WO2002042434A1 - Cells to be used in producing virus vector, process for producing the same and process for producing virus vector with the use of the cells - Google Patents

Cells to be used in producing virus vector, process for producing the same and process for producing virus vector with the use of the cells Download PDF

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Definitions

  • the present invention relates to a virus vector, particularly a cell used for producing a high-titer virus vector, a method for producing the same, and a method for producing a virus vector, particularly a high-valent virus vector using the cell.
  • a method using a viral vector as a method for introducing a gene into animals including humans has been widely known.
  • One of the viral vectors used is, for example, retinovirus s virus, lentivirus, adenovirus, adeno-associated virus, etc.
  • a virus vector using the vector is known.
  • Adeno-associated virus (AAV) vectors can integrate genomic DNA into host chromosomal DNA, but wild-type AAV itself is non-pathogenic (fc. N. IViuzyczka, Current Topics in icrobiolosv and Immunol). oev, 158, 97, 1992) o AAV vectors are characterized by their ability to transfer genes into non-dividing cells such as hematopoietic stem cells and the ability to selectively transfer genes to human chromosome 19. (M. Su adogo and RGRoder, Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 82, 4394, 1985).
  • AAV particles are physically stable, it is possible to prepare a vector with high gene transfer efficiency by enrichment by sucrose density gradient ultracentrifugation or cellulose sulfate affinity chromatography (K Tamayose, et al., Hum. Gene Ther "7, 507-513, 1996).
  • AAV is a virus lacking self-renewal ability (genus Dependentvirus). Proliferation requires the presence of a helper virus such as adenovirus (Ad: Adenovirus).
  • Ad Ad: Adenovirus
  • the transfusion method typified by the calcium phosphate method has the following limitations: (1) The efficiency of gene transfer of plasmid into cells is limited, and it is difficult to obtain a high-titer virus vector required in a clinical setting.
  • a packaging cell in which a helper plasmid is integrated into the genome DNA of a virus vector producing cell has been considered.
  • This cell line is cultivated on an arbitrary scale because plasmid DNA-derived DNA is stably integrated into the genome: DNA and is inherited by daughter cells during cell division. The required amount of recombinant virus can be obtained stably.
  • the establishment of these packaging cell lines involves transferring a helper plasmid carrying a neomycin resistance gene or a drug resistance gene such as a hygromycin resistance gene to cells for producing a virus vector.
  • a packaging cell having a genomic DNA and a plasmid-derived gene incorporated therein can be obtained.
  • AAV vector 293 cells that constantly express adenovirus E1A and E1B genes are used. 293 cells are cell lines established by transforming human fetal kidney cells with the E1 gene (E1A and E1B genes) of adenovirus type 5 (Ad5).
  • the adenovirus E1A protein induces transcription of the AAV p5 promoter over and over, and expresses the AAV REP protein.
  • the REP protein is a protein required when the AAV genome is selectively transfected into human chromosome 19 and, at the same time, directs the cell's protein synthesis system to produce AAV particles. It is considered. However, the REP protein is cytotoxic and has the property of inhibiting cell growth.
  • the adenoviruses E 1 B and E 4 accumulate mRNA, E2A and VA are thought to be required for mRNA slicing and translation (N. Muzyczka, Current Tonics in Microbiology and Immunology, 158, 97, 199 ⁇ 0.
  • the p5 promoter of AAV is activated and the REP protein is expressed even without adenovirus contamination. Due to growth inhibition, cells die.For these reasons, it was difficult to produce AAV vector-based packaging cells in 293 cells.
  • the REP protein is a helper virus, adenovirus.
  • a variety of methods have been studied to avoid viral adenovirus growth suppression: packaging cells established by introducing only the gene sequence derived from the vector-plasmid to be integrated into the AAV vector, A method of preparing an AAV vector by introducing a gene encoding the caP gene and / or introducing a gene sequence encoding the ep and Z or cap genes into cells is also considered. Methods are roughly classified into those using a recombinant virus and those not using a recombinant virus. The method using an adenovirus is preferable for producing an AAV vector having a high gene transfer efficiency and a higher titer.
  • the E1 gene of the adenovirus was already retained in these cells.
  • AAV vectors can be produced simply by infecting a defective adenovirus. Therefore, a method was considered in which the REP and / or CAP protein was supplied by an adenovirus in which a gene sequence encoding the AAV rep and Z or cap genes was incorporated into the E1-deficient region.
  • the known COS-TPC method Kanegae et al., Experimental Medicine Vol. 12, No. 3, 1994, S. Miyake. Etal., Proc. Natl. Acad. Sci.
  • Japanese Patent Application Laid-Open No. 10-33175 discloses a method for producing a recombinant AAV vector in 293 cells by controlling the expression of the rep gene using a Cre / 1 oxP expression control system. It has been disclosed. However, even with this method, the expression control of the re ⁇ gene in the Cre / 1oxP expression control system is not perfect. In addition, when manufacturing an AAV vector, it is necessary to supply Cre and cut out ⁇ ⁇ ⁇ ⁇ , which makes the operation complicated, and the supply of Cre is also very difficult to adjust and expression control. There were problems such as instability.
  • the conventional method is complicated due to the complicated operation, the inability to uniformly introduce genes into all cells with plasmid, the persistence of plasmid DNA, and the high cost.
  • an object of the present invention is to establish a novel cell line for efficiently producing a virus vector without requiring complicated operations, and to provide a method for producing a high titer virus vector using the cell line. It is in.
  • the present inventors have established a novel cell line used for the production of a virus vector, and have found a method for producing a high titer virus vector using the cell line. Was completed.
  • the present invention relates to a cell used for the production of a virus vector, which expresses antisense: RNA against the entire sequence or a partial sequence of sense RNA expressing a gene encoding a cytotoxic polypeptide.
  • Antisense gene RNA against the entire sequence or a partial sequence of sense RNA expressing a gene encoding a cytotoxic polypeptide.
  • One or two or more introduced cells One or two or more introduced cells.
  • the present invention relates to the cell, wherein the gene encoding the polypeptide having cytotoxicity is a virus vector-derived gene.
  • the present invention relates to the cell, wherein the gene derived from one of the virus vectors is a gene derived from an adeno-associated virus vector.
  • the present invention also relates to the cell, wherein the gene derived from one of the adeno-associated virus vectors is a rep gene.
  • the present invention relates to the antisense gene comprising the sequence represented by SEQ ID NO: 1 Or antisense to a sequence in which a part of the sequence is deleted, substituted or added.
  • the present invention relates to the cell, which is an antisense gene that expresses RNA.
  • the present invention relates to the cell, wherein the cell is a cell having an accession number of FERMBP-7377.
  • the present invention relates to the aforementioned cell, wherein the polypeptide having cytotoxicity is a polypeptide that inhibits the growth of a helper virus.
  • the present invention relates to the cell, wherein the helper virus is an adenovirus.
  • the present invention relates to a method for producing a cell used for producing a virus vector, comprising the steps of: providing an antisense RNA against the entire sequence or a partial sequence of a sense RNA expressed by a gene encoding a cytotoxic polypeptide; The present invention relates to the method, wherein one or more expressed antisense genes are introduced.
  • the present invention relates to the method, wherein the gene encoding the polypeptide having cytotoxicity is a gene derived from Willis Yuichi.
  • the present invention relates to the above method, wherein the gene derived from the virus vector is a gene derived from the adeno-associated virus vector Yuichi.
  • the present invention relates to the method, wherein the gene derived from one of the adeno-associated virus vectors is a rep gene.
  • the present invention provides the above-mentioned method, wherein the antisense gene is an antisense gene that expresses an antisense RNA corresponding to the sequence shown in SEQ ID NO: 1 or a sequence in which a part of the sequence is deleted, substituted or added. About.
  • the present invention relates to the above method, wherein the cell is a cell having an accession number of FERMBP-7377.
  • the present invention relates to the aforementioned method, wherein the polypeptide having cytotoxicity is a polypeptide that inhibits the growth of a helper virus.
  • the present invention also relates to the above method, wherein the helper virus is an adenovirus.
  • the present invention relates to a method for producing a viral vector using the cells, wherein a step of obtaining a herpavirus expressing a gene derived from the viral vector, and Transfection of a herpesvirus expressing a virus vector-derived gene and a virus vector plasmid into cells into which no antisense gene has been introduced.
  • a gene encoding a polypeptide having cytotoxicity can be introduced into a cell used for producing a virus vector, and expressed in a cell, in order to produce a target viral vector. Even if there is sexual, in cells antisense gene is constitutively expressed, it is possible to suppress the expression of genes co one de a polypeptide having a '3 ⁇ 4 cytotoxicity.
