DE19937839A1 - OLFXY (gen, cDNA, Expression, Aminosäuresequenz) - Google Patents

OLFXY (gen, cDNA, Expression, Aminosäuresequenz)

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DE19937839A1
DE19937839A1 DE1999137839 DE19937839A DE19937839A1 DE 19937839 A1 DE19937839 A1 DE 19937839A1 DE 1999137839 DE1999137839 DE 1999137839 DE 19937839 A DE19937839 A DE 19937839A DE 19937839 A1 DE19937839 A1 DE 19937839A1
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Michael Brues
Heinz Boenisch
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    • C07K14/00Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
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    • CCHEMISTRY; METALLURGY
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Description

1. Mit Hilfe der Aminosäuresequenz eines G Protein gekoppelten Rezeptors wurde durch Homologiesuche in einer öffentlich zugänglichen Datenbank ein potentielles Gen für einen neuen G Protein gekoppelten Rezeptor auf dem humanen Chromosom 6 identifiziert. Aus der Gensequenz wurden Oligonukleotide zur Amplifikation des potentiellen Rezeptorgens und dessen abgeleiteter cDNA (mRNA) Sequenz hergestellt und für die PCR-Amplifikation des Gens und der cDNA eingesetzt. Mittels dieser Primer konnte das intronlose Gen aus humaner genomischer DNA kloniert und sequenziert werden. Sequenzierung des Gens ergab folgende Eigenschaften des Gens: das Gen (3600 Basenpaare) enthält (wie viele Gene von G Protein- gekoppelten Rezeptoren) keine Introns im kodierenden Bereich. Der kodierende Bereich des Gens (Pos. 1179 bis 2141) besteht aus einem offenem Leseraster von 963 Basen und kodiert somit ein Protein von 321 Aminosäuren. Hydrophobizitätsanalyse der Aminosäuresequenz ergibt, daß es sich um einen G Protein-gekoppelten Rezeptor mit sieben transmembranalen Domänen handelt. Die Aminosäuresequenz ist neu und bisher unbekannt und weist die beste Homologie (50% Identität; 72% Homologie) zu einem olfactorischen Rezeptor (OLF3) des Hundes auf. Die zweithöchste Homologie (48% Identität; 69% Homologie) besteht zu einem olfactorischen Rezeptor der Ratte (OL1) und zu einem olfactorischen Rezeptor des Menschen (51% Identität und 68% Homologie). Weiterhin gehören zu der zu patentierenden Sequenz 1178 Basen des 5' nichttranslatierten Bereichs des Gens, welche vermutlich den Promotor (mit typischer TATA Box und CAP Signal) enthalten, sowie 1459 Basen des 3' nichttranslatierten Bereichs des Gens, welche ein typisches Polyadenylierungssignal in Position 2923 bis 2928 enthalten.
2. Die Expression dieses Gens konnten wir bestätigen durch das Auffinden eines humanen ESTs (expressed Sequence Tag) in einer Datenbank (NCBI). Diese Sequenz ist 387 Basen lang und entspricht unserem Gen im Bereich von Pos. 1095 bis 1265 also dem 5' nichttranslatierten Bereich und dem N-terminalen codierenden Bereich. Die Sequenz des ESTs entstammt aus einer Mischung von drei Geweben (Lunge, Testes und B-Zellen), sodaß davon ausgegangen werden kann, daß der olfactorische Rezeptor zumindest in einem dieser Gewebe exprimiert wird.
Zeichen: MBHB-REZEPT
3. Die von der cDNA Sequenz abgeleitete Aminosäuresequenz des Rezeptors ist 321 Aminosäuren lang. Hydrophobizitätsanalyse der Aminosäuresequenz ergibt eine putative Sekundärstruktur des Proteins als integrales Membransprotein mit 6 bis 8 transmembranalen Domänen (je nachdem, welche Software angewendet wird). Das Protein enthält zwei potentielle N-Glykosylierungstellen (Aminosäure Positionen 5, und 191). Weiterhin sind in der Aminosäuresequenz drei potentielle Proteinkinase C Phosphorylierungsstellen (Aminosäure Positionen 87, 267, und 291) enthalten, deren fakultative Phosphorylierung (sofern sie intrazellulär lokalisiert sind) an der Modulation der Rezeptorfunktion beteiligt sein können. In den Positionen 49, 193 und 313 der Aminosäuresequenz befinden sich drei potentielle Caseinkinase II Phosphorylierungsstellen.
4. Einordnung und potentielle Funktionen des zu patentierenden Rezeptors und seines Gens (bzw cDNA; mRNA):
Der Rezeptor gehört zur großen Genfamile der G-Protein-gekoppelten Rezeptoren (GPCRs). Innerhalb dieser Großfamile zählt er zur Sub-Famile der "Klasse A Rhodopsin-ähnlichen" Rezeptoren. Er besitzt hohe Homologie zu verschiedenen olfactorischen Rezeptoren, welche Duftstoffe, Lockstoffe, chemotaktische Substanzen, Sexuallockstoffe, Immunmodulatorstoffe oder andere Substanzen binden können und dann intrazellulär durch second messenger ein Signal weiterleiten, welches dann direkt oder indirekt zu einem Effekt führt.
Wir haben diesem neuen olfactorischen Rezeptor die Bezeichnung OLFXY gegeben.
MBHB-Rezept-5: OLFXY Gen
MBHB-Rezept-5: OlfXY-Aminosäuresequenz

