PL235848B1 - Nowe pochodne kumaryny, sposób ich wytwarzania oraz ich zastosowanie w sposobie wykrywania i/lub oznaczania aktywności katalitycznej i stereoselektywności reakcji hydrolaz - Google Patents

Nowe pochodne kumaryny, sposób ich wytwarzania oraz ich zastosowanie w sposobie wykrywania i/lub oznaczania aktywności katalitycznej i stereoselektywności reakcji hydrolaz Download PDF

Info

Publication number
PL235848B1
PL235848B1 PL407948A PL40794814A PL235848B1 PL 235848 B1 PL235848 B1 PL 235848B1 PL 407948 A PL407948 A PL 407948A PL 40794814 A PL40794814 A PL 40794814A PL 235848 B1 PL235848 B1 PL 235848B1
Authority
PL
Poland
Prior art keywords
formula
coumarin
alkoxy
alkyl
hydrogen
Prior art date
Application number
PL407948A
Other languages
English (en)
Other versions
PL407948A1 (pl
Inventor
Ryszard Ostaszewski
Anna Żądło
Szymon KŁOSSOWSKI
Szymon Kłossowski
Małgorzata Zysk
Anna Brodzka
Original Assignee
Inst Chemii Organicznej Polskiej Akademii Nauk
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Inst Chemii Organicznej Polskiej Akademii Nauk filed Critical Inst Chemii Organicznej Polskiej Akademii Nauk
Priority to PL407948A priority Critical patent/PL235848B1/pl
Publication of PL407948A1 publication Critical patent/PL407948A1/pl
Publication of PL235848B1 publication Critical patent/PL235848B1/pl

Links

Landscapes

  • Plural Heterocyclic Compounds (AREA)
  • Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)

Abstract

Przedmiotem wynalazku są pochodne kumaryny o wzorze ogólnym 5, gdzie R3 i R4 oznaczają niezależnie od siebie wodór, alkil C1-C25, ewentualnie podstawiony w pozycji α, β, γ grupą -OH, alkoksylową C1-C5, NH2, COOH; alken C2-C25, alkin C2-C25 lub aryl C6-C10; R5, R6, R7, R8, R9 oznaczają niezależnie od siebie wodór, alkil C1-C5, alkoksyl C1-C5, fenyl, -Cl, -Br, -J, NO2, triflorometyl, trichlorometyl, a X oznacza atom tlenu, siarki lub azotu, sposób ich wytwarzania oraz ich zastosowanie jako substratów barwnych do fluorescencyjnych i spektrofotometrycznych, enzymatycznych oznaczeń aktywności hydrolaz, a także do oznaczania stereoselektywności katalizowanych reakcji dla oznaczeń biochemicznych, chemicznych, biotechnologicznych, enzymologicznych.

