WO2024142425A1 - コロニー計数装置、制御方法およびプログラム - Google Patents

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WO2024142425A1
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colony detection
colony
image
unit
inspection
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English (en)
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松村晋吾
関谷傑
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Keyence Corp
Original Assignee
Keyence Corp
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    • G06T7/0012—Biomedical image inspection
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    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12M—APPARATUS FOR ENZYMOLOGY OR MICROBIOLOGY; APPARATUS FOR CULTURING MICROORGANISMS FOR PRODUCING BIOMASS, FOR GROWING CELLS OR FOR OBTAINING FERMENTATION OR METABOLIC PRODUCTS, i.e. BIOREACTORS OR FERMENTERS
    • C12M1/00—Apparatus for enzymology or microbiology
    • C12M1/34—Measuring or testing with condition measuring or sensing means, e.g. colony counters
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
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    • G06T2207/30—Subject of image; Context of image processing
    • G06T2207/30242—Counting objects in image

Definitions

  • FIG. 1 shows a colony counting device.
  • FIG. 2 is a diagram illustrating the structure of a head device.
  • FIG. 2 is a diagram illustrating the electrical configuration of a head device.
  • FIG. 2 is a diagram illustrating the electrical configuration of a control device.
  • FIG. 2 is a diagram for explaining a user interface (UI).
  • FIG. 13 is a diagram illustrating a UI for creating a count table from a sample database.
  • FIG. 13 is a diagram for explaining a UI for assisting in input of a sample name.
  • FIG. 13 is a diagram illustrating a UI for creating a new count table.
  • FIG. 13 is a diagram illustrating a UI for reusing a past count table.
  • FIG. 13 is a diagram for explaining a UI showing automatic identification of a target cell.
  • 13A and 13B are diagrams illustrating a UI for switching the unit of the count result.
  • 11A and 11B are diagrams illustrating a UI for switching information displayed in a cell.
  • FIG. 13 is a diagram illustrating a UI for resetting counting conditions.
  • 5A and 5B are diagrams for explaining the transition of function assignment to buttons.
  • FIG. 13 is a diagram for explaining a UI for changing inspection conditions and the like.
  • 13 is a diagram illustrating a UI for calling up a count table created in the past.
  • FIG. FIG. 4 is a diagram for explaining a user authentication card.
  • FIG. 13 is a diagram illustrating a UI for registering information in a cell of a free column.
  • FIG. 13 is a diagram illustrating an identification image given to a petri dish.
  • FIG. FIG. 13 is a plan view illustrating a coaxial lighting device having a light distribution angle restricting plate.
  • FIG. 2 is a cross-sectional perspective view illustrating the structure of a coaxial lighting device.
  • FIG. 4 is a diagram for explaining a light guide. The light distribution angle for each light emitting element will be described.
  • 1A and 1B are diagrams showing how a desired light distribution angle can be achieved by a lens.
  • 13 is a schematic cross-sectional view of a head device having a coaxial illumination device employing another structure.
  • FIG. 1 is a diagram illustrating low diffusivity.
  • FIG. 4 is a diagram illustrating the structure of a diffusion plate.
  • FIG. 4 is a diagram for explaining a user interface.
  • 11 is a flowchart showing a method for adjusting parameters.
  • 11 is a flowchart showing a method for adjusting parameters.
  • FIG. 4 is a diagram for explaining a user interface.
  • FIG. 4 is a diagram for explaining a user interface.
  • FIG. 4 is a diagram for explaining a user interface.
  • FIG. 1 shows a colony counting device 1.
  • the colony counting device 1 includes a head device 1a and a control device (personal computer (PC)) 1b, which will be described later.
  • the head device 1a and PC 1b may be connected by wire, for example, a universal serial bus (USB) cable, or may be connected wirelessly.
  • USB universal serial bus
  • the lower unit 4 has a metallic front pillar 4b and rear pillar 4d that support the stage 5.
  • a part of the front pillar 4b has a cross-sectional shape resembling an upside-down Greek letter ⁇ .
  • the front pillar 4b has a recess 4c into which the user can insert his or her finger and which functions as a grip. Because the recess 4c is provided on the front pillar 4b, the head device 1a is less likely to become distorted even if the user inserts his or her hand into the recess 4c to lift the head device 1a. This allows the user to carry the head device 1a stably.
  • the dimming control unit 13z electrically controls the degree of diffusion of the diffusion plate 13c according to commands from the MCU 20.
  • the communication circuit 34 of the PC 1b may perform wireless communication with a terminal device 1c such as a smartphone or a tablet terminal.
  • the terminal device 1c may display a count table 55 or a test list created from the count table 55.
  • the test list includes the petri dish number, sample name, bacterial species, culture medium, dilution ratio, culture time, etc., and is referred to when the user prepares test specimens in the petri dish 15.
  • the user pours (mixes) a sample into the medium of each petri dish.
  • the user writes the sample name in the comment field of the test list.
  • the user pours the petri dish into the incubator.
  • the user removes the petri dish from the incubator and counts the number of colonies. For example, while looking through the colonies from the bottom of the petri dish, the user marks the colonies with an oil-based pen to indicate that they have been counted.
  • the number of colonies is written into the inspection list.
  • the user may also count the number of colonies for each type of bacteria while visually checking the species. In this case, the user writes the number of colonies for each type of bacteria for each petri dish into the inspection list.
  • the user starts up the PC and reads the numbers and characters written in the inspection list and enters them into spreadsheet software. The number of colonies is tallied using the macro function of the spreadsheet software, etc.
  • Figure 5 shows the UI 50 of the count application program displayed on the display device 37 of PC 1b.
  • the count application program is stored in the storage device 35 and executed by MCU 30.
  • the UI 50 has buttons, links, tabs, etc. for switching between multiple functions possessed by the count application program.
  • the UI 50 has a table creation area 51 and a DB display area 61.
  • DB is an abbreviation for database.
  • the table creation area 51 displays at least a count table 55.
  • the title display section 52 accepts input of a title (name) given to the count table 55 from the keyboard 32 and displays it.
  • the button 53 is a button for switching between performing/not performing counting for each cell.
  • the button 54 is a button for instructing to add a column to the count table 55.
  • kimchi has two test items.
  • the first test item for kimchi is that a 100-fold dilution ratio of culture medium is used for general live bacteria, and an incubation time of 48 hours is applied. This is the same as the first test item for sandwiches. Therefore, the MCU 30 discards the first test item included in the kimchi template and does not add it as a new column.
  • the second test item for kimchi is that a 100-fold dilution ratio of culture medium is used for E. coli, and an incubation time of 24 hours is applied. The MCU 30 adds this as a new column to the count table 55.
  • the count can also be performed or not performed by operating the count inversion button 53.
  • the MCU 30 may be able to switch between displaying the text or image indicating "not tested” and leaving the field blank for inputting the count result.
  • a search box 65 and a tag search narrowing button 66 may be added.
  • the MCU 30 searches the storage device 3 for the templates based on the characters entered in the search box 65. 5 to extract templates and display the search results in the DB display area 61.
  • a tag search refinement button 66 is pressed, the MCU 30 may display only sample products filtered by the specified classification tag. For example, the same classification tag may be assigned to multiple sample products. In this case, multiple sample products to which the selected classification tag is assigned are added to the count table 55.
  • Figure 7 shows another procedure for adding a new row.
  • the user selects the sample name display cell in the new row with the pointer 57, and inputs the sample name from the first character on the keyboard 32.
  • the MCU 30 searches the sample DB 40 with the input one or more characters, and displays the sample names as input candidates in the candidate display section 58.
  • the MCU 30 searches for templates that include "mix” as a sample name, finds “mixed juice”, and displays "mixed juice” in the candidate display section 58.
  • the MCU 30 reads the test conditions for mixed juice from the storage device 35, and adds a column according to the read test conditions. This associates the search conditions with the mixed juice cell.
  • Figure 8 shows the UI 50 when creating a new count table.
  • the MCU 30 can launch a spreadsheet software in parallel with the application program 39.
  • FIG. 12 is a diagram for explaining how to create a count table 55 including averaging.
  • averaging since averaging has not yet been applied, one row is provided for each sample name.
  • the MCU 30 displays the UI 50 shown in FIG. 11.
  • the MCU 30 divides the input row of the count value associated with each sample name into three rows and adds a column indicating the number of repetitions.
  • the first row has a cell into which the count value obtained in the first test is input.
  • the second row has a cell into which the count value obtained in the second test is input.
  • Figure 13 shows an example of a parent-child relationship between multiple samples.
  • the MCU 30 displays "ham” and "lettuce,” which are ingredients that have a parent-child relationship with the sandwich, in the DB display area 61 in a selectable manner.
  • the MCU 30 reads the test items for "ham” or “lettuce” from the storage device 35 and adds them to the count table 55.
  • Figure 14 shows that the test items for "ham” and "lettuce” are read from the storage device 35 and added to the count table 55.
  • the sandwich, ham, and lettuce, which have a parent-child relationship may be registered together. For example, when the button 64 associated with the sandwich is pressed, the sandwich, ham, and lettuce may be registered together in the count table 55.
  • the algorithm setting unit 95 accepts settings of image processing to be applied to the inspection image.
  • the residue removal is a mode in which residues (e.g., dust, dirt, handwriting) attached to the petri dish 15, etc. are reduced by image processing.
  • the rapid mode is a mode that emphasizes rapid confirmation of results and is a mode in which the petri dish 15 cultured for a shorter culture time than before is inspected with high sensitivity.
  • the medium type setting unit 96 accepts the selection of the type of medium (e.g., general viable bacteria (white), general viable bacteria (black)), etc.
  • the list button 96a is pressed, the MCU 30 may read candidate medium types from the storage device 35, create a list, and display it on the display device 37.
  • the storage device 35 may also store multiple diffusion rates associated with candidate medium types.
  • the MCU 30 can read and obtain the diffusion rate associated with the selected medium from the storage device 35.
  • FIG. 16 shows the UI 100 displayed on the display device 37 of PC 1b while the head device 1a is being controlled from PC 1b to perform counting process.
  • the count table area 101 is an area that displays the count table 55 edited through the UI 50.
  • the result area 102 is an area that displays the inspection image 103 acquired by the main camera 11 of the head device 1a.
  • the inspection image 103 may be a moving image or a still image.
  • the MCU 30 acquires a moving image by the main camera 11 and displays it in the result area 102.
  • the MCU 30 acquires a still image by the main camera 11 and displays it in the result area 102.
  • Check box 106 is a control object for selecting whether or not to display the count result in count value area 104.
  • the first software button 105a is a button that has the same function as the first hardware button 8a.
  • the second software button 105b is a button that has the same function as the second hardware button 8b.
  • the first software button 105a is assigned the instruction to take a picture (shoot button).
  • the second software button 105b is assigned the instruction to register (register button).
  • the second software button 105b is shown with a dashed line, which means that it cannot be operated.
  • Figure 18 shows the UI 100 that the MCU 30 displays on the display device 37 when the first software button 105a, which is a capture button, or the first hardware button 8a is pressed.
  • An image 103 (still image) of the petri dish 15 is displayed in the result area 102.
  • the MCU 30 assigns the first software button 105a from a capture button to a button that instructs counting (count button).
  • the MCU 30 may switch the display between the count value only, the CFU/mL only, and the count value + CFU/mL in that order.
  • CFU is an abbreviation for colony forming unit.
  • the MCU 30 reassigns the first software button 105a from the count button to the shooting button.
  • the MCU 30 changes the second software button 105b and the second hardware button 8b, which are assigned to the registered buttons, from an inoperable state to an operable state.
  • the UI 100 shown in FIG. 20 has a menu 109 for changing the display target of the cell.
  • "Count” has been selected in the menu 109, so "100" is displayed in the cell.
  • Figure 23 shows the UI 100 that the MCU 30 displays on the display device 37 when a cell in which a count value has already been input is double-clicked.
  • the setting screen 120 includes control objects for adjusting parameters related to the colony detection algorithm among the inspection conditions associated with the cell selected by double-clicking.
  • the slide bar 121 is a control object for setting, for example, a threshold for removing small particles by image processing.
  • the slide bar 122 is a control object for adjusting the colony detection sensitivity.
  • the image 103 is a moving image, and the active cell is in the "count value entered” state, the first hardware button 8a (first software button 105a) is assigned the Count button, and the second hardware button 8b (second software button 105b) is assigned the Register button (not operable).
  • the image 103 is a still image, and the active cell is in the "count value has been entered” state, the first hardware button 8a (first software button 105a) is assigned the “shoot” button, and the second hardware button 8b (second software button 105b) is assigned the "re-register” button (operable).
  • the MCU 30 instructs the head device 1a to start the front camera 10.
  • the MCU 20 of the head device 1a starts the front camera 10 and attempts to read the identification image 221.
  • the identification image 221 may simply be called a symbol.
  • the user aligns the position of the inspection list 220 with the front camera 10 so that the front camera 10 reads the identification image 221. If the MCU 20 succeeds in reading the identification image 221, it decodes the identification information from the identification image 221 and transmits it to the PC 1b.
  • the MCU 30 reads the count table associated with the identification information received from the head device 1a from the storage device 35.
  • the front camera 10 and the main camera 11 may capture and read the petri dish number and identification image 221 printed on a sticker 270 attached to the petri dish 15.
  • the identification image 221 may be encoded with identification information of the count table 55, the sample name, unique identification information indicating the cell in which the count result is stored, and the like.
  • the MCU 30 can identify the count table 55, the sample name, the petri dish 15, and the inspection conditions.
  • the MCU 30 transmits the identified inspection conditions to the head device 1a, and the MCU 20 of the head device 1a can control the main camera 11, the ring illumination devices 12 and 13, and the coaxial illumination device 14 according to the received inspection conditions to acquire images.
  • Figure 31 shows the reading screen 250 that is displayed on the display device 37 when the read button 242 is pressed.
  • Check box 251 is a checkbox for instructing the MCU 30 to automatically close the reading screen 250 when the MCU 20 successfully recognizes the code.
  • the image area 252 displays a moving image or a still image captured by the front camera 10.
  • the reading result area 253 is an area that displays the text decoded from the one-dimensional symbol or two-dimensional symbol.
  • the MCU 20 of head device 1a activates the front camera 10, reads the one-dimensional code, decodes the text from the one-dimensional code, and sends the decoded text to PC 1b.
  • the user checks the text displayed in the reading result area 253 and presses the OK button 254 or the cancel button 255.
  • the OK button 254 is pressed, the MCU 30 closes the reading screen 250 and returns to the editing screen 240, and inserts the text received from head device 1a into the cell.
  • the cancel button 255 is pressed, the text received from head device 1a is discarded, the reading screen 250 is closed, and the editing screen 240 is returned to.
  • Figure 32 shows the editing screen 240 with text inserted.
  • the OK button 254 is pressed, the MCU 30 closes the editing screen 240 and displays the UI 50 shown in Figure 29 on the display device 37.
  • MCU 30 sends a counting instruction to head device 1a. Note that when the counting process is performed by PC 1b, MCU 30 performs the counting process instead of MCU 20.
  • MCU 20 determines whether or not a count end instruction has been received. If a count end instruction has been received, MCU 20 ends the count. If a count end instruction has not been received, MCU 20 returns from S31 to S23 and receives the inspection conditions for the next cell.
  • the MCU 30 accepts a selection of a row element to be registered in the sample DB 40 from among the multiple row elements included in the count table. For example, the MCU 30 may accept a click with the pointer 57 on any of the row elements included in the sample table.
  • the MCU 30 accepts input of inspection conditions via the keyboard 32 or pointing device 33.
  • the MCU 20 counts the colonies contained in the inspection image according to the inspection conditions (threshold parameters).
  • Figure 43 is a plan view of the coaxial lighting device 14.
  • a roughly rectangular parallelepiped light guide 4302 is provided above each of the multiple light-emitting elements 14a that make up the coaxial lighting device 14.
  • the light guide 4302 guides the light incident from the bottom side to the top side.
  • a light distribution restricting plate 4301 is provided above the light guide 4302.
  • the light distribution restricting plate 4301 is formed of a light-shielding material such as a metal such as aluminum or a resin.
  • the light distribution restricting plate 4301 is provided with multiple roughly circular apertures 4303.
  • the light guides 4302 and the apertures 4303 are provided in a one-to-one relationship.
  • the light emitted from the light guide 4302 is shaped by the aperture 5404.
  • Figures 44 and 45 are cross-sectional perspective views of the light distribution restriction plate 4301, the light guide 4302, the light guide substrate 4401, the light emitting element 14a, and the substrate 4400.
  • the light emitting elements 14a are mounted on the substrate 4400.
  • the screws 4402 are fastened to the light distribution restriction plate 4301 via the light guide substrate 4401, thereby fixing the light guide substrate 4401 to the light distribution restriction plate 4301.
  • the screws 4403 are fastened to the light distribution restriction plate 4301 via the substrate 4400 and the light guide substrate 4401, thereby fixing the light guide substrate 4401 and the light distribution restriction plate 4301 to the substrate 4400.
  • the light guides 4302 may be integrated with the light guide substrate 4401.
  • the light guides 4302 and the light guide substrate 4401 are molded from a translucent resin (e.g., acrylic) or glass.
  • the light guide 4302 and the aperture 4304 may be replaced with a lens 4701.
  • Li is the distance between the center of the lens 4701 and the emission surface of the light-emitting element 14a.
  • the counting unit may count the number of colonies contained in the inspection image based on shape characteristics such as circularity, aspect ratio, area, and perimeter. This makes it possible to reduce erroneous counts due to scratches and dust, and to more accurately count the number of colonies.
  • FIG. 50 is a diagram showing a configuration example of the diffusion plate 13c.
  • a diffusion film 4901 is provided on the first surface side of a substrate 4900, which is a glass plate or an acrylic plate having translucency.
  • a diffusion film 4902 may be provided on the second surface side of the substrate 4900.
  • the diffusion films 4901 and 4902 may be liquid crystal films.
  • the dimming control unit 13z turns on/off the voltage applied to the diffusion films 4901 and 4902 to change the orientation of the liquid crystal in the diffusion films 4901 and 4902, and the diffusion degree of the diffusion films 4901 and 4902 is changed. For example, when the diffusion films 4901 and 4902 are both off, a second diffusion degree is realized.
  • a first diffusion degree is realized.
  • a third diffusion degree is realized (second diffusion degree ⁇ third diffusion degree ⁇ first diffusion degree).
  • the fourth diffusion degree is realized (second diffusion degree ⁇ fourth diffusion degree ⁇ first diffusion degree).
  • the third diffusion degree may be larger or smaller than the fourth diffusion degree.
  • the third diffusion degree may be equal to the fourth diffusion degree. This makes it possible to switch the diffusion degree of the diffusion plate 13c between three or four levels.
  • Figures 51 and 52 show a method of electrically and mechanically switching the degree of diffusion.
  • the dimming control unit 13z can insert the diffuser plate 13c into the optical path of the inspection light ( Figure 51) or remove the diffuser plate 13c from the optical path ( Figure 52) by controlling the motor 13e. If there is sufficient size for the lower unit 4, a method of electrically and mechanically switching the degree of diffusion can also be implemented. In this case, the degree of diffusion of the diffuser plate 13c is constant.
  • Figure 53 shows inspection image 5301 of an inspection individual irradiated with inspection light diffused with high diffusion by diffuser plate 13c, and inspection image 5302 of an inspection individual irradiated with inspection light diffused with low diffusion by diffuser plate 13c.
  • Enlarged image 5311 is an enlarged view of a certain colony included in inspection image 5301.
  • Enlarged image 5312 is an enlarged view of the same colony included in inspection image 5302.
  • the diffusion degree is linked to the cells of the count table and the test image. This allows the user to easily know the diffusion degree linked to the cell or test image.
  • Figure 54 shows an illumination setting UI 5400 that can be called up from the illumination button of the dialog 90 shown in Figure 15 or the inspection condition confirmation screen 110 shown in Figure 17.
  • the illumination selection section 5401 is a UI for selecting the type of illumination. In this example, one type can be selected from epi-illumination ring (ring illumination device 12), transmitted coaxial (coaxial illumination device 14), or transmitted ring (ring illumination device 13).
  • the selection frame 5402 is a display object that highlights the currently selected type of illumination.
  • the check box 5403 is a control object for selecting the degree of diffusion. When the check box 5403 is checked, high diffusion is selected. When the check box 5403 is unchecked, low diffusion is selected.
  • each cell is also associated with an inspection image.
  • a cell of general viable bacteria and a cell of E. coli may be associated with different diffusion degrees, or the same diffusion degree may be associated with them.
  • each cell in the count table is associated with an inspection condition, an inspection image, and a count result. Since diffusion is one of the inspection conditions, diffusion is also associated with the inspection image and the count result.
  • the diffusion level is selected by check box 5403, but the diffusion level may also be selected through other control objects.
  • a radio button may be used to select one diffusion level from two or more selectable diffusion levels.
  • a check box or radio button may be used to turn on/off a function for reducing scratches and noise (noise reduction function).
  • the MCU 30 selects high diffusion level when the noise reduction function is turned on, and selects low diffusion level when the noise reduction function is turned off.
  • other options on the UI are associated with the diffusion level, and the diffusion level may also be selected indirectly by the user selecting one option from multiple options.
  • the type of culture medium and the diffusion degree may be associated in advance.
  • the MCU 30 may accept the user's selection of the type of culture medium from the culture medium type setting unit 96 shown in FIG. 15, obtain the diffusion degree associated with the selected culture medium from the storage device 35, and set the diffusion degree in the dimming control unit 13z.
  • Figure 55 shows that a composite inspection image 5503 is obtained by combining an inspection image 5501 generated with high diffusion and an inspection image 5502 generated with low diffusion.
  • a transmissive ring illumination device 13 is used as the illumination device. Because a ring illumination device 13 is used, the inspection light passes only through the diffusion plate 13c without passing through the diffusion plate 13d.
  • the MCU 30 When culturing the petri dish 15, condensation may occur in the petri dish 15.
  • the synthesis method may be any method that reduces the influence of the condensation and the characters.
  • the MCU 30 may generate the inspection image 5501 from the difference between the inspection image 5502 and the inspection image 5501. In this way, by calculating the difference between inspection image 5501 and inspection image 5502, a composite inspection image 5503 is generated in which the effects of disturbances observed as bright areas in both images are suppressed. Note that composite inspection image 5503 may also be called a disturbance-suppressed image.
  • Figure 56 is a diagram explaining how to measure bacterial resistance to drugs. It is known that bacteria can acquire resistance to drugs. Therefore, it is very useful to find out which of several drugs is effective against a certain bacterium.
  • a petri dish 15 contains culture medium 5601 on which bacteria are evenly spread. Six types of drugs 5602 are poured or dripped onto it.
  • the diffusion degree effective for measuring the diameter Dc of the inhibition circle may differ depending on the type of culture medium. Therefore, when generating an inspection image for measuring the diameter Dc of the inhibition circle, the MCU 30 accepts the input of the type of culture medium by the user and selects a diffusion degree corresponding to the type of culture medium from among multiple diffusion degrees.
  • the storage device 35 may previously store the type of culture medium and the diffusion degree in association with each other.
  • the MCU 30 may display a UI for one-to-one association between the type of culture medium and the diffusion degree on the display device 37, and accept a setting for linking the diffusion degree to the type of culture medium through the UI.
  • the MCU 30 identifies the diffusion degree corresponding to the type of culture medium input when measuring the inhibition circle by referring to the storage device 35, and sets the identified diffusion degree in the dimming control unit 13z.
  • the dimming control unit 13z applies a voltage to the diffusion plate 13c so that the diffusion degree is set. As a result, a diffusion degree suitable for the culture medium is adopted, and the MCU 30 can accurately measure the diameter Dc of the inhibition circle 5603 from the inspection image.
  • the image of the inspection object is subjected to shading correction, brightness conversion, noise reduction processing (e.g., particle reduction, lint reduction), watershed (a type of image division algorithm), appropriate combination of area sets, etc., and is finally converted into a binary image based on the binary sensitivity (binary threshold). Therefore, the binary conversion process is a very complicated calculation process and requires a considerable amount of calculation time.
  • the MCU 30 then counts the number of colonies from the binary image. Users had to compare the original image with the binary image and check the colony count results to determine which inspection parameters should be fine-tuned and how. By repeating this series of adjustments for each inspection parameter, the final inspection parameters were determined. In particular, because binary image processing takes time, users had to wait a long time between adjusting the inspection parameters and obtaining the counting results that were the result of those adjustments.
  • This embodiment therefore simplifies the process of adjusting the inspection parameters. In addition, some parts of this embodiment will likely shorten the adjustment process compared to conventional methods.
  • the candidates for the inspection parameters may be gradually narrowed down from primary candidates, secondary candidates, ... to final candidates.
  • the multiple inspection parameters that are the nth candidate are composed of one inspection parameter selected by the user from the multiple inspection parameters included in the n-1th candidate, and several inspection parameters located before and after the one inspection parameter. In this way, the inspection parameters closest to the user's sense may be gradually selected.
  • three candidate images 5802 are displayed, each of which has been obtained by applying different inspection parameters.
  • the user selects one candidate image 5802 by manipulating the pointer 57.
  • the selection frame 5806 is a box or frame for highlighting the candidate image 5802 selected by the user.
  • the MCU 30 When the pointer 57 detects that the back button 5804 has been pressed, the MCU 30 returns from the count navigation UI 5800 to the UI 100. When the pointer 57 detects that the next button 5805 has been pressed, the MCU 30 transitions to the next UI (e.g., the UI 5800 shown in FIG. 61).
  • the next UI e.g., the UI 5800 shown in FIG. 61.
  • candidate images 5802 are displayed in FIG. 58, but this is just one example.
  • the number of candidate images 5802 displayed in the candidate display area 5801 may be two or more.
  • the nth order candidates may be determined to include three or more candidates (e.g., 0.25, 0.3, 0.35) centered around the midpoint between the two candidates (e.g., 0.3).
  • Figure 60 shows another example of the count navigation UI 5800.
  • the original image 6001 is a raw image (color image or grayscale image) acquired from the specimen to be inspected.
  • the original image 6001 is an image close to the impression the user gets when viewing the petri dish 15 with the naked eye.
  • the candidate image 5802 is an image generated by superimposing a binary image generated by applying inspection parameters to the original image 6001 and performing image processing on the original image 6001. In this case, the user will be able to determine whether or not the colony present in the original image 6001 has been correctly detected by checking the binary image superimposed on the original image 6001.
  • FIG. 62 does not have a count navigation button 105d
  • a count navigation button 105d may be provided.
  • the user can readjust the multiple types of inspection parameters by pressing the count navigation button 105d.
  • the inspection parameters determined in the previous adjustment may be read from the storage device 35 and adopted as the median value of multiple inspection parameters that are primary candidates for readjustment.
  • the MCU 30 (image processing unit, calculation unit, counting unit) performs a counting calculation for each of the L inspection parameters of the second type. This results in L counting results that are stored in the storage device 35.
  • the second type of inspection parameters are, for example, the on/off of the small particle reduction function, the on/off of the lint reduction function, the size of the shape division, etc.
  • the UI 5800 shown in FIG. 58 etc. displays multiple binary images (candidate images 5802) each generated by applying multiple candidates for the same type of inspection parameter (candidate parameters). However, the UI 5800 shown in FIG. 66 displays only one binary image (candidate image 5802) out of the multiple binary images generated. This increases the display area per candidate image 5802, making it easier for the user to visually check the details of the candidate image 5802.
  • the UI 5800 shown in FIG. 66 may have a slide bar 6601 as a control object for instructing switching of the candidate image 5802 displayed in the candidate display area 5801.
  • the user switches the candidate image 5802 displayed in the candidate display area 5801 by clicking or dragging the slide bar 6601 with the pointer 57.
  • the first candidate image generated by applying the first inspection parameter is switched to the second candidate image generated by applying the second inspection parameter.
  • Figure 67 shows that the candidate image 5802 has been switched by the user.
  • the slide bar 6601 has been dragged to the right, and a different (second) candidate image 5802 is displayed in the candidate display area 5801.
  • the inspection parameters and count numbers displayed in the information display area 5803 are also switched according to the candidate image 5802.
  • Figure 68 shows that the candidate image 5802 has been switched by the user.
  • the slide bar 6601 is dragged further to the right, and yet another (third) candidate image 5802 is displayed in the candidate display area 5801.
  • the inspection parameters and count numbers displayed in the information display area 5803 are also switched in accordance with the candidate image 5802.
  • the candidate image 5802 displayed in the candidate display area 5801 and the inspection parameters displayed in the information display area 5803 at that point in time are confirmed as having been selected by the user.
  • multiple candidate images 5802 may be displayed in a contrasting manner.
  • candidate images 5802 with discretely changed inspection parameters can be displayed in sequence at the same position in the candidate display area 5801. This makes it easy to grasp which area of the candidate image 5802 has been newly counted as a colony and how the candidate image 5802 has changed by changing the inspection parameters.
  • the slide bar 6601 may be operated using cursor keys provided on a keyboard.
  • candidate images 5802 with lower count numbers may be displayed, and as the slide bar 6602 moves to the right, candidate images 5802 with higher count numbers may be displayed. In this way, the multiple candidate images 5802 (the display order) may be sorted according to the count numbers.
  • the storage device 35 is an example of a storage unit that stores a count table including cells into which the count results of each of a plurality of test specimens are input.
  • the MCU 30 and the display control unit 36 are an example of a display control unit that displays the count table stored in the storage unit on the display unit 37.
  • the MCU 30 and the pointing device 33 are an example of a cell identification unit that identifies a target cell into which the count result is input from among a plurality of cells included in the count table displayed by the display control unit.
  • the MCU 20 or the MCU 30 is an example of a counting instruction unit that generates a counting instruction according to a user's operation.
