TW202440645A - 抗muc17*cd3*cd28三特異性抗體 - Google Patents
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Abstract
本發明提供了一種抗MUC17*CD3*CD28三特異性抗體。具體地,本發明的三特異性抗體標靶腫瘤特異性抗原MUC17,同時標靶T細胞表現的CD3和共刺激分子CD28,能夠為T細胞提供共刺激信號,從而激發更強更有效的毒殺活性,有望有效克服固態腫瘤對T細胞銜接子的耐藥性。
Description
本發明涉及抗體領域,具體地涉及一種抗MUC17*CD3*CD28三特異性抗體。
據世界衛生組織IARC發佈的《2020世界癌症報告》中數據顯示,2020年全球新發癌症病例1929萬例,僅中國新發癌症就有457萬人,占全球23.7%,中國癌症新發人數遠超世界其他國家。2020年,我國癌症病種中,癌症病種最高的前10位分別是:肺癌、乳腺癌、胃癌、結直腸癌、肝癌、食道癌、子宮頸癌、甲狀腺癌、子宮體癌、前列腺癌。肺癌為患病率最高的癌症,結直腸癌和胃癌緊隨其後,分別占比12.3%和10.5%。因此,尋找和探索胃腸道腫瘤相關治療標的用於開發更加有效的臨床治療藥物,具有重大臨床意義。
MUC17是一種分子量較大的O-醣基化黏蛋白(Mucins),與其它幾種黏蛋白(MUC1、3、12、13和16)同屬於SEA家族的跨膜黏蛋白。臨床癌症研究數據表明,MUC17在多種消化道腫瘤(包括胃癌和結直腸癌)中高度表現,這使MUC17成為潛在的消化道腫瘤相關標的。
雙特異性T細胞銜接子(Bispecific T-cell Engagers,BiTEs)是一種雙特異型抗體,它由兩類抗體的片段融合而成,分別可以結合T細胞表面的CD3分子以及腫瘤細胞表面抗原分子,從而誘導T細胞對腫瘤細胞的毒殺,此過程不受MHC限制。目前這一療法在血液系統惡性腫瘤中效果較好,其中一種CD3×CD19的BiTE,Blinatumomab,已經被FDA批准用於B細胞惡性腫瘤的治療。由於固態腫瘤存在的物理屏障以及免疫抑制微環境,BiTEs在多種固態腫瘤的臨床治療中沒有達到預期效果。
因此,本領域亟待提供一種能克服BiTEs缺陷的新型T細胞銜接子,例如能夠標靶腫瘤特異性抗原MUC17的三特異性T細胞銜接子(Trispecific T-cell engagers, TriTEs)。
本發明的目的在於提供一種抗MUC17*CD3*CD28三特異性抗體。
本發明的目的在於提供一種三特異性T細胞銜接子(TriTEs),標靶的腫瘤特異性抗原為MUC17,同時標靶T細胞表現的CD3和共刺激分子CD28。
在本發明的第一方面,提供了一種多特異性T細胞銜接子(T-cell Engagers),所述多特異性T細胞銜接子包含:
第一標靶結構域D1,所述D1與選自下組的標的蛋白結合:CD3、CD28、CD40、CD137;
任選的第二標靶結構域D2,所述D2與選自下組的標的蛋白結合:CD3、CD28、CD40、CD137;和
第三標靶結構域D3,所述D3包含一個或多個MUC17抗原結合結構域。
在另一優選例中,所述D1、D2或D3各自獨立地選自:單域抗體(sdAb)、Fab、Fab'、F(ab')
2、TriFab、Fv片段、片段可變(Fv)異二聚體、單鏈Fv(scFv)片段、雙抗體(diabody)、雙特異性T細胞接合器(BiTE)或單結構域片段,優選為單鏈Fv(scFv)、Fv片段或Fab片段。
在另一優選例中,所述MUC17抗原結合結構域包含第三重鏈可變區和第三輕鏈可變區,其中,所述第三重鏈可變區包含如下三個重鏈可變區CDR:
H-CDR1,其具有如SEQ ID NO: 3所示的胺基酸序列;
H-CDR2,其具有如SEQ ID NO: 4所示的胺基酸序列;和
H-CDR3,其具有如SEQ ID NO: 5所示的胺基酸序列;以及
所述第三輕鏈可變區包含如下三個輕鏈可變區CDR:
L-CDR1,其具有如SEQ ID NO: 6所示的胺基酸序列;
L-CDR2,其具有如SEQ ID NO: 7所示的胺基酸序列;和
L-CDR3,其具有如SEQ ID NO: 8所示的胺基酸序列。
在另一優選例中,所述MUC17抗原結合結構域包含如SEQ ID NO:1或9所示的第三重鏈可變區,和如SEQ ID NO:2或10所示的第三輕鏈可變區。
在另一優選例中,所述MUC17抗原結合結構域包含與如SEQ ID NO: 1或9所示的胺基酸序列具有至少80%、90%、95%、96%、97%、98%或99%的序列相同性的第三重鏈可變區(其中CDR序列不變或基本不變);和與如SEQ ID NO: 2或10所示的胺基酸序列具有至少80%、90%、95%、96%、97%、98%或99%的序列相同性的第三輕鏈可變區(其中CDR序列不變或基本不變)。
在另一優選例中,所述第二標靶結構域選自下組:CD3抗原結合結構域、CD28抗原結合結構域、CD40抗原結合結構域、CD137抗原結合結構域、CD40L序列、或CD137L序列。
在另一優選例中,所述第三標靶結構域選自下組:CD3抗原結合結構域、CD28抗原結合結構域、CD40抗原結合結構域、CD137抗原結合結構域、CD40L序列、或CD137L序列。
在另一優選例中,所述多特異性T細胞銜接子還包含Fc片段。
在另一優選例中,所述Fc片段來源於IgG1或IgG4。
在另一優選例中,所述Fc片段為來源於IgG1的Fc片段。
在另一優選例中,所述來源於IgG1的Fc片段具有選自下組的突變:
N297A;
L234F/L235E/P331S;
Y349C/K370E/K409D/K439E;
S354C/D356K/E357K/D399K;
S354C/T366W;
S354C/T366W/H435R/Y436F;
Y349C/T366S/L368A/Y407V;
L234F/L235E/P331S/Y349C/K370E/K409D/K439E;
L234F/L235E/P331S/S354C/D356K/E357K/D399K;
L234F/L235E/P331S/S354C/T366W;
L234F/L235E/P331S/Y349C/T366S/L368A/Y407V;
N297A/Y349C/K370E/K409D/K439E;
N297A/S354C/D356K/E357K/D399K;
N297A/S354C/T366W;
N297A/Y349C/T366S/L368A/Y407V;和/或
S267E;S267E/G236D;S267E/S239D;S267E/L328F。
在另一優選例中,所述來源於IgG1的Fc片段具有選自下組的突變:
L234A/L235A/G237A;
S354C/T366W;
S354C/T366W/H435R/Y436F;
Y349C/T366S/L368A/Y407V。
在另一優選例中,所述多特異性T細胞銜接子為雙/三特異性T細胞銜接子
在另一優選例中,所述多特異性T細胞銜接子為雙特異性T細胞銜接子。
在另一優選例中,所述三特異性T細胞銜接子包含:
第一標靶結構域,所述第一標靶結構域為CD28抗原結合結構域;
第二標靶結構域,所述第二標靶結構域為CD3抗原結合結構域;和
第三標靶結構域,所述第三標靶結構域包含一個或多個MUC17抗原結合結構域。
在另一優選例中,所述第一標靶結構域、第二標靶結構域和第三標靶結構域各包含一個或多個抗體可變區。
在另一優選例中,所述多特異性T細胞銜接子為三特異性T細胞銜接子。
在另一優選例中,所述多特異性T細胞銜接子為同源或異源二聚體。
在另一優選例中,所述三特異性T細胞銜接子為三特異性抗體。
在另一優選例中,所述三特異性抗體的結構對稱或不對稱。
在另一優選例中,所述三特異性抗體為二價、三價、四價或多價分子。
在另一優選例中,所述三特異性抗體為結構不對稱的三價三特異性抗體。
在另一優選例中,所述CD3抗原結合結構域包含第二重鏈可變區和第二輕鏈可變區,其中,所述第二重鏈可變區包含如下三個重鏈可變區CDR:
H-CDR1,其具有如SEQ ID NO: 17所示的胺基酸序列;
H-CDR2,其具有如SEQ ID NO: 18所示的胺基酸序列;和
H-CDR3,其具有如SEQ ID NO: 19所示的胺基酸序列;以及
所述第二輕鏈可變區包含如下三個輕鏈可變區CDR:
L-CDR1,其具有如SEQ ID NO: 20所示的胺基酸序列;
L-CDR2,其具有如SEQ ID NO: 21所示的胺基酸序列;和
L-CDR3,其具有如SEQ ID NO: 22所示的胺基酸序列;或
所述第二重鏈可變區包含如下三個重鏈可變區CDR:
H-CDR1,其具有如SEQ ID NO: 17所示的胺基酸序列;
H-CDR2,其具有如SEQ ID NO: 18所示的胺基酸序列;和
H-CDR3,其具有如SEQ ID NO: 51所示的胺基酸序列;以及
所述第二輕鏈可變區包含如下三個輕鏈可變區CDR:
L-CDR1,其具有如SEQ ID NO: 20所示的胺基酸序列;
L-CDR2,其具有如SEQ ID NO: 21所示的胺基酸序列;和
L-CDR3,其具有如SEQ ID NO: 52所示的胺基酸序列。
在另一優選例中,所述CD3抗原結合結構域包含與如SEQ ID NO:15或23所示的胺基酸序列具有至少80%、90%、95%、96%、97%、98%或99%的序列相同性的第二重鏈可變區,和與如SEQ ID NO: 16或24所示的胺基酸序列具有至少80%、90%、95%、96%、97%、98%或99%的序列相同性的第二輕鏈可變區。
在另一優選例中,所述CD3抗原結合結構域包含與如SEQ ID NO:15所示的第二重鏈可變區,和與如SEQ ID NO: 16所示的第二輕鏈可變區;或如SEQ ID NO: 23所示的第二重鏈可變區,和與如SEQ ID NO: 24所示的第二輕鏈可變區。
在另一優選例中,所述CD28抗原結合結構域包含第一重鏈可變區和第一輕鏈可變區,其中所述第一重鏈可變區包含如下三個重鏈可變區CDR:
H-CDR1,其具有如SEQ ID NO: 30所示的胺基酸序列;
H-CDR2,其具有如SEQ ID NO: 31或53所示的胺基酸序列;和
H-CDR3,其具有如SEQ ID NO: 32所示的胺基酸序列;以及
所述第一輕鏈可變區包含如下三個輕鏈可變區CDR:
L-CDR1,其具有如SEQ ID NO: 33所示的胺基酸序列;
L-CDR2,其具有如SEQ ID NO: 34所示的胺基酸序列;和
L-CDR3,其具有如SEQ ID NO: 35所示的胺基酸序列。
在另一優選例中,所述CD28抗原結合結構域包含與如SEQ ID NO:28或50所示的胺基酸序列具有至少80%、90%、95%、96%、97%、98%或99%的序列相同性的第一重鏈可變區,和與如SEQ ID NO: 29所示的胺基酸序列具有至少80%、90%、95%、96%、97%、98%或99%的序列相同性的第一輕鏈可變區。
在另一優選例中,所述CD28抗原結合結構域包含與如SEQ ID NO: 28或50所示的第一重鏈可變區,和與如SEQ ID NO: 29所示的第一輕鏈可變區。
在另一優選例中,所述三特異性抗體為同源二聚體或異源二聚體。
在另一優選例中,所述第一標靶結構域和第二標靶結構域成異二聚體結構。
在另一優選例中,所述第一標靶結構域包含抗CD28 Fv結構域、Fab結構域或抗CD28 scFv結構域。
在另一優選例中,所述第二標靶結構域包含抗CD3 Fv結構域、Fab結構域或抗CD3 scFv結構域。
在另一優選例中,所述第三標靶結構域包含抗MUC17 Fab結構域。
在另一優選例中,所述三特異性抗體從N端到C端包含如下所示的結構:
(a)第一鏈:VL
1-L1-VH
2-L2-VL
2-L3-VH
1-L4-Fc1;
(b)第二鏈:VH
3-CH1-Fc2;和
(c)第三鏈:VL
3-CL;
或所述三特異性抗體從N端到C端包含如下所示的結構:
(a)第一鏈:VL
1-L1-VH
1-L2-VL
2-L3-VH
2-L4-Fc1;
(b)第二鏈:VH
3-CH1-Fc2;和
(c)第三鏈:VL
3-CL;
其中,
VH1為第一重鏈可變區,VL1為第一輕鏈可變區;
VH2為第二重鏈可變區,VL2為第二輕鏈可變區;
VH3為第三重鏈可變區,VL3為第三輕鏈可變區;
CL為輕鏈恆定區,CH1為CH1結構域;
L1、L2、L3、L4各自獨立地為無、鍵或連接子;
Fc1或Fc2各自獨立地為Fc元件;
“-”代表肽鍵。
在另一優選例中,所述連接子為剛性連接子或柔性連接子。
在另一優選例中,所述L1、L2、L3、L4各自獨立地為無或(GS)n、(G3S)n、(G4S)n(n選自1-6)。
在另一優選例中,所述三特異性抗體與檢查點抑制劑共同施用。
在另一優選例中,所述三特異性抗體與抗PD1和/或抗PDL1拮抗劑共同施用。
在另一優選例中,所述輕鏈恆定區為人Kappa輕鏈恆定區。
在另一優選例中,所述VH
1、VL
1分別為CD28抗原結合結構域包含的第一重鏈可變區、第一輕鏈可變區。
在另一優選例中,所述VH
2、VL
2分別為CD3抗原結合結構域包含的第二重鏈可變區、第二輕鏈可變區。
在另一優選例中,所述VH
3、VL
3分別為MUC17抗原結合結構域包含的第三重鏈可變區、第三輕鏈可變區。
在另一優選例中,所述VH1包含:胺基酸序列分別如SEQ ID NO: 30、SEQ ID NO: 31和SEQ ID NO: 32所示的HCDR1、HCDR2和HCDR3;和所述VL1包含:胺基酸序列分別如SEQ ID NO: 33、SEQ ID NO: 34和SEQ ID NO: 35所示的LCDR1、LCDR2和LCDR3;或
所述VH1包含:胺基酸序列分別如SEQ ID NO: 30、SEQ ID NO: 53和SEQ ID NO: 32所示的HCDR1、HCDR2和HCDR3;和所述VL1包含:胺基酸序列分別如SEQ ID NO: 33、SEQ ID NO: 34和SEQ ID NO: 35所示的LCDR1、LCDR2和LCDR3。
在另一優選例中,所述VH2包含:胺基酸序列分別如SEQ ID NO: 17、SEQ ID NO: 18和SEQ ID NO: 19所示的HCDR1、HCDR2和HCDR3;和所述VL2包含:胺基酸序列分別如SEQ ID NO: 20、SEQ ID NO: 21和SEQ ID NO: 22所示的LCDR1、LCDR2和LCDR3;或
所述VH2包含:胺基酸序列分別如SEQ ID NO: 17、SEQ ID NO: 18和SEQ ID NO: 51所示的HCDR1、HCDR2和HCDR3;和所述VL2包含:胺基酸序列分別如SEQ ID NO: 20、SEQ ID NO: 21和SEQ ID NO: 52所示的LCDR1、LCDR2和LCDR3。
在另一優選例中,所述VH3包含:胺基酸序列分別如SEQ ID NO: 3、SEQ ID NO: 4和SEQ ID NO: 5所示的HCDR1、HCDR2和HCDR3;和所述VL3包含:胺基酸序列分別如SEQ ID NO: 6、SEQ ID NO: 7和SEQ ID NO: 8所示的LCDR1、LCDR2和LCDR3。
在另一優選例中,所述三特異性抗體中,
所述第一鏈的胺基酸序列如SEQ ID NO. 38或42所示。
在另一優選例中,所述三特異性抗體中,
所述第二鏈的胺基酸序列如SEQ ID NO. 40所示;和/或
所述第三鏈的胺基酸序列如SEQ ID NO. 14所示。
在另一優選例中,所述三特異性抗體還包括所述三特異性抗體的活性片段和/或衍生物,所述抗體的衍生物具有與本發明的三特異性抗體至少86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%的序列相同性。
在本發明的第二方面,提供了一種多核苷酸,所述多核苷酸編碼本發明的第一方面所述的多特異性T細胞銜接子。
在本發明的第三方面,提供了一種載體,所述載體含有本發明的第二方面所述的多核苷酸。
在另一優選例中,所述載體包括質體、噬菌體、酵母質體、植物細胞病毒、哺乳動物細胞病毒如腺病毒、反轉錄病毒、或其他載體。
在本發明的第四方面,提供一種宿主細胞,所述宿主細胞含有本發明的第三方面所述的載體或基因組中整合有本發明的第二方面所述的多核苷酸。
在另一優選例中,所述宿主細胞為真核細胞,優選地為哺乳動物細胞。
在本發明的第五方面,提供了一種製備如本發明的第一方面所述的多特異性T細胞銜接子的方法,包括步驟:
(i) 在合適的條件下,培養本發明的第四方面所述的宿主細胞,獲得含有如本發明的第一方面所述的多特異性T細胞銜接子的混合物;
(ii) 對步驟(i)中得到的混合物進行純化和/或分離,從而獲得如本發明的第一方面所述的多特異性T細胞銜接子。
在本發明的第六方面,提供了一種藥物組成物,所述藥物組成物含有:
(I) 如本發明的第一方面所述的多特異性T細胞銜接子;和
(II) 藥學上可接受的載劑。
在另一優選例中,所述藥物組成物還包括其他的藥學活性試劑。
在另一優選例中,所述其他的藥學活性試劑包括一種或多種檢查點調節劑或化療劑。
在另一優選例中,所述檢查點調節劑包括但不限於抗PD1和/或抗PDL1拮抗劑。
在另一優選例中,所述藥物組成物為注射劑型。
在本發明的第七方面,提供了一種免疫偶聯物,所述免疫偶聯物包括:
(a) 如本發明的第一方面所述的多特異性T細胞銜接子;和
(b) 選自下組的偶聯部分:可檢測標記物、藥物、毒素、細胞激素、放射性核種、酵素、或其組合。
在另一優選例中,所述偶聯物部分選自:螢光或發光標記物、放射性標記物、MRI (核磁共振成像)或CT (電腦X射線斷層掃描技術)造影劑、或能夠產生可檢測產物的酵素、放射性核種、生物毒素、細胞激素(如IL-2等)、抗體、抗體Fc片段、抗體scFv片段、金奈米顆粒/奈米棒、病毒顆粒、脂質體、奈米磁粒。
