TR201811689A2 - Cxcl8 ami̇no ucu öncül di̇zi̇si̇nden türevlenen i̇mmünmodülatör pepti̇t - Google Patents
Cxcl8 ami̇no ucu öncül di̇zi̇si̇nden türevlenen i̇mmünmodülatör pepti̇t Download PDFInfo
- Publication number
- TR201811689A2 TR201811689A2 TR2018/11689A TR201811689A TR201811689A2 TR 201811689 A2 TR201811689 A2 TR 201811689A2 TR 2018/11689 A TR2018/11689 A TR 2018/11689A TR 201811689 A TR201811689 A TR 201811689A TR 201811689 A2 TR201811689 A2 TR 201811689A2
- Authority
- TR
- Turkey
- Prior art keywords
- peptide
- cxcl8
- immune system
- peptide molecule
- amino acid
- Prior art date
Links
- 101001055222 Homo sapiens Interleukin-8 Proteins 0.000 title claims abstract description 12
- 102100026236 Interleukin-8 Human genes 0.000 title description 10
- -1 AMINO Chemical class 0.000 title description 2
- 108090000765 processed proteins & peptides Proteins 0.000 claims abstract description 70
- 210000000987 immune system Anatomy 0.000 claims abstract description 20
- 239000002243 precursor Substances 0.000 claims abstract description 16
- QMKFDEUJGYNFMC-AVGNSLFASA-N Leu-Pro-Arg Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(O)=O QMKFDEUJGYNFMC-AVGNSLFASA-N 0.000 claims abstract description 6
- WTUJZHKANPDPIN-CIUDSAMLSA-N Ser-Ala-Lys Chemical compound C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CO)N WTUJZHKANPDPIN-CIUDSAMLSA-N 0.000 claims abstract description 6
- 108010027668 glycyl-alanyl-valine Proteins 0.000 claims abstract description 6
- 230000007935 neutral effect Effects 0.000 claims abstract description 4
- 230000004044 response Effects 0.000 claims abstract description 3
- 102000052624 human CXCL8 Human genes 0.000 claims abstract 2
- 239000003795 chemical substances by application Substances 0.000 claims description 6
- 229940079593 drug Drugs 0.000 claims description 6
- 239000003814 drug Substances 0.000 claims description 6
- 238000002360 preparation method Methods 0.000 claims description 6
- JRDYDYXZKFNNRQ-XPUUQOCRSA-N Gly-Ala-Val Chemical compound CC(C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](C)NC(=O)CN JRDYDYXZKFNNRQ-XPUUQOCRSA-N 0.000 claims description 5
- 230000002209 hydrophobic effect Effects 0.000 claims description 5
- 238000003745 diagnosis Methods 0.000 claims description 4
- 201000010099 disease Diseases 0.000 claims description 4
- 208000037265 diseases, disorders, signs and symptoms Diseases 0.000 claims description 4
- 230000008685 targeting Effects 0.000 claims description 4
- 238000002372 labelling Methods 0.000 claims description 3
- 125000003275 alpha amino acid group Chemical group 0.000 claims 5
- 230000001900 immune effect Effects 0.000 abstract description 2
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 description 19
- 102000019034 Chemokines Human genes 0.000 description 12
- 108010012236 Chemokines Proteins 0.000 description 12
- 230000000694 effects Effects 0.000 description 11
- 102000004127 Cytokines Human genes 0.000 description 10
- 108090000695 Cytokines Proteins 0.000 description 10
- 102000004890 Interleukin-8 Human genes 0.000 description 9
- 108090001007 Interleukin-8 Proteins 0.000 description 9
- 230000006870 function Effects 0.000 description 9
- 230000035755 proliferation Effects 0.000 description 8
- 230000004913 activation Effects 0.000 description 7
- 210000002865 immune cell Anatomy 0.000 description 7
- 102000004196 processed proteins & peptides Human genes 0.000 description 7
- 125000002924 primary amino group Chemical group [H]N([H])* 0.000 description 6
- 150000001413 amino acids Chemical class 0.000 description 5
- 235000018102 proteins Nutrition 0.000 description 5
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 description 5
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 description 5
- 108050006947 CXC Chemokine Proteins 0.000 description 4
- 102000019388 CXC chemokine Human genes 0.000 description 4
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 description 4
- 238000013461 design Methods 0.000 description 4
- 230000028993 immune response Effects 0.000 description 4
- 238000003786 synthesis reaction Methods 0.000 description 4
- 206010061218 Inflammation Diseases 0.000 description 3
- 210000001744 T-lymphocyte Anatomy 0.000 description 3
- 235000001014 amino acid Nutrition 0.000 description 3
- 230000003042 antagnostic effect Effects 0.000 description 3
- 230000008859 change Effects 0.000 description 3
- 230000004054 inflammatory process Effects 0.000 description 3
- 238000000034 method Methods 0.000 description 3
- 210000002433 mononuclear leukocyte Anatomy 0.000 description 3
- 230000000638 stimulation Effects 0.000 description 3
- 230000001225 therapeutic effect Effects 0.000 description 3
- 102100036166 C-X-C chemokine receptor type 1 Human genes 0.000 description 2
- 102100031650 C-X-C chemokine receptor type 4 Human genes 0.000 description 2
- 108010008951 Chemokine CXCL12 Proteins 0.000 description 2
- 102000006573 Chemokine CXCL12 Human genes 0.000 description 2
- 101000947174 Homo sapiens C-X-C chemokine receptor type 1 Proteins 0.000 description 2
- 101000922348 Homo sapiens C-X-C chemokine receptor type 4 Proteins 0.000 description 2