Description

Przedmiotem wynalazku są pochodne kumaryny, sposób ich wytwarzania oraz zastosowanie tych związków jako substratów barwnych do fluorescencyjnego i spektrofotometrycznego wykrywania aktywności katalitycznej oraz oznaczania stereoselektywności reakcji katalizowanych przez hydrolazy.
Enzymy jako katalizatory reakcji chemicznych i biochemicznych znalazły szerokie zastosowanie w procesach technologicznych i biotechnologicznych, szczególnie w syntezie związków nieracemicznych, o wysokiej wartości dodanej, takich jak aktywne składniki farmaceutyków (API; Active Pharmaceutical Ingredients). Zastosowania enzymów wymagają opracowania prostych i wiarygodnych metod oznaczania ich aktywności katalitycznej oraz określania stereoselektywności reakcji gdy substraty są związkami racemicznymi. Dlatego też, zastosowanie enzymów do syntezy związków enancjomerycznie wzbogaconych wymaga wykonania szeregu dodatkowych badań, w ramach których należy wyznaczyć, poza określeniem aktywności poszczególnych enzymów względem achiralnych substratów, także skład enancjomeryczny mieszanin reakcyjnych uzyskanych w wyniku procesów bioakatalitycznych dla substratów racemicznych. Umożliwia to określenie stereoselektywności reakcji katalizowanych przez enzymy co ma kluczowe znaczenie szczególnie dla ich zastosowań szczególnie przemysłowych. Metody oznaczania aktywności enzymatycznej oparte na oznaczeniach optycznych (fotometria, spektrofotometria, fluorescencja, luminescencja) zapewniają wysoki standard odpowiednich oznaczeń. Można je zastosować wtedy, gdy substrat do reakcji enzymatycznej lub uzyskiwany z niego w wyniku reakcji katalizowanej przez poszukiwany enzym produkt są substancjami barwnymi. Nie jest to jednak możliwe w przypadku, gdy oba związki nie różnią się właściwościami spektroskopowymi (J. P. Goddard, J. L. Reymond, Trends in Biotechnology 2004, 22, 363-370).
Powszechnie do oznaczania aktywności lipaz i esteraz stosuje się estry p-nitrofenolu i kwasów karboksylowych o wzorze 1 posiadające grupy R1 będące łańcuchami alifatycznymi C1-C20. Krótkołańcuchowe estry, takie jak octan czy maślan, są rozpuszczalne w wodzie i zwykle wykorzystywane do oznaczania aktywności esteraz, natomiast estry długołańcuchowe, jak laurynian, palmitynian czy oleinian, nie są rozpuszczalne w środowisku wodnym oraz wymagają stosowania dodatku środków powierzchniowo czynnych i są wykorzystywane do oznaczania aktywności lipaz. Reakcje takie przebiegają zgodnie z mechanizmem przedstawionym na Schemacie I, powodując uwalnianie p-nitrofenolu, którego stężenie oznacza się spektofotometrycznie przy długości fali 410 nm.
Wzór 1
Schemat I
Metoda pomimo wielu zalet, jak prostota oznaczania i niski koszt substratów, posiada jednak również szereg wad (C. Huggins, J. Lapides, J. Biol. Chem. 1947, 170, 467-482). Jedną z ważniejszych jest jej ograniczenie tylko do oznaczania jednego achiralnego fenolu i to, że nie pozwala ona na oznaczenie aktywności reakcji dla estrów alkoholi racemicznych.
Aktywność enzymów hydrolitycznych może być oznaczana z dużą czułością i dokładnością za pomocą metod fluorymetrycznych z zastosowaniem substratów fluorogennych, które nie posiadają właściwości fluorescencyjnych a dopiero uwolniony w wyniku hydrolizy enzymatycznej związek wykazuje silną fluorescencję. Szeroko stosowane do tego celu są estry kumaryny o wzorze 2 posiadające jako grupę R2 wodór, metyl lubtrifluorometyl oraz grupę R1 będącą łańcuchem alifatycznymi C1-C20. Najczęściej stosowane są octan i maślan 7-hydroksy-4-metylokumaryny do oznaczania aktywności esteraz oraz palmitynian i laurynian do oznaczania aktywności lipaz (T. De Laborde de Monpezat, B. De Jeso, J.L. Butour, L. Chavant, M. Sancholle, Lipids 1990, 25, 661-664). Metody te jednak nie pozwalają na wyznaczenie stereoselektywności reakcji a także dotyczą tylko pochodnych kwasów karboksylowych.
Zaproponowano pośrednie metody oznaczania aktywności hydrolaz z zastosowaniem procedury składającej się z sekwencji trzech następujących po sobie reakcji (Patent US 2003/0199017 A1 : J.-L. Reymond, D. Wahler, F. Badalassi, H.-K. Nguyen). W pierwszym etapie, z fluorogennych substratów w wyniku hydrolizy enzymatycznej uwalniany był kwas karboksylowy i drugorzędowy alkohol połączony
