SK4012003A3 - Regulatory and auxiliary HIV peptides, antigens, vaccine compositions, an immunoassay kit and method of detecting antibodies induced by HIV - Google Patents
Regulatory and auxiliary HIV peptides, antigens, vaccine compositions, an immunoassay kit and method of detecting antibodies induced by HIV Download PDFInfo
- Publication number
- SK4012003A3 SK4012003A3 SK401-2003A SK4012003A SK4012003A3 SK 4012003 A3 SK4012003 A3 SK 4012003A3 SK 4012003 A SK4012003 A SK 4012003A SK 4012003 A3 SK4012003 A3 SK 4012003A3
- Authority
- SK
- Slovakia
- Prior art keywords
- xaa
- seq
- leu
- pro
- ser
- Prior art date
Links
- 108090000765 processed proteins & peptides Proteins 0.000 title claims abstract description 123
- 102000004196 processed proteins & peptides Human genes 0.000 title claims abstract description 48
- 239000000427 antigen Substances 0.000 title claims abstract description 37
- 102000036639 antigens Human genes 0.000 title claims abstract description 37
- 108091007433 antigens Proteins 0.000 title claims abstract description 37
- 229960005486 vaccine Drugs 0.000 title claims abstract description 31
- 239000000203 mixture Substances 0.000 title claims abstract description 15
- 238000000034 method Methods 0.000 title claims abstract description 12
- 238000003018 immunoassay Methods 0.000 title claims abstract description 8
- 230000001105 regulatory effect Effects 0.000 title claims description 8
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 claims abstract description 29
- 241000713772 Human immunodeficiency virus 1 Species 0.000 claims abstract description 22
- 241000725303 Human immunodeficiency virus Species 0.000 claims abstract description 21
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 claims abstract description 17
- 235000001014 amino acid Nutrition 0.000 claims description 84
- 150000001413 amino acids Chemical class 0.000 claims description 83
- 239000002671 adjuvant Substances 0.000 claims description 18
- 238000002360 preparation method Methods 0.000 claims description 18
- 150000001408 amides Chemical class 0.000 claims description 15
- 235000018102 proteins Nutrition 0.000 claims description 15
- RHGKLRLOHDJJDR-BYPYZUCNSA-N L-citrulline Chemical compound NC(=O)NCCC[C@H]([NH3+])C([O-])=O RHGKLRLOHDJJDR-BYPYZUCNSA-N 0.000 claims description 13
- 125000003275 alpha amino acid group Chemical group 0.000 claims description 13
- 239000004927 clay Substances 0.000 claims description 10
- 239000003102 growth factor Substances 0.000 claims description 8
- XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N water Chemical compound O XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 8
- RHGKLRLOHDJJDR-UHFFFAOYSA-N Ndelta-carbamoyl-DL-ornithine Natural products OC(=O)C(N)CCCNC(N)=O RHGKLRLOHDJJDR-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 6
- 229960002173 citrulline Drugs 0.000 claims description 6
- 235000013477 citrulline Nutrition 0.000 claims description 6
- 239000003981 vehicle Substances 0.000 claims description 6
- AAKRWBIIGKPOKQ-ONGXEEELSA-N Leu-Val-Gly Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)NCC(O)=O AAKRWBIIGKPOKQ-ONGXEEELSA-N 0.000 claims description 5
- 230000003308 immunostimulating effect Effects 0.000 claims description 5
- 239000008223 sterile water Substances 0.000 claims description 5
- FWMNVWWHGCHHJJ-SKKKGAJSSA-N 4-amino-1-[(2r)-6-amino-2-[[(2r)-2-[[(2r)-2-[[(2r)-2-amino-3-phenylpropanoyl]amino]-3-phenylpropanoyl]amino]-4-methylpentanoyl]amino]hexanoyl]piperidine-4-carboxylic acid Chemical compound C([C@H](C(=O)N[C@H](CC(C)C)C(=O)N[C@H](CCCCN)C(=O)N1CCC(N)(CC1)C(O)=O)NC(=O)[C@H](N)CC=1C=CC=CC=1)C1=CC=CC=C1 FWMNVWWHGCHHJJ-SKKKGAJSSA-N 0.000 claims description 4
- 108010028921 Lipopeptides Proteins 0.000 claims description 4
- 125000003178 carboxy group Chemical group [H]OC(*)=O 0.000 claims description 4
- 125000005842 heteroatom Chemical group 0.000 claims description 4
- 239000002502 liposome Substances 0.000 claims description 4
- 229910052757 nitrogen Inorganic materials 0.000 claims description 4
- 229910052760 oxygen Inorganic materials 0.000 claims description 4
- LNCFUHAPNTYMJB-IUCAKERBSA-N His-Pro Chemical compound C([C@H](N)C(=O)N1[C@@H](CCC1)C(O)=O)C1=CN=CN1 LNCFUHAPNTYMJB-IUCAKERBSA-N 0.000 claims description 3
- OGUUKPXUTHOIAV-SDDRHHMPSA-N Leu-Glu-Pro Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCC(=O)O)C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)O)N OGUUKPXUTHOIAV-SDDRHHMPSA-N 0.000 claims description 3
- KWLWZYMNUZJKMZ-IHRRRGAJSA-N Leu-Pro-Leu Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O KWLWZYMNUZJKMZ-IHRRRGAJSA-N 0.000 claims description 3
- 210000001124 body fluid Anatomy 0.000 claims description 3
- 239000010839 body fluid Substances 0.000 claims description 3
- 150000001875 compounds Chemical class 0.000 claims description 3
- 108010085325 histidylproline Proteins 0.000 claims description 3
- 210000002540 macrophage Anatomy 0.000 claims description 3
- 230000004048 modification Effects 0.000 claims description 3
- 238000012986 modification Methods 0.000 claims description 3
- 229940035032 monophosphoryl lipid a Drugs 0.000 claims description 3
- 239000007787 solid Substances 0.000 claims description 3
- BABSVXFGKFLIGW-UWVGGRQHSA-N Leu-Gly-Arg Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)NCC(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCNC(N)=N BABSVXFGKFLIGW-UWVGGRQHSA-N 0.000 claims description 2
- ZJWIXBZTAAJERF-IHRRRGAJSA-N Lys-Lys-Arg Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCN=C(N)N ZJWIXBZTAAJERF-IHRRRGAJSA-N 0.000 claims description 2
- 125000000218 acetic acid group Chemical group C(C)(=O)* 0.000 claims description 2
- 125000002252 acyl group Chemical group 0.000 claims description 2
- WNROFYMDJYEPJX-UHFFFAOYSA-K aluminium hydroxide Chemical compound [OH-].[OH-].[OH-].[Al+3] WNROFYMDJYEPJX-UHFFFAOYSA-K 0.000 claims description 2
- 125000003277 amino group Chemical group 0.000 claims description 2
- 239000003795 chemical substances by application Substances 0.000 claims description 2
- 210000003714 granulocyte Anatomy 0.000 claims description 2
- 150000003839 salts Chemical class 0.000 claims description 2
- 239000003085 diluting agent Substances 0.000 claims 1
- 230000000694 effects Effects 0.000 abstract description 6
- 229940021747 therapeutic vaccine Drugs 0.000 abstract description 5
- 230000028993 immune response Effects 0.000 abstract description 4
- 229940021993 prophylactic vaccine Drugs 0.000 abstract description 4
- 210000001151 cytotoxic T lymphocyte Anatomy 0.000 abstract description 2
- 108091006104 gene-regulatory proteins Proteins 0.000 abstract description 2
- 102000034356 gene-regulatory proteins Human genes 0.000 abstract description 2
- 108091005601 modified peptides Proteins 0.000 abstract description 2
- 230000000069 prophylactic effect Effects 0.000 abstract description 2
- 230000003042 antagnostic effect Effects 0.000 abstract 1
- 230000001939 inductive effect Effects 0.000 abstract 1
- 101710149951 Protein Tat Proteins 0.000 description 29
- 238000004128 high performance liquid chromatography Methods 0.000 description 26
- 208000031886 HIV Infections Diseases 0.000 description 21
- OKKJLVBELUTLKV-UHFFFAOYSA-N Methanol Chemical compound OC OKKJLVBELUTLKV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 21
- QTBSBXVTEAMEQO-UHFFFAOYSA-N Acetic acid Chemical compound CC(O)=O QTBSBXVTEAMEQO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 19
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 description 19
- 238000003786 synthesis reaction Methods 0.000 description 19
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 description 18
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 description 18
- 108091032973 (ribonucleotides)n+m Proteins 0.000 description 15
- 230000014509 gene expression Effects 0.000 description 15
- 238000004989 laser desorption mass spectroscopy Methods 0.000 description 15
- 238000004949 mass spectrometry Methods 0.000 description 15
- 239000007858 starting material Substances 0.000 description 13
- 239000003153 chemical reaction reagent Substances 0.000 description 12
- 239000002245 particle Substances 0.000 description 12
- 241000700605 Viruses Species 0.000 description 11
- 229920001223 polyethylene glycol Polymers 0.000 description 11
- 239000012458 free base Substances 0.000 description 10
- 239000000243 solution Substances 0.000 description 10
- UQTNIFUCMBFWEJ-IWGUZYHVSA-N Thr-Asn Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC(N)=O UQTNIFUCMBFWEJ-IWGUZYHVSA-N 0.000 description 8
- 210000000805 cytoplasm Anatomy 0.000 description 8
- -1 for example Proteins 0.000 description 8
- 239000012535 impurity Substances 0.000 description 8
- 208000015181 infectious disease Diseases 0.000 description 8
- 102000040650 (ribonucleotides)n+m Human genes 0.000 description 7
- 239000000969 carrier Substances 0.000 description 7
- 239000000047 product Substances 0.000 description 7
- 208000030507 AIDS Diseases 0.000 description 6
- DTQVDTLACAAQTR-UHFFFAOYSA-N Trifluoroacetic acid Chemical compound OC(=O)C(F)(F)F DTQVDTLACAAQTR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- 229960000583 acetic acid Drugs 0.000 description 6
- 238000002347 injection Methods 0.000 description 6
- 239000007924 injection Substances 0.000 description 6
- 239000006249 magnetic particle Substances 0.000 description 6
- 230000001225 therapeutic effect Effects 0.000 description 6
- 108020004414 DNA Proteins 0.000 description 5
- LRQKBLKVPFOOQJ-YFKPBYRVSA-N L-norleucine Chemical compound CCCC[C@H]([NH3+])C([O-])=O LRQKBLKVPFOOQJ-YFKPBYRVSA-N 0.000 description 5
- 210000001744 T-lymphocyte Anatomy 0.000 description 5
- 238000011161 development Methods 0.000 description 5
- 210000000987 immune system Anatomy 0.000 description 5
- 230000003647 oxidation Effects 0.000 description 5
- 238000007254 oxidation reaction Methods 0.000 description 5
- 230000010076 replication Effects 0.000 description 5
- 239000011347 resin Substances 0.000 description 5
- 229920005989 resin Polymers 0.000 description 5
- 238000013518 transcription Methods 0.000 description 5
- 230000035897 transcription Effects 0.000 description 5
- 241001430294 unidentified retrovirus Species 0.000 description 5
- 230000037396 body weight Effects 0.000 description 4
- 210000004899 c-terminal region Anatomy 0.000 description 4
- 125000000151 cysteine group Chemical group N[C@@H](CS)C(=O)* 0.000 description 4
- 239000000839 emulsion Substances 0.000 description 4
- 238000011534 incubation Methods 0.000 description 4
- 239000012528 membrane Substances 0.000 description 4
- 108010053725 prolylvaline Proteins 0.000 description 4
- 239000007790 solid phase Substances 0.000 description 4
- 125000000999 tert-butyl group Chemical group [H]C([H])([H])C(*)(C([H])([H])[H])C([H])([H])[H] 0.000 description 4
- 210000002845 virion Anatomy 0.000 description 4
- WEVYAHXRMPXWCK-UHFFFAOYSA-N Acetonitrile Chemical compound CC#N WEVYAHXRMPXWCK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 206010061818 Disease progression Diseases 0.000 description 3
- 108700024394 Exon Proteins 0.000 description 3
- JPUNZXVHHRZMNL-XIRDDKMYSA-N Glu-Pro-Trp Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CC1=CNC2=C1C=CC=C2)C(O)=O JPUNZXVHHRZMNL-XIRDDKMYSA-N 0.000 description 3
- PEDCQBHIVMGVHV-UHFFFAOYSA-N Glycerine Chemical compound OCC(O)CO PEDCQBHIVMGVHV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 108010017213 Granulocyte-Macrophage Colony-Stimulating Factor Proteins 0.000 description 3
- 102000004457 Granulocyte-Macrophage Colony-Stimulating Factor Human genes 0.000 description 3
- 101800000324 Immunoglobulin A1 protease translocator Proteins 0.000 description 3
- KFZMGEQAYNKOFK-UHFFFAOYSA-N Isopropanol Chemical compound CC(C)O KFZMGEQAYNKOFK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- IBMVEYRWAWIOTN-UHFFFAOYSA-N L-Leucyl-L-Arginyl-L-Proline Natural products CC(C)CC(N)C(=O)NC(CCCN=C(N)N)C(=O)N1CCCC1C(O)=O IBMVEYRWAWIOTN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- NVGBPTNZLWRQSY-UWVGGRQHSA-N Lys-Lys Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCCN NVGBPTNZLWRQSY-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 3
- 238000005481 NMR spectroscopy Methods 0.000 description 3
- 239000004793 Polystyrene Substances 0.000 description 3
- 101710149136 Protein Vpr Proteins 0.000 description 3
- YMTLKLXDFCSCNX-BYPYZUCNSA-N Ser-Gly-Gly Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)NCC(=O)NCC(O)=O YMTLKLXDFCSCNX-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 3
- 238000013459 approach Methods 0.000 description 3
- 230000001413 cellular effect Effects 0.000 description 3
- 238000001514 detection method Methods 0.000 description 3
- 235000014113 dietary fatty acids Nutrition 0.000 description 3
- 238000006471 dimerization reaction Methods 0.000 description 3
- 230000005750 disease progression Effects 0.000 description 3
- PRAKJMSDJKAYCZ-UHFFFAOYSA-N dodecahydrosqualene Natural products CC(C)CCCC(C)CCCC(C)CCCCC(C)CCCC(C)CCCC(C)C PRAKJMSDJKAYCZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 239000013604 expression vector Substances 0.000 description 3
- 229930195729 fatty acid Natural products 0.000 description 3
- 239000000194 fatty acid Substances 0.000 description 3
- 150000004665 fatty acids Chemical class 0.000 description 3
- 108010067216 glycyl-glycyl-glycine Proteins 0.000 description 3
- XKUKSGPZAADMRA-UHFFFAOYSA-N glycyl-glycyl-glycine Natural products NCC(=O)NCC(=O)NCC(O)=O XKUKSGPZAADMRA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 108010050848 glycylleucine Proteins 0.000 description 3
- 230000003993 interaction Effects 0.000 description 3
- 108010054155 lysyllysine Proteins 0.000 description 3
- 108020004999 messenger RNA Proteins 0.000 description 3
- 150000007523 nucleic acids Chemical class 0.000 description 3
- 210000004940 nucleus Anatomy 0.000 description 3
- 229920001184 polypeptide Polymers 0.000 description 3
- 229920002223 polystyrene Polymers 0.000 description 3
- 230000001566 pro-viral effect Effects 0.000 description 3
- UQDJGEHQDNVPGU-UHFFFAOYSA-N serine phosphoethanolamine Chemical compound [NH3+]CCOP([O-])(=O)OCC([NH3+])C([O-])=O UQDJGEHQDNVPGU-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 229910052717 sulfur Inorganic materials 0.000 description 3
- 230000014616 translation Effects 0.000 description 3
- CHRJZRDFSQHIFI-UHFFFAOYSA-N 1,2-bis(ethenyl)benzene;styrene Chemical compound C=CC1=CC=CC=C1.C=CC1=CC=CC=C1C=C CHRJZRDFSQHIFI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 102000002260 Alkaline Phosphatase Human genes 0.000 description 2
- 108020004774 Alkaline Phosphatase Proteins 0.000 description 2
- 108010078791 Carrier Proteins Proteins 0.000 description 2
- 102000014914 Carrier Proteins Human genes 0.000 description 2
- 102000004127 Cytokines Human genes 0.000 description 2
- 108090000695 Cytokines Proteins 0.000 description 2
- RTZKZFJDLAIYFH-UHFFFAOYSA-N Diethyl ether Chemical compound CCOCC RTZKZFJDLAIYFH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- CCBIBMKQNXHNIN-ZETCQYMHSA-N Gly-Leu-Gly Chemical compound NCC(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)NCC(O)=O CCBIBMKQNXHNIN-ZETCQYMHSA-N 0.000 description 2
- IEGFSKKANYKBDU-QWHCGFSZSA-N Gly-Phe-Pro Chemical compound C1C[C@@H](N(C1)C(=O)[C@H](CC2=CC=CC=C2)NC(=O)CN)C(=O)O IEGFSKKANYKBDU-QWHCGFSZSA-N 0.000 description 2
- JBCLFWXMTIKCCB-UHFFFAOYSA-N H-Gly-Phe-OH Natural products NCC(=O)NC(C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 JBCLFWXMTIKCCB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- QCBYAHHNOHBXIH-UWVGGRQHSA-N His-Pro-Gly Chemical compound C([C@H](N)C(=O)N1[C@@H](CCC1)C(=O)NCC(O)=O)C1=CN=CN1 QCBYAHHNOHBXIH-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 2
- 108010065920 Insulin Lispro Proteins 0.000 description 2
- 102000014150 Interferons Human genes 0.000 description 2
- 108010050904 Interferons Proteins 0.000 description 2
- LESXFEZIFXFIQR-LURJTMIESA-N Leu-Gly Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)NCC(O)=O LESXFEZIFXFIQR-LURJTMIESA-N 0.000 description 2
- DSFYPIUSAMSERP-IHRRRGAJSA-N Leu-Leu-Arg Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCN=C(N)N DSFYPIUSAMSERP-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 2
- PPGBXYKMUMHFBF-KATARQTJSA-N Leu-Ser-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O PPGBXYKMUMHFBF-KATARQTJSA-N 0.000 description 2
- 102000043129 MHC class I family Human genes 0.000 description 2
- 108091054437 MHC class I family Proteins 0.000 description 2
- 102000043131 MHC class II family Human genes 0.000 description 2
- 108091054438 MHC class II family Proteins 0.000 description 2
- 108010077850 Nuclear Localization Signals Proteins 0.000 description 2
- 108091028043 Nucleic acid sequence Proteins 0.000 description 2
- ZLAKUZDMKVKFAI-JYJNAYRXSA-N Phe-Pro-Val Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O ZLAKUZDMKVKFAI-JYJNAYRXSA-N 0.000 description 2
- 108091000080 Phosphotransferase Proteins 0.000 description 2
- 102000009572 RNA Polymerase II Human genes 0.000 description 2
- FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M Sodium chloride Chemical compound [Na+].[Cl-] FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 2
- CJEHCEOXPLASCK-MEYUZBJRSA-N Thr-Tyr-Lys Chemical compound NCCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@@H](N)[C@H](O)C)CC1=CC=C(O)C=C1 CJEHCEOXPLASCK-MEYUZBJRSA-N 0.000 description 2
- DWAMXBFJNZIHMC-KBPBESRZSA-N Tyr-Leu-Gly Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)NCC(O)=O DWAMXBFJNZIHMC-KBPBESRZSA-N 0.000 description 2
- DOFAQXCYFQKSHT-SRVKXCTJSA-N Val-Pro-Pro Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N1[C@H](C(O)=O)CCC1 DOFAQXCYFQKSHT-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 2
- 210000001106 artificial yeast chromosome Anatomy 0.000 description 2
- 239000000872 buffer Substances 0.000 description 2
- 230000015556 catabolic process Effects 0.000 description 2
- 230000020411 cell activation Effects 0.000 description 2
- 210000000170 cell membrane Anatomy 0.000 description 2
- 230000008878 coupling Effects 0.000 description 2
- 238000010168 coupling process Methods 0.000 description 2
- 238000005859 coupling reaction Methods 0.000 description 2
- 238000006731 degradation reaction Methods 0.000 description 2
- 238000012217 deletion Methods 0.000 description 2
- 230000037430 deletion Effects 0.000 description 2
- 239000000539 dimer Substances 0.000 description 2
- 230000003828 downregulation Effects 0.000 description 2
- 229940079593 drug Drugs 0.000 description 2
- 239000003814 drug Substances 0.000 description 2
- 230000012202 endocytosis Effects 0.000 description 2
- 239000000706 filtrate Substances 0.000 description 2
- 108010081551 glycylphenylalanine Proteins 0.000 description 2
- 230000003394 haemopoietic effect Effects 0.000 description 2
- IPCSVZSSVZVIGE-UHFFFAOYSA-N hexadecanoic acid Chemical compound CCCCCCCCCCCCCCCC(O)=O IPCSVZSSVZVIGE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 230000005847 immunogenicity Effects 0.000 description 2
- 230000010354 integration Effects 0.000 description 2
- 229940047124 interferons Drugs 0.000 description 2
- 239000003446 ligand Substances 0.000 description 2
- 125000005647 linker group Chemical group 0.000 description 2
- 239000007788 liquid Substances 0.000 description 2
- 239000000463 material Substances 0.000 description 2
- 231100000252 nontoxic Toxicity 0.000 description 2
- 102000039446 nucleic acids Human genes 0.000 description 2
- 108020004707 nucleic acids Proteins 0.000 description 2
- 102000020233 phosphotransferase Human genes 0.000 description 2
- 239000013612 plasmid Substances 0.000 description 2
- 108010090894 prolylleucine Proteins 0.000 description 2
- 230000035945 sensitivity Effects 0.000 description 2
- 238000010561 standard procedure Methods 0.000 description 2
- 230000004936 stimulating effect Effects 0.000 description 2
- 230000000638 stimulation Effects 0.000 description 2
- 239000000126 substance Substances 0.000 description 2
- 239000000758 substrate Substances 0.000 description 2
- 230000002194 synthesizing effect Effects 0.000 description 2
- 125000004213 tert-butoxy group Chemical group [H]C([H])([H])C(O*)(C([H])([H])[H])C([H])([H])[H] 0.000 description 2
- 108091006106 transcriptional activators Proteins 0.000 description 2
- 238000012546 transfer Methods 0.000 description 2
- 238000013519 translation Methods 0.000 description 2
- 238000011144 upstream manufacturing Methods 0.000 description 2
- 239000011534 wash buffer Substances 0.000 description 2
- ANAZDOWEOOFEET-UHFFFAOYSA-N (4-hydroxyphenyl) [4-(3-oxo-1h-2-benzofuran-1-yl)phenyl] hydrogen phosphate Chemical compound C1=CC(O)=CC=C1OP(O)(=O)OC1=CC=C(C2C3=CC=CC=C3C(=O)O2)C=C1 ANAZDOWEOOFEET-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- YYGNTYWPHWGJRM-UHFFFAOYSA-N (6E,10E,14E,18E)-2,6,10,15,19,23-hexamethyltetracosa-2,6,10,14,18,22-hexaene Chemical compound CC(C)=CCCC(C)=CCCC(C)=CCCC=C(C)CCC=C(C)CCC=C(C)C YYGNTYWPHWGJRM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000003088 (fluoren-9-ylmethoxy)carbonyl group Chemical group 0.000 description 1
- DHBXNPKRAUYBTH-UHFFFAOYSA-N 1,1-ethanedithiol Chemical compound CC(S)S DHBXNPKRAUYBTH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- LRQKBLKVPFOOQJ-UHFFFAOYSA-N 2-aminohexanoic acid Chemical compound CCCCC(N)C(O)=O LRQKBLKVPFOOQJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- MCSXGCZMEPXKIW-UHFFFAOYSA-N 3-hydroxy-4-[(4-methyl-2-nitrophenyl)diazenyl]-N-(3-nitrophenyl)naphthalene-2-carboxamide Chemical compound Cc1ccc(N=Nc2c(O)c(cc3ccccc23)C(=O)Nc2cccc(c2)[N+]([O-])=O)c(c1)[N+]([O-])=O MCSXGCZMEPXKIW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- ZCYVEMRRCGMTRW-UHFFFAOYSA-N 7553-56-2 Chemical compound [I] ZCYVEMRRCGMTRW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- QTBSBXVTEAMEQO-UHFFFAOYSA-M Acetate Chemical compound CC([O-])=O QTBSBXVTEAMEQO-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- JQDFGZKKXBEANU-IMJSIDKUSA-N Ala-Cys Chemical compound C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CS)C(O)=O JQDFGZKKXBEANU-IMJSIDKUSA-N 0.000 description 1
- UQJUGHFKNKGHFQ-VZFHVOOUSA-N Ala-Cys-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O UQJUGHFKNKGHFQ-VZFHVOOUSA-N 0.000 description 1
- VBRDBGCROKWTPV-XHNCKOQMSA-N Ala-Glu-Pro Chemical compound C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCC(=O)O)C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)O)N VBRDBGCROKWTPV-XHNCKOQMSA-N 0.000 description 1
- WPWUFUBLGADILS-WDSKDSINSA-N Ala-Pro Chemical compound C[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(O)=O WPWUFUBLGADILS-WDSKDSINSA-N 0.000 description 1
- XPSGESXVBSQZPL-SRVKXCTJSA-N Arg-Arg-Arg Chemical compound NC(N)=NCCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(O)=O XPSGESXVBSQZPL-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- BTJVOUQWFXABOI-IHRRRGAJSA-N Arg-Lys-Lys Chemical compound NCCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CCCCN)NC(=O)[C@@H](N)CCCNC(N)=N BTJVOUQWFXABOI-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 1
- 239000004475 Arginine Substances 0.000 description 1
- 241000894006 Bacteria Species 0.000 description 1
- 231100000699 Bacterial toxin Toxicity 0.000 description 1
- 241000588832 Bordetella pertussis Species 0.000 description 1
- 108091003079 Bovine Serum Albumin Proteins 0.000 description 1
- 101100505161 Caenorhabditis elegans mel-32 gene Proteins 0.000 description 1
- 101100152433 Caenorhabditis elegans tat-1 gene Proteins 0.000 description 1
- 101710132601 Capsid protein Proteins 0.000 description 1
- 102000019034 Chemokines Human genes 0.000 description 1
- 108010012236 Chemokines Proteins 0.000 description 1
- 102000009016 Cholera Toxin Human genes 0.000 description 1
- 108010049048 Cholera Toxin Proteins 0.000 description 1
- 108091026890 Coding region Proteins 0.000 description 1
- 108010069514 Cyclic Peptides Proteins 0.000 description 1
- 102000001189 Cyclic Peptides Human genes 0.000 description 1
- 102000002435 Cyclin T Human genes 0.000 description 1
- 108010068106 Cyclin T Proteins 0.000 description 1
- 102100024457 Cyclin-dependent kinase 9 Human genes 0.000 description 1
- XWTGTTNUCCEFJI-UBHSHLNASA-N Cys-Ser-Trp Chemical compound C1=CC=C2C(=C1)C(=CN2)C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@H](CS)N XWTGTTNUCCEFJI-UBHSHLNASA-N 0.000 description 1
- 108010016626 Dipeptides Proteins 0.000 description 1
- 101710146739 Enterotoxin Proteins 0.000 description 1
- 239000004593 Epoxy Substances 0.000 description 1
- 241000588724 Escherichia coli Species 0.000 description 1
- 108700039887 Essential Genes Proteins 0.000 description 1
- 230000010337 G2 phase Effects 0.000 description 1
- 108010010803 Gelatin Proteins 0.000 description 1
- QJCKNLPMTPXXEM-AUTRQRHGSA-N Glu-Glu-Val Chemical compound CC(C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CCC(O)=O QJCKNLPMTPXXEM-AUTRQRHGSA-N 0.000 description 1
- OVSKVOOUFAKODB-UWVGGRQHSA-N Gly-Arg-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](NC(=O)CN)CCCN=C(N)N OVSKVOOUFAKODB-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 1
- XPJBQTCXPJNIFE-ZETCQYMHSA-N Gly-Gly-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)CNC(=O)CN XPJBQTCXPJNIFE-ZETCQYMHSA-N 0.000 description 1
- 208000037357 HIV infectious disease Diseases 0.000 description 1
- SYMSVYVUSPSAAO-IHRRRGAJSA-N His-Arg-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CNC=N1)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O SYMSVYVUSPSAAO-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 1
- 101000980930 Homo sapiens Cyclin-dependent kinase 9 Proteins 0.000 description 1
- 108091006905 Human Serum Albumin Proteins 0.000 description 1
- 206010061598 Immunodeficiency Diseases 0.000 description 1