- 108090000978 Interleukin-4 Proteins 0.000 description 2
- 206010067482 No adverse event Diseases 0.000 description 2
- 102000004887 Transforming Growth Factor beta Human genes 0.000 description 2
- 108090001012 Transforming Growth Factor beta Proteins 0.000 description 2
- 239000000975 dye Substances 0.000 description 2
- 239000002158 endotoxin Substances 0.000 description 2
- 230000000899 immune system response Effects 0.000 description 2
- 238000000338 in vitro Methods 0.000 description 2
- 230000002757 inflammatory effect Effects 0.000 description 2
- 229920006008 lipopolysaccharide Polymers 0.000 description 2
- 210000004698 lymphocyte Anatomy 0.000 description 2
- 210000002540 macrophage Anatomy 0.000 description 2
- 231100000252 nontoxic Toxicity 0.000 description 2
- 210000003819 peripheral blood mononuclear cell Anatomy 0.000 description 2
- 230000000770 proinflammatory effect Effects 0.000 description 2
- 102000005962 receptors Human genes 0.000 description 2
- 108020003175 receptors Proteins 0.000 description 2
- 230000001105 regulatory effect Effects 0.000 description 2
- 230000035945 sensitivity Effects 0.000 description 2
- 150000003384 small molecules Chemical class 0.000 description 2
- 210000001519 tissue Anatomy 0.000 description 2
- PIPTUBPKYFRLCP-NHCYSSNCSA-N Ala-Ala-Phe Chemical compound C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 PIPTUBPKYFRLCP-NHCYSSNCSA-N 0.000 description 1
- 102100032937 CD40 ligand Human genes 0.000 description 1
- 108010055166 Chemokine CCL5 Proteins 0.000 description 1
- 102000001327 Chemokine CCL5 Human genes 0.000 description 1
- 102000009410 Chemokine receptor Human genes 0.000 description 1
- 108050000299 Chemokine receptor Proteins 0.000 description 1
- 108010069514 Cyclic Peptides Proteins 0.000 description 1
- 102000001189 Cyclic Peptides Human genes 0.000 description 1
- 238000002965 ELISA Methods 0.000 description 1
- 102100025137 Early activation antigen CD69 Human genes 0.000 description 1
- 102000006354 HLA-DR Antigens Human genes 0.000 description 1
- 108010058597 HLA-DR Antigens Proteins 0.000 description 1
- 241000282414 Homo sapiens Species 0.000 description 1
- 101000868215 Homo sapiens CD40 ligand Proteins 0.000 description 1
- 101000934374 Homo sapiens Early activation antigen CD69 Proteins 0.000 description 1
- 101001057504 Homo sapiens Interferon-stimulated gene 20 kDa protein Proteins 0.000 description 1
- 101001055144 Homo sapiens Interleukin-2 receptor subunit alpha Proteins 0.000 description 1
- 101000914514 Homo sapiens T-cell-specific surface glycoprotein CD28 Proteins 0.000 description 1
- 101000914484 Homo sapiens T-lymphocyte activation antigen CD80 Proteins 0.000 description 1
- 241000725303 Human immunodeficiency virus Species 0.000 description 1
- 108090000174 Interleukin-10 Proteins 0.000 description 1
- 102100026878 Interleukin-2 receptor subunit alpha Human genes 0.000 description 1
- 108010018951 Interleukin-8B Receptors Proteins 0.000 description 1
- FFEARJCKVFRZRR-BYPYZUCNSA-N L-methionine Chemical compound CSCC[C@H](N)C(O)=O FFEARJCKVFRZRR-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 1
- KWURTLAFFDOTEQ-GUBZILKMSA-N Leu-Cys-Glu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)N[C@@H](CCC(=O)O)C(=O)O)N KWURTLAFFDOTEQ-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- MYZMQWHPDAYKIE-SRVKXCTJSA-N Lys-Leu-Ala Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O MYZMQWHPDAYKIE-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- 241000124008 Mammalia Species 0.000 description 1
- GWADARYJIJDYRC-XGEHTFHBSA-N Met-Thr-Ser Chemical compound CSCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O GWADARYJIJDYRC-XGEHTFHBSA-N 0.000 description 1
- 241001465754 Metazoa Species 0.000 description 1
- 108010076504 Protein Sorting Signals Proteins 0.000 description 1
- ZUGXSSFMTXKHJS-ZLUOBGJFSA-N Ser-Ala-Ala Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O ZUGXSSFMTXKHJS-ZLUOBGJFSA-N 0.000 description 1
- 102100027213 T-cell-specific surface glycoprotein CD28 Human genes 0.000 description 1
- 102100027222 T-lymphocyte activation antigen CD80 Human genes 0.000 description 1
- 239000000556 agonist Substances 0.000 description 1
- 230000000735 allogeneic effect Effects 0.000 description 1
- 230000003110 anti-inflammatory effect Effects 0.000 description 1
- 230000004071 biological effect Effects 0.000 description 1
- 125000003178 carboxy group Chemical group [H]OC(*)=O 0.000 description 1
- 239000006143 cell culture medium Substances 0.000 description 1
- 210000000170 cell membrane Anatomy 0.000 description 1
- 230000004663 cell proliferation Effects 0.000 description 1
- 230000036755 cellular response Effects 0.000 description 1
- 238000007385 chemical modification Methods 0.000 description 1
- 239000002975 chemoattractant Substances 0.000 description 1
- 230000035605 chemotaxis Effects 0.000 description 1
- 238000004891 communication Methods 0.000 description 1
- 210000002808 connective tissue Anatomy 0.000 description 1
- 235000018417 cysteine Nutrition 0.000 description 1
