WO2026097017A2 - Procédés pour améliorer la précision de séquençage - Google Patents
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Abstract
L'invention concerne des procédés permettant d'introduire un identifiant de brin afin de distinguer les descendants d'un brin sens des descendants d'un brin antisens d'un polynucléotide cible double brin, des procédés de préparation de polynucléotides pour le séquençage, et des procédés de séquençage de séquences polynucléotidiques.
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Citations (27)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| WO1998044151A1 (fr) | 1997-04-01 | 1998-10-08 | Glaxo Group Limited | Methode d'amplification d'acide nucleique |
| WO1998044152A1 (fr) | 1997-04-01 | 1998-10-08 | Glaxo Group Limited | Methode de sequençage d'acide nucleique |
| WO2000018957A1 (fr) | 1998-09-30 | 2000-04-06 | Applied Research Systems Ars Holding N.V. | Procedes d'amplification et de sequençage d'acide nucleique |
| US6306597B1 (en) | 1995-04-17 | 2001-10-23 | Lynx Therapeutics, Inc. | DNA sequencing by parallel oligonucleotide extensions |
| WO2002006456A1 (fr) | 2000-07-13 | 2002-01-24 | Invitrogen Corporation | Methodes et compositions d'extraction et d'isolation rapides de proteines et de peptides au moyen d'une matrice de lyse |
| WO2003074734A2 (fr) | 2002-03-05 | 2003-09-12 | Solexa Ltd. | Procedes de detection de variations de sequence a l'echelle du genome associees a un phenotype |
| WO2005068656A1 (fr) | 2004-01-12 | 2005-07-28 | Solexa Limited | Caracterisation d'acides nucleiques |
| US20060024681A1 (en) | 2003-10-31 | 2006-02-02 | Agencourt Bioscience Corporation | Methods for producing a paired tag from a nucleic acid sequence and methods of use thereof |
| WO2006084132A2 (fr) | 2005-02-01 | 2006-08-10 | Agencourt Bioscience Corp. | Reactifs, methodes et bibliotheques pour sequençage fonde sur des billes |
| WO2006110855A2 (fr) | 2005-04-12 | 2006-10-19 | 454 Life Sciences Corporation | Procedes de determination de variantes de sequence utilisant un sequencage des amplicons |
| WO2006135342A1 (fr) | 2005-06-14 | 2006-12-21 | Agency For Science, Technology And Research | Procede permettant de traiter et/ou de mapper des sequences ditag a un genome |
| US20060292611A1 (en) | 2005-06-06 | 2006-12-28 | Jan Berka | Paired end sequencing |
| WO2007010252A1 (fr) | 2005-07-20 | 2007-01-25 | Solexa Limited | Procede de sequencage d'une matrice de polynucleotide |
| WO2007052006A1 (fr) | 2005-11-01 | 2007-05-10 | Solexa Limited | Procede pour preparer des bibliotheques de polynucleotides matrices |
| WO2007091077A1 (fr) | 2006-02-08 | 2007-08-16 | Solexa Limited | Procédé de séquençage d'une matrice polynucléotidique |
| WO2007107710A1 (fr) | 2006-03-17 | 2007-09-27 | Solexa Limited | Procédés isothermiques pour créer des réseaux moléculaires clonales simples |
| WO2008041002A2 (fr) | 2006-10-06 | 2008-04-10 | Illumina Cambridge Limited | Procédé de séquençage d'une matrice polynucléotidique |
| WO2008093098A2 (fr) | 2007-02-02 | 2008-08-07 | Illumina Cambridge Limited | Procedes pour indexer des echantillons et sequencer de multiples matrices nucleotidiques |
| US20120316086A1 (en) | 2011-06-09 | 2012-12-13 | Illumina, Inc. | Patterned flow-cells useful for nucleic acid analysis |
| US20130079232A1 (en) | 2011-09-23 | 2013-03-28 | Illumina, Inc. | Methods and compositions for nucleic acid sequencing |
| WO2013188582A1 (fr) | 2012-06-15 | 2013-12-19 | Illumina, Inc. | Amplification par exclusion cinétique de banques d'acides nucléiques |
| WO2022087150A2 (fr) | 2020-10-21 | 2022-04-28 | Illumina, Inc. | Modèles de séquençage comprenant de multiples inserts et compositions et procédés d'amélioration du débit de séquençage |
| WO2023122755A2 (fr) | 2021-12-23 | 2023-06-29 | Illumina Cambridge Limited | Cuve à circulation et procédés |
| WO2023175037A2 (fr) | 2022-03-15 | 2023-09-21 | Illumina, Inc. | Séquençage simultané de brins de complément avant et inverse sur des polynucléotides séparés pour la détection de méthylation |
| WO2023196572A1 (fr) | 2022-04-07 | 2023-10-12 | Illumina Singapore Pte. Ltd. | Cytidine désaminases modifiées et méthodes d'utilisation |
| WO2024069581A1 (fr) | 2022-09-30 | 2024-04-04 | Illumina Singapore Pte. Ltd. | Complexes hélicase-cytidine désaminase et procédés d'utilisation |
