TR201901998A2 - Direk Karbapenemaz Üçlü (Kpc-2, Oxa-48, Ndm-1) PCR Tanı Kiti - Google Patents
Direk Karbapenemaz Üçlü (Kpc-2, Oxa-48, Ndm-1) PCR Tanı Kiti Download PDFInfo
- Publication number
- TR201901998A2 TR201901998A2 TR2019/01998A TR201901998A TR201901998A2 TR 201901998 A2 TR201901998 A2 TR 201901998A2 TR 2019/01998 A TR2019/01998 A TR 2019/01998A TR 201901998 A TR201901998 A TR 201901998A TR 201901998 A2 TR201901998 A2 TR 201901998A2
- Authority
- TR
- Turkey
- Prior art keywords
- carbapenemase
- pcr
- ndm
- oxa
- kpc
- Prior art date
Links
- 108010068385 carbapenemase Proteins 0.000 title claims abstract description 20
- 238000009007 Diagnostic Kit Methods 0.000 title abstract 2
- 101100026178 Caenorhabditis elegans egl-3 gene Proteins 0.000 title 1
- 238000001514 detection method Methods 0.000 claims abstract description 6
- 108090000790 Enzymes Proteins 0.000 claims description 19
- 102000004190 Enzymes Human genes 0.000 claims description 19
- 238000000034 method Methods 0.000 claims description 12
- 238000007399 DNA isolation Methods 0.000 claims description 11
- 241000894006 Bacteria Species 0.000 claims description 8
- 230000001580 bacterial effect Effects 0.000 claims description 7
- 230000003115 biocidal effect Effects 0.000 claims description 5
- 108091028043 Nucleic acid sequence Proteins 0.000 claims description 4
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 claims description 3
- 230000035945 sensitivity Effects 0.000 claims description 3
- 108020001019 DNA Primers Proteins 0.000 claims description 2
- 239000003155 DNA primer Substances 0.000 claims description 2
- 241000588722 Escherichia Species 0.000 claims description 2
- 206010036790 Productive cough Diseases 0.000 claims description 2
- 239000008280 blood Substances 0.000 claims description 2
- 210000004369 blood Anatomy 0.000 claims description 2
- 238000011534 incubation Methods 0.000 claims description 2
- 210000003802 sputum Anatomy 0.000 claims description 2
- 208000024794 sputum Diseases 0.000 claims description 2
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 claims 1
- 238000009004 PCR Kit Methods 0.000 description 4
- 241000588921 Enterobacteriaceae Species 0.000 description 3
- 239000000523 sample Substances 0.000 description 3
- 238000001228 spectrum Methods 0.000 description 3
- 108020004414 DNA Proteins 0.000 description 2
- 241000588747 Klebsiella pneumoniae Species 0.000 description 2
- 230000000844 anti-bacterial effect Effects 0.000 description 2
- 108010034752 beta-lactamase NDM-1 Proteins 0.000 description 2
- 229940041011 carbapenems Drugs 0.000 description 2
- 238000009396 hybridization Methods 0.000 description 2
- 208000015181 infectious disease Diseases 0.000 description 2
- 238000007403 mPCR Methods 0.000 description 2
- 239000000463 material Substances 0.000 description 2
- 239000002207 metabolite Substances 0.000 description 2
- 239000013612 plasmid Substances 0.000 description 2
- 239000013615 primer Substances 0.000 description 2
- 229930186147 Cephalosporin Natural products 0.000 description 1
- 108090000204 Dipeptidase 1 Proteins 0.000 description 1
- 241000588724 Escherichia coli Species 0.000 description 1
- 229930182555 Penicillin Natural products 0.000 description 1
- 238000012300 Sequence Analysis Methods 0.000 description 1
- 108010006785 Taq Polymerase Proteins 0.000 description 1
- 239000011543 agarose gel Substances 0.000 description 1
- 230000003321 amplification Effects 0.000 description 1
- 239000003242 anti bacterial agent Substances 0.000 description 1
- 229940088710 antibiotic agent Drugs 0.000 description 1
- 102000006635 beta-lactamase Human genes 0.000 description 1
- 238000009835 boiling Methods 0.000 description 1
- YZBQHRLRFGPBSL-RXMQYKEDSA-N carbapenem Chemical compound C1C=CN2C(=O)C[C@H]21 YZBQHRLRFGPBSL-RXMQYKEDSA-N 0.000 description 1
- 229940124587 cephalosporin Drugs 0.000 description 1
