BRPI0707944B1 - gene construct, vector, transgenic microorganism, and processes for converting 18: 2 * 9,12 (linoleic acid) to 20: 2 * 11,14 - Google Patents
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Abstract
ácido nucléico. a presente invenção refere-se ao ácido nucléico derivado de perkinsus marinus que codifica uma enzima de 9-elongase, uma <30>8- dessaturase e <30>5-dessaturase. todas as seqúéncias de codificação podem ser transcritas como uma única transcrição.nucleic acid. The present invention relates to perkinsus marinus-derived nucleic acid encoding a 9-elongase enzyme, a Î ”8-desaturase and a β-5 desaturase. All coding sequences can be transcribed as a single transcript.
Description
Relatório Descritivo da Patente de Invenção para "CONSTRUTO DE GENE, VETOR, MICRORGANISMO TRANSGÊNICO E PROCESSOS PARA A CONVERSÃO DE 18:2Δ912 (ÁCIDO LINOLÉICO) EM 20:2Δ11’14". A presente invenção refere-se ao ácido nucléico derivado de Perkinsus marinus que codifica um 9-elongase, A8-dessaturase e uma enzima de A5-dessaturase. Todas as sequências de codificação podem ser transcritas como uma única transcrição, que simplifica o processo de transformação de células requerido para expressar todas as três proteínas. A invenção também refere-se às sequências de codificação individuais e às proteínas codificadas por estas sequências como também a um processo para converter o ácido linoléico em ácido araquidônico.Report of the Invention Patent for "GENE CONSTRUCTION, VECTOR, TRANSGENIC MICRORGANISM AND PROCESSES FOR THE CONVERSION OF 18: 2Δ912 (LINLEIC ACID) IN 20: 2Δ11'14". The present invention relates to Perkinsus marinus-derived nucleic acid encoding a 9-elongase, A8-desaturase and an A5-desaturase enzyme. All coding sequences can be transcribed as a single transcript, which simplifies the cell transformation process required to express all three proteins. The invention also relates to the individual coding sequences and proteins encoded by these sequences as well as a process for converting linoleic acid to arachidonic acid.
Os ácidos graxos e triacilglicerídeos têm uma multiplicidade de aplicações na indústria alimentícia, em nutrição animal, em cosméticos e no setor farmacológico. Dependendo se eles são ácidos graxos saturados ou não saturados ou então triacilglicerídeos com um conteúdo elevado de ácidos graxos saturados ou não saturados, eles são adequados para muitas aplicações diferentes. Os ácidos graxos poliin-saturados, tal como ácido linoléico e ácido linolênico são essenciais para mamíferos, uma vez que eles não podem ser produzidos pelos mesmos. Os ácidos graxos ω3 e ácidos graxos ω6 poliinsaturados são então um componente importante na nutrição animal e humana. A seguir, os ácidos graxos poliinsaturados são referidos como PUFA, PUFAs, LCPUFA ou LCPUFAs (ácidos graxos poliinsaturados, PUFA, ácidos graxos poliinsaturados de cadeia longa, LCPUFA).Fatty acids and triglycerides have a multitude of applications in the food industry, animal nutrition, cosmetics and the pharmaceutical sector. Depending on whether they are saturated or unsaturated fatty acids or triacylglycerides with a high saturated or unsaturated fatty acid content, they are suitable for many different applications. Polyunsaturated fatty acids such as linoleic acid and linolenic acid are essential for mammals as they cannot be produced by them. The ω3 fatty acids and polyunsaturated ω6 fatty acids are therefore an important component in animal and human nutrition. Hereinafter, the polyunsaturated fatty acids are referred to as PUFA, PUFAs, LCPUFA or LCPUFAs (polyunsaturated fatty acids, PUFA, long chain polyunsaturated fatty acids, LCPUFA).
Os vários ácidos graxos e triglicerídeos são principalmente obtidos de microorganismos tal como Mortierella e Schizochytrium ou de plantas produtoras de óleo, tal como soja, óleo de semente de col-za, algas tal como Crypthecodinium ou Phaeodactylum e outros, onde eles são obtidos, como uma regra, na forma de seus triacilglicerídeos Segue-se folha 1 a (= triglicerídeos = trigliceróis). Entretanto, eles também podem ser obtidos de animais, tal como, por exemplo, peixe. Os ácidos graxos livres são preparados vantajosamente através de hidrólise. Os ácidos graxos poliinsaturados de cadeia longa, tal como, ácido docosae-xanóico (= DHA, C22:6_4,7,10,13,16,19), ácido eicosapentanóico (= EPA, C20:5A5'8’η14’17), ácido araquidônico (= ARA, C20:4A5'8’11·14), ácido di-homo-y-linolênico (C20:3A8, 11, 14) ou ácido de docosapentanóico (DPA, C22:5A7'10’13,16,19), não são sintetizados em colheitas de óleo, tal como óleo de semente de colza, soja, girassol ou açafroa. As fontes naturais convencionais destes ácidos graxos são peixes, tal como arenque, salmão, sardinha, peixe vermelho, enguia, carpa, truta, hipoglosso, cavala, zander ou atum, ou algas.The various fatty acids and triglycerides are mainly obtained from microorganisms such as Mortierella and Schizochytrium or from oil producing plants such as soybean, col-za seed oil, algae such as Crypthecodinium or Phaeodactylum and others where they are obtained, such as a rule in the form of its triglycerides Follows sheet 1 to (= triglycerides = triglycerols). However, they can also be obtained from animals, such as, for example, fish. Free fatty acids are advantageously prepared by hydrolysis. Long chain polyunsaturated fatty acids such as docosae-xanoic acid (= DHA, C22: 6_4,7,10,13,16,19), eicosapentaenoic acid (= EPA, C20: 5A5'8'η14'17) , arachidonic acid (= ARA, C20: 4A5'8'11 · 14), dihomo-y-linolenic acid (C20: 3A8, 11, 14) or docosapentaenoic acid (DPA, C22: 5A7'10'13, 16,19), are not synthesized in oil crops such as rapeseed, soybean, sunflower or safflower oil. Conventional natural sources of these fatty acids are fish, such as herring, salmon, sardines, red fish, eel, carp, trout, halibut, mackerel, zander or tuna, or algae.
Dependendo do uso pretendido, os óleos com ácidos graxos saturados ou não saturados são preferidos. Em nutrição humana, por exemplo, os lipídios com ácidos graxos não saturados, especificamente ácidos graxos poliinsaturados, são preferidos. Os ácidos u)3-graxos poliinsaturados são ditos ter um efeito positivo no nível de colesterol no sangue e desse modo na possibilidade de prevenir doença cardíaca. O risco de doença cardíaca, acidente vascular cerebral ou hipertensão pode ser reduzido notadamente adicionando-se estes ácidos u)3-graxos à comida. Além disso, os ácidos ω3-graxos têm um efeito positivo em processos inflamatórios, especificamente em processos cronicamente inflamatórios, em associação com doenças i-munológicas, tal como artrite reumática. Eles são então adicionados aos comestíveis, especificamente aos comestíveis dietéticos, ou são empregados em medicamentos. Os ácidos graxos u>6 tal como ácido araquidônico tendem a ter um efeito negativo nestes distúrbios com relação a estas doenças reumáticas por causa do influxo dietético habitual. Ácidos graxos ω3 e ω6 são precursores de hormônios de tecido, conhecidos como eicosanóides, tal como o prostaglandinas que são derivadas de ácido di-homo-hinolênico, ácido araquidônico e ácido eicosapenta-nóico, e dos tromboxanos e leucotrienos que são derivados de ácido araquidônico e ácido de eicosapentanóico. Os eicosanóides (conhecidos como as séries PG2) que são geralmente formados de ácidos u>6-graxos promovem as reações inflamatórias, ao mesmo tempo em que os eicosanóides (conhecidos como as séries PG3) de ácidos graxos ω3 têm pouco ou nenhum efeito pró-inflamatório.Depending on the intended use, oils with saturated or unsaturated fatty acids are preferred. In human nutrition, for example, lipids with unsaturated fatty acids, specifically polyunsaturated fatty acids, are preferred. The u) 3-polyunsaturated fatty acids are said to have a positive effect on blood cholesterol level and thus on the possibility of preventing heart disease. The risk of heart disease, stroke or hypertension can be reduced notably by adding these u) 3-fatty acids to food. In addition, ω3-fatty acids have a positive effect on inflammatory processes, specifically chronically inflammatory processes, in association with immune diseases such as rheumatic arthritis. They are then added to edibles, specifically dietary edibles, or employed in medicines. Fatty acids u> 6 such as arachidonic acid tend to have a negative effect on these disorders with respect to these rheumatic diseases because of the usual dietary influx. Ω3 and ω6 fatty acids are precursors of tissue hormones known as eicosanoids, such as prostaglandins which are derived from dihomo-hinolic acid, arachidonic acid and eicosapentaenoic acid, and thromboxanes and leukotrienes that are derived from arachidonic acid. and eicosapentaenoic acid. Eicosanoids (known as the PG2 series) which are generally formed of Î ± 6-fatty acids promote inflammatory reactions, while eicosanoids (known as the PG3 series) of ω3 fatty acids have little or no pro-inflammatory effect. inflammatory.
Devido às características positivas dos ácidos graxos poliinsatu- rados, não houve nenhuma falta de tentativas no passado para fabricar genes disponíveis que estão envolvidos na síntese destes ácidos graxos ou triglicerídeos para a produção de óleos em vários organismos com um conteúdo modificado de ácidos graxos não saturados. Desse modo, WO 91/13972 e sua U.S. equivalente descreve uma A9-dessaturase. WO 93/1 1245 reivindica uma A15-dessaturase e WO 94/11516 uma Δ12-dessaturase. Por exemplo, dessaturases adicionais são descritas nos EP-A-O 550 162, WO 94/18337, WO 97/30582, WO 97/21340, WO 95/18222, EP-A-0 794 250, Stukey e outros, J. Biol. Chem., 265, 1990: 20144-20149, Wa-da e outros, Nature 347, 1990: 200-203 ou Huang e outros, Lipids 34, 1999: 649-659. Entretanto, a caracterização bioquímica das várias dessaturases tem sido insuficiente até hoje uma vez que as enzimas, sendo proteínas ligadas à membrana, apresentam grande dificuldade no seu isolamento e caracterização (McKeon e outros, Methods in Enzymol. 71, 1981: 1214112147, Wang e outros, Plante Physiol. Biochem., 26, 1988: 777-792). Como uma regra, as dessaturases ligadas à membrana são caracterizadas por serem introduzidas em um organismo adequado que é subseqüentemente analisado quanto à atividade de enzima analisando-se os materiais de partida e os produtos. Δ6-Dessaturases são descritas nos WO 93/06712, U.S. 5.614.393, US5614393, WO 96/21022, WO 00/21557 e WO 99/27111 e a aplicação para a produção de ácidos graxos em organismos transgênicos é descrita nos WO 98/46763, WO 98/46764 e WO 98/46765. Neste contexto, a expressão de várias dessaturases e a formação de ácidos graxos poliinsatu-rados, é também descrita e reivindicada no WO 99/64616 ou WO 98/46776. Com respeito à expressão eficácia de dessaturases e seu efeito na formação de ácidos graxos poliinsaturados, deve ser notado que a expressão de uma única dessaturase como descrito até hoje somente resultou em baixos conteúdos de ácidos graxos não saturado /lipídeos tal como, por exemplo, ácido γ-linolênico e ácido estearidônico. Além disso, uma mistura de ácidos graxos u>3 e ω6 foi obtida, como uma regra.Due to the positive characteristics of polyunsaturated fatty acids, there has been no shortage of attempts in the past to manufacture available genes that are involved in the synthesis of these fatty acids or triglycerides for the production of oils in various organisms with a modified unsaturated fatty acid content. . Accordingly, WO 91/13972 and its equivalent U.S. describe an A9 desaturase. WO 93/1 1245 claims an A15 desaturase and WO 94/11516 an Δ12 desaturase. For example, additional desaturases are described in EP-A-0 550 162, WO 94/18337, WO 97/30582, WO 97/21340, WO 95/18222, EP-A-0 794 250, Stukey et al., J. Biol. Chem., 265, 1990: 20144-20149, Wa-da et al., Nature 347, 1990: 200-203 or Huang et al., Lipids 34, 1999: 649-659. However, the biochemical characterization of the various desaturases has been insufficient to date as enzymes, being membrane-bound proteins, have great difficulty in their isolation and characterization (McKeon et al., Methods in Enzymol. 71, 1981: 1214112147, Wang and others, Plante Physiol., Biochem., 26, 1988: 777-792). As a rule, membrane-bound desaturases are characterized by being introduced into a suitable organism which is subsequently analyzed for enzyme activity by analyzing the starting materials and products. Δ6-Desaturases are described in WO 93/06712, US 5,614,393, US5614393, WO 96/21022, WO 00/21557 and WO 99/27111 and the application for the production of fatty acids in transgenic organisms is described in WO 98 / 46763, WO 98/46764 and WO 98/46765. In this context, the expression of various desaturases and the formation of polyunsaturated fatty acids is also described and claimed in WO 99/64616 or WO 98/46776. With respect to the expression efficacy of desaturases and their effect on the formation of polyunsaturated fatty acids, it should be noted that expression of a single desaturase as described to date has only resulted in low unsaturated fatty acid / lipid content such as, for example, acid. γ-linolenic and stearidonic acid. In addition, a mixture of fatty acids u> 3 and ω6 was obtained as a rule.
Os microorganismos especialmente adequados para a produção de PUFAs são microalgas tal como espécies de Phaeodactylum tricornutum, Porphiridium, espécies de Thraustochytrium, espécies de Schizochytrium ou espécies de Crypthecodinium, ciliados tais como Stylonychia ou Colpidium, fungos tais como Mortierella, Entomophthora ou Mucor e/ou musgos tais como Physcomitrella, Ceratodon e Marchantia (R. Vazhappilly & F. Chen (1998) Botanica Marina 41: 553-558; K. Totani & K. Oba (1987) Lipids 22: 1060-1062; M. Akimoto e outros (1998) Appl. Biochemistry e Biotechnology 73: 269-278). A seleção de cepa resultou no desenvolvimento de várias cepas mutantes dos microorganismos em questão que produzem uma série de compostos desejáveis incluindo PUFAs. Entretanto, a mutação e seleção de cepas com uma produção melhorada de uma molécula particular tal como os ácidos graxos poliinsaturados, é um processo demorado e difícil. Isto é por que os métodos recombinantes como descrito acima são preferidos sempre que possível.Microorganisms especially suitable for the production of PUFAs are microalgae such as Phaeodactylum tricornutum, Porphiridium, Thraustochytrium species, Schizochytrium species or Crypthecodinium species, ciliates such as Stylonychia or Colpidium, fungi such as Mortierella, Entomophthora or Mucus mosses such as Physcomitrella, Ceratodon and Marchantia (R. Vazhappilly & F. Chen (1998) Botanica Marina 41: 553-558; K. Totani & K. Oba (1987) Lipids 22: 1060-1062; M. Akimoto et al. ( 1998) Appl, Biochemistry and Biotechnology 73: 269-278). Strain selection has resulted in the development of various mutant strains of the microorganisms in question that produce a number of desirable compounds including PUFAs. However, mutation and selection of strains with improved production of a particular molecule such as polyunsaturated fatty acids is a lengthy and difficult process. This is why recombinant methods as described above are preferred whenever possible.
Porém, somente quantidades limitadas dos ácidos graxos poliinsaturados desejados tais como DPA, EPA ou ARA podem ser produzidas com a ajuda dos microorganismos acima mencionados, e, dependendo do microorganismo usado, estes geralmente são obtidos como misturas de ácido graxo de, por exemplo, EPA, DPA e ARA.However, only limited amounts of the desired polyunsaturated fatty acids such as DPA, EPA or ARA can be produced with the help of the aforementioned microorganisms, and, depending on the microorganism used, these are generally obtained as mixtures of fatty acids from, for example, EPA. , DPA and ARA.
Uma variedade de séries de reação sintéticas está sendo descrita pela síntese de ácido araquidônico, ácido de eicosapentanóico (EPA) e ácido docosaexanóico (DHA) (figura 1). Desse modo, são produzidos EPA ou DHA em bactérias marinhas tal como Vibrio sp. ou Shewanella sp. pelas séries de reação de policetídeo (Yu, R., e outros, Lipids 35:1061-1064, 2000; Takeyama, H., e outros, Microbiology 143:2725-2731,1997).A variety of synthetic reaction series are being described by the synthesis of arachidonic acid, eicosapentaenoic acid (EPA) and docosaexanoic acid (DHA) (Figure 1). Thus, EPA or DHA is produced in marine bacteria such as Vibrio sp. or Shewanella sp. by the polyketide reaction series (Yu, R., et al., Lipids 35: 1061-1064, 2000; Takeyama, H., et al., Microbiology 143: 2725-2731,1997).
Uma estratégia alternativa é a atividade alternada de dessatura-ses e elongases (Zank, T.K. e outros, Plant Journal 31:255-268, 2002; Saku-radani, E., e outros, Gene 238:445-453, 1999). Uma modificação da série de reação descrita acima por A6-dessaturase, A6-elongase, A5-dessaturase, A5-elongase e A4-dessaturase é a série de reação de Sprecher (Sprecher 2000, Biochim. Biophys. Acta 1486:219-231) em mamíferos. Em vez da Δ4-dessaturação, uma outra etapa de alongamento é efetuado aqui para produzir C2A, seguido por uma outra A6-dessaturação e finalmente β-oxidação para produzir o comprimento de cadeia C22. Desse modo, o que é conhecido como série de reação de Sprecher (veja figura 1) é, entretanto, não adequado para a produção em plantas e microorganismos uma vez que os mecanismos reguladores não são conhecidos.An alternative strategy is the alternate activity of desaturases and elongases (Zank, T.K. et al., Plant Journal 31: 255-268, 2002; Saku-radani, E., et al., Gene 238: 445-453, 1999). A modification of the reaction series described above by A6-desaturase, A6-elongase, A5-desaturase, A5-elongase and A4 desaturase is the Sprecher reaction series (Sprecher 2000, Biochim. Biophys. Acta 1486: 219-231) in mammals. Instead of Δ4-desaturation, another stretching step is performed here to produce C2A, followed by another A6-desaturation and finally β-oxidation to produce the C22 chain length. Thus, what is known as the Sprecher reaction series (see figure 1) is, however, not suitable for production in plants and microorganisms since regulatory mechanisms are not known.
Dependendo do seu padrão de dessaturação, os ácidos graxos poliinsaturados podem ser divididos em duas classes grandes, viz. Ácidos graxos ω6 ou ω3, que diferem com respeito às suas atividades metabólicas e funcionais (figura 1). O material de partida para a série de reação metabólica w6éo ácido linoléico de ácido graxo (18:2Δ9,12) ao mesmo tempo em que a série de reação ω3 prossegue através de ácido linolênico (18:3Δ9,12,15). O ácido lino-lênico é formado pela atividade de uma dessaturase ω3 (Tocher e outros 1998, Prog. Lipid Res. 37, 73-117; Domergue e outros 2002, Eur. J. Bio-chem. 269, 4105-4113).Depending on their desaturation pattern, polyunsaturated fatty acids can be divided into two large classes, viz. Fatty acids ω6 or ω3, which differ with respect to their metabolic and functional activities (Figure 1). The starting material for the w6 metabolic reaction series is fatty acid linoleic acid (18: 2Δ9,12) while the ω3 reaction series proceeds through linolenic acid (18: 3Δ9,12,15). Linolenic acid is formed by the activity of a ω3 desaturase (Tocher et al. 1998, Prog. Lipid Res. 37, 73-117; Domergue et al. 2002, Eur. J. Bio-chem. 269, 4105-4113).
Os mamíferos, e desse modo também os humanos, não têm nenhuma atividade de dessaturase correspondente (Δ12 - e Δ oo3-dessaturase) e têm que absorver estes ácidos graxos (ácidos graxo essenciais) pela comida. Começando com estes precursores, os ácidos graxos poliinsaturados fisiologicamente importantes ácido araquidônico (= ARA, 20:4Δ5,8,11,14), um ácido graxo ω6 e os dois ácidos eicosapentanóicos de ácidos graxos ω3 (= ΕΡΑ, 20:5δ5’8’11' h 17) e ácido docosaexanóico (DHA, 22:6Δ4'7’10'13’17’19) são sintetizados pela seqüência de reações de dessaturase e elongase. A aplicação de ácidos graxos ω3 mostra a atividade terapêutica descrita acima no tratamento de doenças cardiovasculares (Shimikawa 2001, World Rev. Nutr. Diet. 88, 100-108), Entzündungen (Calder 2002, Proc. Nutr. Soc. 61, 345358) e Arthritis (Cleland e James 2000, J., Rheumatol. 27, 2305-2307). O alongamento de ácidos graxo, através de elongases, através de 2 ou 4 átomos de C é de importância crucial para a produção de C20 - e C22-PUFAS, respectivamente. Este processo prossegue por 4 etapas. A primeira etapa é a condensação de malonil-CoA com 0 ácido graxo-acil-CoA através de cetoacil-CoA sintase (KCS, a seguir chamado elongase). Isto é seguido por uma etapa de redução (cetoacil-CoA reductase, KCR), uma eta- pa de desidratação (desidratase) e uma etapa de redução final (enoil-CoA reductase). Foi postulado que a atividade de elongase afeta a especificidade e taxa do processo inteiro (Millar e Kunst, 1997 Plant Journal 12:121-131).Mammals, and thus also humans, have no corresponding desaturase activity (Δ12 - and Δ oo3 desaturase) and must absorb these fatty acids (essential fatty acids) by food. Starting with these precursors, the physiologically important polyunsaturated fatty acids arachidonic acid (= ARA, 20: 4Δ5,8,11,14), a ω6 fatty acid and the two ω3 fatty acid eicosapentaenoic acids (= ΕΡΑ, 20: 5δ5'8 '11' h 17) and docosaexanoic acid (DHA, 22: 6Δ4'7'10'13'17'19) are synthesized by the sequence of desaturase and elongase reactions. Application of ω3 fatty acids shows the therapeutic activity described above in the treatment of cardiovascular disease (Shimikawa 2001, World Rev. Nutr. Diet. 88, 100-108), Entzündungen (Calder 2002, Proc. Nutr. Soc. 61, 345358) and Arthritis (Cleland and James 2000, J., Rheumatol. 27, 2305-2307). The elongation of fatty acids by elongases through 2 or 4 C atoms is of crucial importance for the production of C20 - and C22-PUFAS, respectively. This process proceeds through 4 steps. The first step is the condensation of malonyl-CoA with fatty acid-acyl-CoA through ketoacyl-CoA synthase (KCS, hereinafter called elongase). This is followed by a reduction step (ketoacyl-CoA reductase, KCR), a dehydration step (dehydratase) and a final reduction step (enoyl-CoA reductase). It has been postulated that elongase activity affects the specificity and rate of the entire process (Millar and Kunst, 1997 Plant Journal 12: 121-131).
Houve um número grande de tentativas no passado para obter genes de elongase. Millar e Kunst, 1997 (Plant Journal 12:121-131) e Millar e outros, 1999, (Plant Cell 11:825-838) descreve a caracterização de elon-gases de planta para a síntese de ácidos graxo de cadeia longa monoinsatu-rados (C22:1) e para a síntese de ácidos graxos de cadeia muito longa para a formação de ceras em plantas (C28-C32). As descrições com respeito à síntese de ácido araquidônico e EPA, são encontradas, por exemplo, nos WO0159128, W00012720, W002077213 e W00208401. A síntese de ácidos C24-graxos poliinsaturados é descrita, por exemplo, em Tvrdik e outros 2000, JCB 149:707-717 ou W00244320.There have been a large number of attempts in the past to obtain elongase genes. Millar and Kunst, 1997 (Plant Journal 12: 121-131) and Millar et al., 1999, (Plant Cell 11: 825-838) describe the characterization of plant elon gases for the synthesis of monounsaturated long chain fatty acids. (C22: 1) and for the synthesis of very long chain fatty acids for waxing in plants (C28-C32). Descriptions regarding the synthesis of arachidonic acid and EPA are found, for example, in WO0159128, W00012720, W002077213 and W00208401. The synthesis of C24-polyunsaturated fatty acids is described, for example, in Tvrdik et al. 2000, JCB 149: 707-717 or W00244320.
As plantas mais altas compreendem ácidos graxos poliinsaturados tal como ácido linoléico (18:2Δ9,12) e ácido linolênico (18:3Δ9,12,15). ARA, EPA e DHA não são encontrados no óleo de semente de plantas mais altas, ou somente em quantidades pequenas (E. Ucciani: Nouveau Dictionnaire des Huiles Vegetales [New Dictionary of Vegetable Oils]. Technique & Documentation - Lavoisier, 1995. ISBN: 2-7430-0009-0). Porém, a produção de LCPUFAs em plantas mais altas, preferivelmente em colheitas de óleo tal como óleo de semente de colza, linhaça, girassol e soja, seria vantajosa uma vez que quantidades grandes de LCPUFAs de alta qualidade para a indústria alimentícia, nutrição animal e propósitos farmacêuticos poderíam ser obtidos economicamente. Para este fim, é vantajoso introduzir, em colheitas de óleo, genes que codificam enzimas da biosíntese de LCPUFA por métodos recombinantes e para expressá-los aqui. Estes genes podem codificar, por exemplo, A9-elongases, Δδ-dessaturases e/ou Δδ-dessaturases. Estes genes podem ser isolados vantajosamente de microorganismos e plantas mais baixas que produzem LCPUFAs e os incorporam nas membranas ou triacilglicerídeos. Desse modo, já foi possível isolar os genes de Δ6-dessaturase do musgo Physcomitrella patens e genes de A6-elongase de P. patens e do nematódeo C. elegans.Taller plants include polyunsaturated fatty acids such as linoleic acid (18: 2Δ9,12) and linolenic acid (18: 3Δ9,12,15). ARA, EPA and DHA are not found in the seed oil of taller plants, or only in small quantities (E. Ucciani: Nouveau Dictionnaire des Huiles Vegetales). Technique & Documentation - Lavoisier, 1995. ISBN: 2-7430-0009-0). However, the production of LCPUFAs in higher plants, preferably in oil crops such as rapeseed, flaxseed, sunflower and soybean oil would be advantageous since large quantities of high quality LCPUFAs for the food industry, animal nutrition and pharmaceutical purposes could be obtained economically. To this end, it is advantageous to introduce genes encoding LCPUFA biosynthesis enzymes into oil crops by recombinant methods and to express them herein. These genes may encode, for example, A9-elongases, Δδ-desaturases and / or Δδ-desaturases. These genes may advantageously be isolated from lower microorganisms and plants that produce LCPUFAs and incorporate them into membranes or triglycerides. Thus, it was already possible to isolate the Δ6 desaturase genes from the Physcomitrella patens moss and P. patens A6-elongase genes and the C. elegans nematode.
As primeiras plantas transgênicas que compreendem e expressam os genes que codificam enzimas de biossíntese de LCPUFA e que, como uma conseqüência, produzem LCPUFAs foram descritas pela primeira vez, por exemplo, na Patente DE-A-102 19 203 (processo para a produção de ácidos graxos poliinsaturados em plantas). Porém, estas plantas produzem LCPUFAs em quantidades que requerem otimização adicional para processar os óleos que estão presente nas plantas.The first transgenic plants that understand and express the genes encoding LCPUFA biosynthesis enzymes and which, as a consequence, produce LCPUFAs were first described, for example, in DE-A-102 19 203 (process for the production of polyunsaturated fatty acids in plants). However, these plants produce LCPUFAs in quantities that require further optimization to process the oils that are present in the plants.
Como pode ser visto da Figura 1, os produtos da ωΔΘ-série de reação podem ser modificados usando dessaturases apropriadas e, se necessário, elo/igases para produzir ácidos graxos ω3. Portanto, seria sumamente valioso desenvolver um produto que torne possível a produção de ARA em um organismo geneticamente modificado. O parasita de protozoário de ostra Perkinsus marinusi é capaz de sintetizar ácidos graxos saturados e não saturados, incluindo o ácido gra-xo essencial, ácido araquidônico [20:4(n - 6), pela série de reação de Δ -8 dessaturase. Surpreendentemente, os inventores presentes descobriram que P. marinusi contém nucléico que codifica um A9-elongase, um Δ8-dessaturase e um Δ5 - dessaturase que podem todos ser transcritos como uma única transcrição. A seqüência de tamanho natural é mostrada como SEQ ID NO: 1.As can be seen from Figure 1, the ωΔΘ-series reaction products can be modified using appropriate desaturases and, if necessary, linkages / igases to produce ω3 fatty acids. Therefore, it would be extremely valuable to develop a product that makes ARA production possible in a genetically modified organism. The oyster protozoan parasite Perkinsus marinusi is capable of synthesizing saturated and unsaturated fatty acids, including essential fatty acid, arachidonic acid [20: 4 (n - 6), by the Δ -8 desaturase reaction series. Surprisingly, the present inventors found that P. marinusi contains nucleic encoding an A9-elongase, an Δ8-desaturase and a Δ5-desaturase which can all be transcribed as a single transcript. The life-size sequence is shown as SEQ ID NO: 1.
Então, em um primeiro aspecto da invenção, é fornecida uma seqüência de ácido nucléico isolada que codifica polipeptídeos com atividade de A9-elongase, Δδ-dessaturase e Δ5 - dessaturase e que seja selecionado do grupo que consiste em: a) Seqüência de ácido nucléico que compreende resíduos de ácido nucléico 7668 a 12077 de SEQ ID NO: 1 ou um homólogo deste; b) uma seqüência de ácido nucléico que hibridiza sob condições rigorosas com uma seqüência de ácido nucléico que compreende resíduos de ácido nucléico 7668 a 12077 de SEQ ID NO: 1; c) uma seqüência de ácido nucléico, isolada que codifica os polipeptídeos com atividade de A9-elongase, Δδ-dessaturase e Δδ-dessaturase, em que os polipeptídeos são selecionados do grupo que con- siste em SEQ ID NOS 2, 3 e 4; d) Um derivado de uma seqüência de ácido nucléico de SEQ ID NO: 1 que codifica os polipeptídeos com pelo menos 40% de identidade ao nível de aminoácido com SEQ ID NO: 2, SEQ ID NO: 3 e SEQ ID NO: 4; em que os referidos polipeptídeos têm atividade de Δθ-elongase, Δ8 - dessatu-rase e Δδ-dessaturase. A vantagem da seqüência de ácido nucléico da presente invenção é que, embora codifique três enzimas separadas, ela pode ser transcrita como uma única seqüência que torna muito mais simples preparar os vetores de clonagem e expressão que expressam todas as três enzimas.Thus, in a first aspect of the invention, an isolated nucleic acid sequence encoding A9-elongase, Δδ desaturase and Δ5 desaturase activity polypeptides is selected from the group consisting of: a) Nucleic acid sequence comprising nucleic acid residues 7668 to 12077 of SEQ ID NO: 1 or a homologue thereof; (b) a nucleic acid sequence hybridizing under stringent conditions to a nucleic acid sequence comprising nucleic acid residues 7668 to 12077 of SEQ ID NO: 1; c) an isolated nucleic acid sequence encoding the polypeptides with A9-elongase, Δδ-desaturase and Δδ-desaturase activity, wherein the polypeptides are selected from the group consisting of SEQ ID NOS 2, 3 and 4; d) A derivative of a nucleic acid sequence of SEQ ID NO: 1 encoding polypeptides of at least 40% amino acid identity with SEQ ID NO: 2, SEQ ID NO: 3 and SEQ ID NO: 4; wherein said polypeptides have Δθ-elongase, Δ8 - desatu-rase and Δδ-desaturase activity. The advantage of the nucleic acid sequence of the present invention is that although it encodes three separate enzymes, it can be transcribed as a single sequence that makes it much simpler to prepare the cloning and expression vectors that express all three enzymes.
Preferivelmente, a seqüência de ácido nucléico isolada de acordo com a invenção não é idêntica a SEQ ID NO 1 (seqüência 1047306867) propriamente dita.Preferably, the isolated nucleic acid sequence according to the invention is not identical to SEQ ID NO 1 (sequence 1047306867) itself.
No contexto da presente invenção "hibridizar sob condições rigorosas" é pretendido descrever as condições de hibridização e lavagem sob as quais as seqüências de nucleotídeo com pelo menos 60% de homologia para um outro normalmente permanecem hibridizadas com uma outra. As condições são preferivelmente tais que as seqüências com pelo menos cerca de 65%, preferivelmente pelo menos cerca de 70% e especialmente preferivelmente pelo menos 75% ou mais de homologia para uma outra normalmente permaneçam hibridizadas para uma outra. Estas condições rigorosas são conhecidas pelo trabalhador versado e são descritas, por exemplo, em Currents Protocols em Molecular Biology, John Wiley & Sons, N., Y. (1989), 6.3.1-6.3.6. Um exemplo não limitante preferido de condições de hibridização rigorosas, é a hibridização em 6 x de citrato de sódio/cloreto de sódio (= SSC) a aproximadamente 45°C, seguido por uma ou mais etapas de lavagem em 0,2 x SSC, 0,1% de SDS de 50 a 65°C. O trabalhador versado sabe que estas condições de hibridização diferem dependendo do tipo de ácido nucléico e, por exemplo, quando solventes orgânicos estão presentes, relativo à temperatura e concentração de tampão. Sob "condições de hibridização padrão", por exemplo, a temperatura de hibridização está, dependendo do tipo de ácido nucléico, entre 42°C e 58°C em tampão aquoso com uma concentração de 0,1 a 5 x SSC (pH 7,2). Se solventes orgânicos, por exemplo, 50% de formamida, estiverem presentes no tampão acima mencionado, a temperatura sob condições padrão é aproximadamente 42°C. As condições de hibridização para híbridos de DNA:DNA, por exemplo, são 0,1 x SSC e 20°C a 45°C, preferivelmente 30°C a 45°C. As condições de hibridização para híbridos de DNA:RNA são, por exemplo, 0,1 x SSC e 30°C a 550C, preferivelmente 45°C a 55°C. As condições de hibridização acima mencionadas são determinadas por via de exemplo para um ácido nucléico com aproximadamente 100 pb (= pares de base) em comprimento e com um conteúdo de G + C de 50% na ausência de formamida. O trabalhador versado sabe como determinar as condições de hibridização exigidas em base dos livros de ensino acima mencionados ou livros de ensino tal como Sam-brook e outros, "Molecular Cloning", Cold Spring Harbor Laboratory, 1989; Hames e Higgins (Ed.) 1985,"Nucleic Acids Hybridization: A Practical Appro-ach", IRL Press at Oxford University Press, Oxford; Brown (Ed.) 1991,"Essencial Molecular Biology: A Practical Approach", IRL Press at Oxford University Press, Oxford.In the context of the present invention "hybridizing under stringent conditions" is intended to describe the hybridization and washing conditions under which nucleotide sequences with at least 60% homology to one another normally remain hybridized to one another. The conditions are preferably such that sequences of at least about 65%, preferably at least about 70% and especially preferably at least 75% or more homology to one another will normally remain hybridized to one another. These stringent conditions are known to the skilled worker and are described, for example, in Currents Protocols in Molecular Biology, John Wiley & Sons, N., Y. (1989), 6.3.1-6.3.6. A preferred non-limiting example of stringent hybridization conditions is 6x hybridization of sodium citrate / sodium chloride (= SSC) at approximately 45 ° C, followed by one or more 0.2 x SSC washing steps, 0.1% SDS at 50 to 65 ° C. The skilled worker knows that these hybridization conditions differ depending on the type of nucleic acid and, for example, when organic solvents are present, relative to temperature and buffer concentration. Under "standard hybridization conditions", for example, the hybridization temperature is, depending on the type of nucleic acid, between 42 ° C and 58 ° C in an aqueous buffer with a concentration of 0.1 to 5 x SSC (pH 7, 2). If organic solvents, for example 50% formamide, are present in the above buffer, the temperature under standard conditions is approximately 42 ° C. Hybridization conditions for DNA: DNA hybrids, for example, are 0.1 x SSC and 20 ° C to 45 ° C, preferably 30 ° C to 45 ° C. Hybridization conditions for DNA: RNA hybrids are, for example, 0.1 x SSC and 30 ° C to 550 ° C, preferably 45 ° C to 55 ° C. The aforementioned hybridization conditions are determined by way of example for a nucleic acid approximately 100 bp (= base pairs) in length and with a G + C content of 50% in the absence of formamide. The skilled worker knows how to determine the hybridization conditions required on the basis of the aforementioned textbooks or textbooks such as Sam-brook and others, "Molecular Cloning", Cold Spring Harbor Laboratory, 1989; Hames and Higgins (Ed.) 1985, "Nucleic Acids Hybridization: A Practical Appro-ach", IRL Press at Oxford University Press, Oxford; Brown (Ed.) 1991, "Essential Molecular Biology: A Practical Approach", IRL Press at Oxford University Press, Oxford.
