RU2019114709A - Способ получения продуктов с помощью амплификации по типу катящегося кольца - Google Patents

Способ получения продуктов с помощью амплификации по типу катящегося кольца Download PDF

Info

Publication number
RU2019114709A
RU2019114709A RU2019114709A RU2019114709A RU2019114709A RU 2019114709 A RU2019114709 A RU 2019114709A RU 2019114709 A RU2019114709 A RU 2019114709A RU 2019114709 A RU2019114709 A RU 2019114709A RU 2019114709 A RU2019114709 A RU 2019114709A
Authority
RU
Russia
Prior art keywords
membrane
rca products
curable polymer
hardener
solid
Prior art date
Application number
RU2019114709A
Other languages
English (en)
Other versions
RU2755151C2 (ru
RU2019114709A3 (ru
Inventor
Матиас ХОУЭЛ
Уве ЭМАН
Фредрик ПЕРССОН
Линус ОЛАУССОН
Original Assignee
Ванадис Дайэгностикс
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Ванадис Дайэгностикс filed Critical Ванадис Дайэгностикс
Publication of RU2019114709A publication Critical patent/RU2019114709A/ru
Publication of RU2019114709A3 publication Critical patent/RU2019114709A3/ru
Application granted granted Critical
Publication of RU2755151C2 publication Critical patent/RU2755151C2/ru

Links

Classifications

    • BPERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
    • B01PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
    • B01JCHEMICAL OR PHYSICAL PROCESSES, e.g. CATALYSIS OR COLLOID CHEMISTRY; THEIR RELEVANT APPARATUS
    • B01J13/00Colloid chemistry, e.g. the production of colloidal materials or their solutions, not otherwise provided for; Making microcapsules or microballoons
    • B01J13/02Making microcapsules or microballoons
    • B01J13/04Making microcapsules or microballoons by physical processes, e.g. drying, spraying
    • BPERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
    • B01PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
    • B01JCHEMICAL OR PHYSICAL PROCESSES, e.g. CATALYSIS OR COLLOID CHEMISTRY; THEIR RELEVANT APPARATUS
    • B01J13/00Colloid chemistry, e.g. the production of colloidal materials or their solutions, not otherwise provided for; Making microcapsules or microballoons
    • B01J13/02Making microcapsules or microballoons
    • B01J13/20After-treatment of capsule walls, e.g. hardening
    • B01J13/206Hardening; drying
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C08ORGANIC MACROMOLECULAR COMPOUNDS; THEIR PREPARATION OR CHEMICAL WORKING-UP; COMPOSITIONS BASED THEREON
    • C08LCOMPOSITIONS OF MACROMOLECULAR COMPOUNDS
    • C08L83/00Compositions of macromolecular compounds obtained by reactions forming in the main chain of the macromolecule a linkage containing silicon with or without sulfur, nitrogen, oxygen or carbon only; Compositions of derivatives of such polymers
    • C08L83/04Polysiloxanes
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6813Hybridisation assays
    • C12Q1/6816Hybridisation assays characterised by the detection means
    • C12Q1/682Signal amplification
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6844Nucleic acid amplification reactions
    • C12Q1/6851Quantitative amplification
    • GPHYSICS
    • G01MEASURING; TESTING
    • G01NINVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N33/00Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
    • G01N33/48Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
    • G01N33/50Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
    • G01N33/58Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing involving labelled substances
    • G01N33/582Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing involving labelled substances with fluorescent label
    • GPHYSICS
    • G01MEASURING; TESTING
    • G01NINVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N33/00Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
    • G01N33/48Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
    • G01N33/50Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
    • G01N33/58Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing involving labelled substances
    • G01N33/585Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing involving labelled substances with a particulate label, e.g. coloured latex
    • G01N33/586Liposomes, microcapsules or cells
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C08ORGANIC MACROMOLECULAR COMPOUNDS; THEIR PREPARATION OR CHEMICAL WORKING-UP; COMPOSITIONS BASED THEREON
    • C08LCOMPOSITIONS OF MACROMOLECULAR COMPOUNDS
    • C08L2201/00Properties
    • C08L2201/10Transparent films; Clear coatings; Transparent materials
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q2531/00Reactions of nucleic acids characterised by
    • C12Q2531/10Reactions of nucleic acids characterised by the purpose being amplify/increase the copy number of target nucleic acid
    • C12Q2531/125Rolling circle
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q2563/00Nucleic acid detection characterized by the use of physical, structural and functional properties
    • C12Q2563/159Microreactors, e.g. emulsion PCR or sequencing, droplet PCR, microcapsules, i.e. non-liquid containers with a range of different permeability's for different reaction components

