CZ299915B6 - Rekombinantní nukleová kyselina obsahující negativní regulacní elementy pro nervove specifickou expresi transgenu a její použití - Google Patents

Rekombinantní nukleová kyselina obsahující negativní regulacní elementy pro nervove specifickou expresi transgenu a její použití Download PDF

Info

Publication number
CZ299915B6
CZ299915B6 CZ20002906A CZ20002906A CZ299915B6 CZ 299915 B6 CZ299915 B6 CZ 299915B6 CZ 20002906 A CZ20002906 A CZ 20002906A CZ 20002906 A CZ20002906 A CZ 20002906A CZ 299915 B6 CZ299915 B6 CZ 299915B6
Authority
CZ
Czechia
Prior art keywords
nucleic acid
promoter
nrse
cells
sequences
Prior art date
Application number
CZ20002906A
Other languages
English (en)
Other versions
CZ20002906A3 (cs
Inventor
Kiefer@Hélene
Mallet@Jacques
Millecamps@Stéphanie
Original Assignee
Aventis Pharma S. A.
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Aventis Pharma S. A. filed Critical Aventis Pharma S. A.
Publication of CZ20002906A3 publication Critical patent/CZ20002906A3/cs
Publication of CZ299915B6 publication Critical patent/CZ299915B6/cs

Links

Classifications

    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K48/00Medicinal preparations containing genetic material which is inserted into cells of the living body to treat genetic diseases; Gene therapy
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P25/00Drugs for disorders of the nervous system
    • A61P25/28Drugs for disorders of the nervous system for treating neurodegenerative disorders of the central nervous system, e.g. nootropic agents, cognition enhancers, drugs for treating Alzheimer's disease or other forms of dementia
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09Recombinant DNA-technology
    • C12N15/63Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
    • C12N15/79Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
    • C12N15/85Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for animal cells
    • C12N15/86Viral vectors
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N7/00Viruses; Bacteriophages; Compositions thereof; Preparation or purification thereof
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2710/00MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA dsDNA viruses
    • C12N2710/00011Details
    • C12N2710/10011Adenoviridae
    • C12N2710/10041Use of virus, viral particle or viral elements as a vector
    • C12N2710/10043Use of virus, viral particle or viral elements as a vector viral genome or elements thereof as genetic vector
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2799/00Uses of viruses
    • C12N2799/02Uses of viruses as vector
    • C12N2799/021Uses of viruses as vector for the expression of a heterologous nucleic acid
    • C12N2799/022Uses of viruses as vector for the expression of a heterologous nucleic acid where the vector is derived from an adenovirus
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2830/00Vector systems having a special element relevant for transcription
    • C12N2830/001Vector systems having a special element relevant for transcription controllable enhancer/promoter combination
    • C12N2830/005Vector systems having a special element relevant for transcription controllable enhancer/promoter combination repressible enhancer/promoter combination, e.g. KRAB
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2830/00Vector systems having a special element relevant for transcription
    • C12N2830/008Vector systems having a special element relevant for transcription cell type or tissue specific enhancer/promoter combination
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2830/00Vector systems having a special element relevant for transcription
    • C12N2830/15Vector systems having a special element relevant for transcription chimeric enhancer/promoter combination
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2830/00Vector systems having a special element relevant for transcription
    • C12N2830/32Vector systems having a special element relevant for transcription being an silencer not forming part of the promoter region

Landscapes

  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Virology (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Public Health (AREA)
  • Veterinary Medicine (AREA)
  • Animal Behavior & Ethology (AREA)
  • Pharmacology & Pharmacy (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Plant Pathology (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Epidemiology (AREA)
  • Neurology (AREA)
  • Neurosurgery (AREA)
  • Psychiatry (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • General Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Hospice & Palliative Care (AREA)
  • Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
  • Medicines That Contain Protein Lipid Enzymes And Other Medicines (AREA)
  • Medicines Containing Material From Animals Or Micro-Organisms (AREA)
  • Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
  • Pharmaceuticals Containing Other Organic And Inorganic Compounds (AREA)
  • Preparation Of Compounds By Using Micro-Organisms (AREA)

Abstract

Rešení se týká nových konstruktu a zpusobu rízeníexprese nukleových kyselin, zejména konstruktu obsahujících sekvence NRSE, kterými lze dosáhnout cílené exprese transgenu v nervových bunkách in vivonebo ex vivo. Rešení je zejména vhodné pro aplikace prenosu genu in vivo, napr. pro úcely genové terapie nebo vedeckého výzkumu.

