WO2020105723A1 - 単結晶x線構造解析試料の吸蔵装置及び吸蔵方法 - Google Patents
単結晶x線構造解析試料の吸蔵装置及び吸蔵方法Info
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Definitions
- the present invention relates to an apparatus and method for preparing an analytical sample to be used in single crystal X-ray structural analysis, and particularly to a single crystal X-ray structural analysis sample occlusion apparatus suitable for occlusion of the sample in a crystal sponge and Regarding storage method.
- this single crystal X-ray structure analysis had a major limitation that a single crystal had to be prepared by crystallizing a sample.
- a material called “crystal sponge” for example, pores having an infinite number of pores having a diameter of 0.5 nm to 1 nm.
- Non-Patent Document 1 an extremely minute and fragile crystal sponge in which a large number of fine holes are formed is formed, and the inside of the fine holes of this crystal sponge is formed.
- the crystal structure of the single crystal can be obtained relatively easily.
- the present invention solves the above-mentioned problems of the prior art, and in a state where an extremely minute and fragile crystal sponge for single crystallizing an analysis sample is held in a sample holder of a single crystal X-ray structure analyzing apparatus.
- the present invention provides a storage device and a storage method for a single crystal X-ray structure analysis sample, which makes it possible to supply an analysis sample to this crystal sponge and surely store it.
- an occlusion device of the present invention is an occlusion device for occlusion of a sample, wherein the sample is inside an applicator in which a sample holder holding a porous complex crystal is inserted.
- Supply unit for supplying temperature to the applicator, a temperature adjusting unit for controlling the temperature of the applicator, a discharging unit for carrying out the sample from the inside of the applicator in which the sample holder is inserted, the supplying unit and the temperature adjusting unit.
- a control unit that controls the discharge unit.
- the supply unit includes an injection pipe, and the supply unit is the injection pipe inserted into the applicator through a first through hole formed in the sample holder. The sample is supplied to the inside of the applicator via the.
- the discharge part includes a discharge pipe, and the discharge part is inserted into the applicator through a second through hole formed in the sample holder. The sample is carried out from the inside of the applicator via the.
- the supply unit includes a supply-side first actuator that adjusts a pressure or a flow rate of the sample that is supplied from the outside, and the sample that is adjusted by the supply-side first actuator. Through a first through hole formed in the sample holder, and a supply side second actuator that adjusts the pressure or flow rate of the sample analyzed by the supply side analysis unit. And an injection pipe for supplying the sample adjusted by the second supply-side actuator to the inside of the applicator.
- the discharge part includes a discharge pipe inserted into the applicator through a second through hole formed in the sample holder, and the applicator through the discharge pipe.
- a discharge-side first actuator that discharges the sample from inside
- a discharge-side analysis unit that analyzes the components of the sample discharged to the discharge-side first actuator, and a component that has been analyzed by the discharge-side analysis unit.
- a discharge side second actuator for adjusting and discharging the pressure or flow rate or concentration of the sample.
- the supply unit includes a supply-side first actuator that adjusts a pressure or a flow rate of the sample that is externally supplied, and the sample that is adjusted by the supply-side first actuator. Through a first through hole formed in the sample holder, and a supply side second actuator that adjusts the pressure or flow rate of the sample analyzed by the supply side analysis unit. Into the applicator, and a discharge pipe inserted into the applicator through a second through hole formed in the sample holder.
- a discharge side second actuator that adjusts and discharges the pressure or flow rate or concentration of the sample whose components have been analyzed by the discharge side analysis unit, and the sample discharged to the discharge side second actuator is It is characterized in that it is returned to the supply side first actuator.
- control unit controls the supply unit, the temperature adjusting unit, and the discharge unit to cause the porous complex crystal held by the sample holder to have the above-mentioned structure. It is characterized by controlling the occlusion condition for occlusion of the sample.
- a reading unit for reading information held in an information holding unit provided in the sample holder or the applicator is provided, and the control unit has information read by the reading unit. It is characterized by storing.
- control unit controls the supply unit according to the type of the sample supplied from the supply unit to the applicator based on the information read by the reading unit.
- the temperature control unit and the discharge unit are controlled.
- the storage method of the present invention is a storage method for storing a sample, wherein the sample is supplied from an absorption device to an applicator in which a sample holder holding a porous complex crystal is inserted. And a step of discharging the sample supplied to the applicator from the inside of the applicator by the storage device, at least one of the supplying step and the discharging step is a concentration of the sample and a pressure. It is characterized in that it is carried out in a state in which the storage condition including any one of temperature, time and time is controlled.
- the step of supplying the sample is characterized in that the sample is supplied through an injection pipe inserted into the applicator through a first through hole formed in the sample holder. I am trying.
- the sample in the step of discharging the sample, is carried out through a discharge pipe inserted into the applicator through a second through hole formed in the sample holder. It is characterized by carrying out by doing.
- the storage device of the present invention a state in which a sample holder of a single crystal X-ray structure analysis device holds a crystal sponge which is a microscopic and fragile porous complex crystal for single crystallizing an analysis sample
- a crystal sponge which is a microscopic and fragile porous complex crystal for single crystallizing an analysis sample
- FIG. 1 is a block diagram showing a schematic configuration of an entire single crystal X-ray structure analysis system including a single crystal X-ray structure analysis apparatus according to a first embodiment of the present invention. It is a perspective view showing the composition of the single crystal X-ray structure analysis device concerning the 1st example of the present invention. It is a perspective view which shows the structure of the measurement part of the single crystal X-ray structure analysis apparatus which concerns on the 1st Example of this invention.
- (A) is a block diagram showing an example of a detailed electrical internal configuration of a single crystal X-ray structure analyzing apparatus according to a first embodiment of the present invention, and (b) is a first embodiment of the present invention.
- FIG. 3 is a block diagram of a data file showing a file management method for storing a plurality of measurement data in a data file as an example of the details of the electrical internal configuration of the single crystal X-ray structure analysis apparatus according to the example. It is a figure which shows the image of the XRDS pattern observed with the single crystal X-ray-structure-analysis apparatus which concerns on the 1st Example of this invention.
- A is a figure of the execution screen of the application software for a measurement of the single crystal X-ray-structure-analysis apparatus which concerns on the 1st Example of this invention
- (b) relates to the 1st Example of this invention
- FIG. 1 It is a perspective view of the sample holder of the occlusion device which concerns on the 1st Example of this invention. It is a perspective view of an applicator which stores the sample holder of the occlusion device concerning the 1st example of the present invention. It is sectional drawing of the applicator which accommodates the sample holder of the occlusion device which concerns on the 1st Example of this invention. It is sectional drawing which shows the state which accommodated the sample holder of the occlusion device which concerns on the 1st Example of this invention in the applicator.
- FIG. 3 is a perspective view of a sample tray in which a plurality of applicators, each of which has a sample holder with a sample stored at its tip, is stored in the storage device according to the first embodiment of the present invention. It is sectional drawing of the sample holder of the occlusion device which concerns on the 2nd Example of this invention. It is a block diagram which shows the structure of the occlusion device which concerns on the 3rd Example of this invention.
- a single crystal structure analysis sample storage apparatus and storage method for a single crystal X-ray structure analysis apparatus will be described with reference to the drawings.
- the expression “A or B” means “at least one of A and B”, and includes “A and B” unless there is a special circumstance that A and B cannot exist.
- FIG. 1 shows a schematic configuration of the entire single crystal X-ray structure analysis system 100 including the single crystal X-ray structure analysis apparatus according to this embodiment.
- the single crystal X-ray structure analysis system 100 is a chromatography device 200 that extracts a sample to be analyzed from a sample such as a gas or a liquid, and a single crystal X-ray structure analysis from a sample extracted by the chromatography device 200.
- Storage device 300 for a single crystal X-ray structure analysis device (hereinafter, also simply referred to as storage device 300) for preparing a sample, a sample tray 410 for storing a sample for single crystal X-ray structure analysis prepared by the storage device 300, and a sample It is configured to include a single crystal X-ray structure analysis device 500 that analyzes a sample stored in the tray 410 using X-rays. The sample may be moved from the storage device 300 to the single crystal X-ray structure analysis device 500 as a single product without using the sample tray 410.
- FIG. 2 attached herewith shows an overall appearance configuration of a single crystal X-ray structure analyzing apparatus including a single crystal X-ray diffractometer according to an embodiment of the present invention.
- the single crystal X-ray structure analysis apparatus 500 has a base 504 that stores a cooling device and an X-ray generation power supply unit, and an X-ray protection cover 506 that is placed on the base 504.
- the anti-X-ray cover 506 has a casing 507 surrounding the single crystal X-ray diffraction device 509, a door provided on the front surface of the casing 507, and the like.
- a door provided on the front surface of the casing 507 can be opened, and various operations can be performed on the internal single crystal X-ray diffraction apparatus 509 in this opened state.
- the present embodiment shown in the figure is a single crystal X-ray structure analyzing apparatus 500 including a single crystal X-ray diffracting apparatus 509 for performing structural analysis of a substance by using a crystal sponge described later.
- the single crystal X-ray diffractometer 509 has an X-ray tube 511 and a goniometer 512 as shown in FIG.
- the X-ray tube 511 has a filament, a target (also referred to as “anticathode”) arranged to face the filament, and a casing that hermetically stores them, and the filament is
- the X-ray generation power supply unit stored in the base 504 of FIG. 2 energizes to generate heat and emit thermoelectrons.
- the X-ray tube 511 includes a microfocus tube and optical elements such as a multilayer film condensing mirror, and is capable of irradiating a beam of higher brightness. It is also possible to select from radiation sources such as Cu, Mo and Ag.
- the filament, the target arranged facing the filament, and the casing that hermetically stores them function as an X-ray source, and an optical element such as a microfocus tube and a multilayer film condensing mirror.
- the configuration for X-ray irradiation including the above functions as an X-ray irradiation unit.
- the goniometer 512 supports the sample S to be analyzed and is arranged around the ⁇ rotary table 516 which is rotatable around the sample axis ⁇ passing through the X-ray incident point of the sample S and around the ⁇ rotary table. It has a 2 ⁇ rotary table 517 rotatable about the sample axis ⁇ .
- the goniometer 512 includes a goniometer head 514 on which the sample S is mounted.
- the sample S is stored in a crystal sponge that is previously attached to a part of the sample holder 513, which will be described in detail later.
- a drive device (not shown) for driving the above-described ⁇ rotary table 516 and 2 ⁇ rotary table 517 is stored, and driven by these drive devices, ⁇
- the rotary table 516 rotates intermittently or continuously at a predetermined angular velocity and makes a so-called ⁇ rotation.
- the 2 ⁇ rotation base 517 rotates intermittently or continuously, and so-called 2 ⁇ rotation.
- the above drive device can be configured by any structure, for example, a power transmission structure including a worm and a worm wheel.
- An X-ray detector 522 is mounted on a part of the outer circumference of the goniometer 512.
- the X-ray detector 522 is, for example, a CCD or CMOS two-dimensional pixel detector or a hybrid pixel detector. Composed.