- 150000001780 cephalosporins Chemical class 0.000 description 1
- 239000003795 chemical substances by application Substances 0.000 description 1
- 238000013211 curve analysis Methods 0.000 description 1
- 238000003745 diagnosis Methods 0.000 description 1
- 201000010099 disease Diseases 0.000 description 1
- 208000037265 diseases, disorders, signs and symptoms Diseases 0.000 description 1
- 230000001506 immunosuppresive effect Effects 0.000 description 1
- 238000000338 in vitro Methods 0.000 description 1
- 238000002955 isolation Methods 0.000 description 1
- 238000005259 measurement Methods 0.000 description 1
- 230000001404 mediated effect Effects 0.000 description 1
- 238000002844 melting Methods 0.000 description 1
- 230000008018 melting Effects 0.000 description 1
- 244000005700 microbiome Species 0.000 description 1
- 239000000203 mixture Substances 0.000 description 1
- 229940041009 monobactams Drugs 0.000 description 1
- 238000003199 nucleic acid amplification method Methods 0.000 description 1
- 239000002773 nucleotide Substances 0.000 description 1
- 125000003729 nucleotide group Chemical group 0.000 description 1
- 150000002960 penicillins Chemical class 0.000 description 1
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 description 1
- 239000013589 supplement Substances 0.000 description 1
- 230000008685 targeting Effects 0.000 description 1
- 150000003952 β-lactams Chemical class 0.000 description 1
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6844—Nucleic acid amplification reactions
- C12Q1/686—Polymerase chain reaction [PCR]
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/34—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving hydrolase
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6876—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
- C12Q1/6888—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for detection or identification of organisms
- C12Q1/689—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for detection or identification of organisms for bacteria
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
- C12Q2600/16—Primer sets for multiplex assays
Landscapes
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Zoology (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- Immunology (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Microbiology (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
- Measurement And Recording Of Electrical Phenomena And Electrical Characteristics Of The Living Body (AREA)
- Medicines Containing Antibodies Or Antigens For Use As Internal Diagnostic Agents (AREA)
Abstract
Buluş, bir karbapenemazların tespitinde kullanılan PCR temelli hızlı tanı kiti ile ilgilidir.
Description
TARIFNAME
Direk Karbapenemaz Üçlü (Kpc-Z, Oxa-48, Ndm-i) PCR TanEl(iti
Bulusun Ilgili Oldugu Teknik Alan
Bulus, antibiyotik (karbapenem) direncine sebep olan karbapenemazlarlBl tespitinde
kullanilân, PCR temelli, hlîllîiianlîlkiti ile ilgilidir.
Bulusla Ilgili Teknigin Bilinen Durumu (Önceki Teknik)
Karbapenemazlar penisilinleri, çogu olguda sefalosporinleri, belirli dereceye kadar
karbapenemleri ve monobaktamlarEliiidroIize eden [3- IaktamazlardIE
Gram negatif bakterilerde son ylmar içerisinde genislemis spektrumlu beta-laktamaz (GSBL)
ve karbapenemaz üreten etkenlerle gelisen enfeksiyonlar, özellikle hastanede yatmakta olan
hastalarda ve altta yatan immünsüpresif durumu olanlarda ciddi tedavi sorunlarlEla neden
olmaktadlîl
Dünyada Enterobacteriaceae ailesinde en yayglEl olarak saptanan karbapenemazlar;
Klebsiella pneumoniae karbapenemaz (KPC), , New Delhi metallo-ß-laktamaz (NDM) ve
oxacillinase-48 OXA-48 enzimleridir.
Karbapenemler beta-Iaktam lellfJlîiçerisinde en genis spektruma sahip, hlîlEbakterisidaI etki
gösteren antibiyotiklerdir ve genis antibakteriyel spektrumlarlsîla aerob ve anaerob birçok
mikroorganizma taraflîitlan olusturulan enfeksiyonlarda yaygI kullanllîhaktadlîllar.