Description

? Oblast techniky
Předkládaný vynález se týká nově rekombinantní nukleové kyseliny, konstruktů a vektorů, obsahujících tyto konstrukty, které umožňují regulovat expresi nukleových kyselin. Konkrétně se vynález týká nových způsobů, konstruktů a vektorů, které umožňují dosáhnout cílené exprese transgenu v nervových buňkách in vivo nebo ex vivo. Vynález je zejména vhodný pro aplikace, kde se gen přenáší in vivo, např. při léčebném nebo výzkumném použití.
Dosavadní stav techniky (lenová terapie in vivo nebo ex vivo umožňuje lokální a účinný přenos genů {transgenů) kódujících požadované faktory, a to zejména do nervového systému hostitele. V tomto ohledu byla úspěšně použita řada vektorů pro přenos různých transgenů do nervových buněk in vivo nebo cy vivo, Mezi těmito vektory lze uvést zejména virové vektory typu adenoviru. AAV nebo
I (SV, některé nevirové vektory typu kationtových polymerů (např. polyetylenimin). Tyto vektory umožnily účinně a trvale přenést geny do buněk nervového systému in vivo (WO 94/08026, WO 93/09239 a WO 96/02655). Možnost uskutečnit takový přenos genů skýtá široké pole aplikací, zejména v oblasti medicíny. Tyto vektory lze užít pro genovou terapii in vivo nebo e.Y ν/ϊνλ V současné době jsou v běhu klinické studie týkající se přenosu trofíckých faktorů do nervových buněk. Tyto vektory lze také užít pro vytvoření transgenních zvířat, která umožní testování sloučenin, nebo pro různé značící studie nebo studie biologické dostupnosti. Ve všech těchto aplikacích, i když se zdá, žc je dosaženo účinného a trvalého přenosu, je nezbytná potřeba regulovat expresi transgenů. Byly již popsány různé systémy, které se pokoušely omezit expresi transgenu výlučně na určitou tkáň, např, pomocí tzv. „tkáňové specifických'* promotorů nebo so komplexních chimérických systémů, kterc vyžadovaly použití několika konstruktů a/nebo regulačních faktor. Jako příklad tkáňové specifického promotoru lze zmínit konkrétně promotor gliového fibrilárního kyselého proteinu, který je zejména aktivní v gliových nervových buňkách. Avšak regulační systémy, které jsou v současnosti dostupné, trpí některými nevýhodami, zejména tím. že jejich síla a/nebo selektivita nejsou vždy dostatečné. Takže u valné většiny známých systémů jc dobré selektivity dosaženo na úkor síly promotoru a je tudíž obtížné dosáhnout exprese. která je současně dostatečně silná, stálá a specifická.
Předkládaný vynález poskytuje konstrukty a vektory' obsahující tyto konstrukty, které umožňují odstranit nevýhody dosavadního stavu techniky. Předkládaný vynález popisuje chimérický pro•10 motor, který umožňuje neuronově zacílenou expresi. Vynález využívá negativní regulační elementy, které zabraňují expresi genu v jiných buňkách než nervových buňkách. Konstrukty tohoto typu vykazují řadu výhod ve srovnání se systémy dosavadního stavu. Na jedné straně, jelikož represorové sekvence a všudypřítomné (tj. nespecifické) promotory jsou často krátké a dobře charakterizované, je možné je snadno kombinovat s dalšími regulačními elementy. Na druhé straně, tyto regulační elementy lze teoreticky kombinovat s jakýmkoliv všudypřítomným (ubikvitárním) promotorem a tudíž představují vtipný systém, který dovoluje dosáhnout nervově specifické exprese požadovaného transgenu jednoduchým způsobem, dokonce i tehdy, když použitý vektor nemá žádný nebo má jen malý trop ismus pro nervové buňky. Velký počet studií popisuje eis sekvence, které potlačují transkripci neuronových genů v jiných než nervových buňkách.
Jeden typ sekvence s touto vlastností je element NRSE („neurone restrictivc silencer element“, neuronový element restriktivního umlčení), označovaný také RE-ls (represorový element 1). NRSE je krátká sekvence, přibližné velikosti 21 bp, která byla nalezena v poloze proti směru transkripce („upstreatn“) několika neuronových genů: např. genu SCGI0 [I], genu pro sodíkový kanál 11 [2J a synapsin 1 [3J. Kromě toho analogické sekvence byly nalezeny proti směru tran?5 skřipce velkého počtu neuronových genů, i když jejich funkce nebyla dosud vždy prokázána [4].
- 1 CZ 299915 Bó
Tylo sekvence NRSE reprimují (potlačují) expresi genů v jiných než nervových buňkách tím, že váží specifické transkripcní faktory, tj. protein NRSF („neurone restrictive silencer factor, neuronový restriktivní umlčovací faktor), nazývaný také REST (RE-1, „silencing transeríption factor. RE-1 faktor umlčení transkripce), který je přítomen výlučně v jiných buňkách než nervo5 vých [5]. Tento protein patří k rodině transkripčních faktorů se „zinkovými prsty. V průběhu vývoje zasahuje, aby inhiboval represi neuronových genů v ostatních buňkách kromě nervových, a i v dospělosti se podílí na udržovaní teto represe. Výzkumné skupiny, které charakterizovaly přítomnost sekvencí NRSE proti směru transkripce neuronových genů také ověřily schopnost těchto sekvencí snižovat expresi reportcrovcho genu po transfekci jiných buněk než nervových, io Aby se toto ověřilo, kombinovala se sekvence NRSE s minimálním heterologním promotorem, což je promotor, který dovoluje pouze bazální transkripci. Tak např. když byla sekvence NRSE kalciového kanálu II umístěna proti směru transkripce promotoru thymidinkinázy. exprese reportcrovcho genu se snížila na polovinu v buňkách jiných než nervových [9j. A podobně také dvě kopie sekvence NRSE synapsinu I kombinované s minimálním promotorem e fos snížily expresi is v buňkách jiných než nervových o 75 % [3], Kromě toho přítomnost sekvence NRSE také umožnila to, že aktivita promotoru SV 40 byla regulována v buňkách jiných než nervových [10].
Avšak sekvence NRSE nebyly nikdy užity k řízení exprese silného všudypřítomného (nespecifického) promotoru, ani nebyly využity z hlediska genové terapie. Takže dosud nebylo ukázáno, zda tyto sekvence jsou schopny potlačit expresi, která je indukována silným promotorem. Podobně také nebylo dosud nikdy ukázáno, jestli jsou tyto sekvence aktivní in vivo, když jsou umístěny do chimérického prostředí. Obecně řečeno, dosud nebylo prokázáno, zda tyto sekvence jsou aktivní in vivo, když se zkombinují s heterologním promotorem.
Podstata vynálezu
Předkládaný vynález se týká rekombinantních nukleových kyselin, které dovolují nervově specifickou expresi genů. Vynález sc také týká vektorů, které obsahují takové nukleové kyseliny, zejména virového původu, a také buněk, které obsahují tyto nukleové kyseliny a/nebo vektory. Vynález se také týká specifických chimérických promotorů, které jsou schopny exprimovat geny specificky v nervovém systému in vivo. Vynález se dále týká farmaceutických kompozic, kterc obsahují tyto elementy a jejich použití pro přenos genů.
Prvním aspektem předkládaného vynálezu je rekombinantní nukleová kyselina, která obsahuje:
- ubikvitární promotor
- jednu nebo několik sekvencí NRSE, a terapeutický gen.
Konstrukty podle vynálezu tudíž obsahují úsek pro represi, v jiných buňkách než neuronech, aktivní exprese terapeutického genu, který je indukován promotorem. Tento represorový úsek se skládá z.jednoho nebo několika motivů NRSE.
Motiv NRSE, který se užívá podle předkládaného vynálezu, výhodně obsahuje následující sekvenci velikosti 21 bp nebo alespoň její část:
TTCAGCACCACGGAGAG7GCC (sekvence id. č. 1)
Tato sekvence odpovídá sekvenci NRSE genu SCCilO [2]. Nicméně je jasné, že motiv NRSE použitý podle předkládaného vynálezu může obsahovat i nějaké variace ve srovnání s touto sek50 věnci, pokud si uchovává výše uvedené represorové vlastnosti. Sekvence typu NRSE vykazující určitý stupeň variability byly nalezeny v různých genech, jak bylo popsáno v publikovaném článku Schoenherr el al. [4], který je plně zahrnut formou odkazu. Na základě pozorovaných variant
- 2 CZ 299915 B6 byla identifikována kanonická sekvence NRSE, která odpovídá sekvenci, se kterou se lze nejčastěji setkat. Jde o následující sekvenci:
TTCAGCACCACGGACAGCGCC ísekvence íd. č. 2).
Výhodné varianty sekvence podle předkládaného vynálezu obsahují substituce týkající se 1 až 5 5 párů bází v sekvenci id. č. 2. Výhodněji jsou to varianty týkající se 1 až 3 párů bází. Nej výhodněji se varianty tykají zbytků I, 2, IU. 11, 15, 18, 19 a/nebo 20 výše uvedene sekvence. Substituce mohou odpovídat deleeí nebo nahrazení báze jakoukoliv jinou bází. Takže motiv NRSE je představován obecně celou následující sekvencí nebo její částí:
NNCAGCACCKNGGTíiNAGNNNC (sekvence id. č. 3), κι kde N znamená bázi vybranou ze A. T, C a G. Specifické příklady motivů NRSE, které lze užit podle předkládaného vynálezu, jsou následující:
TTCAGCACCACGGACAGCGCC (sekvence id. - 2)
TTCAGCACCACGGAGAGTGCC (sekvence id. č. O
TTCAGCACCGCGGACAGTGCC (sekvence id. c. 5)
TTCAGCACCTCGGACAGCATC (sekvence id. č.
TTCAGCACCGCGGAGAGCGTC (sekvence id. * 7)
TCCAGCACCGTGGACAGAGCC (sekvence id. č. S)
TTCAGCACCGAGGACGGCGGA (sekvence id. č. 9)
ATCAGCACCACGGACAGCGGC (sekvence id. č. i0)
TTCAGCACCTAGGACAGAGGC (sekvence id. č. il)
Kromě toho tyto motivy mohou obsahovat, na jednom z konců nebo na obou koncích, další báze. které ne interferují $ výše popsanou represorovou aktivitou. Konkrétně tyto další báze mohou obsahovat restrikční místa, neutrální sekvence nebo sekvence pocházející z klonovaeíeh kroků a obsahující např. úseky plazmidu nebo vektoru, nebo sekvence, kterc obklopují motiv NRSE v původním genu.
Tyto různé motivy lze připravit jakýmkoliv způsobem pro přípravu nukleových kyselin odborníku koví známým. Takže je lze např. připravit postupem automatizované syntézy užitím komerčně dostupného automatického syntetizátoru nukleových kyselin. Také je lze získat sereeningem
DNA knihoven, např. hybrid izac í se specifickými sondami nebo vazbou na specifické NRSE faktory. Kromě toho jakákoliv varianta sekvence id. č. 1 může být identifikována v DNA knihovně metodou vyhledávání homologic.
Jakmile je motiv NRSE syntetizován, může být funkčně testován. První test zejména obsahuje stanovení schopnosti daného motivu vázat NRSE faktor. To lze provádět různými způsoby, např. experimenty s retardací migrace v gelu, jak to bylo popsáno v publikacích Moři et al, [2] nebo Sehoenherr et al. [5], které jsou zahrnuty formou odkazu. Pak sc stanoví schopnost motivu repri50 movat expresi, a to tak, že se tento motiv vloží do plazmidu, který obsahuje reportérový gen (chloramfenikolacetyltransferáza, luciferáza, lacZ, atd.) řízený promotorem, a porovnají se hladiny exprese reportérového genu v nervových buňkách a jiných než nervových buňkách. Tento postup je např. popsán v publikaci Sehoenherr et al. [4, 5] a také v příkladech. Výhodně je motiv považován za funkční pokud poskytuje expresi reportérového genu v nervových buňkách ajiných než nervových buňkách lišící se alespoň o 40 %. Výhodněji je rozdíl v expresi alespoň 50%, nejvýhodněji alespoň 60 %.
Jak již bylo uvedeno výše, nukleová kyselina podle vynálezu obsahuje jeden nebo několik motivů NRSE, které byly definovány výše. Pokud je přítomno několik motivů, tentýž stejný motiv se
-3CZ 299915 B6 může opakovat několikrát nebo je přítomno několik variant. Výhodně konstrukty podle vynálezu obsahují jeden motiv, který se opakuje několikrát. Konstrukty mohou obsahovat až 50 motivů.
Výhodně je jeden motiv opakován 2 až 20 x. výhodně 3 až 15 x. Jak je ilustrováno v příkladech, výhodné výsledky byly získány, když byl motiv opakován 3, 6 nebo 12 x, a zvláště významné s výsledky byly získány, když byl motiv opakován 6 a 12x.
Motivy NRSE se vkládají do konstruktů v jakémkoliv neiranskribovaném nebo neiransiaiovanéni úseku nebo v intronu. Výhodně se vkládají do nekódujících úseků 5'- konce a ještě výhodněji do proximálního úseku promotoru. Navíc, jelikož je aktivita těchto motivů nezávislá na jejich orienio taei, je možné je vložit v orientaci souhlasné se směrem transkripce nebo v opačné. A nakonec, když se použije několik motivů, jsou výhodné uspořádány do tandemu, v jednom a témže úseku konstruktu. Avšak je jasné, že mohou být také vloženy do různých úseků.
Druhý element, který je součástí molekuly nukleové kyseliny podle předkládaného vynálezu, je promotor, který umožňuje, aby byl transgen exprimován v požadované buňce. Výhodným promotorem je promotor, který je aktivní v nervových buňkách nebo tkáních, a zvláště eukaryotický promotor. Promotor může být např. ubikvitární, tj. všudypřítomný, nespecifický promotor. tj. promotor, který je funkční vc většině typů buněk. Výhodnější jc eukaryotický ubikvitární promotor.