- the X-ray detection and measurement unit refers to a configuration that detects and measures X-rays diffracted or scattered by the sample, and includes the X-ray detector 22 and a control unit that controls the X-ray detector 22.
- the sample S rotates ⁇ around the sample axis ⁇ by the ⁇ rotation of the ⁇ rotation table 516 of the goniometer 512.
- X-rays generated from the X-ray focal point in the X-ray tube 511 and directed to the sample S are incident on the sample S at a predetermined angle and are diffracted / diverged. That is, the incident angle of the X-ray incident on the sample S changes according to the ⁇ rotation of the sample S.
- the sample S When the Bragg diffraction condition is satisfied between the incident angle of the X-ray incident on the sample S and the crystal lattice plane, the sample S generates diffracted X-rays. This diffracted X-ray is received by the X-ray detector 522 and its X-ray intensity is measured. As described above, the angle of the X-ray detector 522 with respect to the incident X-ray, that is, the intensity of the diffracted X-ray corresponding to the diffraction angle is measured, and the crystal structure or the like of the sample S is analyzed from the measurement result.
- FIG. 4A shows an example of the details of the electrical internal configuration of the control unit 550 in the single crystal X-ray structure analysis apparatus 500.
- the present invention is not limited to the embodiments described below.
- This single crystal X-ray structure analyzing apparatus 500 includes the above-mentioned internal configuration, and further, a measuring apparatus 562 for measuring an appropriate substance as a sample, an input apparatus 563 including a keyboard, a mouse, etc., and a display.
- An image display device 564 as a means, a printer 566 as a means for printing and outputting an analysis result, a CPU (Central Processing Unit) 557, a RAM (Random Access Memory) 558, and a ROM (Read Only Memory) 559 and a hard disk as an external storage medium.
- CPU Central Processing Unit
- RAM Random Access Memory
- ROM Read Only Memory
- the image display device 564 is composed of an image display device such as a CRT display or a liquid crystal display, and displays an image on the screen according to an image signal generated by the image control circuit 553.
- the image control circuit 553 generates an image signal based on the image data input thereto.
- the image data input to the image control circuit 553 is formed by the operation of various calculation means realized by a computer including an analysis unit 551 including a CPU 557, a RAM 558, a ROM 559, and a hard disk.
- the analysis unit 551 can be configured by a magneto-optical disk, a semiconductor memory, or a storage medium having an arbitrary structure other than the hard disk.
- analysis application software 5511 that controls the overall operation of the single crystal X-ray structure analysis apparatus 500, and measurement processing that uses the measurement apparatus 562.
- the measurement application software 5512 that controls the operation of the above and the display application software 5513 that controls the operation of the display processing using the image display device 564 are stored. These application software realizes a predetermined function after being read from the hard disk of the analysis unit 551 and transferred to the RAM 558 as necessary.
- the single crystal X-ray structure analysis apparatus 500 further includes a database, for example, placed in a cloud area for storing various measurement results including the measurement data obtained by the measurement apparatus 562.
- a database for example, placed in a cloud area for storing various measurement results including the measurement data obtained by the measurement apparatus 562.
- an XRDS information database 571 that stores XRDS image data obtained by the above-described measuring device 562
- a microscope image database 572 that stores actually measured images obtained by a microscope, and further, for example, , XRF, Raman rays, and other measurement results obtained by analysis other than X-rays
- another analysis database 573 for storing physical property information.
- these databases do not necessarily have to be mounted inside the single crystal X-ray structure analysis apparatus 500, and may be provided outside and connected to each other via a network 580 or the like so that they can communicate with each other. ..
- a method of storing each measurement data in an individual file can be considered, but in the present embodiment, as shown in FIG.
- a plurality of measurement data are continuously stored in one data file.
- the storage area described as “condition” in FIG. 4B is an area for storing various information including device information and measurement conditions when the measurement data was obtained.
- Such measurement conditions include (1) measurement target substance name, (2) measurement device type, (3) measurement temperature range, (4) measurement start time, (5) measurement end time, and (6) measurement angle. Range, (7) moving speed of the scanning movement system, (8) scanning conditions, (9) type of X-rays incident on the sample, (10) whether or not an attachment such as a sample high temperature device is used, and various other conditions Can be considered.
- the information necessary for occlusion may be acquired via the cloud, or the information necessary for occlusion may be acquired from the memory in the control unit of the occlusion device. For example, if you search the storage conditions provided via the cloud structure based on the unique information of the sample holder or applicator, you can easily obtain the required storage conditions and enter / set them. It can also be executed automatically.
- the information is stored in the cloud, but the information is not necessarily limited to this and may be stored in the memory (HDD) inside or outside the single crystal X-ray structure analysis apparatus. If the order of the samples to be measured is predetermined, the unique information is not saved in the sample holder or applicator, but the unique information is stored in the memory in advance, and the unique information is read out in order. Information may be acquired.
- An XRDS (X-ray Diffraction and Scattering) pattern or image (see FIG. 5) is used to detect X-rays received on a plane that is a two-dimensional space of the X-ray detector 522 that constitutes the measurement device 562. It is obtained by receiving / accumulating light for each pixel (for example, CCD, etc.) arranged in a plane forming the container and measuring the intensity thereof. For example, by detecting the intensity of the received X-ray by integration for each pixel of the X-ray detector 522, a pattern or image in a two-dimensional space of r and ⁇ can be obtained.
- the XRDS pattern or image in the observation space obtained by diffraction or scattering of X-rays by the target material with respect to the irradiated X-rays reflects the information of the electron density distribution in the real space of the target material.
- the XRDS pattern is a two-dimensional space of r and ⁇ , and does not directly express the symmetry in the real space of the target material, which is a three-dimensional space. Therefore, it is generally difficult to specify the (spatial) arrangement of the atoms and molecules that make up the material using only the existing XRDS image, and requires specialized knowledge of X-ray structural analysis. Therefore, in the present embodiment, the measurement application software described above is adopted for automation.
- an X-ray diffraction data measurement / processing software called “CrysAlis Pro ” which is a platform for single crystal structure analysis is installed, Perform preliminary measurement, measurement condition setting, main measurement, data processing, etc. Further, by mounting an automatic structural analysis plug-in called “AutoChem”, structural analysis and structural refinement are executed in parallel with X-ray diffraction data acquisition. Then, the structure analysis program called “Olex 2 ” also shown in FIG. 7 performs space group determination, phase determination, molecular model construction and modification, structure refinement, final report, and CIF file creation.
- a “crystal sponge” which is an extremely minute and fragile porous complex crystal with a number of pores with a diameter of 0.5 nm to 1 nm opened innumerably and having a size of about several tens ⁇ m to several hundreds ⁇ m, Due to the development of the so-called material, single crystal X-ray structural analysis is widely applied to liquid compounds that do not crystallize, or very small samples such as several ng to several ⁇ g that cannot be secured in sufficient amounts for crystallization. It is possible to do.
- a skeleton of an extremely minute and fragile crystal sponge with an outer diameter of about 100 ⁇ m provided by impregnating a very small amount of sample in a storage solvent (carrier) such as cyclohexane in a container.
- a storage solvent such as cyclohexane
- the storage solvent includes a liquid, a gas (gas), and a supercritical fluid in the middle thereof.
- the present invention has been achieved based on the findings of the inventor as described above, and a single crystal X-ray structural analysis using a microscopic and fragile crystal sponge is described below.
- a single crystal X-ray structural analysis using a microscopic and fragile crystal sponge is described below.
- Also referred to as a holder makes it possible to perform surely and easily, in other words, a single crystal X-ray structure with good yield and efficiency, excellent versatility, and user friendliness. It realizes an analysis device.
- next-generation single-crystal X-ray structure analysis apparatus an extremely minute and fragile crystal sponge that occludes an extremely small amount of sample S is prepared, and further, the sample S (crystal sponge ) Must be taken out from the occlusion container and attached accurately and quickly to the prescribed position of the tip of the goniota, but especially to realize a versatile and user-friendly device.
- the work needs to be able to be carried out quickly and easily without requiring a high degree of specialized knowledge and precision (denseness) of the work.
- the present invention solves such a problem, that is, anyone can use a crystal sponge that is extremely minute and fragile and is difficult to handle, and anyone can do it quickly, reliably and easily, with high yield and efficiently, and in a user-friendly manner.
- the present invention provides an apparatus and method for performing a single crystal X-ray structural analysis that is capable of performing the above and is also highly versatile, and a sample holder that is an instrument therefor, which will be described in detail below.
- a storage device 300 for storing a sample to be analyzed in a crystal sponge In the configuration of the single crystal X-ray structure analysis system 100 including the single crystal X-ray structure analysis device 500 according to the first embodiment of the present invention shown in FIG. 1, a storage device 300 for storing a sample to be analyzed in a crystal sponge. The configuration will be described with reference to FIGS. 8 to 14.
- FIG. 8 is a block diagram showing the configuration of an occlusion device 300 for a single crystal X-ray structure analysis device 500 according to the first embodiment of the present invention.
- the occlusion device 300 according to the present embodiment includes a supply side pipe 301, a supply side first actuator 302, a supply side analysis unit 303, a supply side second actuator 304, a supply side pipe 305, an injection needle (injection pipe) 306, a sample holder.
- Applicator 311 equipped with 310 (corresponding to the sample holder 513 in FIG.
- temperature controller temperature controller
- discharge needle discharge pipe
- discharge side first actuator discharge pipe
- discharge side analysis A section 334 discharge side second actuator 335
- discharge side pipe 336 discharge side pipe 336
- control section 340 control section 340
- reading section 350 reading section 350
- the occlusion device 300 is a carrier or solvent (hereinafter, referred to as a sample including these) including a sample (gas, liquid or supercritical fluid) to be analyzed supplied from a separation device (for example, gas chromatography or liquid chromatography) 200. ) Is supplied through the supply side pipe 301, and the flow rate and pressure of the sample are adjusted by the supply side first actuator 302.
- FIG. 9 shows an example of the analysis result.
- the graph of FIG. 9 shows that the sample sent from the separation device 200 has a peak 901 in the signal intensity of a certain specific component.
- the sample analyzed by the supply-side analysis unit 303 is sent from the supply-side pipe 305 to the injection needle 306 whose tip portion is inserted into the sample holder 310 attached to the applicator 311 and the tip of the injection needle 306.
- the part is supplied to the sample holder 310 inside the applicator 311.
- the sample alone or the solution in which the sample and the storage solvent (carrier) are mixed is supplied through the sample introduction tube 254 on the supply side.
- the injection needle 306 is driven by a driving means (not shown) and inserted into the sample holder 310 mounted inside the applicator 311.
- the temperature controller 320 is controlled by the control unit 340 to heat or cool the applicator 311 so that the applicator 311 including the sample holder 310 has a desired temperature.
- the discharge-side first actuator 333 operates, and a tip portion is inserted into the inside of the sample holder 310 mounted on the applicator 311 from the discharge needle 331, and an excess sample or a sample and a storage solvent are discharged through the discharge pipe 332.
