RU2811697C2 - Антитела к вирусу денге, обладающие перекрестной реактивностью с вирусом зика - Google Patents

Антитела к вирусу денге, обладающие перекрестной реактивностью с вирусом зика Download PDF

Info

Publication number
RU2811697C2
RU2811697C2 RU2020133003A RU2020133003A RU2811697C2 RU 2811697 C2 RU2811697 C2 RU 2811697C2 RU 2020133003 A RU2020133003 A RU 2020133003A RU 2020133003 A RU2020133003 A RU 2020133003A RU 2811697 C2 RU2811697 C2 RU 2811697C2
Authority
RU
Russia
Prior art keywords
seq
hvr
antibody
amino acid
acid sequence
Prior art date
Application number
RU2020133003A
Other languages
English (en)
Other versions
RU2020133003A (ru
Inventor
Катя ФИНК
Чжэнъи ВАН
Лиза Панг По ЫН
Лоран РЕНЬЯ
Дзэндзиро Сампэй
Синъэр Кристина ГУ
Original Assignee
Чугаи Сейяку Кабусики Кайся
Эйдженси Фор Сайенс, Текнолоджи Энд Рисерч
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Чугаи Сейяку Кабусики Кайся, Эйдженси Фор Сайенс, Текнолоджи Энд Рисерч filed Critical Чугаи Сейяку Кабусики Кайся
Priority claimed from PCT/SG2019/050145 external-priority patent/WO2019177543A1/en
Publication of RU2020133003A publication Critical patent/RU2020133003A/ru
Application granted granted Critical
Publication of RU2811697C2 publication Critical patent/RU2811697C2/ru

Links

Images

Abstract

Изобретение относится к иммунологии. Предложено применение антитела, содержащего последовательность VH с SEQ ID NO: 6, последовательность VL с SEQ ID NO: 7 и последовательность SEQ ID NO: 59, для производства лекарственных препаратов для лечения или предупреждения инфекции, вызываемой вирусом Зика. Антитело специфично к вирусу денге и обладает перекрестной реактивностью с вирусом Зика. Изобретение позволяет эффективно нейтрализовать вирус Зика. 1 з.п. ф-лы, 20 ил., 10 пр.