Promotor je buďto autologní, tj. promotor, který pochází ze stejného biologického druhu jako buňka, v níž má dojít k expresi, nebo je to promotor xenogenní. který pochází z jiného druhu. K výhodným příkladům všudypřítomného eukaryotického promotoru patří silné promotory' jako je promotor genu fosfoglycerátkinázy 1 (PGK). Tzv. silným promotorem je míněn jakýkoliv pro25 motor, jehož aktivita je srovnatelná s aktivitou virového promotoru. V eukaryotiekýeh organismech je PGK enzym účastnící se glykolýzy. U myši promotor tohoto genu velikosti přibližně 500 bp obsahuje tzv. zesilovací úsek (..enhancer”) (^440/-120) a promotorovy' úsek (-120/+80), který obsahuje několik iniciačních míst transkripce [6]. Účinnost promotoru PGK byla ověřena v předchozích experimentech jak in vitro tak in vivo [7, říj.
V jednom výhodném provedení se vynález týká nukleové kyseliny, která obsahuje promotor PGK a jednu nebo několik sekvencí NRSE. Jak je ilustrováno v příkladech, tento typ konstruktu umožňuje nasměrovat nervově specifickou expresi transgenu. Vynález se dále týká chimérického promotoru, který' obsahuje silný ubikvitární promotor a jednu nebo několik sekvencí NRSE.
Vynález ukazuje, že tyto sekvence NRSE lze užít účinně k represi aktivity silného promotoru, a to í v podmínkách in vivo. To tudíž umožňuje využít tyto nové promotory v celé řade aplikací. Specifický chimérický promotor podle předkládaného vynálezu je představován promotorem xNRSE-PGK, kde x je celé číslo od 1 do 50, výhodně od I do 20.
Příkladem dalších ubik vítám ích eukaryotických promotorů, které lze užít v předkládaném vynálezu, jsou promotory, které řídí expresi genů obligatorního buněčného metabolismu (to jsou geny základního metabolismu zvané „domestic“ nebo „housekeeping“ geny, které kódují proteiny nezbytné pro funkce společné všem buňkám, jako je např. dýchání). Příklady těchto genů jsou geny enzymů zúčastněných v Krebsově cyklu, v buněčném dýchání nebo transkripci a replikaci jiných genu. Specifickým příkladem promotoru, který lze zmínit, je promotor genu α 1-antitrypsinu, p~aktinu. vimentinu, aldolázy A nebo Eflot (elongační faktor).
Promotor, který lze užít podle předkládaného vynálezu může být také eukaryotický promotor neurospecifického typu, což ještě zlepší spccifitu pro nervové buňky. Přikladeni takového promosu toru, který' lze zmínit, je promotor genu NSE (enoláza specifická pro neurony), NE (neuroifilamenta), TU (tyrosin hydroxyláza), DAT (přenašeč dopaminu). CHAT (eholinaeetyllransferáza),
DBH (dopamin-p-hydroxyláza), TPH (tryptofanhvdroxyláza) a GAD (dehydrogenáza kyseliny glutamové), obecněji řečeno všechny promotory genů pro enzymy syntézy nebo transportu nervových přenašečů (neurotransmiterů, neuromediátorů) nebo promotory genů, jejichž exprese je specifická pro dané typy nebo subtypy nervových nebo gliovýeh buněk.
-4CZ 299915 B6
Nakonec vynalez také zahrnuje užití virových promotorů, např. CMV (cytomegalo virus). RSV (virus Rousova sarkomu). TK (thymidinkináza), SV40 (opičí virus) a LTR (dlouhá koncová repetice).
Kromě toho obsahuje nukleová kyselina podle předkládaného vynálezu terapeutický gen. Terapeutický gen znamená ve smyslu předkládaného vynálezu jakoukoliv nukleovou kyselinu, která obsahuje alespoň jeden otevřený čtecí rámec, který kóduje RNA terapeutického nebo vakcinačního polypeptidu. Nukleová kyselina jc komplementární, genomová, syntetická nebo semisynteio tická DNA. Může být různého původu, ze savců, rostlin, virů nebo může jít o umělou sekvenci.
Tran skřípění nebo trans lační produkt vykazuje terapeutické nebo vakcinační vlastnosti. Specifickým příkladem jsou enzymy, růstové faktory (zejména trofické faktory), neurotransmitery nebo jejich prekurzory, toxické faktory (thymidinkináza apod.), protilátky nebo fragmenty protilátek atd.
Vynález se také týká užití konstruktů podle vynálezu k nasměrování exprese jednoho několika genů kódujících RNA nebo protein, který je třeba exprimovat v neuronu, aniž by došlo k jeho expresi v jiných buňkách, k vytvoření zvířecích modelů nebo pro účely substituční nebo supresivní, etioiogieké nebo symptomatické léčby. Mohou to být geny např. z rodiny trofiekýeh fakto20 rů jako neurotrofiny (NGF, BDNF, NT3, NT4-5, GMF atd.), rodiny růstových faktorů (jako fibroblastový růstový faktor, FGFa a FGFb). rodiny vaskulárního endotelového růstového faktoru (VEGF). epidermálního růstového faktoru (EGF) a superrodiny TGFp, včetně rodin GDNF/neurturin a TGFp.
Mohou to být také geny, které kódují cytokiny, např. CN 1 F. LIF, onkostatin M nebo kardiotrofin 1, nebo proteiny rodiny interleukinů.
Mohou to být také geny, které kódují receptory těchto mnoha různých faktorů nebo které kódují transkripění faktory, které regulují expresi různých faktoru. Také to mohou být geny, které kódují
5o enzymy syntézy nebo degradace různých neurotransmiterů a neuropeptidů nebo jejich prekurzoru. nebo kofaktory, které jsou nezbytné pro jejich syntézu nebo katabolismus, nebo jiné transkripční faktory, které regulují expresi těchto proteinů, také může jít o geny kódující receptory íieurotransmiterů/neuropcptidů (nebo jejich podjednotky) a nebo proteiny, které se účastní v dráze signální transdukee.
Dalšími zajímavými geny / hlediska předkládaného vynálezu jsou zejména geny kódující antioxidanty. např. SOD (superoxídismutáza). GPX (glutathionperoxidáza), katalázu nebo enzymy buněčného dýchání, enzymy zúčastněné v buněčném cyklu jako je např. p21, nebo jiné proteinové inhibitory dependentníeh kináz, a také geny související s apoptózou jako jsou ICE, Bel2, ίο BAX, atd.
Obecně řečeno, jakýkoliv gen. jeho anomální exprese způsobuje poruchu nervového systému, může být exprimován v konstruktu podle předkládaného vynálezu, jako např. geny, jejichž mutace je přímou příčinou nemoci nebo geny, jejichž produkty se podílejí na stejné metabolické dráze.
Geny mohou také být toxické geny pro protinádorovou terapii (např. thymidinkináza nebo eytosindeamináza), geny pro antisense RNA nebo ribozymy, a nebo reportérové geny pro vývojové studie nebo pro výzkum kinetiky a biologické dostupnosti, jako je gen β--galakatosidázy, luciferázy nebo zeleného fluorescenčního proteinu GFP („green fluorescent protein“). Také to mohou být geny, které jsou součástí systému podmíněné rekombinace v nervovém systému pro vytvořeno ní zvířecího modelu, jako jsou např. transgenní zvířata, včetně systému podmíněného vyřazení genu („knockoul“).
Je zřejmé, že odborník je schopen uzpůsobit požadovaný gen očekávanému použití.
-5CZ 299915 B6
V nukleové kyselině podle předkládaného vynálezu jsou jednotlivé elementy uspořádány tak. že promotor řídí expresi terapeutického genu a sekvence NRSE (jedna nebo několik) řídi aktivitu promotoru. Obecně je tedy gen umístěn po směru transkripce („downstream“) od promotoru a ve shodné fázi s promotorem. Dále regulační úsek je obecně umístěn proti směru transkripce ? („upstream) od promotoru, ačkoliv to není pro aktivitu nezbytné, jak bylo již zmíněno výše. Vzdálenost mezi regulačním úsekem (sekvence NRSE) a promotorem je proměnlivá v závislosti na povaze použité sekvence a počtu opakování motivu NRSE. Výhodné jsou regulační sekvence umístěny ve vzdálenosti menší než 2 kb od promotoru, výhodněji ve vzdálenosti menší než 1 kb od promotoru.
KI
V jednom výhodném provedení vynálezu jsou sekvence NRSE kombinovány s regulačním systémem. aby byla jemně řízena exprese nukleové kyseliny v buňce. Lze uvést zv láště regulační systém užívající na jedná straně tetracyklinem kontrolovaný transaktivátor tTA a na druhé straně promotor senzitivní k tTA. které byly popsány např. v patentové přihlášce FR 98/140080, která je formou odkazu součástí předkládaného přihlášky. Stručně shrnuto, nukleová kyselina se skládá z prvního úseku, který obsahuje nukleovou kyselinu kódující systém tetracykl i nem-regulo váného transaktivátoru (tTA) řízený promotorem, který je senzitivní ktTA. Tento senzitivní promotor může být jakýkoliv promotor, dokonce i silný promotor, jehož aktivita se zvyšuje v přítomnosti transaktivátoru. Ze strukturního hlediska tento promotor obsahuje ve své sekvenci nebo ve funkč20 ní vzdálenosti od své sekvence alespoň jedno místo pro navázání faktoru tTA (operátorový úsek. Op). Výhodně jsou tyto dva úseky odděleny. Při realizaci vynálezu je možné sekvence NRSE umístit proti směru transkripce od tTA-senzitivního promotoru, ačkoliv to není podmínkou jejich aktivity, včetně polohy mezi dvěma výše popsanými úseky, loto výhodné provedení předkládaného vynálezu umožňuje dosáhnout současně nejen regulace exprese nukleové kyseliny tetra2? eyklinem, ale také tkáňové specifičnosti exprese, zejména pro nervové buňky, což umožňuje sekvence NRSE. Kromě toho tato jemná regulace promotor zajišťuje pozoruhodnou účinnost a spolehlivost exprese transgcnu, jak je to potřebné pro genovou terapii.
Předkládaný vynález sc také týká vektorů, které obsahují nukleové kyseliny definované v před30 cliozím popisu. Jelikož tyto vektor jsou výhodně schopny transdukovat savčí buňky, a konkrétné lidské nervové buňky, není nutné, aby měly zvláštní trop ismus pro uvedené buňky, takže vynález výhodně umožňuje použít jakýkoliv typ vektoru. Může to být plazmidový vektor (plazmid, episom, umělý chromosom atd.) neb virový vektor. Z virových vektorů jsou výhodné např. vektory odvozené z adenovirň, AAV a herpetíekýeh virů, jejichž tropismus pro nervovou tkáň a nervové
3? buňky byl již důkladné dokumentován ve stavu techniky. Lze zmínit i jiné viry, jako jsou např. retro viry nebo rhabdoviry. Příklady uvedené v této přihlášce ukazují, že aktivita sekvencí NRSE, které byly vloženy do virových vektorů, je významná. Takže zcela neočekávaně bylo zjištěno, že když byly sekvence NRSE. a sice 6 a 12 sekvencí, vloženy do virového vektoru (adenovirus), snížily expresi transgenu v buňkách jiných než nervových o 91 a 98 % in vitro a o 90 a 96 % in
4d r/vo. Tyto výsledky demonstrují, že je možné podle tohoto jednoduchého systému díky regulačním sekvencím exprimovat požadované nukleové kyseliny specificky v nervových buňkách, aniž by došlo k expresí v ostatních buňkách. Kromě toho sekvence NRSE vykazují značné výhody, neboť vzhledem ke své malé velikosti jsou zvláště vhodné pro regulaci exprese genů. které jsou vloženy do vektoru, kde je omezený prostor pro vložení regulačních sekvencí. Navíc jc možné kombinovat tyto sekvence sjinými regulačními systémy v jednom a témže vektoru.
Předkládaný vynález se zvláště týká také rekombinantního defektního viru, který obsahuje požadovanou nukleovou kyselinu pod kontrolou expresních sekvencí, přičemž tyto expresní sekvence obsahují promotor a jednu nebo několik sekvencí NRSE.
51)
Obecně rekombinantní virus podle předkládaného vynálezu je defektní, tzn. není schopen autonomní replikace v buňce. Produkce defektu ich rekombinantních virů je odborníkům známa, pro ilustraci lze uvést např. publikace Graham, E. a Prevec. L, (ln: Methods in Molecular Biology (1991) Murray E. J. (ed.). The Human Press lne.. Clifton. NJ, kapitola 11. str. 109-128). Každý
-6CZ 299915 B6 z těchto vírů může byt připraven v enkapsidační buněčné linii, která obsahuje funkci deficitní ve viru. Takové buněčné linie byly popsány v odborné literatuře (např. linie 293 a její deriváty).
V jednom provedení vynálezu je defektní rekombinantní virus adenovirus. Byly charakterizovány různé sérotypy tohoto viru, jejichž struktura a vlastnosti jsou poněkud rozdílné. Podle předkládaného vynálezu je výhodné užití sérotypů 2 nebo 5 lidského adenoviru (Ad 2 nebo Ad 5) nebo adenovirů zvířecího původu (viz přihláška w 094/269 i 4). Ádenoviry zvířecího původu, které mohou být užity podle předkládaného vynálezu jsou např. psí, hovězí nebo myší ádenoviry (např. Mávl, Beard et al.. Virology 75 (1990) 1981), nebo ádenoviry ovcí. prasat, ptáků nebo opis κι (např. SAV). Výhodné ádenoviry zvířecího původu jsou psí ádenoviry, výhodněji ádenoviry CAV2 (např, kmen Manhattan nebo A26/61 (ATCC VR-800)), Podle předkládaného vynálezu jc výhodné užití adenovirů lidského nebo psího původu nebo sníženého původu.
Výhodně adenovirus podle předkládaného vynálezu obsahuje sekvence ITR, enkapsidační sekvenci a nukleovou kyselinu podle vynálezu. Ještě výhodněji je alespoň úsek El nefunkční v genomu adenovirů podle předkládaného vynálezu. Tento gen je možné učinil nefunkčním kterýmkoli v v oboru známým způsobem, zejména úplnou delecí, nahrazením, částečnou delecí a adicí jedné nebo několika bází. Takové modifikace lze provést in vitro (s izolovanou DNA) nebo in šitu, např. S využitím metod genového inženýrství a nebo pomocí působení mutagenit