Landscapes

  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Analytical Chemistry (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Urology & Nephrology (AREA)
  • Hematology (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Cell Biology (AREA)
  • Pathology (AREA)
  • General Physics & Mathematics (AREA)
  • Food Science & Technology (AREA)
  • Dispersion Chemistry (AREA)
  • Polymers & Plastics (AREA)
  • Investigating, Analyzing Materials By Fluorescence Or Luminescence (AREA)
  • Investigating Or Analysing Materials By The Use Of Chemical Reactions (AREA)
  • Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
  • Transition And Organic Metals Composition Catalysts For Addition Polymerization (AREA)

Claims (32)

1. Способ обработки мембраны, включающий амплификацию продуктов по типу катящегося кольца (RCA), включающий:
(а) получение пористой капиллярной мембраны, которая содержит флуоресцентно меченые продукты RCA, которые находятся в или на мембране;
(b) нанесение отверждаемого полимера на мембрану; и
(c) отверждение отверждаемого полимера для инкапсуляции продуктов RCA в твердом веществе.
2. Способ по п. 1, отличающийся тем, что твердое вещество, полученное на стадии (с) является прозрачным.
3. Способ по любому из предшествующих пунктов, отличающийся тем, что отверждаемый полимер на стадии (b) содержит отвердитель.
4. Способ по любому из предшествующих пунктов, отличающийся тем, что отверждаемый полимер на стадии (b) содержит разбавитель для снижения вязкости.
5. Способ по любому из предшествующих пунктов, отличающийся тем, что мембрана представляет собой анодную мембрану из оксида алюминия, и в котором твердое вещество (с) имеет свойство к смачиванию, которое делает мембрану прозрачной.
6. Способ по п. 5, отличающийся тем, что отверждаемый полимер представляет собой силикон.
7. Способ по п. 6, отличающийся тем, что силикон смешивают с отвердителем и, необязательно, силиконовым масляным разбавителем.
8. Способ по любому из предшествующих пунктов, отличающийся тем, что стадию отверждения (с) инициируют внешним стимулятором.
9. Способ по п. 8, отличающийся тем, что внешний стимулятор представляет собой тепло, влагу или свет.
10. Способ по любому из предшествующих пунктов, отличающийся тем, что флуоресцентно меченые продукты RCA получены:
фильтрованием продуктов RCA через мембрану с получением продуктов RCA, которые находятся в мембране или на ней; и
флуоресцентную маркировку продуктов RCA до или после фильтрации.
11. Способ по любому из предшествующих пунктов, отличающийся тем, что способ дополнительно содержит
(d) количественное определение количества отдельных меченых продуктов RCA в области мембраны, обеспечивая тем самым оценку количества меченых продуктов RCA в образце.
12. Набор, содержащий:
(а) реагенты для получения флуоресцентно меченых продуктов RCA;
(b) пористую капиллярную мембрану; и
(с) отверждаемый полимер.
13. Набор по п. 12, отличающийся тем, что набор дополнительно содержит отвердитель, где отвердитель находится в том же контейнере что и отверждаемый полимер.
14. Набор по п. 12, отличающийся тем, что набор дополнительно содержит отвердитель, где отвердитель и отверждаемый полимер находятся в разных контейнерах.
15. Набор по любому из пп. 12-14, отличающийся тем, что отверждаемый полимер представляет собой силикон.
16. Набор по любому из пп. 12-15, отличающийся тем, что пористая капиллярная мембрана представляет собой фильтр из анодного оксида алюминия.
17. Композиция, содержащая:
(а) пористую капиллярную мембрану;
(b) множество флуоресцентно меченых продуктов RCA на мембране;
(c) слой твердого вещества, который инкапсулирует флуоресцентно меченые продукты RCA.
18. Композиция по п. 17, отличающаяся тем, что твердый смачивающий агент проникает через поры фильтра.
19. Композиция по п. 17 или 18, отличающаяся тем, что фильтр представляет собой фильтр из оксида алюминия.
20. Композиция по любому из пп. 17-19, отличающаяся тем, что твердый смачивающий агент представляет собой поперечно сшитый силикон.
RU2019114709A 2016-10-27 2017-10-04 Способ получения продуктов с помощью амплификации по типу катящегося кольца RU2755151C2 (ru)

Applications Claiming Priority (3)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US201662413762P 2016-10-27 2016-10-27
US62/413,762 2016-10-27
PCT/IB2017/056121 WO2018078469A1 (en) 2016-10-27 2017-10-04 Method for processing rolling circle amplification products

