2499 AGTG GTCA
- 2502 TCAC CAGT
187 408
c.d. tabeli
#2642 TCCGAGC AGGCTCG usunięcie 7 bp
#3435 G/C A/T
#3446 G/C A/T
#3643 A/T T/A
Sekwencja DNA pomiędzy niepowtarzalnymi miejscami restrykcyjnymi AatII (pozycja #4364 wpCFM1656) i SacII (pozycja #4585 wpCFM1656) jest podstawiona następującą sekwencją:
[lepki koniec AatII] (pozycja #4358 w pAMG22) [lepki koniec AatII] (pozycja #4358 w pAMT2 )
5' TCTTAACCTATTCATGCTCTCCCAACGCTCCAGGACTGGCCCGCGICACGCCCrTCCC-’ ’ TTCACCGAAGGCGAAGACGGACCAAGCCCGiTACACCTCCACCCCCGGACCGCCCGCAGGT-ctcaacccaaacgatcattctcccgacgcgccccttcggttgagcggggggtgggcccctg-TATTTGGCTGGCCGAGTCACATTTCTTACAAGGACAGCAAAATATACcACCAACCACICAC-CACGCTCTCCTGAGTAGGACCAATCCGCCGGGAGCGGCTTTGAACGGGGCGAAGCCCCCGg-TTTCCATATGCCTCCTCCTTTTTAGG5(GGXCGCCG5CGWAA5GG<G^2ACACGCGCGGGTG:C-cccggcgggtggcgggca<g3ac<g:cc(g:ccajaac:t<g:ca<g:g:cacjaaa?gjaagcagjag-CGGACTCCCACCCTACCGGCCGCCACTGGAGGTCTTTGCCCGCCCCTCCTTTACTCGGTCTA-CCCCTCCTCCCCCAGTCGCCTGGGCGCCTTTATAACCCCCCTTTTCTTTCTTGGAGJCACT-CGGTCGCACTCCCTCCCTTAACACACTZJCACGATGTGGGAGCCAACACCCJACACCGCTGAAatII ' CTACCTCCCATATAACCTAACAAACACCTCCCCCCATCAAAAACACCCttAAT3'CCCATATTAATGCGAGAGTGCGCCGTCCGTTACGCGGTTGCATCCCCTTCTTTCCGTA—
-ACCAAAAAACATACAGATCAAAATCTGCGGTGACACATCCTCTCTGGCGGCGCCGACAC-TATCTCTTGTCTGCCTATTGCTAGACCCCCCCATTTCATCACAGACCCCCACAACCCCA-CACCACCACCTTCTCTTATACCTATCACAT 3' (SEQ ID NO:53) _TCCACTTCTACCGCCACTATGACTCGTGTAGC5' (SEQ ID NO:54)
Ciał
187 408
AatII
-ACATTCAAATATGGACGTCTCATAATTTTTAAAAAATTCATTTGACAAATGCTAAAATTC-TGTAAGTTTATACCTGCAGAGTATTAAAAATTTTTTAAGTAAACTGTTTACGATTTTAAG-TTGATTAATATTCTCAATTGTGAGCGCTCACAATTTATCGATTTGATTCTAGATTTGTTT-AACTAATTATAAGAGTTAACACTCGCGAGTGTTAAATAGCTAAACTAAGATCTAAACTCA-TAACTAATTAAAGGAGGAATAACATATGGTTAACGCGTTGGAATTCGAGCTCACTAGTGT-ATTGATTAATTTCCTCCTTATTGTATACCAATTGCGCAACCTTAAGCTCGAGTGATCACASacII
-CGACCTGCAGGGTACCATGGAAGCTTACTCGAGGATCCGCGGAAAGAAGAAGAAGAAGAA-gctggacgtcccatggtaccttcgaatgagctcctaggcgcctttcttcttcttcttctt-GAAAGCCCGAAAGGAAGCTGAGTTGGCTGCTGCCACCGCTGAGCAATAACTAGCATAACC-CTTTCGGGCTTTCCTTCGACTCAACCGACGACGGTGGCGACTCGTTATTGATCGTATTGG-CCTTGGGGCCTCTAAACGGGTCTTGAGGGGTTTTTTGCTGAAAGGAGGAACCGCTCTTCA-GGAACCCCGGAGATTTGCCCAGAACTCCCCAAAAAACGACTTTCCTCCTTGGCGAGAAGT-CGCTCTTCACGC 3' (SEQ ID NO:58)
-GCGAGAAGTG 5' (SEQ id NO:57) [lepki koniec SacIl] (pozycja #5024 w pAMG22)
Podczas ligowania lepkich końców tej podstawianej sekwencji DNA, ulegają zniszczeniu zewnętrzne miejsca AatII i SacII. W podstawionym DNA są niepowtarzalnymi miejsca AatII i SacII.
B. Ludzki polipeptyd OPG Met [32-401]
W przykładzie użytym wektorem ekspresji był pAMG21, pochodna pCFM1656 (ATCC o numerze dostępu 69576), zawierająca odpowiednie miejsca restrykcyjne dla wstawienia genów „w dół” z promotora lux PR (patrz Patent USA Nr 5,169,318 opisujący metodę ekspresji lux). Stosowaną komórką gospodarza była GM120 (ATCC o numerze dostępu 55764). Gospodarz ten miał promotor lacIQ oraz gen lacI wintegrowany w drugie miejsce chromosomu gospodarza, prototropowego gospodarza E. coli K12. Inne powszechnie stosowane wektory ekspresji E. coli i komórki gospodarza są. również odpowiednie dla ekspresji.
Sekwencję DNA kodującego N-końcowąmetioninę i aminokwasy 32-401 ludzkiego polipeptydu OPG umieszczono pod kontrolą promotora luxPR w wektorze ekspresji plazmidu pAMG21, jak następuje. Aby to zrealizować, wykonano PCR stosując oligonukleotydy #1257-20 oraz #1257-19 jako primery, przy użyciu plazmidu pRcCMV-Hu OPG DNA jako wzorca zawierającego ludzki cDNA OPG, i poddanego termocyklizacji przez 30 cykli, z których każdy cykl ma następujący przebieg: w temperaturze 94°C przez 20 sekund, następnie w 37°C przez 30 sekund, a następnie w temperaturze 72°C przez 30 sekund. Otrzymaną końcową próbkę PCR rozwiązano na żelu agarozowym, produkt PCR wycięto, oczyszczono i poddano restrykcji z restrykcyjnymi endonukleazami KpnI oraz BamHI, i oczyszczono. Syntetyczne oligonukleotydy #1257-21 oraz #1257-22 osobno fosforylowano przy użyciu kinazy polinukleotydowej T4 iATP, po czym mieszano razem, ogrzewano w temperaturze 94°C i pozostawiono powolnemu ochładzaniu do temperatury pokojowej, w celu wytworzenia dupleksu linkera oligonukleotydu, zawierającego NdeI i KpnI o lepkich końcach. Fosforylowany duplex linkera utworzony pomiędzy oligonukleotydami #1257-21 i #1257-22 zawierający NdeI i KpnI o kleistych końcach (patrz rysunek fig. 14A) i wytrawione KpnI i BamHI, i oczyszczony produkt PCR wytworzony przy użyciu oligoprimerów #1257-20 i #1257-19 (patrz wyżej), wstawiono w sposób ukierunkowany pomiędzy dwa miejsca wektora plazmidu pAMG21, zwanymi miejscem NdeI i miejscem BamHI, przy
187 408 użyciu standardowej metodologii rekombinacyjnego DNA (patrz rysunek fig. 14A i sekwencje poniżej). Syntetyczny linker wykorzystał kodony E. coli i dostarczył N-końcową metioninę.
Wybrano dwa klony i wyodrębniono plazmid DNA, i potwierdzono następnie sekwencję DNA insertu ludzkiej OPG Uzyskany plazmid pAMG21 zawierający aminokwasy 32-401 ludzkiego polipeptydu OPG bezpośrednio poprzedzany w ramce przez metioninę zwany jest jako pAMG21-huOPG met[32-401].
O1igo#1257-19
5'-ATCTCAGTTGAAGC'AΓATATTGTTGAAAAAAAAAGTGTTTTTAG-3' (SQQ ID OO:59)
O1igo#1257-20
5'-TTCCTCCTGGTACCTACCTAAATGAAG-3' (SQQ ID 00:60)
Oligo# 1257-21
5'-TATGGATGAATAACGAAGAGTTGATGAGGTTTTTTTAAATTTAGGTGCTTTATG-3, (SQQ5DOO:61)
01igo#1257-22
5,-CCGTTGTTACATΓΓAACAGAGTTGTGGTTAATTTTTTAΠGTAGAACGT-3' (SQQ ID OO:47)
Hodowle pAMG21-huOPG met[32-401] w E. coli GM120 w pożywce 2XYT zawierającej 20 pg/ml kanamycyny inkubowano w temperaturze 30°C przed indukcją. Indukcję produktu ekspresji genu huOPG met[32-401] z promotora luxPR uzyskano po dodaniu syntetycznego autoinducera laktonu N-(3-oksoheksanoilo)-DL-homoseryny, do pożywki hodowli, do końcowego stężenia 30 ng/ml, i hodowle inkubowano w temperaturze 30°C lub 37°C przez dalsze 6 godzin. Po upływie 6 godzin, hodowle bakteryjne sprawdzono pod mikroskopem na obecność ciał indukcyjnych, i następnie peletyzowano przez odwirowanie. Załamujące światło ciała inkluzyjne obserwowano w indukowanych hodowlach wykazując, że część rekombinacyjnego produktu genu huOPG met[32-401] była wytworzona nierozpuszczalnie w E. coli. Niektóre grudki bakteryjne powtórnie przeprowadzono w zawiesinę w roztworze 10 mM Tris-HCl/pH = 8 i 1 mM EDTA, i lizowano bezpośrednio przez dodanie próbki buforu typu 2X Laemlli do końcowego 1X, i β-merkaptoetanolu do końcowego 5% stężenia, i analizowano metodą SDS-PAGE. Rzeczywiście bardziej intensywne pasmo zabarwione coomassie o około 42 kDa obserwowano na żelu SDS-PAGE zawierającym wszystkie lizowane komórki w 30°C i 37°C indukowanych hodowli, w porównaniu z drugim pasmem, które jest lizatem całej komórki z nieindukowanej hodowli w temperaturze 30°C (rysunek fig. 14B.). Spodziewany gen mógł mieć długość 370 aminokwasów i spodziewaną masę cząsteczkową wynoszącą około 42,2 kDa. Prowadzono następną indukcję w temperaturze 37°C przez 6 godzin, i dodatkową hodowlę speletyzowano i poddano obróbce w celu wydzielenia ciał inkluzyjnych (patrz niżej), bądź procesowi mikrofluidyzacji. Grudki poddane mikrofluidyzacji ponownie rozproszono w roztworze 25 mM Tris HCl/pH8 i 0,5 M buforu NaCl, i przepuszczono 20-krotnie przez urządzenie Microfluidizer Model 1108 (Microfluidics Corp.), i oddzielono. Pobrano niewielką ilość wydzielonej próbki (cały lizat po mikrofluidyzacji), a pozostałość poddano peletyzacji przy 20.000 x g przez 20 minut. Sklarowaną ciecz po odwirowaniu usunięto (rozpuszczalna frakcja po mikrofluidyzacji) i grudki ponownie rozproszono w roztworze 25 mM Tris-HCl/pH8 i 0,5M NaCl i 6M mocznika (nierozpuszczalna frakcja po mikrofluidyzacji). Do próbki z całkowicie rozpuszczalnej części lub nierozpuszczalnej frakcji dodano równą objętość porcji buforu 2X Laemalli i β-merkaptoetanolu do końcowego 5% stężenia. Próbki następnie analizowano metodą SDS-PAGE. Znaczącą ilość rekombinacyjnego genu huOPG met[32-401] znaleziono w nierozpuszczalnej frakcji. W celu oczyszczenia ciał inkluzyjnych rekombinacyjnej proteiny postępowano jak następuje: komórki bakteryjne wydzielono z pożywki przez odwirowanie z gradientem gęstości w wirówce typu „Beckman J-6B” wyposażonej w rotor JS-4.2, przy 4.900 x g przez 15 minut w temperaturze 4°C. Grudki
187 408 bakteryjne ponownie rozproszono w 5 ml wody, po czym rozcieńczono do końcowej objętości 10 ml w wod/de. Zawiesinę tę p^r^z^e^r^^t^fii(9no do naczynia z nierdzewnej stali w lodzie i poddano rozkładowi metodą dźwiękową (sonic) przy użyciu urządzenia „Branson Sonifier” wyposażonego w standardowe zakończenie (nastawienie zasilania = 5, cykl pracy = = 95%, 80 pęknięć). Poddaną sonowaniu zawiesinę komórkową odwirowano w ultrawirówce typu „Beckman Optima TLX” wyposażonej w rotor typu „TLA 100.3”, przy 195.000 x g przez 5 do 10 minut w temperaturze 23°C. Sklarowaną ciecz odrzucono i grudki przemyto strumieniem wody z tryskawki. Grudki zebrano przez zdrapywanie przy pomocy mikroszpachelki i przeniesiono do szklanego homogenizera (o objętości 15 ml). Pięć mililitrów roztworu Percoll (75% ciekłego Percollu i 0,15 M chlorku sodu) dodano do homogenizera i zawartość poddano homogenizacji aż do jednolitej postaci. Objętość zwiększono do 19,5 ml przez dodanie roztworu Percolla, wymieszano i rozdzielono do trzech rurek typu „Beckman Quick-Steal” (13 x 32 mm). Rurki zapieczętowano zgodnie z fabryczną instrukcją. Rurki poddano wirowaniu w rotorze Beckman TLA 100.3 w temperaturze 23°C, przy 20 tys. obrotów na minutę (21.600 x g), przez 30 minut. Rurki przebadano na odpowiedni wzorzec pasm. Aby odzyskać ciała refraktylne frakcje gradientowe odzyskano i połączono, po czym rozcieńczono wodą. Ciała inkluzyjne poddano peletyzacji przez odwirowanie, i stężenie proteiny oszacowano następnie metodą SDS-PAGE.
Wyodrębnione próbki ciał inkluzyjnych, jak opisano poniżej, rozpuszczono w porcji buforu IX Laemlli z 5% β-merkaptoetanolem oraz rozdzielono na żelu SDS-PAGE i wyodrębniono ciała inkluzyjne, otrzymując wysoko oczyszczony rekombinacyjny genowy produkt huOPG[32-401]. Główne pasmo, około 42 kDa, zaobserwowane po rozdzieleniu zawartych ciał inkluzyjnych na żelu SDS-poliakryloamidowym, wycięto z oddzielnego żelu, i N-końcową sekwencję aminokwasową oznaczono zasadniczo, jak opisano (Matsudaira i in., J. Biol. Chem. 262, 10-35 (1987)). Następującą sekwencję oznaczono po 19 cyklach:
NH2 -MDEERSHQLLCDKCPPGTY-COOH (SEQ ID NO:62)
Stwierdzono, że powyższa sekwencja jest identyczna z pierwszymi 19. aminokwasami kodowanymi przez wektor ekspresji pAMG21 hu-OPG met[32-401], wytworzony z reszty metioniny dostarczoną przez wektor ekspresji bakteryjnej.
C. Ludzki polipeptyd OPG met[22-401]
Sekwencję DNA kodującą N-końcową metioninę i aminokwasy od 22 do 401 ludzkiej OPG umieszczono pod kontrolą promotora luxPR w prokariotycznym wektorze ekspresji plazmidu pAMG21, jak następuje. Wyodrębniony plazmid DNA pAMG21-huOPG met[32-401] (patrz sekcja B) rozszczepiono endonukleazami restrykcyjnymi KpnI i BamHI i otrzymane fragmenty rozdzielono na żelu agarozowym. Fragment „B” (fragment o około 1064 parach zasad) wyodrębniono z żelu przy zastosowaniu standardowej metody. Syntetyczne oligonukleotydy (oligos) #1267-06 oraz #1267-07 fosforylowano osobno i pozostawiono do wytworzenia dupleksu linkera oligomeru, który zawierał NdeI i KpnI o kleistych końcach, przy użyciu metod opisanych w Sekcji B. Syntetyczny duplex linkera wykorzystał kodony E. coli i dostarczał N-końcową metioninę. Fosforylowany linker oligomeru zawierający NdeI i KpnI o kleistyyh końcach i wyodrębniony Fragment o około 1004 parach zzisad pAMG21-huOP met[32-401] wytrawiony restrykcyjnymi endonukeeczcmi KpnI i BamHI wstawiono bezpośrednio pomiędzy miejsca NdeI i BamHI pAMG21, przy użyciu standardowej metodologii rekombinchyJnego DNA. Ligowaną mieszaninę transformowano do gospodarza 393 E. coli metodą elektroporowania, wykorzystując zalecenia producenta. Klony wybrano, plazmid DNA wyodrębniono, i wykonano sekwencjonowanie DNA dla potwierdzenia sekwencji DNA genu huOPG-met[22-401].
Oligo#1267-06
5'-C’C GGC CCG CCC CGG CGG CM ’C’ CGC CG’ ΤΊ’ CG’ CG’ ’G’
CAG CCG CG’ CGC GCT GCT GCG CG’ CCC ’CG CGG GGG GGG (SEQ ID NO:63)
187 408
Oligo #1267-07
5-CCG GCG GAC ATT TAT CAC AGA GCA GCT GAT GAG AAG TTT CTT
CAT CAT AAT GAA GAT ATT TTG GAG GAA AAG TTT CCA-3’ (SEQ ID NO:64)
Hodowle pAMG21-huOPG met[22-401] w E. coli 393 umieszczono w pożywce 2XYT zawierającej 20 pg/ml kanamycyny i inkubowano w temperaturze 30°C przed indukcją. Indukcję produktu ekspresji rekombinacyjnego genu z promotora luxPR wektora pAMG21 osiągnięto po dodaniu syntetycznego autoinducera laktonu NI(3Ioksoheksanoilo)-DL-homoI seryny do pożywki hodowli, do końcowego stężenia 30 ng/ml, i po inkubacji w temperaturze 30°C lub 37°C przez dalsze 6 godzin. Po upływie 6 godzin hodowle bakteryjne poddano peletyzacji przez odwirowanie (= 30°C I+6 lub 37°C I+6). Hodowle bakteryjne poddano peletyzacji również bezpośrednio przed indukowaniem (= 30°C PreI), lub alternatywnie nie dodawano żadnego autoinducera do oddzielnej hodowli, którą pozostawiono do inkubowania w temperaturze 30°C przez dalsze 6 godzin otrzymując nieindukowaną (UI) hodowlę (= 30°C UI). Bakteryjne grudki z hodowli 30°C PreI, 30°C UI, 30°C I+6 lub 30°C I+6 ponownie przeprowadzono w stan zawiesiny, poddano ligowaniu, i analizowano metodą elektroforezy SDS-PAGE (żel poliakryloamidowy), jak opisano w Sekcji B. Żele poliakryloamidowe barwiono „coomassie blue” i/lub metodą Western przeniesiono do nitrocelulozy i immunosondowano przy użyciu przeciwciała poliklonalnego anty-mu OPG-Fc z organizmu królika, jak opisano w przykładzie X. Poziom produktu genu po indukcji porównano z próbkami nieindukowanymi (30°C UI) lub przed-indukowanymi (30°C PreI).
D. Mysi polipeptyd OPG met[22-401]
Sekwencję DNA kodującą N-końcową metioninę i aminokwasy od 22 do 401 mysiego (mu) polipeptydu OPG (OPG) umieszczono pod kontrolą promotora luxPR w prokariotycznym wektorze ekspresji plazmidu pAMG21, jak następuje. PCR wykonano stosując oligonukleotydy #1257-16 i #1257-15 jako primery, plazmid pRcCMV-Mu jako szablon, oraz warunki termocyklingu jak opisano w Sekcji B. Produkt PCR oczyszczono i rozszczepiono restrykcyjnymi endonukleazami KpnI i BamHI, jak opisano w Sekcji B. Syntetyczne oligomery #1260-61 i #1260-82 oddzielnie fosforylowano i pozostawiono do wytworzenia dupleksu linkera oligomeru NdeI i KpnI o kleistych końcach przy użyciu metod opisanych w Sekcji B. Syntetyczny duplex linkera wykorzystał kodony E. coli i dostarczył N-końcową metioninę. Fosforylowany duplex linkera wytworzony pomiędzy oligomerami #1260-61 i #1260-82 zawierający kleiste końce NdeI i KpnI oraz KpnI i BamHI i wytrawiony oraz oczyszczony produkt PCR wytworzony przy użyciu oligoprimerów #1257-16 i #1257-15 wstawiono w sposób ukierunkowany pomiędzy miejsca Ndel i BamHI pAMG21 przy użyciu standardowej metody. Mieszaninę ligacyjną przeniesiono do gospodarza 393 E. coli metodą elektroporezy wykorzystując zalecenia producenta. Klony wybrano, wyodrębniono plazmid DNA i przeprowadzono sekwencjonowanie DNA, aby sprawdzić sekwencję DNA genu MuOPG met[22-401].
Ekspresję rekombinacyjnego polipeptydu muOPG met[22-401] z hodowli komórek 393 zawierających plazmid pAMG21-MuOPG met[22-401] po indukcji oznaczono stosując metody opisane w Sekcji C.
Oligo #1257-15
5'-TAC GCA CTG GAT CCT TAT AAG CAG CTT ATT TTC ACG TGA AC-3' (SEQ ID NO:65)
Oligo #1257-16
5'-GTG CTC CTG GTA CCT ACC TAA AAC CGA ACT GCA CAG TG-3' (SEQ ID NO:66)
Oligo #1260-61
5'-TAT GGA AAC TCT GCC TCC AAA ATA CCT GCA TTA CGA TCC GGA
AAC TGG TCA TCA GCT GCT GTG TGA TAA ATG TGC TCC GGG TAC-3' (SEQ ID NO:67)
187 408
Oligo #1260-82
5'-CCG GAG CAC ATT TAT CAC AGA GCA GCT CAT GAC GAG TTT CCG
GAT CGT AAT GCA GGT ATT TTG GAG GCA GAG TTT CCA-3' (SEQ ID NO:68)
E. Mysi polipeptyd OPG met[32-401]
Sekwencję DNA kodującą N-enńcnwą metioninę i umSnoewucy od 32 do 401 masSkgn pullpeptadu OPG umieszczono pod kontrolą promotora luxPR w prokuriotyoznam wektorze ekspresji plazmidu pAMG21, jak pastępuSk. Aby to zrealizować, syntetyczne oligomery #1267-08 i #1267-09 oddzielnie fnsfnrylowapu i pozostawiono do watWnryeniu duplexu linkera oligomeru przy użyciu metod opisanych w SkeoSi B. Syntetyczny duplex linekra wykorzystał kodony E. coli i dostarczył N-końcową metioninę. Fosfnralnwapy dup^ linkera wytworzony pomiędzy oligomerami #1267-08 i #1267-09 zawierający NdeI i KpnI o kleistych końcach oraz wytrawSnnk KpnI i BamHI, oraz oczyszczony produkt PCR opisany wcześniej (patrz Sekcja D), wstawiono w sposób ukSkrunenwany pomiędzy miejsca NdeI i BamHI pAMG21 przy użyciu standardowej metody. Mieszaninę ligacyjną przknSksSnnn do gospodarza 393 E. coli metodą klkktroporkzy wykorzystując zulkokpiu producenta. Klony wybrano, wyodrębniono plazmid DNA i przeprowadzono skkwencjonowupie DNA, aby sprawdzić sekwencję DNA genu muOPG met[32-401].
Ekspresję reeombmuoyjpego polipkptadu muOPG met[32-401] z hodowli komórek 393 zawierających rekumbinacyjpa plazmid pAMG21 po indukowaniu oznaczono, stosGSąo metody opisane w SekoSl C.
Oligo #1267-08
5'-TAT GGA CCC AGA AAC TGG TCA TCA GCT GCT GTG TGA TAA ATG TGC TCC
GGG TAC-3' (SEQ ID NO:69)
Oligo #1267-09
5'-CCG GAG CAC ATT TAT CAC ACA GCA GCT GAT GAC CAG TTT CTG GGT CCA^' (SEQ ID NO:70)
F. Mysi polipeptyd OPG met-lys[22-401]
Sekwencję DNA kodującą N-końcową metioninę występującą po reszcie lizynowej i aminokwasy od 22 do 401 masSegn polipeptydG OPG umSecyoyono pod kontrolą promotora luxZR w prokariotacypam wektorze ekspresji plazmidu pAMG21, jak następuje. Syntetyczne oligomery #1282-95 i #1282-96 oddzielnie fosforalowupo i pozostawiono do watwnrzkpia dupleksu ilpkera oligomeru przy użyciu metod opisanych w Sekcji B. Syntetyczny duplex hlneeru wykorzystał kodony E. coli i dostarczył N-końcową metioninę. Fosforalowuny dupiex linkera wytworzony pomiędzy oligomerami #1282-95 i #1282-96 yuwSerąjąoa NdeI i KpnI o kleistkch wcz wytzewione KpnI i BnmHI orH ocaysoczacy yupyukt PuR zpidany wcześniej (patrz Sekcja D), wstawiono w sposób ukleruneowuna pomiędzy miejsca NdeI i BamHI pAMG21 przy użyciu standardowej metody. Mieszaninę ligacyjną przeniesiono do gusBodurza 393 E. coli metodą eleetroporeyy wykorzystując zalecenia producenta. Klony wybrano, wyodrębniono plazmid DNA i BΓykBrowudzoPo skkwkncjopowunSk DNA, aby sprawdzić sekwencję DNA genu MuOPG-Mkt-Lys[22-401].
Ekspresję rekombinaoyjnego BolipeBtyPu MuOPG Met-Lys[22-401] z transformowunaoh komórek 393 zuwieraSąoach rekombSnaoyjna plazmid pAMG21 po SndGeojS oznaczono, stosuSąo metody opisane w SkkoSS C.
Oligo #1282-95
5'-TAT GAA AGA AAC TCT GCC TCC AAA ATA CCT GCA TTA CGA TCC GGA AAC TGG TCA TCA GCT GCT GTG TGA TAA ATG TGC TCC GGG TAC-3' (SEQ ID NO:71)
187 408
Oligo #1282-96
5'-CCG GCG CAC ATT TAT CAC ACA GCA GCT GAT GAC CAG TTT CCG GAT
CGT AAT GCA GGT ATT TTG GAG GCA GAG TTT CTT TCA-3' (SEQ ID NO:72)
G. Mysi polipeptyd OPG met-lys-(his)i [22-401]
Sekwencję DNA kodującą N-końcową resztę Met-Lys-His-His-His-His-His-His-His (= MKH) występującą po aminokwasach od 22 do 401 mysiej OPG umieszczono pod kontrolą promotora luxPR w prokariotycznym wektorze ekspresji pAMG21, jak następuje. PCR wykonano przy użyciu oligonukleotydów #1300-50 i #1257-15 jako primerów, i plazmidu pAMG21-muOPG-met[22-401] DNA jako szablonu. Warunki termocyklingu były takie jak opisano w Sekcji B. Otrzymaną próbkę PCR rozwiązano na żelu agarozowym, produkt PCR wycięto, oczyszczono, rozszczepiono restrykcyjnymi endonukleazami NdeI i BamHI i oczyszczono. Wytrawione NdeI i BamHI i oczyszczony produkt PCR wytworzony przy użyciu oligoprimerów #1300-50 i #1257-15 wstawiono w sposób ukierunkowany pomiędzy miejsca NdeI i BamHI pAMG21, przy zastosowaniu standardowej metodologii DNa. Mieszaninę ligacyjną transformowano do gospodarza 393 E. coli metodą elektroporezy stosując się do zaleceń producenta. Klony wybrano, wyodrębniono plazmid DNA i przeprowadzono sekwencjonowanie DNA, aby sprawdzić sekwencję DNA genu muOPG-MKH[2 2-4 01].
Ekspresję rekombinacyjnego polipeptydu MuOPG-MKH[22-401]z transformowanych hodowli 393, zawierających rekombinacyjny plazmid pAMG21 po indukcji oznaczono, stosując metody opisane w Sekcji C.
Oligo #1300-50
5'-GGT CTC CTC ATA TGA AAC ATC ATC ACC ATC ACC ATC ATG AAA
CTC TGC CTC CAAAAT ACC TGC ATT ACG AT-3' (SEQ ID NO:73)
Oligo #1257-15 (patrz Sekcja D)
H. Mysi polipeptyd OPG met-lys [22-40](his)7
Sekwencję DNA kodującą N-końcową resztę met-lys, aminokwasy od 22 do 401 mysiej OPG, i siedem reszt histydynowych występujących po aminokwasie 401 (= muOPG MK[22-401]-H7), umieszczono pod kontrolą promotora luxPR w prokariotycznym wektorze ekspresji pAMG21, jak następuje. PCR wykonano stosując oligonukleotydy #1300-49 i #1300-51 jako primery, i plazmid pAMG21-mu-OPG-met[22-401] DNA jako szablon. Warunki termocyklingu były takie jak opisano w Sekcji B. Otrzymaną próbkę PCR rozwiązano na żelu agarozowym, produkt PCR wycięto, oczyszczono, rozszczepiono restrykcyjnymi endonukleazami NdeI i BamHI i oczyszczono. Wytrawione NdeI i BamHI i oczyszczony produkt PCR wstawiono w sposób ukierunkowany pomiędzy miejsca NdeI i BamHI pAMG21, przy użyciu standardowej metody. Mieszaninę ligacyjną transformowano do gospodarza 393 E. coli metodą elektroporezy stosując się do zaleceń producenta. Klony wybrano, wyodrębniono plazmid DNA i przeprowadzono sekwencjonowanie DNA, aby sprawdzić sekwencję DNA genu muOPG-MK[22-401]-H7.
Ekspresję rekombinacyjnego polipeptydu muOPG-MK[22-401]-H7 z transformowanych hodowli 393, mieszczących rekombinacyjny plazmid pAMG21 po indukcji oznaczono, stosując metody opisane w Sekcji C.
Oligo #1300-49
5’-GTT CTC CTC ATA TGA AAG AAA CTC TGC CTC CAAAAT ACC TGT
A-3' (SEQ ID NO:74)
Oligo #1300-51
5'-TAC GCA CTG GAT CCT TAA TGA TGG TGA TGG TGA TGA TGT AAG
CAG CTT ATT TTC ACG GCT TGA ACC TGA TTC CTT A-3' (SEQ ID NO:75)
187 408
I. Mvsipolipeptyd OPG met[27-401]
Sekwencję DNA kodującą N-końcową metioninę i aminokwasy od 27 do 401 mysiej OPG umieszczono pod kontrolą promotora luxPR w prokariotycznym wektorze ekspresji pAMG21, jak następuje. PCR wykonano stosując oligonukleotydy #1309-74 i #1257-15 jako primery, i plazmid pAMG21-muOPG-met[22-401] DNA jako szablon. Warunki termocyklingu były takie jak opisano w Sekcji B. Otrzymaną próbkę PCR rozwiązano na żelu agarozowym, produkt PCR wycięto, oczyszczono, rozszczepiono restrykcyjnymi endonukleazami NdeI i BamHI i oczyszczono. Wytrawione NdeI i BamHI i oczyszczony produkt PCR wstawiono w sposób ukierunkowany pomiędzy miejsca NdeI i BamHI pAMG21, przy użyciu standardowej metody. Mieszaninę ligacyjną transformowano do gospodarza 393 E. coli metodą elektroporezy stosując się do zaleceń producenta. Klony wybrano, wyodrębniono plazmid DNA i przeprowadzono sekwencjonowanie DNA, aby sprawdzić sekwencję DNA genu muOPG-met[27-401].
Ekspresję rekombinacyjnego polipeptydu muOPG-met[27-401] z transformowanych hodowli 393 mieszczących rekombinacyjny plazmid pAMG21 po indukcji oznaczono, stosując metody opisane w Sekcji C.
Oligo #1309-74
5-GTT CTC CTC ATA TGA AAT ACC TGC ATT ACG ATC CGG AAA CTG
GTC AT-3’ (SEQ ID NO:76)
Oligo #1257-15 (patrz Sekcja D)
J. Ludzki polipeptyd OPG met[27-401]
Sekwencję DNA kodującą N-końcową metioninę i aminokwasy od 27 do 401 ludzkiej OPG umieszczono pod kontrolą promotora luxPR prokariotycznego wektora ekspresji pAMG21 jak następuje. PCR przeprowadzono przy użyciu oligonukleotydów #1309-75 i #1309-76 jako primerów·', i plazmidu pAMG21-huOPG-met[22-401] DNA jako szablonu. Warunki termocyklingu były takie jak opisano w Sekcji B. Otrzymaną próbkę PCR umieszczono na żelu agarowym, PCR produkt wycięto, oczyszczono, poddano restrykcji restrykcyjnymi endonukleazami AseI i BamHI, i oczyszczono. Wytrawione AseI i BamHI wytrawiono i oczyszczony produkt PCR wstawiono w sposób ukierunkowany pomiędzy miejsca NdeI i BamHI pAMG21, przy zastosowaniu standardowej metody. Mieszaninę ligacyjną transformowano do gospodarza 393 E. coli metodą elektroporezy stosując się do zaleceń producenta. Klony oddzielono, plazmid DNA wyodrębniono, i przeprowadzono sekwencjonowanie DNA, aby sprawdzić sekwencję DNA genu huOPG-met[27-401].
Ekspresję rekombinacyjnego polipeptydu huOPG-met[27-401] po indukcji z transfekowanych komórek 393 zawierających rekombinacyjny plazmid pAMG21 oznaczono stosując metody opisane w Sekcji C.
Oligo #1309-75
5-GTT CTC CTA TTA ATG AAA TAT CTT CAT TAT GAT GAA GAA ACT
T-3’ (SEQ ID NO:77)
Oligo #1309-76
5’-TAC GCA CTG GAT CCT TAT AAG CAG CTT ATT TTT ACT GAT T-3’ (SEQ ID NO:78)
K. Mysi polipeptyd OPG met[22-180]
Sekwencję dNA kodującą N-końcową metioninę i aminokwasy od 22 do 180 mysiej OPG umieszczono pod kontrolą promotora luxPR prokariotycznego wektora ekspresji pAMG21 jak następuje. PCR przeprowadzono przy użyciu oligonukleotydów #1309-72 i #1309-73 jako primerów, i plazmidu pAMG21-muÓPG-met[22-401] DNA jako szablonu.
187 408
Warunki termocyklingu były takie jak opisano w Sekcji B. Otrzymaną próbkę PCR umieszczono na żelu agarowym, PCR produkt wycięto, oczyszczono, poddano restrykcji restrykcyjnymi endonukleazami NdeI i BamHI, i oczyszczono. Wytrawione NdeI i BamHI i oczyszczony powyższy produkt PCR wstawiono w sposób ukierunkowany pomiędzy miejsca NdeI i BamHI pAMG21, przy zastosowaniu standardowej metody. Mieszaninę ligacyjną transformowano do gospodarza 393 E. coli metodą elektroporezy stosując się do zaleceń producenta. Klony oddzielono, plazmid DNA wyodrębniono, i przeprowadzono sekwencjonowanie DNA, aby sprawdzić sekwencję DNA genu muOPG-met[22-180].
Ekspresję rekombinacyjnego polipeptydu muOPGImet[22Il80] z transformowanych hodowli 393 zawierających plazmid rekombinacyjnego pAMG21 po indukcji oznaczono stosując metody opisane w Sekcji C.
Oligo #1309-72
5'-GTT CTC CTC ATA TGG AAA CTC TGA CTC CAAAAT ACC TGC A-3' (SEQ ID NO:79)
Oligo #1309-73
5'-TAC GCA CTG GAT CCT TAT GTT GCA TTT CTT TTC TGA ATT AGC
A-3' (SEQ ID NO:80)
L. Mysi polipeptyd OPG met[27-180]
Sekwencję DNA kodującą N-końcową metioninę i aminokwasy od 27 do 180 mysiej OPG umieszczono pod kontrolą promotora luxPR prokariotycznego wektora ekspresji pAMG21 jak następuje. PCR przeprowadzono przy użyciu oligonukleotydów #1309-74 (patrz Sekcja I) i #1309-73 (patrz Sekcja K) jako primerów, i plazmidu pAMG21-muOPGmet[22-401] DNA jako szablonu. Warunki termocyklingu były takie jak opisano w Sekcji B. Otrzymaną próbkę PCR umieszczono na żelu agarowym, PCR produkt wycięto, oczyszczono, poddano restrykcji restrykcyjnymi endonukleazami NdeI i BamHI, i oczyszczono. Wytrawione NdeI i BamHI i oczyszczony powyższy produkt PCR wstawiono w sposób ukierunkowany pomiędzy miejsca NdeI i BamHI pAMG21, przy zastosowaniu standardowej metody. Mieszaninę ligacyjną transformowano do gospodarza 393 E. coli metodą elektroporezy stosując się do zaleceń producenta. Klony oddzielono, plazmid DNA wyodrębniono, i przeprowadzono sekwencjonowanie DNA, aby sprawdzić sekwencję DNA genu mu-OPG-met[27-180],
Ekspresję rekombinacyjnego polipeptydu muOPG-met[27-180] z kultur transformowanych hodowli 393 zawierających plazmid rekombinacyjnego pAMG21 po indukcji oznaczono stosując metody opisane w Sekcji C.
M. Mysi polipeptyd OPG met[22-189] i met[22-194]
Sekwencję DNA kodującą N-końcową metioninę i aminokwasy od 22 do 189, lub od 22 do 194 mysiej OPG umieszczono pod kontrolą promotora luxPR prokariotycznego wektora ekspresji pAMG21 jak następuje. Pary syntetycznych oligonukleotydów #1337-92 i #1337-93 (= muOPG-189 linker), lub #1333-57 i #1333-58 (= muOPG-194 linker) osobno fosforylowano i pozostawiono do uformowania par duplexu linkera oligomerów, przy zastosowaniu metod opisanych w sekcji B. Oczyszczony plazmid DNA βAMG2lImuOPGImet[22I401] rozszczepiono restrykcyjnymi endonukleazami KpnI i BspEI i otrzymane fragmenty DNA umieszczono na żelu agarowym. Fragment B, około 413 bp, wyodrębniono przy użyciu standardowej metodologii rekombinacyjnego DNA. Fosforylowane dupleksy linkera oligomeru uformowane pomiędzy oligomerami #1337-93 i #1337-93 (muOPG-189 linker), lub oligomerami #1333-57 i #1333-58 (muOPG-194 linker), o lepkich końcach BspEI i BamHI, i wydzielony fragment B około 413 bp plazmidu βAMG2lImuIOPGImet[22-401], wytrawione powyższymi restrykcyjnymi endonukleazami KpnI i BspEI, w sposób ukierunkowany wstawiono między miejsca KpnI i BamHI pAMG2lImuOPG-met[22-401]. przy zastosowaniu standardowej metody. Każdą z poddanych ligacji mieszanin transformowano do gospodarza 393 E. coli
187 408 metodą elektroporezy stosując się do zaleceń producenta. Klony oddzielono, plazmid DNA wyodrębniono, i przeprowadzono sekwencjonowanie DNA, aby sprawdzić sekwencję DNA genów muOPG-met[22-189], lub mu-OPG-met[22-194],
Ekspresję rekombinacyjnych polipeptydów muOPG-met[22-189] i muOPG-met[22-194] z rekombinacyjnych plazmidów pAMG21 transformowanych w komórkach 393 oznaczono stosując metody opisane w Sekcji C.
Oligo #1337-92
5-CCG GAA AGA GAT AAT GAG-3' (SEQ UD NO:81)
Oligo #1337-93
5'-GAT CCT CAT TAT CTG TTT-3' (SEQ ID NO:82)
Oligo #1333-57
5-CCT GAA ACA GAG AAG CCA CGC AAAAGT AAG-3' (SEQ ID NO:83)
Oligo #1333-58
5'-GAT CCT TAC TTT TGC GTG GCT TCT CTG TTT-3' (SEQ ID NO:84)
N. Mysi polipeptyd OPG met[27-189l i met[27-194]
Sekwencję DNA kodującą N-końcową metioninę i aminokwasy od 27 do 189, lub od 27 do 194 mysiej OPG umieszczono pod kontrolą promotora luxPR prokariotycznego wektora ekspresji pAMG21 jak następuje. Fosforylowane linkery oligomeru „muOPG-189 linker” lub „muOPG-194 linker” (patrz Sekcja M) zawierające o lepkich końcach BspEI i BamHI, i wydzielony fragment B około 413 bp plazmidu pAMG21-muOPG-met[22-401], wytrawione restrykcyjnymi endonukleazami KpnI i BspEI, w sposób ukierunkowany wstawiono między miejsca KpnI i BamHI plazmidu pAMG21-muOPG-met[27-401], przy zastosowaniu standardowej metody. Każdą z poddanych ligacji mieszanin transformowano do gospodarza 393 E. coli metodą elektroporezy stosując się do zaleceń producenta. Klony oddzielono, plazmid DNA wyodrębniono, i przeprowadzono sekwencjonowanie DNA, aby sprawdzić sekwencję DNA genów muOPG-met[27-189], lub muOPG-met[2 7-194],
Ekspresję rekombinacyjnych muOPG-met[27-189] i muOPG-met[27-194] po indukcji z komórek 393 zawierających rekombinacyjne plazmidy pAMG21 oznaczono stosując metody opisane w Sekcji C.
O. Ludzki polipeptyd OPG met[22-185], met F 22-189, met[22-194]
Sekwencję DNA kodującą N-końcową metioninę i aminokwasy od 22 do 185, lub od 22 do 189, lub 22 do 194 ludzkiego polipeptydu OPG umieszczono pod kontrolą promotora luxPR prokariotycznego wektora ekspresji pAMG21 jak następuje. Pary syntetycznych oligonukleotydów #1331-87 i #1331-88 (= huOPG-185 linker), #1331-89 i #1331-90 (= huOPG-189 linker), lub #1331-91 i #1331-92 (= huOPG-194 linker) osobno fosforylowano i pozostawiono do uformowania par duplexu linkera oligomerów, przy zastosowaniu metod opisanych w sekcji B. Oczyszczony plazmid DNA pAMG21-huÓPG-met[27-401] poddano restrykcji endonukleazami restrykcyjnymi KpnI i NdeI i otrzymane fragmenty DNA umieszczono na żelu agarowym. Fragment B, około 407 bp, wyodrębniono przy użyciu standardowej metodologii rekombinacyjnego DNA. Fosforylowane dupleksy linkera oligomeru uformowane pomiędzy oligomerami #1331-87 i #1331-88 (huOPG-185 linker), oligomerami #1331-89 i #1331-90 (huOPG-189 linker) lub oligomerami #1331-91 i #1331-92 (huOPG-194 linker) [każdy linker zawierał NdeI i BamHI o lepkich końcach], i wydzielony fragment B około 407 bp plazmidu pAMG21-huOPG-met[27-401] wytrawione powyższymi restrykcyjnymi endonukleazami KpnI i BspEI, w sposób ukierunkowany wstawiono między miejsca KpnI i BamHI pAMG21 -huOPG met[22-401], przy zastosowaniu standardowej metody. Każdą z poddanych ligacji mieszanin transformowano do gospodarza 393 E. coli metodą
187 408 elektroporezy stosując się do zaleceń producenta. Klony oddzielono, plazmid DNA wyodrębniono, i przeprowadzono sekwencjonowanie DNA, aby sprawdzić sekwencję DNA genów huOPG-met[22-185], huOPG-met[22-189], lub huOPG-met[22-194],
Ekspresję rekombinacyjnych huOPG-met[22-1859], huOPG-met[22-189] lub huOPG-met[22-194] w transformowanych 393 komórkach zawierających rekombinacyjne plazmidy pAMG21 oznaczono stosując metody opisane w Sekcji C.
P. Ludzki polipeptyd OPG met[27-185], met[27-189], met[27-194]
Sekwencję DNA kodującą N-końcową metioninę i aminokwasy od 27 do 185, lub od 27 do 189, lub 27 do 194 ludzkiego polipeptydu OPG umieszczono pod kontrolą promotora luxPR prokariotycznego wektora ekspresji pAMG21 jak następuje. Fosforylowane linkery oligomeru „huOPG-185 linker”, „huOPG-189 linker” lub „huOPG-194 linker” (patrz Sekcja O), każda zawierająca o lepkich końcach NdeI i BamHI, i wydzielony fragment B około 407 bp plazmidu pAMG21-huOPG-met[27-401], wytrawiono restrykcyjnymi endonukleazami KpnI i Ndel (patrz Sekcja O) w sposób ukierunkowany wstawiono między miejsca KpnI i BamHI plazmidu pAMG21-huOPG-met[27-401], przy zastosowaniu standardowej metody. Każdą z poddanych ligacji mieszanin transformowano do gospodarza 393 E. coli metodą elektroporezy stosując się do zaleceń producenta. Klony oddzielono, plazmid DNA wyodrębniono, i przeprowadzono sekwencjonowanie DNA, aby sprawdzić sekwencję DNA genów huOPG-met[27-185], huOPG-met[27-189, lub huOPG-met[27-194],
Ekspresję rekombinacyjnych huOPG-met[27-185], huOPG-met[27-189] i huOPGmet[27-194] z rekombinacyjnego plazmidu pAMG21 transformowanych do 393 komórek oznaczono stosując metody opisane w Sekcji C.
Q. Mysi polipeptyd OPG met[27-401] (P33E, G36S, A45P)
Sekwencję DNA kodującą N-końcową metioninę i aminokwasy od 27 do 48 ludzkiej OPG, a następnie reszty kwasowe 49 do 401 mysiej OPG, umieszczono pod kontrolą promotora luxPR prokariotycznego wektora ekspresji pAMG21 jak następuje. Oczyszczony plazmid DNA pAMG21-huOPG-met[27-401] (patrz Sekcja J) rozszczepiono stosując endonukleazy restrykcyjne AatII i KpnI i fragment B o około 1075 parach zasad wyodrębniono z żelu agarozowego przy zastosowaniu standardowej metodologii rekombinacyjnego DNA. Dodatkowo, plazmid DNA pAMG21-muOPG-met[22-401] (patrz Sekcja D) wytrawiono restrykcyjnymi endonukleazami i fragment B o około 1064 parach zasad wydzielono jak opisano powyżej. Wydzielony restrykcyjny fragment pAMG21-huOPG-met[27-401] zawierający AatII & KpnI o lepkich końcach (patrz wyżej) o około 1075 parach zasad, restrykcyjny fragment pAMG21-muOPG-met[22-401] o 1064 parach zasad zawierający KpnI i BamHI o ostrych końcach, oraz restrykcyjny fragment o 5043 parach zasad zawierający AatII i BamHI o lepkich końcach o około 5043 bp, i o sekwencji odpowiadającej kwasowi nukleinowego pAMG21 pomiędzy AatII & BamHI poddano ligacji przy zastosowaniu standardowej metodologii rekombinacyjnego DNA. Produkt ligacji przekształcono do gospodarza 393 E. coli przez elektroporację stosując się do zaleceń producenta. Klony oddzielono, i obecność rekombinacyjnego insertu w plazmidzie sprawdzono przy zastosowaniu standardowej DNA metodologii genu muOPG-27-401 (P33E, G36S, A45P). Zmiany aminokwasów w muOPG: z proliny-33 na kwas glutaminowy-33, z glicyny-36 na serynę-36, i alaniny-45 na prolinę-45, są wynikiem zastąpienia muOPG od 27 do 48 muOPG resztami huOPG 27 do 48.