Description

Область техники, к которой относится изобретение
В настоящем изобретении предложены антитела к вирусу Зика и способы их применения.
Предпосылки создания изобретения
Лихорадка денге представляет собой наиболее широко распространенное в мире переносимое членистоногими вирусное заболевание. Вирус, вызывающий лихорадку денге (или вирус, который в настоящем описании обозначают как DENV), можно подразделять на четыре различных инфекционных серотипа, такие как DENV-1, DENV-2, DENV-3 и DENV-4. Симптомы инфекции, вызываемой вирусом денге, включают лихорадку, мышечную боль, головную боль, низкое количество тромбоцитов и низкое количество лейкоцитов, коагулопатию, кровотечение и сосудистую утечку, что может приводить синдрому шока, связанного с лихорадкой денге. При контакте индивидуума с вирусом денге после предшествующего заражения лихорадкой денге антитела к вирусу могут усиливать поглощение вируса клетками-хозяевами, и пациент имеет более высокий риск развития серьезной формы лихорадки денге. Однако серьезные формы лихорадки денге могут возникать также и при первом заражении.
Несмотря на то, что лихорадка денге является наиболее широко распространенным переносимым членистоногими вирусным заболеванием, к настоящему времени отсутствует лекарственное средство, которое можно применять для ее лечения. Подходы, касающиеся лихорадки денге в качестве заболевания, главным образом направлены на предупреждение заражения и/или лечение с целью облегчения симптомов.
В настоящее время создаются вакцины и терапевтические средства на основе антител для предупреждения и лечения вирусной инфекции. Однако варианты лечения на основе антител не лишены рисков. Одним из таких рисков является антителозависимое усиление (инфекции) (ADE), которое имеет место, когда не нейтрализующие противовирусные антитела облегчают проникновение вируса в клетки-хозяева, что приводит к повышенной инфективности в клетках (Expert Rev Anti Infect Ther 11, 2013, cc. 1147-1157). Наиболее общим механизмом ADE является взаимодействие комплекса вирус-антитело через Fc-область антитела с Fc-рецепторами (FcR) на клеточной поверхности. Обычная легкая форма вирусной инфекции может усиливаться благодаря ADE, превращаясь в опасное для жизни заболевание. Описано антитело к DENV с мутациями в Fc-области, которые предупреждают связывание с FcγR, что препятствует усилению вызываемой DENV инфекции (WO 2010/043977). Однако все еще существует необходимость в терапевтических средствах на основе антител, с которыми не связан риск антителозависимого усиления инфекции.
Перекрестная реактивность DENV-специфических антител с вирусом Зика описана в литературе [JCI Insight. 2017; 2(8). doi: 10.1172/jci.insight.92428.]. Продемонстрировано также, что DENV-специфические Ат могут усиливать вызываемую вирусом Зика инфекцию [Nature. 2016; 536(7614): 48-53. doi: 10.1038/nature 18938, Nat Immunol. 2016; 17(9): 1102-8.].
Краткое изложение сущности изобретения
В изобретении предложены антитела к DENV, полипептиды, содержащие варианты Fc-областей, и способы их применения.
В некоторых вариантах осуществления изобретения выделенное антитело к DENV, предлагаемое в настоящем изобретении, связывается с Е-белком DENV. В некоторых вариантах осуществления изобретения антитело к DENV, предлагаемое в изобретении, содержит:
(а) (I) HVR-H3, содержащий аминокислотную последовательность GGX1ALFYDSYTTPX2DX3GSWWFDP, в которой X1 обозначает R или Е, Х2 обозначает R или F, Х3 обозначает G, D или L (SEQ ID NO: 42), (II) HVR-L3, содержащий аминокислотную последовательность QQFX1X2LPIT, в которой X1 обозначает D, S или Е, Х2 обозначает D или A (SEQ ID NO: 45), и (III) HVR-H2, содержащий аминокислотную последовательность VINPRGGSX1X2SAQKFQG, в которой X1 обозначает Т или R, Х2 обозначает А или R (SEQ ID NO: 41);
(б) (I) HVR-H1, содержащий аминокислотную последовательность SX1YX2H, в которой X1 обозначает N или Y, Х2 обозначает I или М (SEQ ID NO: 40), (II) HVR-H2, содержащий аминокислотную последовательность VINPRGGSX1X2SAQKFQG, в которой X1 обозначает Т или R, Х2 обозначает А или R (SEQ ID NO: 41), и (III) HVR-H3, содержащий аминокислотную последовательность GGX1ALFYDSYTTPX2DX3GSWWFDP, в которой X1 обозначает R или Е, Х2 обозначает R или F, Х3 обозначает G, D или L (SEQ ID NO: 42);
(в) (I) HVR-H1, содержащий аминокислотную последовательность SX1YX2H, в которой X1 обозначает N или Y, Х2 обозначает I или М (SEQ ID NO: 40), (II) HVR-H2, содержащий аминокислотную последовательность VINPRGGSX1X2SAQKFQG, в которой X1 обозначает Т или R, Х2 обозначает А или R (SEQ ID NO: 41), (III) HVR-H3, содержащий аминокислотную последовательность GGX1ALFYDSYTTPX2DX3GSWWFDP, в которой X1 обозначает R или Е, Х2 обозначает R или F, Х3 обозначает G, D или L (SEQ ID NO: 42), (IV) HVR-L1, содержащий аминокислотную последовательность QASQX1IRX2YLN, в которой X1 обозначает D или Е, Х2 обозначает К или Q (SEQ ID NO: 43); (V) HVR-L2, содержащий аминокислотную последовательность DASX1LKX2, в которой X1 обозначает N или Е, Х2 обозначает Т или F (SEQ ID NO: 44); и (VI) HVR-L3, содержащий аминокислотную последовательность QQFX1X2LPIT, в которой X1 обозначает D, S или Е, Х2 обозначает D или A (SEQ ID NO: 45); или
(г) (I) HVR-L1, содержащий аминокислотную последовательность QASQX1IRX2YLN, в которой X1 обозначает D или Е, Х2 обозначает К или Q (SEQ ID NO: 43); (II) HVR-L2, содержащий аминокислотную последовательность DASX1LKX2, в которой X1 обозначает N или Е, Х2 обозначает Т или F (SEQ ID NO: 44); и (III) HVR-L3, содержащий аминокислотную последовательность QQFX1X2LPIT, в которой X1 обозначает D, S или Е, Х2 обозначает D или A (SEQ ID NO: 45). В некоторых вариантах осуществления изобретения антитело, предлагаемое в изобретении, не представляет собой антитело, которое содержит (I) HVR-H1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 11, (II) HVR-H2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 13, (III) HVR-H3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 16, (IV) HVR-L1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 21, (V) HVR-L2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 24, и (VI) HVR-L3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 27.
В некоторых вариантах осуществления изобретения антитело к DENV, предлагаемое в изобретении, содержит:
(а) (I) HVR-H3 из VH-последовательности, представленной в любой из SEQ ID NO: 2-6, (II) HVR-L3 из VL-последовательности, представленной в любой из SEQ ID NO: 8-10, и (III) HVR-H2 из VH-последовательности, представленной в любой из SEQ ID NO: 2-6;
(б) (I) HVR-H1 из VH-последовательности, представленной в любой из SEQ ID NO: 2-6, (II) HVR-H2 из VH-последовательности, представленной в любой из SEQ ID NO: 2-6, и (III) HVR-H3 из VH-последовательности, представленной в любой из SEQ ID NO: 2-6;
(в) (I) HVR-H1 из VH-последовательности, представленной в любой из SEQ ID NO: 2-6, (II) HVR-H2 из VH-последовательности, представленной в любой из SEQ ID NO: 2-6, (III) HVR-H3 из VH-последовательности, представленной в любой из SEQ ID NO: 2-6, (IV) HVR-L1 из VL-последовательности, представленной в любой из SEQ ID NO: 8-10; (V) HVR-L2 из VL-последовательности, представленной в любой из SEQ ID NO: 8-10; и (VI) HVR-L3 из VL-последовательности, представленной в любой из SEQ ID NO: 8-10;
(г) (I) HVR-L1 из VL-последовательности, представленной в любой из SEQ ID NO: 8-10; (II) HVR-L2 из VL-последовательности, представленной в любой из SEQ ID NO: 8-10; и (III) HVR-L3 из VL-последовательности, представленной в любой из SEQ ID NO: 8-10; или
(д) (I) HVR-H1 из VH-последовательности, представленной в любой из SEQ ID NO: 2-6, (II) HVR-H2 из VH-последовательности, представленной в любой из SEQ ID NO: 2-6, (III) HVR-H3 из VH-последовательности, представленной в любой из SEQ ID NO: 2-6, (IV) HVR-L1 из VL-последовательности, представленной в SEQ ID NO: 7; (V) HVR-L2 из VL-последовательности, представленной в SEQ ID NO: 7; и (VI) HVR-L3 из VL-последовательности, представленной в SEQ ID NO: 7.
В некоторых вариантах осуществления изобретения антитело, предлагаемое в изобретении, не представляет собой антитело, которое содержит (I) HVR-H1 из VH-последовательности SEQ ID NO: 1, (II) HVR-H2 из VH-последовательности SEQ ID NO: 1, (III) HVR-H3 из VH-последовательности SEQ ID NO: 1, (IV) HVR-L1 из VL-последовательности SEQ ID NO: 7, (V) HVR-L2 из VL-последовательности SEQ ID NO: 7 и (VI) HVR-L3 из VL-последовательности SEQ ID NO: 7.
В некоторых вариантах осуществления изобретения выделенное антитело, предлагаемое в настоящем изобретении, содержит также каркасный участок вариабельного домена тяжелой цепи FR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 31, FR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 32, FR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 33 или 34, FR4, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 35. В некоторых вариантах осуществления изобретения выделенное антитело к DENV, предлагаемое в настоящем изобретении, содержит также каркасный участок вариабельного домена легкой цепи FR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 36, FR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 37, FR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 38, FR4, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 39.
В некоторых вариантах осуществления изобретения выделенное антитело к DENV, предлагаемое в настоящем изобретении, содержит (a) VH-последовательность, которая идентична по меньшей мере на 95% любой из аминокислотных последовательностей SEQ ID NO: 2-6; (б) VL-последовательность, которая идентична по меньшей мере на 95% аминокислотной последовательности любой из SEQ ID NO: 8-10; (в) VH-последовательность, представленную в любой из SEQ ID NO: 2-6, и VL-последовательность, представленную в любой из SEQ ID NO: 8-10; или (г) VH-последовательность, представленную в любой из SEQ ID NO: 2-6, и VL-последовательность, представленную в SEQ ID NO: 7.
В некоторых вариантах осуществления изобретения выделенное антитело к DENV, предлагаемое в настоящем изобретении, представляет собой моноклональное антитело. В некоторых вариантах осуществления изобретения выделенное антитело к DENV, предлагаемое в настоящем изобретении, представляет собой человеческое, гуманизированное или химерное антитело. В некоторых вариантах осуществления изобретения выделенное антитело к DENV, предлагаемое в настоящем изобретении, представляет собой фрагмент антитела, который связывается с DENV или Е-белком DENV. В некоторых вариантах осуществления изобретения выделенное антитело к DENV, предлагаемое в настоящем изобретении, представляет собой полноразмерное антитело IgG-класса.
В некоторых вариантах осуществления изобретения Fc-область антитела к DENV, предлагаемого в настоящем изобретении, содержит Ala в положении 234 и Ala в положении 235 согласно EU-нумерации. В некоторых вариантах осуществления изобретения Fc-область антитела к DENV, предлагаемого в настоящем изобретении, можно выбирать из вариантов Fc-области, указанных в настоящем описании.
В изобретении предложены также выделенные нуклеиновые кислоты, которые кодируют антитело к DENV, предлагаемое в настоящем изобретении. В изобретении предложены также клетки-хозяева, которые содержат нуклеиновую кислоту, предлагаемую в настоящем изобретении. В изобретении предложен также способ получения антитела, который включает культивирование клетки-хозяина, предлагаемой в настоящем изобретении, таким образом, чтобы получать антитело.
В изобретении предложена также фармацевтическая композиция, которая содержит антитело к DENV, предлагаемое в настоящем изобретении, и фармацевтически приемлемый носитель.
Антитела к DENV, предлагаемые в настоящем изобретении, можно применять в качестве лекарственного средства. В некоторых вариантах осуществления изобретения антитела к DENV, предлагаемые в настоящем изобретении, можно применять для лечения вызываемой DENV инфекции.
Антитела к DENV, предлагаемые в настоящем изобретении, можно применять для производства лекарственного средства. В некоторых вариантах осуществления изобретения лекарственное средство предназначено для лечения вызываемой DENV инфекции.
В изобретении предложен также способ лечения индивидуума, имеющего вызванную DENV инфекцию. В некоторых вариантах осуществления изобретения способ включает введение индивидууму в эффективном количестве антитела к DENV, предлагаемого в настоящем изобретении. В некоторых вариантах осуществления изобретения способ включает также введение индивидууму дополнительного терапевтического средства, например, описанного ниже.
В некоторых вариантах осуществления изобретения вариант Fc-области, предлагаемый в настоящем изобретении, содержит по меньшей мере одно аминокислотное изменение в родительской Fc-области. В других вариантах осуществления изобретения вариант Fc-области обладает существенно сниженной FcγR-связывающей активностью по сравнению с родительской Fc-областью. В других вариантах осуществления изобретения вариант Fc-области не обладает существенно сниженной C1q-связывающей активностью по сравнению с родительской Fc-областью.
В некоторых вариантах осуществления изобретения вариант Fc-области, предлагаемый в настоящем изобретении, содержит Ala в положении 234, Ala в положении 235 согласно EU-нумерации. В других вариантах осуществления изобретения вариант Fc-области содержит любое из аминокислотных изменений в положениях, указанных в следующих подпунктах (а)-(в): (а) положения 267, 268 и 324, (б) положения 236, 267, 268, 324 и 332 и (в) положения 326 и 333; согласно EU-нумерации.
В некоторых вариантах осуществления изобретения вариант Fc-области, предлагаемый в настоящем изобретении, содержит аминокислоты, выбранные из группы, которая состоит из: (a) Glu в положении 267, (б) Phe в положении 268, (в) Thr в положении 324, (г) Ala в положении 236, (д) Glu в положении 332, (е) Ala, Asp, Glu, Met или Trp в положении 326 и (ж) Ser в положении 333; согласно EU-нумерации.
В некоторых вариантах осуществления изобретения вариант Fc-области, предлагаемый в настоящем изобретении, содержит также аминокислоты, выбранные из группы, которая состоит из: (a) Ala в положении 434, (б) Ala в положении 434, Thr в положении 436, Arg в положении 438 и Glu в положении 440, (в) Leu в положении 428, Ala в положении 434, Thr в положении 436, Arg в положении 438 и Glu в положении 440 и (г) Leu в положении 428, Ala в положении 434, Arg в положении 438 и Glu в положении 440; согласно EU-нумерации.
В некоторых вариантах осуществления изобретения вариант Fc-области, предлагаемый в настоящем изобретении, содержит любое из аминокислотных изменений, индивидуально или в комбинации, которые представлены в таблице 4. В некоторых вариантах осуществления изобретения родительская Fc-область, указанная в настоящем изобретении, имеет происхождение из человеческого IgG1. В изобретении предложен полипептид, содержащий аминокислотную последовательность, представленную в любой из SEQ ID NO: 51-59.
В некоторых вариантах осуществления изобретения полипептид, который содержит вариант Fc-области, предлагаемый в настоящем изобретении, представляет собой антитело. В других вариантах осуществления изобретения антитело представляет собой противовирусное антитело. В других вариантах осуществления изобретения антитело содержит вариабельную область, имеющую происхождение из антитела к DENV, указанного в настоящем описании.
В других вариантах осуществления изобретения антитело содержит:
(а) (I) HVR-H3, который содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 16, (II) HVR-L3, который содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 27, и (III) HVR-H2, который содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 13;
(б) (I) HVR-H1, который содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 11, (II) HVR-H2, который содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 13, и (III) HVR-H3, который содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 16;
(в) (I) HVR-H1, который содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 11, (II) HVR-H2, который содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 13, (III) HVR-H3, который содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 16, (IV) HVR-L1, который содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 21; (V) HVR-L2, который содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 24; и (VI) HVR-L3, который содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 27, или
(г) (I) HVR-L1, который содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 21; (II) HVR-L2, который содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 24; и (III) HVR-L3, который содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 27.
В других вариантах осуществления изобретения антитело содержит:
(а) (I) HVR-H3 из VH-последовательности SEQ ID NO: 6, (II) HVR-L3 из VL-последовательности SEQ ID NO: 10 и (III) HVR-H2 из VH-последовательности SEQ ID NO: 6;
(б) (I) HVR-H1 из VH-последовательности SEQ ID NO: 6, (II) HVR-H2 из VH-последовательность SEQ ID NO: 6 и (III) HVR-H3 из VH-последовательности SEQ ID NO: 6;
(в) (I) HVR-H1 из VH-последовательности SEQ ID NO: 6, (II) HVR-H2 из VH-последовательности SEQ ID NO: 6, (III) HVR-H3 из VH-последовательности SEQ ID NO: 6, (IV) HVR-L1 из VL-последовательности SEQ ID NO: 10; (V) HVR-L2 из VL-последовательности SEQ ID NO: 10 и (VI) HVR-L3 из VL-последовательности SEQ ID NO: 10;
(г) (I) HVR-L1 из VL-последовательности SEQ ID NO: 10; (II) HVR-L2 из VL-последовательности SEQ ID NO: 10 и (III) HVR-L3 из VL-последовательности SEQ ID NO: 10, или
(д) (I) HVR-H1 из VH-последовательности SEQ ID NO: 6, (II) HVR-H2 из VH-последовательности SEQ ID NO: 6, (III) HVR-H3 из VH-последовательности SEQ ID NO: 6, (IV) HVR-L1 из VL-последовательности SEQ ID NO: 7; (V) HVR-L2 из VL-последовательности SEQ ID NO: 7 и (VI) HVR-L3 из VL-последовательности SEQ ID NO: 7.
В изобретении предложены также выделенные нуклеиновые кислоты, кодирующие полипептид, который содержит вариант Fc-области, предлагаемый в настоящем изобретении. В изобретении предложены также клетки-хозяева, которые содержат нуклеиновую кислоту, предлагаемую в настоящем изобретении. В изобретении предложен также способ получения полипептида, который содержит вариант Fc-области, включающий культивирование хозяина, предлагаемого в настоящем изобретении, таким образом, чтобы получать полипептид.
В изобретении предложена также фармацевтическая композиция, содержащая полипептид, который содержит вариант Fc-области, предлагаемый в настоящем изобретении, и фармацевтически приемлемый носитель.
Полипептиды, которые содержат варианты Fc-областей, предлагаемые в настоящем изобретении, можно применять в качестве лекарственного средства. В некоторых вариантах осуществления изобретения полипептиды, которые содержат варианты Fc-областей, предлагаемые в настоящем изобретении, можно применять для лечения вирусной инфекции.
Полипептиды, которые содержат варианты Fc-областей, предлагаемые в настоящем изобретении, можно применять для производства лекарственного средства. В некоторых вариантах осуществления изобретения лекарственное средство предназначено для лечения вирусной инфекции.
В изобретении предложен также способ лечения индивидуума, имеющего вирусную инфекцию. В некоторых вариантах осуществления изобретения способ включает введение индивидууму в эффективном количестве полипептида, который содержит вариант Fc-области, предлагаемый в настоящем изобретении.
В изобретении предложено также антитело к DENV, указанное в настоящем описании, которое дополнительно содержит полипептид, содержащий вариант Fc-области, предлагаемый в настоящем изобретении.
Одним из объектов изобретения являются способы лечения или предупреждения инфекции, вызываемой вирусом Зика.
В некоторых вариантах осуществления изобретения способ лечения или предупреждения инфекции, вызываемой вирусом Зика, предлагаемый в настоящем изобретении, включает введение антитела, которое связывается с вирусом Зика.
В некоторых вариантах осуществления изобретения антитело, которое связывается с вирусом Зика, предлагаемое в настоящем изобретении, содержит:
(а) (I) HVR-H3, содержащий аминокислотную последовательность GGX1ALFYDSYTTPX2DX3GSWWFDP, в которой X1 обозначает R или Е, Х2 обозначает R или F, Х3 обозначает G, D или L (SEQ ID NO: 42), (II) HVR-L3, содержащий аминокислотную последовательность QQFX1X2LPIT, в которой X1 обозначает D, S или Е, Х2 обозначает D или A (SEQ ID NO: 45), и (III) HVR-H2, содержащий аминокислотную последовательность VINPRGGSX1X2SAQKFQG, в которой X1 обозначает Т или R, Х2 обозначает А или R (SEQ ID NO: 41);
(б) (I) HVR-H1, содержащий аминокислотную последовательность SX1YX2H, в которой X1 обозначает N или Y, Х2 обозначает I или М (SEQ ID NO: 40), (II) HVR-H2, содержащий аминокислотную последовательность VINPRGGSX1X2SAQKFQG, в которой X1 обозначает Т или R, Х2 обозначает А или R (SEQ ID NO: 41), и (III) HVR-H3, содержащий аминокислотную последовательность GGX1ALFYDSYTTPX2DX3GSWWFDP, в которой X1 обозначает R или Е, Х2 обозначает R или F, Х3 обозначает G, D или L (SEQ ID NO: 42);
(в) (I) HVR-H1, содержащий аминокислотную последовательность SX1YX2H, в которой X1 обозначает N или Y, Х2 обозначает I или М (SEQ ID NO: 40), (II) HVR-H2, содержащий аминокислотную последовательность VINPRGGSX1X2SAQKFQG, в которой X1 обозначает Т или R, Х2 обозначает А или R (SEQ ID NO: 41), (III) HVR-H3, содержащий аминокислотную последовательность GGX1ALFYDSYTTPX2DX3GSWWFDP, в которой X1 обозначает R или Е, Х2 обозначает R или F, Х3 обозначает G, D или L (SEQ ID NO: 42), (IV) HVR-L1, содержащий аминокислотную последовательность QASQX1IRX2YLN, в которой X1 обозначает D или Е, Х2 обозначает K или Q (SEQ ID NO: 43); (V) HVR-L2, содержащий аминокислотную последовательность DASX1LKX2, в которой X1 обозначает N или Е, Х2 обозначает Т или F (SEQ ID NO: 44); и (VI) HVR-L3, содержащий аминокислотную последовательность QQFX1X2LPIT, в которой X1 обозначает D, S или Е, Х2 обозначает D или A (SEQ ID NO: 45); или
(г) (I) HVR-L1, содержащий аминокислотную последовательность QASQX1IRX2YLN, в которой X1 обозначает D или Е, Х2 обозначает K или Q (SEQ ID NO: 43); (II) HVR-L2, содержащий аминокислотную последовательность DASX1LKX2, в которой X1 обозначает N или Е, Х2 обозначает Т или F (SEQ ID NO: 44); и (III) HVR-L3, содержащий аминокислотную последовательность QQFX1X2LPIT, в которой X1 обозначает D, S или Е, Х2 обозначает D или A (SEQ ID NO: 45). В некоторых вариантах осуществления изобретения антитело, предлагаемое в изобретении, не представляет собой антитело, которое содержит (I) HVR-H1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 11, (II) HVR-H2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 13, (III) HVR-H3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 16, (IV) HVR-L1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 21, (V) HVR-L2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 24, и (VI) HVR-L3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 27.
В некоторых вариантах осуществления изобретения антитело, которое связывается с вирусом Зика, предлагаемое в настоящем изобретении, содержит также каркасный участок вариабельного домена тяжелой цепи FR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 31, FR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 32, FR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 33 или 34, FR4, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 35. В некоторых вариантах осуществления изобретения антитело, которое связывается с вирусом Зика, предлагаемое в настоящем изобретении, содержит также каркасный участок вариабельного домена легкой цепи FR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 36, FR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 37, FR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 38, FR4, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 39.
В некоторых вариантах осуществления изобретения антитело, которое связывается с вирусом Зика, предлагаемое в настоящем изобретении, содержит (а) VH-последовательность, которая идентична по меньшей мере на 95% любой из аминокислотных последовательностей SEQ ID NO: 2-6; (б) VL-последовательность, которая идентична по меньшей мере на 95% аминокислотной последовательности любой из SEQ ID NO: 8-10; (в) VH-последовательность, представленную в любой из SEQ ID NO: 2-6, и VL-последовательность, представленную в любой из SEQ ID NO: 8-10; или (г) VH-последовательность, представленную в любой из SEQ ID NO: 2-6.
В изобретении предложен также способ лечения инфекции, вызываемой вирусом Зика. В некоторых вариантах осуществления изобретения способ включает введение индивидууму в эффективном количестве антитела к вирусу Зика, предлагаемого в настоящем изобретении.
В некоторых вариантах осуществления изобретения вариант Fc-области антитела, которое связывается с вирусом Зика, предлагаемый в настоящем изобретении, содержит Ala в положении 234, Ala в положении 235 согласно EU-нумерации. В других вариантах осуществления изобретения вариант Fc-области содержит любое из аминокислотных изменений в положениях, указанных в следующих подпунктах (а)-(в): (а) положения 267, 268 и 324, (б) положения 236, 267, 268, 324 и 332 и (в) положения 326 и 333; согласно EU-нумерации.
В некоторых вариантах осуществления изобретения вариант Fc-области антитела, которое связывается с вирусом Зика, предлагаемый в настоящем изобретении, содержит аминокислоты, которые выбраны из группы, состоящей из: (a) Glu в положении 267, (б) Phe в положении 268, (в) Thr в положении 324, (г) Ala в положении 236, (д) Glu в положении 332, (е) Ala, Asp, Glu, Met или Тгр в положении 326 и (ж) Ser в положении 333; согласно EU-нумерации.
В некоторых вариантах осуществления изобретения вариант Fc-области антитела, которое связывается с вирусом Зика, предлагаемый в настоящем изобретении, содержит аминокислоты, которые выбраны из группы, состоящей из: (a) Ala в положении 434, (б) Ala в положении 434, Thr в положении 436, Arg в положении 438 и Glu в положении 440, (в) Leu в положении 428, Ala в положении 434, Thr в положении 436, Arg в положении 438 и Glu в положении 440 и (г) Leu в положении 428, Ala в положении 434, Arg в положении 438 и Glu в положении 440; согласно EU-нумерации.
В изобретении предложен полипептид, который содержит аминокислотную последовательность, представленную в любой из SEQ ID NO: 51-59.
В других вариантах осуществления изобретения антитело, предлагаемое в настоящем изобретении, которое связывается с вирусом Зика, содержит:
(а) (I) HVR-H3, который содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 16, (II) HVR-L3, который содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 27, и (III) HVR-H2, который содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 13;
(б) (I) HVR-H1, который содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 11, (II) HVR-H2, который содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 13, и (III) HVR-H3, который содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 16;
(в) (I) HVR-H1, который содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 11, (II) HVR-H2, который содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 13, (III) HVR-H3, который содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 16, (IV) HVR-L1, который содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 21; (V) HVR-L2, который содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 24; и (VI) HVR-L3, который содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 27; или
(г) (I) HVR-L1, который содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 21; (II) HVR-L2, который содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 24; и (III) HVR-L3, который содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 27.
В других вариантах осуществления изобретения антитело, предлагаемое в настоящем изобретении, которое связывается с вирусом Зика, содержит вариант VH-последовательности, выбранный из группы, которая состоит из: 3СН1047 (SEQ ID NO: 6) и 3СН1049 (SEQ ID NO: 95), с СН-последовательностью человеческого IgG1, выбранной из группы, которая состоит из: SG182 (SEQ ID NO: 46), SG1095 (SEQ ID NO: 54) и SGI 106 (SEQ ID NO: 59); и вариант VL-последовательности, выбранный из группы, которая состоит из: 3CL (SEQ ID NO: 7) и 3CL633 (SEQ ID NO: 98), с человеческой CL-последовательностью SKI (SEQ ID NO: 60).
Краткое описание чертежей
На чертежах показано:
на фиг. 1 (А)-(Г) - иллюстрация BIACORE -сенсограмм антител к DENV 3С и 3Cam к Е-белку DENV-1 (А), Е-белку DENV-2 (Б), Е-белку DENV-3 (В) и Е-белку DENV-4 Е (Г), полученных согласно методу, описанному в примере 2;
на фиг. 2 данные об аффинности связывания антител, содержащих различные варианты Fc, с человеческим C1q, полученные согласно методу, описанному в примере 4. Активность связывания измеряли с помощью ELISA. Тестировали следующие варианты Fc: WT, LALA+KWES, LALA+EFT+АЕ, LALA+EFT и LALA;
на фиг. 3 данные об аффинности связывания антител, содержащих различные варианты Fc, с человеческим C1q, полученные согласно методу, описанному в примере 4. Активность связывания измеряли с помощью ELISA. Тестировали следующие варианты Fc: WT, LALA, LALA+KWES, LALA+KAES, LALA+KDES, LALA+KEES и LALA+KMES;
на фиг. 4 - данные об аффинности связывания антител, содержащих различные варианты Fc, с человеческим C1q, полученные согласно методу, описанному в примере 4. Активность связывания измеряли с помощью ELISA. Тестировали следующие варианты Fc: WT, LALA, LALA+АСТ3, LALA+АСТ5, LALA+KAES, LALA+АСТ3+KAES и LALA+АСТ5+KAES;
на фиг. 5 - данные об аффинности связывания антител, содержащих различные варианты Fc, с человеческим C1q, полученные согласно методу, описанному в примере 4. Активность связывания измеряли с помощью ELISA. Тестировали следующие варианты Fc: WT, LALA, LALA+АСТ3, LALA+ACTS, LALA+KAES, LALA+АСТ3+KAES и LALA+ACT5+KAES;
на фиг. 6 (а)-(з) - данные Biacore-анализа, характеризующие связывание вариантов Fc с человеческими FcγR, полученные согласно методу, описанному в примере 5. Тестировали следующие варианты Fc: WT (на чертеже обозначен как WT IgG), KWES, EFT+АЕ, EFT, KAES, LALA+KWES, LALA+EFT+AE, LALA+EFT, LALA, LALA+АСТ3, LALA+ACT5, LALA+KAES, LALA+KAES+АСТ3 и LALA+KAES+ACT5. Для указанных вариантов Fc оценивали связывание с FcyR, включающими: (а) человеческий FcγR1a, (б) человеческий FcγR2a, аллельный вариант 167Н, (в) человеческий FcγR2a, аллельный вариант 167R, (г) человеческий FcγR2b, (д) человеческий FcγR3a, аллельный вариант 158F, (е) человеческий FcγR3a, аллельный вариант 158V, (ж) человеческий FcγR3b, аллельный вариант NA1 и (з) человеческий FcγR3b, аллельный вариант NA2. Каждый вариант Fc исследовали как в форме индивидуального антитела с вариантом Fc (обозначен как «только Ат»), так и в форме иммунного комплекса, образованного антителом и тримерным антигеном CD154 (обозначен как «CD154 IC»);
на фиг. 7 (а)-(г) данные Biacore-анализа, характеризующие связывание вариантов Fc с мышиными FcγR, полученные согласно методу, описанному в примере 5. Тестировали следующие варианты Fc: WT (на чертеже обозначен как WT IgG), KWES, EFT+АЕ, EFT, KAES, LALA+KWES, LALA+EFT+AE, LALA+EFT, LALA, LALA+АСТ3, LALA+ACT5, LALA+KAES, LALA+KAES+АСТ3 и LALA+KAES+ACTS. Для указанных вариантов Fc оценивали связывание с FcγR, включающими: (а) мышиный FcγR1, (б) мышиный FcγR2b, (в) мышиный FcγR3 и (г) мышиный FcγR4. Каждый вариант Fc исследовали как в форме индивидуального антитела с вариантом Fc (обозначен как «только Ат»), так и в форме иммунного комплекса, образованного антителом и тримерным антигеном CD154 (обозначен как CD154 IC);
на фиг. 8 - данные Biacore-анализа, характеризующие связывание вариантов Fc с человеческим FcRn, полученные согласно методу, описанному в примере 5. Тестировали следующие варианты Fc: WT (на чертеже обозначен как hIgG1), LALA, LALA+АСТ3, LALA+АСТ5, LALA+KAES, LALA+KAES+АСТ3 и LALA+KAES+АСТ5. Каждый вариант Fc исследовали как в форме индивидуального антитела с вариантом Fc (обозначен как «только Ат»), так и в форме иммунного комплекса, образованного антителом и тримерным антигеном CD154 (обозначен как CD154 IC);
на фиг. 9 данные о виремии в день 3 после заражения вирусом DENV-2 мышей линии AG129, полученные согласно методу, описанному в примере 6. Антитела к DENV 3С и 3Cam в комбинации с вариантами Fc WT (обозначен как hIgG1), LALA и LALA+KAES или ЗФР в качестве отрицательного контроля вводили в день 2 после заражения вирусом;
на фиг. 10 данные о виремии в день 3 после заражения вирусами DENV-1 - DENV-4 мышей линии AG129, полученные согласно методу, описанному в примере 6. Антитела к DENV 3С и 3Cam, имеющие одинаковый вариант Fc (LALA+KAES), или Р1-буфер в качестве отрицательного контроля вводили в 2 день после заражения вирусом. LOD: предел обнаружения. Каждым символом обозначен уровень виремии у одной мыши. Односторонний дисперсионный анализ применяли для расчета значимости различий между группами;
на фиг. 11 - данные о виремии в день 3 после заражения вирусом DENV-2 мышей линии AG129, полученные согласно методу, описанному в примере 6. Антитела к DENV 3Cam2-LALA и 3Cam2-LALA+KAES или Р1-буфер в качестве отрицательного контроля вводили в день 2 после заражения вирусом;
на фиг. 12 (А)-(Г) - иллюстрация BIACORE®-сенсограмм антител к DENV 3С и 3Cam2 к Е-белку DENV-1 (А), Е-белку DENV-2 (Б), Е-белку DENV-3 (В) и Е-белку DENV-4 Е (Г), полученных согласно методу, описанному в примере 2;
на фиг. 13 (А)-(Б) результаты анализа нейтрализации вируса Зика, проведенного с использованием клеток BHK-21-DC-SIGN. Применяли штамм вируса Зика KF993678. Каждая экспериментальная точка соответствовала одному измерению. Значение NT50 для 3Cam2-LALA+KAES+ACT5 составляло приблизительно 0,33 мкг/мл, а для 3C-LALA+KAES+ACT5 5,33 мкг/мл в первом эксперименте (А). Значение NT50 для 3Cam2-LALA+KAES+ACT5 составляло приблизительно 0,93 мкг/мл во втором эксперименте (Б);
на фиг. 14 (А)-(Б) - результаты ADE-анализа на клетках К562 для вируса Зика. Применяли штамм вируса Зика KF993678. А) Усиление обнаружено при использовании версии дикого типа 3Cam2, но не при использовании Fc-вариантов 3Cam2-LALA+KAES и 3Cam2-LALA+KAES+ACT5. Инфицированный (на чертеже обозначено «inf»): без добавления антител. Представлены данные в виде средних значений ± погрешность (диапазон) при n=2. Б) Эксперимент повторяли с новой партией 3Cam2-LALA+KAES+ACT5 с использованием версии дикого типа 3Cam2 в качестве контроля. Представлены данные в виде средних значений ± погрешность (диапазон) при n=2;
на фиг. 15 - данные об эффективности in vivo против инфекции, вызываемой вирусом Зика. Мышей инфицировали i.p. вирусом Зика и через два дня после заражения обрабатывали i.v. 100 мкг 3Cam2-LALA+KAES+ACT5 (3Cam2-SG1106) или 3C-LALA+KAES+ACT5 (3C-SG1106). P1-буфер применяли в качестве контроля. Каждая точка соответствует одной мыши и результаты представлены в виде средних значений ±SD. Критерий Крускала-Уоллиса применяли для оценки значимости, *: р<0,05, **: р<0,005;
на фиг. 16 - данные о выживаемости инфицированных вирусом Зика мышей линии IFNAR после обработки антителами. Мышей инфицировали i.p. вирусом Зика и через два дня после заражения обрабатывали i.v. 100 мкг 3Cam2-LALA+KAES+ACT5 или 3C-LALA+KAES+ACT5. P1-буфер применяли в качестве контроля. Представлены данные о проценте выживаемости на группу через 40 дней после заражения;
на фиг. 17 данные об активности связывания моноклональных антител 3С, 3C-LALA и 3Cam2-LALA+KAES+ACT5 с вирусом Зика (ZIKV). Представлены полученные с помощью ELISA кривые для очищенных вирионов ZIKV;
на фиг. 18 - результаты анализа нейтрализующей активности in vitro, полученные с использованием человеческих антител 3С, 3C-LALA и 3Cam2-LALA+KAES+ACT5 против ZIKV. Представлены данные об относительной инфективности вируса при инкубации с антителами по сравнению с вариантом, в котором применяли только вирус. Оценивали две различные партии 3С и 3С-LALA (старую и новую);
на фиг. 19 (А)-(Б) результаты, демонстрирующие, что обработка антителами предупреждала индуцированную ZIKV врожденную недостаточность развития у мышей линии IFNαR KO. (А) Изображения репрезентативных плодов инфицированных имитатором мышей (а), инфицированных ZIKV мышей, обработанных применяемым в качестве контроля изотипа антителом (б), инфицированных ZIKV мышей, обработанных 3C-LALA (в), и инфицированных ZIKV мышей, обработанных 3Cam2-LALA+KAES+ACT5 (г). (Б) Данные о весе плодов в каждой группе (n): вес всего тела (а) и вес головы (б). Каждая точка соответствует 1 плоду;
на фиг. 20 (а)-(г) - результаты, демонстрирующие, что обработка значимо снижала передачу ZIKV от матери к плоду. Представлены данные о вирусной нагрузке в амниотической жидкости (а), плаценте (б), головном мозге плода (в) и печени плода (г). Каждая точка соответствует 1 плоду, n≥7 в каждой группе.
Подробное описание вариантов осуществления изобретения
Технологии и процедуры, которые описаны или на которые сделаны ссылки в настоящем описании, в целом хорошо известны специалистам в данной области, и их широко применяют с использованием общепринятых методологий, таких, например, как описанные у Sambrook и др., Molecular Cloning: А Laboratory Manual, 3-е изд., изд-во Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor, N.Y. 2001; Current Protocols in Molecular Biology (под ред.Б.М. Ausubel и др., 2003); серии Methods in Enzymology (изд-во Academic Press, Inc.): PCR 2: A Practical Approach (под ред. M.J. MacPherson, B.D. Hames и G.R. Taylor, 1995), Antibodies, A Laboratory Manual, под ред. Harlow и Lane, 1988 и Animal Cell Culture (под ред. R.I. Freshney, 1987); Oligonucleotide Synthesis (под ред. M.J. Gait, 1984); Methods in Molecular Biology, изд-во Humana Press; Cell Biology: A Laboratory Notebook (под ред. J.E. Cellis, 1998) из-во Academic Press; Animal Cell Culture (под ред. R.I. Freshney, 1987); Introduction to Cell and Tissue Culture (J. P. Mather и P.E. Roberts, 1998), изд-во Plenum Press; Cell and Tissue Culture: Laboratory Procedures (под ред. A. Doyle, J.B. Griffiths и D.G. Newell, 1993-8), изд-во J. Wiley and Sons; Handbook of Experimental Immunology (под ред. D.M. Weir и С.С. Blackwell); Gene Transfer Vectors for Mammalian Cells (под ред. J.M. Miller и M.P. Calos, 1987); PCR: The Polymerase Chain Reaction, (под ред. Mullis и др., 1994); Current Protocols in Immunology (под ред. J.E. Coligan и др., 1991); Short Protocols in Molecular Biology (изд-во Wiley and Sons, 1999); Immunobiology (C.A. Janeway и P. Travers, 1997); Antibodies (P. Finch, 1997); Antibodies: A Practical Approach (под ред. D. Catty., изд-во IRL Press, 1988-1989); Monoclonal Antibodies: A Practical Approach (под ред. P. Shepherd и С. Dean, изд-во Oxford University Press, 2000); Using Antibodies: A Laboratory Manual (E. Harlow и D. Lane, изд-во Cold Spring Harbor Laboratory Press, 1999); The Antibodies (под ред. M. Zanetti и J.D. Capra, изд-во Harwood Academic Publishers, 1995); и Cancer: Principles and Practice of Oncology (под ред. V.T. DeVita и др., изд-во J.В. Lippincott Company, 1993).
I. Определения
Если не указано иное, то технические и научные понятия, применяемые в настоящем описании, имеют значения, хорошо известные обычному специалисту в области, в которой относится настоящее изобретение. Предназначенное для специалистов в данной области толкование многих понятий, применяемых в настоящей заявке, в целом представлено у Singleton и др., Dictionary of Microbiology and Molecular Biology 2-ое изд., изд-во J. Wiley & Sons, New York, N.Y. 1994 и March, Advanced Organic Chemistry Reactions, Mechanisms and Structure 4-ое изд., изд-во John Wiley & Sons, New York, N.Y. 1992. Bee процитированные в настоящем описании ссылки, включая заявки на патент и публикации патентов, полностью включены в него в качестве ссылки.
Для интерпретации настоящего описания следует применять приведенные ниже определения, и, когда это возможно, понятия, применяемые в единственном числе, включают также их применение во множественном числе и наоборот. Должно быть очевидно, что применяемая в настоящем описании терминология представлена только для цели описания конкретных вариантов осуществления изобретения и не направлена на ограничение его объема. В случае, если любое указанное ниже определение вступает в противоречие с указанным в любом документе, включенном в описание в качестве ссылки, то следует использовать указанное ниже определение.
Для целей настоящего описания «акцепторный человеческий каркасный участок» означает каркасный участок, который содержит аминокислотную последовательность каркасного участка вариабельного домена легкой цепи (VL) или каркасный участок вариабельного домена тяжелой цепи (VH), имеющий происхождение из каркасного участка человеческого иммуноглобулина или человеческого консенсусного каркасного участка, указанного ниже. Акцепторный человеческий каркасный участок, «имеющий происхождение из» каркасного участка человеческого иммуноглобулина или человеческого консенсусного каркасного участка, может иметь такую же аминокислотную последовательность или может содержать изменения в аминокислотной последовательности. В некоторых вариантах осуществления изобретения количество аминокислотных изменений составляет 10 или менее, 9 или менее, 8 или менее, 7 или менее, 6 или менее, 5 или менее, 4 или менее, 3 или менее или 2 или менее. В некоторых вариантах осуществления изобретения последовательность человеческого акцепторного каркасного участка VL идентична последовательности каркасного участка VL человеческого иммуноглобулина или последовательности человеческого консенсусного каркасного участка.
Понятие «аффинность» относится к суммарной силе всех нековалентных взаимодействий между одним сайтом связывания молекулы (например, антитела) и ее партнером по связыванию (например, антигеном). В контексте настоящего описания, если не указано иное, «аффинность связывания» относится к присущей молекуле аффинности связывания, отражающей взаимодействие по типу 1:1 между компонентами связывающейся пары (например, антителом и антигеном). Аффинность молекулы X к ее партнеру Y, как правило, можно характеризовать с помощью константы диссоциации (Kd). Аффинность можно оценивать с помощью общепринятых методов, известных в данной области, включая те, которые представлены в настоящем описании. Ниже в качестве иллюстрации представлены конкретные варианты измерения аффинности связывания.
Антитело «с созревшей аффинностью» означает антитело с одним или несколькими изменениями в одном или нескольких гипервариабельных участках (HVR) по сравнению с родительским антителом, которое не содержит указанных изменений, указанные изменения приводят к повышению аффинности антитела к антигену.
Понятия «антитело к DENV» и «антитело, которое связывается с DENV» относятся к антителу, которое обладает способностью связываться с DENV с аффинностью, достаточной для того, чтобы антитело можно было применять в качестве диагностического и/или терапевтического агента, мишенью которого является DENV. Антитело может связываться с Е-белком DENV. Понятия «антитело к Е-белку DENV» и «антитело, которое связывается с Е-белком DENV» относятся к антителу, которое обладает способностью связываться с Е-белком DENV с аффинностью, достаточной для того, чтобы антитело можно было применять в качестве диагностического и/или терапевтического агента, мишенью которого является DENV. В одном из вариантов осуществления изобретения уровень связывания антитела к Е-белку DENV с неродственным не представляющим собой Е-белок DENV составляет менее чем примерно 10% от связывания антитела с Е-белком DENV по данным измерений, полученным, например, с помощью радиоиммуноанализа (РИА). В некоторых вариантах осуществления изобретения антитело, которое связывается с DENV и/или Е-белком DENV, имеет константу диссоциации (Kd) 1 мкМ или менее, 100 нМ или менее, 10 нМ или менее, 1 нМ или менее, 0,1 нМ или менее, 0,01 нМ или менее или 0,001 нМ или менее (например, 10-8 М или менее, например, от 10-8 М до 10-13 М, например, от 10-9 М до 10-13 М). В некоторых вариантах осуществления изобретения антитело к DENV связывается с эпитопом DENV, который является консервативным для различных серотипов DENV. В некоторых вариантах осуществления изобретения антитело к Е-белку DENV связывается с эпитопом Е-белка DENV, который является консервативным для Е-белка различных серотипов DENV.
Понятия «антитело к вирусу Зика» «антитело против Зика», «антитело к ZIKV» и «антитело, которое связывается с вирусом Зика» относятся к антителу, которое обладает способностью связываться с вирусом Зика с аффинностью, достаточной для того, чтобы антитело можно было применять в качестве диагностического и/или терапевтического агента, мишенью которого является вирус Зика. Понятия «антитело к ZIKV» и «антитело к DENV» можно использовать взаимозаменяемо для обозначения антитела, которое обладает способностью связываться и с вирусом ZIKV, и с DENV.
В контексте настоящего описания понятие «антитело» используется в его наиболее широком смысле и относится к различным структурам антител, включая (но не ограничиваясь только ими) моноклональные антитела, поликлональные антитела, мультиспецифические антитела (например, биспецифические антитела) и фрагменты антител, при условии, что они обладают требуемой антигенсвязывающей активностью.
Понятие «антитело-обусловленная клеточнозависимая цитотоксичность» или «ADCC» относится к форме цитотоксичности, при которой секретируемый Ig, связанный с Fc-рецепторами (FcR), которые присутствуют на некоторых цитотоксических клетках (например, на NK-клетках, нейтрофилах и макрофагах), активирует способность указанных цитотоксических эффекторных клеток специфически связываться с несущими антиген клетками-мишенями и затем уничтожать клетки-мишени с помощью цитотоксинов. Первичные клетки, опосредующие ADCC, т.е. NK-клетки, экспрессируют только Fc-гамма RIII, в то время как моноциты экспрессируют Fc-гамма RI, Fc-гамма RII и Fc-гамма RIII. Данные об экспрессии FcR на гематопоэтических клетках обобщены в таблице 3 на с. 464 у Ravetch и Kinet, Annu. Rev. Immunol. 9, 1991, cc. 457-492. Для оценки ADCC-активности представляющей интерес молекулы можно осуществлять in vitro ADCC-анализ, например, описанный в US №5500362 или 5821337 или в US №6737056 (на имя Presta). Пригодные для такого анализа эффекторные клетки включают РВМС и NK-клетки. В альтернативном или дополнительном варианте ADCC-активность представляющей интерес молекулы можно оценивать in vivo, например, на животной модели, например, как описано у Clynes и др., PNAS (USA) 95, 1998, сс. 652-656.
Понятие «фрагмент антитела» относится к молекуле, отличной от интактного антитела, которая содержит часть интактного антитела, связывающуюся с антигеном, с которым связывается интактное антитело. Примеры фрагментов антитела включают (но не ограничиваясь только ими) Fv, Fab, Fab', Fab'-SH, F(ab')2; димерные антитела (диабоди); линейные антитела; молекулы одноцепочечных антител (например, scFv) и мультиспецифические антитела, образованные из фрагментов антител.
Понятие «антитело, которое связывается с тем же эпитопом», что и референс-антитело, относится к антителу, которое блокирует связывание референс-антитела с его антигеном при оценке с помощью анализа в условиях конкуренции (конкурентный анализ) и/или, наоборот, референс-антитело блокирует связывание антитела с его антигеном при оценке с помощью конкурентного анализа. Пример конкурентного анализа представлен в настоящем описании.
«C1q» представляет собой полипептид, который включает сайт связывания для Fc-области иммуноглобулина. C1q вместе с двумя сериновыми протеазами, C1r и C1s, формирует комплекс С1, который представляет собой первый компонент пути комплементзависимой цитотоксичности (CDC). Человеческий C1q можно покупать, например, у фирмы Quidel, Сан-Диего, шт. Калифорния.
Понятие «химерное» антитело относится к антителу, в котором часть тяжелой и/или легкой цепи имеет происхождение из конкретного источника или вида, а остальная часть тяжелой и/или легкой цепи имеет происхождение из другого источника или вида.
Понятие «класс» антитела относится к типу константного домена или константной области, который/которая входит в его тяжелую цепь. Известно пять основных классов антител: IgA, IgD, IgE, IgG и IgM и некоторые из них можно подразделять дополнительно на подклассы (изотипы), например, IgG1, IgG2, IgG3, IgG4, IgA1 и IgA2. Константные домены тяжелой цепи, которые соответствуют различным классам иммуноглобулинов, обозначают как альфа, дельта, эпсилон, гамма и мю (α, δ, ε, γ и μ) соответственно.
Понятие «комплементзависимая цитотоксичность» или «CDC» относится к лизису клетки-мишени в присутствии комплемента. Активация классического пути системы комплемента инициируется связыванием первого компонента системы комплемента (C1q) с антителами (соответствующего подкласса), которые связаны с когнатным для них антигеном. Для оценки активации комплемента можно осуществлять анализ CDC (см., например, Gazzano-Santoro и др., J. Immunol. Methods 202, 1996, сс. 163-171). Полипептидные варианты с измененными аминокислотными последовательностями Fc-области (полипептиды с вариантом Fc-области) и повышенной или пониженной C1q-связывающей способностью описаны, например, в US №6194551 В1 и WO 1999/51642 (см. также, например, Idusogie и др., J. Immunol. 164, 2000, сс. 4178-4184).
Понятие «цитотоксический агент» в контексте настоящего описания относится к субстанции, которая ингибирует клеточную функцию или препятствует ей и/или вызывает гибель или деструкцию клеток. Цитотоксические агенты включают (но не ограничиваясь только ими) радиоактивные изотопы (например, At211, I131, I125, Y90, Re186, Re188, Sm153, Bi212, P32, Pb212 и радиоактивные изотопы Lu); химиотерапевтические агенты или лекарственные средства (например, метотрексат, адриамицин, алкалоиды барвинка (винкристин, винбластин, этопозид), доксорубицин, мелфалан, митомицин С, хлорамбуцил, даунорубицин или другие интеркалирующие агенты); ингибирующие рост агенты; ферменты и их фрагменты, такие как нуклеолитические ферменты; антибиотики; токсины, такие как низкомолекулярные токсины или ферментативно активные токсины бактериального, грибного, растительного или животного происхождения, включая их фрагменты и/или варианты; и различные противоопухолевые или противораковые агенты, указанные ниже.
Понятие «эффекторные функции» относится к тем видам биологической активности, которые связаны с Fc-областью антитела, которые варьируются в зависимости от изотипа антитела. Примеры эффекторных функций антитела включают: связывание C1q и комплементзависимую цитотоксичность (CDC); связывание Fc-рецептора; антитело-обусловленную клеточнозависимую цитотоксичность (ADCC); фагоцитоз; понижающую регуляцию рецепторов клеточной поверхности (например, В-клеточного рецептора) и активацию В-клеток.
Понятие «эффективное количество» агента, например, фармацевтической композиции, означает количество, эффективное в дозах и в течение периода времени, необходимых для достижения требуемого терапевтического или профилактического результата.
Понятие «эпитоп» включает любую детерминанту, обладающую способностью связываться антителом. Эпитоп представляет собой область антигена, которая связывается с антителом, мишенью которого является указанный антиген, и включает специфические аминокислоты, которые непосредственно контактируют с антителом. Эпитопные детерминанты могут включать химически активные поверхностные группы молекул, таких как аминокислоты, боковые сахарные цепи, фосфорильные или сульфонильные группы, и могут иметь специфические характеристики трехмерной структуры и/или специфические характеристики зарядов. Как правило, антитела, специфические в отношении конкретного антигена-мишени, должны предпочтительно распознавать эпитоп на антигене-мишени в сложной смеси белков и/или макромолекул.
«Fc-рецептор» или «FcR» означает рецептор, который связывается с Fc-областью антитела. В некоторых вариантах осуществления изобретения FcR представляет собой нативный человеческий FcR. В некоторых вариантах осуществления изобретения FcR представляет собой рецептор, который связывается с антителом IgG-класса (гамма-рецептор) и включает рецепторы подкласса Fc-γRI, FcγRII и FcγRIII, в том числе аллельные варианты и полученные в результате альтернативного сплайсинга формы этих рецепторов. Рецепторы FcγRII включают FcγRIIA («активирующий рецептор») и FcγRIIB («ингибирующий рецептор»), которые имеют сходные аминокислотные последовательности, отличающиеся прежде всего их цитоплазматическими доменами. Активирующий рецептор FcγRIIA содержит в своем цитоплазматическом домене активирующие мотивы на основе тирозина иммунорецептора (ITAM). Ингибирующий рецептор FcγRIIB содержит в своем цитоплазматическом домене ингибирующий мотив на основе рецептора тирозина иммунорецептора (ITIM) (см., например, Daeron, Annu. Rev. Immunol. 15, 1997, cc. 203-234). Обзор сведений о FcR представлен, например, у Ravetch и Kinet, Annu. Rev. Immunol. 9, 1991, cc. 457-492; Capel и др., Immunomethods 4, 1994, cc. 25-34 и de Haas и др., J. Lab. Clin. Med. 126, 1995, cc. 330-341. Под понятие «FcR», указанное в настоящем описании, подпадают и другие FcR, включая те, которые будут идентифицированы в будущем.
Понятие «Fc-рецептор» или «FcR» включает также неонатальный рецептор, FcRn, который ответствен за перенос материнских IgG эмбриону (Guyer и др., J. Immunol. 117, 1976, cc. 587-593 и Kim и др., J. Immunol. 24, 1994, cc. 2429-2434) и регулирование гомеостаза иммуноглобулинов. Известны методы измерения связывания с FcRn (см., например, Ghetie и Ward., Immunol. Today 18(12), 1997, cc. 592-598; Ghetie и др., Nature Biotechnology 15(7), 1997, cc. 637-640; Hinton и др., J. Biol. Chem. 279(8), 2004, cc. 6213-6216; WO 2004/92219 (на имя Hinton и др.). Связывание с человеческим FcRn in vivo и время полужизни в сыворотке человеческого FcRn, отличающегося высокой аффинностью связывания с полипептидами, можно оценивать, например, в трансгенных мышах или в трансфектированных человеческих клеточных линиях, экспрессирующих человеческий FcRn, или в приматах, которым вводят полипептиды с вариантом Fc-области. В WO 2000/42072 (на имя Presta) описаны варианты антител с повышенной или пониженной способностью связываться с FcR (см., например, также у Shields и др., J. Biol. Chem. 9(2), 2001, сс. 6591-6604).
Понятие «Fc-область» в контексте настоящего описания относится к С-концевой области тяжелой цепи иммуноглобулина, которая содержит по меньшей мере часть константной области. Понятие включает нативную последовательность Fc-областей и вариант Fc-областей. В одном из вариантов осуществления изобретения Fc-область тяжелой цепи человеческого IgG простирается от Cys226 или от Pro230 до карбоксильного конца тяжелой цепи. Однако С-концевой лизин (Lys447) или глицин-лизин (остатки 446-447) Fc-области может присутствовать или отсутствовать. Если специально не указано иное, то нумерация аминокислотных остатков в Fc-области или константной области соответствует системе нумерации EU, которую обозначают также как EU-индекс, описанной у Kabat Е.А. и др., Sequences of Proteins of Immunological Interest, 5-ое изд., изд-во Public Health Service, National Institutes of Health, Bethesda, MD, 1991.
Понятие «содержащее Fc-область антитело» относится к антителу, которое содержит Fc-область. С-концевой лизин (остаток 447 согласно системе EU-нумерации) или С-концевой глицин-лизин (остатки 446-447) Fc-области может быть удален, например, в процессе очистки антитела или при рекомбинантном конструировании нуклеиновой кислоты, кодирующей антитело. Таким образом, композиция, которая содержит антитело, имеющее Fc-область, предлагаемое в настоящем изобретении, может содержать антитело с G446-K447, с G446 и без K447, со всеми удаленными G446-K447 или смесь из трех описанных выше типов антител.
«Каркасный участок» или «FR», означает остатки вариабельного домена, отличные от остатков гипервариабельного участка (HVR). FR вариабельного домена, как правило, состоит из четырех FR-доменов: FR1, FR2, FR3 и FR4.
Таким образом, последовательности HVR и FR, как правило, имеют следующее расположение в VH (или VL): FR1-H1(L1)-FR2-H2(L2)-FR3-H3(L3)-FR4.
Понятия «полноразмерное антитело», «интактное антитело» и «цельное антитело» в контексте настоящего описания используют взаимозаменяемо для обозначения антитела, имеющего структуру, практически сходную с нативной структурой антитела, или имеющего тяжелые цепи, которые содержат представленную в настоящем описании Fc-область.
«Функциональная Fc-область» обладает «эффекторной функцией», присущей Fc-области с нативной последовательностью. Примеры «эффекторных функций» включают связывание C1q; CDC; связывание Fc-рецептора; ADCC; фагоцитоз; понижающую регуляцию рецепторов клеточной поверхности (например, В-клеточного рецептора; BCR) и т.д. Для проявления указанных эффекторных функций, как правило, требуется, чтобы Fc-область была объединена со связывающим доменом (например, вариабельным доменом антитела), и их можно оценивать с помощью различных анализов, например, представленных в разделе «Определения» в настоящем описании.
Понятия «клетка-хозяин», «линия клеток-хозяев» и «культура клеток-хозяев» используют взаимозаменяемо, и они относятся к клеткам, в которые интродуцирована экзогенная нуклеиновая кислота, включая потомство указанных клеток. К клеткам-хозяевам относятся «трансформанты» и «трансформированные клетки», которые включают первично трансформированную клетку и полученное из нее потомство безотносительно к количеству пересевов. Потомство может не быть полностью идентичным по составу нуклеиновых кислот родительской клетке, но может содержать мутации. Под объем изобретения подпадает мутантное потомство, которое обладает такой же функцией или биологической активностью, которая обнаружена в результате скрининга или отбора у исходной трансформированной клетки.
«Человеческое антитело» представляет собой антитело, имеющее аминокислотную последовательность, которая соответствует последовательности антитела, продуцируемого в организме человека или в человеческой клетке, или имеющее происхождение из нечеловеческого источника, в котором использован спектр человеческих антител или другие кодирующие человеческое антитело последовательности. Из указанного определения человеческого антитела специально исключено гуманизированное антитело, содержащее нечеловеческие антигенсвязывающие остатки.
«Человеческий консенсусный каркасный участок» представляет собой каркасный участок, в который входят наиболее часто встречающиеся аминокислотные остатки в выбранных последовательностях каркасных участков VL или VH человеческого иммуноглобулина. Как правило, выбор последовательностей VL или VH человеческого иммуноглобулина осуществляют из подгруппы последовательностей вариабельных доменов. Как правило, подгруппа последовательностей представляет собой подгруппу, описанную у Kabat и др., Sequences of Proteins of Immunological Interest, 5-ое изд., публикация NIH 91-3242, Bethesda MD, т.т. 1-3, 1991. В одном из вариантов осуществления изобретения касательно VL подгруппа представляет собой подгруппу каппа I согласно Kabat и др., выше. В одном из вариантов осуществления изобретения касательно VH подгруппа представляет собой подгруппу III согласно Kabat и др., выше.
Понятие «гуманизированное» антитело относится к химерному антителу, которое содержит аминокислотные остатки из нечеловеческих HVR и аминокислотные остатки из человеческих FR. В некоторых вариантах осуществления изобретения гуманизированное антитело может содержать практически все из по меньшей мере одного и, как правило, двух вариабельных доменов, в которых все или практически все HVR (например, CDR) соответствуют участкам нечеловеческого антитела, а все или практически все FR соответствуют участкам человеческого антитела. Гуманизированное антитело необязательно может содержать по меньшей мере часть константной области антитела, происходящей из человеческого антитела. Понятие «гуманизированная форма» антитела, например, нечеловеческого антитела, относится к антителу, которое подвергли гуманизации.
Понятие «гипервариабельный участок» или «HVR» в контексте настоящего описания относится к каждому из участков вариабельного домена антитела, последовательности которых являются гипервариабельными («определяющие комплементарность участки» или «CDR») и/или формируют петли определенной структуры («гипервариабельные петли»), и/или содержат контактирующие с антигеном остатки («контакты с антигеном»). Как правило, антитела содержат шесть HVR; три в VH (H1, Н2, Н3) и три в VL (L1, L2, L3). Примеры HVR включают
(а) гипервариабельные петли, включающие аминокислотные остатки 26-32 (L1), 50-52 (L2), 91-96 (L3), 26-32 (H1), 53-55 (Н2) и 96-101 (Н3) (Chothia и Lesk, J. Mol. Biol. 196, 1987, cc. 901-917);
(б) CDR, включающие аминокислотные остатки 24-34 (LI), 50-56 (L2), 89-97 (L3), 31-35b (HI), 50-65 (H2) и 95-102 (Н3) (Kabat и др., Sequences of Proteins of Immunological Interest, 5-ое изд., изд-во Public Health Service, National Institutes of Health, Bethesda, MD,1991);
(в) области контакта с антигеном, включающие аминокислотные остатки 27с-36 (L1), 46-55 (L2), 89-96 (L3), 30-35b (H1), 47-58 (Н2) и 93-101 (Н3) (MacCallum и др., J. Mol. Biol. 262, 1996, cc. 732-745); и
(г) комбинации остатков, указанных в подпунктах (а), (б) и/или (в), включающие аминокислотные остатки HVR 46-56 (L2), 47-56 (L2), 48-56 (L2), 49-56 (L2), 26-35 (H1), 26-35b (HI), 49-65 (Н2), 93-102 (Н3) и 94-102 (Н3).
Если специально не указано иное, то остатки в HVR и другие остатки в вариабельном домене (например, остатки в FR) нумеруют согласно Kabat и др., выше.
«Иммуноконъюгат» представляет собой антитело, конъюгированное с одной или несколькими гетерологичной(ыми) молекулой(ами), включая (но не ограничиваясь только им) цитотоксический агент.
«Индивидуум» или «субъект» представляет собой млекопитающее. К млекопитающим относятся (но не ограничиваясь только ими) одомашненные животные (например, коровы, овцы, кошки, собаки и лошади), приматы (например, человек и приматы кроме человека, например, обезьяны), кролики и грызуны (например, мыши и крысы). В некоторых вариантах осуществления изобретения индивидуум или субъект представляет собой человека.
«Выделенное» антитело представляет собой антитело, которое отделено от компонента его естественного окружения. В некоторых вариантах осуществления изобретения антитело очищают до чистоты, превышающей 95% или 99% по данным, например, электрофоретических анализов (таких, например, как ДСН-ПААГ, изоэлектрическое фокусирование (ИЭФ), капиллярный электрофорез) или хроматографических анализов (таких, например, как ионообменная хроматография или ЖХВР с обращенной фазой). Обзор методов оценки чистоты антител см., например, у Flatman и др., J. Chrom. В 848, 2007, сс. 79-87.
«Выделенная» нуклеиновая кислота представляет собой молекулу нуклеиновой кислоты, которая отделена от компонента ее естественного окружения. Выделенная нуклеиновая кислота включает молекулу нуклеиновой кислоты, содержащуюся в клетке, которая в норме включает молекулу нуклеиновой кислоты, но в которой молекула нуклеиновой кислоты присутствует вне хромосомы или в которой ее локализация на хромосоме отличается от ее встречающейся в естественных условиях локализации на хромосоме.
Понятие «выделенная нуклеиновая кислота, кодирующая антитело» относится к одной или нескольким молекулам нуклеиновых кислот, кодирующих тяжелые и легкие цепи антитела (или их фрагменты), включая указанную(ые) молекулу(ы) нуклеиновой кислоты в одном векторе или в различных векторах, и указанную(ые) молекулу(ы) нуклеиновой(ых) кислоты(т), присутствующую(ие) в одном или нескольких положениях в клетке-хозяине.
Понятие «моноклональное антитело» в контексте настоящего описания относится к антителу, полученному из популяции практически гомогенных антител, т.е. индивидуальные антитела, входящие в популяцию, идентичны и/или связываются с одним и тем же эпитопом, за исключением возможных вариантов антител, например, содержащих мутации, встречающиеся в естественных условиях или возникающие в процессе производства препарата моноклонального антитела, указанные варианты, как правило, присутствуют в минорных количествах. В отличие от препаратов поликлональных антител, которые, как правило, включают различные антитела к различным детерминантам (эпитопам), каждое моноклональное антитело из препарата моноклонального антитела направлено против одной детерминаты на антигене. Таким образом, прилагательное «моноклональный» определяет особенность антитела, характеризуя его как полученное из практически гомогенной популяции антител, а не сконструированное в соответствии с требованиями к получению антитела с помощью какого-либо конкретного метода. Например, моноклональные антитела, которые можно применять согласно настоящему изобретению, можно создавать с помощью различных технологий, включая (но не ограничиваясь только ими) метод гибридом, методы рекомбинантной ДНК, методы фагового дисплея и методы, основанные на использовании трансгенных животных, которые содержат все или часть локусов человеческого иммуноглобулина, указанные методы и другие, приведенные в качестве примера методы получения моноклональных антител, представлены в настоящем описании.
Понятие «голое антитело» относится к антителу, неконъюгированному с гетерологичным фрагментом (например, цитотоксическим фрагментом) или радиоактивной меткой. Голое антитело может присутствовать в фармацевтической композиции.
Понятие «нативные антитела» относится к встречающимся в естественных условиях молекулам иммуноглобулинов с различными структурами. Например, нативные антитела в виде IgG представляют собой гетеротетрамерные гликопротеины с молекулярной массой примерно 150000 Да, состоящие из двух идентичных легких цепей и двух идентичных тяжелых цепей, связанных дисульфидными мостиками. В направлении от N-конца к С-концу, каждая тяжелая цепь имеет вариабельную область (VH), которую называют также вариабельным тяжелым доменом или вариабельным доменом тяжелой цепи, за которой следует три константных домена (CH1, СН2 и СН3). Аналогично этому, в направлении от N-конца к С-концу, каждая легкая цепь имеет вариабельную область (VL), которую называют также вариабельным легким доменом или вариабельным доменом легкой цепи, за которой следует константный домен легкой цепи (CL). Легкая цепь антитела в зависимости от аминокислотной последовательности ее константного домена может принадлежать к одному из двух типов, которые обозначают каппа (κ) и лямбда (λ).
«Имеющая нативную последовательность Fc-область» содержит аминокислотную последовательность, идентичную аминокислотной последовательности Fc-области, которая встречается в природе. Нативная последовательность человеческих Fc-областей включает нативную последовательность Fc-области человеческого IgGl (не-А- и А-аллотипов); нативную последовательность Fc-области человеческого IgG2; нативную последовательность Fc-области человеческого IgG3 и нативную последовательность Fc-области человеческого IgG4, а также их встречающиеся в естественных условиях варианты.
Понятие «листовка-вкладыш в упаковку» относится к инструкциям, которые обычно входят в поступающие в продажу упаковки терапевтических продуктов, содержащим информацию о показаниях, применении, дозе, пути введения, комбинированной терапии, противопоказаниях и/или мерах предосторожности, которые связаны с применением указанных терапевтических продуктов.
«Процент (%) идентичности аминокислотной последовательности» относительно полипептидной референс-последовательности определяют как процент аминокислотных остатков в последовательности-кандидате, которые идентичны аминокислотным остаткам в полипептидной референс-последовательности, после выравнивая последовательностей и при необходимости интродукции брешей для достижения максимального процента идентичности последовательностей, и не рассматривая какие-либо консервативные замены в качестве компонента при оценке идентичности последовательностей. Сравнительный анализ для целей определения процента идентичности аминокислотных последовательностей можно осуществлять различными путями, известными в данной области, используя, например, публично доступные компьютерные программы, такие как программа BLAST, BLAST-2, ALIGN, Megalign (DNASTAR) или GENETYX® (фирма Genetyx Co., Ltd.) Специалисты в данной области могут определять соответствующие параметры для выравнивания последовательностей, включая любые алгоритмы, необходимые для достижения максимального выравнивания по всей длине сравниваемых последовательностей.
Авторство компьютерной программы для сравнения последовательностей ALIGN-2 принадлежит фирме Genentech, Inc., и исходный код был представлен в комплекте с документацией для пользователей в U.S. Copyright Office, Washington D.C., 20559, где он зарегистрирован как U.S. Copyright Registration №TXU510087. Программа ALIGN-2 публично доступна от фирмы Genentech, Inc., Южный Сан-Франциско, шт. Калифорния, или ее можно компилировать на основе исходного кода. Программу ALIGN-2 можно компилировать для применения в операционной системе UNIX, включая цифровую систему UNIX V4.0D. Все параметры, требуемые для сравнения последовательностей, устанавливаются программой ALIGN-2 и не должны изменяться. В ситуациях, в которых ALIGN-2 применяют для сравнения аминокислотных последовательностей, % идентичности аминокислотных последовательностей данной аминокислотной последовательности А по сравнению с или относительно данной аминокислотной последовательности Б (что в альтернативном варианте можно обозначать как данная аминокислотная последовательность А, которая имеет или содержит определенный % идентичности аминокислотной последовательности по сравнению с или относительно данной аминокислотной последовательности Б), рассчитывают следующим образом:
100 × дробь X/Y,
где X обозначает количество аминокислотных остатков, определенных как идентичные совпадения при оценке с помощью программы для сравнительного анализа последовательностей ALIGN-2, где с помощью программы осуществляли сравнение А и Б, и где Y обозначает общее количество аминокислотных остатков в Б. Должно быть очевидно, что, если длина аминокислотной последовательности А не равна длине аминокислотной последовательности Б, то % идентичности аминокислотных последовательностей А относительно Б не может быть равен % идентичности аминокислотной последовательности Б относительно А. Если специально не указано иное, то все величины % идентичности аминокислотных последовательностей, указанные в настоящем описании, получали с использованием описанной в предыдущем параграфе компьютерной программы ALIGN-2.
Понятие «фармацевтическая композиция» относится к препарату, который находится в такой форме, которая обеспечивает биологическую активность входящего в ее состав действующего вещества, которое должно обладать эффективностью, и которая не содержит дополнительных компонентов, обладающих неприемлемой токсичностью для индивидуума, которому следует вводить композицию.
«Фармацевтически приемлемый носитель» относится к ингредиенту в фармацевтической композиции, отличному от действующего вещества, который является нетоксичным для индивидуума. Фармацевтически приемлемые носители включают (но не ограничиваясь только ими) буфер, эксципиент, стабилизатор или консервант.
Понятие «Е-белок DENV» в контексте настоящего описания относится к любому нативному Е-белку DENV из любого серотипа DENV, включая, если не указано иное, DENV-1, DENV-2, DENV-3 и DENV-4. Геном DENV кодирует три структурных (капсидный (С), (пре)мембранный/мембранный (prM/М) и оболочечный (Е)) и семь неструктурных (NS1, NS2A, NS2B, NS3, NS4A, NS4B и NS5) белков. Е-белок, гликопротеин с молекулярной массой примерно 55 кДа, присутствует в виде гетеродимера с PrM-белком до созревания вириона. С помощью кристаллографических исследований в рентгеновских лучах эктодомена Е-белка установлено наличие трех различных бета-бочкообразных (бета-складчатых) доменов, соединенных с вирусной мембраной с помощью имеющего спиральный ствол якоря, и двух антипараллельных трансмембранных доменов. Домен III (EDIII) имеет вид иммуноглобулинподобной складки и, как предполагается, играет основную роль во взаимодействиях с рецепторами. Домен II (EDII) представляет собой удлиненный домен, состоящий из двух длинных пальцеобразных структур, и содержит высококонсервативную состоящую из 13 аминокислот слитую петлю (EDII-FL) на вершине, и он участвует в слиянии с мембраной и димеризации Е-белка. Центральный домен (домен I; EDI) представляет собой состоящую из девяти цепей β-бочку, соединенную с EDIII и EDII с помощью одного и четырех гибких линкеров соответственно. Е-белки являются важными для вирусной сборки, соединения с рецептором, проникновения, вирусного слияния и возможно ускользания от иммунологического надзора в процессе жизненного цикла вируса и, следовательно, представляют собой динамичные белки, требуемые для принятия нескольких различных конформаций и расположений на вирусной частице. Под понятие подпадает «полноразмерный» непроцессированный Е-белок DENV, а также любая форма Е-белка DENV, являющаяся результатом процессинга в клетке. Под понятие подпадают встречающиеся в естественных условиях варианты Е-белка DENV, например, варианты серотипов или квазивиды.
«Вирус Зика (ZIKV)» в контексте настоящего описания обозначает член семейства вирусов Flaviviridae. Он переносится активными в дневное время комарами рода Aedes, такими как A. aegypti и A. albopictus. Геном ZIKV кодирует один полипротеин, состоящий из 3419 аминокислот, который расщепляется вирусными сериновой протеазой и клеточной протезой фурина с образованием двух функциональных доменов: капсидного (С), предшественника мембранного (ргМ), оболочечного (Е) и 7 неструктурных белков (NS).
Понятие «практически уменьшается», «практически повышается» или «практически различается» в контексте настоящего описания относится к значимо высокой степени различия двух численных значений (одно из которых, как правило, ассоциировано с молекулой, а другое ассоциировано с референс-молекулой/молекулой с которой проводится сравнение), такой, что специалист в данной области может рассматривать различие между двумя значениями как статистически значимое в контексте биологической характеристики, которую оценивают указанными значениями (например, значениями Kd).
В контексте настоящего описания понятие «лечение» (и его грамматические вариации, такие как «лечить» или «процесс лечения») относится к клиническому вмешательству с целью изменения естественного течения болезни у индивидуума, подлежащего лечению, и его можно осуществлять либо для профилактики, либо в процессе развития клинической патологии. Требуемыми действиями лечения являются (но не ограничиваясь только ими) предупреждение возникновения или рецидива болезни, облегчение симптомов, уменьшение любых прямых или косвенных патологических последствий болезни, предупреждение метастазов, снижение скорости развития болезни, облегчение или временное ослабление болезненного состояния и ремиссия или улучшение прогноза. В некоторых вариантах осуществления изобретения антитела, предлагаемые в изобретении, применяют для задержки развития болезни или замедления прогрессирования болезни.
Понятие «вариабельная область» или «вариабельный домен» относится к домену тяжелой или легкой цепи антитела, который участвует в связывании антитела с антигеном. Вариабельные домены тяжелой цепи и легкой цепи (VH и VL соответственно) нативного антитела, как правило, имеют сходные структуры, при этом каждый домен содержит четыре консервативных каркасных участка (FR) и три гипервариабельных участка (HVR) (см., например, Kindt и др., Kuby Immunology, 6-ое изд., изд-во W.H. Freeman and Co., 2007, с. 91).
Одного VH- или VL-домена может быть достаточно для обеспечения специфичности связывания антигена. Кроме того, антитела, которые связываются с конкретным антигеном, можно выделять, используя VH- или VL-домен из антитела, которое связывается с антигеном, для скрининга библиотеки комплементарных VL- или VH-доменов соответственно (см., например, Portolano и др., J. Immunol. 150, 1993, сс. 880-887; Clarkson и др., Nature 352, 1991, сс. 624-628).
«Вариант Fc-области» содержит аминокислотную последовательность, которая отличается от нативной последовательности Fc-области благодаря наличию по меньшей мере одной аминокислотной модификации (изменения), предпочтительно одной или нескольких аминокислотной(ых) замены(замен). Предпочтительно вариант Fc-области имеет по меньшей мере одну аминокислотную замену по сравнению с нативной последовательностью Fc-области родительского полипептида, например, от примерно одной до примерно десяти аминокислотных замен, и предпочтительно от примерно одной до примерно пяти аминокислотных замен в нативной последовательности Fc-области или в Fc-области родительского полипептида. Вариант Fc-области предпочтительно должен обладать по меньшей мере примерно 80%-ной гомологией с нативной последовательностью Fc-области и/или Fc-области родительского полипептида и наиболее предпочтительно по меньшей мере примерно 90%-ной гомологией с ней, более предпочтительно по меньшей мере примерно 95%-ной гомологией с ней.
Понятие «вектор» в контексте настоящего описания относится к молекуле нуклеиновой кислоты, которая обладает способностью к размножению другой нуклеиновой кислоты, с которой она связана. Понятие включает вектор в виде самореплицирующейся структуры нуклеиновой кислоты, а также вектор, включенный в геном клетки-хозяина, в которую он интродуцирован. Некоторые векторы обладают способностью контролировать экспрессию нуклеиновых кислот, с которыми они функционально связаны. Указанные векторы в контексте настоящего описания обозначают как «экспрессионные векторы».
II. Композиции и способы
Одним из объектов изобретения являются, в частности, антитела к DENV и их применения. Некоторыми вариантами осуществления изобретения являются антитела, которые связываются с DENV и/или Е-белком DENV. Антитела, предлагаемые в изобретении, можно применять, например, для диагностирования или лечения вызываемой DENV инфекции.
