RS62351B1 - Supstituisani derivati karbonukleozida korisni kao antikancerogena sredstva - Google Patents

Supstituisani derivati karbonukleozida korisni kao antikancerogena sredstva

Info

Publication number
RS62351B1
RS62351B1 RS20211156A RSP20211156A RS62351B1 RS 62351 B1 RS62351 B1 RS 62351B1 RS 20211156 A RS20211156 A RS 20211156A RS P20211156 A RSP20211156 A RS P20211156A RS 62351 B1 RS62351 B1 RS 62351B1
Authority
RS
Serbia
Prior art keywords
mmol
cancer
methyl
mixture
pyrrolo
Prior art date
Application number
RS20211156A
Other languages
English (en)
Inventor
Robert Arnold Kumpf
Indrawan James Mcalpine
Michele Ann Mctigue
Ryan Patman
Eugene Yuanjin Rui
John Howard Tatlock
Michelle Bich Tran-Dube
Martin James Wythes
Original Assignee
Pfizer
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Pfizer filed Critical Pfizer
Publication of RS62351B1 publication Critical patent/RS62351B1/sr

Links

Classifications

    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K31/00Medicinal preparations containing organic active ingredients
    • A61K31/02Halogenated hydrocarbons
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K31/00Medicinal preparations containing organic active ingredients
    • A61K31/13Amines
    • A61K31/135Amines having aromatic rings, e.g. ketamine, nortriptyline
    • A61K31/137Arylalkylamines, e.g. amphetamine, epinephrine, salbutamol, ephedrine or methadone
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K31/00Medicinal preparations containing organic active ingredients
    • A61K31/33Heterocyclic compounds
    • A61K31/395Heterocyclic compounds having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. guanethidine or rifamycins
    • A61K31/495Heterocyclic compounds having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. guanethidine or rifamycins having six-membered rings with two or more nitrogen atoms as the only ring heteroatoms, e.g. piperazine or tetrazines
    • A61K31/505Pyrimidines; Hydrogenated pyrimidines, e.g. trimethoprim
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K31/00Medicinal preparations containing organic active ingredients
    • A61K31/33Heterocyclic compounds
    • A61K31/395Heterocyclic compounds having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. guanethidine or rifamycins
    • A61K31/495Heterocyclic compounds having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. guanethidine or rifamycins having six-membered rings with two or more nitrogen atoms as the only ring heteroatoms, e.g. piperazine or tetrazines
    • A61K31/505Pyrimidines; Hydrogenated pyrimidines, e.g. trimethoprim
    • A61K31/519Pyrimidines; Hydrogenated pyrimidines, e.g. trimethoprim ortho- or peri-condensed with heterocyclic rings
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K31/00Medicinal preparations containing organic active ingredients
    • A61K31/33Heterocyclic compounds
    • A61K31/395Heterocyclic compounds having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. guanethidine or rifamycins
    • A61K31/53Heterocyclic compounds having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. guanethidine or rifamycins having six-membered rings with three nitrogens as the only ring hetero atoms, e.g. chlorazanil, melamine
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P35/00Antineoplastic agents
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P35/00Antineoplastic agents
    • A61P35/02Antineoplastic agents specific for leukemia
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P35/00Antineoplastic agents
    • A61P35/04Antineoplastic agents specific for metastasis
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P43/00Drugs for specific purposes, not provided for in groups A61P1/00-A61P41/00
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07CACYCLIC OR CARBOCYCLIC COMPOUNDS
    • C07C255/00Carboxylic acid nitriles
    • C07C255/01Carboxylic acid nitriles having cyano groups bound to acyclic carbon atoms
    • C07C255/32Carboxylic acid nitriles having cyano groups bound to acyclic carbon atoms having cyano groups bound to acyclic carbon atoms of a carbon skeleton containing at least one six-membered aromatic ring
    • C07C255/34Carboxylic acid nitriles having cyano groups bound to acyclic carbon atoms having cyano groups bound to acyclic carbon atoms of a carbon skeleton containing at least one six-membered aromatic ring with cyano groups linked to the six-membered aromatic ring, or to the condensed ring system containing that ring, by unsaturated carbon chains
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07DHETEROCYCLIC COMPOUNDS
    • C07D237/00Heterocyclic compounds containing 1,2-diazine or hydrogenated 1,2-diazine rings
    • C07D237/02Heterocyclic compounds containing 1,2-diazine or hydrogenated 1,2-diazine rings not condensed with other rings
    • C07D237/06Heterocyclic compounds containing 1,2-diazine or hydrogenated 1,2-diazine rings not condensed with other rings having three double bonds between ring members or between ring members and non-ring members
    • C07D237/10Heterocyclic compounds containing 1,2-diazine or hydrogenated 1,2-diazine rings not condensed with other rings having three double bonds between ring members or between ring members and non-ring members with hetero atoms or with carbon atoms having three bonds to hetero atoms with at the most one bond to halogen, e.g. ester or nitrile radicals, directly attached to ring carbon atoms
    • C07D237/22Nitrogen and oxygen atoms
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07DHETEROCYCLIC COMPOUNDS
    • C07D239/00Heterocyclic compounds containing 1,3-diazine or hydrogenated 1,3-diazine rings
    • C07D239/02Heterocyclic compounds containing 1,3-diazine or hydrogenated 1,3-diazine rings not condensed with other rings
    • C07D239/24Heterocyclic compounds containing 1,3-diazine or hydrogenated 1,3-diazine rings not condensed with other rings having three or more double bonds between ring members or between ring members and non-ring members
    • C07D239/28Heterocyclic compounds containing 1,3-diazine or hydrogenated 1,3-diazine rings not condensed with other rings having three or more double bonds between ring members or between ring members and non-ring members with hetero atoms or with carbon atoms having three bonds to hetero atoms with at the most one bond to halogen, directly attached to ring carbon atoms
    • C07D239/32One oxygen, sulfur or nitrogen atom
    • C07D239/42One nitrogen atom
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07DHETEROCYCLIC COMPOUNDS
    • C07D239/00Heterocyclic compounds containing 1,3-diazine or hydrogenated 1,3-diazine rings
    • C07D239/70Heterocyclic compounds containing 1,3-diazine or hydrogenated 1,3-diazine rings condensed with carbocyclic rings or ring systems
    • C07D239/72Quinazolines; Hydrogenated quinazolines
    • C07D239/78Quinazolines; Hydrogenated quinazolines with hetero atoms directly attached in position 2
    • C07D239/84Nitrogen atoms
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07DHETEROCYCLIC COMPOUNDS
    • C07D251/00Heterocyclic compounds containing 1,3,5-triazine rings
    • C07D251/02Heterocyclic compounds containing 1,3,5-triazine rings not condensed with other rings
    • C07D251/12Heterocyclic compounds containing 1,3,5-triazine rings not condensed with other rings having three double bonds between ring members or between ring members and non-ring members
    • C07D251/14Heterocyclic compounds containing 1,3,5-triazine rings not condensed with other rings having three double bonds between ring members or between ring members and non-ring members with hydrogen or carbon atoms directly attached to at least one ring carbon atom
    • C07D251/16Heterocyclic compounds containing 1,3,5-triazine rings not condensed with other rings having three double bonds between ring members or between ring members and non-ring members with hydrogen or carbon atoms directly attached to at least one ring carbon atom to only one ring carbon atom
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07DHETEROCYCLIC COMPOUNDS
    • C07D251/00Heterocyclic compounds containing 1,3,5-triazine rings
    • C07D251/02Heterocyclic compounds containing 1,3,5-triazine rings not condensed with other rings
    • C07D251/12Heterocyclic compounds containing 1,3,5-triazine rings not condensed with other rings having three double bonds between ring members or between ring members and non-ring members
    • C07D251/14Heterocyclic compounds containing 1,3,5-triazine rings not condensed with other rings having three double bonds between ring members or between ring members and non-ring members with hydrogen or carbon atoms directly attached to at least one ring carbon atom
    • C07D251/16Heterocyclic compounds containing 1,3,5-triazine rings not condensed with other rings having three double bonds between ring members or between ring members and non-ring members with hydrogen or carbon atoms directly attached to at least one ring carbon atom to only one ring carbon atom
    • C07D251/18Heterocyclic compounds containing 1,3,5-triazine rings not condensed with other rings having three double bonds between ring members or between ring members and non-ring members with hydrogen or carbon atoms directly attached to at least one ring carbon atom to only one ring carbon atom with nitrogen atoms directly attached to the two other ring carbon atoms, e.g. guanamines
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07DHETEROCYCLIC COMPOUNDS
    • C07D471/00Heterocyclic compounds containing nitrogen atoms as the only ring hetero atoms in the condensed system, at least one ring being a six-membered ring with one nitrogen atom, not provided for by groups C07D451/00 - C07D463/00
    • C07D471/02Heterocyclic compounds containing nitrogen atoms as the only ring hetero atoms in the condensed system, at least one ring being a six-membered ring with one nitrogen atom, not provided for by groups C07D451/00 - C07D463/00 in which the condensed system contains two hetero rings
    • C07D471/06Peri-condensed systems
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07DHETEROCYCLIC COMPOUNDS
    • C07D487/00Heterocyclic compounds containing nitrogen atoms as the only ring hetero atoms in the condensed system, not provided for by groups C07D451/00 - C07D477/00
    • C07D487/02Heterocyclic compounds containing nitrogen atoms as the only ring hetero atoms in the condensed system, not provided for by groups C07D451/00 - C07D477/00 in which the condensed system contains two hetero rings
    • C07D487/04Ortho-condensed systems
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07DHETEROCYCLIC COMPOUNDS
    • C07D491/00Heterocyclic compounds containing in the condensed ring system both one or more rings having oxygen atoms as the only ring hetero atoms and one or more rings having nitrogen atoms as the only ring hetero atoms, not provided for by groups C07D451/00 - C07D459/00, C07D463/00, C07D477/00 or C07D489/00
    • C07D491/02Heterocyclic compounds containing in the condensed ring system both one or more rings having oxygen atoms as the only ring hetero atoms and one or more rings having nitrogen atoms as the only ring hetero atoms, not provided for by groups C07D451/00 - C07D459/00, C07D463/00, C07D477/00 or C07D489/00 in which the condensed system contains two hetero rings
    • C07D491/04Ortho-condensed systems
    • C07D491/044Ortho-condensed systems with only one oxygen atom as ring hetero atom in the oxygen-containing ring
    • C07D491/048Ortho-condensed systems with only one oxygen atom as ring hetero atom in the oxygen-containing ring the oxygen-containing ring being five-membered
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07DHETEROCYCLIC COMPOUNDS
    • C07D519/00Heterocyclic compounds containing more than one system of two or more relevant hetero rings condensed among themselves or condensed with a common carbocyclic ring system not provided for in groups C07D453/00 or C07D455/00

Landscapes

  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Animal Behavior & Ethology (AREA)
  • Veterinary Medicine (AREA)
  • Public Health (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Pharmacology & Pharmacy (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Epidemiology (AREA)
  • General Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
  • Oncology (AREA)
  • Emergency Medicine (AREA)
  • Hematology (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Pharmaceuticals Containing Other Organic And Inorganic Compounds (AREA)
  • Saccharide Compounds (AREA)
  • Nitrogen Condensed Heterocyclic Rings (AREA)
  • Plural Heterocyclic Compounds (AREA)
  • Nitrogen And Oxygen Or Sulfur-Condensed Heterocyclic Ring Systems (AREA)
  • Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
  • Silicon Polymers (AREA)
  • Management, Administration, Business Operations System, And Electronic Commerce (AREA)

