RU2012104245A

RU2012104245A - Альфатела для ингибирования проникновения вич

Info

Publication number: RU2012104245A
Application number: RU2012104245/10A
Authority: RU
Inventors: Йохан ДЕСМЕТ; Игнас ЛАСТЕРС; Софи ВАНВЕТСВИНКЕЛЬ
Original assignee: Компликс Нв
Priority date: 2009-07-08
Filing date: 2010-07-07
Publication date: 2013-08-20
Also published as: GB2471692A; US20120177676A1; GB0911890D0; RU2562165C2; BR112012000247A2; WO2011003936A1; EP2451826A1; CN102471372A

Abstract

1. Связывающая gp41 ВИЧ-1 одноцепочечная суперспираль, имеющая одиночную непрерывную аминокислотную цепь с формулой HRS1-L1-HRS2-L2-HRS3, по желанию дополненная N- и C-концевыми удлинениями, приводящими к формуле N-HRS1-L1-HRS2-L2-HRS3-C, в которойa) каждый из HRS1, HRS2 и HRS3 является независимой последовательностью гептадных повторов состоящей из от 2 до 7 блоков последовательных гептадных повторов, при этом по меньшей мере 50% всех гептадных позиций a и d заняты остатками изолейцина, и HRS1, HRS2 и HRS3 совместно составляют 3-нитевые альфа-спиральные суперспирализованные структуры;b) каждый из L1 и L2 независимо является линкерным фрагментом, ковалентно соединяющим HRS1 с HRS2 и HRS2 с HRS3, соответственно, начинающимся и заканчивающимся пролином или глицином, и состоящим из от 3 до 30 аминокислотных остатков, из которых по меньшей мере 50% выбраны из группы пролин, глицин, серин;c) N и С независимо являются необязательным удлинением, ковалентно присоединенным к N- и С-концам HRS1 и HRS3, соответственно, при этом это присоединение должно быть обозначено нарушающим спираль пролином или глицином.2. Одноцепочечная суперспираль по п.1, которая связывает внеклеточный домен gp41 ВИЧ-1, при этом указанный внеклеточный домен определяется как аминокислотные остатки от 1 до 683 SEQ ID NO:1.3. Одноцепочечная суперспираль по п.1, которая связывает HR1 фрагмент gp41 ВИЧ-1, при этом указанный HR1 фрагмент определяется как аминокислотные остатки от 546 до 581 SEQ ID NO:1, иликоторая связывает HR2 фрагмент gp41 ВИЧ-1, при этом указанный HR2 фрагмент определяется как аминокислотные остатки от 628 до 661 SEQ ID NO:1.4. Одноцепочечная суперспираль по п.1, которая связывает одновременно HR1 и HR2 фрагменты gp41 ВИЧ-1, при этом указанные

Claims

1. Связывающая gp41 ВИЧ-1 одноцепочечная суперспираль, имеющая одиночную непрерывную аминокислотную цепь с формулой HRS1-L1-HRS2-L2-HRS3, по желанию дополненная N- и C-концевыми удлинениями, приводящими к формуле N-HRS1-L1-HRS2-L2-HRS3-C, в которой

a) каждый из HRS1, HRS2 и HRS3 является независимой последовательностью гептадных повторов состоящей из от 2 до 7 блоков последовательных гептадных повторов, при этом по меньшей мере 50% всех гептадных позиций a и d заняты остатками изолейцина, и HRS1, HRS2 и HRS3 совместно составляют 3-нитевые альфа-спиральные суперспирализованные структуры;

b) каждый из L1 и L2 независимо является линкерным фрагментом, ковалентно соединяющим HRS1 с HRS2 и HRS2 с HRS3, соответственно, начинающимся и заканчивающимся пролином или глицином, и состоящим из от 3 до 30 аминокислотных остатков, из которых по меньшей мере 50% выбраны из группы пролин, глицин, серин;

c) N и С независимо являются необязательным удлинением, ковалентно присоединенным к N- и С-концам HRS1 и HRS3, соответственно, при этом это присоединение должно быть обозначено нарушающим спираль пролином или глицином.

2. Одноцепочечная суперспираль по п.1, которая связывает внеклеточный домен gp41 ВИЧ-1, при этом указанный внеклеточный домен определяется как аминокислотные остатки от 1 до 683 SEQ ID NO:1.

