WO2014129933A1 - Биологический сенсор и способ создания биологического сенсора - Google Patents

Биологический сенсор и способ создания биологического сенсора Download PDF

Info

Publication number
WO2014129933A1
WO2014129933A1 PCT/RU2013/001100 RU2013001100W WO2014129933A1 WO 2014129933 A1 WO2014129933 A1 WO 2014129933A1 RU 2013001100 W RU2013001100 W RU 2013001100W WO 2014129933 A1 WO2014129933 A1 WO 2014129933A1
Authority
WO
WIPO (PCT)
Prior art keywords
molecules
layer
analyte
binding partner
paragraph
Prior art date
Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
Ceased
Application number
PCT/RU2013/001100
Other languages
English (en)
French (fr)
Inventor
Алексей Владимирович АРСЕНИН
Юрий Викторович СТЕБУНОВ
Current Assignee (The listed assignees may be inaccurate. Google has not performed a legal analysis and makes no representation or warranty as to the accuracy of the list.)
FEDERALNOE GOSUDARSTVENNOE AVTONOMNOE OBRAZOVATELNOE UCHREZHDENIE VYSSHEGO PROFESSIONALNOGO OBRAZOVANIA "MOSCOW INSTITUTE OF PHYSICS AND TECHNOLOGY (STATE UNIVERSITY) "
Original Assignee
FEDERALNOE GOSUDARSTVENNOE AVTONOMNOE OBRAZOVATELNOE UCHREZHDENIE VYSSHEGO PROFESSIONALNOGO OBRAZOVANIA "MOSCOW INSTITUTE OF PHYSICS AND TECHNOLOGY (STATE UNIVERSITY) "
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by FEDERALNOE GOSUDARSTVENNOE AVTONOMNOE OBRAZOVATELNOE UCHREZHDENIE VYSSHEGO PROFESSIONALNOGO OBRAZOVANIA "MOSCOW INSTITUTE OF PHYSICS AND TECHNOLOGY (STATE UNIVERSITY) " filed Critical FEDERALNOE GOSUDARSTVENNOE AVTONOMNOE OBRAZOVATELNOE UCHREZHDENIE VYSSHEGO PROFESSIONALNOGO OBRAZOVANIA "MOSCOW INSTITUTE OF PHYSICS AND TECHNOLOGY (STATE UNIVERSITY) "
Priority to US14/647,397 priority Critical patent/US20150301039A1/en
Priority to CA2935101A priority patent/CA2935101C/en
Publication of WO2014129933A1 publication Critical patent/WO2014129933A1/ru
Anticipated expiration legal-status Critical
Priority to US15/671,187 priority patent/US10962536B2/en
Ceased legal-status Critical Current

Links

Classifications

    • G—PHYSICS
    • G01—MEASURING; TESTING
    • G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
    • G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
    • G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
    • G01N33/53—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor
    • G01N33/543—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor with an insoluble carrier for immobilising immunochemicals
    • G01N33/551—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor with an insoluble carrier for immobilising immunochemicals the carrier being inorganic
    • G01N33/553—Metal or metal coated
    • G—PHYSICS
    • G01—MEASURING; TESTING
    • G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
    • G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
    • G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
    • G01N33/53—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor
    • G01N33/543—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor with an insoluble carrier for immobilising immunochemicals
    • G01N33/551—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor with an insoluble carrier for immobilising immunochemicals the carrier being inorganic
    • B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
    • B82—NANOTECHNOLOGY
    • B82Y—SPECIFIC USES OR APPLICATIONS OF NANOSTRUCTURES; MEASUREMENT OR ANALYSIS OF NANOSTRUCTURES; MANUFACTURE OR TREATMENT OF NANOSTRUCTURES
    • B82Y15/00—Nanotechnology for interacting, sensing or actuating, e.g. quantum dots as markers in protein assays or molecular motors
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C23—COATING METALLIC MATERIAL; COATING MATERIAL WITH METALLIC MATERIAL; CHEMICAL SURFACE TREATMENT; DIFFUSION TREATMENT OF METALLIC MATERIAL; COATING BY VACUUM EVAPORATION, BY SPUTTERING, BY ION IMPLANTATION OR BY CHEMICAL VAPOUR DEPOSITION, IN GENERAL; INHIBITING CORROSION OF METALLIC MATERIAL OR INCRUSTATION IN GENERAL
    • C23C—COATING METALLIC MATERIAL; COATING MATERIAL WITH METALLIC MATERIAL; SURFACE TREATMENT OF METALLIC MATERIAL BY DIFFUSION INTO THE SURFACE, BY CHEMICAL CONVERSION OR SUBSTITUTION; COATING BY VACUUM EVAPORATION, BY SPUTTERING, BY ION IMPLANTATION OR BY CHEMICAL VAPOUR DEPOSITION, IN GENERAL
    • C23C14/00—Coating by vacuum evaporation, by sputtering or by ion implantation of the coating forming material
    • C23C14/22—Coating by vacuum evaporation, by sputtering or by ion implantation of the coating forming material characterised by the process of coating
    • C23C14/24—Vacuum evaporation
    • C23C14/28—Vacuum evaporation by wave energy or particle radiation
    • C23C14/30—Vacuum evaporation by wave energy or particle radiation by electron bombardment
    • G—PHYSICS
    • G01—MEASURING; TESTING
    • G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
    • G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
    • G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
    • G01N33/53—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor
    • G01N33/543—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor with an insoluble carrier for immobilising immunochemicals
    • G01N33/54366—Apparatus specially adapted for solid-phase testing
    • G01N33/54373—Apparatus specially adapted for solid-phase testing involving physiochemical end-point determination, e.g. wave-guides, FETS, gratings
    • B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
    • B82—NANOTECHNOLOGY
    • B82Y—SPECIFIC USES OR APPLICATIONS OF NANOSTRUCTURES; MEASUREMENT OR ANALYSIS OF NANOSTRUCTURES; MANUFACTURE OR TREATMENT OF NANOSTRUCTURES
    • B82Y40/00—Manufacture or treatment of nanostructures