- 125000000151 cysteine group Chemical group N[C@@H](CS)C(=O)* 0.000 description 1
- 230000016396 cytokine production Effects 0.000 description 1
- 238000009795 derivation Methods 0.000 description 1
- 238000001514 detection method Methods 0.000 description 1
- 230000004069 differentiation Effects 0.000 description 1
- 238000010790 dilution Methods 0.000 description 1
- 239000012895 dilution Substances 0.000 description 1
- 238000004090 dissolution Methods 0.000 description 1
- 210000003038 endothelium Anatomy 0.000 description 1
- 210000000981 epithelium Anatomy 0.000 description 1
- 238000002474 experimental method Methods 0.000 description 1
- 238000000684 flow cytometry Methods 0.000 description 1
- MHMNJMPURVTYEJ-UHFFFAOYSA-N fluorescein-5-isothiocyanate Chemical compound O1C(=O)C2=CC(N=C=S)=CC=C2C21C1=CC=C(O)C=C1OC1=CC(O)=CC=C21 MHMNJMPURVTYEJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000036541 health Effects 0.000 description 1
- 238000004128 high performance liquid chromatography Methods 0.000 description 1
- 230000002519 immonomodulatory effect Effects 0.000 description 1
- 230000008105 immune reaction Effects 0.000 description 1
- 230000003832 immune regulation Effects 0.000 description 1
- 239000002955 immunomodulating agent Substances 0.000 description 1
- 230000002584 immunomodulator Effects 0.000 description 1
- 229940121354 immunomodulator Drugs 0.000 description 1
- 208000015181 infectious disease Diseases 0.000 description 1
- 208000027866 inflammatory disease Diseases 0.000 description 1
- 230000028709 inflammatory response Effects 0.000 description 1
- 230000003993 interaction Effects 0.000 description 1
- 238000002955 isolation Methods 0.000 description 1
- 229930182817 methionine Natural products 0.000 description 1
- 230000005012 migration Effects 0.000 description 1
- 238000013508 migration Methods 0.000 description 1
- 230000003278 mimic effect Effects 0.000 description 1
- 210000001616 monocyte Anatomy 0.000 description 1
- 210000005087 mononuclear cell Anatomy 0.000 description 1
- 210000000440 neutrophil Anatomy 0.000 description 1
- 210000003463 organelle Anatomy 0.000 description 1
- 244000052769 pathogen Species 0.000 description 1
- 230000001717 pathogenic effect Effects 0.000 description 1
- 210000005259 peripheral blood Anatomy 0.000 description 1
- 239000011886 peripheral blood Substances 0.000 description 1
- 230000035790 physiological processes and functions Effects 0.000 description 1
- 230000008569 process Effects 0.000 description 1
- 238000012545 processing Methods 0.000 description 1
- 230000002797 proteolythic effect Effects 0.000 description 1
- 238000011084 recovery Methods 0.000 description 1
- 238000002798 spectrophotometry method Methods 0.000 description 1
- 239000011550 stock solution Substances 0.000 description 1
- 239000000126 substance Substances 0.000 description 1
- ZRKFYGHZFMAOKI-QMGMOQQFSA-N tgfbeta Chemical compound C([C@H](NC(=O)[C@H](C(C)C)NC(=O)CNC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)[C@H](CCCNC(N)=N)NC(=O)[C@H](CC(N)=O)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@H]([C@@H](C)O)NC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)[C@H]([C@@H](C)O)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)CNC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@H](CCC(N)=O)NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@@H](N)CCSC)C(C)C)[C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC=CC=1)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N1[C@@H](CCC1)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC=CC=1)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N1[C@@H](CCC1)C(=O)N1[C@@H](CCC1)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O)C1=CC=C(O)C=C1 ZRKFYGHZFMAOKI-QMGMOQQFSA-N 0.000 description 1
- 108010072986 threonyl-seryl-lysine Proteins 0.000 description 1
- 238000012546 transfer Methods 0.000 description 1
- 238000013519 translation Methods 0.000 description 1
- XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N water Substances O XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000012224 working solution Substances 0.000 description 1
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- C07K14/435—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
- C07K14/52—Cytokines; Lymphokines; Interferons
- C07K14/521—Chemokines
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K38/00—Medicinal preparations containing peptides
Landscapes
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Gastroenterology & Hepatology (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Zoology (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Toxicology (AREA)
- Peptides Or Proteins (AREA)
- Medicines That Contain Protein Lipid Enzymes And Other Medicines (AREA)
Abstract
Bu buluş insan CXCL8 kemokin öncül peptit dizisinden (CXCL8-(1-30)) türevlenen fonksiyonel kısa peptit - Gly Ala Val Leu Pro Arg Ser Ala Lys - dizisi ile ilgilidir. İmmün sistem yanıtlarını etkilemesi ve immün sistem hücrelerine bağlanması özellikleri ile karakterize edilmiştir. Bu fonksiyonel kısa peptit 8 aa.dan uzundur, nötral pH?da pozitif şarja sahip ve amfifiliktir.
