RU2012135751A - Способ определения генотипов золотистого стафилококка - Google Patents
Способ определения генотипов золотистого стафилококка Download PDFInfo
- Publication number
- RU2012135751A RU2012135751A RU2012135751/10A RU2012135751A RU2012135751A RU 2012135751 A RU2012135751 A RU 2012135751A RU 2012135751/10 A RU2012135751/10 A RU 2012135751/10A RU 2012135751 A RU2012135751 A RU 2012135751A RU 2012135751 A RU2012135751 A RU 2012135751A
- Authority
- RU
- Russia
- Prior art keywords
- gene
- genotypes
- meca
- staphylococcus aureus
- nuc
- Prior art date
Links
- 238000000034 method Methods 0.000 title claims abstract 3
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 claims abstract 12
- 241000191967 Staphylococcus aureus Species 0.000 claims abstract 7
- 230000003321 amplification Effects 0.000 claims abstract 6
- 238000003199 nucleic acid amplification method Methods 0.000 claims abstract 6
- RJQXTJLFIWVMTO-TYNCELHUSA-N Methicillin Chemical compound COC1=CC=CC(OC)=C1C(=O)N[C@@H]1C(=O)N2[C@@H](C(O)=O)C(C)(C)S[C@@H]21 RJQXTJLFIWVMTO-TYNCELHUSA-N 0.000 claims abstract 4
- 229960003085 meticillin Drugs 0.000 claims abstract 4
- 244000005700 microbiome Species 0.000 claims abstract 4
- 238000003752 polymerase chain reaction Methods 0.000 claims abstract 4
- 108010014603 Leukocidins Proteins 0.000 claims abstract 2
- 108010059724 Micrococcal Nuclease Proteins 0.000 claims abstract 2
- 101100241454 Neurospora crassa (strain ATCC 24698 / 74-OR23-1A / CBS 708.71 / DSM 1257 / FGSC 987) nuc-2 gene Proteins 0.000 claims abstract 2
- 206010040070 Septic Shock Diseases 0.000 claims abstract 2
- 206010044248 Toxic shock syndrome Diseases 0.000 claims abstract 2
- 231100000650 Toxic shock syndrome Toxicity 0.000 claims abstract 2
- 238000000246 agarose gel electrophoresis Methods 0.000 claims abstract 2
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 claims abstract 2
- 230000000295 complement effect Effects 0.000 claims abstract 2
- 238000001514 detection method Methods 0.000 claims abstract 2
- 238000002955 isolation Methods 0.000 claims abstract 2
- 238000007403 mPCR Methods 0.000 claims abstract 2
- 235000015097 nutrients Nutrition 0.000 claims abstract 2
- 244000052769 pathogen Species 0.000 claims abstract 2
- 230000001717 pathogenic effect Effects 0.000 claims abstract 2
- 239000007787 solid Substances 0.000 claims abstract 2
- 230000001018 virulence Effects 0.000 claims abstract 2
- 101150116444 TST gene Proteins 0.000 claims 3
- 101150008979 mecA gene Proteins 0.000 claims 1
- 230000002068 genetic effect Effects 0.000 abstract 1
- PCHJSUWPFVWCPO-UHFFFAOYSA-N gold Chemical compound [Au] PCHJSUWPFVWCPO-UHFFFAOYSA-N 0.000 abstract 1
- 239000010931 gold Substances 0.000 abstract 1
- 229910052737 gold Inorganic materials 0.000 abstract 1
Landscapes
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
Abstract
Способ определения генотипов золотистого стафилококка, включающий получение чистой культуры микроорганизмов на плотной питательной среде, выделение и амплификацию ДНК возбудителя с помощью полимеразной цепной реакции (ПЦР) с последующей детекцией результатов методом электрофореза в агарозном геле, отличающийся тем, что используют мультиплексную ПЦР с четырьмя парами праймеров:nuc 1 5'-GCGATTGATGGTGATACGGT-3',nuc 2 5'-AGCCAAGCCTTGACGAACTAAAGC-3,luk-PV-1 5'-ATCATTAGGTAAAATGTCTGGACATGATCCA-3',luk-PV-2 5'-GCATCAAGTGTATTGGATAGCAAAAGC-3',mecA - 1 5'-ACTGCTATCCACCCTCAAAC-3',mecA - 2 5'-CTGGTGAAGTTGTAATCTGG-3',tsst1f- 5'-ACCACCCGTTTTATCGCTTGAACG-3',tsst1r - 5'-AGCCCTTTGTTGCTTGCGACA-3', комплементарных к участкам гена внеклеточной термонуклеазы (), гена лейкоцидина Пантона-Валлентайна (), гена белка токсического шока () и гена устойчивости к метициллину (), и генетические группы (генотипы) золотистого стафилококка определяют по наличию или отсутствию генов вирулентностиии гена устойчивости к метициллинуили их сочетаний, причем ДНК микроорганизма идентифицируют как ДНК золотистого стафилококка при образовании в результате амплификации продукта размером 279 пар оснований, соответствующего генуа генотипы золотистого стафилококка дифференцируют по наличию одного или нескольких специфических продуктов амплификации: для гена- в размере 163 пар оснований, для гена433 пар оснований, для гена- в размере 540 пар оснований.