Definitions

  • the invention relates to the field of biotechnology, namely to
  • Surface plasmon resonance is the phenomenon of excitation of surface plasmons by means of light. It occurs on the surface of metals under the condition of impaired total internal reflection.
  • the term "surface plasmon resonance" in the sense used in the present description refers to an optical phenomenon that allows the analysis of interactions in real time by recording the properties and changes in the properties of the analyte on the matrix.
  • this method has a number of advantages compared with the currently existing methods, for example, this method has the ability of tagless biodetection, that is, without the use of radioactive or fluorescence tags, and also allows you to provide high sensitivity biodetectors based on this method, and high speed analyzes.
  • the present invention relates to the creation of devices with detecting
  • known devices used as biological chips for the production of biosensors include detection surfaces intended for the analysis of selective biological interactions according to US patent US5242828 [1] and consisting of three layers: a substrate, a metal film and a monolayer of organic molecules, with which molecules can be attached
  • binding partner of the analyte and based on them to create biological chips for biodetectors based on surface
  • the biomolecules used in this case have a special structure.
  • the disadvantages of this device include the low number of active centers to which biomolecules can attach, due to the flat structure of the biolayer.
  • Another disadvantage is the complexity of creating the device, since the molecules of the described biolayer are not widely available on the market, and the processes of their creation
  • the disadvantages include the complexity of the production of biosensors based on the proposed devices, because for
  • UK GB 2459604 [2] which consists of the following layers: a substrate, a metal film, an amorphous carbon film and a biomolecule layer, which allows for the implementation of photolithographic processes for the organization of molecules of a binding partner of an analyte on its surface, as well as a biodetection method using this device, and also a method for creating it.
  • the disadvantages of this devices can be attributed to the fact that the sensitivity of detection
  • a multilayer structure is known, described in the article "Graphene-based high-performance surface plasmon resonance biosensors" [4], and includes a thin metal film on the surface of which a thin film based on graphene is applied.
  • This structure allows one to study the reaction between biological molecules and graphene, however, it does not have the property of selectivity with respect to the detected molecules, which makes it unsuitable for use in studying chemical reactions by this method.
  • a graphene film performs the function of an external surface with which all types of analyzed biological molecules in solution directly interact.
  • the device according to US patent US 5763191 [5] is a universal binder film designed for the analysis of selective biological interactions, consisting of a metal film or a film based on metal oxide and a layer of biological reagent attached to the surface of a metal or metal oxide due to thiol, disulfide or phosphine groups using a binding molecule.
  • This biological layer is capable of chemically interacting with other biological molecules, and on its basis it is possible to create biological sensors for biodetectors based on surface plasmon resonance.
  • Also included in this patent are a method for analyzing substances using the described device, as well as a manufacturing process.
  • the disadvantages of the prototype are the complexity of creating a layer of biological molecules, requiring the preliminary preparation of compounds containing the necessary functional groups and capable of attaching to the surface of gold.
  • the disadvantage is the difficulty of attaching the molecules of the binding partner of the analyte to this layer, which require the development of special activation methods aimed at the reaction through certain functional groups, implying that this activation method will work only with a certain class of analyzed molecules, which limits the possible applications of this devices.
  • the surface of the metal film of the proposed device is exposed to the external environment, which imposes a restriction on the working conditions and the chemicals used for biodetection. All these disadvantages do not allow for high detection sensitivity in combination with the specificity of biodetection. Disclosure of invention
  • the technical problem solved in the present invention is the creation of a highly sensitive and versatile biological sensor with high biospecificity for biodetection, based on surface plasmon resonance.
  • a biological sensor for use in biodetection based on surface plasmon resonance, which is a multilayer structure including a substrate (1), on the surface of which a thin metal film is applied (2), on the outer surface of which an intermediate binder layer is located
  • a biospecific layer (4) is conformally and uniformly arranged, which is configured to selectively interact only with certain biological molecules of the analyte.
  • the metal film (2) can be made of metals such as gold, silver, copper and aluminum, and its thickness can be equal to 10-150 nm.
  • the biospecific layer (4) may contain molecules of the binding partner of the analyte (5). Also
  • the biospecific layer may contain molecules of the binding partner of the analyte (5) and molecules having high affinity for the binding partners of the molecules of the analyte (6) and
  • biospecific layer forming a chemical bond with them.
  • biospecific layer forming a chemical bond with them.
  • the (4) may contain a hydrogel (7), with molecules of a binding partner of the analyte immobilized in it (5).
  • the biospecific layer may contain a hydrogel (7) with
  • biospecific layer (4) may contain polysaccharides. Agarose, alginic acid, dextran, carrageenan, starch, cellulose or their derivatives can be used as polysaccharides. As derivatives of dextran, the biospecific layer may contain, for example, carboxymethylated dextran. Also, as molecules having a high affinity for the molecules of the binding partner of the analyte (6), the biospecific layer (4) may contain avidin, streptavidin and deglycosylated avidin molecules, molecules
  • the binding partner is biotinylated.
  • pairs of receptor - ligand, antigen - antibody, enzyme - substrate can be used.
  • the binding partner of the analyte may be an antibody or antibody fragment to the analyte, as well as an analyte receptor.
  • the binding partner of the analyte may be a binding partner of proteins, lipids, DNA, RNA, viruses, cells, bacteria or toxins, as well as chemical modifications of the substances mentioned.
  • the essence of the method of creating a biological sensor is that the method consists of the following stages:
  • an intermediate binder layer (3) made in the form of a thin film of graphene with a thickness of 0.3-2000 nm or a thin film of single-layer or multilayer carbon nanotubes with a thickness of 0.4-2000 nm or a thin film of graphene oxide with a thickness of 0.7-2000 nm;
  • biospecific layer (4) due to stacking interaction or interaction of molecules of the biospecific layer with functional groups of graphene, single-layer or multilayer carbon nanotubes or graphene oxide, while adsorption provide the creation of a large number of activation centers on the surface of the intermediate binder layer with the degree of filling of the surface with molecules
  • a film of gold, silver, copper or aluminum with a thickness of 10-150 nm can be applied.
  • a layer of molecules of the binding partner of the analyte (5) can be applied.
  • a layer of molecules of the binding partner of the analyte (5) and molecules having a high affinity for the molecules of the binding partner of the analyte (6) and forming a chemical bond with them are also included as a biospecific layer (4).
  • a hydrogel layer (7) can be applied with molecules of the binding partner of the analyte molecules (5) immobilized in it.
  • a hydrogel layer (7) can be applied with molecules of the analyte binding partner (5) immobilized in it and molecules having a high affinity for the analyte binding partner molecules (6) and forming a chemical bond with them.
  • polysaccharides As polysaccharides, it is preferable to apply agarose, alginic acid, dextran, carrageenan, starch, cellulose or their derivatives. As dextran derivatives, the biospecific layer may contain carboxymethylated dextran. As molecules having a high affinity for the molecules of the binding partner of the analyte, the molecules of avidin, streptavidin and
  • the molecules of the binding partner are biotinylated.
  • biospecific layer (4) with functional groups of graphene, single-layer or multilayer carbon nanotubes or graphene oxide can be carried out by interaction with functional groups such as epoxy, hydroxyl, carbonyl or
  • the analyte may use an antibody or antibody fragment to the analyte, as well as an analyte receptor.
  • analyte receptor for the analyte to use an antibody or antibody fragment to the analyte, as well as an analyte receptor.
  • a binding partner of the analyte can use a binding partner of proteins, lipids, DNA, RNA, viruses, cells, bacteria or toxins, as well as chemical modifications of these substances.
  • FIG. 1 shows a general view of a biological sensor (side view); in FIG. 2 shows a biological sensor in which
  • the biospecific layer (4) contains molecules of the binding partner of the analyte (5);
  • FIG. 3 shows a biological sensor in which
  • biospecific layer (4) contains molecules of a binding partner (5) and biological molecules capable of forming a bond with molecules of a binding partner (6);
  • FIG. 4 shows a biological sensor in which
  • the biospecific layer (4) contains a hydrogel (7) with molecules of a binding partner (5) attached to it and molecules capable of forming a bond with molecules of a binding partner (6);
  • FIG. 5 shows the kinetic curve of molecular adsorption
  • biotinylated oligonucleotides on the surface of a thin film of graphene oxide and on the surface of a biosensor consisting of layers: a substrate, a metal film, a carboxymethylated dextran onto which streptavidin molecules are adsorbed;
  • FIG. 6 shows the kinetic curve of the adsorption of molecules
  • FIG. 7 shows a kinetic curve for the adsorption of oligonucleotides on the surface of a biospecific layer, including streptavidin molecules;
  • FIG. Figure 8 shows an image of a thin film of graphene oxide deposited on the surface of a metal film and obtained by scanning electron microscopy; in FIG. Figure 9 shows a comparative table of experimental data on the parameters of biological sensors containing
  • the intermediate binder layer is a thin film of hydrogel and a thin film of graphene oxide.
  • the biological sensor (figure 1) consists of a substrate (1), a metal film (2), on the surface of which an intermediate bonding layer (3) is applied, made of a thin film of graphene, or a thin film of graphene oxide or a thin film of carbon nanotubes.
  • the surface of the layer (3) is conformally and uniformly adsorbed
  • the biospecific layer may be a layer of molecules of a binding partner of an analyte (5) (Fig. 2) or a layer of a complex of biological molecules (6) capable of chemically interacting with molecules of a binding partner (5) and forming a complex with them (Fig. 3) . Also as
  • the biospecific layer may be a hydrogel layer (7) (Fig. 4), onto which molecules of the binding partner (5) and / or a complex of molecules of the binding partner and biological molecules (6), which can form a chemical bond with the molecules of the binding
  • FIG. 5 shows a kinetic adsorption curve
  • biotinylated oligonucleotides to the surface of the intermediate binder layer of the biosensor, including a thin film of graphene oxide (curve 8) and to the surface of the biological sensor, which includes the following layers: a substrate, a metal film and a biospecific layer containing a hydrogel (carboxymethylated dextran) and
  • Streptavidin molecules - (curve 9). Time is plotted on the horizontal axis, and a change in the refractive index near the adsorption surface proportional to the mass of molecules deposited on the surface on the vertical axis. Thus, we can conclude that the film based on graphene oxide has better adsorption characteristics compared to layers containing hydrogel.
  • FIG. Figure 6 shows a graph of the deposition of streptavidin molecules on a biological sensor with a thin film of graphene oxide.
  • FIG. 7 is a graph of deposition of oligonucleotides on
  • biological sensor including a substrate consisting of a 0.4 mm thick borosilicate glass plate and a 2 nm thick titanium film deposited on its surface.
  • a 40 nm thick gold film was deposited on the substrate, an intermediate binder layer of graphene oxide 20 nm thick and a biospecific streptavidin molecule with which they form a stable complex of molecules having a biotin residue are deposited on a gold film.
  • Streptavidin was adsorbed for 10 min from a solution with a concentration of 50 ⁇ g / ml onto the surface of the intermediate binder layer using a flow cell.
  • oligonucleotides 1 1, 13 - without a biotin residue, 12 - with a biotin residue.
  • the oligonucleotides used in case 1 1, 13 and in case 12 are complementary and can
  • Fig shows the image of a layer of graphene oxide on the surface of a metal film obtained using a scanning electron microscope.
  • the table (Fig. 9) shows comparative data based on the results of the experiment, biological sensors containing as
  • an intermediate binder layer a 150 nm thick hydrogel film and a 20 nm thick graphene oxide film.
  • the signal obtained by detecting biotinylated DNA and proportional to the change in the refractive index near the surface of the biological sensor amounted to 409 relative units, and in the case of a biological sensor containing a film of graphene oxide, the signal was 570 relative units. So the response as well,
  • the binder layer is a thin film of graphene oxide, 40% higher.
  • the device operates as follows.
  • a solution with the analyte is supplied to the biospecific layer (4) of the biological sensor using a flow cell or a cuvette.
  • the analyte and the molecules of the biospecific layer (4) in the form of molecules of the binding partner of the analyte (5), attached directly to the surface of the intermediate binder film (3), or with the participation of biological molecules (6) that can form a chemical bond with the molecules of the binder partner, and / or hydrogel (7),
  • the essence of the method is that the molecules attached to the surface of the biological sensor change the effective refractive index of the medium near this
  • laser beam excites surface plasmons at the boundary of the metal film (2) and the medium with the analyzed biological molecules.
  • the optimal values of the thickness of the metal film (2) are in the range of 10-150 nm, the upper limit is explained by the fact that, at higher values of the film thickness, the dip in the reflection of the beam in the circuit
  • the intermediate binder layer (3) with a thickness of more than 2000 nm will impede the access of the detected substance to the region where it can be detected.
  • the minimum thickness of the intermediate binder layer (3) containing graphene corresponds to a monomolecular layer, the thickness of which is assumed to be 0.3 nm [7].
  • the minimum possible thickness corresponding to the monomolecular layer is 0.7 nm [8].
  • the minimum possible thickness is the diameter of carbon nanotubes, which can be equal to 0.4 nm [9].
  • the molecules of proteins, lipids, DNA, RNA, viruses, cells, bacteria or toxins, as well as chemical modifications of the given substances can be used as an analyte.
  • the method of creating a biological sensor is implemented as follows:
  • a metal film (2) is applied to the substrate (1), for example, by electron beam deposition.
  • a 40 nm thick gold film a 0.4 mm thick borosilicate glass plate with a 2 nm thick titanium film deposited on its surface is used as a substrate.
  • gold is deposited on a substrate. The thickness and optical properties of the resulting gold film are controlled by ellipsometric measurements.
  • an intermediate binder layer (3) in the form of a thin film based on graphene, graphene oxide or single-layer or multilayer carbon nanotubes an image of a film based on graphene obtained using a scanning electron microscope is shown in Fig. 8).
  • multilayer carbon nanotubes are applied using a solution of the corresponding substance and its subsequent filtration using a cellulose membrane. After the filtration process, the membrane is placed on the surface of a metal film and dissolves in acetone, leaving a thin film of graphene, graphene oxide or carbon nanotubes. So, for example, for applying an intermediate binder layer containing a thin film of graphene oxide with a thickness of 20 nm, use 1 ml of a solution of graphene oxide in water with a concentration of 5 ⁇ g / ml.
  • the next step in creating a biological sensor is the stage of applying a biospecific layer (4) to the intermediate binder layer (3), in which molecules constituting the biospecific layer, such as molecules, are directly adsorbed from the solution
  • the binding partner of the analyte (5) molecules capable of interacting with the molecules of the binding partner (6) or hydrogel (7).
  • the solution with biomolecules is brought into contact with the intermediate
  • FIG. Figure 6 shows the kinetic curve (10) of the adsorption of molecules
  • streptavidin which is a binding partner to molecules having biotin residues, using a flow cell.
  • the adsorption time is chosen so that
  • biological molecules occupied a large number of activation centers on the surface of graphene, graphene oxide, or carbon nanotubes, thus eliminating further nonspecific binding of molecules from the analyzed solution to the surface of the biological sensor. It does not require the use of special substances to create such films, in addition to directly applied molecules. So, for example, to adsorb a biospecific layer containing streptavidin molecules onto the surface of a graphene oxide film, these molecules are adsorbed from a solution with a concentration of 10 ⁇ g / ml using a flow cell for 10 min. In the future, the quality of the obtained surface can be checked using a test sample, about which it is known that molecules from its composition should not interact with the resulting biological layer.
  • the kinetic curve (12) of biotinylated DNA deposition on the obtained biosensor containing streptavidin molecules is shown in FIG. 7.
  • the proposed device and its creation method provide, in comparison with the prior art, the following technical results: high sensitivity of the biosensor in combination with high biospecificity; expanding the range of application of the device; protection of the metal film from environmental influences, which will allow using reagents in the biodetection process that could damage the metal surface, as well as using plasmon materials such as silver, which are easily damaged when exposed to the external environment; the ability to detect large biological objects.
  • the distinguishing features of the proposed biosensor and the method of its creation allow the creation of a highly sensitive and universal biological sensor for biodetection, based on
  • the proposed device and method of its creation may be any known device and method of its creation.
  • the present invention can also be used in