- 208000029462 Immunodeficiency disease Diseases 0.000 description 1
- 102000001706 Immunoglobulin Fab Fragments Human genes 0.000 description 1
- 108010054477 Immunoglobulin Fab Fragments Proteins 0.000 description 1
- 102100034343 Integrase Human genes 0.000 description 1
- 108010002352 Interleukin-1 Proteins 0.000 description 1
- 108010063738 Interleukins Proteins 0.000 description 1
- 102000015696 Interleukins Human genes 0.000 description 1
- ONIBWKKTOPOVIA-BYPYZUCNSA-N L-Proline Chemical compound OC(=O)[C@@H]1CCCN1 ONIBWKKTOPOVIA-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 1
- 150000008575 L-amino acids Chemical class 0.000 description 1
- ZUKPVRWZDMRIEO-VKHMYHEASA-N L-cysteinylglycine Chemical compound SC[C@H]([NH3+])C(=O)NCC([O-])=O ZUKPVRWZDMRIEO-VKHMYHEASA-N 0.000 description 1
- COLNVLDHVKWLRT-QMMMGPOBSA-N L-phenylalanine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=CC=C1 COLNVLDHVKWLRT-QMMMGPOBSA-N 0.000 description 1
- 241000880493 Leptailurus serval Species 0.000 description 1
- IBMVEYRWAWIOTN-RWMBFGLXSA-N Leu-Arg-Pro Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(=O)N1CCC[C@@H]1C(O)=O IBMVEYRWAWIOTN-RWMBFGLXSA-N 0.000 description 1
- WRLPVDVHNWSSCL-MELADBBJSA-N Leu-His-Pro Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CN=CN1)C(=O)N2CCC[C@@H]2C(=O)O)N WRLPVDVHNWSSCL-MELADBBJSA-N 0.000 description 1
- DPURXCQCHSQPAN-AVGNSLFASA-N Leu-Pro-Pro Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N1[C@H](C(O)=O)CCC1 DPURXCQCHSQPAN-AVGNSLFASA-N 0.000 description 1
- DAYQSYGBCUKVKT-VOAKCMCISA-N Leu-Thr-Lys Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(O)=O DAYQSYGBCUKVKT-VOAKCMCISA-N 0.000 description 1
- FZIJIFCXUCZHOL-CIUDSAMLSA-N Lys-Ala-Ala Chemical compound OC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@@H](N)CCCCN FZIJIFCXUCZHOL-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- GNLJXWBNLAIPEP-MELADBBJSA-N Lys-His-Pro Chemical compound C1C[C@@H](N(C1)C(=O)[C@H](CC2=CN=CN2)NC(=O)[C@H](CCCCN)N)C(=O)O GNLJXWBNLAIPEP-MELADBBJSA-N 0.000 description 1
- LJADEBULDNKJNK-IHRRRGAJSA-N Lys-Leu-Val Chemical compound CC(C)C[C@H](NC(=O)[C@@H](N)CCCCN)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O LJADEBULDNKJNK-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 1
- OFOBLEOULBTSOW-UHFFFAOYSA-N Malonic acid Chemical compound OC(=O)CC(O)=O OFOBLEOULBTSOW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- HLQWFLJOJRFXHO-CIUDSAMLSA-N Met-Glu-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CCSC)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O HLQWFLJOJRFXHO-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- NSMXRFMGZYTFEX-KJEVXHAQSA-N Met-Thr-Tyr Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(C=C1)O)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCSC)N)O NSMXRFMGZYTFEX-KJEVXHAQSA-N 0.000 description 1
- 241000699670 Mus sp. Species 0.000 description 1
- AUEJLPRZGVVDNU-UHFFFAOYSA-N N-L-tyrosyl-L-leucine Natural products CC(C)CC(C(O)=O)NC(=O)C(N)CC1=CC=C(O)C=C1 AUEJLPRZGVVDNU-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- AJHCSUXXECOXOY-UHFFFAOYSA-N N-glycyl-L-tryptophan Natural products C1=CC=C2C(CC(NC(=O)CN)C(O)=O)=CNC2=C1 AJHCSUXXECOXOY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 206010067482 No adverse event Diseases 0.000 description 1
- 108050000506 Nuclear RNA export factor Proteins 0.000 description 1
- 102000008731 Nuclear RNA export factor Human genes 0.000 description 1
- 108700020796 Oncogene Proteins 0.000 description 1
- 235000021314 Palmitic acid Nutrition 0.000 description 1
- 241000237988 Patellidae Species 0.000 description 1
- CMHTUJQZQXFNTQ-OEAJRASXSA-N Phe-Leu-Thr Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@H](CC1=CC=CC=C1)N)O CMHTUJQZQXFNTQ-OEAJRASXSA-N 0.000 description 1
- 244000126010 Pithecellobium dulce Species 0.000 description 1
- 208000000474 Poliomyelitis Diseases 0.000 description 1
- 239000002202 Polyethylene glycol Substances 0.000 description 1
- 229920001213 Polysorbate 20 Polymers 0.000 description 1
- ZKQOUHVVXABNDG-IUCAKERBSA-N Pro-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H]1CCCN1 ZKQOUHVVXABNDG-IUCAKERBSA-N 0.000 description 1
- VTFXTWDFPTWNJY-RHYQMDGZSA-N Pro-Leu-Thr Chemical compound [H]N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O VTFXTWDFPTWNJY-RHYQMDGZSA-N 0.000 description 1
- WFIVLLFYUZZWOD-RHYQMDGZSA-N Pro-Lys-Thr Chemical compound [H]N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O WFIVLLFYUZZWOD-RHYQMDGZSA-N 0.000 description 1
- ONIBWKKTOPOVIA-UHFFFAOYSA-N Proline Natural products OC(=O)C1CCCN1 ONIBWKKTOPOVIA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 101710192141 Protein Nef Proteins 0.000 description 1
- 101710150344 Protein Rev Proteins 0.000 description 1
- 101710149122 Protein Vpu Proteins 0.000 description 1
- 108010009460 RNA Polymerase II Proteins 0.000 description 1
- 108010092799 RNA-directed DNA polymerase Proteins 0.000 description 1
- 108020004511 Recombinant DNA Proteins 0.000 description 1
- 108700005075 Regulator Genes Proteins 0.000 description 1
- 208000035415 Reinfection Diseases 0.000 description 1
- 108091027981 Response element Proteins 0.000 description 1
- 108050008861 SH3 domains Proteins 0.000 description 1
- 102000000395 SH3 domains Human genes 0.000 description 1
- 240000004808 Saccharomyces cerevisiae Species 0.000 description 1
- SRTCFKGBYBZRHA-ACZMJKKPSA-N Ser-Ala-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O SRTCFKGBYBZRHA-ACZMJKKPSA-N 0.000 description 1
- FHXGMDRKJHKLKW-QWRGUYRKSA-N Ser-Tyr-Gly Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(=O)NCC(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 FHXGMDRKJHKLKW-QWRGUYRKSA-N 0.000 description 1
- 206010042566 Superinfection Diseases 0.000 description 1
- 230000006044 T cell activation Effects 0.000 description 1
- 230000024932 T cell mediated immunity Effects 0.000 description 1
- 206010043376 Tetanus Diseases 0.000 description 1
- 108010055044 Tetanus Toxin Proteins 0.000 description 1
- BHEOSNUKNHRBNM-UHFFFAOYSA-N Tetramethylsqualene Natural products CC(=C)C(C)CCC(=C)C(C)CCC(C)=CCCC=C(C)CCC(C)C(=C)CCC(C)C(C)=C BHEOSNUKNHRBNM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- YRNBANYVJJBGDI-VZFHVOOUSA-N Thr-Ala-Cys Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)O)N)O YRNBANYVJJBGDI-VZFHVOOUSA-N 0.000 description 1
- JLNMFGCJODTXDH-WEDXCCLWSA-N Thr-Lys-Gly Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)NCC(O)=O JLNMFGCJODTXDH-WEDXCCLWSA-N 0.000 description 1
- 108091027070 Trans-activation response element (TAR) Proteins 0.000 description 1
- 239000007983 Tris buffer Substances 0.000 description 1
- RWAYYYOZMHMEGD-XIRDDKMYSA-N Trp-Leu-Ser Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O)=CNC2=C1 RWAYYYOZMHMEGD-XIRDDKMYSA-N 0.000 description 1
- AUEJLPRZGVVDNU-STQMWFEESA-N Tyr-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=C(O)C=C1 AUEJLPRZGVVDNU-STQMWFEESA-N 0.000 description 1
- JAGGEZACYAAMIL-CQDKDKBSSA-N Tyr-Lys-Ala Chemical compound C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCCCN)NC(=O)[C@H](CC1=CC=C(C=C1)O)N JAGGEZACYAAMIL-CQDKDKBSSA-N 0.000 description 1
- IDKGBVZGNTYYCC-QXEWZRGKSA-N Val-Asn-Pro Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N1CCC[C@H]1C(O)=O IDKGBVZGNTYYCC-QXEWZRGKSA-N 0.000 description 1
- DDNIHOWRDOXXPF-NGZCFLSTSA-N Val-Asp-Pro Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)O)C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)O)N DDNIHOWRDOXXPF-NGZCFLSTSA-N 0.000 description 1
- SRWWRLKBEJZFPW-IHRRRGAJSA-N Val-Cys-Phe Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)O)N SRWWRLKBEJZFPW-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 1
- PIFJAFRUVWZRKR-QMMMGPOBSA-N Val-Gly-Gly Chemical compound CC(C)[C@H]([NH3+])C(=O)NCC(=O)NCC([O-])=O PIFJAFRUVWZRKR-QMMMGPOBSA-N 0.000 description 1
- CXWJFWAZIVWBOS-XQQFMLRXSA-N Val-Lys-Pro Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)O)N CXWJFWAZIVWBOS-XQQFMLRXSA-N 0.000 description 1
- SJRUJQFQVLMZFW-WPRPVWTQSA-N Val-Pro-Gly Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)NCC(O)=O SJRUJQFQVLMZFW-WPRPVWTQSA-N 0.000 description 1
- 241000700647 Variola virus Species 0.000 description 1
- 241000251539 Vertebrata <Metazoa> Species 0.000 description 1
- 108020005202 Viral DNA Proteins 0.000 description 1
- 108010067390 Viral Proteins Proteins 0.000 description 1
- 238000010521 absorption reaction Methods 0.000 description 1
- 239000004480 active ingredient Substances 0.000 description 1
- 108010087924 alanylproline Proteins 0.000 description 1
- 125000002947 alkylene group Chemical group 0.000 description 1
- 229940037003 alum Drugs 0.000 description 1
- AZDRQVAHHNSJOQ-UHFFFAOYSA-N alumane Chemical class [AlH3] AZDRQVAHHNSJOQ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 150000003862 amino acid derivatives Chemical class 0.000 description 1
- 125000000539 amino acid group Chemical group 0.000 description 1
- 239000005557 antagonist Substances 0.000 description 1
- 230000000840 anti-viral effect Effects 0.000 description 1
- 230000006907 apoptotic process Effects 0.000 description 1
- ODKSFYDXXFIFQN-UHFFFAOYSA-N arginine Natural products OC(=O)C(N)CCCNC(N)=N ODKSFYDXXFIFQN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000003556 assay Methods 0.000 description 1
- 230000001580 bacterial effect Effects 0.000 description 1
- 239000000688 bacterial toxin Substances 0.000 description 1
- 239000011324 bead Substances 0.000 description 1
- 230000009286 beneficial effect Effects 0.000 description 1
- 230000033228 biological regulation Effects 0.000 description 1
- 230000005540 biological transmission Effects 0.000 description 1
- 229920001400 block copolymer Polymers 0.000 description 1
- 210000004369 blood Anatomy 0.000 description 1
- 239000008280 blood Substances 0.000 description 1
- 229940098773 bovine serum albumin Drugs 0.000 description 1
- 239000006229 carbon black Substances 0.000 description 1
- 150000001732 carboxylic acid derivatives Chemical group 0.000 description 1
- 230000022131 cell cycle Effects 0.000 description 1
- 108091092328 cellular RNA Proteins 0.000 description 1
- 230000005754 cellular signaling Effects 0.000 description 1
- 238000002648 combination therapy Methods 0.000 description 1
- 229920001577 copolymer Polymers 0.000 description 1
- 235000018417 cysteine Nutrition 0.000 description 1
- XUJNEKJLAYXESH-UHFFFAOYSA-N cysteine Natural products SCC(N)C(O)=O XUJNEKJLAYXESH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108010016616 cysteinylglycine Proteins 0.000 description 1
- 210000000172 cytosol Anatomy 0.000 description 1
- 231100000433 cytotoxic Toxicity 0.000 description 1
- 230000001472 cytotoxic effect Effects 0.000 description 1
- 230000006378 damage Effects 0.000 description 1
- 230000001419 dependent effect Effects 0.000 description 1
- 230000000447 dimerizing effect Effects 0.000 description 1
- 201000010099 disease Diseases 0.000 description 1
- 231100000676 disease causative agent Toxicity 0.000 description 1
- 208000037265 diseases, disorders, signs and symptoms Diseases 0.000 description 1
- 239000012636 effector Substances 0.000 description 1
- 238000005516 engineering process Methods 0.000 description 1
- 239000000147 enterotoxin Substances 0.000 description 1
- 231100000655 enterotoxin Toxicity 0.000 description 1
- 108700004025 env Genes Proteins 0.000 description 1
- 101150030339 env gene Proteins 0.000 description 1
- 210000003743 erythrocyte Anatomy 0.000 description 1
- 210000003527 eukaryotic cell Anatomy 0.000 description 1
- 239000012467 final product Substances 0.000 description 1
- 239000012634 fragment Substances 0.000 description 1
- 230000004927 fusion Effects 0.000 description 1
- 239000000499 gel Substances 0.000 description 1
- 239000008273 gelatin Substances 0.000 description 1
- 229920000159 gelatin Polymers 0.000 description 1
- 235000019322 gelatine Nutrition 0.000 description 1
- 235000011852 gelatine desserts Nutrition 0.000 description 1
- 239000012362 glacial acetic acid Substances 0.000 description 1
- 239000011521 glass Substances 0.000 description 1
- 150000004676 glycans Chemical class 0.000 description 1
- 108010026364 glycyl-glycyl-leucine Proteins 0.000 description 1
- 108010084389 glycyltryptophan Proteins 0.000 description 1
- 230000036541 health Effects 0.000 description 1
- 108060003552 hemocyanin Proteins 0.000 description 1
- 231100000086 high toxicity Toxicity 0.000 description 1
- 239000000710 homodimer Substances 0.000 description 1
- 208000033519 human immunodeficiency virus infectious disease Diseases 0.000 description 1
- XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-M hydroxide Chemical compound [OH-] XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 230000001900 immune effect Effects 0.000 description 1
- 230000003053 immunization Effects 0.000 description 1
- 230000007813 immunodeficiency Effects 0.000 description 1
- 238000010324 immunological assay Methods 0.000 description 1
- 238000000338 in vitro Methods 0.000 description 1
- 238000010348 incorporation Methods 0.000 description 1
- 230000006698 induction Effects 0.000 description 1
- 229940047122 interleukins Drugs 0.000 description 1
- 210000000936 intestine Anatomy 0.000 description 1
- 230000010039 intracellular degradation Effects 0.000 description 1
- 238000007918 intramuscular administration Methods 0.000 description 1
- 238000001990 intravenous administration Methods 0.000 description 1
- 239000011630 iodine Substances 0.000 description 1
- 229910052740 iodine Inorganic materials 0.000 description 1
- 150000002500 ions Chemical class 0.000 description 1
- 108010073472 leucyl-prolyl-proline Proteins 0.000 description 1
- 239000007791 liquid phase Substances 0.000 description 1
- 238000011068 loading method Methods 0.000 description 1
- 230000005923 long-lasting effect Effects 0.000 description 1
- 108010064235 lysylglycine Proteins 0.000 description 1
- 210000004962 mammalian cell Anatomy 0.000 description 1
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 description 1
- 230000035800 maturation Effects 0.000 description 1
- 239000004530 micro-emulsion Substances 0.000 description 1
- 239000011859 microparticle Substances 0.000 description 1
- 239000004005 microsphere Substances 0.000 description 1
- 230000003278 mimic effect Effects 0.000 description 1
- 239000002480 mineral oil Substances 0.000 description 1
- 235000010446 mineral oil Nutrition 0.000 description 1
- 238000002156 mixing Methods 0.000 description 1
- 238000010369 molecular cloning Methods 0.000 description 1
- 108010032806 molgramostim Proteins 0.000 description 1
- 210000004877 mucosa Anatomy 0.000 description 1
- 125000001446 muramyl group Chemical group N[C@@H](C=O)[C@@H](O[C@@H](C(=O)*)C)[C@H](O)[C@H](O)CO 0.000 description 1
- 230000035772 mutation Effects 0.000 description 1
- WQEPLUUGTLDZJY-UHFFFAOYSA-N n-Pentadecanoic acid Natural products CCCCCCCCCCCCCCC(O)=O WQEPLUUGTLDZJY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- JXTPJDDICSTXJX-UHFFFAOYSA-N n-Triacontane Natural products CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC JXTPJDDICSTXJX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108700004028 nef Genes Proteins 0.000 description 1
- 239000013642 negative control Substances 0.000 description 1
- 230000003000 nontoxic effect Effects 0.000 description 1
- 230000012223 nuclear import Effects 0.000 description 1
- 238000004806 packaging method and process Methods 0.000 description 1
- 125000001312 palmitoyl group Chemical group O=C([*])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])[H] 0.000 description 1
- 238000007911 parenteral administration Methods 0.000 description 1
- 230000001717 pathogenic effect Effects 0.000 description 1
- 238000010647 peptide synthesis reaction Methods 0.000 description 1
- 210000005105 peripheral blood lymphocyte Anatomy 0.000 description 1
- 108010018625 phenylalanylarginine Proteins 0.000 description 1
- 229920001467 poly(styrenesulfonates) Polymers 0.000 description 1
- 229920000642 polymer Polymers 0.000 description 1
- 238000006116 polymerization reaction Methods 0.000 description 1
- 239000000256 polyoxyethylene sorbitan monolaurate Substances 0.000 description 1
- 235000010486 polyoxyethylene sorbitan monolaurate Nutrition 0.000 description 1
- 229920001282 polysaccharide Polymers 0.000 description 1
- 239000005017 polysaccharide Substances 0.000 description 1
- 229920000915 polyvinyl chloride Polymers 0.000 description 1
- 239000004800 polyvinyl chloride Substances 0.000 description 1
- 230000008092 positive effect Effects 0.000 description 1
- 230000003334 potential effect Effects 0.000 description 1
- 230000003389 potentiating effect Effects 0.000 description 1
- 125000002924 primary amino group Chemical group [H]N([H])* 0.000 description 1
- 230000001737 promoting effect Effects 0.000 description 1
- 230000001681 protective effect Effects 0.000 description 1
- 238000001243 protein synthesis Methods 0.000 description 1
- 231100000654 protein toxin Toxicity 0.000 description 1
- 239000001397 quillaja saponaria molina bark Substances 0.000 description 1
- 230000004044 response Effects 0.000 description 1
- 230000000717 retained effect Effects 0.000 description 1
- 230000001177 retroviral effect Effects 0.000 description 1
- 108700004030 rev Genes Proteins 0.000 description 1
- 238000004366 reverse phase liquid chromatography Methods 0.000 description 1
- 238000010839 reverse transcription Methods 0.000 description 1
- 229930182490 saponin Natural products 0.000 description 1
- 150000007949 saponins Chemical class 0.000 description 1
- 230000019491 signal transduction Effects 0.000 description 1
- 239000011780 sodium chloride Substances 0.000 description 1
- 239000002904 solvent Substances 0.000 description 1
- 241000894007 species Species 0.000 description 1
- 229940032094 squalane Drugs 0.000 description 1
- 229940031439 squalene Drugs 0.000 description 1
- TUHBEKDERLKLEC-UHFFFAOYSA-N squalene Natural products CC(=CCCC(=CCCC(=CCCC=C(/C)CCC=C(/C)CC=C(C)C)C)C)C TUHBEKDERLKLEC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000003860 storage Methods 0.000 description 1
- 238000012916 structural analysis Methods 0.000 description 1
- 238000007920 subcutaneous administration Methods 0.000 description 1
- 238000010254 subcutaneous injection Methods 0.000 description 1
- 239000007929 subcutaneous injection Substances 0.000 description 1
- 238000006467 substitution reaction Methods 0.000 description 1
- 239000004094 surface-active agent Substances 0.000 description 1
- 239000000725 suspension Substances 0.000 description 1
- 208000011580 syndromic disease Diseases 0.000 description 1
- 230000009885 systemic effect Effects 0.000 description 1
- 238000002560 therapeutic procedure Methods 0.000 description 1
- 108010061238 threonyl-glycine Proteins 0.000 description 1
- 108700012359 toxins Proteins 0.000 description 1
- 230000032258 transport Effects 0.000 description 1
- LENZDBCJOHFCAS-UHFFFAOYSA-N tris Chemical compound OCC(N)(CO)CO LENZDBCJOHFCAS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000002221 trityl group Chemical group [H]C1=C([H])C([H])=C([H])C([H])=C1C([*])(C1=C(C(=C(C(=C1[H])[H])[H])[H])[H])C1=C([H])C([H])=C([H])C([H])=C1[H] 0.000 description 1
- 108010080629 tryptophan-leucine Proteins 0.000 description 1
- 108010051110 tyrosyl-lysine Proteins 0.000 description 1
- 108010078580 tyrosylleucine Proteins 0.000 description 1
- 238000002255 vaccination Methods 0.000 description 1
- 229940125575 vaccine candidate Drugs 0.000 description 1
- 108010003885 valyl-prolyl-glycyl-glycine Proteins 0.000 description 1
- 108010015385 valyl-prolyl-proline Proteins 0.000 description 1
- 239000013598 vector Substances 0.000 description 1
- 235000015112 vegetable and seed oil Nutrition 0.000 description 1
- 239000008158 vegetable oil Substances 0.000 description 1
- 230000007442 viral DNA synthesis Effects 0.000 description 1
- 230000029812 viral genome replication Effects 0.000 description 1
- 230000006656 viral protein synthesis Effects 0.000 description 1
- 230000003612 virological effect Effects 0.000 description 1
- 238000005406 washing Methods 0.000 description 1
- 210000005253 yeast cell Anatomy 0.000 description 1
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- C07K14/005—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from viruses
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P31/00—Antiinfectives, i.e. antibiotics, antiseptics, chemotherapeutics
- A61P31/12—Antivirals
- A61P31/14—Antivirals for RNA viruses
- A61P31/18—Antivirals for RNA viruses for HIV
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K39/00—Medicinal preparations containing antigens or antibodies
- A61K2039/51—Medicinal preparations containing antigens or antibodies comprising whole cells, viruses or DNA/RNA
- A61K2039/525—Virus
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N2740/00—Reverse transcribing RNA viruses
- C12N2740/00011—Details
- C12N2740/10011—Retroviridae
- C12N2740/16011—Human Immunodeficiency Virus, HIV
- C12N2740/16311—Human Immunodeficiency Virus, HIV concerning HIV regulatory proteins
- C12N2740/16322—New viral proteins or individual genes, new structural or functional aspects of known viral proteins or genes
-
- Y—GENERAL TAGGING OF NEW TECHNOLOGICAL DEVELOPMENTS; GENERAL TAGGING OF CROSS-SECTIONAL TECHNOLOGIES SPANNING OVER SEVERAL SECTIONS OF THE IPC; TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC CROSS-REFERENCE ART COLLECTIONS [XRACs] AND DIGESTS
- Y10—TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC
- Y10S—TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC CROSS-REFERENCE ART COLLECTIONS [XRACs] AND DIGESTS
- Y10S435/00—Chemistry: molecular biology and microbiology
- Y10S435/974—Aids related test
-
- Y—GENERAL TAGGING OF NEW TECHNOLOGICAL DEVELOPMENTS; GENERAL TAGGING OF CROSS-SECTIONAL TECHNOLOGIES SPANNING OVER SEVERAL SECTIONS OF THE IPC; TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC CROSS-REFERENCE ART COLLECTIONS [XRACs] AND DIGESTS
- Y10—TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC
- Y10S—TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC CROSS-REFERENCE ART COLLECTIONS [XRACs] AND DIGESTS
- Y10S435/00—Chemistry: molecular biology and microbiology
- Y10S435/975—Kit
-
- Y—GENERAL TAGGING OF NEW TECHNOLOGICAL DEVELOPMENTS; GENERAL TAGGING OF CROSS-SECTIONAL TECHNOLOGIES SPANNING OVER SEVERAL SECTIONS OF THE IPC; TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC CROSS-REFERENCE ART COLLECTIONS [XRACs] AND DIGESTS
- Y10—TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC
- Y10S—TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC CROSS-REFERENCE ART COLLECTIONS [XRACs] AND DIGESTS
- Y10S530/00—Chemistry: natural resins or derivatives; peptides or proteins; lignins or reaction products thereof
- Y10S530/82—Proteins from microorganisms
- Y10S530/826—Viruses
Landscapes
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Virology (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Gastroenterology & Hepatology (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- Pharmacology & Pharmacy (AREA)
- Communicable Diseases (AREA)
- Oncology (AREA)
- AIDS & HIV (AREA)
- General Chemical & Material Sciences (AREA)
- Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
- Tropical Medicine & Parasitology (AREA)
- Animal Behavior & Ethology (AREA)
- Public Health (AREA)
- Veterinary Medicine (AREA)
- Peptides Or Proteins (AREA)
- Medicines Containing Antibodies Or Antigens For Use As Internal Diagnostic Agents (AREA)
- Medicinal Preparation (AREA)
Abstract
Description
Regulačné a pomocné peptidy HIV, antigény, vakcínové kompozície, súprava na imunologickú skúšku a spôsob detekcie protilátok vyvolaných HIVHIV regulatory and helper peptides, antigens, vaccine compositions, immunoassay kit and method for detecting HIV-induced antibodies
Oblasť technikyTechnical field
Tento vynález sa týka nových peptidov vychádzajúcich z konzervatívnych oblastí regulačných a pomocných peptidov HIV, antigénov voľných alebo viazaných na nosiči, ktoré obsahujú aspoň jeden z uvedených peptidov, vakcínových kompozícií obsahujúcich aspoň jeden z antigénov, súprav na imunologickú skúšku a spôsobu detekcie protilátok vyvolaných HIV alebo HIVšpecifickými peptidmi s použitím takýchto antigénov.The present invention relates to novel peptides based on the conserved regions of HIV regulatory and helper peptides, free or bound antigens comprising at least one of said peptides, vaccine compositions comprising at least one of the antigens, immunoassay kits and a method for detecting HIV-induced antibodies or HIV-specific peptides using such antigens.
Doterajší stav technikyBACKGROUND OF THE INVENTION
Ľudský vírus imunitnej nedostatočnosti typu 1 (HIV-1), činiteľ spôsobujúci získaný syndróm imunitnej nedostatočnosti (AIDS), predstavuje stále významné ohrozenie zdravia v rozvojových krajinách. V krajinách Západu majú terapeutické stratégie, ktoré sú zacielené na replikáciu HIV a jeho dozrievanie, významný vplyv na progresiu ochorenia. Vysoké náklady na súčasnú liečbu, vysoká toxicita liekov a nedostatok liečiv však spôsobujú, že vývoj bezpečných a účinných vakcín je naďalej rozhodujúci pre udržanie pandémie AIDS pod kontrolou.Human Type 1 Immunodeficiency Virus (HIV-1), the causative agent of Acquired Immune Deficiency Syndrome (AIDS), remains a significant health threat in developing countries. In Western countries, therapeutic strategies that target HIV replication and maturation have a significant impact on disease progression. However, the high cost of concomitant treatment, the high toxicity of drugs, and the lack of drugs make the development of safe and effective vaccines still crucial to keep the AIDS pandemic under control.