  • the table management unit may associate inspection conditions with the count result cells that store the count results of the number of colonies. By associating inspection conditions with the cells that store the count results, it becomes possible to easily set the inspection conditions when carrying out inspections related to colonies.
  • the acquisition unit may have an illumination unit (e.g., ring illumination devices 12 and 13, coaxial illumination device 14) that illuminates the inspection individual, and an imaging unit (e.g., main camera 11) that images the inspection individual illuminated by the illumination unit.
  • the inspection conditions may include the illumination conditions of the illumination unit (e.g., type of illumination, brightness). Appropriate illumination conditions vary depending on the type of bacteria, such as E. coli or general viable bacteria, and the type of culture medium (e.g., sheet-type culture medium, liquid-type culture medium, selective culture medium). Therefore, by including the illumination conditions as the inspection conditions, it becomes possible to set illumination conditions suitable for each cell.
  • the inspection conditions may include imaging conditions of the imaging unit (e.g., exposure time). Appropriate imaging conditions may vary depending on the color of the culture medium and the color of the colony. By including the imaging conditions in the inspection conditions, it becomes possible to set appropriate imaging conditions for each cell.
  • a cell in the count table into which the number of colonies is input may be assigned unique cell identification information.
  • the MCU 30 may use the printer 38 to print an identification image 221 encoding the unique cell identification information on a sticker 270 (resin or paper with an adhesive surface). The user attaches the sticker 270 to the side of the petri dish 15. The petri dish number may be used as the unique cell identification information.
  • the identification information acquisition unit e.g., MCU 30, front camera 10, or main camera 11
  • the cell identification unit e.g., MCU 30
  • the cell identification unit may identify the target cell based on the cell identification information acquired by the identification information acquisition unit. This saves the user the trouble of specifying the target cell. Furthermore, the target cell corresponding to the test individual may be accurately identified.
  • the MCU 30 may function as a creation unit that creates a count table in response to user operations and stores the count table in the storage unit.
  • a stage e.g., a transparent window 6 having a first surface on which an inspection object is placed and a second surface that is the reverse side of the first surface and capable of transmitting light from the second surface to the first surface, an imaging unit (e.g., a main camera 11) that is disposed opposite the first surface of the stage and generates an inspection image of the inspection object placed on the stage, a surface light source (e.g., a coaxial lighting device 14) that irradiates the inspection light toward the second surface so that a beam of the inspection light is transmitted from the second surface of the stage to the first surface, A colony counting device having a dimming unit (e.g., diffusion plates 13c, 13d) that is disposed between a surface light source and the second surface of the stage and adjusts the diffusion degree of the inspection light beam, a control unit (e.g., MCUs 20, 30, dimming control unit 13z) that controls at least the dimming unit, and a dimming unit (e.g., MCUs
  • Point C2 The colony counting device described in Point C1, in which the surface light source has a light distribution angle regulating section (e.g., light distribution regulating plate 4301) that regulates the light distribution angle of the inspection light output from the surface light source.
  • a light distribution angle regulating section e.g., light distribution regulating plate 43011
  • the light distribution angle regulating unit includes a plurality of light guides (e.g., light guide 4302) arranged for each of the plurality of light emitting elements (e.g., light emitting element 14a) that form the surface light source, and a plurality of apertures (e.g., aperture 4303) arranged for each of the plurality of light guides.
  • a plurality of light guides e.g., light guide 4302
  • the plurality of light emitting elements e.g., light emitting element 14a
  • apertures e.g., aperture 4303
  • the desired light distribution angle can be achieved and there is less unevenness in the amount of light. Furthermore, compared to a configuration using a single light source and lens optical system, it is possible to configure a smaller optical system while maintaining the same irradiation area.
  • Point C4 The colony counting device described in Point C3, in which the multiple light-emitting elements are arranged on any of multiple concentric circles having different radii (e.g., FIG. 43).
  • Point C5 A colony counting device as described in Point C4, in which the spacing (e.g., i1) between the multiple light-emitting elements arranged on the concentric circle with a larger radius among the multiple concentric circles is narrower than the spacing (e.g., i2) between the multiple light-emitting elements arranged on the concentric circle with a smaller radius among the multiple concentric circles (e.g., i2>i1 in FIG. 43).
  • the spacing e.g., i1 between the multiple light-emitting elements arranged on the concentric circle with a larger radius among the multiple concentric circles is narrower than the spacing (e.g., i2) between the multiple light-emitting elements arranged on the concentric circle with a smaller radius among the multiple concentric circles (e.g., i2>i1 in FIG. 43).
  • Point C6 The colony counting device described in Point C1, in which the light distribution angle control unit has a telecentric lens (e.g., telecentric optical system 4802) arranged between the surface light source and the dimming unit.
  • a telecentric lens e.g., telecentric optical system 4802
  • the light distribution angle control section may be realized by a telecentric lens.
  • Point C7 The colony counting device according to Point C1, in which the light control unit is capable of switching the diffusion degree between a first diffusion degree and a second diffusion degree, and the first diffusion degree is greater than the second diffusion degree.
  • the MCU 30 may measure the circularity, aspect ratio, area, circumference, etc. of the colony according to the inspection conditions. In this case, a second diffusion degree that emphasizes the outline of the colony would be effective.
  • the diffusion degree is one of the inspection conditions 28. As shown in FIG. 4, the inspection condition 28 is linked to the count table 55 and the inspection image and stored in the storage device 35. In other words, the diffusion degree set in the dimming unit when acquiring the inspection image 29 is linked to the inspection image 29 and stored in the storage device 35.
  • the control unit is configured to control the dimming unit to control the imaging unit to obtain a first inspection image (e.g., high diffusion inspection images 5301, 5501) as the inspection image to be counted by the counting unit, while controlling the dimming unit to irradiate the inspection individual with inspection light of a first diffusion degree, and to control the imaging unit to obtain a second inspection image (e.g., low diffusion inspection images 5302, 5502) as the inspection image to be counted by the counting unit, and the colony counting device is further configured to control the dimming unit to control the imaging unit to obtain a second inspection image (e.g., low diffusion inspection images 5302, 5502) as the inspection image to be counted by the counting unit,
  • a colony counting device comprising: a registration unit that associates the first inspection image with diffusion information regarding the first diffusion degree and registers the second inspection image in the storage unit, and that associates the second inspection image with diffusion information regarding the second diffusion degree and registers the second inspection
  • Point C12 The colony counting device according to Point C1, in which the light control unit has a diffusion member (e.g., diffusion plate 13c, liquid crystal film type diffusion films 4901, 4902) whose diffusion degree can be electrically changed, and the control unit changes the diffusion degree of the light control unit by electrically changing the diffusion degree of the diffusion member.
  • a diffusion member e.g., diffusion plate 13c, liquid crystal film type diffusion films 4901, 4902
  • the degree of diffusion can be changed by changing the electrical parameters, making it easier to implement the dimming and control units.
  • the colony counting device further comprises a setting reception unit (e.g., MCU 30, UI 5400, checkbox 5403) that receives the setting of the diffusion degree for each type of culture medium, and a type reception unit (e.g., MCU 30, dialog 90) that receives the input of the type of culture medium of the test individual placed on the stage, and the control unit is configured to identify the diffusion degree corresponding to the type of the culture medium of the test individual received by the type reception unit, and to control the light adjustment unit according to the identified diffusion degree.
  • a setting reception unit e.g., MCU 30, UI 5400, checkbox 5403
  • a type reception unit e.g., MCU 30, dialog 90
  • a colony counting device according to Point C1, further comprising a creation unit (e.g. MCU30) that creates a count table that records identification information that identifies the test individual, diffusion degree information related to the diffusion degree of the dimming unit applied to the test individual, and the number of colonies obtained by the counting unit, the control unit being configured to receive a selection of a cell from the count table and to control the diffusion degree of the dimming unit based on the diffusion degree information corresponding to the received cell, and the counting unit being configured to write the number of colonies into the received cell.
  • a creation unit e.g. MCU30
  • creates a count table that records identification information that identifies the test individual, diffusion degree information related to the diffusion degree of the dimming unit applied to the test individual, and the number of colonies obtained by the counting unit
  • the control unit being configured to receive a selection of a cell from the count table and to control the diffusion degree of the dimming unit based on the diffusion degree information corresponding to the received cell
  • the counting unit being configured to
  • the colony counting device 1 may be used to measure the inhibition circle 5603.
  • the inhibition circle 5603 has been measured using a caliper or the like, but in this embodiment, the inhibition circle 5603 can be easily measured using the colony counting device 1.
  • a method for controlling a colony counting device having a stage having a first surface on which an inspection object is placed and a second surface that is the reverse side of the first surface and capable of transmitting light from the second surface to the first surface, an imaging unit disposed opposite the first surface of the stage and generating an inspection image of the inspection object placed on the stage, a surface light source that irradiates the inspection light toward the second surface so that the inspection light beam transmits from the second surface of the stage to the first surface, and a dimming unit disposed between the surface light source and the second surface of the stage and adjusting the diffusion degree of the inspection light beam, the method comprising the steps of: setting the diffusion degree in the dimming unit; turning on the surface light source; generating an inspection image by imaging the inspection object with the imaging unit, the inspection object irradiated with the inspection light beam that is output from the surface light source and has its diffusion degree adjusted by the dimming unit, and that is input from the second surface of the stage and output from the first surface of the stage; and
  • a setting reception unit (e.g., MCU30, UI5400, checkbox 5403) that receives the setting of the diffusion degree for each type of culture medium, a stage on which the test individual is placed, a type reception unit (e.g., MCU30, dialog 90) that receives input of the type of culture medium for the test individual placed on the stage, an illumination unit that irradiates the test individual placed on the stage with inspection light, and a dimming unit that is provided in the optical path along which the inspection light irradiated from the illumination unit reaches the test individual and adjusts the diffusion degree of the inspection light irradiated from the illumination unit, and A colony counting device having a control unit (e.g., MCU20, MCU30, dimming control unit 13z) that identifies the diffusion degree corresponding to the type of the received inspection individual and controls the dimming unit according to the identified diffusion degree, an imaging unit that receives the inspection light that is irradiated from the illumination unit, passes through a control unit (e
  • a colony counting device having an acquisition unit (e.g., MCU 30, main camera 11) that acquires an image of an individual to be inspected by imaging the individual to be inspected; a display processing unit (e.g., MCU 30, display control circuit 36) that displays on a display unit multiple colony detection results obtained by applying different colony detection parameters to the image of the individual to be inspected acquired by the acquisition unit so that they can be compared; a selection unit (e.g., MCU 30, pointing device 33) that selects one colony detection result from the multiple colony detection results displayed on the display unit in response to a user operation; and a counting unit (e.g., MCU 30) that applies the colony detection parameters used to obtain the one colony detection result selected by the selection unit to the image of the individual to be inspected, and counts the number of colonies contained in the image of the individual to be inspected.
  • an acquisition unit e.g., MCU 30, main camera 11
  • a display processing unit e.g., MCU 30, display control circuit 36
  • Aspect D1 makes it easy to adjust the inspection parameters in the colony counting device 1. That is, the user can indirectly select the colony detection parameters by comparing multiple colony detection results and selecting one colony detection result that suits his or her sense. This makes it easy to adjust the colony detection parameters.
