RU2013146377A - СПОСОБ ПОЛУЧЕНИЯ ИЗОПРЕНА С ИСПОЛЬЗОВАНИЕМ БАКТЕРИИ РОДА Bacillus - Google Patents
СПОСОБ ПОЛУЧЕНИЯ ИЗОПРЕНА С ИСПОЛЬЗОВАНИЕМ БАКТЕРИИ РОДА Bacillus Download PDFInfo
- Publication number
- RU2013146377A RU2013146377A RU2013146377/10A RU2013146377A RU2013146377A RU 2013146377 A RU2013146377 A RU 2013146377A RU 2013146377/10 A RU2013146377/10 A RU 2013146377/10A RU 2013146377 A RU2013146377 A RU 2013146377A RU 2013146377 A RU2013146377 A RU 2013146377A
- Authority
- RU
- Russia
- Prior art keywords
- seq
- amino acid
- bacterium
- protein
- less
- Prior art date
Links
- 241000894006 Bacteria Species 0.000 title claims 17
- RRHGJUQNOFWUDK-UHFFFAOYSA-N Isoprene Chemical compound CC(=C)C=C RRHGJUQNOFWUDK-UHFFFAOYSA-N 0.000 title claims 16
- 241000193830 Bacillus <bacterium> Species 0.000 title claims 4
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 title claims 2
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 claims abstract 22
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 claims abstract 22
- 125000003275 alpha amino acid group Chemical group 0.000 claims abstract 20
- 108090000790 Enzymes Proteins 0.000 claims abstract 12
- 102000004190 Enzymes Human genes 0.000 claims abstract 12
- FWMNVWWHGCHHJJ-SKKKGAJSSA-N 4-amino-1-[(2r)-6-amino-2-[[(2r)-2-[[(2r)-2-[[(2r)-2-amino-3-phenylpropanoyl]amino]-3-phenylpropanoyl]amino]-4-methylpentanoyl]amino]hexanoyl]piperidine-4-carboxylic acid Chemical compound C([C@H](C(=O)N[C@H](CC(C)C)C(=O)N[C@H](CCCCN)C(=O)N1CCC(N)(CC1)C(O)=O)NC(=O)[C@H](N)CC=1C=CC=CC=1)C1=CC=CC=C1 FWMNVWWHGCHHJJ-SKKKGAJSSA-N 0.000 claims abstract 8
- 230000000694 effects Effects 0.000 claims abstract 8
- 108010037727 trans-hexaprenyltranstransferase Proteins 0.000 claims abstract 8
- 230000002194 synthesizing effect Effects 0.000 claims abstract 6
- 125000000539 amino acid group Chemical group 0.000 claims abstract 4
- 238000003780 insertion Methods 0.000 claims abstract 4
- 230000037431 insertion Effects 0.000 claims abstract 4
- 238000006467 substitution reaction Methods 0.000 claims abstract 4
- 238000012217 deletion Methods 0.000 claims abstract 2
- 230000037430 deletion Effects 0.000 claims abstract 2
- 239000002773 nucleotide Substances 0.000 claims 6
- 125000003729 nucleotide group Chemical group 0.000 claims 6
- 101150107613 hepS gene Proteins 0.000 claims 4
- 101150051569 hepT gene Proteins 0.000 claims 4
- 244000063299 Bacillus subtilis Species 0.000 claims 3
- 101100268004 Bacillus subtilis (strain 168) yutE gene Proteins 0.000 claims 3
- 235000014469 Bacillus subtilis Nutrition 0.000 claims 2
- 230000014509 gene expression Effects 0.000 claims 2
- 230000002068 genetic effect Effects 0.000 claims 2
- 238000000034 method Methods 0.000 claims 1
- 235000015097 nutrients Nutrition 0.000 claims 1
- 230000002018 overexpression Effects 0.000 claims 1
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Y—ENZYMES
- C12Y205/00—Transferases transferring alkyl or aryl groups, other than methyl groups (2.5)
- C12Y205/01—Transferases transferring alkyl or aryl groups, other than methyl groups (2.5) transferring alkyl or aryl groups, other than methyl groups (2.5.1)
- C12Y205/0103—Heptaprenyl diphosphate synthase (2.5.1.30)
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C08—ORGANIC MACROMOLECULAR COMPOUNDS; THEIR PREPARATION OR CHEMICAL WORKING-UP; COMPOSITIONS BASED THEREON
- C08F—MACROMOLECULAR COMPOUNDS OBTAINED BY REACTIONS ONLY INVOLVING CARBON-TO-CARBON UNSATURATED BONDS
- C08F36/00—Homopolymers and copolymers of compounds having one or more unsaturated aliphatic radicals, at least one having two or more carbon-to-carbon double bonds
- C08F36/02—Homopolymers and copolymers of compounds having one or more unsaturated aliphatic radicals, at least one having two or more carbon-to-carbon double bonds the radical having only two carbon-to-carbon double bonds
- C08F36/04—Homopolymers and copolymers of compounds having one or more unsaturated aliphatic radicals, at least one having two or more carbon-to-carbon double bonds the radical having only two carbon-to-carbon double bonds conjugated
- C08F36/08—Isoprene
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C08—ORGANIC MACROMOLECULAR COMPOUNDS; THEIR PREPARATION OR CHEMICAL WORKING-UP; COMPOSITIONS BASED THEREON
- C08L—COMPOSITIONS OF MACROMOLECULAR COMPOUNDS
- C08L21/00—Compositions of unspecified rubbers
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
- C12N9/10—Transferases (2.)