Description

Opis
Oblast pronalaska
[0001] Ovaj pronalazak se odnosi na nove derivate karbonukleozida korisne u tretmanu nenormalnog rasta ćelija, kao što je kancer, kod sisara. Ovaj pronalazak se takođe odnosi na ova jedinjenja za upotrebu u tretmanu nenormalnog rasta ćelija kod sisara, posebno ljudi i na farmaceutske kompozicije kao antikancerogena sredstva.
Poreklo pronalaska
[0002] Post-translaciona modifikacija ostataka arginina metilacijom je važna za mnoge kritične ćelijske procese, uključujući remodeliranje hromatina, transkripciju gena, translaciju proteina, transdukciju signala, spajanje RNK i proliferaciju ćelija. Metilaciju arginina katalizuju enzimi protein arginin metil transferaze (PRMT). Postoji ukupno devet članova PRMT, a za osam je zabeležena enzimatička aktivnost na ciljane supstrate.
[0003] Enzimi familije protein arginin metil transferaze (PRMT) koriste S-adenozil metionin (SAM) za transfer metil grupa na ostatke arginina kod ciljanih proteina. Tip I PRMTe katališe formiranje mono-metil arginina i asimetričnih di-metil arginina dok Tip II PRMTe katališe mono-metil arginin i simetrične di-metil arginine. PRMT5 je Tip II enzima, koji dva puta prenosi metil grupu od SAM do dva ω-gvanidino atoma azota arginina, dovodeći do ω-NG, N’G di-simetrične metilacije proteina substrata.
[0004] PRMT5 protein je nađen i u nukleusu i u citoplazmi i ima višestruke protein substrate kao što su histoni, faktori transkripcije i splajsozomni proteini. PRMT5 ima vezujućeg partnera, Mep50 (metilozomni protein 50) i funkcioniše u višestrukim kompleksima proteina. PRMT5 je povezan sa hromatih remodelirajućim kompleksima (SWI/SNF, NuRD) i epigenično kontroliše gene uključene u razvoj, proliferaciju i diferencijaciju ćelija, uključujući tumor supresore, metilacijom histona (Karkhanis, V. et al., Versatility of PRMT5 Induced Metilation in Growth Control and Development,Trends Biochem Sci 36(12) 633-641 (2011)). PRMT5 takođe kontroliše ekspresiju gena sjedinjavanjem sa kompleksima proteina u angažovanju PRMT5 da metiliše nekoliko faktora transkripcije p53 (Jansson, M. et al., Arginine Metilation Regulates the p53 Response, Nat. Cell Biol.10, 1431-1439 (2008)); E2F1 (Zheng, S. et al., Arginine Metilation-Dependent Reader-Writer Interplay Governs Growth Control by E2F-1, Mol Cell 52(1), 37-51 (2013)); HOXA9 (Bandyopadhyay, S. et al., HOXA9 Metilation by PRMT5 je Essential for Endothelial Cell Expression of Leukocyte Adhesion Molecules, Mol. Cell. Biol.32(7):1202-1213 (2012)); i NFκB (Wei, H. et al., PRMT5 dimetilates R30 of the p65 Subunit do Activate NFκB, PNAS 110(33), 13516-13521 (2013)). U citoplazmi, PRMT5 ima različite linije substrata uključene u druge ćelijske funkcije, uključujući spajanje RNK splicing (Sm proteini), golgi sklapanje (gm130), biogeneze ribozoma (RPS10), piRNK posredstvom utišavanja gena (Piwi proteini) i EGFR signalizaciju (Karkhanis, 2011).
[0005] Drugi radovi koji se odnose na PRMT5 uključuju: Aggarwal, P. et al., (2010) Nuclear Cyclin D1/CDK4 Kinase Regulates CUL4B Expression and Triggers Neoplastic Growth via Activation of the PRMT5 Metiltransferase, Cancer Cell 18: 329-340; Bao, X. et al., Overexpression of PRMT5 Promotes Tumor Cell Growth and je Associated with Poor Disease Prognosis in Epithelial Ovarian Cancer, J Histochem Cytochem 61: 206-217 (2013); Cho E. et al., Arginine Metilation Controls Growth Regulation by E2F1, EMBO J.31(7) 1785-1797 (2012); Gu, Z. et al., Protein Arginine Metiltransferase 5 Functions in Opposite Ways in the Cytoplasm and Nucleus of Prostate Cancer Cells, PLoS One 7(8) e44033 (2012); Gu, Z. et al., Protein Arginine Metiltransferase 5 is Essential for Growth of Lung Cancer Cells, Biochem J.446: 235-241 (2012); Kim, J. et al., Identification of Gastric Cancer Related Genes Using cDNA Microarray Containing Novel Expressed Sequence Tags Expressed in Gastric Cancer Cells, Clin Cancer Res.11(2) 473-482 (2005); Nicholas, C. et al., PRMT5 is Upregulated in Malignant and Metastatic Melanoma and Regulates Expression of MITF and p27(Kip1), PLoS One 8(9) e74710 (2012); Powers, M. et al., Protein Arginine Metiltransferase 5 Accelerates Tumor Growth by Arginine Metilation of the Tumor Suppressor Programmed Cell Death 4, Cancer Res. 71(16) 5579-5587 (2011); Wang, L. et al., Protein Arginine Metiltransferase 5 Suppresses the Transcription of the RB Family of Tumor Suppressors in Leukemia and Lymphoma Cells, Mol. Cell Biol.28(20), 6262-6277 (2008).
[0006] PRMT5 se prekomerno pojavljuje u brojnim kancerima i uočena je u uzorcima pacijenta i ćelijskim linijama, uključujući limfom B-ćelija i leukemiju (Wang, 2008) i sledećim solidnim tumorima: želuca (Kim 2005) jednjaka (Aggarwal, 2010), dojke (Powers, 2011), pluća (Gu, 2012), prostate (Gu, 2012), melanoma (Nicholas 2012), kolona (Cho, 2012) i jajnika (Bao, 2013). U brojnim od ovih kancera, prekomerno pojavljivanje PRMT5 je u korelaciji sa lošom prognozom. Nenormalna metilacija arginina PRMT5 substrata je povezana pored kancera sa drugim indikacijama, kao što su metabolički poremećaji, inflamatorna i autoimuna bolest i hemaglobinopatija.
Kratak sadržaj pronalaska
[0007] Polazeći od njegove uloge u regulaciji različitih bioloških procesa, PRMT5 je atraktivni cilj za modulaciju sa inhibitorima male molekule. Do danas, je razvijeno malo efektivnih PRMT5 inhibitora i ni jedan PRMT5 nije ušao na kliniku.
[0008] Svako od ostvarenja niže opisanih jedinjenja iz ovog pronalaska može da se kombinuje sa bilo kojim drugim ostvarenjem jedinjenja opisanih u ovom pronalasku bez nedoslednosti sa ostvarenjem sa kojim se kombinuje. Osim toga, svako od niže datih ostvarenja koja opisuju pronalazak se odnosi i na farmaceutski prihvatljive soli jedinjenja iz pronalaska. U skladu sa tim, izraz "ili njegova farmaceutski prihvatljiva so" je sadržan u opisu svih jedinjenja koja su ovde opisana.
[0009] Pronalazak uključuje jedinjenja formule (III):
ili njihovu farmaceutski prihvatljivu so, pri čemu:
svaki R<1>je nezavisno izabran iz grupe koja se sastoji od (C1-C8)alkil, (C1-C8)haloalkil, hidroksi, (C1-C8)alkoksi, (C5-C12)aril, 5-12 člane heteroaril, (C3-C10)cikloalkil, 3-12 člane heterociklil, OR<4>, SR<4>i N(R<4>)2grupe;
R<2>je vodonik, halogen, (C1-C8)alkil, hidroksi, (C1-C8)alkoksi ili N(R<5>)2grupa, gde je svaki R<5>nezavisno vodonik ili (C1-C8)alkil grupa, ili se dva R<5>spajaju da formiraju 4-6 člani heterociklični prsten koji sadrži 1-3 heteroatoma izabrana od N, O i S; svaki R<3>je nezavisno vodonik, hidroksi ili NH2grupa; ili kada je D C(R<3>)2, R<3>je dodatno izabran od fluora;
svaki R<9>je nezavisno vodonik ili fluor;
D je C(R<3>)2, O, ili S(O)1-2;
E je NR<1>, CH2, C(R<1>)2, O ili -S(O)2;
svaki R<8>nije prisutan ili je nezavisno izabran iz grupe koja se sastoji od (C1-C8)alkil, (C1-C8)haloalkil, hidroksi, (C1-C8)alkoksi, (C5-C12)aril, 5-12 člane heteroaril, (C3-C10)cikloalkil, 3-12 člane heterociklil, OR<4>, SR<4>, N(R<4>)2, CN, halogena i CON(R<4>)2grupe, gde su dva R<8>opciono spojena da formiraju 4-6 člani spiro-cikloalkil prsten, cikloalkil kondenzovani prsten, ili alkilen most i gde su dva R<8>opciono spojena da formiraju karbonil grupu;
svaki R<4>je nezavisno A-R<14>, gde A nije prisutan, ili je (C1-C3)alkil, -C(O)- ili -SO2-grupa, a R<14>je vodonik, (C1-C8)alkil, (C5-C12)aril, 5-12 člana heteroaril, (C3-C10)cikloalkil ili 3-12 člana heterociklil grupa, ili su dva R<4>spojena da formiraju 4-6 člani heterociklični prsten koji sadrži 1-3 heteroatoma izabrana od N, O i S;
Q nije prisutan ili je dvovalentni radikal izabran od O, S, NH i (C1-C8)alkilen grupe; V je N ili C, pri čemu ukoliko V formira dvostruku vezu, V je ugljenik;
W je N ili C, pri čemu ukoliko W formira dvostruku vezu, W je ugljenik;
X je N ili C, pri čemu ukoliko X formira dvostruku vezu, X je ugljenik;
Y je CR<10>, N, NR<10>, O ili S, gde je svaki R<10>nezavisno izabran od vodonika, (C1-C8)alkil, hidroksi, (C1-C8)alkoksi, halogena, SH, S-(C1-C8)alkil i N(R<11>)2grupe ukoliko je Y CR<10>, gde Y formira dvostruku vezu sa susednim članom prstena kada je Y CR<10>ili N i gde je svaki R<11>nezavisno vodonik, (C1-C8)alkil, (C5-C12)aril ili 5-12 člana heteroaril grupa ili su dva R<11>spojena da formiraju 4-6 člani heterociklični prsten koji sadrži 1-3 heteroatoma izabrana od N, O i S, ili Y je C(R<10>)2grupa a dva R<10>i ugljenik za koji su vezani formiraju karbonil ili tiokarbonil grupu;
Z je CR<12>, N, NR<12>, O ili S, gde je svaki R<12>nezavisno izabran od vodonika, (C1-C8)alkil, hidroksi, (C1-C8)alkoksi, fluora, hlora, broma, SH, S-(C1-C8)alkil i N(R<13>)2grupe, gde Z formira dvostruku vezu sa susednim članom prstena ukoliko je to CR<12>ili N, gde je svaki R<13>nezavisno vodonik, (C1-C8)alkil, (C5-C12)aril ili 5-12 člana heteroaril grupa, ili su dva R<13>spojeni da formiraju 4-6 člani heterociklični prsten koji sadrži 1-3 heteroatoma izabrana od N, O i S i gde Z nije NR<12>ukoliko je X = N, V je C, W je C a Y je CR<10>, ili Z je C(R<12>)2a dva R<12>i ugljenik za koji su vezani formiraju karbonil ili tiokarbonil grupu; i
svaka ----- je opciono veza, gde može da bude prisutno ne više od dve ne-susedne -----.
[0010] Ovaj pronalazak takođe uključuje jedinjenja formule (IV):
ili njihovu farmaceutski prihvatljivu so, pri čemu:
svaki R<1>je nezavisno izabran iz grupe koja se sastoji od (C1-C8)alkil, (C1-C8)haloalkil, hidroksi, (C1-C8)alkoksi, (C5-C12)aril, 5-12 člane heteroaril, (C3-C10)cikloalkil, 3-12 člane heterociklil, OR<4>, SR<4>i N(R<4>)2grupe;
R<2>je vodonik, halogen, (C1-C8)alkil, hidroksi, (C1-C8)alkoksi ili N(R<5>)2grupa gde je svaki R<5>nezavisno vodonik ili (C1-C8)alkil grupa, ili su dva R<5>spojena da formiraju 4-6 člani heterociklični prsten koji sadrži 1-3 heteroatoma izabrana od N, O i S;
svaki R<3>je nezavisno vodonik, hidroksi ili NH2grupa; ili kada je D C(R<3>)2, R<3>je dodatno izabran od fluora;
svaki R<9>je nezavisno vodonik ili fluor;
D je C(R<3>)2, O, ili S(O)2grupa;
B je N ili C;
E je NR<1>, CH2, C(R<1>)2, O ili -S(O)2grupa;
svaki R<8>nije prisutan ili je nezavisno izabran iz grupe koja se sastoji od (C1-C8)alkil, (C1-C8)haloalkil, hidroksi, (C1-C8)alkoksi, (C5-C12)aril, 5-12 člane heteroaril, (C3-C10)cikloalkil, 3-12 člane heterociklil, OR<4>, SR<4>, N(R<4>)2, CN, halogena i CON(R<4>)2grupe, gde su dva R<8>opciono spojena da formiraju 4-6 člani spiro-cikloalkil prsten, cikloalkil kondenzovani prsten, ili alkilen most i gde su dva R<8>opciono spojena da formiraju karbonil grupu;
svaki R<4>je nezavisno A-R<14>, gde A nije prisutan, ili je (C1-C3)alkil, -C(O)- ili -SO2-grupa i R<14>je vodonik, (C1-C8)alkil, (C5-C12)aril, 5-12 člana heteroaril, (C3-C10)cikloalkil ili 3-12 člana heterociklil grupa, ili su dva R<4>spojena da formiraju 4-6 člani heterociklični prsten koji sadrži 1-3 heteroatoma izabrana od N, O i S;
Q nije prisutan ili je dvovalentni radikal izabran od O, S, NH i (C1-C8)alkilen grupe; V je N ili C, pri čemu ukoliko V formira dvostruku vezu, V je ugljenik;
W je N ili C, pri čemu ukoliko W formira dvostruku vezu, W je ugljenik;
X je N ili C, pri čemu ukoliko X formira dvostruku vezu, X je ugljenik;
Y je CR<10>, N, NR<10>, O ili S, gde je svaki R<10>nezavisno izabran od vodonika, (C1-C8)alkil, hidroksi, (C1-C8)alkoksi, halogena, SH, S-(C1-C8)alkil i N(R<11>)2grupe ukoliko je Y = CR<10>, gde Y formira dvostruku vezu sa susednim članom prstena kada je Y = CR<10>ili N i gde je svaki R<11>nezavisno vodonik, (C1-C8)alkil, (C5-C12)aril ili 5-12 člana heteroaril grupa ili su dva R<11>spojena da formiraju 4-6 člani heterociklični prsten koji sadrži 1-3 heteroatoma izabrana od N, O i S, ili Y je C(R<10>)2i dva R<10>i ugljenik za koji su vezani formiraju karbonil ili tiokarbonil grupu;
Z je CR<12>, N, NR<12>, O ili S, gde je svaki R<12>nezavisno izabran od vodonika, (C1-C8)alkil, hidroksi, (C1-C8)alkoksi, fluora, hlora, broma, SH, S-(C1-C8)alkil i N(R<13>)2grupe, gde Z formira dvostruku vezu sa susednim članom prstena ukoliko je to CR<12>ili N, gde je svaki R<13>nezavisno vodonik, (C1-C8)alkil, (C5-C12)aril ili 5-12 člana heteroaril grupa, ili su dva R<13>spojena da formiraju 4-6 člani heterociklični prsten koji sadrži 1-3 heteroatoma izabrana od N, O i S i gde Z nije NR<12>ukoliko je X = N, V je C, W je C i Y je CR<10>, ili Z je C(R<12>)2grupa a dva R<12>i ugljenik za koji su vezani formiraju karbonil ili tiokarbonil grupu; i
svaka ----- je opciono veza, gde može da bude prisutno ne više od dve ne-susedne-----.
[0011] Naredna ostvarenja iz ovog pronalaska uključuju jedinjenja kako je ovde opisano, gde je
je izabran od:
[0013] Naredna ostvarenja iz ovog pronalaska uključuju jedinjenja kako je ovde opisano, gde
1
je izabrano od:
Ċ
je:
[0015] Naredna ostvarenja ovog pronalaska uključuju jedinjenja izabrana od:
ili njihove farmaceutski prihvatljive soli.
[0016] U nekim ostvarenjima ovog pronalaska, jedinjenje je izabrano od:
2
ili njihovih farmaceutski prihvatljivih soli.
[0017] Naredna ostvarenja ovog pronalaska uključuju jedinjenja izabrana od:
2
ili njihove farmaceutski prihvatljive soli.
[0018] U ovom pronalasku su takođe obezbeđene farmaceutske kompozicije koje uključuju jedinjenje kako je ovde opisano i farmaceutski prihvatljiv nosač.
[0019] Takođe dalje, ovaj pronalazak daje jedinjenje kako je ovde opisano za upotrebu u tretmanu nenormalnog rasta ćelija kod sisara. Nenormalni rast ćelija je kancer. Kancer na koji se ovo odnosi može da bude kancer pluća, kancer kostiju, kancer pankreasa, kancer kože, kancer glave ili vrata, kutenozna ili intraokularna melanoma, kancer materice, kancer jajnika, kancer rektuma, kancer analnog regiona, kancer želuca, kancer kolona, kancer dojke, kancer materice, karcinom jajovoda, karcinom endometrijuma, karcinom grlića materice, karcinom vagine, karcinom vulve, Hočkinsova bolest, kancer jednjaka, kancer tankog creva, kancer endokrinog sistema, kancer tiroidne žlezde, kancer paratiroidne žlezde, kancer nadbubrežne žlezde, sarkom mekog tkiva, kancer uretera, kancer penisa, kancer prostate, hronična ili akutna leukemija, limfocitni limfomi, kancer mokraćne bešike, kancer bubrega ili uretera, karcinom renalnih ćelija, karcinom bubrežne čašice, neoplazme centralnog nervnog sistema (CNS), primarni limfom CNS, tumori kičmene moždine, glioma stem ćelija mozga ili adenom hipofize.
Definicije
[0020] Ukoliko nije drugačije navedeno, niže dati nazivi korišćeni u specifikaciji i zahtevima imaju značenja koja su niže navedena.
[0021] "Alkenil" se odnosi na alkil grupu, kako je ovde definisano, koja se sastoji od najmanje dva atoma ugljenika i najmanje jedne ugljenik-ugljenik dvostruke veze. U reprezentativne primere spadaju, ali se ne ograničavaju samo na, etenil,1-propenil, 2-propenil, 1-, 2-, ili 3-butenil i slično. "Alkenilen" se odnosi na dvovalentni oblik alkenila.
[0022] "Alkoksi" se odnosi na -O-alkil gde je alkil preferirano C1-C8, C1-C7, C1-C6, C1-C5, C1-C4, C1-C3, C1-C2ili C1alkil.
[0023] "Alkil" se odnosi na zasićeni alifatični ugljovodonični radikal uključujući grupe ravnog lanca i račvastog lanca od 1 do 20 atoma ugljenika ("(C1-C20)alkil"), preferirano 1 do 12 atoma ugljenika ("(C1-C12)alkil"), još poželjnije 1 do 8 atoma ugljenika ("(C1-C8)alkil"), ili 1 do 6 atoma ugljenika ("(C1-C6)alkil"), ili 1 do 4 atoma ugljenika ("(C1-C4)alkil"). Primeri alkil grupa uključuju metil, etil, propil, 2-propil, n-butil, izo-butil, terc-butil, pentil, neopentil i slično. "Haloalkil" na primer (C1-C8)haloalkil, se odnosi na alkil grupu koja ima jedan ili više halogen supstituenata. "Alkilen" se odnosi na dvovalentni oblik alkil grupe.
[0024] "Alkinil" se odnosi na alkil grupu, kako je ovde definisano, koja se sastoji od najmanje dva atoma ugljenika i najmanje jedne ugljenik-ugljenik trostruke veze. U reprezentativne primere spadaju, ali se ne ograničavaju samo na, etinil, 1-propinil, 2-propinil, 1-, 2-, ili 3-butinil i slično. "Alkenilen" se odnosi na dvovalentni oblik alkinil grupe.
[0025] "Amino" se odnosi na -NR<x>R<y>grupu, gde su i R<x>i R<y>vodonik.
[0026] "(C6-C12)aril" se odnosi na monociklične grupe samo sa ugljenikom ili policiklične grupe kondenzovanog prstena sa 6 do 12 atoma ugljenika koje imaju potpuno konjugovan sistem pi-elektrona. Slično tome, "(C5-C12)aril" se odnosi na monociklične grupe samo sa ugljenikom ili policiklične grupe kondenzovanog prstena sa 5 do 12 atoma ugljenika koje imaju potpuno konjugovan sistem pi-elektrona. Primeri, bez ograničenja, aril grupa su fenil, naftalenil i antracenil grupe.
[0027] "Cijano" se odnosi na -C≡N grupu. Cijano može da se označi kao CN.
[0028] "(C3-C10)cikloalkil" se odnosi na 3 do 10 člani monociklični prsten samo sa ugljenikom, 3 do 10 člani biciklični prsten samo sa ugljenikom, 5/6 člani ili 6/6 člani kondenzovani biciklični prsten samo sa ugljenikom, multiciklični kondenzovani prsten ("kondenzovani" sistem prstena označava da svi prstenovi u sistemu međusobno dele susedni par atoma ugljenika u sistemu) pri čemu jedan ili više prstenova može da sadrži jednu ili više dvostrukih veza ali ni jedan od prstenova nema potpuno konjugovan sistem pi-elektrona i premošteni sistem prstena samo sa ugljenikom. Primeri, bez ograničenja, cikloalkil grupa su ciklopropan, ciklobutan, ciklopentan, ciklopenten, cikloheksan, cikloheksadien, adamantan, cikloheptan, cikloheptatrien i slično.
[0029] "Halogen" ili skraćenica "halo" se odnosi na fluor, hlor, brom i jod. Preferirano, halogen se odnosi na fluor ili hlor.
[0030] "Heteroalkil" se odnosi na alkil grupu ravnog lanca ili račvastog lanca od 1 do 20 atoma ugljenika, preferirano 1 do 12 atoma ugljenika, još poželjnije 1 do 8 atoma ugljenika, ili 1 do 6 atoma ugljenika, ili 1 do 4 atoma ugljenika, pri čemu su jedan, dva ili tri atoma ugljenika zamenjena sa heteroatomom izabranim od NR<x>, N, O i S(O)n(gde je n = 0, 1 ili 2). Uobičajeno, heteroatomi, ukoliko je prisutno više od jednog heteroatoma, nisu međusobno susedni. Primeri haloalkila uključuju alkil etre, sekundarne i tercijerne alkil amine, amide, alkil sulfide i slično, Grupa može da bude terminalna grupa ili premoštavajuća grupa. Kako se ovde koristi, reference za normalni lanac kada se koristi u kontekstu premoštavajuće grupe se odnosi direktno na atome lanca koji vezuju dva terminalna položaja premoštavajuće grupe. "Heteroalkenil" se odnosi na heteroalkil grupu koja ima jednu ili više ugljenik-ugljenik dvostrukih veza. "Heteroalkilen" se odnosi na dvovalentni oblik heteroalkil grupe.
"Heteroalkenilen" se odnosi na dvovalentni oblik heteroalkenil grupe.
[0031] "Heteroaril" se odnosi na grupu monocikličnog ili kondenzovanog prstena sa 5 do 12 atoma ugljenika u prstenu koji sadrži jedan, dva, tri ili četiri heteroatoma prstena izabranih od NR<x>, N, O i S(O)n (gde je n 0, 1 ili 2) a, pored toga, ima potpuno konjugovan sistem pielektrona. Preferirane heteroaril grupe uključuju (C2-C7)heteroaril u skladu sa prethodnom definicijom. Primeri, bez ograničenja, nesupstituisanih heteroaril grupa su pirol, furan, tiofen, imidazol, oksazol, tiazol, pirazol, piridin, pirimidin, hinolin, izohinolin, purin, tetrazol, triazin i karbazol. Farmaceutski prihvatljiva heteroaril grupa je ona koja je dovoljno stabilna da se veže za jedinjenje iz pronalaska, da se formuliše u farmaceutsku kompoziciju a nakon toga primeni na pacijentu kome je to potrebno. U primere tipičnih monocikličnih heteroaril grupa spadaju, ali se ne ograničavaju samo na:
[0032] Primeri pogodnih heteroaril grupa kondenzovanog prstena uključuju, ali se ne ograničavaju samo na:
pirolo[3,2-b]piridin imidazol[4,5-b]piridin imidazol[4,5-c]piridin pirazolo[4,3-d]piridin (pirolo[3,2-b]piridinil) (imidazol[4,5-b]piridinil) (imidazol[4,5-c]piridinil) (pirazolo[4,3-d]piridinil)
pirazolo[4,3-c]piridin pirazolo[3,4-c]piridin pirazolo[3,4-b]piridin izoindol (pirazolo[4,3-c]piridinil) (pirazolo[3,4-c]piridinil) (pirazolo[3,4-b]piridinil) (izoindol)
indazol purin indolizin imidazol[1,2-apiridin imidazo[1,5-a]piridin (indazolil) (purinil) (indolinil) (imidazo[1,2-a]piridinil) (imidazo[1,5-a]piridinil)
pirazolo[1,5-a]piridin pirolo[1,2-b]piridazin imidazo[1,2-c]pirimidin (pirazolo[1,5-a]pirimidinil) (pirolo[1,2-b]piridazinil) (imidazo[1,2-c]pirimidinil)
5H-pirolo[3,2-b]pirazin 1H-pirazolo[4,3-b]pirazin 1H-pirazolo[3,4-d]pirimidin 7H-pirolo[2,3-d]pirimidin
hinolin izohinnolin cinolin hinazolin (hinolinil) (izohinolinil) (cinolinil) (azahinazolin)
4
hinoksalin ftalazin 1,6-naftiridin 1,7-naftiridin (hinoksalinil) (ftalazinil) (1,6-naftiridinil) (1,7-naftiridinil)
1,8-naftiridin 1,5-naftiridin 2,6-naftiridin 2,7-naftiridin 81,8-naftiridinil) (1,5-naftiridinil) (2,6-naftiridinil) (2,7-naftiridinil)
pirido[3,2-d]pirimidin pirido[4,3-d]pirimidin pirido[3,4-d]pirimidin (pirido[3,2-d]pirimidinil) (pirido[4,3-d]pirimidinil) (pirido[3,4-d]pirimidinil)
pirido[2,3-d]pirimidin pirido[2,3-b]pirazin pirido[3,4-b]pirazin (pirido[2,3-d]pirimidinil) (pirido[2,3-b]pirazinil) (pirido[3,4-b]pirazinil)
pirimido[5,4-d]pirimidin pirazino[2,3-b]pirazin pirimido[4,5-d]pirimidin (pirimido[5,4-d]pirimidinil) (pirazino[2,3-b]pirazinil) (pirimido[4,5-d]pirimidinil)
[0033] "Heterociklil" se odnosi na monocikličini ili kondenzovani sistem prstenova koji ima 3 do 12 atoma u prstenu i sadrži jedan, dva, tri ili četiri heteroatoma u prstenu izabranih od N, O i S(O)n(gde je n = 0, 1 ili 2) i 1-9 atoma ugljenika. Prstenovi mogu takođe da imaju jednu ili više dvostrukih veza. Međutim, prstenovi nemaju potpuno konjugovani sistem pi-elektrona Preferirani heterociklusi uključuju (C2-C6)heterocikluse u skladu sa prethodno datom definicijom. Primeri pogodnih zasićenih heteroalicikličnih grupa uključuju, ali se ne ograničavaju samo na:
1,4-dioksepan 1,4-oksatiepan 1,4-oksaazepan 1,4-ditiepan (1,4-dioksepanil) (1,4-oksatiepanil) (1,4-oksaazepanil) (1,4-ditiepanil)
1,4-tieazepan 1,4-diazepan
(1,4-tieazepanil) (1,4-diazepanil)
[0034] Primeri pogodnih delimično nezasićenih heteroalicikličnih grupa uključuju, ali se ne ograničavaju samo na:
3,4-dihidro-2H-piran 5,6-dihidro-2H-piran 2H-piran
(3,4-dihidro-2H-piranil) (5,6-dihidro-2H-piranil) (2H-piranil)
1,2,3,4-tetrahidropiridin 1,2,5,6-tetrahidropiridin
(1,2,3,4-tetrahidropiridinil) (1,2,5,6-tetrahidropiridinil)
[0035] Osim toga, heterociklus može da sadrži premošćivanje, uključujući premošćivanje između ne-susednih ugljenika na heterociklusu, sa mostom koji sadrži 1-2 ugljenika i 0-1 heteroatoma izabranih od NR<x>, O i S(O)n(gde je n = 0, 1 ili 2).
[0036] "Hidroksi" ili "hidroksil" se odnosi na -OH grupu.
[0037] "In vitro" se odnosi na procedure koje se izvode u veštačkoj sredini kao što je, na primer, bez ograničenja, u test epruveti ili medijumu za kulturu.
[0038] "In vivo" se odnosi na procedure koje se izvode unutar živog organizma kao što su, bez
4
ograničenja, miševi, pacovi ili zečevi.
[0039] "Opciono" ili "opcionalno" označava da naknadno opisani događaj ili okolnosti mogu ali ne moraju da se dese i da opis uključuje slučajeve kada su se događaj ili okolnosti desile i slučajeve u kojima nisu. Na primer, "heterociklična grupa opciono supstituisana sa alkil grupom" znači da alkil grupa nije obavezno prisutna a opis obuhvata situacije gde je heterociklična grupa supstituisana sa alkil grupom i situacije kada heterociklična grupa nije supstituisana sa alkil grupom.
[0040] "Organizam" se odnosi na bilo koje živo biće sastavljeno od najmanje jedne ćelije. Živi organizam može da bude prost, kao na primer, jedna eukariotična ćelija ili kompleksan kao sisari, uključujući ljude.
[0041] "Farmaceutski prihvatljiva podloga" se odnosi na inertnu supstancu dodatu u farmaceutsku kompoziciju da dalje omogući primenu jedinjenja. Primeri podloga, bez ograničenja, uključuju kalcijum karbonat, kalcijum fosfat, različite šećere i tipove skroba, derivate ceuloze, želatin, biljna ulja i polietilen glikole.
[0042] Kako se ovde koristi, naziv "farmaceutski prihvatljiva so" se odnosi na one soli koje zadržavaju biološku efikasnost i osobine osnovnog jedinjenja. Ovakve soli uključuju:
(i) soli nastale dodatkom kiseline, koje mogu da se dobiju reakcijom slobodne baze osnovnog jedinjenja sa neorganskim kiselinama kao što su hlorovodonična kiselina, bromovodonična kiselina, azotna kiselina, fosforna kiselina, sumporna kiselina, perhlorna kiselina i slično, ili sa organskim kiselinama kao što su sirćetna kiselina, oksalna kiselina, (D) ili (L) jabučna kiselina, maleinska kiselina, metansulfonska kiselina, etansulfonska kiselina, p-toluensulfonska kiselina, salicilna kiselina, vinska kiselina, limunska kiselina, sukcinska kiselina ili malonska kiselina i slično; ili
(ii) soli formirane kada se kiseli proton prisutan u osnovnom jedinjenju ili zameni sa jonom metala, na primer jonom alkalnog metala, jonom zemno alkalnog metala ili jonom aluminijuma; ili reaguje sa organskom bazom kao što su etanolamin, dietanolamin, trietanolamin, trometamin, N-metilglukamin i slično.
[0043] "Farmaceutska kompozicija" se odnosi na smešu jednog ili više jedinjenja koja su ovde opisana ili njihove fiziološki/farmaceutski prihvatljive soli, solvata, hidrata ili prolekova, sa drugim hemijskim komponentama, kao što su fiziološki/farmaceutski prihvatljivi nosači ili podloge. Uloga farmaceutske kompozicije je da olakša primenu jedinjenja na organizam.
[0044] Kako se ovde koristi, "fiziološki/farmaceutski prihvatljiv nosač" se odnosi na nosač ili razblaživač koji ne izaziva značajnu iritaciju organizma i ne poništava biološku aktivnost i osobine primenjenog jedinjenja.
[0045] "Terapeutski efektivna količina" se odnosi na količinu primenjenog jedinjenja koja će do neke mere da olakša jedan ili više simptoma poremećaja koji se tretira. Kada je u pitanju tretman kancera, terapeutski efektivna količina se odnosi na količinu koja ima najmanje jedan od narednih efekata:
redukuje veličinu tumora;
inhibira (to jest, usporava do izvesne mere, preferirano zaustavlja) metastaze tumora; do izvesnog nivoa inhibira (to jest, do izvesne mere usporava, preferirano zaustavlja) rasat tumora i do izvesne mere olakšava (ili preferirano eliminiše) jedan ili više simptoma povezanih sa kancerom.
[0046] "Lečenje", "tretiranje" i "tretman" se odnosi na postupak ublažavanja ili poništavanja ćelijskog poremećaja nastalog posredstvom metiltransferaze i/ili njegovih pratećih simptoma. Posebno u vezi sa kancerom, ovi nazivi jednostavno znače da će očekivano trajanje života pojedinca obolelog od kancera biti produženo ili da će jedan ili više simptoma bolesti biti smanjeno.
Detaljan opis
[0047] Opšte šeme za sintezu jedinjenja iz pronalaska mogu ovde da se nađu u delu Primera. Ukoliko nije drugačije navedeno, sve ovde date reference za inventivna jedinjenja uključuju reference za njihove soli, solvate, hidrate i komplekse i na solvate, hidrate i komplekse njihovih soli, uključujući sve njihove polimorfe, stereoizomere i izotopno obeležene verzije.
[0048] Farmaceutski prihvatljive soli uključuju soli nastale dodavanjem kiseline i baze (uključujući disoli). Odgovarajuće soli nastale dodatkom kiseline se formiraju od kiselina koje grade ne-toksične soli. Primeri uključuju acetatne, aspartatne, benzoatne, besilatne, bikarbonatne/karbonatne, bisulfatne/sulfatne, boratne, kamsilatne, citratne, edisilatne, esilatne, formatne, fumaratne, gluceptatne, glukonatne, glukuronatne, heksafluorofosfatne, hibenzatne, hidrohloridne/hloridne, hidrobromidne/bromidne, hidrojodidne/jodidne, izetionatne, laktatne, malatne, maleatne, malonatne, mesilatne, metilsulfatne, naftilatne, 2-napsilatne, nikotinatne,
4
nitratne, orotatne, oksalatne, palmitatne, pamoatne, fosfatne/hidrogen fosfatne/dihidrogen fosfatne, saharatne, stearatne, sukcinatne, tartaratne, tosilatne i trifluoroacetatne soli.
[0049] Odgovarajuće bazne soli se formiraju od baza koje grade ne-toksične soli. Primeri uključuju soli aluminijuma, arginina, benzatina, kalcijuma, holina, dietilamina, diolamina, glicina, lizina, magnezijuma, meglumina, olamina, kalijuma, natrijuma, trometamina i cinka. Za pregled odgovarajućih soli videti "Handbook of Pharmaceutical Salts: Properties, Selection, and Use" by Stahl and Wermuth (Wiley-VCH, Weinheim, Germany, 2002).
[0050] Od interesa su tosilatne, hidrohloridne i mesilatne soli.
[0051] Farmaceutski prihvatljiva so inventivnih jedinjenja može lako da se izradi mešanjem zajedno rastvora jedinjenja i željene kiseline ili baze, po potrebi. So može da precipitira iz rastvora i može da se sakupi filtriranjem ili može da se povrati uparavanjem rastvarača.
Stepen jonizacije soli može da varira od potpuno jonizovane do skoro ne-jonizovane.
Jedinjenja iz pronalaska mogu da egzistiraju i u ne-solvatisanim i u solvatisanim oblicima. Naziv ’solvat’ se ovde koristi da opiše molekularni kompleks koji uključuje jedinjenje iz pronalaska i jednu ili više molekula farmaceutski prihvatljivog rastvarača, na primer, etanola. Naziv ’hidrat’ se koristi kada je rastvarač voda. Farmaceutski prihvatljivi solvati u skladu sa pronalaskom uključuju hidrate i solvate pri čemu rastvarač za kristalizaciju može da bude izotopno supstituisan, na primer, D2O, d6-aceton, d6-DMSO. Takođe, u okvir pronalaska su uključeni kompleksi kao što su klatrati, kompleksi inkluzije lek-domaćin pri čemu, za razliku od preethodno pomenutih solvata, lek i domaćin su prisutni u stehiometrijskim ili nestehiometrijskim količinama. Takođe su uključeni kompleksi leka koji sadrže dve ili više organskih i/ili neorganskih komponenti koje mogu da budu u stehiometrijskim ili nestehiometrijskim količinama. Nastali kompleks može da bude jonizovan, delimično jonizovan ili ne-jonizovan. Za pregled ovakvih kompleksa, videti J Pharm Sci, 64 (8), 1269-1288 by Haleblian (August 1975). Takođe, u okviru pronalaska su polimorfi i izomeri (uključujući optičke, geometrijske i tautomerne izomere) inventivnih jedinjenja, derivati jedinjenja iz pronalaska koji sami mogu da imaju malu ili da nemaju farmakološku aktivnost ali mogu, kada se primene na pacijentu, da se konvertuju u inventivna jedinjenja, na primer, hidrolitičkim cepanjem. Ovakvi derivati su označeni kao ’prolekovi’. Dodatne informacije za upotrebu prolekova mogu da se nađu u ’Pro-drugs as Novel Delivery Systems, Vol.14, ACS Symposium Series (T Higuchi and W Stella) and ’Bioreversible Carriers in Drug Design’, Pergamon Press, 1987 (ed. E B Roche, American Pharmaceutical Association).
[0052] Prolekovi mogu, na primer, da se izrade zamenom odgovarajućih funkcionalnih grupa
4
prisutnih u inventivnim jedinjenjima sa nekim radikalima poznatim stručnjaku sa iskustvom u tehnici kao ’pro-radikali’ kako je opisano, na primer, u “Design of Prodrugs” by H Bundgaard (Elsevier, 1985).
[0053] Neki primeri prolekova uključuju:
(i) kada jedinjenje sadrži karboksilnu kiselu funkcionalnu grupu –(COOH), njegov estar, na primer, zamenom vodonika sa (C1-C8)alkil grupom;
(ii) kada jedinjenje sadrži alkoholnu funkcionalnu grupu (-OH), njegov etar, na primer, zamenom vodonika sa (C1-C6)alkanoilmetil grupom; i
(iii) kada jedinjenje sadrži primarnu ili sekundarnu amino funkcionalnu grupu (-NH2ili -NHR gde R ≠ H), njegov amid, na primer, zamenom jednog ili oba vodonika sa (C1-C10)alkanoil grupom.
[0054] Drugi primeri zamenjenih grupa u skladu sa prethodno datim primerima i primeri drugih tipova prolekova mogu da se nađu u prethodno pomenutim referencama.
Konačno, neka inventivna jedinjenja mogu sama da deluju kao prolekovi drugih inventivnih jedinjenja.
[0055] Jedinjenja iz pronalaska koja sadrže jedan ili više asimetričnih atoma ugljenika mogu da egzistiraju kao dva ili više stereoizomera. Kada jedinjenja u skladu sa ovim pronalaskom imaju najmanje jedan asimetrični centar, ona mogu u skladu sa tim da egzistiraju kao enantiomeri. Kada jedinjenja poseduju dva ili više asimetričnih centara, mogu dodatno da egzistiraju kao diastereomeri. Isto tako, kada jedinjenje iz pronalaska sadrži ciklopropil grupu ili neku drugu cikličnu grupu gde postoji asimetričnost i alkenil ili alkenilen grupu, mogući su geometrijski cis/trans (ili Z/E) izomeri. Kada jedinjenje sadrži, na primer, keto ili oksim grupu ili aromatični ostatak, može da dođe do tautomernog izomerizma (’tautomerizam’). Jedno jedinjenje može da ispolji više od jednog tipa izomerizma.
[0056] Okvirom pronalaska su uključeni svi stereoizomeri, geometrijski izomeri i tautomerni oblici inventivnih jedinjenja, uključujući jedinjenja koja ispoljavaju više od jednog tipa izomerizma i smeše jednog ili više njih. Takođe su uključene soli nastale dodatkom kiseline ili baze u kojima je kaunterjon optički aktivan, na primer, D-laktat ili L-lizin, ili racemati, na primer, DL-tartarat ili DL-arginin.
Cis/trans izomeri mogu da se razdvoje uobičajenim tehnikama dobro poznatim stručnjaku sa iskustvom u praksi, na primer, hromatografijom i frakcionom kristalizacijom.
4
Uobičajene tehnike za izradu/izdvajanje pojedinačnih enantiomera uključuju asimetričnu sintezu iz pogodnog optički čistog prekursora ili rezoluciju racemata (ili racematnih soli ili derivata) koristeći, na primer, asimetričnu visoko efikasnu tečnu hromatografiju (HPLC) ili superkritičnu hromatografiju fluida (SFC).
[0057] Alternativno, racemat (ili racematni prekursor) može da reaguje sa odgovarajućim optički aktivnim jedinjenjem, na primer alkoholom, ili u slučaju kada jedinjenje sadrži kiseli ili bazni ostatak, sa kiselinom ili bazom kao što je vinska kiselina ili 1-feniletilamin. Nastala diastereomerna smeša može da se razdvoji hromatografijom i/ili frakcionom kristalizacijom a jedan ili oba diastereomera konvertuju u odgovarajući čist enantiomer(e) načinima koji su dobro poznati stručnjaku sa iskustvom u praksi.
Stereoizomerni konglomerati mogu da se razdvoje uobičajenim tehnikama poznatim stručnjaku sa iskustvom u praksi; videti, na primer, "Stereochemistry of Organic Jedinjenjes" by E L Eliel (Wiley, New York, 1994).
[0058] Pronalazak takođe uključuje izotopno-obeležena jedinjenja iz pronalaska, pri čemu je jedan ili više atoma zamenjeno sa atomom koji ima isti atomski broj ali su atomska masa ili maseni broj različiti od atomske mase ili masenog broja koji se obično nalazi u prirodi.
Primeri izotopa pogodnih za uključivanje u jedinjenja iz pronalaska uključuju izotope vodonika, kao što su<2>H i<3>H, ugljenika, kao što su<11>C,<13>C i<14>C, hlora, kao što je<36>Cl, fluora, kao što je<18>F, joda, kao što su<123>I i<125>I, azota, kao što su<13>N i<15>N, kiseonika, kao što su<15>O,<17>O i<18>O, fosfora, kao što je<32>P i sumpora, kao što je<35>S. Neka izotopno-obeležena jedinjenja iz pronalaska, na primer, ona u kojima je inkorporiran radioaktivni izotop, su korisna u studijama lekova i/ili distribucije supstrata tkiva. Radioaktivni izotopi tricijum,<3>H i ugljenik-14,<14>C, su posebno korisni u ovu svrhu zbog svoje lake inkorporacije i lakog načina detekcije. Supstitucija sa težim izotopima, kao što je deuterijum,<2>H, može da donese neke terapeutske prednosti koje su rezultat veće metaboličke stabilnosti, na primer, povećanje poluživota in vivo ili smanjenje potrebne doze i na taj način mogu da imaju prednost u nekim situacijama. Supstitucija sa izotopima koji emituju pozitrone, kao što su<11>C,<18>F,<15>O i<13>N, može da bude korisna u studijama pozitron emisionom topografijom (PET) za ispitivanje zauzetosti receptora supstrata.
[0059] Izotopno-obeležena jedinjenja iz pronalaska mogu generalno da se izrade uobičajenim tehnikama poznatim stručnjaku sa iskustvom u praksi ili procesima analognim sa ovde opisanim procesima, korišćenjem odgovarajućeg izotopno-obeleženog reagensa umesto neobeleženog reagensa koji se inače koristi.
4
[0060] Farmaceutski prihvatljivi solvati u skladu sa pronalaskom uključuju one u kojima rastvarač za kristalizaciju može da bude izotopno supstituisan, na primer, D2O, d6-aceton, d6-DMSO.
[0061] Jedinjenja iz pronalaska namenjena za farmaceutsku upotrebu mogu da se primene kao kristalni ili amorfni produkti ili njihove smeše. Mogu da se dobiju, na primer, kao čvrste ploče, praškovi ili filmovi, postupcima kao što su precipitacija, kristalizacija, sušenje zamrzavanjem, sušenje raspršivanjem ili sušenje uparavanjem. U ovu svrhu mogu takođe da se koriste sušenja mikrotalasima ili radiofrekvencijom.
[0062] Jedinjenja mogu da se primene sama ili u kombinaciji sa jednim ili više drugih jedinjenja iz pronalaska. Generalno, primenjuju se kao formulacija sa jednom ili više farmaceutski prihvatljivih podloga. Naziv "podloga" se ovde koristi da opiše bilo koji satojak koji nije jedinjenje(a) iz pronalaska. Izbor podloge će u velikoj meri da zavisi od faktora kao što su određeni način primene, uticaj podloge na rastvorljivost i stabilnost i priroda doznog oblika.
[0063] Farmaceutske kompozicije pogodne za oslobađanje jedinjenja iz pronalaska i postupci za njihovu izradu biće jednostavan izbor za stručnjaka sa iskustvom u praksti. Ovakve kompozicije i postupci za njihovu izradu mogu da se nađu, na primer, u’Remington’s Pharmaceutical Sciences’, 19th Edition (Mack Publishing Company, 1995). Oralna primena: jedinjenja iz pronalaska mogu da se primene oralno. Oralna primena može da uključi gutanje tako da jedinjenje uđe u gastrointestinalni trakt ili može da se koristi bukalna ili sublingvalna primena pri kojoj jedinjenje ulazi u krvotok direktno iz usta.
[0064] Formulacije pogodne za oralnu primenu uključuju čvrste formulacije kao što su tablete, kapsule koje sadrže čvrste čestice, tečnosti ili praškove, lozenge (uključujući punjene tečnošću), gume za žvakanje, multi- i nano-partikulate, gele, čvrste rastvore, lipozome, filmove (uključujući mukoadhezivne), ovule, sprejove i tečne formulacije.
[0065] Tečne formulacije uključuju suspenzije, rastvore, sirupe i eliksire. Ovakve formulacije mogu da se koriste kao punioci u mekim ili čvrstim kapsulama i obično uključuju nosač, na primer, vodu, etanol, polietilen glikol, propilen glikol, metilcelulozu, ili pogodna ulja i jedan ili više emulgatora i/ili suspendujućih sredstava. Tečne formulacije mogu takođe da se izrade rekonstitucijom čvrstih oblika, na primer, iz sahete.
[0066] Jedinjenja iz pronalaska mogu takođe da se koriste u brzo rastvorljivim, brzo raspadljivim doznim oblicima kao što su oni opisani u Expert Opinion in Therapeutic Patents, 11 (6), 981-986 by Liang andChen (2001).
4
[0067] Za tablete kao dozne oblike, u zavisnosti od doze, lek može da čini od 1 mt% do 80 mt% doznog oblika, mnogo češće od 5 mt% do 60 mt% doznog oblika. Pored leka, tablete generalno sdrže sredstvo za raspadanje. Primeri sredstava za raspadanje uključuju natrijum skrob glikolat, natrijum karboksimetil celulozu, kalcijum karboksimetil celulozu, kroskarmelozu natrijum, krospovidon, polivinilpirolidon, metil celulozu, mikrokrisalnu celulozu, nižu alkil-supstituisanu hidroksipropil celulozu, skrob, preželatinizirani skrob i natrijum alginat. Generalno, sredstvo za raspadanje čini od 1 mt% do 25 mt%, preferirano od 5 mt% do 20 mt% doznog oblika.
[0068] Vezivna sredstva se generalno koriste da poboljšaju kohezivne kvalitete tabletne formulacije. U pogodna vezivna sredstva spadaju mikrokristalna celuloza, želatin, šećeri, polietilen glikol, prirodne i sintetičke gume, polivinilpirolidon, preželatinizirani skrob, hidroksipropil celuloza i hidroksipropil metilceluloza. Tabelate mogu takođe da sadrže razblaživače kao što su laktoza (monohidratna, monohidratna sušena raspršivanjem, anhidrovana i slično), manitol, ksilitol, dekstroza, saharoza, sorbitol, mikrokristalna celuloza, skrob i dibazni kalcijum fosfat dihidrat.
[0069] Tabelate mogu takođe opciono da uključe površinski aktivna sredstva, kao što su natrijum lauril sulfat i polisorbat 80 i glidanse kao što su silicijum dioksid i talk. Kada je prisutno, površinski aktivno sredstvo je obično u količini od 0.2 mt% do 5 mt% težine tablete, a glidansi obično od 0.2 mt% do 1 mt% težine tablete.
[0070] Tabelate takođe generalno sadrže lubrikanse kao što su magnezijum stearat, kalcijum stearat, cink stearat, natrijum stearil fumarat i smeše magnezijum stearata sa natrijum lauril sulfatom. Lubrikansi su generalno pristuni u količinama od 0.25 mt% do 10 mt%, preferirano od 0.5 mt% do 3 mt% težine tablete.
U druge uobičajene sastojke spadaju anti-oksidansi, boje, sredstva za korigovanje ukusa, konzervansi i sredstva za maskiranje ukusa.
[0071] Tabelate iz primera sadrže do približno 80 mt% leka, od približno 10 mt% do približno 90 mt% vezivno sredstvo, od približno 0 mt% do približno 85 mt% razblaživač, od približno 2 mt% do približno 10 mt% sredstvo za raspadanje i od približno 0.25 mt% do približno 10 mt% lubrikans.
[0072] Tabelatna smeša može da se komprimuje direktno ili da se preko valjka formiraju tablete. Tabelatna masa ili delovi mase mogu alternativno da se vlažno-, suvo- ili granuliraju topljenjem ili ekstrudiraju pre tabletiranja. Finalna formulacija može da uključi jedan ili više slojeva i može da bude obložena ili neobložena ili enkapsulirana.
[0073] Formulisanje tableta je detaljno obrađeno u "Pharmaceutical Dosage Forms: Tabelats, Vol. 1", by H. Lieberman and L. Lachman, Marcel Dekker, N.Y., N.Y., 1980 (ISBN 0-8247-6918-X).
[0074] Čvrste formulacije za oralnu primenu mogu da budu formulisane za trenutno i/ili modifikovano oslobađanje. Formulacije za modifikovane oslobađanje uključuju odloženo, kontinuirano, pulsirano, kontrolisano, ciljano i programirano oslobađanje.
[0075] Pogodne formulacije sa modifikovanim oslobađanjem su opisane u U.S. Patentu broj 6,106,864. Detalji drugih tehnologija za pogodno oslobađanje kao što su visoko energetske disperzije i osmotske i obložene čestice mogu da se nađu u Verma et al, Pharmaceutical Technology On-line, 25(2), 1-14 (2001). Upotreba guma za žvakanje za postizanje kontrolisanog oslobađanja je opisana u WO 00/35298.
Parenteralna primena
[0076] Jedinjenja iz pronalaska mogu takođe da se primene direktno u krvotok, u mišić ili u unutrašnji organ. Pogodni načini za parenteralnu primenu uključuju intravenski, intraarterijalno, intraperitonealno, intratekalno, intraventrikularno, intrauretralno, intrasternalno, intrakranijalno, intramuskularno i subkutano. Pogodna sredstva za parenteralnu primenu uključuju injektore sa iglom (uključujući mikro igle), injektore bez igle i infuzione tehnike.
[0077] Parenteralne formulacije su obično vodeni rastvori koji mogu da sadrže podloge kao što su soli, ugljeni hidrati i sredstva za puferovanje (preferirano do pH od 3 do 9), ali za neke aplikacije mogu da budu odgovarajuće formulisane kao sterilni ne-vodeni rastvori ili kao suvi oblik koji se koristi u konjukciji sa pogodnim vehikulumom kao što je sterilna, apirogena voda.
[0078] Izrada parenteralnih formulacija pod sterilnim uslovima, na primer, liofilizacijom, može lako da se izvede koristeći standardne farmaceutske tehnike dobro poznate stručnjaku sa iskutvom u tehnici
[0079] Rastvorljivost jedinjenja iz pronalaska koja se koriste u izradi parenteralnih rastvora može da se poveća korišćenjem odgovarajućih tehnika formulisanja, kao što je inkorporiranje sredstava koja pojačavaju rastvorljivost. Formulacije za parenteralnu primenu mogu da se formulišu da budu za trenutno i/ili modifikovano oslobađanje. Formulacije sa modifikovanim oslobađanjem uključuju odloženo, kontinuirano, pulsno, kontrolisano, ciljano i programirano
1
oslobađanje. Prema tome, jedinjenja iz pronalaska mogu da budu formulisana kao čvrsta, polu-čvrsta ili tiksotropna tečnost za primenu kao implantirani depo koji obezbeđuje modifikovano oslobađanje aktivnog jedinjenja. Primeri ovakvih formulacija uključuju stentove obložene lekom i PGLA mikrosfere.
Topična primena
[0080] Jedinjenja iz pronalaska mogu takođe da se primene topično na kožu ili mukozu, to jest, dermalno ili transdermalno. Tipične formulacije za ovu svrhu uključuju gele, hidrogele, losione, rastvore, kreme, masti, praškove za posipanje, prelive, pene, filmove, flastere, pločice, implante, sunđere, gaze, zavoje i mikroemulzije. Takođe mogu da se korite lipozomi. Uobičajeni nosači uključuju alkohol, vodu, mineralno ulje, tečni parafin, beli vazelin, glicerin, polietilen glikol i propilen glikol. Mogu da se inkorporiraju pojačivači penetracije, videti, na primer, J Pharm Sci, 88 (10), 955-958 by Finnin i Morgan (October 1999). Drugi načini topične primene uključuju oslobađanje elektroporacijom, jontoforeze, fonoforeze, sonoforeze i injekcije sa mikro iglom ili bez igle (na primer Powderject™, Bioject™, etc.).
[0081] Formulacije za topičnu primenu mogu da se formulišu da budu za trenutno i/ili modifikovano oslobađanje. Formulacije za modifikovano oslobađanje uključuju odloženo, kontinuirano, pulsirano, kontrolisano, ciljano i programirano oslobađanje.
Inhalaciona/intranazalna primena
[0082] Jedinjenja iz pronalaska mogu takođe da se primene intranazalno ili inhalacijom, obično u obliku suvog praška (ili sama, kao smeša, na primer, u suvoj mešavini sa laktozom ili kao mešavina čestica komponenti, na primer, smeša sa fosfolipidima, kao što je fosfatidilholin) iz inhalera suvog praška ili kao aerosol sprej iz kontejnera pod pritiskom, pumpom, sprejom, atomizerom (preferirano atomizer koji koristi elektrohidrodinamiku za produkciju fine magle) ili nebulizera sa ili bez upotrebe odgovarajućeg propelanta, kao što su 1,1,1,2-tetrafluoroetan ili 1,1,1,2,3,3,3- heptafluoropropan. Za intranazalnu upotrebu, prašak može da sadrži bioadhezivno sredstvo, na primer, hitozan ili ciklodekstrin.
[0083] Kontejner pod pritiskom, pumpa, sprej, atomizer ili nebulizer sadrži rastvor ili suspenziju jedinjenja iz pronalaska, uključujući, na primer, etanol, razblaženi etanol ili pogodno alternativno sredstvo za disperziju, solubilizaciju ili pojačavanje oslobađanja
2
aktivnog sastojka, propelant(e) kao rastvarač i opciono, surfaktant kao što su sorbitan trioleat, oleinska kiselina ili oligolaktatna kiselina.
[0084] Pre upotrebe u formulaciji suvog praška ili suspenzije, lekoviti produkt se mikronizira do veličine pogodne za oslobađanje inhalacijom (obično manje od 5 mikrona). Ovo može da se postigne bilo kojim odgovarajućim postupkom usitnjavanja kao što su mlevenje spiralnim mlazom, mlazno mlevenje sloja fluida, superkritično procesuiranje fluida da se formiraju nanočestice, homogenizacija visokim pritiskom ili sušenje raspršivanjem.
[0085] Kapsule (izrađene, na primer, od želatina ili HPMC), blisteri i kartridži za upotrebu u inhaleru ili insuflatoru mogu da se formulišu tako da sadrže praškastu smešu jedinjenja iz pronalaska, pogodne praškaste baze kao što su laktoza ili skrob i modifikator performansi, kao što su l-leucin, manitol ili magnezijum stearat. Laktoza može da bude anhidrovana ili u obliku monohidrata, poželjno je kao monohidrat. U druge pogodne podloge spadaju dekstran, glukoza, maltoza, sorbitol, ksilitol, fruktoza, saharoza i trehaloza.
[0086] Pogodna formulacija rastvora za upotrebu u atomizeru koji koristi elektrohidrodinamiku za produkciju fine magle može da sadrži od 1 µg do 20 mg jedinjenja iz pronalaska po aktiviranju a zapremina aktivirane formulacije može da varira od 1 µL do 100 µL. Uobičajena formulacija uključuje jedinjenje iz pronalaska, propilen glikol, sterilnu vodu, etanol i natrijum hlorid. Alternativni rastvarači koji mogu da se koriste umesto propilen glikola su glicerol i polietilen glikol.
[0087] Pogodni korigenski ukusa, kao što su mentol i levomentol, ili zaslađivači kao što su saharin ili saharin natrijum, mogu da se dodaju u ove formulacije iz pronalaska namenjene za primenu inhalacijom/intranazalno.
[0088] Formulacije za primenu inhalacijom/intranazalno mogu da budu formulisane za trenutno i/ili modifikovano oslobađanje, koristeći, na primer, poli(DL-laktatnu-koglikolnu kiselinu (PGLA). Formulacije sa modifikovanim oslobađanjem uključuju odloženo, kontinuirano, pulsirano, kontrolisano, ciljano i programirano oslobađanje.
[0089] U slučaju inhalera suvog praška i aerosola, dozna jedinica je određena pomoću ventila koji oslobađa određenu količinu. Jedinice u skladu sa pronalaskom su obično izrađene da oslobode odmerenu dozu ili "puf" koji sadrži željenu količinu jedinjenja iz pronalaska.
Ukupna dnevna doza može da se primeni kao jedna doza ili, mnogo češće, kao podeljene doze u toku dana.
[0090] Rektalna/intravaginalna primena: jedinjenja iz pronalaska mogu da se primene rektalno ili vaginalno, na primer, u obliku supozitorija, pesara ili enema. Kakao buter je tradicionalna podloga za supozitorije, ali po potrebi mogu da se koriste različite alternative. Formulacije za rektalnu/vaginalnu primenu mogu da budu formulisane za trenutno i/ili modifikovano oslobađanje. Formulacije sa modifikovanim oslobađanjem uključuju odloženo, kontinuirano, pulsirano, kontrolisano, ciljano i programirano oslobađanje.
[0091] Okularna primena: jedinjenja iz pronalaska mogu takođe da se primene direktno u oko ili uho, obično u obliku kapi, mikronizirane suspenzije ili rastvora u izotoničnom, pH-podešenom, sterilnom fiziološkom rastvoru. Druge formulacije pogodne za okularnu i auralnu primenu uključuju masti, biodegradibilne (na primer, apsorptivne gel sunđere, kolagen) i nebiodegradibilne (na primer silikon) implante, pločice, sočiva i partikulate ili vezikularne sisteme, kao što su niozomi ili lipozomi. Polimer kao što su unakrsno vezana poliakrilna kiselina, polivinilalkolol, hijaluronska kiselina, celulozni polimer, na primer, hidroksipropilmetilceluloza, hidroksietilceluloza ili metil celuloza ili heteropolisaharidni polimer na primer, gelan guma, mogu da budu inkorporirani zajedno sa konzervansom kao što je benzalkonijum hlorid. Ovakve formulacije mogu takođe da se oslobode jontoforezom.
[0092] Formulacije za okularnu/auralnu primenu mogu da budu formulisane za trenutno i/ili modifikovane oslobađanje. Formulacije sa modifikovanim oslobađanjem uključuju odloženo, kontinuirano, pulsirano, kontrolisano, ciljano i programirano oslobađanje.
Druge tehnologije
[0093] Jedinjenja iz pronalaska mogu da se kombinuju sa rastvorljivim makromolekularnim entitetima kao što su ciklodekstrin i njegovi pogodni derivati ili polimeri koji sadrže polietilen glikol, da bi se povećala njihova rastvorljivost, brzina rastvaranja, maskiranje ukusa, bioraspoloživost i/ili stabilnost za upotrebu u bilo kom od prethodno pomenutih načina primene.
[0094] Nađeno je da su kompleksi lek-ciklodekstrin, na primer, generalno korisni za najveći broj doznih oblika i načina primene. Mogu da se koriste i inkluzioni i ne-inkluzioni kompleksi. Kao alternativa za direktno kompleksiranje sa lekom, ciklodekstrin može da se koristi kao pomoćni aditiv, to jest, kao nosač, razblaživač ili solubilizator. U ovu svrhu se najčešće koriste alfa, beta i gama ciklodekstrini, čiji primeri mogu da se nađu u PCT Publication Nos. WO 91/11172, WO 94/02518 i WO 98/55148.
[0095] Doziranje: količina primenjenog aktivnog jedinjenja će da zavisi od subjekta koji se tretira, težine poremećaja ili stanja, brzine primene, dispozicije jedinjenja i odluke
4
ordinirajućeg lekara. Međutim, efektivna doza je tipično u rasponu od 0.001 do približno 100 mg po kg telesne težine dnevno, poželjno je od približno 0.01 do približno 35 mg/kg/dan, u jednoj ili podeljenim dozama. Za čoveka od 70 kg, ova količina bi bila od približno 0.07 do približno 7000 mg/dan, preferirano približno 0.7 do približno 2500 mg/dan. U nekim slučajevima, vrednosti doza ispod donje granice prethodno pomenutog opsega mogu da budu više nego adekvatne, dok u drugim slučajevima čak i veće doze mogu da se koriste bez izazivanja bilo kakvog neželjenog sporednog efekta, gde su ovakve veće doze obično podeljene u više manjih doza za primenu u toku dana.
[0096] Delovi kompleta: sve dok to može da bude poželjno za primenu kombinacije aktivnih jedinjenja, na primer, u cilju lečenja određene bolesti ili stanja, u okviru ovog pronalaska je da dve ili više farmaceutskih kompozicija, od kojih najmanje jedna sadrži jedinjenje u skladu sa pronalaskom, mogu uobičajeno da se kombinuju u obliku kita pogodnog za ko-primenu kompozicija. Prema tome, kit iz pronalaska uključuje dve ili više odvojenih farmaceutskih kompozicija, od kojih najmanje jedna sadrži jedinjenje iz pronalaska i sredstvo za odvojeno čuvanje ovih kompozicija, kao što su kontejner, podeljena boca ili podeljena blister folija. Primer ovakvog kita je poznato blister pakovanje koje se koristi za pakovanje tableta, kapsula i slično.
[0097] Kit iz pronalaska je posebno pogodan za primenu različitih doznih oblika, na primer, oralno i parenteralno, za primenu odvojenih kompozicija u različitim doznim intervalima ili za titraciju zasebnih kompozicija jedne protiv drugih. Za pomoć pri korišćenju, kit obično sadrži uputstvo za primenu i može da ima i podsetnik za upotrebu.
PRIMERI
[0098] Za neke opisane faze može da bude potrebno da se zaštite potencijalno reaktivne funkcionalne grupe koje ne treba da reaguju i nakon toga da se izvrši cepanje navedenih zaštitnih grupa. U tom slučaju, može da se koristi bilo koji kompatibilni zaštitni radikal. U određenim postupcima zaštite i deprotekcije mogu da se koriste oni koji su opisani od strane T.W. Greene (Protective Groups in Organic Synthesis, A. Wiley-Interscience Publication, 1981) ili od strane P. J. Kocienski (Protecting groups, Georg Thieme Verlag, 1994).
[0099] Sve ovde navedene reakcije i izrade novih početnih materijala koji su ovde korišćeni su uobičajeni, a odgovarajući reagensi i uslovi reakcije za njihovo izvođenje i izradu kao i procedure za izdvajanje željenih produkata će biti dobro poznate stručnjaku sa iskustvom u praksi prema referencama iz postojeće literature i primera i izrada datim u njima.
[0100] Ovde mogu da se koriste sledeće skraćenice:
Ac (acetil); AcCl (acetil hlorid); AcOH ili HOAc (sirćetna kiselina); Ac2O (sirćetni anhidrid); aq. (vodeni); Boc ili boc (terc-butoksikarbonil); ca. (približno ili aproksimativno); CDCl3(deuterisani hloroform); CH2Cl2i/ili DCM (dihlormetan); DAST (Dietilaminosumpor trifluorid); DCE (dihloretan); DEA (dietilamin); DIBAL ili DIBAL-H (diizobutilaluminijum hidrid); DIC (diizopropilkarbodiimid); DIPEA ili Hunigova baza (N,N-diizopropiletilamin); DMA (dimetilacetamid); DMF (dimetilformamid); DME (etilen glikol); DMP (Dess-Martin perjodinan); DMAP (4-dimetil-aminopiridin); DMSO (dimetilsulfoksid); DMSO-d6(deuterisani dimetilsulfoksid); EDC ili EDCl (1-etil-3-(3-dimetilaminopropil)-karbodiimid); Et (etil); Et3N ili TEA (trietilamin); EtOH (etanol); EtOAc (etil acetat); Et2O (dietil etar); g ili gm (gram ili grami); HATU (2-(7-aza-1H-benzotriazol-1-il)-1,1,3,3-tetrametiluronijum heksafluorofosfat); HBTU (o-(benzotriazol-1-il)-1,1,3,3-tetrametiluronijum heksafluorofosfat); HMPT (Tris(dimetilamino)fosfin); HPLC (visoko efikasna tečna hromatografija); HOBT (1-hidroksi benzotriazol); h ili hr (sat ili sati, po potrebi); iBu (izobutil); IPA (izo-propil alkohol); iPr (izopropil); iPrOAc (izopropil acetat); KHMDS (kalijum bis(trimetilsilil)amid); KOAc (kalijum acetat); LCMS (tečna hromatografija-masena spektrometrija); LiH-MDS (litijum bis(trimetilsilil)amid); Me (metil); MeOH (metanol); MeOD (deuterisani metanol); MeCN (acetonitril); m ili min (minut ili minuti, po potrebi); mg (miligram ili miligrami); Ms (metilsulfonil); MsCl (metansulfonil hlorid); N (normal); NBS (N-Bromosukcinimid); NFSI (N-Fluorodibenzensulfonimid); NMR (nuklearna magnetna rezonanca); nBu (n-butil); nBuLi (n-butil litijum); nPr (n-propil); Pd/C (paladijum na ugljeniku); Pd2(dba)3(tris(dibenzilidenaceton)dipaladijum(0)); Pd(dppf)Cl2([1,1’-bis(difenilfosfino)ferocen]dihlorpaladijum(II)); Ph (fenil); PTSA ili pTSA (p-toluen sulfonska kiselina); Rt (vreme zadržavanja); rt (sobna temperatura); RuCl(p-cimen)[(R,R)-Ts-DPEN] ([N-[(1R,2R)-2-(Amino-κN)-1,2-difeniletil]-4-metilbenzensulfonamidatoκN]hlor[(1,2,3,4,5,6-η)-1-metil-4-(1-metiletil)benzen]-rutenijum); s ili sec (sekund ili sekunde, po potrebi); Select-fluor (N-hlormetil-N’-fluorotrietilendiamonijum bis(tetrafluoroborat)); SEM (2-Trimetilsililetoksimetoksi); SFC (superkritična tečna hromatografija); Si-Thiol (silicijum 1-propantiol); T3P (propilfosfonski anhidrid); TBAF (tetrabutil amonijum fluorid); TBDMSCI (t-butil-dimetilsilil hlorid); TBME ili MTBE (tercbutil metil etar); t-BuOH (2-metil-2-propanol, terc-butanol ili terc-butil alkohol); TDA-1 (Tris[2-(2-metoksietoksi)etil]amin ili Tris(3,6-dioksaheptil)amin); TEA, NEt3ili Et3N (trietilamin); TFA (trifluorosirćetna kiselina); THF (tetrahidrofuran); THP (tetrahidropiran); TLC (hromatografija na tankom sloju); TMS (trimetilsilil); TMSCl (trimetilsilil hlorid); TMSCF3(Trimetil(tri-fluorometil)silan); Tos ili tosil (4-toluensulfonil); TOSMIC (ptoluensulfonilmetil izocijanid); UV (ultraljubičast).
Opšte šeme sinteze za jedinjenja karbonukleozida
[0101]
ŠEMA 1
redukcija deprotekcija
[0102] Kao što je pokazano u Šemi 1, jedinjenje kao što je 1a može da se nabavi ili sintetiše (Chem. Rev., 2012, 112 (8), pp 4642-4686). Uobičajeno, metil (1S,2R,3S,4R)-4-amino-2,3-dihidroksiciklopentan-1-karboksilat može da reaguje sa odgovarajuće funkcionalizovanim pirimidinom ili drugim heterociklusom da se dobiju jedinjenja kao što je 1b. Ova reakcija može da se izvede standardnom nukleofilnom aromatičnom supstitucijom koristeći diizopropiletilamin ili trimetilamin u DMSO, DMA ili DMF ili korsteći cezijum fluorid u PDMSO. Alternativni uslov reakcije može da uključi reakciju udvajajućeg metala kao što je udvajajući paladijum. Ciklizacija jedinjenja kao što je 1b do jedinjenja kao što je 1c može da se vrši pod različitim uslovima uključujući kondenzaciju ili udvajanje metala u zavisnosti od tipa atoma na A. Zaštita diola da se dobije 1d može da se izvede upotrebom acetona ili 2,2-dimetoksipropana u slaboj kiselini. Estri kao što je 1d se konvertuju u alkil ili aril ketone kao što je 1e upotrebom alkil i aril metalnih reagenasa kao što su alkil i aril Grignardi (M= Mg), alkil i aril reagensi litijuma, alkil i aril kuprati, alkil i aril cinkati kao i drugi organometalni reagensi. Uobičajeno, ove reakcije se izvode u eteralnim rastvaračima kao što su THF, MeTHF, dioksan ili sličan rastvarač na temperaturama u rasponu od -78 °C do 60 °C. Alkil i aril ketoni kao što je 1e mogu da se konvertuju u sekundarne alkohole kao što je 1f koristeći redukciona sredstva kao što su Na BH4, LiBH4, LiAlH4, DIBAL i drugi. Uobičajeno, ove reakcije mogu da se izvedu u različitim rastvaračima kao što su DCM, THF, MeOH, EtOH ili drugi, na različitim temperaturama. Alkil i aril ketoni kao što je 1e mogu preferencijalno da se konvertuju u diastereomerno obogaćene sekundarne alkohole kao što je 1f koristeći uslove za asimetričnu redukciju kao što su RuCl(p-cimen)[(R,R)-Ts-DPEN] i natrijum format (J. Org. Chem, 2014, 79, 3238-3243). Uobičajeno, ove reakcije se izvode u EtOAc rastvaraču i na sobnoj temperaturi. Konačno, jedinjenja kao što je 1f mogu da se deprotektuju da se otkriju triol jedinjenja kao što je 1g tretmanom sa kiselinom kao što su TFA ili razblažena HCl. Ove reakcije se uobičajeno vrše u prisustvu vode na 0 °C ili rt. Jedinjenja mogu u svakoj fazi da se prečiste standardnim tehnikama kao što su hromatografija na koloni, kristalizacija, reverzno fazna HPLC ili SFC. Ukoliko je potrebno, razdvajanje diastereomera 1f ili 1g može da se izvede po standardnim postupcima poznatim u tehnici kao što su asimetrična SFC ili HPLC, da se dobiju pojedinačni diastereomeri.
ŠEMA 2
[0103] Kao što je pokazano u Šemi 2, jedinjenja kao što je 1d mogu da se hidrolizuju sa bazom da se dobije kiselina 2a. Uobičajeno, ove reakcije se izvode koristeći neki izvor hidroksida kao što su litijum hidroksid, natrijum hidroksid ili drugi. Jedinjenja slična karboksilnoj kiselini 2a se konvertuju u jedinjenja kao što je Weinreb amid 2b tretmanom sa N,O-dimetilhidroksilamin HCl i standardnim reagensima za udvajanje amida kao što su HOBT i EDCl, T3P ili HATU sa bazom kao što su DIPEA ili TEA. Uobičajeno, ove reakcije se izvode u rastvaračima kao što su DMF ili THF i na temperaturama u rasponu od 0 °C do 60 °C. Weinreb amidi kao što je 2b se konvertuju u alkil i aril ketone kao što je 1e koristeći alkil i aril metalne reagense kao što su Grignardi (M= Mg), alkil i aril litijum reagense, alkil i aril kuprate, alkil i aril cinkate kao i druge organometalne reagense. Ove reakcije se uobičajeno izvode u eteralnim rastvaračima kao što su THF, MeTHF, dioksan ili slični rastvarači, na temperaturama u rasponu od -78 °C do 60 °C.
ŠEMA 3
[0104] Kao što je pokazano u Šemi 3, jedinjenje kao što je 3a[(3aS,4R,7S,7aR)-2,2-dimetiltetrahidro-4,7-metano[1,3]dioksolo[4,5-c]piridin-6(3aH)-on] može da se nabavi ili sintetiše (Chem. Rev., 2012, 112 (8), 4642-4686) i može da se zaštiti kao karbamat koristeći reagense kao što su Boc anhidrid ili benzoil hlorid čime se dobijaju laktami kao što je 3b. Ovi aktivirani laktami (3b) se konvertuju u alkil i aril ketone kao što je 3c upotrebom alkil i aril metalnih reagenasa kao što su alkil i aril Grignardi (M= Mg), alkil i aril litijum reagensi, alkil i aril kuprati, alkil i aril cinkati kao i drugi organometalni reagensi. Ove reakcije se uobičajeno izvode u eteralnim rastvaračima kao što su THF, MeTHF, dioksan ili sličan rastvarač, na temperaturama u rasponu od -78 °C do 60 °C. Alkil i aril ketoni kao što je 3c mogu da se konvertuju u sekundarne alkohole kao što je 3d upotrebom redukcionih reagenasa kao što su NaBH4, LiBH4, LiAlH4, DIBAL i drugi. Uobičajeno, ove reakcije mogu da se izvedu u različitim rastvaračima kao što su DCM, THF, MeOH, EtOH ili drugi na različitim temperaturama. Alkil i aril ketoni kao što je 3c mogu preferencijalno da se konvertuju u diastereomerno obogaćene sekundarne alkohole kao što je 3d koristeći uslove asimetrične redukcije kao što su RuCl(p-cimen)[(S,S)-Ts-DPEN] i natrijum format (J. Org. Chem, 2014, 79, 3238-3243). Uobičajeno, ove reakcije se izvode u EtOAc rastvaraču i na sobnoj temperaturi. Dobijeni sekundarni alkohol kao što je 3d može da se zaštiti sa različitim reagensima koji obezbeđuju ortogonalne strategije deprotekcije za karbamat koji je ranije uključen u postupak. U ovakve reagense spadaju TMSCl, TESCI, TBDMSCI, TIPSCI, kao i drugi. Jedinjenja kao što je 3e mogu da se deprotektuju da se dobiju jedinjenja kao što je 3f različitim postupcima u zavisnosti od karbamata koji je uključen. Primeri uključuju korišćenje rastvora razblažene trifluorosirćetne kiseline u slučaju Boc karbamata ili hidrogenoliziu sa Pd katalizatorom i gasom vodonikom u slučaju benzoil karbamata. Jedinjenja kao što je 3f mogu da reaguju sa odgovarajuće supstituisanim heterociklusima u postupku nukleofilne aromatične supstitucije da se dobiju jedinjenja kao što je 3g. Ovakve reakcije se uobičajeno izvode sa organskim bazama kao što su dizopropiletilamin ili trimetilamin u DMSO, DMA ili DMF ili pod uslovima korišćenja cezijum fluorida u DMSO. Alternativno, uslovi reakcije mogu da uključe reakciju udvajanja metala kao što je udvajanje paladijumom. Ciklizacija jedinjenja kao što je 3g u jedinjenja kao što je 3h može da se izvrši pod različitim uslovima uključujući kondenzaciju ili metalna udvajanja u zavisnosti od tipa atoma na A. Konačno, jedinjenja kao što je 3h mogu da se deprotektuju da se oslobode triol jedinjenja kao što je 3i tretmanom sa kiselinom kao što su TFA ili razblažena HCl. Uobičajeno, ove reakcije se izvode u prisustvu vode na 0 °C ili rt. Jedinjenja iz svake faze mogu da se prečiste standardnim tehnikama kao što su hromatografija na koloni, kristalizacija, referzno fazna HPLC ili SFC. Ukoliko je potrebno, razdvajanje diastereomera 3d ili bilo kog drugog narednog jedinjenja može da se izvede standardnim postupcima poznatim u tehnici kao što su asimetrična SFC ili HPLC da se dobiju pojedinačni diastereomeri.
ŠEMA 4
[0105] Kao što je pokazano u Šemi 4, jedinjenje kao što je 4a [(3aR,4S,6R,6aS)-6-amino-2,2-dimetiltetrahidro-4H-ciklopenta[d][1,3]dioksol-4-ol] može da se nabavi ili sintetiše [J. Perkin Trans. I, 1985, 1437; Tetrahedron Letters, 2000, (41) 9537-9530]. Jedinjenja kao što je 4a mogu da se podvrgnu nukleofilnoj aromatičnoj supstituciji sa odgovarajuće supstituisanim heterociklusom da se dobiju jedinjenja kao što je 4b. Ciklizacija jedinjenja kao što je 4b u jedinjenja kao što je 4c može da se izvrši pod različitim uslovima, uključujući kondenzaciju ili metalno udvajanje u zavisnosti od tipa atoma na A. Jedinjenja kao što je 4c mogu da se podvrgnu nukleofilnoj aromatičnoj supstituciji sa odgovarajuće supstituisanim fluorobenzenom da se dobiju fenol etri kao što je 4d. Konačno, jedinjenja kao što je 4d mogu da se deprotektuju da se oslobode diol jedinjenja kao što je 4e tretmanom sa kiselinom kao što su TFA ili razblažena HCl. Ove reakcije se obično izvode u prisustvu vode na 0 °C ili rt. Jedinjenja iz svake faze mogu da se prečiste standardnim tehnikama kao što su hromatografija na koloni, kristalizacija, reverzno fazna HPLC ili SFC. Ukoliko je potrebno, razdvajanje diastereomera 4a ili bilo kog narednog jedinjenja može da se izvede standardnim postupcima poznatim u tehnici kao što su asimetrična SFC ili HPLC, da se dobiju pojedinačni
diastereomeri.
1
ŠEMA 5
alilna alkilacija
[0106] Kao što je pokazano u Šemi 5, jedinjenja kao što je 5a mogu da se nabave ili sintetišu (Chemical Science, 2010, 1, p427; Journal of the American Chemical Society, 2000, 122, p5947; Organic Letters, 2012, 14(9), p2254). Jedinjenja kao što je 5a mogu da se podvrgnu asimetičnoj alilnoj alkilaciji sa odgovarajuće supstituisanim heterociklusom upotrebom različitih paladijum katalizatora i asimetričnih liganda da se formiraju jedinjenja kao što je 5b.
Jedinjenja kao što je 5b mogu da se podvrgnu alilnoj alkilaciji sa odgovarajuće supstituisanim fenolima ili hidroksiheterociklusima koristeći različite paladijum katalizatore i ligande da se formiraju jedinjenja kao što je 5c. Jedinjenja kao što je 5c mogu da se dihidroksiluju da se formiraju dioli kao što je 5d koristeći reagense kao što su osmijum tertroksid ili kalijum permanganat. Jedinjenja iz svake faze mogu da se prečiste standardnim tehnikama kao što su hromatografija na koloni, kristalizacija, reverzno fazna HPLC ili SFC. Ukoliko je potrebno, razdvajanaje diastereomera 5d može da se izvede po standardnim postupcima poznatim u tehnici, kao što su asimetrična SFC ili HPLC da se dobiju pojedinačni diastereomeri.
2
ŠEMA 6
[0107] Kao što je pokazano u Šemi 6, jedinjenja kao što je 5a mogu da se podvrgnu asimetričnoj alilnoj alkilaciji sa odgovarajuće supstituisanim fenolima ili hidroksiheterociklusima koristeći različite paladijum katalizatore ili asimetrične ligande da se formiraju jedinjenja kao što je 6a. Jedinjenja kao što je 6a mogu da se podvrgnu alilnoj alkilaciji sa odgovarajuće supstituisanim heterociklusima koristeći različite paladijum katalizatore i ligande, da se formiraju jedinjenja kao što je 5c. Jedinjenja kao što je 5c Mogu da se dihidroksiluju da se formiraju dioli kao što je 5d koristeći reagense kao što su osmijum tetroksid ili kalijum permanganat.
ŠEMA 7
[0108] Kao što je pokazano u Šemi 7, jedinjenja kao što je 5b mogu da se hidrolizuju u jedinjenja kao što je 7a koristeći neki izvor hidroksida kao što su litijum hidroksid, natrijum hidroksid ili drugi. Jedinjenja kao što je 7a mogu da se podvrgnu nukleofilnoj aromatičnoj supstituciji sa odgovarajuće supstituisanim heterociklusom da se dobiju jedinjenja kao što je 7b. Jedinjenja kao što je 7b mogu da se dihidroksiluju da se formiraju dioli kao što je 7c koristeći reagense kao što su osmijum tetroksid ili kalijum permanganat. Jedinjenja iz svake faze mogu da se prečiste standardnim tehnikama kao što su hromatografija na koloni, kristalizacija, reverzno fazna HPLC ili SFC. Ukoliko je potrebno, razdvajanje diastereomera 7c može da se izvede standardnim postupcima poznatim u tehnici kao što su asimetrična SFC ili HPLC, da se dobiju pojedinačni diastereomeri.
ŠEMA 8
[0109] Kao što je pokazano u Šemi 8; jedinjenja kao što je 6a mogu da se hidrolizuju u jedinjenja kao što je 8a koristeći neki izvor hidroksida kao što su litijum hidroksid, natrijum hidroksid ili drugi. Jedinjenja kao što je 8a mogu da se podvrgnu nukleofilnoj aromatičnoj supstituciji sa odgovarajuće supstituisanim heterociklusom da se dobiju jedinjenja kao što je 8b. Jedinjenja kao što je 8b mogu da se dihidroksiluju da se formiraju dioli kao 8c koristeći reagense kao što su osmijum tertroksid ili kalijum permanganat. Jedinjenja iz svake faze mogu da se prečiste standardnim tehnikama kao što su hromatografija na koloni, kristalizacija, reverzno fazna HPLC ili SFC. Ukoliko je potrebno, razdvajanje diastereomera 8c može da se izvede standardnim postupcima poznatim u tehnici kao što su asimetrična SFC ili HPLC, da se dobiju pojedinačni diastereomeri.
Primer 1 (Šema A): Sinteza (1S,2R,3R,5R)-3-((R)-1-hidroksietil)-5-(4-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)ciklopentan-1,2-diola (A-12) (referenca)
4
Primer 2 (Šema A): Sinteza (1S,2R,3R,5R)-3-((S)-1-hidroksietil)-5-(4-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)ciklopentan-1,2-diola (A-13) (referenca)
[0110]
Šema A
Faza 1: Sinteza (1R,4S,5R,6S)-5,6-dihidroksi-2-azabiciklo[2.2.1]heptan-3-ona (A-2)
[0111] U svetlo žutu dvofaznu smešu (1R,4S)-2-azabiciklo[2.2.1]hept-5-en-3-ona A-1 (Chemical Reviews, 2012, 112 (8), pp 4642-4686) (100 g, 916 mmol) i NMO (118 g, 1.01 mol) u izoamil alkoholu (500 mL) i vodi (500 mL) se na rt (15 °C) doda 2.5 % OsO4u t-BuOH (1.5 g, 5.9 mmol, 76 mL). Smeša se zagreva 2 h na 70 °C. Smeša se ohladi na rt (15 °C). Doda se NaHSO3(12 g) i meša na rt (15 °C) u toku 45 min. Smeša se koncentruje pod vakuumom da se dobije sirovi produkt (150 g) kao tamna čvrsta supstanca koja se prečisti hromatografijom na silika gelu uz eluiranje sa MeOH u DCM = 10% da se dobije A-2 (90 g, 69 %) kao svetlo ružičasta čvrsta supstanca.<1>H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ ppm 7.54 (br. s., 1H), 5.00 (dd, J=21.3, 22.6 Hz, 2H), 3.81 - 3.64 (m, 2H), 3.43 (s, 1H), 2.25 (s, 1H), 1.93 -1.67 (m, 2H)
Faza 2: Sinteza metil (1S,2R,3S,4R)-4-amino-2,3-dihidroksiciklopentan-1-karboksilat-HCl (A-3)
[0112] Jedinjenje A-2 (33 g, 231 mmol) se doda u 4N rastvor HCl u MeOH (500 mL) na rt (15 °C). Suspenzija se meša 20 h na rt (15 °C). Smeša se koncentruje pod vakuumom i ostatak se suspenduje u DCM i filtrira. Čvrsta supstanca se ispere sa DCM i suši pod vakuumom da se dobije A-3 (45 g, 92%) kao bela čvrsta supstanca. LCMS [M+1] 176;<1>H NMR (400 MHz, D2O) δ ppm 4.27 (t, J=5.1 Hz, 1H), 4.04 (t, J=6.4 Hz, 1H), 3.72 (s, 3H), 3.55 (q, J=8.4 Hz, 1H), 2.97 (dt, J=5.0, 8.8 Hz, 1H), 2.49 (td, J=8.5, 13.8 Hz, 1H), 1.83 (td, J=9.2, 13.7 Hz, 1H)
Faza 3: Sinteza metil (1S,2R,3S,4R)-4-(4-hlor-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)-2,3-dihidroksiciklopentan-1-karboksilata (A-4)
[0113] U belu suspenziju jedinjenja A-3 (42 g, 200 mmol) i 2-(4,6-dihlorpirimidin-5-il)acetaldehida (40 g, 209 mmol) u EtOH (400 mL) se doda Et3N (40.4 g, 400 mmol).
Dobijeni žuti rastvor se meša pod refluksom u toku 2 h. Smeša se koncentruje pod vakuumom do približno 100 mL. Ostatak se sipa u NH4Cl aq (500 mL) i ekstrahuje sa EtOAc (200 mL x 3). Ekstrakt se ispere sa slanim rastvorom (200 mL), suši preko Na2SO4i koncentruje pod vakuumom da se dobije sirovi produkt A-4 (60 g, >99%) kao crvena guma koja se direktno koristi u sledećoj fazi. LCMS [M+1] 312
Faza 4: Sinteza metil (3aR,4S,6R,6aS)-6-(4-hlor-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)-2,2-dimetiltetrahidro-4H-ciklopenta[d][1,3]dioksol-4-karboksilata (A-5)
[0114] U rastvor sirovog jedinjenja A-4 (60 g, 192 mmol) u 2,2-dimetoksipropanu (300 mL) i acetonu (300 mL) se doda TsOH. H2O (40 g, 212 mmol). Smeša se meša 1 h na rt (15 °C). Smeša se sipa u NaHCO3aq (1000 mL) i ekstrahuje sa EtOAc (500 mL). Ekstrakt se ispere sa slanim rastvorom, koncentruje pod vakuumom da se dobije sirovi materijal koji se prečisti hromatografijom na silika gelu uz eluiranje sa EtOAc u petrol etru od 0-100 % da se dobije A5 (42 g, 62%) kao žuta guma koja stajanjem očvrsne. LCMS [M+1] 352;<1>H NMR (400 MHz, CDCl3) δ ppm 8.63 (s, 1H), 7.29 (d, J=3.5 Hz, 1H), 6.64 (d, J=3.8 Hz, 1H), 5.15 - 5.04 (m, 2H), 5.03 - 4.98 (m, 1H), 3.76 (s, 3H), 3.12 (ddd, J=5.3, 7.6, 10.7 Hz, 1H), 2.75 - 2.59 (m, 2H), 1.59 (s, 3H), 1.33 (s, 3H)
Faza 5: Sinteza metil (3aR,4S,6R,6aS)-2,2-dimetil-6-(4-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)tetrahidro-4H-ciklopenta[d][1,3]dioksol-4-karboksilata (A-6)
[0115] U rastvor A-5 (15 g, 42.6 mmol) u bezvodnom THF (125 mL) se doda Pd(PPh3)4(1.97 g, 1.71 mmol). U dobijeni žuti rastvor se doda 1M rastvor Zn(Me)2(171 mL, 171 mmol). Smeša se četiri puta degasira sa N2. Žuti rastvor se zagreva 3 h pod refluksom da postane tamni rastvor. Smeša se pažljivo sipa u ohlađeni NH4Cl aq (200 mL) i ekstrahuje sa EtOAc (200 mL x 3). Ekstrakt se ispere sa slanim rastvorom (200 mL), suši preko Na2SO4i koncentruje pod vakuumom da se dobije sirovi produkt (18 g) kao žuta guma. Sirovi materijal se prečisti hromatografijom na silika gelu uz eluiranje sa EtOAc u petrol etru od 0 do 100% da se dobije A-6 (13.5 g, 96%) kao žuta guma. [α]<20>D-21.57° (c= 8.4 mg/mL, metanol).
LCMS [M+1] 332;<1>H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ ppm 8.65 (s, 1H), 7.74 (d, J=3.5 Hz, 1H), 6.74 (d, J=3.8 Hz, 1H), 5.18 - 5.06 (m, 1H), 5.01 - 4.90 (m, 2H), 3.65 (s, 3H), 3.15 - 3.03 (m, 1H), 2.64 (s, 3H), 2.46 - 2.40 (m, 1H), 1.49 (s, 3H), 1.23 (s, 3H)
Faza 6: Sinteza (3aR,4S,6R,6aS)-2,2-dimetil-6-(4-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)tetrahidro-4H- ciklopenta[d][1,3]dioksol-4-karboksilne kiseline (A-7)
[0116] Smeša A-6 (13 g, 33 mmol) i LiOH (2.8 g, 66.7 mmol) u THF (100 mL)/H2O (100 mL) se meša 4 h na rt (15 °C). TLC (DCM/MeOH=10/1) pokazuje da je najveći deo SM utrošen. Smeša se razblaži sa vodom (50 mL) i ispere sa EtOAc (100 mL x 2). U vodeni sloj se doda H3PO4(3.6 g, 37 mmol) i ekstrahuje sa EtOAc/THF (50 mL/50 mL x 5). Ekstrakt se suši preko Na2SO4i koncentruje pod vakuumom da se dobije A-7 (8.9 g, 84%) kao žuta čvrsta supstanca. LCMS [M+1] 318;<1>H NMR (400 MHz, CDCl3) δ ppm 8.77 (s, 1H), 7.26 (br. s, 1H), 6.59 (d, J=3.8 Hz, 1H), 5.25 (t, J=5.3 Hz, 1H), 5.14 - 4.98 (m, 2H), 3.18 (ddd, J=4.8, 7.8, 10.0 Hz, 1H), 2.77 - 2.60 (m, 5H), 1.60 (s, 3H), 1.35 (s, 3H)
Faza 7: Sinteza (3aR,4S,6R,6aS)-N-metoksi-N,2,2-trimetil-6-(4-metil-7H-pirolo[2,3d]pirimidin-7-il)tetrahidro-4H-ciklopenta[d][1,3]dioksol-4-karboksamida (A-8)
[0117] U suspenziju sirovog A-7 (7 g , 22 D.1 mmol) i N,O-dimetilhidroksilamin-HCl (4.30 g, 44.1 mmol) u THF (140 mL) se na rt (15 °C) dodaju DIPEA (11.4 g, 88.2 mmol) i 50% T3P (28.1 g, 25.8 mL, 44.1 mmol). Dobijeni crveni rastvor se meša 20 h na rt (15 °C). LCMS pokazuje da je glavni pik traženo jedinjenje. Smeša se razblaži sa EtOAc i ispere sa NH4Cl aq, NaHCO3aq, slanim rastvorom, suši preko Na2SO4i koncentruje pod vakuumom da se dobije A-8 (7.3 g, 91.8 %) kao žuta guma. [α]<20>D+27.30° (c= 2.82 mg/mL, metanol); LCMS [M+1] 361;<1>H NMR (400 MHz, CDCl3) δ ppm 8.77 (s, 1H), 7.31 (d, J=3.5 Hz, 1H), 6.60 (d, J=3.5 Hz, 1H), 5.36 - 5.27 (m, 1H), 5.11 - 5.03 (m, 1H), 4.91 (dd, J=5.6, 7.2 Hz, 1H), 3.77 (s, 3H), 3.61 - 3.51 (m, 1H), 3.24 (s, 3H), 2.72 (s, 3H), 2.65 - 2.56 (m, 1H), 2.54 - 2.42 (m, 1H), 1.60 (s, 3H), 1.30 (s, 3H)
Faza 8: Sinteza 1-((3aR,4S,6R,6aS)-2,2-dimetil-6-(4-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)tetrahidro-4H-ciklopenta[d][1,3]dioksol-4-il)etan-1-ona (A-9)
[0118] U svetlo žuti rastvor A-8 (130 mg, 0.361 mmol) u THF (5.39 mL) se na 0 °C doda MeMgBr (3.0 M rastvor u dietil etru, 0.144 mL, 0.433 mmol). Nakon dodavanja, smeša se meša 40 min na 0 °C. Smeša se neutrališe sa aq.NH4Cl (40 mL) u ledenom kupatilu i ekstrahuje sa EtOAc (30 mL x 2). Ekstrakt se ispere sa slanim rastvorom (20 mL), suši preko Na2SO4i koncentruje pod vakuumom da se dobije sirovo jedinjenje A-9 (110 mg, 97%) kao žuto ulje i koristi se kao takav u sledećoj fazi.
Faza 9: Sinteza (R)-1-((3aR,4R,6R,6aS)-2,2-dimetil-6-(4-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)tetrahidro-4H-ciklopenta[d][1,3]dioksol-4-il)etan-1-ola (A-10) i (S)-1-((3aR,4R,6R,6aS)-2,2-dimetil-6-(4-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)tetrahidro-4H-ciklopenta[d][1,3]dioksol-4-il)etan-1-ola (A-11)
[0119] U žuti rastvor A-9 (110 mg, 0.349 mmol) u bezvodnom MeOH (6 mL) se na 0°C doda NaBH4(26 mg, 0.698 mmol). Nakon dodavanja, smeša se meša 60 min na 0 °C. Nakon toga se reaktivna smeša koncentruje pod vakuumom da se dobije bela čvrsta supstanca (150 mg) koja se razdvoji asimetričnom SFC da se dobiju A-10 (62 mg, 56%) i A-11 (61 mg, 55%) i koriste se kao takvi.
Faza 10: Sinteza (1S,2R,3R,5R)-3-((R)-1-hidroksietil)-5-(4-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)ciklopentan-1,2-diola (A-12) i (1S,2R,3R,5R)-3-((S)-1-hidroksietil)-5-(4-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)ciklopentan-1,2-diola (A-13)
[0120] U žutu suspenziju A-10 (74 mg, 0.02 mmol) u H2O (1 mL) se na 0 °C doda TFA (1 mL). Smeša se meša 2 h na sobnoj temperaturi (15 °C). U smešu se polako na (0 °C) dodaje zasićeni vodeni rastvor K2CO3(10 mL) do pH 7-8. Prečisti se preparativnom HPLC da se dobije jedinjenje A-12 (34 mg, 53%). LCMS [M+1] 278;<1>H NMR (400 MHz, MeOD-d4) δ ppm 8.60 (s, 1H), 7.60 (d, J=3.8 Hz, 1H), 6.73 (d, J=3.5 Hz, 1H), 5.12 - 5.00 (m, 1H), 4.37 (dd, J=5.8, 9.3 Hz, 1H), 4.17 (dd, J=2.9, 5.6 Hz, 1H), 3.81 (quin, J=6.2 Hz, 1H), 2.71 (s, 3H), 2.31 (td, J=8.3, 12.7 Hz, 1H), 2.07 (ddt, J=2.8, 5.9, 9.0 Hz, 1H), 1.84 (ddd, J=9.3, 10.9, 12.7 Hz, 1H), 1.26 (d, J=6.3 Hz, 3H)
[0121] U žutu suspenziju A-11 (74 mg, 0.23 mmol) u H2O (1.5 mL) se u kapima na 0 °C doda TFA (1.5 mL). Nakon toga se reaktivna smeša meša 2h na sobnoj temperaturi (20 °C), nakon toga podesi do pH=7 sa 20% K2CO3. Vodena faza se prečisti preparativnom HPLC da se dobije A-13 (45 mg, 70%). LCMS [M+1] 278;<1>H NMR (400 MHz, MeOD-d4) δ ppm 8.59 (s, 1 H), 7.61 (d, J=3.53 Hz, 1 H), 6.72 (d, J=3.53 Hz, 1 H), 5.03 - 5.12 (m, 1 H), 3.92 - 4.30 (dd, J=8.60, 5.95 Hz, 1 H), 3.92 - 4.03 (m, 2 H), 2.70 (s, 3 H), 2.28 (dt, J=12.57, 8.27 Hz, 1 H), 2.06 (tt, J=8.71, 4.30 Hz, 1 H), 1.88 - 1.99 (m, 1 H), 1.22 (d, J=6.62 Hz, 3 H)
Primeri 3-16 (reference) se izrađuju upotrebom slične hemije iz Šeme A koristeći odgovarajući Grignardov reagens za fazu 8.
(nastavlja se)
1 (nastavlja se)
2 (nastavlja se)
(nastavlja se)
4 (nastavlja se)
Sinteza (3,4,5-trifluorofenil)magnezijum bromida (za referentne Primere 13 & 14)
[0123]
[0124] U smešu magnezijuma (264 mg, 11.0 mmol) i THF (5 mL) se doda jod (5.0 mg) i rastvor 5-brom-1,2,3-trifluorobenzena (211 mg, 1 mmol) u THF (0.5 mL). Smeša se zagreje na 60°C i u kapima se doda rastvor 5-brom-1,2,3-trifluorobenzena (1.9 g, 9 mmol) u THF (4.5 mL). Reakcija se zagreva dva sata, rastvor se ohladi na sobnu temperaturu i koristi direktno u sledećoj fazi.
Primeri 15 & 16 (Šema B) se izrađuju upotrebom slične hemije iz Šeme A koristeći 2,6-dimetilpiridin i nBuLi u Fazi 8 umesto metilmagnezijum bromida.
[0125]
Šema B
[0126] U rastvor 2.6-dimetil piridina (168 mg, 1.56 mmol) u bezvodnom THF (8 mL) se na -75°C u kapima doda n-BuLi (125 mg, 1.96 mmol, 1.22 mL, 1.6 M), temperatura se održava na približno -70°C. Dobijena suspenzija se meša 1 h na -75°C. U kapima se na -75°C doda rastvor A-8 (282 mg, 0.782 mmol) u bezvodnom THF (4 mL). Dobijena suspenzija se meša na -75°C, ostavi da se zagreje na r.t. i meša u toku noći. THF se upari, u sirovi produkt se doda H2O i ekstrahuje sa EtOAc, koncentruje, prečisti hromatografijom na koloni sa 5% MeOH/EtOAc da se dobije 169 mg B-1 (53% prinos) kao žuto ulje. LCMS [M+1] 407.15.
Primer 17 (Šema C): (1S,2R,3S,5R)-3-(1-hidroksiciklopropil)-5-(4-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)ciklopentan-1,2-diol (C-2) (referenca)
Šema C
Faza 1: Sinteza 1-((3aR,4S,6R,6aS)-2,2-dimetil-6-(4-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)tetrahidro-4H-ciklopenta[d][1,3]dioksol-4-il)ciklopropan-1-ola (C-1)
[0128] U svetlo žuti rastvor A-6 (140 mg, 0.422 mmol) u bezvodnom THF (6.32 mL) se na r.t (13 °C) dodaju Ti(OiPr)4(168 mg, 0.591 mmol) i EtMgBr (3.0 M rastvor u dietil etru, 0.845 mL, 2.53 mmol). Nakon dodavanja, smeša se meša 10 min na 13 °C. Smeša se neutrališe sa H2O (50 mL) u ledenom kupatilu i ekstrahuje sa EtOAc (30 mL x 2). Ekstrakt se ispere sa slanim rastvorom (30 mL), suši preko Na2SO4i koncentruje pod vakuumom da se dobije sirovi ostatak koji se prečisti flash hromatografijom uz eluiranje sa EtOAc/DCM 0-100% da se dobije C-1 (90 mg, 65%) kao žuta čvrsta supstanca. LCMS [M+1] 330;<1>H NMR (400 MHz, CDCl3) δ ppm 8.72 (s, 1H), 7.22 (d, J=3.5 Hz, 1H), 6.55 (d, J=3.8 Hz, 1H), 5.06 - 4.99 (m, 1H), 4.94 (dd, J=3.3, 6.3 Hz, 1H), 4.86 (d, J=5.8 Hz, 1H), 2.74 (s, 3H), 2.68 - 2.57 (m, 2H), 2.11 (d, J=3.0 Hz, 1H), 1.59 (s, 3H), 1.34 (s, 3H), 1.25 (d, J=3.8 Hz, 1H), 0.93 (d, 1H), 0.88 - 0.78 (m, 1H), 0.77 - 0.67 (m, 1H), 0.60 - 0.51 (m, 1H).
Faza 2: Sinteza (1S,2R,3S,5R)-3-(1-hidroksiciklopropil)-5-(4-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)ciklopentan-1,2-diola (C-2)
[0129] U suspenziju C-1 (65 mg, 0.20 mmol) u H2O (3 mL) se na 0 °C doda TFA (3 mL). Smeša se meša 1.5 h na rt (13 °C). Smeša se sipa u 20% K2CO3aq (50 mL) i ekstrahuje sa EtOAc (30 mL x 3). Ekstrakt se ispere sa slanim rastvorom (50 mL x 2), suši preko Na2SO4i koncentruje pod vakuumom da se dobije C-2 (50 mg, 88%) kao čvrsta supstanca. LCMS [M+1] 290;<1>H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ ppm 8.60 (s, 1H), 7.66 (d, J=3.8 Hz, 1H), 6.70 (d, J=3.5 Hz, 1H), 5.32 (s, 1H), 5.03 - 4.93 (m, 1H), 4.77 (d, J=6.8 Hz, 1H), 4.61 (d, J=4.3 Hz, 1H), 4.19 (td, J=6.3, 8.9 Hz, 1H), 4.04 - 3.97 (m, 1H), 2.63 (s, 3H), 2.19 (td, J=8.5, 12.8 Hz, 1H), 1.93 - 1.82 (m, 1H), 1.63 (dt, J=3.0, 8.8 Hz, 1H), 0.67 - 0.60 (m, 1H), 0.57 - 0.48 (m, 2H), 0.46 - 0.39 (m, 1H)
Primer 18 (Šema D): (1S,2R,3S,5R)-3-(2-hidroksipropan-2-il)-5-(4-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)ciklopentan-1,2-diol (D-2) (referenca)
[0130]
Šem
Faza 1: Sinteza 2-((3aR,4S,6R,6aS)-2,2-dimetil-6-(4-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)tetrahidro-4H-ciklopenta[d][1,3]dioksol-4-il)propan-2-ola (D-1)
[0131] U svetlo žuti rastvor A-6 (150 mg, 0.453 mmol) u bezvodnom THF (6.77 mL) se na r.t (13 °C) doda MeMgBr (3.0 M rastvor u dietil etru, 0.905 mL, 2.72 mmol). Nakon dodavanja, smeša se meša 10 min na 13 °C. Smeša se neutrališe sa H2O (50 mL) u ledenom kupatilu i ekstrahuje sa EtOAc (30 mL x 2). Ekstrakt se ispere sa slanim rastvorom (30 mL), suši preko Na2SO4i koncentruje pod vakuumom da se dobije sirovo jedinjenje (160 mg) kao žuto ulje koje se prečisti flash hromatografijom uz eluiranje sa EtOAc/DCM 0-100% da se dobije D-1 (120 mg, 80%) kao bela čvrsta supstanca. LCMS [M+1] 332;<1>H NMR (400 MHz, CDCl3) δ ppm 8.76 (s, 1H), 7.26 (d, J=3.8 Hz, 1H), 6.57 (d, J=3.5 Hz, 1H), 5.03 (ddd, J=6.0, 8.3, 10.8 Hz, 1H), 4.96 - 4.88 (m, 1H), 4.84 (dd, J=5.3, 7.3 Hz, 1H), 2.73 (s, 3H), 2.47 - 2.37 (m, 2H), 2.31 - 2.21 (m, 1H), 1.97 (s, 1H), 1.59 (s, 3H), 1.40 (s, 3H), 1.32 (s, 3H), 1.27 (s, 3H)
Faza 2: Sinteza (1S,2R,3S,5R)-3-(2-hidroksipropan-2-il)-5-(4-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)ciklopentan-1,2-diola (D-2)