Одним из объектов изобретения являются, в частности полипептиды, содержащие варианты Fc-областей, и их применения. Некоторыми вариантами осуществления изобретения являются полипептиды, содержащие варианты Fc-областей с существенно пониженной FcyRIIb-связывающей активностью. Некоторыми вариантами осуществления изобретения являются полипептиды, содержащие варианты Fc-областей без существенно пониженной C1q-связывающей активности. В конкретных вариантах осуществления изобретения полипептиды, предлагаемые в изобретении, представляют собой антитела. Полипептиды, содержащие варианты Fc-областей, предлагаемые в изобретении, можно применять, например, для диагностирования или лечения вирусной инфекции.
Одним из объектов изобретения являются, в частности, антитела к ZIKV и их применения. Некоторыми вариантами осуществления изобретения являются антитела, которые связываются с ZIKV. Некоторыми вариантами осуществления изобретения является антитела к ZIKV, обладающие перекрестной реактивностью с DENV.
Одним из объектов изобретения являются, в частности, способы лечения или предупреждения вызываемой вирусом Зика инфекции, включающие введение антител, которые связываются с ZIKV. Одним из объектов изобретения являются, в частности, способы ингибирования передачи вируса Зика от беременной матери к плоду, включающие введение антител, которые связываются с ZIKV. Одним из объектов изобретения являются, в частности, способы предупреждения врожденного синдрома, вызванного вирусом Зика, включающие введение антител, которые связываются с ZIKV. Одним из объектов изобретения являются, в частности, способы ингибирования уменьшения веса плода (например, веса всего тела ребенка, веса головы и т.д.), включающие введение антител, которые связываются с ZIKV.
В одном из примеров, понятие «врожденный синдром, вызванный вирусом Зика» относится к особой системе врожденных дефектов, уникальной для плодов и младенцев, зараженных до рождения вирусом Зика. Как должно быть очевидно специалисту в данной области, индивидуумы с врожденным синдромом, вызванным вирусом Зика, могут иметь такие синдромы как (но не ограничиваясь только ими) дефицит умственного развития, микроцефалия, серьезная микроцефалия, при которой имеет место частичное уменьшение размера черепа, уменьшение ткани головного мозга со специфической схемой поражения головного мозга, включая субкортикальную кальцификацию, повреждение задней части глаза, включая макулярные рубцы и очаговую пятнистую пигментацию сетчатки, врожденные контрактуры, такие как косолапость или артрогрипоз, гипертония, ограничивающая движение организма вскоре после рождения, и т.п. Вероятно, введение антител, представленных в настоящем описании, может предупреждать по меньшей мере один или по меньшей мере два, или по меньшей мере три, или по меньшей мере четыре, или все симптомы врожденного синдрома, вызванного вирусом Зика. Например, антитело, представленное в настоящем описании, предупреждает заражением вирусом Зика плода или младенца до рождения, тем самым ингибируя уменьшение веса плода (например, веса всего тела ребенка, веса головы и т.д.).
В одном из объектов изобретения понятие «антитело к DENV», указанное в этом разделе (П. Композиции и способы) можно применять для обозначения антитела, которое обладает способностью связываться с ZIKV («антитело к ZIKV»), если антитело может связываться и с DENV, и с ZIKV. Одним из объектов изобретения являются способы лечения или предупреждения инфекции, вызываемой вирусом Зика, включающие введение антител, которые связываются вирусом Зика («антитело к ZIKV»). Одним из объектов изобретения является способ ингибирования передачи вируса Зика от беременной матери к плоду, включающий введение антител, которые связываются с вирусом Зика.
А. Примеры антител к DENV и полипептидов, содержащих варианты Fc-областей
Одним из объектов изобретения являются выделенные антитела, которые связываются с DENV и/или Е-белком DENV. В некоторых вариантах осуществления изобретения антитело к DENV блокирует связывание DENV и/или Е-белка DENV с клеткой-хозяином. В некоторых вариантах осуществления изобретения антитело к DENV ингибирует проникновение DENV в клетку-хозяина. В некоторых вариантах осуществления изобретения антитело к DENV связывается с цельной частицей DENV. В других вариантах осуществления изобретении антитело связывается с цельной частицей DENV лучше, чем с мономерным Е-белком DENV. В некоторых вариантах осуществления изобретения антитело к DENV, предлагаемое в настоящем изобретении связывается и/или нейтрализует по меньшей мере один, по меньшей мере два, по меньшей мере три или все четыре серотипа DENV, выбранных из группы, которая состоит из серотипа 1 DENV (DENV-1), серотипа 2 DENV (DENV-2), серотипа 3 DENV (DENV-3) и серотипа 4 DENV (DENV-4). В некоторых вариантах осуществления изобретения антитело к DENV связывается и/или нейтрализует Е-белок DENV, имеющий происхождение по меньшей мере из одного, по меньшей мере из двух, по меньшей мере из трех или всех четырех серотипов DENV, выбранных из группы, которая состоит из DENV-1, DENV-2, DENV-3 и DENV-4. Понятие «серотип» относится к различным вариациям одного вида вируса.
Одним из объектов изобретения являются выделенные антитела, которые связываются с ZIKV. В некоторых вариантах осуществления изобретения антитело к ZIKV блокирует связывание ZIKV с клеткой-хозяином. В некоторых вариантах осуществления изобретения антитело к ZIKV ингибирует проникновение ZIKV в клетку-хозяина. В некоторых вариантах осуществления изобретения антитело к ZIKV обладает перекрестной реактивностью с DENV. Одним из объектов изобретения является антитело к DENV, которое содержит по меньшей мере один, два, три, четыре, пять или шесть HVR, выбранных из (а) HVR-H1, который содержит аминокислотную последовательность, представленную в любой из SEQ ID NO: 11-12; (б) HVR-H2, который содержит аминокислотную последовательность, представленную в любой из SEQ ID NO: 13-15; (в) HVR-H3, который содержит аминокислотную последовательность, представленную в любой из SEQ ID NO: 16-20; (г) HVR-L1, который содержит аминокислотную последовательность, представленную в любой из SEQ ID NO: 21-23; (д) HVR-L2, который содержит аминокислотную последовательность, представленную в любой из SEQ ID NO: 24-26; и (е) HVR-L3, который содержит аминокислотную последовательность, представленную в любой из SEQ ID NO: 27-30.
Другим объектом изобретения является антитело к DENV, которое содержит по меньшей мере один, два, три, четыре, пять или шесть HVR, выбранных из (a) HVR-H1, который содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 40; (б) HVR-H2, который содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 41; (в) HVR-H3, который содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 42; (г) HVR-L1, который содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 43; (д) HVR-L2, который содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 44; и (е) HVR-L3, который содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 45.
Другим объектом изобретения является антитело к DENV, которое содержит по меньшей мере один, два, три, четыре, пять или шесть HVR, выбранных из (a) HVR-H1, который содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 12; (б) HVR-H2, который содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 15; (в) HVR-H3, который содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 20; (г) HVR-L1, который содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 23; (д) HVR-L2, который содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 26; и (е) HVR-L3, который содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 30.
Другим объектом изобретения является антитело к DENV, которое содержит по меньшей мере один, два, три, четыре, пять или шесть HVR, выбранных из (a) HVR-H1, который содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 12; (б) HVR-H2, который содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 15; (в) HVR-H3, который содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 20; (г) HVR-L1, который содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 21; (д) HVR-L2, который содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 24; и (е) HVR-L3, который содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 27.
Одним из объектов изобретения является антитело, которое содержит по меньшей мере одну, по меньшей мере две или все три HVR-последовательности VH, выбранные из (a) HVR-H1, который содержит аминокислотную последовательность, представленную в любой из SEQ ID NO: 11-12; (б) HVR-H2, который содержит аминокислотную последовательность, представленную в любой из SEQ ID NO: 13-15; и (в) HVR-H3, который содержит аминокислотную последовательность, представленную в любой из SEQ ID NO: 16-20. В одном из вариантов осуществления изобретения антитело содержит HVR-H3, который содержит аминокислотную последовательность, представленную в любой из SEQ ID NO: 16-20. В другом варианте осуществления изобретения антитело содержит HVR-H3, который содержит аминокислотную последовательность, представленную в любой из SEQ ID NO: 16-20, и HVR-L3, который содержит аминокислотную последовательность, представленную в любой из SEQ ID NO: 27-30. В следующем варианте осуществления изобретения антитело содержит HVR-H3, который содержит аминокислотную последовательность, представленную в любой из SEQ ID NO: 16-20, HVR-L3, который содержит аминокислотную последовательность, представленную в любой из SEQ ID NO: 27-30, и HVR-H2 который содержит аминокислотную последовательность, представленную в любой из SEQ ID NO: 13-15. В следующем варианте осуществления изобретения антитело содержит (a) HVR-H1, который содержит аминокислотную последовательность, представленную в любой из SEQ ID NO: 11-12; (б) HVR-H2, который содержит аминокислотную последовательность, представленную в любой из SEQ ID NO: 13-15; и (в) HVR-H3, который содержит аминокислотную последовательность, представленную в любой из SEQ ID NO: 16-20.
Другим объектом изобретения является антитело, которое содержит по меньшей мере одну, по меньшей мере две или все три HVR-последовательности VH, выбранные из (a) HVR-H1, который содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 40; (б) HVR-H2, который содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 41; и (в) HVR-H3, который содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 42. В другом варианте осуществления изобретения антитело содержит HVR-H3, который содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 42, и HVR-L3, который содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 45. В другом варианте осуществления изобретения антитело содержит HVR-H3, который содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 42, HVR-L3, который содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 45, и HVR-H2, который содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 41. В следующем варианте осуществления изобретения антитело содержит (а) HVR-H1, который содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 40; (б) HVR-H2, который содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 41; и (в) HVR-H3, который содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 42.
Другим объектом изобретения является антитело, которое содержит по меньшей мере одну, по меньшей мере две или все три HVR-последовательности VH, выбранные из (a) HVR-H1, который содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 12; (б) HVR-H2, который содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 15; и (в) HVR-H3, который содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 20. В одном из вариантов осуществления изобретения антитело содержит HVR-H3, который содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 20. В другом варианте осуществления изобретения антитело содержит HVR-H3, который содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 20, и HVR-L3, который содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 30. В другом варианте осуществления изобретения антитело содержит HVR-H3, который содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 20, и HVR-L3, который содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 27. В следующем варианте осуществления изобретения антитело содержит HVR-H3, который содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 20, HVR-L3, который содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 30, и HVR-H2, который содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 15. В следующем варианте осуществления изобретения антитело содержит HVR-Н3, который содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 20, HVR-L3, который содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 27, и HVR-H2, который содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 15. В следующем варианте осуществления изобретения антитело содержит (a) HVR-H1, который содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 12; (б) HVR-H2, который содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 15; и (в) HVR-H3, который содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 20.
Другим объектом изобретения является антитело, которое содержит по меньшей мере одну, по меньшей мере две или все три HVR-последовательности VL, выбранные из (a) HVR-L1, который содержит аминокислотную последовательность, представленную в любой из SEQ ID NO: 21-23; (б) HVR-L2, который содержит аминокислотную последовательность, представленную в любой из SEQ ID NO: 24-26; и (в) HVR-L3, который содержит аминокислотную последовательность, представленную в любой из SEQ ID NO: 27-30. В одном из вариантов осуществления изобретения антитело содержит (a) HVR-L1, который содержит аминокислотную последовательность, представленную в любой из SEQ ID NO: 21-23; (б) HVR-L2, который содержит аминокислотную последовательность, представленную в любой из SEQ ID NO: 24-26; и (в) HVR-L3, который содержит аминокислотную последовательность, представленную в любой из SEQ ID NO: 27-30.
Другим объектом изобретения является антитело, которое содержит по меньшей мере одну, по меньшей мере две или все три HVR-последовательности VL, выбранные из (a) HVR-L1, который содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 43; (б) HVR-L2, который содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 44; и (в) HVR-L3, который содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 45. В одном из вариантов осуществления антитело содержит (a) HVR-L1, который содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 43; (б) HVR-L2, который содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 44; и (в) HVR-L3, который содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 45.
Другим объектом изобретения является антитело, которое содержит по меньшей мере одну, по меньшей мере две или все три HVR-последовательности VL, выбранные из (a) HVR-L1, который содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 23; (б) HVR-L2, который содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 26; и (в) HVR-L3, который содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 30. В одном из вариантов осуществления изобретения антитело содержит (a) HVR-L1, который содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 23; (б) HVR-L2, который содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 26; и (в) HVR-L3, который содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 30.
В другом объекте изобретения антитело, предлагаемое в изобретении, содержит (а) VH-домен, который содержит по меньшей мере одну, по меньшей мере две или все три HVR-последовательности VH, выбранные из (I) HVR-H1, который содержит аминокислотную последовательность, представленную в любой из SEQ ID NO: 11-12, (II) HVR-H2, который содержит аминокислотную последовательность, представленную в любой из SEQ ID NO: 13-15, и (III) HVR-НЗ, который содержит аминокислотную последовательность, представленную в любой из SEQ ID NO: 16-20; и (б) VL-домен, который содержит по меньшей мере одну, по меньшей мере две или все три HVR-последовательности VL, выбранные из (I) HVR-L1, который содержит аминокислотную последовательность, представленную в любой из SEQ ID NO: 21-23, (II) HVR-L2, который содержит аминокислотную последовательность, представленную в любой из SEQ ID NO: 24-26, и (III) HVR-L3, который содержит аминокислотную последовательность, представленную в любой из SEQ ID NO: 27-30.
В другом объекте изобретения антитело, предлагаемое в изобретении, содержит (а) VH-домен, который содержит по меньшей мере одну, по меньшей мере две или все три HVR-последовательности VH, выбранные из (I) HVR-H1, который содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 40, (II) HVR-H2, который содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 41, и (III) HVR-H3, который содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 42; и (б) VL-домен, который содержит по меньшей мере одну, по меньшей мере две или все три HVR-последовательности VL, выбранные из (I) HVR-L1, который содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 43, (II) HVR-L2, который содержит аминокислотную последовательность, представленную в любой из SEQ ID NO: 44, и (III) HVR-L3, который содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 45.
В другом объекте изобретения антитело, предлагаемое в изобретении, содержит (а) VH-домен, который содержит по меньшей мере одну, по меньшей мере две или все три HVR-последовательности VH, выбранные из (I) HVR-H1, который содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 12, (II) HVR-H2, который содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 15, и (III) HVR-H3, который содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 20; и (б) VL-домен, который содержит по меньшей мере одну, по меньшей мере две или все три HVR-последовательности VL, выбранные из (I) HVR-L1, который содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 23, (II) HVR-L2, который содержит аминокислотную последовательность, представленную в любой из SEQ ID NO: 26, и (III) HVR-L3, который содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 30.
В другом объекте изобретения антитело, предлагаемое в изобретении, содержит (а) VH-домен, который содержит по меньшей мере одну, по меньшей мере две или все три HVR-последовательности VH, выбранные из (I) HVR-H1, который содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 12, (II) HVR-H2, который содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 15, и (III) HVR-H3, который содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 20; и (б) VL-домен, который содержит по меньшей мере одну, по меньшей мере две или все три HVR-последовательности VL, выбранные из (I) HVR-L1, который содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 21, (II) HVR-L2, который содержит аминокислотную последовательность, представленную в любой из SEQ ID NO: 24, и (III) HVR-L3, который содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 27.
Другим объектом изобретения является антитело, содержащее (a) HVR-H1, который содержит аминокислотную последовательность, представленную в любой из SEQ ID NO: 11-12; (б) HVR-H2, который содержит аминокислотную последовательность, представленную в любой из SEQ ID NO: 13-15; (в) HVR-H3, который содержит аминокислотную последовательность, представленную в любой из SEQ ID NO: 16-20; (г) HVR-L1, который содержит аминокислотную последовательность, представленную в любой из SEQ ID NO: 21-23; (д) HVR-L2, который содержит аминокислотную последовательность, представленную в любой из SEQ ID NO: 24-26; и (е) HVR-L3, который содержит аминокислотную последовательность, представленную в любой из SEQ ID NO: 27-30.
Другим объектом изобретения является антитело, содержащее (a) HVR-H1, который содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 40; (б) HVR-H2, который содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 41; (в) HVR-H3, который содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 42; (г) HVR-L1, который содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 43; (д) HVR-L2, который содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 44; и (е) HVR-L3, который содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 45.
Другим объектом изобретения является антитело, содержащее (a) HVR-H1, который содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 12; (б) HVR-H2, который содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 15; (в) HVR-H3, который содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 20; (г) HVR-L1, который содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 23; (д) HVR-L2, который содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 26; и (е) HVR-L3, который содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 30.
Другим объектом изобретения является антитело, содержащее (a) HVR-H1, который содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 12; (б) HVR-H2, который содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 15; (в) HVR-H3, который содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 20; (г) HVR-L1, который содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 21; (д) HVR-L2, который содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 24; и (е) HVR-L3, который содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 27.
В некоторых вариантах осуществления изобретения в антителе к DENV, описанном выше, любую одну или любые несколько аминокислот заменяют в следующих положениях в HVR: (а) в HVR-H1 (SEQ ID NO: 11) в положениях 2 и 4; (б) в HVR-H2 (SEQ ID NO: 13) в положениях 9 и 10; (в) в HVR-H3 (SEQ ID NO: 16) в положениях 3, 14 и 16; (г) в HVR-L1 (SEQ ID NO: 21) в положениях 5 и 8; (д) в HVR-L2 (SEQ ID NO: 24) в положениях 4 и 7; и (е) в HVR-L3 (SEQ ID NO: 27) в положениях 4 и 5.
В некоторых вариантах осуществления изобретения одна или несколько аминокислотных замен в антителе к DENV представляют собой консервативные замены, указанные в настоящем описании. В некоторых вариантах осуществления изобретения любую одну или любые несколько следующих замен можно осуществлять в любой комбинации: (а) в HVR-H1 (SEQ ID NO: 11), N2Y; I4M; (б) в HVR-H2 (SEQ ID NO: 13), T9R; A10R; (в) в HVR-H3 (SEQ ID NO: 16), R3E; R14F; G16D или L; (г) в HVR-L1 (SEQ ID NO: 21), D5E; K8Q; (д) в HVR-L2 (SEQ ID NO: 24), N4E; T7F; и (e) в HVR-L3 (SEQ ID NO: 27), D4S или E; D5A.
Все возможные комбинации вышеуказанных замен охватываются консенсусными последовательностями SEQ ID NO: 40, 41, 42, 43, 44 и 45 для HVR-H1, HVR-H2, HVR-H3, HVR-L1, HVR-L2 и HVR-L3 соответственно.
В другом варианте осуществления изобретения антитело к DENV, предлагаемое в изобретении, не представляет собой антитело, которое содержит
(I) HVR-H1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 11,
(II) HVR-H2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 13,
(III) HVR-H3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 16,
(IV) HVR-L1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 21,
(V) HVR-L2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 24, и (VI) HVR-L3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 27.
Другим объектом изобретения является антитело к DENV, которое содержит по меньшей мере один, два, три, четыре, пять или шесть HVR, выбранных из (a) HVR-H1 из VH-последовательности, представленной в любой из SEQ ID NO: 2-6; (б) HVR-H2 из VH-последовательности, представленной в любой из SEQ ID NO: 2-6; (в) HVR-H3 из VH-последовательности, представленной в любой из SEQ ID NO: 2-6; (г) HVR-L1 из VL-последовательности, представленной в любой из SEQ ID NO: 8-10; (д) HVR-L2 из VL-последовательности, представленной в любой из SEQ ID NO: 8-10; и (е) HVR-L3 из VL-последовательности, представленной в любой из SEQ ID NO: 8-10.
Другим объектом изобретения является антитело к DENV, которое содержит по меньшей мере один, два, три, четыре, пять или шесть HVR, выбранных из (a) HVR-H1 из VH-последовательности, представленной в любой из SEQ ID NO: 2-6; (б) HVR-H2 из VH-последовательности, представленной в любой из SEQ ID NO: 2-6; (в) HVR-H3 из VH-последовательности, представленной в любой из SEQ ID NO: 2-6; (г) HVR-L1 из VL-последовательности SEQ ID NO: 7; (д) HVR-L2 из VL-последовательности SEQ ID NO: 7; и (е) HVR-L3 из VL-последовательности SEQ ID NO: 7.
Другим объектом изобретения является антитело к DENV, которое содержит по меньшей мере один, два, три, четыре, пять или шесть HVR, выбранных из (a) HVR-H1 из VH-последовательности, представленной в SEQ ID NO: 6; (б) HVR-H2 из VH-последовательности SEQ ID NO: 6; (в) HVR-H3 из VH-последовательности, представленной в SEQ ID NO: 6; (г) HVR-L1 из VL-последовательности SEQ ID NO: 10; (д) HVR-L2 из VL-последовательности SEQ ID NO: 10; и (е) HVR-L3 из VL-последовательности SEQ ID NO: 10.
Другим объектом изобретения является антитело к DENV, которое содержит по меньшей мере один, два, три, четыре, пять или шесть HVR, выбранных из (a) HVR-H1 из VH-последовательности SEQ ID NO: 6; (б) HVR-H2 из VH-последовательности SEQ ID NO: 6; (в) HVR-H3 из VH-последовательности SEQ ID NO: 6; (г) HVR-L1 из VL-последовательности SEQ ID NO: 7; (д) HVR-L2 из VL-последовательности SEQ ID NO: 7; и (е) HVR-L3 из VL-последовательности SEQ ID NO: 7.
Одним из объектов изобретения является антитело, которое содержит по меньшей мере одну, по меньшей мере две или все три HVR-последовательности VH, выбранные из (a) HVR-H1 из VH-последовательности, представленной в любой из SEQ ID NO: 2-6; (б) HVR-H2 из VH-последовательности, представленной в любой из SEQ ID NO: 2-6; и (в) HVR-H3 из VH-последовательности, представленной в любой из SEQ ID NO: 2-6. В одном из вариантов осуществления изобретения антитело содержит HVR-H3 из VH-последовательности, представленной в любой из SEQ ID NO: 2-6. В другом варианте осуществления изобретения антитело содержит HVR-H3 из VH-последовательности, представленной в любой из SEQ ID NO: 2-6, и HVR-L3 из VL-последовательности, представленной в любой из SEQ ID NO: 8-10. В другом варианте осуществления изобретения антитело содержит HVR-H3 из VH-последовательности, представленной в любой из SEQ ID NO: 2-6, и HVR-L3 из VL-последовательности SEQ ID NO: 7. В следующем варианте осуществления изобретения антитело содержит HVR-H3 из VH-последовательности, представленной в любой из SEQ ID NO: 2-6, и HVR-L3 из VL-последовательности, представленной в любой из SEQ ID NO: 8-10, и HVR-H2 из VH-последовательности, представленной в любой из SEQ ID NO: 2-6. В следующем варианте осуществления изобретения антитело содержит HVR-H3 из VH-последовательности, представленной в любой из SEQ ID NO: 2-6, и HVR-L3 из VL-последовательности SEQ ID NO: 7, и HVR-H2 из VH-последовательности, представленной в любой из SEQ ID NO: 2-6. В следующем варианте осуществления изобретения антитело содержит (a) HVR-H1 из VH-последовательности, представленной в любой из SEQ ID NO: 2-6; (б) HVR-H2 из VH-последовательности, представленной в любой из SEQ ID NO: 2-6; и (в) HVR-H3 из VH-последовательности, представленной в любой из SEQ ID NO: 2-6.
Одним из объектов изобретения является антитело, которое содержит по меньшей мере одну, по меньшей мере две или все три HVR-последовательности VH, выбранные из (a) HVR-H1 из VH-последовательности SEQ ID NO: 6; (б) HVR-H2 из VH-последовательности SEQ ID NO: 6; и (в) HVR-H3 из VH-последовательности SEQ ID NO: 6. В одном из вариантов осуществления изобретения антитело содержит HVR-H3 из VH-последовательности SEQ ID NO: 6. В другом варианте осуществления изобретения антитело содержит HVR-H3 из VH-последовательности SEQ ID NO: 6 и HVR-L3 из VL-последовательности SEQ ID NO: 10. В другом варианте осуществления изобретения антитело содержит HVR-H3 из VH-последовательности SEQ ID NO: 6 и HVR-L3 из VL-последовательности SEQ ID NO: 7. В следующем варианте осуществления изобретения антитело содержит HVR-H3 из VH-последовательности SEQ ID NO: 6, HVR-L3 из VL-последовательности SEQ ID NO: 10 и HVR-H2 из VH-последовательности SEQ ID NO: 6. В следующем варианте осуществления изобретения антитело содержит HVR-H3 из VH-последовательности SEQ ID NO: 6, HVR-L3 из VL-последовательности SEQ ID NO: 7 и HVR-H2 из VH-последовательности SEQ ID NO: 6. В следующем варианте осуществления изобретения антитело содержит (a) HVR-H1 из VH- последовательности SEQ ID NO: 6; (б) HVR-H2 из VH-последовательность SEQ ID NO: 6; и (в) HVR-H3 из VH-последовательности SEQ ID NO: 6.
Другим объектом изобретения является антитело, которое содержит по меньшей мере одну, по меньшей мере две или все три HVR-последовательности VL, выбранные из (a) HVR-V1 из VL-последовательности, представленной в любой из SEQ ID NO: 8-10; (б) HVR-L2 из VL-последовательности, представленной в любой из SEQ ID NO: 8-10; и (в) HVR-L3 из VL-последовательности, представленной в любой из SEQ ID NO: 8-10. В одном из вариантов осуществления изобретения антитело содержит (a) HVR-L1 из VL-последовательности, представленной в любой из SEQ ID NO: 8-10; (б) HVR-L2 из VL-последовательности, представленной в любой из SEQ ID NO: 8-10; и (в) HVR-L3 из VL-последовательности, представленной в любой из SEQ ID NO: 8-10.
Другим объектом изобретения является антитело, которое содержит по меньшей мере одну, по меньшей мере две или все три HVR-последовательности VL, выбранные из (a) HVR-V1 из VL-последовательности SEQ ID NO: 10; (б) HVR-L2 из VL-последовательности SEQ ID NO: 10; и (в) HVR-L3 из VL-последовательности SEQ ID NO: 10. В одном из вариантов осуществления изобретения антитело содержит (a) HVR-L1 из VL-последовательности SEQ ID NO: 10; (б) HVR-L2 из VL-последовательности SEQ ID NO: 10; и (в) HVR-L3 из VL-последовательности SEQ ID NO: 10.
Другим объектом изобретения является антитело, предлагаемое в изобретении, которое содержит (а) VH-домен, содержащий по меньшей мере одну, по меньшей мере две или все три HVR-последовательности VH, выбранные из (I) HVR-H1 из VH-последовательности, представленной в любой из SEQ ID NO: 2-6, (II) HVR-H2 из VH-последовательности, представленной в любой из SEQ ID NO: 2-6, и (III) HVR-H3 из VH-последовательности, представленной в любой из SEQ ID NO: 2-6; и (б) VL-домен, содержащий по меньшей мере одну, по меньшей мере две или все три HVR-последовательности VL, выбранные из (I) HVR-L1 из VL-последовательности, представленной в любой из SEQ ID NO: 8-10, (II) HVR-L2 из VL-последовательности, представленной в любой из SEQ ID NO: 8-10, и (III) HVR-L3 из VL-последовательности, представленной в любой из SEQ ID NO: 8-10.
Другим объектом изобретения является антитело, предлагаемое в изобретении, которое содержит (а) VH-домен, содержащий по меньшей мере одну, по меньшей мере две или все три HVR-последовательности VH, выбранные из (I) HVR-H1 из VH-последовательности, представленной в любой из SEQ ID NO: 2-6, (II) HVR-H2 из VH-последовательности, представленной в любой из SEQ ID NO: 2-6, и (III) HVR-H3 из VH-последовательности, представленной в любой из SEQ ID NO: 2-6; и (б) VL-домен, содержащий по меньшей мере одну, по меньшей мере две или все три HVR-последовательности VL, выбранные из (I) HVR-L1 из VL-последовательности SEQ ID NO: 7, (II) HVR-L2 из VL-последовательности SEQ ID NO: 7 и (III) HVR-L3 из VL-последовательности SEQ ID NO: 7.
Другим объектом изобретения является антитело, предлагаемое в изобретении, которое содержит (а) VH-домен, содержащий по меньшей мере одну, по меньшей мере две или все три HVR-последовательности VH, выбранные из (I) HVR-H1 из VH-последовательности SEQ ID NO:6, (II) HVR-H2 из VH-последовательности SEQ ID NO: 6, и (III) HVR-H3 из VH-последовательности SEQ ID NO: 6; и (6) VL-домен, содержащий по меньшей мере одну, по меньшей мере две или все три HVR-последовательности VL, выбранные из (I) HVR-L1 из VL-последовательности SEQ ID NO: 10, (II) HVR-L2 из VL-последовательности SEQ ID NO: 10 и (III) HVR-L3 из VL-последовательности SEQ ID NO: 10.
Другим объектом изобретения является антитело, предлагаемое в изобретении, которое содержит (а) VH-домен, содержащий по меньшей мере одну, по меньшей мере две или все три HVR-последовательности VH, выбранные из (I) HVR-H1 из VH-последовательности SEQ ID NO:6, (II) HVR-H2 из VH-последовательности SEQ ID NO: 6, и (III) HVR-H3 из VH-последовательности SEQ ID NO: 6; и (6) VL-домен, содержащий по меньшей мере одну, по меньшей мере две или все три HVR-последовательности VL, выбранные из (I) HVR-L1 из VL-последовательности SEQ ID NO: 7, (II) HVR-L2 из VL-последовательности SEQ ID NO: 7 и (III) HVR-L3 из VL-последовательности SEQ ID NO: 7.
Другим объектом изобретения является антитело, которое содержит (а) HVR-H1 из VH-последовательности, представленной в любой из SEQ ID NO: 2-6; (б) HVR-H2 из VH-последовательности, представленной в любой из SEQ ID NO: 2-6; (в) HVR-H3 из VH-последовательности, представленной в любой из SEQ ID NO: 2-6; (г) HVR-L1 из VL-последовательности, представленной в любой из SEQ ID NO: 8-10; (д) HVR-L2 из VL-последовательности, представленной в любой из SEQ ID NO: 8-10; и (е) HVR-L3 из VL-последовательности, представленной в любой из SEQ ID NO: 8-10.
Другим объектом изобретения является антитело, которое содержит (а) HVR-H1 из VH-последовательности, представленной в любой из SEQ ID NO: 2-6; (6) HVR-H2 из VH-последовательности, представленной в любой из SEQ ID NO: 2-6; (в) HVR-H3 из VH-последовательности, представленной в любой из SEQ ID NO: 2-6; (г) HVR-L1 из VL-последовательности SEQ ID NO: 7; (д) HVR-L2 из VL-последовательности SEQ ID NO: 7; и (е) HVR-L3 из VL-последовательности SEQ ID NO: 7.
Другим объектом изобретения является антитело, которое содержит (а) HVR-H1 из VH-последовательности SEQ ID NO: 6; (б) HVR-H2 из VH-последовательности SEQ ID NO:6; (в) HVR-H3 из VH-последовательности SEQ ID NO: 6; (г) HVR-L1 из VL-последовательности SEQ ID NO: 10; (д) HVR-L2 из VL-последовательности SEQ ID NO: 10; и (е) HVR-L3 из VL-последовательности SEQ ID NO: 10.
Другим объектом изобретения является антитело, которое содержит (а) HVR-H1 из VH-последовательности SEQ ID NO: 6; (б) HVR-H2 из VH-последовательности SEQ ID NO:6; (в) HVR-H3 из VH-последовательности SEQ ID NO: 6; (г) HVR-L1 из VL-последовательности SEQ ID NO: 7; (д) HVR-L2 из VL-последовательности SEQ ID NO: 7; и (е) HVR-L3 из VL-последовательности SEQ ID NO: 7.
Еще в одном варианте осуществления изобретения антитело к DENV, предлагаемое в изобретении, не представляет собой антитело, которое содержит (I) HVR-H1 из VH-последовательности SEQ ID NO: 1, (II) HVR-H2 из VH-последовательности SEQ ID NO: 1, (III) HVR-H3 из VH-последовательности SEQ ID NO: 1, (IV) HVR-L1 из VL-последовательности SEQ ID NO: 7, (V) HVR-L2 и VL-последовательности SEQ ID NO: 7, и (VI) HVR-L3 из VL-последовательности SEQ ID NO: 7.
В любом из указанных выше вариантов осуществления изобретения антитело к DENV может быть гуманизированным. В одном из вариантов осуществления изобретения антитело к DENV содержит HVR, указанные в любом из приведенных выше вариантов осуществления изобретения, и дополнительно содержит акцепторный человеческий каркасный участок, например, каркасный участок человеческого иммуноглобулина или человеческий консенсусный каркасный участок. В другом варианте осуществления изобретения антитело к DENV содержит HVR, указанные в любом из приведенных выше вариантов осуществления изобретения, и дополнительно содержит VH или VL, содержащие FR-последовательность. В следующем варианте осуществления изобретения антитело к DENV содержит следующие FR-последовательности вариабельного домена тяжелой цепи и/или легкой цепи: в вариабельном домене тяжелой цепи FR1 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 31, FR2 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 32, FR3 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 33 или 34, FR4 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 35. В вариабельном домене легкой цепи FR1 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 36, FR2 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 37, FR3 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 38, FR4 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 39.
В другом объекте изобретения антитело к DENV содержит последовательность вариабельного домена тяжелой цепи (VH), которая по меньшей мере на 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентична аминокислотной последовательности, представленной в любой из SEQ ID NO: 2-6. В некоторых вариантах осуществления изобретения последовательность VH, идентичная по меньшей мере на 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% или 99%, содержит замены (например, консервативные замены), инсерции или делеции относительно референс-последовательности, но антитело к DENV, содержащее указанную последовательность, сохраняет способность связываться с DENV. В некоторых вариантах осуществления изобретения в целом от 1 до 10 аминокислот заменено, встроено и/или удалено путем делеции в любой из SEQ ID NO: 2-6. В некоторых вариантах осуществления изобретения замены, инсерции или делеции затрагивают области вне HVR (т.е. FR). Необязательно антитело к DENV содержит последовательность VH, представленную в любой из SEQ ID NO: 2-6, включая пост-трансляционные модификации указанной последовательности. В конкретном варианте осуществления изобретения VH содержит один, два или три HVR, выбранные из: (a) HVR-H1, который содержит аминокислотную последовательность, представленную в любой из SEQ ID NO: 11-12, (б) HVR-H2, который содержит аминокислотную последовательность, представленную в любой из SEQ ID NO: 13-15, и (в) HVR-H3, который содержит аминокислотную последовательность, представленную в любой из SEQ ID NO: 16-20. Посттрансляционные модификации включают (но не ограничиваясь только ими) модификацию путем пироглутамилирования глутамина или глутамата в N-концевой области тяжелой цепи или легкой цепи в пироглутамовую кислоту.
В другом объекте изобретения антитело к DENV содержит последовательность вариабельного домена тяжелой цепи (VH), которая по меньшей мере на 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 6. В некоторых вариантах осуществления изобретения последовательность VH, идентичная по меньшей мере на 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% или 99%, содержит замены (например, консервативные замены), инсерции или делеции относительно референс-последовательности, но антитело к DENV, содержащее указанную последовательность, сохраняет способность связываться с DENV. В некоторых вариантах осуществления изобретения в целом от 1 до 10 аминокислот заменено, встроено и/или удалено путем делеции в SEQ ID NO:6. В некоторых вариантах осуществления изобретения замены, инсерции или делеции затрагивают области вне HVR (т.е. FR). Необязательно антитело к DENV содержит последовательность VH SEQ ID NO:6, включая пост-трансляционные модификации указанной последовательности. В конкретном варианте осуществления изобретения VH содержит один, два или три HVR, выбранные из: (a) HVR-H1, который содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 12, (б) HVR-H2, который содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 15, и (в) HVR-H3, который содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 20. Пост-трансляционные модификации включают (но не ограничиваясь только ими) модификацию путем пироглутамилирования глутамина или глутамата в N-концевой области тяжелой цепи или легкой цепи в пироглутамовую кислоту.
В другом объекте изобретения антитело к DENV содержит последовательность вариабельного домена легкой цепи (VL), которая по меньшей мере на 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентична аминокислотной последовательности, представленной в любой из SEQ ID NO: 8-10. В некоторых вариантах осуществления изобретения последовательность VL, идентичная по меньшей мере на 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% или 99%, содержит замены (например, консервативные замены), инсерции или делеции относительно референс-последовательности, но антитело к DENV, содержащее указанную последовательность, сохраняет способность связываться с DENV. В некоторых вариантах осуществления изобретения в целом от 1 до 10 аминокислот заменено, встроено и/или удалено путем делеции в любой из SEQ ID NO: 8-10. В некоторых вариантах осуществления изобретения замены, инсерции или делеции затрагивают области вне HVR (т.е. FR). Необязательно антитело к DENV содержит последовательность VL, представленную в любой из SEQ ID NO: 8-10, включая пост-трансляционные модификации указанной последовательности. В конкретном варианте осуществления изобретения VL содержит один, два или три HVR, выбранные из: (a) HVR-L1, который содержит аминокислотную последовательность, представленную в любой из SEQ ID NO: 21-23, (б) HVR-L2, который содержит аминокислотную последовательность, представленную в любой из SEQ ID NO: 24-26, и (в) HVR-L3, который содержит аминокислотную последовательность, представленную в любой из SEQ ID NO: 27-30. Посттрансляционные модификации включают (но не ограничиваясь только ими) модификацию путем пироглутамилирования глутамина или глутамата в N-концевой области тяжелой цепи или легкой цепи в пироглутамовую кислоту.
В другом объекте изобретения антитело к DENV содержит последовательность вариабельного домена легкой цепи (VL), которая по меньшей мере на 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 10. В некоторых вариантах осуществления изобретения последовательность VL, идентичная по меньшей мере на 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% или 99%, содержит замены (например, консервативные замены), инсерции или делеции относительно референс-последовательности, но антитело к DENV, содержащее указанную последовательность, сохраняет способность связываться с DENV. В некоторых вариантах осуществления изобретения в целом от 1 до 10 аминокислот заменено, встроено и/или удалено путем делеции в SEQ ID NO: 10. В некоторых вариантах осуществления изобретения замены, инсерции или делеции затрагивают области вне HVR (т.е. FR). Необязательно антитело к DENV содержит последовательность VL SEQ ID NO: 10, включая пост трансляционные модификации указанной последовательности. В конкретном варианте осуществления изобретения VL содержит один, два или три HVR, выбранные из: (a) HVR-L1, который содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 23, (б) HVR-L2, который содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 26, и (в) HVR-L3, который содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 30. Посттрансляционные модификации включают (но не ограничиваясь только ими) модификацию путем пироглутамилирования глутамина или глутамата в N-концевой области тяжелой цепи или легкой цепи в пироглутамовую кислоту.
Другим объектом изобретения является антитело к DENV, где антитело содержит VH, указанную в любом из представленных выше вариантов осуществления изобретения, и VL, указанную в любом из представленных выше вариантов осуществления изобретения. В одном из вариантов осуществления изобретения антитело содержит VH- и VL-последовательности, представленные в любой из SEQ ID NO: 2-6 и в любой из SEQ ID NO: 8-10 соответственно, включая пост-трансляционные модификации указанных последовательностей. В одном из вариантов осуществления изобретения антитело содержит VH- и VL-последовательности, представленные в любой из SEQ ID NO: 2-6 и в SEQ ID NO 7 соответственно, включая пост-трансляционные модификации указанных последовательностей. Пост-трансляционные модификации включают (но не ограничиваясь только ими) модификацию путем пироглутамилирования глутамина или глутамата в N-концевой области тяжелой цепи или легкой цепи в пироглутамовую кислоту.
Другим объектом изобретения является антитело к DENV, где антитело содержит VH, указанную в любом из представленных выше вариантов осуществления изобретения, и VL, указанную в любом из представленных выше вариантов осуществления изобретения. В одном из вариантов осуществления изобретения антитело содержит VH- и VL-последовательности SEQ ID NO: 6 и SEQ ID NO: 10 соответственно, включая пост-трансляционные модификации указанных последовательностей. В одном из вариантов осуществления изобретения антитело содержит VH- и VL-последовательности SEQ ID NO: 6 и SEQ ID NO: 7 соответственно, включая пост-трансляционные модификации указанных последовательностей. Пост-трансляционные модификации включают (но не ограничиваясь только ими) модификацию путем пироглутамилирования глутамина или глутамата в N-концевой области тяжелой цепи или легкой цепи в пироглутамовую кислоту.
Следующим объектом изобретения является антитело, которое связывается с тем же эпитопом, что и антитело к DENV, представленное в настоящем описании. Некоторыми вариантами осуществления изобретения является антитело, которое связывается с эпитопом, состоящим по меньшей мере из одной, по меньшей мере из двух, по меньшей мере из трех, по меньшей мере из четырех, по меньшей мере из пяти, по меньшей мере из шести, по меньшей мере из семи или из всех аминокислот, выбранных из группы, которая состоит из G100, W101, K122, 1162, S274, K310, W391 и F392 Е-белка DENV-2. Некоторыми вариантами осуществления изобретения является антитело, которое связывается с эпитопом, состоящим их по меньшей мере из одной, по меньшей мере из двух или из всех аминокислот, выбранных из группы, которая состоит из K122, 1162 и S274 Е-белка DENV-2. Некоторыми вариантами осуществления изобретения является антитело, которое связывается с эпитопом, дополнительно содержащим по меньшей мере одну из аминокислот, выбранных из группы, которая состоит из G100, W101, K310, W391 и F392, когда эпитоп содержит по меньшей мере одну, по меньшей мере два или все аминокислоты, выбранные из группы, которая состоит из K122, 1162 и S274.
Одним из объектов изобретения являются способы лечения или предупреждения инфекции, вызываемой вирусом Зика. Одним из объектов изобретения является способ ингибирования передачи вируса Зика от беременной матери к плоду. Одним из объектов изобретения являются способы предупреждения врожденного синдрома, вызванного вирусом Зика (например, дефицит умственного развития, микроцефалия и т.д.). Одним из объектов изобретения являются способы ингибирования уменьшения веса плода (например, веса всего тела ребенка, веса головы и т.д.).
В одном из примеров, понятие «врожденный синдром, вызванный вирусом Зика», относится к особой системе врожденных дефектов, уникальной для плодов и младенцев, зараженных до рождения вирусом Зика. Как должно быть очевидно специалисту в данной области, индивидуумы с врожденным синдромом, вызванным вирусом Зика, могут иметь синдромы, такие как (но не ограничиваясь только ими) дефицит умственного развития, микроцефалия, серьезная микроцефалия, при которой имеет место частичное уменьшение размеров черепа, уменьшение ткани головного мозга со специфической схемой поражения головного мозга, включая субкортикальную кальцификацию, повреждение задней части глаза, включая макулярные рубцы и очаговую пятнистую пигментацию сетчатки, врожденные контрактуры, такие как косолапость или артрогрипоз, гипертония, ограничивающая движение организма вскоре после рождения, и т.п. Вероятно, введение антител, представленных в настоящем описании, может предупреждать по меньшей мере один или по меньшей мере два, или по меньшей мере три, или по меньшей мере четыре, или все симптомы врожденного синдрома, вызванного вирусом Зика. Например, антитело, представленное в настоящем описании, предупреждает заражение вирусом Зика плода или младенца до рождения, тем самым ингибируя уменьшение веса плода (например, веса всего тела ребенка, веса головы и т.д.).
В некоторых вариантах осуществления изобретения способ лечения или предупреждения инфекции, вызываемой вирусом Зика, предлагаемый в настоящем изобретении, включает введение антитела, которое связывается с вирусом Зика. В некоторых вариантах осуществления изобретения способ ингибирования передачи вируса Зика от беременной матери к плоду включает введение антитела, которое связывается с вирусом Зика. В некоторых вариантах осуществления изобретения способ предупреждения врожденного синдрома, вызванного вирусом Зика (например, дефицита умственного развития, микроцефалии и т.д.), предлагаемый в настоящем изобретении, включает введение антитела, которое связывается с вирусом Зика. В некоторых вариантах осуществления изобретения способы ингибирования уменьшения веса плода (например, веса всего тела ребенка, веса головы и т.д.), предлагаемые в настоящем изобретении, включают введение антитела, которое связывается с вирусом Зика. В одном из примеров, понятие «врожденный синдром, вызванный вирусом Зика», относится к особой системе врожденных дефектов, уникальной для плодов и младенцев, зараженных до рождения вирусом Зика. Как должно быть очевидно специалисту в данной области, индивидуумы с врожденным синдромом, вызванным вирусом Зика, могут иметь синдромы, такие как (но не ограничиваясь только ими) дефицит умственного развития, микроцефалия, серьезная микроцефалия, при которой имеет место частичное уменьшение размера черепа, уменьшение ткани головного мозга со специфической схемой поражения головного мозга, включая субкортикальную кальцификацию, повреждение задней части глаза, включая макулярные рубцы и очаговую пятнистую пигментацию сетчатки, врожденные контрактуры, такие как косолапость или артрогрипоз, гипертония, ограничивающая движение организма вскоре после рождения, и т.п. Вероятно, введение антител, представленных в настоящем описании, может предупреждать по меньшей мере один или по меньшей мере два, или по меньшей мере три, или по меньшей мере четыре, или все симптомы врожденного синдрома, вызванного вирусом Зика. Например, антитело, представленное в настоящем описании, предупреждает заражением вирусом Зика плода или младенца до рождения, тем самым ингибируя уменьшение веса плода (например, веса всего тела ребенка, веса головы и т.д.).
В некоторых вариантах осуществления изобретения антитело, которое связывается с вирусом Зика, предлагаемое в настоящем изобретении, обладает перекрестной реактивностью с вирусом денге.
В некоторых вариантах осуществления изобретения антитело к вирусу Зика, предлагаемое в настоящем изобретении, содержит:
(а) (I) HVR-H3, содержащий аминокислотную последовательность GGX1ALFYDSYTTPX2DX3GSWWFDP, в которой X1 обозначает заряженную аминокислоту, Х3 обозначает заряженную аминокислоту или гидрофобную аминокислоту, Х3 обозначает заряженную аминокислоту или гидрофобную аминокислоту, (II) HVR-L3, содержащий аминокислотную последовательность QQFX1X2LPIT, в которой X1 обозначает заряженную аминокислоту или полярную аминокислоту, Х3 обозначает заряженную аминокислоту или полярную аминокислоту, и (III) HVR-H2, содержащий аминокислотную последовательность VINPRGGSX1X2SAQKFQG, в которой X1 обозначает заряженную аминокислоту или полярную аминокислоту, Х3 обозначает заряженную аминокислоту или гидрофобную аминокислоту;
(б) (I) HVR-H1, содержащий аминокислотную последовательность SX1YX2H, в которой X1 обозначает полярную аминокислоту, Х3 обозначает гидрофобную аминокислоту, (II) HVR-H2, содержащий аминокислотную последовательность VINPRGGSX1X2SAQKFQG, в которой X1 обозначает заряженную аминокислоту или полярную аминокислоту, Х3 обозначает заряженную аминокислоту или гидрофобную аминокислоту, и (III) HVR-H3, содержащий аминокислотную последовательность GGX1ALFYDSYTTPX2DX3GSWWFDP, в которой X1 обозначает заряженную аминокислоту, Х3 обозначает заряженную аминокислоту или гидрофобную аминокислоту, Х3 обозначает заряженную аминокислоту или гидрофобную аминокислоту;
(в) (I) HVR-H1, содержащий аминокислотную последовательность SX1YX2H, в которой X1 обозначает полярную аминокислоту, Х3 обозначает гидрофобную аминокислоту, (II) HVR-H2, содержащий аминокислотную последовательность VINPRGGSX1X2SAQKFQG, в которой X1 обозначает заряженную аминокислоту или полярную аминокислоту, Х3 обозначает гидрофобную аминокислоту или заряженную аминокислоту, (III) HVR-H3, содержащий аминокислотную последовательность GGX1ALFYDSYTTPX2DX3GSWWFDP, в которой X1 обозначает заряженную аминокислоту, Х3 обозначает заряженную аминокислоту или гидрофобную аминокислоту, Х3 обозначает заряженную аминокислоту или гидрофобную аминокислоту, (IV) HVR-L1, содержащий аминокислотную последовательность QASQX1IRX2YLN, в которой X1 обозначает заряженную аминокислоту, Х3 обозначает заряженную аминокислоту или полярную аминокислоту; (V) HVR-L2, содержащий аминокислотную последовательность DASX1LKX2, в которой X1 обозначает заряженную аминокислоту или полярную аминокислоту, Х3 обозначает полярную аминокислоту или гидрофобную аминокислоту; и (VI) HVR-L3, содержащий аминокислотную последовательность QQFX1X2LPIT, в которой X1 обозначает заряженную аминокислоту или полярную аминокислоту, Х3 обозначает заряженную аминокислоту или гидрофобную аминокислоту; или
(г) (I) HVR-L1, содержащий аминокислотную последовательность QASQX1IRX2YLN, в которой X1 обозначает заряженную аминокислоту, Х3 обозначает заряженную аминокислоту или полярную аминокислоту; (II) HVR-L2, содержащий аминокислотную последовательность DASX1LKX2, в которой X1 обозначает полярную аминокислоту или заряженную аминокислоту, Х3 обозначает полярную аминокислоту или гидрофобную аминокислоту; и (III) HVR-L3, содержащий аминокислотную последовательность QQFX1X2LPIT, в которой X1 обозначает заряженную аминокислоту или полярную аминокислоту, Х3 обозначает заряженную аминокислоту или гидрофобную аминокислоту.
Как должно быть очевидно специалисту в данной области, заряженная аминокислота представляет собой аргинин (R, Arg), лизин (K, Lys), аспарагиновую кислоту (D, Asp) глутаминовую кислоту (Е, Glu); полярная аминокислота представляет собой глутамин (Q, Gln), аспарагин (N, Asn), гистидин (Н, His), серии (S, Ser), треонин (Т, Thr), тирозин (Y, Tyr), цистеин (С, Cys) и триптофан (W, Тгр); гидрофобная аминокислота представляет собой аланин (Ala, А), изолейцин (Ile, I), лейцин (Leu, L), метионин (Met, М), фенилаланин (Phe, F), валин (Val, V), пролин (Pro, Р) и глицин (Gly, G).
В некоторых вариантах осуществления изобретения предлагаемое в настоящем изобретении антитело, которое связывается с вирусом Зика, содержит:
(а) (I) HVR-H3, содержащий аминокислотную последовательность GGX1ALFYDSYTTPX2DX3GSWWFDP, в которой X1 обозначает R или Е, Х3 обозначает R или F, Х3 обозначает G, D или L (SEQ ID NO: 42), (II) HVR-L3, содержащий аминокислотную последовательность QQFX1X2LPIT, в которой X1 обозначает D, S или Е, Х3 обозначает D или A (SEQ ID NO: 45), и (III) HVR-H2, содержащий аминокислотную последовательность VINPRGGSX1X2SAQKFQG, в которой X1 обозначает Т или R, Х3 обозначает А или R (SEQ ID NO: 41);
(б) (I) HVR-H1, содержащий аминокислотную последовательность SX1YX2H, в которой X1 обозначает N или Y, Х3 обозначает I или М (SEQ ID NO: 40), (II) HVR-H2, содержащий аминокислотную последовательность VINPRGGSX1X2SAQKFQG, в которой X1 обозначает Т или R, Х3 обозначает А или R (SEQ ID NO: 41), и (III) HVR-H3, содержащий аминокислотную последовательность GGX1ALFYDSYTTPX2DX3GSWWFDP, в которой X1 обозначает R или Е, Х3 обозначает R или F, Х3 обозначает G, D или L (SEQ ID NO: 42);
(в) (I) HVR-H1, содержащий аминокислотную последовательность SX1YX2H, в которой X1 обозначает N или Y, Х3 обозначает I или М (SEQ ID NO: 40), (II) HVR-H2, содержащий аминокислотную последовательность VINPRGGSX1X2SAQKFQG, в которой X1 обозначает Т или R, Х3 обозначает А или R (SEQ ID NO: 41), (III) HVR-H3, содержащий аминокислотную последовательность GGX1ALFYDSYTTPX2DX3GSWWFDP, в которой X1 обозначает R или Е, Х3 обозначает R или F, Х3 обозначает G, D или L (SEQ ID NO: 42), (IV) HVR-L1, содержащий аминокислотную последовательность QASQX1IRX2YLN, в которой X1 обозначает D или Е, Х3 обозначает К или Q (SEQ ID NO: 43); (V) HVR-L2, содержащий аминокислотную последовательность DASX1LKX2, в которой X1 обозначает N или Е, Х3 обозначает Т или F (SEQ ID NO: 44); и (VI) HVR-L3, содержащий аминокислотную последовательность QQFX1X2LPIT, в которой X1 обозначает D, S или Е, Х3 обозначает D или A (SEQ ID NO: 45); или
(г) (I) HVR-L1, содержащий аминокислотную последовательность QASQX1IRX2YLN, в которой X1 обозначает D или Е, Х3 обозначает К или Q (SEQ ID NO: 43); (II) HVR-L2, содержащий аминокислотную последовательность DASX1LKX2, в которой X1 обозначает N или Е, Х3 обозначает Т или F (SEQ ID NO: 44); и (III) HVR-L3, содержащий аминокислотную последовательность QQFX1X2LPIT, в которой X1 обозначает D, S или Е, Х3 обозначает D или A (SEQ ID NO: 45).
В некоторых вариантах осуществления изобретения предлагаемое в настоящем изобретении антитело, которое связывается с вирусом Зика, содержит:
(а) (I) HVR-H3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 20, (II) HVR-L3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 27, и (III) HVR-H2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 15;
(б) (I) HVR-H1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 12, (II) HVR-H2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 15, и (III) HVR-H3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 20;
(в) (I) HVR-H1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 12, (II) HVR-H2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 15, (III) HVR-H3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 20, (IV) HVR-L1 содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 21; (V) HVR-L2 содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 24; и (VI) HVR-L3 содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 27; или
(г) (I) HVR-L1 содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 21; (II) HVR-L2 содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 24; и (III) HVR-L3 содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 27.
В некоторых вариантах осуществления изобретения антитело, предлагаемое в изобретении, не представляет собой антитело, которое содержит (I) HVR-H1 содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 11, (II) HVR-H2 содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 13, (III) HVR-H3 содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 16, (IV) HVR-L1 содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 21, (V) HVR-L2 содержащий аминокислотную последовательность of SEQ ID NO: 24, и (VI) HVR-L3 содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 27.
В некоторых вариантах осуществления изобретения предлагаемое в настоящем изобретении антитело, которое связывается с вирусом Зика, содержит:
(а) (I) HVR-H3 из VH-последовательности, представленной в любой из SEQ ID NO: 2, 3, 4, 5 или 6, (II) HVR-L3 из VL-последовательности, представленной в любой из SEQ ID NO: 8, 9 или 10, и (III) HVR-H2 из VH-последовательности, представленной в любой из SEQ ID NO: 2, 3, 4, 5 или 6;
(б) (I) HVR-H1 из VH-последовательности, представленной в любой из SEQ ID NO: 2, 3, 4, 5 или 6, (II) HVR-H2 из VH-последовательности, представленной в любой из SEQ ID NO: 2, 3, 4, 5 или 6, и (III) HVR-H3 из VH-последовательности, представленной в любой из SEQ ID NO: 2, 3, 4, 5 или 6;
(в) (I) HVR-H1 из VH-последовательности, представленной в любой из SEQ ID NO: 2, 3, 4, 5 или 6, (II) HVR-H2 из VH-последовательности, представленной в любой из SEQ ID NO: 2, 3, 4, 5 или 6, (III) HVR-H3 из VH-последовательности, представленной в любой из SEQ ID NO: 2, 3, 4, 5 или 6, (IV) HVR-L1 из VL-последовательности, представленной в любой из SEQ ID NO: 8, 9 или 10; (V) HVR-L2 из VL-последовательности, представленной в любой из SEQ ID NO: 8, 9 или 10; и (VI) HVR-L3 из VL-последовательности, представленной в любой из SEQ ID NO: 8, 9 или 10;
(г) (I) HVR-L1 из VL-последовательности, представленной в любой из SEQ ID NO: 8, 9 или 10; (II) HVR-L2 из VL-последовательности, представленной в любой из SEQ ID NO: 8, 9 или 10; и (III) HVR-L3 из VL-последовательности, представленной в любой из SEQ ID NO: 8, 9 или 10; или
(д) (I) HVR-H1 из VH-последовательности, представленной в любой из SEQ ID NO: 2, 3, 4, 5 или 6, (II) HVR-H2 из VH-последовательности, представленной в любой из SEQ ID NO: 2, 3, 4, 5 или 6, (III) HVR-H3 из VH-последовательности, представленной в любой из SEQ ID NO: 2, 3, 4, 5 или 6, (IV) HVR-L1 из VL-последовательности, представленной в SEQ ID NO: 7; (V) HVR-L2 из VL-последовательности, представленной в SEQ ID NO: 7; и (VI) HVR-L3 из VL-последовательности, представленной в SEQ ID NO: 7.
В некоторых вариантах осуществления изобретения антитело, предлагаемое в изобретении, не представляет собой антитело, которое содержит (I) HVR-H1 из VH-последовательности SEQ ID NO: 1, (II) HVR-H2 из VH-последовательности SEQ ID NO: 1, (III) HVR-H3 из VH-последовательности SEQ ID NO: 1, (IV) HVR-L1 из VL-последовательности SEQ ID NO: 7, (V) HVR-L2 из VL-последовательности SEQ ID NO: 7 и (VI) HVR-L3 из VL-последовательности SEQ ID NO: 7.
В некоторых вариантах осуществления изобретения предлагаемое в настоящем изобретении антитело, которое связывается с вирусом Зика, содержит также каркасный участок вариабельного домена тяжелой цепи FR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 31, FR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 32, FR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 33 или 34, FR4, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 35. В некоторых вариантах осуществления изобретения предлагаемое в настоящем изобретении антитело, которое связывается с вирусом Зика, содержит также каркасный участок вариабельного домена легкой цепи FR1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 36, FR2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 37, FR3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 38, FR4, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 39.
В некоторых вариантах осуществления изобретения предлагаемое в настоящем изобретении антитело, которое связывается с вирусом Зика, содержит (а) VH-последовательность, последовательность которой по меньшей мере на 95% идентична аминокислотной последовательности, представленной в любой из SEQ ID NO: 2, 3, 4, 5 или 6; (б) VL-последовательность, последовательность которой по меньшей мере на 95% идентична аминокислотной последовательности, представленной в любой из SEQ ID NO: 8, 9 или 10; (в) VH-последовательность, представленную в любой из SEQ ID NO: 2, 3, 4, 5 или 6, и VL-последовательность, представленную в любой из SEQ ID NO: 8, 9 или 10; или (г) VH-последовательность, представленную в любой из SEQ ID NO: 2, 3, 4, 5 или 6, и VL-последовательность, представленную в SEQ ID NO: 7.
Согласно другому объекту изобретения антитело к ZIKV содержит последовательность вариабельного домена тяжелой цепи (VH), идентичную по меньшей мере на 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% аминокислотной последовательности, представленной в любой из SEQ ID NO: 2-6. В некоторых вариантах осуществления изобретения VH-последовательность, идентичная по меньшей мере на 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% или 99%, содержит замены (например, консервативные замены), инсерции или делеции по сравнению с референс-последовательностью, но антитело к ZIKV, содержащее такую последовательность, сохраняет способность связываться с ZIKV. В некоторых вариантах осуществления изобретения в целом от 1 до 10 аминокислот заменено, встроено и/или удалено путем делеции в любой из SEQ ID NO: 2-6. В некоторых вариантах осуществления изобретения замены, инсерции или делеции затрагивают области вне HVR (т.е. FR). Необязательно антитело к ZIKV содержит VH-последовательность, представленную в любой из SEQ ID NO: 2-6, включая пост-трансляционные модификации указанной последовательности. В конкретном варианте осуществления изобретения VH содержит один, два или три HVR, выбранных из: (a) HVR-H1, который содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 12, (б) HVR-H2, который содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 15, и (в) HVR-H3, который содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 20. Посттрансляционные модификации включают (но не ограничиваясь только ими) модификацию путем пироглутамилирования глутамина или глутамата в N-концевой области тяжелой цепи или легкой цепи в пироглутамовую кислоту.
Согласно другому объекту изобретения антитело к ZIKV содержит последовательность вариабельного домена тяжелой цепи (VH), идентичную по меньшей мере на 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% аминокислотной последовательности, представленной в любой из SEQ ID NO: 2, 3, 4, 5 или 6. В некоторых вариантах осуществления изобретения VH-последовательность, идентичная по меньшей мере на 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% или 99%, содержит замены (например, консервативные замены), инсерции или делеции по сравнению с референс-последовательностью, но антитело к ZIKV, содержащее такую последовательность, сохраняет способность связываться с ZIKV. В некоторых вариантах осуществления изобретения в целом от 1 до 10 аминокислот заменено, встроено и/или удалено путем делеции в любой из SEQ ID NO: 2, 3, 4, 5 или 6. В некоторых вариантах осуществления изобретения замены, инсерции или делеции затрагивают области вне HVR (т.е. FR). Необязательно антитело к ZIKV содержит VH-последовательность, представленную в любой из SEQ ID NO: 2, 3, 4, 5 или 6, включая пост-трансляционные модификации указанной последовательности. В конкретном варианте осуществления изобретения VH содержит один, два или три HVR, выбранных из: (a) HVR-H1, который содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 12, (б) HVR-H2, который содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 15, и (в) HVR-H3, который содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 20. Посттрансляционные модификации включают (но не ограничиваясь только ими) модификацию путем пироглутамилирования глутамина или глутамата в N-концевой области тяжелой цепи или легкой цепи в пироглутамовую кислоту.
Другим объектом изобретения является антитело к ZIKV, которое содержит последовательность вариабельного домена легкой цепи (VL), идентичную по меньшей мере на 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% аминокислотной последовательности, представленной в любой из SEQ ID NO: 8, 9 или 10. В некоторых вариантах осуществления изобретения VL-последовательность, идентичная по меньшей мере на 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% или 99%, содержит замены (например, консервативные
Перевод материалов заявки для рассмотрения на национальной фазе замены), инсерции или делеции по сравнению с референс-последовательностью, но антитело к ZIKV, содержащее такую последовательность, сохраняет способность связываться с ZIKV. В некоторых вариантах осуществления изобретения в целом от 1 до 10 аминокислот заменено, встроено и/или удалено путем делеции в любой из SEQ ID NO: 8, 9 или 10. В некоторых вариантах осуществления изобретения замены, инсерции или делеции затрагивают области вне HVR (т.е. FR). Необязательно антитело к ZIKV содержит VL-последовательность, представленную в любой из SEQ ID NO: 8, 9 или 10, включая пост-трансляционные модификации указанной последовательности. В конкретном варианте осуществления изобретения VL содержит один, два или три HVR, выбранных из: (a) HVR-L1, который содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 21, (б) HVR- L2, который содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 24, и (в) HVR-L3, который содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 27. Посттрансляционные модификации включают (но не ограничиваясь только ими) модификацию путем пироглутамилирования глутамина или глутамата в N-концевой области тяжелой цепи или легкой цепи в пироглутамовую кислоту.
Другим объектом изобретения является антитело к ZIKV, которое содержит последовательность вариабельного домена легкой цепи (VL), идентичную по меньшей мере на 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 10. В некоторых вариантах осуществления изобретения VL-последовательность, идентичная по меньшей мере на 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% или 99%, содержит замены (например, консервативные замены), инсерции или делеции по сравнению с референс-последовательностью, но антитело к ZIKV, содержащее такую последовательность, сохраняет способность связываться с ZIKV. В некоторых вариантах осуществления изобретения в целом от 1 до 10 аминокислот заменено, встроено и/или удалено путем делеции в SEQ ID NO: 10. В некоторых вариантах осуществления изобретения замены, инсерции или делеции затрагивают области вне HVR (т.е. FR). Необязательно антитело к ZIKV содержит VL-последовательность, представленную в SEQ ID NO: 10, включая пост-трансляционные модификации указанной последовательности. В конкретном варианте осуществления изобретения VL содержит один, два или три HVR, выбранных из: (a) HVR-L1, который содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 21, (б) HVR- L2, который содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 24, и (в) HVR-L3, который содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 27. Посттрансляционные модификации включают (но не ограничиваясь только ими) модификацию путем пироглутамилирования глутамина или глутамата в N-концевой области тяжелой цепи или легкой цепи в пироглутамовую кислоту.
Другим объектом изобретения является антитело к ZIKV, где антитело содержит VH, указанную в любом из представленных выше вариантов осуществления изобретения, и VL, указанную в любом из представленных выше вариантов осуществления изобретения. В одном из вариантов осуществления изобретения антитело содержит последовательности VH и VL, которые представлены в любой из SEQ ID NO: 2, 3, 4, 5 или бив любой из SEQ ID NO: 8, 9 или 10 соответственно, включая пост-трансляционные модификации указанных последовательностей. В одном из вариантов осуществления изобретения антитело содержит последовательности VH и VL, которые представлены в любой из SEQ ID NO: 2, 3, 4, 5 или бив SEQ ID NO: 7 соответственно, включая пост-трансляционные модификации указанных последовательностей. Пост-трансляционные модификации включают (но не ограничиваясь только ими) модификацию путем пироглутамилирования глутамина или глутамата в N-концевой области тяжелой цепи или легкой цепи в пироглутамовую кислоту.
Другим объектом изобретения является антитело к ZIKV, где антитело содержит VH, указанную в любом из представленных выше вариантов осуществления изобретения, и VL, указанную в любом из представленных выше вариантов осуществления изобретения. В одном из вариантов осуществления изобретения антитело содержит последовательности VH и VL, которые представлены в SEQ ID NO: 6 и SEQ ID NO: 7 соответственно, включая посттрансляционные модификации указанных последовательностей. В одном из вариантов осуществления изобретения антитело содержит последовательности VH и VL, которые представлены в SEQ ID NO: бив SEQ ID NO: 7 соответственно, включая пост-трансляционные модификации указанных последовательностей. Пост-трансляционные модификации включают (но не ограничиваясь только ими) модификацию путем пироглутамилирования глутамина или глутамата в N-концевой области тяжелой цепи или легкой цепи в пироглутамовую кислоту.
В некоторых вариантах осуществления изобретения антитело содержит последовательность константной области тяжелой цепи (т.е. СН) SEQ ID NO: 59. В некоторых вариантах осуществления изобретения антитело содержит последовательность константной области легкой цепи (т.е. CL) SEQ ID NO: 60. В некоторых вариантах осуществления изобретения антитело содержит последовательности константной области тяжелой цепи и константной области легкой цепи SEQ ID NO: 59 и SEQ ID NO: 60 соответственно.
В некоторых вариантах осуществления изобретения предлагаемое в изобретении антитело, которое связывается с вирусом Зика, представляет собой моноклональное антитело. В некоторых вариантах осуществления изобретения предлагаемое в изобретении антитело, которое связывается с вирусом Зика, представляет собой человеческое, гуманизированное или химерное антитело. В некоторых вариантах осуществления изобретения предлагаемое в изобретении антитело, которое связывается с вирусом Зика, представляет собой полноразмерное антитело IgG-класса.
В некоторых вариантах осуществления изобретения Fc-область предлагаемого в изобретении антитела, которое связывается с вирусом Зика, содержит Ala в положении 234 и Ala в положении 235 асогласно EU-нумерации. В некоторых вариантах осуществления изобретения Fc-область предлагаемого в изобретении антитела, которое связывается с вирусом Зика, можно выбирать из вариантов Fc-областей, указанных в настоящем описании.
В изобретении предложена также фармацевтическая композиция, содержащая антитело к вирусу Зика, предлагаемое в настоящем изобретении, и фармацевтически приемлемый носитель.
Антитела к вирусу Зика, предлагаемые в настоящем изобретении, можно применять в качестве лекарственного средства. В некоторых вариантах осуществления изобретения антитела к вирусу Зика, предлагаемые в настоящем изобретении, можно применять для лечения или предупреждения вызываемой вирусом Зика инфекции.
Антитела к вирусу Зика, предлагаемые в настоящем изобретении, можно применять для приготовления лекарственного средства. В некоторых вариантах осуществления изобретения лекарственно средство предназначено для лечения или предупреждения вызываемой вирусом Зика инфекции.
В изобретении предложен также способ лечения индивидуума, имеющего вызываемую вирусом Зика инфекцию. В некоторых вариантах осуществления изобретения способ включает введение индивидууму в эффективном количестве антитела к вирусу Зика, предлагаемого в настоящем изобретении. В некоторых вариантах осуществления изобретения способ включает также введение индивидууму дополнительного терапевтического средства, например, описанного ниже.
В некоторых вариантах осуществления вариант Fc-области предлагаемого в настоящем изобретения антитела, которое связывается с вирусом Зика, содержит по меньшей мере одно аминокислотное изменение в родительской Fc-области. В других вариантах осуществления изобретения вариант Fc-области обладает в существенно пониженной FcyR-связывающей активностью по сравнению с родительской Fc-областью. В других вариантах осуществления изобретения вариант Fc-области не обладает существенно пониженной C1q-связывающей активностью по сравнению с родительской Fc-областью.
В некоторых вариантах осуществления изобретения вариант Fc-области предлагаемого в настоящем изобретении антитела, которое связывается с вирусом Зика, содержит Ala в положении 234, Ala в положении 235 согласно EU-нумерации. В других вариантах осуществления изобретения вариант Fc-области содержит аминокислотные изменения, указанные в любом из следующих положений, указанных в подпунктах (а)-(в): (а) положения 267, 268 и 324, (б) положения 236, 267, 268, 324 и 332 и (в) положения 326 и 333; согласно EU-нумерации.
В некоторых вариантах осуществления изобретения вариант Fc-области предлагаемого в настоящем изобретении антитела, которое связывается с вирусом Зика, содержит аминокислоты, выбранные из группы, которая состоит из: (a) Glu в положении 267, (б) Phe в положении 268, (в) Thr в положении 324, (г) Ala в положении 236, (д) Glu в положении 332, (е) Ala, Asp, Glu, Met или Trp в положении 326, и (ж) Ser в положении 333; согласно EU-нумерации.
В некоторых вариантах осуществления изобретения вариант Fc-области предлагаемого в настоящем изобретении антитела, которое связывается с вирусом Зика, содержит также аминокислоты, выбранные из группы, которая состоит из: (a) Ala в положении 434, (б) Ala в положении 434, Thr в положении 436, Arg в положении 438 и Glu в положении 440, (в) Leu в положении 428, Ala в положении 434, Thr в положении 436, Arg в положении 438 и Glu в положении 440 и (г) Leu в положении 428, Ala в положении 434, Arg в положении 438 и Glu в положении 440; согласно EU-нумерации.
В некоторых вариантах осуществления изобретения вариант Fc-области предлагаемого в настоящем изобретении антитела, которое связывается с вирусом Зика, содержит любое из аминокислотных изменений, индивидуально или в комбинации, которые представлены в таблице 4. В некоторых вариантах осуществления родительская Fc-область, указанная в настоящем изобретении, имеет происхождение из человеческого IgG1. В изобретении предложен полипептид, содержащий аминокислотную последовательность, представленную в любой из SEQ ID NO: 51-59.
В других вариантах осуществления изобретения, антитело, предлагаемое в настоящем изобретении, которое связывается с вирусом Зика, содержит:
(а) (I) HVR-H3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 16, (II) HVR-L3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 27, и (III) HVR-H2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 13;
(б) (I) HVR-H1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 11, (II) HVR-H2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 13, и (III) HVR-H3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 16;
(в) (I) HVR-H1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 11, (II) HVR-H2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 13, (III) HVR-H3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 16, (IV) HVR-L1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 21; (V) HVR-L2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 24; и (VI) HVR-L3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 27, или
(г) (I) HVR-L1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 21; (II) HVR-L2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 24; и (III) HVR-L3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 27;
(д) (I) HVR-H1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 12, (II) HVR-H2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 15, и (III) HVR-H3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 20.
В других вариантах осуществления изобретения, антитело, предлагаемое в настоящем изобретении, которое связывается с вирусом Зика, содержит:
(а) (I) HVR-H3 из VH-последовательности SEQ ID NO: 6, (II) HVR-L3 из VL-последовательности SEQ ID NO: 10 и (III) HVR-H2 из VH-последовательности SEQ ID NO: 6;
(б) (I) HVR-H1 из VH-последовательности SEQ ID NO: 6, (II) HVR-H2 из VH-последовательности SEQ ID NO: 6 и (III) HVR-H3 из VH-последовательности SEQ ID NO: 6;