PL 235 848 Β1 wiązaniem eterowym z 7-hydroksy-4-metylokumaryną. Następnie, w wyniku działania najdodanu sodu alkohol był utleniany do odpowiedniego ketonu, który pod działaniem albuminy z surowicy bydlęcej ulegał procesowi β-eliminacji, prowadząc do uwolnienia fluorescencyjnej 7-hydroksy-4-metylokumaryny. W kolejnych latach metoda ta została zaadaptowana do badań przesiewowych nad lipazami i esterazami (E. Nyfeler, J. Grognux, D. Wahler, J.L. Reymond, Helvetica Chimica Acta 2003, 86, 2919-2926), aldolazami (R. P. Carlón, N. Jourdain, J.-L. Reymond, Chem. Eur. J. 2000, 6, 4154-4162), amidazami (E. Henke, U. T. Bornscheuer, Anal. Chem. 2003, 75, 255-260), fosfatazami (E. M. Gonzalez-Garcia, J. Grognux, D. Wahler, J.-L. Reymond, Helvetica Chimica Acta 2003, 86, 2458-2467), hydrolazami epoksydowymi (P. D. Jones, N. M. Wolf, C. Morisseau, P. Wheatstone, B. Hock, B. D. Hammock, Anal. Blochem. 2005, 343, 66-75), monooksygenazami Bayera-Villigera (R. Sicard, L. S. Chen, A. J. Marsaioli, J.-L. Reymond, Adv. Synth. Catal. 2005, 347, 1041-1050). Zaproponowane substraty w wyniki reakcji z hydrolazami dają produkty uboczne takie jak aldehydy lub ketony, które są często inhibitorami badanych hydrolaz.
Przedstawione metody można zastosować, gdy produkty reakcji hydrolizy katalizowanej przez enzym posiadają silną fluorescencję w środowisku reakcji, natomiast substraty nie wykazują fluorescencji i można je użyć do jakościowego oraz ilościowego oznaczania nawet bardzo małych ilości enzymu. Tego typu oznaczenia znakomicie upraszczają procesy wydzielania enzymów. Takie substraty znajdują zastosowanie w technikach „high-throughput screening” (HTS). Niestety, można je zastosować tylko do wybranych grup substratów, w których funkcję grupy alkoksylowej pełni cząsteczka chromoforu lub fluoroforu. Oznaczenie aktywności dla nieracemicznych estrów alkoholi drugorzędowych, tioli czy amidów nieracemicznych amin nie jest bezpośrednio możliwe jak też oznaczenie stereoselektywności tych reakcji.
Nieoczekiwanie, stwierdzono, że pochodne kumaryny według wynalazku przedstawione poniższym wzorem 5, które są mieszanymi węglanami alkoholi, tioli, amin oraz pochodnych kumaryny są o wiele lepszymi substratami od znanych obecnie związków stosowanych do wykrywania obecności oraz oznaczania aktywności hydrolaz oraz wyznaczania stereoselektywności biokatalizowanych reakcji.
Przedmiotem wynalazku są nowe pochodne kumaryny przedstawione wzorem 5,
R7 R6
R9
Wzór 5 gdzie R3 i R4 oznaczają niezależnie od siebie wodór, alkil C1-C25, ewentualnie podstawiony w pozycji α, β, γ grupą -OH, alkoksylową C1-C5, NH2, COOH; alken C2-C25, alkin C2-C25 lub aryl C6-C10; R5, R6, R7, R8, R9 oznaczają niezależnie od siebie wodór, alkil C1-C5, alkoksyl C1-C5, fenyl, -Cl, -Br, -J, NO2, triflorometyl, trichlorometyl, a X oznacza atom tlenu, siarki lub azotu.
Kolejnym przedmiotem wynalazku jest sposób wytwarzania nowych pochodnych kumaryny o wzorze 5. Synteza według wynalazku polega na reakcji odpowiedniego alkoholu, tiolu lub aminy o wzorze 3, gdzie R3 i R4 oznaczają niezależnie od siebie wodór, alkil C1-C25, ewentualnie podstawiony w pozycji α, β, γ grupą -OH, alkoksylową C1-C5, NH2, COOH; alken C2-C25, alkin C2-C25 lub aryl C6-C10; z fosgenem co daje odpowiednią pochodną o wzorze 6, która następnie poddawana jest reakcji z kumaryną o wzorze 4 gdzie R5, R6, R7, R8, R9 oznaczają niezależnie od siebie wodór, alkil C1-C5, alkoksyl C1-C5, fenyl, -Cl, -Br, -J, NO2, triflorometyl, trichlorometyl.
W sposobie według wynalazku substrat barwny o wzorze 5 otrzymuje się jak przedstawiono na Schemacie II (dane eksperymentalne patrz Przykład I) w reakcji pomiędzy podstawioną grupami R3 i R4 alkoholem, aminą lub tiolem z fosgenem co prowadzi do powstania nietrwałego związku o wzorze 6, który natychmiast i bez wydzielania podawany jest reakcji z podstawioną grupami R5, R6, R7i R8, R9 kumaryną o wzorze 4.
PL 235 848 Β1
R4
Wzór 3
COCI2
Wzór 6
Schemat II
Korzystnie, reakcje prowadzi się w rozpuszczalnikach polarnych aprotycznych, np. tetrahydrofuranie, chlorku metylenu, chloroformie lub w węglowodorach aromatycznych, lub w ich mieszaninach, przez 1-24 godziny, w temperaturze od 0 do 100°C i w obecności zasady organicznej, korzystnie EtsN, pirydyny, lutydyny, dimetyloaminopirydyny lub zasady nieorganicznej, korzystnie węglan sodu lub węglan potasu.
Kolejnym przedmiotem wynalazku jest sposób oznaczania aktywności hydrolaz, charakteryzujący tym, że testowaną próbkę kontaktuje się z substratem, a następnie bada się obecność produktu hydrolizy substratu, przy czym jako substrat stosuje się związek według wynalazku o wzorze 5 a jego hydrolizę bada się dokonując pomiaru spektrofotometrycznego lub pomiaru fluorescencji.
Korzystnie, aktywność hydrolaz oznacza się w surowych lub oczyszczonych preparatach organicznych i/lub preparatach biologicznych.