  • the selection unit may select one colony detection result in response to a user operation from among multiple colony detection results that are displayed simultaneously on the display unit or that are displayed by switching between them one by one in order. In either case, it can be said that the multiple colony detection results are displayed in a comparative manner.
  • Point of View D2 The colony counting device described in Point of View D1, in which each of the multiple colony detection results is an image of the inspected individual (e.g., original image, binarized image) with a marker indicating the detected position of the colony superimposed thereon.
  • Each of the multiple colony detection results may include a mark (e.g., a cross mark, a binarized image overlaid on the original image) indicating the detected position of the colony.
  • a mark e.g., a cross mark, a binarized image overlaid on the original image
  • a colony counting device according to any one of points of views D1 to D3, in which the multiple colony detection results are associated with the colony detection parameters used to detect the colonies and displayed on the display unit.
  • the colony detection results may include a binarized image, the detected positions of the colonies, and the number of colonies. This will make it easier for the user to select a colony detection result that best suits their own sensibilities.
  • a colony counting device according to any one of Viewpoints D1 to D5, further comprising a determination unit (e.g., MCU30, S121) which, when the one colony detection result is selected from the multiple colony detection results obtained using the different colony detection parameters that serve as primary candidates, determines multiple different colony detection parameters that serve as secondary candidates based on the colony detection parameters used to obtain the one colony detection result; when the multiple different colony detection parameters that serve as secondary candidates are determined by the determination unit, the display processing unit displays the multiple colony detection results obtained by applying the multiple different colony detection parameters that serve as secondary candidates to the image of the inspection individual on the display unit in a comparable manner (e.g., S122, S123); the selection unit selects one colony detection result from the multiple colony detection results that are simultaneously displayed on the display unit and that are obtained by applying the multiple different colony detection parameters that serve as secondary candidates in accordance with a user operation (e.g., S124); and the counting unit applies the colony detection parameters used to obtain the
  • secondary candidate colony detection parameters may be determined from the primary candidate colony detection parameters. This allows the colony detection parameters to be narrowed down in stages.
  • FIG. D7 The colony counting device according to Viewpoint D6, in which, when the one colony detection result is selected from the multiple colony detection results obtained using the different colony detection parameters serving as the secondary candidates, the determination unit determines multiple different colony detection parameters serving as tertiary candidates based on the colony detection parameters used to obtain the one colony detection result, and when the multiple different colony detection parameters serving as tertiary candidates are determined by the determination unit, the display processing unit displays the multiple colony detection results obtained by applying the multiple different colony detection parameters serving as tertiary candidates to the image of the test individual on the display unit in a comparative manner, the selection unit selects one colony detection result from the multiple colony detection results displayed on the display unit and obtained by applying the multiple different colony detection parameters serving as tertiary candidates in accordance with a user operation, and the counting unit applies the colony detection parameter used to obtain the one colony detection result selected by the selection unit to the image of the test individual, and counts the number of colonies included in the image of the test individual.
  • tertiary candidate colony detection parameters may be determined from secondary candidate colony detection parameters. This allows the colony detection parameters to be narrowed down in stages.
  • Viewpoint D9 The colony counting device described in Viewpoint D6 or D7, wherein the multiple secondary candidate colony detection parameters include a first colony detection parameter corresponding to the one colony detection result selected by the selection unit from among the multiple primary candidate colony detection parameters, a second colony detection parameter that is larger than the first colony detection parameter, and a third colony detection parameter that is smaller than the first colony detection parameter.
  • the multiple secondary candidate colony detection parameters may include colony detection parameters selected from the primary candidates. This allows the user to gradually approach the colony detection parameters that are closest to their own sense.
  • the present invention further includes a calculation unit (e.g., MCU 30) that calculates the multiple colony detection results using different colony detection parameters, the calculation unit calculates multiple colony detection results in advance using multiple colony detection parameters that are primary candidates (e.g., three sensitivities out of five sensitivities) and multiple colony detection parameters that are secondary candidates (e.g., the remaining two sensitivities out of five sensitivities), and stores the multiple colony detection results in a memory unit (e.g., storage device 35), the display processing unit reads out the multiple colony detection results obtained using the multiple colony detection parameters that are primary candidates from the memory unit and displays them on the display unit, and the selection unit selects the multiple colony detection results obtained by applying the multiple colony detection parameters that are primary candidates and displayed on the display unit.
  • a calculation unit e.g., MCU 30
  • the calculation unit calculates multiple colony detection results in advance using multiple colony detection parameters that are primary candidates (e.g., three sensitivities out of five sensi
  • a first type of colony detection parameter e.g.
  • Point of View D12 The colony counting device according to Point of View D11, wherein the first type of colony detection parameter is any one of the following: binary sensitivity that serves as a reference when generating a binary image used to detect colonies from the image of the test individual; on/off of shading correction applied to the image of the test individual; and strength of noise reduction processing applied to the image of the test individual (e.g., size of small particles, lint reduction effect).
  • Point of View D13 The colony counting device according to Point of View D11 or D12, wherein the second type of colony detection parameter is any one of: on/off of a reduction process that reduces small particles from the image of the test individual; on/off of a reduction process that reduces irregularities (e.g., lint) from the image of the test individual; and on/off of a reduction process that reduces large particles from the image of the test individual.
  • the second type of colony detection parameter is any one of: on/off of a reduction process that reduces small particles from the image of the test individual; on/off of a reduction process that reduces irregularities (e.g., lint) from the image of the test individual; and on/off of a reduction process that reduces large particles from the image of the test individual.
  • FIG. 58 The colony counting device according to any one of views D1 to D14, wherein the display processing unit is configured to display a first screen (e.g., UI5800 in FIG. 58) and a second screen (e.g., UI5800 in FIG. 61 and UI6300 in FIG. 63) on the display unit, the first screen being a screen for displaying the multiple colony detection results, and the second screen being a screen for adjusting other colony detection parameters different from the colony detection parameters corresponding to the one colony detection result selected by the user operation on the first screen.
  • a first screen e.g., UI5800 in FIG. 58
  • a second screen e.g., UI5800 in FIG. 61 and UI6300 in FIG. 63
  • Point of View D15 The colony counting device described in Point of View D15, in which the colony detection parameters adjusted through the first screen (e.g., UI5800) are adjusted by selecting one of the multiple colony detection results obtained by applying discretely adjusted image processing parameters (e.g., binarization sensitivity).
  • discretely adjusted image processing parameters e.g., binarization sensitivity
  • Point of View D16 The colony counting device described in Point of View D14 or D15, wherein the second screen (e.g., UI6300) is a screen that accepts adjustment of colony detection parameters that take continuous values (e.g., the size of small particles, lint reduction effect).
  • the second screen e.g., UI6300
  • the second screen is a screen that accepts adjustment of colony detection parameters that take continuous values (e.g., the size of small particles, lint reduction effect).
  • a method for controlling a colony counting device comprising: acquiring an image of an inspection individual obtained by imaging the inspection individual; displaying on a display unit a plurality of colony detection results obtained by applying different colony detection parameters to the acquired image of the inspection individual so as to be contrasted; selecting one colony detection result from the plurality of colony detection results displayed on the display unit in response to a user operation; and applying the colony detection parameter used to obtain the one selected colony detection result to the image of the inspection individual, and counting the number of colonies contained in the image of the inspection individual.
  • control method is also part of this embodiment.

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Abstract

【課題】コロニー計数装置における検査パラメータの調整を容易にする。【解決手段】コロニー計数装置は、検査個体の画像に対してそれぞれ異なるコロニー検出パラメータを適用して得られた複数のコロニー検出結果を対比可能に表示部に表示し、複数のコロニー検出結果のうちユーザ操作に応じて一つのコロニー検出結果を選択し、選択された一つのコロニー検出結果を得るために使用されたコロニー検出パラメータを前記検査個体の画像に対して適用して、当該検査個体の画像に含まれるコロニーの数を計数する。

Description

コロニー計数装置、制御方法およびプログラム
本発明は、コロニー計数装置、制御方法およびプログラムに関する。
食品を製造する工場ではコロニーカウンタを用いて菌が商品に混入しているかどうかが検査される。検査者は、シャーレ内に培地を形成し、培地に食品サンプルを投入し、所定期間にわたり培養器等で培養する。その後、検査者は、培養器からシャーレを取り出して、コロニーカウンタでコロニー（細菌の群体）をカウントする。このようにコロニーカウンタのカウント精度は食品の衛生管理上で重要である。特許文献１によれば、グレースケール画像からコロニーをカウントする方法が提案されている。
特開２０１２－０７５４０９号公報
ところで、コロニーを精度よくカウントするために検査個体の撮影条件、照明条件および検出条件など、様々な検査パラメータをユーザが設定しなければならなかった。通常、一つのパラメータが変更されると、コロニー計数装置は、新しいパラメータを用いて検査個体を撮影して検査画像を取得し、検査画像からコロニーをカウントする必要があった。つまり、多くのパラメータを調整するには、何度も撮影、画像処理および計数処理が繰り返し実行されるため、パラメータの調整時間が膨大なものになっていた。そこで、本発明は、コロニー計数装置における検査パラメータの調整を容易にすることを目的とする。
本発明は、たとえば、　検査個体を撮像して得られた検査個体の画像を取得する取得部と、　前記取得部により取得された前記検査個体の画像に対してそれぞれ異なるコロニー検出パラメータを適用して得られた複数のコロニー検出結果を対比可能に表示部に表示する表示処理部と、　前記表示部に表示される複数のコロニー検出結果のうちユーザ操作に応じて一つのコロニー検出結果を選択する選択部と、　前記選択部により選択された前記一つのコロニー検出結果を得るために使用されたコロニー検出パラメータを前記検査個体の画像に対して適用して、当該検査個体の画像に含まれるコロニーの数を計数する計数部と、を有するコロニー計数装置を提供する。
本発明によれば、コロニー計数装置における検査パラメータの調整が容易になる。
コロニー計数装置を示す図。 ヘッド装置の構造を説明する図。 ヘッド装置の電気的な構成を説明する図。 制御装置の電気的な構成を説明する図。 ユーザインタフェース（ＵＩ）を説明する図。 サンプルデータベースからカウント表を作成するＵＩを説明する図。 サンプル名の入力補助に関するＵＩを説明する図。 新規にカウント表を作成するＵＩを説明する図。 表計算ソフトのシートを説明する図。 過去のカウント表を流用するためのＵＩを説明する図。 統計処理の設定を容易化するＵＩを説明する図。 統計処理の設定を容易化するＵＩを説明する図。 親子関係に関するＵＩを説明する図。 親子関係に関するＵＩを説明する図。 列要素を追加するためのＵＩを説明する図。 検査時のＵＩを説明する図。 検査条件等を変更するＵＩを説明する図。 カウントを指示する際のＵＩを説明する図。 カウント結果をセルに登録する際のＵＩを説明する図。 対象セルの自動特定を示すＵＩを説明する図。 カウント結果の単位を切り替えるＵＩを説明する図。 セルに表示する情報を切り替えるＵＩを説明する図。 計数条件を再設定するＵＩを説明する図。 ボタンへの機能の割り当ての遷移を説明する図。 検査条件等を変更するためのＵＩを説明する図。 過去に作成されたカウント表を呼び出すＵＩを説明する図。 検査リストを説明する図。 ユーザ認証札を説明する図。 自由列のセルへ情報を登録するＵＩを説明する図。 自由列のセルへ情報を登録するＵＩを説明する図。 コード（シンボル）の読み取りＵＩを説明する図。 シンボルのデコード結果を説明する図。 レポートを説明する図。 ＰＣにより実行される処理を示すフローチャート。 ヘッド装置により実行される処理を示すフローチャート。 サンプルデータベースの編集を示すフローチャート。 カウント表の編集を説明するフローチャート。 カウント表の特定を説明するフローチャート。 コロニーのカウント方法を説明するフローチャート。 自由列のセルへ情報を登録する方法を説明するフローチャート。 シャーレに付与された識別画像を説明する図。 ヘッド装置の概略断面図。 配光角規制板を有する同軸照明装置を説明する平面図。 同軸照明装置の構造を説明する断面斜視図。 ライトガイドを説明する図。 一つの発光素子ごとの配光角を説明する。 レンズにより所望の配光角を実現することを示す図。 他の構造を採用した同軸照明装置を有するヘッド装置の概略断面図。 低拡散度を説明する図。 拡散板の構造を説明する図。 機械的に実現される高拡散度を説明する図。 機械的に実現される低拡散度を説明する図。 拡散度が検査画像に及ぼす効果を説明する図。 拡散度を設定するＵＩを説明する図。 合成検査画像を説明する図。 阻止円の計測方法を説明する図。 ユーザインタフェースを説明する図。 ユーザインタフェースを説明する図。 ユーザインタフェースを説明する図。 ユーザインタフェースを説明する図。 ユーザインタフェースを説明する図。 ユーザインタフェースを説明する図。 ユーザインタフェースを説明する図。 パラメータの調整方法を示すフローチャート。 パラメータの調整方法を示すフローチャート。 ユーザインタフェースを説明する図。 ユーザインタフェースを説明する図。 ユーザインタフェースを説明する図。
以下、添付図面を参照して実施形態を詳しく説明する。なお、以下の実施形態は特許請求の範囲に係る発明を限定するものではなく、また実施形態で説明されている特徴の組み合わせの全てが発明に必須のものとは限らない。実施形態で説明されている複数の特徴のうち二つ以上の特徴が任意に組み合わされてもよい。また、同一若しくは同様の構成には同一の参照番号を付し、重複した説明は省略する。　
［コロニー計数装置］　図１はコロニー計数装置１を示している。なお、コロニー計数装置１は、ヘッド装置１ａと、後述される制御装置（パーソナルコンピュータ（ＰＣ））１ｂとを含む。ヘッド装置１ａとＰＣ１ｂとは、たとえば、ユニバーサルシリアルバス（ＵＳＢ）ケーブルで有線接続されてもよいし、無線により接続されてもよい。　
ヘッド装置１ａは、上部ユニット２、支持ユニット３および下部ユニット４を有している。ヘッド装置１ａの内部には、カメラおよび照明装置が設けられている。支持ユニット３は、上部ユニット２と下部ユニット４との間に存在し、上部ユニット２を支持している。下部ユニット４の頂面にはステージ５が設けられている。ステージ５は、シャーレ１５が載置される透過窓６と、透過窓６の中央にシャーレ１５を位置決めするための位置決め部材７とが設けられている。下部ユニット４の正面には、操作部８とフロントカメラ１０が設けられている。操作部８は、ユーザが指示を入力するための複数のスイッチ（例：第一ハードウエアボタン８ａ、第二ハードウエアボタン８ｂ、第三ハードウエアボタン８ｃ）などを含む。フロントカメラ１０は、オプションであり、たとえば、二次元シンボル（バーコード）などを読み取る。フロントカメラ１０は、ヘッド装置１の筐体の前面に設けられた凹部４ａに、配置されている。切替レバー１０ａは、フロントカメラ１０の向きを前方または下方に切り替えるためのレバーである。下部ユニット４の側面には電源スイッチ９が設けられている。　
図２はヘッド装置１ａの断面図である。上部ユニット２の下面付近には、落射照明を行うためのリング照明装置１２が配置されている。落射照明とは、検査個体で反射した光を受光することで検査個体を観察するための照明手法である。リング照明装置１２の上方にはメインカメラ１１と光学系１６とが配置されている。透過窓６の下方にもリング照明装置１３が配置されている。リング照明装置１３のさらに下方には、同軸照明（全射照明）を行う同軸照明装置１４が配置されている。同軸照明（全射照明）は、透過照明とも呼ばれ、検査個体を透過してきた光を受光することで検査個体を観察する手法で利用される。リング照明装置１２は、リング状に並べられた複数の発光素子１２ａと、複数の発光素子１２ａから出力される光を拡散する拡散板１２ｂとを有している。同時に点灯する発光素子１２ａを選択することで、照明方向が自在に変更可能となっている。これは、それぞれ異なる方向から照明された検査個体（食品サンプル）を撮像して取得された複数の検査画像を合成する際に役立つであろう。リング照明装置１３は、リング状に並べられた複数の発光素子１３ａと、反射板１３ｂと、拡散板１３ｃとを有している。反射板１３ｂは、複数の発光素子１３ａから出力された光を拡散板１３ｃに向けて反射する。　
拡散板１３ｃは、反射板１３ｂからの光を均一に拡散する。拡散板１３ｃは、拡散度を電気的に調整可能な拡散部材であってもよい。拡散板１３ｃの下方には第二の拡散板１３ｄが設けられている。拡散板１３ｄは、拡散度が一定の拡散部材である。　
複数の発光素子１３ａのうち同時に点灯する発光素子１３ａを選択することで、照明方向が自在に変更される。同軸照明装置１４は、同心円状またはアレイ状に並べられた複数の発光素子１４ａを有する。このように複数のタイプの照明装置を設け、食品サンプルと培地との組み合わせごとに適切な照明装置を選択することで、コロニーの個数を正確にカウントすることが可能となろう。　
下部ユニット４は、ステージ５を指示する、金属製の前方柱４ｂと後方柱４ｄとを有している。前方柱４ｂの一部は、ギリシャ文字のηを逆さまにしたような断面形状を有している。つまり、前方柱４ｂは、ユーザが指を挿入可能で、かつ、把持部として機能する凹部４ｃを有している。凹部４ｃは前方柱４ｂに設けられていることから、ユーザが凹部４ｃに手を入れてヘッド装置１ａを持ち上げても、ヘッド装置１ａが歪みにくい。よって、ユーザは、安定的にヘッド装置１ａを運ぶことができる。　
図３はヘッド装置１ａの電気的構成を示している。ＭＣＵ２０は、記憶装置２５に記憶されている制御プログラム２７を実行し、制御プログラム２７にしたがってヘッド装置１ａを制御するプロセッサである。なお、ＭＣＵはマイクロコントローラユニットの略称である。ＭＣＵ２０は撮像制御部２１を介してメインカメラ１１およびフロントカメラ１０を制御し、様々な画像データを取得する。撮像制御部２１は、たとえば、メインカメラ１１の露光時間などを制御する。ＭＣＵ２０は、照明制御部２２を介してリング照明装置１２、１３および同軸照明装置１４を点灯させたり、消灯させたりする。照明制御部２２は、リング照明装置１２、１３および同軸照明装置１４に供給される駆動電力を制御する。ＭＣＵ２０は、操作受付部２３を介して操作部８から入力されるユーザ入力を受け付ける。操作受付部２３は、操作部８のスイッチ部の状態を示す信号を生成する入力回路などを含む。通信回路２４は、通信ケーブル２６