Mohou být modifikovány i jiné úseky, zejména E3 {(WO95/02697), E2 (WO94/28938), E4 (WO94/28152. WO94/12649, WO95/Ó2697) a E5 (WO95/02697). Vc výhodném provedení vynálezu obsahuje adenovirus podle vynálezu delecí v úseku El a E4. V jiném výhodném provedení obsahuje delecí v úseku El, do které je vložen úsek E4 a požadovaná nukleová kyselina podle vynálezu (viz FR94 13355). Rekombinantní adenovirus může být také adenovirus. který je defektní např. v úseku El a/nebo E2 a/nebo E4. Ve viru podle předkládaného vynálezu je delece v úseku El výhodně v úseku nukleotidu 455 až nukleotidu 3329 v případě sekvence adenovirů Ad5.
Defektní rekombinantní ádenoviry podle předkládaného vynálezu mohou být připraveny jakýmsi) koliv způsobem odborníkům známým (Levrero et al., Gene 101 (1991) 195, EP 185 573; Graham, EMBO J. 3 (1984) 2917). Mohou být připraveny zejména např. například homologní rekombinací mezi defektnírn virem a plazmidem nesoucím, kromě jiného, sekvenci nukleové kyseliny podle vynálezu nebo požadovanou nukleovou kyselinu pod kontrolou expresní sekvence obsahující promotor a jednu nebo několik sekvencí NRSE. K homologní rekombinací dojde v důsledku kotransfekce uvedeného adenoviru a plazmidu do vhodné buněčné linie. Vhodná buněčná linie, která se může použít, výhodně musí I) být transfomiovatclná uvedenými prvky a 11) obsahovat sekvence, které jsou schopny komplementovat část genomu replikačně deťcktního adenoviru, výhodně v integrované formě, aby se zabránilo riziku rekombinace. Příkladem buněčné linie, která se může užít, je linie lidských buněk 293 z embryonální ledviny (Graham et al,, •io J. Gen. Virol. 36. 1977, 59), která obsahuje levou část genomu adenoviru Ad5 (12%) integrovanou do svého genomu, nebo buněčná linie schopná komplementovat funkce El a E4, která je popsána např. v patentových přihláškách WO94/26914 a WO95/02697, nebo v publikaci Yeh et al., J. Virol. 70(1996)559.
Viry se poté namnoží, izolují a purifikují běžnými metodami molekulární biologie, které jsou odborníkovi známy.
V jiném výhodném provedení předkládaného vynálezu defektní rekombinantní virus je AAV. Adenoasociované viry (AAV) jsou DNA viry relativně malé velikosti, které se trvale
5o a místně-specificky integrují do genomu bunčk, kleré infikují. Jsou schopné infikovat široké spektrum buněk, aniž by měly jakýkoliv vliv na růst, morfologii nebo diferenciaci bunčk. Kromě toho se nepodílejí na žádné lidské nemoci. Genom AAV byl klonován, sekvencován a charakterizován. Obsahuje přibližně 4700 bází a na každém konci obsahuje úsek invertované koncové repetice (I I R) velikosti 143 bází, který' slouží jako počátek replikace víru. Zbytek genomu je rozdělen do dvou esenciálních částí, kterc nesou enkapsidační funkce: levá část genomu, obsah u-7CZ 299915 B6 jící gen rep, který se účastní virové replikace a exprese virových genů, a pravá část genomu, která obsahuje gen cap. který kóduje proteiny virové kapsidy.
Použití vektorů odvozených z AAV pro přenos genů in vitro a in vivo bylo popsáno v patentové s literatuře (viz zejména WO 91/18088; WO 93/092939; US 4 797 368, US 5 139 941.
EP488 528), Tyto dokumenty' popisují různé konstrukty odvozené z AAV, ve kterých byly geny řep a/nebo cap deietovány a nahrazeny požadovanými geny, ajejich použití pro přenos požadovaných genů in vitro (do buněk v kulturách) nebo in vivo (přímo do organismu). Defektní rekombinantní AAV podle vynálezu jsou defektní v celém nebo části úseku Rep a/nebo Cap. Lze ío je připravit kotransfekcí plazmidů obsahujících sekvence nukleové kyseliny, nebo kombinaci sekvencí nukleové kyseliny podle vynálezu obklopené úseky invertovaných koncových repetic (ITR) a AAV a plazmídu nesoucího enkapsidační geny AAV (cap a rep) do buněk, které jsou infikovány pomocným lidským virem (helper virus), např. adenovirem. Příkladem buněčné linie, kterou lze použít, je buněčná linie 293. Jiné produkční systémy jsou popsány např. v patentových i? přihláškách WO95/14771. WO95/13365, WO95/13392 a WO95/06743. Rekombinantní AAV takto připravené se pak standardním způsobem puriflkují.
V dalším výhodném provedení vynálezu je defektní rekombinantní virus retrovirus, rhabdovirus nebo US V. Konstrukce rekombinantních vektorů založených na retro virech a herpetických virech byla popsána v odborné literatuře, zejména v Breakfíeld et al„ New Bíologist 3 (1991) 203;
EP 453242, EP 178220, Bernstein et al., Gcnet. Eng. 7 (1985) 235: McCormiek. BioTechnology 3 (1985) 689. Retroviry jsou integrující se viry, které selektivně infikují dělící se buňky. Představují proto zajímavé vektory pro nádorové aplikace. Genom retrovirů nutně obsahuje dva úseky LTR. enkapsidační sekvence a tři kódující úseky, gag, pol a env. V rekombinantních vektorech odvozených z retrovirů jsou geny gag, pol a env buďto z části, nebo zcela deietovány a nahrazeny požadovanou sekvencí heterologní nukleové kyseliny. Tyto vektory lze připravil z retrovirů různých typů, jako je např. zejména MoMuLV („Moloney murine leukaemia virus, Moloncyho myší leukemieký virus, také označovaný MoMLV), MSV („Moloney murine sarcoma virus, Moloneyho myší sarkomový virus). HaSV („Harvey sarcotna virus“, virus
3o Harveyho sarkomu). SNV („spleen neerosis virus, virus nekrózy sleziny), RSV (Rous sarcoma virus, virus Rousova sarkomu) nebo Fricndův virus.
Pro konstrukci rekombinantních retrovirů podle předkládaného vynálezu, které obsahují nukleo* vou kyselinu podle vynálezu nebo požadovanou nukleovou kyselinu pod kontrolou expresní i5 sekvence obsahující promotor a jednu nebo několik sekvencí NRSE, připraví se plazmid obsahující zejména oba úseky LTR, enkapsidační sekvence a požadovanou nukleovou kyselinu, a pak se transťekuje do tzv. enkapsidační buněčné linie, která je schopná v trans doplnit retrovirové funkce. které chybí v plazmídu. Jakové enkapsidační linie byly popsány v dosavadním stavu techniky, zejména např. linie ΡΛ317 (viz US 4 861 719), linie PsiCRlP (viz W090/02806), a linie
GP+envAM-12 (viz W089/07I50). Obecně tyto enkapsidační linie jsou schopny exprimovat geny gag, pol a env. Kromě toho rekombinantní relrovny mohou obsahovat změny v úsecích ETR, kterc vedou k supresi transkripění aktivity a nebo rozšířené enkapsidační sekvence, které obsahují část genu gag (Bender et al., J. Virol 61 (1987) 1639). Takto připravené rekombinantní retroviry se pak purifikují standardními postupy.
Předkládaný vynález demonstruje možnost použít sekvence NRSE pro regulaci genové exprese in vivo. Výsledky pokusů uvedených v příkladech této přihlášky ukázaly, že tyto sekvence jsou in vivo vždy aktivní a umožňují expresi transgenu v nervových buňkách aniž by byla ex pr i mo vány v buňkách jiného typu.
Předkládaný vynález dále ukazuje, že sekvence NRSE jsou také schopny, v závislosti na jejich uspořádání (a počtu kopií) účinně regulovat aktivitu silného promotoru, eož skýtá četné možnosti výhodného použití. Získané výsledky překvapivě ukázaly, že aktivita sekvencí NRSE jc zesílena, když jsou tyto sekvence vloženy do vektoru virového původu. Konstrukt takového typu tedy kombinuje zvláště výhodné vlastnosti jako je účinnost přenosu a selektivita exprese.
-8CZ 299915 B6
Předkládaný vynález sc také týká jakýchkoliv buněk, které obsahují nukleovou kyselinu podle vynálezu, nebo vektor či virus, které byly definovány výše. Výhodně se jedná o lidské nervové buňky. Může to být buňka, která pochází z trvalé buněčné linie nebo buňka pocházející z primár5 ní kultury'. Buňky se mohou užít např. k produkci polypeptidů nebo k testování aktivity genu.
Také je lze využít v buněčné terapií, kdy sc buňky implantují nebo i nj i kují subjektu.
Předkládaný vynález se také týká farmaceutických kompozic nebo farmaceutických přípravků, které obsahují nukleovou kyselinu nebo vektor nebo virus nebo buňku podle předkládaného io vynálezu a excipient. Pro použití podle předkládaného vynálezu jsou výhodně nukleové kyseliny, vektory nebo buňky kombinovány sjedním nebo několika farmaceuticky přijatelnými excipientv. aby mohly být podávány způsobem topickým, zejména stereotaktickým perorálním, parenterálním. intranazálním. intravenózním, intramuskulámím, subkutánním, intraokulárním. transdermálním atd. Nukleové kyseliny, vektory nebo buňky podle vynálezu jsou výhodně užívány v injiko15 vatelné formě. Tato injikovatelná forma je výhodně zejména sterilní ísotonícký solný roztok (dihydrogen- nebo hydrogenfosforečnan sodný, chlorid sodný, horečnatý, draselný nebo vápenatý, nebo směsi těchto solí), nebojsou to suché, výhodně lyofilízované přípravky, které umožňují po přidání sterilní vody nebo fyziologického roztoku rekonstituovat i nj i kováte lny roztok.
Ve výhodném provedení se přípravek podle předkládaného vynálezu podává Íntramuskulárně, výhodně inlramuskulární injekcí. Důvodem je. že intramuskulární injekce zcela překvapivě umožňuje dosáhnout podstatného terapeutického účinku díky zpětnému transportu produktu terapeutického genu tvořeného ve svalech. Takže tyto produkty, které odpovídají nukleovým kyselinám podle vynálezu nebojsou odvozeny z vektorů podle vynálezu, jsou absorbovány na úrovni nervos valové ploténky (motorického zakončení) a zpětným přenosem prostřednictvím axonu se dostávají do buněčného těla motorických neuronů. Tento způsob podávání má navíc výhodu, že zabraňuje nežádoucím důsledkům ektopické exprese terapeutických genů při léčení neurologických nemocí. Pokud se užije tato metoda, je možné okamžitě infikovat specificky nervové buňky, aniž by došlo k expresi v inj i kovaném svalu nebo exkreci produktů do krevního oběhu. Takže tato metoda nepochybně překonává všechny nedostatky dosavadních terapií způsobované zejména nedostatečným přístupem neurotofickýeh faktorů k motorickým neuronům, velmi krátkým poločasem těchto proteinů a škodlivými vedlejšími účinky, ke kterým docházelo při systémovém podávání těchto produktů. Navíc vzhledem ke snadnému přístupu k místu, které má být in j i kováno. lze tuto metodu výhodně užít pro jakoukoliv nemoc neuronů nebo motorických neuronů.
Množství jednotlivých elementů lze nastavil kompetentním odborníkem ve shodě s předpokládanou aplikací a zejména s místem podávání, počtem injekcí, genem, kteý má být exprimován a očekávanou dobou léčení.
Předkládaný vynález se také týká použití, pro přípravu přípravku pro přenos požadované nukleové kyseliny a její expresi v tkáni nebo nervové buňce, konstruktu, který obsahuje:
ubikvitární promotor jednu nebo několik sekvencí NRSE, a
- nukleovou kyselinu uspořádané tak, že exprese nukleové kyseliny jc řízena promotorem a aktivita promotoru je řízena uvedenou sekvencí nebo sekvencemi NRSE.
sn Použití nukleové kyseliny podle vynálezu k přenosu genů in vitro a in vivo, např. při genové terapii, umožňuje omezit eklopiekou expresi požadovaných transgenů a zaměřil terapeutický účinek specificky na populaci nervových buněk. Zabrání sc tím škodlivým, ke kterým by mohlo dojít v důsledku difúze transgenů do organismu. Tento systém může být užit při léčení mnohých poškození, degenerativních nebo traumatických, míchy nebo jiných nemocí centrálních nebo
-9CZ 299915 B6 periferních nervů nebo ncuropsyehiatrické nervové nemoci, při kterých je specificky ovlivněna populace neuronů. V základní neurologii lze tento systém využít k objasnění původu (gliového nebo neuronového) příznaků pozorovaných in vivo nebo in vitro.
Předkládaný vynález se dále také týká použití, pro přípravu přípravku pro léčení nemocí motorických neuronů intramuskulárním podáváním požadované nukleové kyseliny do nervové tkáně nebo nervových buněk, kierý obsahuje konstrukt, který obsahuje:
ubikvitární promotor io - jednu nebo několik sekvencí NRSE. a nukleovou kyselinu uspořádané tak, že exprese nukleové kyseliny je řízena promotorem a aktivita promotoru je řízena uvedenou sekvencí nebo sekvencemi NRSE.
Předkládaný vynález se dále týká použití výše definovaných vektorů, které obsahují požadovanou nukleovou kyselinu pod kontrolou expresních sekvencí, kdy tyto sekvence obsahují promotor a jednu nebo několik sekvencí NRSE.
