TH21884Y - A set of primers and DNA probes for the detection of genetic material of the liver fluke Fasciola gigantica using the LAMP (loop-mediated isothermal amplification) technique, and a DNA biosensor dipstick. - Google Patents

A set of primers and DNA probes for the detection of genetic material of the liver fluke Fasciola gigantica using the LAMP (loop-mediated isothermal amplification) technique, and a DNA biosensor dipstick.

Info

Publication number
TH21884Y
TH21884Y TH2103000550U TH2103000550U TH21884Y TH 21884 Y TH21884 Y TH 21884Y TH 2103000550 U TH2103000550 U TH 2103000550U TH 2103000550 U TH2103000550 U TH 2103000550U TH 21884 Y TH21884 Y TH 21884Y
Authority
TH
Thailand
Prior art keywords
dna
lamp
dipstick
genetic material
primer
Prior art date
Application number
TH2103000550U
Other languages
Thai (th)
Other versions
TH21884U (en
Inventor
ดรฐาปนา ชลธนานารถ ผู้ช่วยศาสตราจารย์
ดรธนวรรณ เตชางกูร อาจารย์
Original Assignee
มหาวิทยาลัยศรีนครินทรวิโรฒ
Filing date
Publication date
Application filed by มหาวิทยาลัยศรีนครินทรวิโรฒ filed Critical มหาวิทยาลัยศรีนครินทรวิโรฒ
Publication of TH21884U publication Critical patent/TH21884U/en
Publication of TH21884Y publication Critical patent/TH21884Y/en

Links

Abstract

ชุดไพรเมอร์ (primer) และตัวตรวจจับ (DNA probe) สำหรับการตรวจสารพันธุกรรมของพยาธิใบไม้ ในตับชนิด Fasciola gigantica ด้วยเทคนิคแลมป์ (LAMP: loop-mediated isothermal amplification) และแผ่นตรวจสอบดีเอ็นเอไบโอเซนเซอร์ (DNA biosensor dipstick) มีบทสรุป ดังนี้ 1. สามารถใช้เป็นชุดตรวจอย่างง่ายที่ใช้งานสะดวก และรวดเร็ว ทราบผลในเวลา 1 ชั่วโมง สามารถ นำไปใช้ตรวจภาคสนาม (point-of-care) ได้ 2. มีความจำเพาะต่อเป้าหมายที่ต้องการตรวจสอบ (specificity) 3. ใช้สำหรับตรวจสารพันธุกรรมของพยาธิใบไม้ในตับชนิด F. giganticaThe primer and DNA probe kit for detecting the genetic material of the liver fluke Fasciola gigantica using the LAMP (loop-mediated isothermal amplification) technique and a DNA biosensor dipstick can be summarized as follows: 1. It is a simple, convenient, and rapid diagnostic kit, providing results within one hour, suitable for point-of-care field testing. 2. It exhibits high specificity. 3. It is used for detecting the genetic material of the liver fluke F. gigantica.

Claims (6)