を介して、図４に示されるＰＣ１ｂと通信する回路である。通信回路２４は、無線通信回路およびＬＡＮインタフェース回路を含んでもよい。ＬＡＮはローカルエリアネットワークの略称である。通信ケーブル２６は、たとえば、ＵＳＢケーブルであってもよい。記憶装置２５は、たとえば、制御プログラム２７を記憶するリードオンリメモリ（ＲＯＭ）と、ワークエリアとして利用されるランダムアクセスメモリ（ＲＡＭ）とを含む。記憶装置２５は、たとえば、ＰＣ１ｂにより設定された検査条件２８と、メインカメラ１１により取得された検査画像２９などを記憶してもよい。検査条件２８は、たとえば、照明条件や撮像条件、カウント条件などを含みうる。検査画像２９は、培地およびサンプルを含むシャーレ１５の画像である。　
調光制御部１３ｚは、ＭＣＵ２０からの命令にしたがって拡散板１３ｃの拡散度を電気的に制御する。　
図４は、ヘッド装置１ａを制御するＰＣ１ｂを示す。ＭＣＵ３０は、記憶装置３５に記憶されたプログラムを実行し、プログラムにしたがってＰＣ１ｂおよびヘッド装置１ａを制御するプロセッサである。ＭＣＵ３０は、入出力回路３１に接続されたキーボード３２およびポインティングデバイス３３からユーザの指示を受け付ける。ＭＣＵ３０は、入出力回路３１に接続されたプリンタ３８を制御し、表などを紙に印刷する。ＭＣＵ３０は、グラフィクスボードなどの表示制御部３６を介して、表示装置３７に様々な情報を表示する。通信回路３４は、通信ケーブル２６を介して、ヘッド装置１ａと通信する回路である。通信回路３４は、無線通信回路およびＬＡＮインタフェース回路を含んでもよい。記憶装置３５は、たとえば、プログラムを記憶するリードオンリメモリ（ＲＯＭ）と、ワークエリアとして利用されるランダムアクセスメモリ（ＲＡＭ）とを含む。さらに、記憶装置３５は、ハードディスクドライブ（ＨＤＤ）およびソリッドステートドライブ（ＳＳＤ）を含んでもよい。記憶装置３５は、アプリケーションプログラム３９、検査条件２８、検査画像２９、サンプルＤＢ４０およびカウント表５５などを記憶してもよい。ＤＢはデータベースの略称である。アプリケーションプログラム３９は、たとえば、サンプルＤＢ４０およびカウント表５５の作成・編集、ヘッド装置１の制御などを担当する。検査条件２８は、アプリケーションプログラム３９にしたがって、ＭＣＵ３０により設定される。検査画像２９はヘッド装置１から受信される。サンプルＤＢ４０は、カウント表５５を作成する際に参照されるデータベースである。カウント表５５は、複数のセルがアレイ状に配置された表であり、行要素と列要素とを含む。　
ＰＣ１ｂは、通信回路３４は、スマートフォンやタブレット端末などの端末装置１ｃと無線通信を実行してもよい。端末装置１ｃは、カウント表５５を表示したり、カウント表５５から作成された検査リストを表示したりしてもよい。検査リストは、シャーレ番号、サンプル名、菌種、培地、希釈倍率、培養時間などを含み、ユーザが検査個体をシャーレ１５に準備する際に参照される。　
［検査手順］　一般的な検査手順は以下のとおりである。（１）ユーザは、手書きで検査リストを作成する。検査リストは、複数の行を含み、各行は、シャーレ番号、菌種、希釈倍率、カウント数、コメント（サンプル品名など）を書き込み可能となっている。なお、ここでシャーレ番号とは、培地の種類や希釈倍率などの培養条件を特定するために予め所定のルールで割り当てられた識別情報である。（２）ユーザは、検査リストにしたがってシャーレのふたに番号を書き込むか、または、シャーレに予め書き込まれた番号を検査リストに書き込む。（３）ユーザは、検査リストに書き込まれている希釈倍率にしたがって培地を作成する。検査リストに希釈倍率が書き込まれていなければ、ユーザは、実際の希釈倍率を検査リストに書き込む。（４）ユーザは、各シャーレの培地にサンプルを投入（混釈）する。ユーザは、検査リストのコメント欄にサンプル名を書き込む。（５）ユーザは、培養器にシャーレを投入する。（６）所定時間が経過すると、ユーザは、培養器からシャーレを取り出して、コロニーの個数をカウントする。たとえば、ユーザは、シャーレの底面側からコロニーを透かし見ながら、コロニーの位置に油性ペンでカウント済みのマークを付与して行く。コロニーの個数は検査リストに書き込まれる。なお、ユーザは、目視で菌種を確かめながら、菌種ごとのコロニーの個数をカウントしてもよい。この場合、ユーザは、各シャーレについて菌種ごとのコロニーの個数を検査リストに書き込む。（７）ユーザは、ＰＣを起動し、検査リストに書き込まれている数値および文字を読み取りながら、表計算ソフトウエアに、入力する。表計算ソフトウエアのマクロ機能などを使用して、コロニーの個数が集計される。　
このように、従来の検査手順では、手書きで検査リストが作成されており、これはユーザにとって非常に面倒な作業であった。また、検査リストに書き込まれた数値等を表計算ソフトウエアのシートに転記する際に誤入力があると、集計結果も誤ってしまう可能性があった。仮に、コロニーの個数をコロニーカウンタによって自動的に取得できたとしても、依然として、従来手法では、検査リストの作成と、コロニー個数の検査リストへの書き込みと、検査リストから表計算ソフトウエアのシートへの転記は、いずれも手書きであり、誤記入および誤入力の可能性があった。　
そこで、本実施例では、ＰＣ１ｂにより電子的な検査リストを作成し、電子的な検査リストにしたがってコロニーを計数し、当該計数結果を電子的な検査リストに直接入力し、入力された個数を集計することが提案される。これにより、コロニーの計数結果についての事後処理に関するユーザの負担が軽減されるだろう。また、ユーザによる手書き、または、手入力が減少するため、誤入力も減少し、検査精度も向上するであろう。　
［検査リスト（カウント表）の作成］　図５は、ＰＣ１ｂの表示装置３７に表示されるカウントアプリケーションプログラムのＵＩ５０を示している。カウントアプリケーションプログラムは記憶装置３５に記憶されており、ＭＣＵ３０により実行される。ＵＩ５０は、カウントアプリケーションプログラムが有している複数の機能を切り替えるためのボタン、リンクまたはタブなどを有している。　
ＵＩ５０は、表作成領域５１と、ＤＢ表示領域６１とを有している。ＤＢはデータベースの略称である。表作成領域５１は、少なくともカウント表５５を表示する。タイトル表示部５２は、カウント表５５に付与されたタイトル（名称）の入力をキーボード３２から受け付けて表示する。ボタン５３は各セルのカウントの実施／非実施を切り替えるボタンである。ボタン５４は、カウント表５５に列を追加することを指示するボタンである。平均化設定部５６は、カウント結果の平均化を実行するかどうかを指示するためのチェックボックスと、平均化の対象となるカウント値の数（＝カウントの反復回数）の選択部と、を有する。　
ＤＢ表示領域６１は、予め登録されたカウント項目のひな型の一覧（例：サンプルＤＢ４０）を表示する。ここで、カウント項目とは、カウント表５５における一行に相当する。カウント項目は、通常、検査対象物の名称（サンプル名）により区別される。名称表示部６２は、予め登録されているひな型の名称（サンプル名）を表示する。インジケータ６３は、サンプル名に対して関連付けられている分類タグを視覚的に表示するオブジェクトである。分類タグとは、ユーザによって定義された分類（例：主食、総菜、デザート）を示すタグである。たとえば、インジケータ６３は、色の違いによって分類タグの違いを表現してもよい。インジケータ６３は、インジケータ６３の形状の違いによって分類タグの違いを表現してもよい。ボタン６７は、あるサンプル名に対して親子関係にある１つ以上のサブ項目を展開して表示するためのボタンである。親子関係とは、あるサンプルと、そのサンプルを構成する複数の具材との関係をいう。たとえば、サンドイッチを親とすると、サンドイッチを構成する具材（例：ハム、レタス、玉子）は子となる。ボタン６４は、対応するひな型をカウント表５５に追加することを指示するボタンである。このように予めサンプルＤＢ４０を用意しておくことで、ユーザは、カウント表５５を容易に作成できるようになる。　
図５に示された事例では、ユーザがサンドイッチに関連付けられたボタン６４を押すと、ＭＣＵ３０は、カウント表５５に一行を追加し、追加された行のＩＤ表示セルにＩＤとして"１"を表示し、追加された行においてサンプル名を表示するセルに「サンドイッチ」を表示する。ＩＤは識別情報の略称である。すなわち、ＩＤやサンプル名は行単位で設定されるものであり、「行に対する設定」である。さらに、ＭＣＵ３０は、サンプルＤＢ４０に登録されているサンドイッチの検査条件を記憶装置３５から読み出し、カウント表５５に新規の列を追加し、新規の列に、読み出した検査条件を表示する。この例では、検査条件は、菌種（例：一般生菌／大腸菌）、培地の希釈倍率、サンプルの培養時間などを含んでいる。各列は、たとえば、菌種のセル、希釈倍率のセル、培養時間のセルおよびカウント値のセルを含む。すなわち、菌種や希釈倍率、培養時間は列単位で設定されるものであり、「列に対する設定」である。この例では、まだ、検査の実行前であり、カウント値が入手されていないため、カウント値のセルには何も入力されていない。サンドイッチについての一つ目の検査項目は、一般生菌について希釈倍率として１００倍の培地を使用し、培養時間として４８時間が適用されることである。サンドイッチについての二つ目の検査項目は、一般生菌について希釈倍率として１０００倍の培地を使用し、培養時間として４８時間が適用されることである。このように、ＭＣＵ３０は、検査項目の個数に応じて列を追加する。　
図６は、ユーザがキムチに関連付けられたボタン６４を押すと、ＭＣＵ３０は、サンプルＤＢ４０に登録されているキムチの検査条件を記憶装置３５から読み出し、読み出された検査条件に対応する行と列をカウント表５５に追加する。　
この例で、キムチは、二つの検査項目を有している。キムチについての一つ目の検査項目は、一般生菌について希釈倍率として１００倍の培地を使用し、培養時間として４８時間が適用されることである。これは、サンドイッチについての一つ目の検査項目と共通している。そのため、ＭＣＵ３０は、キムチのひな型に含まれている一つ目の検査項目を破棄し、新規の列として追加しない。キムチについての二つ目の検査項目は、大腸菌について希釈倍率として１００倍の培地を使用し、培養時間として２４時間が適用されることである。ＭＣＵ３０は、これを新規の列としてカウント表５５に追加する。　
なお、サンドイッチについては大腸菌に関する検査は実行されない。そのためカウント値のセルには「非検査」を示す文字または画像が表示されてもよい。同様に、キムチについては一般生菌について希釈倍率として１０００倍の培地を使用する検査は実行されない。そのため、カウント値のセルには「非検査」を示す文字または画像が表示されてもよい。　
なお、カウントの実施・非実施はカウント反転ボタン５３の操作により実行することもできる。サンドイッチについて、大腸菌に対応するセルを選択した状態で、カウント反転ボタン５３が操作されると、ＭＣＵ３０は、「非検査」を示す文字または画像を表示するか、カウント結果を入力するために空欄とするのかを切り替えることができてもよい。　
図５および図６が示すように検索ボックス６５やタグ検索絞り込みボタン６６が追加されてもよい。サンプルＤＢ４０に登録されているひな型の個数が多くなると、ＤＢ表示領域６１は、一度にすべてのひな型を表示することができなくなる。そこで、ＭＣＵ３０は、検索ボックス６５に入力された文字に基づき記憶装置３
５から検索してひな型を抽出し、ＤＢ表示領域６１に検索結果を表示してもよい。また、タグ検索絞り込みボタン６６が押されると、ＭＣＵ３０は、指定した分類タグでフィルタされたサンプル品だけを表示してもよい。たとえば、複数のサンプル品に対して同じ分類タグが付与されていてもよい。この場合、選択された分類タグが付与されている複数のサンプル品をカウント表５５へ追加する。　
図７は、新規の行を追加する別の手順を示している。ユーザは、新規の行におけるサンプル名表示セルをポインタ５７で選択し、キーボード３２を通じてサンプル名を先頭の文字から順番に入力して行く。ＭＣＵ３０は、入力された一以上の文字でサンプルＤＢ４０を検索し、入力候補となるサンプル名を候補表示部５８に表示する。この例では、サンプル名表示セルに「ミックス」が入力されたため、ＭＣＵ３０は「ミックス」をサンプル名として含むひな型を検索し、「ミックスジュース」を発見し、候補表示部５８に「ミックスジュース」を表示する。ここで、ユーザが、ポインタ５７によって候補表示部５８に表示された「ミックスジュース」を選択すると、ＭＣＵ３０は、ミックスジュースの検査条件を記憶装置３５から読み出し、読み出された検査条件に応じて列を追加する。これにより、ミックスジュースのセルに検索条件が関連付けられることになる。　
図８は、新規にカウント表を作成する場合のＵＩ５０を示している。たとえば、ＭＣＵ３０は、アプリケーションプログラム３９と並行して表計算ソフトウエアを起動することができる。　
図９は、表計算ソフトウエアのシート７０を示している。ＭＣＵ３０は、表計算ソフトウエアにおいて選択されたシート７０またはセル群について、ＵＩ５０へのコピーペーストの指示を受け付ける。これにより、ＭＣＵ３０は、図６に示されたカウント表５５を作成してもよい。　
図１０は、すでにカウント値が入力されたカウント表８２を呼び出して新規のカウント表５５を作成する手順を説明する図である。ＭＣＵ３０は、検索ボックス６５に入力されたファイル名に対応するファイルを記憶装置３５から読み出し、そのファイルの属性を属性表示部８０に表示してもよい。ＭＣＵ３０は、表作成領域５１に、読み出されたカウント表８２を表示する。図１０が示すように、カウント値のセルにはカウント値が入力済みである。ＭＣＵ３０は、新規作成ボタン８１が押されたことを検知すると、読み出されたカウント表８２を構成しているカウント値のセルに入力されているカウント値をすべて削除し、新規のカウント表５５を作成する。図１１は、すでにカウント値が入力されたカウント表８２から作成された新規のカウント表５５を示している。カウント値を削除する代わりに、カウント値が０にリセットされてもよい。　
なお、ＭＣＵ３０は、複数のカウント表８２をマージして一つのカウント表５５を作成してもよい。この場合、ＭＣＵ３０は、複数のカウント表８２を分析し、重複する行と列を削除し、新規のカウント表５５を作成する。　
図１２は、平均化を含むカウント表５５の作成方法を説明するための図である。この例では、平均化がまだ適用されていないため、一つのサンプル名について一つの行が設けられている。この状態で平均化設定部５６がチェックされ、反復回数として「２」が選択されると、ＭＣＵ３０は、図１１に示されたＵＩ５０を表示する。図１１が示すように、反復回数が「２」であることから、ＭＣＵ３０は、各サンプル名に関連付けられたカウント値の入力行を三つの行に分割するとともに、反復回数を示す列を追加する。この例では、三つの行のうち、一つ目の行は１回目の検査で取得されたカウント値が入力されるセルを有する。二つ目の行は２回目の検査で取得されたカウント値が入力されるセルを有する。三つ目の行は１回目の検査で取得されたカウント値と、２回目の検査で取得されたカウント値との平均値が入力されるセルを有する。このように、ＭＣＵ３０は、反復回数に応じて、カウント値が入力されるセルと平均値が入力されるセルとをカウント表５５に追加してもよい。　
図１３は、複数のサンプル間の親子関係の一例を示す。この例では、サンドイッチのインジケータ６３が押されると、ＭＣＵ３０は、サンドイッチと親子関係を有する具材である「ハム」と「レタス」を選択可能にＤＢ表示領域６１に表示する。この状態で、「ハム」または「レタス」のボタン６４が押されると、ＭＣＵ３０は、「ハム」または「レタス」の検査項目を記憶装置３５から読み出し、カウント表５５に追加する。図１４は、「ハム」および「レタス」の各検査項目が記憶装置３５から読み出されて、カウント表５５に追加されたことを示す。親子関係を有するサンドイッチ、ハムおよびレタスが一括して登録されてもよい。たとえば、サンドイッチに関連付けられたボタン６４が押されると、サンドイッチ、ハムおよびレタスがカウント表５５に一括して登録されてもよい。　
図１５は、列を追加するためのダイアログ９０を示している。ＵＩ５０に設けられたボタン５４が押されると、ＭＣＵ３０は、ダイアログ９０を表示装置３７に表示する。項目名設定部９１は、列の項目名である菌種の名称の入力を受け付ける。列タイプ設定部９２は、列のタイプがカウント列であるか、または、自由列であるかの設定を受け付ける。カウント列とは、カウント値が入力されるセルを含む列である。自由列とは、備考やコメントなど、ユーザが自由にテキスト、画像、その他の情報を入力可能な列である。希釈倍率設定部９３は、希釈倍率の入力を受け付ける。培養時間設定部９４は、培養時間の入力を受け付ける。アルゴリズム設定部９５は、検査画像に適用される画像処理の設定を受け付ける。残渣除去とは、シャーレ１５などに付着した残渣（例：ゴミ、汚れ、手書き）を画像処理によって低減するモードである。迅速モードとは、迅速な結果の確認を重視したモードであり、従来よりも短い培養時間で培養されたシャーレ１５を高感度で検査するモードである。培地タイプ設定部９６は、培地の種類（例：一般生菌（白）、一般生菌（黒））などの選択を受け付ける。なお、一覧ボタン９６ａが押されると、ＭＣＵ３０は、記憶装置３５から培地タイプの候補を読み出してリストを作成して表示装置３７に表示してもよい。カウント設定部９７は、メインカメラ１１の撮影条件（例：露光時間）、照明の種類（例：明るさ、照明装置）、表示処理の種類、画像処理の種類などの設定を受け付ける。すなわち、ダイアログ９０で受け付けられた菌種、希釈倍率、培養時間、アルゴリズム設定、培地タイプ、またはカウント設定は、デフォルトの設定として列ごとに設定される。　
後述されるように、カウント設定部９７の照明ボタンを押すことで、照明の種類の選択、明るさの設定、拡散度の設定等を受け付けるＵＩが表示装置３７に表示されてもよい。　
また、記憶装置３５は、培地タイプの候補に紐づけられた複数の拡散度を記憶していてもよい。この場合、ＭＣＵ３０は、選択された培地に紐づけられた拡散度を記憶装置３５から読み出して取得することができる。　
［カウント処理］　図１６は、ＰＣ１ｂからヘッド装置１ａを制御してカウント処理を実行中にＰＣ１ｂの表示装置３７に表示されるＵＩ１００を示している。カウント表領域１０１は、ＵＩ５０を通じて編集されたカウント表５５を表示する領域である。結果領域１０２は、ヘッド装置１ａのメインカメラ１１により取得された検査画像１０３を表示する領域である。なお、検査画像１０３は、動画像であってもよいし、静止画像であってもよい。一般に、メインカメラ１１の露光時間の調整、リング照明装置１２、１３および同軸照明装置１４の明るさ、点灯すべき発光素子の選択、画像処理の選択などを実行する際は、ＭＣＵ３０は、メインカメラ１１により動画像を取得して、結果領域１０２に表示する。一方で、カウント処理を実行する際には、ＭＣＵ３０は、メインカメラ１１により静止画像を取得して、結果領域１０２に表示する。　
チェックボックス１０６は、カウント値領域１０４にカウント結果を表示するかどうかを選択するためのコントロールオブジェクトである。第一ソフトウエアボタン１０５ａは、第一ハードウエアボタン８ａと同一の機能を有するボタンである。第二ソフトウエアボタン１０５ｂは、第二ハードウエアボタン８ｂと同一の機能を有するボタンである。この例では、第一ソフトウエアボタン１０５ａには撮影の指示（撮影ボタン）が割り当てられている。第二ソフトウエアボタン１０５ｂには登録の指示（登録ボタン）が割り当てられている。図１５においては、第二ソフトウエアボタン１０５ｂが破線で示されているが、これは操作不可能であることを意味する。　
ユーザは、カウント表領域１０１に表示されたカウント表に含まれる複数のセルのうち、ステージ５にセットしたシャーレ１５に対応するセルをポインタ５７によりクリックして選択する。図１６に示すように、どのセルがユーザにより選択されたかが分かるように、ポインタ５７により選択されたセルは、強調して表示されてもよい。各セルには、予め検査条件（コロニーを二値化する際の感度、照明装置の種類、明るさなど）が関連付けられて記憶装置３５に保存されている。ＭＣＵ３０は、選択されたセルに関連付けられている検査条件を記憶装置３５から読み出して、ヘッド装置１ａに送信する。ヘッド装置１ａのＭＣＵ２０は受信された検査条件にしたがってメインカメラ１１、リング照明装置１２、１３、および同軸照明装置１４を制御し、画像を取得して、ＰＣ１ｂへ送信する。なお、別のセルが選択されると、ＭＣＵ３０は、選択されたセルに関連付けられている検査条件を記憶装置３５から読み出して、ヘッド装置１ａに送信する。ヘッド装置１ａのＭＣＵ２０は受信された検査条件にしたがってメインカメラ１１、リング照明装置１２、１３および同軸照明装置１４を制御し、画像を取得して、ＰＣ１ｂへ送信する。このように、ユーザは、セルを選択することで、検査条件を変更することができる。　
図１７は、設定タブまたは設定ボタンをポインタ５７にクリックすることで表示される検査条件の確認画面１１０を示す。これにより、ユーザは、各セルごとの検査条件を確認することができる。なお、セルをポインタ５７により右クリックすることで、確認画面１１０が表示されてもよい。確認画面１１０に表示される情報としては、たとえば、サンプル名、培地の種類、希釈倍率、培養時間、シャーレ番号、コメント、撮影設定（落射照明のオンオフ、照明装置の種類、落射照明の明るさ、透過照明の明るさ、画像処理（ハイダイナミックレンジ"ＨＤＲ"のオンオフ、リング除去のオンオフなどのカウント設定）などである。図１７において、「上リング」とはリング照明装置１２の略称である。「下リング」とはリング照明装置１３の略称である。「全射」とは同軸照明装置１４の略称である。ここで、ＭＣＵ３０は、菌種、希釈倍率、培養時間、アルゴリズム設定、培地タイプ、または撮影設定（カウント設定）について、図１５に示すダイアログ９０上で、列単位で、デフォルト値を設定するが、図１７の確認画面１１０上で、各セルに対して個別に設定してもよい。　
確認画面１１０は、拡散度を選択するためのプルダウンリスト、チェックボックスまたはラジオボタンを有していてもよい。あるいは、ＭＣＵ３０は、確認画面１１０で選択された培地の種類に紐づけられている拡散度を記憶装置３５から読み出してセルに関連づけてもよい。確認画面１１０において拡散度が変更されると、ＭＣＵ３０は変更後の拡散度を調光制御部１３ｚに設定し、調光制御部１３ｚに拡散板１３ｃの拡散を変更される。変更後の拡散度で拡散された検査光は検査個体に照射され、メインカメラ１１により撮像される。メインカメラ１１により生成された検査画像１０３は、結果領域１０２に表示される。これにより、ユーザは、検査画像１０３を観察しながら、どの拡散度が適切かを判断できる。　
　なお、セルに対してダブルクリックなどの特定の入力を受け付けることで、当該セルに対応する設定を一覧表示した確認画面１１０がＵＩ１００上に重畳して表示されてもよい。また、ポインタ５７によりセルが選択されると、ＭＣＵ３０は、当該セルに対応する設定をＵＩ１００上に表示するようにしてもよい。　
図１８は、撮影ボタンである第一ソフトウエアボタン１０５ａまたは第一ハードウエアボタン８ａが押されると、ＭＣＵ３０が表示装置３７に表示するＵＩ１００を示している。結果領域１０２には、シャーレ１５の画像１０３（静止画像）が表示される。ＭＣＵ３０は、第一ソフトウエアボタン１０５ａを撮影ボタンからカウントを指示するボタン（カウントボタン）に割り当てる。　
図１９は、カウントボタンである第一ソフトウエアボタン１０５ａまたは第一ハードウエアボタン８ａが押されると、ＭＣＵ３０が表示装置３７に表示するＵＩ１００を示している。カウントボタンが押されると、ＭＣＵ３０は、ヘッド装置１ａにコロニーのカウントを指示する。ヘッド装置１ａのＭＣＵ２０はカウント指示にしたがってコロニーをカウントし、カウント値をＰＣ１ｂへ送信する。なお、カウント処理はＭＣＵ３０により実行されてもよい。ＭＣＵ３０は、カウント値をカウント値領域１０４に表示する。この際には、ＭＣＵ３０は、カウント値をＣＦＵ／ｍＬ（単位体積（ミリリットル）あたりのコロニーの個数）に変換してカウント値領域１０４に表示してもよい。たとえば、カウント値領域１０４をポインタ５７でクリックするごとに、ＭＣＵ３０は、カウント値のみ、ＣＦＵ／ｍＬのみ、カウント値＋ＣＦＵ／ｍＬと順番に表示を切り替えてもよい。なお、ＣＦＵはコロニー形成単位の略称である。また、カウント値が取得されると、ＭＣＵ３０は、第一ソフトウエアボタン１０５ａをカウントボタンから撮影ボタンに割り当て直す。さらに、ＭＣＵ３０は、登録ボタンに割り当てられている第二ソフトウエアボタン１０５ｂおよび第二ハードウエアボタン８ｂを操作不可能状態から操作可能状態に変更する。　
図２０は、登録ボタンが押された状態を示している。ＭＣＵ３０は、現在選択中のセルに対してカウント値を書き込み、次のセルを選択中（注目セル）に変更してもよい。この例では、１行目のセルから２行目のセルに注目セル（アクティブセル）が変更されている。このように、ＭＣＵ３０が自動的に次のセルを選択することで、ユーザの負担が軽減される。なお、ＭＣＵ３０は、登録ボタンに割り当てられている第二ソフトウエアボタン１０５ｂおよび第二ハードウエアボタン８ｂを操作可能状態から操作不可能状態に戻す。　
図２０に示されているＵＩ１００は、セルの表示対象の変更メニュー１０９を有している。図２０では、変更メニュー１０９において「カウント数」が選択されているため、セルには、「１００」が表示されている。　
図２１が示すように、ユーザが変更メニュー１０９において「ＣＦＵ／ｍＬ」を選択すると、ＭＣＵ３０は、セルの表示対象を「カウント数」から「ＣＦＵ／ｍＬ」に変更する。これにより、ユーザは容易にセルの表示対象を切り替えることができる。　
図２２が示すように、ユーザが変更メニュー１０９において「コメント」を選択すると、ＭＣＵ３０は、セルの表示対象を「コメント」に変更する。これにより、ユーザは容易にセルの表示対象をコメントに切り替えることができる。また、このＵＩ１００においても、ユーザは、図２２に示すように「コンタミ発生」などのコメントを直接入力できる。ここで、コメントとは、カウント表の一行に含まれる備考などである。　
図２３は、カウント値が入力済みであるセルをダブルクリックされると、ＭＣＵ３０が表示装置３７に表示するＵＩ１００を示している。設定画面１２０は、ダブルクリックにより選択されたセルに関連付けられている検査条件のうちコロニーの検出アルゴリズムに関するパラメータを調整するためのコントロールオブジェクトを含む。スライドバー１２１は、たとえば、小粒子を画像処理により除去するための閾値を設定するためのコントロールオブジェクトである。スライドバー１２２は、コロニーの検出感度を調整するためのコントロールオブジェクトである。　
ＭＣＵ３０は、結果領域１０２に表示された画像１０３において、コロニーとして検出された部分にサークルなどのマークを重畳表示してもよい。スライドバー１２１、１２２の調整に応じて、ＭＣＵ３０がアルゴリズムを変更するため、コロニーを示すマークの位置と個数も変化する。これにより、ユーザは、適切な調整量を見出しやすくなるであろう。　
［ボタンの割り当て］　図２４は、第一ハードウエアボタン８ａ（第一ソフトウエアボタン１０５ａ）と、第二ハードウエアボタン８ｂ（第二ソフトウエアボタン１０５ｂ）に割り当てられる機能の一例を示している。　
カウント表の状態が「カウント表が表示されている」状態であり、画像１０３が動画像であり、かつ、アクティブセルの状態がカウント値未入力であれば、第一ハードウエアボタン８ａ（第一ソフトウエアボタン１０５ａ）にはカウントボタンが割り当てられ、第二ハードウエアボタン８ｂ（第二ソフトウエアボタン１０５ｂ）には登録ボタン（操作不可能）が割り当てられる。　
カウント表の状態が「カウント表が表示されている」状態であり、画像１０３が動画像であり、かつ、アクティブセルの状態がカウント値入力済みであれば、第一ハードウエアボタン８ａ（第一ソフトウエアボタン１０５ａ）にはカウントボタンが割り当てられ、第二ハードウエアボタン８ｂ（第二ソフトウエアボタン１０５ｂ）には登録ボタン（操作不可能）が割り当てられる。　
カウント表の状態が「カウント表が表示されている」状態であり、画像１０３が静止画像であり、かつ、アクティブセルの状態がカウント値未入力であれば、第一ハードウエアボタン８ａ（第一ソフトウエアボタン１０５ａ）には撮影ボタンが割り当てられ、第二ハードウエアボタン８ｂ（第二ソフトウエアボタン１０５ｂ）には登録ボタン（操作可能）が割り当てられる。なお、撮影ボタンは、撮りなおしボタンと呼ばれてもよい。　
カウント表の状態が「カウント表が表示されている」状態であり、画像１０３が静止画像であり、かつ、アクティブセルの状態がカウント値入力済みであれば、第一ハードウエアボタン８ａ（第一ソフトウエアボタン１０５ａ）には撮影ボタンが割り当てられ、第二ハードウエアボタン８ｂ（第二ソフトウエアボタン１０５ｂ）には登録ボタン（操作不可能）が割り当てられる。　
カウント表の状態が「カウント表が表示されていない」状態であり、画像１０３が動画像であり、かつ、アクティブセルの状態がカウント値未入力であれば、第一ハードウエアボタン８ａ（第一ソフトウエアボタン１０５ａ）にはカウントボタンが割り当てられ、第二ハードウエアボタン８ｂ（第二ソフトウエアボタン１０５ｂ）には登録ボタン（操作不可能）が割り当てられる。　
カウント表の状態が「カウント表が表示されていない」状態であり、画像１０３が動画像であり、かつ、アクティブセルの状態がカウント値入力済みであれば、第一ハードウエアボタン８ａ（第一ソフトウエアボタン１０５ａ）にはカウントボタンが割り当てられ、第二ハードウエアボタン８ｂ（第二ソフトウエアボタン１０５ｂ）には登録ボタン（操作不可能）が割り当てられる。　
カウント表の状態が「カウント表が表示されていない」状態であり、画像１０３が静止画像であり、かつ、アクティブセルの状態がカウント値未入力であれば、第一ハードウエアボタン８ａ（第一ソフトウエアボタン１０５ａ）には撮影ボタンが割り当てられ、第二ハードウエアボタン８ｂ（第二ソフトウエアボタン１０５ｂ）には登録ボタン（操作可能）が割り当てられる。　
カウント表の状態が「カウント表が表示されていない」状態であり、画像１０３が静止画像であり、かつ、アクティブセルの状態がカウント値入力済みであれば、第一ハードウエアボタン８ａ（第一ソフトウエアボタン１０５ａ）には撮影ボタンが割り当てられ、第二ハードウエアボタン８ｂ（第二ソフトウエアボタン１０５ｂ）には再登録ボタン（操作可能）が割り当てられる。　
図１７や図２３が示すように、カウント表の状態が「カウント表が表示されていない」状態では、カウント表に代えて、検査条件を変更可能なＵＩが表示されている。したがって、検査条件が変更されると、カウント値も変化するため、ユーザには、変化後のカウント値をアクティブセルに書き込む（再登録）するかどうかをＭＣＵ３０が問い合わせることになる。　
「カウント表が表示されていない」状態は、カウント結果が入力されたカウント表が表示され、かつ、カウント結果を再編集可能な状態であってもよい。図２５は、再編集のための編集タブ１２４が設けられたＵＩ１００を示している。図２４に表示された「カウント表が表示されていない」状態は、カウント結果が入力されたカウント表が表示され、かつ、編集タブ１２４がクリックされた状態であってもよい。図２５において検査条件タブ１２３は、図１７に示された検査条件の確認画面１１０を表示するためのタブである。上述されたように、確認画面１１０において照明やメインカメラ１１の設定が変更可能となっている。　
このように結果領域１０２に動画像が表示されているときにカウントボタンが押されると、動画像が静止画像に変更され、カウント結果が表示され、登録ボタンが操作可能となる。静止画像が表示されているときに登録ボタンが押されると、カウント結果がアクティブセルに書き込まれ、結果領域１０２は動画像を表示する状態に戻る。一度登録されたカウント結果が変更され、再登録ボタンが押されると、変更されたカウント結果がカウント表に上書きされ、結果領域１０２は動画像を表示する状態に戻る。結果領域１０２が静止画像を表示しているときに、撮影ボタン（撮りなおしボタン）が押されると、結果領域１０２は動画像を表示する状態に戻る。　
［カウント表の特定方法］　ユーザは、シャーレ１５で菌を培養したり、コロニーをカウントしたりする際にカウント表を見ることになる。ここで、カウント表を作成された日と、カウント表を目視して準備作業およびカウント作業を実行する日と、が異なっている場合がある。この場合、ユーザは、所望のカウント表を記憶装置３５から読み出して表示装置３７に表示させる必要がある。　
図２６は、カウント表などのファイルを呼び出すファイルＵＩ２００を示している。ボタン２１０は、呼び出す対象としてカウント表を指定するためのボタンである。ファイルリスト２１１は、記憶装置３５に記憶されたファイルを一覧２１２として表示する領域である。ボタン２１０が押されると、ＭＣＵ３０は、複数のファイルのうちカウント表に特有の拡張子を有するファイルのみをファイルリスト２１１に表示する。一覧２１２は、ＩＤ（通し番号）、タイトル、最終更新日、カウントが済んでいるかどうか、その他の情報を含む。　
検索ボックス２１３は、一覧２１２に含まれる複数のファイルからさらに所望のファイルを検索するためのキーワードを入力されるボックスである。ボタン２１４は、カウント表を紙に印刷することで作成された検査リストに付与されている識別画像を読み取るためにフロントカメラ１０を起動することを指示するためのボタンである。開くボタン２１５は、一覧２１２から選択されたカウント表を開くことを指示するボタンである。　
図２７は、検査リスト２２０を示している。ＭＣＵ３０は検査リスト２２０をプリンタ３８から出力してもよいし、端末装置１ｃの表示装置に出力してもよい。検査リスト２２０は、対応するカウント表５５から作成されたリストである。カウント表５５における情報の並ぶ順序と検査リスト２２０における情報の並ぶ順序とは異なっていてもよいし、一致