Landscapes

  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Urology & Nephrology (AREA)
  • Hematology (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Analytical Chemistry (AREA)
  • General Physics & Mathematics (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Cell Biology (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Food Science & Technology (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Pathology (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Nanotechnology (AREA)
  • Inorganic Chemistry (AREA)
  • Crystallography & Structural Chemistry (AREA)
  • Mechanical Engineering (AREA)
  • Toxicology (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • Materials Engineering (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Metallurgy (AREA)
  • Investigating Or Analysing Materials By Optical Means (AREA)
  • Apparatus Associated With Microorganisms And Enzymes (AREA)

Abstract

Изобретение относится к области биотехнологии, а именно к исследованию биомолекулярных взаимодействий и детектированию биомолекул с использованием поверхностного плазмонного резонанса. Описаны биологический сенсор, а также способ создания биологического сенсора с использованием тонких пленок на основе графена, оксида графена или однослойных или многослойных углеродных нанотрубок. Техническими результатами изобретения является высокая чувствительность биосенсора в сочетании с высокой биоспецифичностью; расширение спектра применения устройства; защиту металлической пленки от воздействий внешней среды; возможность детектирования крупных биологических объектов. Предлагаемое устройство и способ его создания могут быть использованы для контроля и регистрации концентрации химических и биохимических веществ и определения параметров биомолекулярных реакций в различных промышленных процессах, происходящих с использованием биологического материала, быть использован также в фармацевтической промышленности для исследования фармакологических свойств и определения химического состава разрабатываемых лекарственных средств и могут быть применены в процессах контроля качества продукции пищевой промышленности.