Description
TARIFNAME
CXCL8 amino ucu önc'L'II bölgesinden t'üretilen imm'ünmod'ülatör peptit
Teknik Alan:
Bu bulus CXCL8 kemokin molekül'üne ait amino-ucu bölgesinde yer alan önc'ul diziden
(CXCL8-(1-30)) esinlenilerek türetilen ve immün sistem yanitlarini etkileme fonksiyonu
oldugu tespit edilen kisa peptit dizisi ile ilgilidir.
Teknigin Durumu:
Sitokinler, hayvan ve bitki hücrelerince üretilen, hücrelerin birbirleriyle iletisimini saglayan
protein ve peptidlerin bir grubudur. Inflamasyon ve bagisiklik reaksiyonlarinda, aktif
lenfositler, makrofajlar dahil immün hücreler, endotel, epitel ve konnektif dokular tarafindan
olusturulurlar. Sitokinler, hücrelerdeki reseptörlere baglanarak hücre çogalmasini,
farklilasmasini ve hücresel yanitlarin düzenlenmesini uyarirlar.
Bir patojen varliginda sitokinler, T hücresi ve makrofajlar gibi bagisiklik sistemi hücrelerine
sinyal verir ve enfeksiyon bölgesine gitmelerini saglarlar.
Sitokinlerin özgül bir grubu kemokinler olup, hücreler arasinda kemotaksiye aracilik ederler.
Kemokinlerin CXC, CC, CX3C ve XC olmak 'üzere dört alt familyasi vardir.
CXC kemokinlerde iki N-terminal sistein bir amino asit ile ayrilmistir. Memelilerde 17 farkli
CXC kemokin bulunmakta olup, glutamik asit-Iösin-arginin yapisindaki spesifik amino asit
sekansi (ELR motifi) içerip içermemesine göre ELR-pozitif ve ELR-negatif olmak 'üzere iki
kategoriye ayrilir.
ELR-pozitif CXC kemokinler diger bazi immün hücrelerin yani sira spesifik olarak nötrofillerin
migrasyonunu indüklerler ve CXCR1 ile CXCR2 kemokin reseptörleri ile etkilesirler. ELR
motifi içermeyen diger CXC kemokinler genellikle lenfositler için kemoatraktan olarak islev
benzer görevler gören bir peptit (020),yi kapsar.
W, CXCR4'e baglanan CXCL12 kemokinini antagonize etme yetenegine
sahip yeni bir siklik peptit dizisini kapsar.
no.lu patentler CXCR4'e baglanan CXCL12 kemokinini antagonize etme yetenegine sahip
peptit dizilerini kapsar.
U, CXCR1' baglanma kapasitesine sahip ve IL-8'i antagonize etme
yetenegi gösteren peptit dizilerini kapsar.
US no.lu patent kemokinlere dogrudan baglanarak bu molekül'un aktivitesini
engelleyen, bu sayede inflamasyon ile iliskili süreçleri degistirebilecek peptitleri tanimlar.
W no.Iu patent CCRS'e baglanan CCL5 kemokinini antagonize etme ve
bu reseptör araciligi ile hücreyi enfekte eden HIV virüsünün girisini bloke etme yetenegine
sahip peptit dizilerini kapsar.
W, bu patent çesitli kemokin reseptörlerine baglanarak, kemokinlerin
aktivitesini antagonize eden peptit dizilerini kapsar.
Bu patentler asagidaki özelliklerden birisine sahiptir: 1- Ilgili peptidin köken aldigi kemokinin
fonksiyonunu taklit (agonist) edebilme, 2- Ilgili peptidin köken aldigi kemokinin fonksiyonunu
antagonize edebilme, 3- Ilgili peptidin köken aldigi kemokinin olgun protein bölgesinden
(öncül bölgesinin disindan) tasarlanmis olma, 4- Belirli bir CXCL veya CCL kemokin
molekülüne özgül olma.
Bu patent basvurusunda sözü geçen CXCL8 kemokininin amino ucundaki öncül bölgesinden
(CXCL8-(1-30)) türevlenen kisa peptit dizisinin (Pep8) herhangi bir kemokinin fonksiyonunu
antagonize veya agonize etme söz konusu degildir. Bu bulusta bagisiklik sistemi yanitlarini
etkileme kapasitesine sahip peptit dizisi belirlenmistir.