Teknigin bilinen durumunda; Karbapenemazlar rutin mikrobiyoloji IaboratuvarlarIa klasik
kültür ve antibiyogram tayini seklinde identifiye edilmektedir.
Rutin mikrobiyoloji Iaboratuvarlarlda kullan [lân bakteri tanIiIama ve antibiyogram seklindeki
klasik tanIilama metoduyla, öncelikle hastadan gelen materyalin kültüre edilerek 24 saatlik
inkübasyonundan sonra otomatize sistemler kullanüârak, bakteri ismi konmaktadEI
Sistemlerin çalisma prensibi, bakterinin üreme esnasliîtia kullandEgJEl metabolitler ve
sonucunda olusturdugu enzim ve pH degisiklikleri temel aI-rak, özetle biyokimyasal
özelliklerine göre isimlendirilmektedir. Bu yöntemlerin kullanllîzhasIa söz konusu
Enterobacteriaceae üyesi bakteriler için teknik bir sorun olmamakla birlikte, tespiti için en az
48 saate ihtiyaç duyulmasElie bu süre zarfIa direnç enzimlerinin hlîla hastadan hastaya
yayüüiasßöz konusu olmaktadlE
Ikincil islem olarak da Antibiyogram ile söz konusu bakterinin hangi antibiyotige karsülluyarllîl
oldugu yine otomatize sistemler tarafIdan belirlenmektedir. Söz konusu islem sEisHa,
direnç enziminin varl[g]- isaret edilirken, direnç detayElie tipi hakkIa kesin bir yargüa
varllâmamaktadEI Böylelikle tehlike arz eden, hastalar arasIa hlîla yayEIân, plazmid
aracHJKlEEnzim tipinin belirlenmesi ve hastanI diger hastalardan izole edilerek bulaslElDglEl
dolaylîlîzla da salg ar olusmasßngelIenememektedir.
Karbapenemazlarl identi'rikasyonunda ayrEla teknigin bilinen durumunda, fenotipik Carba NP
ve Modifiye Hodge Test (MHT) de kullanllBiaktadE MHT Mebsie//a pneumoniae'de oldukça
duyarlElolmas- ragmen diger Enterobacteriaceae üyelerinde iyi sonuç vermemektedir.
AyrEla teknigin bilinen durumundaki bu testler genel bir karbapenemaz varliglllîl
dogrulamakta fakat dirence neden olan enzimin tam ismini belirtememektedir. Carba NP test,
güvenilir bir test olmasEla ragmen maliyeti yüksek oldugundan dolayEllercih edilmemektedir.
Ülkemizde enzimlerin belirlenmesinde genellikle konvansiyonel PCR ya da uluslararasEiliretimli
kitler kullanlßiaktadlü Bu kitler ülkemizde sllZllIZIa görülen ve probleme sebebiyet veren üç
önemli (Kpc-Z, Oxa-48, Ndm-l) enzimin dlglîida çok say. enzimi içerdigi ve yurt dlgl]
üretimli oldugu için maliyeti oldukça yüksektir. Ayrlîla, direnç tayini daha uzun zaman
almaktadlE
den fazla karbapenemaz enzim çesidi tayin eden bir kit ile ilgilidir. Bu nedenle direnç tayini
islemi oldukça uzun sürmektedir.
Bulusun Klâla AÇEEIamasüie AmaçlarEl
Bulusta, antibiyotik direncine sahip karbapenemazlarl tespitini saglayan PCR temelli, hlîIEl
Bulustaki PCR temelli hElEllanEkiti sayesinde antibiyotige karsütlirenç olusturan enzimler hlîlEl
bir sekilde (1-2 saat) tanIiIanmakta ve hangi enzimin dirence neden oldugu tespit
edilmektedir. Plazmid araclIJKIEllJir enzim ise hastanI izolasyonu hlîla saglanmakta ve direnç
yayEIJEJl Ebnlenmektedir.
Yogun bakIi ünitelerinde yatan komorbîditesi yüksek hastalar için önem arz eden direnç
enzimlerinin hlîla hastadan hastaya yayllBiasII önlenmesi ve hastanI diger hastalardan
izole edilerek bulaslEllIglül gerçeklesmesi önlenmektedir.