在本發明的第八方面,提供了如本發明的第一方面所述多特異性T細胞銜接子、如本發明的第六方面所述的藥物組成物或如本發明的第七方面所述的免疫偶聯物的用途,用於製備(a)檢測試劑或套組;和/或(b)製備預防和/或治療癌症/腫瘤的藥物。
在另一優選例中,所述癌症/腫瘤為MUC17相關的癌症/腫瘤。
在另一優選例中,所述癌症/腫瘤包括固態腫瘤和血液腫瘤。
在另一優選例中,所述癌症/腫瘤為固態腫瘤。
在另一優選例中,所述癌症/腫瘤選自下組:胃癌、胃腸癌、結直腸癌、食道癌、胃食道癌、胰腺癌、肺癌、乳腺癌、肝癌、子宮頸癌、甲狀腺癌、子宮體癌、前列腺癌或其組合。
在本發明的第九方面,提供了一種套組,所述套組包括如本發明的第一方面所述的多特異性T細胞銜接子、如本發明的第二方面所述的多核苷酸、如本發明的第三方面所述的載體、如本發明的第四方面所述的宿主細胞、如本發明的第六方面所述的藥物組成物或如本發明的第七方面所述的免疫偶聯物。
在本發明的第十方面,提供了如本發明的第一方面所述的多特異性T細胞銜接子、如本發明的第二方面所述的多核苷酸、如本發明的第三方面所述的載體、如本發明的第四方面所述的宿主細胞、如本發明的第六方面所述的藥物組成物或如本發明的第七方面所述的免疫偶聯物在製備預防、治療和/或檢測癌症/腫瘤的藥物中的用途。
在本發明的第十一方面,提供了一種預防、治療和/或檢測癌症/腫瘤的方法,向有需要的受試者施用安全有效量的如本發明的第一方面所述的多特異性T細胞銜接子、其藥物組成物或其免疫偶聯物。
應理解,在本發明範圍內中,本發明的上述各技術特徵和在下文(如實施例)中具體描述的各技術特徵之間都可以互相組合,從而構成新的或優選的技術方案。限於篇幅,在此不再一一累述。
本發明人經過廣泛而深入地研究,首次意外地開發了一種抗MUC17的多特異性T細胞銜接子。本發明的多特異性T細胞銜接子優選地包含經人源化改造的MUC17、CD3和CD28標靶結構域。本發明的多特異性T細胞銜接子除了能結合CD3外還能標靶CD28,能夠為T細胞提供共刺激信號,從而激發更強更有效的毒殺活性,能夠有效克服固態腫瘤對T細胞銜接子的耐藥性。在此基礎上完成了本發明。
術語
除非另有定義,否則本文中所用的全部技術術語和科學術語均具有如本發明所屬領域普通技術人員通常理解的相同含義。
術語“約”可以是指在本領域普通技術人員確定的特定值或組成的可接受誤差範圍內的值或組成,其將部分地取決於如何測量或測定值或組成。
如本文所用,術語“含有”或“包括(包含)”可以是開放式、半封閉式和封閉式的。換言之,所述術語也包括“基本上由…構成”、或“由…構成”。
MUC17
MUC17是一種分子量較大的O-醣基化黏蛋白(Mucins),與其它幾種黏蛋白(MUC1、3、12、13和16)同屬於SEA (Sea urchin sperm protein, Enterokinase, and Agrin)家族的跨膜黏蛋白。跨膜黏蛋白在維持粘膜屏障功能方面起著重要作用,它們可以防止病原體侵入粘膜表面,還與發炎性腸病的發展有關。透過對HPA (Human Protein Atlas,基因組學資料庫)數據的分析,申請人發現MUC17的RNA主要表現於結直腸和胃相關器官(小腸、十二指腸、直腸、結腸和胃)。臨床癌症研究數據表明,MUC17在多種消化道腫瘤(包括胃癌和結直腸癌)中高度表現,這使MUC17成為潛在的消化道腫瘤相關標的。
T 細胞銜接子 (T-cell Engagers)
雙特異性T細胞銜接子(Bispecific T-cell Engagers,BiTEs)是一種雙特異型抗體,它由兩類抗體的片段融合而成,分別可以結合T細胞表面的CD3分子以及腫瘤細胞表面抗原分子,從而誘導T細胞對腫瘤細胞的毒殺,此過程不受MHC限制。
2022年2月,賽諾菲的研發團隊在《Nature》發表了一篇關於標靶HER2×CD3×CD28的三特異性T細胞銜接子(Trispecific T-cell engagers, TriTEs)(採用CODV-IgG結構)的研究進展(參考文獻:Seung E, Xing Z, Wu L, et al. A trispecific antibody targeting HER2 and T cells inhibits breast cancer growth via CD4 cells[J]. Nature, 2022, 603(7900): 328-334.)。該研究表明,該TriTEs能比BiTEs更加有效地刺激IL-2分泌並活化NF-κB訊息途徑,並具有更強烈的毒殺活性。在用原代人CD3陽性T細胞重建的免疫缺陷NSG小鼠體內,該TriTEs使CD8陽性T細胞中顆粒酶的表現增加了6.8倍,劑量低至10 μg/kg時,HER2×CD3×CD28依然能夠誘導腫瘤消退。該論文中標靶HER2×CD3×CD28的TriTEs已經處於臨床1期開發階段,具有治療HER2陽性固態腫瘤的潛力。
抗體
通常,“抗體”也稱為“免疫球蛋白“其可以是天然或常規的抗體,其中兩條重鏈透過二硫鍵彼此連接且每條重鏈與輕鏈透過二硫鍵連接。存在兩種類型的輕鏈,λ(l)和κ(k)。存在五種主要的重鏈種類(或同型),其決定抗體分子的功能活性:IgM、IgD、IgG、IgA和IgE。每種鏈包含不同的序列結構域。輕鏈包括兩個結構域或區,可變結構域(VL)和恆定結構域(CL)。重鏈包括四個結構域,重鏈可變區(VH)和三個恆定區(CH1、CH2和CH3,統稱為CH)。輕鏈(VL)和重鏈(VH)的可變區都決定對抗原的結合辨識和特異性。輕鏈的恆定結構域(CL)和重鏈的恆定區(CH)賦予重要的生物性質如抗體鏈結合、分泌、經胎盤的移動性、補體結合和與Fc受體(FcR)的結合。Fv片段是免疫球蛋白Fab片段的N-末端部分且由一條輕鏈和一條重鏈的可變部分組成。抗體的特異性取決於抗體結合位和抗原決定區間的結構互補。抗體結合位由主要來自高度可變區或互補決定區(CDR)的殘基組成。偶爾,來自非高度可變或框架區(FR)的殘基影響整體結構域結構且進而影響結合位。互補決定區或CDR指共同限定結合親和力和天然免疫球蛋白結合位天然Fv區的特異性的胺基酸序列。免疫球蛋白的輕鏈和重鏈各具有三個CDR,分另稱為CDR1-L、CDR2-L、CDR3-L和CDR1-H、CDR2-H、CDR3-H。常規抗體抗原結合位因此包括六個CDR,包含來自每個重鏈和輕鏈v區的CDR集合。
在一個給定的抗體的輕鏈可變區或重鏈可變區胺基酸序列中,各CDR的精確胺基酸序列邊界可以使用許多公知的抗體CDR指派系統的任一種或其組合確定,所述指派系統包括例如:Chothia,Kabat,AbM,Contact,國際Immuno GeneTics database (IMGT),EU編號系統等。
應理解,本發明中的CDR的精確胺基酸序列邊界可以任選地利用上述提及的不同指派系統定義。優選地,除非另有說明,否則在本發明中,當提及抗體可變區中的殘基位置(包括重鏈可變區殘基和輕鏈可變區殘基)時,是指根據Kabat編號系統的編號位置。
如本文所用,術語“可變”表示抗體中可變區的某些部分在序列上有所不同,它形成了各種特定抗體對其特定抗原的結合和特異性。然而,可變性並不均勻地分佈在整個抗體可變區中。它集中於輕鏈和重鏈可變區中稱為互補決定區(CDR)或超變區中的三個片段中。可變區中較保守的部分稱為框架區(FR)。天然重鏈和輕鏈的可變區中各自包含四個FR區,它們大致上呈β-折疊構型,由形成連接環的三個CDR相連,在某些情況下可形成部分β-折疊結構。每條鏈中的CDR透過FR區緊密地靠在一起並與另一鏈的CDR一起形成了抗體的抗原結合部位(參見Kabat等, NIH Publ. No. 91-3242, 卷I,647-669頁(1991))。恆定區不直接參與抗體與抗原的結合,但是它們表現出不同的效應功能,例如參與抗體的依賴於抗體的細胞毒性。
如本文所用,術語“框架區”(FR)指插入CDR間的胺基酸序列,即指在單一物種中不同的免疫球蛋白間相對保守的免疫球蛋白的輕鏈和重鏈可變區的那些部分。免疫球蛋白的輕鏈和重鏈各具有四個FR,分別稱為FR1-L、FR2-L、FR3-L、FR4-L和FR1-H、FR2-H、FR3-H、FR4-H。相應地,輕鏈可變結構域可因此稱作(FR1-L)-(CDR1-L)-(FR2-L)-(CDR2-L)-(FR3-L)-(CDR3-L)-(FR4- L)且重鏈可變結構域可因此表示為(FR1-H)-(CDR1-H)-(FR2-H)-(CDR2-H)-(FR3-H)-(CDR3-H)-(FR4-H)。優選地,本發明的FR是人抗體FR或其衍生物,所述人抗體FR的衍生物與天然存在的人抗體FR基本相同,即序列相同性達到85%、90%、95%、96%、97%、98%或99%。
獲知CDR的胺基酸序列,本領域的技術人員可輕易確定框架區FR1-L、FR2-L、FR3-L、FR4-L和/或FR1-H、FR2-H、FR3-H、FR4-H。
如本文所用,術語“人框架區”是與天然存在的人抗體的框架區基本相同的(約85%或更多,具體地90%、95%、97%、99%或100%)框架區。
如本文所用,術語“片段”、“衍生物”和“類似物”是指基本上保持本發明抗體相同的生物學功能或活性的多肽。本發明的多肽片段、衍生物或類似物可以是(i)有一個或多個保守或非保守性胺基酸殘基(優選保守性胺基酸殘基)被取代的多肽,而這樣的取代的胺基酸殘基可以是也可以不是由遺傳密碼編碼的,或(ii)在一個或多個胺基酸殘基中具有取代基團的多肽,或(iii)成熟多肽與另一個化合物(比如延長多肽半衰期的化合物,例如聚乙二醇)融合所形成的多肽,或(iv)附加的胺基酸序列融合到此多肽序列而形成的多肽(如前導序列或分泌序列或用來純化此多肽的序列或蛋白原序列,或與6His標籤形成的融合蛋白)。根據本文的教導,這些片段、衍生物和類似物屬於本領域熟練技術人員公知的範圍。
如本文所用,術語“抗體片段”、“抗原結合片段”、“標靶結構域”或“抗原結合結構域”用於指抗體的一部分,例如F(ab')2,F(ab)2,Fab',Fab,Fv,單鏈Fvs(scFv),單鏈抗體,二硫鍵連接的Fvs(sdFv),包含VL或VH結構域的片段,Fab表現序列庫產生的片段以及抗個體遺傳型(anti-Id)抗體。不論結構如何,抗體片段都與完整抗體所辨識的相同抗原結合。本發明的標靶結構域的實例包括例如但不限於Fab、Fab'、F(ab')
2、Fv片段、單鏈Fv(scFv)片段和單結構域片段。
“Fv”片段是含有完整標的辨識和結合位的抗體的最小片段。該區域由以緊密的非共價結合的一個重鏈和一個輕鏈可變結構域的二聚體(VH-VL二聚體)組成。在該構型中,每個可變結構域的三個CDR相互作用,以限定在VH-VL二聚體的表面上的標的結合位。通常,六個CDR對抗體賦予標的結合特異性。然而,在一些情況下,甚至單個可變結構域(或僅包含對於標的特異性的三個CDR的Fv的一半)可以具有辨識且結合標的的能力,儘管其親和力低於整個結合位。
“單鏈Fv”或“scFv”抗體結合片段包含抗體的VH和VL結構域,其中這些結構域存在於單條多肽鏈中。一般地,Fv多肽進一步包含在VH和VL結構域之間的多肽連接子,其致使scFv能夠形成有利於標的結合的結構。
“單結構域片段”由對冠狀病毒RBD顯示出足夠親和力的單個VH或VL結構域組成。在一個具體實施方案中,單結構域片段是駱駝化的。
如本文所用,術語“輕鏈恆定區(CL)”包括衍生自抗體輕鏈的胺基酸序列CL。優選地,輕鏈恆定區包括恆定κ結構域或恆定λ結構域中的至少一個。
如本文所用,術語“重鏈恆定區(CH)”包括源自免疫球蛋白重鏈的胺基酸序列。包含重鏈恆定區的多肽包含以下至少之一:CH1結構域,樞紐區(例如,上部,中間和/或下部樞紐區)結構域,CH2結構域,CH3結構域或其變體或片段。應當理解,可以修飾重鏈恆定區,使得它們的胺基酸序列與天然存在的免疫球蛋白分子不同。
如本文所用,術語“抗原”或“標的抗原”指能夠由抗體或抗體樣結合蛋白所結合的分子或分子的部分。該術語進一步指能夠用於動物以產生能夠與該抗原的表位結合的抗體的分子或分子的部分。標的抗原可具有一個或多個表位。對於每種由抗體或由抗體樣結合蛋白辨識的標的抗原,抗體樣結合蛋白能夠與辨識標的抗原的完整抗體競爭。
如本文所用,術語“連接子”是指插入免疫球蛋白結構域中為輕鏈和重鏈的結構域提供足夠的可動性以折疊成交換雙重可變區免疫球蛋白的一個或多個胺基酸殘基。合適的連接子實例包括單甘胺酸(Gly)、或絲胺酸(Ser)殘基,連接子中胺基酸殘基的標識和序列可隨著連接子中需要實現的次級結構要素的類型而變化。優選的連接子可以為(GS)n、(G3S)n、(G4S)n(n選自1-6)。
如本文所用,抗體、抗體片段或抗體結構域的“變體”是指如下,抗體、抗體片段或抗體結構域:(1)與原始抗體、抗體片段或抗體結構域具有至少80%,85%,90%,95%,96%,97%,98%或99%的序列相同性,和(2)特異性結合至與原始抗體,抗體片段或抗體結構域特異性結合的相同標的。應當理解,在以“至少x%相同”或“至少x%相同性”的形式表示序列相同性的情況下,這樣的實施方案包括等於或高於下限的任何和所有數值百分比。此外,應當理解,在本申請中存在胺基酸序列的情況下,應將其解釋為另外揭示或包含與該胺基酸序列具有至少80%,至少85%,至少90%,至少95%,至少96%,至少97%,至少98%或至少99%的相同性。
本發明的 T 細胞銜接子
如本文所用,術語“多特異性T細胞銜接子”是指包含至少兩個具有不同結合特異性的標靶結構域的分子,其中至少一個標靶結構域特異性結合T細胞表面抗原。在一些實施方式中,多特異性抑制劑是包含支架和標靶不同抗原或表位的兩個或更多個免疫球蛋白抗原結合結構域的多肽。在某些實施方式中,多特異性T細胞銜接子是雙特異性抗體或三特異性抗體。
如本文所用,術語“雙特異性抗體”和“雙特異性T細胞銜接子”在本文中可互換使用,涉及可以特異性結合兩種不同抗原(或表位)的抗體。
如本文所用,術語“本發明的三特異性抗體”、“本發明的三特異性T細胞銜接子”、“3Sbody”在本文中可以互換使用,涉及包含具有三個不同結合特異性的三個標靶結構域的分子。每個標靶結構域都能夠與標的分子特異性結合,並在與標的分子結合時抑制標的分子的生物學功能。在一些實施方式中,三特異性拮抗劑是具有兩個或更多個肽的聚合物分子。在一些實施方案中,標靶結構域包含抗體的抗原結合結構域或CDR。在一些實施方式中,標靶結構域包含與標的蛋白特異性結合的配體或其片段。
應理解,本發明的三特異性T細胞銜接子本質上是三特異性抗體,是能同時特異性結合三種抗原的抗體分子。根據對稱性,三特異性抗體可以分為結構對稱的和不對稱的分子。根據結合位的多少,雙特異性抗體可以分為二價、三價、四價和多價分子。本發明的兩種三特異性抗體為結構不對稱的三價三特異性抗體,針對每個特定標的,該三特異性抗體都是單價的。
如本文所用,術語“Fc片段”或“Fc”是指抗體的不具有抗原結合活性但是最初被觀察到容易結晶的部分,並因此將其命名為Fc片段(針對片段可結晶性)。這種片段對應於成對的CH2和CH3結構域,並且是抗體分子的與效應分子和細胞相互作用的部分。本文所述的Fc片段可以衍生自IgG1、IgG2和IgG4抗體。對於特定用途,可以優選特定的IgG亞型。此外,可以透過將一個或多個突變引入Fc來增加或減少抗體的效應子功能。較佳地,Fc段可以含有L234A/L235A/G237A突變以削弱Fc與Fcγ受體之間的相互作用。
進一步地,可以引入突變以形成杵臼結構(Knob-Into-Hole,KIH)。其主要功能是促使雙特異性抗體的兩條不同重鏈異二聚化。其結構特點為:組成雙特異性抗體的兩條不同重鏈,其中一條重鏈的CH3區發生突變形成一個突起的“杵”的結構,另一條重鏈的CH3區發生突變形成一個凹陷的“臼”的結構,杵臼結構設計有利於兩種異源抗體重鏈的正確裝配。具體地,將第一條重鏈CH3結構域的366位的T突變成側鏈體積更大的W,形成一個突起的“杵”的結構;同時將第二條重鏈CH3結構域的366位的T突變成S、368位的L突變成A、407位的Y突變成V,這三種突變均使得側鏈體積更小,從而形成一個凹陷的“臼”的結構。進一步地,將第一條重鏈354位的S突變成C,將第二條重鏈349位的Y突變C,如此可使第一重鏈和第二重鏈在形成杵臼結構後再增加一個共價的二硫鍵,這能夠進一步地穩定形成的杵臼結構。
具體地,對於杵-臼形式,除了可以在第一個Fc中引入T366W突變產生“杵”,在第二個Fc引入T366S、L368A和Y407V突變產生“臼”外。對於電荷對形式,透過在相反的Fc結構域中引入連接電荷殘基來穩定離子相互作用,從而有利於異二聚化。例如,第一Fc結構域中的D356K、E357K和D399K,以及第二Fc結構域中的K370E、K409D和K439E突變,或其組合(根據Kabat EU編號系統對殘基進行編號)。此外,半胱胺酸可被引入以穩定異二聚體的配對,例如第一Fc中的S234C和第二Fc中的Y349C,或者第一Fc中的Y349C和第二Fc中的S344C。將“臼”鏈435位的H突變成R、436位的Y突變成F,這樣可以消除“臼”鏈對Protein A的結合作用,以便在純化步驟將“臼”鏈的同源二聚體去除。
本發明的多特異性分子可以包括選自下組的各種結構:不對稱IgG樣抗體(例如,三功能單株抗體/四價體瘤(triomab/quadroma));鈕孔式抗體(knobs-into-holes antibodies);交叉單株抗體(Cross MAb);靜電匹配抗體;LUZ-Y;鏈交換工程化結構域(SEED)體;Fab交換抗體;對稱IgG類抗體;二合一抗體;交聯的單株抗體,mAb2;Cov X-body;雙可變區結構域(DVD)-Ig融合蛋白;IgG樣雙特異性抗體;Ts2Ab;BsAb;scFv/Fc融合;雙(scFv)2-Fabs;F(ab)2融合蛋白;雙作用或Bis-Fab;Dock-and-Lock (DNL);Fab-Fv;scFv抗體和雙抗體(例如雙特異性T細胞銜接子(BiTEs));串聯雙抗體(Tandab);DARTs;單鏈雙抗體;TCR樣抗體;人類血清白蛋白scFv融合蛋白,COMBODIES和IgG/non-IgG融合蛋白。