Teknigin durumunda basvuru kapsamindaki peptit sekansi ile örtüsen bir sekanstan veya bu
küçük peptidin tarif ettigimiz spesifik fonksiyonlarindan dogrudan bahseden bir bilgi
bulunmamistir. CXCL8 kemokininin öncül dizisinden (CXCL8-(1-30) türevlenen “Gly Ala Val
Leu Pro Arg Ser Ala Lys” dizisi teknigin durumunda bilinmemektedir.
Teknigin durumunda CXCL8'den köken alan peptitler karboksi uç kisimlarini da içermekte
(bizim bulusumuzdaki gibi öncül bölgelerden köken almamaktadir) ve CXCL8'in yaptigi
fonksiyonlari antagonize veya agonize etmesi açisindan degerlendirilmektedir. Bu patent
basvurusunda sözü geçen CXCL8 kemokininin amino ucundaki öncül bölgelerinden
türevlenen kisa peptit dizisinin (Pep8) herhangi bir kemokini antagonize veya agonize etme
fonksiyonu söz konusu degildir. Bu bulusta bagisiklik sistemi yanitlarini etkileme
kapasitesine sahip peptit dizisi belirlenmistir.
Bulusun açiklamasi
Peptit yapili küçük moleküller pek çok fizyolojik sürecin düzenlenmesinde ve hücrelerarasi
iletisimin saglanmasinda rol alir. Basit yapidaki ve düsük moleküler agirliga sahip peptitler
daha kolay stabilize olur ve hedef dokuya daha rahat ulasir.
Bu bulus, bilinen CXCL8 kemokin molekülünün amino ucunda yer alan öncül (CXCL8-(1-30))
dizisinin rasyonel ve 'özgün bir algoritma ile irdelenmesi suretiyle bu dizilerden türevlenen
küçük peptit molekülünün belirlenmesini ve eldesini içermektedir.
Bu diziden küçük peptit molekül türetilmis, in vitro kullanima uygun olacak ve sentezlenmesi
mümkün peptit seçilmistir ve Pep8 olarak adlandirilmistir.
Daha sonra sözkonusu küçük peptit molekülünün periferik kan mononükleer hücreleri
üzerinde toksik etkisinin olmadigi belirlenmis ve molekülün immün hücrelerin çesitli uyaranlar
altinda aktivasyonunu, çogalmasini ve sitokin sentezini nasil etkiledigi arastirilmis ve immün
düzenleyici etki gösterebildigi saptanmistir.
Pep8 floresan isaretli olarak da sentezlenmis ve hangi immün hücre tipleri ile daha çok
etkilestigi arastirilmistir.
Bulusun detayli açiklamasi
CXCL8'e ait amino ucunda yer alan öncül dizinin (CXCL8-(1-30)) rasyonel bir algoritma ile
irdelenmesi suretiyle bu diziden bir küçük peptit molekülü ve in vitro kullanima uygun olacak
ve sentezlenmesi mümkün olacak sekilde türetilmistir.
Bu asamada kullanilan tasarim ve türetme kriteri asagida belirtilmistir:
0 8 aa.dan uzun olma,
. nötral pH'da pozitif sarj tasima,
. amfipatiklik,
. polar ortamda çözünmesidir (hidrofobik aa. oraninin 555% olmasi).
Tasarlanan peptit molekülüne ait kimyasal formül, izoelektrik nokta, polar ortamda çözünme
(hidrofobik aa. %), moleküler agirlik parametreleri de biyoinformatik yazilimlar kullanilarak
hesaplanmistir. Ilgili parametreler hem öncül protein bölgelerinin içerdigi total peptit dizilerini
hem de bu bölgelerden türevlenen küçük peptit molekülü için kiyaslanmistir (Tablo-1a,b).
Kalip olarak kullanilan amino ucu öncül peptid dizisi Küçük peptid molekülü (Pep)
CXCL8 Met Thr Ser Lys Leu Ala Val Ala Leu Leu Ala Ala Phe Leu Ile Pep8= Gly Ala Val Leu Pro Arg Ser Ala Lys
Ser Ala Ala Leu Cys Glu Gly Ala Val Leu Pro Arg Ser Ala Lys
CXCL8 Pep8
Uzunluk aa. 30 9
Net yük (pH7) +2 +2
Hidrofobik aa. %56.67 %44.44
Suda çözünürlük ZAYlF IYI
Küçük peptit molekülünün tasarimi asamasinda, öncelikle National Center for Biotechnology
edilmistir. Biyolojik aktivite kazanmis olgun kemokinler için karakteristik CXC veya ELR
motifine kadar olan protein bölgeleri seçilerek Janin hidrofobisite egrileri [SIB 7
Bioinformatics Resource Portal (ExPASy); Lifetein peptide property calculator; Innovagen
peptide property calculator yazilimlari kullanilarak] olusturulmustur (Sekil-1, A grafigi).
a) Bu egriler kullanilarak öncül kemokin bölgesinin (CXCL8-(1-30)) amfipatik özellige
sahip kisimlari belirlenmistir. Bu bölgelerin izoelektrik noktalari yine ayni yazilim
kullanilarak grafigi hazirlanmistir. (Sekil-1, B grafigi).
b) Proteinlerin translasyon sonrasinda organel ve hücre membranlarina transferini
saglayan sinyal dizisi ile örtüsen hidrofobik bölgeler (genellikle ilk 24-28 aa.) disarida
tutularak en az 8 aa. uzunluga sahip olacak sekilde farkli peptit dizileri seçilmis ve
peptitlerin, hücre yüzeyi ile iyi etkilesebilmeleri için, nötral pH'daki net yükü (Sekil-1, C
grafigi) analiz edilmistir.