3. Одноцепочечная суперспираль по п.1, которая связывает HR1 фрагмент gp41 ВИЧ-1, при этом указанный HR1 фрагмент определяется как аминокислотные остатки от 546 до 581 SEQ ID NO:1, или

которая связывает HR2 фрагмент gp41 ВИЧ-1, при этом указанный HR2 фрагмент определяется как аминокислотные остатки от 628 до 661 SEQ ID NO:1.

4. Одноцепочечная суперспираль по п.1, которая связывает одновременно HR1 и HR2 фрагменты gp41 ВИЧ-1, при этом указанные HR1 и HR2 фрагменты определяются как аминокислотные остатки от 546 до 581 и от 628 до 661 SEQ ID NO:1, соответственно.

5. Одноцепочечная суперспираль по любому из пп.1-4, в которой связывание с gp41 ВИЧ-1 характеризуется константой диссоциации (Kd) или половиной максимальной эффективной концентрации (ЕС50) в субмикромолярных пределах.

6. Одноцепочечная суперспираль по п.1, в которой связывание с gp41 ВИЧ-1 ингибирует опосредованное env ВИЧ межклеточное слияние, характеризуемая половиной максимальной ингибирующей концентрации (IC50) в субмикромолярных пределах, или в которой связывание с gp41 ВИЧ-1 ингибирует проникновение вируса ВИЧ, характеризуемая половиной максимальной ингибирующей концентрации (IC50) в субмикромолярных пределах, или в которой связывание с gp41 ВИЧ-1 ингибирует вирусную репликацию ВИЧ, характеризуемая половиной максимальной ингибирующей концентрации (IC50) в субмикромолярных пределах.

7. Одноцепочечная суперспираль по п.1, в которой связывание с Gp41 ВИЧ-1 ингибирует ВИЧ-инфекцию клеток млекопитающих.

8. Одноцепочечная суперспираль по п.1, в которой связывание с gp41 ВИЧ-1 ингибирует ВИЧ-инфекцию человеческих клеток.

9. Способ идентификации химического соединения или молекулы, которая связывает одноцепочечную суперспираль по любому из пп.1-8 и ингибирует ВИЧ-инфекцию, содержащий следующее: воздействуют на представляющее интерес химическое соединение или молекулу указанной одноцепочечной суперспиралью, определяют связывание указанного представляющего интерес химического соединения или молекулы с упомянутой одноцепочечной суперспиралью, производят отбор указанного представляющего интерес химического соединения или молекулы, если связывание происходит, и оценивают ингибиторную активность по отношению к ВИЧ указанного отобранного представляющего интерес химического соединения или молекулы.

10. Способ идентификации химического соединения или молекулы, которая ингибирует ВИЧ-инфекцию, содержащий следующее: воздействуют на экспрессирующие env клетки одновременно одноцепочечной суперспиралью по любому из пп.1-8 и представляющим интерес химическим соединением или молекулой, определяют конкурентное связывание указанного представляющего интерес химического соединения или молекулы по отношению к указанной одноцепочечной суперспирали, отбирают указанное представляющее интерес химическое соединение или молекулу, если конкурентное связывание происходит, и оценивают ингибиторную активность по отношению к ВИЧ указанного отобранного представляющего интерес химического соединения или молекулы.

11. Фармацевтическая композиция, содержащая связывающую gp41 ВИЧ-1 одноцепочечную суперспираль по любому из пп.1-8 и фармацевтически приемлемый носитель.

12. Связывающая gp41 ВИЧ-1 одноцепочечная суперспираль по любому из пп.1-8 для применения при ингибировании ВИЧ-инфекции у индивидуума.

13. Одноцепочечная суперспираль по любому из пп.1-8 для применения при активации иммунного ответа по отношению к ВИЧ у индивидуума.

14. Связывающая gp4 ВИЧ-1 одноцепочечная суперспираль по любому из пп.1-8 для применения в качестве лекарственного средства или вакцины.

15. Связывающая gp4 ВИЧ-1 одноцепочечная суперспираль по любому из пп.1-8 для применения при лечении или предотвращении ВИЧ-инфекции.

16. Связывающая gp4 ВИЧ-1 одноцепочечная суперспираль по любому из пп.1-8 для применения в способе диагностирования ВИЧ-инфекции.

17. Молекула нуклеиновой кислоты, кодирующая аминокислотную последовательность связывающей gp41 ВИЧ-1 одноцепочечной суперспирали по любому из пп.1-8.

18. Клетка хозяина, содержащая молекулу нуклеиновой кислоты по п.17.