| WO2025072783A1 (fr) | 2023-09-28 | 2025-04-03 | Illumina, Inc. | Cytidine désaminases modifiées et méthodes d'utilisation |
-
2025
- 2025-11-03 WO PCT/US2025/053775 patent/WO2026097017A2/fr active Pending
Patent Citations (29)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| US6306597B1 (en) | 1995-04-17 | 2001-10-23 | Lynx Therapeutics, Inc. | DNA sequencing by parallel oligonucleotide extensions |
| WO1998044152A1 (fr) | 1997-04-01 | 1998-10-08 | Glaxo Group Limited | Methode de sequençage d'acide nucleique |
| WO1998044151A1 (fr) | 1997-04-01 | 1998-10-08 | Glaxo Group Limited | Methode d'amplification d'acide nucleique |
| WO2000018957A1 (fr) | 1998-09-30 | 2000-04-06 | Applied Research Systems Ars Holding N.V. | Procedes d'amplification et de sequençage d'acide nucleique |
| WO2002006456A1 (fr) | 2000-07-13 | 2002-01-24 | Invitrogen Corporation | Methodes et compositions d'extraction et d'isolation rapides de proteines et de peptides au moyen d'une matrice de lyse |
| WO2003074734A2 (fr) | 2002-03-05 | 2003-09-12 | Solexa Ltd. | Procedes de detection de variations de sequence a l'echelle du genome associees a un phenotype |
| US20060024681A1 (en) | 2003-10-31 | 2006-02-02 | Agencourt Bioscience Corporation | Methods for producing a paired tag from a nucleic acid sequence and methods of use thereof |
| WO2005068656A1 (fr) | 2004-01-12 | 2005-07-28 | Solexa Limited | Caracterisation d'acides nucleiques |
| WO2006084132A2 (fr) | 2005-02-01 | 2006-08-10 | Agencourt Bioscience Corp. | Reactifs, methodes et bibliotheques pour sequençage fonde sur des billes |
| WO2006110855A2 (fr) | 2005-04-12 | 2006-10-19 | 454 Life Sciences Corporation | Procedes de determination de variantes de sequence utilisant un sequencage des amplicons |
| US20060292611A1 (en) | 2005-06-06 | 2006-12-28 | Jan Berka | Paired end sequencing |
| WO2006135342A1 (fr) | 2005-06-14 | 2006-12-21 | Agency For Science, Technology And Research | Procede permettant de traiter et/ou de mapper des sequences ditag a un genome |
| WO2007010252A1 (fr) | 2005-07-20 | 2007-01-25 | Solexa Limited | Procede de sequencage d'une matrice de polynucleotide |
| WO2007052006A1 (fr) | 2005-11-01 | 2007-05-10 | Solexa Limited | Procede pour preparer des bibliotheques de polynucleotides matrices |
| WO2007091077A1 (fr) | 2006-02-08 | 2007-08-16 | Solexa Limited | Procédé de séquençage d'une matrice polynucléotidique |
| WO2007107710A1 (fr) | 2006-03-17 | 2007-09-27 | Solexa Limited | Procédés isothermiques pour créer des réseaux moléculaires clonales simples |
| WO2008041002A2 (fr) | 2006-10-06 | 2008-04-10 | Illumina Cambridge Limited | Procédé de séquençage d'une matrice polynucléotidique |
| WO2008093098A2 (fr) | 2007-02-02 | 2008-08-07 | Illumina Cambridge Limited | Procedes pour indexer des echantillons et sequencer de multiples matrices nucleotidiques |
| US20120316086A1 (en) | 2011-06-09 | 2012-12-13 | Illumina, Inc. | Patterned flow-cells useful for nucleic acid analysis |
| US20130079232A1 (en) | 2011-09-23 | 2013-03-28 | Illumina, Inc. | Methods and compositions for nucleic acid sequencing |
| WO2013188582A1 (fr) | 2012-06-15 | 2013-12-19 | Illumina, Inc. | Amplification par exclusion cinétique de banques d'acides nucléiques |
| WO2022087150A2 (fr) | 2020-10-21 | 2022-04-28 | Illumina, Inc. | Modèles de séquençage comprenant de multiples inserts et compositions et procédés d'amélioration du débit de séquençage |
| WO2023122755A2 (fr) | 2021-12-23 | 2023-06-29 | Illumina Cambridge Limited | Cuve à circulation et procédés |
| WO2023175037A2 (fr) | 2022-03-15 | 2023-09-21 | Illumina, Inc. | Séquençage simultané de brins de complément avant et inverse sur des polynucléotides séparés pour la détection de méthylation |
| WO2023196572A1 (fr) | 2022-04-07 | 2023-10-12 | Illumina Singapore Pte. Ltd. | Cytidine désaminases modifiées et méthodes d'utilisation |
| WO2024069581A1 (fr) | 2022-09-30 | 2024-04-04 | Illumina Singapore Pte. Ltd. | Complexes hélicase-cytidine désaminase et procédés d'utilisation |
| WO2025072783A1 (fr) | 2023-09-28 | 2025-04-03 | Illumina, Inc. | Cytidine désaminases modifiées et méthodes d'utilisation |
| WO2025072793A1 (fr) | 2023-09-28 | 2025-04-03 | Illumina, Inc. | Cytidine désaminases modifiées et procédés d'utilisation |
| WO2025072800A2 (fr) | 2023-09-28 | 2025-04-03 | Illumina, Inc. | Cytidine désaminases modifiées et procédés d'utilisation |
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