HIV-1 je zložitý retrovírus, ktorý kóduje šesť regulačných a pomocných génov, ktoré sa nenachádzajú v jednoduchých retrovírusoch, menovite tat, rev, nef, vif, vpr a vpu (Tabuľka 1).HIV-1 is a complex retrovirus that encodes six regulatory and helper genes not found in single retroviruses, namely tat, rev, nef, vif, vpr, and vpu (Table 1).
V eukaryotických bunkách sa len dokonale skombinované mRNA exportujú do cytoplazmy na transláciu. Neskombinované alebo čiastočne skombinované RNA sa v jadre zadržia a nakoniec sa rozkladajú. Týmto spôsobom prebieha najprv expresia proteínov kódovaných génmi tat, rev a nef (označovaných ako Tat, Rev a Nef) odvodených z viacnásobne skombinovaných druhov RNA a predstavujúcich počiatočnú expresiu génu HIV-1. Na expresiu jednodu2 cho skombinovaných RNA a tiež na prenos genómu neskombinovanej RNA úplnej dĺžky do cytoplazmy na zbalenie si HIV-1 vyvinul prostriedky na prekonanie obmedzení v prenose RNA. Regulačné proteíny Tat a Rev sú kľúčové pri replikácii HIV, pretože mutácie v týchto proteínoch zabraňujú tvorbe HIV-1 (Dayton A.I. a kol. (1986) Celí, 44:941-947 a Fisher A.G. a kol. (1986) Náture, 320:367-371).In eukaryotic cells, only perfectly combined mRNAs are exported to the cytoplasm for translation. Uncombined or partially combined RNAs are retained in the nucleus and eventually decompose. In this way, the proteins encoded by the tat, rev and nef genes (referred to as Tat, Rev, and Nef) are derived first from multiple-combined RNA species and represent the initial expression of the HIV-1 gene. For the expression of simply combined RNAs, as well as for transferring the genome of uncomplexed full-length RNA into the cytoplasm for packaging, HIV-1 has developed a means to overcome the limitations of RNA transfer. Tat and Rev regulatory proteins are crucial in HIV replication because mutations in these proteins prevent the production of HIV-1 (Dayton AI et al. (1986) Cell, 44: 941-947 and Fisher AG et al. (1986) Nature, 320: 367-371).
Pomocné gény sú odvodené z exónov umiestnených výlučne v protismere vývoja génu HIV-1, napríklad vif alebo exónov v protismere od alebo tiež vo tAuxiliary genes are derived from exons located exclusively upstream of the HIV-1 gene, for example, vif or exons upstream or downstream of the HIV-1 gene.
vnútri env, ale v rozličných čítacích rámcoch, napr. tat, rev. Efektívnosť skombinovania sčasti reguluje úrovne génovej expresie rozličných pomocných proteínov.inside env, but in different reading frames, e.g. tat, rev. The efficiency of combining partially regulates gene expression levels of various helper proteins.
Po integrácii HIV-1 provírusovej DNA sa syntetizujú prevažne skrátené formy mRNA bunkovou RNA polymerázou II, ktorá interaguje s polohami na 5' dlhom terminálnom opakovaní (LTR) provírusovej DNA. tat je jeden z prvých génov, ktorého expresia prebieha a ktorý nesie jadrový lokalizačný signál. Je to účinný aktivátor transkripcie, ktorý zvyšuje transkripciu riadenú LTR až tisíckrát. Nepretržitá expresia Tat zaisťuje kladnú spätnú väzbu pre vysokú úroveň expresie génu. Na rozdiel od bežných aktivátorov transkripcie, ktoré interagujú so sekvenciami DNA, sa Tat viaže priamo na 5' konce všetkých RNA HIV-1 pri zvláštnej sekundárnej štruktúre v tvare slučky TAR (prvku transaktivačnej odozvy). Štruktúra tejto slučky je vysoko konzervatívna aje nevyhnutná pre funkciu Tat. Štruktúra interakcie Tat/TAR sa analyzovala s použitím jadrovej magnetickej rezonancie (NMR) (Puglisi a kol. (1992) Science, 257:76-80). Tat viaže TAR v spojení s bunkovým proteínom cyklínom T, ktorý zasa viaže CDK9, ktorý fosforyluje C-terminálnu doménu RNA polymerázy II, čím podporuje predlžovanie transkripcie RNA. Tieto bunkové kofaktory Tat sú prítomné iba v aktivovaných bunkách, ich neprítomnosť potláča transkripciu provírusovej DNA, čím dochádza ku „kvázilatencii“ v T lymfocytoch. Expresia Tat prebieha z dvoch exónov, pričom jadrový lokalizačný signál a väzbová oblasť TAR sú umiestnené v prvom exóne. Infikované bunky vylučujú Tat a tento môže pôsobiť heterológnymi účinkami na susedné bunky. K týmto účinkom patrí bunková aktivácia (Hofman a kol. (1993) Blood, 82:2774-2780), vyvolanie bunkovej a3 poptózy (Macho a kol. (1999) Oncogene, 18:7543-7551), fungovanie ako vyliečiteľný rastový faktor (Trinh, D.P. a kol. (1999) Biochem. Biophys. Res. Commun., 256:299-306) a modulovanie syntézy hostiteľského bunkového proteínu v prospech syntézy vírusového proteínu (Xiao a kol. (1998) Biochem. Biophys. Res. Commun., 244:384-389). Terapeutické stratégie cielené na Tat budú preto mať značný vplyv na infekciu HIV-1.Upon integration of HIV-1 proviral DNA, predominantly truncated forms of mRNA are synthesized by cellular RNA polymerase II, which interacts with positions at the 5 'long terminal repeat (LTR) of the proviral DNA. tat is one of the first genes to be expressed and which carries a nuclear localization signal. It is a potent transcriptional activator that increases LTR-driven transcription up to a thousand fold. Continuous expression of Tat provides positive feedback for a high level of gene expression. Unlike conventional transcriptional activators that interact with DNA sequences, Tat binds directly to the 5 'ends of all HIV-1 RNAs in a separate TAR loop (transactivation response element) secondary structure. The structure of this loop is highly conserved and necessary for the Tat function. The structure of the Tat / TAR interaction was analyzed using nuclear magnetic resonance (NMR) (Puglisi et al. (1992) Science, 257: 76-80). Tat binds TAR in conjunction with the cell protein cyclin T, which in turn binds CDK9, which phosphorylates the C-terminal domain of RNA polymerase II, thereby promoting prolongation of RNA transcription. These Tat cell cofactors are present only in activated cells, their absence suppresses transcription of proviral DNA, thereby "quasi-latency" in T lymphocytes. Tat expression occurs from two exons, with the nuclear localization signal and the TAR binding region located in the first exon. Infected cells secrete Tat, and this may exert heterologous effects on neighboring cells. These effects include cell activation (Hofman et al. (1993) Blood, 82: 2774-2780), induction of cellular α3 demand (Macho et al. (1999) Oncogene, 18: 7543-7551), functioning as a curable growth factor ( Trinh, DP et al (1999) Biochem. Biophys. Res. Commun., 256: 299-306) and modulating host cell protein synthesis in favor of viral protein synthesis (Xiao et al. (1998) Biochem. Biophys. Res. Commun. 244: 384-389). Therapeutic strategies targeted to Tat will therefore have a significant impact on HIV-1 infection.
V počiatočných štádiách po infikovaní majú prevahu malé viacnásobne skombinované mRNA kódujúce Tat, Rev a Nef. Keď sa dosiahne prahová hladina Rev, neskombinované a jednoducho skombinované RNA sa zhromažďujú v cytoplazme na transláciu, čo umožní pokračovanie rozširovania infekcie. Zlyhanie pri tvorení tejto prahovej hladiny Rev môže prispieť k kvázilatencii HIV. Rev sa môže viazať len na tie RNA, ktoré obsahujú zvláštnu RNA štruktúru RRE (prvok odozvy na Rev), ktorá je umiestnená v env kódujúcej oblasti genómu. Rev interaguje s RRE ako multimér prostredníctvom zásaditej oblasti bohatej na arginín, ktorá je prítomná v amino terminálnej polovici proteínu. Dôsledkom tejto interakcie je prenos čiastočne skombinovaných RNA, ktoré poskytnú produkty génov, ako sú Env, Vif, Vpu a Vpr, ako aj neskombinovaných RNA, ktoré budú slúžiť ako nové genómy na začlenenie do vytvárajúcich sa častíc. Urobila sa tiež štruktúrna analýza interakcie Rev/RRE s pomocou NMR (Battiste a kol. (1996) Science, 273:1547-1551). Rev obsahuje bohatý exportný signál, čo mu umožňuje byť prenášačom pre nepretržitý transport práve syntetizovaných RNA medzi jadrom a cytoplazmou (Kalland a kol. (1994) J. Virol., 68:1475-1485; Meyer & Málim, (1994) Genes Dev., 8:1538-1547). Týmto spôsobom Rev zabezpečuje, že expresia štruktúrnych génov prebieha neskôr, až po regulačných génoch. Terapeutické stratégie nasmerované voči Rev prerušia vo včasnom štádiu infekcie životný cyklus vírusu.In the early stages after infection, small, multiple, combined mRNAs encoding Tat, Rev and Nef predominate. When the Rev threshold is reached, un combined and simply combined RNAs are collected in the cytoplasm for translation, allowing the infection to continue to spread. Failure to create this Rev threshold can contribute to HIV quasi-latency. Rev can only bind to RNAs that contain a particular RNA structure of the RRE (Rev Response Element) that is located in the env coding region of the genome. Rev interacts with RRE as a multimer through an arginine-rich basic region that is present in the amino terminal half of the protein. The consequence of this interaction is the transfer of partially combined RNAs, which will provide products of genes such as Env, Vif, Vpu and Vpr, as well as non-combined RNAs, which will serve as new genomes for incorporation into the forming particles. Structural analysis of Rev / RRE interaction by NMR was also performed (Battiste et al. (1996) Science, 273: 1547-1551). Rev contains a rich export signal, allowing it to be a carrier for the continuous transport of just synthesized RNA between the nucleus and the cytoplasm (Kalland et al. (1994) J. Virol., 68: 1475-1485; Meyer & Malim, (1994) Genes Dev. 8: 1538-1547). In this way, Rev ensures that the expression of structural genes takes place later, up to the regulatory genes. Therapeutic strategies directed at Rev interrupt the virus life cycle at an early stage of infection.
Aj keď bol pôvodne Nef opísaný ako negatívny faktor, neskôr sa ukázalo, že má pozitívne účinky na replikáciu vírusu a jeho expresia prebieha vo väčšom rozsahu ako Tat a Rev na začiatku aj v priebehu infekcie. Nef sa myristyluje na N konci a je spojený s vnútornou stranou plazmovej membrány. Nef je sčasti zodpovedný za reguláciu znižovaním a za rozklad povrchovej CD4 endocytózou (Piguet a kol. (1998) EMBO J., 17:2472-2481). Odstránenie CD4 z povrchu bunky zabraňuje superinfekcii inými kmeňmi HIV-1 alebo opätovnej infekcii práve uvoľneným vírusom. Nef je tiež zodpovedný za reguláciu znižovaním MHC triedy I, čím ochraňuje infikované bunky pred deštrukciou cytotoxickými lymfocytmi T (Le Gali a kol. (1997) Res. Virol., 148:43-47). Nef nie je kľúčovým proteínom vírusu, pretože nie je potrebný pre infekciu in vitro lymfocytov periférnej krvi alebo bunkových línii T. Delečné mutanty Nef sú však v dlhších časových obdobiach menej patogénne. Nef má tiež zložité vplyvy na prenosové cesty signálu v bunke a obsahuje oblasti bohaté na prolín, ktoré môžu interagovať s doménou SH3 kináz zúčastňujúcich sa na aktivácii buniek T, čo je vlastnosť potrebná na účinnú replikáciu HIV (Moarefi a kol. (1997) Náture, 385:650-653). Vírusy obsahujúce Nef sú schopné syntetizovať viac vírusovej DNA než vírusy s vynechaným génom Nef, čo naznačuje, že Nef priamo alebo nepriamo aktivuje reverzné transkriptázy vírusu. Za tento jav môže byť zodpovedná nízka hladina Nef spojená s viriónmi. Nízke hladiny Nef sa uvoľňujú aj z infikovaných buniek, hoci potenciálny účinok susedných buniek je nejasný. Pretože expresia Nef prebieha na začiatku infekcie a má výrazné účinky na expresiu CD4 a MHC triedy I, ako aj na progresiu choroby, predstavuje Nef dôležitý cieľ pre budúce terapeutické stratégie.Although initially Nef has been described as a negative factor, it has later been shown to have positive effects on virus replication and is expressed to a greater extent than Tat and Rev at the beginning and during infection. Nef is myristylated at the N terminus and is joined to the inside of the plasma membrane. Nef is partly responsible for downregulation and degradation of surface CD4 by endocytosis (Piguet et al. (1998) EMBO J., 17: 2472-2481). Removal of CD4 from the cell surface prevents superinfection with other strains of HIV-1 or reinfection with just released virus. Nef is also responsible for regulation by reducing MHC class I, thereby protecting infected cells from destruction by cytotoxic T lymphocytes (Le Gali et al. (1997) Res. Virol., 148: 43-47). Nef is not a key viral protein since it is not required for infection of peripheral blood lymphocytes or T cell lines in vitro. However, Nef deletion mutants are less pathogenic over longer periods of time. Nef also has complex effects on signal transduction pathways in the cell and contains proline-rich regions that can interact with the SH3 domain of kinases involved in T cell activation, a property necessary for efficient HIV replication (Moarefi et al. (1997) Nature, 385: 650-653). Nef-containing viruses are capable of synthesizing more viral DNA than Nef omitted viruses, suggesting that Nef directly or indirectly activates virus reverse transcriptases. The low level of Nef associated with virions may be responsible for this phenomenon. Low levels of Nef are also released from infected cells, although the potential effect of neighboring cells is unclear. Since Nef expression occurs at the onset of infection and has profound effects on the expression of CD4 and MHC class I as well as disease progression, Nef is an important target for future therapeutic strategies.
Tat a Nef sa vylučujú a môžu byť prijímané makrofágmi a ich expresia môže prebiehať v spojení s molekulami MHC triedy II. To zvyšuje ich stabilitu ako cieľov pre terapie na báze peptidov, ktorých expresia by tiež mohla prebiehať v súvislosti s MHC triedy II. Je jasné, že zameranie sa na počiatočné génové produkty, ktoré sú kľúčové pri replikácii HIV-1, ako sú Tat a Rev, by malo dostať prednosť rovnako ako Nef, ktorého expresia prebieha tiež na začiatku a ovplyvňuje progresiu choroby.Tat and Nef are secreted and can be taken up by macrophages and can be expressed in association with MHC class II molecules. This increases their stability as targets for peptide-based therapies, which could also be expressed in connection with MHC class II. It is clear that focusing on the initial gene products that are key in HIV-1 replication, such as Tat and Rev, should be preferred as Nef, whose expression also occurs initially and affects disease progression.
Tabuľka 1 Regulačné a pomocné proteíny HIV-1Table 1 HIV-1 regulatory and helper proteins
Prirodzene sa vyskytujúce sekvencie HIV v kandidátoch na vakcínu nie sú schopné stimulovať stabilnú a dlhotrvajúcu imunitnú odozvu kvôli vnútornej schopnosti HIV ukryť sa pre imunitný systém zmenou vzhľadu prítomných epitopov. Na prekonanie tohto premenlivého vzhľadu epitopov budú niektoré substitúcie aminokyselín a kombinácie aminokyselín podporovať imunitný systém v objavení a rozpoznávaní týchto antigénov cudzieho vírusu spoľahlivým spôsobom, a preto aj vo väčšej miere.The naturally occurring HIV sequences in the vaccine candidates are unable to stimulate a stable and long lasting immune response due to the intrinsic ability of HIV to hide for the immune system by altering the appearance of the epitopes present. To overcome this variable epitope appearance, some amino acid substitutions and combinations of amino acids will support the immune system in the discovery and recognition of these foreign virus antigens in a reliable manner and therefore to a greater extent.
Na základe vyššie uvedených známych faktov sme sa rozhodli preskúmať možnosť vytvorenia nových syntetických peptidov, ktoré môžu napodobňovať epitopy z regulačných a pomocných proteínov HIV takým spôsobom, že môžu rBased on the above known facts, we decided to explore the possibility of generating new synthetic peptides that can mimic epitopes from HIV regulatory and helper proteins in such a way that they can
byť prístupné pre humorálnu ako aj bunkovú časť imunitného systému, a spĺňali by požiadavky na účinnú terapeutickú a/alebo profylaktickú vakcínu.be accessible to the humoral as well as the cellular part of the immune system, and would meet the requirements for an effective therapeutic and / or prophylactic vaccine.
Počiatočné práce vychádzali z prirodzených sekvencií aminokyselín Tat publikovaných Korberom a kol., Human Retroviruses and AIDS (Ľudské retrovírusy a AIDS), 1997, Red. Theoretical Biology and Biophysics Group, Los Alamos National Laboratory, Los Alamos, NM. Prvý epitop Tat je umiestnený medzi aminokyselinou 1 a aminokyselinou 24 proteínu tat:The initial work was based on the natural amino acid sequences of Tat published by Korber et al., Human Retroviruses and AIDS, 1997, Red. Theoretical Biology and Biophysics, Los Alamos National Laboratory, Los Alamos, NM. The first Tat epitope is located between amino acid 1 and amino acid 24 of the tat protein:
Tabuľka 2. Epitop TatTable 2. Epitope Tat
ΊΊ
Jednopísmenové, rovnako ako trojpísmenové kódy definujúce aminokyseliny v sekvenciách uvedených v tejto špecifikácii sú v súlade s medzinárodnými normami a sú uvedené v učebniciach, napríklad Lehninger A.L., „Principles of Biochemistry“ (Základy biochémie), Worth Publishers Inc., New York, 1982. Aminokyseliny uvedené napravo od ľavého stĺpca predstavujú prirodzené varianty sekvencie. Naše analýzy viedli k sekvencii obsahujúcej tento modifikovaný epitop:The single-letter as well as three-letter codes defining amino acids in the sequences given in this specification are in accordance with international standards and are given in textbooks, for example Lehninger AL, "Principles of Biochemistry", Worth Publishers Inc., New York, 1982. The amino acids listed to the right of the left column represent natural sequence variants. Our analyzes led to a sequence containing this modified epitope:
CSWVNPRLEPWLHPGSQPN1TACTN v ktorom NI označuje kyselinu 2-aminohexánovú (norleucín, v skratke Nie v trojpísmenovom resp. NI v jednopísmenovom kóde) a cysteínové zvyšky sú v oxidovanom stave, t.j. vytvárajú vnútroreťazcovú disulfidickú väzbu. Pretože cysteínový zvyšok v C-koncovej časti (v polohe 22) peptidu je časťou intramolekulovej disulfidickej väzby mimo tohto zvoleného epitopu, podobná intrapeptidová disulfidická väzba sa vytvorí umiestnením cysteínu do N-koncovej časti zvoleného epitopu. Inou možnosťou je vytvorenie intermolekulovej disulfidickej väzby dimerizáciou sekvencií:CSWVNPRLEPWLHPGSQPN1TACTN in which NI denotes 2-aminohexanoic acid (norleucine, abbreviated as Not in the three-letter or NI in the one-letter code, respectively) and the cysteine residues are in an oxidized state, i.e. they form an intra-chain disulfide bond. Since the cysteine residue in the C-terminal portion (at position 22) of the peptide is part of an intramolecular disulfide bond outside this selected epitope, a similar intrapeptide disulfide bond is formed by placing a cysteine in the N-terminal portion of the selected epitope. Another possibility is to form an intermolecular disulfide bond by dimerizing the sequences:
WVNPRLEPWLHPGSQPN1TACTNWVNPRLEPWLHPGSQPN1TACTN
WVNPRLEPWLHPGSQPN1TACTNWVNPRLEPWLHPGSQPN1TACTN
Ďalšou možnosťou je dimerizácia s iným vybraným epitopom z Tat. Druhý epitop na Tat je umiestnený medzi aminokyselinami 35 a 57 v smere Ckonca aje oddelený od prvého epitopu 10 aminokyselinami obsahujúcimi ďalších 5 Cys zvyškov, okrem Cys zvyškov v každom z epitopov. Pomerne veľký počet Cys zvyškov ponúka veľa možností medzimolekulových a vnútromolekulových prepojení. Je pravdepodobné, že táto doména bohatá na Cys bude dominovať v imunologickej expozícii tohto proteínu a tým zabezpečí „ukrytie“ dvoch relevantných epitopov. Výber a modifikácia týchto dvoch susedných epitopov môže sprístupniť kľúčovú časť proteínu Tat optimálnejším spôsobom.Another possibility is dimerization with another selected epitope from Tat. The second epitope on Tat is located between amino acids 35 and 57 in the C-terminal direction and is separated from the first epitope by 10 amino acids containing an additional 5 Cys residues, in addition to the Cys residues in each epitope. The relatively large number of Cys residues offers many intermolecular and intra-molecular linkage options. It is likely that this Cys-rich domain will dominate the immunological exposure of this protein, thereby providing "hiding" of the two relevant epitopes. Selection and modification of these two adjacent epitopes can make the key portion of the Tat protein more accessible.
Aby sa obmedzila pravdepodobnosť vývoja únikových mutantov, počet epitopov sa ďalej zvýšil a vybrali sa dve ďalšie sekvencie peptidov. Tieto sekvencie sú umiestnené na Rev (zvyšky 58-78) a Nef (zvyšky 65-85). Prirodzené sekvencie sa publikovali v knihe Human Retroviruses and AIDS 1999; A Compilation and Analysis of Nucleic Acid and Amino Acid Sequences (Ľudské retrovírusy a AIDS, 1999; Prehľad a analýzy sekvencií nukleových kyselín a aminokyselín). Red. Theoretical Biology and Biophysics Group, Los Alamos Laboratory, Los Alamos:In order to limit the likelihood of escape mutant development, the epitope number was further increased and two additional peptide sequences were selected. These sequences are located on Rev (residues 58-78) and Nef (residues 65-85). Natural sequences were published in Human Retroviruses and AIDS 1999; A Compilation and Analysis of Nucleic Acids and Amino Acid Sequences (Human Retroviruses and AIDS, 1999; Overview and Analysis of Nucleic Acid and Amino Acid Sequences). Red. Theoretical Biology and Biophysics, Los Alamos Laboratory, Los Alamos:
Tabuľka 3. Epitop TatTable 3. Epitope Tat
Tabuľka 4. Epitop RevTable 4. Epitope Rev
Tabuľka 5. Epitop NefTable 5. Epitope Nef
Niekoľko modifikovaných peptidov sa syntetizovalo na to, aby sa stanovila jedinečnosť sekvencií ako aj ich vlastností stimulácie imunitného systému v kombinácii s ich špecificitou a citlivosťou ako antigénov HIV-1.Several modified peptides were synthesized to determine the uniqueness of the sequences as well as their immune stimulation properties in combination with their specificity and sensitivity as HIV-1 antigens.
Podstata vynálezuSUMMARY OF THE INVENTION
Peptidy podľa tohto vynálezu pochádzajú zo štyroch rozličných konzervatívnych oblastí proteínov Tat, Rev a Nef HIV-1, ktoré sú opísané vyššie a ktoré majú vlastnosti uchovávajúce jedinečnosť (imunogenicitu, citlivosť a špecificitu) epitopov HIV-1. Nové peptidy podľa tohto vynálezu ďalej nemajú pozorovateľný cytotoxický antagonistický účinok na T lymfocyty (CTL) a musia mať aspoň jeden potenciálny CTL epitop.The peptides of the invention originate from four different conserved regions of the Tat, Rev and Nef proteins of HIV-1 described above and having properties that retain the uniqueness (immunogenicity, sensitivity, and specificity) of HIV-1 epitopes. Furthermore, the novel peptides of the invention have no observable cytotoxic antagonist effect on T lymphocytes (CTLs) and must have at least one potential CTL epitope.