していてもよい。検査リスト２２０は、表示装置３７に表示されるカウント表５５と同じであってもよい。また、検査リスト２２０にはカウント結果を記入する必要が無いため、カウント結果を記入するためのセルが省略されていてもよい。さらに、ユーザが検査リスト２２０を培養サンプルの準備に用いる場合、培養時間は必ずしも必要ではない。そのため、培養時間のセルが省略されていてもよい。検査リスト２２０は、各カウント表を識別するための識別情報として一次元シンボルや二次元シンボルなどの識別画像２２１を付与されていてもよい。識別画像２２１は、ユーザの識別情報を含んでいてもよい。　
図２６に示されたボタン２１４が押されると、ＭＣＵ３０は、ヘッド装置１ａにフロントカメラ１０の起動を指示する。ヘッド装置１ａのＭＣＵ２０は、フロントカメラ１０を起動し、識別画像２２１の読み取りを試行する。識別画像２２１は単にシンボルと呼ばれてもよい。この際にユーザは、フロントカメラ１０に識別画像２２１を読み取らせるよう、検査リスト２２０の位置をフロントカメラ１０に対して合わせる。ＭＣＵ２０は、識別画像２２１の読取に成功すると、識別画像２２１から識別情報を復号（デコード）して、ＰＣ１ｂへ送信する。ＭＣＵ３０は、ヘッド装置１ａから受信された識別情報に関連付けられているカウント表を記憶装置３５から読み出す。　
図２８は、ユーザが身に着けるユーザ認証札２３０を示している。データインテグリティ規制のために、ヘッド装置１ａを使用するユーザに種々の制限が課されることがある。たとえば、米国のＦＤＡ（食品医薬品局）の規則である２１ ＣＦＲ Ｐａｒｔ１１によれば、ユーザは、物理的および論理的に管理されることが求められている。たとえば、ヘッド装置１ａおよびＰＣ１ｂについてもユーザごとに使用可能な機能を制限するために、ユーザ認証札２３０が利用されてもよい。ユーザは、フロントカメラ１０によりユーザ認証札２３０の識別画像２２１を読み取らせることで、ＭＣＵ２０またはＭＣＵ３０がユーザ認証を実行してもよい。つまり、識別画像２２１は、ユーザ名とパスワードなどのアカウント情報を示すシンボルを含んでいてもよい。ただし、ユーザ名とパスワードは暗号化された上で、識別画像２２１となっている。　
ユーザごとの機能制限としては、次のようなものが考えられる。一例として、ユーザは、管理者、リーダー、および作業者に分かれている。管理者は、ユーザを追加したり、各ユーザの権限を設定したりすることができる。リーダーは、カウント表を作成でき、カウントを実行でき、カウント結果を保存でき、カウント結果を編集でき、カウント結果を出力（印刷、送信）できる。作業者は、カウントを実行でき、カウント結果を保存できる。ＭＣＵ２０およびＭＣＵ３０は、識別画像２２１から特定されたユーザの権限に応じて、そのユーザが実行できる機能を制限してもよい。　
ここで、フロントカメラ１０により識別画像２２１が読み取られているが、メインカメラ１１により識別画像２２１が読み取られてもよい。　
図４１が示すように、フロントカメラ１０およびメインカメラ１１は、シャーレ１５に貼付されたシール２７０に印刷されているシャーレ番号や識別画像２２１を撮像して読み取ってもよい。識別画像２２１には、カウント表５５の識別情報、サンプル名、カウント結果が格納されるセルを示す固有の識別情報などが符号化されていてもよい。つまり、識別画像２２１を読み取ることで、ＭＣＵ３０は、カウント表５５、サンプル名、シャーレ１５、検査条件を特定することができる。さらに、ＭＣＵ３０は、特定された検査条件をヘッド装置１ａに送信し、ヘッド装置１ａのＭＣＵ２０は受信された検査条件にしたがってメインカメラ１１、リング照明装置１２、１３、および同軸照明装置１４を制御し、画像を取得できる。　
［フロントカメラの他の応用例］　（１）セルへのテキスト入力　図２９はボタン５４を押すことで備考として利用される新規の列が追加されたカウント表５５を示している。新規の列は、自由列として定義されており、文字や数字だけでなく、画像などを保持することができる。　
図３０は、自由列のセルをポインタ５７で右クリックされると表示される編集画面２４０を示している。この例では、セルに対するテキスト「商品番号：」が入力済みであり、それに続くテキストを入力するためのダイアログ２４１が表示されている。ダイアログ２４１は、編集画面２４０のテキストボックス内をポインタ５７で右クリックすることで表示される。ダイアログ２４１は、フロントカメラ１０を利用することで商品等からコードを読み取り、読取結果をセルに入力するための複数の選択肢を含む。この例では、選択肢として、フロントカメラ１０によるコードの読み取りが含まれる。たとえば、「コード読み取り（一次元シンボル）」がポインタ５７により選択され、読み取りボタン２４２が押されると、ＭＣＵ３０は、ヘッド装置１ａに対して一次元シンボルの読み取りを指示する。　
図３１は、読み取りボタン２４２が押されると、表示装置３７に表示される読取画面２５０を示している。チェックボックス２５１は、ＭＣＵ２０がコードの認識に成功したときにＭＣＵ３０が読取画面２５０を自動的に閉じることを指示するためのチェックボックスである。画像領域２５２は、フロントカメラ１０により取得された動画像または静止画像を表示する。読取結果領域２５３は、一次元シンボルや二次元シンボルから復号されたテキストを表示する領域である。　
ヘッド装置１ａのＭＣＵ２０はフロントカメラ１０を起動し、一次元コードを読み取らせ、一次元コードからテキストを復号し、復号されたテキストをＰＣ１ｂへ送信する。ユーザは読取結果領域２５３に表示されたテキストを確認し、ＯＫボタン２５４またはキャンセルボタン２５５を押す。ＯＫボタン２５４が押されると、ＭＣＵ３０は、読取画面２５０を閉じて編集画面２４０に戻り、ヘッド装置１ａから受信されたテキストをセルに挿入する。キャンセルボタン２５５が押されると、ヘッド装置１ａから受信されたテキストを破棄し、読取画面２５０を閉じて、編集画面２４０に戻る。　
図３２は、テキストを挿入された編集画面２４０を示す。ここで、ＯＫボタン２５４が押されると、ＭＣＵ３０は、編集画面２４０を閉じ、図２９に示されたＵＩ５０を表示装置３７に表示する。　
（２）セルへの画像入力　図３３は、カウント表の一部、またはカウント表から作成されたカウントレポート２６０の一例を示している。カウント表５５に含まれる自由列のセルには画像データを関連付けることができる。ＭＣＵ３０は、ヘッド装置１ａのメインカメラ１１を制御してシャーレ１５の画像（シャーレ画像）を取得し、取得したシャーレ画像をセルに関連付ける。あるいは、ＭＣＵ３０は、ヘッド装置１ａのフロントカメラ１０を制御してシャーレ１５の画像（シャーレ画像）を取得し、取得したシャーレ画像をセルに関連付けてもよい。同様に、ＭＣＵ３０は、ヘッド装置１ａのフロントカメラ１０を制御して商品の外観画像を取得し、取得した外観画像をセルに関連付けてもよい。さらに、ＭＣＵ３０は、ヘッド装置１ａのフロントカメラ１０を制御して商品に付与されているバーコードを読み取って復号させ、復号された商品番号等をセルに入力してもよい。ＭＣＵ３０は、プリンタ３８を制御し、カウントレポート２６０を紙に印刷してもよい。　
ここでは、フロントカメラ１０により様々な画像が取得されているが、メインカメラ１１により様々な画像が取得されて、セルに関連付けられてもよい。　
［フローチャート］　（１）ＰＣ１ｂの主な処理　図３４は、ＰＣ１ｂのＭＣＵ３０により実行される一連の処理を示すフローチャートである。ＭＣＵ３０は、記憶装置３５に記憶されたカウントアプリケーションプログラムにしたがって以下の処理を実行する。　
Ｓ１でＭＣＵ３０はカウント表の編集を実行する。図５から図１５などを用いて説明されたように、ＵＩ５０などを通じてカウント表が編集または作成される。　
Ｓ２でＭＣＵ３０はカウント表を記憶装置３５に保存する。　
Ｓ３でＭＣＵ３０はカウント表を特定する。カウント表の特定は、フロントカメラ１０と検査リスト２２０またはユーザ認証札２３０を用いて実行されたり、図２６に示されたファイルＵＩ２００を使用して実行されたりしてもよい。　
Ｓ４でＭＣＵ３０は特定されたカウント表を記憶装置３５から読み出す。これにより、図１６に示されたＵＩ１００が表示装置３７に表示される。　
Ｓ５でＭＣＵ３０はカウント値を書き込まれるセルを特定する。最初は、カウント表において最も上に位置する行のセルが選択されてもよいし、ポインタ５７によりクリックされたセルが選択されてもよい。　
Ｓ６でＭＣＵ３０はアクティブセルに関連付けられている検査条件を特定する。たとえば、ＭＣＵ３０は、カウント表の作成の際に各セルに対し関連付けられた検査条件を記憶装置３５から読み出す。　
Ｓ７でＭＣＵ３０は、アクティブセルに関連付けられている検査条件をヘッド装置１ａに設定する。上述されたように、メインカメラ１１の感度、点灯すべき照明装置、明るさ、点灯すべき発光素子の数（照射方向）、画像処理（ＨＤＲ、リング除去）、カウントアルゴリズム（閾値などのパラメータ）などをヘッド装置１ａに送信する。　
Ｓ８でＭＣＵ３０は検査条件が変更されたかどうかを判定する。上述されたように、セルに関連付けられた検査条件は検査中においても随時変更可能である。よって、検査条件が変更されると、ＭＣＵ３０は、Ｓ７に戻り、変更後の検査条件をヘッド装置１ａに送信する。検査条件が変更されていなければ、ＭＣＵ３０は、Ｓ９に進む。　
Ｓ９でＭＣＵ３０は、ユーザにより撮影指示が入力されたかどうかを判定する。ユーザは、ヘッド装置１ａの第一ハードウエアボタン８ａまたはＵＩ１００の第一ソフトウエアボタン１０５ａを押すことで撮影を指示することができる。撮影指示が入力されていなければ、ＭＣＵ３０はＳ９からＳ８に戻る。撮影指示が入力されると、ＭＣＵ３０は、Ｓ９からＳ１０に進む。　
Ｓ１０でＭＣＵ３０は、ヘッド装置１ａに対して撮像指示を送信する。　
Ｓ１１でＭＣＵ３０は、ヘッド装置１ａからメインカメラ１１により取得されたシャーレ画像１０３の画像（検査画像）を取得し、ＵＩ１００の結果領域１０２に検査画像を表示する。　
Ｓ１２でＭＣＵ３０は、カウント指示が入力されたかどうかを判定する。ユーザは、カウントボタンとして割当たられたヘッド装置１ａの第一ハードウエアボタン８ａまたはＵＩ１００の第一ソフトウエアボタン１０５ａを押すことで、カウント指示を入力できる。カウント指示が入力されていなければ、ＭＣＵ３０は、Ｓ１２からＳ８に戻る。カウント指示が入力されると、ＭＣＵ３０は、Ｓ１２からＳ１３に進む。　
Ｓ１３でＭＣＵ３０は、カウント指示をヘッド装置１ａへ送信する。なお、カウント処理がＰＣ１ｂにより実行される場合、ＭＣＵ３０がＭＣＵ２０の代わりにカウント処理を実行する。　
Ｓ１４でＭＣＵ３０は、ヘッド装置１ａからカウント結果を受信し、カウント結果をカウント値領域１０４に表示する。なお、Ｓ１４でＭＣＵ３０がカウント処理を実行する場合、ＭＣＵ３０はカウント処理を実行することで得られたカウント結果をカウント値領域１０４に表示する。　
Ｓ１５で、ＭＣＵ３０は、画像処理、カウントアルゴリズム等の検査条件が変更されたかどうかを判定する。検査条件が変更されると、Ｓ１３に戻る。検査条件が変更されていなければ、ＭＣＵ３０はＳ１６に進む。なお、Ｓ８の検査条件の変更は画像の再取得が必要になるような検査条件の変更が想定されている。Ｓ１５の検査条件の変更は取得された画像に対する画像処理の変更
をもたらすが、画像の再取得は不要なものが想定されている。　
Ｓ１６でＭＣＵ３０は、ユーザにより登録指示が入力されたかどうかを判定する。ユーザは、登録ボタンとして割当たられたヘッド装置１ａの第二ハードウエアボタン８ｂまたはＵＩ１００の第二ソフトウエアボタン１０５ｂを押すことで、登録指示を入力できる。登録指示が入力されていなければ、ＭＣＵ３０は、Ｓ１６からＳ８に戻り、撮りなおしを実行したり、検査条件を変更したりする。登録指示が入力されると、ＭＣＵ３０は、Ｓ１６からＳ１７に進む。　
Ｓ１７でＭＣＵ３０は、カウント結果をアクティブセルに登録する。　
Ｓ１８でＭＣＵ３０は、カウントがすべて終了したかどうかを判定する。たとえば、カウント表に存在するすべてのセルにカウント結果が入力されていれば、ＭＣＵ３０は、カウント終了と判定する。まだ、未入力のセルが存在している場合、ＭＣＵ３０は、Ｓ１８からＳ５に進み、アクティブセルを次のセルに変更する（セルの特定）。　
（２）ヘッド装置１ａの主な処理　図３５は、ヘッド装置１ａのＭＣＵ２０が制御プログラムにしたがって実行する一連の処理を示す。　
Ｓ２１でＭＣＵ２０は、フロントカメラ１０に対する撮影の指示を受信したかどうかを判定する。上述されたように検査リスト２２０の識別画像２２１を読み取る場合、フロントカメラ１０に対する撮影の指示（コードを読み取り指示）がＰＣ１ｂからヘッド装置１ａへ入力される。フロントカメラ１０に対する撮影の指示が入力されていなければ、ＭＣＵ２０は、Ｓ２１からＳ２３に進む。フロントカメラ１０に対する撮影の指示が入力されると、ＭＣＵ２０は、Ｓ２１からＳ２２に進む。　
Ｓ２２でＭＣＵ２０は、フロントカメラ１０を起動して画像（フロントカメラ画像）を取得し、フロントカメラ画像またはシンボルのデコード結果をＰＣ１ｂへ送信する。　
Ｓ２３でＭＣＵ２０は、ＰＣ１ｂから検査条件を受信し、記憶装置２５に保存する。　
Ｓ２４でＭＣＵ２０は、検査条件を各部に設定する。検査条件のうち感度は撮像制御部２１に設定される。点灯すべき照明装置、明るさ、照明方向などは照明制御部２２に設定される。　
Ｓ２５でＭＣＵ２０は、ＰＣ１ｂから検査条件の変更指示が受信されたかどうかを判定する。変更指示は、新しい検査条件とともに受信される。検査条件の変更指示が受信されると、ＭＣＵ２０は、Ｓ２４に戻り、新しい検査条件を設定する。変更指示が受信されていなければ、ＭＣＵ２０は、Ｓ２５からＳ２６に進む。　
Ｓ２６でＭＣＵ２０は、ＰＣ１ｂから撮像指示が受信されたかどうかを判定する。撮像指示が入力されていなければ、ＭＣＵ２０は、Ｓ２６からＳ２５に戻る。撮像指示が入力されると、ＭＣＵ２０は、Ｓ２６からＳ２７に進む。　
Ｓ２７でＭＣＵ２０は、メインカメラ１１を起動して検査画像を取得し、検査画像をＰＣ１ｂへ送信する。　
Ｓ２８でＭＣＵ２０は、ヘッド装置１ａからカウント指示が入力されたかどうかを判定する。カウント指示が入力されていなければ、ＭＣＵ２０は、Ｓ２８からＳ２５に戻る。カウント指示が入力されると、ＭＣＵ２０は、Ｓ２８からＳ２９に進む。　
Ｓ２９でＭＣＵ２０は、検査条件にしたがってコロニーのカウントを実行する。　
Ｓ３０でＭＣＵ２０は、カウント結果をＰＣ１ｂへ送信する。　
Ｓ３１でＭＣＵ２０は、カウント終了指示を受信したかどうかを判定する。カウント終了指示が受信されると、ＭＣＵ２０は、カウントを終了する。カウント終了指示が受信されていなければ、ＭＣＵ２０は、Ｓ３１からＳ２３に戻り、次のセルについての検査条件を受信する。　
（３）サンプルデータベースの登録　カウント表は複数の行および列を有し、さらに各セルには検査条件が関連付けられている。カウント表や検査リストは、日ごとに作り替えられることがある。ただし、同一のサンプルについて毎日検査が実行されることもある。したがって、検査頻度の多いサンプルについては、サンプルＤＢ４０に予め登録しておくことで、カウント表の作成処理の負担が軽減される。そこで、サンプル表を作成したときに、ユーザは、各サンプルに対応する行要素をサンプルＤＢ４０に登録してもよい。　
図３６は、ＰＣ１ｂのＭＣＵ３０により実行されるサンプルＤＢ４０の編集処理を示すフローチャートである。ＭＣＵ３０は、記憶装置３５に記憶されたアプリケーションプログラム３９にしたがって以下の処理を実行する。　
Ｓ４１でＭＣＵ３０は、カウント表に含まれる複数の行要素のうちサンプルＤＢ４０に登録したい行要素の選択を受け付ける。たとえば、ＭＣＵ３０は、サンプル表に含まれる行要素のうちいずれかの行要素に対するポインタ５７によるクリックを受け付けてもよい。　
Ｓ４２でＭＣＵ３０は、選択された行要素の追加指示を受け付ける。たとえば、行要素が選択された状態でポインタ５７により右クリックが実行されると、追加指示が入力されてもよい。　
Ｓ４３でＭＣＵ３０は、追加指示された行要素のサンプル名を取得し、同一のサンプル名がすでにサンプルＤＢ４０に登録済みであるかどうかを判定する（重複判定）。追加指示された行要素が既に存在しなければ、ＭＣＵ３０は、Ｓ４３からＳ４５に進む。追加指示された行要素がサンプルＤＢ４０に存在すれば、ＭＣＵ３０は、Ｓ４３からＳ４４に進む。　
Ｓ４４でＭＣＵ３０は、サンプルＤＢ４０に行要素を上書きするかどうかをユーザに問い合わせる。キャンセル指示が入力されると、ＭＣＵ３０は、行要素の追加をキャンセルする。上書き指示が入力されると、ＭＣＵ３０は、Ｓ４４からＳ４５に進む。　
Ｓ４５でＭＣＵ３０は、追加対象の行要素を構成している項目名（例：サンプル名、菌種、培地タイプ、希釈倍率）を取得する。　
Ｓ４６でＭＣＵ３０は、行要素のセルに関連付けられている検査条件を記憶装置３５から取得する。　
Ｓ４７でＭＣＵ３０は、項目名と検査条件をサンプルＤＢ４０に登録する。　
Ｓ４８でＭＣＵ３０は、ＵＩ５０におけるサンプルＤＢ４０の表示を更新する。　
（４）カウント表の編集　図３７は、ＰＣ１ｂのＭＣＵ３０により実行されるカウント表の編集処理を示すフローチャートである。ＭＣＵ３０は、記憶装置３５に記憶されたカウントアプリケーションプログラムにしたがって以下の処理を実行する。　
Ｓ５１でＭＣＵ３０は、カウント表において新しく行要素を追加される位置（セルまたは行）を特定する。たとえば、ＭＣＵ３０は、カウント表においてサンプル名が入力済みである最終行の次の行を選択する。なお、ある行と別の行との間に新たな行が選択されてもよい。たとえば、カウント表においてサンプル名が入力済みである行が選択され、ポインタ５７による右クリックが実行されると、選択された行の次に空行が追加される。　
Ｓ５２でＭＣＵ３０は、サンプルＤＢ４０から行の追加が指示されたかどうかを判定する。たとえば、ＵＩ５０のボタン６４が押されると、ＭＣＵ３０は、サンプルＤＢ４０から行の追加が指示されたと認識する。サンプルＤＢ４０から行の追加が指示されると、ＭＣＵ３０は、Ｓ５３に進む。サンプルＤＢ４０から行の追加が指示されていなければ、ＭＣＵ３０は、Ｓ６１に進む。　
Ｓ５３でＭＣＵ３０は、追加指示された行の項目名をサンプルＤＢ４０から取得する。　
Ｓ５４でＭＣＵ３０は、追加指示された行の検査条件をサンプルＤＢ４０から取得する。　
Ｓ５５でＭＣＵ３０は、取得された項目名と検査条件とをカウント表に貼り付ける。つまり、ＭＣＵ３０は新規の行要素をカウント表に追加する。なお、ＭＣＵ３０は、サンプルＤＢ４０に保持されている複数の行要素のうちユーザにより指定された行要素が新規のカウント表に含まれているか否かを判定してもよい。さらに、ユーザにより指定された行要素が新規のカウント表に含まれていないと判定された場合、ＭＣＵ３０は、ユーザにより指定された行要素が新規のカウント表に含まれていない列要素のセルを含むか否かを判定してもよい。ユーザにより指定された行要素が新規のカウント表に含まれていない列要素のセルを含むと判定された場合、ＭＣＵ３０は、当該列要素を新規のカウント表に追加する。つまり、すでにカウント表に存在する他のサンプル名を付与された行要素にも列要素が追加されることになる。　
Ｓ５６でＭＣＵ３０は、編集完了かどうかを判定する。ユーザにより編集完了が指示されると、ＭＣＵ３０は、カウント表を記憶装置３５に保存する。ユーザにより編集完了が指示されなければ、ＭＣＵ３０は、Ｓ５６からＳ５１に戻る。　
サンプルＤＢ４０を利用せずに新規に行が追加される場合、Ｓ６１でＭＣＵ３０は、キーボード３２やポインティングデバイス３３を通じた項目名の入力を受け付ける。　
Ｓ６２でＭＣＵ３０は、キーボード３２やポインティングデバイス３３を通じた検査条件の入力を受け付ける。　
Ｓ６３でＭＣＵ３０は、取得された項目名と検査条件とをカウント表に書き込む。その後、ＭＣＵ３０は、Ｓ５６に進む。　
（５）カウント表の特定　図３８は、ＰＣ１ｂのＭＣＵ３０により実行されるカウント表の特定処理を示すフローチャートである。ＭＣＵ３０は、記憶装置３５に記憶されたカウントアプリケーションプログラムにしたがって以下の処理を実行する。　
Ｓ７１でＭＣＵ３０は、フロントカメラ１０の起動指示が入力されたどうかを判定する。たとえば、図２６に示されたファイルＵＩ２００のボタン２１４がクリックされると、ＭＣＵ３０は、起動指示が入力されたと判定し、Ｓ７２に進む。　
Ｓ７２でＭＣＵ３０は、フロントカメラ１０の起動指示をヘッド装置１ａへ送信する。　
Ｓ７３でＭＣＵ３０は、ヘッド装置１ａにおいて識別画像２２１の読取が成功するのを待つ。　
Ｓ７４でＭＣＵ３０は、ヘッド装置１ａにおいて識別画像２２１からデコードされた識別情報を取得する。　
Ｓ７５でＭＣＵ３０は、記憶装置３５において、識別情報に対応するカウント表を検索する。　
Ｓ７６でＭＣＵ３０は、識別情報に対応するカウント表が発見されたかどうかを判定する。カウント表が存在しない場合、ＭＣＵ３０は、Ｓ７１に戻る。カウント表が存在した場合、ＭＣＵ３０は、Ｓ７７に進む。　
Ｓ７７でＭＣＵ３０は、カウント表を記憶装置３５から読み出し、ＵＩ１００にセットする。　
Ｓ７１で起動指示が入力されていなければ、ＭＣＵ３０は、Ｓ７８に進む。Ｓ７８でＭＣＵ３０は、カウント表の検索画面を表示装置３７に表示する。Ｓ７９でＭＣＵ３０は、カウント表の選択を受け付ける。たとえば、図２６に示されたファイルＵＩ２００においていずれかカウント表が選択されてもよい。その後、ＭＣＵ３０は、Ｓ７７に進む。　
（６）コロニーのカウント　図３９は、ヘッド装置１ａのＭＣＵ２０が制御プログラムにしがって実行するコロニーのカウント処理を示す。ただし、画像処理やカウント処理は、ＭＣＵ３０により実行されてもよい。　
Ｓ８１でＭＣＵ２０は、ＰＣ１ｂから受信された検査条件からカウントアルゴリズムを取得する。具体的には、カウントアルゴリズムにおいて使用される画像処理や閾値パラメータ（例：二値化閾値）が取得される。　
Ｓ８２でＭＣＵ２０は、メインカメラ１１により取得された検査画像にカウントアルゴリズムを適用する。たとえば、ＨＤＲやリング除去などの画像処理が検査画像に適用される。　
Ｓ８３でＭＣＵ２０は、検査条件（閾値パラメータ）にしたがって検査画像に含まれるコロニーをカウントする。　
（７）自由列（例：備考
セル）への情報の登録　図４０は、ＰＣ１ｂのＭＣＵ３０により実行される備考セル等の自由列への情報登録処理を示すフローチャートである。ＭＣＵ３０は、記憶装置３５に記憶されたカウントアプリケーションプログラムにしたがって以下の処理を実行する。　
Ｓ９１でＭＣＵ３０は、備考セルの選択を受け付ける。ここでは一例として備考セルが挙げられているが、他の自由列のセルであってもよい。ＭＣＵ３０は、ポインタ５７により選択された備考セルをアクティブセルに設定する。　
Ｓ９２でＭＣＵ３０は、備考セルの属性を特定する。各セルには、属性（例：カウント値、文字列、画像）が予め付与されていてもよい。ＭＣＵ３０は、各セルの属性を記憶装置３５から読み出する。　
Ｓ９３でＭＣＵ３０は、フロントカメラの起動が指示されたかどうかを判定する。フロントカメラ１０の起動が指示されなければ、ＭＣＵ３０は、キーボード３２等から入力されたテキストを備考セルに入力する。一方、起動指示が入力されると、ＭＣＵ３０は、Ｓ９４に進む。　
Ｓ９４でＭＣＵ３０は、ヘッド装置１ａのフロントカメラ１０を起動する。　
Ｓ９５でＭＣＵ３０は、フロントカメラ１０により画像を取得する。　
Ｓ９６でＭＣＵ３０は、特定された属性が画像かどうかを判定する。属性が画像である場合、ＭＣＵ３０は、Ｓ９７に進む。　
Ｓ９７でＭＣＵ３０は、フロントカメラ１０により取得された画像（例：商品の外観画像）を備考セルに関連付ける。　
Ｓ９６で、特定された属性が画像でないと判定されると、ＭＣＵ３０は、Ｓ９８に進む。　
Ｓ９８でＭＣＵ３０は、フロントカメラ１０により取得された画像のデコード結果をヘッド装置１ａから取得する。　
Ｓ９９でＭＣＵ３０は、取得された情報（デコード結果（例：商品のシリアル番号など））を備考セルに書き込む。　
［同軸照明装置の詳細］　図４２はヘッド装置１ａの概略断面図である。同軸照明装置１４に設けられた複数の発光素子１４ａから出力された検査光が拡散板１３ｄおよび拡散板１３ｃで拡散されて透過窓６ａの裏面から入射して表面から出射し、シャーレ１５に収容されている検査個体を照明する。メインカメラ１１は、このように同軸照明装置１４からの検査光により照明された検査個体を撮像し、検査画像を生成する。拡散板１３ｄおよび拡散板１３ｃを採用することで、簡単な構成で、大きな拡散度を達成することが可能である。反射板１３ｂは底の抜けたお椀または皿のような形状を有しており、その底の部分に拡散板１３ｄが設けられている。拡散板１３ｃは、お椀形状の反射材１３ｂの上面または出射面に配置されている。　
図４３は、同軸照明装置１４の平面図である。同軸照明装置１４を構成する複数の発光素子１４ａのそれぞれの上方には概ね直方体形状のライトガイド４３０２が設けられている。つまり、発光素子１４ａとライトガイド４３０２とは一対一で設けられている。ライドガイド４３０２は、底面側から入射した光を天面側へ誘導する。ライトガイド４３０２の上方には配光規制板４３０１が設けられている。配光規制板４３０１は、アルミなどの金属や樹脂などの遮光部材により形成されている。配光規制板４３０１にはほぼ円形の複数の絞り４３０３が設けられている。ライトガイド４３０２と絞り４３０３とは一対一で設けられている。ライドガイド４３０２から出射した光は絞り５４０４によって整形される。　
図４３からわかるように、複数の発光素子１４ａは、複数（例：８個）の同心円のそれぞれに配置されている。また、外側の同心円に配置される複数の発光素子１４ａの密度は、内側の同心円に配置される複数の発光素子１４ａの密度よりも高い。つまり、外側の同心円上で隣り合った二つ発光素子間の距離（配置間隔ｉ１）は、内側の同心円上で隣り合った二つ発光素子間の距離（配置間隔ｉ２）よりも短い。これは、同軸照明装置１４から出力される検査光を均一にするために、役立っている。つまり、同軸照明装置１４の中心付近の検査光の光量と、同軸照明装置１４の外縁部付近の検査光の光量とを均一化できる。　
図４４および図４５は、配光規制板４３０１、ライトガイド４３０２、ライトガイド基板４４０１、発光素子１４ａおよび基板４４００の断面斜視図である。複数の発光素子１４ａは基板４４００に実装されている。ビス４４０２はライトガイド基板４４０１を介して配光規制板４３０１に締結することで、ライトガイド基板４４０１を配光規制板４３０１に固定している。ビス４４０３は、基板４４００およびライトガイド基板４４０１を介して配光規制板４３０１と締結することで、ライトガイド基板４４０１および配光規制板４３０１を基板４４００に固定している。なお、複数のライトガイド４３０２はライトガイド基板４４０１と一体化されていてもよい。複数のライトガイド４３０２およびライトガイド基板４４０１は、透光性を有する樹脂（例：アクリル）やガラスにより成型されている。　
図４５が示すように、ライトガイド基板４４０１は複数の同心円に配置された複数の突起部４５０１を有していてもよい。複数の突起部４５０１は、ライトガイド基板４４０１の形状を維持することに役立っている。つまり、複数の突起部４５０１は、ライトガイド基板４４０１の剛性を高めることに役立っている。　
図４６は、同軸照明装置１４の配光角を説明するための概略図である。同軸照明装置１４の配光角は、たとえば、１０度以上でかつ２５度以下程度に設計されうる。配光角をこの範囲から外れた値で設計すると、透過窓６の縁部付近に載置された検査個体を撮像することが難しくなる。また、シャーレ１５の汚れおよび傷が誤検知されるおそれがある。同軸照明装置１４の配光角を１０度以上でかつ２５度以下程度にするには、複数の発光素子１４ａのそれぞれから出射される光線の配光角θを２０度以上でかつ５０度以下に設計すればよい。　
図４６が示すように、絞り４３０４の直径はＤａである。ライトガイド４３０２は直方体または四角錘でありうるが、説明の便宜上、図４６ではライトガイド４３０２が円錐台であると仮定されている。ライトガイド４３０２の出射面の面積をＳ２とし、入射面の面積をＳ１とする。発光素子１４ａの発光面積をＳ０とする。発光素子１４ａ、ライトガイド４３０２および絞り４３０４の１つのセットの配光角を所望角度にするには、エタンデュの保存則に基づき、以下の条件式が満たされればよい。０．８＝＜Ｓ１／Ｓ２＝＜１．２　　・・・・（１）１．０＝＜Ｓ２／Ｓ９＝＜２５　　　・・・・（２）Ｄｐ＝＜Ｄａ　　　　　　　　　　　・・・・（３）ここで、Ｄｐはライトガイド４３０２の出射面の直径である。Ｄａは絞り４３０３の直径である。　
一般に、配光角θが２０度を下回ると、ゴミ、傷および透過窓６の縁の影響が検査画像に影響しやすくなり、コロニーのカウント値を誤らせる。一方、配光角θが５０度を超えると、拡散度が高くなりすぎて、検査画像のコントラストが低くなる。　
なお、（１）式と（２）式が満たされている場合、絞り４３０３は省略可能である。ただし、ライトガイド４３０２と発光素子１４ａの製造上の誤差や取付誤差を考慮し、絞り４３０４が設けられている。絞り４３０４を設けることで、配光角θを理想状態に近づけることが可能となる。　
本実施例では、ライトガイド４３０２および絞り４３０４の１つのセットとする照明光学系が採用されているが、他の照明光学系が採用されてもよい。たとえば、２０度以上でかつ５０℃以下の配光角θを有する砲弾型の発光ダイオードが、発光素子１４ａ、ライトガイド４３０２および絞り４３０４の１つのセットと置換可能である。　
図４７が示すように、ライトガイド４３０２および絞り４３０４は、レンズ４７０１と置換されてもよい。この場合、レンズ４７０１の開口数ＮＡと直径Ｄｉは以下の条件を満たすことが求められる。ＮＡ＞＝０．１７　　　　　・・・（４）Ｄｉ／２Ｌｉ＞＝０．１７　・・・（５）ここで、Ｌｉはレンズ４７０１の中心と発光素子１４ａの出射面との間の距離である。（４）式と（５）式とを満たすことで、レンズ４７０１自体のＮＡが０．１７以上となり、かつ、レンズ４７０１による発光素子１４ａからの光の取り込み角がＮＡ０．１７以上となり、配光角θが２０度以上になる。　
［同軸照明装置の変形例］　図４８はテレセントリック光学系４８０２を採用した同軸照明装置１４を示している。本実施例で同軸照明装置１４はおおむねテレセントリックであることが求められる。そこで、同軸照明装置１４は、ハロゲンライトなどの光源４８０１と、テレセントリック光学系４８０２と、ミラー４８０３とを有している。光源４８０１から出力された検査光はテレセントリック光学系４８０２を通過することでテレセントリック性の高い検査光ビームとなる。検査光ビームはミラー４８０３によって偏向され、拡散板１３ｄおよび拡散板１３ｃを通過し、透過窓６の裏面からシャーレ１５内の検査個体を照明する。光源４８０１は面光源であってもよい。　
図４８に示された同軸照明装置１４はテレセントリック光学系４８０２が必要になるため、同軸照明装置１４が大きくなってしまう。一方で、図４２に示された同軸照明装置１４は小型化に有利である。　
［拡散板による調光］　図４９は拡散板１３ｃの拡散度を第一拡散度から第二拡散度に切り替えたときの検査光の様子を示している。なお、すでに説明された図４２は、拡散板１３ｃの拡散度が第一拡散度であるときの検査光の様子を示している。図４２で、検査光は、拡散度が一定の拡散板１３ｄで拡散され、さらに、拡散板１３ｃを通過することでさらに拡散されて所望の検査光になる。一方、図４９では、検査光は、拡散度が一定の拡散板１３ｄで拡散されるものの、拡散板１３ｃを通過する際には拡散されないか、小さな拡散度で拡散されて、所望の検査光になる。　
図４２が示すように、第一拡散度で拡散板１３ｃにより拡散された検査光は、検査画像のコントラストを低下させ、シャーレ１５の傷やゴミの影響を低減できる。一方で、図４９が示すように、第一拡散度よりも小さな第二拡散度で拡散板１３ｃにより拡散された検査光は、検査画像のコントラストを増大させ、コロニーのカウント値を増加させることができる。あるいはコロニーの輪郭を明確にすることができ、コロニーの形状を検査することに有用である。　
拡散度が第一拡散度よりも小さな第二拡散度の場合、第一拡散度の場合と比較して相対的に傷やゴミの影響を受ける。計数部は、円形度やアスペクト比、面積、周囲長などの形状特徴に基づいて、検査画像に含まれるコロニーの数を計数してもよい。これにより、傷やゴミによる誤カウントを抑制でき、より正確にコロニーの数を計数できる。　
ユーザはキーボード３２またはポインティングデバイス３３を通じて拡散板１３ｃの拡散度を調光制御部１３ｚに設定する。調光制御部１３ｚは、設定された拡散度となるように、拡散板１３ｃを電気的に制御する。たとえば、第一拡散度は第一電圧を拡散板１３ｃに印加することで実現され、第二拡散度は第二電圧を拡散板１３ｃに印加することで実現されてもよい。　
図５０は拡散板１３ｃの構成例を示す図である。透光性を有するガラス板またはアクリル板である基材４９００の第一面側に拡散フィルム４９０１が設けられている。オプションで、基材４９００の第二面側に拡散フィルム４９０２が設けられてもよい。拡散フィルム４９０１、４９０２は液晶フィルムであってもよい。この場合、調光制御部１３ｚは拡散フィルム４９０１、４９０２に印加する電圧をオン／オフすることで、拡散フィルム４９０１、４９０２内の液晶の向きが変化し、拡散フィルム４９０１、４９０２の拡散度が変更される。たとえば、拡散フィルム４９０１、４９０２がともにオフの場合、第二拡散度が実現され
る。拡散フィルム４９０１、４９０２がともにオンの場合、第一拡散度が実現される。拡散フィルム４９０１がオンで、拡散フィルム４９０がオフの場合、第三拡散度が実現される（第二拡散度＜第三拡散度＜第一拡散度）。拡散フィルム４９０１がオフで、拡散フィルム４９０がオンの場合、第四拡散度が実現される（第二拡散度＜第四拡散度＜第一拡散度）。ここで、第三拡散度は第四拡散度より大きくても、小さくてもよい。あるいは、第三拡散度は第四拡散度と等しくてもよい。これにより、拡散板１３ｃの拡散度を３段階または４段階で切り替え可能となる。　
図５１および図５２は電気的および機械的に拡散度を切り替える方法を示す。調光制御部１３ｚは、モータ１３ｅを制御することで、検査光の光路に拡散板１３ｃを挿入したり（図５１）、光路から拡散板１３ｃを抜き取ったり（図５２）することができる。下部ユニット４のサイズに余裕がある場合、電気的および機械的に拡散度を切り替える方法も実装可能である。また、この場合、拡散板１３ｃの拡散度は一定である。　