Claims (1)
- Способ определения генотипов золотистого стафилококка, включающий получение чистой культуры микроорганизмов на плотной питательной среде, выделение и амплификацию ДНК возбудителя с помощью полимеразной цепной реакции (ПЦР) с последующей детекцией результатов методом электрофореза в агарозном геле, отличающийся тем, что используют мультиплексную ПЦР с четырьмя парами праймеров:nuc 1 5'-GCGATTGATGGTGATACGGT-3',nuc 2 5'-AGCCAAGCCTTGACGAACTAAAGC-3,luk-PV-1 5'-ATCATTAGGTAAAATGTCTGGACATGATCCA-3',luk-PV-2 5'-GCATCAAGTGTATTGGATAGCAAAAGC-3',mecA - 1 5'-ACTGCTATCCACCCTCAAAC-3',mecA - 2 5'-CTGGTGAAGTTGTAATCTGG-3',tsst1f - 5'-ACCACCCGTTTTATCGCTTGAACG-3',tsst1r - 5'-AGCCCTTTGTTGCTTGCGACA-3', комплементарных к участкам гена внеклеточной термонуклеазы (nuc), гена лейкоцидина Пантона-Валлентайна (pvl), гена белка токсического шока (tst) и гена устойчивости к метициллину (mecA), и генетические группы (генотипы) золотистого стафилококка определяют по наличию или отсутствию генов вирулентности pvl и tst и гена устойчивости к метициллину mecA или их сочетаний, причем ДНК микроорганизма идентифицируют как ДНК золотистого стафилококка при образовании в результате амплификации продукта размером 279 пар оснований, соответствующего гену nuc, а генотипы золотистого стафилококка дифференцируют по наличию одного или нескольких специфических продуктов амплификации: для гена mecA - в размере 163 пар оснований, для гена pvl - 433 пар оснований, для гена tst - в размере 540 пар оснований.
Priority Applications (1)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| RU2012135751/10A RU2526497C2 (ru) | 2012-10-31 | 2012-10-31 | Способ определения генотипов золотистого стафилококка |
Applications Claiming Priority (1)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| RU2012135751/10A RU2526497C2 (ru) | 2012-10-31 | 2012-10-31 | Способ определения генотипов золотистого стафилококка |
Publications (2)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| RU2012135751A true RU2012135751A (ru) | 2014-05-10 |
| RU2526497C2 RU2526497C2 (ru) | 2014-08-20 |
Family
ID=50629115
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| RU2012135751/10A RU2526497C2 (ru) | 2012-10-31 | 2012-10-31 | Способ определения генотипов золотистого стафилококка |
Country Status (1)
| Country | Link |
|---|---|
| RU (1) | RU2526497C2 (ru) |
Cited By (1)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| EP3696268A4 (en) * | 2017-10-12 | 2021-06-30 | Mitsui Chemicals, Inc. | PAIR OF mecA GENE AMPLIFICATION PRIMERS, mecA GENE DETECTION KIT AND mecA GENE DETECTION PROCESS |
Families Citing this family (1)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| RU2755690C1 (ru) * | 2021-01-13 | 2021-09-20 | федеральное государственное бюджетное учреждение "Национальный медицинский исследовательский центр имени В.А. Алмазова" Министерства здравоохранения Российской Федерации | Способ детекции генов метициллин-резистентности mecA и mecC у стафилококков |
Family Cites Families (1)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| AT410798B (de) * | 2001-01-26 | 2003-07-25 | Cistem Biotechnologies Gmbh | Verfahren zur identifizierung, isolierung und herstellung von antigenen gegen ein spezifisches pathogen |
-
2012
- 2012-10-31 RU RU2012135751/10A patent/RU2526497C2/ru active IP Right Revival
Cited By (1)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| EP3696268A4 (en) * | 2017-10-12 | 2021-06-30 | Mitsui Chemicals, Inc. | PAIR OF mecA GENE AMPLIFICATION PRIMERS, mecA GENE DETECTION KIT AND mecA GENE DETECTION PROCESS |
Also Published As
| Publication number | Publication date |