Korzystnie, sposobem według wynalazku oznacza się stereoselektywność reakcji katalizowanych przez hydrolazy, przy czym do oznaczeń stosuje się enancjomerycznie czyste lub wzbogacone pochodne kumaryny o wzorze 5.
Uzyskany substrat barwny o wzorze 5, według wynalazku jest stosowany do wykrywania, oznaczania aktywności enzymatycznej oraz wyznaczania stereoselektywności reakcji katalizowanych przez hydrolazy takie jak lipazy, esterazy, proteazy obecne w surowych i oczyszczonych preparatach organicznych i/lub preparatach biologicznych zawierających te enzymy natywne lub genetycznie modyfikowane, zgodnie ze Schematem III.
Schemat III
Uzyskiwane w tej reakcji produkty, którymi są pochodne kumaryny o wzorze 4 silnie pochłaniają światło w zakresie UV oraz silnie fluoryzują co umożliwia ich szybkie jakościowe i ilościowe oznaczenie, a także wyznaczenie prędkości poszczególnych reakcji jednostkowych z enzymami. Zastosowanie obu enancjomerów substratu barwnego do reakcji oddzielnie umożliwia bezpośrednie wyznaczenie prędkości reakcji obu enancjomerów a tym samym oznaczenie stereoselektywności procesu i określenia który z enancjomerów substratu reaguje szybciej w obecności danego enzymu.
Oznaczenia takie można prowadzić dla różnych preparatów biologicznych zawierających hydrolazy, niezależnie od ich pochodzenia w roztworach wodnych, w procesie oczyszczania enzymów, w procesie ich immobilizacji, w badaniu aktywności próbek otrzymywanych w procesie oczyszczania tego enzymu po rozdziale metodą średniociśnieniowej chromatografii cieczowej i wysokosprawnej chromatografii cieczowej, hodowlach inokulum, fermentacji w skali laboratoryjnej i przemysłowej. Ponadto, używając te związki jako substraty barwne można wykrywać obecność oraz określać stereoselektywność hydrolaz na żelach po procesie rozdziału próbek metodą elektroforezy. Identyfikacja taka polega na oświetleniu powierzchni żelu światłem UV o długości fali 360 nm i obserwacji fluoryzującego prążka produktu reakcji katalizowanej przez hydrolazę na jego powierzchni.
PL 235 848 B1
Przedmiot wynalazku w przykładach wykonania jest uwidoczniony na rysunku, na którym na fig. 1 przedstawiono widma absorpcji i fluorescencji 7-hydroksy-4-metylokumaryny, 7-hydroksy-4-trifluorometylokumaryny, związku 5a.
W podanych przykładach pokazano zastosowanie tych związków do fluorescencyjnego oznaczania aktywności enzymatycznej hydrolaz (przykład II, IV) do spektrofotometrycznego oznaczania aktywności enzymatycznej hydrolaz (przykład III).
P r z y k ł a d I
Wytwarzanie substratu barwnego o wzorze 5a (ogólnie Schemat II, szczegółowo)
Ogólna metoda syntezy związków o wzorze 5
Roztwór odpowiedniego alkoholu, aminy lub tiolu (1 mmol) w bezwodnym tetrahydrofuranie THF (2 ml) schłodzono do temperatury 0°C, w atmosferze argonu, i dodano roztwór fosgenu w toluenie (20%, 1.25 ml, 2.5 mmol). Następnie mieszaninę reakcyjną mieszano przez 2 godziny w temperaturze pokojowej. Przepuszczono przez 15 minut argon, aby usunąć nieprzereagowany fosgen. Ponownie schłodzono do 0°C i powoli dodano roztwór dimetyloaminopirydyny (25 mg, 0.2 mmol), trietyloaminy (0.42 ml, 3 mmol) i odpowiedniej kumaryny o wzorze 4 (1 mmol) w bezwodnym THF (2 ml). Następnie mieszano przez 2 godziny w temperaturze pokojowej, dodano chlorek metylenu (10 ml) i ekstrahowano roztworem kwasu solnego (1 M, 5 ml). Fazy rozdzielono i fazę organiczną suszono za pomocą siarczanu magnezu. Po odparowaniu rozpuszczalnika pozostałość poddano chromatografii kolumnowej na żelu krzemionkowym stosując jako eluent mieszaninę chlorku metylenu i metanolu (99:1, obj./obj.).
Produkt 5a węglan etylo-(2-okso-4-metylo-2H-chromen-7-ylo) (X=O, R3= Et, R4, R5, R7, R8, R9 =H, R6 = Me) otrzymano w postaci białego proszku (161.4 mg, wydajność 65%, tt = 98-99°C).
1H NMR (COCI3, 400 MHz) δ 7.61-7.59 (d, 1H, J = 8.8 Hz), 7.21-7.14 (m, 2H), 6.26 (d, 1H, J = 1.2 Hz), 4.37-4.31 (q, 2H, J = 7.2 Hz), 2.43-2.42 (d, 3H, J = 1.2 Hz), 1.42-1.38 (t, 3H, J = 7.2 Hz); 13C NMR (COCI3, 100 MHz) δ 160.4, 154.1, 153.2, 152.7, 151.8, 125.4, 117.9, 117.4, 114.6, 109.9, 65.3, 18.7, 14.1; UV/Vis Xmax (MeCN, nm, loge): 215 (4.25), 270 (4.12), 310 (4.03); Analiza obliczona dla C13H12O5: C 62.90, H 4.87; znaleziona C 62.76, H 4.79.
Produkt 5b węglan izopropylo-(2-okso-4-metylo-2H-chromen-7-ylo) (X=O, R3=i-Pr, R4, R5, R7, R8, R9 =H, R6 = Me) otrzymano w postaci białego proszku (91.8 mg, wydajność 35%, tt = 94-95°C) 1H NMR (COCI3, 200 MHz) δ 7.64-7.59 (d, 1H, J = 8.8 Hz), 7.23-7.14 (m, 2H), 6.28-6.27 (d, 1H, J = 1.2 Hz), 5.08-4.95 (m, 1H, J = 6.2 Hz), 2.44-2.43 (d, 3H, J = 1.4 Hz), 1.42-1.39 (d, 6H, J = 6.2 Hz); 13C NMR (COCI3, 50 MHz) δ 160.4, 154.1, 153.3, 152.7, 151.8, 125.4, 117.8, 117.4, 114.5, 109.9, 73.8, 21.7, 18.7; UV/Vis Xmax (MeCN, nm, loge): 215 (4.20), 270 (4.04), 310 (3.96); Analiza obliczona dla C14H14O5: C 64.12, H 5.38; znaleziona: C 64.02, H 5.33.