Použití virových vektorů je založeno na přirozené transfekční schopnosti virů (tj. schopnosti infikovat buňku). Bylo prokázáno, že tyto vektory jsou zvláště účinné při transfckci. Vektory podle vynálezu se tedy použijí k přenosu požadovaných genů a jejich expresi v nervových buňkách, in vivo, in vitro nebo ex vivo. a to zejména pro účely genové terapie. K expresi požadované nukleové kyseliny, která je zejména pod kontrolou jedné nebo několika sekvencí NRSE, dochází specificky v nervových buňkách, přičemž ektopická exprese je omezena. Tyto vektory'jsou proto vhodné k léčení a/nebo prevenci různých nemocí centrálního nebo periferního nerv štva nebo neuropsychiatrických nervových nemocí, které ovlivňují nervové buňky, zejména neurodegenerativních onemocnění a různých nemocí míchy. Jako příklady takových nemocí lze uvést zejména Alzheimerovou nemoc, Parkinsonovu nemoc, ataxií míchy a Huntíngtonovu nemoc.
Vektory podle vynálezu lze užít zejména k prevenci a/nebo léčení nemocí motorických neuronů jako je např, amyotrofní laterální skleróza, amyotrofie míchy typu I (Werdnig-1 loffmannova nemoc) a typu 11 a lll (Kugclbcrg-Wclanderova nemoc) a amyoirofie míšních uzlin (např. Kennedyho nemoc).
Vektory podle vynálezu jsou zejména vhodné pro léčení a/nebo prevenci těchto nemocí intramuskulárním podáváním. Jak již bylo vysvětleno výše, tento způsob umožňuje dosáhnout motorických neuronů prostřednictvím zpětného transportu.
Přesněji, předkládaný vynález sc týká použití, pro přípravu přípravku pro přenos požadované nukleové kyseliny a její expresi v nervové tkáni nebo nervových buňkách, který obsahuje vektor definovaný výše, který obsahuje konstrukt, kde ubikvitární promotor
4? - jedna nebo několik sekvencí NRSE, a nukleová kyselina jsou uspořádané tak, že exprese nukleové kyseliny je řízena promotorem a aktivita promotoru je řízena uvedenou sekvencí nebo sekvencemi NRSE.
Dále se předkládaný vynález také týká použití, pro přípravu přípravku k léčení nemocí motorických neuronů intramuskulárním podáváním požadované nukleové kyseliny do nervové tkáně nebo nervových buněk, který obsahuje vektor definovaný výše, který obsahuje konstrukt, kde
- 10CZ 299915 B6 ubikvitámí promotor
- jedna nebo několik sekvencí NRSE. a nukleová kyselina jsou uspořádané tak, že exprese nukleové kyseliny je řízena promotorem a aktivita promotoru je řízena uvedenou sekvencí nebo sekvencemi NRSE,
Dále se předkládaný vynález týká způsobu regulace exprese genu in vivo. přičemž tento způsob obsahuje vložení sekvencí NRSE do místa proti směru transkripce („upstrearn“) od požadovaněío ho genu a in vivo podání výsledného konstruktu a/nebo vektoru obsahujícího tento konstrukt.
Předkládaný vynález bude dále podrobněji popsán formou následujících příkladů, které jsou ilustrativní a vynález nijak neomezují. V těchto příkladech se nejdříve popisuje klonování zvětšujícího se počtu sekvencí NRSE do místa „upstrearn“ od promotoru genu PGK v plazmidu obsahují15 eím lucifcrázový reportérový gen a následnou selekci konstruktu, u kterých je exprese luciferázy snížena, když jsou transfekovány jiné buňky než neurony. Pak byly připraveny odpovídající adenovirové konstrukty a testovány in vitro tím. že se infikovaly buněčné linie a primární kultury'. a také in vivo poté, co byly myši intramuskulárnč inj ikovány rekombinantním adenovirem. Uvedené výsledky demonstrují výhody nukleové kyseliny podle vynálezu.
Přehled obrázků na výkresech
Obr. 1: Schematické znázornění plazmidů, které nesou chimérický promotor podle předkláda25 ného vynálezu.
Obr. 2: Studie funkční kapacity plazmidů, která byla provedena transfekční plazmidů do nervových (PC 12, obr. 2B) a jiných buněk (3T3, obr. 2A) a pak měřením luciferázovc aktivity.
.to Obr. 3: Studie funkční kapacity defektuího rekombinantního viru in vitro, kdy sc měřila lucifcrázová aktivita a po injekcích:
do jiných než nervových buněk (fibroblasty 373 potkana, obr. 2A)
- nervových buněk (fcochromoeylom PC 12 potkana, obr. 3B) primární kultury jiných než nervových buněk, neonatálních ledvinnych buněk potkana (obr. 3B),
- primární kultury' nervových buněk, neonatálních horních krčních nervových ganglií (obr. 3D).
- primární kultury' jiných než nervových buněk, primární kultury aslrocytů pocházejících z embrya potkana (obr. 3E), primární kultury nervových buněk, infekce primární kultury' kortikálníeh neuronů 7 embrya potkana (obr. 3F).
Obr. 4: Studie funkční kapacity defektního rekombinantního viru in vivo, kdy myš byla injiko50 vána intramuskulárně a pak byla měřena lueiferázová aktivita.
Obr. 5: Studie funkční kapacity defektního rekombinantního víru in vivo, kdy myš bvla inj i kována intramuskulárně do svalu jazyka a pak byla měřena lueiferázová aktivita.
-11CZ 299915 B6
Obr. 5A; Měření aktivity luciferázy ve svalu jazyka 8. a 35. den.
Obr. 5B: Měření aktivity luciferázy v buňkách nervového systému (prodloužená mícha) 8 a 35. den.
Příklady provedeni vynalezu
Materiály a metody použité v následujících příkladech io
Buněčné linie a primární kultury
Buňky získané z linie feoehromoeytomu potkana (PC 12) byly kultivovány v médiu RPMI 1640 (Gibeo) obsahujícím 15 % telecího fetálního séra (FCS) (Boehringcr). Buňky získané z linie fíbroblastů 34 3 potkana byly kultivovány v Eaglcho médiu modifikovaném Dulbeceem (DMEM) s přídavkem 10 % telecího fetálního séra. Kultury buněk horních krčních nervových uzlin (SCO) získaných z novorozených potkanů W i stár (lífa-Crcdo) starých 1 až 2 dny, kdy buňky byly disodovány pomocí 3 mg/ml dispázy (Boehringcr) a pak naneseny na destičky, které byly předem potažen} kolagenem získaným z ocasu potkana. Buňky byly kultivovány v 0,5 ml Leibovitzova
2d média [.—15 (Gibeo). které bylo pufrováno bikarbonátem a obsahovalo různé faktory včetně 70 ng/ml NGF (nervový růstový faktor), 5% sérum dospělého potkana a lOgM cytosinarabinofuranosid.
Primární kultury ledvinných buněk byly připraveny tak. že ledvinná tkáň z novorozených potka25 nů Wistar (Iffa-Credo) starých 1 až 2 dny byla disociována trypsinem. Buňky pak byly přeneseny na destičky do 10 % FCS. aby se umožnilo jejich dělení až do okamžiku použití k infekci.
Kultury kortikálních buněk byly získány z embryí potkanů kmene El7 Sprague-Dawley (IffaCredo). Buňky byly získány pitvou a mechanicky disociovány a pak byly kultivovány v médiu
DMEM obsahujícím transfer in 100 gg/ml, inzulín 25 gg/ml, putresein 10 gg/ml. selenit sodný 5 ng/ml, progesteron 6,3 ng/ml a 2mM glutamin (Sigma),
Primární kultury astroeytů byly odvozeny z kortikální tkáně embryí potkanů (El7, SpragueDawley) a kultivovány v médiu DMEM obsahujícím 10 % FCS a v atmosféře 10% CO2/90% vzduch.
Experimenty in vitro
Pro experimenty s přechodnou expresí byl milion buněk transfekován elektroporací pomocí systému firmy Bio-rad, při 960 gF a 190 V v případě buněk PC 12. nebo 250 V v případě buněk 3T3. a sice 6 gg každého z testovaných plazmidu, 7 gg plazmidu Bluescrípt (Stratagene) a 2 gg kontrolního vektoru pCAT (Promega), který' kóduje chloram fen i kol acetyl transferázu (CAT), což umožnilo monitorování transfekce.
Buněčné kultury' byly transfekovány tak, že kultivační médium bylo nahrazeno médiem bez séra, které obsahovalo virovou suspenzi s MOI přibližně 200 pfu (plaky tvořící jednotky) a inkubovaly se 45 minut. Pro každý konstrukt (plazmid nebo adenovirus) byty stanoveny 3 hodnoty luciferázové aktivity ze 3 různých jamek. Pro každý virový konstrukt se infekční experimenty opakovaly dvakrát vždy s užitím jiného zásobního roztoku viru.
hodin po elektroporací nebo infekci byly buňky sklizeny do 200 gl lyzovacího pufru následujícího složení: 25 mM Tri s/fosfát, pH 7.8, 0,0 8mM lucifer i n: 0,1 mM ATP, 8mM MgCL, lmM dithiothreitol, lmM EDI A, 15% glycerol a 1% Triton. Eueiferázová aktivita byla měřena luminometrem LU MAT LB9501 (Berthold). V případě transfekovaných buněk byl k lyzovacímu
5? pufru přidán 1% hovězí sérový albumin (BSA) a aktivita byla standardizována na základě aktivi. i? .
C7. 299915 B6 ty CA T. která byla měřena kapalinovou scintilacní metodou. V případě rekombinantních adenovirů byla luciferázová aktivita standardizována pomocí koncentrace proteinu v buněčném extraktu. která byla stanovena pomocí systému Bio-rad (Βίο-Rad Laboratories).
Experimenty in vivo
Samci myši kmene Č5/BÍ6 (Charles River) ve stáři ó měsíců byly podrobeni anesiezi směsí Rompun (Bayer)/Ketamine (UVA) a konstrukt Ad-NRSE PGK Lue byl pomalu inj i kován (2.5 μΐ/ίτιΐ) do jazyku (109 pfu/4x2.5 pl) a do lýtkového svalu v dávce 2.1(f pfu/sval (30 pl).
Myši byly v období od 7. do 35. dne po infekci utraceny pentobarbitalem (Sanofi). Byly vyjmuty prodloužená mícha, jazyk a látkový sval pro měření aktivity luciferázy. Prodloužená mícha byla disoeiována mechanicky ve 200 pl lyzovaciho pufru. Sval a jazyk byly disociovánv pomocí polytronu DIAX 900 (I leidolph) v 1 a 2 ml lyzovaciho pufru (v uvedeném pořadí).
!5
Příklad 1
Konstrukce chimérických promotoru a plazmidovýeh vektorů
Cílem tohoto příkladu je popsat přípravu chimérických promotorů a konstrukci plazmidovýeh vektorů, které obsahují právě tyto promotory'.
Plazmid pPGK-Luc obsahuje gen Lue pod kontrolou všudypřítomného eukaryotického promotoru PGK. Pro získání plazmidu pPGK-Luc byl fragment velikosti 500 bp myšího promotoru PGK vložen do komerčního plazmidu pUT 103 (CAYLA FRANCE), který obsahuje luciťerázový reportérovy gen fúzovaný se zcocincm a polyadeny lační sekvencí SV40 včasné konfiguraci (PolyA).
V dalším kroku byla vložena jedna nebo dvě. tři, šest a dvanáct kopií sekvence NRSE z genu io SCGI0 (TTCAGCACCACGGAGAGTGCC, sekvence id. č. 1) [2] v antiparalelní konfiguraci do polohy proti směru transkripce (upstream) od promotoru PGK. Pro tento účel byl zkonstruován fragment velikosti 26 bp obsahující sekvenci NRSE obklopenou dvěma místy Mlul, a sice hybridizací dvou odpovídajících oligonukleotidů. Tento fragment byl vložen v jedné nebo několika kopiích do Mlul místa pPGK-Luc, čímž vznikly plazmidy obsahující 1. 2 a 3 kopie NRSE sekvence. Plazmid obsahující 6 sekvencí NRSE, byl získán z plazmidu obsahujícího 3 kopie (pNRSE3-PGK-Tuc) následující strategií: fragment Bamlll/Xhol obsahující 3 kopie NRSE, byl vyjmut zpNRSE3 PGK Lue a vložen do místa Xbol v pNRSE3-PGK-Luc, čímž vznikl póNRSlS-PGK-Luc. Podobně byl plazmid obsahující 12 kopií NRSE připraven z plazmidu obsahujícího 6 kopií (p6NRSE-PGK-Luc) tak, že do p6NRSE-PGK-Luc byly vloženy dvě kopie fragmentu BamHl/XhoE
Nakonec expresní kazeta „PGK(s nebo NRSE)-Luc-PolyA“ z různých plazmidů popsaných výše byla vložena do ITR levé části adenovirů (invertovaná terminální repetice, replikační počátek) a sekvenci kódující polypeptid IX (virový kapsidový protein) kyvadlového plazmidu, který' může být užit ke konstrukci defektu ích rekombinantních virů (obr. 1).
Je jasné, že stejný postup lze užít ke konstrukci dalších plazmidů. které obsahují I až 50 kopií motivu NRSE kombinovaných s ubikvitámím promotorem odlišným od PGK. pod jehož kontrolu lze vložil jakýkoliv transgen.
- i ? CZ 299915 B6
Příklad 2
Funkční analýza provedená transfekci buněčných linií
Cílem tohoto příkladu bylo ukázat, že plazmidové konstrukty' obsahující chimérický promotor se sekvencí NRSE jsou funkční a umožňují buněčnou expresi požadovaného genu.
Plazmidové konstrukty popsané v příkladu I byly testovány přechodnou transfekci (elektroporaio cí) linie nervových buněk PC 12 (fcochrornocytom potkana) a 3T3 (fibroblasty potkana). Výsledné hodnoty luciferázové aktivity byly standardizovány vzhledem k aktivitě CAT (chloramfenikoltransferázy). která byla měřena v roztoku obsahujícím 125mM tris—fosfát, pil 7,8. 125μΜ chloramfenikol a 0.12μΜ radioaktivně značený aeetylkoenzym A. l est byl proveden, po inkubaci ve 37 °C po 1 hodinu, po přidání scintilační kapaliny Econofluor pomocí počítače KONT RON. i? Hodnoty luciferázové aktivity byly stanoveny pro každý plazmidový konstrukt, a získané průměrné hodnoty a střední chyby jsou uvedeny na obr. 2.
Získané výsledky ukázaly, že konstrukty obsahující 6 a 12 kopií NRSE byly schopny snížit expresi luciferázy o 66 a 82 % v buňkách jiných než nervových (3T3), což je snížení exprese řádu téměř logaritmu vc srovnání konstruktem pPGK-Luc. Výsledky také ukázaly, že přítomnost motivu NRSE v nervových buňkách PC 12 nesnižuje expresi luciferázy a ve skutečnosti je dokonce schopni jí zvýšit. Statisticky významné zvýšení v rozsahu 25% mezi bylo pozorováno při srovnání pl2NRSE-PGK-Luc a pPGK-Luc.