- the solution mixed with (carrier) is discharged. That is, the excess sample refers to a sample discharged according to the length of the discharge needle 331.
- the ejection needle 331 is driven by a driving unit (not shown) and inserted into the sample holder 310.
- a driving unit not shown
- unnecessary storage solvent (carrier) or solution flows in the sample introduction pipe 254 on the discharge side and is discharged. Therefore, the sample may not flow into the sample introduction pipe 254 on the discharge side.
- gas or supercritical fluid is used as the carrier, the carrier containing the sample is discharged.
- FIG. 10 shows an example of the analysis result.
- the sample discharged from the inside of the applicator 311 whose components have been analyzed by the discharge-side analysis unit 334 is adjusted in pressure, flow rate, or concentration by the discharge-side second actuator 335, and the mass spectrometer 600 is discharged from the discharge-side pipe 336. And its mass component is analyzed.
- the intensity peak 901 is shown in FIG. It can be seen that the level of the component peak 1001 in the graph of FIG. This indicates that a part of the components having peaks in FIG. 9 was consumed inside the applicator 311.
- the data shown in FIG. 9 and the data shown in FIG. 10 are compared by the control unit 340, and when the difference or ratio between the peak values of the two reaches a preset value, the applicator 311 It is determined that the sample to be analyzed is occluded in the crystal sponge attached to the tip portion of the sample holder 310 mounted inside, and a series of operations is ended.
- FIG. 11 shows a sectional view of the sample holder 310 seen from the front.
- the sample holder 310 has a flat surface 3102 formed at one end of a root portion 3101 held by an operator who handles it.
- a body portion 3103 having an outer diameter smaller than that of the root portion 3101 is formed at the tip of the flat surface 3102, and a tapered guide surface 310D is formed at the tip of the body portion 3103.
- a thin pin 3104 is formed on the portion.
- a recess 3105 which is a positioning member for mounting the sample holder on the goniometer head 514 of the single crystal X-ray structure analysis apparatus 500, is formed on the upper surface 310A in the drawing, which is the other end surface of the root portion 3101.
- the sample holder 310 is provided with an injection needle hole 3106 and a discharge needle hole 3107 which penetrate from the root portion 3101 to the body portion 3103.
- the injection needle hole 3106 and the discharge needle hole 3107 are provided with tapered tapered portions 310B and 310C, respectively, on their end surfaces on the concave portion 3105 side.
- the tapered portions 310B and 310C serve as guide surfaces when the injection needle 306 and the discharge needle 331 are inserted.
- the whole of the sample holder 310, or the concave portion 3105 of the root portion 3101 which is a part of the sample holder 310, is formed of a magnetic material so as to be magnetically coupled to the magnetic material of the tip portion of the goniometer head 514.
- a crystal sponge 380 for occluding the sample to be analyzed is attached (adhered) to the tip portion of the pin 3104.
- the crystal sponge 380 is formed of different components depending on the type of target sample to be analyzed.
- FIG. 12 shows a perspective view of the appearance of the sample holder 310.
- An information storage unit 3108 is formed on the outer peripheral surface of the root portion 3101 for storing information (information such as the type of the crystal sponge 380, the lot number, etc.) regarding the crystal sponge 380 attached (bonded) to the tip portion of the pin 3104. ing.
- the information storage unit 3108 is formed of, for example, a barcode, a QR code (registered trademark), an IC chip, or the like.
- the information stored in the information storage unit 3108 is read by the reading unit 350 shown in FIG. 8 and stored in the control unit 340.
- the control unit 340 based on the information stored in the information storage unit 3108 read by the reading unit 350, the supply-side first actuator 302, the supply-side analysis unit 303, the supply-side second actuator 304, the temperature controller 320, the discharge.
- the first side actuator 333, the discharge side analysis unit 334, and the second discharge side actuator 335 are controlled to analyze from the injection needle 306 with respect to the crystal sponge 380 attached (adhered) to the tip portion of the pin 3104 of the sample holder 310.
- the target sample is supplied and the sample is stored in the crystal sponge 380.
- the control unit 340 includes occlusion conditions when the crystal sponge 380 occludes the sample inside the applicator 311 (including any of temperature, pressure, concentration, processing time, etc. of the sample supplied into the sample holder 310). Condition) is memorized.
- the storage condition stored in the control unit 340 can be transferred to another processing unit by opening a communication line (not shown).
- FIG. 13 is a perspective view showing the appearance of an applicator 311 for mounting the sample holder 310.
- the appearance of the applicator 311 has a rectangular parallelepiped shape.
- the applicator 311 is made of resin and is color-coded according to the type of the crystal sponge 380 attached to the tip of the pin 3104 of the sample holder 310 mounted inside. Accordingly, with the sample holder 310 attached to the applicator 311, the type of the crystal sponge 380 attached to the tip of the pin 3104 of the sample holder 310 can be determined from the color of the applicator 311.
- FIG. 14 shows an AA cross section of the applicator 311 in FIG.
- the applicator 311 has a portion 3111 into which the root portion 3101 of the sample holder 310 is inserted, a tubular portion 3112 into which the body portion 3103 of the sample holder 310 is inserted, and a tip portion 3113 into which the pin 3104 of the sample holder 310 is inserted. Are formed.
- the tip portion 3113 into which the pin 3104 is inserted has a conical shape whose diameter becomes smaller toward the front.
- an O-ring groove 3115 is formed on the inner surface 3114 where the applicator 311 contacts the flat surface 3102 of the root portion 3101 of the sample holder 310.
- the sample holder 310 is attached to the applicator 311, the injection needle 306 and the discharge needle 331 are inserted into the applicator 311, and the crystal sponge is attached to the tip portion of the pin 3104 of the sample holder 310.
- the state where 380 is attached is shown. Since the injection needle 306 supplies the sample in the vicinity of the crystal sponge 380 attached to the tip portion of the pin 3104, it is inserted inside the applicator 311 so as to be deeper than the discharge needle 331.
- the sample holder 310 is pressed against the applicator 311 by a pressing means (not shown), and the flat surface 3102 of the root portion 3101 of the sample holder 310 is formed in the inner surface 3114 of the applicator 311 in the O-ring groove.
- the O-ring 3116 attached to the 3115 is pressed to deform the O-ring 3116.
- the space between the injection needle 306 and the hole 3106 for the injection needle and the space between the discharge needle 331 and the hole 3107 for the discharge needle are sealed by unillustrated sealing means.
- control unit 340 shown in FIG. 8 controls the supply-side first actuator 302, the supply-side analysis unit 303, the supply-side second actuator 304, and the temperature controller 320 to send out from the chromatography device 200.
- the sample is supplied from the injection needle 306 to the tubular portion 3112 of the applicator 311 and the tip portion 3113 thereof.
- the control unit 340 controls the discharge-side first actuator 333, the discharge-side analysis unit 334, and the discharge-side second actuator 335 to supply the discharge needle 331 to the inside of the tubular portion 3112 of the applicator 311. Excess sample is discharged from the sample.
- the sample is occluded inside the crystal sponge 380 by holding the sample for a certain period of time in a state of being supplied to the tubular portion 3112 of the applicator 311 and the tip portion 3113 thereof.
- the control unit 340 controls the supply-side first actuator 302, the supply-side analysis unit 303, the supply-side second actuator 304, and the temperature adjuster 320, so that the tubular tip portion of the applicator 311 from the injection needle 306.
- the storage conditions for storing the sample in the crystal sponge including the temperature, pressure, concentration, and processing time of the sample supplied to the 3113 are controlled.
- the state shown in FIG. 15 is a state in which the injection needle 306 and the discharge needle 331 shown in FIG. 8 are inserted into the sample holder 310 and the applicator 311.
- the mass spectrometer 600 has been described as a configuration different from the storage device 300 for a single crystal X-ray structure analyzer, but the mass spectrometer 600 does not have the single crystal X-ray. It may be integrated with the occlusion device 300 for the line structure analysis device to be a part of the occlusion device 300 for the single crystal X-ray structure analysis device.
- FIG. 16 shows a state in which a plurality of applicators 311 each having a sample holder 310 storing a sample at its tip end are stored in a tray 400 in the storage device for a single crystal X-ray structure analyzing apparatus according to the present embodiment.
- 3 is a perspective view of a sample tray (well plate) 410.
- the sample tray 410 accommodates a plurality of applicators 311 having the sample holders 310 mounted therein, but the colors of the applicators 311 are distinguished according to the type of the crystal sponge 380 that has occluded the analysis sample.
- the type of sample occluded in the crystal sponge 380 in the various applicators 311 can be easily determined by its color.
- the sample is placed inside the extremely minute and fragile crystal sponge 380 attached to the tip portion of the pin 3104 of the sample holder 310. Can be stored more safely.
- control unit 340 controls the supply-side first actuator 302, the supply-side analysis unit 303, the supply-side second actuator 304, and the discharge-side first actuator 333, the discharge-side analysis unit 334, and the discharge-side analysis unit 334. Since the sample is stored inside the crystal sponge 380 by controlling the second side actuator 335 and the temperature controller 320, the sample to be analyzed can be stored in the crystal sponge 380 as compared with the case where the sample is stored manually. The storage conditions can be easily set.
- control unit 340 compares the data obtained by the analysis on the supply side analysis unit 303 with the data obtained by the analysis on the discharge side analysis unit 334 to obtain a crystal. It can be easily confirmed that a single crystal of the sample is formed inside the sponge 380.
- the structure in which the crystal sponge 380 is attached to the tip portion of the pin 3104 of the sample holder 310 has been described, but in the present embodiment, the sample holder 710 having the structure shown in FIG. 17 is used. The case where there is is explained.
- the configuration other than the sample holder 710 is the same as the configuration shown in FIG. 8 in the first embodiment, and the configuration of the applicator 311 is also the applicator described in the first embodiment with reference to FIGS. Since the shape is the same as that of 311, detailed description will be omitted.
- the sample holder 710 used in the present embodiment has a recess 710E formed at the tip of the tapered guide surface 710D of the body portion 7103 of the sample holder 710, as shown in the cross-sectional shape of FIG.
- a pipe 7104 is newly attached and fixed. Inside the pipe 7104, a hole 7108 that connects to the injection needle hole 7106 formed in the sample holder 710 is formed.
- a crystal sponge 780 for occluding the sample is formed (or attached) inside the hole 7108 of the pipe 7104.
- the main body of the sample holder 710 is formed of a magnetic metal, but the pipe 7104 is formed of a material that transmits X-rays such as borosilicate glass, quartz, and Kapton, and is provided at the tip of the guide surface 710D. It is inserted into the formed recess 710E and further fixed with an adhesive or the like.
- the root portion 7101 of the sample holder 710, the lower surface 7102 of the root portion 7101, and the recess 7105 inside the upper surface 710A of the root portion 7101 have the same configurations as the corresponding portions of the sample holder 310 described in the first embodiment. , Its detailed description is omitted.
- the sample holder 710 having such a configuration is attached to the applicator 311 described in Embodiment 1 with reference to FIG. 14, and the injection needle 306 is inserted into the injection needle hole 7106 to discharge the injection needle.