Além disso, quando o relatório presente refere-se às moléculas de ácido nucléico isoladas de uma seqüência de nucleotídeo que hibridiza com uma das seqüências de nucleotídeo mostrada em SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 3 ou com uma parte desta sob condições rigorosas, "uma parte desta" é compreendida como significando, de acordo com a invenção, que pelo menos 25 pares de base (= pb), 50 pb, 75 pb, 100 pb, 125 pb ou 150 pb, preferivelmente pelo menos 175 pb, 200 pb, 225 pb, 250 pb, 275 pb ou 300 pb, especialmente preferivelmente 350 pb, 400 pb, 450 pb, 500 pb ou mais pares de base são usados para a hibridização.In addition, when the present report relates to nucleic acid molecules isolated from a nucleotide sequence that hybridizes to one of the nucleotide sequences shown in SEQ ID NO: 1, or part thereof under stringent conditions. "a part thereof" is understood to mean according to the invention that at least 25 base pairs (= bp), 50 bp, 75 bp, 100 bp, 125 bp or 150 bp, preferably at least 175 bp, 200 bp, 225 bp, 250 bp, 275 bp or 300 bp, especially preferably 350 bp, 400 bp, 450 bp, 500 bp or more base pairs are used for hybridization.
No contexto da presente invenção "Homólogos" da seqüência de ácido nucléico com a seqüência SEQ ID NO: 1 significa, por exemplo, variantes alélicas com pelo menos aproximadamente 50 ou 60%, preferivelmente pelo menos aproximadamente 60 ou 70%, mais preferivelmente pelo menos aproximadamente 70 ou 80%, 90% ou 95% e até mesmo mais preferivelmente pelo menos aproximadamente 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% ou mais de identidade ou homologia com uma sequência de nucleotídeo mostrada na SEQ ID NO: 1. "Variantes alélicas" compreendem, em particular, variantes funcionais que podem ser obtidas por deleção, inserção ou substituição de nu-cleotídeos de/na seqüência, sendo pretendido, porém, que a atividade de enzima das proteínas resultantes que são sintetizadas seja retida vantajosamente para a inserção de um ou mais genes. "Homólogos" também quer dizer homólogos bacterianos, fúngi- f cos e de planta, seqüências truncadas, DNA ou RNA de filamento único da seqüência de DNA de codificação e não codificação e derivados tal como, por exemplo, variantes de promotor. Os promotores a montante das seqüências de nucleotídeo detalhadas podem ser modificados por uma ou mais trocas de nucleotídeo, através de inserção(s) deleção{s) sem a funcionalidade ou atividade dos promotores que são adversamente afetados, porém. É, além disso, possível que a modificação da seqüência promotora aumente a sua atividade ou que ela seja substituída completamente por promotores mais ativos, incluindo aqueles de organismos heterólogos.In the context of the present invention "Nucleic acid sequence homologues" having the sequence SEQ ID NO: 1 means, for example, allelic variants of at least about 50 or 60%, preferably at least about 60 or 70%, more preferably at least about 70 or 80%, 90% or 95% and even more preferably at least about 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95 %, 96%, 97%, 98%, 99% or more of identity or homology to a nucleotide sequence shown in SEQ ID NO: 1. "Allelic variants" include, in particular, functional variants which may be obtained by deletion, insertion or substitution of nu-cleotides from / in sequence, however, it is intended that the enzyme activity of the resulting proteins that are synthesized be advantageously retained for insertion of one or more genes. "Homologs" also means bacterial, fungal and plant homologs, truncated sequences, single stranded DNA or RNA from the coding and non-coding DNA sequence, and derivatives such as, for example, promoter variants. Promoters upstream of the detailed nucleotide sequences may be modified by one or more nucleotide exchanges by deletion insert (s) without the functionality or activity of the adversely affected promoters, however. It is furthermore possible that modification of the promoter sequence increases its activity or that it is completely replaced by more active promoters, including those from heterologous organisms.
Para determinar a porcentagem de homologia (= identidade) de duas seqüências de aminoácido, as seqüências são escritas uma sob a outra para uma comparação ideal (por exemplo, podem ser introduzidas aberturas na seqüência de uma proteína ou de um ácido nucléico para gerar um alinhamento ideal com a outra proteína ou o outro ácido nucléico). Então, o resíduo de aminoácido ou nucleotídeos nas posições de aminoácido ou posições de nucleotídeo correspondentes, é comparado. Se uma posição em uma seqüência estiver ocupada pelo mesmo resíduo de aminoácido ou pelo mesmo nucleotídeo como a posição correspondente na outra seqüência, então as moléculas são homólogas a esta posição (isto é, "homologia" de aminoácido ou ácido nucléico como usado no presente contexto corresponde a "identidade" do aminoácido ou ácido nucléico). A porcentagem de homologia entre as duas seqüências é uma função do número de posições que as seqüências compartilham (isto é,% de homologia = número de posições idênticas/número total de posições x 100). Os termos homologia e identidade serão considerados então como sinônimos. A homologia foi calculada sobre a região de seqüência de ácido nucléico ou aminoácido total. O trabalhador versado tem disponível uma série de programas que são com base em vários algoritmos para a comparação de várias sequências. Aqui, os algoritmos de Needleman e Wunsch ou Smith e Waterman dão resultados particularmente seguros. O programa Pil-eUp (o J. Mol. Evolution, 25, 351-360, 1987, Higgins e outros, CABIOS, 5 1989: 151-153) ou os programas Gap e BestFit [Needleman e Wunsch (J. Mol. Biol. 48; 443-453 (1970) e Smith e Waterman (Adv. Appl. Math. 2; 482489 (1981)], que fazem parte do pacote de software GCG [Genetics Computer Group, 575 Science Drive, Madison, Wisconsin, U.S.A. 53711 (1991)], foi usado para o alinhamento de seqüência. Os valores Ogy de seqüência que são indicados acima como uma porcentagem, foram determinado sobre a região de seqüência total que usa o programa GAP as seguintes colocações: Peso GAP: 50, Peso de Comprimento: 3, Equilíbrio Médio: 10.000 e Desequilíbrio Médio: 0,000. A menos que de outro modo especificado, estes ajustes foram sempre usados como ajustes padrões para os alinhamentos de seqüência.To determine the percent homology (= identity) of two amino acid sequences, the sequences are written under one another for optimal comparison (for example, openings in the sequence of a protein or nucleic acid can be introduced to generate alignment). ideal with the other protein or other nucleic acid). Then, the amino acid residue or nucleotide at the corresponding amino acid positions or nucleotide positions is compared. If a position in one sequence is occupied by the same amino acid residue or nucleotide as the corresponding position in the other sequence, then the molecules are homologous to that position (ie amino acid or nucleic acid "homology" as used in the present context). corresponds to the "identity" of the amino acid or nucleic acid). The percentage of homology between the two sequences is a function of the number of positions the sequences share (ie,% of homology = number of identical positions / total number of positions x 100). The terms homology and identity will then be considered as synonyms. Homology was calculated over the sequence region of nucleic acid or total amino acid. The skilled worker has available a number of programs that are based on various algorithms for comparing various sequences. Here, the algorithms of Needleman and Wunsch or Smith and Waterman give particularly reliable results. The Pil-eUp program (J. Mol. Evolution, 25, 351-360, 1987, Higgins et al., CABIOS, 5 1989: 151-153) or the Gap and BestFit programs [Needleman and Wunsch (J. Mol. Biol 48; 443-453 (1970) and Smith and Waterman (Adv. Appl. Math. 2; 482489 (1981)], which are part of the GCG software package [Genetics Computer Group, 575 Science Drive, Madison, Wisconsin, USA 53711 (1991)], was used for sequence alignment.The sequence Ogy values which are given above as a percentage were determined over the total sequence region using the GAP program the following settings: GAP Weight: 50, Weight Length: 3, Average Balance: 10,000, and Average Imbalance: 0,000.Unless otherwise specified, these settings have always been used as default settings for sequence alignments.
No contexto da presente invenção "atividade de A9-elongase, Δδ-dessaturase e A5-dessaturase" é entendida como significando que uma proteína codificada por um derivado de SEQ ID NO:1 ou resíduos de ácido nucléico 7668 a 12077 de SEQ ID NO: 1 retém uma atividade enzimática de pelo menos 10%, preferivelmente 20%, especialmente preferivelmente 30% e muito especialmente 40% comparada com as proteínas/enzimas codificadas pela seqüência SEQ ID NO: 1 ou resíduos de ácido nucléico 7668 a 12077 de SEQ ID NO: 1 e ttttt pode desse modo catalisar a conversão de ácido linoléico em ácido araquidônico.In the context of the present invention "A9-elongase, Δδ-desaturase and A5-desaturase activity" is understood to mean that a protein encoded by a derivative of SEQ ID NO: 1 or nucleic acid residues 7668 to 12077 of SEQ ID NO: 1 retains an enzyme activity of at least 10%, preferably 20%, especially preferably 30% and most especially 40% compared to proteins / enzymes encoded by the sequence SEQ ID NO: 1 or nucleic acid residues 7668 to 12077 of SEQ ID NO. : 1 and ttttt can thus catalyze the conversion of linoleic acid to arachidonic acid.
Embora seja freqüentemente extremamente útil transcrever ácido nucléico que codifica polipeptídeos com atividade de A9-elongase, Δδ-dessaturase e A5-dessaturase como uma única seqüência, pode haver algumas circunstâncias nas quais seja preferível para fazer uso de ácido nucléico que codifica uma única enzima, isto é, uma A9-elongase, uma Δ8- dessaturase ou uma A5-dessaturase.Although it is often extremely useful to transcribe nucleic acid encoding A9-elongase, Δδ-desaturase and A5-desaturase activity polypeptides as a single sequence, there may be some circumstances in which it is preferable to make use of nucleic acid encoding a single enzyme, that is, an A9-elongase, an Δ8-desaturase or an A5-desaturase.
Então, em um segundo aspecto da invenção é fornecida uma seqüência de ácido nucléico isolada que codifica um polipeptídeo com atividade de A9-elongase e que é selecionada do grupo que consiste em: a) uma seqüência que compreende resíduos de ácido nucléico 7668 a 9200 de SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 9 ou um homólogo de uma destas; b) seqüências de ácido nucléico que hibridizam sob condições rigorosas com uma seqüência de ácido nucléico que compreende resíduos 7668 a 9200 de SEQ ID NO: 1 ou SEQ ID NO: 9; c) uma seqüência de ácido nucléico isolada que codifica polipep-tídeos com atividade de A9-elongase, em que o polipeptídeo compreende SEQ ID NO: 2 ou SEQ ID NO: 10; d) um derivado de um uma seqüência que compreende resíduos de ácido nucléico 7668 a 9200 de SEQ ID NO: 1 ou SEQ ID NO: 9, que codificam um polipeptídeo com pelo menos 40% de identidade no nível de ami-noácido com SEQ ID NO: 2 ou SEQ ID NO: 10; em que o referido polipeptídeo tem atividade de A9-elongase.Thus, in a second aspect of the invention there is provided an isolated nucleic acid sequence encoding an A9-elongase activity polypeptide and selected from the group consisting of: a) a sequence comprising nucleic acid residues 7668 to 9200 of SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 9 or a homolog of one of these; (b) nucleic acid sequences that hybridize under stringent conditions to a nucleic acid sequence comprising residues 7668 to 9200 of SEQ ID NO: 1 or SEQ ID NO: 9; c) an isolated nucleic acid sequence encoding A9-elongase activity polypeptides, wherein the polypeptide comprises SEQ ID NO: 2 or SEQ ID NO: 10; d) a derivative of a sequence comprising nucleic acid residues 7668 to 9200 of SEQ ID NO: 1 or SEQ ID NO: 9, encoding a polypeptide of at least 40% identity at the amino acid level of SEQ ID NO: 2 or SEQ ID NO: 10; wherein said polypeptide has A9-elongase activity.
Em um terceiro aspecto da invenção, é fornecida uma seqüência de ácido nucléico isolada que codifica um polipeptídeo com atividade de Δ8-dessaturase e que é selecionado do grupo que consiste em: a) uma seqüência que compreende resíduos de ácido nucléico 9351 a 10724 de SEQ ID NO: 1 ou um homólogo deste; b) seqüências de ácido nucléico que hibridizam sob condições rigorosas com uma seqüência de ácido nucléico que compreende resíduos 9351 a 10724 de SEQ ID NO: 1; c) uma seqüência de ácido nucléico isolada que codifica polipep-tídeos com atividade de A8-dessaturase, em que o polipeptídeo compreende SEQ ID NO: 3;In a third aspect of the invention there is provided an isolated nucleic acid sequence encoding a Δ8-desaturase activity polypeptide selected from the group consisting of: a) a sequence comprising nucleic acid residues 9351 to 10724 of SEQ ID NO: 1 or a homologue thereof; (b) nucleic acid sequences hybridizing under stringent conditions to a nucleic acid sequence comprising residues 9351 to 10724 of SEQ ID NO: 1; c) an isolated nucleic acid sequence encoding A8-desaturase activity polypeptides, wherein the polypeptide comprises SEQ ID NO: 3;
d) um derivado de um uma seqüência que compreende resíduos de ácido nucléico 9351 a 10724 de SEQ ID NO: 1 que codifica um polipeptídeo com pelo menos 40% de identidade no nível de aminoácido com SEQ ID NO: 3; em que o referido polipeptídeo tem atividade de Δδ-dessaturase.d) a derivative of a sequence comprising nucleic acid residues 9351 to 10724 of SEQ ID NO: 1 encoding a polypeptide with at least 40% amino acid level identity to SEQ ID NO: 3; wherein said polypeptide has Δδ desaturase activity.
Em um quarto aspecto da invenção, é fornecida uma seqüência de ácido nucléico isolada que codifica um polipeptídeo com atividade de Δ5-dessaturase e que é selecionado do grupo que consiste em: a) uma seqüência que compreende resíduos de ácido nucléico 10842 a 12077 de SEQ ID NO: 1 ou um homólogo desta; b) seqüências de ácido nucléico que hibridizam sob condições rigorosas com uma seqüência de ácido nucléico que compreende resíduos 10842 a 12077 de SEQ ID NO: 1; c) uma seqüência de ácido nucléico isolada que codifica polipep-tídeos com atividade de Δδ-dessaturase, em que o polipeptídeo compreende SEQ ID NO: 4; d) um derivado de um uma seqüência que compreende resíduos de ácido nucléico 10842 a 12077 de SEQ ID NO: 1 que codifica um polipeptídeo com pelo menos 40% de identidade no nível de aminoácido com SEQ ID NO: 4; em que o referido polipeptídeo tem atividade de Δδ-dessaturase.In a fourth aspect of the invention there is provided an isolated nucleic acid sequence encoding a Δ5 desaturase activity polypeptide selected from the group consisting of: a) a sequence comprising nucleic acid residues 10842 to 12077 of SEQ ID NO: 1 or a homologue thereof; (b) nucleic acid sequences hybridizing under stringent conditions to a nucleic acid sequence comprising residues 10842 to 12077 of SEQ ID NO: 1; c) an isolated nucleic acid sequence encoding polypeptides with Δδ desaturase activity, wherein the polypeptide comprises SEQ ID NO: 4; d) a derivative of a sequence comprising nucleic acid residues 10842 to 12077 of SEQ ID NO: 1 encoding a polypeptide of at least 40% identity at the amino acid level of SEQ ID NO: 4; wherein said polypeptide has Δδ desaturase activity.
Em ainda outro aspecto da invenção, é fornecido um polipeptídeo que é codificado por uma seqüência de ácido nucléico de quaisquer dos primeiro a quarto aspectos da invenção.In yet another aspect of the invention, there is provided a polypeptide which is encoded by a nucleic acid sequence of any of the first to fourth aspects of the invention.
Vantajosamente, o polipeptídeo codificado por estas moléculas de ácido nucléico têm, pelo menos aproximadamente 60%, preferivelmente pelo menos aproximadamente 60% e mais preferivelmente pelo menos aproximadamente 70%, 80% ou 90% e preferivelmente pelo menos aproximadamente 8δ%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 9δ%, 96%, 97%, 98%, 99% ou mais de identidade com as seqüências de aminoá-cido mostradas nas SEQ ID NO: 2, SEQ ID NO: 3, SEQ ID NO: 4 ou SEQ ID NO: 9.Advantageously, the polypeptide encoded by these nucleic acid molecules is at least about 60%, preferably at least about 60% and more preferably at least about 70%, 80% or 90% and preferably at least about 8δ%, 86%. 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 9δ%, 96%, 97%, 98%, 99% or more of identity with the amino acid sequences shown in SEQ ID NO: 2, SEQ ID NO: 3, SEQ ID NO: 4 or SEQ ID NO: 9.
As seqüências de ácido nucléico usadas no processo são introduzidas vantajosamente em um cassete de expressão que torna possível a expressão dos ácidos nucléicos em organismos tal como microorganismos ou plantas.The nucleic acid sequences used in the process are advantageously introduced into an expression cassette which makes the expression of nucleic acids possible in organisms such as microorganisms or plants.
Então, em outro aspecto da invenção é fornecida um construto de gene compreendendo uma seqüência de ácido nucléico que codifica um ou mais polipeptídeos com atividade de A9-elongase, Δδ-dessaturase e/ou A5-dessaturase como apresentado acima, operavelmente ligado com uma ou mais seqüências reguladoras.Then, in another aspect of the invention there is provided a gene construct comprising a nucleic acid sequence encoding one or more A9-elongase, Δδ-desaturase and / or A5-desaturase activity polypeptides as shown above, operably linked with one or more more regulatory sequences.
No cassete de expressão, a seqüência de ácido nucléico que codifica A9-elongase, Δδ-dessaturase e/ou Δδ-dessaturase, é unida operavelmente com uma ou mais seqüências reguladoras, vantajosamente para realçar a expressão de gene. É pretendido que estas seqüências reguladoras tornem possível a expressão específica dos genes e proteínas. Dependendo do organismo de hospedeiro, isto pode significar, por exemplo, que o gene é expressado e/ou superexpressado somente após a indução ter ocorrido, ou então que é expressado e/ou superexpressado imediatamente. Por exemplo, estas seqüências reguladoras tomam a forma de seqüências às quais indutores ou repressores se ligam, desse modo controlando a expressão do ácido nucléico. Além destas novas seqüências reguladoras, ou em vez destas seqüências, os elementos reguladores naturais destas seqüências podem ainda estar presentes antes dos genes estruturais atuais e, se apropriado, podem ter sido geneticamente modificados de um tal modo que seu regulamento natural seja eliminado e a expressão dos genes seja intensificada. Entretanto, o cassete de expressão (= construto de expressão = construto de gene) também pode ser mais simples na construto, isto é, nenhum sinal regulador adicional foi inserido antes da seqüência de ácido nucléico ou seus derivados, e o promotor natural junto com seu regulamento não foi removido. Ao invés, a seqüência reguladora natural foi mutada de um tal modo que o regulamento já não mais ocorra e/ou expressão de gene, é intensificada. Estes promotores modificados também podem estar posicionados neles mesmos antes do gene natural na forma de partes de seqüências (= promotor com partes das seqüências de ácido nucléico usadas de acordo com a invenção) para realçar a atividade. Além disso, o construto de gene pode vantajosamente também compreender uma ou mais das que são conhecidas como seqüências realçadoras em ligação operável com o promotor, o que torna possível uma expressão intensificada da seqüência de ácido nucléico.In the expression cassette, the nucleic acid sequence encoding A9-elongase, Δδ-desaturase and / or Δδ-desaturase is operably joined with one or more regulatory sequences, advantageously to enhance gene expression. These regulatory sequences are intended to make specific expression of genes and proteins possible. Depending on the host organism, this may mean, for example, that the gene is expressed and / or overexpressed only after induction has occurred, or that it is expressed and / or overexpressed immediately. For example, these regulatory sequences take the form of sequences to which inducers or repressors bind, thereby controlling the expression of nucleic acid. In addition to these new regulatory sequences, or instead of these sequences, the natural regulatory elements of these sequences may still be present before the current structural genes and, if appropriate, may have been genetically modified in such a way that their natural regulation is eliminated and expression of genes is intensified. However, the expression cassette (= expression construct = gene construct) may also be simpler in the construct, that is, no additional regulatory signal was inserted before the nucleic acid sequence or derivatives thereof, and the natural promoter along with its regulation has not been removed. Instead, the natural regulatory sequence has been mutated in such a way that regulation no longer occurs and / or gene expression is intensified. These modified promoters may also be positioned within themselves prior to the natural gene in the form of sequence parts (= promoter with parts of nucleic acid sequences used in accordance with the invention) to enhance activity. In addition, the gene construct may also advantageously comprise one or more of what are known as enhancer sequences in operable linkage with the promoter, which makes enhanced expression of the nucleic acid sequence possible.
Seqüências vantajosas adicionais, tai como outros elementos reguladores ou seqüências terminadoras, também podem ser inseridas na extremidade 3' das seqüências de DNA. Uma ou mais seqüências que codificam enzimas que catalisam a conversão de ARA em um ácido graxo ω3-insaturado tal como EPA ou DHA também podem estar presentes. Desse modo, por exemplo, as seqüências que codificam um A5-elongase, Δ3-dessaturase e/ou A4-dessaturase, podem estar presentes em uma ou mais cópias do cassete de expressão (= construto de gene). Preferivelmente, somente uma cópia dos genes está presente em cada cassete de expressão. Este construto de gene ou os construtos de gene podem ser expressados juntos no organismo de hospedeiro. Neste contexto, o(s) construto(s) de gene pode(m) ser inserido(s) em um ou mais vetores e está(ão) presente(s) na célula na forma livre, ou então é inserido(s) no genoma. É vantajoso para a inserção de outros genes no genoma quando os genes a serem expressados estão presentes juntos em um construto de gene.Additional advantageous sequences, such as other regulatory elements or terminator sequences, may also be inserted at the 3 'end of the DNA sequences. One or more enzyme coding sequences that catalyze the conversion of ARA into an ω3-unsaturated fatty acid such as EPA or DHA may also be present. Thus, for example, sequences encoding an A5-elongase, Δ3-desaturase and / or A4-desaturase may be present in one or more copies of the expression cassette (= gene construct). Preferably, only one copy of the genes is present in each expression cassette. This gene construct or gene constructs may be expressed together in the host organism. In this context, the gene construct (s) may be inserted into one or more vectors and are present in the cell in free form, or may be inserted into the genome It is advantageous for the insertion of other genes into the genome when the genes to be expressed are present together in a gene construct.
Neste contexto, os fatores ou seqüências reguladoras podem, como descrito acima, preferivelmente ter um efeito positivo na expressão de gene dos genes introduzidos, desse modo intensificando. Desse modo, um realce dos elementos reguladores, vantajosamente no nível transcricional, pode ocorrer usando-se sinais de transcrição fortes como intensificadores e/ou promotores. Além disso, porém, a translação intensificada também é possível, por exemplo, melhorando-se a estabilidade do mRNA.In this context, regulatory factors or sequences may, as described above, preferably have a positive effect on gene expression of the introduced genes, thereby enhancing. Thus, enhancement of regulatory elements, advantageously at the transcriptional level, may occur using strong transcriptional signals as enhancers and / or promoters. In addition, however, enhanced translation is also possible, for example by improving mRNA stability.
As seqüências reguladoras incluem, em particular, seqüências de planta tal como as seqüências promotoras e terminadoras. Os construtos podem ser vantajosamente estavelmente propagados em microorganismos, em particular em E. coli e Agrobacterium tumefaciens, sob condições seletivas, e torna possível a transferência de DNA heterólogo em plantas ou microorganismos.In particular, regulatory sequences include plant sequences such as promoter and terminator sequences. The constructs may advantageously be stably propagated in microorganisms, in particular E. coli and Agrobacterium tumefaciens, under selective conditions, and make it possible to transfer heterologous DNA into plants or microorganisms.
As seqüências reguladoras úteis estão presentes, por exemplo, em promotores tal como o promotor cos, tac, trp, tet, trp-tet, Ipp, lac, Ipp-lac, laclq, 17, T5, T3, gal, trc, ara, SP6, λ-PR ou λ-PL e são empregadas vantajo- samente em bactérias Gram-negativas. Outras, seqüências reguladoras vantajosas estão, por exemplo, presentes nos promotores Gram-positivos amy e SP02, nos promotores de levedura ou fúngicos ADC1, MFa, CA, P-60, CYC1, GAPDH, TEF, rp28, ADH ou nos promotores de planta CaMV/35S [Franck e outros, Cell 21 (1980) 285-294], PRP1 [Ward e outros, Plant. Mol. Biol. 22 (1993)], SSU, OCS, iib4, usp, STLS1, B33, nos ou no promotor de ubiquitina ou faseolina. Vantajoso neste contexto também são os promotores induzíveis, tal como os promotores descritos nos EP-A-0 388 186 (induzível por benzenossulfonamida), Plant J. 2, 1992:397-404 (Gatz e outros, induzível por tetraciclina), EP-A-0 335 528 (induzível por ácido abscíssico) ou promotores de WO 93/21334 (induzível por etanol ou cicloexenol). Outros promotores de planta adequados são o promotor de FBPase citosólico ou o promotor ST-LSI de batata (Stockhaus e outros, EMBO J. 8, 1989, 2445), o promotor de glicina max fosforibosilpirofosfato amidotransferase (N°. de Acesso de Genbank U87999) ou o promotor nodo-específico descrito na Patente EP-A-0 249 676.Useful regulatory sequences are present, for example, in promoters such as the cos, tac, trp, tet, trp-tet, Ipp, lac, Ipp-lac, laclq, 17, T5, T3, gal, trc, ara, SP6, λ-PR or λ-PL and are advantageously employed in Gram-negative bacteria. Other advantageous regulatory sequences are, for example, present in the amy and SP02 Gram-positive promoters, ADC1, MFa, CA, P-60, CYC1, GAPDH, TEF, rp28, ADH or plant promoters. CaMV / 35S [Franck et al., Cell 21 (1980) 285-294], PRP1 [Ward et al., Plant. Mol. Biol. 22 (1993)], SSU, OCS, ibib, usp, STLS1, B33, in or on the ubiquitin or phaseolin promoter. Advantageous in this context are also inducible promoters such as those described in EP-A-0 388 186 (benzenesulfonamide inducible), Plant J. 2, 1992: 397-404 (Gatz et al., Tetracycline inducible), EP- A-0 335 528 (abscissic acid inducible) or promoters of WO 93/21334 (ethanol or cyclohexenol inducible). Other suitable plant promoters are the cytosolic FBPase promoter or potato ST-LSI promoter (Stockhaus et al., EMBO J. 8, 1989, 2445), glycine max phosphoribosyl pyrophosphate amidotransferase promoter (Genbank Accession No. U87999). ) or the node-specific promoter described in EP-A-0 249 676.
Os promotores especialmente vantajosos são promotores que tornam possível a expressão em tecidos que estão envolvidos na biossínte-se de ácidos graxos. Muito especialmente vantajosos são os promotores específicos de semente, tal como o promotor de USP como descrito, porém também outros promotores tal como LeB4, DC3, promotor de faseolina ou napin. Outros promotores especialmente vantajosos são promotores específicos de semente que podem ser usados para plantas monocotiledôneas ou dicotiledôneas e que são descritos nos US 5.608.152 (promotor de napin de óleo de semente de colza), WO 98/45461 (promotor de Arabidopsis oleosin), US 5.504.200 (promotor de Phaseolus vulgaris phaseolin), WO 91/13980 (promotor de Brassica Bce4), por Baeumlein e outros, Plant J., 2, 2, 1992:233-239 (promotor LeB4 de um legume), estes promotores que são adequados para dicotilédonas. Os exemplos de promotores que são adequados para monocotilédonas são o lpt-2 de cevada ou promotor de lpt-1 (WO 95/15389 e WO 95/23230), o promotor de proteína da cevada e outros promotores adequados descritos nos WO 99/16890.Especially advantageous promoters are promoters that make possible expression in tissues that are involved in fatty acid biosynthesis. Most especially advantageous are seed specific promoters such as the USP promoter as described, but also other promoters such as LeB4, DC3, phaseolin promoter or napin. Other especially advantageous promoters are seed specific promoters which may be used for monocotyledonous or dicotyledonous plants and which are described in US 5,608,152 (rapeseed oil napin promoter), WO 98/45461 (Arabidopsis oleosin promoter), US 5,504,200 (Phaseolus vulgaris phaseolin promoter), WO 91/13980 (Brassica Bce4 promoter), by Baeumlein et al., Plant J., 2, 2, 1992: 233-239 (one legume LeB4 promoter), these promoters that are suitable for dichotyledones. Examples of promoters that are suitable for monocotyledones are barley lpt-2 or lpt-1 promoter (WO 95/15389 and WO 95/23230), barley protein promoter and other suitable promoters described in WO 99/16890. .
Em princípio, é possível usar todos os promotores naturais junto com as suas seqüências reguladoras, tal como aquelas mencionadas acima. Também é possível e vantajoso usar os promotores sintéticos, ou em adição ou sozinho, em particular quando eles medeiam expressão específica de semente, tal como aquelas descritas no WO 99/16890.In principle, it is possible to use all natural promoters in conjunction with their regulatory sequences, such as those mentioned above. It is also possible and advantageous to use synthetic promoters, either in addition or alone, particularly when they mediate seed specific expression, such as those described in WO 99/16890.
Para alcançar um conteúdo de ARA particularmente elevado, especialmente em plantas transgênicas os genes deveríam ser expressados vantajosamente em colheitas de óleo de uma maneira específica de semente. Para este fim, podem ser usados os promotores específicos de semente, ou aqueles promotores que são ativos no embrião e/ou no endosperma. Em princípio, os promotores específicos semente podem ser isolados tanto de plantas dicotiledôneas quanto monocotiledôneas. Os promotores preferidos são listados a seguir: USP (= proteína de semente desconhecida) e vicilina (Vicia faba) [Baumlein e outros, Mol. Gen Genet, 1991, 225(3)], napin (óleo de semente de colza) [US 5.608.152], proteína portadora de acila (óleo de semente de colza) [US 5.315.001 e WO 92/18634], oleosina (Arabidopsis thaliana) [WO 98/45461 e WO 93/20216], faseolina (Phaseolus vulgaris) [US 5.504.200], Bce4 [WO 91/13980], leguminas B4 (promotor de LegB4) [Baumlein e outros, Plant J., 2,2, 1992], Lpt2 e Ipt1 (cevada) [WO 95/15389 e WO95/23230], promotores específicos de semente de arroz, milho e trigo [WO 99/16890], Amy32b, Amy 6-6 e aleuraína [US 5.677.474], Bce4 (óleo de semente de colza) [US 5.530.149], glicinina (soja) [EP 571 741], fosfoenol piruvato carboxilase (soja) [JP 06/62870], ADR12-2 (soja) [WO 98/08962], isocitrato liase (óleo de semente de colza) [US 5.689.040] ou α-amilase (cevada) [EP 781 849]. A expressão de gene planta também pode ser facilitada por um promotor quimicamente induzível (veja , revisão em Gatz 1997, Annu. Rev. Plant Physiol. Plant Mol. Biol., 48:89-108). Os promotores quimicamente in-duzíveis são particularmente adequados quando é desejado que expressão de gene ocorra de uma maneira específica de tempo. Os exemplos de tais promotores são um promotor induzível por ácido salicílico (WO 95/19443), um promotor induzível por tetraciclina (Gatz e outros (1992) Plant J. 2, 397- 404) e um promotor induzível por etanol.To achieve a particularly high ARA content, especially in transgenic plants, genes should advantageously be expressed in oil crops in a specific seed manner. For this purpose, seed-specific promoters or promoters that are active in the embryo and / or endosperm may be used. In principle, seed specific promoters can be isolated from either dicotyledonous or monocotyledonous plants. Preferred promoters are listed below: USP (= unknown seed protein) and viciline (Vicia faba) [Baumlein et al., Mol. Gen Genet, 1991, 225 (3)], napin (rapeseed oil) [US 5,608,152], acyl carrier protein (rapeseed oil) [US 5,315,001 and WO 92/18634], oleosin (Arabidopsis thaliana) [WO 98/45461 and WO 93/20216], phaseolin (Phaseolus vulgaris) [US 5,504,200], Bce4 [WO 91/13980], B4 Legumes (LegB4 Promoter) [Baumlein et al., Plant J., 2,2, 1992], Lpt2 and Ipt1 (Barley) [WO 95/15389 and WO95 / 23230], rice, corn and wheat seed specific promoters [WO 99/16890], Amy32b, Amy 6-6 and Aleurain [US 5,677,474], Bce4 (rapeseed oil) [US 5,530,149 ], glycine (soy) [EP 571 741], phosphoenol pyruvate carboxylase (soy) [JP 06/62870], ADR12-2 (soy) [WO 98/08962], isocitrate lyse (rapeseed oil) [US 5,689 .040] or α-amylase (barley) [EP 781 849]. Plant gene expression can also be facilitated by a chemically inducible promoter (see, review in Gatz 1997, Annu. Rev. Plant Physiol. Plant Mol. Biol., 48: 89-108). Chemically inducible promoters are particularly suitable when gene expression is desired to occur in a specific time frame. Examples of such promoters are a salicylic acid inducible promoter (WO 95/19443), a tetracycline inducible promoter (Gatz et al. (1992) Plant J. 2, 397- 404) and an ethanol inducible promoter.