［拡散度の設定と検査画像への紐づけ］　図５３は拡散板１３ｃにより高拡散度で拡散された検査光を照射された検査個体の検査画像５３０１と、拡散板１３ｃにより低拡散度で拡散された検査光を照射された検査個体の検査画像５３０２である。また、拡大画像５３１１は検査画像５３０１に含まれる、あるコロニーを拡大した図である。拡大画像５３１２は検査画像５３０２に含まれる、同一のコロニーを拡大した図である。　
検査画像５３０１のコントラストが低いため、検査画像５３０１では傷や汚れなどが目立っていない。一方、検査画像５３０２のコントラストが高いため、検査画像５３０１では傷や汚れなどが目立つ。その一方で、検査画像５３０１およびその拡大画像５３１１ではコロニーの輪郭が目立っていない。検査画像５３０２およびその拡大画像５３１２ではコロニーの輪郭が目立っている。つまり、検査の用途に応じて拡散度を切り替えることで、用途に応じた所望の検査画像が得られるようになる。　
図５３の比較結果は、菌種および培地の種類に依存して、適切な拡散度が異なることを示唆している。その一方で、検査画像５３０１と検査画像５３０２とを比較することでユーザは初めて拡散度の違いを理解できる。つまり、検査画像５３０１だけ、または、検査画像５３０２だけを見ても、それが高拡散度で撮影されたものなのか、それとも低拡散度で撮影されたすぐには理解できないだろう。とりわけ、検査画像を取得したユーザと、検査画像を観察するユーザとが違うケースや、検査画像を取得してから数日または数か月が経過した後に検査画像を再度観察するケースでは、検査画像からすぐに拡散度を思い出すことができないかもしれない。　
そこで、本実施例では、カウント表のセルおよび検査画像に拡散度が紐づけられる。これによりユーザはセルまたは検査画像に紐づけられている拡散度を容易に知ることができる。　
図５４は、図１５に示されたダイアログ９０の照明ボタンまたは図１７に示された検査条件の確認画面１１０から呼び出されうる照明設定ＵＩ５４００を示している。照明選択部５４０１は照明の種類を選択するためのＵＩである。この例では、落射リング（リング照明装置１２）、透過同軸（同軸照明装置１４）、または、透過リング（リング照明装置１３）から一つの種類が選択可能となっている。選択枠５４０２は現在選択中の照明の種類を強調表示するディスプレイオブジェクトである。チェックボックス５４０３は、拡散度を選択するためのコントロールオブジェクトである。チェックボックス５４０３にチェックが入れられると、高拡散度が選択される。チェックボックス５４０３からチェックが外されると、低拡散度が選択される。　
明るさ調整部５４１０は、明るさの調整方法（オートまたはマニュアル）を選択するためのラジオボタンと、明るさを選択するためのスライドバーとを有している。オートが選択されると、ＭＣＵ３０により明るさが自動で決定されてスライドバーに反映される。マニュアルが選択されると、スライドバーの操作に応じて、明るさが選択される。このようにして決定された明るさは照明選択部５４０１のスライドバーと数値にも反映される。　
ここで、決定された照明の種類、拡散度、および明るさは、カウント表のセルのうち、照明設定ＵＩ５４００を呼び出したセルに関連付けられる。上述されたように各セルには検査画像も関連付けられる。たとえば、一般生菌のセルと大腸菌のセルとでは異なる拡散度が関連付けられてもよいし、同一の拡散度が関連付けられてもよい。　
上述されたようにカウント表の各セルには検査条件、検査画像およびカウント結果が関連づけられる。拡散度は検査条件の一つであることから、拡散度は検査画像およびカウント結果にも関連付けられることになる。　
ここでは、チェックボックス５４０３によって拡散度が選択されているが、他のコントロールオブジェクトを通じて拡散度が選択されてもよい。たとえば、選択可能な二つ以上の拡散度から一つの拡散度を選択するためのラジオボタンが採用されてもよい。あるいは、傷やノイズを軽減する機能（ノイズ軽減機能）をオン／オフするチェックボックスまたはラジオボンタンが採用されてもよい。この場合、ＭＣＵ３０は、ノイズ軽減機能がオンされると、高拡散度を選択し、ノイズ軽減機能がオフされると、低拡散度を選択する。このように、ＵＩ上の他の選択肢と拡散度とが関連付けられており、ユーザが複数の選択肢から一つの選択肢を選択することで、間接的に拡散度も選択されてもよい。　
培地の種類と拡散度とが予め関連付けられていてもよい。ＭＣＵ３０は、図１５に示される培地タイプ設定部９６からユーザによる培地の種類の選択を受け付け、選択された培地に関連付けられている拡散度を記憶装置３５から取得し、調光制御部１３ｚに拡散度を設定してもよい。　
［拡散度の切替の応用］　本実施例のコロニー計数装置１は拡散度を変えながら複数の検査画像を取得できる。一般には、コロニーを精度よく計数可能なひとつの拡散度が選択され、選択された拡散度で生成された一つの検査画像からコロニーが計数される。しかし、それぞれ異なる拡散を適用された複数の検査画像が、コロニーの計数のために、生成されてもよい。　
図５５は、高拡散度で生成された検査画像５５０１と、低拡散度で生成された検査画像５５０２とを合成して合成検査画像５５０３が得られることを示している。ここでは、照明装置として、透過型のリング照明装置１３が使用されている。リング照明装置１３が使用されるため、検査光は拡散板１３ｄを通過することなく、拡散板１３ｃのみを通過することになる。　
シャーレ１５を培養していると、シャーレ１５内に結露が発生することがある。とりわけ、検査画像５５０２では結露の輪郭が強調されてしまい、結露の一つ一つの水滴までもがコロニーとしてカウントされてしまう（例：カウント値＝３０００）。一方で、検査画像５５０１ではユーザがシャーレに手書きした文字がコロニーとしてカウントされてしまうことがある（例：カウント値＝１７５）。そこで、ＭＣＵ３０は、拡散板１３ｃを高拡散度に設定して生成した検査画像５５０１と、拡散板１３ｃを低拡散度に設定して生成した検査画像５５０２と、を合成して、検査画像５５０３を生成し、検査画像５５０３においてコロニーをカウントする。その結果、より正確なコロニー数（例：６４）が得られる。合成方法としては、結露や文字の影響が低減されるような方法であればよい。たとえば、ＭＣＵ３０は、検査画像５５０２と検査画像５５０１との差分から検査画像５５０１を生成してもよい。このように、検査画像５５０１と検査画像５５０２との差分を算出することで、これらの双方で明領域として観察される外乱の影響を抑制した合成検査画像５５０３が生成される。なお、合成検査画像５５０３は、外乱抑制画像と呼ばれてもよい。　
［阻止円の計測］　図５６は薬剤に対する菌の耐性を測定することを説明する図である。菌は薬剤に対して耐性を獲得することが知られている。したがって、ある菌について複数の薬剤のうちのどの薬剤が有効であるかを調べることは非常に有用である。図５６ではシャーレ１５に菌を均一に塗布された培地５６０１が収容されている。そこに、６種類の薬剤５６０２が投入または滴下されている。　
菌に対して薬剤５６０２が有効であれば、薬剤５６０２の周囲に存在する複数の菌類が死滅する。培地５６０１のうち、菌類が死滅した円形領域は阻止円５６０３と呼ばれる。この阻止円の５６０３の直径Ｄｃは、菌に対する薬剤の有効性を示している。ある薬剤の阻止円の直径Ｄｃが小さいほど、その薬剤に対して菌は強い耐性を獲得している。ある薬剤の阻止円の直径Ｄｃが大きいほど、その薬剤は菌に対して強い有効性を有している。　
培地の種別に依存して阻止円の直径Ｄｃを測定するのに有効な拡散度は異なりうる。そこで、ＭＣＵ３０は、阻止円の直径Ｄｃを計測するための検査画像を生成する際に、ユーザによる培地の種別の入力を受け付け、複数の拡散度のうち、培地の種別に応じた拡散度を選択する。記憶装置３５は、予め培地の種別と拡散度を紐づけて記憶していてもよい。たとえば、ＭＣＵ３０は、培地の種別と拡散度とを一対一で紐づけるためのＵＩを表示装置３７に表示し、そのＵＩを通じて培地の種別に対して拡散度を紐づけるための設定を受け付けてもよい。ＭＣＵ３０は、阻止円を計測する際に入力された培地の種別に対応する拡散度を、記憶装置３５を参照することで、特定し、特定された拡散度を調光制御部１３ｚに設定する。調光制御部１３ｚは、設定された拡散度となるような電圧を拡散板１３ｃに印加する。これにより、培地に適した拡散度が採用されるため、ＭＣＵ３０は、検査画像から阻止円５６０３の直径Ｄｃを正確に計測することが可能となる。　
［検査パラメータの調整の容易化］　（１）基本的な考え方　これまで、検査パラメータの調整はユーザにとって困難な作業の一つであった。コロニー計数装置１によるコロニーの計数結果は、人間による計数結果とほぼ一致することが求められる。そのためには、撮像条件、照明条件、および画像処理条件（計数条件）等が適切に調整されなければならない。一般に、照明条件にしたがって照明された検査個体が、撮像条件にしたがってメインカメラ１１によって撮影されることで、検査個体の画像が生成される。検査個体の画像は、画像処理条件によって、シェーディング補正、明るさ変換、ノイズ低減処理（例：粒子低減、糸くず低減）、ｗａｔｅｒｓｈｅｄ（画像分割アルゴリズムの一種）、領域集合の適切な結合などを適用され、最終的に二値化感度（二値化閾値）に基づき二値化画像に変換される。したがって、二値化変換処理は、非常に複雑な演算処理であり、かなりの演算時間を要する。その後、ＭＣＵ３０は二値化画像からコロニー数をカウントする。ユーザは、元画像と二値化画像を比較したり、コロニーの計数結果を確認したりして、どの検査パラメータをどのように微調整すべきかを決定する必要があった。このような一連の調整作業を各検査パラメータについて繰り返すことで、最終的な検査パラメータが確定することになる。特に、二値化画像処理に時間がかかるため、ユーザは、検査パラメータを調整してからその調整結果である計数結果を取得するまで、長い時間にわたり待たされていた。　
そこで、本実施例は、検査パラメータの調整作業を容易化する。また、本実施例の一部は、調整作業を従来よりも短時間化するだろう。　
具体的には、ＭＣＵ３０は、ある検査パラメータについて複数の候補を予め用意しておき、複数の候補を検査個体の画像に適用して二値化画像と計数結果とを事前に求めておく。さらに、ＭＣＵ３０は、複数の候補それぞれを適用されて求められた複数の二値化画像とその計数結果とを表示装置３７に表示する。ユーザ
は、表示装置３７に表示された複数の検出結果（二値化画像と計数結果）から一つの検出結果をポインタ５７により選択する。ＭＣＵ３０は、選択された検出結果を求めるために使用された検査パラメータの候補を正式な検査パラメータ（調整後の検査パラメータ）として確定する。ユーザは、自分の感覚にあった検出結果を選択するだけで検査パラメータを調整できるため、調整作業が非常に容易となろう。　
なお、検査パラメータの候補は、一次候補、二次候補、・・・、最終候補というように、徐々に絞り込まれてもよい。たとえば、ｎ次候補となる複数の検査パラメータは、ｎ－１次候補に含まれる複数の検査パラメータからユーザにより選択された一つの検査パラメータと、その一つの検査パラメータの前後に位置するいくつかの検査パラメータとから構成される。このように、ユーザの感覚に近い検査パラメータが徐々に選抜されてもよい。　
（２）ユーザインタフェース　図５７は、検査パラメータを調整する前のＵＩ１００（検査結果確認画面）を示している。ＵＩ１００においてすでに説明済みのディスプレイオブジェクトについてはその説明が省略される。情報表示領域５７００は、検査個体（サンプル）の情報を表示する領域である。コロニー編集部５７０５は、調整後の検査パラメータなどを表示する領域である。撮影ボタン１０５ａは、検査個体の撮りなおしをＭＣＵ３０に指示するためのボタンである。カウントボタン１０５ｃは、ＭＣＵ３０にコロニーのカウントを指示するための押されるボタンである。カウントナビボタン１０５ｄは、検査パラメータを離散的に調整するためのＵＩを表示することをＭＣＵ３０に指示するためのボタンである。登録ボタン１０５ｂは、カウント結果をカウント表に登録することをＭＣＵ３０に指示するためのボタンである。　
結果領域１０２には、メインカメラ１１によりリアルタイムで撮影されている動画が表示される。ただし、結果領域１０２には、その時点で設定されている照明条件と撮像条件に基づきメインカメラ１１により取得された静止画としての検査画像１０３が表示されてもよい。たとえば、結果領域１０２に動画が表示されているときに、カウントボタン１０５ｃが押されると、ＭＣＵ３０は、静止画としての検査画像１０３を取得し、カウント演算を実行する。図５７では、カウント値領域１０４に、まだカウント結果は表示されていないが、静止画としての検査画像１０３からカウント結果が求められると、カウント値領域１０４にカウント結果が表示される。　
図５８は、カウントナビボタン１０５ｄが押されると表示装置３７に表示されるカウントナビＵＩ５８００を示す。カウントナビＵＩ５８００は、候補表示領域５８０１を有している。候補表示領域５８０１は、候補画像、候補パラメータおよびカウント数を表示する領域である。この例では、複数の同一種類の検査パラメータの候補（候補パラメータ）を適用してそれぞれ生成された複数の二値化画像（候補画像５８０２）が表示されている。情報表示領域５８０３は、候補画像５８０２を求めるために適用された検査パラメータ（例：感度（二値化感度の略称））と、カウント数とを表示する領域である。検査パラメータはコロニー検出パラメータと呼ばれてもよい。　
この例では、それぞれ異なる検査パラメータを適用されて求められた三つの候補画像５８０２が表示されている。ユーザは、ポインタ５７を操作することで一つの候補画像５８０２を選択する。選択枠５８０６は、ユーザにより選択された候補画像５８０２を強調表示するためのボックスまたはフレームである。　
ポインタ５７により、戻るボタン５８０４が押されたことを検知すると、ＭＣＵ３０は、カウントナビＵＩ５８００からＵＩ１００に戻る。次へボタン５８０５が押されことを検知すると、ＭＣＵ３０は、次のＵＩ（例：図６１に示されたＵＩ５８００）に遷移する。　
ところで、図５８には三つの候補画像５８０２が表示されているが、これは一例にすぎない。候補表示領域５８０１に表示される候補画像５８０２の個数は２以上であればよい。　
ＭＣＵ３０は、候補画像５８０２の一部がポインタ５７によりクリックされると、その一部を拡大表示してもよい（ズーム機能）。さらに、ＭＣＵ３０は、候補画像５８０２の一部がポインタ５７によりドラッグされると、拡大位置を平行移動させてもよい。その際に、ＭＣＵ３０は、三つの候補画像５８０２のすべてにおいて同時並行的にズームまたはパンを実行してもよい。これにより、三つの候補画像５８０２の細部を同時に対比できるようになる。　
図５９はカウントナビＵＩ５８００の別の例を示している。この例では、候補表示領域５８０１に５個の候補表示画像５８０２が表示されている。ただし、候補表示領域５８０１に表示される候補画像５８０２の個数が増加するにつれて、候補画像５８０２の視認性が低下したり、情報表示領域５８０３に表示可能な情報量が減少したりする。この例では、情報表示領域５８０３はカウント数しか表示できず、カウントナビＵＩ５８００の他の位置に、検査パラメータ（感度）の表示領域５９０１が設けられている。この表示領域５９０１は、ポインタ５７により選択された候補画像５８０２を求めるために使用された検査パラメータを表示する。　
ところで、図５８と図５９とは本実施例の他の側面を示唆している。ＭＣＵ３０は、同一種のＮ個の検査パラメータ（例：感度：０．２，０．４，０．６，０．８，１．０）について検出結果（例：候補画像５８０２、カウント数）を事前に演算しておくことができる。たとえば、図５９が示すように、５個の検出結果が事前に演算されてもよい。さらに、ＭＣＵ３０は、Ｎ個の検出結果のうち、実際にはＭ個の検出結果だけを候補表示領域５８０１に表示してもよい（Ｎ，Ｍは整数であり、Ｎ＞Ｍ）。たとえば、図５８が示すように、３個の検出結果だけが表示されてもよい。このように事前に演算を実行しておくことで、候補画像５８０２を切り替える際のユーザの待ち時間が減少するであろう。　
さらに、図５８と図５９とは本実施例のさらに他の側面を示唆している。たとえば、図５９は一次候補を示し、図５８は二次候補を示すと理解されてもよい。たとえば、一次候補（例：感度：０．２，０．４，０．６，０．８，１．０）から感度として０．４が選択され、二次候補では、感度として、０．３、０．４、０．５とが選択可能に表示されてもよい。なお、候補画像５８０２を選択することは、候補画像５８０２に関連付けられている検査パラメータを間接的に選択することに相当する。さらに、ＭＣＵ３０は、二次候補から選択された検査パラメータから三次候補を決定し、三次候補から一つの検査パラメータをユーザに選択させてもよい。このように、一次候補からｎ次候補へと進むにつれて徐々に、ユーザが適切と考える検査パラメータに絞り込むことができる（ｎは３以上の整数）。なお、各検査パラメータの候補間の間隔（差）は、一次候補からｎ次候補へと進むにつれて徐々に、削減されてもよい。　
また、ｎ－１次の候補において二つの候補（例：０．２、０．４）が選択されると、ｎ次候補は、二つの候補の中間値（例：０．３）を中心とした三つ以上の候補（例：０．２５、０．３、０．３５）を含むように決定されてもよい。　
図６０はカウントナビＵＩ５８００のさらに別の例を示している。この例では、元画像６００１は、検査個体から取得された生画像（カラー画像またはグレースケール画像）である。つまり、元画像６００１は、ユーザがシャーレ１５を肉眼で見た印象に近い画像である。一方で、候補画像５８０２は、元画像６００１に検査パラメータを適用して画像処理されて生成された二値化画像を、元画像６００１に対して重畳することで生成された画像である。この場合、ユーザは、元画像６００１に重畳された二値化画像を確認することで、元画像６００１に存在するコロニーが正しく検出されていかどうかを判断できるであろう。つまり、ユーザがコロニーであると認識した画像領域が、ＭＣＵ３０もコロニーであると検出されているかどうかを、ユーザが知ることができるであろう。この場合、元画像６００１に重畳される二値化画像は、コロニーの検出位置を示す目印として機能するであろう。なお、ＭＣＵ３０は、実際にコロニーとして検出された画像領域に目印（例：赤色の十字マークなど）を重畳して表示してもよい。　
図６１は、次へボタン５８０５が押されたときに表示されるカウントナビＵＩ５８００を示している。ここで、Ｓｔｅｐ１において感度が調整され、Ｓｔｅｐ２において他の検査パラメータが調整されることが想定されている。これは２ステップ調整と呼ばれてもよい。なお、ＭＣＵ３０は、Ｓｔｅｐ１で感度をユーザが選択している間（またはその前）に、各感度の候補について、他の検査パラメータの組み合わせを適用した検出結果（候補画像とカウント数）を事前に演算し、記憶装置３５に記憶していてもよい。次へボタン５８０５が押されると、ＭＣＵ３０は、記憶装置３５からＳｔｅｐ２の検出結果を読み出して、候補表示領域５８０１に複数の検出結果（候補）を表示してもよい。　
なお、Ｓｔｅｐ１で調整される検査パラメータの演算負荷は、Ｓｔｅｐ２で調整される検査パラメータの演算負荷よりも多いことが想定されている。Ｓｔｅｐ１で調整される検査パラメータとしては、たとえば、ノイズ除去の強度、感度（二値化閾値）、シェーディング補正のオン／オフなどがある。Ｓｔｅｐ２で調整される検査パラメータとしては、たとえば、小粒子低減機能のオン／オフ、形状分割のサイズ、糸くず低減機能のオン／オフ、大粒子低減機能のオン／オフ、膨張収縮機能のオン／オフなどがある。　
この例では、他の検査パラメータとして、小粒子低減機能のオン／オフと、糸くず低減機能のオン／オフと、が採用されている。つまり、三つの候補画像５８０２は、共通の感度を適用され、小粒子低減機能のオン／オフと糸くず低減機能のオン／オフとの組み合わせ（４通りあるうちの３通りの組み合わせ）を適用されて生成された候補画像である。情報表示領域５８０３は、カウント数と、第二種類の検査パラメータ（小粒子低減機能のオン／オフと、糸くず低減機能のオン／オフ）を示している。ユーザが一つの候補画像５８０２を選択し、完了ボタン６１０１を押したことを検知すると、ＭＣＵ３０は、選択された候補画像５８０２を生成するために適用された一連の検査パラメータを正式な検査パラメータとして記憶装置３５に保存する。　
図６２は、完了ボタン６１０１が押されると表示される結果確認画面（ＵＩ１００）である。コロニー編集部５７０５は、カウントナビＵＩ５８００を通じて調整された検査パラメータを表示する。ＭＣＵ３０は、調整された検査パラメータを赤色で表示たり、太字で表示したり、点滅表示したりするなど、強調表示してもよい。カウント値領域１０４は、ＵＩ５８００を通じて確定した複数種類の検査パラメータが適用されたカウント数を表示する。このカウント数はさらにカウント表にも登録されてＵＩ１００にも表示される。　
図６２は、カウントナビボタン１０５ｄが設けられていないが、カウントナビボタン１０５ｄが設けられてもよい。この場合、一度、複数種類の検査パラメータが調整された後に、ユーザは、カウントナビボタン１０５ｄを押すことで、複数種類の検査パラメータを再調整することができる。なお、再調整において一次候補となる複数の検査パラメータの中央値として、前回の調整で確定された検査パラメータが記憶装置３５から読み出されて採用されてもよい。　
図６３は、コロニー編集部５７０５をポインタ５７によりダブルクリックまたは右クリックすることで表示されるＵＩ６３００を示している。ＵＩ６３００は、連続的に検査パラメータを調整可能なコントロールオブジェクトを有していてもよい。スライドバー６３０１は、ＵＩ５８００を通じて調整された感度をさらに微調整する
ためのスライドバーである。スライドバー６３０２は、コロニーとして検出される形状を分割する際のサイズを調整するためのスライドバーである。スライドバー６３０３は、小粒子低減機能がオンに設定されたときに、その低減効果を調整するためのスライドバーである。スライドバー６３０４は、糸くず低減機能がオンに設定されたときに、その低減効果を調整するためのスライドバーである。完了ボタン６３０５が押されたことを検知すると、ＭＣＵ３０は、その時点でスライドバー６３０１～６３０４によって調整された四つの検査パラメータを確定して記憶装置３５に記憶し、ＵＩ６３００からＵＩ１００に遷移する。　
（３）フローチャート　図６４は、ＭＣＵ３０により実行される検査パラメータの調整方法を示すフローチャートである。ここでは、表示装置３７にＵＩ１００が表示されていることが前提とされている。　
Ｓ１０１でＭＣＵ３０（指示受付部）は、ＵＩ１００においてポインティングデバイス３３によるカウントナビボタン１０５ｄのクリックを受け付ける。　
Ｓ１０２でＭＣＵ３０（画像処理部、演算部、計数部）は、第一種類のＮ個の検査パラメータ（例：感度）のそれぞれについてカウント演算を実行する。たとえば、それぞれ値の異なる５個の感度が検査個体の画像に適用されて、カウント演算が実行される。ここで、カウント演算とは、検査個体の画像を二値化し、生成された二値化画像からコロニーの数をカウントすることをいう。カウント演算において、他の種類の検査パラメータとしては、記憶装置３５に記憶されているデフォルト値が採用される。Ｎ個のカウント結果（検出結果）は記憶装置３５に保存される。　
Ｓ１０３でＭＣＵ３０（表示処理部）は、ＵＩ５８００においてＮ個のカウント結果のうちＭ個のカウント結果を対比可能に表示する。基本的に、Ｎ＞Ｍであるが、Ｎ＝Ｍであってもよい。　
Ｓ１０４でＭＣＵ３０（選択部）は、Ｍ個のカウント結果から一つのカウント結果の選択を受け付ける。上述されたように、ポインタ５７により一つの候補画像５８０２が選択されてもよい。　
Ｓ１０５でＭＣＵ３０（指示受付部）は、次のステップへの遷移指示を受け付ける。遷移指示は、たとえば、次へボタン５８０５を押されたことである。　
Ｓ１０６でＭＣＵ３０（画像処理部、演算部、計数部）は、第二種類のＬ個の検査パラメータのそれぞれについてカウント演算を実行する。これにより、Ｌ個のカウント結果が得られ、記憶装置３５に記憶される。第二種類の検査パラメータは、たとえば、小粒子低減機能のオン／オフと、糸くず低減機能のオン／オフ、形状の分割のサイズなどである。　
Ｓ１０７でＭＣＵ３０（表示処理部）は、カウントナビＵＩ５８００においてＬ個のカウント結果のうちＫ個のカウント結果を対比可能に表示する。上述されたＮ、Ｍと動揺の理由から、基本的に、Ｌ＞Ｋであるが、Ｌ＝Ｋであってもよい。なお、図６１では、Ｌ＝４、Ｍ＝３の事例が紹介されている。　
Ｓ１０８でＭＣＵ３０（選択部）は、Ｋ個のカウント結果のうち一つのカウント結果の選択を受け付ける。上述されたように、ポインタ５７により一つの候補画像５８０２が選択される。　
Ｓ１０９でＭＣＵ３０（指示受付部）は、ポインティングデバイス３３による結果画面（例：ＵＩ１００）への遷移指示を受け付ける。遷移指示は、たとえば、完了ボタン６１０１を押すことである。　
Ｓ１１９でＭＣＵ３０（表示処理部）は、表示装置３７に結果画面（例：ＵＩ１００）を表示する。　
図６５は、ＭＣＵ３０により実行される検査パラメータの調整方法を示すフローチャートである。ここでは、表示装置３７にＵＩ１００が表示されていることが前提とされている。図６５では、図６４と比較して、Ｓ１０５とＳ１０６との間に、Ｓ１２１～Ｓ１２５が挿入されている。　
Ｓ１２１でＭＣＵ３０（決定部）は、二次候補を取得するために、選択されたカウント結果に対応する第一種類の検査パラメータに近いいくつかの第一種類の検査パラメータを決定する。たとえば、感度の一次候補として０．２，０．４，０．６，０．８，１．０があり、そこから０．４が選択されたと仮定する。この場合、感度の二次候補は０．３、０．４、０．５となる。　
Ｓ１２２でＭＣＵ３０（取得部）は、決定されたいくつかの第一種類の検査パラメータについてカウント結果を取得する。たとえば、感度の二次候補は０．３、０．４、０．５である場合、事前に記憶装置３５に記憶された、感度が０．３であるカウント結果、感度が０．４であるカウント結果、および、感度が０．５であるカウント結果が読み出される。あるいは、ＭＣＵ３０は、感度が０．３であるカウント結果、感度が０．４であるカウント結果、および、感度が０．５であるカウント結果をカウント演算する。　
Ｓ１２３でＭＣＵ３０（表示処理部）は、複数のカウント結果を対比可能に表示する。　
Ｓ１２４でＭＣＵ３０（選択部）は、対比可能に表示された複数のカウント結果から一つのカウント結果の選択を受け付ける。　
Ｓ１２５でＭＣＵ３０（指示受付部）は、次のステップへの遷移指示を受け付ける。遷移指示は、たとえば、次へボタン５８０５を押されたことである。　
このように、感度などの第一種類の検査パラメータが段階的に絞り込まれてもよい。これにより、ユーザは、より精緻に第一種類の検査パラメータを調整することが可能となろう。なお、第二種類の検査パラメータについてもこのような段階的な絞り込み処理が適用されてもよい。　
確定した検査パラメータは、サンプル名や培地の種類に関連付けて、記憶装置３５に記憶されてもよい。ＭＣＵ３０は、次にＵＩ１００が呼び出されたときに、記憶装置３５に記憶されている前回の検査パラメータを読み出し、候補画像５８０２を作成するための中心（中央値）となる検査パラメータとして利用する。この場合、ＭＣＵ３０は、前回の検査パラメータから残りの候補となる検査パラメータを演算し、一次候補となる検査パラメータ群を生成してもよい。一次候補となる検査パラメータ群となる複数の検査パラメータは一定間隔で、かつ、離散的な数値として演算可能である。ここで、間隔（パラメータ間隔）は、培地の種別に応じて決定されてもよい。たとえば、記憶装置３５は、培地の種別と間隔とのペアをテーブル化またはデータベース化して保持していてもよい。　
［ＵＩの変形例］　図６６、図６７および図６８は、カウントナビボタン１０５ｄが押されると表示装置３７に表示されるカウントナビＵＩ５８００の他の例を示す。図５８等に関連して説明された部分には同一の参照符号が付与されており、その説明は省略される。　
図５８等に示されたＵＩ５８００では、複数の同一種類の検査パラメータの候補（候補パラメータ）を適用してそれぞれ生成された複数の二値化画像（候補画像５８０２）が表示される。しかし、図６６に示されたＵＩ５８００は、生成されたた複数の二値化画像のうち一つの二値化画像（候補画像５８０２）だけが表示される。そのため、一つの候補画像５８０２あたりの表示面積が増加し、ユーザは、候補画像５８０２の細部を視覚的に確認しやすくなる。　
図６６に示されたＵＩ５８００は、候補表示領域５８０１に表示される候補画像５８０２を切り替えることを指示するためのコントロールオブジェクトとして、スライドバー６６０１を有していてもよい。ユーザは、ポインタ５７によりスライドバー６６０１をクリックまたはドラッグすることで、候補表示領域５８０１に表示される候補画像５８０２を切り替える。ここでは、第１の検査パラメータを適用して生成された第１の候補画像から、第２の検査パラメータを適用して生成された第２の候補画像に切り替える。候補表示領域５８０１に表示される画像が生成される際に適用される検査パラメータを、第１の検査パラメータから第２の検査パラメータに離散的に切り替えるとともに、検査パラメータが離散的に切り替わる前後の候補画像を候補表示領域５８０１の同じ位置に順次表示させることによって、ユーザは第１の検査パラメータを適用した場合と、第２の検査パラメータを適用した場合との候補画像の差分や計数結果の差分を容易に把握することができる。すなわちこの場合、ユーザは、画面上で視線を移したりすることなく、また差分箇所を目視で抽出することもなく、第１の検査パラメータを適用した場合と、第２の検査パラメータを適用した場合との候補画像の差分や計数結果の差分を認識することができる。　
図６７は、ユーザによって候補画像５８０２が切り替えられたことを示している。この例では、スライドバー６６０１が右方向にドラッグされ、候補表示領域５８０１には別の（第二の）候補画像５８０２が表示される。情報表示領域５８０３に表示される検査パラメータとカウント数も、候補画像５８０２に応じて切り替えられる。　
図６８は、ユーザによって候補画像５８０２が切り替えられたことを示している。この例では、スライドバー６６０１がさらに右方向にドラッグされ、候補表示領域５８０１には、さらに別の（第三の）候補画像５８０２が表示される。情報表示領域５８０３に表示される検査パラメータとカウント数も、候補画像５８０２に応じて切り替えられる。　
ＵＩ５８００に設けられている確定ボタン６６０２がポインタ５７によって選択されて押し下げられると、その時点で、候補表示領域５８０１に表示される候補画像５８０２と、情報表示領域５８０３に表示される検査パラメータとが、ユーザにより選択されたものとして、確定される。　このようにスライドバー６６０１によって複数の候補画像５８０２が切り替えられることで、複数の候補画像５８０２が対比可能に表示されてもよい。特に、スライドバー６６０１が右方向又は左方向に順にドラッグされることによって、候補表示領域５８０１の同じ位置に離散的に検査パラメータを変更した候補画像５８０２を順に切り替えながら表示できる。これにより、検査パラメータを変化させることで、候補画像５８０２のどの領域が新たにコロニーとしてカウントされたかや、候補画像５８０２がどのように変化したかを把握することが容易になる。　
スライドバー６６０１は、キーボードに設けられたカーソルキーによって、操作されてもよい。　
なお、スライドバー６６０２が左に行くほど、カウント数が少ない候補画像５８０２が表示され、スライドバー６６０２が右に行くほど、カウント数が多い候補画像５８０２が表示されてもよい。このように、複数の候補画像５８０２（の表示順序）は、カウント数に応じてソートされてもよい。　
［その他］　分析業界ではＬＩＭＳ（Laboratory Information Management System）が着目されている。ＬＩＭＳは一種のアプリケーションであり、検査個体とそれに関連する検査条件、検査画像、検査結果、検査フロー、検査機器などをデータベース化するものである。これにより、実験室における書類の整理から解放され、検査データを効率よく、かつ、透明性をもって管理することが可能となる。コロニー計数装置１もカウント表と連携したり、検査条件と検査結果とを紐づけしたりするため、ＬＩＭＳの一端を担うことになる。とりわけ、検査画像に拡散度が紐付けされて管理されるため、後日に、検査時の検査条件（とりわけ、拡散度）について検証することが可能となる。　
［実施例から導き出される技術思想］　［観点Ａ１］　記憶装置３５は、複数の検査個体の各々のカウント結果が入力されるセルを含むカウント表を記憶する記憶部の一例である。ＭＣＵ３０および表示制御部３６は、記憶部に記憶されているカウント表を表示装置３７に表示する表示制御部の一例である。ＭＣＵ３０およびポインティングデバイス３３などは、表示制御部により表示されるカウント表に含まれる複数のセルの中から、カウント結果が
入力される対象セルを特定するセル特定部の一例である。ＭＣＵ２０またはＭＣＵ３０は、ユーザの操作にしたがった計数指示を生成する計数指示部の一例である。ＭＣＵ３０およびメインカメラ１１は、計数指示部で生成された計数指示に基づいて検査個体の画像である検査画像を取得する取得部の一例である。ＭＣＵ２０またはＭＣＵ３０は、取得部で取得された検査画像に基づき検査個体に含まれるコロニーを計数する計数部の一例である。図１９や図２０などが例示するように、ＭＣＵ２０またはＭＣＵ３０は、計数部により計数されたコロニーの数を対象セルに反映する表管理部として機能する。これにより、コロニーの計数結果についての事後処理に関するユーザの負担が軽減される。　
［観点Ａ２］　表管理部（例：ＭＣＵ３０）は、ユーザ操作に応じて検査個体の識別情報を格納する識別情報セルと、識別情報セルと関連付けられ、検査個体についてのコロニーの数のカウント結果を格納するカウント結果セルと、を含むカウント表を作成し、記憶部に当該カウント表を記憶させてもよい。つまり、図５や図１６などが示すように、カウント表５５、８２は、検査個体の識別情報（例：サンプル名）を格納する識別情報セルと、識別情報セルと関連付けられ、検査個体についてのコロニーの数のカウント結果を格納するカウント結果セルと、を含んでもよい。これにより、ユーザは、カウント表を手書きで作成する手間を省くことができるであろう。　