  • the cell of the present invention itself suppresses the expression of a gene encoding a cytotoxic polypeptide, and therefore, as in the case of using the conventional CreoxP expression control system, the cytotoxic polypeptide is not used. There is no need to insert a special sequence into the gene encoding the peptide, and there is no need to supply a special enzyme into the cell to control gene expression. Thus, a desired virus vector can be produced.
  • the cell with accession number FE RM BP-737 77 was obtained from the National Institute of Advanced Industrial Science and Technology (AIST) at the Patent Organism Depositary Center ( ⁇ 305-85656, Tsukuba, Higashi, Ibaraki, Japan 1-1-1) No. 3) and deposited on January 21, 2001.
  • FIG. 1 is a photograph showing the results of Northern hybridization in which cells expressing the rep antisense of the present invention were confirmed.
  • FIG. 2 is a graph comparing the gene transfer efficiencies of a recombinant AAV vector solution prepared using the AdZA AV solution of the present invention and a recombinant AAV vector solution prepared using a conventional plasmid. .
  • FIG. 3 is a schematic diagram showing the structure of plasmid pCAGS / LN.
  • FIG. 4 is a schematic diagram showing the structure of plasmid pCAGS-r / anti-p5 + pl9 / LN.
  • FIG. 5 is a schematic diagram showing the structure of plasmid pAAV / Ad.
  • FIG. 6 is a schematic diagram showing the structure of cosmid pAdexlw.
  • FIG. 7 is a schematic diagram showing the structure of the cosmid pAdexlw / AAV.
  • FIG. 8 is a schematic diagram showing COS-TPC obtained by treating pAdexlw / AAV with EcoT22I.
  • FIG. 9 is a schematic diagram showing the configuration of the recombinant AAV vector vector plasmid pCAGSETN / sub.
  • FIG. 10 shows the nucleotide sequence of the PCR amplification product (P5-19 / PCR) introduced into cells expressing the rep antisense of the present invention.
  • virus vector refers to a virus that exists in nature and has been modified by DNA technology and inserted into the genome of a virus.
  • Virus vectors can be broadly classified into DNA virus vectors, whose viral genome is DNA, and RNA virus vectors, whose viral genome is RNA.
  • the virus vector has a function of introducing and expressing an arbitrary gene into a target cell by utilizing the gene transfer activity inherent in the virus.
  • Such viral vectors include adeno-associated virus (AAV) vector, adenovirus vector, mouse leukemia virus (MoMLV) vector, human immunodeficiency virus (HIV) vector, simian immunodeficiency virus (SIV) vector, Sendai virus vectors, herpes virus vectors, and the like.
  • AAV adeno-associated virus
  • MoMLV mouse leukemia virus
  • HAV human immunodeficiency virus
  • SIV simian immunodeficiency virus
  • Sendai virus vectors Sendai virus vectors
  • herpes virus vectors and the like.
  • pseudotypes in which one or more of a group of constituent proteins of a virus vector are replaced with a constituent protein of a heterologous virus, or a part of a nucleic acid sequence constituting genetic information is replaced with a nucleic acid sequence of a heterologous virus
  • Virus vectors of the type can also be used in the present invention.
  • high-titer virus vector refers to a virus vector having a high titer and a virus vector having a high gene transfer efficiency.
  • the titer of a virus vector is usually expressed in colony forming units (CFU).
  • CFU colony forming units
  • the evaluation is performed by introducing a virus vector in which a neomycin resistance gene has been inserted or substituted into the virus genome into any cell, and counting the number of colonies of cells grown in a neomycin-containing medium.
  • helper virus refers to a virus that is required to induce replication of a virus vector that cannot replicate alone.
  • AAV a virus that is defective in self-renewal and requires either adenovirus or herpes virus to replicate itself.
  • adenoviruses or herpes viruses are AAV helper viruses.
  • helper plasmid refers to, for example, cutting out a structural gene between the ITR sequence at the 5 'end and the ITR sequence at the 3' end of the wild-type AAV genome, and not packaging itself. It is a plasmid that retains a gene sequence that enables expression of a protein necessary for the production of an AAV vector. Helper plasmid can be constructed by a known method.
  • the wild-type 1'11 inverted terminal repeat
  • helper plasmid has no promoter-even sequence, and the AAV gene is expressed only from the AAV-derived promoter.
  • the helper plasmid used for production of the AAV vector can be transcribed from p5 by using 29.3 packaging cells.
  • p5 is an AAV promoter, which is usually located upstream of the rep gene.
  • vector plasmid refers to a plasmid having a foreign gene to be introduced (transfer gene).
  • transfer gene For example, the whole genome sequence of a wild-type AAV represented by psub201 is copied.
  • the wild-type AAV genomic sequence between the 5 'and 3' ITR sequences of the plasmid of the plasmid being replaced has been replaced with at least one gene marker and / or transgene.
  • the transgene contains at least one promoter and a poly A signal, and promoters include adenovirus (Ad), cytomegalovirus (CMV), human immunodeficiency virus (HIV), and adeno-associated virus (AAV).
  • Ad adenovirus
  • CMV cytomegalovirus
  • HAV human immunodeficiency virus
  • AAV adeno-associated virus
  • Simian virus 40 (SV40), Rous sarcoma virus (RSV), herpes simplex virus (HSV), mouse leukemia virus (MoMLV), Sindbis virus (Sindbis virus) s Sendai virus (SeV), hepatitis A Virus (HAV :), hepatitis B virus (HBV), hepatitis C virus (HCV), human papilloma virus (HPV), human papilloma virus (BPV), human T-cell leukemia virus (HTLV), vesicular intraoral Inflammation virus (VSV), influenza virus (Influenza virus), Japanese encephalitis virus (Japanese encephalitis viru, JC virus (JC viru ⁇ parvovirus B19)
  • parvovirus B19 promoters derived from viruses such as poliovirus (Poliovirus), SR-(alpha-subunit of signal-recognition granular receptor), myelin basic protein (MBP), glial-specific glial fibers Acidic acidic protein (GFAP), ⁇ -actin, elongation factor—hi (EF1-hi), glyceraldehyde-13-phosphate dehydrogenase (GAPDH), multidrug resistance gene (Mdrl), albumin alpha huet protein (AFP), heat shock protein (HSP), hypoxia-inducible protein (HIP), etc.
  • viruses such as poliovirus (Poliovirus), SR-(alpha-subunit of signal-recognition granular receptor), myelin basic protein (MBP), glial-specific glial fibers Acidic acidic protein (GFAP), ⁇ -actin, elongation factor—hi (EF1-hi), glyceraldehy
  • LTR which is a gene and a retrovirus-derived promoter that expresses them, is used in the U3 region of the LTR, for example, CAG, CMV, RSV, simple herpes virus-thymidine kinase (HSV-TK :), SV40 , SR-hi, MBP,?
  • CAG Promote is preferred because it allows high expression of genes in various organs of various experimental animals and humans.
  • a drug resistance gene such as a neomycin resistance gene can also be incorporated for selection.
  • the term "packaging cell” refers to a cell into which a gene encoding a necessary protein has been introduced in advance by, for example, integrating it into a chromosome in order to produce infectious virus particles. Virus particles produced in germ cells do not carry the viral genome. By supplying a packaging cell with a viral genome in which an arbitrary gene has been inserted or replaced, this viral genome is taken up by viral particles and a viral vector is produced.
  • Cells used as packaging cells include 293 cells, HeLa cells, COS cells, 3T3 cells, and the like. Since the helper virus is necessary for the production of the AAV vector, it is preferable that the cells be infected with the helper virus adenovirus.
  • cytotoxic polypeptide refers to a protein which, when produced in a cell for producing a viral vector, causes the cell to lose its normal state due to cytotoxicity. Containing polypeptide. Examples include the REP protein encoded by the rep gene, the viral envelope protein (ENV) encoded by the HIV env gene, and the viral envelope protein (VSV-1G) encoded by the VSV G gene.
  • the term "rep gene” is a gene derived from AAV, which encodes a REP protein involved in AAV replication.
  • the rep gene encodes four proteins: Large Rep (Rep78, Rep68), which is transcribed and translated from the viral p5 promoter, and Small Rep (Rep52, Rep40), which is transcribed and translated from the 19 promoter. ing. Large Rep and Small Rep vary in size due to splicing.
  • the REP protein encoded by the rep gene is involved in AAV replication, but inhibits adenovirus replication and is cytotoxic.