Para assegurar a integração estável dos genes de biossíntese na planta transgênica em uma pluralidade de gerações, é normalmente necessário para cada dos ácidos nucléico que codifique uma proteína de interesse a ser expressada sob o controle de um promotor separado, preferivelmente um promotor que difere dos outros promotores, uma vez que os motivos de seqüência de repetição podem levar a instabilidade do T-DNA, ou aos eventos de recombinação. Esta é uma razão por que o ácido nucléico da presente invenção é particularmente vantajoso uma vez que seqüências que codificam A9-elongase, Δδ-dessaturase e Δδ-dessaturase podem ser transcritas como uma única unidade que precisa de somente um promotor. Certamente, será necessário para outros genes codificar, por exemplo, Δ5-elongase, u>3-dessaturase e/ou de A4-dessaturase para estar sob o controle de promotores separados.To ensure stable integration of biosynthesis genes in the transgenic plant over a plurality of generations, it is normally necessary for each nucleic acid to encode a protein of interest to be expressed under the control of a separate promoter, preferably a promoter that differs from the others. promoters, since repeat sequence motifs can lead to T-DNA instability or recombination events. This is one reason why the nucleic acid of the present invention is particularly advantageous since sequences encoding A9-elongase, Δδ-desaturase and Δδ-desaturase can be transcribed as a single unit that needs only one promoter. Of course, it will be necessary for other genes to encode, for example, Δ5-elongase, u> 3 desaturase and / or A4 desaturase to be under the control of separate promoters.
Neste contexto, o cassete de expressão é construído vantajosamente de um tal modo que um promotor seja seguido por um sítio de divagem, vantajosamente em um poliligante, para inserção do ácido nucléico a ser expressado e, se apropriado, uma seqüência terminadora é posicionada atrás do poliligante. Esta seqüência é várias vezes repetida, preferivelmente três, quatro ou cinco vezes, de forma que até cinco genes possam ser combinados em um construto e introduzidos na planta transgênica a ser expressada. Vantajosamente, a seqüência é repetida até três vezes. Para expressar as seqüências de ácido nucléico, a última é inserida atrás do promotor por um sítio de divagem adequado, por exemplo, no poliligante. Vantajosamente, cada seqüência de ácido nucléico tem seu próprio promotor e, se apropriado, sua própria seqüência terminadora. Tais construtos vantajosos são descritos, por exemplo, em DE 101 02 337 ou DE 101 02 338. Porém, também é possível inserir uma pluralidade de seqüências de ácido nucléico atrás de um promotor e, se apropriado, antes de uma seqüência terminadora. Aqui, o sítio de inserção, ou a seqüência, dos ácidos nucléicos inseridos no cassete de expressão não é de importância crítica, quer dizer que uma seqüência de ácido nucléico pode ser inserida na primeira ou última posição no cassete sem sua expressão sendo influenciada substancialmente desse modo. Vantajosamente, os promotores diferentes tal como, por exemplo, o promotor USP, LegB4 ou DC3, e seqüências terminadoras diferentes podem ser usadas no cassete de expressão. Porém, também é possível usar somente um tipo de promotor no cassete. Porém, isto pode levar aos eventos de recombinação indesejados.In this context, the expression cassette is advantageously constructed such that a promoter is followed by a dividing site, advantageously in a polylinker, for insertion of the nucleic acid to be expressed and, if appropriate, a terminator sequence is positioned behind the polyligante. This sequence is repeated several times, preferably three, four or five times, so that up to five genes can be combined into one construct and introduced into the transgenic plant to be expressed. Advantageously, the sequence is repeated up to three times. To express nucleic acid sequences, the latter is inserted behind the promoter by a suitable dividing site, for example, into the polylinker. Advantageously, each nucleic acid sequence has its own promoter and, if appropriate, its own terminator sequence. Such advantageous constructs are described, for example, in DE 101 02 337 or DE 101 02 338. However, it is also possible to insert a plurality of nucleic acid sequences behind a promoter and, if appropriate, before a terminator sequence. Here, the insertion site, or sequence, of nucleic acids inserted into the expression cassette is not of critical importance, meaning that a nucleic acid sequence can be inserted at the first or last position in the cassette without its expression being substantially influenced by that. mode. Advantageously, different promoters such as, for example, the USP, LegB4 or DC3 promoter, and different terminator sequences may be used in the expression cassette. However, it is also possible to use only one type of promoter in the cassette. However, this can lead to unwanted recombination events.
Como descrito acima, a transcrição dos genes que foram introduzidos, deveria ser vantajosamente terminada por seqüências terminadoras adequadas na extremidade 3' dos genes de biossíntese que foram introduzidos (atrás do codon de interrupção). Um exemplo de uma seqüência que pode ser usada neste contexto é a seqüência terminadora OCS 1. Como é o caso com os promotores, seqüências terminadoras diferentes deveriam ser usadas para cada gene. O construto de gene da presente invenção também pode compreender genes de biossíntese do ácido graxo ou metabolismo de lipídio selecionados do grupo de deidrogenase(s) de acil-CoA, acil-ACP [= proteína portadora de acila] dessaturase(s), tioesterase(s), acil-ACP aciltransferase(s) de ácido graxo, acil-CoA:lisofosfolipídeo aciltransferase(s), ácido graxo sin-tases, ácido graxo hidroxilases, acetil-coenzima A carboxilase(s), acil-coenzima A oxidase(s), ácido graxo dessaturase(s), ácido graxo acetilena-ses, lipoxigenases, triacilglycerol lipases, alenóxido sintases, hidroperóxido liases ou ácido graxo elongase(s) e dessaturase(s) tal como A4-dessaturase, A5-dessaturase, Δ6 - dessaturase, Δδ-dessaturase, A9-dessaturase, Δ12-dessaturase ou Δδ-elongase.As described above, the transcription of the genes that were introduced should advantageously be terminated by suitable terminator sequences at the 3 'end of the biosynthesis genes that were introduced (behind the disruption codon). An example of a sequence that can be used in this context is the OCS 1 terminator sequence. As is the case with promoters, different terminator sequences should be used for each gene. The gene construct of the present invention may also comprise fatty acid biosynthesis or lipid metabolism genes selected from the group of acyl-CoA dehydrogenase (s), acyl-ACP [= acyl-carrying protein] desaturase (s), thioesterase ( fatty acid acyl-ACP acyltransferase (s), acyl-CoA: lysophospholipid acyltransferase (s), fatty acid synthases, fatty acid hydroxylases, acetyl coenzyme A carboxylase (s), acyl coenzyme A oxidase (s) ), fatty acid desaturase (s), fatty acid acetylene ses, lipoxygenases, triacilglycerol lipases, alenoxide synthases, hydroperoxide liases or fatty acid elongase (s) such as A4 desaturase, A5 desaturase, Δ6 desaturase , Δδ desaturase, A9 desaturase, Δ12 desaturase or Δδ elongase.
Estes genes ou ácidos nucléicos adicionais podem ser clonados nos cassetes de expressão, que são então usados para transformar plantas com a ajuda de vetores como Agrobacterium.These additional genes or nucleic acids can be cloned into expression cassettes, which are then used to transform plants with the help of vectors such as Agrobacterium.
Aqui, os fatores ou seqüências reguladoras podem, como descrito acima, preferivelmente ter um efeito positivo, e desse modo realçar, nos genes de expressão que foram introduzidos. Desse modo, o realce dos elementos reguladores pode vantajosamente ocorrer no nível transcricional usando sinais de transcrição fortes sinaliza como intensificadores e/ou promo- tores. Porém, uma translação intensificada também é possível, por exemplo, melhorando a estabilidade do mRNA. Em princípio, os cassetes de expressão podem ser usados diretamente para introdução nas plantas ou então podem ser introduzidos em um vetor.Here, regulatory factors or sequences may, as described above, preferably have a positive effect, and thereby enhance, on the expression genes that have been introduced. Thus enhancement of regulatory elements may advantageously occur at the transcriptional level using strong transcription signals as enhancers and / or promoters. However, enhanced translation is also possible, for example by improving mRNA stability. In principle, expression cassettes can be used directly for plant introduction or can be introduced into a vector.
Então, em ainda outro aspecto da invenção, é fornecido um vetor que compreende um ácido nucléico ou um construto de gene em quaisquer dos aspectos da invenção descritos acima.Then, in yet another aspect of the invention, there is provided a vector comprising a nucleic acid or gene construct in any of the aspects of the invention described above.
Em uma modalidade, o vetor pode ser um vetor de clonagem.In one embodiment, the vector may be a cloning vector.
As seqüências de ácido nucléico da invenção podem ser introduzidas sozinhas, ou preferivelmente, em combinação com um cassete de expressão (construto de ácido nucléico) em um organismo. Para introduzir os ácidos nucléicos, os ácidos nucléicos são vantajosamente ampliados e ligados de maneira conhecida. Preferivelmente, um procedimento que segue o protocolo para Pfu DNA polimerase ou uma mistura de Pfu/Taq DNA poli-merase é seguida. Os iniciadores são selecionados levando em consideração a seqüência a ser ampliada. Os iniciadores deveríam ser escolhidos vantajosamente de tal um modo que o amplificado compreenda a seqüência codogênica total desde o códon de partida ao códon de interrupção. Após a amplificação, o amplificado é convenientemente analisado. Por exemplo, uma separação de gelelectroforético pode ser realizada, a qual é seguida por uma análise quantitativa e qualitativa. Após isso, o amplificado pode ser purificado seguindo um protocolo padrão (por exemplo, Qiagen). Uma alíquota do amplificado purificado é então disponível para a etapa de clonagem subseqüente.The nucleic acid sequences of the invention may be introduced alone, or preferably in combination with an expression cassette (nucleic acid construct) into an organism. To introduce nucleic acids, nucleic acids are advantageously extended and ligated in known manner. Preferably, a procedure following the protocol for Pfu DNA polymerase or a mixture of Pfu / Taq DNA polymerase is followed. Primers are selected taking into consideration the sequence to be extended. The primers should be advantageously chosen such that the amplifier comprises the total codogenic sequence from the start codon to the stop codon. After amplification, the amplifier is conveniently analyzed. For example, a gel electrophoretic separation may be performed, which is followed by a quantitative and qualitative analysis. After this, the amplified can be purified following a standard protocol (eg Qiagen). An aliquot of the purified amplifier is then available for the subsequent cloning step.
Os vetores de clonagem adequados são geralmente conhecidos pelo trabalhador versado. Estes incluem, em particular, os vetores que são capazes de replicação em sistemas microbianos, quer dizer principalmente vetores que garantem a clonagem eficiente em leveduras ou fungos e que tornam possível a transformação estável de plantas. Aqueles que devem ser mencionados em particular são vários sistemas de vetor binário e co-integrado que são adequados para a transformação mediada por T-DNA. Tais sistemas de vetor são, como uma regra, caracterizados pelo fato de que eles compreendem os genes vir requeridos para a transformação mediada por Agrobacterium e as seqüências de delimitação de T-DNA (borda de T-DNA). Estes sistemas de vetor vantajosamente também compreendem outras regiões cis-reguladoras tal como os promotores e seqüências termina-doras e/ou marcadores de seleção, por meio dos quais os organismos adequadamente transformados podem ser identificados. Ao mesmo tempo em que no caso de sistemas de vetor co-integrado, os genes vir e seqüências de T-DNA estão dispostos no mesmo vetor, os sistemas binários são com base em pelo menos dois vetores, um dos quais transporta os genes vir, porém nenhum T-DNA, ao mesmo tempo em que um segundo transporta o T-DNA, porém nenhum gene vir. Devido a este fato, os últimos vetores mencionados são relativamente pequenos, fáceis de manipular e replicar tanto em £ coli quanto em Agrobacterium. Estes vetores binários incluem vetores das séries pBIB-HYG, pPZP, pBecks, pGreen. De acordo com a invenção, Bin19, pB1101, pBinAR, pGPTV e pCAMBIA são usados por preferência. Uma avaliação dos vetores binários e de seu uso é encontrada em Hellens e outros, Trends in Plant Science (2000) 5, 446 - 451. Para preparar os vetores, os vetores podem ser primeiro linearizados com endonuclease(s) de restrição e então modificados enzimaticamente de uma maneira adequada. Depois disso, o vetor é purificado, e uma alíquota é empregada para a etapa de clonagem. Na etapa de clonagem, o amplificado enzimaticamente clivado e, se apropriado, purificado é clonado com fragmentos de vetor foram preparados de uma maneira semelhante, usando ligase. Neste contexto, um cons-truto de ácido nucléico particular, ou construto de vetor ou plasmídeo, pode ter um ou então mais de um segmento de gene codogênico. Os segmentos de gene codogênico nestas construtos são preferivelmente ligados opera-velmente com seqüências reguladoras. As seqüências reguladoras incluem, em particular, seqüências de planta como os promotores e seqüências ter-minadoras descritas acima. O construto pode ser vantajosamente estavel-mente propagado em microorganismos, em particular em £ coli e Agrobacterium tumefaciens, sob condições seletivas e torna possível a transferência de DNA heterólogo em plantas ou microorganismos.Suitable cloning vectors are generally known to the skilled worker. These include, in particular, vectors that are capable of replication in microbial systems, namely vectors which ensure efficient cloning into yeast or fungi and which make stable plant transformation possible. Those that should be mentioned in particular are various binary and cointegrated vector systems that are suitable for T-DNA mediated transformation. Such vector systems are, as a rule, characterized by the fact that they comprise the genes come required for Agrobacterium-mediated transformation and the T-DNA boundary sequences (T-DNA border). These vector systems advantageously also comprise other cis-regulatory regions such as promoters and terminator sequences and / or selection markers, by which suitably transformed organisms can be identified. While in the case of co-integrated vector systems, vir genes and T-DNA sequences are arranged in the same vector, binary systems are based on at least two vectors, one of which carries vir genes, but no T-DNA, while a second carries the T-DNA, but no gene comes. Due to this fact, the last vectors mentioned are relatively small, easy to manipulate and replicate in both Coli and Agrobacterium. These binary vectors include pBIB-HYG, pPZP, pBecks, pGreen series vectors. In accordance with the invention, Bin19, pB1101, pBinAR, pGPTV and pCAMBIA are preferably used. An evaluation of binary vectors and their use is found in Hellens et al., Trends in Plant Science (2000) 5, 446 - 451. To prepare vectors, vectors can first be linearized with restriction endonuclease (s) and then modified. enzymatically in a suitable manner. After that, the vector is purified, and an aliquot is employed for the cloning step. In the cloning step, the enzymatically cleaved and, if appropriate, purified amplified cloned vector fragments were prepared in a similar manner using ligase. In this context, a particular nucleic acid construct, or vector or plasmid construct, may have one or more than one codogenic gene segment. The codogenic gene segments in these constructs are preferably operably linked with regulatory sequences. In particular, regulatory sequences include plant sequences such as promoters and terminator sequences described above. The construct may advantageously be stably propagated in microorganisms, in particular E. coli and Agrobacterium tumefaciens, under selective conditions and makes it possible to transfer heterologous DNA into plants or microorganisms.
Os ácidos nucléicos da invenção podem ser introduzidos em organismos, tais como microorganismos ou vantajosamente plantas, vantajosamente usando vetores de clonagem, e desse modo ser usado na transformação de plantas tal como aquelas que são publicadas e citadas em: Plant Molecular Biology and Biotechnology (CRC Press, Boca Raton, Florida), Capítulo 6/7, p. 71-119 (1993); F.F. White, Vectors for Gene Transfer in Higher Plants; in: Transgenic Plants, Vol. 1 , Engineering and Utilization, Ed.: Kung e R. Wu, Academic Press, 1993, 15-38; B. Jenes e outros, Techniques for Gene Transfer, em: Transgenic Plants, Vol. 1 , Engineering and Utilization, Ed.: Kung e R. Wu, Academic Press (1993), 128-143; Potrykus, Annu. Rev. Plant Physiol. Plant Molec. Biol. 42 (1991), 205-225. Desse modo, os ácidos nucléicos, os ácidos nucléicos inventivos e construtos de ácido nu-cléico e/ou vetores usados no processo podem ser de usados para a modificação de recombinante de um espectro amplo de organismos, vantajosamente plantas, de forma que o último se torne o produtor melhor e/ou mais eficiente de ARA.The nucleic acids of the invention may be introduced into organisms, such as microorganisms or advantageously plants, advantageously using cloning vectors, and thereby be used in transformation of plants such as those published and cited in: Plant Molecular Biology and Biotechnology (CRC) Press, Boca Raton, Florida), Chapter 6/7, p. 71-119 (1993); F.F. White, Vectors for Gene Transfer in Higher Plants; in: Transgenic Plants, Vol. 1, Engineering and Utilization, Ed .: Kung and R. Wu, Academic Press, 1993, 15-38; B. Jenes et al., Techniques for Gene Transfer, in: Transgenic Plants, Vol. 1, Engineering and Utilization, Ed .: Kung and R. Wu, Academic Press (1993), 128-143; Potrykus, Annu. Rev. Plant Physiol. Plant Molec. Biol. 42 (1991), 205-225. Thus, the inventive nucleic acids, nucleic acids and nucleic acid constructs and / or vectors used in the process can be used for recombinant modification of a broad spectrum of organisms, advantageously plants, so that the latter is make ARA the best and / or most efficient producer.
Uma série de mecanismos existe pelo qual a modificação das proteínas de A9-elongase, A8-dessaturase e Δδ-dessaturase é possível, de forma que o rendimento, produção e/ou eficiência de produção de ARA em uma planta, preferivelmente em uma planta de colheita de óleo ou um microorganismo, possa ser influenciado diretamente devido a estas proteínas modificadas. O número ou atividade das proteínas ou genes pode ser aumentado, de forma que maiores quantidades dos produtos de gene e, no final das contas, maiores quantidades dos compostos da fórmula geral I, sejam produzidas. Uma síntese de novo em um organismo que precisou da atividade e capacidade de biossintetizar os compostos antes de introdução do gene(s) correspondente também é possível. Isto se aplica analogamente à combinação com outras dessaturases ou elongases ou outras enzimas do metabolismo de lipídio e ácido graxo. O uso de várias seqüências divergentes, isto é, seqüências que diferem no nível de seqüência de DNA, também pode ser vantajoso neste contexto, ou então o uso de promotores para expressão de gene que torna possível uma expressão de gene diferente com o passar do tempo, por exemplo, como uma função do grau de maturidade de uma semente ou um tecido de armazenamento de óleo.A number of mechanisms exist whereby modification of A9-elongase, A8-desaturase and Δδ-desaturase proteins is possible, so that yield, production and / or production efficiency of ARA in one plant, preferably in one plant. oil harvesting or a microorganism can be directly influenced due to these modified proteins. The number or activity of the proteins or genes may be increased so that larger amounts of gene products and ultimately greater amounts of the compounds of general formula I are produced. A de novo synthesis in an organism that needed activity and ability to biosynthesize compounds before introduction of the corresponding gene (s) is also possible. This applies analogously to combination with other desaturases or elongases or other enzymes of lipid and fatty acid metabolism. The use of various divergent sequences, that is, sequences that differ at the DNA sequence level, may also be advantageous in this context, or the use of promoters for gene expression that makes different gene expression possible over time , for example, as a function of the degree of maturity of a seed or oil storage tissue.
Devido à introdução de um gene que codifica A9-elongase, Δ8-dessaturase e/ou A5-dessaturase em um organismo, sozinho ou em combinação com outros genes em uma célula, não é somente possível aumentar o fluxo de biossíntese para o produto final, porém também aumentar, ou criar a composição de triacilglicerol correspondente de novo. Igualmente, o número ou atividade de outros genes que estão envolvidos na importação de nutrientes que são requeridos para a biossíntese de um ou mais ácidos graxos, óleos, lipídios neutros e/ou polares pode ser aumentado, de forma que a concentração destes precursores, co-fatores ou intermediários dentro das células ou dentro do compartimento de armazenamento seja aumentada, desse modo, a capacidade das células de produzir ARA como descrito abaixo é intensificada também. Otimizando-se a atividade ou aumentando-se o número de um ou mais genes que codifica Δθ-elongase, Δδ-dessaturase e/ou Δ5-dessaturase que estão envolvidos na ARA de biossíntese, ou destruindo-se a atividade de um ou mais genes que estão envolvidos na degradação de ARA, um rendimento, produção e/ou eficiência aumentados de produção de ácido graxo e moléculas de lipídio em organismos, vantajosamente em plantas, é tornado possível.Due to the introduction of a gene encoding A9-elongase, Δ8-desaturase and / or A5-desaturase in an organism alone or in combination with other genes in a cell, it is not only possible to increase the biosynthesis flow to the end product. but also increase or create the corresponding triacylglycerol composition again. Likewise, the number or activity of other genes that are involved in the importation of nutrients that are required for biosynthesis of one or more fatty acids, oils, neutral and / or polar lipids may be increased, so that the concentration of these precursors, such as Factors or intermediates within the cells or within the storage compartment are thereby increased, the ability of cells to produce ARA as described below is enhanced as well. By optimizing activity or increasing the number of one or more genes encoding Δθ-elongase, Δδ desaturase and / or Δ5 desaturase that are involved in biosynthesis ARA, or by destroying the activity of one or more genes. which are involved in ARA degradation, an increased yield, production and / or efficiency of fatty acid and lipid molecule production in organisms, advantageously in plants, is made possible.
Os ácidos nucléicos, que vantajosamente podem ser usados no processo são derivados de bactérias, fungos, diatomáceass, animais tal como, Caenorhabditis ou Oncorhynchus ou plantas tal como algas ou musgos, tal como os gêneros Shewanella, Physcomitrella, Thraustochytrium, Fusari-um, Phytophthora, Ceratodon, Mantonieila, Ostreococcus, Isochrysis, Aleuri-ta, Muscarioides, Mortierella, Borago, Phaeodactylum, Crypthecodinium, especificamente dos gêneros e espécies Oncorhynchus mykiss, Xenopus lae-vis, Ciona intestinalis, Thalassiosira pseudonona, Mantonieila squamata, Ostreococcus sp., Ostreococcus Tauri, Euglena gracilis, Physcomitrella patens, Phytophtora infestans, Fusarium graminaeum, Cryptocodinium cohnii, Cera. todon purpureus, Isochrysis galbana, Aleurita farinosa, Thraustochytrium sp., Muscarioides Viallii, Mortierella alpina, Borago officinalis, Phaeodactylum tricornutum, Caenorhabditis elegans ou especialmente vantajosamente de Oncorhynchus mykiss, Euglena gracilis, Thalassiosira pseudonona ou Cryp-thecodinium cohnii.Nucleic acids, which may advantageously be used in the process are derived from bacteria, fungi, diatoms, animals such as Caenorhabditis or Oncorhynchus or plants such as algae or moss, such as the genera Shewanella, Physcomitrella, Thraustochytrium, Fusari-one, Phytophthora , Ceratodon, Mantonieila, Ostreococcus, Isochrysis, Aleuri-ta, Muscarioides, Mortierella, Borago, Phaeodactylum, Crypthecodinium, specifically of the genera and species Oncorhynchus mykiss, Xenopus lae-vis, Ciona intestinalis, Thalassiosira Pseudeoccuscus, Pseudococcus Tauri, Euglena gracilis, Physcomitrella patens, Phytophtora infestans, Fusarium graminaeum, Cryptocodinium cohnii, Wax. todon purpureus, Isochrysis galbana, Aleurita farinosa, Thraustochytrium sp., Muscarioides Viallii, Mortierella alpina, Borago officinalis, Phaeodactylum tricornutum, Caenorhabditis elegans or especially advantageously of Oncorhynchus mykiss pseudius thiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiii.
Em uma modalidade alternativa, o vetor pode ser um vetor de expressão projetado para transformar um organismo no qual o ácido nucléi-co deve ser expressado e o ácido linoléico convertido em ARA.In an alternative embodiment, the vector may be an expression vector designed to transform an organism into which nucleic acid must be expressed and linoleic acid converted to ARA.
Estes vetores vantajosos, preferivelmente vetores de expressão, compreendem o(s) ácido(s) nucléico(s) que codifica(m) o A9-elongase, Δ8-dessaturase e/ou Δδ-dessaturase e que são descritos nos primeiro a quarto aspectos da invenção.These advantageous vectors, preferably expression vectors, comprise nucleic acid (s) encoding A9-elongase, Δ8-desaturase and / or Δδ-desaturase and which are described in the first to fourth aspects. of the invention.
Como usado no presente contexto, o termo "vetor" refere-se a uma molécula de ácido nucléico que é capaz de transportar outro ácido nu-cléico ao qual está ligado. Um tipo de vetor é um "plasmídeo", uma alça de DNA de filamento duplo circular na qual os segmentos de DNA adicionais podem ser ligados. Um tipo adicional de vetor é um vetor viral, sendo possível para os segmentos de DNA adicionais serem ligados no genoma viral. Certos vetores são capazes de replicação autônoma em uma célula hospedeira na qual eles foram introduzidos (por exemplo, vetores bacterianos com origem de replicação bacteriana). Outros vetores são vantajosamente integrados no genoma de uma célula hospedeira quando eles são introduzidos na célula hospedeira, e desse modo replicam junto com o genoma hospedeiro. Além disso, certos vetores podem administrar a expressão de genes com a qual eles estão em ligação operável. Estes vetores são referidos no presente contexto como "vetores de expressão". Normalmente, os vetores de expressão são adequados para técnicas de recombinação de DNA que tomam a forma de plasmídeos.As used herein, the term "vector" refers to a nucleic acid molecule that is capable of carrying another nucleic acid to which it is attached. One type of vector is a "plasmid", a circular double stranded DNA loop in which additional DNA segments can be ligated. An additional type of vector is a viral vector, and it is possible for additional DNA segments to be linked in the viral genome. Certain vectors are capable of autonomous replication in a host cell into which they have been introduced (for example, bacterial vectors of bacterial replication origin). Other vectors are advantageously integrated into the genome of a host cell when they are introduced into the host cell, and thus replicate together with the host genome. In addition, certain vectors may administer the expression of genes to which they are operably linked. These vectors are referred to in the present context as "expression vectors". Typically, expression vectors are suitable for plasmid DNA recombination techniques.
Na presente descrição onde o termo "plasmídeo” é usado, deveria ser entendido que os plasmídeos podem ser substituídos por outros tipos de vetor de expressão, tal como vetores virais, que exercem funções semelhantes. Além disso, o termo "vetor" também é pretendido compreender outros vetores com os quais o trabalhador versado está familiarizado, tal como fagos, vírus tais como SV40, CMV, TMV, transposons, elementos IS, fasmí- deos, fagomídeos, cosmídeos, DNA linear ou circular.In the present description where the term "plasmid" is used, it should be understood that plasmids may be substituted for other types of expression vectors, such as viral vectors, which perform similar functions. In addition, the term "vector" is also intended. comprise other vectors with which the skilled worker is familiar, such as phages, viruses such as SV40, CMV, TMV, transposons, IS elements, phasases, phagemids, cosmids, linear or circular DNA.
Os vetores de expressão recombinantes vantajosamente usados no processo compreendem os ácidos nucléicos descritos abaixo ou o cons-truto de gene descrito acima em uma forma que é adequada para expressar os ácidos nucléicos usados em uma célula hospedeira, o que significa que os vetores de expressão recombinantes compreendem uma ou mais seqüências reguladoras, selecionadas em base das células hospedeiras usadas para a expressão, cuja seqüência(s) reguladora é ligada operavelmente com a seqüência de ácido nucléico a ser expressada. Em um vetor de expressão recombinante, "operavelmente ligado" significa que a seqüência de nucleotídeo de interesse é ligada a seqüência(s) reguladora(s) de um tal modo que a expressão da seqüência de nucleotídeo seja possível, e elas são ligadas uma à outra de um tal modo que ambas as seqüências realizam a função predita que é designada para seqüência (por exemplo, em um sistema de transcrição/translação in vitro, ou em uma célula hospedeira se o vetor é introduzido na célula hospedeira). O termo "seqüência reguladora" é pretendido compreender os promotores, intensificadores e outros elementos de controle de expressão (por exemplo, sinais de poliadenilação). Por exemplo, estas seqüências reguladoras são descritas em Goeddel: Gene Expression Technology: Methods in Enzymology 185, Academic Press, San Diego, CA (1990), ou veja: Gruber e Crosby, em: Methods in Plant Molecular Biology and Biotechnolgy, CRC Press, Boca Raton, Florida, Ed.: Glick and Thompson, Capítulo 7, 89-108, incluindo as referências citadas aqui. As seqüências reguladoras compreendem aquelas que administram a expressão constitutiva de uma seqüência de nucleotídeo em muitos tipos de célula hospedeira e aquelas que administram a expressão direta da seqüência de nucleotídeo somente em células hospedeiras específicas sob condições específicas. O trabalhador versado sabe que o desígnio do vetor de expressão pode depender de fatores tal como a escolha da célula hospedeira ser transformada, o nível de expressão desejado da proteína e similares.Advantageously recombinant expression vectors used in the process comprise the nucleic acids described below or the gene construct described above in a form that is suitable for expressing the nucleic acids used in a host cell, meaning that the recombinant expression vectors comprise one or more regulatory sequences, selected on the basis of the host cells used for expression, whose regulatory sequence (s) is operably linked to the nucleic acid sequence to be expressed. In a recombinantly expressed expression vector, "operably linked" means that the nucleotide sequence of interest is linked to the regulatory sequence (s) in such a way that expression of the nucleotide sequence is possible, and they are linked one to the other. another such that both sequences perform the predicted function that is assigned to sequence (for example, in an in vitro transcription / translation system, or in a host cell if the vector is introduced into the host cell). The term "regulatory sequence" is intended to include promoters, enhancers, and other expression control elements (e.g., polyadenylation signals). For example, these regulatory sequences are described in Goeddel: Gene Expression Technology: Methods in Enzymology 185, Academic Press, San Diego, CA (1990), or see: Gruber and Crosby in: Methods in Plant Molecular Biology and Biotechnolgy, CRC Press , Boca Raton, Florida, Ed .: Glick and Thompson, Chapter 7, 89-108, including references cited herein. Regulatory sequences include those that administer constitutive expression of a nucleotide sequence in many host cell types and those that administer direct expression of the nucleotide sequence only in specific host cells under specific conditions. The skilled worker knows that the expression vector design may depend on factors such as the choice of host cell to be transformed, the desired expression level of the protein and the like.
Os vetores de expressão recombinantes usados podem ser projetados para a expressão de Δ9 - elongase, Δδ-dessaturase e/ou Δ5- dessaturase em células procarióticas ou eucarióticas. Isto é vantajoso uma vez que as etapas intermediárias da construto de vetor freqüentemente são realizadas em microorganismos devido à simplicidade. Por exemplo, o gene de Δθ-elongase, Δδ-dessaturase e/ou Δδ-dessaturase pode ser expressado em células bacterianas, células de inseto (usando vetores de expressão de Baculovírus), levedura e outras células fúngicas (veja Romanos, Μ., A., e outros (1992) "Foreign gene expression in yeast: a review", Yeast 8:423-488; van den Hondel, CAM. J. J., e outros (1991) "Heterologous gene expression in filamentous fungi", em: More Gene Manipulations in Fungi, J. W. Bennet & L. L. Lasure, Ed., pp. 396-428: Academic Press: San Diego; e van den Hondel, C. A.M. J. J., & Punt, P.J. (1991) "Gene transfer systems and vector development for filamentous fungi, em: Applied Molecular Genetics of Fungi, Peberdy, J. F., e outros, Ed., pp. 1-28, Cambridge University Press: Cam-bridge), algae (Falciatore e outros, 1999, Marine Biotechnology.1 , 3:239-251), os ciliatos dos tipos: Holotrichia, Peritrichia, Spirotrichia, Suctoria, Te-trahymena, Paramecium, Colpidium, Glaucoma, Platyophrya, Potomacus, Dessaturaseudocohnilembus, Euplotes, Engelmaniella e Stylonychia, em particular do gênero Stylonychia lemnae, usando vetores em um método de transformação como descrito no WO 98/01572 e, preferivelmente, em células de plantas de multicelulares (veja Schmidt, R. e Willmitzer, L. (1988) "Hi-gh efficiency Agrobacterium tumefaciens-mediated transformation of Arabi-dopsis thaliana leaf and cotyledon explants" Plant Cell Rep.:583-586; Plant Molecular Biology and Biotechnology, C Press, Boca Raton, Florida, Capítulo 6/7, pp.71-1 19 (1993); F.F. White, B. Jenes e outros, Techniques for Gene Transfer, em: Transgenic Plants, Vol. 1 , Engineering and Utilization, Ed.: Kung e R. Wu, Academic Press (1993), 128-43; Potrykus, Annu. Rev. Plant Physiol. Plant Molec. Biol. 42 (1991), 205-225 (e referências citadas aqui)). As células hospedeiras adequadas são também descritas em Goeddel, Gene Expression Technology: Methods in Enzymology 185, Academic Press, San Diego, CA (1990). Como uma alternativa, o vetor de expressão recom-binante pode ser transcrito transladado in vitro, por exemplo, usando as se-qüências reguladoras T7-promotoras e T7-polimerase.The recombinant expression vectors used may be designed for the expression of Δ9 - elongase, Δδ desaturase and / or Δ5 desaturase in prokaryotic or eukaryotic cells. This is advantageous since intermediate steps of the vector construct are often performed on microorganisms due to simplicity. For example, the Δθ-elongase, Δδ-desaturase and / or Δδ-desaturase gene may be expressed in bacterial cells, insect cells (using Baculovirus expression vectors), yeast and other fungal cells (see Romans, Μ., A., et al. (1992) "Foreign gene expression in yeast: a review," Yeast 8: 423-488; van den Hondel, CAM.JJ, et al. (1991) "Heterologous gene expression in filamentous fungi", in: More Gene Manipulations in Fungi, JW Bennet & LL Lasure, Ed., Pp. 396-428: Academic Press: San Diego; and van den Hondel, CAMJJ, & Punt, PJ (1991) "Gene transfer systems and vector development for filamentous fungi, in: Applied Molecular Genetics of Fungi, Peberdy, JF, et al., Ed., pp. 1-28, Cambridge University Press: Cam-bridge), algae (Falciatore et al., 1999, Marine Biotechnology.1, 3: 239-251), the ciliatos of the types Holotrichia, Peritrichia, Spirotrichia, Suctoria, Te-trahymena, Paramecium, Colpidium, Glaucoma, Platyophrya, Potomacus, De ssaturaseudocohnilembus, Euplotes, Engelmaniella and Stylonychia, in particular of the genus Stylonychia lemnae, using vectors in a transformation method as described in WO 98/01572 and preferably in multicellular plant cells (see Schmidt, R. and Willmitzer, L. (1988) "Hi-gh efficiency Agrobacterium tumefaciens-mediated transformation of Arabi-dopsis thaliana leaf and cotyledon explants" Plant Cell Rep.:583-586; Plant Molecular Biology and Biotechnology, C Press, Boca Raton, Florida, Chapter 6/7, pp.71-1 19 (1993); F.F. White, B. Jenes et al., Techniques for Gene Transfer, in: Transgenic Plants, Vol. 1, Engineering and Utilization, Ed .: Kung and R. Wu, Academic Press (1993), 128-43; Potrykus, Annu. Rev. Plant Physiol. Plant Molec. Biol. 42 (1991), 205-225 (and references cited herein)). Suitable host cells are also described in Goeddel, Gene Expression Technology: Methods in Enzymology 185, Academic Press, San Diego, CA (1990). As an alternative, the recombinant expression vector may be transcribed in vitro translated, for example, using the T7 promoter and T7 polymerase regulatory sequences.