Bulus kit içerigi basit bir sekilde kullanIi amac. uygun olarak dizayn edilebilmektedir.
Örnegin, mikrobiyoloji rutin Iaboratuvarlarda, tanlîlamaçllîlkullanllâcak olan kitler prob
hibridizasyon teknigine dayalÇIepidemiyoIojik arastüina çalânalaria kullanllâcak olanlar ise
istege uygun olarak, Konvansiyonel Tekli veya Multipleks ve Sybr-Green teknikleriyle
üretilebilmektedir.
Bulus kiti, ülkemizde s[th;a karsllâsllân ve tehlike arz eden üç önemli (Koc-2, Oxa-48, Ndm-l)
karbapenemaz enzimini içerdiginden direnç tayini hlîlüa (1-2 saat) yapllâbilmektedir ve
maliyeti oldukça düsüktür.
Bulusu AçEIilayan Sekillerin TanlEilarEl
Sekil 1: Is aklgsemaslîl
Bulusu olusturan unsurlarIII/klilünar[parçalar tanliilarü
Karbapenemaz pozitif Escherichia coli, Klebsiella pneumoniae vb. bakteri
Klinik örnek
Klinik örnekten bakteri kültürü
Klinik örnekten direk DNA izolasyonu
Bakteri kültüründen DNA izolasyonu
DNA izolasyonu standardizasyonu, özgüllük ve hassasiyet belirleme
Konvansiyonel PCR (blaKPC-2, blaOXA-48, bIaNDM-l)
Multiplex PCR
Sybr-Green PCR
. DNA sekans ve varyant analizi
PPHQWF-WNH
Bulusun AyrItEIJIJçIIamasEI
Bulus Sekil 1 de belirtilen islem adi leas- göre; öncelikle Karbapenemaz pozitif
°C'de biriktirilerek
üretilmektedir. SonrasIa klinik örnekler (2) rutin tanIZllaboratuvarlarIa, laboratuvara
Escherichia ::o/i; K/ebsie//a pneumani'ae vb. bakterileri (1) -80
gönderilen kan, endotrakeal aspirat ve balgam gibi örnekler seçilen DNA izolasyon kitinde
önerilen sekilde hazlEllanmakta ve klinik örneklerden bakteri kültürü (3) üretilmektedir. Klinik
örneklerden direk DNA izolasyonu (4) ve bakteri kültüründen DNA izolasyonu (5), es zamanlEl
olarak DNA izolasyon kiti ya da kaynatma metodu ile gerçeklesmektedir. PCR basamagi
hemen geçilmeyecekse, örnekler kia süre (birkaç hafta) için +4 °C' de ve 6 aylilg bir süre -
80°C' de bekletilmektedir. DNA izolasyonu standardizasyonu, özgüllük ve hassasiyet
belirlenmesi yapI[than sonra (6), çalisma amac. uygun say. enzim tespitini saglayan
kitler Konvansiyonel Tekli (7) veya Multipleks (8) ve Sybr-Green (9) teknikleriyle üretilerek
ölçüm yapilâbilmektedir. Tekli konvansiyonel PCR b/aKPC-Z, b/aOXA-48, b/aNDM-l' den
herhangi birisi ile olusurken, Multipleks PCR; blaKPC-Z, b/aOXA-48, b/aNDM-l' den istenilen
ikisi veya üçü tek reaksiyondan, Prob hibridizasyon ise tekli ve/veya çoklu enzimden
olusabilecektir. Bu teknikte, sorun teskil eden direnç enzimlerini kodlayan DNA bölgelerini
hedef alan primerler kullanilarak, çallgi'nanl amac. uygun farklEtipte dizayn edilecek olan
hazlElseçilen DNA bölgelerinin çogalmaslßaglayan PCR kitleri üretilmektedir. Kitte bulunan
ve farkIEkarbapenemaz genlerin tespiti için spesifik olan DNA primer çiftleri Tablo 1'de
gösterilmektedir.