［観点Ａ３］　表管理部（例：ＭＣＵ３０）は、コロニーの数のカウント結果を格納するカウント結果セルに対して検査条件を関連付けてもよい。これにより、カウント結果が格納されるセルに対して検査条件を関連付けておくことで、コロニーに関する検査を事項する際に検査条件を容易に設定することが可能となる。　
［観点Ａ４］　取得部は、検査個体を照明する照明部（例：リング照明装置１２、１３、同軸照明装置１４）と、照明部により照明された検査個体を撮像する撮像部（例：メインカメラ１１）と、を有してもよい。検査条件は、照明部の照明条件（例：照明の種類、明るさ）を含んでもよい。大腸菌、一般生菌などの菌の種別や培地の種別（例：シート型の培地、液体型の培地、選択型の培地）に応じて適切な照明条件は異なる。よって、検査条件として照明条件を含めることで、各セルに適した照明条件が設定可能となる。さらに、検査条件は、撮像部の撮像条件（例：露光時間）を含んでもよい。培地の色やコロニーの色によって適切な撮像条件は異なりうる。検査条件が撮像条件を含むことで、各セルごとに適切な撮像条件が設定可能となろう。　
［観点Ａ５］　照明部は、検査個体を落射照明する第一照明モード（例：リング照明装置１２を点灯するモード）と、撮像部に対して対向する方向から検査個体を透過照明する第二照明モード（例：同軸照明装置１４を点灯するモード）とのいずれかにしたがって動作してもよい。検査条件は、第一照明モードまたは第二照明モードの選択を含む。検査条件が照明モードの指定を含むことで、各セルごとに適切な照明モードを選択することが可能となろう。　
［観点Ａ６］　検査条件は、計数部に適用される計数条件を含んでもよい。ここで、計数条件は、コロニーを検出するための閾値、および、コロニーを検出する際の基準となる色の少なくとも一方を含みうる。たとえば、計数条件は、コロニーとそれ以外とを区別するための閾値（例：検出感度を左右する二値化閾値）、および、コロニーを計数する際の基準となる色（例：前景色、背景色）を含んでもよい。ＭＣＵ２０またはＭＣＵ３０は、検査画像を二値化してコロニーの個数をカウントしてもよい。よって、二値化閾値はコロニーの検出感度を左右する。二値化閾値を適切に設定することで、コロニーの誤検出が減少する。また、コロニーの色と培地の色とを適切に設定することが出来れば、コロニーの誤検出が減少する。各セルごとに計数条件を設定することで、各セルごとにコロニーの誤検出が減少するであろう。また、計数条件に応じて計数アルゴリズムを適切に調整することが可能となろう。　
［観点Ａ７］　計数部（例：ＭＣＵ２０、ＭＣＵ３０）は、ユーザにより計数指示が入力されると、対象セルに関連付けられている検査条件にしたがった照明コマンドを照明部に出力してもよい。照明部は、照明コマンドにしたがって検査個体を照明する。撮像部は、照明コマンドにしたがって照明部により照明された検査個体を撮像して検査画像を生成する。計数部は、照明コマンドが反映された検査画像に基づきコロニーの数を計数する。これにより、各セルごとに設定された検査条件が反映された検査画像についてコロニー数を計数することが可能となる。　
［観点Ａ８］　計数部（例：ＭＣＵ２０、ＭＣＵ３０）は、特定部により対象セルが第一セルから第二セルに変更されると、取得部に適用される検査条件を、第一セルに関連付けられている第一検査条件から、第二セルに関連付けられている第二検査条件に変更する。このように、対象セルが変更されるとそれに連動して検査条件を変更することが可能となる。各セルごとに、つまり、検査個体ごとに適切な検査条件はことなることがある。予めセルごとに適切な検査条件が設定されていれば、ユーザはセルを選択するだけで適切な検査条件を選択することが可能となろう。　
［観点Ａ９］　サンプルＤＢ４０は、カウント表５５，８２の作成を補助するためのデータベースである。ＭＣＵ３０は、データベースにデータを登録する登録部として機能してもよい。カウント表５５、８２は、識別情報セルとカウント結果セルとをそれぞれ含む複数の行要素を有してもよい。登録部（ＭＣＵ３０）は、カウント結果がカウント結果セルに入力されたカウント表８２に含まれる行要素をデータベースに登録するように構成されてもよい。ここで、行要素は、セルと当該セルに関連付けられた検査条件とを含む。表管理部（ＭＣＵ３０）は、データベースに保持されている複数の行要素のうちユーザにより指定された行要素に基づき新規のカウント表を作成してもよい。たとえば、ユーザにより指定された行要素を構成するセルと当該セルに関連付けられている検査条件とが新規のカウント表へコピーされる。また、セルに格納されていたカウント結果は、サンプルＤＢ４０に登録される際に削除されてもよい。このように、予めカウント表の行要素として採用可能な行要素をデータベース化しておくことで、ユーザは、新規のカウント表を容易に作成することができる。　
［観点Ａ１０］　カウント表５５、８２は、複数の列要素を有してもよい。複数の列要素は、それぞれ組み合わせに関連付けられていてもよい。ここで、組み合わせとは、検査個体の培養条件（例：希釈倍率、培養時間）と菌種（例：一般生菌、大腸菌）との組み合わせである。各列要素は、培養条件と菌種との組み合わせが異なっている。たとえば、第一列要素と第二列要素とでは、培養条件と菌種とのうち少なくとも一方が異なっている。これにより、ある検査個体について、様々な培養条件と様々な菌種とから構成される複数の組み合わせそれぞれ対応するセルを一行にまとめることも可能となろう。　
［観点Ａ１１］　表管理部（例：ＭＣＵ３０）は、データベースに保持されている複数の行要素のうちユーザにより指定された行要素（指定行要素）が、新規のカウント表に含まれているか否かを判定してもよい。指定行要素がカウント表に含まれていないと判定された場合、ＭＣＵ３０は、指定行要素が、カウント表に含まれていない新規の列要素のセルを含むか否かを判定してもよい。指定行要素が新規の列要素のセルを含むと判定された場合、ＭＣＵ３０は、当該新規の列要素を新規のカウント表に追加する。一方、指定行要素がカウント表にすでに含まれているか、または、指定行要素が新規の列要素のセルを含まない場合、当該列要素はカウント表に追加されない。これにより、カウント表における行要素の重複と列要素の重複が抑制され、カウント表のコンパクト化が実現されよう。　
［観点Ａ１２、１３］　データベースは、親子関係を定義された複数の行要素を含んでもよい。親子関係は、完成品を親とし、当該完成品を構成する具材を子とする関係であってもよい。商品全体（完成品）の培養結果におけるコロニーのカウントと、商品を構成する個別の具材の培養結果におけるコロニーのカウントとが必要なケースがある。よって、親子関係をあらかじめ定義しておくことで、カウント表を作成する際のユーザ工数が削減される。たとえば、ある完成品（例：サンドイッチ）が選択されたときに、その具材（例：ハム、レタス）が選択可能に提示されてもよい。　
［観点Ａ１４］　表管理部（例：ＭＣＵ３０）は、親子関係を定義された複数の行要素を一括して新規のカウント表に追加してもよい。これにより、カウント表を作成する際のユーザの負担がさらに軽減されるであろう。　
［観点Ａ１５］　表管理部（例：ＭＣＵ３０）は、統計処理の適用が指示されると、同一の検査個体をそれぞれ培養するｎ個の培養器の各カウント結果を格納するｎ個の行要素と、当該ｎ個の行要素の統計処理結果を格納する少なくとも１個の行要素と、を含むようにカウント表を作成してもよい。図１１によれば、ｎ＝２の事例が説明されている。ｎは３以上であってもよい。これにより、平均化等の統計処理を実行するカウント表の作成が容易になろう。　
［観点Ａ１６］　図１６などが例示するように、表示制御部（例：ＭＣＵ３０）は、表示装置３７に、検査画像とカウント表とを並べて（同時並行的に）表示させてもよい。セル特定部（例：ＭＣＵ３０）は、表示装置３７に検査画像とともに表示されるカウント表に含まれる複数のセルの中から、ユーザの選択にしたがって対象セルを特定してもよい。表示制御部（例：ＭＣＵ３０）は、計数部により計数されたコロニーの数が対象セルに反映されたカウント表を、検査画像とともに表示装置に表示させてもよい。これにより、カウント結果を格納されるセルが容易に選択可能となろう。　
［観点Ａ１７］　図２５が例示するように、表示制御部（例：ＭＣＵ３０）は、対象セルに関連付けられる検査条件に含まれる照明条件を設定するための第一コントロールオブジェクト（例：タブ１２３）と、当該検査条件に含まれる計数条件を設定するための第二コントロールオブジェクト（例：タブ１２４）と、を表示装置３７に表示してもよい。これにより、セルに関連付けられている検査条件を容易に変更することが可能となろう。さらに、表示制御部（例：ＭＣＵ３０）は、第一コントロールオブジェクト（例：タブ１２３）に対するユーザ操作を検知すると、照明条件を設定するための設定画面（例：確認画面１１０）を表示装置に表示してもよい。表示制御部（例：ＭＣＵ３０）は、第二コントロールオブジェクト（例：タブ１２４）に対するユーザ操作を検知すると、計数条件を設定するための設定画面（例：設定画面１２０）を表示装置に表示してもよい。　
［観点Ａ１８］　表示制御部（例：ＭＣＵ３０）は、計数部に計数を指示するための第三コントロールオブジェクト（例：第一ソフトウエアボタン１０５ａ）と、カウント結果を対象セルに登録することを指示するための第四コントロールオブジェクト（例：第二ソフトウエアボタン１０５ｂ）と、を表示装置３７に表示してもよい。これによりユーザは容易にカウントの指示とカウント結果の登録とを指示することが可能となろう。　
［観点Ａ１９］　表示制御部（例：ＭＣＵ３０）は、第三コントロールオブジェクトに対するユーザ操作を検知すると、当該第三コントロールオブジェクトを、計数を指示するためのコントロールオブジェクト（例：カウントボタン）から、取得部に検査画像の取得を指示するためのコントロールオブジェクト（例：撮影ボタン、撮りなおしボタン）に割り当ててもよい。つまり、ＭＣＵ３０は、第三コントロールオブジェクトを操作することで発行されるコマンドを、計数を指示するためのコマ
ンドから、検査画像の取得を指示するためのコマンドに変更してもよい。これにより、操作可能なボタンの数が削減され、ユーザは、今、何を操作すべきかを容易に判断できるであろう。　
［観点Ａ２０］　図１８が例示するように、表示制御部（例：ＭＣＵ３０）は、第三コントロールオブジェクトが計数を指示するためのコントロールオブジェクト（例：カウントボタン）に割り当てられているときは、ユーザ操作を受け付けないように第四コントロールオブジェクト（例：登録ボタン）を表示してもよい。図１９が例示すように、計数を指示するためのコントロールオブジェクトに割り当てられている第三コントロールオブジェクトが操作されると、計数結果が取得される。表示制御部（例：ＭＣＵ３０）は、計数結果が取得されると、第三コントロールオブジェクトが取得部に検査画像の取得を指示するためのコントロールオブジェクト（例：撮影ボタン）に割り当てられ、かつ、ユーザ操作を受け付けるように第四コントロールオブジェクト（例：登録ボタン）を変更してもよい。つまり、第三コントロールオブジェクトに対して計数を指示するためのコマンドが割り当てられているときは、ユーザ操作を受け付けないように第四コントロールオブジェクトが表示されてもよい。さらに、計数を指示するためのコマンドが割り当てられている第三コントロールオブジェクトが操作されて、カウント結果が取得されると、第三コントロールオブジェクトに対して、取得部に検査画像の取得を指示するためのコマンドが割り当てられ、かつ、ユーザ操作を受け付けるように、第四コントロールオブジェクトの表示が変更されてもよい。これにより、ユーザは、今、何を操作すべきかを容易に判断できるであろう。　
［観点Ａ２１］　図１９，図２０などが例示するように、表示制御部（例：ＭＣＵ３０）は、第四コントロールオブジェクト（例：登録ボタン）が操作されると、カウント結果を対象セルに登録し、ユーザ操作を受け付けないように第四コントロールオブジェクトを再び変更してもよい。ここで、セル特定部は、対象セルを次のセルに変更する。図２０および図１８が例示するように、表示制御部（例：ＭＣＵ３０）は、取得部に検査画像の取得を指示するためのコマンドが割り当てられた第三コントロールオブジェクト（例：撮影ボタン）が操作されると、取得部に検査画像を取得させ、計数を指示するためのコマンドが第三コントロールオブジェクト（例：カウントボタン）に割り当てられてもよい。これにより、ユーザは、今、何を操作すべきかを容易に判断できるであろう。　
［観点Ａ２２］　ヘッド装置１は、たとえば、コロニー計数装置の筐体に設けられた第一ハードウエアボタンおよび第二ハードウエアボタンをさらに有してもよい。第一ハードウエアボタンと第三コントロールオブジェクトには同一の機能が割り当てられ、第二ハードウエアボタンと第四コントロールオブジェクトには同一の機能が割り当てられてもよい。これにより、ハードウエアボタンとソフトウエアボタンとを連携させることが可能となろう。ユーザが、ヘッド装置１にセットされたシャーレ１５に注視している場合、ヘッド装置１のハードウエアボタンにより指示を入力することが可能となる。つまり、ユーザは、ＰＣ１ｂの表示装置３７に視線を移し、かつ、ポインティングデバイス３３を操作することなく、簡単に指示を入力できるようになろう。その一方で、ユーザが、ＰＣ１ｂに表示された検査画像に注視している場合、ハードウエアボタンに視線を移し、それを押すことは、作業効率を低下させるだろう。よって、この場合、表示装置３７にソフトウエアボタンを表示することで、ユーザは簡単かつ正確にボタンを操作できるようになろう。　
［観点Ａ２３］　アプリケーションプログラム３９は、コロニー計数装置を制御する制御装置において実行されるプログラムの一例である。アプリケーションプログラム３９は、ＰＣ１ｂに、　複数の検査個体の各々のカウント結果が入力されるセルを含むカウント表を記憶部に記憶させ、　記憶部に記憶されているカウント表を表示装置に表示させ、　表示装置に表示されるカウント表に含まれる複数のセルの中から、カウント結果が入力される対象セルを特定させ、　検査個体の画像である検査画像を取得させ、　ユーザにより入力される計数指示にしたがって、取得部で取得された検査画像に基づき検査個体に含まれるコロニーの数を取得させ、　コロニーの数を対象セルに反映させる。　
［観点Ａ２４］　上記の実施例によれば、コロニー計数装置１を制御する制御方法が提供される。当該制御方法は、　複数の検査個体の各々のカウント結果が入力されるセルを含むカウント表を記憶部に記憶させることと、　記憶部に記憶されているカウント表を表示装置に表示することと、　表示装置に表示されるカウント表に含まれる複数のセルの中から、カウント結果が入力される対象セルを特定することと、　検査個体の画像である検査画像を取得することと、　ユーザにより入力される計数指示にしたがって、取得部で取得された検査画像に基づき検査個体に含まれるコロニーを計数することと、　計数されたコロニーの数を対象セルに反映させることと、を有する。　
［観点Ｂ１］　記憶装置３５は、検査個体についてのコロニーのカウント結果が入力されるセルを含むカウント表と、当該カウント表に関連付けられた識別情報と、を記憶する記憶部として機能する。ＭＣＵ３０およびＭＣＵ２０は、識別情報を符号化した識別画像（例：一次元シンボル、二次元シンボル）から当該識別情報を取得する識別情報取得部として機能する。ＭＣＵ３０は、取得部により取得された識別情報に関連付けられているカウント表を記憶部から読み出す表管理部として機能する。さらに、ＭＣＵ３０は、表管理部で読み出されたカウント表に含まれる複数のセルの中から、カウント結果が入力される対象セルを特定するセル特定部として機能する。ＭＣＵ２０またはＭＣＵ３０は、ユーザの操作にしたがった計数指示を生成する計数指示部として機能する。メインカメラ１１は、計数指示部で生成された計数指示に基づいて検査個体の画像である検査画像を撮像する第一撮像部として機能する。ＭＣＵ２０またはＭＣＵ３０は、前記第一撮像部で撮像された検査画像に基づき検査個体に含まれるコロニーを計数する計数部として機能する。表管理部（例：ＭＣＵ３０）は、セル特定部で特定された対象セルに、計数部により計数されたコロニーの数を反映するように構成されている。このように、識別画像から、カウント結果を入力されることになるカウント表が特定されて表示されるため、コロニーの計数に関するユーザの負担が軽減される。　
［観点Ｂ２］　識別情報取得部は、第一撮像部（例：メインカメラ１１）により撮像された識別画像から識別情報を取得するように構成されていてもよい。このように、検査個体を撮像する撮像部を、識別画像を撮像する撮像部として兼用してもよい。　
［観点Ｂ３］　識別情報取得部は第二撮像部を有してもよい。フロントカメラ１０は、識別画像を撮像する第二撮像部の一例である。識別情報取得部（例：ＭＣＵ２０，３０）は、第二撮像部により撮像された識別画像から識別情報を取得するように構成されていてもよい。　
［観点Ｂ４］　第二撮像部（例：フロントカメラ１０）は、検査個体の外観、包装体（例：包装袋、商品パッケージ）により包装された検査個体の外観、および、当該包装体に印刷された情報のうちの少なくとも一つである付加画像を撮像するように構成されていてもよい。記憶部（例：記憶装置３５）は、対象セルに対して、付加画像と、当該付加画像から取得される付加情報とのうちの少なくとも一方を関連付けて記憶してもよい。上述されたように、カウント表は、カウント結果が入力されるセルと、画像等を格納可能なセル（例：備考セル、自由列のセル）を有してもよい。この場合、後者のセルには、付加画像（例：商品外観）や付加情報（例：商品コード）が格納されるか、関連付けられてもよい。ユーザは、対象セルに関連付けられて記憶されている付加情報または付加画像を参照することで、どの検査個体についてのカウント結果であるかを、容易に把握できるようになろう。　
［観点Ｂ５］　カウント表は、付加画像と付加情報とのうちの少なくとも一方を保持する付加セル（例：備考セル、自由列のセル）を含んでもよい。ユーザは、付加セルに保持されている付加情報または付加画像を参照することで、どの検査個体についてのカウント結果であるかを、容易に把握できるようになろう。　
［観点Ｂ６］　図２９や図４０が示すように、ＭＣＵ３０およびポインタ５７は、カウント表に存在する複数の付加セルから一つの付加セルを選択する選択部として機能してもよい。さらに、ＭＣＵ３０は、選択部により選択された一つの付加セルに、付加画像と付加情報とのうちの少なくとも一方を登録する付加情報登録部として機能してもよい。これにより、ユーザは、カウント表において希望するセルに対して付加画像や付加情報を登録することができる。　
［観点Ｂ７］　ＭＣＵ３０は、対象セルに関連付けられている検査個体の識別情報（例：サンプル名、シャーレ番号）を入手する入手部として機能してもよい。記憶部は、ユーザにより入力される計数指示により第一撮像部により撮像された検査個体の検査画像を検査個体の識別情報と関連付けて記憶するように構成されていてもよい。従来、検査画像と検査個体との関係を正しく記録することは多くの工数が必要であった。たとえば、デジタルカメラで検査画像を取得することが考えられるが、この場合、検査画像と検査個体の識別情報とを人手による紐づけすること必要となるだろう。また、人手による紐づけは、ヒューマンエラーの原因となる。本実施例では、ＭＣＵ３０が対象セルを特定し、かつ、対象セルに関連付けられている検査個体の識別情報に対して検査個体の検査画像を関連付ける。よって、従来によりユーザに必要とされる項数が削減され、かつ、検査個体の検査画像と検査個体の識別情報との関係を正しく記録することが可能となる。　
［観点Ｂ８］　図３３が例示するように、ＭＣＵ３０は、検査個体の識別情報と、計数部により計数されたコロニーの数と、検査個体の検査画像と、を含むレポートを生成するレポート生成部として機能してもよい。これにより、ユーザは、どのサンプルの計測結果であるかを直感的に把握できるようになろう。　
［観点Ｂ９］　カウント表においてコロニーの数を入力されるセルには固有のセル識別情報が付与されていてもよい。図４１が示すように、ＭＣＵ３０は、固有のセル識別情報を符号化した識別画像２２１をプリンタ３８によりシール２７０（粘着面を有する樹脂または紙）に印刷してもよい。ユーザは、シャーレ１５の側面にシール２７０を貼り付ける。なお、シャーレ番号は、固有のセル識別情報として利用されてもよい。識別情報取得部（例：ＭＣＵ３０、フロントカメラ１０またはメインカメラ１１）は、セル識別情報を取得するように構成されていてもよい。セル特定部（例：ＭＣＵ３０）は、識別情報取得部により取得されたセル識別情報に基づき対象セルを特定してもよい。これにより、ユーザが対象セルを指定する手間が省けるようになる。さらに、検査個体に対応した対象セルが正確に特定されるようになろう。　
［観点Ｂ１０］　図２８が示すように、識別情報取得部（例：ＭＣＵ３０）は、第一撮像部または第二撮像部によりユーザ認証情報を取得してもよい。これにより、ユーザ認証用の専用のカメラやコードリーダーを省略できるようになろう。　
［観点Ｂ１１］　図２７が例示するように、識別情報取得部（例：ＭＣＵ３０、フロントカメラ１０またはメインカメラ１１）は、印刷媒体（例：検査リスト２２０）に印刷された識別画像から識別情報を取得するように構成されていてもよい。　
［観点Ｂ１２］　ＭＣＵ３０は、カウント表と、当該カウント表に関連付けられた識別情報とを含む検
査リストのデータを作成するデータ作成部として機能してもよい。　
［観点Ｂ１３］　識別情報取得部（例：ＭＣＵ３０、フロントカメラ１０またはメインカメラ１１）は、端末装置１ｃに表示された識別画像から識別情報を取得するように構成されていてもよい。これにより、紙媒体を削減することが可能となる。　
［観点Ｂ１４］　通信回路３４は、端末装置１ｃと通信し、端末装置１ｃに識別画像を送信する通信部の一例である。　
［観点Ｂ１５］　ＭＣＵ３０は、ユーザ操作に応じてカウント表を作成し、記憶部に当該カウント表を記憶させる作成部として機能してもよい。　
［観点Ｂ１６］　作成部（例：ＭＣＵ３０）は、コロニーの数のカウント結果を格納するセルに対して検査条件を関連付けてもよい。第一撮像部は、検査条件（例：露光時間、照明の種類、明るさ）にしたがって検査個体を撮像するように構成されていてもよい。　
［観点Ｂ１７］　コロニー計数装置１は、第一撮像部を有する筐体（例：上部ユニット２、支持ユニット３および下部ユニット４）をさらに有してもよい。　
筐体は、検査個体を収容したシャーレ１５を保持するステージ５と、検査個体を照明する照明部（例：リング照明装置１２、１３、同軸照明装置１４）と、ユーザにより入力される計数指示を受け付ける受付部（例：第一ハードウエアボタン８ａ）と、を有してもよい。　
［観点Ｂ１８］　コロニー計数装置１は、第一撮像部および第二撮像部を有する筐体（例：上部ユニット２、支持ユニット３および下部ユニット４）をさらに有してもよい。筐体は、検査個体を収容したシャーレ１５を保持するステージ５と、検査個体を照明する照明部（例：リング照明装置１２、１３、同軸照明装置１４）と、ユーザにより入力される計数指示を受け付ける受付部（例：第一ハードウエアボタン８ａ）とを有してもよい。さらに、筐体は、凹部４ａを有してもよい。第二撮像部（例：フロントカメラ１０）は、凹部に配置されていてもよい。受付部（例：第一ハードウエアボタン８ａ）は、ステージと凹部との間にある操作部（操作部８）に配置されていてもよい。これにより、簡単に、計数指示を入力することが可能となる。　
［観点Ｂ１９］　コロニー計数装置１が第一状態にあるときに受付部（例：第一ハードウエアボタン８ａ）が撮像指示を受け付けると、第一撮像部が撮像を実行してもよい。コロニー計数装置１が第一状態と異なる第二状態にあるときに受付部が撮像指示を受け付けると、第二撮像部が撮像を実行してもよい。これにより、単一の受付部に対する同一の操作であるにも拘らず、異なる撮像部に撮像を指示することが可能となる。第一状態とは、たとえば、カウント表がすでに特定された状態である。第二状態とは、たとえば、カウント表がまだ特定されていない状態である。　
［観点Ｂ２０］　コロニー計数装置を制御するプロセッサにおいて実行されるプログラムであって、プロセッサに、　検査個体についてのコロニーのカウント結果が入力されるセルを含むカウント表と、当該カウント表に関連付けられた識別情報と、を記憶部に記憶させ、　前記識別情報を符号化した識別画像から当該識別情報を取得させ、　前記取得された前記識別情報に関連付けられている前記カウント表を前記記憶部から読み出させ、　前記読み出されたカウント表に含まれる複数のセルの中から、カウント結果が入力される対象セルを特定させ、　ユーザの操作にしたがった計数指示を生成させ、　前記生成された計数指示に基づき前記検査個体の画像である検査画像を撮像させ、　前記撮像された検査画像に基づき前記検査個体に含まれるコロニーを計数させ、　前記特定された対象セルに、前記計数されたコロニーの数を反映させる。　
［観点Ｂ２３］　コロニー計数装置を制御するプロセッサにおいて実行される制御方法であって、　検査個体についてのコロニーのカウント結果が入力されるセルを含むカウント表と、当該カウント表に関連付けられた識別情報と、を記憶部に記憶することと、　識別情報を符号化した識別画像から当該識別情報を取得することと、　前記取得された前記識別情報に関連付けられている前記カウント表を前記記憶部から読み出すことと、　前記読み出されたカウント表に含まれる複数のセルの中から、カウント結果が入力される対象セルを特定することと、　ユーザの操作にしたがった計数指示を生成することと、　前記生成された計数指示に基づき、前記検査個体の画像である検査画像を撮像することと、　前記撮像された検査画像に基づき前記検査個体に含まれるコロニーを計数することと、　前記特定された対象セルに、前記計数されたコロニーの数を反映することと、を有する。　
［観点Ｃ］　［観点Ｃ１］　検査個体が載置される第一面と、前記第一面の裏面である第二面とを有し、前記第二面から前記第一面に光を透過可能なステージ（例：透過窓６）と、　前記ステージの前記第一面に対向して配置され、当該ステージに載置された前記検査個体の検査画像を生成する撮像部（例：メインカメラ１１）と、　前記ステージの前記第二面から前記第一面へ検査光のビームが透過するように、前記第二面に向けて前記検査光を照射する面光源（例：同軸照明装置１４）と、　前記面光源と、前記ステージの前記第二面との間に配置され、前記検査光のビームの拡散度を調整する調光部（例：拡散板１３ｃ、１３ｄ）と、　少なくとも前記調光部を制御する制御部（例：ＭＣＵ２０、３０、調光制御部１３ｚ）と、　前記面光源から出力され、前記調光部で拡散度が調整された前記検査光のビームが照射された前記検査個体を、前記撮像部により撮像することで生成された検査画像に含まれるコロニーの数を計数する計数部（例：ＭＣＵ２０，３０）と、を有するコロニー計数装置。　
本実施例によれば、調光部が拡散度を調整可能であるため、拡散度を切り替える際のユーザの負担が軽減される。また、培養する菌種・培地の種類に合わせて最適な照明（拡散性）を選択することができ、カウント精度を向上させることができる。　
［観点Ｃ２］　前記面光源は、当該面光源から出力される前記検査光の配光角を規制する配光角規制部（例：配光規制板４３０１）を有する、観点Ｃ１に記載のコロニー計数装置。　
一般に面光源では各発光素子が独立していることから、光量のムラが発生する。特に面光源から平行光を検査光として検査個体に照射することがある。光量ムラは小さくするには、透過窓６から面光源を遠ざけねばならず、ヘッド装置１ａが大型化してしまう。そこで、配光角規制部を採用することで、面光源から透過窓６までの距離を削減しても、光量ムラが少なくなる。　
［観点Ｃ３］　前記配光角規制部は、　　　前記面光源を形成する複数の発光素子（例：発光素子１４ａ）の各々に対して配置される複数のライトガイド（例：ライトガイド４３０２）と、　　　前記複数のライトガイドの各々に対して配置される複数の絞り（例：絞り４３０３）と、を有する、観点Ｃ２に記載のコロニー計数装置。　
このような構造を採用することで、所望の配光角が実現され、光量ムラが少なくなる。また、単一の光源とレンズ光学系で構成する場合と比較して、照射面積を維持しつつ、より小型に光学系を構成することができる。　
［観点Ｃ４］　前記複数の発光素子は、それぞれ半径が異なる複数の同心円のいずれか上に配置されている（例：図４３）、観点Ｃ３に記載のコロニー計数装置。　
このように複数の発光素子を配置することでさらに光量ムラが少なくなる。　
［観点Ｃ５］　前記複数の同心円のうち半径の大きな同心円上に配置される複数の発光素子の配置間隔（例：ｉ１）は、前記複数の同心円のうち半径の小さな同心円に配置される複数の発光素子の配置間隔（例：ｉ２）よりも狭い（例：図４３でｉ２＞ｉ１）、観点Ｃ４に記載のコロニー計数装置。　
このように複数の発光素子を配置することで、面光源の中心部の光量と外縁部の光量との差が小さくなる。　
［観点Ｃ６］　前記配光角規制部は、前記面光源と前記調光部との間に配置されたテレセントリックレンズ（例：テレセントリック光学系４８０２）を有する、観点Ｃ１に記載のコロニー計数装置。　
このように配光角規制部がテレセントリックレンズにより実現されてもよい。　
［観点Ｃ７］　前記調光部は、第一拡散度と、第二拡散度との間で前記拡散度を切り替え可能であり、　前記第一拡散度は、前記第二拡散度よりも大きい、観点Ｃ１に記載のコロニー計数装置。　
このように少なくとも二つの拡散度を実現可能な調光部が採用されてもよい。これにより、ユーザは、簡単に拡散度を選択できるようになろう。　
［観点Ｃ８］　前記撮像部は、前記調光部により前記検査光のビームの拡散度が前記第一拡散度に切り替えられることにより、前記検査個体を収容する容器（例：シャーレ１５）の傷または前記検査個体に起因するノイズが低減された検査画像を生成する、観点Ｃ７に記載のコロニー計数装置。　
拡散度を大きくすることで、検査個体を収容する容器の傷や、検査個体に起因するノイズを低減することができ、カウントを正確に実行することが可能となろう。　
［観点Ｃ９］　前記撮像部は、前記調光部により前記検査光のビームの拡散度が前記第二拡散度に切り替えられることにより、前記コロニーの輪郭が強調された検査画像を生成する、観点Ｃ７に記載のコロニー計数装置。　
ＭＣＵ３０は、検査条件に従って、コロニーの円形度、アスペクト比、面積、周長などを計測することがある。この場合、コロニーの輪郭が強調される第二拡散度が有効であろう。　
［観点Ｃ１０］　前記検査画像を取得する際に前記調光部に設定された拡散度と、当該検査画像とを対応付けて記憶する記憶部（例：記憶装置３５）をさらに有する、観点Ｃ１に記載のコロニー計数装置。　
拡散度は検査条件２８の一つである。図４が示すように検査条件２８はカウント表５５，検査画像と紐づけられて記憶装置３５に記憶される。つまり、検査画像２９を取得する際に調光部に設定された拡散度と検査画像２９とが紐付けられて記憶装置３５に記憶される。　
［観点Ｃ１１］　前記制御部は、前記計数部による計数対象の前記検査画像として、前記調光部を制御して前記検査個体に第一拡散度の検査光が照射された状態で、前記撮像部を制御して第一検査画像（例：高拡散度の検査画像５３０１、５５０１）を取得するとともに、前記調光部を制御して前記検査個体に前記第一拡散度よりも小さい二拡散度の検査光が照射された状態で、前記撮像部を制御して第二検査画像（例：低拡散度の検査画像５３０２、５５０２）を取得するように構成されており、　前記コロニー計数装置は、さらに、　前記第一検査画像と前記第一拡散度に関する拡散度情報とを対応付けて記憶部に登録するとともに、前記第二検査画像と前記第二拡散度に関する拡散度情報とを対応付けて前記記憶部に登録する登録部と、　前記第一検査画像と、前記第二検査画像と、の差分を算出することで、前記第一検査画像と前記第二検査画像との双方で明領域として観察される外乱の影響を抑制した外乱抑制画像を生成する画像処理部と、を有し、　前記計数部は、前記検査画像として、前記画像処理部により生成された前記外乱抑制画像に基づいて前記コロニーの数を計数する、観点Ｃ１０に記載のコロニー計数装置。　
ＭＣＵ３０は、検査画像５３０１、５５０１と第一拡散度に関する拡散度情報とを対応付けて記憶装置３５に登録する登録部として機能する。さらに、ＭＣＵ３０は、第二検査画像５３０２、５５０２と第二拡散度に関する拡散度情報とを対応付けて記憶装置３５に登録する登録部として機能する。拡散度情報は、数値、レベル、程度（強弱、大小、高低）、機能（ノイズ低減オン／オフ）などを含みうる。　
［観点Ｃ１２］　前記調光部は、電気的に拡散度を変更可能な拡散部材（例：拡散板１３ｃ、液晶フィルムタイプの拡散フィルム４９０１、４９０２）を有し、　前記制御部は、前記拡散部材の拡散度を電気的に変更することで、前記調光部の拡散度を変更する、観点Ｃ１に記載のコロニー計数装置。　
これにより即座に拡散度を切り替えることが可能となる。また、拡散部材の設置スペースを削減することが可能となる。　
［観点Ｃ１３］　前記調光部は、電気的に拡散度を変更可能な複数の拡散部材（例：拡散板１３ｃ、液晶フィルムタイプの拡散フィルム４９０１、４９０２）を有し、　前記制御部は、前記複数の拡散部材の拡散度を電気的に変更することで、前記調光部の拡散度を変更する、観点Ｃ１に記載のコロニー計数装置。　
上記の実施例では拡散板１３ｃが拡散フィルム４９０１、４９０２により実現されているが、拡散板１３ｄも拡散フィルム４９０１、４９０２により実現されてもよい。つまり、拡散板１３ｄも拡散板１３ｃと同様に拡散度を切り替え可能であってもよい。　
［観点Ｃ１４］　前記制御部（例：調光制御部１３ｚ）は、前記拡散部材に印加される電圧を変化させることで、前記拡散部材の拡散度を変更する、観点Ｃ１２または１３に記載のコロニー計数装置。　
このように電気的パラメータを変更することで拡散度が変更できるため、調光部および制御部の実装が容易になろう。　
［観点Ｃ１５］　前記調光部は、　　　透光性を有する透明基板（例：ガラス板などの基材４９００）と、　　　前記透明基板の第一面に設けられた第一拡散フィルム（例：拡散フィルム４９０１、４９０２）と、　　　前記透明基板の第二面に設けられた第二拡散フィルム（例：拡散フィルム４９０１、４９０２）と、を有し、　前記制御部（例：調光制御部１３ｚ）は、前記第一拡散フィルムと前記第二拡散フィルムとのうちの少なくとも一方の拡散度を電気的に変更することで、前記調光部の拡散度を変更する、観点Ｃ１に記載のコロニー計数装置。　