- C12N9/1085—Transferases (2.) transferring alkyl or aryl groups other than methyl groups (2.5)
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12P—FERMENTATION OR ENZYME-USING PROCESSES TO SYNTHESISE A DESIRED CHEMICAL COMPOUND OR COMPOSITION OR TO SEPARATE OPTICAL ISOMERS FROM A RACEMIC MIXTURE
- C12P5/00—Preparation of hydrocarbons or halogenated hydrocarbons
- C12P5/007—Preparation of hydrocarbons or halogenated hydrocarbons containing one or more isoprene units, i.e. terpenes
Landscapes
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Zoology (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Polymers & Plastics (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- General Chemical & Material Sciences (AREA)
- Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
- Enzymes And Modification Thereof (AREA)
- Preparation Of Compounds By Using Micro-Organisms (AREA)
Abstract
1. Фермент, содержащий комбинацию указанных далее (А) и (В):(A) белок, имеющий аминокислотную последовательность SEQ ID NO:2; или белок, имеющий аминокислотную последовательность SEQ ID NO:2, но который содержит замену, делению, вставку и/или добавление одного или нескольких аминокислотных остатков и имеет активность гептапренилдифосфатсинтазы с белком (В); или белок, имеющий аминокислотную последовательность SEQ ID NO:2, но который имеет идентичность аминокислотной последовательности не менее чем 50%, не менее чем 55%, не менее чем 60%, не менее чем 65%, не менее чем 70%, не менее чем 75%, не менее чем 80%, не менее чем 85%, не менее чем 90%, не менее чем 95% или не менее чем 98% по отношению к целой аминокислотной последовательности, представленной в SEQ ID NO:2, и имеющий активность гептапренилдифосфатсинтазы с белком (В); и(B) белок, имеющий аминокислотную последовательность SEQ ID NO:4; или белок, имеющий аминокислотную последовательность SEQ ID NO:4, но который содержит замену, делецию, вставку и/или добавление одного или нескольких аминокислотных остатков и имеет активность гептапренилдифосфатсинтазы с белком (А); или белок, имеющий аминокислотную последовательность SEQ ID NO:4, но который имеет идентичность аминокислотной последовательности не менее чем 50%, не менее чем 55%, не менее чем 60%, не менее чем 65%, не менее чем 70%, не менее чем 75%, не менее чем 80%, не менее чем 85%, не менее чем 90%, не менее чем 95% или не менее чем 98% по отношению к целой аминокислотной последовательности, представленной в SEQ ID NO:4, и имеющий активность гептапренилдифосфатсинтазы с белком (А); отличающийся тем, что указанный фермент имеет изопренсинтезирующую активность.2. Фермент по п.1, отличающийся т�
Claims (14)
1. Фермент, содержащий комбинацию указанных далее (А) и (В):
(A) белок, имеющий аминокислотную последовательность SEQ ID NO:2; или белок, имеющий аминокислотную последовательность SEQ ID NO:2, но который содержит замену, делению, вставку и/или добавление одного или нескольких аминокислотных остатков и имеет активность гептапренилдифосфатсинтазы с белком (В); или белок, имеющий аминокислотную последовательность SEQ ID NO:2, но который имеет идентичность аминокислотной последовательности не менее чем 50%, не менее чем 55%, не менее чем 60%, не менее чем 65%, не менее чем 70%, не менее чем 75%, не менее чем 80%, не менее чем 85%, не менее чем 90%, не менее чем 95% или не менее чем 98% по отношению к целой аминокислотной последовательности, представленной в SEQ ID NO:2, и имеющий активность гептапренилдифосфатсинтазы с белком (В); и
(B) белок, имеющий аминокислотную последовательность SEQ ID NO:4; или белок, имеющий аминокислотную последовательность SEQ ID NO:4, но который содержит замену, делецию, вставку и/или добавление одного или нескольких аминокислотных остатков и имеет активность гептапренилдифосфатсинтазы с белком (А); или белок, имеющий аминокислотную последовательность SEQ ID NO:4, но который имеет идентичность аминокислотной последовательности не менее чем 50%, не менее чем 55%, не менее чем 60%, не менее чем 65%, не менее чем 70%, не менее чем 75%, не менее чем 80%, не менее чем 85%, не менее чем 90%, не менее чем 95% или не менее чем 98% по отношению к целой аминокислотной последовательности, представленной в SEQ ID NO:4, и имеющий активность гептапренилдифосфатсинтазы с белком (А); отличающийся тем, что указанный фермент имеет изопренсинтезирующую активность.