  • the nucleotide sequence of the rep gene is shown in SEQ ID NO: 5 and SEQ ID NO: 6, but is not limited to this sequence. As long as they have substantially the same functions and properties, even if a part of the sequence is deleted, substituted or added, it is included in the rep gene as used herein.
  • the antisense gene introduced into the cell of the present invention may be one or more antisense genes.
  • the antisense gene may have a plurality of copies of the same type of antisense gene introduced therein, or may contain a heterologous antisense gene, that is, a heterologous polypeptide.
  • a plurality of antisense genes for a plurality of genes to be introduced may be introduced.
  • the antisense gene may have a partially deleted, substituted or added nucleotide sequence.
  • G-3 (SEQ ID NO: 3); the underline indicates the BglII site.
  • Plasmid pAAV / Ad (Samulski, RJ et al., J. Virol., 63, 3822-3828, 1989; FIG. 5; obtained from Samulski), which carries the entire structural gene of AAV; A part of the coding region of the ⁇ gene was amplified by PCR (polymerase chain reaction). PCR was performed at 94 ° C for 5 minutes, followed by 30 cycles of 94 ° C for 30 seconds, 61 ° C for 30 seconds, and 72 ° C for 1 minute, and the reaction was performed again at 72 ° C.
  • the PCR reaction product was subjected to electrophoresis using 2% agarose gel and 1X TAE buffer, stained with ethidium bromide at a final concentration of S ⁇ gZml, and observed by ultraviolet irradiation in the usual manner. However, it was confirmed that an amplification product of about 0.8 kb was obtained.
  • the approximately 0.8 kb amplification product was recovered from the gel and digested with Bgl II.
  • pCAGS / LN (FIG. 3) was digested with BamHI, the ends were dephosphorylated by BAP treatment, and the BglII-digested amplification product was subcloned.
  • the nucleotide sequence of the clone obtained by subcloning was analyzed, and a clone in which the fragment was integrated in the direction in which the antisense of the rep gene was transcribed from the CAG promoter was selected (pCAGS-r / anti- p5 + P 19 / LN; Fig. 4).
  • the base sequence of the amplification product is shown in FIG.
  • CAG promoter is a chimeric promoter consisting of CMV early enhancer / avian actin promoter / 1/5 globin poly A.
  • Amp in the figure indicates an ampicillin-resistant gene that can be used as a selection marker.
  • CMV-IE Enhancer shows the early promoter-Euhansa sequence from cytomegalovirus (CMV).
  • SV40 ori is derived from Simian virus 40 (SV40) and is derived from SV40 Large T antigen. Indicates a replication origin to be replicated.
  • Egret-globin poIyA indicates a poly A signal derived from the Egret-globin gene.
  • the adenovirus ITR indicates an ITR (Inverted Terminal Repeat) derived from adenovirus type 5.
  • rep indicates a rep gene derived from AAV type 2.
  • cap indicates the cap gene derived from AAV type 2.
  • COS indicates a packaging recognition sequence derived from phage.
  • pBR322 ori indicates a plasmid origin of replication in E. coli derived from pBR322.
  • 293 cells were used to establish a rep antisense expressing cell line.
  • 293 cells were maintained in Dulbecco's modified Eagle's medium (DMEM; Gibco) supplemented with 10% fetal calf serum (Gibco) and antibiotics. The cells are cultured at about 70% confluence in a 10 cm dish, and the constructed plasmid pCAGS / anti-p5 + pl9 / LN (Fig. 4) is subjected to the known calcium phosphate method (M. Kringler, Gene Transfer and Expression). Protocol., A Labolatory Manua, Oxford University Press, 1990).
  • FBS Ham base Uz co modified Eagle's medium containing Gibco Co.
  • phosphate buffer PBS
  • G418 manufactured by Gibco
  • C0 2 was continued for Incubation evening 10 days of incubation in the primary, surviving cell population (colony) were separated one by one, further continued Inkyube one Chillon in fresh culture medium, neomycin-resistant cell lines (r ep antisense expressing cells).
  • RNA was extracted from the rep antisense-expressing cells obtained in Example 3 by AGP C (Acid-Guanidium-Phenol-Chroloform) method and used.
  • the prepared total RNA (15 jug) was subjected to electrophoresis with 1% formaldehyde-aga mouth gel and immobilized on Nitrocellulose Fill Yuichi (Hyb0ndN + : manufactured by Amersham).
  • pAAV / Ad (FIG. 5) was digested with XbaI and SacI, and a DNA fragment (SEQ ID NO: 4) specific to the P5 promoter overnight region of the rep gene of about 630 bP was recovered.
  • the L9 / 293 cells are a cell line that constantly expresses the antisense (SEQ ID NO: 1) of the rep gene. 2 Deposited on 1st, with accession number FERM BP-7377 Was commissioned.
  • the recombinant adenovirus vector used in this experiment was prepared according to the C0S-TPC method (Miyake, S. et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA., 93, 1320, 1996). 5 ⁇ g of the constructed cosmid pAdexlw / AAV and EcoT22 I-treated COS-TPC (FIG. 8) were added to the rep antisense-expressing L9 / 293 cells established in Example 4 by the calcium phosphate method. (Fig. 1). 37. C, 5% C0 2 was cultured for 12 hours under the conditions, cells were seeded in 96-well plates was continued for an additional 10 to 15 days culture.
  • the culture solution was collected from the cells in which the cells had died, together with the dead cells, and freeze-thaw was repeated 6 times, followed by centrifugation at 5,000 rpm for 5 minutes.
  • the supernatant was stored at 180 ° C as a primary virus solution.
  • the primary virus solution was used to infect L9 / 293 cells and HeLa cells, respectively. Three days after infection, no degeneration was observed in the HeLa cells, and with respect to the primary virus solution from which the L9 / 293 cells were completely killed, a culture solution of the killed cells was collected from the cloned L9 / 293 cells.
  • the collected culture was freeze-thawed six times and then centrifuged at 5,000 rpm for 5 minutes.
  • the supernatant was stored at -80 ° C as a secondary virus solution.
  • the cells from the preparation of the secondary virus solution were collected, suspended in 1 XTEN buffer (TEN: 5 OmM Tris-HC 1 (pH 8.0), 10 mM EDTA, 100 mM NaC 1) and homogenized. . SDS (10) was added to the homogenized suspension at a final concentration of 0.1%, and Proteinase K (MERCK, 2 Omg / m1) was added to a volume of 0.1 mgZml. Incubated at C for 1 hour. The phenol / cloth form extraction was performed twice, and the collected supernatant was further extracted twice and the supernatant was collected.
  • TEN 5 OmM Tris-HC 1 (pH 8.0), 10 mM EDTA, 100 mM NaC 1
  • SDS 10
  • Proteinase K MERCK, 2 Omg / m1
  • a TE buffer (1 OmM Tris-HCl (pH 8.0), 1 mM EDTA) was added to the DNA recovered by the ethanol precipitation to dissolve the DNA. After digestion of this DNA with EcoRI, agarose gel electrophoresis was performed to confirm the adenovirus genome and the presence of the inserted gene.
  • An AAV vector was prepared using the Ad / AAV solution.
  • the 293 cells were cultured in a 10 cm Petri dish using 10 ml of DMEM (10% FCS) until they reached 70% confluence.
  • the cells were scraped together with the culture solution, freeze-thawed repeatedly to destroy the cells, and then centrifuged at 3,000 rpm for 10 minutes to collect the supernatant. After heating at 56 ° C for 45 minutes to inactivate the adenovirus, the mixture was centrifuged at 3,000 rpm for 10 minutes, and the supernatant (recombinant AAV vector solution) was recovered.
  • the titer of the recombinant AAV vector obtained in Example 6 was assayed by the bioassay method using He La cells shown below.
  • step (2) comprises using a cell into which the antisense gene of the present invention has been introduced. It has been shown that by suppressing the production of cytotoxic Rep protein without the need for complicated operations, cell death can be prevented and a helper virus can be produced.