Peptidy podľa tohto vynálezu, ktoré spĺňali nasledujúce kritériá, sú vybraté z nasledujúcich skupín:Peptides of the invention that meet the following criteria are selected from the following groups:
Xaaj Xaa2 Xaa3 Xaa4 Xaas Xaa6 Xaa7 Leu Glu Pro Trp Xaai2 His Pro Xaais Xaai6 Xaan Xaaig Xaa(9 Xaa20 Xaa2i Xaa22 Xaa23 Xaa24 (SEQ ID NO: 1), kde aminokyseliny reťazca môžu mať nasledujúci význam;Xaa Xaa 2 Xaa3 Xaa4 Xaa Xaa6 Xaa7 Leu Glu Pro Trp Xaaa 2 His Pro Xaaa Xaaa6 Xaaa Xaaig Xaa (9 Xaa 20 Xaa 2 and Xaa 22 Xaa 23 Xaa 24 (SEQ ID NO: 1) wherein the amino acids of the chain may have the following meanings;
Xaa v polohe 1 derivátu peptidu je Met, Ser, Cys alebo nič,Xaa at position 1 of the peptide derivative is Met, Ser, Cys or nothing,
Xaa v polohe 2 je Glu, Asp, Val, Ser alebo nič,Xaa at position 2 is Glu, Asp, Val, Ser or nothing,
Xaa v polohe 3 je Ser, Gin, Pro, Leu, Val, Ala, Trp, Tyr alebo Phe,Xaa at position 3 is Ser, Gln, Pro, Leu, Val, Ala, Trp, Tyr, or Phe,
Xaa v polohe 4 je Val alebo Ile,Xaa at position 4 is Val or Ile,
Xaa v polohe 5 je Asp, Asn alebo Ile,Xaa at position 5 is Asp, Asn or Ile,
Xaa v polohe 6 je Pro, His alebo Ala,Xaa at position 6 is Pro, His, or Ala,
Xaa v polohe 7 je Arg, Asn, Ser, Lys, Glu alebo Asp,Xaa at position 7 is Arg, Asn, Ser, Lys, Glu, or Asp,
Xaa v polohe 12 je Leu, Ile alebo Nie,Xaa at position 12 is Leu, Ile or No,
Xaa v polohe 15 je Gly alebo Pro,Xaa at position 15 is Gly or Pro,
Xaa v polohe 16 je Ser, Asn alebo Ala,Xaa at position 16 is Ser, Asn, or Ala,
Xaa v polohe 17 je Gin, Lys alebo Thr,Xaa at position 17 is Gln, Lys, or Thr,
Xaa v polohe 18 je Pro alebo His,Xaa at position 18 is Pro or His,
Xaa v polohe 19 je Lys, Thr, Ser, Ala, Arg, Pro, Glu, Leu, íle alebo Nie,Xaa at position 19 is Lys, Thr, Ser, Ala, Arg, Pro, Glu, Leu, Ile or No,
Xaa v polohe 20 je Thr, Ala alebo íle,Xaa at position 20 is Thr, Ala, or clay,
Xaa v polohe 21 je Ala, Pro, Asp alebo Val,Xaa at position 21 is Ala, Pro, Asp, or Val,
Xaa v polohe 22 je Cys alebo Ser,Xaa at position 22 is Cys or Ser,
Xaa v polohe 23 je Thr, Asn alebo Ser,Xaa at position 23 is Thr, Asn, or Ser,
Xaa v polohe 24 je Asn, Lys, Arg, Gin, Ala, Pro alebo Thr, peptid obsahuje aspoň šesť po sebe idúcich aminokyselín sekvencie SEQ ID NO: 1, okrem toho dva alebo viac Cys zvyškov môžu vytvárať časť vnútroreťazcovej alebo medzireťazcovej disulfidickej väzby, mostík -S-(CH2)P-S- alebo -(CH2)P-, kde p = 1-8, prípadne s vloženým jedným alebo viacerými heteroatómami, ako je O, N alebo S,Xaa at position 24 is Asn, Lys, Arg, Gln, Ala, Pro, or Thr, the peptide comprises at least six contiguous amino acids of SEQ ID NO: 1, in addition two or more Cys residues may form part of an interchain or interchain disulfide bond, the bridge -S- (CH 2) p -S- or - (CH 2) p -, wherein p = 1-8, optionally with one or more heteroatoms inserted, such as O, N or S,
Xaai Xaa2 Xaa3 Phe Xaas Xaa6 Xaa7 Xaas Xaa9 Xaaio Xaan Xaa^ -Z- Tyr Xaaj Gly Xaais Lys Lys Arg Xaaig Xaa2o Xaa2i Xaa22 Xaa23 (SEQ ID NO: 4), kde aminokyseliny reťazca majú nasledujúci význam;Xaa Xaa 2 Xaa 3 Phe Xaa Xaa 6 Xaa 7 Xaa Xaa 9 Xaa 10 Xaa Xaa 4 -Z- Tyr Xaa Gly Xaa Lys Lys Arg Xaaa Xaa 20 Xaa 21 Xaa 22 Xaa 23 (SEQ ID NO: 4) wherein the amino acids of the chain have the following;
Xaa v polohe 1 je Pro, íle, Leu, Thr, Tyr alebo Val,Xaa at position 1 is Pro, Ile, Leu, Thr, Tyr or Val,
Xaa v polohe 2 je Val, Ala, Cys, Leu,Xaa at position 2 is Val, Ala, Cys, Leu,
Xaa v polohe 3 je Cys, íle, Leu, Val alebo Nie,Xaa at position 3 is Cys, Ile, Leu, Val or No,
Xaa v polohe 5 je íle, Leu, Gin, Met alebo Thr,Xaa at position 5 is white, Leu, Gln, Met or Thr,
Xaa v polohe 6 je Thr, Asn, Lys alebo Arg,Xaa at position 6 is Thr, Asn, Lys, or Arg,
Xaa v polohe 7 je Lys, Arg alebo Gin,Xaa at position 7 is Lys, Arg, or Gln,
Xaa v polohe 8 je Gly alebo Ala,Xaa at position 8 is Gly or Ala,
Xaa v polohe 9 je Leu alebo íle,Xaa at position 9 is Leu or clay,
Xaa v polohe 10 je Gly, Ser alebo Ala,Xaa at position 10 is Gly, Ser, or Ala,
Xaa v polohe 11 je íle alebo Gly,Xaa at position 11 is white or Gly,
Xaa v polohe 12 je Ser, Phe alebo Tyr,Xaa at position 12 is Ser, Phe, or Tyr,
Xaaj vložená pred polohou 14 je Leu, íle, Nie,Xaaj inserted before position 14 is Leu, clay, No,
Xaa v polohe 15 je Arg, Lys, Ser alebo citrulín (Cit),Xaa at position 15 is Arg, Lys, Ser, or Citrulline (Cit),
Xaa v polohe 19 je Arg, Lys, Ser, Gly alebo Cit,Xaa at position 19 is Arg, Lys, Ser, Gly or Cit,
Xaa v polohe 20 je Gin, Arg alebo Pro,Xaa at position 20 is Gln, Arg, or Pro,
Xaa v polohe 21 je íle alebo Leu,Xaa at position 21 is white or Leu,
Xaa v polohe 22 je Gly, Leu, íle, Cys alebo nič,Xaa at position 22 is Gly, Leu, Ile, Cys or nothing,
Xaa v polohe 23 je Gly alebo nič, kde sekvencia SEQ ID NO: 4 obsahuje aspoň šesť po sebe idúcich aminokyselín, -Z- je možný spoj a predstavuje PEG, modifikovaný PEG a/alebo [Gly]„, v ktorom n = 1,2 alebo 3, okrem toho dva alebo viac Cys zvyškov môže vytvárať časť vnútroreťazcovej alebo medzireťazcovej disulfidickej väzby, mostík -S-(CH2)P-S- alebo -(CH2)p-, kde p = 1-8, prípadne s vloženým jedným alebo viacerými heteroatómami, ako je O, N alebo S,Xaa at position 23 is Gly or nothing, wherein the sequence of SEQ ID NO: 4 comprises at least six consecutive amino acids, -Z- is a fused linkage and represents PEG, modified PEG and / or [Gly] n, wherein n = 1, 2 or 3, furthermore two or more of the Cys residues may form part of intrachain or interchain disulphide binding, a -S- (CH 2) p -S- or a - (CH 2) p -, wherein p = 1-8, optionally intervened by one or more heteroatoms such as O, N or S,
Xaai íle Leu Xaa4 Xaas Xaa6 Leu Gly Arg Xaajo Xaan -Z- Xaai2 Leu Xaaj Xaaj Xaai4 Xaais Xaaiô Xaa^ Xaai8 Xaai9 Leu Pro Pro Leu (SEQ ID NO: 7), kde Xaa v polohe 1 je Phe, Tyr, Trp alebo Arg,Xaa 1 Leu Xaa 4 Xaa Xaa 6 Leu Gly Arg Xaa Xoan -Z- Xaa 2 Leu Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa 6 Xaa 8 Xaa 9 Leu Pro Leu (SEQ ID NO: 7) wherein Xaa at position 1 is Phe or Tyr Arg,
Xaa v polohe 4 je Gly, Ser, Asn, Asp, Cys, Val, Thr, Ala alebo Arg,Xaa at position 4 is Gly, Ser, Asn, Asp, Cys, Val, Thr, Ala, or Arg,
Xaa v polohe 5 je Thr, Ala, Asp, Asn alebo Ser,Xaa at position 5 is Thr, Ala, Asp, Asn or Ser,
Xaa v polohe 6 je Tyr, Cys, Phe, Arg, His, Ser, Val alebo Leu,Xaa at position 6 is Tyr, Cys, Phe, Arg, His, Ser, Val, or Leu,
Xaa v polohe 10 je Ser, Pro, Phe, Leu alebo íle,Xaa at position 10 is Ser, Pro, Phe, Leu, or Ile,
Xaa v polohe 11 je Ala, Thr, Glu, Gin, Val, Pro alebo Ser,Xaa at position 11 is Ala, Thr, Glu, Gln, Val, Pro, or Ser,
Xaa v polohe 12 je Glu, Lys, Gin, Asp, Asn, Tyr, Trp alebo Phe,Xaa at position 12 is Glu, Lys, Gln, Asp, Asn, Tyr, Trp, or Phe,
Xaaj vložená za polohou 13 je Ser, Pro, Phe, Leu alebo íle,Xaaj inserted after position 13 is Ser, Pro, Phe, Leu or Ile,
Xaaj vložená pred polohou 14 je Ala, Thr, Glu, Gin, Val, Pro alebo Ser,Xaaj inserted before position 14 is Ala, Thr, Glu, Gln, Val, Pro or Ser,
Xaa v polohe 14 je Glu, Lys, Gin, Asp alebo Asn,Xaa at position 14 is Glu, Lys, Gln, Asp, or Asn,
Xaa v polohe 15 je Pro, Ser, Ala alebo Asn,Xaa at position 15 is Pro, Ser, Ala, or Asn,
Xaa v polohe 16 je Val, Asn, Gly alebo Pro,Xaa at position 16 is Val, Asn, Gly, or Pro,
Xaa v polohe 17 je Pro, Gin, His, Ser, Leu, Arg, Thr, Asp alebo íle,Xaa at position 17 is Pro, Gln, His, Ser, Leu, Arg, Thr, Asp, or Ile,
Xaa v polohe 18 je Leu, Phe alebo Val,Xaa at position 18 is Leu, Phe, or Val,
Xaa v polohe 19 je Gin, Leu, Pro, His, Asp alebo Glu, kde sekvencia SEQ ID NO: 7 obsahuje aspoň šesť po sebe idúcich aminokyselín, spojka -Z- je dobrovoľná a predstavuje PEG, modifikovaný PEG a/alebo [Gly]„, v ktorom n = 1,2 alebo 3,Xaa at position 19 is Gln, Leu, Pro, His, Asp, or Glu, wherein the sequence of SEQ ID NO: 7 comprises at least six consecutive amino acids, the -Z- linker is optional and represents PEG, modified PEG and / or [Gly] ", In which n = 1,2 or 3,
Xaaj Leu Val Gly Xaas Pro Xaa7 Xaag Pro Xaaio Xaan Pro -Z- [Arg]m Xaa,Xaaj Leu Val Gly Xaa Pro Xaa7 Xaag Pro Xaaio Xaan Pro -Z- [Arg] m Xaa,
Xaa n Xaai4 Pro Xaaiô Xaan Xaaj g Xaan Xaa2o Xaa2i (SEQ ID NO: 10), kde Xaa v polohe 1 je Lys alebo Arg,Xaa n Xaa 4 Pro Xaa 6 Xaa Xaa g Xaa Xaa 2 o Xaa 2 i (SEQ ID NO: 10), wherein Xaa at position 1 is Lys or Arg,
Xaa v polohe 5 je Phe alebo Leu,Xaa at position 5 is Phe or Leu,
Xaa v polohe 7 je íle alebo Val,Xaa at position 7 is white or Val,
Xaa v polohe 8 je Thr, Arg, Lys, Ala alebo Met,Xaa at position 8 is Thr, Arg, Lys, Ala or Met,
Xaa v polohe 10 je Gin alebo His,Xaa at position 10 is Gln or His,
Xaa v polohe 11 je Val, Leu alebo íle,Xaa at position 11 is Val, Leu, or clay,
Xaai vložená pred polohou 13 je Leu,Xaai inserted before position 13 is Leu,
Xaa v polohe 13 je Leu, Val alebo Thr,Xaa at position 13 is Leu, Val, or Thr,
Xaa v polohe 14 je Arg alebo citrulín (Cit),Xaa at position 14 is Arg or citrulline (Cit),
Xaa v polohe 16 je Met, Val, íle alebo Nie, Leu,Xaa at position 16 is Met, Val, Ile or No, Leu,
Xaa v polohe 17 je Thr alebo Asp,Xaa at position 17 is Thr or Asp,
Xaa v polohe 18 je Tyr, Phe alebo Arg,Xaa at position 18 is Tyr, Phe, or Arg,
Xaa v polohe 19 je Lys alebo Arg,Xaa at position 19 is Lys or Arg,
Xaa v polohe 20 je Ala, Gly, Ser, Glu alebo Gin,Xaa at position 20 is Ala, Gly, Ser, Glu, or Gln,
Xaa v polohe 21 je Ala, Ser alebo Val, kde sekvencia SEQ ID NO: 10 obsahuje aspoň šesť po sebe idúcich aminokyselín, spojka -Z- je dobrovoľná a predstavuje PEG, modifikovaný PEG a/alebo [Gly]n, v ktorom n = 1,2 alebo 3 a nezávisle od n je m v [Arg]m rovné 0, 1, 2 alebo 3, terminálnymi ukončeniami sekvencií môžu byť voľné karboxylové skupiny alebo aminoskupiny, amidy, acyly, acetyly alebo ich soli a/alebo sú uvedené sekvencie peptidov imobilizované na pevnom nosiči.Xaa at position 21 is Ala, Ser, or Val, wherein the sequence of SEQ ID NO: 10 comprises at least six consecutive amino acids, the -Z- linker is optional and represents PEG, modified PEG, and / or [Gly] n , wherein n = 1, 2 or 3 and independently of n is mv [Arg] m equal to 0, 1, 2 or 3, the terminal terminations of the sequences may be free carboxyl or amino groups, amides, acyls, acetyls or salts thereof and / or peptide sequences are indicated immobilized on a solid support.
Nové sekvencie peptidov majú schopnosť slúžiť ako dobrý antigén, v ktorom antigén obsahuje aspoň jeden peptid vybratý zo skupiny sekvenciíThe novel peptide sequences have the ability to serve as a good antigen in which the antigen comprises at least one peptide selected from the sequence group
SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 4, SEQ ID NO: 7 alebo SEQ ID NO: 10. Antigeni15 cita sa môže upravovať zmenou pomeru koncentrácií rozličných peptidov alebo veľkosti peptidov napríklad dimerizáciou alebo polymerizáciou a/alebo imobilizáciou na tuhej fáze. Antigén obsahuje dve alebo viac sekvencii polypeptidov podľa tohto vynálezu, ktoré by mohli byť buď spojené mostíkom, napríklad disulfidickým mostíkom medzi Cys zvyškami reťazcov alebo mostíkmi ako je Cr Cg alkylén, prípadne s vloženým jedným alebo viacerými heteroatómami, ako sú O, S alebo N, alebo sú výhodne nespojené. Reťazce môžu byť imobilizované na tuhej fáze v monomérnej, dimérnej alebo oligomérnej forme. Ku koncom sa môžu pridať ďalšie aminokyseliny, aby vzniklo «rameno» na uľahčenie imobilizácie.SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 4, SEQ ID NO: 7, or SEQ ID NO: 10. Antigenicity can be adjusted by varying the concentration ratio of different peptides or peptide sizes, for example by dimerization or polymerization and / or solid phase immobilization. The antigen comprises two or more sequences of polypeptides of the invention that could be either linked by a bridge, for example a disulfide bridge between Cys chain residues or bridges such as C 1 -C 8 alkylene, optionally with one or more heteroatoms such as O, S or N inserted. or are preferably unconnected. The chains may be immobilized on a solid phase in monomeric, dimeric or oligomeric form. Additional amino acids may be added to the ends to form an "arm" to facilitate immobilization.
PEG je polyetylénglykol (HO(CH2CH2O)a H) a môže byť časťou spojky Z-, prípadne je PEG modifikovaný dikarboxylovou skupinou (HO(CH2CH2O)a CO(CH2)b COOH) alebo koncovou karboxylovou skupinou (HO(CH2CH2O)a-i CH2COOH), kde pred spojením a = 1-10 a b = 2-6.PEG is polyethylene glycol (HO (CH2CH2O) a H), and may be part of the linker -Z-, optionally PEG is modified by a dicarboxylic acid (HO (CH2CH2O) a CO (CH 2) b COOH) or a terminal carboxylic acid (HO (CH2CH2O) a -i CH2COOH), where before coupling a = 1-10 and b = 2-6.
Spojka -Z- môže byť tvorená buď PEG, modifikovaným PEG alebo ich kombináciou a/alebo kombináciou jedného alebo viacerých Gly zvyškov. Spojka -Z- môže byť tiež tvorená Gly-mostíkom [Gly]n, v ktorom n = 1,2 alebo 3.The -Z- linker may be either PEG, modified PEG, or a combination thereof and / or a combination of one or more Gly residues. The linker -Z- may also be a Gly-bridge [Gly] n in which n = 1, 2 or 3.
Všetky aminokyseliny v peptidoch podľa tohto vynálezu môžu byť v Dforme alebo v L-forme, hoci prirodzene sa vyskytujúca L-forma je výhodnejšia.All amino acids in the peptides of the invention may be in the Dform or in the L-form, although the naturally occurring L-form is more preferred.
C- a N-terminálne ukončenia sekvencii peptidov sa môžu odlišovať od prírodných sekvencii modifikáciou terminálnych NH2 skupín a/alebo COOH skupín, môžu byť napríklad acylované, acetylované, amidované alebo modifikované tak, že poskytujú miesto naviazania pre nosič alebo inú molekulu.The C- and N-terminal ends of the peptide sequences can be distinguished from natural sequences by modifying the terminal NH 2 groups and / or COOH groups, for example, they can be acylated, acetylated, amidated or modified to provide a point of attachment for a carrier or other molecule.
Peptidy podľa tohto vynálezu pozostávajú zo 6 až 50 aminokyselín, výhodne z 10 až 30 aminokyselín. Tieto predstavujú celú prírodnú paletu aminokyselín v identifikovaných polohách.The peptides of the invention consist of 6 to 50 amino acids, preferably 10 to 30 amino acids. These represent the entire natural variety of amino acids at the identified positions.
Polypeptidový antigén podľa tohto vynálezu je buď voľný alebo vo forme viazanej na nosiči. Nosič alebo tuhá fáza, na ktorú je peptid prípadne naviazaný, sa môže vybrať zo širokej palety známych nosičov. Mal by byť vybratý s ohľadom na zamýšľané použitie imobilizovaného polypeptidu ako diagnostického antigénu alebo ako imunizačnej zložky vo vakcíne.The polypeptide antigen of the invention is either free or in a form bound to a carrier. The carrier or solid phase to which the peptide is optionally attached can be selected from a wide variety of known carriers. It should be selected with respect to the intended use of the immobilized polypeptide as a diagnostic antigen or as an immunizing component in a vaccine.
Príkladmi nosičov, ktoré sa môžu použiť napríklad na diagnostické účely, sú magnetické guličky alebo živica z kopolymérov, ako je styréndivinylbenzén, hydroxylovaný styrén-divinylbenzén, polystyrén, karboxylovaný polystyrén, guľôčky z uhlíkovej černe, neaktivované alebo polystyrénom alebo polyvinylchloridom aktivované sklo, epoxidom aktivované porózne magnetické sklo, želatínové alebo polysacharidové častice alebo iné proteínové častice, červené krvinky, monoklonálne a polyklonálne protilátky alebo fab fragmenty týchto protilátok.Examples of carriers that can be used, for example, for diagnostic purposes are magnetic beads or copolymers resins such as styrene-divinylbenzene, hydroxylated styrene-divinylbenzene, polystyrene, carboxylated polystyrene, carbon black beads, inactivated or polystyrene-activated polyvinyl chloride activated epoxy, magnetic glass, gelatin or polysaccharide particles or other protein particles, red blood cells, monoclonal and polyclonal antibodies, or fab fragments thereof.
Podľa ďalšieho praktického uskutočnenia tohto vynálezu môžu byť antigény súčasťou vakcíny s možnosťou kombinácie s nosičmi, adjuvantmi alebo s inými imunostimulačnými prvkami, ako je vírus kiahní obsahujúci env gén. Príkladmi nosičov a/alebo adjuvantov na účely vakcíny sú iné proteíny, ako je ľudský alebo hovädzí sérový albumín, limpetový hemocyanín a mastné kyseliny. Imunostimulačné materiály sa dajú rozdeliť do troch skupín: adjuvanty, nosiče pre antigény a vehikulá. Príkladmi adjuvantov sú hydroxid hlinitý, hlinité soli, saponín, muramyl di- a tripeptidy, monofosforyllipid A, kyselina palmitová, B.pertussis a rozličné cytokíny zahŕňajúce Thl cytokín IL-12 a IL-1. Rad proteínových toxínov, ktoré sú užitočné pri vývoji CTL vakcín, sa môže použiť na dopravu prenášačových proteínov cez bunkové membrány do cytosolu. K nosičom patria bakteriálne toxoidy, ako je inaktivovaný toxín tetanu a cholery, geneticky detoxifikované bakteriálne toxíny, ako je teplotné labilný enterotoxín z E.coli, mastné kyseliny, živé vektory, ako je polio chimeras, a hybridné proteíny, ktoré tvoria častice, napríklad častice kvasinkového retrotranspozónového hybridu TY a častice HBcAg. Vehikulá, ktoré sú často sa vyskytujúcimi zložkami v moderných vakcínach, obsahujú emulzie minerálnych olejov, Freundov úplný a neúplný adjuvant, emulzie rastlinných olejov, povrchovo aktívne látky na báze neiónových blokových kopolymérov, skvalén alebo skvalán, lipopeptidy, lipozómy a biologicky odbúrateľná mikroguľôčky. Dvoma novými adjuvantami, ktoré sú významné pri vývoji nových vakcín, sú mikroemulzia olej vo vode (MF59) a polymérne mikročastice. Môže sa použiť akákoľvek látka, ktorá môže zvýšiť imunogenicitu antigénu, a niektoré ďalšie alternatívy nosičov alebo adjuvantov sú uvedené v americkom alebo v európskom liekopise.According to another practical embodiment of the invention, the antigens may be part of a vaccine with the possibility of combination with carriers, adjuvants or other immunostimulatory elements such as smallpox virus containing the env gene. Examples of carriers and / or adjuvants for vaccine purposes are other proteins, such as human or bovine serum albumin, limpet hemocyanin, and fatty acids. Immunostimulatory materials can be divided into three groups: adjuvants, carriers for antigens and vehicles. Examples of adjuvants are aluminum hydroxide, aluminum salts, saponin, muramyl di- and tripeptides, monophosphoryl lipid A, palmitic acid, B. pertussis, and various cytokines including the Th1 cytokine IL-12 and IL-1. A number of protein toxins that are useful in the development of CTL vaccines can be used to deliver carrier proteins across cell membranes to the cytosol. Carriers include bacterial toxoids such as inactivated tetanus and cholera toxin, genetically detoxified bacterial toxins such as thermal labile enterotoxin from E. coli, fatty acids, living vectors such as polio chimeras, and hybrid proteins that form particles, such as particles yeast retrotransposone hybrid TY and HBcAg particles. Vehicles that are frequently found in modern vaccines include mineral oil emulsions, Freund's complete and incomplete adjuvant, vegetable oil emulsions, nonionic block copolymer surfactants, squalene or squalane, lipopeptides, liposomes, and biodegradable microspheres. Two new adjuvants that are important in the development of new vaccines are the oil-in-water microemulsion (MF59) and polymer microparticles. Any substance that may enhance the immunogenicity of the antigen may be used, and some other alternatives to carriers or adjuvants are listed in the US or European Pharmacopoeia.
Vhodný prípravok obsahujúci antigén na imunostimulačné použitie môže tiež obsahovať interferóny, ako je INF-γ, antivírusové chemokíny alebo hematopoetické rastové faktory, ako je rastový faktor granulocytov-makrofágov.A suitable antigen-containing composition for immunostimulatory use may also contain interferons such as INF-γ, antiviral chemokines or hematopoietic growth factors such as granulocyte-macrophage growth factor.
Iným priblížením, ktorého cieľom je zvýšiť stimuláciu a absorpciu, napríklad v črevách, je podanie peptidov podľa tohto vynálezu s malými peptidmi, ako sú di-, tri- alebo tetrapeptidy. Tieto peptidy sa môžu podávať navyše alebo v kombinácii s peptidmi podľa tohto vynálezu. Výhodne sa tieto peptidy podávajú spolu s tripeptidom YGG, ktorý pozostáva z aminokyselín v D-forme alebo v L-forme, výhodne v D-forme.Another approach to enhance stimulation and absorption, for example in the intestines, is to administer the peptides of the invention with small peptides such as di-, tri- or tetrapeptides. These peptides may be administered in addition or in combination with the peptides of the invention. Preferably, these peptides are administered together with the tripeptide YGG, which consists of amino acids in the D-form or in the L-form, preferably in the D-form.
Nedávne prístupy k neparenterálnemu podávaniu vakcíny, napríklad cez sliznicu, zahŕňajú: technológiu génovej fúzie na vytvorenie netoxických derivátov sliznicových adjuvantov, geneticky inaktivované antigény s deléciou v esenciálnom géne, koexpresiu antigénu a špecifického cytokínu, ktorý je dôležitý pri modulácii a riadení sliznicovej imunitnej odozvy, a samotný genetický materiál, ktorý by umožnil prijatie DNA alebo RNA a jeho endogénnu expresiu v hostiteľských bunkách.Recent approaches to non-parenteral administration of a vaccine, for example through the mucosa, include: gene fusion technology to generate non-toxic derivatives of mucosal adjuvants, genetically inactivated antigens with deletion in the essential gene, coexpression of antigen and specific cytokine that is important for mucosal and immune responses genetic material alone that would allow the uptake of DNA or RNA and its endogenous expression in host cells.
Jedným prístupom k vývoju trvanlivých odoziev, keď sa vyžaduje bunkami sprostredkovaná imunita, je vakcinácia s plazmidom DNA kódujúcim jeden alebo viac špecifických antigénov.One approach to the development of durable responses when cell-mediated immunity is required is vaccination with a plasmid DNA encoding one or more specific antigens.
Na ochranu proti infekcii HIV musia vakcíny vykazovať sliznicovú aj systémovú imunitnú odozvu a mali by sa podávať akýmkoľvek konvenčným spôsobom, napríklad parenterálne alebo neparenterálne, ako je napríklad subkutánne, intrakutánne, intravenózne, intramuskulárne, perorálne, mukoticky alebo intranazálne.To protect against HIV infection, vaccines must exhibit both mucosal and systemic immune responses and should be administered by any conventional means, for example parenterally or non-parenterally, such as subcutaneously, intracutaneously, intravenously, intramuscularly, orally, mucotically or intranasally.
Vo výhodnom praktickom uskutočnení vakcína podľa tohto vynálezu obsahuje antigény obsahujúce peptidy vybraté z aspoň jednej zo skupín SEQ IDIn a preferred embodiment, the vaccine of the invention comprises antigens comprising peptides selected from at least one of SEQ ID NOs
NO: 1, 4, 7 a 10, výhodnejšie sa peptidy vyskytujú v rovnakých množstvách.NO: 1, 4, 7 and 10, more preferably the peptides are present in equal amounts.
V ďalšom praktickom uskutočnení vakcína obsahuje antigény:In another practical embodiment, the vaccine comprises antigens:
F VI H RL EP WL HP GS QHN1 T A S TN - NH2 (SEQ ID NO: 14) aF VI H RL EP WL HP GS QHN1 TAS TN - NH 2 (SEQ ID NO: 14) a
RLVGFP VKPQVPGLLRPLTYKAA - NH2 (SEQ ID NO: 15).RLVGFP VKPQVPGLLRPLTYKAA-NH 2 (SEQ ID NO: 15).
Tieto sekvencie môžu aktivovať bunkový imunitný systém a spolupracuje s CTL-epitopmi. Zmeny v aminokyselinách zabudované v rámci CTL-epitopov sú navrhnuté tak, aby sa dosiahlo zlepšenie viazania. Vykonali sa aj ďalšie zmeny v aminokyselinách, aby sa uľahčila syntéza peptidú a/alebo sa zvýšila rozpustnosť peptidú.These sequences can activate the cellular immune system and interact with CTL-epitopes. The amino acid changes incorporated within the CTL-epitopes are designed to achieve improved binding. Other amino acid changes have also been made to facilitate peptide synthesis and / or increase peptide solubility.
Ďalším praktickým uskutočnením vynálezu je spôsob detekcie protilátok vyvolaných HIV-1 alebo HIV-1-špecifickými peptidmi alebo proteínmi vo vzorke telovej tekutiny pomocou uvedených antigénov. Tento vynález zahŕňa aj súpravu na imunologickú skúšku pre uvedenú detekciu a protilátky schopné selektívne reagovať s uvedenými antigénmi.Another practical embodiment of the invention is a method of detecting antibodies elicited by HIV-1 or HIV-1-specific peptides or proteins in a body fluid sample using said antigens. The invention also includes an immunoassay kit for said detection and antibodies capable of selectively reacting with said antigens.
Opis prípravy peptidovDescription of peptide preparation
Peptidy podľa tohto vynálezu sa môžu pripraviť akoukoľvek známou metódou prípravy lineárnej sekvencie aminokyselín, ako sú rekombinantné DNA techniky. Sekvencia nukleových kyselín, ktorá kóduje jeden alebo viac peptid podľa tohto vynálezu alebo multimér uvedených peptidov sa zavedie do expresného vektora. Vhodnými expresnými vektormi sú napríklad plazmidy, kozmidy, vírusy a YAC (kvasinkové umelé chromozómy), ktoré obsahujú potrebné kontrolné oblasti pre replikáciu a expresiu. Expresný vektor môže byť stimulovaný na expresiu v hostiteľskej bunke. Vhodnými hostiteľskými bunkami sú napríklad baktérie, bunky kvasiniek a bunky cicavcov. Takéto techniky sú dobre známe odborníkom v problematike a sú opísané napríklad Sambrookom a kol., Molecular Cloning: A Laboratory Manual (Molekulárne klonovanie: Laboratórna príručka), Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor, 1989. Inými dobre známymi technikami sú degradácia alebo syntéza pri19 pojením aminokyselinového zvyšku k ďalšiemu zvyšku v kvapalnej fáze alebo výhodne na tuhej fáze (živica), napríklad takzvanou Merrifieldovou syntézou. Pozri napríklad Barany a Merrifield v knihe Peptides, Analysis, Synthesis, Biology (Peptidy, analýza, syntéza, biológia), zv. 2, red. E. Gross a Meinhofer (Acad. Press, N.Y., 1980), Kneib-Coronier a Mullen, Int. J. Peptid Res., 30, s. 705-739 (1987) a Fields a Noble, Int. J. Peptid Protein Res. 35, s.161-214 (1990).The peptides of the invention may be prepared by any known method for preparing a linear amino acid sequence, such as recombinant DNA techniques. A nucleic acid sequence that encodes one or more of the peptides of the invention or multimers of said peptides is introduced into an expression vector. Suitable expression vectors are, for example, plasmids, cosmids, viruses and YACs (yeast artificial chromosomes) which contain the necessary control regions for replication and expression. The expression vector may be stimulated for expression in a host cell. Suitable host cells are, for example, bacteria, yeast cells and mammalian cells. Such techniques are well known to those skilled in the art and are described, for example, by Sambrook et al., Molecular Cloning: A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor, 1989. Other well known techniques are degradation or synthesis by coupling an amino acid residue to another residue in a liquid phase or preferably a solid phase (resin), for example by so-called Merrifield synthesis. See, for example, Barany and Merrifield in Peptides, Analysis, Synthesis, Biology, Vol. 2, red. E. Gross and Meinhofer (Acad. Press, N.Y., 1980), Kneib-Coronier and Mullen, Int. J. Peptide Res., 30, p. 705-739 (1987) and Fields and Noble, Int. J. Peptide Protein Res. 35, pp. 161-214 (1990).