Na maioria dos casos, a expressão de proteínas em procariotas envolve o uso de vetores que compreendem promotores constitutivos ou induzíveis que administram a expressão de proteínas de fusão ou não fusão. Os vetores de expressão de fusão típicos são, inter alia, pGEX (Pharmacia Biotech Inc; Smith, D.B., e Johnson, K.S. (1988) Gene 67:31-40), pMAL (New England Biolabs, Beverly, MA) und pRIT5 (Pharmacia, Piscataway, NJ), onde glutationa S-transferase (GST), proteína de ligação de maltose-E e proteína A, respectivamente, são fundidas com a proteína alvo recombi-nante.In most cases, protein expression in prokaryotes involves the use of vectors comprising constitutive or inducible promoters that administer expression of fusion or non-fusion proteins. Typical fusion expression vectors are, inter alia, pGEX (Pharmacia Biotech Inc; Smith, DB, and Johnson, KS (1988) Gene 67: 31-40), pMAL (New England Biolabs, Beverly, MA) und pRIT5 ( Pharmacia, Piscataway, NJ), where glutathione S-transferase (GST), maltose-E binding protein and protein A, respectively, are fused to the recombinant target protein.
Os exemplos de vetores de expressão de E coli de não fusão induzíveis adequados são, inter alia, pTrc (Amann e outros (1988) gene 69:301-315) e pET 11 d (Studier e outros, Gene Expression Technology: Methods in Enzymology 185, Academic Press, San Diego, Califórnia (1990) 6089). A expressão de gene alvo do vetor pTrc é com baseado na transcrição de um promotor de fusão trp-lac híbrido pelo RNA polimerase hospedeiro. A expressão de gene alvo do vetor pET 11 d é com base na transcrição de um promotor de fusão T7-gn10-lac que é mediado por um RNA polimerase viral (T7gn1) que é co-expressAdo. Esta polimerase viral é fornecida pelas cepas hospedeiras BL21 (DE3) ou HMS174 (DE3) de um λ-profago residente que aloja um gene T7 gn1 sob controle transcricional do promotor lacUV 5.Examples of suitable inducible non-fusion E coli expression vectors are, inter alia, pTrc (Amann et al. (1988) gene 69: 301-315) and pET 11 d (Studier et al., Gene Expression Technology: Methods in Enzymology 185, Academic Press, San Diego, California (1990) 6089). Target gene expression of the pTrc vector is based on the transcription of a hybrid trp-lac fusion promoter by the host RNA polymerase. Target gene expression of the pET 11d vector is based on the transcription of a T7-gn10-lac fusion promoter that is mediated by a viral RNA polymerase (T7gn1) that is co-expressed. This viral polymerase is provided by the BL21 (DE3) or HMS174 (DE3) host strains of a resident λ-phage that house a T7 gn1 gene under transcriptional control of the lacUV 5 promoter.
Outros vetores que são adequados para organismos procarióti-cos são conhecidos pelo trabalhador versado, estes vetores estão, por exemplo, em pLG338 de E. coli, pACYC184, as séries pBR, tal como pBR322, as séries pUC tal como pUC18 ou pUC19, as séries M113mp, pKC30, pRep4, pHS1, pHS2, pPLc236, pMBL24, pLG200, pUR290, plN-111113-B1, Agt11 ou pBdCI, em Streptomyces plJ101, plJ364, plJ702 ou plJ361, em Bacilo pUB1 10, pC194 ou pBD214, em Corynebacterium pSA77 ou pAJ667.Other vectors that are suitable for prokaryotic organisms are known to the skilled worker, such vectors are, for example, in E. coli pLG338, pACYC184, the pBR series, such as pBR322, the pUC series such as pUC18 or pUC19, series M113mp, pKC30, pRep4, pHS1, pHS2, pPLc236, pMBL24, pLG200, pUR290, plN-111113-B1, Agt11 or pBdCI, in Streptomyces plJ101, plJ364, plJ702 or plJ361, in Bacillus pUB14 pB144 or CJ141 pSA77 or pAJ667.
Em uma outra modalidade, o vetor de expressão é um vetor de expressão de levedura. Os exemplos para vetores para expressão na levedura S.cerevisiae compreendem pYeDessaturased (Baldari e outros (1987) Embo J. 6:229-234), pMFa (Kurjan e Herskowitz (1982) Cell 30:933-943), pJRY88 (Schultz e outros (1987) Gene 54:113-123) e pYES2 (Invitrogen Corporation, San Diego, CA). Os vetores e processos para a construto de vetores que são adequados para uso em outros fungos, tal como os fungos filamentosos, compreendem aqueles que são descritos nos detalhes em: van den Hondel, C.A.M.J.J., & Punt, P.J. (1991) "Gene transfer systems and vector development for filamentous fungi, in: Applied Molecular Genetics of fun-gi, J. F. Peberdy e outros, Ed., pp.. 1-28, Cambridge University Press: Cam-bridge, ou em: More Gene Manipulations in Fungi [J.W. Bennet & L.L. Lasu-re, Ed., pp. 396-428: Academic Press: San Diego]. Outros vetores de levedura adequados são, por exemplo, pAG-1, YEp6, YEpl 3 ou pEMBLYe23.In another embodiment, the expression vector is a yeast expression vector. Examples for vectors for expression in S.cerevisiae yeast include pYeDessaturased (Baldari et al. (1987) Embo J. 6: 229-234), pMFa (Kurjan and Herskowitz (1982) Cell 30: 933-943), pJRY88 (Schultz and others (1987) Gene 54: 113-123) and pYES2 (Invitrogen Corporation, San Diego, CA). Vectors and processes for constructing vectors that are suitable for use in other fungi, such as filamentous fungi, include those described in detail in: van den Hondel, CAMJJ, & Punt, PJ (1991) "Gene transfer systems and vector development for filamentous fungi, in: Applied Molecular Genetics of fungi, JF Peberdy et al., Ed., pp. 1-28, Cambridge University Press: Cam-bridge, or in: More Gene Manipulations in Fungi [JW Bennet & LL Lasuer, Ed., Pp. 396-428: Academic Press: San Diego] Other suitable yeast vectors are, for example, pAG-1, YEp6, YEpl 3 or pEMBLYe23.
Como uma alternativa, A9-elongase, Δδ-dessaturase e/ou Δ5-dessaturase podem ser expressados em células de inseto que usam vetores de Baculovirus. Os vetores de expressão de Baculovirus que estão disponíveis para a expressão de proteínas em células de inseto cultivadas (por exemplo, células de Sf9) compreendem as séries pAc (Smith e outros (1983) Mol. Cell Biol. 3:2156-2165) e as séries pVL (Lucklow e Summers (1989) Virology 170:31-39).As an alternative, A9-elongase, Δδ desaturase and / or Δ5 desaturase may be expressed in insect cells using Baculovirus vectors. Baculovirus expression vectors that are available for protein expression in cultured insect cells (e.g., Sf9 cells) comprise the pAc series (Smith et al. (1983) Mol. Cell Biol. 3: 2156-2165) and the pVL series (Lucklow and Summers (1989) Virology 170: 31-39).
Os vetores de acima mencionados são somente uma pequena avaliação sobre os vetores adequados que são possíveis. Outros plasmí-deos são conhecidos por trabalhadores versados e são descritos, por exemplo, em: Cloning Vectors (Ed. Pouwels, P. H., e outros, Elsevier, Amsterdam-Nova lorque-Oxford, 1985, ISBN 0 444 904018). Para outros sistemas de expressão adequados para células procarióticas e eucarióticas, veja os Capítulos 16 e 17 em Sambrook, J., Fritsch, E. F., e Maniatis, T., Molecular Cloning: A Laboratory Manual, 2- edição, Cold Spring Harbor Laboratory, Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor, NY, 1989.The vectors mentioned above are only a small assessment of the appropriate vectors that are possible. Other plasmids are known to skilled workers and are described, for example, in: Cloning Vectors (Ed. Pouwels, P. H., et al., Elsevier, Amsterdam-New York-Oxford, 1985, ISBN 0 444 904018). For other expression systems suitable for prokaryotic and eukaryotic cells, see Chapters 16 and 17 in Sambrook, J., Fritsch, EF, and Maniatis, T., Molecular Cloning: A Laboratory Manual, 2nd edition, Cold Spring Harbor Laboratory, Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor, NY, 1989.
Em uma modalidade adicional do processo, as A9-elongase, Δδ-dessaturase e/ou Δδ-dessaturase podem ser expressadas em células de planta unicelulares (tal como, algas), veja Falciatore e outros, 1999, Marine Biotechnology 1 (3):239-251 e referências citadas aqui, e em células de planta de plantas mais altas (por exemplo, espermatófitos, tal como colheitas cultiváveis). Os exemplos de vetores de expressão de planta compreendem aqueles que são descritos nos detalhes: Becker, D., Kemper, E., Schell, J., e Masterson, R., (1992) "New plant binary vectors with selectable markers located proximal to the left border", Plant Mol. Biol. 20:1195-1197; e Bevan, M.W. (1984) "Binary Agrobacterium vectors for plant transformation", Nucl. Acids Res. 12:8711-8721 ; Vectors for Gene Transfer in Higher Plants; em: Transgenic Plants, Vol. 1 , Engineering and Utilization, Ed.: Kung e R. Wu, Academic Press, 1993, pp. 15-38.In an additional embodiment of the process, A9-elongase, Δδ desaturase and / or Δδ desaturase may be expressed in unicellular plant cells (such as algae), see Falciatore et al., 1999, Marine Biotechnology 1 (3): 239-251 and references cited herein, and in higher plant plant cells (e.g., spermatophytes, such as cultivable crops). Examples of plant expression vectors include those described in detail: Becker, D., Kemper, E., Schell, J., and Masterson, R., (1992) "New plant binary vectors with selectable markers located proximally". to the left border ", Plant Mol. Biol. 20: 1195-1197; and Bevan, M.W. (1984) "Binary Agrobacterium vectors for plant transformation", Nucl. Acids Res. 12: 8711-8721; Vectors for Gene Transfer in Higher Plants; in: Transgenic Plants, Vol. 1, Engineering and Utilization, Ed .: Kung and R. Wu, Academic Press, 1993, pp. 15-38.
Um cassete de expressão de planta preferivelmente compreende sequências reguladoras que são capazes de administrar a expressão de genes em células de planta e são ligadas operavelmente de forma que cada seqüência possa cumprir sua função, tal como terminação transcricional, por exemplo, sinais de poliadenilação. Os sinais de poliadenilação preferidos são aqueles que são derivados de T-DNA de Agrobacterium tumefaciens, tal como gene 3 do plasmídeo Ti pTiACH5 (Gielen e outros, EMBO J. 3 (1984) 835 et. seq), que é conhecido como octopina sintase, ou equivalentes funcionais destes, porém todas as outras seqüências terminadoras que são funcionalmente ativas em plantas também são adequadas.A plant expression cassette preferably comprises regulatory sequences that are capable of administering gene expression in plant cells and are operably linked so that each sequence can fulfill its function, such as transcriptional termination, for example polyadenylation signals. Preferred polyadenylation signals are those derived from Agrobacterium tumefaciens T-DNA, such as Ti pTiACH5 gene gene 3 (Gielen et al., EMBO J. 3 (1984) 835 et. Seq), which is known as octopine synthase. , or functional equivalents of these, but all other terminator sequences that are functionally active in plants are also suitable.
Uma vez que a expressão de gene de planta é muito freqüente-mente não limitada ao nível transcricional, um cassete de expressão de planta preferivelmente compreende outras seqüências que são operavelmente ligadas, tal como intensificadores de translação, por exemplo, a seqüência "overdrive", que realça a seqüência líder 5’-não transladada de vírus em mosaico do tabaco, que aumenta a relação de proteína/RNA (Gallie e outros, 1987, Nucl. Acids Research 15:8693-8711).Since plant gene expression is very often not limited to the transcriptional level, a plant expression cassette preferably comprises other sequences that are operably linked, such as translation enhancers, for example, the overdrive sequence, which highlights the 5'-non-translated leader sequence of tobacco mosaic virus, which increases the protein / RNA ratio (Gallie et al., 1987, Nucl. Acids Research 15: 8693-8711).
Como descrito acima, a expressão de gene de planta deve estar ligada operavelmente com um promotor adequado que ativa a expressão de gene com a temporização correta ou de uma maneira específica de célula ou tecido. Os promotores utilizáveis são os promotores constitutivos (Benfey e outros, EMBO J. 8 (1989) 2195-2202), tal como aqueles esses que são derivados de vírus de planta, tal como 35S CaMV (Franck e outros, Cell 21 (1980) 285-294), 19S CaMV (também veja EUA 5352605 e WO 84/02913), ou promotores de planta, tal como o promotor do subunidade de Rubisco, que é descrito na Patente US 4.962.028.As described above, plant gene expression must be operably linked with a suitable promoter that activates gene expression with the correct timing or in a cell or tissue specific manner. Usable promoters are constitutive promoters (Benfey et al., EMBO J. 8 (1989) 2195-2202), such as those derived from plant viruses, such as 35S CaMV (Franck et al., Cell 21 (1980)). 285-294), 19S CaMV (also see US 5352605 and WO 84/02913), or plant promoters, such as the Rubisco subunit promoter, which is described in US Patent 4,962,028.
Outras seqüências preferidas para uso em ligação operável em cassetes de expressão de gene de planta são seqüências de alvejamento, que são requeridas para guiar o produto de gene em seu compartimento de célula correspondente (veja uma revisão em Kermode, Crit. Rev. Plant Sei. 15, 4 (1996) 285-423 e referências citadas aqui), por exemplo, no vacúolo, no núcleo, todos os tipos de plastídeos, tais como amiloplastos, cloroplastos, cromoplastos, o espaço extracelular, as mitocôndrias, o reticulo de endo-plasmídeo, elaioplastos, peroxisomas e outros compartimentos de células de planta.Other preferred sequences for use in operable binding in plant gene expression cassettes are targeting sequences, which are required to guide the gene product into its corresponding cell compartment (see a review in Kermode, Crit. Rev. Plant Sci. 15, 4 (1996) 285-423 and references cited herein), for example, in the vacuole, nucleus, all types of plastids, such as amyloplasts, chloroplasts, chromoplasts, the extracellular space, mitochondria, the endothelial reticulum. plasmid, elaioplasts, peroxisomes and other plant cell compartments.
Como descrito acima, a expressão de gene de planta também pode ser obtida por um promotor quimicamente induzível (veja revisão em Gatz 1997, Annu. Rev. Plant Physiol. Plant Mol. Biol., 48:89-108). Os promotores quimicamente induzíveis são particularmente adequados quando é desejado que a expressão de gene ocorra de uma maneira específica de tempo. Os exemplos de tais promotores são um promotor induzível por ácido salicílico (WO 95/19443), um promotor induzível por tetraciclina (Gatz e outros (1992) Plant J. 2, 397-404) e um promotor induzível por etanol.As described above, plant gene expression can also be obtained by a chemically inducible promoter (see review in Gatz 1997, Annu. Rev. Plant Physiol. Plant Mol. Biol., 48: 89-108). Chemically inducible promoters are particularly suitable when gene expression is desired to occur in a specific time manner. Examples of such promoters are a salicylic acid inducible promoter (WO 95/19443), a tetracycline inducible promoter (Gatz et al. (1992) Plant J. 2,397-404) and an ethanol inducible promoter.
Os promotores que respondem às condições de tensão bióticas ou abióticas também são adequados, por exemplo, o promotor de gene PRP1 induzido por patógeno (Ward e outros, Plant. Mol. Biol. 22 (1993) 361366), o promotor de tomate hsp80 de tomate induzível por calor (US 5.187.267), o promotor de alfa-amilase de batata induzível por (WO 96/12814) ou o promotor pinll induzível por ferida (EP-A-0 375 091).Promoters that respond to biotic or abiotic stress conditions are also suitable, for example, the pathogen-induced PRP1 gene promoter (Ward et al., Plant. Mol. Biol. 22 (1993) 361366), the hsp80 tomato promoter of heat-inducible tomato (US 5,187,267), the potato-inducible alpha-amylase promoter (WO 96/12814) or the wound-inducible pin11 promoter (EP-A-0 375 091).
Especialmente preferidos são aqueles promotores que provocam a expressão de gene em tecidos e órgãos nos quais a biossíntese de ácidos graxos, lipídios e óleos, ocorre, em células de semente, tal como células do endosperma e do embrião em desenvolvimento. Os promotores adequados são o promotor de napin de óleo de semente de colza (US 5.608.152), o promotor de Vicia faba USP (Baeumlein e outros, Mol Gen Genet, 1991,225 (3):459-67), o promotor de oleosina Arabidopsis (WO 98/45461), o promotor de faseolina Phaseolus vulgaris (US 5.504.200), o promotor de Bce4 Brassi-ca (WO 91/13980) ou o promotor de legumina B4 (LeB4; Baeumlein e ou- tros, 1992, Plant Journal, 2 (2):233-9), e promotores que provocam a expressão específica semente em plantas monocotiledôneas, tal como milho, cevada, trigo, centeio, arroz e similares. Promotores notáveis adequados são o promotor de gene de cevada Ipt2 ou Ipt1 (WO 95/15389 e WO 95/23230) ou os promotores do gene de proteína de cevada, o gene de glutelina de arroz, o gene de orizina de arroz, o gene de prolamina de arroz, o gene de gliadina de trigo, o gene de glutelina de trigo, o gene de zeína de milho, o gene de glutelina de aveia, o gene de casirina de Sorghum ou o gene de secalina de centeio que são descritos no WO 99/16890.Especially preferred are those promoters that cause gene expression in tissues and organs in which biosynthesis of fatty acids, lipids and oils occurs in seed cells such as endosperm and developing embryo cells. Suitable promoters are the rapeseed oil napin promoter (US 5,608,152), the Vicia faba USP promoter (Baeumlein et al., Mol Gen Genet, 1991,225 (3): 459-67), the promoter. Arabidopsis (WO 98/45461), the Phaseolus vulgaris phaseoline promoter (US 5,504,200), the Bce4 Brassi-ca promoter (WO 91/13980) or the B4 legumin promoter (LeB4; Baeumlein and others). , 1992, Plant Journal, 2 (2): 233-9), and promoters that elicit seed specific expression in monocotyledonous plants such as maize, barley, wheat, rye, rice and the like. Suitable notable promoters are the Ipt2 or Ipt1 barley gene promoter (WO 95/15389 and WO 95/23230) or barley protein gene promoters, rice glutelin gene, rice orizine gene, rice prolamine, the wheat gliadin gene, the wheat glutelin gene, the corn zein gene, the oat glutelin gene, the Sorghum casirin gene, or the rye secaline gene that are described in WO 99/16890.
Como descrito acima, pode ser vantajoso incluir em um cassete de expressão, enzimas de codificação de ácidos nucléicos capazes de converter ARA em ácidos graxos A3-não saturados tal como EPA ou DHA. Desse modo, por exemplo, o cassete de expressão pode também incluir o ácido nucléico que codifica uma Δδ-elongase, oo3-dessaturase e/ou Δ4-dessaturase. Tais cassetes de expressão podem ser introduzidos pela transformação simultânea de uma pluralidade de construtos de expressão individuais ou, preferivelmente, combinando-se uma pluralidade de cassetes de expressão em um construto. Além disso, uma pluralidade de vetores pode ser transformada com, em cada caso, uma pluralidade de cassetes de expressão e então transferida na célula hospedeira.As described above, it may be advantageous to include in an expression cassette nucleic acid coding enzymes capable of converting ARA into unsaturated A3 fatty acids such as EPA or DHA. Thus, for example, the expression cassette may also include nucleic acid encoding a Δδ-elongase, oo3 desaturase and / or Δ4 desaturase. Such expression cassettes may be introduced by simultaneously transforming a plurality of individual expression constructs or, preferably, by combining a plurality of expression cassettes into one construct. In addition, a plurality of vectors may be transformed with, in each case, a plurality of expression cassettes and then transferred into the host cell.
Outros promotores que são igualmente especialmente adequados são aqueles que realizam uma expressão específica de plastídeo, uma vez que os plastídeos constituem o compartimento no qual os precursores e alguns produtos finais são sintetizados de biossíntese de lipídio. Os promotores adequados, tal como o promotor de RNA polimerase viral, são descritos nos WO 95/16783 e WO 97/06250, e o promotor cIpP de Arabidopsis, descrito no WO 99/46394. O DNA de vetor pode ser introduzido em células procarióticas e eucarióticas por técnicas de transformação ou transfecção convencionais. Os termos "transformação" e "transfecção", conjugação e transdução, como usado no presente contexto, são pretendidos compreender uma multiplicidade de métodos conhecidos na técnica anterior pela introdução de ácido nu- cléico estrangeiro (por exemplo, o DNA) em uma célula hospedeira, incluindo a co-precipitação de fosfato de cálcio ou cloreto de cálcio, transfecção mediada por DEAE-dextrana, lipofecção, competência natural, transferência quimicamente mediada, eletroporação ou bombardeio de partícula. Os métodos adequados para a transformação ou transfecção de células hospedeiras, incluindo células de planta, podem ser encontrados em Sambrook e outros (Molecular Cloning: A Laboratory Manual., 2- ed., Cold Spring Harbor Laboratory, Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor, NY, 1989) e outros livros de laboratório tal como Methods in Molecular Biology, 1995, Vol. 44, Agrobacterium protocols, Ed.: Gartland and Davey, Humana Press, Totowa, Nova Jérsei.Other promoters that are equally especially suitable are those which perform plastid-specific expression, since plastids constitute the compartment in which precursors and some end products are synthesized from lipid biosynthesis. Suitable promoters such as the viral RNA polymerase promoter are described in WO 95/16783 and WO 97/06250, and the Arabidopsis cIpP promoter described in WO 99/46394. Vector DNA can be introduced into prokaryotic and eukaryotic cells by conventional transformation or transfection techniques. The terms "transformation" and "transfection", conjugation and transduction, as used herein, are intended to encompass a multitude of methods known in the prior art by introducing foreign nucleic acid (e.g., DNA) into a host cell. , including calcium phosphate or calcium chloride co-precipitation, DEAE-dextran-mediated transfection, lipofection, natural competence, chemically mediated transfer, electroporation or particle bombardment. Suitable methods for transformation or transfection of host cells, including plant cells, can be found in Sambrook et al. (Molecular Cloning: A Laboratory Manual., 2nd ed., Cold Spring Harbor Laboratory, Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor, NY, 1989) and other laboratory books such as Methods in Molecular Biology, 1995, Vol. 44, Agrobacterium protocols, Ed .: Gartland and Davey, Humana Press, Totowa, New Jersey.
Em um outro aspecto da invenção é fornecido um organismo não humano transgênico que compreende pelo menos um ácido nucléico, construto de gene ou vetor de acordo com um aspecto anterior da invenção. O organismo não humano transgênico pode ser um microorganismo, um animal não humano ou uma planta.In another aspect of the invention there is provided a transgenic non-human organism comprising at least one nucleic acid, gene construct or vector according to an earlier aspect of the invention. The transgenic nonhuman organism can be a microorganism, a nonhuman animal or a plant.
As células hospedeiras que são, em princípio, adequadas para absorver o ácido nucléico de acordo com a invenção, o produto de gene de acordo com a invenção ou o vetor de acordo com a invenção são todos os organismos procarióticos ou eucarióticos. Os organismos hospedeiros que são vantajosamente usados são os microorganismos tais como fungos ou leveduras, ou células de planta, preferivelmente plantas ou partes desta. Os fungos, leveduras ou plantas são preferivelmente usados, especialmente plantas, por exemplo, plantas tal como colheitas de óleo, que têm alto teor em compostos de lipídio tal como óleo de semente de colza, prímula de noite, linho, cardo, amendoim, óleo de colza, linhaça, soja, açafroa, girassol, borragem, ou plantas tal como milho, trigo, centeio, aveias, triticale, arroz, cevada, algodão, mandioca, pimenta, Tagetes, plantas Solanacea tal como batata, tabaco, berinjela e tomate, espécies de Vicia, ervilha, alfafa, plantas fechadas (café, cacau, chá), espécies de Salix, árvores (óleo de palma, coco), e gramas perenes e colheitas de forragem. As plantas especialmente preferidas de acordo com a invenção são colheitas de óleo tal como soja, amendoim, óleo de semente de colza, óleo de colza, linhaça, linho, prímula de noite, girassol, açafroa, árvores (óleo de palma, coco).Host cells that are, in principle, suitable for absorbing nucleic acid according to the invention, the gene product according to the invention or the vector according to the invention are all prokaryotic or eukaryotic organisms. The host organisms that are advantageously used are microorganisms such as fungi or yeast, or plant cells, preferably plants or parts thereof. Fungi, yeast or plants are preferably used, especially plants, for example plants such as oil crops, which are high in lipid compounds such as rapeseed oil, evening primrose, flax, thistle, peanuts, oil. rapeseed, flaxseed, soybeans, safflower, sunflower, borage, or plants such as corn, wheat, rye, oats, triticale, rice, barley, cotton, cassava, pepper, Tagetes, Solanacea plants such as potato, tobacco, eggplant and tomato , Vicia species, peas, alfalfa, enclosed plants (coffee, cocoa, tea), Salix species, trees (palm oil, coconut), and perennial grass and forage crops. Especially preferred plants according to the invention are oil crops such as soybean, peanut, rapeseed oil, rapeseed oil, flaxseed, flax, evening primrose, sunflower, safflower, trees (palm oil, coconut).
Em uma modalidade vantajosa, o termo "ácido nucléico (molécula)" como usado no presente contexto adicionalmente compreende a sequência não transladada nas extremidades 3' e 5' da região de gene de codificação: pelo menos 500, preferivelmente 200, especialmente preferivelmente 100 nucleotídeos da seqüência a jusante da extremidade 5' da região de codificação e pelo menos 100, preferivelmente 50, especialmente preferivelmente 20 nucleotídeos da seqüência a jusante da extremidade 3' da região de gene de codificação. Uma molécula de ácido nucléico "isolada" é separada de outras moléculas de ácido nucléico que estão presentes na fonte natural do ácido nucléico. Um ácido nucléico "isolado" preferivelmente não tem nenhuma seqüência que naturalmente flanqueie o ácido nucléico no DNA genômico do organismo do qual o ácido nucléico é derivado (por exemplo, seqüências que ficam situadas nas extremidades 5' e 3' do ácido nucléico). Em várias modalidades, a molécula de Δθ-elongase, Δ8-dessaturase ou Δδ-dessaturase isolada pode compreender, por exemplo, menos do que aproximadamente 5 kb, 4 kb, 3 kb, 2 kb, 1 kb, 0,5 kb ou 0,1 kb de seqüências de nucleotídeo que naturalmente flanqueiam a molécula de ácido nucléico no DNA genômico da célula da qual o ácido nucléico é derivado. O mesmo se aplica a outras seqüências de ácido nucléico que podem ser incluídas em um cassete de expressão, por exemplo seqüências que codificam uma Δδ-elongase, co3-dessaturase e/ou A4-dessaturase As moléculas de ácido nucléico da presente invenção, por exemplo, uma molécula de ácido nucléico com uma seqüência de nucleotídeo de SEQ ID NO: 1 ou resíduos 7668 a 12077 desta, ou as partes da SEQ ID NO: 1 especificada pelos segundo a quarto aspectos da invenção, podem ser isoladas usando técnicas padrão molecular-biológicas e as informações de seqüência fornecidas nelas. Além disso, por exemplo, uma seqüência homóloga ou regiões de seqüência homóloga, conservadas podem ser identificadas no nível de aminoácido ou DNA com a ajuda de algoritmos comparativos. Eles podem ser usados como sonda de hibridização e técnicas de hibridização padrão (tal como, por exemplo, aquelas descritas em Sambrook e outros, Molecular Cloning: A Laboratory Manual. 2- ed., Cold Spring Harbor Laboratory, Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor, NY, 1989) para isolar seqüências de ácido nucléico adicionais que podem ser usadas no processo.In an advantageous embodiment, the term "nucleic acid (molecule)" as used herein further comprises the untranslated sequence at the 3 'and 5' ends of the coding gene region: at least 500, preferably 200, especially preferably 100 nucleotides. of the sequence downstream of the 5 'end of the coding region and at least 100, preferably 50, especially preferably 20 nucleotides of the sequence downstream of the 3' end of the coding gene region. An "isolated" nucleic acid molecule is separated from other nucleic acid molecules that are present in the natural source of nucleic acid. An "isolated" nucleic acid preferably has no sequence that naturally flanks the nucleic acid in the genomic DNA of the organism from which the nucleic acid is derived (for example, sequences that are located at the 5 'and 3' ends of the nucleic acid). In various embodiments, the Δθ-elongase, Δ8-desaturase or isolated Δδ-desaturase molecule may comprise, for example, less than approximately 5 kb, 4 kb, 3 kb, 2 kb, 1 kb, 0.5 kb or 0 , 1 kb of nucleotide sequences that naturally flank the nucleic acid molecule in the genomic DNA of the cell from which the nucleic acid is derived. The same applies to other nucleic acid sequences that may be included in an expression cassette, for example sequences encoding a Δδ-elongase, co3 desaturase and / or A4 desaturase. The nucleic acid molecules of the present invention, for example , a nucleic acid molecule with a nucleotide sequence of SEQ ID NO: 1 or residues 7668 to 12077 thereof, or parts of SEQ ID NO: 1 specified by the second to fourth aspects of the invention, may be isolated using standard molecular techniques. and the sequence information provided therein. In addition, for example, a homologous sequence or conserved homologous sequence regions can be identified at the amino acid or DNA level with the help of comparative algorithms. They can be used as a hybridization probe and standard hybridization techniques (such as, for example, those described in Sambrook et al., Molecular Cloning: A Laboratory Manual. 2- ed., Cold Spring Harbor Laboratory, Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor, NY, 1989) to isolate additional nucleic acid sequences that can be used in the process.
Além disso, uma molécula de ácido nucléico de Perkinsus mari-nus que compreende uma seqüência completa de SEQ ID NO: 1 ou uma parte desta pode ser isolada através de reação em cadeia de polimerase, onde os iniciadores de oligonucleotídeo são usados sobre a base desta seqüência ou partes desta (por exemplo, uma molécula de ácido nucléico que compreende a seqüência completa ou parte desta pode ser isolada através de reação em cadeia de polimerase que usa iniciadores de oligonucleotídeo que foram gerados com base nesta mesma seqüência). Por exemplo, mRNA pode ser isolado de células (por exemplo, por meio do método de extração de tiocianato de guanidíneo de Chirgwin e outros (1979) Biochemistry 18:5294-5299) e cDNA por meio de transcriptase reversa (por exemplo, transcriptase reversa Moloney MLV, disponibilizado por Gibco/BRL, Bethes-da, MD, ou transcriptase reversa AMV, disponibilizado por Seikagaku America, Inc., St.Petersburg, FL).In addition, a Perkinsus mari-nus nucleic acid molecule comprising a complete sequence of SEQ ID NO: 1 or a portion thereof may be isolated by polymerase chain reaction, where oligonucleotide primers are used on the basis of this sequence. sequence or parts thereof (for example, a nucleic acid molecule comprising the complete sequence or part thereof may be isolated by polymerase chain reaction using oligonucleotide primers that were generated based on that sequence). For example, mRNA can be isolated from cells (e.g., by the Chirgwin et al. (1979) guanidine thiocyanate extraction method (1979) Biochemistry 18: 5294-5299) and cDNA by reverse transcriptase (e.g. reverse transcriptase Moloney MLV, available from Gibco / BRL, Bethes-da, MD, or AMV reverse transcriptase, available from Seikagaku America, Inc., St.Petersburg, FL).
Os iniciadores de oligonucleotídeo sintéticos para a amplificação por meio de reação em cadeia de polimerase podem ser gerados com base em uma das seqüências mostradas na SEQ ID NO: 1 ou com a ajuda das seqüências de aminoácido detalhadas em SEQ ID NO: 2, SEQ ID NO: 3 e SEQ ID NO: 4. São mostrados iniciadores particularmente adequados nos Exemplos como SEQ ID NO: 5 e SEQ ID NO: 6.Synthetic oligonucleotide primers for polymerase chain reaction amplification can be generated based on one of the sequences shown in SEQ ID NO: 1 or with the help of the amino acid sequences detailed in SEQ ID NO: 2, SEQ ID NO: 3 and SEQ ID NO: 4. Particularly suitable primers are shown in the Examples as SEQ ID NO: 5 and SEQ ID NO: 6.
Um ácido nucléico de acordo com a invenção pode ser amplificado por técnicas padrão de amplificação de PCR que usam cDNA ou, alternativamente, DNA genômico como modelo (SEQ ID NO 9) e iniciadores de oligonucleotídeo adequados (SEQ ID NO: 5 e SEQ ID NO: 6). O ácido nucléico amplificado desse modo pode ser clonado de em um vetor adequado e pode ser caracterizado por meio de análise de seqüência de DNA. Os oli-gonucleotídeos que correspondem a uma seqüência de nucleotídeo de des- saturase ou elongase podem ser gerados através de métodos sintéticos padrão, por exemplo, usando um sintetizador de DNA automático.A nucleic acid according to the invention may be amplified by standard PCR amplification techniques using cDNA or, alternatively, genomic DNA as a template (SEQ ID NO 9) and suitable oligonucleotide primers (SEQ ID NO: 5 and SEQ ID NO). : 6). The nucleic acid amplified in this way can be cloned from into a suitable vector and can be characterized by DNA sequence analysis. Oligonucleotides corresponding to a desaturase or elongase nucleotide sequence can be generated by standard synthetic methods, for example, using an automated DNA synthesizer.
Os ácidos nucléicos e moléculas de proteína acima mencionados com atividade de A9-elongase, Δδ-dessaturase e/ou Δδ-dessaturase, podem ser usados em um processo para a produção de ARA de ácido lino-léico em organismos transgênicos.The aforementioned nucleic acids and protein molecules with A9-elongase, Δδ-desaturase and / or Δδ-desaturase activity can be used in a process for the production of lino-lactic acid ARA in transgenic organisms.