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Description

明細 i ウィルスベクターの製造に用いられる細胞、 その製法および その細胞を用いたウィルスぺク夕一の製造方法 技術分野
本発明は、 ウィルスベクター、 とくに高力価ウィルスベクターの製造に用いら れる細胞、 その製法およびその細胞を用いたウィルスベクタ一、 とくに高カ価ゥ ィルスべクタ一の製造方法に関する。
背景技術
近年、 ヒトを含む動物に対し、 遺伝子を導入する方法としてウィルスベクター を用いる方法が広く知られており、 用いられるウィルスベクタ一としては、 レト 口 sウィルス、 レンチウィルス、 アデノウイルス、 アデノ随伴ウィルスなどを利用 したウィルスベクターが知られている。
アデノ随伴ウィルス ( A A V : Adeno-Associated Virus) ベクターは、 ゲノム D N Aを宿主染色体 D N Aへ組み込むことができるが、 野生型 A A V自体は非病原 '性で fcる (N. IViuzyczka, Current Topics in icrobiolosv and Immunol oev, 158, 97, 1992) o A A Vベクタ一は、 造血幹細胞等の非分裂細胞へも遺伝子導入ができる ことや、 ヒトの第 1 9染色体に選択的に遺伝子導入することができる等の特徴が ある (M. Su adogo and R. G.Roder, Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A., 82, 4394, 1985)。 また、 A A V粒子は物理的に安定であるため、 ショ糖密度勾配超遠心法や硫酸セ ルロースァフィ二ティ一クロマトグラフィー等による濃縮により遺伝子導入効率 の高いベクタ一を調製することが可能である (K. Tamayose, et al., Hum. Gene Ther" 7, 507-513, 1996)。
A A Vは、 自己複製能の欠損したウィルス ( Dependentvirus属) であり、 増殖 には、 アデノウイルス (A d : Adenovirus) などのヘルパーウィルスの存在が必 要である。 これまで、 A A Vベクタ一を用いる場合、 ヘルパープラスミ ドとべク 夕一プラスミ ドとのコトランスフエクシヨンに加え、 ヘルパーウィルスであるァ デノウィルスの感染を同時におこなうことによつて調製されていた (R. M. Kotin, Hum. Gene Ther. 5, 793, 1994)。 しかし、 リン酸カルシウム法に代表されるトラン スフヱクシヨン法は、 ( 1 ) プラスミ ドの細胞への遺伝子導入効率に限界があり、 臨床の場で必要とされる高い力価のウィルスベクタ一を得ることは困難である、 ( 2 ) いくつかの口ヅトに分けてトランスフエクシヨンをおこなった場合に、 各 ロット間の遺伝子導入効率に差が生じ、 一定の力価のウィルスベクターを安定的 に供給することができない、 (3 ) トランスフエクシヨンの操作が繁雑であるた めに、 一度に大量のベクタ一を調製するのは困難である、 (4 ) 大量の AAVベ クタ一を調製するためには大量のトランスフエクシヨン用プラスミ ドを調製する 必要がある、 等の問題点が存在する。
このような問題点を解決する手段として、 ヘルパープラスミ ドを、 ウイルスべ ク夕一産生細胞のゲノム D N Aに組み込んだパッケージング細胞が考えられてい る。 この細胞株は、 プラスミ ド由来の D NAがゲノム: D NAに安定的に組み込ま. れているため細胞分裂の際にも娘細胞に受け継がれることから、 任意の規模で培 養することにより、 必要に応じた量の組換えウィルスを安定的に得ることができ る。 一般的に、 これらのパッケージング細胞株の樹立は、 ネオマイシン耐性遺伝 子や、 ハイグロマイシン耐性遺伝子等の薬剤耐性遺伝子を保持したヘルパーブラ スミ ドを、 ウィルスぺクタ一を産生させるための細胞にトランスフエクシヨンす ることにより行われ、 その細胞を抗生物質の含有する培地で長期間培養すること により、 ゲノム D N Aにプラスミ ド由来の遺伝子が組み込まれたパッケージング 細胞が得られる。 AAVベクタ一の調製には、 アデノウイルスの E 1 A、 E 1 B 遺伝子を恒常的に発現している 2 9 3細胞が用いられている。 2 9 3細胞は、 ヒ ト胎児腎細胞がアデノウイルス 5型 (A d 5 ) の E 1遺伝子 (E 1 Aおよび E 1 B遺伝子) により形質転換して樹立された細胞株である。
アデノウィルスの E 1 A蛋白質は、 AAVの p 5プロモ一夕一からの転写を誘 導し、 AAVの R E P蛋白質を発現させる。 R E P蛋白質は、 AAVゲノムがヒ トの第 1 9染色体に選択的に遺伝子導入される際に必要な蛋白質であると同時 に、 細胞の蛋白質合成系を、 AAV粒子を作らせる方向に向かわせると考えられ ている。 しかしながら、 R E P蛋白質は細胞毒性を有し、 細胞の増殖を抑制する 性質を有する。 さらにまた、 アデノウイルスの E 1 Bと E 4は mR NAの蓄積、 E 2 Aと V Aは mR N Aのスブライシングと翻訳に必要であると考えられている (N. Muzyczka, Current Tonics in Microbiology and Immunology, 158, 97, 199^0 アデノウイルス 5型の E 1遺伝子を恒常的に発現している 2 9 3細胞では、 ァ デノウィルスの混入がなくても AAVの p 5プロモー夕一が活性化され、 R E P 蛋白質が発現する。 この R E P蛋白質を恒常的に発現させると細胞の増殖阻害が 起こるため細胞が死滅する。 このような理由から 2 9 3細胞での AAVベクタ一 のパヅケ一ジング細胞の製造は困難であった。 さらに、 R E P蛋白質は、 ヘルパ —ウィルスであるアデノウィルスの増殖を抑制する作用があり、 r e p遺伝子が 恒常的に発現した細胞の中では、 アデノウィルスの増殖が抑制されてしまう。 r e p遺伝子産物 (すなわち、 R E P蛋白質) の細胞への毒性、 およびヘルパー ウィルスのアデノウィルスの増殖抑制を回避するために、 様々な方法が検討され ている。 A A Vベクタ一に組み込まれるベクタ一プラスミド由来の遺伝子配列の みを導入して樹立したパッケージング細胞に対して、 r e pおよび/または c a P遺伝子をコードする遺伝子を公知の方法により導入し、 AAVベクタ一を調製 する方法も考えられている。 こので e pおよび Zまたは c a p遺伝子をコードす る遺伝子配列の細胞への導入法には、 大きく分けて、 組換えウィルスを用いる方 法と用いない方法があるが、 アデノウイルスを用いる方法では遺伝子導入効率が 高く、 力価がより高い AAVベクタ一を産生するのに好ましい。
パッケージング細胞に 2 9 3細胞を使用した場合には、 この細胞にすでにアデ ノウィルスの E 1遺伝子が保持されているため、 A A Vベクタ一を製造する際、 野生型アデノウイルスではなく、 E 1欠損型アデノウイルスを感染させるだけで も、 AAVベクタ一を製造することができる。 そこでこの E 1欠損領域に AAV の r e pおよび Zまたは c a p遺伝子をコードする遺伝子配列を組み込んだァデ ノウィルスによって R E Pおよび/または C A P蛋白を供給する方法が考えられ た。 しかしながら、公知の C O S— T P C法(鐘ケ江ら、 実験医学 Vol. 12, No. 3, 1994, S. Miyake. Et al., Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A., 93, 1320, 1996、 特閧平 8— 8 4 5 8 9号、 特閧平 7— 2 9 8 8 7 7号) によりアデノウイルスを調製しようと すると、 2 9 3細胞において R E P蛋白質の発現が起こるため、 : r e p遺伝子を ゲノム配列内に保持したアデノウィルスを得ることができない。 特開平 1 0— 3 3 1 7 5号では、 C r e/ 1 o x P発現制御システムを用いて r e p遺伝子の発現を制御することによって、 2 9 3細胞における組換え AAV ベクタ一を製造する方法が開示されている。しかしながら、この方法を用いても、 C r e / 1 o x P発現制御システムでの r e ρ遺伝子の発現制御は完全ではな い。 また、 AA Vベクタ一を製造する場合に、 C r eを供給して Ι ο χ Ρを切り 出す必要があり、 操作が煩雑で、 さらに C r eの供給についても非常に調整が難 しく発現制御が不安定となるなどの問題点があつた。