2. Фермент по п.1, отличающийся тем, что указанный фермент из бактерии, принадлежащей к роду Bacillus.
3. Фермент по п.2, отличающийся тем, что указанный фермент из бактерии, принадлежащей к виду Bacillus subtilis.
4. ДНК, кодирующая фермент по любому из пп.1-3, имеющий изопренсинтезирующую активность.
5. ДНК по п.4, отличающаяся тем, что указанная ДНК содержит комбинацию указанных далее (С) и (D):
(C) ген hepS, кодируемый нуклеотидной последовательностью SEQ ID NO:1; или вариант нуклеотидной последовательности SEQ ID NO:1, кодирующий белок как определено в предшествующем (А); или вариант нуклеотидной последовательности SEQ ID NO:1 вследствие вырожденности генетического кода; и
(D) ген hepT, кодируемый нуклеотидной последовательностью SEQ ID NO:3; или вариант нуклеотидной последовательности SEQ ID NO:3, кодирующий белок как определено в предшествующем (В); или вариант нуклеотидной последовательности SEQ ID NO:3 вследствие вырожденности генетического кода.
6. Бактерия-продуцент изопрена рода Bacillus, отличающаяся тем, что указанная бактерия модифицирована таким образом, что ДНК по любому из пп.4 или 5 сверхэкспрессирована.
7. Бактерия по п.6, отличающаяся тем, что указанная бактерия модифицирована таким образом, что гены hepS и hepT сверхэкспрессированы.
8. Бактерия по п.6, отличающаяся тем, что указанная ДНК сверхэкспрессирована увеличением числа копий этой ДНК или модификацией последовательности, контролирующей экспрессию указанной ДНК, так что экспрессия указанной ДНК повышена по сравнению с немодифицированной бактерией.
9. Бактерия по любому из пп.6-8, отличающаяся тем, что указанная бактерия есть Bacillus subtilis.
10. Бактерия-продуцент изопрена рода Bacillus, отличающаяся тем, что указанная бактерия модифицирована таким образом, что изопренсинтезирующая активность фермента по любому из пп.1-3 повышена.
11. Бактерия по п.10, отличающаяся тем, что указанная бактерия модифицирована таким образом, что изопренсинтезирующая активность фермента, кодируемого генами hepS и hepT, повышена.
12. Бактерия по п.11, отличающаяся тем, что указанная изопренсинтезирующая активность повышена сверхэкспрессией генов hepS и hepT.
13. Бактерия по любому из пп.10-12, отличающаяся тем, что указанная бактерия есть Bacillus subtilis.
14. Способ получения изопрена, включающий:
(i) выращивание бактерии по любому из пп.6-13 в питательной среде для продукции указанного изопрена; и
(ii) выделение указанного изопрена из среды.