Belirlenen Pep8 dizisi LifeTein (ABD) firmasi tarafindan amino terminal asetillenmis olacak
sekilde sentezlenmis ve HPLC (Saflik, 91.09%), kütle spektrofotometri analizleri ile peptit
dizisinin safligi ve dogrulugu teyit edilmistir.
Liyofilize formdaki Pep8 steril dH20 ile 5 mM stok konsantrasyonuna gelecek sekilde
çözülmüstür. Peptit stok çözeltileri son konsantrasyonlari 500 uM, 50 pM, 5 uM, 0.5 uM ve
50 nM olacak sekilde, hücre kültür ortami içerisinde seyreltilerek çalisma çözeltileri
olusturulmustur. Çözülen peptitler alikotlanarak -86° C'de saklanmistir.
Daha sonra sözkonusu küçük peptit molekülünin periferik kan mononükleer hücreleri
üzerinde toksik etkisinin olmadigi belirlenmis ve molekülün immün hücrelerin çesitli uyaranlar
altinda aktivasyonunu, çogalmasini ve sitokin sentezini nasil etkiledigi arastirilmis ve Pep8'in
immün düzenleyici etki gösterebilen bir küçük peptit molekülü oldugu saptanmistir.
Pep8'in periferik kan mononükleer (PKM) hücrelerinin aktivasyonu üzerine etkileri
incelenmistir. CXCL öncül peptit türevlerinin PKM hücrelerinin aktivasyonu üzerine olan
analiz edilerek degerlendirilmistir.
Pep8'in PKM hücrelerinin çogalmasi üzerine etkilerinin akim sitometrik arastirilmis ve PKM
hücrelerinin çogalmasi üzerine olan etkileri CFSE boyasinin seyrelme düzeyine göre
degerlendirilmistir. Ilgili analizler akim sitometri yöntemi ile yapilmistir.
Pep8'in PKM hücrelerinden salgilanan sitokin düzeyleri üzerine etkileri ELISA deneyleri ile
arastirilmistir.
Sonuç olarak, Pep8'in PKM hücrelerinin çogalmasi, aktivasyon belirteçlerinin düzeyi ve
sitokin sentezi üzerine etki gösterdigi belirlenmistir. Pep8 immün hücrelerin proliferasyon
yetenegini etkilemistir. Sitokin üretimi de Pep8 varliginda degisim göstermistir.
Immün düzenleme etkisi: Lipopolisakkarit (LPS) uyarimi altinda mononükleer lökositlerin
belirteçler açisindan düsük düzeyde artis yönünde etkiler. Pro-inflamatuvar IFN-y sitokin
sentezini azaltir; lL-10, lL-4, TGF-ß, TNF-oi düzeylerini degistirmez.
CDB/CD28 uyarimi altinda mononükleer lökositlerin aktivasyon düzeyini (CD86 artisi; HLA-
DR, CD154, CD25 CD69, CD80 düzeyini degistirmez) belirteçler açisindan düsük düzeyde
artis yönünde etkiler. T lenfositlerin çogalmasini etkilemez.
CD3/allojenik mononükleer hücre THP-1 uyarimi altinda mononükleer lökositlerin aktivasyon
düzeyini etkilemez. T lenfositlerin çogalmasini artirir. Pro-inflamatuvar sitokinler TNF-oi ve
lFN-y düzeyini artirir; anti-inflamatuvar sitokinler TGF-ß ve lL-1O düzeylerini artirir; IL-4
düzeyini degistirmez.
Bu peptit dizisinin floresan (FITC) ile isaretlenmesi sonucunda özellikle monosit, NK ve B
olmadigi belirlenmistir.
Sonuçlar
Pep8'in immün yanitlari farkli açilardan ve farkli hassasiyette etkileme kapasitesi vardir. Elde
edilen molekülün; bagisiklik sistemi biyolojisi çalismalari, tüm inflamatuvar hastaliklarin
teshis ve tedavisi ve immün sistem veya immün sistem ile etkilesen diger doku ve hücreleri
hedefleyebilmek için kullanimlari sözkonusu olabilir.
Sonuçta elde edilen bu peptit türevinin immün yanitlari farkli açilardan ve farkli hassasiyette
etkileyebilecegi anlasilmaktadir. Bagisiklik sistemi biyolojisi açisindan ele alindigi zaman,
ilgili küçük molekülün inflamatuvar yanitlar sirasinda açiga çikma olasiligi bulunmaktadir. Bu
peptitlerin inflamatuvar bölgelerden izolasyonu veya tespiti yapilmamasina ragmen elde
edilen bulgular CXCL kemokinlerin proteolitik olarak islenmesi sirasinda açiga çikan küçük
peptit molekülünün immün yanitlari etkileme kapasitesinin bulunabilecegine isaret
etmektedir.