編碼核酸和表現載體
本發明還提供了編碼上述抗體或其片段的多核苷酸分子。本發明的多核苷酸可以是DNA形式或RNA形式。DNA形式包括cDNA、基因組DNA或人工合成的DNA。DNA可以是單鏈的或是雙鏈的。DNA可以是編碼鏈或非編碼鏈。編碼成熟多肽的編碼區序列可以與本發明抗體的編碼區序列相同或者是簡併的變異體。如本文所用,“簡併的變異體”在本發明中是指編碼具有與本發明的多肽相同的胺基酸序列,但其編碼區序列有差別的核酸序列。
編碼本發明的成熟多肽的多核苷酸包括:只編碼成熟多肽的編碼序列;成熟多肽的編碼序列和各種附加編碼序列;成熟多肽的編碼序列(和任選的附加編碼序列)以及非編碼序列。
術語“編碼多肽的多核苷酸”可以是包括編碼此多肽的多核苷酸,也可以是還包括附加編碼和/或非編碼序列的多核苷酸。
本發明還涉及與上述的序列雜交且兩個序列之間具有至少50%,較佳地至少70%,更佳地至少80%相同性的多核苷酸。本發明特別涉及在嚴格條件下與本發明所述多核苷酸可雜交的多核苷酸。在本發明中,“嚴格條件”是指:(1)在較低離子強度和較高溫度下的雜交和洗提,如0.2×SSC,0.1%SDS,60℃;或(2)雜交時加有變性劑,如50%(v/v)甲醯胺,0.1%小牛血清/0.1% Ficoll,42℃等;或(3)僅在兩條序列之間的相同性至少在90%以上,更好是95%以上時才發生雜交。並且,可雜交的多核苷酸編碼的多肽與SEQ ID NO.4、SEQ ID NO.9所示的成熟多肽有相同的生物學功能和活性。
本發明的抗體的核苷酸全長序列或其片段通常可以用PCR擴增法、重組法或人工合成的方法獲得。一種可行的方法是用人工合成的方法來合成有關序列,尤其是片段長度較短時。通常,透過先合成多個小片段,然後再進行連接可獲得序列很長的片段。此外,還可將重鏈的編碼序列和表現標籤(如6His)融合在一起,形成融合蛋白。
一旦獲得了有關的序列,就可以用重組法來大批量地獲得有關序列。這通常是將其選殖入載體,再轉入細胞,然後透過常規方法從增殖後的宿主細胞中分離得到有關序列。本發明所涉及的生物分子(核酸、蛋白等)包括以分離的形式存在的生物分子。
目前,已經可以完全透過化學合成來得到編碼本發明蛋白(或其片段,或其衍生物)的DNA序列。然後可將該DNA序列引入本領域中已知的各種現有的DNA分子(或如載體)和細胞中。此外,還可透過化學合成將突變引入本發明蛋白序列中。
本發明還涉及包含上述的適當DNA序列以及適當啟動子或者控制序列的載體。這些載體可以用於轉形適當的宿主細胞,以使其能夠表現蛋白質。
宿主細胞可以是原核細胞,如細菌細胞;或是低等真核細胞,如酵母細胞;或是高等真核細胞,如哺乳動物細胞。代表性例子有:大腸桿菌,鏈黴菌屬;鼠傷寒沙門氏菌的細菌細胞;真菌細胞如酵母;果蠅S2或Sf9的昆蟲細胞;CHO、COS7、293細胞的動物細胞等。
用重組DNA轉形宿主細胞可用本領域技術人員熟知的常規技術進行。當宿主為原核生物如大腸桿菌時,能吸收DNA的勝任細胞可在指數生長期後收穫,用CaCl
2法處理,所用的步驟在本領域眾所周知。另一種方法是使用MgCl
2。如果需要,轉形也可用電穿孔的方法進行。當宿主是真核生物,可選用如下的DNA轉染方法:磷酸鈣共沉澱法,常規機械方法如顯微注射、電穿孔、脂質體包裝等。
獲得的轉形株可以用常規方法培養,表現本發明的基因所編碼的多肽。根據所用的宿主細胞,培養中所用的培養基可選自各種常規培養基。在適於宿主細胞生長的條件下進行培養。當宿主細胞生長到適當的細胞密度後,用合適的方法(如溫度轉換或化學誘導)誘導選擇的啟動子,將細胞再培養一段時間。
在上面的方法中的重組多肽可在細胞內、或在細胞膜上表現、或分泌到細胞外。如果需要,可利用其物理的、化學的和其它特性透過各種分離方法分離和純化重組的蛋白。這些方法是本領域技術人員所熟知的。這些方法的例子包括但並不限於:常規的復性處理、用蛋白沉澱劑處理(鹽析方法)、離心、滲透破菌、超處理、超高速離心、分子篩層析(凝膠過濾)、吸附層析、離子交換層析、高效液相層析(HPLC)和其它各種液相層析技術及這些方法的結合。
本發明的抗體可以單獨使用,也可與可檢測標記物(為診斷目的)、治療劑、PK (蛋白激酶)修飾部分或任何以上這些物質的組合結合或偶聯。
用於診斷目的的可檢測標記物包括但不限於:螢光或發光標記物、放射性標記物、MRI (核磁共振成像)或CT (電腦X射線斷層掃描技術)造影劑、或能夠產生可檢測產物的酵素。
可偶聯的治療劑包括但不限於:胰島素、IL-2、干擾素、降鈣素、GHRH肽、腸肽類似物、白蛋白、抗體片段、細胞激素、和激素。
組成物
本發明還提供了一種組成物。在優選例中,所述的組成物是藥物組成物,它含有上述的抗體或其活性片段或其融合蛋白,以及藥學上可接受的載劑。通常,可將這些物質配製於無毒的、惰性的和藥學上可接受的水性載劑介質中,其中pH通常約為5-8,較佳地pH約為6-8,儘管pH值可隨被配製物質的性質以及待治療的病症而有所變化。配製好的藥物組成物可以透過常規途徑進行給藥,其中包括(但並不限於):口服、呼吸道、瘤內、腹膜內、靜脈內、或局部給藥。
本發明的藥物組成物可用於治療癌症/腫瘤,尤其是固態腫瘤,特別是MUC17高度表現的固態腫瘤。
本發明的藥物組成物含有安全有效量(如0.001-99 wt%,較佳地0.01-90 wt%,更佳地0.1-80 wt%)的本發明上述的單株抗體(或其偶聯物)以及藥學上可接受的載劑或賦形劑。這類載劑包括(但並不限於):鹽水、緩衝液、葡萄糖、水、甘油、乙醇、及其組合。藥物製劑應與給藥方式相匹配。本發明的藥物組成物可以被製成針劑形式,例如用生理鹽水或含有葡萄糖和其他佐劑的水溶液透過常規方法進行製備。藥物組成物如針劑、溶液宜在無菌條件下製造。活性成分的給藥量是治療有效量,例如每天約1微克/千克體重-約10毫克/千克體重。此外,本發明的藥物組成物還可與其他治療劑一起使用。
使用藥物組成物時,是將安全有效量的免疫偶聯物施用於哺乳動物,其中該安全有效量通常至少約10微克/千克體重,而且在大多數情況下不超過約8毫克/千克體重,較佳地該劑量是約10微克/千克體重-約1毫克/千克體重。當然,具體劑量還應考慮給藥途徑、病人健康狀況等因素,這些都是熟練醫師技能範圍之內的。
應用
本發明涉及預防、治療和/或檢測癌症/腫瘤或自身免疫性疾病的方法。該方法包括向有需要的受試者施用有效量的本發明的多特異性T細胞銜接子或三特異性抗體。另一方面,預防、治療和/或檢測癌症/腫瘤的方法包括向有需要的受試者施用有效量的一種或多種表現本發明的三特異性抗體的表現載體。在另一優選例中,所述癌症/腫瘤為MUC17相關的癌症/腫瘤,特徵在於表現MUC17的細胞的數量/比例/活性增加的疾病/病症,與在沒有疾病/病症的情況下表現MUC17的細胞的數量/比例/活性相比。所述癌症/腫瘤包括固態腫瘤和血液腫瘤。優選地選自下組:胃癌、胃腸癌、結直腸癌、食道癌、胃食道癌、胰腺癌、肺癌、乳腺癌、肝癌、子宮頸癌、甲狀腺癌、子宮體癌、前列腺癌或其組合。
本發明的主要優點包括(1) 本發明的三特異性抗體能夠同時標靶腫瘤特異性抗原MUC17、T細胞表現的CD3和共刺激分子CD28,對標的細胞能激發更強更有效的毒殺活性;並有良好的體外安全性。
(2) 本發明的三特異性抗體具有高純度和良好的理化性質,避免抗體分子在生產和存儲抗體的過程中容易出現的聚集體、降解片段和不完整組裝等問題,有利於工業化生產。
下面結合具體實施例,進一步陳述本發明。應理解,這些實施例僅用於說明本發明而不用於限制本發明的範圍。下列實施例中未註明詳細條件的實驗方法,通常按照常規條件如Sambrook等人,分子選殖:實驗室手冊(New York:Cold Spring Harbor Laboratory Press, 1989)中所述的條件,或按照製造廠商所建議的條件。除非另外說明,否則百分比和份數按重量計算。
實施例 1. 抗 MUC17 單株抗體的來源和序列
根據CN202111500224.5中所述,抗MUC17鼠源單株抗體44H4的重鏈可變區胺基酸序列如下所示(SEQ ID NO:1):
EVQLQQSGAELVKPGASVKLSFTASGFNIKDTYIHWVKQRPEQGLEWIGRIDPANGYTKYGPRFQGKATITADTASNAAYLQLSSLTSEDTAVYYCARNYGTSYPNAMDYWGQGTSVTVSS
抗MUC17鼠源單株抗體44H4的輕鏈可變區胺基酸序列如下(SEQ ID NO:2):
DIVLTQSPASLAVSLGQRATISCRASESVETYGNSFMHWYQQKPGQPPKLLIYRASSLESGIPARFSGSGSRTDFTLTITPVEADDVATYFCQQSNEDPYTFGGGTKLEIK
對鼠源單抗44H4的重鏈可變區和輕鏈可變區胺基酸序列進行分析,依據Kabat編碼規則分別確定其重鏈和輕鏈可變區的互補決定區(complementarity determining region,CDR)和框架區。44H4重鏈可變區CDR胺基酸序列分別為
H-CDR1:DTYIH (SEQ ID NO:3)、H-CDR2:RIDPANGYTKYGPRFQG (SEQ ID NO:4)和H-CDR3:NYGTSYPNAMDY (SEQ ID NO:5),
輕鏈可變區CDR的胺基酸序列分別為L-CDR1:RASESVETYGNSFMH (SEQ ID NO:6)、L-CDR2:RASSLES (SEQ ID NO:7)和L-CDR3:QQSNEDPYT (SEQ ID NO:8)。
鼠源44H4的人源化過程描述如下。將鼠源單抗44H4的重鏈可變區與人抗體重鏈可變區胚系序列進行同源性比較,選擇IGHV1-46*01為人源化的模板,將鼠源44H4的3個重鏈CDR移植入IGHV1-46*01,分別替換IGHV1-46*01對應位置的CDR,並在H-CDR3之後加入第四個框架區,獲得CDR移植重鏈可變區胺基酸序列。同樣地,將鼠源44H4的輕鏈可變區與人抗體輕鏈可變區胚系序列進行同源性比較,選擇IGKV7-3*01為人源化的模板,將鼠源44H4的3個輕鏈CDR移植入IGKV7-3*01的框架區,分別替換IGKV7-3*01對應位置的CDR,並在L-CDR3之後加入第四個框架區,獲得CDR移植輕鏈可變區胺基酸序列。在CDR移植可變區的基礎上,對框架區的一些位點進行回復突變(回復突變就是將人源框架區的某些胺基酸殘基突變成鼠源框架區同一位置的胺基酸殘基,回復突變的位點一般對維持抗體的結構和/或親和力是至關重要的)。在進行回復突變時,將胺基酸序列進行Kabat編碼,位點的位置由Kabat碼指示。
優選的,對於CDR移植後的重鏈可變區,將第27位的Y回復突變為鼠源的F,將第28位的T突變為N,將第29位的F突變為I,將第30位的T突變為K,將第69位的M突變為I,第71位的R突變為A。對於CDR移植後的輕鏈可變區,將第81位的N突變為D,以消除輕鏈的N醣基化位點。上述帶有突變的重鏈和輕鏈可變區分別定義為44H4人源化重鏈可變區(SEQ ID NO:9)和輕鏈可變區(SEQ ID NO:10)。
由上海生工生物工程有限公司合成編碼上述人源化重鏈和輕鏈可變區的DNA。用基因工程的方法將合成的人源化重鏈可變區與人IgG1重鏈恆定區(SEQ ID NO:11)相連,獲得全長的人源化重鏈,命名為44H4-Hu-HC (SEQ ID NO:12);將人源化輕鏈可變區與人Kappa輕鏈恆定區(SEQ ID NO:13)相連,獲得全長的人源化輕鏈,命名為44H4-Hu-LC (SEQ ID NO:14)。
將44H4-Hu-HC和44H4-Hu-LC的編碼基因分別選殖到pcDNA3.4表現載體中,利用PEI將重鏈和輕鏈的表現載體共同轉染到HEK293F細胞中以表現抗體。5天後收取FreeStyle™ 293-F細胞培養上清液,利用Protein A親和層析法純化抗體,所得抗體命名為44H4-Hu-IgG1。
實施例 2. 抗 CD3 單株抗體的來源和序列
鼠源抗人CD3單株抗體(簡稱SP34)的重鏈和輕鏈可變區胺基酸序列分別來自於US8236308B2中的SEQ ID NO:2和4,分別對應本發明中的序列SEQ ID NO:15和16。
SP34重鏈可變區胺基酸序列(SEQ ID NO:15):
EVKLLESGGGLVQPKGSLKLSCAASGFTFNTYAMNWVRQAPGKGLEWVARIRSKYNNYATYYADSVKDRFTISRDDSQSILYLQMNNLKTEDTAMYYCVRHGNFGNSYVSWFAYWGQGTLVTVSA
SP34輕鏈可變區胺基酸序列(SEQ ID NO:16)
QAVVTQESALTTSPGETVTLTCRSSTGAVTTSNYANWVQEKPDHLFTGLIGGTNKRAPGVPARFSGSLIGDKAALTITGAQTEDEAIYFCALWYSNLWVFGGGTKLTVL
對SP34的重鏈和輕鏈可變區胺基酸序列進行分析,依據Kabat規則分別確定SP34重鏈和輕鏈的互補決定區(CDR)和框架區。
SP34重鏈3個CDR的胺基酸序列分別為H-CDR1:TYAMN (SEQ ID NO:17)、H-CDR2:RIRSKYNNYATYYADSVKD (SEQ ID NO:18)和H-CDR3:HGNFGNSYVSWFAY (SEQ ID NO:19),
輕鏈3個CDR的胺基酸序列分別為L-CDR1:RSSTGAVTTSNYAN (SEQ ID NO:20)、L-CDR2:GTNKRAP (SEQ ID NO:21)和L-CDR3:ALWYSNLWV (SEQ ID NO:22)。
鼠源SP34的人源化過程描述如下。將鼠源單抗SP34的重鏈可變區與人抗體重鏈可變區胚系序列進行同源性比較,選擇IGHV3-23*04為人源化的模板,將鼠源SP34的3個重鏈CDR移植入IGHV3-23*04,分別替換IGHV3-23*04對應位置的CDR,並在H-CDR3之後加入第四個框架區,獲得CDR移植重鏈可變區胺基酸序列。同樣地,將SP34的輕鏈可變區與人抗體重鏈可變區胚系序列進行同源性比較,選擇IGLV7-46*01為輕鏈CDR移植模板,將鼠源SP34的3個輕鏈CDR移植入IGLV7-46*01,分別替換IGLV7-46*01對應位置的CDR,並在L-CDR3之後加入第四個框架區,獲得CDR移植輕鏈可變區胺基酸序列。在CDR移植可變區的基礎上,對框架區的一些位點進行回復突變。在進行回復突變時,將胺基酸序列進行Kabat編碼,位點的位置由Kabat碼指示。
優選的,對於CDR移植重鏈可變區,將第73位的N回復突變為D,將第94位的K突變為R。對於CDR移植輕鏈可變區,將第36位的F突變為V,第46位的T突變為G,第49位的Y突變為G,第57位的W突變為G,第58位的T突變為V。此外,將CDR移植重鏈可變區第2位的A突變為T,第96位的G (位於H-CDR3)突變為D。此外,對於CDR移植輕鏈可變區,將第24位的R突變為G,第33位的A突變為P,第94位的N (位於L-CDR3)突變為D。上述改造可以進一步提高SP34人源化抗體的親和力和穩定性等性能。上述帶有突變的重鏈和輕鏈可變區分別定義為SP34人源化重鏈可變區(SEQ ID NO:23)和輕鏈可變區(SEQ ID NO:24)。
由上海生工生物工程有限公司合成編碼上述人源化重鏈和輕鏈可變區的DNA。用基因工程的方法將合成的人源化重鏈可變區與人IgG1重鏈恆定區(SEQ ID NO:11)相連,獲得全長的人源化重鏈,命名為SP34-Hu-HC (SEQ ID NO:25);將人源化輕鏈可變區與人Lambda輕鏈恆定區(SEQ ID NO:26)相連,獲得全長的人源化輕鏈,命名為SP34-Hu-LC (SEQ ID NO:27)。
將SP34-Hu-HC和SP34-Hu-LC的編碼基因分別選殖到pcDNA3.4表現載體中,利用PEI將所得重鏈和輕鏈的表現載體共同轉染到FreeStyle™ 293-F細胞中以表現抗體,5天後收取FreeStyle™ 293-F細胞培養上清液,利用Protein A親和層析法從上清液中純化抗體,所得抗體命名為SP34-Hu-IgG1。
實施例 3. 抗 CD28 單株抗體的來源和序列
抗人CD28單株抗體(簡稱Anti-CD28)的重鏈和輕鏈可變區胺基酸序列分別來自於US20060286104A1中的SEQ ID NO:46和48,分別對應本發明中的序列SEQ ID NO:28和29。
Anti-CD28重鏈可變區胺基酸序列(SEQ ID NO:28):
QVQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKASGYTFTSYYIHWVRQAPGQGLEWIGCIYPGNVNTNYNEKFKDRATLTVDTSISTAYMELSRLRSDDTAVYFCTRSHYGLDWNFDVWGQGTTVTVSS
Anti-CD28輕鏈可變區胺基酸序列(SEQ ID NO:29):
DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCHASQNIYVWLNWYQQKPGKAPKLLIYKASNLHTGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYCQQGQTYPYTFGGGTKVEIK
對Anti-CD28的重鏈和輕鏈可變區胺基酸序列進行分析,依據Kabat規則分別確定Anti-CD28重鏈和輕鏈的互補決定區(CDR)和框架區。Anti-CD28重鏈3個CDR的胺基酸序列分別為H-CDR1:SYYIH (SEQ ID NO:30)、H-CDR2:CIYPGNVNTNYNEKFKD (SEQ ID NO:31)和H-CDR3:SHYGLDWNFDV (SEQ ID NO:32),