[0132] U suspenziju D-1 (100 mg, 0.302 mmol) u H2O (5 mL) se na 0 °C doda TFA (5 mL). Smeša se meša 1.5 h na rt (13 °C). Smeša se sipa u 20% K2CO3aq (50 mL) i ekstrahuje sa EtOAc (30 mL x 3). Ekstrakt se ispere sa slanim rastvorom (50 mL x 2), suši preko Na2SO4i koncentruje pod vakuumom da se dobije D-2 (70mg, 80%) kao žuta čvrsta supstanca. LCMS [M+1] 292;<1>H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ ppm 8.60 (s, 1H), 7.65 (d, J=3.5 Hz, 1H), 6.69 (d, J=3.5 Hz, 1H), 4.92 (dt, J=7.3, 10.4 Hz, 1H), 4.73 (d, J=7.0 Hz, 1H), 4.53 (d, J=4.3 Hz, 1H), 4.32 (s, 1H), 4.08 (td, J=6.7, 9.7 Hz, 1H), 3.92 (t, J=6.3 Hz, 1H), 2.63 (s, 3H), 2.03 (td, J=7.8, 11.5 Hz, 1H), 1.88 (dt, J=2.3, 9.0 Hz, 1H), 1.84 - 1.73 (m, 1H), 1.19 (s, 3H), 1.08 (s, 3H)
Primer 19 (Šema E): (1S,2R,3S,5R)-3-[(1S)-1-(4-fluorofenil)-1-hidroksietil]-5-(4-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)ciklopentan-1,2-diol (E-3) (referenca)
Primer 20 (Šema E): (1S,2R,3S,5R)-3-[(1R)-1-(4-fluorofenil)-1-hidroksietil]-5-(4-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)ciklopentan-1,2-diol (E-4) (referenca)
[0133]
Šema E
Faza 1: Sinteza ((3aR,4S,6R,6aS)-2,2-dimetil-6-(4-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)tetrahidro-4H-ciklopenta[d][1,3]dioksol-4-il)(4-fluorofenil)metanona (E-1)
[0134] Po sličnom postpuku iz Faze 8 u Šemi A koristeći (4-fluorofenil)magnezijum bromid dobija se E-1 (240 mg, 95%). LCMS [M+1] 395.80.<1>H NMR (400 MHz, HLOROFORM-d) δ ppm 8.75 (s, 1 H) 8.12 (dd, J=8.86, 5.44 Hz, 2 H) 7.34 (dd, J=8.56, 5.50 Hz, 1 H) 7.15 -7.22 (m, 2 H) 6.61 (d, J=3.67 Hz, 1 H) 5.28 - 5.37 (m, 1 H) 4.98 - 5.08 (m, 2 H) 3.71 (br. s., 1 H) 2.70 - 2.76 (m, 4 H) 2.60 - 2.70 (m, 1 H) 1.68 (s, 3 H) 1.33 (s, 3 H)
Faza 2: Sinteza 1-((3aR,4S,6R,6aS)-2,2-dimetil-6-(4-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)tetrahidro-4H-ciklopenta[d][1,3]dioksol-4-il)-1-(4-fluorofenil)etan-1-ola (E-2)
[0135] U rastvor E-1 (66 mg, 0.17 mmol) u bezvodnom THF (6.0 mL, c=0.106 M) se na 50°C doda metilmagnezijum bromid (99.5 mg, 0.835 mmol, 0.278 mL, 3.0 M) i dobijeni rastvor se meša 0.5 h na 50°C. Smeša se polako doda u std. NH4Cl (20 mL) i smeša ekstrahuje sa EtOAc (25 mLx3). Ekstrakt se ispere sa slanim rastvorom (25 mL), suši preko Na2SO4i koncentruje pod vakuumom da se dobije 70 mg E-2 kao bezbojno ulje. LCMS [M+1] 411.80.
Faza 3: Sinteza (1S,2R,3S,5R)-3-[(1S)-1-(4-fluorofenil)-1-hidroksietil]-5-(4-metil-7H-pirolo[2,3-d]piridin-7-il)ciklopentan-1,2-diola (E-3) i (1S,2R,3S,5R)-3-[(1R)-1-(4-fluorofenil)-1-hidroksietil]-5-(4-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)ciklopentan-1,2-diola (E-4)
[0136] Po sličnom postpuku iz Faze 10 u Šemi A i naknadnim razdvajanjem asimetričnom SFC dobija se E-3 (19 mg, 31%). LCMS [M+1] 371.90.<1>H NMR (700 MHz, DMSO-d6) δ ppm 8.61 (s, 1 H) 7.61 (d, J=3.74 Hz, 1 H) 7.54 (dd, J=8.58, 5.72 Hz, 2 H) 7.13 (t, J=8.80 Hz, 2 H) 6.72 (d, J=3.52 Hz, 1 H) 5.26 (s, 1 H) 4.97 - 5.06 (m, 1 H) 4.70 (d, J=5.94 Hz, 1 H) 4.17 (d, J=3.30 Hz, 1 H) 4.04 - 4.12 (m, 1 H) 3.54 (br. s., 1 H) 2.64 (s, 3 H) 2.39 (t, J=8.91 Hz, 1 H) 2.19 (dt, J=12.54, 8.58 Hz, 1 H) 1.95 (td, J=11.83, 8.91 Hz, 1 H) 1.35 (s, 3 H)
i E-4 (12 mg, 19%). LCMS [M+1] 371.90.<1>H NMR (700 MHz, DMSO-d6) δ ppm 8.51 - 8.59 (m, 1 H) 7.52 - 7.59 (m, 1 H) 7.40 - 7.47 (m, 2 H) 7.02 - 7.10 (m, 2 H) 6.65 (dd, J=3.52, 1.54 Hz, 1 H) 5.24 (s, 1 H) 4.78 - 4.88 (m, 2 H) 4.67 - 4.74 (m, 1 H) 4.10 - 4.19 (m, 2 H) 2.57 -2.65 (m, 3 H) 2.35 (t, J=9.35 Hz, 1 H) 1.54 (s, 3 H) 1.39 - 1.51 (m, 2 H)
Primer 21 (Šema F): (1S,2R,3S,5R)-3-[fluor(4-fluorofenil)metil]-5-(4-metil-7H-pirolo[2,3-d] pirimidin-7-il)ciklopentan-1,2-diol (F-3 Izomer A)
Primer 22 (Šema F): (1S,2R,3S,5R)-3-[fluor(4-fluorofenil)metil]-5-(4-metil-7H-pirolo[2,3-d] pirimidin-7-il)ciklopentan-1,2-diol (F-4 Izomer B) (referenca)
1
Šema F
2) asimetrično
razdvajanje
F-3 izomer A F-4 izomer B
Faza 1: Sinteza ((3aR,4R,6R,6aS)-2,2-dimetil-6-(4-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)tetrahidro-4H-ciklopenta[d][1,3]dioksol-4-il)(4-fluorofenil)metanola (F-1)
[0138] Po sličnom postpuku iz Faze 8 u Šemi A dobija se F-1 (110 mg, 99%). LCMS [M+1] 398.15.
Faza 2: Sinteza 7-((3aS,4R,6S,6aR)-6-(fluor(4-fluorofenil)metil)-2,2-dimetiltetrahidro-4H-ciklopenta[d][1,3]dioksol-4-il)-4-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidina (F-2)
[0139] U rastvor F-1 (110 mg, 0.277 mmol) u 5 mL DCM se doda DAST (223 mg, 1.38 mmol) i meša na r.t. u toku 30 min. Reakcija se neutrališe sa std. NaHCO3, faze se razdvoje i vodena faza ekstrahuje sa 3 porcije DCM. Organske faze se kombinuju i isperu sa slanim rastvorom, koncentruju da se dobije sirovo F-2 koje se koristi direktno u sledećoj fazi. LCMS [M+1] 400.10.
Faza 3: Sinteza (1S,2R,3S,5R)-3-[fluor(4-fluorofenil)metil]-5-(4-metil-7H-pirolo[2,3-d] pirimidin-7-il)ciklopentan-1,2-diola
[0140] Po sličnom postpuku iz Faze 10 u Šemi A i naknadnim razdvajanjem asimetričnom SFC dobija se F-3 Izomer A (7.7 mg, 7.8% dve faze)
[0141] LCMS [M+1] 360.10.<1>H NMR (700 MHz, DMSO-d6) δ ppm 1.40- 1.49 (m, 1 H) 1.91
2
(dt, J=12.87, 8.64 Hz, 1 H) 2.55 (dd, J=17.39, 8.58 Hz, 1 H) 2.62 (s, 3 H) 4.07 (br. s., 1 H) 4.36 - 4.48 (m, 1 H) 4.91 - 5.02 (m, 3 H) 5.59 (dd, J=1.00 Hz, 1 H) 6.67 (d, J=3.30 Hz, 1 H) 7.22 (t, J=8.58 Hz, 2 H) 7.45 - 7.56 (m, 2 H) 7.65 (d, J=3.30 Hz, 1 H) 8.60 (s, 1 H) i
F-4 Izomer B (1.3 mg, 1.3% dve faze)
LCMS [M+1] 360.15.<1>H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ ppm 1.84 - 1.94 (m, 1 H) 2.09 - 2.16 (m, 1 H) 2.64 (s, 3 H) 3.83 (q, J=4.40 Hz, 1 H) 4.24 - 4.35 (m, 1 H) 4.80 (d, J=4.52 Hz, 1 H) 4.89 - 5.04 (m, 2 H) 5.72 - 5.83 (m, 1 H) 6.71 (d, J=3.55 Hz, 1 H) 7.20 - 7.30 (m, 2 H) 7.47 (dd, J=8.13, 5.81 Hz, 2 H) 7.66 (d, J=3.55 Hz, 1 H) 8.61 (s, 1 H)
Primer 23 (Šema G): (1R,2S,3R,5R)-3-(4-amino-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)-5-((S)-(4-hlor-3-fluorofenil)(hidroksi)metil)ciklopentan-1,2-diol (G-7) (referenca)
Primer 24 (Šema G): (1R,2S,3R,5R)-3-(4-amino-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)-5-((R)-(4-hlor-3-fluorofenil)(hidroksi)metil)ciklopentan-1,2-diol (G-9) (referenca)
Šema G
Faza 1: Sinteza (3aR,4S,6R,6aS)-6-(4-hlor-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)-2,2-dimetiltetrahidro-4H-ciklopenta[d][1,3]dioksol-4-karboksilne kiseline (G-1)
[0143] Smeša A-5 (200 mg, 0.48 mmol) i LiOH (40.6 mg, 0.966 mmol) u THF (2 mL)/H2O (2 mL) se meša 2 h na rt (25 °C). Smeša se razblaži sa vodom (5 mL) i podesi do pH=2 sa 1N rastvorom HCl i ekstrahuje sa EtOAc (10 mL x 2). Ekstrakt se suši preko Na2SO4i koncentruje pod vakuumom da se dobije sirovi produkt G-1 (200 mg) kao žuta guma, koja se direktno koristi u sledećoj fazi. LCMS [M+1] 338;<1>H NMR (400MHz, DMSO-d6) δ ppm 8.65 (s, 1H), 7.97 (d, J=3.8 Hz, 1H), 6.72 (d, J=3.5 Hz, 1H), 5.17 - 5.07 (m, 1H), 5.01 - 4.90 (m, 2H), 3.03 - 2.93 (m, 1H), 2.60 - 2.53 (m, 2H), 1.49 (s, 3H), 1.23 (s, 3H)
Faza 2: Sinteza (3aR,4S,6R,6aS)-6-(4-hlor-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)-N-metoksi-N,2,2-trimetiltetrahidro-4H-ciklopenta[d][1,3]dioksol-4-karboksamida (G-2)
[0144] U suspenziju sirovog G-1 (200 mg, 461 mmol) i N,O-dimetilhidroksilamin-HCl (70
4
mg, 0.72 mmol) u THF (4 mL) se na rt (15 °C) dodaju DIPEA (186 mg, 1.44 mmol) i 50% T3P (458 mg, 0.42 mL, 1.5 mmol). Dobijeni crveni rastvor se meša 20 h na rt (15 °C). U reaktivnoj smeši se formira neka čvrsta supstanca. Smeša se sipa u NaHCO3aq (15 mL) i ekstrahuje sa EtOAc (10 mL x 3). Ekstrakt se ispere sa slanim rastvorom (10 mL x 2), suši preko Na2SO4i koncentruje pod vakuumom da se dobije G-2 (150 mg, 82% u dve faze) kao žuta guma. LCMS [M+1] 381;<1>H NMR (400 MHz, CDCl3) δ ppm 8.66 (s, 1H), 7.42 (d, J=3.5 Hz, 1H), 6.67 (d, J=3.8 Hz, 1H), 5.27 (dd, J=5.1, 7.2 Hz, 1H), 5.06 (dd, J=5.0, 7.0 Hz, 1H), 4.92 (dd, J=5.5, 7.0 Hz, 1H), 3.78 (s, 3H), 3.64 - 3.51 (m, 1H), 3.25 (s, 3H), 2.70 - 2.42 (m, 2H), 1.61 (s, 3H), 1.32 (s, 3H)
Faza 3: Sinteza (4-hlor-3-fluorofenil)((3aR,4S,6R,6aS)-6-(4-hlor-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)-2,2-dimetiltetrahidro-4H-ciklopenta[d][1,3]dioksol-4-il)metanona (G-3)
[0145] U rastvor G-2 (150 mg, 0.394 mmol) u bezvodnom THF (3 mL) se na 0 °C doda (4-hlor-3-fluorofenil)magnezijum bromid (3.1 mL, 1.54 mmol). Smeša se meša 3 h na 0 °C. Smeša se neutrališe sa NH4Cl aq (20 mL) i razblaži sa EtOAc (10 mL x 2). Organski sloj se ispere sa slanim rastvorom (10 mL), suši preko Na2SO4i koncentruje pod vakuumom da se dobije sirovo G-3 (250 mg, >99%) kao žuto ulje koje se direktno koristi u sledećoj fazi.
LCMS [M+1] 450
Faza 4: Sinteza (S)-(4-hlor-3-fluorofenil)((3aR,4R,6R,6aS)-6-(4-hlor-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)-2,2-dimetiltetrahidro-4H-ciklopenta[d][1,3]dioksol-4-il)metanola (G-4) i (R)-(4-hlor-3-fluorofenil)((3aR,4R,6R,6aS)-6-(4-hlor-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)-2,2-dimetiltetrahidro-4H-ciklopenta[d][1,3]dioksol-4-il)metanola (G-5)
[0146] U rastvor sirovog G-3 (150 mg, 0.4 mmol) u MeOH (5 mL) se na 0 °C doda NaBH4(45 mg, 1.18 mmol). Smeša se meša 1 h na 0 °C. Smeša se neutrališe sa NH4Cl aq (10 mL) i razblaži sa EtOAc (10 mL x 3). Organski sloj se ispere sa slanim rastvorom (10 mL), suši preko Na2SO4i koncentruje pod vakuumom a nakon toga prečisti hromatografijom na silika gelu uz eluiranje sa EtOAc u petrol etru od 0 do 60% da se dobiju G-4 (30 mg, 17%) i G-5 (50 mg, 28%) kao svetlo žuta čvrsta supstanca.
G-4: LCMS [M+1] 452
G-5: LCMS [M+1] 452
Faza 5: Sinteza (S)-((3aR,4R,6R,6aS)-6-(4-amino-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)-2,2-dimetiltetrahidro-4H-ciklopenta[d][1,3]dioksol-4-il)(4-hlor-3-fluorofenil)metanola (G-6)
[0147] Smeša G-4 (30 mg, 0.0663 mmol) u smeši dioksan/NH3.H2O (1 mL/1 mL) se zagreva mikrotalasima u toku 2 h na 120 °C. LCMS pokazuje da je najveći deo SM utrošen i formira se good spot. Smeša se koncentruje pod vakuumom da se dobije sirovi produkt G-6 (50 mg, >100 %) kao žuta čvrsta supstanca, koja se direktno koristi u sledećoj fazi. LCMS [M+1] 433
Faza 6: Sinteza (1R,2S,3R,5R)-3-(4-amino-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)-5-((S)-(4-hlor-3-fluorofenil)(hidroksi)metil)ciklopentan-1,2-diola (G-7)
[0148] Smeša G-6 (30 mg, 0.0663mmol) u TFA/H2O (1 mL/ 1 mL) se meša 1 h na rt (25 °C). LCMS pokazuje da je najveći deo SM utrošen i glavni pik je traženo jedinjenje. Smeša se sipa u 20% K2CO3aq (10 mL) i ekstrahuje sa EtOAc (10 mL x 2). Ekstrakt se ispere sa slanim rastvorom (10 mL x 2), suši preko Na2SO4i koncentruje pod vakuumom da se dobije sirovi materijal koji se prečisti prep-HPLC da se dobije G-7 (10 mg, 37 %) kao bela čvrsta supstanca. LCMS [M+1] 393;<1>H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ ppm 8.01 (s, 1H), 7.52 (t, J=8.0 Hz, 1H), 7.35 (dd, J=1.6, 10.4 Hz, 1H), 7.27 - 7.18 (m, 2H), 6.92 (s, 2H), 6.55 (d, J=3.5 Hz, 1H), 5.74 (d, J=5.3 Hz, 1H), 4.85 (d, J=6.5 Hz, 1H), 4.84 - 4.73 (m, 2H), 4.62 (d, J=4.8 Hz, 1H), 4.24 - 4.10 (m, 1H), 3.91 (q, J=4.9 Hz, 1H), 2.21 (td, J=4.3, 8.5 Hz, 1H), 1.90 -1.64 (m, 2H)
[0149] Jedinjenje G-9 se izrađuje od G-5 (10 mg, 37%) kao bela čvrsta supstanca sličnim postupkom kako se G-7 izrađuje od G-4.
G-9: LCMS [M+1] 393;<1>H NMR (400MHz, DMSO-d6) δ ppm 8.02 (s, 1H), 7.54 (t, J=8.0 Hz, 1H), 7.40 (dd, J=1.6, 10.7 Hz, 1H), 7.30 - 7.24 (m, 1H), 7.21 (d, J=3.5 Hz, 1H), 6.92 (s, 2H), 6.54 (d, J=3.5 Hz, 1H), 5.76 (d, J=4.5 Hz, 1H), 4.87 - 4.76 (m, 2H), 4.61 (t, J=5.5 Hz, 1H), 4.51 (d, J=3.8 Hz, 1H), 4.28 - 4.19 (m, 1H), 3.93 - 3.88 (m, 1H), 2.23 (d, J=8.5 Hz, 1H), 2.06 - 1.94 (m, 1H), 1.66 - 1.52 (m, 1H)
Primer 25 (Šema H): (1R,2S,3R,5R)-3-(4-amino-5-fluor-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)-5-[(S)-(4-fluorofenil)(hidroksi)metil]ciklopentan-1,2-diol (H-5) (referenca)
Primer 26 (Šema H): (1R,2S,3R,5R)-3-(4-amino-5-fluor-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)-5-[(R)-(4-fluorofenil)(hidroksi)metil]ciklopentan-1,2-diol (H-6) (referenca)
[0150]
Šema H
Faza 1: Sinteza (3aR,4S,6R,6aS)-6-(4-hlor-5-fluor-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)-N-metoksi-N,2,2-tri-metiltetrahidro-4H-ciklopenta[d][1,3]dioksol-4-karboksamida (H-1)
[0151] U rastvor G-2 (Šema G) (400 mg, 1.05 mmol) u 20 mL anhidrovanog CH3CN se dodaju selektfluor (558 mg, 1.58 mmol) i AcOH (10 ml). Smeša se zagreva 6 sati na 70°C u atmosferi N2. Reaktivna smeša se koncentruje, dodaju se H2O i EtOAc i vodeni sloj se ekstrahuje 3 puta sa EtOAc. Organski sloj se ispere sa slanim rastvorom, suši preko Na2SO4i koncentruje da se dobije braon ulje.
[0152] Gore dobijeno braon ulje se doda u 2,2-dimetoksipropan (109 mg, 1.05 mmol, 3.50 mL, 0.3 M) i toluensulfonsku kiselinu monohidrat (599 mg, 3.15 mmol), žuta braon suspenzija se energično meša na r.t. u toku 15 min. Reaktivna smeša se razblaži sa 50 mL H2O, neutrališe sa čvrstim NaHCO3, isparive supstance se pažljivo uklone pod vakuumom i dobijeni braon vodeni rastvor se ekstrahuje sa EtOAc 3 x 20 mL, organski deo se kombinuje i koncentruje, prečisti hromatografijom na koloni sa 60% EtOAc/heptan da se dobije 100 mg H-1 (24% prinos) kao bezbojna guma.
LCMS [M+1] 398.80.<1>H NMR (400 MHz, HLOROFORM-d) δ ppm 8.63 (s, 1 H) 7.22 (d, J=2.57 Hz, 1 H) 5.25 - 5.36 (m, 1 H) 5.01 (dd, J=7.03, 4.95 Hz, 1 H) 4.83 (dd, J=6.97, 5.50 Hz, 1 H) 3.77 (s, 3 H) 3.58 (d, J=7.34 Hz, 1 H) 3.25 (s, 3 H) 2.58 - 2.68 (m, 1 H) 2.38 - 2.52 (m, 1 H) 1.61 (s, 3 H) 1.31 (s, 3 H)
Faza 2: Sinteza ((3aR,4S,6R,6aS)-6-(4-hlor-5-fluor-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)-2,2-dimetiltetrahidro-4H-ciklopenta[d][1,3]dioksol-4-il)(4-fluorofenil)metanona (H-2)
[0153] Po sličnom postpuku iz faze 8 u Šemi A koristeći 4-fluorofenilmagnezijum bromid i H-1 dobije se H-2 (100 mg, 92%).
LCMS [M+1] 433.70.<1>H NMR (400 MHz, HLOROFORM-d) δ ppm 8.62 (s, 1 H) 8.07 - 8.16 (m, 2 H) 7.14 - 7.23 (m, 3 H) 5.25 - 5.37 (m, 1 H) 4.98 (dd, J=6.91, 4.58 Hz, 1 H) 4.86 - 4.93 (m, 1 H) 4.03 (ddd, J=10.30, 7.79, 4.52 Hz, 1 H) 2.58 - 2.76 (m, 2 H) 1.67 (s, 3 H) 1.32 (s, 3 H)
Faza 3: Sinteza ((3aR,4R,6R,6aS)-6-(4-hlor-5-fluor-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)-2,2-dimetiltetrahidro-4H-ciklopenta[d][1,3]dioksol-4-il)(4-fluorofenil)metanola (H-3)
[0154] Po sličnom postpuku iz faze 4 u Šemi G, H-2 se redukuje u H-3 (88 mg, 88%). LCMS [M+1] 435.70.
Faza 4: Sinteza ((3aR,4R,6R,6aS)-6-(4-amino-5-fluor-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)-2,2-dimetiltetrahidro-4H-ciklopenta[d][1,3]dioksol-4-il)(4-fluorofenil)metanola (H-4)
[0155] Po sličnom postpuku iz faze 5 u Šemi G, H-3 se transformiše u H-4 kao sirovi produkt za narednu fazu.
LCMS [M+1] 417.80.
Faza 5: Sinteza (1R,2S,3R,5R)-3-(4-amino-5-fluor-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)-5-[(S)-(4-fluorofenil)(hidroksi)metil]ciklopentan-1,2-diola (H-5) i (1R,2S,3R,5R)-3-(4-amino-5-fluor-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)-5-[(R)-(4-fluorofenil)(hidroksi)metil]ciklopentan-1,2-diola (H-6)
[0156] Po sličnom postpuku iz faze 6 u Šemi G i naknadnim prečišćavanjem asimetričnom SFC, H-4 se deprotektuje i izomeri razdvoje na H-5 i H-6 (26.5 mg, 35%).
H-5: LCMS [M+1] 376.90.<1>H NMR (700 MHz, DMSO-d6) δ ppm 8.01 (s, 1 H) 7.40 (dd, J=8.36, 5.72 Hz, 1 H) 7.19 (s, 1 H) 7.13 (t, J=8.80 Hz, 1 H) 6.85 (br. s., 1 H) 5.52 (d, J=4.62 Hz, 1 H) 4.87 (q, J=9.68 Hz, 1 H) 4.77 (d, J=6.82 Hz, 1 H) 4.53 (dd, J=7.04, 4.62 Hz, 1 H) 4.51 (d, J=3.52 Hz, 1 H) 4.16 (dt, J=9.63, 5.97 Hz, 1 H) 3.93 (br. s., 1 H) 2.16 - 2.22
(m, 1 H) 1.86 (dt, J=13.04, 8.78 Hz, 1 H) 1.42 (ddd, J=12.98, 10.56, 8.14 Hz, 1 H)
H-6: LCMS [M+1] 376.90.<1>H NMR (700 MHz, DMSO-d6) δ ppm 8.01 (s, 1 H) 7.37 (dd, J=8.47, 5.61 Hz, 1 H) 7.23 (d, J=1.76 Hz, 1 H) 7.12 (t, J=8.80 Hz, 1 H) 6.87 (br. s., 1 H) 5.51 (d, J=4.84 Hz, 1 H) 4.82 - 4.88 (m, 1 H) 4.79 - 4.82 (m, 1 H) 4.76 (t, J=4.84 Hz, 1 H) 4.58 (d, J=4.62 Hz, 1 H) 4.10 (dt, J=8.36, 6.05 Hz, 1 H) 3.80 - 3.86 (m, 1 H) 2.17 (tt, J=8.64, 4.46 Hz, 1 H) 1.79 (dt, J=13.09, 8.53 Hz, 1 H) 1.68 (dt, J=12.93, 9.60 Hz, 1 H)
Primer 27 (Šema I) - (1S,2R,3R,5R)-3-[(S)-(3,4-difluorofenil)(hidroksi)metil]-5-(7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-4-ilamino)ciklopentan-1,2-diol (I-12) (referenca)
Primer 28 (Šema I) - (1S,2R,3R,5R)-3-[(R)-(3,4-difluorofenil)(hidroksi) metil]-5-(7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-4-ilamino)ciklopentan-1,2-diol (I-13) (referenca)
[0157]
Šema I
Faza 1: Sinteza terc-butil (3aS,4R,7S,7aR)-2,2-dimetil-6-oksotetrahidro-4,7-metano[1,3] dioksolo[4,5-c]piridin-5(4H)-karboksilata (I-2)
[0158] U rastvor (3aS,4R,7S,7aR)-2,2-dimetiltetrahidro-4,7-metano[1,3]dioksolo[4,5-c]piridin-6(3aH)-ona I-1 (Chemical Reviews, 2012, 112 (8), pp 4642-4686) (5000 mg, 27.29 mmol) i Boc anhidrida (7.15 g, 32.7 mmol) u THF (54.6 mL, c=0.5 M) se dodaju trietilamin (3.31 g, 32.7 mmol, 4.56 mL) i DMAP (333 mg, 2.73 mmol). Reakcija se meša 3 h na r.t. Smeša se koncentruje do žutomrke čvrste supstance koja se prečisti hromatografijom na koloni sa 30% EtOAc/Heptan da se dobije 7.9 g I-2 (100% prinos) kao bela čvrsta supstanca. LCMS [M+1-tBu] 228.<1>H NMR (400MHz, HLOROFORM-d) δ ppm 4.60 (d, J=5.4 Hz, 1H), 4.49 (d, J=5.4 Hz, 1H), 4.44 (s, 1H), 2.90 (s, 1H), 2.16 - 2.07 (m, 1H), 2.05 - 1.96 (m, 1H), 1.53 (s, 9H), 1.50 (s, 3H), 1.37 (s, 3H).
Faza 2: Sinteza terc-butil ((3aS,4R,6S,6aR)-6-(3,4-difluorobenzoil)-2,2-dimetiltetrahidro-4H-ciklopenta[d][1,3]dioksol-4-il)karbamata (I-3)
[0159] U rastvor I-2 (1.42 g, 5.00 mmol) u THF (10.0 mL, c=0.5 M) ohlađenom u kupatilu led-voda se doda 4-fluorofenilmagnezijum bromid (997 mg, 5 mmol, 5.00 mL, 1 M).
Reaktivna smeša se meša 10 min u ledenom kupatilu, neutrališe dodavanjem 50 mL MeOH i 50 mL std. NH4Cl uz hlađenje u ledenom kupatilu. Vodeni sloj se ekstrahuje sa EtOAc, organski sloj se koncentruje, prečisti hromatografijom na koloni sa 30% EtOAc/heptan da se dobije 4.15 g I-3 (93% prinos) kao bela čvrsta supstanca.
LCMS [M+1-Boc] 298.<1>H NMR (400 MHz, HLOROFORM-d) δ ppm 7.84 - 7.95 (m, 2 H) 7.29 - 7.35 (m, 1 H) 5.43 (br. s., 1 H) 4.77 (d, J=5.50 Hz, 1 H) 4.51 (d, J=5.62 Hz, 1 H) 4.18 (br. s., 1 H) 3.87 (d, J=8.68 Hz, 1 H) 2.53 (d, J=6.85 Hz, 1 H) 2.04 (d, J=13.94 Hz, 1 H) 1.55 (s, 3 H) 1.45 (s, 9 H) 1.31 (s, 3 H)
Faza 3: Sinteza terc-butil ((3aS,4R,6R,6aR)-6-((3,4-difluorofenil)(hidroksi)metil)-2,2-dimetiltetrahidro-4H-ciklopenta[d][1,3]dioksol-4-il)karbamata (I-4)
[0160] U rastvor I-3 (4531 mg, 11.40 mmol) u EtOH (57.0 mL, c=0.2 M) se doda NaBH4(2160 mg, 57.0 mmol) i meša na r.t. u toku 30 min. Reakcija se neutrališe dodavanjem std. NH4Cl, ekstrahuje sa EtOAc, organski slojevi se koncentruju, prečiste hromatografijom na koloni uz eluiranje sa 50% EtOAc/heptan da se dobije 4120 mg I-4 (90% prinos) kao bela čvrsta supstanca. LCMS [M+1-Boc] 300.
Faza 4: Sinteza terc-butil ((3aS,4R,6S,6aR)-6-(((terc-butildimetilsilil)oksi)(3,4-difluorofenil)metil)-2,2-dimetiltetrahidro-4H-ciklopenta[d][1,3]dioksol-4-il)karbamata (I-5)
[0161] U rastvor I-4 (4300 mg, 10.77 mmol) i imidazola (2200 mg, 32.3 mmol) u DMF (53.8 mL, c=0.2 M) se doda t-butildimetilsilil hlorid (4870 mg, 32.3 mmol). Smeša se meša na r.t. u toku noći. Doda se nova količina TBSCl (1620 mg, 10.8 mmol) i meša na r.t. u toku noći. Reaktivna smeša se neutrališe sa H2O i ekstrahuje sa EtOAc (x3). Organski sloj se suši preko
1
Na2SO4, koncentruje, prečisti hromatografijom na koloni sa 15-20% EtOAc/heptan da se dobije 5.27 g I-5 (87% prinos) kao bezbojno ulje koje očvrsne pod vakuumom. LCMS [M+1-Boc] 414.
Faza 5: Sinteza smeše (3aS,4R,6S,6aR)-6-(((terc-butildimetilsilil)oksi)(3,4-difluorofenil)metil)-2,2-dimetiltetrahidro-4H-ciklopenta[d][1,3]dioksol-4-amina (I-6) i (1R,2S,3R,5S)-3-amino-5-(((terc-butildimetilsilil)oksi)(3,4-difluorofenil)metil)ciklopentan-1,2-diola (I-7)
[0162] I-5 (1250 mg, 2.433 mmol) u TFA (5.0 mL, c=0.5 M) se meša na r.t. u toku 10-15 min. U reaktivnu smešu se doda EtOAc i neutrališe sa std. NaHCO3do pH približno 7, vodeni sloj se ekstrahuje sa EtOAc, organski sloj se kombinuje, suši preko Na2SO4i koncentruje da se dobije 1 g (99% prinos) svetlo žutog ulja kao smeša dva jedinjenja I-6 i I-7.
Faza 6: Sinteza smeše N-((3aS,4R,6S,6aR)-6-(((terc-butildimetilsilil)oksi)(3,4-difluorofenil)metil)-2,2-dimetiltetrahidro-4H-ciklopenta[d][1,3]dioksol-4-il)-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-4-amina (I-8) i (1R,2S,3R,5S)-3-((7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-4-il)amino)-5-(((terc-butildimetilsilil)oksi)(3,4-difluorofenil)metil)ciklopentan-1,2-diola (I-9)
[0163] U rastvor prethodno dobijenih jedinjenja I-6 i I-7 (154 mg, 0.372 mmol) u 4 mL nBuOH se dodaju 4-hlor-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin (85.8 mg, 0.559 mmol) i DIPEA (96.3 mg, 0.745 mmol, 0.123 mL), uz 2 dana zagrevanja na 100°C. Reaktivna smeša se ohladi na r.t. i doda se EtOAc. Organski sloj se tri puta ispere sa H2O a nakon toga sa slanim rastvorom, suši preko Na2SO4, koncentruje, prečisti hromatografijom na koloni uz eluiranje od 80% EtOAc/heptan do 10% EtOAc/MeOH da se dobije 35.3 mg (19% prinos) smeše dva jedinjenja I-8 i I-9 kao braon ulje.
Faza 7: Sinteza smeše ((3aR,4R,6R,6aS)-6-((7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-4-il)amino)-2,2-dimetiltetrahidro-4H-ciklopenta[d][1,3]dioksol-4-il)(3,4-difluorofenil)metanola (I-10) i (1R,2S,3R,5R)-3-((7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-4-il)amino)-5-((3,4-difluorofenil)(hidroksi)metil) ciklopentan-1,2-diola (I-11)
2
[0164] U smešu prethodno dobijenih jedinjenja I-8 i I-9 (49 mg, 0.10 mmol) u 1 mL THF se u kapima doda TBAF (39.2 mg, 0.150 mmol, 0.15 mL, 1.0 M), meša na r.t. u toku 0.5 h, koncentruje i koristi sirovo za sledeću fazu.
Faza 8: Sinteza (1S,2R,3R,5R)-3-[(S)-(3,4-difluorofenil)(hidroksi)metil]-5-(7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-4-ilamino)ciklopentan-1,2-diola (I-12) i (1S,2R,3R,5R)-3-[(R)-(3,4-difluorofenil) (hidroksi)metil]-5-(7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-4-ilamino)ciklopentan-1,2-diola (I-13)
[0165] Smeša prethodno dobijenih jedinjenja I-10 i I-11 (42 mg, 0.10 mmol) se rastvori u TFA/H2O (1 mL/1 mL) i meša na rt u toku 2h. Po završetku, smeša se koncentruje da se dobije sirovo ulje, koje se rastvori u H2O i ispere sa EtOAc (1 mL x 2). Vodeni sloj se liofilizira i smeša razdvoji superkritičnom CO2tečnom hromatografijom da se dobiju (1S,2R,3R,5R)-3-[(S)-(3,4-difluorofenil)(hidroksi)metil]-5-(7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-4-ilamino)ciklopentan-1,2-diol I-12 (5.88 mg, 15%) i (1S,2R,3R,5R)-3-[(R)-(3,4-difluorofenil)(hidroksi)metil]-5-(7H- pirolo[2,3-d]pirimidin-4-ilamino)ciklopentan-1,2-diol I-13 (5.72 mg, 15%).
I-12: LCMS [M+1] 376.90.<1>H NMR (700 MHz, DMSO-d6) δ ppm 1.06 - 1.12 (m, 1 H) 1.88 - 1.96 (m, 1 H) 2.15 - 2.21 (m, 1 H) 2.88 (q, J=6.83 Hz, 1 H) 3.77 (t, J=6.15 Hz, 1 H) 3.88 (br. s., 1 H) 4.24 - 4.32 (m, 1 H) 4.47 (d, J=5.98 Hz, 1 H) 6.53 (br. s., 1 H) 7.06 (br. s., 1 H) 7.15 (br. s., 1 H) 7.25 - 7.36 (m, 3 H) 7.99 (br. s., 1 H) I-13: LCMS [M+1] 376.90.<1>H NMR (700 MHz, DMSO-d6) δ ppm 1.32 - 1.40 (m, 1 H) 1.81 (dt, J=12.55, 8.07 Hz, 1 H) 2.10 - 2.20 (m, 1 H) 2.88 (q, J=6.83 Hz, 1 H) 3.75 - 3.81 (m, 1 H) 3.83 (br. s., 1 H) 4.18 - 4.31 (m, 1 H) 4.73 (br. s., 1 H) 6.55 (br. s., 1 H) 7.07 (br. s., 1 H) 7.14 (br. s., 1 H) 7.24 - 7.41 (m, 3 H) 8.00 (br. s., 1 H)
Primeri 29 i 30 se izrađuju upotrebom slične hemije iz Šeme I koristeći 4-hlorhinolin-8-karbonitril u fazi 6 umesto 4-hlor-7H-pirolo[2,3-d]pirimidina.
[0166]
Primer 31 (Šema J) - (1S,2R,3R,5R)-3-[(S)-(3,4-difluorofenil)(hidroksi)metil]-5-[metil(pirimidin-4-il) amino]ciklopentan-1,2-diol (J-5) (referenca)
Primer 32 (Šema J) - (1S,2R,3R,5R)-3-[(R)-(3;4-difluorofenil)(hidroksi)metil]-5-[metil(pirimidin-4-il)amino]ciklopentan-1,2-diol (J-5) (referenca)
4
Šema J
Faza 1: Sinteza terc-butil ((3aS,4R,6S,6aR)-6-(((terc-butildimetilsilil)oksi)(3,4-difluorofenil)metil)-2,2-dimetiltetrahidro-4H-ciklopenta[d][1,3]dioksol-4-il)(metil)karbamata (J-1)
[0168] Natrijum hidrid (304 mg, 7.59 mmol) se u porcijama doda u rastvor I-5 (1300 mg, 2.531 mmol) u DMF (15 mL, 0.1 M) u atmosferi azota, nakon 5 min se doda jodometan (1080 mg, 7.59 mmol) i meša 30 min na r.t.. U reaktivnu smešu se doda H2O, ekstrahuje sa EtOAc, koncentruje i prečisti hromatografijom na koloni sa 20% EtOAc/heptan da se dobije 1290 mg J-1 (96% prinos) kao bezbojno ulje, LCMS [M+1-Boc] 428.1.
Faza 2: Sinteza (3aS,4R,6S,6aR)-6-(((terc-butildimetilsilil)oksi)(3,4-difluorofenil)metil)-N,2,2-trimetiltetrahidro-4H-ciklopenta[d][1,3]dioksol-4-amina (J-2)
[0169] J-1 (967 mg, 1.83 mmol) u TFA (5.0 mL, c=0.1 M) se meša 10-15 min na r.t. U reaktivnu smešu se dodaju EtOAc i std. NaHCO3za neutralizaciju pH do približno 7, ekstrahuje sa EtOAc, organski sloj se suši preko Na2SO4i koncentruje da se dobije bezbojno ulje.
[0170] Gore izrađeno ulje se rastvori u aceton dimetil acetalu (10 mL, c=0.1 M), doda se toluen-4-sulfonska kiselina (349 mg,1.83 mmol) i meša 15 min na r.t.. U reaktivnu smešu se doda std NaHCO3, ekstrahuje sa EtOAc, organski sloj se ispere sa slanim rastvorom, suši preko Na2SO4i koncentruje da se dobije 0.78 g J-2 (99% prinos) kao svetlo žuto ulje. LCMS [M+1] 428.15.
Faza 3: Sinteza N-((3aS,4R,6S,6aR)-6-(((terc-butildimetilsilil)oksi)(3,4-difluorofenil) metil)-2,2-dimetiltetrahidro-4H-ciklopenta[d][1,3]dioksol-4-il)-N-metilpirimidin-4-amina (J-3)
[0171] Smeša J-2 (200 mg, 0.468 mmol), 4-hlorpirimidina (64.3 mg, 0.561 mmol) i DIPEA (121 mg, 0.935 mmol , 0.155 mL) u n-butanolu (2.0 mL, c=0.2 M) se zagreva na 120°C u toku noći. Reaktivna smeša se ohladi na r.t. i rastvarač se ukloni. U ostatak se doda EtOAc, ispere 3 puta sa H2O i nakon toga sa slanim rastvorom, suši preko Na2SO4i koncentruje, prečisti hromatografijom na koloni sa 70% EtOAc/heptan da se dobije 64 mg J-3 (27% prinos) kao braon ulje. LCMS [M+1] 506.20.
Faza 4: Sinteza (3,4-difluorofenil)((3aR,4R,6R,6aS)-2,2-dimetil-6-(metil(pirimidin-4-il) amino)tetrahidro-4H-ciklopenta[d][1,3]dioksol-4-il)metanola (J-4)
[0172] Po sličnom postupku kao za fazu 7 u Šemi I, J-3 se deprotektuje da se dobije J-4 kao sirovi produkt za sledeću fazu. LCMS [M+1] 392.15.
Faza 5: Sinteza (1S,2R,3R,5R)-3-[(S)-(3,4-difluorofenil)(hidroksi)metil]-5-[metil (pirimidin-4-il)amino]ciklopentan-1,2-diola (J-5) i (1S,2R,3R,5R)-3-[(R)-(3;4-difluorofenil) (hidroksi)metil]-5-[metil(pirimidin-4-il)amino]ciklopentan-1,2-diola (J-6)
[0173] Po sličnom postupku kao za fazu 8 u Šemi I, J-4 (50 mg, 0.13 mmol) se deprotektuje da se dobiju J-5 (19.73 mg, 44%) i J-6 (3.14 mg, 7%).
J-5: LCMS [M+1] 351.90.<1>H NMR (700 MHz, DMSO-d6) δ ppm 1.18 - 1.31 (m, 1 H) 1.63 (d, J=9.68 Hz, 1 H) 2.08 - 2.19 (m, 1 H) 2.90 (br. s., 3 H) 3.73 - 3.82 (m, 1 H) 3.90 (dd, J=9.35, 5.17 Hz, 1 H) 4.38 (br. s., 1 H) 4.49 (d, J=5.94 Hz, 1 H) 4.63 (br. s., 1 H) 5.60 (br. s., 1 H) 6.57 - 6.69 (m, 1 H) 7.21 (br. s., 1 H) 7.31 - 7.42 (m, 2 H) 8.02 - 8.14 (m, 1 H) 8.41 (br. s., 1 H) J-6: LCMS [M+1] 351.90.<1>H NMR (700 MHz, DMSO-d6) δ ppm 1.42 (br. s., 2 H) 2.10 (br. s., 1 H) 2.90 (br. s., 3 H) 3.76 (br. s., 1 H) 3.86 - 3.97 (m, 1 H) 4.54 (br. s., 1 H) 4.65 (br. s., 1 H) 4.70 - 4.78 (m, 1 H) 5.58 (br. s., 1 H) 6.63 (br. s., 1 H) 7.17 (br. s., 1 H) 7.28 7.40 (m, 2 H) 8.09 (br. s., 1 H) 8.41 (br. s., 1 H)
Primeri 33-36 (reference) se izrađuju po sličnoj hemiji za Šemu J koristeći hlorpirimidin naveden u fazi 3.
[0174]
(nastavlja se)
Primer 37 (Šema K) - (1R,2S,3R,5R)-3-[(4-amino-1,3,5-triazin-2-il)(metil)amino]-5-[(S)-(3,4-difluorofenil) (hidroksi)metil]ciklopentan-1,2-diol (K-4) (referenca)
Primer 38 (Šema K) - (1R,2S,3R,5R)-3-[(4-amino-1,3,5-triazin-2-il)(metil) amino]-5-[(R)-(3,4-difluorofenil)(hidroksi)metil]ciklopentan-1,2-diol (K-5) (referenca)
Šema K
Faza 1: Sinteza N-((3aS,4R,6S,6aR)-6-(((terc-butildimetilsilil)oksi)(3,4-difluorofenil) metil)-2,2-dimetiltetrahidro-4H-ciklopenta[d][1,3]dioksol-4-il)-4-hlor-N-metil-1,3,5-triazin-2-amina (K-1)
[0176] Po sličnom postpuku iz faze 3 u Šemi J, koristeći 2,4-dihlor-[1,3,5]triazin sa J-2 se dobija K-1 (267 mg, 58%).
Faza 2: Sinteza N2-((3aS,4R,6S,6aR)-6-(((terc-butildimetilsilil)oksi)(3,4-difluorofenil) metil)-2,2-dimetiltetrahidro-4H-ciklopenta[d][1,3]dioksol-4-il)-N2-metil-1,3,5-triazin-2,4-diamina (K-2)
[0177] Po sličnom postpuku iz faze 5 u Šemi G, K-1 se konvertuje u K-2 (86 mg, 81%). LCMS [M+1] 522.
Faza 3: Sinteza ((3aR,4R,6R,6aS)-6-((4-amino-1,3,5-triazin-2-il)(metil)amino)-2,2-dimetil tetrahidro-4H-ciklopenta[d][1,3]dioksol-4-il)(3,4-difluorofenil)metanola (K-3)
[0178] Po sličnom postpuku iz faze 4 u Šemi J, K-2 se deprotektuje sa TBAF da se dobije K-3 kao sirovi produkt za sledeću fazu.
Faza 4: Sinteza (1R,2S,3R,5R)-3-[(4-amino-1,3,5-triazin-2-il)(metil)amino]-5-[(S)-(3,4difluorofenil)(hidroksi)metil]ciklopentan-1,2-diola (K-4) i (1R,2S,3R,5R)-3-[(4-amino-1,3,5-triazin-2-il)(metil)amino]-5-[(3R)-(3,4-difluorofenil)(hidroksi)metil]ciklopentan-1,2-diola (K-5)
[0179] Po sličnom postpuku iz faze 5 u Šemi J sa naknadnim razdvajanjem asimetričnom SFC, K-3 se konvertuje u K-4 (12 mg, 20%) i K-5 (48 mg, 80%).
K-4: LCMS [M+1] 367.90.<1>H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ ppm 1.12 - 1.23 (m, 1 H) 1.52 -1.64 (m, 1 H) 2.08 (br. s., 1 H) 2.96 (d, J=9.78 Hz, 3 H) 3.78 (br. s., 1 H) 3.87 (br. s., 1 H) 4.48 (d, J=5.38 Hz, 1 H) 4.94 (br. s., 1 H) 5.55 (br. s., 1 H) 6.95 (s, 1 H) 7.08 (br. s, 2 H) 7.21 (br. s, 1 H) 7.30 - 7.45 (m, 2 H) 8.07 (br. s., 1 H) K-5: LCMS [M+1] 367.90.<1>H NMR (700 MHz, DMSO-d6) δ ppm 1.31 - 1.45 (m, 2 H) 2.05 (br. s., 1 H) 2.93 (m, 3 H) 3.72 (br. s., 1 H) 3.90 (br. s., 1 H) 4.65 - 4.72 (m, 1 H) 4.86 (d, J=15.03 Hz, 1 H) 7.14 (br. s., 1 H) 7.25 - 7.35 (m, 2 H) 7.98 (br. s., 1 H) 8.30 (br. s., 2 H)
Primeri 39-42 (reference) se izrađuju po sličnoj hemiji za Šemi K koristeći 2,4-dihlorpirimidin (Primeri 39 & 40) ili 2,4-dihlor-6-metil-1,3,5-triazin (Primeri 41 & 42) navedene u fazi 1.
[0180]
1
11 (nastavlja se)
Primer 43 (Šema L) - (1R,2S,3R,5R)-3-[(6-aminopirimidin-4-il)(metil)amino]-5-[(S)-(3,4-difluorofenil) (hidroksi)metil]ciklopentan-1,2-diol (L-4) (referenca)
Primer 44 (Šema L) - (1R,2S,3R,5R)-3-[(6-aminopirimidin-4-il)(metil)amino]-5-[(R)-(3,4-difluorofenil)(hidroksi)metil]ciklopentan-1,2-diol (L-5) (referenca)
1 2
Šema L
Faza 1: Sinteza N-((3aS,4R,6S,6aR)-6-(((terc-butildimetilsilil)oksi)(3,4-difluorofenil)metil)-2,2-dimetiltetrahidro-4H-ciklopenta[d][1,3]dioksol-4-il)-6-hlor-N-metilpirimidin-4-amina (L-1)
[0182] Po sličnom postpuku iz faze 1 u Šemi K, J-2 se tretira sa 4,6-dihlorpirimidinom u nbutanolu i DIPEA da se dobije L-1 (188 mg, 60%). LCMS [M+1] 540.20.
Faza 2: Sinteza N4-((3aS,4R,6S,6aR)-6-(((terc-butildimetilsilil)oksi)(3,4-difluorofenil) metil)-2,2-dimetiltetrahidro-4H-ciklopenta[d][1,3]dioksol-4-il)-N4-metilpirimidin-4,6-diamina (L-2)
[0183] U rastvor L-1 (188 mg, 0.348 mmol) u THF (10 mL, c=0.035 M) se dodaju tris(dibenzilidenaceton)di-paladijum (41.4 mg, 0.045 mmol) i dicikloheksil(2-fenilfenil)fosfan (33.7 mg, 0.092 mmol), zatvore u posudi i prečiste sa azotom, nakon toga se doda LHMDS (153 mg, 0.905 mmol , 0.90 mL, 1.0 M) i zagreva 18 h na 75°C. Reakcija se ohladi na r.t., razblaži sa vodom i EtOAc i slojevi se razdvoje. Organska faza se suši preko Na2SO4, filtrira i koncentruje. Produkt se prečisti hromatografijom na koloni sa 80%-100% EtOAc/heptan da se dobije 180 mg L-2 (99% prinos) kao svetlo žuto ulje. LCMS [M+1] 521.30.
Faza 3: Sinteza ((3aR,4R,6R,6aS)-6-((6-aminopirimidin-4-il)(metil)amino)-2,2-dimetil tetrahidro-4H-ciklopenta[d][1,3]dioksol-4-il)(3,4-difluorofenil)metanola (L-3)
1
[0184] Po sličnom postupku kao za fazu 3 u Šemi K, L-2 se tretira sa TBAF da se dobije L-3 kao sirovi produkt za sledeću fazu. LCMS [M+1] 407.20.
Faza 4: Sinteza (1R,2S,3R,5R)-3-[(6-aminopirimidin-4-il)(metil)amino]-5-[(S)-(3,4-difluoro fenil)(hidroksi)metil]ciklopentan-1,2-diola (L-4) i (1R,2S,3R,5R)-3-[(6-aminopirimidin-4-il)(metil) amino]-5-[(R)-(3,4-difluorofenil)(hidroksi)metil]ciklopentan-1,2-diola (L-5)
[0185] Po sličnom postupku kao za fazu 4 u Šemi K, L-3 se tretira sa TFA u vodi. L-4 (31 mg, 25%) i L-5 (11 mg, 9%) se izdvoje nakon dorade i prečišćavanja asimetričnom SFC. L-4: LCMS [M+1] 366.90.<1>H NMR (700 MHz, DMSO-d6) δ ppm 1.13 - 1.26 (m, 1 H) 1.55 (dt, J=12.60, 8.56 Hz, 1 H) 2.04 - 2.13 (m, 1 H) 2.77 (s, 2 H) 3.71 - 3.79 (m, 1 H) 3.81 - 3.88 (m, 1 H) 4.27 - 4.35 (m, 1 H) 4.47 (t, J=5.28 Hz, 1 H) 4.55 (d, J=5.72 Hz, 1 H) 5.47 (s, 1 H) 5.58 (d, J=4.62 Hz, 1 H) 6.03 (br. s., 2 H) 7.15 - 7.23 (m, 1 H) 7.30 - 7.40 (m, 2 H) 7.86 (s, 1 H) L-5: LCMS [M+1] 366.90.<1>H NMR (700 MHz, DMSO-d6) δ ppm 1.29 - 1.42 (m, 2 H) 1.99 - 2.09 (m, 1 H) 2.78 (br. s., 3 H) 3.74 (br. s., 1 H) 3.86 (d, J=7.04 Hz, 1 H) 4.41 - 4.49 (m, 1 H) 4.52 - 4.60 (m, 1 H) 4.72 (br. s., 1 H) 5.47 (s, 1 H) 5.56 (d, J=3.96 Hz, 1 H) 6.03 (br. s., 1 H) 7.15 (br. s., 1 H) 7.28 - 7.38 (m, 2 H) 7.86 (s, 1 H)
Primer 46 (Šema M) - (1S,2R,3R,5R)-3-[(S)-(3,4-difluorofenil)(hidroksi)metil]-5-[metil(4-metil-1,3,5-triazin-2-il)amino]ciklopentan-1,2-diol (M-4) (referenca)
Primer 47 (Šema M) - (1S,2R,3R,5R)-3-[(R)-(3,4-difluorofenil)(hidroksi)metil]-5-[metil(4-metil-1,3,5-triazin-2-il)amino]ciklopentan-1,2-diol (M-5) (referenca)
1 4
Šema M
Faza 1: Sinteza N-((3aS,4R,6S,6aR)-6-(((terc-butildimetilsilil)oksi)(3,4-difluorofenil) metil)-2,2-dimetiltetrahidro-4H-ciklopenta[d][1,3]dioksol-4-il)-4-hlor-N-metil-1,3,5-triazin-2-amina (M-1)
[0187] Reaktivna smeša J-2 (360 mg, 0.842 mmol), 2,4-dihlor-[1,3,5] triazina (152 mg, 1.01 mmol) i DIPEA (218 mg, 1.68 mmol, 0.279 mL) u DMA (5 mL, 0.16 M) se meša 5 h na r.t. U reaktivnu smešu se doda EtOAc, ispere 3 puta sa H2O i nakon toga sa slanim rastvorom.
Organski sloj se suši preko Na2SO4i koncentruje, prečisti hromatografijom na koloni sa 20% EtOAc/heptan da se dobije 267 mg M-1 (58.6% prinos) kao bezbojno ulje. LCMS [M+1] 541.
Faza 2: Sinteza N-((3aS,4R,6S,6aR)-6-(((terc-butildimetilsilil)oksi)(3,4-difluorofenil) metil)-2,2-dimetiltetrahidro-4H-ciklopenta[d][1,3]dioksol-4-il)-N,4-dimetil-1,3,5-triazin-2-amina (M-2)
[0188] M-2 (176 mg, 99%) se izrađuje od M-1 po sličnom postupku iz faze 5 u Šemi A.
LCMS [M+1] 521.
Faza 3: Sinteza (3,4-difluorofenil)((3aR,4R,6R,6aS)-2,2-dimetil-6-(metil(4-metil-1,3,5-triazin-2-il)amino)tetrahidro-4H-ciklopenta[d][1,3]dioksol-4-il)metanola (M-3)
[0189] Po sličnom postupku kao za fazu 3 u Šemi K, M-2 se tretira sa TBAF da se dobije M-3
kao sirovi produkt za sledeću fazu. LCMS [M+1] 407.
1
Faza 4: Sinteza (1S,2R,3R,5R)-3-((S)-(3,4-difluorofenil)(hidroksi)metil)-5-(metil(4-metil-1,3,5-triazin-2-il)amino)ciklopentan-1,2-diola (M-4) i (1S,2R,3R,5R)-3-((R)-(3,4-difluorofenil) (hidroksi)metil)-5-(metil(4-metil-1,3,5-triazin-2-il)amino)ciklopentan-1,2-diola (M-5)
[0190] Po sličnom postupku kao za fazu 4 u Šemi K, M-3 se tretira sa TFA u vodi. M-4 (78.97 mg, 64%) i M-5 (24.48 mg, 20%) se izdvoje nakon naredne dorade i prečišćavanja asimetričnom SFC.
M-4: LCMS [M+1] 366.90.<1>H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ ppm 1.26 - 1.34 (m, 1 H) 1.56 - 1.69 (m, 1 H) 2.13 (br. s., 1 H) 2.24 - 2.32 (m, 3 H) 3.00 (s, 3 H) 3.78 (br. s., 1 H) 3.91 (br. s., 1 H) 4.33 (d, J=15.89 Hz, 1 H) 4.48 (br. s., 1 H) 4.60 (br. s., 1 H) 4.92 - 5.04 (m, 1 H) 5.56 (d, J=4.40 Hz, 1 H) 7.22 (d, J=4.52 Hz, 1 H) 7.30 - 7.43 (m, 2 H) 8.39 (d, J=14.67 Hz, 1 H) M-5: LCMS [M+1] 366.90.<1>H NMR (700 MHz, DMSO-d6) δ ppm 1.36 - 1.48 (m, 2 H) 2.09 (br. s., 1 H) 2.27 (d, J=23.74 Hz, 3 H) 2.98 (d, J=4.10 Hz, 3 H) 3.73 (br. s., 1 H) 3.90 (m, 1 H) 4.70 (br. s., 1 H) 4.93 (t, J=9.99 Hz, 1 H) 7.15 (br. s., 1 H) 7.31 (d, J=9.39 Hz, 2 H) 8.34 (d, J=33.65 Hz, 1 H)
Primer 48 (Šema N) - (1R,2S,3R,5R)-3-(2-amino-4-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)-5-[(S)-(3,4-difluorofenil)(hidroksi)metil]ciklopentan-1,2-diol (N-5) (referenca)
Primer 49 (Šema N) - (1R,2S,3R,5R)-3-(2-amino-4-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)-5-[(R)-(3,4-difluorofenil)(hidroksi)metil]ciklopentan-1,2-diol (N-6) (referenca)
1
Šema N
Faza 1: Sinteza ((3aR,4R,6R,6aS)-6-amino-2,2-dimetiltetrahidro-4H-ciklopenta[d][1,3] dioksol-4-il)(3,4-di-fluorofenil)metanola (N-1)
[0192] I-5 (616 mg, 1.54 mmol) u TFA (3 mL, c=0.5 M) se meša 10-15 min na r.t.. U reaktivnu smešu se doda EtOAc i neutrališe sa std. NaHCO3do pH približno 7, vodeni sloj se ekstrahuje 3 puta sa EtOAc, organski sloj se suši preko Na2SO4i koncentruje da se dobije 460 mg N-1 (100% prinos) kao bela čvrsta supstanca, koja se koristi u sledećoj fazi. LCMS [M+1] 300.15.
Faza 2: Sinteza ((3aR,4R,6R,6aS)-6-((2-amino-6-hlor-5-(2,2-dietoksietil)pirimidin-4-il) amino)-2,2-dimetiltetrahidro-4H-ciklopenta[d][1,3]dioksol-4-il)(3,4-difluorofenil)metanola (N-2)
[0193] Smeša N-1 (214 mg, 0.714 mmol), 4,6-dihlor-5-(2,2-dietoksietil)pirimidin-2-amina (200 mg, 0.714 mmol) i trietilamina (289 mg, 2.86 mmol) u 10 mL nBuOH se zagreva na 135°C u zatvorenoj epruveti u toku 40 h. Reaktivna smeša se ohladi na r.t., koncentruje, doda se H2O, ekstrahuje sa EtOAc i produkt se prečisti hromatografijom na koloni sa 50-60% EtOAc/heptan da se dobije 200 mg N-2 (51% prinos) kao žuta čvrsta supstanca. LCMS [M+1] 543.20.
Faza 3: Sinteza ((3aR,4R,6R,6aS)-6-(2-amino-4-hlor-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)-2,2-dimetiltetrahidro-4H-ciklopenta[d][1,3]dioksol-4-il)(3,4-difluorofenil)metanola (N-3)
1
[0194] N-2 (200 mg, 0.368 mmol) se doda u sirćetnu kiselinu (15 mL, c=0.025 M), rastvor se zagreva 1 h na 100°C. Isparive supstance se uklone pod vakuumom, u ostatak se doda EtOAc, neutrališe sa std. NaHCO3, slojevi se razdvoje i vodeni sloj se ekstrahuje 3 puta sa EtOAc. Organski sloj se koncentruje, prečisti hromatografijom na koloni sa 50% EtOAc/heptan da se dobije 100 mg N-3 (60% prinos) kao beličasta čvrsta supstanca. LCMS [M+1] 451.10.
Faza 4: Sinteza ((3aR,4R,6R,6aS)-6-(2-amino-4-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)-2,2-dimetiltetrahidro-4H-ciklopenta[d][1,3]dioksol-4-il)(3,4-difluorofenil)metanola (N-4)
[0195] Po sličnom postpuku iz faze 5 u Šemi A, N-3 se konvertuje u N-4 (69 mg, 85%).
LCMS [M+1] 431.15.
Faza 5: Sinteza (1R,2S,3R,5R)-3-(2-amino-4-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)-5-[(S)-(3,4-difluorofenil)(hidroksi)metil]ciklopentan-1,2-diola (N-5) i (1R,2S,3R,5R)-3-(2-amino-4-metil-7H-pirolo[2,3-d]piridin-7-il)-5-[(R)-(3,4-difluorofenil)(hidroksi)metil]ciklopentan-1,2-diola (N-6)
[0196] Po sličnom postupku kao za fazu 4 u Šemi K, N-4 se tretira sa TFA u vodi. N-5 (14.6 mg, 23%) i N-6 (6.6 mg, 11%) se izdvoje nakon naredne dorade i prečišćavanja asimetričnom SFC.
N-5: LCMS [M+1] 390.85.<1>H NMR (700 MHz, DMSO-d6) δ ppm 7.35 - 7.40 (m, 1 H) 7.29 -7.35 (m, 1 H) 7.21 (br. s., 1 H) 7.07 (d, J=3.74 Hz, 1 H) 6.38 (d, J=3.52 Hz, 1 H) 5.90 (s, 2 H) 5.74 (d, J=4.40 Hz, 1 H) 4.83 (d, J=6.60 Hz, 1 H) 4.71 - 4.79 (m, 1 H) 4.51 - 4.58 (m, 2 H) 4.15 - 4.21 (m, 1 H) 3.90 (br. s., 1 H) 2.38 (s, 3 H) 2.18 (d, J=7.92 Hz, 1 H) 1.83 - 1.93 (m, 1 H) 1.44 (d, J=10.34 Hz, 1 H)
N-6: LCMS [M+1] 390.90.<1>H NMR (700 MHz, DMSO-d6) δ ppm 7.29 - 7.36 (m, 2 H) 7.16 (br. s., 1 H) 7.12 (d, J=3.52 Hz, 1 H) 6.40 (d, J=3.30 Hz, 1 H) 5.89 (s, 2 H) 5.76 (br. s., 1 H) 4.86 (d, J=5.94 Hz, 1 H) 4.76 (t, J=4.62 Hz, 1 H) 4.73 (q, J=8.88 Hz, 1 H) 4.68 (br. s., 1 H) 4.08 - 4.12 (m, 1 H) 3.83 - 3.86 (m, 1 H) 2.39 (s, 3 H) 2.16 (dt, J=8.53, 4.21 Hz, 1 H) 1.76 (dt, J=12.98, 8.47 Hz, 1 H) 1.57 - 1.64 (m, 1 H)
1
Primer 50 (Šema O) - (1S,2R,3S,5R)-3-[2-amino-1-fluor-1-(4-fluorofenil)etil]-5-(4-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)ciklopentan-1,2-diol (O-5) (referenca)
Primer 51 (Šema O) - (1S,2R,3R,5R)-3-[(1S)-2-amino-1-(4-fluorofenil)etil]-5-(4-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)ciklopentan-1,2-diol (O-6) (referenca)
Primer 52 (Šema O) - (1S,2R,3R,5R)-3-[(1R)-2-amino-1-(4-fluorofenil)etil]-5-(4-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)ciklopentan-1,2-diol (O-7) (referenca)
[0197]
Šema O
1) TFA, H2O
2) asimetrično razdvajanje
Faza 1: Sinteza 2-((3aR,4S,6R,6aS)-2,2-dimetil-6-(4-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)tetrahidro-4H-ciklopenta[d][1,3]dioksol-4-il)-2-fluor-2-(4-fluorofenil)acetonitrila (O-1)
[0198] U smešu E-1 (175 mg, 0.443 mmol) i cink(II) jodida (2.12 mg, 0.00664 mmol) u zatvorenoj epruveti se doda 2 mL anhidrovanog CH2Cl2, zatim se u atmosferi azota doda trimetilsilil cijanid (0.25 mL). Reakcija se zatvori i zagreva 2 dana na 50°C. Dobijena smeša se ohladi u ledenom kupatilu, u kapima se doda DAST (78.5 mg, 0.487 mmol) i meša na r.t. u toku 15 min. Reaktivna smeša se ispere sa H2O, 0.5 N rastvorom HCl, std. NaHCO3, slanim
1
rastvorom i koncentruje. Produkt se prečisti hromatografijom na koloni sa 50% EtOAc/heptan da se dobije 80 mg O-1 (43% prinos) kao žuto ulje. LCMS [M+1] 425.10.
Faza 2: Sinteza 2-((3aR,4S,6R,6aS)-2,2-dimetil-6-(4-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)tetrahidro-4H-ciklopenta[d][1,3]dioksol-4-il)-2-fluor-2-(4-fluorofenil)etan-1-amina (O-2) i 2-((3aR,4R,6R,6aS)-2,2-dimetil-6-(4-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)tetrahidro-4H-ciklopenta[d][1,3]dioksol-4-il)-2-(4-fluorofenil)etan-1-amina (O-3)
[0199] O-1 (70 mg, 0.16 mmol) se rastvori u 0.5 mL MeOH. Doda se kobalt (II) hlorid heksahidrat (118 mg, 0.495 mmol) i smeša se ohladi u ledenom kupatilu. Doda se NaBH4(32.8 mg, 0.825 mmol) i reakcija meša 0.5 h na 0°C. Reaktivna smeša se neutrališe sa std. NH4Cl, ekstrahuje sa EtOAc, organski sloj se ispere sa slanim rastvorom, koncentruje, prečisti prep TLC pločom sa 5% MeOH/CH2Cl2da se dobije 20 mg O-2 (28% prinos) kao žuto ulje, (LCMS [M+1] 429.10) i 22 mg O-3 (32% prinos) kao žuto ulje. (LCMS [M+1] 411.20)
Faza 3: Sinteza (1S,2R,3S,5R)-3-[2-amino-1-fluor-1-(4-fluorofenil)etil]-5-(4-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)ciklopentan-1,2-diola (O-4)
[0200] Po sličnom postupku kao za fazu 4 u Šemi K, O-2 se tretira sa TFA u vodi. O-4 (1.2 mg, 6.6%) se izdvoji nakon naredne dorade i prečišćavanja sa SFC.
[0201] LCMS [M+1] 388.90.<1>H NMR (400 MHz, METANOL-d4) δ ppm 1.62 - 1.73 (m, 1 H) 1.81 (s, 3 H) 2.54 - 2.73 (m, 4 H) 4.17 (br. s., 1 H) 4.76 - 4.94 (m, 2 H) 6.59 (d, J=3.42 Hz, 1 H) 7.04 (t, J=8.68 Hz, 2 H) 7.29 - 7.42 (m, 3 H) 8.46 (s, 1 H)
Faza 4: Sinteza (1S,2R,3R,5R)-3-[(1S)-2-amino-1-(4-fluorofenil)etil]-5-(4-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)ciklopentan-1,2-diola (O-5) i (1S,2R,3R,5R)-3-[(1R)-2-amino-1-(4-fluorofenil)etil]-5-(4-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)ciklopentan-1,2-diola (O-6)
[0202] Po sličnom postupku kao za fazu 4 u Šemi K, O-3 se tretira sa TFA u vodi. O-5 (5.4 mg, 27%) i O-6 (3.7 mg, 19%) se izdvoje nakon naredne dorade i prečišćavanja asimetričnom SFC.
O-5: LCMS [M+1] 370.90.<1>H NMR (400 MHz, METANOL-d4) δ ppm 1.42 - 1.57 (m, 1 H)
11
1.65 - 1.79 (m, 1 H) 2.24 (br. s., 1 H) 2.49 - 2.68 (m, 3 H) 2.83 (br. s., 1 H) 2.96 - 3.10 (m, 1 H) 3.31 (d, J=13.20 Hz, 1 H) 4.02 (t, J=5.81 Hz, 1 H) 4.27 (t, J=6.79 Hz, 1 H) 4.75 (br. s., 1 H) 6.56 (d, J=3.18 Hz, 1 H) 6.98 (t, J=8.38 Hz, 2 H) 7.13 - 7.28 (m, 2 H) 7.31 (d, J=2.93 Hz, 1 H) 8.45 (s, 1 H)
O-6: LCMS [M+1] 370.90.<1>H NMR (400 MHz, METANOL-d4) δ ppm 1.78 (d, J=9.29 Hz, 1 H) 2.26 - 2.40 (m, 2 H) 2.53 - 2.67 (m, 4 H) 2.91 - 3.00 (m, 1 H) 3.24 - 3.25 (m, 1 H) 3.67 -3.78 (m, 1 H) 4.19 - 4.32 (m, 1 H) 4.82 - 4.89 (m, 1 H) 6.60 (d, J=3.67 Hz, 1 H) 7.08 (t, J=8.68 Hz, 2 H) 7.27 - 7.40 (m, 3 H) 8.44 - 8.52 (m, 1 H)
Primer 53 (Šema P) - (1S,2R,3R,5R)-3-((S)-(2-(aminometil)-4-hlorfenil)(hidroksi)metil)-5-(4-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)ciklopentan-1,2-diol (P-8) (referenca)
Primer 54 (Šema P) - (1S,2R,3R,5R)-3-((R)-(2-(aminometil)-4-hlorfenil)(hidroksi)metil)-5-(4-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)ciklopentan-1,2-diol (P-9) (referenca)
[0203]
Šema P
Faza 1: Sinteza (1R,2S,3R,5R)-3-((6-hlor-5-(2,2-dietoksietil)pirimidin-4-il)amino)-5-(hidroksimetil)ciklopentan-1,2-diola (P-1)
[0204] (1R,2S,3R,5R)-3-amino-5-(hidroksimetil)ciklopentan-1,2-diol (4160 mg, 22.6 mmol) i 4,6-dihlor-5-(2,2-dietoksietil)pirimidin (J. Med. Chem.10, 665, 1967) (5000 mg, 18.86 mmol) u 40 mL apsolutnog etanola u zatvorenoj boci se tretira sa Et3N (7630 mg, 75.4 mmol) i zagreva 18 h na 80°C. Reaktivna smeša se ohladi u ledenom kupatilu, čvrsta supstanca se filtrira i osnovni rastvor se koncentruje da se dobije P-1 kao braon žitka masa koja se koristi direktno u sledećoj fazi. LCMS [M+1] 375.80.
Faza 2: Sinteza (1R,2S,3R,5R)-3-(4-hlor-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)-5-(hidroksimetil) ciklopentan-1,2-diola (P-2)
[0205] Suspenzija P-1 (7088 mg, 18.86 mmol) u 30 mL dioksana, se tretira sa 10 mL 1 N rastvorom HCl i zagreva 30 min na 80°C. Reaktivna smeša se neutrališe sa NH4OH do pH 7 i isparive supstance se uklone pod vakuumom da se dobije P-2 kao braon žitka masa koje se koristi direktno u sledećoj fazi. LCMS [M+1] 283.85.
Faza 3: Sinteza ((3aR,4R,6R,6aS)-6-(4-hlor-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)-2,2-dimetiltetrahidro-4H-ciklopenta[d][1,3]dioksol-4-il)metanola (P-3)
[0206] P-2 (5350 mg, 18.86 mmol) i 2,2-dimetoksipropan (50 mL, c=0.38 M) se tretiraju sa p-toluensulfonskom kiselinom monohidratnom (7170 mg, 37.7 mmol) i žuta braon suspenzija se podesi na pH 4-5 i energično meša 15 min na r.t. Reaktivna smeša se razblaži sa 100 mL H2O i neutrališe sa čvrstim NaHCO3. Isparive supstance se pažljivo uklone pod vakuumom i dobijeni braon vodeni rastvor se ekstrahuje sa smešom 20% izopropanol/DCM, organske komponente se kombinuju, koncentruju i prečiste hromatografijom na koloni sa 50% EtOAc/DCM do 100% EtOAc da se dobije 4.4 g P-3 kao žuta guma (72% ukupni prinos). LCMS [M+1] 324.10.<1>H NMR (400 MHz, HLOROFORM-d) δ ppm 8.63 (s, 1 H) 7.33 (d, J=3.55 Hz, 1 H) 6.63 (d, J=3.67 Hz, 1 H) 4.94 - 5.06 (m, 2 H) 4.72 (dd, J=6.66, 4.46 Hz, 1 H) 3.85 - 3.92 (m, 1 H) 3.78 - 3.85 (m, 1 H) 2.43 - 2.56 (m, 2 H) 2.28 - 2.42 (m, 1 H) 2.09 (br. s., 1 H) 1.55 - 1.64 (m, 3 H) 1.33 (s, 3 H)
Faza 4: Sinteza ((3aR,4R,6R,6aS)-2,2-dimetil-6-(4-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)tetrahidro-4H-ciklopenta[d][1,3]dioksol-4-il)metanola (P-4)
[0207] Po sličnom postpuku iz faze 5 u Šemi A, P-3 se konvertuje u P-4 (930 mg, 88%). LCMS [M+1] 304.15.<1>H NMR (400 MHz, HLOROFORM-d) δ ppm 1.25 (s, 3 H) 1.53 (s, 3 H) 2.21 - 2.34 (m, 2 H) 2.38 - 2.47 (m, 2 H) 2.75 (s, 3 H) 3.75 (br. s., 1 H) 3.80 (br. s., 1 H) 4.65 (dd, J=6.66, 4.10 Hz, 1 H) 4.86 - 5.00 (m, 2 H) 6.57 (br. s., 1 H) 7.25 (br. s., 1 H) 8.71 (s, 1 H)
Faza 5: Sinteza (3aR,4S,6R,6aS)-2,2-dimetil-6-(4-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)tetrahidro-4H-ciklopenta[d][1,3]dioksol-4-karbaldehida (P-5)
[0208] EDC·HCl (3110 mg, 16.2 mmol) se doda u rastvor P-4 (1230 mg, 4.055 mmol) u anhidrovanom dimetil sulfoksidu (22.5 mL, c=0.18 M). Doda se piridin (641 mg, 8.11 mmol) a nakon toga TFA (462 mg, 4.05 mmol) i meša 1.5 h na r.t. Reaktivna smeša se razblaži sa H2O, ekstrahuje dva puta sa EtOAc, kombinovane organske komponente se 3 puta isperu sa H2O, slanim rastvorom, suše preko Na2SO4, filtriraju i koncentruju da se dobije P-5 (950 mg) kao braon ulje (78% prinos).
LCMS [M+1] 302.15.<1>H NMR (400 MHz, HLOROFORM-d) δ ppm 1.28 (s, 3 H) 1.53 (s, 3 H) 2.47 - 2.57 (m, 1 H) 2.58 - 2.69 (m, 1 H) 2.85 (s, 3 H) 3.13 (td, J=8.68, 4.28 Hz, 1 H) 4.94 (dd, J=6.60, 4.16 Hz, 1 H) 5.04 (td, J=8.04, 4.34 Hz, 1 H) 5.14 (dd, J=6.42, 4.22 Hz, 1 H) 6.66 (d, J=3.42 Hz, 1 H) 7.26 (br. s., 1 H) 8.73 (s, 1 H) 9.80 (s, 1 H)
Faza 6: Sinteza 5-hlor-2-(((3aR,4R,6R,6aS)-2,2-dimetil-6-(4-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)tetrahidro-4H-ciklopenta[d][1,3]dioksol-4-il)(hidroksi)metil)benzonitrila (P-6)
[0209] U rastvor 5-hlor-2-jodbenzonitrila (1570 mg, 5.97 mmol) u bezvodnom THF (29.9 mL, c=0.2 M) se na -78°C doda izopropilmagnezijum hlorid (1080 mg, 7.47 mmol, 5.74 mL, 1.3 M). Dobijeni rastvor se meša 15 min na -78°C i u kapima se doda P-5 (900 mg, 2.99 mmol) u THF (5.0 mL). Reaktivna smeša se prenese u kupatilo sa ledom, ostavi da se zagreje na r.t. i meša u toku noći. Reakcija se nakon toga neutrališe sa std. NH4Cl, ekstrahuje
3 puta sa EtOAc; organski slojevi se kombinuju, isperu sa slanim rastvorom, suše preko
11
Na2SO4, koncentruju i prečiste hromatografijom na koloni sa 5% MeOH/DCM da se dobije P-6 (700 mg) kao žuto ulje. LCMS [M+1] 439.10.
Faza 7: Sinteza (2-(aminometil)-4-hlorfenil)((3aR,4R,6R,6aS)-2,2-dimetil-6-(4-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)tetrahidro-4H-ciklopenta[d][1,3]dioksol-4-il)metanola (P-7)
[0210] U rastvor P-6 (200 mg, 0.456 mmol) u MeOH (5 mL, c=0.09 M) se dodaju kobalt(II) hlorid heksahidrat (545 mg, 2.28 mmol) i NaBH4(181 mg, 4.56 mmol). Reaktivna smeša se meša 0.5 h na r.t. a nakon toga neutrališe sa std. NH4Cl. Vodeni sloj se zasiti sa čvrstim NaCl i ekstrahuje više puta sa smešom 20% izopropil alkohol/DCM. Organski slojevi se koncentruju i prečiste preparativnom HPLC da se dobije 50 mg P-7 kao bezbojno ulje (13% dve faze). LCMS [M+1] 443.10.
Faza 8: Sinteza (1S,2R,3R,5R)-3-((S)-(2-(aminometil)-4-hlorfenil)(hidroksi)metil)-5-(4-metil-7H- pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)ciklopentan-1,2-diola (P-8) i (1S,2R,3R,5R)-3-((R)-(2-(aminometil)-4-hlorfenil)(hidroksi)metil)-5-(4-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)ciklopentan-1,2-diola (P-9)
[0211] Po sličnom postupku kao za fazu 4 u Šemi K, P-7 se tretira sa TFA u vodi. P-8 (5.5 mg, 12% prinos) i P-9 (0.2 mg, 0.4% prinos) se izdvoje nakon naredne dorade i prečišćavanja asimetričnom SFC. LCMS [M+1] 403.00.
Primer 55 (Šema Q) - (1S,2R,3S,5R)-3-(2-(aminometil)-4-hlorbenzil)-5-(4-metil-7H-pirolo[2,3-d] pirimidin-7-il)ciklopentan-1,2-diol (Q-4) (referenca)
Faza 1: Sinteza 7-((3aS,4R,6S,6aR)-6-(jodmetil)-2,2-dimetiltetrahidro-4H-ciklopenta[d]
[1,3]dioksol-4- il)-4-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidina (Q-1)
[0213] U rastvor trifenilfosfina (529 mg, 1.98 mmol) i imidazola (135 mg, 1.98 mmol) u metilen hloridu (8.24 mL, c=0.2 M) se doda I2(502 mg, 1.98 mmol), nakon toga se u kapima doda P-4 (500 mg, 1.65 mmol) u 2 mL metilen hlorida. Dobijena reaktivna smeša se meša na r.t. u toku noći a nakon toga razblaži sa vodom (20 mL) i ekstrahuje sa metilen hloridom (3 x 20 mL). Kombinovani organski slojevi se suše preko Na2SO4, koncentruju i prečiste hromatografijom na koloni sa 60% EtOAc/heptan da se dobije 280 mg Q-1 kao žuto ulje (25% prinos). LCMS [M+1] 414.00.<1>H NMR (400 MHz, HLOROFORM-d) δ ppm 1.33 (s, 3 H) 1.60 (s, 3 H) 2.26 - 2.37 (m, 1 H) 2.40 (dd, J=11.55, 5.93 Hz, 1 H) 2.59 (dt, J=12.29, 6.08 Hz, 1 H) 2.80 (s, 3 H) 3.41 (dd, J=10.03, 6.72 Hz, 1 H) 3.50 (dd, J=10.09, 4.83 Hz, 1 H) 4.56 (t, J=6.11 Hz, 1 H) 5.02 - 5.13 (m, 2 H) 6.64 (d, J=3.55 Hz, 1 H) 7.28 (d, J=3.55 Hz, 1 H) 8.79 (s, 1 H)
Faza 2: Sinteza 5-hlor-2-(((3aR,4S,6R,6aS)-2,2-dimetil-6-(4-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)tetrahidro-4H-ciklopenta[d][1,3]dioksol-4-il)metil)benzonitrila (Q-2)
[0214] U suspenziju cinka (318 mg, 4.87 mmol) u bezvodnom degasiranom DMF (8.11 mL, c=0.1 M) se u atmosferi azota doda 1,2-dibromoetan (33 mg, 0.17 mmol, 15 uL). Smeša se zagreva sa fenom za vruć vazduh približno 30 sec dok gas ne počne da se oslobađa iz rastvora što ukazuje na aktivaciju cinka. Smeša se ostavi da se ohladi na r.t. Doda se TMSCl (19 mg, 0.18 mmol, 23 uL) i reakcija se meša 15 min na r.t., a nakon toga se doda rastvor Q-1 (335 mg, 0.811 mmol) u bezvodnom degasiranom DMF (1 mL). Dobijena smeša se zagreva 5 min na 60°C, a zatim meša 30 min na r.t.. Nakon taloženja čvrstih čestica cinka, reaktivna smeša
11
se filtrira kroz špric filter u smešu 5-hlor-2-jodbenzonitrila (214 mg, 0.812 mmol), Pd2(dba)3(37.2 mg, 0.0406 mmol) i tri-o-tolil-fosfina (49.4 mg, 0.162 mmol) u 1 mL vezvodnog degasiranog DMF. Reaktivna smeša se ispere sa azotom i meša 2 h na 80°C. Nakon hlađenja na r.t., reaktivna smeša se podeli između H2O (30 mL) i EtOAc (30 mL). Organska faza se odvoji, ispere sa H2O (3 x 30mL) i slanim rastvorom (1 x 30mL), suši preko Na2SO4, koncentruje i prečisti hromatografijom na koloni sa 70% EtOAc/heptan da se dobije 25 mg Q-2 (7.3% prinos).
LCMS [M+1] 423.10.<1>H NMR (400 MHz, HLOROFORM-d) δ ppm 1.29 (s, 3 H) 1.56 (s, 3 H) 2.21 - 2.38 (m, 2 H) 2.48 - 2.60 (m, 1 H) 2.78 (s, 3 H) 2.95 - 3.04 (m, 1 H) 3.24 (dd, J=14.18, 6.72 Hz, 1 H) 4.62 (t, J=6.72 Hz, 1 H) 4.92 - 5.01 (m, 1 H) 5.04 (dd, J=7.09, 5.38 Hz, 1 H) 6.61 (d, J=3.67 Hz, 1 H) 7.25 (d, J=3.67 Hz, 1 H) 7.36 (d, J=8.31 Hz, 1 H) 7.52 (dd, J=8.44, 2.20 Hz, 1 H) 7.60 (d, J=2.20 Hz, 1 H) 8.76 (s, 1 H)
Faza 3: Sinteza (5-hlor-2-(((3aR,4S,6R,6aS)-2,2-dimetil-6-(4-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)tetrahidro-4H-ciklopenta[d][1,3]dioksol-4-il)metil)fenil)metanamina (Q-3)
[0215] Po sličnom postupku kao za fazu 7 u Šemi P, Q-2 se redukuje u Q-3 kao sirovi produkt za sledeću fazu. LCMS [M+1] 427.10.
Faza 4: Sinteza (1S,2R,3S,5R)-3-(2-(aminometil)-4-hlorbenzil)-5-(4-metil-7H-pirolo[2,3-d] pirimidin-7-il)ciklopentan-1,2-diola (Q-4)
[0216] Po sličnom postupku kao za fazu 4 u Šemi K, Q-3 se tretira sa TFA u vodi. Q-4 (9.5 mg, 35%) se izdvoji nakon naredne dorade i prečišćavanja asimetričnom SFC.
Q-4: LCMS [M+1] 386.85.<1>H NMR (700 MHz, DMSO-d6) δ ppm 1.48 - 1.56 (m, 1 H) 1.97 -2.04 (m, 1 H) 2.11 (br. s., 1 H) 2.53 - 2.60 (m, 5 H) 2.91 (dd, J=14.09, 5.72 Hz, 1 H) 3.68 -3.78 (m, 2 H) 4.29 (t, J=6.23 Hz, 1 H) 4.84 (q, J=8.37 Hz, 1 H) 6.63 (d, J=3.42 Hz, 1 H) 7.09 -7.17 (m, 2 H) 7.41 (br. s., 1 H) 7.62 (d, J=2.22 Hz, 1 H) 8.53 (s, 1 H)
Primer 56 (Šema R) - (1S,2R,3R,5R)-3-((S)-hidroksi(1,2,3,4-tetrahidroizohinolin-8-il)metil)-5-(4-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)ciklopentan-1,2-diol (R-7)
11
Primer 57 (Šema R) - (1S,2R,3R,5R)-3-((R)-hidroksi(1,2,3,4-tetrahidroizohinolin-8-il)metil)-5-(4-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)ciklopentan-1,2-diol (R-8)
[0217]
Šema R
Faza 1: Sinteza terc-butil 8-jod-3,4-dihidroizohinolin-2(1H)-karboksilata (R-2)
[0218] Smeša terc-butil 8-brom-3,4-dihidroizohinolin-2(1H)-karboksilata (R-1) (1100 mg, 3.52 mmol), NaI (4.76 g, 31.8 mmol), CuI (402 mg, 2.12 mmol) i trans-N,N-dimetilcikloheksana (602 mg, 4.22 mmol) u dioksanu (20 mL) se 10 min prečišćava sa N2. Dobijena žuta suspenzija se meša 48 h na 110 °C u zatvorenoj epruveti. Reakcija se razblaži sa petrol etrom (50 mL) i filtrira. Filtrat se koncentruje pod vakuumom i ostatak se prečisti hromatografijom na silika gelu uz eluiranje sa EtOAC u petrol etru od 0 do 20 % da se dobije R-2 (1200 mg, 94.8 %) kao svetlo žuta guma. LCMS [M+1-tBu] 304;<1>H NMR (400 MHz, CDCl3) δ ppm 7.70 (d, J=7.8 Hz, 1H), 7.45 - 7.39 (m, 1H), 7.12 (d, J=7.5 Hz, 1H), 6.88 (s, 1H), 4.44 (br. s., 2H), 3.62 (t, J=5.5 Hz, 2H), 2.81 (d, J=4.8 Hz, 2H), 1.50 (s, 9H)
Faza 2: Sinteza (2-(terc-butoksikarbonil)-1,2,3,4-tetrahidroizohinolin-8-il)boratne
11
kiseline (R-3)
[0219] U rastvor R-2 (250 mg, 0.696 mmol) i triizopropil borata (262 mg, 0.321 mmol) u bezvodnom THF (8 mL) se na -60 °C doda 2.5 M n-BuLi (0.418 mL, 1.04 mmol). Smeša se meša 30 min na -600 °C. Smeša se sipa u NH4Cl aq (15 mL) i ekstrahuje sa EtOAc (10 mL x 3). Ekstrakt se suši preko Na2SO4i koncentruje pod vakuumom da se dobije sirovi produkt. Sirovi produkt se prečisti hromatografijom na silika gelu uz eluiranje sa MeOH u DCM od 0 do 10 % da se dobije R-3 (180 mg, 93 %) kao svetlo žuta guma koja se direktno koristi u sledećoj fazi.
Faza 3: Sinteza S-(p-tolil) (3aR,4S,6R,6aS)-2,2-dimetil-6-(4-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)tetrahidro-4H-ciklopenta[d][1,3]dioksol-4-karbotioata (R-4)
[0220] U A-7 (270 mg, 0.851 mmol) u THF se na rt (15 °C) dodaju 4-metilbenzentiol (211 mg, 1.7 mmol), DIPEA (440 mg, 3.4 mmol) i T3P (1.08 g, 1.7 mmol). Smeša se meša 2 dana na rt 5-10 °C. Smeša se sipa u NaHCO3aq (20 mL) i ekstrahuje sa EtOAc (10 mL x 2). Ekstrakt se ispere sa slanim rastvorom (15 mL) i koncentruje pod vakuumom, nakon toga prečisti hromatografijom na silika gelu uz eluiranje sa EtOAc u petrol etru od 0 do 100 % da se dobije R-4 (320 mg, 89%) kao bela čvrsta supstanca. LCMS [M+1] 424
Faza 4: Sinteza terc-butil 8-((3aR,4S,6R,6aS)-2,2-dimetil-6-(4-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)tetrahidro-4H-ciklopenta[d][1,3]dioksol-4-karbonil)-3,4-dihidroizohinolin-2(1H)-karboksilata (R-5)
[0221] Smeša R-4 (125 mg, 0.3 mmol) i R-3 (180 mg, 0.32 mmol), CuTC (90 mg, 0.47 mmol), Pd2(dba)3.CHCl3(31 mg, 0.03 mmol) i TFP (20.6 mg, 0.0886 mmol) u bezvodnom THF (5 mL) se degasira četiri puta sa N2. Smeša se meša 16 sati na 50 °C u zatvorenoj epruveti. Smeša se razblaži sa EtOAc (10 mL) i filtrira. Filtrat se koncentruje pod vakuumom do sušenja. Ostatak se prečisti hromatografijom na silika gelu uz eluiranje sa EtOAc u petrol etru od 0 do 100 % da se dobije R-5 (70 mg, 40%) kao bela čvrsta supstanca. LCMS [M+1] 533
Faza 5: Sinteza terc-butil 8-(((3aR,4R,6R,6aS)-2,2-dimetil-6-(4-metil-7H-pirolo[2,3-
11
d]pirimidin-7-il)tetrahidro-4H-ciklopenta[d][1,3]dioksol-4-il)(hidroksi)metil)-3,4-dihidroizohinolin-2(1H)-karboksilata (R-6)
[0222] U rastvor R-5 (70 mg, 0.131 mmol) u MeOH (2 mL) se na rt (15 °C) doda NaBH4(86.9 mg, 2.30 mmol). Smeša se meša 30 min na rt (15 °C). Smeša se razblaži sa vodom (10 mL) i ekstrahuje sa EtOAc (10 mL x 3). Ekstrakt se ispere sa slanim rastvorom (10 mL), suši preko Na2SO4i koncentruje pod vakuumom da se dobije sirovi produkt R-6 (60 mg, 85%) kao svetlo žuta čvrsta supstanca.
Faza 6: Sinteza (1S,2R,3R,5R)-3-((S)-hidroksi(1,2,3,4-tetrahidroizohinolin-8-il)metil)-5-(4-metil-7H- pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)ciklopentan-1,2-diola (R-7) i (1S,2R,3R,5R)-3-((R)-hidroksi(1,2,3,4-tetrahidroizohinolin-8-il)metil)-5-(4-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)ciklopentan-1,2-diola (R-8)
[0223] U jedinjenje R-6 (60 mg, 0.1 mmol) se doda TFA/H2O (1 mL/ 1 mL, prethodno ohlađeno na 0 °C). Smeša se meša 3 h na rt (15 °C). Smeša se koncentruje pod vakuumom da se dobije sirovi produkt koji se prečisti pomoću SFC. Nakon SFC, produkti se ponovo prečiste prep TLC da se dobiju R-7 (4.5 mg, 13%) i R-8 (3.5 mg, 9%) kao bele čvrste supstance.
R-7: LCMS [M+1] 395;<1>H NMR (400 MHz, MeOD-d4) δ ppm 8.63 (s, 1H), 7.59 (d, J=3.8 Hz, 1H), 7.42 (d, J=7.5 Hz, 1H), 7.21 (t, J=7.5 Hz, 1H), 7.06 (d, J=7.3 Hz, 1H), 6.73 (d, J=3.8 Hz, 1H), 5.09 - 5.01 (m, 1H), 4.81 (d, J=7.0 Hz, 1H), 4.64 (dd, J=5.3, 9.5 Hz, 1H), 4.31 (dd, J=2.0, 5.5 Hz, 1H), 4.29 - 4.16 (m, 2H), 3.21 - 3.06 (m, 2H), 2.92 (d, J=4.0 Hz, 2H), 2.72 (s, 3H), 2.56 - 2.47 (m, 1H), 2.22 (td, J=8.8, 13.1 Hz, 1H), 1.83 (ddd, J=8.3, 10.7, 13.1 Hz, 1H) R-8: LCMS [M+1] 395;<1>H NMR (400 MHz, MeOD-d4) δ ppm 8.63 (s, 1H), 7.72 (d, J=3.8 Hz, 1H), 7.42 (d, J=8.0 Hz, 1H), 7.23 - 7.17 (m, 1H), 7.07 (d, J=7.5 Hz, 1H), 6.77 (d, J=3.8 Hz, 1H), 5.12 - 5.04 (m, 2H), 4.48 - 4.42 (m, 1H), 4.30 - 4.15 (m, 2H), 4.14 - 4.10 (m, 1H), 3.24 - 3.18 (m, 2H), 3.00 - 2.94 (m, 2H), 2.74 (s, 3H), 2.45 - 2.36 (m, 1H), 2.20-2.14 (m, 1H) 2.09 - 1.99 (m, 1H)
Primer 58 (Šema S) - (1S,2R,3S,5R)-3-(4-fluorobenzil)-5-(4-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)ciklopentan-1,2-diol (S-1) (referenca)
11
Šema S
[0225] Smeša (1S,2R,3R,5R)-3-((R)-(4-fluorofenil)(hidroksi)metil)-5-(4-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)ciklopentan-1,2-diola (Primer 10) (30 mg, 0.084 mmol), trifluorosirćetne kiseline (302 ul) i trietilsilana (268 ul, 1.68 mmol) se zagreva 2 sata na 50 °C. Reaktivna smeša se koncentruje do ulja a nakon toga se dodaju litijumhidroksid monohidrat (20 mg, 0.48 mmol) i metanol (1 ml) i meša 45 min na r.t. Reaktivna smeša se koncentruje da se ukloni metanol, nakon toga se podeli između vode i EtOAc. EtOAc sloj se ispere sa slanim rastvorom, suši sa Na2SO4, filtrira i koncentruje da se dobije S-1 kao ulje u 52% prinosa. LCMS-APCI(+): MH+=342,<1>H NMR (700MHz, DMSO-d6) δ ppm 8.58 (s, 1H), 7.64 (d, J=3.5 Hz, 1H), 7.25 (dd, J=5.9, 8.1 Hz, 2H), 7.08 (t, J=8.8 Hz, 2H), 6.68 (d, J=3.5 Hz, 1H), 4.98 - 4.84 (m, 2H), 4.77 (d, J=4.4 Hz, 1H), 4.44 - 4.23 (m, 1H), 3.82 - 3.75 (m, 1H), 2.92 (dd, J=6.6, 13.6 Hz, 1H), 2.68 - 2.57 (m, 4H), 2.26 - 2.12 (m, 1H), 2.06 (td, J=8.3, 13.0 Hz, 1H), 1.60 - 1.41 (m, 1H)
Primer 59 (Šema T) - (+/-)-(1S,2S,3S,5R)-3-metoksi-5-(4-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)ciklopentan-1,2-diol (T-5) (referenca)
Primer 60 (Šema T) - (1S,2S,3S,5R)-3-metoksi-5-(4-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)ciklopentan-1,2-diol (T-6) (referenca)
Primer 61 (Šema T) - (1R,2R,3R,5S)-3-metoksi-5-(4-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)ciklopentan-1,2-diol (T-7) (referenca)
12
Šema T
a TFA, aceton 60 C
Faza 1: (+/-)-(3aR,4S,6R,6aS)-6-((5-brom-6-metilpirimidin-4-il)amino)-2,2-dimetiltetrahidro-4H-ciklopenta[d][1,3]dioksol-4-ol. (T-2)
[0227] Smeša (+/-)-(3aR,4S,6R,6aS)-6-amino-2,2-dimetiltetrahidro-4H-ciklopenta[d][1,3]dioksol-4-ola (T-1) (786 mg, 4.54 mmol), 5-brom-4-hlor-6-metilpirimidina (1.04 g, 4.99 mmol) i trimetilamina (0.822 ml, 5.9 mmol) u etanolu (9.0 ml, 0.5 M) se zagreva 20 sati na 80°C. Sirova reaktivna smeša se koncentruje do čvrste supstance, a nakon toga prečisti hromatografijom na silika gelu uz gradijent od 0% do 100% EtOAc u heptanu da se dobije T-2 kao bela čvrsta supstanca, 1.35 g (87% prinos).
LCMS-ESI(+): MH+=344/346,<1>H NMR (400MHz, METANOL-d4) δ ppm 8.29 (s, 1H), 4.60 (d, J=6.4 Hz, 1H), 4.56 - 4.52 (m, 1H), 4.51 - 4.47 (m, 1H), 4.22 (d, J=3.9 Hz, 1H), 2.33 -2.23 (m, 1H), 1.76 (d, J=14.2 Hz, 1H), 1.41 (s, 3H), 1.27 (s, 3H).
Faza 2: Sinteza (+/-)-(3aR,4S,6R,6aS)-6-((5-((E)-2-etoksivinil)-6-metilpirimidin-4-il)amino)-2,2-dimetil-tetrahidro-4H-ciklopenta[d][1,3]dioksol-4-ola. (T-3)
[0228] U rastvor T-2 (2.06 g, 5.98 mmol) i (E)-2-(2-etoksivinil)-4,4,5,5-tetrametil-1,3,2-dioksaborolana (1.19 g, 5.98 mmol) u dioksanu (19.9 ml, 0.3 M) koji je prethodno prečišćen azotom pod vakuumom se doda 2N natrijum karbonat (aq) (8.98 ml) a nakon toga S-Phos prekatalizator (136 mg, 0.180 mmol). Dobijena smeša se zagreva 23 sata na 80 °C. Reaktivna smeša se ohladi na r.t. a nakon toga razblaži sa EtOAc i vodom. Organski sloj se ispere sa slanim rastvorom, suši sa Na2SO4, filtrira i koncentruje do ulja i nakon toga prečisti hromatografijom na silika gelu uz eluiranje sa gradijentom od 0% do 100% EtOAc u heptanu da se dobije T-3 kao bela čvrsta supstanca, 1.21 g (60% prinos).
LCMS-ESI(+): MH+=336,<1>H NMR (400MHz, DMSO-d6) δ ppm 8.23 (s, 1H), 6.66 (d, J=13.2 Hz, 1H), 6.38 (d, J=8.6 Hz, 1H), 5.63 (d, J=2.4 Hz, 1H), 5.32 (d, J=13.2 Hz, 1H), 4.50 - 4.33 (m, 3H), 4.07 (br. s., 1H), 3.87 (q, J=6.9 Hz, 2H), 2.24 (s, 3H), 2.12 (td, J=5.2, 13.6 Hz, 1H), 1.62 (d, J=13.9 Hz, 1H), 1.34 (s, 3H), 1.25 (t, J=7.0 Hz, 3H), 1.18 (s, 3H)
Faza 3: Sinteza (+/-)-7-((3aS,4R,6S,6aR)-6-metoksi-2,2-dimetiltetrahidro-4H-ciklopenta[d][1,3]dioksol-4- il)-4-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidina. (T-4)
[0229] Smeša (+/-)-(3aR,4S,6R,6aS)-6-((5-((E)-2-etoksivinil)-6-metilpirimidin-4-il)amino)-2,2-dimetiltetrahidro-4H-ciklopenta[d][1,3]dioksol-4-ola (111 mg, 0.331 mmol) i trifluorosirćetne kiseline (127 ul, 1.65 mmol) u acetonu (3.31 ml, 0.1 M) se zagreva 43 sata na 60 °C. Reaktivna smeša se koncentruje do ulja i nakon toga azeotropira sa toluenom. Sirovo ulje se rastvori u acetonu (3.31 ml) nakona čega se dodaju DMP (81 ul, 0.662 mmol) i PTSA (3.1 mg, 0.016 mmol). Smeša se meša 48 sati na r.t. Reaktivna smeša se koncentruje do ulja, a nakon toga ponovo rastvori u EtOAc. EtOAc sloj se ispere sa zasićenim rastvorom NaHCO3(aq), slanim rastvorom, suši sa Na2SO4, filtrira i koncentruje do ulja. Sirova smeša se prečisti hromatografijom na silika gelu uz eluiranje sa gradijentom od 0% do 100% EtOAc u heptanu da se dobije (3aR,4S,6R,6aS)-2,2-dimetil-6-(4-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)tetrahidro-4H-ciklopenta[d][1,3]dioksol-4-ol kao bela čvrsta supstanca, 76 mg (79% prinos, 80% čistoće).
[0230] U suspenziju (3aR,4S,6R,6aS)-2,2-dimetil-6-(4-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)tetrahidro-4H-ciklopenta[d][1,3]dioksol-4-ola (76 mg, 80% čisto) u 2-metiltetrahidrofuranu (1ml) se na r.t. doda 60% natrijum hidrid (26 mg). Nakon 15 minuta se doda metil jodid (200 ul). Nakon 1 sat se doda još metil jodida (200 ul) i smeša se meša još 3 sata na r.t. Reaktivna smeša se neutrališe sa zasićenim rastvorom amonijum hlorida (aq) i ekstrahuje sa EtOAc. EtOAc sloj se ispere sa slanim rastvorom, suši sa Na2SO4, filtrira i koncentruje do ulja. Sirovo ulje se prečisti hromatografijom na silika gelu uz eluiranje sa gradijentom od 0% do 100% EtOAc u heptanu da se dobije (+/-)-7-((3aS,4R,6S,6aR)-6-metoksi-2,2-dimetiltetrahidro-4H-ciklopenta[d][1,3]dioksol-4-il)-4-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin kao bezbojno ulje, 39 mg (39% prinos).
LCMS-ESI(+): MH+=304,<1>H NMR (400MHz, HLOROFORM-d) δ ppm 8.77 (s, 1H), 7.43 (d, J=3.7 Hz, 1H), 6.53 (d, J=3.7 Hz, 1H), 5.30 (ddd, J=2.6, 5.3, 7.8 Hz, 1H), 4.84 (dd, J=2.1, 6.2 Hz, 1H), 4.71 (d, J=6.4 Hz, 1H), 3.94 (t, J=4.2 Hz, 1H), 3.41 (s, 3H), 2.80 - 2.65 (m, 4H), 2.24 (td, J=4.6, 14.5 Hz, 1H), 1.54 (s, 3H), 1.30 (s, 3H).
Faza 4: Sinteza (+/-)-(1S,2S,3S,5R)-3-metoksi-5-(4-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)ciklopentan-1,2-diola (T-5), (1S,2S,3S,5R)-3-metoksi-5-(4-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)ciklopentan-1,2-diola (T-6) i (1R,2R,3R,5S)-3-metoksi-5-(4-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)ciklopentan-1,2-diola (T-7).
[0231] Smeša T-4 (39 mg, 0.13 mmol) i 50% vodenog rastvora TFA (800 ul) se zagreva 2 sata na 60 °C. Reaktivna smeša se koncentruje do ulja, nakon toga prečisti sa SFC (3HOP kolona) da se dobije (+/-)-(1S,2S,3S,5R)-3-metoksi-5-(4-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)ciklopentan-1,2-diol (T-5) kao bela čvrsta supstanca, 25 mg (75% prinos).
T-5: LCMS-APCI(+): MH+=264,<1>H NMR (400MHz, HLOROFORM-d) δ ppm 8.61 (s, 1H), 7.31 (d, J=3.7 Hz, 1H), 6.59 (d, J=3.4 Hz, 1H), 4.95 (q, J=8.6 Hz, 1H), 4.54 - 4.39 (m, 1H), 4.23 (d, J=4.9 Hz, 1H), 3.87 (t, J=5.4 Hz, 1H), 3.47 (s, 3H), 2.98 - 2.81 (m, 1H), 2.71 (s, 3H), 2.09 (ddd, J=5.1, 9.0, 13.8 Hz, 1H).
T-5 se razdvoji asimetričnom SFC (Lux Cellulose-44.6 x 100 mm 3u kolona, 30% MeOH/DEA @ 120 bar, 4 mL/min) da se dobiju (1S,2S,3S,5R)-3-metoksi-5-(4-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)ciklopentan-1,2-diol (T-6) kao bela čvrsta supstanca, 6 mg (19% prinos).
T-6: LCMS-APCI(+): MH+=264,<1>H NMR (700MHz, DMSO-d6) δ ppm 8.61 (s, 1H), 7.60 (d, J=3.5 Hz, 1H), 6.70 (d, J=3.5 Hz, 1H), 5.11 - 4.83 (m, 3H), 4.40 - 4.26 (m, 1H), 3.91 (br. s., 1H), 3.61 (t, J=4.8 Hz, 1H), 3.31 (s, 3H), 2.63 (s, 3H), 2.56 (td, J=8.0, 14.0 Hz, 1H), 1.77 (ddd, J=4.8, 9.1, 13.8 Hz, 1H)
i (1R,2R,3R,5S)-3-metoksi-5-(4-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)ciklopentan-1,2-diol (T-7) kao bela čvrsta supstanca, 6 mg (19% prinos).
T-7: LCMS-APCI(+): MH+=264,<1>H NMR (700MHz, DMSO-d6) δ ppm 8.61 (s, 1H), 7.60 (d, J=3.5 Hz, 1H), 6.70 (d, J=3.5 Hz, 1H), 5.07 - 4.92 (m, 3H), 4.38 - 4.25 (m, 1H), 3.91 (br. s., 1H), 3.66 - 3.52 (m, 1H), 3.31 (s, 3H), 2.63 (s, 3H), 2.56 (td, J=8.1, 13.8 Hz, 1H), 1.76 (ddd, J=4.6, 8.9, 13.8 Hz, 1H)
12
Primer 62: (Šema U) - (1S,2S,3S,5R)-3-(2-(aminometil)fenoksi)-5-(4-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7- l)ciklopentan-1,2-diol (U-6) (referenca)
Primer 63: (Šema U) - (1R,2R,3R,5S)-3-(2-(aminometil)fenoksi)-5-(4-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)ciklopentan-1,2-diol (U-7) (referenca)
[0232]
Šema U
Faza 1: Sinteza 2-(((3aR,4S,6R,6aS)-6-((5-((E)-2-etoksivinil)-6-metilpirimidin-4-il)amino)-2,2-dimetil-tetrahidro-4H-ciklopenta[d][1,3]dioksol-4-il)oksi)benzonitrila. (U-1)
[0233] U smešu T-3 (181 mg, 0.54 mmol) i 2-fluorobenzonitrila (57.4 ul, 65.4 mg, 0.54 mmol) u THF (1.8 ml, 0.3 M) se na r.t. doda 60% natrijum hidrid (45.3 mg, 1.13 mmol). Nakon 5 min mešanja, reaktivna smeša se zagreva 6 sati na 70°C. Reaktivna smeša se ohladi na r.t. a nakon toga neutrališe sa zasićenim rastvorom NH4Cl (aq), razblaži sa vodom i ekstrahuje sa EtOAc. EtOAc sloj se ispere sa slanim rastvorom, suši sa MgSO4, filtrira a zatim koncentruje do ulja. Sirovo ulje se prečisti hromatografijom na silika gelu uz eluiranje sa 0-100% EtOAc-heptan da se dobije U-1 kao ulje boje ćilibara, 210 mg (89% prinos).
LCMS-ESI(+): MH+=437,<1>H NMR (400MHz, HLOROFORM-d) δ ppm 8.48 (s, 1H), 7.68 7.49 (m, 2H), 7.19 - 6.98 (m, 2H), 6.47 (d, J=13.2 Hz, 1H), 5.45 (d, J=7.6 Hz, 1H), 5.41 (d, J=13.2 Hz, 1H), 4.82 - 4.69 (m, 4H), 3.86 (q, J=6.8 Hz, 2H), 2.70 (td, J=6.1, 15.0 Hz, 1H), 2.35 (s, 3H), 2.13 (d, J=15.2 Hz, 1H), 1.51 (s, 3H), 1.32 (s, 3H), 1.26 (t, J=7.0 Hz, 4H).
Faza 2: 2-(((3aR,4S,6R,6aS)-2,2-dimetil-6-(4-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)tetrahidro-4H-ciklopenta[d][1,3]dioksol-4-il)oksi)benzonitril. (U-2)
[0234] Rastvor U-1 (210 mg, 0.481 mmol) u sirćetnoj kiselini (4.81 ml, 0.1 M) se zagreva 19 sati na 110 °C. Reaktivna smeša se koncentruje do ulja, nakon toga prečisti hromatografijom na silika gelu uz eluiranje sa 0-100% EtOAc-heptan da se dobije U-2 kao tamno staklo boje ćilibara, 166 mg (88% prinos).
LCMS-ESI(+): MH+=391,<1>H NMR (400MHz, HLOROFORM-d) δ ppm 8.79 (s, 1H), 7.69 (d, J=3.4 Hz, 1H), 7.65 - 7.51 (m, 2H), 7.13 (d, J=8.6 Hz, 1H), 7.07 (t, J=7.6 Hz, 1H), 6.66 (d, J=3.7 Hz, 1H), 5.48 (dd, J=3.2, 6.8 Hz, 1H), 5.01 (d, J=4.6 Hz, 1H), 4.95 (dd, J=2.7, 6.1 Hz, 1H), 4.86 (d, J=5.9 Hz, 1H), 3.06 (td, J=7.6, 14.7 Hz, 1H), 2.74 (s, 3H), 2.57 (d, J=14.9 Hz, 1H), 1.62 (s, 4H), 1.34 (s, 4H).
Faza 3: Sinteza (2-(((3aR,4S,6R,6aS)-2,2-dimetil-6-(4-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)tetrahidro-4H-ciklopenta[d][1,3]dioksol-4-il)oksi)fenil)metanamina (U-3)
[0235] U smešu U-2 (139 mg, 0.356 mmol) u etanolu (7.12 ml, 0.05 M) se doda 28% NH4OH (3 ml) i Raney Nickel (70 mg, 1.2 mmol). Smeša se hidrogenizuje 24 sata na 50 psi u cilindru od nerđajućeg čelika. Reaktivna smeša se filtrira kroz celite ploču, a filtrat se nakon toga koncentruje do ulja i prečisti hromatografijom na silika gelu uz eluiranje sa 0-100% MeOH u EtOAc da se dobije U-3 kao bezbojno ulje, 81 mg (58% prinos).
LCMS-APCI(+): MH+=395,<1>H NMR (400MHz, METANOL-d4) δ ppm 8.64 (s, 1H), 7.62 (d, J=3.7 Hz, 1H), 7.34 - 7.23 (m, 2H), 7.12 (d, J=8.6 Hz, 1H), 6.96 (t, J=7.5 Hz, 1H), 6.75 (d, J=3.7 Hz, 1H), 5.28 (dt, J=3.5, 7.0 Hz, 1H), 5.19 (dd, J=3.4, 6.4 Hz, 1H), 4.94 (d, J=6.4 Hz, 1H), 4.87 (t, J=5.9 Hz, 1H), 3.72 (br. s., 2H), 2.95 (td, J=7.0, 14.1 Hz, 1H), 2.73 (s, 3H), 2.65 - 2.54 (m, 1H), 1.60 (s, 3H), 1.35 (s, 3H).
Faza 4: Sinteza terc-butil (2-(((1S,2S,3S,4R)-2,3-dihidroksi-4-(4-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)ciklopentil)oksi)benzil)karbamata (U-4) i terc-butil (2-(((1R,2R,3R,4S)-
12
2,3-dihidroksi-4-(4-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)ciklopentil)oksi)benzil)karbamata (U-5)
[0236] Rastvor U-3 (81 mg, 0.21 mmol) u 50% TFA (aq) (600 ul) se meša 16 sati na r.t. Reaktivna smeša se nakon toga koncentruje do ulja. Smeša sirovog ulja i Boc2O (30.8 mg, 1.41 mmol) u DCM 30.8 mg, 0.141 mmol) se meša 6 sati na r.t. Reaktivna smeša se koncentruje, nakon toga prečisti hromatografijom na silika gelu uz eluiranje sa 40 do 100% EtOAc u heptanu a zatim 0-20% MeOH u EtOAc da se dobije racematna smeša U-4 i U-5 kao bezbojno ulje, 73 mg. Enantiomeri se razdvoje asimetričnom SFC (Chiralpak IC-34.6 x 100 mm 3u kolona, 30% MeOH @ 120 bar, 4 mL/min) da se dobiju U-4 (25.4 mg, 40% prinos) i U-5 (24.4 mg, 38% prinos) kao bele čvrste supstance.
U-4 : LCMS-ESI(+): MH+=455,<1>H NMR (400MHz, METANOL-d4) δ ppm 8.52 (s, 1H), 7.51 (br. s., 1H), 7.23 - 7.09 (m, 2H), 6.92 (d, J=8.1 Hz, 1H), 6.84 (t, J=7.5 Hz, 1H), 6.64 (d, J=3.7 Hz, 1H), 5.15 (q, J=8.6 Hz, 1H), 4.67 - 4.58 (m, 2H), 4.34 - 4.15 (m, 2H), 4.11 (d, J=4.4 Hz, 1H), 2.90 (ddd, J=7.3, 9.4, 14.5 Hz, 1H), 2.61 (s, 3H), 2.24 - 2.08 (m, 1H), 1.33 (s, 9H).
[α]D22= 61.3° (c=0.1, MeOH).
U-5: LCMS-ESI(+): MH+=455,<1>H NMR (400MHz, METANOL-d4) δ ppm 8.62 (s, 1H), 7.61 (br. s., 1H), 7.33 - 7.17 (m, 2H), 7.02 (d, J=8.1 Hz, 1H), 6.94 (t, J=7.3 Hz, 1H), 6.74 (d, J=3.7 Hz, 1H), 5.25 (q, J=9.0 Hz, 1H), 4.74 (d, J=7.1 Hz, 2H), 4.43 - 4.25 (m, 2H), 4.21 (d, J=4.4 Hz, 1H), 3.00 (ddd, J=7.3, 9.5, 14.7 Hz, 1H), 2.71 (s, 3H), 2.38 - 2.12 (m, 1H), 1.43 (s, 9H). [α]D22= - 86.1° (c=0.1, MeOH)
Faza 5: Sinteza (1S,2S,3S,5R)-3-(2-(aminometil)fenoksi)-5-(4-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)ciklopentan-1,2-diola (U-6)
[0237] Smeša U-4 (24 mg, 0.053 mmol) i trifluorosirćetne kiseline (120 mg, 1.06 mmol) u DCM (0.176 ml, 0.3 M) se meša 3 sata na r.t., nakon toga koncentruje do ulja i prečisti sa SFC (ZymorSpher piridin Diol 150 x 21.2mm kolona sa 20-40% MeOH @ 5%/min, 100 bar, 60 mL/min.) da se dobije U-6 kao bela čvrsta supstanca, 6.54 mg (35% prinos).
LCMS-APCI(+): MH+=355,<1>H NMR (700MHz, DMSO-d6) δ ppm 8.62 (s, 1H), 7.66 (d, J=2.2 Hz, 1H), 7.37 (d, J=7.0 Hz, 1H), 7.28 (t, J=7.5 Hz, 1H), 7.07 (d, J=7.9 Hz, 1H), 6.96 (t, J=7.0 Hz, 1H), 6.72 (d, J=2.6 Hz, 1H), 5.12 (q, J=8.8 Hz, 1H), 4.61 (d, J=3.1 Hz, 1H), 4.06 (br. s., 1H), 2.94 - 2.75 (m, 1H), 2.64 (s, 3H), 2.03 (t, J=9.7 Hz, 1H)
12
Faza 6: Sinteza (1R,2R,3R,5S)-3-(2-(aminometil)fenoksi)-5-(4-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)ciklopentan-1,2-diola (U-7)
[0238] U-7 se izradi na sličan način kao u U-6 počevši od U-5 da se dobije bela čvrsta supstanca, 9 mg (50% prinos).
LCMS-APCI(+): MH+=355,<1>H NMR (700MHz, DMSO-d6) δ ppm 8.63 (s, 1H), 7.66 (d, J=3.5 Hz, 1H), 7.39 (d, J=7.5 Hz, 1H), 7.36 (t, J=7.7 Hz, 1H), 7.13 (d, J=8.4 Hz, 1H), 7.00 (t, J=7.5 Hz, 1H), 6.72 (d, J=3.5 Hz, 1H), 5.19 - 5.04 (m, 2H), 4.63 (d, J=4.4 Hz, 2H), 4.08 (d, J=4.4 Hz, 1H), 4.06 (s, 2H), 2.87 (td, J=8.3, 14.2 Hz, 1H), 2.64 (s, 3H), 2.06 (ddd, J=4.0, 9.5, 13.9 Hz, 1H)
Primer 64 (Šema V) - 2-(((1S,2S,3S,4R)-2,3-dihidroksi-4-(4-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)ciklopentil)oksi)benzonitril (V-1) (referenca)
Primer 65 (Šema V) - 2-(((1R,2R,3R,4S)-2,3-dihidroksi-4-(4-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)ciklopentil)oksi)benzonitril (V-2) (referenca)
[0239]
Šema V
Faza 1: Sinteza 2-(((1S,2S,3S,4R)-2,3-dihidroksi-4-(4-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)ciklopentil)oksi)benzonitrila (V-1) i 2-(((1R,2R,3R,4S)-2,3-dihidroksi-4-(4-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)ciklopentil)oksi)benzonitrila (V-2)
[0240] V-1 (9.5 mg, 47% prinos) i V-2 (9.4 mg, 47% prinos) se izrađuju od U-2 na sličan način kao za fazu 5 u Šemi U.
V-1: LCMS-ESI(+): MH+=351,<1>H NMR (400MHz, METANOL-d4) δ ppm 8.68 (br. s., 1H),
12
7.75 (d, J=3.7 Hz, 1H), 7.71 - 7.60 (m, 2H), 7.30 (d, J=8.6 Hz, 1H), 7.12 (t, J=7.6 Hz, 1H), 6.82 (d, J=3.7 Hz, 1H), 5.36 (q, J=8.5 Hz, 1H), 4.89 (d, J=6.1 Hz, 1H), 4.71 (dd, J=4.6, 8.3 Hz, 1H), 4.23 (d, J=4.2 Hz, 1H), 3.16 - 3.01 (m, 1H), 2.75 (s, 3H), 2.18 (ddd, J=2.4, 7.6, 14.7 Hz, 1H).
V-2: LCMS-ESI(+): MH+=351,<1>H NMR (400MHz, METANOL-d4) δ ppm 8.73 (br. s., 1H), 7.79 (d, J=3.7 Hz, 1H), 7.72 - 7.61 (m, 1H), 7.31 (d, J=8.6 Hz, 1H), 7.12 (t, J=7.6 Hz, 1H), 6.87 (d, J=3.7 Hz, 1H), 5.43 - 5.31 (m, 1H), 4.90 (d, J=5.9 Hz, 1H), 4.72 (dd, J=4.6, 8.6 Hz, 1H), 4.23 (d, J=4.4 Hz, 1H), 3.16 - 3.01 (m, 1H), 2.77 (s, 2H), 2.19 (ddd, J=2.3, 7.6, 14.8 Hz, 1H)
Primer 66 (Šema W) - (1S,2S,3S,5R)-3-(2-(aminometil)-4-fluorofenoksi)-5-(4-metil-7H-pirolo[2,3-d]piridin-7-il)ciklopentan-1,2-diol (W-5) (referenca)
Primer 67 (Šema W) - (1R,2R,3R,5S)-3-(2-(aminometil)-4-fluorofenoksi)-5-(4-metil-7H-pirolo[2,3-d]piridin-7-il)ciklopentan-1,2-diol. (W-6) (referenca)
[0241]
Šema W
Faza 1: Sinteza (3aR,4S,6R,6aS)-2,2-dimetil-6-(4-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)tetrahidro-4H-ciklopenta[d][1,3]dioksol-4-ola (W-1)
[0242] Smeša T-3 (111 mg, 0.331 mmol) i trifluorosirćetne kiseline (127 ul, 1.65 mmol) u acetonu (3.31 ml, 0.1 M) se zagreva 43 sata na 60 °C. Reaktivna smeša se koncentruje do ulja, nakon toga rastvori u EtOAc. EtOAc sloj se ispere sa zasićenim rastvorom NaHCO3(aq),
12
slanim rastvorom, suši sa Na2SO4, filtrira i koncentruje do ulja. Sirova smeša se prečisti hromatografijom na silika gelu uz eluiranje sa gradijentom od 0% do 100% EtOAc u heptanu da se dobije W-1 kao bela čvrsta supstanca, 76 mg (79% prinos, 80% čistoće).
Faza 1: Sinteza 2-(((3aR,4S,6R,6aS)-2,2-dimetil-6-(4-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)tetrahidro-4H-ciklopenta[d][1,3]dioksol-4-il)oksi)-5-fluorobenzonitrila (W-2)
[0243] U smešu W-1 (67.1 mg, 0.2 mmol) i 2,5-difluorobenzonitrila (55.0 mg, 0.395 mmol, 55.0 uL) u THF (1.01 mL, c=0.3 M) se na r.t. doda 60% natrijum hidrid (24.3 mg, 0.608 mmol). Nakon 3 minuta mešanja, reaktivna smeša se zagreva 6 sati na 70 °C, nakon toga neutrališe sa zasićenim rastvorom NH4Cl(aq) a zatim razblaži sa EtOAc i vodom. EtOAc sloj se ispere sa slanim rastvorom, suši sa Na2SO4filtrira i nakon toga koncentruje do ulja. Ulje se prečisti hromatografijom na silika gelu uz eluiranje sa 0-100% EtOAc u heptanu da se dobije W-2 kao bela pena, 101 mg (81% prinos). LCMS-ESI(+): MH+=409,<1>H NMR (400 MHz, HLOROFORM-d) δ ppm 1.34 (s, 3 H) 1.61 (s, 3 H) 2.59 (d, J=15.41 Hz, 1 H) 2.78 (s, 3 H) 3.05 (dt, J=15.16, 7.34 Hz, 1 H) 4.84 (d, J=6.36 Hz, 1 H) 4.86 - 4.92 (m, 1 H) 5.04 (d, J=4.40 Hz, 1 H) 5.35 - 5.53 (m, 1 H) 6.68 (d, J=3.18 Hz, 1 H) 7.11 (dd, J=9.78, 3.67 Hz, 1 H) 7.32 (d, J=7.58 Hz, 2 H) 7.66 (br. s., 1 H) 8.80 (s, 1 H).
Faza 2: Sinteza terc-butil (2-(((1S,2S,3S,4R)-2,3-dihidroksi-4-(4-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)ciklopentil)oksi)-5-fluorobenzil)karbamata (W-3) i terc-butil (2-(((1R,2R,3R,4S)-2,3-dihidroksi-4-(4-metil-7H- pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)ciklopentil)oksi)-5-fluorobenzil)karbamata (W-4)
[0244] U smešu W-2 (101 mg, 0.247 mmol) u etanolu (7.0 mL) se dodaju 28% amonijum hidroksid (3.0 mL) i Raney Nickel (70 mg, 1.2 mmol). Smeša se hidrogenizuje 24 sata na 50 psi u cilindru od nerđajućeg čelika. Reaktivna smeša se filtrira kroz celite a nakon toga koncentruje do pene.
[0245] U ovaj sirovi amin se doda boc anhidrid (54 mg, 0.247 mmol) u DCM (3 ml, 0.3 M) i meša 2 sata na r.t.. Produkt se koncentruje do pene i prečisti hromatografijom na silika gelu da se dobije racematna smeša W-3 i W-4 kao bezbojno ulje (104 mg 982% prinos). Enantiomeri se razdvoje asimetričnom SFC (Chiralpak AS-34.6 x 100 mm 3u kolona, 8% MeOH 10mM NH3@ 120 bar, 4 mL/min) da se dobiju W-3 (34.2 mg, 27% prinos) i W-4 (35.9 mg, 28%
12
prinos) kao bele čvrste supstance.
W-3: LCMS-ESI(+): MH+=513,<1>H NMR (400MHz, HLOROFORM-d) δ ppm 8.86 - 8.76 (m, 1H), 7.45 (br. s., 1H), 7.02 (d, J=8.6 Hz, 1H), 6.95 (d, J=5.1 Hz, 2H), 6.67 (d, J=3.2 Hz, 1H), 5.35 (br. s., 1H), 5.07 (d, J=3.7 Hz, 1H), 4.89 - 4.71 (m, 3H), 4.21 (br. s., 1H), 2.98 (td, J=7.2, 14.7 Hz, 1H), 2.81 (s, 3H), 2.54 (d, J=15.2 Hz, 1H), 1.61 (s, 3H), 1.50 - 1.38 (m, 10H), 1.34 (s, 3H), [α]D22= 28.2° (c=0.1, MeOH)
W-4: LCMS-ESI(+): MH+=513 -80% čistoće.
Faza 3: Sinteza (1S,2S,3S,5R)-3-(2-(aminometil)-4-fluorofenoksi)-5-(4-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)ciklopentan-1,2-diola. (W-5)
[0246] Smeša W-3 (34 mg, 0.066 mmol) u smeši 50% TFA(aq) (0.4 ml) se meša 3 sata na r.t. a nakon toga koncentruje i prečisti sa SFC (ZymorSpher piridin Diol 150 x 21.2mm kolona sa 20-40% MeOH @ 5%/min, 100 bar, 60 mL/min.) da se dobije W-5 kao bela čvrsta supstanca, 16.5 mg (67% prinos).
LCMS-ESI(+): MH+=373,<1>H NMR (400MHz, DMSO-d6) δ ppm 8.63 (s, 1H), 7.65 (d, J=3.7 Hz, 1H), 7.28 (dd, J=2.6, 9.2 Hz, 1H), 7.21 - 7.03 (m, 2H), 6.72 (d, J=3.4 Hz, 1H), 5.19 - 4.98 (m, 2H), 4.69 - 4.48 (m, 2H), 4.06 (d, J=4.6 Hz, 1H), 4.00 (s, 2H), 2.95 - 2.76 (m, 1H), 2.64 (s, 3H), 2.04 (ddd, J=4.0, 9.5, 13.8 Hz, 1H)
Faza 4: Sinteza (1R,2R,3R,5S)-3-(2-(aminometil)-4-fluorofenoksi)-5-(4-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)ciklopentan-1,2-diola. (W-6)
[0247] W-6 se izrađuje od W-4 na sličan način kao za fazu 3 u Šemi W da se dobije bela čvrsta supstanca, 17.2 mg (70% prinos). LCMS-ESI(+): MH+=373,<1>H NMR (400MHz, DMSO-d6) δ ppm 8.63 (s, 1H), 7.65 (d, J=3.7 Hz, 1H), 7.28 (dd, J=2.6, 9.2 Hz, 1H), 7.21 -7.07 (m, 2H), 6.72 (d, J=3.4 Hz, 1H), 5.18 - 5.02 (m, 2H), 4.69 - 4.54 (m, 2H), 4.06 (d, J=4.6 Hz, 1H), 4.01 (s, 2H), 2.94 - 2.74 (m, 1H), 2.64 (s, 3H), 2.04 (ddd, J=4.2, 9.5, 13.7 Hz, 1H).
Primer 68 (Šema X) - 2-(((1S,2S,3S,4R)-2,3-dihidroksi-4-(4-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)ciklopentil)oksi)-5-fluorobenzonitril (X-2) (referenca)
1
Primer 69 (Šema X) - 2-(((1R,2R,3R,4S)-2,3-dihidroksi-4-(4-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)ciklopentil)oksi)-5-fluorobenzonitril (X-3) (referenca)
[0248]
Šema X
Faza 1: Sinteza 2-(((3aR,4S,6R,6aS)-6-((5-((Z)-2-etoksivinil)-6-metilpirimidin-4-il)amino)-2,2-dimetil-tetrahidro-4H-ciklopenta[d][1,3]dioksol-4-il)oksi)-5-fluorobenzonitrila. (X-1)
[0249] U smešu T-3 (67.1 mg, 0.2 mmol) i O-fluorobenzonitrila (25.5 ul, 0.240 mmol) u THF (0.67 ml, 0.3 M) se na r.t. doda 60% natrijum hidrid (16.8 mg, 0.42 mmol). Smeša se nakon toga zagreva 30 minuta na 70°C u mikrotalasnom reaktoru. Reaktivna smeša se neutrališe sa zasićenim rastvorom NH4Cl(aq), nakon toga razblaži sa vodom i ekstrahuje sa EtOAc. EtOAc se ispere sa slanim rastvorom, suši sa Na2SO4, filtrira i koncentruje do ulja a nakon toga prečisti hromatografijom na silika gelu uz eluiranje sa 0-100% EtOAc/heptan da se dobije X-1 kao ulje boje ćilibara, 58 mg (64% prinos).
LCMS-ESI(+): MH+=455,<1>H NMR (400MHz, HLOROFORM-d) δ ppm 8.47 (s, 1H), 7.35 -7.28 (m, 2H), 7.16 - 7.06 (m, 1H), 6.47 (d, J=13.2 Hz, 1H), 5.43 (d, J=7.3 Hz, 1H), 5.39 (d, J=13.2 Hz, 1H), 4.81 - 4.65 (m, 4H), 3.87 (q, J=7.0 Hz, 2H), 2.69 (td, J=6.1, 14.9 Hz, 1H), 2.34 (s, 3H), 2.11 (d, J=14.9 Hz, 1H), 1.50 (s, 3H), 1.31 (s, 2H), 1.27 (t, J=7.0 Hz, 3H).
Faza 2: Sinteza 2-(((1S,2S,3S,4R)-2,3-dihidroksi-4-(4-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)ciklopentil)oksi)-5-fluorobenzonitrila (X-2) i 2-(((1R,2R,3R,4S)-2,3-dihidroksi-4-(4-metil-7H-pirolo[2,3-d]piridin-7-il)ciklopentil)oksi)-5-fluorobenzonitrila (X-3)
[0250] Smeša X-1 (58 mg, 0.13 mmol) i 1N rastvora HCl(aq) (255 ul, 0.255 mmol) u 1,4-dioksanu (0.382 ml, 0.15 M) se meša 24 sata na r.t. Doda se tifluorosirćetna kiselina (200 ul) i smeša se meša 48 sati na r.t., a nakon toga zagreva 6 sati na 60 °C. Reaktivna smeša se
1 1
koncentruje do ulja, zatim podeli između EtOAc i vode. Doda se zasićeni rastvor NaHCO3(aq) i EtOAc sloj se ispere sa slanim rastvorom, suši sa Na2SO4, filtrira, nakon toga koncentruje do bele čvrste supstance, 44 mg. Enantiomeri se razdvoje asimetričnom SFC (Lux Cellulose-2 4.6 x 100 mm 3u kolona, 30% MeOH @ 120 bar, 4 mL/min) da se dobiju X-2 (17 mg, 36% prinos) i X-3 (16.2 mg, 35% prinos) kao bele čvrste supstance.
X-2: LCMS-ESI(+): MH+=369,<1>H NMR (400MHz, DMSO-d6) δ ppm 8.64 (s, 1H), 7.79 (dd, J=3.1, 8.2 Hz, 1H), 7.70 (d, J=3.4 Hz, 1H), 7.65 - 7.51 (m, 2H), 7.40 (dd, J=4.2, 9.3 Hz, 1H), 6.76 (d, J=3.4 Hz, 1H), 5.41 (br. s., 1H), 5.15 (q, J=8.9 Hz, 1H), 4.77 (br. s., 1H), 4.53 (br. s., 1H), 4.05 (br. s., 1H), 2.97 - 2.75 (m, 1H), 2.65 (s, 3H), 2.11 - 1.93 (m, 1H), [α]D22= 47.3° (c=0.1, MeOH).
X-3: LCMS-ESI(+): MH+=369,<1>H NMR (400MHz, METANOL-d4) δ ppm 7.72 (d, J=3.4 Hz, 1H), 7.51 (dd, J=2.9, 7.6 Hz, 1H), 7.47 - 7.38 (m, 1H), 7.32 (dd, J=4.0, 9.2 Hz, 1H), 6.80 (d, J=3.4 Hz, 1H), 5.33 (q, J=8.6 Hz, 1H), 4.85 (br. s., 1H), 4.71 (dd, J=4.8, 8.2 Hz, 1H), 4.22 (d, J=3.9 Hz, 1H), 3.12 - 2.97 (m, 1H), 2.74 (br. s., 3H), 2.26 - 2.12 (m, 1H), [α]D22= -53.5° (c=0.1, MeOH).
Primer 70 (Šema Y) - 2-(((1S,2S,3S,4R)-2,3-dihidroksi-4-(4-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)ciklopentil)oksi)-5-fluorobenzamid (Y-3) (referenca)