Description

БИОЛОГИЧЕСКИЙ СЕНСОР И СПОСОБ СОЗДАНИЯ
БИОЛОГИЧЕСКОГО СЕНСОРА
Область техники
Изобретение относится к области биотехнологии, а именно к
устройствам для исследования биомолекулярных взаимодействий и
детектирования биомолекул с использованием поверхностного плазмонного резонанса и способам их создания. Поверхностный плазмонный резонанс - это явление возбуждения поверхностных плазмонов посредством света. Оно возникает на поверхности металлов при условии нарушенного полного внутреннего отражения. Термин «поверхностный плазмонный резонанс» в используемом в настоящем описании смысле относится к оптическому явлению, которое позволяет проводить анализ взаимодействий в режиме реального времени посредством регистрации свойств и изменений свойств исследуемого вещества на матрице.
Метод биодетектирования с использованием поверхностного
плазмонного резонанса обладает рядом преимуществ по сравнению с существующими на данный момент методами, например, данный метод обладает возможностью безметкового биодетектирования, то есть без использования радиоактивных или флуоресцентных меток, а также позволяет обеспечить высокие значения чувствительности биодетекторов, основанных на данном методе, и высокую скорость проводимых анализов. Предлагаемое изобретение относится к созданию устройств с детектирующими
поверхностями, на которых протекают химические реакции, изучаемые данным методом.
Предшествующий уровень техники
Из уровня техники известен ряд технических решений, относящихся к созданию устройств с детектирующими поверхностями для
биодетектирования с использованием поверхностного плазмонного
резонанса: Например, к известным устройствам, используемым в качестве биологических чипов, предназначенных для производства биосенсоров, относятся детектирующие поверхности, предназначенные для анализа избирательных биологических взаимодействий по патенту США US5242828 [1] и состоящие из трех слоев: субстрата, металлической пленки и монослоя органических молекул, к которым можно прикреплять молекулы
связывающего партнера анализируемого вещества и на их основе создавать биологические чипы для биодетекторов на основе поверхностного
плазмонного резонанса. Используемые в данном случае биомолекулы имеют особую структуру. К недостаткам данного устройства можно отнести низкое число активных центров, к которым могут присоединяться биомолекулы, вследствие плоской структуры биослоя. Также недостатком является сложность создания устройства, поскольку молекулы описываемого биослоя не являются широко доступными на рынке, а процессы их создания
включают много этапов и требуют наличия различных химических
реагентов. Также к недостаткам можно отнести сложность производства биосенсоров на основе предлагаемых устройств, поскольку для
присоединения молекул связывающего партнера анализируемого вещества эти молекулы должны обладать определенными функциональными
группами, и, соответственно в каждом конкретном случае требуется
разработка и осуществление методов активации, что также ограничивает класс используемых анализируемых веществ.
Кроме того, известен биологический сенсор по патенту
Великобритании GB 2459604 [2], состоящий из следующих слоев: подложки, металлической пленки, пленки на основе аморфного углерода и слоя биомолекул, позволяющий реализовать фотолитографические процессы организации молекул связывающего партнера анализируемого вещества на его поверхности, а также метод биодетектирования с использованием данного устройства, а также метод его создания. К недостаткам данного устройства можно отнести то, что чувствительность детектирования
понижена ввиду влияния углеродных пленок на электромагнитные свойства возбуждаемых плазмонов вследствие поглощения излучения углеродными материалами. Также у пленок из аморфного углерода преимущественным механизмом связывания с биомолекулами является образование С-С связей из-за отсутствия кристаллической решетки, которая могла бы позволить другие механизмы, что в свою очередь накладывает ограничения на диапазон возможных для образования биослоя молекул и требует разработки методов активации поверхности для каждого конкретного случая.
Также из уровня техники известен биологический сенсор по заявке ЕР 2216642 А1 [3], содержащий металлический слой, в который включены частички алмаза. К недостаткам данного устройства относится сложность его создания, поскольку используются довольно сложные композитные
структуры, а также очень низкая площадь поверхности, определяемая площадью открытых для внешней среды алмазных частиц и доступная для осаждения биомолекул, что понижает чувствительность биодетектирования.
Кроме того, известна многослойная структура, описанная в статье "Graphene-based high-performance surface plasmon resonance biosensors" [4], и включающая в себя тонкую металлическую пленку, на поверхность которой нанесена тонкая пленка на основе графена. Данная структура позволяет изучить реакцию между биологическими молекулами и графеном, однако она не обладает свойством избирательности по отношению к детектируемым молекулам, что делает ее непригодной для использования для изучения химических реакций данным методом. В данной работе пленка из графена выполняет функцию внешней поверхности, с которой непосредственно взаимодействуют все типы анализируемых биологических молекул, находящихся в растворе.
Наиболее близким к предлагаемому изобретению, выбранном в качестве прототипа предлагаемого биологического сенсора является з устройство по патенту США US 5763191 [5] - универсальная связующая пленка, предназначенная для анализа избирательных биологических взаимодействий, состоящая из металлической пленки или пленки на основе оксида метала и слоя биологического реагента, прикрепляемого к поверхности металла или оксида металла за счет тиоловой, дисульфидной или фосфиновой группы с помощью связующей молекулы. Данный биологический слой способен химически взаимодействовать с другими биологическими молекулами, и на его основе можно создавать биологические сенсоры для биодетекторов на основе поверхностного плазмонного резонанса. Также к данному патенту относятся метод анализа веществ с использованием описанного устройства, а также процесс его производства.
Недостатками прототипа являются сложность создания слоя биологических молекул, требующего предварительного получения соединений, содержащих необходимые функциональные группы и способных прикрепляться к поверхности золота. Кроме того, недостатком является сложность присоединения молекул связывающего партнера анализируемого вещества к данному слою, требующих разработки специальных методов активации, нацеленных на реакцию через определенные функциональные группы, подразумевающих, что данный способ активации будет работать только с определенным классом анализируемых молекул, что ограничивает возможные применения данного устройства. Кроме того, поверхность металлической пленки предложенного устройства подвержена воздействию внешней среды, что накладывает ограничение на условия работы и используемые для биодетектирования химические реактивы. Все эти недостатки не позволяют обеспечить высокую чувствительность детектирования в совокупности со специфичностью биодетектирования. Раскрытие изобретения
Технической задачей, решаемой в настоящем изобретении, является создание высокочувствительного и универсального биологического сенсора с высокой биоспецифичностью для биодетекторования, основанного на поверхностном плазмонном резонансе.
Решение поставленной технической задачей достигается путем создания биологического сенсора (фиг. 1 -4) для использования его в биодетектировании, основанном на поверхностном плазмонном резонансе, представляющего собой многослойную структуру, включающую подложку (1), на поверхность которой нанесена тонкая металлическая пленка (2), на внешней поверхности которой расположен промежуточный связующий слой
(3) , выполненный из тонкой пленки из графена толщиной 0,3- 2000 нм, или тонкой пленки из однослойных или многослойных углеродных нанотрубок толщиной 0,4- 2000 нм, или тонкой пленки из оксида графена толщиной 0,7- 2000 нм. На поверхности промежуточного связующего слоя (3) конформно и однородно расположен биоспецифический слой (4), который выполнен с возможностью осуществления избирательного химического взаимодействия только с определенными биологическими молекулами анализируемого вещества.
Металлическая пленка (2) может быть изготовлена из таких металлов, как золото, серебро, медь и алюминий, причем ее толщина может быть равной 10-150 нм. Биоспецифический слой (4) может содержать молекулы связывающего партнера анализируемого вещества (5). Также
биоспецифический слой может содержать молекулы связывающего партнера анализируемого вещества (5) и молекулы, обладающие высоким сродством к связывающим партнерам молекул анализируемого вещества (6) и
образующие с ними химическую связь. Кроме того, биоспецифический слой
(4) может содержать гидрогель (7), с иммобилизованными в нем молекулами связывающего партнера анализируемого вещества (5). Также биоспецифический слой может содержать гидрогель (7) с
иммобилизованными в нем молекулами связывающего партнера молекул анализируемого вещества (5) и молекулами, обладающими высоким
сродством к молекулам связывающего партнера анализируемого вещества (6) и образующими с ними химическую связь. В качестве гидрогеля (7)
биоспецифический слой (4) может содержать полисахариды. В качестве полисахаридов могут быть использованы агароза, альгиновая кислота, декстран, каррагинан, крахмал, целлюлоза или их производные. В качестве производных декстрана биоспецифический слой может содержать, например, карбоксиметилированный декстран. Также в качестве молекул, обладающих высоким сродством к молекулам связывающего партнера анализируемого вещества (6), биоспецифический слой (4) может содержать молекулы авидина, стрептавидина и дегликозилированного авидина, молекулы