Produkt 5c węglan tri(etylenowego glikolumonoetylowego)-(2-okso-4-metylo-2H-chromen-7- ylo) (X=O, R3= Et(OCH2CH2)3, R4, R5, R7, R8, R9 = H, R6 = Me) otrzymano w postaci bezbarwnego oleju z wydajnością 35%.
1H NMR (COCI3, 400 MHz) δ 7.63-7.61 (d, 1H, J = 8.8 Hz), 7.23-7.16 (m, 2H), 6.28 (d, 1H, J = 1.2 Hz), 4.45-4.43 (m, 2H, J = 2.8 Hz), 3.83-3.81 (m, 2H, J = 2.8 Hz), 3.73-3.66 (m, 6H), 3.62-3.60 (m, 2H), 3.56-3.51 (q, 2H, J = 7.2 Hz), 2.44 (d, 3H, J = 1.6Hz), 1.23-1.20 (t, 3H, J = 7.2 Hz);
13C NMR (COCI3, 100 MHz) δ 160.4, 154.0, 153.2, 152.8, 151.8, 125.5, 117.9, 117.3, 114.6, 109.9, 70.7, 70.6, 70.5, 69.7, 68.6, 68.1,66.6, 18.7, 15.1; UV/Vis Xmax (MeCN, nm, loge): 215 (4.19), 270 (4.04), 310 (3.98); Analiza obliczona dla C19H24O8: C 59.99, H 6.36; znaleziona: C 59.75, H 6.25
Produkt 5d węglan (R)-1-fenyloetylo-(2-okso-4-metylo-2H-chromen-7-ylo) (X=O, R3=Me, R4=CH2Ph, R5, R7, R8, R9 =H, R6 = Me) otrzymano w postaci białego proszku (115.8, 71%, t1 = 65-66°C).
1H NMR (COCI3, 200 MHz) δ 7.79-7.83 (d, 1 H, J = 8.6 Hz), 7.65-7.59 (m, 5H), 7.43-7.35 (td, 2H, Ji = 8.8 Hz, J2 = 6.4 Hz), 6.49 (s, 1 H), 6.09-6.06 (q, 1 H, J = 6.6 Hz), 2.65-2.64 (d, 3H, J = 1.2 Hz), 1.94-1.91 (d, 3H, J = 6.6 Hz); 13C NMR (COCI3, 50 MHz) δ 160.4, 154.0, 153.2, 151.9, 151.8, 140.1, 128.7, 128.5, 126.2, 125.4, 117.9, 117.4, 114.6, 109.9, 78.1,22.1, 18.7 UV/Vis Xmax (MeCN, nm, loge): 215 (4.23), 270 (4.02), 310 (3.93); Analiza obliczona dla C19H16O5: C 70.36, H 4.97; znaleziona: C 70.51, H 4.99; [a]o = 124 (c 1.0,CHCh).
Produkt 5e węglan (S)-1-fenyloetylo-(2-okso-4-metylo-2H-chromen-7-ylo) (X=O, R3=Me, R4=CH2Ph, R5, R7, R8, R9 =H, R6 = Me) otrzymano w postaci białego proszku (113.5, 70%, t1 = 65-66°C).
1H NMR (COCI3, 200 MHz) δ 7.84-7.79 (d, 1H, J = 8.6 Hz), 7.67-7.59 (m, 4H), 7.43-7.35 (m, 2H), 6.49 (d, 1H, J = 1.2 Hz), 6.09-6.06 (q, 1H, J = 6.6 Hz), 2.65-2.64 (d, 3H, J = 1.2 Hz), 1.94-1.91 (d, 3H,
PL 235 848 B1
J = 6.6 Hz); 13C NMR (CDCI3, 50 MHz) δ 160.4, 154.1, 153.2, 151.8, 151.8, 140.1, 128.7, 128.5, 126.2, 125.4, 117.9, 117.4, 114.6, 109.9, 78.1,22.1, 18.7; UV/Vis 7max(MeCN, nm, logs): 215 (4.22), 270 (4.03), 310 (3.95); Analiza obliczona dla C19H16O5: C 70.36, H 4.97; znaleziona: C 70.49, H 4.86; [a]D = -122 (c1.0, CHCI3)
Produkt 5f węglan (R)-1-fenyloetylo-(2-okso-4-trifluorometylo-2H-chromen-7-ylo) (X=O, R3=Me, R4=CH2Ph, R5, R7, R8, R9 =H, R6 = CF3) otrzymano w postaci bezbarwnego oleju (131.8 mg, 70%) 1H NMR (CDCI3, 400 MHz) δ 7.66-7.64 (dd, 1H, Ji = 8.8 Hz, J2 = 1.6 Hz), 7.36-7.12 (m, 7H), 6.70 (s, 1H), 5.81-5.76 (q, 1H, J = 6.4 Hz), 1.64-1.63 (d, 3H, J = 6.4 Hz), 13C NMR (CDCI3, 100 MHz) δ 158.4, 155.0, 154.2, 151.8, 139.9, 128.7, 128.7, 126.5, 126.3, 126.2, 119.6, 118.3, 115.4, 111.3, 110.4, 78.4, 22.1, UV/Vis 7max(MeCN, nm, loge): 215 (4.14), 280 (3.97), 315 (3.86), Analiza obliczona dla C19H13F3O5: C 60.32, H 3.46; znaleziona: C 60.89, H 3.85 [a]D = 109 (c 1.0, CHCI3)
Produkt 5g węglan (S)-1-fenyloetylo-(2-okso-4-trifluorometylo-2H-chromen-7-ylo) (X=O, R3=Me, R4=CH2Ph, R5, R7, R8, R9 = H, R6 = CF3) otrzymano w postaci bezbarwnego oleju (139.5 mg, 74%) 1H NMR (CDCI3, 400 MHz) δ 7.66-7.63 (dt, 1H, Ji = 2.0 Hz, J2 = 7.2 Hz), 7.37-7.10 (m, 7H), 6.69 (s, 1H), 5.80-5.75 (q, 1H, J = 6.4 Hz), 1.64-1.62 (d, 3H, J = 6.4 Hz), 13CNMR (CDCI3, 100 MHz) δ 158.4, 155.0, 154.1, 151.8, 139.9, 128.7, 128.6, 126.5, 126.3, 126.2, 120.0, 118.3, 115.4, 111.3, 110.4, 78.4, 22.1 UV/Vis 7max(MeCN, nm, loge): 215 (4.13), 280 (3.98), 315 (3.87). Analiza obliczona dla C19H13F3O5: C 60.32, H 3.46; znaleziona: C 61.27, H 3.72 [a]D = -112 (c 1.0, CHCI3).
Produkt 5h węglan (R)-1-fenyloetyloamino-(2-okso-4-metylo-2H-chromen-7-ylo) (X=N, R3=Me, R4=CH2Ph, R5, R7, R8, R9 = H, R6 = Me) otrzymano w postaci białego proszku (107.1 mg, 66%, t1 = 128-130°C).
1H NMR (CDCI3, 400 MHz) δ 7.49-7.45 (d, 1H, J = 18.4 Hz), 7.32-7.28 (m, 4H), 7.25-7.20 (m, 1H), 7.05-7.03 (m, 2H), 6.15-6.14 (d, 1H, J = 1.2 Hz), 5.43-5.42 (d, 1H, J = 6.8 Hz), 4.88-4.81 (q, 1 H, J = 7.2 Hz), 2.32 (d, 3H, J = 0.8 Hz), 1.52-1.50 (d, 3H, J = 6.8 Hz), 13C NMR (CDCI3, 100 MHz) δ 160.6, 154.1, 153.6, 152.6, 152.0, 142.6, 128.8, 127.6, 126.0, 125.1, 117.9, 117.2, 114.1, 110.0, 51.1, 22.1, 18.6, UV/Vis 7max(MeCN, nm, loge): 215 (4.20), 270 (3.95), 310 (3.94), Analiza obliczona dla C19H13F3O5: C 70.58, H 5.30, N 4.33; znaleziona: C 70.09, H 5.29, N 4.16, [a]D = 81 (c 1.0, CHCI3)