Claims (16)

1. Das dargestellte Gen inclusive des 5' und 3' nichttranslatierten Bereichs.
2. Transkriptionsfaktoren, RNA Polymerasen und Pharmaka sowie Chemikalien, die die Expresssion des Gens in positiver oder negativer Weise beeinflussen.
3. Die von dem Gen transkribierte messenger RNA inclusive davon abgeleitete Spleißvarianten und Isoformen.
4. Die von der mRNA oder von dem intronlosen Gen abgeleitete cDNA.
5. Das von der mRNA (oder dem Gen oder der cDNA) abgeleitete oder hergestellte Protein.
6. Antikörper oder Antiseren, welche gegen einzelne oder mehrere Epitope des Proteins oder gegen das ganze Protein hergestellt werden.
7. Monoklonale Antikörper oder Antiseren, die gegen einzelne oder mehrere Epitope des Proteins oder gegen das ganze Protein hergestellt werden.
8. Expressionssysteme (eukaryotische Zellinien, Hefezellen, Xenopus Oocyten, Baculovirussysteme, bakterielle Expressionssysteme), welche das genannte Protein exprimieren (nativ oder recombinant).
9. Ligand Bindungsstudien und Screening assays an nativen oder recombinanten Rezeptoren oder Zellen oder Zellmembranen, welche diesen Rezeptor enthalten.
10. Transgene Tiere und knock out Tiere, welche diesen Rezeptor in veränderter Dichte oder gar nicht exprimieren.
11. Methoden der Gentherapie, welche sich auf diesen Rezeptor bzw. sein Gen oder seine mRNA (cDNA) erstrecken und deren Entwicklung und Anwendung.
12. Sense und Antisense Oligonukleotide, welche von diesem Gen abgeleitet wurden sowie deren Anwendung.
13. Die Diagnose und Behandlung von Krankheiten, die mit diesem Rezeptor in direkter oder indirekter Weise in Verbindung stehen.
14. Methoden zur Diagnose von Erkrankungen, die mit diesem Rezeptor (oder dessen Gen, mRNA) in direkter oder indirekter Weise in Verbindung stehen wie z. B. Hybridisierungstechniken, Sequenzierung, SSCP, RFLP, Northern Blot, Southern Blot, Western Blot, Expressions Arrays, Antikörper, Mutationsanalysen.
15. Die Benutzung der Informationen zur Entwicklung neuer Pharmaka, Verbindungen und Chemikalien und Therapien und die Evaluierung vorhandener Pharmaka, Verbindungen und Chemikalien sowie zur Entwicklung neuer Technologien oder Evaluierung vorhandener Technologien.
16. Das Patent soll sich auch erstrecken auf die Punkte 1. bis 15. für modifizierte Proteine, und Gen, cDNA und mRNA Sequenzen (Aminosäureaustausche, Basenaustausche).
DE1999137839 1999-08-13 1999-08-13 OLFXY (gen, cDNA, Expression, Aminosäuresequenz) Withdrawn DE19937839A1 (de)

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Cited By (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
EP1925286A1 (de) 2006-11-24 2008-05-28 KPSS-Kao Professional Salon Services GmbH Körperreinigungszusammensetzung

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