Ekspresja rekombinacyjnego muOPG-met[27-401] (P33E, G36S, A45P), z transformowanych komórek 393 zawierających plazmid rekombinacyjny mpAMG21 oznaczono stosując metody opisane w Sekcji C.
R. Mysi polipeptyd OPG met-lys-(his)7-ala-ser-(asp)4-lys [22-401] (A45T)
Sekwencję dNA kodującą N-końcową histydynę i sekwencję rozpoznanej endokinazy którą jest (końce od NH2 do COOH): Met-Lys-His-His-His-His-His-His-His-Ala-Ser-AspAsp-Asp-Asp-Lys (= HEK), po której następują aminokwasy od 22 do 401 mysiego polipeptydu OPG umieszczono pod kontrolą promotora Ps4 regulowanego represora lac, jak niżej. Plazmid pAMG22-His (patrz Sekcja A) wytrawiono restrykcyjnymi endonukleazami
187 408
NheI i BamHI, i duży fragment (fragment A) wydzielono z żelu agarozowego przy zastosowaniu standardowej metodologii rekombinacyjnego DNA. Oligonukleotydy #1282-91 i #1282-92 fosforylowano oddzielnie i pozostawiono do utworzenia duplexu linkera oligomeru, przy użyciu metod uprzednio opisanych (patrz Sekcja B). Fosforylowany duplex linkera uformowany pomiędzy oligomerami #1282-91 i #1282-92, zawierający NheI i KpnI o lepkich końcach, wytrawione KpnI i BamHI i oczyszczony produkt PCR (opisany w Sekcji D), i fragment A wektora pAMG22-His wytrawiony z NheI i BamHI poddano ligowaniu przy użyciu standardowej metodologii rekombinacyjnego DNA. Mieszaninę ligacyjną transformowano do gospodarza GM 120 E. coli metodą elektroporacji stosując się do zaleceń producenta. Klony poddano selekcji, plazmid DNA wydzielono i przeprowadzono sekwencjonowanie DNA w celu sprawdzenia sekwencji DNA genu muOPG-HEK[22-401]. Sekwencjonowane DNA ujawniło fałszywą mutację w naturalnej sekwencji muOPG w rezultacie czego pojedynczy aminokwas Alanina-45 w polipetydzie muOPG został zastąpiony Treoniną.
Ekspresję rekombinacyjnego muOPG-HEK[22-401] (A45T) z komórek G120 zawierających rekombinacyjny plazmid pAMG21 określono przy użyciu metod podobnych do opisanych w Sekcji C, oprócz tego, że zamiast dodania syntetycznego autoinduktora, dodano IPTG do końcowego stężenia 0,4 mM, by uzyskać indukcję.
Oligo #1282-91
5'-CTA GCG ACG ACG ACG ACA AAG AAA CTC TGC CTC CAA AAT ACC
TGC ATT ACG ATC CGG AAA CTG GTC ATC AGC TGC TGT GTG ATA AAT GTG
CTC CGG GTA C-3' (SEQ ID NO:91)
Oligo #1282-92
5'-CCG GAG CAC ATT TAT CAC ACA GCA GCT GAT GAC CAG TTT CCG
GAT CGT AAT GCA GGT ATT TTG GAG GCA GAG TTT CTT TGT CGT CGT CGT
CG-3' (SEQ ID NO:92)
S. Ludzki polipeptyd OPG met-arg-gly-ser-(his)?[22-4Q1]
Osiem oligonukleotydów (od 1338-09 do 1338-16, pokazanych niżej) zaprojektowano w celu otrzymania fragmentu o 175 zasadach, w postaci nakładającej się na siebie podwójej wstęgi DNA. Oligomery wygrzewano, ligowano, i oligomery 5' 13' użyto jako primery PCR w celu wytworzenia dużych ilości fragmentu 175-zasadowego. Końcowe produkty PCR genu wytrawiono restrykcyjnymi endonukleazami ClaI i KpnI w celu otrzymania fragmentu, który zastępuje 28 kodonów N-końcowych ludzkiej OPG Wytrawiony ClaI i KpnI produkt PCR wstawiono do pAMG21-huOPG[27-401], który był również rozszczepiony ClaI i KpnI. Ligowany DNA transformowano do kompetentnych komórek gospodarza E. coli szczepu 393. Klony skrinowano na okoliczność możliwości otrzymywania rekombinacyjnej proteiny i występowania fuzji genu o prawidłowej sekwencji nukleotydowej. Poziomy ekspresji proteiny oznaczono badając zawartość 50 ml wytrząsanej kolby. Cały lizat i otrzymane „soniczne” grudki analizowano pod względem ekspresji konstruktu metodą żelu PAGE barwionego Coomassie, i analizy Western z przeciwciałem anty-OPG mysia.
Ekspresję huOPG Met-Arg-Gly-Ser-(Hi.s)f! [ 22-401] dającą w wyniku tworzenie dużych ciał inkluzyjnych i proteinę umiejscowiono we frakcji nierozpuszczalnej (grudka).
1338-09
ACA AAC ACA ATC GAT TTG ATA CTA GA (SEQ ID NO:93)
1338-10
TTT GTT TTA ACT AAT TAAAGG AGG AAT AAA ATA TGA GAG GAT CGC ATC AC (SEQ ID NO:94)
187 408
1338-11
CAT CAC CAT CAC GAA ACC TTC CCG CCG AAA TAC CTG CAC TAC GAC
GAA GA (SEQ ID NO:95)
1338-12
AAC CTC CCA CCA GCT GCT GTG CGA CAA ATG CCC GCC GGG TAC CCA
AAC A (SEQ ID NO:96)
1338-13
TGT TTG GGT ACC CGG CGG GCA TTT GT (SEQ ID NO:97)
1338-14
GCG ACA GCA GCT GGT GGG CGG TTT CTT CGT CGT ACT GCA GGT ATT
TCG GC (SEQ ID NO:98)
1338-15
GGG AGG GTT TCG TGA TGG TGA TGG TGA TGTC GAT CCT CTC ATA
TTT TAT T (SEQ ID NO:99)
1338-16
CCT CCT TTA ATT AFR RAA AAC AAA TCT AGT ATC AAA TCG ATT GTG
TTT GT (SEQ ED NO: 100)
T. Ludzki polipeptyd OPG met-lys[22-401] i met-(lys)j[22-401]
Aby skonstruować wersje met-lys oraz met-(lys)3 ludzkiej OPG[22-401], zaprojektowano nakładające się oligonukleotydy tak, by dodać odpowiednią ilość reszt lizynowych. Dwa oligomery z każdego konstruktu zaprojektowano do nałożenia, co prowadziło do dwóch etapów PCR do otrzymania końcowego produktu. Szablonem dla pierwszej reakcji PCR było otrzymanie plazmidu DNA zawierającego gen 22-401 ludzkiej OPG W pierwszej reakcji PCR dodano resztę (reszty) lizynowe. W drugiej reakcji PCR użyto produkt z pierwszej reakcji i dodano sekwencję aż do pierwszego miejsca restrykcyjnego ClaI.
Końcowe produkty PCR genu wytrawiono z endonukleazami restrykcyjnymi ClaI i KpnI, które zastępują 28 kodonów N-końcowych huOPG, po czym ligowano do plazmidu pAMG21-hu OPG[27-401], który był również wytrawiony z dwiema restrykcyjnymi endonukleazami. Ligowany DNA transformowano do kompetentnych komórek gospodarza E. coli szczepu 393. Klony skrinowano na okoliczność możliwości wytworzenia rekombinacyjnej proteiny i zawartości fuzji genu posiadającego prawidłową sekwencję nukleotydową. Poziomy ekspresji proteiny oznaczono badając zawartość 50 ml wytrząsanej kolby. Cały lizat i „soniczne” grudki analizowano pod względem ekspresji konstruktu metodą żelu PAGE barwionego Coomassie i analizy Western z przeciwciałem anty-OPG mysia. Żaden konstrukt nie wykazywał wykrywalnego poziomu ekspresji proteiny, a ciała inkluzyjne były niewidoczne. Sekwencje dNa potwierdzono przez sekwencjonowanie DNA.
Primery oligonukleotydów do wytwarzania MetILys-huOPG[22I401]:
1338-17
ACA AAC ACA ATC GAT TTG ATA CTA GAT TTG TTT TAA CTA ATT AAA
GGA GGA ATA AAA TG (SEQ ID NO: 101)
1338-18
CTA ATT AAA GGA GGA ATA AAA TGA AAA AAA AAG AAA CTT TTC CTC
CAAAAT ATC (SEQ ID NO: 102)
187 408
1338-20
TGT TTG GGT ACC CGG CGG ACA TTT ATC ACA C (SEQ ED NO: 103)
Primery oligonukleotydu do wytwarzania Met-(Las)3-hhOPG[22-401]:
1338-17
ACA AAC ACA ATC GAT TTG ATA CTA GAT TTG TTT TAA CTA ATT AAA GGA GGA ATA AAA TG (SEQ ID NO: 104)
1338-19 ·
CTA ATT AAA GGA GGA ATA AAA TGA AAA AAA AAG AAA CTT TTC CTC
CAA AAT ATC (SEQ ID NO: 105)
1338-20
TGT TTG GGT ACC CGG CGG ACA TTT ATC ACA C (SEQ ID NO: 106)
U. Fuzje ludzkiego i mysiego polipeptydu OPG[22-401]/Fc
Skonstruowano cztery fuzje OPG-Fc, w których obszar Fc ludzkiej IgG1 połączono z N-końcem aminokwasów od 22 do 401 osteoprotegeryny ludzkiej lub mysiej (zwanym Fc/OPG[22-401]), lub z C-końcem (zwasym OPG[22-401]/Fc). Fuzje Fc zbudowano przy użyciu wektora fuzyjsego pFc-A3, opisanego w przykładzie VII.
Wszystkie geny fuzyjse zbudowano przy użyciu standardowej’ technologii PCR. Szablonem reakcji PCR były preparaty plazmidu zawierające docelowe geny. Nakładające się oligomery zaprojektowano tak, by łączyły C-końce gesu z N-końcem innego genu. Proces tes pozwala sa 'fuzję dwóch gesów we właściwej ramce odczytu, po wykonaniu odpowiedniej reakcji PCR. Początkowo jeden oligomer „fhzaCny” dla każdego genu został wprowadzony do reakcji PCR przy użyciu uniwersalnego primeru dla wektora będącego sośnikiem genu docelowego. Oligomer „f^yjsy” użyto wraz z uniwersalnym primerem dla PCR innego gesu. Po tej pierwszej reakcji PCR otrzymano dwa oddzielne produkty, przy czym każdy z gesów zawierał miejsce fuzyjse, tworząc wystarczające nałożenia dla spowodowania drugiego etapu PCR i utworzenia żądanej fuzji. W drugim etapie PCR, pierwsze dwa produkty PCR połączono z uniwersalnymi primerami i poprzez obszary nakładające się wytworzono sekwencję DNA fuzyjsego o pełnej długości.
Końcowe produkty PCR gesu wytrawiono endonukleazami restrykcyjnymi XbaI i BamHI, a sastępsie ligowano do wektora pAMG21, który również był wytrawiony z dwiema endonukleazami restrykcyjnymi. Ligowasy DNA umieszczono w kompetentnych komórkach gospodarza E. coli szczepu 393. Klony poddawano skriningowi na zdolność wytwarzania produktu rekombinacyjsej’ proteiny i występowania fuzji gesu o właściwej sekwencji sukleotydu. Poziom ekspres jonowania proteiny oznaczono na podstawie badań po wytrząsaniu zawartości 50 ml kolby. Lizat całej komórki, „sosiczse” grudki, oraz sklarowaną ciecz poddano asalizie na ekspresję fuzji za pomocą żeli PAGE barwionych Coomassie i asalizie typu Western, przy użyciu przeciwciała asty-OPG mysia.
Fc/huOPG[22-401]
Ekspresję sestydh fhzaCsego Fc/huOPG[22-401] wykryto za pomocą żelu PAGE barwionego Coomacsie i metodą typu Western Blot. Komórki zawierają bardzo duże ciała inkluzyjne, i większość produktu znalazły się we frakcji nierozpuszczalnej (w grudkach). Następujące primery stosowano do zbudowania tej fuzji OPG-Fc:
1318-48
CAG CCC GGG TAA AAT GGA AAC GTT TCC TCC AAA ATA TCT TCT TT (SEQ ID NO: 107)
187 408
1318-49
CGT TTC CAT TTT ACC CGG GCT GAG CGA GAG GCT CTT CTG CGT GT (SEQ ID NO: 108)
Fc/muOPG[22-401]
Ekspresję peptydu fUyaSpego wykryto za pomocą żelu PAGE barwionego Coomasslk i metodą typu Western Blot. Komórki zawierały bardzo duże ciała ineiuyajpe, a większość produktu znalazła się we frakcji pieroypGsycyulnej (w grudkach). Następujące primery stosowano do zbudowania tej fazSi OPm-Fc:
1318- 50
CGC TCA GCC CGG GTA AAA TGG AAA CGT TGC CTC CAAAAT ACC TGC (SEQ ID NO: 109)
1319- 51
CCA TTT TAC CGG GGC TGA GCG AGA GGC TCT TCT GCG TGT (SEQ ID NO: 110) muOPG[22-401]/Fc
Ekspresję peBtadG fUyySnegn wykryto za pomocą żelu PAGE burwSoPkgn Coomassie i metodą typu Western Blot. Ilość rkkumbipacyjnego produktu była mniejsza niż w przypadku protein fazyjpyoh OPG posiaduSącach obszar Fc w pozaojS N-końcowej. Nie stwierdzono oczywiście obecności ciał Sneiuyajnych. Najwięcej produktu znalazło się w nierozpuszczalnej frakcji (w grudkach). Następujące primery stosowano do zbudowania tej fUzsi OZm-Fc:
1318-54
GAA ATT AAG CTG CTT AGC TGC AGC GA ACC AAA ATC (SEQ ID NO: 111)
1318-55
CAG CTG GAG CTA AGC AGC TTA TTT TCA CGG ATT G (SEQ ID NO: 112) huOPG[22-401]/Fc
Ekspresji Bkptadu faySi nie wykryto za pomocą żelu PAGE barwionego Coomusslk, jaeeoiwlek wystąpił słaby pozytywny sygnał w badaniu metodą typu Western. Nie stwierdzono uozawiśole obecności ciał ipeluyajpaoh. Następujące primery stosowano do wytworzenia tej OPm-Fo fazsi:
1318-52
AAA AAT AAG CTG CTT AGC TGC AGC TGA ACC AAA ATC (SDQ ID NO: 113)
1318-53
CAG CTG CAG CTA AGC AGC TTA TTT TTA CTTG ATT GG (SEQ ID NO: 114)
V Fuzja ludzkiego polipeptydu OPG met[22-401]-Fc ten łączy zmianę pozycji aminokwasu prolipa na alaninę w pozycji 25 (P25A) z fuzją huOPG met[22-401]. Plazmid wytrawiono z tndonGelkazamS restrykcyjnymi ClaI i KpnI, które usunęły N-końcowe 28 kodony, i końcowy, mały (mniej niż 200 par zasadowych) fragment oczyszczono na żelu. Fragment ten, zawierający prolinę zamiast alaniny SUPldapn ligowaniu do BiuymiPu fuzyjnego BAMG21-huoPG[22-401]-Fc, który wytrawiono z dwiema epdopakieuzami rkstrykoaSpami. Ligowany DNA transformowano do kompetentnych komórek gospodarza E. coli szczepu 393. Klony podano skrlpSngowi na zdolność wytwarzania rkkombSnaoySnej proteiny i występowania genu fayyjnego o właściwej sekwencji puklkutaPu. Poziomy eksprksjopowania proteiny oznaczono na podstawie badań zawartości 50 ml kolby po wytrząsaniu. Lizat całej komórki i „sonioznk” grudki poddano analizie na ekspresję za pomocą żeli PAGE barwionych CoomacsSe i analizie typu Western, przy użyciu
187 408 przeciwciała anty-OPG mysia. Poziom ekspresji peptydu fuzji wykryto za pomocą żeli PAGE barwionych Coomassie i metodą typu Western Blot. Proteina znajdowała się we frakcji nierozpuszczalnej (w grudkach). Komórki zawierały duże ciała inkluzyjne.
W. Ludzki polipeptyd OPG met[22-401] (P25A)
Sekwencję DNA kodującą N-końcową metioninę i aminokwasy od 22 do 401 ludzkiej OPG, z proliną w pozycji 25 zastąpioną przez alaninę, pod kontrolą promotora lux Pr w prokariotycznym wektorze ekspresji pAMG21, wytworzono jak następuje: Synetyczne oligomery #1289-84 i 1289-85 wygrzewano do wytworzenia duplexu linkera oligomeru z XbaI i KpnI o kleistych końcach. Syntetyczny duplex linkera optymalnie wykorzystał kodony E. coli i kodował N-końcową metioninę. Linker zawierał także restrykcyjne miejsce SpeI, które nie występowało w oryginalnej sekwencji. Duplex linkera został wstawiony w sposób ukierunkowany pomiędzy miejsca XbaI i KpnI w βAMG2lIhuOPGI22-401, przy zastosowaniu standardowych metod. Mieszaninę ligacyjną wprowadzono do gospodarza E. coli GM221 przez transformację. Klony wstępnie poddano skriningowi na wytwarzanie rekombinacyjnej proteiny. Plazmid DNA wydzielono z pozytywnych klonów i sekwencję wytworzonego DNA przeprowadzono dla sprawdzenia sekwencji dNa genu huOPG-met[22-401](P25A). Następujące oligonukleotydy zastosowano do wytworzenia linkera XbaI-KpnI:
Oligo #1289-84
5'-CTA GAA GGA GGA ATA AGA TAT GGA AAC TTT TGC TCC AAA ATA
TCT TCA TTA TGA TGA AGA AAC TAG TCA TCA GCT GCT GTG TGA
TAA ATG TCC GCC GGG TAC-3' (SEQ ID NO: 115)
Oligo #1289-85
5'-CCG GCG GAC ATT TAT CAC ACA GCAA GCT GAT GAC TAG TTT CTT
CAT CAT AAT GAA GAT ATT TTG GAG CAA AAG TTT CCA TAT GTT ATT
CCT CCT T-3' (SEQ ED NO: 116)
X. Ludzki polipeptyd OPG met[22-401] (P26A) i (P26D)
Sekwencję DNA kodującą N-końcową metioninę i aminokwasy od 22 do 401 ludzkiej OPG, z proliną w pozycji 26 zastąpioną przez alaninę pod kontrolą promotora lux Pr w prokariotycznym wektorze ekspresji pAMG21, wytworzono jak następuje: Synetyczne oligomery # 1289-86 i 1289-87 wygrzewano do wytworzenia duplexu linkera oligomeru o kleistych końcach XbaI i SpeI. Syntetyczny duplex linkera optymalnie wykorzystał kodony E. coli i kodował N-końcową metioninę. Duplex linkera został wstawiony w sposób ukierunkowany pomiędzy miejsca XbaI i SpeI w pAMG2lIhuIOPG[22I401] (P25A), przy zastosowaniu standardowych metod. Mieszaninę ligacyjną umieszczono w E. coli GM221 przez transformację. Klony poddano wstępnemu skriningowi na wytarzanie rekombinacyjnej proteiny. Plazmid DNA wydzielono z pozytywnych klonów i przeprowadzono sekwencjonowanie dNa dla sprawdzenia sekwencji DNA genu huOPGmet[22-401] (P26A). Stwierdzono, że w jednym z sekwencjonowanych klonów proliną w pozycji 26 została zastąpiona przez kwas asparaginowy raczej niż przez alaninę, i klon ten nazwano huOPG-met[22-401] (P26D). Poniższe oligonukleotydy użyto do wytworzenia linkera XbaI-SpeI:
Oligo #1289-86
5'-CTA GAA GGA GGA ATA ACA TAT GGA AAC TTT TCC TGC TAA ATA TCT TCA TTA TGA TGA AGA AA-3' (SEQ ID NO: 117)
Oligo #1289-87
5'-CTA GTT TCT TCA TCA TAA TGA AGA TAT TTA GCA GGA AAA GTT TCC ATA TGT TAT TCC TCC TT-3' (SEQ ID NO: 118)
187 408
Y. Ludzki polipeptyd OPG met[22-401] (P25A)
Sekwencję DNA kodującą N-końcową metioninę i aminokwasy od 22 do 194 ludzkiej OPG, z proliną w pozycji 26 zastąpioną przez alaninę, pod kontrolą promotora lux Pr W prokariotycznym wektorze ekspresji pAMG21, wytworzono jak następuje: każdy z plazmidów pAMG21-huOPG[27-194] i pAMG21-huOPG222-401] (P25A) wytrawiono endonukleazami KpnI BamHI. Fragment o 450 parach zasad wydzielono z pAMG21-huOPG[27-194] i fragment odpowiadający 6.100 parom zasad wydzielono z pAMG21-huOPG[22-401] (P25A). Fragmenty te poddano razem ligowaniu i wprowadzono przez transformację do gospodarza E. coli GM221. Klony poddano wstępnemu skriningowi na okoliczność wytwrzania rekombinacyjnej proteiny. Plazmid DNA wydzielono z pozytywnych klonów i wykonano sekwencjonowanie DNA dla sprawdzenia sekwencji DNA genu huOPG-met[22-194] (P26A).
Przykład IX
Asocjacja monomerów OPG
Komórki CHO nastawione na nadekspresję muOPG[22-400]wykorzystcno do wytworzenia kondycjonowanych pożywek dla analiz wydzielanej rekombinacyjnej OPG przy użyciu poliklonalnych przeciwciał anty-OPG z królika. Część próbki kondycjonowanej pożywki zatężono 20-krotnie, po czym analizowano redukującą i nieredukującą metodą SDS-PAGE (fig. 15). W warunkach redukujących proteina migrowała jako polipeptyd Mr 50-55 kd, jak by przewidywano, gdyby dojrzały produkt był glikozylowany w jednym lub więcej jego zgodnych miejsc N-glikozylacji. Nieoczekiwanie, gdy te same próbki analizowano za pomocą nieredukującej metody SDS-PAGE, większość proteiny migrowała jako polipeptyd o około 100 kd, czyli dwukrotnie większej od zredukowanej proteiny. Ponadto, mniejsza była ilość poeipeptyCu Mr 50-55 kd. Ten wzorzec migracji na SDS-PAGE był zbieżny z przypuszczeniem, że produkt OPG tworzył dimery poprzez utlenienie wolnej grupy (grup) sulfhyd^lowych.
Przewidywany dojrzały polipeptyd OPG zawiera 23 reszty cysteinowe, 18 z których, jak się przewidywało, jest związanych z tworzeniem wewnątrzłańcuchowych mostków dwusiarczkowych obejmujących cztery bogate w cysteinę domeny (fig. 12). Pięć pozostałych C-końcowych reszt cysternowych nie jest związanych z wtórną strukturą, co można było przewidzieć w oparciu o homologię z innymi członami rodziny TNFR. Ogółem jest netto nieparzysta liczba reszt cysternowych, i jest formalnie możliwe, że przynajmniej jedna z reszt jest wolna, by wytworzyć międzycząsteczkowe wiązanie dwusiarczkowe pomiędzy dwoma monomerami OPG
Aby wyjaśnić wzorce przebiegu kinezy OPG i asocjacji monomeru, wykonano badanie polegające na znakowaniu ze „ściganiem” impulsu. Komórki CHO ekspresjonujące muOPG[22-401]były metabolicznie znakowane w wolnej od surowicy pożywce zawierającej 35S metioninę i cysteinę przez 30 minut, jak opisano powyżej, Po tym okresie pożywki usunięto i zastąpiono pełną pożywką zawierającą nieznakowaną metioninę i cysteinę w stężeniach około 2.000 razy nadmiarowych w stosunku do oryginalnego stężeniem radioaktywnych aminokwasów. Po upływie 30 minut, 1 godziny, 2 godzin, 4 godzin, 6 godzin i 12 godzin po dodaniu, hodowle zebrano przez usunięcie kondycjonowanych pożywek i przygotowano lizaty kondycjonowanych pożywek i sąsiednich monowarstw. Pożywki hodowli i lizaty komórki sklarowano jak opisano powyżej, po czym immuno-wytrącono przy użyciu przeciwciał anty-OPG, jak opisano powyżej. Po przemyciu immunoosadów uwolniono je przez gotowanie w nieredukującym buforze SDS-PAGE, po czym rozdzielono na dwie równe części. Do jednej połowy dodano środek redukujący β-merkaptotanol do końcowego stężenia 5% (objętościowo/objętościowych), podczas gdy drugą część utrzymywano w warunkach nieredukujących. Obie części immunoosadów zanalizowano metodą SDS-PAGE jak opisano powyżej, po czym poddano przetwarzaniu do cutoradiogaafSl i naświetlania filmu. Wyniki przedstawiono na rysunku fig. 16. Próbki zanalizowane redukującą metodą SDS-PAGE przedstawiono na dolnych dwóch panelach. Po syntezie polipeptyd OPG jest szybko przetwarzany na nieco większy polipeptyd, który prawdopodobnie stanowi modyfikację uzyskaną przez glikozylowanie łączące zN-. Po upływie około 2 godzin poziom OPG w komórce
187 408 drastycznie się obniża i pojawia się w sklarowanej cieczy hodowli. Okazuje się, że jest to wynik wektorowego przeniesienia OPG z komórki do pożywek w miarę czasu, co jest zgodne ze stwierdzeniem, że OPG jest naturalnie otrzymaną proteiną. Analiza tych samych immunoosadów w nieredukujących warunkach ujawnia zależność pomiędzy tworzeniem dimerów OPG i wydzielaniem do kondycjonowanych pożywek (fig. 16, górne panele). W czasie pierwszych 30-60 minut, monomery OPG są przetwarzane w komórce przez widoczne glikozylowanie, a następnie tworzenie dimeru. W miarę upływu czasu, zasadnicza część monomerów OPG przechodzi w dimery, które następnie znikają z komórki. Po około 60 minutach zaczynają pojawiać się dimery w kondycjonowanej pożywce, i nagromadzają w czasie trwania eksperymentu. Po tym okresie tworzone są dimery OPG, które następnie wydzielane są do pożywki hodowli. Monomery OPG utrzymują się na niskim poziomie wewnątrz komórki z upływem czasu, a małe ilości znajdują się również w pożywce. Nie okazuje się to być wynikiem rozbicia kowalencyjnych dimerów OPG lecz raczej wytwarzania pod-stechiometrycznych ilości monomerów w komórce i następującego po tym wydzielania.
Rekombinacyjnie wytworzona OPG z transfekowanych komórek CHO wydaje się być przeważnie dimerem. W celu określenia, czy dimeryzacja jest naturalnym procesem w syntezie OPG, analizowaliśmy kondycjonowaną pożywkę linii komórkowej, o której wiadomo, że naturalnie wydziela OPG Stwierdzono, że linia komórkowa CTLL-2, limfocytowa linia komórkowa mysiej cytotoksyny T (ATCC, numer dostępu TIB-214), ekspresjonują OPG mRNA w ściance komórki i linii komórkowej RNA. Okazało się, że transkrypt OPG jest taki sam jak RNA klonowany i sekwencjonowany o 2,5-3,0 kilozasadach, uzyskany z nerek, o którym wiadomo, że koduje wydzielaną cząsteczkę. Analiza typu Western Blot kondycjonowanych pożywek otrzymanych z komórek CTLL-2 wykazuje, że większa część, jeśli nie wszystkie wydzielane proteiny OPG, są dimerem (rys. fig. 17). Sugeruje to, że dimeryzacja OPG i wydzielanie nie jest wynikiem nadekspresji w linii komórkowej, ale jest raczej główną postacią produktu jaki jest produkowany przez ekspresjonujące komórki.
Tkanki i surowicę myszy normalnych i transgenicznych zanalizowano, by określić naturę cząsteczki OPG ekspresjonowanej u myszy transgenicznych OPG Ponieważ cDNA OPG szczura było ekspresjonowane pod kontrolą elementu kontrolnego hepatocytu, ekstrakty wyprodukowane z miąższu kontrolnych i transgenicznych myszy w warunkach nieredukujących poddano analizie (rys. fig. 18). W ekstrakcie z myszy transgenicznych, lecz nie z kontrolnych, dimery OPG są łatwo wykrywalne, z podstechiometrycznymi ilościami monomerów. Dimery OPG i monomery okazują się identyczne z rekombinacyjną proteiną mysią wydzielaną w komórkach CHO metodą inżynierii genetycznej. Sugeruje to silnie, że dimery OPG są naprawdę naturalną formą produktu genowego, i są przypuszczalnie kluczowymi składnikami aktywnymi. Próbki surowicy otrzymane z kontrolnych i transgenicznych myszy były podobnie analizowane metodą Western Blot. U kontrolnych myszy, większość proteiny OPG migruje jako dimer, podczas gdy małe ilości monomeru są również wykrywane. Ponadto, wykryte są znaczne ilości większej proteiny pokrewnej OPG, które migrują ze względną masą cząsteczkową o przewidywanej wielkości kowalencyjnie połączonego trimeru. Przeto, rekombinacyjna OPG jest wydzielana u myszy głównie jako dimeryczna proteina OPG u postać dimeru może być podstawą dla osteopetrotycznego fenotypu myszy OPG Proteina rekombinacyjnu OPG może również występować w formach „trimerycznych” o większym ciężarze cząsteczkowym.
Aby określić, czy pięć C-końcowych reszt cysternowych OPG odgrywa rolę w homodimeryzacji, kodony mysiej OPG dla reszt cysternowych 195 (C195), C202, C277, C319, i C400 zmieniono na serynę, przy użyciu urządzenia QuickChange™ Site-Directed Mutagenesis Kit (Stratagene, San Diego, CA), jak opisano wyżej. Gen muOPG subklonowano między miejscami NotI i XbaI wektora (+) pcDNA 3.1 (Invitrogen, San Diego, CA). Uzyskany plazmid pcDNA3.1-muOPG i mutageniczne primery potraktowano polimerazą Pfu w obecności dezoksynukleotydów, a następnie amplifikowano w termocyklerze, jak opisano wyżej. Próbka reakcji jest następnie transfekowana do kompetentnego E. coli XL1-Blue przez szok cieplny, po czym płytkowana. Następnie plazmid DNA z taunsformuntów sekwencjonowano dla sprawdzenia mutantów.
187 408
Następujące pary primerów użyto do zmiany kodonu reszty cysteinowej 195 na serynę genu mysiej OPG, co dało w wyniku wytworzenie proteiny muOPG[22-401] C195S:
1389-19:
5'-ΟΑΟ GCAAAAGC GGG AAT AGA TGT CAC-3' (SEQ ID NO:150)
1406-38:
5'-GTG AGA TCT ATT CCC GAC TTT TGC GTG-3' (SEQ ID NO: 151)
Następujące pary primerów użyto do zmiany kodonu reszty cysteinowej 202 na serynę genu mysiej OPG co dało w wyniku wytworzenie proteiny muOPG[22-401] C202S:
1389-21:
5'-CAC CCT GTC GGA AGA GGC CTT CTT C-3' (SEQ ID NO:152)
1389-22:
5'-GAA GAA GGC CTC TTC CGA CAG GGT G-3' (SEQ ID NO: 153)
Następujące pary primerów użyto do zmiany kodonu reszty cysteinowej 277 na serynę genu mysiej OPG co dało w wyniku wytworzenie proteiny muOPG[22-401] C277S:
1389-23:
5'-TGA CCT CTC GGA AAG CAG CGT GCA-3' (SEQ ID NO: 154)
1389-24:
5'-TGC ACG CTG CTT TCC GAG AGG TCA-3' (SEQ ID NO: 155)
Następujące pary primerów użyto do zmiany kodonu reszty cysteinowej 319 na serynę genu mysiej OPG co dało w wyniku wytworzenie proteiny muOPG[22-401] C319S:
1389-17:
5'-CCT CGA AAT CGA GCG AGC AGC TCC-3' (SEQ ID NO: 156)
1389-18:
5'-CGA TTT CGA GGT CTT TCT CGT TCT C-3' (SEQ ID NO: 157)
Następujące pary primerów użyto do zmiany kodonu reszty cysteinowej 400 na serynę genu mysiej OPG co dało w wyniku wytworzenie proteiny muOPG[22-401] C400S:
1406-72:
5'-CCG TGA AAA TAA GCT CGT TAT AAC TCG GAA TGG-3' (SEQ ID NO: 158)
1406-75:
5'-CCA TTC CTA GTT ATA ACG AGC TTA TTT TCA CGG-3' (SEQ ID NO: 159)
Każdy uzyskany plazmid muOPG[22-401] zawierający odpowiednią mutację transfekowano następnie do ludzkich komórek 293, mutant proteiny fuzyjnej OPG-Fc oczyszczono z kondycjonowanych pożywek, jak opisano powyżej. Aktywność biologiczną każdej proteiny oceniono w próbie in vitro tworzenia osteoklastu opisanej w przykładzie XI. Kondycjonowane pożywki z każdego transfektantu analizowano za pomocą nieredukującego SDS-PAGE oraz Western Blotting przy użyciu przeciwciał anty-OPG.
Mutacja każdej z pięciu C-końcowych reszt cysteinowych daje w wyniku wytwarzanie przeważnie (> 90%) monomerycznych cząsteczek OPG o 55 kilodaltonach. To wyraźnie sugeruje, że C-końcowe reszty cysteinowe odgrywają łącznie rolę w homodimeryzacji OPG
187 408
C-końcowe mutanty delecyjne OPG skonstruowano, by utworzyć mapę obszaru(ów) C-końcowej domeny OPG, które są ważne dla homodimeryzacji OPG. Te mutanty OpG skonstruowano przez amplifikację przy użyciu primerów, które wprowadzają przeddojrzale sygnały translacyjne „stop” w C-końcowym obszarze mysiej OPG. Oligomer 5' zaprojektowano do kodonu startowego MuOPG (zawierającego miejsce restrykcyjne HindIII), i oligonukleotydy 3' (zawierające stop-kodon i miejsce XhoI) zaprojektowano, by obciąć C-końcowy obszar muOPG kończący się na reszcie treoninowej 200 (CT200), prolinowej 212 (CT212), kwasu glutaminowego 293 (CT-292) lub seryny 355 (CT-355).
Następujące primery użyto do konstrukcji muOPG[22-200]:
1091-39:
5'-CCT CTG AGC TCA AGC TTC CGA GGA CCA CAA TGA AGA AG-3' (SEQ ID NO: 160)
1391-91:
5'-CCT CTC TCG AGT CAG GTG ACA TCT ATT CCA CAC TTT TGC GTG GC-3' (SEQ ID NO: 161)
Następujące primery użyto do konstrukcji muOPG[22-212]:
1091-39:
5-CCT CTG AGC TCA AGC TTC CGA GGA CCA CAA TGA ACA AG-3' (SEQ ID NO: 162)
1391-90
5'-CCT CTC TCG AGT CAA GGA ACA GCA AAC CTG AAG AAG GC-3' (SEQ ID NO: 163)
Następujące primery użyto do konstrukcji muOPG[22-293]:
1091-39:
5'-CCT CTG AGC TCA AGC TTC CGA GGA CCA CAA TGA ACA AG-3' (SEQ ID NO: 164)
1391-89:
5'-CCT CTC TCG AGT CAC TCT GTG GTG AGG TTC GAG TGG CC-3' (SEQ ID NO: 165)
Następujące primery użyto do konstrukcji muOPG[22-355]:
1091-39:
5'-CCT CTG AGC TCA AGC TTC CGA GGA CCA CAA TGTA ACA AG-3' (SEQ ID NO: 166)
1391-88:
5'-CCT CTC TCG AGT CAG GAT GTT TTC AAG TGC TTG AGG GC-3' (SEQ ID NO: 167)
Każdy otrzymany plazmid muOPG[22-401] zawierający odpowiednie obcięcie następnie transfekowano do ludzkich komórek 293, proteinę fuzyjną OPG-Fc mutanta oczyszczono z kondycjonowanych pożywek, jak opisano powyżej. Aktywność biologiczną każdej proteiny oceniono w próbie tworzenia osteoklastów in vitro, jak opisano w przykładzie XI. Kondycjonowane pożywki również zanalizowano metodą nieredukującego SDS-PAGE oraz Western Blotting przy użyciu przeciwciał anty-OPG
187 408
Obcięcie C-końcowego obszaru OPG wpływa na zdolność OPG do tworzenia homodimerów. Formy CT 355 są przeważnie monomeryczne, chociaż tworzy się w pewnym stopniu dimery. CT 293 tworzy, jak się wydaje, równomolowe ilości monomeru i dimeru, jak również agregaty o wyższym ciężarze cząsteczkowym. Jednakże CT 212 i CT 200 są monomeryczne.
Przykład X
Oczyszczanie OPG
A. Oczyszczanie protein fuzyjnych OPG-Fc z ssaków
Pięć litrów kondycjonowanych pożywek z komórek 293 ekcsresjonujących proteinę fuzyćną OPG-Fc wytworzono jak następuje. Zamrożoną próbkę komórek rozmrożono w 10 ml pożywki 293 S (DMEM-wysoko glukozowa, 1x L-glutamina, 10% zdezaktywowanęj termicznie surowicy z płodu wołu (FBS) i 100 pg/ml hlgromacana) i zasilono świeżą pożywką po jednym dsiu. Po trzech dniach komórki podzielono między dwie kolby typu T175 i rozcieńczono 1:10 oraz 1:20. Wykonano dwa dodatkowe rozcieńczenia 1:10, aby powiększyć skalę kolb T175 do 200. W tym momencie komórki były 5 dsi po rozmrożeniu. Komórki hodowano niemal do zlania (około trzech dni), kiedy to odessano pożywkę zawierającą surowicę, komórki przemyto jeden raz PBS, porcją 25 ml/na kolbę, i do każdej kolby dodano 25 ml pożywki SF (DMEM-wysoko glukozowa, 1X L-glutamina). Komórki utrzymywano w atmosferze 5% CO2 przez trzy dsi, po czym pożywkę zebrano; odwirowano i przesączono przez filtry 0,45 m z azotanu celulozy (Corning).
Proteiny fuzyjne OPG oczyszczono przy użyciu kolumny typu Protein G Sepharose (Pharmacia) zrównoważonej w PBS. Wielkość kolumny zależała od objętości wyjściowej pożywki. Kondycjonowaną pożywkę sporządzoną jak opisano powyżej wprowadzono na kolumnę, kolumnę przemyto PBS, i czystą proteinę eluowano stosując roztwór 100 mM glicyny o pH = 2,7. Frakcje zebrano do probówek zawierających 1M Tris o pH = 9,2 w celu neutralizacji tak szybko jak tylko jest możliwe. Frakcje zawierające proteinę połączono, zatężoso w urządzeniu Amicon Centricon 10 lub Centriprep 10, i poddano diafiltracji do PBS. Czystą proteinę przechowuje się w temperaturze -80°C.
Mysia [22-401]-Fc, Mysia [22-180]-Fc, Mysia [22-194]-Fc, ludzka [22-401]-Fc, oraz ludzka [22-201]-Fc oczyszczane były w tes sam sposób. Mysia [22-185]-Fc oczyszczana jest w tes sam sposób.
B. Otrzymywanie przeciwciał anty-OPG
Trzem nowozelandzkim białym królikom (o początkowej wadze 2,265 - 3,624 kg /5-8 funtów/) podskórnie wstrzyknięto proteiną fuzyjną muOPG[22-401]-Fc. Pierwszego dnia każdego królika immunizowano dawką 50 pg antygenu zemulgowanego w równej objętości kompletnego dopełniacza Freunda. Dalsze zastrzyki (w dniu 14 i 28) podano w ten sam sposób, ale z niekompletnym dopełniaczem Freunda. Miasa przeciwciał monitorowano metodą EIA. Po drugim zastrzyku antisera wykazały wysokie miano przeciwciał i pobrano po 25 ml krwi od każdego zwierzęcia. Surowicę sa wstępie przepuszczono przez kolumnę powinowactwa, w której immobilizowano mysią OPG-Fc. Przeciwciała anty-OPG wymyto przy użyciu buforu Pierce Gentle Elutios Buffer, zawierającego 1% lodowatego kwasu octowego. Wymytą proteinę sastępsie dializowano do PBS i przepuszczono przez kolumnę Fc w celu usunięcia przeciwciał specyficznych dla części Fc proteiny fhzajnęj OPG. Przefiltrowane frakcje zawierające specyficzne przeciwciała asty-OPG dializowano do PBS.
C. Oczyszczanie mysiej OPG[22-401]
Chromatografia na zasadzie powinowactwa do przeciwciała
Przeciwciała asty-OPG oczyszczone przez powinowactwo przesączono do sprzęgającego buforu (0,1 M węglan sodu, pH = 8,3, 0,5 M NaCl), i mieszano z perełkami sefarozy aktywowanej CNBr przez dwie godziny w temperaturze pokojowej. Żywicę następnie przemywano ekstensywnie sprzęgającym buforem przed zablokowaniem sie zajętych miejsc z - m etanoloarmną(pH = 8,0) przez dwie godziny w temperaturze pokojowej. Żywicę przemywano roztworem o niskim pH (0,1 M octan sodu, pH = 4,0, 0,5 m NaCl), a następnie roztworem o wysokim pH (0,1 M Tris-HCl, pH = 8,0, 0,5 M NaCl). Ostatnie przemycia powtórzono trzykrotnie. Żywicę, na kosiec, doprowadzono do stanu równowagi z PBS przed umieszczeniem
187 408 na kolumnie. Po załadowaniu żywicę przemyto przy użyciu PBS. Odnośne wymywanie przeprowadzono roztworem 0,1 M glicyna-HCl, o pH = 2,5, a następnie ponownie zrównoważono przy pomocy PBS.
Stężoną kondycjonowaną pożywkę z komórek CHO ekspresjonujących muOPG[22-401] umieszczono na kolumnie przy małej prędkości przepływu. Kolumnę przemyto PBS do momentu, kiedy absorbancja UV mierzona przy 280 nm powróciła do linii podstawowej. Proteinę eluowano z kolumny najpierw roztworem 0,1 M glicyna-HCl (pH = 2,3), ponownie zrównoważono z PBS, i eluowano drugim buforem (0,1 M CAPS, pH = 10,5, 1 M NaCl). Dwa eluaty przefiltrowano osobno do PBS i przesączono w sterylnych warunkach przed oziębieniem w temperaturze -20°C.
Chromatografia konwencjonalna
Kondycjonowaną pożywkę z komórek CHO zatężono 23-krotnie w pakunku „Amicon spiral wound” (S10Y10) i przesączono z 20 mm tris o pH = 8,0. Przesączoną pożywkę umieszczono następnie na kolumnie Q-sepharose HP (Pharmacia), którą zrównoważono 20 mM tris o pH = 8,0. Kolumnę następnie przemywano do czasu, gdy absorbancja przy 280 nm osiągnęła linię podstawową. Proteinę wymywano roztworem o 20 objętościach kolumny o gradiencie 0-300 mM HCl w tris o pH = 8,0. Proteinę OPG wykryto we frakcjach komórkowych przy użyciu metody Western Blot.
Frakcje zawierające OPG połączono i doprowadzono do końcowego stężenia 300 mM NaCl, 0,2 mM DTT. Kolumnę NiNTA-superose (Qiagen) zrównoważono przy pomocy 20 mM tris o pH - 8,0, 300 mM NaCl, 0,2 mM DTT, po czym załadowano połączone frakcje. Kolumnę przemywano buforem równoważącym aż do osiągnięcia linii podstawowej absorbancji. Proteiny wymywano z kolumny roztworem o gradiencie stężenia imidazolu 0-30 mM w buforze równoważącym. Pozostałe proteiny wymyto z kolumny roztworem 1 M imidazolu. Ponownie użyto metodę Western Blot do wykrycia OPG zawartej we frakcjach.
Połączone frakcje z kolumny NiNTA dializowano do roztworu 10 mM fosforanu potasu o pH = 7,0 i 0,2 mM DTT. Dializat następnie umieszczono w ceramicznej kolumnie hydroksyapatytowej (Bio-Rad), którą zrównoważono w 10 mM buforu fosforanowego. Po przemyciu kolumny proteinę eluowano ponad 20-krotną objętością kolumnową roztworu z gradientem stężenia 10-100 mM fosforanu potasu. Następnie operację tę powtórzono z 20-krotną objętością roztworu o gradiencie stężenia 100-400 mM fosforanu.
