WO2013009084A3 - Composition pour la détection simultanée de mycobacterium tuberculosis et de mycobactéries non-tuberculeuses au moyen d'une réaction en chaîne de la polymérase multiplexe en temps réel comprenant un système de sonde pna d'hybridation nichée ayant une structure de liaison parallèle, et procédé de détection à l'aide de celle-ci - Google Patents

Composition pour la détection simultanée de mycobacterium tuberculosis et de mycobactéries non-tuberculeuses au moyen d'une réaction en chaîne de la polymérase multiplexe en temps réel comprenant un système de sonde pna d'hybridation nichée ayant une structure de liaison parallèle, et procédé de détection à l'aide de celle-ci Download PDF

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Abstract

La présente invention concerne une composition pour la détection simultanée de Mycobatérium tuberculosis et de mycobactéries non-tuberculeuses sur la base d'un système de sonde acide nucléique peptidique (PNA) d'hybridation nichée ayant une structure de liaison parallèle, et un procédé de détection simultanée de Mycobacterium tuberculosis et de mycobactéries non-tuberculeuses à l'aide de la composition et d'une réaction en chaîne de la polymérase en temps réel. La présente invention concerne également une amorce, une composition de sonde et un procédé d'analyse pour détecter simultanément Mycobarterium tuberculosis et des mycobactéries non tuberculeuses sur la base du système de sonde PNA d'hybridation nichée ayant une structure de liaison parallèle. Lors de la mise en œuvre de la réaction en chaîne de la polymérase multiplexe en temps réel par l'utilisation de la composition comprenant le système de sonde PNA hybridé niché ayant la structure de liaison parallèle selon la présente invention, Mycobacterium tuberculosis et des mycobactéries non-tuberculeuses peuvent être détectés simultanément et de façon précise dans un tube unique avec une sensibilité élevée, permettant ainsi l'avantage de réaliser un diagnostic clinique plus rapide et plus précis.
PCT/KR2012/005483 2011-07-12 2012-07-11 Composition pour la détection simultanée de mycobacterium tuberculosis et de mycobactéries non-tuberculeuses au moyen d'une réaction en chaîne de la polymérase multiplexe en temps réel comprenant un système de sonde pna d'hybridation nichée ayant une structure de liaison parallèle, et procédé de détection à l'aide de celle-ci Ceased WO2013009084A2 (fr)

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Families Citing this family (12)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
KR102008454B1 (ko) * 2012-08-28 2019-08-08 주식회사 파나진 평행결합 구조의 이중 혼성화 ｐｎａ 프로브 시스템을 포함하는 ｃ형 간염바이러스(ｈｃｖ) 유전자형 감별용 조성물 및 이를 이용한 감별방법
KR101403507B1 (ko) * 2013-03-21 2014-06-09 주식회사 현일바이오 결핵균 및 비결핵 마이코박테리아의 선택적 검출 방법, 그리고 이를 이용한 키트
CN106536483B (zh) * 2014-05-09 2020-02-07 生物检索技术股份有限公司 Cosmic猝灭剂
US10087490B2 (en) * 2014-12-18 2018-10-02 Roche Molecular Systems, Inc. Compositions and methods for detection of drug resistant Mycobacterium tuberculosis
CN105671211A (zh) * 2016-04-07 2016-06-15 广东省农业科学院动物卫生研究所 小反刍兽疫病毒、施马伦贝格病毒和库布病毒分子鉴别诊断方法及其应用
KR101985378B1 (ko) 2017-05-02 2019-06-10 주식회사 레이 치아 촬영용 엑스레이 촬영기
KR101899371B1 (ko) 2017-07-25 2018-10-29 (주)엔바이오텍 핵산 복합체 페어, 핵산 복합체 페어를 포함하는 pcr용 키트, 및 핵산 복합체 페어를 이용한 타겟 검출 방법
KR20200045212A (ko) * 2018-10-22 2020-05-04 (주)바이오니아 옥타민 또는 옥타민 유도체가 결합된 프로브 및 이의 용도
KR102097721B1 (ko) * 2019-01-24 2020-04-06 주식회사 시선바이오머티리얼스 태그서열 snp를 이용한 단일 검출 프로브 기반 다중 표적 검출방법
CN113025729B (zh) * 2020-12-24 2022-11-04 复旦大学 结核分枝杆菌对氨基水杨酸耐药相关的基因突变位点及其应用
CN114592036B (zh) * 2022-04-02 2023-03-31 予果生物科技（北京）有限公司 放线菌核酸提取检测试剂、试剂盒及其方法和应用
KR20240028084A (ko) 2022-08-24 2024-03-05 주식회사 멀티렉스 표지자가 결합된 태그 프로브 및 이의 용도

Citations (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US6355421B1 (en) * 1997-10-27 2002-03-12 Boston Probes, Inc. Methods, kits and compositions pertaining to PNA molecular beacons

Patent Citations (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US6355421B1 (en) * 1997-10-27 2002-03-12 Boston Probes, Inc. Methods, kits and compositions pertaining to PNA molecular beacons

Non-Patent Citations (4)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
DROBNIEWSKI, F. A. ET AL.: "Differentiation of Mycobacterium tuberculosis Complex and Nontuberculous Mycobacterial Liquid Cultures by Using Peptide Nucleic Acid Fluorescence In Situ Hybridization Probes", JOURNAL OF CLINICAL MICROBIOLOGY, vol. 38, 31 January 2000 (2000-01-31), pages 444 - 447 *
RAY, A. ET AL.: "Peptide nucleic acid (PNA), its medical and biotechnical applications and promise for the future", THE FASEB JOURNAL, vol. 14, 30 June 2000 (2000-06-30), pages 1041 - 1060 *
STENDER, H. ET AL.: "Fluorescence In Situ Hybridization Assay Using Peptide Nucleic Acid Probes for Differentiation between Tuberculous and Nontuberculous Mycobacterium Species in Smears of Mycobacterium Cultures", JOURNAL OF CLINICAL MICROBIOLOGY, vol. 37, 30 September 1999 (1999-09-30), pages 2760 - 2765 *
TEDESCHI, T. ET AL.: "Lysine Based Peptide Nucleic Acids (PNAs) with Strong Chiral Constraint: Control of Helix Handedness and DNA Binding by Chirality", CHIRALITY, vol. 17, 31 December 2005 (2005-12-31), pages 196 - 204 *

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