Výsledky tedy prokázaly. Že plazmidové konstrukty obsahující chimérický promotor se sekvencemi NRSE jsou funkční a dovolují buněčnou expresi požadovaného genu výlučně v nervových buňkách, zatímco exprese genu je v jiných než nervových buňkách významně inhibována.
Příklad 3
Konstrukce defektníeh rekombinantních virů
Cílem tohoto příkladu je popsat přípravu chimérického promotoru a konstrukci virových vektorů, které obsahují konkrétně tyto promotory.
K provedení této studie in vitro a in vivo byly připraveny tři odpovídající adenovirovc konstrukty: Ad-PGK-Luc, Ad-6NRSE-PCK-Euc a AD-12NRSE PGK-Luc. Tyto rekombinantní viry byly zkonstruovány pomocí odborníkovi známých technik, a to tak, že se kotransfekoval kyvadlový plazmid popsaný v příkladu I a defektní genom adenoviru typu 5 do enkapsidační linie (buňky 293). Kyvadlový plazmid byl nejdříve linearizován restrikčním štěpením v místě Fspl a pak byl kotransťekován společně s dlouhým fragmentem adenoviru štěpeného Cla! do buněk 293 metodou kalciumfosfátové precipitace DNA.
Enkapsidované rekombinantní genomy pak byly purifikovány standardními postupy, zejména plakovou purifikační technikou. Integrovaný fragment byl pak ověřen analýzou restrikcních fragmentů a pomocí PCR. Byl připraven virový zásobní roztok namnožením rekombínantního adenoviru na buňkách 293 a pak ultracentrifugací zejména na gradientu chloridu česného, a purifíkaeí na purifikační koloně sc Scphadexem G25M (Pharmacia). Virové titry byly stanoveny měřením optické hustoty a dodatečně byly ověřeny plakovou metodou. Všechny zásobní roztoky viru měly titr přibližně 2 x I08 pfii/μΐ.
- 14CZ 299915 Bó
Příklad 4
Funkční analýza in vitro
Cílem tohoto příkladu bylo ukázat, že virové konstrukty uvedené v příkladu 3. které obsahují chiméricky promotor se sekvencemi NRSE. jsou funkční a umožňují řídit promotor v různých typech buněk.
ío I ři adenoviry zkonstruované v příkladu 3 byly testovány in vitro tak, že byly infikovány buněčné linie a primární kultury dávkami 20 a 200 pfu/buňka. Měření byla provedena s 50 μΐ supernatantu. jak bylo popsáno výše. a standardizována vzhledem k množství celkového proteinu, který byl stanoven pomocí soupravy Bio-rad kc stanovení proteinu (Bio-Rad). Pro každý adenovirus byly stanoveny 3 hodnoty aktivity luciferázy v různých jamkách. Získané průměrné hodnoty a střední chyby jsou uvedeny na obr. 3 pro buněčné linie a na obr. 4 pro primární kultury.
Když byly užity rekombinantní adenoviry' Ad-6NRSE-PGK-Lue a Ad 12NRSE PGK Luc, exprese luciferázového rcportcrovcho genu byla snížena o 97 a 99 %, v uvedeném pořadí, v bunéčné linii jiných než nervových buněk (fibroblasty 3 T3).
V linii nervových buněk PCI2 byla pozorovaná luciferázová aktivita dvou adenoviru obsahujících sekvence NRSE vyšší než u adenoviru Ad-PGK-Luc. Podobně také luciferázová aktivita získaná se 3 adenovirovýrni konstrukty jc podobná po infekci primárních kultur buněk horních krčních ganglií (SCG) z novorozených potkanů (jednofaktorová globální analýza rozptylu
ANO V A neukázala žádný významný rozdíl mezi skupinami). Na druhé straně exprese luciferázy byla snížena o 91 až 98 % po infekci primárních kultur Icdvinných buněk z novorozených potkanů konstrukty rekombinantních adenoviru Ad-6NRSE-PGK-Luc a Ad-12NRSE-PGK-Luc, což je pokles v řádu 2 logaritmů exprese řízenc PGK v přítomnosti 12 kopií NRSE.
so Když byly tří konstrukty užity k infekci astrocytů a nervových buněk získaných z kortexu 17denníeh embryí potkana, ukázalo se, jak se dalo čekat, velmi významné snížení luciferázové aktivity (10 x) u astrocytů v případě konstruktů obsahujících 6 nebo 12 sekvencí NRSE (obr, 3E), což potvrdilo předchozí výsledky. Jak se také očekávalo, luciferázová aktivita všech třech výše zmíněných virových konstruktů byla srovnatelná v buňkách kortexu (obr. 3E).
Tyto výsledky jsou zejména překvapující a pozoruhodné, neboť demonstrují, že (I) chimérické promotory podle předkládaného vynálezu jsou funkční v primárních kulturách. (II) promotory jsou funkční ve virovém kontextu a (III) represorová aktivita je vyšší v adenovirovem kontextu než v odpovídajícím plazmidovem vektoru (srovnej obr. 2 a 3).
Takže tento příklad ukázal, že virové konstrukty obsahující chimérický promotor, který obsahuje sekvence NRSE. jsou funkční a umožňují buněčnou expresi požadovaného genu výlučně v nervových buňkách, zatímco v jiných než nervových buňkách jc exprese významně inhibována.
Příklad 5
Funkční analýza in vivo
5o Cílem tohoto příkladu bylo ukázat, že virové konstrukty popsané v příkladu 3 obsahující chimérický promotor, který obsahuje sekvence NRSE, jsou funkční a dovolují kontrolu promotoru in vivo.
- 15 CZ 299915 Bó
Vzhledem k velmi povzbudivým výsledkům v příkladu 4 byta aktivita konstruktů podle předkládaného vynálezu testována in vivo měřením exprese luciferázy po intramuskulámí injekci (lýtkový sval a sval jazyku) těchto .3 rekombinantních adenovirů do myší.
5.1. injekce do lýtkového svalu
Každý adenovirový konstrukt byl injikován ve 3 stadiích do pravého lýtkového svalu ί myši v dávce 2 x KU pfu/sval a objemu .30 μΙ. Injikovaný sval byl vyjmut 7 dnů po injekci a disoeiován v 1 ml pufru. aby bylo možné stanovit lucilérázovou aktivitu, která byla měřena ve 150 μ! ίο supernatantu. Průměrné hodnoty a střední chyby získané ze 7 měření, vztažené k hodnotě celkového proteinu, jsou uvedeny na obr. 5.
Výsledky ukazují, že když byly užity rekombinantní adenoviry Ad 6NRSF-PGK-I.uc a Ad12NRSE-PGK-Uuc, exprese luciferázy byla snížena o 90 a 96 % jeden týden po injekcích.
Exprese luciferázy po intramuskulámí injekci Ad-12NRSE-PGK Lue a Ad-PGK-I.uc byla u myší porovnávána v delším časovém období. Když byl užit konstrukt Ad-12Ni<SE-PGK Luc, aktivita byla vždy snížena jeden měsíc (95 %) a tři měsíce (91 %) po injekcích.
2o 5.2. Injekce do svalu jazyka
Bylo využito zpětného transportu, aby bylo možné srovnat expresi dvou konstruktů Ad-PGKEuc and Ad-12NRSE-PGK-Luc v prodloužené míše a ve svalu jazyka u myší injikovanyeh intrainuskulámě do jazyka.
Srovnatelně s výsledky již získanými, luciferázové aktivity dvou konstruktů v nervovém systému byly podobné jeden týden po podání (obr. 5B), Naopak, luciferázová aktivita byla snížena o 90 % ve svalu injikovancm konstruktem Ad-12NRSE-PGK-Luc ve srovnání se svalem injikovaným konstruktem Ad-PGK-Lue (obr. 5A). Tato represe se udržuje nejméně 35 dní po infekci.
Je zajímavé, že i přes to, že hladina exprese po 35 dnech je nižší než hladina 8 dnů po infekci, rozdíly v expresi mezi uvedenými virovými konstrukty zůstávají velmi významné.
Uvedené výsledky tedy znovu potvrdily, že konstrukty podle předkládaného vynálezu jsou funkční in vivo a demonstrovaly represní účinek, který byl dokonce větší než účinek pozorovaný in vitro po transfekci plazmidu do buněk jiných než nervových.
Výsledky dále prokázaly vysokou účinnost konstruktů podle předkládaného vynálezu in vivo ve směrování exprese požadovaného genu do nervových buněk. Použití vynálezu v genové terapii umožňuje omezit ektopickou expresi požadovaného transgenu a zabránit tak škodlivým vedlejším účinkům, které mohou vznikat v důsledku difúze transgenu v organismu.
CITOVANÁ LITERATURA f 1] Moři N., Stein R., Sigmund O. and Anderson D. J. Neurone, 4; 583-594 (1990) [2] Moři N.. Schoenherr C., Vandenbergh D. J. and Anderson D. J. Neurone, 9: 45—54 (1992) [3] Li L., Suzuki T„ Moři N. and Greencard P. PNAS USA, 90: 1460-1464 (1993) [4] Schoenherr C. J., Paquetle A. J. and Anderson D. J. PNAS USA. 93: 9981-9886 (1996) [5J Schoenherr C. J. and Anderson D. J. Science. 267: 1360-1363 (1995)
-16C7. 299915 B6 [6] McBurney, Sutherland. Adra, leclair. Kudnicki. Jardine Nucleic Acids Research, Vol. 19, No.20:5755-5761(1991) [7] Moullier P., Marcchal V.. DanosO. and Heard J. M, Transplantation. 56: 427-432 (1993) [8J McDonald R. J„ Lukason M. J.. Raabe O. (í.. Canfield D. R„ Burr E. A., Kaplan J. Wadsworth S. C. and St George J. A. Hum. Gene I her., 8: 41 1422 (199/) (9] Mane R. A.. Kraner S. D.. Goodman R. 11. and Mandel G. Neurone, 4: 223-231 (1990)
Γ10J Bessis A.. Champliaux N„ Chatelin E. and Changeux J, P. PNAS USA, 94: 5906-591 I (1997).
SEZNAM SEKVENCÍ (2) INFORMACE PRO SEKVENCI S ID. Č. 1: Sekvence motivu NRSE (i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 21 páru bází (B) TYP: nukleotidy (C) TYP VLÁKNA: jednoduché (D) TOPOLOGIE: lineární (ii) TYP MOLEKULY: cDNA (iii) HYPOTETICKÁ: Ne 50 (iv) ANTI SENSE: Ne (ix) DALŠÍ ZNAKY:
(A) JMÉNO/OZNAČENÍ: CDS (B) POZICE: E..21 (xi) POPIS SEKVENCE: SEKVENCE S ID. Č. I:
TTCAGCACCA CGGAGAGTGC C 21 (2) INFORMACE PRO SEKVENCI S ID. Č. 2: kanonická sekvence motivu NRSE (i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 21 párů bází (B) TYP: nukleotidy (C) TYP VLÁKNA: jednoduché (D) TOPOLOGIE: lineární (ii) TYP MOLEKULY: cDNA (iii) HYPOTETICKÁ: Ne
- 17 CZ 299915 B6 (iv) ANTI-SENSE: Nc (ix) DALŠÍ ZNAKY:
(A) JMÉNO/OZNAČENÍ: CDS (B) POZICE: 1...21 (xi) POPIS SEKVENCE: SEKVENCE S ID. Č. 2:
TTCAGCACCA CGGACAGCGC C 21 (2) INFORMACE PRO SEKVENCI S ID. C. 3: Obecná sekvence motivu NRSE (i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
b (A) DÉLKA: 21 párů bází (B) TYP: nukleotidy (C) TYP VLÁKNA: jednoduché <D) TOPOLOGIE: lineární (ii) TYP MOLEKULY: cDNA (iii) HYPOTETICKÁ; Ne (ív> ANTI-SENSE: Ne (ix) DALŠÍ ZNAKY:
(A) JMÉNO/OZNAČENÍ: CDS (B) POZICE: 1...21 (xi) POPIS SEKVENCE: SEKVENCE S ID. Č. 3:
NNCAGCACCN NGGANAGNNN C 21 (2) INEORMACE PRO SEKVENCI S ID. Č. 4:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 21 párů bází (B) TYP: nukleotidy io (C) TYP VLÁKNA: jednoduché (D) TOPOLOGIE: lineární (ii) TYP MOLEKULY: cDNA (iii) HYPOTETICKÁ: Ne (iv) ANTI-SENSE: Nc
- ix CZ 299915 B6 (ix) DALŠÍ ZNAKY:
(A) JMÉNO/OZNAČENÍ: CDS (B) POZICE: E..21 (xi) POPIS SEKVENCE: SEKVENCE S ID. Č. 4:
TTCAGCACCA CGGAGAGTGC C io (2) INFORMACE PRO SEKVENCI S ID. Č. 5:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉEKA: 21 párů bází 15 (B) TYP: nukleotidy (C) TYP VLÁKNA: jednoduché (D) TOPOLOGIE: lineární (ii) TYP MOLEKULY: eDNA (iii) HYPOTETICKÁ: Ne (iv) ANTI-SENSE: Ne (ix) DALŠÍ ZNAKY:
(A) JMÉNO/OZNAČENÍ: CDS (B) POZICE: 1...21 (xi) POPIS SEKVENCE: SEKVENCE S ID. Č. 5:
TTCAGCACCG CGGACAGTGC C (2) INFORMACE PRO SEKVENCI S ID. Č. 6: 35 (i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 21 párů bází (B) TYP: nukleotidy (C) TYP VLÁKNA: jednoduché (D) TOPOLOGIE: lineární (ii) TYP MOLEKULY: eDNA (iii) HYPOT ET ICKÁ: Ne (iv) ANTI-SENSE: Ne (ix) DALŠÍ ZNAKY:
(A) JMÉNO/OZNAČENÍ: CDS (B) POZICE: 1...21
- 19C7 299915 Bó (xi) POPIS SEKVENCE; SEKVENCE S ID. Č. 6:
TTCAGCACCT CGGACAGCAT C 21 (i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA. 21 párů bází (B) TYP: nukleotidy (C) TYP VLÁKNA: jednoduché (D) TOPOLOGIE: lineární (ii) TYP MOLEKULY; cDNA (iii) HYPOTETICKÁ; Ne (iv) ANTI-SENSE: Ne (ix) DALŠÍ ZNAKY:
(A) JMÉNO/OZNAČENÍ: CDS (B) POZICE; 1...21 (xi) POPIS SEKVENCE: SEKVENCE S ID. Č. 7;
TTCAGCACCG CGGAGAGCGT C 21 (2) INFORMACE PRO SEKVENCI S ID. Č. 8:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 21 páru bází (B) TYP: nukleotidy (C) TYP VLÁKNA; jednoduché (D) TOPOLOGIE: lineární (ii) TYP MOLEKULY: cDNA (iii) HYPOTETICKÁ: Ne (iv) ANTI-SENSE: Ne (ix) DALŠÍ ZNAKY:
(A) JMÉNO/OZNAČENÍ: CDS (B) POZICE: 1...21 (xi) POPIS SEKVENCE: SEKVENCE S ID. Č. 8:
TCCAGCACCG TGGACAGAGC C 21
-20CZ 299915 B6 ro ) INFORMACE PRO SEKVENCI S ID. Č. 9;
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 21 párů bází (Β) 1 YP: nukleotidy (C) TYP VLÁKNA: jednoduché (D) TOPOLOGIE: lineární (ii) TYP MOLEKULY: cDNA (iii) HYPOTETICKÁ: Ne (iv) ANTI-SENSE: Ne (ix) DALŠÍ ZNAKY:
(A) JMÉNO/OZNAČENÍ: CDS 20 (B) POZICE: I...2I (xi) POPIS SEKVENCE: SEKVENCE S ID. Č. 9:
TTCAGCACCG AGGACGGCGG A 21 (2) INFORMACE PRO SEKVENCI S ID. Č. 10:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 21 párů bází jo (B) TYP: nukleotidy (C) TYP VLÁKNA: jednoduché (D) TOPOLOGIE; lineární (ii) ΊΎΡ MOLEKULY: cDNA 55 (iii) HYPOTETICKÁ: Ne (iv) ANTI-SENSE: Ne
4o (ix) DALŠÍ ZNAKY:
(A) JMÉNO/OZNAČENÍ: CDS (B) POZICE; 1...21 (xi) POPIS SEKVENCE: SEKVENCE S ID. Č. 10:
ATCAGCACCA CGGACAGCGG C 21
(2) INFORMACE PRO SEKVENCI S ID. Č. 1 1:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 21 páru bází (Β) I YP: nukleotidy (C) TYP VLÁKNA: jednoduché (D) TOPOLOGIE: lineární (ii) TYP MOLEKULY: eDNA (iii) HYPOTETICKÁ: Ne (iv) ANTI -SENSE: Ne (ix) DALŠÍ ZNAKY:
(A) JMÉNO/OZNAČENÍ: CDS (B) POZICE: 1...21 (xi) POPIS SEKVENCE: SEKVENCE S ID. Č. 11:
TTCAGCACCT AGGACAGAGG C 21