(в) (I) HVR-H1 из VH-последовательности SEQ ID NO: 6, (II) HVR-H2 из VH-последовательности SEQ ID NO: 6, (III) HVR-H3 из VH-последовательности SEQ ID NO: 6, (IV) HVR-L1 из VL-последовательности SEQ ID NO: 10; (V) HVR-L2 из VL-последовательности SEQ ID NO: 10 и (VI) HVR-L3 из VL-последовательности SEQ ID NO: 10;
(г) (I) HVR-L1 из VL-последовательности SEQ ID NO: 10, (II) HVR-L2 из VL-последовательности SEQ ID NO: 10 и (III) HVR-L3 из VL-последовательности SEQ ID NO: 10; или
(д) (I) HVR-H1 из VH-последовательности SEQ ID NO: 6, (II) HVR-H2 из VH-последовательности SEQ ID NO: 6, (III) HVR-H3 из VH-последовательности SEQ ID NO: 6, (IV) HVR-L1 из VL-последовательности SEQ ID NO: 7, (V) HVR-L2 из VL-последовательности SEQ ID NO: 7 и (VI) HVR-L3 из VL-последовательности SEQ ID NO: 7.
В других вариантах осуществления изобретения, антитело, предлагаемое в настоящем изобретении, которое связывается с вирусом Зика, содержит (I) VH, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO:6, (II) VL, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO:7, (III) СН, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 59, и (IV) CL, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 60. В других вариантах осуществления изобретения, антитело, предлагаемое в настоящем изобретении, которое связывается с вирусом Зика, содержит вариант VH последовательности, выбранный из группы, которая состоит из: ЗСН1047 (VH из 3Cam2-LALA+KAES+ACT5; SEQ ID NO: 6) и 3CH1049 (SEQ ID NO: 95), с СН-последовательностью человеческого IgG1, выбранной из группы, которая состоит из: SG182 (WT; SEQ ID NO: 46), SG1095 (SEQ ID NO: 54) и SGI 106 (CH 3Cam2-LALA+KAES+ACT5; SEQ ID NO: 59); содержит вариант VL-последовательности, выбранный из группы, которая состоит из: 3CL (VL из 3Cam2-LALA+KAES+ACT5; SEQ ID NO: 7) и 3CL633 (SEQ ID NO: 98), с человеческой CL-последовательностью SKI (CL из 3Cam2-LALA+KAES+ACT5 SEQ ID NO: 60). Предлагаемые в настоящем изобретении последовательности вариантов и мутации указаны и подробно описаны в таблицах 2 и 4.
В некоторых примерах антитело, предлагаемое в настоящем изобретении, которое связывается с вирусом Зика, описано, например, в разделе «Примеры» в настоящем описании. Например, антитело, указанное в настоящем описании, может представлять собой антитело, описанное в примере 7, такое как (но не ограничиваясь только ими) следующие его варианты: (а) ЗСат2, представляющее собой DG3CH1047 (SEQ ID NO: 6)-SG182 (SEQ ID NO: 46)/3CL (SEQ ID NO: 7)_SK1 (SEQ ID NO: 60), (6) 3Cam2-LALA+KAES, представляющее собой DG3CH1047 (SEQ ID NO: 6)-SG1095 (SEQ ID NO: 54)/3CL (SEQ ID NO: 7) SKI (SEQ ID NO: 60), (в) 3Cam2-LALA+KAES+ACT5, представляющее собой DG3CH1047 (SEQ ID NO: 6)-SG1106 (SEQ ID NO: 59)/3CL (SEQ ID NO: 7)_SK1 (SEQ ID NO: 60), (г) ЗС, представляющее собой DG 3CH (SEQ ID NO: 1)-SG182 (SEQ ID NO: 46)/3CL (SEQ ID NO: 7) SKI (SEQ ID NO: 60), (д) 3C-LALA, представляющее собой DG 3CH (SEQ ID NO: 1)-SG192 (SEQ ID NO: 47)/3CL (SEQ ID NO: 7) SKI (SEQ ID NO: 60), (e) 3C-LALA+KAES+ACT5, представляющее собой DG3CH (SEQ ID NO: 1)-SG1106 (SEQ ID NO: 59)/3CL (SEQ ID NO: 7)_SK1 (SEQ ID NO: 60), и т.п.
В следующем объекте изобретения антитело к DENV или антитело к ZIKV, указанное в любом из приведенных выше объектов изобретения, представляет собой моноклональное антитело, включая химерное, гуманизированное или человеческое антитело. В одном из вариантов осуществления изобретения антитело к DENV или антитело к ZIKV представляет собой фрагмент антитела, например, Fv, Fab, Fab', scFv, димерное антитело (диабоди) или Е(ab')2-фрагмент антитела. В другом варианте осуществления изобретения антитело представляет собой полноразмерное антитело, например, интактное антитело IgG1-подкласса или антитело другого класса или изотипа, указанного в настоящем описании.
В следующем объекте изобретения антитело к DENV или антитело к ZIKV, предлагаемое в изобретении, может иметь модификацию, которая аннулирует связывание антител с Fc-гамма-рецепторами (FcyR). Не вдаваясь в теорию, можно предположить, что модификация, которая аннулирует связывание антител с Fc-гамма-рецепторами, может быть ценной, поскольку пониженное связывание FcR может предотвращать явление ADE (антителозависимое усиление) инфекции, которое, вероятно, обусловлено главным образом взаимодействием с FcR. В одном из вариантов осуществления изобретения Fc-область антитела к DENV, предлагаемого в изобретении, содержит Ala в положении 234 и Ala в положении 235 согласно EU-нумерации.
В следующем объекте изобретения антитело к DENV или антитело к ZIKV, указанное в любом из приведенных выше вариантов осуществления изобретения, может обладать любыми особенностями, индивидуально или в комбинации, описанными ниже в разделах 1-7:
1. Аффинность антител
В некоторых вариантах осуществления изобретения антитело, указанное в настоящем описании, имеет величину константы диссоциации (Kd), составляющую 1 мкМ или менее, 100 нМ или менее, 10 нМ или менее, 1 нМ или менее, 0,1 нМ или менее, 0,01 нМ или менее, или 0,001 нМ или менее (например 10-8 М или менее, например, от 10-8 М до 10-13 М, например, от 10-9 М до 10-13 М).
В одном из вариантов осуществления величину Kd измеряют с помощью анализа связывания несущего радиоактивную метку антигена (РИА). В одном из вариантов осуществления изобретения РИА осуществляют с использованием Fab-версии представляющего интерес антитела и его антигена. Например, измеряют в растворе аффинность связывания Fab с антигеном путем уравновешивания Fab минимальной концентрацией 125I-меченного антигена в присутствии полученных титрованием разведений немеченого антигена, осуществляя затем «захват» связанного антигена на сенсибилизированном антителом к Fab планшете (см., например, Chen и др., J. Mol Biol 293, 1999, сс. 865-881). Для обеспечения условий, необходимых для проведения анализа, многолуночные планшеты MICROTITER® (фирма Thermo Scientific) сенсибилизируют в течение ночи захватывающим антителом к Fab (фирма Cappel Labs) в концентрации 5 мкг/мл в 50 мМ карбонате натрия (рН 9,6) и затем блокируют с помощью 2% (мас./об.) бычьего сывороточного альбумина в ЗФР в течение 2-5 ч при комнатной температуре (примерно 23°С). В неадсорбирующем планшете (фирма Nunc, №269620) смешивают взятый в концентрации 100 или 26 пМ меченный с помощью 125I антиген с серийными разведениями представляющего интерес Fab (например, пригодного для оценки антитела к VEGF, Fab-12, см. Presta и др., Cancer Res. 57, 1997, сс. 4593-4599). Затем представляющий интерес Fab инкубируют в течение ночи; однако инкубацию можно осуществлять в течение более продолжительного периода времени (например, в течение 65 ч) для того, чтобы гарантировать достижение равновесия. После этого смеси переносят в подготовленный для захвата планшет и инкубируют при комнатной температуре (например, в течение 1 ч). Затем раствор удаляют и планшет промывают восемь раз 0,1% полисорбатом 20 (TWEEN-20) в ЗФР. После просушки планшетов в них добавляют по 150 мкл/лунку сцинтилляционной жидкости ((MICROSCINT-20™; фирма Packard) и осуществляют считывание планшетов с помощью гамма-счетчика TOPCOUNT™ (фирма Packard) в течение 10 мин. Для осуществления анализа связывания в условиях конкуренции выбирают концентрации каждого Fab, обеспечивающие уровень связывания, составляющий менее или равный 20% от максимального.
В другом варианте осуществления изобретения Kd измеряют методом поверхностного плазмонного резонанса с помощью устройства BIACORE®. Например, анализ осуществляют с помощью устройства BIACORE®-2000 или BIACORE®-3000 (фирма GE Healthcare Inc., Пискатавей, шт. Нью-Джерси) при 25°С с использованием антигена, иммобилизованного на СМ5-чипах с уровнем иммобилизации, соответствующим -10 единицам ответа (RU). В одном из вариантов осуществления изобретения биосенсорные чипы из карбоксиметилированного декстрана (СМ5, фирма GE Healthcare Inc.) активируют с помощью гидрохлорида N-этил-N'-(3-диметиламинопропил)карбодиимида (EDC) и N-гидроксисукцинимида (NHS) согласно инструкциям поставщика. Антиген разводят 10 мМ ацетатом натрия, рН 4,8 до концентрации 5 мкг/мл (~ 0,2 мкМ) перед инъекцией со скоростью потока 5 мкл/мин для достижения уровня иммобилизации, соответствующего примерно 10 единицам ответа (RU) сшитого белка. После инъекции антигена инъецируют 1М этаноламин для блокады непрореагировавших групп. Для кинетических измерений инъецируют двукратные серийные разведения Fab (от 0,78 до 500нМ) в ЗФР, дополненном 0,05% полисорбата 20 (TWEEN-20) в качестве поверхностно-активного вещества (ЗФРТ), при 25°С со скоростью потока примерно 25 мкл/мин. Скорость реакции ассоциации (kon) и реакции диссоциации (koff) рассчитывают с использованием простой модели связывания Ленгмюра 1:1 (программное обеспечение Evaluation версия 3.2, BIACORE®) путем одновременной аппроксимации сенсограмм ассоциации и диссоциации. Константу равновесия реакции диссоциации (Kd) рассчитывают как соотношение koff/kon (см., например, Chen и др., J Mol Biol 293, 1999, сс. 865-881). Если скорость реакции ассоциации превышает 106М-1 с-1 при оценке с помощью описанного выше метода поверхностного плазмонного резонанса, то скорость реакции ассоциации можно определять с помощью метода гашения флуоресценции, который позволяет измерять повышение или снижение интенсивности излучения флуоресценции (длина волны возбуждения 295 нм; длина волны испускания 340 нм, полоса пропускания 16 нм) при 25°С применяемого в концентрации 20 нМ антитела к антигену (Fab-формат) в ЗФР, рН 7,2, в присутствии возрастающих концентраций антигена, осуществляя измерения с помощью спектрометра, такого как спектрофотометр, снабженный блоком для остановки потока (фирма Aviv Instruments), или спектрофотометр SLM-AMINCO™ серии 8000 (фирма ThermoSpectronic), при перемешивании содержимого кюветы.
2. Фрагменты антител
В некоторых вариантах осуществления изобретения антитело, указанное в настоящем описании, представляет собой фрагмент антитела. Фрагменты антител включают (но не ограничиваясь только ими) такие фрагменты как Fab, Fab', Fab'-SH, F(ab')2, Fv и scFv и другие описанные ниже фрагменты. Обзор некоторых фрагментов антител см., у Hudson и др., Nat. Med. 9, 2003, сс. 129-134. Обзор scFv-фрагментов см., например, у Plueckthun в: The Pharmacology of Monoclonal Antibodies, под ред. Rosenburg и Moore, изд-во Springer, New York, т.113, 1994, cc. 269-315; см. также WO 93/16185; и US №№5571894 и 5587458. Обсуждение, касающееся Fab- и F(ab')2-фрагментов, которые содержат остатки эпитопа, связывающегося с рецептором спасения, и обладают удлиненным временем полужизни in vivo, см. в US №5869046.
Димерные антитела представляют собой фрагменты антител с двумя антигенсвязывающими центрами, которые могут быть двухвалентными или биспецифическими (см., например, ЕР 0404097; WO 1993/01161; Hudson и др., Nat. Med. 9, 2003, сс. 129-134; и Holliger и др., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 90, 1993, сс. 6444-6448). Тримерные и тетрамерные антитела описаны также у Hudson и др., Nat. Med. 9, 2003, сс. 129-134.
Однодоменные антитела представляют собой фрагменты антител, содержащие весь вариабельный домен тяжелой цепи или его часть, или весь вариабельный домен легкой цепи антитела или его часть. В некоторых вариантах осуществления изобретения однодоменное антитело представляет собой человеческое однодоменное антитело (фирма Domantis, Inc., Уолтхэм, шт. Массачусетс; см., например, US №6248516 В1).
Фрагменты антител можно создавать различными методиками, включая (но не ограничиваясь только ими) протеолитическое расщепление интактного антитела, а также получать с помощью рекомбинантных клеток-хозяев (например, Е. coli или фаг), указанных в настоящем описании.
3. Химерные и гуманизированные антитела
В некоторых вариантах осуществления изобретения антитело, указанное в настоящем описании, представляет собой химерное антитело. Некоторые химерные антитела описаны, например, в US №4816567; и у Morrison и др., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 81, 1984, сс. 6851-6855. В одном из примеров химерное антитело содержит нечеловеческую вариабельную область (например, вариабельную область из антитела мышей, крыс, хомяков, кроликов или приматов кроме человека, таких как обезьяны) и человеческую константную область. В другом примере химерное антитело представляет собой антитело «переключенного класса», класс или подкласс которого был изменен относительно родительского антитела. Химерные антитела включают их антигенсвязывающие фрагменты.
В некоторых вариантах осуществления изобретения химерное антитело представляет собой гуманизированное антитело. Как правило, нечеловеческое антитело гуманизируют для снижения иммуногенности для людей, сохраняя при этом специфичность и аффинность родительского нечеловеческого антитела. Как правило, гуманизированное антитело содержит один или несколько вариабельных доменов, в которых HVR, например, CDR (или их участки), имеют происхождение из нечеловеческого антитела, a FR (или их участки) имеют происхождение из последовательностей человеческого антитела. Гуманизированное антитело необязательно может содержать также по меньшей мере часть человеческой константной области. В некоторых вариантах осуществления изобретения некоторые остатки FR в гуманизированном антителе заменены на соответствующие остатки из нечеловеческого антитела (например, антитела, из которого имеют происхождение остатки HVR), например, для сохранения или улучшения специфичности или аффинности антитела.
Сведения о гуманизированных антителах и методах их создания обобщены, например, у Almagro и Fransson, Front. Biosci. 13, 2008, сс. 1619-1633, и описаны также у Riechmann и др., Nature 332, 1988, сс. 323-329; Queen и др., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 86, 1989, сс. 10029-10033; US №№5821337, 7527791, 6982321 и 7087409; Kashmiri и др., Methods 36, 2005, сс. 25-34 (описание трансплантации SDR (a-CDR)); Padlan, Mol. Immunol. 28, 1991, сс. 489-498 (описание «нанесения нового покрытия»); Dall'Acqua и др., Methods 36, 2005, сс. 43-60 (описание «перестановки FR»); и Osbourn и др., Methods 36, 2005, сс. 61-68 и Klimka и др., Br. J. Cancer 83, 2000, сс. 252-260 (описание подхода «направленной селекции» для перестановки FR).
Человеческие каркасные участки, которые можно применять для гуманизации, включают (но не ограничиваясь только ими): каркасные участки, выбранные с использованием методов «наилучшего подбора» (см., например, Sims и др., J. Immunol. 151, 1993, сс. 2296-2308; каркасные участки, имеющие происхождение из консенсусной последовательности конкретной подгруппы вариабельных областей легких и тяжелых цепей человеческих антител (см., например, Carter и др., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 89, 1992, сс. 4285-4289 и Presta и др., J. Immunol. 151, 1993, сс. 2623-2632); человеческие зрелые (с соматическими мутациями) каркасные области или каркасные области человеческой зародышевой линии (см., например, Almagro и Fransson, Front. Biosci. 13, 2008, с. 1619-1633); и каркасные участки, полученные в результате скрининга FR-библиотек (см., например, Васа и др., J. Biol. Chem. 272, 1997, сс. 10678-10684 и Rosok и др., J. Biol. Chem. 271, 1996, сс. 22611-22618). 4. Человеческие антитела
В некоторых вариантах осуществления изобретения антитело, указанное в настоящем описании, представляет собой человеческое антитело. Человеческие антитела можно получать, используя различные методики, известные в данной области. Человеческие антитела описаны в целом у van Dijk и van de Winkel, Curr. Opin. Pharmacol. 5, 2001, cc. 368-374 и Lonberg, Curr. Opin. Immunol. 20, 2008, cc. 450-459.
Человеческие антитела можно получать путем введения иммуногена трансгенному животному, модифицированному таким образом, чтобы оно продуцировало интактные человеческие антитела или интактные антитела с человеческими вариабельными областями в ответ на контрольное заражение антигеном. Указанные животные, как правило, содержат все или часть локусов человеческого иммуноглобулина вместо эндогенных иммуноглобулиновых локусов, которые либо присутствуют вне хромосом, либо интегрированы произвольно в хромосомы животного. У таких трансгенных мышей эндогенные иммуноглобулиновые локусы, как правило, инактивированы. Обзор методов получения человеческих антител в трансгенных животных см. у Lonberg, Nat. Biotech. 23, 2005, сс. 1117-1125 (см., например, также в US №6075181 и US №6150584 описание технологии XENOMOUSE™; в US №5770429 описание технологии HUMAB®; в US №7041870 описание технологии К-М MOUSE® и в публикации заявки на патент США 2007/0061900 описание технологии VELOCIMOUSE®). Человеческие вариабельные области из интактных антител, полученных с помощью указанных животных, можно дополнительно модифицировать, например, путем объединения с другой человеческой константной областью.
Человеческие антитела можно создавать с помощью методов на основе гибридом. Описаны клеточные линии человеческой миеломы и мышиной человеческой гетеромиеломы, предназначенные для получения человеческих моноклональных антител (см., например, Kozbor, J. Immunol. 133, 1984, сс. 3001 -3005; Brodeur и др., Monoclonal Antibody Production Techniques and Applications, изд-во Marcel Dekker, Inc., New York, 1987, cc. 51-63 и Boerner и др., J. Immunol. 147, 1991, cc. 86-95). Человеческие антитела, созданные с использованием технологии на основе человеческих В-клеточных гибридом, описаны также у Li и др., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 103, 2006, cc. 3557-3562. Дополнительные методы включают методы, описанные, например, в US №7189826 (описание получения моноклональных человеческих антител типа IgM из клеточных линий гибридом), и у Ni, X1andai Mianyixue 26, 2006, сс. 265-268 (описание человеческих-человеческих гибридом). Технология человеческих гибридом (технология Trioma) описана также у Vollmers и Brandlein, Histology and Histopathology 20, 2005, cc. 927-937 и Vollmers и Brandlein, Methods and Findings in Experimental and Clinical Pharmacology 27, 2005, cc. 185-191.
Человеческие антитела можно создавать также путем выделения последовательностей вариабельных доменов Fv-клонов, выбранных из фаговых дисплейных библиотек, для создания которых использовали человеческие антитела. Указанные последовательности вариабельных доменов затем можно объединять с требуемым человеческим константным доменом. Методики отбора человеческих антител из библиотек антител описаны ниже.
5. Антитела, получаемые из библиотек
Антитела, предлагаемые в изобретении, можно выделять путем скрининга комбинаторных библиотек антител с требуемой активностью или видами активности. Например, в данной области известны разнообразные методы для создания фаговых дисплейных библиотек и скрининга указанных библиотек в отношении антител, обладающих требуемыми характеристиками связывания. Указанные методы обобщены, например, у Hoogenboom и др. в: Methods in Molecular Biology 178, 2001, cc. 1-37 (под ред. O'Brien и др., изд-во Human Press, Totowa, NJ, 2001), и описаны также, например, у McCafferty и др., Nature 348, 1990, сс. 552-554; Clackson и др., Nature 352, 1991, сс. 624-628; Marks и др., J. Mol. Biol. 222, 1992, сс. 581-597; Marks и Bradbury в: Methods in Molecular Biology 248, 2003, cc. 161-175 (под ред. Lo, изд-во Human Press, Totowa, NJ, 2003); Sidhu и др., J. Mol. Biol. 338, 2004, cc. 299-310; Lee и др., J. Mol. Biol. 340, 2004, сс. 1073-1093; Fellouse, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 101, 2004, cc. 12467-12472 и Lee и др., J. Immunol. Methods 284, 2004, cc. 119-132.
При осуществлении некоторых методов фагового дисплея популяции VH- и VL-генов клонируют по отдельности с помощью полимеразной цепной реакции (ПЦР) и рекомбинируют произвольно в фаговых библиотеках, которые затем подвергают скринингу в отношении антигенсвязывающего фага согласно методу, описанному у Winter и др., Ann. Rev. Immunol. 12, 1994, сс. 433-455. Фаг, как правило, экспонирует фрагменты антител либо в виде одноцепочечных Fv-фрагментов (scFv), либо в виде Fab-фрагментов. Библиотеки, полученные из иммунизированных источников, включают антитела, обладающие высокой аффинностью к иммуногену, при этом отсутствует необходимость в создании гибридом. Альтернативно этому, можно клонировать необработанную («наивную») популяцию (например, из организма человека), получая один источник антител к широкому спектру чужих, а также своих антигенов без какой-либо иммунизации, что описано у Griffiths и др., EMBO J, 12, 1993, сс. 725-734. И, наконец, «наивные» библиотеки можно получать также методами синтеза путем клонирования неперегруппированных сегментов V-гена из стволовых клеток и с помощью ПЦР-праймеров, содержащих случайную последовательность, для кодирования гипервариабельных CDR3-участков и для осуществления перегруппировки in vitro согласно методу, описанному у Hoogenboom и Winter, J. Mol. Biol. 227, 1992, cc. 381-388. Фаговые библиотеки человеческих антител описаны, например, в следующих патентных публикациях: US №5750373 и публикациях заявок на патент США 2005/0079574, 2005/0119455, 2005/0266000, 2007/0117126, 2007/0160598, 2007/0237764, 2007/0292936 и 2009/0002360.
Антитела или фрагменты антител, выделенные из библиотек человеческих антител, рассматриваются как человеческие антитела или фрагменты человеческих антител.
6. Мультиспецифические антитела
В некоторых вариантах осуществления изобретения антитело, указанное в настоящем описании, представляет собой мультиспецифическое антитело, например, биспецифическое антитело. Мультиспецифические антитела представляют собой моноклональные антитела, которые имеют специфичности, связывающиеся по меньше мере с двумя различными сайтами. В некоторых вариантах осуществления изобретения одна из связывающих специфичностей обеспечивает связывание с Е-белком DENV, а другая с любым другим антигеном. В некоторых вариантах осуществления изобретения биспецифические антитела могут связываться с двумя различными эпитопами Е-белка DENV. Биспецифические антитела можно применять также для локализации цитотоксических агентов в клетках, которые экспрессируют Е-белок DENV. Биспецифические антитела можно получать в виде полноразмерных антител или фрагментов антител.
Методики создания мультиспецифических антител включают (но не ограничиваясь только ими) рекомбинантную совместную экспрессию двух пар тяжелых цепей-легких цепей иммуноглобулинов, обладающих различными специфичностями (см. Milstein и Cuello, Nature 305, 1983, сс. 537-540, WO 93/08829 и Traunecker и др., EMBO J. 10,1991, сс. 3655-3659), и технологию «knob-in-hole» (обеспечение взаимодействия по типу «выступ-во впадину», см., например, US №5731168). Мультиспецифические антитела можно получать также путем создания регулируемых электростатическими силами воздействий для получения молекул антитела с гетеродимерными Fc (WO 2009/089004); перекрестного связывания двух или большего количества антител или фрагментов (см., например, US №4676980 и Brennan и др., Science 229, 1985, сс. 81-83); применения лейциновых молний для получения биспецифических антител (см., например, Kostelny и др., J. Immunol. 148, 1992, сс. 1547-1553); применения технологии «димерных антител» для создания фрагментов биспецифических антител (см., например, Holliger и др., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 90, 1993, cc. 6444-6448); и применения димеров одноцепочечных Fv (sFv) (см., например, Gruber и др., J. Immunol. 152, 1994, сс. 5368-5374); и получения триспецифических антител согласно методу, описанному, например, у Tutt и др., J. Immunol. 147, 1991, сс. 60-69).
Под объем настоящего изобретения подпадают также сконструированные антитела с тремя или большим количеством функциональных антигенсвязывающих сайтов, включая «антитела-осьминоги» (см., например, US 2006/0025576 А1).
Антитело или его фрагмент может включать также «Fab двойного действия» или «DAF», содержащий антигенсвязывающий сайт, который связывается с Е-белком DENV, а также с другим, отличным от него антигеном (см., например, US 2008/0069820).
7. Варианты антител
Некоторые варианты осуществления изобретения относятся к вариантам аминокислотных последовательностей антител, представленных в настоящем описании. Например, может требоваться повышать аффинность связывания и/или другие биологические свойства антитела. Варианты аминокислотной последовательности антитела можно получать путем интродукции соответствующих модификаций в нуклеотидную последовательность, кодирующую антитело, или путем синтеза пептидов. Указанные модификации включают, например, делеции и/или инсерции, и/или замены остатков в аминокислотных последовательностях антитела. Для получения конечной конструкции можно использовать любую комбинацию делеции, инсерции и замен, при условии, что конечная конструкция обладает требуемыми характеристиками, например, способностью связываться с антигеном. а) Полученные путем замены, инсерции и делеции варианты Некоторыми вариантами осуществления изобретения являются варианты антител, которые имеют одну или несколько аминокислотных замен. Сайты, представляющие интерес для замещающего мутагенеза, включают HVR и FR. Консервативные замены представлены ниже в таблице 1 под заголовком «предпочтительные замены», и они описаны ниже со ссылкой на классы боковых цепей аминокислот. Более значимые замены представлены ниже в таблице 1 под заголовком «приведенные в качестве примера замены», и они описаны ниже со ссылкой на классы боковых цепей аминокислот. Аминокислотные замены можно интродуцировать в представляющее интерес антитело и продукты подвергать скринингу в отношении требуемой активности, например, сохранения/повышения способности к связыванию антигена, пониженной иммуногенности или повышенной ADCC или CDC.
Аминокислоты можно группировать на основе общих свойств боковых цепей следующим образом:
(1) гидрофобные: норлейцин, Met, Ala, Val, Leu, Ile;
(2) нейтральные гидрофильные: Cys, Ser, Thr, Asn, Gln;
(3) кислотные: Asp, Glu;
(4) основные: His, Lys, Arg;
(5) остатки, которые влияют на ориентацию цепи: Gly, Pro;
(6) ароматические: Тгр, Tyr, Phe.
Под неконсервативными заменами подразумевают замену представителя одного из указанных классов на представителя из другого класса.
Один из типов полученного в результате замены варианта включает замену одного или нескольких остатков гипервариабельного участка родительского антитела (например, гуманизированного или человеческого антитела). Как правило, полученный(ые) в результате вариант(ы), отобранный(ые) для дополнительного исследования, должен(ы) иметь модификации (например, улучшения) некоторых биологических свойств (например, повышенную аффинность, пониженную иммуногенность) относительно родительского антитела, и/или должен(ы) иметь практически сохраненные определенные биологические свойства родительского антитела. Примером полученного в результате замены варианта является антитело с созревшей аффинностью, которое можно создавать, например, с использованием технологий созревания аффинности на основе фагового дисплея, например, указанных в настоящем описании. В целом, метод состоит в следующем: один или несколько остатков HVR подвергают мутации и варианты антител экспонируют на фаге и подвергают скринингу в отношении конкретной биологической активности (например, аффинности связывания).
Изменения (например, замены) можно осуществлять в HVR, например, для повышения аффинности антитела. Указанные изменения можно делать в «горячих (активных) точках» в HVR, т.е. остатках, кодируемых кодонами, которые с высокой частотой подвергаются мутации в процессе соматического созревания (см., например, Chowdhury, Methods Mol. Biol. 207, 2008, cc. 179-196), и/или в остатках, которые контактируют с антигеном, с последующим тестированием полученного варианта VH или VL в отношении аффинности связывания. Созревание аффинности путем создания и повторной селекции из вторичных библиотек описано, например, у Hoogenboom и др. в: Methods in Molecular Biology 178, 2002, cc. 1-37 (под ред. O'Brien и др., изд-во Human Press, Totowa, NJ, 2001). В некоторых вариантах осуществления процесса созревания аффинности интродуцируют разнообразие в гены вариабельной области, выбранные для созревания, с помощью любого из широкого разнообразия методов (например, ПЦР пониженной точности, перестановка цепи или сайтнаправленный мутагенез с использованием олигонуклеотидов). Затем создают вторичную библиотеку. Далее библиотеку подвергают скринингу для идентификации любых вариантов антител с требуемой аффинностью. Другой метод, применяемый для интродукции разнообразия, включает подходы, мишенью которых является HVR, при которых рандомизируют несколько остатков HVR (например, одновременно 4-6 остатков). Остатки HVR, участвующие в связывании антигена, можно специфически идентифицировать, например, используя аланин-сканирующий мутагенез или моделирование. Часто мишенями являются, прежде всего CDR-H3 и CDR-L3.
В некоторых вариантах осуществления изобретения замены, инсерции или делеции могут затрагивать один или несколько HVR, если указанные изменения не снижают существенно способность антитела связываться с антигеном. Например, в HVR могут быть сделаны консервативные изменения (например, консервативные замены, указанные в настоящем описании), которые не снижают существенно аффинность связывания. Указанные изменения, например, могут находиться вне принимающих участие в контактировании с антигеном остатков HVR. В некоторых вариантах осуществления изобретения в последовательностях вариантов VH и VL, указанных выше, каждый HVR либо является неизмененным, либо содержит не более одной, двух или трех аминокислотных замен.
Ценным методом идентификации остатков или областей антитела, которые можно подвергать мутагенезу, является так называемый «аланин-сканирующий мутагенез», описанный у Cunningham и Wells, Science 244, 1989, сс. 1081-1085. При осуществлении этого метода остаток или группу остатков-мишеней (например, заряженные остатки, такие как arg, asp, his, lys и glu) идентифицируют и заменяют на нейтральную или отрицательно заряженную аминокислоту (например, на аланин или полиаланин) для решения вопроса о том, будет ли это влиять на взаимодействие антитела с антигеном. Дополнительные замены можно интродуцировать в те положения аминокислот, для которых продемонстрирована функциональная чувствительность к начальным заменам.
В альтернативном или дополнительном варианте можно анализировать кристаллическую структуру комплекса антиген-антитело для идентификации точек контакта между антителом и антигеном. Указанные контактирующие остатки и соседние остатки можно рассматривать в качестве мишеней или исключать из рассмотрения в качестве кандидатов для замены. Варианты можно подвергать скринингу для решения вопроса о том, обладают ли они требуемыми свойствами.
Инсерции в аминокислотные последовательности включают амино- и/или карбоксиконцевые слияния, варьирующие по длине от одного остатка до полипептидов, содержащих сто или большее количество остатков, а также инсерции одного или нескольких аминокислотных остатков внутрь последовательности. Примером результата осуществления концевых инсерции является антитело с N-концевым метионильным остатком. Другие инсерционные варианты молекул антител включают слияние N- или С-концов антитела с ферментом (например, для ADEPT (антитело-направляемый фермент пролекарственной терапии) или полипептидом, который удлиняет время полужизни антитела в плазме.
б) Варианты гликозилирования
В некоторых вариантах осуществления изобретения антитело, представленное в настоящем описании, изменяют с целью повышения или понижения степени гликозилирования антитела. Добавление или делецию сайтов гликозилирования в антителе можно легко осуществлять путем такого изменения аминокислотной последовательности, которое позволяет создавать или удалять один или несколько сайтов гликозилирования.
Если антитело содержит Fc-область, то можно изменять присоединенный к ней углевод. Нативные антитела, которые продуцируются клетками млекопитающих, как правило, содержат разветвленный биантенный олигосахарид, который, как правило, присоединен с помощью N-связи к Asn297 СН2-домена Fc-области (см., например, Wright и др., TIBTECH 15, 1997, сс. 26-32). Олигосахарид может включать различные углеводы, например, маннозу, N-ацетилглюкозамин (GlcNAc), галактозу и сиаловую кислоту, а также фукозу, присоединенную к GlcNAc в «стебле» биантенной олигосахаридной структуры. В некоторых вариантах осуществления изобретения модификации олигосахарида в антителе, предлагаемом в изобретении, можно осуществлять для создания вариантов антитела с определенными улучшенными свойствами.
Одним из вариантов осуществления изобретения являются варианты антитела, имеющие углеводную структуру, в которой снижено содержание фукозы, присоединенной (прямо или косвенно) к Fc-области. Например, содержание фукозы в указанной Fc-области может составлять от 1% до 80%, от 1% до 65%, от 5% до 65% или от 20% до 40%. Содержание фукозы определяют путем расчета среднего содержания фукозы в сахарной цепи на Asn297 относительно суммы всех гликоструктур, присоединенных к Asn297 (например, комплексных, гибридных структур и структур с высоким содержанием маннозы), которое измеряют с помощью MALDI-TOF-масс-спектрометрии согласно методу, описанному, например, в WO 2008/077546. Asn297 обозначает остаток аспарагина, присутствующий примерно в положении 297 в Fc-области (EU-нумерация остатков Fc-области); однако вследствие минорных вариаций последовательности антитела Asn297 может располагаться также в положении, находящемся на расстоянии примерно ±3 аминокислоты в прямом или обратном направлении от положения 297, т.е. между положениями 294 и 300. Указанные фукозилированные варианты могут обладать улучшенной ADCC-функцией (см., например, US 2003/0157108 (Presta L.); US 2004/0093621 (фирма Kyowa Hakko Kogyo Co., Ltd). Примерами публикаций, касающихся «дефукозилированных» вариантов антител или вариантов антител «с дефицитом фукозы» являются: US 2003/0157108; WO 2000/61739; WO 2001/29246; US 2003/0115614; US 2002/0164328; US 2004/0093621; US 2004/0132140; US 2004/0110704; US 2004/0110282; US 2004/0109865; WO 2003/085119; WO 2003/084570; WO 2005/035586; WO 2005/035778; WO 2005/053742; WO 2002/031140; Okazaki и др., J. Mol. Biol. 336, 2004, cc. 1239-1249; Yamane-Ohnuki и др., Biotech. Bioeng. 87, 2004, cc. 614-622). Примерами клеточных линий, которые обладают способностью продуцировать дефукозилированные антитела, являются Lecl3 СНО-клетки с дефицитом белкового фукозилирования (Ripka и др., Arch. Biochem. Biophys. 249, 1986, сс. 533-545; US 2003/0157108 (на имя Presta L.) и WO 2004/056312 (на имя Adams и др., см., прежде всего, пример 11), и клеточные линии с «выключенным» геном, например, СНО клетки с «выключенным» геном альфа-1,6-фукозилтрансферазы, FUT8 (см., например, Yamane-Ohnuki и др., Biotech. Bioeng. 87, 2004, сс. 614-622); Kanda и др., Biotechnol. Bioeng., 94(4), 2006, сс. 680-688; и WO 2003/085107).
Кроме того, описаны варианты антител с бисекционными олигосахаридами, например, в которых биантенный олигосахарид, присоединенный к Fc-области антитела, бисекционнируется с помощью GlcNAc. Указанные варианты антител могут отличаться пониженным фукозилированием и/или повышенной ADCC-функцией. Примеры указанных вариантов антител описаны, например, в WO 2003/011878 (на имя Jean-Mairet и др.); US №6602684 (на имя Umana и др.) и US 2005/0123546 (на имя Umana и др.). Предложены также варианты антител по меньшей мере с одним остатком галактозы в олигосахариде, присоединенном к Fc-области. Указанные варианты антител могут обладать повышенной CDC-функцией. Указанные варианты антител описаны, например, в WO 1997/30087 (на имя Patel и др.); WO 1998/58964 (на имя Raju S.); и WO 1999/22764 (на имя Raju S.).
в) Варианты Fc-области
Согласно конкретным вариантам осуществления изобретения можно интродуцировать в Fc-область антитела, представленного в настоящем описании, одну или несколько аминокислотных модификаций, создавая тем самым вариант Fc-области. Вариант Fc-области может содержать последовательность человеческой Fc-области (например, Fc-области человеческого IgG1 IgG2, IgG3 или IgG4), включающую аминокислотную модификацию (например, замену) в одном или нескольких аминокислотных положениях.
Некоторые варианты осуществления изобретения относятся к варианту антитела, который обладает некоторыми, но не всеми эффекторными функциями, что делает его перспективным кандидатом для путей применения, для которых является важным время полужизни антитела in vivo, однако некоторые эффекторные функции (например, ADCC) не являются необходимыми или являются вредными. Можно осуществлять анализы цитотоксичности in vitro и/или in vivo для подтверждения изменения CDC- и/или ADCC-активности. Например, можно осуществлять анализы связывания Fc-рецептора (FcR) для подтверждения того, что антитело обладает способностью к связыванию с Fc-гамма R (и поэтому, вероятно, обладает ADCC-активностью) и способностью связываться с FcRn. Первичные клетки, опосредующие ADCC, т.е. NK-клетки, экспрессируют только Fc-гамма RIII, в то время как моноциты экспрессируют Fc-гамма RI, Fc-гамма RII и Fc-гамма RIII. Данные об экспрессии FcR на гематопоэтических клетках обобщены в таблице 3 на с. 464 у Ravetch и Kinet, Annu. Rev. Immunol. 9, 1991, cc. 457-492. Примерами анализов in vitro ADCC-активности представляющей интерес молекулы являются (но не ограничиваясь только ими) анализы, описанные в US №5500362 (см., например, Hellstrom и др., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 83, 1986, cc. 7059-7063 и Hellstrom и др., Proc. Nat'l Acad. Sci. USA 82, 1985, cc. 1499-1502); US №5821337 (см. Bruggemann и др., J. Exp.Med. 166, 1987, cc. 1351-1361). В альтернативном варианте можно применять нерадиоактивные методы анализа (см., например, нерадиоактивный анализ цитотоксичности АСТ1™ на основе проточной цитометрии (фирма CellTechnology, Inc. Маунтин-Вью, шт. Калифорния); и нерадиоактивный анализ цитотоксичности CytoTox 96 (фирма Promega, Мэдисон, шт. Висконсин). Пригодными для таких анализов эффекторными клетками являются мононуклеарные клетки периферической крови (РВМС) и естественные клетки-киллеры (NK). В альтернативном или дополнительном варианте ADCC-активность представляющей интерес молекулы можно оценивать in vivo, например, на животной модели, например, как описано у Clynes и др., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 95, 1998, cc. 652-656. Можно осуществлять также анализы связывания C1q для подтверждения того, что антитело может связываться с C1q и поэтому обладает CDC-активностью (см., например, описание ELISA для оценки связывания C1q и СЗс в WO 2006/029879 и WO 2005/100402). Для оценки активации комплемента можно осуществлять анализ CDC (см., например, Gazzano-Santoro и др., J. Immunol. Methods 202, 1996, сс. 163-171; Cragg и др., Blood 101, 2003, сс. 1045-1052; и Cragg, Blood 103, 2004, сс. 2738-2743). Определение FcRn-связывания и клиренса/времени полужизни in vivo можно осуществлять также с использованием методов, известных в данной области (см., например, Petkova и др., Int'l. Immunol. 18(12), 2006, сс. 1759-1769).
Антитела с модифицированной эффекторной функцией включают антитела с заменой одного или нескольких следующих остатков Fc-области, таких как 238, 265, 269, 270, 297, 327 и 329 (см., например, US №6737056). К указанным мутантам Fc относятся мутанты Fc с заменами в двух или большем количестве из следующих аминокислотных положений: 265, 269, 270, 297 и 327, включая так называемый мутант «DANA» Fc-области, несущий замену остатков 265 и 297 на аланин (US №7332581).
Описаны некоторые варианты антител с измененной способностью связываться с FcR (см., например, US №6737056; WO 2004/056312 и Shields и др., J. Biol. Chem. 276, 2001, сс. 6591-6604).
Согласно конкретным вариантам осуществления изобретения вариант антитела содержит Fc-область с одной или несколькими аминокислотными заменами, которые изменяют ADCC, например, замены в положениях 298, 333 и/или 334 Fc-области (EU-нумерация остатков).
В некоторых вариантах осуществления изобретения в Fc-области осуществляют изменения, которые приводят к измененной (т.е. либо повышенной, либо пониженной) способности связывать C1q и/или комплементзависимой цитотоксичности (CDC), что описано, например, в US №6194551, WO 1999/51642 и у Idusogie и др., J. Immunol. 164, 2000, сс. 4178-4184.
Антитела с удлиненным временем полужизни и повышенной способностью к связыванию с неонатальным Fc-рецептором (FcRn), который ответствен за перенос материнских IgG эмбриону (Guyer и др., J. Immunol. 117, 1976, сс. 587-593 и Kim и др., J. Immunol. 24, 1994, сс. 2429-2434), описаны в US 2005/0014934 А1 (Hinton и др.). Эти антитела содержат Fc-область с одной или несколькими заменами, которые повышают связывание Fc-области с FcRn. Указанные варианты Fc-области включают варианты с заменами одного или нескольких следующих остатков Fc-области: 238, 256, 265, 272, 286, 303, 305, 307,311,312, 317,340, 356, 360, 362, 376, 378, 380, 382, 413, 424 или 434, например, замену остатка 434 в Fc-области (US №7371826).
Дополнительные примеры, касающиеся других вариантов Fc-области, описаны также у Duncan, Nature 322, 1988, сс. 738-740; в US №5648260; US №5624821 и в WO 1994/29351.
В другом варианте осуществления изобретения антитело может содержать вариант Fc-области, предлагаемый в настоящем изобретении, описанный более подробно ниже.
г) Варианты антител, сконструированные с использованием цистеина
В некоторых вариантах осуществления изобретения может оказаться желательным создавать антитела, сконструированные с использованием цистеина, например, «тиоМАт», в которых один или несколько остатков в антителе заменены на остатки цистеина. В конкретных вариантах осуществления изобретения замененные остатки находятся в доступных сайтах антитела. Путем замены этих остатков на цистеин реакционноспособные тиольные группы помещаются в доступные сайты антитела и могут использоваться для конъюгации антитела с другими фрагментами, такими как фрагменты, представляющие собой лекарственное средство, или фрагменты, представляющие собой линкер, связанный с лекарственным средством, с созданием иммуноконъюгата, указанного ниже в настоящем описании. В некоторых вариантах осуществления изобретения любой(ые) один или несколько следующих остатков может(гут) быть заменен(ы) на цистеин: V205 (нумерация по Кэботу) легкой цепи; А118 (EU-нумерация) тяжелой цепи и S400 (EU-нумерация) Fc-области тяжелой цепи. Антитела, сконструированные с использованием цистеина, можно создавать согласно методу, например, описанному в US №7521541.
д) Производные антител
В некоторых вариантах осуществления изобретения антитело, представленное в настоящем описании, можно дополнительно модифицировать таким образом, чтобы оно содержало известные в данной области и легко доступные дополнительные небелковые фрагменты. Фрагменты, пригодные для дериватизации антитела, включают (но не ограничиваясь только ими) водорастворимые полимеры. Примерами водорастворимых полимеров являются (но не ограничиваясь только ими) полиэтиленгликоль (ПЭГ), сополимеры этиленгликоля/пропиленгликоля, карбоксиметилцеллюлоза, декстран, поливиниловый спирт, поливинилпирролидон, поли-1,3-диоксолан, поли-1,3,6-триоксан, сополимер этилена/малеинового ангидрида, полиаминокислоты (либо гомополимеры, либо статистические сополимеры) и декстран- или поли(н-винилпиролидон)полиэтиленгликоль, гомополимеры пропиленгликоля, сополимеры пропиленоксида/этиленоксида, полиоксиэтилированные полиолы (например, глицерин), поливиниловый спирт и их смеси. Полиэтиленгликольпропиональдегид может иметь преимущество при производстве благодаря его стабильности в воде. Полимер может иметь любую молекулярную массу и может быть разветвленным или неразветвленным. Количество полимеров, присоединенных к антителу, может варьироваться и, если присоединено более одного полимера, то они могут представлять собой одинаковые или различные молекулы. В целом, количество и/или тип полимеров, применяемых для дериватизации, можно определять с учетом таких особенностей (но не ограничиваясь только ими), как конкретные свойства или функции антитела, подлежащие усовершенствованию, предполагается ли применение производного антитела в терапии в определенных условиях, и т.д.
Другим вариантом осуществления изобретения являются конъюгаты антитела и небелкового фрагмента, которые можно избирательно нагревать, воздействуя на него излучением. В одном из вариантов осуществления изобретения небелковый фрагмент представляет собой углеродную нанотрубку (Kam и др., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 102, 2005, сс. 11600-11605). Излучение может иметь любую длину волны и включает (но не ограничиваясь только ими) длины волн, которые не повреждают обычные клетки, но которые нагревают небелковый фрагмент до температуры, при которой уничтожаются клетки, ближайшие к конъюгату: антитело-небелковый фрагмент.
Одним из объектов изобретения является выделенный полипептид, содержащий вариант Fc-области, обладающий существенно пониженной FcγR-связывающей активностью. Одним из объектов изобретения является выделенный полипептид, содержащий вариант Fc-области, который не обладает существенно пониженной C1q-связывающей активностью. Одним из объектов изобретения является выделенный полипептид, содержащий вариант Fc-области, обладающий существенно пониженной FcγR-связывающей активностью, и который не обладает существенно пониженной C1q-связывающей активностью. В некоторых объектах изобретения полипептид представляет собой антитело. В некоторых объектах изобретения полипептид представляет собой содержащий Fc белок (Fc-слитый белок). В некоторых вариантах осуществления изобретения вариант Fc-области содержит по меньшей мере одно изменение аминокислотного остатка (например, замену) по сравнению с соответствующей нативной последовательностью Fc-области или последовательностью референс-варианта (в некоторых случаях обозначена в целом как «родительская» Fc-область). В некоторых вариантах осуществления изобретения вариант Fc-области, предлагаемый в изобретении, обладает существенно пониженной FcγR-связывающей активностью по сравнению с родительской Fc-областью. В некоторых вариантах осуществления изобретения вариант Fc-области, предлагаемый в изобретении не обладает существенно пониженной C1q-связывающей активностью по сравнению с родительской Fc-областью. В некоторых вариантах осуществления изобретения FcγR представляет собой FcγR человека, FcγR обезьян (например, FcγR обезьян циномолгус, макак резус, мармозеток, шимпанзе или бабуинов) или FcγR мышей.
В одном из объектов изобретения вариант Fc-области, предлагаемый в изобретении, обладает существенно пониженной связывающей активностью в отношении одного или нескольких человеческих FcγR, включая (но не ограничиваясь только ими) FcγRIa, FcγRIIa (включая аллельные варианты 167Н и 167R), FcγRIIb, FcγRIIIa (включая аллельные варианты 158F и 158V) и FcγRIIIb (включая аллельные варианты NA1 и NA2) по сравнению с родительской Fc-областью. В следующем объекте изобретения вариант Fc-области, предлагаемый в изобретении, обладает существенно пониженной связывающей активностью в отношении человеческих FcγRIa, FcγRIIa (включая аллельные вариант 167Н и 167R), FcγRIIb, FcγRIIIa (включая аллельные варианты 158F и 158V) и FcγRIIIb (включая аллельные варианты NA1 и NA2) по сравнению с родительской Fc-областью.
В одном из объектов изобретения вариант Fc-области, предлагаемый в изобретении, обладает существенно пониженной связывающей активностью в отношении одного или нескольких мышиных FcγR, включая (но не ограичиваясь только ими) FcγRI, FcγRIIb, FcγRIII и FcγRIV, по сравнению с родительской Fc-областью. В другом объекте изобретения вариант Fc-области, предлагаемый в изобретении, обладает существенно пониженной связывающей активностью в отношении мышиных FcγRI, FcγRIIb, FcγRIII и FcγRIV по сравнению с родительской Fc-областью.
«Fcγ-рецепторы» (обозначены в настоящем описании как Fcγ-рецепторы, FcγR или FcgR) представляют собой рецепторы, которые могут связываться с Fc-областью моноклональных антител изотипа IgG1, IgG2, IgG3 и IgG4, и прежде всего представляют собой любого члена семейства белков, кодируемых генами Fcγ-рецептора. У человека это семейство включает (но не ограничиваясь только ими) FcγRI (CD64), в том числе изоформы FcγRIa, FcγRIb и Fcγ RIc; FcγRII (CD32), в том числе изоформы FcγRIIa (включая аллотипы Н131 (тип Н) и R131 (тип R)), FcγRIIb (в том числе FcγRIIb-1 и FcγRIIb-2), и FcγRIIc; и FcγRIII (CD16), в том числе изоформы FcγRIIIa (включая аллотипы V158 и F158), и FcγRIIIb (включая аллотипы FcγRIIIb-NA1 и FcγRIIIb-NA2), и любые человеческие FcγR, изоформы или аллотипы FcγR, которые пока еще не открыты. FcγRIIb 1 и FcγRIIb2 описаны в виде сплайсинговых вариантов человеческого FcγRIIb. Кроме того, описан сплайсинговый вариант, обозначенный как FcγRIIb3 (J Exp Med, 170, 1989, сс. 1369-1385). Помимо указанных сплайсинговых вариантов человеческий FcγRIIb включает все сплайсинговые варианты, зарегистрированные в NCBI, которые представляют собой NP_001002273.1, NP_001002274.1, NP_001002275.1, NP_001177757.1 и NP_003992.3. Кроме того, человеческий FcγRIIb включает каждый из описанных ранее генных полиморфизмов, а также FcγRIIb (Arthritis Rheum. 48, 2003, сс. 3242-3252; Kono и др., Hum. Mol. Genet. 14, 2005, сс. 2881-2892 и Kyogoju и др., Arthritis Rheum. 46, 2002, сс. 1242-1254), и каждый генный полиморфизм, который будет описан в будущем.
У FcγRIIa существует два аллотипа, один, у которого аминокислота в положении 167 FcγRIIa представляет собой гистидин (тип Н), а другой, у которого аминокислота в положении 167 заменена на аргинин (тип R) (Warrmerdam, J. Exp.Med. 172, 1990, сс. 19-25).
FcγR включает FcγR, имеющие происхождение из человека, мышей, крыс, кроликов и обезьян (но не ограничен указанными), и он может иметь происхождение из любого организма. Мышиные FcγR включают (но не ограничиваясь только ими) FcγRI (CD64), FcγRII (CD32), FcγRIII (CD16) и FcγRIII-2 (CD16-2) и любые мышиные FcγR или изоформы FcγR.
Аминокислотная последовательность человеческого FcγRIa представлена в SEQ ID NO: 69; аминокислотная последовательность человеческого FcγRIIa (167Н) представлена в SEQ ID NO: 70; аминокислотная последовательность человеческого FcγRIIa (167R) представлена в SEQ ID NO: 71; аминокислотная последовательность человеческого FcγRIIb представлена в SEQ ID NO: 72; аминокислотная последовательность человеческого FcγRIIIa (158F) представлена в SEQ ID NO: 73; аминокислотная последовательность человеческого FcγRIIIa (158V) представлена в SEQ ID NO: 74; аминокислотная последовательность человеческого FcγRIIIb (NA1) представлена в SEQ ID NO: 75 и аминокислотная последовательность человеческого FcγRIIIb (NA2) представлена в SEQ ID NO: 76.
Аминокислотная последовательность мышиного FcγRI представлена в SEQ ID NO: 77; аминокислотная последовательность мышиного FcγRIIb представлена в SEQ ID NO: 78; аминокислотная последовательность мышиного FcγRIII представлена в SEQ ID NO: 79 и аминокислотная последовательность мышиного FcγRIV представлена в SEQ ID NO: 80.
В одном из объектов изобретения вариант Fc-области, предлагаемый в изобретении, обладает существенно пониженной FcγR-связывающей активностью, которая составляет менее чем 50%, менее чем 45%, менее чем 40%, менее чем 35%, менее чем 30%, менее чем 25%, менее чем 20%, менее чем 15%, менее чем 10%, менее чем 5%, менее чем 2%, менее чем 1%, менее чем 0,5%, менее чем 0,2% или менее чем 0,1% от FcγR-связывающей активности родительской Fc-области. В одном из объектов изобретения вариант Fc-области, предлагаемый в изобретении, обладает существенно пониженной FcγR-связывающей активностью, это означает, что соотношение [различие в величинах RU на сенсограммах, которое обнаружено до и после взаимодействия FcγR с вариантом Fc-области]/[различие в величинах RU на сенсограммах, которое обнаружено до и после «захвата» FcγR сенсорными чипами] составляет менее чем 1, менее чем 0,8, менее чем 0,5, менее чем 0,3, менее чем 0,2, менее чем 0,1, менее чем 0,08, менее чем 0,05, менее чем 0,03, менее чем 0,02, менее чем 0,01, менее чем 0,008, менее чем 0,005, менее чем 0,003, менее чем 0,002 или менее чем 0,001.
В одном из объектов изобретения вариант Fc-области, предлагаемый в изобретении, не обладает существенно пониженной C1q-связывающей активностью, это означает, что различие C1q-связывающей активности между вариантом Fc-области и родительской Fc-областью, предлагаемой в изобретении, составляет менее чем 50%, менее чем 45%, менее чем 40%, менее чем n 35%, менее чем 30%, менее чем 25%, менее чем 20%, менее чем 15%, менее чем 10% или менее чем 5% по сравнению с C1q-связывающей активностью родительской Fc-области.
Одним из объектов изобретения является выделенный полипептид, содержащий вариант Fc-области с существенно пониженной ADCC-активностью. Одним из объектов изобретения является выделенный полипептид, содержащий вариант Fc-области, не обладающий существенно пониженной CDC-активностью. Одним из объектов изобретения является выделенный полипептид, содержащий вариант Fc-области с существенно пониженной ADCC-активностью и не обладающий существенно пониженной CDC-активностью.
В одном из объектов изобретения вариант Fc-области, предлагаемый в изобретении, обладает существенно пониженной ADCC-активностью, которая составляет менее чем 50%, менее чем 45%, менее чем 40%, менее чем 35%, менее чем 30%, менее чем 25%, менее чем 20%, менее чем 15%, менее чем 10%, менее чем 5%, менее чем 2%, менее чем 1%, менее чем 0,5%, менее чем 0,2% или менее чем 0,1% от ADCC-активности родительской Fc-области.
В одном из объектов изобретения вариант Fc-области, предлагаемый в изобретении, не обладает существенно пониженной CDC-активностью, это означает, что различие CDC-активности между вариантом Fc-области и родительской Fc-областью, предлагаемой в изобретении, составляет менее чем 50%, менее чем 45%, менее чем 40%, менее чем п 35%, менее чем 30%, менее чем 25%, менее чем 20%, менее чем 15%, менее чем 10% или менее чем 5% по сравнению с CDC-активностью родительской Fc-области.
Одним из объектов изобретения является выделенный полипептид, который содержит вариант Fc-области, обладающий существенно пониженной FcγR-связывающей активностью и не обладающий существенно пониженной C1q-связывающей активностью по сравнению с полипептидом, содержащим родительскую Fc-область. В других объектах изобретения полипептид, предлагаемый в изобретении, содержит по меньшей мере одно аминокислотное изменение по меньшей мере в одном положении, выбранном из группы, которая состоит из: 234, 235, 236, 267, 268, 324, 326, 332 и 333 согласно EU-нумерации.
В одном из объектов изобретения вариант Fc-области, обладающий существенно пониженной FcγR-связывающей активностью и не обладающий существенно пониженной C1q-связывающей активностью, содержит Ala в положении 234, Ala в положении 235 и по меньшей мере одно аминокислотное изменение по меньшей мере в одном положении, выбранном из группы, которая состоит из: 234, 235, 236, 267, 268, 324, 326, 332 и 333 согласно EU-нумерации.
В одном из объектов изобретения вариант Fc-области, обладающий существенно пониженной FcγR-связывающей активностью и не обладающий существенно пониженной C1q-связывающей активностью, содержит Ala в положении 234, Ala в положении 235 и дополнительные аминокислотные изменения, указанные в одном из следующих подпунктов (а)-(в): (а) положения 267, 268 и 324; (б) положения 236, 267, 268, 324 и 332; и (в) положения 326 и 333 согласно EU-нумерации.
В следующем объекте изобретения вариант Fc-области, обладающий существенно пониженной FcγR-связывающей активностью и не обладающий существенно пониженной C1q-связывающей активностью, содержит аминокислоты, выбранные из группы, которая состоит из: (a) Glu в положении 267; (б) Phe в положении 268; (в) Thr в положении 324; (г) Ala в положении 236; (д) Glu в положении 332; (е) Ala, Asp, Glu, Met или Trp в положении 326; и (ж) Ser в положении 333 согласно EU-нумерации.
В одном из объектов изобретения вариант Fc-области, обладающий существенно пониженной FcγR-связывающей активностью и не обладающий существенно пониженной C1q-связывающей активностью, содержит аминокислоты: Ala в положении 234, Ala в положении 235, Ala в положении 326 и Ser в положении 333 согласно EU-нумерации. В одном из объектов изобретения вариант Fc-области, обладающий существенно пониженной FcγR-связывающей активностью и не обладающий существенно пониженной C1q-связывающей активностью, содержит аминокислоты: Ala в положении 234, Ala в положении 235, Asp в положении 326 и Ser в положении 333 согласно EU-нумерации. В одном из объектов изобретения вариант Fc-области, обладающий существенно пониженной FcγR-связывающей активностью и не обладающий существенно пониженной C1q-связывающей активностью, содержит аминокислоты: Ala в положении 234, Ala в положении 235, Glu в положении 326 и Ser в положении 333 согласно EU-нумерации. В одном из объектов изобретения вариант Fc-области, обладающий существенно пониженной FcγR-связывающей активностью и не обладающий существенно пониженной C1q-связывающей активностью, содержит аминокислоты: Ala в положении 234, Ala в положении 235, Met в положении 326 и Ser в положении 333 согласно EU-нумерации. В одном из объектов изобретения вариант Fc-области, обладающий существенно пониженной FcγR-связывающей активностью и не обладающий существенно пониженной C1q-связывающей активностью, содержит аминокислоты: Ala в положении 234, Ala в положении 235, Trp в положении 326 и Ser в положении 333 согласно EU-нумерации.
Согласно другому объекту изобретения вариант Fc-области, предлагаемый в изобретении, может дополнительно содержать по меньшей мере одно аминокислотное изменение по меньшей мере в одном положении, выбранном из группы, которая состоит из: 428, 434, 436, 438 и 440 согласно EU-нумерации.
В следующем объекте изобретения вариант Fc-области может дополнительно содержать аминокислоты, выбранные из группы, которая состоит из: (а) Ala в положении 434; (б) Ala в положении 434, Thr в положении 436, Arg в положении 438 и Glu в положении 440; (в) Leu в положении 428, Ala в положении 434, Thr в положении 436, Arg в положении 438 и Glu в положении 440; и (г) Leu в положении 428, Ala в положении 434, Arg в положении 438 и Glu в положении 440 согласно EU-нумерации (см. также в WO 2016/125495 описание связи между аминокислотными изменениями и FcRn-связывающей активностью варианта Fc-области).
В другом объекте изобретения вариант Fc-области, предлагаемый в изобретении, содержит аминокислоты: Ala в положении 234, Ala в положении 235, Ala в положении 326, Ser в положении 333, Leu в положении 428, Ala в положении 434, Thr в положении 436, Arg в положении 438 и Glu в положении 440 согласно EU-нумерации. В другом объекте изобретения вариант Fc-области, предлагаемый в изобретении, содержит аминокислоты: Ala в положении 234, Ala в положении 235, Ala в положении 326, Ser в положении 333, Leu в положении 428, Ala в положении 434, Arg в положении 438 и Glu в положении 440 согласно EU-нумерации.
В одном из объектов изобретения предпочтительно, чтобы вариант Fc-области, предлагаемый в изобретении, не обладал существенно повышенной FcRn-связывающей активностью, прежде всего при рН 7,4, по сравнению с родительской Fc-областью.
«FcRn» является структурным аналогом полипептидов главного комплекса гистосовместимости (ГКГС) класса I и характеризуется 22-29%-ной идентичностью последовательности с молекулами ГКГС класса I. FcRn экспрессируется в виде гетеродимера, состоящего из растворимой β- или легкой цепи (β2-микроглобулин) в комплексе с трансмембранной α- или тяжелой цепью. Так же как и у ГКГС, α-цепь FcRn содержит три внеклеточных домена (α1, α2 и α3) и с помощью ее короткого цитоплазматического домена прикрепляется к клеточной поверхности. α1- и α2-домены взаимодействуют с FcRn-связывающим доменом Fc-области антитела. Полинуклеотидные и аминокислотные последовательности человеческого FcRn можно получать, например, из предшественников, зарегистрированных под номерами NM_004107.4 и NP_004098.1 (которые содержат сигнальную последовательность) соответственно.
Аминокислотная последовательность человеческого FcRn (α-цепь) представлена в SEQ ID NO: 81; а аминокислотная последовательность человеческого β2-микроглобулина представлена в SEQ ID NO: 82.
Согласно одному из объектов изобретения предпочтительно, чтобы вариант Fc-области, предлагаемый в изобретении, не обладал существенно повышенной FcRn-связывающей активностью, прежде всего при рН 7,4, которая превышала бы менее чем в 1000 раз, менее чем в 500 раз, менее чем в 200 раз, менее чем в 100 раз, менее чем в 90 раз, менее чем в 80 раз, менее чем в 70 раз, менее чем в 60 раз, менее чем в 50 раз, менее чем в 40 раз, менее чем в 30 раз, менее чем в 20 раз, менее чем в 10 раз, менее чем в 5 раз, менее чем в 3 раза или менее чем в 2 раза FcRn-связывающую активность родительской Fc-области. Согласно одному из объектов изобретения вариант Fc-области, предлагаемый в изобретении, не обладает существенно повышенной FcRn-связывающей активностью, прежде всего при рН 7,4, это означает, что соотношение [различие в величинах RU на сенсограммах, которое обнаружено до и после взаимодействия FcRn с вариантом Fc-области]/[различие в величинах RU на сенсограммах, которое обнаружено до и после «захвата» FcRn сенсорными чипами] составляет менее чем 0,5, менее чем 0,3, менее чем 0,2, менее чем 0,1, менее чем 0,08, менее чем 0,05, менее чем 0,03, менее чем 0,02, менее чем 0,01, менее чем 0,008, менее чем 0,005, менее чем 0,003, менее чем 0,002 или менее чем 0,001.
Согласно другому объекту изобретения вариант Fc-области, предлагаемый в изобретении, содержит любое из аминокислотных изменений, индивидуально или в комбинации, которые представлены в таблице 4. Согласно другому объекту изобретения вариант Fc-области, предлагаемый в изобретении, содержит любое из аминокислотных изменений, представленных в таблице 4. Другим объектом изобретения является полипептид, содержащий аминокислотную последовательность, представленную в любой из SEQ ID NO: 51-59.
В некоторых вариантах осуществления изобретения полипептид, который содержит вариант Fc-области, предлагаемый в настоящем изобретении, представляет собой константную область тяжелой цепи антитела. В некоторых вариантах осуществления изобретения полипептид; который содержит вариант Fc-области, предлагаемый в настоящем изобретении, дополнительно содержит антигенсвязывающий домен. В другом варианте осуществления изобретения полипептид представляет собой тяжелую цепь антитела. В следующем варианте осуществления изобретения полипептид представляет собой антитело. В некоторых вариантах осуществления изобретения антитело представляет собой химерное антитело или гуманизированное антитело. Происхождение антитела не ограничено конкретным происхождением, но примеры включают человеческое антитело, мышиное антитело, крысиное антитело и кроличье антитело. В другом варианте осуществления изобретения полипептид представляет собой Fc-слитый белок.
Два или большее количество полипептидов, которые содержат вариант Fc-области, указанный в настоящем описании, могут быть включены в одну молекулу, при этом два полипептида, которые содержат варианты Fc-областей, находятся в ассоциации, максимально напоминающей ассоциацию в антителе.
Тип антитела не ограничен конкретным типом и можно применять IgA (IgA1, IgA2), IgD, IgE, IgG (IgG1, IgG2, IgG3, IgG4) и IgM или т.п.
В некоторых вариантах осуществления изобретения полипептид, который содержит вариант Fc-области, предлагаемый в настоящем изобретении, представляет собой антитело. В других вариантах осуществления изобретения полипептид, который содержит вариант Fc-области, предлагаемый в настоящем изобретении, представляет собой противовирусное антитело.
В других вариантах осуществления изобретения полипептид, который содержит вариант Fc-области, предлагаемый в настоящем изобретении, содержит вариабельную область антитела, которая содержит:
(a) (I) HVR-H3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 16, (II) HVR-L3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 27, и (III) HVR-H2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 13;
(б) (I) HVR-H1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 11, (II) HVR-H2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 13, и (III) HVR-H3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 16;
(в) (I) HVR-H1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 11, (II) HVR-H2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 13, (III) HVR-H3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 16, (IV) HVR-L1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 21; (V) HVR-L2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 24; и (VI) HVR-L3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 27, или
(г) (I) HVR-L1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 21; (II) HVR-L2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 24; и (III) HVR-L3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 27.
В других вариантах осуществления изобретения полипептид, который содержит вариант Fc-области, предлагаемый в настоящем изобретении, содержит вариабельную область антитела, которая содержит:
(а) (I) HVR-H3 из VH-последовательности SEQ ID NO: 6, (II) HVR-L3 из VL-последовательности SEQ ID NO: 10 и (III) HVR-H2 из VH-последовательности SEQ ID NO: 6;
(б) (I) HVR-H1 из VH-последовательности SEQ ID NO: 6, (II) HVR-H2 из VH-последовательности SEQ ID NO: 6 и (III) HVR-H3 из VH-последовательности SEQ ID NO: 6;
(в) (I) HVR-H1 из VH-последовательности SEQ ID NO: 6, (II) HVR-H2 из VH-последовательности SEQ ID NO: 6, (III) HVR-H3 из VH-последовательности SEQ ID NO: 6, (IV) HVR-L1 из VL-последовательности SEQ ID NO: 10; (V) HVR-L2 из VL-последовательности SEQ ID NO: 10 и (VI) HVR-L3 из VL-последовательности SEQ ID NO: 10;
(г) (I) HVR-L1 из VL-последовательности SEQ ID NO: 10; (II) HVR-L2 из VL-последовательности SEQ ID NO: 10 и (III) HVR-L3 из VL-последовательности SEQ ID NO: 10; или
(д) (I) HVR-H1 из VH-последовательности SEQ ID NO: 6, (II) HVR-H2 из VH-последовательности SEQ ID NO: 6, (III) HVR-H3 из VH-последовательности SEQ ID NO: 6, (IV) HVR-L1 из VL-последовательности SEQ ID NO: 7; (V) HVR-L2 из VL-последовательности SEQ ID NO: 7 и (VI) HVR-L3 из VL-последовательности SEQ ID NO: 7.
В других вариантах осуществления изобретения полипептид, который содержит вариант Fc-области, предлагаемый в настоящем изобретении, содержит VH-область, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 1, и VL-область, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 7. Другими вариантами осуществления изобретения является антитело, которое содержит VH-область, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 1, и вариант Fc-области, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 54, в тяжелой цепи, и VL-область, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 7, в легкой цепи. Другими вариантами осуществления изобретения является антитело, которое содержит VH-область, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 1, и вариант Fc-области, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 58, в тяжелой цепи, и VL-область, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 7, в легкой цепи. Другими вариантами осуществления изобретения является антитело, которое содержит VH-область, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 1, и вариант Fc-области, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 59, в тяжелой цепи, и VL-область, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 7, в легкой цепи.
В изобретении предложено также антитело к DENV, указанное в настоящем описании, которое дополнительно содержит полипептид, содержащий вариант Fc-области, предлагаемый в настоящем изобретении. В некоторых вариантах осуществления изобретения антитело к DENV, предлагаемое в изобретении, содержит VH-область, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 6, и вариант Fc-области, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 54, в тяжелой цепи, и VL-область, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 10, в легкой цепи. В некоторых вариантах осуществления изобретения антитело к DENV, предлагаемое в изобретении, содержит VH-область, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 6, и вариант Fc-области, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 58, в тяжелой цепи, и VL-область, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 10, в легкой цепи. В некоторых вариантах осуществления изобретения антитело к DENV, предлагаемое в изобретении, содержит VH-область, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 6, и вариант Fc-области, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 59, в тяжелой цепи, и VL-область, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 10, в легкой цепи.
В некоторых вариантах осуществления изобретения антитело к DENV, предлагаемое в изобретении, содержит VH-область, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 6, и вариант Fc-области, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 59, в тяжелой цепи, и VL-область, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 7, в легкой цепи.
В контексте настоящего описания понятие «родительская Fc-область» относится к Fc-области до интродукции в нее аминокислотного(ых) изменения(й), указанного(ых) в настоящем описании. Предпочтительными примерами родительской Fc-области являются Fc-области из нативных антител. Антитела включают, например, IgA (IgA1, IgA2), IgD, IgE, IgG (IgG1, IgG2, IgG3, IgG4) и IgM или т.п. Антитела могут иметь происхождение из организма человека или обезьян (например, циномолгус, макаки резус, мармозетки, шимпанзе или бабуины). Нативные антитела могут включать также встречающиеся в естественных условиях мутации. Множество аллотипических последовательностей IgG, связанных с генетическим полиморфизмом, описаны в «Sequences proteins of immunological interest», публикация NIH №91-3242, и любую из них можно применять в настоящем изобретении. В частности, в случае человеческого IgG1 аминокислотная последовательность в положениях 356-358 (EU-нумерация) может представлять собой либо DEL, либо ЕЕМ. Предпочтительные примеры родительской Fc-области включают Fc-области из константной области тяжелой цепи человеческого IgG1 (SEQ ID NO: 83), человеческого IgG2 (SEQ ID NO: 84), человеческого IgG3 (SEQ ID NO: 85) и человеческого IgG4 (SEQ ID NO: 86). Другим предпочтительным примером родительской Fc-области является Fc-область из константной области тяжелой цепи SG1 (SEQ ID NO: 87). Другим предпочтительным примером родительской Fc-области является Fc-область из константной области тяжелой цепи SG182 (SEQ ID NO: 46). Кроме того, родительская Fc-область может представлять собой Fc-область, полученную путем добавления аминокислотного(ых) изменения(й), отличного(ых) от аминокислотного(ых) изменения(й), указанного(ых) в настоящем описании для Fc-области из нативного антитела.
Кроме того, аминокислотные изменения, которые осуществляют для другой(их) цели(ей), можно объединять в варианте Fc-области, указанном в настоящем описании. Например, можно добавлять аминокислотные замены, которые повышают FcRn-связывающую активность (Hinton и др., J. Immunol. 176(1), 2006, сс. 346-356; Dall'Acqua и др, J. Biol. Chem. 281(33), 2006, сс. 23514-23524; Petkova и др., Intl. Immunol. 18(12), 2006, сс. 1759-1769; Zalevsky и др., Nat. Biotechnol. 28(2), 2010, cc. 157-159; WO 2006/019447; WO 2006/053301; и WO 2009/086320), и аминокислотные замены, которые повышают гетерогенность или стабильность антитела (WO 2009/041613). Альтернативно этому, полипептиды, обладающие способностью усиливать клиренс антигена, которые описаны в WO 2011/122011, WO 2012/132067, WO 2013/046704 или WO 2013/180201, полипептиды, обладающие способностью специфически связываться с тканью-мишенью, которые описаны в WO 2013/180200, полипептиды, обладающие способностью повторно связываться с множеством молекул антигенов, которые описаны в WO 2009/125825, WO 2012/073992 или WO 2013/047752, можно объединять с вариантом Fc-области, указанном в настоящем описании. Альтернативно этому, с целью придания способности связываться с другими антигенами аминокислотные изменения, описанные в ЕР 1752471 и ЕР 1772465, можно объединять в СН3-участке варианта Fc-области, указанного в настоящем описании. Альтернативно этому, с целью повышения удерживания в плазме можно объединять аминокислотные изменения, которые снижают pI константной области (WO 2012/016227), в варианте Fc-области, указанном в настоящем описании. Альтернативно этому, с целью повышения поглощения клеткой можно объединять аминокислотные изменения, которые повышают pI константной области (WO 2014/145159), в варианте Fc-области, указанном в настоящем описании. Альтернативно этому, с целью усиления элиминации молекулы-мишени из плазмы можно объединять аминокислотные изменения, которые повышают pI константной области (WO 2016/125495 и WO 2016/098357), в варианте Fc-области, указанном в настоящем описании.
Аминокислотные изменения, повышающие связывающую активность в отношении человеческого FcRn при кислых значениях рН, можно объединять также в варианте Fc-области, указанном в настоящем описании. В частности, указанные изменения могут включать, например, замену на Leu Met в положении 428 и замену на Ser Asn в положении 434 согласно EU-нумерации (Nat Biotechnol, 28, 2010, сс. 157-159); замену на Ala Asn в положении 434 (Drug Metab Dispos, 38(4), апрель 2010 г., сс. 600-605); замену на Tyr Met в положении 252, замену на Thr Ser в положении 254 и замену на Glu Thr в положении 256 (J Biol Chem, 281, 2006, сс. 23514-23524); замену на Gln Thr в положении 250 и замену на Leu Met в положении 428 (J Immunol, 176(1), 2006, сс. 346-356); замену на His Asn в положении 434 (Clin Pharmacol Ther, 89(2), 2011, сс. 283-290), и изменения, описанные в WO 2010/106180, WO 2010/045193, WO 2009/058492, WO 2008/022152, WO 2006/050166, WO 2006/053301, WO 2006/031370, WO 2005/123780, WO 2005/047327, WO 2005/037867, WO 2004/035752, WO 2002/060919 или т.п.В другом варианте осуществления изобретения такие изменения могут включать, например, по меньшей мере одно изменение, выбранное из группы, состоящей из замены на Leu Met в положении 428, замены на Ala Asn в положении 434 и замены на Thr Tyr в положении 436. Указанные изменения могут включать также замену на Arg Gln в положении 438 и/или замену на Glu Ser в положении 440 (WO 2016/125495).
Согласно настоящему изобретению аминокислотное изменение означает любую замену, делецию, добавление, инсерцию и модификацию или их комбинацию. Согласно настоящему изобретению аминокислотное изменение можно рассматривать как аминокислотную мутацию.
Аминокислотные изменения получают с помощью различных методов, известных специалистам в данной области. Указанные методы включают (но не ограничиваясь только ими) метод сайтнаправленного мутагенеза (Hashimoto-Gotoh и др., Gene 152, 1995, сс. 271-275; Zoller, Meth. Enzymol. 100, 1983, сс. 468-500; Kramer и др., Nucleic Acids Res. 12, 1984, сс. 9441-9456; Kramer и Fritz, Methods Enzymol. 154, 1987, сс. 350-367 и Kunkel, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 82, 1985, сс. 488-492), метод на основе ПЦР-мутагенеза и кассетного мутагенеза.
Количество аминокислотных изменений, интродуцированных с Fc-область, не ограничено. В некоторых вариантах осуществления изобретения оно может составлять 1, 2 или менее, 3 или менее, 4 или менее, 5 или менее, 6 или менее, 8 или менее, 10 или менее, 12 или менее, 14 или менее, 16 или менее, 18 или менее или 20 или менее.
Кроме того, полипептид, который содержит вариант Fc-области, предлагаемый в настоящем изобретении, можно модифицировать химически с помощью различных молекул, таких как полиэтиленгликоль (ПЭГ) и цитотоксические субстанции. Методы указанной химической модификации полипептида известны в данной области.
В некоторых вариантах осуществления изобретения полипептид, который содержит вариант Fc-области, предлагаемый в настоящем изобретении, представляет собой антитело или Fc-слитый белок, содержащий домен(ы), который(ые) может(гут) связываться с любым антигеном. Примеры антигенов, с которыми могут связываться указанные антитела и Fc-слитые белки, включают (но не ограничиваясь только ими) лиганды (цитокины, хемокины и т.п.), рецепторы, раковые антигены, вирусные антигены, антигены ГКГС, дифференцировочные антигены, иммуноглобулины и иммунные комплексы и иммунные комплексы, частью которых являются иммуноглобулины.
Б. Методы рекомбинации и композиции
Антитела можно получать, используя методы рекомбинации и композиции, например, описанные в US №4816567. Одним из вариантов осуществления изобретения является выделенная нуклеиновая кислота, кодирующая антитело DENV, представленное в настоящем описании. Согласно одному из вариантов осуществления изобретения антитело к DENV обладает перекрестной реактивностью с ZIKV. Другим вариантом осуществления изобретения является выделенная нуклеиновая кислота, которая кодирует полипептид, содержащий вариант Fc-области или родительскую Fc-область, указанный/указанную в настоящем описании. Указанная нуклеиновая кислота может кодировать аминокислотную последовательность, содержащую VL, и/или аминокислотную последовательность, содержащую VH антитела (например, легкие и/или тяжелые цепи антитела). Следующим вариантом осуществления изобретения является(ются) один или несколько векторов (например, экспрессионных векторов), который(е) содержит(ат) указанную нуклеиновую кислоту. Еще одним вариантом осуществления изобретения является клетка-хозяин, которая содержит указанную нуклеиновую кислоту. В одном из указанных вариантов осуществления изобретения клетка-хозяин содержит (например, в результате трансформации указанными векторами): (1) вектор, содержащий нуклеиновую кислоту, которая кодирует аминокислотную последовательность, содержащую VL антитела, и аминокислотную последовательность, содержащую VH антитела, или (2) первый вектор, содержащий нуклеиновую кислоту, которая кодирует аминокислотную последовательность, содержащую VL антитела, и второй вектор, содержащий нуклеиновую кислоту, которая кодирует аминокислотную последовательность, содержащую VH антитела. В одном из вариантов осуществления изобретения клетка-хозяин представляет собой эукариотическую клетку, например, клетку яичника китайского хомячка (СНО) или лимфоидную клетку (например, Y0-, NS0-, Sp20-клетку). Одним из вариантов осуществления изобретения является способ получения антитела к DENV, включающий культивирование клетки-хозяина, содержащей нуклеиновую кислоту, которая кодирует антитело, описанное выше, в условиях, пригодных для экспрессии антитела, и необязательно выделение антитела из клетки-хозяина (или среды для культивирования клетки-хозяина). Другим вариантом осуществления изобретения является способ получения полипептида, который содержит вариант Fc-области или родительскую Fc-область, включающий культивирование клетки-хозяина, которая содержит нуклеиновую(ые) кислоту(ы), кодирующую(ие) полипептид, такой как антитело, Fc-область или вариант Fc-области, указанные выше, в условиях, пригодных для экспрессии полипептида, и необязательно выделение полипептида из клетки-хозяина (или среды для культивирования клетки-хозяина).