|---|---|
| RU2526497C2 (ru) | 2014-08-20 |
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| Wang et al. | Specific and rapid detection of foodborne Salmonella by loop-mediated isothermal amplification method | |
| Burley et al. | CRISPR-Cas, a prokaryotic adaptive immune system, in endodontic, oral, and multidrug-resistant hospital-acquired Enterococcus faecalis | |
| Martins et al. | Characteristics of resistance and virulence factors in different species of coagulase-negative staphylococci isolated from milk of healthy sheep and animals with subclinical mastitis | |
| Salasia et al. | Genotypic characterization of Staphylococcus aureus isolated from bovines, humans, and food in Indonesia | |
| Ezeokoli et al. | PCR-denaturing gradient gel electrophoresis analysis of microbial community in soy-daddawa, a Nigerian fermented soybean (Glycine max (L.) Merr.) condiment | |
| JP2012528567A5 (ru) | ||
| Liu et al. | Development of DNAzyme-based PCR signal cascade amplification for visual detection of Listeria monocytogenes in food | |
| RU2012135751A (ru) | Способ определения генотипов золотистого стафилококка | |
| WO2014102761A8 (es) | Cebadores para detección y tipificación de cepas bacterianas productoras de carbapenemasas, kit y método de detección | |
| CN103409549A (zh) | 枯草芽孢杆菌pcr检测、鉴定特异引物对 | |
| RU2011141514A (ru) | Олигонуклеотиды и способ определения днк бактерий, относящихся к семейству chlamydiaceae | |
| CN104611459A (zh) | 一种一次性卫生用品中5种常见致病菌多重pcr快速检测的试剂盒及检测方法 | |
| Badr et al. | Isolation and molecular identification of two novel cyanobacterial isolates obtained from a stressed aquatic system | |
| RU2552611C2 (ru) | Способ подвидовой дифференциации штаммов возбудителя чумы методом полимеразной цепной реакции | |
| RU2404256C1 (ru) | Способ подвидовой дифференциации штаммов возбудителя чумы методом секвенирования | |
| RU2425891C1 (ru) | Способ дифференциации штаммов возбудителя чумы основного и неосновных подвидов и возбудителя псевдотуберкулеза методом полимеразной цепной реакции | |
| RU2478713C1 (ru) | ОЛИГОНУКЛЕОТИДНЫЕ ПРАЙМЕРЫ BmVAT7-Ch2s/BmVAT7-Ch2as ДЛЯ ОБНАРУЖЕНИЯ ФРАГМЕНТА ДИФФЕРЕНЦИАЦИИ ВМАА0871 ШТАММОВ ВОЗБУДИТЕЛЯ САПА | |
| Drais et al. | Antimicrobial resistance and plasmid profile of Vibrio alginolyticus isolated from Malaysian seawater | |
| Hasap et al. | Multiplex-direct PCR assay for foodborne pathogen identification: An application in forensic investigation | |
| RU2474619C1 (ru) | ОЛИГОНУКЛЕОТИДНЫЕ ПРАЙМЕРЫ ДЛЯ ГЕНОТИПИРОВАНИЯ B. mallei МЕТОДОМ ПОЛИМЕРАЗНОЙ ЦЕПНОЙ РЕАКЦИИ | |
| ATE438849T1 (de) | Verfahren zur detektion von staphylococcus epidermidis | |
| RU2684231C1 (ru) | СПОСОБ ДИФФЕРЕНЦИАЦИИ ШТАММОВ Yersinia pestis СРЕДНЕВЕКОВОГО БИОВАРА ПО ФИЛОГЕНЕТИЧЕСКОЙ ПРИНАДЛЕЖНОСТИ МЕТОДОМ ПЦР С ЭЛЕКТРОФОРЕТИЧЕСКИМ УЧЕТОМ РЕЗУЛЬТАТОВ | |
| RU2474615C1 (ru) | ОЛИГОНУКЛЕОТИДНЫЕ ПРАЙМЕРЫ ДЛЯ ГЕНОТИПИРОВАНИЯ B. mallei МЕТОДОМ ПОЛИМЕРАЗНОЙ ЦЕПНОЙ РЕАКЦИИ | |
| Zoolkifli et al. | Molecular typing among beef isolates of Escherichia coli using consensus repetitive intergenic enterobacteria-polymerase chain reaction (ERIC-PCR) | |
| RU2474618C1 (ru) | ОЛИГОНУКЛЕОТИДНЫЕ ПРАЙМЕРЫ ДЛЯ ГЕНОТИПИРОВАНИЯ B. mallei МЕТОДОМ ПОЛИМЕРАЗНОЙ ЦЕПНОЙ РЕАКЦИИ |
Legal Events
| Date | Code | Title | Description |
|---|---|---|---|
| MM4A | The patent is invalid due to non-payment of fees |
Effective date: 20141101 |
|
| NF4A | Reinstatement of patent |
Effective date: 20170502 |
|
| PD4A | Correction of name of patent owner | ||
| QB4A | Licence on use of patent |
Free format text: LICENCE FORMERLY AGREED ON 20191015 Effective date: 20191015 |