- the ejection needle 331 is inserted into the hole 7107.
- a taper portion 710B serving as a guide surface when the injection needle 306 is inserted is formed at the upper end of the injection needle hole 7106.
- a taper portion 710C that serves as a guide surface when the discharge needle 331 is inserted is formed.
- the diameter of the hole 7108 formed in the pipe 7104 is the same from the top to the bottom, but the diameter of the hole 7108 becomes larger toward the lower side in FIG. It may be formed in a tapered shape, or may be formed in a step shape in which the diameter is increased in the middle as compared with the upper side.
- a microscopic hole attached inside the hole 7108 for the injection needle formed through the pipe 7104 at the central portion of the sample holder 710.
- the sample can be more safely stored inside the fragile crystal sponge 780.
- the supply-side first actuator 302 the supply-side analyzing unit 303, the supply-side second actuator 304, and the discharge are discharged.
- the first side actuator 333, the discharge side analysis unit 334, the second discharge side actuator 335, and the temperature controller 320 are controlled to occlude the sample in the crystal sponge 780 which is extremely minute and fragile. Compared with the case where the sample is stored in the crystal sponge during the work, it becomes easier to set the conditions for storing the sample.
- the control unit 340 the data obtained by the analysis by the supply side analysis unit 303 and the data obtained by the discharge side analysis unit 334 are obtained. By comparing the data with the data, it can be easily confirmed that the sample was occluded inside the crystal sponge 780.
- the gas or sample solution discharged from the inside of the applicator 311 by the discharge needle 331 is sent to the mass spectrometer 600 and exhausted. Has become.
- a return route 360 for sending the sample discharged from the mass spectrometer 600 to the chromatography device 200 is provided.
- the sample returned from the mass spectrometer 600 to the chromatography device 200 through the return route 360 is again extracted with predetermined components by the chromatography device 200 and supplied to the storage device 300.
- the sample circulates from the chromatography device 200 to the mass spectrometer 600 through the storage device 300.
- the operation of the occlusion device 300 is the same as that described in the first embodiment.
- the analysis waveform data (corresponding to FIG. 10 of the first embodiment) of the component discharged from the applicator 311 detected by the discharge side analysis unit 334 is supplied.
- the waveform data detected by the side analysis unit 303 corresponding to FIG. 9 of Example 1
- the peak value of the waveform of the sample component being stored in the crystal sponge 380 among the waveform data detected by the discharge-side analysis unit 334 changes with time. Will decrease.
- the storage of the sample to be analyzed in the crystal sponge 380 is completed, the consumption of the component corresponding to the target sample is lost, so that the target sample of the waveform data detected by the discharge side analysis unit 334 is removed.
- the peak value corresponding to the component is the same as the peak value corresponding to the target sample component in the waveform data detected by the supply-side analysis unit 303.
- the waveform data at the position corresponding to the single crystal component detected by the supply side analysis unit 303 and the discharge side analysis unit 334 are detected by the configuration as shown in FIG.
- the waveform data at the position corresponding to the single crystal component is compared, and the time point when the peak levels become the same is detected as the end point.
- the sample can be used by circulating it from the chromatography device 200 through the storage device 300 to the mass spectrometer 600, so that even when the amount of the sample is very small Therefore, it is possible to reliably detect that the sample to be analyzed is occluded in the fragile crystal sponge.
- the present invention is not limited to the above-described embodiments and includes various modifications.
- the above-described embodiment is a detailed description of the entire system in order to explain the present invention in an easy-to-understand manner, and is not necessarily limited to one having all the configurations described.
- part of the configuration of one embodiment can be replaced with the configuration of another embodiment, and the configuration of another embodiment can be added to the configuration of one embodiment. It would be possible to add, delete, or replace some of the example configurations with other configurations.
- the present invention can be widely used in a method for searching a material structure, an X-ray structure analysis apparatus used for the method, and the like.
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Abstract
細孔性錯体結晶に試料を供給して確実に吸蔵させることを可能にする単結晶X線構造解析試料の吸蔵装置及び吸蔵方法を提供する。試料を吸蔵させる吸蔵装置300であって、前記試料を、細孔性錯体結晶を保持した試料ホルダ310が挿入されたアプリケータ311の内部に供給する供給部と、前記アプリケータ311の温度を制御する温度調整部320と、前記試料ホルダ310が挿入された前記アプリケータ311の内部から前記試料を搬出する排出部と、前記供給部と前記温度調整部320と前記排出部とを制御する制御部340と、を備える。
Description
本発明は、単結晶X線構造解析で使用する解析試料を準備するための装置及び方法に係り、特に、試料を結晶スポンジに吸蔵させるのに適した単結晶X線構造解析試料の吸蔵装置及び吸蔵方法に関する。
新たなデバイスや材料の研究開発では、日常的に材料の合成、材料の評価、それに基づいた次の研究方針の決定が行なわれている。短期間に材料開発を行うためのX線回折を用いた物質の構造解析では、目的の材料の機能・物性を実現する物質構造を効率良く探索するために、構造解析を効率的に行うことを可能とする物質の構造解析を中心とした物質構造の探索方法とそれに用いるX線構造解析は必要不可欠である。
しかし、当該手法で得られた結果に基づいて構造解析を行うことは、X線の専門家でなければ難しかった。そのため、X線の専門家でなくても構造解析を行うことができるX線構造解析システムが求められていた。その中でも、特に、以下の特許文献1にも知られるように、単結晶X線構造解析は、正確で精度の高い分子の立体構造を得ることができる手法として注目されている。