Então, em um outro aspecto da invenção, é fornecido um processo para a conversão de ácido linoléico ou um derivado deste em ácido araquidônico ou um derivado deste em um organismo, o processo compreendendo introduz em um organismo que compreende ácido linoléico, pelo menos uma seqüência de ácido nucléico que compreende: a) SEQ ID NO: 1 (seqüência completa 1047306867), seqüência que compreende resíduos de ácido nucléico 7668 a 12077 de SEQ ID NO: 1 ou um homólogo de um destes; b) seqüências de ácido nucléico que hibridizam sob condições rigorosas com uma seqüência de ácido nucléico de SEQ ID NO: 1 ou uma seqüência que compreende resíduos de ácido nucléico 7668 a 12077 de SEQ ID NO: 1; c) uma seqüência de ácido nucléico isolada que codifica polipep-tídeos com atividade de A9-elongase, A8-dessaturase e Δδ-dessaturase, em que o polipeptídeos é selecionado do grupo que consiste em SEQ ID NOS 2, 3 e 4; d) um derivado de uma seqüência de ácido nucléico de SEQ ID NO: 1 que codifica os polipeptídeos com pelo menos 40% de identidade no nível de aminoácido com SEQ ID NO: 2, SEQ ID NO: 3 e SEQ ID NO: 4; em que os referidos polipeptídeos têm atividade de A9-elongase, Δδ-dessaturase e Δδ-dessaturase. e expressando a referida seqüência de ácido nucléico.Then, in another aspect of the invention, there is provided a process for converting linoleic acid or a derivative thereof to arachidonic acid or a derivative thereof into an organism, the process comprising introducing into an organism comprising linoleic acid at least one sequence. nucleic acid comprising: (a) SEQ ID NO: 1 (complete sequence 1047306867), sequence comprising nucleic acid residues 7668 to 12077 of SEQ ID NO: 1 or a homologue thereof; (b) nucleic acid sequences hybridizing under stringent conditions to a nucleic acid sequence of SEQ ID NO: 1 or a sequence comprising nucleic acid residues 7668 to 12077 of SEQ ID NO: 1; c) an isolated nucleic acid sequence encoding polypeptides with A9-elongase, A8-desaturase and Δδ-desaturase activity, wherein the polypeptides are selected from the group consisting of SEQ ID NOS 2, 3 and 4; d) a derivative of a nucleic acid sequence of SEQ ID NO: 1 encoding polypeptides of at least 40% amino acid level identity with SEQ ID NO: 2, SEQ ID NO: 3 and SEQ ID NO: 4; wherein said polypeptides have A9-elongase, Δδ desaturase and Δδ desaturase activity. and expressing said nucleic acid sequence.
No contexto da presente invenção, um "derivado" de ácido linoléico ou araquidônico é um composto no qual o OH da porção de ácido car-boxílico é substituído por uma porção de R1, em que: R1 é coenzima A (tioéster), lisofosfatidilcolina, lisofosfatidiletano- lamina, lisofosfatidilglicerol, liso - difosfatidiIglicerol, lisofosfatidilserina, liso-fosfatidilinositol, base de esfingo ou um radical da fórmula II <il) em qual R2 = hidrogênio, colina de lisofosfatidila, lisofosfatidiletanolamina, lisofosfatidilglicerol, lisodifosfatidilglcerol, lisofosfatidilserina, lisofosfatidilinositol ou C2-C24-alquilcarbonila saturada ou não saturada, R3 = hidrogênio, C2-C24-alquilcarbonila saturada ou não saturada, ou R2 e R3 são independentemente um do outro um radical da fórmula Ia: (Ia) em que n = 2, 3, 4, 5, 6, 7 ou 9, m = 2, 3, 4, 5 ou 6 e p = 0 ou 3; e em que um oxigênio no radical R1 pode ser substituído enxofre tal que R1 seja ligado ao restante da molécula por uma ligação de tioéster.In the context of the present invention, a linoleic or arachidonic acid "derivative" is a compound in which the OH of the carboxylic acid moiety is replaced by a moiety of R1, wherein: R1 is coenzyme A (thioester), lysophosphatidylcholine, lysophosphatidylethanolamine, lysophosphatidylglycerol, smooth - difosfatidiIglicerol, lysophosphatidylserine, lysophosphatidylinositol, sphingo base or a radical of the formula II <iL) in which R 2 = hydrogen, lisofosfatidila choline, lysophosphatidylethanolamine, lysophosphatidylglycerol, lisodifosfatidilglcerol, lysophosphatidylserine, lysophosphatidylinositol or C2 Saturated or unsaturated C24-alkylcarbonyl, R3 = hydrogen, saturated or unsaturated C2-C24-alkylcarbonyl, or R2 and R3 are independently of each other a radical of formula Ia: (Ia) wherein n = 2, 3, 4, 5, 6, 7 or 9, m = 2, 3, 4, 5 or 6 and p = 0 or 3; and wherein an oxygen in the radical R1 may be substituted sulfur such that R1 is bound to the remainder of the molecule by a thioester bond.
Os processos de acordo com a invenção preferivelmente produzem ARA total em um conteúdo de pelo menos 1% em peso, vantajosamente pelo menos 3% em peso, com base nos ácidos graxos totais nos organismos transgênicos, preferivelmente em uma planta transgênica.The processes according to the invention preferably produce total ARA in a content of at least 1 wt.%, Advantageously at least 3 wt.%, Based on total fatty acids in transgenic organisms, preferably in a transgenic plant.
Uma vez que uma pluralidade de etapas de reação é realizada pelos compostos de partida, o ácido linoléico de (18:2Δ9,12) no processo de acordo com a invenção, ARA (20:4Δ5,8,11·14) não é obtido como um produto puro; traços menores dos precursores sempre estão presentes no produto final. ARA quimicamente puro também pode ser sintetizado pelo processo descrito acima. Para este fim, ARA ou um derivado deste é isolado dos organismos, tal como os microorganismos ou as plantas ou o meio de cultura dentro ou sobre os quais os organismos foram crescidos, ou do organismo e do meio de cultura, da maneira conhecida, por exemplo, por ex- tração, destilação, cristalização, cromatografia ou uma combinação destes métodos. Estes derivados de ARA ou ARA quimicamente são vantajosos para aplicações no setor de indústria alimentícia, no setor de cosmético e especialmente no setor de indústria farmacológica. O processo pode incluir etapas adicionais de converter o ARA em um ácido graxo ω-3 introduzindo-se no organismo o ácido nucléico que codifica um ω-3 dessaturase e opcionalmente um A5-elongase e/ou um Δ4-elongase e/ou um A4-dessaturase.Since a plurality of reaction steps are performed by the starting compounds, the linoleic acid of (18: 2Δ9,12) in the process according to the invention, ARA (20: 4Δ5,8,11 · 14) is not obtained. as a pure product; Minor traits of precursors are always present in the final product. Chemically pure ARA can also be synthesized by the process described above. To this end, ARA or a derivative thereof is isolated from organisms, such as microorganisms or plants or the culture medium within or on which the organisms were grown, or from the organism and culture medium, in the manner known as for example by extraction, distillation, crystallization, chromatography or a combination of these methods. These ARA or ARA derivatives are chemically advantageous for applications in the food industry, cosmetic sector and especially in the pharmaceutical industry sector. The process may include additional steps of converting ARA into a ω-3 fatty acid by introducing nucleic acid encoding a ω-3 desaturase and optionally an A5-elongase and / or Δ4-elongase and / or A4. desaturase.
Em um outro aspecto a invenção compreende um processo para a conversão de 18:2Δ9,12 (ácido linoléico) em 20:2Δ11, u, o processo compreendendo introduzir em um organismo que compreende ácido linoléico pelo menos uma seqüência de ácido nucléico que codifica um polipeptídeo que tem atividade de A9-elongase e que compreende: a) uma seqüência que compreende resíduos de ácido nucléico 7668 a 9200 de SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 9 ou um homólogo de um destes; b) uma seqüência de ácido nucléico que hibridiza sob condições rigorosas com uma seqüência de ácido nucléico que compreende resíduos 7668 a 9200 de SEQ ID NO: 1 ou SEQ ID NO: 9; c) uma seqüência de ácido nucléico isolada que codifica um polipeptídeo com atividade de A9-elongase, em que o polipeptídeo compreende SEQ ID NO: 2 ou SEQ ID NO: 10; d) um derivado de um uma seqüência que compreende resíduos de ácido nucléico 7668 a 9200 de SEQ ID NO: 1 ou SEQ ID NO: 9 que codifica um polipeptídeo com pelo menos 40% de identidade no nível de amino-ácido com SEQ ID NO: 2 ou SEQ ID NO: 10; em que o referido polipeptídeo tem atividade de A9-elongase; e expressando a referida seqüência de ácido nucléico.In another aspect the invention comprises a process for converting 18: 2Δ9,12 (linoleic acid) to 20: 2Δ11,1u, the process comprising introducing into an organism comprising linoleic acid at least one nucleic acid sequence encoding a A9-elongase activity polypeptide comprising: a) a sequence comprising nucleic acid residues 7668 to 9200 of SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 9 or a homologue thereof; (b) a nucleic acid sequence hybridizing under stringent conditions to a nucleic acid sequence comprising residues 7668 to 9200 of SEQ ID NO: 1 or SEQ ID NO: 9; c) an isolated nucleic acid sequence encoding an A9-elongase activity polypeptide, wherein the polypeptide comprises SEQ ID NO: 2 or SEQ ID NO: 10; d) a derivative of a sequence comprising nucleic acid residues 7668 to 9200 of SEQ ID NO: 1 or SEQ ID NO: 9 encoding a polypeptide of at least 40% amino acid level identity with SEQ ID NO : 2 or SEQ ID NO: 10; wherein said polypeptide has A9-elongase activity; and expressing said nucleic acid sequence.
Em um outro aspecto da invenção é fornecido um processo para a conversão de 20:2Δ11,14 em 20:3Δ8,11,14, o processo compreendendo introduzir em um organismo que compreende 20:2Δ11,14, ou que compreende ácido linoléico e um Δ9 elongase, uma seqüência de ácido nucléico isolada que codifica um polipeptídeo com atividade de A8-dessaturase e que é selecionado do grupo que consiste em: a) uma seqüência que compreende resíduos de ácido nucléico 9351 a 10724 de SEQ ID NO: 1 ou um homólogo desta; b) seqüências de ácido nucléico que hibridiza sob condições rigorosas com uma seqüência de ácido nucléico que compreende resíduos 9351 a 10724 de SEQ ID NO: 1; c) uma seqüência de ácido nucléico isolada que codifica polipep-tídeos com atividade de Δδ-dessaturase, em que o polipeptídeo compreende SEQ ID NO: 3; d) um derivado de um uma seqüência que compreende resíduos de ácido nucléico 9351 a 10724 de SEQ ID NO: 1 que codifica um polipeptídeo com pelo menos 40% de identidade no nível de aminoácido com SEQ ID NO: 3; em que o referido polipeptídeo tem atividade de A8-dessaturase; e expressando a referida seqüência de ácido nucléico.In another aspect of the invention there is provided a process for converting 20: 2Δ11,14 to 20: 3Δ8,11,14, the process comprising introducing into an organism comprising 20: 2Δ11,14, or comprising linoleic acid and a Δ9 elongase, an isolated nucleic acid sequence encoding an A8-desaturase polypeptide selected from the group consisting of: a) a sequence comprising nucleic acid residues 9351 to 10724 of SEQ ID NO: 1 or a counterpart thereof; (b) nucleic acid sequences hybridizing under stringent conditions to a nucleic acid sequence comprising residues 9351 to 10724 of SEQ ID NO: 1; c) an isolated nucleic acid sequence encoding polypeptides with Δδ desaturase activity, wherein the polypeptide comprises SEQ ID NO: 3; d) a derivative of a sequence comprising nucleic acid residues 9351 to 10724 of SEQ ID NO: 1 encoding a polypeptide with at least 40% amino acid level identity to SEQ ID NO: 3; wherein said polypeptide has A8 desaturase activity; and expressing said nucleic acid sequence.
Em um outro aspecto da invenção, é fornecido um processo para a conversão de 20:3Δ8,11,14 em 20:4Δ5,8·11,14 (ARA), o processo compreendendo introduzir em um organismo que compreende 20:3Δ8'11'14 ou que compreende 20:2δ11, 14 e um Δδ-dessaturase, ou que compreende ácido linoléico, um A9-elongase e um Δδ-dessaturase, uma seqüência de ácido nucléico isolada que codifica um polipeptídeo com atividade de Δδ-dessaturase e que é selecionado do grupo que consiste em: a) uma seqüência que compreende resíduos de ácido nucléico 10842 a 12077 de SEQ ID NO: 1 ou um homólogo desta; b) seqüências de ácido nucléico que hibridizam sob condições rigorosas com uma seqüência de ácido nucléico que compreende resíduos 10842 a 12077 de SEQ ID NO: 1; c) uma seqüência de ácido nucléico isolada que codifica polipep-tídeos com atividade de Δδ-dessaturase, em que o polipeptídeo compreende SEQ ID NO: 4; d) um derivado de um uma seqüência que compreende resíduos de ácido nucléico 10842 a 12077 de SEQ ID NO: 1 que codifica um polipep-tídeo com pelo menos 40% de identidade no nível de aminoácido com SEQ ID NO: 4; em que o referido polipeptídeo tem atividade de Δδ-dessaturase. e expressando a referida seqüência de ácido nucléico. O processo pode incluir etapas adicionais para converter o ARA em um ácido graxo ω-3 introduzindo no organismo, o ácido nucléico que codifica um ω-3 dessaturase e opcionalmente um Δδ-elongase e/ou um Δ4-elongase e/ou um A4-dessaturase.In another aspect of the invention there is provided a process for converting 20: 3Δ8,11,14 to 20: 4Δ5,8 · 11.14 (ARA), the process comprising introducing into an organism comprising 20: 3Δ8'11 '14 or comprising 20: 2δ11, 14 and an Δδ desaturase, or comprising linoleic acid, an A9 elongase and an Δδ desaturase, an isolated nucleic acid sequence encoding a polypeptide with Δδ desaturase activity and is selected from the group consisting of: a) a sequence comprising nucleic acid residues 10842 to 12077 of SEQ ID NO: 1 or a homologue thereof; (b) nucleic acid sequences hybridizing under stringent conditions to a nucleic acid sequence comprising residues 10842 to 12077 of SEQ ID NO: 1; c) an isolated nucleic acid sequence encoding polypeptides with Δδ desaturase activity, wherein the polypeptide comprises SEQ ID NO: 4; d) a derivative of a sequence comprising nucleic acid residues 10842 to 12077 of SEQ ID NO: 1 encoding a polypeptide of at least 40% identity at the amino acid level of SEQ ID NO: 4; wherein said polypeptide has Δδ desaturase activity. and expressing said nucleic acid sequence. The process may include additional steps for converting ARA into a ω-3 fatty acid by introducing nucleic acid encoding a ω-3 desaturase into the body and optionally a Δδ-elongase and / or a Δ4-elongase and / or an A4- desaturase.
Para os processos apresentados acima, descobriu-se que a expressão foi mais efetivamente obtida usando indução com galactose.For the processes presented above, it was found that expression was most effectively obtained using galactose induction.
Os organismos adequados para a produção no processo de acordo com a invenção são, em princípio, qualquer organismo tais como microorganismos, animais não humanos ou plantas.Suitable organisms for production in the process according to the invention are in principle any organism such as microorganisms, non-human animals or plants.
As plantas que são adequadas são, em princípio, todas aquelas plantas que são capazes de sintetizar ácidos graxos, tal como todas as plantas dicotiledôneas ou monocotiledôneas, algas ou musgos. Plantas vantajosas são selecionadas do grupo das famílias de planta Adelotheciaceae, A-nacardiaceae, Asteraceae, Apiaceae, Betulaceae, Boraginaceae, Brassica-ceae, Bromeliaceae, Caricaceae, Cannabaceae, Convolvulaceae, Chenopo-diaceae, Crypthecodiniaceae, Cucurbitaceae, Ditrichaceae, Elaeagnaceae, Ericaceae, Euphorbiaceae, Fabaceae, Geraniaceae, Gramineae, Juglanda-ceae, Lauraceae, Leguminosae, Linaceae, Euglenaceae, Prasinophyceae ou plantas vegetais ou ornamentais, tal como Tagetes.Plants that are suitable are in principle all those plants that are capable of synthesizing fatty acids, such as all dicotyledonous or monocotyledonous plants, algae or moss. Advantageous plants are selected from the group of plant families Adelotheciaceae, A-nacardiaceae, Asteraceae, Apiaceae, Betulaceae, Boraginaceae, Brassica-ceae, Bromeliaceae, Caricaceae, Cannabaceae, Convolvulaceae, Chenopo-diaceae, Cryptheceuceae, Eleptheaeeaeeae Euphorbiaceae, Fabaceae, Geraniaceae, Gramineae, Juglanda-ceae, Lauraceae, Leguminosae, Linaceae, Euglenaceae, Prasinophyceae or vegetable or ornamental plants, such as Tagetes.
Os exemplos que podem ser mencionados são as seguintes plantas selecionadas do grupo que consiste em: Adelotheciaceae tal como os gêneros Physcomitrella, por exemplo, o gênero e espécies Physcomitrella patens, Anacardiaceae tal como os gêneros Pistacia, Mangifera, Anacardi-um, por exemplo, o gênero e espécies Pistacia vera [pistache], Mangifer indica [manga] ou Anacardium occidentale [cajueiro], Asteraceae, tal como os gêneros Calendula, Carthamus, Centaurea, Cichorium, Cynara, Helianthus, Lactuca, Locusta, Tagetes, Valeriana, por exemplo, o gênero e espécies Ca- lendula officinalis [calêndula comum], Carthamus tinctorius [açafroa], Centáurea cyanus [centáurea], Cichorium intybus [chicória], Cynara scolymus [alcachofra], Helianthus annus [girassol], Lactuca sativa, Lactuca crispa, Lac-tuca esculenta, Lactuca scariola, L. ssp. sativa, Lactuca scariola, L. var. inte-grata, Lactuca scariola, L. var. integrifoiia, Lactuca sativa subsp. romana, Locusta communis, Valeriana locusta [legumes de salada], Tagetes lúcida, Tagetes erecta ou Tagetes tenuifolia [calêndula africana ou de trincheira], Apiaceae, tal como o gênero Daucus, por exemplo o gênero e espécies Daucus carota [cenoura], Betulaceae, tal como o gênero Corylus, por exemplo, os gêneros e espécies Corylus avellana ou Corylus colurna [avelã], Bo-raginaceae, tal como o gênero Borago, por exemplo, o gênero e espécies Borago officinalis [borragem], Brassicaceae, tal como os gêneros Brassica, Camelina, Melanosinapis, Sinapis, Arabadopsis, por exemplo, os gêneros e espécies Brassica napus, Brassica rapa ssp. [óleo de semente de colza], Sinapis arvensis, Brassica juncea, Brassica juncea var. juncea, Brassica jun-cea var. crispifolia, Brassica juncea var. foliosa, Brassica nigra, Brassica si-napioides, Camelina sativa, Melanosinapis communis [mostarda], Brassica oleracea [beterraba de forragem] ou Arabidopsis thaliana, Bromeliaceae, tal como os gêneros Anana, Bromelia (abacaxi), por exemplo, os gêneros e espécies Anana comosus, Ananas ananas ou Bromelia comosa [abacaxi], Ca-ricaceae, tal como o gênero Carica, tal como o gênero e espécies de Carica papaya [mamão], Cannabaceae, tal como a Cannabis de gênero, tal como o gênero e espécies de Canabbis sativa [linho], Convolvulaceae, tal como os gêneros Ipomea, Convolvulus, por exemplo, os gêneros e espécies Ipomoea batatus, Ipomoea pandurata, Convolvulus batatas, Convolvulus tiliaceus, Ipomoea fastigiata, Ipomoea tiliacea, Ipomoea triloba ou Convolvulus pandu-ratus [batata-doce, batata], Chenopodiaceae, tal como o gênero Beta, tal como os gêneros e espécies Beta vulgaris, Beta vulgaris. var altíssima, Beta vulgaris var. vulgaris, Beta marítima, Beta vulgaris var. perennis, Beta vulgaris var. conditiva ou Beta vulgaris var. esculenta [beterraba doce], Crypthe-codiniaceae, tal como o gênero Crypthecodinium, por exemplo, o gênero e espécies Cryptecodinium cohnii, Cucurbitaceae, tal como o gênero Cucurbi- ta, por exemplo, os gêneros e espécies Cucurbita maxima, Cucurbita mixta, Cucurbita pepo ou Cucurbita moschata [abóbora], Cymbellaceae, tal como os gêneros Ânfora, Cymbella, Okedenia, Phaeodactylum, Reimeria, por exemplo, o gênero e espécies Phaeodactylum tricornutum, Ditrichaceae, tal como os gêneros Ditrichaceae, Astomiopsis, Ceratodon, Chrysoblastella, Ditrichum, Distichium, Eccremidium, Lophidion, Philibertiella, Pleuridium, Sa-elania, Trichodon, Skottsbergia, por exemplo os gêneros e espécies Ceratodon antarcticus, Ceratodon columbiae, Ceratodon heterophyllus, Ceratodon purpurascens, Ceratodon purpureus, purpureus Ceratodon ssp,. convolutus, Ceratodon purpureus ssp. stenocarpus, Ceratodon purpureus var. rotundifo-lius, Ceratodon ratodon, Ceratodon stenocarpus, Chrysoblastella Chilensis, Ditrichum ambiguum, Ditrichum brevisetum, Ditrichum crispatissimum, Ditrichum difficile, Ditrichum falcifolium, Ditrichum flexicaule, Ditrichum gigan-teum, Ditrichum heteromallum, Ditrichum lineare, Ditrichum lineare, Ditrichum montanum, Ditrichum montanum, Ditrichum pallidum, Ditrichum punctulatum, Ditrichum pusillum, Ditrichum pusillum var. tortile, Ditrichum rhynchostegium, Ditrichum schimperi, Ditrichum tortile, Distichium capillaceum, Distichium ha-genii, Distichium inclinatum, Distichium macounii, Eccremidium floridanum, Eccremidium whiteleggei, Lophidion strictus, Pleuridium acuminatum, Pleuridium altemifoiium, Pleuridium holdridgei, Pleuridium mexicanum, Pleuridium ravenelii, Pleuridium subulatum, Saelania glaucescens, Trichodon borealis, Trichodon cylindricus ou Trichodon cylindricus var. oblongus, Elaeagnaceae, tal como o gênero Elaeagnus, por exemplo, o gênero e espécie Olea euro-paea [azeitona], Ericaceae, tal como o gênero Kalmia, por exemplo, o gênero e espécies Kalmia latifolia, Kalmia angustifolia, Kalmia microphylla, Kalmia polifolia, Kalmia occidentalis, Cistus chamaerhodendros ou Kalmia lúcida [loureiro da montanha], Euglenaceae, tal como o gênero Ascoglena, Astasia, Colacium, Cyclidiopsis, Euglena, Euglenopsis, Hyalaphacus, Khawkinea, Lepocinclis, Phacus, Strombomonas, Trachelomonas, por exemplo, o gênero e espécie Euglena gracilis; Euphorbiaceae, tal como o gênero Manihot, Jani-pha, Jatropha, Ricinus, por exemplo, o gênero e espécies Manihot utilissima, Janipha manihot, Jatropha manihot, Manihot aipil, Manihot dulcis, Manihot manihot, Manihot melanobasis, Manihot esculenta [mandioca] ou Ricinus communis [planta de óleo de rícino], Fabaceae, tal como o gênero Pisum, Albizia, Cathormion, Feuillea, Inga, Pithecolobium, Acacia, Mimosa, Medica-jo, Glycine, Dolichos, Phaseolus, soybean, por exemplo, o gênero e espécies Pisum sativum, Pisum arvense, Pisum humile [pea], Albizia berteriana, Albizia julibrissin, Albizia lebbeck, Acacia berteriana, Acacia littoralis, Albizia berteriana, Albizzia berteriana, Cathormion berteriana, Feuillea berteriana, Inga fragrans, Pithecellobium berterianum, Pithecellobium fragrans, Pithecolobium berterianum, Pseudalbizzia berteriana, Acacia julibrissin, Acacia nemu, Albizia nemu, Feuilleea julibrissin, Mimosa julibrissin, Mimosa speciosa, Serican-rda julibrissin, Acacia lebbeck, Acacia macrophylla, Albizia lebbeck, Feuilleea lebbeck, Mimosa lebbeck, Mimosa speciosa, Medicago sativa, Medicago fal-cata, Medicago varia [alfafa] Glycine max Dolichos soja, Glycine gracilis, Glycine hispida, Phaseolus max, Soja hispida ou Soja max [soja], Funariace-ae, tal como o gênero Aphanorrhegma, Entosthodon, Funaria, Physcomitrel-la, Physcomitrium, por exemplo, o gênero e espécies Aphanorrhegma serra-tum, Entosthodon attenuatus, Entosthodon bolanderi, Entosthodon bonplan-dii, Entosthodon califomicus, Entosthodon drummondii, Entosthodon jame-sonii, Entosthodon leibergii, Entosthodon neoscoticus, Entosthodon rubrise-tus, Entosthodon spathulifolius, Entosthodon tucsoni, Funaria americana, Funaria bolanderi, Funaria calcarea, Funaria californica, Funaria calvescens, Funaria convoluta, Funaria flavicans, Funaria groutiana, Funaria hygrometri-ca, Funaria hygrometrica var. arctica, Funaria hygrometrica var. calvescens, Funaria hygrometrica var. convoluta, Funaria hygrometrica var. muralis, Funaria hygrometrica var. utahensis, Funaria microstoma, Funaria microstoma var. obtusifolia, Funaria muhlenbergii, Funaria orcuttii, Funaria plano-convexe, Funaria polaris, Funaria ravenelii, Funaria rubriseta, Funaria serra-ta, Funaria sonorae, Funaria sublimbatus, Funaria tucsoni, Physcomitrella californica, Physcomitrella patens, Physcomitrella readeri, Physcomitrium australe, Physcomitrium califomicum, Physcomitrium collenchymatum, Physcomitrium coloradense, Physcomitrium cupuliferum, Physcomitrium drummondii, Physcomitrium eurystomum, Physcomitrium flexifolium, Physcomitri- um hookeri, Physcomitrium hookeri var. serratum, Physcomitrium immersum, Physcomitrium kellermanii, Physcomitrium megalocarpum, Physcomitrium pyriforme, pyriforme Physcomitrium var. serratum, Physcomitrium rufipes, Physcomitrium sandbergii, Physcomitrium subsphaericum, Physcomitrium washíngtoniense, Geraniaceae, tal como os gêneros Pelargonium, Cocos, Oleum, por exemplo, os gêneros e espécies Cocos nucifera, Pelargonium grossularioides ou Oleum cocois [coco], Gramineae, tal como o gênero Sac-charum, por exemplo, o gênero e espécies Saccharum officinarum, Juglan-daceae, tal como os gêneros Juglans, Wallia, por exemplo, os gêneros e espécies Juglans regia, Juglans ailanthifolia, Juglans sieboldiana, Juglans cinerea, Wallia cinerea, Juglans bixbyi, Juglans californica, Juglans hindsii, Juglans intermedia, Juglans jamaicensis, Juglans major, Juglans microcarpa, Juglans nigra ou Wallia nigra [noz], Lauraceae, tal como os gêneros Persea, Laurus, por exemplo, os gêneros e espécies Laurus nobilis [baía], Persea americana, Persea gratíssima ou Persea persea [abacate], Leguminosae, tal como o gênero Arachis, por exemplo, o gênero e espécies Arachis hypogaea [amendoim], Linaceae.tal como os gêneros Adenolinum, por exemplo, os gêneros e espécies Linum usitatissimum, Linum humile, Linum austriacum, Linum bienne, Linum angustifolium, Linum catharticum, Linum flavum, Linum grandiflorum, Adenolinum grandiflorum, Linum lewisii, Linum narbonense, Linum perenne, Linum perenne var. lewisii, Linum pratense ou Linum trigy-num [linhaça], Lythrarieae, tal como o gênero Punica, por exemplo, o gênero e espécies Punica granatum [romã], Malvaceae, tal como o gênero Gossypi-um, por exemplo, os gêneros e espécies Gossypium hirsutum, Gossypium arboreum, Gossypium barbadense, Gossypium herbaceum ou Gossypium thurberi [algodão], Marchantiaceae, tal como o gênero Marchantia, por exemplo, os gêneros e espécies Marchantia berteroana, Marchantia foliacea, Marchantia macropora, Musaceae, tal como o gênero Musa, por exemplo os gêneros e espécies Musa nana, Musa acuminata, Musa paradisíaca, Musa spp. [banana], Onagraceae, tal como os gêneros Camissonia, Oenothera, por exemplo, os gêneros e espécies Oenothera biennis ou Camissonia bre-vipes [prímula de noite], Palmae, tal como o gênero Elaeis, por exemplo, o gênero e espécies Elaeis guineensis [óleo de palma], Papaveraceae, tal como, por exemplo, o gênero Papaver, por exemplo, os gêneros e espécies Papaver orientale, Papaver rhoeas, Papaver dubium [papoula], Pedatiaceae, tal como o gênero Sesamum, por exemplo, o gênero e espécies Sesamum indicum [gergelim], Piperaceae, tal como o gênero Piper, Artanthe, Pepero-mia, Steffensia, por exemplo, os gêneros e espécies Piper aduncum, Piper amalago, Piper angustifolium, Piper auritum, Piper betei, Piper cubeba, Piper longum, Piper nigrum, Piper retrofractum, Artanthe adunca, Artanthe elonga-ta, Peperomia elongata, Piper elongatum, Steffensia elongata [pimenta], Po-aceae, tal como os gêneros Hordeum, Secale, Avena, Sorghum, Andropo-gon, Holcus, Panicum, Oryza, Zea [milho], Triticum, por exemplo, os gêneros e espécies Hordeum vulgare, Hordeum jubatum, Hordeum murinum, Hordeum secalinum, Hordeum distichon, Hordeum aegiceras, Hordeum hexasti-chon, Hordeum hexastichum, Hordeum irregulare, Hordeum sativum, Hordeum secalinum [cevada], Secale cereale [centeio], Avena sativa, Avena fatua, Avena byzantina, Avena fatua var. sativa, Avena hybrida [aveias], Sorghum bicolor, Sorghum halepense, Sorghum saccharatum, Sorghum vulgare, Andropogon drummondii, Holcus bicolor, Sorghum Holcus, Sorghum ae-thiopicum, Sorghum arundinaceum, Sorghum caffrorum, Sorghum cernuum, Sorghum dochna, Sorghum drummondii, Sorghum durra, Sorghum guineen-se, Sorghum lanceolatum, Sorghum nervosum, Sorghum saccharatum, Sorghum subglabrescens, Sorghum verticilliflorum, Sorghum vulgare, Holcus halepensis, Sorghum miliaceum, Panicum militaceum [milho miúdo], Oryza sativa, Oryza latifolia de [arroz], Zea mays [milho] Triticum aestivum, Triticum durum, Triticum turgidum, Triticum hybernum, Triticum macha, Triticum sativum ou Triticum vulgare [trigo], Porphyridiaceae, tal como os gêneros Chroo-thece, Flintiella, Petrovanella, Porphyridium, Rhodella, Rhodosorus, Vanho-effenia, por exemplo, o gênero e espécies Porphyridium cruentum, Protea-ceae, como o gênero Macadamia, por exemplo, o gênero e espécies Maca-damia intergrifolia [macadâmia], Prasinophyceae, tal como os gêneros Nep-hroselmis, Prasinococcus, Scherffelia, Tetraselmis, Mantoniella, Ostreococ-cus, por exemplo, os gêneros e espécies, Olivacea de Nephroselmis, Prasi- nococcus capsulatus, Scherffelia dubia, Tetraselmis chui, Tetraselmis sueci-ca, Mantoniella squamata, Ostreococcus tauri, Rubiaceae, tal como o gênero Coffea, por exemplo, os gêneros e espécies Coffea spp., Coffea Arabica, Coffea canephora ou Coffea liberica, Scrophulariaceae, tal como o gênero Verbascum, por exemplo, os gêneros e espécies Verbascum blattaria, Ver-bascum chaixii, Verbascum densiflorum, Verbascum lagurus, Verbascum longifolium, Verbascum lychnitis, Verbascum nigrum, Verbascum olympicum, Verbascum phlomoides, Verbascum phoenicum, Verbascum pulverulentum ou Verbascum thapsus [verbascum], Solanaceae, tal como os gêneros Cap-sicum, Nicotiana, Solanum, Lycopersicon, por exemplo, os gêneros e espécies Capsicum annuum, Capsicum annuum var. glabriusculum, Capsicum frutescens [pimenta], Capsicum annuum [páprica], Nicotiana tabacum, Nicotiana alata, Nicotiana attenuata, Nicotiana glauca, Nicotiana langsdorffii, Nicotiana obtusifolia, Nicotiana quadrivalvis, Nicotiana repanda, Nicotiana rústica, Nicotiana sylvestris [tabaco], Solanum tuberosum [batata], Solanum me-longena [berinjela], Lycopersicon esculentum, Lycopersicon lycopersicum, Lycopersicon Pyriforme, Solanum integrifolium ou Solanum lycopersicum [tomate], Sterculiaceae, tal como o gênero Theobroma, por exemplo, o gênero e espécies Theobroma cacau [cacau] ou Theaceae, tal como o gênero Camellia, por exemplo, o gênero e espécies de Camellia sinensis [chá].Examples that may be mentioned are the following plants selected from the group consisting of: Adelotheciaceae such as the genera Physcomitrella, for example, the genus and species Physcomitrella patens, Anacardiaceae such as the genera Pistacia, Mangifera, Anacardi-um, for example, the genus and species Pistacia vera [pistachio], Mangifer indica [mango] or Anacardium occidentale [cashew], Asteraceae, such as the genera Calendula, Carthamus, Centaurea, Cichorium, Helianthus, Lactuca, Locusta, Tagetes, Valerian, for example. , the genus and species Calendula officinalis [Common Marigold], Carthamus tinctorius [Saffron], Cornflower cyanus [Cornflower], Cichorium intybus [Chicory], Cynara scolymus [Artichoke], Helianthus