Claims (25)

PATENTOVÉ NÁROKY
1. Rekombinantní nukleová kyselina, která obsahuje:
ubikvitámí promotor.
- jednu nebo několik sekvencí neuronového elementu restriktivního umlčení (NRSE) a
- terapeutický gen
2(1
2. Rekombinantní nukleová kyselina podle nároku U kde promotor je silný promotor.
3. Rekombinantní nukleová kyselina podle nároku 2. kde promotor je promotor z genu základního metabolismu.
3? uspořádané tak, že exprese terapeutického genu je řízena ubikvitamím promotorem a přitom aktivita tohoto promotoru je řízena sekvencí (sekvencemi) NRSE, přičemž sekvence NRSE obsahuje celou nebo část sekvence id. č. 3, ve které N je A. G, C' nebo T, nebo obsahuje část nebo celou sekvenci vybranou ze skupiny obsahující sekvence id. č. 1, 2 a 4 až 11, nebo varianty těchto sekvencí.
4. Rekombinantní nukleová kyselina podle nároku 3, kde promotor jc vybrán ze skupiny obsahující promotory genu PGK. ΕΠα, β-akt i nu, vimcntinu. adolázy A a α 1- an titry psinu.
- 99 .
5 a ct vivo.
5. Rekombinantní nukleová kyselina podle nároku 1. která obsahuje 1 až 20. výhodně 3 až 15, sekvence NRSE.
5
5(1
6. Rekombinantní nukleová kyselina podle nároku 5, která obsahuje 3, 6 nebo 12 sekvencí
NRSE.
7. Rekombinantní nukleová kyselina podle kteréhokoliv z předchozích nároků, která obsahuje několikrát se opakující sekvenci NRSE. jak je vymezena v nároku 1.
io
8. Rekombinantní nukleová kyselina podle kteréhokoliv z předchozích nároků, kde sekvence NRSE je u mí stěn a/j sou umístěny proti směru transkripce od promotoru,
9. Rekombinantní nukleová kyselina podle nároku 1, kde terapeutický gen je nukleová kyselila na. která obsahuje otevřený čtceí rámec kódující RNA nebo terapeutický nebo vakcinační polypeptid.
10. Rekombinantní nukleová kyselina podle nároku 9. kde terapeutický gen je nukleová kyselina, která obsahuje otevřený čtecí rámec kódující trofický faktor.
11. Rekombinantní nukleová kyselina podle nároku 9, kde terapeutický gen je nukleová kyselina. která obsahuje otevřený čtecí rámec kódující antioxidant.
12. Rekombinantní nukleová kyselina podle nároku I. která kromě sekvencí NRSE obsahuje 2? regulační elementy.
13. Regulační element podle nároku 12. kterým je systém tetracyklinového operátoru/represoru.
14. Vektor, který obsahuje nukleovou kyselinu podle kteréhokoliv z nároků I až 12.
15. Vektor podle nároku 14, který je virový vektor.
16. Defeklní rekombinantní virus, který obsahuje nukleovou kyselinu podle kteréhokoliv z nároků 1 až 12.
17. Virus podle nároku 16, který je adenovirus.
18. Virus podle nároku 16, který je AAV.
io
19. Virus podle nároku 16, který je relrovírus.
20. Virus podle nároku 16, který je rhabdovirus.
21. Použití vektoru podle nároku Í4 pro výrobu přípravku pro přenos nukleove kyseliny a její expresi v nervové tkáni nebo buňkách.
io 28. Použití vektoru podle nároku 14 pro výrobu přípravku pro léčení nemocí motorických neuronů intramuskulárním podáváním nukleové kyseliny do nervové tkáně nebo buněk.
29. Použití podle nároku 27 nebo 28. kdy vektor je virus.
is
30. Farmaceutický přípravek, vyznačující se tím, že obsahuje nukleovou kyselinu podle nároku 1 nebo vektor podle nároku 14 nebo virus podle nároku 16.
31. Přípravek podle nároku 30, vyznačující se tím, že jc formulován pro intramuskulární podávání, výhodně pro podávaní i n tramu skulami injekcí.
32. Chimérický promotor, který obsahuje ubikvitární promotor a jednu nebo několik sekvencí neuronového elementu restriktivního umlčení (NRSE).
33. Chimérický promotor podle nároku 32, kterým je promotor xNRSE-PGK, kde x je celé číslo
21. Buňky, které obsahují nukleovou kyselinu podle nároku 1 nebo vektor podle nároku 14 nebo 45 virus podle nároku 16.
22. Buňky podle nároku 21. které jsou savčí nervové buňky.
23. Použití nukleové kyseliny podle nároku l pro výrobu přípravku pro přenos nuklcových 50 kyselin a jejich expresi v nervových buňkách nebo tkáni,
24. Použití nukleové kyseliny podle nároku 1 pro výrobu přípravku pro léčení nemocí motorických neuronů intramuskulámím podáváním nukleové kyseliny do nervové tkáně nebo buněk.
C'Z 299915 B6
25. Použití defektního rekombinantního viru podle nároku 16 pro přípravu farmaceutické kompozice pro přenos nukleových kyselin pro nervově specifickou expresi.
26. Použití podle nároku 25 k přenosu genu a jeho expresí v nervových buňkách in vitro
25 od 1 do 50,
CZ20002906A 1998-02-12 1999-01-14 Rekombinantní nukleová kyselina obsahující negativní regulacní elementy pro nervove specifickou expresi transgenu a její použití CZ299915B6 (cs)