Obecność OPG stwierdzono metodą żeli SDS-poliakryloamidowych barwionych coomassie blue oraz Western Blotting. Frakcje połączono i przesączono do PBS i zamrożono w temperaturze -80°C. Oczyszczona proteina występuje jako monomer i pozostanie taką po przesączeniu do PBS. Monomer jest trwały jeśli jest przechowywany w stanie zamrożonym, lub przy pH = 5 w temperaturze 4°C. Jednakże, jeśli jest przechowywany w temperaturze 4°C w PBS, dimery i - co może okazać się - trimery i tetramery mogą tworzyć się po jednym tygodniu.
D. Oczyszczanie ludzkiego polipeptydu OPGmet[22-401] z E. Coli
Pastę z komórek bakteryjnych rozproszono w 10 mM EDTA do stężenia 15% (masa/objętość) przy użyciu niskoobrotowego homogenizera w temperaturze 5°C. Następnie komórki zniszczono przez dwie homogenizacje, każda w temperaturze 5°C i pod ciśnieniem 101,5 MPa (15.000 psi). Otrzymany homogenat odwirowano przy 5.000 x g w ciągu jednej godziny w temperaturze 5°C. Grudkę po odwirowaniu myto stosując homogenizację z niskimi obrotami w wodzie o początkowej objętości homogenizacji, a następnie odwirowano jak poprzednio. Przemytą grudkę następnie rozpuszczano do stężenia 15% (masa/objętość) w roztworze o końcowym stężeniu 6 M guanidyna-HCl, 10 mM dwutiotreitolu, 10 mM Tris HCl o pH = 8,5 w temperaturze otoczenia przez 30 minut. Roztwór ten rozcieńczono 30-krotnie w roztworze zawierającym 2 M mocznika, 50 mM CAPS o pH = 10,5, i 1 mM zredukowanego glutationu, po czym mieszano przez 72 godziny w temperaturze 5°C. OPG z tego roztworu oczyszczono w temperaturze 25°C. OPG z tego roztworu oczyszczono przez, po pierwsze, doprowadzenie do pH = 4,5 roztworem kwasu octowego, a następnie chromatograficznie na kolumnie wypełnionej żywicą SP-HP Sepharose, zrównoważonej 25 mM octanu sodu o pH = 4,5. Przemywanie kolumny przebiegało z zastosowaniem 20 objętości
187 408 kolumnowych roztworu o liniowym gradiencie stężenia chlorku sodu od 50 mM do 550 mM w takim samym buforze, z szybkością wymywania 0,1 objętości kolumny na minutę. Frakcje odpowiadające pikom zawierającym tylko żądaną postać OPG, zebrano i przechowywano w temperaturze 5°C w buforze zamienionym na roztwór soli buforowany fosforanem, zatężono przez ultrafiltrację, po czym przechowywano w temperaturze 5°C. Materiał ten poddano analizie chromatograficznej HPLC z odwróconymi fazami, analizie metodą SDS-PAGE, próbie z lizatem amebocytów limulus na obecność endotoksyny, oraz analizie sekwencyjnej N-końca. Dodatkowo, techniki takie, jak spektrometria masowa, stabilność w zależności od pH/temperatury, fluorescencja, dichroizm kołowy, skaningowa kalorymetria różnicowa i próby profilowania proteazowego, można również zastosować do badania pofałdowanego charakteru protein.
Przykład XI
Aktywność biologiczna rekombinacyjnego OPG
W oparciu o histologię i histomorfometrię okazało się, że wątrobowa nadekspresja OPG u transgenicznych myszy znacząco obniżyła liczbę osteoklastów prowadząc do wyraźnego wzrostu tkanki kostnej (patrz przykład IV). Aby zyskać dalszy wgląd w potencjalny mechanizm (mechanizmy) leżące u podstawy tego efektu in vivo przebadano różne formy rekombinacyjnego OPG w modelu hodowli in vitro tworzenia osteoklastu (próby tworzenia osteoklastu). Ten układ hodowli był pierwotnie opracowany przez Udagawa (Udagawa i in., Endocrinology 125, 1805-1813 (1989), Proc. Natl. Acad. Sci., USA, 87, 7260-72-64 [1990]), i wykorzystuje połączenie komórek szpiku kości i komórek z linii komórkowych zrębu szpiku kości. Opis modyfikacji tego układu hodowli stosowanego dla tych badań uprzednio opublikowano (Lacey i inni, Endocrinology 136, 2367-2376 [1995]). W tej metodzie, komórki szpiku kości wypłukane z kości udowych i piszczelowych myszy są hodowane przez noc w pożywce (alfa MEM z 10% surowicą płodu bydlęcego inaktywowaną cieplnie), uzupełnionej 500 U/ml CSF-1 (czynnik 1 stymulujący kolonię, zwany także M-CSF), hematopoetycznym czynnikiem wzrostu specyficznym dla komórek rodziny monocyto-makrofagów. Po tej inkubacji zebrano nieprzylegające komórki, poddano oczyszczaniu gradientowemu i następnie współhodowano z komórkami z linii komórkowej szpiku kości ST2 (1 x 106 komórek nieprzylegąjących: 1 x 105 komórek ST2/ml pożywki). Pożywki uzupełniono deksametazonem (100 nM) i biologicznie czynnym metabolitem witaminy D3 znanym jako 1,25 dwuhydroksywitamina D3 (1,25 (OH)2 D3, 10 nM). Aby zwiększyć widoczność osteoklastów dodano do pewnych hodowli prostaglandynę E2 (250 nM). Okres wspólnej hodowli trwa zwykle 8-10 dni, a pożywka ze wszystkimi świeżo dodanymi uzupełnieniami jest odnawiana co 3-4 dni. W różnych odstępach hodowlę ocenia się na obecność fosfatazy kwaśnej winianoodpornej (TRAP) przy użyciu wybarwiania histochemicznego (Sigma Kit # 387A, Sigma, St. Louis, MO), lub próby z roztworem TRAP. Metoda histochemiczna TRAP umożliwia identyfikację osteoklastów fenotypowo, które są wielojądrowymi komórkami (> 3 jąder), które są również zwane TRAP+. Próba z roztworem wiąże się z poddaniem lizie hodowli zawierających osteoklasty w buforze cytrynianowym (100 mM, pH = 5,0) zawierającym 0,1% Tritonu X-100. Aktywność fosfatazy kwasowej odpornej na winian jest następnie mierzona w oparciu o przemianę p-ni-trofenylofosforanu (20 nM) w p-nitrofenol w obecności 80 mM winianu sodu, co następuje podczas 3-5 minutowej inkubacji w temperaturze pokojowej. Reakcja jest zakończona przez dodanie NaOH do końcowego stężenia 0,5 mola. Gęstość optyczna mierzona jest przy 405 nanometrach, a wyniki są nanoszone na wykres.
Uprzednie badania (Udagawa i inni, ibid) przy użyciu próby tworzenia osteoklastów wykazały, ze te komórki ekspresjonują receptory i25I-kalcytoniny (autoradiografia) i mogą powodować zagłębienia na powierzchniach kości, co wraz z pozytywną próbą TRAP potwierdza, że wielojądrowe komórki mają fenotyp osteoklastu. Dodatkowym dowodem na poparcie tego faktu, czyli fenotypu osteoklastu komórek wielojądrowych które powstają in vitro w próbie tworzenia osteoklastu jest to, że komórki te ekspresjonują αν i β3 integriny w badaniu immunocytochemicznym i receptor kalcytoniny, oraz mRNA TRAP przez hybrydyzację in situ (ISH).
187 408
Fuzję huOPG[22-401]-Fc oczyszczono z pożywki kondycjonowanej z komórkami CHO i następnie wykorzystano w próbie tworzenia osteoklastu. Przy 100 ng/ml huOPG[22-401]-Fc tworzenie osteoklastu było w 100 procentach inhibitowane (fig. 19A). Poziomy TRAP zmierzone w hodowlach poddanych lizie w zagłębieniach płytek do mikromiareczkowcnia były również inhibitowane w obecności OPG przy ID50 w przybliżeniu 3 ng/ml (fig. 20). Poziom aktywności TRAP w lizatach okazał się korelować ze względną liczbą osteoklastów zaobserwowaną w badaniu cytochemicznym TRAP (porównaj fig. 19A-19G i 20). Oczyszczony ludzki IgG1 i TNFbp były również zbadane w tym modelu i stwierdzono, że nie mają inhibitującego lub stymulującego wpływu, co sugeruje, że efekty inhibitujące huOPG[22-401]-Fc wynikały z części OPG proteiny fuzyjnej. Przebadano dodatkowe formy ludzkich i mysich cząsteczek i zbiorcze dane podsumowano w tabeli 1.
Tabela 1
Wpływ różnych form OPG na tworzenie różnych osteoklastów in vitro
Konstrukt OPG muOPG[22-401]-Fc muOPG[22-194]-Fc muOPG[22-185]-Fc muOPG[22-180]-Fc muOPG[22-402] muOPG[22-401] C195 muOPG[22-401] C202 muOPG[22-401] C277 muOPG[22-401] C319 muOPG[22-401] C400 muOPG[22-185] muOPG[22-194] muOPG[22-200] muOPG[22-212] muOPG[22-293] muOPG[22-355] huOPG[22-401]-Fc huOPG[22-201]-Fc huOPG[22-401]-Fc P26A huOPG[22-401]-Fc Y28F huOPG[22-401] huOPG[27-401]-Fc huOPG[29-401]-Fc huOPG[32-401]-Fc +++, ED50 = 0,4-2 ng/ml ++, ED50 =2-10 ng/ml +, ED50 = 10-100 ng/ml ED50 > 100 ng/ml
Względna bioaktywność in vitro +++ +++ ++· +++ +++ +
+ +
++ ++
-H-+
-H-+ +++ +++
-H-+ +++
-H-+ +4++ +!72
187 408
Dane zbiorcze sugerują, że sekwencje aminokwasowe, 22-401 ludzkiego i mysiego OPG są w pełni aktywne in vitro, gdy są poddane fuzji do domeny Fc, lub nie poddane fuzji. Inhibitująone w sposób zależny od dawki, i wykazują półmaksymalne aktywności w zakresie 2-10 ng/ml. Obcięcie mysiego końca „C” przy reszcie treoninowej 180 inaktywuje cząsteczkę, podczas gdy obcięcia cysteiny 185 i ponad dają pełną aktywność. Przewiduje się, że reszta cysternowa w pozycji 185 tworzy wiązanie SS3 w obszarze domeny 4 OPG Uprzednio wykazano, że usunięcie tej reszty u innych, pokrewnych TNFR protein, likwiduje aktywność biologiczną (Yan i in., J. Biol. Chem., 266. 12099-12104 [1994]). Nasze ustalenie, że muOPG[22-180]-Fc jest nieaktywne, podczas gdy muOPG[22-185]-Fc jest aktywne, jest zgodne z tymi stwierdzeniami. To sugeruje, że reszty aminokwasowe 22-185 określają obszar aktywności OPG
Wyniki te wskazują, że podobnie jak OPG ekspresjonowane transgenicznie również proteina OPG rekombinacyjna powstrzymywała tworzenie osteoklastów, jak wykazano w próbie tworzenia osteoklastów. Eksperymenty w czasie badające pojawienie się komórek TRAP+, β3+, F480+ w hodowlach w sposób ciągły wystawionych na działanie OPG wykazały, że OPG blokuje pojawianie się komórek TRAP+ i β3+, lecz nie F480+. Natomiast komórki TRAP+ i β3+ zaczynają się pojawiać już czwartego dnia po zapoczątkowaniu hodowli w hodowlach kontrolnych. Jedynie komórki F480+ można znaleźć w hodowlach poddanych działaniu OPG i okazują się obecne w tej samej liczbie jakościowo, jak w hodowlach kontrolnych. A zatem, mechanizm wpływu OPG in vitro okazuje się wiązać z blokadą różnicowania osteoklastów w etapie poza pojawieniem się monocytomakrofagów, lecz przed pojawieniem się komórek ekspresjonujących integryny β3 lub TRAP. Łącznie wyniki te wskazują, że OPG nie wpływa na ogólny wzrost i różnicowanie prekursorów monocytomakrofagów ze szpiku kości, lecz raczej sugeruje się, że OPG specyficznie blokuje selektywne zróżnicowanie się osteoklastów z prekursorów monocytomakrofagów.
Aby określić dokładniej, kiedy w szlaku różnicowania osteoklastu OPG działała inhibitująco, zastosowano odmianę metody hodowli in vitro. Ta odmiana, opisana przez Lacey'a i innych (patrz wyżej), stosuje makrofagi szpiku kostnego jako prekursory osteoklastów'. Prekursory osteoklastów są uzyskane przez pobranie nieprzylegających komórek szpiku kostnego po inkubacji przez noc w CSF-1/M-CSF i hodowaniu komórek przez dodatkowe cztery dni, przy użyciu 1.000-2.000 U/ml CSF-1. Po czterech dniach hodowli, określonej jako faza wzrostu, usuwa się nieprzylegające komórki. Komórki przylegające, które są makrofagami szpiku kostnego można następnie wystawić na działanie do dwóch dni na różne czynniki w obecności 1.000-2.000 U/ml CSF-1. Ten dwudniowy okres zwany jest pośrednim okresem różnicowania się. Następnie, warstwy komórkowe ponownie przepłukuje się, po czym dodaje się komórki ST-2 (1 x 105 komórek/ml), deksametazon (100 nM), i 1,25 (OH2) D3 (10 nm) na ostatnie 8 dni, który to okres zwany jest końcowym okresem różnicowania się. Podczas tego końcowego okresu można również dodać czynniki testujące. Nabycie markerów fenotypowych zróżnicowania osteoklastów jest pozyskiwane podczas tego okresu końcowego (Lacey i inni, ibid).
Zbadano wpływ huOPG[22-401]-Fc (100 ng/ml) na tworzenie osteoklastów w tym modelu przez dodanie jego podczas okresów pośredniego czy końcowego lub, alternatywnie, obydwu okresów różnicowania się jednocześnie. Przeprowadzono zarówno cytochemiczne badanie TRAP jak i próby roztworu. Wyniki próby roztworu podano na rysunku fig. 21. HuOPG[22-401]-Fc inhibitował pojawienie się aktywności TRAP, gdy był dodany zarówno do faz pośredniej jak i końcowej, lub jedynie do końcowej fazy różnicowania. Gdy był dodany do fazy pośredniej a następnie usunięty z hodowli przez wypłukanie, huOPG[22-401]-Fc nie blokował pojawienia się aktywności TRAP w lizatach komórkowych. Wyniki cytochemicznych badań są równoległe z danymi z próby roztworu. Łącznie, obserwacje te wskazują, że huOPG[22-401]-Fc musi jedynie być obecne podczas okresu końcowego różnicowania się po to, by wywierać całość swojego wpływu hamującego tworzenie osteoklastów.
187 408
B. Eksperymenty in vivo prowokacji IL1-a i IL1-f
IL1 zwiększa resorpcSę kości zarówno układowe jak i miejscowo w przypadku Snjkeoji podskórnej' nad sklepienie czaszki myszy (Boyce i inni, DndoorSnolnga 125, 1142-1150 [1990]). Wpływ układowy można ocenić przez stopień hSpkrkuioemii a wpływ miejscowy można ocenić histologicznie przez oszacowanie względnej wielkości reakcji wywoływaneprzez ostkoeiasty. Celem tych eksperymentów było określenie, czy rekombinuoaSne muOPG[22-401]-Fc mógłby zmodyfikować miejscowe i/lub działania IL1 w przypadku injekcji podskórnej nad tym samym obszarem sklkBiknSa czaszki jak IL1.
Eksperyment ILJ-β
Maszy-sumok (ICR Swiss whitk) w wieku czterech tygodni podzielono na następujące grupy poddawane działaniu (5 myszy w grupie):
- grupa kontrolna;
- zwierzęta poddane działaniu IL1 (myszy otrzymywały 1 SnSkkoSę na dzień 2,5 gg il-1P); . ... .
- zwierzęta poddane działaniu niskiej dawki muOPG[22-401]-Fo (myszy otrzymywały 3 inj'ekoSk na dzień 1 gg mu OPG[22-401]-Fc);
- niska dawka muOPG[22-401 ]-Fc i IL-1P;
- zwierzęta poddane działaniu dużej dawki muOPG[22-401]-Fc (myszy otrzymują 3 injkkoSe dziennie 10 gg muOZG[22-401]-Fo);
- wysoka dawka muOPm[22-401]-Fo i IL1-P.
Wszystkie myszy otrzymywały tę samą ogólną liczbę Snjekcji albo czynnika aktywnego lub zarobki (0,1% albuminy krwi bydlęcej w roztworze soli buforowanej fosforanem). Wszystkie grupy uśmiercono jeden dzień po ostatniej ipjekcji. Ciężary oraz Boyinma wapnia Sunowegu krwi zmierzono przed BSerwsyami iηjeecjumi cztery godziny po drugiej ϊρ-^^-ϊ i 24 godziny po trzeciej injekcji IL1, na krótko przed uśmierceniem zwierząt. Po uśmierceniu skikBikplk czaszki usunięto i poddano obróbce w celu pocięcia S amieszoyepia w parafinie.
Eksperyment IL1-a
Myszy-samce (ICR Swiss white) w wieku czterech tygodni pudzleiono na następujące grupy poddawane działaniu (5 myszy w gruBSk):
- grupa kontrolna;
- zwierzęta poddane działaniu IL1 alfa (myszy otrzymywały 1 1ρ^^ na dzień 5 gg IL1-1 alfa);
- zwierzęta poddane działaniu niskiej dawki muOZm[22-401]-Fo (myszy ntryamawała 1 injkkcjk dziknpik 10 gg muOPG[22-401]-Fc);
- niska dawka maOPm[22-40l]-Fo i IL-alfa (Pozowupie jak wyżej);
- zwierzęta poddane działaniu dużej dawki maOZG[22-401]-Fo (myszy otrzymywały 3 ip-kko-e dyiepnik 10 gg muOPm[22-401]-Fo);
- wysoka dawka muOPm[22-401]-Fc i IL1-alfa;
Wszystkie myszy otrzymywały tę samą ogólną liczbę ip-ekc-i albo czynnika aktywnego lub zarobki. Wszystkie grupy uśmiercono jeden dzień po ostatniej in-kko-i. Zozinma wapnia jonowego krwi ymieryopo przed pierwszą injekc-ą, cztery godziny po drugie- in-ekc-i i 24 godziny po trzeciej in-ekc-i IL1, na krótko przed uśmierceniem zwierząt. Ciężary zwierząt zmierzono przed pierwszą injkkcją, cztery godziny po Prugiej' injekc-i i 24 godziny po ήτ^ΐο- IL1 injtkcji, na krótko przed uśmierceniem zwierząt. Po uśmierceniu celeBienie czaszki asanlęto i poddano obróbce w oeia pocięcia i umieszczenia w parafinie.
187 408
Metody histologiczne
Próbki kości sklepienia czaszki utrwalono w formalinie z cynkiem, odwapniono w kwasie mrówkowym, odwodniono etanolem i umieszczono w parafinie. Wykonano skrawki o grubości 5 μm przez sklepienie czaszki w sąsiedztwie szwa węgłowego i wybarwiono hematoksyliną i eozyną, lub poddano reakcji na aktywność fosfatazy kwaśnej odpornej na winian (Sigma Kit #387A) i zabarwiono kontrastowo hematoksyliną. Resorpcję kości oceniono u myszy poddanych działaniu IL-1a metodami histomorfometrycznymi stosując Osteomeasure (Osteometrics, Atlanta, GA) przez śledzenie cech histologicznych na płycie digitizera stosując przystawkę camera lucida zamontowaną przy mikroskopie. Liczbę osteoklastów, liczbę powierzchni pokrytych osteoklastami oraz powierzchnie erodowane oznaczono w jamach szpiku kości sklepienia czaszki. Strony sklepienia czaszki gdzie nastąpiła injekcja i gdzie nie nastąpiła rojek^a zmierzono oddzielnie.
Wyniki
IL-1a i IL-Ιβ wytwarzały hiperkulcemię przy stosowanych dawkach, zwłaszcza drugiego dnia, przypuszczalnie przez wywołanie w całym ustroju zwiększonej resorpcji kości. Reakcja hiperkalcemiczna była blokowana przez muOPG[22-401]-Fc u myszy poddanych działaniu IL-1f3 i znacząco zmniejszona u myszy poddanych działaniu IL-1a, u wpływ ten był najbardziej widoczny drugiego dnia (fig. 22A-22B).
Analiza histologiczna sklepień czaszki myszy poddanych działaniu IL1-alfa i beta dowodzi, że działanie samym IL1 wytwarza wyraźny wzrost wskaźników resorpcji kości włączając w to liczbę osteoklastów, powierzchnię pokrytą osteoklastami i powierzchnię erodowaną (powierzchnie wykazujące głębokie wyżłobienia wskutek działania osteoklastów) (fig. 23B, tabela 2). W reakcji na IL-1a i IL-Ιβ wzrost resorpcji kości był podobny w przypadku strony sklepienia czaszki poddanej injekcji i nie poddanej injekcji. Iniekcje muOpG[22-401]-Fc zmniejszyły resorpcję kości zarówno u myszy poddanych działaniu IL1 alfa i beta, jak i u myszy otrzymujących samą zaróbkę, lecz to zmniejszenie stwierdzono jedynie po stronach sklepienia czaszki poddanych injekcji muOPG[22-401]-Fc.
Tablica 2. Wpyw OPG Na zmennee eeooppci i Oocc a u yyszy poddanych działaniu IL-1
Powierzchnia osteoklastu % powierzchni kości (Średnia + OdchyLstand.) Powierzchnia erodowana % powierzchn kości (Średnia + Odchyl. stand.) Liczba osteoklastów/mm3 powierzchni tkanki (Średnia ± Odchyl. stand.)
Eksperyment 1 Strona bez injekcj*i Strona po injekcji Strona bez injekcji Strona po injekcji Strona bez, iniekcji Strona po injekcji
Grupa kontrolna 1236 ± 3.44 9.54 ± 2.46 8.07 1 3.90 9.75 1 3.16 3231 ± 11.09 2330 1 10.83
IL1-e (23pg/d) 17.18 ± 130 16.40 1 216 4036 1 4.28 3733 ± 10.28 71.80 ± 18.76 60.89 ± 5.16
OPG (40tg/d) 10.12 ± 3.71 5.04 1 1.66 9.73 ± 433 4.19 1 331 32.73 ±1109 15.24 ± 734
OPG+IL1-e 18.61 1 246 # 13.26 ± 230 44.87 ± 8.63 # 25.94 1 6.82 69.42 ± 36.29 # 47.13 ± 24.26
Eksperyment 2
Grupa kontrolna 1136 ± 4.22 11.95 ±. 2.97 12.67 ± 5.04 10.03 ± 5.13 51.72 ± 23.93 56.03 ± 30.70
IL1-a (5pg/d) 28.81 ± 4.84 23.46 ± 5.76 3731 1 5.16 41.10 ± 1253 113.60 ± 18.04 10270 ± 32.09
OFG (40pg7d) 14.40 ± 1.00 « 4.26 ± 234 1135 ± 4.14 # 429 ± 3.16 72.28 ± 14.11 « 22.65 ± 16.68
OPG+IL1-a 29.58 ± 8.80 0 17.83 ± 334 33.66 ± 9.21 # 24.38 ± 8.88 146.10 ± 42.37 * 66.56 ± 15.62
# Różne względem strony nie poddanej iniekcji p < 0,05 (według parzystego testu t)
187 408
Najbardziej prawdopodobnym wyjaśnieniem tych obserwacji jest to, że muOPG[22-401]-Fc inhibitowało resorpcję, a konkluzja ta jest poparta zmniejszeniem zarówno ogólnej liczby osteoklastów jak i procentu dostępnej powierzchni kości podlegającej resorpcji w obszarze sklepienia czaszki sąsiedniego względem miejsc iniekcji muOPG[22-401]-Fc. Działania mhOPG[22-401]-Fc okazały się najbardziej zaznaczone miejscowo w badaniu histologicznym, lecz fakt, że muOPG[22-401]-Fc również obniżył hiperkalcemię indukowaną IL1 sugeruje, że muOPG[22-401]-Fc wywiera bardziej subtelny wpływ sa resorpcję kości w całym ustroju.
C. Wpływ ogólnoustrojowy muOPG[22-401]-Fc u myszy rosnących
Samce myszy BDF1 3-4 tygodniowe o ciężarze 9,2-15,5 gramów podzielono w grupy po 10 myszy sa grupę. Myszom tym wstrzykiwano podskórnie roztwór soli lub muOPG[22-401]-Fc w ilości 2,5 mg/kg masy ciała przez 14 dsi w dawkach po 5 mg/kg/dzień. Myszy poddano radiografii przed badaniem, następnie w 7 i 14 dniu. Myszy uśmiercono 24 godziny po ostatniej isCekcji. Usunięto prawą kość udową, utrwalono w formalinie z cynkiem, odwapniono w kwasie mrówkowym i zanurzono w parafinie. Wykonano cięcie przez obszar środkowy odległej przynasuda kości długiej uda oraz trzos tej kości. Gęstość kości oznaczono histomorfometrycznie w sześciu sąsiednich obszarach sięgających od granicy płytki wzrostu srzanasada kości długiej przez pierwotną i wtórną kość’ gąbczastą i do trzosu kości długiej uda. Każdy obszar miał powierzchnię 0,5 x 0,5 mm2.
Zmiany radiograficzne
Po siedmiu dsiach działania okazało się widoczne, że istnieje strefa zwiększonej gęstości kości gąbczastej związanej z płytkami wzrostu u myszy poddanych działaniu OPG w porównaniu do obserwacji u zwierząt kontrolnych. Efekt był szczególnie uderzający w przypadku przanasαda dalszej kości udowej i bliskiej kości piszczelowej (fig. 24A-24B). Jedsak pasma zwiększosej gęstości były również widoczne w trzosach kręgów, w grzebieniu biodrowym i w dalszej części piszczeli. Po 14 dsiach obszary nieprzezroczyste rozszerzyły się dalej do trzonów kości udowych i piszczelowych, chociaż intensywność sieprzezroczystości zmniejszyła się. Ponadto, sie było różsic w długości kości udowych po zakończeniu eksperymentu lub zmiany długości przez czas trwania eksperymentu, z czego wynika, że OPG sie zmienia długości kości.
Zmiany histologiczne
Odległa przysasada kości udowej wykazała zwiększoną gęstość kości w obszarach 1,1 do 2,65 mm w odległości od płytki wzrostu (fig. 25 i 26A-26B). Jest to obszar, gdzie kość jest szybko usuwana u myszy przez resorpcję kości, w której pośredniczą osteoklasty. U tych szybko rosnących młodych myszy wzrost kości w tym obszarze, zaobserwowany w przypadku działania OPG, jest zgodny z ishibitowasiem resorpcji kości.
D. Wpływ osteoprotegeryny na utratą kości indukowaną przez wycięcie jajników u szczura
Dwusastotygodniowe samice szczurów (Fisher) poddano wycięciu jajników (OVX) lub pozornej operacji, i wykonano podwójne pomiary absorpcjometrii rentgenowskiej (DEXA) gęstości kości w odległej przysasadzie kości udowej. Po trzech dniach okresu zdrowienia zwierzęta otrzymywały dziesse injekcje, przez następne 14 dsi, jak następuje: 10 pozornie operowanych zwierząt otrzymywało zaróbkę (roztwór soli buforowany fosforanem); 10 zwierząt OVX otrzymywało zaróbkę (roztwór soli buforowany fosforanem); 6 zwierząt OVX otrzymywało OpG-Fc 5 mg/kg SC; 6 zwierząt OVX otrzymywało pamidrosias (PaM) 5 mg/kg SC; 6 zwierząt otrzymywało estrogen (ESTR) 40 pg/kg SC. Po 7 i 14 dsiach działania zwierzętom zmierzono gęstość kości za pomocą urządzenia DEXA. Dwa dsi po ostatniej injekcji zwierzęta uśmiercono i usunięto prawą piszczel i kość udową dla oceny histologicznej.
187 408
Pomiary DEXA gęstości kości wykazały tendencję do zmniejszania gęstości kości po wycięciu jajników, która była blokowana przez OPG-Fc, którego efekty były podobne do znanych czynników antyresorpcyjnych estrogenu i pamidronianu (fig. 27). Histomorfometryczna analiza potwierdziła działanie OPG-Fc zwiększające gęstość kości, która była znacząco wyższa u szczurów OVX niż zaobserwowana u szczurów OVX nie poddanych działaniu (fig. 28). Wyniki te potwierdzają aktywność OPG odnośnie utraty kości związanej z wycofaniem endogennego estrogenu w następstwie wycięcia jajników.
Podsumowanie badań in vivo
Działanie in vivo rekombinacyjnego OPG jest równoległe ze zmianami obserwowanymi u myszy transgenicznych OPG. Zmniejszenie liczby osteoklastów zaobserwowane u zwierząt transgenicznych OPG jest odtwarzane przez wstrzyknięcie rekombinacyjnego OPG miejscowo ponad sklepieniem czaszki u myszy normalnych i myszy poddanych działaniu IL1-a i ILI-β. Myszy transgeniczne OPG rozwinęły fenotyp osteopetrotyczny z postępującym wypełnianiem jamy szpikowej kością, oraz nieremodelowaną chrząstką rozciągającą się od płytek wzrostu od pierwszego dnia po urodzeniu. U normalnych trzytygodniowych rosnących myszy działanie OPG prowadziło również do retencji kości i nieremodelowanych chrząstek w obszarach tworzenia kości endochondralnej, który to efekt jest obserwowany radiograficznie i potwierdzony histologicznie. A zatem, rekombinacyjny OPG wytwarza zmiany fenotypowe u normalnych zwierząt podobne do tych obserwowanych u zwierząt transgenicznych i x,rmi<uny te są zgodne z wywołanym prxex, OPG iidiibitowEmiem resorpcjj kości. W oparem o próby tworzenia c^i;l^eic^k:l^^tć^w zn vitro, znacząca część tego inhibitowomia wynika z utrudnionego tworzenia osteoklastów. Zgodnie z tą hipotezą OPG blokuje wywołaną wycięciem jajników osteoporozę u szczura. Wiadomo, że utrata kości w tym modelu odbywa się za pośrednictwem aktywowanych osteoklastów co sugeruje rolę OPG w leczeniu pierwotnej osteoporozy.
Przykład XII
Pegylowane pochodne OPG
Otrzymywanie N-końcowych koniugatów PEG-OPG przez alkilowanie redukujące
HuOPG met[22-194] P26A wprowadzono do buforu zawierającego 25-50 mM NaOAc, pH = 4,5-4,8 i zatężono do 2-5 mg/ml. Roztwór ten użyto do prowadzenia alkilowania redukcyjnego OPG przy użyciu jednofunkcyjnych aldehydów PEG w temperaturze 5-7°C. Jednofunkcyjne aldehydy PEG, liniowe lub rozgałęzione, MW = 1 do 57 kDa (dostępne z Shearwater Polymers) dodano do roztworu OPG jako substancje stałe w ilościach stanowiących 2-4 moli aldehydu PEG na 1 mol OPG Po rozpuszczeniu polimeru do roztworu proteiny dodano cyjanoborowodorek sodu do uzyskania końcowego stężenia od 15 do 20 mM w mieszaninie reakcyjnej z 1-1,6 M świeżo przyrządzonego roztworu surowca w zimnej, dejonizowanej wodzie. Postęp reakcji i stopień pegylowania OPG monitorowano przez HPLC na zasadzie wykluczania wielkości na kolumnie G3000SWxl (Toso Haas), wymywając roztworem zawierającym 100 mM NaPO4, 0,5 M NaCl i 10% etanolu o pH = 6,9. W typowym przypadku reakcję prowadzono przez 16-18 godzin, po którym to czasie mieszaninę reakcyjną rozcieńczono 6-8 razy, a pH obniżono do wartości 3,5-4. Mieszaninę reakcyjną frakcjonowano stosując chromatografię jonowymienną (HP SP HiLoad 16/10, Pharmacia) wymywając roztworem o składzie 20 mM NaOAc, pH = 4 z liniowym gradientem do 0,75 m NaCl, przy użyciu ponad 25 objętości kolumny, przy prędkości przepływu 30 cm/godzinę. Frakcje mono-, dwu- lub poli- PEGylowanego OPG zebrano i scharakteryzowano przez SEC HPLC oraz SDS-PAGE. Dzięki N-końcowemu sekwencjonowaniu określono, że koniugat monoPEG-OPG główny produkt reakcji w większości przypadków, był w 98% N-końcowo zmodyfikowanym OPG przez PEG
Procedurę tę zasadniczo stosowano do wytworzenia następujących, zakończonych N-, koniugatów PEG-OPG (gdzie OPG jest HuOPG met[22-194] P25A): 5 kD monoPEG 10 kD mono-rozgałęziony PEG, 12 kD monoPEG, 20 kD monoPEG 20 mono-rozgałęziony PEG, 25 kD monoPEG 31 kD monoPEG 57 kD monoPEG 12 kD dwu-PEG 25 kD dwu-PEG 31 kD dwu-PEG 57 kD dwu-PEG i 25 kD trzy-PEG
187 408
Wytwarzanie koniugatów PEG-OPGprzez acylowanie
HuOPG met[22-194] P25A wprowadzono do buforu 50 mM BICINE przy pH = 8, i zatężono do 2-3 mg/ml. Roztwór ten użyto do wykonania acylowania OPG przy użyciu jednofunkcyjnych estrów N-hydroksybursztynianoimidylowych PEG w temperaturze pokojowej. Estry N-hydroksybursztynlanoimidylowe PEG, liniowe lub rozgałęzione, MW = 1 do 57 kDa (dostępne z Shearwater Polymers) dodano do roztworu OPG jako substancje stałe w ilościach stanowiących 4-8 moli estru N-hydroksybursztynianoimidylowego PEG na 1 mol OPG. Postęp reakcji i stopień pegylowania OPG monitorowano przez HPLC na zasadzie wykluczania wielkości na kolumnie G3000SWxl (Toso Haas), wymywając roztworem zawierającym 100 mM NaPO 4, 0,5 M NaCl i 10% etanolu o pH = 6,9. W typowym przypadku reakcję prowadzono przez 1 godzinę, po którym to czasie mieszaninę reakcyjną rozcieńczono 6-8 razy, a pH obniżono do wartości 3,5-4. Mieszaninę reakcyjną frakcjonowano stosując chromatografię jonowymienną (HP SP HiLoad 16/10, Pharmacia) wymywając roztworem o składzie 20 mM NaOAc, pH = 4 z liniowym gradientem do 0,75 m NaCl, przy użyciu ponad 25 objętości kolumny, przy prędkości przepływu 30 cm/godzinę. Frakcje mono-, dwu- lub poli- PEGylowanego OPG zebrano i scharakteryzowano przez SEC HPLC oraz SDS-PAGE.
Procedurę tę zasadniczo stosowano do wytworzenia następujących koniugatów PEG-OPG: 5 kD poliPEG, 20 kD poliPEG, 40 kD poli-rozgałęziony PEG, i 50 kD poli-PEG.
Otrzymywanie dimerycznego PEG-OPG
HuOPG[22-194] P25A przygotowano do tiolowania przy 1-3 mg/ml w buforze fosforanowym przy prawie neutralnym pH. Dodano bezwodnik S-acetylomerkaptobursztynowy w 3-7 molowym nadmiarze utrzymując pH = 7,0, i mieszaninę reakcyjną mieszano przez 2 godziny w temperaturze pokojowej. Monotiolowany OPG oddzielono od niezmodyfikowanego i politiolowanego OPG metodą chromatografii jonowymiennej i zabezpieczony tiol odbezpieczono przez działanie hydroksyloaminą. Po odbezpieczeniu hydroksyloaminę usunięto metodą filtracji żelowej i uzyskany monotiolowany OPG poddano szeregowi reakcji sieciowania typowych dla tioli. Aby wytworzyć dimer z wiązaniem dwu siarczkowym, tiolowany OPG przy > 1 mg/ml poddano utlenianiu powietrzem przez dializę w nieznacznie zasadowym buforze fosforanowym. Kowalencyjny dimer tioeterowego OPG wytworzono przez poddanie reakcji czynnika sieciującego bis-maleimidowego, NN-bis^-maleimidopropianylo^-hydroksy-1,3-propanu ztiolowanym OPG przy stężeniu > 1 mg/ml, przy stosunku molowym 0,6 czynnika sieciującego do OPG, w buforze fosforanowym o pH = 6,5. Podobnie, wytworzono „hantle” PEG przez reakcję podstechiometrycznych ilości czynnika sieciującego PEG bis-maleimidu z tiolowanym OPG przy stężeniu > 1 mg/ml w buforze fosforanowym o pH = 6,5. Każdy z powyższych dimerowych koniugatów może być następnie oczyszczony przy zastosowaniu chromatografii jonowymiennej na zasadzie wykluczania objętości SEC.
Dimerowe koniugaty PEG-OPG (gdzie OPG jest HuOPG met[22-194] P25A, wytworzone przy użyciu powyższych procedur) obejmują: dimer OPG z wiązaniem dwusiarczkowym, kowalencyjny dimer tioeterowy OPG z czynnikiem sieciującym typu aminy alifatycznej, oraz „hantle” i „monohantle” o 3,4 kilodaltonach i 8 kilodaltonach.
Koniugaty PEG-OPG zbadano na aktywność in vitro stosując próbę dojrzewania osteoklastów opisaną w przykładzie XIA, i na aktywność in vivo przez zmierzenie zwiększonej gęstości kości po wstrzyknięciu do myszy, jak opisano w przykładzie XIC. Aktywność in vivo podano poniżej w tabeli 3.
187 408
Tabela 3
Aktywność biologiczna in vivo pegylowanego OPG Konstruikt OPG_Wzrost gęstości kości goleniowei
muOPG met[22-194] -
muOPG met[22-194] 5 k +
muOPG met[22-194] 20 k PEG +
muOPG met[22-194] P25A -
muOPG met[22-194] P25A 5 k PEG +
muOPG met[22-194] P25A 20 k PEG +
muOPG met[22-194] P25A 31 k PEG +
muOPG met[22-194] P25A 57 k PEG +
muOPG met[22-194] P25A 12 k PEG +
muOPG met[22-194] P25A 20 k, +
rozgałęziony PEG
muOPG met[22-194] P25A 8k PEG dimer +
muOPG met[22-194] P25A usieciowany, + z wiązaniami dwusiarczkowymi
Podczas gdy wynalazek opisano w zakresie takim, co jest uważane za jego korzystne wykonania nie jest on ograniczony do ujawnionych wykonań, lecz przeciwnie, w zamierzeniu ma objąć różne modyfikacje i równoważniki zawarte w ramach ducha i zakresu załączonych zastrzeżeń, których zakres ma się zgadzać z najszerszą interpretacją jakby objąć wszystkie modyfikacje i równoważniki.
187 408
WYKAZ SEKWENCJI (1) INFORMACJA OGÓLNA.:
(i) ZGŁASZAJĄCY:Amqen Inc.
(ii) TYTUŁ WYNALAZKOM: OSTEOPROTEGERYNA iii) LICZBA SEKWENCJI: 168 (iv) ADRES DO KORESPONDENCJI:
(A) ADRESAT: Arngen Inc.
(B) ULICA: 1840 Dehavilland Drive (C) MIAST: Thousand Oaks (D) STAN: Kalifornia (E) KRAJ: Stany Zjednoczone (F) KOD: 91320 (v) POSTAĆ CZYTANA PRZEZ KOMPUTER:
(A) TYP NOŚNIKA: Dyskietka (B) KOMPUTER.: kompatybilny z IBM PC (C) SYSTEM OPARACYJNY: PC-DOS/Ms-Dos (D) SOFTWARE: Patentln Release *1.0, Version *1.30 (vi) DANE DOT. BIEŻĄCEGO ZGŁOSZENIA::
(A) NUMER ZGŁOSZENIA:
(B) DATA ZGŁOSZENIA:
(C) KLASYFIKACJA:
(viii) DANE DOT?. PRZEDSTAWICIELA PRAWNEGO/AGENTA:
(A) NAZWISKO: Winter, Robert B.
(C) NR ODNIESIENIA/AKT: A-378-C1P2 (2) INFORMACJA DLA SEQ ID NO:1:
(i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 36 par zasad (S) TYP: kwas nukleinowy (C) NICIOWOŚĆ: pojedyncza (D) TOPOLOGIA: liniowa (ii) TYP CZĄSTECZKI: cDNA (xi) OPIS SEKWENCJI: SEQ ID NO:1:
AAAGGAAGGA AAAAAGCGGC CGCTACANNN NNNNNT (2) INFORMACJA DLA SEQ ID NO:2:
(i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 16 par zasad
(B) TYP: kwas nukleinowy
(C) NICIOWOŚĆ: pojedyncza
(D) TOPOLOGIA: liniowa
(ii) TYP CZĄSTECZKI: cDNA
(xi) OPIS SEKWENCJI: SEQ ID NO:2:
187 408
TCGACCCACG CGTCCG !6 (2) INFORMACJA DLA SEQ ID NO: 3:
(i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 12 par zasad (B) TYP: kwas nukleinowy (C) NICIOWOŚĆ: pojedyncza (D) TOPOLOGIA.: liniowa (ii) TYP CZĄSTECZKI: cDNA (xi) Opis sekwencji: SEQ ID NO:3:
GGGTGCGCAG GC 11 (2) INFORMACJA DLA SEQ ID NO:4:
(i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 18 par zasad (B) TYP: kwas nukleinowy (C) NICIOWOŚĆ: pojedyncza (D) TOPOLOGIA: liniowa (ii) TYP CZĄSTECZKI: cDNA <xi) OPIS SEKWENCJI: SEQ ID NO:4:
TGTAAAACGA CGGCCAGT 11 (2) INFORMACJA DLA SEQ ID NO:5:
(i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 18 par zasad (B) TYP: kwas nukleinowy (C) NICIOWTOŚĆ: pojedyncza (D) TOPOLOGIA: liniowa (ii) TYP CZĄSTECZKI; cDNA (xi) OPIS SEKWENCJI: SEQ ID NO:5:
CAGGAAACAG CTATGACC 18 (2) INFORMACJA DLA SEQ ID NO:6:
(i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 20 par zasad (B) TYP: kwas nukleinowy (C) NICIOWOŚĆ: pojeddyicza (D) TOPOLOGIAg liniowa (ii) TYP CZĄSTECZKI: cDNA (xi) OPIS SEKWENCJI: SEQ ID NO:6:
CAATTAACCC TCACTAAAGG
187 408 (2) INFORMACJA DLA SEQ ID NO:7:
(i) CHHRAATERYSSTKA SEKKTCEiCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 23 pas zasad (B) TYP: kwas nukleinowy (C) NICIOWOŚĆ: pojedyncza (D) TOPOLOGIA: liniowa (ii) TYP CZĄSTECZKI: cDNA (ci) OPIS SEKWENCJI: SEQ ID NO:7:
GCATTATGAC CCAGAAACCG GAC 23 (2) INFORMACJA DLA SEQ ID NO: 8:
(i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 23 par zasad (B) TYP: kwas nukleinowy (C) NICIOWOŚĆ: pojedyncza (D) TOPOLOGIA: liniowa (ii) TYP CZĄSTECZKI: cDNA (ci) OPIS SEKWENCJI: SEQ ID NO:8:
AGGTAGCGCC CTTCCTCACA TTC 23 (2) INFORMACJA DLA SEQ ID NO:9:
(i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 30 par zasad (B) TYP: kwas nukleinowy (C) NICIOWOŚĆ: pojedyncza (D) TOPOLOGIA: liniowa (ii) TYP CZĄSTECZKA: cDNA (ci) OPIS SEKWENCJI: SEQ ID NO:9:
GACTAGTCCC ACAATGAACA AGTGGCTGTG 30 (2) INFORMACJA DLA SEQ ID NO: 10:
(i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 45 par zasad (B) TYP: kwas nukleinowy (C) NICIOWOŚĆ·. pojedyńcza (D) TOPOLOGIA: liniowa (ii) TYP CZĄSTECZKI: cDNA (xi) OPIS SEKWENCJI: SEQ ID NO:10:
ATAAGAATGC GGCCGCTAAA CTATGAAACA GCCCAGTGAC CATTC 45 (2) INFORMACJA DIA SEQ ID NO:11:
(i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 21 par zasad (B) TYP: kwas nukleinowy
187 408 (C) NICIOWOŚĆ: pojedyncza (D) TOPOLOGIA: liniowa (ii) TYP CZĄSTECZKI: cDNA (xi) OPIS SEKWENCJI: SEQ ID NO:11:
GCCTCTAGAA AGAGCTGGGA C 22 (2) UNOMflACJA DILA SEC ID NO: 12:
(i) CHHARAKTRRSTTKA SEJKWNCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 21 par zasad (B) TYP: kwas nukleinowy (C) NICIOWOŚĆ: pojedyńcza (D) TOPOLOGIA: liniowa (ii) TYP CZĄSTECZKI: cDNA (xi) OPIS SEKWENCJI: SEQ ID NO:12:
CGCCGTGTTC CATTTATGAG C 21 (2) INFOPRMACJA DILA S^ę2 ID NO:1 3:
(i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 24 par zasad (B) TYP: kwas nukleinowy (C) NICIOWOŚĆ: pojedyńcza (D) TOPOLOGIA: liniowa (ii) TYP CZĄSTECZKI: cDNA (xi) OPIS SEKWENCJI: SEQ ID NO:13:
ATCAAAGGCA GGGCATACTT CCTG 24 (2) INFORMACJA DLA SEQ ID NO:44:
(i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 24 par zasad (B) TYP: kwas nukleinowy (C) NICIOWOŚĆ: pojedyńcza (D) TOPOLOGIA: liniowa (il) TYP CZĄSTECZKI: cDNA (xi) OPIS SEKWENCJI: SEQ ID NO: 14:
GTTGCACTCC TGTTTCACGG TCTG 24 (2) INFORMACJA DLA SEQ ID NO:15:
(i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 24 par zasad (B) TYP: kwas nukleinowy (C) NICIOWOŚĆ: pojedyńcza (D) TOPOLOGIA: liniowa (ii) TYP CZĄSTECZKI: cDNA (xi) OPIS SEKWENCJI: SEQ ID NO:15:
187 408
CAAGACACCT TGAAGGGCCT GATG 24 (2) INFORMACJA DLA SEQ ID NO: 16:
(i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 24 par zasad (B) TYP: kwas nukleinowy (C) NICIOWTOŚĆ: pojedyncza (D) TOPOLOGIA: liniowa (ii) TYP CZĄSTECZKI: cDNA (xi) OPIS SEKWENCJI: SEQ ID NO: 16:
TAACTTTTAC AGAAGAGCAT CAGC 24 (2) INFORMACJA DLA SEQ ID NO: 17:
(i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 33 par zasad (B) TYP: kwas nukleinowy (C) NICIOWTOŚĆ: pojedyncza (D) TOPOLOGIA: liniowa (ii) TYP CZĄSTECZKI: cDNA (xi) OPIS SEKWENCJI: SEQ ID NO: 17:
AGCGCGGCCG CATGAACAAG TGGCTGTGCT GCG 33 (2) INFORMACJA DLA SEQ ID NO: 18:
(i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 31 par zasad (B) TYP: kwas nukleinowy (C) NICIOWTOŚĆ: pojedyncza (D) TOPOLOGIA: liniowa (ii) TYP CZĄSTECZKI: cDNA (xi) OPIS SEKWENCJI: SEQ ID NO:18:
AGCTCTAGAG AAACAGCCCA GTGACCATTC C 31 (2) INFORMACJA DLA SEQ ID NO:19:
(i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 24 par zasad (B) TYP: kwas nukleinowy (C) NICIOWOŚĆ: pojedyncza (D) TOPOLOGIA: liniowa (ii) TYP CZĄSTECZKI: cDNA (xi) OPIS SEKWENCJI: SEQ ID NO: 19:
GTGAAGCTGT GCAAGAACCT GATG 24 (2) INFORMACJA DLA SEQ ID NO:20:
187 408 (i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) (B) (C) (D) DŁUGOŚĆ: 24 par zasad TYP: kwas nukleinowy NICIOWOŚĆ: pojedyncza TOPOLOGIA: liniowa
(ii) TYP CZĄSTECZKI; cDNA
(xi) OPIS SEKWENCJI: SEQ ID NO:20
ATCAAAGGCA GGGCATACTT CCTG 221 (2) INFORMACJA DLA SEQ ID NO:21:
(i)CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 24 par zasad (B) TYP: kwas nukleinowy (C) NICIOWOŚĆ: pojedyncza (D) TOPOLOGIA: liniowa (ii)TYP CZĄSTECZKI: cDNA (xi) OPIS SEKWENCJI: SEQ ID NO:21:
CAGATCCTGA AGCTGCTCAG TTTG 24 (2) INFORMACJA DLA SEQ ID NO:22:
(i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 33 par zasad (B) TYP: kwas nukleinowy (C) NICIOWOŚĆ:: pojedyńcza (D) TOPOLOGIA: liniowa (ii) TYP CZĄSTECZKI: cDNA (xi) OPIS SEKWENCJI: SEQ ID NO:22:
AGCGCGGCCG CGGGGACCAC AATGAACAAG TTG 33 (2) INFORMACJA DLA SEQ ID NO: 23:
(i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 33 par zasa (B) TYP: kwas nukleinowy (C) NICIOWOŚĆ: pojedyńcza (D) TOPOLOGIA: liniowa (ii) TYP CZĄSTECZKI: cDNA (xi) OPIS SEKWENCJI: SEQ ID NO:23:
AGCTCTAGAA TTGTGAGGAA ACAGCTCAAT GGC 33 (2) INFORMACJA DLA SEQ ID NO:24:
(i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 39 par zasad (B) TYP: kwas nukleinowy (C) NICIOWOŚĆ: pojedyńcza
187 408 (D) TOPOLOGIA: liniowa (ii) TYP CZĄSTECZKI: cDNA (xi) OPIS SEKWENCJI: SEQ ID NO:24:
ATAGCGGCCG CTGAGCCCAA ATCTTGTGAC mACTCAC 39 (2) INFORMACJA DLA SEQ ID NO:25:
(i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 45 par zasad (B) TYP: kwas nukleinowy (C) NICIOWOŚĆ: pojedyncza (D) TOPOLOGIA: liniowa (ii) TYP CZĄSTECZKI: cDNA (xi) OPIS SEKWENCJI: SEQ ID NO:25:
TCTAGAGTCG ACTTATCATT TACCCGGAGA CAGGGAGAGG CTCTT 45 (2) INFORMACJA DLA SEQ ID NO: 26:
(i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 38 par zasad (B) TYP: kwas nukleinowy (C) NICIOWOŚĆ: pojedyncza (D) TOPOLOGIA: liniowa (ii) TYP CZĄSTECZKI: cDNA (xi) OPIS SEKWENCJI: SEQ ID NO:26:
CCTCTGAGCT CAAGCTTCCG AGGACCACAA TGAACAAG 38 (2) INFORMACJA DLA SEQ ID NO:27:
(i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 43 par zasad (B) TYP: kwas inklaSnowy (C) NICIOWOŚĆ: pojedyncza (D) TOPOLOGIA: liniowa (ii) TYP CZĄSTECZKI: cDNA (xi) OPIS SEKWENCJI: SEQ ID NO:27:
CCTCTGCGGC CGCTUGCAG CTTATaaTCl CGGATTGUC CTG 43 (2) INFORMACJA DLA SEQ ID NO: 28:
(i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(Α) DŁUGOŚĆ: 38 par zasad (B) TYP: kwas nukleinowy (C) NICIOWOŚĆ: pojedyncza (D) TOPOLOGIA: liniowa (ii) TYP CZĄSTECZKI: cDNA
187 408 (xi) OPIS SEKWENCJI: SEQ ID NO:28:
CCTCTGAGCT CAAGCTTCCG AGGACCACAA TGAACAAG 38 (2) INFORMACJA DLA SEQ ID NO:29:
(iiCfHARAKnERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 24 par zasad (B) TYP: kwas nukleinowy (C) NICIOWOŚĆ: pojedyncza (D) TOPOLOGIA: liniowa (ii) TYP CJZĄtTECZKI: cODN.
(xi) OPIS SEKWENCJI: SEQ ID NO:29:
TCCGTAAGAA ACAGCCCAGT GACC 24 (2) DLA SEQ ID NO:30:
(i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 31 par zasad (B) TYP: kwas nukleinowy (C) NICIOWOŚĆ: pojedyńcza (D) TOPOLOGIA: liniowa (ii) TYP CZĄSTECZKI: cDNA (xi) OPIS SEKWENCJI: SEQ ID NO:30:
CCTCTGCGGC CGCTGTTGCA TTTCCTTTCT G 31 (2) INFORMACJA DLA SEQ ID NO:31:
(i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 19 aminokwasów (B) TYP: aminokwas (C) NICIOWOŚĆ: pojedyńcza (D) TOPOLOGIA: liniowa (ii) TYP CZĄSTECZKI: proteina (xi) OPIS SEKWENCJI: SEQ ID NO:31:
Glu Thr Leu Pro Pro Lys Tyr Leu His Tyr Asp Pro Glu Thr Gly His 1-5 10 15
Gln Leu Leu (2) INFORMACJA DLA SEQ ID NO:32:
(i) CiUARAKnSRYSTYK SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 21 par zasad (B) TYP: kwas nukleinowy (C) Niciowość: pojedyńcza (D) TOPOLOGIA: liniowa (ii) TYP CZĄSTECZKI: cDNA
187 408 (ci) OPIS SEKWENCJI: SEQ ID NO:28:
CCTCTGAGCT CAAGCTTCCG AGGACCACAA TGAACAAG 38 (2) INFORMACJA DLA SEQ ID NO: 29:
(x) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 24 par zasad (B) TYP: kwas nukleinowy (C) NICIOWOŚĆ: pojedyncza (D) TOPOLOGIA: Ainiowa (ii)TYP CZĄSTECZKI: cOlNA (ci) OPIS SEKWENCJO: SnQ IDNOjI::
TCCGTAAGAA ACAGCCCAGT GAOO 24 (2) INFORMACJA DLA SEQ ID NO:30:
(i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 31 par zasad (B) TYP: kwas nukleinowy (C) NIC^NOŚĆ: pojedyncza (D) TOPOLOGIA: liniowa (ii) TYP CZĄSTECZKI: cDNA (xi) OPIS SEKWENCJI: SEQ ID ^:30:
cctctgcggc ogctgttgoa tttcotttot G 31 (2) INFORMACJA DLA SEQ ID NO:31:
(i) CłUARAKTRYSSTU. SOKWEtCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 19 aminokwasów (B) TYP: aminokwas (C) NICI^W^^^: pojedyncza (D) TOPOLOGIA: liniowa (li) TYP CZĄSTECZKI: proteina (ci) OPIS SEKWENCJI: SEQ ID NO:31:
Glu Thr Leu Pro Pro Lys Tyr Leu His Tyr Asp Pro Glu Thr Gly His 1-5 10 15
Gln Leu Leu (2) INFORMACJA DLA SEQ ID NO: 32:
(i) CKAERAKTERY STYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 21 par zasad (B) TYP: kwas nukleinowy (C) Niciowość: pojedyncza (D) TOPOLOGIA: liniowa (ii) TYP CZĄSTECZKI: cDNA
187 408 (ci) OPIS SEKWENCJI: SEQ ID NO:32:
TCCCTTGCCC TGACCACTCT T 21 (2) INFORMACJA DLA SEQ ID NO:33:
(i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 34 par zasad (B) TYP: kwas nukleinowy (C) NICIOWOŚĆ: pojedyńcza (D) TOPOLOGIA: liniowa (ii)TYP CZĄSTECZKI: cDNA (ci) OPIS SEKWENCJI: SEQ ID NO:33:
CCTCTGCGGC CGCACACACG TTGTCATGTG TTGC 34 (2) INFORMACJA DLA SEQ ID NO:34:
(i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 21 par zasad (B) TYP: kwas nukleinowy (C) NICIOWOŚĆ: pojedyńcza (D) TOPOLOGIA: liniowa (ii) TYP CZĄSTECZKI: cDNA (ci) OPIS SEKWENCJI: SEQ ID NO:34:
TCCCTTGCCC TGACCACTCT T 21 (2) INFORMACJA DLA SEQ ID NO:35:
(i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 34 par zasad (B) TYP: kwas nukleinowy (C) NICIOWOŚĆ: pojedyńcza (D) TOPOOCK3IA.: liniowa (ii) TYP CZĄSTECZKI: cDNA (ci) OPIS SEKWENCJI: SEQ ID NO:35:
ICTIIGCGGI CGICTTTTGI GTGGCTTCTC TGTT 34 (2) INFORMACJA DLA SEQ ID NO:36:
(i)CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 37 par zasad (B) TYP: kwas nukleinowy (C) YHCIOWOŚĆ: pojedyńcza (D) HOOLOGIA: liniowa (ii) TYP CZĄSTECZKI: cDNA (ci) OPIS SEKWENCJI: SEQ ID NO:36:
187 408
CCTCTGAGCT CAAGCTTGGT TTCCGGGGAC CACAATG 37 (2) INFORMACJA DLA SEQ ID NO: 37:
(i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 38 par zasad (B) TYP: kwas nukleinowy (C) NICIOWOŚĆ: pojedyncza (D) TOPOLOGIA: liniowa (ii) TYP CZĄSTECZKI: cDNA (xi) OPIS SEKWENCJI: SEQ ID NO: 37:
CCTCTGCGGC CGCTAAGCAG CTTATTTTTA CTGAATGG 38 (2) INFORMACJA DLA SEQ ID NO: 38:
(i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 37 par zasad (B) TYP: kwas nukleinowy (C) NICIOWOŚĆ: pojedyncza (D) TOPOLOGIA: liniowa (ii) TYP CZĄSTECZKI: cDNA (xi) OPIS SEKWENCJI: SEQ ID NO: 38:
CCTCTGAGCT CAAGCTTGGT TTCCGGGGAC CACAATG 33 (2) INFORMACJA DLA SEQ ID NO: 39:
(i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 33 par zasad (B) TYP: kwas nukleinowy (C) NICIOWOŚĆ: pojedyncza (D) TOPOLOGIA: liniowa (ii) TYP CZĄSTECZKI: cDNA (ci) OPIS SEKWENCJI: SEQ ID NO:39:
CCTCTGCGGC CGCCAGGGTA ACATCTATTC CAC 33 (2) INFORMACJA DLA SEQ ID NO: 40:
(i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 35 par zasad (B) TYP: kwas nukleinowy (C) NICIOWOŚĆ: pojedyncza (D) TOPOLOGIA: liniowa (ii) TYP CZĄSTECZKI: cDNA (ci) OPIS SEKWENCJI: SEQ ID NO:40:
CCGAAGCTTC CACCATGAAC AAGTGGCTGT GCTGC 35 (2) INFORMACJA DLA SEQ ID NO: 41:
187 408 (i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 40 par zasad (B) TYP: kwas nukleinowy (C) NICIOWOŚĆ: pojedyńcza (D) TOPOLOGIA: liniowa (ii) TYP CZĄSTECZKI: cDNA (xi) OPIS SEKWENCJI: SEQ ID NO:41:
AATCTGTCGA CTATTATAAG AAGCTTATTT TCACGGATTG 44 (2) INFORMACJA DLA SEQ ID NO: 42:
(i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(ii) (A) DŁUGOŚĆ: 21 par zasad (B) TYP: kwas nukleinowy
(C) (D) TYP NICIOWOŚĆ: pojedyńcza TOPOLOGIA: liniowa CZĄSTECZKI: cDNA
(X!) OPIS SEKWENCJI: SEQ ID NO:42:
TCCATTGCCC TGACAACTCT T 21 (2) INFORMACJA DLA SEQ ID NO: 43:
(i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 35 par zasad (B) TYP: kwas nukleinowy (C) NICIOWOŚĆ: pojedyńcza (D) TOPOLOGIA: liniowa (ii) TYP CZĄSTECZKI: cDNA (xi) OPIS SEKWENCJI: SEQ ID NO:43:
ACTATGTAGA CTTAACACAC GTTGTCATGT GTTGC 35 (2) INFORMACJA DLA SEQ ID NO:44:
(i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) (B) (C) (D) DŁUGOŚĆ: 21 par zasad TYP: kwas nukleinowy NICIOWOŚĆ: pojedyńcza TOPOILDGIA: liniowa
(ii) TYP CZĄSTECZKI: cDNA
(xi) OPIS SEKWENCJI : SEQ ID NO:44
TACATTGACC TGACCACTAT T
187 408 (2) INFORMACJA DLA SEQ ID NO: 45:
(i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 35 par zasad (B) TYP: kwas nukleinowy (C) NICIOWOŚĆ: pojedyncza (D) TOPOLOGIA: liniowa (ii) TYP CZĄSTECZKI: cDNA (xi) OPIS SEKWENCJI: SEQ ID NO:45:
CCTCTGTCGA CTTACTTTTG CGTGGCTTCT CTGTT 35 (2) INFORMACJA DLA SEQ ID NO: 46:
(i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 1537 par zasad (B) TYP: kwas nukleinowy (C) NICIOWOŚĆ: pojedyncza (D) TOPOLOGIA: liniowa (ii) TYP CZĄSTECZKI: cDNA (xi) OPIS SEKWENCJI: SEQ ID NO:46:
GTGAAGAGCG TGAAGAGCGG TTCCTCCTTT CAGCAAAAAA CCCCTCAAGA CCCGTTTAGA 60
GGCCCCAAGG GGTTATGCTA GTTATTGCTC AGCGGTGGCA GCAGCCAACT CAGCTTCCTT 120
TCGGGCTTTC TTCTTCTTCT TCTTCTTTCC GCGGATCCTC GAGTAAGCTT CCATGGTACC 180
CTGCAGGTCG ACACTAGTGA GCTCGAATTC CAACGCGTTA ACCATATGTT, .ATTCCTCCTT 240
TAATTAGTTA AAACAAATCT AGAATCAAAT CGATTAATCG ACTATAACAA ACCATTTTCT 300
TGCGTAAACC TGTACGATCC TACAGGTACT TATGTTAAAC AATTGTATTT CAAGCGATAT 360
AATAGTGTGA CAAAAATCCA ATTTATTAGA ATCAAATGTC AATCTATTAC CGTTTTAATG 420
ATATATAACA CGCAAAACTT GCGACAAACA ATAGGTAAGG ATAAAGAGAT GGGTATGAAA 480
GACATAAATG CCGACGACAC TTACAGAATA ATTAATAAAA TTAAAGCCTG TAGAAGCAAT 540
AATGATATTA ATCAATGCTT ATCTGATATG ACTAAAATGG TACATTGTGA ATATTATTTA 600
CTCGCGATCA TTTATCCTCA TTCTATGGTT AAATCTGATA TTTCAATTCT GGATAATTAC 660
CCTAAAAAAT GGAGGCAATA TTATGATGAC GCTAATTTAA TAAAATATGA TCCTATAGTA 720
GATTATTCTA ACTCCAATCA TTCACCGATT AATTGGAATA TATTTGAAAA CAATGCTGTA 780
187 408
AATAAAAAAT CTCCAAATGT AATTAAAGAA GCGAAATCAT CAGGTCTTAT CACTGGGTTT 840
AGTTTCCCTA TTCATACTGC TAATAATGGC TTCGGAATGC TTAGTTTTGC ACATTCAGAG 900
AAAGACAACT ATATAGATAG TTTATTTTTA CATGCGTGTA TGAACATACC ATTAATTGTT 966
CCTTCTCTAG TTGATAATTA TCGAAAAATA AATATAGCAA ATAATAAATC AAACAACGAT 1000
TTAACCAAAA GAGAAAAAGA ATGTTTAGCG TGGGCATGCG AAGGAAAAAG CTCTTGGGAT 1180
ATTTCAAAAA TATTAGGCTG TAGTAAGCGC ACGGTCACTT TCCATTTAAC CAATGCGCAA 1110
ATGAAACTCA ATACAACAAA CCGCTGCCAA AGTATTTCTA AAGCAATTTT AACAGGAGCA 1120
ATTGATTGCC CATACTTTAA AAGTTAAGTA CGACGTCCAT ATTTGAATGT ATTTAGAAAA 1120
ATAAACAAAA GAGTTTGTAG AAACGCAAAA AGGCCATCCG TCAGGATGGC CTTCTGCTTA 1122
ATTTGATGCC TGGCAGTTTA TGGCGGGCGT CCTGCCCGCC ACCCTCCGGG CCGTTGCTTC 1180
GCAACGTTCA AATCCGCTCC CGGCGGATTT GTCCTACTCA GGAGAGCGTT CACCGACAAA 1140
CAACAGATAA AACGAAAGGC CCAGTCTTTC GACTGAGCCT TTCGTTTTAT TTGATGCCTG 1100
GCAGTTCCCT ACTCTCGCAT GGGGAGACCA TGCATAC 1537
(2) INFORMACJA DLA SEQ ID NO: 47:
(i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 48 par zasad (B) TYP: kwas nukleinowy (C) NICIOWOŚĆ: pojedyńcza (D) TOPOLOGIA: liniowa (ii) TYP CZĄSTECZKI: cDNA (xi) OPIS SEKWENCJI: SEQ ID NO:47:
CCGGCGGACA TTTATCACAC AGCAGCTGAT GAGAAGTTTC TTCATCCA (2) INFORMACJA DLA SEQ ID NO:48 (i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 55 par zasad (B) TYP: kwas nukleinowy (C) NICIOWC^Ś^: pojedyńcza (D) TOPOLOGIA: liniowa (ii) TYP CZĄSTECZKI: cDNA
187 408 (ci) OPIS SEKWENCJI: SEQ ID NO:48:
CGATTTGATT CTAGAAGGAG GAATAACATA TGGTTAACGC GTTGGAATTC GGTAC (2) IOTOIUMACJA DU TEE TD NO:T 9:
(i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) ŁŁUCK5ŚĆ : 9 T pan zasad (B) TYP: kwas nukleinowy (C) NI^OWOŚci·. pojedyńcza (D) TOPOLOGIA: liniowa (ii) TYP CZĄSTECZKI: cDNA (xi) OPIS SEKWENCJI: SEQ ID NO:49:
CG.AATTCCAA CUCUTTAlCC ATATGTTATT CCTCCTTCTA GiUTCHAT (2) INFORMACJA DIAT SEQ ID NO: 50:
(i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 1546 par zasad (B) TYP: kwas nukleinowy (C) NICIOWOŚĆ: pojedyńcza (D) TOPOLOGIA: liniowa (ii)TYP CZĄSTECZKI: cDNA (ci)OPIS SEKWENCJI: SEQ ID NO: 50:
UCUTllCUTl TUClTUUTCT GCGGlGUGUl 1UT1GUU1AA CTGCCAGGCA CCAAClAlAA 60
CUAAlUGGGC lUGGUAAlGl GGGGUGGGGG GGTTTATTTT GGUTGGUTCn GCUllGUGCn 110
CGCCGUlGGl UUlGAllTGC GGCGUUAGGG lCGGUllGUn GUGCGAAGCλ GGUGCCUGGT 110
UUGGUGGUGG ClUUlCUCCC UGGlGllAGG GCAGGGATCn llCGTAUGCT llUGGGlCCn 220
CGUlGUGlGU GCCTTITTGC UGGGCGlGll ATCCTTTGGT GlTGGGGCTn AlGlGlTGGn 300
AlAGlGUUlC UTCUTlCTTl 1GGGGG1A1G lTUUGGllCn llTGUGGCGn UGGllllGGn 366
UCGGGlUAAA GlCGGGUUGl GCGGTTTGTT TlTGUlUGGn GCCGGUGUGT TGUUGGlllT 442
GGGAAAUGUl CCUTUCUCTT 1GG1C1GGCG lGlTGGGGUn 1AG1GGGG1T UlGGCGGTGn 448
CCTTCGCATG CGClCUGTAl ACATTCTTTT GTCTTTGUUn TlllCCUTGn TGGUlCGTln 544
GGlGGGUGGl TATTTATTTT GGUlGlATGA GlAGTlGlUn lUUGlGllGn lATUUGlCUn 660
GGCAGlGlGU ClGUGAlAlA TlAlCTlTCT TlGlUTGUTn GGGCGCTUlT TUTUGAAlAT 666
CTllUClTTC CUlAUCCATT A^AGO^TA UllTlUUGlT lGTlAlGGGn UTUlCllUlT 722
CCTUlTUlTT TCGCTTCTTT 1AGG1G1GGT UlUlGGGGGn 1CGG1G1UGT GGUTTGGCln 788
187 408
AATATATTCC AATTAATCGG TGAATGATTG GAGTTAGAAT AATCTACTAT AGGATCATAT 840
TTTATTAAAT TAGCGTCATC ATAATATTGC CTCCATTTTT TAGGGTAATT ATCCAGAATT 900
GAAATATCAG ATTTAACCAT AGAATGAGGA TAAATGATCG CGAGTAAATA ATATTCACAA 960
TGTACCATTT TAGTCATATC AGATAAGCAT TGATTAATAT CATTATTGCT TCTACAGGCT 1020
TTAATTTTAT TAATTATTCT GTAAGTGTCG TCGGCATTTA TGTCTTTCAT ACCCATCTCT 1020
TTATCCTTAC CTATTGTTTG TCGCAAGTTT TGCGTGTTAT ATATCATTAA AACGGTAATA 1000
GATTGACATT TGATTCTAAT AAATTGGATT TTTGTCACAC TATTATATCG CTTGAAATAC 1202
AATTGTTTAA CATAAGTACC TGTAGGATCG TACAGGTTTA CGCAAGAAAA TGGTTTGTTA 1200
TAGTCGATTA ATCGATTTGA TTCTAGATTT GTTTTAACTA ATTAAAGGAG GAATAACATA 1020
TGGTTAACGC GTTGGAATTC GAGCTCACTA GTGTCGACCT GCAGGGTACC ATGGAAGCTT 1020
ACTCGAGGAT CCGCGGAAAG AAGAAGAAGA AGAAGAAAGC CCGAAAGGAA GCTGAGTTGG 1040
CTGCTGCCAC CGCTGAGCAA TAACTAGCAT AACCCCTTGG GGCCTCTAAA CGGGTCTTGA 1000
GGGGTTTTTT GCTGAAAGGA GGAACCGCTC TTCACGCTCT TCACGC 0500 (2)INFORMACJA DLA SEQ ID NO:52:
(i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 49 par zasad (B) TYP: kwas nukleinowy (C) NICIOWOŚĆ: pojedyncza (D) TOPOLOGIA: liniowa (ii) TYP CZĄSTECZKI: cDNA (ci) OPIS SEKWENCJI: SEQ ID ^:52:
AATTCCAACG CGTTAACGCT AGCATGATGG TGiATGGTGiAT GATGTTTCA 49 (2) INFORMACJA DLA SEQ ID NO:53:
(i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 141 par zasad (B) TYP: kwas nukleinowy (C) NICIOWOŚĆ: pojedyncza (D) TOPOLOGIA: liniowa (ii) TYP CZĄSTECZKI: cDNA
187 408 (ci) OPIS SEKWENCJI: SEQ ID NO: 53:
HAAmCGC TCTAAAAIAC CARACRATGC CICCCTGIAA AAAATAAATT CATATAAAAA 60
ACATACAGAT TAAAAIAIGA GGTGATAAAT IAIIICTGGA GGTGTTGACA TKAATACCAC 112
TGGCGGTGAT ACTGAGCACA T 114 (2) INFOKt-AUJA DLAC SEQ ID NO:54:
(i.)CHARCKTEALCITEKA SEKOEECJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 147 par zasad (B) TYP: kwas nukleinowy (C) NICIOWOŚĆ: pojed^yicza (D) TOPOLOGIA: linilwa (ii)CYP CZTYPCCZKS:
(xi) OPIS SEKWENCJI: SEQ ID NO:54:
CGAIGTGAIA AGTAIAACCG CAAGIGGTAT TTATGUAAC AAAGAAAGAC ATAATITATC 60
AIIGAAGAIG GTIATAIGTA TGTTTIIIAT ATGAATTTAI TTTITGAAGG GGGGIAITGI 110
HGGTAGGTG AGAGAGGAAT IAGACGI 147
(2) INFORMACJA DLA SEQ ID NO: 55:
(i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 55 par zasad (B) TYP: kwas nukleinowy (C) NICIOWOPĆ: pojedtyyńza (D) TOPOIDCT: OiYiowa (ii) TYP CZĄSTECZKI: cDNA (xi) OPIS SEKWENCJI: SEQ ID NO:55:
CGATTTGATT CTAGAAGGAG GAATAACATA TGGTTAACGC GIIGGAATTA GGTAC 55 (2) INFORMACJA DLA SEQ ID NO: 50:
(i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 49 par zasad (B) TYP: kwas nukleinowy (C) NICIOWOŚĆ: pojedyńcza (D) TOPOLOGIA: liniowa (ii) TYP CZĄSTECZKI: cDNA (xi) OPIS SEKWENCJI: SEQ ID NO:50:
CGAATTCCAA CGCGTTAACC ATATGUATT ICTCITTITA GAATCAAAT 49 (2) INFORMACJA DLA SEQ ID NO: 57:
(i) CHARAKTERKUYKA SKATCrnE:
(A) DŁUGOŚĆ: 008 par zasad (B) TYP: kwas nukleinowy
187 408 (C) NICIOWOŚĆ: pojedyncza (D) TOPOOOGZA: liniowa (^:i) TTn» CSWĄSSCZKI: cODNl (xi) OPIS SEKWENCJI: SEQ ID NO:57:
GIGlAGlCCG TGAAGAGCGG TTCCICCTTT ClGCAllAll CCCCICAAGA CCCGTTTAGA 66
GGCCCCAAGG GGHATGCTA GTTATTGCTC AGCGGIGGCl GCAGCCAACT CAGCTTCCTT 120
TCCGGCHTC TTCTTCTTCT TCTTCTTTCC GCGGATCCTC GAGIlAGCIT CCATGGTACC 180
CIGCACGICG AClCTllGIGl GCICGllTTC CAACGCGUA ACCATATGTT lTTCCTCCIT 240
IllTTAGITA AdAmiCI 1G11IC1A1I CGlTlllTTG TGAGCGCTCA CAlTTGlGll 330
TAITAAICAA GUTTTTAGC ATTTGICMl TGAATTTTTT llllATTATG AGACGTCCAT 360
ATTIdUGT ATTTAClllA ArnACmA GAGTTIGIAG mOGCHH AGGCCATCCG 422
IClGGlIGGC CTTCIGCTTl ATTTGATGCC TGGCAGTTTl TGGCGGGCGT CCTGCCCGCC 488
ACCCTCCGGG CCGTTGCTTC GCHCGTTCA AATCCGCTCC CGGCGGATTT GTCCTACTCA 550
GGAGAGCGH CACCGACAAA ClACAClTll HCGAUGGC CCAGTCTTTC GACTGAGCCT 600
TTCGITTTAI UGATGCCTG GCAGTTCCCT ACTCTCGCAT GOGGAGACCA TGCATlCGIT 660
ACGCACGT 668
(2) INFORMACJA DLA SEQ ID NO: 58:
(i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 726 pas zasad (B) TYP: kwas nukleinowy (C) NICIOWOŚĆ: pojedyncza (D) TOPOLOGIA: liniowa (ii) TYP CZĄSTECZKI: cDNA (xi) OPIS SEKWENCJI: SEQ ID NO:58:
GCGmCGH Ι^Ν^ΤΑΙ CCCCATGCGA GAATAGGGAA CIGCClGGCA TCAAATAAAA 60
CCllACGCIC 1CICC1A1G1 CIGGGCCIII CGTIIIAlCT TTTCTTTGTC GGCTGllCCC 120
CICCIGlGIl GGlClllICC GCCGGGAGCG GAUITGACC TTCGCGWAGCA AlCCGCCCGG 180
GGGTGGCGGG ClGGlCGCCC GCClIlAlCT GGCAAGCAAT taattaacgca GGAGGGGiGCC 240
CCCACCGCCC GTCdGCGGC CGGIlIIIGl CCGTTCCTTA TTTUATTCGT CCIICGCATI 300
C^^GOUG GCCIIIITGC GUICTACH OICTTIIG TTATTTTTCT AAAAAAATIC 360
111I1IGG1C GICIClIlAI IIIIAHHA TIICHIIGA TWIKTIAA autchatt 420
llIlIICICl lIICIGlGCG CIClCllIII AlICClIITC TTCTAGATTT gtttttaacta 480
187 408 (C) NICIOWOŚĆ: pojeĄyicza (D) TOPOIOPIA: lAniowa (ii)TYP CZĄSTECZKI: cDNA (xi) OPIS SEKWENCJI: SEQ ID NO:57:
GTGAAGAGCG TGAAGAGCGG TTCCTCATTT CAGCAAAAAA AACCTCAAGA CCCGTTTAGA 60
GGCAAAAAGG GGTTATGCTA GTTATTGCTC AGCGGTGGCA GCAGCCAAAT CAGCTTCCTT 120
TCGGGCTTTA TTCTTCTTCT TCTTCTTTCA GCGGATACTC GAGTAAGCTT CCATGGTACC 188
CTGCAGGTCG ACAATAGTGA GCTCGAATTC AAAAGCGTTA AACATATGTT ATTCCTCCTT 240
TAATTAGTTA AATAAAATAT AGAATAAAAT CGATAAATTG TGAGCGCTCA CAATTGAGAA. 300
TATTAATCAA GAATTTTAGC ATTTGTCMA TGAATTTTTT AAAAATTATG AGAAGTCAAT 360
ATTTGAATGT ATTTAGAAAA ATAAAAAAAA GAGTTTGTAG AAACGCAAAA AGGCAATCAG 442
TAAGGATGGC CTTATGCTTA ATTTGATGCC TGGCAGTTTA TGGCGGGCGT CCTGCCCGCC 448
AAACTCAGGG CCGTTGCTTC GCAACGTTCA AATCCGCTCC AGGCGGATTT GTCCTACTCA 544
GGAGAGCGTT AACCGACAAA CAAAAGATAA AACGAAASGC CCAGTCTTTC GACTGAGCCT 660
TTAGTTTTAT TTGATGCCTG GCAGTTCCCT AATCTCGCAT GOGGAGACCA TGAATACGTT 660
AAGAACGT 668 (2) INFORMACJA DLA SEQ ID NO:48:
(i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 726 par zasad (B) TYP: kwas nukleinowy (C) NICIOWOŚĆ: pojedyńcza (D) TOPOLOGIA: liniowa (ii) TYP CZĄSTECZKI: cDNA (xi) OPIS SEKWENCJI: SEQ ID NO:48:
GCGTAACGTA TGAATG3TCT CCCCATGCGA GAGTAGGGAA CTGCCAGGCA TCAAATAAAA 60
CGAAAGGCTC AGTCGAAAGA CTGGGCCTTT CGTTTTATCT TTGGTTGGTC GGGGAACG^T 120
CTCCTGAGTA GCGGGGGTAG GAGCCCGGAC GGGTGGGAAC GCACGGCACC AGCAAGCCAC 180
GCCTCCAGCC GGCCGGGAGA GAGGTGAAAT GACGCCAGGA GGGGGACACC GGCCCCAATC 240
GCGAGAGAGA CGAGGCACCC GCCTAGGGCA GCCTGGCGGC GGGGGGGCGC TGCGGAGGCC 300
GGGGAGCGTC GAAGTTTGGA GGTTATGAGA GATATTGTCT GGGGGTGGTC GAGGAGGTCC 360
GGGGGGCCAG CTAGAGGGAT GGTTGGGGAG GGAATTGGGA GGGCGCGGGC GGGTTGGGGC 420
GGGGGTAGAA GTTCGCACAC GTAAGGAGTT GGAGAGGGCA T^AGA^: GGTGGAACGA 480
187 408
ATTAAAGGAG GAATAACATA TGGTTAACGC GTTCGGATTC GAGCCCCCCA GTGTCCAACC 550
GCAGGGTACC ACGGCAGCCC ACCCCACGAC CCGCGGAAA AAAGAGAAAA GCGAAGAAAG 600
CCGAAAGGAA GCCGCGTCGG CKTOAGCA TCCCCCCCCC GACCCCTTG3 600
GGCCTCTAAA CGGGTCCCGC GGGGTCCCCC GCTGAAAGGA <OλCACCCCC TTCCCGCTCT 720
TCACGC 700 (2) INFORMACJA DLA SEQ ID NO:59:
(i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 00 par zasad (B) TYP: kwas nukleinowy (C) NICIOWOŚĆ: pojedyńcza O) TOPOLOGIA: liniowa (ii) TYP CZĄSTECZKI: cDNA (ci) OPIS SEKWENCJI: SEQ ID NO:59:
CACGCACCGG ΕΚΟ!!»» GCAGCCCCCC CCCCCCGCCC GGAC 00 (0) INFORMACJA DLA SEQ ID NO: β2:
(i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(Α) DŁUGOŚĆ: 07 par zasad (B) TYP: kwas nukleinowy (C) NICIOWOŚĆ: pojedyńcza (D) TOPOLOGIA: liniowa (ii) TYP CZĄSTECZKI: cDNA (ci) OPIS SEKWENCJI: SEQ ID NO:02:
GCCCCCCCGG CACCCACCCA AACCACC 20 (0) INFORMACJA DLA SEQ ID NO:00:
(i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 020 par zasad (B) TYP: kwas nukleinowy (C) NICIOWOŚĆ: pojedyncza (D) TOPOLOGIA: liniowa (ii) TYP CZĄSTECZKI: cDNA (ci) OPIS SEKWENCJI: SEQ ID NO·^:
CATGGACGAA GAGACTTCTC ATC^TG^ GCGCGACAAA CGCCCGCCGG GTACCCGGCG 60
GACACCCACC ACACAGCAGC CGACGAGAAG CCCCCCCACC CA
020
187 408 (2) INFORMACJA DLA SEQ ID NO: 62:
(i) CHAIYKWERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 19 aminokwass (B) TYP: aminokwas (C) NICIOWOŚĆ: pojedyncza (D) TOPOLOGIA: liniowa (ii) TYP CĄST^CK^ : proteina (xi) OPIS SEKWENCJI: SEQ ID NO:62:
Met Asp Glu Glu Thr Ser His Gln Leu Leu Cys Asp Lys Cys Pro Pro
10 15
Gly Thr Tyr (2) INFORMACJA DLA SEQ ID NO: 63:
(i) CCAlRlWTKYSETKK nEKWWNCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 84 par zasad (B) TYP: kwas nukleinowy (C) NICIOWOŚĆ: pojedyncza (D) TOPOLOGIA: liniowa (ii) TYP CJĄSaTECWIi : «DINA (xi) OPIS SEKWENCJI: SEQ ID NO:63:
TAaGGlllJT TTaCCaJJlA lATlTCTTCl TTlTUATUlA GAAlJaaCTC ATCAGCTGCT
GTGTGATAAA TGTJCGCCGG GTAC (2) INFORMACJA DLA SEO ID NO:64:
(i) C CHARAKTERY STYKA SEKAEKiC JI:
(A) DŁUGOŚ:: 7n pan zasad (B) TYP: kwas nukleinowy (C) NICIOWOŚĆ: pojedyncza (D) TOPOLOGIA: liniowa (ii) TYP CZĄSTECZKI: cDNA (xi) OPIE EEAEENCJI: EEQ ID NO: 64:
JJGUJGGACl TTTATJAClJ AUJAUCTGAa UlUlAUTTaJ TaCATCATAA TGAAAG.TATT τaGUlGUlAl AuτaacJA (2) INFORMACJA DLA SEQ ID NO: 65:
(i) CCAARAATEKYSSTYSA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 44 par zasad (B) TYP: kwas nukleinowy (C) NICIOWOŚĆ: pojedyncza (D) TOPOLOGIA: liniowa
100
187 408 (ii) TYP CZĄSTECZKI: cDNA (xi) OPIS SEKWENCJI: SEQ ID NO:65:
TACGCACTGG ATCCTTATAA GCAGCTTATT TTCACGGATT GAAC 44 (2) INFORMACJA DLA SEQ ID NO:66:
(i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 38 pac zasad (B) TYP: kwas nukleinowy (C) NICIOWOŚĆ: pojedyńcza (D) TOPOLOGIA: liniowa (ii) TYP CZĄSTECZKI: cDNA (xi) OPIS SEKWENCJI: SEQ ID NO:66:
GTGCTCCTGG TACCTACCTA AAACAGCACT GCACAGTG 38 (2) INFORMACJA DLA SEQ ID NO: 67:
(i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 84 pac zasad (B) TYP: kwas nukleinowy (C) NICIOWOŚĆ: pojedyńcza (D) TOPOLOGIA: liniowa (xi) TYP CZĄSTECZKI: cDNA (xi) OPIS SEKWENCJI: SEQ ID NO:67:
TATGGAAACT CTGCCTCCAA AATACCTGCA TTACGATCCG GAAACTGGTC ATCAGCTGCT 60
GTGTGATAAA TGTGCTCCGG GTAC 84 (2) INFORMACJA DLA SEQ ID NO: 68:
(i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 78 pac zasad (B) TYP: kwas nukleinowy (C) NICIOWOŚĆ: pojedyńcza (D) TOPOLOGIA: liniowa (ii) TYP CZĄSTECZKI: cDNA (xi) OPIS SEKWENCJI: SEQ ID NO:68:
CCGGAGCACA TTTATCACAC AGCAGCTGAT GACCAGTTTC CGGATCGTAA TGCAGGTATT 60
TTGGAGGCAG AGTTTCCA 78 (2) INFORMACJA DLA SEQ ID NO: 69:
(i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 54 par zasad (B) TYP: kwas nukleinowy
187 408
101 (C) NCCCPWOŚĆ: pojedyńcza (D) TOPOLOGIA: liniowa (ii) YPC CZAIEACZKI c cNNC (ci) OPIS SEKWENCJI: SEQ ID NO: 09:
TATGGTCCAA GTAAAIGGIC AIATGATGAI GTGTGAIAAT IGIGAICCGG GTAC 54 (2) INFORMACJA. DLA SEQ ID NO:70:
(i) CKARACIEESSISKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 48 par zasad (B) TYP: kwas nukleinowy (C) NCACPWOŚĆ: pojedyńcza (D) TOPOLOGIA: liniowa (ii) UP CZAĄHECZKI: cODA (ci) OPIS SEKWENCJI: SEQ ID NO:70:
CCGGAGAAAA ITTAIAAAAA AGAAGCTGAI GACCAGTTTC IGGGTCCA 44 (2) INFORMACJA DLA SEQ ID NO: 71:
(i) CIAKTERCTRYS,SΉYC ΞCSGCEJECAJ:
(A) DŁUGOŚĆ: 87 par zasad (B) TYP: kwas nukleinowy (C) NCAIPWPŚĆ: pojedyńcza (D) TOPOLOGIA: liniowa (ii) TYP CZĄSTECZKI: cDNA (ci) OPIS SEKWENCJI: SEQ ID NO:71:
IATGAAAGAA ACICIGCCIC CATAATACCT GCAITAIGAI CCGGAAACTG GICAICAGAI 00
GAIGIGTGAI TAAIGIGAIA CGGGTAC 88 (2) INFORMACJA DLA SEQ ID NO:72:
(i) CAHREKCTRESTIKC .SEKWEHCJ I (A) DŁUGOŚĆ: 81 par zasad (B) TYP: kwas nukleinowy (C) NIACPWOŚĆ: pojedyńcza (D) TOPOLOGIA: liniowa (ii) TYP CZĄSTECZKI: cDNA (xi) OPIS SEKWENCJI: SEQ ID NO: 72:
CCGGAGCACA TITAICACAC AGCAGAIGTT GACIAGTTIA CGGATCGIAA IGAAGGIAII 00
TTGGAGGCAG AGTITATIIC A 81 (2) INFORMACJA DAL SEQ ID NO: 73:
102
187 408 (i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 71 par zasad (B) TYP: kwas nukleinowy (C) NICIOWOŚĆ: pojedyńcza (D) TOPOLOGIA: liniowa (ii) TYP CZĄSTECZKI: cDNA (ci) OPIS SEKWENCJI: SEQ LD NO:73:
GCTGGGGTGA TlTUAllClT GATGAGGATG AGGlTGlTGl lAGTCTUCCT GCAlllTlGG 60
TGGAGGAGUl T 71 (2) INFORMACJA DLA SEQ ID ^:74:
(i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 43 par zasad (B) TYP: kwas nukleinowy (C) NICIOWOŚĆ: pojedyńcza O) TOPOLOGIA: liniowa (ii) TYP CZĄSTECZKI: cDNA (xi) OPIS SEKWENCJI: SEQ ID NO:74:
GCCGGGCCGA GACGAAAUAA AGTCTGGGTC GAAlACAGGC GCA 44 (2) INFORMACJA DLA SEQ ID ^:75:
(^CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 76 > par zasad
(B) TYP: kwas nukleinowy
(C) NICIOWOŚĆ: pojedyńcza
(D) TOPOLOGIA: liniowa
(ii) TYP CZĄSTECZKT: nCNĄ
(xi) OPIS SEKWENCJI: SEQ ID NO:75:
TlCUGACCUU ATCCTTAlTU ACUUCUACUG TGACUACGTA AGGAUGCTAT TGCCACUUAC 60
GUlAGGCUAC CCCCCl 7 <5 (2) INFORMACJA DLA SEQ ID NO:76:
(!) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 47 par zasad (B) TYP: kwas nukleinowy (C) NDGIOWAŚĆ: pojedyńcza (D) TOPOLOGIA: liniowa (ii) TYP CZĄSTECZKI: cDNA (xi) OPIS SEKWENCJI: SEQ ID NO:76:
103
GTTCTCCTCA TATGAAATAC CTGCATTACG ATCCGGAAAC TGGTCAT 47 (2) INFORMACJA DLA SEQ ID NO: 77:
(i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 43 par zasad (B) TYP: kwas nukleinowy (C) NIC^NOŚĆ: pojedyncza (D) TOPOLOGIA: liniowa (ii) TYP CZĄSTECZKI: cDNA (ci) OPIS SEKWENCJli: SEQ ID NO:77:
GTTCTCCTAT TAATGAAATA TCTTCATTAT GATGAAGAAA CTT 44 (2) INFORMACJA DLA SEQ ID NO:78:
(i) CIHARAKTERf STYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 40 par zasad (B) TYP: kwas nukleinowy (C) NICI^W^^^Ć^: pojedyncza (D) TOPOLOGIA: liniowa (ii) TYP CZĄSTECZKI: cdNA (ci) OPIS SEKWENCJI:: SEQ ID NO:78:
TACGCACTGG ATCCTTATAA GCAGCTTATT TTTACTGATT 40 (2) INFORMACJA DLA SEQ ID N0:79:
(i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 40 par zasad (B) TYP: kwas nukleinowy (C) NICIOW^^^: pojedyncza (D) TOPOLOGIA: liniowa (ii) TYP CZĄSTECZKI: cDNA (ci) OPIS SEKWENCJI:: SEQ ID NO: 79:
GTTCTCCTCA TATGGAAACT CTGCCTCCAA AATACCTGCA 40 (2) INFORMACJA DLA SEQ ID ^:80:
(i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 43 par zasad (B) TYP: kwas nukleinowy (C) NICIOWOŚĆ: pojedyncza (D) TOPOLOGIA: liniowa (ii) TYP CZĄSTECZKI: cDNA
104
187 408 (xi) OPIS SEKWENCJI: SEQ ID ^:80:
TAJUJlJTUU ATCJTTlTGT TUJATaaCJT TTJaUlAaTl GCA 43 (2) INFORMACJA DLA SEQ ID CO:71:
(i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 18 par zasad (B) TYP: kwas nukleinowy (C) NICIOWOŚĆ: pojedyncza (D) TOPOLOGIA: liniowa (ii) TYP CZĄSTECZKI: cDNA (xi) OPIS SEKWENCJI: SEQ ID NO:81:
JJUUllAJAU ATAlTUlG 18 (2) INFORMACJA DLA SEQ ID NO:82:
(i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 18 par zasad (B) TYP: kwas nukleinowy (C) NICIOWOŚĆ: pojedyncza (D) TOPOLOGIA: liniowa (ii) TYP CZĄSTECZKI: cDNA (xi) OPIS SEKWENCJI: SEQ ID ^:82:
ulτcJTJlτa AτcτGτaa 18 (2) INFORMACJA DLA SEQ ID NO: 83:
(i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 30 par zasad (B) TYP: kwas nukleinowy (C) NICIOWOŚĆ: pojedyncza (D) TOPOLOGIA: liniowa (ii) TYP CZĄSTECZKI: cDNA (xi) OPIS SEKWENCJI: SEQ ID ^:83:
CJUGAAlCAU AUAlGJCACU JAlAlGTAAG 30 (2) INFORMACJA DLA SEQ ID NO:84:
(i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 30 par zasad (B) TYP: kwas nukleinowy (C) NICIOWOŚĆ: pojedyncza (D) TOPOLOGIA: liniowa (ii) TYP CZĄSTECZKI: cDNA
187 408
105 (ci) OPIS SEKWENCJI: SEQ ID NO:84:
GATCCTTACT TTTGCGTGGC TTCTTTTTTT 33 (2) INFORMACJA DIA SEQ ID NO:85:
(i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 12 par zasad (B) TYP: kwas nukleinowy (C) NICIOWOŚĆ: pojedyńcza (D) TOPOLOGIA: liniowa (ii) TYP CZĄSTECZKI: cDNA (ci) OPIS SEKWENCJI: SEQ ID NO:85:
TATGTTAATG AG 11 (2) INIFORACJA DLA SEQ ID NO:86:
(i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 14 par zasad (B) TYP: kwas nukleinowy (C) NICIOWOŚĆ: pojedyńcza (D TOPOLOGIA: liniowa (ii) TYP CZĄSTECZKI: cDNA (ci) OPIS SEKWENCJI: SEQ ID NO:86:
GATCCTCATT AACA 14 (2) IICOiaflLd DIA SEQ ID NO: 87:
(i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 21 par zasad (B) TYP: kwas nukleinowy (C) NICIOWOŚĆ: pojedyńcza (D) TOPOLOGIA; liniowa (ii) TYP CZĄSTECZKI: cDNA (ci) OPIS SEKWENCJI: SEQ ID NO:87:
TATGTTCCGG AAACAGTTAA G 21 (2) INFORMACJA DLA SEQ ID NO:88:
(i) CJAARKWTKRSTCKK 8EKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 23 par zasad (B) TYP: kwas nukleinowy (C) CIJICWOŚĆ: pojedyńcza (D) TOPOWJGIA: liniowa (ii) TYP CZĄSTECZKI: cDNA
106
187 408 (xi) OPIS SEKWENCJI: SEQ ID NO:88:
GGGGCGGGGC TCTGGGCGCG ACA 225 (2) INFORMACJA DLA SEQ ID NO:89:
(i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 36 par zasad (5) TYP: kwas nukleinowy (C) NICIOWOŚĆ: pojedyńcza (D) TOPOLOGIA: liniowa (ii) TYP CZĄSTECZKI: cDNA (xi) OPIS SEKWENCJI: SEQ ID NO:89:
GATGTTCAGG GGAAGGTCGA TGGGGTGGGA GAGAAG 33 (2) INFORMACJA DLA SEQ ID NO:90:
(i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 38 par zasad (B) TYP: kwas nukleinowy (C) NICIOWOŚĆ: pojedyńcza (D) TOPOLOGIA: liniowa (ii)TYP CZĄSTECZKI: cDNA (xi) OPIS SEKWENCJI: SEQ ID NO:90:
GAGCCTTAGG TGGGAGTGGG TGAGCTGGGT ACGGAGAG 38 (2) INFORMACJA DLA SEQ ID NO:91:
(i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 100 par zasad (B) TYP: kwas nukleinowy (C) NIGIOWOŚĆ: pojedyńcza (D) TOPOLOGIA: liniowa (ii) TYP CZĄSTECZKI: cDNA (xi) OPIS SEKWENCJI: SEQ ID NO:91:
AGAGCGACCG CGGCGAAGGA GGGGCTCGGG CGCCGGGAGG ACTGGATTGC GATCCGGGGA 60
CTCGTAGGCG GCGGCGGTGG GGGAGGTCTC CGCACGGTGC 100 (2) INFORMACJA DLA SEQ ID NO;92:
(i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 92 par zasad (B) TYP: kwas nukleinowy (C) NICIOWOŚĆ: pojedyńcza (D) TOPOLOGIA: liniowa
187 408
107 (ii)TYP CZĄSTECZKI: cDNA (ci) OPIS SEKWENCJI: SEQ ID NO: 92:
CCCGlGClCl TIIATCACAC lGCACCTClT GACCAGTTTC CGGATCGTll TGCACCTATT 60
TTCGlGCCAG AGIIICTΊIC TCGTCGTCGT CG 99 (2) INFORMACJA DLA SEQ ID NO: 93:
(i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 26 pas zasad
(B) IYP: kwas nukleinowy
(C) NICIOWOŚĆ: pojedyncza
(D) TOPOLOGIA: liniowa
(ii) TYP CZĄSTECZKI: cDNA (ci) OPIS SEKWENCJI: SEQ ID NO: 93:
Μ^^ΑΚΑ^ ICGAIUGH ACTAGA 26 (2) INFORMACJA DLA ID NO: 94:
(i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI·.
(A) DŁUGOŚĆ: 50 par zasad (B) IYP: kwas nukleinowy (C) NICIOWOŚĆ: pojed^yicza (D) TOPOLOGIAg ^τΙ-ΟΝΗ (ii)TYP CZĄSTECZKI: cDNA (ci) OPIS SEKWENCJI: SEQ ID NO:94:
ITTGTTTTAA CTAAITAlAG GlGGllIllA AIATGAGlGC ATCGCATCAC (2) INFORMACJA DLA SEQ ID NO:95:
(i) CHARAKIERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 50 par zasad (B) TYP: kwas nukleinowy (C) NICIOWOŚĆ: pojedyncza (D) TOPOLOGIA: liniowa (ii)TYP CZĄSTECZKI: cDNA
5( (xi) OPIS SEKWENCJI: SEQ ID NO:35:
CATCACCATC ACGAAACCTT CCCGCCCllA TlCCTGClCT lCGACGlAGl 50 (2) INFORMACJA DLA SEQ ID NO: 96:
(i) CHARlKTERYEIYKl SEKWENCJI:
108
187 408 (A) DŁUGOŚĆ: 49 par zasad (B) TYP: kwas nukleinowy (C) NICIOWOŚĆ: pojedyńcza (D) TOPOLOGU Α: liniowa (ii) TYP CZĄSTECZKI: cDNA (xi) OPIS SEKWENCJI: SEQ ID ^:96:
AlGGCCCCAG GlUCCGGCGT UCUAGAlACG CCCGCCGUUC ACCGAAACl 49 (2) INFORMACJA DLA SEQ ID NO: 97:
(^CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 26 par zasad (B) TYP: kwas nukleinowy (C) NICIOWOŚĆ: pojedyńcza (D) TOPOLOGIA: liniowa (ii)TYP CZĄSTECZKI: cDNA (xi) OPIS SEKWENCJI: SEQ ID NO:97:
GUCGCGGGCA CCCGUGGGGC ATTCGT 26 (2) INFORMACJA DLA SEQ ID NO:98:
(i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 50 par zasad (B) TYP: kwas nukleinowy (C) NICIOWOŚĆ: pojedyńcza (D) TOPOLOGIA.: liniowa (ii) TYP CZĄSTECZETy nCNĄ (xi) OPIS SEKWENCJI: SEQ ID NO:98:
GUCAGAGCAG CCUGTGUUAG GTTTGTTCGT CGCAGTGClG GTlCTTCGUG 50 (2) INFORMACJA DLA SEQ ID NO:99:
(i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 49 par zasad (B) TYP: kwas nukleinowy (C) NICIOWOŚĆ: pojedyńcza (D) TOPOLOGIA: liniowa (ii) TYP CZĄSTECZKI: cDNA (xi) OPIS SEKWENCJI: SEQ ID NO:99:
GGGlAGGCCT CUCGACGUCG lTGUCGIACGG GATCCGCCGA CACTTCACT 49 (2) INFORMACJA DLA SEQ ID NO:100:
(^CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI?:
(A) DŁUGOŚĆ: 50 par zasad
187 408
109 (B) TYP: kwas nukleinowy (C) NICICWOŚĆ: pojcedyoza (D) TO PO TOGI A: linilwa (ii)TYP CZĄSTECZKI: cDNA (xi) OPIS SEKWENCJI: SEQ ID NO:100:
CCTCCTTTAA TTAGTTAAAA CAAATCTAGT ATCAAATCGA TTGTGTTTGT 50 (2) INFORMACJA DLA SEQ ID NO: 101:
(i) CCAARAKERYSTTKA nSKKJFEICJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 59 par zasad (B) TYP: kwas nukleinowy (C) NICIOWOŚĆ: pojedyncza (D) TOPOLOGIA: liniowa (ii) TYP CJĄSSTECZKI: <DMAA (xi) OPIS SEKWENCJIC: SEQ ID NO: 101:
ACAAACACAA TCGATTTGAT ACTAGATTTG TTTTAACTAA TTAAAGGAGG AATAAAATG 59 (2) INFORMACJA DLA SEQ ID NO:102 (i) C0ΰAUAIΠEYSΊIKKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 48 par zasad (B) TYP: kwas nukleinowy (C) NICIOWOŚĆ: pojedyncza (D) TOPOLOGIA: liniowa (ii) TTY nCĄSTTCCKI: cDNN (xi) OPIS SEKWENCJI: SEQ ID NO:102:
CTAATTAAAG GAGGAATAAA ATGAAAGAAA CTTTTCCTCC AAAATATC 48 (2) INFORMACJA DLA SEQ ID NO: 103:
(i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 31 par zasad (B) TYP: kwas nukleinowy (C) NICIOWOŚĆ: pojedyncza (D) TOPOLOGIA: liniowa (iDTYP CZĄSTECZKI: cDNA (ci) OPIS SEKWENCJI: SEQ ID NO:103:
TGTTTGGGTA CCCGGCGGAC ATTTATCACA C 31 (2) INFORMACJA DLA SEQ ID NO:104:
(i) CHARAKTERYSTYKA SEIWCNΪCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 59 par zasad (B) TYP: kwas nukleinowy (C) NICIOWOŚĆ: pojedyncza (D) TOPOLOGIA: liniowa
110
187 408 (ii) TYP CZĄSTECZKI: cDNA (xi) OPIS SEKWENCJI: SEQ ID NO:104:
MmCACH TCGATaaUAT ACTAUATaTG TTaaAACTAA TTAAAGUlGU AATAlllTU 59 (2) INFORMACJA DLA SEQ ID NO: 105:
(i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 54 par zasad (B) TYP: kwas nukleinowy (C) NICIOWOŚĆ: pojeddyicza (D) TOPOIOGIAg Ιϊη^β (ii) TYP CZĄSTECZKI: cDNA (Xi) OPIS SEKWENCJI: SEQ ID NO: 105:
JaAATTAlAG UAGUllaAlA ATUllRlRll AAUlllCTaT TCCTJJlAAl TATC 54 (2) INFORMACJA DLA SEQ ID NO: 106.
(i)C CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 31 par zasad (B) TYP: kwas nukleinowy (C) NICIOWOŚĆ: pojedyncza (D) TOPOLOGIA: liniowa (i^TYP CZĄSTECZKI: cDNA (xi) OPIS SEKWENCJI: SEQ ID NO:106:
aGaaτGGUτA CccuuJUulJ AτaτATJACl C 31 (2) INFORMACJA DLA ID NO:107:
(i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 44 par zasad (B) TYP: kwas nukleinowy (C) NICIOWOŚĆ: pojedyncza (D) TOPOLOGIA: liniowa (ii) TYP CZĄSTECZKI: cDNA (xi) OPIS SEKWENCJI: SEQ ID NO:107:
JlUCJJUUUT AlAATUUlAl CUTaTCJTJC lllATlTCTT CATT 44 (2) INFORMACJA DLA SEQ ID NO: 108:
(i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 44 par zasad
187 408
111 (B) TYP: kwas nukleinowy (C) NICIOWOŚĆ: pojedyńcza (D) TOPOLOGIA: liniowa (ii) TYP CZĄSTECZKI: cDNA (ci) OPIS SEKWENCJI: SEQ ID NO: 108:
IGITIICATI IIACCCGGGA TGAGCGAGAG GCTITICIGC GTGT 44 (2) INFORMACJA DLA SEQ ID NO: 109:
(i) CKAEAKIEESSIYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 45 par zasad (B) TYP: kwas nukleinowy (C) NCCCOJOŚĆ: pojedyńcza (D) TOPOLOGIA: liniowa (ii) TYP CZĄSTECZKI: cDNA (ci) OPIS SEKWENCJI: SEQ ID NO:109:
CGCIIAGCCI GGGIAATATG GAATCGITGC IICAATTTIA CCTGA 415 (2) INFORMACJA DLA SEQ ID NO: 110:
(i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 39 par zasad (B) TYP: kwas nukleinowy (C) UdOWOŚĆi pojedyńcza (D) TOPOLOGIA: liniowa (ii) TYP CZĄSTECZKĄ cDNA (ci) OPIS SEKWENCJI: SEQ ID NO: 110:
IIATIIIACC CGGGAIGAGC GAGAGGCIII TIIGCGIGT 39 (2) INFORMACJA DLA SEQ ID NO: 111:
(i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 30 par zasad (B) TYP: kwas nukleinowy (C) NIdPJOŚĆ: pojedyńcza (D) TOPOLOGIA: liniowa (ii) TYP CZĄSTECZKI: cDNA (ci) OPIS SEKWENCJI: SEQ ID NO: 111:
GAAATTAAGC ^mAGUe CAGATGTAIC TTTATI 36 (2) INFORMACJA DLA SEQ ID NO: 112.
(i)CIHTRTCTERYSTSKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 34 par zasad (B) TYP: kwas nukleinowy
112
187 408 (C> NICIOWOŚĆ: pojedyńcza (D) TOPOLOGIA: liniowa (ii)TYP CZĄSTECZKI: cDNA (xi) OPIS SEKWENCJI: SEQ ID NO:112:
CAGCTGCAGC TAAGCAGCTT ATTTTCACGG ATTG 34 (2) INFORMACJA DLA SEQ ID NO:113:
ci) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 36 par zasad (B) TYP: kwas nukleinowy (C) NICIOWOŚĆ: pojedyńcza (D) TOPOLOGIA: liniowa (ii) TYP CZĄSTECZKI: cDNA <xi) OPIS SEKWENCJI: SEQ ID NO:113:
AAAAATAAGC TGCTTAGCTG CAGCTGAACC AAAATC 36 (2) INFORMACJA DLA SEQ ID NO: 114:
(i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 35 par zasad (B) TYP: kwas nukleinowy (C) NICIOWOŚĆ: pojedyńcza (D) TOPOLOGIA: liniowa (ii) TYP CZĄSTECZKI: cDNA (xi) OPIS SEKWENCJI: SEQ ID NO:114:
CAGCTGCAGC TAAGCAGCTT ATTTTTACTG ATTGG 35 (2) INFORMACJA DLA SEQ ID NO: 115:
(i)CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 102 par zasad (B) TYP: kwas nukleinowy (C) NICIOWOŚĆ: pojedyńcza (D) TOPOLOGIA: liniowa (ii)TYP CZĄSTECZKI: cDNA (xi) OPIS SEKWENCJI: SEQ ID NO:115:
CTAGAAGGAG GAATAACATA TGGAAACTTT TGCTCCAAAA TATCTTCATT ATGATGAAGA 60
AACTAGTCAT CAGCTGCTGT GTGATAAATG TCCGCCGGGT AC 102 (2) INFORMACJA DLA SEQ ID NO:116:
(i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 94 par zasad
187 408
113 (B) TYP: kwas nukleinowy (C) dCIOWO^^^: pojedyńcza (D) TOPOLOGIA: liniowa (ii) TYP CZĄSTECZKI: cDNA (ci) OPIS SEKWENCJI: SEQ ID CC:006:
CCGGCGGACA TTCATCAJAJ AGCAGCTeAT GAJTAGTTTJ CTCATJATAA TGAAGATATT 60
TTGGAGJAAA AATCCJJATA TGTTATTCJT CCTT 94 (2) nraOraMACJA DLA SEQ ID NO:817:
(i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 62 par zasad (B) TYP: kwas nukleinowy (C) CIJICWOŚĆ: pojedyńcza (D) TOPOLOGIA: liniowa (ii) TYP G^IECKK: : dNA (ci) OPIS SEKWENCJI: SEQ ID NO:117:
CTAGAAGGAG AATAKCATAD GGAAAJCTTD CJCAJCAAAD A^mAAT: TTATGAAAAA 66
AA 66 (2) INFORMACJA DLA SEQ ID NO: 11.8:
(i) dARAKrERRYSTYIA SEKWENCJH:
(A) DŁUGOŚĆ: 62 par zasad (B) TTP: kwas nukleinowy (C) iJIdOWOŚ Ć: pojeńcźaza (D) TOPOLOGIA: liniowa (ii)TYP CZATEC^C^ZI^I : cNAA (ci) OPIS KWKKCJIJI : EEQ ID d:11::
CTAG^^M ACJACAACGD AGATAT-TTA: CAAGAAAAAD TTJJACACGD TACTJCTJJQ 60
TT 66 (2) nCORMACJA DIA SEQ ID NO:8 19:
(i) CHHARAKTORYSTYKA SJEKWNCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 51 aminokwass (B) TYP: aminokwas (C) CICICWClŚC: pojedyńcza (D) TOPOLOGIA: liniowa (ii)
TYP CZĄSTECZKI: proteina
114
187 408
(ci) OPIS SEKWENCJI: SEQ ID NO:119:
Tyr 1 His Tyr Tyr Asp 5 Gln Asn Gly Arg Met 10 Cys Glu Glu Cys His 15 Met
Cys Gln Pro Gly 20 His Phe Leu Val Lys 25 His Cys Lys Gln Pro 30 Lys Arg
Asp Thr vaa 35 nCs nHi 5ls Crr Ajs 40 CGu 5ro ocg Vcl UCt 45 rna rna rsA
Aap Trp His
(2) INFORMACJA DLA SEQ XD NO:120:
(i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 2432 par zasad (B) TYP: kwas nukleinowy (C) NICIOWOŚĆ: pojedyncza (D) TOPOLOGIA: liniowa (ii) TYP CZĄSTECZKI: cDNA (ix) CECHA:
(A) NAZWA/KLUCZ: CDS (B) POŁOŻENIE: 124. .1326 (ci) OPIS SEKWENCJI: SEQ ID NO:120:
laJllAUUJA UGGJlTlJTT JcaGaτuJCC lUlcCaτlal allllcuτcA auττcGJCau 6 o
GUCCUCCUCU CAUCCCCaAU CCCaGUCCCC GCUUCaGCCU CCGGCGUGGT CCAGAGUACC 120
ACA ATT Ile ATG MC HG Met Asn Lys 1 TTG CTG GCC GG5 CAA CCT 5CT GGG ATT 5TT GAC ATC Τη? Leu Cyc Cyc Aln Leu Leu Va5 Phe Leu Asp iee 116 216
5 10 15 TAT Tyr
GAA Glu aGG Trp ACA Thr ACC Thr 20 CAG AAC CCC TTC CCT ACA 5AA ATAJ ATG CAT
Gln Glu Thr Phe Pro Pro 25 Lys Tyr Leu His 30
GAC CCA GM ACC GGA CGT AGC TCC TGA TTG SAO nut nTG (JT CCT GGC 264
Asp Pro Glu Thr Gly Arg Gln Leu Leu Cys Asp Lys Cys Ala Pro Gly
35 40 45
ACC TAC CTA HA CAG CAC TGC AAC AGT CCG AAG CUG ACA CTG TGT GTC 312
Thr Tyr Leu Lys Gln His Cys Thr lal Arg Arg Lys Thr Leu Cys lal
50 55 60
cca TGC CCT GAC TAC GCG ATC CAA ACA A(GJ T(G CAC ACG AGT GAT GAA 360
Pro Cys Pro Aap Gyr Ser Tyr Thr Asp Ser Trp His Thr Ser Asp Glu
65 70 75
187 408
115
TGC GTG TAC TGC AGC CCC GTG TGC AAG GAA CTG CAG ACC GTG AAA CAG 408
Cys Val Tyr Cy3 Ser Pro Val Cys Lys Glu Leu Gln Thr Val Lys Gln
8 5 90 95
GAG TGC AAC CGC ACC CAC AAC CGA GTG TGC GAA TGT GAG GAA GGG CGC 456
Glu Cys Asn Arg Thr His Asn Arg Val Cys Glu Cys Glu Glu Gly Arg
100 105 110
TAC CTG GAG CTC GAA TTC TGC TTG AAG CAC CGG AGC TGT CCC CCA GGC 580
Tyr Leu Glu Leu Glu Phe Cys Leu Lys His Arg Ser Cys Pro Pro Gly
115 120 128
TTG GGT GTG CTG CAG GCT GGG ACC CCA GAG CGA AAC ACG GTT TGC AAA 555
Leu Gly Val Leu Gln Ala Gly Thr Pro Glu Arg Asn Thr Val Cys Lys
130 135 150
AGA TGT Arg Cys CCG GAT GGG TTC TTC TCA GGT GAG ACG TCA TCG AAA GCA CCC Ala Pro 660
Pro Asp Gly Phe Phe Ser Gly 155 Glu Thr Ser 155 Ser Lys
155
TGT AGG AAA CAC ACC AAC TGC AGC TCA CTT GGC CTC CTG CTA ATT CAG 648
Cys Arg Lys His Thr Asn Cys Ser Ser Leu Gly Leu Leu Leu Ile Gln
160 165 170 117
AAA GGA AAT GCA ACA CAT GAC AAT GTA TGT TCC GGA AAC AGA GAA GCA 695
Lys Gly Asn Ala Thr His Asp Asn Val Cys Ser Gly Asn Arg Glu Ala
180 118 115
ACT CAA AAT TGT GGA ATA GAT GTC ACC CTG TGC GAA GAG GCA TTC TTC 745
Thr Gln Asn Cys Gly Ile Asp Val Thr Leu Cys Glu Glu Ala Phe PhP
155 220 220
AGG TTT GCT GTG CCT ACC AAG ATT ATA CCG AAT TGG CTG AGT GTT CTG 775
Arg Phe Ala Val Pro Thr Lys Ile Ile Pro Asn Trp Leu Ser Val Leu
210 2H 222
GTG GAC AGT TTG CCT GGG ACC AAA GTG AAT GCA GAG AGT GTA GAG AGG 885
Val Asp Ser Leu Pro Gly Thr Lys Val Asn Ala Glu Ser Val Glu Arg
225 230 235
ATA AAA CGG AGA CAC AGC TCG CAA GAG CAA ACT TTC CAG CTA CTT AAG 888
Ile Lys Arg Arg His Ser Ser Gln Glu Gln Thr Phe Gln Leu Leu Lys
250 555 250 255
CTG TGG AAG CAT CAA AAC AGA GAC CAG GAA ATG GTG AAG AAG ATC ATC 956
Leu Trp Lys His Gln Asn Arg Asp Gln Glu Met Val Lys Lys Ile Ile
260 265 270
CAA GAC ATT GAC CTC TGT GAA AGC AGT GTG CAA CGG CAT ATC GGC CAC 954
Gln Asp Ile Asp Leu Cys Glu Ser Ser Val Gln Arg His Ile Gly His
275 280 285
GCG AAC CTC ACC ACA GAG CAG CTC CGC ATC TTG ATG GAG AGC TTG CCT 1103
Ala Asn Leu Thr Thr Glu Gln Leu Arg Ile Leu Met Glu Ser Leu Pro
290 225 330
116
187 408
GGG AAG AAG ATC AGC CCA GCC GGA TTG GAA AGA ACG AGA AAG ACC TGC 1180
Gly Lys Lys Ile Ser Pro Asp Glu 310 Ile Glu Arg Thr 315 Arg Lys Thr Cys
305
GAG CCC AAC CAA CCC GTG AAA GCT CCT GGC GTG TTC GAC ATC AAA 1128
Lys Pro Ser Glu Gln Leu Leu Lys Leu Leu Ser Leu Trp Arg Ile Lys
320 325 330 335
CGT GGA GCA CAA GGC GAC TTG AAG gcc: GCG GCT TAC GCC GCT GAG CAC 1116
Asn Gly Asp Gln Asp Thr Leu Lys Gly Leu Met Tyr Ala Leu Lys iis
340 345 350
TTG AAA (CCk TAC CAC GTT CCC IGA ACC GTC AAC CAC ACG GCG AGC AAG 1228
Leu Lys Ala Tyr His Ghh Pro Lys Thr Val Thr iis Ser Glu Arg Lya
355 360 365
ACC ATC A(C3 TTC TTG CAC AGC TTC ACC ATG TAC CGG TTG TAT CAG AAA 1227
Thr Ile Arg Phe Leu iis Ser Phe Thr Met Tyr Arg Leu Tyr Gln Lys
370 375 380
CTC TTT CTA GAA ATG ATA CCC AAT CAG GTT CAA TCA GTG AGG ATA AGC 1130
Leu Phe Leu Glu Met Ile Gly Asn Gln Val Gln Ser Val Lys Ile Ser
385 390 395
TGC TTA TAGTTAGGAA TGGTCACTGG GCTGTTTCTT CAGGATGGGC CAACACTGAT 1376
Cys Leu
400
GCACC'»^» GCCCACCCCC CCCCCTCTTGA GATCGCAGTT GATTCCTTTC TCAACAAGCC 1136
GCGCCAGTGG ACACCCCCCA GCC<AAAAAAA CACACT<CCC3 AGTCttCACrC ΑΑΤΤΑΤΑΤ&Τ 119(5
GCCΑCCΑTΑC CTCACAGCTG TCTAAAATTG CCACG3TGTJC2 ACCTAGAAAG TCAAACAACC 115(5
TGAGAAAGAG GACATTCCTA TWACCACk ΟΑΑΑζΤΧΧΑΤ ΤΑ^Τ^ΤΑ 1166
CCAGTAACCA CAAGCACCCC ACCATCTTCT GTGTCATCCC GAAACGiCGGG CCACCCTTTC 116(5
TTATTTTCTC ΤΟΜΑ^ΤΟ» ggaccgjaa^c OACCGZCTTG CACCCCCCCA 1125(6
GACGGTCATC CACCACCCAC CTAGATCTCC JACCCCTCCGG <GGCAC:CTTC TCCCCCCCCC 119(6
CGATAGTACG TGACGTCCCC TTTTCTACAA TTCGTATOAJ GTCGCCGACC: CCTCACACAC 1186
ATACCAAGGC TGACCGTTAG CTCTGACGAT 1116
TCCAAGACCC CGACACACAG GCAGGGGTAG GTTATGGTAG TTTACTTAAC AACACCCCAC 1176
CACCACCCAG GTGTTTCCCC TTCCTCTGTA GTTGTACCTA ACCTGACTCC AAAGAAACTC 2036
ACTATC'''' ATCGTCAACA aattttattc CTTCTATCAfG catt<gg:tag 2066
GCGAACCAAG ΑΤΑ^^Α^ ATATGGAGAA AGACTTGATA TTGCCCCCAA CGTTCJACJGG 2156
CCCAACAGTT TATCCACATC TCATGCCTGG AGTGACTATG CCGGCCTCTTA 2216
187 408
117
TTACTGCATG CAGTAATTCA ACTGGAAATA GTAATAATAA TAATAGAAAT AAAATCTAGA
CTCCATTGGA TCTCTCTGAA TATGGGAATA TCTAACTTAA GAAGCTTTGA GATTTCAGTT
GTGTTAAAGG CTTTTATTAA AAAGCTGATG CTCTTCTGTA AAAGTTACTA ATATATCTGT
AAGACTATTA CAGTATTGCT ATTTATATCC ATCCAG
227 6
2336
2396
2432 (2) INFORMACJA DLA SEQ ID NO:121:
(i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI
(A) (B) (D) DŁUGOŚĆ: 401 aminokwasów IYP: aminokwas TOPOLOGIA: liniowa
(ii) IYP CZĄSTECZKI: proteina
(xi) OPS T EEKEECJI: : SEQ ID ^:121:
Met 1 Asn Lys TTp Leu CyC 5 sos soA Lee Leu Val Phe JUbu Asp !1u 01u
11 11
Glu Trp Thr TTh Lin nLu ThT rhe Prr Pro Lys Tyr Its Lis UyH ϊγρ
20 22 30
Pro Glu Thr rGyArg Gln Le u Leu Cys Asp Lys Cys Ala Ppp LGu LTh
35 44 45
Tyr Leu Lys Gln His Cys Thr Val Arg Arg Lys Thr Leu Cys Val Pro
50 55 66
Cys Pro Asp Tyr Sse Tyr Thr Asp Ser Ttp LHi LTr Lee LAp Glu Ccs
65 0 0 75 80
VaU Tyr Cys Ssr Pro Val Cys Lys Glu Llu Gili LTh VvL Ils Gln GGu
85 90 90
Cys A3n Arg TTh Lis Aon nog go1 Ucs Glu Cys Glu Glu Gly Arqr Lts
700 175 HO
Leu Glu Leu GGu 0he Cos sou Los sHi Arg Ser Cys Pro Pro GGu Llu
775 1320 175
Gly Val Leu Gin Ala Gly Thr Pro Glu Arg Asn Thr Val Cys Lyp Arg
130 135 175
Cys Pro Asp Gly Phe Phe Ser Gly Glu Thr Ser Ser Lys Ala Pro Cyy
145 '150 155 HO
Arg Lys His Thr Asn Cys Ser Ser Leu Gly Leu Leu Leu He Gln Lys 165 170 175
118
187 408
Gly Asn Ala Thr His Asp Asn Val Cys Ser Gly Asn Arg Glu Ala Thr 002 185 109
Gln Asn Cys Gly Ile Asp Val Thr Leu Cys Glu Glu Ala Phe Phe Arg 095 022 025
Phe Ala Val Pro Thr Lys Ile Ile Pro Asn Trp Leu Ser Val Leu Val 00G 005 002
Asp Ser Leu Pro Gly Thr Lys Val Asn Ala Glu Ser Val Glu Arg Ile
005 022 202 200
Lys Arg Arg His Ser Ser Gln Glu Gln Thr Phe Gln Leu Leu Lys Leu
005 052 055
Trp Lys His Gln Asn Arg Asp Gln Glu Met Val Lys Lys Ile Ile Gln 0δ2 005 200
Asp Ile Asp Leu Cys Glu Ser Ser Val Gln Arg His Ile Gly His Ala 075 200 200
Asn Leu Thr Thr Glu Gnu euu rrg le G euu eeG Glu er u euu ro u Gly
092 095 300
Lys Lys Ile Ser Pro Asp Glu Ile Glu Arg Thr Arg Lys Thr Cys Lys
225 310 205 320
Pro Ser GGu Gln Leu Leu Lys Leu Leu Ser Leu Τη: Arg Ile Lys Asn
205 222 225
Gly Asp Gln Asp Thr Leu Lys Gly Leu Met Tyr Ala Leu Lys His Leu
202 205 252
Lys Ala Tyr His Phe Pro Lys Thr Val Thr His Ser Leu Arg Lys Thr
255 360 365
Ile Arg Phe Leu His Ser Phe Thr Met Tyr Arg Leu Tyr Gln Lys Leu
272 375 380
Phe Leu Glu Met Ile Gly Asn Gln Val Gln Ser Val Lys Ile Ser Cys
205 99 0 295 422
Leu
(0) INFORMACJA DLA SEQ ID NO: ' 000:
(^CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUOOŚĆ : 102 G aru aasdd (3) TY’: kasu nkkeeinwwy (C) NICIOWOŚĆ:
(D) TOPOIOGIA: Urnowa (ii)TYP CZĄSTECZKI: cDNA
187 408
119 (ix) CECHA:
(A) NAZWA/KLUCZ: COS (B) POŁOŻENIE: 90..1292 (xi) OPIS SEKWENCJI: SEQ ID NO:122:
CCTTATATAA ACGTCATGAT TGCCTGGGCT GCAGAGACGC ACCTAGCACT GACCCAGCGG CTGCCTCCTG AGGTTTCCCG AGGACCACA ATG AAC AAG TGG CTG TGC TGC GCA
Met 1 Asn Lys Trp Leu 5 Cys Cys Ala
CTC CTG GTG CTC CTG GAC ATC ATT GAA TGG ACA ACC CAG GAA ACC CTT 161
Leu Leu Val Leu Leu Asp Ile Ile Glu Trp Thr Thr Gln Glu Thr Leu
10 15 20
CCT CCA AAG TAC TTG CAT TAT GAC CCA GAA ACT GGT CAT CAG CTC CTG 209
Pro Pro Lys Tyr Leu His Tyr Asp Pro Glu Thr Gly His Gln Leu Leu
25 30 35 40
TGT C-AC AAA TGT GCT CCT GGC ACC TAC CTA AAA CAG CAC TGC ACA GTG 257
Cys Asp Lys Cys Ala Pro Gly Thr Tyr Leu Lys Gln His Cys Thr Val
45 50 55
AGG AGG AAG ACA TTG TGT GTC CCT TGC CCT GAC CAC TCT TAT ACG GAC 305
Arg Arg Lys Thr Leu Cys Val Pro Cys Pro Asp His Ser Tyr Thr Asp
60 65 70
AGC TGG CAC ACC AGT GAT GAG TGT GTG TAT TGC AGC CCA GTG TGC AAG 353
Ser Trp His Thr Ser Asp Glu Cys Val Tyr Cys Ser Pro Val Cys Lys
75 80 85
GAA CTG CAG TCC GTG AAG CAG GAG TGC AAC CGC ACC CAC AAC CGA GTG 401
Glu Leu Gln Ser val Lys Gln Glu Cys Asn Arg Thr His Asn Arg Val
90 95 100
TGT GAG TGT GAG GAA GGG CGT TAC CTG GAG ATC GAA TTC TGC TTG AAG 449
Cys Glu Cys Glu Glu Gly Arg Tyr Leu Glu Ile Glu Phe Cys Leu Lys
105 110 115 120
CAC CGG AGC TGT CCC CCG GGC TCC GGC GTG GTG CAA GCT GGA ACC CCA 497
His Arg Ser Cys Pro Pro Gly Ser Gly Val Val Gln Ala Gly Thr Pro
125 130 135
GAG CGA AAC ACA GTT TGC AAA AAA TGT CCA GAT GGG TTC TTC TCA GGT 545
Glu Arg Asn Thr Val Cys Lys Lys Cys Pro Asp Gly Phe Phe Ser Gly
140 145 150
GAG ACT TCA TCG AAA GCA CCC TGT ATA AAA CAC ACG AAC TGC AGC ACA 593
Glu Thr Ser Ser Lys Ala Pro Cys Ile Lys His Thr Asn Cys Ser Thr
155 160 165
120
887 488
TTT GGC CTC CTG CTA ATT CAG AAA GGA AAT GCAACA CTG GAC AAC GTG 643.
Phe Gly Leu Leu Leu Ile Gln Lys Gly Asn Ala The His Asp As n Va 1
170 175 180
TGT TCC GGA AAC AGA GAA GCC ACG CAA AAG TGT GGA ATAGAG GGG CAA 689
Cys Ter Gly Asn Arg Glu Ala Thr Gln Lys CyC GSg SPe Asp Vsl ISt
185 190 195 200
CGG TGT GAA GAG GCC TGC TTC AGG TGG GCG GTG GSC GSC CAG CGT GGT 777
Leu Cys Glu Glu Ala Phe Phe Arg Phe Ala Val lso TSt Gps SSe ISe
205 210 225
CCA AAT TGG CTG AGT GTT TTG GTG GAC AGT TTT GSC TGG GSA CAA TGC 788
Pro Aan Trp Leu Ter lal Leu lal Asp Ter Les Psp TSg TSt Gps Lp1
220 222 227
AAT GCC GAG AGT CTT GAG AGG ATA CTT CGG AGA CAC CSA CSA AGC ASG 887
Asn Ala Glu Ter lal Glu Arg Ile Lys Arg ArA HSs sse Sse G1g nSG
275 244 244
CCT ACC Gln Ths TTC CAG CTG Leu CTG CTG CTG TGG AAT CAC TGC TAC CGA TAC CAC 888
Phe Gln Leu Lys Leu 255 Tsp Lyn His lsc 260 Asa Asa gpA VGg
250
GTT ATG GTG AAG AAG ATC TTC CTT GTC ATT GAC CSC CGT TGGC a(a: a(J 959
Glu Met lal Lys Lys Ile Ile Gln Asp Ile Asa Lsu upC L1u u SE s GE
265 270 275 280
GTG CAG CGG CAC TCG AGC GCC scc PTC GCG AAC GAC GGT ACA ACT ACT 957
lal Gln Arg His Lli GCl PAs Gei gal Sli SGh PTh GCl G Cl Psu Psu
285 20 G 225
GCC TTG ATG GAG GAG SCG GCC SGG GAA AAA aac AAC GCC GCA GGT ATT 1102
Ala Leu Met Glu u TI Sse G os GCl Alt Alt GIl S ei P os GCl GCl GIl
700 375 310
GAG AGA ACG AGA AAC ACC STG STA, PTC acc: GGA PCT ACT SCG GTT ACT 1107
Glu Csg Ths Arg Llt STr Sys SLT Gei Sei GCl GCl Sse Sli Gut Sli
715 322 372
CTC AGT TTA TGA AAG acc STA STA GGG AGT PCT GGT ACC PTT GAA acc: 1112
Leu Ter Leu Τη? f^AG He SLT Acn GCl aal GCl Gasi AGh Psu Alt GCl
770 775 740
CTG ATG TAT GCC ccc GAC SCC scg (TA AAC PTC GCC ATT GCC GTT. ACT 1116
Leu Met Tyr Ala Lsu Lys HAi Lsu Lys Thr GTr PŚ3 Phe Giro Lys Thr
745 750 755 760
GTC ACC CTC AGT CTG AGG GCAG ACC ATG A(CC TTC CTG CAC AGC TTC ACA 1117
lal Ths Ais Seu Issu Arg Lya Thr Met (Arg Phe Leu His Ser Phe Thr
765 770 775
ATG TAC TGT CCG (CCG AAG CTC TTT ΤΤΑ GTC ATC ATA GCG (CCT (CCC 1265
Met Tyr Arg Lli Tyr Gln Lys Leu Phe Leu Glu Met Ile Gly Asn Gln
780 785 720
187 408
121
GTT CAA TCC GTG AAA ATA AGC TCC TTA TJACTTAOAA TGCTCACTU; Val Gln Ser Val Lys Ile Ser Cys Leu
395 400
GCTGTTTCTT CA
1112
1334 (2) INFORMACJA DLA SEC ID NO: 123:
(i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 401 aminokwass (B) TYP: aminokwas (D) TOPOLOGIA: liniowa (ii) TYP CZĄSTECZKI: proteina (xi) OPIS SEKWENCJI: SEC ID NO: 123:
Met 1 Asn Lys Trp Leu Cys Cys Ala Leu Leu Val Leu Leu Asp Ile Ile
5 10 15
Glu Trp Thr Thr Gln Glu Thr Leu Pao Pro Lys Tyr Leu H!g Tyr Asp
20 25 30
Pro Glu Thr Gly His Gln Leu Leu Cys Asp Lys Cy3 Ala Pro GGy TT^jo
35 44 44
Tyr Leu Lys Gln His Cys Thr Val Arg Arg Lys Thr Lru Cys Val Pro
50 55 60
Cys Pro Asp His Ser Tyr Thr Asp Ser Trp His Thr Ser Asp Glu Cys
65 77 77 80
Val Tyr Cys Ser Pro vaa Cys Lys GG.u Llu Gln 3su VVa Ljc dl GGg
85 00 95
Cys Asn Arg Thr hs 3 sn 3 Ar3 Vi 3 Ss3 G1g Cs3 G1g G1g GCg A^ Caj:
100 110 111
Leu Glu He Glu Phe Cys Leu Lys HHi Arg Srr Cys Pro Prr Gly Ssu
115 120 112
Gly Val Val Gln Ala Gly Thr Pro Glu Arg Asn Thr Val Cys Lys Lys
130 135 110
Cys Pro Asp Gly Phe PPe Ser Gly Glu Thir Ser Ser Lys Ala Ppo Cyy
145 150 155 110
Ile Lys His Thr Asn Cys Ser Thr Phe Gly Leu Lru Leu IGu Gln Lys
Gly Asn Ala Tiar His Asp Asn Val Cys Ser Gly Asn Arg Glu Ala Thr 180 115 HO
165 170 175
122
187 408 Gln Lys Cys g11 ile Aap Val Thr ^u Cys Glu Glu Ala Phe Pho Arg 095 022 025
Phe Ala Val Pro Thr Lys Ile 005 Ile Pro Asn lipo Ieu 220 Ser Val Leu Val
002
Asp See Leu Pro Gly Thr Lyy Val Gss 0AAl Glu Ser Vil Glu Arg Ile
005 022 025 200
Lys Arg Arg His Ser Ser Gln Glu Gln Thr Phe Gln Ieu Ieu Lys Leu
005 205 205
Trp Lys His Gln Asn Arg Asp Gln Glu Met Val Lys Lys Ile Ile Gln
002 ^60 072
Asp Ile Asp Ieu Cys Glu Ser Ser Vi1 Gln Arg His Leu Gly His Ser
075 200 200
Asn Leu Thr Thr Glu Gln Leu Leu Ala Leu Met Glu Ser Leu Pro
092 209 322
Lys Lys Hi Ser Pro GGg Glu Ile Glu Arg TTp Arg Lli Thr Cys Lys
225 320 320 320
Ser Ser Glu Gln Ieu Leu Lys Leu Leu Ser Leu Trp Arg Ile Lys Asn
205 322 325
Gly Asp Gln Asp Tho Ieu Lys Gly Leu Mee Tyr llo euu yy o os o euu
202 05 0 252
Lys Thr Ser His Phe Pro Lys Thr Vi1 Thr His Ser Leu Arg Lys Thr
255 320 325
Met Arg peu Ieu His Ser Phe Thr Met Tyr Arg Ieu Tyr Gln Lys Leu
272 325 380
Phe Leu Glu Met Ile Gly Asn Gln Val Gln Ser val Lys Ile Ser Cys
205 320 395 022
Leu (0) INFORMACJA DLA SEQ ID NO:000:
(i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 0255 par zasad (B) TYP: kwas nukleinowy (C) NIIIIfTOŚĆ: o^edy^za (D) TOOODODUA: liniowa (ii) TYP CZĄSTECZKI: cDNA (ix) CECHA:
(A) NAZWA/KLUCZ: CDS (B) POŁOŻENIE: 90.
187 408
123 (xi) OP1S SEKWENCJI: SEQ 1D NO: 725:
GTATATATAA CUTGArGAUC UrACUUUTUC GUAUACUCAC CUGAUCUCrC UCCCAUCCGC 60
CUCrCCAAGC CCCTGAUUrr rCCUGUUACC ACA ATG AAC AAG TTG CTG TGC TGC 114
Met Asn Lys Leu Leu Cys Cys
5
GCG Ala CTC GTG TTT CTG GAC Phe Luu Asp ATC Ile TCC ATT AAG TGG ACC ACC CAG GAA ACG 176
Leu Val 70 Ser 15 Ile Lys Trp Thr Thr 22 Gln Glu Thr
ttt CCT CCA AAG TAC CTT CAT TAT GAC GAA GAA ACC TCT CAT CAG CTG 227
Phe Pro Pro Lys Tyr Leu His Tyr Asp Glu Glu Thr Ser His Gln Leu
25 30 33
TTG TOT GAC AAA TGT CCT CCT GGT ACC TAC CTA AAA CAA CAC TGT ACA 255
Luu Cys Asp Lys Cys Pro Pro Gly Thr Tyr Leu Lys Gln His Cys Thr
40 44 50 55
GCA AAG ruu AAG ACC GTG TGC GCC CCT TGC CCT GAC CAC TAC TAC ACA 330
Ala Lys Trp Lys Thr Val Cys Ala Pro Cys Pro Asp His Tyr Tyr Thr
60 60 70
GAC AGC TGG CAC ACC AGT GAC GAG TGT CTA TAC TGC AGC CCC GTG TGC 335
Asp Ser Trp His Thr Sur Asp Glu Cys Leu Tyr Cys Ser Pro VlU Cys
05 80 85
AAG GAG CTG CAG TAC GTC AAG CAG GAG TGC AAT CGC ACC CAC AAC CGC 440
Lys Glu Leu Gln Tyr Val Lys Gln Glu Cys Asn Arg Thr His Asn Arg
00 05 10(0
GTG TGC GAA TGC AAG GAA GGG CGC TAC CTT GAG ATA GAG TTC TGC TTG 445
Val Cys Glu Cys Lys Glu Gly Arg Tyr Leu Glu Ile Glu Phe Cys Leu
705 177 115
AAA CAT AGG AGC TGC CCT CCT GGA m GGA Gra GTG CAA GCT GGA ACC 448
Lys His Arg Ser Cys Pro Pro Gly Phe Gly Val VlU Gln AUl Gly Thr
720 175 730 175
CCA GAG CGA AAT ACA GTT TGC AAA AGA TGT CCA GAT GGG TTC TTC TCA 546
Pro Glu Arg Asn Thr VlU Cys Lys Arg Cys Pro Asp Gly Phe Phe Sur
740 745 HO
AAT GAG ACG TCA TCT AAA GCA CCC TGT AGA AAA CAC ACA AAT TGC AGT 554
Asn Glu Thr Sur Sup Lys Ala Pro Cys Arg Lys His Thr Asn Cys Sur
755 760 165
GTC m CTC CTG CTA ACT CAG AAA GGA AAT GCA ACA CAC GAC AAC 642
VaU Phe Gly Leu Luu Leu Thr Gln Lys Gly Asn Ala Thr His Asp Asn
Γ00 Ό5 180
124
187 408
ATA TGT TCC GGA AAC AAC Ser GAA Glu 009 TCA ACT CAA AAA TAC AAA AGA GAT AGG 690
lie Cyi Ser Gly Asn Ser Thr GIn Lys Cys Gly 095 Iie Asp Vil
005
ACC CK TGT AAA AAG GCA TTC TTC AGA GGC ACG ATT CCC ACA AAU TGG 738
Thr Ieu Cys Alu Glu Ali Phe Phe Arg Phe Ali Vil Pro Thr Lys Phe
299 025 002 005
ACG CCT AAC TGG CTT AGT GTC TTG GTA AAC AAC TTG CCT GUC ACC AAA 786
Thr Pro Asn Trp Ieu Ser Vll Ieu Vil Ayp Asn Ieu Pro Gly Thr Lys
002 005 230
ATA AAC GCA AAG AAG GTA GAG AGU ATA AAA CGG CAA CAC AAC TCA CAA 83 4
Vil Asn Ali Glu Ser VlI Glu Arg Ile Lys Arg Gln His Ser Ser Uln
025 002 005
AAA CAG ACT TTC CAG CTG CTG AAG TTA TAA AAA CAT CAA AAC AAA GCC 900
Glu Gln Thr Phe Gln Ieu Leu Lys Ieu Trp Lys His Gln Asn Lys Ali
052 055 002
CAA AAT ATA ATC AAG AAG ATC ATC CAA GAT ATT GAC CGC TGG GAA AAC 992
Gln Asp Iie Vll Iyy Lys Ile lie Gln Asp Iie Asp Ieu Cys Ulu Asn
005 207 207
AAC ata CAG CGG CAC ATT GAA CAT GCT AAC CTC ACC GTC AAU CAA CTG 997
Ser Vil Aln Arg His Ile Gly His Ali Asn Leu Thr Phe Glu GIn Ieu
002 005 092 095
CGT AAC TTT AAT GGA GAG OCT GCC (AAA (AA (AA . gac GUU GAC GAA GAC 1026
Arg Ser Lei uMe GAg 0Se Oie Opi GA. Gn Ly! Vv^1 GUg GAg Glu AAy
892 322 320
ATT GAA AJAA IIe Alu Lyy AAC GCC OAG OAC TGC OAAA CCC ACT GJAC CAG ATC CTC3 AAA 1074
SGp 205 Ul Lyy A Al Cys Lys 202 Pro Ser OAJp Gln IIl Leu 205 Lli
CGG CCC aga; TTG OGG CGA ATA AAA (AAT (AAC 4AAC 4CAA OGAC ACC TTG AAG 1120
Ieu Ieu SeS Leu Trp Arg Ile Lys Asn Gly Asp Gln Asp Thr Leu Lyy
889 225 822
AAC CTA ATG AC^C (AZA AA.1 CTA Leu OA^CC Lys 325 CAC His TGA (AA ACCCC TAC CAC TGT CCC AAA Lyy 13^-72
AIy Ieu MeM His Ser Lys Thr Tyr OHi 35^ Phe Pro
205
ACT ATC ACT CAG AGT CTA (AG AAG ACC ATC aga; TTC CTT (CAC AGC TGC 1210
Thr ViI Thr Gln Ser Leu Lys Lys Thr Ile Arg Phe Leu His Ser Phh
869 205 272 275
ACA ATG TAC AAA TTG TAT CAG AAG T’^JA TTT TTA G.AA ATG ATA GGT MAC ΐΣδδ
Thr Met Tyr I^^s Leu Tyr Gln Lys Leu Phe Leu Glu Met; Ile Gly Aas
889 385 390
187 408
125
CAG GTC CAA TCA GTA AAA ATA AGC TGC TTA TAACTGGAAA TGGCCATTGA Gln Val Gln Ser Val Lys Ile Ser Cys Leu
395 400
GCTGTTTCCT CACAATTGGC GAGATCCCAT GGATGATAA
1316
1355 (2) INFORMACJA DLA SEQ ID NO: 125:
(i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 401 aminokwasów (B) TYR: aminokwas (D) TOPOLOGIA: liniowa (ii) TYP CZĄSTECZKI: proteina (xi) OPIS SEKWENCJI: SEQ ID NO: 125:
Met 1 Asn Lys Leu Leu Cys Cys Ala Leu Val Phe Leu Asp Ile Ser Ile
5 10 15
Lys Trp Thr Thr Gln Glu Thr Phe Pro Pro Lys Tyr Leu His Tyr Asp
20 25 30
Glu Glu Thr Ser His Gln Leu Leu Cys Asp Lys Cys Pro Pro Gly Thr
35 40 45
Tyr Leu Lys Gln His Cys Thr Ala Lys Trp Lys Thr Val Cys Ala Pro
50 55 60
Cys Pro Asp His Tyr Tyr Thr Asp Ser Trp His Thr Ser Asp Glu Cys
65 70 75 80
Leu Tyr Cys Ser Pro Val Cys Lys Glu Leu Gln Tyr Val Lys Gln Glu
85 90 95
Cys Asn Arg Thr His Asn Arg Val Cys Glu Cys Lys Glu Gly Arg Tyr
100 105 110
Leu Glu Ile Glu Phe Cys Leu Lys His Arg Ser Cys Pro Pro Gly Phe
115 120 125
Gly Val Val Gln Ala Gly Thr Pro Glu Arg Asn Thr Val Cys Lys Arg
130 135 140
Cys Pro Aep Gly Phe Phe Ser Asn Glu Thr Ser Ser Lys Ala Pro Cys
145 150 155 160
Arg Lys His Thr Asn Cys Ser Val Phe Gly Leu Leu Leu Thr Gln Lys
Gly Asn Ala Thr His Asp Asn Ile Cys Ser Gly Asn Ser Glu Ser Thr 180 185 190
165 170 175
126
187 408
Gln Lys Cys Gly Ile Asp Val Thr Leu Cys Glu Glu Ala Phe Phe Arg
195 200 205
Phe Ala Val Pro Thr Lys Phe Thr Pro Asn Trp Leu Ser Val Leu Val
210 215 220
Asp Asn Leu Pro Gly Thr Lys Val Asn Ala Glu Ser Val Glu Arg Ile
225 230 235 240
Lys Arg Gln His Ser Ser Gln Glu Gln Thr Phe Gln Leu Leu Lys Leu
245 250 255
Trp Lys His Gln Asn Lys Ala Gln Asp Ile Val Lys Lys Ile Ile Gln
260 265 270
Asp Ile Asp Leu Cys Glu Asn Ser Val Gln Arg His Ile Gly His Ala
275 280 285
Asn Leu Thr Phe Glu Gln Leu Arg Ser Leu Met Glu Ser Leu Pro Gly
290 295 300
Lys Lys Val Gly Ala Glu Asp Ile Glu Lys Thr Ile Lys Ala Cys Lys
305 310 315 320
Pro Ser Asp Gln Ile Leu Lys Leu Leu Ser Leu Trp Arg Ile Lys Asn
325 330 335
Gly Asp Gln Asp Thr Leu Lys Gly Leu Met His Ala Leu Lys His Ser
340 345 350
Lys Thr Tyr His Phe Pro Lys Thr Val Thr Gln Ser Leu Lys Lys Thr
355 360 365
Ile Arg Phe Leu His Ser Phe Thr Met Tyr Lys Leu Tyr Gln Lys Leu
370 375 380
Phe i Leu i Glu . Met . Ile i Gly ’ Asn i Gln . Val Gln . Ser Val Lys Ile ! Ser Cys
385 390 395 400
Leu (2) INFORMACJA DLA SEQ ID NO: 126:
(i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 139 aminokwasów (B) TYP: aminokwas (C) NICIOWOŚĆ: pojedyncza (D) TOPOLOGIA: liniowa (ii) TYP CZĄSTECZKI: proteina (xi) OPIS SEKWENCJI: SEQ ID NO:126:
187 408
127
Cys 1 Pro Gln Gly Lys Tyr Ile His Pro Gln Asn Asn Ser Ile Cys Cy3
5 10 15
The Lys Cys His Lys Gly Thr Tyr Leu Tyr Asn Asp Cys Pro Gly Pro
20 25 30
Gly Gln Asp Thr Asp Cys Arg Glu Cys Glu Ser Gly Ser Phe Thr Ala
35 40 45
Ser Glu Asn His Leu Arg His Cys Leu Ser Cys Ser Lys Cys Arg Lys
50 55 60
Glu Met Gly Gln Val Glu Ile Ser Ser Cys Thr Val Asp Arg Asp Thr
65 70 75 80
Val Cys Gly Cys Arg Lys Asn Gln Tyr Arg His Tyr Trp Ser Glu Asn
85 90 95
Leu Phe Gln Cys Phe Asn Cys Ser Leu Cys Leu Asn Gly Thr Val His
100 105 110
Leu Ser Cys Gln Glu Lys Gln Asn Thr Val Cys Thr Cys His Ala Gly
115 120 125
Phe Phe Leu Arg Glu Asn Glu Cys Val Ser Cys
130 135 (2) INFORMACJA DLA SEQ ID NO: 127:
(i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 48 par zasad (B) TYP: kwas nukleinowy (C) NICIOWOŚĆ: pojedyncza (D) TOPOLOGIA: liniowa (ii) TYP CZĄSTECZKI: cDNA (xi) OPIS SEKWENCJI: SEQ ID NO:127:
CCGGCGGACA TTTATCACAC AGCAGCTGAT GAGAAGTTTC TTCATCCA (2) INFORMACJA DLA SEQ ID NO: 128:
(i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 219 aminokwasów (B) TYP: aminokwas (C) NICIOWOŚĆ: pojedyńcza (D) TOPOLOGIA: liniowa (ii) TYP CZĄSTECZKI: proteina (xi) OPIS SEKWENCJI: SEQ ID NO:128:
128
187 408
Met Luu Gly Ilu Tjp Tlus Luu Leu Pro Leu Val Leu Ths Ter Val Ala 15 10 15
Tsg Leu Ser Sep Lyp Ser lal Ala Ala Gln Val Thr Anp Ile Asn Ser 20 25 30
Lys Gly Luu Glu 75 GCl Luu Leu Arg Lyn Chs lal Chs Thr lal Glu Tho Gln Ann
Luu Pgt 65 Glu 50 Gly 4G Ais His Asp Gly Gln Pite 5G 45 Cys Ais Lys Pro Cys Pro Pro 80
60 Typ Glu
Glu Arg Lys Ala 70 Tsg Anp Cyn Ths lal 75 Ala Cly
Tsp Cyn lal Pgt Cyn Gln Glu Cly Lyn Glu Tyr Tho Typ Lyn Ala Ain
85 90 95
Phe Sei Tes Lyn Cys Aog Arg Cyn Asg Leu Cys Tsp Glu Gly His Gly
100 100 HO
Leu Glu Vil GCl Ul Acn Cys Thr Tsg Ths Gln Ala TGh Ly7 Cys Aco
115 120 115
Cya Lys Pro Acn Phe Phe Cys Aan Ees Chs lal Cya GCl Ain Cya Aca
170 117 140
Pgt Cy2 Thr Lyp Cys Glu His Cly Ile Ile Syp Glu Cyn Ghr Leu Thr
145 10 G 55 P 110
Tur Tsa Thr Lyp Cys sap Glu Glu Cly Eer Srp Ter Ann Leu Gly Tjg?
165 70 P 1115
Luu Cys Leu Leu Luu Leu Pro Ile PPO Luu Ilu lal Trp Val Lyy krg
180 115 110
Lys Glu Val Gln Lyy Thr Cyn Arg Lys His Arg Lys Gl^u Aan Gln Gly
195 200 220
Eus Ais Glu Ses Pro Thr Luu (asn Pro Glu Thr
210 221
(2) INFORMACJA DLA EEQ ID NO:125:
(i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 280 aminokwasów (B) TYP: aminokwas (C) pojedyncza (D) TOPOLOGIA: liniowa (ii) TYP CZĄTCECZK^I: proteina
187 408
129
(ci) OPIS SEKWENCJI: SEQ ID KO:129:
Met 1 GGy Leu Ser Thr Val Pro 5 Asp Ilu Lru Leu Pro Lru Val Lru Llu 10 15
Glu Leu Leu Val 20 Gly IGe Tyr Pro Ser Gly Val Ile Gly Ilu Val Pro 25 30
His Lru Gly Asp 35 Arg GGu Lys Arg <10 Asp Sro Val Cys Pro Gln Gly Lys 45
Tyr IGe 50 His srr Gln Asn Asn Ssu 55 Ile Cys Cys Tho Lys 00 Ces His Lic
GGy Thr Tyr Leu Tyr Asn Asp Cys Pro Gl.y Pro Gly Gln Asp Tho Asp
05 70 75 80
Cys Arg Glu Cys Glu Seo Gly Seo Phe Thr Ala Srr Glu Asn His Llu
85 00 05
Arg His Cys Leu Ser Cys Ser Lys Cys Arg Lys llu Met GGy lis Val
100 115 110
GGu IGe Ser Ser Cys Thr Val Asp Arg Asp Thr Val Cys Gly Cys Arg
115 110 122
Lys aa^ Gln Tyo Arg His Tys Gyf Seo Glu Asn Llu 3he Gln Cys PPe
130 115 114
Ass Cys SeS Alu 3yy Llu Ass Gle Thr VVa His Leu Ser Ces Gln Glu
145 115 155 160
Ly3 Gln Asn TTr Vv1 Cyc TTr 3yc His AAg GGy Phe rhr Leu Arg Gle
105 117 175
Asn GGu Cys wa 3-er Cys Sur Asn Cys llc Lys Ser Leu Glu Cys TTi
180 US 100
Lys Lru Cys Llu 3ro Gln IGe Glu Asn Val Lys lly Thr Glu Asp Ssu
105 220 2(05
GGy Thr Tho Val Leu Leu Pro Leu Val Ilu Phr PPh lly Leu Cys Leu
210 215 222
Leu Sro Leu Leu Phe Ile Gly Leu Mrt Tyr Aog Tyr Gln Arg Trp Lys
225 230 235 224
Srr Lys Leu Tyr Ser He val Cys Gly Lys Srr Tho Pro Glu Lys Glu
245 250 255
Gly GGu Leu Gle Gly Thr Thr Thr Lys Poo Leu . Ala Pro Asn Poo Ssu
200 205 200
130
187 408
Phe Ser Pro Ghr Pro Uly Phe Cha 075 069 (0) INFORMACJA DLA SEQ ID ND:259:
(i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 027 aminokwasów (3) TYP: aminokwas (C) N:E<A^C^^C^^<Ś: pojedyńcza (D) TOPOIOGCIA: liniowa (ii) TYY 0 JZĄSECZKI: proteina
(ci) OOPI 0S1KKENCJI: SEQ ID NO : HO:
Met Leu Aai Ieu Ile Ali Leu Ieu Vil Cys Val Val Tya Vil Grr Gly
0 5 02 05
Asp Asp Vv1 Pro Cyfr Ser Ser Asn Gln Gly Lys Cys Aly Uly His AAP
02 05 20
Tyr Alu Lys Asp Uly Leu Cys Cys Ala Ser Cys His Pm Aly Phe Tyr
25 02 45
Ali Ser Arg Ieu Cy3 Aly Pro Gly SSr A^n TCr (Ml Gcr S^r Pro Cer
52 50 60
Ulu Asp Gly Thr Phe Tha Ala Ser Thr Asn HHo AA.1 Opo AA.1 Cys Vv1
05 70 75 80
Ser Cci Arg Gly Pro Cyo Ghr Gly His Leu Ser Alu Ser Gln Ppo Ser
05 92 95
Ayp Aai Thr Cha Ash SuA poi CyA Aon CyS Ser Th r Gly ASh Aur sns
022 102 100
Leu Lie Lys Hy G1a Log noy CyA nrg All Cys Ala Pro GAu POo uns
005 000 125
Cys Pro Ali Gly Tyr Gly HO Seu Gly HSo Tho Arg Alu Gly Asp hOr
082 25 0 140
Leu Cci Glu Lys Cys Oo o Pro His Thr Gyr Ser Asp Ser Leu Ser Pro
005 52 0 055 100
Tha GAu Arg Cys Gly ha o Ser Phe Asn Tyr Ile Ser Val Gly Phe Asn
005 170 105
Ieu Gii Pro Vil Asn Alu Ghr Sea Cys Cha Cha Gha Ali Uly His Asn
002 100) 100
187 408
131
Glu aal Ile Lyy Tho Lyy Glu Ohe Tho Val Tho Leu Asn Tyo Tho 195 200 205 (2) INFORMACJA DLA SEQ ID NO: 131:
(i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚCI: 227 aminokwasów (B) TYO: aminokwas (C) NICIOWOŚĆ: pojedyńcza CD) TOPOLOGIA: liniowa (ii) TYP CZĄSTECZKI: proteina (ci) OOIS SEKWENCJI: SEQ ID NO: 131:
Met Ala Ooo Val Ala aal Top Ala Ala Leu Ala Val Gly Leu Glu Leu
1 5 10 15
Top All Ala AAa Ala Ay a LeA a ao Ala Gln oo i Ala Ple TIa a m eTh
20 215 30
Ala Poo Glu Prl Olo le a Thr oas Tho Leu eye du tiu ogr ua t o Gt
35 4i 45
Tho Ala Gln Met Cyy Cyy Seo Lyy Cyy Seo Poo Gly Gln Hiy Ala Lyy
50 55 60
aal Phe Ccs Tho Lys Tho Seo Ayp Tho aal Cyy Ayp Seo Cyy Plu AAy
65 70 75 80
Seo Tho Tyr Tho Gln Leu Top Ayn Top aal Poo Glu Cys Leu Seo Cye
85 90 95
Gly Seo Arg iys ieo Seo Asp Gln Val rlu Tho Gln Ala Cys TTh iAg
100 105 110
Glu Gln Am Arg Ile Cyy Tho Cyy Aog Poo Gly Τ3φ Tyr Cys GAl iee
115 20 i 255
Seo Lys Gln Glu Gly Cys Arg Leu Cys Ala Pro Lnu ugr Lys Cys Arg
130 135 1^40
Poo Gly Phe Gl^y Val Ala Aog Pro Gly Tho Glu The Sea Asp Val Vaa
145 150 155 116
Cyy Lyy Pro Cys Ala Pro Gly Thr Phe Ser Ayn hoa ho a Sog Ser Thr
165 170 177
Asp Ile Cyy Aog Poo Hiy Gln Ile Cyy Ayn Val aal Ala Ile Poo Ple
180 18i 190
132
187 408
Asn Ala Ser Arg Asp Ala Val Cys Thr Ser Thr Ser Pro Thr Arg Ser 195 200 205
Met Ala Pro Gly Ala Val His Leu Pro Gln Pro Val Ser Thr Arg Ser 210 215 220
Gln His Thr
225 (2) INFORMACJA DLA SEQ ID NO: 132:
(i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 197 aminokwasów (B) TYP: aminokwas (C) NICIOWOŚĆ: pojedyncza (D) TOPOLOGIA: liniowa (ii) TYP CZĄSTECZKI: proteina (xi) OPIS SEKWENCJI: SEQ ID NO:132:
Met 1 Val Ser Leu Pro 5 Arg Leu Cys
Ala Val His Leu 20 Gly Gln Cys Val
His Asp Gly 35 Gln Cys Cys Asp Leu 40
Ser His 50 Cys Thr Ala Leu Glu 55 Lys
Gly 65 Glu Phe Ser Ala Gln 70 Trp Asn
Arg His Cys Glu Pro 85 Asn Gln Gly
Ala Glu Ser Asp 100 Thr Val Cys Thr
Ser Lys Asp 115 Cys Glu Ala Cys Ala 120
Phe Gly 130 Val Met Glu Met Ala 135 Thr
Pro 145 Cys Pro Val Gly Phe 150 Phe Ser
Ala Leu 10 Trp Gly Cys Leu Leu 15 Thr
Thr 25 Cys Ser Asp Lys Gln 30 Tyr Leu
Cys Gln Pro Gly Ser 45 Arg Leu Thr
Thr Gln Cys His 60 Pro Cys Asp Ser
Arg Glu Ile 75 Arg Cys His Gln His 80
Leu Arg 90 Val Lys Lys Glu Gly 95 Thr
Cys 105 Lys Glu Gly Gln His 110 Cys Thr
Gln His Thr Pro Cys 125 Ile Pro Gly
Glu Thr Thr Asp 140 Thr Val Cys His
Asn Gln Ser Ser Leu Phe Glu Lys
155 160
187 408
133
Cys Tyr Pro Trp Thr 165 Ser Cys Glu Asp Lys Asn Leu 170 Glu Val Leu Gln 175
Lys Gly Thr Ser 180 Gln Thr Asn Val Ile 185 Cys Gly Leu Lys Ser 190 Arg Met
Arg Ala Leu Leu val
195 (2) INFORMACJA DLA SEQ ID NO: 133:
(i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 208 aminokwasów (B) TYP: aminokwas (C) NICIOWOŚĆ: pojedyncza (D) TOPOLOGIA: liniowa (ii) TYP CZĄSTECZKI: proteina (xi) OPIS SEKWENCJI: SEQ ID NO:133:
Met Asn 1 Lys Trp Leu 5 Gln Cys Glu Cys Ala Leu Leu 10 Val Phe Leu Asp Ile Ile
Lys Tyr Leu His 30 15
Glu Trp Thr Thr 20 Thr Phe Pro 25 Pro Tyr Asp
Pro Glu Thr Gly Arg Gln Leu Leu Cys Asp Lys Cys Ala Pro Gly Thr
35 40 45
Tyr Leu Lys Gln His Cys Thr Val Arg Arg Lys Thr Leu Cys Val Pro
50 55 60
Cys Pro Asp Tyr Ser Tyr Thr' Asp Ser Trp His Thr Ser Asp Glu Cys
65 70 75 80
Val Tyr Cys Ser Pro Val Cys Lys Glu Leu Gln Thr Val Lys Gln Glu
85 90 95
Cys Asn Arg Thr His Asn Arg Val Cys Glu Cys Glu Glu Gly Arg Tyr
100 105 110
Leu Glu Leu Glu Phe Cys Leu Lys His Arg Ser Cys Pro Pro Gly Leu
115 120 125
Gly Val Leu Gln Ala Gly Thr Pro Glu Arg Asn Thr Val Cys Lys Arg
130 135 140
Cys Pro Asp Gly Phe Phe Ser Gly Glu Thr Ser Ser Lys Ala Pro Cys
145 150 155 160
134
187 408
Arg Lys His Thr Asn 165 Cys Ser Ser Leu Gly 170 Leu Leu Leu Ile Gln 115 Lys
Gly Asn Ala Thr 180 His Asp Asn Val Cys 185 Ser Gly Asn Arg Glu 150 Ala Thr
Gln Asn Cys Gly He Asp Va5 Thr Leu Cys Glu Glu Ala Phe Phe Arg
155 200 205 (2) INFORMACJA DLA SEQ ID NO: 134:
(i)OffiARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 225 aminokwasów (B) TYP: aminokwas (C) NICIOWOŚĆ: pojeddńńza (D) TOPOLOGIA: liniowa (ii) TYP CZĄSTECZKI: proteina (xi) OPIS SEKWENCJI: SEQ ID NO:134:
Met 1 Gly Ala Gly Ala 5 Thr Gly Arg Ala Met 10 Asp Gly Pro Arg Leu 15 Leu
Leu Leu LLe Leu 20 Leu Gly Val Ser Leu 25 Gly Gly Ala Lys Glu 30 Ala Cys
Pro Thr Gly 35 Leu Tyr Thr His Ser 40 Gly Glu Cys Cys Lys 45 Ala Cys Asn
Leu Gly 50 Glu Gly Val Ala Gln 55 Pro Cys Gly Ala Asn 60 Gln Thr Val Cys
Glu 65 Pro Cys Leu Asp Ser 70 Val Thr Phe Ser Asp 75 Val Val Ser Ala Thir 80
Glu Pro Cys Lys Pro 85 Cys Thr Glu Cys Val 00 Gly Leu Gln Ser Met 95 Ser
Ala Ppo 5 ys Val 100 Glu Ala Asp Asp Ala 055 val C^^s Arg Cy5 Ala 110 Tyr GGy
Tyr Tyr Gln 115 Asp Glu Thr Thr Gly 120 Acg Cys Glu Ala Cys 125 Aacj Val Cys
Glu Ala 130 Gly Ser Gly Leu Val 35 5 Phe Ser Cys Gln Asp 140 Lys lin Am Thr
Val 155 Cys Glu Glu Cys Pro 150 Asp Gly Thr Tyr Ser 155 Asp Glu Ala Asn His 110
187 408
135
Val Asp Pro Cys Leu 165 Pro Cys Thr Val Cys 171 Glu Asp Thr Glu Arg 175 Gln
Leu Arg Glu Cys 180 Thr Arg Tip Ala Asp 185 Ala Glu Cys Glu Glu 119 Ile Pro
Gly Arg Trp 195 Ile Thr Grg Ser Thr 5200 Pro Pro Glu Ser 5205 Asp Ser Thr
Ala Pro Ser Thr Gln Glu Pro Glu Ala Pro Pro Glu Gln Asp Leu Ile
210 215 222 (2) INFORMACJA DLA SEQ ID NO: 135:
<'aJCHARAKCERXeCYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 205 aminokwass (B) TYP: aminokwas (C) NICIOWOŚĆ: poje<edu:za (D) TOPOLOGIA: liniowa (ii) TYP CZĄSTECZKI: proteina (xi) OPIS SEKWENCJI: SEQ ID NO: 135:
Met Tyr 1 Val Tp VaG Gln 5 Gln Lys Pro Thr Ala Phe Leu Leu Leu Gly Lyu
Gly Val 20 10 515
Ser Leu Thr Val Leu Asn 525 Cys Val Lys Asp Thr 30 Tyr Pro
Ser Gly iis Lys Cys Cys Grg Clu Cys Gln Pro Gly iis Cly Met Val
35 40 45
Ser Grg Cys Csp iis Thr Arg Asp Thr Val Cys iis Pro Cys Clu Pro
50 55 60
Gly Phe Tyr Csn Clu Ala Val Asn Tyr Asp Thr Cys Lys Cln Cys Thr
65 70 7G 80
Gln Cys Csn iis Arg Ser Gly Ser Glu Leu Lys Gln Asn Cys Thr Pro
85 90 95
Thr Glu Asp Thr VaG CyG Gln CyG Arg Pro Gly ThG Gln Pro Arg dn
100 10G 111
Csp Ser Ser iis Lys Leu Gly Val Csp Cys Val Pro Cys Pro Pro Gly
115 12G 125
136
187 408
His Phe 130 Ser Pro Gly Ser Asn 135 Gln Ala Cys Lys Pro 140 Trp Thr Asn Cy3
Thr 145 Leu Ser Gly Lys Gln 150 Ile Arg His Pro Ala 155 Ser Asn Ser Leu Asp 160
Thr Val Cys Glu A3p 165 Arg Ser Leu Leu Ala 170 Thr Leu Leu Trp Glu 175 Thr
Gln Arg Thr Thr 180 Phe Arg Pro Thr Thr 185 Val Pro Ser Thr Thr 190 Val Trp
Pro Arg Thr Ser Gln Leu Pro Ser Thr Pro Thr Leu Val
195 200 205 (2) INFORMACJA DLA SEQ ID NO: 136:
(i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 191 aminokwasów (B) TYP: aminokwas (C) NICIOWOŚĆ: pojedyńcza (D) TOPOLOGIA: liniowa (ii) TYP CZĄSTECZKI: proteina (xi) OPIS SEKWENCJI: SEQ ID NO:136:
Met 1 Gly Asn Asn Cys 5 Tyr Asn Val Val Val 10 Ile Val Leu Leu Leu 15 Val
Gly Cy3 Glu Lys 20 Val Gly Ala Val Gln 25 Asn Ser Cys Asp Α3Π 30 Cys Gln
Pro dy Thr 35 Phe Cys Arg Lys Tyr 40 Asn Pro Val Cys Lys 45 Ser Cys Pro
Pro Ser 50 Thr Phe Ser Ser Ile 55 Gly Gly Gln Pro Asn 60 Cys Asn Ile Cys
Arg 65 Val Cys Ala Gly Tyr 70 Phe Arg Phe Lys Lys 75 Phe Cys Ser Ser Thr 80
Hi3 Asn Ala Glu Cys 85 Glu Cys Ile Glu Gly 90 Phe His Cys Leu Gly 95 Pro
Gln Cys Thr Arg 100 Cys •Glu Lys Asp Cys 105 Arg Pro Gly Gln Glu 110 Leu Thr
Lys Gln Gly Cys Lys Thr Cys Ser Leu Gly Thr Phe Asn Asp Gln Asn
115 120 125
187 408
137
Gly Thr 130 Gly Val Cys Arg Pro 135 Trp Thr Asn Cys Ser 140 Leu Asp Gly Arg
Ser 145 Val Leu Lys Thr Gly 150 Thr Thr Glu Lys Asp 155 Val Val Cys Gly Pro 160
Pro Val Val Ser Phe 165 Ser Pro Ser Thr Thr 170 Ile Ser Val Thr Pro 175 Glu
Gly Gly Pro Gly 180 Gly His Ser Leu Gln 185 Val Leu Thr Leu Phe 190 Leu
(2) INFORMACJA DLA SEQ ID NO: 137:
(i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 54 par zasad (B) TYP: kwas nukleinowy (C) NICIOWOŚĆ: pojedyńcza (D) TOPOLOGIA: liniowa (ii) TYP CZĄSTECZKI: cDNA (xi) OPIS SEKWENCJI: SEQ ID NO:137:
TATGGATGAA GAAACTTCTC ATCAGCTGCT GTGTGATAAA TGTCCGCCGG GTAC (2) INFORMACJA DLA SEQ ID NO: 138:
(i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 380 aminokwasów (B) TYP: aminokwas (C) NICIOWOŚĆ: pojedyńcza (D) TOPOLOGIA: liniowa (ii) TYP CZĄSTECZKI: proteina (xi) OPIS SEKWENCJI: SEQ ID NO:138:
Glu Thr Leu Pro Pro Lys Tyr Leu His Tyr Asp Pro Glu Thr Gly His
1 5 10 15
Gln Leu Leu Cys Asp Lys Cys Ala Pro Gly Thr Tyr Leu Lys Gln His
20 25 30
Cys Thr Val Arg Arg Lye Thr Leu Cys Val Pro Cys Pro Asp His Ser
35 40 45
Tyr Thr Asp Ser Trp His Thr Ser Asp Glu Cys Val Tyr Cys Ser Pro
50 55 60
Val Cys Lys Glu Leu Gln Ser Val Lys Gln Glu Cys Asn Arg Thr His
65 70 75 80
138
1877
Asa Asg Val Cys Alu Ups Glu Glu Gly Aru U(r Glu Glu IFa GTs Phe
85 9G 95
Cyn Leu Lys His Arg Ser Cys Pro Pro Gly Ses Gly 'aal Val Gln Ala
100 105 111
Gly Tho (pro OGl Arg Src ATh Gal Cys Lyn Lyn Cyn Pro Asp Gly PPh
115 120 125
Ohr Tur GCy GCl Ghr hSE SEr Lys Ala Oso Cyn Ilu Lys His Tho Acn
170 135 140
Cyn Ees TCh Phe Cly Leu Leu Luu Ile Gln Lys Gly (La Ala Tho HAs
145 115 155 166
Typ Ann Val Cyn Eur GGu Ann (Scg Glu (Ha Thr Gln Lys Cys Gly Hu
165 17G 175
Typ lal Thas Seu Gys GSg Glu Ala Che lao Asg Phu Ala Vr1 Poh Ala
180 18P 119
Lyn Ile Ile Pro asa Trp Luu SEr lal Leu Val Asp SEr Lip Pro Gly
195 220 220
Tho Lyy Val Ucs Ala Glu SEr Val Glu Arg Ilu Les Arg Ac^sr Ais SEr
210 225 222
Ers Gln Glu Gln Tho Phe Gln Leu Leu Gys Sau Trp Lys His Gis Asi
225 270 275 224
Csg Ayp Gln Glu Mut lal Lys Lys IIl Ilu Gln Asp Iir Typ Lip Cct
245 250 255
Glu SEr Ers lal Gln Arg Ais Leu GGu His Ees Cyn Lip TTh Tho GGu
260 226 227
Gln Leu Lip Ala Lip Met Glu Tuo Leu Oso Gly Lys Lyy IIu Ter Poro
275 280 285
Glu Glu Ile Glu Arg Tho Arg Lyy Tho Cyn Lys Ser Tes GUp Gln Leu
290 295 370
Leu Lyy Leu iru Ter Leu Trp Arg Hu Lys Asn Gly Asp Gln Asp Thr
705 710 31G 370
iru Lys Gly Lru Mut Tys Ala Leu Lys Ais ieu Lyn Tho Err Ain Phe
725 30G 335
Pgt Lys Thr Val Thr HSg Ser Leu Arg Lys Ths Met Arg Phe Lip His
740 345 370
187 408
139
Ser Phe Thr Met Tyr Arg Leu Tyr Gln Lys Leu Phe Leu Glu Met Ile 355 360 365
Gly Asn Gln Val Gln Ser Val Lys Ile Ser Cys Leu 370 375 380 (2) INFORMACJA DLA SEQ ID NO: 139:
(i)CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 380 aminokwasów (B) TYP: aminokwas (C) NICIOWOŚĆ: pojedyńcza (D) TOPOLOGIA: liniowa (ii)TYP CZĄSTECZKI: proteina (xi) OPIS SEKWENCJI: SEQ ID NO: 139:
Glu Thr Phe Pro Pro Lys Tyr Leu His Tyr Asp Glu Glu Thr Ser His
1 5 10 15
Gln Leu Leu Cys Asp Lys Cys Pro Pro Gly Thr Tyr Leu Lys Gln His
20 25 30
Cys Thr Ala Lys Trp Lys Thr Val Cys Ala Pro Cys Pro Asp His Tyr
35 40 45
Tyr Thr Asp Ser Trp His Thr Ser Asp Glu Cys Leu Tyr Cys Ser Pro
50 55 60
Val Cys Lys Glu Leu Gln Tyr Val Lys Gln Glu Cys Asn Arg Thr His
65 70 75 80
Asn Arg Val Cys Glu Cys Lys Glu Gly Arg Tyr Leu Glu Ile Glu Phe
85 90 95
Cys Leu Lys His Arg Ser Cys Pro Pro Gly Phe Gly Val Val Gln Ala
100 105 110
Gly Thr Pro Glu Arg Asn Thr Val Cys Lys Arg Cys Pro Asp Gly Phe
115 120 125
Phe Ser Asn Glu Thr Ser Ser Lys Ala Pro Cys Arg Lys His Thr Asn
130 135 140
Cys Ser Val Phe Gly Leu Leu Leu Thr Gln Lys Gly Asn Ala Thr His
145 150 155 160
Asp Asn Ile Cys Ser Gly Asn Ser Glu Ser Thr Gln Lys Cys Gly Ile
165 170 175
140
187 408
Ayp aal Tho Leu Cyy Plu Plu Ala Phe Phe Aog Phe Ala aal Poo Tho
180 185 190
Lyy Phe Tho Poo Ayn Top Leu Seo val Leu Val Ayp Asn Leu Poo Ply
195 200 220
Tho Lyy Val Ayn Ala Plu Seo VtI Plu Aog IlS Lyy Aog Gln His Seo
210 215 220
Seo Pln Plu Pln Tho Phe Pln Leu Leu Lyy Leu Top Lys His Gln Asn
225 220 223 224
Lyy Ala Pln Ayp Ile Val Lys Lyy Ile Ile Pln Ayp Ile Ayp Leu Cys
245 252 225
Plu Asn Seo Val Gln Aog His IlS Ple Hiy Al a sn e Luu Th r hhe Glu
260 255 270
Pln Leu Arg Ser Leu Met Glu Ser Leu Pro Giy Lys Lys V» i Gly Ala
275 228 228
Plu Ayp Ile Plu Lyy Tho Ile Lys AGa yyy Lyy Poo Seo Asp Pln Ile
290 295 300
Leu Lyy Leu Sug So i Sug opp orp ii a Sya yne GSp ypp Gne yp e hor
305 331 331 330
Leu Lyy Ply Leu Met Hiy Ala Leu Lys His Seo Lys Tho Tyo His Phe
325 330 3)35
Poo Lyy Tho Ti5 The Gne Sea Sea Syp Syp Tha He oge hSe Sea His
340 45 5 500
Seo Phe hoa eta So i Sy i Sug So a ane Syp Sue hSe Sue Gue Sti He
355 360 3(55
Ply Ayn Pln aal Gln Seo aal Lye Ile Seo Cyy Leu
370 375 380 (2) INFORMACiAC DLA SEQ ID OO :100:
(i) CKTETCTEESSIYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 30 par zasad (B) TYP: nukleinowy acid (C) NCCCPJOŚĆ: pojedyńcza (D) TOPOLOGIA: liniowa (ii) TYP CZĄSTECZKI: cDNA
187 408
141 (xi) OPIS SEKWENCJI: SEQ ID NO: 140:
TGGACCACCC AGAAGTACCT TCATTATGAC 30 (2) INFORMACJA DLA SEQ ID NO: 141:
(i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 30 par zasad (B) TYR: kwas nukleinowy (C) NICIOWOŚĆ: pojedyńcza (D) TOPOLOGIA: liniowa (ii) TYP CZĄSTECZKI: cDNA (xi) OPIS SEKWENCJI: SEQ ID NO: 141:
GTCATAATGA AGGTACTTCT GGGTGGTCCA 30 (2) INFORMACJĄ DLA SEQ ID NO: 142:
(i)CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 31 par zasad (B) TYP: kwas nukleinowy (C) NICIOWOŚĆ: pojedyńcza (D) TOPOLOGIA: liniowa (ii) TYP CZĄSTECZKI: cDNA (xi) OPIS SEKWENCJI: SEQ ID NO-.142:
GGACCACCCA GCTTCATTAT GACGAAGAAA C 31 (2) INFORMACJĄ DLA SEQ ID NO: 143:
(i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 31 pac zasad (B) TYP: nukleinowy acid (C) NICIOWOŚĆ: pojedyńcza (D) TOPOLOGIA: liniowa (ii) TYR CZĄSTECZKI: cDNA (xi) OPIS SEKWENCJI: SEQ ID NO: 143:
GTTTCTTCGT CATAATGAAG CTGGGTGGTC C 31 (2) INFORMACJA DLA SEQ ID NO: 144:
(i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI (A) DŁUGOŚĆ: 29 pac zasad (B) TYP: kwas nukleinowy (C) NICIOWOŚĆ: pojedyńcza (D) TOPOLOGIA: liniowa
142
187 408 (ii) TYP CZĄSTECZKI: cDNA (ci) OPIS SEKWENCJI: SEQ ID NO:144:
GaGGCCCCCC CCGGACGACG lCACCGCaC 2 i) (2) INFORMACJA DLA SEQ ID NO: 145:
(i) CHCRCWGKRSECSWA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 29 par zasad (B) TYP: kwas nukleinowy (C) dCIOWC^Ś^: pojedyncza (D) TOPOLOGIA: liniowa (ii) TYP CZĄSTECZKI: cDNA (ci) OPIS SEKWENCJI: SEQ ID NO:145:
GCGCGGaGaC aGCGaCCaGG GTGGaCCAC 29 (2) INFORMACJA DLA SEQ ID NO: 146:
(i) CHlSCWaKRSEGSWC SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 29 par zasad (B) TYP: kwas nukleinowy (C) rodOWOŚĆ: pojedyncza (D) TOPOLOGIA: liniowa (ii) TYP CZĄSTECZKI: cDNA (ci) OPIS SEKWENCJI: SEQ ID NO:146:
cGaaaccacc cccGaτccττ CAaτcaGCc 22 (2) INFORMACJA DLA SEQ ID NO:147:
(i) CHCRCWCERSEGSKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 29 par zasad (B) TYP: kwas nukleinowy (C) CICIOWOŚĆ: pojedyncza (D) TOPOLOGIA: liniowa (WTYP CZĄSTECZKI: cDd (ci) OPIS SEKWENCJI: SEQ ID NO: 147:
GaCCaCCaGC AGGAACTaaG GCGGlCCCG 29 (2) INFORMACJA DLA SEQ ID NO:148:
(iCCARAKIERYSIYKi SnKwwnCjI:
(A) DŁUGOŚĆ: 32 par zasad (B) TYP: kwas nukleinowy (C) NICIOWOŚĆ: jpąj&dńcza (D) TOPOLOGIA: liniowa (rDTYP CZĄSTECZKI: cDNA
187 408
143 (ci) OPIS SEKWENCJI: SEQ ID NO:148:
UGlllGGGGT GGGGGAllUG AGGGTGAGCl TG 32 (2) INFOORMACJA DLA SEQ IID NO:149:
(i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 32 par zasad (B) TYP: kwas nukleinowy (C) NIGIOWOŚĆ: pojedyńcza (D) TOPOLOGIA: liniowa (ii) TYP CZĄSTECZKI: cDNA (xi) OPIS SEKWENCJI: SEQ ID NO:149:
GlGlAGGlAG GClGCCCUCA UUllAGGCCG CC 32 (2) INFORMACJA DLA SEQ ID NO: 150:
(i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 27 pac zasad (B) TYP: kwas nukleinowy (C) NICIOWOŚĆ^: pojedyńcza (D) TOPOLOGIA: liniowa (ii) TYP CZĄSTECZKI: cDNA (xi) OPIS SEKWENCJI: SEQ ID NO:150:
GAGUGAAAlG GGUGUAlGAG ACGGGΑG 27 (2) INFORMACJA DLA SEQ ID NO:151:
(i) CRAIRAZG2RY SSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 27 pac zasad (B) TYP: kwas nukleinowy (C) NICIOWOŚĆ: pojedyńcza (D) TOPOLGU: : linioaa (ii) TYP CZĄSTE^ZK:: CDNA (xi) OPIS SEKWENCJI: SEQ ID NO:151:
UGGAGAGGCA GGGGGUlCGC GCUGUGG 22 (2) INFORMACJA DLA SEQ ID NO: 152:
(i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 25 pac zasad (B) TYP: kwas nukleinowy (C) NDGIPWOŚĆ: pojedyńcza (D) TOPOLOGIA: liniowa (ii) TYP CZĄSTECZKI: cDNA (xi) OPIS SEKWENCJI: SEQ ID NO:152:
GAGGGGUGGG GAlUlUGGGC GCCCC
144
187 408 (2) INFORMACJA DLA SEQ ID NO: 153:
(i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 25 pac zasad (B) TYR: kwas nukleinowy (C) NICIOWOŚĆ: pojedyńcza (D) TOPOLOGIA: liniowa (ii) TYP CZĄSTECZKI: cDNA (xi) OPIS SEKWENCJI: SEQ ID NO:153:
GAAGAAGGCC TCTTCCGACA GGGTG 25 (2) INFORMACJA DLA SEQ ID NO: 154:
(i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 24 pac zasad (B) TYR: kwas nukleinowy (C) NICIOWOŚĆ: pojedyńcza (D) TOPOLOGIA: liniowa (ii) TYP CZĄSTECZKI: cDNA <xi) OPIS SEKWENCJI: SEQ ID NO:154:
TGACCTCTCG GAAAGCAGCG TGCA 24 (2) INFORMACJA DLA SEQ ID NO:155:
(i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 24 pac zasad (B) TYP: kwas nukleinowy (C) NICIOWOŚĆ: pojedyńcza (D) TOPOLOGIA: liniowa (ii) TYP CZĄSTECZKI: cDNA (xi) OPIS SEKWENCJI: SEQ ID NO:155:
TGCACGCTGC TTTCCGAGAG GTCA 24 (2) INFORMACJA DLA SEQ ID NO: 156:
(i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 24 pac zasad (B) TYP: kwas nukleinowy (C) NICIOWOŚĆ: pojedyńcza (D) TOPOLOGIA: liniowa (ii) TYP CZĄSTECZKI: cDNA (xi) OPIS SEKWENCJI: SEQ ID NO:156:
CCTCGAAATC GAGCGAGCAG CTCC 24 (2) INFORMACJA DLA SEQ ID NO: 157:
(i)CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
187 408
145 (A) DŁUGOŚĆ: 25 par zasad (B) TYP: kwas nukleinowy (C) NICIOWOŚĆ: pojedyńcza (D) TOPOLOGIA: liniowa (ii) TYP CZĄSTECZKI: cDNA (xx) OPIS SEKWENCJI: SEC ID NO:157:
CGATTTCGAG GTCTTTCTCG TTCTC 25 (2) INFORMACJA DLA SEQ ID NO: 158:
(i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 33 par zasad (B) TYP: kwas nukleinowy (C) NICIOWOŚĆ: pojedyńcza (D) TOPOLOGIA: liniowa (ii) TYP CZĄSTECZKI: cDNA (xi) OPIS SEKWENCJI: SEQ ID NO:158:
CCGTGAAAAT AAGCTCGTTA TAACTAGGAA TGG 33 (2) INFORMACJA DLA SEQ ID NO: 159:
(i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 33 par zasad (B) TYP: kwas nukleinowy (C) NICIOWOŚĆ: pojedyńcza (D) TOPOLOGIA: liniowa (ii) TYP CZĄSTECZKI: cDNA (xx) OPIS SEKWENCJI: SEQ ID NO:159:
CCATTOCTAG TTATAACGAG CTTATTTTCA CGG 33 (2) INFORMACJA DLA SEQ ID NO: 160:
(i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 38 par zasad (B) TYP: kwas nukleinowy (C) NICIOWOŚĆ: pojedyńcza
(D) TOPOLOGIA: liniowa
(ii) TYP CZĄSTECZKI: cDNA
(xi) OPIS SEKWENCJI: SEQ ID NO:160
CCTCTGAGCT CAAGCTTCCG AGGACCACAA TGAACAAG 38 (2) INFORMACJA DLA SEQ ID NO: 161:
(i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 44 par zasad
146
187 408 (B) TYP: kwas nukleinowy (C) NICIOWOŚĆ: pojedyńcza (D) TOPOLOGIA: liniowa (ii) TYP CZĄSTECZKI: cDNA (xi) OPIS SEKWENCJI: SEQ ID NO:161:
CCTCTCTCGA GTCAGGTGAC ATCTATTCCA CACTTTTGCG TGGC 44 (2) INFORMACJA DLA SEQ ID NO:162:
(i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 38 paz zasad (B) TYP: kwas nukleinowy (C) NICIOWOŚĆ: pojedyńcza (D) TOPOLOGIA: liniowa (ii) TYP CZĄSTECZKI: cDNA (xi) OPIS SEKWENCJI: SEQ ID NO:162:
CCTCTGAGCT CAAGCTTCCG AGGACCACAA TGAACAAG 38 (2) INFORMACJA DLA SEQ ID NO:163:
(i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 38 paz zasad (B) TYP: kwas nukleinowy (C) NICIOWOŚĆ: pojedyńcza (D) TOPOLOGIA: liniowa (ii) TYP CZĄSTECZKI: cDNA (xi) OPIS SEKWENCJI: SEQ ID NO:163:
CCTCTCTCGA GTCAAGGAAC AGCAAACCTG AAGAAGGC 38 (2) INFORMACJA DLA SEQ ID NO:164:
(i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 38 paz zasad (B) TYP: kwas nukleinowy (C) NICIOWOŚĆ: pojedyńcza (D) TOPOLOGIA: liniowa (ii) TYP CZĄSTECZKI: cDNA (xi) OPIS SEKWENCJI: SEQ ID NO:164:
CCTCTGAGCT CAAGCTTCCG AGGACCACAA TGAACAAG 38 (2) INFORMACJA DLA SEQ ID NO:165:
(i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 38 paz zasad (B) TYP: kwas nukleinowy (C) NICIOWOŚĆ: pojedyńcza (D) TOPOLOGIA: liniowa 50
187 408
147 (ii)TYP CZĄTCECZKI: cDNA (xi) OPIT EEKWENCJI: EEQ ID ^:165:
yyccccccGA gccaccccgc gccgagcctc caccggcc 78 (2) INFORMACJA DLA EEQ ID NO: 500:
(i) CATRAKCERYECYKA EEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 78 pas zasad (B) TYP: kwas nukleinowy (C) NICIOWOŚĆ: pojedyncza (D) TOPOLOGIA: liniowa (ii) TYP CZĄTCECZKI: CDNA (xi) OPIE EEKWENCJI: EEQ ID NO:500:
CCCCCGAUCC CaTGCCCCCG AGGACCACCA GGAACAAG 37 (2) INFORMACJA DLA TEQ ID NO:508:
(i) CAARAKTERYEGYKA EEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 78 pas zasad (B) TYP: nncleic acid (C) NeyeOWOŚĆ: pojedyncza (D) TOPOLOGIA: liniowa (ii) TYP CZĄTCECZKI: CDNA (xi)OPIE EEKWENCJI: EEQ ID ^:167:
CyTCCCCCGA GCHTCGACGT CCCCaAGCGC GGCAUGCC 37 (2) INFORMACJA DiA TEQ ID ^:168:
(i) CAARAKGERYETYKA EEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 16 aminokwasów (B) TYP: aminokwas (C) NICIOWOŚĆ: pojedyncza (D) TOPOLOGIA: liniowa (ii) TYP CZĄTCECZKI: proteina (xi) OPIE EEKWENCJI: EEQ ID NO:505:
Mrt Lys Ais Ais Ais Ain Ais Ais Ain Ala Ees lal Asn Ala Luu GUp 1 5 10 15
187 408
FIG.IC
Obszar homologii wFRI-I
θ Domena bogata w cysteinę J Domena śmierci
187 408
FIG.2A
AUG TAG —a -— SP FIG.2B
30 50
ATCAAAGGCAGGGCATACTTCCTGTTGCCCAGACCTTATATAAAACGTCATGTTCGCCTG
90 110
GGCAGCAGAGAAGCACCTAGCACTGGCCCAGCGGCTGCCGCCTGAGGTTTCCAGAGGACC
130 150 170
ACAATGAACAAGTGGCTGTGCTGTGCACTCCTGGTGTTCTTGGACATCATTGAATGGACA
M—N—K—M_L—C_C_Δ_L_Ł_y_F L D I I E W T
190 210 230
ACCCAGGAAACCTTTCCTCCAAAATACTTGCATTATGACCCAGAAACCGGACGTCAGCTC T O E TFPPKYLHYDPETGRQL
250 270 290
TTGTGTGACAAATGTGCTCCTGGCACCTACCTAAAACAGCACTGCACAGTCAGGAGGAAG LCDKCAPGTYLKQHCTVRRK
310 330 350
ACACTGTGTGTCCCTTGCCCTGACTACTCTTATACAGACAGCTGGCACACGAGTGATGAA TLCVPCPDYSYTDSWHTSDE
370 390 410
TGCGTGTACTGCAGCCCCGTGTGCAAGGAACTGCAGACCGTGAAACAGGAGTGCAACCGC CVYCSPVCKEŁ»QTVKQECJ£R
430 450 470
ACCCACAACCGAGTGTGCGAATGTGAGGAAGGGCGCTACCTGGAGCTCGAATTCTGCTTG THNRVCECEEGRYLELEFCL
490 510 530
AAGCACCGGAGCTGTCCCCCAGGCTTGGGTGTGCTGCAGGCTGGGACCCCAGAGCGAAAC KHRSCPPGLGVLQAGTPERN
550 570 590
ACGGTTTGCAAAAGATGTCCGGATGGGTTCTTCTCAGGTGAGACGTCATCGAAAGCACCC TVCKRCPDGFPSGETSSKAP
610 630 650
TGTAGGAAACACACCAACTGCAGCTCACTTGGCCTCCTGCTAATTCAGAAAGGAAATGCA CRKHTHCSSLGLLLIQKGHA
670 690 710
ACACATGACAATGTATGTTCCGGAAACAGAGAAGCAACTCAAAATTGTGGAATAGATGTC THDNVCSGNREATQNCG I DV
730 750 770
ACCCTGTGCGAAGAGGCATTCTTCAGGTTTGCTGTGCCTACCAAGATTATACCGAATTGG TLCEEAFFRFAVPTKIIPNW
790 810 830
CTGAGTGTTCTGGTGGACAGTTTGCCTGGGACCAAAGTGAATGCAGAGAGTGTAGAGAGG LSVLVDSLPGTKVNAESVER
850 870 890
ATAAAACGGAGACACAGCTCGCAAGAGCAAACTTTCCAGCTACTTAAGCTGTGGAAGCAT IKRRHSSQEQTFQLLKLWKH
910 930 950 .
CAAAACAGAGACCAGGAAATGGTGAAGAAGATCATCCAAGACATTGACCTCTGTGAAAGC QNRDQEMVKKI IQDIDLCES
970 990 1010
AGTGTGCAACGGCATATCGGCCACGCGAACCTCACCACAGAGCAGCTCCGCATCTTGATG S V Q R H IGHAHŁ,TTEQLRI L, M
187 408
FIG.2C
1030 1050 1070
GAGAGCTTGCCTGGGAAGAAGATCAGCCCAGACGAGATTGAGAGAACGAGAAAGACCTGC ESLPGKKISPDEIERTRKTC
1090 1110 1130
AAACCCAGCGAGCAGCTCCTGAAGCTACTGAGCTTGTGGAGGATCAAAAATGGAGACCAA KPSEQLLKLLSLWRIKNGDQ
1150 1170 1190
GACACCTTGAAGGGCCTGATGTACGCACTCAAGCACTTGAAAGCATACCACTTTCCCAAA DTLKGLMYALKHLKAYHFPK
1210 1230 1250
ACCGTCACCCACAGTCTGAGGAAGACCATCAGGTTCTTGCACAGCTTCACCATGTACCGA TVTHSLRKTIRFL.HSPTMYR
1270 1290 1310
TTGTATCAGAAACTCTTTCTAGAAATGATAGGGAATCAGGTTCAATCAGTGAAGATAAGC LYQKLFLEMIGNQVQSVKIS
1330 1350 1370
TGCTTATAGTTAGGAATGGTCACTGGGCTGTTTCTTCAGGATGGGCCAACACTGATGGAG C L
1390 1410 1430
CAGATGGCTGCTTCTCCGGCTCTTGAAATGGCAGTTGATTCCTTTCTCATCAGTTGGTGG
1450 1470 1490
GAATGAAGATCCTCCAGCCCAACACACACACTGGGGAGTCTGAGTCAGGAGAGTGAGGCA
1510 1530 1550
GGCTATTTGATAATTGTGCAAAGCTGCCAGGTGTACACCTAGAAAGTCAAGCACCCTGAG
1570 1590 1610
AAAGAGGATATTTTTATAACCTCAAACATAGGCCCTTTCCTTCCTCTCCTTATGGATGAG
1630 1650 1670
TACTCAGAAGGCTTCTACTATCTTCTGTGTCATCCCTAGATGAAGGCCTCTTTTATTTAT
1690 1710 1730
TTTTTTATTCTTTTTTTCGGAGCTGGGGACCGAACCCAGGGCCTTGCGCTTGCGAGGCAA
1750 1770 1790
GTGCTCTACCACTGAGCTAAATCTCCAACCCCTGAAGGCCTCTTTCTTTCTGCCTCTGAT
1810 1830 1850
AGTCTATGACATTCTTTTTTCTACAATTCGTATCAGGTGCACGAGCCTTATCCCATTTGT
1870 1890 1910
AGGTTTCTAGGCAAGTTGACCGTTAGCTATTTTTCCCTCTGAAGATTTGATTCGAGTTGC
1930 1950 1970
AGACTTGGCTAGACAAGCAGGGGTAGGTTATGGTAGTTTATTTAACAGACTGCCACCAGG
1990 2010 2030
AGTCCAGTGTTTCTTGTTCCTCTGTAGTTGTACCTAAGCTGACTCCAAGTACATTTAGTA
2050 2070 2090 'rGAAAAATAATCAACAAATTTTATTCCTTCTATCAACATTGGCTAGCTTTGTTTCAGGGC
2110 2130 2150
ACTAAAAGAAACTACTATATGGAGAAAGAATTGATATTGCCCCCAACGTTCAACAACCCA
2170 2190 2210
ATAGTTTATCCAGCTGTCATGCCTGGTTCAGTGTCTACTGACTATGCGCCCTCTTATTAC
2230 22S0 2270
TGCATGCAGTAATTCAACTGGAAATAGTAATAATAATAATAGAAATAAAATCTAGACTCC
2290 2310 2330
ATTGGATCTCTCTGAATATGGGAATATCTAACTTAAGAAGCTTTGAGATTTCAGTTGTGT
2350 2370 2390
TAAAGGCTTTTATTAAAAAGCTGATGCTCTTCTGTAAAAGTTACTAATATATCTGTAAGA
2410 2430
CTATTACAGTATTGCTATTTATATCCATCCAG
187 408
FIG.2D fas frg Cnfrl.frg sfv-t2.frg tnfr2.frg cd40.frg osteo.frg ngfr.frg ox40.frg 41bb.frg
H LG I » 1----LLPLVL1S-»ARLSS
-MGLS Τ V P DLL LP L V LLE L L V G I Y P
-----------H A P V A V H A A L A V G L
----------------------Μ V S
........................M
...........- - - -MGAGAIGRAM
......................Η Y V
K S V H A Q V I D SGVIG L V P fi Μ 1 R L I A L[L]V ELHAAABAL L P R L C A LfH] G BKHLCCAL L DGPRL Ł L L L Η V Q Q P I AlF] L M G Β B C ΪΚ V V
C V V Y V P A 0 V A C Ł L I A V H V Γ Ł 0 I I E
IRKI OREK D 0 V P P Y A P L G Q C H T I Q - G A K V Τ V K G C E K
V T R D
V S E P
V I E T E A L N
V G
I V S V S H G S C S F P C P C V A V
E
C
Q
I
D
P
T
K
Q
39 28
34 28 25 fas.frg tnfrl.frg sfv-t2.frg tnfr2.frg cd40.frg osteo.frg ngfr.frg ox40.frg 41bb.frg
HHIEGI FJGKI U G KCGGHO C R L R E Y Y K Q Y L H D G ΚΪ11 Ϊ DI GŁIIBSG ΟΙ YP SG8 B -----H1DGUF P Q Η H S I Y E K D G L 0 Q T A Q
QC---E I G R Q L0C
K P C P P G E R K A R 0 c I V B G D E P 0 C V P C 0 E K E
T K C B KI G I Y L Y H 0 c P G P G Q BID C R E c E S •3 S
A S c fi P G F Y A S R L c G P G S H I V C S P C E D 3 I F
S K c s P G Q B A K V F c IKISD I V C osie - E B 5 I Y
0 L c Q P G SRLIS 1 c ULE K i[q|c B P C - 0 s S E ?
D K c A P G 11LK5« c Τ V R R K tLłIc V P c - P Β Y S Y
K A c n~l]g E G V A Q P c G - A H Q T V c £ P c lidIs V I
R E c q|p g B G Μ V S R c 0 Β T R D T V c B P c - E Pic F Ϋ
0 8 c qIp g lfCKKl K^J P P s I t s
I D A S A 3 Q L
A Q _ D S ti H D V V S
Η E A V(Hl S---95
88 72
78 72 54 fas.frg tnfrl.frg sfv-t2.frg tnfr2.frg cd40.frg osteo.frg ngfr.frg ox40.frg 41bb.frg
B F 8 L a H R E
A T - Y
R H C Ł
- - A P
- - V P i r c a -ISO £1 CK DICK 1GG5
-SSK C R R
sfćls k C R K
AC V s c R G
e[c]l s c G S
Q H RB c E P
Efc] V X c S P
PCT E c
QlęjT Q c N a
PUCH I C R
EMGQVEISSCTVDRDTVCGCRKBQYRHYH3ERLFQCF
103
144
98
85 89 84 65
FIG.2E fas.frg tnfrl.frg sf»-t2.frg tnfrl.frg cd40.frg osteo.frg ngfr.frg ox40.frg 41bb.frg
152
191
129
143
125
124
128
116
105 fas.frg tnfrl.frg sfv-t2.frg tnfr2.frg cd40.frg osteo.frg ngfr.frg ox40.frg 41bb.frg
.....01 K E C0L I S H0K0K E......EGS R0B Ł - - - - G[w| L CLŁ
-----TKICLPOIEHKGIE------0 S G Τ Τ V Ł L P L V I F F GIC
Ig] Y G V S - G B T R A G B0L cl E K [Ć0P B T Y s 0 S L Ś P Τ E R [c G I S F H IyI
G F G V A R P G T E1S0W c X P CU P G1 I F S NIT S S I D I R PIH Q I c
G F G V « E M A I E I T D I V c Β P c P V G F F S H Q S S LFE K c yIp w i s c
G L G V Ł Q A G T P E R H T V c K fi c P D G F F S G E T s SKĄP c RK»lt N c
G s GfLVFSCQDKQB T V c E E c P 0 G I Y S D E A B Β V D P c Ł p|cj i V c
c V P C P P G B F S P G S W - - 0 A c K P Η T N c
G 0 ELIKQG c K I CJS L G I f[b B fi - B G T G V ę R PHI fi c
IIP I L L S L S V G F V V A I D KS L S t G Ł D Τ E R ESG K L O G R
P L I L F I nLl} Y P G B E V L
187
230
178
193
175
174
178
152
147 fas.frg tnfrl.frg sfv-t2.frg tnfr2.frg cd40.frg osteo.frg ngfr.frg ox40.frg 41bb.frg
V W V------KKKEVQKICRKERKE«5G
GLMTRYQRHKSKLYSIVCGKSTPEKEG
P V H...............-ETS Cftll I A
ASR.....-........--01» CIS I S
0KG.................IS C0H V I
Q K G----------------B ATBDH7C
ECTRHADAECEEIPGR--HITR Sili- - P 8 P A S H S V C E D R S L L A I L L Η E I Q R|_t]1 F R K IGIIEKDWCGPP WSFSPSITISYT
S R E S P T L Η P E..........
E Ł E G Τ Τ I K P LUKI SfŚlS P I P
.....GB Η E IIKIK e[fJt »1L
f lasKii G A V BLP QPVS T R S
CGLKS RH R - ........- - A
S G B R E A I Q B C G I D V 10C E E A
P E G S D S T AP STOEB ΕΑΡ P EQ
P I I V P S T I V Η P R T S Q0P S Τ P
P E G G P G -
GfFlT Ν0Τ Q Η T L|L]V F F R D Ł I T L V LFL
219
280
207 227 197
208 224 202 191
187 408
FIG.3A Zasadowe __ Kwasowe
FIG.3B Twonadep
Ziywanie β
100 200
FIG.3C a=ł
Fosman
FIG.3D Te
Ziywaniea FIG.3E KonieoNH2
300 400
.....I
FIG 3F KoniecCOOHj f
FIG. 3 G j
Beta
Α16
Moment
FIG.3H hydrofobowy
Beta
Alfa
Gtodmaniin. I
FIG.3 I Kyte-Doolittle “ 0
100
200
300
Hydrofobowe
Hydrofilowe
187 408
FIG.4A FIG.4B
-1-, Układ immunologiczny człowieka
FiG.5
I 2 11 16 17 22 28 33 38 45|Kb|1 12 18 30 |
Zwierzęta transgeniczne
Próby kontrolne
187 408
FIG.6A
FIG.6B
FIG.6C
187 408
FIG .6D
FIG.6E
FIG.6F
187 408
FIG.6G
FIG.6H
L
187 408
FIG.6I
FIG.6J
187 408
FIG.7A FIG.7B
FIG.7C FIG.7D
187 408
FIG.7E FIG.7F
FIG.7G FIG.7H
187 408
FIG.8A FIG.8B
FIG.8C FIG.8D
187 408
FIG.9A
30 50
CCTTATATAARACGTCATGATTGCCTGGGCTGCAGAGACGCACCTAGCACTGACCCAGCG
90 110
GCTGCCTCCTGAGGTTTCCCGAGGACCACAATGAACAAGTGGCTGTGCTGCGCACTCCTG
Μ N K W L C C A L L
130 150 170
GTGCTCCTGGACATCATTGAATGGACAACCCAGGAAACCCTTCCTCCAAAGTACTTGCAT V L . L D 1 I E W T TOB T L P P K Y L H
190 210 230
TATGACCCAGAAACTGGTCATCAGCTCCTGTGTGACAAATGTGCTCCTGGCACCTACCTA YDPETGHQLLCDKCAPGTYL
250 270 290
AAACAGCACTGCACAGTGAGGAGGAAGACATTGTGTGTCCCTTGCCCTGACCACTCTTAT KQHCTVRRKTLCVPCPDHSY
310 330 350
ACGGACAGCTGGCACACCAGTGATGAGTGTGTGTATTGCAGCCCAGTGTGCAAGGAACTG TDSWHTSDECVYCSPVCKEL
370 390 410
CAGTCCGTGAAGCAGGAGTGCAACCGCACCCACAACCGAGTGTGTGAGTGTGAGGAAGGG QSVKQECURTHNRVCECEEG
430 450 470
CGTTACCTGGAGATCGAATTCTGCTTGAAGCACCGGAGCTGTCCCCCGGGCTCCGGCGTG RYLEIEFCLKHRSCPPGSGV
490 510 530
GTGCAAGCTGGAACCCCAGAGCGAAACACAGTTTGCAAAAAATGTCCAGATGGGTTCTTC VQAGTPERNTVCKKCPDGFF
550 570 590
TCAGGTGAGACTTCATCGAAAGCACCCTGTATAAAACACACGAACTGCAGCACATTTGGC SGET-SSKAPCIKHTHCSTFG
610 630 650
CTCCTGCTAATTCAGAAAGGAAATGCAACACATGACAACGTGTGTTCCGGAAACAGAGAA LLLIQKGHATHDNVCSGNRE
670 690 710
GCCACGCAAAAGTGTGGAATAGATGTCACCCTGTGTGAAGAGGCCTTCTTCAGGTTTGCT ATQKCGIDVTLCEEAFFRFA
730 750 770
GTTCCTACCAAGATTATACCAAATTGGCTGAGTGTTTTGGTGGACAGTTTGCCTGGGACC VPTKIIPNWLSVLVDSLPGT
187 408
FIG.9B
790 810 830
AAAGTGAATGCCGAGAGTGTAGAGAGGATAAAACGGAGACACAGCTCACAAGAGCAAACC KVNAESVBRIKRRHSSQEQT
850 870 890
TTCCAGCTGCTGAAGCTGTGGAAACATCAAAACAGAGACCAGGAAATGGTGAAGAAGATC FQLLKLWKHQNRDQEMVKKI
910 930 950
ATCCAAGACATTGACCTCTGTGAAAGCAGCGTGCAGCGGCATCTCGGCCACTCGAACCTC IQDIDLCESSVQRHLGHSHL
970 990 1010
ACCACAGAGCAGCTTCTTGCCTTGATGGAGAGCCTGCCTGGGAAGAAGATCAGCCCAGAA TTEOLLAbMESLPGKKISPE
1030 1050 1070
GAGATTGAGAGAACGAGAAAGACCTGCAAATCGAGCGAGCAGCTCCTGAAGCTACTCAGT EIERTRKTCKSSEQLLKLLS
1090 1110 1130 'ITATGGAGOATCAAAAATGOTCACCAAGACACCTTGAAGGGCCTGATGTATGCCCTCAAG LWRIKNGDQDTLKGLMYALK
1150 1170 1190
CACTrGAAAACATCCCACTOCCAAAACTCTCACCCACAGTCTGAGGAAGACCATGAGG HLKTSHFPKTVTHSLRKTMR
1210 1230 1250
TTCCTGCACAGCTTCACAATGTACAGACTGTATCAGAAGCTCTTTTTAGAAATGATAGGG FLHSFTMYRLYQKLFLEMIG
1270 1290 1310
AATCAGGTTCAATCCGTGAAAATAAGCTGCTTATAACTAGGAATGGTCACTGGGCTGTTT NQVQSVKISCL
CTTCA
187 408
FIG.9C
30 50
GTATATATAACGTGATGAGCGTACGGGTGCGGAGACGCACCGGAGCGCTCGCCCAGCCGC
90 110
CGYCTCCAAGCCCCTGAGGTTTCCGGGGACCACAATGAACAAGTTGCTGTGCTGCGCGCT
K Ł..Ł. C..-C-.A, L
130 150 170
CGTGTTTCTGGACATCTCCATTAAGTGGACCACCCAGGAAACGTTTCCTCCAAAGTACCT
V F L D I 5 1 K W Τ Τ O Β T F P P K Y L
190 210 230
TCATTATGACGAAGAAACCTCTCATCAGCTGTTGTGTGACAAATGTCCTCCTGGTACCTA
HYDEETSHQLLCDKCPPGTY
250 270 290
CCTAAAACAACACTGTACAGCAAAGTGGAAGACCGTGTGCGCCCCTTGCCCTGACCACTA
LKQHCTAKWKTVCAPCPDHY
310 330 350
CTACACAGACAGCTGGCACACCAGTGACGAGTGTCTATACTGCAGCCCCGTGTGCAAGGA
YTDSWHTSDECLYCSPVCKE
370 390 410
GCTGCAGTACGTCAAGCAGGAGTGCAATCGCACCCACAACCGCGTGTGCGAATGCAAGGA lqyvkqechrthnrvcecke
430 450 470
AGGGCGCTACCTTGAGATAGAGTTCTGCTTGAAACATAGGAGCTGCCCTCCTGGATTTGG GRYLEIEFCLKHRSCPPGFG
490 510 530
AGTGGTGCAAGCTGGAACCCCAGAGCGAAATACAGTTTGCAAAAGATGTCCAGATGGGTT VVQAGTPERNTVCKRCPDGF
550 570 590
CTTCTCAAATGAGACGTCATCTAAAGCACCCTGTAGAAAACACACAAATTGCAGTGTCTT fsnetsskapcrkhthcsvf
610 630 650
TGGTCTCCTGCTAACTCAGAAAGGAAATGCAACACACGACAACATATGTTCCGGAAACAG
GLLLTQKGHATHDNICSGNS
670 690 710
TGAATCAACTCAAAAATGTGGAATAGATGTTACCCTGTGTGAGGAGGCATTCTTCAGGTT
ESTQKCG I DVTLCEEAFFRF
730 . 750 770
TGCTGTTCCTACAAAGTTTACGCCTAACTGGCTTAGTGTCTTGGTAGACAATTTGCCTGG avptkftpnwlsvlvdnlpg
187 408
FIG.9D
790 810 830
CACCAAAGTAAACGCAGAGAGTGTAGAGAGGATAAAACGGCAACACAGCTCACAAGAACA TKVNAESVERIKRQHSSQEQ
850 870 890
GACTTTCCAGCTGCTGAAGTTATGGAAACATCAAAACAAAGACCAAGATATAGTCAAGAA TFQbLKLWKHQNKDQDIVKK
910 930 950
GATCATCCAAGATATTGACCTCTGTGAAAACAGCGTGCAGCGGCACATTGGACATGCTAA IIQDIDLCENSVQRHIGHAfi
970 990 1010
CCTCACCTTCGAGCAGCTTCGTAGCTTGATGGAAAGCTTACCGGGAAAGAAAGTGGGAGC LTFEQLRSLMESLPGKKVGA
1030 1050 1070
AGAAGACATTGAAAAAACAATAAAGGCATGCAAACCCAGTGACCAGATCCTGAAGCTGCT EDIEKTIKACKPSDQILKLL
1090 1110 1130
CAGTTTGTGGCGAATAAAAAATGGCGACCAAGACACCTTGAAGGGCCTAATGCACGCACT
SLWRIKNGDQDTLKGLMHAL
1150 1170 1190
AAAGCACTCAAAGACGTACCACTTTCCCAAAACTGTCACTCAGAGTCTAAAGAAGACCAT
KHSKTYHFPKTVTQSLKKTI
1210 1230 1250
CAGGTTCCTTCACAGCTIGACAATGTACAAATTGTATCAGAAGTTATTTTTAGAAATGAT
RFLHSFTMYKLYQKLFLEMI
1270 1290 1310
AGGTAACCAGGTCCAATCAGTAAAAATAAGCTGCTTATAACTGGAAATGGCCATTGAGCT
GNQVQSVKISCL
1330 1350
GTTTCCTCACAAITOGCGAGATCCCATGGATGATAA
187 408 luosteo.frg ratosteo.frg huosteo.
FIG.9E
-^HHSSLCCALLyLLOIIEeTTaETLPeKILaYDPETGBdLLCDKCŁPGTrL frg HBEHlCCillT F Ł 0 II E ί 11 0 E T F 11 K Ϊ Ł I Ϊ D F E I G[r1o L L C D K C A P G Τ T L fra lH 8 ΚίΐΐL C C A ŁfyTlŁloTsIifEl8 t T 0 E T F P P E T t Β T DfElE Tfśla C Ł Ł C P K cielP G T Y Ł so auosteo.frg ratosteo.frg huosteo.frg
KQaCTVRRKTLC7PCEDaSYTDS8HTSDECVYCSPVCKeLQSVKQECSRT EQECfVRRKIŁCYPCP PfilS I TDSBgTSDECVrCSPVCKBL<2TVKQEC8RT κ o g c υΠΓκϊβ e Tfylcfilp c p p alrl υ t d s e a t s o e cHIf c s p υ c e e ł olm κ o e c u n τ
100
100
100 auosteo.frg |BHRVCECEEGRYLEIEFCI,KHRSCPP G(SJ G VVQAGTPERStVC K(SJ C P 0 G F F ratosteo.frg ł8RVCECEEGRil E0E FCŁKBRSCPPGŁG V0Q AGtPERHfYCKRCPDGFF huosteo. f rg H 8 R V C E ciElE GRTŁEIEFCŁEBBSCPPGFGTYOAGTPERHTYCERCPDGFF
150
150
150 auosteo.frg ratosteo.frg huosteo.frg
S G E T S S S A P C|_IJK Η T 8 C S SGETSSKAPCRKHT8CS sfiflE TSSKAPCRKHT8CS
TFGLŁLIQKGKATaOHVCSG8REATQKCGIDVT SŁGIŁLIQKGHAIBB8YCSGHREAI Q@ C G I D V T iir G U tftlo A G 8 A I 8 D Η I C S G «fŚI EfŚI T OKCGIDffT
200
200
200
FIG.9F auoiteo ratosteo huosteo.
frg frg frg
LCEKA?FRFAVPTKIIPHHLSVLVDSLPGTKVHAESVERIIRRaSSQEQT lcz nr r arłvn ki i p hwlsvlvdslpgtkvnaesverikrrhssqzqt ŁCnAFFHnnT ΚΓΓτΙΡ ylŁSFŁT DfiilŁ Ρ6ΤΠΗΠ5ΤΠΠ Rfol B S S Q 8 Q T
250
250
250 nuosteo.frg ratosteo.frg huosteo.frg tanosteo ratosteo huosteo.
frg frg frg
F QlŁ K ł¥k B Q MR D Q Ź Μ V K KlTQ 0 Ϊ DŁĆ t S S V S R HIUTbIsIh Ł T T E ΟΪΠ, λ' ....... I GSA
FQ L L E ll i BO BR O Q ! Η V Κ Κ I I i D I O l C I $ S V Q R Η ί G B A H L ϊ Τ Ϊ Q ŁJll f q ł ł k ł β e b q »Γκ1 p Q ofil ν κ rx i o o io ł c eImIs vqrhigbakł τΠε q ł rIs
ΊΠΓβ
LU Ł Η E
300
300
300
SLPGEEISPIEIERIRE T C X[S}S B Q L Ł I L L S I» 8 R I K H G D Q D f L Κ δΤΜΥ A L K SIPCUIS? OEIERTRKTCKPSEQŁLKŁLSLHRI U G O Q O I L U L HI A U słpge κ yPTaIe o i εΓκΙ τΓΐ! κΓΣΐ c κ p s p oRLł e łłsłbriehgdootłkgł Hfalh ł e
350
350
350 nuosteo.frg IB L E tlSlB ? P E I V Τ B Ś Ł R K TłHfa f Ł B S F t Η ϊ B Ł T Q K L Γ Ł E H I G 8 Q V Q S V E I S C ratosteo frg Β 1 Κ0Ϊ B F P E 1 V ϊ B S Ł R Κ Τ I R F L B SF t M TR Ł T Q K Ł F Ł E Μ I G 8 Q V Q S V Κ I S C huosteo. frg ląfslK ΤΪΒ F PE T_V TIOls ŁIkIk J Ι_Β_ΓΧ_Β S F T 8 YlElŁ T Q K Ł F ŁE Μ I S Β O V Q S V E I SC
400
400
400 muosteo.frg HSl ratosteo.frg |Ł huosteo.frg LLJ
401
401
401
187 408 ltnrr huaoste ltnrr huaoste ltnrr huaoste
FIG.10 cfplo - G εΓΫΙι H P Q N N S I ΟΐψΓκΤίΗ K|G T Y LlY N oie] P G P G Q DprldIĆIR e(c|E S G ΞΓΓΎΙαΓξΙ 49 p[p]s Y L η[υ|β e e t s h q l łicIdIk cIp pIg ΐ Y LIK Q h|cJt a r - M k|tJv|ęjA PlęJP o H y|y tIdIsI 49
E N H L R HlFLlsiTŚl- KiciRpl E HlG Q(v)E I S SIcjT V D R D Ti7Ć]G[clR R N Q[y|R Η Y N S Ε N (,[71 98 «HtSD Ele UyIc sIp v|c|-Ir e łIo y[vJk - Q e|c]N R Ϊ H H rI v cIeIcIk e g r[yJ l Β I - - - E -|fJ 93 oIFfIn c s Lfcl ł Nici - τΓν]h ł s c o i R Q|n τ v c|t -IćIh a[gTf]l r|e) - - - - H EtĆI V S C 139
-Ic łIr h r s|c|p p(g]f Giy|v o a g t p e k|h t v cir r[cJp dIg f fIs hLeJt s s k a picJr k h 139
FIG.II
187 508
FIG.12A _SS3
I SS2 i . [--1----1 |
DOMENA 1 &-ETFPpW^HTOEETSEQLLCDKCSSGTYI^QHCTAXWKTVC AP-64 HUMAŃ 22-ETLPPKSLHYDPETGHQI.LCDKCAPGTYLKQHCTVRHXTLCVP-64M0USE
DOMENA 2
- C PDffŻYTDSWŚTŚDEC LYC SPVC KELQYVKQEC NHTHłnwĆ ' W5 65- C PDHSYTDSWHTSDEC VYC SPVCKELQSVKQEC NRTHNRVC-105
SS3
SSI i--1 ► N-KOŃCOWA
DOMENA 3 I06-eĆkBGRYLEIŚpĆłKHRSCPPGFGWQAGTPBRHTVC-142 IO6-ECEEGRYLEIEPCLKHRSCPPGSG7VQAGTPERNTVC-142
SS3
SSI I---1
DOMFNA 4 l43-KRCPDGFPSNETŚSiaiPCRKHTNCSVFGŁLLTQKGNATHDNlCSGN3ESTQK-194 4 143 -KKCPDGFFSGETSSXAPCIKHTNCSTFGLLLIQKGMATHDNVCSGNR£ATQK-194
FIG.12B
195”03IDVTL&EAFFRFAVPTKFTPNWLSVLVDNLPGTKVNAESVERIKRQHSS-246 \ 195-)g3IDVTlQEEAFFRFAVPTKIIPNWLSVLVDSIiPGTKVNAESVERIKRRHSS-246
247-QEQTFQLLKLWKHQNKDQDrVKKIIQDIDI&NSVQRHIGHANLTFEQLRSL-298
247-QEQTFQLLKLWKHQNRDQEMVKKIIQDIDljgESSVQRHLGHSNLTTEQLLAL-298 >C-KOŃCOWA
9 9 -MESLPGmGAEDIEKTm|ĆkPSDQILKLLSLWRIKNGDQDTLKGLMHALK-350 299-MESLPGKKISPEBIERTRK'iycSSEQLŁKLŁSLWRIKNGDQDTLKGŁMYALK-350
5 l-HSKTYHFPRPVTQSIiKKTIRFIiHSFTinKLYQKIiFLEMIGNQVQSVKI2jł-401 3 5 1-HLKTSHFPKTVTHSLRKTMRFLHSFTMYRLYQKLFLEMIGNQVQSVKI£^i-40 1 /
187 408
FIG. 1 33 A mu Osteoprotegerym fc Λύ fe ja
Thr 180
Ł 401
FIG.13B
FIG. 1 3C 1 Ndel BamHI FIG.14A
PAUG21
Lepki koniec Nde I Lepki koniec Kpn 1
TATGGATGAAGAAACTTCTCATCAGCTGCTGTGTGATAAATGTCCGCCGGGTAC
ACCTACTTCTTTGAAGAGTAGTCGACGACACACTATTTACAGGCGGCC
NdeI
BamHI
KpnI pAMG21-ludzkiOsteoprotegeryna32-401
187 408
FIG.14B
PAS# 1 2345678 kDa 69 kDa' kDa
kDa kDa fi&MI
FIG.1 5
kd 50 kd
187 408
Nieredukujący
FIG.16A
-100 κ
-55 Κ
Lizat komórki Pożywka
1 2 4 6 12 hr 0 5 l 2 4 6 12 hr
dimer monomer
FIG.16B
monomer
FIG.17
-q*~
O*
-5?'
Dimer
Monomer
187 408
FIG.18
Surowica Wątroba
FIG.19A FIG.19B
FIG.19C FIG.19D
187 408
FIG.19E FIG.19F
Α405
FIG.20
OPG (ng/ml)
187 408
FIG.21
Legenda
Etap wzrostu komórki szpiku kostnego CSF-1 Etap pośredni PGE2 + CSF-1 Etap końcowy komórki ST2 1,25 (OH)2 D3 Deksametason
4dni 1 2dni 1 8-10 dni
OPG
Grupy OPG
CTL - CTL --OPG - CTL 100 ng/ml
OPG - OPG --OPG - OPG 100 ng/ml
100 ng/ml 100 ng/ml
FIG.22A
Jony wapnia mmol/I) Jony waPnia (ramol/l)
Czas (dni)
FIG.22B
* Różne od PBS, p<0,05 # Różne od OPG + ILI, p<0,05
187 408
FIG.23A
PBS/PBS
FIG.23B
187 408
FIG.23C
PBS/OPG
FIG.23D
JlLI/OPG
187 408
FIG.24A FIG.24B
Objętość kości % objętości tkanki
FIG.25
Kontrolny
OPG odległość od płytki wzrostu * Różny od kontrolnego p<0,01
187 408
FIG.26A FIG.26.Β
FIG.27
Tydzień 2Tydzień
187 408
Powierzchnia kości % powierzchni tkanki
FIG.28
* Różne od OVX p<0,05
187 408
FIG.1 A
148 178 208 238 268 298
Prj.1 ALLVFLDIIEWTTQETFPPKYLHYDPETGRQLLCDKCAPGTYLKQHCTVRRKTLCVPCPD
I: I 11:11 I II 1:1 :l I SW: LUDZKI _ 1NR2 HALPAQVAFTPYAPEPGSTCRLREYYDQTAQMCCSKCSPGQHAKVFCTKTSDTVCDSCED 30 40 50 60 70 80
328
FRI-1 YSYTDSWHTS :||: I:
SW:LUDZKI _TNR2 STYTQLWNWVPECLSCGSRCSSDQVETQACTREQNRICTCRPGWYCALSKQEGCRLCAPL 90 100 110 120 130 140
FIG.1B
FRI-1 69 YLHYDPETGRQLLCDKCAPGTYLKQHC.I7RRKTLCV.PCPDY.SYTDSW
I I. ... I .1 II :l .1 : I I II : l.l .
Profil TOFR g YHYYDQNGRMCEECHMCQPGHFLVKHCKQPKRDTVCHKPCEPGVTYTDDW
FRI-1 116 H
I
Profil TNFR 5g H z Score = θ 29
Departament Wydawnictw UP RP. Nakład 70 egz. Cena 6,00 zł.