связывающего партнера при этом являются биотинилированными. В качестве пары анализируемого вещества и связывающего партнера к нему могут использовать пары рецептор - лиганд, антиген - антитело, фермент - субстрат. Связывающим партнером анализируемого вещества может являться антитело или фрагмент антитела к анализируемому веществу, а также рецептор анализируемого вещества. Кроме того, связывающим партнером анализируемого вещества может являться связывающий партнер протеинов, липидов, ДНК, РНК, вирусов, клеток, бактерий или токсинов, а также химических модификаций приведенных веществ.
Использование в предлагаемом устройстве тонких пленок из графена, оксида графена, однослойных или многослойных углеродных нанотрубок, выполняющих функцию промежуточного связующего слоя биосенсора, позволяет обеспечить адсорбции на них в качестве биоспецифического слоя большого класса биологических молекул, что делает возможным
использование описанного устройства для различных применений, а также защитить поверхность металлического слоя от вредного воздействия внешней среды при работе биосенсора, что позволит использовать в процессе биодетектирования реагенты, которые могли бы повредить поверхность металла, а также использовать такие плазмонные материалы, как серебро.
Сущность способа создания биологического сенсора заключается в том, что способ состоит из следующих стадий:
а) стадии нанесения металлической пленки (2) на подложку (1);
б) стадии нанесения на внешнюю поверхность металлической пленки (2) промежуточного связующего слоя (3), выполненного в виде тонкой пленки из графена толщиной 0,3-2000 нм или тонкой пленки из однослойных или многослойных углеродных нанотрубок толщиной 0,4-2000 нм или тонкой пленки из оксида графена толщиной 0,7-2000 нм;
в) стадии нанесения биоспецифического слоя (4), который конформно и однородно адсорбируют на поверхность промежуточного связующего (3) слоя за счет возникновения сил химического взаимодействия между
молекулами промежуточного связующего слоя (3) и молекулами
биоспецифического слоя (4), обусловленного стэкинг-взаимодействием или взаимодействием молекул биоспецифического слоя с функциональными группами графена, однослойных или многослойных углеродных нанотрубок или оксида графена, при этом при адсорбции обеспечивают создание большого количества центров активации на поверхности промежуточного связующего слоя со степенью заполнения поверхности молекулами
биоспецифического слоя 15-100 % от площади поверхности промежуточного связующего слоя.
В качестве металлической пленки (2) может быть нанесена пленка из золота, серебра, меди или алюминия толщиной 10-150 нм.
В качестве биоспецифического слоя (4) может быть нанесен слой молекул связывающего партнера анализируемого вещества (5).
Также в качестве биоспецифического слоя (4) может быть нанесен слой молекул связывающего партнера анализируемого вещества (5) и молекул, обладающих высоким сродством к молекулам связывающего партнера анализируемого вещества (6) и образующих с ними химическую связь.
Кроме того, в качестве биоспецифического слоя (4) может быть нанесен слой гидрогеля (7), с иммобилизованными в нем молекулами связывающего партнера молекул анализируемого вещества (5).
Также в качестве биоспецифического слоя (4) можно наносить слой гидрогеля (7), с иммобилизованными в нем молекулами связывающего партнера анализируемого вещества (5) и молекулами, обладающими высоким сродством к молекулам связывающего партнера анализируемого вещества (6) и образующими с ними химическую связь.
В качестве гидрогеля (7) целесообразно использовать полисахариды. В качестве полисахаридов предпочтительно наносить агарозу, альгиновую кислоту, декстран, каррагинан, крахмал, целлюлозу или их производные. В качестве производных декстрана биоспецифический слой может содержать карбоксиметилированный декстран. В качестве молекул, обладающих высоким сродством к молекулам связывающего партнера анализируемого вещества, могут быть нанесены молекулы авидина, стрептавидина и
дегликозилированного авидина, молекулы связывающего партнера при этом являются биотинилированными. Взаимодействие молекул
биоспецифического слоя (4) с функциональными группами графена, однослойных или многослойных углеродных нанотрубок или оксида графена может осуществляться за счет взаимодействия с такими функциональными группами, как эпоксидными, гидроксильными, карбонильными или
карбоксильными группами. В качестве связывающего партнера
анализируемого вещества могут использовать антитело или фрагмент антитела к анализируемому веществу, а также рецептор анализируемого вещества. Кроме того, в качестве связывающего партнера анализируемого вещества могут использовать связывающий партнер протеинов, липидов, ДНК, РНК, вирусов, клеток, бактерий или токсинов, а также химических модификаций приведенных веществ.
Краткий перечень чертежей
на фиг. 1 изображен общий вид биологического сенсора (вид сбоку); на фиг. 2 изображен биологический сенсор, в котором
биоспецифический слой (4) содержит молекулы связывающего партнера анализируемого вещества (5);
на фиг. 3 изображен биологический сенсор, в котором
биоспецифический слой (4) содержит молекулы связывающего партнера (5) и биологические молекулы, способные образовывать связь с молекулами связывающего партнера (6);
на фиг. 4 изображен биологический сенсор, в котором
биоспецифический слой (4) содержит гидрогель (7) с прикрепленными к нему молекулами связывающего партнера (5) и молекулами, способными образовывать связь с молекулами связывающего партнера (6);
на фиг. 5 изображена кинетическая кривая адсорбции молекул
биотинилированных олигонуклеотидов на поверхность тонкой пленки оксида графена и на поверхность биосенсора, состоящего из слоев: подложки, металлической пленки, карбоксиметилированного декстрана, на который адсорбированны молекулы стрептавидина;
на фиг. 6 приведена кинетическая кривая адсорбции молекул,
способных образовывать химическую связь с молекулами связывающего партнера, на биологический сенсор на основе тонкой пленки оксида графена; на фиг. 7 приведена кинетическая кривая адсорбции олигонуклеотидов на поверхность биоспецифического слоя, включающего в себя молекулы стрептавидина;
на фиг. 8 приведено изображение тонкой пленки оксида графена, нанесенной на поверхность металлической пленки и полученной с помощью растровой электронной микроскопии; на фиг. 9 приведена сравнительная таблица экспериментальных данных параметров биологических сенсоров, содержащих в качестве
промежуточного связующего слоя тонкую пленку из гидрогеля и тонкую пленку из оксида графена.
Осуществление изобретения
Биологический сенсор (фиг.1) состоит из подложки (1), металлической пленки (2), на поверхность которой нанесен промежуточный связующий слой (3), выполненный из тонкой пленки из графена, или тонкой пленки оксида графена или тонкой пленки из углеродных нанотрубок. На
поверхность слоя (3) конформно и однородно адсорбирован
биоспецифический слой (4). В качестве биоспецифического слоя может выступать слой молекул связывающего партнера анализируемого вещества (5) (фиг. 2) или слой из комплекса биологических молекул (6), способных химически взаимодействовать с молекулами связывающего партнера (5) и образовавших с ними комплекс (фиг. 3). Также в качестве
биоспецифического слоя может выступать слой гидрогеля (7) (фиг. 4), на который осаждены молекулы связывающего партнера (5) и/или комплекс из молекул связывающего партнера и биологических молекул (6), которые могут образовывать химическую связь с молекулами связывающего
партнера. На фиг. 5 изображена кинетическая кривая адсорбции
биотинилированных олигонуклеотидов на поверхность промежуточного связующего слоя биосенсора, включающего тонкую пленку из оксида графена (кривая 8) и на поверхность биологического сенсора, включающего следующие слои: подложку, металлическую пленку и биоспецифический слой содержащий гидрогель (карбоксиметилированный декстран) и
молекулы стрептавидина - (кривая 9). По горизонтальной оси отложено время, на вертикальной - изменение показателя преломления вблизи поверхности адсорбции, пропорциональное массе молекул осажденных на поверхность. Таким образом, можно сделать вывод, что пленка на основе ю оксида графена обладает лучшими адсорбционными характеристиками по сравнению со слоями, содержащими гидрогель. На фиг. 6 приведен график осаждения молекул стрептавидина на биологический сенсор с тонкой пленкой оксида графена.
На фиг. 7 приведен график осаждения олигонуклеотидов на
биологический сенсор, включающий подложку, состоящую из пластины борсиликатного стекла толщиной 0,4 мм и нанесенной на его поверхности пленки титана толщиной 2 нм. На подложку нанесена золотая пленка толщиной 40 нм, на золотую пленку нанесен промежуточный связующий слой из оксида графена толщиной 20 нм и биоспецифический слой из молекул стрептавидина, с которым образуют устойчивый комплекс молекулы, имеющие биотиновый остаток. Стрептавидин адсорбировали в течение 10 мин из раствора с концентрацией 50 мкг/мл на поверхность промежуточного связующего слоя при помощи проточной ячейки. Три пика на графике отражают осаждение олигонуклеотидов: 1 1, 13 - без биотинового остатка, 12 - с биотиновым остатком. Олигонуклеотиды, используемые в случае 1 1, 13 и в случае 12 являются комплементарными и могут
образовывать связь между собой. Малость пика в случае 1 1 говорит о высокой биоспецифичности полученного биологического сенсора,
показывающей то, что биологический сенсор взаимодействует только с определенными типами молекул. На фиг.8 приведено изображение слоя оксида графена на поверхности металлической пленки, полученное с помощью растрового электронного микроскопа. В таблице (фиг. 9) приведены сравнительные данные, основанные на результатах проведенного эксперимента, биологических сенсоров, содержащих в качестве
промежуточного связующего слоя тонкую пленку из гидрогеля толщиной 150 нм и тонкую пленку из оксида графена толщиной 20 нм. В случае биологического сенсора, содержащего пленку из гидрогеля, сигнал, полученный при детектировании биотинилированных ДНК и пропорциональный изменению показателя преломления вблизи поверхности биологического сенсора, составил 409 относительных единиц, а в случае биологического сенсора, содержащего пленку из оксида графена, сигнал составил 570 относительных единиц. Таким образом, отклик, а,