[0251]
Šema Y
Faza 1 - Sinteza 2-(((3aR,4S,6R,6aS)-2,2-dimetil-6-(4-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)tetrahidro-4H-ciklopenta[d][1,3]dioksol-4-il)oksi)-5-fluorobenzonitrila (Y-1)
[0252] U suspenziju X-2 (4 g, 9.8 mmol) u smeši dimetoksipropan (60 mL)/DMF (20 mL) se na rt (20 °C) doda TsOH.H2O (2990 mg, 15.75 mmol). Dobijeni rastvor se meša 24 h na rt (20 °C). Smeša se direktno prečisti hromatografijom na silika gelu uz eluiranje sa EtOAc u petrol etru od 0 do 100 % da se dobije Y-1 (2.2 g, 55%) kao bela čvrsta supstanca. LCMS 409
1 2
[M+1];<1>H NMR (400 MHz, CDCl3) δ ppm 8.77 (s, 1H), 7.60 (d, J=3.8 Hz, 1H), 7.33 - 7.25 (m, 2H), 7.15 - 7.06 (m, 1H), 6.63 (d, J=3.5 Hz, 1H), 5.44 (ddd, J=2.5, 5.0, 7.8 Hz, 1H), 5.02 (dd, J=2.3, 6.0 Hz, 1H), 4.90 - 4.85 (m, 1H), 4.82 (d, J=6.3 Hz, 1H), 3.04 (ddd, J=6.8, 8.0, 15.1 Hz, 1H), 2.72 (s, 3H), 2.63 - 2.53 (m, 1H), 1.60 (s, 3H), 1.33 (s, 3H)
Faza 2 - Sinteza 2-(((3aR,4S,6R,6aS)-2,2-dimetil-6-(4-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)tetrahidro-4H-ciklopenta[d][1,3]dioksol-4-il)oksi)-5-fluorobenzamida (Y-2)
[0253] U rastvor Y-1 (50 mg, 0.12 mmol) u DMSO (0.25 mL) se dodaju K2CO3(20 mg, 0.15 mmol) a nakon toga u kapima H2O2(0.25 mL) u ledenoj vodi, nakon toga reakcija može da se zagreva 2h na sobnu temperaturu, za koje vreme je uočena pojava gasa. U reaktivnu smešu se doda voda i ekstrahuje dva puta sa EtOAc. Organski sloj se suši preko natrijum sulfata, filtrira i ostatak se prečisti prep-TLC da se dobije Y-2 (36 mg, 69%) koji se koristi kao takav u sledećoj fazi.
Faza 3 - Sinteza 2-(((1S,2S,3S,4R)-2,3-dihidroksi-4-(4-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)ciklopentil)oksi)-5-fluorobenzamida (Y-3)
[0254] U suspenziju Y-2 (42 mg, 0.1 mmol) u H2O (0.3 mL) se u kapima na 0 °C doda TFA (0.3 mL). Nakon toga se reaktivna smeša meša 16h na sobnoj temperaturi (20 °C). Reakcija se nakon toga podesi do pH 7 sa 20% K2CO3pri čemu se formira čvrsti ostatak, zatim filtrira i ispere sa vodom i MTBE. Čvrsta supstanca se suši da se dobije Y-3 (32 mg, 84%). LCMS 387 [M+1];<1>H NMR (400 MHz, MeOD-d4) δ ppm 8.63 (s, 1H), 7.62-7.65 (m, 1H), 7.60 (d, J=3.8 Hz, 1H), 7.24-7.30 (m, 2H), 6.75 (d, J=3.5 Hz, 1H), 5.16 (q, J=8.8 Hz, 1H), 4.82-4.87 (m, 2H), 4.27 (d, J=4.8 Hz, 1H), 3.02 (ddd, J=14.6, 9.6, 7.4 Hz, 1H), 2.73 (s, 3H), 2.42 ppm (ddd, J=13.7, 9.2, 4.3 Hz, 1H)
Primer 71 (Šema Z) - (1S,2S,3S,5R)-3-(2-((dimetilamino)metil)-4-fluorofenoksi)-5-(4-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)ciklopentan-1,2-diol (8) (referenca)
1
Šema Z
Faza 1 - Sinteza (2-(((3aR,4S,6R,6aS)-2,2-dimetil-6-(4-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)tetrahidro-4H-ciklopenta[d][1,3]dioksol-4-il)oksi)-5-fluorofenil)metanamina (Z-1)
[0256] Smeša Y-1 (500 mg, 1.22 mmol) i Ra-Ni (100 mg) u EtOH (30 mL)/NH3.H2O (3 mL) se degasira četiri puta sa H2. Smeša se meša 20 h na rt (20 °C) u balonu H2i nakon toga ostavi da stoji 20 h na rt. Smeša se filtrira i koncentruje pod vakuumom da se dobije Z-1 (510 mg, >99%) kao svetlo žuta guma. LCMS [M+1] 413;<1>H NMR (400 MHz, CDCl3) δ ppm 8.79 (s, 1H), 7.37 (d, J=3.5 Hz, 1H), 7.05 (dd, J=2.4, 8.7 Hz, 1H), 6.99 - 6.88 (m, 2H), 6.58 (d, J=3.8 Hz, 1H), 5.33 (ddd, J=2.6, 5.5, 8.0 Hz, 1H), 5.05 (dd, J=2.9, 6.1 Hz, 1H), 4.88 - 4.80 (m, 1H), 4.80 - 4.75 (m, 1H), 3.76 (br. s., 2H), 3.06 - 2.89 (m, 1H), 2.73 (s, 3H), 2.62 - 2.47 (m, 1H), 1.61 (s, 3H), 1.34 (s, 3H)
Faza 2 - Sinteza 1-(2-(((3aR,4S,6R,6aS)-2,2-dimetil-6-(4-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)tetrahidro-4H-ciklopenta[d][1,3]dioksol-4-il)oksi)-5-fluorofenil)-N,N-dimetilmetanamina (Z-2)
[0257] Smeša Z-1 (100 mg, 0.24 mmol), 37% CH2O (59 mg, 0.73 mmol) i NaBHOAc3(206 mg, 0.970 mmol) u THF (2 mL) se meša 2 h na rt. Smeša se sipa u NaHCO3aq (10 mL) i ekstrahuje sa EtOAc (10 mL x 3). Ekstrakt se ispere sa slanim rastvorom (10 mL), suši preko Na2SO4i koncentruje pod vakuumom da se dobije Z-2 (100 mg, 94%) kao bezbojna guma. LCMS 441 [M+1];<1>H NMR (400 MHz, CDCl3) δ ppm 8.79 (s, 1H), 7.49 (d, J=3.8 Hz, 1H), 7.14 - 7.08 (m, 1H), 7.01 - 6.86 (m, 2H), 6.55 (d, J=3.5 Hz, 1H), 5.37 (t, J=2.8 Hz, 1H), 5.02
1 4
(d, J=4.0 Hz, 1H), 4.83 (d, J=6.3 Hz, 1H), 4.77 (dd, J=3.3, 5.8 Hz, 1H), 3.33 (s, 2H), 2.97 (d, J=8.0 Hz, 1H), 2.73 (s, 3H), 2.54 (d, J=13.8 Hz, 1H), 2.23 (s, 6H), 1.60 (s, 3H), 1.33 (s, 3H)
Faza 3 - Sinteza (1S,2S,3S,5R)-3-(2-((dimetilamino)metil)-4-fluorofenoksi)-5-(4-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)ciklopentan-1,2-diola (Z-3)
[0258] U smešu TFA/H2O (1 mL/2 mL) se na rt doda Z-2 (100 mg, 0.23 mmol). Smeša se meša 1 h na rt. Smeša se sipa u 20% K2CO3(10 mL). Smeša se ispere sa zasićenim NaCl i dva puta ekstrahuje sa smešom EtOAc/THF (20 mL/ 20 mL). Ekstrakt se ispere i koncentruje pod vakuumom. Ostatak se rastvori u smeši CH3CN/H2O (10 mL/ 50 mL) i liofilizira da se dobije Z-3 (70 mg, 77%) kao bela čvrsta supstanca. LCMS 404 [M+1];<1>H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ ppm 8.61 (s, 1H), 7.69 (d, J=3.8 Hz, 1H), 7.13 (d, J=8.5 Hz, 1H), 7.05 (d, J=5.5 Hz, 2H), 6.72 (d, J=3.5 Hz, 1H), 5.36 (br. s., 1H), 5.16 - 5.09 (m, 2H), 4.60 - 4.49 (m, 2H), 4.01 (d, J=3.3 Hz, 1H), 3.57 - 3.48 (m, 1H), 3.44 (br. s., 1H), 2.90 - 2.78 (m, 1H), 2.63 (s, 3H), 2.23 (s, 6H), 1.96 - 1.86 (m, 1H)
Primer 72 (Šema AA) - (1S,2S,3S,5R)-3-(4-fluor-2-((metilamino)metil)fenoksi)-5-(4-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)ciklopentan-1,2-diol (11) (referenca)
[0259]
Šema AA
Faza 1 - Sinteza terc-butil (2-(((3aR,4S,6R,6aS)-2,2-dimetil-6-(4-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)tetrahidro-4H-ciklopenta[d][1,3]dioksol-4-il)oksi)-5-fluorobenzil)karbamata (AA-1)
[0260] U rastvor Z-1 (140 mg, 0.34 mmol) i Et3N (34 mg, 0.34 mmol) u DCM (5 mL) se na rt (20 °C) doda Boc2O (74 mg, 0.34 mmol). Smeša se meša 1 h na rt (20 °C). Smeša se prečisti hromatografijom na silika gelu uz eluiranje sa EtOAC u petrol etru od 0 do 100 % da se
1
dobije AA-1 (140 mg, 81%) kao bezbojno ulje.
LCMS 513 [M+1];<1>H NMR (400 MHz, CDCl3) δ ppm 8.78 (s, 1H), 7.33 (s, 1H), 7.00 (d, J=8.8 Hz, 1H), 6.93 (d, J=5.2Hz, 2H), 6.58 (d, J=3.6Hz, 1H), 5.30-5.28 (m, 1H), 5.06-5.05 (m, 1H), 4.81 (d, J=6Hz, 2H), 4.76-4.75 (m, 1H), 4.18 (d, J=3.2Hz, 1H), 2.98-2.90 (m, 1H), 2.71 (s, 3H), 2.54-2.50 (m, 1H), 1.55 (s, 3H), 1.44 (s, 9H), 1.24 (s, 3H)
Faza 2 - Sinteza terc-butil (2-(((3aR,4S,6R,6aS)-2,2-dimetil-6-(4-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)tetrahidro-4H-ciklopenta[d][1,3]dioksol-4-il)oksi)-5-fluorobenzil)(metil)karbamata (AA-2)
[0261] U rastvor AA-1 (140 mg, 0.27 mmol) u bezvodnom DMF (3 mL) se na rt (20 °C) doda 60 % NaH (16.4 mg, 0.41 mmol). Smeša se meša 1 h na rt (20 °C). U smešu se doda CH3I (56 mg, 0.4 mmol) i meša 20 h na rt (20 °C). Smeša se sipa u NH4Cl aq (10 mL) i ekstrahuje sa EtOAc (5 mL x 3). Ekstrakt se ispere sa slanim rastvorom (5 mL), suši preko Na2SO4i koncentruje pod vakuumom da se dobije sirovi materijal (200 mg) kao braon ulje koje se prečisti hromatografijom na silika gelu uz eluiranje sa EtOAc u petrol etru od 0 do 100 % da se dobije AA-2 (100 mg, 70%) kao bezbojna guma. LCMS 527 [M+1]
Faza 3 - Sinteza (1S,2S,3S,5R)-3-(4-fluor-2-((metilamino)metil)fenoksi)-5-(4-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)ciklopentan-1,2-diola (AA-3)
[0262] U smešu TFA/H2O (1 mL/2 mL) se na rt doda AA-2 (89 mg, 0.169 mmol). Smeša se meša 2 h na rt, nakon toga sipa u 20% K2CO3aq (5 mL). Smeša se ekstrahuje sa EtOAc (10 mL x 3). Ekstrakt se ispere sa slanim rastvorom (10 mL x 2), suši preko Na2SO4, filtrira i koncentruje pod vakuumom. Ostatak se rastvori u CH3CN/H2O (4 mL/10 mL) i liofilizira da se dobije AA-3 (55 mg, 84%) kao bela čvrsta supstanca. LCMS 387 [M+1];<1>H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ ppm 8.62 (s, 1H), 7.67 (d, J=3.8 Hz, 1H), 7.23 - 7.14 (m, 1H), 7.08 - 6.98 (m, 2H), 6.73 (d, J=3.8 Hz, 1H), 5.12 (q, J=9.1 Hz, 2H), 4.57 (br. s., 2H), 4.02 (d, J=4.8 Hz, 1H), 3.71 (s, 2H), 2.92 - 2.77 (m, 1H), 2.65 (s, 3H), 2.34 (s, 3H), 2.03 - 1.93 (m, 1H)
Primer 73 (Šema BB) - (1S,2S,3S,5R)-3-(4-fluorofenoksi)-5-(4-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)ciklopentan-1,2-diol (BB-4) (referenca)
1
Šema BB
Faza 1: Sinteza terc-butil-((1S,4R)-4-(4-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)ciklopent-2-en-1-il)-karbonata (BB-2)
[0264] Posuda A: U reaktivnu posudu osušenu u pećnici, opremljenu magnetnom mešalicom i ohlađenu u struji argona, se dodaju tris(benzilidenaceton)dipaladijum(0)hloroform adukt (78.7 mg, 0.0760 mmol) i (S,S)-DACH-naftil Trost Ligand (MFCD02684552) (180 mg, 0.228 mmol). Posuda se pod vakuumom prečisti sa argonom pod dinamičkim vakuumom i DCE (7.5 mL), koji se prethodno 30 minuta prska sa argonom. Rastvor se meša 30 minuta na rt kada se dobija sjajno narandžasti rastvor ligatiranog katalizatora. U ovoj fazi se priprema Posuda B.
[0265] Posuda B: U posudu osušenu u pećnici, opremljenu magnetnom mešalicom i ohlađenu u struji argona, se dodaju 4-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin (HG-1) (506 mg, 3.8 mmol), diterc-butil-((1R,3S)-ciklopent-4-en-1,3-diil)-bis(karbonat) (BB-1) (kako je zabeleženo u J. Am. Chem. Soc.2006, 128, 6054-6055) (1.37 g, 4.56 mmol) i cezijum karbonat (1.36 g, 4.18 mmol). Posuda se prečisti pod vakuumom sa argonom pod dinamičkim vakuumom i doda se DCE (7.5 mL), koji je prethodno 30 minuta prskan sa argonom, a nakona toga se doda sadržaj Posude A hermetički zatvorenim špricem. Reakcija se meša 48 sati na rt u atmosferi argona. Reakcija se prenese u levak za razdvajanje sa DCM. Rastvor se ispere sa 2 porcije vode i 1 porcijom slanog rastvora. Mala količina 1M rastvora HCl se koristi da se razbije emulzija pri poslednjem ispiranju. Organska faza se suši (MgSO4), filtrira i koncentruje pod vakuumom. Sirovi ostatak se prečisti flash hromatografijom na koloni (40 g SiO2, Isco, 100% Hept. do 100% EtOAc, 20 mL frakcije) da se dobije jedinjenje BB-2 (814 mg, 68%, >99% ee) kao braon guma koja stajanjem očvrsne.
LCMS [M+H] = 316 zabeleženo; asimetrični LCMS (Chiralcel OJ-34.6x100 mm 3µ kolona, 4% MeOH+10nM NH3@ 120 bar, 4 mL/min) pik 1 @ 0.63 min., pik 2 @ 0.77 min., uočeni glavni pik @ 0.65 min, 99.8:0.2% u MS oblasti;<1>H NMR (400MHz, HLOROFORM-d) δ
1
ppm 8.78 (s, 1H), 7.32 - 7.22 (m, 1H), 6.60 (d, J=3.7 Hz, 1H), 6.35 - 6.23 (m, 1H), 6.10 (d, J=5.4 Hz, 1H), 6.00 (br. s., 1H), 5.66 - 5.57 (m, 1H), 3.21 - 3.07 (m, 1H), 2.75 (s, 3H), 1.89 (d, J=14.9 Hz, 1H), 1.57 - 1.46 (m, 9H).
Faza 2: Sinteza 7-((1R,4S)-4-(4-fluorofenoksi)ciklopent-2-en-1-il)-4-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidina (BB-3)
[0266] U scintilacionu posudu, opremljenu magnetnom mešalicom, se dodaju BB-2 (56.8 mg, 0.180 mmol), 4-fluorofenol (22.2 mg, 0.198 mmol), difenilfosfinopropan (dppp) (4.5 mg, 0.0108 mmol), tris(dibenzilidenaceton)dipaladijum(0)hloroform adukt (4.7 mg, 0.0045 mmol) i cezijum karbonat (64.6 mg, 0.198 mmol). Posuda se prečisti sa argonom pod dinamičkim vakuumom a nakon toga se doda DCE (0.9 mL) koji je prethodno prskan 30 minuta sa argonom. Reakcija se meša 2.5 sata na rt u atmosferi argona. U reakciju se doda DCM i prenese direktno na prethodno pripremljenu kolonu silika gela. Sirovi ostatak se prečisti flash hromatografijom na koloni (12g SiO2, Isco, 100% Hept. do 100% EtOAc, 9 mL frakcije) da se dobije jedinjenje BB-3 (38.8 mg, 70% prinos) kao bezbojna guma. LCMS [M+H] = 310 zabeleženo;<1>H NMR (400 MHz, HLOROFORM-d) δ ppm 8.77 (s, 1H), 7.34 (d, J=3.55 Hz, 1H), 6.92-7.04 (m, 2H), 6.80-6.92 (m, 2H), 6.57 (d, J=3.55 Hz, 1H), 6.37 (d, J=5.38 Hz, 1H), 6.14 (d, J=4.03 Hz, 1H), 5.97-6.09 (m, 1H), 5.17-5.34 (m, 1H), 3.02-3.18 (m, 1H), 2.56-2.91 (m, 3H), 1.97 (td, J=3.35, 14.70 Hz, 1H).
Faza 3: Sinteza (1S,2S,3S,5R)-3-(4-fluorofenoksi)-5-(4-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)ciklopentan-1,2-diola (BB-4)
[0267] U scintilacionu posudu, opremljenu magnetnom mešalicom i koja sadrži BB-3 (38.8 mg, 0.125 mmol), se dodaju DCM (0.73 mL) i voda (0.03 mL). U rastvor se doda 4-metilmorfolin-N-oksid (NMO) (44.1 mg, 0.376 mmol) a nakon toga se u kapima doda osmijum tetraoksid (32 mL, 0.005 mmol) kao 4 mt% rastvor u vodi. Reakcija se meša 8 sati na rt. Reakcija se neutrališe sa 1M rastvorom NaHSO3aq., meša 30 minuta i prenese u levak za razdvajanje sa DCM. Rastvor se dalje razblaži sa vodom i produkt se ekstrahuje sa 4 porcije smeše 3:1 CHCl3/i-PrOH. Kombinovani organski ekstrakti se suše (MgSO4), filtriraju i koncentruju pod vakuumom da se dobije sirovi produkt kao bela čvrsta supstanca. Sirovi ostatak se prečisti preparativnom HPLC (Lux Cellulose-1 4.6x100 mm 3µ kolona, 15%
1
MeOH @ 120 bar, 4 mL/min) da se dobije jedinjenje BB-4 (30.4 mg, 71%, >99% de) kao bela čvrsta supstanca. LCMS [M+H] = 344 zabeleženo; [α]<22>D = -36.0° (c=0.1, MeOH);<1>H NMR (400 MHz, METANOL-d4) δ ppm 8.61 (s, 1H), 7.58 (d, J=3.67 Hz, 1H), 6.94-7.09 (m, 4H), 6.75 (d, J=3.67 Hz, 1H), 5.27 (q, J=8.64 Hz, 1H), 4.58-4.68 (m, J=3.67 Hz, 2H), 4.17 (d, J=4.89 Hz, 1H), 2.96 (ddd, J=7.15, 9.32, 14.46 Hz, 1H), 2.71 (s, 3H), 2.09 (ddd, J=3.85, 8.53, 14.03 Hz, 1H).19F NMR (377 MHz, METANOL-d4) δ ppm = -125.65 (s, 1F).
Primeri 74-77 se izrađuju koristeći hemiju opisanu u Šemi BB i koristeći odgovarajući komercijalni fenol reagens za fazu 2.
[0268]
1
(nastavlja se)
Primer 78 (Šema CC) - (1S,2S,3S,5R)-3-((6-hlor-5-fluor-1,2,3,4-tetrahidroizohinolin-8-il)oksi)-5-(4-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)ciklopentan-1,2-diol (CC-3)
14
Šema CC
Faza 1 - Sinteza terc-butil 8-(((1S,4R)-4-(4-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)ciklopent-2-en-1-il)oksi)-3,4-dihidroizohinolin-2(1H)-karboksilata (CC-1)
[0270] Smešu BB-2 (600 mg, 1.9 mmol), terc-butil 8-hidroksi-3,4-dihidroizohinolin-2(1H)-karboksilata (474 mg, 1.9 mmol), Cs2CO3( 682 mg, 2.09 mmol) i DPPP (47.1 mg, 0.11 mmol) u DCE (15 mL) se 40 min prska sa N2. U smešu se doda Pd2(dba)3.CHCl3(49 mg, 0.048 mmol) u atmosferi N2. Reakcija se prska 5 min sa N2i nakon toga 40 min meša na rt (20 °C) u atmosferi N2. Smeša se odmah prečisti (rastvor se prečisti direktno) hromatografijom na silika gelu uz eluiranje sa smešom petrol etar/EtOAc=8/1 do 1/1 nakon toga DCM/MeOH=12/1 da se dobije CC-1 (735 mg, 87%) kao žuta guma. LCMS [M+1] 447;<1>H NMR (400 MHz, CDCl3) δ ppm 8.77 (s, 1H), 7.33 (d, J=3.5 Hz, 1H), 7.13 (t, J=7.9 Hz, 1H), 6.79 - 6.72 (m, 2H), 6.62 - 6.52 (m, 1H), 6.44 - 6.33 (m, 1H), 6.21 - 6.11 (m, 1H), 6.09 - 6.01 (m, 1H), 5.41 - 5.33 (m, 1H), 4.71 - 4.40 (m, 2H), 3.71 - 3.48 (m, 2H), 3.22 - 3.12 (m, 1H), 2.82 (br. s., 2H), 2.73 (s, 3H), 1.98 (d, J=15.1 Hz, 1H), 1.51 (s, 9H)
Faza 2 - Sinteza terc-butil 8-(((1S,2S,3S,4R)-2,3-dihidroksi-4-(4-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)ciklopentil)oksi)-3,4-dihidroizohinolin-2(1H)-karboksilata (CC-2)
[0271] U smešu CC-1 (730 mg, 1.63 mmol) u DCM (15 mL)/H2O (0.5 mL) se dodaju NMO (575 mg, 4.9 mmol) i OsO4(4 % u t-BuOH, 832 mg, 0.12 mmol). Smeša se meša 3 h na rt (25 °C). Dodaju se Na2SO3(500 mg) i voda (20 mL). Smeša se meša 1 h na rt a nakon toga se smeša filtrira. Filtrat se razblaži sa vodom (50 mL) i ekstrahuje sa EtOAc (50 mLx2). Ekstrakt se ispere sa slanim rastvorom (50 mL), suši preko Na2SO4, koncentruje pod vakuumom i prečisti hromatografijom na silika gelu uz eluiranje sa MeOH u DCM od 0 do 10 % da se dobije CC-2 (560 mg, 71%) kao bela čvrsta supstanca. LCMS [M+1] 481;<1>H NMR (400 MHz, CDCl3) δ ppm 8.67 (s, 1H), 7.24 (d, J=3.8 Hz, 1H), 7.18 (t, J=7.9 Hz, 1H), 6.90 (d, J=8.0 Hz, 1H), 6.80 (d, J=7.8 Hz, 1H), 6.60 (d, J=3.3 Hz, 1H), 5.08 - 4.94 (m, 1H), 4.87 -4.76 (m, 1H), 4.61 - 4.39 (m, 3H), 4.37 - 4.28 (m, 1H), 3.76 - 3.55 (m, 2H), 3.46 - 3.31 (m, 1H), 3.20 - 3.04 (m, 1H), 2.86 - 2.79 (m, 2H), 2.73 (s, 3H), 2.48 - 2.30 (m, 1H), 1.48 (s, 9H)
Faza 3 - Sinteza (1S,2S,3R,5S)-3-(4-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)-5-((1,2,3,4-tetrahidroizohinolin-8-il)oksi)ciklopentan-1,2-diola (CC-3)
[0272] U rastvor CC-2 (560 mg, 1.17 mmol) u DCM (15 mL) se na 0 °C doda TFA (4.5 mL). Reaktivna smeša se meša 1 sat na 0 °C. Reaktivna smeša se upari i rastvori u vodi (30 mL) i doda se K2CO3(1 g). Smeša se razblaži sa slanim rastvorom (30 mL) i ekstrahuje sa smešom EtOAc/THF (1/1, 30 mLx3). Ekstrakt se ispere sa slanim rastvorom (30 mLx2), suši preko Na2SO4, filtrira i koncentruje pod vakuumom da se dobije CC-3 (400 mg, 90%) kao bela čvrsta supstanca. LCMS [M+1] 381;<1>H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ ppm 8.64 (s, 1H), 7.62 (d, J=3.8 Hz, 1H), 7.11 - 7.02 (m, 1H), 6.81 (d, J=8.3 Hz, 1H), 6.73 (d, J=3.5 Hz, 1H), 6.68 (d, J=7.5 Hz, 1H), 5.33 (br. s., 1H), 5.19 - 5.08 (m, 2H), 4.56 (br. s., 2H), 3.99 (br. s., 1H), 3.85 (s, 2H), 2.93 (t, J=5.8 Hz, 2H), 2.90 - 2.81 (m, 1H), 2.70 - 2.66 (m, 2H), 2.65 (s, 3H), 1.98 - 1.86 (m, 1H)
Primeri 79 & 80 se izrađuju koristeći hemiju opisanu u Šemi CC i koristeći odgovarajući komercijalni NBoc-zaštićeni fenol reagens za fazu 1.
[0273]
Primer 81 (Šema DD) - (1S,2S,3R,5S)-3-(4-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)-5-[(2-metil-1,2,3,4-tetrahidroizohinolin-5-il)oksi]ciklopentan-1,2-diol (DD-1) (referenca)
14
Šema DD
Faza 1: Sinteza (1S,2S,3R,5S)-3-(4-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)-5-[(2-metil-1,2,3,4-tetrahidroizohinolin-5-il)oksi]ciklopentan-1,2-diola (DD-1)
[0275] Smeša jedinjenja iz Primera 80 (42 mg, 0.11 mmol), 37 % CH2O (26.9 mg, 0.331 mmol) i NaBHOAc3(93.6 mg, 0.442 mmol) u THF (1.2 mL) se meša 2 h na rt. Smeša se sipa u NaHCO3aq (10 mL) i ekstrahuje sa EtOAc (20 mL x 4). Ekstrakt se suši preko Na2SO4i koncentruje pod vakuumom da se dobije ostatak (50 mg) kao bela čvrsta supstanca koja se prečisti prep-TLC (DCM:MeOH=10:1 sa NH3.H2O) da se dobije DD-1 (35 mg, 80%) kao bela čvrsta supstanca. LCMS 395 [M+1];<1>H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ ppm 8.63 (s, 1H), 7.63 (d, J=3.5 Hz, 1H), 7.16 (t, J=8.0 Hz, 1H), 6.92 (d, J=8.5 Hz, 1H), 6.75 - 6.69 (m, 2H), 5.36 (d, J=3.8 Hz, 1H), 5.18 - 5.09 (m, 2H), 4.64 - 4.54 (m, 2H), 4.02 (br. s., 1H), 3.83 (br. s., 2H), 2.99 (br. s., 2H), 2.92 - 2.82 (m, 3H), 2.65 (s, 3H), 2.58 (br. s., 3H), 1.95 (ddd, J=3.8, 9.5, 13.8 Hz, 1H)
Primer 82 & 83 se izrađuju na sličan način kao za Primer 79 & 78 tim redom
[0276]
Sinteza terc-butil 6-fluor-8-hidroksi-3,4-dihidroizohinolin-2(1H)-karboksilata (TP-1)
[0277]
Faza 1 - Sinteza 5-fluor-7-metoksi-2,3-dihidro-1 H-inden-1-ona (EE-2)
[0278] U rastvor 5-fluor-7-hidroksi-2,3-dihidro-1H-inden-1-ona (izrađen na sličan način kao u Bio. Med. Chem Letters, 20, 1004-1007, 2010) (1 g, 6.02 mmol) i K2CO3(2.5 g, 18 mmol) u bezvodnom DMF (10 mL) se na 0 °C doda MeI (1710 mg, 12.0 mmol). Nakon dodavanja, reakcija se meša 4 sata na 25 °C. Reaktivna smeša se podeli između EtOAc i H2O. Vodeni
14
sloj se ekstrahuje sa EtOAc. Kombinovani organski slojevi se isperu sa slanim rastvorom, suše preko Na2SO4i koncentruju da se dobije EE-2 (1 g, 92%) kao žuta čvrsta supstanca. LCMS 181 [M+1];<1>H NMR (400 MHz, CDCl3) δ ppm 6.73 - 6.69 (m, 1H), 6.51 (dd, J=2.0, 11.3 Hz, 1H), 3.94 (s, 3H), 3.13 - 3.03 (m, 2H), 2.73 - 2.65 (m, 2H)
Faza 2 - Sinteza 6-fluor-8-metoksi-3,4-dihidroizohinolin-1(2H)-ona (EE-3)
[0279] U rastvor EE-2 (950 mg, 5.27 mmol) u 1,2-DCE/MeSO3H (38 mL/29 mL) se na 0 °C u porcijama doda NaN3(1.4 mg, 21.1 mmol). Nakon dodavanja, smeša se meša 16 h na 70 °C. Smeša se ohladi na 0 °C, pH se podesi na 7-8 dodavanjem vodenog rastvora NaHCO3(sat). Smeša se ekstrahuje sa DCM (15 mL x 2), suši preko Na2SO4, filtrira i koncentruje da se dobije EE-3 (1.15 g, 74%) kao braon čvrsta supstanca. LCMS 196 [M+1];<1>H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ ppm 7.70 (br. s., 1H), 6.85 (dd, J=2.4, 11.9 Hz, 1H), 6.73 (dd, J=2.4, 8.9 Hz, 1H), 3.76 (s, 3H), 3.21 (dt, J=3.5, 6.3 Hz, 2H), 2.80 (t, J=6.3 Hz, 2H)
Faza 3 - Sinteza 6-fluor-8-metoksi-1,2,3,4-tetrahidroizohinolina (EE-4)
[0280] Jedinjenje EE-4 se izrađuje od EE-3 sličnim postupkom kao za fazu 5 u Šemi FF da se dobije sirovo EE-4 (455 mg, >99%) kao žuto ulje i koristi direktno u sledećoj fazi. LCMS 182 [M+1];<1>H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ ppm 6.63 (dd, J=2.3, 11.3 Hz, 1H), 6.48 (dd, J=2.3, 9.5 Hz, 1H), 3.75 (s, 3H), 3.67 - 3.61 (m, 2H), 2.85 (t, J=5.8 Hz, 2H), 2.61 (t, J=5.6 Hz, 2H)
Faza 4 - Sinteza 6-fluor-1,2,3,4-tetrahidroizohinolin-8-ola (EE-5)
[0281] Jedinjenje EE-5 se izrađuje od EE-4 sličnim postupkom kao za fazu 6 u Šemi FF da se dobije sirovo EE-5 (228 mg, 54%) kao žuta čvrsta supstanca. LCMS 168 [M+1];<1>H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ ppm 6.39 - 6.28 (m, 2H), 3.63 (s, 2H), 2.85 (t, J=5.8 Hz, 2H), 2.63 -2.57 (m, 2H)
Faza 5 - Sinteza terc-butil 6-fluor-8-hidroksi-3,4-dihidroizohinolin-2(1H)-karboksilata (TP-1)
14
[0282] Jedinjenje TP-1 se izrađuje od EE-5 sličnim postupkom kao za fazu 7 u Šemi FF da se dobije TP-1 (182 mg, 50%) kao žuta čvrsta supstanca. MS 212 [M-56+1];<1>H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ ppm 10.11 (s, 1H), 6.45 (d, J=10.5 Hz, 2H), 4.29 (s, 2H), 3.51 (m, J=5.8 Hz, 2H), 2.69 (m, J=5.6 Hz, 2H), 1.43 (s, 9H)
Sinteza terc-butil 5-fluor-8-hidroksi-3,4-dihidroizohinolin-2(1H)-karboksilat (TP-2)
[0283]
Šema FF
Faza 1 - Sinteza terc-butil (pivaloiloksi)karbamata (FF-2)
[0284] U rastvor jedinjenje FF-1 (20 g, 150 mmol) u CHCl3(200 mL) se polako dodaje pivalinski anhidrid (34 g, 180 mmol) u ledenom kupatilu i nakon toga meša 16 h na 70 °C. Reaktivni rastvor se razblaži sa DCM (200 mL) i ispere sa zasićenim rastvorom NaHCO3(200 mL x 2) do pH~7. Organski sloj se suši preko Na2SO4, filtrira i koncentruje pod sniženim pritiskom da se dobije svetlo žuto ulje. Sirovi produkt kristališe sa petrol etrom (20 mL) da se dobije FF-2 (18 g, 55%) kao bela čvrsta supstanca.<1>H NMR (400 MHz, CDCl3) δ ppm 7.8 (br. s., 1H), 1.5 (s, 9H), 1.3 (s, 9H)
Faza 2 - Sinteza O-pivaloilhidroksilamina (FF-3)
[0285] U rastvor FF-2 (16 g, 70 mmol) u TBME (32 mL) se na 0 °C doda CF3SO3H (10.6 g,
14
70.7 mmol). Reaktivni rastvor se meša 2 h na 15 °C. Reaktivna smeša se upari da se dobije sirovi produkt FF-3 (20 g, >99%) kao bela čvrsta supstanca i koristi direktno u sledećoj reakciji.
Faza 3 - Sinteza 5-fluor-2-metoksi-N-(pivaloiloksi)benzamida (FF-4)
[0286] U rastvor 5-fluor-2-metoksibenzoeve kiseline (4.50 g, 26.4 mmol) u THF (90.0 mL) se na 0 °C doda T3P (19 g, 29.1 mmol). Nakon dodavanja, reaktivna smeša se meša 30 min na 25 °C. U reaktivnu smešu se doda DIPEA (13.8 mL, 8.82 mmol) a nakon toga FF-3 (7.28 g, 29.1 mmol). Nakon dodavanja, reaktivna smeša se meša 16 sati na 25 °C. Reaktivna smeša se filtrira i filtrat se podeli između EtOAc i H2O. Organski sloj se razdvoji, suši preko Na2SO4i koncentruje da se dobije sirovi produkt koji se prečisti flash hromatografijom na koloni (EtOAc: petrol etar = 1~100%, nakon toga MeOH: DCM = 1%~10%) da se dobije FF-4 (9 g, >99%) kao bela čvrsta supstanca i koristi direktno u sledećoj reakciji.
Faza 4 - Sinteza 5-fluor-8-metoksi-3,4-dihidroizohinolin-1(2H)-ona (FF-5)
[0287] Suspenzija FF-4 (8.00 g, 28.0 mmol), KOAc (6.06 g, 61.7 mmol) i [Cp*RhCl2]2(867 mg, 1.40 mmol) u MeCN (100 mL) u posudi se prečišćava 5 min sa N2i nakon toga ohladi na -40 °C sa smešom suvi led/aceton. Etilen se 30 min prečišćava u posudi, nakon toga posuda zatvori i meša 16 h na 25 °C. Tamno crvena suspenzija se filtrira i filter pogača se ispere sa CH3CN. Kombinovani filtrat se koncentruje da se dobije sirovi produkt koji se prečisti flash hromatografijom na koloni (EtOAc:petrol etar = 1%~100%, nakon toga MeOH:DCM =1-8%) da se dobije FF-5 (4.62 g, 84%) kao žuta čvrsta supstanca.<1>H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ ppm 7.85 (br. s., 1H), 7.32 (t, J=9.0 Hz, 1H), 6.99 (dd, J=4.3, 9.3 Hz, 1H), 3.76 (s, 3H), 3.31 -3.22 (m, 2H), 2.79 (t, J=6.3 Hz, 2H)
Faza 5 - Sinteza 5-fluor-8-metoksi-1,2,3,4-tetrahidroizohinolina (FF-6)
[0288] U rastvor FF-5 (4.66 g, 23.9 mmol) u bezvodnom THF (240 mL) se u porcijama doda LiAlH4(3.62 g, 95.5 mmol). Nakon dodavanja, reaktivna smeša se zagreva 2 sata na 65 °C (refluks). Reaktivna smeša se neutrališe sa 4 mL H2O. Smeša se destiliše u EtOAc i filtrira. Filter pogača se ispere sa EtOAc. Filtrat se suši preko Na2SO4i koncentruje da se dobije
14
sirovi produkt koji se prečisti flash hromatografijom na koloni (MeOH: DCM = 1-8%) da se dobije FF-6 (2.9 g, 66%) kao žuta guma.<1>H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ ppm 6.92 (t, J=9.2 Hz, 1H), 6.73 (dd, J=4.4, 8.9 Hz, 1H), 3.73 (s, 3H), 3.69 (s, 2H), 2.88 (t, J=5.8 Hz, 2H), 2.55 (t, J=5.8 Hz, 2H)
Faza 6 - Sinteza 5-fluor-1,2,3,4-tetrahidroizohinolin-8-ola (FF-7)
[0289] U rastvor FF-6 (2.86 g, 15.8 mmol) u DCM (28.6 mL) se u kapima na -10 °C doda BBr3(2.86 mL, 30.3 mmol). Nakon dodavanja, reaktivna smeša se meša 2 sata na 0 °C.
Reaktivna smeša se ohladi na -10 °C i neutrališe sa MeOH. Dobijena smeša se razblaži u H2O, zaalkališe sa sat. K2CO3do pH 9-10 i nakon toga ekstrahuje sa EtOAc (50 mL x 3). Kombinovani organski slojevi se isperu sa slanim rastvorom, suše preko Na2SO4i koncentruju da se dobije sirovi produkt koji se prečisti flash hromatografijom na koloni (MeOH: DCM = 1:10) da se dobije FF-7 (1.0 g, 38%) kao žuta čvrsta supstanca.<1>H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ ppm 9.24 (br. s., 1H), 6.76 (t, J=9.0 Hz, 1H), 6.55 (dd, J=4.6, 8.7 Hz, 1H), 3.69 (s, 2H), 2.90 (t, J=5.9 Hz, 2H), 2.54 (t, J=6.4 Hz, 2H)
Faza 7 - Sinteza terc-butil 5-fluor-8-hidroksi-3,4-dihidroizohinolin-2(1H)-karboksilata (TP-2)
[0290] U rastvor FF-7 (1.0 g, 6 mmol) u DCM (25.00 mL) i MeOH (5 mL) se na 0 °C dodaju Boc2O (1.4 g, 6.6 mmol) a nakon toga Et3N (2.08 mL, 15.0 mmol). Nakon dodavanja, reaktivna smeša se meša 16 sati na 25 °C. Reaktivna smeša se zakiseli sa aq. limunskom kiselinom do pH 3-4 i dobijena smeša se podeli između DCM i H2O. Organski sloj se odvoji i vodeni sloj se ekstrahuje sa DCM. Kombinovani organski slojevi se isperu sa sat. NaHCO3, slanim rastvorom, suše preko Na2SO4i koncentruju da se dobije sirovi produkt koji se prečisti flash hromatografijom na koloni (MeOH:DCM = 1:10) da se dobije TP-2 (744 mg, 47%) kao bela čvrsta supstanca. MS 212 [M-55+1];<1>H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ ppm 9.55 (s, 1H), 6.83 (t, J=9.0 Hz, 1H), 6.62 (dd, J=4.6, 8.9 Hz, 1H), 4.32 (s, 2H), 3.52 (t, J=5.9 Hz, 2H), 2.63 (t, J=5.6 Hz, 2H), 1.41 (s, 9H)
Prethodno dati postupci u Šemi FF su korišćeni za sintezu hidroksitetrahidroizohinolin međuproizvoda TP-3 preko TP-7.
14
1 Sinteza terc-butil 8-hidroksi-6-(2-hidroksipropan-2-il)-3,4-dihidroizohinolin-2(1H)-karboksilata (TP-9)
[0292]
Šema GG
m roaas
Faza 1: Sinteza benzil 2-(benziloksi)-4-bromobenzoata (GG-2)
[0293] U rastvor salicilne kiseline GG-1 (50 g, 230 mmol) u THF (1000 mL) se dodaju kalijum karbonat (95.5 g, 691 mmol), tetrabutil amonijum bromid (14.9 g, 46.1 mmol) i benzil bromid (95.8 g, 576 mmol). Reakcija se meša 16 sati na 20°C. Rastvor se filtrira i koncentruje pod vakuumom da se dobije željeni produkt GG-2 kao sirova braon čvrsta supstanca (150 g). Ovaj materijal se koristi u sledećoj fazi bez daljeg prečišćavanja. TLC (PE./EA=10:1, Rf~0.5)
Faza 2: Sinteza 2-(benziloksi)-4-bromobenzoeve kiseline (GG-3)
[0294] U rastvor GG-2 (140 g, 352 mmol, sirovo, -53% čistoće) u smeši MeOH/voda/DCM (500 mL/500 mL/500 mL) se na 10 °C doda litijum hidroksid (44.4 g, 1060 mmol). Reakcija se meša 16 sati na 70°C. Rastvor se koncentruje pod vakuumom i žuta čvrsta supstanca precipitira iz rastvora. Čvrste susptance se filtriraju i filter pogača se ispere sa vodom (50 mL X 2). Žuta čvrsta supstanca se zakiseli sa 1N rastvorom HCl do pH=2. Žuta čvrsta supstanca se filtrira i suši u pećnici sa infracrvenim zracima da se dobije jedinjenje GG-3 (43.3 g, 40%)
1 1
kao žuta čvrsta supstanca.<1>NMR (400MHz, DMSO-d6) δ ppm 12.76 (bs, 1H), 7.61 (d, J=8.3 Hz, 1H), 7.52 - 7.47 (m, 2H), 7.44 (d, J=1.8 Hz, 1H), 7.43 - 7.38 (m, 2H), 7.37 - 7.31 (m, 1H), 7.23 (dd, J=1.8, 8.3 Hz, 1H), 5.25 (s, 2H).
Faza 3: Sinteza 2-(benziloksi)-4-brom-N-(pivaloiloksi)-benzamida (GG-4)
[0295] U rastvor GG-3 (31.2 g, 101.58 mmol) u THF (630 mL) se na 0°C doda T3P (71.1 g, 112 mmol). Nakon dodavanja, reaktivna smeša se meša 30 minuta na 25°C. U prethodno dobijeni rastvor se doda DIPEA (78.8 g, 609 mmol) a nakon toga O-pivaloilhidroksilamin (28 g, 112 mmol). Nakon dodavanja, reaktivna smeša se meša 2 sata na 25°C. Rastvor se prenese u levak za razdvajanje sa EtOAc (500 mL) i ispere sa 1 porcijom vode (300 mL), 1 porcijom limunske kiseline aq. (300 mL), 1 porcijom sat. NaHCO3i 1 porcijom slanog rastvora (300 mL). Organski sloj se suši preko Na2SO4, filtrira i koncentruje pod vakuumom. Sirovi ostatak se prečisti flash hromatografijom na koloni (silika gel, petrol etar:EtOAc=7:1) da se dobije jedinjenje GG-4 (30.4 g, 74%) kao žuta čvrsta supstanca.<1>H NMR (400MHz, DMSO-d6) δ ppm 10.74 (s, 1H), 8.06 (d, J=8.5 Hz, 1H), 7.52 - 7.35 (m, 5H), 7.28 (d, J=1.5 Hz, 1H), 7.26 (d, J=1.8 Hz, 1H), 7.23 (d, J=1.5 Hz, 1H), 5.27 (s, 2H), 1.34 (s, 9H)
Faza 4: Sinteza 8-(benziloksi)-6-brom-1-okso-3,4-dihidroizohinolin-2(1H)-il pivalata (GG-5)
[0296] Suspenzija GG-4 (40.7 g, 100.18 mmol), KOAc (10.8 g, 110 mmol) i Cp2RhCl2(3.1 g, 5.01 mmol) u MeCN (1300 mL) se ohladi na 0°C i rastvor se prska sa etilen gasom 45 minuta. Posuda se zatvori i meša 16 sati na 10°C. Reaktivna suspenzija se filtrira i pogača se ispere sa 2 porcije smeše 5:1 DCM/MeOH (100 mL). Filtrat se koncentruje pod sniženim pritiskom da se dobije sirovi produkt (50 g) kao žuta čvrsta supstanca. Sirovi ostatak se prečisti flash hromatografijom na koloni (silika gel, DCM:MeOH=40:1) da se dobije jedinjenje GG-5 (28 g, 84%) kao žuta čvrsta supstanca. LCMS [M+H+Na] 356 zabeleženo;<1>H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ ppm 7.79 (t, J=3.1 Hz, 1H) 7.53 - 7.59 (m, 2H) 7.35 - 7.42 (m, 2H) 7.30 - 7.34 (m, 1H) 7.26 (d, J=2.0 Hz, 1H) 7.15 (d, J=2.0 Hz, 1H) 5.20 (s, 2H) 3.25 (td, J=6.1, 3.6 Hz, 2H) 2.83 (t, J=6.3 Hz, 2H).
Faza 5: Sinteza 8-(benziloksi)-6-brom-3,4-dihidroizohinolin-1(2H)-ona (GG-6)
1 2
[0297] U smešu GG-5 (36.5 g, 110 mmol) u anhidrovanom THF (700 mL) se na 0°C u kapima u atmosferi N2doda BH3. Me2S (10M, 33 mL, 330 mmol). Nakon dodavanja, reakcija se meša 12 sati na 5 °C. U ovoj fazi, reaktivna smeša se zagreva 3 sata na 78°C (refluks) da se reakcija završi. Reakcija se ostavi da se postepeno ohladi na rt i pažljivo neutrališe sa 70 mL MeOH na 0°C. Rastvor se koncentruje a nakon toga prenese u THF (2 mL) i MeOH (10 mL) i stavi u sa mikrotalasima. Rastvor se zagreva 1 sat na 120°C u mikrotalasnom reaktoru.
Rastvor se koncentruje da se dobije crna čvrsta supstanca. Sirovi ostatak se prečisti flash hromatografijom na koloni (120 g silika gel x 3, MeOH/DCM=10%~20%) da se dobije jedinjenje GG-6 (8.28 g, 24%) kao braon čvrsta supstanca. LCMS [M+H] 319 zabeleženo;<1>H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ ppm 8.99 (br. s, 1H) 7.37 - 7.50 (m, 5H) 7.23 (d, J=1.3 Hz, 1H) 7.11 (d, J=1.3 Hz, 1H) 5.21 (s, 2H) 4.11 (s, 2H) 2.97 (t, J=5.9 Hz, 2H).
Faza 6: Sinteza terc-butil 8-(benziloksi)-6-brom-3,4-dihidroizohinolin-2(1H)-karboksilata (GG-7)
[0298] U smešu GG-6 (10.99 g, 34.537 mmol) u DCM (110 mL) i THF (22 mL) se na 10 °C dodaju Et3N (10.5 g, 104 mmol) i (Boc)2O (11.3 g, 51.8 mmol). Reakcija se meša 16 sati na 10°C. Smeša se koncentruje pod vakuumom da se dobije sirovi produkt kao crna guma. Sirovi ostatak se prečisti flash hromatografija na koloni (120 g silika gel, EtOAc/petrol etar od 4% do 7%) da se dobije jedinjenje GG-7 (9.9 g, 68.5%) kao žuta guma. LCMS [M+H-Boc] 319 zabeleženo;<1>H NMR (400MHz, HLOROFORM-d) δ ppm 7.48 - 7.30 (m, 5H), 6.98
- 6.88 (m, 2H), 5.15 - 4.96 (m, 2H), 4.60 - 4.44 (m, 2H), 3.71 - 3.54 (m, 2H), 2.88 - 2.71 (m, 2H), 1.50 (s, 9H).
Faza 7: Sinteza 2-(terc-butil) 6-metil 8-(benziloksi)-3,4-dihidroizohinolin-2,6(1H)-dikarboksilata (GG-8)
[0299] Smeša GG-7 (600 mg, 1.43 mmol), DPPP (296 mg, 0.717 mmol), TEA (435 mg, 4.30 mmol) i Pd(OAc)2(161 mg, 0.717 mmol) u MeOH (20 mL) i DMF (20 mL) se zagreva 24 sata na 120 °C pod pritiskom ugljen monoksida od 22 bara. Smeša se koncentruje pod vakuumom i prenese u levak za razdvajanje sa EtOAc. Rastvor se ispere sa 5 porcija slanog rastvora, suši preko natrijum sulfata, filtrira i koncentruje pod vakuumom. Sirovi ostatak se
1
prečisti flash hromatografijom na koloni (12 g, silika gel, 20% EtOAc/petrol etar) da se dobije jedinjenje GG-8 (440 mg, 77% prinos) kao bela čvrsta supstanca.<1>H NMR (400MHz, HLOROFORM-d) δ ppm 7.54 - 7.28 (m, 7H), 5.22 - 5.08 (m, 2H), 4.67 - 4.54 (m, 2H), 3.91 (s, 3H), 3.70 - 3.57 (m, 2H), 2.93 - 2.77 (m, 2H), 1.50 (s, 9H).
Faza 8: Sinteza terc-butil 8-(benziloksi)-6-(2-hidroksipropan-2-il)-3,4-dihidroizohinolin-2(1H)-karboksilata (GG-9)
[0300] U bezbojni rastvor GG-8 (327 mg, 0.823 mmol) u bezvodnom THF (15 mL) se u kapima na 0°C doda MeMgBr (3.0 M rastvor u dietil etru, 1.65 mL, 4.94 mmol). Smeša se meša 1.5 sat na 17°C. Rastvor se ohladi na 0°C i neutrališe sa vodom (10 mL). Rastvor se prenese u levak za razdvajanje sa EtOAc i faze se razdvoje. Vodena faza se ekstrahuje sa 2 porcije EtOAc (20 mL). Kombinovani organski ekstrakti se isperu sa 1 porcijom slanog rastvora (30 mL), suše preko natrijum sulfata, filtriraju i koncentruju pod vakuumom. Sirovi ostatak se prečisti flash hromatografijom na koloni (silika gel, 12 g, petrol etar:EA=3:1) da se dobije jedinjenje GG-9 (320 mg, 98%) kao bezbojna guma.<1>H NMR (400 MHz, HLOROFORM-d) δ ppm 7.29 - 7.49 (m, 5H) 6.97 (s, 1H) 6.84 (s, 1H) 5.12 (br. s., 2H) 4.58 (s, 2H) 3.65 (br. s., 2H) 2.82 (br. s., 2H) 1.57 (s, 6H) 1.49 (s, 9H).
Faza 9: Sinteza terc-butil 8-hidroksi-6-(2-hidroksipropan-2-il)-3,4-dihidroizohinolin-2(1H)-karboksilata (TP-9)
[0301] Smeša GG-9 (290 mg, 0.73 mmol) i Pd/C (105 mg) u MeOH (10 mL) se meša 5 sati na 15°C u balonu vodonika. Smeša se filtrira kroz celite ploču i filtrat koncentruje pod vakuumom. Sirovi ostatak se prečisti flash hromatografijom na koloni (4 g, silika gel, 60% EtOAc/petrol etar) da se dobije jedinjenje TP-9 (144 mg, 64%) kao bela čvrsta supstanca.<1>H NMR (400MHz, HLOROFORM-d) δ ppm 6.91 (br. s., 1H), 6.76 (s, 1H), 4.53 (br. s., 2H), 3.63 (br. s., 2H), 2.80 (br. s., 2H), 1.55 (s, 6H), 1.50 (s, 9H).
Sekvence koje sadrže Faze 1-6 & 9 iz Šeme GG se koriste za sintezu hidroksitetrahidroizohinolin međuproizvoda TP-8 (Šema III), TP-10 - 12 od odgovarajuće salicilne kiseline.
1 4
Sinteza terc-butil 6-etil-8-hidroksi-3,4-dihidroizohinolin-2(1H)-karboksilata (TP-13)
1
Šema HH
Faza 1 - Sinteza terc-butil 8-(benziloksi)-6-vinil-3,4-dihidroizohinolin-2(1H)-karboksilata (HH-1)
[0304] Smeša GG-7 (530 mg, 1.27 mmol), 4,4,5,5-tetrametil-2-vinil-1,3,2-dioksaborolana (410 mg, 2.67 mmol), K3PO4.3H2O (675 mg, 2.53 mmol), PdCl2(dppf) (93 mg, 0.013 mmol) u dioksanu (20 mL) i H2O (5 mL) se degasira sa N2i zagreva 2 sata na 100 °C. Smeša se prečisti pre-TLC (petrol etar/EtOAc=8/1) da se dobije HH-1 (370 mg, 80%) kao bezbojna guma. LCMS 266 [M-Boc+1];<1>H NMR (400 MHz, CDCl3) δ ppm 7.51 - 7.28 (m, 5H), 6.83 (d, J=12.0 Hz, 2H), 6.65 (dd, J=10.9, 17.4 Hz, 1H), 5.69 (d, J=17.6 Hz, 1H), 5.22 (d, J=10.8 Hz, 1H), 5.12 (br. s., 2H), 4.58 (br. s., 2H), 3.73 - 3.56 (m, 2H), 2.90 - 2.73 (m, 2H), 1.50 (s, 9H)
Faza 2 - Sinteza terc-butil 6-etil-8-hidroksi-3,4-dihidroizohinolin-2(1H)-karboksilata (TP-13)
[0305] Smeša HH-1 (370 mg, 1.01 mmol) i Pd/C (370 mg) u MeOH (20 mL) se degasira sa H2i meša 24 h na 50 °C u atmosferi H2(50 psi). Smeša se filtrira i filtrat se koncentruje pod vakuumom da se dobije sirovi materijal koji se prečisti hromatografijom na silika gelu uz eluiranje sa EtOAc u petrol etru od 0 do 20 % da se dobije TP-12 (210 mg, 75%) kao bela čvrsta supstanca. LCMS 222 [M-55+1];<1>H NMR (400 MHz, CDCl3) δ ppm 6.57 (br. s., 1H), 6.48 (s, 1H), 4.51 (br. s., 2H), 3.63 (br. s., 2H), 2.78 (br. s, 2H), 2.62 - 2.45 (q, J=7.5 Hz, 2H), 1.50 (s, 9H), 1.20 (t, J=7.5 Hz, 3H)
Sinteza terc-butil 6-(difluorometil)-8-hidroksi-3,4-dihidroizohinolin-2(1H)-karboksilata (TP-14)
1
Šema II
Faza 1: Sinteza terc-butil 8-(benziloksi)-6-formil-3,4-dihidroizohinolin-2(1H)-karboksilata (II-1)
[0307] U bocu sa dva grla opremljenu sa termometrom osušenu u pećnici se rastvori GG-7 (1000 mg, 2.390 mmol) u tetrahidrofuranu (22.0 mL, c=0.109 M), ohladi na -78°C, polako se u atmosferi N2dodaje terc-butillitijum (459 mg, 7.17 mmol , 4.22 mL, 1.7 M) uz održavanje unutrašnje temperature na približno -70°C, meša 30 min na -78°C, doda se N,N-dimetil formamid (262 mg, 3.59 mmol) u kapima i meša 1.5 h na -78°C. Reakcija se na -78°C neutrališe sa std. NH4Cl i ekstrahuje 3 puta sa EtOAc. Organski slojevi se kombinuju, isperu sa slanim rastvorom, suše preko Na2SO4, koncentruju i prečiste hromatografijom na koloni sa 15% EtOAc/heptan da se dobije II-1 (300 mg, 34% prinos) kao bezbojno ulje.
LCMS [M+1-Boc] 268.10.<1>H NMR (400 MHz, HLOROFORM-d) δ ppm 1.51 (s, 9 H) 2.91 (t, J=5.38 Hz, 2 H) 3.68 (t, J=5.69 Hz, 2 H) 4.65 (s, 2 H) 5.17 (br. s., 2 H) 7.29 (d, J=9.05 Hz, 2 H) 7.31 - 7.37 (m, 1 H) 7.40 (t, J=7.27 Hz, 2 H) 7.43 - 7.48 (m, 2 H) 9.92 (s, 1 H)
Faza 2: Sinteza terc-butil 8-(benziloksi)-6-(difluorometil)-3,4-dihidroizohinolin-2(1H)-karboksilata (II-2)
[0308] U rastvor II-1 (300 mg, 0.816 mmol) u DCM (16.3 mL, c=0.05 M) se na 0°C doda (dietilamino)sumpor trifluorid (1320 mg, 8.16 mmol, 1070 uL). Reakcija se ukloni iz ledenog kupatila i meša na r.t. u toku noći. Reakcija se razblaži sa DCM i neutrališe sa std. NaHCO3, meša na r.t. sve dok ne prestane razvijanje CO2. Slojevi se razdvoje i vodeni sloj se ekstrahuje
1
sa DCM. Organski sloj se suši preko Na2SO4i koncentruje, prečisti hromatografijom na koloni sa 15% EtOAc/heptan da se dobije II-2 (240 mg, 75% prinos) kao bistro ulje.
LCMS [M+1-Boc] 290.10.<1>H NMR (400 MHz, HLOROFORM-d) δ ppm 1.51 (s, 9 H) 2.86 (t, J=5.26 Hz, 2 H) 3.66 (t, J=5.62 Hz, 2 H) 4.61 (s, 2 H) 5.13 (br. s., 2 H) 6.58 (t, J=57.22 Hz, 1 H) 6.92 (d, J=8.31 Hz, 2 H) 7.31 - 7.48 (m, 5 H)
Faza 3: Sinteza terc-butil 6-(difluorometil)-8-hidroksi-3,4-dihidroizohinolin-2(1H)-karboksilata (TP-14)
[0309] U rastvor II-2 (240 mg, 0616 mmol) u metanolu (10 mL) se doda paladijum na ugljeniku (66 mg, 0.616 mmol). Reaktivni rastvor se degasira i ponovo napuni sa vodonik gasom. Smeša se prenese u balon vodonika i meša na rt u toku noći. Reakcija se filtrira, rastvarači uklone pod vakuumom i materijal prečisti hromatografijom na koloni sa 20% EtOAc/heptan da se dobije TP-14 (175 mg, 95% prinos) kao bela čvrsta supstanca.
LCMS [M+1-tBu] 242.<1>H NMR (400 MHz, HLOROFORM-d) δ ppm 1.52 (s, 9 H) 2.84 (br. s., 2 H) 3.66 (t, J=5.81 Hz, 2 H) 4.56 (br. s., 2 H) 6.53 (t, J=57.22 Hz, 1 H) 6.76 (s, 1 H) 6.84 (br. s., 1 H)
Sinteza terc-butil 6-(1,1-difluoroetil)-8-hidroksi-3,4-dihidroizohinolin-2(1H)-karboksilata (TP-15)
[0310]
Šema JJ
1
Faza 1: Sinteza benzil 4-acetil-2-(benziloksi)benzoata (JJ-1)
[0311] Smeša GG-2 (8544 mg, 21.51 mmol), tributil(1-etoksivinil)kalaja (8160 mg, 22.6 mmol), Pd2(dba)3(394 mg, 0.430 mmol) i 2,2’-bis(difenilfosfino)-1,1’-binaftila (536 mg, 0.860 mmol) u toluenu (108 mL, c=0.2 M) se degasira i zagreva 18 h na 90°C. Toluen se ukloni i sirovi produkt se prenese u sledeću fazu.
[0312] Sirovi produkt se rastvori u THF (108 mL, c=0.20 M), doda se hlorovodonična kiselina (6670 mg, 183 mmol , 45.7 mL, 4.0 M) i meša 2 h na r.t. Organski rastvarač se ukloni; doda se H2O i ekstrahuje 3 puta sa EtOAc. Organski slojevi se kombinuju, isperu sa slanim rastvorom, suše preko Na2SO4, filtriraju i koncentruju, prečiste hromatografijom na silika gelu uz eluiranje sa 15% EtOAc/heptan da se dobije 7180 mg žutog ulja.
LCMS [M+1] 361.10.<1>H NMR (400 MHz, HLOROFORM-d) δ ppm 2.60 (s, 3 H) 5.23 (s, 2 H) 5.37 (s, 2 H) 7.29 - 7.42 (m, 8 H) 7.45 (d, J=6.85 Hz, 2 H) 7.54 (dd, J=8.01, 1.28 Hz, 1 H) 7.62 - 7.65 (m, 1 H) 7.90 (d, J=7.95 Hz, 1 H)
Faza 2: Sinteza benzil 2-(benziloksi)-4-(1,1-difluoroetil)benzoata (JJ-2)
[0313] U JJ-1 (7.380 g, 20.48 mmol) se doda deoksofluor (22.7 g, 102 mmol). Reaktivna smeša se zagreva 4.5 h na 80°C, ohladi na r.t., sipa u std. NaHCO3i nakon prestanka izdvajanja CO2, vodeni sloj se ekstrahuje 3 puta sa EtOAc. Organski sloj se koncentruje pod vakuumom, prečisti hromatografijom na koloni sa 10% EtOAc/heptan da se dobije JJ-2 (5.94 g, 76% prinos) kao bezbojno ulje koje očvrsne pod vakuumom.
<1>H NMR (400 MHz, HLOROFORM-d) δ ppm 1.89 (t, J=18.16 Hz, 3 H) 5.19 (s, 2 H) 5.36 (s, 2 H) 7.12 (d, J=8.07 Hz, 1 H) 7.17 (s, 1 H) 7.29 - 7.42 (m, 8 H) 7.45 (d, J=6.72 Hz, 2 H) 7.89 (d, J=8.07 Hz, 1 H)
Faza 3: Sinteza 2-(benziloksi)-4-(1,1-difluoroetil)benzoeve kiseline (JJ-3)
[0314] Po sličnom postupku kao za fazu 2 u Šemi GG, JJ-2 se hidrolizuje u JJ-3 (4.49 g, 99%) kao bela čvrsta supstanca.
<1>H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ ppm 1.97 (t, J=18.89 Hz, 3 H) 5.26 (s, 2 H) 7.19 (d, J=7.95 Hz, 1 H) 7.29 - 7.36 (m, 2 H) 7.40 (t, J=7.34 Hz, 2 H) 7.51 (d, J=7.21 Hz, 2 H) 7.71 (d, J=7.95
1
Hz, 1 H) 12.89 (br. s., 1 H)
Faza 4-8: Sinteza terc-butil 6-(1,1-difluoroetil)-8-hidroksi-3,4-dihidroizohinolin-2(1H)-karboksilata (TP- 15)
[0315] Po sličnim postupcima kao za fazu 3 u Šemi GG (1.30 g, 70%), fazi 4 u Šemi GG (684 mg, 65%), fazi 5 u Šemi FF, fazi 6 u Šemi GG (575 mg, 77%), fazi 9 u Šemi GG (400 mg, 90%), JJ-3 se konvertuje u TP-15.
LCMS [M+1-Boc] 214.10.<1>H NMR (400 MHz, HLOROFORM-d) δ ppm 1.52 (s, 9 H) 1.87 (t, J=18.10 Hz, 3 H) 2.83 (br. s., 2 H) 3.65 (t, J=5.69 Hz, 2 H) 4.56 (br. s., 2 H) 6.76 (s, 1 H) 6.83 (br. s., 1 H)
Sinteza terc-butil 8-hidroksi-3,4-dihidro-2,6-naftiridin-2(1H)-karboksilata (TP-16)
[0316]
Šema KK
Faza 1-3: Sinteza 8-metoksi-1,2,3,4-tetrahidro-2,6-naftiridina (KK-4)
[0317] Po sličnim postupcima kao u fazi 3 u Šeme GG (939 mg, 57%), fazi 4 u Šemi GG koristeći cezijum pivolat i dihloretan umesto kalijum acetata i acetonitrila (290 mg, 70%) i fazi 5 u Šemi FF (136 mg, 50%), KK-1 se konvertuje u KK-4.
LCMS [M+1] 165.10.<1>H NMR (400 MHz, HLOROFORM-d) δ ppm 2.77 (t, J=5.81 Hz, 2 H) 3.11 (t, J=5.81 Hz, 2 H) 3.90 (s, 3 H) 3.94 (s, 2 H) 8.03 (d, J=2.93 Hz, 2 H)
Faza 4: Sinteza 5,6,7,8-tetrahidro-2,6-naftiridin-4-ola (KK-5)
1
[0318] KK-4 (136.0 mg, 0.828 mmol) u 5 mL 48% HBr i 3 mL glacijalne sirćetne kiseline se zatvori i refluksuje 4 dana na 120°C. Reakcija se ohladi na RT, sirćetna kiselina se eliminiše koncentrovanjem, azeotropiranjem 3 puta iz heptana i neutrališe pažljivim dodavanjem 5 N rastvora NaOH do pH približno 9. Rotoevaporacijom se ukloni najveći deo H2O, doda se MeOH i suši upakovana sa silika gelom. Produkt se prečisti hromatografijom na koloni sa 10% MeOH/DCM uz 0.5% NH4OH da se dobije KK-5 (124 mg, 100%). LCMS [M+1] 151.10.
Faza 5: Sinteza terc-butil 8-hidroksi-3,4-dihidro-2,6-naftiridin-2(1H)-karboksilata (TP-16)
[0319] Po sličnim postupcima kao u fazi 6 u Šemi GG, KK-5 se konvertuje u TP-16 (106 mg, 51%).
LCMS [M-55+1] 228.<1>H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ ppm 10.13 (s, 1H), 6.68 (s, 2H), 4.29 (s, 2H), 3.53 - 3.45 (t, J=5.6 Hz, 2H), 2.74 - 2.64 (t, J=5.5 Hz, 2H), 1.42 (s, 9H)
Sinteza terc-butil 8-hidroksi-5-metil-3,4-dihidro-2,6-naftiridin-2(1H)-karboksilata (TP-17)
[0320]
Šema LL
1 1
Faza 1: Sinteza (5-(benziloksi)-2-metilpiridin-4-il)(etoksi)metanola (LL-2)
[0321] Etil 5-hidroksi-2-metilizonikotinat (LL-1) (sinteza je opisana u WO10100475) (2190 mg, 17.22 mmol), N-benzil bromid (3540 mg, 20.7 mmol) i K2CO3(4810 mg, 34.4 mmol) u 20 mL DMF se zagrevaju na 80°C u toku noći. Kada se reaktivna smeša ohladi na r.t., doda se EtOAc i ispere 3 puta sa H2O. Organski sloj se koncentruje, prečisti hromatografijom na koloni sa 30% EtOAc/heptan da se dobije LL-2 (16 g, 48% prinos) kao braon čvrsta supstanca.
LCMS [M+1] 272.10.<1>H NMR (400 MHz, HLOROFORM-d) δ ppm 1.37 (t, J=7.15 Hz, 3 H) 2.54 (s, 3 H) 4.39 (q, J=7.13 Hz, 2 H) 5.23 (s, 2 H) 7.34 (d, J=7.09 Hz, 1 H) 7.36 - 7.43 (m, 2 H) 7.44 - 7.51 (m, 3 H) 8.35 (s, 1 H)
Faza 2: Sinteza (5-(benziloksi)-2-metilpiridin-4-il)metandiola (LL-3)
[0322] U rastvor LL-2 (2160 mg, 7.961 mmol) u 20 mL MeOH se doda natrijum hidroksid (1590 mg, 39.8 mmol, 7.96 mL, 5.0 M) i reakcija se zagreva 4 h na 50°C. Smeša se ohladi na r.t., MeOH se upari, doda se H2O, neutrališe sa 1 N rastvorom HCl do pH približno 4, žuta čvrsta supstanca izdvoji, filtrira i ispere sa H2O da se dobije LL-3 (1.66 g, 86% prinos).
LCMS [M+1] 244.10.<1>H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ ppm 2.42 (s, 3 H) 5.27 (s, 2 H) 7.33 (d, J=7.21 Hz, 1 H) 7.35 - 7.43 (m, 3 H) 7.44 - 7.52 (m, 2 H) 8.41 (s, 1 H)
Faza 3-7: - Sinteza terc-butil 8-hidroksi-5-metil-3,4-dihidro-2,6-naftiridin-2(1H)-karboksilata (TP-17)
[0323] Po sličnim postupcima kao u fazi 3 u Šemi GG (1.60 g, 68%), fazi 4 u Šemi GG koristeći cezijum pivolat i dihloretan umesto kalijum acetata i acetonitrila (620 mg, 49%), fazi 5 u Šemi FF (366 mg, 64%), fazi 6 u Šemi GG (483 mg, 96%) i fazi 9 u Šemi GG (386 mg, 100%), LL-3 se konvertuje u TP-17.<1>H NMR (400 MHz, HLOROFORM-d) δ ppm 1.51 (s, 9 H) 2.41 (s, 3 H) 2.71 (t, J=5.38 Hz, 2 H) 3.69 (t, J=5.75 Hz, 2 H) 4.59 (s, 2 H) 7.95 (s, 1 H)
Sinteza terc-butil 6-cijano-8-hidroksi-3,4-dihidroizohinolin-2(1H)-karboksilata (TP-18)
1 2
Šema MM
Faza 1: Sinteza terc-butil 8-(benziloksi)-6-cijano-3,4-dihidroizohinolin-2(1H)-karboksilata (MM-1)
[0325] Jedinjenje GG-7 (700 mg, 1.67 mmol) se rastvori u DMF (5.00 mL). U gore dobijeni rastvor se doda Zn(CN)2(236 mg, 2.01 mmol). Reaktivni rastvor se degasira 2 min. U gore dobijenu smešu se doda Pd(PPh3)4(580 mg, 0.502 mmol). Reaktivna smeša se degasira 3 min sa N2. Nakon toga se reaktivna smeša zagreva mikrotalasima 30 min na 150 °C. Reaktivni rastvor iz žute prelazi u crnu boju. Reaktivni rastvor se ohladi i razblaži sa EtOAc/H2O (8 mL/ 8mL), nakon toga se smeša filtrira i filtrat se ekstrahuje. Organski sloj se izdvoji, suši i upari da se dobije sirovi produkt koji se prečisti flash hromatografijom sa smešom petrol etar/EtOAc od 0-25% da se dobije MM-1 (350 mg, 57%) kao bela čvrsta supstanca. LCMS 265 [M-Boc]+;<1>H NMR (400MHz, DMSO-d6) δ ppm 7.52 - 7.32 (m, 6H), 7.29 (s, 1H), 5.22 (br. s., 2H), 4.53 - 4.40 (m, 2H), 3.54 (t, J=5.6 Hz, 2H), 2.79 (t, J=5.5 Hz, 2H), 1.41 (s, 9H)
Faza 2: Sinteza terc-butil 6-cijano-8-hidroksi-3,4-dihidroizohinolin-2(1H)-karboksilata (TP-18)
[0326] Jedinjenje MM-1 (320 mg, 0.878 mmol) se rastvori u MeOH (3 mL). U reaktivni rastvor se doda Pd/C (93 mg, 0.44 mmol), degasira sa tri puta u balonu H2i meša 1 sat u balonu H2na 20 °C. U prethodno dobijenu smešu se doda DCM (5 mL), reaktivna smeša se filtrira i koncentruje da se dobije sirovi produkt koji se prečisti flash hromatografijom sa smešom petrol etar/EtOAc od 0-50% da se dobije TP-18 kao bela čvrsta supstanca (125 mg, 51.9%). LCMS [219-tBu]+;<1>H NMR (400 MHz, CDCl3) δ ppm 7.45 - 7.28 (m, 1H), 7.10 -6.95 (m, 1H), 6.87 (br. s., 1H), 4.57 (br. s., 2H), 3.66 (t, J=5.9 Hz, 2H), 2.82 (br. s., 2H), 1.53 (s, 9H)
1
Primeri 84-98 se izrađuju na sličan način kao Primer 78 u Šemi CC koristeći odgovarajući NBoc-zaštićeni tetrahidroizohinolin u fazi 1.
[0327]
1 4
(nastavlja se)
1 (nastavlja se)
1 n l
1 (nastavlja se)
1 (nastavlja se)
1 (nastavlja se)
Primer 99 (Šema NN) - (1S,2S,3R,5S)-3-(4-amino-5-fluor-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)-5-((1,2,3,4-tetrahidroizohinolin-8-il)oksi)ciklopentan-1,2-diol (NN-5)
[0328]
Šema NN
Faza 1 - Sinteza terc-butil ((1S,4R)-4-(4-hlor-5-fluor-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)ciklopent-2-en-1-il) karbonata (NN-1)
[0329] Bočica A: U suvu bocu okruglog dna (prečisti se sa N2) se dodaju (S,S)-DACH-Naphthyl Trost Ligand (1.13 g, 1.43 mmol) i Pd2(dba)3.CHCl3(493 mg, 0.48 mmol). Bočica
1
se prečisti četiri puta sa N2i doda se DCE (50 mL, prska 30 min sa N2). Crni rastvor se meša 30 min na 12 °C kada se dobija crveno braon rastvor.
[0330] Bočica B: U suvu bocu okruglog dna (prečisti se sa N2) se dodaju BB-1 (7155 mg, 23.82 mmol), 4-hlor-5-fluor-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin (4.5 g, 26.23 mmol) i Cs2CO3(8.54 g, 26.2 mmol). Bočica se prečisti pet puta sa N2i doda se DCE (50 mL), a nakon toga pomoću šprica doda sadržaj iz Bočice A. Reakcija se meša 24 sata na 12 °C u atmosferi N2.
[0331] Reaktivna smeša se filtrira i koncentruje do braon gume. Sirovi ostatak se prečisti flash biotage (120 g, silika gel, EtOAc/petrol etar = 15%) da se dobije NN-1 (6.4 g, 76%) kao beličasta čvrsta supstanca. LCMS [M+1] 354;<1>H NMR (400 MHz, CDCl3) δ ppm 8.62 (s, 1H), 7.08 (d, J=2.5 Hz, 1H), 6.35 - 6.29 (m, 1H), 6.10 - 6.00 (m, 2H), 5.63 - 5.55 (m, 1H), 3.11 (td, J=7.8, 15.4 Hz, 1H), 1.87 (td, J=3.8, 15.0 Hz, 1H), 1.52 (s, 9H)
Faza 2 - Sinteza terc-butil 8-(((1S,4R)-4-(4-hlor-5-fluor-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)ciklopent-2-en-1-il)oksi)-3,4-dihidroizohinolin-2(1H)-karboksilata (NN-2)
[0332] U suvu mikrotalasnu bočicu (prečisti se sa N2) se dodaju NN-1 (200 mg, 0.57 mmol), terc-butil 8-hidroksi-3,4-dihidroizohinolin-2(1H)-karboksilat (141 mg, 0.57 mmol), Cs2CO3(203 mg, 0.622 mmol), Pd2(dba)3.CHCl3(15 mg, 0.014 mmol) i DPPP (14 mg, 0.03 mmol). Nakon toga se bočica tri puta prečisti sa N2i doda se DCE (2.6 mL, prska 30 minuta sa N2). Crna smeša se meša 1 sat na 20 °C. Nakon toga se reaktivna smeša direktno prečisti prep-TLC (petrol etar:EtOAc=4:1) da se dobije NN-2 (260 mg, 95%) kao bela pena.
LCMS [M+23] 507;<1>H NMR (400 MHz, CDCl3) δ ppm 8.63 (s, 1H), 7.16 (d, J=2.0 Hz, 1H), 7.14 - 7.09 (m, 1H), 6.79 (d, J=7.3 Hz, 1H), 6.74 (d, J=7.5 Hz, 1H), 6.46 - 6.40 (m, 1H), 6.15 - 6.06 (m, 2H), 5.37 - 5.31 (m, 1H), 4.74 - 4.42 (m, 2H), 3.75 - 3.54 (m, 2H), 3.19 - 3.10 (m, 1H), 2.87 - 2.79 (m, 2H), 1.97 (d, J=14.6 Hz, 1H), 1.51 (s, 9H)
Faza 2 - Sinteza terc-butil 8-(((1S,2S,3S,4R)-4-(4-hlor-5-fluor-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)-2,3-dihidroksiciklopentil)oksi)-3,4-dihidroizohinolin-2(1H)-karboksilata (NN-3)
[0333] U smešu NN-2 (260 mg, 0.536 mmol) u DCM (9 mL)/H2O (0.3 mL) se na 20 °C dodaju NMO (188 mg, 1.61 mmol) i OsO4(4 % u t-BuOH, 204 mg, 0.0322 mmol). Crna smeša se meša 2 sata na 20 °C. Smeša se razblaži sa DCM (10 mL) i neutrališe sa sat. Na2SO3(5 mL) i razdvoji. Vodeni sloj se ekstrahuje sa DCM (10 mL). Kombinovani organski sloj se
1 1
ispere sa slanim rastvorom (10 mL), suši preko Na2SO4, filtrira, koncentruje i prečisti ISCO (12 g, silika gel, EtOAc:petrol etar=1:1) da se dobije NN-3 (230 mg, 83%) kao bezbojna guma.
LCMS [M+23] 541;<1>H NMR (400 MHz, CDCl3) δ ppm 8.62 (s, 1H), 7.17 (t, J=8.0 Hz, 1H), 7.13 (d, J=2.5 Hz, 1H), 6.86 - 6.79 (m, 2H), 5.21 - 5.05 (m, 1H), 5.02 - 4.75 (m, 2H), 4.67 -4.56 (m, 1H), 4.53 - 4.42 (m, 2H), 4.37 - 4.29 (m, 1H), 3.72 - 3.57 (m, 2H), 3.32 - 2.99 (m, 2H), 2.87 - 2.78 (m, 2H), 2.33 - 2.22 (m, 1H), 1.50 - 1.44 (m, 9H)
Faza 3 - Sinteza terc-butil 8-(((1S,2S,3S,4R)-4-(4-amino-5-fluor-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)-2,3-dihidroksiciklopentil)oksi)-3,4-dihidroizohinolin-2(1H)-karboksilata (NN-4)
[0334] Rastvor NN-3 (105 mg, 0.202 mmol) u NH3.H2O i dioksanu (2.8 mL /2.8 mL) se zatvori u čeličnoj epruveti na 90 °C i ostavi 15 sati. Reakcija se koncentruje da se dobije NN-4 (101 mg, >99%) kao žuta guma i koristi direktno u sledećoj fazi. LCMS [M+23] 522
Faza 4 - Sinteza (1S,2S,3R,5S)-3-(4-amino-5-fluor-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)-5-((1,2,3,4-tetrahidroizohinolin-8-il)oksi)ciklopentan-1,2-diola (NN-5)
[0335] U svetlo žuti rastvor NN-4 (101 mg, 0.202 mmol) u DCM (5 mL) se u kapima na 0 °C doda TFA (1 mL). Žuta rastvorena smeša se meša 2 sata na 20 °C. Smeša se koncentruje, u ostatak se doda MeOH (4 mL) i zaalkališe sa čvrstim K2CO3do pH 7-8. Smeša se filtrira i koncentruje, prečisti prep-HPLC da se dobije NN-5 (35 mg, 39%) kao svetlo žuta čvrsta supstanca.
LCMS [M+1] 400;<1>H NMR (400 MHz,<MeOD) δ>ppm 8.09 (s, 1H), 7.35 - 7.23 (m, 1H), 7.15 -7.06 (m, 1H), 7.03 - 6.96 (m, 1H), 6.94 - 6.83 (m, 1H), 5.16 - 5.07 (m, 1H), 4.75 - 4.68 (m, 1H), 4.63 - 4.55 (m, 1H), 4.37 (s, 2H), 4.22 - 4.16 (m, 1H), 3.54 - 3.44 (m, 2H), 3.17 - 3.08 (m, 2H), 3.04 - 2.92 (m, 1H), 2.16 - 2.02 (m, 1H)
Primeri 100-111 se izrađuju na sličan način kao Primer 99 u Šemi NN koristeći odgovarajući NBoc-zaštićeni tetrahidroizohinolin u fazi 2.
[0336]
1 2
1 (nastavlja se)
14 (nastavlja se)
1 (nastavlja se)
1 (nastavlja se)
1 (nastavlja se)
1 (nastavlja se)
Primer 114 (Šema OO) - (1S,2S,3R,5S)-3-(4-amino-5-fluor-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)-5-((2-metil- 1,2,3,4-tetrahidroizohinolin-8-il)oksi)ciklopentan-1,2-diol (OO-1) (referenca)
[0337]
Šema OO
Faza 1 - Sinteza (1S,2S,3R,5S)-3-(4-amino-5-fluor-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)-5-((2-metil-1,2,3,4-tetrahidroizohinolin-8-il)oksi)ciklopentan-1,2-diola (OO-1)
[0338] Smeša NN-5 (100 mg, 0.25 mmol), 37% CH2O (31 mg, 0.38 mmol) i NaBH(OAc)3
1
(212 mg, 1.0 mmol) u THF (6 mL) se meša 2 h na 20 °C. Smeša se filtrira i prenese u prep-HPLC da se dobije OO-1 (65 mg, 53%) kao svetlo žuta čvrsta supstanca. LCMS 414 [M+1];<1>H NMR (400 MHz, MeOD-d4) δ ppm 8.10 (s, 1H), 7.34 - 7.27 (m, 1H), 7.16 - 7.10 (m, 1H), 7.03 - 6.97 (m, 1H), 6.94 - 6.88 (m, 1H), 5.18 - 5.09 (m, 1H), 4.75 - 4.68 (m, 1H), 4.59 - 4.53 (m, 1H), 4.42 - 4.34 (m, 2H), 4.21 - 4.16 (m, 1H), 3.55 - 3.46 (m, 2H), 3.23 - 3.16 (m, 2H), 3.08 (s, 3H), 3.04 - 2.92 (m, 1H), 2.16 - 2.03 (m, 1H)
Primeri 115 & 116 su izrađeni koristeći slične postupke kao u Šemi OO iz Primeri 110 & 111 tim redom.
[0339]
1
(nastavlja se)
Sinteza 5-fluor-2-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidina (HG-3)
[0340]
Šema PP
Faza 1 - Sinteza 2-hlor-5-fluor-7H-pirolo[2,3-d]pirimidina (PP-2)
[0341] U rastvor 2-hlor-7H-pirolo[2,3-d] pirimidina (PP-1) (8.5 g, 55 mmol) i selektfluora (29.4 g, 83.0 mmol) u CH3CN (500 mL) se u atmosferi N2doda AcOH (100 mL). Smeša se meša 16 sati na 70 °C. Boja reakcije iz žute prelazi u narandžastu. Reakcija se koncentruje i azeotropira sa toluenom (30 mL x 3). Nakon toga se čvrsta supstanca razblaži sa smešom CH2Cl2/EtOAc (1/1, 200 mL), meša 16 h na sobnoj temperaturi (25°C) i filtrira. Filtrat se
1 1
koncentruje i ispere sa DCM da se dobije sirovi materijal kao braon čvrsta supstanca. MBTE se doda i meša u toku noći i filtrira da se dobije PP-2 (1.5 g, 15%) kao žuta čvrsta supstanca. LCMS 172 [M+1];<1>H NMR (400 MHz, MeOD-d4) δ ppm 8.89 (d, J=0.8 Hz, 1H), 7.31 (d, J=2.5 Hz, 1H)
Faza 2 - Sinteza 5-fluor-2-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidina (HG-3)
[0342] Pd(PPh3)4(835 mg, 0.723 mmol) se na 10 °C doda u rastvor PP-2 (2.48 g , 14.46 mmol) u bezvodnom THF (36 mL). Suspenzija se degasira sa N2. U prethodno dobijenu smešu se na -10 °C polako dodaje rastvor Me3Al (2M, 14.5 mL, 28.9 mmol). Nakon dodavanja, smeša se zagreva 16 sati na 70 °C. Reaktivna smeša se pažljivo doda u vodu sa ledom. Smeša se razblaži sa EtOAc i filtrira kroz celite. Filtrat se podeli između EtOAc i H2O. Organski sloj se izdvoji i ispere sa slanim rastvorom, suši preko Na2SO4i koncentruje da se dobije sirovi produkt koji se prečisti flash kolonom (MeOH: DCM = 1%~7.5%) da se dobije produkt HG-3 (1.2 g, 55%) kao žuta čvrsta supstanca. LCMS 152 [M+1];<1>H NMR (400 MHz, MeOD-d4) δ ppm 11.76 (br. s., 1H), 8.96 (s, 1H), 7.44 (t, J=2.5 Hz, 1H), 2.63 (s, 3H)
Sinteza 5-fluor-4-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidina (HG-4)
[0343]
Šema QQ
[0344] U Pd(PPh3)4(2 g, 1.75 mmol) se doda rastvor HG-2 (7.5 g, 43.7 mmol) u bezvodnom THF (75 mL). Suspenzija se degasira sa N2. U prethodno dobijenu smešu u vodi sa ledom se doda rastvor AlMe3(43.7 mL, 87.5 mmol, 2M). Nakon dodavanja, žuti rastvor se zagreva 16h na 80 °C. Reaktivna smeša se neutrališe sa ledom i vodenim rastvorom Rochelle soli. Smeša se podeli između EtOAc i H2O. Smeša se filtrira i filter pogača se ispere sa EtOAc (100 mL x 3). Organski sloj se odvoji i suši preko Na2SO4i koncentruje a nakon toga prečisti preko flash
1 2
kolone (MeOH:DCM = 1%~4%) da se dobije produkt. Produkt se triturira u DCM i filtrira. Filter pogača se ispere sa TBME i sakupi da se dobije produkt HG-4 (2.00 g, 30%) kao žuta čvrsta supstanca. Filtrat se koncentruje i prečisti preko flash kolone (MeOH: DCM = 1%~5%) da se dobije produkt. LCMS 152 [M+1];<1>H NMR (400 MHz, MeOD-d4) δ ppm 11.89 (br. s., 1H), 8.62 (s, 1H), 7.48 (t, J=2.5 Hz, 1H), 2.70 (s, 3H)
Sinteza 4-hlor-5-fluor-2-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidina (HG-5)
[0345]
Šema RR
Faza 1 - Sinteza 4-hlor-2-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidina (RR-2)
[0346] Smeša 2-metil-3,7-dihidro-4H-pirolo[2,3-d]pirimidin-4-ona (RR-1) (2.7 g, 18.1 mmol) u POCl3(35 mL) se zagreva 4 sata pod refluksom. Smeša se ohladi na 20 °C i koncentruje. U ostatak se doda voda sa ledom (20 mL) i zaalkališe sa čvrstim Na2CO3do pH~8. Smeša se ekstrahuje sa EtOAc (60 mL X 2). Kombinovani organski slojevi se isperu sa slanim rastvorom (100 mL), suše preko Na2SO4, filtriraju i koncentruju da se dobije RR-2 (2.4 g, 78%) kao beličasta čvrsta supstanca. LCMS 168 [M+1];<1>H NMR (400 MHz, CDCl3) δ ppm 10.70 - 10.41 (m, 1H), 7.36 - 7.29 (m, 1H), 6.67 - 6.56 (m, 1H), 2.81 (s, 3H)
Faza 2 - Sinteza 4-hlor-5-fluor-2-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidina (HG-5)
[0347] Smeša RR-2 (2.35 g, 14 mmol) i Selectfluora (7.45 g, 21 mmol) u CH3CN (110 mL) i AcOH (22 mL) se meša 16 sati na 70 °C u atmosferi N2za koje vreme reakcija prelazi iz ružičaste u braon boju. Smeša se koncentruje i azeotropira sa toluenom (50 ml x 2). Filtrat se koncentruje i prečisti prep-HPLC da se dobije HG-5 (600 mg, 23%) kao žuta čvrsta
1
supstanca. LCMS 186 [M+1];<1>H NMR (400 MHz, MeOD-d4) δ ppm 12.27 - 12.18 (m, 1H), 7.62 - 7.56 (m, 1H), 2.61 (s, 3H)
Primeri 117-119 se izrađuju na sličan način kao CC-3 (Primer 78) koristeći odgovarajući pirolopirimidin u fazi 1 Šeme BB i odgovarajući N-Boc zaštićeni tetrahidroizohinolin u fazi 1 Šeme CC.
[0348]
1 4
(nastavlja se)
Primer 120 se izrađuje na sličan način kao za NN-5 (Primer 99) koristeći odgovarajući pirolopirimidin u fazi 1 Šeme BB i odgovarajući N-Boc zaštićeni tetrahidroizohinolin u fazi 1 Šeme NN.
1
Primer 121 (Šema SS) - (1S,2S,3R,5S)-3-(4-amino-5-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)-5-((5-fluor-1,2,3,4-tetrahidroizohinolin-8-il)oksi)ciklopentan-1,2-diol (SS-5)
[0350]
Šema SS
Faza 1: Sinteza terc-butil 8-(((1S,4R)-4-((terc-butoksikarbonil)oksi)ciklopent-2-en-1-il)oksi)-5-fluor-3,4-di-hidroizohinolin-2(1H)-karboksilata (SS-1)
1
[0351] Bočica A: U reaktivnu bočicu osušenu u pećnici, opremljenu magnetnom mešalicom i ohlađenu u struji argona, se dodaju Tris(benzilidenaceton)dipaladijum(0)hloroform adukt (62 mg, 0.060 mmol) i MFCD02684551 (R,R)-DACH-Naphthyl Trost Ligand (142 mg, 0.180 mmol). Bočica se prečisti pod vakuumom sa argonom pod dinamičkim vakuumom i doda se DCE (5.0 mL), koji je 30 minuta prskan sa argonom. Rastvor se meša 30 minuta na rt nakon čega se dobija sjajni narandžasti rastvor ligatiranog katalizatora. U ovoj fazi je pripremljena Bočica B.
[0352] Bočica B: U reaktivnu bočicu osušenu u pećnici, opremljenu magnetnom mešalicom i ohlađenu u struji argona, se dodaju TP-2 (800 mg, 2.99 mmol) i di-terc-butil-((1R,3S)-ciklopent-4-en-1,3-diil)-bis(karbonat) (BB-1) (izrađen kako je zabeleženo u J. Am. Chem. Soc. 2006, 128, 6054-6055) (1.08 g, 3.59 mmol). Bočica se prečisti pod vakuumom sa argonom pod dinamičkim vakuumom i doda se DCE (5.0 mL), koji je 30 minuta prskan sa argonom, a nakon toga se doda sadržaj Bočice A pomoću hermetički zatvorenog šprica.
Reakcija se meša 12 sati u atmosferi argona na rt. Reakcija se koncentruje pod vakuumom i prečisti flash hromatografijom na koloni (24g SiO2, Isco, 100% Hept. do 100% EtOAc, 20 mL frakcije) da se dobije SS-1 (1.33 g, >95%) kao bledo žuta čvrsta supstanca. LCMS [M+H-Boc-izobutilen] = 294 zabeleženo;<1>H NMR (400MHz, HLOROFORM-d) δ ppm 6.84 (t, J=8.8 Hz, 1H), 6.65 (dd, J=4.3, 8.9 Hz, 1H), 6.20 (td, J=1.5, 5.7 Hz, 1H), 6.17 - 6.11 (m, 1H), 5.46 (t, J=5.9 Hz, 1H), 5.09 (t, J=5.6 Hz, 1H), 4.57 - 4.40 (m, 2H), 3.72 - 3.54 (m, 2H), 3.02 (td, J=7.4, 14.5 Hz, 1H), 2.77 (t, J=5.7 Hz, 2H), 1.94 (td, J=4.5, 14.4 Hz, 1H), 1.50 (d, J=1.6 Hz, 18H).
Faza 2: Sinteza terc-butil 8-(((1S,4R)-4-(4-hlor-5-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)ciklopent-2-en-1-il)oksi)-5-fluor-3,4-dihidroizohinolin-2(1H)-karboksilata (SS-2)
[0353] U scintilacionu bočicu, opremljenu magnetnom mešalicom, se dodaju HG-6 (113 mg, 0.674 mmol), SS-1 (303 mg, 0.674 mmol), difenilfosfinopropan (dppp) (13.9 mg, 0.034 mmol), tris(dibenzilidenaceton)dipaladijum(0)hloroform adukt (14 mg, 0.014 mmol) i cezijum karbonat (242 mg, 0.741 mmol). Bočica se prečisti sa argonom pod dinamičkim vakuumom a nakon toga se doda DCE (2.25 mL) koji je 30 minuta prskan sa argonom.
Reakcija se meša 1.5 sat na rt u atmosferi argona. Reakcija se prenese u levak za razdvajanje sa DCM i razblaži sa vodom. Faze se razdvoje i vodena faza se ekstrahuje sa 2 porcije DCM. Kombinovane organske faze se suše (MgSO4), filtriraju i koncentruju pod vakuumom. Sirovi
1
ostatak se prečisti flash hromatografijom na koloni (12g SiO2, Isco, 100% Hept. do 100% EtOAc, 9 mL frakcije) da se dobije SS-2 (287.6 mg, 86%) kao bezbojna guma. LCMS [M+H] = 499 zabeleženo;<1>H NMR (400MHz, HLOROFORM-d) δ ppm 8.57 (s, 1H), 7.14 (s, 1H), 6.86 (t, J=8.8 Hz, 1H), 6.68 (dd, J=3.7, 8.4 Hz, 1H), 6.37 (d, J=5.4 Hz, 1H), 6.11 (d, J=4.4 Hz, 1H), 6.06 - 5.96 (m, 1H), 5.33 - 5.25 (m, 1H), 4.69 - 4.41 (m, 2H), 3.75 - 3.55 (m, 2H), 3.22 -3.03 (m, 1H), 2.79 (t, J=5.4 Hz, 2H), 2.49 (s, 3H), 1.95 (td, J=3.6, 14.8 Hz, 1H), 1.51 (s, 9H).
Faza 3: Sinteza terc-butil 8-(((1S,2S,3S,4R)-4-(4-hlor-5-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)-2,3-dihidroksiciklopentil)oksi)-5-fluor-3,4-dihidroizohinolin-2(1H)-karboksilata (SS-3)
[0354] U scintilacionu bočicu, opremljenu magnetnom mešalicom, koja sadrži SS-2 (278 mg, 0.557 mmol), se doda DCM (2.79 mL). U rastvor se doda 4-metilmorfolin-N-oksid (NMO) (0.13 mL, 0.613 mmol) kao 50 mt% rastvor u vodi a nakon toga se u kapima dodaje osmijum tetraoksid (100 µL, 0.022 mmol) kao 4 mt% rastvor u vodi. Reakcija se meša 4 sata na rt. Reakcija se prenese u levak za razdvajanje sa DCM, razblaži sa vodom i dalje razblaži sa 1M rastvorom NaHSO3. Faze se razdvoje i vodena faza se ekstrahuje sa 3 porcije DCM.
Kombinovani organski ekstrakti se suše (MgSO4), filtriraju i koncentruju pod vakuumom. Sirovi ostatak se prečisti flash hromatografijom na koloni (12g SiO2, Isco, 100% Hept. do 100% EtOAc, 9 mL frakcije) da se dobije SS-3 (169 mg, 57%) kao bela čvrsta supstanca. LCMS [M+H] = 533 zabeleženo;<1>H NMR (400MHz, HLOROFORM-d) δ ppm 8.49 (s, 1H), 7.09 (br. s., 1H), 6.89 (t, J=8.8 Hz, 1H), 6.81 (dd, J=4.2, 8.8 Hz, 1H), 5.03 (q, J=8.9 Hz, 1H), 4.73 (t, J=5.2 Hz, 1H), 4.55 (dd, J=5.2, 8.1 Hz, 1H), 4.53 - 4.40 (m, 2H), 4.30 (d, J=4.5 Hz, 1H), 3.73 - 3.54 (m, 2H), 3.13 - 2.97 (m, 1H), 2.79 (t, J=5.7 Hz, 2H), 2.49 (s, 3H), 2.31 (ddd, J=4.6, 9.4, 14.1 Hz, 1H), 1.48 (br. s., 9H).
Faza 4: Sinteza terc-butil 8-(((1S,2S,3S,4R)-4-(4-amino-5-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)-2,3-dihidroksiciklopentil)oksi)-5-fluor-3,4-dihidroizohinolin-2(1H)-karboksilata (SS-4)
[0355] U reaktivnu bočicu, opremljenu magnetnom mešalicom, se doda SS-3 (159 mg, 0.298 mmol) kao rastvor u dioksanu (0.8 mL) i amonijum hidroksidu (0.8 mL, 5.00 mmol). Reakcija se stavi u mikrotalasni reaktor i zagreva 6 sati na 120°C. Rastvor se prenese u levak za
1
razdvajanje sa DCM i razblaži sa vodom. Faze se razdvoje i vodena faza se ekstrahuje sa 3 porcije smeše 3:1 DCM:IPA. Kombinovani organski ekstrakti se suše (MgSO4), filtriraju i koncentruju pod vakuumom. Sirovi ostatak se prečisti flash hromatografijom na koloni (12g SiO2, Isco, 100% Hept. do 10% MeOH/EtOAc, 9 mL frakcije) da se dobije SS-4 (98.4 mg, 64%) kao bela čvrsta supstanca. LCMS [M+H] = 514 zabeleženo; [α]<22>D = -70.0° (C=0.1, MeOH);<1>H NMR (400MHz, HLOROFORM-d) δ ppm 8.13 (s, 1H), 6.98 - 6.81 (m, 2H), 6.76 (br. s., 1H), 5.32 (br. s., 2H), 4.93 - 4.80 (m, 1H), 4.73 (t, J=5.3 Hz, 1H), 4.54 (br. s., 1H), 4.44 (d, J=16.8 Hz, 2H), 4.25 (br. s., 1H), 3.75 - 3.51 (m, 2H), 3.11 - 2.92 (m, 1H), 2.79 (t, J=5.5 Hz, 2H), 2.43 (s, 3H), 2.38 - 2.25 (m, 1H), 1.48 (br. s., 9H).
Faza 5: Sinteza (1S,2S,3R,5S)-3-(4-amino-5-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)-5-((5-fluor-1,2,3,4-tetrahidroizohinolin-8-il)oksi)ciklopentan-1,2-diola (SS-5)
[0356] U scintilacionu bočicu, opremljenu magnetnom mešalicom i koja sadrži SS-4 (79.4 mg, 0.155 mmol), se doda dioksan (0.4 mL). U rastvor se doda hlorovodonična kiselina (0.4 mL) kao 4M rastvor u dioksanu i reakcija se meša 17 sati na rt. Reakcija se neutrališe sa upola zasićenim vodenim rastvorom NaHCO3i prenese u levak za razdvajanje sa DCM. Faze se razdvoje i vodena faza se ekstrahuje sa 3 porcije smeše 3:1 DCM/IPA. Kombinovani organski ekstrakti se suše (MgSO4), filtriraju i koncentruju pod vakuumom. Izdvojeni materijal se rastvori u minimalnoj količini metanola i razblaži sa vodom. Uzorak se zamrzne i liofilizira u toku noći da se dobije SS-5 (51.3 mg, 80%) kao bela čvrsta supstanca. LCMS [M+H] 414 zabeleženo;<1>H NMR (400MHz, METANOL-d4) δ ppm 8.03 (s, 1H), 6.98 (d, J=1.0 Hz, 1H), 6.93 - 6.81 (m, 2H), 5.07 (q, J=8.7 Hz, 1H), 4.62 (ddd, J=1.8, 4.0, 7.0 Hz, 1H), 4.51 (dd, J=5.0, 8.5 Hz, 1H), 4.17 - 4.11 (m, 1H), 3.98 (s, 2H), 3.10 (t, J=6.0 Hz, 2H), 2.93 (ddd, J=7.3, 9.3, 14.5 Hz, 1H), 2.77 (t, J=5.9 Hz, 2H), 2.43 (d, J=1.1 Hz, 3H), 1.99 (ddd, J=4.0, 8.4, 13.8 Hz, 1H); 19F NMR (376MHz, METANOL-d4) δ = -131.36 (s, 1F).
Primeri 122-129 se izrađuju na sličan način kao SS-5 (Primer 121) koristeći odgovarajući N-Boc zaštićeni tetrahidroizohinolin u fazi 1 S i odgovarajući pirolopirimidin u fazi 2 Šeme SS.
[0357]
1
1 (nastavlja se)
11 (nastavlja se)
12 (nastavlja se)
Primeri 130 - 132 se izrađuju koristeći hemiju opisanu u Šemi SS pomoću odgovarajućeg tetrahidroizohinolina za fazu 1 i pirolopirimidina za fazu 2. U modifikovanoj faze 5, trifluorosirćetna kiselina (TFA) se koristi za deprotekciju.
Primer 130 (Šema TT) - (1S,2S,3R,5S)-3-(4-amino-5-hlor-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)-5-((6-hlor-1,2,3,4-tetrahidroizohinolin-8-il)oksi)ciklopentan-1,2-diol (TT-2)
1
Šema TT
[0359] U ohlađeni rastvor TT-1 (50.0 mg, 0.091 mmol) u DCM (2.0 mL) se doda TFA (0.50 mL). Žuti rastvor se meša 1 sat na 15°C. Reakcija se koncentruje pod vakuumom da se dobije sirovi produkt a pH rastvora se podesi na 7-8 koristeći zasićeni NaHCO3aq. (2 mL). Nakon toga se u reaktivni rastvor doda FA (1%) aq. (2 mL). Smeša se prečisti prep-HPLC i tražene frakcije se kombinuju i liofiliziraju da se dobije TT-2 (35.0 mg, 86%) kao bela čvrsta supstanca.
1 4
(nastavlja se)
1 Primeri 133 & 134 se izrađuju koristeći hemiju opisanu u Šemi SS uz odgovarajući tetrahidroizohinolin za fazu 1 i pirolopirimidin za fazu 2. U modifikaciji opšte procedure za fazu 4, kao katalizator se koristi HOBt kako je opisano u Šemi UU
Sinteza terc-butil 8-(((1S,2S,3S,4R)-4-(4-amino-5-hlor-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)-2,3-dihidroksiciklopentil)oksi)-5-fluor-3,4-dihidroizohinolin-2(1H)-karboksilata (UU-2)
[0360]
Šema UU
[0361] U reaktivnu bočicu, opremljenu magnetnom mešalicom, se doda UU-1 (147 mg, 0.266) kao rastvor u DMA (2.5 mL) a nakon toga se doda HOBt.hidrat (8.13 mg, 0.053 mmol). U rastvor se doda amonijum hidroksid (1.0 mL, 7.96 mmol). Bočica se zatvori sa teflonskim zatvaračem i stavi u blok za zagrevanje. Reakcija se zagreva 19 sati na 100°C. Rastvor se prenese u levak za razdvajanje sa DCM i razblaži sa vodom. Faze se razdvoje i vodena faza se ekstrahuje sa 3 porcije DCM. Kombinovani organski ekstrakti se suše (MgSO4), filtriraju i koncentruju pod vakuumom. Sirovi ostatak se prečisti flash hromatografijom na koloni (4g SiO2, Isco, 100% Hept. do 10% MeOH/EtOAc, 9 mL frakcije). Frakcije koje sadrže produkt se sakupe i koncentruju pod vakuumom. Materijal se liofilizira da se dobije produkt sadrži malo nečistoća, kao beličasta čvrsta supstanca (140.7 mg, 99%). Materijal se koristi u fazi 5, koristeći TFA/DCM za deprotekciju, kako je opisano u Šemi TT, bez daljeg prečišćavanja.
1
Primer 135 (Šema VV) - (1S,2S,3S,5R)-3-(4-fluor-2-(hidroksimetil)fenoksi)-5-(4-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)ciklopentan-1,2-diol (2) (referenca)
1
Šema VV
[0363] Jedinjenje VV-1 se izrađuje koristeći postupke iz faza 2 i 3 Šeme BB počevši od BB-2 i koristeći komercijalno raspoloživ metil 5-fluor-2-hidroksibenzoat. U rastvor VV-1 (90 mg, 0.22 mmol) u bezvodnom THF (5 mL) se na 0 °C doda LiAlH4(30 mg, 0.79 mmol) u toku 2 sata. U reaktivnu smešu se doda H2O (30 mL) i smeša se ekstrahuje sa EtOAc (30 mLx4). Organski sloj se ispere sa slanim rastvorom, suši preko Na2SO4i koncentruje pod vakuumom do ostatka koji se prečisti prep-TLC da se dobije VV-2 (60 mg, 72%) kao bela čvrsta supstanca. LCMS 374 [M+1];<1>H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ ppm 8.62 (s, 1H), 7.65 (d, J=3.8 Hz, 1H), 7.18 (d, J=9.0 Hz, 1H), 7.04 - 6.99 (m, 2H), 6.72 (d, J=3.5 Hz, 1H), 5.32 (d, J=3.8 Hz, 1H), 5.23 (t, J=5.6 Hz, 1H), 5.16 - 5.07 (m, 2H), 4.58 (d, J=5.8 Hz, 2H), 4.56 - 4.50 (m, 2H), 3.99 (br. s., 1H), 2.88 - 2.78 (m, 1H), 2.64 (s, 3H), 1.97 - 1.87 (m, 1H)
Primer 136 (Šema WW) - (1S,2S,3S,5R)-3-(4-fluor-2-hidroksifenoksi)-5-(4-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)ciklopentan-1,2-diol (WW-6) (referenca)
[0364]
Šema WW
Faza 1 - Sinteza 1-(2-(((3aR,4S,6R,6aS)-2,2-dimetil-6-(4-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)tetrahidro-4H-ciklopenta[d][1,3]dioksol-4-il)oksi)-5-fluorofenil)etan-1-ona (WW-2)
1
[0365] Jedinjenje WW-1 se izrađuje koristeći postupke iz faza 2 i 3 Šeme BB počevši od BB-2 i koristeći komercijalno raspoloživ 1-(5-fluor-2-hidroksifenil)etan-1-on. U izmešanu belu suspenziju rastvora WW-1 (1.06 g, 2.75 mmol) u acetonu (6 mL) se na r.t (25 °C) dodaju 2,2-dimetoksipropan (16 mL) i p-toluensulfonska kiselina (523 mg, 2.75 mmol). Reakcija se meša 15 h na 25 °C. U reaktivnu smešu se dodaje vodeni rastvor NaHCO3sve dok pH ne dostigne 8.0. Nakon toga se smeša ekstrahuje sa EtOAc (15 mL x 5). Organski slojevi se razdvoje, suše i upare da se dobije sirovi produkt koji se prečisti hromatografijom, uz eluiranje sa Me-OH/DCM 0-5% da se dobije WW-2 (1.06 g, 91%) kao bela čvrsta supstanca. Materijal se koristi direktno u sledećoj fazi.
Faza 2 - Sinteza 7-((3aS,4R,6S,6aR)-6-(2-acetil-4-fluorofenoksi)-2,2-dimetiltetrahidro-4H-ciklopenta[d][1,3]dioksol-4-il)-4-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin 3-oksida (WW-3)
[0366] Jedinjenje WW-2 (1.03 g, 2.42 mmol) se rastvori u DCM (15 mL). U prethodno dobijenu smešu se nakon toga doda m-CPBA (1.97 g, 9.68 mmol). Reaktivna smeša se zagreva 16 sati na 40 °C. Smeša se ohladi na 25 °C. Nakon toga se smeša razblaži sa DCM (15 mL) i zatim se doda zasićeni natrijum tiosulfat (15 mL) i organski sloj se odvoji. Organski sloj se ispere sa zasićenim rastvorom NaHCO3(20 mL), suši preko Na2SO4, filtrira i prečisti flash hromatografijom uz eluiranje sa od 0-10% MeOH/DCM da se dobije WW-3 (600 mg, 56%) kao žuto ulje i koristi direktno u sledećoj fazi.
Faza 3 - Sinteza 7-((1R,2S,3S,4S)-4-(2-acetoksi-4-fluorofenoksi)-2,3-dihidroksiciklopentil)-4-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin 3-oksida (WW-4)
[0367] Trifluoroacetatni anhidrid (3.56 g, 16.9 mmol) se ohladi na -10 °C u toku približno 10-20 min i u kapima se dodaje 30% H2O2(457 mg, 3.13 mL) i meša 10 min (održavajući temperaturu između 0 i -10 °C). U ovu smešu se u kapima dodaje jedinjenje WW-3 (570 mg, 1.29 mmol) u DCM (5 mL) i meša 10-30 min na 25 °C. U prethodno dobijenu smešu se doda smeša zasićenog Na2S2O3/NaHCO3aq (15 mL) i meša 10 min na 25 °C. Reaktivni rastvor se ekstrahuje sa DCM (10 mL x 2), suši i upari da se dobije sirovo WW-4 (540 mg, >99%) kao žuto ulje. LCMS 418 [M+1]
1
Faza 4 - Sinteza 2-(((1S,2S,3S,4R)-2,3-dihidroksi-4-(4-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)ciklopentil)oksi)-5-fluorofenil acetata (WW-5)
[0368] Jedinjenje WW-4 (540 mg, 1.22 mmol) se rastvori u DMF (1 mL). U prethodno dobijenu smešu se nakon toga doda hipodiborna kiselina (658 mg, 7.34 mmol) i meša 30 min na 25 °C. Reaktivni rastvor WW-5 se koristi direktno za sledeću fazu bez daljeg prečišćavanja. LCMS 402 [M+1]
Faza 5 - Sinteza (1S,2S,3S,5R)-3-(4-fluor-2-hidroksifenoksi)-5-(4-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)ciklopentan-1,2-diola (WW-6)
[0369] U prethodno dobijenu smešu se u rastvor jedinjenja WW-5 (490 mg, 1.11 mmol) u DMF se doda MeOH (2 mL). U dobijenu smešu se doda K2CO3(2.30 g, 16.6 mmol).
Reaktivna smeša se meša 2 sata na 25 °C. Rastvarač se upari i sirovi produkt se prečisti prep-HPLC da se dobije WW-6 (62 mg, 16%) kao bela čvrsta supstanca. LCMS 360 [M+1];<1>H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ ppm 9.53 (s, 1H), 8.63 (s, 1H), 7.75 (d, J=3.5 Hz, 1H), 7.01 (dd, J=5.9, 8.9 Hz, 1H), 6.75 (d, J=3.8 Hz, 1H), 6.68 (d, J=3.0 Hz, 1H), 6.66 (d, J=3.0 Hz, 1H), 6.56 (dt, J=3.0, 8.7 Hz, 1H), 5.26 (d, J=3.0 Hz, 1H), 5.16 (q, J=8.9 Hz, 1H), 5.07 (d, J=6.8 Hz, 1H), 4.54 (br. s., 2H), 4.00 (br. s., 1H), 2.83 - 2.74 (m, 1H), 2.65 (s, 3H), 1.97 - 1.90 (m, 1H)
Primer 137 (Šema XX) - (1S,2S,3S,5R)-3-(2-((R)-1-aminoetil)-4-fluorofenoksi)-5-(4-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)ciklopentan-1,2-diol (XX-3) (referenca)
Primer 138 (Šema XX) - (1S,2S,3S,5R)-3-(2-((S)-1-aminoetil)-4-fluorofenoksi)-5-(4-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)ciklopentan-1,2-diol (XX-4) (referenca)
2
Šema XX
Faza 1 - Sinteza 1-(2-(((3aR,4S,6R,6aS)-2,2-dimetil-6-(4-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)tetrahidro-4H-ciklopenta[d][1,3]dioksol-4-il)oksi)-5-fluorofenil)etan-1-amina (XX-1)
[0371] Jedinjenje WW-2 (100 mg, 0.235 mmol) se rastvori u MeOH (1 mL). Nakon toga se u prethodno dobijenu smešu doda NH4OAc (181 mg, 2.35 mmol) i meša 1 sat na 25 °C. Nakon toga se doda NaBH3CN (89 mg, 1.41 mmol) i zagreva 16 sati na 80 °C. Smeša se ohladi na 25 °C, zatim se doda 1 mL zasićenog NaHCO3i meša 10 min na 25 °C. Reaktivna smeša se ekstrahuje sa DCM (5 mL x 3), razdvoji, suši i upari da se dobije sirovi materijal koji se prečisti prep-TLC (MeOH/DCM 0-10%) da se dobije XX-1 (35 mg, 35%) kao bezbojno ulje i koristi direktno u sledećoj fazi.
Faza 2 - Sinteza (1S,2S,3S,5R)-3-(2-(1-aminoetil)-4-fluorofenoksi)-5-(4-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)ciklopentan-1,2-diola (XX-2)
[0372] U jedinjenje XX-1 (100 mg, 0.234 mmol) u H2O (0.5 mL) se na 0 °C doda TFA (0.5 mL). Smeša se meša 60 min na 0 °C. pH reaktivnog rastvora se podesi na pH=9 dodavanjem zasićenog K2CO3aq. Konačni rastvor se razdvoji prep-HPLC, da se dobije 90 mg XX-2 (90 mg, 99%) kao bela čvrsta supstanca.
Faza 3- Razdvajanje (1S,2S,3S,5R)-3-(2-((R)-1-aminoetil)-4-fluorofenoksi)-5-(4-metil-7H-pirolo[2,3-d]piridin-7-il)ciklopentan-1,2-diola (XX-3) i (1S,2S,3S,5R)-3-(2-((S)-1-aminoetil)-4-fluorofenoksi)-5-(4-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)ciklopentan-1,2-diola (XX-4)
2 1
[0373] Razdvajanje jedinjenje XX-2 asimetričnom SFC
XX-3: LCMS 370 [M-NH2];<1>H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ ppm 8.61 (s, 1H), 7.61 (d, J=3.7 Hz, 1H), 7.29 (dd, J=3.0, 10.0 Hz, 1H), 7.03 - 6.90 (m, 2H), 6.72 (d, J=3.7 Hz, 1H), 5.34 (br. s., 1H), 5.18 - 5.01 (m, 2H), 4.61 - 4.49 (m, 2H), 4.33 (q, J=6.4 Hz, 1H), 4.01 (d, J=4.5 Hz, 1H), 2.94 - 2.79 (m, 1H), 2.64 (s, 3H), 2.00 (ddd, J=4.0, 9.4, 13.8 Hz, 2H), 1.25 (d, J=6.5 Hz, 3H)
XX-4: LCMS 370 [M-NH2];<1>H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ ppm 8.62 (s, 1H), 7.60 (d, J=3.7 Hz, 1H), 7.29 (dd, J=3.0, 10.0 Hz, 1H), 7.04 - 6.87 (m, 2H), 6.71 (d, J=3.5 Hz, 1H), 5.35 (br. s., 1H), 5.20 - 5.03 (m, 2H), 4.63 - 4.46 (m, 2H), 4.33 (q, J=6.6 Hz, 1H), 4.02 (d, J=4.3 Hz, 1H), 2.91 - 2.78 (m, 1H), 2.64 (s, 3H), 2.04 - 1.91 (m, 2H), 1.26 (d, J=6.6 Hz, 3H)
Primeri 139-142 su izrađeni na sličan način kao u XX-3 & XX-4 počevši od BB-2 i odgovarajućeg fenolnog ketona. Sekvence započiniju sa fazama 2 (alilna alkilacija) & 3 (dihidroksilacija) iz Šeme BB a nakon toga fazom 1 (formiranje acetonida) iz Šeme WW i nakon toga fazama 1 (reduktivna aminacija), 2 (deprotekcija) i 3 (asimetrično razdvajanje) u Šemi XX.
[0374]
2 2
(nastavlja se)
2 (nastavlja se)
Primer 143 (Šema YY) - (1S,2S,3S,5R)-3-(2-(aminometil)-4-hlor-3-fluorofenoksi)-5-(4-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)ciklopentan-1,2-diol (YY-6) (referenca)
[0375]
Šema YY
2 4
Faza 1 - Sinteza 3-hlor-2-fluor-6-metoksibenzaldehida (YY-2)
[0376] U rastvor 4-hlor-3-fluoroanizola (YY-1) (250 mg, 1.56 mmol) u anhidrovanom THF se u kapima na -78 °C u atmosferi N2doda LDA (0.86 mL, 2M, 1.71 mmol) i meša 30 min na -78°C u atmosferi N2. U prethodno dobijeni rastvor se na -78 °C u atmosferi N2doda DMF (125 mg, 1.71 mmol) i dobijena smeša se meša 20 min na -78 °C. Reakcija se neutrališe sa sat. NH4Cl na -78 °C. Dobijena smeša se zagreje na 25 °C. Smeša se podeli između EtOAc i H2O. Organski sloj se odvoji i vodeni sloj se ekstrahuje sa EtOAc. Kombinovani organski slojevi se isperu sa slanim rastvorom, suše preko Na2SO4i koncentruju da se dobije sirovi produkt. Sirovi produkt se prečisti na flash koloni (EtOAc:petrol etar = 1%-12%) da se dobije YY-2 (178 mg, 61%) kao bela čvrsta supstanca.<1>H NMR (400 MHz, CDCl3) δ ppm 10.41 (d, J=1.3 Hz, 1H), 7.54 (dd, J=8.0, 9.0 Hz, 1H), 6.76 (dd, J=1.5, 9.0 Hz, 1H), 3.95 (s, 3H)
Faza 2 - Sinteza (3-hlor-2-fluor-6-metoksifenil)metanamina (YY-3)
[0377] U rastvor YY-2 (400 mg, 2.12 mmol) u anhidrovanom MeOH (20.0 mL) se doda NH4OAc (1.63 g, 21.2 mmol). Smeša se meša 1 sat na 25 °C. U prethodno dobijeni rastvor se na 25 °C doda NaCNBH3(533 mg, 8.48 mmol). Dobijena smeša se meša 16 sati na 25 °C. Reaktivna smeša se podeli između EtOAc i H2O. Organski sloj se odvoji, ispere sa slanim rastvorom, suši preko Na2SO4i koncentruje da se dobije sirovi produkt koji se prečisti na flash koloni (MeOH: DCM = 1%-15%) da se dobije YY-3 (270 mg, 67%) kao žuta guma.<1>H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ ppm 7.35 (t, J=8.8 Hz, 1H), 6.78 (d, J=9.0 Hz, 1H), 3.77 (s, 3H), 3.70 (s, 2H)
Faza 3 - Sinteza 2-(aminometil)-4-hlor-3-fluorofenola (YY-4)
[0378] U rastvor YY-3 (180 mg, 0.949 mmol) u H2O (15.0 mL) se u kapima na 0 °C u atmosferi N2dodaje aq.HBr (1.50 mL). Nakon dodavanja, reakcija se zagreva pod refluksom (110 °C) i meša 6 sati. Reaktivna smeša se ohladi na 0 °C, razblaži sa H2O i neutrališe sa sat. NaOH. Vodeni sloj se ekstrahuje sa EtOAc. Organski sloj se ispere sa slanim rastvorom, suši preko Na2SO4i koncentruje da se dobije sirovi produkt koji se prečisti pre-TLC (MeOH: DCM = 1:10) da se dobije YY-4 (50 mg, 30%) kao bela čvrsta supstanca.<1>H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ ppm 7.18 (t, J=8.9 Hz, 1H), 6.52 (dd, J=1.5, 8.8 Hz, 1H), 3.92 (d, J=1.3 Hz, 2H)
2
Faza 4 - Sinteza terc-butil (3-hlor-2-fluor-6-hidroksibenzil)karbamata (YY-5)
[0379] U rastvor YY-4 (50.0 mg, 0.285 mmol) u DCM (5.00 mL) i MeOH (1.0 mL) se na 0 °C doda Boc2O (68.4 mg, 0.313 mmol) a nakon toga se doda Et3N (72 mg, 0.71 mmol).
Nakon dodavanja, reaktivna smeša se meša 16 sati na 25 °C. Reaktivna smeša se zakiseli sa sat. limunskom kiselinom do pH 5-6. Smeša se podeli između DCM i H2O. Organski sloj se odvoji i vodeni sloj se ekstrahuje sa DCM. Kombinovani organski sloj se ispere sa sat.
NaHCO3i slanim rastvorom, suši preko Na2SO4i koncentruje da se dobije sirovi produkt koji se prečisti pre-TLC (EtOAc: petrol etar = 1:2) da se dobije YY-5 (45 mg, 57%) kao bela čvrsta supstanca.<1>H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ ppm 10.22 (s, 1H), 7.27 (t, J=8.4Hz), 7.02 (br. s, 1H), 6.67 (d, J=9.2 Hz), 4.14 (s, 2H), 1.37 (s, 9H)
Faza 5 - Sinteza (1S,2S,3S,5R)-3-(2-(aminometil)-4-hlor-3-fluorofenoksi)-5-(4-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)ciklopentan-1,2-diola (YY-6)
[0380] Jedinjenje YY-6 se sintetiše koristeći YY-5 i BB-2 po postupcima iz faza 2 & 3 u Šemi BB.
[0381] LCMS 407 [M+1];<1>H NMR (400 MHz, DMSO-d6+D2O) δ ppm 8.57 (s, 1H), 7.61 (d, J=3.5 Hz, 1H), 7.56 (t, J=8.7 Hz, 1H), 7.00 (d, J=9.0 Hz, 1H), 6.72 (br. s., 1H), 5.14 - 4.99 (m, 1H), 4.64 (br. s., 1H), 4.59 (dd, J=4.6, 9.4 Hz, 1H), 4.08 (s, 3H), 2.90 - 2.78 (m, 1H), 2.62 (s, 3H), 2.06 (t, J=10.4 Hz, 1H)
Primeri 144 - 146 su izrađeni na sličan način kao u YY-6 počevši od odgovarajućeg anizol reagensa i po fazama 3 & 4 u Šemi YY.
[0382]
2
2 Primer 147 (Šema ZZ) - (1S,2S,3S,5R)-3-(2-(aminometil)-4,5-dihlorfenoksi)-5-(4-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)ciklopentan-1,2-diol (ZZ-7) (referenca)
[0383]
Šema ZZ
Faza 1 - Sinteza (4,5-dihlor-2-metoksifenil)metanola (ZZ-2)
[0384] U rastvor metoksibenzoeve kiseline (ZZ-1) (500 mg, 2.26 mmol) u anhidrovanom THF (23 mL) se na 0 °C u atmosferi N2doda BH3.THF (6.79 mL, 6.79 mmol). Nakon dodavanja, reaktivna smeša se meša 3 sata na 30 °C u atmosferi N2. Reaktivna smeša se ohladi na -20 °C i neutrališe sa sat. NH4Cl. Reaktivna smeša se podeli između EtOAc i H2O. Organski sloj se odvoji i vodeni sloj se ekstrahuje sa EtOAc. Kombinovani organski slojevi se isperu sa slanim rastvorom, suše preko Na2SO4i koncentruju da se dobije sirovi produkt koji se prečisti flash hromatografijom na koloni (EtOAc: petrol etar = 1%-35%) da se dobije ZZ-2 (383 mg, 81.8%) kao bela čvrsta supstanca.<1>H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ ppm 7.49 (s, 1H), 7.22 (s, 1H), 5.28 (t, J=5.6 Hz), 4.44 (d, J=6 Hz), 3.31 (s, 3H)
2
Faza 2 - Sinteza 2-(4,5-dihlor-2-metoksibenzil)izoindolin-1,3-diona (ZZ-3)
[0385] U rastvor ZZ-2 (230 mg, 1.11 mmol) i ftalamida (163 mg, 1.11 mmol) u anhidrovanom THF (12 mL) se doda PPh3(291 mg, 2.30 mmol). Reaktivna smeša se meša 30 min na -20 °C u atmosferi N2. U prethodno dobijeni rastvor se na -10 °C~-20 °C doda DEAD (193 mg, 1.11 mmol). Nakon dodavanja, reaktivna smeša postaje žuti rastvor, koji se zagreje na 25 °C i meša 2 sata. Reaktivna smeša se koncentruje i ostatak se prečisti na flash koloni (12.0 g gel, EtOAc: petrol etar = 10%-35%) da se dobije sirovi produkt koji se dalje prečisti prep-TLC (EtOAc: petrol = 1%~15%) da se dobije produkt ZZ-3 (30 mg, 8%) kao bela čvrsta supstanca koja se koristi kao takva u sledećoj fazi.
Faza 3 - Sinteza 2-(4,5-dihlor-2-hidroksibenzil)izoindolin-1,3-diona (ZZ-4)
[0386] U rastvor ZZ-3 (50 mg, 0.15 mmol) u DCM (2.00 mL) se u kapima na 0 °C doda BBr3(0.20 mL). Nakon dodavanja, reakcija se meša 2 sata na 0 °C. Reaktivna smeša se pažljivo neutrališe sa MeOH. Dobijena smeša se podeli između DCM i sat. NaHCO3. Organski sloj se ispere sa slanim rastvorom, suši preko Na2SO4i koncentruje da se dobije sirovi produkt koji se prečisti prep-TLC (EtOAc: petrol etar = 1:1) da se dobije ZZ-4 (43 mg, 90%) kao bela čvrsta supstanca.<1>H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ ppm 10.50 (s, 1H), 7.94 - 7.76 (m, 4H), 7.32 (s, 1H), 7.00 (s, 1H), 4.68 (s, 2H)
Faza 4 - Sinteza 2-(4,5-dihlor-2-(((1S,4R)-4-(4-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)ciklopent-2-en-1-il)oksi)benzil)izoindolin-1,3-diona (ZZ-5)
[0387] U promešani rastvor ZZ-4 (43 mg, 0.13 mmol) i terc-butil ((1S,4R)-4-(4-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin- 7-il)ciklopent-2-en-1-il) karbonata (42 mg, 0.13 mmol) u DCE (1.50 mL) se dodaju Cs2CO3(52 mg, 0.16 mmol), Pd2(dba)3.CHCl3, (3.5 mg, 0.003 mmol) i dppp (3.3 mg, 0.008 mmol). Reaktivna smeša se degasira i prečisti 3 puta sa N2. Dobijeni rastvor se meša 1.5 h na 25 °C. Reaktivna smeša se koncentruje i prečisti prep-TLC (EtOAc: petrol etar = 1:1) da se dobije produkt ZZ-5 (62 mg, 89%) kao žuta guma koja se koristi direktno u sledećoj fazi.