annus [Sunflower], Lactuca crispa, Lactuca crispa, Lactuca crispa Lac-tuca esculenta, Lactuca scariola, L. ssp. sativa, Lactuca scariola, L. var. grata, Lactuca scariola, L. var. integrifoiia, Lactuca sativa subsp. romana, Locusta communis, Valeriana locusta [salad vegetables], Tagetes lucida, Tagetes erecta or Tagetes tenuifolia [African or trench marigold], Apiaceae, such as the genus Daucus, for example the genus and species Daucus carota [carrot], Betulaceae , such as the genus Corylus, for example, the genera and species Corylus avellana or Corylus colurna [hazelnut], Bo-raginaceae, such as the genus Borago, for example, the genus and species Borago officinalis [borage], such as the genera Brassica, Camelina, Melanosinapis, Sinapis, Arabadopsis, for example, the genera and species Brassica napus, Brassica rapa ssp. [rapeseed oil], Sinapis arvensis, Brassica juncea, Brassica juncea var. juncea, Brassica jun-cea var. crispifolia, Brassica juncea var. folica, Brassica nigra, Brassica si-napioides, Camelina sativa, Melanosinapis communis [mustard], Brassica oleracea [mangold] or Arabidopsis thaliana, Bromeliaceae, such as genera Anana, Bromelia (pineapple), for example, genera and species. Anana comosus, Ananas ananas or Bromelia comosa [pineapple], Ca-ricaceae, such as the genus Carica, such as the genus and species of Carica papaya [papaya], Cannabaceae, such as the genus Cannabis, such as the genus and species of Canabbis sativa [flax], Convolvulaceae, such as the genera Ipomea, Convolvulus, for example, the genera and species Ipomoea batatus, Ipomoea pandurata, Convolvulus potatoes, Convolvulus tiliaceus, Ipomoea fastigiata, Ipomoea tiliacea, Ipomoea triland or Convolvulus pu sweet potato, potato], Chenopodiaceae, such as the genus Beta, as well as the genera and species Beta vulgaris, Beta vulgaris. very high var Beta vulgaris var. vulgaris, Marine Beta, Beta vulgaris var. perennis, Beta vulgaris var. conditiva or Beta vulgaris var. esculenta [sweet beet], Crypthe-codiniaceae, such as genus Crypthecodinium, for example, genus and species Cryptecodinium cohnii, Cucurbitaceae, such as genus Cucurbita, for example, genera and species Cucurbita maxima, Cucurbita mixta, Cucurbita pepo or Cucurbita moschata [pumpkin], Cymbellaceae, such as the genera Amphora, Cymbella, Okedenia, Phaeodactylum, Reimeria, for example, the genus and species Phaeodactylum tricornutum, Ditrichaceae, such as the genera Ditrichaceae, Cerumis, Chrysanthemum, Ceromiis, Distichium, Eccremidium, Lophidion, Philibertiella, Pleuridium, Sa-elania, Trichodon, Skottsbergia, for example the genera and species Ceratodon antarcticus, Ceratodon colophyia, Ceratodon purpurascens, Ceratodon purpureus, Ceratodon purpureus, Ceratodon purpureus. Convolutus Ceratodon purpureus ssp. stenocarpus, Ceratodon purpureus var. Rotundifo-lius, Ceratodon ratodon, Ceratodon stenocarpus, Chrysoblastella chilensis, Ditrichum ambiguum, Ditrichum brevisetum, Ditrichum crispatissimum, Ditrichum falcifolium, Ditrichum flexicaule, Ditrichum flexumule, Ditrichum flexumule, Ditrichum ambumum Ditrichum pallidum, Ditrichum punctulatum, Ditrichum pusillum, Ditrichum pusillum var. Tortile, Ditrichum rhynchostegium, Ditrichum schimperi, Ditrichum tortile, Distichium capillaceum, Distichium ha-genii, Distichium inclinatum, Distichium macounii, Eccremidium floridanum, Eccremidium whiteleggei, Lophidion strictus subulatum, Saelania glaucescens, Trichodon borealis, Trichodon cylindricus or Trichodon cylindricus var. oblongus, Elaeagnaceae, such as the genus Elaeagnus, for example, the genus and species Olea euro-paea [olive], Ericaceae, such as the genus Kalmia, for example, the genus and species Kalmia latifolia, Kalmia angustifolia, Kalmia microphylla, Kalmia polypholia, Kalmia occidentalis, Cistus chamaerhodendros or lucid Kalmia [mountain laurel], Euglenaceae, such as the genus Ascoglena, Astasia, Colacium, Cyclidiopsis, Euglena, Euglenopsis, Hyalaphacus, Khawkinea, Lepocinclis, Phacus, Strombomonas, Trachel, e.g. genus and species Euglena gracilis; Euphorbiaceae, such as the genus Manihot, Jani-pha, Jatropha, Ricinus, for example, the genus and species Manihot utilissima, Janipha manihot, Jatropha manihot, Manihot dulcis, Manihot manihot, Manihot melanobasis, Manihot esculenta or Manihot esculenta Ricinus communis [castor oil plant], Fabaceae, such as the genus Pisum, Albizia, Cathormion, Feuillea, Inga, Pithecolobium, Acacia, Mimosa, Medica-jo, Glycine, Dolichos, Phaseolus, soybean, for example, the genus and Species Pisum sativum, Pisum arvense, Pisum humile [pea], Albizia berteriana, Albizia julibrissin, Albizia lebbeck, Acacia berteriana, Acacia littoralis, Albizia berteriana, Cathormion berteriana, Feuillea berteriana, Ingaellith pransobium peacobium, Transverse frogium berterianum, Pseudalbizzia berteriana, Acacia julibrissin, Acacia nemu, Albizia nemu, Feuilleea julibrissin, Mimosa julibrissin, Mimosa speciosa, Serican-rda julibrissin, Acacia lebbeck, A cacia macrophylla, Albizia lebbeck, Feuilleea lebbeck, Mimosa lebbeck, Mimosa speciosa, Medicago sativa, Medicago fal-cata, Medicago var. [alfalfa] Glycine max Soybean dolichos, Glycine gracilis, Glycine hispida, Phaseolus max, Soy max. , Funariace-ae, such as the genus Aphanorrhegma, Entosthodon, Funaria, Physcomitrel-la, Physcomitrium, for example, genus and species Aphanorrhegma saw-tum, Entosthodon attenuatus, Entosthodon bonplan-dii, Entosthodon califomicus, Entosthodon Entosthodon jame-sonii, Entosthodon leibergii, Entosthodon neoscoticus, Entosthodon rubrise-tus, Entosthodon spathulifolius, Entosthodon tucsoni, American Funaria, Bolariai Funaria, California Funaria, Funaria calvescens, Convolaria Funaria, Funaria fungriana, Hyria fungiiana , Funaria hygrometrica var. arctica, Funaria hygrometrica var. calvescens, Funaria hygrometrica var. convolute, Funaria hygrometrica var. muralis, Funaria hygrometrica var. utahensis, Funaria microstoma, Funaria microstoma var. obtusifolia, Funeral muhlenbergii, Funicular orcuttii, Funeral flat-convex, Funeral polaris, Funeral ravenelii, Funeral rubra, Funeral saw, Funaria sonorae, Funaria sublimbatus, Funeral tucsoni, Physcomitrella californica, Physcomitrella patens, Physcomitrella readerum, Physcomitrium australum , Physcomitrium collenchymatum, Physcomitrium coloradense, Physcomitrium cupuliferum, Physcomitrium drummondii, Physcomitrium eurystomum, Physcomitrium flexifolium, Physcomitrium hookeri, Physcomitrium hookeri var. serratum, Physcomitrium immersum, Physcomitrium kellermanii, Physcomitrium megalocarpum, Physcomitrium pyriform, Pyriform Physcomitrium var. serratum, Physcomitrium rufipes, Physcomitrium sandbergii, Physcomitrium subsphaericum, Physcomitrium washíngtoniense, Geraniaceae, such as the genera Pelargonium, Cocos, Oleum, for example, the genera and species Cocos nucifera, Pelargonium grossularioides or Oleum cocoamin [, coco], such as Cocoum gramineae, Coco Sac-charum genus, for example, the genus and species Saccharum officinarum, Juglan-daceae, such as the genera Juglans, Wallia, for example, genera and species Juglans regia, Juglans ailanthifolia, Juglans sieboldiana, Juglans cinerea, Juglans bixbyi, Juglans californica, Juglans hindsii, Juglans intermedia, Juglans jamaicensis, Juglans major, Juglans microcarpa, Juglans nigra or Wallia nigra [walnut], Lauraceae, such as the genera Persea, Laurus, for example, the genus and species Laurus nobilis. ], Persea americana, Persea gratiosa or Persea persea [avocado], Leguminosae, such as the genus Arachis, for example, the genus and species Arachis hypogae a [peanut], Linaceae.tal as the genera Adenolinum, for example, the genera and species Linum usitatissimum, Linum humile, Linum austriacum, Linum bienne, Linum angustifolium, Linum flavum, Linum grandiflorum, Adenolinum grandiflorum, Linum lewisii, Narbonan linum, Perennial linum, Perennial linum var. lewisii, Linum pratense or Linum trigy-num [linseed], Lythrarieae, such as the genus Punica, for example, the genus and species Punica granatum [pomegranate], such as the genus Gossypi-um, for example, genera and Gossypium hirsutum, Gossypium arboreum, Gossypium barbadense, Gossypium herbaceum or Gossypium thurberi [cotton], Marchantiaceae, such as the genus Marchantia, for example, the genera and species Marchantia berteroana, Marchantia foliacea, Marchantia macropora, Musaceae, such as , for example the genera and species Musa nana, Musa acuminata, Musa paradisiac, Musa spp. [banana], Onagraceae, such as genera Camissonia, Oenothera, for example, genera and species Oenothera biennis or Camissonia bre-vipes [evening primrose], Palmae, such as genus Elaeis, for example, genus and species Elaeis guineensis [palm oil], Papaveraceae, such as, for example, the genus Papaver, for example, genera and species Papaver orientale, Papaver rhoeas, Papaver dubium [poppy], Pedatiaceae, such as the genus Sesamum, for example, genus and species Sesamum indicum [sesame], Piperaceae, such as the genus Piper, Artanthe, Pepero-mia, Steffensia, for example, the genera and species Piper aduncum, Piper amalago, Piper auritum, Piper betei, Piper cubeba, Piper longum, Piper nigrum, Piper retrofractum, Artanthe adunca, Artanthe elonga-ta, Peperomia elongata, Piper elongatum, Steffensia elongata [pepper], Po-aceae, such as the genera Hordeum, Secale, Avena, Sorghum, Andropo-gon, Holcus , Panicum, Oryza, Zea [corn], T riticum, for example, the genera and species Hordeum vulgare, Hordeum jubatum, Hordeum murinum, Hordeum secalinum, Hordeum distichon, Hordeum aegiceras, Hordeum hexasti-chon, Hordeum hexastichum, Hordeum sativum, Hordeum secalinum [cerevea] rye], Avena sativa, Avena fatua, Avena byzantina, Avena fatua var. sativa, Avena hybrida [oats], Sorghum bicolor, Sorghum halepense, Sorghum saccharatum, Sorghum vulgare, Andropogon drummondii, Bicolor Holcus, Sorghum Holcus, Sorghum ae-thiopicum, Sorghum caundrorum, Sorghum docernum Sorghum drumghum, Sorghum cernuuma durra, Sorghum guineen, Sorghum lanceolatum, Sorghum nervosum, Sorghum saccharatum, Sorghum subglabrescens, Sorghum verticilliflorum, Sorghum vulgare, Holcus halepensis, Sorghum miliaceum, Panicum militaceum [Oize maize], Oryza sativa, Oryza rice Zorea [maize] Triticum aestivum, Triticum durum, Triticum turgidum, Triticum hybernum, Triticum macha, Triticum sativum or Triticum vulgare [wheat], Porphyridiaceae, such as the genera Chroo-thece, Flintiella, Petrovanella, Rhodium Vanilla, Porphyros, Rhodella , for example, the genus and species Porphyridium cruentum, Protea-ceae, such as the genus Macadamia, for example, the genus and species Maca-damia intergrifolia [macadam ia], Prasinophyceae, such as the genera Nep-hroselmis, Prasinococcus, Scherffelia, Tetraselmis, Mantoniella, Ostreococ-cus, e.g. -ca, Mantoniella squamata, Ostreococcus tauri, Rubiaceae, such as the genus Coffea, for example, the genera and species Coffea spp., Coffea arabica, Coffea canephora or Coffea liberica, such as the genus Verbascum, for example, genera and species Verbascum blattaria, Ver-bascum chaixii, Verbascum densiflorum, Verbascum lagurus, Verbascum longifolium, Verbascum lychnitis, Verbascum nigrum, Verbascum phlomoides, Verbascum phoenicum, Verbascum verbascum, Verbascum lympnum, Verbascum olificum -sicum, Nicotiana, Solanum, Lycopersicon, for example, the genera and species Capsicum annuum, Capsicum annuum var. glabriusculum, Capsicum frutescens [pepper], Capsicum annuum [paprika], Nicotiana tabacum, Nicotiana alata, Nicotiana attenuata, Nicotiana glauca, Nicotiana langsdorffii, Nicotiana obtusifolia, Nicotiana quadrivalvis, Nicotiana repanda, Nicotiana rusticus, Nicotiana rusticum [Nicotiana syrup] potato], Solanum me-longena [eggplant], Lycopersicon esculentum, Lycopersicon lycopersicum, Lycopersicon Pyriforme, Solanum integrifolium or Solanum lycopersicum [tomato], such as the genus Theobroma, for example, the genus and species Theobroma or cocoa [cocoa] Theaceae, such as the genus Camellia, for example, the genus and species of Camellia sinensis [tea].
Os microorganismos vantajosos são, por exemplo, fungos selecionados do grupo das famílias Chaetomiaceae, Choanephoraceae, Crypto-coccaceae, Cunninghameliaceae, Demetiaceae, Moniliaceae, Mortierellace-ae, Mucoraceae, Pythiaceae, Sacharomycetaceae, Saprolegniaceae, Schi-zosacharomycetaceae, Sodariaceae ou Tuberculariaceae.Advantageous microorganisms are, for example, fungi selected from the group of families Chaetomiaceae, Choanephoraceae, Crypto-coccaceae, Cunninghameliaceae, Demetiaceae, Moniliaceae, Mortierellace-ae, Mucoraceae, Pythiaceae, Sacharomycetaceae, Saprolegniaceae or Schpracegneae.
Os exemplos de microorganismos que podem ser mencionados são aqueles dos grupos: Choanephoraceae, tal como os gêneros Blakeslea, Choanephora, por exemplo, os gêneros e espécies Blakeslea trispora, Choanephora cucurbitarum, Choanephora infundibulifera var. cucurbitarum, Mor-tierellaceae, tal como o gênero Mortierella, por exemplo, os gêneros e espécies Mortierella isabellina, Mortierella polycephala, Mortierella ramanniana, Mortierella vinacea, Mortierella zonata, Pythiaceae, tal como os gêneros, Phytium, Phytophthora, por exemplo, os gêneros e espécies Pythium debar-yanum, Pythium intermedium, Pythium irregulare, Pythium megalacanthum, Pythium paroecandrum, Pythium sylvaticum, Pythium ultimum, Phytophthora cactorum, Phytophthora cinnamomi, Phytophthora citricola, Phytophthora citrophthora, Phytophthora cryptogea, Phytophthora drechsleri, Phytophthora erythroseptica, Phytophthora lateralis, Phytophthora megasperma, Phytophthora nicotianae, Phytophthora nicotianae var. parasitica, Phytophthora pal-mivora, Phytophthora parasitica, Phytophthora syringae, Saccharomycetace-ae, tal como os gêneros Hansenula, Pichia, Saccharomyces, Saccharomy-codes, Yarrowia, por exemplo, os gêneros e espécies Hansenula anômala, Hansenula californica, Hansenula canadensis, Hansenula capsulata, Hansenula ciferrii, Hansenula glucozyma, Hansenula henricii, Hansenula holstii, Hansenula minuta, Hansenula nonfermentans, Hansenula philodendri, Hansenula polymorpha, Hansenula saturnus, Hansenula subpelliculosa, Hansenula wickerhamii, Hansenula wingei, Pichia alcoholophila, Pichia angusta, Pichia anômala, Pichia bispora, Pichia burtonii, Pichia canadensis, Pichia capsulata, Pichia carsonii, Pichia cellobiosa, Pichia ciferrii, Pichia farinosa, Pichia fermentans, Pichia finlandica, Pichia glucozyma, Pichia guilliermondii, Pichia haplophila, Pichia henricii, Pichia holstii, Pichia jadinii, Pichia lindnerii, Pichia membranaefaciens, Pichia methanolica, Pichia minuta var. minuta, Pichia minuta var. nonfermentans, Pichia norvegensis, Pichia ohmeri, Pichia pastoris, Pichia philodendri, Pichia pini, Pichia polymorpha, Pichia quercuum, Pichia rhodanensis, Pichia sargentensis, Pichia stipitis, Pichia strasburgen-sis, Pichia subpelliculosa, Pichia toletana, Pichia trehalophila, Pichia vini, Pichia xylosa, Saccharomyces aceti, Saccharomyces bailii, Saccharomyces bayanus, Saccharomyces bisporus, Saccharomyces capensis, Saccharomyces carlsbergensis, Saccharomyces cerevisiae, Saccharomyces cerevisiae var. ellipsoideus, Saccharomyces chevalieri, Saccharomyces delbrueckii, Saccharomyces diastaticus, Saccharomyces drosophilarum, Saccharomyces elegans, Saccharomyces ellipsoideus, Saccharomyces fermentati, Saccharomyces florentinus, Saccharomyces fragilis, Saccharomyces heterogenicus, Saccharomyces hienipiensis, Saccharomyces inusitatus, Saccharomyces italicus, Saccharomyces kluyveri, Saccharomyces krusei, Saccharomyces lactis, Saccharomyces marxianus, Saccharomyces microellipsoides, Saccharomyces montanus, Saccharomyces norbensis, Saccharomyces oleaceus, Paradoxus, Saccharomyces, Saccharomyces pastorianus, Saccharomyces pretoriensis, Saccharomyces rosei, Saccharomyces rouxii, Saccharomyces uvarum, Saccharomycodes ludwigii, Yarrowia lipolytica, Schizosacharomyce-taceae tal como os gêneros Schizosaccharomyces, por exemplo, as espécies Schizosaccharomyces japonicus var. japonicus, Schizosaccharomyces japonicus var. versatilis, Schizosaccharomyces malidevorans, Schizosaccha-romyces octosporus, Schizosaccharomyces pombe var. malidevorans, Schi-zosaccharomyces pombe var. pombe, Thraustochytriaceae tal como os gêneros Althornia, Aplanochytrium, Japonochytrium, Schizochytrium, Thraustochytrium, por exemplo as espécies Schizochytrium aggregatum, Schizochytrium limacinum, Schizochytrium mangrove, Schizochytrium minutum, Schizochytrium octosporum, Thraustochytrium aggregatum, Thraustochytrium amoeboídeum, Thraustochytrium antacticum, Thraustochytrium arudimenta-le, Thraustochytrium aureum, Thraustochytrium benthicola, Thraustochytrium globosum, Thraustochytrium indicum, Thraustochytrium kerguelense, T-hraustochytrium kinnei, Thraustochytrium motivum, Thraustochytrium multi-rudimentale, Thraustochytrium pachydermum, Thraustochytrium proliferum, Thraustochytrium roseum, Thraustochytrium rossii, Thraustochytrium striatum ou Thraustochytrium visurgense.Examples of microorganisms that may be mentioned are those of the groups: Choanephoraceae, such as the genera Blakeslea, Choanephora, for example, genera and species Blakeslea trispora, Choanephora cucurbitarum, Choanephora infundibulifera var. cucurbitarum, Mor-tierellaceae, such as the genus Mortierella, for example, the genera and species Mortierella isabellina, Mortierella polycephala, Mortierella ramanniana, Mortierella vinacea, Mortierella zonata, Pythiaceae, such as the genera, Phytium, Phytophthora, for example, the genera and Pythium species debar-yanum, Pythium intermedium, Pythium irregulare, Pythium megalacanthum, Pythium paroecandrum, Pythium sylvaticum, Pythium ultimum, Phytophthora cactorum, Phytophthora cinnamomi, Phytophthora citricola, Phytophthora citrophthora, Phytophthora cryptogea, Phytophthora drechsleri, erythroseptica Phytophthora Phytophthora lateralis, Phytophthora megasperma, Phytophthora nicotianae, Phytophthora nicotianae var. parasitic, Phytophthora pal-mivora, Phytophthora parasitica, Phytophthora syringae, Saccharomycetace-ae, such as the genera Hansenula, Pichia, Saccharomyces, Saccharomy-codes, Yarrowia, for example, the genera and species Hansenula anomalous, Hansenula canadornensis, Hansenula canadornensis, Hansenula canadornensis, capsulata, Hansenula ciferrii, Hansenula glucozyma, Hansenula henricii, Hansenula holstii, Hansenula minuta, Hansenula nonfermentans, Hansenula philodendri, Hansenula polymorpha, Hansenula saturnus, Hansenula subpelliculosa, Hansenula wickerhamii, Pichia angora wingei, Pichia angora, Pichia angora Pichia burtonii, Pichia canadensis, Pichia capsulata, Pichia carsonii, Pichia cellobiosa, Pichia ciferrii, Pichia farinosa, Pichia finans, Pichia glucozyma, Pichia guilliermondii, Pichia haplophila, Pichia henricii membrane , Pichia methanolica, Pichia minuta var. Minute, Pichia Minute var. nonfermentans, Pichia norvegensis, Pichia ohmeri, Pichia pastoris, Pichia philodendri, Pichia pini, Pichia polymorpha, Pichia quercuum, Pichia rhodanensis, Pichia storgitis, Pichia strasburgen-sis, Pichia subpellich Pichia trichia subpellia xylosa, Saccharomyces aceti, Saccharomyces bailii, Saccharomyces bayanus, Saccharomyces bisporus, Saccharomyces capensis, Saccharomyces carlsbergensis, Saccharomyces cerevisiae, Saccharomyces cerevisiae var. ellipsoideus, Saccharomyces chevalieri, Saccharomyces delbrueckii, Saccharomyces diastaticus, Saccharomyces drosophilarum, Saccharomyces elegans, Saccharomyces ellipsoideus, Saccharomyces fermentati, Saccharomyces Florentinus fragilis Saccharomyces, Saccharomyces heterogenicus Saccharomyces hienipiensis Saccharomyces inusitatus, Saccharomyces italicus, Saccharomyces kluyveri, Saccharomyces krusei, Saccharomyces lactis, Saccharomyces marxianus, Saccharomyces microellipsoides, Saccharomyces montanus, Saccharomyces norbensis, Saccharomyces oleaceus, Paradoxus, Saccharomyces, Saccharomyces pastorianus. For example, the species Schizosaccharomyces japonicus var. japonicus, Schizosaccharomyces japonicus var. versatilis, Schizosaccharomyces malidevorans, Schizosaccha-romyces octosporus, Schizosaccharomyces pombe var. malidevorans, Schi-zosaccharomyces pombe var. pombe, Thraustochytriaceae such as Althornia genera Aplanochytrium, Japonochytrium, Schizochytrium, Thraustochytrium, for example Schizochytrium species aggregatum, Schizochytrium limacinum, Schizochytrium, mangrove, Schizochytrium minutum, Schizochytrium octosporum, Thraustochytrium aggregatum, Thraustochytrium amoeboídeum, Thraustochytrium antacticum, Thraustochytrium arudimenta-le, Thraustochytrium aureum, Thraustochytrium benthicola, Thraustochytrium globosum, Thraustochytrium indicum, Thraustochytrium kerguelense, Thraustochytrium kinnei, Thraustochytrium motivum, Thraustochytrium multi-rudimentale, Thraustochytrium pachydermum, Thraustochytrium proliferum, Thraustochytrium roseum, Thraustochytrium rossii, Thraustochytrium striatum or Thraustochytrium visurgense.
Outros microorganismos vantajosos são, por exemplo, bactérias selecionadas do grupo das famílias Bacillaceae, Enterobacteriacae ou Rhi-zobiaceae.Other advantageous microorganisms are, for example, bacteria selected from the Bacillaceae, Enterobacteriacae or Rhi-zobiaceae families.
Os exemplos que podem ser mencionados são os seguintes microorganismos selecionados do grupo que consiste em: Bacillaceae, tal como o gênero de Bacillus, por exemplo, os gêneros e espécies de Bacillus acidocaldarius, Bacillus acidoterrestris, Bacillus alcalophilus, Bacillus amylo-liquefaciens, Bacillus amylolyticus, Bacillus brevis, Bacillus cereus, Bacillus circulans, Bacillus coagulans, Bacillus sphaericus subsp, fusiformis, Bacillus galactophilus, Bacillus globisporus, Bacillus globisporus subsp. marinus, Ba- cillus halophilus, Bacillus lentimorbus, Bacillus lentus, Bacillus licheniformis, Bacillus megaterium, Bacillus polymyxa, Bacillus psychrosaccharolyticus, Bacillus pumilus, Bacillus sphaericus, Bacillus subtilis. subsp. spizizenii, Bacillus subsp subtilis. subtilis ou Bacillus thuringiensis; Enterobacteriacae tal como os gêneros Citrobacter, Edwardsiella, Enterobacter, Erwinia, Escheri-chia, Klebsiella, Salmonela ou Serratia, por exemplo, os gêneros e espécies Citrobacter amalonaticus, Citrobacter diversus, Citrobacter freundii, Citrobacter genomospecies, Citrobacter gillenii, Citrobacter intermedium, Citrobacter koseri, Citrobacter murliniae, Citrobacter sp., Edwardsiella hoshinae, Edwardsiella ictaluri, Edwardsiella tarda, Erwinia alni, Erwinia amylovora, Erwinia ananatis, Erwinia aphidicola, Erwinia billingiae, Erwinia cacticida, Erwinia cancerogena, Erwinia carnegieana, Erwinia carotovora subsp. atroseptica, Erwinia carotovora subsp. betavasculorum, Erwinia carotovora subsp. odori-fera, Erwinia carotovora subsp. wasabiae, Erwinia chrysanthemi, Erwinia cy-pripedii, Erwinia dissolvens, Erwinia herbicola, Erwinia mallotivora, Erwinia milletiae, Erwinia nighfluens, Erwinia nimipressuralis, Erwinia persicina, Erwinia psidii, Erwinia pyrifoliae, Erwinia quercina, Erwinia rhapontici, Erwinia rubrifaciens, Erwinia salicis, Erwinia stewartii, Erwinia tracheiphila, Erwinia uredovora, Escherichia adecarboxylata, Escherichia anindolica, Escherichia aurescens, Escherichia blattae, Escherichia coli, Escherichia coli var. com-munior, Escherichia coli-mutabile, Escherichia fergusonii, Escherichia her-mannii, Escherichia sp., Escherichia Vulneris, Klebsiella aerogenes, Klebsiella edwardsii subsp. atlantae, Klebsiella ornithinolytica, Klebsiella oxytoca, Klebsiella planticola, Klebsiella pneumoniae, Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae, Klebsiella sp., Klebsiella terrigena, Klebsiella trevisanii, Salmonela abony, Salmonela arizonae, Salmonela bongori, Salmonela cholerae-suis subsp. arizonae, Salmonela choleraesuis subsp. bongori, Salmonela choleraesuis subsp. cholereasuis, Salmonela choleraesuis subsp. diarizona-e, Salmonela choleraesuis subsp. houtenae, Salmonela choleraesuis subsp. indica, Salmonela choleraesuis subsp. salamae, Salmonela daressalaam, Salmonela enterica subsp. houtenae, Salmonela enterica subsp. salamae, Salmonela enteritidis, Salmonela gallinarum, Salmonela heidelberg, Salmo- nela panama, Salmonela senftenberg, Salmonela typhimurium, Serratia en-tomophila, Serratia ficaria, Serratia fonticola, Serratia grimesii, Serratia lique-faciens, Serratia marcescens, Serratia marcescens subsp. marcescens, Serratia marinorubra, Serratia odorifera, Serratia plymouthensis, Serratia piymu-thica, Serratia proteamaculans, Serratia proteamaculans subsp,. quinovora, Serratia quinivorans ou Serratia rubidaea; Rhizobiaceae, tal como os gêneros Agrobacterium, Carbophilus, Cheiatobacter, Ensifer, Rhizobium, Sinorhi-zobium, por exemplo, os gêneros e espécies Agrobacterium atlanticum, Agrobacterium ferrugineum, Agrobacterium gelatinovorum, Agrobacterium lar-rymoorei, Agrobacterium meteori, Agrobacterium radiobacter, Agrobacterium rhizogenes, Agrobacterium rubi, Agrobacterium stellulatum, Agrobacterium tumefaciens, Agrobacterium vitis, Carbophilus carboxidus, Cheiatobacter heintzii, Ensifer adhaerens, Ensifer arboris, Ensifer fredii, Ensifer kostiensis, Ensifer kummerowiae, Ensifer medicae, Ensifer meliloti, Ensifer saheli, Ensifer terangae, Ensifer xinjiangensis, Rhizobium cice, Rhizobium etli, Rhizobium fredii, Rhizobium galegae, Rhizobium gallicum, Rhizobium giardinii, Rhizobium hainanense, Rhizobium huakuif, Rhizobium huautlense, Rhizobium indigoferae, Rhizobium japonicum, Rhizobium leguminosarum, Rhizobium loessense, Rhizobium loti, Rhizobium lupini, Rhizobium mediterraneum, Rhizobium meliloti, Rhizobium mongolense, Rhizobium phaseoli, Rhizobium radiobacter, Rhizobium rhizogenes, Rhizobium rubi, Rhizobium sullae, Rhizobium tianshanense, Rhizobium trifolii, Rhizobium tropici, Rhizobium undicola, Rhizobium vitis, Sinorhizobium adhaerens, Sinorhizobium arboris, Sinorhizo-bium fredii, Sinorhizobium kostiense, Sinorhizobium kummerowiae, Sinorhizobium medicae, Sinorhizobium meliloti, Sinorhizobium morelense, Sinorhizobium saheli ou Sinorhizobium xinjiangense.Examples that may be mentioned are the following microorganisms selected from the group consisting of: Bacillaceae, such as Bacillus genus, for example, Bacillus acidocaldarius genera and species, Bacillus acidoterrestris, Bacillus alcalophilus, Bacillus amylo-liquefaciens, Bacillus amylolyticus , Bacillus brevis, Bacillus cereus, Bacillus circulans, Bacillus coagulans, Bacillus sphaericus subsp, fusiformis, Bacillus galactophilus, Bacillus globisporus, Bacillus globisporus subsp. marinus, Bacillus halophilus, Bacillus lentimorbus, Bacillus lentus, Bacillus licheniformis, Bacillus megaterium, Bacillus polymyxa, Bacillus psychrosaccharolyticus, Bacillus pumilus, Bacillus sphaericus, Bacillus subtilis. subsp. spizizenii, Bacillus subsp subtilis. subtilis or Bacillus thuringiensis; Enterobacteriacae such as the genera Citrobacter, Edwardsiella, Enterobacter, Erwinia, Escherichia, Klebsiella, Salmonella or Serratia, for example, the genera and species Citrobacter amalonaticus, Citrobacter freundii, Citrobacter genomospecies, Citrobacter gillenium, Citrobacter intermediate, Citrobacter gillenii, Citrobacter , Citrobacter murliniae, Citrobacter sp., Edwardsiella hoshinae, Edwardsiella ictaluri, Edwardsiella tarda, Erwinia alni, Erwinia amylovora, Erwinia ananatis, Erwinia billingiae, Erwinia cacticida, Erwinia cancerogena Erainia carninia, Erwinia carnogena, Erainia carninia atroseptica, Erwinia carotovora subsp. betavasculorum, Erwinia carotovora subsp. odori-fera, Erwinia carotovora subsp. wasabiae, Erwinia chrysanthemi, Erwinia cy-pripedii, Erwinia dissolvens, Erwinia herbicola, Erwinia mallotivora, Erwinia milletiae, Erwinia nighfluens, Erwinia persicina, Erwinia psidii, Erwinia pyrifoliae, Erwinia psifii, Erwinia pyrifoliae stewartii, Erwinia tracheiphila, Erwinia uredovora, Escherichia adecarboxylata, Escherichia anindolica, Escherichia aurescens, Escherichia blattae, Escherichia coli, Escherichia coli var. such as Escherichia coli-mutabile, Escherichia fergusonii, Escherichia her-mannii, Escherichia sp., Escherichia vulneris, Klebsiella aerogenes, Klebsiella edwardsii subsp. atlantae, Klebsiella ornithinolytica, Klebsiella oxytoca, Klebsiella planticola, Klebsiella pneumoniae, Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae, Klebsiella sp., Klebsiella terrigena, Klebsiella trevisanii, Salmonella abony, Salmonella arizonae, Salmonella bongori, Salmonella cholerae-suis subsp. arizonae, Salmonella choleraesuis subsp. bongori, Salmonella choleraesuis subsp. cholereasuis, Salmonella choleraesuis subsp. diarizone-e, Salmonella choleraesuis subsp. houtenae, Salmonella choleraesuis subsp. indica, Salmonella choleraesuis subsp. salamae, Salmonella daressalaam, Salmonella enterica subsp. houtenae, Salmonella enterica subsp. salamae, Salmonella enteritidis, Salmonella gallinarum, Salmonella heidelberg, Salmonella panama, Salmonella senftenberg, Salmonella typhimurium, Serratia en-tomophila, Serratia ficaria, Serratia grimesii, Serratia lique-faciens, Serratia marcescens subs, Serratia marcescens subs. marcescens, Serratia marinorubra, Serratia odorifera, Serratia plymouthensis, Serratia piymu-thica, Serratia proteamaculans, Serratia proteamaculans subsp. quinovora, Serratia quinivorans or Serratia rubidaea; Rhizobiaceae, such as the genera Agrobacterium, Carbophilus, Cheiatobacter, Ensifer, Rhizobium, Sinorhi-zobium, for example, the genera and species Agrobacterium atlanticum, Agrobacterium ferrugineum, Agrobacterium gelatinovorum, Agrobacterium lar-rymoorei, Agrobacterium meteorob, Agrobacterium meteorobium, Agrobacterium rubi, Agrobacterium stellulatum, Agrobacterium tumefaciens, Agrobacterium vitis, Carbophilus carboxidus, Cheiatobacter heintzii, Ensifer adhaerens, Ensifer fredii, Ensifer kostiensis, Ensifer kummerowiae, Ensifer medi, Ensifer meliiceum , Rhizobium etli, Rhizobium fredii, Rhizobium galegae, Rhizobium gallicum, Rhizobium giardinii, Rhizobium hainanense, Rhizobium huakuif, Rhizobium indigoferae, Rhizobium indigoferae, Rhizobium japonicum, Rhizobium legumizobium Rhizobium rhizobium iloti, Rhizobium mongolense, Rhizobium phaseoli, Rhizobium radiobacter, Rhizobium rhizogenes, Rhizobium ruby, Rhizobium sullae, Rhizobium tianshanense, Rhizobium tropici, Rhizobium undicola, Rhizobium vitis, Sinerizium biori, Sinizium rhizobis kummerowiae, Sinorhizobium medicae, Sinorhizobium meliloti, Sinorhizobium morelense, Sinorhizobium saheli or Sinorhizobium xinjiangense.