Diger taraftan küçük peptit molekülünün terapötik uygulamalar için elverisli oldugu
bilinmektedir. Mevcut bulus ile sentezlenen peptitin immün yanitlari degistirici etkilerinin
olabilecegi gösterildiginden immünolojik veya immün sistemin dahil oldugu veya inflamatuvar
hastaliklarda veya olaylarda bulunan peptit molekülünün saglik bilimleri ve biyoloji alanlarinin
çesitli uygulamalarinda terapötik kullanim olanagi olabilecektir.
Basvuruda belirtilen CXCL8 kemokin öncül dizisinden veya bu bölgeye komsu amino asit
bölgelerinden türevlenen küçük peptit molekülünün immün hücreleri özgül olarak isaretleme
kapasitesinden yararlanilmasi mümkündür. Bu sayede özellikle miyeloid kökenli ve monositik
hücrelerin belirlenmesi ilgili peptit molekülünün kullanimi ile söz konusu olabilecektir.
Immün sistem ile iliskili hastaliklarin teshis ve tedavisinde veya immün sistem hücrelerinin
hedeflenmesinde ve/veya isaretlenmesinde kullanilacak bir ilacin veya ajanin
hazirlanmasinda Pep8 molekülünün kullanimi mümkündür. Bu amaçla Pep8 molekülü
dogrudan kullanilabilecegi gibi çesitli biyolojik ve kimyasal modifikasyonlarinin eldesi
suretiyle de kullanilabilecektir.
Belirtilen amino asit sekansina sahip Pep8 molekülü asagidaki terapötik amaçlar için bir
ilacin veya ajanin hazirlanmasinda kullanilabilecektir.
o Immün sistem hücreleri ile etkileserek immün sistem hücrelerinin yanitlarini etkileme için
o Immün sistem ile iliskili hastaliklarin teshis ve tedavisinde
o immün sistem hücrelerinin hedeflenmesinde
o Immün sistem hücrelerinin isaretlenmesinde
Sekillerin açiklamasi:
Sekil-1. Pep8 peptitinin tasarim asamasinda çizilen hidrofobisite (A) ve izoelektrik nokta (B
ve C) grafikleri
A) CXCL8 kemokinlerin total öncül peptit dizilerine ait Janin hidrofobisite egrisi. Küçük peptit
tasarim algoritmasina en uygun oldugu belirlenen bölgeler kutu içinde isaretlenmistir. Seçilen
küçük peptite ait amino asit dizisi kutunun altinda belirtilmistir.
8) CXCL8'e ait total öncül peptit dizilerinin (1. pozisyondaki metiyonin aa.'dan CXC veya
ELR motifine kadar olan bölge) izoelektrik nokta grafigi verilmistir. Kutu içerisinde pH 7'de
izlenen net sarj degeri gösterilmistir.
C) CXCL8'e ait küçük peptit dizilerinin izoelektrik nokta grafigi verilmistir. Kutu içerisinde pH
7'de izlenen net sarj degeri gösterilmistir.
<110> ESENDAGLI, GUNES
<120> AN IMMUNOMODULATOR PEPTlDE DERIVED FROM CXCL8
AMINO TERMINAL PRECURSOR SEQUENCE
<160> 13
<210> 1
<211> 9
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<220>
<223> A peptide molecule derived from CXCL8 chemokine amino terminal
precursor sequence
<400> Gly Ala Val Leu Pro Arg Ser Ala Lys
Hidrofobisite
Janin hidrofobisite
MTSKLAVALLAAFLlSAALCEGAVLPRSAK
üm pro-peptit
Claims (6)
1-Insan CXCL8 kemokin öncül peptit dizisinden (CXCL8-(1-30)) türevlenen küçük peptit molekülü olup, 0 Gly Ala Val Leu Pro Arg Ser Ala Lys (Pep8)
2- Istem 1'de belirtilen amino asit sekansina sahip peptid molekülü olup, asagida belirtilen özelliklere sahiptir: 0 8 aa.dan uzundur, o nötral pH'da pozitif sarj tasir, o amfipatiktir, ve . polar ortamda çözünecek sekilde hidrofobik aa. orani %55 veya daha küçüktür.
3- Immün sistem hücreleri ile etkileserek immün sistem hücrelerinin yanitlarini etkileme için kullanilacak bir ilacin veya ajanin hazirlanmasinda Istem 1'de belirtilen amino asit sekansina sahip peptid molekülünün kullanimi.
4- Immün sistem ile iliskili hastaliklarin teshis ve tedavisinde kullanilacak bir ilacin veya ajanin hazirlanmasinda Istem 1'de belirtilen amino asit sekansina sahip peptid molekülünün kullanimi.
5- Immün sistem hücrelerinin hedeflenmesinde kullanilacak bir ilacin veya ajanin hazirlanmasinda Istem 1'de belirtilen amino asit sekansina sahip peptid molekülün'ün kullanimi.
6- Immün sistem hücrelerinin isaretlenmesinde kullanilacak bir ilacin veya ajanin hazirlanmasinda Istem 1'de belirtilen amino asit sekansina sahip peptid molekülünün kullanimi.