他方、この単結晶X線構造解析には、試料を結晶化して単結晶を用意しなければならないという大きな制約があった。しかしながら、以下の非特許文献1や2、更には、特許文献2にも知られるように、「結晶スポンジ」と呼ばれる材料(例えば、直径0.5nmから1nmの細孔が無数に開いた細孔性錯体結晶)の開発によって、結晶化しない液体状化合物や結晶化を行うに足る量を確保できない試料なども含め、単結晶X線構造解析を広く適用することが可能となっている。
単結晶X線構造解析の分野において、単結晶サンプルを単結晶X線構造解析装置で解析して単結晶の結晶構造を求める場合、分析対象の単結晶サンプルを作成することが難しく、さらに、この分析対象の単結晶サンプルを単結晶X線構造解析装置で解析して得られたデータから単結晶の結晶構造を求めるには経験と勘などの熟練度が必要になり、ごく限られた人しか操作することができなかった。
一方、近年、単結晶X線構造解析装置の技術開発が進み、単結晶サンプルさえ手に入れられれば、結晶構造解析技術に熟練していない人でも単結晶サンプルを単結晶X線構造解析装置で解析できて、単結晶サンプルの結晶構造を比較的容易に求めることができるようになってきた。
Makoto Fujita; X-ray analysis on the nanogram to microgram scale using porous complexes; Nature 495, 461-466; 28 March 2013
Hoshino et al. (2016), The updated crystalline sponge method IUCrJ, 3, 139-151
従来技術では、非特許文献1に記載されているように、微細な孔が多数形成されている極微小で脆弱(fragile)な結晶スポンジを形成して、この結晶スポンジの微細な孔の内部に試料を吸蔵し、これを単結晶X線構造解析装置で解析することにより、単結晶の結晶構造を比較的容易に求めることができる。
この結晶スポンジを用いて単結晶X線構造解析装置で解析するには、結晶スポンジの微細な孔の内部に吸蔵させて形成した単結晶化した試料を、単結晶X線構造解析装置で分析するために使用される試料用ホルダの一部(ゴニオヘッドピンの先端)に確実に装着させることが必要になる。しかしながら、上述した従来技術には、極微小で脆弱(fragile)な結晶スポンジに吸蔵して形成した試料を確実に試料ホルダに搭載する方法については開示されていない。
本発明は、上記した従来技術の課題を解決して、単結晶X線構造解析装置の試料ホルダに解析試料を単結晶化するための極微小で脆弱(fragile)な結晶スポンジを保持した状態で、この結晶スポンジに解析試料を供給して確実に吸蔵させることを可能にする単結晶X線構造解析試料の吸蔵装置及び吸蔵方法を提供するものである。
(1)上記の目的を達成するため、本発明の吸蔵装置は、試料を吸蔵させる吸蔵装置であって、前記試料を、細孔性錯体結晶を保持した試料ホルダが挿入されたアプリケータの内部に供給する供給部と、前記アプリケータの温度を制御する温度調整部と、前記試料ホルダが挿入された前記アプリケータの内部から前記試料を搬出する排出部と、前記供給部と前記温度調整部と前記排出部とを制御する制御部と、を備えることを特徴としている。
(2)また、本発明の吸蔵装置において、前記供給部は、注入パイプを備え、前記供給部は、前記試料ホルダに形成された第1の貫通穴を通して前記アプリケータに挿入された前記注入パイプを介して、前記アプリケータの内部に前記試料を供給することを特徴としている。
(3)また、本発明の吸蔵装置において、前記排出部は、排出パイプを備え、前記排出部は、前記試料ホルダに形成された第2の貫通穴を通して前記アプリケータに挿入された前記排出パイプを介して、前記アプリケータの内部から前記試料を搬出することを特徴としている。
(4)また、本発明の吸蔵装置において、前記供給部は、外部から供給された前記試料の圧力または流量を調整する供給側第1アクチュエータと、前記供給側第1アクチュエータで調整された前記試料を分析する供給側分析部と、前記供給側分析部で分析された前記試料の圧力または流量を調整する供給側第2アクチュエータと、前記試料ホルダに形成された第1の貫通穴を通して前記アプリケータに挿入され、前記供給側第2アクチュエータで調整された前記試料を前記アプリケータの内部に供給する注入パイプと、を備えることを特徴としている。
(5)また、本発明の吸蔵装置において、前記排出部は、前記試料ホルダに形成された第2の貫通穴を通して前記アプリケータに挿入される排出パイプと、前記排出パイプを介して前記アプリケータの内部から前記試料を排出する排出側第1アクチュエータと、前記排出側第1アクチュエータに排出された前記試料の成分を分析する排出側分析部と、前記排出側分析部で成分が分析された前記試料の圧力又は流量又は濃度を調整して排出する排出側第2アクチュエータと、を備えることを特徴としている。
(6)また、本発明の吸蔵装置において、前記供給部は、外部から供給された前記試料の圧力または流量を調整する供給側第1アクチュエータと、前記供給側第1アクチュエータで調整された前記試料を分析する供給側分析部と、前記供給側分析部で分析された前記試料の圧力または流量を調整する供給側第2アクチュエータと、前記試料ホルダに形成された第1の貫通穴を通して前記アプリケータに挿入され、前記供給側第2アクチュエータで調整された前記試料を前記アプリケータの内部に供給する注入パイプと、前記試料ホルダに形成された第2の貫通穴を通して前記アプリケータに挿入される排出パイプと、前記排出パイプを介して前記アプリケータの内部から前記試料を排出する排出側第1アクチュエータと、前記排出側第1アクチュエータに排出された前記試料の成分を分析する排出側分析部と、前記排出側分析部で成分が分析された前記試料の圧力又は流量又は濃度を調整して排出する排出側第2アクチュエータと、を備え、前記排出側第2アクチュエータに排出された前記試料は、前記供給側第1アクチュエータに戻されることを特徴としている。
(7)また、本発明の吸蔵装置において、前記制御部は、前記供給部と前記温度調整部と前記排出部とを制御して、前記試料ホルダに保持させた前記細孔性錯体結晶に前記試料を吸蔵させるための吸蔵条件を制御することを特徴としている。
(8)また、本発明の吸蔵装置において、前記試料ホルダまたは前記アプリケータに備えられた情報保持部に保持された情報を読み取る読取部を備え、前記制御部は、前記読取部が読み取った情報を記憶することを特徴としている。
(9)また、本発明の吸蔵装置において、前記制御部は、前記読取部が読み取った情報に基づいて、前記供給部から前記アプリケータに供給される前記試料の種類に応じて前記供給部と前記温度調整部と前記排出部とを制御することを特徴としている。
(10)また、本発明の吸蔵方法は、試料を吸蔵させる吸蔵方法であって、前記試料を、細孔性錯体結晶を保持した試料ホルダが挿入されたアプリケータに吸蔵装置から、供給する工程と、前記吸蔵装置により前記アプリケータの内部から前記アプリケータに供給された前記試料を排出する工程と、を含み、前記供給する工程または前記排出する工程の少なくとも一方は、前記試料の濃度、圧力、温度又は時間の何れかを含む吸蔵条件を制御した状態で行なわれることを特徴としている。
(11)また、本発明の吸蔵方法において、前記試料を供給する工程は、前記試料ホルダに形成された第1の貫通穴を通して前記アプリケータに挿入された注入パイプを介して供給することを特徴としている。
(12)また、本発明の吸蔵方法において、前記試料を排出する工程は、前記試料ホルダに形成された第2の貫通穴を通して前記アプリケータに挿入された排出パイプを介して前記試料を搬出することにより行うことを特徴としている。
本発明の吸蔵装置によれば、単結晶X線構造解析装置の試料ホルダに解析試料を単結晶化するための極微小で脆弱(fragile)な細孔性錯体結晶である結晶スポンジを保持した状態で、この細孔性錯体結晶に解析試料を供給して確実に吸蔵させることを可能にした。
以下に、本発明による、解析試料をスポンジ状の材料(結晶スポンジ、又は、細孔性錯体結晶)内に吸蔵させ、単結晶X線構造解析装置の試料ホルダとして確実に供給することを可能にする単結晶X線構造解析装置用の単結晶構造解析試料の吸蔵装置及び吸蔵方法について、図面を用いて説明する。なお、本出願において「AまたはB」の表現は、「AおよびBの少なくとも一方」を意味し、AおよびBがありえないという特段の事情がない限り「AおよびB」を含む。
図1に、本実施例に係る単結晶X線構造解析装置を備えた単結晶X線構造解析システム100全体の概略構成を示す。本実施例に係る単結晶X線構造解析システム100は、気体や液体などの試料の中から分析対象の試料を抽出するクロマトグラフィ装置200、クロマトグラフィ装置200で抽出した試料から単結晶X線構造解析用の試料を作成する単結晶X線構造解析装置用吸蔵装置300(以下、単に吸蔵装置300とも記す)、吸蔵装置300で作成した単結晶X線構造解析用の試料を収納するサンプルトレイ410、サンプルトレイ410に収納された試料をX線を用いて分析する単結晶X線構造解析装置500を備えて構成されている。なお、サンプルトレイ410を用いずに、試料を単品で吸蔵装置300から単結晶X線構造解析装置500へ移動させるようにしてもよい。
添付の図2には、本発明の一実施の形態になる、単結晶X線回折装置を含む単結晶X線構造解析装置の全体外観構成が示されており、図からも明らかなように、単結晶X線構造解析装置500は、冷却装置やX線発生電源部を格納した基台504と、その基台504の上に載置された防X線カバー506とを有する。
防X線カバー506は、単結晶X線回折装置509を包囲するケーシング507及びそのケーシング507の前面に設けられた扉等を有する。ケーシング507の前面に設けられた扉は開くことができ、この開いた状態で内部の単結晶X線回折装置509に対して種々の操作を行うことができる。なお、図に示す本実施形態は、後にも述べる結晶スポンジを利用して物質の構造解析を行う単結晶X線回折装置509を含んだ単結晶X線構造解析装置500である。
単結晶X線回折装置509は、図3にも示すように、X線管511及びゴニオメータ512を有する。X線管511は、ここでは図示しないが、フィラメントと、フィラメントに対向して配置されたターゲット(「対陰極」とも言う)と、それらを気密に格納するケーシングとを有し、このフィラメントは、図2の基台504に格納されたX線発生電源部によって通電されて発熱して熱電子を放出する。
また、フィラメントとターゲットとの間にはX線発生電源部によって高電圧が印加され、フィラメントから放出された熱電子が高電圧によって加速されてターゲットに衝突する。この衝突領域がX線焦点を形成し、このX線焦点からX線が発生して発散する。より詳細には、このX線管511は、ここでは図示しないが、マイクロフォーカス管と多層膜集光ミラー等の光学素子を含んで構成されており、より高い輝度のビームを照射することが可能であり、また、Cu、MoやAgなどの線源から選択可能となっている。上記に例示するように、フィラメントと、フィラメントに対向して配置されたターゲットと、それらを気密に格納するケーシングが、X線源として機能し、マイクロフォーカス管と多層膜集光ミラー等の光学素子を含むX線照射のための構成がX線照射部として機能する。
また、ゴニオメータ512は、解析すべき試料Sを支持すると共に、試料SのX線入射点を通る試料軸線ωを中心として回転可能とするθ回転台516と、θ回転台のまわりに配置されて試料軸線ωを中心として回転可能な2θ回転台517とを有する。ゴニオメータ512には、試料Sを搭載するゴニオメータヘッド514を備えている。なお、試料Sは、本実施形態の場合、後にも詳述する試料ホルダ513の一部に予め取り付けられた結晶スポンジの内部に吸蔵されている。
ゴニオメータ512の基台518の内部には、上述したθ回転台516及び2θ回転台517を駆動するための駆動装置(図示せず)が格納されており、これらの駆動装置によって駆動されて、θ回転台516は所定の角速度で間欠的又は連続的に回転し、いわゆるθ回転する。また、これらの駆動装置によって駆動されて2θ回転台517は間欠的又は連続的に回転し、いわゆる2θ回転する。上記の駆動装置は任意の構造によって構成できるが、例えば、ウォームとウォームホイールとを含んで構成される動力伝達構造によって構成できる。
ゴニオメータ512の外周の一部にはX線検出器522が載置されており、このX線検出器522は、例えば、CCD型やCMOS型の2次元ピクセル検出器、ハイブリッド型ピクセル検出器などによって構成される。なお、X線検出測定部は、試料により回折又は散乱されたX線を検出して測定する構成を指し、X線検出器22およびこれを制御する制御部を含む。
単結晶X線回折装置509は、以上のように構成されているので、試料Sは、ゴニオメータ512のθ回転台516のθ回転によって試料軸線ωを中心としてθ回転する。この試料Sがθ回転する間、X線管511内のX線焦点から発生して試料Sへ向けられるX線は所定の角度で試料Sに入射して回折・発散する。即ち、試料Sへ入射するX線の入射角度は試料Sのθ回転に応じて変化する。