Faza 5 - Sinteza 2-(4,5-dihlor-2-(((1S,2S,3S,4R)-2,3-dihidroksi-4-(4-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)ciklopentil)oksi)benzil)izoindolin-1,3-diona (ZZ-6)
2
[0388] U rastvor ZZ-5 (62 mg, 0.12 mmol) u THF (2.50 mL) i H2O (0.50 mL) se doda NMO (29.4 mg, 0.251 mmol) a nakon toga OsO4(136 mg, 0.02 mmol, 4% m/m u t-BuOH). Nakon dodavanja, reaktivna smeša se meša 4 sata na 28 °C. Reaktivna smeša se razblaži sa H2O i neutrališe sa sat. NaHSO3. Tamni rastvor se ekstrahuje sa EtOAc, suši preko Na2SO4i koncentruje da se dobije sirovi produkt koji se prečisti prep-TLC (MeOH: DCM = 1:10, UV) da se dobije ZZ-6 (30 mg, 45%) kao žuta čvrsta supstanca.<1>H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ ppm 8.61 (s, 1H), 7.95 - 7.77 (m, 4H), 7.60 (d, J=3.5 Hz, 1H), 7.56 (s, 1H), 7.36 (s, 1H), 6.73 (d, J=3.5 Hz, 1H), 5.43 (d, J=4.0 Hz, 1H), 5.18 - 5.05 (m, 2H), 4.81 (s, 2H), 4.70 - 4.61 (m, J=6.0 Hz, 1H), 4.52 - 4.41 (m, 1H), 3.99 - 3.94 (m, 1H), 2.91 - 2.78 (m, 1H), 2.65 (s, 3H), 1.98 - 1.86 (m, 1H)
Faza 6 - Sinteza (1S,2S,3S,5R)-3-(2-(aminometil)-4,5-dihlorfenoksi)-5-(4-metil-7H-pirolo[2,3-d]piridin-7-il)ciklopentan-1,2-diola (ZZ-7)
[0389] U rastvor ZZ-6 (30 mg, 0.05 mmol) u THF (2.5 mL) se u kapima dodaje NH2NH2(31 mg, 0.81 mmol). Nakon dodavanja, reaktivni rastvor se meša 16 sati na 28 °C. Reaktivna smeša se filtrira i filtrat se koncentruje. Ostatak se prečisti prep-HPLC da se dobije ZZ-7 (11 mg, 46%) kao bela čvrsta supstanca. LCMS 423 [M+1];<1>H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ ppm 8.62 (s, 1H), 7.66 (d, J=3.8 Hz, 1H), 7.60 (s, 1H), 7.31 (s, 1H), 6.72 (d, J=3.3 Hz, 1H), 5.14
[0390] - 5.05 (m, 2H), 4.63 (m, 1H), 4.00 (m, 1H), 3.74 (s, 2H), 2.89 - 2.81 (m, 1H), 2.64 (s, 3H), 2.02 (m, 1H)
Primer 148 (1S,2S,3S,5R)-3-(2-(aminometil)-4,5-difluorofenoksi)-5-(4-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)ciklopentan-1,2-diol se izrađuje na sličan način kao ZZ-7 počevši od (4,5-difluoro-2-metoksifenil)metanola i prateći faze 2 do 6 u Šemi ZZ.
[0391]
21
Primer 149 (Šema AAA) - (1S,2S,3S,5R)-3-(2-(2-amino-1-hidroksietil)-4-hlorfenoksi)-5-(4-metil-7H- pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)ciklopentan-1,2-diol (AAA-9) (referenca)
[0392]
Šema AAA
Faza 1 - Sinteza 2-brom-1-(5-hlor-2-hidroksifenil)etan-1-ona (AAA-2)
[0393] U žuti rastvor 1-(5-hlor-2-hidroksifenil)etan-1-ona (AAA-1) (2 g, 11.72 mmol) i u THF (60 mL) se na rt (25 °C) doda PhMe3NBr3 (4.85 g, 12.9 mmol). Dobijeni crveni rastvor se meša 12 h na rt za koje vreme se formira čvrsta supstanca, a nakon toga se smeša filtrira. Filtrat se koncentruje pod vakuumom i ostatak se prečisti hromatografijom na silika gelu uz eluiranje sa EtOAc u petrol etru od 0 do 10% da se dobije AAA-2 (2.4 g) kao žuto ulje koje se direktno koristi u sledećoj fazi.
Faza 2 - Sinteza 2-((3r,5r,7r)-1/4,3,5,7-tetraazaadamantan-1-il)-1-(5-hlor-2-hidroksifenil)etan-1-ona, bromidne soli (AAA-3)
[0394] U rastvor 1,3,5,7-tetraazaadamantana (4.67 g, 33.3 mmol) u CHCb (40 mL) se na rt (25 °C) doda AAA-2 (2.6 g, 10 mmol). Smeša se meša 12 h na rt za koje vreme se formira čvrsta supstanca. Čvrsta supstanca se sakupi filtriranjem i ispere sa DCM i suši pod vakuumom da se dobije sirovi produkt AAA-3 (3 g, 74%) kao bela čvrsta supstanca, koja se direktno koristi u sledećoj fazi.
Faza 3 - Sinteza 2-amino-1-(5-hlor-2-hidroksifenil)etan-1-ona (AAA-4)
[0395] U suspenziju SM1 (3 g, 8 mmol) u EtOH (15 mL) se na rt (25 °C) doda conc. HCl (3 mL). Suspenzija se meša 2 h na rt. Reakcija se upari da se dobije AAA-4 (1.5 g, >100%) kao žuto ulje koje se koristi direktno bez daljeg prečišćavanja. LCMS 186 [M+1]
Faza 4 - Sinteza terc-butil (2-(5-hlor-2-hidroksifenil)-2-oksoetil)karbamata (AAA-5)
[0396] U rastvor (Boc)2O (2.29 g, 10.5 mmol) u dioksanu (15 mL) se na 0 °C doda rastvor AAA-4 (200 mg, rastvor, neutralisan sa NaHCO3aq.). Reaktivni rastvor se meša na 25 °C. Reaktivni rastvor se ekstrahuje sa EtOAc (6 mL x 3). Organski slojevi se razdvoje, suše i upare da se dobije sirovi produkt koji se prečisti flash hromatografijom sa 0-25% EtOAc/petrol etar, da se dobije AAA-5 (600 mg, 22%) kao bela čvrsta supstanca i koristi se kao takva u sledećoj fazi.
Faza 5 - Sinteza terc-butil (2-(5-hlor-2-(((1S,4R)-4-(4-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)ciklopent-2-en-1-il)oksi)fenil)-2-oksoetil)karbamata (AAA-6)
[0397] Koristeći BB-2 i prateći sliične postupke kao u fazi 2 u Šemi BB, dobija se AAA-6 (288 mg, 31%) kao žuta guma, koja se direktno koristi u sledećoj fazi.
Faza 6 - Sinteza terc-butil (2-(5-hlor-2-(((1S,2S,3S,4R)-2,3-dihidroksi-4-(4-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)ciklopentil)oksi)fenil)-2-oksoetil)karbamata (AAA-7)
[0398] Počevši od AAA-6 i prateći slične postupke kao u fazi 3 u Šemi BB, dobija se AAA-7 (70 mg, 33%) kao bela čvrsta supstanca. LCMS 517 [M+1]
Faza 7 - Sinteza terc-butil (2-(5-hlor-2-(((1S,2S,3S,4R)-2,3-dihidroksi-4-(4-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)ciklopentil)oksi)fenil)-2-hidroksietil)karbamata (AAA-8)
[0399] U smešu AAA-7 (70 mg, 0.14 mmol) u MeOH (1 mL) se doda NaBH4(15.4 mg, 0.406 mmol). Smeša se meša 2h na 25 °C. Smeša se neutrališe sa 1N rastvorom HCl aq. (5 mL). Smeša se upari da se dobije sirovi produkt AAA-8 (70 mg, >99%) kao bela čvrsta supstanca.
Faza 8 - Sinteza (1S,2S,3S,5R)-3-(2-(2-amino-1-hidroksietil)-4-hlorfenoksi)-5-(4-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)ciklopentan-1,2-diola (AAA-9)
[0400] Jedinjenje AAA-8 (62 mg, 0.12 mmol) se rastvori u DCM (0.6 mL). Smeša se ohladi na 0 °C u ledenom kupatilu. U prethodno dobijenu smešu se u kapima dodaje TFA (0.2 mL). Reaktivna smeša se meša 2 sata na 25 °C. Reaktivni rastvor se neutrališe sa zasićenim NaHCO3aq. (1 mL), filtrira i filtrat se direktno prečisti prep-HPLC da se dobije AAA-9 (21 mg, 42%) kao bela čvrsta supstanca. LCMS 441 [M+23];<1>H NMR (400 MHz, MeOD-d4) δ ppm 8.62 (d, J=2.8 Hz, 1H), 7.58 (dd, J=3.3, 11.3 Hz, 1H), 7.48 (s, 1H), 7.26 - 7.22 (m, 1H), 7.03 (dd, J=2.1, 8.7 Hz, 1H), 6.75 (t, J=3.8 Hz, 1H), 5.20 (d, J=3.8 Hz, 1H), 5.10 (br. s., 1H), 4.70 (br. s., 2H), 4.22 (d, J=9.5 Hz, 1H), 3.04 - 2.94 (m, 2H), 2.77 (br. s., 1H), 2.71 (s, 3H), 2.26 (br. s., 1H)
Primer 150 (Šema BBB) - (1S,2S,3S,5R)-3-(2-(aminometil)-3,4-dihlorfenoksi)-5-(4-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)ciklopentan-1,2-diol (BBB-8) (referenca)
21
Šema BBB
Faza 1 - Sinteza 2,3-dihlor-6-fluorobenzaldehida (BBB-2)
[0402] U rastvor 1,2-dihlor-4-fluorobenzena (BBB-1) (2 g, 12.12 mmol) u anhidrovanom THF (30 mL) se u kapima na -65 °C u atmosferi N2doda LDA (6.67 mL, 2M, 13.3 mmol). Nakon dodavanja, reaktivna smeša se meša 30 min na -65 °C u atmosferi N2. U dobijeni crveni rastvor se doda DMF (1.77 g, 24.2 mmol) na -65 °C u atmosferi N2i dobijena smeša se meša 20 min na -65 °C. Reakcija se neutrališe sa vodom (50 mL) i ekstrahuje sa EtOAc (30 mL x 2). Ekstrakt se ispere sa 1 N rastvorom HCl (30 mL), slanim rastvorom (30 mL), suši preko Na2SO4i koncentruje da se dobije sirovi materijal koji se ekstrahuje sa petrol etrom (30 mL x 3). Ekstrakt se koncentruje pod vakuumom da se dobije BBB-2 (2.2 g, 94%) kao žuta čvrsta supstanca.<1>H NMR (400 MHz, CDCl3) δ ppm 10.44 (s, 1H), 7.66 (dd, J=5.3, 9.0 Hz, 1H), 7.10 (t, J=9.2 Hz, 1H)
Faza 2 - Sinteza 2,3-dihlor-6-hidroksibenzaldehida (BBB-3)
[0403] U žuti rastvor sirovog BBB-2 (2.2 g, 11.4 mmol) u DMSO (10 mL) se polako na 0 °C dodaje KOH (1280 mg, 22.8 mmol). Nakon dodavanja, smeša se menja, postaje crvena i meša se 16 h na sobnoj temperaturi (20 °C). Smeša se razblaži sa MTBE (100 mL). Tečnost se dekantuje i ostatak se ispere sa MTBE (100 mL). Ostatak se nakon toga razblaži sa vodom (30 mL), podesi sa 1 N rastvor HCl do pH 2 i ekstrahuje sa EtOAc (20 mL x 2). Ekstrakt se ispere sa slanim rastvorom (20 mL), suši preko Na2SO4i koncentruje pod vakuumom da se dobije sirovi BBB-3 (390 mg, 18%) kao žuta čvrsta supstanca.<1>H NMR (400 MHz, CDCl3) δ ppm 11.98 (s, 1H), 10.44 (s, 1H), 7.56 (d, J=9.0 Hz, 1H), 6.90 (d, J=9.3 Hz, 1H)
Faza 3 - Sinteza (R,E)-N-(2,3-dihlor-6-hidroksibenziliden)-2-metilpropan-2-sulfinamida (4)
[0404] Smeša sirovog BBB-3 (150 mg, 0.79 mmol), (R)-2-metilpropan-2-sulfinamida (143 mg, 1.2 mmol) i CuSO4(376 mg, 2.36 mmol) u CHCl3(3 mL) se meša 5 dana na rt (30 °C). Smeša se filtrira i prečisti hromatografijom na silika gelu uz eluiranje sa EtOAc u petrol etru od 0 do 30 % da se dobije BBB-4 (70 mg, 30%) kao svetlo žuta čvrsta supstanca.<1>H NMR (400 MHz, CDCl3) δ ppm 11.98 (s, 1H), 9.28 (s, 1H), 7.49 (d, J=8.8 Hz, 1H), 6.92 (d, J=9.3 Hz, 1H), 1.29 (s, 9H)
[0405]
Faza 4 - Sinteza (R)-N-(2,3-dihlor-6-hidroksibenzil)-2-metilpropan-2-sulfinamida (BBB-5)
[0406] U rastvor BBB-4 (70 mg, 0.238 mmol) u MeOH (3 mL) se na rt (30 °C) doda NaBH4(27 mg, 0.714 mol). Smeša se meša 1 h na rt. Smeša se koncentruje pod vakuumom i rastvori u vodi (5 mL). U smešu se doda NH4Cl aq (2 mL) za koje vreme se formira malo čvrste supstance. Smeša se ekstrahuje sa EtOAc (5 mL x 3). Ekstrakt se ispere sa slanim rastvorom (5 mL), suši preko Na2SO4i koncentruje pod vakuumom da se dobije BBB-5 (55 mg, 78%) kao žuta čvrsta supstanca.<1>H NMR (400 MHz, CDCl3) δ ppm 9.31 (br. s., 1H), 7.17 (d, J=8.8 Hz, 1H), 6.69 (d, J=9.0 Hz, 1H), 4.58 - 4.40 (m, 2H), 4.09 - 3.97 (m, 1H), 1.27 (s, 9H)
Faza 5 - Sinteza (R)-N-(2,3-dihlor-6-(((1S,4R)-4-(4-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)ciklopent-2-en-1-il)oksi)benzil)-2-metilpropan-2-sulfinamida (BBB-6)
[0407] Jedinjenje BBB-6 (130 mg, 98%, sadrži 1 eq DCM) se izrađuje kao žuta guma od BBB-5 i BB-2, koristeći slične postupke kao u fazi 2 Šeme BB. LCMS 493 [M+1];<1>H NMR (400 MHz, CDCl3) δ ppm 8.77 (s, 1H), 7.39 - 7.31 (m, 2H), 6.84 (d, J=9.0 Hz, 1H), 6.60 (d, J=3.5 Hz, 1H), 6.41 (d, J=5.5 Hz, 1H), 6.22 (d, J=4.8 Hz, 1H), 6.13 - 6.01 (m, 1H), 5.41 - 5.35
21
(m, 1H), 4.63 - 4.39 (m, 2H), 3.65 (t, J=6.7 Hz, 1H), 3.29 - 3.09 (m, 1H), 2.73 (s, 3H), 1.98 (td, J=3.8, 14.7 Hz, 1H), 1.18 (s, 9H)
Faza 6 - Sinteza N-(2,3-dihlor-6-(((1S,2S,3S,4R)-2,3-dihidroksi-4-(4-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)ciklopentil)oksi)benzil)-2-metilpropan-2-sulfonamida (BBB-7)
[0408] Jedinjenje BBB-6 se tretira na sličan način kao u postupcima iz faze 3 u Šemi BB da se dobije BBB-7 (70 mg, 58%). LCMS 543 [M+16+1];<1>H NMR (400 MHz, CDCl3) δ ppm 8.62 (s, 1H), 7.56 (br. s., 1H), 7.19 (d, J=8.8 Hz, 1H), 6.77 (d, J=9.0 Hz, 1H), 6.54 (d, J=3.8 Hz, 1H), 5.64 (t, J=5.5 Hz, 1H), 5.14 (s, 1H), 5.13-5.04 (m, 1H), 4.56-4.50 (m, 1H), 4.47 (dd, J=4.8, 8.5 Hz, 1H), 4.44 - 4.34 (m, 2H), 4.04 (d, J=4.8 Hz, 1H), 2.83 - 2.75 (m, 1H), 2.62 (s, 3H), 2.14 - 2.04 (m, 1H), 1.20 (s, 9H)
Faza 7 - Sinteza (1S,2S,3S,5R)-3-(2-(aminometil)-3,4-dihlorfenoksi)-5-(4-metil-7H-pirolo[2,3-d]piridin-7-il)ciklopentan-1,2-diola (BBB-8)
[0409] U rastvor BBB-7 (35 mg, 0.064 mmol) u bezvodnom DCM (5 mL) se na rt (25 °C) dodaju anizol (170 mg, 1.56 mmol) i AlCl3(86 mg, 0.64 mmol). Bela suspenzija se meša 3 h na rt. Smeša se neutrališe sa NaHCO3aq (3 mL), a nakon toga sa kalijum natrijum tartaratom aq (5 mL). Smeša se ekstrahuje sa EtOAc (5 mL x 3). Ekstrakt se koncentruje pod vakuumom i prečisti TLC (DCM/MeOH=10/1) da se dobije BBB-8 (8 mg, 29%) kao bela čvrsta supstanca. LCMS 423 [M+1];<1>H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ ppm 8.61 (s, 1H), 7.69 (d, J=3.5 Hz, 1H), 7.49 (d, J=8.8 Hz, 1H), 7.11 (d, J=9.0 Hz, 1H), 6.72 (d, J=3.8 Hz, 1H), 5.44 (br. s., 1H), 5.10 (q, J=9.0 Hz, 2H), 4.64 (d, J=5.3 Hz, 2H), 4.06 (d, J=4.8 Hz, 1H), 3.92 (s, 2H), 2.92 - 2.81 (m, 1H), 2.64 (s, 3H), 2.05 (ddd, J=4.1, 9.2, 13.8 Hz, 1H)
Primer 151 (Šema CCC) - (1S,2S,3S,5R)-3-(2-(2-aminoetoksi)-4,5-dihlorfenoksi)-5-(4-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)ciklopentan-1,2-diol (CCC-4) (referenca)
21
Šema CCC
Faza 1 - Sinteza 4,5-dihlor-2-(((1S,4R)-4-(4-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)ciklopent-2-en-1-il)oksi)fenola (CCC-1)
[0411] Jedinjenje CCC-1 se izrađuje koristeći slične postupke iz faze 2 u šemi BB sa komercijalno raspoloživim 4,5-dihlorbenzen-1,2-diolom i BB-2.
Faza 2 - Sinteza terc-butil (2-(4,5-dihlor-2-(((1S,4R)-4-(4-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)ciklopent-2-en-1-il)oksi)fenoksi)etil)karbamata (CCC-2)
[0412] U promešani žuti rastvor CCC-1 (78 mg, 0.21 mmol) u bezvodnom DMF (5 mL) se na 25 °C dodaju K2CO3(86 mg, 0.62 mmol) i terc-butil (2-bromoetil)karbamat (923 mg, 0.42 mmol) i mešaju 20 sati. U reaktivnu smešu se doda voda (10 mL) i ekstrahuje sa EtOAc (2 x 20 mL). Kombinovani organski slojevi se isperu sa slanim rastvorom (5 x 20 mL), suše preko Na2SO4, filtriraju i koncentruju pod vakuumom da se dobije ostatak koji se prečisti hromatografijom na koloni (silika gel, uz eluiranje sa EtOAc) da se dobije CCC-2 (108 mg, >99%) kao bezbojna guma. LCMS [M+1] 519;<1>H NMR (400 MHz, CDCl3) δ ppm 8.77 (s, 1H), 7.42 (d, J=3.5 Hz, 1H), 7.04 (s, 1H), 6.98 (s, 1H), 6.60 (d, J=3.5 Hz, 1H), 6.39 (td, J=1.9, 5.5 Hz, 1H), 6.19 (dd, J=2.3, 5.3 Hz, 1H), 6.06 (dd, J=2.0, 4.8 Hz, 1H), 5.29 (d, J=7.0 Hz, 1H), 5.02 (br. s., 1H), 4.03 (t, J=5.0 Hz, 2H), 3.59 - 3.47 (m, 2H), 3.10 (td, J=7.7, 15.2 Hz, 1H), 2.73 (s, 3H), 2.07 (t, J=2.9 Hz, 1H), 1.42 (s, 9H)
Faza 3 - Sinteza terc-butil (2-(4,5-dihlor-2-(((1S,2S,3S,4R)-2,3-dihidroksi-4-(4-metil-7H-
21
pirolo[2,3-d]piridin-7-il)ciklopentil)oksi)fenoksi)etil)karbamata (CCC-3)
[0413] Jedinjenje CCC-2 se podvrgne sličnim postupcima kao za fazu 3 u Šemi BB da se dobije CCC-3 (55 mg, 48%) kao braon guma. LCMS [M+23] 575
Faza 4 - Sinteza (1S,2S,3S,5R)-3-(2-(2-aminoetoksi)-4,5-dihlorfenoksi)-5-(4-metil-7H-pirolo[2,3-d]piridin-7-il)ciklopentan-1,2-diola (CCC-4)
[0414] Jedinjenje CCC-3 se podvrgne standardnim postupcima TFA/voda deprotekcije sličnim kao u fazi 8 u šemi AAA a nakon toga prep-HPLC da se dobije CCC-4 (35 mg, 75%). LCMS [M+23] 475;<1>H NMR (400 MHz, MeOD-d4) δ ppm 8.64 (s, 1H), 7.66 (d, J=3.8 Hz, 1H), 7.37 (s, 1H), 7.29 (s, 1H), 6.79 (d, J=3.5 Hz, 1H), 5.20 (q, J=8.9 Hz, 1H), 4.76 -4.68 (m, 1H), 4.66 (dd, J=5.3, 8.0 Hz, 1H), 4.33 - 4.23 (m, 3H), 3.40 - 3.36 (m, 2H), 3.01 -2.90 (m, 1H), 2.74 (s, 3H), 2.29 (ddd, J=5.0, 8.8, 14.3 Hz, 1H)
Primer 152 (1S,2S,3S,5R)-3-(2-(2-aminoetoksi)-4,5-difluorofenoksi)-5-(4-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)ciklopentan-1,2-diol se izrađuje na sličan način kao u CCC-4 počevši od 4,5-difluorobenzen-1,2-diola i prateći faze 1 do 4 u Šemi CCC.
[0415]
Primer 153 (Šema DDD) - (1S,2S,3S,5R)-3-(2-(2-aminoetoksi)-4-hlorfenoksi)-5-(4-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)ciklopentan-1,2-diol (DDD-6) (referenca)
21
Šema DDD
Faza 1 - Sinteza 1-(5-hlor-2-(((1S,2S,3S,4R)-2,3-dihidroksi-4-(4-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)ciklopentil)oksi)fenil)etan-1-ona (DDD-1)
[0417] Jedinjenje DDD-1 se izrađuje koristeći slične postupke kao u fazama 2 & 3 u šemi BB sa komercijalno raspoloživim 1-(5-hlor-2-hidroksifenil)etan-1-onom i BB-2.
Faza 2 - Sinteza 5-hlor-2-(((1S,2S,3S,4R)-2,3-dihidroksi-4-(4-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)ciklopentil)oksi)fenil acetata (DDD-2)
[0418] Trifluoroacetatni anhidrid (1.46 g, 6.95mmol) se ohladi na -10 °C, u kapima se doda 30% H2O2(185 mg, 1.63 mmol) i rastvor se meša 10 min. U ovu smešu se u kapima na 0 °C dodaje DDD-1 (210 mg, 0.523 mmol) u DCM (3.5 mL) i meša 15 min na 25 °C. Nakon toga se u reaktivni rastvor doda zasićeni rastvor natrijum tiosulfata (2 mL). Reaktivni rastvor se zaalkališe sa zasićenim rastvorom NaHCO3do pH=7~8 i ekstrahuje sa DCM (30 mL x 2). Kombinovani organski slojevi se isperu sa slanim rastvorom (40 mL), suše preko Na2SO4, filtriraju i upare da se dobije sirovi materijal koji se prečisti ISCO (silika gel, 12 g, MeOH/OCM=10%~14%) da se dobije željeni produkt DDD-2 (160 mg, 73%) kao bela čvrsta supstanca. LCMS [M+1] 418;<1>H NMR (400 MHz, CDCl3) δ ppm 8.67 (s, 1H), 7.25 (m, 1H), 7.21 (dd, J=2.5, 8.8 Hz, 1H), 7.12 - 7.06 (m, 2H), 6.60 (d, J=3.8 Hz, 1H), 4.97 (q, J=8.5 Hz, 1H), 4.78 (t, J=6.0 Hz, 1H), 4.50 (dd, J=5.3, 8.3 Hz, 1H), 4.29 (d, J=5.5 Hz, 1H), 3.12 - 3.01
21
(m, 1H), 2.72 (s, 3H), 2.36 - 2.27 (m, 1H), 2.24 (s, 3H)
Faza 2 - Sinteza 5-hlor-2-(((3aR,4S,6R,6aS)-2,2-dimetil-6-(4-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)tetrahidro-4H-ciklopenta[d][1,3]dioksol-4-il)oksi)fenil acetata (DDD-3)
[0419] U izmešani bezbojni rastvor DDD-2 (160 mg, 0.38 mmol) u acetonu (0.64 mL) se na 25 °C dodaju 2,2-dimetoksipropan (6.4 mL) i p-toluensulfonska kiselina (73 mg, 0.38 mmol). Reakcija se meša 1 sat na 25 °C. U reaktivnu smešu se nakon toga dodaje aq.NaHCO3(3 mL) do pH 8.0. Nakon toga se smeša ekstrahuje sa EtOAc (15 mL x 2). Organski slojevi se razdvoje, isperu sa slanim rastvorom (20 mL), suše preko Na2SO4i filtriraju. Organski sloj se upari da se dobije sirovi produkt kao bezbojna guma, koja se prečisti hromatografijom na koloni (etar:EtOAc=1:1, Rf~0.55) da se dobije DDD-3 (126 mg, 72%) kao bela čvrsta supstanca. LCMS [M+1] 458;<1>H NMR (400 MHz, CDCl3) δ ppm 8.79 (s, 1H), 7.43 (d, J=3.8 Hz, 1H), 7.25 - 7.20 (m, 1H), 7.14 - 7.07 (m, 2H), 6.58 (d, J=3.5 Hz, 1H), 5.46 - 5.38 (m, 1H), 4.93 (d, J=5.8 Hz, 1H), 4.83 - 4.74 (m, 2H), 3.06 - 2.89 (m, 1H), 2.74 (s, 3H), 2.52 - 2.37 (m, 1H), 2.21 (s, 3H), 1.60 (br. s., 3H), 1.32 (s, 3H)
Faza 3 - Sinteza 5-hlor-2-(((3aR,4S,6R,6aS)-2,2-dimetil-6-(4-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)tetrahidro-4H-ciklopenta[d][1,3]dioksol-4-il)oksi)fenola (DDD-4)
[0420] Jedinjenje DDD-3 (142 mg, 0.31 mmol) se rastvori u MeOH (3 mL) i H2O (1 mL). U prethodno dobijenu smešu se doda K2CO3(85.7 g, 0.62 mmol). Reaktivna smeša se meša 1 sat na 25 °C. Smeša se neutrališe sa 10% limunskom kiselinom do pH 6-7. Smeša se razblaži sa H2O (10 mL) i ekstrahuje sa EtOAc (10 mL x 2). Kombinovani organski slojevi se isperu sa slanim rastvorom (10 mL), suše preko Na2SO4, filtriraju i upare da se dobije DDD-4 (140 mg, >99%) kao bezbojna guma. LCMS [M+1] 416;<1>H NMR (400 MHz, CDCl3) δ ppm 8.79 (s, 1H), 7.22 (d, J=3.5 Hz, 1H), 6.96 - 6.90 (m, 2H), 6.87 - 6.81 (m, 1H), 6.61 (d, J=3.5 Hz, 1H), 5.95 - 5.74 (m, 1H), 5.27 - 5.19 (m, 2H), 4.87 - 4.78 (m, 2H), 2.99 - 2.87 (m, 1H), 2.74 (s, 3H), 2.61 - 2.50 (m, 1H), 1.59 (s, 3H), 1.34 (s, 3H)
Faza 4 - Sinteza terc-butil (2-(5-hlor-2-(((3aR,4S,6R,6aS)-2,2-dimetil-6-(4-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)tetrahidro-4H-ciklopenta[d][1,3]dioksol-4-il)oksi)fenoksi)etil)karbamata (DDD-5)
22
[0421] U promešani rastvor DDD-4 (140 mg, 0.34 mmol) u bezvodnom DMF (5 mL) se na 25 °C dodaju K2CO3(140 mg, 1.0 mmol) i terc-butil (2-bromoetil)karbamat (151 mg, 0.67 mmol). Reakcija se meša 15 sati na 25 °C. U reaktivnu smešu se doda voda (10 mL) i smeša se ekstrahuje sa EtOAc (20 mL x 2). Kombinovani organski slojevi se isperu sa slanim rastvorom (20 mL x 5), suše preko Na2SO4, filtriraju i koncentruju da se dobije sirovi materijal koji se prečisti ISCO (EtOAc/petrol etar=60%) da se dobije DDD-5 (170 mg, 90%) kao bezbojna guma. LCMS [M+23] 581;<1>H NMR (400 MHz, CDCl3) δ ppm 8.80 (s, 1H), 7.77 (d, J=3.8 Hz, 1H), 6.96 - 6.84 (m, 3H), 6.59 (d, J=3.8 Hz, 1H), 5.50 (d, J=8.0 Hz, 1H), 5.18 (br. s., 1H), 4.92 - 4.86 (m, 1H), 4.85 - 4.81 (m, 2H), 4.08 - 3.98 (m, 2H), 3.65 -3.54 (m, 2H), 3.08 - 2.98 (m, 1H), 2.74 (s, 3H), 2.47 (d, J=14.6 Hz, 1H), 1.59 (s, 3H), 1.42 (s, 9H), 1.31 (s, 3H)
Faza 5 - Sinteza (1S,2S,3S,5R)-3-(2-(2-aminoetoksi)-4-hlorfenoksi)-5-(4-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)ciklopentan-1,2-diola (DDD-6)
[0422] Jedinjenje DDD-5 se podvrgne postupcima standardne deprotekcije TFA/voda a nakon toga prep-HPLC da se dobije DDD-6 (40 mg, 31%). LCMS [M+23] 441;<1>H NMR (400 MHz, MeOD-d4) δ ppm 8.64 (s, 1H), 7.78 (d, J=3.8 Hz, 1H), 7.14 - 7.05 (m, 2H), 6.96 (d, J=8.3 Hz, 1H), 6.82 (d, J=3.8 Hz, 1H), 5.41 - 5.27 (m, 1H), 4.74 - 4.70 (m, J=5.5 Hz, 1H), 4.67 (dd, J=4.6, 7.9 Hz, 1H), 4.21 (d, J=4.5 Hz, 1H), 4.15 - 4.07 (m, 2H), 3.18 - 3.08 (m, 2H), 3.06 -2.94 (m, 1H), 2.74 (s, 3H), 2.14 (dd, J=6.8, 14.1 Hz, 1H)
(Šema EEE) - Sinteza terc-butil 5-hlor-8-hidroksi-3,4-dihidroizohinolin-2(1H)-karboksilata (TP-19)
Šema EE
Faza 1 - Sinteza (2-hlor-5-metoksifenil)metanola (EEE-2)
[0424] U rastvor metil 2-hlor-5-metoksibenzoata EEE-1 (4.55 g, 22.7 mmol) u anhidrovanom THF (200 mL) se na -10 °C~-5 °C u porcijama dodaje LiAlH4(1.72 g, 45.4 mmol).
Temperatura se poveća na 0 °C. Nakon dodavanja, reakcija se meša 2 sata na 0 °C. Reaktivna smeša se neutrališe sa 5% NaOH. Reaktivna smeša se filtrira kroz Celite ploču. U Celite pogaču se dodaju THF (100 mL) i EtOAc (100 mL) i meša 0.5 sati na 25 °C. Smeša se filtrira i kombinovani organski slojevi se suše preko Na2SO4i koncentruju da se dobije sirovo EEE-2 (4.5 g) kao bezbojno ulje koje se koristi direktno u sledećoj fazi.<1>H NMR (400 MHz, CDCl3) δ ppm 7.25 (d, J=9.5 Hz, 1H), 7.05 (d, J=2.8 Hz, 1H), 6.78 (dd, J=2.9, 8.7 Hz, 1H), 4.75 (d, J=3.8 Hz, 2H), 3.81 (s, 3H), 2.04 - 1.94 (m, 1H)
Faza 2 - Sinteza 2-hlor-5-metoksibenzaldehida (EEE-3)
[0425] U rastvor EEE-2 (3.63 g, 16.16 mmol) u CH3CN (120 mL) se na 25 °C doda IBX (17.7 g, 63.1 mmol). Dobijena smeša se zagreva 2 sata na 80 °C. Reaktivna smeša se ohladi na 25 °C, filtrira i ispere sa DCM (50 mL). Kombinovani filtrat se koncentruje da se dobije sirovi materijal koji se prečisti ISCO (silika gel, 80 g, EtOAc/petrol etar=17%) da se dobije EEE-3 (1.76 g, 49%) kao bela čvrsta supstanca.<1>H NMR (400 MHz, CDCl3) δ ppm 10.45 (s, 1H), 7.42 (d, J=3.0 Hz, 1H), 7.36 (d, J=8.8 Hz, 1H), 7.11 (dd, J=3.3, 8.8 Hz, 1H), 3.86 (s, 3H)
Faza 3 - Sinteza (E)-1-hlor-4-metoksi-2-(2-nitrovinil)benzena (EEE-4)
[0426] U rastvor EEE-3 (1.76 g, 10.3 mmol) u AcOH (17.0 mL) se doda NH4OAc (0.795 g, 10.3 mmol) a nakon toga MeNO2(3.15 g, 51.6 mmol). Nakon dodavanja, reaktivna smeša se zagreva 10 sati na 85 °C i nakon toga ohladi na 28 °C. Reakcija se razblaži u DCM i koncentruje da se ukloni AcOH i da se dobije sirovi produkt koji se prečisti na flash koloni (12 g gel, EtOAc: petrol etar = 1 %-10%) da se dobije EEE-4 (1.78 g, 81%) kao žuta čvrsta supstanca.<1>H NMR (400 MHz, CDCl3) δ ppm 8.36 (d, J=13.8 Hz, 1H), 7.58 (d, J=13.8 Hz, 1H), 7.39 (d, J=9.0 Hz, 1H), 7.05 (d, J=3.0 Hz, 1H), 6.99 (dd, J=3.0, 9.0 Hz, 1H), 3.85 (s, 3H)
Faza 4 - Sinteza 2-(2-hlor-5-metoksifenil)etan-1-amina (EEE-5)
[0427] U rastvor EEE-4 (862 mg, 4.04 mmol) u anhidrovanom THF (40 mL) se na -20 °C u atmosferi N2doda LiAlH4(613 mg, 16.1 mmol). Nakon dodavanja, reaktivna smeša se meša 1 sat na 25 °C. Reaktivna smeša se nakon toga zagreva 2 sata na 50 °C i meša. Reaktivna smeša se neutrališe sa kapljicama vode. Reaktivna smeša se razblaži sa EtOAx, filtrira i koncentruje da se dobije sirovi produkt koji se prečisti flash hromatografijom na koloni (40 g gel, MeOH: DCM = 1%~8.0%) da se dobije EEE-5 (290 mg, 38.7%) kao žuto ulje.<1>H NMR (400 MHz, CDCl3) δ ppm 7.27 - 7.24 (m, 1H), 6.79 (d, J=2.8 Hz, 1H), 6.72 (dd, J=3.0, 8.8 Hz, 1H), 3.79 (s, 3H), 3.02 - 2.95 (m, 2H), 2.90 - 2.80 (m, 2H)
Faza 5 - Sinteza 5-hlor-8-metoksi-1,2,3,4-tetrahidroizohinolina (EEE-6)
[0428] U rastvor EEE-5 (195.0 mg, 0.679 mmol) u DCM (7.00 mL) se doda TFA (0.70 mL), a nakon toga vodeni rastvor HCHO (37%, 110 mg, 1.36 mmol). Nakon dodavanja, reaktivna smeša se meša 3 sata na 25 °C. Reaktivna smeša se razblaži u H2O i neutrališe sa sat. Na2CO3. Smeša se podeli sa EtOAc i H2O. Organski sloj se suši preko Na2SO4i koncentruje da se dobije sirovi produkt koji se prečisti pomoću prep-TLC (EtOAc:petrol etar = 1:1) da se dobije međuproizvod (170 mg) koji se suspenduje u aq. HCl (24%, 2 mL) i zagreva 3 sata na 110 °C. Reaktivna smeša se neutrališe sa sat. Na2CO3a nakon toga podeli između EtOAc i H2O.
Organski sloj se upari da se dobije sirovi produkt koji se prečisti prep-TLC hromatografijom na tankom sloju (EtOAc:petrol etar = 1:0) da se dobije produkt EEE-6 (50.0 mg, 37%) kao žuta guma.<1>H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ ppm 7.22 (d, J=8.8 Hz, 1H), 6.81 (d, J=8.8 Hz, 1H), 3.76 (s, 3H), 3.70 (s, 2H), 2.91 (t, J=6.0 Hz, 2H), 2.57 (t, J=5.8 Hz, 2H)
22
Faza 6 - Sinteza 5-hlor-1,2,3,4-tetrahidroizohinolin-8-ola (EEE-7)
[0429] U rastvor EEE-6 (50.0 mg, 0.253 mmol) u DCM (4.00 mL) se na 0 °C doda BBr3(0.40 mL, 4.20 mmol). Nakon dodavanja, reaktivna smeša se meša 1 sat na 25 °C. Reaktivna smeša se neutrališe sa MeOH i zaalkališe sa sat. K2CO3do pH 11-12. Smeša se ekstrahuje sa EtOAc. Organski sloj se suši preko Na2SO4i koncentruje da se dobije sirovi produkt koji se prečisti prep-TLC (MeOH: DCM = 1:10) da se dobije EEE-7 (50 mg, >99%) kao žuta guma i koristi direktno u sledećoj fazi.<1>H NMR (400 MHz, CDCl3) δ ppm 7.05 (d, J=8.5 Hz, 1H), 6.51 (d, J=9.3 Hz, 1H), 4.00 (s, 2H), 3.16 (t, J=6.0 Hz, 2H), 2.79 (t, J=6.1 Hz, 2H)
Faza 7 - Sinteza terc-butil 5-hlor-8-hidroksi-3,4-dihidroizohinolin-2(1H)-karboksilata (TP-19)
[0430] U rastvor EEE-7 (50 mg, 0.272 mmol) u DCM (5.00 mL) i MeOH (1.00 mL) se doda Boc2O (65 mg, 0.300 mmol) a nakon toga Et3N (68.9 mg, 0.681 mmol). Nakon dodavanja, reaktivna smeša se meša 2.5 sata na 25 °C. Reaktivna smeša se na 0 °C neutrališe sa aq. HCl (0.1 M) do pH 4-5. Dobijena smeša se podeli između DCM i H2O. Organski sloj se izdvoji, ispere sa slanim rastvorom, suši preko Na2SO4i koncentruje da se dobije sirovi produkt koji se prečisti prep-TLC (MeOH: DCM = 1:10) da se dobije TP-19 (50 mg, 65%) kao bela čvrsta supstanca.
Primeri 154 & 155 se izrađuju na sličan način kao Primer 78 u Šemi CC koristeći odgovarajući NBoc-zaštićeni tetrahidroizohinolin u fazi 1.
[0431]
Primer 156 (Šema FFF) - (1S,2S,3R,5S)-3-(4-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)-5-((5,6,7,8-tetrahidro-pirido[4,3-d]pirimidin-4-il)oksi)ciklopentan-1,2-diol (FFF-4)
22
Šema FFF
Faza 1: Sinteza (1S,4R)-4-(4-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)ciklopent-2-en-1-ola (FFF-1)
[0433] U rastvor BB-2 (650 mg, 2.06 mmol) u dioksanu (0.3 mL) i H2O (0.3 mL) se doda litijum hidroksid (494 mg, 20.6 mmol). Reakcija se zagreva na 90°C u toku noći. Reaktivna smeša se ohladi na r.t., razblaži sa H2O, ekstrahuje sa smešom 20% izopropil alkohol/DCM, organski slojevi se kombinuju i prečiste ISCO 4 g sa 100% EtOAc do 10% MeOH/EtOAc da se dobije 424 mg FFF-1 (96% prinos) kao bezbojno ulje koje stajanjem očvrsne.
LCMS [M+1] 216.15.<1>H NMR (400 MHz, HLOROFORM-d) δ ppm 2.22 (dt, J=15.16, 2.14 Hz, 1 H) 2.73 (s, 3 H) 3.00 (ddd, J=15.25, 9.20, 7.70 Hz, 1 H) 4.89 (br. s., 1 H) 5.37 (dq, J=9.23, 2.22 Hz, 1 H) 5.58 (br. s., 1 H) 5.85 (dd, J=5.50, 2.45 Hz, 1 H) 6.25 - 6.33 (m, 1 H) 6.54 (d, J=3.55 Hz, 1 H) 7.23 (d, J=3.55 Hz, 1 H) 8.69 (s, 1 H)
Faza 2: Sinteza terc-butil 4-(((1S,4R)-4-(4-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)ciklopent-2-en-1-il)oksi)-7,8-dihidropirido[4,3-d]pirimidin-6(5H)-karboksilata (FFF-2)
[0434] U rastvor FFF-1 (100 mg, 0.465 mmol) u THF (3 mL, c=0.2 M) se u malim količinama dodaje natrijum hidrid (27.9 mg, 0.697 mmol). Nakon 10 min mešanja na r.t., doda se terc-butil 4-hlor-7,8-dihidropirido[4,3-d]pirimidin-6(5H)-karboksilat (TP-20) (125 mg, 0.465 mmol). Dobijena reaktivna smeša se meša 3.5 h na r.t. i nakon toga neutrališe sa H2O, podeli između EtOAc (20 mL) i H2O (20 mL). Organska faza se odvoji, ispere sa slanim rastvorom, suši preko Na2SO4, koncentruje, prečisti hromatografijom na koloni sa 5-10% Me-OH/EtOAc da se dobije 150 mg FFF-2 (72% prinos) kao svetlo žuta penasta čvrsta supstanca. LCMS [M+1] 449.15.<1>H NMR (400 MHz, HLOROFORM-d) δ ppm 1.44 (s, 9 H) 1.87 (d,
22
J=15.04 Hz, 1 H) 2.66 (s, 3 H) 2.80 (t, J=4.77 Hz, 2 H) 3.15 (dt, J=15.31, 7.81 Hz, 1 H) 3.57 -3.65 (m, 1 H) 3.65 - 3.75 (m, 1 H) 4.33 (d, J=17.61 Hz, 1 H) 4.44 (d, J=17.12 Hz, 1 H) 5.98 (dt, J=4.31, 1.94 Hz, 1 H) 6.01 - 6.07 (m, 1 H) 6.07 - 6.14 (m, 1 H) 6.33 (br. s., 1 H) 6.52 (d, J=3.18 Hz, 1 H) 7.20 (d, J=3.67 Hz, 1 H) 8.51 (s, 1 H) 8.70 (s, 1 H)
Faza 3: Sinteza terc-butil 4-(((1S,2S,3S,4R)-2,3-dihidroksi-4-(4-metil-7H-pirolo[2,3-d] pirimidin-7-il)ciklopentil)oksi)-7,8-dihidropirido[4,3-d]pirimidin-6(5H)-karboksilata (FFF-3)
[0435] Jedinjenje FFF-2 se tretira sličnim postupcima kao u fazi 3 u Šemi BB da se dobije FFF-3 (50 mg, 33%). LCMS [M+1] 483.20.<1>H NMR (400 MHz, HLOROFORM-d) δ ppm 1.49 (s, 9 H) 2.36 - 2.50 (m, 1 H) 2.76 (s, 3 H) 2.91 (t, J=5.81 Hz, 2 H) 3.06 - 3.22 (m, 1 H) 3.62 - 3.84 (m, 2 H) 4.13 (s, 1 H) 4.36 - 4.50 (m, 2 H) 4.53 (d, J=6.24 Hz, 1 H) 4.93 - 5.05 (m, 1 H) 5.45 (td, J=7.12, 3.12 Hz, 1 H) 5.64 (br. s., 1 H) 6.61 (d, J=3.67 Hz, 1 H) 7.23 (d, J=3.67 Hz, 1 H) 8.64 (s, 1 H) 8.76 (s, 1 H)
Faza 4: Sinteza (1S,2S,3R,5S)-3-(4-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)-5-((5,6,7,8-tetrahidropirido[4,3-d]pirimidin-4-il)oksi)ciklopentan-1,2-diola (FFF-4)
[0436] Jedinjenje FFF-3 se tretira po standardnom uslovu deprotekcije slično kao u fazi 3 u Šemi CC da se dobije FFF- 4 (24 mg, 100%).
LCMS [M+1] 383.10.<1>H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ ppm 2.00 - 2.11 (m, 1 H) 2.92 (s, 3 H) 2.94 - 3.02 (m, 1 H) 3.06 (br. s., 2 H) 3.48 (br. s., 2 H) 4.11 (d, J=3.42 Hz, 1 H) 4.25 (br. s., 2 H) 4.66 (dd, J=8.86, 4.58 Hz, 1 H) 5.22 (q, J=8.93 Hz, 1 H) 5.28 - 5.37 (m, 1 H) 7.20 (br. s., 1 H) 8.09 (br. s., 1 H) 8.69 (s, 1 H) 9.18 (br. s., 1 H) 9.71 (br. s., 1 H) 9.87 (br. s., 1 H)
Primer 157 (Šema GGG) - (1S,2S,3R,5S)-3-(4-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)-5-((5,6,7,8-tetrahidro- 2,7-naftiridin-1-il)oksi)ciklopentan-1,2-diol (GGG-5)
22
Šema GGG
Faza 1: Sinteza terc-butil 8-hlor-3,4-dihidro-2,7-naftiridin-2(1H)-karboksilata (GGG-2)
[0438] U rastvor terc-butil 8-hidroksi-3,4-dihidro-2,7-naftiridin-2(1H)-karboksilata (GGG-1) (250 mg, 0.999 mmol) u CH3CN (2.5 mL) se polako dodaje POCl3(2.5 mL) i zagreva na 90°C u toku noći. Reaktivna smeša se neutrališe sa std. NaHCO3, rastvarač se ukloni rotoevaporacijom. U ostatak se doda MeOH 10 mL, u žitku masu se dodaju (BOC)2(337 mg, 1.50 mmol , 0.355 mL) i DIPEA (258 mg, 2.00 mmol , 0.331 mL) i meša 30 min na r.t.
Organski rastvarač se upari na rotoevaporatoru, dodaju se EtOAc i H2O, ekstrahuje sa EtOAc, organski sloj se koncentruje, prečisti hromatografijom na koloni sa 30% EtOAc/heptan da se dobije 240 mg GGG-2 (89% prinos) kao bezbojno ulje.
LCMS [M+1] 269.10.<1>H NMR (400 MHz, HLOROFORM-d) δ ppm 1.51 (s, 9 H) 2.84 (t, J=5.69 Hz, 2 H) 3.66 (t, J=5.81 Hz, 2 H) 4.56 (s, 2 H) 7.03 (d, J=5.01 Hz, 1 H) 8.17 (d, J=5.01 Hz, 1 H)
Faza 2: Sinteza terc-butil 8-(((1S,4R)-4-(4-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)ciklopent-2-en-1-il)oksi)- 3,4-dihidro-2,7-naftiridin-2(1H)-karboksilata (GGG-3)
[0439] Rastvor FFF-1 (92 mg, 0.43 mmol) i GGG-2 (115 mg, 0.427 mmol) u DMSO (4.27 mL, c=0.1 M) se tretira sa kalijum butoksidom (61.8 mg, 0.534 mmol, 0.534 mL, 1.0 M). Reakcija se zagreva 15 min na 120°C. Reakcija se ohladi na r.t., razblaži sa H2O i EtOAc (10 mL svaki). Vodena faza se ekstrahuje sa EtOAc (10 mL). Kombinovanje organske supstance se isperu sa H2O (2 x 15 mL), slanim rastvorom (15 mL) i suše preko Na2SO4. Uzorak se koncentruje i prečisti preparativnom HPLC da se dobije 40 mg GGG-3 kao braon čvrsta
22
supstanca (21% prinos). LCMS [M+1] 448.20.<1>H NMR (400 MHz, HLOROFORM-d) δ ppm 1.45 - 1.56 (m, 9 H) 1.94 (d, J=14.92 Hz, 1 H) 2.63 (s, 3 H) 2.68 - 2.81 (m, 2 H) 3.20 (dt, J=15.13, 7.78 Hz, 1 H) 3.55 - 3.69 (m, 2 H) 4.33 - 4.45 (m, 1 H) 4.49 (br. s., 1 H) 6.06 (br. s., 2 H) 6.11 (d, J=4.03 Hz, 1 H) 6.45 (br. s., 1 H) 6.62 (br. s., 1 H) 6.68 (d, J=5.01 Hz, 1 H) 7.39 (br. s., 1 H) 7.92 (d, J=5.14 Hz, 1 H) 8.84 (br. s., 1 H)
Faza 3: Sinteza terc-butil 8-(((1S,2S,3S,4R)-2,3-dihidroksi-4-(4-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)ciklopentil)oksi)-3,4-dihidro-2,7-naftiridin-2(1H)-karboksilata (GGG-4)
[0440] Jedinjenje GGG-3 se tretira sličnim postupcima kao u fazi 3 u Šemi BB da se dobije GGG-4 (7.3 mg, 17%). LCMS [M+1] 481.90.<1>H NMR (400 MHz, HLOROFORM-d) δ ppm 1.49 (s, 10 H) 2.43 - 2.54 (m, 1 H) 2.75 (s, 3 H) 2.81 (t, J=5.75 Hz, 2 H) 3.03 (br. s., 1 H) 3.63 - 3.71 (m, 2 H) 4.38 (br. s., 1 H) 4.47 (br. s., 3 H) 4.66 (br. s., 1 H) 5.03 - 5.12 (m, 1 H) 5.25 -5.32 (m, 1 H) 5.48 (s, 1 H) 6.60 (d, J=3.55 Hz, 1 H) 6.77 (d, J=5.26 Hz, 1 H) 7.29 (d, J=3.79 Hz, 1 H) 7.93 (d, J=5.14 Hz, 1 H) 8.77 (s, 1 H)
Faza 4: Sinteza (1S,2S,3R,5S)-3-(4-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)-5-((5,6,7,8-tetrahidro-2,7-naftiridin-1-il)oksi)ciklopentan-1,2-diola (GGG-5)
[0441] Jedinjenje GGG-4 se tretira po standardnom uslovu deprotekcije slično kao u fazi 3 u Šemi CC da se dobije GGG-5 (6 mg, 90%).
LCMS [M+1] 382.20<1>H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ ppm 1.93 - 2.02 (m, 1 H) 2.86 - 2.92 (m, 3 H) 2.92 - 2.98 (m, 1 H) 3.01 (t, J=5.99 Hz, 2 H) 3.57 (s, 2 H) 4.08 (d, J=4.03 Hz, 1 H) 4.20 (br. s., 2 H) 4.66 (dd, J=8.93, 4.52 Hz, 1 H) 5.15 - 5.23 (m, 1 H) 5.23 - 5.29 (m, 1 H) 6.91 (d, J=5.26 Hz, 1 H) 7.16 (d, J=3.30 Hz, 1 H) 7.99 - 8.06 (m, 2 H) 9.13 (s, 1 H)
9.52 (br. s., 1 H) 9.64 (br. s., 1 H)
Primer 158 (Šema HHH) - (1S,2R,3R,5S)-3-((2-metilpirimidin-4-il)oksi)-5-((1,2,3,4-tetrahidroizohinolin-8-il)oksi)ciklopentan-1,2-diola (HHH-6) (referenca)
22
Šema HHH
Faza 1: Sinteza terc-butil 8-(((1S,4R)-4-((terc-butoksikarbonil)oksi)ciklopent-2-en-1-il)oksi)-3,4-dihidroizo-hinolin-2(1 H)-karboksilata (HHH-1)
[0443] Bočica A: U reaktivnu bočicu osušenu u pećnici, opremljenu magnetnom mešalicom i ohlađenu u struji argona, se dodaju Tris(benzilidenaceton)dipaladijum(0)hloroform adukt (44.7 mg, 0.043 mmol) i MFCD02684551 (R,R)-DACH-Naphthyl Trost Ligand (102 mg, 0.129 mmol). Bočica se prečisti pod vakuumom sa argonom pod dinamičkim vakuumom i doda se DCE (3.6 mL), koji je prethodno 30 minuta prskan sa argonom. Rastvor se meša 30 minuta na rt kada se dobija svetlo narandžasti rastvor ligatiranog katalizatora. U ovoj fazi se pripremi Bočica B.
[0444] Bočica B: U reaktivnu bočicu osušenu u pećnici, opremljenu magnetnom mešalicom i ohlađenu u struji argona, se dodaju terc-butil 8-hidroksi-3,4-dihidroizohinolin-2(1H)-karboksilat (538 mg, 2.16 mmol) i di-terc-butil-((1R, 3S)-ciklopent-4-en-1,3-diil)-bis(karbonat) (BB-1) (izrađen kako je zabeleženo u J. Am. Chem. Soc.2006, 128, 6054-6055) (778 mg, 2.59 mmol). Bočica se prečisti pod vakuumom sa argonom pod dinamičkim vakuumom i doda se DCE (3.6 mL), koji je prethodno 30 minuta prskan sa argonom a nakon toga se hermetičkim špricem doda sadržaj Bočice A. Reakcija se meša 14 sati u atmosferi argona na rt. Reakcija se koncentruje pod vakuumom i prečisti flash hromatografijom na
2
koloni (24g SiO2, Isco, 100% Hept. do 100% EtOAc, 20 mL frakcije) da se dobije HHH-1 (973 mg, >95%) kao žuta pena. LCMS [M+H-Boc-izobutilen] = 276 zabeleženo;<1>H NMR (400MHz, HLOROFORM-d) δ ppm 7.12 (t, J=7.9 Hz, 1H), 6.75 (d, J=7.7 Hz, 1H), 6.72 (d, J=8.2 Hz, 1H), 6.22 (td, J=1.4, 5.7 Hz, 1H), 6.18 - 6.09 (m, 1H), 5.47 (t, J=5.8 Hz, 1H), 5.15 (t, J=5.7 Hz, 1H), 4.59 - 4.40 (m, J=8.2 Hz, 2H), 3.74 - 3.54 (m, 2H), 3.05 (td, J=7.4, 14.5 Hz, 1H), 2.81 (t, J=5.7 Hz, 2H), 1.96 (td, J=4.5, 14.5 Hz, 1H), 1.52 - 1.47 (m, 18H).
Faza 2: Sinteza terc-butil 8-(((1S,2S,3R,4R)-4-((terc-butoksikarbonil)oksi)-2,3-dihidroksiciklopentil)oksi)-3,4-dihidroizohinolin-2(1H)-karboksilata (HHH-2)
[0445] U scintilacionu bočicu, opremljenu magnetnom mešalicom i koja sadrži HHH-1 (225 mg, 0.521 mmol), se doda DCM (2.6 mL). U rastvor se doda 4-Metilmorfolin-N-oksid (NMO) (0.32 mL, 1.50 mmol) kao 50 mt% rastvor u vodi a nakon toga u se kapima dodaje osmijum tetraoksid (130 mL, 0.02 mmol) kao 4 mt% rastvor u vodi. Reakcija se meša 23 sata na rt. Reakcija se prenese u levak za razdvajanje sa DCM, razblaži sa vodom i dalje razblaži sa 1M rastvorom NaHSO3. Faze se razdvoje i vodena faza se ekstrahuje sa 3 porcije DCM. Kombinovani organski ekstrakti se suše (MgSO4), filtriraju i koncentruju pod vakuumom. Sirovi ostatak se prečisti flash hromatografijom na koloni (12g SiO2, Isco, 100% Hept. do 100% EtOAc, 9 mL frakcije) da se dobije HHH-2 (211 mg, 87%) kao bela čvrsta supstanca. LCMS [M+H-Boc-izobutilen] = 310 zabeleženo;<1>H NMR (400MHz, CHLO- ROFORM-d) δ ppm 7.12 (t, J=7.9 Hz, 1H), 6.76 (d, J=7.7 Hz, 1H), 6.71 (d, J=8.2 Hz, 1H), 4.90 (td, J=5.8, 9.0 Hz, 1H), 4.69 - 4.59 (m, 1H), 4.45 (s, 2H), 4.34 (s, 1H), 4.26 (br. s., 1H), 3.63 (d, J=5.7 Hz, 2H), 2.81 (t, J=5.7 Hz, 3H), 2.03 - 1.91 (m, J=5.7, 9.3 Hz, 1H), 1.53 - 1.48 (m, 18H).
Faza 3: Sinteza terc-butil 8-(((3aR,4S,6R,6aS)-6-((terc-butoksikarbonil)oksi)-2,2-dimetiltetrahidro-4H-ciklopenta[d][1,3]dioksol-4-il)oksi)-3,4-dihidroizohinolin-2(1H)-karboksilata (HHH-3)
[0446] U reaktivnu bočicu, opremljenu magnetnom mešalicom i koja sadrži HHH-2 (211 mg, 0.453 mmol), se dodaju aceton (0.29 mL), 4-toluensulfonska kiselina monohidrat (172 mg, 0.906 mmol) i 2,2-dimetoksipropan (0.56 mL, 4.53 mmol). Reakcija se meša 1 sat na rt.
Reakcija se prenese u levak za razdvajanje sa EtOAc i vodom. Dvofazna smeša se razblaži sa sat. NaHCO3i faze se razdvoje. Organska faza se ispere sa 1 porcijom napola sat. NaHCO3i
2 1
kokmbinovani vodeni sloj se ponovo ekstrahuje sa 1 portion EtOAc. Kombinovane organske faze se suše (MgSO4), filtriraju i koncentruju pod vakuumom. Sirovi ostatak se prečisti flash hromatografijom na koloni (12g SiO2, Isco, 100% Hept do 100% EtOAc, 9 mL frakcije) da se dobije HHH-3 (140.5 mg, 61%) kao bela čvrsta supstanca. LCMS [M+H-Boc-izobutilen] = 350 zabeleženo;<1>H NMR (400MHz, HLOROFORM-d) δ ppm 7.12 (s, 1H), 6.73 (t, J=8.1 Hz, 2H), 4.94 (d, J=4.6 Hz, 1H), 4.80 - 4.66 (m, 3H), 4.61 - 4.43 (m, 2H), 3.63 (s,
2H), 2.80 (t, J=5.6 Hz, 2H), 2.47 (td, J=5.4, 15.4 Hz, 1H), 2.25 (td, J=1.5, 15.4 Hz, 1H), 1.49 (s, 12H), 1.45 (s, 9H), 1.31 (s, 3H).
Faza 4: Sinteza terc-butil 8-(((3aR,4S,6R,6aS)-6-hidroksi-2,2-dimetiltetrahidro-4H-ciklopenta[d][1,3]dioksol-4-il)oksi)-3,4-dihidroizohinolin-2(1H)-karboksilata (HHH-4)
[0447] U mikrotalasnu bočicu, opremljenu magnetnom mešalicom i koja sadrži HHH-3 (134.5 mg, 0.266 mmol) se dodaju dioksan (1.3 mL) i voda (1.3 mL). U rastvor se doda litijum hidroksid (63.7 mg, 2.66 mmol) i bočica se zatvori sa Teflon zatvaračem. Bočica se stavi u pećnicu i meša 19 sati na 100°C. Bočica se ukloni iz pećnice i ostavi da se ohladi na rt. Rastvor se prenese u levak za razdvajanje sa EtOAc i razblaži sa vodom. Faze se razdvoje i vodena faza se ekstrahuje sa 3 porcije EtOAc. Kombinovani organski ekstrakti se suše (MgSO4), filtriraju i koncentruju pod vakuumom. Sirovi ostatak se prečisti flash hromatografijom na koloni (4g SiO2, Isco, 100% Hept. do 100% EtOAc, 9 mL frakcije) da se dobije HHH-4 (97.3 mg, 90%) kao bela pena. LCMS [M+H-Boc] = 306 zabeleženo;<1>H NMR (400MHz, HLOROFORM-d) δ ppm 7.17 (t, J=7.9 Hz, 1H), 6.84 (d, J=8.3 Hz, 1H), 6.81 (d, J=7.7 Hz, 1H), 4.75 (dd, J=5.4, 7.8 Hz, 2H), 4.67 (dd, J=1.3, 5.6 Hz, 1H), 4.55 - 4.33 (m, 2H), 4.27 (d, J=4.6 Hz, 1H), 3.78 - 3.49 (m, 2H), 2.82 (t, J=5.7 Hz, 2H), 2.42 (td, J=5.0, 15.0 Hz, 1H), 2.10 (d, J=15.0 Hz, 1H), 1.49 (s, 9H), 1.46 (s, 3H), 1.31 (s, 3H).
Faza 5: Sinteza terc-butil 8-(((3aR,4S,6R,6aS)-2,2-dimetil-6-((2-metilpirimidin-4-il)oksi)tetrahidro-4H-ciklopenta[d][1,3]dioksol-4-il)oksi)-3,4-dihidroizohinolin-2(1H)-karboksilata (HHH-5)
[0448] U reaktivnu bočicu osušenu u pećnici, opremljenu magnetnom mešalicom i koja sadrži HHH-4 (43 mg, 0.110 mmol), se dodaju DMF (0.53 mL) i natrijum hidrid (8.5 mg, 0.210 mmol) kao 60 mt% disperzija u mineralnom ulju. Rastvor se meša 1 sat na rt da se dobije
2 2
tamno braon rastvor natrijum alkoksida. U rastvor se doda 4-hlor- -metilpirimidin (16.4 mg, 0.127 mmol) i bočica se stavi u blok za zagrevanje i zagreva 16 sati na 115°C. Reakcija se pažljivo neutrališe dodavanjem vode u kapima. Rastvor se dalje razblaži sa vodom i prenese u levak za razdvajanje sa EtOAc. Faze se razdvoje i vodena faza se ekstrahuje sa 4 porcije smeše 3:1 DCM/IPA. Kombinovani organski ekstrakti se isperu sa 1 porcijom slanog rastvora, suše (MgSO4), filtriraju i koncentruju pod vakuumom. Sirovo HHH-5 se koristi u sledećoj fazi bez daljeg prečišćavanja. LCMS [M+H-Boc] = 398 zabeleženo
Faza 6: Sinteza (1S,2R,3R,5S)-3-((2-metilpirimidin-4-il)oksi)-5-((1,2,3,4-tetrahidroizohinolin-8-il)oksi)ciklopentan-1,2-diola (HHH-6)
[0449] U bocu okruglog dna, opremljenu magnetnom mešalicom i koja sadrži HHH-5 (53 mg, 0.11 mmol, sirovo iz faze 5) se dodaju voda (1.0 mL) i TFA (0.5 mL). Rastvor se meša 1 sat na rt. Reakcija se prenese u levak za razdvajanje sa DCM i podesi na bazni pH sa sat. NaHCO3aq. Faze se razdvoje i vodena faza se ekstrahuje sa 4 porcije smeše 3:1 DCM/IPA. Kombinovani organski ekstrakti se isperu sa 1 porcijom sat. NaHCO3aq., suše (MgSO4), filtriraju i koncentruju pod vakuumom. Sirovi ostatak se prečisti prep-HPLC (Lux Cellulose-14.6 x 100 mm 3µ kolona, 20% MeOH/DEA @ 120 bar, 4 mL/min) da se dobije HHH-6 (7.06 mg, 19% preko 2 faze) kao bela čvrsta supstanca. LCMS [M+H] = 358 zabeleženo; [α]<22>D= 3.7° (c=0.1, MeOH);<1>H NMR (400MHz, METANOL-d4) δ ppm 8.05 (d, J=6.4 Hz, 1H), 7.15 (t, J=7.9 Hz, 1H), 6.84 (d, J=8.1 Hz, 1H), 6.79 (d, J=7.6 Hz, 1H), 6.67 (d, J=6.5 Hz, 1H), 4.68 (br. s, 2H), 4.61 (td, J=4.2, 8.1 Hz, 1H), 4.26 (t, J=4.3 Hz, 1H), 4.12 (td, J=4.9, 7.4 Hz, 1H), 4.02 - 3.90 (m, 3H), 2.90 (t, J=5.7 Hz, 2H), 2.74 (td, J=7.7, 15.0 Hz, 1H), 2.47 (s, 3H), 1.62 (td, J=4.7, 14.6 Hz, 1H).
Sinteza 2-(benziloksi)-5-fluor-4-metilbenzoeve kiseline (III-4)
2
Šema III
Faza 1 - Sinteza metil 2-(benziloksi)-4-brom-5-fluorobenzoata (III-2)
[0451] U rastvor metil 4-brom-5-fluor-2-hidroksibenzoata III-1 (1.62 g, 6.505 mmol) u DMF (20 mL) se dodaju K2CO3(2.7 g, 19.5 mmol) i BnBr (2.23 g, 13 mmol). Smeša se meša 3 h na 16 °C. Smeša se razblaži sa vodom (100 mL). Nakon toga se smeša ekstrahuje sa EtOAc (50 mL x 2). Organski slojevi se sakupe, suše i upare da se dobije sirovi produkt koji se prečisti flash hromatografijom uz eluiranje sa smešom petrol etar/EtOAc od 0-10% da se dobije III-2 (1.8 g, 82 %) kao bela čvrsta supstanca i koristi direktno u sledećoj fazi.
Faza 2 - Sinteza metil 2-(benziloksi)-5-fluor-4-metilbenzoata (III-3)
[0452] Smeša III-2 (2 g, 5.87 mmol), Pd(Ph3P)4(339 mg, 0.293 mmol) u THF (20mL) se degasira četiri puta sa N2, nakon toga se na 0 °C doda AlMe3(7.87 mL, 15.7 mmol, 2M) i reakcija se meša 24 sata na 80 °C. Reakcija se nakon toga neutrališe sa aq. kalijum natrijum tartarat tetrahidratom, ekstrahuje tri puta sa EtOAc, kombinovani organski slojevi se suše preko Na2SO4, rastvarač ukloni pod vakuumom, a ostatak se prečisti flash biotage (petrol etar/EtOAc=0-5%) da se dobije III-3 (660 mg, 41%) kao žuto ulje.<1>H NMR (400 MHz, CDCl3) δ ppm 7.57 - 7.47 (m, 3H), 7.43 - 7.37 (m, 2H), 7.36 - 7.30 (m, 1H), 6.84 (d, J=6.0 Hz, 1H), 5.14 (s, 2H), 3.90 (s, 3H), 2.29 (d, J=2.0 Hz, 3H)
Faza 3 - Sinteza 2-(benziloksi)-5-fluor-4-metilbenzoeve kiseline (III-4)
[0453] U rastvor III-3 (0.71 g, 2.59 mmol) u MeOH (4 mL) se doda rastvor LiOH.H2O (326 gm, 7.77 mmol) u H2O (4 mL). Reaktivna smeša se meša 2 sata na 20 °C. Reaktivni rastvor se upari da se ukloni najveći deo metanola a ostatak se nakon toga podesi na pH~2 sa 1N rastvorom HCl. Formiraju se bele čvrste supstance i ekstrahuju sa EtOAc (20 mL x 2).
2 4
Organski slojevi se suše i upare da se dobije III-4 (670 mg, 99.5%) kao bela čvrsta supstanca.
<1>H NMR (400 MHz, CDCl3) δ ppm 10.76 (br. s., 1H), 7.83 (d, J=9.5 Hz, 1H), 7.52 - 7.37 (m, 5H), 6.96 (d, J=6.0 Hz, 1H), 5.26 (s, 2H), 2.35 (s, 3H)
Primer 159 (Šema JJJ) - (1S,2S,3S,5R)-3-(2-(aminometil)-4-hlorfenoksi)-5-(4-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)ciklopentan-1,2-diol (JJJ-3) (referenca)
[0454]
Faza 1 - Sinteza 5-hlor-2-(((1S,4R)-4-(4-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)ciklopent-2-en-1- il)oksi)benzonitrila (JJJ-1)
[0455] U osušenu mikrotalasnu bočicu (prečisti se sa N2) se dodaju BB-2 (100 mg, 0.317 mmol), 5-hlor-2-hidroksibenzonitril (56 mg, 0.37 mmol), Cs2CO3(114 mg, 0.35 mmol), Pd2(dba)3(8.2 mg, 0.008 mmol) i DPPP (7.85 mg, 0.019 mmol). Bočica se tri puta prečisti sa N2i doda se DCE (1.5 mL, prska 30 min. sa N2). Crna smeša se meša 1 sat na 20 °C. Nakon toga se reaktivna smeša direktno prečisti prep-TLC (Petroleum etar:EtOAc=1/4) da se dobije JJJ-1 (83 mg, 75%) kao žuta guma. LCMS [M+1] 351;<1>H NMR (400 MHz, CDCl3) δ ppm 8.77 (s, 1H), 7.56 (d, J=2.8 Hz, 1H), 7.50 (dd, J=2.6, 8.9 Hz, 1H), 7.41 (d, J=3.8 Hz, 1H), 7.00 (d, J=9.0 Hz, 1H), 6.63 (d, J=3.5 Hz, 1H), 6.40 (td, J=1.9, 5.5 Hz, 1H), 6.26 (dd, J=2.4, 5.6 Hz, 1H), 6.14 - 6.08 (m, 1H), 5.44 (d, J=7.0 Hz, 1H), 3.21 - 3.11 (m, 1H), 2.73 (s, 3H), 2.04 (td, J=3.2, 14.9 Hz, 1H)
2
Faza 2 - Sinteza 5-hlor-2-(((1S,2S,3S,4R)-2,3-dihidroksi-4-(4-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)ciklopentil)oksi)benzonitrila (JJJ-2)
[0456] U smešu JJJ-1 (83 mg, 0.237 mmol) u DCM (6 mL)/H2O (0.2 mL) se na 20 °C dodaju NMO (96 mg, 0.71 mmol) i OSO4(4 % u t-BuOH, 80 mg, 0.013 mmol). Braon smeša se meša 6 sati na 20 °C. Smeša se razblaži sa DCM (5 mL) i neutrališe sa sat. Na2SO3(2 mL) i razdvoji. Organski sloj se ispere sa slanim rastvorom (5 mL). Kombinovani organski slojevi se ekstrahuju sa DCM (5 mL X 2). Kombinovani organski slojevi se suše preko Na2SO4, filtriraju i koncentruju da se dobije sirovi produkt (100 mg) kao svetlo žuta čvrsta supstanca, koja se prečisti prep-TLC (EtOAc:MeOH=10:1) da se dobije JJJ-2 (40 mg, 44%) kao bela čvrsta supstanca. LCMS [M+1] 385;<1>H NMR (400 MHz, MeOD) δ ppm 8.60 (s, 1H), 7.73 (d, J=2.5 Hz, 1H), 7.66 (d, J=3.5 Hz, 1H), 7.63 (dd, J=2.6, 9.2 Hz, 1H), 7.30 (d, J=9.0 Hz, 1H), 6.76 (d, J=3.5 Hz, 1H), 5.35 - 5.26 (m, 1H), 4.69 (dd, J=4.9, 8.4 Hz, 1H), 4.21 (d, J=4.5 Hz, 1H), 3.04 (ddd, J=6.8, 9.8, 14.8 Hz, 1H), 2.71 (s, 3H), 2.17 (ddd, J=3.0, 7.7, 14.7 Hz, 1H)
Faza 3 - Sinteza (1S,2S,3S,5R)-3-(2-(aminometil)-4-hlorfenoksi)-5-(4-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)ciklopentan-1,2-diola (JJJ-3)
[0457] Smeša JJJ-2 (40 mg, 0.104 mmol) i Raney-Ni (8 mg) u smeši EtOH (7 mL)/NH3.H2O (0.5 mL) se degasira četiri puta sa H2. Smeša se meša 20 h na 20 °C u balonu H2. Smeša se filtrira i filtrat se koncentruje pod vakuumom da se dobije bela čvrsta supstanca, koja se prečisti prep-TLC (DCM:MeOH:NH3.H2O=10:1:0.1) da se dobije produkt (-20 mg) kao žuta guma i liofilizira. Materijal se ponovo prečisti prep-HPLC da se dobije JJJ-3 (9 mg, 22%). LCMS [M+1] 389;<1>H NMR (400 MHz, MeOD) δ ppm 8.60 (s, 1H), 7.56 (d, J=3.8 Hz, 1H), 7.42 (d, J=2.5 Hz, 2H), 7.21 (d, J=8.8 Hz, 1H), 6.74 (d, J=3.5 Hz, 1H), 5.11 (q, J=9.1 Hz, 1H), 4.82 - 4.76 (m, 2H), 4.29 (dd, J=2.1, 5.1 Hz, 1H), 4.26 - 4.15 (m, 2H), 3.06 - 2.92 (m, 1H), 2.72 (s, 3H), 2.37 (ddd, J=5.0, 9.7, 14.4 Hz, 1H)
Primeri 160 & 161 se izrađuju upotrebom slične hemije iz Šeme A koristeći (4-hlor-3-fluorofenil)magnezijum bromid za fazu 8.
[0458]
2
Primer 162 se izrađuju na sličan način kao Primer 99 u Šemi NN koristeći izohinolin-8-ol u fazi 2.
[0459]
2
Sinteza 6-hidroksi-3,4-dihidrobenzo[f][1,4]oksazepin-5(2H)-ona (TP-21) i terc-butil 6-hidroksi-2,3-dihidrobenzo[f][1,4]oksazepin-4(5H)-karboksilata (TP-22) (Šema KKK)
[0460]
Šema KKK
Faza 1 - Sinteza metil 2-(2-((terc-butoksikarbonil)amino)etoksi)-6-hidroksibenzoata (KKK-2)
[0461] Rastvor metil 2,6-dihidroksibenzoata (1.2 g, 7.14 mmol), terc-butil (2-bromoetil)karbamata (2.33 g, 7.14 mmol) i K2CO3(2.5 g, 17.8 mmol) u DMF (10 mL) se meša 32 h na 15 °C. U reaktivnu smešu se doda voda i ekstrahuje tri puta sa EtOAc.
Kombinovani organski slojevi se suše preko natrijum sulfata, koncentruju pod vakuumom, a
2
ostatak se prečisti flash hromatografijom (petrol etar/EtOAc=10-20%) da se dobije jedinjenje KKK-2 (900 mg, 41%) kao bela čvrsta supstanca koja se direktno koristi u sledećoj fazi.
Faza 2 - Sinteza metil 2-(2-((terc-butoksikarbonil)amino)etoksi)-6-hidroksibenzoata (KKK-3)
[0462] U rastvor jedinjenja KKK-2 (900 mg, 2.89 mmol) u DCM (10 ml) se na 0-5 °C doda TFA (2 mL), nakona toga se reaktivna smeša meša 2 h na 15 °C. Rastvarač se ukloni i ostatak (700 mg, >99%) se direktno koristi u sledećoj fazi.
Faza 3 - Sinteza 6-hidroksi-3,4-dihidrobenzo[f][1,4]oksazepin-5(2H)-ona (TP-21)
[0463] U rastvor jedinjenja KKK-3 (700 mg, 3.31 mmol) u i-PrOH (6 mL) se na 15 °C doda TEA (3.35 g, 33.1 mmol), a nakon toga se reaktivna smeša meša 6 h na 95 °C. Rastvarač se ukloni a ostatak se prečisti flash hromatografijom (20 g, petrol etar/EtOAc=10-50%) da se dobije jedinjenje TP-21 (480 mg, 81%) kao bela čvrsta supstanca.<1>H NMR (400 MHz, CDCl3) δ ppm 12.61 (s, 1H), 7.33 - 7.29 (m, 1H), 6.70 (d, J=8.3 Hz, 1H), 6.57 (br. s., 1H), 6.53 (d, J=8.0 Hz, 1H), 4.41 - 4.35 (m, 2H), 3.57 (q, J=4.8 Hz, 2H)
Faza 4 - Sinteza 2,3,4,5-tetrahidrobenzo[f][1,4]oksazepin-6-ola (KKK-4)
[0464] U rastvor jedinjenja TP-21 (100 mg, 0.56 mmol) u anhidrovanom THF (2 mL) se na 0 °C u kapima u atmosferi N2dodaje BH3-Me2S (127 mg, 1.67 mmol). Nakon dodavanja, smeša se zagreva 3 sata na 70 °C (refluks). Reaktivna smeša se nakon toga pažljivo neutrališe sa 1 mL MeOH na -10~20 °C, nakon toga se doda još 6N rastvora HCl 10 mL, a zatim refluksuje 3h, najveći deo rastvarača se ukloni pod vakuumom, a ostatak se zatim podesi na pH 8-9 sa K2CO3i tri puta ekstrahuje sa EtOAc. Kombinovani organski slojevi se suše preko Na2SO4, filtriraju i koncentruju da se dobije sirovo jedinjenje KKK-4 (0.5 g, >99%). LCMS [M+1] 166
Faza 5 - Sinteza terc-butil 6-hidroksi-2,3-dihidrobenzo[f][1,4]oksazepin-4(5H)-karboksilata (TP-22)
2
[0465] Sirovo jedinjenje KKK-4 (500 mg, 0.61 mmol) se rastvori u DCM (5 mL) i MeOH (5 mL). Dodaju se (Boc)2O (132 mg, 0.605 mmol) i Et3N (184 mg, 1.82 mmol) i reaktivna smeša se meša 16 sati na 15 °C. Doda se DCM (10 mL), nakon toga ispere sa sirćetnom kiselinom (5 mL) i zasićenim NaCl (5 mL). Organski sloj se odvoji, suši i upari da se dobije ostatak.
Nakon toga se doda 10 mL MeOH da rastvori ostatak, a zatim se u smeša doda K2CO3(200 mg). Reaktivna smeša se meša 2 sata na 15 °C. U rastvor se doda DCM (25 mL x 2), rastvor se ispere sa sirćetnom kiselinom (5 mL,pH <7) i zasićenim NaCl (5 mL). Organski slojevi se kombinuju, suše i upare da se dobije sirovi produkt koji se prečisti prep-TLC da se dobije jedinjenje TP-22 (13 mg, 8%) kao žuta čvrsta supstanca.<1>H NMR (400 MHz, CDCl3) δ ppm 7.62 (br s, 1H), 7.07 (t, J=8.2 Hz, 1H), 6.73 (d, J=7.5 Hz, 1H), 6.64 (d, J=7.8 Hz, 1H), 4.37 (s, 2H), 4.01 - 3.92 (m, 2H), 3.79 - 3.70 (m, 2H), 1.40 (s, 9H) LCMS [M-Boc+1] 210.
Sinteza terc-butil 6-(1-(terc-butoksikarbonil)-1 H-pirazol-4-il)-8-hidroksi-3,4-dihidroizohinolin- 2(1H)-karboksilata (TP-23) (Šema LLL)
[0466]
Šema LLL
[0467] U atmosferi N2, u bočicu se dodaju TP-12 (50 mg, 0.15 mmol), terc-butil 4-(4,4,5,5-tetrametil-1,3,2-dioksaborolan-2-il)-1H-pirazol-1-karboksilat (67 mg, 0.23 mmol), K3PO4(97 mg, 0.46 mmol) i XPhos-paladaciklus (13 mg, 0.015 mmol). Doda se DMF (1.60 mL) i reaktivni rastvor se zagreva mikrotalasima 16 sati na 50 °C. Dodaju se EtOAc i H2O da se razblaži reaktivni rastvor. Vodeni sloj se ekstrahuje sa EtOAc (3 mL x 2). Organski slojevi se razdvoje, suše i upare da se dobije sirovi produkt koji se prečisti prep-TLC (petrol etar/EtOAc=1/ 1) da se dobije traženo jedinjenje TP-23 (33 mg, 90%) kao bezbojno ulje. LCMS [M-Boc+1] 316.
24
Sinteza terc-butil 6-(1-(terc-butoksikarbonil)-1H-pirazol-4-il)-5-fluor-8-hidroksi-3,4-dihidroizohinolin-2(1H)-karboksilata (TP-24) (Šema MMM)
[0468]
Šema MMM
[0469] TP-24 se sintetiše na sličan način kao u TP-23 (Šema LLL) počevši od TP-11. LCMS [M-Boc+1] 334.
Sinteza terc-butil 8-hidroksi-6-(1-metil-1H-1,2,3-triazol-5-il)-3,4-dihidroizohinolin-2(1H)-karboksilata (TP-25) (Šema NNN)
[0470]
Faza 1 - Sinteza terc-butil 8-(benziloksi)-6-(4,4,5,5-tetrametil-1,3,2-dioksaborolan-2-il)-3,4-dihidroizohinolin-2(1H)-karboksilata (NNN-1)
[0471] Smeša GG-7 (3.00 g, 7.17 mmol), bis(pinakolato)dibora (2.73 g, 10.8 mmol), KOAc (1.4 g, 14.3 mmol) i PdCl2(dppf).CH2Cl2(262 mg, 0.36 mmol) u dioksanu (30.0 mL) se zagreva 16 sati na 80 °C. Doda se voda (30 mL) da se razblaži reaktivni rastvor i zatim ekstrahuje sa EtOAc (30 mL x 2). Organski slojevi se kombinuju, suše i upare da se dobije sirovi produkt koji se prečisti flash hromatografijom (120 g silika gel), eluira sa smešom petrol etar/EtOAc 0-20%, da se dobije NNN-1 (3 g, 90%) kao bela čvrsta supstanca. LCMS [M-Boc+1] 366;<1>H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ ppm 7.50 - 7.45 (m, 2H), 7.43 - 7.39 (m, 2H), 7.37 - 7.30 (m, 1H), 7.13 (d, J=2.5 Hz, 2H), 5.15 (br. s., 2H), 4.54 - 4.38 (m, 2H), 3.59 -3.50 (m, 2H), 2.77 (t, J=5.5 Hz, 2H), 1.42 (s, 9H), 1.29 (s, 12H)
Faza 2 - Sinteza terc-butil 8-(benziloksi)-6-(1-metil-1H-1,2,3-triazol-5-il)-3,4-dihidroizohinolin-2(1H)-karboksilata (NNN-2)
[0472] U atmosferi argona, bočica koja sadrži NNN-1 (800 mg, 1.72 mmol), 5-jod-1-metil-1H-1,2,3-triazol (467 mg, 2.23 mmol), PdCl2(dppf)-DCM (126 mg, 0.172 mmol), K2CO3(475 mg, 3.44 mmol), DME (10.0 mL) i vodu (1.00 mL) se zatvori i zagreva 16 sati na 80°C. U reakciju se doda voda (10.0 mL) i ekstrahuje sa EtOAc (10 mL x 2). Organski slojevi se razdvoje, suše i upare da se dobije sirovi produkt koji se prečisti flash hromatografijom (80 g), uz eluiranje sa smešom petrol etar/EtOAc (1:1) da se dobije NNN-2 (640 mg, 89%) kao bezbojno ulje. LCMS [M+1] 421.
Faza 3 - Sinteza terc-butil 8-hidroksi-6-(1-metil-1H-1,2,3-triazol-5-il)-3,4-dihidroizohinolin-2(1H)-karboksilata (TP-25)
[0473] Jedinjenje NNN-2 (640 mg, 1.52 mmol) se rastvori u EtOAc (3 mL). U prethodno dobijenu smešu se doda Pd/C (162 mg, 1.52 mmol) i reaktivna smeša se meša 48 sati na 25 °C. Rastvor se razblaži sa EtOAc (10 mL) i filtrira. Filtrat se upari da se dobije sirovi produkt koji se prečisti flash hromatografijom, uz eluiranje sa smešom petrol etar/EtOAc od 0-30%, da se dobije željeni produkt TP-25 (320 mg, 64%) kao bela čvrsta supstanca. LCMS [M+1] 331;<1>H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ ppm 10.04 (s, 1H), 7.82 (s, 1H), 6.91 - 6.77 (m, 2H), 4.40 (s, 2H), 4.04 (s, 3H), 3.56 (m, 2H), 2.78 (m, 2H), 1.45 (s, 9H)
Sinteza terc-butil 8-hidroksi-6-(tiazol-4-il)-3,4-dihidroizohinolin-2(1H)-karboksilata (TP-26) (Šema OOO)
Šema OOO
Faza 1 - Sinteza terc-butil 8-(benziloksi)-6-(tiazol-4-il)-3,4-dihidroizohinolin-2(1H)-karboksilata (OOO-1)
[0475] U atmosferi argona, bočica koja sadrži jedinjenje NNN-1 (800 mg, 1.72 mmol), 4-bromotiazol (367 mg, 2.23 mmol), Pd(PPh3)4(278 mg, 0.241 mmol), K2CO3(523 mg, 3.78 mmol), dioksan (10 mL) i vodu (1 mL) se zatvori i zagreva 16 sati na 80 °C. U reakciju se doda voda (10 mL) i ekstrahuje sa EtOAc (10 mL x 2). Organski slojevi se razdvoje, suše i upare da se dobije sirovi produkt koji se prečisti flash hromatografijom, uz eluiranje sa smešom petrol etar/EtOAc od 0-20% da se dobije OOO-1 (370 mg, 51%) kao bezbojno ulje. LCMS [M+23] 445
Faza 2 - Sinteza 6-(tiazol-4-il)-1,2,3,4-tetrahidroizohinolin-8-ola (OOO-2)
[0476] Jedinjenje OOO-1 (320 mg, 0.76 mmol) se rastvori u DCM (10 mL) i ohladi na 0 °C u ledenom kupatilu. U reaktivni rastvor se doda BBr3(1.14 g, 4.54 mmol) i meša 16 sati na 25 °C. Reaktivni rastvor se ohladi na 0 °C. U reaktivni rastvor se u kapima dodaje metanol (3.00 mL) a nakon toga se doda voda (20 mL). Reaktivni rastvor se ispere sa DCM (10 mL x 2). Vodeni sloj se odvoji. Čvrsti Na2CO3se koristi da podesi pH na 9. Finalni rastvor jedinjenja OOO-2 se direktno koristi za sledeću fazu. LCMS [M+1] 233.
Faza 3 - Sinteza terc-butil 8-hidroksi-6-(tiazol-4-il)-3,4-dihidroizohinolin-2(1H)-karboksilata (TP-26)
[0477] MeOH (5.00 mL) i dioksan (5.00 mL) se dodaju u rastvor jedinjenja OOO-2 (180 mg, reaktivni vodeni rastvor, 40.0 mL), nakon toga se u reakciju doda (Boc)2O (335 mg, 1.55 mmol) i meša 16 sati na 25 °C. Doda se DCM (20 mL) da razblaži rastvor. pH se podesi na
24
pH~3 dodavanjem 1N rastvora HCl aq. Rastvor se razdvoji i vodeni sloj se ekstrahuje sa DCM (10 mL). Organski slojevi se kombinuju i isperu sa zasićenim rastvorom NaCl (20.0 mL). Organski slojevi se razdvoje, suše i upare da se dobije sirovi produkt koji se prečisti flash hromatografijom, uz eluiranje sa smešom petrol etar/EtOAc 0-50% da se dobije TP-26 (180 mg, 70%) kao žuta čvrsta supstanca. LCMS [M+1] 333;<1>H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ ppm 9.78 (s, 1H), 9.16 (d, J=2.0 Hz, 1H), 7.99 (d, J=2.0 Hz, 1H), 7.33 (d, J=1.3 Hz, 1H), 7.24 (s, 1H), 4.38 (s, 2H), 3.56 (m, 2H), 2.77 (m, 2H), 1.44 (s, 9H)
Sinteza terc-butil 8-hidroksi-3-metil-3,4-dihidroizohinolin-2(1H)-karboksilata (TP-28) (Šema PPP)
[0478]
Šema PPP
Faza 1: Sinteza 3-metil-1,2,3,4-tetrahidroizohinolin-8-ola (PPP-1)
[0479] U rastvor 3-metilizohinolin-8-ola (TP-27) [izrađen u Tetrahedron Letters 49 (2008) 3725-3728] (100 mg, 0.628 mmol) u smeši EtOH/AcOH (6mL/0.2mL) se doda u PtO2(80 mg, 0.35 mmol), hidrogenizuje 16h na rt pod pritiskom H2od 45 psi. Reaktivna smeša se filtrira i ispere sa EtOH, rastvarač se upari da se dobije sirovo PPP-1 (103 mg, 100%) koje se koristi u sledećoj fazi bez daljeg prečišćavanja. LCMS [M+1] 163.9.
Faza 2: Sinteza terc-butil 8-hidroksi-3-metil-3,4-dihidroizohinolin-2(1H)-karboksilata (TP-28)
[0480] U rastvor PPP-1 (103 mg, 0.628 mmol) u THF (6 mL, 0.1 M) se na 15 °C dodaju Boc2O (225 mg, 1.03 mmol) i K2CO3(356 mg, 2.57 mmol) i meša 15 h na rt. Rastvarač se ukloni, ostatak se rastvori u MeOH, doda se 0.1 g K2CO3i meša 2 h. Čvrsta supstanca se filtrira i ispere sa EtOAc, filtrat se koncentruje i prečisti preparativnom TLC da se dobije TP-28 (70 mg, 42%) kao žuta čvrsta supstanca.
LCMS [M+1-tBu] 207.9.<1>H NMR (400MHz, HLOROFORM-d) δ ppm 7.09 - 7.01 (m, 1H), 6.71 (d, J=7.8 Hz, 1H), 6.63 (d, J=8.0 Hz, 1H), 4.81 (br d, J=17.6 Hz, 1H), 4.63 (br s, 1H), 4.18 (d, J=17.6 Hz, 1H), 3.08 (br dd, J=5.5, 16.1 Hz, 1H), 2.55 (br ddd, J=1.8, 14.6, 16.3 Hz, 1H), 1.54 - 1.43 (s, 9H), 1.09 (d, J=6.8 Hz, 3H)
Sinteza terc-butil 8-hidroksi-6-(oksazol-5-il)-3,4-dihidroizohinolin-2(1H)-karboksilata (TP-29) (Šema QQQ)
[0481]
Šema QQQ
Faza 1: Sinteza terc-butil 8-(benziloksi)-6-(oksazol-5-il)-3,4-dihidroizohinolin-2(1H)-karboksilata (QQQ-1)
[0482] U rastvor II-1 (265 mg, 0.721 mmol) i p-toluensulfonilmetil izocijanida (465 mg, 2.38 mmol) u metanolu (14.4 mL, c=0.05 M) se doda K2CO3(199 mg, 1.44 mmol), dobijena suspenzija se refluksuje u toku noći. Reaktivna smeša se koncentruje i dodaju se EtOAc i H2O. Slojevi se razdvoje; vodeni sloje se ekstrahuje sa EtOAc. Organski slojevi se koncentruju, prečiste hromatografijom na koloni sa 35% EtOAc/heptan da se dobije QQQ-1 (100 mg, 34%) kao bezbojno ulje.
LCMS [M+1-Boc] 307.15.<1>H NMR (400 MHz, HLOROFORM-d) δ ppm 1.51 (s, 9 H) 2.86 (t, J=5.01 Hz, 2 H) 3.67 (t, J=5.62 Hz, 2 H) 4.62 (s, 2 H) 5.16 (br. s., 2 H) 7.06 (s, 1 H) 7.08 (s, 1 H) 7.31 (s, 1 H) 7.35 (d, J=7.21 Hz, 1 H) 7.41 (t, J=7.34 Hz, 2 H) 7.44 - 7.50 (m, 2 H) 7.90 (s, 1 H)
Faza 2: Sinteza terc-butil 8-hidroksi-6-(oksazol-5-il)-3,4-dihidroizohinolin-2(1H)-
24
karboksilata (TP-29)
[0483] Jedinjenje TP-29 se izrađuje od QQQ-1 sličnim postupkom kao za fazu 9 u Šemi GG (79 mg, 100%). LCMS [M+1-Boc] 217.10.<1>H NMR (400 MHz, HLOROFORM-d) δ ppm 1.54 (s, 9 H) 2.83 (br. s., 2 H) 3.67 (t, J=5.69 Hz, 2 H) 4.60 (br. s., 2 H) 6.95 (br. s., 2 H) 7.27 (s, 1 H) 7.90 (s, 1 H)
Sinteza terc-butil 8-hidroksi-6-(1H-pirazol-3-il)-3,4-dihidroizohinolin-2(1H)-karboksilata (TP-30) (Šema RRR)
[0484]
Šema RRR
Faza 1: Sinteza terc-butil 6-acetil-8-(benziloksi)-3,4-dihidroizohinolin-2(1H)-karboksilata (RRR-1)
[0485] Jedinjenje RRR-1 se izrađuje od GG-7 sličnim postupkom kao za fazu 1 u Šemi JJ (360.0 mg, 80.2%).
Faza 2: Sinteza terc-butil (E)-8-(benziloksi)-6-(3-(dimetilamino)akriloil)-3,4-dihidroizohinolin-2(1H)-karboksilata (RRR-2)
[0486] RRR-1 (65 mg, 0.17 mmol) i N,N-dimetilformamid dimetilcetal (0.5 mL) se zagrevaju
24
na 100°C u toku noći. Reaktivna smeša se koncentruje, prečisti hromatografijom na koloni sa 70% EtOAc/heptan da se dobije RRR-270 mg (94% prinos) kao žuto ulje.
LCMS [M+1] 437.20.<1>H NMR (400 MHz, HLOROFORM-d) δ ppm 1.50 (s, 9 H) 2.77 - 2.92 (m, 2 H) 2.92 - 3.22 (m, 6 H) 3.66 (t, J=5.01 Hz, 2 H) 4.62 (s, 2 H) 5.17 (br. s., 2 H) 5.66 (d, J=12.35 Hz, 1 H) 7.28 (br. s., 1 H) 7.32 (d, J=7.21 Hz, 1 H) 7.38 (t, J=7.27 Hz, 3 H) 7.43 -7.49 (m, 2 H) 7.80 (d, J=12.35 Hz, 1 H)
Faza 3: Sinteza terc-butil 8-(benziloksi)-6-(1H-pirazol-3-il)-3,4-dihidroizohinolin-2(1H)-karboksilata (RRR-3)
[0487] RRR-2 (70 mg, 0.16 mmol) i hidrazin monohidrat (183 mg, 1.28 mmol, 0.178 mL) u 2 mL EtOH se meša na rt u toku noći. U reaktivnu smešu se dodaju EtOAc i H2O, slojevi se razdvoje a vodeni sloj se ekstrahuje sa EtOAc. Organski slojevi se kombinuju i isperu sa slanim rastvorom, suše preko Na2SO4i koncentruju da se dobije RRR-358.8 mg (90% prinos) kao čvrsta supstanca.
LCMS [M+1-tBu] 350.10.<1>H NMR (400 MHz, HLOROFORM-d) δ ppm 1.51 (s, 9 H) 2.76-2.93 (m, 2 H) 3.67 (t, J=5.50 Hz, 2 H) 4.62 (s, 2 H) 5.16 (br. s., 2 H) 6.59 (d, J=2.32 Hz, 1 H) 7.15 (s, 1 H) 7.23 (s, 1 H) 7.30 - 7.36 (m, 1 H) 7.39 (t, J=7.27 Hz, 2 H) 7.44 - 7.49 (m, 2 H) 7.62 (d, J=2.20 Hz, 1 H)
Faza 4: Sinteza terc-butil 8-hidroksi-6-(1H-pirazol-3-il)-3,4-dihidroizohinolin-2(1H)-karboksilata (TP-30)
[0488] Jedinjenje TP-30 se izrađuje od RRR-3 sličnim postupkom kao za fazu 9 u Šemi GG (32 mg, 70%).
LCMS [M+1-Boc] 216.10.<1>H NMR (400 MHz, HLOROFORM-d) δ ppm 1.51 (s, 9 H) 2.77 (t, J=5.26 Hz, 2 H) 3.62 (t, J=5.50 Hz, 2 H) 4.58 (br. s., 2 H) 6.46 (br. s., 1 H) 6.97 (s, 1 H) 7.12 (br. s., 1 H) 7.50 - 7.63 (m, 1 H)
Primeri 163-171 se izrađuju na sličan način kao Primer 78 u Šemi CC koristeći odgovarajući NBoc-zaštićeni tetrahidroizohinolin u fazi 1.
[0489]
24
24 (nastavlja se)
24 (nastavlja se)
2 (nastavlja se)
21 (nastavlja se)
Primer 172 (Šema SSS) - Sinteza (1S,2S,3S,5R)-3-(izohinolin-8-iloksi)-5-(4-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)ciklopentan-1,2-diola (SSS-6) (referenca)
2 2
Šema SSS
Faza 1: Sinteza terc-butil ((1S,2S,3S,4R)-2,3-dihidroksi-4-(4-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)ciklopentil) karbonata (SSS-1)
[0491] Jedinjenje SSS-1 se izrađuje od BB-2 sličnim postupkom kao za fazu 2 u Šemi CC da se dobije 274 mg (82% prinos) kao bezbojno ulje.
LCMS [M+1] 350.10.<1>H NMR (400 MHz, HLOROFORM-d) δ ppm 1.51 (s, 9 H) 2.18 (ddd, J=14.21, 9.14, 5.26 Hz, 1 H) 2.71 (s, 3 H) 3.02 (dt, J=14.18, 8.07 Hz, 1 H) 3.95 - 4.02 (m, 1 H) 4.30 (dd, J=5.38, 2.08 Hz, 1 H) 4.51 (dd, J=7.82, 5.50 Hz, 1 H) 4.96 - 5.08 (m, 2 H) 6.61 (d, J=3.67 Hz, 1 H) 7.29 (d, J=3.67 Hz, 1 H) 8.66 (s, 1 H)
Faza 2: Sinteza terc-butil ((3aR,4S,6R,6aS)-2,2-dimetil-6-(4-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)tetrahidro-4H-ciklopenta[d][1,3]dioksol-4-il) karbonata (SSS-2)
[0492] Jedinjenje SSS-2 se izrađuje od SSS-1 sličnim postupkom kao za fazu 3 u Šemi P da se dobije 181 mg (59% prinos) kao bezbojno ulje.
LCMS [M+1] 390.15.<1>H NMR (400 MHz, HLOROFORM-d) δ ppm 1.32 (s, 3 H) 1.50 (s, 9 H) 1.58 (s, 3 H) 2.38 - 2.48 (m, 1 H) 2.73 (s, 3 H) 2.84 - 2.95 (m, 1 H) 4.82 (d, J=6.11 Hz, 1
2
H) 4.99 (dd, J=6.54, 3.12 Hz, 1 H) 5.06 - 5.13 (m, 1 H) 5.21 - 5.29 (m, 1 H) 6.57 (d, J=3.67 Hz, 1 H) 7.31 (d, J=3.67 Hz, 1 H) 8.78 (s, 1 H)
Faza 3: Sinteza (3aR,4S,6R,6aS)-2,2-dimetil-6-(4-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)tetrahidro-4H-ciklopenta[d][1,3]dioksol-4-ola (SSS-3)
[0493] Jedinjenje SSS-3 se izrađuje od SSS-2 sličnim postupkom kao za fazu 1 u Šemi FFF da se dobije 127 mg (94% prinos) kao bela čvrsta supstanca.
LCMS [M+1] 290.15.<1>H NMR (400 MHz, HLOROFORM-d) δ ppm 1.33 (s, 3 H) 1.55 (s, 3 H) 2.20 (dd, J=15.65, 1.34 Hz, 1 H) 2.75 (s, 3 H) 2.95 - 3.08 (m, 1 H) 4.44 - 4.50 (m, 1 H) 4.80 (d, J=5.38 Hz, 1 H) 4.84 (dt, J=10.58, 2.48 Hz, 1 H) 4.98 (d, J=5.01 Hz, 1 H) 6.15 (d, J=9.41 Hz, 1 H) 6.55 (d, J=3.67 Hz, 1 H) 8.73 (s, 1 H)
Faza 4: Sinteza terc-butil 8-(((3aR,4S,6R,6aS)-2,2-dimetil-6-(4-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)tetrahidro-4H-ciklopenta[d][1,3]dioksol-4-il)oksi)-3,4-dihidro-2,7-naftiridin-2(1H)-karboksilata (SSS-4) i
1-(((3aR,4S,6R,6aS)-2,2-dimetil-6-(4-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)tetrahidro-4H-ciklopenta[d][1,3]dioksol-4-il)oksi)-2,7-naftiridina (SSS-5)
[0494] U rastvor SSS-3 (80.7 mg, 0.279 mmol) u DMF (5.58 mL, c=0.05 M) se doda NaH (16.7 mg, 0.419 mmol, 60%). Nakon 10 min mešanja, doda se GGG-2 (75.0 mg, 0.279 mmol). Dobijena reaktivna smeša se zagreva 1.5 h na 100°C. Reakcija se neutrališe sa razblaženim NaHCO3i nakon toga podeli između etil acetata (20 mL) i vode (20 mL).
Organska faza se odvoji, ispere sa slanim rastvorom, suši preko natrijum sulfata, koncentruje i prečisti hromatografijom na koloni sa 60% EtOAc/heptan da se dobije SSS-4 (15 mg, 10%) LCMS [M+1] 522.20.<1>H NMR (400 MHz, HLOROFORM-d) δ ppm 1.34 (s, 3 H) 1.50 (s, 9 H) 1.60 (s, 3 H) 2.45 (d, J=14.18 Hz, 1 H) 2.72 (s, 3 H) 2.76 (t, J=5.38 Hz, 2 H) 3.05 (dt, J=14.61, 7.12 Hz, 1 H) 3.60 (br. s., 1 H) 3.65 (br. s., 1 H) 4.39 (br. s., 2 H) 4.94 (d, J=6.24 Hz, 1 H) 5.05 (dd, J=6.17, 1.90 Hz, 1 H) 5.34 (ddd, J=7.70, 4.95, 2.38 Hz, 1 H) 5.60 (br. s., 1 H) 6.61 (br. s., 1 H) 6.69 (d, J=5.14 Hz, 1 H) 7.38 (d, J=3.67 Hz, 1 H) 7.95 (d, J=5.14 Hz, 1 H) 8.79 (m, 1 H) i eluira sa 5% MeOH/EtOAc da se dobije SSS-5 (35 mg, 30%)
LCMS [M+1] 418.15.<1>H NMR (400 MHz, HLOROFORM-d) δ ppm 1.38 (s, 3 H) 1.63 (s, 3 H) 2.56 (dt, J=14.98, 3.82 Hz, 1 H) 2.72 (s, 3 H) 3.04 - 3.19 (m, 1 H) 5.11 (d, J=6.11 Hz, 1 H)
2 4
5.21 (d, J=6.11 Hz, 1 H) 5.35 - 5.46 (m, 1 H) 5.83 (dt, J=3.97, 2.05 Hz, 1 H) 6.61 (d, J=3.67 Hz, 1 H) 7.20 (d, J=5.87 Hz, 1 H) 7.39 (d, J=3.67 Hz, 1 H) 7.55 (d, J=5.62 Hz,
1 H) 8.22 (d, J=5.87 Hz, 1 H) 8.70 (br. s., 1 H) 8.77 (s, 1 H) 9.38 (br. s., 1 H)
Faza 5: Sinteza (1S,2S,3S,5R)-3-(izohinolin-8-iloksi)-5-(4-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)ciklopentan-1,2-diola (SSS-6)
[0495] Jedinjenje SSS-6 se izrađuje od SSS-5 sličnim postupkom kao za fazu 10 u Šemi A da se dobije 11.6 mg (36% prinos) kao bela čvrsta supstanca.
LCMS [M+1] 378.10.<1>H NMR (700 MHz, DMSO-d6) δ ppm 2.05 - 2.15 (m, 1 H) 2.64 - 2.72 (m, 3 H) 2.98 (ddd, J=14.75, 9.24, 7.48 Hz, 1 H) 4.25 (d, J=3.08 Hz, 1 H) 4.72 (dd, J=8.69, 4.73 Hz, 1 H) 5.21 (q, J=8.88 Hz, 1 H) 5.48 (dd, J=5.94, 3.30 Hz, 1 H) 6.80 (d, J=3.52 Hz, 1 H) 7.43 (d, J=5.94 Hz, 1 H) 7.78 - 7.89 (m, 2 H) 8.24 (d, J=5.72 Hz, 1 H) 8.64 (s, 1 H) 8.80 (br. s., 1 H) 9.72 (br. s., 1 H)
Primer 173 se izrađuju na sličan način kao za CC-3 (Primer 78) koristeći odgovarajući pirolopirimidin u fazi 1 Šeme BB i odgovarajući N-Boc zaštićeni tetrahidroizohinolin u fazi 1 Šeme CC.
[0496]
2
Primer 174 se izrađuju na sličan način kao za NN-5 (Primer 99) koristeći odgovarajući pirolopirimidin u fazi 1 Šeme BB i odgovarajući N-Boc zaštićeni tetrahidroizohinolin u fazi 1 Šeme NN.
[0497]
2
Primeri 175 - 179 se izrađuju na sličan način kao SS-5 (Primer 121) koristeći odgovarajući N-Boc zaštićeni tetrahidroizohinolin u fazi 1 i odgovarajući pirolopirimidin u fazi 2 Šeme SS. Faza 4 u Šemi SS nije bila potrebna za ove primere.
[0498]
2
2 (nastavlja se)
2 (nastavlja se)
Primer 180 (Šema TTT) - (1S,2S,3R,5S)-3-(4-amino-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)-5-((5-fluor-1,2,3,4-tetrahidroizohinolin-8-il)oksi)ciklopentan-1,2-diol (TTT-5)
[0499]
Šema TTT
Faza 1: Sinteza terc-butil 8-(((3aR,4S,6R,6aS)-6-(5-brom-4-hlor-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)-2,2-dimetiltetrahidro-4H-ciklopenta[d][1,3]dioksol-4-il)oksi)-5-fluor-
2
3,4-dihidroizohinolin-2(1H)-karboksilata (TTT-2)
[0500] Međuproizvod TTT-1 se izrađuje po niže datim opštim postupcima za faze 1-3 u Šemi SS koristeći TP-2 i 5-brom-4-hlor-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin kao odgovarajuće početne materijale.
[0501] U scintilacionu bočicu, opremljenu magnetnom mešalicom i koja sadrži međuproizvod TTT-2 (281 mg, 0.470 mmol) se dodaju DCM (5.0 mL), 2,2-dimetoksipropan (0.58 mL, 4.70 mmol) i PPTS (11.8 mg, 0.047 mmol). Reakcija se meša 23 sata na rt. Rastvor se prenese u levak za razdvajanje sa DCM i ispere sa 2 porcije upola zasićenog slanog rastvora. Organska faza se suši (MgSO4), filtrira i koncentruje pod vakuumom da se dobije naslovljeno jedinjenje TTT-2 (266 mg, 89%) kao bela čvrsta supstanca. LCMS [M+H] = 637 zabeleženo.<1>H NMR (400MHz, HLOROFORM-d) δ ppm 8.68 (s, 1H), 7.49 (br. s., 1H), 6.97 - 6.86 (m, 1H), 6.84 -6.71 (m, 1H), 5.35 (br. s., 1H), 4.95 (dd, J=2.1, 6.1 Hz, 1H), 4.81 (d, J=6.1 Hz, 2H), 4.48 (br. s., 2H), 3.65 (br. s., 2H), 3.07 - 2.89 (m, 1H), 2.80 (br. s., 2H), 2.50 (d, J=15.3 Hz, 1H), 1.60 (s, 3H), 1.47 (br. s., 9H), 1.34 (s, 3H).
Faza 2: Sinteza terc-butil 8-(((3aR,4S,6R,6aS)-6-(4-amino-5-brom-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)-2,2-dimetiltetrahidro-4H-ciklopenta[d][1,3]dioksol-4-il)oksi)-5-fluor-3,4-dihidroizohinolin-2(1H)-karboksilata (TTT-3)
[0502] U mikrotalasnu bočicu, opremljenu magnetnom mešalicom se doda TTT-2 (152 mg, 0.238 mmol) kao rastvor u dioksanu (0.60 mL). U rastvor se doda amonijum hidroksid (0.6 mL, 5.00 mmol) i bočica se zatvori sa Teflon zatvaračem. Bočica se stavi u mikrotalasni reaktor i zagreva 6 sati na 120°C a nakon toga ostavi da se ohladi na rt u toku noći. Rastvor se prenese u levak za razdvajanje sa DCM i razblaži sa vodom. Faze se razdvoje i vodena faza se ekstrahuje sa 3 porcije DCM. Kombinovani organski ekstrakti se suše (MgSO4), filtriraju i koncentruju pod vakuumom. Sirovi ostatak se prečisti flash hromatografijom na koloni (12g SiO2, Isco, 100% Hept. do 100% EtOAc, 9 mL frakcije) da se dobije naslovljeno jedinjenje TTT-3 (81 mg, 55%) kao bela čvrsta supstanca. LCMS [M+H] = 618 zabeleženo.
<1>H NMR (400MHz, HLOROFORM-d) δ ppm 8.31 (s, 1H), 7.16 (s, 1H), 6.98 - 6.85 (m, 1H), 6.84 - 6.73 (m, 1H), 5.61 (br. s., 2H), 5.36 - 5.18 (m, 1H), 4.94 (dd, J=2.5, 6.1 Hz, 1H), 4.82 -4.73 (m, 2H), 4.56 - 4.45 (m, 2H), 3.90 - 3.42 (m, 2H), 3.02 - 2.87 (m, 1H), 2.80 (t, J=4.9 Hz, 2H), 2.46 (td, J=4.4, 14.8 Hz, 1H), 1.59 (s, 3H), 1.53 - 1.42 (m, 9H), 1.33 (s, 3H).
2 1
Faza 3: Sinteza terc-butil 8-(((3aR,4S,6R,6aS)-6-(4-amino-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)-2,2-dimetiltetrahidro-4H-ciklopenta[d][1,3]dioksol-4-il)oksi)-5-fluor-3,4-dihidroizohinolin-2(1H)-karboksilata (TTT-4)
[0503] U reaktivnu bočicu, opremljenu sa magnetnom mešalicom, se dodaju TTT-3 (81.0 mg, 0.131 mmol), kalijum karbonat (54.3 mg, 0.393 mmol) i Pd(PPh3)4(15.1 mg, 0.013 mmol). Bočica se zatvori sa teflonskim zatvaračem i prečisti sa argonom pod dinamičkim vakuumom. U bočicu se dodaju dioksan (0.58 mL) i voda (0.07 mL). Bočica se prenese u blok za zagrevanje i zagreva 3.5 dana na 100°C. Bočica se ukloni iz bloka za zagrevanje i ostavi da se ohladi na rt. Reakcija se razblaži sa vodom i prenese u levak za razdvajanje sa DCM. Faze se razdvoje i vodena faza se ekstrahuje sa 3 porcije DCM. Kombinovani organski ekstrakti se suše (MgSO4), filtriraju i koncentruju pod vakuumom. Sirovi ostatak se prečisti preparativnom visoko efikasnom tečnom hromatografijom (Lux 5u Cellulose-230x250mm kolona, 33% MeOH w/ 0.05% DEA u CO2, 100 bar, 80 mL/min) da se dobije naslovljeno jedinjenje TTT-4 (17.1 mg, 24%) kao bela čvrsta supstanca. LCMS [M+H] = 540 zabeleženo.
[α]D22 = 2.2° (C=0.1, MeOH).<1>H NMR (400MHz, HLOROFORM-d) δ ppm 8.35 (s, 1H), 7.19 (d, J=3.7 Hz, 1H), 6.94 - 6.85 (m, 1H), 6.84 - 6.75 (m, 1H), 6.44 (br. s., 1H), 5.34 - 5.26 (m, 1H), 5.19 (br. s., 2H), 5.01 (dd, J=2.6, 6.2 Hz, 1H), 4.79 (d, J=6.4 Hz, 1H), 4.75 (t, J=5.3 Hz, 1H), 4.44 (br. s., 2H), 3.65 (br. s., 2H), 3.07 - 2.86 (m, 1H), 2.78 (t, J=5.1 Hz, 2H), 2.59 -2.42 (m, 1H), 1.60 (s, 3H), 1.49 (br. s., 9H), 1.33 (s, 3H).
Faza 4: Sinteza (1S,2S,3R,5S)-3-(4-amino-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)-5-((5-fluor-1,2,3,4-tetrahidroizohinolin-8-il)oksi)ciklopentan-1,2-diola (TTT-5)
[0504] U scintilacionu bočicu, opremljenu magnetnom mešalicom i koja sadrži TTT-4 (17.1 mg, 0.032 mmol) se doda voda (0.08 mL). U rastvor se doda hlorovodonična kiselina (0.4 mL, 4.0 M rastvor u dioksanu, 2 mmol) i reakcija se meša 15 sati na rt. Rastvor se prenese u levak za razdvajanje sa DCM, razblaži sa vodom i neutrališe sa sat. NaHCO3. Faze se razdvoje i vodena faza se ekstrahuje sa 3 porcije smeše 3:1 DCM:IPA. Kombinovani organski ekstrakti se suše (MgSO4), filtriraju i koncentruju pod vakuumom. Ovako dobijeni materijal se suši zamrzavanjem da se dobije naslovljeno jedinjenje TTT-5 (12.5 mg, >95%) kao bela čvrsta supstanca. LCMS [M+H] = 400 zabeleženo.<1>H NMR (400MHz, METANOL-d4) δ
2 2
ppm 8.08 (s, 1H), 7.22 (d, J=3.7 Hz, 1H), 6.95 - 6.79 (m, 2H), 6.63 (d, J=3.7 Hz, 1H), 5.12 (q, J=8.6 Hz, 1H), 4.69 - 4.61 (m, 1H), 4.57 (dd, J=4.8, 8.4 Hz, 1H), 4.16 (d, J=4.3 Hz, 1H), 3.96 (br. s., 2H), 3.08 (t, J=5.1 Hz, 2H), 2.97 (ddd, J=7.3, 9.3, 14.6 Hz, 1H), 2.76 (t, J=5.9 Hz, 2H), 2.04 (ddd, J=3.9, 8.4, 14.1 Hz, 1H).
Primer 181 - (1S,2S,3S,5R)-3-((3-metil-5,6,7,8-tetrahidro-2,7-naftiridin-1-il)oksi)-5-(4-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)ciklopentan-1,2-diol
[0505]
Šema UUU
Faza 1 - Sinteza 2-benzil-6-metil-8-okso-7,8-dihidro-2,7-naftiridin-2-ium bromida (UUU-2)
[0506] U smešu 3-metil-2,7-naftiridin-1(2H)-ona UUU-1 (izrađeno po sličnom postupku u patentu WO2002068393) (3.9 g, 21.85 mmol) u CH3CN (50 mL) se na rt (25 °C) doda BnBr (6.25 g, 36.5 mmol). Nakon toga, smeša se zagreva 16 sati i refluksuje (85 °C). Precipitat se sakupi filtriranjem, ispere sa etanolom (30 mL) i suši pod vakuumom da se dobije UUU-2 (4.8 g, 60%) kao žuta čvrsta supstanca. LCMS [M-Br] 251;<1>H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ ppm = 12.57 (br s, 1H), 9.77 (s, 1H), 8.88 (d, J=6.8 Hz, 1H), 8.08 (d, J=6.8 Hz, 1H), 7.55 (br d, J=6.8 Hz, 2H), 7.44 (br d, J=7.3 Hz, 3H), 6.70 (s, 1H), 5.86 (s, 2H), 2.40 (s, 3H)
Faza 2 - Sinteza 7-benzil-3-metil-5,6,7,8-tetrahidro-2,7-naftiridin-1(2H)-ona (UUU-3)
2
[0507] U rastvor jedinjenja UUU-2 (4.8 g, 14.49 mmol) u MeOH (50 mL) se u porcijama u toku 10 minuta na 0 °C dodaje NaBH4(7.68 g, 203 mmol) a nakon toga meša 4 sata na rt (25 °C). Smeša se koncentruje pod vakuumom da se ukloni rastvarač. Doda se DCM (40 mL) i filtrira. Filtrat se koncentruje pod vakuumom da se dobije sirovi produkt koji se prečisti hromatografijom na silika gelu (MeOH/OCM=0~10%) da se dobije UUU-3 (2.65 g,72%) kao žuta čvrsta supstanca. LCMS [M+1] 255;<1>H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ ppm = 11.33 (br s, 1H), 7.42 - 7.32 (m, 4H), 7.30 - 7.24 (m, 1H), 5.78 (s, 1H), 3.63 (s, 2H), 3.11 (s, 2H), 2.59 (br d, J=4.5 Hz, 2H), 2.56 (br d, J=3.5 Hz, 2H), 2.10 (s, 3H)
Faza 3 - 2-benzil-8-brom-6-metil-1,2,3,4-tetrahidro-2,7-naftiridin (UUU-4)
[0508] U rastvor UUU-3 (2.15 g, 8.45 mmol) u CH3CN (20 mL) se na rt (25 °C) doda Ph2O (40mL). Nakon toga se u porcijama doda POBr3(12.1 g, 42.3 mmol) i zagreva 4 sata na refluksu (85 °C) u atmosferi N2gde nakon 20 minuta počinje da se formira naradžasta čvrsta supstanca. Precipitat se sakupi filtriranjem, rastvori u vodi (20 mL) i neutrališe sa rastvorom NaHCO3do pH 8. Nakon toga se smeša ekstrahuje sa TBME (50mL x 2). Organski sloj se ispere sa slanim rastvorom (25 mLx2), suši preko Na2SO4, filtrira i koncentruje pod vakuumom da se dobije sirovi produkt koji se prečisti hromatografijom (silika gel EtOAc/petrol etar=0~40%) da se dobije UUU-4 (1.55 g, 58%) kao narandžasta čvrsta supstanca. LCMS [M+1] 317;<1>H NMR (400 MHz, CDCl3) δ ppm = 7.40 - 7.32 (m, 4H), 7.32 - 7.28 (m, 1H), 6.87 (s, 1H), 3.75 (s, 2H), 3.59 (s, 2H), 2.84 - 2.78 (m, 2H), 2.69 - 2.64 (m, 2H), 2.47 (s, 3H)
Faza 4 - Sinteza terc-butil 8-brom-6-metil-3,4-dihidro-2,7-naftiridin-2(1H)-karboksilata (UUU-5) i terc-butil 8-hlor-6-metil-3,4-dihidro-2,7-naftiridin-2(1H)-karboksilata (UUU-6)
[0509] U rastvor jedinjenja UUU-4 (1.30 g, 4.1 mmol) u DCM (15 mL) se na rt (0 °C) u toku 1 min u kapima dodaje 1-hloretil hloroformat (0.62 mL, 5.74 mmol). Nakon toga se smeša zagreje na rt (20 °C) meša 10 minuta i 2 sata zagreva na refluksu (40 °C). Smeša se koncentruje pod vakuumom da se ukloni rastvarač. Nakon toga se čvrsta supstanca rastvori u MeOH (15 mL) i zagreva 1.5 sat na refluksu (63 °C). Nakon toga se dodaju (Boc)2O (1.07 g 4.92 mmol) i Et3N (1.71 mL,12.3 mmol). Smeša se zagreva 16 sati na 63 °C. Smeša se
2 4
koncentruje pod vakuumom da se dobije sirovi produkt koji se prečisti hromatografijom (silika gel MeOH/DCM=0~10% ) da se dobije produkt kao smeša jedinjenja UUU-5 i UUU-6 u ~1:1 odnosu (872 mg) kao bela čvrsta supstanca i koristi se direktno u sledećoj fazi. LCMS [M+1] 327 i 283.
Faze 5-7 se izvode na sličan način kao faze 2-4 u Šemi GGG koristeći FFF-1.
[0510]
Sinteza terc-butil-5-fluor-8-hidroksi-4-metil-3,4-dihidroizohinolin-2(1H)-karboksilata (TP-31)
2
Šema VVV
Cs HF,
4
Faza 1: Sinteza metil 2-(benziloksi)-5-fluorobenzoata (VVV-2)
[0512] U bocu okruglog dna, opremljenu magnetnom mešalicom, se dodaju metil 5-fluor-2-hidroksibenzoat VVV-1 (3.68 g, 21.6 mmol), kalijum karbonat (10.5 g, 75.7 mmol) i aceton (108 mL). U rastvor se doda benzil bromid (2.70 mL, 22.7 mmol) i učvrsti sa Findenser™. Boca se stavi u blok za zagrevanje i zagreva 13 sati na 65°C. Boca se ukloni iz bloka za zagrevanje i ostavi da se ohladi na rt. Čvrste supstance se filtriraju preko celite ploče i isperu sa nekoliko porcija acetona. Filtrat se koncentruje pod vakuumom i prenese u levak za razdvajanje sa EtOAc (-100 mL). Rastvor se ispere sa 2 porcije upola zasićenog slanog rastvora, suši (MgSO4), filtrira i koncentruje pod vakuumom da se dobije naslovljeno jedinjenje VVV-2 (5.64 g, >95% prinos) kao bela kristalna čvrsta supstanca. Ovaj materijal se koristi u sledećoj fazi bez daljeg prečišćavanja.<1>H NMR (400MHz, HLOROFORM-d) δ ppm 7.54 (dd, J=3.3, 8.7 Hz, 1H), 7.51 - 7.45 (m, 2H), 7.44 - 7.36 (m, 2H), 7.36 - 7.29 (m, 1H), 7.14 (ddd, J=3.2, 7.5, 9.1 Hz, 1H), 6.97 (dd, J=4.3, 9.0 Hz, 1H), 5.16 (s, 2H), 3.92 (s, 3H). 19F NMR (376MHz, HLOROFORM-d) δ ppm -122.59 (s, 1F).
Faza 2: Sinteza 2-(benziloksi)-5-fluor-N-hidroksibenzamida (VVV-3)
[0513] U bocu okruglog dna, opremljenu magnetnom mešalicom i koja sadrži VVV-2 (5.64 g, 21.7 mmol), se dodaju hidroksil amin hidrohlorid (4.52 g, 65.0 mmol), kalijum hidroksid
2
(7.29 g, 130 mmol) i metanol (108 mL). Boca se opremi sa Findenser™ i stavi u blok za zagrevanje. Reakcija se zagreva 3.5 sata na 75°C. Reakcija se ukloni iz bloka za zagrevanje i ostavi da se postepeno ohladi na rt. Rastvor se neutrališe sa sirćetnom kiselinom i koncentruje pod vakuumom. Ostatak se prenese u levak za razdvajanje sa EtOAc i razblaži sa vodom. Faze se razdvoje i vodena faza se ekstrahuje sa porcijama 3 x 100 mL EtOAc.
Organski ekstrakti se suše (MgSO4), filtriraju i koncentruju pod vakuumom da se dobije naslovljeno jedinjenje VVV-3 (5.62 g, >95% prinos) kao bela čvrsta supstanca. Materijal se koristi u sledećoj fazi bez daljeg prečišćavanja. LCMS [M+H] = 262 zabeleženo.<1>H NMR (400MHz, DMSO-d6) δ ppm 10.71 (s, 1H), 9.18 (d, J=1.5 Hz, 1H), 7.47 (d, J=7.3 Hz, 2H), 7.39 (t, J=7.4 Hz, 2H), 7.35 - 7.27 (m, 2H), 7.25 (dd, J=3.2, 8.3 Hz, 1H), 7.19 - 7.13 (m, 1H), 5.20 (s, 2H).19F NMR (376MHz, DMSO-d6) δ ppm -123.18 (s, 1F).
Faza 3: Sinteza 2-(benziloksi)-5-fluor-N-(pivaloiloksi)benzamida (VVV-4)
[0514] U bocu okruglog dna, opremljenu magnetnom mešalicom i koja sadrži VVV-3 (3.0 g, 11.5 mmol), se dodaju THF (35 mL) i trietil amin (1.60 mL, 11.5 mmol) a nakon toga se u kapima dodaje pivaloil hlorid (1.55 mL, 12.6 mmol). Reakcija se meša 30 minuta na rt.
Reakcija se prenese u levak za razdvajanje sa EtOAc. Rastvor se ispere sa 2 porcije 1 M HCl aq., 1 porcijom upola zasićenim NaHCO3i 2 porcije slanog rastvora. Organski rastvor se nakon toga suši (MgSO4), filtrira i koncentruje pod vakuumom. Sirovi ostatak se prečisti flash hromatografijom na koloni (40 g SiO2, Isco, 100% Hept. do 100% EtOAc, 20 mL frakcije) da se dobije naslovljeno jedinjenje (3.83 g, >95%) kao bezbojno ulje solvatizovano sa EtOAc. Ulje se prenese u DCM i razblaži sa heptanom a nakon toga koncentruje pod vakuumom. Dobijeni materijal se dalje suši pod visokim vakuumom u toku noći da se dobije naslovljeno jedinjenje VVV-4 (3.59 g, 90%) kao bela čvrsta supstanca. LCMS [M+H] = 346 zabeleženo.
<1>H NMR (400MHz, HLOROFORM-d) δ ppm 10.95 (s, 1H), 7.89 (dd, J=3.2, 9.1 Hz, 1H), 7.53 - 7.33 (m, 5H), 7.16 (ddd, J=3.3, 7.2, 9.0 Hz, 1H), 7.00 (dd, J=4.1, 9.1 Hz, 1H), 5.27 (s, 2H), 1.35 (s, 9H).
Faza 4: Sinteza 8-(benziloksi)-5-fluor-4-metil-3,4-dihidroizohinolin-1(2H)-ona (VVV-5)
[0515] U scintilacionu bočicu, opremljenu magnetnom mešalicom, se dodaju VVV-4 (500 mg, 1.45 mmol), cezijum pivalat (678 mg, 2.90 mmol) i [CptRhCl2]2(25.4 mg, 0.036 mmol).
2
Sadržaji bočice se prenesu u reaktor visokog pritiska i doda se TFE (7.0 mL). Reaktor se 3 puta prečisti sa azotom a nakon toga se u 3 ciklusa prečisti sa propilen gasom. Reakcija se zagreva 20 sati na 45°C pod pritiskom propilen gasa od 4 bara. Rastvor se prenese u bocu okruglog dna i koncentruje pod vakuumom. Sirovi ostatak se prečisti flash hromatografijom na koloni (24 g SiO2, Isco, 100% Hept. do 100% EtOAc, 9 mL frakcije) da se dobije naslovljeno jedinjenje VVV-5 (270 mg, 65%, 93:7 r.r.) kao svetlo ružičasta čvrsta supstanca. HSCQC i HOESY analize su konzistentne sa proverenim regioizomerom. LCMS [M+H] = 286 zabeleženo.<1>H NMR (400MHz, HLOROFORM-d) δ ppm 7.55 (d, J=7.5 Hz, 2H), 7.43 -7.34 (m, 2H), 7.30 (d, J=7.3 Hz, 1H), 7.10 (t, J=8.8 Hz, 1H), 6.87 (dd, J=4.3, 9.0 Hz, 1H), 5.98 (d, J=3.7 Hz, 1H), 5.29 - 5.21 (m, 1H), 5.18 - 5.11 (m, 1H), 3.70 (ddd, J=0.7, 4.0, 12.6 Hz, 1H), 3.38 - 3.28 (m, 1H), 3.23 (ddd, J=1.5, 6.0, 12.6 Hz, 1H), 1.35 (d, J=7.0 Hz, 3H).19F NMR (376MHz, HLOROFORM-d) δ ppm -129.24 (s, 1F).
Faza 5: Sinteza terc-butil-8-(benziloksi)-5-fluor-4-metil-1-okso-3,4-dihidroizohinolin-2(1H)-karboksilata (VVV-6)
[0516] U bocu okruglog dna, opremljenu magnetnom mešalicom, se doda VVV-5 (100 mg, 0.350 mmol) kao rastvor u DMF (4.0 mL). Rastvor se ohladi na 10°C a nakon toga se dodaju (Boc)2O (84.1 mg, 0.386 mmol), DIPEA (92 µL, 0.526 mmol) i DMAP (2.1 mg, 0.017 mmol). Reakcija se ostavi da se meša 16 sati na rt obezbeđujući nisku konverziju u željeni produkt. Reakcija se nakon toga zagreva 24 sata na 50°C a nakon toga se temperatura poveća na 75°C u naredna 24 sata kako bi se postigao potpuni utrošak početnog materijala. Reakcija se razblaži sa vodom i prenese u levak za razdvajanje sa EtOAc. Faze se razdvoje i organska faza se ispere sa 1 porcijom slanog rastvora, suši (Ns2SO4), filtrira i koncentruje pod vakuumom. Sirovi ostatak se prečisti flash hromatografijom na koloni (SiO2, 1% EtOAc/petrol etar do 40% EtOAc/petrol etar) da se dobije naslovljeno jedinjenje VVV-6 (100 mg, 74%) kao bezbojna guma. LCMS [M+H-Boc] = 286 zabeleženo.
Faza 6: Sinteza terc-butil-8-(benziloksi)-5-fluor-4-metil-3,4-dihidroizohinolin-2(1H)-karboksilata (VVV- 7)
[0517] U bocu okruglog dna, opremljenu magnetnom mešalicom, se doda VVV-6 (100 mg, 0.259 mmol) kao rastvor u THF. Rastvor se ohladi na 0°C a nakon toga se u kapima dodaje
2
BH3·THF. Po završenom dodavanju, reakcija se ukloni iz ledenog kupatila i zagreva 6 sati na 60°C u atmosferi azota. U ovoj fazi se reakcija ohladi na -10°C i neutrališe pažljivim dodavanjem MeOH u kapima. Reakcija se ostavi da se meša 16 sati na -10°C i nakon toga koncentruje pod vakuumom. Sirovi ostatak se prečisti preparativnom hromatografijom na tankom sloju (SiO2, 20% EtOAc/petrol etar) da se dobije naslovljeno jedinjenje VVV-7 (35.0 mg, 36%) kao bezbojna guma. LCMS [M+H-izobutilen] = 316 zabeleženo.