следовательно, и чувствительность при биодетектировании с использованием биологического сенсора, содержащего в качестве промежуточного
связующего слоя тонкую пленку из оксида графена, выше на 40 %.
Устройство работает следующим образом. К биоспецифическому слою (4) биологического сенсора подводится раствор с анализируемым веществом при помощи проточной ячейки или кюветы. При этом между анализируемым веществом и молекулами биоспецифического слоя (4) в виде молекул связывающего партнера анализируемого вещества (5), прикрепленным к поверхности промежуточной связующей пленки (3) непосредственно, либо с участием биологических молекул (6), способных образовывать химическую связь с молекулами связывающего партнера, и/или гидрогелем (7),
осажденным на поверхность биологического сенсора, осуществляется химическая реакция. Далее с помощью метода биодетектирования,
основанного на поверхностном плазмонном резонансе, происходит
получение необходимых параметров данной реакции. Суть метода состоит в том, что прикрепляемые к поверхности биологического сенсора молекулы меняют эффективный показатель преломления среды вблизи этой
поверхности, изменяя таким образом резонансные условия возбуждения поверхностных плазмонов на металлическом слое (2) биологического сенсора, которые могут детектироваться различными способами. Наиболее распространенным в коммерческих устройствах способом является
возбуждение поверхностных плазмонов, предложенное Кречманом [6] и состоящее в том, что падающий под определенным углом на металлическую пленку (2) со стороны подложки (1), имеющей больший показатель
преломления, чем среды с биологическими молекулами, лазерный луч возбуждает поверхностные плазмоны на границе металлической пленки (2) и среды с анализируемыми биологическими молекулами. При этом
оптимальные значения толщины металлической пленки (2) находятся в диапазоне 10-150 нм, верхняя граница объясняется тем фактом, что при более высоких значениях толщины пленки провал в отражении луча в схеме
Кречмана будет малым, что сильно скажется на чувствительности метода. При значениях толщины пленки (2) менее 10 нм, изменится форма
резонансной кривой, соответствующей поверхностному плазмону, из-за изменения вида самой волноводной моды поверхностного плазмона. Далее на основе получения значений величин резонансного угла возбуждения плазмонов, резонансной длины волны, сдвига фаз в отраженном от
металлической пленке луче или изменении интенсивности отраженного луча, получают информацию об изменении показателя преломления среды, находящейся вблизи металлической пленки. При этом не имеет смысла наносить промежуточный связующий слой (3) на поверхность металлической пленки (2) с толщиной более 2000 нм, в виду того, что глубина
проникновения электромагнитного поля поверхностного плазмона в среду около 500 нм, соответственно, молекулы, находящиеся на расстоянии более 2000 нм от поверхности металлической пленки (2), оказывают слабое влияние на условия возбуждения поверхностного плазмона, а, следовательно, не могут быть детектированы. В свою очередь промежуточный связующий слой (3) толщиной более 2000 нм затруднит доступ детектируемого вещества в область, где оно может быть детектировано. Минимальная толщина промежуточного связующего слоя (3), содержащего графен, соответствует мономолекулярному слою, толщина которого принимается равной 0,3 нм [7]. Для промежуточного связующего слоя (3), содержащего оксид графена, минимальная возможная толщина, соответствующая мономолекулярному слою, равна 0,7 нм [8]. Для промежуточного связующего слоя (3),
содержащего углеродные нанотрубки, минимальная возможна толщина равна диаметру углеродных нанотрубок, который может быть равен 0,4 нм [9]. При работе биологического сенсора в качестве анализируемого вещества могут использовать молекулы протеинов, липидов, ДНК, РНК, вирусы, клетки, бактерии или токсины, а также химические модификации приведенных веществ.
Способ создания биологического сенсора реализуется следующим образом:
На подложку (1) наносят металлическую пленку (2), например, при помощи электронно- лучевого осаждения. Так, например, для нанесения золотой пленки толщиной 40 нм в качестве подложки используют пластину боросиликатного стекла толщиной 0,4 мм с нанесенной на его поверхность пленкой титана толщиной 2 нм. Далее при помощи электронно- лучевого осаждения, проводимого в вакуумной камере с давлением 10" мм рт. ст. при ускоряющем напряжении электронов 4 кВ и температуре в камере 150 градусов Цельсия проводят осаждение золота на подложку. Толщина и оптические свойства получаемой золотой пленки контролируется при помощи эллипсометрических измерений.
Далее на поверхность металлической пленки (2) наносят
промежуточный связующий слой (3) в виде тонкой пленки на основе графена, оксида графена или однослойных или многослойных углеродных нанотрубок (изображение пленки на основе оксида графена, полученное с помощью растрового электронного микроскопа приведено на фиг. 8).
Тонкую пленку из графена, оксида графена или однослойных или
многослойных углеродных нанотрубок, наносят с использованием раствора соответствующего вещества и его последующей фильтрацией с помощью целлюлозной мембраны. После процесса фильтрации мембрана помещается на поверхность металлической пленки и растворяется в ацетоне, оставляя тонкую пленку из графена, оксида графена или углеродных нанотрубок. Так, например, для нанесения промежуточного связующего слоя, содержащего тонкую пленку из оксида графена толщиной 20 нм, используют 1 мл раствора оксида графена в воде концентрацией 5 мкг/мл.
Следующим этапом создания биологического сенсора является стадия нанесения на промежуточный связующий слой (3) биоспецифического слоя (4), при которой осуществляют непосредственную адсорбцию из раствора молекул, составляющих биоспецифический слой, таких как молекул
связывающего партнера анализируемого вещества (5), молекул, способных взаимодействовать с молекулами связывающего партнера (6) или гидрогеля (7). Раствор с биомолекулами приводят в контакт с промежуточным
связующим слоем (3) с помощью, например, проточной ячейки или кюветы. На фиг. 6 приведена кинетическая кривая (10) адсорбции молекул
стрептавидина, являющимся связывающим партнером к молекулам, имеющим биотиновые остатки, с использованием проточной ячейки. При этом время адсорбции выбирают таким образом, чтобы наносимые
биологические молекулы заняли большое количество центров активации на поверхности графена, оксида графена или углеродных нанотрубок, исключив таким образом в дальнейшем неспецифическое связывание молекул из анализируемого раствора с поверхностью биологического сенсора. При этом не требуется использование специальных веществ для создания таких пленок, кроме непосредственно наносимых молекул. Так, например, для адсорбции биоспецифического слоя, содержащего молекулы стрептавидина, на поверхность пленки из оксида графена данные молекулы адсорбируют из раствора концентрацией 10 мкг/мл при помощи проточной ячейки в течение 10 мин. В дальнейшем качество полученной поверхности можно проверить использованием тестового образца, про который известно, что молекулы из его состава не должны взаимодействовать с полученным биологическим слоем. Кинетическая кривая (12) осаждения биотинилированных ДНК на полученный биосенсор, содержащий молекулы стрептавидина, приведена на фиг. 7. Малость пика (11), отражающего взаимодействие небиотинилированных молекул со слоем стрептавидина, показывает достаточный уровень малости неспецифических взаимодействий.
Предлагаемые устройство и способ его создания обеспечивают в сравнении с известным уровнем техники получение следующих технических результатов: высокую чувствительность биосенсора в сочетании с высокой биоспецифичностью; расширение спектра применения устройства; защиту металлической пленки от воздействий внешней среды, что позволит использовать в процессе биодетектирования реагенты, которые могли бы повредить поверхность металла, а также использовать такие плазмонные материалы, как серебро, легко повреждающие при воздействии внешней среды; возможность детектирования крупных биологических объектов.
Таким образом, новая взаимосвязь известных и совокупности
отличительных признаков предлагаемого биосенсора и способа его создания позволяют обеспечить создание высокочувствительного и универсального биологического сенсора для биодетектирования, основанного на
поверхностном плазмонном резонансе.
Предлагаемое устройство и способ его создания могут быть
использованы для контроля и регистрации концентрации химических и биохимических веществ и определения параметров биомолекулярных реакций в различных промышленных процессах, происходящих с
использованием биологического материала.
Предлагаемое изобретение может быть использовано также в
фармацевтической промышленности для исследования фармакологических свойств и определения химического состава разрабатываемых лекарственных средств.
Кроме того, разрабатываемое устройство и способ его создания могут быть применены в процессах контроля качества продукции пищевой промышленности. Источники
1. Патент US5242828;
2. Патент GB 2459604;
3. Описание по заявке ЕР 2216642 А 1 ;
4. Wijaya Е., Maaloulib N., Boukherroubb R., Szuneritsb S., Vilcota J- P., "Graphene-based high-performance surface plasmon resonance biosensors", Proceedings of SPIE, Vol. 8424, 84240R, 2012;
5. Патент US 5763191;
6. Schasfoort R.B.M., Tudos A.J., Handbook of Surface Plasmon Resonance, RCS Publishing, Cambridge, 2008.
7. Blake P., Hill E.W., Castro Neto A.H., Novoselov K.S., Jiang D., Yang R., Booth T.J., and Geim A.K., "Making graphene visible", Appl. Phys. Lett., Vol. 91, 063124, 2007.
8. Pandey D., Reifenberger R., Piner R., "Scanning probe microscopy study of exfoliated oxidized graphene sheets", Surface Science, V. 602, pp. 1607- 1613, 2008.
9. Guan L., Suenaga K., and Iijima S., "Smallest Carbon Nanotube Assigned with Atomic Resolution Accuracy", Nano Letters, Vol. 8, pp. 459-462, 2008.