輕鏈3個CDR的胺基酸序列分別為L-CDR1:HASQNIYVWLN (SEQ ID NO:33)、L-CDR2:KASNLHT (SEQ ID NO:34)和L-CDR3:QQGQTYPYT (SEQ ID NO:35)。
為進一步提高Anti-CD28單株抗體的人源化程度,改造其重鏈可變區胺基酸序列,過程描述如下。將Anti-CD28重鏈可變區胺基酸序列與人抗體重鏈可變區胚系序列進行同源性比較,選擇IGHV1-46*01為參照模板。在此將Anti-CD28重鏈可變區框架區的某些胺基酸殘基突變成IGHV1-46*01框架區同一位置的胺基酸殘基。在進行突變時,將胺基酸序列進行Kabat編碼,位點的位置由Kabat碼指示。
優選的,對於Anti-CD28重鏈可變區胺基酸序列,將其第48位的I突變為M,將第67位的A突變為V,將第91位的F突變為Y。此外,將Anti-CD28重鏈可變區H-CDR2的第一個胺基酸殘基C突變成S,以避免生產過程中抗體分子之間形成共價的二硫鍵。
改造後的Anti-CD28重鏈可變區胺基酸序列如下:
QVQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKASGYTFTSYYIHWVRQAPGQGLEWMGSIYPGNVNTNYNEKFKDRVTLTVDTSISTAYMELSRLRSDDTAVYYCTRSHYGLDWNFDVWGQGTTVTVSS (SEQ ID NO. 50)
由上海生工生物工程有限公司合成編碼上述改造後的Anti-CD28重鏈可變區和未改造的Anti-CD28輕鏈可變區的DNA。用基因工程的方法將合成的人源化重鏈可變區與人IgG1重鏈恆定區(SEQ ID NO:11)相連,獲得全長的人源化重鏈,命名為Anti-CD28-Hu-HC (SEQ ID NO:36);將Anti-CD28輕鏈可變區與人Kappa輕鏈恆定區(SEQ ID NO:13)相連,獲得全長的人源化輕鏈,命名為Anti-CD28-Hu-LC (SEQ ID NO:37)。
將Anti-CD28-Hu-HC和Anti-CD28-Hu-LC的編碼基因分別選殖到pcDNA3.4表現載體中,利用PEI將所得重鏈和輕鏈表現載體共同轉染到FreeStyle™ 293-F細胞中以表現抗體,5天後收取FreeStyle™ 293-F細胞培養上清液,利用Protein A親和層析法從上清液中純化抗體,所得抗體命名為Anti-CD28-Hu-IgG1。
實施例 4. 抗 MUC17*CD3*CD28 三特異性抗體的建構和製備
第一種結構含有三條序列不同的多肽鏈,分別由三條基因編碼,它們的設計和建構方式描述如下。
第一條多肽鏈或基因的建構方法描述如下:
用基因工程的方法,Anti-CD28-Hu-IgG1的輕鏈可變區(含Q100C突變)透過短人工連接子(在此使用的連接子是G
4S)連接SP34-Hu-IgG1的重鏈可變區,末端再透過長人工連接子(在此使用的連接子是四個串聯的G
4S)連接SP34-Hu-IgG1的輕鏈可變區,末端再透過短人工連接子(在此使用的連接子是G
4S)連接Anti-CD28-Hu-IgG1的重鏈可變區(含G44C突變),末端再透過長人工連接子(在此使用的連接子是三個串聯的G
4S)連接人IgG1的樞紐區和Fc段(Fc段表示人IgG1重鏈恆定區的CH2和CH3結構域)。
此處,Fc段含有L234A/L235A/G237A突變以削弱Fc與Fcγ受體之間的相互作用(參考文獻:Liu R, Oldham R J, Teal E, et al. Fc-engineering for modulated effector functions—improving antibodies for cancer treatment[J]. Antibodies, 2020, 9(4): 64.),還含有S354C/T366W突變以與後述的另一條重鏈多肽形成Knob-Into-Hole (KIH)結構的異源二聚體(參考文獻:Ha J H, Kim J E, Kim Y S. Immunoglobulin Fc heterodimer platform technology: from design to applications in therapeutic antibodies and proteins[J]. Frontiers in Immunology, 2016, 7: 394.)。
第一條多肽鏈或基因命名為CD28-44-SP34-Dia-IgG1-Knob-HC (胺基酸序列SEQ ID NO:38,核苷酸序列SEQ ID NO:39)。
第二條多肽鏈或基因的建構方法描述如下:
44H4-Hu-IgG1的重鏈可變區與含有多個突變的人IgG1重鏈恆定區(包括CH1、CH2和CH3結構域)相連。此處,Fc段含有L234A/L235A/G237A突變以削弱Fc與Fcγ受體之間的相互作用,還含有Y349C/T366S/L368A/Y407V突變以與前述的另一條重鏈多肽形成Knob-Into-Hole (KIH)結構的異源二聚體。第二條多肽鏈或基因命名為44H4-IgG1-Hole-HC (胺基酸序列SEQ ID NO:40,核苷酸序列SEQ ID NO:41)。
第三條多肽鏈或基因即44H4-Hu-IgG1的輕鏈,不做任何改動和修飾。
將CD28-44-SP34-Dia-IgG1-Knob-HC、44H4-IgG1-Hole-HC和44H4-Hu-LC的編碼基因分別選殖到pcDNA3.4表現載體中,利用PEI將所得表現載體共同轉染到FreeStyle™ 293-F細胞中以表現抗體,5天後收取FreeStyle™ 293-F細胞培養上清液,利用Protein A親和層析法從上清液中純化抗體,所得抗體命名為CD28-44/SP34-Dia+44H4-KIH。
該三特異性抗體的結構示意圖如圖1A所示,圖中VL1和VH1分別為抗CD28抗體的輕鏈和重鏈可變區,VH2和VL2分別為抗CD3抗體的重鏈和輕鏈可變區,VH3和VL3分別為抗MUC17抗體的重鏈和輕鏈可變區。直線箭頭和曲線箭頭表示人工設計的銜接子和其方向,雙向直線箭頭表示人工設計的二硫鍵的位置。圖1A中的VL1、VH2、VL2和VH1透過長度不同的銜接子依次相連,最終折疊並組合成Diabody的結構(Diabody的結構可參考文獻Wu C. Diabodies: molecular engineering and therapeutic applications[J]. Drug News Perspect, 2009, 22(8): 453.)。
第二種結構含有三條序列不同的多肽鏈,分別由三條基因編碼,它們的設計和建構方式描述如下。
第一條多肽鏈或基因的建構方法描述如下:
用基因工程的方法,Anti-CD28-Hu-IgG1的輕鏈可變區(含Q100C突變)透過長人工連接子(在此使用的連接子是四個串聯的G
4S)連接Anti-CD28-Hu-IgG1的重鏈可變區(含G44C突變),末端再透過短人工連接子(在此使用的連接子是兩個串聯的G
3S)連接SP34-Hu-IgG1的輕鏈可變區,末端再透過長人工連接子(在此使用的連接子是四個串聯的G
4S)連接SP34-Hu-IgG1的重鏈可變區,末端再透過短人工連接子(在此使用的連接子是兩個串聯的GGGS)連接人IgG1的樞紐區和Fc段(Fc段表示人IgG1重鏈恆定區的CH2和CH3結構域)。此處,Fc段含有L234A/L235A/G237A突變以削弱Fc與Fcγ受體之間的相互作用,還含有S354C/T366W突變以與後述的另一條重鏈多肽形成Knob-Into-Hole (KIH)結構的異源二聚體。第一條多肽鏈或基因命名為CD28-44-SP34-2ScFv-IgG1-Knob-HC (胺基酸序列SEQ ID NO:42,核苷酸序列SEQ ID NO:43)。
第二條多肽鏈或基因為44H4-IgG1-Hole-HC。
第三條多肽鏈或基因為44H4-Hu-LC。
將CD28-44-SP34-2ScFv-IgG1-Knob-HC、44H4-IgG1-Hole-HC和44H4-Hu-LC的編碼基因分別選殖到pcDNA3.4表現載體中,利用PEI將所得表現載體共同轉染到FreeStyle™ 293-F細胞中以表現抗體,5天後收取FreeStyle™ 293-F細胞培養上清液,利用Protein A親和層析法從上清液中純化抗體,所得抗體命名為CD28-44/SP34-ScFv+44H4-KIH。
該三特異性抗體的結構示意圖如圖1B所示,圖中VL1和VH1分別為抗CD28抗體的輕鏈和重鏈可變區,VL2和VH2分別為抗CD3抗體的輕鏈和重鏈可變區,VH3和VL3分別為抗MUC17抗體的重鏈和輕鏈可變區。曲線箭頭表示人工設計的銜接子和其方向,雙向直線箭頭表示人工設計的二硫鍵的位置。
圖1B中的VL1、VH1、VL2和VH2透過長度不同的銜接子依次相連,最終折疊並組合成2個串聯的ScFv的結構(ScFv的結構可參考文獻Ahmad Z A, Yeap S K, Ali A M, et al. scFv antibody: principles and clinical application[J]. Clinical and developmental immunology, 2012, 2012:980250.)。
本實施例中,在人IgG1重鏈恆定區Fc段進行突變,分別建構成帶有“杵”結構的重鏈恆定區和帶有“臼”結構的重鏈恆定區。將 “臼”鏈435位的H突變成R、436位的Y突變成F,這樣可以消除“臼”鏈對Protein A的結合作用,可以在純化步驟將“臼”鏈的同源二聚體去除(參見文獻:Smith E, Olson K, Haber L, et al. A novel, native-format bispecific antibody triggering T-cell killing of B-cells is robustly active in mouse tumor models and cynomolgus monkeys[J]. Scientific Reports, 2016, 5(1): 17943-17943.)。將上述“杵”重鏈恆定區和改進後的“臼”重鏈恆定區Fc段分別命名為IgG1-Knob-HC (SEQ ID NO:44)和IgG1-Hole-HC (SEQ ID NO:45)。
實施例 5. 抗 MUC17*CD3*CD28 三特異性抗體結合抗原的能力
表現並純化相關重組蛋白的方法說明如下:人類MUC17胺基酸序列來自Uniprot (Entry: Q685J3),選取其中的第4131到4390位胺基酸序列,並在其N端引入信號肽,在其C端引入一個銜接子(G
4S)和6個組胺酸殘基,透過基因合成獲得前述重組胺基酸序列的編碼基因,將該重組蛋白的編碼基因選殖到pcDNA3.4 (購自Thermo Fisher Scientific)表現載體中,利用PEI將表現載體轉入FreeStyle™ 293-F細胞(購自Thermo Fisher Scientific)中以表現重組蛋白,適當時間後收集細胞培養上清液並過濾,然後用鎳親和層析法從上清液中純化相應重組蛋白,所得重組蛋白命名為MUC17-His (SEQ ID:46)。人類CD28胺基酸序列來自Uniprot (Entry: P10747),選取其中的第19到152位胺基酸序列,並在其N端引入信號肽,在其C端引入一個銜接子(G
4S)和6個組胺酸殘基,透過基因合成獲得前述重組胺基酸序列的編碼基因,透過上述相似的方法表現並純化該重組蛋白,所得重組蛋白命名為CD28-His (SEQ ID:47)。
此實施例中使用ELISA (Enzyme-Linked Immunosorbent Assay)測定抗MUC17*CD3*CD28三特異性抗體對MUC17、CD3和CD28的結合力,該方法說明如下:
用重組蛋白MUC17-His、CD3-Epsilon (購自ACROBiosystems,貨號:CDE-H5223)和CD28-His分別塗佈微孔盤(96孔),各種重組蛋白的塗佈量為10 ng/孔,用含有1%牛血清白蛋白的PBST (PBST表示含0.05% Tween-20的磷酸鹽緩衝液)封阻微孔盤。將待測抗體進行梯度稀釋,然後轉移到上述塗佈重組蛋白的微孔盤中,室溫培育半小時後洗滌培養盤;加入適當稀釋的HRP (Horseradish Peroxidase)標記的羊抗人抗體(Fc specific,購自Sigma,貨號:SAB3701283),室溫培育半小時後洗滌培養盤;每孔加入100 μL以TMB (3,3′,5,5′-Tetramethylbenzidine)為受質的顯色液,室溫培育1~5 min;加50 μL終止液(2M H
2SO
4)終止反應;Microplate Reader (型號SpectraMax 190)讀取OD450,用GraphPad Prism7進行作圖和數據分析,並計算EC
50(concentration for 50% of maximal effect)。
表1. 抗MUC17*CD3*CD28三特異性抗體結合抗原的能力
| Antibody | EC 50(nM) | ||
| MUC17-His | CD3-Epsilon | CD28-His | |
| 44H4-Hu-IgG1 | 0.06507 | NA | NA |
| SP34-Hu-IgG1 | NA | 0.05533 | NA |
| Anti-CD28-Hu-IgG1 | NA | NA | 0.1166 |
| CD28-44/SP34-Dia+44H4-KIH | 0.06246 | 0.9199 | 0.8207 |
| CD28-44/SP34-ScFv+44H4-KIH | 0.1732 | 3.363 | 1.711 |
表1為圖2A/B/C中各曲線計算結果的匯總。如圖2A/B/C和表1所示,44H4-Hu-IgG1、SP34-Hu-IgG1和Anti-CD28-Hu-IgG1均能夠有效地分別結合MUC17-His、CD3-Epsilon和CD28-His,EC
50分別是0.06507 nM、0.05533 nM和0.1166 nM。CD28-44/SP34-Dia+44H4-KIH能有效地結合MUC17-His、CD3-Epsilon和CD28-His,EC
50分別為0.06246 nM、0.9199 nM和0.8207 nM。CD28-44/SP34-ScFv+44H4-KIH也能有效地結合MUC17-His、CD3-Epsilon和CD28-His,EC
50分別為0.1732 nM、3.363 nM和1.711 nM。
CD28-44/SP34-Dia+44H4-KIH和CD28-44/SP34-ScFv+44H4-KIH均能有效地結合MUC17-His、CD3-Epsilon和CD28-His,這說明它們是三特異性抗體。
實施例 6. 抗 MUC17*CD3*CD28 三特異性抗體結合細胞表面抗原的能力
用流式細胞儀分別測定抗MUC17*CD3*CD28三特異性抗體結合人結腸腺癌細胞LS 174T (購自ATCC,貨號:CL-188)表面MUC17,以及結合人T細胞表面CD3/CD28的能力。
具體方法描述如下:將LS 174T細胞或者新鮮人周邊血液單核細胞(簡稱PBMC,購自上海澳能生物技術有限公司,貨號:FPB002-C-200)接種到96孔圓底微孔盤中(每孔30萬個細胞),300 g離心5 min,用多道移液器吸掉上清液,每孔加入200 μL含有1%牛血清白蛋白(BSA)的磷酸鹽緩衝液(PBS)(記作PBS+1% BSA)重新懸浮細胞團塊,300 g離心5 min,吸掉上清液。加入梯度稀釋的抗體,重新懸浮細胞團塊,室溫培育半小時左右。300 g離心5 min,吸掉上清液,每孔細胞用200 μL PBS洗滌2遍。每孔加入適量用PBS+1%BSA以1:1000稀釋的R-Phycoerythrin標記的Goat Anti-Human IgG (購自Jackson ImmunoResearch,貨號:109-115-098),重新懸浮細胞團塊,室溫培育半小時左右。對於PBMC,此處還要加入APC Mouse Anti-Human CD4 (購自BD Biosciences,貨號:555349)以標記CD4陽性T細胞。300 g離心5 min,吸掉上清液,每孔細胞用200 μL PBS洗滌2遍。每孔加入Fix Buffer I (購自BD Biosciences,貨號:557870)以固定細胞,室溫培育5 min。300 g離心5 min,吸掉上清液,每孔細胞用200 μL PBS洗滌2遍,最終用200 μL PBS重新懸浮細胞。在流式細胞儀CytoFLEX Cytometer System (購自Beckman Coulter)檢測PE通道的螢光強度。對於PBMC,此處檢測的是CD4陽性T細胞的PE螢光強度。用流式細胞儀的軟體處理數據並導出各個樣本PE通道的平均螢光強度(MFI)。用GraphPad Prism 7進行數據分析和作圖,計算EC
50。
此處,引入Amgen開發的抗MUC17*CD3雙特異性抗體AMG199作為對照抗體。AMG199的胺基酸序列來自WO2022060901A1中的SEQ ID NO: 171。按照上述實施例中的表現和純化方法製備AMG199。
表2. 抗MUC17*CD3*CD28三特異性抗體結合細胞表面抗原的能力
| Antibody | LS 174T | CD4 T | ||
| EC 50 (nM) | Top | EC 50 (nM) | Top | |
| 44H4-Hu-IgG1 | 0.652 | 3745 | NA | NA |