試料Sに入射するX線の入射角度と結晶格子面との間でブラッグの回折条件が満足されると、その試料Sから回折X線が発生する。この回折X線はX線検出器522に受光されてそのX線強度が測定される。以上により、入射X線に対するX線検出器522の角度、すなわち回折角度に対応する回折X線の強度が測定され、この測定結果から試料Sに関する結晶構造等が解析される。
続いて、図4(a)は、上記単結晶X線構造解析装置500における制御部550を構成する電気的な内部構成の詳細の一例を示す。なお、本発明が以下に述べる実施形態に限定されるものでないことは、もちろんである。
この単結晶X線構造解析装置500は、上述した内部構成を含んでおり、更に、適宜の物質を試料として測定を行う測定装置562と、キーボード、マウス等によって構成される入力装置563と、表示手段としての画像表示装置564と、解析結果を印刷して出力するための手段としてのプリンタ566と、CPU(Central Processing Unit)557と、RAM(Random Access Memory)558と、ROM(Read Only Memory)559と、外部記憶媒体としてのハードディスクなどを有する。これらの要素はバス552によって相互につながれている。
画像表示装置564は、CRTディスプレイ、液晶ディスプレイ等といった画像表示機器によって構成されており、画像制御回路553によって生成される画像信号に従って画面上に画像を表示する。画像制御回路553はこれに入力される画像データに基づいて画像信号を生成する。画像制御回路553に入力される画像データは、CPU557、RAM558、ROM559及びハードディスクを備えた解析部551を含んで構成されるコンピュータによって実現される各種の演算手段の働きによって形成される。
プリンタ566は、インクプロッタ、ドットプリンタ、インクジェットプリンタ、静電転写プリンタ、その他任意の構造の印刷用機器を用いることができる。なお、解析部551は、ハードディスクのほかに、光磁気ディスク、半導体メモリ、その他、任意の構造の記憶媒体によって構成することもできる。
ハードディスクを備えて単結晶の構造解析処理を行う解析部551の内部には、単結晶X線構造解析装置500の全般的な動作を司る分析用アプリケーションソフト5511と、測定装置562を用いた測定処理の動作を司る測定用アプリケーションソフト5512と、画像表示装置564を用いた表示処理の動作を司る表示用アプリケーションソフト5513とが格納されている。これらのアプリケーションソフトは、必要に応じて解析部551のハードディスクから読み出されてRAM558へ転送された後に所定の機能を実現する。
この単結晶X線構造解析装置500は、更に、上記測定装置562によって得られた測定データを含めた各種の測定結果を記憶するための、例えば、クラウド領域に置かれたデータベースも含んでいる。図の例では、後にも説明するが、上記の測定装置562によって得られたXRDSイメージデータを格納するXRDS情報データベース571、顕微鏡により得られた実測イメージを格納する顕微鏡イメージデータベース572、更には、例えば、XRFやラマン光線等、X線以外の分析により得られた測定結果や、物性情報を格納するその他分析データベース573が示されている。なお、これらのデータベースは、必ずしも、単結晶X線構造解析装置500の内部に搭載される必要はなく、例えば、外部に設けられてネットワーク580等を介して相互に通信可能に接続されてもよい。
データファイル内に複数の測定データを記憶するためのファイル管理方法としては、個々の測定データを個別のファイル内に格納する方法も考えられるが、本実施形態では、図4(b)に示すように、複数の測定データを1つのデータファイル内に連続して格納することとしている。なお、図4(b)において「条件」と記載された記憶領域は、測定データが得られたときの装置情報および測定条件を含む各種の情報を記憶するための領域である。
このような測定条件としては、(1)測定対象物質名、(2)測定装置の種類、(3)測定温度範囲、(4)測定開始時刻、(5)測定終了時刻、(6)測定角度範囲、(7)走査移動系の移動速度、(8)走査条件、(9)試料に入射するX線の種類、(10)試料高温装置等といったアタッチメントを使ったか否か、その他、各種の条件が考えられる。
なお、クラウド経由で吸蔵に必要な情報を取得してもよいし、吸蔵装置の制御部内の記憶から吸蔵に必要な情報を取得してもよい。例えば、試料ホルダ、又は、アプリケータの固有情報を基にしてクラウド構造を介して提供される吸蔵のための条件等を検索すれば、必要な吸蔵条件を容易に入手し、その入力/設定を自動的に実行することもできる。
このことから、その後の構造解析処理により得られるデータを一元的に管理することが可能となる。更には、測定/解析後における試料の保管や検証や管理も、より容易に行うことができる。
上記の例ではクラウドに情報を保持するが、必ずしもこれに限定されず単結晶X線構造解析装置の装置内または装置外のメモリ(HDD)に保持してもよい。また、測定する試料の順番が予め決まっている場合は、試料ホルダやアプリケータから固有情報を取得する構成とせず、予め固有情報をメモリ内に保存しておき、それを順次読み出して、対応する情報を取得しても良い。
XRDS(X-ray Diffraction and Scattering)パターン又はイメージ(図5を参照)は、上記測定装置562を構成するX線検出器522の2次元空間である平面上で受け取られたX線を、当該検出器を構成する平面状に配列された画素毎(例えば、CCD等)に受光/蓄積して、その強度を測定することにより得られるものである。例えば、X線検出器522の各画素毎に、積分によって受光したX線の強度を検出することによれば、rとθの2次元空間上のパターン又はイメージが得られる。
<測定用アプリケーションソフト>
照射されるX線に対する対象材料によるX線の回折や散乱によって得られる観測空間上のXRDSパターン又はイメージは、対象材料の実空間における電子密度分布の情報を反映している。しかしながら、XRDSパターンは、rとθの2次元空間であり、3次元空間である対象材料の実空間における対称性を直接的に表現するものではない。そのため、一般的に、現存のXRDSイメージだけでは、材料を構成する原子や分子の(空間)配列を特定することは困難であり、X線構造解析の専門知識を必要とする。そのため、本実施例では、上述した測定用アプリケーションソフトを採用して自動化を図っている。
照射されるX線に対する対象材料によるX線の回折や散乱によって得られる観測空間上のXRDSパターン又はイメージは、対象材料の実空間における電子密度分布の情報を反映している。しかしながら、XRDSパターンは、rとθの2次元空間であり、3次元空間である対象材料の実空間における対称性を直接的に表現するものではない。そのため、一般的に、現存のXRDSイメージだけでは、材料を構成する原子や分子の(空間)配列を特定することは困難であり、X線構造解析の専門知識を必要とする。そのため、本実施例では、上述した測定用アプリケーションソフトを採用して自動化を図っている。
その一例として、図6(a)及び(b)にその実行画面を示すように、単結晶構造解析のためのプラットフォームである「CrysAlisPro」と呼ばれるX線回折データ測定・処理ソフトウェアを搭載し、予備測定、測定条件の設定、本測定、データ処理などを実行する。更には、「AutoChem」と呼ばれる自動構造解析プラグインを搭載することにより、X線回折データ収集と並行して、構造解析および構造の精密化を実行する。そして、図7にも示す「Olex2」と呼ばれる構造解析プログラムにより、空間群決定から位相決定、分子モデルの構築と修正、構造の精密化、最終レポート、CIFファイルの作成を行う。
以上、単結晶X線構造解析装置500の全体構造やその機能について述べたが、以下には、特に、本発明に係る結晶スポンジと、それに関連する装置や器具について、添付の図面を参照しながら詳細に述べる。
<結晶スポンジ>
上述したように、内部に直径0.5nmから1nmの細孔が無数に開いた、寸法が数10μm~数100μm程度の極微小で脆弱(fragile)な細孔性錯体結晶である「結晶スポンジ」と呼ばれる材料の開発によって、単結晶X線構造解析は、結晶化しない液体状化合物や、或いは、結晶化を行うに足る量が確保できない数ng~数μgの極微量の試料なども含め、広く適用することが可能となっている。
上述したように、内部に直径0.5nmから1nmの細孔が無数に開いた、寸法が数10μm~数100μm程度の極微小で脆弱(fragile)な細孔性錯体結晶である「結晶スポンジ」と呼ばれる材料の開発によって、単結晶X線構造解析は、結晶化しない液体状化合物や、或いは、結晶化を行うに足る量が確保できない数ng~数μgの極微量の試料なども含め、広く適用することが可能となっている。
しかしながら、現状においては、上述した結晶スポンジの骨格内への試料の結晶化である吸蔵(post-crystallization)を行うためには、各種の前処理(分離)装置によって分離された数ng~数μg程度の極微量の試料を、既に述べたように、容器内において、シクロヘキサン等の保存溶媒(キャリア)に含浸して提供される外径100μm程度の極微小で脆弱(fragile)な結晶スポンジの骨格内に吸蔵させる工程が必要となる。保存溶媒(キャリア)には、液体と、気体(ガス)と、その中間にあたる超臨界流体が含まれる。更には、その後、この試料を吸蔵した極微小で脆弱(fragile)な取り扱い難い結晶スポンジを、迅速に(結晶スポンジが乾燥により破壊されない程度の短い時間で)、容器から取り出し、回折装置内のX線照射位置に、より具体的には、ゴニオメータ512の試料軸(所謂、ゴニオヘッドピン)の先端部に、センタリングを行いながら正確に搭載する工程を必要とする。
これらの工程は、X線構造解析の専門知識の有無に関わらず、作業者に非常に緻密な作業を要求する繊細で、かつ、迅速性をも要求される作業であり、結晶スポンジに吸蔵した後の試料の測定結果に多大な影響を及ぼすこととなる。即ち、これらの作業が極微小な結晶スポンジを利用した単結晶X線構造解析を歩留まりの悪いものとしており、このことが、結晶スポンジを利用した単結晶X線構造解析が広く利用されることから阻害されることの一因ともなっている。
本発明は、上述したような発明者の知見に基づいて達成されたものであり、極微小で脆弱(fragile)な結晶スポンジによる単結晶X線構造解析を、以下に述べる試料ホルダ(単に、試料ホルダともいう)を用いることにより、確実にかつ容易に行うことを可能とするものであり、換言すれば、歩留まり良くかつ効率的で、汎用性に優れ、かつ、ユーザーフレンドリな単結晶X線構造解析装置を実現するものである。
即ち、本発明に係る次世代の単結晶X線構造解析装置では、極微量な試料Sを吸蔵した極微小で脆弱(fragile)な結晶スポンジを用意すると共に、更には、当該試料S(結晶スポンジ)を吸蔵容器から取り出して、ゴニオータの先端部の所定位置に、正確かつ迅速に取り付けなければならないという、大きな制約があるが、特に、汎用性に優れたユーザーフレンドリな装置を実現するためには、かかる作業を、高度な専門知識や作業の精密(緻密)性を必要とせずに、迅速かつ容易に実行可能なものとする必要がある。
本発明は、かかる課題を解消し、即ち、極微小で脆弱(fragile)な取り扱い難い結晶スポンジを使用しながらも、誰でも、迅速かつ確実かつ容易に、歩留まり良く効率的で、ユーザーフレンドリに行うことが可能で、かつ、汎用性にも優れた単結晶X線構造解析を行うための装置や方法、更には、そのための器具である試料ホルダを提供するものであり、以下に詳述する。
図1に示した本発明の第一の実施例に係る単結晶X線構造解析装置500を備えた単結晶X線構造解析システム100の構成における、結晶スポンジに分析対象試料を吸蔵させる吸蔵装置300の構成を、図8乃至図14を用いて説明する。
図8は、本発明の第1の実施例に係る単結晶X線構造解析装置500用の吸蔵装置300の構成を示すブロック図である。本実施例に係る吸蔵装置300は、供給側配管301、供給側第1アクチュエータ302、供給側分析部303、供給側第2アクチュエータ304、供給側配管305、注入針(注入パイプ)306、試料ホルダ310(図3の試料ホルダ513に相当)を装着したアプリケータ311、温度調節器(調温器)320、排出針(排出パイプ)331、排出管332、排出側第1アクチュエータ333、排出側分析部334、排出側第2アクチュエータ335、排出側配管336、制御部340および読取部350を備えている。
吸蔵装置300は、分離装置(例えばガスクロマトグラフィ又は液体クロマトグラフィなど)200から供給された分析対象の試料(気体、液体または超臨界流体など)を含む担体又は溶媒(以下、これらを含めて試料と記す)が供給側配管301を通して供給され、供給側第1アクチュエータ302で試料の流量や圧力などが調整される。
次に、分析対象試料は、供給側分析部303に送られ、そこで、圧力、濃度、温度が調整された試料の成分が分析される。図9にその分析した結果の一例を示す。図9のグラフでは、分離装置200から送られてきた試料が、ある特定の成分での信号強度にピーク901を持っていることを示している。