Faza 7: Sinteza terc-butil-5-fluor-8-hidroksi-4-metil-3,4-dihidroizohinolin-2(1H)-karboksilata (TP-31)
[0518] U bocu okruglog dna, opremljenu magnetnom mešalicom, se doda VVV-7 (70 mg, 0.190 mmol) kao rastvor u MeOH (4.5 mL). U rastvor se doda Pd/C (10.0 mg, 0.094 mmol) i sadržaj na vrhu boce se prečisti 5 puta sa vodonikom. Reakcija se ostavi da se meša 2.5 sata na rt pod pritiskom gasa vodonika od 1 atm. Reakcija se filtrira i čvrste supstance se isperu sa DCM. Filtrat se koncentruje pod vakuumom i sirovi ostatak se prečisti preparativnom hromatografijom na tankom sloju (SiO2, 20% EtOAc/petrol etar) da se dobije naslovljeno jedinjenje TP-31 (45 mg, 85%) kao bezbojna guma. LCMS [M+H-izobutilen] = 226 zabeleženo.<1>H NMR (400MHz, HLOROFORM-d) δ ppm 6.76 (br t, J=8.8 Hz, 1H), 6.55 (dd, J=4.4, 8.7 Hz, 1H), 5.14 - 4.78 (m, 2H), 4.22 - 3.95 (m, 2H), 3.23 - 2.94 (m, 2H), 1.54 - 1.46 (s, 9H), 1.23 (d, J=7.3 Hz, 3H).
Sinteza terc-butil (8-hidroksi-1,2,3,4-tetrahidronaftalen-1-il)karbamata (TP-32)
[0519]
Šema WWW
Faza 1 - Sinteza 8-metoksi-1,2,3,4-tetrahidronaftalen-1-amina (WWW-2)
2
[0520] U promešanu žutu suspenziju 8-metoksi-3,4-dihidronaftalen-1(2H)-ona WWW-1 (600 mg, 3.4 mmol) u MeOH (30 mL) se na 15 °C doda CH3COONH4(5.25 g, 68 mmol). Smeša se meša 15 min na 15 °C a nakon toga se na 15 °C doda NaBH3CN (1.5 g, 24 mmol). Smeša se zrači u mikrotalasnom reaktoru 45 min na 60 °C. Smeša se neutrališe sa sat. NaHCO3(15 mL) i H2O (15 mL) i meša 5 min na 15 °C. Smeša se koncentruje da se ukloni MeOH. Ostatak se ekstrahuje sa DCM (20 mL X 2). Kombinovani organski slojevi se isperu sa slanim rastvorom (10 mL), suše preko Na2SO4, filtriraju i koncentruju da se dobije sirovo WWW-2 (580 mg, 96%) kao bledo ružičasta guma i koristi se kao takva u sledećoj fazi.
Faza 2 - Sinteza 8-amino-5,6,7,8-tetrahidronaftalen-1-ola (WWW-3)
[0521] Jedinjenje WWW-2 (550 mg, 3.10 mmol) se rastvori u smeši HCl/dioksan (5.00 mL) i rastvor se meša 10 min na 15 °C. Nakon toga se rastvor upari da se dobije ostatak. Ostatak se rastvori u DCM i ohladi na 0 °C u ledenom kupatilu. Nakon toga se u reaktivni rastvor u kapima doda BBr3(7.77 mg, 31.0 mmol). Reaktivni rastvor se meša 5 h na 20 °C. Reaktivni rastvor se neutrališe sa MeOH (8.00 mL), nakon toga se pH rastvora podesi na pH=7 dodavanjem zasićenog rastvora aq NaHCO3. Finalni rastvor WWW-3 se direktno koristi za sledeću fazu (100 mL).
Faza 3 - Sinteza terc-butil (8-hidroksi-1,2,3,4-tetrahidronaftalen-1-il)karbamata (TP-32)
[0522] U rastvor (Boc)2O (730 mg, 3.34 mmol) u dioksanu (5.00 mL) se na 0 °C u jednoj porciji doda rastvor jedinjenja WWW- 3 (rastvor u aq. sat. NaHCO3, 15 mL ~3.3 mmol). Reaktivni rastvor se meša 50 sati na 20 °C. Reakcija se ekstrahuje sa DCM (2x) i organski slojevi se kombinuju i isperu sa zasićenim rastvorom limunske kiseline (2 x 15 mL), aq sat. Na2CO3(2 x 15 mL) i slanim rastvorom (2 x 15 mL). Organski slojevi se suše i upare da se dobije ostatak koji se prečisti prep-TLC (petrol etar/EtOAc=4/1) da se dobije TP-32 (410 mg, 50%) kao bela čvrsta supstanca. LCMS [M-tBu+1] 207;<1>H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ ppm 9.20 (s, 1H), 6.96 (t, J=7.8 Hz, 1H), 6.78 (br d, J=7.5 Hz, 1H), 6.57 (d, J=7.7 Hz, 1H), 6.51 (d, J=7.4 Hz, 1H), 4.80 - 4.71 (m, 1H), 2.72 - 2.63 (m, 1H), 2.61 - 2.53 (m, 1H), 1.89 -1.74 (m, 2H), 1.67 - 1.46 (m, 2H), 1.39 (s, 9H)
2
Sinteza terc-butil (5-hidroksihroman-3-il)karbamata (TP-33)
[0523]
Šema XXX
Faza 1 - Sinteza 5-(benziloksi)hroman-3-amina (XXX-2)
[0524] Jedinjenje XXX-1 (700 mg, 2.73 mmol, izrađeno po egzaktnim procedurama iz literature J. Org. Chem, 2013, 78, 7859-7884) se uvede u slične Mitsunobu i Staudinger procedure na isti način da se dobije produkt XXX-2 (520 mg, 75 %) kao bezbojna guma, koja se direktno koristi u sledećoj fazi. LCMS [M+1] 266;<1>H NMR (400 MHz, CDCl3) δ ppm 7.48 - 7.36 (m, 4H), 7.36 - 7.30 (m, 1H), 7.07 (t, J=8.3 Hz, 1H), 6.52 (dd, J=2.5, 8.3 Hz, 2H), 5.07 (s, 2H), 4.18 - 4.07 (m, 1H), 3.80 (ddd, J=1.0, 7.3, 10.5 Hz, 1H), 3.43 - 3.29 (m, 1H), 3.07 (dd, J=5.0, 16.6 Hz, 1H), 2.50 (dd, J=7.3, 16.8 Hz, 1H)
Faza 2 - Sinteza terc-butil (5-(benziloksi)hroman-3-il)karbamata (XXX-3)
[0525] U rastvor XXX-2 (520 mg, 2.04 mmol) u bezvodnom MeOH (20 mL) se na rt doda Boc2O (889 mg, 4.07 mmol) i meša 30 min (20 mL EtOAc se doda zbog rastvorljivosti). Smeša se koncentruje pod vakuumom da se dobije sirovi materijal koji se prečisti hromatografijom na silika gelu uz eluiranje sa EtOAc u petrol etru od 0 do 50 %, nakon toga EtOAc u DCM od 0 do 50 % da se dobije XXX-3 (620 mg, 76%) kao bela čvrsta supstanca. LCMS [M-tBu+1] 300;<1>H NMR (400 MHz, CDCl3) δ ppm 7.45 - 7.36 (m, 4H), 7.34 (br d, J=6.8 Hz, 1H), 7.12 - 7.05 (m, 1H), 6.53 (d, J=8.3 Hz, 2H), 5.06 (s, 2H), 4.91 - 4.79 (m, 1H), 4.26 - 4.15 (m, 1H), 4.08 (br s, 2H), 3.01 - 2.92 (m, 1H), 2.81 - 2.69 (m, 1H), 1.44 (s, 9H)
Faza 3 - Sinteza terc-butil (5-hidroksihroman-3-il)karbamata (TP-33)
[0526] Smeša XXX-3 (620 mg, 2.43 mmol) i Pd/C (300 mg) u smeši MeOH/EtOAc (10
2 1
mL/10 mL) se degasira četiri puta sa H2. Smeša se meša 16 h na rt u H2balonu. Smeša se filtrira i koncentruje. (Višak Boc2O iz prethodnih faza, takođe Boc-zaštićeni fenol, zato se dodaju MeOH (20 mL) i K2CO3(2 g) i meša 2 h, a nakon toga filtrira). Smeša se filtrira i koncentruje. Sirovi materijal se razblaži sa EtOAc i ispere sa slanim rastvorom (15 mL), suši preko Na2SO4i koncentruje pod vakuumom, nakon toga liofilizira da se dobije TP-33 (420 mg, 91%) kao bela čvrsta supstanca. LCMS [M-tBu+1] 210;<1>H NMR (400 MHz, CDCl3) δ ppm 6.99 (t, J=8.2 Hz, 1H), 6.48 (d, J=8.3 Hz, 1H), 6.40 (d, J=8.0 Hz, 1H), 5.19 (br s, 1H), 4.96 - 4.89 (m, 1H), 4.22 (br s, 1H), 4.15 - 4.03 (m, 2H), 2.91 (dd, J=5.5, 16.8 Hz, 1H), 2.71 (br d, J=17.3 Hz, 1H), 1.45 (s, 9H)
Primer 182 i Primer 183 (Šema YYY) - (1S,2S,3S,5R)-3-((-5-fluor-4-metil-1,2,3,4-tetrahidroizohinolin-8-il)oksi)-5-(4-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)ciklopentan-1,2-diol hidrohlorid (YYY-3-izomer 1 i YYY-3-izomer 2)
[0527]
Šema YYY
YYY-2 izomer 1YYY-3 izomer 1
YYY-2 izomer 2 YYY-3 izomer 2
Faza 1: Sinteza terc-butil-5-fluor-4-metil-8-(((1S,4R)-4-(4-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)ciklopent-2-en-1-il)oksi)-3,4-dihidroizohinolin-2(1H)-karboksilata (YYY-1)
2 2
[0528] U mikrotalasnu bočicu, opremljenu magnetnom mešalicom, se dodaju TP-31 (45 mg, 0.160 mmol), BB-2 (50.4 mg, 0.160 mmol), Pd2(dba)3·CHCl3(4.14 mg, 0.004 mmol), DPPP (3.96 mg, 0.010 mmol) i cezijum karbonat (57.3 mg, 0.176 mmol). Bočica se prečisti sa azotom pod dinamičkim vakuumom i doda se sveže degasirani DCE (1.0 mL). Rastvor se meša 1 sat na rt u atmosferi azota. Rastvor se koncentruje pod vakuumom i sirovi ostatak se prečisti preparativnom hromatografijom na tankom sloju (SiO2, 33% EtOAc/petrol etar) da se dobije naslovljeno jedinjenje YYY-1 (60 mg, 86%) kao guma. LCMS [M+H] = 579 zabeleženo.<1>H NMR (400MHz, HLOROFORM-d) δ ppm 8.76 (s, 1H), 7.35 - 7.28 (m, 1H), 6.84 (br t, J=8.7 Hz, 1H), 6.73 - 6.51 (m, 2H), 6.37 (br s, 1H), 6.19 - 5.99 (m, 2H), 5.28 (br s, 1H), 4.24 - 3.95 (m, 2H), 3.22 - 3.05 (m, 3H), 2.73 (d, J=2.5 Hz, 3H), 1.96 (br d, J=14.6 Hz, 1H), 1.69 - 1.63 (m, 1H), 1.50 (s, 9H), 1.23 (t, J=7.0 Hz, 3H)
Faza 2: Sinteza terc-butil-8-(((1S,2S,3S,4R)-2,3-dihidroksi-4-(4-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)ciklopentil)oksi)-5-fluor-4-metil-3,4-dihidroizohinolin-2(1H)-karboksilata (YYY-2)
[0529] U reaktivnu bočicu, opremljenu magnetnom mešalicom, se doda YYY-1 (60.0 mg, 0.130 mmol) kao rastvor u DCM (6.0 mL). U rastvor se dodaju voda (0.2 mL), NMO (44.1 mg, 0.376 mmol) i OsO4(112 mg, 0.0176 mmol). Reakcija se ostavi da se meša 5 sati na rt. Reakcija se neutrališe sa sat. Na2SO3(5 mL) i prenese u levak za razdvajanje sa DCM. Faze se razdvoje i vodena faza se ekstrahuje sa 1 porcijom DCM. Kombinovani organski ekstrakti se suše (Na2SO4), filtriraju i koncentruju pod vakuumom. Sirovi ostatak se prečisti preparativnom hromatografijom na tankom sloju da se dobije naslovljeno jedinjenje YYY-2 (35 mg, 54%) kao bezbojna guma. LCMS [M+H] = 513 zabeleženo.
Faza 3: Sinteza terc-butil-8-(((1S,2S,3S,4R)-2,3-dihidroksi-4-(4-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)ciklopentil)oksi)-5-fluor-4-metil-3,4-dihidroizohinolin-2(1H)-karboksilata (YYY-2-izomer 1 & YYY-2-izomer 2)
[0530] YYY-2 (30 mg, 0.058 mmol) se dalje prečisti preparativnom superkritičnom tečnom hromatografijom (OD 250mmx30mmx5µm, 0.1% NH4OH/IPA do 30% NH4OH/IPA, 60 mL/min) da se dobiju razdvojeni diastereomeri YYY-2-izomer 1 (15 mg, 50%) i YYY-2-izomer 2 (15 mg, 50%) kao bele čvrste supstance. LCMS [M+H] = 513 zabeleženo.
2
Faza 4 koristi YYY-2-izomer 1: Sinteza (1S,2S,3S,5R)-3-((-5-fluor-4-metil-1,2,3,4-tetrahidroizohinolin-8-il)oksi)-5-(4-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)ciklopentan-1,2-diol hidrohlorida (YYY-3-izomer 1)
[0531] U reaktivnu bočicu, opremljenu magnetnom mešalicom, se doda YYY-2-izomer 1 (15 mg, 0.029 mmol) kao rastvor u EtOAc (1.0 mL). Rastvor se ohladi na 0°C a nakon toga se doda HCl (4M EtOAc, 59 µL). Reakcija se ukloni iz ledenog kupatila i meša 16 sati na rt. Rastvor se koncentruje pod vakuumom a nakon toga suši na vazduhu da se dobije naslovljeno jedinjenje YYY-3-izomer 1 (8.26 mg, 63%) kao bela čvrsta supstanca. LCMS [M+H] = 413 zabeleženo.<1>H NMR (400MHz, METANOL-d4) δ ppm 9.05 (d, J=3.3 Hz, 1H), 8.08 (d, J=2.4 Hz, 1H), 7.24 (d, J=3.7 Hz, 1H), 7.15 - 6.99 (m, 2H), 5.41 (q, J=9.3 Hz, 1H), 4.76 (br d, J=4.8 Hz, 2H), 4.52 - 4.41 (m, 1H), 4.36 - 4.27 (m, 1H), 4.23 (d, J=4.8 Hz, 1H), 3.57 - 3.40 (m, 3H), 3.12 - 2.99 (m, 4H), 2.27 (dt, J=5.1, 9.5 Hz, 1H), 1.47 (d, J=6.7 Hz, 3H).
Faza 4 koristi YYY-2-izomer 2: Sinteza (1S,2S,3S,5R)-3-((-5-fluor-4-metil-1,2,3,4-tetrahidroizohinolin-8-il)oksi)-5-(4-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)ciklopentan-1,2-diol hidrohlorida (YYY-3-izomer 2))
[0532] U reaktivnu bočicu, opremljenu magnetnom mešalicom, se doda YYY-2-izomer 2 (15 mg, 0.029 mmol) kao rastvor u EtOAc (1.0 mL). Rastvor se ohladi na 0°C a nakon toga se doda HCl (4M EtOAc, 59 mL). Reakcija se ukloni iz ledenog kupatila i meša 16 sati na rt. Rastvor se koncentruje pod vakuumom a nakon toga suši na vazduhu da se dobije naslovljeno jedinjenje YYY-2-izomer 2 (8.48 mg, 70%) kao bela čvrsta supstanca. LCMS [M+H] = 413 zabeleženo.<1>H NMR (400MHz, METANOL-d4) δ ppm 9.04 (d, J=3.0 Hz, 1H), 8.06 (d, J=3.2 Hz, 1H), 7.24 (d, J=3.7 Hz, 1H), 7.16 - 7.01 (m, 2H), 5.42 (q, J=9.4 Hz, 1H), 4.77 - 4.70 (m, 2H), 4.48 - 4.39 (m, 1H), 4.36 - 4.27 (m, 1H), 4.21 (d, J=4.7 Hz, 1H), 3.55 - 3.40 (m, 3H), 3.17 - 2.96 (m, 4H), 2.33 - 2.18 (m, 1H), 1.46 (d, J=6.7 Hz, 3H).
Primeri 184 -189 su izrađeni na sličan način kao Primeri 182 & 183 (Šema YYY) počevši od odgovarajućeg racematnog tetrahidroizohinolina u fazi 1 i razdvajanjem diastereomera pre finalne deprotekcije.
2 4
2 (nastavlja se)
2 (nastavlja se)
Primer 190 (Šema ZZZ) - (1S,2S,3S,5R)-3-((6-(difluorometil)-5-fluor-1,2,3,4-tetrahidroizohinolin-8- il)oksi)-5-(4-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)ciklopentan-1,2-diol (ZZZ-16)
2
Šema ZZZ
Faza 1 - Sinteza metil 4-brom-5-fluor-2-metoksibenzoata (ZZZ-2)
[0535] Rastvor 4-brom-2,5-difluorobenzoeve kiseline ZZZ-1 (95 g, 400.85 mmol) u 4M HCl/MeOH (1500 mL) se zagreva 3 sata na 65 °C. Smeša se koncentruje pod vakuumom da se dobije ZZZ-2 (100 g, >99%) kao svetlo žuta čvrsta supstanca.<1>H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ ppm 7.93 (dd, J=5.5, 9.8 Hz, 1H), 7.81 (dd, J=6.0, 8.5 Hz, 1H), 3.92 - 3.85 (m, 3H)
Faza 2 - Sinteza 4-brom-5-fluor-2-metoksibenzoeve kiseline (ZZZ-3)
[0536] U rastvor ZZZ-2 (80 g, 7.97 mmol) u bezvodnom DMF (1200 mL) se na 0 °C doda rastvor MeONa (-17.2 g, 319 mmol, dobijenog rastvaranjem8 g Na u 80 mL MeOH). Smeša se meša 10 minuta na 0 °C, nakon toga zagreje na rt (25 °C) i meša 1h. U smešu se nakon
2
toga doda TBME (1 L) i sipa u vodu sa ledom (800 mL). Smeša se ekstrahuje sa TBME (500 mL x 4). Organski sloj se ispere sa slanim rastvorom (300 mL x 2), suši preko Na2SO4, filtrira i koncentruje da se dobije produkt metil etar, metil estar (12.1 g) kao svetlo žuta guma.
Vodeni sloj koji sadrži karboksilnu kiselinu se nakon toga neutrališe sa HCl (1M) do pH=5 i ekstrahuje sa EtOAc (800 mL x 3). Organski sloj se ispere sa slanim rastvorom (400mL x 2), suši preko Na2SO4, filtrira i koncentruje da se dobije ZZZ-3 (100g, >99% sirovo) kao žuto ulje i koristi direktno u sledećoj fazi. NMR sadržaja DMF.<1>H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ ppm 7.59 (d, J=8.8 Hz, 1H), 7.46 (d, J=5.8 Hz, 1H), 3.83 (s, 3H)
Faza 3 - Sinteza 4-brom-5-fluor-2-hidroksibenzoeve kiseline (ZZZ-4)
[0537] U rastvor ZZZ-3 (~60g sirovo, 240.93 mmol) u bezvodnom DCM (600 mL) se na rt (20°C) doda BBr3(68.3 mL rastvorenog u DCM 600 mL, 723 mmol). Smeša se meša 2 h na rt (20 °C). U smešu se sipa voda (500 mL) i ekstrahuje sa DCM (800 mL x 3). Organski sloj se ispere sa slanim rastvorom (300 mL x 2), suši preko Na2SO4, filtrira i koncentruje da se dobije ZZZ-4 (35 g, 62%) kao žuta guma.<1>H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ ppm 7.62 (d, J=9.0 Hz, 1H), 7.33 (d, J=5.8 Hz, 1H)
Faza 4 - Sinteza benzil 2-(benziloksi)-4-brom-5-fluorobenzoata (ZZZ-5)
[0538] U rastvor ZZZ-4 (35 g, 148.93 mmol) u bezvodnom DMF (300 mL) se dodaju K2CO3(41.2 g, 298 mmol) i BnBr (38.2 g, 223 mmol). Smeša se meša 16 h na 25 °C. Smeša se razblaži sa vodom (200 mL) i ekstrahuje sa EtOAc (300 mL x 3). Organski slojevi se sakupe, suše i koncentruju da se dobije sirovo svetlo žuto ulje koje se prečisti kombi-flash (silika gel EtOAc/petrol etar = 0-8%) da se dobije ZZZ-5 (22 g, 36%) kao svetlo žuta čvrsta supstanca.
<1>H NMR (400 MHz, CDCl3) δ ppm 7.67 (d, J=8.6 Hz, 1H), 7.48 - 7.32 (m, 10H), 7.25 (d, J=5.5 Hz, 1H), 5.36 (s, 2H), 5.14 (s, 2H)
Faza 5 - Sinteza 2-(benziloksi)-4-brom-5-fluorobenzoeve kiseline (ZZZ-6)
[0539] U rastvor ZZZ-5 (22 g, 52.98 mmol) u MeOH (200 mL) se doda rastvor LiOH.H2O (6.67 g, 159 mmol) u H2O (200 mL). Reaktivna smeša se meša 4 sata na 20°C. Reaktivna smeša se ekstrahuje sa EtOAc (150 mL x 2). Vodeni sloj se na 0 °C neutrališe sa 1 M
2
vodenim rastvorom HCl do pH 4-5, a nakon toga ekstrahuje sa EtOAc (200 mL x 2).
Organski sloj se ispere sa slanim rastvorom (50mL x 2), suši preko Na2SO4, filtrira i koncentruje da se dobije ZZZ-6 (12.5 g, 73%) kao bela čvrsta supstanca. LCMS [M+1] 324.96;<1>H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ ppm 13.16 (br s, 1H), 7.66 - 7.56 (m, 2H), 7.53 -7.46 (m, 2H), 7.45 - 7.37 (m, 1H), 7.45 - 7.37 (m, 1H), 7.37 - 7.30 (m, 1H), 5.22 (s, 2H)
Faza 6 - Sinteza 2-(benziloksi)-4-brom-5-fluor-N-(pivaloiloksi)benzamida (ZZZ-7)
[0540] U rastvor ZZZ-6 (23 g, 70.74 mmol) u THF (300 mL) se na rt (25°C) dodaju O-pivaloilhidroksilamin (35.4 g, 141 mmol) i DIPEA (54.9 g, 424 mmol). Nakon toga se na 0°C doda T3P (113 g, 177mmol). Nakon dodavanja, smeša se meša 10 minuta na 0 °C, zatim zagreje na rt (20 °C) i meša 16 sati. Smeša se koncentruje da se ukloni najveći deo rastvarača. Preostala smeša se razblaži sa EtOAc (80 mL), ispere sa zasićenim vodenim rastvorom NaHCO3(50 mL) i ekstrahuje sa EtOAc (100 mL x 2). Organski sloj se ispere sa slanim rastvorom (50 mL x 2), suši preko Na2SO4, filtrira i koncentruje da se dobije sirovi produkt (42 g) kao žuta guma koja se prečisti hromatografijom (silika gel, EtOAc/petrol etar = 0-25%) da se dobije ZZZ-7 (26 g, 87%) kao svetlo žuta čvrsta supstanca. LCMS [M+1] 424;<1>H NMR (400 MHz, CDCl3) δ ppm 10.80 (br s, 1H), 7.93 (d, J=8.8 Hz, 1H), 7.51 - 7.34 (m, 5H), 7.27 - 7.23 (m, 1H), 5.24 (s, 2H), 1.33 (s, 9H)
Faza 7 - Sinteza 8-(benziloksi)-6-brom-5-fluor-3,4-dihidroizohinolin-1(2H)-ona (ZZZ-8)
[0541] U posudu sa suspenzijom ZZZ-7 (26g, 64 mmol) u MeCN (600 mL) se dodaju KOAc (6.91g, 70.4 mmol) i [Cp*Rh2Cl2]2 (2.37 g, 3.84 mmol) i posuda ohladi na 0 °C, posuda se prečišćava etilenom u teoku 30 minuta i zatvori. Reakcija se meša 16 sati na rt (20 °C). Smeša se koncentruje da se dobije sirovi produkt (26 g) kao žuta čvrsta supstanca koja se prečisti hromatografijom (silika gel petrol etar: EtOAc = 0-100%) da se dobije ZZZ- 8 (12 g, 59%) kao žuta čvrsta supstanca. LCMS [M+1] 351;<1>H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ ppm 7.92 (br s, 1H), 7.56 (d, J=7.0 Hz, 2H), 7.44 - 7.35 (m, 3H), 7.34 - 7.28 (m, 1H), 5.19 (s, 2H), 3.30 (dt, J=3.6, 6.2 Hz, 2H), 2.86 (t, J=6.1 Hz, 2H)
Faza 8 - Sinteza terc-butil 8-(benziloksi)-6-brom-5-fluor-1-okso-3,4-dihidroizohinolin-2(1H)-karboksilata (ZZZ-9)
2
[0542] U rastvor ZZZ-8 (11 g, 33.113 mmol) u THF (40 mL) i DCM (120mL) se dodaju Boc2O (11.6 g, 53 mmol), DIPEA (15 g, 116 mmol) i DMAP (607 mg, 4.97 mmol). Nakon dodavanja, smeša se meša 16 sati na rt (22 °C). Reakcija se koncentruje da se dobije sirovi materijal (17.2 g,) kao žuta guma koja se nakon toga prečisti kombi-flash (EtOAc/petrol etar = 0-20%) da se dobije ZZZ-9 (14.52 g, 97%) kao svetlo žuta čvrsta supstanca. LCMS [M+23] 472;<1>H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ ppm 7.63 - 7.22 (m, 6H), 5.32 - 5.14 (m, 2H), 3.86 (t, J=6.0 Hz, 2H), 2.97 (t, J=5.9 Hz, 2H), 1.50 (s, 9H)
Faza 9 - Sinteza terc-butil 8-(benziloksi)-6-brom-5-fluor-3,4-dihidroizohinolin-2(1H)-karboksilata (ZZZ- 10)
[0543] U rastvor ZZZ-9 (14.81 g, 32.9 mmol) u THF (150 mL) se na rt (25 °C) doda BH3Me2S (19.7 mL, 197 mmol). Smeša se zagreva 1 sat na 70°C. Reakcija se polako neutrališe sa MeOH (40 mL). Smeša se refluksuje 16 h na 65 °C. Smeša se koncentruje da se dobije sirovi produkt (26 g) kao žuta guma u koji se doda voda (60 mL) a produkt ekstrahuje sa EtOAc (100mL x 2) .Organski sloj se ispere sa slanim rastvorom (50 mL x 2), suši preko Na2SO4, filtrira i koncentruje da se dobije sirovi materijal (17 g) koji se prečisti hromatografijom (silika gel, EtOAc/ petrol etar = 0-25%) da se dobije ZZZ-10 (13.2 g) kao svetlo žuta guma koja se liofilizira da se dobije ZZZ-10 (13.06 g, 91%) kao bela čvrsta supstanca. LCMS [M-Boc+1] 337;<1>H NMR (400 MHz, CDCl3) δ ppm 7.44 - 7.31 (m, 5H), 6.92 (d, J=5.5 Hz, 1H), 5.04 (br s, 2H), 4.51 (s, 2H), 3.63 (br t, J=5.8 Hz, 2H), 2.88 - 2.72(m, 2H), 1.50 (s, 9H)
Faza 10 - Sinteza terc-butil 8-(benziloksi)-5-fluor-6-formil-3,4-dihidroizohinolin-2(1H)-karboksilata (ZZZ-11)
[0544] U bocu okruglog dna osušenu u pećnici se dodaju ZZZ-10 (285 mg, 0.653 mmol) i bezvodni THF (4.35 mL, 0.15 M). Doda se rastvor DMF (0.98 mL, 0.98 mmol, 1M rastvor u THF) i smeša se ohladi na -78 °C sa smešom suvi led/aceton. U kapima se doda nBuLi (0.92 mL, 1.47 mmol, 1.6M rastvor u heksanima) i meša 30 min na -78 °C za koje vreme reakcija iz bistre postaje žuta. LCMS i dalje pokazuje -50% ZZZ-10 i stoga se doda još 0.5 ekvivalenta DMF (0.49 mL, 0.49 mmol, 1M rastvor u THF) i nBuLi (0.46 mL, 0.735 mmol, 1M rastvor u
2 1
heksanima) i meša 25 min. Reakcija se neutrališe sa vodom i ekstrahuje sa EtOAc. Vodeni sloj se ekstrahuje 3x sa EtOAc. Kombinovani organski slojevi se isperu sa vodom i suše preko Na2SO4, filtriraju i koncentruju da se dobije sirovo žuto ulje (404 mg) koje se prečisti ISCO 25g 0-20% EtOAc/heptani da se dobije ZZZ-11 kao bistro ulje (215 mg, 60%). LCMS [M+1] 286;<1>H NMR (400 MHz, CDCl3) δ ppm 10.35 (s, 1H), 7.49 - 7.32 (m, 5H), 7.23 (d, J=5.3 Hz, 1H), 5.13 (br. s., 2H), 4.64 (s, 2H), 3.69 (t, J=5.7 Hz, 2H), 2.86 (t, J=5.1 Hz, 2H), 1.52 (s, 9H)
Faza 11 - Sinteza terc-butil 8-(benziloksi)-6-(difluorometil)-5-fluor-3,4-dihidroizohinolin-2(1H)-karboksilata (ZZZ-12)
[0545] U rastvor ZZZ-11 (418 mg, 1.08 mmol) se doda DCM (10.8 mL, 0.1M). Rastvor se ohladi na 0 °C, nakon toga se u kapima dodaje DAST (0.36 mL, 2.71 mmol) i meša 4 h na r.t. LCMS pokazuje -25% produkta. Reakcija se ohladi na 0 °C i u kapima se ponovo dodaje DAST (0.36 mL, 2.71 mmol) i meša 2 sata na r.t. Reakcija nije završena i doda se još 2 ekivalenta i meša 2h. Reakcija se nakon toga neutrališe sa sat. aq. NaHCO3. Slojevi se razdvoje i vodeni sloj se ekstrahuje 2x sa DCM, suši preko Na2SO4, filtrira i koncentruje a nakon toga prečisti ISCO 12g 0-15% EtOAc/heptani da se dobije ZZZ-12 kao bela čvrsta supstanca (322 mg, 73%). LCMS [M-Boc+1] 308;<1>H NMR (400 MHz, CDCl3) δ ppm 7.47 -7.32 (m, 5H), 7.03 - 6.75 (m, 2H), 5.10 (br. s., 2H), 4.59 (br. s., 2H), 3.66 (t, J=5.6 Hz, 2H), 2.84 - 2.75 (m, 2H), 1.50 (s, 9H)
Faza 12 - Sinteza terc-butil 6-(difluorometil)-5-fluor-8-hidroksi-3,4-dihidroizohinolin-2(1H)-karboksilata (ZZZ-13)
[0546] U bocu okruglog dna se dodaju ZZZ-12 (322 mg, 0.79 mmol) i MeOH (15.8 mL, 0.05 M). Doda se 10% Pd/C (30 mg) i prenese u balon vodonika. Reakcija se meša na r.t. u toku noći. Reakcija se filtrira kroz špric i filter nastavak. Sirovi beli materijal (252 mg) se rastvori u smeši DCM:MeOH (-2:1) zbog potpune rastvorljivosti i doda u ISCO 12g i prečisti sa 0-25% EtOAc/heptani da se dobije ZZZ-13 kao bela čvrsta supstanca (239 mg, 95%). LCMS [M-Boc+1] 218;<1>H NMR (400 MHz, CDCl3) δ ppm 6.99 - 6.62 (m, 2H), 4.55 (br. s., 2H), 3.66 (t, J=5.9 Hz, 2H), 2.79 (br. s., 2H), 1.52 (s, 9H)
Faza 13 - Sinteza terc-butil 6-(difluorometil)-5-fluor-8-(((1S,4R)-4-(4-metil-7H-
2 2
pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)ciklopent-2-en-1-il)oksi)-3,4-dihidroizohinolin-2(1H)-karboksilata (ZZZ-14)
[0547] U mikrotalasnu bočicu (koja se suši zagrevanjem fenom, a nakon toga ohladi u struji N2) se dodaju jedinjenje BB-2 (238 mg, 0.753 mmol), ZZZ-13 (239 mg, 0.753 mmol), Cs2CO3(270 mg, 0.829 mmol), DPPP (18.7 mg, 0.0452 mmol) i Pd2(dba)3-CHCl3(19.5 mg, 0.02 mmol), bočica se prečisti sa N2pet puta i doda se DCE (3 mL, prska sa N2u toku 30 minuta). Bočica se prečisti sa N2još tri puta. Rastvor se meša 55 min na 18 °C u atmosferi N2. Reaktivna smeša se prečisti prep-TLC (EtOAc/petrol etar=1.5:1) da se dobije produkt ZZZ-14 (330 mg, 85%) kao bezbojna guma. LCMS [M+1] 515;<1>H NMR (400 MHz, CDCl3) δ ppm 8.78 (s, 1H), 7.29 (br d, J=3.4 Hz, 1H), 7.04 - 6.72 (m, 2H), 6.59 (br d, J=3.0 Hz, 1H), 6.39 (br d, J=5.3 Hz, 1H), 6.19 (br d, J=4.6 Hz, 1H), 6.08 (br dd, J=2.2, 4.3 Hz, 1H), 5.40 -5.32 (m, 1H), 4.50 (br s, 2H), 3.73 - 3.57 (m, 2H), 3.26 - 3.16 (m, 1H), 2.80 (br t, J=5.4 Hz, 2H), 2.74 (s, 3H), 1.52 (s, 9H)
Faza 14 - Sinteza terc-butil 6-(difluorometil)-8-(((1S,2S,3S,4R)-2,3-dihidroksi-4-(4-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)ciklopentil)oksi)-5-fluor-3,4-dihidroizohinolin-2(1H)-karboksilata (ZZZ-15)
[0548] U smešu ZZZ-14 (330 mg, 0.641 mmol) u DCM (10 mL)/H2O (0.4 mL) se na 15 °C dodaju NMO (225 mg, 1.92 mmol) i OsO4(4% u t-BuOH, 285 mg, 0.045 mmol). Crni rastvor se meša 3 sata na 18 °C. Smeša se neutrališe sa sat. aq. Na2SO3(5 mL), razblaži sa DCM (10 mL) i razdvoji. Vodeni sloj se ekstrahuje sa DCM (5 mL). Kombinovani organski slojevi se isperu sa slanim rastvorom (10 mL), suše preko Na2SO4, filtriraju i koncentruju da se dobije sirovi produkt (450 mg) kao braon čvrsta supstanca, koja se prečisti prep-TLC (prvo sa smešom EtOAc/MeOH=20:1, zatim sa EtOAc) da se dobije ZZZ-15 (210 mg, 60%) kao svetlo žuta čvrsta supstanca. LCMS [M+1] 549;<1>H NMR (400 MHz, CDCl3) δ ppm 8.69 (s, 1H), 7.22 (d, J=3.8 Hz, 1H), 7.10 (br d, J=5.3 Hz, 1H), 7.04 - 6.73 (m, 1H), 6.61 (d, J=3.8 Hz, 1H), 5.03- 4.88 (m, 1H), 4.80 (br s, 1H), 4.60 - 4.39 (m, 3H), 4.36 - 4.24 (m, 1H), 3.65 (br d, J=5.8 Hz, 2H), 3.46 - 3.29 (m, 1H), 3.20 - 3.02 (m, 1H), 2.80 (br t, J=5.4 Hz, 2H), 2.74 (s, 3H), 2.62 (s, 1H), 2.39 (s, 1H), 1.56 - 1.34 (m, 9H)
Faza 15 - Sinteza (1S,2S,3S,5R)-3-((6-(difluorometil)-5-fluor-1,2,3,4-
2
tetrahidroizohinolin-8-il)oksi)-5-(4- metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)ciklopentan-1,2-diola (ZZZ-16)
[0549] U rastvor ZZZ-15 (210 mg, 0.383 mmol) u DCM (2 mL) se na 0°C doda smeša HCl (g) /dioksan (4 N, 0.766 mL, 3.06 mmol). Smeša se meša 2 sata na 23°C. Čvrsti produkt precipitira. Rastvarač se dekantuje i čvrsta supstanca suši i liofilizira da se dobije ZZZ-16 kao 2HCl so 2 H2O (165 mg, 83%) kao svetlo žuta čvrsta supstanca.
LCMS [M+1] 449;<1>H NMR (400 MHz, D2O) δ ppm 8.93 (s, 1H), 7.91 (d, J=3.8 Hz, 1H), 7.24 - 6.88 (m, 3H), 5.41 (q, J=9.0 Hz, 1H), 4.87 (br dd, J=2.4, 4.4 Hz, 1H), 4.75 (dd, J=5.0, 8.8 Hz, 1H), 4.45 (s, 2H), 4.39 (br d, J=5.0 Hz, 1H), 3.58 (t, J=6.3 Hz, 2H), 3.19 - 3.07 (m, 3H), 2.99 (s, 3H), 2.35 - 2.24 (m, 1H).
Primer 191 (Šema AAAA) - Sinteza (1S,2S,3S,5R)-3-((4-fluor-3-metoksi-5,6,7,8-tetrahidro-2,7-naftiridin-1-il)oksi)-5-(4-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)ciklopentan-1,2-diola (AAAA-6)
[0550]
Šema AAAA
Faza 1: Sinteza 2,6-dihlor-5-fluor-N-(pivaloiloksi)nikotinamida (AAAA-1)
[0551] Jedinjenje AAAA-1 se izrađuje sličnim postupkom kao za fazu 4 u Šemi FF koristeći 2,6-dihlor-5-fluoronikotinsku kiselinu da se dobije 5.85 g (80% prinos) kao bela čvrsta
2 4
supstanca.<1>H NMR (400 MHz, HLOROFORM-d) δ ppm 9.91 (br. s., 1 H) 8.02 (d, J=5.14 Hz, 1 H) 1.37 (s, 9 H)
Faza 2: Sinteza 6,8-dihlor-5-fluor-3,4-dihidro-2,7-naftiridin-1(2H)-ona (AAAA-2)
[0552] Jedinjenje AAAA-2 se izrađuje od AAAA-1 sličnim postupkom kao za fazu 4 u Šemi GG koristeći cezijum pivalat da se dobije 1.47 g (33% prinos) kao žuta čvrsta supstanca. LCMS [M+1-2Cl] 167.0.<1>H NMR (400 MHz, HLOROFORM-d) δ ppm 6.13 (br. s., 1 H) 3.59 (td, J=6.45, 3.48 Hz, 2 H) 3.09 (t, J=6.42 Hz, 2 H)
Faza 3: Sinteza 8-hlor-5-fluor-6-metoksi-3,4-dihidro-2,7-naftiridin-1(2H)-ona (AAAA-3)
[0553] U rastvor AAAA-2 (200 mg, 0.85 mmol) u 20 mL MeOH se doda natrijum metoksid (161 mg, 2.98 mmol, 5.96 mL, 0.5 M) i rastvor se zagreva 1 h na 60°C. Reakcija se koncentruje, ponovo rastvori u DCM, ispere dva puta sa H2O, DCM se upari na rotoevaporatoru, sirovi produkt se prečisti hromatografijom na koloni sa 100% EtOAc da se dobije 100 mg AAAA-3 (51% prinos) kao beličasta čvrsta supstanca. LCMS [M+1] 231.0.<1>H NMR (400 MHz, HLOROFORM-d) δ ppm 5.96 (br. s., 1 H) 4.09 (s, 3 H) 3.52 (td, J=6.39, 3.48 Hz, 2 H) 3.03 (t, J=6.24 Hz, 2 H)
Faza 4: Sinteza terc-butil 8-hlor-5-fluor-6-metoksi-3,4-dihidro-2,7-naftiridin-2(1H)-karboksilata (AAAA-4)
[0554] Jedinjenje AAAA-4 se izrađuje od AAAA-3 sličnim postupkom kao za fazu 5 u Šemi GG da se dobije 105 mg (76% prinos) bezbojnog ulja. LCMS [M+1-Boc] 217.0.<1>H NMR (400 MHz, HLOROFORM-d) δ ppm 4.48 (s, 2 H) 4.00 (s, 3 H) 3.63 (t, J=5.93 Hz, 2 H) 2.82 (t, J=5.69 Hz, 2 H) 1.50 (s, 9 H)
Faza 5: Sinteza terc-butil 8-(((3aR,4S,6R,6aS)-2,2-dimetil-6-(4-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)tetrahidro-4H-ciklopenta[d][1,3]dioksol-4-il)oksi)-5-fluor-6-metoksi-3,4-dihidro-2,7-naftiridin-2(1H)-karboksilata (AAAA-5)
[0555] Smeša (3aR,4S,6R,6aS)-2,2-dimetil-6-(4-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-
2
il)tetrahidro-4H-ciklopenta[d][1,3]dioksol-4-ola (SSS-3) (98.0 mg, 0.34 mmol), AAAA-4 (107 mg, 0.339 mmol), cezijum karbonata (221 mg, 0.677 mmol), tris(dibenzilidenaceton)dipaladijuma (31.0 mg, 0.0339 mmol) i BINAP (42.2 mg, 0.0677 mmol) u toluenu (6.77 mL, c=0.05 M) se degasira i prečisti tri puta sa N2. Reaktivna smeša se zagreva na 100°C u toku noći, LCMS ukazuje da reakcija nije završena. Dodaju se cezijum karbonat (221 mg, 0.677 mmol), tris(dibenziliden-aceton)dipaladijum (31.0 mg, 0.0339 mmol) i BINAP (42.2 mg, 0.0677 mmol), degasiraju i zagrevanje se nastavi 2 dana na 100°C. Reaktivna smeša se ohladi na rt, doda se H2O, ekstrahuje sa EtOAc, sirovi produkt se koncentruje i prečisti hromatografijom na koloni sa 85% EtOAc/heptan da se dobije 60 mg (31 % prinos) žutog ulja. LCMS [M+1] 570.1.<1>H NMR (400 MHz, HLOROFORM-d) δ ppm 8.79 (s, 1 H) 7.37 (d, J=3.67 Hz, 1 H) 6.61 (br. s., 1 H) 5.47 (br. s., 1 H) 5.35 (ddd, J=7.95, 5.26, 2.69 Hz, 1 H) 4.98 - 5.05 (m, 1 H) 4.89 (d, J=6.24 Hz, 1 H) 4.36 (br. s., 2 H) 3.99 (s, 3 H) 3.56 - 3.64 (m, 2 H) 3.01 (dt, J=14.55, 7.27 Hz, 1 H) 2.78 (t, J=5.26 Hz, 2 H) 2.73 (s, 3 H) 2.41 - 2.52 (m, 1 H) 1.60 (s, 3 H) 1.50 (s, 9 H) 1.33 (s, 3 H)
Faza 6: Sinteza (1S,2S,3S,5R)-3-((4-fluor-3-metoksi-5,6,7,8-tetrahidro-2,7-naftiridin-1-il)oksi)-5-(4-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)ciklopentan-1,2-diola (AAAA-6)
[0556] Jedinjenje AAAA-6 se izrađuje od AAAA-5 sličnim postupkom kao za fazu 10 u Šemi A da se dobije 19.7 mg (33% prinos). LCMS [M+1] 430.0.<1>H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ ppm 9.68 (br. s., 1 H) 9.56 (br. s., 1 H) 9.07 (s, 1 H) 7.99 (br. s., 1 H) 7.10 (br. s., 1 H) 5.11 -5.26 (m, 2 H) 4.64 (dd, J=9.05, 4.65 Hz, 1 H) 4.15 (br. s., 2 H) 4.10 (d, J=4.03 Hz, 1 H) 3.94 (s, 3 H) 3.38 (br. s., 2 H) 2.91 - 3.03 (m, 3 H) 2.87 (s, 3 H) 1.95 - 2.05 (m, 1 H)
[0557] Primeri 192 & 193 se izrađuju na sličan način kao Primer 191 izuzev što se koristi natrijum etoksid u etanolu u fazi 3 Šeme AAAA za Primer 192 a natrijum izopropoksid u izopropanolu se koristi u fazi 3 Šeme AAAA za Primer 193.
2
Šema BBBB - Sinteza 2-hlor-6-(difluorometil)nikotinske kiseline (BBBB-4)
[0558]
Faza 1: Sinteza (E)-4-butoksi-1,1-difluorobut-3-en-2-ona (BBBB-1)
[0559] Jedinjenje BBBB-1 se izrađuje u skladu sa WO20080269059.<1>H NMR (400 MHz, HLOROFORM-d) δ ppm 7.86 (d, J=12.47 Hz, 1 H) 5.90 (d, 1 H) 5.77 (t, J = 56 Hz, 1 H) 4.01 (t, J=6.48 Hz, 2 H) 1.68 - 1.80 (m, 2 H) 1.41 - 1.48 (m, 2 H) 0.97 (t, J=7.40 Hz, 3 H)
2
Faza 2: Sinteza metil 6-(difluorometil)-2-okso-1,2-dihidropiridin-3-karboksilata (BBBB-2)
[0560] Jedinjenje BBBB-2 se izrađuje u skladu sa WO20080269059.<1>H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ ppm 12.18 (br. s., 1 H) 8.20 (d, J=5.87 Hz, 1 H) 7.05 (br. s., 1 H) 6.86 (t, J = 52 Hz, 1 H) 3.81 (s, 3 H)
Faza 3: Sinteza metil 2-hlor-6-(difluorometil)nikotinata (BBBB-3)
[0561] Smeša BBBB-2 (3340 mg, 16.44 mmol) i fosfor oksihlorida (10 mL) se zagreva 24 h na 110°C, ohladi na rt, doda se ledena voda i neutrališe sa čvrstim KOH. Reaktivna smeša se ekstrahuje tri puta sa EtOAc, organski slojevi se kombinuju i koncentruju, prečiste hromatografijom na koloni sa 18% EtOAc/heptan da se dobije 3.27 g (90% prinos) BBBB-3 kao bela čvrsta supstanca.<1>H NMR (400 MHz, HLOROFORM-d) δ ppm 8.31 (d, J=7.83 Hz, 1 H) 7.67 (d, J=7.83 Hz, 1 H) 6.61 (t, J = 56 Hz, 1 H) 4.00 (s, 3 H); 19F NMR (376 MHz, HLOROFORM-d) δ ppm -116.82 (s, 1 F)
Faza 4: Sinteza 2-hlor-6-(difluorometil)nikotinske kiseline (BBBB-4)
[0562] U rastvor BBBB-3 (1160 mg, 5.235 mmol) u 20 mL MeOH se doda natrijum hidroksid (1050 mg, 26.2 mmol , 5.23 mL, 5 M) i zagreva 4 h na 65°C. Reaktivna smeša se neutrališe sa 1 N rastvorom HCl do pH 4, rastvarač se ukloni, čvrsta supstanca se suši preko vakuuma i koristi za sledeću fazu.
[0563] Primer 194 se izrađuju na sličan način kao Primer 191 (Šema AAAA) izuzev što je faza 3 izostavljena.
2
[0564] Primeri 195 & 196 se izrađuju na sličan način kao Primer 99 u Šemi NN koristeći odgovarajući NBoc-zaštićeni tetrahidroizohinolin u fazi 2.
2
(nastavlja se)
Šema CCCC - Sinteza terc-butil 8-hidroksi-6-(izoksazol-4-il)-3,4-dihidroizohinolin-2(1H)-karboksilata (TP-34)
[0565]
Šema CCCC
Faza 1 - Sinteza terc-butil 8-(benziloksi)-6-(izoksazol-4-il)-3,4-dihidroizohinolin-2(1H)-karboksilata (CCCC-1)
[0566] Rastvor NNN-1 (600 mg, 1.29 mmol), 4-bromoizoksazola (286 mg, 1.93 mmol), K2CO3(535 mg, 3.87 mmol) i PdCl2(dppf)-DCM (94 mg, 0.129 mmol) u toluenu (2.5 mL) i
2
vodi (1.5 mL) se meša 16 h u atmosferi N2na 75 °C. Reaktivna smeša se nakon toga ohladi na r.t. doda se voda i smeša se ekstrahuje sa EtOAc (3 x 5 mL). Kombinovani organski slojevi se isperu sa slanim rastvorom (5 mL), suše preko Na2SO4, filtriraju i koncentruju. Sirovi produkt se prečisti hromatografijom na koloni sa smešom EtOAc/petrol etar od 15-85% da se dobije bezbojno ulje CCCC-1 (160 mg, 31%). LCMS [M-tBu+1] 350.9
Faza 2 - Sinteza 6-(izoksazol-4-il)-1,2,3,4-tetrahidroizohinolin-8-ola (CCCC-2)
[0567] Jedinjenje CCCC-1 (140 mg, 0.344 mmol) se rastvori u DCM (10 mL). Reaktivni rastvor se ohladi na 0 °C u ledenom kupatilu. Doda se BBr3(518 mg, 2.07 mol). Reakcija iz suspenzije prelazi u bistar žuti rastvor. Reaktivna smeša se meša 16 sati na 25 °C. Reakcija se ohladi na 0 °C i u reakciju se u kapima doda MeOH (2 mL) a nakon toga voda (20 mL).
Reaktivni rastvor se ispere sa DCM (10 mL x 2). Vodeni sloj se odvoji i pH se podesi na pH 9, koristeći čvrsti NaHCO3. Finalni rastvor CCCC-2 se direktno koristi za sledeću fazu bez daljeg prečišćavanja (23 mL, aq sol. sirovo, >99%).
Sinteza terc-butil 8-hidroksi-6-(izoksazol-4-il)-3,4-dihidroizohinolin-2(1H)-karboksilata (TP-34)
[0568] MeOH (5 mL) i dioksan (5 mL) se dodaju u rastvor CCCC-2 (23 mL aq), nakon toga se u reaktivni rastvor doda Boc2O (83 mg, 0.38 mmol) i rastvor se meša 16 sati na 25 °C. pH reaktivnog rastvora se podesi na pH~3 dodavanjem 1N HCl aq. Rastvor se razdvoji, nakon čega se vodeni sloj ekstrahuje sa DCM (10 mL). Organski slojevi se kombinuju i isperu sa zasićenim rastvorom NaCl (20.0 mL). Organski sloj se odvoji, suši i upari da se dobije sirovi produkt koji se prečisti flash hromatografijom, uz eluiranje sa smešom petrol etar/EtOAc od 0-50%, da se dobije željeni produkt kao bela čvrsta supstanca TP-34 (84 mg, 77% prinos iz 2 faze). MS [M-Boc+1] 217.1;<1>H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ ppm 9.83 (s, 1H), 9.32 (s, 1H), 9.02 (s, 1H), 6.97 (s, 1H), 6.89 (s, 1H), 4.36 (s, 2H), 3.55 (m, 2H), 2.75 (m, 2H), 1.44 (s, 9H)
[0569] Primer 197 se izrađuje koristeći hemiju opisanu u Šemi CC i koristeći jedinjenje TP-34.
2 1
Šema DDDD - Sinteza terc-butil 5-fluor-8-hidroksi-6-metoksi-3,4-dihidroizohinolin-2(1H)-karboksilata (TP-35)
[0570]
Šema DDDD
Faza 1 - Sinteza terc-butil 8-(benziloksi)-5-fluor-6-metoksi-3,4-dihidroizohinolin-2(1H)-karboksilata (DDDD-1)
[0571] Bočica A se napuni sa t-BuBrettPhos (49 mg, 0.10 mmol), NaOtBu (67.8 mg, 0.706 mmol) i ZZZ-10 (220 mg, 0.504 mmol) u dioksanu (3 mL). Bočica se degasira tri puta sa N2.
2 2
Nakon toga se u bočicu A doda MeOH (81 mg, 2.52 mmol). Bočica B se napuni sa RockPhosPd3G (85 mg, 0.10 mmol) i degasira tri puta sa N2a nakon toga se doda dioksan (2 mL) i meša 1 min. Prekatalizator iz bočice B se prenese u bočicu A i reaktivni rastvor se meša 16 sati na 25 °C. Doda se EtOAc (10 mL) da razblaži rastvor i rastvor ispere sa vodom (5 mL x 2). Organski slojevi se razdvoje, suše i upare da se dobije sirovi produkt koji se prečisti flash hromatografijom, uz eluiranje sa smešom EtOAc/petrol etar od 0-15% da se dobije željeni produkt kao bezbojno ulje DDDD-1 (110 mg, 56%). LCMS [M-Boc+1] 287.9;<1>H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ ppm 7.54 - 7.27 (m, 5H), 6.83 (d, J=7.5 Hz, 1H), 5.15 (s, 2H), 4.43 - 4.26 (m, 2H), 3.82 (s, 3H), 3.53 (t, J=5.8 Hz, 2H), 2.71 - 2.66 (m, 2H), 1.42 (s, 9H)
Faza 2 - Sinteza terc-butil 5-fluor-8-hidroksi-6-metoksi-3,4-dihidroizohinolin-2(1H)-karboksilata (TP-35)
[0572] Jedinjenje DDDD-1 (110 mg, 0.28 mmol) se rastvori u MeOH (3 mL) i EtOAc (1 mL) a nakon toga se doda Pd/C (15 mg, 0.142 mmol). Rastvor se degasira četiri puta sa H2i meša 16 sati na 25 °C u balonu H2. Reakcija se razblaži sa DCM (5 mL), filtrira i koncentruje da se dobije TP-35 kao bela čvrsta supstanca (70 mg, 83%). LCMS [M-tBu+1] 242.1;<1>H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ ppm 9.58 (s, 1H), 6.46 (d, J=7.3 Hz, 1H), 4.28 (s, 2H), 3.74 (s, 3H), 3.55 - 3.50 (m, 2H), 2.65 (m, 2H), 1.43 (s, 9H)
Jedinjenje TP-36 se izrađuje koristeći sličnu hemiju kao u Šemu DDDD koristeći EtOH u Fazi 1
[0573]
[0574] Primeri 198 & 199 se izrađuju koristeći sličnu hemiju opisanu u Šemi CC i koristeći jedinjenja TP-35 & TP-36, tim redom.
2
Šema EEEE - Sinteza terc-butil 6-(difluorometoksi)-5-fluor-8-hidroksi-3,4-dihidroizohinolin-2(1H)-karboksilata (TP-37)
2 4
Šema EEEE
Faza 1 - Sinteza terc-butil 8-(benziloksi)-5-fluor-6-(4,4,5,5-tetrametil-1,3,2-dioksaborolan-2-il)-3,4-dihidroizohinolin-2(1H)-karboksilata (EEEE-1)
[0576] U rastvor ZZZ-10 (500 mg, 1.15 mmol) u dioksanu (29 mL) se doda bis(pinakolato)dibor (1.46 g, 5.73 mmol). Rastvor se 10 min degasira sa N2i u atmosferi N2se u reaktivni rastvor dodaju cataCXium® A-Pd-G2 (76.6 mg, 0.12 mmol) i KOAc (337 mg, 1.79 mmol). Reakcija se zagreva 16 sati na 80 °C. Doda se voda (10 mL) i reakcija se ekstrahuje sa EtOAc (10 mL x 2). Organski slojevi se razdvoje, suše i upare da se dobije sirovi produkt koji se prečisti flash hromatografijom, uz eluiranje sa smešom petrol etar/EtOAc 0-20% da se dobije EEEE-1 (78%, 443 mg) kao siva čvrsta supstanca. LCMS [M-Boc+1] 384.0;<1>H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ ppm 7.52 - 7.32 (m, 5H), 7.05 (d, J=4.3 Hz, 1H), 5.13 (s, 2H), 4.47 (br s, 2H), 3.57 (br t, J=5.8 Hz, 2H), 2.72 - 2.66 (m, 2H), 1.43 (s, 9H), 1.30 (s, 12H)
Faza 2 - Sinteza terc-butil 8-(benziloksi)-5-fluor-6-hidroksi-3,4-dihidroizohinolin-2(1H)-karboksilata (EEEE-2)
[0577] U rastvor EEEE-1 (430 mg, 0.89 mmol) u THF (4 mL) i vodi (4 mL) se u jednoj porciji na RT u atmosferi N2doda natrijum perborat (306 mg, 3.74 mmol). Reaktivni rastvor se meša 8 sati na sobnoj temperaturi. Smeša se razblaži sa EtOAc (10 mL) i vodom (5 mL). Organski sloj se odvoji, suši i upari da se dobije sirovi produkt koji se prečisti flash hromatografijom, uz eluiranje sa smešom petrol etar/EtOAc 0-20% da se dobije EEEE-2 (150 mg, 45%) kao bela čvrsta supstanca. LCMS [M+Na] 396.
Faza 3 - Sinteza terc-butil 8-(benziloksi)-6-(difluorometoksi)-5-fluor-3,4-dihidroizohinolin-2(1H)-karboksilata (EEEE-3)
[0578] KOH (165 mg, 2.95 mol) se suspenduje u smeši acetonitrila (1 mL) i vode (1 mL) i
2
ohladi na -20 °C. Doda se jedinjenje EEEE-2 (110 mg, 0.295 mmol) u porcijama, a nakon toga se u toku 15 minuta dodaje dietil (brom-difluorometil)fosfonat (157 mg, 0.59 mmol). Smeša se zagreva 2 dana na 25 °C. U reaktivni rastvor se doda voda i ekstrahuje sa EtOAc (10 mL x 3). Organski slojevi se razdvoje, suše i koncentruju da se dobije sirovi produkt koji se prečisti flash hromatografijom, uz eluiranje sa smešom petrol etar/EtOAc 0-10%, da se dobije EEEE-3 (100 mg, 80%) kao bela čvrsta supstanca. LCMS [M-Boc+1] 324.
Faza 4 - Sinteza terc-butil 6-(difluorometoksi)-5-fluor-8-hidroksi-3,4-dihidroizohinolin-2(1H)-karboksilata (TP-37)
[0579] U rastvor EEEE-3 (100 mg, 0.23 mmol) u MeOH (5 mL) se doda Pd/C (25 mg, 0.024 mmol). Smeša se degasira i prečisti tri puta sa H2. Dobijena smeša se meša 16 sati na r.t. (28 °C). Reakcija se razblaži sa DCM (20 mL), filtrira i koncentruje da se dobije TP-37 kao bela čvrsta supstanca (75 mg, 95%). LCMS [M-tBu+1] 278.0;<1>H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ ppm 9.99 (bs, 1H), 7.31 (t, J=74 Hz, 1H), 6.62 (d, J=8 Hz, 1H), 4.33 (s, 2H), 3.55 (t, J=8 Hz, 2H), 2.69 (t, J = 8 Hz, 2H), 1.43 (s, 9H)
[0580] Primer 200 se izrađuje koristeći sličnu hemiju opisanu u Šemi CC i koristeći jedinjenje TP-37.
2
Šema FFFF - Sinteza terc-butil 5-fluor-8-hidroksi-6-izopropoksi-3,4-dihidroizohinolin-2(1H)-karboksilata (TP-38)
[0581]
Šema FFFF
Faza 1 - Sinteza terc-butil 8-(benziloksi)-5-fluor-6-izopropoksi-3,4-dihidroizohinolin-2(1H)-karboksilata (FFFF-1)
[0582] Rastvor EEEE-2 (170 mg, 0.455 mmol) u THF (3 mL) se ohladi u ledenom kupatilu i u atmosferi N2se doda PPh3(478 mg, 1.82 mmol). U kapima se doda DIAD (368 mg, 1.82 mmol) i reakcija se meša 30 min na 25 °C da postane bela suspenzija. Nakon toga se u reaktivni rastvor doda iPrOH (82.1 mg, 1.37 mmol) u jednoj porciji i meša 16 sati na 15 °C. Smeša se razblaži sa EtOAc (50 mL) i H2O (100 mL). Smeša se razdvoji i vodeni sloj se ekstrahuje sa EtOAc (50 mL). Kombinovani organski slojevi se isperu sa slanim rastvorom (50 mL), suše preko Na2SO4, filtriraju i koncentruju. Sirovi produkt se prečisti flash hromatografijom, uz eluiranje sa smešom petrol etar/EtOAc 0-20% da se dobije FFFF-1 (160 mg, 85%) kao bezbojno ulje. LCMS [M- tBu+1] 270.1;<1>H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ ppm 7.50 - 7.29 (m, 5H), 6.78 (d, J=7.0 Hz, 1H), 5.15 (s, 2H), 4.65 - 4.53 (m, 1H), 4.38 (br d, J=2.8 Hz, 2H), 3.54 (t, J=5.9 Hz, 2H), 2.74 - 2.62 (m, 2H), 1.43 (s, 9H), 1.23 (d, J=6.0 Hz, 6H)
Faza 2 - Sinteza terc-butil 5-fluor-8-hidroksi-6-izopropoksi-3,4-dihidroizohinolin-2(1H)-karboksilata (TP- 38)
[0583] U rastvor FFFF-1 (160 mg, 0.385 mmol) u MeOH (5 mL) se doda Pd/C (41 mg, 0.039 mmol). Smeša se degasira i prečisti tri puta sa H2koristeći ballon H2a nakon toga meša
2
16 sati na sobnoj temperaturi (28 °C) u balonu H2. Reakcija se razblaži sa DCM (20.0 mL), filtrira i koncentruje da se dobije TP-38 kao žuta čvrsta supstanca (118 mg, 94%).<1>H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ ppm 9.50 (br d, J=2.5 Hz, 1H), 6.45 (d, J=7.3 Hz, 1H), 4.41 (td, J=6.0, 12.0 Hz, 1H), 4.28 (s, 2H), 3.52 (t, J=5.6 Hz, 2H), 2.64 (br t, J=5.8 Hz, 2H), 1.42 (s, 9H), 1.26 (d, J=6.0 Hz, 6H)
[0584] Primer 201 se izrađuje koristeći sličnu hemiju opisanu u Šemi CC i koristeći jedinjenje TP-38.
Šema GGGG - Sinteza terc-butil 8-cijano-6-hidroksi-2,3-dihidrobenzo[f][1,4]oksazepin-4(5H)-karboksilata (TP-39)
2
Šema GGGG
Faza 1 - Sinteza 8-brom-6-fluor-3,4-dihidrobenzo[f][1,4]oksazepin-5(2H)-ona (GGGG-2)
[0586] U suspenziju GGGG-1 (13.8 g, 43.87 mmol, izrađenu koristeći referentni patent US2015/64196) u bezvodnom THF (400 mL) se na 0 °C dodaju DIPEA (28.3 g, 219 mmol) i T3P (50% u EtOAc, 41.9 g, 65.8 mmol). Smeša se meša 10 h na 0 °C, nakona toga 6 h na rt (25 °C). Smeša se sipa u vodu (400 mL) i ekstrahuje sa EtOAc (400 mL x 2). Ekstrakt se ispere sa slanim rastvorom (300 mL), suši preko Na2SO4i koncentruje da se dobije GGGG-2 (9500 mg, 83%) kao svetlo žuta čvrsta supstanca. LCMS [M+1] 261.6;<1>H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ ppm 8.57 (br s, 1H), 7.44 (dd, J=1.8, 9.5 Hz, 1H), 7.22 (s, 1H), 4.22 (t, J=5.5 Hz, 2H), 3.27 (q, J=5.6 Hz, 2H)
Faza 2 - Sinteza 6-(benziloksi)-8-brom-3,4-dihidrobenzo[f][1,4]oksazepin-5(2H)-ona (GGGG-3)
[0587] U suspenziju 60% NaH (6 g, 150 mmol) u bezvodnom DMF (140 mL) se na rt (25 °C) u atmosferi N2doda rastvor GGGG-2 (6.5 g, 25 mmol) i BnOH (5.41 g, 50 mmol) u bezvodnom DMF (70 mL), nakon toga se meša 16 h na rt (25 °C) u atmosferi N2. Smeša se sipa u vodu sa ledom (400 mL) za koje vreme se formira čvrsta supstanca. Smeša se filtrira. Čvrsta supstanca se ispere sa vodom i suši pod vakuumom da se dobije GGGG-3 (9500 mg, >99%) kao bela čvrsta supstanca. LCMS [M+1] 347.7;<1>H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ ppm 8.27 (br t, J=5.7 Hz, 1H), 7.47 (d, J=6.6 Hz, 2H), 7.42 - 7.36 (m, 2H), 7.35 - 7.29 (m, 1H), 7.26 - 7.15 (m, 1H), 6.93 (d, J=1.4 Hz, 1H), 5.19 (s, 2H), 4.12 (t, J=5.5 Hz, 2H), 3.18 (q, J=5.6 Hz, 2H).
2
Faza 3 - Sinteza terc-butil 6-(benziloksi)-8-brom-5-okso-2,3-dihidrobenzo[f][1,4]oksazepin-4(5H)-karboksilata (GGGG-4)
[0588] U rastvor GGGG-3 (7.3 g, 21 mmol) u DMF (150 mL) se na rt (25 °C) dodaju Boc2O (6.86 g, 31.43 mmol), DIPEA (8.13 g, 62.9 mmol) i DMAP (256 mg, 2.1 mmol) u toku 2h. Smeša se sipa u vodu. Čvrsta supstanca se sakupi filtriranjem i ispere sa vodom. Čvrsta supstanca se rastvori u smeši EtOAc/THF (50 mL/ 50 mL), suši preko Na2SO4i koncentruje pod vakuumom da se dobije sirovi produkt GGGG-4 (10 g, >99%) kao žuta guma koja se koristi direktno u sledećoj fazi bez daljeg prečišćavanja.
Faza 4 - Sinteza terc-butil 6-(benziloksi)-8-brom-2,3-dihidrobenzo[f][1,4]oksazepin-4(5H)-karboksilata (GGGG-5)
[0589] U rastvor GGGG-4 (10 g, 21 mmol) u THF (150 mL) se na rt (25 °C) doda BH3.Me2S (8.39 mL, 83.9 mmol). Smeša se meša 16 h na 60 °C u atmosferi N2a nakon toga ostavi 2 dana na rt. Reakcija se polako neutrališe sa MeOH (70 mL). Nakon toga se smeša refluksuje 16 h i koncentruje. Sirovi produkt se prečisti hromatografijom na koloni (120 g kolona silika gela, EtOAc u petrol etru od 0% do 50%) da se dobije GGGG-5 (3130 mg, 34%) kao bela čvrsta supstanca. LCMS [M+23] 456;<1>H NMR (400 MHz, CDCl3) δ ppm 7.52 - 7.31 (m, 5H), 6.84 (bs, 1H), 6.82 (bs, 1H), 5.06 (br s, 2H), 4.64 (br s, 2H), 4.15 - 4.10 (m, 2H), 3.80 (br s, 2H), 1.29 (br s, 9H)
Faza 5 - Sinteza terc-butil 6-(benziloksi)-8-cijano-2,3-dihidrobenzo[f][1,4]oksazepin-4(5H)-karboksilata (GGGG-6)
[0590] Jedinjenje GGGG-5 (680 mg, 1.57 mmol), Zn(CN)2(368 mg, 3.13 mmol) i Pd(PPh3)4(181 mg, 0.157 mmol) u DMF (10 ml) se prska sa N2u toku 10 min. Smeša se meša 3 h na 120 °C. Smeša se ohladi, filtrira i koncentruje. Ostatak se prečisti hromatografijom na silika gelu uz eluiranje sa EtOAc u petrol etru od 0 do 50 % da se dobije GGGG-6 (520 mg, 87%) kao bela čvrsta supstanca. LCMS [M-Boc+1] 280.9.
Faza 6 - Sinteza terc-butil 6-(benziloksi)-8-karbamoil-2,3-dihidrobenzo[f][1,4]oksazepin-4(5H)-karboksilata (GGGG-7)
[0591] U rastvor GGGG-6 (520 mg, 1.37 mmol) i K2CO3(189 mg, 1.37 mmol) u DMSO (5 mL) se na rt (25 °C) polako doda 30% H2O2(465 mg, 4.1 mmol). Napomena: razvija se gas i reakcija je egzotermna. Smeša se meša 1 h na rt (25 °C). Smeša se sipa u vodu (10 mL) i filtrira. Čvrsta supstanca se ispere sa vodom. Čvrsta supstanca se suspenduje u MeOH (30 mL) i koncentruje pod vakuumom da se dobije GGGG-7 (520 mg, 96%) kao bela čvrsta supstanca. LCMS [M+Na] 421.
Faza 7 - Sinteza terc-butil 8-karbamoil-6-hidroksi-2,3-dihidrobenzo[f][1,4]oksazepin-4(5H)-karboksilata (GGGG-8)
[0592] Smeša GGGG-7 (520 mg, 1.31 mmol) i Pd/C (125 mg) u smeši MeOH/THF (15 mL/15 mL) se degasira četiri puta sa H2. Smeša se meša 16 h na 25 °C u balonu H2. Smeša se filtrira i koncentruje pod vakuumom da se dobije GGGG-8 (400 mg, 99%) kao bela čvrsta supstanca.<1>H NMR (400 MHz, DMSO-d6, rotameri) δ ppm 9.85 (br s, 1H), 7.80 (br s, 1H), 7.22 (br s, 1H), 7.11 - 6.97 (m, 1H), 6.92 (br s, 1H), 4.57 (br s, 2H), 4.20 - 4.03 (m, 2H), 3.68 (br s, 2H), 1.42 - 1.13 (m, 9H)
Faza 8 - Sinteza terc-butil 8-cijano-6-hidroksi-2,3-dihidrobenzo[f][1,4]oksazepin-4(5H)-karboksilata (TP-39)
[0593] U suspenziju GGGG-8 (100 mg, 0.324 mol) i piridina (128 mg, 1.62 mol) u anhidrovanom DCM (2 mL) se na 0 °C doda Tf2O (275 mg, 0.973 mol) i meša 0.5 h.
Reaktivna smeša se zagreje na 25 °C i meša 16 h. Smeša se koncentruje pod vakuumom do sušenja. Ostatak se rastvori u MeOH (3 mL), a nakon toga se doda K2CO3(300 mg). Smeša se meša 16 h na rt (25 °C). Reakcija se filtrira i prečisti prep-TLC (petrol etar/EtOAc 1:1) da se dobije TP-39 (55 mg, 58%) kao bela čvrsta supstanca. LCMS [M-Boc+1] 190.8;<1>H NMR (400 MHz, DMSO-d6, rotameri) δ ppm 10.47 (br s, 1H), 6.83 (br s, 2H), 4.70 - 4.51 (m, 2H), 4.22-4.18 (m, 2H), 3.69 (br s, 2H), 1.46 - 1.21 (m, 9H)
Šema HHHH - Sinteza terc-butil 8-fluor-6-hidroksi-2,3-dihidrobenzo[f][1,4]oksazepin-4(5H)-karboksilata (TP -40)
1
Šema HHHH
[0595] U rastvor HHHH-1 (izrađeno koristeći sličan postupak kao u fazama 1-4 u Šemi GGGG koristeći 2-(2-aminoetoksi)-4,6-difluorobenzoevu kiselinu, 1980 mg, 5.302 mmol) u MeOH (74 mL) se na 25 °C doda 10% ovlaženi Pd/C (590 mg). Smeša se meša 1.2 sata na 25 °C u balonu H2. Reakcija se filtrira i koncentruje da se dobije TP-40 (1420 mg, 95%) kao bela čvrsta supstanca. LCMS [M-Boc+1] 184.8<1>H NMR (400 MHz, DMSO-d6, rotameri) δ ppm 10.60 - 9.69 (bs, 1H), 6.34-6.30 (m, 1H), 6.26 - 6.12 (m, 1H), 4.63 - 4.39 (m, 2H), 4.23 - 4.01 (m, 2H), 3.75 - 3.58 (m, 2H), 1.46 - 1.20 (m, 9H);<1>H NMR (400 MHz, DMSO-d6, promenljiva temperatura 80 °C) δ ppm 6.33 (br d, J=10.3 Hz, 1H), 6.19 (dd, J=2.3, 10.3 Hz, 1H), 4.53 (s, 2H), 4.19 - 4.06 (m, 2H), 3.69 (br t, J=4.4 Hz, 2H), 1.36 (s, 9H)
Šema IIII - Sinteza terc-butil 8-hlor-6-hidroksi-2,3-dihidrobenzo[f][1,4]oksazepin-4(5H)-karboksilata (TP-41)
[0596]
Šema IIII
Faza 1 - Sinteza 8-hlor-2,3,4,5-tetrahidrobenzo[f][1,4]oksazepin-6-ola (IIII-2)
[0597] U rastvor IIII-1 (izrađeno koristeći sličan postupak kao u fazama 1-3 u Šemi GGGG koristeći 2-(2-aminoetoksi)-4-hlor-6-fluorobenzoevu kiselinu, 1000 mg, 3.292 mmol) u bezvodnom THF (11 mL) se na rt (25 °C) u atmosferi N2doda BH3.Me2S (2.63 mL, 26.3 mmol). Nakon dodavanja, smeša se zagreva 16 sati na 70°C. Smeša se ohladi na rt (25°C) i neutrališe sa MeOH (3 mL). Smeša se koncentruje do bele čvrste supstance. Sirovi produkt se rastvori u conc HCl (13.7 mL) i zagreva 16 sati na 110 °C. Smeša se koncentruje da se dobije
2
IIII-2 (860 mg, >99%) kao svetlo žuta čvrsta supstanca koja se direktno koristi u sledećoj fazi. LCMS [M+1] 199.7
Faza 2 - Sinteza terc-butil 8-hlor-6-hidroksi-2,3-dihidrobenzo[f][1,4]oksazepin-4(5H)-karboksilata (TP-41)
[0598] U rastvor IIII-2 (1171 mg, 3.3 mmol) u MeOH (21 mL) se dodaju TEA (3.58 mL, 25.6 mmol) i Boc2O (1.32 g, 6.02 mmol) i nakon toga meša 2 sata na r.t. Smeša se koncentruje pod vakuumom da se dobije sirovi produkt (1032 mg) kao bela čvrsta supstanca. Sirovi produkt se prečisti kombi-flash (EtOAc/petrol etar=0~50%) da se dobije TP-41 (520 mg, 30%) kao bela čvrsta supstanca. LCMS [M-tBu+1] 243.6;<1>H NMR (400 MHz, DMSO-d6, rotameri) δ ppm 10.13 (s, 1H), 6.61 - 6.57 (m, 1H), 6.45 (bs, 1H), 4.61 - 4.46 (m, 2H), 4.25 - 4.05 (m, 2H), 3.66 (br s, 2H), 1.42 - 1.27 (m, 9H)
[0599] Primeri 202-204 se izrađuju koristeći sličnu hemiju opisanu u Šemi CC i koristeći jedinjenja TP-39, TP-40 & TP-41, tim redom.
(nastavlja se)
Šema JJJJ - Sinteza terc-butil 8-(difluorometil)-6-hidroksi-2,3-dihidrobenzo[f][1,4]oksazepin-4(5H)-karboksilata (TP-42)
4
Šema JJJJ
Faza 1 - Sinteza terc-butil 6-(benziloksi)-8-formil-2,3-dihidrobenzo[f][1,4]oksazepin-4(5H)-karboksilata (JJJJ-1)
[0601] Ref. Manabe, K. et al. Org. Lett., 2013, 5370-5373. U reaktivnu bočicu se doda rastvor GGGG-5 (1.64 g, 3.62 mmol) u anhidrovanom DMF (18 mL), N-formilsaharinu (1200 mg, 5.66 mmol), G3 ksantfos (107 mg, 0.113 mmol) i DIPEA (634 mg, 4.91 mmol). Smeša se prska 4 min sa N2. U prethodno dobijeni rastvor se na 0°C doda Et3SiH (571 mg, 4.91 mmol). Nakon dodavanja, dobijena smeša se 5 min prska sa N2i nakon toga zagreva 16 sati na 75 °C. Reaktivna smeša se podeli između EtOAc i vode. Organski sloj se odvoji i vodeni sloj se ekstrahuje sa EtOAc (30 mL x 3). Kombinovani organski slojevi se isperu sa slanim rastvorom, suše preko Na2SO4i koncentruju da se dobije sirovi produkt koji se prečisti na flash koloni (20 g, gel, EtOAc: petrol etar 1%-14%) da se dobije JJJJ-1 (730 mg, 53%) kao bela čvrsta supstanca.<1>H NMR (400 MHz, CDCl3, rotameri) δ ppm 9.87 (br s, 1H), 7.59 -7.30 (m, 5H), 7.21 (bs, 1H), 7.14 (bs, 1H), 5.16 (br s, 2H), 4.75 (br s, 2H), 4.24 - 4.17, (m, 2H), 3.85 (br s, 2H), 1.54 - 1.13 (m, 9H)
Faza 2 - Sinteza terc-butil 6-(benziloksi)-8-(difluorometil)-2,3-dihidrobenzo[f][1,4]oksazepin-4(5H)-karboksilata (JJJJ-2)
[0602] U rastvor JJJJ-1 (930 mg, 2.43 mmol) u anhidrovanom DCM (49 mL) se na 0°C u atmosferi N2doda DAST (3.91 g, 24.3 mmol). Nakon dodavanja, reaktivna smeša se zagreje na sobnu temperaturu (32 °C) i meša 16 sati na ovoj temperaturi. Reaktivni rastvor se razblaži sa DCM (50 mL) i sat. aq NaHCO3i meša dok ne prestane izdvajanje CO2. Reaktivna smeša se podeli između DCM i H2O. Organski sloj se odvoji, ispere sa slanim rastvorom, suši preko Na2SO4i koncentruje da se dobije sirovi produkt koji se prečisti na flash koloni (EtOAc: petrol etar 1%-15%) da se dobije JJJJ-2 (530 mg, 54%) kao bela čvrsta supstanca.<1>H NMR (400 MHz, CDCl3, rotameri) δ ppm 7.58 - 7.29 (m, 5H), 6.82 (bs, 1H), 6.79 (bs, 1H), 6.54 (t, J = 54 Hz, 1H), 5.12 (br s, 2H), 4.72 (br s, 2H), 4.21 - 4.07 (m, 2H), 3.83 (br s, 2H), 1.54 -1.13 (m, 9H)
Faza 3 - Sinteza terc-butil 8-(difluorometil)-6-hidroksi-2,3-dihidrobenzo[f][1,4]oksazepin-4(5H)-karboksilata (TP-42)
[0603] U rastvor JJJJ-2 (530 mg, 1.31 mmol) u MeOH (13 mL) se doda Pd/C (139 mg, 0.0163 mmol). Smeša se degasira i tri puta prečisti sa H2, a nakon toga meša 16 sati na rt (35 °C). Reakcija se filtrira kroz celite i koncentruje. Ostatak se liofilizira da se ukloni zaostali rastvarač da se dobije TP-42 (360 mg, 87%) kao bela čvrsta supstanca. LCMS [M-tBu+1] 259.7;<1>H NMR (400 MHz, DMSO-d6, rotameri) δ ppm 10.21 - 9.89 (m, 1H), 7.02 - 6.47 (m, 3H), 4.65 - 4.49 (m, 2H), 4.22 - 4.04 (m, 2H), 3.74 - 3.62 (m, 2H), 1.46 - 1.11 (m, 9H)
[0604] Primer 205 se izrađuje koristeći sličnu hemiju opisanu u Šemi CC i koristeći jedinjenje TP-42.
Šema KKKK - Sinteza terc-butil 6-hidroksi-8-metil-2,3-dihidrobenzo[f][1,4]oksazepin-4(5H)-karboksilata (TP-43)
[0605]
Šema KKKK
Faza 1 - Sinteza terc-butil 6-(benziloksi)-8-metil-2,3-dihidrobenzo[f][1,4]oksazepin-4(5H)-karboksilata (KKKK-1)
[0606] Rastvor GGGG-5 (200 mg, 0.46 mmol) u dioksanu (9.21 mL) se 5 min degasira sa N2. U reaktivni rastvor se nakon toga dodaju bis(tri-terc-butilfosfin)Pd(0) (23.5 mg, 0.05 mmol) i (Me)2Zn (0.921 mL, 0.92 mmol) i zagreva 16 sati na 90 °C. Reaktivni rastvor se sipa u EtOAc i 1N rastvor HCl (20 mL:20 mL). Smeša se razdvoji i vodeni sloj se ispere sa EtOAc (20 mL x 2). Organski slojevi se odvoje, suše i upare da se dobije sirovi produkt koji se prečisti flash hromatografijom, uz eluiranje sa smešom petrol etar/EtOAc od 0-25%, da se dobije KKKK-1 (160 mg, 94%) kao žuta čvrsta supstanca. LCMS [M+Na] 392.1;<1>H NMR (400 MHz, DMSO-d6, rotameri) δ ppm 7.57 - 7.30 (m, 5H), 6.62 (bs, 1H), 6.39 (s, 1H), 5.09 (bs, 2H), 4.65-4.60 (m, 2H), 4.17 - 4.04 (m, 2H), 3.68 (br s, 2H), 2.22 (s, 3H), 1.42 - 1.15 (m, 9H)
Faza 2 - Sinteza terc-butil 6-hidroksi-8-metil-2,3-dihidrobenzo[f][1,4]oksazepin-4(5H)-karboksilata (TP-43)
[0607] Jedinjenje KKKK-1 (160 mg, 0.433 mmol) se rastvori u MeOH (8.00 mL). Nakon toga se u reaktivni rastvor doda Pd/C, zatim se degasira četiri puta sa H2i meša 16 sati na 30 °C u balonu H2. U razblaženi reaktivni rastvor se doda DCM (20 mL), nakon toga filtrira i koncentruje da se dobije sirovi produkt koji se prečisti flash hromatografijom, uz eluiranje sa smešom petrol etar/EtOAc od 0-25%, da se dobije TP-43 (100 mg, 83%) kao bela čvrsta supstanca. LCMS [M-Boc+1] 179.9;<1>H NMR (400 MHz, DMSO-d6, rotameri) δ ppm 9.41 (s, 1H), 6.37-6.35 (m, 1H), 6.22-6.20 (m, 1H), 4.58 - 4.42 (m, 2H), 4.13 - 3.95 (m, 2H), 3.70 3.59 (m, 2H), 2.13 (s, 3H), 1.41 - 1.27 (m, 9H)
[0608] Primer 206 se izrađuje koristeći sličnu hemiju opisanu u Šemi CC i koristeći jedinjenje TP-43
Šema LLLL - Sinteza terc-butil (S)-6-hidroksi-3-metil-2,3-dihidrobenzo[f][1,4]oksazepin-4(5H)-karboksilata (TP-44)
[0609]
Šema LLLL
Faza 1 - Sinteza metil (S)-2-(benziloksi)-6-(2-((tercbutoksikarbonil)amino)propoksi)benzoata (LLLL-1)
[0610] U rastvor metil 2-(benziloksi)-6-hidroksibenzoata (2.80 mg, 10.8 mmol) u THF (40.0 mL) u ledenom kupatilu se u atmosferi N2doda PPh3(7.11 g, 27.1 mmol). U prethodno dobijenu smešu se u kapima doda DIAD (5.48 g, 27.1 mmol), a nakon toga meša 40 min na 25 °C. Nakon toga se doda terc-butil (S)-(1-hidroksipropan-2-il)karbamat (5.70 g, 32.5 mmol) u bezvodnom THF (20.0 mL) i reakcija meša 16 sati na 28 °C. Smeša se razblaži sa EtOAc (50 mL) i H2O (100 mL). Smeša se razdvoji i vodeni sloj se ekstrahuje sa EtOAc (50 mL). Kombinovani organski slojevi se isperu sa slanim rastvorom (50 mL), suše preko Na2SO4, filtriraju i koncentruju da se dobije sirovi produkt koji se prečisti ISCO (120 g silika gel, petrol etar:EtOAc=4:1) da se dobije LLLL-1 (3.50 g, 78%) kao bezbojna guma.<1>H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ ppm 7.42 - 7.35 (m, 4H), 7.34 - 7.29 (m, 2H), 6.83 - 6.75 (m, 2H), 6.71 (d, J=8.5 Hz, 1H), 5.16 (s, 2H), 3.95-3.92 (m, 1H), 3.80 - 3.70 (m, 5H), 1.43 - 1.34 (m, 9H), 1.08 (d, J=6.5 Hz, 3H)
Faza 2 - Sinteza metil (S)-2-(2-aminopropoksi)-6-(benziloksi)benzoata (LLLL-2)
[0611] U rastvor LLLL-1 (4.30 g, 10.3 mmol) u DCM (10 mL) se na 0 °C doda HCl(g)/dioksan (~4N, 20 mL). Smeša se meša 2 sata na 25 °C. Smeša se koncentruje da se dobije LLLL-2 kao HCl so (4.00 g, >99%) kao žuta čvrsta supstanca koja se direktno koristi u sledećoj fazi.
Faza 3 - Sinteza (S)-2-(2-aminopropoksi)-6-(benziloksi)benzoeve kiseline (LLLL-3)
[0612] U suspenziju LLLL-2 (4.0 g, 3.17 mmol) u MeOH (60 mL) i vodi (12 mL) se na 25 °C doda LiOH.H2O (3.46 g, 82.4 mmol). Smeša se meša 15 sati na 75 °C. pH rastvora se podesi na pH~3 sa 1N HCl. Rastvor se upari da se dobije sirovi produkt LLLL-3 (3.10 g, >99%) kao bela čvrsta supstanca koja se direktno koristi u sledećoj fazi bez daljeg prečišćavanja.
Faza 4 - Sinteza (S)-6-(benziloksi)-3-metil-3,4-dihidrobenzo[f][1,4]oksazepin-5(2H)-ona (LLLL-4)
[0613] U suspenziju LLLL-3 (4.00 g, 5.77 mmol) u bezvodnom THF (60 mL) se na 0 °C dodaju DIPEA (3.73 g, 28.9 mmol) i T3P (50% u EtOAc, 7.35 g, 11.5 mmol). Smeša se meša 15 sati na 25 °C. Reakcija nije završena i dodaju se DIPEA (3.73 g, 28.9 mmol) i T3P (50% u EtOAc, 7.35 g, 11.5 mmol) i meša narednih 16 sati. Doda se EtOAc (40.0 mL) da razblaži rastvor. Rastvor se ispere sa 1N rastvorom HCl (30 mL), zasićenim vodenim rastvorom NaHCO3(30 mL) i slanim rastvorom (30 mL). Organski slojevi se odvoje, suše i upare da se dobije sirovi produkt koji se prečisti flash hromatografijom, uz eluiranje sa smešom petrol etar/EtOAc od 0-50% da se dobije željeni produkt LLLL-4 (900 mg, 55%) kao bela čvrsta supstanca. LCMS [M+1] 283.9;<1>H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ ppm 8.09 (d, J=6.3 Hz, 1H), 7.51 - 7.44 (m, 2H), 7.41 - 7.25 (m, 4H), 6.99 - 6.91 (m, 1H), 6.68 (dd, J=0.9, 8.2 Hz, 1H), 5.15 (s, 2H), 3.97 (dd, J=4.3, 10.3 Hz, 1H), 3.86 - 3.77 (m, 1H), 3.46-3.44 (m, 1H), 1.05 (d, J=6.5 Hz, 3H)
Faza 5 - Sinteza terc-butil (S)-6-(benziloksi)-3-metil-5-okso-2,3-dihidrobenzo[f][1,4]oksazepin-4(5H)-karboksilata (LLLL-5)
[0614] U rastvor LLLL-4 (900 mg, 3.18 mmol) u DMF (20.0 mL) se na 25 °C dodaju DIPEA (1.23 g, 9.53 mmol), DMAP (38.8 mg, 0.318 mmol) i Boc2O (1.04 mg, 4.76 mmol) i reaktivna smeša se meša 16 sati na 25 °C. Smeša se razblaži sa ledenom vodom (20 mL) i ekstrahuje sa EtOAc (20 mL X 2). Kombinovani organski slojevi se isperu sa slanim rastvorom (30 mL X 5), suše preko Na2SO4, filtriraju i koncentruju pod vakuumom da se dobije sirovi produkt koji se prečisti ISCO (4 g silika gel, EtOAc:petrol etar=18%-20%) da se dobije LLLL-5 (720 mg, 59%) kao bela čvrsta supstanca i koristi direktno u sledećoj fazi. LCMS [M-Boc+1] 238.9
Faza 6 - Sinteza terc-butil (S)-6-(benziloksi)-3-metil-2,3-dihidrobenzo[f][1,4]oksazepin-4(5H)-karboksilata (LLLL-6)
[0615] U rastvor LLLL-5 (720 mg, 1.88 mmol) u THF (20 mL) se na 0 °C doda BH3.Me2S (10 M, 0.751 mL, 7.51 mmol). Smeša se meša 2 sata na 74 °C u atmosferi N2. Reakcija se polako neutrališe sa MeOH (5 mL) i zagreva 16 sati pod refluksom. Smeša se koncentruje da se dobije sirovi produkt koji se prečisti kombi flash (40 g kolona silika gela, EtOAc u petrol
1
etru od 9-10%) da se dobije LLLL-6 (530 mg, 76.4 %) kao bezbojna guma. LCMS [M-Boc+1] 270.0;<1>H NMR (400 MHz, DMSO-d6, rotameri) δ ppm 7.54 - 7.32 (m, 5H), 7.06 (t, J=8.2 Hz, 1H), 6.70 (d, J=8.3 Hz, 1H), 6.46 (dd, J=0.8, 8.3 Hz, 1H), 5.35 - 4.97 (m, 3H), 4.54 - 4.30 (m, 1H), 4.24 - 4.02 (m, 3H), 1.39-1.22 (m, 9H), 1.06 (m, 3H)
Faza 7 - Sinteza terc-butil (S)-6-hidroksi-3-metil-2,3-dihidrobenzo[f][1,4]oksazepin-4(5H)-karboksilata (TP-44)
[0616] U rastvor LLLL-6 (530 mg, 1.43 mmol) u MeOH (10.0 mL) se doda ovlaženi 10% Pd/C (100 mg). Reaktivni rastvor se meša 16 h na 30 °C u balonu H2. Nakon toga se smeša filtrira kroz celite, ispere sa MeOH i koncentruje da se dobije TP-44 (360 mg, 90%) kao bela čvrsta supstanca.<1>H NMR (400 MHz, DMSO-d6, rotameri) δ ppm 9.61 - 9.49 (m, 1H), 6.87 (t, J=8.2 Hz, 1H), 6.44 (d, J=7.8 Hz, 1H), 6.26 (dd, J=1.0, 8.0 Hz, 1H), 5.23 - 4.94 (m, 1H), 4.54 - 4.28 (m, 1H), 4.15 - 4.00 (m, 3H), 1.39-1.25 (m, 9H), 1.06 (d, J=6.8 Hz, 3H)
[0617] Jedinjenje TP-45 se izrađuje koristeći slične uslove kao u Šemi LLLL koristeći tercbutil (R)-(1-hidroksipropan-2-il)karbamat u fazi 1
[0618] Primeri 207 & 208 se izrađuju koristeći sličnu hemiju opisanu u Šemi CC i koristeći jedinjenja TP-44 & TP-45, tim redom
11
Šema MMMM - Sinteza terc-butil (R)-6-hidroksi-2-metil-2,3-dihidrobenzo[f][1,4]oksazepin-4(5H)-karboksilata (TP-46)
12
Šema MMMM
Faza 1 - Sinteza terc-butil (R)-6-(benziloksi)-2-metil-2,3-dihidrobenzo[f][1,4]oksazepin-4(5H)-karboksilata (MMMM-1)
[0620] U jedinjenje MMMM-1 (izrađeno sličnim postupkom kao za faze 1-5 u Šemi LLLL koristeći terc-butil (R)-(2-hidroksipropil)karbamat), 500 mg, (1.5 mmol) u bezvodnom THF (10.0 mL) se na 25 °C doda LAH (233 mg, 6.14 mmol). Smeša se meša 2 h na 75 °C.
Reakcija se ohladi na r.t., kada se u reakciju doda voda (2.0 mL) a nakon toga Boc2O (670 mg, 3.07 mmol). Smeša se meša 2.5 h na r.t., nakon toga se doda voda i reakcija ekstrahuje sa EtOAc (10 mL x3), suši sa Na2SO4i koncentruje da se dobije sirovi produkt koji se prečisti ISCO (20 g, silika gel, EtOAc/petrol etar=15 %) da se dobije MMMM-2 (520 mg, 92%) kao bezbojna guma.
LCMS [M-Boc+1] 269.9
Faza 2 - Sinteza terc-butil (R)-6-hidroksi-2-metil-2,3-dihidrobenzo[f][1,4]oksazepin-4(5H)-karboksilata (TP-46)
[0621] U jedinjenje MMMM-2 (520 mg, 1.3 mmol) rastvoreno u MeOH (10 mL) se doda Pd/C (100 mg, 0.940 mmol). Reaktivni rastvor se meša 2 h na 25 °C u atmosferi H2. Nakon toga se smeša filtrira kroz celite, ispere sa MeOH i koncentruje. Ostatak se prečisti ISCO (20 g, silika gel, EtOAc/petrol etar=25 %) da se dobije TP-46 (234 mg, 67%) kao bela čvrsta supstanca. LCMS [M-Boc+1] 179.7;<1>H NMR (400 MHz, CDCl3) δ ppm 7.55 (s, 1H), 7.06 (t, J=8.1 Hz, 1H), 6.73 (d, J=8.1 Hz, 1H), 6.67 - 6.55 (m, 1H), 4.64 (d, J=14.7 Hz, 1H), 4.15 -4.07 (m, 1H), 3.90 (br d, J=14.4 Hz, 1H), 3.84 - 3.76 (m, 1H), 3.29 (dd, J=8.9, 14.5 Hz, 1H), 1.41 (s, 9H), 1.29 (d, J=6.5 Hz, 3H)
[0622] Jedinjenje TP-47 se izrađuje sličnim postupkom kako je opisano u Šemi MMMM
1
koristeći terc-butil (S)-(2-hidroksipropil)karbamat
[0623] Primeri 209 & 210 se izrađuju koristeći sličnu hemiju opisanu u Šemi CC i koristeći jedinjenja TP-46 & TP-47, tim redom.
14
(nastavlja se)
Šema NNNN - Sinteza terc-butil-6-(difluorometil)-5-fluor-8-hidroksi-4-metil-3,4-dihidroizohinolin-2(1H)-karboksilata (TP-48)
[0624]
Šema NNNN
1
Faza 1: Sinteza 2-(benziloksi)-4-brom-5-fluorobenzoeve kiseline (ZZZ-6)
[0625] U bocu okruglog dna, opremljenu magnetnom mešalicom, se dodaju litijum tercbutoksid (3.81 g, 47.6 mmol) i DMSO (119 mL, 0.2M). Boca se opremi sa fendenserom i doda se benzil alkohol (4.95 mL, 47.6 mmol). Boca se stavi u oblogu za zagrevanje i zagreva 5 minuta na 80°C. Boca se ukloni i doda se ZZZ-1 (5.64 g, 23.8 mmol). Boca se vrati u oblogu za zagrevanje i zagreva 17 sati na 80°C. Reakcija se ukloni iz obloge za zagrevanje i ostavi da se ohladi na rt. Rastvor se sipa u 1.2 L vode i zakiseli sa 48 mL 1M HCl aq. da se dobije žutomrki precipitat. Čvrste supstance se filtriraju i isperu sa vodom. Čvrste supstance se sakupe i suše u vakuumskoj pećnici 3.5 sata na 80°C da se dobije naslovljeno jedinjenje ZZZ-6 (7.21 g, 93%) kao svetlo smeđa čvrsta supstanca.<1>H NMR (400MHz, DMSO-d6) δ ppm 13.10 (br. s., 1H), 7.61 (d, J=8.8 Hz, 1H), 7.57 (d, J=5.6 Hz, 1H), 7.48 (d, J=7.1 Hz, 2H), 7.44 - 7.36 (m, 2H), 7.35 - 7.28 (m, 1H), 5.22 (s, 2H).
Faza 2: Sinteza 2-(benziloksi)-4-brom-5-fluor-N-(pivaloiloksi)benzamida (ZZZ-7)
[0626] U bocu okruglog dna, opremljenu magnetnom mešalicom, se dodaju ZZZ-6 (5.73 g, 17.6 mmol) i THF (176 mL, 0.1M). Rastvor se ohladi na 0°C i doda se T3P (24.7 g, 38.8 mmol) kao 50% m/t rastvor u EtOAc. Nakon dodavanja, reaktivna smeša se meša 30 min na 25°C. U prethodno dobijeni rastvor se doda DIPEA (18.4 mL, 106 mmol) a nakon toga FF-3 (5.18 g, 19.4 mmol). Nakon dodavanja, reaktivna smeša se meša 1 sat na 25°C. Reakcija se neutrališe sa vodom, razblaži sa EtOAc i prenese u levak za razdvajanje. Faze se razdvoje i organska faza se ispere sa 1 porcijom 10% limunske kiseline, 1 porcijom sat. NaHCO3i 1 porcijom slanog rastvora. Organski ekstrakt se nakon toga suši (MgSO4), filtrira i koncentruje pod vakuumom. Sirovi ostatak se prečisti flash hromatografijom na koloni (12g SiO2, Isco, 100% Hept. do 100% EtOAc, 9 mL frakcije) da se dobije naslovljeno jedinjenje ZZZ-7 (6.24 g, 83%) kao bela čvrsta supstanca.<1>H NMR (400MHz, HLOROFORM-d) δ ppm 10.79 (s, 1H), 7.94 (d, J=8.9 Hz, 1H), 7.52 - 7.35 (m, 5H), 7.27 - 7.23 (m, 1H), 5.26 (s, 2H), 1.34 (s, 9H).
Faza 3: Sinteza 8-(benziloksi)-6-brom-5-fluor-4-metil-3,4-dihidroizohinolin-1(2H)-ona (NNNN-1)
1
[0627] U čelični reaktor zapremine 80 mL se dodaju ZZZ-7 (4.00 g, 9.43 mmol), cezijum pivalat (4.41 g, 18.9 mmol), [CptRhCl2]2(166 mg, 0.236 mmol) i trifluoroetanol (47 mL, 0.2M). Reaktor se prečisti 3 puta sa azotom a nakon toga se 3 puta prečisti sa propilen gasom. Reakcija se 3 dana zagreva na 40°C pod pritiskom propilen gasa od 4 bara. Rastvor se neutrališe sa NaHCO3aq. i prenese u levak za razdvajanje sa DCM. Faze se razdvoje i vodena faza se ekstrahuje sa 2 porcije DCM. Kombinovani organski ekstrakti se suše (MgSO4), filtriraju i koncentruju pod vakuumom. Sirovi ostatak se prečisti flash hromatografijom na koloni (40g SiO2, Isco, 100% Hept. do 10% MeOH/EtOAc, 25 mL frakcije) da se dobije naslovljeno jedinjenje NNNN-1 (2.27 g, 66%, 9:1 r.r.) kao braon čvrsta supstanca. LCMS [M+H] = 364 zabeleženo.<1>H NMR (400MHz, HLOROFORM-d) δ ppm 7.55 (d, J=7.5 Hz, 2H), 7.47 - 7.36 (m, 2H), 7.35 - 7.28 (m, 1H), 7.13 (d, J=5.5 Hz, 1H), 5.92 (d, J=3.8 Hz, 1H), 5.27 - 5.19 (m, 1H), 5.16 - 5.10 (m, 1H), 3.69 (dd, J=4.0, 12.7 Hz, 1H), 3.40 - 3.30 (m, 1H), 3.23 (ddd, J=1.3, 6.0, 12.6 Hz, 1H), 1.36 (d, J=7.1 Hz, 3H).
Faza 4: Sinteza terc-butil-8-(benziloksi)-6-brom-5-fluor-4-metil-1-okso-3,4-dihidroizohinolin-2(1H)-karboksilata (NNNN-2)
[0628] U bocu okruglog dna, opremljenu magnetnom mešalicom i koja sadrži NNNN-1 (1.20 g, 3.29 mmol) se dodaju DCM (11.0 mL, 0.3M), DIPEA (0.86 mL, 4.94 mmol), (Boc)2O (1.08 g, 4.94 mmol) i DMAP (60.4 mg, 0.494mmol). Boca se opremi sa findenserom i stavi u blok za zagrevanje. Reakcija se zagreva 16 sati na 40°C. Boca se ukloni iz bloka za zagrevanje i ostavi da se ohladi na rt. Reakcija se neutrališe sa vodom i prenese u levak za razdvajanje sa DCM. Faze se razdvoje i vodena faza se ekstrahuje sa 2 porcije DCM.
Kombinovani organski ekstrakti se suše (MgSO4), filtriraju i koncentruju pod vakuumom. Sirovi ostatak se prečisti flash hromatografijom na koloni (40g SiO2, Isco, 100% Hept do 100% EtOAc, 9 mL frakcije) da se dobije naslovljeno jedinjenje NNNN-2 (1.41 g, 92%) kao bela pena. LCMS [M+H-Boc] = 364 zabeleženo.<1>H NMR (400MHz, HLOROFORM-d) δ ppm 7.55 (d, J=7.5 Hz, 2H), 7.44 - 7.35 (m, 2H), 7.32 (d, J=7.3 Hz, 1H), 7.11 (d, J=5.6 Hz, 1H), 5.28 - 5.20 (m, 1H), 5.18 - 5.09 (m, 1H), 4.21 (dd, J=2.2, 13.2 Hz, 1H), 3.61 (dd, J=3.2, 13.1 Hz, 1H), 3.39 - 3.27 (m, 1H), 1.59 (s, 9H), 1.33 (d, J=7.1 Hz, 3H).
1
Faza 5: Sinteza terc-butil-8-(benziloksi)-6-brom-5-fluor-4-metil-3,4-dihidroizohinolin-2(1H)-karboksilata (NNNN-3)
[0629] U bocu okruglog dna, opremljenu magnetnom mešalicom i koja sadrži NNNN-2 (1.41 g, 3.04 mmol), se dodaju THF (15 mL, 0.2M) i bor dimetilsulfid kompleks (1.44 mL, 15.2 mmol).
[0630] Boca se opremi sa findenserom i prenese u blok za zagrevanje. Reakcija se zagreva 30 minuta na 70°C. Boca se ukloni iz bloka za zagrevanje i ostavi da se postepeno ohladi na rt. Reakcija se neutrališe dodavanjem metanola u kapima sve dok ne prestane izdvajanje gasa, a nakon toga razblaži sa heptanom. Rastvor se koncentruje pod vakuumom. Sirovi ostatak se prečisti flash hromatografijom na koloni (40g SiO2, Isco, 100% Hept do 10% EtOAc/Hept. do 100% EtOAc, 9 mL frakcije) da se dobije naslovljeno jedinjenje NNNN-3 (1.13 g, 82%) kao bela pena. LCMS [M+H-Boc] = 350 zabeleženo.<1>H NMR (400MHz, HLOROFORM-d) δ ppm 7.47 - 7.30 (m, 5H), 6.93 (d, J=5.5 Hz, 1H), 5.18 - 4.79 (m, 3H), 4.26 - 3.96 (m, 2H), 3.28 - 2.95 (m, 2H), 1.51 (s, 9H), 1.25 (d, J=6.8 Hz, 3H).
Faza 6: Sinteza terc-butil-8-(benziloksi)-5-fluor-6-formil-4-metil-3,4-dihidroizohinolin-2(1H)-karboksilata (NNNN-4)
[0631] Napomena: nBuLi se titrira, THF se suši preko aktiviranih 4A molekularnih sita a igle za špric se suše u peći @ 85C pod vakuumom pre upotrebe.
[0632] Boca okruglog dna koja sadrži NNNN-3 (1.00 g, 2.22 mmol) se suši pod visokim vakuumom u toku noći, opremljena je magnetnom mešalicom i prečišćena sa argonom pod dinamičkim vakuumom. U bocu se doda THF (11.0 mL, 0.2M) i rastvor se ohladi na -78°C u kupatilu AcMe/suvi led. U ohlađeni rastvor se u kapima doda n-butil litijum (1.7 mL, 2.30 mmol) da se indukuje razmena metal-halogen. Reakcija se meša 30 minuta na -78°C u atmosferi argona.
[0633] Napomena: Reakcija postaje svetlo narandžasta nakon dodavanja nBuLi u kapima.
[0634] U rastvor se u kapima na -78°C doda DMF (0.26 mL, 3.4 mmol). U ovoj fazi, ledeno kupatilo se ukloni i reakcija se ostavi da se postepeno zagreje na sobnu temperaturu.
[0635] Napomena: Reakcija postaje bledo žuta nakon zagrevanja na sobnu temperaturu.
[0636] Reakcija se ponovo neutrališe dodavanjem reaktivnog rastvora u sat. NH4Cl aq. (10 mL). Vodena faza se ekstrahuje sa 4 porcije DCM. Kombinovani organski ekstrakti se suše (MgSO4), filtriraju i koncentruju pod vakuumom. Sirovi ostatak se prečisti flash
1
hromatografijom na koloni (24 g SiO2, Isco, 100% Hept. do 100% EtOAc, 20 mL frakcije) da se dobije naslovljeno jedinjenje NNNN-4 (885 mg, >95%) kao bela voštana čvrsta supstanca. LCMS [M+H-Boc] = 300 zabeleženo.<1>H NMR (400MHz, HLOROFORM-d) δ ppm 10.34 (s, 1H), 7.48 - 7.31 (m, 5H), 7.21 (d, J=5.3 Hz, 1H), 5.29 - 4.87 (m, 3H), 4.32 - 4.03 (m, 2H), 3.35 - 3.18 (m, 1H), 3.17 - 3.00 (m, 1H), 1.52 (s, 9H), 1.29 (d, J=6.8 Hz, 3H).
Faza 7: Sinteza terc-butil-8-(benziloksi)-6-(difluorometil)-5-fluor-4-metil-3,4-dihidroizohinolin-2(1H)-karboksilata (NNNN-5)
[0637] Scintilaciona bočica, opremljena magnetnom mešalicom i koja sadrži NNNN-4 (1.77 g, 4.43 mmol), se prečisti sa argonom pod dinamičkim vakuumom. Bočica se napuni sa DCM (44 mL, 0.1M) i rastvor se ohladi na 0°C a nakon toga se u kapima doda DAST (1.46 mL, 11.1 mmol). Ledeno kupatilo se ukloni i rastvor se ostavi da se postepeno zagreje na rt.
Reakcija se meša 24 sata u atmosferi argona. U toku reakcije, dodaju se još 2 alikvota DAST (1.46 mL, 11.1 mmol) na 12 i 17 sati, tim redom, da se obavi konverzija (ukupno 7.5 ekvivalenata DAST). Reakcija se neutrališe dodavanjem sat. NaHCO3aq u kapima.
UPOZORENJE: Dolazi do brzog izdvajanja CO2gasa tokom neutralizacije. Sadržaji bočice se prenesu levak za razdvajanje sa DCM i razblaže sa vodom. Faze se razdvoje i vodena faza se ekstrahuje sa 3 porcije DCM. Kombinovani organski ekstrakti se suše (MgSO4), filtriraju i koncentruju pod vakuumom. Sirovi ostatak se prečisti flash hromatografijom na koloni (40g SiO2, Isco, 100% Hept. do 100% EtOAc, 20 mL frakcije) da se dobije naslovljeno jedinjenje NNNN-5 (1.59 g, 85%) kao bledo žuta guma. LCMS [M+H-Boc] = 322 zabeleženo.<1>H NMR (400MHz, HLOROFORM-d) δ ppm 7.49 - 7.29 (m, 5H), 6.95 (d, J=5.3 Hz, 1H), 6.89 (t, J=55.1 Hz, 1H), 5.22 - 4.90 (m, 3H), 4.27 - 4.02 (m, 2H), 3.28 - 2.96 (m, 2H), 1.51 (s, 9H), 1.26 (d, J=7.0 Hz, 3H).
Faza 8: Sinteza terc-butil-6-(difluorometil)-5-fluor-8-hidroksi-4-metil-3,4-dihidroizohinolin-2(1H)-karboksilata (TP-48)
[0638] U bocu okruglog dna zapremine 500 mL, opremljenu magnetnom mešalicom i koja sadrži NNNN-5 (1.65 g, 3.91 mmol), se doda metanol (78 mL, 0.05M). U rastvor se doda Pd/C 10mt% (417 mg, 0.391 mmol) i rastvor se prečisti sa vodonik gasom pod dinamičkim vakuumom. Reakcija se energično meša 1.5 sat pod pritiskom vodonika od 1 atm. Reakcija se
1
filtrira preko celite, čvrste supstance se isperu sa DCM i filtrat koncentruje pod vakuumom. Sirovi ostatak se prečisti flash hromatografijom na koloni (24g SiO2, Isco, 100% Hept. do 100% EtOAc, 20 mL frakcije) da se dobije naslovljeno jedinjenje TP-48 (1.15 g, 88%) kao bela pena. LCMS [M+H-Boc] = 232 zabeleženo.
<1>H NMR (400MHz, HLOROFORM-d) δ ppm 7.00 - 6.65 (m, 2H), 5.22 - 4.79 (m, 1H), 4.29 -3.94 (m, 2H), 3.28 - 2.95 (m, 2H), 1.58 - 1.51 (m, 9H), 1.23 (d, J=7.0 Hz, 3H).
Šema OOOO - Sinteza terc-butil-5-fluor-8-hidroksi-1-metil-3,4-dihidroizohinolin-2(1H)-karboksilata (TP-49)
[0639]
Šema OOOO
PhMe, 130°C
mikrotalasi
,
Faza 1: Sinteza 7-(benziloksi)-10-fluor-1,4a,5,10b-tetrahidro-1,4-metanofenantridin-6(4H)-ona (OOOO-1)
[0640] U bocu okruglog dna, opremljenu magnetnom mešalicom, se dodaju VVV-4 (2.29 g, 6.63 mmol), cezijum pivalat (3.10 g, 13.3 mmol), [Cp*RhCl2]2(20.5 mg, 0.0332 mmol) i trifluoroetanol (33 mL, 0.2M). Boca se zatvori sa gumenim čepom i doda se norbornadien (0.74 mL, 7.29 mmol). Boca se stavi u blok za zagrevanje i reakcija se zagreva 40 minuta na 45°C. Boca se ukloni iz bloka za zagrevanje i ostavi da se ohladi na rt. Rastvor se razblaži sa vodom a nakon toga sa DCM i faze se razdvoje. Organska faza se ispere sa 1 porcijom vode, suši (MgSO4), filtrira i koncentruje pod vakuumom. Sirovi ostatak se dalje suši pod visokim vakuumom da se dobije naslovljeno jedinjenje OOOO-1 kao narandžasta čvrsta supstanca koja se koristi u sledećoj fazi bez daljeg prečišćavanja. LCMS [M+H] = 336 zabeleženo.
2
Faza 2: Sinteza 8-(benziloksi)-5-fluoroizohinolin-1(2H)-ona (OOOO-2)
[0641] U mikrotalasnu bočicu, opremljenu magnetnom mešalicom, se doda OOOO-1 (-6.63 mmol) kao rastvor u toluenu (15 mL, 0.44M). Bočica se zatvori sa teflonskim zatvaračem i stavi u mikrotalasni reaktor. Reakcija se zagreva 1 sat na 130°C. Rastvor se prenese u bocu okruglog dna sa DCM i koncentruje pod vakuumom. Sirovi ostatak se dalje suši pod visokim vakuumom da se dobije naslovljeno jedinjenje OOOO-2 (1.79 g, >95%) kao braon čvrsta supstanca koja se koristi u sledećoj fazi bez daljeg prečišćavanja. LCMS [M+H] = 270 zabeleženo.<1>H NMR (400MHz, DMSO-d6) δ ppm 11.07 (br. s., 1H), 7.62 (d, J=7.2 Hz, 2H), 7.46 (t, J=9.3 Hz, 1H), 7.39 (t, J=7.5 Hz, 2H), 7.33 - 7.27 (m, 1H), 7.24 - 7.19 (m, 1H), 7.00 (dd, J=4.2, 9.0 Hz, 1H), 6.45 (d, J=7.1 Hz, 1H), 5.20 (s, 2H).
Faza 3: Sinteza 8-(benziloksi)-1-hlor-5-fluoroizohinolina (OOOO-3)
[0642] U reaktivnu bočicu, opremljenu magnetnom mešalicom, se dodaju benziltrietilamonijum hlorid (846 mg, 3.71 mmol) i OOOO-2 (500 mg, 1.86 mmol) kao rastvor u acetonitrilu (19 mL, 0.1M). Bočica se zatvori sa teflonskim zatvaračem i doda se dimetilanilin (0.35 mL, 2.79 mmol) a nakon toga se u kapima dodaje fosfor oksihlorid (1.04 mL, 11.1 mmol). Bočica se stavi u blok za zagrevanje i zagreva 10 minuta na 80°C. Rastvor se koncentruje i sirovo ostatak se prenese u levak za razdvajanje sa DCM i razblaži sa vodom. Faze se razdvoje i vodena faza se ekstrahuje sa 2 porcije DCM. Kombinovani organski ekstrakti se suše (MgSO4), filtriraju i koncentruju pod vakuumom. Sirovi ostatak se prečisti flash hromatografijom na koloni (24g SiO2, Isco, 100% Hept. do 100% EtOAc, 9 mL frakcije) da se dobije naslovljeno jedinjenje OOOO-3 (465 mg, 87%) kao bledo narandžasta čvrsta supstanca. LCMS [M+H] = 288 zabeleženo.<1>H NMR (400MHz, HLOROFORM-d) δ ppm 8.32 (d, J=5.6 Hz, 1H), 7.78 (d, J=5.6 Hz, 1H), 7.56 (d, J=7.2 Hz, 2H), 7.48 - 7.28 (m, 4H), 6.97 (dd, J=4.3, 8.7 Hz, 1H), 5.27 (s, 2H).
Faza 4: Sinteza 8-(benziloksi)-5-fluor-1-metilizohinolina (OOOO-4)
[0643] U reaktivnu bočicu osušenu u pećnici, opremljenu magnetnom mešalicom i ohlađenu u struji argona, se dodaju OOOO-3 (422 mg, 1.47 mmol) i Pd(PPh3)4(84.7 mg, 0.0733 mmol). Bočica se zatvori sa gumenim čepom i prečisti sa argonom pod dinamičkim vakuumom. U
21
bočicu se doda THF (7.33 mL, 0.2M) a nakon toga se u kapima dodaje dimetil cink (2.20 mL, 4.40 mmol). Bočica se zatvori sa teflonskim zatvaračem i stavi u blok za zagrevanje. Reakcija se refluksuje 1 sat na 75°C. Bočica se ukloni iz bloka za zagrevanje i ostavi da se ohladi na rt. Reakcija se pažljivo neutrališe dodavanjem sat. NH4Cl aq u kapima. Rastvor se prenese u levak za razdvajanje sa DCM. Faze se razdvoje i vodena faza se ekstrahuje sa 3 porcije DCM. Kombinovani organski ekstrakti se isperu sa 1 porcijom slanog rastvora, suše (MgSO4), filtriraju i koncentruju pod vakuumom. Sirovi ostatak se prečisti flash hromatografijom na koloni (12g SiO2, Isco, 100% Hept. do 100% EtOAc, 9 mL frakcije) da se dobije 356 mg svetlo narandžaste čvrste supstance. Izdvojeni materijal se ponovo podvrgne flash hromatografiji na koloni (12g SiO2, Isco, 100% Hept. do 10% MeOH/EtOAc, 9 mL frakcije) da se dobije naslovljeno jedinjenje OOOO-4 (310 mg, 79%) kao bela čvrsta supstanca.
Izdvojena čvrsta supstanca se koristi u sledećoj fazi sa -80% čistoće na osnovu<1>H NMR analize. LCMS [M+H] = 268 zabeleženo.<1>H NMR (400MHz, HLOROFORM-d) δ = 8.43 (d, J=5.7 Hz, 1H), 7.68 (d, J=5.9 Hz, 1H), 7.50 (d, J=7.1 Hz, 2H), 7.47 - 7.39 (m, 3H), 7.22 (t, J=8.9 Hz, 1H), 6.86 (dd, J=4.3, 8.6 Hz, 1H), 5.22 (s, 2H), 3.10 (s, 3H).
Faza 5: Sinteza 5-fluor-1-metil-1,2,3,4-tetrahidroizohinolin-8-ola (OOOO-5)
[0644] U čelični reaktor se dodaju OOOO-4 (250 mg, 0.935 mmol), PtO2(42.5 mg, 0.187 mmol), etanol (15 mL) i sirćetna kiselina (0.5 mL). Rastvor se 20 sati hidrogenizuje na rt pod pritiskom gasa vodonika od 45 psi. Rastvor se filtrira kroz celite i čvrste supstance isperu sa etanolom. Filtrat se koncentruje pod vakuumom da se dobije naslovljeno jedinjenje OOOO-5 (178 mg, >95%) kao svetlo žuta čvrsta supstanca koja se koristi u sledećoj fazi bez daljeg prečišćavanja.<1>H NMR (400MHz, METANOL-d4) δ ppm 6.92 - 6.85 (m, 1H), 6.71 - 6.65 (m, 1H), 4.69 (q, J=6.7 Hz, 1H), 3.51 - 3.37 (m, 2H), 3.06 - 2.84 (m, 2H), 1.62 (d, J=6.8 Hz, 3H)
Faza 6: Sinteza terc-butil 5-fluor-8-hidroksi-1-metil-3,4-dihidroizohinolin-2(1H)-karboksilata (TP-49)
[0645] U bocu okruglog dna, opremljenu magnetnom mešalicom i koja sadrži OOOO-5 (130 mg, 0.717 mmol), se dodaju metanol (10 mL, 0.07M), (Boc)2O (157 mg, 0.717 mmol) i trimetilamin (145 mg, 1.43 mmol). Reakcija se meša 2.5 sata na 25°C. Rastvor se koncentruje pod vakuumom. Sirovi ostatak se prečisti flash hromatografijom na koloni (20g SiO2, Isco,
22
25% EtOAc/pet etar) da se dobije naslovljeno jedinjenje TP-49 (158 mg, 78%) kao bela čvrsta supstanca.<1>H NMR (400MHz, HLOROFORM-d) δ ppm 6.81 - 6.69 (m, 1H), 6.55 (dd, J=4.4, 8.7 Hz, 1H), 5.54 - 5.20 (m, 1H), 4.32 - 4.03 (m, 1H), 3.36-3.07 (m, 1H), 2.86 - 2.66 (m, 2H), 1.51 (s, 9H), 1.43 (d, J=6.6 Hz, 3H).
Primeri 211 - 214 su izrađeni na sličan način kao Primeri 182 & 183 (Šema YYY) počevši od odgovarajuće racematnog tetrahidroizohinolina u fazi 1 i razdvajajući diastereomere pre finalne deprotekcije.
2
24 (nastavlja se)
Primeri 215 & 216 su izrađeni na sličan način kao Primeri 182 & 183 (Šema YYY) počevši od odgovarajuće racematnog tetrahidroizohinolina u fazi 1, izvođenjem aminolize na sličan način kao u faza 4 (Šema NN) i razdvajanjem diastereomera pre finalne deprotekcije.
[0647]
2
Biološki Primeri
Postupci biohemijskog ispitivanja
[0648] Jedinjenja se solubiliziraju u DMSO i serijski razblaže koristeći trostruka razblaženja,
2
u 100% DMSO u koncentraciji 50 puta većoj od koncentracije tražene u analizi. Nakon razblaženja, 1 ul se doda u praznu mikrotitarnu ploču sa 96 udubljenja. PRMT5/MEP50 protein kompleks se kombinuje sa H4(1-21) peptidom (SGRGKGGKGLGKG-GAKRHRKV) u PRMT5 puferu za analizu (50 mM Tris pH 8.5, 50 mM NaCl, 5 mM MgCl2, 1 mM EDTA, 1 mM TCEP) i 44 ul se doda u mikrotitarnu ploču koja sadrži jedinjenje. S-Adenosyl-L-metionin (SAM) se pripremi kombinovanjem 3H obeleženog SAM sa neobeleženim SAM u PRMT5 puferu za analizu tako da je finalna koncentracija SAM 10 uM a specifična aktivnost je 0.2 uCi/ul. Reakcija se započinje dodavanjem 5 ul osnovnog rastvora SAM u mikrotitarnu ploču. Uslovi finalne reakcije su 10 nM PRMT5/MEP50 kompleksa, 200 nM peptida i 1 uM SAM. Nakon 25 minuta inkubacije na sobnoj temperaturi, reakcija se zaustavlja dodavanjem 100 uL 20% TCA. Produkt 3H-peptid se vezuje koristeći filter ploču sa 96 udubljenja (MSIPN4B, Millipore) i ispere se 5 puta sa PBS puferom. U osušenu filter ploču se doda scintilaciona tečnost (100 ul) i broji u scintilacionom brojaču tečnosti. IC50vrednosti se određuju nanošenjem rezultata u standardnu 4 parametarsku jednačinu odgovora na dozu koristećieći Pfizer vlasnički softver.
[0649] Rezultati biohemijskog ispitivanja primera su sumirani u Tabeli 1, pokazani kao IC50vrednosti u µM.
Tabela 1
2
n l
2 (nastavlja se)
Ispitivanje proliferacije A549
[0650] A549 ćelije adenokarcinoma pluća (American Type CuIture Collection) se održavaju u DMEM podlozi za rast (Life Technologies) obogaćenoj sa 10% v/v serma fetusa govečeta inaktiviranog toplotom (Sigma) i uzgajaju na 37°C, uz 5% CO2. Eksponencijalno umnožene A549 ćelije se prenesu u crne ploče sa 96 udubljenja za tretiranje kulture tkiva (Corning) u gustini od 2500 ćelija/ml u zapremini od 100 µl podloge za kulturu i ostave da se vežu u toku noći na 37°C, 5% CO2. Narednog dana, ploče sa jedinjenjima se pripreme izradom 9 tačaka 3.3-puta razblaženja u DMSO sa najvećom koncentracijom od 10 mM. Jedinjenja se dalje
2
razblaže u podlozi za kulturu i 11 µl se doda u ćelije (konačna maksimalna koncentracija analize je 10 µM a DMSO je 0.2%). Ćelije se inkubiraju sa jedinjenjem 7 dana na 37°C, 5% CO2sa podlogom a jedinjenje se zameni na dan 4. Preživljavanje ćelija se ispituje na dan 7 dodavanjem 100 µl Cell Titer Glo (Promega) reagensa u ploče za merenje količine ATP prisutnog u ćelijama. Luminiscencija se očitava na Envision 2104 Multilabel Reader (Perkin Elmer). 50% inhibitorna koncentracija (IC50) se određuje koristeći model 4-parametarskog nanošenja normalizovanog sa DMSO kontrolom u odgovoru na dozu.
[0651] Rezultati ispitivanja proliferacije A549 u primerima su sumirani u Tabeli 2 i pokazani kao IC50vrednosti u µM.
Tabela 2
(nastavlja se)
Molekularna biologija
[0652] Otvoreni okvir čitanja (ORF) gena koji enkodira celu dužinu PRMT5 je kondenzovan direktno sa Ala2 za MDYKDDDDKGRAT sekvencu enkodirajući Flag repić (SEQ ID: 1) a cela dužina neoznačenog MEP50 (SEQ ID: 2) je kodon optimizirana za ekspresiju kod sisara i sintetizovana od strane GenScript, Piscataway, NJ. Sintetizovani geni su klonirani u pFASTBac Dual (Life Technologies) vektoru ekspresije ćelija insekata koristeći standardne procedure kloniranja na bazi restrikcije enzima. U konačnom konstruktu PRMT5 ORF je pod kontrolom polihedrin promotora (polH) dok je MEP50 ORF pod kontrolom p10 promotora. Pored toga, MEP50 (SEQ ID: 2) je subkloniran u pFASTBac1 vektoru koristeći standardne procedure kloniranja na bazi restrikcije enzima.
Ekspresija proteina
[0653] Virusi su generisani pomoću standardnih protokola generisanja Bac-to-Bac virusa (Life Technologies) i pojačani do dve (P2) zalihe visoko-titarne pasaže. Prekomerna ekspresija proteina se sprovodi u eksponencijalnom rastu inficiranih Sf21 ćelija pri 2x106 sa
1
P2 zalihom virusa pri MOI=1 PRMT5-Mep50 dualnom konstruktu virusa i Mep50 konstruktu virusa u odnosu 1:1. Protokol ko-ekspresije se koristi da dodatno pojača Mep50 za formiranje FlagPRMT5-Mep50 heterodimera. Ćelije se centrifugiranjem sakupe 72h nakon infekcije a zamrznute pelete se čuvaju na -80 °C.
Prečišćavanje proteina
[0654] FlagPRMT5-Mep50 kompleks se prečisti od ćelijskog lizata koristeći hromatografiju sa afinitetom za Flag. Ćelije se liziraju u 50mM Tris 7.5, 200mM NaCl, 10% glicerolu, 0.25mM TCEP obogaćenog sa koktelom inhibitora proteaze bez EDTA (Roche).1.5 ml lizirajućeg pufera se doda po 1 g zamrznute pelete. Bistar lizat se dobija centrifugiranjem ćelijskog lizata 1 h na 4 °C pri 10,000 g.5 ml Anti-FLAG M2 Agarose (Sigma) se 3h dodaje u izolat da se izbistri lizat i izoluje FlagPRMT5-Mep50. Nakon 3 h vezivanja serije na 4 °C, Flag smola vezana za FlagPRMT5-Mep50 se ispere sa 20 zapremina kolone (CV) 50mM Tris 7.5, 200mM NaCl, 10% glicerola, 0.25mM TCEP a nakon toga FlagPRMT5-Mep50 kompleks eluira koristeći 3 CV 50mM Tris 7.5, 200mM NaCl, 10% glicerol, 0.25mM TCEP obogaćen sa 200 ug/ml FLAG peptida (DYKDDDDK). FlagPRMT5-Mep50 se dalje prečisti pomoću S30026/600 kolone (GE Healthcare) prethodno uravnotežene sa 2 CV 25mM Tris pH7.5, 150mM NaCl, 5% glicerola, 0.5mM TCEP pufera. Pik frakcije koje sadrže kompleks FlagPRMT5-Mep50 se koncentruju do 1.6 mg/ml, flash zamrznu u malim alikvotama koristeći tečni azot i čuvaju na -80 °C.
Sekvence
[0655] SEQ ID: 1
2
Sekvence
[0655] SEQ ID: 1