Produkt 5i węglan (S)-1-fenyloetyloamino-(2-okso-4-metylo-2H-chromen-7-ylo) (X=N, R3=Me, R4=CH2Ph, R5, R7, R8, R9 = H, R6 = Me) otrzymano w postaci białego proszku (107.1 mg, 66%, t1 = 128-130°C).
1H NMR (CDCI3, 200 MHz) δ 7.79-7.75 (d, 1H, J = 18.4 Hz), 7.61-7.49 (m, 5H), 7.35-7.33 (m, 2H), 6.45 (d, 1H, J = 1.2 Hz), 5.81-5.77 (d, 1H, J = 7.2 Hz), 5.22-5.11 (q, 1H, J = 7.0 Hz), 2.63 (d, 3H, J = 0.8 Hz), 1.83-1.79 (d, 3H, J = 6.8 Hz), 13C NMR (CDCI3, 50 MHz) δ 160.6, 154.1, 153.6, 152.6, 152.0, 142.6, 128.7, 127.6, 126.0, 125.1, 117.9, 117.2, 114.1, 110.0, 51.1,22.1, 18.6, UV/Vis 7max(MeCN, nm, loge): 215 (4.23), 270 (3.96), 310 (3.94)
Analiza obliczona dla: C19H13F3O5: C 70.58, H 5.30, N 4.33; znaleziona: C 70.52, H 5.52, N 4.25, [a]D = -74 (c 1.0, CHCI3).
Produkt 5j węglan 1-fenyloetylotio-(2-okso-4-metylo-2H-chromen-7-ylo) (X=S, R3=Me, R4=CH2Ph, R5, R7, R8, R9 = H, R6 = Me) otrzymano w postaci jasnożółtego proszku (78.3 mg, 23%, t1 = 87-88°C).
1H NMR (CDCI3, 400 MHz) δ 7.53-7.49 (d, 1H, J = 8.6 Hz), 7.29-7.18 (m, 5H), 7.08-7.01 (m, 2H), 6.19-6.18 (d, 1H, J = 1.2 Hz), 4.64-4.58 (q, 1H, J = 7.2 Hz), 2.34 (d, 3H, J = 1.2 Hz), 1.71-1.69 (d, 3H, J = 7.2 Hz), 13C NMR (CDCI3, 100 MHz) δ 168.9, 160.3, 154.1, 153.2, 151.7, 141.6, 128.7, 127.8, 127.2, 125.4, 118.0, 117.6, 114.7, 110.2, 45.7, 22.2, 18.7, UV/Vis 7max (MeCN, nm, loge): 215 (4.30), 270 (4.02), 310 (3.95), Analiza obliczona dla: C19H13F3O5: C 67.04, H 4.74; znaleziona: C 67.12, H 4.9.9
P r z y k ł a d II
Fluorymetryczne oznaczenie aktywności hydrolaz
Wyznaczano prędkości początkowe hydrolizy 100 μM roztworów substratów 5a, 5b, 5c, 5d, 5e o stężeniu 5 milimoli w buforze fosforanowym o pH 7.4, w temperaturze 30°C, w obecności albuminy surowicy bydlęcej (BSA) o stężeniu 2 mg/ml i 100 μg enzymu. Stosowano długość fali wzbudzenia ex = 360 nm, a dane rejestrowano przy długości fali emisji em = 445 nm przez 2 godziny. Pomiary prowadzono za pomocą spektrofluorymetru SHIMAZU F7000. Do obliczenia prędkości początkowych zestawionych w Tabeli 1 wykorzystano zależność intensywności fluorescencji od stężenia 7-hydroksy-4-metylokumaryny.
PL 235 848 Β1
Tabela 1. Prędkości początkowe reakcji autohydrolizy związków 5a-5e w buforze fosforanowym w obecności BSA i w przypadku jego braku
Związek bez BSA [nM s’1] BSA [nM s1] BSA/bez BSA
5a 0.4 3.0 8
5b 0.1 2.5 18
5c 0.9 2.1 3
5d 2.2 3.9 2
5e 2.9 5.1 2
Wartości prędkości netto (Vnet) podane w Tabeli 2 obliczono ze wzoru Vnet = Venz- VnoE, gdzie Venz to prędkości początkowe reakcji w obecności enzymu i BSA, a VnoE to prędkości początkowe reakcji w obecności BSA.
Tabela 2. Prędkości netto reakcji hydrolizy enzymatycznej związków 5a-5e
Enzym _ Vnet [nM s 1]
5a 5b 5c 5d 5e 5f 5g
Lipaza z Candida rugosa 145 129 24 8 27 15 43
Esteraza z wątroby końskiej 44 9 35 25 18
Lipaza z Candida antarctica 75 15 25 4 2
Lipaza z Candida cylindracea 15 10 1 13 20
Lipaza z Porcine pancreas 11 7 8 15 1 9 2
Lipaza z Hog pancreas 6 4 1 12 1
Lipaza z Candida lipolityca 15 3 0.3 9 1
Lipaza z Rhizopus arrhizus 14 1 2 10 1
Lipaza z Pseudomonas fluorescens 4 2 3 14 11
Lipaza z Pseudomonas cepacia 8 2 4 8 1
Esteraza z wątroby świńskiej 7 6 3 88 67
Esteraza z Pseudomonas fluorescens 4 2 0 6 6
V net—νθηζΎποΕ
Przykład III
Spektrofotometryczne oznaczenie aktywności hydrolaz
Substraty przygotowano w postaci 5 mM roztworów w acetonitrylu. Sporządzono krzywe zależności absorbancji w czasie dla reakcji hydrolizy pochodnych kumaryny dla serii lipaz i esteraz. Wyznaczono prędkości początkowe hydrolizy 100 μΜ roztworów substratów 5d, 5e, 5f, 5g w buforze fosforanowym o pH 7.4, w temperaturze 30°C w obecności 200 μg enzymu. Pomiary prowadzono za pomocą spektrofotometru Hitachi U-1900 przez 1 godzinę. Dane rejestrowano przy długości fali 360 nm dla związków 5d, 5e lub 410 nm dla związków 5f, 5g.
PL 235 848 Β1
Tabela 3. Prędkości początkowe hydrolizy enzymatycznej związków 4-5 wyznaczane metodą spektrometrii UV-Vis
Enzym _ V [nM/s]
5f 5g 5d 5e
Lipaza z Porcine pancreas. 23 14 83 6
Lipaza z Candida rugosa 30 113 18 89
Przykład IV
Fluorymetryczne oznaczenie aktywności hydrolaz
Stosując procedurę opisaną w przykładzie II przeprowadzono analizę fluorometryczną aktywności hydrolaz według poniższej tabeli.
Tabela 4. Prędkości początkowe hydrolizy enzymatycznej fluorogennych substratów 5h, 5i
Enzym — V [nM/s]
5h 5i 5j
Autodroliza 5 5 0.2
Proteaza z Bovine Pancreas 18 15
Proteaza Bacillus Licheniformis 7 13
Lipaza z Candida cylindracea 0.9
Lipaza z Candida rugosa 2
Lipaza z Candida antardica 2
Esteraza z wątroby końskiej 4
Zastrzeżenia patentowe