1. ชุดไพรเมอร์ (primer) และตัวตรวจจับ (DNA probe) สำหรับการตรวจสารพันธุกรรมของพยาธิ ใบไม้ในตับชนิด Fasciola gigantica ด้วยเทคนิคแลมป์ (LAMP: loop-mediated isothermal amplification) และแผ่นตรวจสอบดีเอ็นเอไบโอเซนเซอร์ (DNA biosensor dipstick) ประกอบด้วยไพรเมอร์ 4 เส้น ที่สามารถเข้าจับกับสารพันธุกรรมของพยาธิใบไม้ในตับชนิด F. gigantica ได้ ดังนี้ ไพรเมอร์ เอฟจี-1เอฟ3 (Fg-1F3) ลำดับเบส (5’-3’) GCGATTGCTGGTTTGTTCAA ไพรเมอร์ เอฟจี-1บี3 (Fg-1B3) ลำดับเบส (5’-3’) AGAGGAACGGATTTGTTGC ไพรเมอร์ เอฟจี-เอฟไอพีแอลเอพี (Fg-FIPLab) ลำดับเบส (5’-3’) biotin-ACTGTTGCGCACGAAAGCCA-TCTGGGTCGACTTCAACCT ไพรเมอร์ เอฟจี-1บีไอพี (Fg-1BIP) ลำดับเบส (5’-3') TAGCTCGTTCCGGCCAACGTTTCGCACAACAGATCAGTCA1. A set of primers and DNA probes for detecting the genetic material of parasites. The liver fluke Fasciola gigantica was detected using the LAMP (loop-mediated isothermal amplification) technique and a DNA biosensor dipstick containing four primers capable of binding to the genetic material of F. gigantica: primer Fg-1F3 (5’-3’ sequence: GCGATTGCTGGTTTGTTCAA), primer Fg-1B3 (5’-3’ sequence: AGAGGAACGGATTTGTTGC), primer Fg-FIPLab (5’-3’ sequence: biotin-ACTGTTGCGCACGAAAGCCA-TCTGGGTCGACTTCAACCT), and primer Fg-1BIP (5’-3’ sequence: ...). TAGCCTCGTTCCGGCCAACGTTTCGCACAACAGATCAGTCA 2. ชุดไพรเมอร์ (primer) และตัวตรวจจับ (DNA probe) สำหรับการตรวจสารพันธุกรรมของพยาธิ ใบไม้ในตับชนิด Fasciola gigantica ด้วยเทคนิคแลมป์ (LAMP: loop-mediated isothermal amplification) และแผ่นตรวจสอบดีเอ็นเอไบโอเซนเซอร์ (DNA biosensor dipstick) ตามข้อถือสิทธิที่ 1 ที่ ซึ่งสภาวะที่เหมาะสมในการตรวจสอบผลิตภัณฑ์แลมป์ (LAMP product) มีลักษณะเฉพาะคือ ทำปฏิกิริยา แลมป์ที่อุณหภูมิคงที่ 60 องศาเซลเซียส ในระยะเวลา 30 นาที แล้วตรวจสอบผลิตภัณฑ์แลมป์ได้ด้วยแผ่น ตรวจสอบดีเอ็นเอไบโอเซนเซอร์ (DNA biosensor dipstick)2. A primer and DNA probe set for the detection of genetic material of the liver fluke Fasciola gigantica using the LAMP (loop-mediated isothermal amplification) technique and a DNA biosensor dipstick, as per claim 1, where the optimal conditions for detecting the LAMP product are characterized by a LAMP reaction at a constant temperature of 60°C for 30 minutes, followed by detection of the LAMP product using the DNA biosensor dipstick. 3. ชุดไพรเมอร์ (primer) และตัวตรวจจับ (DNA probe) สำหรับการตรวจสารพันธุกรรมของพยาธิ ใบไม้ในตับชนิด Fasciola gigantica ด้วยเทคนิคแลมป์ (LAMP: loop-mediated isothermal amplification) และแผ่นตรวจสอบดีเอ็นเอไบโอเซนเซอร์ (DNA biosensor dipstick) ตามข้อถือสิทธิที่ 1 ใน ที่ซึ่งตัวตรวจจับ (DNA probe) สำหรับตรวจสอบการติดพยาธิใบไม้ในตับชนิด F. gigantica มีกรรมวิธีการ ออกแบบที่มีลักษณะเฉพาะ คือ ตัวตรวจจับติดฉลากฟิซซี (FITC) ที่ปลายด้าน 5’ เพื่อการตรวจสอบผลิตภัณฑ์ แลมป์ (LAMP product) บนแผ่นตรวจสอบดีเอ็นเอไบโอเซนเซอร์ (DNA biosensor dipstick) มีลำดับเบส ดังนี้ 5’-FITC-CAGATTCGTA-3’3. A primer and DNA probe set for the detection of genetic material of the liver fluke Fasciola gigantica using the LAMP (loop-mediated isothermal amplification) technique and a DNA biosensor dipstick, as per Patent 1, in which the DNA probe for detecting F. gigantica infection has a unique design: a FITC labeled probe at the 5’ end for the detection of the LAMP product on the DNA biosensor dipstick with the following base sequence: 5’-FITC-CAGATTCGTA-3’. 