Publications (3)

Publication Number Publication Date
RU2019114709A true RU2019114709A (ru) 2020-11-16
RU2019114709A3 RU2019114709A3 (ru) 2021-02-05
RU2755151C2 RU2755151C2 (ru) 2021-09-13

Family

ID=60452687

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
RU2019114709A RU2755151C2 (ru) 2016-10-27 2017-10-04 Способ получения продуктов с помощью амплификации по типу катящегося кольца

Country Status (12)

Country Link
US (2) US10781476B2 (ru)
EP (1) EP3532636B1 (ru)
JP (1) JP6997775B2 (ru)
KR (1) KR102376437B1 (ru)
CN (1) CN110023505B (ru)
AU (1) AU2017352056B2 (ru)
BR (1) BR112019007865A2 (ru)
CA (1) CA3039133A1 (ru)
ES (1) ES2867299T3 (ru)
PL (1) PL3532636T3 (ru)
RU (1) RU2755151C2 (ru)
WO (1) WO2018078469A1 (ru)

Families Citing this family (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US12377412B2 (en) 2019-04-16 2025-08-05 Countagen Ab Sample analysis device
GB2604872B (en) * 2021-03-15 2023-11-01 Countagen Ab Methods and uses for determining the efficiency of genetic-editing procedures

Family Cites Families (26)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
DK386784A (da) * 1983-08-17 1985-02-18 Hovione Int Ltd Fremgangsmaade til fremstilling af alfa-6-desoxy-tetracykliner
GB8609250D0 (en) * 1986-04-16 1986-05-21 Alcan Int Ltd Anodic oxide membranes
GB9119735D0 (en) * 1991-09-16 1991-10-30 Secr Defence Gene probe biosensor method
US5332681A (en) 1992-06-12 1994-07-26 The United States Of America As Represented By The Secretary Of The Navy Method of making a semiconductor device by forming a nanochannel mask
US5264722A (en) 1992-06-12 1993-11-23 The United States Of America As Represented By The Secretary Of The Navy Nanochannel glass matrix used in making mesoscopic structures
US5854033A (en) 1995-11-21 1998-12-29 Yale University Rolling circle replication reporter systems
US5855716A (en) 1996-09-24 1999-01-05 The United States Of America As Represented By The Secretary Of The Navy Parallel contact patterning using nanochannel glass
US5976444A (en) 1996-09-24 1999-11-02 The United States Of America As Represented By The Secretary Of The Navy Nanochannel glass replica membranes
US6483640B1 (en) 1997-04-08 2002-11-19 The United States Of America As Represented By The Secretary Of The Navy Optical notch filters based on two-dimensional photonic band-gap materials
WO1999013110A1 (en) * 1997-09-11 1999-03-18 Seq, Ltd. Method to make fluorescent nucleotide photoproducts for dna sequencing and analysis
US6087274A (en) 1998-03-03 2000-07-11 The United States Of America As Represented By The Secretary Of The Navy Nanoscale X-Y-Z translation of nanochannel glass replica-based masks for making complex structures during patterning
JP2001269196A (ja) * 2000-03-24 2001-10-02 Hamamatsu Photonics Kk 被検体核酸の定量方法、および被検体核酸の分子数の計数方法
US20050009022A1 (en) * 2001-07-06 2005-01-13 Weiner Michael P. Method for isolation of independent, parallel chemical micro-reactions using a porous filter
JP4824312B2 (ja) 2002-11-26 2011-11-30 ユニバーシティ オブ ユタ リサーチ ファンデーション 微小孔物質、被分析物の局在化及び定量の方法、並びに被分析物の局在化及び定量用物品
US20060228813A1 (en) 2003-04-10 2006-10-12 Ying Wu Method for immobilizing biomolecules on metal oxide substrates
US20090220948A1 (en) * 2005-03-16 2009-09-03 Attogenix Biosystems Pte Ltd. Methods and Device for Transmitting, Enclosing and Analysing Fluid Samples
US7989166B2 (en) 2005-04-12 2011-08-02 In Situ Rcp A/S Circle probes and their use in the identification of biomolecules
JP5473195B2 (ja) * 2007-05-16 2014-04-16 東レ・ダウコーニング株式会社 架橋シリコーン粒子およびその製造方法
US20140186827A1 (en) 2010-05-14 2014-07-03 Fluidigm, Inc. Assays for the detection of genotype, mutations, and/or aneuploidy
US20120034603A1 (en) 2010-08-06 2012-02-09 Tandem Diagnostics, Inc. Ligation-based detection of genetic variants
EP2633081B1 (en) 2010-10-29 2017-01-11 Olink Bioscience AB Proximity ligation technology for western blot applications
CN102827929B (zh) 2012-08-01 2014-06-04 浙江大学 一种核酸检测方法
US9644232B2 (en) * 2013-07-26 2017-05-09 General Electric Company Method and device for collection and amplification of circulating nucleic acids
GB2520765A (en) * 2013-12-02 2015-06-03 Vanadis Diagnostics Ab Multiplex detection of nucleic acids
GB2520763A (en) 2013-12-02 2015-06-03 Vanadis Diagnostics Ab Nucleic acid probe and method of detecting genomic fragments
GB201507376D0 (en) * 2015-04-30 2015-06-17 Vanadis Diagnostics Ab Use of a porous transparent capillary membrane for counting rolling circle amplification products