| SP34-Hu-IgG1 | NA | NA | 0.6691 | 39823 |
| Anti-CD28-Hu-IgG1 | NA | NA | 2.38 | 21894 |
| CD28-44/SP34-Dia+44H4-KIH | 2.265 | 8072 | 4.175 | 31073 |
| CD28-44/SP34-ScFv+44H4-KIH | 1.844 | 7494 | 2.802 | 26579 |
| AMG199 | 0.4247 | 4068 | 2.714 | 12929 |
表2為圖3A/B中各曲線計算結果的匯總。Top表示擬合曲線的高平臺,代表抗體結合的理論最大信號強度。
如圖3A和表2所示,44H4-Hu-IgG1、CD28-44/SP34-Dia+44H4-KIH、CD28-44/SP34-ScFv+44H4-KIH和AMG199均能夠有效地結合LS 174T細胞,EC
50分別是0.652 nM、2.265 nM、1.844 nM和0.4247 nM,它們的Top分別為3745、8072、7494和4068。
上述結果表明,44H4-Hu-IgG1和AMG199對LS 174T細胞的結合力是相當的,CD28-44/SP34-Dia+44H4-KIH和CD28-44/SP34-ScFv+44H4-KIH對LS 174T細胞的結合力是相當的。在高濃度時,CD28-44/SP34-Dia+44H4-KIH和CD28-44/SP34-ScFv+44H4-KIH的Top明顯高於44H4-Hu-IgG1和AMG199,這表明本發明三特異性抗體對細胞表面抗原的結合能力優於後兩者。
如圖3B和表2所示,SP34-Hu-IgG1、Anti-CD28-Hu-IgG1、CD28-44/SP34-Dia+44H4-KIH、CD28-44/SP34-ScFv+44H4-KIH和AMG199均能夠有效地結合CD4陽性T細胞,EC
50分別是0.6691 nM、2.38 nM、4.175 nM、2.802 nM和2.714 nM,它們的Top分別為39823、21894、31073、26579和12929。
上述結果表明,單抗SP34-Hu-IgG1對CD4 T細胞的結合力最強,Anti-CD28-Hu-IgG1、CD28-44/SP34-Dia+44H4-KIH和CD28-44/SP34-ScFv+44H4-KIH對CD4 T細胞的結合能力相當,AMG199的結合能力最弱。
實施例 7. 抗 MUC17*CD3*CD28 三特異性抗體對標的細胞的毒殺活性
標的細胞的製備方法描述如下:Luciferase基因序列來源於GenBank (MK484108.1),經生工生物工程(上海)股份有限公司合成其編碼基因,將Luciferase基因選殖至pLVX-puro慢病毒載體中(購自Clontech,貨號:632164),獲得的表現載體命名為pLVX-Luciferase-puro。將慢病毒包裝質體和pLVX-Luciferase-puro共同轉染至HEK293細胞中,以製備攜帶Luciferase基因的重組慢病毒。收集含有重組慢病毒的細胞培養上清液用以感染LS 174T細胞,三天後用Puromycin加壓篩選以獲得轉入目的基因的細胞選殖株。最終獲得的穩定表現Luciferase的細胞株命名為LS174T-Luciferase。
CD3陽性T細胞(購自上海澳能生物技術有限公司,貨號:FPB009-1-C-100)在此作為效應細胞。在抗MUC17*CD3*CD28三特異性抗體的媒介下,效應細胞可以有效活化並毒殺上述建立的腫瘤標的細胞LS174T-Luciferase。效應細胞的毒殺效果或者標的細胞被毒殺的程度,可以透過測定Luciferase的強度反應出來,從而計算出三特異性抗體的功能活性。
按照1:10的比例將LS174T-Luciferase和CD3陽性T混合,離心並棄掉上清液後用Advanced RPMI 1640完全培養基(含有10% FBS,1% Penicillin Streptomycin,1% GlutaMAX和1‰ 2-Mercaptoethanol)重新懸浮細胞團塊,然後按照每孔1萬個LS174T-Luciferase細胞的密度將細胞混合物接種到平底96孔細胞培養盤中。然後加入梯度稀釋的各種抗體。此外,在若干個孔中加入0.01%的Triton X-100以完全毒殺標的細胞,在另外若干個孔中補充不含抗體的完全培養基。72小時之後,用Bio-Glo™ Luciferase Assay System (購自Promega,貨號:G7940)測定Luciferase強度。加入Triton X-100的若干孔的Luciferase強度的平均值作為最低背景值,不含抗體的若干孔的Luciferase強度的平均值作為細胞增殖程度的最大參考值。抗體毒殺活性(Cytotoxicity)的計算公式為:
Cytotoxicity=(最大參考值-Luciferase)/(最大參考值-最低背景值)*100%
表3A. 抗MUC17*CD3*CD28三特異性抗體對標的細胞的毒殺活性
表3B. 抗MUC17*CD3*CD28三特異性抗體對標的細胞的毒殺活性
| Antibody | EC 50(pM) | Top (%) |
| 44H4-Hu-IgG1 | NA | NA |
| SP34-Hu-IgG1 | 432.4 | 37.76 |
| Anti-CD28-Hu-IgG1 | NA | NA |
| CD28-44/SP34-Dia+44H4-KIH | 8.418 | 97.11 |
| CD28-44/SP34-ScFv+44H4-KIH | 25.71 | 85.14 |
| AMG199 | 13.63 | 83.04 |
| Antibody | EC 50(pM) | Top (%) |
| 44H4-Hu-IgG1 | NA | NA |
| SP34-Hu-IgG1 | 253.3 | 49.58 |
| Anti-CD28-Hu-IgG1 | NA | NA |
| CD28-44/SP34-Dia+44H4-KIH | 9.284 | 93.55 |
| CD28-44/SP34-ScFv+44H4-KIH | 20.59 | 85.72 |
| AMG199 | 10.48 | 83.91 |
圖4A和4B分別是兩次獨立重複實驗的結果,兩次實驗中使用的效應細胞來自不同的人類個體,表3A/B分別為圖4A/B中各曲線計算結果的匯總。Top表示擬合曲線的高平臺,代表細胞毒性的理論最大強度。
圖4A和表3A結果顯示,單抗44H4-Hu-IgG1和Anti-CD28-Hu-IgG1沒有毒殺標的細胞LS174T-Luciferase的活性,SP34-Hu-IgG1顯示出較弱的毒殺活性(EC
50為432.4 pM,Top為37.76%)。CD28-44/SP34-Dia+44H4-KIH、CD28-44/SP34-ScFv+44H4-KIH和AMG199均能夠有效地毒殺LS174T-Luciferase細胞,EC
50分別是8.418 pM、25.71 pM和13.63 pM,它們的Top分別為97.11%、85.14%和83.04%,CD28-44/SP34-Dia+44H4-KIH對標的細胞的毒殺程度最高(97.11%)。
綜合評估後確定,三種抗體對標的細胞的毒殺活性從強到弱的排序為:CD28-44/SP34-Dia+44H4-KIH>AMG199>CD28-44/SP34-ScFv+44H4-KIH。
圖4B和表3B結果顯示,單抗44H4-Hu-IgG1和Anti-CD28-Hu-IgG1沒有毒殺標的細胞LS174T-Luciferase的活性,SP34-Hu-IgG1顯示出較弱的毒殺活性(EC
50為253.3 pM,Top為49.58%)。CD28-44/SP34-Dia+44H4-KIH、CD28-44/SP34-ScFv+44H4-KIH和AMG199均能夠有效地毒殺LS174T-Luciferase細胞,EC
50分別是9.284 pM、20.59 pM和10.48 pM,它們的Top分別為93.55%、85.72%和83.91%,CD28-44/SP34-Dia+44H4-KIH對標的細胞的毒殺程度最高(93.55%)。
綜合評估後確定,三種抗體對標的細胞的毒殺活性從強到弱的排序為:CD28-44/SP34-Dia+44H4-KIH>AMG199>CD28-44/SP34-ScFv+44H4-KIH。
實施例 8. 評估抗 MUC17*CD3*CD28 三特異性抗體相對於雙特異性抗體的優效性
分別在單抗SP34-Hu-IgG1和Anti-CD28-Hu-IgG1的CDR中關鍵位置處,引入定點突變,製備各個單抗的系列突變體,用上述實施例5中的ELISA評估突變體的結合活性,獲得不能再結合各自對應的標的的單抗突變體。圖5A結果顯示,在SP34-Hu-IgG1重鏈CDR3中引入A101D突變,製備成的突變體SP34-Hu-IgG1 (A101D)不再結合CD3-Epsilon。圖5B結果顯示,在Anti-CD28-Hu-IgG1重鏈CDR1中引入H35A突變,在CDR3中引入H96A突變,製備成的突變體Anti-CD28-Hu-IgG1 (H35A+H96A)不再結合CD28。
CD28-44/SP34-Dia+44H4-KIH和CD28-44/SP34-ScFv+44H4-KIH包含有SP34-Hu-IgG1的VH和VL,在VH中引入A101D突變,重新製備突變後的抗體,並將其分別命名為CD28-44/SP34-Dia+44H4-KIH (-CD3)和CD28-44/SP34-ScFv+44H4-KIH (-CD3),突變後的這兩個抗體不再具有結合CD3-Epsilon的能力,理論上為可以結合MUC17和CD28的雙特異性抗體。
CD28-44/SP34-Dia+44H4-KIH和CD28-44/SP34-ScFv+44H4-KIH包含有Anti-CD28-Hu-IgG1的VH和VL,在VH中引入H35A和H96A突變,重新製備突變後的抗體,並將分別其命名為CD28-44/SP34-Dia+44H4-KIH (-CD28)和CD28-44/SP34-ScFv+44H4-KIH (-CD28),突變後的這兩個抗體不再具有結合CD28的能力,理論上為可以結合MUC17和CD3的雙特異性抗體。
用實施例7中的方法,測定上述三特異性抗體及其突變體對標的細胞的毒殺活性。表4為圖6A中各曲線計算結果的匯總。
圖6A和表4中結果顯示,CD28-44/SP34-Dia+44H4-KIH和CD28-44/SP34-ScFv+44H4-KIH依然能夠有效地毒殺標的細胞,EC
50分別為6.6 pM和12.99 pM,Top分別為97.51%和96.41%。CD28-44/SP34-Dia+44H4-KIH (-CD3)和CD28-44/SP34-ScFv+44H4-KIH (-CD3)對標的細胞沒有展現出毒殺活性。CD28-44/SP34-Dia+44H4-KIH (-CD28)和CD28-44/SP34-ScFv+44H4-KIH (-CD28)對標的細胞毒殺活性的EC
50分別為117.8 pM和87.59 pM,Top分別為98.15%和92.51%,與母代三特異性抗體相比,突變體的活性明顯變弱。
表4. 三特異性抗體及其突變體對LS174T-Luciferase細胞的毒殺活性
| Antibody | EC 50(pM) | Top (%) |
| 44H4-Hu-IgG1 | NA | NA |
| CD28-44/SP34-Dia+44H4-KIH | 6.6 | 97.51 |
| CD28-44/SP34-ScFv+44H4-KIH | 12.99 | 96.41 |
| CD28-44/SP34-Dia+44H4-KIH(-CD3) | NA | NA |
| CD28-44/SP34-ScFv+44H4-KIH(-CD3) | NA | NA |
| CD28-44/SP34-Dia+44H4-KIH(-CD28) | 117.8 | 98.15 |
| CD28-44/SP34-ScFv+44H4-KIH(-CD28) | 87.59 | 92.51 |
上述細胞毒殺實驗中,效應細胞為CD3陽性T細胞,標的細胞為LS174T-Luciferase。在三特異性抗體或其突變體的媒介下,T細胞能夠辨識標的細胞表面表現的特異性抗原並被活化,活化的T細胞會分泌一些細胞激素,這些細胞激素能夠進一步活化T細胞並增強其毒殺活性。為進一步驗證三特異性抗體相較於雙特異性抗體的優效性,本實施例還測定了上述細胞毒殺反應系統上清液中INF-gamma的濃度。上清液中INF-gamma濃度的測定方法描述如下:
採用抗人IFN-gamma抗體(BD Biosciences,貨號:551221)塗佈ELISA微孔盤,塗佈量為0.3 μg/孔,用含有1%牛血清白蛋白的PBST (PBST表示含0.05% Tween-20的磷酸鹽緩衝液)封阻微孔盤。用含1% BSA的PBST配製IFN-gamma標準品(BD Biosciences,貨號:554617)。用含1%BSA的PBST將上述細胞毒殺反應系統的上清液稀釋4倍。將梯度稀釋的IFN-gamma標準品和4倍稀釋的上清液轉移入上述塗佈抗人IFN-gamma抗體的微孔盤中,每孔100 μL,室溫培育1小時;用PBST洗滌培養盤3次後,每孔加生物素化的抗人IFN-gamma抗體(BD Biosciences,貨號:554550。臨用前用含有1% BSA的PBST稀釋1000倍) 100 μL,室溫培育0.5小時;PBST洗滌培養盤3次後,每孔加Streptavidin HRP (BD Biosciences,貨號:554066。臨用前用含有1% BSA的PBST稀釋1000倍) 100 μL,室溫培育0.5小時;PBST洗滌培養盤3次後,每孔加入100 μL以TMB (3,3′,5,5′-Tetramethylbenzidine)為受質的顯色液,室溫培育1~5 min;加50 μL終止液(2M H
2SO
4)終止反應;Microplate Reader (型號SpectraMax 190)讀取OD450,並依據標準曲線計算各孔的IFN-gamma濃度;用GraphPad Prism7進行作圖和數據分析,並計算EC
50。
圖6B結果顯示,CD28-44/SP34-Dia+44H4-KIH和CD28-44/SP34-ScFv+44H4-KIH能有效地刺激CD3陽性T細胞分泌IFN-gamma,EC
50分別為16.65 pM和165.8 pM,抗體在高濃度時可以使IFN-gamma分泌量達到10 ng/mL。CD28-44/SP34-Dia+44H4-KIH (-CD3)和CD28-44/SP34-ScFv+44H4-KIH (-CD3)沒有展現出促進IFN-gamma分泌的活性。與母代三特異性抗體相比,CD28-44/SP34-Dia+44H4-KIH (-CD28)和CD28-44/SP34-ScFv+44H4-KIH (-CD28)刺激T細胞分泌IFN-gamma的活性非常微弱。
本實施例的結果表明,CD28-44/SP34-Dia+44H4-KIH和CD28-44/SP34-ScFv+44H4-KIH對標的細胞的毒殺活性和刺激T細胞分泌IFN-gamma的活性是相關和一致的。
CD28是T細胞表面表現的經典共刺激分子,本發明的三特異性抗體在結合CD3的同時還可以進一步結合CD28,從而為T細胞的活化提供雙重信號,因此展現出比常規的雙特異性抗體更加有效地活化T細胞的毒殺活性。
實施例 9. 評估抗 MUC17*CD3*CD28 三特異性抗體相對於 CODV-IgG 的優效性
CODV-Ig為賽諾菲的多特異性抗體平臺(參考文獻:Steinmetz A, Vallée F, Beil C, et al. CODV-Ig, a universal bispecific tetravalent and multifunctional immunoglobulin format for medical applications[C]//MAbs. Taylor & Francis, 2016, 8(5): 867-878.)。借助此平臺,賽諾菲設計了一款標靶HER2*CD3*CD28的三特異性抗體(參考文獻:Seung E, Xing Z, Wu L, et al. A trispecific antibody targeting HER2 and T cells inhibits breast cancer growth via CD4 cells[J]. Nature, 2022, 603(7900): 328-334.)。
為證明本發明的抗MUC17*CD3*CD28三特異性抗體相對於CODV-IgG的優效性,本實施例製備了具有CODV-IgG結構和相關抗CD3/CD28抗體可變區序列的抗MUC17*CD3*CD28三特異性抗體,製備過程描述如下:
CODV-IgG相關抗CD3/CD28抗體重鏈可變區的胺基酸序列來自US20200140552A1中的SEQ ID:64,將該序列與前述多肽CD28-44-SP34-Dia-IgG1-Knob-HC的重鏈恆定區序列拼接,透過基因工程的方法獲得編碼該重組序列的編碼基因,將這條多肽及其編碼基因命名為CD28-CD3-CODV-IgG1-Knob-HC (SEQ ID:48)。CODV-IgG相關抗CD3/CD28抗體輕鏈的胺基酸序列來自US20200140552A1中的SEQ ID:61,此處將這條多肽及其編碼基因命名為CD3-CD28-CODV-LC (SEQ ID:49)。