Priority Applications (2)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| RU2013146377/10A RU2013146377A (ru) | 2013-10-17 | 2013-10-17 | СПОСОБ ПОЛУЧЕНИЯ ИЗОПРЕНА С ИСПОЛЬЗОВАНИЕМ БАКТЕРИИ РОДА Bacillus |
| PCT/JP2014/078280 WO2015056813A1 (en) | 2013-10-17 | 2014-10-17 | Method for producing isoprene using bacterium |
Applications Claiming Priority (1)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| RU2013146377/10A RU2013146377A (ru) | 2013-10-17 | 2013-10-17 | СПОСОБ ПОЛУЧЕНИЯ ИЗОПРЕНА С ИСПОЛЬЗОВАНИЕМ БАКТЕРИИ РОДА Bacillus |
Publications (1)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| RU2013146377A true RU2013146377A (ru) | 2015-04-27 |
Family
ID=51871255
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| RU2013146377/10A RU2013146377A (ru) | 2013-10-17 | 2013-10-17 | СПОСОБ ПОЛУЧЕНИЯ ИЗОПРЕНА С ИСПОЛЬЗОВАНИЕМ БАКТЕРИИ РОДА Bacillus |
Country Status (2)
| Country | Link |
|---|---|
| RU (1) | RU2013146377A (ru) |
| WO (1) | WO2015056813A1 (ru) |
Cited By (1)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| CN110702821A (zh) * | 2019-11-26 | 2020-01-17 | 四川大学华西医院 | 一种慢性阻塞性肺疾病分型检测试剂盒 |
Families Citing this family (2)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| CN107418910B (zh) * | 2017-05-05 | 2020-08-25 | 昆明理工大学 | 一种防治十字花科作物根肿病的生物制剂及其应用 |
| EP3861109A1 (en) | 2018-10-05 | 2021-08-11 | Ajinomoto Co., Inc. | Method for producing target substance by bacterial fermentation |
Family Cites Families (16)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| FR2627508B1 (fr) | 1988-02-22 | 1990-10-05 | Eurolysine | Procede pour l'integration d'un gene choisi sur le chromosome d'une bacterie et bacterie obtenue par ledit procede |
| US5849970A (en) | 1995-06-23 | 1998-12-15 | The Regents Of The University Of Colorado | Materials and methods for the bacterial production of isoprene |
| JP5035871B2 (ja) | 2005-09-16 | 2012-09-26 | 株式会社ブリヂストン | パラゴムノキのプレニルトランスフェラーゼの遺伝子群 |
| WO2007037460A1 (en) | 2005-09-27 | 2007-04-05 | Ajinomoto Co., Inc. | An l-amino acid-producing bacterium and a method for producing l-amino acids |
| RU2418069C2 (ru) | 2006-09-29 | 2011-05-10 | Закрытое акционерное общество "Научно-исследовательский институт Аджиномото-Генетика" (ЗАО АГРИ) | Способ конструирования рекомбинантных бактерий, принадлежащих к роду pantoea, и способ продукции l-аминокислот с использованием бактерий, принадлежащих к роду pantoea |
| JP5540504B2 (ja) | 2007-01-22 | 2014-07-02 | 味の素株式会社 | Ｌ−アミノ酸を生産する微生物及びｌ−アミノ酸の製造法 |
| AU2008334945C1 (en) | 2007-12-13 | 2013-09-05 | Danisco Us Inc. | Compositions and methods for producing isoprene |
| JP5488467B2 (ja) | 2008-09-05 | 2014-05-14 | 味の素株式会社 | Ｌ−アミノ酸生産菌及びｌ−アミノ酸の製造法 |
| EP2336347B1 (en) | 2008-09-08 | 2017-03-15 | Ajinomoto Co., Inc. | An l-amino acid-producing microorganism and a method for producing an l-amino acid |
| CA2737158A1 (en) | 2008-09-15 | 2010-03-18 | Danisco Us Inc. | Increased isoprene production using the archaeal lower mevalonate pathway |
| RU2010101135A (ru) | 2010-01-15 | 2011-07-20 | Закрытое акционерное общество "Научно-исследовательский институт "Аджиномото-Генетика" (ЗАО АГРИ) (RU) | Бактерия семейства enterobacteriaceae - продуцент l-аспартата или метаболитов, производных l-аспартата, и способ получения l-аспартата или метаболитов, производных l-аспартата |
| DE102010001832A1 (de) * | 2010-02-11 | 2011-08-11 | Wacker Chemie AG, 81737 | Verfahren zur fermentativen Herstellung von Menachinon-7 mit Escherichia coli |
| BR112013027555A2 (pt) | 2011-04-29 | 2021-08-10 | Danisco Us Inc. | células recombinantes capazes de maior produção de isopreno, mevalonato e isoprenoides e método para produzir isopreno, mevalonato e isoprenoides |