このように、 従来の方法では、 操作が煩雑であること、 プラスミ ドではすベて の細胞に一様に遺伝子導入できないこと、 プラスミ ド DNAが残留すること、 コ ストが高いことなどの理由から、 所望の AAVベクターを効率よく製造する方法 が望まれていた。
発明の開示
したがって、 本発明の目的は、 煩雑な操作を必要とせず、 ウィルスベクターを 効率よく製造するための新規細胞系を樹立し、 該細胞系を用いた高力価ウィルス ベクターの製造方法を提供することにある。
本発明者は、 前記課題を解決すべく鋭意研究を重ねた結果、 ウィルスベクター の製造に用いる新規細胞系を樹立し、 該細胞系を用いた高力価ウィルスベクター の製造方法を見出し、 本発明を完成するに至った。
すなわち、 本発明は、 ウィルスベクタ一の製造に用いられる細胞であって、 細 胞毒性を有するポリペプチドをコードする遺伝子が発現するセンス R N Aの全配 列または一部配列に対するアンチセンス: R N Aを発現するアンチセンス遺伝子が
1又は 2以上導入された、 前記細胞に関する。
また本発明は、 細胞毒性を有するポリペプチドをコードする遺伝子が、 ウィル スベクター由来の遺伝子である、 前記細胞に関する。
さらに本発明は、 ウィルスベクタ一由来の遺伝子が、 アデノ随伴ウィルスべク 夕一由来の遺伝子である、 前記細胞に関する。
また本発明は、 アデノ随伴ウィルスベクタ一由来の遺伝子が、 r e p遺伝子で ある、 前記細胞に関する。
さらに本発明は、 アンチセンス遺伝子が、 配列番号 1で示される配列およびノ または該配列の一部が欠失、 置換若しくは付加された配列に対するアンチセンス
R N Aを発現するアンチセンス遺伝子である、 前記細胞に関する。
また本発明は、 細胞が、 受託番号が F E RM B P— 7 3 7 7の細胞である、 前記細胞に関する。
さらに本発明は、 細胞毒性を有するポリペプチドが、 ヘルパーウィルスの増殖 を阻害するポリペプチドである、 前記細胞に関する。
また本発明は、 ヘルパーウィルスが、 アデノウイルスである、 前記細胞に関す る。
さらに本発明は、 ウィルスベクタ一の製造に用いられる細胞を製造する方法で あって、 細胞毒性を有するポリべプチドをコードする遺伝子が発現するセンス R N Aの全配列または一部配列に対するアンチセンス R N Aを発現するアンチセン ス遺伝子を 1又は 2以上導入することを特徴とする、 前記方法に関する。
また本発明は、 細胞毒性を有するポリペプチドをコードする遺伝子が、 ウィル スぺク夕一由来の遺伝子である、 前記方法に関する。
さらに本発明は、 ウィルスベクター由来の遺伝子が、 アデノ随伴ウィルスべク 夕一由来の遺伝子である、 前記方法に関する。
また本発明は、 アデノ随伴ウィルスベクタ一由来の遺伝子が、 r e p遺伝子で ある、 前記方法に関する。
さらに本発明は、 アンチセンス遺伝子が、 配列番号 1で示される配列およびノ または該配列の一部が欠失、 置換若しくは付加された配列に対するアンチセンス R N Aを発現するアンチセンス遺伝子である、 前記方法に関する。
また本発明は、 細胞が、 受託番号が F E RM B P— 7 3 7 7の細胞である、 前記方法に関する。
さらに本発明は、 細胞毒性を有するポリペプチドが、 ヘルパーウィルスの増殖 を阻害するポリペプチドである、 前記方法に関する。
また本発明は、 ヘルパーウィルスが、 アデノウイルスである、 前記方法に関す る ο
さらに本発明は、前記細胞を用いてウィルスベクターを製造する方法であって、 ウィルスベクター由来の遺伝子を発現するへルパ一ウィルスを得る工程、 および アンチセンス遺伝子が導入されていない細胞に、 ウィルスベクター由来の遺伝 子を発現するへルパ一ウィルスとウィルスベクタ一プラスミドをトランスフエク シヨンする工程
を含むことを特徴とする、 前記方法に関する。
本発明によれば、 目的のウィルスベクターを製造するために、 細胞毒性を有す るポリペプチドをコードする遺伝子が、 ウィルスベクタ一の製造に用いられる細 胞に導入され、 細胞内で発現する可能性がある場合でも、 細胞内ではアンチセン ス遺伝子が恒常的に発現しており、' ¾細胞毒性を有するポリぺプチドをコ一ドする 遺伝子の発現を抑えることができる。
すなわち、 本発明の細胞自体が、 細胞毒性を有するポリペプチドをコードする 遺伝子の発現を抑えるので、 従来の C r e 1 o x P発現制御システムを利用し た場合のように、 細胞毒性を有するポリぺプチドをコードする遺伝子に特別な配 列を挿入しておく必要もなく、 また、 遺伝子の発現制御をするために、 特別な酵 素を細胞内に与える必要もなくなるので、 簡便な操作で効率的に目的のウィルス ベクターを製造することができる。
なお、 受託番号が F E RM B P— 7 3 7 7の細胞は、 独立行政法人産業技術 総合研究所特許生物寄託センタ一 (〒 3 0 5— 8 5 6 6日本国茨城県つくば巿東 1丁目 1番 3号) に 2 0 0 0年 1 1月 2 1日付で寄託された細胞である。
図面の簡単な説明
図 1は、 本発明の r e pアンチセンスを発現する細胞を確認したノーザンハイ ブリダィゼ一シヨンの結果を示す写真である。
図 2は、 本発明の A dZA A V溶液を用いて調製した組換え A A Vベクタ一溶 液と、 従来のプラスミドを用いて調製した組換え AAVベクタ一溶液との遺伝子 導入効率を比較したグラフである。
図 3は、 プラスミド pCAGS/LNの構成を示す概略図である。
図 4は、 プラスミド pCAGS-r/anti-p5+pl9/LNの構成を示す概略図である。 図 5は、 プラスミド pAAV/Adの構成を示す概略図である。
図 6は、 コスミド pAdexlwの構成を示す概略図である。
図 7は、 コスミ ド pAdexlw/AAVの構成を示す概略図である。 図 8は、 pAdexlw/AAVを E c o T 2 2 I処理した C O S— T P Cを示す概略 図である。
図 9は、 組換え A A Vベクタ一べク夕一プラスミ ド pCAGSETN/sub の構成を 示す概略図である。
図 1 0は、 本発明の r e pアンチセンスを発現する細胞に導入した P C R増幅 産物 (P 5— 1 9 /P C R ) の塩基配列である。
発明を実施するための形態
本明細書でいう 「ウィルスベクタ一」 とは、 自然界に存在するウィルスを組換 え DNA技術により改変したもので、 任意の遺伝子をウィルスのゲノムに挿入し たものをさす。 ウィルスベクターは、 ウィルスゲノムが DNAである DNAウイ ルスべクタ一と、 ウィルスゲノムが RNAである RNAウィルスベクタ一に大別 できる。 ウィルスベクタ一は、 ウィルスがもともと持つ遺伝子導入活性をを利用 して、 任意の遺伝子を標的細胞に導入して発現させる機能を有している。 このよ うなウィルスベクターとしては、 アデノ随伴ウィルス (AAV) ベクター、 アデ ノウィルスベクタ一、 マウス白血病ウィルス (MoMLV) ベクタ一、 ヒト免疫不 全ウィルス (H I V) ベクター、 サル免疫不全ウィルス (S I V) ベクター、 セ ンダイウィルスベクター、 ヘルぺスウィルスベクターなどがあげられる。 また、 ウィルスベクタ一の構成蛋白質群のうち 1つ以上を、 異種ウィルスの構成蛋白質 に置換する、 もしくは、 遺伝子情報を構成する核酸配列のうち 1部を異種ウィル スの核酸配列に置換する、 シユードタイプ型のウィルスベクターも本発明に使用 できる。
また、 高力価ウィルスベクターとは、 力価の高いウィルスベクタ一のことをい い、 遺伝子導入効率が高いウィルスベクターのことをいう。 ウィルスベクタ一の 力価は、 通常、 CFU (colony forming units) で表される。 例えば、 ウィルスゲノ ムにネオマイシン耐性遺伝子を挿入、 もしくは置換したウィルスぺク夕一を任意 の細胞に遺伝子導入して、 ネオマイシン含有培地で生育した細胞のコロニー数を 数えるという方法で評価される。