Priority Applications (2)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| TR2018/11689A TR201811689A2 (tr) | 2018-08-10 | 2018-08-10 | Cxcl8 ami̇no ucu öncül di̇zi̇si̇nden türevlenen i̇mmünmodülatör pepti̇t |
| PCT/TR2019/050621 WO2020032894A1 (en) | 2018-08-10 | 2019-07-25 | An immunomodulator peptide derived from a cxcl8 amino terminal precursor sequence |
Applications Claiming Priority (1)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| TR2018/11689A TR201811689A2 (tr) | 2018-08-10 | 2018-08-10 | Cxcl8 ami̇no ucu öncül di̇zi̇si̇nden türevlenen i̇mmünmodülatör pepti̇t |
Publications (1)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| TR201811689A2 true TR201811689A2 (tr) | 2018-09-21 |
Family
ID=67001006
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| TR2018/11689A TR201811689A2 (tr) | 2018-08-10 | 2018-08-10 | Cxcl8 ami̇no ucu öncül di̇zi̇si̇nden türevlenen i̇mmünmodülatör pepti̇t |
Country Status (2)
| Country | Link |
|---|---|
| TR (1) | TR201811689A2 (tr) |
| WO (1) | WO2020032894A1 (tr) |
Family Cites Families (2)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| WO2005040210A2 (en) * | 2003-10-22 | 2005-05-06 | Applied Research Systems Ars Holding N.V. | Novel cxcl8 antagonists |
| EP2997042B1 (en) * | 2013-05-17 | 2019-08-07 | Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS) | Anti-cxcl1, cxcl7 and cxcl8 antibodies and their applications |
-
2018
- 2018-08-10 TR TR2018/11689A patent/TR201811689A2/tr unknown
-
2019
- 2019-07-25 WO PCT/TR2019/050621 patent/WO2020032894A1/en not_active Ceased
Also Published As
| Publication number | Publication date |
|---|---|
| WO2020032894A1 (en) | 2020-02-13 |
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| Bokesch et al. | A potent novel anti-HIV protein from the cultured cyanobacterium Scytonema varium | |
| CN112048005B (zh) | 新型冠状病毒s蛋白片段多倍体及其制备方法、检测试剂盒、疫苗及药物 | |
| Ziegman et al. | Bioactive components in fish venoms | |
| Nilsson et al. | C3a and C5a are chemotaxins for human mast cells and act through distinct receptors via a pertussis toxin-sensitive signal transduction pathway | |
| Tanaka et al. | CXCR4 stimulates macropinocytosis: implications for cellular uptake of arginine-rich cell-penetrating peptides and HIV | |
| Stone et al. | Homogeneous sulfopeptides and sulfoproteins: synthetic approaches and applications to characterize the effects of tyrosine sulfation on biochemical function | |
| ES2274514T5 (es) | Eotaxina = citocina quimiotáctica de eosinófilos | |
| Veldkamp et al. | Solution structure of CCL19 and identification of overlapping CCR7 and PSGL-1 binding sites | |
| Tiwary et al. | Initiation and pathogenesis of severe asthma with fungal sensitization | |
| CN114656529B (zh) | 一种新型冠状病毒t细胞的抗原表位肽及其应用 | |
| CN107106655A (zh) | 使用白细胞介素‑10治疗疾病和病症的方法 | |
| Pittman et al. | Safety and immunogenicity of ricin vaccine, RVEc™, in a Phase 1 clinical trial | |
| CN113388011A (zh) | 新型冠状病毒刺突蛋白Spike蛋白的免疫表位及其预测和应用 | |
| Stączek et al. | Fungal α-1, 3-Glucan as a new pathogen-associated molecular pattern in the insect model host Galleria mellonella | |
| Vacchini et al. | Differential effects of posttranslational modifications of CXCL8/interleukin-8 on CXCR1 and CXCR2 internalization and signaling properties | |
| Guzmán-Téllez et al. | Lectins as virulence factors in Entamoeba histolytica and free-living amoebae | |
| Blanchet et al. | Chemokine heteromers and their impact on cellular function—a conceptual framework | |
| WO2016178811A1 (en) | Modified h7 hemagluttinin glycoprotein of the influenza a/shanghai/2/2013 h7 sequence | |
| Taylor et al. | Immune response to Chikungunya virus: Sex as a biological variable and implications for natural delivery via the mosquito | |
| Bosch-Camós et al. | Nanoparticle-based secretory granules induce a specific and long-lasting immune response through prolonged antigen release | |
| TR201811689A2 (tr) | Cxcl8 ami̇no ucu öncül di̇zi̇si̇nden türevlenen i̇mmünmodülatör pepti̇t | |
| TR201811691A2 (tr) | Cxcl17 ami̇no ucu öncül di̇zi̇si̇nden türevlenen i̇mmünmodülatör pepti̇t | |
| TR201811690A2 (tr) | Cxcl14 ami̇no ucu öncül di̇zi̇si̇nden türevlenen i̇mmünmodülatör pepti̇t | |
| EP3892298A1 (en) | Epitopes having sequence homology to coronavirus spike protein subunit and uses thereof | |
| Xavier | An in vitro test of new peptide against melanoma |