Claims (21)

  1. Patentni zahtevi 1. Jedinjenje formule (IV):
  2. ili njegova farmaceutski prihvatljiva so, naznačena time što: svaki R<1>je nezavisno izabran iz grupe koja se sastoji od (C1-C8)alkil, (C1-C8)haloalkil, hidroksi, (C1-C8)alkoksi, (C5-C12)aril, 5-12 člane heteroaril, (C3-C10)cikloalkil, 3-12 člane heterociklil, OR<4>, SR<4>i N(R<4>)2grupe; R<2>je vodonik, halogen, (C1-C8)alkil, hidroksi, (C1-C8)alkoksi ili N(R<5>)2grupa gde je svaki R<5>nezavisno vodonik ili (C1-C8)alkil grupa, ili su dva R<5>spojena da formiraju 4-6 člani heterociklični prsten koji sadrži 1-3 heteroatoma izabrana od N, O i S; svaki R<3>je nezavisno vodonik, hidroksi ili NH2grupa; ili kada je D = C(R<3>)2, R<3>je dodatno izabran od fluora; svaki R<9>je nezavisno vodonik ili fluor; D je C(R<3>)2, O, ili S(O)1-2grupa; B je N ili C; E je NR<1>, CH2, C(R<1>)2, O ili -S(O)2grupa; 4 svaki R<8>ili nije prisutan ili je nezavisno izabran iz grupe koja se sastoji od (C1-C8)alkil, (C1-C8)haloalkil, hidroksi, (C1-C8)alkoksi, (C5-C12)aril, 5-12 člane heteroaril, (C3-C10)cikloalkil, 3-12 člane heterociklil, OR<4>, SR<4>, N(R<4>)2, CN, halogena i CON(R<4>)2grupe, gde su dva R<8>opciono spojena da formiraju 4-6 člani spiro-cikloalkil prsten, cikloalkil kondenzovani prsten, ili alkilen most i gde su dva R<8>opciono spojena da formiraju karbonil grupu; svaki R<4>je nezavisno A-R<14>, gde A nije prisutan, ili je (C1-C3)alkil, -C(O)- ili -SO2-grupa a R<14>je vodonik, (C1-C8)alkil, (C5-C12)aril, 5-12 člana heteroaril, (C3-C10)cikloalkil ili 3-12 člana heterociklil grupa, ili su dva R<4>spojena da formiraju 4-6 člani heterociklični prsten koji sadrži 1-3 heteroatoma izabrana od N, O i S; Q nije prisutan ili je dvovalentni radikal izabran od O, S, NH i (C1-C8)alkilen grupe; V je N ili C, pri čemu ukoliko V formira dvostruku vezu, V je ugljenik; W je N ili C, pri čemu ukoliko W formira dvostruku vezu, W je ugljenik; X je N ili C, pri čemu ukoliko X formira dvostruku vezu, X je ugljenik; Y je CR<10>, N, NR<10>, O ili S, gde je svaki R<10>nezavisno izabran od vodonika, (C1-C8)alkil, hidroksi, (C1-C8)alkoksi, halogena, SH, S-(C1-C8)alkil i N(R<11>)2grupe ukoliko je Y = CR<10>, gde Y formira dvostruku vezu sa susednim članom prstena kada je Y = CR<10>ili N i gde je svaki R<11>nezavisno vodonik, (C1-C8)alkil, (C5-C12)aril ili 5-12 člana heteroaril grupa ili su dva R<11>spojena da formiraju 4-6 člani heterociklični prsten koji sadrži 1-3 heteroatoma izabrana od N, O i S, ili je Y = C(R<10>)2i dva R<10>i ugljenik za koji su vezani formiraju karbonil ili tiokarbonil grupu; Z je CR<12>, N, NR<12>, O ili S, gde je svaki R<12>nezavisno izabran od vodonika, (C1-C8)alkil, hidroksi, (C1-C8)alkoksi, fluora, hlora, broma, SH, S-(C1-C8)alkil i N(R<13>)2grupe, gde Z formira dvostruku vezu sa susednim članom prstena ukoliko je to CR<12>ili N, gde je svaki R<13>nezavisno vodonik, (C1-C8)alkil, (C5-C12)aril ili 5-12 člana heteroaril grupa, ili su dva R<13>spojena da formiraju 4-6 člani heterociklični prsten koji sadrži 1-3 heteroatoma izabrana od N, O i S i gde Z nije NR<12>ukoliko je X = N, V je C, W je C i Y je CR<10>, ili Z je C(R<12>)2grupa a dva R<12>i ugljenik za koji su vezani formiraju karbonil ili tiokarbonil grupu; i svaka ----- je opciono veza, gde može da bude prisutno ne više od dve ne-susedne-----. 2. Jedinjenje u skladu sa patentnim zahtevom 1, naznačeno time što ima formulu (III):
  3. ili njegova farmaceutski prihvatljiva so. 3. Jedinjenje ili njegova farmaceutski prihvatljiva so u skladu sa bilo kojim patentnim zahtevom 1-2, naznačeno time što je
  4. 4. Jedinjenje ili njegova farmaceutski prihvatljiva so u skladu sa patentnim zahtevom 3, naznačeno time što je
  5. 5. Jedinjenje ili njegova farmaceutski prihvatljiva so u skladu sa patentnim zahtevom 4, naznačeno time što
    je
  6. 6. Jedinjenje ili njegova farmaceutski prihvatljiva so u skladu sa patentnim zahtevom 2, naznačeno time što je:
    41
  7. 7. Jedinjenje ili njegova farmaceutski prihvatljiva so u skladu sa patentnim zahtevom 6, naznačeno time što:
    je: 42
  8. 8. Jedinjenje ili njegova farmaceutski prihvatljiva so u skladu sa patentnim zahtevom 7, naznačeno time što:
    je:
  9. 9. Jedinjenje u skladu sa patentnim zahtevom 1, naznačeno time što je izabrano od:
    4
    44
    ili njihove farmaceutski prihvatljive soli.
  10. 10. Jedinjenje u skladu sa patentnim zahtevom 1, naznačeno time što je izabrano od:
    4 ili njihove farmaceutski prihvatljive soli.
  11. 11. Jedinjenje u skladu sa patentnim zahtevom 1, naznačeno time što je izabrano od:
    ili njihove farmaceutski prihvatljive soli.
  12. 12. Jedinjenje u skladu sa patentnim zahtevom 1, naznačeno time što je to (1S,2S,3S,5R)-3-((6-(difluorometil)-5-fluor-1,2,3,4-tetrahidroizohinolin-8-il)oksi)-5-(4-metil-7H-pirolo[2,3-d]pirimidin-7-il)ciklopentan-1,2-diol ili njegova farmaceutski prihvatljiva so.
  13. 13. Jedinjenje u skladu sa patentnim zahtevom 1, naznačeno tim što ima strukturu:
  14. 14. Jedinjenje ili njegova farmaceutski prihvatljiva so u skladu sa bilo kojim od patentnih zahteva 1-13, naznačeno time što je navedena so izabrana od acetatnih, aspartatnih, benzoatnih, besilatnih, bikarbonatnih/karbonatnih, bisulfatnih/sulfatnih, boratnih, kamsilatnih, citratnih, edisilatnih, esilatnih, formatnih, fumaratnih, gluceptatnih, glukonatnih, glukuronatnih, heksafluorofosfatnih, hibenzatnih, hidrohloridnih/hloridnih, hidrobromidnih/bromidnih, hidrojodidnih/jodidnih, izetionatnih, laktatnih, malatnih, maleatnih, malonatnih, mesilatnih, metilsulfatnih, naftilatnih, 2-napsilatnih, nikotinatnih, nitratnih, orotatnih, oksalatnih, palmitatnih, pamoatnih, fosfatnih/hidrogen fosfatnih/dihidrogen fosfatnih, saharatnih, stearatnih, sukcinatnih, tartaratnih, tosilatnih, trifluoroacetatnih, soli aluminijuma, arginina, benzatina, kalcijuma, holina, dietilamina, diolamina, glicina, lizina, magnezijuma, meglumina, olamina, kalijuma, natrijuma, trometamina i cinka.
  15. 15. Jedinjenje ili njegova farmaceutski prihvatljiva so u skladu sa patentnim zahtevom 14, naznačeno time što je navedena so izabrana od hidrohloridnih, tosilatnih i mesilatnih soli.
  16. 16. Farmaceutska kompozicija, naznačena time što uključuje jedinjenje ili njegovu farmaceutski prihvatljivu so u skladu sa bilo kojim od patentih zahteva 1-15 i farmaceutski prihvatljiv nosač.
  17. 17. Jedinjenje ili njegova farmaceutski prihvatljiva so u skladu sa bilo kojim od patentnih zahteva 1 do 15, naznačeno time što je za upotrebu u tretmanu nenormalnog rasta ćelija kod sisara.
  18. 18. Jedinjenje ili njegova farmaceutski prihvatljiva so za upotrebu u skladu sa patentnim zahtevom 17, naznačeno time što je nenormalni rast ćelija kancer.
  19. 19. Jedinjenje ili njegova farmaceutski prihvatljiva so za upotrebu u skladu sa patentnim zahtevom 18, naznačeno time što je kancer, kancer pluća, kancer kostiju, kancer pankreasa, kancer kože, kancer glave ili vrata, kutenozna ili intraokularna melanoma, kancer materice, kancer jajnika, kancer rektuma, kancer analnog regiona, kancer želuca, kancer kolona, kancer dojke, kancer materice, kancer jajovoda, karcinom endometrijuma, karcinom grlića materice, karcinom vagine, karcinom vulve, Hočkinsova bolest, kancer jednjaka, kancer tankog creva, kancer endokrinog sistema, kancer tiroidne žlezde, kancer paratiroidne žlezde, kancer nadbubrežne žlezde, sarkom mekog tkiva, kancer uretera, kancer penisa, kancer prostate, hronična ili akutna leukemija, limfocitni limfomi, kancer mokraćne bešike, kancer bubrega ili uretera, karcinom bubrežnih ćelija, karcinom bubrežne čašice, neoplazme centralnog nervnog sistema (CNS), primarna CNS limfoma, tumori kičmene moždine, glioma stem ćelija mozga ili adenom hipofize.
  20. 20. Jedinjenje ili njegova farmaceutski prihvatljiva so za upotrebu u skladu sa patentnim zahtevom 19, naznačeno time što je kancer, kancer pluća, kancer glave ili vrata, kancer dojke, karcinom endometrijuma, karcinom grlića materice, kancer jednjaka ili kancer mokraćne bešike.
  21. 21. Jedinjenje ili njegova farmaceutski prihvatljiva so za upotrebu u skladu sa patentnim zahtevom 20, naznačeno time što je kancer, kancer pluća. Izdaje i štampa: Zavod za intelektualnu svojinu, Beograd, Kneginje Ljubice 5
RS20211156A 2016-06-06 2017-06-03 Supstituisani derivati karbonukleozida korisni kao antikancerogena sredstva RS62351B1 (sr)