Для рекомбинантного получения антитела к DENV нуклеиновые кислоты, кодирующие антитело, например, описанные выше, выделяют и встраивают в один или несколько векторов для дальнейшего клонирования и/или экспрессии в клетке-хозяине. Для рекомбинантного получения Fc-области нуклеиновую кислоту, кодирующую Fc-область, выделяют и встраивают в один или несколько векторов для дальнейшего клонирования и/или экспрессии в клетке-хозяине. Указанную нуклеиновую кислоту легко можно выделять и секвенировать с помощью общепринятых процедур (например, путем использования олигонуклеотидных зондов, которые обладают способностью специфически связываться с генами, кодирующими тяжелые и легкие цепи антитела).
Приемлемые клетки-хозяева для клонирования или экспрессии кодирующих антитело векторов включают прокариотические или эукариотические клетки, представленные в настоящем описании. Например, антитела можно получать в бактериях, в частности, когда не требуется гликозилирование и связанная с Fc эффекторная функция. Сведения об экспрессии фрагментов антитела и полипептидов в бактериях см. например, в US №№5648237, 5789199 и 5840523 (см. также у Charlton в: Methods in Molecular Biology, под ред. Lo В.K.С., изд-во Humana Press, Totowa, NJ, т. 248, 2003, сс. 245-254 описание экспрессии фрагментов антител в Е. coli.) После экспрессии антитело можно выделять из пасты бактериальных клеток в виде растворимой фракции и можно дополнительно очищать.
Помимо прокариотических организмов в качестве хозяев, пригодных для клонирования или экспрессии векторов, которые кодируют антитела, можно использовать эукариотические микроорганизмы, такие как нитчатые грибы или дрожжи, включая штаммы грибов и дрожжей, пути гликозилирования которых были «гуманизированы», что позволяет получать антитело с частично или полностью человеческой схемой гликозилирования (см. Gerngross, Nat. Biotech. 22, 2004, сс. 1409-1414 и Li и др., Nat. Biotech. 24, 2006, сс. 210-215).
Клетки-хозяева, которые можно использовать для экспрессии гликозилированного антитела, получают также из многоклеточных организмов (беспозвоночных и позвоночных животных). Примерами клеток беспозвоночных являются клетки насекомых, а также можно применять клетки растений. Были выявлены многочисленные штаммы бакуловирусов и соответствующие пригодные для них в качестве хозяев клетки насекомых, прежде всего для трансфекции клеток Spodoptera frugiperda.
В качестве хозяев можно применять также культуры растительных клеток (см., например, US №№5959177, 6040498, 6420548, 7125978 и 6417429 (описание технологии PLANTIBODIES™ для получения антител в трансгенных растениях).
В качестве хозяев можно применять также клетки позвоночных. Например, можно использовать клеточные линии млекопитающих, которые адаптированы к росту в суспензии. Другими примерами приемлемых линий клеток-хозяев млекопитающих являются линия клеток почки обезьяны CV1, трансформированная с помощью ОВ40 (COS-7); линия клеток почки эмбриона человека (HEK 293-клетки или клетки линии 293, описанные, например, у Graham и др., J. Gen. Virol., 36, 1977, сс. 59); клетки почки детеныша хомяка (ВНК); клетки Сертоли мыши (ТМ4-клетки, описанные, например, у Mather, Biol. Reprod., 23, 1980, сс. 243-251); клетки почки обезьяны (CV1); клетки почки африканской зеленой мартышки (VERO-76,); клетки карциномы шейки матки человека (HELA); клетки почки собаки (MDCK); клетки печени бычьей крысы (BRL 3А); клетки легкого человека (W138); клетки печени человека (Нер G2); клетки опухоли молочной железы мыши (ММТ 060562); клетки TRI, описанные, например, у Mather и др., Annals N.Y. Acad. Sci., 383, 1982, сс. 44-68); клетки MRC 5 и клетки FS4. Другими ценными линиями клеток-хозяев млекопитающих являются клетки яичника китайского хомячка (СНО), включая DHFR--СНО-клетки (Urlaub и др., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 77, 1980, сс. 4216); и клеточные линии миеломы, такие как Y0, NS0 и Sp2/0. Обзор конкретных линий клеток-хозяев млекопитающих, которые можно применять для производства антител, см., например, у Yazaki и Wu, в: Methods in Molecular Biology под ред. В.K.С. Lo, изд-во Humana Press, Totowa, NJ, т. 248, 2003, сс. 255-268.
Поликлональные антитела предпочтительно вырабатываются у животных после нескольких подкожных (sc) или внутрибрюшинных (ip) инъекций релевантного антигена и адъюванта. Можно конъюгировать релевантный антиген с белком, иммуногенным для подлежащего иммунизации вида, например, гемоцианином лимфы улитки, сывороточным альбумином, бычьим тироглобулином или соевым ингибитором трипсина, с использованием бифункционального или дериватизирующего агента, например, сложного сульфосукцинимидного эфира малеимидобензоила (конъюгация через остатки цистеина), N-гидроксисукцинимида (конъюгация через остатки лизина), глутарового альдегида, янтарного ангидрида, SOCl2 или R1N=C=NR, где R и R1 обозначают различные алкильные группы.
Животных (как правило, млекопитающих кроме человека) иммунизируют с использованием антигена, иммуногенных конъюгатов или производных путем объединения, например, 100 или 5 мкг белка или конъюгата (для кроликов и мышей соответственно) с 3 объемами полного адъюванта Фрейнда, и осуществляют введение раствора внутрикожно в несколько мест. Через 1 месяц животных подвергают бустерной вакцинации (ревакцинации) с использованием от 1/5 до 1/10 исходного количества пептида или конъюгата в полном адъюванте Фрейнда путем подкожной инъекции в несколько мест. Через 7-14 дней получают образцы крови животных и оценивают в сыворотке титр антитела. Животных подвергают ревакцинации вплоть до выхода титра на плато. Предпочтительно животных ревакцинируют с использованием конъюгата, в который входит тот же антиген, но конъюгированный с другим белком и/или через другой перекрестносшивающий реагент. Конъюгаты можно получать также в рекомбинантной клеточной культуре в виде белковых слияний. Кроме того, для усиления иммунного ответа можно применять агрегирующие агенты, такие как квасцы.
Моноклональные антитела получают из популяции практически гомогенных антител, т.е. индивидуальные антитела, входящие в популяцию, идентичны за исключением возможных встречающихся в естественных условиях мутаций и/или пост-трансляционных модификаций (например, изомеризации, амидирования), которые могут присутствовать в минорных количествах. Прилагательное «моноклональный» свидетельствует о том, что антитело не присутствует в смеси различных антител.
Например, моноклональные антитела можно получать, используя метод гибридом, впервые описанный Kohler и др., Nature 256(5517), 1975, сс. 495-497. При осуществления метода гибридом мышь или другое пригодное в качестве хозяина животное, такое как хомяк, иммунизируют согласно описанному выше методу для выработки лимфоцитов, которые продуцируют или обладают способностью продуцировать антитела, специфически связывающиеся с белком, применяемым для иммунизации. Альтернативно этому, лимфоциты можно иммунизировать in vitro.
Иммунизирующий агент должен, как правило, включать антигенный белок или его слитый вариант. Как правило, применяют либо лимфоциты периферической крови (PBL), если требуются клетки человеческого происхождения, либо применяют селезеночные клетки или клетки лимфатических узлов, если источниками являются млекопитающие кроме человека. Затем лимфоциты сливают с иммортализованной клеточной линией с помощью приемлемого агента для слияния, такого как полиэтиленгликоль, с получением клетки гибридомы (Goding, Monoclonal Antibodies: Principles and Practice, изд-во Academic Press, 1986, cc. 59-103).
Иммортализованные клеточные линии, как правило, представляют собой трансформированные клетки млекопитающих, прежде всего клетки миеломы грызунов, быков и человека. Как правило, применяют крысиные или мышиные клеточные линии миеломы. Полученные таким образом клетки гибридомы высевают и выращивают в приемлемой культуральной среде, которая предпочтительно содержит одну или несколько субстанций, которые ингибируют рост или выживание неслитых родительских клеток миеломы. Например, если в родительских клетках миеломы отсутствует фермент гипоксантингуанинфосфорибозилтрансфераза (HGPRT или HPRT), то культуральная среда для гибридом, как правило, должна включать гипоксантин, аминоптерин и тимидин (НАТ-среда), т.е. субстанции, которые препятствуют росту клеток с дефицитом HGPRT.
Предпочтительными иммортализованными клетками миеломы являются клетки, которые можно эффективно сливать, которые поддерживают стабильный высокий уровень производства антитела отобранными антителопродуцирующими клетками и обладают чувствительностью к среде, такой как НАТ-среда. Среди них предпочтительными являются мышиные линии миеломы, например, полученные из мышиных опухолей МОРС-21 и МРС-11, которые можно получать от фирмы Salk Institute Cell Distribution Center, Сан-Диего, шт. Калифорния, США, и SP-2-клетки (и их производные, например, Х63-Ag8-653), которые можно получать из Американской коллекции типовых культур, Манассас, шт. Вирджиния, США. Также описаны клеточные линии человеческой миеломы и мышиной-человеческой гетеромиеломы, которые можно применять для производства человеческих моноклональных антител (Kozbor и др., J. Immunol. 133(6), 1984, сс. 3001-3005; Brodeur и др., Monoclonal Antibody Production Techniques and Applications, изд-во Marcel Dekker, Inc., New York, 1987, cc. 51-63).
Культуральную среду, в которой выращивают клетки гибридомы, оценивают в отношении производства моноклональных антител против антигена. Предпочтительно специфичность связывания моноклональных антител, продуцируемых клетками гибридомы, определяют с помощью иммунопреципитации или анализа связывания in vitro, такого как радиоиммуноанализ (РИА) или твердофазный иммуноферментный анализ (ELISA). Указанные методики и анализы известны в данной области. Например, аффинность связывания можно определять с помощью анализа Скэтчарда, описанного у Munson, Anal. Biochem. 107(1), 1980, cc. 220-239.
После того, как установлено, что клетки гибридом продуцируют антитела требуемой специфичности, аффинности и/или активности, клоны можно субклонировать, используя процедуры серийного разведения, и выращивать с помощью стандартных методов (Coding, выше). Приемлемые для этой цели культуральные среды включают, например, среду D-MEM или RPMI-1640. Кроме того, клетки гибридомы можно выращивать in vivo в виде опухолей в организме млекопитающих.
Моноклональные антитела, секретируемые субклонами, можно отделять от культуральной среды, асцитной жидкости или сыворотки с помощью общепринятых процедур очистки иммуноглобулинов, таких, например, как хроматография на белок А-сефарозе, гидроксиапатите, гель-электрофорез, диализ или аффинная хроматография.
Fc-область можно получать путем повторной элюции фракции, адсорбированной на колонке с белком А, после частичного расщепления моноклональных антител в виде IgG1, IgG2, IgG3, IgG4 или т.п.с помощью протеазы, такой как пепсин. Протеаза не ограничена конкретной протеазой, если она может расщеплять полноразмерное антитело с образованием Fab и F(ab')2 ограниченным образом при создании соответствующих условий ферментативной реакции, таких как рН, и ее примеры включают пепсин и папаин.
Кроме того, в настоящем изобретении предложен способ получения полипептида, содержащего вариант Fc-области, который обладает существенно пониженной FcγR-связывающей активностью и не обладает существенно пониженной C1q-связывающей активностью по сравнению с полипептидом, содержащим родительскую Fc-область, который включает интродукцию по меньшей мере одного аминокислотного изменения в родительскую Fc-область. В некоторых объектах изобретения полученный полипептид представляет собой антитело. В некоторых вариантах осуществления изобретения антитело представляет собой химерное антитело или гуманизированное антитело. В некоторых объектах изобретения полученный полипептид представляет собой Fc-слитый белок.
В одном из объектов изобретения при осуществлении указанного выше способа получения полипептида, содержащего вариант Fc-области, который обладает существенно пониженной FcγR-связывающей активностью и не обладает существенно пониженной C1q-связывающей активностью, изменяют по меньшей мере одну аминокислоту по меньшей мере в одном положении, выбранном из группы, которая состоит из: 234, 235, 236, 267, 268, 324, 326, 332 и 333 согласно EU-нумерации.
В другом объекте изобретения при осуществлении указанного выше способа получения полипептида, содержащего вариант Fc-области, который обладает существенно пониженной FcγR-связывающей активностью и не обладает существенно пониженной C1q-связывающей активностью, изменяют две аминокислоты в положениях 234 и 235.
В другом объекте изобретения изменяют аминокислоты при осуществлении указанного выше способа получения полипептида, содержащего вариант Fc-области, который обладает существенно повышенной FcγR-связывающей активностью и не обладает существенно пониженной C1q-связывающей активностью, где изменения включают: (а) два аминокислотных изменения в положениях 234 и 235, и (б) по меньшей мере одно аминокислотное изменение по меньшей мере в одном положении, выбранном из группы, которая состоит из: 236, 267, 268, 324, 326, 332 и 333 согласно EU-нумерации.
В другом объекте изобретения изменяют аминокислоты при осуществлении указанного выше способа получения полипептида, содержащего вариант Fc-области, который обладает существенно пониженной FcγR-связывающей активностью и не обладает существенно пониженной C1q-связывающей активностью, где изменения включают: (а) два аминокислотных изменения в положениях 234 и 235; и (б) по меньшей мере одно аминокислотное изменение, указанное в одном из следующих подпунктов (I)-(III): (I) положения 267, 268 и 324; (II) положения 236, 267, 268, 324 и 332; и (III) положения 326 и 333 согласно EU-нумерации.
В следующем объекте изобретения при осуществлении указанного выше способа получения полипептида, содержащего вариант Fc-области, который обладает существенно пониженной FcγR-связывающей активностью и не обладает существенно пониженной C1q-связывающей активностью, аминокислотное изменение в каждом положении выбирают из группы, которая состоит из: (а) Ala в положении 234; (б) Ala в положении 235; (в) Glu в положении 267; (г) Phe в положении 268; (д) Thr в положении 324; (е) Ala в положении 236; (ж) Glu в положении 332; (з) Ala, Asp, Glu, Met, Trp в положении 326; и (и) Ser в положении 333 согласно EU-нумерации.
В следующем объекте изобретения аминокислотные изменения при осуществлении указанного выше способа получения полипептида, содержащего вариант Fc-области, обладающий существенно пониженной FcγR-связывающей активностью и не обладающий существенно пониженной C1q-связывающей активностью, представляют собой: Ala в положении 234, Ala в положении 235, Ala в положении 326, and Ser в положении 333 согласно EU-нумерации. В следующем объекте изобретения аминокислотные изменения при осуществлении указанного выше способа получения полипептида, содержащего вариант Fc-области, обладающий существенно пониженной FcγR-связывающей активностью и не обладающий существенно пониженной C1q-связывающей активностью, представляют собой: Ala в положении 234, Ala в положении 235, Asp в положении 326, and Ser в положении 333 согласно EU-нумерации. В следующем объекте изобретения аминокислотные изменения при осуществлении указанного выше способа получения полипептида, содержащего вариант Fc-области, который обладает существенно пониженной FcγR-связывающей активностью и не обладает существенно пониженной C1q-связывающей активностью, представляют собой: Ala в положении 234, Ala в положении 235, Glu в положении 326, and Ser в положении 333 согласно EU нумерации. В следующем объекте изобретения аминокислотные изменения при осуществлении указанного выше способа получения полипептида, содержащего вариант Fc-области, который обладает существенно пониженной FcγR-связывающей активностью и не обладает существенно пониженной C1q-связывающей активностью, представляют собой: Ala в положении 234, Ala в положении 235, Met в положении 326 и Ser в положении 333 согласно EU-нумерации. В следующем объекте изобретения аминокислотные изменения при осуществлении указанного выше способа получения полипептида, содержащего вариант Fc-области, который обладает существенно пониженной FcγR-связывающей активностью и не обладает существенно пониженной C1q-связывающей активностью, представляют собой: Ala в положении 234, Ala в положении 235, Trp в положении 326 и Ser в положении 333 согласно EU-нумерации.
В другом объекте изобретения при осуществлении указанного выше способа по меньшей мере одну аминокислоту дополнительно изменяют по меньшей мере в одном положении, выбранном из группы, которая состоит из 428, 434, 436, 438 и 440 согласно EU-нумерации.
В следующем объекте изобретения при осуществлении указанного выше способа аминокислотное изменение выбирают также из следующих изменений, указанных в подпунктах (а)-(г): (а) Ala в положении 434; (б) Ala в положении 434, Thr в положении 436, Arg в положении 438 и Glu в положении 440; (в) Leu в положении 428, Ala в положении 434, Thr в положении 436, Arg в положении 438 и Glu в положении 440; и (г) Leu в положении 428, Ala в положении 434, Arg в положении 438 и Glu в положении 440 согласно EU-нумерации (см. также в WO 2016/125495 описание взаимосвязи между аминокислотными изменениями и FcRn-связывающей активностью варианта Fc-области).
В следующем объекте изобретения при осуществлении указанного выше способа аминокислотные изменения представляют собой: Ala в положении 234, Ala в положении 235, Ala в положении 326, Ser в положении 333, Leu в положении 428, Ala в положении 434, Thr в положении 436, Arg в положении 438 и Glu в положении 440 согласно EU-нумерации. В следующем объекте изобретения при осуществлении указанного выше способа аминокислотные изменения представляют собой: Ala в положении 234, Ala в положении 235, Ala в положении 326, Ser в положении 333, Leu в положении 428, Ala в положении 434, Arg в положении 438 и Glu в положении 440, согласно EU-нумерации.
Согласно одному из объектов изобретения предпочтительно, чтобы вариант Fc-области, предлагаемый в изобретении, не обладал существенно повышенной FcRn-связывающей активностью, прежде всего при рН 7,4, по сравнению с родительской Fc-областью.
В следующем объекте изобретения при осуществлении указанного выше способа аминокислотные изменения выбирают из одного единственного изменения, комбинации индивидуальных изменений или комбинации изменений, которые представлены в таблице 4.
Полипептиды, содержащие вариант Fc-области, полученные с помощью любого из указанных выше способов или других методов, известных в данной области, включены в настоящее изобретение.
В. Анализы
Представленные в настоящем описании антитела к DENV можно идентифицировать, осуществлять их скрининг или характеризовать их физические/химические свойства и/или виды биологической активности с помощью различных анализов, известных в данной области.
Варианты Fc-областей, представленные в настоящем описании, можно идентифицировать, осуществлять их скрининг или характеризовать их физические/химические свойства и/или виды биологической активности с помощью различных анализов, известных в данной области.
1. Анализы связывания и другие анализы
Согласно одному из объектов изобретения антитело, предлагаемое в изобретении, тестируют в отношении антигенсвязывающей активности с использованием, например, известных методов, таких как ELISA, Вестерн-блоттинг и т.д. В одном из объектов изобретения полипептид, содержащий вариант Fc-области, предлагаемый в изобретении, тестируют в отношении его антигенсвязывающей активности с помощью известных методов, таких, например, как ELISA, Вестерн-блоттинг и т.д.
Согласно другому объекту изобретения можно использовать анализы в условиях конкуренции для идентификации антитела, которое конкурирует за связывание с DENV и/или Е-белком DENV с любым антителом к DENV, представленным в настоящем описании. В некоторых вариантах осуществления изобретения, когда указанное конкурирующее антитело присутствует в избытке, оно блокирует (например, снижает) связывание референс-антитела с DENV и/или Е-белком DENV по меньшей мере на 10%, 15%, 20%, 25%, 30%, 35%, 40%, 45%, 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75% или более. В некоторых случаях связывание ингибируется по меньшей мере на 80%, 85%, 90%, 95% или более. В некоторых вариантах осуществления изобретения указанное конкурирующее антитело связывается с тем же самым эпитопом (например, линейным или конформационным эпитопом), с которым связывается антитело к DENV, представленное в настоящем описании. Подробное описание приведенных в качестве примера методов картирования эпитопа, с которым связывается антитело, представлено у Morris, Epitope Mapping Protocols, в: Methods in Molecular Biology, т. 66, изд-во Humana Press, Totowa, NJ, 1996.
В качестве примера анализа в условиях конкуренции иммобилизованный DENV или Е-белок DENV инкубируют в растворе, содержащем первое меченое антитело, которое связывается с DENV или Е-белком DENV, и второе немеченое антитело, подлежащее тестированию с отношении способности конкурировать с первым антителом за связывание с DENV или Е-белком DENV. Второе антитело может присутствовать в супернатанте гибридомы. В качестве контроля иммобилизованный DENV или Е-белок DENV инкубируют в растворе, содержащим первое меченое антитело, но не содержащим второе немеченое антитело. После инкубации в условиях, приемлемых для связывания первого антитела с DENV или Е-белком DENV, избыток несвязанного антитела удаляют и измеряют количество метки, ассоциированной с иммобилизованным DENV или Е-белком DENV. Если количество метки, ассоциированной с иммобилизованным DENV или Е-белком DENV, существенно снижается в тестируемом образце по сравнению с контрольным образцом, то это свидетельствует о том, что второе антитело конкурирует с первым антителом за связывание с DENV или Е-белком DENV (см., например, Harlow и Lane, Antibodies: A Laboratory Manual, глава 14, изд-во Cold Spring Harbor Laboratory, Cold Spring Harbor, NY, 1988).
Анализы по определению активности связывания полипептида, содержащего вариант Fc-области, с одним или несколькими членами семейства FcR представлены в настоящем описании или известны в данной области. Такие анализы связывания включают (но не ограничиваясь только ими) BIACORE®-анализ, в котором используется явление поверхностного плазменного резонанса (SPR), скрининг на основе гомогенного анализа усиленной за счет эффекта близости люминесценции (Amplified Luminescent Proximity Homogeneous Assay (ALPHA), ELISA, и сортинг клеток по интенсивности флуоресценции (FACS) (Lazar и др., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 103(11), 2006, ее. 4005-4010).
В одном из вариантов осуществления изобретения BIACORE®-анализ можно применять для решения вопроса о том, является ли активность связывания полипептида, содержащего вариант Fc-области, повышенной, или сохраняется на том же уровне, или снижается в отношении конкретного члена семейства FcR. Например, для этой цели определяют снижается ли или повышается величина константы диссоциации (KD), для определения которой применяют анализ сенсограмм, когда различные FcR подвергают взаимодействию в качестве аналита с полипептидами, содержащими вариант Fc-области, иммобилизованными или «захваченными» на сенсорном чипе, с использованием известных методов и реагентов, таких как белок А, белок L, белок A/G, белок G, антитела к лямбда-цепи, антитела к каппа-цепи, антигенные пептиды, антигенные белки. Изменения в активности связывания можно определять также путем сравнения изменений в количестве резонансных единиц (RU) на сенсограмме до и после того, как один или несколько типов FcR подвергают взаимодействию в качестве аналитов с «захваченными» полипептидами, содержащими вариант Fc-области. Альтернативно этому, FcR можно иммобилизовать или «захватывать» на сенсорных чипах, а полипептиды, содержащие вариант Fc-области, применять в качестве аналита.
При осуществлении BIACORE®-анализов одну из субстанций (лиганд), предназначенных для исследования взаимодействия, иммобилизуют на тонком слое золота на сенсорном чипе и при освещении светом с задней поверхности сенсорного чипа таким образом, чтобы имело место полное отражение на границе раздела между тонким слоем золота и стеклом, в части отраженного света формируется область с пониженной интенсивностью (SPR-сигнал). Подготавливают другую субстанцию (аналит), предназначенную для исследования взаимодействия, для инъекции на поверхность сенсорного чипа; и когда лиганд связывается с аналитом, масса иммобилизованной молекулы-лиганда возрастает и показатель преломления растворителя на поверхности сенсорного чипа изменяется. В результате указанного изменения показателя преломления положение SPR-сигнала сдвигается (и наоборот, положение сигнала возвращается в исходное, если происходит диссоциация указанного связывания). С помощью BIACORE®-системы определяют уровень описанного выше сдвига, или более конкретно изменение массы в зависимости от времени, откладывая изменение массы на поверхности сенсорного чипа по вертикальной оси, и таким образом получают количественные данные (сенсограмма). Количество аналита, связанного с лигандом, иммобилизованном на поверхности сенсорного чипа, определяют из сенсограммы. Кинетические параметры, такие как константа скорости реакции ассоциации (ka) и константа скорости реакции диссоциации (kd), определяют из представленных в виде кривых сенсограмм, и определяют аффинность (KD) как соотношение указанных констант. BIACORE®-метод предпочтительно применяют в качестве метода для анализа ингибирования. Примеры такого метода для анализа ингибирования описаны у Lazar и др., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 103(11), 2006, сс. 4005-4010.
Скрининг на основе ALPHA осуществляют с применением технологии ALPHA, которая основана на описанном ниже принципе, с использованием двух типов гранул, доноров и акцепторов. Люминесцентные сигналы поддаются обнаружению только тогда, когда молекулы, связанные с гранулами-донорами, физически взаимодействуют с молекулами, связанными с гранулами-акцепторами, и когда обе гранулы находятся в непосредственной близости друг от друга. Возбужденный лазерным пучком фотосенсибилизатор в гранулах-донорах превращает кислород окружающей среды в возбужденный синглетный кислород. Когда синглетный кислород диффундирует из гранул-доноров и достигает гранул-акцепторов, локализованных в непосредственной близости, то индуцируется хемилюминесцентная реакция в гранулах, что в итоге приводит к испусканию света. Если молекулы, связанные с гранулами-донорами, не взаимодействуют с молекулами, связанными с гранулами-акцепторами, то хемилюминесцентная реакция не происходит, поскольку синглетный кислород, который продуцируется гранулами-донорами, не достигает гранул-акцепторов.
Например, биотинилированный полипептидный комплекс связывают с гранулами-донорами и Fc-рецептор, меченный глутатион-S-трансферазой (GST), связывают с гранулами-акцепторами. В отсутствии конкурирующего полипептидного комплекса, содержащего вариант Fc-области, полипептидный комплекс, содержащий родительскую Fc-область, взаимодействует с Fc-рецептором и генерирует сигналы с длиной волны от 520 до 620 нм. Полипептидный комплекс, содержащий немеченый вариант Fc-области, конкурирует с полипептидным комплексом, содержащим родительскую Fc-область, за связывание с Fc-рецептором. Относительную активность связывания можно оценивать, определяя количественно снижение флуоресценции в результате конкуренции. Методы биотинилирования полипептидных комплексов, таких как антитела, с помощью сульфо-NHS-биотина или подобных агентов являются хорошо известными. Метод экспрессии Fc-рецептора и GST в клетке, несущей слитый ген, полученный путем слияния полинуклеотида, который кодирует Fc-рецептор, в рамке считывания с полинуклеотидом, который кодирует GST, в экспрессионном векторе и осуществления очистки с помощью содержащей глутатион колонки, соответствующим образом адаптируют, получая метод мечения Fc-рецептора с помощью GST. Индуцированные сигналы можно анализировать, например, посредством подгонки к односайтовой модели конкуренции на основе нелинейного регрессионного анализа с использованием такого программного обеспечения, как GRAPHPAD PRISM (фирма GraphPad; Сан-Диего).
Понятие «вариант Fc-области с пониженной FcR-связывающей активностью» относится к Fc-области, которая связывается с FcR с существенно более слабой связывающей активностью, чем родительская Fc-область, при осуществлении анализов с использованием практически одинаковых количеств соответствующей родительской Fc-области и варианта Fc-области. Кроме того, понятие «вариант Fc-области с повышенной FcR-связывающей активностью» относится к Fc-области, которая связывается с FcR с существенно более сильной связывающей активностью, чем родительская Fc-область, при осуществлении анализов с использованием практически одинаковых количеств соответствующей родительской Fc-области и варианта Fc-области. Понятие «вариант Fc-области с сохраненной FcR-связывающей активностью» относится к Fc-области, которая связывается с FcR с активностью, эквивалентной или практически такой же, что и активность родительской Fc-области, при осуществлении анализов с использованием практически одинаковых количеств соответствующей родительской Fc-области и полипептида, содержащего вариант Fc-области.
Повышается ли или понижается активность связывания Fc-области с различными FcR, можно определять по увеличению или понижению уровня связывания различных FcR с Fc-областью при определении с использованием вышеописанного метода измерения. В контексте настоящего описания уровень связывания различных FcR с Fc-областью можно оценивать в виде величины, полученной делением разницы в уровнях RU на сенсограммах до и после взаимодействия различных FcR, которые применяют в качестве аналита, с Fc-областью, на разницу в уровнях RU на сенсограммах, которая изменилась до и после «захвата» Fc-областей на сенсорных чипах. Активность связывания Fc-области с FcγR или FcRn можно определять с помощью метода, представленного в настоящем описании в примере 5.
В настоящем изобретении существенно пониженная FcγR-связывающая активность предпочтительно означает, например, что связывающая активность варианта Fc-области в отношении FcγR составляет менее чем 50%, менее чем 45%, менее чем 40%, менее чем 35%, менее чем 30%, менее чем 25%, менее чем 20%, менее чем 15%, менее чем 10%, менее чем 5%, менее чем 2%, менее чем 1%, менее чем 0,5%, менее чем 0,2% или менее чем 0,1% от FcγR-связывающей активности родительской Fc-области. Это предпочтительно означает также, что, например, соотношение [различие в величинах RU на сенсограммах, которое обнаружено до и после взаимодействия FcγR с вариантом Fc-области]/[различие в величинах RU на сенсограммах, которое обнаружено до и после «захвата» FcγR сенсорными чипами] составляет менее чем 1, менее чем 0,8, менее чем 0,5, менее чем 0,3, менее чем 0,2, менее чем 0,1, менее чем 0,08, менее чем 0,05, менее чем 0,03, менее чем 0,02, менее чем 0,01, менее чем 0,008, менее чем 0,005, менее чем 0,003, менее чем 0,002 или менее чем 0,001.
В настоящем изобретении не существенно увеличенная FcRn-связывающая активность, прежде всего при рН 7,4, предпочтительно означает, например, что связывающая активность варианта Fc-области в отношении FcRn превышает менее чем в 1000 раз, менее чем в 500 раз, менее чем в 200 раз, менее чем в 100 раз, менее чем в 90 раз, менее чем в 80 раз, менее чем в 70 раз, менее чем в 60 раз, менее чем в 50 раз, менее чем в 40 раз, менее чем в 30 раз, менее чем в 20 раз, менее чем в 10 раз, менее чем в 5 раз, менее чем в 3 раза или менее чем в 2 раза FcRn-связывающую активность родительской Fc-области. Это предпочтительно означает, например, также, что соотношение [различие в величинах RU на сенсограммах, которое обнаружено до и после взаимодействия FcRn с вариантом Fc-области]/[различие в величинах RU на сенсограммах, которое обнаружено до и после «захвата» FcRn сенсорными чипами] составляет менее чем 0,5, менее чем 0,3, менее чем 0,2, менее чем 0,1, менее чем 0,08, менее чем 0,05, менее чем 0,03, менее чем 0,02, менее чем 0,01, менее чем 0,008, менее чем 0,005, менее чем 0,003, менее чем 0,002 или менее чем 0,001.
Для определения связывающей активности полипептида, содержащего вариант Fc-области, в отношении C1q, можно осуществлять анализ связывания с C1q с помощью ELISA. В целом, метод состоит в следующем: планшеты для анализа можно сенсибилизировать в течение ночи при 4°С полипептидом, который содержит вариант Fc-области, или полипептидом, который содержит родительскую Fc-область (контроль), в буфере для сенсибилизации. Затем планшеты можно промывать и блокировать. После промывки аликвоту человеческого C1q можно добавлять в каждую лунку и инкубировать в течение 2 ч при комнатной температуре. После дополнительной промывки в каждую лунку можно добавлять 100 мкл овечьего антитела к комплементу C1q, конъюгированного с пероксидазой, и инкубировать в течение 1 ч при комнатной температуре. Планшет можно вновь промывать буфером для промывки и в каждую лунку можно добавлять 100 мкл буфера для субстрата, содержащего OPD (дигидрохлорид о-фенилендиамина (фирма Sigma)). Можно давать протекать реакции окисления, которую выявляют по появлению желтой окраски, в течение 30 мин и прекращать реакцию путем добавления 100 мкл 4,5н.H2SO4. Затем можно определять абсорбцию при длине волны (492-405) нм. Активность в отношении связывания с Fc-областью с C1q можно определять с помощью метода, представленного в настоящем описании в примере 4.
В одном из объектов изобретения различие в C1q-связывающей активности между вариантом Fc-области и родительской Fc-областью, предлагаемой в изобретении, составляет менее чем 50%, менее чем 45%, менее чем 40%, менее чем 35%, менее чем 30%, менее чем 25%, менее чем 20%, менее чем 15%, менее чем 10% или менее чем 5% от C1q-связывающей активности родительской Fc-области.
2. Анализы активности
Одним из объектов изобретения являются анализы, предназначенные для идентификации антител к DENV, которые обладают биологической активностью. Биологическая активность может включать, например, блокирование связывания Е-белка DENV с клеткой-хозяином, ингибирование проникновения DENV в клетку-хозяина, ингибирование и/или предупреждение заражения DENV клетки-хозяина и т.д. Предложены также антитела, обладающие указанной биологической активностью in vivo и/или in vitro.
В некоторых вариантах осуществления изобретения антитело, предлагаемое в изобретении, тестируют в отношении указанной биологической активности. В некоторых вариантах осуществления изобретения можно применять тест нейтрализации/уменьшения (подавления) бляшкообразования (PRNT) для измерения активности или нейтрализующей способности тестируемого антитела. В некоторых вариантах осуществления изобретения для измерения анти-DENV активности in vivo можно применять животных-хозяев.
В некоторых вариантах осуществления изобретения клетки можно непосредственно анализировать в отношении связывания между DENV и тестируемым антителом. Предназначенные для оценки связывания иммуногистохимические методики, методы конфокальной микроскопии и/или другие методики, хорошо известны специалистам в данной области. Для указанных скрининговых анализов можно использовать различные клеточные линии, включая клетки, специально созданные для указанной цели. Примеры клеток, которые применяют в скрининговых анализах, включают клетки млекопитающих, клетки грибов, клетки бактерий или клетки вирусов. Клетка может представлять собой стимулированную клетку, например, клетку, стимулированную фактором роста. Специалисту в данной области должно быть очевидно, что под объем указанного изобретения подпадает широкое разнообразие анализов, предназначенных для измерения способности тестируемого антитела связываться с DENV.
Одним из объектов изобретения являются анализы, предназначенные для идентификации антител к ZIKV, которые обладают биологической активностью. Биологическая активность может включать, например, блокирование связывания ZIKV с клеткой-хозяином, ингибирование проникновения ZIKV в клетку-хозяина, ингибирование и/или предупреждение заражения ZIKV клетки-хозяина и т.д. Предложены также антитела, обладающие указанной биологической активностью in vivo и/или in vitro.
В некоторых вариантах осуществления изобретения антитело, предлагаемое в изобретении, тестируют в отношении указанной биологической активности. В некоторых вариантах осуществления изобретения можно применять тест нейтрализации/уменьшения бляшкообразования (PRNT) или тест нейтрализации/уменьшения фокусообразования (FRNT) для измерения активности или нейтрализующей способности тестируемого антитела. В некоторых вариантах осуществления изобретения для измерения анти-ZIKV активности in vivo можно применять животных-хозяев.
В некоторых вариантах осуществления изобретения клетки можно непосредственно анализировать в отношении связывания между ZIKV и тестируемым антителом. Предназначенные для оценки связывания иммуногистохимические методики, методы конфокальной микроскопии и/или другие методики, хорошо известны специалистам в данной области. Для указанных скрининговых анализов можно использовать различные клеточные линии, включая клетки, специально созданные для указанной цели. Примеры клеток, которые применяют в скрининговых анализах, включают клетки млекопитающих, клетки грибов, клетки бактерий или клетки вирусов. Клетка может представлять собой стимулированную клетку, например, клетку, стимулированную фактором роста. Специалисту в данной области должно быть очевидно, что под объем указанного изобретения подпадает широкое разнообразие анализов, предназначенных для измерения способности тестируемого антитела связываться с ZIKV.
В зависимости от анализа могут требоваться культуры клеток и/или тканей. Для оценки на клетках можно использовать любые из многочисленных различных физиологических анализов. В альтернативном или дополнительном варианте можно осуществлять молекулярные анализы, включая (но не ограничиваясь только ими) Вестерн-блоттинг для мониторинга экспрессии белков и/или белок-белковых взаимодействий; масс-спектрометрию для мониторинга других химических модификаций и т.д.
В некоторых вариантах осуществления изобретения в указанных методах используют животного-хозяина. Например, пригодными животными-хозяевами в контексте изобретения могут быть млекопитающие-хозяева, включая приматов, хорьков, кошек, собак, коров, лошадей и грызунов, таких как мыши, хомяки, кролики и крысы. В некоторых вариантах осуществления изобретения животное-хозяина инокулируют, заражают или иным образом подвергают воздействию вируса до или одновременно с введением тестируемого антитела. Наивных и/или инокулированных животных можно применять в любом из разнообразных исследований. Например, указанные животные-модели можно применять в различных опытах по передаче вируса, известных в данной области. Тестируемое антитело можно вводить приемлемому животному-хозяину до, во время или после опытов по передаче вируса для определения эффективности тестируемого антитела в отношении блокирования связывания и/или инфективности вируса в организме животного-хозяина.
Одним из объектов изобретения являются анализы, предназначенные для идентификации полипептидов, которые содержат варианты Fc-области, обладающие биологической активностью. Биологическая активность может включать, например, ADCC-активность и CDC-активность. Предложены также полипептиды, которые содержат варианты Fc-области, обладающие указанной биологической активностью in vivo и/или in vitro.
В некоторых вариантах осуществления изобретения полипептид, содержащий вариант Fc-области, предлагаемый в изобретении, тестируют в отношении указанной биологической активности. В некоторых объектах изобретения полипептид, содержащий вариант Fc-области, предлагаемый в изобретении, модулирует эффекторную функцию по сравнению с полипептидом, который содержит родительскую Fc-область. В некоторых объектах изобретения модуляция представляет собой модуляцию ADCC и/или CDC.
Можно осуществлять анализы цитотоксичности in vitro и/или in vivo для подтверждения наличия CDC- и/или ADCC-активности. Например, можно осуществлять анализы связывания Fc-рецептора (FcR) для гарантии того, что антитело обладает способностью к связыванию с FcγR (и поэтому, вероятно, обладает ADCC-активностью), но сохраняется способность связываться с FcRn. Первичные клетки, опосредующие ADCC, т.е. NK-клетки, экспрессируют только FcγRIII, в то время как моноциты экспрессируют FcγRI, FcγRII и FcγRIII. Данные об экспрессии FcR на гематопоэтических клетках обобщены в таблице 3 на с. 464 у Ravetch и Kinet, Annu. Rev. Immunol. 9, 1991, сс. 457-492. Примерами анализов in vitro ADCC-активности представляющей интерес молекулы являются (но не ограничиваясь только ими) анализы, описанные в US №5500362 (см., например, Hellstrom и др., Proc. Nail. Acad. Sci. USA 83, 1986, сс. 7059-7063 и Hellstrom и др., Proc. Nat'l Acad. Sci. USA 82, 1985, сс. 1499-1502); US №5821337 (см. Bruggemann и др., J. Exp. Med. 166, 1987, сс. 1351-1361). В альтернативном варианте можно применять нерадиоактивные методы анализа (см., например, нерадиоактивный анализ цитотоксичности АСТ1™ на основе проточной цитометрии (фирма CellTechnology, Inc. Маунтин-Вью, шт. Калифорния); и нерадиоактивный анализ цитотоксичности CytoTox 96® (фирма Promega, Мэдисон, шт. Висконсин). Пригодными для таких анализов эффекторными клетками являются мононуклеарные клетки периферической крови (РВМС) и естественные клетки-киллеры (NK). В альтернативном или дополнительном варианте ADCC-активность представляющей интерес молекулы можно оценивать in vivo, например, на животной модели, например, как описано у Clynes и др., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 95, 1998, сс 652-656. Можно осуществлять также анализы связывания C1q для подтверждения того, что антитело связывается с C1q и поэтому обладает CDC-активностью (см., например, описание ELISA для оценки связывания C1q и С3с в WO 2006/029879 и WO 2005/100402). Для оценки активации комплемента можно осуществлять анализ CDC (см., например, Gazzano-Santoro и др., J. Immunol. Methods 202, 1996, cc. 163-171; Cragg и др., Blood 101, 2003, cc. 1045-1052; и Cragg и Glennie, Blood 103, 2004, cc. 2738-2743). Определение FcRn-связывания и клиренса/времени полужизни in vivo можно осуществлять также с использованием методов, известных в данной области (см., например, Petkova и др., Int'l. Immunol. 18(12), 2006, cc. 1759-1769).
Г. Иммуноконъюгаты
Некоторыми вариантами осуществления изобретения являются также иммуноконъюгаты, содержащие антитело к DENV, представленное в настоящем описании, конъюгированное с одним или несколькими цитотоксическим агентами, такими как химиотерапевтические агенты или лекарственные средства, ингибирующие рост агенты, токсины (например, белковые токсины, обладающие ферментативной активностью токсины бактериального, грибного, растительного или животного происхождения или их фрагменты) или радиоактивные изотопы.
В некоторых вариантах осуществления изобретения предложены также иммуноконъюгаты, содержащие полипептид, который содержит вариант Fc-области, представленный в настоящем описании, конъюгированный с одним или несколькими цитотоксическим агентами, такими как химиотерапевтические агенты или лекарственные средства, ингибирующие рост агенты, токсины (например, белковые токсины, обладающие ферментативной активностью токсины бактериального, грибного, растительного или животного происхождения или их фрагменты) или радиоактивные изотопы.
В одном из вариантов осуществления изобретения иммуноконъюгат представляет собой конъюгат антитело-лекарственное средство (ADC), в котором антитело конъюгировано с одним или несколькими лекарственными средствами, включая (но не ограничиваясь только ими) майтансиноид (см. US №№5208020, 5416064 и ЕР 0425235 В1); ауристатин, например, фрагменты DE и DF монометилауристатина (ММАЕ и MMAF) (см. US №№5635483, 5780588 и 7498298); доластатин; калихеамицин или его производные (см. US №№5712374, 5714586, 5739116,5767285,5770701, 5770710, 5773001 и 5877296; Hinman и др., Cancer Res. 53, 1993, сс. 3336-3342; и Lode и др., Cancer Res. 58, 1998, сс. 2925-2928); антрациклин, такой как дауномицин или доксорубицин (см. Kratz и др., Curr. Med. Chem. 13, 2006, сс. 477-523; Jeffrey и др., Bioorg. Med. Chem. Lett. 16, 2006, сс. 358-362; Torgov и др., Bioconjug. Chem. 16, 2005, сс. 717-721; Nagy и др., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 97, 2000, сс. 829-834; Dubowchik и др., Bioorg. & Med. Chem. Letters 12, 2002, сс. 1529-1532; King и др., J. Med. Chem. 45, 2002, сс. 4336-4343; и US №6630579); метотрексат; виндесин; таксан, такой как доцетаксел, паклитаксел, ларотаксел, тесетаксел и ортатаксел; трихотецен и СС1065.
В другом варианте осуществления изобретения иммуноконъюгат содержит антитело, представленное в настоящем описании, конъюгированное с обладающим ферментативной активностью токсином или его фрагментом, включая (но не ограничиваясь только ими) А-цепь дифтерийного токсина, несвязывающиеся активные фрагменты дифтерийного токсина, А-цепь экзотоксина (из Pseudomonas aeruginosa), А-цепь рицина, А-цепь абрина, А-цепь модецина, альфа-сарцин, белки Aleurites fordii, диантиновые белки, белки Phytolaca americana (PAPI, PAPII и PAP-5), ингибитор из Momordica charantia, курцин, кротин, ингибитор из Sapaonaria officinalis, гелонин, митогеллин, рестриктоцин, феномицин, эномицин и трихотецены.
В другом варианте осуществления изобретения иммуноконъюгат содержит антитело, представленное в настоящем описании, конъюгированное с радиоактивным атомом с образованием радиоконъюгата. Для получения радиоконъюгатов можно применять широкое разнообразие радиоактивных изотопов. Примеры включают 211At, 131I, 125I, 90Y, 186Re, 188Re, 153Sm, 212Bi, 32P, 212Pb и радиоактивные изотопы Lu. Когда радиоконъюгат применяют для детекции, то он может содержать радиоактивный атом для сцинтиграфических исследовании, например, TC99m или I123, или спиновую метку для визуализации методом ядерного магнитного резонанса (ЯМР) (известный также как магнитно-резонансная визуализация, МРВ), такую как йод-123, иод-131, индий-111, фтор-19, углерод-13, азот-15, кислород-17, гадолиний, марганец или железо.
Конъюгаты антитела и цитотоксического агента можно получать с использованием разнообразных бифункциональных связывающих белки агентов, таких как N-сукцинимидил-3-(2-пиридилдитио)пропионат (SPDP), сукцинимидил-4-(N-малеимидометил)циклогексан-1-карбоксилат (SMCC), иминотиолан (IT), бифункциональные производные сложных имидоэфиров (такие как диметиладипимидат × HCL), активные сложные эфиры (такие как дисукцинимидилсуберат), альдегиды (такие как глутаровый альдегид), бисазидопроизводные (такие как бис(пара-азидобензоил)гександиамин), производные бисдиазония (такие как бис(пара-диазониумбензоил)этилендиамин), диизоцианаты (такие как толуол-2,6-диизоцианат), и обладающие двойной активностью фторсодержащие соединения (такие как 1,5-дифтор-2,4-динитробензол). Например, иммунотоксин рицин можно получать согласно методу, описанному у Vitetta и др., Science 238, 1987, сс. 1098-1104. Меченная с помощью С 1-изотиоцианатбензил-3-метилдиэтилентриаминпентауксусная кислота (MX-DTPA) является примером хелатирующего агента, применяемого для конъюгации радионуклеотида с антителом (см. WO 94/11026). Линкер может представлять собой «расщепляемый линкер», облегчающий высвобождение цитотоксического лекарственного средства в клетке. Например, можно использовать неустойчивый в кислой среде линкер, чувствительный к действию пептидаз линкер, фотолабильный линкер, диметильный линкер или содержащий дисульфид линкер (Chari и др., Cancer Res. 52, 1992, сс. 127-131; US №5208020).
В контексте настоящего описания под иммуноконъюгатами или ADC подразумеваются (но не ограничиваясь только ими) указанные конъюгаты, полученные с использованием перекрестносшивающих реагентов, которые включают (но не ограничиваясь только ими) BMPS, EMCS, GMBS, HBVS, LC-SMCC, MBS, МРВН, SBAP, SIA, SIAB, SMCC, SMPB, SMPH, сульфо-EMCS, сульфо-GMBS, сульфо-KMUS, сульфо-MBS, сульфо-SIAB, сульфо-SMCC и сульфо-SMPB, а также SVSB (сукцинимидил(4-винилсульфон)бензоат), которые поступают в продажу (например, от фирмы Pierce Biotechnology, Inc., Рокфорд, шт. Иллинойс, США).
Д. Способы и композиции для диагностирования и обнаружения
В некоторых вариантах осуществления изобретения любое из антител к DENV, представленных в настоящем описании, можно применять для обнаружения присутствия DENV и/или Е-белка DENV в биологическом образце. В некоторых вариантах осуществления изобретения любое из антител к ZIKV, представленных в настоящем описании, можно применять для обнаружения присутствия ZIKV в биологическом образце. Понятие «обнаружение (детекция)» в контексте настоящего описания предусматривает количественное или качественное обнаружение. В некоторых вариантах осуществления изобретения биологический образец содержит клетку или ткань, например, сыворотку, цельную кровь, плазму, полученный с помощью биопсии образец, образец ткани, клеточную суспензию, слюну, мокроту, оральную жидкость, спинномозговую жидкость, амниотическую жидкость, асцитную жидкость, молоко, молозиво, секрет молочных желез, лимфу, мочу, пот, слезную жидкость, желудочный сок, синовиальную жидкость, перитонеальную жидкость, жидкость хрусталика глаза или слизь.
Одним из вариантов осуществления изобретения является антитело к DENV, представленное в настоящем описании, для применения в способе диагностирования или обнаружения. Другой объект изобретения относится к способу обнаружения присутствия DENV в биологическом образце. В некоторых вариантах осуществления изобретения способ заключается в том, что приводят в контакт биологический образец с антителом к DENV, представленным в настоящем описании, в условиях, обеспечивающих связывание антитела к DENV с DENV, и выявляют образование комплекса между антителом к DENV и DENV. Указанный способ может представлять собой способ in vitro или in vivo. Следующий объект изобретения относится к способу обнаружения присутствия Е-белка DENV в биологическом образце. В некоторых вариантах осуществления изобретения способ заключается в том, что приводят в контакт биологический образец с антителом к DENV, представленным в настоящем описании, в условиях, обеспечивающих связывание антитела к DENV с Е-белком DENV, и выявляют образование комплекса между антителом к DENV и Е-белком DENV. Указанный способ может представлять собой способ in vitro или in vivo. В одном из вариантов осуществления изобретения антитело к DENV применяют для отбора индивидуумов, которых можно лечить с помощью антитела к DENV, например, когда DENV или Е-белок DENV является биомаркером для отбора пациентов.
Примеры нарушений, которые можно диагностировать с использованием антитела, предлагаемого в изобретении, включают (но не ограничиваясь только ими) заражение DENV и заболевания и/или симптомы, вызванные или ассоциированные с заражением DENV, такие как лихорадка денге, геморрагическая лихорадка денге (DHF) и синдром шока денге (DSS).
Одним из вариантов осуществления изобретения является антитело к ZIKV, представленное в настоящем описании, для применения в способе диагностирования или обнаружения. Другой объект изобретения относится к способу обнаружения присутствия ZIKV в биологическом образце. В некоторых вариантах осуществления изобретения способ заключается в том, что приводят в контакт биологический образец с антителом к ZIKV, представленным в настоящем описании, в условиях, обеспечивающих связывание антитела к ZIKV с ZIKV, и выявляют образование комплекса между антителом к ZIKV и ZIKV. Указанный способ может представлять собой способ in vitro или in vivo. Другой объект изобретения относится к способу обнаружения присутствия ZIKV в биологическом образце. В некоторых вариантах осуществления изобретения способ заключается в том, что приводят в контакт биологический образец с антителом к ZIKV, представленным в настоящем описании, в условиях, обеспечивающих связывание антитела к ZIKV с ZIKV, и выявляют образование комплекса между антителом к ZIKV и ZIKV. Указанный способ может представлять собой способ in vitro или in vivo. В одном из вариантов осуществления изобретения антитело к ZIKV применяют для отбора индивидуумов, которых можно лечить с помощью антитела к ZIKV, например, когда ZIKV является биомаркером для отбора пациентов.
Примеры нарушений, которые можно диагностировать с использованием антитела, предлагаемого в изобретении, включают (но не ограничиваясь только ими) заражение ZIKV и заболевания и/или симптомы, вызванные или ассоциированные с заражением ZIKV, такие как лихорадка, сыпь, головная боль, боль суставов, покраснение глаз и мышечная боль.
Некоторыми вариантами осуществления изобретения являются меченые антитела к DENV. Некоторыми вариантами осуществления изобретения являются меченые антитела к ZIKV. Метки включают (но не ограничиваясь только ими) метки или фрагменты, которые можно обнаруживать непосредственно (такие как флуоресцентные, хромофорные, электронноплотные, хемилюминисцентные и радиоактивные метки), а также фрагменты, такие как ферменты или лиганды, которые подлежат косвенному обнаружению, например, посредством ферментативной реакции или молекулярного взаимодействия.
Примеры меток включают (но не ограничиваясь только ими) радиоизотопы 32Р, 14С, 125I, 3H и 31I, флуорофоры, такие как хелаты редкоземельных металлов или флуоресцеин и его производные, родамин и его производные, дансил, умбеллиферон, люциферазы, например, люцифераза светлячка и бактериальная люцифераза (US №4737456), люциферин, 2,3-дигидрофталазиндионы, пероксидаза из хрена (HRP), щелочная фосфатаза, β-галактозидаза, глюкоамилаза, лизоцим, оксидазы сахаридов, например, глюкозооксидаза, галактозооксидаза и глюкозо-6-фосфатдегидрогеназа, гетероциклические оксидазы, такие как уриказа и ксантиноксидаза, сшитые с ферментом, который использует пероксид водорода для окисления предшественника красителя, такого как HRP, лактопероксидаза или микропероксидаза, биотин/авидин, спиновые метки, метки в виде бактериофагов, стабильные свободные радикалы и т.п.
В одном из вариантов осуществления изобретения антитело, содержащее вариант Fc-области, предлагаемый в изобретении, можно применять в качестве агента для аффинной очистки. При осуществлении указанного процесса вариант антитела иммобилизуют на твердой фазе, такой как смола Сефадекс или фильтровальная бумага, используя методы, хорошо известные в данной области. Иммобилизованный вариант антитела приводят в контакт с образцом, содержащим подлежащий очистке антиген, и затем подложку промывают приемлемым растворителем, который должен удалять практически полностью материалы в образце за исключением подлежащего очистке антигена, который связан с иммобилизованным вариантом антитела. И, наконец, подложку промывают другим приемлемым растворителем, таким как глициновый буфер, рН 5,0, который должен отделять антиген от варианта антитела.
Вариант антитела можно применять также в диагностических анализах, например, для обнаружения экспрессии представляющего интерес антигена в конкретных клетках, тканях или сыворотке.
Вариант антитела можно применять для осуществления любых известных анализов, таких как анализы связывания в условиях конкуренции, прямые и косвенные сэндвич-анализы и анализы иммунопреципитации (Zola, Monoclonal Antibodies: A Manual of Techniques, 1987, cc. 147-158, изд-во CRC Press, Inc.).
E. Фармацевтические композиции
Фармацевтические композиции антитела к DENV, представленного в настоящем описании, получают путем смешения указанного антитела, имеющего необходимую степень чистоты, с одним или несколькими необязательными фармацевтически приемлемыми носителями (Remington's Pharmaceutical Sciences, 16-е изд. под ред. Osol A., 1980) в форме лиофилизированных композиций или водных растворов.
Фармацевтические композиции антитела к ZIKV, представленного в настоящем описании, получают путем смешения указанного антитела, имеющего необходимую степень чистоты, с одним или несколькими необязательными фармацевтически приемлемыми носителями (Remington's Pharmaceutical Sciences, 16-е изд. под ред. Osol А., 1980) в форме лиофилизированных композиций или водных растворов.
Фармацевтические композиции полипептида, содержащего вариант Fc-области, представленный в настоящем описании, получают путем смешения указанного полипептида, имеющего необходимую степень чистоты, с одним или несколькими необязательными фармацевтически приемлемыми носителями в форме лиофилизированных композиций или водных растворов.
Фармацевтически приемлемые носители, как правило, являются нетоксичными для реципиентов в используемых дозах и концентрациях, они включают (но не ограничиваясь только ими): буферы, такие как фосфатный, цитратный буферы, а также буферы на основе других органических кислот; антиоксиданты, включая аскорбиновую кислоту и метионин; консерванты (такие как хлорид октадецилдиметилбензиламмония; хлорид гексаметония; хлорид бензалкония; хлорид бензетония; фенол; бутиловый или бензиловый спирт; алкилпарабены, такие как метил- или пропилпарабен; катехол; резорцинол; циклогексанол; 3-пентанол и мета-крезол); полипептиды с низкой молекулярной массой (содержащие менее приблизительно 10 остатков); белки, такие как сывороточный альбумин, желатин или иммуноглобулины; гидрофильные полимеры, такие как поли(винилпирролидон); аминокислоты, такие как глицин, глутамин, аспарагин, гистидин, аргинин или лизин; моносахариды, дисахариды и другие углеводы, включая глюкозу, маннозу или декстрины; хелатирующие агенты, такие как ЭДТК; сахара, такие как сахароза, маннит, трегалоза или сорбит; солеобразующие против оионы, такие как натрий; содержащие металл комплексы (например, комплексы Zn-белок); и/или неионогенные поверхностно-активные вещества, такие как полиэтиленгликоль (ПЭГ). В контексте настоящего описания примеры фармацевтически приемлемых носителей включают также диспергирующие агенты интерстициальных лекарственных средств, такие как растворимые активные в нейтральной среде гликопротеины гиалуронидаз (sHASEGP), например, человеческие растворимые гликопротеины гиалуронидазы РН-20, такие как rHuPH20 (HYLENEX®, фирма Baxter International, Inc.). Некоторые примеры sHASEGP и методы их применения, в том числе rHuPH20, описаны в публикациях патентов США №№2005/0260186 и 2006/0104968. Согласно одному из объектов изобретения sHASEGP объединяют с одним или несколькими дополнительными гликозаминогликаназами, такими как хондроитиназы.
Примеры лиофилизированных композиций антител описаны в US №6267958. Водные композиции антител включают композиции, описанные в US №6171586 и WO 2006/044908, последние композиции включают гистидин-ацетатный буфер.
Композиция, предлагаемая в изобретении, может содержать также более одного действующего вещества, если это необходимо для конкретного подлежащего лечению показания, предпочтительно вещества с дополнительными видами активности, которые не оказывают отрицательного воздействия друг на друга. Например, может требоваться применение дополнительного противовирусного агента, такого как (но не ограничиваясь только ими) интерфероны (например, интерферон α-2b, интерферон-γ и т.д.), моноклональные антитела к DENV, поликлональные антитела к DENV, ингибиторы РНК-полимеразы, ингибиторы протеазы, ингибиторы геликазы, иммуномодуляторы, антисмысловые соединения, короткие интерферирующие РНК, короткие РНК-шпильки, микроРНК, РНК аптамеры, рибозимы и их комбинации. Такие действующие вещества должны присутствовать в комбинации в количествах, эффективных для достижения поставленной цели.
Действующие вещества можно включать также в микрокапсулы, например, полученные с помощью методов коацервации или межфазной полимеризации, например в гидроксиметилцеллюлозные или желатиновые микрокапсулы и поли(метилметакрилатные) микрокапсулы соответственно, в коллоидные системы введения лекарственного средства (например в липосомы, альбуминовые микросферы, микроэмульсии, наночастицы и нанокапсулы) или в макроэмульсии. Такие методы описаны в Remington's Pharmaceutical Sciences, 16-е изд., под ред. Osol А., 1980.
Можно приготавливать препараты с замедленным высвобождением. Приемлемыми примерами препаратов с замедленным высвобождением являются полупроницаемые матрицы из твердых гидрофобных полимеров, включающие антитело или конъюгат, такие матрицы представляют собой изделия определенной формы, например, пленки или микрокапсулы.
Композиции, предназначенные для применения in vivo, как правило, должны быть стерильными. Стерильность можно легко обеспечивать, например, путем фильтрации через стерильные фильтрующие мембраны.
Ж. Терапевтические способы и композиции
Любое из антител к DENV, представленных в настоящем описании, можно применять в терапевтических способах.
Одним из объектов изобретения является антитело к DENV, представленное в настоящем описании, для применения в качестве лекарственного средства. Другими объектами изобретения является антитело к DENV, представленное в настоящем описании, для применения для лечения вызываемой DENV инфекции. Некоторыми вариантами осуществления изобретения является антитело к DENV для применения в способе лечения. Некоторыми вариантами осуществления изобретения является антитело к DENV для применения в способе лечения индивидуума, имеющего вызываемую DENV инфекцию, который включает введение индивидууму в эффективном количестве антитела к DENV. В одном из указанных вариантов осуществления изобретения способ включает также введение индивидууму в эффективном количестве по меньшей мере одного дополнительного терапевтического средства, например, описанного ниже. В других вариантах осуществления изобретения антитело к DENV предназначено для применения для блокирования связывания Е-белка DENV с клеткой-хозяином и/или проникновения DENV в клетку-хозяина. В некоторых вариантах осуществления изобретения антитело к DENV предназначено для применения в способе блокирования связывания Е-белка DENV с клеткой-хозяином и/или проникновения DENV в клетку-хозяина у индивидуума, который включает введение индивидууму в эффективном количестве антитела к DENV для блокирования связывания Е-белка DENV с клеткой-хозяином и/или проникновения DENV в клетку-хозяина. «Индивидуум» в контексте любого из указанных выше вариантов осуществления изобретения предпочтительно представляет собой человека.
Следующим объектом изобретения является применение антитела к DENV для приготовления или получения лекарственного средства. В одном из вариантов осуществления изобретения лекарственное средство предназначено для лечения вызываемой DENV инфекции. В другом варианте осуществления изобретения лекарственное средство применяют в способе лечения вызываемой DENV инфекции, который включает введение индивидууму, имеющему вызываемую DENV инфекцию, в эффективном количестве лекарственного средства. В одном из указанных вариантов осуществления изобретения способ включает также введение индивидууму в эффективном количестве по меньшей мере одного дополнительного терапевтического средства, например, описанного ниже. В следующем варианте осуществления изобретения лекарственное средство предназначено для блокирования связывания Е-белка DENV с клеткой-хозяином и/или проникновения DENV в клетку-хозяина. В другом варианте осуществления изобретения лекарственное средство предназначено для применения в способе блокирования связывания Е-белка DENV с клеткой-хозяином и/или проникновения DENV в клетку-хозяина, включающем введение индивидууму в эффективном количестве лекарственного средства для блокирования связывания Е-белка DENV с клеткой-хозяином и/или проникновения DENV в клетку-хозяина. «Индивидуум» в контексте любого из указанных выше вариантов осуществления изобретения может представлять собой человека.
Другим объектом изобретения является способ лечения вызываемой DENV инфекции. В одном из вариантов осуществления изобретения способ включает введение индивидууму, имеющему вызываемую DENV инфекцию, в эффективном количестве антитела к DENV. В одном из вариантов осуществления изобретения способ включает также введение индивидууму в эффективном количестве по меньшей мере одного дополнительного терапевтического средства, описанного ниже. «Индивидуум» в контексте любого из указанных выше вариантов осуществления изобретения может представлять собой человека.
Следующим объектом изобретения является способ блокирования связывания Е-белка DENV с клеткой-хозяином и/или проникновения DENV в клетку-хозяина у индивидуума. В одном из вариантов осуществления изобретения способ включает введение индивидууму в эффективном количестве антитела к DENV для блокирования связывания Е-белка DENV с клеткой-хозяином и/или проникновения DENV в клетку-хозяина. В одном из вариантов осуществления изобретения «индивидуум» представляет собой человека.
Другим объектом изобретения являются фармацевтические композиции, содержащие любое из антител к DENV, представленных в настоящем описании, которые предназначены, например, для применения в любом из указанных выше терапевтических способов. В одном из вариантов осуществления изобретения фармацевтическая композиция содержит любое из антител к DENV, представленных в настоящем описании, и фармацевтически приемлемый носитель. В другом варианте осуществления изобретения фармацевтическая композиция содержит любое из антител к DENV, представленных в настоящем описании, и по меньшей мере одно дополнительное терапевтическое средство, например, описанное ниже.
Следующим объектом изобретения является фармацевтическая композиция, предназначенная для лечения вызываемой DENV инфекции. В следующем варианте осуществления изобретении фармацевтическая композиция предназначена для блокирования связывания Е-белка DENV с клеткой-хозяином и/или проникновения DENV в клетку-хозяина. В одном из вариантов осуществления изобретения фармацевтическую композицию вводят индивидууму, имеющему вызываемую DENV инфекцию. «Индивидуум» в контексте любого из указанных выше вариантов осуществления изобретения предпочтительно представляет собой человека.
В некоторых вариантах осуществления изобретения вызываемая DENV инфекция может включать заболевания и/или симптомы, вызванные или ассоциированные с заражением DENV, такие как лихорадка денге, геморрагическая лихорадка денге (DHF) и синдром шока денге (DSS).
Одним из объектов изобретения являются способы лечения или предупреждения инфекции, вызываемой вирусом Зика, включающие введение антитела, которое связывается с ZIKV. Одним из объектов изобретения являются способы ингибирования передачи вируса Зика от беременной матери к плоду. Одним из объектов изобретения являются способы предупреждения врожденного синдрома, вызванного вирусом Зика (например, дефицита умственного развития, микроцефалии и т.д.), включающие введение антитела, которое связывается с ZIKV. Одним из объектов изобретения являются способы ингибирования уменьшения веса плода (например, веса тела всего ребенка, веса головы и т.д.), включающие введение антитела, которое связывается с ZIKV.
В одном из примеров, понятие «врожденный синдром, вызванный вирусом Зика», относится к особой системе врожденных дефектов, уникальной для плодов и младенцев, зараженных до рождения вирусом Зика. Как должно быть очевидно специалисту в данной области, индивидуумы с врожденным синдромом, вызванным вирусом Зика, могут иметь синдромы, такие как (но не ограничиваясь только ими) дефицит умственного развития, микроцефалия, серьезная микроцефалия, при которой имеет место частичное разрушения черепа, уменьшение ткани головного мозга со специфической схемой поражения головного мозга, включая субкортикальную кальцификацию, повреждение задней части глаза, включая макулярные рубцы и очаговую пятнистую пигментацию сетчатки, врожденные контрактуры, такие как косолапость или артрогрипоз, гипертония, ограничивающая движение организма вскоре после рождения, и т.п. Вероятно, введение антител, представленных в настоящем описании, может предупреждать по меньшей мере один или по меньшей мере два, или по меньшей мере три, или по меньшей мере четыре, или все симптомы врожденного синдрома, вызванного вирусом Зика. Например, антитело, представленное в настоящем описании, предупреждает заражение вирусом Зика плода или младенца до рождения, тем самым ингибируя уменьшение веса плода (например, веса всего тела ребенка, веса головы и т.д.).
Любое из антител к ZIKV, представленных в настоящем описании, можно применять в терапевтических способах.
Одним из объектов изобретения является антитело к ZIKV, представленное в настоящем описании, для применения в качестве лекарственного средства. Другими объектами изобретения является антитело к ZIKV, представленное в настоящем описании, для применения для лечения вызываемой ZIKV инфекции. Некоторыми вариантами осуществления изобретения является антитело к ZIKV для применения в способе лечения. Некоторыми вариантами осуществления изобретения является антитело к ZIKV для применения в способе лечения индивидуума, имеющего вызываемую ZIKV инфекцию, который включает введение индивидууму в эффективном количестве антитела к ZIKV. В одном из указанных вариантов осуществления изобретения способ включает также введение индивидууму в эффективном количестве по меньшей мере одного дополнительного терапевтического средства, например, описанного ниже. В других вариантах осуществления изобретения антитело к ZIKV предназначено для применения для блокирования связывания ZIKV с клеткой-хозяином и/или проникновения ZIKV в клетку-хозяина. В некоторых вариантах осуществления изобретения антитело к ZIKV предназначено для применения в способе блокирования связывания ZIKV с клеткой-хозяином и/или проникновения ZIKV в клетку-хозяина у индивидуума, включающем введение индивидууму в эффективном количестве антитела к ZIKV для блокирования связывания ZIKV с клеткой-хозяином и/или проникновения ZIKV в клетку-хозяина. «Индивидуум» в контексте любого из указанных выше вариантов осуществления изобретения предпочтительно представляет собой человека.
Следующим объектом изобретения является применение антитела к ZIKV для приготовления или получения лекарственного средства. В одном из вариантов осуществления изобретения лекарственное средство предназначено для лечения вызываемой ZIKV инфекции. В другом варианте осуществления изобретения лекарственное средство применяют в способе лечения вызываемой ZIKV инфекции, включающем введение индивидууму, который имеет вызываемую ZIKV инфекцию, в эффективном количестве лекарственного средства. В одном из указанных вариантов осуществления изобретения способ включает также введение индивидууму в эффективном количестве по меньшей мере одного дополнительного терапевтического средства, например, описанного ниже. В следующем варианте осуществления изобретения лекарственное средство предназначено для блокирования связывания ZIKV с клеткой-хозяином и/или проникновения ZIKV в клетку-хозяина. В другом варианте осуществления изобретения лекарственное средство предназначено для применения в способе блокирования связывания ZIKV с клеткой-хозяином и/или проникновения ZIKV в клетку-хозяина, который включает введение индивидууму в эффективном количестве лекарственного средства для блокирования связывания ZIKV с клеткой-хозяином и/или проникновения ZIKV в клетку-хозяина. «Индивидуум» в контексте любого из указанных выше вариантов осуществления изобретения может представлять собой человека.
Другим объектом изобретения является способ лечения вызываемой ZIKV инфекции. В одном из вариантов осуществления изобретения способ включает введение индивидууму, имеющему вызываемую ZIKV инфекцию, в эффективном количестве антитела к ZIKV. В одном из указанных вариантов осуществления изобретения способ включает также введение индивидууму в эффективном количестве по меньшей мере одного дополнительного терапевтического средства, описанного ниже. «Индивидуум» в контексте любого из указанных выше вариантов осуществления изобретения может представлять собой человека.
Следующим объектом изобретения является способ блокирования связывания ZIKV с клеткой-хозяином и/или проникновения ZIKV в клетку-хозяина у индивидуума. В одном из вариантов осуществления изобретения способ включает введение индивидууму в эффективном количестве антитела к ZIKV для блокирования связывания ZIKV с клеткой-хозяином и/или проникновения ZIKV в клетку-хозяина. В одном из вариантов осуществления изобретения «индивидуум» представляет собой человека.
Другим объектом изобретения являются фармацевтические композиции, содержащие любое из антител к ZIKV, представленных в настоящем описании, которые предназначены, например, для применения в любом из указанных выше терапевтических способов. В одном из вариантов осуществления изобретения фармацевтическая композиция содержит любое из антител к ZIKV, представленных в настоящем описании, и фармацевтически приемлемый носитель. В другом варианте осуществления изобретения фармацевтическая композиция содержит любое из антител к ZIKV, представленных в настоящем описании, и по меньшей мере одно дополнительное терапевтическое средство, например, описанное ниже.
Следующим объектом изобретения является фармацевтическая композиция, предназначенная для лечения вызываемой ZIKV инфекции. В следующем варианте осуществления изобретении фармацевтическая композиция предназначена для блокирования связывания ZIKV с клеткой-хозяином и/или проникновения ZIKV в клетку-хозяина. В одном из вариантов осуществления изобретения фармацевтическую композицию вводят индивидууму, имеющему вызываемую ZIKV инфекцию. «Индивидуум» в контексте любого из указанных выше вариантов осуществления изобретения предпочтительно представляет собой человека.
В некоторых вариантах осуществления изобретения вызываемая ZIKV инфекция может включать заболевания и/или симптомы, вызванные или ассоциированные с заражением ZIKV, такие как лихорадка, сыпь, головная боль, боль суставов, покраснение глаз и мышечная боль.
Любой из полипептидов, содержащих вариант Fc-области, представленный в настоящем описании, можно применять в терапевтических способах.
Одним из объектов изобретения является полипептид, содержащий вариант Fc-области, предназначенный для применения в качестве лекарственного средства. В некоторых вариантах осуществления изобретения полипептид, содержащий вариант Fc-области, предназначен для применения в способе лечения. В некоторых вариантах осуществления изобретения полипептид, содержащий вариант Fc-области, предназначен для применения в способе лечения индивидуума, имеющего нарушение, который включает введение индивидууму в эффективном количестве полипептида, содержащего вариант Fc-области. В одном из указанных вариантов осуществления изобретения способ включает также введение индивидууму в эффективном количестве по меньшей мере одного дополнительного терапевтического средства. В одном из вариантов осуществления изобретения нарушение представляет собой вирусную инфекцию. В одном из вариантов осуществления изобретения «индивидуум» представляет собой человека.
Следующим объектом изобретения является применение полипептида, содержащего вариант Fc-области, для приготовления или получения лекарственного средства. В одном из вариантов осуществления изобретения лекарственное средство предназначено для лечения нарушения. В некоторых объектах изобретения полипептид представляет собой антитело. В некоторых объектах изобретения полипептид представляет собой содержащий Fc слитый белок. В другом варианте осуществления изобретения лекарственное средство предназначено для применения в способе лечения нарушения, включающем введение индивидууму, который имеет нарушение, подлежащее лечению, в эффективном количестве лекарственного средства. В одном из указанных вариантов осуществления изобретения способ дополнительно включает введение индивидууму в эффективном количестве по меньшей мере одного дополнительного терапевтического средства. В одном из вариантов осуществления изобретения нарушение представляет собой вирусную инфекцию. В одном из вариантов осуществления изобретения «индивидуум» представляет собой человека.
Следующим объектом изобретения является способ лечения нарушения. В одном из вариантов осуществления изобретения способ включает введение индивидууму, который имеет указанное нарушение, в эффективном количестве полипептида, содержащего вариант Fc-области. В одном из вариантов осуществления изобретения способ дополнительно включает введение индивидууму в эффективном количестве по меньшей мере одного дополнительного терапевтического средства. В одном из вариантов осуществления изобретения нарушение представляет собой вирусную инфекцию. В одном из вариантов осуществления изобретения «индивидуум» представляет собой человека.
