DE19937837A1 - OLFXX Gen, cDNA, Expression u. Aminosäuresequenz - Google Patents
OLFXX Gen, cDNA, Expression u. AminosäuresequenzInfo
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Description
Mit Hilfe der Aminosäuresequenz eines G Protein gekoppelten Rezeptors wurde durch
Homologiesuche in einer öffentlich zugänglichen Datenbank ein potentielles Gen für einen
neuen G Protein gekoppelten Rezeptor auf dem humanen X-Chromosom identifiziert. Aus der
Gensequenz wurden Oligonukleotide zur Amplifikation des potentiellen Rezeptorgens und
dessen abgeleiteter cDNA (mRNA) Sequenz hergestellt und für die PCR-Amplifikation des
Gens und der cDNA eingesetzt. Mittels dieser Primer konnte der kodierende Teil des
intronlosen Gens aus humaner genomischer DNA kloniert und sequenziert werden. Das Gen
(4486 Basenpaare) enthält (wie viele Gene von G Protein-gekoppelten Rezeptoren) keine
Introns. Der kodierende Bereich des Gens (Pos. 1287 bis 2210) besteht aus einem offenem
Leseraster von 924 Basen und kodiert somit ein Protein von 308 Aminosäuren.
Hydrophobizitätsanalyse der Aminosäuresequenz ergibt, daß es sich um einen G Protein-
gekoppelten Rezeptor mit sieben transmembranalen Domänen handelt. Die
Aminosäuresequenz ist neu und bisher unbekannt und weist die beste Homologie (50%
Identität; 69% Homologie) zu einem "olfactorischen" (Geruchstoff, Chemozeptor, Lockstoff-)
Rezeptor der Ratte auf. Die zweithöchste Homologie (46% Identität; 65% Homologie) besteht
zu einem humanen "olfactorischen Rezeptor 3 ", der. Weiterhin gehören zu der zu
patentierenden Sequenz 1286Basen des 5' nichttranslatierten Bereichs des Gens, welche
vermutlich den Promotor (mit typischer TATA Box und CAP Signal) enthalten, sowie 2266
Basen des 3' nichttranslatierten Bereichs des Gens welche ein typisches
Polyadenylierungssignal (AATAAA) in Position 2571 bis 2576 enthalten. Weiterhin ist auf
dem 3' Ende der genomischen DNA (Position 4279 bis Ende) ein L1-Element welches
vermutlich ein retrotransposables Element darstellt enthalten.
2. Die von der cDNA Sequenz abgeleitete Aminosäuresequenz des Rezeptors ist 308
Aminosäuren lang. Hydrophobizitätsanalyse der Aminosäuresequenz ergibt eine putative
Sekundärstruktur des Proteins als integrales Membransprotein mit 7 transmembranalen
Domänen. Das Protein enthält zwei potentielle N-Glykosylierungstellen im N-terminalen
Bereich (Aminosäure Positionen 5 und 65). Weiterhin sind in der Aminosäuresequenz zwei
potentielle Proteinkinase C Phosphorylierungsstellen (Aminosäure Positionen 162 und 290)
enthalten, deren fakultative Phosphorylierung (sofern sie intrazellulär lokalisiert sind) an der
Modulation der Rezeptorfunktion beteiligt sein können. In den Positionen 67, 187, 192 und
265 der Aminosäuresequenz befindet sich potentielle Caseinkinase II
Phosphorylierungsstellen.
Der Rezeptor gehört höchstwahrscheinlich zur großen Genfamile der G-Protein-gekoppleten
Rezeptoren (GPCRs). Innerhalb dieser Großfamile zählt er zur Sub-Famile der "Klasse A
Rhodopsin-ähnlichen" Rezeptoren. Er besitzt hohe Homologie zu olfactorischen Rezeptoren,
welche in olfactorischen Neuronen, aber auch in vielen anderen Geweben wie z. B. Placenta,
embryonales Herz, Pankreas, Milz etc exprimiert werden. Diese Rezeptoren vermitteln eine
Vielzahl verschiedener Reize, unter anderem die Reizvermittlung von Geruchsstoffen, von
chemotaktischen Signalen, Lockstoffen und Sexuallockstoffen. Da das Gen unseres neu
entdeckten Rezeptors auf dem X-Chromosom lokalisiert ist haben wir ihm die Bezeichnung
OlfXX verliehen.