本明細書でいう 「ヘルパーウィルス」 とは、 単独では複製し得ないウィルスべ クタ一の複製を誘導するために必要とされるウィルスをいう。 例えば、 AA Vで は、 自己複製能の欠損したウィルスであり、 それ自身の複製にはアデノウイルス あるいはヘルぺスウィルスのいずれかが必要である。 このようなアデノウィルス あるいはヘルぺスウィルスが、 A A Vのヘルパーウィルスである。
本明細書でいう 「ヘルパープラスミ ド」 とは、 例えば、 野生型 A A Vのゲノム の 5 '末端側の I T Rおよび 3 '末端側の I T R配列の間の構造遺伝子を切り出し、 それ自身はパッケージングされず、 A A Vベクタ一の産生に必要な蛋白質を発現 することを可能とする遺伝子配列を保持するようなプラスミ ドのことである。 へ ルパープラスミ ドは、 公知の方法により構築することができる。 ここで、 野生型 八¥の1丁11 (inverted terminal repeat) とは、 A A Vのゲノム D N Aの両末端 に存在する 1 4 5塩基の配列であって、 T型のヘアピン構造を持ち、 ウィルスの 複製、 パッケージング、 染色体への組み込み等に必須である (R. Samulski et al., Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 79, 2077, 1982)。 このへルパープラスミ ドにはプロモ —夕一配列がなく、 A A V由来のプロモーターからのみ AA V遺伝子は発現され る。 AA Vベクタ一の製造に用いるヘルパープラスミ ドは、 パッケージング細胞 を 2 9 3細胞とすることにより、 p 5からの転写ができる。ここでいう p 5とは、 AAVのプロモ一夕一であって、 通常、 r e p遺伝子の上流に存在する。
本明細書でいう 「ベクタープラスミ ド」 とは、 導入する目的の外来遺伝子 (導 入用遺伝子) を有するプラスミ ドで、 例えば、 p s u b 2 0 1に代表される野生 型 A A Vの全ゲノム配列をコ一ドするプラスミ ドのゲノムの 5 '末端側の I T R と 3 '末端側の I T R配列間の野生型 A A Vゲノム配列が、 少なくとも 1つの遺 伝子マーカ一および/または導入用遺伝子で置換されている A A Vベクタ一ブラ スミ ドをいう。 導入用遺伝子は、 少なくとも 1つのプロモー夕一とポリ Aシグナ ルを含み、 プロモーターとしては、 アデノウイルス (A d )、 サイ トメガロウイ ルス (CMV)、 ヒト免疫不全ウィルス (H I V)、 アデノ随伴ウィルス (AAV)、 シミアンウィルス 4 0 (SV40)、 ラウス肉腫ウィルス (RSV)、 単純ヘルぺスゥ ィルス (HSV)、 マウス白血病ウィルス (MoMLV)、 シンビスウィルス (Sindbis virus) s センダイウィルス (SeV)、 A型肝炎ウィルス (HAV:)、 B型肝炎ウィル ス (HBV)、 C型肝炎ウィルス (HCV)、 ヒトパピローマウィルス (HPV)、 ゥシ パピローマウィルス (BPV)、 ヒト T細胞白血病ウィルス (HTLV)、 水疱性口内 炎ウィルス (VSV)、 インフルエンザウイルス (Influenza virus)、 日本脳炎ウィル ス (Japanese encephalitis viru 、 JCウィルス ( JC viru^ パルボウイルス B19
(Parvovirus B19)、 ポリオウイルス (Poliovirus) 等のウィルス由来のプロモー夕 ―、 SR - (シグナル認識粒状レセプ夕一のアルファサブュニヅト)、 ミエリン 塩基性蛋白質 (MBP)、 グリア特異的グリア線維性酸性蛋白質 (GFAP)、 β—ァ クチン、 伸長因子—ひ (EF 1—ひ)、 グリセルアルデヒド一 3—リン酸デヒドロ ゲナーゼ (GAPDH)、 多剤耐性遺伝子 (Mdrl)、 アルブミンアルファフエトプロ ティン (AFP)、 熱ショック蛋白質 (HSP)、 低酸素誘導蛋白質 (H I P) 等の哺 乳類由来のプロモ一夕一、 もしくは、 CMV初期ェンハンサ一ノトリ/?ァクチン プロモ一夕一//?グロビンポリ Aからなるキメラプロモ一夕一 (CAG)、 CMV 初期ェンハンサ一 /アルファースケルトンァクチンプロモ一夕一からなるキメラ プロモーター等のキメラ型プロモーター等を含む。 また、 遺伝子とそれらを発現 させるレトロウィルス由来のプロモーターである LTR を、 LTRの U3領域を例 えば、 CAG、 CMV、 RSV、単純へルぺスゥィルス—チミジンキナーゼ(HSV一 TK:)、 SV 4 0、 SR—ひ、 MBP、 ?—ァクチン、 EF1 —ひ等のプロモ一夕一に置換した、 キメラ型 LTR等が挙げられるが、 遺伝子の発現効率が高く、 プロモー夕一に宿 主、 臓器特異性がないため、 各種実験動物やヒトの様々な臓器で、 遺伝子を高発 現できる等の理由から CAG プロモー夕一が好ましい。 ネオマイシン耐性遺伝子 等の薬剤耐性遺伝子を選択のために組み込むこともできる。
本明細書でいう 「パッケージング細胞」 とは、 感染性を有するウィルス粒子を 産生するために、 必要な蛋白質をコードする遺伝子を染色体に組み込むなどして あらかじめ導入した細胞のことであるが、 パッケージング細胞で産生されるゥィ ルス粒子はウィルスゲノムを保持しない。 パッケージング細胞に、 任意の遺伝子 を揷入、 もしくは置換したウィルスゲノムを供給することによって、 このウィル スゲノムはウィルス粒子に取り込まれ、 ウィルスベクタ一が産生されるというも のである。 パッケージング細胞に用いられる細胞には、 2 9 3細胞、 H e L a細 胞、 COS細胞、 3 T 3細胞などが挙げられる。 AAVベクター作製に際してはへ ルパーウィルスが必要であるので、 ヘルパーウィルスであるアデノウィルスが感 染しゃすい 2 9 3細胞が好ましい。 本明細書でいう 「細胞毒性を有するポリペプチド」 とは、 ウィルスベクタ一を 製造するための細胞内で産生された場合、 細胞毒性によって該細胞が正常な状態 を保てなくなる原因となる蛋白質を含むポリペプチドをいう。 例えば、 r e p遺 伝子にコードされる R E P蛋白質、 H I Vの env遺伝子にコードされるウィル ス皮膜蛋白質(ENV)、 VSVの G遺伝子にコードされるウィルス皮膜蛋白質( VSV 一 G) などがあげられる。
本明細書でいう 「r e p遺伝子」 とは、 A A V由来の遺伝子であって、 AAV の複製に関与する R E P蛋白質をコードしている遺伝子である。 r e p遺伝子は、 ウィルス p 5プロモ一夕一から転写、 翻訳される Large Rep (Rep78、 Rep68) と 1 9プロモー夕一から転写、 翻訳される Small Rep ( Rep52, Rep40) の 4つの 蛋白質をコードしている。 Large Repと Small Repはスプライシングによってサ ィズが変わる。 r e p遺伝子にコードされる R E P蛋白質は、 AAV複製に関与 するが、 一方でアデノウイルスの複製は阻害し、 細胞毒性を有する。 r e p遺伝 子の塩基配列については配列番号 5および配列番号 6で示しているが、 この配列 だけに限定されるものではない。実質的に同等の機能および性質を有していれば、 配列の一部が欠失、 置換または付加されていても、 本明細書でいう r e p遺伝子 に ι3まれる。
本発明の細胞に導入されるアンチセンス遺伝子は、 1又は 2以上のアンチセン ス遺伝子であってよい。 アンチセンス遺伝子が 2以上細胞に導入される場合、 ァ ンチセンス遺伝子は、 同種のアンチセンス遺伝子が複数コピー導入されていても よく、 また、 異種のアンチセンス遺伝子、 すなわち、 異種のポリペプチドをコ一 ドする複数の遺伝子に対する複数のアンチセンス遺伝子が導入されていてもよ い。 さらに、 細胞毒性を有するポリペプチドをコードする遺伝子の発現を抑える 性質を有する限り、 アンチセンス遺伝子の塩基配列が一部が欠失、 置換若しくは 付加された配列であってもよい。
以下、 本発明を実施例を示しながら、 さらに詳細に説明するが、 本発明は以下 の実施例のみに限定されるものではない。
[実施例:!
