PL422535A1 - Dwie pary oligonukleotydowych starterów do wykrywania obecności alleli dominującego lub recesywnego genu odporności na rdzę koronową Pc39 w genomie owsa zwyczajnego (Avena sativa L.), kombinacja dwóch par starterów oraz sposób wykrywania układu alleli genu Pc39 - Google Patents

Abstract

Przedmiotem zgłoszenia są dwie pary oligonukleotydowych starterów, mianowicie: silicoDArT2_F1 oraz silicoDArT2_R1 do wykrywania allelu dominującego genu odporności na rdzę koronową Pc39 w roślinach owsa o sekwencjach nr 1 i 2 przedstawionych na liście sekwencji oraz DArT2_F oraz DArT2_R do wykrywania allelu recesywnego genu Pc39 w roślinach owsa o sekwencjach nr 3 i 4 przedstawionych na liście sekwencji. Przedmiot wynalazku stanowi również kombinacja tych par. Przedmiotem zgłoszenia jest ponadto sposób identyfikacji allelu dominującego genu odporności na rdzę koronową Pc39 w roślinach owsa, w którym polimorficzny fragment DNA sprzężony z badanym genem amplifikowany jest w reakcji PCR z zastosowaniem pary starterów, po czym dokonuje się detekcji produktu amplifikacji, a parę starterów stanowi para oligonukleotydowych starterów o sekwencjach nr 1 i 2 przedstawionych na liście sekwencji, przy czym stosuje się marker silicoDArT2. W wyniku reakcji PCR amplifikowany jest fragment DNA o długości 42 par zasad o sekwencji nr 5 przedstawionej na liście sekwencji. Natomiast identyfikację allelu recesywnego genu Pc39 w roślinach owsa, prowadzi się według sposobu, w którym polimorficzny fragment DNA sprzężony z badanym genem amplifikowany jest w reakcji PCR z zastosowaniem pary starterów, po czym dokonuje się detekcji produktu amplifikacji, przy czym parę starterów stanowi para oligonukleotydowych starterów o sekwencjach nr 3 i 4 przedstawionych na liście sekwencji, przy czym stosuje się marker DArT2. W wyniku reakcji PCR amplifikowany jest fragment DNA o długości 420 par zasad o sekwencji nr 6 przedstawionej na liście sekwencji.