Claims (6)

1. Nowa pochodna kumaryny o wzorze 5,
Wzór 5 gdzie R3 i R4 oznaczają niezależnie od siebie wodór, alkil C1-C25, ewentualnie podstawiony w pozycji α, β, γ grupą -OH, alkoksylową C1-C5, NH2, COOH;
alken C2-C25, alkin C2-C25 lub aryl C6-C10;
R5, R6, R7, R8, R9 oznaczają niezależnie od siebie wodór, alkil C1-C5, alkoksyl C1-C5, fenyl, Cl, -Br, -J, NO2, triflorometyl, trichlorometyl,
X oznacza atom tlenu, siarki lub azotu.
2. Sposób wytwarzania związku określonego w zastrz. 1, znamienny tym, że związek o wzorze 3
R4
Wzór 3
PL 235 848 Β1 gdzie R3 i R4 oznaczają niezależnie od siebie wodór, alkil C1-C25, ewentualnie podstawiony w pozycji α, β, γ grupą: -OH, alkoksylową C1-C5, NH2, COOH; alken C2-C25, alkin C2-C25 lub aryl C6-C10; X oznacza atom tlenu, siarki lub azotu poddaje się reakcji z fosgenem i uzyskuje się związek o wzorze 6,
Wzór 6 gdzie R3, R4 i X mają znaczenie jak powyżej, który następnie poddaje się reakcji z kumaryną o wzorze 4
R7 R6
R9
Wzór 4 gdzie R5, R6, R7, R8, R9 oznaczają niezależnie od siebie wodór, alkil C1-C5, alkoksyl C1-C5, fenyl,
-Cl, -Br, -J, NO2, triflorometyl, trichlorometyl i uzyskuje się związek o wzorze 5:
R7 R6
R9
Wzór 5
3. Sposób według zastrz. 2, znamienny tym, że reakcje prowadzi się w rozpuszczalnikach polarnych aprotycznych, korzystnie tetrahydrofuranie, chlorku metylenu, chloroformie lub w węglowodorach aromatycznych, lub w ich mieszaninach; przez 1-24 godziny; w temperaturze od 0 do 100°C; w obecności zasady organicznej, korzystnie EtsN, pirydyny, lutydyny, dimetyloaminopirydyny; lub zasady nieorganicznej, korzystnie węglan sodu lub węglan potasu.
4. Sposób oznaczania aktywności hydrolaz, znamienny tym, że testowaną próbkę kontaktuje się z substratem, a następnie bada się obecność produktu hydrolizy substratu, przy czym jako substrat stosuje się związek określony w zastrz. 1, a jego hydrolizę bada się dokonując pomiaru spektrofotometrycznego lub pomiaru fluorescencji.
5. Sposób według zastrz. 4, znamienny tym, że aktywność hydrolaz oznacza się w surowych lub oczyszczonych preparatach organicznych i/lub preparatach biologicznych.
6. Sposób według zastrz. 4, znamienny tym, że oznacza się stereoselektywność reakcji katalizowanych przez hydrolazy, przy czym do oznaczeń stosuje się enancjomerycznie czyste lub wzbogacone pochodne kumaryn o wzorze 5.
PL407948A 2014-04-18 2014-04-18 Nowe pochodne kumaryny, sposób ich wytwarzania oraz ich zastosowanie w sposobie wykrywania i/lub oznaczania aktywności katalitycznej i stereoselektywności reakcji hydrolaz PL235848B1 (pl)