| US8962296B2 (en) | 2012-05-30 | 2015-02-24 | Bridgestone Corporation | Isoprene synthase and gene encoding the same, and method for producing isoprene monomer |
| WO2013179722A1 (ja) | 2012-05-30 | 2013-12-05 | 株式会社ブリヂストン | イソプレンシンターゼおよびそれをコードするポリヌクレオチド、ならびにイソプレンモノマーの製造方法 |
| US20130323820A1 (en) * | 2012-06-01 | 2013-12-05 | Lanzatech New Zealand Limited | Recombinant microorganisms and uses therefor |
-
2013
- 2013-10-17 RU RU2013146377/10A patent/RU2013146377A/ru not_active Application Discontinuation
-
2014
- 2014-10-17 WO PCT/JP2014/078280 patent/WO2015056813A1/en not_active Ceased
Cited By (2)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| CN110702821A (zh) * | 2019-11-26 | 2020-01-17 | 四川大学华西医院 | 一种慢性阻塞性肺疾病分型检测试剂盒 |
| CN110702821B (zh) * | 2019-11-26 | 2022-06-07 | 四川大学华西医院 | 一种慢性阻塞性肺疾病分型检测试剂盒 |
Also Published As
| Publication number | Publication date |
|---|---|
| WO2015056813A1 (en) | 2015-04-23 |
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| RU2014132203A (ru) | НОВЫЕ ФЕРМЕНТЫ МЕТАНОЛДЕГИДРОГЕНАЗЫ ИЗ Bacillus | |
| RU2022103603A (ru) | Направляемые нуклеиновыми кислотами нуклеазы | |
| PH12017502281A1 (en) | Thermostable cas9 nucleases | |
| RU2011108196A (ru) | СПОСОБ ПОЛУЧЕНИЯ ПИРРОЛОХИНОЛИНОХИНОНА (PQQ) С ИСПОЛЬЗОВАНИЕМ БАКТЕРИИ РОДА Methylobacterium ИЛИ Hyphomicrobium | |
| NZ596231A (en) | Manipulating fructan biosynthesis and enhancing plant biomass | |
| RU2014153638A (ru) | Изопренсинтаза и кодирующий ее ген, способ получения мономера изопрена | |
| RU2017128034A (ru) | Новый промотор и пути его применения | |
| WO2022017633A3 (en) | Novel, non-naturally occurring crispr-cas nucleases for genome editing | |
| NZ595476A (en) | Plant snf1-related protein kinase gene | |
| MX2022005119A (es) | Metodos de reduccion de olor. | |
| CA2634269A1 (en) | Novel peptide-forming enzyme gene | |
| NZ601950A (en) | Method for producing pyripyropene | |
| RU2006145713A (ru) | Способ продукции пуриновых нуклиозидов и нуклиотидов методом ферментации с использованием бактерий, принадлежащих к роду escherichia или bacillus | |
| EA200600408A1 (ru) | Получение l-аскорбиновой кислоты в результате микробиологического процесса | |
| NZ604057A (en) | Plant cytochrome p450 | |
| MX2015004401A (es) | Cepas de streptomyces microflavus y metodos de uso de las mismas para controlar enfermedades y plagas en plantas. | |
| RU2016130093A (ru) | Трансформант для экспрессии цис-пренилтрансферазы и рецептора Nogo-B | |
| RU2010119028A (ru) | Удф-глюкуронилтрансфераза и кодирующий ее полинуклеотид | |
| UA115235C2 (uk) | Ген токсину axmi335 bacillus thuringiensis та спосіб його застосування | |
| RU2016111682A (ru) | Модифицированный микроорганизм для улучшенного получения аланина | |
| RU2018132244A (ru) | Микроорганизм для продуцирования O-ацетилгомосерина и способ получения O-ацетилгомосерина с использованием этого микроорганизма | |
| MY170467A (en) | High molecular weight pha-producing microbe and method of producing high molecular weight pha using same | |
| RU2013146377A (ru) | СПОСОБ ПОЛУЧЕНИЯ ИЗОПРЕНА С ИСПОЛЬЗОВАНИЕМ БАКТЕРИИ РОДА Bacillus | |
| NZ603990A (en) | Biotechnological production of chondroitin | |
| RU2012135337A (ru) | СПОСОБ ПОЛУЧЕНИЯ L-АРГИНИНА С ИСПОЛЬЗОВАНИЕМ БАКТЕРИИ СЕМЕЙСТВА Enterobacteriaceae, СОДЕРЖАЩЕЙ N-АЦЕТИЛОРНИТИНДЕАЦЕТИЛАЗУ С НАРУШЕННОЙ АКТИВНОСТЬЮ |
Legal Events
| Date | Code | Title | Description |
|---|---|---|---|
| FA93 | Acknowledgement of application withdrawn (no request for examination) |
Effective date: 20161018 |