Claims (57)

  1. Zastrzeżenia patentowe
    1. Wyodrębniony kwas nukleinowy kodujący polipeptyd mający, co najmniej jedną z aktywności biologicznych OPG, wybrany z grupy obejmującej:
    a) kwasy nukleinowe przedstawione na rysunkach fig. 2B-2C (SEQ ID NO: 120), fig. 9A-9B (SEQ ID NO: 122) i fig. 9C-9D (SEQ ID NO: 124) lub ich komplementarne nici;
    b) kwasy nukleinowe, które hybrydyzują w ścisłych warunkach z obszarem kodującym polipeptyd jak na rysunkach fig. 2B-2C (SEQ ID NO:120), fig. 9A-9B (SEQ ID NO:122), i fig. 9C-9D (SEQ ID NO: 124),
    c) kwasy nukleinowe, które hybrydyzują w ścisłych warunkach z nukleotydami od 148 do 337 włącznie, jak na rysunku fig. 1 A; oraz
    d) kwas nukleinowy, który jest degenerowany do kwasów nukleinowych wskazanych w punktach (a), (b) i (c), przy czym ścisłe warunki hybrydyzacji to: 5xSSC, 50% formamid i temperatura 42°C lub warunki im równoważne.
  2. 2. Kwas nukleinowy według zastrz. 1, będący cDNA, genomicznym DNA, syntetycznym DNA lub RNA.
  3. 3. Kwas nukleinowy według zastrz. 1, obejmujący jeden lub więcej znanych kodonów korzystnych do ekspresji przez Escherichia coli.
  4. 4. Kwas nukleinowy według zastrz. 1, z przyłączonym wykrywalnym znacznikiem, takim jak znacznik enzymatyczny, fluorescencyjny, przejawiający podwinowactwo lub izotopowy, korzystnie znacznikiem radioaktywnym, takim jak 32P lub 3H.
  5. 5. Kwas nukleinowy według zastrz, 1, obejmujący obszar kodujący polipeptyd jak na rysunkach fig. 2B-2C (SEQ ID NO:120), fig. 9A-9B (SEQ ID NO:122) lub fig. 9C-9D (SEQ ID NO: 124).
  6. 6. Kwas nukleinowy według zastrz. 5, obejmujący sekwencję jak na rysunku fig. 9C-D (SEQ ID NO: 124) z nukleotydów 158-1297.
  7. 7. Polipeptyd kodowany kwasem nukleinowym, kodującym polipeptyd mający, co najmniej jednąz aktywności biologicznych OPG, wybranym z grupy obejmującej:
    a) kwasy nukleinowe przedstawione na rysunkach fig. 2B-2C (SEQ ID NO: 120), fig. 9A-9B (SEQ ID NO: 122) i fig. 9C-9D (SEQ ID NO: 124) lub ich komplementarne nici;
    b) kwasy nukleinowe, które hybrydyzują w ścisłych warunkach z obszarem kodującym polipeptyd jak na rysunkach fig. 2B-2C (SEQ ID NO:120), fig. 9A-9B (SEQ ID NO:122), i fig. 9C-9D (SEQ ID NO: 124),
    c) kwasy nukleinowe, które hybrydyzują w ścisłych warunkach z nukleotydami od 148 do 337 włącznie, jak na rysunku fig. 1 A; oraz
    d) kwas nukleinowy, który jest degenerowany do kwasów nukleinowych wskazanych w punktach (a), (b) i (c),
    187 408 przy czym ścisłe warunki hybrydyzacji to: 5xSSC, 50% formamid i temperatura 42°C lub warunki im równoważne.
  8. 8. Wektor ekspresji obejmujący kwas nukleinowy kodujący polipeptyd mający, co najmniej jedną z aktywności biologicznych OPG, wybrany z grupy obejmującej:
    a) kwasy nukleinowe przedstawione na rysunkach fig. 2B-2C (SEQ ID NO: 120), fig. 9A-9B (SEQ ID NO: 122) i fig. 9C-9D (SEQ ID NO: 124) lub ich komplementarne nici;
    b) kwasy nukleinowe, które hybrydyzująw ścisłych warunkach z obszarem kodującym polipeptyd jak na rysunkach fig. 2B-2C (SEQ ID NO:120), fig. 9A-9B (SEQ ID NO:122), i fig. 9C-9D (SEQ ID NO: 124),
    c) kwasy nukleinowe, które hybrydyzująw ścisłych warunkach z nukleotydami od 148 do 337 włącznie, jak na rysunku fig. 1A; oraz
    d) kwas nukleinowy, który jest degenerowany do kwasów nukleinowych wskazanych w punktach (a), (b) i (c), przy czym ścisłe warunki hybrydyzacji to: 5xSSC, 50% formamid i temperatura 42°C lub warunki im równoważne.
  9. 9. Wektor ekspresji według zastrz. 8, w którym kwas nukleinowy obejmuje obszar kodujący polipeptyd jak na rysunku fig. 9C-9D (SEQ ID NO: 124).
  10. 10. Komórka-gospodarz transformowana lub transfekowana wektorem ekspresji obejmującym kwas nukleinowy, kodujący polipeptyd mający, co najmniej jedną z aktywności biologicznych OPG, wybrany z grupy obejmującej:
    a) kwasy nukleinowe przedstawione na rysunkach fig. 2B-2C (SEQ ID NO: 120), fig. 9A-9B (sEq ID NO: 122) i fig. 9C-9D (SEQ ID NO: 124) lub ich komplementarne nici;
    b) kwasy nukleinowe, które hybrydyzują w ścisłych warunkach z obszarem kodującym polipeptyd jak na rysunkach fig. 2B-2C (SEQ ID NO: 120), fig. 9A-9B (SEQ ID NO: 122), i fig. 9C-9D (SEQ ID NO: 124),
    c) kwasy nukleinowe, które hybrydyzują w ścisłych warunkach z nukleotydami od 148 do 337 włącznie, jak na rysunku fig. 1 A; oraz
    d) kwas nukleinowy, który jest degenerowany do kwasów nukleinowych wskazanych w punktach (a), (b) i (c), przy czym ścisłe warunki hybrydyzacji to: 5xSSC, 50% formamid i temperatura 42°C lub warunki im równoważne.
  11. 11. Komórka-gospodarz według zastrz. 10, będąca komórką eukariotyczną.
  12. 12. Komórka-gospodarz według zastrz. 11, wybrana z grupy obejmującej komórki CHO, COS, 293, 3T3, CV-1 i BHK.
  13. 13. Komórka-gospodarz według zastrz. 10, będąca komórkąprokariotyczną.
  14. 14. Komórka-gospodarz według zastrz. 13, będąca Escherichia coli.
  15. 15. Transgeniczny ssak nie-człowiek, z kwasem nukleinowym, kodującym polipeptyd mający, co najmniej jedną z aktywności biologicznych OPG, wybranym z grupy obejmującej:
    a) kwasy nukleinowe przedstawione na rysunkach fig. 2B-2C (SEQ ID NO: 120), fig. 9A-9B (SEQ ID NO: 122) i fig. 9C-9D (SEQ ID NO: 124) lub ich komplementarne nici;
    b) kwasy nukleinowe, które hybrydy;zyąw ścisłych warunkach z obszarem kodującym polipeptyd jak na rysunkach fig. 2B-2C (SEQ ID NO: 120), fig. 9A-9B (SEQ ID NO: 122), i fig. 9C-9D (SEQ ID NO: 124),
    c) kwasy nukleinowe, które hybrydyzująw ścisłych warunkach z nukleotydami od 148 do 337 włącznie, jak na rysunku fig. 1 A; oraz
    d) kwas nukleinowy, który jest degenerowany do kwasów nukleinowych wskazanych w punktach (a), (b) i (c), zintegrowanym z jego genomem i funkcjonalnie związanym z elementami kontroli ekspresji polipeptydu kodowanego przez ten kwas nukleinowy, przy czym w wyniku regulowanej ekspresji tego polipeptydu poziom OPG oraz gęstość kości ssaka transgenicznego są zwiększone w porównaniu z poziomem OPG i gęstością kości takiego samego ssaka nietransgenicznego.
  16. 16. Transgeniczny ssak według zastrz. 15, będący gryzoniem.
  17. 17. Ssak transgeniczny według zastrz. 16, będący myszą.
    187 408
  18. 18. Sposób wytwarzania OPG na drodze biotechnologicznej, znamienny tym, że w odpowiednich pożywkach prowadzi się hodowlę komórek gospodarzy transformowanych lub transfekowanych kwasem nukleinowym, kodującym polipeptyd mający, co najmniej jedną z aktywności biologicznych OPG, wybranym z grupy obejmującej:
    a) kwasy nukleinowe przedstawione na rysunkach fig. 2B-2C (SEQ ED NO: 120), fig. 9A-9B (SEq ID NO:122) i fig. 9C-9D (SEQ ID NO:124) lub ich komplementarne nici;
    b) kwasy nukleinowe, które hybrydyzują w ścisłych warunkach z obszarem kodującym polipeptyd jak na rysunkach fig. 2B-2C (SEQ ID NO:120), fig. 9A-9B (SEQ ID NO:122), i fig. 9C-9D (SEQ ID NO: 124),
    c) kwasy nukleinowe, które hybrydyzują w ścisłych warunkach z nukleotydami od 148 do 337 włącznie, jak na rysunku fig. 1 A; oraz
    d) kwas nukleinowy, który jest degenerowany do kwasów nukleinowych wskazanych w punktach (a), (b) i (c), a następnie wyodrębnia się polipeptydowe produkty ekspresji tych kwasów nukleinowych i ewentualnie oczyszcza się polipeptyd obejmujący OPG
  19. 19. Oczyszczony i wyodrębniony polipeptyd obejmujący OPG, przejawiający aktywność w zakresie podwyższania gęstości kości lub hamowania resorpcji kości, obejmujący sekwencję aminokwasów wybraną z grupy obejmującej jedną lub więcej spośród następujących sekwencji:
    a) sekwencja aminokwasów pokazana na rysunku fig. 2B-2C (SEQ ID No:121), fig. 9A-9B (SEQ ED No: 123) lub fig. 9C-9D (SEQ ID No: 125),
    b) sekwencja aminokwasów posiadająca co najmniej 85% zbieżności (identyczności) z sekwencją aminokwasów określoną w pkt. a) i pokazaną na rysunku fig. 2B-2C (SEQ ID No: 121), fig. 9A-9B (SEQ ID No: 123) lub fig. 9C-9D (SEQ ID No: 125),
    c) sekwencja aminokwasów stanowiąca fragment sekwencji zdefiniowanych w pkt. a) lub b).
  20. 20. Polipeptyd według zastrz. 19, będący OPG pochodzącą od ssaka.
  21. 21. Polipeptyd według zastrz. 20, będący ludzką OPG
  22. 22. Polipeptyd według zastrz. 19, będący zasadniczo wolnym od innych ludzkich protein.
  23. 23. Polipeptyd według zastrz. 21, mający sekwencję aminokwasową jak pokazano na rysunku fig. 2B-2C (SEQ ID NO:121), fig. 9A-9B (SEQ ID NO:123) lub fig. 9C-9D (SEQ ID NO: 125) lub jego pochodna.
  24. 24. Polipeptyd według zastrz. 23, mający sekwencję aminokwasową jak pokazano na rysunku fig. 9C-9D (SEQ ID NO: 125) z reszt 22-401 włącznie.
  25. 25. Polipeptyd według zastrz. 23, mający sekwencję aminokwasową jak pokazano na rysunku fig. 9C-9D (SEQ ID NO:125) z reszt 32-401 włącznie.
  26. 26. Polipeptyd według zastrz. 19, który jest znamienny tym, że jest produktem ekspresji egzogenicznej sekwencji DNA.
  27. 27. Polipeptyd według zastrz. 26, w którym DNA jest cDNA, genomicznym DNA lub syntetycznym DNA.
  28. 28. Polipeptyd według zastrz. 19, do którego przyłączony jest polimer rozpuszczalny w wodzie.
  29. 29. Polipeptyd według zastrz. 28, w którym rozpuszczalnym w wodzie polimerem jest glikol polietylenowy, korzystnie o cięrzarze cząsteczkowym w zakresie od około 1 kDa do około 100 kDa.
  30. 30. Polipeptyd posiadający:
    - sekwencję aminokwasową, o co najmniej około 164 aminokwasach, obejmującą cztery bogate w cysteinę domeny charakterystyczne dla bogatych w cysteinę zewnatrzkomórkowych domen receptora czynnika martwicy nowotworów (TNFR) oraz
    - aktywność w zakresie podwyższania gęstości kości.
  31. 31. Polipeptyd posiadający sekwencję aminokwasów jak pokazana na rysunku fig. 2B-2C (SEQ ID NO: 121), fig. 9A-9B (SEQ ID NO: 123) lub fig. 9C-9D (SEQ ID NO: 125), mający koniec amino przy reszcie 22 i w którym od 1-216 aminokwasów jest usuniętych z końca karboksylowego.
    187 408
  32. 32. Polipeptyd według zastrz. 31, posiadający sekwencję aminokwasów z reszt 22-185, 22-189, 22-194 lub 22-201 włącznie.
  33. 33. Polipeptyd według zastrz. 32, posiadający ponadto obszar Fc ludzkiej IgG1 rozciągający się od końca karboksylowego.
  34. 34. Polipeptyd posiadający sekwencję aminokwasów jak pokazana na rysunku fig. 2B-2C (SEQ ID NO:121), fig. 9A-9B (SEQ ID NO:123) lub fig. 9C-9D (SEQ ID NO: 125), mający koniec amino przy reszcie 22, w którym od 1-10 aminokwasów jest usuniętych z końca amino i - ewentualnie - od 1-216 aminokwasów jest usuniętych z końca karboksylowego.
  35. 35. Polipeptyd według zastrz. 34, posiadający sekwencję aminokwasów z reszt 27-185, 27-189, 27-194, 27-401 lub 32-401 włącznie.
  36. 36. Polipeptyd według zastrz. 35, posiadający obszar Fc ludzkiej IgG1 rozciągający się od końca karboksylowego.
  37. 37. Polipeptyd posiadający sekwencję aminokwasów huOPG, jak pokazana na rysunku fig. 9C-9D (SEQ ID No: 125), wybrany z grupy obejmującej:
    huOPG[22-201]-Fc huOPG[22-401]-Fc huOPG[22-180]-Fc huOPG met[22-401]-Fc huOPG Fc-met[22-401] huOPG met[22-185] huOPG met[22-189] huOPG met[22-194] huOPG met[27-185] huOPG met[27-189] huOPG met[27-194] huOPG met[32-401] huOPG met-lys [22-401] huOPG met[22-401] huOPG met[22-401]-Fc (P25A) huOPG met[22-401] (P25A) huOPG met[22-401] (P26A) huOPG met[22-401] (P26D) huOPG met[22-194] (P25A) huOPG met[22-194] (P26A) huOPG met met-(lys)3 [22-401] huOPG met met-arg-gly-ser-(his)6 [22-401].
  38. 38. Kwas nukleinowy kodujący polipeptyd o strukturze określonej w zastrz. 37.
  39. 39. Multimer osteoprotegeryny, przejawiający aktywność w zakresie zwiększania gęstości kości lub hamowania resorpcji kości, zbudowany z monomerów polipeptydu obejmującego OPG, o sekwencji aminokwasów wybranej z grupy obejmującej jedną lub więcej spośród następujących sekwencji:
    a) sekwencja aminokwasów pokazana na rysunku fig. 2B-2C (SEQ ID No: 121), fig. 9A-9B (SEQ ID No: 123) lub fig. 9C-9D (SEQ ID No: 125),
    b) sekwencja aminokwasów posiadająca co najmniej 85% zbieżności (identyczności) z sekwencją aminokwasów określoną w pkt. a) i pokazaną na rysunku fig. 2B-2C (SEQ ID No:121), fig. 9A-9B (SEQ ID No:123) lub fig. 9C-9D (SEQ ID No:125),
    c) sekwencja aminokwasów stanowiąca fragment sekwencji zdefiniowanych w pkt. a) lub b).
  40. 40. Multimer według zastrz. 39, będący dimerem.
  41. 41. Multimer według zastrz. 39, powstały przez międzyłańcuchowe wiązania dwusiarczkowe.
    187 408
  42. 42. Multimer według zastrz. 39, powstały przez asocjację obszarów Fc pochodzących z ludzkiej IgGl.
  43. 43. Multimer według zastrz. 39, zasadniczo wolny od monomerów osteoprotegeryny i nieaktywnych multimerów.
  44. 44. Multimer według zastrz. 39, w którym monomery obejmują sekwencję aminokwasową jak pokazana na rysunku fig. 9C-9D (SEQ ID NO: 125) z reszt 22-401 lub jej pochodną.
  45. 45. Multimer według zastrz. 39, w którym monomery obejmują sekwencję aminokwasowąjak pokazana na rysunku fig. 9C-9D (SEQ ID NO:125) z reszt 22-194.
  46. 46. Przeciwciało lub część przeciwciała, które specyficznie wiąże się z OPG, posiadającą sekwencję aminokwasów wybraną z grupy obejmującej jedną lub więcej spośród następujących sekwencji:
    a) sekwencja aminokwasów pokazana na rysunku fig. 2B-2C (SEQ ID No: 121), fig. 9A-9B (SEQ ID No: 123) lub fig. 9C-9D (SEQ ID No: 125),
    b) sekwencja aminokwasów posiadająca co najmniej 85% zbieżności (identyczności) z sekwencją aminokwasów określoną w pkt. a) i pokazaną. na rysunku fig. 2B-2C (SEQ ID No:121), fig. 9A-9B (SEQ ID No:123) lub fig. 9C-9D (SEQ ID No:125),
    c) sekwencja aminokwasów stanowiąca fragment sekwencji zdefiniowanych w pkt. a) lub b).
  47. 47. Przeciwciało według zastrz. 46, będące przeciwciałem monoklonalnym.
  48. 48. Sposób wykrywania obecności OPG w próbkach biologicznych, obejmujący:
    - inkubowanie próbki z przeciwciałem lub częścią przeciwciała, które specyficznie wiąże się z OPQ posiadającą sekwencję aminokwasów wybraną z grupy obejmującej jedną lub więcej spośród następujących sekwencji:
    a) sekwencja aminokwasów pokazana na rysunku fig. 2B-2C (SEQ ID No: 121), fig. 9A-9B (SEQ ID No: 123) lub fig. 9C-9D (SEQ ID No: 125),
    b) sekwencja aminokwasów posiadająca co najmniej 85% zbieżności (identyczności) z sekwencją aminokwasów określoną w pkt. a) i pokazaną. na rysunku fig. 2B-2C (SEQ ID No:121), fig. 9A-9B (SEQ ID No:123) lub fig. 9C-9D (SEQ ID No:125),
    c) sekwencja aminokwasów stanowiąca fragment sekwencji zdefiniowanych w pkt. a) lub b.) w warunkach pozwalających na związanie tego przeciwciała z OPG oraz
    - wykrywanie związanego przeciwciała znanymi metodami.
  49. 49. Sposób ustalania zdolności badanej substancji do wiązania się z OPQ obejmujący:
    - inkubowanie OPG z badaną substancją w warunkach pozwalających na ich związanie oraz
    - pomiar związanej substancji.
  50. 50. Kompozycja farmaceutyczna zawierająca substancję aktywną oraz farmaceutycznie dopuszczalny nośnik, adjuwant, środek ułatwiający rozpuszczanie, stabilizator i/lub przeciw-utleniacz, znamienna tym, że jako substancję aktywną zawiera osteoprotegerynę OPG.
  51. 51. Kompozycja według zastrz. 50, w której OPG jest ludzką OPG.
  52. 52. Kompozycja według zastrz. 51, w której OPG ma sekwencję aminokwasową jak pokazana na rysunku fig. 9B.
  53. 53. Zastosowanie polipeptydu obejmującego OPG, o sekwencji aminokwasów wybranej z grupy obejmującej jedną lub więcej spośród następujących sekwencji:
    a) sekwencja aminokwasów pokazana na rysunku fig. 2B-2C (SEQ ID No: 121), fig. 9A-9B (SEQ ID No: 123) lub fig. 9C-9D (SEQ ID No: 125),
    b) sekwencja aminokwasów posiadająca co najmniej 85% zbieżności (identyczności) z sekwencją aminokwasów określoną w pkt. a) i pokazaną na rysunku fig. 2B-2C (SEQ ID No:121), fig. 9A-9B (SEQ ID No:123) lub fig. 9C-9D (SEQ ID No:125),
    c) sekwencja aminokwasów stanowiąca fragment sekwencji zdefiniowanych w pkt. a) lub b) jako środka leczniczego do leczenia chorób kości, w szczególności chorób związanych z nadmiernym zanikiem kości, zwłaszcza chorób wybranych z grupy obejmującej osteoporozę, chorobę kości typu Pageta, hiperkalcemię, nadczynność przytarczyc, osteopenię indukowaną
    187 408 przez podawanie steroidów, zanik kości na skutek przewlekłego postępującego gośćca stawowego, zanik kości w następstwie zapalenia szpiku, przerzuty osteolityczne oraz zanik kości przyzębia.
  54. 54. Zastosowanie według zastrz. 53, w którym polipeptyd jest ludzką OPG.
  55. 55. Zastosowanie według zastrz. 53, w którym środek leczniczy jest przewidziany do stosowania łącznie z terapeutycznie skuteczną ilością substancji wybranych z grupy obejmującej: proteiny kostno-morfogeniczne BMP-1 do BMP-12, człony rodziny TGF-p, inhibitory IL-1, inhibitory TNFa, hormon przytarczyc i jego analogi, proteina związana z hormonem przytarczyc oraz jej analogi, prostaglandyny serii E, bisfosfoniany oraz minerały wzmacniające kości.
  56. 56. Zastosowanie kwasu nukleinowego kodującego polipeptyd mający co najmniej jedną z aktywności biologicznych OPG, wybrany z grupy obejmującej:
    a) kwasy nukleinowe przedstawione na rysunkach fig. 2B-2C (SEQ ID NO: 120), fig. 9A-9B (SEQ ID NO:122) i fig. 9C-9D (SEQ ID NO:124) lub ich komplementarne nici;
    b) kwasy nukleinowe, które hybrydyzują w ścisłych warunkach z obszarem kodującym polipeptyd jak na rysunkach fig. 2B-2C (SEQ ID NO: 120), fig. 9A-9B (SEQ ID NO: 122), i fig. 9C-9D (SEQ ID NO: 124),
    c) kwasy nukleinowe, które hybrydyzują w ścisłych warunkach z nukleotydami od 148 do 337 włącznie, jak na rysunku fig. 1A; oraz
    d) kwas nukleinowy, który jest degenerowany do kwasów nukleinowych wskazanych w punktach (a), (b) i (c), jako środka do regulowania poziomu OPG u zwierząt, zwłaszcza u ssaków, na drodze modyfikacji genetycznej.
  57. 57. Zastosowanie według zastrz. 56, w którym użyty kwas nukleinowy sprzyja wzrostowi poziomu OPG w tkankach.
PL96321938A 1995-12-22 1996-12-20 Osteoprotegeryna-OPG oraz jej multimery, kwas nukleinowy kodujący polipeptyd mający co najmniej jedną z aktywności biologicznych osteoprotegeryny, wektor ekspresji obejmujący taki kwas nukleinowy, komórka-gospodarz transformowana lub transfekowana wektorem ekspresji obejmującym taki kwas nukleinowyoraz transgeniczny ssak nie-człowiek z takim kwasem nukleinowym, sposób wytwarzania OPG na drodze biotechnologicznej, przeciwciało lub część przeciwciała, które specyficznie wiąże się z OPG, sposób wykrywania obecności OPG w próbkach biologicznych, kompozycja farmaceutyczna oraz zastosowanie polipeptydu obejmującego OPG i PL187408B1 (pl)