供給側分析部303で分析された試料は、供給側配管305から、先端部分がアプリケータ311に装着された試料ホルダ310の内部に差し込まれている注入針306に送られ、注入針306の先端部分からアプリケータ311の内部の試料ホルダ310に供給される。このとき、試料のみ、または試料と保存溶媒(キャリア)とが混合された溶液が、供給側の試料導入管254内を流れ供給される。注入針306は、図示していない駆動手段で駆動されて、アプリケータ311の内部に装着された試料ホルダ310の内部へ差し込まれる。
この状態で、温度調節器320は、制御部340で制御されて、試料ホルダ310を含むアプリケータ311が所望の温度になるように、アプリケータ311を加熱または冷却する。
吸蔵装置300を用いる場合、温度調節器320により温度がコントロールされたアプリケータ311内に装着された試料ホルダ310の内部に注入針306から試料が注入された状態で所定の時間が経過した後、排出側第1アクチュエータ333が作動して、先端部分がアプリケータ311に装着された試料ホルダ310の内部に差し込まれた排出針331から、排出管332を介して過剰な試料、または試料と保存溶媒(キャリア)とが混合された溶液が排出される。すなわち、過剰な試料とは、排出針331の長さに応じて排出される試料を指す。排出針331は、図示していない駆動手段で駆動されて試料ホルダ310の内部へ差し込まれる。吸蔵装置300を用いない場合、不要な保存溶媒(キャリア)または溶液が排出側の試料導入管254内を流れ排出される。したがって、排出側の試料導入管254には、試料が流れない場合がありうる。なお、気体や超臨界流体をキャリアとした場合には、試料を含んだキャリアが排出される。
排出側第1アクチュエータ333によりアプリケータ311の内部から排出された試料は、排出側分析部334で成分が分析される。図10に、その分析した結果の一例を示す。排出側分析部334で成分が分析されたアプリケータ311の内部から排出された試料は、排出側第2アクチュエータ335で圧力、流量、又は濃度が調整されて、排出側配管336から質量分析装置600へ送られて、その質量成分が分析される。
ここで、排出側分析部334で分析して得られた図10のグラフを、供給側分析部303で分析して得られた図9のグラフと比較すると、図9で強度のピーク901を示していた成分の信号に対応する図10のグラフにおける成分のピーク1001のレベルが低下していることがわかる。これは、図9でピークを示した成分の一部が、アプリケータ311の内部で消費されたことを示している。
この図9に示したようなデータと図10に示したようなデータとを制御部340で比較して、両者のピーク値の差又は比率が予め設定した値になった時点で、アプリケータ311の内部に装着された試料ホルダ310の先端部分に取り付けた結晶スポンジに、分析対象の試料が吸蔵されたと判定し、一連の操作を終了する。
図11には、試料ホルダ310を正面から見た断面図を示す。試料ホルダ310は、取り扱う作業者が把持する根元部分3101の一方の端部に平坦な面3102が形成されている。この平坦な面3102の先端には、外径が根元部分3101よりも細い胴体部3103が形成されており、胴体部3103の先端にはテーパ状に加工された案内面310Dが形成され、その先端部に細いピン3104が形成されている。
根元部分3101の他方の端面である図の上面310Aには、当該試料ホルダを単結晶X線構造解析装置500のゴニオメータヘッド514に装着するための位置決め部材である凹部3105が形成されている。また、試料ホルダ310には、根元部分3101から胴体部3103にかけて貫通する注入針用孔3106と排出針用孔3107が形成されている。注入針用孔3106と排出針用孔3107には、それぞれその凹部3105側の端面に、テーパ状に加工されたテーパ部310Bと310Cが形成されている。テーパ部310Bと310Cとは、注入針306および排出針331を挿入するときのガイド面となる。
試料ホルダ310の全体、または、その一部である根元部分3101の凹部3105は、ゴニオメータヘッド514の先端部分の磁性体と磁気的に結合させるため、磁性体で形成されている。
ピン3104の先端部分には、分析する試料を吸蔵するための結晶スポンジ380が付着(接着)されている。この結晶スポンジ380は、分析する対象試料の種類に応じて異なる成分で形成される。
図12に、試料ホルダ310の外観を斜視図で示す。根元部分3101の外周面には、ピン3104の先端部分に付着(接着)させた結晶スポンジ380に関する情報(結晶スポンジ380の種類、ロット番号などの情報)を記憶する、情報記憶部3108が形成されている。情報記憶部3108は、例えば、バーコード、QRコード(登録商標)、ICチップなどで形成される。
この情報記憶部3108に記憶された情報は、図8に示した読取部350で読み取られ、制御部340内に記憶される。制御部340は、読取部350で読み取った情報記憶部3108に記憶された情報に基づいて、供給側第1アクチュエータ302、供給側分析部303、供給側第2アクチュエータ304、温度調節器320、排出側第1アクチュエータ333、排出側分析部334、排出側第2アクチュエータ335を制御して、試料ホルダ310のピン3104の先端部分に付着(接着)させた結晶スポンジ380に対して注入針306から分析対象の試料を供給し、結晶スポンジ380に試料を収蔵させる。
制御部340は、アプリケータ311の内部でこの結晶スポンジ380に試料を吸蔵させたときの吸蔵条件(試料ホルダ310の内部に供給した試料の温度、圧力、濃度、処理時間などのいずれかを含む条件)を記憶する。この制御部340に記憶された吸蔵条件は、図示していない通信回線を解して、他の処理手段へ転送することができる。
図13には、試料ホルダ310を装着するためのアプリケータ311の外観を斜視図で示す。アプリケータ311の外観は直方体の形状をしている。また、アプリケータ311は樹脂で形成され、内部に装着する試料ホルダ310のピン3104の先端部分に付着させる結晶スポンジ380の種類に応じて、色分けされている。これにより、アプリケータ311に試料ホルダ310を装着した状態で、試料ホルダ310のピン3104の先端に付着させた結晶スポンジ380の種類を、アプリケータ311の色から判断することができる。
図13におけるアプリケータ311の、A-A断面を図14に示す。アプリケータ311には、試料ホルダ310の根元部分3101が挿入される部分3111、試料ホルダ310の胴体部3103が挿入される筒状の部分3112、試料ホルダ310のピン3104が挿入される先端部分3113が形成されている。ピン3104が挿入される先端部分3113は、先に行くほど径が小さくなる、円錐状の形状をしている。また、アプリケータ311が試料ホルダ310の根元部分3101の平坦な面3102と当接する内面3114には、Oリング溝3115が形成されている。
図15には、試料ホルダ310をアプリケータ311に装着し、さらに、注入針306と排出針331とがアプリケータ311の内部に挿入され、かつ、試料ホルダ310のピン3104の先端部分に結晶スポンジ380が付着されている状態を示す。注入針306は、ピン3104の先端部分に取り付けた結晶スポンジ380の近傍に試料を供給するので、排出針331よりも深くなるようにアプリケータ311の内部に挿入されている。
この状態において、試料ホルダ310は、図示していない押圧手段によりアプリケータ311に押し付けられて、試料ホルダ310の根元部分3101の平坦な面3102がアプリケータ311の内面3114に形成されたOリング溝3115に装着されたOリング3116を押圧してOリング3116を変形させる。また、注入針306と注入針用孔3106との間、及び排出針331と排出針用孔3107との間は、それぞれ図示していないシール手段によりシールされている。このような構成とすることにより、試料ホルダ310が装着されたアプリケータ311の筒状の部分3112とその先端の円錐状の先端部分3113とは、外部に対して気密な状態を保つことができる。
この状態で、図8に示した制御部340は、供給側第1アクチュエータ302、供給側分析部303、供給側第2アクチュエータ304および温度調節器320を制御して、クロマトグラフィ装置200から送り出された試料を注入針306からアプリケータ311の筒状の部分3112とその先端部分3113に供給する。
また、制御部340は、排出側第1アクチュエータ333、排出側分析部334、排出側第2アクチュエータ335を制御して、排出針331からアプリケータ311の筒状の部分3112の内部に供給された試料のうち過剰な試料を排出する。
試料を、アプリケータ311の筒状の部分3112とその先端部分3113に供給した状態で、ある時間保持することにより、結晶スポンジ380の内部に試料が吸蔵される。この時、制御部340では、供給側第1アクチュエータ302、供給側分析部303、供給側第2アクチュエータ304および温度調節器320を制御して、注入針306からアプリケータ311の筒状の先端部分3113に供給される試料の温度、圧力、濃度、及び処理の時間などを含む、試料を結晶スポンジに吸蔵させるための吸蔵条件を制御する。
なお、この図15に示した状態は、上記の図8に示した注入針306及び排出針331が試料ホルダ310及びアプリケータ311に差し込まれて状態を示している。
なお、上記で説明した図8に示した構成においては、質量分析装置600を、単結晶X線構造解析装置用吸蔵装置300とは別の構成として説明したが、質量分析装置600を単結晶X線構造解析装置用吸蔵装置300と一体化して、単結晶X線構造解析装置用吸蔵装置300の一部としてもよい。
図16は、本実施例に係る単結晶X線構造解析装置用吸蔵装置で先端部分に試料を吸蔵した試料ホルダ310を装着したアプリケータ311を、複数個、トレイ400内に収納した状態を示す、サンプルトレイ(ウェルプレート)410の斜視図である。サンプルトレイ410には試料ホルダ310を内部に装着したアプリケータ311が複数個収納されているが、解析試料を吸蔵した結晶スポンジ380の種類に応じてアプリケータ311の色が区別されているので、色々のアプリケータ311内の結晶スポンジ380に吸蔵された試料の種類は、その色によって容易に判断することができる。
本実施例によれば、試料ホルダ310をアプリケータ311内に装着した状態で、試料ホルダ310のピン3104の先端部分に付着させた極微小で脆弱(fragile)な結晶スポンジ380の内部に、試料をより安全に吸蔵させることができる。
また、本実施例によれば、制御部340により、供給側第1アクチュエータ302、供給側分析部303、供給側第2アクチュエータ304、および、排出側第1アクチュエータ333、排出側分析部334、排出側第2アクチュエータ335、更に温度調節器320を制御して、結晶スポンジ380の内部に試料を吸蔵させるので、従来の手作業で試料の吸蔵を行っていた場合と比べて、分析対象の試料の吸蔵条件の設定が容易になる。
更に、本実施例によれば、制御部340で、供給側分析部303で分析して得られたデータと、排出側分析部334で分析して得られたデータとを比較することにより、結晶スポンジ380の内部に試料の単結晶が形成されたことを、容易に確認することができる。
第1の実施例においては、試料ホルダ310のピン3104の先端部分に結晶スポンジ380を付着させた構成について説明したが、本実施例においては、図17に示すような構成の試料ホルダ710を用いた場合について説明する。
本実施例において、試料ホルダ710以外の構成においては、実施例1において図8に示した構成と同じであり、アプリケータ311の構成も実施例1において図13乃至15を用いて説明したアプリケータ311の形状と同じであるので、詳しい説明を省略する。
本実施例で用いる試料ホルダ710は、図17にその断面形状を示すように、試料ホルダ710の胴体部7103の先のテーパ状に加工された案内面710Dの先端部分に形成された凹部710Eに、新たに、パイプ7104が装着され固定されている。パイプ7104の内部には、試料ホルダ710に形成された注入針用孔7106に接続する孔7108が形成されている。このパイプ7104の孔7108の内部には、試料を吸蔵するための結晶スポンジ780が形成(又は、取り付け)されている。
試料ホルダ710本体は磁性体の金属で形成されているが、このパイプ7104は、例えば硼珪酸ガラス、石英、カプトンなどのX線を透過する材料で形成されており、案内面710Dの先端部分に形成された凹部710Eに挿入され、更には、接着剤等で固定されている。
試料ホルダ710の根元部分7101、根元部分7101の下面7102、根元部分7101の上面710Aの内側の凹部7105については、それぞれ、実施例1で説明した試料ホルダ310の対応する部分の構成と同じであり、その詳細な説明は省略する。