Also Published As

Publication number Publication date
AU2017352056A1 (en) 2019-05-02
US20180119201A1 (en) 2018-05-03
US20200362388A1 (en) 2020-11-19
US10781476B2 (en) 2020-09-22
US11365440B2 (en) 2022-06-21
EP3532636A1 (en) 2019-09-04
CN110023505B (zh) 2023-04-04
AU2017352056B2 (en) 2023-07-06
RU2755151C2 (ru) 2021-09-13
PL3532636T3 (pl) 2021-12-13
WO2018078469A1 (en) 2018-05-03
ES2867299T3 (es) 2021-10-20
JP6997775B2 (ja) 2022-01-18
EP3532636B1 (en) 2021-03-24
CN110023505A (zh) 2019-07-16
JP2019533998A (ja) 2019-11-28
CA3039133A1 (en) 2018-05-03
BR112019007865A2 (pt) 2019-07-02
RU2019114709A3 (ru) 2021-02-05
KR102376437B1 (ko) 2022-03-17
KR20190067186A (ko) 2019-06-14

Similar Documents

Publication Publication Date Title
ATE525482T1 (de) Nanoreporter und verfahren zu deren herstellung und verwendung
DE60322111D1 (de) Verfahren zur herstellung von hydrogelen aus thiosulfonat-zusammensetzungen und ihre verwendungen
MX2021004486A (es) Composicion polimerica que comprende particulas y colorante, su metodo de preparacion y uso.
DE50210457D1 (de) Vorrichtung zur referenzierung von fluoreszenzsignalen
WO2005003086A3 (de) Sulfonsäurederivate polycyclischer farbstoffe für analytische anwendungen
Nevares et al. Characterization of the oxygen transmission rate of new-ancient natural materials for wine maturation containers
JP2015506469A5 (ru)
CN108225871A (zh) Uv光学胶在病理切片制作中的用途
RU2006139009A (ru) Способ окрашивания композиции для нанесения покрытия
WO2018089641A3 (en) Encode solid phase compound library with polynucleotide based barcoding
WO2014144360A3 (en) Methods for dye selection for protein melt temperature determinations
ATE519116T1 (de) Verfahren zur normierung der konzentration von analyten in einer urinprobe
KR101872091B1 (ko) 표적 생체 분자 다중 검출을 위한 적층 부호화 수화겔 입자의 제조장치, 그 제조방법 및 이를 이용한 상기 수화겔 입자의 제조방법
EA202092910A1 (ru) Способ нанесения покрытия на удобрения
EP4516737A4 (en) METHOD FOR SYNTHESIZING SEVERAL KILOGRAMS OF SILICON CARBIDE POWDER
DK1695088T3 (da) Fremgangsmåde til at analysere metabolitter
EP2168780A3 (de) Sicherheitsmerkmal zur Absicherung von Wertgegenständen
CN104502619A (zh) 一种亲水性粘附载玻片的制备方法及其使用方法
ES2621119A1 (es) Virutas de madera con microorganismos, su preparación y su uso
ATE500500T1 (de) Verfahren zur herstellung von werkzeugen für analysen
Hassan et al. Quality evaluation of epoxy pore casts using silicon micromodels: Application to confocal imaging of carbonate samples
MX392344B (es) Sistemas y métodos de corrección de codificación sobre tiras.
EA202090515A1 (ru) Капиллярное изоэлектрическое фокусирование с детектированием непосредственно в капилляре для анализа вариантов белка в матрице образца
EP4219438C0 (en) PROCESS FOR PRODUCING ALDEHYDE
RU2755151C2 (ru) Способ получения продуктов с помощью амплификации по типу катящегося кольца