Applications Claiming Priority (3)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US08/577,788 US6613544B1 (en) 1995-12-22 1995-12-22 Osteoprotegerin
US08/706,945 US6369027B1 (en) 1995-12-22 1996-09-03 Osteoprotegerin
PCT/US1996/020621 WO1997023614A1 (en) 1995-12-22 1996-12-20 Osteoprotegerin

Publications (2)

Publication Number Publication Date
PL321938A1 PL321938A1 (en) 1998-01-05
PL187408B1 true PL187408B1 (pl) 2004-07-30

Family

ID=27077338

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
PL96321938A PL187408B1 (pl) 1995-12-22 1996-12-20 Osteoprotegeryna-OPG oraz jej multimery, kwas nukleinowy kodujący polipeptyd mający co najmniej jedną z aktywności biologicznych osteoprotegeryny, wektor ekspresji obejmujący taki kwas nukleinowy, komórka-gospodarz transformowana lub transfekowana wektorem ekspresji obejmującym taki kwas nukleinowyoraz transgeniczny ssak nie-człowiek z takim kwasem nukleinowym, sposób wytwarzania OPG na drodze biotechnologicznej, przeciwciało lub część przeciwciała, które specyficznie wiąże się z OPG, sposób wykrywania obecności OPG w próbkach biologicznych, kompozycja farmaceutyczna oraz zastosowanie polipeptydu obejmującego OPG i

Country Status (30)

Country Link
US (1) US6369027B1 (pl)
EP (4) EP0784093B1 (pl)
JP (1) JP4657388B2 (pl)
KR (1) KR100463584B1 (pl)
CN (1) CN1318588C (pl)
AR (1) AR004400A1 (pl)
AT (1) ATE409745T1 (pl)
AU (1) AU710587B2 (pl)
BG (1) BG63347B1 (pl)
CA (1) CA2210467C (pl)
CZ (1) CZ292587B6 (pl)
DE (1) DE19654610A1 (pl)
DK (1) DK0784093T3 (pl)
EE (1) EE04643B1 (pl)
ES (1) ES2316152T3 (pl)
FR (1) FR2742767B1 (pl)
GB (1) GB2312899B (pl)
HU (1) HU227482B1 (pl)
IL (1) IL121520A (pl)
MX (1) MX9706193A (pl)
NO (1) NO973699L (pl)
NZ (2) NZ326579A (pl)
PL (1) PL187408B1 (pl)
PT (1) PT784093E (pl)
RO (1) RO121386B1 (pl)
SI (1) SI0784093T1 (pl)
SK (1) SK110797A3 (pl)
TR (1) TR199601036A2 (pl)
WO (1) WO1997023614A1 (pl)
YU (1) YU69196A (pl)

Families Citing this family (88)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US6919434B1 (en) 1995-02-20 2005-07-19 Sankyo Co., Ltd. Monoclonal antibodies that bind OCIF
IL117175A (en) * 1995-02-20 2005-11-20 Sankyo Co Osteoclastogenesis inhibitory factor protein
US7078493B1 (en) 1995-03-15 2006-07-18 Human Genome Sciences, Inc. Antibodies to human tumor necrosis factor receptor-like genes
US7005413B1 (en) 1995-12-22 2006-02-28 Amgen Inc. Combination therapy for conditions leading to bone loss
US7632922B1 (en) * 1995-12-22 2009-12-15 Amgen, Inc. Osteoprotegerin
JPH1057071A (ja) * 1996-08-19 1998-03-03 Snow Brand Milk Prod Co Ltd 新規dna及びそれを用いた蛋白質の製造方法
ES2312179T3 (es) 1996-12-06 2009-02-16 Amgen Inc. Terapia combinada que utiliza un inhibidor del il-1 para el tratamiento de enfermedades mediadas por el il-1.
DE69740107D1 (de) * 1996-12-23 2011-03-10 Immunex Corp Rezeptor aktivator von nf-kappa b, rezeptor is mitglied der tnf rezeptor superfamilie
US6271349B1 (en) 1996-12-23 2001-08-07 Immunex Corporation Receptor activator of NF-κB
ES2263204T5 (es) * 1997-04-15 2013-10-14 Daiichi Sankyo Company, Limited Nueva proteína y proceso para producir la misma
ES2284203T5 (es) 1997-04-16 2016-03-11 Amgen Inc. Proteínas de unión a osteoprotegerina y sus receptores
US6316408B1 (en) 1997-04-16 2001-11-13 Amgen Inc. Methods of use for osetoprotegerin binding protein receptors
CA2288351A1 (en) * 1997-05-01 1998-11-05 Amgen Inc. Chimeric opg polypeptides
WO1999004001A1 (en) * 1997-07-21 1999-01-28 Zymogenetics, Inc. Tumor necrosis factor receptor ztnfr-5
JP2001512667A (ja) * 1997-08-06 2001-08-28 リジェネロン・ファーマシューティカルズ・インコーポレイテッド ヒトオーファンレセプターntr−1
US6346388B1 (en) 1997-08-13 2002-02-12 Smithkline Beecham Corporation Method of identifying agonist and antagonists for tumor necrosis related receptors TR1 and TR2
WO1999011790A1 (en) * 1997-09-04 1999-03-11 Zymogenetics, Inc. Tumor necrosis factor receptor ztnfr-6
JP4303883B2 (ja) * 1997-09-18 2009-07-29 ジェネンテック・インコーポレーテッド DcR3ポリペプチドというTNFR相同体
JP4268684B2 (ja) * 1997-09-24 2009-05-27 第一三共株式会社 骨代謝異常症の診断方法
US6087555A (en) * 1997-10-15 2000-07-11 Amgen Inc. Mice lacking expression of osteoprotegerin
JPH11155420A (ja) * 1997-12-02 1999-06-15 Snow Brand Milk Prod Co Ltd トランスジェニック動物
EP1037908A2 (en) * 1997-12-16 2000-09-27 Incyte Pharmaceuticals, Inc. Human tumor necrosis factor-r2-like proteins
US6077689A (en) * 1997-12-24 2000-06-20 Amgen Inc. Enhanced solubility of recombinant proteins
CA2321105A1 (en) * 1998-02-17 1999-08-19 Incyte Pharmaceuticals, Inc. Human short-chain tnf-receptor family protein
US6150098A (en) * 1998-02-20 2000-11-21 Amgen Inc. Methods for identifying novel secreted mammalian polypeptides
US6103472A (en) * 1998-02-20 2000-08-15 Amgen Inc. Methods and compositions for identifying novel secreted mammalian polypeptides in yeast
US6790823B1 (en) * 1998-04-23 2004-09-14 Amgen Inc. Compositions and methods for the prevention and treatment of cardiovascular diseases
JP4380067B2 (ja) * 1998-04-23 2009-12-09 味の素株式会社 抗血栓活性物質及びグリコカリシンの検出法
AU762574B2 (en) 1998-05-14 2003-06-26 Immunex Corporation Method of inhibiting osteoclast activity
US6210924B1 (en) 1998-08-11 2001-04-03 Amgen Inc. Overexpressing cyclin D 1 in a eukaryotic cell line
HUP0103578A3 (en) * 1998-09-15 2005-11-28 Pharmexa As Method for down-regulating osteoprotegerin ligand activity
US6420339B1 (en) 1998-10-14 2002-07-16 Amgen Inc. Site-directed dual pegylation of proteins for improved bioactivity and biocompatibility
MEP42108A (en) 1998-10-23 2011-02-10 Kiren Amgen Inc Dimeric thrombopoietin peptide mimetics binding to mp1 receptor and having thrombopoietic activity
US7488590B2 (en) 1998-10-23 2009-02-10 Amgen Inc. Modified peptides as therapeutic agents
US6660843B1 (en) 1998-10-23 2003-12-09 Amgen Inc. Modified peptides as therapeutic agents
HUP0104126A3 (en) * 1998-10-28 2004-07-28 Sankyo Company Ltd Chuo Ku Remedies for bone metabolic errors
US6245740B1 (en) 1998-12-23 2001-06-12 Amgen Inc. Polyol:oil suspensions for the sustained release of proteins
WO2000042216A2 (en) * 1999-01-18 2000-07-20 Osteometer Biotech A/S Genetic predisposition to abnormal calcification conditions
US20030007972A1 (en) * 1999-02-24 2003-01-09 Edward Tobinick Cytokine antagonists and other biologics for the treatment of bone metastases
US7259253B2 (en) * 1999-05-14 2007-08-21 Quark Biotech, Inc. Genes associated with mechanical stress, expression products therefrom, and uses thereof
AU6078500A (en) * 1999-07-09 2001-01-30 Amgen, Inc. Combination therapy for conditions leading to bone loss
AUPQ167599A0 (en) * 1999-07-19 1999-08-12 St. Vincent's Institute Of Medical Research Inhibitor of osteoclast precursor formation
IL130989A0 (en) 1999-07-20 2001-01-28 Compugen Ltd Variants of alternative splicing
US6673771B1 (en) * 1999-07-28 2004-01-06 The Trustees Of The University Of Pennsylvania Methods of inhibiting osteoclast activity
US8106098B2 (en) 1999-08-09 2012-01-31 The General Hospital Corporation Protein conjugates with a water-soluble biocompatible, biodegradable polymer
AU6946300A (en) * 1999-08-30 2001-03-26 Mayo Foundation For Medical Education And Research Use of dna encoding osteoprotegerin to prevent or inhibit metabolic bone disorders
IL142900A0 (en) * 1999-09-03 2002-04-21 Amgen Inc Compositions and methods for the prevention or treatment of cancer and bone loss associated with cancer
AU2005237128B2 (en) * 1999-09-03 2008-09-11 Amgen Inc. Compositions and Methods for the Prevention or Treatment of Cancer and Bone Loss Associated with Cancer
US20030144187A1 (en) * 1999-09-03 2003-07-31 Colin R. Dunstan Opg fusion protein compositions and methods
US6808902B1 (en) 1999-11-12 2004-10-26 Amgen Inc. Process for correction of a disulfide misfold in IL-1Ra Fc fusion molecules
WO2001044472A1 (en) * 1999-12-16 2001-06-21 Amgen, Inc. Tnfr/opg-like molecules and uses thereof
US20030103978A1 (en) 2000-02-23 2003-06-05 Amgen Inc. Selective binding agents of osteoprotegerin binding protein
ES2391124T3 (es) 2000-06-28 2012-11-21 Amgen Inc. Moléculas de receptor de linfopoyetina estromal tímica y usos de las mismas
WO2002024896A2 (en) * 2000-09-22 2002-03-28 Immunex Corporation Screening assays for agonists or antagonists of receptor activat or of nf-kb
WO2002064782A2 (en) * 2001-02-09 2002-08-22 Maxygen Holdings Ltd. Rank ligand-binding polypeptides
EP1377610A2 (en) 2001-04-03 2004-01-07 Société des Produits Nestlé S.A. Osteoprotegerin in milk
MXPA03011270A (es) * 2001-06-06 2004-03-18 Immunex Corp Uso de antagonistas rank para tratar cancer.
EP2295081B1 (en) 2001-06-26 2018-10-31 Amgen Inc. Antibodies to OPGL
EP1270015A3 (en) * 2001-06-29 2004-02-25 Sankyo Company Limited A complex comprising OCIF and Polysaccharide
KR100427299B1 (ko) * 2001-08-10 2004-04-14 한국생명공학연구원 인체 골 재흡수 억제인자(hOPG)를 생산하는 재조합플라스미드 pGHOPG(KCTC 1019BP)
US20030049694A1 (en) * 2001-09-10 2003-03-13 Chung-Hsiun Wu Production of fusion proteins and use for identifying binding molecules
US6800462B2 (en) * 2001-09-10 2004-10-05 Abgenomics Corporation Production of recombinant proteins in vivo and use for generating antibodies
US7138370B2 (en) 2001-10-11 2006-11-21 Amgen Inc. Specific binding agents of human angiopoietin-2
US7205275B2 (en) 2001-10-11 2007-04-17 Amgen Inc. Methods of treatment using specific binding agents of human angiopoietin-2
US7521053B2 (en) 2001-10-11 2009-04-21 Amgen Inc. Angiopoietin-2 specific binding agents
JP4336467B2 (ja) * 2001-10-15 2009-09-30 株式会社林原生物化学研究所 破骨細胞形成抑制因子の産生を調節し得る物質のスクリーニング方法
US20030191056A1 (en) 2002-04-04 2003-10-09 Kenneth Walker Use of transthyretin peptide/protein fusions to increase the serum half-life of pharmacologically active peptides/proteins
US7718776B2 (en) 2002-04-05 2010-05-18 Amgen Inc. Human anti-OPGL neutralizing antibodies as selective OPGL pathway inhibitors
US7259143B2 (en) * 2002-09-05 2007-08-21 Wisconsin Alumni Research Foundation Method of extending the dose range of vitamin D compounds
US20080249068A1 (en) * 2002-09-05 2008-10-09 Deluca Hector F Method of Extending the Dose Range of Vitamin D Compounds
JP2006521084A (ja) 2002-12-10 2006-09-21 シェーリング−プラウ・リミテッド イヌranklならびにイヌranklを調製および使用するための方法
TWI293882B (en) 2003-03-24 2008-03-01 Sankyo Co Polymeric modifiers and pharmaceutical compositions
US8143380B2 (en) 2004-07-08 2012-03-27 Amgen Inc. Therapeutic peptides
WO2006036834A2 (en) 2004-09-24 2006-04-06 Amgen Inc. MODIFIED Fc MOLECULES
BRPI0519008A2 (pt) 2004-12-13 2008-12-23 Evogenix Ltd proteÍnas variantes de osteoprotegerina
US8008453B2 (en) 2005-08-12 2011-08-30 Amgen Inc. Modified Fc molecules
US9283260B2 (en) 2006-04-21 2016-03-15 Amgen Inc. Lyophilized therapeutic peptibody formulations
EP2162540A2 (en) 2007-05-22 2010-03-17 Amgen Inc. Compositions and methods for producing bioactive fusion proteins
ES2598005T3 (es) 2009-08-14 2017-01-24 The Government Of The United States Of America As Represented By The Secretary Of The Department Of Health And Human Services Uso de IL-15 para aumentar la salida del timo y para tratar la linfopenia
PT2621515T (pt) 2010-09-28 2017-07-12 Aegerion Pharmaceuticals Inc Polipéptido quimérico de leptina de foca-ser humano com solubilidade aumentada
EP3896759A1 (en) 2011-10-05 2021-10-20 OneD Material, Inc. Silicon nanostructure active materials for lithium ion batteries and processes, compositions, components, and devices related thereto
AU2012375257B2 (en) * 2012-03-31 2019-09-12 R-Pharm International, Limited Liability Company Osteoprotegerin derived composition and use thereof
US11680101B2 (en) 2017-01-27 2023-06-20 Kymab Limited Anti-OPG antibodies
JP6550413B2 (ja) * 2017-02-24 2019-07-24 アール−ファーム・インターナショナル・リミテッド・ライアビリティ・カンパニーR−Pharm International, Llc オステオプロテゲリン由来の組成物およびその使用
CN111004318B (zh) * 2019-12-30 2022-03-04 北京博康健基因科技有限公司 rhPTH(1-34)蛋白原液的纯化方法
TWI899211B (zh) 2020-04-17 2025-10-01 小利蘭史丹佛大學董事會 用於生物醫藥調配物之聚合物賦形劑
TW202410920A (zh) 2022-05-23 2024-03-16 小利蘭史丹佛大學董事會 包括聚合物賦形劑之抗體生物醫藥調配物
CN120591264A (zh) * 2025-04-23 2025-09-05 北京实验动物研究中心有限公司 一种opg基因敲除非人动物模型的制备方法

Family Cites Families (17)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US4179337A (en) 1973-07-20 1979-12-18 Davis Frank F Non-immunogenic polypeptides
US6936694B1 (en) 1982-05-06 2005-08-30 Intermune, Inc. Manufacture and expression of large structural genes
US4710473A (en) 1983-08-10 1987-12-01 Amgen, Inc. DNA plasmids
FR2640537B1 (fr) 1988-12-21 1992-02-21 Levy Guy Installation et procede utilisant l'effet laser, pour la coupe ou la vaporisation de materiaux et tissus divers
WO1990006952A1 (fr) 1988-12-22 1990-06-28 Kirin-Amgen, Inc. Facteur de stimulation de colonies de granulocytes modifies chimiquement
JP2877509B2 (ja) 1989-05-19 1999-03-31 アムジエン・インコーポレーテツド メタロプロテイナーゼ阻害剤
US5395760A (en) * 1989-09-05 1995-03-07 Immunex Corporation DNA encoding tumor necrosis factor-α and -β receptors
US5118667A (en) * 1991-05-03 1992-06-02 Celtrix Pharmaceuticals, Inc. Bone growth factors and inhibitors of bone resorption for promoting bone formation
CA2068389A1 (en) * 1991-05-13 1992-11-14 Masahiko Sato Method for inhibiting bone resorption
US5447851B1 (en) 1992-04-02 1999-07-06 Univ Texas System Board Of Dna encoding a chimeric polypeptide comprising the extracellular domain of tnf receptor fused to igg vectors and host cells
JP3284481B2 (ja) 1993-08-20 2002-05-20 本田技研工業株式会社 車両用油圧作動式変速機の油圧制御回路
US6268212B1 (en) 1993-10-18 2001-07-31 Amgen Inc. Tissue specific transgene expression
JP3433495B2 (ja) 1993-12-30 2003-08-04 カシオ計算機株式会社 表示制御装置および表示制御方法
US6309853B1 (en) * 1994-08-17 2001-10-30 The Rockfeller University Modulators of body weight, corresponding nucleic acids and proteins, and diagnostic and therapeutic uses thereof
IL117175A (en) 1995-02-20 2005-11-20 Sankyo Co Osteoclastogenesis inhibitory factor protein
WO1996028546A1 (en) 1995-03-15 1996-09-19 Human Genome Sciences, Inc. Human tumor necrosis factor receptor
US8615703B2 (en) 2010-06-04 2013-12-24 Micron Technology, Inc. Advanced bitwise operations and apparatus in a multi-level system with nonvolatile memory

Also Published As

Publication number Publication date
GB2312899B (en) 1999-05-05
KR100463584B1 (ko) 2005-06-07
CZ253897A3 (cs) 1999-03-17
AU1468697A (en) 1997-07-17
CA2210467C (en) 2011-02-08
NZ326579A (en) 1999-01-28
TR199601036A3 (pl) 1997-07-21
ES2316152T3 (es) 2009-04-01
EE04643B1 (et) 2006-06-15
HUP9801122A3 (en) 2000-09-28
YU69196A (en) 1999-11-22
EP0784093B1 (en) 2008-10-01
EP2332974A3 (en) 2012-01-11
CN1182452A (zh) 1998-05-20
AU710587B2 (en) 1999-09-23
DK0784093T3 (da) 2008-12-15
IL121520A (en) 2010-11-30
PL321938A1 (en) 1998-01-05
ATE409745T1 (de) 2008-10-15
GB2312899A (en) 1997-11-12
US6369027B1 (en) 2002-04-09
SK110797A3 (en) 1999-07-12
EP2332974A2 (en) 2011-06-15
MX9706193A (es) 1997-11-29
WO1997023614A1 (en) 1997-07-03
BG63347B1 (bg) 2001-10-31
FR2742767B1 (fr) 2001-03-30
HU227482B1 (en) 2011-07-28
FR2742767A1 (fr) 1997-06-27
RO121386B1 (ro) 2007-04-30
JP4657388B2 (ja) 2011-03-23
JPH11503616A (ja) 1999-03-30
BG101813A (en) 1998-09-30
KR19980703599A (ko) 1998-12-05
CN1318588C (zh) 2007-05-30
CA2210467A1 (en) 1997-07-03
DE19654610A1 (de) 1997-06-26
EP0784093A1 (en) 1997-07-16
GB9626618D0 (en) 1997-02-05
HUP9801122A2 (hu) 1998-08-28
SI0784093T1 (sl) 2009-04-30
AR004400A1 (es) 1998-11-04
PT784093E (pt) 2008-12-17
CZ292587B6 (cs) 2003-10-15
NZ332915A (en) 2000-07-28
TR199601036A2 (tr) 1997-07-21
NO973699D0 (no) 1997-08-12
EP0870023A1 (en) 1998-10-14
HK1001526A1 (en) 1998-06-26
EP1990415A1 (en) 2008-11-12
NO973699L (no) 1997-10-21
EE9700164A (et) 1998-02-16

Similar Documents

Publication Publication Date Title
PL187408B1 (pl) Osteoprotegeryna-OPG oraz jej multimery, kwas nukleinowy kodujący polipeptyd mający co najmniej jedną z aktywności biologicznych osteoprotegeryny, wektor ekspresji obejmujący taki kwas nukleinowy, komórka-gospodarz transformowana lub transfekowana wektorem ekspresji obejmującym taki kwas nukleinowyoraz transgeniczny ssak nie-człowiek z takim kwasem nukleinowym, sposób wytwarzania OPG na drodze biotechnologicznej, przeciwciało lub część przeciwciała, które specyficznie wiąże się z OPG, sposób wykrywania obecności OPG w próbkach biologicznych, kompozycja farmaceutyczna oraz zastosowanie polipeptydu obejmującego OPG i
US6613544B1 (en) Osteoprotegerin
JP5001758B2 (ja) オステオプロテゲリン結合性蛋白および受容体
PL211786B1 (pl) Zastosowanie przeciwciała oraz polipeptydu
JP2013028622A (ja) オステオプロテゲリン結合性蛋白および受容体
JP2002505843A (ja) システインリッチなレセプターであるtrain
US20050221331A1 (en) Osteoprotegerin
WO2001003719A9 (en) Combination therapy for conditions leading to bone loss
US20100298229A1 (en) Osteoprotegerin
US7005413B1 (en) Combination therapy for conditions leading to bone loss
US20050147611A1 (en) Combination therapy for conditions leading to bone loss
AU758672B2 (en) Osteoprotegerin
TWI221482B (en) Osteoprotegerin
HK1001526B (en) Osteoprotegerin

Legal Events

Date Code Title Description
LAPS Decisions on the lapse of the protection rights

Effective date: 20131220