Следующим объектом изобретения являются фармацевтические композиции, содержащие полипептид, который содержит вариант Fc-области, представленный в настоящем описании, которые предназначены для применения в терапевтическом способе, таком как любой из терапевтических способов, представленных в настоящем описании. В одном из вариантов осуществления изобретения фармацевтическая композиция содержит полипептид, который содержит вариант Fc-области, представленный в настоящем описании, и фармацевтически приемлемый носитель. В другом варианте осуществления изобретения фармацевтическая композиция содержит полипептид, который содержит вариант Fc-области, представленный в настоящем описании, и по меньшей мере одно дополнительное терапевтическое средство.
Согласно следующему объекту изобретения фармацевтическая композиция предназначена для лечения нарушения. В одном из вариантов осуществления изобретения фармацевтическую композицию вводят индивидууму, который имеет нарушение. В одном из вариантов осуществления изобретения нарушение представляет собой вирусную инфекцию. В одном из вариантов осуществления изобретения «индивидуум» представляет собой человека.
Антивирусные антитела, которые содержат вариант Fc-области, предлагаемый в настоящем изобретении, могут подавлять антителозависимое усиление (инфекции) (ADE), которое имеет место при применении канонических антивирусных антител. ADE представляет собой явление, при котором происходит фагоцитоз вируса, связанного с антителом, посредством активирующих FcγR, что приводит к повышению заражения вирусом клетки. Модификации Fc, которые снижают взаимодействие через активирующие FcγR, могут уменьшать риск ADE. Установлено, что мутации в положениях 234 и 235, приводящие к замене лейцина на аланин, что приводит к образованию мутантов LALA, снижают риск ADE при заражении вирусом денге in vivo (Cell Host Microbe 8, 2010, cc. 271-283). Однако указанные модификации снижают другие эффекторные иммунные функции, опосредуемые антителами, такие как ADCC и CDC. Прежде всего, можно ожидать, что CDC играет важную роль в ингибировании ADE, поэтому для терапевтической эффективности не следует снижать связывание Fc-областей с компонентом системы комплемента C1q. Кроме того, время полужизни антитела можно удлинять путем конструирования Fc-областей с измененной аффинностью связывания с их рецептором спасения, FcRn, что может обеспечивать профилактическое применение антител для защиты от вирусной инфекции.
Вирус предпочтительно выбирают из аденовируса, астровируса, гепаднавируса, герпесвируса, паповируса, поксивируса, аренавируса, буньявируса, кальцивируса, коронавируса, филовируса, флавивируса, ортомиксовируса, парамикосвируса, пикорнавируса, реовируса, ретровируса, рабдовируса или тогавируса.
В предпочтительных вариантах осуществления изобретения аденовирус включает (но не ограничиваясь только им) человеческий аденовирус. В предпочтительных вариантах осуществления изобретения астровирус включает (но не ограничиваясь только им) астровирус млекопитающих. В предпочтительных вариантах осуществления изобретения гепаднавирус включает (но не ограничиваясь только ими) вирус гепатита В. В предпочтительных вариантах осуществления изобретения герпесвирус включает (но не ограничиваясь только ими) вирус герпеса простого типа I, вирус герпеса простого типа 2, человеческий цитомегаловирус, вирус Эпштейна-Барра, вирус ветряной оспы, розеоловирус и ассоциированный с саркомой Капоши герпесвирус. В предпочтительных вариантах осуществления изобретения паповавирус включает (но не ограничиваясь только ими) вирус папилломы человека и вирус полиомы человека. В предпочтительных вариантах осуществления изобретения поксвирус включает (но не ограничиваясь только ими) вирус натуральной оспы, вирус коровьей оспы, вирус осповакцины, вирус обезьяньей оспы, вирус оспы человека, вирус псевдооспы коров, вирус папулезного стоматита, вирус Танапокс, вирус опухоли обезьян Яба и вирус контагиозного моллюска. В предпочтительных вариантах осуществления изобретения аренавирус включает (но не ограничиваясь только ими) вирус лимфоцитарного хориоменингита, вирус Ласса, вирус Мачупо и вирус Юнин. В предпочтительных вариантах осуществления изобретения буньявирус включает (но не ограничиваясь только ими) хантавирус, найровирус, ортобуньявирус и флебовирус. В предпочтительных вариантах осуществления изобретения кальцивирус включает (но не ограничиваясь только ими) везивирус, норовирус, такой как вирус Норфолк и саповирус. В предпочтительных вариантах осуществления изобретения коронавирус включает (но не ограничиваясь только ими) коронавирус человека (этиологический агент серьезного острого респираторного синдрома (SARS)). В предпочтительных вариантах осуществления изобретения филовирус включает (но не ограничиваясь только ими) вирус Эбола и вирус Марбург. В предпочтительных вариантах осуществления изобретения флавивирус включает (но не ограничиваясь только ими) вирус желтой лихорадки, вирус Западного Нила, вирус денге (DENV-1, DENV-2, DENV-3 и DENV-4), вирус гепатита С, вирус клещевого энцефалита, вирус японского энцефалита, вирус энцефалита долины Мюррей, вирус энцефалита Сент-Луис, вирус русского весенне-летнего энцефалита, вирус омской геморрагической лихорадки, вирус вирусной диареи крупного рогатого скота, вирус киасанурской лесной болезни и вирус энцефалита Повассан. В предпочтительных вариантах осуществления изобретения ортомиксовирус включает (но не ограничиваясь только ими) вирус гриппа типа А, вирус гриппа типа В и вирус гриппа типа С. В предпочтительных вариантах осуществления изобретения парамиксовирус включает (но не ограничиваясь только ими) вирус парагриппа, вирус краснухи (паротита), морбилливирус (вирус кори), пневмовирус, такой как респираторно-синцитиальный вирус человека и вирус подострого склерозирующего панэнцефалита. В предпочтительных вариантах осуществления изобретения пикорнавирус включает (но не ограничиваясь только ими) полиовирус, риновирус, вирус Коксаки А, вирус Коксаки В, вирус гепатита А, эховирус и энтеровирус. В предпочтительных вариантах осуществления изобретения реовирус включает (но не ограничиваясь только ими) вирус клещевой лихорадки Колорадо и ротавирус. В предпочтительных вариантах осуществления изобретения ретровирус включает (но не ограничиваясь только ими) лентивирус, такой как вирус иммунодефицита человека и Т-лимфотропный вирус человека (HTLV). В предпочтительных вариантах осуществления изобретения рабдовирус включает (но не ограничиваясь только ими) лиссавирус, такой как вирус бешенства, вирус везикулярного стоматита и вирус инфекционного гематопоэтического некроза. В предпочтительных вариантах осуществления изобретения тогавирус включает (но не ограничиваясь только ими) альфавирус, такой как вирус реки Росс, О'Ньонг-Ньонг, вирус Синдбис, вирус венесуэльского лошадиного энцефалита, вирус восточного лошадиного энцефалита и вирус западного лошадиного энцефалита, и вирус краснухи.
Следующим объектом изобретения являются способы приготовления лекарственного средства или фармацевтической композиции, включающие смешение любых антител к DENV, представленных в настоящем описании, с фармацевтически приемлемым носителем, например, для применения в любом из указанных выше терапевтических способов. В одном из вариантов осуществления изобретения способы приготовления лекарственного средства или фармацевтической композиции дополнительно включают добавление по меньшей мере одного дополнительного терапевтического средства к лекарственному средству или фармацевтической композиции.
Следующим объектом изобретения являются способы приготовления лекарственного средства или фармацевтической композиции, включающие смешение любых антител к ZIKV, представленных в настоящем описании, с фармацевтически приемлемым носителем, например, для применения в любом из указанных выше терапевтических способов. В одном из вариантов осуществления изобретения способы приготовления лекарственного средства или фармацевтической композиции дополнительно включают добавление по меньшей мере одного дополнительного терапевтического средства к лекарственному средству или фармацевтической композиции.
Антитела, предлагаемые в изобретении, можно применять либо индивидуально, либо в комбинации с другими средствами, применяемыми в терапии. Например, антитело, предлагаемое в изобретении, можно применять совместно по меньшей мере с одним дополнительным терапевтическим средством. В некоторых вариантах осуществления изобретения дополнительное терапевтическое средство представляет собой противовирусный агент, такой как (но не ограничиваясь только ими) интерфероны (например, интерферон α-2b, интерферон-γ и т.д.), моноклональные антитела к DENV, поликлональные антитела к DENV, ингибиторы РНК-полимеразы, ингибиторы протеазы, ингибиторы геликазы, иммуномодуляторы, антисмысловые соединения, короткие интерферирующие РНК, короткие РНК-шпильки, микроРНК, РНК аптамеры, рибозимы и их комбинации.
Следующим объектом изобретения являются способы приготовления лекарственного средства или фармацевтической композиции, включающие смешение любых полипептидов, содержащих вариант Fc-области, представленных в настоящем описании, с фармацевтически приемлемым носителем, например, для применения в любом из указанных выше терапевтических способов. В одном из вариантов осуществления изобретения способы приготовления лекарственного средства или фармацевтической композиции дополнительно включают добавление по меньшей мере одного дополнительного терапевтического средства к лекарственному средству или фармацевтической композиции.
Полипептиды, содержащие вариант Fc-области, предлагаемые в изобретении, можно применять либо индивидуально, либо в комбинации с другими средствами, применяемыми в терапии. Например, полипептид, содержащий вариант Fc-области, предлагаемый в изобретении, можно применять совместно по меньшей мере с одним дополнительным терапевтическим средством. В некоторых вариантах осуществления изобретения дополнительное терапевтическое средство представляет собой противовирусный агент, такой как (но не ограничиваясь только ими) интерфероны (например, интерферон α-2b, интерферон-γ и т.д.), противовирусные моноклональные антитела, противовирусные поликлональные антитела, ингибиторы РНК-полимеразы, ингибиторы протеазы, ингибиторы геликазы, иммуномодуляторы, антисмысловые соединения, короткие интерферирующие РНК, короткие РНК-шпильки, микроРНК, РНК аптамеры, рибозимы и их комбинации.
Такие комбинированные терапии, указанные выше, предусматривают совместное введение (когда два или большее количество терапевтических средств включены в одну и ту же или в различные композиции) и раздельное введение, в этом случае введение антитела или полипептида, содержащего вариант Fc-области, предлагаемый в изобретении, можно осуществлять до, одновременно и/или после введения дополнительного терапевтического средства или средств. В одном из вариантов осуществления изобретения введение антитела к DENV и введение дополнительного терапевтического средства можно осуществлять в пределах примерно одного месяца или в пределах примерно 1, 2 или 3 недель, или в пределах примерно 1, 2, 3, 4, 5 или 6 дней относительно друг друга. В другом варианте осуществления изобретения введение полипептида, содержащего вариант Fc-области, и введение дополнительного терапевтического средства можно осуществлять в пределах примерно одного месяца или в пределах примерно 1, 2 или 3 недель, или в пределах примерно 1, 2, 3, 4, 5 или 6 дней относительно друг друга.
Антитело или полипептид, содержащий вариант Fc-области, предлагаемый в изобретении (и любое дополнительное терапевтическое средство), можно вводить любыми приемлемыми путями, включая парентеральный, внутрилегочный и интраназальный и при необходимости применять для местной обработки, введения в повреждение. Парентеральные инфузии включают внутримышечное, внутривенное, внутриартериальное, внутрибрюшинное или подкожное введение. Дозирование можно осуществлять любым приемлемым путем, например, путем инъекций, таких как внутривенные или подкожные инъекции, в зависимости, в том числе, от того, является ли лечение кратковременным или хроническим. Можно применять различные схемы дозирования, включая (но не ограничиваясь только ими) однократное введение или несколько введений в различные моменты времени, болюсное введение и пульсирующую инфузию.
Антитела или полипептиды, содержащие вариант Fc-области, предлагаемые в изобретении, можно включать в состав композиций, дозировать и вводить в соответствии с надлежащей клинической практикой. Рассматриваемые в этом контексте факторы включают конкретное нарушение, подлежащее лечению, конкретное млекопитающее, подлежащее лечению, клиническое состояние индивидуального пациента, причину нарушения, область введения агента, метод введения, схему введения и другие факторы, известные практикующим медикам. Агент можно, но это не является обязательным, включать в композицию в сочетании с одним или несколькими другими агентами, которые в настоящее время применяют для профилактики и лечения рассматриваемого нарушения. Эффективное количество указанных других агентов зависит от количества агента, присутствующего в композиции, типа нарушения или лечения и других указанных выше факторов. Их, как правило, применяют в таких же дозах и с использованием таких же путей введения, которые указаны в настоящем описании, или в количестве, составляющем от 1 до 99% от дозы, указанной в настоящем описании, или в любой дозе и с помощью любого пути, которые по данным эмпирической/клинической оценки являются пригодными.
Для предупреждения или лечения заболевания приемлемая доза антитела или полипептида, содержащего вариант Fc-области, предлагаемого в изобретении (при его применении индивидуально или в сочетании с одним или несколькими другими дополнительными терапевтическими средствами), должна зависеть от типа заболевания, подлежащего лечению, типа антитела, типа полипептида, содержащего вариант Fc-области, серьезности и течения болезни, применяют ли антитело или полипептид, содержащий вариант Fc-области, для превентивных или терапевтических целей, предшествующей терапии, истории болезни пациента и ответа на антитело или полипептид, содержащий вариант Fc-области, а также предписания лечащего врача. Антитело или полипептид, содержащий вариант Fc-области, можно вводить пациенту однократно или в виде серии обработок. В зависимости от типа и серьезности заболевания примерно от 1 мкг/кг до 15 мг/кг (например, 0,1-10 мг/кг) антитела или полипептида, содержащего вариант Fc-области, может представлять собой начальную возможную дозу для введения пациенту, например, с помощью одной или нескольких отдельных обработок или с помощью непрерывной инфузии. Одним из примеров типичных суточных доз может являться доза, составляющая от примерно 1 мкг/кг до 100 мг/кг или более в зависимости от указанных выше факторов. При использовании повторных введений в течение нескольких дней или более длительного периода времени, в зависимости от состояния, лечение, как правило, следует продолжать до достижения подавления симптомов заболевания. Одним из примеров доз антитела или полипептида, содержащего вариант Fc-области, является доза, составляющая от примерно 0,05 до примерно 10 мг/кг. Так, пациенту можно вводить одну или несколько следующих доз: примерно 0,5, 2,0, 4,0 или 10 мг/кг (или любую их комбинацию). Указанные дозы можно вводить дробно, например, каждую неделю или каждые три недели (например, так, чтобы пациент получал от примерно двух до примерно двадцати, например, примерно шесть доз антитела или полипептида, содержащего вариант Fc-области). Можно применять начальную повышенную ударную дозу с последующим введением одной или нескольких более низких доз. С помощью общепринятых методов и анализов можно легко осуществлять мониторинг действия указанной терапии.
Очевидно, что любые из вышеуказанных композиций или терапевтических способов можно применять с использованием иммуноконъюгата, предлагаемого в изобретении, вместо или в дополнение к антителу к DENV или антителу к ZIKV. Очевидно, что любые из вышеуказанных композиций или терапевтических способов можно применять с использованием иммуноконъюгата, предлагаемого в изобретении, вместо или в дополнение к полипептиду, содержащему вариант Fc-области, представленный в настоящем описании.
З. Изделия
Другим объектом изобретения является изделие, которое содержит продукты, применяемые для лечения, предупреждения и/или диагностирования указанных выше нарушений. Изделие представляет собой контейнер и этикетку или листовку-вкладыш в упаковку, которые размещены на контейнере или вложены в него. Приемлемыми контейнерами являются, например банки, пузырьки, шприцы, пакеты для внутривенного (IV) раствора и т.д. Контейнеры можно изготавливать из различных материалов, таких как стекло или пластмасса. Контейнер содержит композицию, которая сама или в сочетании с другой композицией является эффективной для лечения, предупреждения и/или диагностирования состояния, и может иметь стерильный порт доступа (например, контейнер может представлять собой пакет для внутривенного раствора или пузырек, снабженный пробкой, которую можно прокалывать с помощью иглы для подкожных инъекций). По меньшей мере одно действующее вещество в композиции представляет собой антитело или полипептид, содержащий вариант Fc-области, предлагаемое/предлагаемый в изобретении. На этикетке или листовке-вкладыше в упаковку указано, что композицию применяют для лечения выбранного состояния. Кроме того, изделие может включать (а) первый контейнер с находящейся в нем композицией, где композиция содержит антитело или полипептид, содержащий вариант Fc-области, предлагаемое/предлагаемый в изобретении; и (б) второй контейнер с находящейся в нем композицией, где композиция содержит дополнительное цитотоксическое или иное терапевтическое средство. Согласно этому варианту осуществления изобретения изделие может содержать листовку-вкладыш в упаковку, которая содержит информацию о том, что композиции можно использовать для лечения конкретного состояния. В альтернативном или дополнительном варианте изделие может дополнительно включать второй (или третий) контейнер с фармацевтически приемлемым буфером, таким как бактериостатическая вода для инъекций (БСВИ), забуференный фосфатом физиологический раствор, раствор Рингера и раствор декстрозы. Кроме того, оно может включать другие продукты, необходимые с коммерческой точки зрения и с точки зрения потребителя, в частности, другие буферы, разбавители, фильтры, иглы и шприцы.
Как должно быть очевидно, любое из указанных выше изделий может включать иммуноконъюгат, предлагаемый в изобретении, вместо или в дополнение к антителу к DENV или антителу к ZIKV. Как должно быть очевидно, любое из указанных выше изделий может включать иммуноконъюгат, предлагаемый в изобретении, вместо или в дополнение к полипептиду, содержащему вариант Fc-области.
Примеры
Ниже приведены примеры методов и композиций, предлагаемых в изобретении. Как должно быть очевидно, различные другие варианты осуществления изобретения можно применять на практике с учетом общего описания изобретения, представленного выше.
Пример 1: Получение антигенов и антител
Экспрессия и очистка рекомбинантного растворимого Е-белка из DENV-1, DENV-2, DENV-3 и DENV-4
Рекомбинантные растворимые Е-белки (0.8E-His) из DENV-1, DENV-2, DENV-3 и DENV-4 с карбоксиконцевой 8× гистидиновой меткой (SEQ ID NO: 65-68, соответственно) кратковременно экспрессировали с использованием клеточной линии FreeStyle293-F или клеточной линии Expi293 (фирма Thermo Fisher, Карлсбад, шт. Калифорния, США). При экспрессии prM0.8E-His из DENV-1, DENV-2, DENV-3 и DENV-4 (SEQ ID NO: 61-64 соответственно) prM0.8E-His экспрессировали в виде индивидуального полипептида в клетках, который затем внутриклеточно процессировался, расщепляясь между prM и 0.8E-His. В результате 0.8E-His секретировался в среду для культуры клеток. Кондиционированную среду, содержащую 0.8E-His, вносили на колонку, упакованную смолой для аффинной хроматографии с иммобилизованным металлом (IMAC), загруженную никелем или кобальтом, после чего осуществляли элюирование имидазолом. Фракции, содержащие 0.8E-His, объединяли и вносили на колонку для гель-фильтрации Супердекс 200 (фирма GE healthcare, Уппсала, Швеция). Фракции, содержащие 0.8E-His, объединяли и хранили при -80°С.
Экспрессия и очистка рекомбинантных человеческих FcγR
Внеклеточные домены человеческих FcγR получали следующим образом. Сначала ген внеклеточного домена FcγR синтезировали с помощью метода, хорошо известного специалистам в данной области. Одновременно последовательность каждого FcγR получали на основе информации, зарегистрированной в NCBI. В частности, основой для создания FcγRIa была последовательность NCBI, имеющая код доступа NM_000566 (версия № NM_000566.3), основой для создания FcγRIIa была последовательность NCBI, имеющая код доступа NM_001136219 (версия № NM_001136219.1), основой для создания FcγRIIb была последовательность NCBI, имеющая код доступа NCBI NM_004001 (версия № NM_004001.3), основой для создания FcγRIIIa была последовательность NCBI, имеющая код доступа NCBI NM_001127593 (версия №. NM_001127593.1), и основой для создания FcγRIIIb была последовательность NCBI, имеющая код доступа NM_000570 (версия № NM_000570.3), и His-метку присоединяли к С-концу каждой конструкции FcγR. Кроме того, для FcγRIIa, FcγRIIIa и FcγRIIIb известно наличие полиморфизма, и сайты полиморфизма получали на основе данных, описанных у Warmerdam и др. (J Exp Med 172, 1990, сс. 19-25) для FcγRIIa; у Wu и др. (J Clin Invest 100, 1997, сс. 1059-1070) для FcγRIIIa; и у Ory и др. (J Clin Invest 84, 1989, сс. 1688-1691) для FcγRIIIb.
Экспрессионные векторы создавали путем встраивания в экспрессионные векторы для клеток животных полученных генных фрагментов. Созданные экспрессионные векторы кратковременно интродуцировали в полученные из клетки рака почки человеческого эмбриона клетки линии FreeStyle293 (фирма Invitrogen) для экспрессии представляющих интерес белков. Жидкости, полученные путем фильтрации через фильтр с размером пор 0,22 мкм супернатантов культур, которые получали из культуральной среды вышеуказанных клеток, подвергнутых кратковременной интродукции, очищали, используя, в целом, четыре следующие стадии: (I) катионообменная колоночная хроматография (SP Сефароза FF); (II) аффинная колоночная хроматография против His-метки (HisTrap HP); (III) колоночная гель-фильтрация (Супердекс 200); и (IV) стерилизация фильтрацией. Для очистки FcγRI на стадии (I) применяли анионообменную колончатую хроматографию с использованием Q Сефарозы FF. Абсорбцию при 280 нм очищенных белков измеряли с помощью спектрофотометра, На основе измеренных величин концентрацию очищенных белков определяли, используя коэффициент экстинкции, рассчитанный таким методом как РАСЕ (Protein Science 4, 1995, сс. 2411-2423).
Экспрессия и очистка рекомбинантных мышиных FcγR
Внеклеточные домены мышиных FcγR (mFcγR) получали следующим образом. Сначала ген внеклеточного домена FcγR синтезировали с помощью метода, хорошо известного специалистам в данной области. Для осуществления указанного синтеза последовательность каждого FcγR получали на основе информации, зарегистрированной в NCBI. В частности, mFcγRI получали на основе зарегистрированной в NCBI референс-последовательности: NP_034316.1; mFcγPIIb получали на основе зарегистрированной в NCBI референс-последовательности: NP_034317.1; mFcγRIII получали на основе зарегистрированной в NCBI референс-последовательности: NP_034318.2; и mFcγRIV получали на основе зарегистрированной в NCBI референс-последовательности: NP_653142.2. Каждую из указанных последовательностей метили на С-конце His-меткой.
Каждый полученный генный фрагмент встраивали в векторы для экспрессии в клетках животных с получением экспрессионных векторов. Полученными экспрессионными векторами кратковременно трансфектировали полученные из клетки рака почки человеческого эмбриона клетки линии FreeStyle 293 (фирма Invitrogen) для экспрессии представляющего интерес белка. Образовавшийся супернатант культуры выделяли и затем пропускали через фильтр с размером пор 0,22 мкм с получением супернатанта культуры. Полученный супернатант культуры очищали, как правило, с использованием четырех следующих стадий: (I) ионообменная колончатая хроматография; (II) аффинная колоночная хроматография против His-метки (HisTrap HP); (III) колоночная гель-фильтрация (Супердекс 200); и (IV) стерилизация фильтрацией. Ионообменную колоночную хроматографию на стадии (I) осуществляли, используя Q Сефарозу HP для mFcγRI, SP Сефарозу FF для mFcγRIIb и mFcγRIV и SP Сефарозу HP для mFcγRIII. D-ЗФР(-) применяли в качестве растворителя на стадии (III) или более поздних стадиях, a D-ЗФР(-), содержащий 0,1М аргинин применяли для mFcγRIII. Абсорбцию при 280 нм очищенных белков измеряли с помощью спектрофотометра. На основе измеренных величин концентрацию очищенных белков определяли, используя коэффициент экстинкции, рассчитанный таким методом как РАСЕ (Protein Science 4, 1995, сс. 2411-2423).
Экспрессия и очистка рекомбинантного человеческого FcRn
FcRn представляет собой гетеродимер FcRn, состоящий из альфа-цепи и бета2-микроглобулина. Олиго-ДНК-праймеры получали на основе опубликованной последовательности человеческого гена FcRn (J Exp Med, 180, 1994, сс. 2377-2381). ДНК-фрагмент, кодирующий полный ген, получали с помощью ПЦР, используя человеческую кДНК (Human Placenta Marathon-Ready cDNA, фирма Clontech) в качестве матрицы, и получали праймеры. Используя полученный ДНК-фрагмент в качестве матрицы, ДНК-фрагмент, кодирующий внеклеточный домен, содержащий сигнальную область (Met1-Leu290), амплифицировали с помощью ПЦР и встраивали в экспрессионный вектор для клеток млекопитающих. Аналогично этому, олиго-ДНК-праймеры получали на основе опубликованной последовательности человеческого гена бета2-микроглобулина (Proc Natl Acad Sci USA 99, 2002, cc. 16899-16903). ДНК-фрагмент, кодирующий полный ген, получали с помощью ПЦР, используя человеческую кДНК (Human Placenta Marathon-Ready cDNA, фирма Clontech) в качестве матрицы, и получали праймеры. Используя полученный ДНК-фрагмент в качестве матрицы, ДНК-фрагмент, кодирующий полный белок, содержащий сигнальную область (Met1-Met119), амплифицировали с помощью ПЦР и встраивали в экспрессионный вектор для клеток млекопитающих.
Растворимый человеческий FcRn экспрессировали с помощью следующей процедуры. Плазмиды, сконструированные для экспрессии альфа-цепи человеческого FcRn (SEQ ID NO: 81) и бета2-микроглобулина (SEQ ID NO: 82), интродуцировали в клетки полученной из клетки рака почки человеческого эмбриона клеточной линии HEK293H (фирма Invitrogen) с помощью метода липофекции с использованием ПЭИ (полиэтилимин) (фирма Polyscience). Образовавшийся супернатант культуры собирали и FcRn очищали, используя IgG Сефарозу 6 Fast Flow (фирма Amersham Biosciences), после чего осуществляли дополнительную очистку с помощью HiTrap Q HP (фирма GE Healthcare) (J Immunol 169, 2002, cc. 5171-5180).
Экспрессия и очистка рекомбинантных антител
Рекомбинантные антитела экспрессировали кратковременно, используя либо клеточную линию FreeStyle293-F, либо клеточную линию Expi293 (фирма Thermo Fisher, Карлсбад, шт. Калифорния, США). Очистку из кондиционированной среды, экспрессирующей антитела, осуществляли общепринятым методом с применением белка А. При необходимости дополнительно осуществляли гель-фильтрацию.
Экспрессия и очистка рекомбинантного растворимого человеческого CD154
Ген человеческого CD154 синтезировали на основе опубликованных данных о белковой последовательности (NP_000065.1). ДНК-фрагмент, кодирующий растворимую форму человеческого CD154 (shCD154), с FLAG-меткой получали с помощью ПЦР, используя синтезированную ДНК в качестве матрицы, и образовавшиеся ДНК-фрагменты встраивали в экспрессионный вектор для клеток млекопитающих, получая тем самым экспрессионный вектор FLAG-shCD154 (SEQ ID NO: 106). Нуклеотидные последовательности полученных экспрессионных векторов определяли, используя общепринятые методологии, известные специалистам в данной области. FLAG-shCD154 экспрессировали с использованием клеточной линии FreeStyle 293 (фирма Invitrogen) согласно протоколу производителя. После трансфекции клетки выращивали в течение требуемого периода времени, после чего осуществляли сбор кондиционированной среды. Кондиционированную среду подвергали катионообменной хроматографии с использованием 25 мМ MES (рН 6,0), и FLAG-shCD154 элюировали с помощью непрерывного градиента 25 мМ MES, 1М NaCl (рН 6,0). Пиковые фракции объединяли, концентрировали с помощью устройства AmiconUltra Ultracel и подвергали гель-фильтрации с использованием забуференного фосфатом физиологического раствора (фирма Wako). Пиковые фракции вновь объединяли и концентрировали с помощью AmiconUltra Ultracel, затем стерилизовали фильтрацией с использованием мембранного ПВДФ-фильтра с размером пор 0,22 мкм. Для определения концентрации очищенного FLAG-shCD154 измеряли абсорбцию при 280 нм с помощью спектрофотометра. Концентрации белков рассчитывали на основе измеренных величин, применяя коэффициент абсорбции, рассчитанный методом, который описан в Protein Science 4, 1995, сс. 2411-2423.
Пример 2: Создание вариантов антител с улучшенной аффинностью к Е-белку DENV
Синтезировали гены, кодирующие VH (3СН, SEQ ID NO: 1) и VL (3CL, SEQ ID NO: 7) антитела к Е-белку DENV, и объединяли с СН человеческого IgG1 (SG182, SEQ ID NO: 46) и человеческой CL (SK1, SEQ ID NO: 60) соответственно, и обе конструкции клонировали в одном экспрессионном векторе. В настоящем описании антитело обозначали как DG_3CH-SG182/3CL-SK1 или как 3С.
Оценивали количество мутаций и их комбинаций для идентификации мутаций и комбинаций, повышающих связывающие свойства 3С. Затем множество мутаций интродуцировали в вариабельные области для повышения аффинности связывания с Е-белком. Таким образом создавали оптимизированные варианты VH, такие как 3СН912 (SEQ ID NIO: 2), 3СН953 (SEQ ID NO: 3), 3CH954 (SEQ ID NO: 4), 3CH955 (SEQ ID NO: 5), 3CH1047 (SEQ ID NO: 6), 3CH987 (SEQ ID NO: 90), 3CH989 (SEQ ID NO: 91), 3CH992 (SEQ ID NO: 92), 3CH1000 (SEQ ID NO: 93), 3CH1046 (SEQ ID NO: 94), 3CH1049 (SEQ ID NO: 95), и оптимизированные варианты VL, такие как 3CL499 (SEQ ID NO: 8), 3CL563 (SEQ ID NO: 9), 3CL658 (SEQ ID NO: 10), 3CL012 (SEQ ID NO: 96), 3CL119 (SEQ ID NO: 97), 3CL633 (SEQ ID NO: 98), 3CL666 (SEQ ID NO: 99), 3CL668 (SEQ ID NO: 100). Гены, кодирующие VH, объединяли с геном СН человеческого IgG1 (любой из SG182, SEQ ID NO: 46; SG1095, SEQ ID NO: 54; или SG1106, SEQ ID NO: 59), а гены, кодирующие VL, объединяли с геном человеческой CL (SK1, SEQ ID NO: 60). Каждую из конструкций клонировали в экспрессионном векторе. Данные об аминокислотных последовательностях вариантов антител обобщены в таблице 2. Один из вариантов, DG_3CH1047-SG182/3CL658-SK1, в настоящем описании обозначали также как 3Cam, а другой вариант, DG_3CH1047-SG182/3CL-SK1, в настоящем описании обозначали также как 3Cam2.
Антитела экспрессировали в HEK293-клетках, совместно трансфектированных смесью экспрессионных векторов для тяжелых и легких цепей, и очищали с использованием белка А.
Аффинность антител к Е-белку DENV, связывающихся с Е-белком DENV-1, DENV-2, DENV-3 и DENV-4, определяли при 25°С с помощью устройства Biacore Т200 (фирма GE Healthcare). Антитело к гистидину (фирма GE Healthcare) иммобилизовывали на всех проточных ячейках сенсорного чипа СМ4, используя набор для аминного сочетания (фирма GE Healthcare). Все антитела и аналиты приготавливали в ЗФР, рН 7,4, содержащем 20 мМ фосфат натрия, 150 мМ NaCl, 0,05% Твин 20 и 0,005% NaN3. Е-белок DENV-1, DENV-2, DENV-3 и DENV-4 с С-концевой His-меткой «захватывали» на проточной ячейке 2 или 3, а проточная ячейка 1 представляла собой проточную референс-ячейку Уровень иммобилизации Е-белка должен был соответствовать 200 резонансным единицам (RU). Антитела к Е-белку DENV инъецировали в концентрации 250нМ на всю сенсорную поверхность в течение 180 с с последующей диссоциаций в течение 300 с. Сенсорную поверхность регенерировали после каждого цикла, используя 10 мМ Gly-HCl, рН 1,5. Аффинность связывания определяли путем обработки и подгонки данных к модели связывания 1:1, используя программное обеспечение BIACORE® Т200 Evaluation, версия 2.0 (фирма GE Healthcare).
В таблицах 3а и 3б представлены данные об аффинности (Kd) антител к Е-белку DENV, связывающихся с Е-белком DENV-1 (обозначен в таблице как DV1), DENV-2 (обозначен в таблице DV2), DENV-3 (обозначен в таблице DV3) и DENV-4 (обозначен в таблице DV4). Для каждого варианта 3С продемонстрирована повышенная аффинность связывания со всеми четырьмя серотипами DENV по сравнению с родительским 3С. В качестве примера на фиг. 1 представлены сенсограммы родительского антитела 3С (DG_3CH-SG182/3CL-SK1) и одного из вариантов антитела 3Cam (DG_3CH1047-SG182/3CL658-SK1). Кроме того, на фиг. 12 представлены сенсограммы родительского антитела 3С (DG_3CH-SG182/3CL-SK1) и одного из вариантов антитела 3Cam2 (DG_3CH1047-SG182/3CL-SK1).
Пример 3: Создание вариантов СН для улучшения характеристик антител
В константную область тяжелой цепи СН человеческого IgG1 (SG182, SEQ ID NO: 46) интродуцировали множество мутаций и в результате создавали варианты СН человеческого IgG1 SG192 (SEQ ID NO: 47), SG1085 (SEQ ID NO: 48), SG1086 (SEQ ID NO: 49), SG1087 (SEQ ID NO: 50), SG1088 (SEQ ID NO: 51), SG1089 (SEQ ID NO: 52), SG1090 (SEQ ID NO: 53), SG1095 (SEQ ID NO: 54), SG1096 (SEQ ID NO: 55), SG1097 (SEQ ID NO: 56), SG1098 (SEQ ID NO: 57), SG1105 (SEQ ID NO: 58), SG1106 (SEQ ID NO: 59), SG1109 (SEQ ID NO: 107), SG1044 (SEQ ID NO: 108) и SG1045 (SEQ ID NO: 109). Гены, кодирующие CH-варианты, объединяли с VH 3С (3СН, SEQ ID NO: 1), одним из вариантов 3С (3СН1047, SEQ ID NO: 6) или с антителом к CD154 (SLAPH0336a, SEQ ID NO: 88). Ген VL антитела к CD154 (SLAPL0336a, SEQ ID NO: 89) объединяли с геном человеческой CL (SK1, SEQ ID NO: 60). Каждую из конструкций клонировали в экспрессионном векторе. Подробности, касающиеся СН-вариантов, обобщены в таблице 4. Вариабельную область антитела к CD154 SLAPH0336a/SLAPL0366a, которая может образовывать крупный иммунный комплекс в присутствии тримерного антигена CD154, применяли для оценки авидности связывания СН-вариантов с каждым Fc-рецептором.
Антитела экспрессировали в HEK293-клетках, совместно трансфектированных смесью экспрессионных векторов для тяжелых и легких цепей, и очищали с использованием белка А.
Пример 4: Аффинности связывания антитела, имеющего Fc-варианты, с комплементом C1q
Анализ связывания с человеческим C1q
Антитела к CD154 с Fc-вариантами (полученные в лаборатории заявителей антитела, которые создавали с помощью метода, описанного в примере 3) распределяли на планшетах Nunc-ImmunoPlate MaxiSorp (фирма Nalge Nunc International) и давали выстояться в течение ночи при 4°С. После промывки ЗФР-Т планшет блокировали с помощью TBST, содержащего 0,5% БСА и 1 × Block Асе: блокирующий реагент (фирма DS Pharma), в течение 2 ч при комнатной температуре. После промывки планшета человеческий C1q (фирма Calbiochem) распределяли на планшете и давали выстояться в течение 1 ч при комнатной температуре. Планшет промывали и добавляли меченное HRP антитело к человеческому C1q (фирма Bio Rad), давая прореагировать в течение 1 ч при комнатной температуре, и осуществляли промывку. Затем добавляли субстрат ТМВ (фирма Invitrogen). Сигнал измеряли с помощью планшет-ридера при длине 450 нм (рабочая длина волны) и 570 нм (длина референс-волны). Аффинность связывания антитела, имеющего Fc-область дикого типа (WT), с человеческим C1q снижалась при интродукции мутаций LALA в Fc-область, и пониженная аффинность связывания с человеческим C1q восстанавливалась при интродукции дополнительных мутаций KWES, EFT или EFT+АЕ помимо LALA (фиг. 2). Мутации LALA+KMES несколько повышали аффинность связывания, в то время как мутанты LALA+KWES, LALA+KAES и LALA+KEES связывались с C1q с аффинностью, сопоставимой с аффинностью WT (фиг. 3). Характеристики связывания мутантов LALA или LALA+KAES, описанных выше, не изменялись при дополнительной интродукции мутаций АСТЗ или АСТ5 (фиг. 4).
Анализ связывания с мышиным C1q
Антитела к CD154 с Fc-вариантами (полученные в лаборатории заявителей антитела, которые создавали с помощью метода, описанного в примере 3) распределяли на планшетах Nunc-ImmunoPlate MaxiSorp (фирма Nalge Nunc International) и давали выстояться в течение ночи при 4°С. После промывки ЗФР-Т планшет блокировали с помощью TBST, содержащего 0,5% БСА и 1 × Block Асе: блокирующий реагент (фирма DS Pharma), в течение 7 ч при 4°С. После промывки планшета на планшете распределяли 10%-ную мышиную плазму (фирма Innovative Research) и давали выстояться в течение ночи при 4°С. Планшет промывали и добавляли биотинилированное антитело к мышиному C1q (фирма Hycult Biotech), давая прореагировать в течение 1 ч при комнатной температуре, и осуществляли промывку. Добавляли стрептавидин-HRP (фирма Pierce), давая прореагировать в течение 1 ч при комнатной температуре, и осуществляли промывку. Затем добавляли применяемый при осуществлении ELISA субстрат ABTS для HRP (фирма KPL). Сигнал измеряли с помощью планшет-ридера при длине 405 нм. Аффинность связывания антитела, имеющего Fc-область дикого типа (WT), с мышиным C1q снижалась при интродукции мутаций LALA в Fc-область, и пониженная аффинность связывания с мышиным C1q восстанавливалась при интродукции дополнительной мутации KAES помимо LALA. Характеристики связывания мутантов LALA или LALA+KAES, описанных выше, не изменялись при интродукции дополнительных мутаций АСТ3 или АСТ5 (фиг. 5).
Пример 5: Biacore-анализ связывания Fc-вариантов с FcγR и FcRn
Связывание Fc-вариантов с человеческим или мышиными FcγR и человеческим FcRn при рН 7,4 определяли при 25°С с помощью устройства Biacore Т200 (фирма GE Healthcare). Все антитела и FcγR или FcRn приготавливали в ЗФР-Р, рН 7,4, содержащем 50 мМ фосфат натрия, 150 мМ NaCl, 0,05% Твин 20 и 0,005% NaN3. Для анализа связывания FcγR антитело к гистидину (фирма GE Healthcare) иммобилизовывали с помощью антитела к гистидину на всех проточных ячейках сенсорного чипа СМ4, используя набор для аминного сочетания (фирма GE Healthcare). Каждый из FcγR иммобилизовывали на проточной ячейке 2, 3 или 4, а проточная ячейка 1 представляла собой проточную референс-ячейку. Уровни иммобилизации FcγR должны были соответствовать 400 резонансным единицам (RU). Все антитела инъецировали в концентрации 100 нМ на все проточные ячейки. Иммунный комплекс получали путем смешения в молярном соотношении 1:1 антитела и тримерного CD154, и инкубировали при комнатной температуре в течение 1 ч. Сенсорную поверхность регенерировали после каждого цикла, используя 10 мМ глицин-HCl, рН 1,5.
Для анализа FcRn-связывания биотинилированный «захватывающий реагент» (реагент Biotin CAPture) (фирма GE Healthcare)) иммобилизовывали на обеих проточный ячейках 1 и 2 сенсорного чипа САР, используя набор Biotin CAPture (фирма GE Healthcare). Биотинилированный FcRn иммобилизовывали на проточной ячейке 2, а проточная ячейка 1 представляла собой проточную референс-ячейку. Уровни иммобилизации FcRn должны были соответствовать 400 RU. Все антитела инъецировали в концентрации 100 нМ на проточные ячейки 1 и 2. Иммунные комплексы получали путем смешения в молярном соотношении 1:1 антитела и тримерного CD154 и инкубировали при комнатной температуре в течение 1 ч. Сенсорную поверхность регенерировали после каждого цикла, используя 8М гуанидин-HCl, 1М NaOH (3:1 об./об.).
Уровни связывания стандартизовали относительно уровня иммобилизации соответствующих FcγR или FcRn. Осуществляли мониторинг связывания только антитела или иммунного комплекса (антитело и тримерный антиген CD154) с человеческими или мышиными FcγR и человеческим FcRn на основе ответов, характеризующих связывание. Иммунный комплекс применяли для оценки повышенного в результате эффекта авидности связывания с FcγR или FcRn. Результаты для человеческих FcγR1a, FcγR2a 167Н и 167R, FcγR2b, FcγR3a 158F и 158V, FcγR3b NA1 и NA2 представлены на фиг.6 (а)-(з). Результаты для мышиных FcγR1, FcγR2b, FcγR3, FcγR4 представлены на фиг. 7 (а)-(г). Связывание Fc-области дикого типа (обозначена как WT IgG) существенно снижалось при интродукции мутаций LALA, LALA+KAES или LALA+KWES в Fc-область для каждого из изученных FcγR. Указанная тенденция примерно сохранялась в анализах, в которых применяли только антитело (обозначено как только Ат) и иммунного комплекса (обозначен как CD154 IC). Связывание мутантов KAES или KWES не существенно снижалось по сравнению с WT IgG для большинства изученных FcγR. Результаты для человеческого FcRn представлены на фиг. 8. Связывание Fc-области дикого типа (обозначена как hIgG1) с человеческим FcRn заметно не изменялось даже после интродукции мутаций LALA или LALA+KAES в Fc-область. Связывание несколько повышалось после дополнительной интродукции мутаций АСТ3 или АСТ5, однако все еще оставалось сравнительно низким (фиг. 8).
Пример 6: Эффективность in vivo антител к DENV в отношении вызываемой DENV инфекции
6-8-недельных мышей линии AG129 заражали внутрибрюшинно, используя 106 бляшкообразующих единиц (БОЕ) штаммом DENV-2 D2Y98P. Через 48 ч мышей обрабатывали антителом в количестве 1-30 мкг в Р1-буфере. Антитело инъецировали внутривенно ретроорбитальным путем. Через 24 ч, т.е. через 72 ч после начального заражения, собирали образцы крови. В предшествующих исследованиях (Zust и др., J Virol 88, 2014, сс. 7276-7285; Tan и др., PLOS Negl Trop Dis 4, 2010, е672) было установлено, что пик виремии после заражения D2Y98P достигался в период времени между 3-4 днями после заражения. Вирусную РНК экстрагировали из плазмы каждой мыши и подвергали количественной ПЦР и сравнивали с DENV-2-стандартом с известной инфективностью с помощью анализа бляшкообразования. Обработка обоими антителами 3С и 3Cam существенно снижала виремию по сравнению с применяемым в качестве контроля ЗФР на указанной мышиной модели, и эффективность обоих антител оказалась сопоставимой. Антитело, имеющее мутацию LALA+KAES в Fc-области, обладало более выраженной эффективностью по сравнению с антителом, имеющим только мутацию LALA. Это имело место в случае обоих антител 3С и 3Cam (фиг. 9). Указанный результат свидетельствует о том, что восстановление C1q-связывающей активности в результате добавления мутации KAES к мутации LALA, принимает участие в противовирусной эффективности антител.
6-8-недельных мышей линии AG129 заражали внутрибрюшинно, используя 106-107 бляшкообразующих единиц (БОЕ) вирусом DENV (штамм DENV-1 08K3126, штамм DENV-2 D2Y98P, штамм DENV-3 VN32/96, штамм DENV-4 TVP360). Через 48 ч мышей обрабатывали антителом в количестве 1-30 мкг в Р1-буфере. Антитело инъецировали внутривенно ретроорбитальным путем. Через 24 ч, т.е. через 72 ч после начального заражения, собирали образцы крови. В предшествующих исследованиях (Zust и др., J Virol 88, 2014, cc. 7276-7285; Tan и др., PLOS Negl Trop Dis 4, 2010, e672) было установлено, что пик виремии после заражения D2Y98P достигалась в период времени между 3-4 днями после заражения. Вирусную РНК экстрагировали из плазмы каждой мыши и подвергали количественной ПЦР и сравнивали с DENV-стандартом с известной инфективностью с помощью анализа фокусообразования. Оба антитела 3С и 3Cam2 с одинаковым Fc-вариантом (LALA+KAES) существенно снижали виремию по сравнению с применяемым в качестве контроля Р1-буфером на указанной мышиной модели, и антитело 3Cam2 в большей степени снижало виремию, чем антитело 3С (фиг. 10).
Антитело 3Cam2, имеющее мутацию LALA+KAES в F-области, обладало более выраженной эффективностью по сравнению с антителом, имеющим только мутацию LALA, при введение антитела в более высокой дозе (фиг. 11). Указанный результат свидетельствует о том, что восстановление C1q-связывающей активности в результате добавления мутации KAES к мутации LALA, принимает участие в противовирусной эффективности антител.
Хотя выше изобретение описано для лучшего понимания с указанием некоторых деталей с целью иллюстрации и примеров, описание и примеры не должны рассматриваться в качестве ограничивающих объем изобретения. Описание всей патентной и научной литературы, процитированной в настоящем описании, специально полностью включено в настоящее описание в качестве ссылки.
Пример 7: Тестирование in vitro перекрестной реактивности с вирусом Зика специфических для вируса денге антител 3С и 3Cam2
7.1. FRNT-анализ
Для оценки нейтрализующей способности DG_3CH1047-SG1106/3CL_SK1 (или 3Cam2-LALA+KAES+ACT5) в отношении вируса Зика осуществляли анализ нейтрализации/уменьшения фокусообразования (FRNT) (реакция нейтрализации вируса). В результате установлено, что антитело 3Cam2-LALA+KAES+ACT5 обладало более выраженной нейтрализующей способностью в отношении вируса Зика по сравнению с DG_3CH-SG1106/3CL_SK1 (или 3C-LALA+KAES+ACT5) (фиг. 13). Средняя нейтрализующая способность или величина ЕС50 для вируса Зика представлена в таблице 5.
Ниже представлены последовательности изученных антител:
3Cam2:
DG_3СН1047 (SEQ ID NO: 6)-SG182 (SEQ ID NO: 46)/3CL (SEQ ID NO: 7)_ SK1 (SEQ ID NO: 60)
3Cam2-LALA+KAES:
DG_3CH1047 (SEQ ID NO: 6)-SG1095 (SEQ ID NO: 54)/3CL (SEQ ID NO: 7)_SK1 (SEQ ID NO: 60)
3Cam2-LALA+KAES+ACT5:
DG_3CH1047 (SEQ ID NO: 6)-SG1106 (SEQ ID NO: 59)/3CL (SEQ ID NO: 7)_SK1 (SEQ ID NO: 60)
3C:
DG_3CH (SEQ ID NO: 1)-SG182 (SEQ ID NO: 46)/3CL (SEQ ID NO: 7)_SK1 (SEQ ID NO: 60)
3C-LALA:
DG_3CH (SEQ ID NO: 1)-SG192 (SEQ ID NO: 47)/3CL (SEQ ID NO: 7)_SK1 (SEQ ID NO: 60)
3C-LALA+KAES+ACT5:
DG_3CH (SEQ ID NO: 1)-SG1106 (SEQ ID NO: 59)/3CL (SEQ ID NO: 7)_SK1 (SEQ ID NO: 60)
7.2. ADE-анализ в отношении вируса Зика
Для решения вопрос о том, может ли антитело 3Cam2-LALA+KAES+ACT5 аннулировать не только усиление DENV-инфекции, но также и усиление заражения вирусом Зика по сравнению с антителом с Fc-версией дикого типа, осуществляли ADE-анализ с использованием клеток K562 (фиг. 14). Применяли такую же методологию, что и для DENV. Усиление обнаружено при применении антитела с Fc-версией дикого типа DG_3CH1047-SG182/3CL_SK1 (или 3Cam2), но не в случае его Fc-вариантов DG_3CH1047-SG1095/3CL_SK1 (или 3Cam2-LALA+KAES) и 3Cam2-LALA+KAES+ACT5 (фиг. 14А). Эксперимент, повторенный с использованием новой партии 3Cam2 At, подтвердил аннулирование усиления при применении антитела с Fc-вариантом.
В целом, данные продемонстрировали, что мутация LALA аннулирует усиление заражения как вирусом DENV, так и вирусом Зика, и что дополнительные мутации KAES и АСТ5 не снижали действие LALA.
7.3. Методы in vitro
7.3.1. Вирус
Вирус Зика (азиатский штамм, регистрационный номер KF993678) получали из Института экологической медицины (Environmental Health Institute), Сингапур. Вирус выращивали в клетках линии С6/36 (АТСС) и оценивали количественно, используя следующий анализ фокусообразования: за 20-24 ч до заражения 1×105 клеток BHK-21 высевали в лунку 24-луночных планшетов и инкубировали в течение ночи при 37°С, 5% СО2. Содержащий вирусы супернатант серийно разводили в соотношении от 1:100 до 1:100000 и инкубировали в объеме 500 мкл на клеточных монослоях при 37°С, 5% СО2 в течение 2-3 ч. В конце периода инкубации на каждую лунку наслаивали 0,5 мл 0,8% метилцеллюлозы в RPMI. Планшеты инкубировали при 37°С, 5% СО2 в течение дней.
Для окрашивания зараженных клеток культуральную среду с метилцеллюлозой удаляли и клетки фиксировали 3,7%-ным формальдегидом в течение 30 мин. После удаления формальдегида планшеты промывали водопроводной водой и клетки пермеабилизировали с помощью 1% Тритон X-100 в 1×ЗФР. После второй стадии промывки антитело 4G2, разведенное в l%FBS/1×ЗФР, применяли для окрашивания зараженных клеток с последующей инкубацией с поликлональным козьим антимышиным антителом-HRP, разведенным в соотношении 1:2000 в 1% FBS/ЗФР. Субстрат истинно голубой для пероксидазы (Trueblue Peroxidase Substrate) (фирма KPL) применяли для цветной реакции. Фокусы подсчитывали вручную в каждой лунке и начальную концентрацию рассчитывали на основе средних количеств для всех лунок, в которых количество поддавалось подсчету.
7.3.2. FRNT-анализ
За 20-24 ч до заражения 1×105 клеток BHK-21 высевали в лунку 24-луночных планшетов и инкубировали в течение ночи при 37°С, 5% СО2. Разведения антител приготавливали в 96-луночных стерильных планшетах с U-образным дном в RPMI-среде и добавляли постоянное количество вируса. Указанную смесь инкубировали в течение 30 мин при 37°С, 5% СО2 перед добавлением к клеткам. После инкубации в течение ночи удаляли среду из 24-луночных планшетов, заменяя 450 мкл свежей среды 5% FBS/RPMI, и добавляли в лунки 50 мкл смеси вирус/антитело и инкубировали при 37°С, 5% СО2 в течение 2-3 ч.
В конце периода инкубации на каждую лунку наслаивали 0,5 мл 0,8% метилцеллюлозы в RPMI. Планшеты инкубировали при 37°С, 5% СО2 в течение дней.
Для окрашивания зараженных клеток культуральную среду с метилцеллюлозой удаляли и клетки фиксировали 3,7%-ным формальдегидом в течение 30 мин. После удаления формальдегида планшеты промывали водопроводной водой и клетки пермеабилизировали с помощью 1% Тритон X-100 в 1×ЗФР. После второй стадии промывки антитело 4G2, разведенное в 1%FBS/1×ЗФР, применяли для окрашивания зараженных клеток с последующей инкубацией с поликлональным козьим антимышиным антителом-HRP, разведенным в соотношении 1:2000 в 1% FBS/ЗФР. Истинно голубой субстрат для пероксидазы (Trueblue Peroxidase Substrate) (фирма KPL) применяли для цветной реакции. Фокусы подсчитывали вручную в каждой лунке и величины ЕС50 рассчитывали с помощью программного обеспечения Prism (трехпараметрическая подгонка кривых).
7.3.3. ADE-анализ с использованием клеток K562
Высевали 6×104 k562-клеток/лунку в среде RPMI/10%FCS в 96-луночные круглодонные планшеты для культуры тканей и культивировали в течение ночи. Серийные разведения антитела приготавливали в других круглодонных планшетах и добавляли постоянное количество вируса. Смесь инкубировали в течение 30 мин при 37°С, после чего добавляли 50 мкл к K562-клеткам. Применяли множественность заражения (MOI) 1. После инкубации в течение ночи среду удаляли, после чего добавляли смеси антитело/вирус. После инкубации в течение 90 мин при 37°С добавляли RPMI, 10% FCS для дополнительной инкубации в течение 2,5 дней. Затем клетки фиксировали раствором Cytofix/Cytoperm (фирма Becton Dickinson), после чего окрашивали антителом к Е-белку 4G2-Alexa647 и антителом к NS1-А1еха488. Образцы анализировали с помощью проточного цитометра FACS Verse с 96-луночным HTS-устройством (фирма BD).
Пример 8: Тестирование in vivo защищающей способности специфических для вируса денге антител 3С и 3Cam2 в отношении заражения вирусом Зика
8.1. Эффективность терапевтической обработки антителом
Поскольку мыши линии AG129 обладают высокой чувствительностью к вирусу Зика и у них развивается инфекция даже раньше, чем после заражения DENV, при создании изобретения для изучения вируса Зика вместо указанной линии мышей выбрана модель IFNAR.
Мыши линии IFNAR отличаются дефицитом IFN-рецептора типа I (IFNAR), но нормальной экспрессией IFN-рецептора типа II или IFN-гамма-рецептора (IFNGR).
Доза вируса 104 БОЕ/мышь выбранная на основе известной публикации (Cell Host Microbe. 19(5), 2016, cc. 720-730. doi: 10.1016/j.chom.2016.03.010). Применяемый штамм вируса Зика был выделен в Канаде у путешественника, вернувшегося из Тайланда. Штамм относится к азиатской линии. Мышей обрабатывали антителом в дозе 100 мкг.
У мышей, которых обрабатывали 3Cam2-LALA+KAES+ACT5 за 2 дня до заражения вирусом Зика, обнаружена существенно более низкая виремия в день 3 и день 5 после заражения по сравнению с контрольными мышами, которых обрабатывали Р1-буфером. Антитело 3Cam2-LALA+KAES+ACT5 снижало виремию более эффективно, чем 3C-LALA+KAES+ACT5 (фиг. 15). Анализ выживаемости продемонстрировал, что в обеих обработанных антителом группах животные выживали по меньшей мере вплоть до дня 50 (окончание эксперимента), в отличие от обработанной Р1-группы, в которой все мыши погибли через 15 дней после заражения (фиг. 16).
8.2. Методы in vivo
8.2.1. Получение антитела для обработки in vivo
Антитело концентрировали до нескольких миллиграммов/мл в Р1-буфере (20 мМ His, 150 мМ Arg-Asp, рН 6,0) и разводили в P1-буфере до требуемой концентрации непосредственно перед обработкой in vivo.
8.2.2. Мыши
Мышей линии AG129 или IFNAR применяли в экспериментах in vivo согласно указанному методу. Мышей линии AG129 покупали у фирмы В&K Universal, Великобритания. Мышей линии IFNAR (B6.129S2-Ifnar1tm1 Agt/Mmjax) покупали у фирмы The Jackson Laboratory (США).
8.2.3. Терапевтическая обработка
Мышей заражали внутрибрюшинно (i.p.), используя 104 БОЕ/мышь. Через 48 ч после заражения мышей анестезировали изофлураном для внутривенной (i.v.) инъекции антитела. Ат разводили в P1-буфере и инъецировали ретроорбитальным путем в объеме 100 мкл.
Пример 9: In vitro эффективность 3Cam2-LALA+KAES+ACT5 в отношении вируса Зика
9.1 Связывание
Оценивали связывание человеческих антител DG_3CH-SG182/3CL_SK1 (или 3С), DG_3CH-SG192/3CL_SK1 (или 3C-LALA) и 3Cam2-LALA+KAES+ACT5 с вирусом Зика (ZIKV).
В целом, метод состоял в следующем: МАт разводили и затем инкубировали в течение 1 ч при 37°С на сенсибилизированных очищенным ZIKV планшетах для ELISA. Конъюгированное с HRP вторичное антитело к человеческому IgG применяли для детекции связывания 3С, 3C-LALA и 3Cam2-LALA+KAES+ACT5 с вирионами ZIKV. Для обнаружения использовали ТМВ-субстрат. После прекращения реакции измеряли абсорбцию, осуществляя считывание с дублированием.
Антитело 3Cam2-LALA+KAES+ACT5 связывалось с ZIKV аналогично антителам 3С и 3C-LALA (фиг. 17).
9.2 Нейтрализация
Изучали также способность антитела ингибировать заражение ZIKV клеток. ZIKV смешивали, используя MOI 10, с разведенным человеческим МАт и инкубировали в течение 2 ч при 37°С при осторожном перемешивании. Затем добавляли смеси вирус/МАт к клеткам HEK 293Т, высеянным в 96-луночные планшеты. После культивирования в течение 2 дней при 37°С уровень заражения клеток измеряли путем детекции ZIKV-специфического антигена с помощью проточной цитометрии. Все считывания осуществляли в трех повторностях, нейтрализующую способность рассчитывали относительно клеток, инфицированных ZIKV в отсутствии антител.
Все антитела, т.е. 3Cam2-LALA+KAES+ACT5, 3С и 3C-LALA, характеризовались сходной способностью нейтрализовать заражение HEK-клеток ZIKV (фиг. 18).
Пример 10: In vivo эффективность 3Cam2-LALA+KAES+ACT5 в отношении вируса Зика: передача от матери к плоду
Далее в опытах in vivo изучали способность антител ингибировать передачу вируса от матери к потомству.
Беременных мышей с «выключенным» в результате нокдауна IFNαR инокулировали ZIKV через 10,5 дней после спаривания. Антитела вводили в дни -1, 0 и 3 после заражения. В день 16,5 после спаривания беременных мышей отбирали и изымали плоды. Определяли вес плода, в том числе, вес всего тела и вес головы; измеряли вирусную нагрузку в амниотической жидкости, плаценте, головном мозге плода и печени.
Плоды обработанных матерей отличались существенно большим весом по сравнению с необработанными плодами мышей, это позволяет предположить защиту от врожденной недостаточности развития, обнаруженной у необработанных зараженных ZIKV животных (фиг. 19). Антитела существенно ингибировали передачу вируса от беременной матери к плоду (фиг. 20).
--->
ПЕРЕЧЕНЬ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЕЙ
<110> ЧУГАИ СЕЙЯКУ КАБУСИКИ КАЙСЯ
<120> АНТИТЕЛА К ВИРУСУ ДЕНГЕ, ОБЛАДАЮЩИЕ ПЕРЕКРЕСТНОЙ РЕАКТИВНОСТЬЮ
С ВИРУСОМ ЗИКА, И СПОСОБЫ ИХ ПРИМЕНЕНИЯ
<130> 34246SG6/MBR(JKN)/ndh
<160> 109
<170> PatentIn version 3.5
<210> 1
<211> 132
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 1
Gln Val Gln Leu Val Gln Ser Gly Pro Asp Val Glu Lys Pro Gly Ala
1 5 10 15
Ser Val Lys Val Ser Cys Lys Ala Ser Gly Tyr Thr Phe Thr Ser Asn
20 25 30
Tyr Ile His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Gln Gly Leu Glu Trp Met
35 40 45
Gly Val Ile Asn Pro Arg Gly Gly Ser Thr Ala Ser Ala Gln Lys Phe
50 55 60
Gln Gly Arg Ile Thr Met Thr Arg Asp Thr Ser Thr Ser Thr Val Tyr
65 70 75 80
Met Glu Leu Ser Ser Leu Arg Ser Asp Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Arg Gly Gly Arg Ala Leu Phe Tyr Asp Ser Tyr Thr Thr Pro Arg
100 105 110
Asp Gly Gly Ser Trp Trp Phe Asp Pro Trp Gly Gln Gly Ser Leu Val
115 120 125
Thr Val Ser Ser
130
<210> 2
<211> 132
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> VH
<400> 2
Gln Val Gln Leu Val Gln Ser Gly Pro Asp Val Glu Lys Pro Gly Ala
1 5 10 15
Ser Val Lys Val Ser Cys Lys Ala Ser Gly Tyr Thr Phe Thr Ser Asn
20 25 30
Tyr Ile His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Gln Gly Leu Glu Trp Met
35 40 45
Gly Val Ile Asn Pro Arg Gly Gly Ser Arg Ala Ser Ala Gln Lys Phe
50 55 60
Gln Gly Arg Ile Thr Met Thr Arg Asp Thr Ser Thr Ser Thr Val Tyr
65 70 75 80
Met Glu Leu Ser Ser Leu Arg Ser Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Arg Gly Gly Arg Ala Leu Phe Tyr Asp Ser Tyr Thr Thr Pro Phe
100 105 110
Asp Gly Gly Ser Trp Trp Phe Asp Pro Trp Gly Gln Gly Ser Leu Val
115 120 125
Thr Val Ser Ser
130
<210> 3
<211> 132
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> VH
<400> 3
Gln Val Gln Leu Val Gln Ser Gly Pro Asp Val Glu Lys Pro Gly Ala
1 5 10 15
Ser Val Lys Val Ser Cys Lys Ala Ser Gly Tyr Thr Phe Thr Ser Asn
20 25 30
Tyr Ile His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Gln Gly Leu Glu Trp Met
35 40 45
Gly Val Ile Asn Pro Arg Gly Gly Ser Arg Arg Ser Ala Gln Lys Phe
50 55 60
Gln Gly Arg Ile Thr Met Thr Arg Asp Thr Ser Thr Ser Thr Val Tyr
65 70 75 80
Met Glu Leu Ser Ser Leu Arg Ser Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Arg Gly Gly Arg Ala Leu Phe Tyr Asp Ser Tyr Thr Thr Pro Phe
100 105 110
Asp Gly Gly Ser Trp Trp Phe Asp Pro Trp Gly Gln Gly Ser Leu Val
115 120 125
Thr Val Ser Ser
130
<210> 4
<211> 132
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> VH
<400> 4
Gln Val Gln Leu Val Gln Ser Gly Pro Asp Val Glu Lys Pro Gly Ala
1 5 10 15
Ser Val Lys Val Ser Cys Lys Ala Ser Gly Tyr Thr Phe Thr Ser Asn
20 25 30
Tyr Ile His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Gln Gly Leu Glu Trp Met
35 40 45
Gly Val Ile Asn Pro Arg Gly Gly Ser Arg Arg Ser Ala Gln Lys Phe
50 55 60
Gln Gly Arg Ile Thr Met Thr Arg Asp Thr Ser Thr Ser Thr Val Tyr
65 70 75 80
Met Glu Leu Ser Ser Leu Arg Ser Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Arg Gly Gly Arg Ala Leu Phe Tyr Asp Ser Tyr Thr Thr Pro Arg
100 105 110
Asp Asp Gly Ser Trp Trp Phe Asp Pro Trp Gly Gln Gly Ser Leu Val
115 120 125
Thr Val Ser Ser
130
<210> 5
<211> 132
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> VH
<400> 5
Gln Val Gln Leu Val Gln Ser Gly Pro Asp Val Glu Lys Pro Gly Ala
1 5 10 15
Ser Val Lys Val Ser Cys Lys Ala Ser Gly Tyr Thr Phe Thr Ser Asn
20 25 30
Tyr Ile His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Gln Gly Leu Glu Trp Met
35 40 45
Gly Val Ile Asn Pro Arg Gly Gly Ser Arg Arg Ser Ala Gln Lys Phe
50 55 60
Gln Gly Arg Ile Thr Met Thr Arg Asp Thr Ser Thr Ser Thr Val Tyr
65 70 75 80
Met Glu Leu Ser Ser Leu Arg Ser Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Arg Gly Gly Arg Ala Leu Phe Tyr Asp Ser Tyr Thr Thr Pro Arg
100 105 110
Asp Leu Gly Ser Trp Trp Phe Asp Pro Trp Gly Gln Gly Ser Leu Val
115 120 125
Thr Val Ser Ser
130
<210> 6
<211> 132
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> VH
<400> 6
Gln Val Gln Leu Val Gln Ser Gly Pro Asp Val Glu Lys Pro Gly Ala
1 5 10 15
Ser Val Lys Val Ser Cys Lys Ala Ser Gly Tyr Thr Phe Thr Ser Tyr
20 25 30
Tyr Met His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Gln Gly Leu Glu Trp Met
35 40 45
Gly Val Ile Asn Pro Arg Gly Gly Ser Arg Arg Ser Ala Gln Lys Phe
50 55 60
Gln Gly Arg Ile Thr Met Thr Arg Asp Thr Ser Thr Ser Thr Val Tyr
65 70 75 80
Met Glu Leu Ser Ser Leu Arg Ser Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Arg Gly Gly Glu Ala Leu Phe Tyr Asp Ser Tyr Thr Thr Pro Phe
100 105 110
Asp Gly Gly Ser Trp Trp Phe Asp Pro Trp Gly Gln Gly Ser Leu Val
115 120 125
Thr Val Ser Ser
130
<210> 7
<211> 107
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 7
Asp Ile Gln Leu Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu Ser Ala Ser Val Gly
1 5 10 15
Asp Arg Val Thr Phe Thr Cys Gln Ala Ser Gln Asp Ile Arg Lys Tyr
20 25 30
Leu Asn Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Leu Ile
35 40 45
Tyr Asp Ala Ser Asn Leu Lys Thr Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly
50 55 60
Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Phe Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro
65 70 75 80
Glu Asp Val Ala Thr Tyr Tyr Cys Gln Gln Phe Asp Asp Leu Pro Ile
85 90 95
Thr Phe Gly Gln Gly Thr Arg Leu Gln Ile Lys
100 105
<210> 8
<211> 107
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> VL
<400> 8
Asp Ile Gln Leu Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu Ser Ala Ser Val Gly
1 5 10 15
Asp Arg Val Thr Phe Thr Cys Gln Ala Ser Gln Asp Ile Arg Lys Tyr
20 25 30
Leu Asn Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Leu Ile
35 40 45
Tyr Asp Ala Ser Asn Leu Lys Phe Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly
50 55 60
Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Phe Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro
65 70 75 80
Glu Asp Val Ala Thr Tyr Tyr Cys Gln Gln Phe Asp Ala Leu Pro Ile
85 90 95
Thr Phe Gly Gln Gly Thr Arg Leu Gln Ile Lys
100 105
<210> 9
<211> 107
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> VL
<400> 9
Asp Ile Gln Leu Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu Ser Ala Ser Val Gly
1 5 10 15
Asp Arg Val Thr Phe Thr Cys Gln Ala Ser Gln Asp Ile Arg Gln Tyr
20 25 30
Leu Asn Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Leu Ile
35 40 45
Tyr Asp Ala Ser Asn Leu Lys Phe Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly
50 55 60
Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Phe Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro
65 70 75 80
Glu Asp Val Ala Thr Tyr Tyr Cys Gln Gln Phe Ser Ala Leu Pro Ile
85 90 95
Thr Phe Gly Gln Gly Thr Arg Leu Gln Ile Lys
100 105
<210> 10
<211> 107
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> VL
<400> 10
Asp Ile Gln Leu Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu Ser Ala Ser Val Gly
1 5 10 15
Asp Arg Val Thr Phe Thr Cys Gln Ala Ser Gln Glu Ile Arg Lys Tyr
20 25 30
Leu Asn Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Leu Ile
35 40 45
Tyr Asp Ala Ser Glu Leu Lys Thr Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly
50 55 60
Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Phe Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro
65 70 75 80
Glu Asp Val Ala Thr Tyr Tyr Cys Gln Gln Phe Glu Asp Leu Pro Ile
85 90 95
Thr Phe Gly Gln Gly Thr Arg Leu Gln Ile Lys
100 105
<210> 11
<211> 5
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 11
Ser Asn Tyr Ile His
1 5
<210> 12
<211> 5
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> HVR-H1
<400> 12
Ser Tyr Tyr Met His
1 5
<210> 13
<211> 17
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 13
Val Ile Asn Pro Arg Gly Gly Ser Thr Ala Ser Ala Gln Lys Phe Gln
1 5 10 15
Gly
<210> 14
<211> 17
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> HVR-H2
<400> 14
Val Ile Asn Pro Arg Gly Gly Ser Arg Ala Ser Ala Gln Lys Phe Gln
1 5 10 15
Gly
<210> 15
<211> 17
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> HVR-H2
<400> 15
Val Ile Asn Pro Arg Gly Gly Ser Arg Arg Ser Ala Gln Lys Phe Gln
1 5 10 15
Gly
<210> 16
<211> 23
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 16
Gly Gly Arg Ala Leu Phe Tyr Asp Ser Tyr Thr Thr Pro Arg Asp Gly
1 5 10 15
Gly Ser Trp Trp Phe Asp Pro
20
<210> 17
<211> 23
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> HVR-H3
<400> 17
Gly Gly Arg Ala Leu Phe Tyr Asp Ser Tyr Thr Thr Pro Phe Asp Gly
1 5 10 15
Gly Ser Trp Trp Phe Asp Pro
20
<210> 18
<211> 23
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> HVR-H3
<400> 18
Gly Gly Arg Ala Leu Phe Tyr Asp Ser Tyr Thr Thr Pro Arg Asp Asp
1 5 10 15
Gly Ser Trp Trp Phe Asp Pro
20
<210> 19
<211> 23
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> HVR-H3
<400> 19
Gly Gly Arg Ala Leu Phe Tyr Asp Ser Tyr Thr Thr Pro Arg Asp Leu
1 5 10 15
Gly Ser Trp Trp Phe Asp Pro
20
<210> 20
<211> 23
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> HVR-H3
<400> 20
Gly Gly Glu Ala Leu Phe Tyr Asp Ser Tyr Thr Thr Pro Phe Asp Gly
1 5 10 15
Gly Ser Trp Trp Phe Asp Pro
20
<210> 21
<211> 11
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 21
Gln Ala Ser Gln Asp Ile Arg Lys Tyr Leu Asn
1 5 10
<210> 22
<211> 11
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> HVR-L1
<400> 22
Gln Ala Ser Gln Asp Ile Arg Gln Tyr Leu Asn
1 5 10
<210> 23
<211> 11
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> HVR-L1
<400> 23
Gln Ala Ser Gln Glu Ile Arg Lys Tyr Leu Asn
1 5 10
<210> 24
<211> 7
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 24
Asp Ala Ser Asn Leu Lys Thr
1 5
<210> 25
<211> 7
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> HVR-L2
<400> 25
Asp Ala Ser Asn Leu Lys Phe
1 5
<210> 26
<211> 7
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> HVR-L2
<400> 26
Asp Ala Ser Glu Leu Lys Thr
1 5
<210> 27
<211> 9
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 27
Gln Gln Phe Asp Asp Leu Pro Ile Thr
1 5
<210> 28
<211> 9
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> HVR-L3
<400> 28
Gln Gln Phe Asp Ala Leu Pro Ile Thr
1 5
<210> 29
<211> 9
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> HVR-L3
<400> 29
Gln Gln Phe Ser Ala Leu Pro Ile Thr
1 5
<210> 30
<211> 9
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> HVR-L3
<400> 30
Gln Gln Phe Glu Asp Leu Pro Ile Thr
1 5
<210> 31
<211> 30
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 31
Gln Val Gln Leu Val Gln Ser Gly Pro Asp Val Glu Lys Pro Gly Ala
1 5 10 15
Ser Val Lys Val Ser Cys Lys Ala Ser Gly Tyr Thr Phe Thr
20 25 30
<210> 32
<211> 14
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 32
Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Gln Gly Leu Glu Trp Met Gly
1 5 10
<210> 33
<211> 32
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 33
Arg Ile Thr Met Thr Arg Asp Thr Ser Thr Ser Thr Val Tyr Met Glu
1 5 10 15
Leu Ser Ser Leu Arg Ser Asp Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys Ala Arg
20 25 30
<210> 34
<211> 32
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> FR-H3
<400> 34
Arg Ile Thr Met Thr Arg Asp Thr Ser Thr Ser Thr Val Tyr Met Glu
1 5 10 15
Leu Ser Ser Leu Arg Ser Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys Ala Arg
20 25 30
<210> 35
<211> 11
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 35
Trp Gly Gln Gly Ser Leu Val Thr Val Ser Ser
1 5 10
<210> 36
<211> 23
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 36
Asp Ile Gln Leu Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu Ser Ala Ser Val Gly
1 5 10 15
Asp Arg Val Thr Phe Thr Cys
20
<210> 37
<211> 15
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 37
Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Leu Ile Tyr
1 5 10 15
<210> 38
<211> 32
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 38
Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr
1 5 10 15
Phe Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro Glu Asp Val Ala Thr Tyr Tyr Cys
20 25 30
<210> 39
<211> 10
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 39
Phe Gly Gln Gly Thr Arg Leu Gln Ile Lys
1 5 10
<210> 40
<211> 5
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> HVR-H1
<220>
<221> MISC_FEATURE
<222> (2)..(2)
<223> Xaa is Asn or Tyr
<220>
<221> MISC_FEATURE
<222> (4)..(4)
<223> Xaa is Ile or Met
<400> 40
Ser Xaa Tyr Xaa His
1 5
<210> 41
<211> 17
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> HVR-H2
<220>
<221> MISC_FEATURE
<222> (9)..(9)
<223> Xaa is Thr or Arg
<220>
<221> MISC_FEATURE
<222> (10)..(10)
<223> Xaa is Ala or Arg
<400> 41
Val Ile Asn Pro Arg Gly Gly Ser Xaa Xaa Ser Ala Gln Lys Phe Gln
1 5 10 15
Gly
<210> 42
<211> 23
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> HVR-H3
<220>
<221> MISC_FEATURE
<222> (3)..(3)
<223> Xaa is Arg or Glu
<220>
<221> MISC_FEATURE
<222> (14)..(14)
<223> Xaa is Arg or Phe
<220>
<221> MISC_FEATURE
<222> (16)..(16)
<223> Xaa is Gly, Asp or Leu
<400> 42
Gly Gly Xaa Ala Leu Phe Tyr Asp Ser Tyr Thr Thr Pro Xaa Asp Xaa
1 5 10 15
Gly Ser Trp Trp Phe Asp Pro
20
<210> 43
<211> 11
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> HVR-L1
<220>
<221> MISC_FEATURE
<222> (5)..(5)
<223> Xaa is Asp or Glu
<220>
<221> MISC_FEATURE
<222> (8)..(8)
<223> Xaa is Lys or Gln
<400> 43
Gln Ala Ser Gln Xaa Ile Arg Xaa Tyr Leu Asn
1 5 10
<210> 44
<211> 7
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> HVR-L2
<220>
<221> MISC_FEATURE
<222> (4)..(4)
<223> Xaa is Asn or Glu
<220>
<221> MISC_FEATURE
<222> (7)..(7)
<223> Xaa is Thr or Phe
<400> 44
Asp Ala Ser Xaa Leu Lys Xaa
1 5
<210> 45
<211> 9
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> HVR-L3
<220>
<221> MISC_FEATURE
<222> (4)..(4)
<223> Xaa is Asp, Ser or Glu
<220>
<221> MISC_FEATURE
<222> (5)..(5)
<223> Xaa is Asp or Ala
<400> 45
Gln Gln Phe Xaa Xaa Leu Pro Ile Thr
1 5
<210> 46
<211> 328
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> CH
<400> 46
Ala Ser Thr Lys Gly Pro Ser Val Phe Pro Leu Ala Pro Ser Ser Lys
1 5 10 15
Ser Thr Ser Gly Gly Thr Ala Ala Leu Gly Cys Leu Val Lys Asp Tyr
20 25 30
Phe Pro Glu Pro Val Thr Val Ser Trp Asn Ser Gly Ala Leu Thr Ser
35 40 45
Gly Val His Thr Phe Pro Ala Val Leu Gln Ser Ser Gly Leu Tyr Ser
50 55 60
Leu Ser Ser Val Val Thr Val Pro Ser Ser Ser Leu Gly Thr Gln Thr
65 70 75 80
Tyr Ile Cys Asn Val Asn His Lys Pro Ser Asn Thr Lys Val Asp Lys
85 90 95
Arg Val Glu Pro Lys Ser Cys Asp Lys Thr His Thr Cys Pro Pro Cys
100 105 110
Pro Ala Pro Glu Leu Leu Gly Gly Pro Ser Val Phe Leu Phe Pro Pro
115 120 125
Lys Pro Lys Asp Thr Leu Met Ile Ser Arg Thr Pro Glu Val Thr Cys
130 135 140
Val Val Val Asp Val Ser His Glu Asp Pro Glu Val Lys Phe Asn Trp
145 150 155 160
Tyr Val Asp Gly Val Glu Val His Asn Ala Lys Thr Lys Pro Arg Glu
165 170 175
Glu Gln Tyr Asn Ser Thr Tyr Arg Val Val Ser Val Leu Thr Val Leu
180 185 190
His Gln Asp Trp Leu Asn Gly Lys Glu Tyr Lys Cys Lys Val Ser Asn
195 200 205
Lys Ala Leu Pro Ala Pro Ile Glu Lys Thr Ile Ser Lys Ala Lys Gly
210 215 220
Gln Pro Arg Glu Pro Gln Val Tyr Thr Leu Pro Pro Ser Arg Glu Glu
225 230 235 240
Met Thr Lys Asn Gln Val Ser Leu Thr Cys Leu Val Lys Gly Phe Tyr
245 250 255
Pro Ser Asp Ile Ala Val Glu Trp Glu Ser Asn Gly Gln Pro Glu Asn
260 265 270
Asn Tyr Lys Thr Thr Pro Pro Val Leu Asp Ser Asp Gly Ser Phe Phe
275 280 285
Leu Tyr Ser Lys Leu Thr Val Asp Lys Ser Arg Trp Gln Gln Gly Asn
290 295 300
Val Phe Ser Cys Ser Val Met His Glu Ala Leu His Asn His Tyr Thr
305 310 315 320
Gln Lys Ser Leu Ser Leu Ser Pro
325
<210> 47
<211> 328
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> CH
<400> 47
Ala Ser Thr Lys Gly Pro Ser Val Phe Pro Leu Ala Pro Ser Ser Lys
1 5 10 15
Ser Thr Ser Gly Gly Thr Ala Ala Leu Gly Cys Leu Val Lys Asp Tyr
20 25 30
Phe Pro Glu Pro Val Thr Val Ser Trp Asn Ser Gly Ala Leu Thr Ser
35 40 45
Gly Val His Thr Phe Pro Ala Val Leu Gln Ser Ser Gly Leu Tyr Ser
50 55 60
Leu Ser Ser Val Val Thr Val Pro Ser Ser Ser Leu Gly Thr Gln Thr
65 70 75 80
Tyr Ile Cys Asn Val Asn His Lys Pro Ser Asn Thr Lys Val Asp Lys
85 90 95
Arg Val Glu Pro Lys Ser Cys Asp Lys Thr His Thr Cys Pro Pro Cys
100 105 110
Pro Ala Pro Glu Ala Ala Gly Gly Pro Ser Val Phe Leu Phe Pro Pro
115 120 125
Lys Pro Lys Asp Thr Leu Met Ile Ser Arg Thr Pro Glu Val Thr Cys
130 135 140
Val Val Val Asp Val Ser His Glu Asp Pro Glu Val Lys Phe Asn Trp
145 150 155 160
Tyr Val Asp Gly Val Glu Val His Asn Ala Lys Thr Lys Pro Arg Glu
165 170 175
Glu Gln Tyr Asn Ser Thr Tyr Arg Val Val Ser Val Leu Thr Val Leu
180 185 190
His Gln Asp Trp Leu Asn Gly Lys Glu Tyr Lys Cys Lys Val Ser Asn
195 200 205
Lys Ala Leu Pro Ala Pro Ile Glu Lys Thr Ile Ser Lys Ala Lys Gly
210 215 220
Gln Pro Arg Glu Pro Gln Val Tyr Thr Leu Pro Pro Ser Arg Glu Glu
225 230 235 240
Met Thr Lys Asn Gln Val Ser Leu Thr Cys Leu Val Lys Gly Phe Tyr
245 250 255
Pro Ser Asp Ile Ala Val Glu Trp Glu Ser Asn Gly Gln Pro Glu Asn
260 265 270
Asn Tyr Lys Thr Thr Pro Pro Val Leu Asp Ser Asp Gly Ser Phe Phe
275 280 285
Leu Tyr Ser Lys Leu Thr Val Asp Lys Ser Arg Trp Gln Gln Gly Asn
290 295 300
Val Phe Ser Cys Ser Val Met His Glu Ala Leu His Asn His Tyr Thr
305 310 315 320
Gln Lys Ser Leu Ser Leu Ser Pro
325
<210> 48
<211> 328
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> CH
<400> 48
Ala Ser Thr Lys Gly Pro Ser Val Phe Pro Leu Ala Pro Ser Ser Lys
1 5 10 15
Ser Thr Ser Gly Gly Thr Ala Ala Leu Gly Cys Leu Val Lys Asp Tyr
20 25 30
Phe Pro Glu Pro Val Thr Val Ser Trp Asn Ser Gly Ala Leu Thr Ser
35 40 45
Gly Val His Thr Phe Pro Ala Val Leu Gln Ser Ser Gly Leu Tyr Ser
50 55 60
Leu Ser Ser Val Val Thr Val Pro Ser Ser Ser Leu Gly Thr Gln Thr
65 70 75 80
Tyr Ile Cys Asn Val Asn His Lys Pro Ser Asn Thr Lys Val Asp Lys
85 90 95
Arg Val Glu Pro Lys Ser Cys Asp Lys Thr His Thr Cys Pro Pro Cys
100 105 110
Pro Ala Pro Glu Leu Leu Gly Gly Pro Ser Val Phe Leu Phe Pro Pro
115 120 125
Lys Pro Lys Asp Thr Leu Met Ile Ser Arg Thr Pro Glu Val Thr Cys
130 135 140
Val Val Val Asp Val Ser His Glu Asp Pro Glu Val Lys Phe Asn Trp
145 150 155 160
Tyr Val Asp Gly Val Glu Val His Asn Ala Lys Thr Lys Pro Arg Glu
165 170 175
Glu Gln Tyr Asn Ser Thr Tyr Arg Val Val Ser Val Leu Thr Val Leu
180 185 190
His Gln Asp Trp Leu Asn Gly Lys Glu Tyr Lys Cys Lys Val Ser Asn
195 200 205
Trp Ala Leu Pro Ala Pro Ile Ser Lys Thr Ile Ser Lys Ala Lys Gly
210 215 220
Gln Pro Arg Glu Pro Gln Val Tyr Thr Leu Pro Pro Ser Arg Glu Glu
225 230 235 240
Met Thr Lys Asn Gln Val Ser Leu Thr Cys Leu Val Lys Gly Phe Tyr
245 250 255
Pro Ser Asp Ile Ala Val Glu Trp Glu Ser Asn Gly Gln Pro Glu Asn
260 265 270
Asn Tyr Lys Thr Thr Pro Pro Val Leu Asp Ser Asp Gly Ser Phe Phe
275 280 285
Leu Tyr Ser Lys Leu Thr Val Asp Lys Ser Arg Trp Gln Gln Gly Asn
290 295 300
Val Phe Ser Cys Ser Val Met His Glu Ala Leu His Asn His Tyr Thr
305 310 315 320
Gln Lys Ser Leu Ser Leu Ser Pro
325
<210> 49
<211> 328
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> CH
<400> 49
Ala Ser Thr Lys Gly Pro Ser Val Phe Pro Leu Ala Pro Ser Ser Lys
1 5 10 15
Ser Thr Ser Gly Gly Thr Ala Ala Leu Gly Cys Leu Val Lys Asp Tyr
20 25 30
Phe Pro Glu Pro Val Thr Val Ser Trp Asn Ser Gly Ala Leu Thr Ser
35 40 45
Gly Val His Thr Phe Pro Ala Val Leu Gln Ser Ser Gly Leu Tyr Ser
50 55 60
Leu Ser Ser Val Val Thr Val Pro Ser Ser Ser Leu Gly Thr Gln Thr
65 70 75 80
Tyr Ile Cys Asn Val Asn His Lys Pro Ser Asn Thr Lys Val Asp Lys
85 90 95
Arg Val Glu Pro Lys Ser Cys Asp Lys Thr His Thr Cys Pro Pro Cys
100 105 110
Pro Ala Pro Glu Leu Leu Ala Gly Pro Ser Val Phe Leu Phe Pro Pro
115 120 125
Lys Pro Lys Asp Thr Leu Met Ile Ser Arg Thr Pro Glu Val Thr Cys
130 135 140
Val Val Val Asp Val Glu Phe Glu Asp Pro Glu Val Lys Phe Asn Trp
145 150 155 160
Tyr Val Asp Gly Val Glu Val His Asn Ala Lys Thr Lys Pro Arg Glu
165 170 175
Glu Gln Tyr Asn Ser Thr Tyr Arg Val Val Ser Val Leu Thr Val Leu
180 185 190
His Gln Asp Trp Leu Asn Gly Lys Glu Tyr Lys Cys Lys Val Thr Asn
195 200 205
Lys Ala Leu Pro Ala Pro Glu Glu Lys Thr Ile Ser Lys Ala Lys Gly
210 215 220
Gln Pro Arg Glu Pro Gln Val Tyr Thr Leu Pro Pro Ser Arg Glu Glu
225 230 235 240
Met Thr Lys Asn Gln Val Ser Leu Thr Cys Leu Val Lys Gly Phe Tyr
245 250 255
Pro Ser Asp Ile Ala Val Glu Trp Glu Ser Asn Gly Gln Pro Glu Asn
260 265 270
Asn Tyr Lys Thr Thr Pro Pro Val Leu Asp Ser Asp Gly Ser Phe Phe
275 280 285
Leu Tyr Ser Lys Leu Thr Val Asp Lys Ser Arg Trp Gln Gln Gly Asn
290 295 300
Val Phe Ser Cys Ser Val Met His Glu Ala Leu His Asn His Tyr Thr
305 310 315 320
Gln Lys Ser Leu Ser Leu Ser Pro
325
<210> 50
<211> 328
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> CH
<400> 50
Ala Ser Thr Lys Gly Pro Ser Val Phe Pro Leu Ala Pro Ser Ser Lys
1 5 10 15
Ser Thr Ser Gly Gly Thr Ala Ala Leu Gly Cys Leu Val Lys Asp Tyr
20 25 30
Phe Pro Glu Pro Val Thr Val Ser Trp Asn Ser Gly Ala Leu Thr Ser
35 40 45
Gly Val His Thr Phe Pro Ala Val Leu Gln Ser Ser Gly Leu Tyr Ser
50 55 60
Leu Ser Ser Val Val Thr Val Pro Ser Ser Ser Leu Gly Thr Gln Thr
65 70 75 80
Tyr Ile Cys Asn Val Asn His Lys Pro Ser Asn Thr Lys Val Asp Lys
85 90 95
Arg Val Glu Pro Lys Ser Cys Asp Lys Thr His Thr Cys Pro Pro Cys
100 105 110
Pro Ala Pro Glu Leu Leu Gly Gly Pro Ser Val Phe Leu Phe Pro Pro
115 120 125
Lys Pro Lys Asp Thr Leu Met Ile Ser Arg Thr Pro Glu Val Thr Cys
130 135 140
Val Val Val Asp Val Glu Phe Glu Asp Pro Glu Val Lys Phe Asn Trp
145 150 155 160
Tyr Val Asp Gly Val Glu Val His Asn Ala Lys Thr Lys Pro Arg Glu
165 170 175
Glu Gln Tyr Asn Ser Thr Tyr Arg Val Val Ser Val Leu Thr Val Leu
180 185 190
His Gln Asp Trp Leu Asn Gly Lys Glu Tyr Lys Cys Lys Val Thr Asn
195 200 205
Lys Ala Leu Pro Ala Pro Ile Glu Lys Thr Ile Ser Lys Ala Lys Gly
210 215 220
Gln Pro Arg Glu Pro Gln Val Tyr Thr Leu Pro Pro Ser Arg Glu Glu
225 230 235 240
Met Thr Lys Asn Gln Val Ser Leu Thr Cys Leu Val Lys Gly Phe Tyr
245 250 255
Pro Ser Asp Ile Ala Val Glu Trp Glu Ser Asn Gly Gln Pro Glu Asn
260 265 270
Asn Tyr Lys Thr Thr Pro Pro Val Leu Asp Ser Asp Gly Ser Phe Phe
275 280 285
Leu Tyr Ser Lys Leu Thr Val Asp Lys Ser Arg Trp Gln Gln Gly Asn
290 295 300
Val Phe Ser Cys Ser Val Met His Glu Ala Leu His Asn His Tyr Thr
305 310 315 320
Gln Lys Ser Leu Ser Leu Ser Pro
325
<210> 51
<211> 328
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> CH
<400> 51
Ala Ser Thr Lys Gly Pro Ser Val Phe Pro Leu Ala Pro Ser Ser Lys
1 5 10 15
Ser Thr Ser Gly Gly Thr Ala Ala Leu Gly Cys Leu Val Lys Asp Tyr
20 25 30
Phe Pro Glu Pro Val Thr Val Ser Trp Asn Ser Gly Ala Leu Thr Ser
35 40 45
Gly Val His Thr Phe Pro Ala Val Leu Gln Ser Ser Gly Leu Tyr Ser
50 55 60
Leu Ser Ser Val Val Thr Val Pro Ser Ser Ser Leu Gly Thr Gln Thr
65 70 75 80
Tyr Ile Cys Asn Val Asn His Lys Pro Ser Asn Thr Lys Val Asp Lys
85 90 95
Arg Val Glu Pro Lys Ser Cys Asp Lys Thr His Thr Cys Pro Pro Cys
100 105 110
Pro Ala Pro Glu Ala Ala Gly Gly Pro Ser Val Phe Leu Phe Pro Pro
115 120 125
Lys Pro Lys Asp Thr Leu Met Ile Ser Arg Thr Pro Glu Val Thr Cys
130 135 140
Val Val Val Asp Val Ser His Glu Asp Pro Glu Val Lys Phe Asn Trp
145 150 155 160
Tyr Val Asp Gly Val Glu Val His Asn Ala Lys Thr Lys Pro Arg Glu
165 170 175
Glu Gln Tyr Asn Ser Thr Tyr Arg Val Val Ser Val Leu Thr Val Leu
180 185 190
His Gln Asp Trp Leu Asn Gly Lys Glu Tyr Lys Cys Lys Val Ser Asn