V prípade, že sa požaduje lineárny alebo cyklický peptid, na sekvencii aminokyselín sa vykoná krok chemickej oxidácie, aby sa pri syntetizovaní vhodných sekvencií lineárnych aminokyselín cyklizovali alebo spojili dva cysteínové zvyšky v rámci jednej alebo medzi dvoma sekvenciami peptidov, pozri Akaji a kol., Tetrahedron Letter, 33, 8, s. 1073-1076, 1992.If a linear or cyclic peptide is desired, a chemical oxidation step is performed on the amino acid sequence to cyclize or join two cysteine residues within or between two peptide sequences when synthesizing suitable linear amino acid sequences, see Akaji et al., Tetrahedron. Letter, 33, 8, p. 1073-1076, 1992.
Všeobecný opis syntézyGeneral description of the synthesis
Všetky deriváty peptidov pripravené v príkladoch uvedených nižšie sa syntetizovali na syntezátore peptidov Milligen 9050 s použitím štandardného programu. Použitá živica bola Tenta Gel P RAM s teoretickým plnením 0,20 meq/g (RAPP POLYMERE GmBH, Tiibingen). Konečný produkt syntézy sa vysušil cez noc vo vákuu. Peptid sa potom oddelil od živice pôsobením 90 % kyseliny trifluóroctovej v prítomnosti etánditiolu (5 %) a vody (5 %) ako lapačov nečistôt (1,5 hodiny pri teplote miestnosti). Potom sa živica odfiltrovala a premyla na filtri ďalšou dávkou kyseliny trifluóroctovej (100 %) (2 x 20 ml). Spojené filtráty sa odparili vo vákuu (vodný kúpeľ pri teplote miestnosti) a zvyšok sa zmiešal s etyléterom (200 ml) a vyzrážaný produkt sa odfiltroval. Tuhá látka sa ihneď rozpustila na filtri v ľadovej kyseline octovej (100 ml), pridala sa k 1,5 1 20 % kyseliny octovej v metanole a na zmes sa pôsobilo 0,1 M roztokom jódu v metanole, až sústava získala svetlohnedú farbu. Potom sa pridal iónomenič Dowex 1 χ 8 vo forme acetátu (15 g) (Bio-Rad, Richmond, CA, USA) a zmes sa prefiltrovala. Filtrát sa odparil a zvyšok sa lyofilizoval z kyseliny octovej. Produkt sa potom prečistil kvapalinovou chromatografiou s obrátenými fázami na stĺpci s Kromasilom® 100 - 5 C8 (EKA Nobel, Súrte,All peptide derivatives prepared in the examples below were synthesized on a Milligen 9050 peptide synthesizer using a standard program. The resin used was Tenta Gel P RAM with a theoretical loading of 0.20 meq / g (RAPP POLYMERE GmBH, Tiibingen). The final synthesis product was dried overnight in vacuo. The peptide was then separated from the resin by treatment with 90% trifluoroacetic acid in the presence of ethanedithiol (5%) and water (5%) as scavengers (1.5 hours at room temperature). The resin was then filtered off and washed on the filter with another portion of trifluoroacetic acid (100%) (2 x 20 mL). The combined filtrates were evaporated in vacuo (water bath at room temperature) and the residue was treated with ethyl ether (200 mL) and the precipitated product was filtered off. The solid was immediately dissolved on the filter in glacial acetic acid (100 mL), added to 1.5 L of 20% acetic acid in methanol and treated with a 0.1 M solution of iodine in methanol until the system became light brown. Dowex 1 χ 8 ion exchanger as acetate (15 g) (Bio-Rad, Richmond, CA, USA) was then added and the mixture was filtered. The filtrate was evaporated and the residue was lyophilized from acetic acid. The product was then purified by reverse phase liquid chromatography on a Kromasil® 100-5 C8 column (EKA Nobel, Surte,
Švédsko) vo vhodnom systéme obsahujúcom acetonitril v 0,1 % vodnom roztoku kyseliny trifluóroctovej. Vzorky odobraté zo stĺpca sa analyzovali analytickou vysokoúčinnou kvapalinovou chromatografiou (HPLC) (Beckman System Gold, USA) na stĺpci Kromasilu® 100 - 5 C8 (EKA Nobel, Súrte, Švédsko). Frakcie obsahujúce čistú látku sa spojili, rozpúšťadlo sa odparilo a produkt sa lyofilizoval z kyseliny octovej. Na výslednom produkte sa urobila záverečná analýza HPLC a štruktúra peptidu sa potvrdila analýzou aminokyselín a hmotnostnou spektrometriou (LDI-MS).Sweden) in a suitable system containing acetonitrile in 0.1% aqueous trifluoroacetic acid. Samples taken from the column were analyzed by analytical high performance liquid chromatography (HPLC) (Beckman System Gold, USA) on a Kromasil® 100-5 C8 column (EKA Nobel, Surte, Sweden). Fractions containing pure material were combined, the solvent was evaporated and the product was lyophilized from acetic acid. Final product HPLC was performed on the resulting product and the peptide structure was confirmed by amino acid analysis and mass spectrometry (LDI-MS).
Všetky aminokyseliny použité v syntéze boli L-aminokyseliny a ich funkčná α-aminoskupina bola chránená fluorenylmetoxykarbonylovou skupinou. Bočné reťazce boli chránené nasledujúcim spôsobom:All amino acids used in the synthesis were L-amino acids and their functional α-amino group was protected by a fluorenylmethoxycarbonyl group. The side chains were protected as follows:
Cys (Trt), Gln(Trt), Glu(OtBu), Thr(tBu).Cys (Trt), Gln (Trt), Glu (OtBu), Thr (tBu).
Skratky v zátvorkách znamenajú:Abbreviations in brackets mean:
Trt = trifenylmetyl, t-Bu = /erc-butyl,Trt = triphenylmethyl, t-Bu = tert-butyl,
OtBu = Zerc-butylester.OtBu = tert-butyl ester.
Deriváty aminokyselín dodala firma Bachem AG, Švajčiarsko.Amino acid derivatives were supplied by Bachem AG, Switzerland.
Príklady uskutočnenia vynálezuDETAILED DESCRIPTION OF THE INVENTION
PRÍKLAD 1EXAMPLE 1
Príprava CSWVNPRLEPWN1HPGSQHN1TACTN - NH2 (SEQ ID NO: 2). Peptid sa syntetizoval vo forme amidu zo zodpovedajúcich východiskových materiálov podľa všeobecného opisu syntézy. Pepid sa potom cyklizoval oxidáciou pomocú I2. Peptid sa rozpustil v kyseline octovej/metanole (1:4) a pridalo sa 0,1 M I2 v metanole. Čistota sa stanovila analýzou HPLC a štruktúra sa potvrdila analýzou aminokyselín a hmotnostnou spektrometriou (LDI-MS).Preparation of CSWVNPRLEPWN1HPGSQHN1TACTN-NH 2 (SEQ ID NO: 2). The peptide was synthesized as an amide from the corresponding starting materials according to the general description of the synthesis. The peptide was then cyclized by oxidation with I 2 . The peptide was dissolved in acetic acid / methanol (1: 4) and 0.1 M 2 in methanol was added. Purity was determined by HPLC analysis and the structure was confirmed by amino acid analysis and mass spectrometry (LDI-MS).
Čistota (HPLC): viac než 97 % (menej ako 1 % jednotlivej nečistoty) Mólová hmotnosť (voľná báza): 2746,2Purity (HPLC): greater than 97% (less than 1% of the individual impurity) Molar mass (free base): 2746.2
PRÍKLAD 2EXAMPLE 2
Príprava F V I P R L E P W Nl H P G S Q P Nl T A C T N -NH2 (SEQ ID NO: 3). Peptid sa syntetizoval vo forme amidu zo zodpovedajúcich východiskových materiálov podľa všeobecného opisu syntézy. Čistota sa stanovila analýzou HPLC a štruktúra sa potvrdila analýzou aminokyselín a hmotnostnou spektrometriou (LDI-MS).Preparation of FVIPRLEPW N1 HPGSQP N1 TACTN -NH 2 (SEQ ID NO: 3). The peptide was synthesized as an amide from the corresponding starting materials according to the general description of the synthesis. Purity was determined by HPLC analysis and the structure was confirmed by amino acid analysis and mass spectrometry (LDI-MS).
Čistota (HPLC): viac než 97 % (menej ako 1 % jednotlivej nečistoty)Purity (HPLC): greater than 97% (less than 1% of single impurity)
Mólová hmotnosť (voľná báza): 2538,0Molar mass (free base): 2538.0
PRÍKLAD 3EXAMPLE 3
Príprava YLLFLTKGLGISGGGYNIGCitKKRCitQILG- NH2 (SEQ ID NO: 5). Peptid sa syntetizoval vo forme amidu zo zodpovedajúcich východiskových materiálov podľa všeobecného opisu syntézy. Čistota sa stanovila analýzou HPLC a štruktúra sa potvrdila analýzou aminokyselín a hmotnostnou spektrometriou (LDI-MS).Preparation of YLLFLTKGLGISGGGYNIGCitKKRCitQILG-NH 2 (SEQ ID NO: 5). The peptide was synthesized as an amide from the corresponding starting materials according to the general description of the synthesis. Purity was determined by HPLC analysis and the structure was confirmed by amino acid analysis and mass spectrometry (LDI-MS).
PRÍKLAD 4EXAMPLE 4
Príprava YLNIFLTRGLGISGGGYNIGCitKKRCitQICG - NH2 (SEQ ID NO: 6). Peptid sa syntetizoval vo forme amidu zo zodpovedajúcich východiskových materiálov podľa všeobecného opisu syntézy. Čistota sa stanovila analýzou HPLC a štruktúra sa potvrdila analýzou aminokyselín a hmotnostnou spektrometriou (LDI-MS).Preparation of YLNIFLTRGLGISGGGYNIGCitKKRCitQICG-NH 2 (SEQ ID NO: 6). The peptide was synthesized as an amide from the corresponding starting materials according to the general description of the synthesis. Purity was determined by HPLC analysis and the structure was confirmed by amino acid analysis and mass spectrometry (LDI-MS).
Čistota (HPLC): viac než 97 % (menej ako 1 % jednotlivej nečistoty)Purity (HPLC): greater than 97% (less than 1% of single impurity)
Mólová hmotnosť (voľná báza): 3097,7Molar mass (free base): 3097.7
PRÍKLAD 5EXAMPLE 5
Príprava R I L S T Y L G R I S G G G W L S A E P V P L Q L P P L - NH2 (SEQ ID NO: 8). Peptid sa syntetizoval vo forme amidu zo zodpovedajúcich východiskových materiálov podľa všeobecného opisu syntézy. Čistota sa stanovila analýzou HPLC a štruktúra sa potvrdila analýzou aminokyselín a hmotnostnou spektrometriou (LDI-MS).Preparation of RILSTYLGRISGGGWLSAEPV PLQLPPL-NH 2 (SEQ ID NO: 8). The peptide was synthesized as an amide from the corresponding starting materials according to the general description of the synthesis. Purity was determined by HPLC analysis and the structure was confirmed by amino acid analysis and mass spectrometry (LDI-MS).
Čistota (HPLC): viac než 97 % (menej ako 1 % jednotlivej nečistoty)Purity (HPLC): greater than 97% (less than 1% of single impurity)
Mólová hmotnosť (voľná báza): 2990,6Molar mass (free base): 2990.6
PRÍKLAD 6EXAMPLE 6
Príprava RILSTYLGRISGGGYLSAEPVPLQLPPL- NH2 (SEQ ID NO: 9). Peptid sa syntetizoval vo forme amidu zo zodpovedajúcich východiskových materiálov podľa všeobecného opisu syntézy. Čistota sa stanovila analýzou HPLC a štruktúra sa potvrdila analýzou aminokyselín a hmotnostnou spektrometriou (LDI-MS).Preparation of RILSTYLGRISGGGYLSAEPVPLQLPPL-NH 2 (SEQ ID NO: 9). The peptide was synthesized as an amide from the corresponding starting materials according to the general description of the synthesis. Purity was determined by HPLC analysis and the structure was confirmed by amino acid analysis and mass spectrometry (LDI-MS).
PRÍKLAD 7EXAMPLE 7
Príprava KLVGFPVKPQVPGGGRLLCitPNITYKAA - NH2 (SEQ ID NO: 11). Peptid sa syntetizoval vo forme amidu zo zodpovedajúcich východiskových materiálov podľa všeobecného opisu syntézy. Čistota sa stanovila analýzou HPLC a štruktúra sa potvrdila analýzou aminokyselín a hmotnostnou spektrometriou (LDI-MS).Preparation of KLVGFPVKPQVPGGGRLLCitPNITYKAA - NH 2 (SEQ ID NO: 11). The peptide was synthesized as an amide from the corresponding starting materials according to the general description of the synthesis. Purity was determined by HPLC analysis and the structure was confirmed by amino acid analysis and mass spectrometry (LDI-MS).
PRÍKLAD 8EXAMPLE 8
Príprava RLVGFPVKPQVPGGGRLLRPLTYKAA- NH2 (SEQPreparation of RLVGFPVKPQVPGGGRLLRPLTYKAA-NH 2 (SEQ
ID NO: 12). Peptid sa syntetizoval vo forme amidu zo zodpovedajúcich východiskových materiálov podľa všeobecného opisu syntézy. Čistota sa stanovila a23 nalýzou HPLC a štruktúra sa potvrdila analýzou aminokyselín a hmotnostnou spektrometriou (LDI-MS).ID NO: 12). The peptide was synthesized as an amide from the corresponding starting materials according to the general description of the synthesis. Purity was determined by a23 HPLC analysis and the structure was confirmed by amino acid analysis and mass spectrometry (LDI-MS).
Čistota (HPLC): viac než 97 % (menej ako 1 % jednotlivej nečistoty)Purity (HPLC): greater than 97% (less than 1% of single impurity)
Mólová hmotnosť (voľná báza): 2790,4 Molekulový vzorec: C130H217O39N29Molecular Weight (Free Base): 2790,4 Molecular Formula: C130H217O39N29
PRÍKLAD 9EXAMPLE 9
Dimerizácia pomocou disulfidického mostíka.Dimerization using a disulfide bridge.
Sekvencie peptidov z príkladu 2 sa spojili oxidačným krokom za vzniku dipeptidu, v ktorom cysteínové zvyšky tvoria disulfidický mostík. Mostík sa vytvoril jedným z dvoch spôsobov:The peptide sequences of Example 2 were combined by an oxidation step to form a dipeptide in which the cysteine residues form a disulfide bridge. The bridge was created in one of two ways:
A) Oxidácia pomocou I2. Peptidy (rovnaké množstvá, ak sú rôzne) sa rozpustia v kyseline octovej/metanole (1:4) a pridá sa 0,1 M I2 v metanole za vzniku zmesi homodiméru, aleboA) Oxidation by I2. The peptides (equal amounts, if different) are dissolved in acetic acid / methanol (1: 4) and 0.1 M 2 is added in methanol to form a homodimer mixture, or
B) Oxidácia pomocou [Cys(Spy)22]-SEQ ID NO: 3. 2,3 mM peptidú SEQ ID NO: 3 rozpusteného v 2 M AcOH (aq) a 2-propanolu (1:1) sa nechajú reagovať s 2,2-ditiodipyridínom (3 ekv), pričom sa získa [Cys(Spy)22]-SEQ ID NO: 3. [Cys(Spy)22]-SEQ ID NO: 3 sa rozpustí v 10 mM NHíOac (aq pH=6,5) a metanole (5:2), pričom sa získa dimér SEQ ID NO: 13.B) Oxidation with [Cys (Spy) 22 ] -SEQ ID NO: 3. 2.3 mM of peptide SEQ ID NO: 3 dissolved in 2 M AcOH (aq) and 2-propanol (1: 1) were reacted with 2 With 2-dithiodipyridine (3 eq) to give [Cys (Spy) 22 ] -SEQ ID NO: 3. [Cys (Spy) 22 ] -SEQ ID NO: 3 was dissolved in 10 mM NH 4 Oac (aq pH = 6). , 5) and methanol (5: 2) to obtain the dimer of SEQ ID NO: 13.
Čistota výsledného diméru sa určuje analýzou HPLC a štruktúra sa potvrdzuje analýzou aminokyselín a hmotnostnou spektrometriou (LDI-MS).The purity of the resulting dimer was determined by HPLC analysis and the structure was confirmed by amino acid analysis and mass spectrometry (LDI-MS).
PRÍKLAD 10EXAMPLE 10
Príprava FVIHRLEPWLHPGSQHN1TASTN- NH2 (SEQ ID NO:Preparation FVIHRLEPWLHPGSQHN1TASTN- NH 2 (SEQ ID NO:
14). Peptid sa syntetizoval vo forme amidu zo zodpovedajúcich východisko vých materiálov podľa všeobecného opisu syntézy. Čistota sa stanovila analýzou HPLC a štruktúra sa potvrdila analýzou aminokyselín a hmotnostnou spektrometriou (LDI-MS).14). The peptide was synthesized as an amide from the corresponding starting materials according to the general description of the synthesis. Purity was determined by HPLC analysis and the structure was confirmed by amino acid analysis and mass spectrometry (LDI-MS).
Čistota (HPLC): viac než 98 % (menej ako 1 % jednotlivej nečistoty)Purity (HPLC): more than 98% (less than 1% of single impurity)
Mólová hmotnosť (voľná báza): 2540,2Molar mass (free base): 2540.2
PRÍKLADUEXAMPLE
Príprava RLVGFPVKPQVPGLLRPLTYKAA - NH2 (SEQ ID NO: 15). Peptid sa syntetizoval vo forme amidu zo zodpovedajúcich východiskových materiálov podľa všeobecného opisu syntézy. Čistota sa stanovila analýzou HPLC a štruktúra sa potvrdila analýzou aminokyselín a hmotnostnou spektrometriou (LDI-MS).Preparation of RLVGFPVKPQVPGLLRPLTYKAA - NH 2 (SEQ ID NO: 15). The peptide was synthesized as an amide from the corresponding starting materials according to the general description of the synthesis. Purity was determined by HPLC analysis and the structure was confirmed by amino acid analysis and mass spectrometry (LDI-MS).
Čistota (HPLC): viac než 99 % (menej ako 1 % jednotlivej nečistoty)Purity (HPLC): greater than 99% (less than 1% of single impurity)
Mólová hmotnosť (voľná báza): 2520,3Molar mass (free base): 2520.3
PRÍKLAD 12 - REFERENČNÝ PRÍKLADEXAMPLE 12 - REFERENCE EXAMPLE
Príprava prirodzenej sekvencie tatl; MESVDPRLEPWKHPGSQPK T A C T N - NH2 (SEQ ID NO: 16). Peptid sa syntetizoval vo forme amidu zo zodpovedajúcich východiskových materiálov podľa všeobecného opisu syntézy. Čistota sa stanovila analýzou HPLC a štruktúra sa potvrdila analýzou aminokyselín a hmotnostnou spektrometriou (LDI-MS).Preparation of the natural tatl sequence; MESVDPRLEPWKHPGSQPK TACTN-NH 2 (SEQ ID NO: 16). The peptide was synthesized as an amide from the corresponding starting materials according to the general description of the synthesis. Purity was determined by HPLC analysis and the structure was confirmed by amino acid analysis and mass spectrometry (LDI-MS).
Čistota (HPLC): viac než 97 % (menej ako 1 % jednotlivej nečistoty)Purity (HPLC): greater than 97% (less than 1% of single impurity)
Mólová hmotnosť (voľná báza): 2708,1Molar mass (free base): 2708.1
PRÍKLAD 13 - REFERENČNÝ PRÍKLADEXAMPLE 13 - REFERENCE EXAMPLE
Príprava prirodzenej sekvencie tat2; QVCFITKGLGISYGRKKRR Q R R R - NH2 (SEQ ID NO: 17). Peptid sa syntetizoval vo forme amidu zo zodpovedajúcich východiskových materiálov podľa všeobecného opisu syntézy. Čistota sa stanovila analýzou HPLC a štruktúra sa potvrdila analýzou aminokyselín a hmotnostnou spektrometriou (LDI-MS).Preparation of the native tat2 sequence; QVCFITKGLGISYGRKKRR QRRR-NH 2 (SEQ ID NO: 17). The peptide was synthesized as an amide from the corresponding starting materials according to the general description of the synthesis. Purity was determined by HPLC analysis and the structure was confirmed by amino acid analysis and mass spectrometry (LDI-MS).
Čistota (HPLC): viac než 94 %Purity (HPLC):> 94%
Mólová hmotnosť (voľná báza): 2806,4Molar mass (free base): 2806.4
PRÍKLAD 14 - REFERENČNÝ PRÍKLADEXAMPLE 14 - REFERENCE EXAMPLE
Príprava prirodzenej sekvencie Nef; EEV GFPVRPQVPLRPMTYK A A - NH2 (SEQ ID NO: 18). Peptid sa syntetizoval vo forme amidu zo zodpovedajúcich východiskových materiálov podľa všeobecného opisu syntézy. Čistota sa stanovila analýzou HPLC a štruktúra sa potvrdila analýzou aminokyselín a hmotnostnou spektrometriou (LDI-MS).Preparation of natural sequence Nef; EEV GFPVRPQVPLRPMTYK A NH NH 2 (SEQ ID NO: 18). The peptide was synthesized as an amide from the corresponding starting materials according to the general description of the synthesis. Purity was determined by HPLC analysis and the structure was confirmed by amino acid analysis and mass spectrometry (LDI-MS).
Čistota (HPLC): viac než 95 %Purity (HPLC):> 95%
Mólová hmotnosť (voľná báza): 2384,8Molar mass (free base): 2384.8
PRÍKLAD 15EXAMPLE 15
Pripraví sa vakcína obsahujúca peptidy SEQ ID NO: 3 a 12. Lyofilizované peptidy sa rozpustia v sterilnej vode na výslednú koncentráciu 4 mg/ml. Pripraví sa tiež preparát faktoru stimulujúceho granulocytovo-makrofágové kolónie (GM-CSF) podľa návodu na použitie výrobcu s výslednou koncentráciou 0,3 mg/ml. Tieto dva roztoky sa podávajú intrakutánne. Typická injekčná dávka je 100 μΐ.A vaccine containing peptides of SEQ ID NOs: 3 and 12 is prepared. Lyophilized peptides are dissolved in sterile water to a final concentration of 4 mg / ml. A granulocyte-macrophage colony stimulating factor (GM-CSF) preparation is also prepared according to the manufacturer's instructions for a final concentration of 0.3 mg / ml. The two solutions are administered intracutaneously. A typical injection dose is 100 μΐ.
PRÍKLAD 16EXAMPLE 16
Pripraví sa vakcína obsahujúca peptidy SEQ ID NOS: 14 a 15. Lyofilizované peptidy sa rozpustia v sterilnej vode na výslednú koncentráciu 4 mg/ml. Pripraví sa tiež preparát faktoru stimulujúceho granulocytovo-makrofágové kolo26 nie (GM-CSF) podľa návodu na použitie výrobcu s výslednou koncentráciou 0,3 mg/ml. Tieto dva roztoky sa podávajú intrakutánne. Typická injekčná dávka je 100 pl.A vaccine containing peptides of SEQ ID NOS: 14 and 15 is prepared. Lyophilized peptides are dissolved in sterile water to a final concentration of 4 mg / ml. A granulocyte-macrophage-wheel stimulating factor 26 (GM-CSF) preparation was also prepared according to the manufacturer's instructions for a final concentration of 0.3 mg / ml. The two solutions are administered intracutaneously. A typical injection dose is 100 µl.
PRÍKLAD 17EXAMPLE 17
Roztok alebo suspenzia antigénu sa zmieša s rovnakými množstvami Freundovho adjuvantu od Behringa, úplného alebo neúplného, a potom sa jemne emulguje natiahnutím do injekčnej striekačky a ráznym vytlačením z nej, alebo homogenizátorom. Emulzia by mala ostať stabilná aspoň 30 minút. Emulzie antigén-adjuvant je najlepšie podávať injekčné subkutánne ako depot.The antigen solution or suspension is mixed with equal amounts of Freund's adjuvant from Behring, complete or incomplete, and then gently emulsified by drawing into a syringe and vigorously expelling it, or with a homogenizer. The emulsion should remain stable for at least 30 minutes. The antigen-adjuvant emulsion is preferably administered by subcutaneous injection as a depot.
PRÍKLAD 18EXAMPLE 18
Imunologická skúška na detekciu protilátok vyvolaných HIV-1Immunological assay for the detection of HIV-1 induced antibodies
Činidlá s magnetickými časticami sa pripravia podľa protokolu odporúčaného výrobcom. Dynal AS je výrobcom Dynabeads, ktoré sa použili. Magnetické častice pokryté ligandom sa nazývajú Činidlo 1. Peptid podľa tohto vynálezu je kovalentne naviazaný na predaktivovaný povrch magnetických častíc. Je tiež možné absorbovať peptid fyzikálne na povrchu magnetických častíc. Koncentrácia častíc v Činidle 1 je v rozsahu od 1 mg/ml do 15 mg/ml. Veľkosť častíc sa mení v rozsahu 0,2 pm až 15 pm. Koncentrácia peptidov je v rozsahu od 0,01 mg/mg častíc do 1 mg/mg častíc.Reagents with magnetic particles are prepared according to the protocol recommended by the manufacturer. Dynal AS is the manufacturer of the Dynabeads that have been used. The ligand-coated magnetic particles are called Reagent 1. The peptide of the invention is covalently bound to the pre-activated surface of the magnetic particles. It is also possible to absorb the peptide physically on the surface of the magnetic particles. The concentration of the particles in Reagent 1 ranges from 1 mg / ml to 15 mg / ml. The particle size varies from 0.2 µm to 15 µm. The peptide concentration ranges from 0.01 mg / mg particles to 1 mg / mg particles.
Antihumánnou lg alkalickou fosfatázou (AP) konjugované protilátkové činidlo sa pripraví podľa odporúčaného protokolu Dáko AS. Tento protokol je štandardným postupom v tomto odbore. Toto činidlo sa nazýva Činidlo 2.An anti-human Ig alkaline phosphatase (AP) conjugated antibody reagent is prepared according to the recommended Dáko AS protocol. This protocol is a standard procedure in the art. This reagent is called Reagent 2.
Roztok substrátu fenolftaleínmonofosfátu sa pripraví podľa odporúčaného protokolu Fluka AG. Tento protokol je štandardným postupom v tomto odbore. Roztok substrátu sa nazýva Činidlo 3.The phenolphthalein monophosphate substrate solution is prepared according to the Fluka AG recommended protocol. This protocol is a standard procedure in the art. The substrate solution is called Reagent 3.
Použitý premývací a inkubačný tlmivý roztok je štandardný tlmivý roztok 0,05 M tris-zásady s nasledujúcimi prídavnými zlúčeninami: Tween 20 (0,01% až 0,1%), glycerol (0,1% až 10%) a chlorid sodný (0,2% až 0,1%).The wash and incubation buffer used is a standard 0.05 M tris-base buffer with the following additional compounds: Tween 20 (0.01% to 0.1%), glycerol (0.1% to 10%) and sodium chloride ( 0.2% to 0.1%).