將CD28-CD3-CODV-IgG1-Knob-HC和CD3-CD28-CODV-LC的編碼基因分別選殖到pcDNA3.4表現載體中,並與前述實施例中的44H4-IgG1-Hole-HC和44H4-Hu-LC表現載體按比例組合後,利用PEI將四個表現載體共同轉染到FreeStyle™ 293-F細胞中以表現抗體,5天後收取FreeStyle™ 293-F細胞培養上清液,利用Protein A親和層析法從上清液中純化抗體,所得抗體命名為44H4-CD3-CD28-CODV。
本實施例對本發明和CODV-IgG結構的三特異性抗體進行了活性上的研究和比較,用前述實施例中的方法測定了這些三特異性抗體的毒殺活性,並測定了細胞反應系統中IFN-gamma的分泌。
圖7A中結果顯示,CD28-44/SP34-Dia+44H4-KIH和CD28-44/SP34-ScFv+44H4-KIH依然能夠有效地毒殺標的細胞,EC
50分別為6.6 pM和12.99 pM。44H4-CD3-CD28-CODV對標的細胞毒殺活性的EC
50為173.2 pM。與本發明的兩種三特異性抗體相比,44H4-CD3-CD28-CODV的活性明顯變弱。
圖7B結果顯示,CD28-44/SP34-Dia+44H4-KIH和CD28-44/SP34-ScFv+44H4-KIH能有效地刺激CD3陽性T細胞分泌IFN-gamma,EC
50分別為16.65 pM和165.8 pM,抗體在高濃度時可以使IFN-gamma分泌量達到10 ng/mL。與本發明的兩種三特異性抗體相比,44H4-CD3-CD28-CODV刺激T細胞分泌IFN-gamma的活性非常微弱。
實施例 10. 評估抗 MUC17*CD3*CD28 三特異性抗體的體外安全性
將PBMC (購自上海澳能生物技術有限公司,貨號:FPB002-C-200)用PBS洗滌兩次,然後用Advanced RPMI 1640完全培養基(含有10% FBS,1% Penicillin Streptomycin,1% GlutaMAX,1‰ 2-Mercaptoethanol)重新懸浮細胞團塊,計數並調整細胞密度後,接種至96孔圓底細胞培養盤中,每孔30萬個細胞,每孔150 μL。在另一96孔微孔盤中用培養基梯度稀釋抗體,取50 μL梯度稀釋好的抗體加入上述細胞培養盤中。將加有抗體的96孔細胞培養盤置於CO
2細胞培養箱中37℃培育2天。取適量細胞培養上清液,測定其中IL-2和IFN-gamma的分泌量。
IL-2分泌量的測定方法與上述實施例中IFN-gamma的測量方法非常相似,也採用雙抗夾心法,相關試劑購自BD Biosciences,分別為抗人IL-2抗體(貨號:9133977)、IL-2標準品(貨號:9220085)和生物素化的抗人IL-2抗體(貨號:9120557)。棄掉細胞培養盤中多餘上清液之後,用Cell-Titer-Glo Luminescent Cell Viability Assay套組(購自Promega,貨號:G7572)測定細胞的增殖情況。
實驗結果顯示,SP34-Hu-IgG1單抗能夠強烈刺激PBMC分泌IL-2 (圖8A,EC
50為7.596 pM)、IFN-gamma (圖8B,EC
50為24.49 pM),並能夠刺激PBMC增殖(圖8C,EC
50為0.4244 pM)。上述體外實驗結果表明,本發明的兩種三特異性抗體在合理濃度範圍內,沒有非特異性地活化PBMC細胞。
實施例 11. 評估抗 MUC17*CD3*CD28 三特異性抗體的理化性質
抗體是高分子量蛋白質,具有高度複雜的二級和三級結構。由於轉譯後修飾、聚集和降解等變化,抗體在生物化學和生物物理特性方面是異質的。當透過分離技術分析雙特異性抗體時,通常會觀察到變體、聚集體和降解片段,它們的存在可能會損害安全性和有效性。在生產和存儲抗體的過程中容易出現聚集體、降解片段和不完整組裝的分子。
本發明使用高效液相層析-粒徑篩析層析(High-performance liquid chromatography–size exclusion chromatography,HPLC-SEC)檢測樣品中上述雜質的含量。聚集體的分子量要大於單體,因此相應峰的保留時間較短;降解片段或不完整組裝分子的分子量要小於單體,因此相應峰的保留時間較長。HPLC-SEC所用層析儀為Dionex Ultimate 3000;流動相配製方法如下:取適量20 mM磷酸二氫鈉儲備溶液,用20 mM磷酸氫二鈉調節PH至6.8±0.1;進樣量:20 µg;層析管柱為TSK G3000SWXL,規格為7.8×300mm 5 μm;流速0.5 mL/min,洗提時間30 min;管柱溫度25℃,樣品室溫度10℃;檢測波長214 nm。
圖9A是CD28-44/SP34-Dia+44H4-KIH的HPLC-SEC圖譜,其中保留時間為16.263分鐘的主峰占比為98.8%。圖9B是CD28-44/SP34-ScFv+44H4-KIH的HPLC-SEC圖譜,其中保留時間為15.997分鐘的主峰占比為98.2%。這兩個三特異性抗體的主峰占比相近,說明它們的SEC純度相當。
本發明使用CE-SDS (Capillary Electrophoresis-Sodium Dodecyl Sulfate)分析樣品中降解片段或不完整組裝的分子的含量。CE分為非還原和還原兩種類型,用於前者的樣品在變性時不需要用還原劑DTT將分子內的二硫鍵破壞,而用於後者的樣品在變性時需要用還原劑DTT將分子內的二硫鍵破壞。非還原和還原CE-SDS分別記作NR-CE-SDS和R-CE-SDS。所用毛細管電泳儀為ProteomeLabTM PA800 plus (Beckman Coulter),配備UV 214 nm檢測器,毛細管型號為Bare Fused-Silica Capillary,規格30.7 cm×50 μm,有效長度20.5 cm;其它相關試劑購自Beckman Coulter。儀器關鍵參數設置如下:毛細管和樣品室溫度為20±2℃,分離電壓為15 kV。
圖10A和圖10B分別是CD28-44/SP34-Dia+44H4-KIH的NR-CE-SDS和R-CE-SDS圖譜,圖10C和圖10D分別表示CD28-44/SP34-ScFv+44H4-KIH的NR-CE-SDS和R-CE-SDS圖譜。CD28-44/SP34-Dia+44H4-KIH的NR-CE-SDS主峰占比97.5%,CD28-44/SP34-ScFv+44H4-KIH的NR-CE-SDS主峰占比98.1%。CD28-44/SP34-Dia+44H4-KIH的R-CE-SDS主峰3、8和11 (分別對應該三特異性抗體的分子量由小到大的三條多肽鏈)占比分別為15.5%、32.5%和50.7%,三者峰面積占比之和為98.7%。CD28-44/SP34-ScFv+44H4-KIH的R-CE-SDS主峰2、6和10 (分別對應該三特異性抗體的分子量由小到大的三條多肽鏈)占比分別為15.6%、32.2%和50.8%,三者峰面積占比之和為98.6%。
上述結果表明,本發明的兩種三特異性抗體的SEC純度均高於98%,CE測得的純度接近或者高於98%,這表明它們的純度較高,理化性質良好。
實施例 12 評估抗 MUC17*CD3*CD28 三特異性抗體的動物抑瘤藥效
利用人周邊血液單核細胞hPBMC在NOG (維通利華)小鼠體內重建人源免疫系統,並在此小鼠上建立經改造的人結腸癌LS174T-MUC17皮下移植瘤模型,用以評估MUC17*CD3*CD28三特異抗體的體內抗腫瘤效果。標的細胞的製備方法描述如下:將MUC17基因選殖至pLVX-puro慢病毒載體中(購自Clontech,貨號: 632164),獲得的表現載體命名為Muc17-plvx。將慢病毒包裝質體和Muc17-plvx共同轉染至HEK293細胞中,收集含有重組慢病毒的細胞培養上清液用以感染LS 174T細胞,三天後用Puromycin加壓篩選以獲得轉入目的基因的細胞選殖株。最終獲得的穩定表現MUC17的細胞株命名為LS174T-MUC17。具體實施步驟如下:腫瘤細胞接種前10天,體外復甦購買的PBMC (Peripheral blood mononuclear cell,周邊血液單核細胞,澳能生物,貨號FPB004F-C),用PBS重新懸浮PBMC細胞,將PBMC懸浮液濃度調整為2.5×10
7/mL。經小鼠尾靜脈注射,每隻小鼠接種200 μL PBMC細胞懸浮液,即每隻小鼠接種5×10
6個PBMC細胞。10天後,收集體外培養的經改造的人結腸癌LS174T-MUC17細胞,將細胞懸浮液濃度調整為4×10
7/mL,與基質膠以1:1等體積混合。在無菌條件下,接種100 μL細胞懸浮液於NOG小鼠右側肋部皮下。待接種的腫瘤細胞在皮下形成固態腫瘤,體積約50-100 mm
3,根據腫瘤體積將小鼠隨機分組。空白對照組,僅注射生理鹽水,作為對照;陽性對照抗體AMG199組,給藥劑量0.5 mg/kg;MUC17*CD3*CD28組,劑量0.5 mg/kg。隨後,按照上述設計好的方案給藥,每週給藥2次,共給藥5次,每週測定腫瘤體積2次。最終,測定的各組腫瘤隨時間的生長曲線如圖11所示。
結果表明:抗MUC17*CD3*CD28三特異性抗體相對AMG199具有相對較高的抑瘤藥效。
序列表
抗MUC17鼠源單株抗體44H4的重鏈可變區胺基酸序列如下(SEQ ID NO:1):
EVQLQQSGAELVKPGASVKLSFTASGFNIKDTYIHWVKQRPEQGLEWIGRIDPANGYTKYGPRFQGKATITADTASNAAYLQLSSLTSEDTAVYYCARNYGTSYPNAMDYWGQGTSVTVSS
抗MUC17鼠源單株抗體44H4的輕鏈可變區胺基酸序列如下(SEQ ID NO:2):
DIVLTQSPASLAVSLGQRATISCRASESVETYGNSFMHWYQQKPGQPPKLLIYRASSLESGIPARFSGSGSRTDFTLTITPVEADDVATYFCQQSNEDPYTFGGGTKLEIK
鼠源單抗44H4的H-CDR1 (SEQ ID NO. 3) DTYIH
鼠源單抗44H4的H-CDR2 (SEQ ID NO. 4) RIDPANGYTKYGPRFQG
鼠源單抗44H4的H-CDR3 (SEQ ID NO. 5) NYGTSYPNAMDY
鼠源單抗44H4的L-CDR1 (SEQ ID NO. 6) RASESVETYGNSFMH
鼠源單抗44H4的L-CDR2 (SEQ ID NO. 7) RASSLES
鼠源單抗44H4的L-CDR3 (SEQ ID NO. 8) QQSNEDPYT
44H4人源化重鏈可變區胺基酸序列(SEQ ID NO:9):
QVQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKASGFNIKDTYIHWVRQAPGQGLEWMGRIDPANGYTKYGPRFQGRVTITADTSTSTVYMELSSLRSEDTAVYYCARNYGTSYPNAMDYWGQGTLVTVSS
44H4人源化輕鏈可變區胺基酸序列(SEQ ID NO:10):
DIVLTQSPASLAVSPGQRATITCRASESVETYGNSFMHWYQQKPGQPPKLLIYRASSLESGVPARFSGSGSGTDFTLTINPVEADDTANYYCQQSNEDPYTFGQGTKVEIK
人IgG1重鏈恆定區胺基酸序列(SEQ ID NO:11):
ASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSCDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSREEMTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK
44H4-Hu-HC胺基酸序列(SEQ ID NO:12):
QVQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKASGFNIKDTYIHWVRQAPGQGLEWMGRIDPANGYTKYGPRFQGRVTITADTSTSTVYMELSSLRSEDTAVYYCARNYGTSYPNAMDYWGQGTLVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSCDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSREEMTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK
人Kappa輕鏈恆定區胺基酸序列(SEQ ID NO:13):
RTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC
44H4-Hu-LC胺基酸序列(SEQ ID NO:14):
DIVLTQSPASLAVSPGQRATITCRASESVETYGNSFMHWYQQKPGQPPKLLIYRASSLESGVPARFSGSGSGTDFTLTINPVEADDTANYYCQQSNEDPYTFGQGTKVEIKRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC
SP34重鏈可變區胺基酸序列(SEQ ID NO:15):
EVKLLESGGGLVQPKGSLKLSCAASGFTFNTYAMNWVRQAPGKGLEWVARIRSKYNNYATYYADSVKDRFTISRDDSQSILYLQMNNLKTEDTAMYYCVRHGNFGNSYVSWFAYWGQGTLVTVSA
SP34輕鏈可變區胺基酸序列(SEQ ID NO:16):
QAVVTQESALTTSPGETVTLTCRSSTGAVTTSNYANWVQEKPDHLFTGLIGGTNKRAPGVPARFSGSLIGDKAALTITGAQTEDEAIYFCALWYSNLWVFGGGTKLTVL
SP34抗體H-CDR1 (SEQ ID NO. 17)
TYAMN
SP34 抗體H-CDR2 (SEQ ID NO. 18) RIRSKYNNYATYYADSVKD
SP34 抗體H-CDR3 (SEQ ID NO. 19) HGNFGNSYVSWFAY
SP34抗體L-CDR1 (SEQ ID NO. 20) RSSTGAVTTSNYAN
SP34 抗體L-CDR2 (SEQ ID NO. 21) GTNKRAP
SP34 抗體L-CDR3 (SEQ ID NO. 22) ALWYSNLWV
SP34人源化重鏈可變區胺基酸序列(SEQ ID NO:23):
EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFSTYAMNWVRQAPGKGLEWVSRIRSKYNNYATYYADSVKDRFTISRDDSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCARHDNFGNSYVSWFAYWGQGTLVTVSS
SP34人源化輕鏈可變區胺基酸序列(SEQ ID NO:24):
QTVVTQEPSLTVSPGGTVTLTCGSSTGAVTTSNYPNWVQQKPGQAPRGLIGGTNKRAPGVPARFSGSLLGGKAALTLSGAQPEDEAEYYCALWYSDLWVFGGGTKLTVL
SP34-Hu-HC胺基酸序列(SEQ ID NO:25):
EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFSTYAMNWVRQAPGKGLEWVSRIRSKYNNYATYYADSVKDRFTISRDDSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCARHDNFGNSYVSWFAYWGQGTLVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSCDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSREEMTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK
Lambda輕鏈恆定區胺基酸序列(SEQ ID NO:26):
GQPKAAPSVTLFPPSSEELQANKATLVCLISDFYPGAVTVAWKADSSPVKAGVETTTPSKQSNNKYAASSYLSLTPEQWKSHRSYSCQVTHEGSTVEKTVAPTECS
SP34-Hu-LC胺基酸序列(SEQ ID NO:27):
QTVVTQEPSLTVSPGGTVTLTCGSSTGAVTTSNYPNWVQQKPGQAPRGLIGGTNKRAPGVPARFSGSLLGGKAALTLSGAQPEDEAEYYCALWYSDLWVFGGGTKLTVLGQPKAAPSVTLFPPSSEELQANKATLVCLISDFYPGAVTVAWKADSSPVKAGVETTTPSKQSNNKYAASSYLSLTPEQWKSHRSYSCQVTHEGSTVEKTVAPTECS
Anti-CD28重鏈可變區胺基酸序列(SEQ ID NO:28):
QVQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKASGYTFTSYYIHWVRQAPGQGLEWIGCIYPGNVNTNYNEKFKDRATLTVDTSISTAYMELSRLRSDDTAVYFCTRSHYGLDWNFDVWGQGTTVTVSS
Anti-CD28輕鏈可變區胺基酸序列(SEQ ID NO:29):
DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCHASQNIYVWLNWYQQKPGKAPKLLIYKASNLHTGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYCQQGQTYPYTFGGGTKVEIK
Anti-CD28抗體H-CDR1 (SEQ ID NO. 30) SYYIH
Anti-CD28抗體H-CDR2 (SEQ ID NO. 31) CIYPGNVNTNYNEKFKD
Anti-CD28抗體H-CDR3 (SEQ ID NO. 32) SHYGLDWNFDV
Anti-CD28抗體L-CDR1 (SEQ ID NO. 33) HASQNIYVWLN
Anti-CD28抗體L-CDR2 (SEQ ID NO. 34) KASNLHT
Anti-CD28抗體L-CDR3 (SEQ ID NO. 35) QQGQTYPYT
Anti-CD28-Hu-HC胺基酸序列(SEQ ID NO:36):
QVQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKASGYTFTSYYIHWVRQAPGQGLEWMGSIYPGNVNTNYNEKFKDRVTLTVDTSISTAYMELSRLRSDDTAVYYCTRSHYGLDWNFDVWGQGTTVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSCDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSREEMTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK
Anti-CD28-Hu-LC胺基酸序列(SEQ ID NO:37):
DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCHASQNIYVWLNWYQQKPGKAPKLLIYKASNLHTGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYCQQGQTYPYTFGGGTKVEIKRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC
CD28-44-SP34-Dia-IgG1-Knob-HC的胺基酸序列(SEQ ID NO:38):
DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCHASQNIYVWLNWYQQKPGKAPKLLIYKASNLHTGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYCQQGQTYPYTFGCGTKVEIKGGGGSEVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFSTYAMNWVRQAPGKGLEWVSRIRSKYNNYATYYADSVKDRFTISRDDSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCARHDNFGNSYVSWFAYWGQGTLVTVSSGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSQTVVTQEPSLTVSPGGTVTLTCGSSTGAVTTSNYPNWVQQKPGQAPRGLIGGTNKRAPGVPARFSGSLLGGKAALTLSGAQPEDEAEYYCALWYSDLWVFGGGTKLTVLGGGGSQVQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKASGYTFTSYYIHWVRQAPGQCLEWMGSIYPGNVNTNYNEKFKDRVTLTVDTSISTAYMELSRLRSDDTAVYYCTRSHYGLDWNFDVWGQGTTVTVSSGGGGSGGGGSGGGGSDKTHTCPPCPAPEAAGAPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPCRDELTKNQVSLWCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK
CD28-44-SP34-Dia-IgG1-Knob-HC的核苷酸序列(SEQ ID NO:39):
GACATCCAGATGACCCAGAGTCCCAGCAGCCTGTCTGCTTCTGTGGGAGATAGAGTGACAATTACATGTCATGCTTCTCAGAATATCTACGTGTGGCTGAACTGGTACCAGCAGAAACCTGGAAAGGCTCCTAAGCTGCTGATCTACAAGGCTTCTAACCTGCACACAGGCGTGCCTTCTAGATTTTCTGGATCTGGCTCCGGAACAGATTTTACTCTGACCATCTCTAGCCTGCAGCCAGAAGATTTTGCCACCTATTATTGTCAGCAGGGACAGACCTACCCTTACACATTTGGCTGCGGCACAAAGGTGGAGATCAAGGGTGGAGGCGGTAGCGAGGTGCAGCTGGTGGAGTCTGGCGGCGGCCTGGTGCAGCCTGGCGGCTCTCTGAGACTGTCTTGTGCTGCTTCTGGCTTTACCTTTTCTACCTATGCTATGAATTGGGTGAGACAGGCTCCTGGCAAGGGCCTGGAGTGGGTGTCTAGAATCAGATCTAAGTATAATAATTACGCTACCTATTATGCTGATTCTGTGAAGGACAGATTCACAATCTCTAGAGATGATTCTAAGAATACCCTGTATCTGCAGATGAACTCTCTGAGAGCTGAGGATACCGCTGTGTATTACTGTGCTAGACATGACAATTTTGGCAACTCTTATGTGTCTTGGTTTGCTTATTGGGGACAGGGAACACTGGTGACAGTGAGCTCTGGTGGAGGCGGTTCAGGCGGCGGAGGCAGCGGAGGTGGCGGGAGTGGAGGGGGTGGCTCTCAGACCGTGGTGACACAGGAGCCCAGCCTGACCGTGAGCCCCGGCGGCACCGTGACCCTGACCTGCGGCTCCTCCACAGGCGCCGTGACCACCTCCAACTACCCCAACTGGGTGCAGCAGAAGCCCGGCCAGGCCCCAAGGGGCCTGATCGGCGGCACCAATAAGAGGGCCCCCGGCGTGCCCGCTAGATTCTCTGGCTCTCTTCTGGGAGGAAAGGCTGCTCTGACACTGTCTGGAGCTCAGCCCGAGGATGAGGCTGAATACTATTGTGCTCTGTGGTATTCTGATCTGTGGGTGTTTGGCGGTGGAACTAAACTTACAGTTCTGGGCGGGGGCGGTAGCCAGGTGCAGCTGGTCCAGAGCGGAGCCGAGGTGAAGAAGCCCGGCGCCAGCGTGAAGGTGAGCTGCAAGGCCAGCGGCTACACTTTTACCTCTTACTACATTCACTGGGTGAGACAGGCTCCCGGCCAGTGCCTGGAGTGGATGGGATCCATCTATCCTGGAAATGTGAACACCAACTATAATGAGAAGTTTAAAGATAGAGTGACCCTGACCGTGGATACATCTATCTCTACCGCTTATATGGAGCTGTCTAGACTGAGATCCGATGACACAGCTGTGTATTATTGTACCAGATCTCATTACGGACTGGATTGGAATTTTGATGTGTGGGGCCAGGGCACCACAGTGACCGTGTCTTCTGGTGGGGGTGGTTCAGGGGGTGGTGGAAGTGGCGGTGGAGGGAGTGACAAGACCCACACATGTCCCCCCTGTCCCGCTCCTGAAGCTGCAGGAGCCCCTTCCGTGTTCCTGTTCCCCCCTAAGCCCAAGGACACCCTGATGATTTCCAGGACACCCGAGGTGACCTGTGTGGTGGTGGACGTCAGCCACGAGGACCCCGAGGTGAAATTCAACTGGTACGTCGATGGCGTGGAGGTGCACAACGCTAAGACCAAGCCCAGGGAGGAGCAGTACAATTCCACCTACAGGGTGGTGTCCGTGCTGACCGTCCTCCATCAGGACTGGCTGAACGGCAAAGAGTATAAGTGCAAGGTGAGCAACAAGGCCCTCCCTGCTCCCATCGAGAAGACCATCAGCAAAGCCAAGGGCCAGCCCAGGGAACCTCAAGTCTATACCCTGCCTCCCTGCAGGGATGAGCTGACCAAGAACCAAGTGAGCCTCTGGTGCCTCGTCAAGGGCTTCTATCCTTCCGATATTGCCGTCGAGTGGGAGTCCAACGGACAGCCCGAGAACAACTACAAGACAACACCCCCCGTGCTCGATTCCGATGGCAGCTTCTTCCTGTACTCCAAGCTGACCGTGGACAAGTCCAGATGGCAACAAGGCAACGTCTTCAGTTGCAGCGTCATGCATGAGGCCCTCCACAACCACTACACCCAGAAGAGCCTCTCCCTGAGCCCTGGAAAG
44H4-IgG1-Hole-HC的胺基酸序列(SEQ ID NO:40):
QVQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKASGFNIKDTYIHWVRQAPGQGLEWMGRIDPANGYTKYGPRFQGRVTITADTSTSTVYMELSSLRSEDTAVYYCARNYGTSYPNAMDYWGQGTLVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSCDKTHTCPPCPAPEAAGAPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVCTLPPSRDELTKNQVSLSCAVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLVSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNRFTQKSLSLSPGK
44H4-IgG1-Hole-HC的核苷酸序列(SEQ ID NO:41):
CAGGTGCAGCTGGTGCAGTCTGGCGCTGAGGTGAAGAAGCCTGGCGCTTCTGTGAAGGTGTCTTGTAAGGCTTCTGGCTTTAATATCAAGGATACATATATCCATTGGGTGAGACAGGCCCCTGGCCAGGGCCTGGAGTGGATGGGCAGAATCGATCCAGCTAATGGCTACACCAAGTATGGCCCTAGATTTCAGGGAAGAGTGACCATCACAGCTGATACATCTACCTCCACCGTGTATATGGAGCTGTCCTCTCTGAGATCTGAGGATACAGCTGTGTATTATTGTGCTAGAAATTATGGCACATCTTACCCTAATGCTATGGATTACTGGGGACAGGGAACACTGGTGACAGTGAGCTCTGCTTCCACCAAAGGACCCAGCGTGTTTCCTCTGGCCCCTTCCAGCAAGAGCACCAGCGGAGGCACAGCTGCCCTGGGATGCCTGGTGAAGGACTATTTCCCTGAGCCCGTGACAGTCAGCTGGAACTCCGGCGCTCTGACCTCCGGCGTCCACACCTTTCCTGCCGTGCTGCAGAGCAGCGGCCTGTACAGCCTGTCCAGCGTGGTGACCGTGCCTAGCTCCAGCCTGGGCACCCAGACCTACATCTGCAACGTGAACCACAAGCCCTCCAACACCAAGGTGGACAAGAAGGTGGAGCCTAAGAGCTGTGACAAGACCCACACATGCCCTCCTTGTCCTGCTCCTGAAGCCGCCGGCGCACCTTCCGTGTTCCTGTTCCCCCCTAAGCCCAAGGATACCCTCATGATTTCCAGGACCCCCGAAGTGACCTGCGTGGTGGTCGATGTGAGCCACGAAGACCCTGAAGTGAAGTTCAACTGGTACGTGGACGGCGTCGAGGTCCACAACGCCAAAACCAAGCCCAGGGAGGAGCAGTACAATAGCACCTACCGGGTGGTGAGCGTGCTGACCGTGCTGCACCAGGACTGGCTGAACGGCAAGGAGTACAAGTGTAAGGTCAGCAACAAGGCCCTCCCTGCCCCCATCGAGAAGACCATTTCCAAGGCTAAGGGACAGCCTCGGGAACCCCAAGTGTGCACCCTGCCTCCTAGCAGGGATGAGCTGACCAAGAACCAGGTGAGCCTGAGCTGTGCTGTGAAGGGCTTCTACCCTTCCGACATCGCTGTCGAGTGGGAGAGCAACGGCCAGCCCGAGAATAACTACAAGACAACCCCCCCCGTGCTCGACAGCGATGGCAGCTTCTTTCTGGTGTCCAAGCTCACCGTGGACAAGTCCAGGTGGCAGCAGGGCAACGTCTTCTCCTGCTCCGTCATGCACGAGGCCCTGCACAACCGCTTCACACAGAAGTCCCTGTCCCTGTCCCCTGGAAAG
CD28-44-SP34-2ScFv-IgG1-Knob-HC的胺基酸序列(SEQ ID NO:42):
DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCHASQNIYVWLNWYQQKPGKAPKLLIYKASNLHTGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYCQQGQTYPYTFGCGTKVEIKGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSQVQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKASGYTFTSYYIHWVRQAPGQCLEWMGSIYPGNVNTNYNEKFKDRVTLTVDTSISTAYMELSRLRSDDTAVYYCTRSHYGLDWNFDVWGQGTTVTVSSGGGSGGGSQTVVTQEPSLTVSPGGTVTLTCGSSTGAVTTSNYPNWVQQKPGQAPRGLIGGTNKRAPGVPARFSGSLLGGKAALTLSGAQPEDEAEYYCALWYSDLWVFGGGTKLTVLGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSEVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFSTYAMNWVRQAPGKGLEWVSRIRSKYNNYATYYADSVKDRFTISRDDSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCARHDNFGNSYVSWFAYWGQGTLVTVSSGGGSGGGSDKTHTCPPCPAPEAAGAPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPCRDELTKNQVSLWCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK
CD28-44-SP34-2ScFv-IgG1-Knob-HC的核苷酸序列(SEQ ID NO:43):