195 200 205
Trp Ala Leu Pro Ala Pro Ile Ser Lys Thr Ile Ser Lys Ala Lys Gly
210 215 220
Gln Pro Arg Glu Pro Gln Val Tyr Thr Leu Pro Pro Ser Arg Glu Glu
225 230 235 240
Met Thr Lys Asn Gln Val Ser Leu Thr Cys Leu Val Lys Gly Phe Tyr
245 250 255
Pro Ser Asp Ile Ala Val Glu Trp Glu Ser Asn Gly Gln Pro Glu Asn
260 265 270
Asn Tyr Lys Thr Thr Pro Pro Val Leu Asp Ser Asp Gly Ser Phe Phe
275 280 285
Leu Tyr Ser Lys Leu Thr Val Asp Lys Ser Arg Trp Gln Gln Gly Asn
290 295 300
Val Phe Ser Cys Ser Val Met His Glu Ala Leu His Asn His Tyr Thr
305 310 315 320
Gln Lys Ser Leu Ser Leu Ser Pro
325
<210> 52
<211> 328
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> CH
<400> 52
Ala Ser Thr Lys Gly Pro Ser Val Phe Pro Leu Ala Pro Ser Ser Lys
1 5 10 15
Ser Thr Ser Gly Gly Thr Ala Ala Leu Gly Cys Leu Val Lys Asp Tyr
20 25 30
Phe Pro Glu Pro Val Thr Val Ser Trp Asn Ser Gly Ala Leu Thr Ser
35 40 45
Gly Val His Thr Phe Pro Ala Val Leu Gln Ser Ser Gly Leu Tyr Ser
50 55 60
Leu Ser Ser Val Val Thr Val Pro Ser Ser Ser Leu Gly Thr Gln Thr
65 70 75 80
Tyr Ile Cys Asn Val Asn His Lys Pro Ser Asn Thr Lys Val Asp Lys
85 90 95
Arg Val Glu Pro Lys Ser Cys Asp Lys Thr His Thr Cys Pro Pro Cys
100 105 110
Pro Ala Pro Glu Ala Ala Ala Gly Pro Ser Val Phe Leu Phe Pro Pro
115 120 125
Lys Pro Lys Asp Thr Leu Met Ile Ser Arg Thr Pro Glu Val Thr Cys
130 135 140
Val Val Val Asp Val Glu Phe Glu Asp Pro Glu Val Lys Phe Asn Trp
145 150 155 160
Tyr Val Asp Gly Val Glu Val His Asn Ala Lys Thr Lys Pro Arg Glu
165 170 175
Glu Gln Tyr Asn Ser Thr Tyr Arg Val Val Ser Val Leu Thr Val Leu
180 185 190
His Gln Asp Trp Leu Asn Gly Lys Glu Tyr Lys Cys Lys Val Thr Asn
195 200 205
Lys Ala Leu Pro Ala Pro Glu Glu Lys Thr Ile Ser Lys Ala Lys Gly
210 215 220
Gln Pro Arg Glu Pro Gln Val Tyr Thr Leu Pro Pro Ser Arg Glu Glu
225 230 235 240
Met Thr Lys Asn Gln Val Ser Leu Thr Cys Leu Val Lys Gly Phe Tyr
245 250 255
Pro Ser Asp Ile Ala Val Glu Trp Glu Ser Asn Gly Gln Pro Glu Asn
260 265 270
Asn Tyr Lys Thr Thr Pro Pro Val Leu Asp Ser Asp Gly Ser Phe Phe
275 280 285
Leu Tyr Ser Lys Leu Thr Val Asp Lys Ser Arg Trp Gln Gln Gly Asn
290 295 300
Val Phe Ser Cys Ser Val Met His Glu Ala Leu His Asn His Tyr Thr
305 310 315 320
Gln Lys Ser Leu Ser Leu Ser Pro
325
<210> 53
<211> 328
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> CH
<400> 53
Ala Ser Thr Lys Gly Pro Ser Val Phe Pro Leu Ala Pro Ser Ser Lys
1 5 10 15
Ser Thr Ser Gly Gly Thr Ala Ala Leu Gly Cys Leu Val Lys Asp Tyr
20 25 30
Phe Pro Glu Pro Val Thr Val Ser Trp Asn Ser Gly Ala Leu Thr Ser
35 40 45
Gly Val His Thr Phe Pro Ala Val Leu Gln Ser Ser Gly Leu Tyr Ser
50 55 60
Leu Ser Ser Val Val Thr Val Pro Ser Ser Ser Leu Gly Thr Gln Thr
65 70 75 80
Tyr Ile Cys Asn Val Asn His Lys Pro Ser Asn Thr Lys Val Asp Lys
85 90 95
Arg Val Glu Pro Lys Ser Cys Asp Lys Thr His Thr Cys Pro Pro Cys
100 105 110
Pro Ala Pro Glu Ala Ala Gly Gly Pro Ser Val Phe Leu Phe Pro Pro
115 120 125
Lys Pro Lys Asp Thr Leu Met Ile Ser Arg Thr Pro Glu Val Thr Cys
130 135 140
Val Val Val Asp Val Glu Phe Glu Asp Pro Glu Val Lys Phe Asn Trp
145 150 155 160
Tyr Val Asp Gly Val Glu Val His Asn Ala Lys Thr Lys Pro Arg Glu
165 170 175
Glu Gln Tyr Asn Ser Thr Tyr Arg Val Val Ser Val Leu Thr Val Leu
180 185 190
His Gln Asp Trp Leu Asn Gly Lys Glu Tyr Lys Cys Lys Val Thr Asn
195 200 205
Lys Ala Leu Pro Ala Pro Ile Glu Lys Thr Ile Ser Lys Ala Lys Gly
210 215 220
Gln Pro Arg Glu Pro Gln Val Tyr Thr Leu Pro Pro Ser Arg Glu Glu
225 230 235 240
Met Thr Lys Asn Gln Val Ser Leu Thr Cys Leu Val Lys Gly Phe Tyr
245 250 255
Pro Ser Asp Ile Ala Val Glu Trp Glu Ser Asn Gly Gln Pro Glu Asn
260 265 270
Asn Tyr Lys Thr Thr Pro Pro Val Leu Asp Ser Asp Gly Ser Phe Phe
275 280 285
Leu Tyr Ser Lys Leu Thr Val Asp Lys Ser Arg Trp Gln Gln Gly Asn
290 295 300
Val Phe Ser Cys Ser Val Met His Glu Ala Leu His Asn His Tyr Thr
305 310 315 320
Gln Lys Ser Leu Ser Leu Ser Pro
325
<210> 54
<211> 328
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> CH
<400> 54
Ala Ser Thr Lys Gly Pro Ser Val Phe Pro Leu Ala Pro Ser Ser Lys
1 5 10 15
Ser Thr Ser Gly Gly Thr Ala Ala Leu Gly Cys Leu Val Lys Asp Tyr
20 25 30
Phe Pro Glu Pro Val Thr Val Ser Trp Asn Ser Gly Ala Leu Thr Ser
35 40 45
Gly Val His Thr Phe Pro Ala Val Leu Gln Ser Ser Gly Leu Tyr Ser
50 55 60
Leu Ser Ser Val Val Thr Val Pro Ser Ser Ser Leu Gly Thr Gln Thr
65 70 75 80
Tyr Ile Cys Asn Val Asn His Lys Pro Ser Asn Thr Lys Val Asp Lys
85 90 95
Arg Val Glu Pro Lys Ser Cys Asp Lys Thr His Thr Cys Pro Pro Cys
100 105 110
Pro Ala Pro Glu Ala Ala Gly Gly Pro Ser Val Phe Leu Phe Pro Pro
115 120 125
Lys Pro Lys Asp Thr Leu Met Ile Ser Arg Thr Pro Glu Val Thr Cys
130 135 140
Val Val Val Asp Val Ser His Glu Asp Pro Glu Val Lys Phe Asn Trp
145 150 155 160
Tyr Val Asp Gly Val Glu Val His Asn Ala Lys Thr Lys Pro Arg Glu
165 170 175
Glu Gln Tyr Asn Ser Thr Tyr Arg Val Val Ser Val Leu Thr Val Leu
180 185 190
His Gln Asp Trp Leu Asn Gly Lys Glu Tyr Lys Cys Lys Val Ser Asn
195 200 205
Ala Ala Leu Pro Ala Pro Ile Ser Lys Thr Ile Ser Lys Ala Lys Gly
210 215 220
Gln Pro Arg Glu Pro Gln Val Tyr Thr Leu Pro Pro Ser Arg Glu Glu
225 230 235 240
Met Thr Lys Asn Gln Val Ser Leu Thr Cys Leu Val Lys Gly Phe Tyr
245 250 255
Pro Ser Asp Ile Ala Val Glu Trp Glu Ser Asn Gly Gln Pro Glu Asn
260 265 270
Asn Tyr Lys Thr Thr Pro Pro Val Leu Asp Ser Asp Gly Ser Phe Phe
275 280 285
Leu Tyr Ser Lys Leu Thr Val Asp Lys Ser Arg Trp Gln Gln Gly Asn
290 295 300
Val Phe Ser Cys Ser Val Met His Glu Ala Leu His Asn His Tyr Thr
305 310 315 320
Gln Lys Ser Leu Ser Leu Ser Pro
325
<210> 55
<211> 328
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> CH
<400> 55
Ala Ser Thr Lys Gly Pro Ser Val Phe Pro Leu Ala Pro Ser Ser Lys
1 5 10 15
Ser Thr Ser Gly Gly Thr Ala Ala Leu Gly Cys Leu Val Lys Asp Tyr
20 25 30
Phe Pro Glu Pro Val Thr Val Ser Trp Asn Ser Gly Ala Leu Thr Ser
35 40 45
Gly Val His Thr Phe Pro Ala Val Leu Gln Ser Ser Gly Leu Tyr Ser
50 55 60
Leu Ser Ser Val Val Thr Val Pro Ser Ser Ser Leu Gly Thr Gln Thr
65 70 75 80
Tyr Ile Cys Asn Val Asn His Lys Pro Ser Asn Thr Lys Val Asp Lys
85 90 95
Arg Val Glu Pro Lys Ser Cys Asp Lys Thr His Thr Cys Pro Pro Cys
100 105 110
Pro Ala Pro Glu Ala Ala Gly Gly Pro Ser Val Phe Leu Phe Pro Pro
115 120 125
Lys Pro Lys Asp Thr Leu Met Ile Ser Arg Thr Pro Glu Val Thr Cys
130 135 140
Val Val Val Asp Val Ser His Glu Asp Pro Glu Val Lys Phe Asn Trp
145 150 155 160
Tyr Val Asp Gly Val Glu Val His Asn Ala Lys Thr Lys Pro Arg Glu
165 170 175
Glu Gln Tyr Asn Ser Thr Tyr Arg Val Val Ser Val Leu Thr Val Leu
180 185 190
His Gln Asp Trp Leu Asn Gly Lys Glu Tyr Lys Cys Lys Val Ser Asn
195 200 205
Asp Ala Leu Pro Ala Pro Ile Ser Lys Thr Ile Ser Lys Ala Lys Gly
210 215 220
Gln Pro Arg Glu Pro Gln Val Tyr Thr Leu Pro Pro Ser Arg Glu Glu
225 230 235 240
Met Thr Lys Asn Gln Val Ser Leu Thr Cys Leu Val Lys Gly Phe Tyr
245 250 255
Pro Ser Asp Ile Ala Val Glu Trp Glu Ser Asn Gly Gln Pro Glu Asn
260 265 270
Asn Tyr Lys Thr Thr Pro Pro Val Leu Asp Ser Asp Gly Ser Phe Phe
275 280 285
Leu Tyr Ser Lys Leu Thr Val Asp Lys Ser Arg Trp Gln Gln Gly Asn
290 295 300
Val Phe Ser Cys Ser Val Met His Glu Ala Leu His Asn His Tyr Thr
305 310 315 320
Gln Lys Ser Leu Ser Leu Ser Pro
325
<210> 56
<211> 328
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> CH
<400> 56
Ala Ser Thr Lys Gly Pro Ser Val Phe Pro Leu Ala Pro Ser Ser Lys
1 5 10 15
Ser Thr Ser Gly Gly Thr Ala Ala Leu Gly Cys Leu Val Lys Asp Tyr
20 25 30
Phe Pro Glu Pro Val Thr Val Ser Trp Asn Ser Gly Ala Leu Thr Ser
35 40 45
Gly Val His Thr Phe Pro Ala Val Leu Gln Ser Ser Gly Leu Tyr Ser
50 55 60
Leu Ser Ser Val Val Thr Val Pro Ser Ser Ser Leu Gly Thr Gln Thr
65 70 75 80
Tyr Ile Cys Asn Val Asn His Lys Pro Ser Asn Thr Lys Val Asp Lys
85 90 95
Arg Val Glu Pro Lys Ser Cys Asp Lys Thr His Thr Cys Pro Pro Cys
100 105 110
Pro Ala Pro Glu Ala Ala Gly Gly Pro Ser Val Phe Leu Phe Pro Pro
115 120 125
Lys Pro Lys Asp Thr Leu Met Ile Ser Arg Thr Pro Glu Val Thr Cys
130 135 140
Val Val Val Asp Val Ser His Glu Asp Pro Glu Val Lys Phe Asn Trp
145 150 155 160
Tyr Val Asp Gly Val Glu Val His Asn Ala Lys Thr Lys Pro Arg Glu
165 170 175
Glu Gln Tyr Asn Ser Thr Tyr Arg Val Val Ser Val Leu Thr Val Leu
180 185 190
His Gln Asp Trp Leu Asn Gly Lys Glu Tyr Lys Cys Lys Val Ser Asn
195 200 205
Glu Ala Leu Pro Ala Pro Ile Ser Lys Thr Ile Ser Lys Ala Lys Gly
210 215 220
Gln Pro Arg Glu Pro Gln Val Tyr Thr Leu Pro Pro Ser Arg Glu Glu
225 230 235 240
Met Thr Lys Asn Gln Val Ser Leu Thr Cys Leu Val Lys Gly Phe Tyr
245 250 255
Pro Ser Asp Ile Ala Val Glu Trp Glu Ser Asn Gly Gln Pro Glu Asn
260 265 270
Asn Tyr Lys Thr Thr Pro Pro Val Leu Asp Ser Asp Gly Ser Phe Phe
275 280 285
Leu Tyr Ser Lys Leu Thr Val Asp Lys Ser Arg Trp Gln Gln Gly Asn
290 295 300
Val Phe Ser Cys Ser Val Met His Glu Ala Leu His Asn His Tyr Thr
305 310 315 320
Gln Lys Ser Leu Ser Leu Ser Pro
325
<210> 57
<211> 328
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> CH
<400> 57
Ala Ser Thr Lys Gly Pro Ser Val Phe Pro Leu Ala Pro Ser Ser Lys
1 5 10 15
Ser Thr Ser Gly Gly Thr Ala Ala Leu Gly Cys Leu Val Lys Asp Tyr
20 25 30
Phe Pro Glu Pro Val Thr Val Ser Trp Asn Ser Gly Ala Leu Thr Ser
35 40 45
Gly Val His Thr Phe Pro Ala Val Leu Gln Ser Ser Gly Leu Tyr Ser
50 55 60
Leu Ser Ser Val Val Thr Val Pro Ser Ser Ser Leu Gly Thr Gln Thr
65 70 75 80
Tyr Ile Cys Asn Val Asn His Lys Pro Ser Asn Thr Lys Val Asp Lys
85 90 95
Arg Val Glu Pro Lys Ser Cys Asp Lys Thr His Thr Cys Pro Pro Cys
100 105 110
Pro Ala Pro Glu Ala Ala Gly Gly Pro Ser Val Phe Leu Phe Pro Pro
115 120 125
Lys Pro Lys Asp Thr Leu Met Ile Ser Arg Thr Pro Glu Val Thr Cys
130 135 140
Val Val Val Asp Val Ser His Glu Asp Pro Glu Val Lys Phe Asn Trp
145 150 155 160
Tyr Val Asp Gly Val Glu Val His Asn Ala Lys Thr Lys Pro Arg Glu
165 170 175
Glu Gln Tyr Asn Ser Thr Tyr Arg Val Val Ser Val Leu Thr Val Leu
180 185 190
His Gln Asp Trp Leu Asn Gly Lys Glu Tyr Lys Cys Lys Val Ser Asn
195 200 205
Met Ala Leu Pro Ala Pro Ile Ser Lys Thr Ile Ser Lys Ala Lys Gly
210 215 220
Gln Pro Arg Glu Pro Gln Val Tyr Thr Leu Pro Pro Ser Arg Glu Glu
225 230 235 240
Met Thr Lys Asn Gln Val Ser Leu Thr Cys Leu Val Lys Gly Phe Tyr
245 250 255
Pro Ser Asp Ile Ala Val Glu Trp Glu Ser Asn Gly Gln Pro Glu Asn
260 265 270
Asn Tyr Lys Thr Thr Pro Pro Val Leu Asp Ser Asp Gly Ser Phe Phe
275 280 285
Leu Tyr Ser Lys Leu Thr Val Asp Lys Ser Arg Trp Gln Gln Gly Asn
290 295 300
Val Phe Ser Cys Ser Val Met His Glu Ala Leu His Asn His Tyr Thr
305 310 315 320
Gln Lys Ser Leu Ser Leu Ser Pro
325
<210> 58
<211> 328
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> CH
<400> 58
Ala Ser Thr Lys Gly Pro Ser Val Phe Pro Leu Ala Pro Ser Ser Lys
1 5 10 15
Ser Thr Ser Gly Gly Thr Ala Ala Leu Gly Cys Leu Val Lys Asp Tyr
20 25 30
Phe Pro Glu Pro Val Thr Val Ser Trp Asn Ser Gly Ala Leu Thr Ser
35 40 45
Gly Val His Thr Phe Pro Ala Val Leu Gln Ser Ser Gly Leu Tyr Ser
50 55 60
Leu Ser Ser Val Val Thr Val Pro Ser Ser Ser Leu Gly Thr Gln Thr
65 70 75 80
Tyr Ile Cys Asn Val Asn His Lys Pro Ser Asn Thr Lys Val Asp Lys
85 90 95
Arg Val Glu Pro Lys Ser Cys Asp Lys Thr His Thr Cys Pro Pro Cys
100 105 110
Pro Ala Pro Glu Ala Ala Gly Gly Pro Ser Val Phe Leu Phe Pro Pro
115 120 125
Lys Pro Lys Asp Thr Leu Met Ile Ser Arg Thr Pro Glu Val Thr Cys
130 135 140
Val Val Val Asp Val Ser His Glu Asp Pro Glu Val Lys Phe Asn Trp
145 150 155 160
Tyr Val Asp Gly Val Glu Val His Asn Ala Lys Thr Lys Pro Arg Glu
165 170 175
Glu Gln Tyr Asn Ser Thr Tyr Arg Val Val Ser Val Leu Thr Val Leu
180 185 190
His Gln Asp Trp Leu Asn Gly Lys Glu Tyr Lys Cys Lys Val Ser Asn
195 200 205
Ala Ala Leu Pro Ala Pro Ile Ser Lys Thr Ile Ser Lys Ala Lys Gly
210 215 220
Gln Pro Arg Glu Pro Gln Val Tyr Thr Leu Pro Pro Ser Arg Glu Glu
225 230 235 240
Met Thr Lys Asn Gln Val Ser Leu Thr Cys Leu Val Lys Gly Phe Tyr
245 250 255
Pro Ser Asp Ile Ala Val Glu Trp Glu Ser Asn Gly Gln Pro Glu Asn
260 265 270
Asn Tyr Lys Thr Thr Pro Pro Val Leu Asp Ser Asp Gly Ser Phe Phe
275 280 285
Leu Tyr Ser Lys Leu Thr Val Asp Lys Ser Arg Trp Gln Gln Gly Asn
290 295 300
Val Phe Ser Cys Ser Val Leu His Glu Ala Leu His Ala His Thr Thr
305 310 315 320
Arg Lys Glu Leu Ser Leu Ser Pro
325
<210> 59
<211> 328
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> CH
<400> 59
Ala Ser Thr Lys Gly Pro Ser Val Phe Pro Leu Ala Pro Ser Ser Lys
1 5 10 15
Ser Thr Ser Gly Gly Thr Ala Ala Leu Gly Cys Leu Val Lys Asp Tyr
20 25 30
Phe Pro Glu Pro Val Thr Val Ser Trp Asn Ser Gly Ala Leu Thr Ser
35 40 45
Gly Val His Thr Phe Pro Ala Val Leu Gln Ser Ser Gly Leu Tyr Ser
50 55 60
Leu Ser Ser Val Val Thr Val Pro Ser Ser Ser Leu Gly Thr Gln Thr
65 70 75 80
Tyr Ile Cys Asn Val Asn His Lys Pro Ser Asn Thr Lys Val Asp Lys
85 90 95
Arg Val Glu Pro Lys Ser Cys Asp Lys Thr His Thr Cys Pro Pro Cys
100 105 110
Pro Ala Pro Glu Ala Ala Gly Gly Pro Ser Val Phe Leu Phe Pro Pro
115 120 125
Lys Pro Lys Asp Thr Leu Met Ile Ser Arg Thr Pro Glu Val Thr Cys
130 135 140
Val Val Val Asp Val Ser His Glu Asp Pro Glu Val Lys Phe Asn Trp
145 150 155 160
Tyr Val Asp Gly Val Glu Val His Asn Ala Lys Thr Lys Pro Arg Glu
165 170 175
Glu Gln Tyr Asn Ser Thr Tyr Arg Val Val Ser Val Leu Thr Val Leu
180 185 190
His Gln Asp Trp Leu Asn Gly Lys Glu Tyr Lys Cys Lys Val Ser Asn
195 200 205
Ala Ala Leu Pro Ala Pro Ile Ser Lys Thr Ile Ser Lys Ala Lys Gly
210 215 220
Gln Pro Arg Glu Pro Gln Val Tyr Thr Leu Pro Pro Ser Arg Glu Glu
225 230 235 240
Met Thr Lys Asn Gln Val Ser Leu Thr Cys Leu Val Lys Gly Phe Tyr
245 250 255
Pro Ser Asp Ile Ala Val Glu Trp Glu Ser Asn Gly Gln Pro Glu Asn
260 265 270
Asn Tyr Lys Thr Thr Pro Pro Val Leu Asp Ser Asp Gly Ser Phe Phe
275 280 285
Leu Tyr Ser Lys Leu Thr Val Asp Lys Ser Arg Trp Gln Gln Gly Asn
290 295 300
Val Phe Ser Cys Ser Val Leu His Glu Ala Leu His Ala His Tyr Thr
305 310 315 320
Arg Lys Glu Leu Ser Leu Ser Pro
325
<210> 60
<211> 107
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> CL
<400> 60
Arg Thr Val Ala Ala Pro Ser Val Phe Ile Phe Pro Pro Ser Asp Glu
1 5 10 15
Gln Leu Lys Ser Gly Thr Ala Ser Val Val Cys Leu Leu Asn Asn Phe
20 25 30
Tyr Pro Arg Glu Ala Lys Val Gln Trp Lys Val Asp Asn Ala Leu Gln
35 40 45
Ser Gly Asn Ser Gln Glu Ser Val Thr Glu Gln Asp Ser Lys Asp Ser
50 55 60
Thr Tyr Ser Leu Ser Ser Thr Leu Thr Leu Ser Lys Ala Asp Tyr Glu
65 70 75 80
Lys His Lys Val Tyr Ala Cys Glu Val Thr His Gln Gly Leu Ser Ser
85 90 95
Pro Val Thr Lys Ser Phe Asn Arg Gly Glu Cys
100 105
<210> 61
<211> 585
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> DENV
<400> 61
Met Lys Cys Leu Leu Tyr Leu Ala Phe Leu Phe Ile Gly Val Asn Cys
1 5 10 15
Phe His Leu Thr Thr Arg Gly Gly Glu Pro His Met Ile Val Ser Lys
20 25 30
Gln Glu Arg Gly Lys Ser Leu Leu Phe Lys Thr Ser Ala Gly Val Asn
35 40 45
Met Cys Thr Leu Ile Ala Met Asp Leu Gly Glu Leu Cys Glu Asp Thr
50 55 60
Met Thr Tyr Lys Cys Pro Arg Ile Thr Glu Ala Glu Pro Asp Asp Val
65 70 75 80
Asp Cys Trp Cys Asn Ala Thr Asp Thr Trp Val Thr Tyr Gly Thr Cys
85 90 95
Ser Gln Thr Gly Glu His Arg Arg Asp Lys Arg Ser Val Ala Leu Ala
100 105 110
Pro His Val Gly Leu Gly Leu Glu Thr Arg Thr Glu Thr Trp Met Ser
115 120 125
Ser Glu Gly Ala Trp Lys Gln Ile Gln Lys Val Glu Thr Trp Ala Leu
130 135 140
Arg His Pro Gly Phe Thr Val Ile Ala Leu Phe Leu Ala His Ala Ile
145 150 155 160
Gly Thr Ser Ile Thr Gln Lys Gly Ile Ile Phe Ile Leu Leu Met Leu
165 170 175
Val Thr Pro Ser Met Ala Met Arg Cys Val Gly Ile Gly Asn Arg Asp
180 185 190
Phe Val Glu Gly Leu Ser Gly Ala Thr Trp Val Asp Val Val Leu Glu
195 200 205
His Gly Ser Cys Val Thr Thr Met Ala Lys Asn Lys Pro Thr Leu Asp
210 215 220
Ile Glu Leu Leu Lys Thr Glu Val Thr Asn Pro Ala Val Leu Arg Lys
225 230 235 240
Leu Cys Ile Glu Ala Lys Ile Ser Asn Thr Thr Thr Asp Ser Arg Cys
245 250 255
Pro Thr Gln Gly Glu Ala Thr Leu Val Glu Glu Gln Asp Ala Asn Phe
260 265 270
Val Cys Arg Arg Thr Val Val Asp Arg Gly Trp Gly Asn Gly Cys Gly
275 280 285
Leu Phe Gly Lys Gly Ser Leu Leu Thr Cys Ala Lys Phe Lys Cys Val
290 295 300
Thr Lys Leu Glu Gly Lys Ile Val Gln Tyr Glu Asn Leu Lys Tyr Ser
305 310 315 320
Val Ile Val Thr Val His Thr Gly Asp Gln His Gln Val Gly Asn Glu
325 330 335
Thr Thr Glu His Gly Thr Ile Ala Thr Ile Thr Pro Gln Ala Pro Thr
340 345 350
Ser Glu Ile Gln Leu Thr Asp Tyr Gly Thr Leu Thr Leu Asp Cys Ser
355 360 365
Pro Arg Thr Gly Leu Asp Phe Asn Glu Met Val Leu Leu Thr Met Lys
370 375 380
Glu Lys Ser Trp Leu Val His Lys Gln Trp Phe Leu Asp Leu Pro Leu
385 390 395 400
Pro Trp Thr Ser Gly Ala Ser Thr Ser Gln Glu Thr Trp Asn Arg Gln
405 410 415
Asp Leu Leu Val Thr Phe Lys Thr Ala His Ala Lys Lys Gln Glu Val
420 425 430
Val Val Leu Gly Ser Gln Glu Gly Ala Met His Thr Ala Leu Thr Gly
435 440 445
Ala Thr Glu Ile Gln Thr Ser Gly Thr Thr Thr Ile Phe Ala Gly His
450 455 460
Leu Lys Cys Arg Leu Lys Met Asp Lys Leu Thr Leu Lys Gly Met Ser
465 470 475 480
Tyr Val Met Cys Thr Gly Ser Phe Lys Leu Glu Lys Glu Val Ala Glu
485 490 495
Thr Gln His Gly Thr Val Leu Val Gln Val Lys Tyr Glu Gly Thr Asp
500 505 510
Ala Pro Cys Lys Ile Pro Phe Ser Thr Gln Asp Glu Lys Gly Val Thr
515 520 525
Gln Asn Gly Arg Leu Ile Thr Ala Asn Pro Ile Val Thr Asp Lys Glu
530 535 540
Lys Pro Val Asn Ile Glu Thr Glu Pro Pro Phe Gly Glu Ser Tyr Ile
545 550 555 560
Ile Val Gly Ala Gly Glu Lys Ala Leu Lys Leu Ser Trp Phe Lys Lys
565 570 575
Gly His His His His His His His His
580 585
<210> 62
<211> 585
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> DENV
<400> 62
Met Lys Cys Leu Leu Tyr Leu Ala Phe Leu Phe Ile Gly Val Asn Cys
1 5 10 15
Phe His Leu Thr Thr Arg Asn Gly Glu Pro His Met Ile Val Ser Arg
20 25 30
Gln Glu Lys Gly Lys Ser Leu Leu Phe Lys Thr Glu Asp Gly Val Asn
35 40 45
Met Cys Thr Leu Met Ala Met Asp Leu Gly Glu Leu Cys Glu Asp Thr
50 55 60
Ile Thr Tyr Lys Cys Pro Phe Leu Arg Gln Asn Glu Pro Glu Asp Ile
65 70 75 80
Asp Cys Trp Cys Asn Ser Thr Ser Thr Trp Val Thr Tyr Gly Thr Cys
85 90 95
Thr Thr Thr Gly Glu His Arg Arg Glu Lys Arg Ser Val Ala Leu Val
100 105 110
Pro His Val Gly Met Gly Leu Glu Thr Arg Thr Glu Thr Trp Met Ser
115 120 125
Ser Glu Gly Ala Trp Lys His Ala Gln Arg Ile Glu Thr Trp Ile Leu
130 135 140
Arg His Pro Gly Phe Thr Ile Met Ala Ala Ile Leu Ala Tyr Thr Ile
145 150 155 160
Gly Thr Thr His Phe Gln Arg Ala Leu Ile Phe Ile Leu Leu Thr Ala
165 170 175
Val Ala Pro Ser Met Thr Met Arg Cys Ile Gly Ile Ser Asn Arg Asp
180 185 190
Phe Val Glu Gly Val Ser Gly Gly Ser Trp Val Asp Ile Val Leu Glu
195 200 205
His Gly Ser Cys Val Thr Thr Met Ala Lys Asn Lys Pro Thr Leu Asp
210 215 220
Phe Glu Leu Ile Lys Thr Glu Ala Lys Gln Pro Ala Thr Leu Arg Lys
225 230 235 240
Tyr Cys Ile Glu Ala Lys Leu Thr Asn Thr Thr Thr Asp Ser Arg Cys
245 250 255
Pro Thr Gln Gly Glu Pro Ser Leu Asn Glu Glu Gln Asp Lys Arg Phe
260 265 270
Val Cys Lys His Ser Met Val Asp Arg Gly Trp Gly Asn Gly Cys Gly
275 280 285
Leu Phe Gly Lys Gly Gly Ile Val Thr Cys Ala Met Phe Thr Cys Lys
290 295 300
Lys Asn Met Lys Gly Lys Val Val Gln Pro Glu Asn Leu Glu Tyr Thr
305 310 315 320
Ile Val Ile Thr Pro His Ser Gly Glu Glu His Ala Val Gly Asn Asp
325 330 335
Thr Gly Lys His Gly Lys Glu Ile Lys Ile Thr Pro Gln Ser Ser Ile
340 345 350
Thr Glu Ala Glu Leu Thr Gly Tyr Gly Thr Val Thr Met Glu Cys Ser
355 360 365
Pro Arg Thr Gly Leu Asp Phe Asn Glu Met Val Leu Leu Gln Met Glu
370 375 380
Asn Lys Ala Trp Leu Val His Arg Gln Trp Phe Leu Asp Leu Pro Leu
385 390 395 400
Pro Trp Leu Pro Gly Ala Asp Thr Gln Gly Ser Asn Trp Ile Gln Lys
405 410 415
Glu Thr Leu Val Thr Phe Lys Asn Pro His Ala Lys Lys Gln Asp Val
420 425 430
Val Val Leu Gly Ser Gln Glu Gly Ala Met His Thr Ala Leu Thr Gly
435 440 445
Ala Thr Glu Ile Gln Met Ser Ser Gly Asn Leu Leu Phe Thr Gly His
450 455 460
Leu Lys Cys Arg Leu Arg Met Asp Lys Leu Gln Leu Lys Gly Met Ser
465 470 475 480
Tyr Ser Met Cys Thr Gly Lys Phe Lys Val Val Lys Glu Ile Ala Glu
485 490 495
Thr Gln His Gly Thr Ile Val Ile Arg Val Gln Tyr Glu Gly Asp Gly
500 505 510
Ser Pro Cys Lys Ile Pro Phe Glu Ile Met Asp Leu Glu Lys Arg His
515 520 525
Val Leu Gly Arg Leu Ile Thr Val Asn Pro Ile Val Thr Glu Lys Asp
530 535 540
Ser Pro Val Asn Ile Glu Ala Glu Pro Pro Phe Gly Asp Ser Tyr Ile
545 550 555 560
Ile Ile Gly Val Glu Pro Gly Gln Leu Lys Leu Asn Trp Phe Lys Lys
565 570 575
Gly His His His His His His His His
580 585
<210> 63
<211> 583
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> DENV
<400> 63
Met Lys Cys Leu Leu Tyr Leu Ala Phe Leu Phe Ile Gly Val Asn Cys
1 5 10 15
Phe His Leu Thr Ser Arg Asp Gly Glu Pro Arg Met Ile Val Gly Lys
20 25 30
Asn Glu Arg Gly Lys Ser Leu Leu Phe Lys Thr Ala Ser Gly Ile Asn
35 40 45
Met Cys Thr Leu Ile Ala Met Asp Leu Gly Glu Met Cys Asp Asp Thr
50 55 60
Val Thr Tyr Lys Cys Pro His Ile Thr Glu Val Glu Pro Glu Asp Ile
65 70 75 80
Asp Cys Trp Cys Asn Leu Thr Ser Thr Trp Val Thr Tyr Gly Thr Cys
85 90 95
Asn Gln Ala Gly Glu His Arg Arg Asp Lys Arg Ser Val Ala Leu Ala
100 105 110
Pro His Val Gly Met Gly Leu Asp Thr Arg Thr Gln Thr Trp Met Ser
115 120 125
Ala Glu Gly Ala Trp Arg Gln Val Glu Lys Val Glu Thr Trp Ala Leu
130 135 140
Arg His Pro Gly Phe Thr Ile Leu Ala Leu Phe Leu Ala His Tyr Ile
145 150 155 160
Gly Thr Ser Leu Thr Gln Lys Val Val Ile Phe Ile Leu Leu Met Leu
165 170 175
Val Thr Pro Ser Met Thr Met Arg Cys Val Gly Val Gly Asn Arg Asp
180 185 190
Phe Val Glu Gly Leu Ser Gly Ala Thr Trp Val Asp Val Val Leu Glu
195 200 205
His Gly Gly Cys Val Thr Thr Met Ala Lys Asn Lys Pro Thr Leu Asp
210 215 220
Ile Glu Leu Gln Lys Thr Glu Ala Thr Gln Leu Ala Thr Leu Arg Lys
225 230 235 240
Leu Cys Ile Glu Gly Lys Ile Thr Asn Ile Thr Thr Asp Ser Arg Cys
245 250 255
Pro Thr Gln Gly Glu Ala Ile Leu Pro Glu Glu Gln Asp Gln Asn Tyr
260 265 270
Val Cys Lys His Thr Tyr Val Asp Arg Gly Trp Gly Asn Gly Cys Gly
275 280 285
Leu Phe Gly Lys Gly Ser Leu Val Thr Cys Ala Lys Phe Gln Cys Leu
290 295 300
Glu Ser Ile Glu Gly Lys Val Val Gln His Glu Asn Leu Lys Tyr Thr
305 310 315 320
Val Ile Ile Thr Val His Thr Gly Asp Gln His Gln Val Gly Asn Glu
325 330 335
Thr Gln Gly Val Thr Ala Glu Ile Thr Ser Gln Ala Ser Thr Ala Glu
340 345 350
Ala Ile Leu Pro Glu Tyr Gly Thr Leu Gly Leu Glu Cys Ser Pro Arg
355 360 365
Thr Gly Leu Asp Phe Asn Glu Met Ile Leu Leu Thr Met Lys Asn Lys
370 375 380
Ala Trp Met Val His Arg Gln Trp Phe Phe Asp Leu Pro Leu Pro Trp
385 390 395 400
Thr Ser Gly Ala Thr Thr Lys Thr Pro Thr Trp Asn Arg Lys Glu Leu
405 410 415
Leu Val Thr Phe Lys Asn Ala His Ala Lys Lys Gln Glu Val Val Val
420 425 430
Leu Gly Ser Gln Glu Gly Ala Met His Thr Ala Leu Thr Gly Ala Thr
435 440 445
Glu Ile Gln Thr Ser Gly Gly Thr Ser Ile Phe Ala Gly His Leu Lys
450 455 460
Cys Arg Leu Lys Met Asp Lys Leu Lys Leu Lys Gly Met Ser Tyr Ala
465 470 475 480
Met Cys Leu Asn Thr Phe Val Leu Lys Lys Glu Val Ser Glu Thr Gln
485 490 495
His Gly Thr Ile Leu Ile Lys Val Glu Tyr Lys Gly Glu Asp Ala Pro
500 505 510
Cys Lys Ile Pro Phe Ser Thr Glu Asp Gly Gln Gly Lys Ala His Asn
515 520 525
Gly Arg Leu Ile Thr Ala Asn Pro Val Val Thr Lys Lys Glu Glu Pro
530 535 540
Val Asn Ile Glu Ala Glu Pro Pro Phe Gly Glu Ser Asn Ile Val Ile
545 550 555 560
Gly Ile Gly Asp Lys Ala Leu Lys Ile Asn Trp Tyr Arg Lys Gly His
565 570 575
His His His His His His His
580
<210> 64
<211> 585
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> DENV
<400> 64
Met Lys Cys Leu Leu Tyr Leu Ala Phe Leu Phe Ile Gly Val Asn Cys
1 5 10 15
Phe Ser Leu Ser Thr Arg Asp Gly Glu Pro Leu Met Ile Val Ala Lys
20 25 30
His Glu Arg Gly Arg Pro Leu Leu Phe Lys Thr Thr Glu Gly Ile Asn
35 40 45
Lys Cys Thr Leu Ile Ala Met Asp Leu Gly Glu Met Cys Glu Asp Thr
50 55 60
Val Thr Tyr Lys Cys Pro Leu Leu Val Asn Thr Glu Pro Glu Asp Ile
65 70 75 80
Asp Cys Trp Cys Asn Leu Thr Ser Thr Trp Val Met Tyr Gly Thr Cys
85 90 95
Thr Gln Ser Gly Glu Arg Arg Arg Glu Lys Arg Ser Val Ala Leu Thr
100 105 110
Pro His Ser Gly Met Gly Leu Glu Thr Arg Ala Glu Thr Trp Met Ser
115 120 125
Ser Glu Gly Ala Trp Lys His Ala Gln Arg Val Glu Ser Trp Ile Leu
130 135 140
Arg Asn Pro Gly Phe Ala Leu Leu Ala Gly Phe Met Ala Tyr Met Ile
145 150 155 160
Gly Gln Thr Gly Ile Gln Arg Thr Val Phe Phe Val Leu Met Met Leu
165 170 175
Val Ala Pro Ser Tyr Gly Met Arg Cys Val Gly Val Gly Asn Arg Asp
180 185 190
Phe Val Glu Gly Val Ser Gly Gly Ala Trp Val Asp Leu Val Leu Glu
195 200 205
His Gly Gly Cys Val Thr Thr Met Ala Gln Gly Lys Pro Thr Leu Asp
210 215 220
Phe Glu Leu Thr Lys Thr Thr Ala Lys Glu Val Ala Leu Leu Arg Thr
225 230 235 240
Tyr Cys Ile Glu Ala Ser Ile Ser Asn Ile Thr Thr Ala Thr Arg Cys
245 250 255
Pro Thr Gln Gly Glu Pro Tyr Leu Lys Glu Glu Gln Asp Gln Gln Tyr
260 265 270
Ile Cys Arg Arg Asp Val Val Asp Arg Gly Trp Gly Asn Gly Cys Gly
275 280 285
Leu Phe Gly Lys Gly Gly Val Val Thr Cys Ala Lys Phe Ser Cys Ser
290 295 300
Gly Lys Ile Thr Gly Asn Leu Val Gln Ile Glu Asn Leu Glu Tyr Thr
305 310 315 320
Val Val Val Thr Val His Asn Gly Asp Thr His Ala Val Gly Asn Asp
325 330 335
Thr Ser Asn His Gly Val Thr Ala Met Ile Thr Pro Arg Ser Pro Ser
340 345 350
Val Glu Val Lys Leu Pro Asp Tyr Gly Glu Leu Thr Leu Asp Cys Glu
355 360 365
Pro Arg Ser Gly Ile Asp Phe Asn Glu Met Ile Leu Met Lys Met Lys
370 375 380
Lys Lys Thr Trp Leu Val His Lys Gln Trp Phe Leu Asp Leu Pro Leu
385 390 395 400
Pro Trp Thr Ala Gly Ala Asp Thr Ser Glu Val His Trp Asn Tyr Lys
405 410 415
Glu Arg Met Val Thr Phe Lys Val Pro His Ala Lys Arg Gln Asp Val
420 425 430
Thr Val Leu Gly Ser Gln Glu Gly Ala Met His Ser Ala Leu Ala Gly
435 440 445
Ala Thr Glu Val Asp Ser Gly Asp Gly Asn His Met Phe Ala Gly His
450 455 460
Leu Lys Cys Lys Val Arg Met Glu Lys Leu Arg Ile Lys Gly Met Ser
465 470 475 480
Tyr Thr Met Cys Ser Gly Lys Phe Ser Ile Asp Lys Glu Met Ala Glu
485 490 495
Thr Gln His Gly Thr Thr Val Val Lys Val Lys Tyr Glu Gly Ala Gly
500 505 510
Ala Pro Cys Lys Val Pro Ile Glu Ile Arg Asp Val Asn Lys Glu Lys
515 520 525
Val Val Gly Arg Ile Ile Ser Ser Thr Pro Leu Ala Glu Asn Thr Asn
530 535 540
Ser Val Thr Asn Ile Glu Leu Glu Pro Pro Phe Gly Asp Ser Tyr Ile
545 550 555 560
Val Ile Gly Val Gly Asn Ser Ala Leu Thr Leu His Trp Phe Arg Lys
565 570 575
Gly His His His His His His His His
580 585
<210> 65
<211> 403
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> DENV
<400> 65
Met Arg Cys Val Gly Ile Gly Asn Arg Asp Phe Val Glu Gly Leu Ser
1 5 10 15
Gly Ala Thr Trp Val Asp Val Val Leu Glu His Gly Ser Cys Val Thr
20 25 30
Thr Met Ala Lys Asn Lys Pro Thr Leu Asp Ile Glu Leu Leu Lys Thr
35 40 45
Glu Val Thr Asn Pro Ala Val Leu Arg Lys Leu Cys Ile Glu Ala Lys
50 55 60
Ile Ser Asn Thr Thr Thr Asp Ser Arg Cys Pro Thr Gln Gly Glu Ala
65 70 75 80
Thr Leu Val Glu Glu Gln Asp Ala Asn Phe Val Cys Arg Arg Thr Val
85 90 95
Val Asp Arg Gly Trp Gly Asn Gly Cys Gly Leu Phe Gly Lys Gly Ser
100 105 110
Leu Leu Thr Cys Ala Lys Phe Lys Cys Val Thr Lys Leu Glu Gly Lys
115 120 125
Ile Val Gln Tyr Glu Asn Leu Lys Tyr Ser Val Ile Val Thr Val His
130 135 140
Thr Gly Asp Gln His Gln Val Gly Asn Glu Thr Thr Glu His Gly Thr
145 150 155 160
Ile Ala Thr Ile Thr Pro Gln Ala Pro Thr Ser Glu Ile Gln Leu Thr
165 170 175
Asp Tyr Gly Thr Leu Thr Leu Asp Cys Ser Pro Arg Thr Gly Leu Asp
180 185 190
Phe Asn Glu Met Val Leu Leu Thr Met Lys Glu Lys Ser Trp Leu Val
195 200 205
His Lys Gln Trp Phe Leu Asp Leu Pro Leu Pro Trp Thr Ser Gly Ala
210 215 220
Ser Thr Ser Gln Glu Thr Trp Asn Arg Gln Asp Leu Leu Val Thr Phe
225 230 235 240
Lys Thr Ala His Ala Lys Lys Gln Glu Val Val Val Leu Gly Ser Gln
245 250 255
Glu Gly Ala Met His Thr Ala Leu Thr Gly Ala Thr Glu Ile Gln Thr
260 265 270
Ser Gly Thr Thr Thr Ile Phe Ala Gly His Leu Lys Cys Arg Leu Lys
275 280 285
Met Asp Lys Leu Thr Leu Lys Gly Met Ser Tyr Val Met Cys Thr Gly
290 295 300
Ser Phe Lys Leu Glu Lys Glu Val Ala Glu Thr Gln His Gly Thr Val
305 310 315 320
Leu Val Gln Val Lys Tyr Glu Gly Thr Asp Ala Pro Cys Lys Ile Pro
325 330 335
Phe Ser Thr Gln Asp Glu Lys Gly Val Thr Gln Asn Gly Arg Leu Ile
340 345 350
Thr Ala Asn Pro Ile Val Thr Asp Lys Glu Lys Pro Val Asn Ile Glu
355 360 365
Thr Glu Pro Pro Phe Gly Glu Ser Tyr Ile Ile Val Gly Ala Gly Glu
370 375 380
Lys Ala Leu Lys Leu Ser Trp Phe Lys Lys Gly His His His His His
385 390 395 400
His His His
<210> 66
<211> 403
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> DENV
<400> 66
Met Arg Cys Ile Gly Ile Ser Asn Arg Asp Phe Val Glu Gly Val Ser
1 5 10 15
Gly Gly Ser Trp Val Asp Ile Val Leu Glu His Gly Ser Cys Val Thr
20 25 30
Thr Met Ala Lys Asn Lys Pro Thr Leu Asp Phe Glu Leu Ile Lys Thr
35 40 45
Glu Ala Lys Gln Pro Ala Thr Leu Arg Lys Tyr Cys Ile Glu Ala Lys
50 55 60
Leu Thr Asn Thr Thr Thr Asp Ser Arg Cys Pro Thr Gln Gly Glu Pro
65 70 75 80
Ser Leu Asn Glu Glu Gln Asp Lys Arg Phe Val Cys Lys His Ser Met
85 90 95
Val Asp Arg Gly Trp Gly Asn Gly Cys Gly Leu Phe Gly Lys Gly Gly
100 105 110
Ile Val Thr Cys Ala Met Phe Thr Cys Lys Lys Asn Met Lys Gly Lys
115 120 125
Val Val Gln Pro Glu Asn Leu Glu Tyr Thr Ile Val Ile Thr Pro His
130 135 140
Ser Gly Glu Glu His Ala Val Gly Asn Asp Thr Gly Lys His Gly Lys
145 150 155 160
Glu Ile Lys Ile Thr Pro Gln Ser Ser Ile Thr Glu Ala Glu Leu Thr
165 170 175
Gly Tyr Gly Thr Val Thr Met Glu Cys Ser Pro Arg Thr Gly Leu Asp
180 185 190
Phe Asn Glu Met Val Leu Leu Gln Met Glu Asn Lys Ala Trp Leu Val
195 200 205
His Arg Gln Trp Phe Leu Asp Leu Pro Leu Pro Trp Leu Pro Gly Ala
210 215 220
Asp Thr Gln Gly Ser Asn Trp Ile Gln Lys Glu Thr Leu Val Thr Phe
225 230 235 240
Lys Asn Pro His Ala Lys Lys Gln Asp Val Val Val Leu Gly Ser Gln
245 250 255
Glu Gly Ala Met His Thr Ala Leu Thr Gly Ala Thr Glu Ile Gln Met
260 265 270
Ser Ser Gly Asn Leu Leu Phe Thr Gly His Leu Lys Cys Arg Leu Arg
275 280 285
Met Asp Lys Leu Gln Leu Lys Gly Met Ser Tyr Ser Met Cys Thr Gly
290 295 300
Lys Phe Lys Val Val Lys Glu Ile Ala Glu Thr Gln His Gly Thr Ile
305 310 315 320
Val Ile Arg Val Gln Tyr Glu Gly Asp Gly Ser Pro Cys Lys Ile Pro
325 330 335
Phe Glu Ile Met Asp Leu Glu Lys Arg His Val Leu Gly Arg Leu Ile
340 345 350
Thr Val Asn Pro Ile Val Thr Glu Lys Asp Ser Pro Val Asn Ile Glu
355 360 365
Ala Glu Pro Pro Phe Gly Asp Ser Tyr Ile Ile Ile Gly Val Glu Pro
370 375 380
Gly Gln Leu Lys Leu Asn Trp Phe Lys Lys Gly His His His His His
385 390 395 400
His His His
<210> 67
<211> 401
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> DENV
<400> 67
Met Arg Cys Val Gly Val Gly Asn Arg Asp Phe Val Glu Gly Leu Ser
1 5 10 15
Gly Ala Thr Trp Val Asp Val Val Leu Glu His Gly Gly Cys Val Thr
20 25 30
Thr Met Ala Lys Asn Lys Pro Thr Leu Asp Ile Glu Leu Gln Lys Thr
35 40 45
Glu Ala Thr Gln Leu Ala Thr Leu Arg Lys Leu Cys Ile Glu Gly Lys
50 55 60
Ile Thr Asn Ile Thr Thr Asp Ser Arg Cys Pro Thr Gln Gly Glu Ala
65 70 75 80
Ile Leu Pro Glu Glu Gln Asp Gln Asn Tyr Val Cys Lys His Thr Tyr
85 90 95
Val Asp Arg Gly Trp Gly Asn Gly Cys Gly Leu Phe Gly Lys Gly Ser
100 105 110
Leu Val Thr Cys Ala Lys Phe Gln Cys Leu Glu Ser Ile Glu Gly Lys
115 120 125
Val Val Gln His Glu Asn Leu Lys Tyr Thr Val Ile Ile Thr Val His
130 135 140
Thr Gly Asp Gln His Gln Val Gly Asn Glu Thr Gln Gly Val Thr Ala
145 150 155 160
Glu Ile Thr Ser Gln Ala Ser Thr Ala Glu Ala Ile Leu Pro Glu Tyr
165 170 175
Gly Thr Leu Gly Leu Glu Cys Ser Pro Arg Thr Gly Leu Asp Phe Asn
180 185 190
Glu Met Ile Leu Leu Thr Met Lys Asn Lys Ala Trp Met Val His Arg
195 200 205
Gln Trp Phe Phe Asp Leu Pro Leu Pro Trp Thr Ser Gly Ala Thr Thr
210 215 220
Lys Thr Pro Thr Trp Asn Arg Lys Glu Leu Leu Val Thr Phe Lys Asn
225 230 235 240
Ala His Ala Lys Lys Gln Glu Val Val Val Leu Gly Ser Gln Glu Gly
245 250 255
Ala Met His Thr Ala Leu Thr Gly Ala Thr Glu Ile Gln Thr Ser Gly
260 265 270
Gly Thr Ser Ile Phe Ala Gly His Leu Lys Cys Arg Leu Lys Met Asp
275 280 285
Lys Leu Lys Leu Lys Gly Met Ser Tyr Ala Met Cys Leu Asn Thr Phe
290 295 300
Val Leu Lys Lys Glu Val Ser Glu Thr Gln His Gly Thr Ile Leu Ile
305 310 315 320
Lys Val Glu Tyr Lys Gly Glu Asp Ala Pro Cys Lys Ile Pro Phe Ser
325 330 335
Thr Glu Asp Gly Gln Gly Lys Ala His Asn Gly Arg Leu Ile Thr Ala
340 345 350
Asn Pro Val Val Thr Lys Lys Glu Glu Pro Val Asn Ile Glu Ala Glu
355 360 365
Pro Pro Phe Gly Glu Ser Asn Ile Val Ile Gly Ile Gly Asp Lys Ala
370 375 380
Leu Lys Ile Asn Trp Tyr Arg Lys Gly His His His His His His His
385 390 395 400
His
<210> 68
<211> 403
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> DENV
<400> 68
Met Arg Cys Val Gly Val Gly Asn Arg Asp Phe Val Glu Gly Val Ser
1 5 10 15
Gly Gly Ala Trp Val Asp Leu Val Leu Glu His Gly Gly Cys Val Thr
20 25 30
Thr Met Ala Gln Gly Lys Pro Thr Leu Asp Phe Glu Leu Thr Lys Thr
35 40 45
Thr Ala Lys Glu Val Ala Leu Leu Arg Thr Tyr Cys Ile Glu Ala Ser
50 55 60
Ile Ser Asn Ile Thr Thr Ala Thr Arg Cys Pro Thr Gln Gly Glu Pro
65 70 75 80
Tyr Leu Lys Glu Glu Gln Asp Gln Gln Tyr Ile Cys Arg Arg Asp Val
85 90 95
Val Asp Arg Gly Trp Gly Asn Gly Cys Gly Leu Phe Gly Lys Gly Gly
100 105 110
Val Val Thr Cys Ala Lys Phe Ser Cys Ser Gly Lys Ile Thr Gly Asn
115 120 125
Leu Val Gln Ile Glu Asn Leu Glu Tyr Thr Val Val Val Thr Val His
130 135 140
Asn Gly Asp Thr His Ala Val Gly Asn Asp Thr Ser Asn His Gly Val
145 150 155 160
Thr Ala Met Ile Thr Pro Arg Ser Pro Ser Val Glu Val Lys Leu Pro
165 170 175
Asp Tyr Gly Glu Leu Thr Leu Asp Cys Glu Pro Arg Ser Gly Ile Asp
180 185 190
Phe Asn Glu Met Ile Leu Met Lys Met Lys Lys Lys Thr Trp Leu Val
195 200 205
His Lys Gln Trp Phe Leu Asp Leu Pro Leu Pro Trp Thr Ala Gly Ala
210 215 220
Asp Thr Ser Glu Val His Trp Asn Tyr Lys Glu Arg Met Val Thr Phe
225 230 235 240
Lys Val Pro His Ala Lys Arg Gln Asp Val Thr Val Leu Gly Ser Gln
245 250 255
Glu Gly Ala Met His Ser Ala Leu Ala Gly Ala Thr Glu Val Asp Ser
260 265 270
Gly Asp Gly Asn His Met Phe Ala Gly His Leu Lys Cys Lys Val Arg
275 280 285
Met Glu Lys Leu Arg Ile Lys Gly Met Ser Tyr Thr Met Cys Ser Gly
290 295 300
Lys Phe Ser Ile Asp Lys Glu Met Ala Glu Thr Gln His Gly Thr Thr
305 310 315 320
Val Val Lys Val Lys Tyr Glu Gly Ala Gly Ala Pro Cys Lys Val Pro
325 330 335
Ile Glu Ile Arg Asp Val Asn Lys Glu Lys Val Val Gly Arg Ile Ile
340 345 350
Ser Ser Thr Pro Leu Ala Glu Asn Thr Asn Ser Val Thr Asn Ile Glu
355 360 365
Leu Glu Pro Pro Phe Gly Asp Ser Tyr Ile Val Ile Gly Val Gly Asn
370 375 380
Ser Ala Leu Thr Leu His Trp Phe Arg Lys Gly His His His His His
385 390 395 400
His His His
<210> 69
<211> 374
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 69
Met Trp Phe Leu Thr Thr Leu Leu Leu Trp Val Pro Val Asp Gly Gln
1 5 10 15
Val Asp Thr Thr Lys Ala Val Ile Thr Leu Gln Pro Pro Trp Val Ser
20 25 30
Val Phe Gln Glu Glu Thr Val Thr Leu His Cys Glu Val Leu His Leu
35 40 45
Pro Gly Ser Ser Ser Thr Gln Trp Phe Leu Asn Gly Thr Ala Thr Gln
50 55 60
Thr Ser Thr Pro Ser Tyr Arg Ile Thr Ser Ala Ser Val Asn Asp Ser
65 70 75 80
Gly Glu Tyr Arg Cys Gln Arg Gly Leu Ser Gly Arg Ser Asp Pro Ile
85 90 95
Gln Leu Glu Ile His Arg Gly Trp Leu Leu Leu Gln Val Ser Ser Arg
100 105 110
Val Phe Thr Glu Gly Glu Pro Leu Ala Leu Arg Cys His Ala Trp Lys
115 120 125
Asp Lys Leu Val Tyr Asn Val Leu Tyr Tyr Arg Asn Gly Lys Ala Phe
130 135 140
Lys Phe Phe His Trp Asn Ser Asn Leu Thr Ile Leu Lys Thr Asn Ile
145 150 155 160
Ser His Asn Gly Thr Tyr His Cys Ser Gly Met Gly Lys His Arg Tyr
165 170 175
Thr Ser Ala Gly Ile Ser Val Thr Val Lys Glu Leu Phe Pro Ala Pro
180 185 190
Val Leu Asn Ala Ser Val Thr Ser Pro Leu Leu Glu Gly Asn Leu Val
195 200 205
Thr Leu Ser Cys Glu Thr Lys Leu Leu Leu Gln Arg Pro Gly Leu Gln
210 215 220
Leu Tyr Phe Ser Phe Tyr Met Gly Ser Lys Thr Leu Arg Gly Arg Asn
225 230 235 240
Thr Ser Ser Glu Tyr Gln Ile Leu Thr Ala Arg Arg Glu Asp Ser Gly
245 250 255
Leu Tyr Trp Cys Glu Ala Ala Thr Glu Asp Gly Asn Val Leu Lys Arg
260 265 270
Ser Pro Glu Leu Glu Leu Gln Val Leu Gly Leu Gln Leu Pro Thr Pro
275 280 285
Val Trp Phe His Val Leu Phe Tyr Leu Ala Val Gly Ile Met Phe Leu
290 295 300
Val Asn Thr Val Leu Trp Val Thr Ile Arg Lys Glu Leu Lys Arg Lys
305 310 315 320
Lys Lys Trp Asp Leu Glu Ile Ser Leu Asp Ser Gly His Glu Lys Lys
325 330 335
Val Ile Ser Ser Leu Gln Glu Asp Arg His Leu Glu Glu Glu Leu Lys
340 345 350
Cys Gln Glu Gln Lys Glu Glu Gln Leu Gln Glu Gly Val His Arg Lys
355 360 365
Glu Pro Gln Gly Ala Thr
370
<210> 70
<211> 316
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 70
Met Thr Met Glu Thr Gln Met Ser Gln Asn Val Cys Pro Arg Asn Leu
1 5 10 15
Trp Leu Leu Gln Pro Leu Thr Val Leu Leu Leu Leu Ala Ser Ala Asp
20 25 30
Ser Gln Ala Ala Pro Pro Lys Ala Val Leu Lys Leu Glu Pro Pro Trp
35 40 45
Ile Asn Val Leu Gln Glu Asp Ser Val Thr Leu Thr Cys Gln Gly Ala
50 55 60
Arg Ser Pro Glu Ser Asp Ser Ile Gln Trp Phe His Asn Gly Asn Leu
65 70 75 80
Ile Pro Thr His Thr Gln Pro Ser Tyr Arg Phe Lys Ala Asn Asn Asn
85 90 95
Asp Ser Gly Glu Tyr Thr Cys Gln Thr Gly Gln Thr Ser Leu Ser Asp
100 105 110
Pro Val His Leu Thr Val Leu Ser Glu Trp Leu Val Leu Gln Thr Pro
115 120 125
His Leu Glu Phe Gln Glu Gly Glu Thr Ile Met Leu Arg Cys His Ser
130 135 140
Trp Lys Asp Lys Pro Leu Val Lys Val Thr Phe Phe Gln Asn Gly Lys
145 150 155 160
Ser Gln Lys Phe Ser His Leu Asp Pro Thr Phe Ser Ile Pro Gln Ala
165 170 175
Asn His Ser His Ser Gly Asp Tyr His Cys Thr Gly Asn Ile Gly Tyr
180 185 190
Thr Leu Phe Ser Ser Lys Pro Val Thr Ile Thr Val Gln Val Pro Ser
195 200 205
Met Gly Ser Ser Ser Pro Met Gly Val Ile Val Ala Val Val Ile Ala
210 215 220
Thr Ala Val Ala Ala Ile Val Ala Ala Val Val Ala Leu Ile Tyr Cys
225 230 235 240
Arg Lys Lys Arg Ile Ser Ala Asn Ser Thr Asp Pro Val Lys Ala Ala
245 250 255
Gln Phe Glu Pro Pro Gly Arg Gln Met Ile Ala Ile Arg Lys Arg Gln
260 265 270
Leu Glu Glu Thr Asn Asn Asp Tyr Glu Thr Ala Asp Gly Gly Tyr Met
275 280 285
Thr Leu Asn Pro Arg Ala Pro Thr Asp Asp Asp Lys Asn Ile Tyr Leu
290 295 300
Thr Leu Pro Pro Asn Asp His Val Asn Ser Asn Asn
305 310 315
<210> 71
<211> 316
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 71
Met Thr Met Glu Thr Gln Met Ser Gln Asn Val Cys Pro Arg Asn Leu
1 5 10 15
Trp Leu Leu Gln Pro Leu Thr Val Leu Leu Leu Leu Ala Ser Ala Asp
20 25 30
Ser Gln Ala Ala Pro Pro Lys Ala Val Leu Lys Leu Glu Pro Pro Trp
35 40 45
Ile Asn Val Leu Gln Glu Asp Ser Val Thr Leu Thr Cys Gln Gly Ala
50 55 60
Arg Ser Pro Glu Ser Asp Ser Ile Gln Trp Phe His Asn Gly Asn Leu
65 70 75 80
Ile Pro Thr His Thr Gln Pro Ser Tyr Arg Phe Lys Ala Asn Asn Asn
85 90 95
Asp Ser Gly Glu Tyr Thr Cys Gln Thr Gly Gln Thr Ser Leu Ser Asp
100 105 110
Pro Val His Leu Thr Val Leu Ser Glu Trp Leu Val Leu Gln Thr Pro
115 120 125
His Leu Glu Phe Gln Glu Gly Glu Thr Ile Met Leu Arg Cys His Ser
130 135 140
Trp Lys Asp Lys Pro Leu Val Lys Val Thr Phe Phe Gln Asn Gly Lys
145 150 155 160
Ser Gln Lys Phe Ser Arg Leu Asp Pro Thr Phe Ser Ile Pro Gln Ala
165 170 175
Asn His Ser His Ser Gly Asp Tyr His Cys Thr Gly Asn Ile Gly Tyr
180 185 190
Thr Leu Phe Ser Ser Lys Pro Val Thr Ile Thr Val Gln Val Pro Ser
195 200 205
Met Gly Ser Ser Ser Pro Met Gly Val Ile Val Ala Val Val Ile Ala
210 215 220
Thr Ala Val Ala Ala Ile Val Ala Ala Val Val Ala Leu Ile Tyr Cys
225 230 235 240
Arg Lys Lys Arg Ile Ser Ala Asn Ser Thr Asp Pro Val Lys Ala Ala
245 250 255
Gln Phe Glu Pro Pro Gly Arg Gln Met Ile Ala Ile Arg Lys Arg Gln
260 265 270
Leu Glu Glu Thr Asn Asn Asp Tyr Glu Thr Ala Asp Gly Gly Tyr Met
275 280 285
Thr Leu Asn Pro Arg Ala Pro Thr Asp Asp Asp Lys Asn Ile Tyr Leu
290 295 300
Thr Leu Pro Pro Asn Asp His Val Asn Ser Asn Asn
305 310 315
<210> 72
<211> 291
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 72
Met Gly Ile Leu Ser Phe Leu Pro Val Leu Ala Thr Glu Ser Asp Trp
1 5 10 15
Ala Asp Cys Lys Ser Pro Gln Pro Trp Gly His Met Leu Leu Trp Thr
20 25 30
Ala Val Leu Phe Leu Ala Pro Val Ala Gly Thr Pro Ala Ala Pro Pro
35 40 45
Lys Ala Val Leu Lys Leu Glu Pro Gln Trp Ile Asn Val Leu Gln Glu
50 55 60
Asp Ser Val Thr Leu Thr Cys Arg Gly Thr His Ser Pro Glu Ser Asp
65 70 75 80
Ser Ile Gln Trp Phe His Asn Gly Asn Leu Ile Pro Thr His Thr Gln
85 90 95
Pro Ser Tyr Arg Phe Lys Ala Asn Asn Asn Asp Ser Gly Glu Tyr Thr
100 105 110
Cys Gln Thr Gly Gln Thr Ser Leu Ser Asp Pro Val His Leu Thr Val
115 120 125
Leu Ser Glu Trp Leu Val Leu Gln Thr Pro His Leu Glu Phe Gln Glu
130 135 140
Gly Glu Thr Ile Val Leu Arg Cys His Ser Trp Lys Asp Lys Pro Leu
145 150 155 160
Val Lys Val Thr Phe Phe Gln Asn Gly Lys Ser Lys Lys Phe Ser Arg
165 170 175
Ser Asp Pro Asn Phe Ser Ile Pro Gln Ala Asn His Ser His Ser Gly
180 185 190
Asp Tyr His Cys Thr Gly Asn Ile Gly Tyr Thr Leu Tyr Ser Ser Lys
195 200 205
Pro Val Thr Ile Thr Val Gln Ala Pro Ser Ser Ser Pro Met Gly Ile
210 215 220
Ile Val Ala Val Val Thr Gly Ile Ala Val Ala Ala Ile Val Ala Ala
225 230 235 240
Val Val Ala Leu Ile Tyr Cys Arg Lys Lys Arg Ile Ser Ala Asn Pro
245 250 255
Thr Asn Pro Asp Glu Ala Asp Lys Val Gly Ala Glu Asn Thr Ile Thr
260 265 270
Tyr Ser Leu Leu Met His Pro Asp Ala Leu Glu Glu Pro Asp Asp Gln
275 280 285
Asn Arg Ile
290
<210> 73
<211> 254
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 73
Met Trp Gln Leu Leu Leu Pro Thr Ala Leu Leu Leu Leu Val Ser Ala
1 5 10 15
Gly Met Arg Thr Glu Asp Leu Pro Lys Ala Val Val Phe Leu Glu Pro
20 25 30
Gln Trp Tyr Arg Val Leu Glu Lys Asp Ser Val Thr Leu Lys Cys Gln
35 40 45
Gly Ala Tyr Ser Pro Glu Asp Asn Ser Thr Gln Trp Phe His Asn Glu
50 55 60
Ser Leu Ile Ser Ser Gln Ala Ser Ser Tyr Phe Ile Asp Ala Ala Thr
65 70 75 80
Val Asp Asp Ser Gly Glu Tyr Arg Cys Gln Thr Asn Leu Ser Thr Leu
85 90 95
Ser Asp Pro Val Gln Leu Glu Val His Ile Gly Trp Leu Leu Leu Gln
100 105 110
Ala Pro Arg Trp Val Phe Lys Glu Glu Asp Pro Ile His Leu Arg Cys
115 120 125
His Ser Trp Lys Asn Thr Ala Leu His Lys Val Thr Tyr Leu Gln Asn
130 135 140
Gly Lys Gly Arg Lys Tyr Phe His His Asn Ser Asp Phe Tyr Ile Pro
145 150 155 160
Lys Ala Thr Leu Lys Asp Ser Gly Ser Tyr Phe Cys Arg Gly Leu Phe
165 170 175
Gly Ser Lys Asn Val Ser Ser Glu Thr Val Asn Ile Thr Ile Thr Gln
180 185 190
Gly Leu Ser Val Ser Thr Ile Ser Ser Phe Phe Pro Pro Gly Tyr Gln
195 200 205
Val Ser Phe Cys Leu Val Met Val Leu Leu Phe Ala Val Asp Thr Gly
210 215 220
Leu Tyr Phe Ser Val Lys Thr Asn Ile Arg Ser Ser Thr Arg Asp Trp
225 230 235 240
Lys Asp His Lys Phe Lys Trp Arg Lys Asp Pro Gln Asp Lys
245 250
<210> 74
<211> 254
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 74
Met Trp Gln Leu Leu Leu Pro Thr Ala Leu Leu Leu Leu Val Ser Ala
1 5 10 15
Gly Met Arg Thr Glu Asp Leu Pro Lys Ala Val Val Phe Leu Glu Pro
20 25 30
Gln Trp Tyr Arg Val Leu Glu Lys Asp Ser Val Thr Leu Lys Cys Gln
35 40 45
Gly Ala Tyr Ser Pro Glu Asp Asn Ser Thr Gln Trp Phe His Asn Glu
50 55 60
Ser Leu Ile Ser Ser Gln Ala Ser Ser Tyr Phe Ile Asp Ala Ala Thr
65 70 75 80
Val Asp Asp Ser Gly Glu Tyr Arg Cys Gln Thr Asn Leu Ser Thr Leu
85 90 95
Ser Asp Pro Val Gln Leu Glu Val His Ile Gly Trp Leu Leu Leu Gln
100 105 110
Ala Pro Arg Trp Val Phe Lys Glu Glu Asp Pro Ile His Leu Arg Cys
115 120 125
His Ser Trp Lys Asn Thr Ala Leu His Lys Val Thr Tyr Leu Gln Asn
130 135 140
Gly Lys Gly Arg Lys Tyr Phe His His Asn Ser Asp Phe Tyr Ile Pro
145 150 155 160
Lys Ala Thr Leu Lys Asp Ser Gly Ser Tyr Phe Cys Arg Gly Leu Val
165 170 175
Gly Ser Lys Asn Val Ser Ser Glu Thr Val Asn Ile Thr Ile Thr Gln
180 185 190
Gly Leu Ser Val Ser Thr Ile Ser Ser Phe Phe Pro Pro Gly Tyr Gln
195 200 205
Val Ser Phe Cys Leu Val Met Val Leu Leu Phe Ala Val Asp Thr Gly
210 215 220
Leu Tyr Phe Ser Val Lys Thr Asn Ile Arg Ser Ser Thr Arg Asp Trp
225 230 235 240
Lys Asp His Lys Phe Lys Trp Arg Lys Asp Pro Gln Asp Lys
245 250
<210> 75
<211> 233
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 75
Met Trp Gln Leu Leu Leu Pro Thr Ala Leu Leu Leu Leu Val Ser Ala
1 5 10 15
Gly Met Arg Thr Glu Asp Leu Pro Lys Ala Val Val Phe Leu Glu Pro
20 25 30
Gln Trp Tyr Arg Val Leu Glu Lys Asp Ser Val Thr Leu Lys Cys Gln
35 40 45
Gly Ala Tyr Ser Pro Glu Asp Asn Ser Thr Gln Trp Phe His Asn Glu
50 55 60
Asn Leu Ile Ser Ser Gln Ala Ser Ser Tyr Phe Ile Asp Ala Ala Thr
65 70 75 80
Val Asp Asp Ser Gly Glu Tyr Arg Cys Gln Thr Asn Leu Ser Thr Leu
85 90 95
Ser Asp Pro Val Gln Leu Glu Val His Val Gly Trp Leu Leu Leu Gln
100 105 110
Ala Pro Arg Trp Val Phe Lys Glu Glu Asp Pro Ile His Leu Arg Cys
115 120 125
His Ser Trp Lys Asn Thr Ala Leu His Lys Val Thr Tyr Leu Gln Asn
130 135 140
Gly Lys Asp Arg Lys Tyr Phe His His Asn Ser Asp Phe His Ile Pro
145 150 155 160
Lys Ala Thr Leu Lys Asp Ser Gly Ser Tyr Phe Cys Arg Gly Leu Val
165 170 175
Gly Ser Lys Asn Val Ser Ser Glu Thr Val Asn Ile Thr Ile Thr Gln
180 185 190
Gly Leu Ala Val Ser Thr Ile Ser Ser Phe Ser Pro Pro Gly Tyr Gln
195 200 205
Val Ser Phe Cys Leu Val Met Val Leu Leu Phe Ala Val Asp Thr Gly
210 215 220
Leu Tyr Phe Ser Val Lys Thr Asn Ile
225 230
<210> 76
<211> 233
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 76
Met Trp Gln Leu Leu Leu Pro Thr Ala Leu Leu Leu Leu Val Ser Ala
1 5 10 15
Gly Met Arg Thr Glu Asp Leu Pro Lys Ala Val Val Phe Leu Glu Pro
20 25 30
Gln Trp Tyr Ser Val Leu Glu Lys Asp Ser Val Thr Leu Lys Cys Gln
35 40 45
Gly Ala Tyr Ser Pro Glu Asp Asn Ser Thr Gln Trp Phe His Asn Glu
50 55 60
Ser Leu Ile Ser Ser Gln Ala Ser Ser Tyr Phe Ile Asp Ala Ala Thr
65 70 75 80
Val Asn Asp Ser Gly Glu Tyr Arg Cys Gln Thr Asn Leu Ser Thr Leu
85 90 95
Ser Asp Pro Val Gln Leu Glu Val His Ile Gly Trp Leu Leu Leu Gln
100 105 110
Ala Pro Arg Trp Val Phe Lys Glu Glu Asp Pro Ile His Leu Arg Cys
115 120 125
His Ser Trp Lys Asn Thr Ala Leu His Lys Val Thr Tyr Leu Gln Asn
130 135 140
Gly Lys Asp Arg Lys Tyr Phe His His Asn Ser Asp Phe His Ile Pro
145 150 155 160
Lys Ala Thr Leu Lys Asp Ser Gly Ser Tyr Phe Cys Arg Gly Leu Val
165 170 175
Gly Ser Lys Asn Val Ser Ser Glu Thr Val Asn Ile Thr Ile Thr Gln
180 185 190
Gly Leu Ala Val Ser Thr Ile Ser Ser Phe Ser Pro Pro Gly Tyr Gln
195 200 205
Val Ser Phe Cys Leu Val Met Val Leu Leu Phe Ala Val Asp Thr Gly
210 215 220
Leu Tyr Phe Ser Val Lys Thr Asn Ile
225 230
<210> 77
<211> 404
<212> PRT
<213> Mus musculus
<400> 77
Met Ile Leu Thr Ser Phe Gly Asp Asp Met Trp Leu Leu Thr Thr Leu
1 5 10 15
Leu Leu Trp Val Pro Val Gly Gly Glu Val Val Asn Ala Thr Lys Ala
20 25 30
Val Ile Thr Leu Gln Pro Pro Trp Val Ser Ile Phe Gln Lys Glu Asn
35 40 45
Val Thr Leu Trp Cys Glu Gly Pro His Leu Pro Gly Asp Ser Ser Thr
50 55 60
Gln Trp Phe Ile Asn Gly Thr Ala Val Gln Ile Ser Thr Pro Ser Tyr
65 70 75 80
Ser Ile Pro Glu Ala Ser Phe Gln Asp Ser Gly Glu Tyr Arg Cys Gln
85 90 95
Ile Gly Ser Ser Met Pro Ser Asp Pro Val Gln Leu Gln Ile His Asn
100 105 110
Asp Trp Leu Leu Leu Gln Ala Ser Arg Arg Val Leu Thr Glu Gly Glu
115 120 125
Pro Leu Ala Leu Arg Cys His Gly Trp Lys Asn Lys Leu Val Tyr Asn
130 135 140
Val Val Phe Tyr Arg Asn Gly Lys Ser Phe Gln Phe Ser Ser Asp Ser
145 150 155 160
Glu Val Ala Ile Leu Lys Thr Asn Leu Ser His Ser Gly Ile Tyr His
165 170 175
Cys Ser Gly Thr Gly Arg His Arg Tyr Thr Ser Ala Gly Val Ser Ile
180 185 190
Thr Val Lys Glu Leu Phe Thr Thr Pro Val Leu Arg Ala Ser Val Ser
195 200 205
Ser Pro Phe Pro Glu Gly Ser Leu Val Thr Leu Asn Cys Glu Thr Asn
210 215 220
Leu Leu Leu Gln Arg Pro Gly Leu Gln Leu His Phe Ser Phe Tyr Val
225 230 235 240
Gly Ser Lys Ile Leu Glu Tyr Arg Asn Thr Ser Ser Glu Tyr His Ile
245 250 255
Ala Arg Ala Glu Arg Glu Asp Ala Gly Phe Tyr Trp Cys Glu Val Ala
260 265 270
Thr Glu Asp Ser Ser Val Leu Lys Arg Ser Pro Glu Leu Glu Leu Gln
275 280 285
Val Leu Gly Pro Gln Ser Ser Ala Pro Val Trp Phe His Ile Leu Phe
290 295 300
Tyr Leu Ser Val Gly Ile Met Phe Ser Leu Asn Thr Val Leu Tyr Val
305 310 315 320
Lys Ile His Arg Leu Gln Arg Glu Lys Lys Tyr Asn Leu Glu Val Pro
325 330 335
Leu Val Ser Glu Gln Gly Lys Lys Ala Asn Ser Phe Gln Gln Val Arg
340 345 350
Ser Asp Gly Val Tyr Glu Glu Val Thr Ala Thr Ala Ser Gln Thr Thr
355 360 365
Pro Lys Glu Ala Pro Asp Gly Pro Arg Ser Ser Val Gly Asp Cys Gly
370 375 380
Pro Glu Gln Pro Glu Pro Leu Pro Pro Ser Asp Ser Thr Gly Ala Gln
385 390 395 400
Thr Ser Gln Ser
<210> 78
<211> 293
<212> PRT
<213> Mus musculus
<400> 78
Met Gly Ile Leu Pro Phe Leu Leu Ile Pro Met Glu Ser Asn Trp Thr
1 5 10 15
Val His Val Phe Ser Arg Thr Leu Cys His Met Leu Leu Trp Thr Ala
20 25 30
Val Leu Asn Leu Ala Ala Gly Thr His Asp Leu Pro Lys Ala Val Val
35 40 45
Lys Leu Glu Pro Pro Trp Ile Gln Val Leu Lys Glu Asp Thr Val Thr
50 55 60
Leu Thr Cys Glu Gly Thr His Asn Pro Gly Asn Ser Ser Thr Gln Trp
65 70 75 80
Phe His Asn Gly Arg Ser Ile Arg Ser Gln Val Gln Ala Ser Tyr Thr
85 90 95
Phe Lys Ala Thr Val Asn Asp Ser Gly Glu Tyr Arg Cys Gln Met Glu
100 105 110
Gln Thr Arg Leu Ser Asp Pro Val Asp Leu Gly Val Ile Ser Asp Trp
115 120 125
Leu Leu Leu Gln Thr Pro Gln Leu Val Phe Leu Glu Gly Glu Thr Ile
130 135 140
Thr Leu Arg Cys His Ser Trp Arg Asn Lys Leu Leu Asn Arg Ile Ser
145 150 155 160
Phe Phe His Asn Glu Lys Ser Val Arg Tyr His His Tyr Ser Ser Asn
165 170 175
Phe Ser Ile Pro Lys Ala Asn His Ser His Ser Gly Asp Tyr Tyr Cys
180 185 190
Lys Gly Ser Leu Gly Arg Thr Leu His Gln Ser Lys Pro Val Thr Ile
195 200 205
Thr Val Gln Gly Pro Lys Ser Ser Arg Ser Leu Pro Val Leu Thr Ile
210 215 220
Val Ala Ala Val Thr Gly Ile Ala Val Ala Ala Ile Val Ile Ile Leu
225 230 235 240
Val Ser Leu Val Tyr Leu Lys Lys Lys Gln Val Pro Asp Asn Pro Pro
245 250 255
Asp Leu Glu Glu Ala Ala Lys Thr Glu Ala Glu Asn Thr Ile Thr Tyr
260 265 270
Ser Leu Leu Lys His Pro Glu Ala Leu Asp Glu Glu Thr Glu His Asp
275 280 285
Tyr Gln Asn His Ile
290
<210> 79
<211> 267
<212> PRT
<213> Mus musculus
<400> 79
Met Thr Leu Asp Thr Gln Met Phe Gln Asn Ala His Ser Gly Ser Gln
1 5 10 15
Trp Leu Leu Pro Pro Leu Thr Ile Leu Leu Leu Phe Ala Phe Ala Asp
20 25 30
Arg Gln Ser Ala Ala Leu Pro Lys Ala Val Val Lys Leu Asp Pro Pro
35 40 45
Trp Ile Gln Val Leu Lys Glu Asp Met Val Thr Leu Met Cys Glu Gly
50 55 60
Thr His Asn Pro Gly Asn Ser Ser Thr Gln Trp Phe His Asn Trp Ser
65 70 75 80
Ser Ile Arg Ser Gln Val Gln Ser Ser Tyr Thr Phe Lys Ala Thr Val
85 90 95
Asn Asp Ser Gly Glu Tyr Arg Cys Gln Met Glu Gln Thr Arg Leu Ser
100 105 110
Asp Pro Val Asp Leu Gly Val Ile Ser Asp Trp Leu Leu Leu Gln Thr
115 120 125
Pro Gln Arg Val Phe Leu Glu Gly Glu Thr Ile Thr Leu Arg Cys His
130 135 140
Ser Trp Arg Asn Lys Leu Leu Asn Arg Ile Ser Phe Phe His Asn Glu
145 150 155 160
Lys Ser Val Arg Tyr His His Tyr Lys Ser Asn Phe Ser Ile Pro Lys
165 170 175
Ala Asn His Ser His Ser Gly Asp Tyr Tyr Cys Lys Gly Ser Leu Gly
180 185 190
Ser Thr Gln His Gln Ser Lys Pro Val Thr Ile Thr Val Gln Asp Pro
195 200 205
Ala Thr Thr Ser Ser Ile Ser Leu Val Trp Tyr His Thr Ala Phe Ser
210 215 220
Leu Val Met Cys Leu Leu Phe Ala Val Asp Thr Gly Leu Tyr Phe Tyr
225 230 235 240
Val Arg Arg Asn Leu Gln Thr Pro Arg Asp Tyr Trp Arg Lys Ser Leu
245 250 255
Ser Ile Arg Lys His Gln Ala Pro Gln Asp Lys
260 265
<210> 80
<211> 249
<212> PRT
<213> Mus musculus
<400> 80
Met Trp Gln Leu Leu Leu Pro Thr Ala Leu Val Leu Thr Ala Phe Ser
1 5 10 15
Gly Ile Gln Ala Gly Leu Gln Lys Ala Val Val Asn Leu Asp Pro Lys
20 25 30
Trp Val Arg Val Leu Glu Glu Asp Ser Val Thr Leu Arg Cys Gln Gly
35 40 45
Thr Phe Ser Pro Glu Asp Asn Ser Ile Lys Trp Phe His Asn Glu Ser
50 55 60
Leu Ile Pro His Gln Asp Ala Asn Tyr Val Ile Gln Ser Ala Arg Val
65 70 75 80
Lys Asp Ser Gly Met Tyr Arg Cys Gln Thr Ala Leu Ser Thr Ile Ser
85 90 95
Asp Pro Val Gln Leu Glu Val His Met Gly Trp Leu Leu Leu Gln Thr
100 105 110
Thr Lys Trp Leu Phe Gln Glu Gly Asp Pro Ile His Leu Arg Cys His
115 120 125
Ser Trp Gln Asn Arg Pro Val Arg Lys Val Thr Tyr Leu Gln Asn Gly
130 135 140
Lys Gly Lys Lys Tyr Phe His Glu Asn Ser Glu Leu Leu Ile Pro Lys
145 150 155 160
Ala Thr His Asn Asp Ser Gly Ser Tyr Phe Cys Arg Gly Leu Ile Gly
165 170 175
His Asn Asn Lys Ser Ser Ala Ser Phe Arg Ile Ser Leu Gly Asp Pro
180 185 190
Gly Ser Pro Ser Met Phe Pro Pro Trp His Gln Ile Thr Phe Cys Leu
195 200 205
Leu Ile Gly Leu Leu Phe Ala Ile Asp Thr Val Leu Tyr Phe Ser Val
210 215 220
Arg Arg Gly Leu Gln Ser Pro Val Ala Asp Tyr Glu Glu Pro Lys Ile
225 230 235 240
Gln Trp Ser Lys Glu Pro Gln Asp Lys
245
<210> 81
<211> 365
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 81
Met Gly Val Pro Arg Pro Gln Pro Trp Ala Leu Gly Leu Leu Leu Phe
1 5 10 15
Leu Leu Pro Gly Ser Leu Gly Ala Glu Ser His Leu Ser Leu Leu Tyr
20 25 30
His Leu Thr Ala Val Ser Ser Pro Ala Pro Gly Thr Pro Ala Phe Trp
35 40 45
Val Ser Gly Trp Leu Gly Pro Gln Gln Tyr Leu Ser Tyr Asn Ser Leu
50 55 60
Arg Gly Glu Ala Glu Pro Cys Gly Ala Trp Val Trp Glu Asn Gln Val
65 70 75 80
Ser Trp Tyr Trp Glu Lys Glu Thr Thr Asp Leu Arg Ile Lys Glu Lys
85 90 95
Leu Phe Leu Glu Ala Phe Lys Ala Leu Gly Gly Lys Gly Pro Tyr Thr
100 105 110
Leu Gln Gly Leu Leu Gly Cys Glu Leu Gly Pro Asp Asn Thr Ser Val
115 120 125
Pro Thr Ala Lys Phe Ala Leu Asn Gly Glu Glu Phe Met Asn Phe Asp
130 135 140
Leu Lys Gln Gly Thr Trp Gly Gly Asp Trp Pro Glu Ala Leu Ala Ile
145 150 155 160
Ser Gln Arg Trp Gln Gln Gln Asp Lys Ala Ala Asn Lys Glu Leu Thr
165 170 175
Phe Leu Leu Phe Ser Cys Pro His Arg Leu Arg Glu His Leu Glu Arg
180 185 190
Gly Arg Gly Asn Leu Glu Trp Lys Glu Pro Pro Ser Met Arg Leu Lys
195 200 205
Ala Arg Pro Ser Ser Pro Gly Phe Ser Val Leu Thr Cys Ser Ala Phe
210 215 220
Ser Phe Tyr Pro Pro Glu Leu Gln Leu Arg Phe Leu Arg Asn Gly Leu
225 230 235 240
Ala Ala Gly Thr Gly Gln Gly Asp Phe Gly Pro Asn Ser Asp Gly Ser
245 250 255
Phe His Ala Ser Ser Ser Leu Thr Val Lys Ser Gly Asp Glu His His
260 265 270
Tyr Cys Cys Ile Val Gln His Ala Gly Leu Ala Gln Pro Leu Arg Val
275 280 285
Glu Leu Glu Ser Pro Ala Lys Ser Ser Val Leu Val Val Gly Ile Val
290 295 300
Ile Gly Val Leu Leu Leu Thr Ala Ala Ala Val Gly Gly Ala Leu Leu
305 310 315 320
Trp Arg Arg Met Arg Ser Gly Leu Pro Ala Pro Trp Ile Ser Leu Arg
325 330 335
Gly Asp Asp Thr Gly Val Leu Leu Pro Thr Pro Gly Glu Ala Gln Asp
340 345 350
Ala Asp Leu Lys Asp Val Asn Val Ile Pro Ala Thr Ala
355 360 365
<210> 82
<211> 119
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 82
Met Ser Arg Ser Val Ala Leu Ala Val Leu Ala Leu Leu Ser Leu Ser
1 5 10 15
Gly Leu Glu Ala Ile Gln Arg Thr Pro Lys Ile Gln Val Tyr Ser Arg
20 25 30
His Pro Ala Glu Asn Gly Lys Ser Asn Phe Leu Asn Cys Tyr Val Ser
35 40 45
Gly Phe His Pro Ser Asp Ile Glu Val Asp Leu Leu Lys Asn Gly Glu
50 55 60
Arg Ile Glu Lys Val Glu His Ser Asp Leu Ser Phe Ser Lys Asp Trp
65 70 75 80
Ser Phe Tyr Leu Leu Tyr Tyr Thr Glu Phe Thr Pro Thr Glu Lys Asp
85 90 95
Glu Tyr Ala Cys Arg Val Asn His Val Thr Leu Ser Gln Pro Lys Ile
100 105 110
Val Lys Trp Asp Arg Asp Met
115
<210> 83
<211> 330
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 83
Ala Ser Thr Lys Gly Pro Ser Val Phe Pro Leu Ala Pro Ser Ser Lys
1 5 10 15
Ser Thr Ser Gly Gly Thr Ala Ala Leu Gly Cys Leu Val Lys Asp Tyr
20 25 30
Phe Pro Glu Pro Val Thr Val Ser Trp Asn Ser Gly Ala Leu Thr Ser
35 40 45
Gly Val His Thr Phe Pro Ala Val Leu Gln Ser Ser Gly Leu Tyr Ser
50 55 60
Leu Ser Ser Val Val Thr Val Pro Ser Ser Ser Leu Gly Thr Gln Thr
65 70 75 80
Tyr Ile Cys Asn Val Asn His Lys Pro Ser Asn Thr Lys Val Asp Lys
85 90 95
Lys Val Glu Pro Lys Ser Cys Asp Lys Thr His Thr Cys Pro Pro Cys
100 105 110
Pro Ala Pro Glu Leu Leu Gly Gly Pro Ser Val Phe Leu Phe Pro Pro
115 120 125
Lys Pro Lys Asp Thr Leu Met Ile Ser Arg Thr Pro Glu Val Thr Cys
130 135 140
Val Val Val Asp Val Ser His Glu Asp Pro Glu Val Lys Phe Asn Trp
145 150 155 160
Tyr Val Asp Gly Val Glu Val His Asn Ala Lys Thr Lys Pro Arg Glu
165 170 175
Glu Gln Tyr Asn Ser Thr Tyr Arg Val Val Ser Val Leu Thr Val Leu
180 185 190
His Gln Asp Trp Leu Asn Gly Lys Glu Tyr Lys Cys Lys Val Ser Asn
195 200 205
Lys Ala Leu Pro Ala Pro Ile Glu Lys Thr Ile Ser Lys Ala Lys Gly
210 215 220
Gln Pro Arg Glu Pro Gln Val Tyr Thr Leu Pro Pro Ser Arg Asp Glu
225 230 235 240
Leu Thr Lys Asn Gln Val Ser Leu Thr Cys Leu Val Lys Gly Phe Tyr
245 250 255
Pro Ser Asp Ile Ala Val Glu Trp Glu Ser Asn Gly Gln Pro Glu Asn
260 265 270
Asn Tyr Lys Thr Thr Pro Pro Val Leu Asp Ser Asp Gly Ser Phe Phe
275 280 285
Leu Tyr Ser Lys Leu Thr Val Asp Lys Ser Arg Trp Gln Gln Gly Asn
290 295 300
Val Phe Ser Cys Ser Val Met His Glu Ala Leu His Asn His Tyr Thr
305 310 315 320
Gln Lys Ser Leu Ser Leu Ser Pro Gly Lys
325 330
<210> 84
<211> 326
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 84
Ala Ser Thr Lys Gly Pro Ser Val Phe Pro Leu Ala Pro Cys Ser Arg
1 5 10 15
Ser Thr Ser Glu Ser Thr Ala Ala Leu Gly Cys Leu Val Lys Asp Tyr
20 25 30
Phe Pro Glu Pro Val Thr Val Ser Trp Asn Ser Gly Ala Leu Thr Ser
35 40 45
Gly Val His Thr Phe Pro Ala Val Leu Gln Ser Ser Gly Leu Tyr Ser
50 55 60
Leu Ser Ser Val Val Thr Val Pro Ser Ser Asn Phe Gly Thr Gln Thr
65 70 75 80
Tyr Thr Cys Asn Val Asp His Lys Pro Ser Asn Thr Lys Val Asp Lys
85 90 95
Thr Val Glu Arg Lys Cys Cys Val Glu Cys Pro Pro Cys Pro Ala Pro
100 105 110
Pro Val Ala Gly Pro Ser Val Phe Leu Phe Pro Pro Lys Pro Lys Asp
115 120 125
Thr Leu Met Ile Ser Arg Thr Pro Glu Val Thr Cys Val Val Val Asp
130 135 140
Val Ser His Glu Asp Pro Glu Val Gln Phe Asn Trp Tyr Val Asp Gly
145 150 155 160
Val Glu Val His Asn Ala Lys Thr Lys Pro Arg Glu Glu Gln Phe Asn
165 170 175
Ser Thr Phe Arg Val Val Ser Val Leu Thr Val Val His Gln Asp Trp
180 185 190
Leu Asn Gly Lys Glu Tyr Lys Cys Lys Val Ser Asn Lys Gly Leu Pro
195 200 205
Ala Pro Ile Glu Lys Thr Ile Ser Lys Thr Lys Gly Gln Pro Arg Glu
210 215 220
Pro Gln Val Tyr Thr Leu Pro Pro Ser Arg Glu Glu Met Thr Lys Asn
225 230 235 240
Gln Val Ser Leu Thr Cys Leu Val Lys Gly Phe Tyr Pro Ser Asp Ile
245 250 255
Ala Val Glu Trp Glu Ser Asn Gly Gln Pro Glu Asn Asn Tyr Lys Thr
260 265 270
Thr Pro Pro Met Leu Asp Ser Asp Gly Ser Phe Phe Leu Tyr Ser Lys
275 280 285
Leu Thr Val Asp Lys Ser Arg Trp Gln Gln Gly Asn Val Phe Ser Cys
290 295 300
Ser Val Met His Glu Ala Leu His Asn His Tyr Thr Gln Lys Ser Leu
305 310 315 320
Ser Leu Ser Pro Gly Lys
325
<210> 85
<211> 377
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 85
Ala Ser Thr Lys Gly Pro Ser Val Phe Pro Leu Ala Pro Cys Ser Arg
1 5 10 15
Ser Thr Ser Gly Gly Thr Ala Ala Leu Gly Cys Leu Val Lys Asp Tyr
20 25 30
Phe Pro Glu Pro Val Thr Val Ser Trp Asn Ser Gly Ala Leu Thr Ser
35 40 45
Gly Val His Thr Phe Pro Ala Val Leu Gln Ser Ser Gly Leu Tyr Ser
50 55 60
Leu Ser Ser Val Val Thr Val Pro Ser Ser Ser Leu Gly Thr Gln Thr
65 70 75 80
Tyr Thr Cys Asn Val Asn His Lys Pro Ser Asn Thr Lys Val Asp Lys
85 90 95
Arg Val Glu Leu Lys Thr Pro Leu Gly Asp Thr Thr His Thr Cys Pro
100 105 110
Arg Cys Pro Glu Pro Lys Ser Cys Asp Thr Pro Pro Pro Cys Pro Arg
115 120 125
Cys Pro Glu Pro Lys Ser Cys Asp Thr Pro Pro Pro Cys Pro Arg Cys
130 135 140
Pro Glu Pro Lys Ser Cys Asp Thr Pro Pro Pro Cys Pro Arg Cys Pro
145 150 155 160
Ala Pro Glu Leu Leu Gly Gly Pro Ser Val Phe Leu Phe Pro Pro Lys
165 170 175
Pro Lys Asp Thr Leu Met Ile Ser Arg Thr Pro Glu Val Thr Cys Val
180 185 190
Val Val Asp Val Ser His Glu Asp Pro Glu Val Gln Phe Lys Trp Tyr
195 200 205
Val Asp Gly Val Glu Val His Asn Ala Lys Thr Lys Pro Arg Glu Glu
210 215 220
Gln Tyr Asn Ser Thr Phe Arg Val Val Ser Val Leu Thr Val Leu His
225 230 235 240
Gln Asp Trp Leu Asn Gly Lys Glu Tyr Lys Cys Lys Val Ser Asn Lys
245 250 255
Ala Leu Pro Ala Pro Ile Glu Lys Thr Ile Ser Lys Thr Lys Gly Gln
260 265 270
Pro Arg Glu Pro Gln Val Tyr Thr Leu Pro Pro Ser Arg Glu Glu Met
275 280 285
Thr Lys Asn Gln Val Ser Leu Thr Cys Leu Val Lys Gly Phe Tyr Pro
290 295 300
Ser Asp Ile Ala Val Glu Trp Glu Ser Ser Gly Gln Pro Glu Asn Asn
305 310 315 320
Tyr Asn Thr Thr Pro Pro Met Leu Asp Ser Asp Gly Ser Phe Phe Leu
325 330 335
Tyr Ser Lys Leu Thr Val Asp Lys Ser Arg Trp Gln Gln Gly Asn Ile
340 345 350
Phe Ser Cys Ser Val Met His Glu Ala Leu His Asn Arg Phe Thr Gln
355 360 365
Lys Ser Leu Ser Leu Ser Pro Gly Lys
370 375
<210> 86
<211> 327
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 86
Ala Ser Thr Lys Gly Pro Ser Val Phe Pro Leu Ala Pro Cys Ser Arg
1 5 10 15
Ser Thr Ser Glu Ser Thr Ala Ala Leu Gly Cys Leu Val Lys Asp Tyr
20 25 30
Phe Pro Glu Pro Val Thr Val Ser Trp Asn Ser Gly Ala Leu Thr Ser
35 40 45
Gly Val His Thr Phe Pro Ala Val Leu Gln Ser Ser Gly Leu Tyr Ser
50 55 60
Leu Ser Ser Val Val Thr Val Pro Ser Ser Ser Leu Gly Thr Lys Thr
65 70 75 80
Tyr Thr Cys Asn Val Asp His Lys Pro Ser Asn Thr Lys Val Asp Lys
85 90 95
Arg Val Glu Ser Lys Tyr Gly Pro Pro Cys Pro Ser Cys Pro Ala Pro
100 105 110
Glu Phe Leu Gly Gly Pro Ser Val Phe Leu Phe Pro Pro Lys Pro Lys
115 120 125
Asp Thr Leu Met Ile Ser Arg Thr Pro Glu Val Thr Cys Val Val Val
130 135 140
Asp Val Ser Gln Glu Asp Pro Glu Val Gln Phe Asn Trp Tyr Val Asp
145 150 155 160
Gly Val Glu Val His Asn Ala Lys Thr Lys Pro Arg Glu Glu Gln Phe
165 170 175
Asn Ser Thr Tyr Arg Val Val Ser Val Leu Thr Val Leu His Gln Asp
180 185 190
Trp Leu Asn Gly Lys Glu Tyr Lys Cys Lys Val Ser Asn Lys Gly Leu
195 200 205
Pro Ser Ser Ile Glu Lys Thr Ile Ser Lys Ala Lys Gly Gln Pro Arg
210 215 220
Glu Pro Gln Val Tyr Thr Leu Pro Pro Ser Gln Glu Glu Met Thr Lys
225 230 235 240
Asn Gln Val Ser Leu Thr Cys Leu Val Lys Gly Phe Tyr Pro Ser Asp
245 250 255
Ile Ala Val Glu Trp Glu Ser Asn Gly Gln Pro Glu Asn Asn Tyr Lys
260 265 270
Thr Thr Pro Pro Val Leu Asp Ser Asp Gly Ser Phe Phe Leu Tyr Ser
275 280 285
Arg Leu Thr Val Asp Lys Ser Arg Trp Gln Glu Gly Asn Val Phe Ser
290 295 300
Cys Ser Val Met His Glu Ala Leu His Asn His Tyr Thr Gln Lys Ser
305 310 315 320
Leu Ser Leu Ser Leu Gly Lys
325
<210> 87
<211> 328
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> CH
<400> 87
Ala Ser Thr Lys Gly Pro Ser Val Phe Pro Leu Ala Pro Ser Ser Lys
1 5 10 15
Ser Thr Ser Gly Gly Thr Ala Ala Leu Gly Cys Leu Val Lys Asp Tyr
20 25 30
Phe Pro Glu Pro Val Thr Val Ser Trp Asn Ser Gly Ala Leu Thr Ser
35 40 45
Gly Val His Thr Phe Pro Ala Val Leu Gln Ser Ser Gly Leu Tyr Ser
50 55 60
Leu Ser Ser Val Val Thr Val Pro Ser Ser Ser Leu Gly Thr Gln Thr
65 70 75 80
Tyr Ile Cys Asn Val Asn His Lys Pro Ser Asn Thr Lys Val Asp Lys
85 90 95
Lys Val Glu Pro Lys Ser Cys Asp Lys Thr His Thr Cys Pro Pro Cys
100 105 110
Pro Ala Pro Glu Leu Leu Gly Gly Pro Ser Val Phe Leu Phe Pro Pro
115 120 125
Lys Pro Lys Asp Thr Leu Met Ile Ser Arg Thr Pro Glu Val Thr Cys
130 135 140
Val Val Val Asp Val Ser His Glu Asp Pro Glu Val Lys Phe Asn Trp
145 150 155 160
Tyr Val Asp Gly Val Glu Val His Asn Ala Lys Thr Lys Pro Arg Glu
165 170 175
Glu Gln Tyr Asn Ser Thr Tyr Arg Val Val Ser Val Leu Thr Val Leu
180 185 190
His Gln Asp Trp Leu Asn Gly Lys Glu Tyr Lys Cys Lys Val Ser Asn
195 200 205
Lys Ala Leu Pro Ala Pro Ile Glu Lys Thr Ile Ser Lys Ala Lys Gly
210 215 220
Gln Pro Arg Glu Pro Gln Val Tyr Thr Leu Pro Pro Ser Arg Glu Glu
225 230 235 240
Met Thr Lys Asn Gln Val Ser Leu Thr Cys Leu Val Lys Gly Phe Tyr
245 250 255
Pro Ser Asp Ile Ala Val Glu Trp Glu Ser Asn Gly Gln Pro Glu Asn
260 265 270
Asn Tyr Lys Thr Thr Pro Pro Val Leu Asp Ser Asp Gly Ser Phe Phe
275 280 285
Leu Tyr Ser Lys Leu Thr Val Asp Lys Ser Arg Trp Gln Gln Gly Asn
290 295 300
Val Phe Ser Cys Ser Val Met His Glu Ala Leu His Asn His Tyr Thr
305 310 315 320
Gln Lys Ser Leu Ser Leu Ser Pro
325
<210> 88
<211> 119
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> VH
<400> 88
Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Ser Val Lys Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Lys Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Asp His
20 25 30
Tyr Met Tyr Trp Val Arg Gln Thr Pro Glu Lys Arg Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ala Ile Ile Ser Gly Gly Gly Ser Tyr Thr Ser Tyr Pro Asp Ser Met
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ala Lys Asn Ile Leu His
65 70 75 80
Leu Gln Met Ser Ser Leu Lys Ser Glu Asp Thr Ala Met Tyr Tyr Cys
85 90 95
Thr Arg Glu Ser Asn Gly Lys Pro Gly Phe Ala Tyr Trp Gly Gln Gly
100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ala
115
<210> 89
<211> 111
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> VL
<400> 89
Asp Ile Glu Leu Thr Gln Ser Pro Thr Ser Leu Ala Val Ser Leu Gly
1 5 10 15
Gln Arg Ala Thr Ile Ser Cys Lys Ala Ser Gln Ser Val Asp Tyr Ala
20 25 30
Gly Asp Ser Tyr Met Asn Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Pro Pro
35 40 45
Lys Leu Leu Ile Tyr Ala Ala Ser Asn Leu Glu Ser Gly Ile Pro Ala
50 55 60
Arg Phe Ser Ala Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Asn Ile His
65 70 75 80
Pro Val Glu Glu Glu Asp Ala Ala Thr Tyr Tyr Cys Gln Gln Ser Tyr
85 90 95
Glu Asp Pro Trp Thr Phe Gly Gly Gly Thr Lys Leu Glu Ile Lys
100 105 110
<210> 90
<211> 132
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> VH
<400> 90
Gln Val Gln Leu Val Gln Ser Gly Pro Asp Val Glu Lys Pro Gly Ala
1 5 10 15
Ser Val Lys Val Ser Cys Lys Ala Ser Gly Tyr Thr Phe Thr Ser Tyr
20 25 30
Tyr Ile His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Gln Gly Leu Glu Trp Met
35 40 45
Gly Val Ile Asn Pro Arg Gly Gly Ser Arg Arg Ser Ala Gln Lys Phe
50 55 60
Gln Gly Arg Ile Thr Met Thr Arg Asp Thr Ser Thr Ser Thr Val Tyr
65 70 75 80
Met Glu Leu Ser Ser Leu Arg Ser Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Arg Gly Gly Arg Ala Leu Phe Tyr Asp Ser Tyr Thr Thr Pro Phe
100 105 110
Asp Gly Gly Ser Trp Trp Phe Asp Pro Trp Gly Gln Gly Ser Leu Val
115 120 125
Thr Val Ser Ser
130
<210> 91
<211> 132
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> VH
<400> 91
Gln Val Gln Leu Val Gln Ser Gly Ala Glu Val Lys Lys Pro Gly Ala
1 5 10 15
Ser Val Lys Val Ser Cys Lys Ala Ser Gly Tyr Thr Phe Thr Ser Asn
20 25 30
Tyr Ile His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Gln Gly Leu Glu Trp Met
35 40 45
Gly Val Ile Asn Pro Arg Gly Gly Ser Arg Arg Ser Ala Gln Lys Phe
50 55 60
Gln Gly Arg Val Thr Met Thr Arg Asp Thr Ser Thr Ser Thr Val Tyr
65 70 75 80
Met Glu Leu Ser Ser Leu Arg Ser Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Arg Gly Gly Arg Ala Leu Phe Tyr Asp Ser Tyr Thr Thr Pro Phe
100 105 110
Asp Gly Gly Ser Trp Trp Phe Asp Pro Trp Gly Gln Gly Ser Leu Val
115 120 125
Thr Val Ser Ser
130
<210> 92
<211> 132
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> VH
<400> 92
Gln Val Gln Leu Val Gln Ser Gly Ala Glu Val Lys Lys Pro Gly Ala
1 5 10 15
Ser Val Lys Val Ser Cys Lys Ala Ser Gly Tyr Thr Phe Thr Ser Tyr
20 25 30
Tyr Ile His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Gln Gly Leu Glu Trp Met
35 40 45
Gly Val Ile Asn Pro Arg Gly Gly Ser Arg Arg Ser Ala Gln Lys Phe
50 55 60
Gln Gly Arg Val Thr Met Thr Arg Asp Thr Ser Thr Ser Thr Val Tyr
65 70 75 80
Met Glu Leu Ser Ser Leu Arg Ser Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Arg Gly Gly Arg Ala Leu Phe Tyr Asp Ser Tyr Thr Thr Pro Phe
100 105 110
Asp Gly Gly Ser Trp Trp Phe Asp Pro Trp Gly Gln Gly Ser Leu Val
115 120 125
Thr Val Ser Ser
130
<210> 93
<211> 132
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> VH
<400> 93
Gln Val Gln Leu Val Gln Ser Gly Pro Asp Val Glu Lys Pro Gly Ala
1 5 10 15
Ser Val Lys Val Ser Cys Lys Ala Ser Gly Tyr Thr Phe Thr Ser Tyr
20 25 30
Tyr Met His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Gln Gly Leu Glu Trp Met
35 40 45
Gly Val Ile Asn Pro Arg Gly Gly Ser Arg Arg Ser Ala Gln Lys Phe
50 55 60
Gln Gly Arg Ile Thr Met Thr Arg Asp Thr Ser Thr Ser Thr Val Tyr
65 70 75 80
Met Glu Leu Ser Ser Leu Arg Ser Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Arg Gly Gly Arg Ala Leu Phe Tyr Asp Ser Tyr Thr Thr Pro Phe
100 105 110
Asp Gly Gly Ser Trp Trp Phe Asp Pro Trp Gly Gln Gly Ser Leu Val
115 120 125
Thr Val Ser Ser
130
<210> 94
<211> 132
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> VH
<400> 94
Gln Val Gln Leu Val Gln Ser Gly Ala Glu Val Lys Lys Pro Gly Ala
1 5 10 15
Ser Val Lys Val Ser Cys Lys Ala Ser Gly Tyr Thr Phe Thr Ser Tyr
20 25 30
Tyr Met His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Gln Gly Leu Glu Trp Met
35 40 45
Gly Val Ile Asn Pro Arg Gly Gly Ser Arg Arg Ser Ala Gln Lys Phe
50 55 60
Gln Gly Arg Val Thr Met Thr Arg Asp Thr Ser Thr Ser Thr Val Tyr
65 70 75 80
Met Glu Leu Ser Ser Leu Arg Ser Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Arg Gly Gly Arg Ala Leu Phe Tyr Asp Ser Tyr Thr Thr Pro Phe
100 105 110
Asp Gly Gly Ser Trp Trp Phe Asp Pro Trp Gly Gln Gly Ser Leu Val
115 120 125
Thr Val Ser Ser
130
<210> 95
<211> 132
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> VH
<400> 95
Gln Val Gln Leu Val Gln Ser Gly Ala Glu Val Lys Lys Pro Gly Ala
1 5 10 15
Ser Val Lys Val Ser Cys Lys Ala Ser Gly Tyr Thr Phe Thr Ser Tyr
20 25 30
Tyr Met His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Gln Gly Leu Glu Trp Met
35 40 45
Gly Val Ile Asn Pro Arg Gly Gly Ser Arg Arg Ser Ala Gln Lys Phe
50 55 60
Gln Gly Arg Val Thr Met Thr Arg Asp Thr Ser Thr Ser Thr Val Tyr
65 70 75 80
Met Glu Leu Ser Ser Leu Arg Ser Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Arg Gly Gly Glu Ala Leu Phe Tyr Asp Ser Tyr Thr Thr Pro Phe
100 105 110
Asp Gly Gly Ser Trp Trp Phe Asp Pro Trp Gly Gln Gly Ser Leu Val
115 120 125
Thr Val Ser Ser
130
<210> 96
<211> 107
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> VL
<400> 96
Asp Ile Gln Leu Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu Ser Ala Ser Val Gly
1 5 10 15
Asp Arg Val Thr Phe Thr Cys Gln Ala Ser Gln Asp Ile Arg Lys Tyr
20 25 30
Leu Asn Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Leu Ile
35 40 45
Tyr Asp Ala Ser Asn Leu Lys Thr Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly
50 55 60
Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Phe Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro
65 70 75 80
Glu Asp Val Ala Thr Tyr Tyr Cys Gln Gln Phe Glu Asp Leu Pro Ile
85 90 95
Thr Phe Gly Gln Gly Thr Arg Leu Gln Ile Lys
100 105
<210> 97
<211> 107
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> VL
<400> 97
Asp Ile Gln Leu Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu Ser Ala Ser Val Gly
1 5 10 15
Asp Arg Val Thr Phe Thr Cys Gln Ala Ser Gln Glu Ile Arg Lys Tyr
20 25 30
Leu Asn Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Leu Ile
35 40 45
Tyr Asp Ala Ser Asn Leu Lys Thr Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly
50 55 60
Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Phe Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro
65 70 75 80
Glu Asp Val Ala Thr Tyr Tyr Cys Gln Gln Phe Asp Asp Leu Pro Ile
85 90 95
Thr Phe Gly Gln Gly Thr Arg Leu Gln Ile Lys
100 105
<210> 98
<211> 107
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> VL
<400> 98
Asp Ile Gln Leu Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu Ser Ala Ser Val Gly
1 5 10 15
Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys Gln Ala Ser Gln Asp Ile Arg Lys Tyr
20 25 30
Leu Asn Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Leu Ile
35 40 45
Tyr Asp Ala Ser Asn Leu Lys Thr Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly
50 55 60
Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro
65 70 75 80
Glu Asp Val Ala Thr Tyr Tyr Cys Gln Gln Phe Asp Asp Leu Pro Ile
85 90 95
Thr Phe Gly Gln Gly Thr Arg Leu Gln Ile Lys
100 105
<210> 99
<211> 107
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> VL
<400> 99
Asp Ile Gln Leu Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu Ser Ala Ser Val Gly
1 5 10 15
Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys Gln Ala Ser Gln Glu Ile Arg Lys Tyr
20 25 30
Leu Asn Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Leu Ile
35 40 45
Tyr Asp Ala Ser Asn Leu Lys Thr Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly
50 55 60
Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro
65 70 75 80
Glu Asp Val Ala Thr Tyr Tyr Cys Gln Gln Phe Asp Asp Leu Pro Ile
85 90 95
Thr Phe Gly Gln Gly Thr Arg Leu Gln Ile Lys
100 105
<210> 100
<211> 107
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> VL
<400> 100
Asp Ile Gln Leu Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu Ser Ala Ser Val Gly
1 5 10 15
Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys Gln Ala Ser Gln Asp Ile Arg Lys Tyr
20 25 30
Leu Asn Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Leu Ile
35 40 45
Tyr Asp Ala Ser Asn Leu Lys Thr Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly
50 55 60
Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro
65 70 75 80
Glu Asp Val Ala Thr Tyr Tyr Cys Gln Gln Phe Glu Asp Leu Pro Ile
85 90 95
Thr Phe Gly Gln Gly Thr Arg Leu Gln Ile Lys
100 105
<210> 101
<211> 5
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> HVR-H1
<400> 101
Ser Tyr Tyr Ile His
1 5
<210> 102
<211> 30
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> FR-H1
<400> 102
Gln Val Gln Leu Val Gln Ser Gly Ala Glu Val Lys Lys Pro Gly Ala
1 5 10 15
Ser Val Lys Val Ser Cys Lys Ala Ser Gly Tyr Thr Phe Thr
20 25 30
<210> 103
<211> 32
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> FR-H3
<400> 103
Arg Val Thr Met Thr Arg Asp Thr Ser Thr Ser Thr Val Tyr Met Glu
1 5 10 15
Leu Ser Ser Leu Arg Ser Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys Ala Arg
20 25 30
<210> 104
<211> 23
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> FR-L1
<400> 104
Asp Ile Gln Leu Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu Ser Ala Ser Val Gly
1 5 10 15
Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys
20
<210> 105
<211> 32
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> FR-L3
<400> 105
Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr
1 5 10 15
Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro Glu Asp Val Ala Thr Tyr Tyr Cys
20 25 30
<210> 106
<211> 157
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> CD154
<400> 106
Asp Tyr Lys Asp Asp Asp Asp Lys Met Gln Lys Gly Asp Gln Asn Pro
1 5 10 15
Gln Ile Ala Ala His Val Ile Ser Glu Ala Ser Ser Lys Thr Thr Ser
20 25 30
Val Leu Gln Trp Ala Glu Lys Gly Tyr Tyr Thr Met Ser Asn Asn Leu
35 40 45
Val Thr Leu Glu Asn Gly Lys Gln Leu Thr Val Lys Arg Gln Gly Leu
50 55 60
Tyr Tyr Ile Tyr Ala Gln Val Thr Phe Cys Ser Asn Arg Glu Ala Ser
65 70 75 80
Ser Gln Ala Pro Phe Ile Ala Ser Leu Cys Leu Lys Ser Pro Gly Arg
85 90 95
Phe Glu Arg Ile Leu Leu Arg Ala Ala Asn Thr His Ser Ser Ala Lys
100 105 110
Pro Cys Gly Gln Gln Ser Ile His Leu Gly Gly Val Phe Glu Leu Gln
115 120 125
Pro Gly Ala Ser Val Phe Val Asn Val Thr Asp Pro Ser Gln Val Ser
130 135 140
His Gly Thr Gly Phe Thr Ser Phe Gly Leu Leu Lys Leu
145 150 155
<210> 107
<211> 328
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> CH
<400> 107
Ala Ser Thr Lys Gly Pro Ser Val Phe Pro Leu Ala Pro Ser Ser Lys
1 5 10 15
Ser Thr Ser Gly Gly Thr Ala Ala Leu Gly Cys Leu Val Lys Asp Tyr
20 25 30
Phe Pro Glu Pro Val Thr Val Ser Trp Asn Ser Gly Ala Leu Thr Ser
35 40 45
Gly Val His Thr Phe Pro Ala Val Leu Gln Ser Ser Gly Leu Tyr Ser
50 55 60
Leu Ser Ser Val Val Thr Val Pro Ser Ser Ser Leu Gly Thr Gln Thr
65 70 75 80
Tyr Ile Cys Asn Val Asn His Lys Pro Ser Asn Thr Lys Val Asp Lys
85 90 95
Arg Val Glu Pro Lys Ser Cys Asp Lys Thr His Thr Cys Pro Pro Cys
100 105 110
Pro Ala Pro Glu Leu Leu Gly Gly Pro Ser Val Phe Leu Phe Pro Pro
115 120 125
Lys Pro Lys Asp Thr Leu Met Ile Ser Arg Thr Pro Glu Val Thr Cys
130 135 140
Val Val Val Asp Val Ser His Glu Asp Pro Glu Val Lys Phe Asn Trp
145 150 155 160
Tyr Val Asp Gly Val Glu Val His Asn Ala Lys Thr Lys Pro Arg Glu
165 170 175
Glu Gln Tyr Asn Ser Thr Tyr Arg Val Val Ser Val Leu Thr Val Leu
180 185 190
His Gln Asp Trp Leu Asn Gly Lys Glu Tyr Lys Cys Lys Val Ser Asn
195 200 205
Ala Ala Leu Pro Ala Pro Ile Ser Lys Thr Ile Ser Lys Ala Lys Gly
210 215 220
Gln Pro Arg Glu Pro Gln Val Tyr Thr Leu Pro Pro Ser Arg Glu Glu
225 230 235 240
Met Thr Lys Asn Gln Val Ser Leu Thr Cys Leu Val Lys Gly Phe Tyr
245 250 255
Pro Ser Asp Ile Ala Val Glu Trp Glu Ser Asn Gly Gln Pro Glu Asn
260 265 270
Asn Tyr Lys Thr Thr Pro Pro Val Leu Asp Ser Asp Gly Ser Phe Phe
275 280 285
Leu Tyr Ser Lys Leu Thr Val Asp Lys Ser Arg Trp Gln Gln Gly Asn
290 295 300
Val Phe Ser Cys Ser Val Met His Glu Ala Leu His Asn His Tyr Thr
305 310 315 320
Gln Lys Ser Leu Ser Leu Ser Pro
325
<210> 108
<211> 328
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> CH
<400> 108
Ala Ser Thr Lys Gly Pro Ser Val Phe Pro Leu Ala Pro Ser Ser Lys
1 5 10 15
Ser Thr Ser Gly Gly Thr Ala Ala Leu Gly Cys Leu Val Lys Asp Tyr
20 25 30
Phe Pro Glu Pro Val Thr Val Ser Trp Asn Ser Gly Ala Leu Thr Ser
35 40 45
Gly Val His Thr Phe Pro Ala Val Leu Gln Ser Ser Gly Leu Tyr Ser
50 55 60
Leu Ser Ser Val Val Thr Val Pro Ser Ser Ser Leu Gly Thr Gln Thr
65 70 75 80
Tyr Ile Cys Asn Val Asn His Lys Pro Ser Asn Thr Lys Val Asp Lys
85 90 95
Arg Val Glu Pro Lys Ser Cys Asp Lys Thr His Thr Cys Pro Pro Cys
100 105 110
Pro Ala Pro Glu Ala Ala Gly Gly Pro Ser Val Phe Leu Phe Pro Pro
115 120 125
Lys Pro Lys Asp Thr Leu Met Ile Ser Arg Thr Pro Glu Val Thr Cys
130 135 140
Val Val Val Asp Val Ser His Glu Asp Pro Glu Val Lys Phe Asn Trp
145 150 155 160
Tyr Val Asp Gly Val Glu Val His Asn Ala Lys Thr Lys Pro Arg Glu
165 170 175
Glu Gln Tyr Asn Ser Thr Tyr Arg Val Val Ser Val Leu Thr Val Leu
180 185 190
His Gln Asp Trp Leu Asn Gly Lys Glu Tyr Lys Cys Lys Val Ser Asn
195 200 205
Lys Ala Leu Pro Ala Pro Ile Glu Lys Thr Ile Ser Lys Ala Lys Gly
210 215 220
Gln Pro Arg Glu Pro Gln Val Tyr Thr Leu Pro Pro Ser Arg Glu Glu
225 230 235 240
Met Thr Lys Asn Gln Val Ser Leu Thr Cys Leu Val Lys Gly Phe Tyr
245 250 255
Pro Ser Asp Ile Ala Val Glu Trp Glu Ser Asn Gly Gln Pro Glu Asn
260 265 270
Asn Tyr Lys Thr Thr Pro Pro Val Leu Asp Ser Asp Gly Ser Phe Phe
275 280 285
Leu Tyr Ser Lys Leu Thr Val Asp Lys Ser Arg Trp Gln Gln Gly Asn
290 295 300
Val Phe Ser Cys Ser Val Leu His Glu Ala Leu His Ala His Thr Thr
305 310 315 320
Arg Lys Glu Leu Ser Leu Ser Pro
325
<210> 109
<211> 328
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> CH
<400> 109
Ala Ser Thr Lys Gly Pro Ser Val Phe Pro Leu Ala Pro Ser Ser Lys
1 5 10 15
Ser Thr Ser Gly Gly Thr Ala Ala Leu Gly Cys Leu Val Lys Asp Tyr
20 25 30
Phe Pro Glu Pro Val Thr Val Ser Trp Asn Ser Gly Ala Leu Thr Ser
35 40 45
Gly Val His Thr Phe Pro Ala Val Leu Gln Ser Ser Gly Leu Tyr Ser
50 55 60
Leu Ser Ser Val Val Thr Val Pro Ser Ser Ser Leu Gly Thr Gln Thr
65 70 75 80
Tyr Ile Cys Asn Val Asn His Lys Pro Ser Asn Thr Lys Val Asp Lys
85 90 95
Arg Val Glu Pro Lys Ser Cys Asp Lys Thr His Thr Cys Pro Pro Cys
100 105 110
Pro Ala Pro Glu Ala Ala Gly Gly Pro Ser Val Phe Leu Phe Pro Pro
115 120 125
Lys Pro Lys Asp Thr Leu Met Ile Ser Arg Thr Pro Glu Val Thr Cys
130 135 140
Val Val Val Asp Val Ser His Glu Asp Pro Glu Val Lys Phe Asn Trp
145 150 155 160
Tyr Val Asp Gly Val Glu Val His Asn Ala Lys Thr Lys Pro Arg Glu
165 170 175
Glu Gln Tyr Asn Ser Thr Tyr Arg Val Val Ser Val Leu Thr Val Leu
180 185 190
His Gln Asp Trp Leu Asn Gly Lys Glu Tyr Lys Cys Lys Val Ser Asn
195 200 205
Lys Ala Leu Pro Ala Pro Ile Glu Lys Thr Ile Ser Lys Ala Lys Gly
210 215 220
Gln Pro Arg Glu Pro Gln Val Tyr Thr Leu Pro Pro Ser Arg Glu Glu
225 230 235 240
Met Thr Lys Asn Gln Val Ser Leu Thr Cys Leu Val Lys Gly Phe Tyr
245 250 255
Pro Ser Asp Ile Ala Val Glu Trp Glu Ser Asn Gly Gln Pro Glu Asn
260 265 270
Asn Tyr Lys Thr Thr Pro Pro Val Leu Asp Ser Asp Gly Ser Phe Phe
275 280 285
Leu Tyr Ser Lys Leu Thr Val Asp Lys Ser Arg Trp Gln Gln Gly Asn
290 295 300
Val Phe Ser Cys Ser Val Leu His Glu Ala Leu His Ala His Tyr Thr
305 310 315 320
Arg Lys Glu Leu Ser Leu Ser Pro
325
<---