このように複数の拡散フィルムの拡散度を選択的に変更することで、複数の拡散度を実現することが可能となる。また、複数の拡散フィルムのうち、より光量ムラを小さくできるような拡散フィルムをＭＣＵ３０が優先的に使用してもよい。　
［観点Ｃ１６］　前記調光部は、　　　所定の拡散度を有する拡散部材（例：拡散板１３ｃ、１３ｄ）と、　　　前記拡散部材を前記検査光の光路中に配置したり、前記拡散部材を前記光路中から退避させたりするよう前記拡散部材を移動するアクチュエータ（例：モータ１３ｅ）と、を有し、　前記制御部（例：調光制御部１３ｚ）は、前記アクチュエータを制御することで、前記検査光のビームの拡散度を変更する、観点Ｃ１に記載のコロニー計数装置。　
ヘッド装置１ａのサイズに余裕がある場合、このような機械的な拡散度調整機構が採用されてもよい。これにより、ユーザは簡単に拡散度を切り替えることが可能となる。　
［観点Ｃ１７］　培地の種別ごとに拡散度の設定を受け付ける設定受付部（例：ＭＣＵ３０，ＵＩ５４００、チェックボックス５４０３）と、　前記ステージに載置された前記検査個体の培地の種別の入力を受け付ける種別受付部（例：ＭＣＵ３０，ダイアログ９０）と、をさらに有し、　前記制御部は、前記種別受付部により受け付けられた前記検査個体の前記培地の前記種別に対応する拡散度を特定し、当該特定された拡散度に応じて前記調光部を制御するように構成されている、観点Ｃ１に記載のコロニー計数装置。　
このように、ＭＣＵ３０は、キーボード３２やポインティングデバイス３３を通じて、培地の種別ごとに拡散度を受け付け、培地の種別と拡散度とを紐づけて記憶装置３５に記憶してもよい。さらに、ＭＣＵ３０は、キーボード３２やポインティングデバイス３３を通じて、ステージに載置された検査個体の培地の種別の入力を受け付けてもよい。ＭＣＵ３０は、種別受付部により受け付けられた検査個体の培地の種別に対応する拡散度を特定し、当該特定された拡散度に応じて拡散板１３ｃを制御してもよい。　
［観点Ｃ１８］　前記検査個体を識別する識別情報と、前記検査個体に適用される前記調光部の拡散度に関する拡散度情報と、前記計数部により取得される前記コロニーの数と、を記録するカウント表を作成する作成部（例：ＭＣＵ３０）をさらに有し、　前記制御部は、　　　前記カウント表からセルの選択を受け付け、　　　前記受け付けたセルに対応する前記拡散度情報に基づき前記調光部の前記拡散度を制御するように構成されており、　前記計数部は、前記コロニーの数を前記受け付けたセルに書き込むように構成されている、観点Ｃ１に記載のコロニー計数装置。　
このように、ＭＣＵ３０は、検査個体を識別する識別情報と、検査個体に適用される調光部の拡散度に関する拡散度情報と、計数部により取得されるコロニーの数と、を記録するカウント表を作成する作成部として機能する。ＭＣＵ３０は、カウント表の拡散度情報に基づき調光部の拡散度を制御するように構成されてもよい。さらに、ＭＣＵ３０は、コロニーの数をカウント表に書き込む。　
［観点Ｃ１９］　前記検査個体は、容器と、当該容器に収容され、菌が塗布された培地（例：培地５６０１）と、当該培地に置かれた薬剤（例：薬剤５６０２）と、を含み、　前記コロニー計数装置は、さらに、　前記検査画像から、前記薬剤が広がることで前記菌の周囲に形成される阻止円のサイズ（例：直径Ｄｃ）を演算する演算部（例：ＭＣＵ３０）をさらに有する、観点Ｃ１に記載のコロニー計数装置。　
図５６が示すように阻止円５６０３を測定するためにコロニー計数装置１が利用されてもよい。従来は、ノギス等を用いて阻止円５６０３が計測されていたが、本実施例であれば、コロニー計数装置１を用いて容易に阻止円５６０３を計測できるようになる。　
［観点Ｃ２０］　検査個体を載置される第一面と、前記第一面の裏面である第二面とを有し、前記第二面から前記第一面に光を透過可能なステージと、　前記ステージの前記第一面に対向して配置され、当該ステージに載置された前記検査個体の検査画像を生成する撮像部と、　前記ステージの前記第二面から前記第一面へ検査光のビームが透過するように、前記第二面に向けて前記検査光を照射する面光源と、　前記面光源と、前記ステージの前記第二面との間に配置され、前記検査光のビームの拡散度を調整する調光部と、を有するコロニー計数装置の制御方法であって、　前記調光部に前記拡散度を設定することと、　前記面光源を点灯することと、　前記面光源から出力され、前記調光部で拡散度を調整され、前記ステージの前記第二面から入射して前記ステージの前記第一面から出射した前記検査光のビームが照射された前記検査個体を、前記撮像部により撮像することで検査画像を生成することと、　前記検査画像に含まれるコロニーの数を計数することと、を有する制御方法。　
［観点Ｃ２１］　観点Ｃ２０に記載の制御方法をコロニー計数装置に実行させる、プログラム。　
［観点Ｃ２２］　培地の種別ごとに拡散度の設定を受け付ける設定受付部（例：ＭＣＵ３０，ＵＩ５４００、チェックボックス５４０３）と、　検査個体を載置されるステージと、　前記ステージに載置された前記検査個体の培地の種別の入力を受け付ける種別受付部（例：ＭＣＵ３０，ダイアログ９０）と、　前記ステージに載置された前記検査個体に対して検査光を照射する照明部と、　前記照明部から照射された前記検査光が前記検査個体に至るまでの光路中に設けられ、前記照明部から照射された前記検査光の拡散度を調整する調光部と、　前記種別受付部により受け付けられた前記検査個体の前記種別に対応する拡散度を特定し、当該特定された拡散度に応じて前記調光部を制御する制御部（例：ＭＣＵ２０、ＭＣＵ３０、調光制御部１３ｚ）と、　前記照明部から照射され、前記調光部を透過し、前記ステージに載置された前記検査個体を透過または前記検査個体で反射してきた検査光を受光し、当該検査個体の検査画像を生成する撮像部と、　前記調光部を介して前記検査光が照射された前記検査個体について、前記撮像部により生成された前記検査画像に含まれるコロニーの数を計数する計数部と、を有するコロニー計数装置。　
［観点Ｄ］　［観点Ｄ１］　検査個体を撮像して得られた検査個体の画像を取得する取得部（例：ＭＣＵ３０、メインカメラ１１）と、　前記取得部により取得された前記検査個体の画像に対してそれぞれ異なるコロニー検出パラメータを適用して得られた複数のコロニー検出結果を対比可能に表示部に表示する表示処理部（例：ＭＣＵ３０、表示制御回路３６）と、　前記表示部に表示される複数のコロニー検出結果のうちユーザ操作に応じて一つのコロニー検出結果を選択する選択部（例：ＭＣＵ３０、ポインティングデバイス３３）と、　前記選択部により選択された前記一つのコロニー検出結果を得るために使用されたコロニー検出パラメータを前記検査個体の画像に対して適用して、当該検査個体の画像に含まれるコロニーの数を計数する計数部（例：ＭＣＵ３０）と、を有するコロニー計数装置。　
観点Ｄ１によれば、コロニー計数装置１における検査パラメータの調整が容易になる。すなわち、ユーザは、複数のコロニー検出結果を対比して自分の感覚に合った一つのコロニー検出結果を選択することで、間接的にコロニー検出パラメータを選択できる。そのため、コロニー検出パラメータの調整が容易になる。なお、前記選択部は、前記表示部に同時に表示されるか、または、順番に一つずつ切り替えられながら表示される複数のコロニー検出結果のうちユーザ操作に応じて一つのコロニー検出結果を選択してもよい。いずれの場合でも複数のコロニー検出結果は対比可能に表示されていると言えるからである。　
［観点Ｄ２］　前記複数のコロニー検出結果はそれぞれ、前記検査個体の画像（例：元画像、二値化画像）に、コロニーの検出位置を示す目印が重畳された画像である、観点Ｄ１に記載のコロニー計数装置。　
これにより、ユーザは検査個体の画像を見ながら、自分がコロニーと考える画像領域を確認することが可能となる。　
前記複数のコロニー検出結果はそれぞれ、コロニーの検出位置を示す目印（例：十字マーク、元画像に重ねられた二値化画像）を含んでもよい。　
これにより、ユーザは検査個体の画像を見ながら、自分がコロニーと考える画像領域が、コロニーとして抽出されているかどうかを確認することが可能となる。つまり、ユーザは、パラメータの値を見ずとも、画像を確認するだけで、パラメータを調整できるようになる。　
［観点Ｄ３］　前記複数のコロニー検出結果はそれぞれ、検出されたコロニーの個数を示す数値（例：カウント数）を含む、観点Ｄ１またはＤ２に記載のコロニー計数装置。　
これにより、ユーザは、自ら数えたコロニー数と、コロニー計数装置１により得られたコロニー数とを比べることが可能となる。その結果、ユーザは、パラメータの値を見ずとも、コロニー数を確認するだけで、パラメータを調整できるようになる。　
［観点Ｄ４］　前記複数のコロニー検出結果は、コロニーを検出するために使用されたコロニー検出パラメータを対応付けられて、前記表示部に表示される、観点Ｄ１からＤ３のいずれかに記載のコロニー計数装置。　
これにより、どのような値のコロニー検出パラメータが適切であるかを、学習することが可能となろう。　
［観点Ｄ５］　前記コロニー検出パラメータに基づき前記検査個体の画像から二値化画像を生成する画像処理部（例：ＭＣＵ３０）と、　前記二値化画像からコロニーを検出する検出部（例：ＭＣＵ３０）と、をさらに有し、　前記計数部は、前記検出部により検出されたコロニーの数を計数し、　前記複数のコロニー検出結果
は、前記二値化画像と、前記コロニーの検出位置と、前記コロニーの数と、を含む、観点Ｄ１からＤ４のいずれかに記載のコロニー計数装置。　
図６０などが例示するように、コロニー検出結果は、二値化画像と、コロニーの検出位置と、コロニーの数とを含んでもよい。これにより、ユーザは、自分の感覚に近い、コロニー検出結果を選択しやすくなるであろう。　
［観点Ｄ６］　一次候補となるそれぞれ異なるコロニー検出パラメータを用いて取得された前記複数のコロニー検出結果から前記一つのコロニー検出結果が選択されると、前記一つのコロニー検出結果を得るために使用されたコロニー検出パラメータに基づき二次候補となるそれぞれ異なる複数のコロニー検出パラメータを決定する決定部（例：ＭＣＵ３０、Ｓ１２１）をさらに有し、　前記決定部により前記二次候補となるそれぞれ異なる複数のコロニー検出パラメータが決定されると、　前記表示処理部は、前記検査個体の画像に対して前記二次候補となるそれぞれ異なる複数のコロニー検出パラメータを適用して得られた複数のコロニー検出結果を対比可能に前記表示部に表示し（例：Ｓ１２２、Ｓ１２３）、　前記選択部は、前記表示部に同時に表示され、前記二次候補となるそれぞれ異なる複数のコロニー検出パラメータを適用して得られた前記複数のコロニー検出結果のうちユーザ操作に応じて一つのコロニー検出結果を選択し（例：Ｓ１２４）、　前記計数部は、前記選択部により選択された前記一つのコロニー検出結果を得るために使用されたコロニー検出パラメータを前記検査個体の画像に対して適用して、当該検査個体の画像に含まれるコロニーの数を計数する、観点Ｄ１からＤ５のいずれかに記載のコロニー計数装置。　
このように一次候補となるコロニー検出パラメータから二次候補となるコロニー検出パラメータが決定されてもよい。これにより、段階的にコロニー検出パラメータが絞り込まれてもよい。　
［観点Ｄ７］　前記決定部は、前記二次候補となるそれぞれ異なるコロニー検出パラメータを用いて取得された前記複数のコロニー検出結果から前記一つのコロニー検出結果が選択されると、前記一つのコロニー検出結果を得るために使用されたコロニー検出パラメータに基づき三次候補となるそれぞれ異なる複数のコロニー検出パラメータを決定し、　前記決定部により前記三次候補となるそれぞれ異なる複数のコロニー検出パラメータが決定されると、　前記表示処理部は、前記検査個体の画像に対して前記三次候補となるそれぞれ異なる複数のコロニー検出パラメータを適用して得られた複数のコロニー検出結果を対比可能に前記表示部に表示し、　前記選択部は、前記表示部に表示された、前記三次候補となるそれぞれ異なる複数のコロニー検出パラメータを適用して得られた前記複数のコロニー検出結果のうちユーザ操作に応じて一つのコロニー検出結果を選択し、　前記計数部は、前記選択部により選択された前記一つのコロニー検出結果を得るために使用されたコロニー検出パラメータを前記検査個体の画像に対して適用して、当該検査個体の画像に含まれるコロニーの数を計数する、観点Ｄ６に記載のコロニー計数装置。　
このように二次候補となるコロニー検出パラメータから三次候補となるコロニー検出パラメータが決定されてもよい。これにより、段階的にコロニー検出パラメータが絞り込まれてもよい。　
［観点Ｄ８］　前記二次候補となる複数のコロニー検出パラメータの間隔は、前記一次候補となる複数のコロニー検出パラメータの間隔よりも精緻である、観点Ｄ６に記載のコロニー計数装置。これにより、徐々にかつ緻密にコロニー検出パラメータを調整することが可能となろう。　
［観点Ｄ９］　前記二次候補となる複数のコロニー検出パラメータは、　　　前記一次候補となる複数のコロニー検出パラメータのうち、前記選択部により選択された前記一つのコロニー検出結果に対応する第一のコロニー検出パラメータと、　　　前記第一のコロニー検出パラメータより大きな第二のコロニー検出パラメータと、　　　前記第一のコロニー検出パラメータより小さな第三のコロニー検出パラメータと、を含む、観点Ｄ６またはＤ７に記載のコロニー計数装置。　
このように、二次候補となる複数のコロニー検出パラメータには、一次候補から選択されたコロニー検出パラメータが含まれてもよい。これにより、ユーザは徐々に自分の感覚に近いコロニー検出パラメータに近づくことができよう。　
［観点Ｄ１０］　それぞれ異なるコロニー検出パラメータを用いて前記複数のコロニー検出結果を演算する演算部（例：ＭＣＵ３０）をさらに有し、　前記演算部は、一次候補となる複数のコロニー検出パラメータ（例：５個の感度のうちの３個の感度）と二次候補となる複数のコロニー検出パラメータ（例：５個の感度のうちの残りの２個の感度）とを用いて予め複数のコロニー検出結果を演算し、当該複数のコロニー検出結果を記憶部（例：記憶装置３５）に記憶させ、　前記表示処理部は、前記一次候補となる複数のコロニー検出パラメータを用いて得られた複数のコロニー検出結果を前記記憶部から読み出して前記表示部に表示し、　前記選択部は、前記表示部に表示される、前記一次候補となる複数のコロニー検出パラメータを適用して得られた前記複数のコロニー検出結果のうちユーザ操作に応じて一つのコロニー検出結果を選択し、　前記表示処理部は、前記一つのコロニー検出結果と、前記二次候補となる複数のコロニー検出パラメータを用いて得られた複数のコロニー検出結果と、を前記記憶部から読み出して前記表示部に表示し、　前記選択部は、前記表示部に表示される、前記一つのコロニー検出結果と、前記二次候補となる複数のコロニー検出パラメータを適用して得られた前記複数のコロニー検出結果と、のうちユーザ操作に応じて一つのコロニー検出結果を選択し、　前記計数部は、前記選択部により選択された前記一つのコロニー検出結果を得るために使用されたコロニー検出パラメータを前記検査個体の画像に対して適用して、当該検査個体の画像に含まれるコロニーの数を計数する、観点Ｄ６に記載のコロニー計数装置。　
このように、一次候補から選択されたコロニー検出パラメータは、実質的に、二次候補における一つのコロニー検出パラメータとして取り扱われてもよい。　
［観点Ｄ１１］　第一の種類のコロニー検出パラメータ（例：感度）が前記ユーザ操作に応じて確定されて保存部に保存されると、　前記表示処理部は、前記検査個体の画像に対して、前記第一の種類のコロニー検出パラメータを共通に適用しつつ、それぞれ異なる第二の種類のコロニー検出パラメータ（例：ノイズ低減処理のオン／オフ）を適用して得られた複数のコロニー検出結果を対比可能に前記表示部に表示し、　前記選択部は、前記表示部に表示された、前記それぞれ異なる第二種類のコロニー検出パラメータを適用して得られた前記複数のコロニー検出結果のうちユーザ操作に応じて一つのコロニー検出結果を選択し、　前記計数部は、前記選択部により選択された前記一つのコロニー検出結果を得るために使用された前記第一の種類のコロニー検出パラメータと前記第二の種類のコロニー検出パラメータとを、前記検査個体の画像に対して適用して、当該検査個体の画像に含まれるコロニーの数を計数する、観点Ｄ１からＤ１０のいずれかに記載のコロニー計数装置。　
このように第一の種類のコロニー検出パラメータが確定すると、第二の種類のコロニー検出パラメータについて調整処理が実行される。第二の種類のコロニー検出パラメータについても複数のコロニー検出結果が対比可能に表示される。これにより、ユーザは、第二の種類のコロニー検出パラメータについても容易に調整できるようになる。　
［観点Ｄ１２］　前記第一の種類のコロニー検出パラメータは、　　　前記検査個体の画像からコロニーを検出するために使用される二値化画像を生成する際の基準となる二値化感度、　　　前記検査個体の画像に対して適用されるシェーディング補正のオン／オフ、および、　　　前記検査個体の画像に対して適用されるノイズ低減処理の強度（例：小粒子のサイズ、糸くず低減効果）、のうちのいずれかである、観点Ｄ１１に記載のコロニー計数装置。　
このように演算に時間がかかるパラメータについて先に調整されてもよい。　
［観点Ｄ１３］　前記第二の種類のコロニー検出パラメータは、　　　前記検査個体の画像から小粒子を低減する低減処理のオン／オフ、　　　前記検査個体の画像から異形物（例：糸くず）を低減する低減処理のオン／オフ、および　　　前記検査個体の画像から大粒子を低減する低減処理のオン／オフ、のうちのいずれかである、観点Ｄ１１またはＤ１２に記載のコロニー計数装置。　
このように演算に時間がかからないパラメータについて後に調整されてもよい。　
［観点Ｄ１４］　前記表示処理部は、前記表示部に、第１の画面（例：図５８のＵＩ５８００）と、第２の画面（例：図６１のＵＩ５８００、図６３のＵＩ６３００）とを表示するように構成されており、　前記第１の画面は、前記複数のコロニー検出結果を表示する画面であり、　前記第２の画面は、前記第１の画面に対する前記ユーザ操作により選択された前記一つのコロニー検出結果に対応するコロニー検出パラメータとは異なる他のコロニー検出パラメータを調整する画面である、観点Ｄ１からＤ１４のいずれかに記載のコロニー計数装置。　
このように複数の画面を切り替えることで、一つの画面に含まれる情報量が削減され、ユーザにとって理解しやすいユーザインタフェースが実現される。　
［観点Ｄ１５］　前記第１の画面（例：ＵＩ５８００）を通じて調整されるコロニー検出パラメータは、離散的に調整された画像処理パラメータ（例：二値化感度）を適用して得られた前記複数のコロニー検出結果のうち前記一つのコロニー検出結果を選択することで調整される、観点Ｄ１５に記載のコロニー計数装置。　
このように離散的な値から画像処理パラメータを調整することで、連続的に変化する画像処理パラメータを、限られた表示画面上で調整することが容易になろう。　
［観点Ｄ１６］　前記第２の画面（例：ＵＩ６３００）は、連続的な値をとるコロニー検出パラメータ（例：小粒子のサイズ、糸くず低減効果）の調整を受け付ける画面である、観点Ｄ１４またはＤ１５に記載のコロニー計数装置。　
このように、連続的な値をとるコロニー検出パラメータの調整画面が容易されてもよい。　
［観点Ｄ１７］　前記表示処理部は、前記表示部に、　　　前記ユーザ操作に応じて前記選択部により選択された前記一つのコロニー検出結果（例：検査画像１０３）と、　　　当該一つのコロニー検出結果に対応する前記検査個体の識別情報（例：ＩＤ、シャーレ番号）と、　　　当該検査個体についての培養条件（例：培地、希釈倍率、培養時間）と、　　　コロニーの数（例：カウント数）と、を含む結果表示画面（例：ＵＩ１００）を表示するように構成されている、観点Ｄ１からＤ１７のいずれかに記載のコロニー計数装置。　
これにより、ユーザは調整結果を視覚的に確認できるようになろう。　
［観点Ｄ１８］　前記表示処理部は、前記複数のコロニー検出結果を対比可能に示す調整画面を前記表示部に表示し、　前記調整画面を通じて前記選択部により選択された前記一つのコロニー検出結果を得るために使用されたコロニー検出パラメータが保存部に保存されると、前記表示処理部は、前記調整画面から前記結果表示画面に遷移し、　前記結果表示画面において、前記調整画面への遷移が指示されると、前記表示処理部は、前記結果表示画面から前記調整画面に遷移し、　前記選択部は、前記調整画面を通じて前記コロニー検出パラメータの再調整を受け付ける、観点Ｄ１７に記載のコロニー計数装置。　
図６２に関連して説明されたように、ＭＣＵ３０
は、ＵＩ１００から再びＵＩ５８００に遷移して、コロニー検出パラメータの再調整を受け付けてもよい。　
［観点Ｄ１９］　検査個体を撮像して得られた検査個体の画像を取得することと、　前記取得された前記検査個体の画像に対してそれぞれ異なるコロニー検出パラメータを適用して得られた複数のコロニー検出結果を対比可能に表示部に表示することと、　前記表示部に表示される複数のコロニー検出結果のうちユーザ操作に応じて一つのコロニー検出結果を選択することと、　前記選択された前記一つのコロニー検出結果を得るために使用されたコロニー検出パラメータを前記検査個体の画像に対して適用して、当該検査個体の画像に含まれるコロニーの数を計数することと、を有するコロニー計数装置の制御方法。　
このように制御方法も本実施例の一部である。　
［観点Ｄ２０］　観点Ｄ１９に記載されたコロニー計数装置の制御方法をプロセッサに実行させるプログラム。　
なお、プログラムは、記憶装置３５に記憶されるコンピュータプログラムであってもよい。　
［観点Ｄ２１］　取得部により取得された検査個体の画像に対してそれぞれ異なる第一種類のコロニー検出パラメータを適用して得られた複数のコロニー検出結果を対比可能に表示部に表示し、前記表示部に表示される複数のコロニー検出結果のうちユーザ操作に応じて一つのコロニー検出結果を選択し、当該選択された一つのコロニー検出結果を得るために使用された第一種類のコロニー検出パラメータを記憶装置に保存する第一ステップと、　前記取得部により取得された前記検査個体の画像に対して、前記一つのコロニー検出結果に適用された第一種類のコロニー検出パラメータと、それぞれ異なる第二種類のコロニー検出パラメータを適用して得られた複数のコロニー検出結果を対比可能に前記表示部に表示し、前記表示部に表示された複数のコロニー検出結果のうちユーザ操作に応じて一つのコロニー検出結果を選択し、当該選択された一つのコロニー検出結果を得るために使用された第二種類のコロニー検出パラメータを前記記憶装置に保存する第二ステップと、を有するコロニー計数装置の制御方法。　
このように二つのステップを通じて複数種類のコロニー検出パラメータが調整されてもよい。これによりユーザは複数種類のコロニー検出パラメータを容易に調整できるようになる。　
発明は上記の実施形態に制限されるものではなく、発明の要旨の範囲内で、種々の変形・変更が可能である。

Claims (21)

  1. 検査個体を撮像して得られた検査個体の画像を取得する取得部と、　前記取得部により取得された前記検査個体の画像に対してそれぞれ異なるコロニー検出パラメータを適用して得られた複数のコロニー検出結果を対比可能に表示部に表示する表示処理部と、　前記表示部に表示される複数のコロニー検出結果のうちユーザ操作に応じて一つのコロニー検出結果を選択する選択部と、　前記選択部により選択された前記一つのコロニー検出結果を得るために使用されたコロニー検出パラメータを前記検査個体の画像に対して適用して、当該検査個体の画像に含まれるコロニーの数を計数する計数部と、を有するコロニー計数装置。
  2. 前記複数のコロニー検出結果はそれぞれ、前記検査個体の画像に、コロニーの検出位置を示す目印が重畳された画像である、請求項１に記載のコロニー計数装置。
  3. 前記複数のコロニー検出結果はそれぞれ、検出されたコロニーの個数を示す数値を含む、請求項１に記載のコロニー計数装置。
  4. 前記複数のコロニー検出結果は、コロニーを検出するために使用されたコロニー検出パラメータを対応付けられて、前記表示部に表示される、請求項１に記載のコロニー計数装置。
  5. 前記コロニー検出パラメータに基づき前記検査個体の画像から二値化画像を生成する画像処理部と、　前記二値化画像からコロニーを検出する検出部と、をさらに有し、　前記計数部は、前記検出部により検出されたコロニーの数を計数し、　前記複数のコロニー検出結果は、前記二値化画像と、前記コロニーの検出位置と、前記コロニーの数と、を含む、請求項１に記載のコロニー計数装置。
  6. 一次候補となるそれぞれ異なるコロニー検出パラメータを用いて取得された前記複数のコロニー検出結果から前記一つのコロニー検出結果が選択されると、前記一つのコロニー検出結果を得るために使用されたコロニー検出パラメータに基づき二次候補となるそれぞれ異なる複数のコロニー検出パラメータを決定する決定部をさらに有し、　前記決定部により前記二次候補となるそれぞれ異なる複数のコロニー検出パラメータが決定されると、　前記表示処理部は、前記検査個体の画像に対して前記二次候補となるそれぞれ異なる複数のコロニー検出パラメータを適用して得られた複数のコロニー検出結果を対比可能に前記表示部に表示し、　前記選択部は、前記表示部に表示され、前記二次候補となるそれぞれ異なる複数のコロニー検出パラメータを適用して得られた前記複数のコロニー検出結果のうちユーザ操作に応じて一つのコロニー検出結果を選択し、　前記計数部は、前記選択部により選択された前記一つのコロニー検出結果を得るために使用されたコロニー検出パラメータを前記検査個体の画像に対して適用して、当該検査個体の画像に含まれるコロニーの数を計数する、請求項１に記載のコロニー計数装置。
  7. 前記決定部は、前記二次候補となるそれぞれ異なるコロニー検出パラメータを用いて取得された前記複数のコロニー検出結果から前記一つのコロニー検出結果が選択されると、前記一つのコロニー検出結果を得るために使用されたコロニー検出パラメータに基づき三次候補となるそれぞれ異なる複数のコロニー検出パラメータを決定し、　前記決定部により前記三次候補となるそれぞれ異なる複数のコロニー検出パラメータが決定されると、　前記表示処理部は、前記検査個体の画像に対して前記三次候補となるそれぞれ異なる複数のコロニー検出パラメータを適用して得られた複数のコロニー検出結果を対比可能に前記表示部に表示し、　前記選択部は、前記表示部に表示された、前記三次候補となるそれぞれ異なる複数のコロニー検出パラメータを適用して得られた前記複数のコロニー検出結果のうちユーザ操作に応じて一つのコロニー検出結果を選択し、　前記計数部は、前記選択部により選択された前記一つのコロニー検出結果を得るために使用されたコロニー検出パラメータを前記検査個体の画像に対して適用して、当該検査個体の画像に含まれるコロニーの数を計数する、請求項６に記載のコロニー計数装置。
  8. 前記二次候補となる複数のコロニー検出パラメータの間隔は、前記一次候補となる複数のコロニー検出パラメータの間隔よりも精緻である、請求項６に記載のコロニー計数装置。
  9. 前記二次候補となる複数のコロニー検出パラメータは、　　　前記一次候補となる複数のコロニー検出パラメータのうち、前記選択部により選択された前記一つのコロニー検出結果に対応する第一のコロニー検出パラメータと、　　　前記第一のコロニー検出パラメータより大きな第二のコロニー検出パラメータと、　　　前記第一のコロニー検出パラメータより小さな第三のコロニー検出パラメータと、を含む、請求項６に記載のコロニー計数装置。
  10. それぞれ異なるコロニー検出パラメータを用いて前記複数のコロニー検出結果を演算する演算部をさらに有し、　前記演算部は、一次候補となる複数のコロニー検出パラメータと二次候補となる複数のコロニー検出パラメータとを用いて予め複数のコロニー検出結果を演算し、当該複数のコロニー検出結果を記憶部に記憶させ、　前記表示処理部は、前記一次候補となる複数のコロニー検出パラメータを用いて得られた複数のコロニー検出結果を前記記憶部から読み出して前記表示部に表示し、　前記選択部は、前記表示部に表示される、前記一次候補となる複数のコロニー検出パラメータを適用して得られた前記複数のコロニー検出結果のうちユーザ操作に応じて一つのコロニー検出結果を選択し、　前記表示処理部は、前記一つのコロニー検出結果と、前記二次候補となる複数のコロニー検出パラメータを用いて得られた複数のコロニー検出結果と、を前記記憶部から読み出して前記表示部に表示し、　前記選択部は、前記表示部に表示される、前記一つのコロニー検出結果と、前記二次候補となる複数のコロニー検出パラメータを適用して得られた前記複数のコロニー検出結果と、のうちユーザ操作に応じて一つのコロニー検出結果を選択し、　前記計数部は、前記選択部により選択された前記一つのコロニー検出結果を得るために使用されたコロニー検出パラメータを前記検査個体の画像に対して適用して、当該検査個体の画像に含まれるコロニーの数を計数する、請求項６に記載のコロニー計数装置。
  11. 第一の種類のコロニー検出パラメータが前記ユーザ操作に応じて確定されて保存部に保存されると、　前記表示処理部は、前記検査個体の画像に対して、前記第一の種類のコロニー検出パラメータを共通に適用しつつ、それぞれ異なる第二の種類のコロニー検出パラメータを適用して得られた複数のコロニー検出結果を対比可能に前記表示部に表示し、　前記選択部は、前記表示部に表示された、前記それぞれ異なる第二種類のコロニー検出パラメータを適用して得られた前記複数のコロニー検出結果のうちユーザ操作に応じて一つのコロニー検出結果を選択し、　前記計数部は、前記選択部により選択された前記一つのコロニー検出結果を得るために使用された前記第一の種類のコロニー検出パラメータと前記第二の種類のコロニー検出パラメータとを、前記検査個体の画像に対して適用して、当該検査個体の画像に含まれるコロニーの数を計数する、請求項１に記載のコロニー計数装置。
  12. 前記第一の種類のコロニー検出パラメータは、　　　前記検査個体の画像からコロニーを検出するために使用される二値化画像を生成する際の基準となる二値化感度、　　　前記検査個体の画像に対して適用されるシェーディング補正のオン／オフ、および、　　　前記検査個体の画像に対して適用されるノイズ低減処理の強度のうちのいずれかである、請求項１１に記載のコロニー計数装置。
  13. 前記第二の種類のコロニー検出パラメータは、　　　前記検査個体の画像から小粒子を低減する低減処理のオン／オフ、　　　前記検査個体の画像から異形物を低減する低減処理のオン／オフ、および　　　前記検査個体の画像から大粒子を低減する低減処理のオン／オフ、のうちのいずれかである、請求項１１に記載のコロニー計数装置。
  14. 前記表示処理部は、前記表示部に、第１の画面と、第２の画面とを表示するように構成されており、　前記第１の画面は、前記複数のコロニー検出結果を表示する画面であり、　前記第２の画面は、前記第１の画面に対する前記ユーザ操作により選択された前記一つのコロニー検出結果に対応するコロニー検出パラメータとは異なる他のコロニー検出パラメータを調整する画面である、請求項１に記載のコロニー計数装置。
  15. 前記第１の画面を通じて調整されるコロニー検出パラメータは、離散的に調整された画像処理パラメータを適用して得られた前記複数のコロニー検出結果のうち前記一つのコロニー検出結果を選択することで調整される、請求項１４に記載のコロニー計数装置。
  16. 前記第２の画面は、連続的な値をとるコロニー検出パラメータの調整を受け付ける画面である、請求項１４に記載のコロニー計数装置。
  17. 前記表示処理部は、前記表示部に、　　　前記ユーザ操作に応じて前記選択部により選択された前記一つのコロニー検出結果と、　　　当該一つのコロニー検出結果に対応する前記検査個体の識別情報と、　　　当該検査個体についての培養条件と、　　　コロニーの数と、を含む結果表示画面を表示するように構成されている、請求項１に記載のコロニー計数装置。
  18. 前記表示処理部は、前記複数のコロニー検出結果を対比可能に
    示す調整画面を前記表示部に表示し、　前記調整画面を通じて前記選択部により選択された前記一つのコロニー検出結果を得るために使用されたコロニー検出パラメータが保存部に保存されると、前記表示処理部は、前記調整画面から前記結果表示画面に遷移し、　前記結果表示画面において、前記調整画面への遷移が指示されると、前記表示処理部は、前記結果表示画面から前記調整画面に遷移し、　前記選択部は、前記調整画面を通じて前記コロニー検出パラメータの再調整を受け付ける、請求項１７に記載のコロニー計数装置。
  19. 検査個体を撮像して得られた検査個体の画像を取得することと、　前記取得された前記検査個体の画像に対してそれぞれ異なるコロニー検出パラメータを適用して得られた複数のコロニー検出結果を対比可能に表示部に表示することと、　前記表示部に表示される複数のコロニー検出結果のうちユーザ操作に応じて一つのコロニー検出結果を選択することと、　前記選択された前記一つのコロニー検出結果を得るために使用されたコロニー検出パラメータを正式なコロニー検出パラメータとして保存することと、を有するコロニー計数装置の制御方法。
  20. 請求項１９に記載されたコロニー計数装置の制御方法をプロセッサに実行させるプログラム。
  21. 取得部により取得された検査個体の画像に対してそれぞれ異なる第一種類のコロニー検出パラメータを適用して得られた複数のコロニー検出結果を対比可能に表示部に表示し、前記表示部に表示される複数のコロニー検出結果のうちユーザ操作に応じて一つのコロニー検出結果を選択し、当該選択された一つのコロニー検出結果を得るために使用された第一種類のコロニー検出パラメータを記憶装置に保存する第一ステップと、　前記取得部により取得された前記検査個体の画像に対して、前記一つのコロニー検出結果に適用された第一種類のコロニー検出パラメータと、それぞれ異なる第二種類のコロニー検出パラメータを適用して得られた複数のコロニー検出結果を対比可能に前記表示部に表示し、前記表示部に表示された複数のコロニー検出結果のうちユーザ操作に応じて一つのコロニー検出結果を選択し、当該選択された一つのコロニー検出結果を得るために使用された第二種類のコロニー検出パラメータを前記記憶装置に保存する第二ステップと、を有するコロニー計数装置の制御方法。
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