GACATCCAGATGACCCAGAGTCCCAGCAGCCTGTCTGCTTCTGTGGGAGATAGAGTGACAATTACATGTCATGCTTCTCAGAATATCTACGTGTGGCTGAACTGGTACCAGCAGAAACCTGGAAAGGCTCCTAAGCTGCTGATCTACAAGGCTTCTAACCTGCACACAGGCGTGCCTTCTAGATTTTCTGGATCTGGCTCCGGAACAGATTTTACTCTGACCATCTCTAGCCTGCAGCCAGAAGATTTTGCCACCTATTATTGTCAGCAGGGACAGACCTACCCTTACACATTTGGCTGCGGCACAAAGGTGGAGATCAAGGGTGGAGGCGGTTCAGGCGGCGGAGGCAGCGGAGGTGGCGGGAGTGGAGGGGGTGGCTCTCAGGTGCAGCTGGTCCAGAGCGGAGCCGAGGTGAAGAAGCCCGGCGCCAGCGTGAAGGTGAGCTGCAAGGCCAGCGGCTACACTTTTACCTCTTACTACATTCACTGGGTGAGACAGGCTCCCGGCCAGTGCCTGGAGTGGATGGGATCTATCTATCCTGGAAATGTGAACACCAACTATAATGAGAAGTTTAAAGATAGAGTGACCCTGACCGTGGATACATCTATCTCTACCGCTTATATGGAGCTGTCTAGACTGAGATCCGATGACACAGCTGTGTATTATTGTACCAGATCTCATTACGGACTGGATTGGAATTTTGATGTGTGGGGCCAGGGCACCACAGTGACCGTGTCTTCTGGGGGCGGTAGCGGGGGCGGGTCTCAGACCGTGGTGACACAGGAGCCCAGCCTGACCGTGAGCCCCGGCGGCACCGTGACCCTGACCTGCGGCTCCTCCACCGGCGCCGTGACCACCTCCAACTACCCCAACTGGGTGCAGCAGAAGCCCGGCCAGGCCCCAAGGGGCCTGATCGGCGGCACCAATAAGAGGGCCCCCGGCGTGCCCGCTAGATTCTCTGGCTCTCTTCTGGGAGGAAAGGCTGCTCTGACACTGTCTGGAGCTCAGCCCGAGGATGAGGCTGAATACTATTGTGCTCTGTGGTATTCTGATCTGTGGGTGTTTGGCGGTGGAACTAAACTTACAGTTCTGGGTGGGGGTGGTTCAGGGGGTGGTGGAAGTGGCGGTGGAGGGAGTGGTGGAGGCGGTAGCGAGGTGCAGCTGGTGGAGTCTGGCGGCGGCCTGGTGCAGCCTGGCGGCTCTCTGAGACTGTCTTGTGCTGCTTCTGGCTTTACCTTTTCTACCTATGCTATGAATTGGGTGAGACAGGCTCCTGGCAAGGGCCTGGAGTGGGTGTCTAGAATCAGATCTAAGTATAATAATTACGCTACCTATTATGCTGATTCTGTGAAGGACAGATTCACAATCTCTAGAGATGATTCTAAGAATACCCTGTATCTGCAGATGAACTCTCTGAGAGCTGAGGATACCGCTGTGTATTACTGTGCTAGACATGACAATTTTGGCAACTCTTATGTGTCTTGGTTTGCTTATTGGGGACAGGGAACACTGGTGACAGTGAGCTCTGGCGGGGGATCAGGAGGTGGCAGTGACAAGACCCACACATGTCCCCCCTGTCCCGCTCCTGAAGCTGCAGGAGCCCCTTCCGTGTTCCTGTTCCCCCCTAAGCCCAAGGACACCCTGATGATTTCCAGGACACCCGAGGTGACCTGTGTGGTGGTGGACGTCAGCCACGAGGACCCCGAGGTGAAATTCAACTGGTACGTCGATGGCGTGGAGGTGCACAACGCTAAGACCAAGCCCAGGGAGGAGCAGTACAATTCCACCTACAGGGTGGTGTCCGTGCTGACCGTCCTCCATCAGGACTGGCTGAACGGCAAAGAGTATAAGTGCAAGGTGAGCAACAAGGCCCTCCCTGCTCCCATCGAGAAGACCATCAGCAAAGCCAAGGGCCAGCCCAGGGAACCTCAAGTCTATACCCTGCCTCCCTGCAGGGATGAGCTGACCAAGAACCAAGTGAGCCTCTGGTGCCTCGTCAAGGGCTTCTATCCTTCCGATATTGCCGTCGAGTGGGAGTCCAACGGACAGCCCGAGAACAACTACAAGACAACACCCCCCGTGCTCGATTCCGATGGCAGCTTCTTCCTGTACTCCAAGCTGACCGTGGACAAGTCCAGATGGCAACAAGGCAACGTCTTCAGTTGCAGCGTCATGCATGAGGCCCTCCACAACCACTACACCCAGAAGAGCCTCTCCCTGAGCCCTGGAAAG
IgG1-Knob-HC胺基酸序列(SEQ ID NO:44):
DKTHTCPPCPAPEAAGAPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPCRDELTKNQVSLWCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK
IgG1-Hole-HC胺基酸序列(SEQ ID NO:45):
DKTHTCPPCPAPEAAGAPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVCTLPPSRDELTKNQVSLSCAVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLVSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNRFTQKSLSLSPGK
MUC17-His的胺基酸序列(SEQ ID:46):
RTTTCFGDGCQNTASRCKNGGTWDGLKCQCPNLYYGELCEEVVSSIDIGPPETISAQMELTVTVTSVKFTEELKNHSSQEFQEFKQTFTEQMNIVYSGIPEYVGVNITKLRLGSVVVEHDVLLRTKYTPEYKTVLDNATEVVKEKITKVTTQQIMINDICSDMMCFNTTGTQVQNITVTQYDPEEDCRKMAKEYGDYFVVEYRDQKPYCISPCEPGFSVSKNCNLGKCQMSLSGPQCLCVTTETHWYSGETCNQGTQKSLGGGGSHHHHHH
CD28-His的胺基酸序列(SEQ ID:47):
NKILVKQSPMLVAYDNAVNLSCKYSYNLFSREFRASLHKGLDSAVEVCVVYGNYSQQLQVYSKTGFNCDGKLGNESVTFYLQNLYVNQTDIYFCKIEVMYPPPYLDNEKSNGTIIHVKGKHLCPSPLFPGPSKPGGGGSHHHHHH
CD28-CD3-CODV-IgG1-Knob-HC的胺基酸序列(SEQ ID:48):
QVQLVQSGAEVVKPGASVKVSCKASGYTFTSYYIHWVRQAPGQGLEWIGSIYPGNVNTNYAQKFQGRATLTVDTSISTAYMELSRLRSDDTAVYYCTRSHYGLDWNFDVWGKGTTVTVSSSQVQLVESGGGVVQPGRSLRLSCAASGFTFTKAWMHWVRQAPGKQLEWVAQIKDKSNSYATYYADSVKGRFTISRDDSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCRGVYYALSPFDYWGQGTLVTVSSRTASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSCDKTHTCPPCPAPEAAGAPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPCRDELTKNQVSLWCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK
CD3-CD28-CODV-LC的胺基酸序列(SEQ ID:49):
DIVMTQTPLSLSVTPGQPASISCKSSQSLVHNNANTYLSWYLQKPGQSPQSLIYKVSNRFSGVPDRFSGSGSGTDFTLKISRVEAEDVGVYYCGQGTQYPFTFGSGTKVEIKGQPKAAPDIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCQASQNIYVWLNWYQQKPGKAPKLLIYKASNLHTGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDIATYYCQQGQTYPYTFGQGTKLEIKTKGPSRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC
改造後的Anti-CD28重鏈可變區胺基酸序列(SEQ ID NO:50):
QVQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKASGYTFTSYYIHWVRQAPGQGLEWMGSIYPGNVNTNYNEKFKDRVTLTVDTSISTAYMELSRLRSDDTAVYYCTRSHYGLDWNFDVWGQGTTVTVSS
人源化SP34抗體的H-CDR3 (SEQ ID NO. 51) HDNFGNSYVSWFAY
人源化SP34抗體L-CDR3 (SEQ ID NO. 52) ALWYSDLWV
人源化Anti-CD28抗體H-CDR2 (SEQ ID NO. 53) SIYPGNVNTNYNEKFKD
在本發明提及的所有文獻都在本申請中引用作為參考,就如同每一篇文獻被單獨引用作為參考那樣。此外應理解,在閱讀了本發明的上述講授內容之後,本領域技術人員可以對本發明作各種改動或修改,這些等價形式同樣落於本申請所附申請專利範圍所限定的範圍。
圖1顯示了本發明的三特異性抗體的結構示意圖。其中圖1A為CD28-44/SP34-Dia+44H4-KIH抗體的結構示意圖,圖1B為CD28-44/SP34-ScFv+44H4-KIH抗體的結構示意圖。
圖2顯示了ELISA測定抗MUC17*CD3*CD28三特異性抗體對MUC17 (圖2A)、CD3 (圖2B)和CD28 (圖2C)的抗原結合力。
圖3顯示了流式細胞儀測定抗MUC17*CD3*CD28三特異性抗體結合人結腸腺癌細胞LS174T表面MUC17 (圖3A),以及結合人T細胞表面CD3/CD28的能力(圖3B)。
圖4顯示了抗MUC17*CD3*CD28三特異性抗體對標的細胞LS174T-Luciferase的毒殺活性,圖4A和4B分別是兩次獨立重複實驗的結果,兩次實驗中使用的效應細胞來自不同的人類個體。
圖5顯示了抗MUC17*CD3*CD28三特異性抗體相對於雙特異性抗體的優效性評價。其中,圖5A中的突變體SP34-Hu-IgG1 (A101D)不再結合CD3-Epsilon。圖5B中的突變體Anti-CD28-Hu-IgG1 (H35A+H96A)不再結合CD28。
圖6顯示了本發明的三特異性抗體及其突變體對標的細胞的毒殺活性(圖6A)和刺激T細胞分泌IFN-gamma的活性(圖6B)。
圖7顯示了抗MUC17*CD3*CD28三特異性抗體相對於CODV-IgG的優效性,其中圖7A顯示了對標的細胞的毒殺活性比較,圖7B顯示了刺激CD3陽性T細胞分泌IFN-gamma的能力比較。
圖8顯示了抗MUC17*CD3*CD28三特異性抗體的體外安全性評估,其中顯示了SP34-Hu-IgG1單抗能夠強烈刺激PBMC分泌IL-2 (圖8A)、IFN-gamma (圖8B),並能夠刺激PBMC增殖(圖8C)。
圖9顯示了抗MUC17*CD3*CD28三特異性抗體的SEC純度分析。其中,圖9A和圖9B分別顯示了CD28-44/SP34-Dia+44H4-KIH、CD28-44/SP34-ScFv+44H4-KIH的HPLC-SEC圖譜。
圖10顯示了抗MUC17*CD3*CD28三特異性抗體的CE-SDS分析。其中,圖10A和圖10B分別為CD28-44/SP34-Dia+44H4-KIH的NR-CE-SDS和R-CE-SDS圖譜,圖10C和圖10D分別為CD28-44/SP34-ScFv+44H4-KIH的NR-CE-SDS和R-CE-SDS圖譜。
圖11顯示了抗MUC17*CD3*CD28三特異性抗體的動物抑瘤藥效(包括小鼠體重和腫瘤體積大小)。
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Claims (17)
- 一種多特異性T細胞銜接子(T-cell Engagers),其特徵在於,所述多特異性T細胞銜接子包含: 第一標靶結構域D1,所述D1與選自下組的標的蛋白結合:CD3、CD28、CD40、CD137; 任選的第二標靶結構域D2,所述D2與選自下組的標的蛋白結合:CD3、CD28、CD40、CD137;和 第三標靶結構域D3,所述D3包含一個或多個MUC17抗原結合結構域。
- 如請求項1所述的多特異性T細胞銜接子,其特徵在於,所述D1、D2或D3各自獨立地選自:單域抗體(sdAb)、Fab、Fab'、F(ab') 2、TriFab、Fv片段、片段可變(Fv)異二聚體、單鏈Fv(scFv)片段、雙抗體(diabody)、雙特異性T細胞接合器(BiTE)或單結構域片段,優選為單鏈Fv(scFv)、Fv片段或Fab片段。
- 如請求項1所述的多特異性T細胞銜接子,其特徵在於,所述MUC17抗原結合結構域包含第三重鏈可變區和第三輕鏈可變區,其中,所述第三重鏈可變區包含如下三個重鏈可變區CDR: H-CDR1,其具有如SEQ ID NO: 3所示的胺基酸序列; H-CDR2,其具有如SEQ ID NO: 4所示的胺基酸序列;和 H-CDR3,其具有如SEQ ID NO: 5所示的胺基酸序列;以及 所述第三輕鏈可變區包含如下三個輕鏈可變區CDR: L-CDR1,其具有如SEQ ID NO: 6所示的胺基酸序列; L-CDR2,其具有如SEQ ID NO: 7所示的胺基酸序列;和 L-CDR3,其具有如SEQ ID NO: 8所示的胺基酸序列。
- 如請求項1所述的多特異性T細胞銜接子,其特徵在於,所述多特異性T細胞銜接子還包含Fc片段,較佳地來源於IgG1或IgG4的Fc片段。
- 如請求項1所述的多特異性T細胞銜接子,其特徵在於,所述來源於IgG1的Fc片段具有選自下組的突變: N297A; L234F/L235E/P331S; Y349C/K370E/K409D/K439E; S354C/D356K/E357K/D399K; S354C/T366W; S354C/T366W/H435R/Y436F; Y349C/T366S/L368A/Y407V; L234F/L235E/P331S/Y349C/K370E/K409D/K439E; L234F/L235E/P331S/S354C/D356K/E357K/D399K; L234F/L235E/P331S/S354C/T366W; L234F/L235E/P331S/Y349C/T366S/L368A/Y407V; N297A/Y349C/K370E/K409D/K439E; N297A/S354C/D356K/E357K/D399K; N297A/S354C/T366W; N297A/Y349C/T366S/L368A/Y407V;和/或 S267E;S267E/G236D;S267E/S239D;S267E/L328F。
- 如請求項1所述的多特異性T細胞銜接子,其特徵在於,所述多特異性T細胞銜接子為三特異性抗體,其從N端到C端包含如下所示的結構: (a) 第一鏈:VL 1-L1-VH 2-L2-VL 2-L3-VH 1-L4-Fc1; (b) 第二鏈:VH 3-CH1-Fc2;和 (c) 第三鏈:VL 3-CL; 或所述三特異性抗體從N端到C端包含如下所示的結構: (a) 第一鏈:VL 1-L1-VH 1-L2-VL 2-L3-VH 2-L4-Fc1; (b) 第二鏈:VH 3-CH1-Fc2;和 (c) 第三鏈:VL 3-CL; 其中, VH 1為第一重鏈可變區,VL 1為第一輕鏈可變區; VH 2為第二重鏈可變區,VL 2為第二輕鏈可變區; VH 3為第三重鏈可變區,VL 3為第三輕鏈可變區; CL為輕鏈恆定區,CH1為CH1結構域; L1、L2、L3、L4各自獨立地為無、鍵或連接子; Fc1或Fc2各自獨立地為Fc元件; “-”代表肽鍵。
- 一種多核苷酸,其特徵在於,所述多核苷酸編碼請求項1-6任一所述的多特異性T細胞銜接子。
- 一種載體,其特徵在於,所述載體含有請求項7所述的多核苷酸。
- 一種宿主細胞,其特徵在於,所述宿主細胞含有請求項8所述的載體或基因組中整合有請求項7所述的多核苷酸。
- 一種製備如請求項1-6任一所述的多特異性T細胞銜接子的方法,其特徵在於,包括步驟: (i) 在合適的條件下,培養請求項9所述的宿主細胞,獲得含有如請求項1-6任一所述的多特異性T細胞銜接子的混合物; (ii) 對步驟(i)中得到的混合物進行純化和/或分離,從而獲得如請求項1-6任一所述的多特異性T細胞銜接子。
- 一種藥物組成物,其特徵在於,所述藥物組成物含有: (I) 如請求項1-6任一所述的多特異性T細胞銜接子;和 (II) 藥學上可接受的載劑。
- 一種免疫偶聯物,其特徵在於,所述免疫偶聯物包括: (a) 如請求項1-6任一所述的多特異性T細胞銜接子;和 (b) 選自下組的偶聯部分:可檢測標記物、藥物、毒素、細胞激素、放射性核種、酵素、或其組合。
- 如請求項1-6任一所述多特異性T細胞銜接子、如請求項11所述的藥物組成物或如請求項12所述的免疫偶聯物的用途,其特徵在於,用於製備(a)檢測試劑或套組;和/或(b)製備預防和/或治療癌症/腫瘤的藥物。
- 如請求項13所述的用途,其特徵在於,所述癌症/腫瘤為MUC17相關的癌症/腫瘤。
- 如請求項13所述的用途,其特徵在於,所述癌症/腫瘤包括固態腫瘤和血液腫瘤。
- 如請求項13所述的用途,其特徵在於,所述癌症/腫瘤選自下組:胃癌、胃腸癌、結直腸癌、食道癌、胃食道癌、胰腺癌、肺癌、乳腺癌、肝癌、子宮頸癌、甲狀腺癌、子宮體癌、前列腺癌或其組合。
- 一種套組,其特徵在於,所述套組包括如請求項1-6任一所述的多特異性T細胞銜接子、如請求項7所述的多核苷酸、如請求項8所述的載體、如請求項9所述的宿主細胞、如請求項11所述的藥物組成物或如請求項12所述的免疫偶聯物。
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