Ileri primer Geri primer
Bu kitlerin içeriginde Master mix olarak adlandEllân ana karlglülida Taq DNA polimeraz
enzimini de içeren ve çogaltiiâcak bölgeye özgü primerleri içeren ayrlîia kontrol olarak
hazlEllanan tüplerden olusan solüsyon ve malzemeler yer almaktadE Süpheli direnç enzimine
uygun olarak seçilen PCR kiti ile kisa sürede (yaklasliZl 1-2 saat) Elglal döngü cihazlEtla
reaksiyon tamamlanmaktadlB Son adli olan DNA sekans ve varyant analizi (10) Için; Klasik
PCR kiti seçilmis ise PCR örnekleri % 1'lik agaroz jelde, 100V' da, 30 dakika yürütülür. Real-
Time PCR kiti seçilmis ise MeIt-Curve analizi ve dogru erime noktalarlîlle ayrEla internal
amplifikasyon kontrolleri (IAK) degerlendirilerek sonuçlar kaydedilmektedir. Seçilen örneklerin
DNA Sekans Analizi sonucuna göre nükleotid farkIHJKIarElincelenerek, enzim varyasyonu
istatiksel olarak da degerlendirilecektir.
Claims (2)
1. Antibiyotik direncine sahip karbapenemaz tespitini saglayan PCR temelli tanleiti olup özelligi; karbapenemaz grubundan olan Mebsi'e//a pneumoni'ae karbapenemaz (KPC), New Delhi metallo-B-laktamaz (NDM), oxacillinase-48 (Oxa-48) enzim çesitlerinin tespitini saglayacak sekilde No:1, No:2 ve No:3, No:4, No:5, No:6 DNA primer çiftlerini içermesidir.
2. Istem 1'e göre PCR temelli tanEllitinin çallgina yöntemi olup özelligi, . Karbapenemaz pozitif Escherichia evli ve K/ebsie//a pneumon/'ae bakterilerinin (1) -80 °C'de biriktirilerek üretilmesi, . Kan, endotrakeal aspirat veya balgam gibi klinik örneklerden (2), bakteri kültürü (3) eldesi, - Klinik örneklerden direk DNA izolasyonu (4) ve bakteri kültüründen DNA izolasyonu (5), o DNA izolasyonu standardizasyonu, özgüllük ve hassasiyet belirlenmesi (6), o Enzim tespitini saglayan kitler Konvansiyonel Tekli (7) veya Multipleks (8) ve Sybr-Green (9) teknikleriyle üretimesi, o DNA sekans ve varyant analizi (10) islem ad larEiÇermesidir.
Priority Applications (3)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| TR2019/01998A TR201901998A2 (tr) | 2019-02-11 | 2019-02-11 | Direk Karbapenemaz Üçlü (Kpc-2, Oxa-48, Ndm-1) PCR Tanı Kiti |
| PCT/TR2020/050066 WO2020167272A2 (en) | 2019-02-11 | 2020-02-03 | Direct carbapenemases triple (kpc-2, oxa-48, ndm-1) pcr diagnostic kit |
| US17/429,357 US20220145358A1 (en) | 2019-02-11 | 2020-02-03 | Direct carbapenemase triple (kpc-2, oxa-48, ndm-1) pcr diagnostic kit |
Applications Claiming Priority (1)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| TR2019/01998A TR201901998A2 (tr) | 2019-02-11 | 2019-02-11 | Direk Karbapenemaz Üçlü (Kpc-2, Oxa-48, Ndm-1) PCR Tanı Kiti |
Publications (1)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| TR201901998A2 true TR201901998A2 (tr) | 2020-08-21 |
Family
ID=72044401
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| TR2019/01998A TR201901998A2 (tr) | 2019-02-11 | 2019-02-11 | Direk Karbapenemaz Üçlü (Kpc-2, Oxa-48, Ndm-1) PCR Tanı Kiti |
Country Status (3)
| Country | Link |
|---|---|
| US (1) | US20220145358A1 (tr) |
| TR (1) | TR201901998A2 (tr) |
| WO (1) | WO2020167272A2 (tr) |
Family Cites Families (1)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| US20050058985A1 (en) * | 2003-09-12 | 2005-03-17 | Dodgson Kirsty Jane | Method and kit for identifying vancomycin-resistant enterococcus |
-
2019
- 2019-02-11 TR TR2019/01998A patent/TR201901998A2/tr unknown
-
2020
- 2020-02-03 US US17/429,357 patent/US20220145358A1/en not_active Abandoned
- 2020-02-03 WO PCT/TR2020/050066 patent/WO2020167272A2/en not_active Ceased
Also Published As
| Publication number | Publication date |
|---|---|
| WO2020167272A2 (en) | 2020-08-20 |
| US20220145358A1 (en) | 2022-05-12 |