Outros exemplos de microorganismos vantajosos para o processo de acordo com a invenção são protistas ou diatomáceas selecionadas do grupo das famílias Dinophyceae, Turaniellidae ou Oxytrichidae, tal como os gêneros e espécies: Crypthecodinium cohnii, Phaeodactylum tricornutum, Stylonychia mytilus, Stylonychia pustulata, Stylonychia putrina, Stylonychia notophora, Stylonychia sp., Colpidium campylum ou Colpidium sp.Other examples of microorganisms advantageous to the process according to the invention are protists or diatoms selected from the Dinophyceae, Turaniellidae or Oxytrichidae family, such as genera and species: Crypthecodinium cohnii, Phaeodactylum tricornutum, Stylonychia mytilus, Stylonychia pchiarata, Stylonychia pustulata, Stylonychia notophora, Stylonychia sp., Colpidium campylum or Colpidium sp.
Aqueles que são vantajosamente aplicados no processo de acordo com a invenção são organismos transgênicos, tal como fungos, tal como mortierella ou thraustrochytrium, leveduras tal como Saccharomyces ou Schizosaccharomyces, musgos tal como Physcomitrella ou Ceratodon, animais não humanos tal como Caenorhabditis, algas tal como Nephrosel-mis, Pseudoscourfielda, Prasinococcus, Scherffelia, Tetraselmis, Mantoniel-la, Ostreococcus, Crypthecodinium ou Phaeodactylum ou plantas tal como plantas dicotiledôneas ou monocotiledôneas. Os organismos que são especialmente vantajosamente usados no processo de acordo com a invenção são organismos que pertencem aos organismos produtores de óleo, quer dizer que são usados para a produção de óleo, tal como fungos, tal como Mortierella ou Thraustochytrium, algas tal como Nephroselmis, Pseudoscourfielda, Prasinococcus, Scherffelia, Tetraselmis, Mantoniella, Ostreococcus, Crypthecodinium, Phaeodactylum, ou plantas, em particular plantas, preferivelmente plantas de semente de óleo ou de colheita de óleo que compreendem quantidades grandes de compostos de lipídio, tal como amendoim, óleo de semente de colza, óleo de colza, girassol, açafroa (Carthamus tinctoria), papoula, mostarda, linho, planta de óleo de rícino, azeitona, gergelim, Ca-lêndula, Punica, prímula de noite, verbascum, cardo, rosas selvagens, avelã, amêndoa, macadâmia, abacate, baía, abóbora, linhaça, soja, pistaches, bor-ragem, árvores (óleo de palma, coco ou noz) ou colheitas cultiváveis tal como milho, trigo, centeio, aveias, triticale, arroz, cevada, algodão, mandioca, pimenta, plantas Tagetes, Solanaceae, tal como batata, tabaco, berinjela e tomate, espécies de Vicia, ervilha, alfafa ou plantas fechadas (café, cacau, chá), espécies de Salix, e gramas perenes e colheitas de forragem. As plantas preferidas de acordo com a invenção são plantas de colheita de óleo tal orno amendoim, óleo de semente de colza, óleo de colza, girassol, açafroa, papoula, mostarda, linho, planta de óleo de rícicno, azeitona, Calêndula, Punica, prímula de noite, abóbora, linhaça, soja, borragem, árvores (óleo de palma, coco). Especialmente preferido para o processo são plantas que têm o teor alto de ácidos graxos C18:2-, tal como girassol, açafroa, tabaco, verbascum, gergelim, algodão, abóbora, papoula, prímula de noite, noz, linhaça, linho ou cardo. Muito especialmente preferidas plantas são plantas tal como açafroa, girassol, papoula, prímula de noite, noz, linhaça ou linho.Those which are advantageously applied in the process according to the invention are transgenic organisms such as fungi such as mortierella or thraustrochytrium, yeasts such as Saccharomyces or Schizosaccharomyces, mosses such as Physcomitrella or Ceratodon, non-human animals such as Caenorhabditis, algae such as Nephrosel-mis, Pseudoscourfielda, Prasinococcus, Scherffelia, Tetraselmis, Mantoniel-la, Ostreococcus, Crypthecodinium or Phaeodactylum or plants such as dicotyledonous or monocotyledonous plants. Organisms which are especially advantageously used in the process according to the invention are organisms which belong to oil producing organisms, that is to say they are used for oil production, such as fungi such as Mortierella or Thraustochytrium, algae such as Nephroselmis, Pseudoscourfielda, Prasinococcus, Scherffelia, Tetraselmis, Mantoniella, Ostreococcus, Crypthecodinium, Phaeodactylum, or plants, in particular plants, preferably oil seed or oil crop plants comprising large amounts of lipid compounds, such as peanut, seed oil rapeseed, rapeseed oil, sunflower, safflower (Carthamus tinctoria), poppy, mustard, flax, castor oil plant, olive, sesame, Ca-calendula, Punica, evening primrose, verbascum, thistle, wild roses, hazelnut, almond, macadamia nuts, avocado, bay, pumpkin, flaxseed, soybeans, pistachios, blot, trees (palm oil, coconut or walnut) or cultivable crops is such as corn, wheat, rye, oats, triticale, rice, barley, cotton, cassava, pepper, Tagetes, Solanaceae plants, such as potato, tobacco, eggplant and tomato, Vicia species, peas, alfalfa or closed plants (coffee , cocoa, tea), Salix species, and perennial grams and forage crops. Preferred plants according to the invention are oil harvesting plants such as peanut, rapeseed oil, rapeseed oil, sunflower, safflower, poppy, mustard, flax, castor oil plant, olive, calendula, punica, Evening primrose, pumpkin, flaxseed, soybean, borage, trees (palm oil, coconut). Especially preferred for the process are plants that have the high content of C18: 2- fatty acids, such as sunflower, safflower, tobacco, verbascum, sesame, cotton, pumpkin, poppy, evening primrose, walnut, flaxseed, flax or thistle. Most especially preferred plants are plants such as safflower, sunflower, poppy, evening primrose, walnut, flaxseed or flax.
Também deve ser vantajoso para o método acima descrito de acordo com a invenção adicionalmente introduzir, no organismo, outros ácidos nucléicos que codificam as enzimas do metabolismo de ácido graxo ou lipídio, além dos ácidos nucléicos dos primeiro a quarto aspectos da invenção.It should also be advantageous for the above-described method according to the invention to further introduce into the body other nucleic acids encoding the enzymes of fatty acid or lipid metabolism in addition to the nucleic acids of the first to fourth aspects of the invention.
Tais ácidos nucléico são vantajosamente derivados de plantas tal como algas, por exemplo, algas da família do Prasinophyceae tal como os gêneros Heteromastix, Mammella, Mantoniella, Micromonas, Nephrosel-mis, Ostreococcus, Prasinocladus, Prasinococcus, Pseudoscourfielda, Pyc-nococcus, Pyramimonas, Scherffelia ou Tetraselmis, tal como os gêneros e espécies Heteromastix longifillis, Mamiella gilva, Mantoniella squamata, Micromonas pusilla, Nephroselmis olivacea, Nephroselmis pyriformis, Nephro-selmis rotunda, Ostreococcus tauri, Ostreococcus sp,. Prasinocladus Ascus, Prasinocladus lubricus, Pycnococcus provasolii, Pyramimonas amylifera, Pyramimonas disomata, Pyramimonas obovata, Pyramimonas orientalis, P-yramimonas parkeae, Pyramimonas spinifera, Pyramimonas sp., Tetraselmis apiculata, Tetraselmis carteriaformis, Tetraselmis chui, Tetraselmis convolu-tae, Tetraselmis desikacharyi, Tetraselmis gracilis, Tetraselmis hazeni, Tetraselmis impellucida, Tetraselmis inconspicua, Tetraselmis levis, Tetraselmis maculata, Tetraselmis marina, Tetraselmis striata, Tetraselmis subcordi-formis, Tetraselmis suecica, Tetraselmis tetrabrachia, Tetraselmis tetrathele, Tetraselmis verrucosa, Tetraselmis verrucosa fo. rubens ou Tetraselmis sp. ou de algas da família Euglenaceae tal como o gênero Ascoglena, Astasia, Colacium, Cyclidiopsis, Euglena, Euglenopsis, Hyalophacus, Khawkinea, Lepocinclis, Phacus, Strombomonas ou Trachelomonas, tal como o gênero e espécie Euglena acus, Euglena geniculate, Euglena gracilis, Euglena mixoc-ylindracea, Euglena rostrifera, Euglena viridis, Colacium stentorium, Trachelomonas cylindrica ou Trachelomonas volvocina. São derivados os ácidos nucléicos usados vantajosamente de algas dos gêneros Euglena, Mantoniella ou Ostreococcus.Such nucleic acids are advantageously derived from plants such as algae, for example, algae of the Prasinophyceae family such as the genera Heteromastix, Mammella, Mantoniella, Micromonas, Nephrosel-mis, Ostreococcus, Prasinococcus, Pasudoscourfielda, Pycimimonas, Pycimimonas Scherffelia or Tetraselmis, such as the genera and species Heteromastix longifillis, Mamiella gilva, Mantoniella squamata, Micromonas pusilla, Nephroselmis pyriformis, Nephroselm rotunda, Ostreococcus tauri, Ostreococcus sp. Prasinocladus Ascus, Prasinocladus lubricus, Pycnococcus evidolii, Pyramimonas amylifera, Pyramimonas disomata, Pyramimonas obovata, Pyramimonas orientalis, Pyramimonas spinifera, Pyramimonas sp. gracilis tetraselmis, tetraselmis hazeni, tetraselmis impellucida, tetraselmis inconspicua, tetraselmis levis, tetraselmis maculata, tetraselmis marina, tetraselmis striata, tetraselmis subcordi-formis, tetraselmis suecica, tetraselmis tetrabrachia, tetraselmis tetrathele, warty tetraselmis, tetraselmis warty fo. rubens or Tetraselmis sp. or algae of the Euglenaceae family such as the genus Ascoglena, Astasia, Colacium, Cyclidiopsis, Euglena, Euglenopsis, Hyalophacus, Khawkinea, Lepocinclis, Phacus, Strombomonas or Trachelomonas, such as the genus and species Euglena accuse, Euglena geniculate, Euglena gril mixoc-ylindracea, Euglena rostrifera, Euglena viridis, Colacium stentorium, Trachelomonas cylindrica or Trachelomonas volvocina. Advantageously used nucleic acids are derived from algae of the genera Euglena, Mantoniella or Ostreococcus.
Outras plantas vantajosas são algas tal como Isochrysis ou Crypthecodinium, algas/diatomáceas, tal como Thalassiosira ou Phaeodact-ylum, musgos tal como Physcomitrella ou Ceratodon, ou plantas mais altas tal como Primulaceae, tal como Aleuritia, Calendula stellata, Osteospermum spinescens ou Osteospermum hyoseroides, microorganismos tal como fungos, tal como Aspergillus, Thraustochytrium, Phytophthora, Entomophthora, Mucor ou Mortierella, bactérias tal como Shewanella, leveduras ou animais tal como nematódeos como Caenorhabditis, insetos, rãs, abalone, ou peixe. As seqüências de ácido nucléico isoladas de acordo com a invenção são vantajosamente derivadas de um animal da ordem dos vertebrados. Preferivelmente, as seqüências de ácido nucléico são derivadas das classes do Vertebrata; Euteleostomi, Actinopterygii; Neopterygii; Teleostei; Euteleostei, Protacanthopterygii, Salmoniformes; Salmonidae ou Oncorhynchus ou Vertebrata, Amphibia, Anura, Pipidae, Xenopus ou Evertebrata tal como Proto-chordata, Tunicata, Holothuroidea, Cionidae tal como Amaroucium constella-tum, Botryllus schlosseri, Ciona intestinalis, Molgula citrina, Molgula manhat-tensis, Perophora viridis ou Styela partita. Os ácidos nucléicos são especialmente vantajosamente derivados de fungos, animais, ou de plantas tal como algas ou musgos, preferivelmente da ordem do Salmoniformes, tal como a família do Salmonidae, tal como o gênero Salmo, por exemplo, dos gêneros e espécies Oncorhynchus mykiss, Trutta trutta ou Salmo trutta fario, de algas, tal como os gêneros Mantoniella ou Ostreococcus, ou das diatomá-ceas tal como os gêneros Thalassiosira ou Phaeodactylum ou de algas tal como Crypthecodinium.Other advantageous plants are algae such as Isochrysis or Crypthecodinium, algae / diatoms such as Thalassiosira or Phaeodact-ylum, mosses such as Physcomitrella or Ceratodon, or taller plants such as Primulaceae such as Aleuritia, Calendula stellata, Osteospermum hypersumensus or Osteospermum spinescensium , microorganisms such as fungi such as Aspergillus, Thraustochytrium, Phytophthora, Entomophthora, Mucor or Mortierella, bacteria such as Shewanella, yeast or animals such as nematodes such as Caenorhabditis, insects, frogs, abalone, or fish. The isolated nucleic acid sequences according to the invention are advantageously derived from a vertebrate animal. Preferably, the nucleic acid sequences are derived from the Vertebrata classes; Euteleostomi, Actinopterygii; Neopterygii; Teleostei; Euteleostei, Protacanthopterygii, Salmoniformes; Salmonidae or Oncorhynchus or Vertebrata, Amphibia, Anura, Pipidae, Xenopus or Evertebrata such as Proto-chordata, Tunicata, Holothuroidea, Cionidae such as Amaroucium constella-tum, Botryllus schlosseri, Ciona intestinalis, Molgula citrina viris, Molgula manhat or Perisula manhat Styela leaves. Nucleic acids are especially advantageously derived from fungi, animals, or plants such as algae or moss, preferably of the order Salmoniformes, such as the Salmonidae family, such as the genus Salmo, for example, the genera and species Oncorhynchus mykiss, Trutta trutta or Salmo trutta fario, from algae such as Mantoniella or Ostreococcus or diatoms such as Thalassiosira or Phaeodactylum or algae such as Crypthecodinium.
Em uma modalidade preferida, o processo compreende a etapa de obter uma célula ou um organismo intacto que compreende as seqüências de ácido nucléico usadas no processo, onde a célula e/ou organismo é transformado com uma seqüência de ácido nucléico de acordo com a invenção que codifica o A9-elongase, e/ou Δδ-dessaturase e/ou A5-dessaturase, um construto de gene ou um vetor como descrito acima, sozinho ou em combinação com outras seqüências de ácido nucléico que codificam as proteínas do metabolismo de ácido graxo ou lipídio. Em uma outra modalidade preferida, este processo também compreende a etapa de obter os óleos, lipídios ou ácidos graxos livres do organismo ou da cultura. A cultura pode, por exemplo, tomar a forma de uma cultura de fermentação, por exemplo, no caso do cultivo de microorganismos, tal como, por exemplo, Mortierella, Tha-lassiosira, Mantoniella, Ostreococcus, Saccharomyces ou Thraustochytrium, ou uma cultura de crescimento em estufa ou campo de uma planta. A célula ou o organismo produzido desse modo é vantajosamente uma célula de um organismo produtor de óleo, tal como uma colheita de óleo, tal como, por exemplo, amendoim, óleo de semente de colza, óleo de colza, linhaça, linho, amendoim, soja, açafroa, linho, girassóis ou borragem.In a preferred embodiment, the process comprises the step of obtaining an intact cell or organism comprising the nucleic acid sequences used in the process, wherein the cell and / or organism is transformed with a nucleic acid sequence according to the invention which encodes A9-elongase, and / or Δδ desaturase and / or A5-desaturase, a gene construct or a vector as described above, alone or in combination with other nucleic acid sequences encoding the proteins of fatty acid metabolism or lipid. In another preferred embodiment, this process also comprises the step of obtaining free oils, lipids or fatty acids from the organism or culture. The culture may, for example, take the form of a fermentation culture, for example in the case of the cultivation of microorganisms such as, for example, Mortierella, Tha-lassiosira, Mantoniella, Ostreococcus, Saccharomyces or Thraustochytrium, or greenhouse or field growth of a plant. The cell or organism thus produced is advantageously a cell of an oil producing organism, such as an oil crop, such as, for example, peanuts, rapeseed oil, rapeseed oil, flaxseed, flax, peanuts, soybeans, safflower, flax, sunflowers or borage.
No caso de células de planta, tecido de planta ou órgãos de planta, "crescer" é entendido como significando, por exemplo, o cultivo dentro ou sobre um meio de nutriente, ou da planta intacta sobre ou dentro de um substrato, por exemplo, em uma cultura hidropônica, composto de plantação ou em terra cultivável.In the case of plant cells, plant tissue or plant organs, "growing" is understood to mean, for example, cultivation in or on a nutrient medium, or intact plant on or within a substrate, for example, in a hydroponic crop, composed of plantation or in arable land.
Para os propósitos da invenção, "transgênico" ou "recombinante" significa com respeito a, por exemplo, uma seqüência de ácido nucléico, um cassete de expressão (=construto de gene) ou um vetor que compreende a seqüência de ácido nucléico ou um organismo transformado com as se-qüências de ácido nucléico, cassetes de expressão ou vetores de acordo com a invenção, todas essas construtos são realizadas através de métodos recombinantes nos quais ou a) a seqüência de ácido nucléico de acordo com a invenção, ou b) uma seqüência de controle genética que é operavelmente ligada com a seqüência de ácido nucléico de acordo com a invenção, por exemplo, um promotor, ou c) a) e b) não ficam situadas no seu ambiente genético natural ou foi modificada através de métodos recombinantes, isto sendo possível para a modificação tomar a forma de, por exemplo, uma substituição, adição, deleção, inversão ou inserção de um ou mais resíduos de nucleotídeo. O ambiente genético natural é compreendido como significando o loco genômico ou cromossômico natural no organismo original ou a presença em uma biblioteca genômica. No caso de uma biblioteca genômica, o ambiente genético natural da seqüência de ácido nucléico é preferivelmente retido, pelo menos em parte. O ambiente flanqueia a seqüência de ácido nucléico pelo menos em um lado e tem um comprimento de seqüência de pelo menos 50 pb, preferivelmente pelo menos 500 pb, especialmente preferivelmente pelo menos 1000 pb, preferivelmente pelo menos 5000 pb. Um cassete de expressão de ocorrência natural - por exemplo, a combinação de ocorrência natural do promotor natural das seqüências de ácido nucléico com o gene de Δ5-dessaturase correspondente - se torna um cassete de expressão transgêni-co quando este cassete de expressão é modificado por métodos não-naturais, sintéticos ("artificial") tal como, por exemplo, tratamento mutagêni-co. Os métodos adequados são descritos, por exemplo, na US 5.565.350 ou WO 00/15815.For purposes of the invention, "transgenic" or "recombinant" means with respect to, for example, a nucleic acid sequence, an expression cassette (= gene construct) or a vector comprising the nucleic acid sequence or an organism. transformed with nucleic acid sequences, expression cassettes or vectors according to the invention, all such constructs are performed by recombinant methods in which either a) the nucleic acid sequence according to the invention, or b) a genetic control sequence that is operably linked to the nucleic acid sequence according to the invention, for example, a promoter, or c) a) and b) are not located in their natural genetic environment or have been modified by recombinant methods, i.e. being possible for the modification to take the form of, for example, a substitution, addition, deletion, inversion or insertion of one or more nucleotide residues. The natural genetic environment is understood to mean the natural genomic or chromosomal locus in the original organism or presence in a genomic library. In the case of a genomic library, the natural genetic environment of the nucleic acid sequence is preferably retained, at least in part. The environment flanks the nucleic acid sequence at least on one side and has a sequence length of at least 50 bp, preferably at least 500 bp, especially preferably at least 1000 bp, preferably at least 5000 bp. A naturally occurring expression cassette - for example, the naturally occurring combination of the natural promoter of nucleic acid sequences with the corresponding Δ5 desaturase gene - becomes a transgenic expression cassette when this expression cassette is modified by unnatural, synthetic ("artificial") methods such as, for example, mutagenic treatment. Suitable methods are described, for example, in US 5,565,350 or WO 00/15815.
Um organismo transgênico ou plantas transgênicas para os propósitos da invenção é então compreendido como significando, como acima, que os ácidos nucléico usados no processo não estão no seu lugar natural no genoma de um organismo, sendo possível que os ácidos nucléicos sejam expressados homologamente ou heterologamente. Porém, como mencionado, transgênico também significa que, ao mesmo tempo em que os ácidos nucléicos de acordo com a invenção estão em sua posição natural no genoma de um organismo, a seqüência foi modificada com respeito à seqüência natural, e/ou que as seqüências reguladoras das seqüências naturais foram modificadas. Transgênico é preferivelmente entendido como significando a expressão dos ácidos nucléicos de acordo com a invenção em um lugar antinatural no genoma, isto é, homólogo ou, preferivelmente, a expressão hete-róloga dos ácidos nucléicos ocorre. Os organismos transgênicos preferidos são fungos tal como Mortierella ou Phytophtora, musgos tal como Physcomi-trella, algas tal como Mantoniella, Euglena, Crypthecodinium ou Ostreococ-cus, diatomáceas tal como Thalassiosira ou Phaeodactylum, ou plantas tal como as colheitas de óleo.A transgenic organism or transgenic plants for the purposes of the invention is then understood to mean, as above, that the nucleic acids used in the process are not in their natural place in the genome of an organism, and nucleic acids may be expressed homologously or heterologously. . However, as mentioned, transgenic also means that while the nucleic acids according to the invention are in their natural position in the genome of an organism, the sequence has been modified with respect to the natural sequence, and / or that the sequences regulators of natural sequences have been modified. Transgenic is preferably understood to mean expression of nucleic acids according to the invention at an unnatural place in the genome, that is, homologous or, preferably, heterologous expression of nucleic acids occurs. Preferred transgenic organisms are fungi such as Mortierella or Phytophtora, mosses such as Physcomitrella, algae such as Mantoniella, Euglena, Crypthecodinium or Ostreococ-cus, diatoms such as Thalassiosira or Phaeodactylum, or plants such as oil crops.
Os organismos ou organismos hospedeiros para os ácidos nu- cléico, o cassete de expressão ou o vetor usado no processo de acordo com a invenção são, em princípio, vantajosamente todos os organismos que são capazes de sintetizar ácidos graxos, especificamente ácidos graxos não saturados, e/ou que são adequados para a expressão de genes recombinan-tes. Os exemplos que podem ser mencionados são plantas tal como Arabi-dopsis, Asteraceae tal como Calendula ou plantas de colheita tal como soja, amendoim, planta de óleo de rícino, girassol, milho, algodão, linho, óleo de semente de colza, coco, óleo de palma, açafroa (Carthamus tinctorius) ou semente de cacau, microorganismos, tal como fungos, por exemplo, o gênero Mortierella, Thraustochytrium, Saprolegnia, Phytophtora ou Pythium, bactérias, tal como o gênero Escherichia ou Shewanella, leveduras, tal como o gênero Saccharomyces, cyanobacteria, ciliates, algas tal como Mantoniella, Euglena, Thalassiosira ou Ostreococcus, ou protozoários tal como dinofla-gellates, tal como Crypthecodinium. Os organismos preferidos são aqueles que são naturalmente capazes de sintetizar quantidades significativas de óleo, tal como fungos, tal como Mortierella alpina, Pythium insidiosum, Phytophtora infestans, ou plantas tal como soja, óleo de semente de colza, coco, óleo de palma, açafroa, linho, linho, planta de óleo de rícino, calêndula, amendoim, semente de cacau ou girassol, ou leveduras, tal como Saccharomyces cerevisiae, tal com soja, linho, óleo de semente de colza, açafroa, girassol, Calêndula, Mortierella ou Saccharomyces cerevisiae que são especialmente preferidos. Em princípio, os organismos hospedeiros são, além dos organismos transgênicos acima mencionados, também animais transgê-nicos, vantajosamente os animais não humanos, por exemplo, C. elegans, Ciona intestinalis ou Xenopus laevis.The host organisms or organisms for the nucleic acids, the expression cassette or the vector used in the process according to the invention are in principle advantageously all organisms which are capable of synthesizing fatty acids, specifically unsaturated fatty acids. and / or which are suitable for expression of recombinant genes. Examples that may be mentioned are plants such as Arabidopsis, Asteraceae such as Calendula or harvesting plants such as soybean, peanut, castor oil plant, sunflower, corn, cotton, flax, rapeseed oil, coconut, palm oil, safflower (Carthamus tinctorius) or cocoa seed, microorganisms such as fungi, for example the genus Mortierella, Thraustochytrium, Saprolegnia, Phytophtora or Pythium, bacteria such as the genus Escherichia or Shewanella, yeasts such as genus Saccharomyces, cyanobacteria, ciliates, algae such as Mantoniella, Euglena, Thalassiosira or Ostreococcus, or protozoa such as dinofla-gellates such as Crypthecodinium. Preferred organisms are those which are naturally capable of synthesizing significant amounts of oil such as fungi such as Mortierella alpina, Pythium insidiosum, Phytophtora infestans, or plants such as soybean, rapeseed oil, coconut, palm oil, safflower. , flax, flax, castor oil plant, calendula, peanut, cocoa or sunflower seed, or yeast, such as Saccharomyces cerevisiae, such as soybean, flax, rapeseed oil, safflower, sunflower, calendula, mortierella or saccharomyces cerevisiae which are especially preferred. In principle, the host organisms are, in addition to the above-mentioned transgenic organisms, also transgenic animals, advantageously non-human animals, for example C. elegans, Ciona intestinalis or Xenopus laevis.
Também utilizáveis são as células hospedeiras detalhadas em: Goeddel, Gene Expression Technology·. Methods in Enzymology 185, Academic Press, San Diego, CA (1990). A expressão cepas que pode ser usada, por exemplo, aquelas com uma atividade de protease mais baixa, é descrita em: Gottesman, Sr, Gene Expression Technology: Methods in Enzymology 185, Academic Press, San Diego, Califórnia (1990) 119-128.Also useful are host cells detailed in: Goeddel, Gene Expression Technology ·. Methods in Enzymology 185, Academic Press, San Diego, CA (1990). The expression strains that can be used, for example, those with lower protease activity, is described in: Gottesman, Sr, Gene Expression Technology: Methods in Enzymology 185, Academic Press, San Diego, California (1990) 119-128 .
Estes incluem células de planta e certos tecidos, órgãos e partes de plantas em todas suas formas fenotípicas tal como anteras, fibras, cabelos da raiz, talos, embriões, caule, cotiledôneas, pecíolos, material colhido, tecido de planta, tecido reprodutivo e culturas de célula que sejam derivados da planta transgênica atual e/ou possam ser usados para realizar a planta transgênica.These include plant cells and certain plant tissues, organs and parts in all their phenotypic forms such as anthers, fibers, root hair, stems, embryos, stem, cotyledons, petioles, harvested material, plant tissue, reproductive tissue and cultures. which are derived from the current transgenic plant and / or may be used to make the transgenic plant.
As plantas transgênicas que compreendem os ácidos graxos poliinsaturados sintetizados no processo de acordo com a invenção podem ser comercializadas vantajosamente e diretamente sem haver qualquer necessidade de que os óleos, lipídios ou ácidos graxos sintetizados sejam isolados. As plantas para o processo de acordo com a invenção são listadas como significando plantas intactas e todas as partes da planta, órgãos de planta ou partes de planta tal como folha, talo, sementes, raiz, tubérculos, anteras, fibras, cabelos da raiz, talos, embriões, caule, cotiledôneas, pecíolos, material colhido, tecido de planta, tecido reprodutivo e cultura de célula que são derivados da planta transgênica atual e/ou podem ser usados para realizar a planta transgênica. Neste contexto, a semente compreende todas as partes da semente tal como a casca da semente, células epidérmicas, células da semente, endosperma ou tecido embrionário. Porém, os compostos produzidos no processo de acordo com a invenção também podem ser isolados dos organismos, vantajosamente plantas, na forma de seus óleos, gorduras, lipídios e/ou ácidos graxos livres. Os ácidos graxos poliinsaturados produzidos por este processo podem ser obtidos colhendo-se os organismos, ou da colheita na qual eles crescem, ou do campo. Isto pode ser feito por pressão ou extração das partes da planta, preferivelmente as sementes de planta. Neste contexto, os óleos, gorduras, de lipídios e/ou ácidos graxos livres podem ser obtidos pelo que é conhecido como batimento a frio ou pressionamento a frio sem aplicar calor. Para permitir maior facilidade de rompimento das partes da planta, especificamente as sementes, elas são previamente fragmentadas, cozidas em vapor ou assadas. As sementes que foram pré-tratadas desta maneira podem ser subseqüentemente apertadas ou extraídas com solventes como hexano quente. O solvente é subseqüen- temente removido. No caso de microorganismos, os últimos são, após colheita, por exemplo, extraídos diretamente sem outras etapas de processamento ou ainda, após rompimento, extraídos por vários métodos com os quais o operário qualificado está familiarizado. Desta maneira, pode ser isolado mais que 96% dos compostos produzidos no processo. Depois disso, os produtos resultantes são processados mais adiante, isto é, refinados. Neste processo, substâncias como as mucilagens de planta e substâncias suspensas são primeiro removidas. O que é conhecido como desenlamea-mento pode ser realizado enzimaticamente ou, por exemplo, quimio-fisicamente por adição de ácido tal como ácido fosfórico. Depois disso, os ácidos graxos livres são removidos através de tratamento com uma base, por exemplo, solução de hidróxido de sódio. O produto resultante é lavado completamente com água para remover o álcali que permanece no produto e então é secado. Para remover o pigmento que permanece no produto, os produtos são sujeitados a branqueamento, por exemplo, usando a terra da carga ou carvão ativo. No final, o produto é desodorizado, por exemplo, usando vapor.Transgenic plants comprising the polyunsaturated fatty acids synthesized in the process according to the invention may be advantageously and directly marketed without any need for synthesized oils, lipids or fatty acids to be isolated. Plants for the process according to the invention are listed as meaning intact plants and all plant parts, plant organs or plant parts such as leaf, stalk, seeds, root, tubers, anthers, fibers, root hair, Stalks, embryos, stem, cotyledons, petioles, harvested material, plant tissue, reproductive tissue, and cell culture that are derived from the current transgenic plant and / or may be used to make the transgenic plant. In this context, the seed comprises all parts of the seed such as seed husk, epidermal cells, seed cells, endosperm or embryonic tissue. However, the compounds produced in the process according to the invention may also be isolated from organisms, advantageously plants, in the form of their oils, fats, lipids and / or free fatty acids. Polyunsaturated fatty acids produced by this process can be obtained by harvesting the organisms, or from the crop on which they grow, or from the field. This can be done by pressing or extracting plant parts, preferably plant seeds. In this context, oils, fats, lipids and / or free fatty acids may be obtained by what is known as cold beating or cold pressing without applying heat. In order to facilitate breakability of plant parts, specifically seeds, they are pre-broken, steamed or roasted. Seeds that have been pretreated in this manner can be subsequently squeezed or extracted with solvents such as hot hexane. The solvent is subsequently removed. In the case of microorganisms, the latter are, after harvesting, for example, extracted directly without further processing steps or, after disruption, extracted by various methods with which the skilled worker is familiar. In this way, more than 96% of the compounds produced in the process can be isolated. Thereafter, the resulting products are further processed, i.e. refined. In this process, substances such as plant mucilages and suspended substances are first removed. What is known as degreasing may be carried out enzymatically or, for example, chemically physically by addition of acid such as phosphoric acid. Thereafter, the free fatty acids are removed by treatment with a base, for example sodium hydroxide solution. The resulting product is washed thoroughly with water to remove the alkali remaining in the product and then dried. To remove the pigment that remains in the product, the products are subjected to bleaching, for example, using cargo earth or active charcoal. In the end, the product is deodorized, for example using steam.
Os ácidos graxos produzidos pelos processos da presente invenção podem ser isolados do organismo na forma de um óleo, um lipídio ou um ácido graxo livre. Por exemplo, os organismos adequados são aqueles mencionados acima. Os organismos preferidos são plantas transgênicas.Fatty acids produced by the processes of the present invention may be isolated from the body in the form of an oil, lipid or free fatty acid. For example, suitable organisms are those mentioned above. Preferred organisms are transgenic plants.
Uma modalidade da invenção é então óleos, lipídios ou ácidos graxos da fórmula I ou frações destes que foram produzidos pelo processo acima descrito, especialmente preferivelmente óleo, lipídio ou uma composição de ácido graxo que compreendem um composto de fórmula I e sendo derivado de plantas transgênicas.One embodiment of the invention is then oils, lipids or fatty acids of formula I or fractions thereof which were produced by the process described above, especially preferably oil, lipid or a fatty acid composition comprising a compound of formula I and being derived from transgenic plants. .