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
FR9801715A FR2774698B1 (fr) 1998-02-12 1998-02-12 Utilisation d'elements de regulation negative pour l'expression neurospecifique de transgenes

Publications (2)

Publication Number Publication Date
CZ20002906A3 CZ20002906A3 (cs) 2000-11-15
CZ299915B6 true CZ299915B6 (cs) 2008-12-29

Family

ID=9522917

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
CZ20002906A CZ299915B6 (cs) 1998-02-12 1999-01-14 Rekombinantní nukleová kyselina obsahující negativní regulacní elementy pro nervove specifickou expresi transgenu a její použití

Country Status (16)

Country Link
US (1) US20060121013A1 (cs)
EP (2) EP1120466A3 (cs)
JP (1) JP2002503476A (cs)
KR (2) KR20070013362A (cs)
CN (1) CN1221665C (cs)
AU (1) AU766153B2 (cs)
BR (1) BR9907759A (cs)
CA (1) CA2321220A1 (cs)
CZ (1) CZ299915B6 (cs)
FR (1) FR2774698B1 (cs)
HU (1) HUP0100660A3 (cs)
IL (1) IL137609A0 (cs)
NO (1) NO20004025L (cs)
PL (1) PL198201B1 (cs)
WO (1) WO1999041396A1 (cs)
ZA (1) ZA991070B (cs)

Families Citing this family (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN115887655B (zh) * 2021-09-30 2025-06-17 上海鲸奇生物科技有限公司 直接转分化治疗神经系统疾病

Citations (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO1996027665A2 (en) * 1995-03-03 1996-09-12 California Institute Of Technology Neuron-restrictive silencer factor proteins
WO1997013866A2 (en) * 1995-10-11 1997-04-17 University Of British Columbia Recombinant herpes virus vectors for expression in neuronal cells

Family Cites Families (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US5912411A (en) * 1993-06-14 1999-06-15 University Of Heidelberg Mice transgenic for a tetracycline-inducible transcriptional activator
TWM447817U (zh) * 2012-09-21 2013-03-01 Basso Ind Corp 具有縮頭部的氣動棘輪扳手
TWI555260B (zh) * 2016-02-05 2016-10-21 見智科技股份有限公司 電池模組及其製造方法

Patent Citations (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO1996027665A2 (en) * 1995-03-03 1996-09-12 California Institute Of Technology Neuron-restrictive silencer factor proteins
WO1997013866A2 (en) * 1995-10-11 1997-04-17 University Of British Columbia Recombinant herpes virus vectors for expression in neuronal cells

Non-Patent Citations (4)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
Bessis, A. et al.: "The neuron-restrictive silencer element: A dual enhancer/silencer crucial for patterned expression of a nicotinic receptor gene in the brain", PNAS USA 94, 5906-5911,1997 *
Martinou, J.C. et al.: "Overexpression of BCL-2 in transgenic mice protects neurons from naturally occurring cell death and experimental ischemia", Neuron, 13 (4), 1017-1030, 1994 *
Nishiyama, S. et al.: "The silencer of mouse Pgk-2 consists of two discrete DNA elements that individually have no effect", Gene 141 (2), 261-266, 1994 *
Schoenherr, C.J. and D.J. Anderson: "The neuron-restrictive silencer factor (NRSF): a coordinate repressor of multiple neuron-specific genes", Science, 267(5202), 1360-1363, 1995 *

Also Published As

Publication number Publication date
ZA991070B (en) 1999-08-11
EP1053341A1 (fr) 2000-11-22
KR20010072544A (ko) 2001-07-31
KR20070013362A (ko) 2007-01-30
CN1290303A (zh) 2001-04-04
NO20004025D0 (no) 2000-08-10
KR100720201B1 (ko) 2007-05-21
CZ20002906A3 (cs) 2000-11-15
HUP0100660A1 (hu) 2001-06-28
HUP0100660A3 (en) 2003-10-28
WO1999041396A1 (fr) 1999-08-19
AU2058199A (en) 1999-08-30
PL342265A1 (en) 2001-06-04
US20060121013A1 (en) 2006-06-08
PL198201B1 (pl) 2008-06-30
FR2774698A1 (fr) 1999-08-13
JP2002503476A (ja) 2002-02-05
CN1221665C (zh) 2005-10-05
AU766153B2 (en) 2003-10-09
IL137609A0 (en) 2001-07-24
CA2321220A1 (fr) 1999-08-19
EP1120466A2 (fr) 2001-08-01
NO20004025L (no) 2000-10-10
EP1120466A3 (fr) 2003-01-22
FR2774698B1 (fr) 2002-03-01
BR9907759A (pt) 2000-10-17

Similar Documents

Publication Publication Date Title
CN114174520B (zh) 用于选择性基因调节的组合物和方法
KR100403708B1 (ko) 재조합아데노-수반바이러스(aav)제조방법및이의용도
ES2264123T3 (es) Adenovirus recombinantes defectivos para la terapia genica de tumores.
KR20210103469A (ko) 재조합 바이러스 벡터 및 이를 생산하기 위한 핵산
JPH08510122A (ja) 動物起源のアデノウイルスベクターおよび遺伝子治療におけるそれらの使用
JPH11503314A (ja) ウイルスベクターおよび過増殖性疾患、特に再発性狭窄症を治療するための該ベクターの使用
JP2003265193A (ja) 組換えp53アデノウイルス
Duale et al. Differences in transductional tropism of adenoviral and lentiviral vectors in the rat brainstem
JP2021534814A (ja) アルファ−シヌクレインに対するバリアントRNAi
JP2023542614A (ja) レット症候群の治療のためのアデノ随伴ウイルスベクター
CN117545842A (zh) SMN1和miR-23a在治疗脊髓性肌萎缩中的协同效应
JP2024109708A (ja) 非症候性感音性聴力喪失の治療方法
HU226018B1 (en) Deficien recombinant adenovirus vectors, method for reducing homologous recombination phenomena and method for producing said adenoviruses
CN115803441A (zh) 用于恢复pah基因功能的腺相关病毒组合物和其使用方法
JPH11503608A (ja) グルコースで誘導し得る組換えウイルスベクター
JP2022512831A (ja) 網膜疾患の遺伝子治療
US20030100116A1 (en) Canine adenovirus vectors for the transfer of genes in targeted cells
CZ20002906A3 (cs) Rekombinantní nukleová kyselina obsahující negativní regulační elementy pro nervově specifickou exresi transgenu a její použití
Jani et al. Modulation of cell-mediated immunity prolongs adenovirus-mediated transgene expression in sciatic nerve
JP3937446B2 (ja) 特に神経変性疾患の治療のための医薬組成物およびその使用
CN115484975A (zh) 用于ids基因转移的腺相关病毒组合物和其使用方法
US20020031493A1 (en) Recombinant adenoviruses coding for glial-derived cell neurotrophic factor (gdnf)
EP1118670A1 (en) Canine adenovirus vectors for the transfer of genes in targeted cells
RU2839898C2 (ru) Синергетическое действие SMN1 и miR-23a при лечении спинальной мышечной атрофии
JP2002503086A (ja) Hsv/aavハイブリッドアンプリコンベクター

Legal Events

Date Code Title Description
MM4A Patent lapsed due to non-payment of fee

Effective date: 20100114