Claims (17)
1. Das dargestellte Gen inclusive des 5' und 3' nichttranslatierten Bereichs
2. Transkriptionsfaktoren, RNA Polymerasen und Pharmaka sowie Chemikalien die die
Expresssion des Gens in positiver oder negativer Weise beeinflussen.
3. Die von dem Gen transkribierte messenger RNA inclusive davon abgeleitete
Spleißvarianten und Isoformen.
4. Die von der mRNA oder von dem intronlosen Gen abgeleitete cDNA.
5. Das von der mRNA (oder dem Gen oder der cDNA) abgeleitete oder hergestellte Protein.
6. Antikörper oder Antiseren welche gegen einzelne oder mehrere Epitope des Proteins oder
gegen das ganze Protein hergestellt werden.
7. Monoklonale Antikörper oder Antiseren die gegen einzelne oder mehrere Epitope des
Proteins oder gegen das ganze Protein hergestellt werden.
8. Expressionssysteme (eukaryotische Zellinien, Hefezellen, Xenopus Oocyten,
Baculovirussysteme, bakterielle Expressionssysteme) welche das genannte Protein
exprimieren (nativ oder recombinant)
9. Ligand Bindungsstudien und Screening assays an nativen oder recombinanten Rezeptoren
oder Zellen oder Zellmembranen welche diesen Rezeptor enthalten.
10. Transgene Tiere und knock out Tiere welche diesen Rezeptor in veränderter Dichte oder
gar nicht exprimieren.
11. Methoden der Gentherapie welche sich auf diesen Rezeptor bzw sein Gen oder seine
mRNA (cDNA) erstrecken und deren Entwicklung und Anwendung.
12. Sense und Antisense Oligonukleotide welche von diesem Gen abgeleitet wurden sowie
deren Anwendung.
13. Die Diagnose und Behandlung von Krankheiten die mit diesem Rezeptor in direkter oder
indirekter Weise in Verbindung stehen.
14. Neue Therapien und Anwendungen von Stoffen welche direkt oder indirekt über diesen
Rezeptor wirken
15. Methoden zur Diagnose von Erkrankungen die mit diesem Rezeptor (oder dessen Gen,
mRNA) in direkter oder indirekter Weise in Verbindung stehen wie z. B.
Hybridisierungstechniken, Sequenzierung, SSCP, RFLP, Northern Blot, Southern Blot,
Western Blot, Expressions Arrays, Antikörper, Mutationsanalysen.
16. Die Benutzung der Informationen zur Entwicklung neuer Pharmaka, Verbindungen,
Duftstoffen, Lockstoffen, Hormonen, Chemikalien und die Evaluierung vorhandener
Pharmaka, Verbindungen und Chemikalien sowie zur Entwicklung neuer Technologien oder
Evaluierung vorhandener Technologien.
17. Das Patent soll sich auch erstrecken auf die Punkte 1. bis 15. für modifizierte Proteine,
und Gen, cDNA und mRNA Sequenzen (Aminosäureaustausche, Basenaustausche).
Priority Applications (1)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| DE1999137837 DE19937837A1 (de) | 1999-08-13 | 1999-08-13 | OLFXX Gen, cDNA, Expression u. Aminosäuresequenz |
Applications Claiming Priority (1)
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| DE1999137837 DE19937837A1 (de) | 1999-08-13 | 1999-08-13 | OLFXX Gen, cDNA, Expression u. Aminosäuresequenz |
Publications (1)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| DE19937837A1 true DE19937837A1 (de) | 2001-02-22 |
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Family Applications (1)
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|---|---|---|---|
| DE1999137837 Withdrawn DE19937837A1 (de) | 1999-08-13 | 1999-08-13 | OLFXX Gen, cDNA, Expression u. Aminosäuresequenz |
Country Status (1)
| Country | Link |
|---|---|
| DE (1) | DE19937837A1 (de) |
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1999
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