Priority Applications (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
PL407948A PL235848B1 (pl) 2014-04-18 2014-04-18 Nowe pochodne kumaryny, sposób ich wytwarzania oraz ich zastosowanie w sposobie wykrywania i/lub oznaczania aktywności katalitycznej i stereoselektywności reakcji hydrolaz

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
PL407948A PL235848B1 (pl) 2014-04-18 2014-04-18 Nowe pochodne kumaryny, sposób ich wytwarzania oraz ich zastosowanie w sposobie wykrywania i/lub oznaczania aktywności katalitycznej i stereoselektywności reakcji hydrolaz

Publications (2)

Publication Number Publication Date
PL407948A1 PL407948A1 (pl) 2015-10-26
PL235848B1 true PL235848B1 (pl) 2020-11-02

Family

ID=54330441

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
PL407948A PL235848B1 (pl) 2014-04-18 2014-04-18 Nowe pochodne kumaryny, sposób ich wytwarzania oraz ich zastosowanie w sposobie wykrywania i/lub oznaczania aktywności katalitycznej i stereoselektywności reakcji hydrolaz

Country Status (1)

Country Link
PL (1) PL235848B1 (pl)

Families Citing this family (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
PL448929A1 (pl) * 2024-06-21 2025-12-22 Instytut Chemii Organicznej Polskiej Akademii Nauk Nowe (kumaryno-7-amino)-acetamidy oraz ich zastosowania

Also Published As

Publication number Publication date
PL407948A1 (pl) 2015-10-26

Similar Documents

Publication Publication Date Title
CN106496204A (zh) 荧光探针和基于羧酸酯酶抑制法的农药残留检测试剂盒
EP2880045B1 (fr) Substrat de glycosidase fluorogène et procédé de détection associé
Zadlo et al. Mixed carbonates as useful substrates for a fluorogenic assay for lipases and esterases
Liu et al. Selective and sensitive detection and quantification of human carboxylesterase 1 by a ratiometric fluorescence probe
US7465814B2 (en) Sulfonate compound and fluorescent probe using the same
CN110105391B (zh) 碱性磷酸酶响应型分子探针及其应用
Żądło-Dobrowolska et al. Self-immolative versatile fluorogenic probes for screening of hydrolytic enzyme activity
PL235848B1 (pl) Nowe pochodne kumaryny, sposób ich wytwarzania oraz ich zastosowanie w sposobie wykrywania i/lub oznaczania aktywności katalitycznej i stereoselektywności reakcji hydrolaz
US4777269A (en) 7-Phenylacetic acid-4-alkyl-coumarinyl amides useful in fluorometric determination of the activity of hydrolases
Kitamura et al. Probing substrate recognition of bacterial lipoprotein signal peptidase using FRET reporters
US9518285B2 (en) Chemiluminescent compositions, methods, assays and kits for oxidative enzymes
WO2009067031A1 (en) Method for detection and/or assay of lovastatin esterase with use of fluorogenic/chromogenic reagent, lovastatin esterase isolated and/or purified by this method, assembly for detection and/or assay and use of fluorogenic/chromogenic reagent for detection and/or assay of lovastatin esterase
Levine et al. Sensitive fluorogenic substrate for alkaline phosphatase
Wu et al. Tetrabutylammonium Fluoride-Assisted Rapid Alkylation Reaction in Microtiter Plates for Discovery of Enzyme Inhibitors in Situ
JPS6058980A (ja) 新規カルボン酸エステルおよびその製法
Sicart et al. Fluorogenic substrates for lipases, esterases, and acylases using a TIM‐mechanism for signal release
JP4441606B2 (ja) スルホン酸エステル化合物およびそれを用いた蛍光プローブ
JP2006519001A (ja) シス−1,3−シクロヘキサンジオール誘導体のエナンチオマー形の製造法
Mori et al. Lipase-catalyzed asymmetric acylation of boron cluster-containing secondary alcohols
CN101472901B (zh) (s)-1-甲基-3-苯基哌嗪的立体选择性合成
Fulton et al. High-throughput screening assays for lipolytic enzymes
CN101287842A (zh) 用于测定生物活性血清对氧磷酶水平的方法和组合物
Qian et al. Fingerprint lipolytic enzymes with chromogenic p-nitrophenyl esters of structurally diverse carboxylic acids
US6528675B1 (en) Cyanohydrin ethers and esters as high-sensitivity enzyme substrates
US6756209B1 (en) 7-Alkoxycoumarins as CYP2C9 substrates and activity assay