Applications Claiming Priority (6)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US201662346226P 2016-06-06 2016-06-06
US201662376856P 2016-08-18 2016-08-18
US201662431714P 2016-12-08 2016-12-08
US201762506076P 2017-05-15 2017-05-15
PCT/IB2017/053295 WO2017212385A1 (en) 2016-06-06 2017-06-03 Substituted carbonucleoside derivatives useful as anticancer agents
EP17730948.1A EP3464249B1 (en) 2016-06-06 2017-06-03 Substituted carbonucleoside derivatives useful as anticancer agents

Publications (1)

Publication Number Publication Date
RS62351B1 true RS62351B1 (sr) 2021-10-29

Family

ID=59071035

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
RS20211156A RS62351B1 (sr) 2016-06-06 2017-06-03 Supstituisani derivati karbonukleozida korisni kao antikancerogena sredstva

Country Status (42)

Country Link
US (2) US10220037B2 (sr)
EP (1) EP3464249B1 (sr)
JP (2) JP6553825B2 (sr)
KR (2) KR102215313B1 (sr)
CN (1) CN109890797B (sr)
AU (2) AU2017279014B2 (sr)
BR (1) BR112018075166A2 (sr)
CA (1) CA2969295A1 (sr)
CL (1) CL2018003504A1 (sr)
CO (1) CO2018013105A2 (sr)
CR (1) CR20180578A (sr)
CU (1) CU24517B1 (sr)
CY (1) CY1124798T1 (sr)
DK (1) DK3464249T3 (sr)
DO (1) DOP2018000268A (sr)
EC (1) ECSP18090743A (sr)
ES (1) ES2890435T3 (sr)
GE (1) GEP20217211B (sr)
HR (1) HRP20211449T1 (sr)
HU (1) HUE056634T2 (sr)
IL (2) IL263505B (sr)
LT (1) LT3464249T (sr)
MA (1) MA45153B1 (sr)
MD (1) MD3464249T2 (sr)
MX (1) MX384948B (sr)
MY (1) MY196413A (sr)
NI (1) NI201800128A (sr)
PE (1) PE20190439A1 (sr)
PH (1) PH12018502535B1 (sr)
PL (1) PL3464249T3 (sr)
PT (1) PT3464249T (sr)
RS (1) RS62351B1 (sr)
RU (1) RU2712944C1 (sr)
SG (2) SG11201810485SA (sr)
SI (1) SI3464249T1 (sr)
SV (1) SV2018005794A (sr)
TN (1) TN2018000424A1 (sr)
TW (2) TWI667240B (sr)
UA (1) UA124386C2 (sr)
UY (1) UY37274A (sr)
WO (1) WO2017212385A1 (sr)
ZA (1) ZA201807723B (sr)

Families Citing this family (37)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2019084470A1 (en) * 2017-10-26 2019-05-02 Prelude Therapeutics, Incorporated SELECTIVE INHIBITORS OF THE PROTEIN ARGININE METHYLTRANSFERASE 5 (PRMT5)
JP2021505583A (ja) * 2017-12-05 2021-02-18 エンジェクス ファーマシューティカル インコーポレイテッド Pmrt5阻害剤としての複素環式化合物
CN108997309A (zh) * 2018-07-17 2018-12-14 中国科学技术大学苏州研究院 一种吡唑-4-芳基衍生物的制备方法
US12552826B2 (en) 2018-08-07 2026-02-17 Merck Sharp & Dohme Llc PRMT5 inhibitors
KR20210105955A (ko) * 2019-01-23 2021-08-27 화이자 인코포레이티드 공지된 테트라히드로이소퀴놀린 유도체의 모노포스페이트 수화물 염의 다형체 형태
IL318073A (en) 2019-03-25 2025-02-01 California Inst Of Techn PRMT5 inhibitors and their uses
MA55556A (fr) 2019-04-02 2022-02-09 Aligos Therapeutics Inc Composés ciblant prmt5
CN114126614A (zh) * 2019-05-30 2022-03-01 安杰斯制药公司 作为prmt5抑制剂的杂环化合物
HUE064493T2 (hu) 2019-06-10 2024-03-28 Lupin Ltd PRMT5 inhibitorok
CN114727993B (zh) * 2019-10-07 2025-11-14 D·E·萧尔研究有限责任公司 作为Kv1.3钾SHAKER通道阻断剂的芳基亚甲基杂环化合物
EP4069698A1 (en) * 2019-12-03 2022-10-12 Lupin Limited Substituted nucleoside analogs as prmt5 inhibitors
IL293351A (en) 2019-12-18 2022-07-01 Pfizer Once daily cancer treatment regimen with a prmt5 inhibitor
CN114929234A (zh) * 2020-01-07 2022-08-19 辉瑞公司 用于治疗银屑病及其他自体免疫性病况的方法中的prmt5抑制剂
CN111138355A (zh) * 2020-01-17 2020-05-12 成都睿智化学研究有限公司 一种甲醛取代的氮杂稠环类化合物的制备方法
CN115038690A (zh) 2020-01-31 2022-09-09 索尔维公司 用于制造卤代烷基取代的吡啶化合物的方法
US20220112194A1 (en) * 2020-04-01 2022-04-14 Aligos Therapeutics, Inc. Compounds targeting prmt5
US20230242539A1 (en) * 2020-07-15 2023-08-03 Pfizer Inc. Polymorphs of (1S,2S,3S,5R)-3-((6-(Difluoromethyl)-5-Fluoro-1,2,3,4-Tetrahydroisoquinolin-8-YL)OXY)-5-(4-Methyl-7H-Pyrrolo[2,3-D]Pyrimidin-7-YL)Cyclopentane-1,2-DIOL Mono-Hydrochloride
US20240116937A1 (en) 2020-07-15 2024-04-11 Pfizer Inc. Polymorph of (1S,2S,3S,5R)-3-((6-(difluoromethyl)-5-fluoro-1,2,3,4-tetrahydroisoquinolin-8-yl)oxy)-5-(4-methyl-7H-pyrrolo[2,3-D]pyrimidin-7-yl)cyclopentane-1,2-diol
WO2022153161A1 (en) 2021-01-14 2022-07-21 Pfizer Inc. Treatment of cancer using a prmt5 inhibitor
CN113234079B (zh) * 2021-04-30 2022-02-01 上海湃隆生物科技有限公司 用作prmt5抑制剂的核苷类似物
WO2024118943A2 (en) * 2022-11-30 2024-06-06 Ideaya Biosciences, Inc. Combination therapy comprising a mat2a inhibitor and a prmt5 inhibitor
WO2024170488A1 (en) 2023-02-13 2024-08-22 Astrazeneca Ab Prmt5 inhibitor for use in cancer therapy
TW202508595A (zh) 2023-05-04 2025-03-01 美商銳新醫藥公司 用於ras相關疾病或病症之組合療法
US20250049810A1 (en) 2023-08-07 2025-02-13 Revolution Medicines, Inc. Methods of treating a ras protein-related disease or disorder
AU2024360465A1 (en) 2023-10-12 2026-04-09 Revolution Medicines, Inc. Macrocyclic ras inhibitors
WO2025171296A1 (en) 2024-02-09 2025-08-14 Revolution Medicines, Inc. Ras inhibitors
TW202547461A (zh) 2024-05-17 2025-12-16 美商銳新醫藥公司 Ras抑制劑
WO2025255438A1 (en) 2024-06-07 2025-12-11 Revolution Medicines, Inc. Methods of treating a ras protein-related disease or disorder
WO2025265060A1 (en) 2024-06-21 2025-12-26 Revolution Medicines, Inc. Therapeutic compositions and methods for managing treatment-related effects
WO2026006747A1 (en) 2024-06-28 2026-01-02 Revolution Medicines, Inc. Ras inhibitors
WO2026008533A1 (en) 2024-07-01 2026-01-08 Janssen Pharmaceutica Nv Prmt5 inhibitors for treating adenomas
WO2026015796A1 (en) 2024-07-12 2026-01-15 Revolution Medicines, Inc. Methods of treating a ras related disease or disorder
WO2026015790A1 (en) 2024-07-12 2026-01-15 Revolution Medicines, Inc. Methods of treating a ras related disease or disorder
WO2026015825A1 (en) 2024-07-12 2026-01-15 Revolution Medicines, Inc. Use of ras inhibitor for treating pancreatic cancer
WO2026015801A1 (en) 2024-07-12 2026-01-15 Revolution Medicines, Inc. Methods of treating a ras related disease or disorder
WO2026050446A1 (en) 2024-08-29 2026-03-05 Revolution Medicines, Inc. Ras inhibitors
WO2026072904A2 (en) 2024-09-26 2026-04-02 Revolution Medicines, Inc. Compositions and methods for treating lung cancer

Family Cites Families (17)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
KR0166088B1 (ko) 1990-01-23 1999-01-15 . 수용해도가 증가된 시클로덱스트린 유도체 및 이의 용도
US5376645A (en) 1990-01-23 1994-12-27 University Of Kansas Derivatives of cyclodextrins exhibiting enhanced aqueous solubility and the use thereof
US6143749A (en) * 1995-06-07 2000-11-07 Abbott Laboratories Heterocyclic substituted cyclopentane compounds
GB9518953D0 (en) 1995-09-15 1995-11-15 Pfizer Ltd Pharmaceutical formulations
WO2000035296A1 (en) 1996-11-27 2000-06-22 Wm. Wrigley Jr. Company Improved release of medicament active agents from a chewing gum coating
GB9711643D0 (en) 1997-06-05 1997-07-30 Janssen Pharmaceutica Nv Glass thermoplastic systems
CA2434666A1 (en) 2001-02-22 2002-09-06 Celltech R&D Limited Phenylalanine enamide derivatives possessing a cyclobutene group, for use as integrin inhibitors
US20040043959A1 (en) * 2002-03-04 2004-03-04 Bloom Laura A. Combination therapies for treating methylthioadenosine phosphorylase deficient cells
EP1987717A1 (de) 2007-04-30 2008-11-05 Bayer CropScience AG Pyridoncarboxamide, diese enthaltende nutzpflanzenschützende Mittel und Verfahren zu ihrer Herstellung und deren Verwendung
WO2010100475A1 (en) 2009-03-02 2010-09-10 Astrazeneca Ab Hydroxamic acid derivatives as gram-negative antibacterial agents
CN103339132B (zh) * 2010-12-02 2017-02-15 株式会社麦迪帕克特 嘌呤基吡啶基氨基‑2,4‑二氟苯基磺酰胺衍生物、其药学上可接受的盐、其制备方法及包含其作为活性成分的对Raf激酶具有抑制活性的药物组合物
JP6182593B2 (ja) 2012-04-20 2017-08-16 アドヴィーナス セラピューティクス リミテッド 置換ヘテロ二環化合物、組成物及び医薬並びにそれらの用途
DK2935222T3 (en) 2012-12-21 2019-01-07 Epizyme Inc PRMT5 INHIBITORS AND APPLICATIONS THEREOF
WO2015013256A1 (en) 2013-07-22 2015-01-29 Baylor College Of Medicine Non-ribose containing inhibitors of histone methyltransferase dot1l for cancer treatment
US20170198006A1 (en) 2014-06-25 2017-07-13 Epizyme, Inc. Prmt5 inhibitors and uses thereof
KR102731877B1 (ko) * 2015-02-25 2024-11-21 아웃센스 다이아그나스틱스 엘티디. 신체 배출물 분석
TWI870767B (zh) * 2015-08-26 2025-01-21 比利時商健生藥品公司 使用作為prmt5抑制劑之新穎經6-6雙環芳香環取代之核苷類似物

Also Published As

Publication number Publication date
AU2019264640A1 (en) 2019-12-05
TWI667240B (zh) 2019-08-01
SG11201810485SA (en) 2018-12-28
PL3464249T3 (pl) 2021-12-20
CN109890797B (zh) 2023-02-28
US20170348313A1 (en) 2017-12-07
JP2019194231A (ja) 2019-11-07
TW201802074A (zh) 2018-01-16
LT3464249T (lt) 2021-10-11
US10220037B2 (en) 2019-03-05
BR112018075166A2 (pt) 2019-03-26
CN109890797A (zh) 2019-06-14
JP2019521100A (ja) 2019-07-25
NI201800128A (es) 2019-04-08
HUE056634T2 (hu) 2022-02-28
IL263505B (en) 2021-04-29
US20190111060A1 (en) 2019-04-18
CR20180578A (es) 2019-03-05
DOP2018000268A (es) 2019-01-31
MY196413A (en) 2023-03-29
EP3464249A1 (en) 2019-04-10
CY1124798T1 (el) 2022-11-25
NZ748652A (en) 2021-06-25
CU24517B1 (es) 2021-06-08
AU2017279014A1 (en) 2018-12-13
UA124386C2 (uk) 2021-09-08
CA2969295A1 (en) 2017-12-06
ZA201807723B (en) 2020-01-29
MX2018015094A (es) 2019-08-16
PE20190439A1 (es) 2019-03-27
GEP20217211B (en) 2021-01-25
IL263505A (en) 2019-01-31
SG10202100861TA (en) 2021-03-30
CO2018013105A2 (es) 2018-12-28
PH12018502535A1 (en) 2019-10-21
PH12018502535B1 (en) 2022-08-19
US10709709B2 (en) 2020-07-14
MA45153A (fr) 2021-04-07
DK3464249T3 (da) 2021-09-06
UY37274A (es) 2018-01-31
IL282167A (en) 2021-05-31
SI3464249T1 (sl) 2021-11-30
TN2018000424A1 (en) 2020-06-15
TWI637945B (zh) 2018-10-11
KR20210018529A (ko) 2021-02-17
RU2712944C1 (ru) 2020-02-03
HRP20211449T1 (hr) 2021-12-24
EP3464249B1 (en) 2021-08-11
MX384948B (es) 2025-03-11
AU2017279014B2 (en) 2019-08-15
MA45153B1 (fr) 2021-10-29
CL2018003504A1 (es) 2019-02-01
WO2017212385A1 (en) 2017-12-14
KR102215313B1 (ko) 2021-02-17
TW201840570A (zh) 2018-11-16
ES2890435T3 (es) 2022-01-19
JP6553825B2 (ja) 2019-07-31
SV2018005794A (es) 2019-03-19
ECSP18090743A (es) 2019-01-31
MD3464249T2 (ro) 2021-12-31
KR20190015745A (ko) 2019-02-14
CU20180144A7 (es) 2019-07-04
PT3464249T (pt) 2021-09-22

Similar Documents

Publication Publication Date Title
RS62351B1 (sr) Supstituisani derivati karbonukleozida korisni kao antikancerogena sredstva
AU2016225133B2 (en) Substituted nucleoside derivatives useful as anticancer agents
RU2478636C2 (ru) ПРОИЗВОДНЫЕ ИМИДАЗОПИРИДИН-2-ОНА, ОБЛАДАЮЩИЕ mTOR ИНГИБИРУЮЩЕЙ АКТИВНОСТЬЮ
WO2024040109A2 (en) Kras inhibitors
WO2019150305A1 (en) Substituted quinazoline and pyridopyrimidine derivatives useful as anticancer agents
EP4592289A1 (en) Novel prmt5 inhibitor and use thereof
MX2014003800A (es) Derivado de pirazoloquinolina.
EP4055013B1 (en) Wdr5 inhibitors and modulators
NZ748652B2 (en) Substituted carbonucleoside derivatives useful as anticancer agents
OA19125A (en) Substituted carbonucleoside derivatives useful as anticancer agents
OA18433A (en) Substituted nucleoside derivatives useful as anticancer agents
HK40008995A (en) Substituted carbonucleoside derivatives useful as anticancer agents
HK40008995B (en) Substituted carbonucleoside derivatives useful as anticancer agents