Postup skúšky zahŕňa inkubačný krok, v ktorom sa v každej jamke zmieša 1 kvapka Činidla 1 s 2 kvapkami premývacieho tlmivého roztoku. Po zmiešaní sa pridá 30 μΐ vzorky a roztok sa inkubuje 5 minút. Magnetické častice sa môžu magnetom zachytiť a kvapalina sa môže odstrániť, po čom sa magnet oddiali. Potom sa jamky vypláchnu dvakrát 4 kvapkami premývacieho roztoku, po čom nasleduje inkubácia Činidlom 2. Pridá sa 1 kvapka Činidla 2 s 2 kvapkami premývacieho tlmivého roztoku a roztok sa inkubuje 5 minút. Magnetické častice sa môžu magnetom zachytiť a kvapalina sa môže odstrániť, po čom sa magnet oddiali. Potom sa premývací krok opakuje a nasleduje inkubácia s Činidlom 3. Do každej jamky sa pridajú 2 kvapky Činidla 3 a roztok sa inkubuje 3 minúty. Výsledky sa môžu odčítať oproti bielemu pozadiu. Pozitívne výsledky sú červené (3+ = sýto červené), kým negatívne výsledky sú jasne svetložlté/svetlohnedé roztoky, aké sa získajú pri negatívnej kontrole.The assay procedure includes an incubation step in which 1 drop of Reagent 1 is mixed with 2 drops of Wash Buffer in each well. After mixing, add 30 μΐ of sample and incubate for 5 minutes. The magnetic particles can be captured by the magnet and the liquid can be removed after the magnet has separated. The wells are then rinsed twice with 4 drops of wash solution followed by incubation with Reagent 2. 1 drop of Reagent 2 is added with 2 drops of wash buffer and incubated for 5 minutes. The magnetic particles can be captured by the magnet and the liquid can be removed after the magnet has separated. Then, the washing step is repeated, followed by incubation with Reagent 3. Two drops of Reagent 3 are added to each well and the solution is incubated for 3 minutes. Results can be read against a white background. Positive results are red (3+ = deep red), while negative results are bright light yellow / light brown solutions as obtained with negative control.
PRÍKLAD 19EXAMPLE 19
Terapeutická a profylaktická vakcínaTherapeutic and prophylactic vaccine
Aspoň jeden z peptidov podľa tohto vynálezu vybratý zo skupiny sekvencií SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 4, SEQ ID NO: 7 alebo SEQ ID NO: 10 môže tvoriť antigény a predstavovať aktívnu zložku profylaktickej alebo terapeutickej vakcíny určenej na to, aby poskytovala ochranu proti vírusu ľudskej imunitnej nedostatočnosti typu 1 (HIV-1). Vakcína môže obsahovať zlúčeniny, ktoré majú priaznivé účinky pri ochrane alebo stimulácii imunitného systému hostiteľa (človeka alebo iného živočícha-stavovca), napríklad interleukíny, interferóny, rastové faktory granulocytov-makrofágov, hematopoetické rastové faktory a podobne. Vakcíny ďalej výhodne obsahujú adjuvant alebo vehikulum, výhodnejšie je adjuvantom alebo vehikulom monofosforyllipid A (MPL ®), prípadne s alumom, Freundov adjuvant (úplný alebo neúplný) alebo hydroxid hli28 nity. Optimálne množstvo adjuvantu/vehikula bude závisieť od vybratého typu (typov).At least one of the peptides of the invention selected from the sequence of SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 4, SEQ ID NO: 7 or SEQ ID NO: 10 may form antigens and constitute the active ingredient of a prophylactic or therapeutic vaccine intended to provided protection against human immunodeficiency virus type 1 (HIV-1). The vaccine may comprise compounds that have beneficial effects in protecting or stimulating the immune system of the host (human or other vertebrate animal), for example, interleukins, interferons, granulocyte-macrophage growth factors, hematopoietic growth factors, and the like. The vaccines further preferably comprise an adjuvant or vehicle, more preferably the adjuvant or vehicle is monophosphoryl lipid A (MPL ®), optionally with alum, Freund's adjuvant (complete or incomplete) or the hydroxide of the thread. The optimum amount of adjuvant / vehicle will depend on the type (s) selected.
Peptidy podľa tohto vynálezu by sa mohli modifikovať C-koncovou adíciou jednoduchej mastnej kyseliny, ako je jednoduchý palmitoylový reťazec, za vzniku lipopeptidovej vakcíny. Lipopeptidy sa môžu ďalej zaviesť do lipozómových membrán metódou cyklov zmrazenia a roztopenia, čím sa získajú lipozómy, ktoré majú na svojom povrchu peptidové ligandy.The peptides of the invention could be modified by the C-terminal addition of a simple fatty acid, such as a single palmitoyl chain, to form a lipopeptide vaccine. Lipopeptides can be further introduced into liposome membranes by freeze-thaw cycles to yield liposomes having peptide ligands on their surface.
Preparát peptidu alebo vakcíny sa pred uskladnením môže lyofilizovať. Lyofilizované peptidy sa môžu rozpustiť v sterilnej vode na konečnú koncentráciu 0,1 - 100 mg/ml. Vakcína sa môže skladovať výhodne pri nízkej teplote, v ampulách obsahujúcich jednu alebo viac jednotkových dávok použiteľných bez úpravy. Typická jednotková dávka peptidu podľa tohto vynálezu je v rozmedzí koncentrácií: 0,05 gg - 1 mg na kg telesnej hmotnosti, výhodne 0,15 gg 0,15 mg na kg telesnej hmotnosti. Osoby s praxou v problematike ocenia, že vhodná dávka bude závisieť na telesnej hmotnosti pacienta, na type ochorenia, závažnosti stavu, spôsobu podávania a niektorých ďalších faktoroch. Keď sa používa vakcína ako terapeutická, môže sa podať až dvanásťkrát, injekčné. Za tým môžu nasledovať aj ďalšie dávky injekcií a v niektorých prípadoch sa môže pokračovať počas celého života pacientov. Pri príprave injekčného roztoku sa peptidy rozpustia v sterilnej vode na výslednú koncentráciu 1 mg/ml peptidu. Typický objem injekcie je 100 gl až 200 gl (2x100 gl). Peptid sa výhodne podáva spolu s vhodným adjuvantom a/alebo s rastovým faktorom granulocytovmakrofágov, napríklad s prípravkom Leucomax® «Shering Plough» pripraveným v koncentračnom rozsahu od 0,1 mg/ml do 1 mg/ml alebo podľa návodov na použitie od ich výrobcov. Obzvlášť výhodnou je kombinovaná terapia, kde sa tieto peptidy podávajú spolu s peptidmi, ktoré sú opísané v publikovanej medzinárodnej prihláške patentu č. PCT/NO00/00075 a/alebo v spoločne prejednávanej prihláške nórskeho patentu č. 20004413. Tieto peptidy sa môžu podávať súčasne alebo po sebe. Vhodným spôsobom podania môže byť intrakutánne, subkutánne, intravenózne, perorálne, intramuskulárne, intranazálne, mukozálne alebo inou vhodnou cestou. Na udržanie ochranného účinku sa môže vyžadovať opakované podávanie. Pre odborníkov v problematike bude zrejmé, že vakcínové kompozície podľa tohto vynálezu sú prospešné nielen v prevencii infekcie, ale aj pri liečbe infekcie.The peptide or vaccine preparation may be lyophilized prior to storage. Lyophilized peptides can be dissolved in sterile water to a final concentration of 0.1-100 mg / ml. The vaccine may be stored preferably at low temperature in ampoules containing one or more unit doses usable without modification. A typical unit dose of the peptide of the invention is in the concentration range: 0.05 gg - 1 mg per kg body weight, preferably 0.15 gg 0.15 mg per kg body weight. Those of skill in the art will appreciate that the appropriate dosage will depend on the patient's body weight, the type of disease, the severity of the condition, the route of administration, and some other factors. When used as a therapeutic vaccine, it can be administered up to twelve times, by injection. This may be followed by additional doses of injections and in some cases may be continued throughout the patient's lifetime. To prepare a solution for injection, the peptides are dissolved in sterile water to a final concentration of 1 mg / ml peptide. A typical injection volume is 100g to 200g (2x100g). The peptide is preferably administered together with a suitable adjuvant and / or granulocyte macrophage growth factor, for example Leucomax® «Shering Plow» prepared in a concentration range of 0.1 mg / ml to 1 mg / ml or according to the manufacturer's instructions for use. Particularly preferred is a combination therapy wherein these peptides are administered together with the peptides described in published international patent application no. PCT / NO00 / 00075 and / or co-pending application no. These peptides may be administered simultaneously or sequentially. A suitable route of administration may be intracutaneous, subcutaneous, intravenous, oral, intramuscular, intranasal, mucosal or other suitable route. Repeated administration may be required to maintain the protective effect. It will be apparent to those skilled in the art that the vaccine compositions of the invention are useful not only in preventing infection but also in treating infection.
Žiadne toxické účinky peptidov podľa tohto vynálezu sa nepozorovali, keď sa podali injekčné myšiam v dávke 100 pg na kg telesnej hmotnosti.No toxic effects of the peptides of the invention were observed when injected into mice at a dose of 100 µg per kg body weight.
Vyššie uvedené príklady sú mienené len ako ilustrácia vynálezu. Musí to byť chápané tak, že osoba s praxou v problematike môže modifikovať tu opísané peptidy, antigény a vakcíny tak, že sa neodchýlia od zmyslu a z rámca tohto vynálezu, ako je uvedené v nárokoch.The above examples are intended to illustrate the invention only. It is to be understood that a person skilled in the art can modify the peptides, antigens and vaccines described herein so that they do not depart from the spirit and scope of the invention as set forth in the claims.
ww
ZOZNAM SEKVENCIÍ (1) VŠEOBECNÉ INFORMÁCIE:LIST OF SEQUENCES (1) GENERAL INFORMATION:
(i) PRIHLASOVATEĽ:(i) APPLICANT:
(A) MENO: Bionor Immuno AS (B) ULICA: Stremdalsjordet 4, P.O.Box 1893 Gulset (C) MESTO: 3703 Skien (E) ŠTÁT: Nórsko (F) POŠTOVÝ KÓD (ZIP): N-3705 (G) TELEFÓN: +47 35 50 57 50 (H) TELEFAX: +47 35 50 57 01 (i) PÔVODCA:(A) NAME: Bionor Immuno AS (B) STREET: Stremdalsjordet 4, POBox 1893 Gulset (C) CITY: 3703 Skien (E) COUNT: Norway (F) MAIL CODE (ZIP): N-3705 (G) PHONE: +47 35 50 57 50 (H) TELEFAX: +47 35 50 57 01 (i)
(A) MENO : Birger Sorensen (B) ULICA: Meierlia 3 (C) MESTO : 3727 Skien (D) ŠTÁT: Nórsko (ii) NÁZOV VYNÁLEZU: Regulačné a pomocné peptidy HIV, antigény, vakcínové kompozície, súprava na imunologickú skúšku a spôsob detekcie protilátok vyvolaných HIV.(A) NAME: Birger Sorensen (B) STREET: Meierlia 3 (C) CITY: 3727 Skien (D) STATE: Norway (ii) NAME OF THE INVENTION: HIV regulatory and helper peptides, antigens, vaccine compositions, immunoassay kit and method detection of HIV-induced antibodies.
(iii) POČET SEKVENCIÍ: 18 (iv) POČÍTAČOVÁ ČÍTACIA FORMA:(iii) NUMBER OF SEQUENCES: 18 (iv) COMPUTER READING FORM:
(A) TYP MÉDIA: Floppy disk (B) POČÍTAČ: IBM Kompatibilný (C) OPERAČNÝ SYSTÉM: Windows 2000 (D) SOFTWARE: Word 7.0 (v) ÚDAJE O SÚČASNEJ PRIHLÁŠKE:(A) MEDIA TYPE: Floppy disk (B) COMPUTER: IBM Compatible (C) OPERATING SYSTEM: Windows 2000 (D) SOFTWARE: Word 7.0 (v) CURRENT APPLICATION DETAILS:
ČÍSLO PRIHLÁŠKY:APPLICATION NUMBER:
(2) INFORMÁCIE O SEQ ID NO:1:(2) INFORMATION ON SEQ ID NO: 1:
(i) CHARAKTERISTIKY SEKVENCIE:(i) SEQUENCE CHARACTERISTICS:
(A) DĹŽKA: 22-24 aminokyselín (B) TYP: aminokyselina (C) REŤAZEC: jednoduchý (D) TOPOLÓGIA: obidvoje (ii) TYP MOLEKULY: peptid (iii) HYPOTETICKÁ: Nie (v) TYP FRAGMENTU : vnútorný (ix) ZNAKY:(A) LENGTH: 22-24 amino acids (B) TYPE: amino acid (C) STRING: simple (D) TOPOLOGY: both (ii) MOLECULA TYPE: peptide (iii) HYPOTHETICAL: No (v) FRAGMENT TYPE: internal (ix) FEATURES:
(A) MENO/KĽÚČ: Modifikované miesto (B) UMIESTNENIE: 1 (D) ĎALŠIE INFORMÁCIE: /poznámka = Xaa v polohe 1 je Met, Ser, Cys alebo nič ix) ZNAKY:(A) NAME / KEY: Modified Site (B) LOCATION: 1 (D) ADDITIONAL INFORMATION: / note = Xaa at position 1 is Met, Ser, Cys or nothing ix) CHARACTERS:
(A) MENO/KĽÚČ: Modifikované miesto (B) UMIESTNENIE: 2 (D) ĎALŠIE INFORMÁCIE: /poznámka = Xaa v polohe 2 je Glu, Asp, Val, Ser alebo ix) ZNAKY:(A) NAME / KEY: Modified Site (B) LOCATION: 2 (D) ADDITIONAL INFORMATION: / note = Xaa at position 2 is Glu, Asp, Val, Ser or ix) CHARACTERS:
(A) MENO/KĽÚČ: Modifikované miesto (B) UMIESTNENIE: 3 (D) ĎALŠIE INFORMÁCIE: /poznámka = Xaa v polohe 3 je Ser, Gin, Pro, Leu, Val, Ala, Trp, Tyr alebo Phe ix) ZNAKY:(A) NAME / KEY: Modified Site (B) LOCATION: 3 (D) ADDITIONAL INFORMATION: / Note = Xaa at position 3 is Ser, Gln, Pro, Leu, Val, Ala, Trp, Tyr or Phe (ix) CHARACTERS:
(A) MENO/KĽÚČ: Modifikované miesto (B) UMIESTNENIE: 4 (D) ĎALŠIE INFORMÁCIE: /poznámka = Xaa v polohe 4 je Val alebo lle ix) ZNAKY:(A) NAME / KEY: Modified Site (B) LOCATION: 4 (D) ADDITIONAL INFORMATION: / note = Xaa at position 4 is Val or lle ix) CHARACTERS:
(A) MENO/KĽÚČ: Modifikované miesto (B) UMIESTNENIE: 5 (D) ĎALŠIE INFORMÁCIE: /poznámka = Xaa v polohe 5 je Asp, Asn alebo lle ix) ZNAKY:(A) NAME / KEY: Modified Site (B) LOCATION: 5 (D) ADDITIONAL INFORMATION: / Note = Xaa at position 5 is Asp, Asn or lle ix) CHARACTERS:
(A) MENO/KĽÚČ: Modifikované miesto (B) UMIESTNENIE: 6 (D) ĎALŠIE INFORMÁCIE: /poznámka = Xaa v polohe 6 je Pro, His alebo Ala ix) ZNAKY:(A) NAME / KEY: Modified Site (B) LOCATION: 6 (D) ADDITIONAL INFORMATION: / note = Xaa at position 6 is Pro, His or Ala (ix) FEATURES:
(A) MENO/KĽÚČ: Modifikované miesto (B) UMIESTNENIE: 7 (D) ĎALŠIE INFORMÁCIE: /poznámka = Xaa v polohe 7 je Arg, Asn, Ser, Lys, Glu alebo Asp ix) ZNAKY:(A) NAME / KEY: Modified Site (B) LOCATION: 7 (D) ADDITIONAL INFORMATION: / Note = Xaa at position 7 is Arg, Asn, Ser, Lys, Glu or Asp ix) CHARACTERS:
(A) MENO/KĽÚČ: Modifikované miesto (B) UMIESTNENIE: 12 (D) ĎALŠIE INFORMÁCIE: /poznámka = Xaa v polohe 12 je Leu, lle alebo Nie ix) ZNAKY:(A) NAME / KEY: Modified Site (B) LOCATION: 12 (D) ADDITIONAL INFORMATION: / note = Xaa at position 12 is Leu, lle or No ix) CHARACTERS:
(A) MENO/KĽÚČ: Modifikované miesto (B) UMIESTNENIE: 15 (D) ĎALŠIE INFORMÁCIE: /poznámka = Xaa v polohe 15 je Gly alebo Pro ix) ZNAKY:(A) NAME / KEY: Modified Site (B) LOCATION: 15 (D) ADDITIONAL INFORMATION: / note = Xaa at position 15 is Gly or Pro ix) CHARACTERS:
(A) MENO/KĽÚČ: Modifikované miesto (B) UMIESTNENIE: 16 (D) ĎALŠIE INFORMÁCIE: /poznámka = Xaa v polohe 16 je Ser, Asn alebo Ala ix) ZNAKY:(A) NAME / KEY: Modified Site (B) LOCATION: 16 (D) ADDITIONAL INFORMATION: / Note = Xaa at position 16 is Ser, Asn or Ala ix) CHARACTERS:
(A) MENO/KĽÚČ: Modifikované miesto (B) UMIESTNENIE: 17 (D) ĎALŠIE INFORMÁCIE: /poznámka = Xaa v polohe 17 je Gin, Lys alebo Thr ix) ZNAKY:(A) NAME / KEY: Modified Site (B) LOCATION: 17 (D) ADDITIONAL INFORMATION: / note = Xaa at position 17 is Gin, Lys or Thr ix) CHARACTERS:
(A) MENO/KĽÚČ: Modifikované miesto (B) UMIESTNENIE: 18 (D) ĎALŠIE INFORMÁCIE: /poznámka = Xaa v polohe 18 je Pro alebo His ix) ZNAKY:(A) NAME / KEY: Modified Site (B) LOCATION: 18 (D) ADDITIONAL INFORMATION: / Note = Xaa at position 18 is Pro or His (ix) FEATURES:
(A) MENO/KĽÚČ: Modifikované miesto (B) UMIESTNENIE: 19 (D) ĎALŠIE INFORMÁCIE: /poznámka = Xaa v polohe 19 je Lys, Thr, Ser, Ala, Arg, Pro, Glu, Leu, lle alebo Nie ix) ZNAKY:(A) NAME / KEY: Modified Site (B) LOCATION: 19 (D) ADDITIONAL INFORMATION: / note = Xaa at position 19 is Lys, Thr, Ser, Ala, Arg, Pro, Glu, Leu, lle or No ix) FEATURES:
(A) MENO/KĽÚČ: Modifikované miesto (B) UMIESTNENIE: 20 (D) ĎALŠIE INFORMÁCIE: /poznámka = Xaa v polohe 20 je Thr, Ala, alebo lle ix) ZNAKY:(A) NAME / KEY: Modified Site (B) LOCATION: 20 (D) ADDITIONAL INFORMATION: / note = Xaa at position 20 is Thr, Ala, or lle ix) CHARACTERS:
(A) MENO/KĽÚČ: Modifikované miesto (B) UMIESTNENIE: 21 (D) ĎALŠIE INFORMÁCIE: /poznámka = Xaa v polohe 21 je Ala, Pro, Asp alebo Val ix) ZNAKY:(A) NAME / KEY: Modified Site (B) LOCATION: 21 (D) ADDITIONAL INFORMATION: / Note = Xaa at position 21 is Ala, Pro, Asp or Val ix) CHARACTERS:
(A) MENO/KĽÚČ: Modifikované miesto (B) UMIESTNENIE: 22 (D) ĎALŠIE INFORMÁCIE: /poznámka = Xaa v polohe 22 je Cys alebo Ser ix) ZNAKY:(A) NAME / KEY: Modified Site (B) LOCATION: 22 (D) ADDITIONAL INFORMATION: / note = Xaa at position 22 is Cys or Ser ix) FEATURES:
(A) MENO/KĽÚČ: Modifikované miesto (B) UMIESTNENIE: 23 (D) ĎALŠIE INFORMÁCIE: /poznámka = Xaa v polohe 23 je Thr, Asn alebo Ser ix) ZNAKY:(A) NAME / KEY: Modified Site (B) LOCATION: 23 (D) ADDITIONAL INFORMATION: / note = Xaa at position 23 is Thr, Asn or Ser ix) CHARACTERS:
(A) MENO/KĽÚČ: Modifikované miesto (B) UMIESTNENIE: 24 (D) ĎALŠIE INFORMÁCIE: /poznámka = Xaa v polohe 24 je Asn, Lys, Arg, Gin, Ala Pro alebo Thr ix) ZNAKY:(A) NAME / KEY: Modified Site (B) LOCATION: 24 (D) ADDITIONAL INFORMATION: / note = Xaa at position 24 is Asn, Lys, Arg, Gln, Ala Pro or Thr ix) CHARACTERS:
(A) MENO/KĽÚČ: Modifikované miesto (B) UMIESTNENIE: 1 (D) ĎALŠIE INFORMÁCIE: /poznámka = Cys v polohe 1 môže tvoriť časť disulfidického mostíka ix) ZNAKY:(A) NAME / KEY: Modified Site (B) LOCATION: 1 (D) ADDITIONAL INFORMATION: / note = Cys at position 1 may form part of disulfide bridge ix) FEATURES:
(A) MENO/KĽÚČ: Modifikované miesto (B) UMIESTNENIE: 22 (D) ĎALŠIE INFORMÁCIE: /poznámka = Cys v polohe 22 môže tvoriť časť disulfidického mostíka (xi) OPIS SEKVENCIE: SEQ ID NO: 1 :(A) NAME / KEY: Modified Site (B) LOCATION: 22 (D) ADDITIONAL INFORMATION: / note = The Cys at position 22 may form part of a disulfide bridge (xi) SEQUENCE DESCRIPTION: SEQ ID NO: 1:
Xaa! Xaa2Xaa3Xaa4 Xaa5 Xaa6 Xaa7 Leu Glu Pro Trp Xaa12 His Pro Xaa15 Xaa,6 Xaa17 15 10 15Xaa! Xaa 2 Xaa 3 Xaa 4 Xaa 5 Xaa 6 Xaa 7 Leu Glu Pro Trp Xaa 12 His Pro Xaa 15 Xaa 6 Xaa 17 15 10 15
XaaieXaaig Xaa2oXaa2i Xaa22 Xaa23Xaa24 20 *3 >r (2) INFORMÁCIE O SEQ ID NO:2:XaaieXaaig Xaa 2 oXaa 2 i Xaa 22 Xaa 2 3Xaa 2 4 20 * 3> r (2) INFORMATION ON SEQ ID NO: 2:
(i) CHARAKTERISTIKY SEKVENCIE:(i) SEQUENCE CHARACTERISTICS:
(A) DĹŽKA: 24 aminokyselín (B) TYP: aminokyselina (C) REŤAZEC: jednoduchý (D) TOPOLÓGIA: obidvoje (ii) TYP MOLEKULY: peptid (iii) HYPOTETICKÁ: Nie ix) ZNAKY:(A) LENGTH: 24 amino acids (B) TYPE: amino acid (C) STRING: simple (D) TOPOLOGY: both (ii) MOLECULA TYPE: peptide (iii) HYPOTHETICAL: No ix) FEATURES:
(A) MENO/KĽÚČ: Modifikované miesto (B) UMIESTNENIE: 1...22 (D) ĎALŠIE INFORMÁCIE: /poznámka = Cys v polohe 1 a 22 môže tvoriť časť vnútroreťazcového disulfidického mostíka (xi) OPIS SEKVENCIE: SEQ ID NO: 2 :(A) NAME / KEY: Modified Site (B) LOCATION: 1 ... 22 (D) ADDITIONAL INFORMATION: / note = Cys at positions 1 and 22 may form part of an intra-chain disulfide bridge (xi) SEQUENCE DESCRIPTION: SEQ ID NO: 2:
Cys Ser Trp Val Asn Pro Arg Leu Glu Pro Trp Nle His Pro Gly Ser Gin His Nle Thr 15 10 15 20Cys Ser Trp Val Asn Pro Glu Pro Trp Nle His Pro Gly Ser Gin His Nle Thr 15 10 15 20
Ala Cys Thr Asn (2) INFORMÁCIE O SEQ ID NO: 3 :Ala Cys Thr Asn (2) INFORMATION ON SEQ ID NO: 3:
(i) CHARAKTERISTIKY SEKVENCIE:(i) SEQUENCE CHARACTERISTICS:
(A) DĹŽKA: 22 aminokyselín (B) TYP: aminokyselina (C) REŤAZEC: jednoduchý (D) TOPOLÓGIA: obidvoje (ii) TYP MOLEKULY: peptid (iii) HYPOTETICKÁ: Nie (xi) OPIS SEKVENCIE: SEQ ID NO: 3 :(A) LENGTH: 22 amino acids (B) TYPE: amino acid (C) STRING: simple (D) TOPOLOGY: both (ii) MOLECULA TYPE: peptide (iii) HYPOTHETICAL: No (xi) SEQUENCE DESCRIPTION: SEQ ID NO: 3:
Phe Val lle Pro Arg Leu Glu Pro Trp Nle His Pro Gly Ser Gin Pro Nle Thr Ala Cys 15 10 15 20Phe Val lle Pro Gle Pro Trle Nle His Pro Gly Ser Gin Pro Nle Thr Ala Cys 15 10 15 20
Thr Asn (2) INFORMÁCIE O SEQ ID NO: 4 :Thr Asn (2) INFORMATION ON SEQ ID NO: 4:
(i) CHARAKTERISTIKY SEKVENCIE:(i) SEQUENCE CHARACTERISTICS:
(A) DĹŽKA: 24-27 aminokyselín (B) TYP: aminokyselina (C) REŤAZEC: jednoduchý (D) TOPOLÓGIA: obidvoje (ii) TYP MOLEKULY: peptid (iii) HYPOTETICKÁ: Nie ix) ZNAKY:(A) LENGTH: 24-27 amino acids (B) TYPE: amino acid (C) STRING: simple (D) TOPOLOGY: both (ii) MOLECULA TYPE: peptide (iii) HYPOTHETICAL: No ix) FEATURES:
(A) MENO/KĽÚČ: Modifikované miesto (B) UMIESTNENIE: 1 (D) ĎALŠIE INFORMÁCIE: /poznámka = Xaa v polohe 1 je Pro, lle, Leu, Thr, Tyr alebo Val ix) ZNAKY:(A) NAME / KEY: Modified Site (B) LOCATION: 1 (D) ADDITIONAL INFORMATION: / note = Xaa at position 1 is Pro, lle, Leu, Thr, Tyr or Val ix) CHARACTERS:
(A) MENO/KĽÚČ: Modifikované miesto (B) UMIESTNENIE: 2 (D) ĎALŠIE INFORMÁCIE: /poznámka = Xaa v polohe 2 je Val, Ala Cys, Leu, ix) ZNAKY:(A) NAME / KEY: Modified Site (B) LOCATION: 2 (D) ADDITIONAL INFORMATION: / note = Xaa at position 2 is Val, Ala Cys, Leu, (ix) FEATURES:
(A) MENO/KĽÚČ: Modifikované miesto (B) UMIESTNENIE: 3 (D) ĎALŠIE INFORMÁCIE: /poznámka = Xaa v polohe 3 je Cys, lle, Leu, Val alebo ix) ZNAKY:(A) NAME / KEY: Modified Site (B) LOCATION: 3 (D) ADDITIONAL INFORMATION: / note = Xaa at position 3 is Cys, lle, Leu, Val or ix) CHARACTERS:
(A) MENO/KĽÚČ: Modifikované miesto (B) UMIESTNENIE: 5 (D) ĎALŠIE INFORMÁCIE: /poznámka = Xaa v polohe 5 je lle, Leu, Gin, Met alebo ix) ZNAKY:(A) NAME / KEY: Modified Site (B) LOCATION: 5 (D) ADDITIONAL INFORMATION: / Note = Xaa at position 5 is lle, Leu, Gin, Met or ix) CHARACTERS:
(A) MENO/KĽÚČ: Modifikované miesto (B) UMIESTNENIE: 6 (D) ĎALŠIE INFORMÁCIE: /poznámka = Xaa v polohe 6 je Thr, Asn, Lys alebo Arg ix) ZNAKY:(A) NAME / KEY: Modified Site (B) LOCATION: 6 (D) ADDITIONAL INFORMATION: / note = Xaa at position 6 is Thr, Asn, Lys or Arg ix) CHARACTERS:
(A) MENO/KĽÚČ: Modifikované miesto (B) UMIESTNENIE: 7 (D) ĎALŠIE INFORMÁCIE: /poznámka = Xaa v polohe 7 je Lys, Arg alebo Gin ix) ZNAKY:(A) NAME / KEY: Modified Site (B) LOCATION: 7 (D) ADDITIONAL INFORMATION: / note = Xaa at position 7 is Lys, Arg or Gin ix) CHARACTERS:
(A) MENO/KĽÚČ: Modifikované miesto (B) UMIESTNENIE: 8 (D) ĎALŠIE INFORMÁCIE: /poznámka = Xaa v polohe 8 je Gly alebo Ala ix) ZNAKY:(A) NAME / KEY: Modified Site (B) LOCATION: 8 (D) ADDITIONAL INFORMATION: / note = Xaa at position 8 is Gly or Ala ix) CHARACTERS:
(A) MENO/KĽÚČ: Modifikované miesto (B) UMIESTNENIE: 9 (D) ĎALŠIE INFORMÁCIE: /poznámka = Xaa v polohe 9 je Leu alebo lle ix) ZNAKY:(A) NAME / KEY: Modified Site (B) LOCATION: 9 (D) ADDITIONAL INFORMATION: / note = Xaa at position 9 is Leu or lle ix) CHARACTERS:
(A) MENO/KĽÚČ: Modifikované miesto (B) UMIESTNENIE: 10 (D) ĎALŠIE INFORMÁCIE: /poznámka = Xaa v polohe 10 je Gly, Ser alebo Ala ix) ZNAKY:(A) NAME / KEY: Modified Site (B) LOCATION: 10 (D) ADDITIONAL INFORMATION: / note = Xaa at position 10 is Gly, Ser or Ala ix) CHARACTERS:
v (A) MENO/KĽÚČ: Modifikované miesto (B) UMIESTNENIE: 11 (D) ĎALŠIE INFORMÁCIE: /poznámka = Xaa v polohe 11 je lle alebo Gly ix) ZNAKY:v (A) NAME / KEY: Modified Site (B) LOCATION: 11 (D) ADDITIONAL INFORMATION: / note = Xaa at position 11 is lle or Gly ix) FEATURES:
(A) MENO/KĽÚČ: Modifikované miesto (B) UMIESTNENIE: 12 (D) ĎALŠIE INFORMÁCIE: /poznámka = Xaa v polohe 12 je Ser, Phe alebo Tyr ix) ZNAKY:(A) NAME / KEY: Modified Site (B) LOCATION: 12 (D) ADDITIONAL INFORMATION: / note = Xaa at position 12 is Ser, Phe or Tyr ix) CHARACTERS:
(A) MENO/KĽÚČ: Modifikované miesto (B) UMIESTNENIE: Xaaj vložený pred polohou 14 (D) ĎALŠIE INFORMÁCIE: /poznámka = Xaaj vložený pred polohou 14 je Leu, lle, ix) ZNAKY:(A) NAME / KEY: Modified Location (B) LOCATION: Xaaj inserted before position 14 (D) ADDITIONAL INFORMATION: / note = Xaaj inserted before position 14 is Leu, lle, ix) CHARACTERS:
(A) MENO/KĽÚČ: Modifikované miesto (B) UMIESTNENIE: 15 (D) ĎALŠIE INFORMÁCIE: /poznámka = Xaa v polohe 15 je Arg, Lys, Ser alebo Citrulín ix) ZNAKY:(A) NAME / KEY: Modified Site (B) LOCATION: 15 (D) ADDITIONAL INFORMATION: / note = Xaa at position 15 is Arg, Lys, Ser or Citrulline (ix) FEATURES:
(A) MENO/KĽÚČ: Modifikované miesto (B) UMIESTNENIE: 19 (D) ĎALŠIE INFORMÁCIE: /poznámka = Xaa v polohe 19 je Arg, Lys, Ser, Gly alebo Citrulín ix) ZNAKY:(A) NAME / KEY: Modified Site (B) LOCATION: 19 (D) ADDITIONAL INFORMATION: / note = Xaa at position 19 is Arg, Lys, Ser, Gly or Citrulline ix) CHARACTERS:
(A) MENO/KĽÚČ: Modifikované miesto (B) UMIESTNENIE: 20 (D) ĎALŠIE INFORMÁCIE: /poznámka = Xaa v polohe 20 je Gin, Arg alebo Pro ix) ZNAKY:(A) NAME / KEY: Modified Site (B) LOCATION: 20 (D) ADDITIONAL INFORMATION: / note = Xaa at position 20 is Gin, Arg or Pro ix) FEATURES:
(A) MENO/KĽÚČ: Modifikované miesto (B) UMIESTNENIE: 21 (D) ĎALŠIE INFORMÁCIE: /poznámka = Xaa v polohe 21 je lle alebo leu ix) ZNAKY:(A) NAME / KEY: Modified Site (B) LOCATION: 21 (D) ADDITIONAL INFORMATION: / Note = Xaa at position 21 is lle or leu ix) FEATURES:
(A) MENO/KĽÚČ: Modifikované miesto (B) UMIESTNENIE: 22 (D) ĎALŠIE INFORMÁCIE: /poznámka = Xaa v polohe 22 je Gly, Leu, lle, Cys alebo ix) ZNAKY:(A) NAME / KEY: Modified Site (B) LOCATION: 22 (D) ADDITIONAL INFORMATION: / note = Xaa at position 22 is Gly, Leu, lle, Cys or ix) CHARACTERS:
(A) MENO/KĽÚČ: Modifikované miesto (B) UMIESTNENIE: 23 (D) ĎALŠIE INFORMÁCIE: /poznámka = Xaa v polohe 23 je Gly alebo nič ix) ZNAKY:(A) NAME / KEY: Modified Site (B) LOCATION: 23 (D) ADDITIONAL INFORMATION: / note = Xaa at position 23 is Gly or Nothing ix) CHARACTERS:
(A) MENO/KĽÚČ: Modifikované miesto (B) UMIESTNENIE: 12..13 (D) ĎALŠIE INFORMÁCIE: /poznámka = prípadne vložený spoj -Zix) ZNAKY:(A) NAME / KEY: Modified Location (B) LOCATION: 12..13 (D) ADDITIONAL INFORMATION: / Note = Zix inserts if applicable) SYMBOLS:
z (A) MENO/KĽÚČ: Modifikované miesto (B) UMIESTNENIE: 2, 3 a 22 (D) ĎALŠIE INFORMÁCIE: /poznámka = Cys v polohách 2, 3 a 22 môže tvoriť časť disulfidického mostíka (xi) OPIS SEKVENCIE: SEQ ID NO: 4 :of (A) NAME / KEY: Modified Site (B) LOCATION: 2, 3 and 22 (D) ADDITIONAL INFORMATION: / note = Cys at positions 2, 3 and 22 may form part of disulfide bridge (xi) SEQUENCE DESCRIPTION: SEQ ID NO: 4:
Xaa1Xaa2 Xaa3 Phe Xaa5 XaaeXaayXaasXaagXaa^Xaau Xaa12 -Z-TyrXaa|Gly 1 5 10 15Xaa 1 Xaa 2 Xaa 3 Phe Xaa 5 XaaXaayXaasXaagXaa ^ Xaau Xaa 12 -Z-TyrXaa | Gly 1 5 10 15
Xaa15 Lys Lys ArgXaaigXaaaj Xaa2i Xaa22Xaa23 20 (2) INFORMÁCIE O SEQ ID NO: 5 :Xaa 15 Lys Lys ArgXaaigXaaaj Xaa 2 and Xaa 22 Xaa 23 20 (2) INFORMATION ON SEQ ID NO: 5:
(i) CHARAKTERISTIKY SEKVENCIE:(i) SEQUENCE CHARACTERISTICS:
(A) DĹŽKA: 27 aminokyselín (B) TYP: aminokyselina (C) REŤAZEC: jednoduchý (D) TOPOLÓGIA: obidvoje (ii) TYP MOLEKULY: peptid (iii) HYPOTETICKÁ: Nie ix) ZNAKY:(A) LENGTH: 27 amino acids (B) TYPE: amino acid (C) STRING: simple (D) TOPOLOGY: both (ii) MOLECULA TYPE: peptide (iii) HYPOTHETICAL: No ix) FEATURES:
(A) MENO/KĽÚČ: Modifikované miesto (B) UMIESTNENIE: 12..13 (D) ĎALŠIE INFORMÁCIE: /poznámka = vložený Gly-mostík 3 zvyškov (xi) OPIS SEKVENCIE: SEQ ID NO: 5 :(A) NAME / KEY: Modified Site (B) LOCATION: 12..13 (D) ADDITIONAL INFORMATION: / note = 3 Gly-Bridge inserted (xi) SEQUENCE DESCRIPTION: SEQ ID NO: 5:
Tyr Leu Leu Phe Leu Thr Lys Gly Leu Gly lle Ser Gly Gly Gly Tyr Nie Gly Cit Lys Lys 15 10 15 20Tyr Leu Phu Leu Thr Lys Gly Leu Gly Lly Ser Gly Gly Gly Tyr No Gly Cit Lys Lys 15 10 15 20
Arg Cit Gin lle Leu Gly (2) INFORMÁCIE O SEQ ID NO: 6 :Arg Cit Gin lle Leu Gly (2) INFORMATION ON SEQ ID NO: 6:
(i) CHARAKTERISTIKY SEKVENCIE:(i) SEQUENCE CHARACTERISTICS:
(A) DĹŽKA: 28 aminokyselín (B) TYP: aminokyselina (C) REŤAZEC: jednoduchý (D) TOPOLÓGIA: obidvoje (ii) TYP MOLEKULY: peptid (iii) HYPOTETICKÁ: Nie ix) ZNAKY:(A) LENGTH: 28 amino acids (B) TYPE: amino acid (C) STRING: simple (D) TOPOLOGY: both (ii) MOLECULA TYPE: peptide (iii) HYPOTHETICAL: No ix) FEATURES:
(A) MENO/KĽÚČ: Modifikované miesto (B) UMIESTNENIE: 12..13 (D) ĎALŠIE INFORMÁCIE: /poznámka = vložený Gly-mostík 3 zvyškov ix) ZNAKY:(A) NAME / KEY: Modified Site (B) LOCATION: 12..13 (D) ADDITIONAL INFORMATION: / note = Gly-bridge inserted 3 residues ix) CHARACTERS:
(A) MENO/KĽÚČ: Modifikované miesto (B) UMIESTNENIE: 27 (D) ĎALŠIE INFORMÁCIE: /poznámka = Cys v polohe 27 môže tvoriť časť disulfidického mostíka (xi) OPIS SEKVENCIE: SEQ ID NO: 6:(A) NAME / KEY: Modified Site (B) LOCATION: 27 (D) ADDITIONAL INFORMATION: / note = Cys at position 27 may form part of a disulfide bridge (xi) SEQUENCE DESCRIPTION: SEQ ID NO: 6:
Tyr Leu Nie Phe Leu Thr Arg Gly Leu Gly lle Ser Gly Gly Gly Tyr Nie Gly Cit Lys Lys 15 10 15 20Tyr Leu No Phe Leu Thr Gly Leu Gly lly Ser Gly Gly Gly Tyr No Gly Cit Lys Lys 15 10 15 20
Arg Cit Gin lle Cys Gly 25 (2) INFORMÁCIE O SEQ ID NO: 7 :Arg Cit Gin lle Cys Gly 25 (2) INFORMATION ON SEQ ID NO: 7:
(i) CHARAKTERISTIKY SEKVENCIE:(i) SEQUENCE CHARACTERISTICS:
(A) DĹŽKA: 25-28 aminokyselín (B) TYP: aminokyselina (C) REŤAZEC: jednoduchý (D) TOPOLÓGIA: obidvoje (ii) TYP MOLEKULY: peptid (iii) HYPOTETICKÁ: Nie ix) ZNAKY:(A) LENGTH: 25-28 amino acids (B) TYPE: amino acid (C) STRING: simple (D) TOPOLOGY: both (ii) MOLECULA TYPE: peptide (iii) HYPOTHETICAL: No ix) FEATURES:
(A) MENO/KĽÚČ: Modifikované miesto (B) UMIESTNENIE: 1 (D) ĎALŠIE INFORMÁCIE: /poznámka = Xaa v polohe 1 je Phe, Tyr, Trp alebo Arg ix) ZNAKY:(A) NAME / KEY: Modified Site (B) LOCATION: 1 (D) ADDITIONAL INFORMATION: / note = Xaa at position 1 is Phe, Tyr, Trp or Arg ix) CHARACTERS:
(A) MENO/KĽÚČ: Modifikované miesto (B) UMIESTNENIE: 4 (D) ĎALŠIE INFORMÁCIE: /poznámka = Xaa v polohe 4 je Gly, Ser, Asn, Asp, Cys, Val, Thr, Ala, alebo Arg ix) ZNAKY:(A) NAME / KEY: Modified Site (B) LOCATION: 4 (D) ADDITIONAL INFORMATION: / note = Xaa at position 4 is Gly, Ser, Asn, Asp, Cys, Val, Thr, Ala, or Arg ix) CHARACTERS :
(A) MENO/KĽÚČ: Modifikované miesto (B) UMIESTNENIE: 5 (D) ĎALŠIE INFORMÁCIE: /poznámka = Xaa v polohe 5 je Thr, Ala, Asp, Asn alebo ix) ZNAKY:(A) NAME / KEY: Modified Site (B) LOCATION: 5 (D) ADDITIONAL INFORMATION: / Note = Xaa at position 5 is Thr, Ala, Asp, Asn or ix) CHARACTERS:
(A) MENO/KĽÚČ: Modifikované miesto (B) UMIESTNENIE: 6 (D) ĎALŠIE INFORMÁCIE: /poznámka = Xaa v polohe 6 je Tyr, Cys, Phe, Arg, His, Ser, Val alebo Leu ix) ZNAKY:(A) NAME / KEY: Modified Site (B) LOCATION: 6 (D) ADDITIONAL INFORMATION: / note = Xaa at position 6 is Tyr, Cys, Phe, Arg, His, Ser, Val or Leu ix) CHARACTERS:
(A) MENO/KĽÚČ: Modifikované miesto (B) UMIESTNENIE: 10 (D) ĎALŠIE INFORMÁCIE: /poznámka = Xaa v polohe 10 je Ser, Pro, Phe, Leu alebo lle r(A) NAME / KEY: Modified Site (B) LOCATION: 10 (D) ADDITIONAL INFORMATION: / note = Xaa at position 10 is Ser, Pro, Phe, Leu or lle r
ix) ZNAKY:(ix) FEATURES:
(A) MENO/KĽÚČ: Modifikované miesto (B) UMIESTNENIE: 11 (D) ĎALŠIE INFORMÁCIE: /poznámka = Xaa v polohe 11 je Ala, Thr, Glu, Gin, Val, Pro alebo Ser ix) ZNAKY:(A) NAME / KEY: Modified Site (B) LOCATION: 11 (D) ADDITIONAL INFORMATION: / Note = Xaa at position 11 is Ala, Thr, Glu, Gin, Val, Pro or Ser ix) CHARACTERS:
(A) MENO/KĽÚČ: Modifikované miesto (B) UMIESTNENIE: 12 (D) ĎALŠIE INFORMÁCIE: /poznámka = Xaa v polohe 12 je Glu, Lys, Gin, Asp, Asn, Tyr, Trp alebo Phe ix) ZNAKY:(A) NAME / KEY: Modified Site (B) LOCATION: 12 (D) ADDITIONAL INFORMATION: / note = Xaa at position 12 is Glu, Lys, Gln, Asp, Asn, Tyr, Trp or Phe ix) CHARACTERS:
(A) MENO/KĽÚČ: Modifikované miesto (B) UMIESTNENIE: Xaa, vložený za polohou 13 (D) ĎALŠIE INFORMÁCIE: /poznámka = Xaaj vložený za polohou 13 je Ser, Pro, Phe, Leu alebo ile ix) ZNAKY:(A) NAME / KEY: Modified Site (B) LOCATION: Xaa, inserted after position 13 (D) ADDITIONAL INFORMATION: / note = Xaaj inserted after position 13 is Ser, Pro, Phe, Leu or ile ix) CHARACTERS:
(A) MENO/KĽÚČ: Modifikované miesto (B) UMIESTNENIE: Xaa, vložený pred polohou 14 (D) ĎALŠIE INFORMÁCIE: /poznámka = Xaaj vložený pred polohou 14 je Ala, Thr, Glu, Gin, Val, Pro, alebo Ser ix) ZNAKY:(A) NAME / KEY: Modified Site (B) LOCATION: Xaa inserted before position 14 (D) ADDITIONAL INFORMATION: / note = Xaa inserted before position 14 is Ala, Thr, Glu, Gin, Val, Pro, or Ser ix ) FEATURES:
(A) MENO/KĽÚČ: Modifikované miesto (B) UMIESTNENIE: 14 (D) ĎALŠIE INFORMÁCIE: /poznámka = Xaa v polohe 14 je Glu, Lys, Gin, Asp alebo ix) ZNAKY:(A) NAME / KEY: Modified Site (B) LOCATION: 14 (D) ADDITIONAL INFORMATION: / note = Xaa at position 14 is Glu, Lys, Gin, Asp or ix) FEATURES:
(A) MENO/KĽÚČ: Modifikované miesto (B) UMIESTNENIE: 15 (D) ĎALŠIE INFORMÁCIE: /poznámka = Xaa v polohe 15 je Pro, Ser, Ala alebo Asn ix) ZNAKY:(A) NAME / KEY: Modified Site (B) LOCATION: 15 (D) ADDITIONAL INFORMATION: / note = Xaa at position 15 is Pro, Ser, Ala or Asn ix) CHARACTERS:
(A) MENO/KĽÚČ: Modifikované miesto (B) UMIESTNENIE: 16 (D) ĎALŠIE INFORMÁCIE: /poznámka = Xaa v polohe 16 je Val, Asn, Gly alebo Pro ix) ZNAKY:(A) NAME / KEY: Modified Site (B) LOCATION: 16 (D) ADDITIONAL INFORMATION: / note = Xaa at position 16 is Val, Asn, Gly or Pro (ix) FEATURES:
(A) MENO/KĽÚČ: Modifikované miesto (B) UMIESTNENIE: 17 (D) ĎALŠIE INFORMÁCIE: /poznámka = Xaa v polohe 17 je Pro, Gin, His, Ser, Leu, Arg, Thr, Asp alebo Ile ix) ZNAKY:(A) NAME / KEY: Modified Site (B) LOCATION: 17 (D) ADDITIONAL INFORMATION: / note = Xaa at position 17 is Pro, Gin, His, Ser, Leu, Arg, Thr, Asp, or Ile ix) CHARACTERS:
(A) MENO/KĽÚČ: Modifikované miesto (B) UMIESTNENIE: 18 (D) ĎALŠIE INFORMÁCIE: /poznámka = Xaa v polohe 18 je Leu Phe alebo Val ix) ZNAKY:(A) NAME / KEY: Modified Site (B) LOCATION: 18 (D) ADDITIONAL INFORMATION: / note = Xaa at position 18 is Leu Phe or Val ix) CHARACTERS:
(A) MENO/KĽÚČ: Modifikované miesto (B) UMIESTNENIE: 19 (D) ĎALŠIE INFORMÁCIE: /poznámka = Xaa v polohe 19 je Gin, Leu, Pro, His, Asp alebo Glu ix) ZNAKY:(A) NAME / KEY: Modified Site (B) LOCATION: 19 (D) ADDITIONAL INFORMATION: / note = Xaa at position 19 is Gin, Leu, Pro, His, Asp or Glu (ix) FEATURES:
(A) MENO/KĽÚČ: Modifikované miesto (B) UMIESTNENIE: 11..12 (D) ĎALŠIE INFORMÁCIE: /poznámka = prípadne vložený spoj -Zix) ZNAKY:(A) NAME / KEY: Modified Location (B) LOCATION: 11..12 (D) ADDITIONAL INFORMATION: / Note = Zlin inserted if applicable) SYMBOLS:
(A) MENO/KĽÚČ: Modifikované miesto (B) UMIESTNENIE: 4 (D) ĎALŠIE INFORMÁCIE: /poznámka = Cys v polohe 4 a 6 môže tvoriť časť disulfidického mostíka (xi) OPIS SEKVENCIE: SEQ ID NO: 7 :(A) NAME / KEY: Modified Site (B) LOCATION: 4 (D) ADDITIONAL INFORMATION: / note = Cys at positions 4 and 6 may form part of a disulfide bridge (xi) SEQUENCE DESCRIPTION: SEQ ID NO: 7:
Xaa, lle Leu Xaa4Xaas Xaa6Leu Gly ArgXaa10Xaan -Z- Xaa12 Leu13 Xaa, Xaai Xaa,4 1 5 10 15Xaa, lle Leu Xaa 4 Xaa with Xaa 6 Leu Gly ArgXaa 10 Xaa -Z- Xaa 12 Leu 13 Xaa, Xaai Xaa, 4 1 5 10 15
Xaa15 Xaais Xaa17 Xaa18 Xaaig Leu Pro Pro Leu 20 25 (2) INFORMÁCIE O SEQ ID NO: 8 :Xaa 15 Xaa Xaa 17 Xaa 18 Xaa ig Leu Pro Pro Leu 20 25 (2) INFORMATION ON SEQ ID NO: 8:
(i) CHARAKTERISTIKY SEKVENCIE:(i) SEQUENCE CHARACTERISTICS:
(A) DĹŽKA: 28 aminokyselín (B) TYP: aminokyselina (C) REŤAZEC: jednoduchý (D) TOPOLÓGIA: obidvoje (ii) TYP MOLEKULY: peptid (iii) HYPOTETICKÁ: Nie ix) ZNAKY:(A) LENGTH: 28 amino acids (B) TYPE: amino acid (C) STRING: simple (D) TOPOLOGY: both (ii) MOLECULA TYPE: peptide (iii) HYPOTHETICAL: No ix) FEATURES:
(A) MENO/KĽÚČ: Modifikované miesto (B) UMIESTNENIE: 11..12 (D) ĎALŠIE INFORMÁCIE: /poznámka = vložený [Gly]„ mostík, kde n = 3 (xi) OPIS SEKVENCIE: SEQ ID NO: 8 :(A) NAME / KEY: Modified Site (B) LOCATION: 11..12 (D) ADDITIONAL INFORMATION: / note = inserted [Gly] 'bridge where n = 3 (xi) SEQUENCE DESCRIPTION: SEQ ID NO: 8:
Arg lle Leu Ser Thr Tyr Leu Gly Arg lle Ser Gly Gly Gly Trp Leu Ser Ala Glu Pro Val 15 10 15 20Arg lle Leu Ser Thr Tyr Leu Gly Arg lle Ser Gly Gly Trp Leu Ser Ala Glu Pro Val 15 10 15 20
Pro Leu Gin Leu Pro Pro Leu 25Pro Leu Gin Leu
INFORMÁCIE O SEQ ID NO: 9 :INFORMATION ABOUT SEQ ID NO: 9:
(i) CHARAKTERISTIKY SEKVENCIE:(i) SEQUENCE CHARACTERISTICS:
(A) DĹŽKA: 28 aminokyselín ίο y(A) LENGTH: 28 amino acids ίο y
(B) TYP: aminokyselina (C) REŤAZEC: jednoduchý (D) TOPOLÓGIA: obidvoje (ii) TYP MOLEKULY: peptid (iii) HYPOTETICKÁ: Nie ix) ZNAKY:(B) TYPE: amino acid (C) CHAIN: simple (D) TOPOLOGY: both (ii) MOLECULA TYPE: peptide (iii) HYPOTHETICAL: No ix) FEATURES:
(A) MENO/KĽÚČ: Modifikované miesto (B) UMIESTNENIE: 11..12 (D) ĎALŠIE INFORMÁCIE: /poznámka = vložený [Gly]n mostík, kde n = 3 (xi) OPIS SEKVENCIE: SEQ ID NO: 9:(A) NAME / KEY: Modified Site (B) LOCATION: 11..12 (D) ADDITIONAL INFORMATION: / note = inserted [Gly] n bridge where n = 3 (xi) SEQUENCE DESCRIPTION: SEQ ID NO: 9:
Arg lle Leu Ser Thr Tyr Leu Gly Arg lle Ser Gly Gly Gly Tyr Leu Ser Ala Glu Pro Val 15 10 15 20Arg Lle Leu Ser Thr Tyr Leu Gly Arg Lle Le Gly Gly Leu Ser Ala Glu Pro Val 15 10 15 20
Pro Leu Gin Leu Pro Pro Leu 25 (2) INFORMÁCIE O SEQ ID NO: 10 :Pro Leu Gin Leu Pro Leu 25 (2) INFORMATION ON SEQ ID NO: 10:
(i) CHARAKTERISTIKY SEKVENCIE:(i) SEQUENCE CHARACTERISTICS:
(A) DĹŽKA: 22-29 aminokyselín (B) TYP: aminokyselina (C) REŤAZEC: jednoduchý (D) TOPOLÓGIA: obidvoje (ii) TYP MOLEKULY: peptid (iii) HYPOTETICKÁ: Nie ix) ZNAKY:(A) LENGTH: 22-29 amino acids (B) TYPE: amino acid (C) STRING: simple (D) TOPOLOGY: both (ii) MOLECULA TYPE: peptide (iii) HYPOTHETICAL: No ix) FEATURES:
(A) MENO/KĽÚČ: Modifikované miesto (B) UMIESTNENIE: 1 (D) ĎALŠIE INFORMÁCIE: /poznámka = Xaa v polohe 1 je Lys alebo Arg ix) ZNAKY:(A) NAME / KEY: Modified Site (B) LOCATION: 1 (D) ADDITIONAL INFORMATION: / note = Xaa at position 1 is Lys or Arg ix) CHARACTERS:
(A) MENO/KĽÚČ: Modifikované miesto (B) UMIESTNENIE: 5 (D) ĎALŠIE INFORMÁCIE: /poznámka = Xaa v polohe 5 je Phe alebo Leu ix) ZNAKY:(A) NAME / KEY: Modified Site (B) LOCATION: 5 (D) ADDITIONAL INFORMATION: / Note = Xaa at position 5 is Phe or Leu ix) FEATURES:
(A) MENO/KĽÚČ: Modifikované miesto (B) UMIESTNENIE: 7 (D) ĎALŠIE INFORMÁCIE: /poznámka = Xaa v polohe 7 je lle alebo Val ix) ZNAKY:(A) NAME / KEY: Modified Site (B) LOCATION: 7 (D) ADDITIONAL INFORMATION: / Note = Xaa at position 7 is lle or Val ix) CHARACTERS:
(A) MENO/KĽÚČ: Modifikované miesto (B) UMIESTNENIE: 8 x(A) NAME / KEY: Modified Site (B) LOCATION: 8 x
(D) ĎALŠIE INFORMÁCIE: /poznámka = Xaa v polohe 8 je Thr, Arg, Lys, Ala alebo ix) ZNAKY:(D) ADDITIONAL INFORMATION: / note = Xaa at position 8 is Thr, Arg, Lys, Ala or ix) CHARACTERS:
(A) MENO/KĽÚČ: Modifikované miesto (B) UMIESTNENIE: 10 (D) ĎALŠIE INFORMÁCIE: /poznámka = Xaa v polohe 10 je Gin alebo His ix) ZNAKY:(A) NAME / KEY: Modified Site (B) LOCATION: 10 (D) ADDITIONAL INFORMATION: / note = Xaa at position 10 is Gin or His (ix) FEATURES:
(A) MENO/KĽÚČ: Modifikované miesto (B) UMIESTNENIE: 11 (D) ĎALŠIE INFORMÁCIE: /poznámka = Xaa v polohe 11 je Val, Leu alebo lle ix) ZNAKY:(A) NAME / KEY: Modified Site (B) LOCATION: 11 (D) ADDITIONAL INFORMATION: / note = Xaa at position 11 is Val, Leu or lle ix) CHARACTERS:
(A) MENO/KĽÚČ: Modifikované miesto (B) UMIESTNENIE: Xaa, vložený pred polohou 13 (D) ĎALŠIE INFORMÁCIE: /poznámka = Leu je vložený pred polohou 13 ix) ZNAKY:(A) NAME / KEY: Modified Location (B) LOCATION: Xaa, inserted before position 13 (D) ADDITIONAL INFORMATION: / note = Leu is inserted before position 13 (ix) FEATURES:
(A) MENO/KĽÚČ: Modifikované miesto (B) UMIESTNENIE: 13 (D) ĎALŠIE INFORMÁCIE: /poznámka = Xaa v polohe 13 je Leu, Val alebo Thr ix) ZNAKY:(A) NAME / KEY: Modified Site (B) LOCATION: 13 (D) ADDITIONAL INFORMATION: / Note = Xaa at position 13 is Leu, Val or Thr ix) CHARACTERS:
(A) MENO/KĽÚČ: Modifikované miesto (B) UMIESTNENIE: 14 (D) ĎALŠIE INFORMÁCIE: /poznámka = Xaa v polohe 14 je Arg alebo Cit ix) ZNAKY:(A) NAME / KEY: Modified Site (B) LOCATION: 14 (D) ADDITIONAL INFORMATION: / note = Xaa at position 14 is Arg or Cit ix) FEATURES:
(A) MENO/KĽÚČ: Modifikované miesto (B) UMIESTNENIE: 16 (D) ĎALŠIE INFORMÁCIE: /poznámka = Xaa v polohe 16 je Met, Val, lle, Leu alebo ix) ZNAKY:(A) NAME / KEY: Modified Site (B) LOCATION: 16 (D) ADDITIONAL INFORMATION: / note = Xaa at position 16 is Met, Val, lle, Leu or ix) CHARACTERS:
(A) MENO/KĽÚČ: Modifikované miesto (B) UMIESTNENIE: 17 (D) ĎALŠIE INFORMÁCIE: /poznámka = Xaa v polohe 17 je Thr alebo Asp ix) ZNAKY:(A) NAME / KEY: Modified Site (B) LOCATION: 17 (D) ADDITIONAL INFORMATION: / Note = Xaa at position 17 is Thr or Asp ix) FEATURES:
(A) MENO/KĽÚČ: Modifikované miesto (B) UMIESTNENIE: 18 (D) ĎALŠIE INFORMÁCIE: /poznámka = Xaa v polohe 18 je Tyr, Phe alebo Arg ix) ZNAKY:(A) NAME / KEY: Modified Site (B) LOCATION: 18 (D) ADDITIONAL INFORMATION: / Note = Xaa at position 18 is Tyr, Phe or Arg ix) CHARACTERS:
(A) MENO/KĽÚČ: Modifikované miesto (B) UMIESTNENIE: 19 (D) ĎALŠIE INFORMÁCIE: /poznámka = Xaa v polohe 19 je Lys alebo Arg hl ix) ZNAKY:(A) NAME / KEY: Modified Site (B) LOCATION: 19 (D) ADDITIONAL INFORMATION: / Note = Xaa at position 19 is Lys or Arg hl ix) FEATURES:
(A) MENO/KĽÚČ: Modifikované miesto (B) UMIESTNENIE: 20 (D) ĎALŠIE INFORMÁCIE: /poznámka = Xaa v polohe 20 je Ala, Gly, Ser, Glu alebo ix) ZNAKY:(A) NAME / KEY: Modified Site (B) LOCATION: 20 (D) ADDITIONAL INFORMATION: / note = Xaa at position 20 is Ala, Gly, Ser, Glu or ix) CHARACTERS:
(A) MENO/KĽÚČ: Modifikované miesto (B) UMIESTNENIE: 21 (D) ĎALŠIE INFORMÁCIE: /poznámka = Xaa v polohe 21 je Ala, Ser alebo Val ix) ZNAKY:(A) NAME / KEY: Modified Site (B) LOCATION: 21 (D) ADDITIONAL INFORMATION: / Note = Xaa at position 21 is Ala, Ser or Val ix) CHARACTERS:
(A) MENO/KĽÚČ: Modifikované miesto (B) UMIESTNENIE: 12...(LeUjXaa13) (D) ĎALŠIE INFORMÁCIE: /poznámka = prípadne spoj -Z- a/alebo [Arg]m mostík je vložený medzi Xaa12 a (Leu, Xaan), kde m je 0,1, 2 alebo 3.(A) NAME / KEY: Modified Site (B) LOCATION: 12 ... (LeUjXaa 13 ) (D) ADDITIONAL INFORMATION: / note = optional -Z- and / or [Arg] m bridge is inserted between Xaa 12 and (Leu, Xaan) wherein m is 0, 1, 2 or 3.