4. ชุดไพรเมอร์ (primer) และตัวตรวจจับ (DNA probe) สำหรับการตรวจสารพันธุกรรมของพยาธิ ใบไม้ในตับชนิด Fasciola gigantica ด้วยเทคนิคแลมป์ (LAMP: loop-mediated isothermal amplification) และแผ่นตรวจสอบดีเอ็นเอไบโอเซนเซอร์ (DNA biosensor dipstick) ตามข้อถือสิทธิที่ 1 ประกอบด้วยส่วนประกอบหลักสำหรับใช้ในปฏิกิริยา ดังนี้ไพร์เมอร์เอฟจี-1เอฟ3 และเอฟจี-1บี3 ความ เข้มข้นอย่างละ 0.2 ไมโครโมล่าร์ (ไมโครโมล่าร์) ไพร์เมอร์เอฟจี-เอฟไอพีแอลเอพี และเอฟจี-1บีไอพี ความเข้มข้นอย่าง ละ 2 ไมโครโมล่าร์ เอนไซม์บีเอสทีพอลิเมอเรส (Bst polymerase) 0.32 ยูนิต (unit) สารละลายบัฟเฟอร์ สำหรับเอนไซม์เจือจางที่ 1 เท่า ดีออกซีนิวคลีโอไทด์ ไตรฟอสเฟต (dNTPs: deoxynucleotide triphosphate) ความเข้มข้น 1.4 มิลลิโมลาร์ (mM) แมกนีเซียมซัลเฟต (MgSO4) ความเข้มข้น 8 มิลลิโมลาร์ เบตาอีน (betaine) ความเข้มข้น 0.8 โมลาร์ (M) และนํ้า (dH2O)4. The primer and DNA probe kit for the detection of genetic material of the liver fluke Fasciola gigantica using the LAMP (loop-mediated isothermal amplification) technique and a DNA biosensor dipstick, as per claim 1, consists of the following main components for the reaction: 0.2 micromolar each of primers FG-1F3 and FG-1B3; 2 micromolar each of primers FG-FIP LAP and FG-1BIP; 0.32 units of BST polymerase enzyme; and buffer solution. For a 1x dilution of the enzyme, use 1.4 millimolar (mM) deoxynucleotide triphosphate (dNTPs), 8 millimolar (mM) magnesium sulfate (MgSO4), 0.8 molar (M) betaine, and water (dH2O). 5. ชุดไพรเมอร์ (primer) และตัวตรวจจับ (DNA probe) สำหรับการตรวจสารพันธุกรรมของพยาธิ ใบไม้ในตับชนิด Fasciola gigantica ด้วยเทคนิคแลมป์ (LAMP: loop-mediated isothermal amplification) และแผ่นตรวจสอบดีเอ็นเอไบโอเซนเซอร์ (DNA biosensor dipstick) ตามข้อถือสิทธิที่ 1 มี ลักษณะเฉพาะ คือ ไม่ต้องใช้เครื่องเทอร์ไมไซเคลอร์ (thermocycler)5. The primer and DNA probe set for the detection of genetic material of the liver fluke Fasciola gigantica using the LAMP (loop-mediated isothermal amplification) technique and the DNA biosensor dipstick, as per claim 1, has the unique characteristic of not requiring a thermocycler. 6. ชุดไพรเมอร์ (primer) และตัวตรวจจับ (DNA probe) สำหรับการตรวจสารพันธุกรรมของพยาธิ ใบไม้ในตับชนิด Fasciola igantica ด้วยเทคนิคแลมป์ (LAMP: loop-mediated isothermal amplification) และแผ่นตรวจสอบดีเอ็นเอไบโอเซนเซอร์ (DNA biosensor dipstick) ตามข้อถือสิทธิที่ 1 ใช้ สำหรับการตรวจวินิจฉัยพยาธิใบไม้ในตับชนิด F. gigantica ในตัวอย่างสิ่งส่งตรวจทางคลินิกซึ่งคือ อุจจาระ6. A primer and DNA probe set for the detection of genetic material of the liver fluke Fasciola igantica using the LAMP (loop-mediated isothermal amplification) technique and a DNA biosensor dipstick, as per claim 1, for the diagnosis of F. gigantica in clinical samples, namely stool.
TH2103000550U 2021-02-24 A set of primers and DNA probes for the detection of genetic material of the liver fluke Fasciola gigantica using the LAMP (loop-mediated isothermal amplification) technique, and a DNA biosensor dipstick. TH21884Y (en)