害施例 1 プラスミド pCAGS-r/anti-p5+P19/LNの構築 r e p遺伝子の p 5プロモー夕一の転写開始点を含むように、 B g 1 I Iサイ ト をデザインしたプライマ一 (repS; 5, : -GAAGATCTTCCATT TTGAAGCGGGAGGTTTGAACG-35 ; (配列番号 2 );下線は B g 1 I Iサイ トを示す) と、 p 19プロモー夕一の転写開始点から約 200 bp 下流に、 Bgl I Iサイ トをデザインしたプライマ一 (repA ; 55 ; -GA AGATCTGAATTCGCCGCATTGAAGGAGATGTATGAG
G— 3, ; (配列番号 3);下線は Bgl I Iサイトを示す) を設計した。
A A Vの全構造遺伝子を保持するプラスミ ド pAAV/Ad (Samulski, R. J. et al., J. Virol., 63, 3822 - 3828, 1989;図 5 ; Samulski氏より入手) を鎵型にして、 ; r θ Ρ遺伝子のコーディング領域の一部を PCR (ポリメラ一ゼ連鎖反応) により増 幅した。 PCR条件は、 94°Cで 5分反応後、 94°C30秒、 61°C30秒、 7 2°C1分を 30サイクルし、 再度 72 °Cで反応を行った。 PCR反応物を、 常法 にしたがい、 2%ァガロースゲル、 1 X TAEバッファ一を用いて電気泳動を行 い、 終濃度 S^gZmlのェチジゥムブロマイドにより染色し、 紫外線照射によ り観察したところ、 約 0. 8 kbの増幅産物が得られたことが確認された。
この約 0. 8 kbの増幅産物をゲルから回収し、 Bgl I I消化した。一方で、 pCAGS/LN (図 3) を BamH I消化後、 末端を BAP処理により脱リン酸化し、 前述の Bgl I I消化した増幅産物をサブクローニングした。 サブクローニング で得られたクローンの塩基配列の解析を行い、 C AGプロモ一夕一から r e p遺 伝子のアンチセンスが転写される方向に断片が組み込まれたクローンを選択した ( pCAGS-r/anti-p5+P19/LN;図 4 )。
なお、 増幅産物の塩基配列は図 10に示す。
ここで、 C AGプロモーターとは、 CMV初期ェンハンサ一 /トリ^アクチン プロモ一夕一/ 5グロビンポリ Aからなるキメラプロモ一夕一である。
また、 図中の ampは、 選択マ一カーとして使用できるアンピシリン耐性遺伝 子を示す。
CMV - I Eェンハンサ一は、 サイトメガロウィルス (CMV) 由来の初期プロ モ—夕一のェンハンサ—配列を示す。
SV40 oriは、 シミアンウィルス 40 (SV40) 由来で、 SV40 Large T抗原によ り複製される複製起点を示す。
ゥサギ ?一グロビン poIyAは、 ゥサギ ?一グロビン遺伝子由来のポリ Aシグ ナルを示す。
実施例 2 プラスミ ド pAdexlw/AAVの構築
pAAV/Ad (図 5) から、 八八¥の 6 遺伝子ぉょび0 & 遺伝子を含む約 4. 3kbの Xb a l断片を回収した。 次にこの Xba l断片をコスミ ド pAdexlw (Miyake, S. et al Proc. Natl. Acad. Sci. USA., 93, 1320-1324, 1996.;図 6 ; 斉藤氏より入手) の Swa l部位にサブクローニングし、 コスミ ド pAdexlw/AAV (図 7) を構築した。 なお、 遺伝子断片の回収およびサブクロー ニングは実施例 1と同様にして行った。
また、 図中のアデノウイルス I TR (Ad I TR) は、 アデノウイルス 5型由 来の I T R (Inverted Terminal Repeat) を示す。
repは、 AAV 2型由来の rep遺伝子を示す。
capは、 AAV 2型由来の cap遺伝子を示す。
COSは、 えファージ由来のパヅケージング認識配列を示す。
pBR322 oriは、 pBR322由来の大腸菌内でのプラスミド複製起点を示す。
実施例 3 r e pアンチセンス発現細胞株の樹立
r epアンチセンス発現細胞株を樹立するために 293細胞を用いた。 293 細胞を 10%牛胎児血清 (Gibco社製) および抗生物質を補充したダルベッコ改 良イーグル培地 (DMEM; Gibco社製) 中に維持した。 この細胞を 10 cmの ディヅシュで約 70 %コンフルェントの状態に培養して、 構築したプラスミ ド pCAGS/ anti-p5+pl9/LN (図 4)を公知のリン酸カルシウム法( M. Kringler, Gene Transfer and Expression Protocol., A Labolatory Manua, Oxford University Press, 1990) により トランスフエクシヨンした。 トランスフエクシヨンした 293細胞 を C 02ィンキュベー夕一内(培養条件;細胞は 10 %ゥシ胎仔血清(FBS、 Gibco 社製) を含むダルべヅコ改変イーグル培地 (DMEM、 Gibco社製) を用いて 5% 酸素濃度、 37°C条件下で培養した) で 4時間インキュベーションした後、 新鮮 な培養液に置換してさらに 2日間ィンキュベーションした。
次にトランスフエクタントのみを選択するために、 リン酸バッファ一 (PBS (一)、 Gibco社製) で細胞を 2度洗浄後、 トリプシン— E D T A混液により細 胞を培養皿から剥がし、 新しい 10 cmの培養皿に再播種した。 細胞が培養皿に 接着したのを確認後、 ネオマイシンの類縁物質である G418 (Gibco社製) を 培養液中に最終濃度 1000 g/mlになるように添加した。 C02インキュ ベー夕一内で 10日間インキュベーションを続けた後、 生き残った細胞集団 (コ ロニー)を 1つずつ分離し、新鮮な培養液中でさらにィンキュベ一シヨンを続け、 ネオマイシン耐性細胞株 (r epアンチセンス発現細胞) を得た。
実施例 r epアンチセンス発現量の確認
実施例 3で得られた r e pアンチセンス発現細胞から AGP C (Acid- Guanidium-Phenol-Chroloform) 法により全 RNAを抽出して使用した。 調製した トータル RNA ( 1 5 ju g) を 1 %ホルムアルデヒド—ァガ口一スゲルで電気泳 動し、 ニトロセルロースフィル夕一 (Hy b 0 ndN+:アマシャム社製) に固 定化した。 pAAV/Ad (図 5) を Xb a Iおよび S a c Iで消化し、 約 630 b Pの r e p遺伝子の P 5プロモ一夕一領域に特異的な D N A断片 (配列番号 4) を回収した。
この断片を32 Pでラベルしたプロ一プを用いてノーザンハイブリダィゼーショ ン (42°C、 12時間) を行った。 メンプレンを 5 XSSC、 50%ホルムアミ ド、 I Xデンハールト水溶液、 0. 2%SDS、 10%硫酸デキストラン、 熱変 性させた 200 /g/mlのサケ精巣 DNAを含むバッファ一中に入れ、 ラジオ アイソト一プでラベルしたプロ一ブ DNAを加え 65°Cでハイブリダィズした。 その後フィル夕一を 55°Cの 2 X S S C/0.5 %SD Sバッファ一中で洗浄し、 さらに 55°Cの 0. 1 XSS CZ0. 5 %SDSバッファ一中でもう一度洗浄し た。 X線フィルム上でォ一トラジオグラフィーにかけて、 ネオマイシン耐性細胞 株における r epアンチセンスの発現を碑認した (図 1)。 特にクローン L 9/ 293 (以下、 L 9/293細胞と称する) は、 高い r e pアンチセンスの発現 を示した。
なお、 L 9/2 93細胞は r ep遺伝子のアンチセンス (配列番号 1 ) を恒常 的に発現する細胞株であって、 通商産業省工業技術院生命工学工業技術研究所に 2000年 1 1月 2 1日付で寄託され、 寄託番号 FERM BP— 7377とし て受託された。
実施例 5 rep— cap発現アデノウイルスの作製
本実験で用いられる組換えアデノウイルスベクタ一は C 0 S— T P C法 (Miyake, S. et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA.,93, 1320, 1996) に従って作製した。 構築したコスミ ド pAdexlw/AAVを と EcoT22 I処理した C OS- TP C (図 8) を 5〃gとを、 リン酸カルシウム法にて実施例 4で樹立した r e pアンチセンス発現細胞の L 9/293細胞 (図 1) にトランスフエクシヨンし た。 37。C、 5%C02条件下で 12時間培養した後、 細胞を 96穴プレートに 播種し、 さらに 10〜15日間培養を続けた。 細胞が死滅したゥエルから死滅細 胞ごと培養液を回収し、 凍結融解を 6回繰り返した後、 5, 000 rpm、 5分 間遠心分離した。 上清を 1次ウィルス液として一 80°Cにて保存した。 1次ウイ ルス液を L 9/293細胞および H e La細胞にそれそれ感染させた。 感染 3日 後に H e L a細胞では変性が認められず、 L 9/293細胞が完全に死滅した 1 次ウィルス液について、 クローンの L 9/293細胞から死滅細胞ごと培養液を 回収した。 回収した培養液は、 凍結融解を 6回行った後、 5, 000 rpm、 5 分間遠心分離した。 上清を 2次ウィルス液として— 80°Cにて保存した。