| WO2020167272A3 (en) | 2020-10-08 |
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| Banerjee et al. | Rapid antimicrobial susceptibility testing methods for blood cultures and their clinical impact | |
| Price et al. | Community analysis of chronic wound bacteria using 16S rRNA gene-based pyrosequencing: impact of diabetes and antibiotics on chronic wound microbiota | |
| JP6258360B2 (ja) | 抗生物質耐性細菌を検出するための方法およびキット | |
| Buchan et al. | Multiplex identification of gram-positive bacteria and resistance determinants directly from positive blood culture broths: evaluation of an automated microarray-based nucleic acid test | |
| US20180135108A1 (en) | Method for detecting bacterial and fungal pathogens | |
| Chen et al. | Identification of methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA) using simultaneous detection of mecA, nuc, and femB by loop-mediated isothermal amplification (LAMP) | |
| Turutoglu et al. | Methicillin and aminoglycoside resistance in Staphylococcus aureus isolates from bovine mastitis and sequence analysis of their mecA genes | |
| Nieman et al. | A prospective multicenter evaluation of direct molecular detection of blood stream infection from a clinical perspective | |
| Smiljanic et al. | Comparison of in-house and commercial real time-PCR based carbapenemase gene detection methods in Enterobacteriaceae and non-fermenting gram-negative bacterial isolates | |
| CN101965407A (zh) | 使用经标记的抗生素鉴定抗生素耐受性 | |
| Franco et al. | Genotyping and rifampicin and isoniazid resistance in Mycobacterium bovis strains isolated from the lymph nodes of slaughtered cattle | |
| US20250188550A1 (en) | Methods and compositions for drug resistance screening | |
| Fang et al. | Screening for vancomycin-resistant enterococci: an efficient and economical laboratory-developed test | |
| CN110656188A (zh) | 检测引发血流感染的杆菌的引物和/或探针组合物及其应用 | |
| Genc et al. | The identification of carbapenemase types in Enterobacteriaceae by using molecular assay and phenotyping confirmation tests | |
| Tomaso et al. | Comparison of commercial DNA preparation kits for the detection of Brucellae in tissue using quantitative real-time PCR | |
| Rocchetti et al. | Detection of Mycobacterium chelonae, Mycobacterium abscessus group, and Mycobacterium fortuitum complex by a multiplex real-time PCR directly from clinical samples using the BD MAX system | |
| Pu et al. | Investigation of Streptococcus agalactiae using pcs B‐based LAMP in milk, tilapia and vaginal swabs in Haikou, China | |
| Xiao et al. | Evaluation of real-time PCR coupled with multiplex probe melting curve analysis for pathogen detection in patients with suspected bloodstream infections | |
| van Almsick et al. | Rapid detection of carbapenemase-producing Acinetobacter baumannii and carbapenem-resistant Enterobacteriaceae using a bioluminescence-based phenotypic method | |
| Alzahrani et al. | Antibiotic resistance profile and random amplification typing of β-lactamase-producing Enterobacteriaceae from the local area of Al-Taif and nearby cities in Saudi Arabia | |
| Metan et al. | Rapid detection of antibacterial resistance in emerging Gram-positive cocci | |
| Mencacci et al. | Comparison of conventional culture with SeptiFast real-time PCR for microbial pathogen detection in clinical specimens other than blood | |
| Zhu et al. | A locked nucleic acid (LNA)-based real-time PCR assay for the rapid detection of multiple bacterial antibiotic resistance genes directly from positive blood culture | |
| Eisner et al. | Identification of glycopeptide-resistant enterococci by VITEK 2 system and conventional and real-time polymerase chain reaction |