Publications (2)

Publication Number Publication Date
TH21884U TH21884U (en) 2023-06-13
TH21884Y true TH21884Y (en) 2023-06-13

Family

ID=

Similar Documents

Publication Publication Date Title
WO2017212904A1 (en) Method for rapid detection of african swine fever virus using lamp method in which multiple primer sets are combined
Sakai et al. Evaluation of a high-speed but low-throughput RT-qPCR system for detection of SARS-CoV-2
TH21884U (en) A set of primers and DNA probes for the detection of genetic material of the liver fluke Fasciola gigantica using the LAMP (loop-mediated isothermal amplification) technique, and a DNA biosensor dipstick.
Li et al. Integrated RPA-CRISPR/Cas12a system towards Point-of-Care H. pylori detection
WO2022040443A3 (en) A rapid diagnostic test for lamp
TH25415U (en) A primer and DNA probe kit for detecting the genetic material of the intestinal flukes Echinostoma revolutum and E. miyagawai using loop-mediated isothermal amplification (LAMP) and its application with a DNA biosensor dipstick.
TH25415Y (en) A primer and DNA probe kit for detecting the genetic material of the intestinal flukes Echinostoma revolutum and E. miyagawai using loop-mediated isothermal amplification (LAMP) and its application with a DNA biosensor dipstick.
MX2023011146A (en) Compositions and methods for rapid covid-19 detection.
TH27408U (en) A set of primers and DNA probes for detecting matrix protein genes in influenza virus A using loop-mediated isothermal amplification (LAMP) with a dipstick test strip.
TH27408Y (en) A set of primers and DNA probes for detecting matrix protein genes in influenza virus A using loop-mediated isothermal amplification (LAMP) with a dipstick test strip.
TH22050U (en) Primer and DNA probe set for testing the New Delhi metallo-beta-lactamase-1 (NDM-) carbapenem resistance gene. 1) in Enterobacteriaceae group of bacteria (Enterobacteriaceae) by loop mediated isothermal amplification reaction. (Loop-mediated isothermalamplification) or LAMP combined with a colored strip measuring plate (Dipstick).
TH22050Y (en) A primer and DNA probe kit for detecting the carbapenem resistance gene newel-metallo-beta-lactamase-1 (NDM-1) in Enterobacteriaceae bacteria using loop-mediated isothermal amplification (LAMP) reaction, combined with a colorimetric dipstick.
TH18825Y (en) A set of primers and DNA probes designed from the base sequence of the invasion-associated protein (iap) gene for the detection of Listeria monocytogenes using DNA amplification reactions.
TH13934Y (en) A primer and DNA probe kit for the detection of canine heartworm (Dirofilaria immitis) using loop-mediated isothermal amplification (LAMP) combined with a gold nanoprobe DNA biosensor.
TH19224Y (en) A primer and DNA probe kit for detecting Campylobacter spp. using loop-mediated isothermal amplification (L(AMP)) reaction, combined with a colorimetric dipstick.
TH18826U (en) A set of primers and detectors (DNA probes) designed from the phosphoribosyl pyrophosphate synthetase (prs) gene for the detection of Listeria sp. using DNA amplification reactions.
TH16951B (en) Primers and DNA probes for the detection of Campylobacter spp. With loop mediated isothermal reactions. Application (Loop-mediated isothermal amplification (LAMP)), combined with the use of a gold nanoprobe DNA biosensor labeled probe.
TH25413Y (en) A set of primers and DNA probes specific to the 28s rDNA gene for the detection of the tapeworms Raillietina (R. echinobothrida, R. tetragona, and R. cesticillus) using loop-mediated isothermal amplification (LAMP) technique in conjunction with a lateral flow dipstick (LFD).
TH25413U (en) A set of primers and a probe specific for the 28S rDNA gene for the detection of Raillietina tapeworms (R. echinobothrida, R. tetragona and R. cesticillus) by loop-mediated isothermal amplification (LAMP) technique coupled to a lateral flow dipstick (LFD).
TH13577A3 (en) A primer and DNA probe set for detecting dengue virus by Polymerase Chain Reaction or PCR. Color-coded measuring sheet (dipstick)
TH20369Y (en) A primer and DNA probe kit for detecting Newcastle disease virus using loop-mediated isothermal amplification (LAMP) combined with a dipstick test strip.
WO2021191795A8 (en) Coronavirus detection
TH27549U (en) Listeria spp. detection kit
TH27549Y (en) Listeria spp. detection kit
TH26892U (en) A primer and detector kit for the detection of Treponema pallidum subspecies pallidum using basic membrane protein genes, employing the loop mediated isothermal amplification reaction (LAMP), combined with a colorimetric strip detector.