2次ウィルス液を調製した際の細胞を回収し、 1 XTEN緩衝液 (TEN : 5 OmM T r i s -HC 1 (pH 8. 0)、 10 mM EDTA、 100 mM NaC 1) 中に懸濁しホモジナイズした。 ホモジナイズした懸濁液に SDS ( 1 0 ) を終濃度 0. 1 %、 Proteinase K (MERCK社製、 2 Omg/m 1 ) を 0. lmgZmlとなるように加え、 緩やかに転倒混和し、 50°Cで 1時間インキュ ペートした。 フヱノール ·クロ口ホルム抽出を 2回行い、 回収した上清からさら にクロ口ホルム抽出を 2回行い上清を回収した。 ェ夕ノ一ル沈澱により回収した DNAに適量の TE緩衝液 ( 1 OmM Tr i s-HCl (pH 8. 0)、 1 m M EDTA) を加え、 DNAを溶解した。 この DNAを E c o R I消化した後 に、 ァガロースゲル電気泳動を行い、 アデノウイルスゲノムおよび、 挿入遺伝子 の有無を確認した。
この操作で選択したクローンの 2次ウィルス液から、 L 9/293細胞に感染 させ、 細胞が死滅したものについて、 死滅細胞ごと培養液を回収し、 凍結融解を 6回繰り返した後、 3, 000 rpm、 10分間遠心分離した。 上清を 3次ウイ ルス液として一 80°Cにて保存した。 同様の操作でスケールアップを行い、 最終 的に 4次ウィルス液 (以下、 Ad/AAV溶液と称す) を調製し、 — 80°Cにて 保存した。
実施例 6 Ad/A A V溶液を利用した組換え A A Vベクターの調製
Ad/AAV溶液を用いて、 AAVベクタ一の調製を行った。
293細胞を 10 cmシャーレで、 10mlの D MEM ( 10%F C S) を用い て 70%コンフルェントの状態になるまで培養した。
実施例 5で調製した Ad/AAV溶液 60〃1を加ぇたDMEM(2%FCS) lmlを、 培地を除いたシャーレに加えて、 1時間インキュベートした。 DME M ( 10%FCS) を 8ml加えた後、 AAV由来の I TRの間に C AGプロモ 一ターで誘導される EGFP (ォワンクラゲ由来の緑色蛍光蛋白質で、 紫外線照 射下で緑色蛍光を発するという性質を有する) 遺伝子と、 TKプロモーター (単 純へルぺスウィルスのチミジンキナーゼ遺伝子由来のプロモ一夕一) で誘導され るネオマイシン耐性遺伝子を含む組換え AAVベクターベクタ一プラスミ ド pCAGSETN/sub (図 9 ) 10〃 gをリン酸カルシウム法により 293細胞に小ラ ンスフエクシヨンした。 6時間後に培地を除去し、 DMEM (10%FCS) を 6 ml加えて、 2日間培養した。
細胞を培養液ごとかき集め、 凍結融解を繰り返して細胞を破壊した後、 3, 0 00 r pm、 10分間遠心分離し、上清を回収した。 56°Cで 45分間加熱して、 アデノウイルスを不活化した後、 3, 000 rpm、 10分間遠心分離し、 上清 (組換え AAVベクタ一溶液) を回収した。
実施例 7 A A Vベクタ一の力価測定
実施例 6で得られた組換え A A Vベクタ一の力価を、 以下に示す He La細胞 を用いたバイオアツセィ法により検定した。
1 X 105個の He La細胞を 6ゥエルの培養皿に播種し、 一晩 CO 2インキュ ベ一夕一内に放置した。 細胞を PBS (—) で 2度洗浄後、 lmlの組換え AA Vベクター溶液を添加した。 4時間 C02インキュベーター内に放置した後、 1 0%FCSを含む3mlのDMEMを添加し、 2日間 C 02インキュベータ一内 でインキュベーションした。 PBS (—) で洗浄後トリプシン一 EDTA混液で 細胞を培養皿から剥がし、 新しい 10 cmの培養皿に再播種した。 細胞が培養皿 に接着したのを確認後、 ネオマイシンの類縁物質である G 418 (Gibco社製) を培養液中に最終濃度 1000 /g/mlになるように添加した。 C02インキ ュぺ一夕—内で 10日間ィンキュベ一ションを続けた後、生き残った細胞集団(コ ロニー) をクリスタルバイオレットによって染色し、 染色されたコロニーをカウ ントした (図 2)。 対照として、 未処置の HeLa細胞を G418処理した際の コロニ一数を示す。 その結果、 repアンチセンス発現細胞株を用いることによつ て、 AAVベクタ一を作製することが可能であることが明らかとなった。
以上の結果から、
(1) 細胞毒性を有する rep遺伝子をアデノウイルス (ヘルパーウィルス) ゲノ ムに揷入する工程、
(2) 前記ヘルパーウィルスを大量増殖させる工程、
(3) 前記ヘルパーウィルスを用いて AAVべク夕一を作製する工程、 を含む AAVベクタ一の製造方法において、 (2) の工程で、 本発明のアンチセ ンス遺伝子を導入した細胞を用いることで、 煩雑な操作をする必要がなく細胞毒 性を有する Rep蛋白質の産生を抑制することで、 細胞の死滅を防ぎ、 ヘルパー ウィルスを製造することができることが示された。
産業上の利用可能性
本発明の、 細胞毒性を有するポリペプチドをコードする遺伝子が発現するセン ス RN Aの全配列または一部配列に対するアンチセンス RN Aを発現するアンチ センス遺伝子を導入した細胞を用いることによって、 高力価ウィルスベクタ一溶 液を得ることができる。

Claims

請求の範囲
1. ウィルスベクタ一の製造に用いられる細胞であって、 細胞毒性を有するポリ ペプチドをコードする遺伝子が発現するセンス R N Aの全配列または一部配列 に対するアンチセンス RN Aを発現するアンチセンス遺伝子が 1又は 2以上導 入された、 前記細胞。
2. 細胞毒性を有するポリペプチドをコードする遺伝子が、 ウィルスベクタ一由 来の遺伝子である、 請求項 1に記載の細胞。
3. ウィルスベクタ一由来の遺伝子が、 アデノ随伴ウィルスベクター由来の遺伝 子である、 請求項 2に記載の細胞。
4. アデノ随伴ウィルスベクタ一由来の遺伝子が、 rep遺伝子である、 請求項 3に記載の細胞。
5. アンチセンス遺伝子が、 配列番号 1で示される配列および/または該配列の 一部が欠失、 置換若しくは付加された配列に対するアンチセンス RNAを発現 するアンチセンス遺伝子である、 請求項 1に記載の細胞。
6. 細胞が、 受託番号が F E RM BP-7377の細胞である、 請求項 5に記 載の細胞。
7. 細胞毒性を有するポリペプチドが、 ヘルパーウィルスの増殖を阻害するポリ ペプチドである、 請求項 1に記載の細胞。
8. ヘルパーウィルスが、 アデノウイルスである、 請求項 7記載の細胞。
9. ウィルスベクタ一の製造に用いられる細胞を製造する方法であって、 細胞毒 性を有するポリぺプチドをコードする遺伝子が発現するセンス RN Aの全配列 または一部配列に対するアンチセンス RN Aを発現するアンチセンス遺伝子を 1又は 2以上導入することを特徴とする、 前記方法。
10. 細胞毒性を有するポリペプチドをコードする遺伝子が、 ウィルスベクター 由来の遺伝子である、 請求項 9に記載の方法。
11. ウィルスベクタ一由来の遺伝子が、 アデノ随伴ウィルスベクタ一由来の遺 伝子である、 請求項 10に記載の方法。
12. アデノ随伴ウィルスベクタ一由来の遺伝子が、 rep遺伝子である、 請求 項 11に記載の方法。
13. アンチセンス遺伝子が、 配列番号 1で示される配列および/または該配列 の一部が欠失、 置換若しくは付加された配列に対するアンチセンス RNAを発 現するアンチセンス遺伝子である、 請求項 9に記載の方法。
14. 細胞が、 受託番号が FERM BP— 7377の細胞である、 請求項 13 に記載の方法。
15. 細胞毒性を有するポリペプチドが、 ヘルパーウィルスの増殖を阻害するポ リペプチドである、 請求項 9に記載の方法。
16. ヘルパーウィルスが、 アデノウイルスである、 請求項 15記載の方法。
17. 請求項 1〜8のいずれかに記載の細胞を用いてウィルスべク夕一を製造す る方法であって、
ウィルスベクター由来の遺伝子を発現するヘルパーウィルスを得る工程、 およ び
アンチセンス遺伝子が導入されていない細胞に、 ウィルスベクタ一由来の遺伝 子を発現するヘルパーウィルスとウィルスベクタープラスミ ドをトランスフエ クシヨンする工程
を含むことを特徴とする、 前記方法。
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