Claims

Формула изобретения
1. Биологический сенсор, состоящий из подложки, на поверхность которой нанесена металлическая пленка, на внешней поверхности которой расположен промежуточный связующий слой с адсорбированным на его поверхность биоспецифическим слоем, отличающийся тем, что промежуточный связующий слой выполнен из тонкой пленки из графена толщиной 0,3-2000 нм или тонкой пленки из однослойных или многослойных углеродных нанотрубок толщиной 0,4-2000 нм или тонкой пленки из оксида графена толщиной 0,7-2000 нм, а биоспецифический слой расположен на поверхности промежуточного связующего слоя конформно и однородно и выполнен с возможностью осуществления избирательного химического взаимодействия с анализируемыми биологическими молекулами.
2. Биологический сенсор по пункту 1, отличающийся тем, что в качестве металлической пленки используют пленку из золота, серебра, меди или алюминия толщиной 10-150 нм.
3. Биологический сенсор по пункту 1, отличающийся тем, что
биоспецифический слой содержит молекулы связывающего партнера
анализируемого вещества.
4. Биологический сенсор по пункту 1, отличающийся тем, что биоспецифический слой содержит молекулы связывающего партнера анализируемого вещества и молекулы, обладающие высоким сродством к связывающим партнерам молекул анализируемого вещества и образующие с ними химическую связь.
5. Биологический сенсор по пункту 1 , отличающийся тем, что
биоспецифический слой содержит гидрогель, с иммобилизованными в нем молекулами связывающего партнера анализируемого вещества.
6. Биологический сенсор по пункту 1, отличающийся тем, что
биоспецифический слой содержит гидрогель, с иммобилизованными в нем молекулами связывающего партнера молекул анализируемого вещества и
18
ЗАМЕНЯЮЩИЙ ЛИСТ (ПРАВИЛО 26) молекулами, обладающими высоким сродством к молекулам связывающего партнера анализируемого вещества и образующими с ними химическую связь.
7. Биологический сенсор по пункту 5 или по пункту 6, отличающийся тем, что в качестве гидрогеля биоспецифический слой содержит полисахариды.
8. Биологический сенсор по пункту 7, отличающийся тем, что в качестве полисахаридов биоспецифический слой содержит агарозу, альгиновую кислоту, декстран, каррагинан, крахмал, целлюлозу или их производные.
9. Биологический сенсор по пункту 8, отличающийся тем, что в качестве производных декстрана биоспецифический слой содержит
карбоксиметилированный декстран.
10. Биологический сенсор по пункту 4 или по пункту 6, отличающийся тем, что в качестве молекул, обладающих высоким сродством к молекулам
связывающего партнера анализируемого вещества, биоспецифический слой содержит молекулы авидина, стрептавидина и дегликозилированного авидина, молекулы связывающего партнера при этом являются биотинилированными.
1 1. Биологический сенсор по пунктам 3-6, отличающийся тем, что
связывающим партнером анализируемого вещества является антитело или фрагмент антитела к анализируемому веществу.
12. Биологический сенсор по пунктам 3-6, отличающийся тем, что
связывающим партнером анализируемого вещества является рецептор
анализируемого вещества.
13. Биологический сенсор по пунктам 3-6, отличающийся тем, что
связывающим партнером анализируемого вещества является связывающий партнер протеинов, липидов, ДНК, РНК, вирусов, клеток, бактерий или токсинов, а также химических модификаций приведенных веществ.
14. Способ создания биологического сенсора, охарактеризованного в пункте 1 , состоящий из стадий:
а) стадии нанесения металлической пленки на подложку;
б) стадии нанесения промежуточного связующего слоя на внешнюю
поверхность металлической пленки;
19
ЗАМЕНЯЮЩИЙ ЛИСТ (ПРАВИЛО 26) в) стадии нанесения биоспецифического слоя на поверхность промежуточного связующего слоя, отличающийся тем, что в качестве промежуточного
связующего слоя на внешнюю поверхность металлической пленки наносят тонкую пленку из графена толщиной 0,3- 2000 нм или тонкую пленку из однослойных или многослойных углеродных нанотрубок толщиной 0,4-2000 нм или тонкую пленку из оксида графена толщиной 0,7-2000 нм, а
биоспецифический слой конформно и однородно адсорбируют на поверхность промежуточного связующего слоя за счет возникновения сил химического взаимодействия между молекулами промежуточного связующего слоя и молекулами биоспецифического слоя, обусловленного стэкинг- взаимодействием или взаимодействием молекул биоспецифического слоя с функциональными группами графена, однослойных или многослойных углеродных нанотрубок или оксида графена, при этом при адсорбции
обеспечивают создание большого количества центров активации на
поверхности промежуточного связующего слоя со степенью заполнения поверхности молекулами биоспецифического слоя 15-100 % от площади поверхности промежуточного связующего слоя.
15. Способ по пункту 14, отличающийся тем, что в качестве металлической пленки наносят пленку из золота, серебра, меди или алюминия толщиной 10-150 нм.
16. Способ по пункту 14, отличающийся тем, что в качестве
биоспецифического слоя наносят слой молекул связывающего партнера анализируемого вещества.
17. Способ по пункту 14, отличающийся тем, что в качестве
биоспецифического слоя наносят слой молекул связывающего партнера анализируемого вещества и молекул, обладающих высоким сродством к молекулам связывающего партнера анализируемого вещества и образующих с ними химическую связь.
20
ЗАМЕНЯЮЩИЙ ЛИСТ (ПРАВИЛО 26)
18. Способ по пункту 14, отличающийся тем, что в качестве
биоспецифического слоя наносят слой гидрогеля, с иммобилизованными в нем молекулами связывающего партнера молекул анализируемого вещества
19. Способ по пункту 14, отличающийся тем, что в качестве
биоспецифического слоя наносят слой гидрогеля, с иммобилизованными в нем молекулами связывающего партнера анализируемого вещества и молекулами, обладающими высоким сродством к молекулам связывающего партнера " анализируемого вещества и образующими с ними химическую связь.
20. Способ по пунктам 18-19, отличающийся тем, что в качестве гидрогеля наносят полисахариды.
21. Способ по пункту 20, отличающийся тем, что в качестве полисахаридов наносят агарозу, альгиновую кислоту, декстран, каррагинан, крахмал,
целлюлозу или их производные.
22. Способ по пункту 21, отличающийся тем, что в качестве производных декстрана биоспецифический слой содержит карбоксиметилированный декстран.
23. Способ по пунктам 17 или 19, отличающийся тем, что в качестве молекул, обладающих высоким сродством к молекулам связывающего партнера
анализируемого вещества, наносят молекулы авидина, стрептавидина и дегликозилированного авидина, молекулы связывающего партнера при этом являются биотинилированными.
24. Способ по пункту 14, отличающийся тем, что взаимодействие молекул биоспецифического слоя с функциональными группами графена, однослойных или многослойных углеродных нанотрубок или оксида графена осуществляется за счет взаимодействия с такими функциональными группами, как
эпоксидными, гидроксильными, карбонильными или карбоксильными
группами.
25. Способ по пунктам 16-19, отличающийся тем, что в качестве
связывающего партнера анализируемого вещества используют антитело или фрагмент антитела к анализируемому веществу.
21
ЗАМЕНЯЮЩИЙ ЛИСТ (ПРАВИЛО 26)
26. Способ по пунктам 16-19, отличающийся тем, что в качестве связывающего партнера анализируемого вещества используют рецептор анализируемого вещества.
27. Способ по пунктам 16-19, отличающийся тем, что в качестве связывающего партнера анализируемого вещества используют связывающий партнер протеинов, липидов, ДНК, РНК, вирусов, клеток, бактерий или токсинов, а также химических модификаций приведенных веществ.
22
ЗАМЕНЯЮЩИЙ ЛИСТ (ПРАВИЛО 26)
PCT/RU2013/001100 2013-02-20 2013-12-09 Биологический сенсор и способ создания биологического сенсора Ceased WO2014129933A1 (ru)

Priority Applications (3)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US14/647,397 US20150301039A1 (en) 2013-02-20 2013-12-09 Biological Sensor and a Method of the Production of Biological Sensor
CA2935101A CA2935101C (en) 2013-02-20 2013-12-09 Biological sensor and method for producing same
US15/671,187 US10962536B2 (en) 2013-02-20 2017-08-08 Biological sensor and a method of the production of biological sensor

Applications Claiming Priority (2)

Application Number Priority Date Filing Date Title
RU2013107267 2013-02-20
RU2013107267/15A RU2527699C1 (ru) 2013-02-20 2013-02-20 Биологический сенсор и способ создания биологического сенсора

Related Child Applications (2)

Application Number Title Priority Date Filing Date
US14/647,397 A-371-Of-International US20150301039A1 (en) 2013-02-20 2013-12-09 Biological Sensor and a Method of the Production of Biological Sensor
US15/671,187 Division US10962536B2 (en) 2013-02-20 2017-08-08 Biological sensor and a method of the production of biological sensor

Publications (1)

Publication Number Publication Date
WO2014129933A1 true WO2014129933A1 (ru) 2014-08-28

Family

ID=51391604

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
PCT/RU2013/001100 Ceased WO2014129933A1 (ru) 2013-02-20 2013-12-09 Биологический сенсор и способ создания биологического сенсора

Country Status (4)

Country Link
US (2) US20150301039A1 (ru)
CA (1) CA2935101C (ru)
RU (1) RU2527699C1 (ru)
WO (1) WO2014129933A1 (ru)