本実施例では、このような構成の試料ホルダ710を、実施例1で図14を用いて説明したアプリケータ311に装着して、注入針用孔7106に注入針306を挿入し、排出針用孔7107に排出針331を挿入する。注入針用孔7106の上側の端部には、注入針306を挿入するときのガイド面となるテーパ部710Bが形成されている。排出針用孔7107の上側の端部には、排出針331を挿入するときのガイド面となるテーパ部710Cが形成されている。
上端部にテーパ部710Bが形成された注入針用孔7106に挿入した注入針306から試料を結晶スポンジ780に供給して、排出針331でアプリケータ311の内部の気体または液体を排出する構成については実施例1の場合と同じであるので、説明を省略する。
なお、図17に示した構成においては、パイプ7104に形成した孔7108の径が上から下まで同一な場合について示したが、孔7108は、図17において下側に行くほど径が大きくなるようなテーパ形状でもよく、あるいは、上側に比べて途中で径が大きくなる段差形状に形成してもよい。
本実施例によれば、試料ホルダ710をアプリケータ311に装着した状態で、試料ホルダ710の中心部分でパイプ7104を貫通して形成された注入針用の孔7108の内部に取り付けられた極微小で脆弱(fragile)な結晶スポンジ780の内部に、試料をより安全に吸蔵させることができる。
また、本実施例によれば、実施例1の場合と同様に、制御部340では、供給側第1アクチュエータ302、供給側分析部303を、更には、供給側第2アクチュエータ304、および、排出側第1アクチュエータ333、排出側分析部334、排出側第2アクチュエータ335、更に温度調節器320を制御して、極微小で脆弱(fragile)な結晶スポンジ780に試料を吸蔵させるので、従来の手作業で試料を結晶スポンジに吸蔵させていた場合と比べて、試料吸蔵の条件の設定が容易になる。
更に、本実施例によれば、実施例1の場合と同様に、制御部340において、供給側分析部303で分析して得られたデータと、排出側分析部334で分析して得られたデータとを比較することにより、結晶スポンジ780の内部に試料が確実に吸蔵されたことを、容易に確認することができる。
実施例1で説明した図8の吸蔵装置300を備えた構成では、排出針331によりアプリケータ311の内部から排出されたガスまたは試料液は、質量分析装置600に送られて排気されてしまう構成となっている。これに対して本実施例においては、図18に示すように、質量分析装置600から排出された試料をクロマトグラフィ装置200へ送るための戻りルート360を備えた。
この戻りルート360を通って質量分析装置600からクロマトグラフィ装置200へ戻された試料は、再びクロマトグラフィ装置200で所定の成分が抽出されて、吸蔵装置300に供給される。このような構成とすることにより、試料は、クロマトグラフィ装置200から吸蔵装置300を通って質量分析装置600までの間を循環する。吸蔵装置300の動作は実施例1で説明したのと同じである。
本実施例では、図18に示したような構成とすることにより、排出側分析部334で検出したアプリケータ311から排出される成分の分析波形データ(実施例1の図10に相当)を供給側分析部303で検出した波形データ(実施例1の図9に相当)と比較して、目的とする試料の結晶スポンジ380への吸蔵がその終点まで達したことを検出できるようにした。
すなわち、結晶スポンジ380に目的とする試料を吸蔵している期間は、排出側分析部334で検出される波形データのうちの結晶スポンジ380に吸蔵途中の試料成分の波形のピーク値は、時間とともに減少していく。これに対して、結晶スポンジ380への分析対象の試料の吸蔵が完了すると、目的とする試料に対応する成分の消費がなくなるので、排出側分析部334で検出される波形データの目的とする試料成分に対応する波高値は、供給側分析部303で検出した波形データにおける目的とする試料成分に対応する波高値と同じ値となる。
本実施例では、この特性を利用して、図18に示したような構成により、供給側分析部303で検出した単結晶成分に対応する位置の波形データと排出側分析部334で検出される単結晶成分に対応する位置の波形データとを比較して、そのピークレベルが同じになった時点を終点として検出する。
本実施例によれば、クロマトグラフィ装置200から吸蔵装置300を通って質量分析装置600までの間を循環させて試料を用いることができるので、試料の量がごくわずかな時などにおいても、極微小で脆弱(fragile)な結晶スポンジに分析対象の試料が吸蔵されたことを確実に検出することができる。
なお、以上には本発明の種々の実施例を説明したが、本発明は上記した実施例に限定されるものではなく様々な変形例が含まれる。例えば、上記した実施例は本発明を分かりやすく説明するためにシステム全体を詳細に説明したものであり、必ずしも説明した全ての構成を備えるものに限定されるものではない。また、ある実施例の構成の一部を他の実施例の構成に置き換えることが可能であり、またある実施例の構成に他の実施例の構成を加えることも可能であり、また、各実施例の構成の一部について、他の構成の追加・削除・置換をすることが可能であろう。
本発明は、物質構造の探索方法やそれに用いるX線構造解析装置等において広く利用可能である。
なお、本国際出願は、2018年11月23日に出願した日本国特許出願第2018-219809号に基づく優先権を主張するものであり、日本国特許出願第2018-219809号の全内容を本国際出願に援用する。
100…単結晶X線構造解析システム、200…クロマトグラフィ装置、300…単結晶X線構造解析装置用吸蔵装置、302…供給側第1アクチュエータ、303…供給側分析部、304…供給側第2アクチュエータ、306…注入針、310、710…試料ホルダ、311…アプリケータ、320…温度調節器、331…排出針、333…排出側第1アクチュエータ、334…排出側分析部、335…排出側第2アクチュエータ、340…制御部、350…読取部。
Claims (12)
- 試料を吸蔵させる吸蔵装置であって、
前記試料を、細孔性錯体結晶を保持した試料ホルダが挿入されたアプリケータの内部に供給する供給部と、
前記アプリケータの温度を制御する温度調整部と、
前記試料ホルダが挿入された前記アプリケータの内部から前記試料を搬出する排出部と、
前記供給部と前記温度調整部と前記排出部とを制御する制御部と、を備えることを特徴とする吸蔵装置。 - 請求項1記載の吸蔵装置であって、
前記供給部は、注入パイプを備え、
前記供給部は、前記試料ホルダに形成された第1の貫通穴を通して前記アプリケータに挿入された前記注入パイプを介して、前記アプリケータの内部に前記試料を供給することを特徴とする吸蔵装置。 - 請求項1又は2に記載の吸蔵装置であって、
前記排出部は、排出パイプを備え、
前記排出部は、前記試料ホルダに形成された第2の貫通穴を通して前記アプリケータに挿入された前記排出パイプを介して、前記アプリケータの内部から前記試料を搬出することを特徴とする吸蔵装置。 - 請求項1記載の吸蔵装置であって、
前記供給部は、
外部から供給された前記試料の圧力または流量を調整する供給側第1アクチュエータと、
前記供給側第1アクチュエータで調整された前記試料を分析する供給側分析部と、
前記供給側分析部で分析された前記試料の圧力または流量を調整する供給側第2アクチュエータと、
前記試料ホルダに形成された第1の貫通穴を通して前記アプリケータに挿入され、前記供給側第2アクチュエータで調整された前記試料を前記アプリケータの内部に供給する注入パイプと、を備えることを特徴とする吸蔵装置。 - 請求項1又は4に記載の吸蔵装置であって、
前記排出部は、
前記試料ホルダに形成された第2の貫通穴を通して前記アプリケータに挿入される排出パイプと、
前記排出パイプを介して前記アプリケータの内部から前記試料を排出する排出側第1アクチュエータと、
前記排出側第1アクチュエータに排出された前記試料の成分を分析する排出側分析部と、
前記排出側分析部で成分が分析された前記試料の圧力又は流量又は濃度を調整して排出する排出側第2アクチュエータと、を備えることを特徴とする吸蔵装置。 - 請求項1記載の吸蔵装置であって、
前記供給部は、
外部から供給された前記試料の圧力または流量を調整する供給側第1アクチュエータと、
前記供給側第1アクチュエータで調整された前記試料を分析する供給側分析部と、
前記供給側分析部で分析された前記試料の圧力または流量を調整する供給側第2アクチュエータと、
前記試料ホルダに形成された第1の貫通穴を通して前記アプリケータに挿入され、前記供給側第2アクチュエータで調整された前記試料を前記アプリケータの内部に供給する注入パイプと、
前記試料ホルダに形成された第2の貫通穴を通して前記アプリケータに挿入される排出パイプと、
前記排出パイプを介して前記アプリケータの内部から前記試料を排出する排出側第1アクチュエータと、
前記排出側第1アクチュエータに排出された前記試料の成分を分析する排出側分析部と、
前記排出側分析部で成分が分析された前記試料の圧力又は流量又は濃度を調整して排出する排出側第2アクチュエータと、を備え、
前記排出側第2アクチュエータに排出された前記試料は、前記供給側第1アクチュエータに戻されることを特徴とする吸蔵装置。 - 請求項1~6の何れか一項に記載の吸蔵装置であって、
前記制御部は、前記供給部と前記温度調整部と前記排出部とを制御して、前記試料ホルダに保持させた前記細孔性錯体結晶に前記試料を吸蔵させるための吸蔵条件を制御することを特徴とする吸蔵装置。 - 請求項1~7の何れか一項に記載の吸蔵装置であって、
前記試料ホルダまたは前記アプリケータに備えられた情報保持部に保持された情報を読み取る読取部を備え、
前記制御部は、前記読取部が読み取った情報を記憶することを特徴とする吸蔵装置。 - 請求項8記載の吸蔵装置であって、
前記制御部は、前記読取部が読み取った情報に基づいて、前記供給部から前記アプリケータに供給される前記試料の種類に応じて前記供給部と前記温度調整部と前記排出部とを制御することを特徴とする吸蔵装置。 - 試料を吸蔵させる吸蔵方法であって、
前記試料を、細孔性錯体結晶を保持した試料ホルダが挿入されたアプリケータに吸蔵装置から、供給する工程と、
前記吸蔵装置により前記アプリケータの内部から前記アプリケータに供給された前記試料を排出する工程と、を含み、
前記供給する工程または前記排出する工程の少なくとも一方は、前記試料の濃度、圧力、温度又は時間の何れかを含む吸蔵条件を制御した状態で行なわれることを特徴とする吸蔵方法。 - 請求項10記載の吸蔵方法であって、
前記試料を供給する工程は、前記試料ホルダに形成された第1の貫通穴を通して前記アプリケータに挿入された注入パイプを介して供給することを特徴とする吸蔵方法。 - 請求項10または11に記載の吸蔵方法であって、
前記試料を排出する工程は、前記試料ホルダに形成された第2の貫通穴を通して前記アプリケータに挿入された排出パイプを介して前記試料を搬出することにより行うことを特徴とする吸蔵方法。
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| INOKUMA, YASUHIDE: "X-ray analysis on the nanogram to microgram scale using porous complexes", NATURE, vol. 495, 28 March 2013 (2013-03-28), pages 461 - 466, XP055400439, DOI: 10.1038/nature11990 * |
| MAKOTO FUJITA: "X-ray analysis on the nanogram to microgram scale using porous complexes", NATURE, vol. 495, 28 March 2013 (2013-03-28), pages 461 - 466, XP055400439, DOI: 10.1038/nature11990 |
| See also references of EP3885755A4 |
| YASUHIDE INOKUMA , MAKOTO FUJITA: "X-ray crystallography of extremely small amount of compounds by crystal sponge method", FARUMASHIA, THE PHARMACEUTICAL SOCIETY OF JAPAN, vol. 50, no. 8, 1 January 2014 (2014-01-01), JP, pages 756 - 761, XP009528326, ISSN: 0014-8601, DOI: 10.14894/faruawpsj.50.8_756 * |
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| EP3885755B1 (en) | 2025-03-05 |
| EP3885755A1 (en) | 2021-09-29 |
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