(xi) OPIS SEKVENCIE: SEQ ID NO: 10 :(xi) SEQUENCE DESCRIPTION: SEQ ID NO: 10:
Xaa! Leu Val Gly Xaa5 Pro Xaa7XaaB Pro Xaam Xaan Pro -Z- [Arg]m Leu, Xaai3 1 5 10Xaa! Leu Val Gly Xaa 5 Xaa 7 Xaa B Xaam Xaan Pro -Z- [Arg] m Leu, Xaai 3 1 5 10
Xaai4 Pro Xaa^ Xaa-ιγ Xaa-igXaajg Xaa2oXaa2i 15 20 (2) INFORMÁCIE O SEQ ID NO: 11 :Xaa 14 Pro Xaa ^ Xaa-γγ Xaa-igXaajg Xaa 2 oXaa 2 i 15 20 (2) INFORMATION ON SEQ ID NO: 11:
(i) CHARAKTERISTIKY SEKVENCIE:(i) SEQUENCE CHARACTERISTICS:
(A) DĹŽKA: 26 aminokyselín (B) TYP: aminokyselina (C) REŤAZEC: jednoduchý (D) TOPOLÓGIA: obidvoje (ii) TYP MOLEKULY: peptid (iii) HYPOTETICKÁ: Nie ix) ZNAKY:(A) LENGTH: 26 amino acids (B) TYPE: amino acid (C) STRING: simple (D) TOPOLOGY: both (ii) MOLECULA TYPE: peptide (iii) HYPOTHETICAL: No ix) FEATURES:
(A) MENO/KĽÚČ: Modifikované miesto (C) UMIESTNENIE: 12...(LeUiXaa13....) (D) ĎALŠIE INFORMÁCIE: /poznámka = spoj -Z- je [Gly]n kde n je 3 a [Arg]m kde m je Ť (xi) OPIS SEKVENCIE: SEQ ID NO: 11 :(A) NAME / KEY: Modified Site (C) LOCATION: 12 ... (LeUiXaa 13 ....) (D) ADDITIONAL INFORMATION: / note = join -Z- is [Gly] n where n is 3 and [ Arg] m where m is ((xi) DESCRIPTION OF THE SEQUENCE: SEQ ID NO: 11:
Lys Leu Val Gly Phe Pro Val Lys Pro Gin Val Pro Gly Gly Gly Arg Leu Leu Cit Pro NieLys Leu Val Gly Phe Pro Val Lys Pro Gin Val Gly Gly Gly Arg Leu Leu Cit Pro No
10 15 2010 15 20
Thr Tyr Lys Ala Ala 25 (2) INFORMÁCIE O SEQ ID NO: 12 :Thr Tyr Lys Ala Ala 25 (2) INFORMATION ON SEQ ID NO: 12:
(i) CHARAKTERISTIKY SEKVENCIE:(i) SEQUENCE CHARACTERISTICS:
(A) DĹŽKA: 26 aminokyselín (B) TYP: aminokyselina (C) REŤAZEC: jednoduchý (D) TOPOLÓGIA: obidvoje (ii) TYP MOLEKULY: peptid (iii) HYPOTETICKÁ: Nie ix) ZNAKY:(A) LENGTH: 26 amino acids (B) TYPE: amino acid (C) STRING: simple (D) TOPOLOGY: both (ii) MOLECULA TYPE: peptide (iii) HYPOTHETICAL: No ix) FEATURES:
(A) MENO/KĽÚČ: Modifikované miesto (E) UMIESTNENIE: 12...(LeUjXaa13) (F) ĎALŠIE INFORMÁCIE: /poznámka = spoj -Z- je [Gly]„ kde n je 3 a [Arg]m kde m je 1.(A) NAME / KEY: Modified Site (E) LOCATION: 12 ... (LeUjXaa 13 ) (F) ADDITIONAL INFORMATION: / note = join -Z- is [Gly] "where n is 3 and [Arg] m where m is 1.
(xi) OPIS SEKVENCIE: SEQ ID NO: 12 :(xi) SEQUENCE DESCRIPTION: SEQ ID NO: 12:
Arg Leu Val Gly Phe Pro Val Lys Pro Gin Val Pro Gly Gly Gly Arg Leu Leu Arg Pro Leu 15 10 15 20Arg Leu Val Gly Phe Pro Val Lys Pro Gin Val Pro Gly Gly G Arg Leu Leu Arg Pro Leu 15 10 15 20
Thr Tyr Lys Ala Ala 25 (2) INFORMÁCIE O SEQ ID NO: 13 :Thr Tyr Lys Ala Ala 25 (2) INFORMATION ON SEQ ID NO: 13:
(i) CHARAKTERISTIKY SEKVENCIE:(i) SEQUENCE CHARACTERISTICS:
(A) DĹŽKA: 44 aminokyselín (B) TYP: aminokyselina (C) REŤAZEC: dvojitý (D) TOPOLÓGIA: obidvoje (ii) TYP MOLEKULY: dimérický peptid (iii) HYPOTETICKÁ: Nie ix) ZNAKY:(A) LENGTH: 44 amino acids (B) TYPE: amino acid (C) STRING: double (D) TOPOLOGY: both (ii) MOLECULA TYPE: dimeric peptide (iii) HYPOTHETICAL: No ix) FEATURES:
(A) MENO/KĽÚČ: Modifikované miesto (B) UMIESTNENIE: disulfidická väzba medzi polohou 20 v SEQ ID NO : 3 a polohou 20 v SEQ ID NO : 3 (2) INFORMÁCIE O SEQ ID NO: 14:(A) NAME / KEY: Modified site (B) LOCATION: disulfide bond between position 20 in SEQ ID NO: 3 and position 20 in SEQ ID NO: 3 (2) INFORMATION ON SEQ ID NO: 14:
(i) CHARAKTERISTIKY SEKVENCIE:(i) SEQUENCE CHARACTERISTICS:
(A) DĹŽKA: 22 aminokyselín (B) TYP: aminokyselina (C) REŤAZEC: dvojitý (D) TOPOLÓGIA: obidvoje (ii) TYP MOLEKULY: peptid (iii) HYPOTETICKÁ: Nie (xi) OPIS SEKVENCIE: SEQ ID NO: 14:(A) LENGTH: 22 amino acids (B) TYPE: amino acid (C) STRING: double (D) TOPOLOGY: both (ii) MOLECULA TYPE: peptide (iii) HYPOTHETICAL: No (xi) SEQUENCE DESCRIPTION: SEQ ID NO: 14:
Phe Val lle His Arg Leu Glu Pro Trp Leu His Pro Gly Ser Gin His Nie Thr Ala Ser Thr AsnPhe Val lle His Arg Leu Glu Pro Trp Leu His Pro Gly Ser
10 15 20 w10 15 20 w
μ (2) INFORMÁCIE O SEQ ID NO: 15 :μ (2) INFORMATION ON SEQ ID NO: 15:
(i) CHARAKTERISTIKY SEKVENCIE:(i) SEQUENCE CHARACTERISTICS:
(A) DĹŽKA: 23 aminokyselín (B) TYP: aminokyselina (C) REŤAZEC: dvojitý (D) TOPOLÓGIA: obidvoje (ii) TYP MOLEKULY: peptid (iii) HYPOTETICKÁ: Nie (xi) OPIS SEKVENCIE: SEQ ID NO: 15 :(A) LENGTH: 23 amino acids (B) TYPE: amino acid (C) STRING: double (D) TOPOLOGY: both (ii) MOLECULA TYPE: peptide (iii) HYPOTHETICAL: No (xi) SEQUENCE DESCRIPTION: SEQ ID NO: 15:
Arg Leu Val Gly Phe Pro Val Lys Pro Gin Val Pro Gly Leu Leu Arg Pro Leu Thr Tyr Lys AlaArg Leu Val Gly Phe Pro Val Lys Pro Gin Val Pro Gly Leu Leu Arg Pro Leu Thr Tyr Lys Ala
10 15 2010 15 20
Ala (2) INFORMÁCIE O SEQ ID NO: 16 :Ala (2) INFORMATION ON SEQ ID NO: 16:
(i) CHARAKTERISTIKY SEKVENCIE:(i) SEQUENCE CHARACTERISTICS:
(A) DĹŽKA: 24 aminokyselín (B) TYP: aminokyselina (C) REŤAZEC: dvojitý (D) TOPOLÓGIA: obidvoje (ii) TYP MOLEKULY: peptid (iii) HYPOTETICKÁ: Nie, tat1 prirodzená sekvencia (xi) OPIS SEKVENCIE: SEQ ID NO: 16 :(A) LENGTH: 24 amino acids (B) TYPE: amino acid (C) STRING: double (D) TOPOLOGY: both (ii) MOLECULA TYPE: peptide (iii) HYPOTHETIC: No, tat1 natural sequence (xi) SEQUENCE DESCRIPTION: SEQ ID NO: 16:
Met Glu Ser Val Asp Pro Arg Leu Glu Pro Trp Lys His Pro Gly Ser Gin Pro Lys Thr Ala Cys 15 10 15 20Met Glu Ser Val Asp Pro Glu Pro Trp Lys His Pro Gly Ser Gin Pro Lys Thr Ala Cys 15 10 15 20
Thr Asn (2) INFORMÁCIE O SEQ ID NO: 17 :Thr Asn (2) INFORMATION ON SEQ ID NO: 17:
(i) CHARAKTERISTIKY SEKVENCIE:(i) SEQUENCE CHARACTERISTICS:
(A) DĹŽKA: 23 aminokyselín (B) TYP: aminokyselina (C) REŤAZEC: dvojitý (D) TOPOLÓGIA: obidvoje(A) LENGTH: 23 amino acids (B) TYPE: amino acid (C) STRING: double (D) TOPOLOGY: both
K (ii) TYP MOLEKULY: peptid (iii) HYPOTETICKÁ: Nie, tat2 prirodzená sekvencia (xi) OPIS SEKVENCIE: SEQ ID NO: 17 :K (ii) MOLECULA TYPE: peptide (iii) HYPOTHETICAL: No, tat2 natural sequence (xi) SEQUENCE DESCRIPTION: SEQ ID NO: 17:
Gin Val Cys Phe lle Thr Lys Gly Leu Gly lle Ser Tyr Gly Arg Lys Lys Arg Arg Gin Arg Arg Arg 15 10 15 20 (2) INFORMÁCIE O SEQ ID NO: 18 :Gin Val Cys Phe lle Thr Lys Gly Leu Gly lle Ser Tyr Gly Arg Lys Lys Arg Arg Gin Arg Arg Arg 15 10 15 20
(i) CHARAKTERISTIKY SEKVENCIE:(i) SEQUENCE CHARACTERISTICS:
(A) DĹŽKA: 21 aminokyselín (B) TYP: aminokyselina (C) REŤAZEC: dvojitý (D) TOPOLÓGIA: obidvoje (ii) TYP MOLEKULY: peptid (iii) HYPOTETICKÁ: Nie, prirodzená Nef sekvencia (xi) OPIS SEKVENCIE: SEQ ID NO: 18:(A) LENGTH: 21 amino acids (B) TYPE: amino acid (C) STRING: double (D) TOPOLOGY: both (ii) MOLECULA TYPE: peptide (iii) HYPOTHETIC: No, natural Nef sequence (xi) SEQUENCE DESCRIPTION: SEQ ID NO: 18:
Glu Glu Val Gly Phe Pro Val Arg Pro Gin Val Pro Leu Arg Pro Met Thr Tyr Lys Ala Ala 1 5 10 21Glu Glu Val Gly Phe Pro Val Pro Pro Gin Val Pro Pro Leu Arg Pro Met Thr Tyr Lys Ala Ala 1 5 10 21
Claims (16)
Applications Claiming Priority (2)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| NO20004412A NO314587B1 (en) | 2000-09-04 | 2000-09-04 | HIV regulatory and auxiliary peptides, antigens, vaccine preparations, immunoassay test kits and a method for detecting antibodies induced by HIV |
| PCT/NO2001/000363 WO2002020555A2 (en) | 2000-09-04 | 2001-09-03 | Hiv peptides from tat, rev and wef conserved regions and their application as e.g.vaccine components |
Publications (2)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| SK4012003A3 true SK4012003A3 (en) | 2003-09-11 |
| SK287913B6 SK287913B6 (en) | 2012-03-02 |
Family
ID=19911532
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| SK401-2003A SK287913B6 (en) | 2000-09-04 | 2001-09-03 | Peptide derived from HIV-1 regulatory protein, antigens and use thereof, vaccine composition, method of detecting antibodies induced by HIV, immunoassay kit, antibody and plasmid DNA |
Country Status (18)
| Country | Link |
|---|---|
| US (1) | US7097971B2 (en) |
| EP (1) | EP1322666B1 (en) |
| JP (1) | JP2004508382A (en) |
| CN (2) | CN1458936A (en) |
| AR (1) | AR033997A1 (en) |
| AT (1) | ATE378350T1 (en) |
| AU (2) | AU2001286336B2 (en) |
| BR (1) | BR0114046A (en) |
| CA (1) | CA2421199A1 (en) |
| DE (1) | DE60131432T2 (en) |
| EA (1) | EA006210B1 (en) |
| ES (1) | ES2296793T3 (en) |
| HU (1) | HUP0303132A3 (en) |
| NO (1) | NO314587B1 (en) |
| NZ (2) | NZ535908A (en) |
| SK (1) | SK287913B6 (en) |
| WO (1) | WO2002020555A2 (en) |
| ZA (1) | ZA200301742B (en) |
Families Citing this family (15)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| EP1307130A4 (en) | 2000-02-04 | 2005-01-12 | Beth Israel Hospital | VACCINE AGAINST HUMAN IMMUNE WEAK VIRUS |
| SG170092A1 (en) | 2006-03-10 | 2011-04-29 | Peptcell Ltd | Peptides of regulatory or accessory proteins of hiv, compositions and the utilization thereof |
| JP4931483B2 (en) * | 2006-06-14 | 2012-05-16 | ルネサスエレクトロニクス株式会社 | Semiconductor failure analysis apparatus, failure analysis method, and failure analysis program |
| EP2550362B1 (en) | 2010-03-25 | 2017-01-04 | Oregon Health&Science University | Cmv glycoproteins and recombinant vectors |
| CN102210874A (en) * | 2011-05-17 | 2011-10-12 | 浙江大学 | Preparation method of HIV (Human Immunodeficiency Virus) recombinant subtype DNA (Deoxyribonucleic Acid) vaccine |
| CA2832109C (en) | 2011-06-10 | 2021-07-06 | Oregon Health & Science University | Cmv glycoproteins and recombinant vectors |
| EP2568289A3 (en) | 2011-09-12 | 2013-04-03 | International AIDS Vaccine Initiative | Immunoselection of recombinant vesicular stomatitis virus expressing hiv-1 proteins by broadly neutralizing antibodies |
| US9402894B2 (en) | 2011-10-27 | 2016-08-02 | International Aids Vaccine Initiative | Viral particles derived from an enveloped virus |
| JP6310909B2 (en) * | 2012-06-06 | 2018-04-11 | ビオノール イミュノ エーエスBionor Immuno As | Peptides derived from viral proteins for use as immunogens and dosing reactants |
| EP2679596B1 (en) | 2012-06-27 | 2017-04-12 | International Aids Vaccine Initiative | HIV-1 env glycoprotein variant |
| DK2928910T3 (en) * | 2012-12-06 | 2019-10-07 | Pin Pharma Inc | TREATMENT OF INFLAMMATION, AUTOIMMUNE AND NEURODEGENERATIVE DISEASES WITH IMMUNOSUPPRESSIVE TAT-DERIVATE POLYPEPTIDES |
| EP2848937A1 (en) | 2013-09-05 | 2015-03-18 | International Aids Vaccine Initiative | Methods of identifying novel HIV-1 immunogens |
| US10058604B2 (en) | 2013-10-07 | 2018-08-28 | International Aids Vaccine Initiative | Soluble HIV-1 envelope glycoprotein trimers |
| EP3069730A3 (en) | 2015-03-20 | 2017-03-15 | International Aids Vaccine Initiative | Soluble hiv-1 envelope glycoprotein trimers |
| EP3072901A1 (en) | 2015-03-23 | 2016-09-28 | International Aids Vaccine Initiative | Soluble hiv-1 envelope glycoprotein trimers |
Family Cites Families (9)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| US5219990A (en) * | 1991-01-28 | 1993-06-15 | Biogen, Inc. | Papillomavirus e2 trans-activation repressors |
| WO1994015634A1 (en) | 1992-12-30 | 1994-07-21 | Matthias Rath | Tat and rev oligopeptides in hiv treatment |
| PL322143A1 (en) * | 1995-03-08 | 1998-01-05 | Neovacs | Non-topxic immunogenes originating frommretroviral regulator protein, antibodies as such, method of preparing them and pharmaceutic compositions containing them |
| US5891994A (en) * | 1997-07-11 | 1999-04-06 | Thymon L.L.C. | Methods and compositions for impairing multiplication of HIV-1 |
| IT1297090B1 (en) * | 1997-12-01 | 1999-08-03 | Barbara Ensoli | TAT OF HIV-1 OR ITS DERIVATIVES, ALONE OR IN COMBINATION, FOR VACCINAL, PROPHYLACTIC AND THERAPEUTIC PURPOSES, AGAINST AIDS, CANCERS AND |
| FR2773156B1 (en) * | 1997-12-26 | 2000-03-31 | Biovacs Inc | NOVEL ANTI-RETROVIRAL IMMUNOGENS (TOXOIDS), NOVEL PREPARATION METHODS AND APPLICATION TO AIDS PREVENTION AND TREATMENT |
| NO311807B1 (en) | 1999-03-04 | 2002-01-28 | Bionor Immuno As | HIV peptides, antigens, vaccine preparations, immunoassay test kits and a method for detecting antibodies induced by HIV |
| WO2000078969A1 (en) * | 1999-06-21 | 2000-12-28 | The Government Of The United States Of America, As Represented By The Secretary, Department Of Health And Human Services | Hiv tat peptides and multiple peptide conjugate system |
| SE0001351L (en) * | 2000-04-12 | 2001-03-26 | Kjell Sjoegren | Small Pet Toilet |
-
2000
- 2000-09-04 NO NO20004412A patent/NO314587B1/en not_active IP Right Cessation
-
2001
- 2001-09-03 NZ NZ535908A patent/NZ535908A/en not_active IP Right Cessation
- 2001-09-03 AU AU2001286336A patent/AU2001286336B2/en not_active Ceased
- 2001-09-03 JP JP2002525175A patent/JP2004508382A/en active Pending
- 2001-09-03 EA EA200300335A patent/EA006210B1/en not_active IP Right Cessation
- 2001-09-03 CN CN01815739A patent/CN1458936A/en active Pending
- 2001-09-03 HU HU0303132A patent/HUP0303132A3/en unknown
- 2001-09-03 NZ NZ524557A patent/NZ524557A/en not_active IP Right Cessation
- 2001-09-03 BR BR0114046-9A patent/BR0114046A/en not_active IP Right Cessation
- 2001-09-03 EP EP01965768A patent/EP1322666B1/en not_active Expired - Lifetime
- 2001-09-03 CN CN200910140941A patent/CN101628933A/en active Pending
- 2001-09-03 SK SK401-2003A patent/SK287913B6/en not_active IP Right Cessation
- 2001-09-03 AT AT01965768T patent/ATE378350T1/en not_active IP Right Cessation
- 2001-09-03 DE DE60131432T patent/DE60131432T2/en not_active Expired - Lifetime
- 2001-09-03 CA CA002421199A patent/CA2421199A1/en not_active Abandoned
- 2001-09-03 WO PCT/NO2001/000363 patent/WO2002020555A2/en not_active Ceased
- 2001-09-03 US US10/129,333 patent/US7097971B2/en not_active Expired - Fee Related
- 2001-09-03 ES ES01965768T patent/ES2296793T3/en not_active Expired - Lifetime
- 2001-09-03 AU AU8633601A patent/AU8633601A/en active Pending
- 2001-09-04 AR ARP010104195A patent/AR033997A1/en active IP Right Grant
-
2003
- 2003-03-03 ZA ZA200301742A patent/ZA200301742B/en unknown
Also Published As
| Publication number | Publication date |
|---|---|
| EP1322666B1 (en) | 2007-11-14 |
| WO2002020555A2 (en) | 2002-03-14 |
| NZ524557A (en) | 2005-04-29 |
| JP2004508382A (en) | 2004-03-18 |
| EP1322666A2 (en) | 2003-07-02 |
| EA006210B1 (en) | 2005-10-27 |
| EA200300335A1 (en) | 2003-08-28 |
| DE60131432D1 (en) | 2007-12-27 |
| AU2001286336B2 (en) | 2007-03-15 |
| HUP0303132A2 (en) | 2005-03-29 |
| NZ535908A (en) | 2006-03-31 |
| US20050053616A1 (en) | 2005-03-10 |
| NO20004412D0 (en) | 2000-09-04 |
| DE60131432T2 (en) | 2008-09-18 |
| CN101628933A (en) | 2010-01-20 |
| AR033997A1 (en) | 2004-01-21 |
| CN1458936A (en) | 2003-11-26 |
| US7097971B2 (en) | 2006-08-29 |
| WO2002020555A3 (en) | 2002-06-06 |
| ZA200301742B (en) | 2004-06-21 |
| SK287913B6 (en) | 2012-03-02 |
| HUP0303132A3 (en) | 2012-09-28 |
| NO314587B1 (en) | 2003-04-14 |
| NO20004412L (en) | 2002-03-05 |
| CA2421199A1 (en) | 2002-03-14 |
| AU8633601A (en) | 2002-03-22 |
| BR0114046A (en) | 2003-07-22 |
| ATE378350T1 (en) | 2007-11-15 |
| ES2296793T3 (en) | 2008-05-01 |
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| JP5814331B2 (en) | HIV peptide, antigen, vaccine composition, immunoassay kit and method for detecting antibodies induced by HIV | |
| US7009037B2 (en) | Modified HIV-1gag p17 peptide and immunogenic composition | |
| AU2001282706A1 (en) | HIV peptides from conserved in gag p17 and 924 and their application in E.G. vaccines | |
| SK4012003A3 (en) | Regulatory and auxiliary HIV peptides, antigens, vaccine compositions, an immunoassay kit and method of detecting antibodies induced by HIV | |
| AU2001286336A1 (en) | HIV peptides from Tat, Rev and Wef conserved and their application as E.G. vaccine components | |
| HK1137766A (en) | Hiv peptides from tat, rev and nef conserved regions and their applications as e.g.vaccine components | |
| HK1124867A (en) | Hiv peptides, antigens, vaccine compositions, immunoassay kit and a method of detecting antibodies induced by hiv | |
| HK1124865A (en) | Hiv peptides, antigens, vaccine compositions, immunoassay kit and a method of detecting antibodies induced by hiv |
Legal Events
| Date | Code | Title | Description |
|---|---|---|---|
| MM4A | Patent lapsed due to non-payment of maintenance fees |
Effective date: 20120120 |