Families Citing this family (15)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US8906320B1 (en) 2012-04-16 2014-12-09 Illumina, Inc. Biosensors for biological or chemical analysis and systems and methods for same
FR3045826A1 (fr) 2015-12-17 2017-06-23 Commissariat Energie Atomique Supports amplificateurs de contraste utilisant un materiau bidimensionnel
RU2616879C1 (ru) * 2016-03-04 2017-04-18 федеральное государственное автономное образовательное учреждение высшего образования "Российский университет дружбы народов" (РУДН) Флуоресцентный оптический ДНК-биосенсор
US10903319B2 (en) * 2016-06-15 2021-01-26 Nanomedical Diagnostics, Inc. Patterning graphene with a hard mask coating
RU2636048C1 (ru) * 2016-10-25 2017-11-17 Общество с ограниченной ответственностью Научно-производственное предприятие "Центр перспективных технологий" Биосенсорное устройство для обнаружения биологических микро- и нанообъектов
CN106596926B (zh) * 2016-12-26 2018-04-10 上海微谱化工技术服务有限公司 一种氨基糖苷类抗生素的检测方法
JP6949987B2 (ja) * 2017-03-31 2021-10-13 アルセロールミタル キッシュグラファイトから酸化グラフェンを製造するための方法
MA49291A (fr) * 2017-03-31 2020-02-05 Arcelormittal Procédé de fabrication d'oxyde de graphène réduit à partir de graphite de sursaturation
US10861829B2 (en) 2017-12-26 2020-12-08 Illumina, Inc. Sensor system
RU2697701C1 (ru) * 2018-12-28 2019-08-19 федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего образования "Московский государственный технический университет имени Н.Э. Баумана (национальный исследовательский университет)" (МГТУ им. Н.Э. Баумана) Способ изготовления биологического сенсора на основе оксида графена и биологический сенсор на гибкой подложке
RU2745511C1 (ru) * 2019-12-31 2021-03-25 федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего образования "Московский государственный технический университет имени Н.Э. Баумана (национальный исследовательский университет)" (МГТУ им. Н.Э. Баумана) Способ иммобилизации коротких нуклеотидных последовательностей на поверхность и торцевые области наноматериалов
RU2745663C1 (ru) * 2019-12-31 2021-03-30 федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего образования "Московский государственный технический университет имени Н.Э. Баумана (национальный исследовательский университет)" (МГТУ им. Н.Э. Баумана) Способ изготовления матричного биосенсора на основе восстановленного оксида графена и матричный биосенсор на полимерной подложке
RU2749698C1 (ru) * 2020-11-17 2021-06-16 федеральное государственное автономное образовательное учреждение высшего образования "Санкт-Петербургский политехнический университет Петра Великого" (ФГАОУ ВО "СПбПУ") Биомолекулярный сенсор с микроэлектронным генератором электромагнитной волны
CN114295557B (zh) * 2021-12-29 2023-07-04 北京建工环境修复股份有限公司 一种表面等离子体共振传感芯片和全氟化合物检测方法
US20250110119A1 (en) * 2023-03-03 2025-04-03 Sartorius Bioanalytical Instruments, Inc. Methods for quantitating viral capsids

Citations (4)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US20090116020A1 (en) * 2007-10-31 2009-05-07 Seikoh Giken Co., Ltd. Biosensor, method for producing the same and sensor measurement system
RU2379671C1 (ru) * 2008-10-23 2010-01-20 Государственное образовательное учреждение высшего профессионального образования "Московский государственный институт электронной техники (технический университет)" Сенсорная структура на основе квазиодномерных проводников
WO2011004136A1 (en) * 2009-07-07 2011-01-13 Uws Ventures Limited Graphene biosensor
US20130011914A1 (en) * 2010-03-19 2013-01-10 Gachon University Industry University Cooperation Foundation Biochip

Family Cites Families (7)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
SE462454B (sv) 1988-11-10 1990-06-25 Pharmacia Ab Maetyta foer anvaendning i biosensorer
US5763191A (en) 1990-12-12 1998-06-09 Boehringer Mannheim Gmbh Universal binding film
US20070065954A1 (en) * 2005-09-15 2007-03-22 Minoru Taya Surface plasmon resonance biosensor system for detection of antigens and method for determining the presence of antigens
DE112008000507T5 (de) 2007-02-26 2010-02-18 Wisconsin Alumni Research Foundation, Madison Mit Oberflächen-Plasmon-Resonanz kompatible Kohlenstoff-Dünnschichten
EP2216642B1 (en) 2009-02-06 2017-08-23 Fraunhofer-Gesellschaft zur Förderung der angewandten Forschung e.V. Surface plasmon resonance sensor
WO2010111466A1 (en) * 2009-03-27 2010-09-30 The Trustees Of Columbia University In The City Of New York Aptamer-mediated drug release
US8852444B2 (en) * 2009-08-14 2014-10-07 Northwestern University Sorting two-dimensional nanomaterials by thickness

Patent Citations (4)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US20090116020A1 (en) * 2007-10-31 2009-05-07 Seikoh Giken Co., Ltd. Biosensor, method for producing the same and sensor measurement system
RU2379671C1 (ru) * 2008-10-23 2010-01-20 Государственное образовательное учреждение высшего профессионального образования "Московский государственный институт электронной техники (технический университет)" Сенсорная структура на основе квазиодномерных проводников
WO2011004136A1 (en) * 2009-07-07 2011-01-13 Uws Ventures Limited Graphene biosensor
US20130011914A1 (en) * 2010-03-19 2013-01-10 Gachon University Industry University Cooperation Foundation Biochip

Also Published As

Publication number Publication date
US20170336401A1 (en) 2017-11-23
US10962536B2 (en) 2021-03-30
RU2013107267A (ru) 2014-08-27
CA2935101A1 (en) 2014-08-28
CA2935101C (en) 2019-02-26
US20150301039A1 (en) 2015-10-22
RU2527699C1 (ru) 2014-09-10

Similar Documents

Publication Publication Date Title
RU2527699C1 (ru) Биологический сенсор и способ создания биологического сенсора
Santos et al. Nanoporous anodic aluminum oxide for chemical sensing and biosensors
KR101879794B1 (ko) 나노구조를 가지는 표면 플라스몬 공명(ｓｐｒ) 센서 장치
US7586601B2 (en) Applications of laser-processed substrate for molecular diagnostics
JP5175584B2 (ja) 局所表面プラズモン共鳴イメージング装置
US20120081703A1 (en) Highly Efficient Plamonic Devices, Molecule Detection Systems, and Methods of Making the Same
Zhu et al. A localized surface plasmon resonance nanosensor based on rhombic Ag nanoparticle array
CN106233140A (zh) 用于增强测定灵敏度的数字lspr
KR20070015609A (ko) 표면 증강 라만 산란에 의한 화학그룹의 증강된 검출을위한 층상의 플라스몬 구조를 가진 옵티컬 센서
Schalkhammer Metal nano clusters as transducers for bioaffinity interactions
WO2002056012A1 (en) Fluorescent analysis element with the use of metallic nanowell and process for producing the same
US11280784B2 (en) Patterned plasmonic nanoparticle arrays for multiplexed, microfluidic biosensing assays
JP6968056B2 (ja) 蛍光を増強するための基材
WO2012051451A2 (en) Highly efficient plasmonic devices, molecule detection systems, and methods of making the same
Yin et al. Emerging trends in SERS-based veterinary drug detection: multifunctional substrates and intelligent data approaches
Saleem et al. Gold nano-ripple structure with potential for bio molecular sensing applications
Zhang et al. Silver nanopillar arrayed thin films with highly surface-enhanced Raman scattering for ultrasensitive detection
EP2948771B1 (en) Chemical sensing device
Aoyama et al. Enhanced immunoadsorption on imprinted polymeric microstructures with nanoengineered surface topography for lateral flow immunoassay systems
WO2024034561A1 (ja) 固相担体及び対象物の測定用キット
EP2941639B1 (en) A three-dimensional dispersible nanoresonator structure for biological, medical and environmental applications and a method for manufacture thereof
US8780351B2 (en) Method for demonstrating the presence of molecules by means of optical gratings
Nocerino et al. Next-Generation Plasmonic Platforms: Hybrid Au–Si3N4 Nanostructures for Scalable Sub-Femtomolar Biosensing
KR20250135255A (ko) 플라즈모닉 바이오센싱을 위한 플라즈모닉 나노구조체를 제조하기 위한 2-단계 방법
Reda A Nano-Biosensor for Label-Free Detection of Nucleic Acid Using Silicon Nano-Structured Materials

Legal Events

Date Code Title Description
121 Ep: the epo has been informed by wipo that ep was designated in this application

Ref document number: 13876041

Country of ref document: EP

Kind code of ref document: A1

WWE Wipo information: entry into national phase

Ref document number: 14647397

Country of ref document: US

NENP Non-entry into the national phase

Ref country code: DE

122 Ep: pct application non-entry in european phase

Ref document number: 13876041

Country of ref document: EP

Kind code of ref document: A1

ENP Entry into the national phase

Ref document number: 2935101

Country of ref document: CA