Uma outra modalidade de acordo com a invenção é o uso do óleo, lipídio, dos ácidos graxos e/ou da composição de ácido graxo em produtos alimentícios, comestíveis, cosméticos ou farmacêuticos. Os óleos, lipídios, ácidos graxos ou misturas de ácido graxo de acordo com a invenção podem ser usados da maneira com a qual o trabalhador versado está familiarizado para misturar com outros óleos, lipídios, ácidos graxos ou misturas de ácido graxo de origem animal, tal como, por exemplo, óleos de peixe. Também podem ser usados estes óleos, lipídios, ácidos graxos ou misturas de ácido graxo que sejam compostos de legume e componentes de animais para a preparação de produtos alimentícios, comestíveis, cosméticos ou farmacológicos. O termo "óleo", "lipídio" ou "gordura" é entendido como significando uma mistura de ácido graxo que compreende ácido(s) graxo não saturado, saturado, preferivelmente esterificado. O óleo, lipídio ou gordura é preferivelmente elevado em ácido(s) graxo poliinsaturado livre ou, vantajosamente, esterificado, em particular ácido linoléico, ácido γ-linolênico, ácido di-homo- γ-linolênico, ácido araquidônico, ácido α-linolênico, ácido estearidôni-co, ácido eicosatetraenóico, ácido eicosapentaenóico, ácido docosapentae-nóico ou ácido docosaexaenóico. A quantidade de ácidos graxos esterificados não saturados preferivelmente quantidades de aproximadamente 30%, um conteúdo de 50% é mais preferido, um conteúdo de 60%, 70%, 80% ou mais é ainda mais preferido. Para a análise, o conteúdo de ácido graxo pode, por exemplo, ser determinado por cromatografia de gás depois de converter os ácidos graxos nos ésteres de metila através de transesterificação. O óleo, lipídio ou gordura podem compreender vários outros ácidos graxo saturados ou não saturados, por exemplo ácido calendúlico, ácido palmítico, ácido palmitoléico, ácido esteárico, ácido oléico e outros. O conteúdo dos vários ácidos graxos no óleo ou gordura pode variar, em particular dependendo do organismo de partida. O ARA produzido no processo pode estar, como descrito acima, na forma de derivado de ácido graxo, por exemplo, esfingolipídeos, fosfogli-cerídeos, lipídios, glicolipídeos, fosfolipídeos, monoacilglicerol, diacilglicerol, triacilglicerol ou outros ésteres de ácido graxo. O ARA e outros ácidos graxos poliinsaturados que estão presentes podem ser liberados, por exemplo, por tratamento com álcali, por exemplo, KOH ou NaOH aquoso, ou hidrólise de ácido, vantajosamente na presença de um álcool tal como metanol ou etanol, ou por divagem enzimática, e isolado por, por exemplo, separação de fase e acidificação subseqüente por, por exemplo, H2SO4. Os ácidos graxos também podem ser liberados diretamente sem a etapa de processamento acima descrita.Another embodiment according to the invention is the use of oil, lipid, fatty acids and / or fatty acid composition in food, edible, cosmetic or pharmaceutical products. The oils, lipids, fatty acids or fatty acid mixtures according to the invention may be used in the manner in which the skilled worker is familiar with mixing with other animal origin oils, lipids, fatty acids or fatty acid mixtures such as such as fish oils. These oils, lipids, fatty acids or mixtures of fatty acids which are vegetable compounds and animal components may also be used for the preparation of food, edible, cosmetic or pharmacological products. The term "oil", "lipid" or "fat" is understood to mean a fatty acid mixture comprising unsaturated, saturated, preferably esterified fatty acid (s). The oil, lipid or fat is preferably high in free or advantageously esterified polyunsaturated fatty acid (s), in particular linoleic acid, γ-linolenic acid, dihomo-γ-linolenic acid, arachidonic acid, α-linolenic acid, stearidonic acid, eicosatetraenoic acid, eicosapentaenoic acid, docosapentaeenoic acid or docosaexaenoic acid. The amount of unsaturated esterified fatty acids is preferably amounts of approximately 30%, a content of 50% is more preferred, a content of 60%, 70%, 80% or more is even more preferred. For analysis, the fatty acid content may, for example, be determined by gas chromatography after converting the fatty acids into methyl esters by transesterification. The oil, lipid or fat may comprise various other saturated or unsaturated fatty acids, for example calendulic acid, palmitic acid, palmitoleic acid, stearic acid, oleic acid and others. The content of the various fatty acids in the oil or fat may vary, in particular depending on the starting organism. The ARA produced in the process may be, as described above, in the form of a fatty acid derivative, for example, sphingolipids, phosphoglycerides, lipids, glycolipids, phospholipids, monoacylglycerol, diacylglycerol, triacylglycerol or other fatty acid esters. ARA and other polyunsaturated fatty acids that are present may be released, for example, by treatment with alkali, for example aqueous KOH or NaOH, or acid hydrolysis, advantageously in the presence of an alcohol such as methanol or ethanol, or by divising. enzymatic, and isolated by, for example, phase separation and subsequent acidification by, for example, H2SO4. Fatty acids can also be released directly without the processing step described above.
Depois da sua introdução em um organismo, vantajosamente uma célula de planta ou planta, os ácidos nucléicos usados no processo, ou podem estar presentes em um plasmídeo separado ou, vantajosamente, integrado no genoma da célula hospedeira. No caso de integração no geno-ma, a integração pode ser aleatória ou então pode se efetuar através de re-combinação tal que o gene nativo seja substituído pela cópia introduzida, por meio do que a produção do composto desejado pela célula é modulada, ou pelo uso de um gene em trans, de forma que o gene seja operavelmente ligado com uma unidade de expressão funcional que compreende pelo menos uma seqüência que garante a expressão de um gene, e pelo menos uma seqüência que garante a poliadenilação de um gene funcionalmente transcrito. Os ácidos nucléicos são introduzidos vantajosamente nos organismos por cassetes de multiexpressão ou construtos para expressão multi-paralela, vantajosamente nas plantas para a expressão específica de semente multiparalela de genes.Upon introduction into an organism, advantageously a plant or plant cell, the nucleic acids used in the process may either be present in a separate plasmid or advantageously integrated into the host cell genome. In the case of integration into the genome, the integration may be random or may be effected by re-combining such that the native gene is replaced by the introduced copy, whereby the production of the desired compound by the cell is modulated, or by the use of a gene in trans, such that the gene is operably linked with a functional expression unit comprising at least one sequence that guarantees expression of a gene, and at least one sequence that ensures polyadenylation of a functionally transcribed gene. . Nucleic acids are advantageously introduced into organisms by multi-expression cassettes or constructs for multi-parallel expression, advantageously into plants for multiparallel seed specific expression of genes.
Se os microorganismos tal como leveduras, tal como Saccha-romyces ou Schizosaccharomyces, fungos tal como Mortierella, Aspergillus, Phytophtora, Entomophthora, Mucor ou Thraustochytrium, algas tal como Isochrysis, Mantoniella, Euglena, Ostreococcús, Phaeodactylum ou Crypthe-codinium forem usados como organismos no processo de acordo com a invenção, estes organismos serão vantajosamente crescidos em culturas de fermentação.If microorganisms such as yeast, such as Saccha-romyces or Schizosaccharomyces, fungi such as Mortierella, Aspergillus, Phytophtora, Entomophthora, Mucor or Thraustochytrium, algae such as Isochrysis, Mantoniella, Euglena, Ostreococche, Phainium-Cryptus or Phainiumodactyl organisms are used In the process according to the invention, these organisms will advantageously be grown in fermentation cultures.
Se os microorganismos forem usados como organismos no processo de acordo com a invenção, eles são crescidos ou cultivados da maneira com qual 0 trabalhador versado está familiarizado, dependendo do organismo hospedeiro. Como uma regra, os microorganismos são crescidos em um meio líquido que compreende uma fonte de carbono, normalmente na forma de açúcares, uma fonte de nitrogênio, normalmente na forma de fontes de nitrogênio orgânico tal como extrato de levedura ou sais tal como sul- fato de amônio, elementos traço, tal como sais de ferro, manganês e magnésio e, se apropriado, vitaminas, a temperaturas de entre 0°C e 100°C, preferivelmente entre 10°C e 60°C, ao mesmo tempo em que passando em oxigênio. O pH do meio líquido pode ou ser qualquer um mantido constante, quer dizer regulado durante o período de cultivo, ou não. As culturas podem ser cultivadas em bateladas, semibateladas ou continuamente. Os nutrientes podem ser fornecidos no começo da fermentação ou podem ser alimentados semicontinuamente ou continuamente. Os ácidos graxos poliinsaturados produzidos podem ser isolados dos organismos como descrito acima por processos conhecidas pelo trabalhador versado, por exemplo, através de extração, destilação, cristalização, precipitação apropriada com sal, e/ou cromatografia. Para este fim, os organismos podem ser rompidos vantajosamente anteriormente.If the microorganisms are used as organisms in the process according to the invention, they are grown or grown in the manner in which the skilled worker is familiar, depending on the host organism. As a rule, microorganisms are grown in a liquid medium comprising a carbon source, usually in the form of sugars, a nitrogen source, usually in the form of organic nitrogen sources such as yeast extract or salts such as sulfate. of ammonium, trace elements such as iron, manganese and magnesium salts and, if appropriate, vitamins, at temperatures of between 0 ° C and 100 ° C, preferably between 10 ° C and 60 ° C, while passing in oxygen. The pH of the liquid medium can either be kept constant, ie regulated during the cultivation period or not. Crops can be grown in batches, semi-split or continuously. Nutrients may be supplied at the beginning of fermentation or may be fed semicontinuously or continuously. The polyunsaturated fatty acids produced may be isolated from the organisms as described above by methods known to the skilled worker, for example by extraction, distillation, crystallization, appropriate salt precipitation, and / or chromatography. To this end, the organisms may advantageously be previously disrupted.
Se os organismos hospedeiros forem microorganismos, o processo de acordo com a invenção é realizado vantajosamente a uma temperatura de entre 0°C e 95°C, preferivelmente entre 10°C e 85°C, especialmente preferivelmente entre 15°C e 75°C, muito especialmente preferivelmente entre 15°C e 45°C.If the host organisms are microorganisms, the process according to the invention is advantageously carried out at a temperature of between 0 ° C and 95 ° C, preferably between 10 ° C and 85 ° C, especially preferably between 15 ° C and 75 ° C. most especially preferably between 15 ° C and 45 ° C.
Neste processo, o valor de pH é mantido vantajosamente entre pH 4 e 12, preferivelmente entre pH 6 e 9, especialmente preferivelmente entre pH 7 e 8. O processo de acordo com a invenção pode ser operado em bateladas, semibateladas ou continuamente. Uma avaliação sobre os métodos de cultivo conhecidos pode ser encontrada no livro de Chmiel (Bioprozeptechnik 1. Einführung in die Bioverfahrenstechnik [Bioprocess technology 1. Introduction to Bioprocess technology] (Gustav Fischer Verlag, Stuttgart, 1991)) ou no livro de Storhas (Bioreaktoren und periphere Einrich-tungen [Bioreactors and peripheral equipment] (Vieweg Verlag, Braunsch-weig/Wiesbaden, 1994)). O meio de cultura a ser usado tem que satisfazer adequadamente às exigências das cepas em questão. As descrições dos meios de cultura para vários microorganismos podem ser encontradas no livro "Manual of Methods fur General Bacteriology" of the American Society for Bacteriology (Washington D. C, USA, 1981).In this process, the pH value is advantageously maintained between pH 4 and 12, preferably between pH 6 and 9, especially preferably between pH 7 and 8. The process according to the invention may be batch, semi-batch or continuous. An assessment of known cultivation methods can be found in Chmiel's book (Bioprozeptechnik 1. Einführung in die Bioverfahrenstechnik (Gustav Fischer Verlag, Stuttgart, 1991)) or Storhas's book (Bioreaktoren und periphere Einrich-tungen [Bioreactors and peripheral equipment] (Vieweg Verlag, Braunsch-weig / Wiesbaden, 1994)). The culture medium to be used must adequately meet the requirements of the strains in question. Descriptions of the culture media for various microorganisms can be found in the book "Manual of Methods for General Bacteriology" of the American Society for Bacteriology (Washington D. C, USA, 1981).
Como descrito acima, estes meios que normalmente podem ser empregados de acordo com a invenção compreendem uma ou mais fontes de carbono, fontes de nitrogênio, sais inorgânicos, vitaminas e/ou elementos traços.As described above, these media which may normally be employed in accordance with the invention comprise one or more carbon sources, nitrogen sources, inorganic salts, vitamins and / or trace elements.
As fontes de carbono preferidas são açúcares, tal como mono-, di- ou polissacarídeos. Os exemplos de fontes de carbono muito boas são glicose, frutose, manose, galactose, ribose, sorbose, ribulose, lactose, mal-tose, sacarose, rafinose, amido ou celulose. Os açúcares também podem ser adicionados aos meios por compostos complexos tal como melados ou outros subprodutos de refinação de açúcar. A adição de misturas de uma variedade de fontes de carbono também pode ser vantajosa. Outras possíveis fontes de carbono são óleos e gorduras tal como, por exemplo, óleo de soja, óleo de girassol, óleo de amendoim e/ou gordura de coco, ácidos gra-xos tal como, por exemplo, ácido palmítico, ácido esteárico e/ou ácido lino-léico, poliálcoois e/ou álcoois tal como, por exemplo, glicerol, etanol e/ou metanol, e/ou ácidos orgânicos tal como, por exemplo, ácido láctico e/ou ácido acético.Preferred carbon sources are sugars such as mono-, di- or polysaccharides. Examples of very good carbon sources are glucose, fructose, mannose, galactose, ribose, sorbose, ribulose, lactose, maltose, sucrose, raffinose, starch or cellulose. Sugars may also be added to the media by complex compounds such as molasses or other sugar refining by-products. Adding mixtures from a variety of carbon sources can also be advantageous. Other possible carbon sources are oils and fats such as, for example, soybean oil, sunflower oil, peanut oil and / or coconut fat, fatty acids such as, for example, palmitic acid, stearic acid and / or linoic acid, polyalcohols and / or alcohols such as, for example, glycerol, ethanol and / or methanol, and / or organic acids such as, for example, lactic acid and / or acetic acid.
As fontes de nitrogênio são compostos de nitrogênio normalmente orgânicos ou inorgânicos ou materiais compreendendo estes compostos. Os exemplos de fontes de nitrogênio compreendem amônio na forma líquida ou na forma gasosa ou sais de amônio tal como sulfato de amônio, cloreto de amônio, fosfato de amônio, carbonato de amônio ou nitrato de amônio, nitrato, uréia, aminoácidos ou fontes de nitrogênio complexas tal como licor macerado de milho, carne de soja, proteína de soja, extrato de levedura, extrato de carne e similares. As fontes de nitrogênio podem ser usadas individualmente ou como uma mistura.Nitrogen sources are normally organic or inorganic nitrogen compounds or materials comprising these compounds. Examples of nitrogen sources include liquid or gaseous ammonium or ammonium salts such as ammonium sulfate, ammonium chloride, ammonium phosphate, ammonium carbonate or ammonium nitrate, nitrate, urea, amino acids or nitrogen sources. complexes such as macerated corn liquor, soy meat, soy protein, yeast extract, meat extract and the like. Nitrogen sources can be used individually or as a mixture.
Os compostos de sal inorgânicos que podem estar presentes nos meios compreendem os sais de cloreto, fósforo e sulfato de cálcio, magnésio, sódio, cobalto, molibdênio, potássio, manganês, zinco, cobre e ferro.Inorganic salt compounds which may be present in the media include calcium chloride, phosphorus and sulfate salts of calcium, magnesium, sodium, cobalt, molybdenum, potassium, manganese, zinc, copper and iron.
Os compostos contendo enxofre inorgânico tal como, por exemplo, sulfatos, sulfetos, ditionetos, tetrationatos, tiossulfatos, sulfetos, ou então compostos de enxofre orgânico tal como mercaptanos e tióis, podem ser usados como fontes de enxofre para a produção de substâncias químicas finas contendo enxofre, em particular de metionina. Ácido fosfórico, fosfato de díidrogênio de potássio ou fosfato de hidrogênio de dipotássio ou sais contendo sódio podem ser usados sais como fontes de fósforo.Inorganic sulfur-containing compounds such as, for example, sulfates, sulfides, dithionides, tetrationates, thiosulfates, sulfides, or else organic sulfur compounds such as mercaptans and thiols, may be used as sulfur sources for the production of fine chemicals containing sulfur, in particular methionine. Phosphoric acid, potassium hydrogen phosphate or dipotassium hydrogen phosphate or salts containing sodium may be used as sources of phosphorus.
Os agentes de quelação podem ser adicionados ao meio para manter os íons de metal na solução. Os agentes de quelação particularmente adequados incluem diidroxifenóis, tal como catecol ou protocatecuato e ácidos orgânicos tal como ácido cítrico.Chelating agents may be added to the medium to keep the metal ions in the solution. Particularly suitable chelating agents include dihydroxyphenols such as catechol or protocatecuate and organic acids such as citric acid.
Os meios de fermentação usados de acordo com a invenção para cultivar microorganismos normalmente também compreendem outros fatores de crescimento, por exemplo, tal como vitaminas ou promotores de crescimento que incluem, biotina, riboflavina, tiamina, ácido fólico, ácido ni-cotínico, pantotenato e piridoxina. Os fatores de crescimento e sais freqüen-temente são derivados de componentes de meios complexos tal como extrato de levedura, melados, licor macerado de milho e similares. Também é possível adicionar precursores adequados ao meio de cultura. A composição exata dos compostos do meio pesadamente depende da experiência particular e é decidida individualmente para cada caso específico. Informações sobre a otimização do meio podem ser encontradas no livro "Applied Microbiol. Physiology, A Practical Approach" (Editors P.M. Rhodes, P.F. Stanbury, IRL Press (1997) pp. 53-73, ISBN 0 19 963577 3). Os meios de crescimento também podem ser obtidos de fornecedores comerciais, por exemplo Standard 1 (Merck) ou BHI (infusão de cérebro coração, DIFCO) e similares.Fermentation media used according to the invention for cultivating microorganisms usually also comprise other growth factors, for example, such as vitamins or growth promoters which include biotin, riboflavin, thiamine, folic acid, nioquinic acid, pantothenate and pyridoxine. Growth factors and salts are often derived from complex media components such as yeast extract, molasses, macerated corn liquor and the like. Suitable precursors may also be added to the culture medium. The exact composition of the medium compounds depends heavily on particular experience and is decided individually for each specific case. Information on media optimization can be found in the book "Applied Microbiol. Physiology, A Practical Approach" (Editors P. Rhodes, P. Stanbury, IRL Press (1997) pp. 53-73, ISBN 0 19 963577 3). Growth media may also be obtained from commercial suppliers, for example Standard 1 (Merck) or BHI (Heart Brain Infusion, DIFCO) and the like.
Todos os componentes do meio são esterilizados, ou através de calor (20 min a 1,5 bar e 121°C) ou através de esterilização de filtro. Os componentes ou podem ser esterilizados juntos ou, se preciso for, separadamente. Todos os componentes do meio podem estar presentes no começo do cultivo ou adicionados continuamente ou em batelada, como desejado. A temperatura de cultura normalmente está entre 15°C e 45°C, preferivelmente de 25°C a 40°C, e pode ser mantida constante ou pode ser alterada durante a experiência. O pH do meio deveria estar na faixa de 5 a 8,5, preferivelmente em cerca de 7,0. O pH para cultivo pode ser controlado durante cultivo adicionando-se compostos básicos tal como hidróxido de sódio, hidróxido de potássio, amônio e amônia aquosa ou compostos ácidos tal como ácido fosfórico ou ácido sulfúrico. A espumação pode ser controlada empregando antiespumantes tal como, por exemplo, ésteres de poliglicol de ácido graxo. Para manter a estabilidade de plasmídeos é possível adicionar ao meio, substâncias adequadas que têm um efeito seletivo, por exemplo, antibiótico. As condições aeróbias são mantidas introduzindo oxigênio ou misturas de gás contendo oxigênio tal como, por exemplo, ar ambiente na cultura. A temperatura da cultura normalmente é 20° a 40°C e preferivelmente 25°C a 40°C. A cultura é continuada até que formação do produto desejado esteja em um máximo. Este objetivo normalmente é alcançado dentro de 10 a 160 horas.All media components are sterilized either by heat (20 min at 1.5 bar and 121 ° C) or by filter sterilization. The components can either be sterilized together or, if necessary, separately. All components of the medium may be present at the beginning of cultivation or added continuously or in batch as desired. The culture temperature is usually between 15 ° C and 45 ° C, preferably 25 ° C to 40 ° C, and may be kept constant or may be changed during the experiment. The pH of the medium should be in the range of 5 to 8.5, preferably about 7.0. The pH for cultivation can be controlled during cultivation by adding basic compounds such as sodium hydroxide, potassium hydroxide, ammonium and aqueous ammonia or acidic compounds such as phosphoric acid or sulfuric acid. Foaming can be controlled by employing defoamers such as, for example, fatty acid polyglycol esters. To maintain the stability of plasmids, suitable substances which have a selective effect, for example antibiotic, may be added to the medium. Aerobic conditions are maintained by introducing oxygen or oxygen-containing gas mixtures such as, for example, ambient air into the culture. The culture temperature is usually 20 ° to 40 ° C and preferably 25 ° C to 40 ° C. Cultivation is continued until desired product formation is at a maximum. This goal is usually achieved within 10 to 160 hours.
Os caldos de fermentação obtidos deste modo, em particular aqueles contendo ácidos graxos poliinsaturados, normalmente contêm uma massa seca de 7,5 a 25% em peso. O caldo de fermentação pode então ser processado também. A biomassa pode, de acordo com a exigência, ser removida completamente ou parcialmente do caldo de fermentação através de métodos de separação tal como, por exemplo, centrifugação, filtração, decantação ou uma combinação destes métodos ou ser deixada completamente no referido caldo. É vantajoso processar a biomassa após sua separação.Fermentation broths thus obtained, in particular those containing polyunsaturated fatty acids, usually contain a dry mass of 7.5 to 25% by weight. The fermentation broth can then be processed as well. The biomass may, as required, be completely or partially removed from the fermentation broth by separation methods such as, for example, centrifugation, filtration, decanting or a combination of these methods or left completely in said broth. It is advantageous to process the biomass after its separation.
Porém, o caldo de fermentação também pode ser engrossado ou pode ser concentrado sem separar as células, usando métodos conhecidos tal como, por exemplo, com a ajuda de um evaporador giratório, evaporador de película fina, evaporador de película de queda, por osmose inversa ou através de nanofiltração. Finalmente, este caldo de fermentação concentrado pode ser processado para obter os ácidos graxos presentes nele.However, the fermentation broth can also be thickened or concentrated without separating the cells using known methods such as, for example, with the aid of a rotary evaporator, thin film evaporator, reverse osmosis drop film evaporator or through nanofiltration. Finally, this concentrated fermentation broth can be processed to obtain the fatty acids present in it.
Os ácidos graxos obtidos no processo também são adequados como material de partida para a síntese química de produtos adicionais de interesse. Por exemplo, eles podem ser usados em combinação com um outro ou sozinhos para a preparação de farmacêuticos, comestíveis, alimentos animais ou cosméticos. Todas as seqüências de ácido nucléico usadas no processo de acordo com a invenção são vantajosamente derivadas de um organismo eucariótico, tal como uma planta, um microorganismo ou um animal. As seqüências de ácido nucléico são derivadas preferivelmente da ordem Salmoniformes, algas tal como Mantoniella, Crypthecodinium, Eugle-na ou Ostreococcus, fungos tal como o gênero Phytophthora ou de diatomá-ceas tal como os gêneros Thalassiosira ou Phaeodactylum. A invenção será descrita agora em maiores detalhes com referência aos seguintes Exemplos e aos desenhos nos quais: Figura 1 mostra várias séries de reação sintéticas para a bios-síntese de ácidos graxo ω-6 e u>-3.The fatty acids obtained in the process are also suitable as a starting material for the chemical synthesis of additional products of interest. For example, they may be used in combination with one another or alone for the preparation of pharmaceuticals, edibles, animal foods or cosmetics. All nucleic acid sequences used in the process according to the invention are advantageously derived from a eukaryotic organism, such as a plant, a microorganism or an animal. Nucleic acid sequences are preferably derived from the order Salmoniformes, algae such as Mantoniella, Crypthecodinium, Eugle-na or Ostreococcus, fungi such as the genus Phytophthora or diatom-ceas such as the genera Thalassiosira or Phaeodactylum. The invention will now be described in greater detail with reference to the following Examples and the drawings in which: Figure 1 shows various synthetic reaction series for the ω-6 and u> -3 fatty acid biosynthesis.
Figura 2 é um traço de cromatografia de gás que mostra a conversão de Δ9, 12-18:2 (ácido linoléico) em Δ11 ,14-20:2 por expressão hete-róloga da seqüência de A9-elongase de P. marinus (SEQ ID NO: 1, resíduos 7668 a 9200) em levedura ou induzido por galactose (Figura 2A) ou glicose (Figura 2B).Figure 2 is a trace of gas chromatography showing the conversion of Δ9, 12-18: 2 (linoleic acid) to Δ11, 14-20: 2 by heterologous expression of the P. marinus A9-elongase sequence (SEQ ID NO: 1, residues 7668 to 9200) in yeast or galactose induced (Figure 2A) or glucose (Figure 2B).
Exemplo 1 - Clonagem de um elonqase de FAE1 de Perkinsus marinus Perkinsus marinusi é um parasita de protozoário de ostra capaz de sintetizar ácidos graxos saturados e não saturados incluindo o ácido graxo essencial, ácido araquidônico [20:4(n-6)j. P. marinus emprega a série de reação delta-8 (Δ -8) dessaturase para sintetizar o ácido araquidônico. Materiais e Métodos.Example 1 - Cloning of a Perkinsus marinus FAE1 elonqase Perkinsus marinusi is an oyster protozoan parasite capable of synthesizing saturated and unsaturated fatty acids including essential fatty acid, arachidonic acid [20: 4 (n-6) j. P. marinus employs the delta-8 (Δ -8) desaturase reaction series to synthesize arachidonic acid. Materials and methods.
Crescimento e colheita de P. marinus Perkinsus marinus meronts foram cultivados a 28°C em um meio preparado como descrito por La Peyre e outros (J Eukaryot Microbiol 1993;40:304-10) e conteve aminoácidos, nucleotídeos, carboidrato, e vitaminas, porém nenhum soro bovino fetal.Growth and harvest of P. marinus Perkinsus marinus meronts were grown at 28 ° C in a medium prepared as described by La Peyre et al. (J Eukaryot Microbiol 1993; 40: 304-10) and contained amino acids, nucleotides, carbohydrate, and vitamins, however no fetal bovine serum.
Manipulação de ácido nucléico e clonagem com base em PCR O DNA foi extraído de células usando um minikit de DNA DNeasy (Qiagen). O DNA foi amplificado com iniciadores específicos para gene de del-ta5 dessaturase como segue: as reações foram aquecidas a 95°C durante 2 min seguido por 35 ciclos a 95°C durante 1 minutos, 2 minutos a 52 e 72°C durante 4 minutos, em seguida uma única etapa a 72°C durante 5 minutos. Os produtos de amplificação de PCR foram clonados em vetor de TOPO (Invitro-gen) e verificados através de sequenciamento. O gen FAE elongase foi amplificado com iniciadores específicos de gene (Tabela I) designados para as extremidades 5' e 3' da região de codificação, com locais de restrição para facilitar a clonagem no vetor de levedura (Tabela I). Os iniciadores dianteiros para clonagem em vetor de expressão de levedura pYES2 (Invitrogen) foram projetados para conter um G/A na posição -3 e um G na posição +4 para melhorar a iniciação de translação em células eucarióticas.Nucleic acid manipulation and PCR-based cloning DNA was extracted from cells using a DNeasy DNA minikit (Qiagen). The DNA was amplified with del-ta5 desaturase gene specific primers as follows: reactions were heated at 95 ° C for 2 min followed by 35 cycles at 95 ° C for 1 min, 2 minutes at 52 ° C and 72 ° C for 4 min. minutes, then a single step at 72 ° C for 5 minutes. PCR amplification products were cloned into TOPO vector (Invitro-gen) and verified by sequencing. The FAE elongase gene was amplified with gene-specific primers (Table I) designed for the 5 'and 3' ends of the coding region, with restriction sites to facilitate cloning into the yeast vector (Table I). The forward primers for pYES2 yeast expression vector cloning (Invitrogen) were designed to contain a G / A at -3 position and a G at +4 position to improve translational initiation in eukaryotic cells.
Iniciadores de oligonucleotídeo usados neste estudo As transcrições de Perkinsus marinus foram analisadas através de transcriptase reversa PCR (RT - PCR). O RNA total foi extraído de células que usam um minikit de planta RNeasy (Qiagen). Primeiro o cDNA do filamento foi sintetizado de RNA total que usa o kit de Amplificação de cDNA SMARTE RACE (BD-Clontech, Basingstoke, UK) de acordo com as instruções do fabricante. Os cDNAs de filamento único foram amplificados com os seguintes iniciadores.Oligonucleotide primers used in this study Perkinsus marinus transcripts were analyzed by PCR reverse transcriptase (RT - PCR). Total RNA was extracted from cells using an RNeasy (Qiagen) plant minikit. First the strand cDNA was synthesized from total RNA using the SMARTE RACE cDNA Amplification kit (BD-Clontech, Basingstoke, UK) according to the manufacturer's instructions. Single stranded cDNAs were amplified with the following primers.
FAEoperon dianteiro 5’ - GGAATTCGAGGAGTAGGATCTTATCTGAGGATAGTC A-CACTAGTCGTACT-3' FAEoperon reverso 5'-CATCTGCGAATACTAACCATACATTFAE Front Peron 5 '- GGAATTCGAGGAGTAGGATCTTATCTGAGGATAGTC A-CACTAGTCGTACT-3' FAE Reverse Peron 5'-CATCTGCGAATACTAACCATACATT
As reações foram aquecidas a 95°C durante 2 minutos seguidos por 30 ciclos a 94°C durante 30 segundos, 30 segundos em temperaturas que variam de 55 a 72 de acordo com o iniciador designado e 72°C durante 2 minutos, em seguida uma única etapa a 72°C durante 10 minutos. Os produtos de amplificação de PCR foram clonados em vetor TOPO (Invitrogen) e verificados através de sequenciamento. Surpreendentemente foi mostrado que as transcrições da A9-elongase, Δδ-dessaturase e Δδ-dessaturase são todas encontradas no mesmo mRNA. Este é o primeiro exemplo mostrando os genes de PUFA a serem organizados em uma estrutura tipo operon.Reactions were heated at 95 ° C for 2 minutes followed by 30 cycles at 94 ° C for 30 seconds, 30 seconds at temperatures ranging from 55 to 72 according to the designated primer and 72 ° C for 2 minutes, then a single step at 72 ° C for 10 minutes. PCR amplification products were cloned into TOPO vector (Invitrogen) and verified by sequencing. Surprisingly it has been shown that the transcripts of A9-elongase, Δδ desaturase and Δδ desaturase are all found in the same mRNA. This is the first example showing PUFA genes to be organized into an operon-like structure.
Em uma investigação adicional foi analisada a especificidade da A9-elongase. Para este propósito a sequência de codificação deste gene foi amplificada por RT-PCR como descrito acima usando os seguintes iniciado- res.In further investigation the specificity of A9-elongase was analyzed. For this purpose the coding sequence for this gene was amplified by RT-PCR as described above using the following primers.
Elo2For: 5' - ATGCAAGTTCCCGCGGAGCATCACTCC -3' Elo2Rev: 5' - CGTT ACGCAT C AAT ATT AT GCAT AGCCAACC -3' O produto de PCR amplificado foi então clonado em um vetor de pCRscript de acordo com as recomendações do fabricante (Stratagen). Em uma segunda etapa de PCR as sequências modificadas para expressão de levedura foram introduzidas usando os seguintes iniciadores.Elo2For: 5 '- ATGCAAGTTCCCGCGGAGCATCACTCC -3' Elo2Rev: 5 '- CGTT ACGCAT C AAT ATT AT GCAT AGCCAACC -3' The amplified PCR product was then cloned into a pCRscript vector according to the manufacturer's recommendations (Stratagen). In a second PCR step the modified yeast expression sequences were introduced using the following primers.
Expressão de levedura Kpn Elo2 dianteira 5' - TTGGTACCATGGGATTTCCTGCGGAG -3' Sac Elo1 Reversa 5' - GGG AGCT CTT ACGCAT CAAT ATT AT GCAT AGC-3’ A seqüência dos iniciadores é determinada na orientação 5' a 3'. Os sítios de restrição usados para clonagem estão em negrito. RESULTADOSYp Expression 5 'Front Elo2 Kpn - TTGGTACCATGGGATTTCCTGCGGAG -3' 5 'Reverse Sac Elo1 - GGG AGCT CTC ACGCAT ATAT AT GCAT AGC-3' The sequence of primers is determined in the 5 'to 3' orientation. Restriction sites used for cloning are in bold. RESULTS
Isolamento de elonqase de FAE1 de P.marinus Usando dados publicamente disponíveis derivados de um projeto de sequenciamento de genoma de P.marinus realizado por TIGR (http://www.tigr.org/tdb/e2k1/pmg /) foi identificado um contig (1047306867) que mostrou homologia significante a elongases conhecidas, com a seqüência alvo (designada Elol Para, SEQ ID NO: 9) consistindo em uma estrutura de leitura aberta de 511 resíduos e nenhum íntron. O aminoácido putativo derivado da seqüência designada é SEQ ID NO: 10.Isolation of P.marinus FAE1 elonqase Using publicly available data derived from a P.marinus genome sequencing project conducted by TIGR (http://www.tigr.org/tdb/e2k1/pmg /) a contig was identified. (1047306867) which showed significant homology to known elongases, with the target sequence (designated Elol Para, SEQ ID NO: 9) consisting of an open reading frame of 511 residues and no introns. The putative amino acid derived from the designated sequence is SEQ ID NO: 10.
Caracterização funcional em Saccharomvces cerevisiae O cDNA de tamanho natural que corresponde a Δ9 elongase de ácido graxo putativo (SEQ ID NO: 9) foi clonado em vetor expressão de levedura pYES2 para determina um construto pYPmFAE designada. A cepa de S. cerevisiae W303-1A foi transformada com o pYPmFAE ou o vetor vazio como um controle. As células transformadas foram crescidas em um meio mínimo que contém rafinose, e foram induzidas com 2% de galactose. Depois de 48 horas de crescimento os ácidos graxos de levedura totais foram extraídos e os FAMEs resultantes analisados por GC. A análise de GC (Figura 2) revelou que as células de levedura transformadas com pYPmFAE produziram um ácido graxo adicional que foi identificado como ácido eicosadienóico que indica que o gene que foi clona-do codificou um ácido graxo delta 9 elongase. A célula de levedura que expressa o ácido graxo delta 9 elongase de P. marinus é capaz de reconhecer o C18:2 (c9,12) substrato com uma porcentagem de 8,2% de taxa de conversão. A tabela 1 mostra o conteúdo de ácido graxo das células de levedura após a transformação com pYPmFAE (+) ou com o vetor vazio pYES2 (-) e indução com 2% de galactose. A porcentagem de conversão em 18:2δ9,12 a 20:2δ11,14, por exemplo, é calculado pela equação: Tabela 1 Os resultados apresentados na Tabela 1 mostram que nenhuma atividade de elongase foi detectada com 20:4Δ5,8' 11,14, e uma atividade mínima (1% de conversão) em 18:3A6ISI12. Portanto parece que o ácido graxo Δ9 elongase é seletivo para ácido linoléico e não age para prolongar outros PUFAs.Functional Characterization in Saccharomvces cerevisiae The full-size cDNA corresponding to Δ9 putative fatty acid elongase (SEQ ID NO: 9) was cloned into pYES2 yeast expression vector to determine a designated pYPmFAE construct. The S. cerevisiae W303-1A strain was transformed with pYPmFAE or the empty vector as a control. Transformed cells were grown in minimal medium containing raffinose, and were induced with 2% galactose. After 48 hours of growth the total yeast fatty acids were extracted and the resulting FAMEs analyzed by GC. GC analysis (Figure 2) revealed that pYPmFAE-transformed yeast cells produced an additional fatty acid that was identified as eicosadenoic acid indicating that the clone gene encoded a delta 9 elongase fatty acid. The yeast cell expressing P. marinus delta 9 fatty acid elongase is able to recognize the substrate C18: 2 (c9,12) with a conversion rate of 8.2%. Table 1 shows the fatty acid content of yeast cells after transformation with pYPmFAE (+) or empty vector pYES2 (-) and induction with 2% galactose. The conversion percentage at 18: 2δ9,12 to 20: 2δ11,14, for example, is calculated by the equation: Table 1 The results presented in Table 1 show that no elongase activity was detected with 20: 4Δ5,8 '11, 14, and a minimum activity (1% conversion) at 18: 3A6ISI12. Therefore it appears that Δ9 elongase fatty acid is selective for linoleic acid and does not act to prolong other PUFAs.
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