Claims (2)

1. Применение антитела для производства лекарственных препаратов для лечения или предупреждения инфекции, вызываемой вирусом Зика, где антитело содержит последовательность VH с SEQ ID NO: 6 и последовательность VL с SEQ ID NO: 7, где антитело также содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 59.
2. Применение по п. 1, в котором антитело содержит последовательность VH, как показано в SEQ ID NO: 6, с последовательностью СН человеческого IgG1, как показано в SEQ ID NO: 59, и последовательность VL, как показано в SEQ ID NO: 7, с человеческой CL-последовательностью, как показано в SEQ ID NO: 60.
RU2020133003A 2018-03-15 2019-03-15 Антитела к вирусу денге, обладающие перекрестной реактивностью с вирусом зика RU2811697C2 (ru)

Applications Claiming Priority (3)

Application Number Priority Date Filing Date Title
SG10201802164Y 2018-03-15
SG10201802164Y 2018-03-15
PCT/SG2019/050145 WO2019177543A1 (en) 2018-03-15 2019-03-15 Anti-dengue virus antibodies having cross-reactivity to zika virus and methods of use

Related Child Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
RU2023135059A Division RU2023135059A (ru) 2018-03-15 2019-03-15 Антитела к вирусу денге, обладающие перекрестной реактивностью с вирусом зика, и способы их применения

Publications (2)

Publication Number Publication Date
RU2020133003A RU2020133003A (ru) 2022-04-15
RU2811697C2 true RU2811697C2 (ru) 2024-01-16

Family

ID=

Citations (4)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
RU2008125077A (ru) * 2005-11-22 2009-12-27 Сентро Де Инхеньериа Хенетика И Биотекнолохия (Cu) Способы и белки для профилактического и/или терапевтического лечения инфекций, вызванных четырьмя серотипами вируса денге и другими флавивирусами
WO2016148653A1 (en) * 2015-03-17 2016-09-22 Agency For Science, Technology And Research A serotype cross-reactive, dengue neutralizing antibody and uses thereof
WO2017212291A1 (en) * 2016-06-10 2017-12-14 Imperial Innovations Ltd Neutralising antibody against dengue for use in a method of prevention and/or treatment of zika infection
CA3026050A1 (en) * 2016-08-05 2018-02-08 Chugai Seiyaku Kabushiki Kaisha Composition for prophylaxis or treatment of il-8 related diseases

Patent Citations (4)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
RU2008125077A (ru) * 2005-11-22 2009-12-27 Сентро Де Инхеньериа Хенетика И Биотекнолохия (Cu) Способы и белки для профилактического и/или терапевтического лечения инфекций, вызванных четырьмя серотипами вируса денге и другими флавивирусами
WO2016148653A1 (en) * 2015-03-17 2016-09-22 Agency For Science, Technology And Research A serotype cross-reactive, dengue neutralizing antibody and uses thereof
WO2017212291A1 (en) * 2016-06-10 2017-12-14 Imperial Innovations Ltd Neutralising antibody against dengue for use in a method of prevention and/or treatment of zika infection
CA3026050A1 (en) * 2016-08-05 2018-02-08 Chugai Seiyaku Kabushiki Kaisha Composition for prophylaxis or treatment of il-8 related diseases

Non-Patent Citations (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
FERNANDEZ E. ET AL. Anti-Dengue E-dimer epitope human antibodies have therapeutic activity against Zika virus infection. Nat Immunol., 2017, v.18, No.11, p.1-24, DOI: 10.1038/NI.3849. PRIYAMVADA L. ET AL. Human antibody responses after dengue virus infection are highly cross-reactive to Zika virus. PNAS, 2016, v.113, No. 28, p.7852-7857, DOI: 10.1073/PNAS.1607931113. XU M. ET AL. A potent neutralizing antibody with therapeutic potential against all four serotypes of dengue virus. npj Vaccines, 2017, v.2, no.2, p.1-10, DOI:10.1038/S41541-016-0003-3. *
KAM Y.-W. ET AL. Cross-reactive dengue human monoclonal antibody prevents severe pathologies and death from Zika virus infections. JCI Insight, 2017, v.2, No.8, e92428: p.1-10, DOI: 10.1172/JCI.INSIGHT.92428. STETTLER K. ET AL. Specificity, cross-reactivity, and function of antibodies elicited by Zika virus infection, Science, 2016, v.353, no.6301, p.823-826, DOI: 10.1126/science.aaf8505. PARK H. I. ET AL. The Highly Evolvable Antibody Fc Domain. TRENDS IN BIOTECHNOLOGY, vol. 34, no. 11, p.895-908, DOI: 10.1016/J.TIBTECH.2016.04.005. MOORE G. L. ET AL. Engineered Fc variant antibodies with enhanced ability to recruit complement and mediate effector functions. MABS, 2010, v.2, no.2, p.181-189, DOI: 10.4161/MABS.2.2.11158. *

Similar Documents

Publication Publication Date Title
JP7672456B2 (ja) 抗デングウイルス抗体、変異型Ｆｃ領域を含むポリペプチド、およびその使用方法
KR102938315B1 (ko) 지카 바이러스에 대해 교차-반응성을 갖는 항-뎅기 바이러스 항체 및 사용 방법
RU2811697C2 (ru) Антитела к вирусу денге, обладающие перекрестной реактивностью с вирусом зика
HK40095869A (zh) 对寨卡病毒具有交叉反应性的抗登革热病毒抗体及使用方法
HK40096500A (zh) 抗登革热病毒抗体、含有变体fc区域的多肽及使用方法
HK40035580A (en) Anti-dengue virus antibodies having cross-reactivity to zika virus and methods of use
HK40035580B (en) Anti-dengue virus antibodies having cross-reactivity to zika virus and methods of use
HK40002107A (en) Anti-dengue virus antibodies, polypeptides containing variant fc regions, and methods of use