DK160565B - Plasmid p sg 2, fremgangsmaade til dets fremstilling og dets anvendelse - Google Patents

Plasmid p sg 2, fremgangsmaade til dets fremstilling og dets anvendelse Download PDF

Info

Publication number
DK160565B
DK160565B DK192482A DK192482A DK160565B DK 160565 B DK160565 B DK 160565B DK 192482 A DK192482 A DK 192482A DK 192482 A DK192482 A DK 192482A DK 160565 B DK160565 B DK 160565B
Authority
DK
Denmark
Prior art keywords
plasmid
fragments
culture
length
lengths
Prior art date
Application number
DK192482A
Other languages
English (en)
Other versions
DK192482A (da
DK160565C (da
Inventor
Alfred Puehler
Wolfgang Wohlleben
Michael Leineweber
Original Assignee
Hoechst Ag
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Family has litigation
First worldwide family litigation filed litigation Critical https://patents.darts-ip.com/?family=6131159&utm_source=google_patent&utm_medium=platform_link&utm_campaign=public_patent_search&patent=DK160565(B) "Global patent litigation dataset” by Darts-ip is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License.
Application filed by Hoechst Ag filed Critical Hoechst Ag
Publication of DK192482A publication Critical patent/DK192482A/da
Publication of DK160565B publication Critical patent/DK160565B/da
Application granted granted Critical
Publication of DK160565C publication Critical patent/DK160565C/da

Links

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09Recombinant DNA-technology
    • C12N15/63Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
    • C12N15/74Vectors or expression systems specially adapted for prokaryotic hosts other than E. coli, e.g. Lactobacillus, Micromonospora
    • C12N15/76Vectors or expression systems specially adapted for prokaryotic hosts other than E. coli, e.g. Lactobacillus, Micromonospora for Actinomyces; for Streptomyces

Landscapes

  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Plant Pathology (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Saccharide Compounds (AREA)
  • Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
  • Enzymes And Modification Thereof (AREA)
  • Preparation Of Compounds By Using Micro-Organisms (AREA)

Description

DK 160565 B
Opfindelsen angår plasmidet p SG 2, en fremgangsmåde til dets fremstilling og dets anvendelse.
Det er fra DE offentliggørelsesskrift nr. 3.005.226 kendt, at plasmidet p UC 6 kan fremstilles ud fra en kultur 5 af Streptomyces espinosus. Det er endvidere fra PCT-ansøgning nr. 79/01169 kendt, at der ud fra Streptomyces lividans kan fremstilles et plasmid, der synes egnet som vektor til indføring af DNA i mikroorganismer.
Det fremgår heraf, at anvendelsen af genteknologiske 10 metoder på antibiotikadannende Streptomycesarter tillægges særlig betydning. Imidlertid er de hidtil kendte metoder forblevet af ringe interesse for praktisk anvendelse.
Den genetiske forbedring af de til antibiotikafremstilling anvendte Streptomycet-stammer med det formål at 15 forøge mængden af det dannede antibiotikum er en vigtig opgave. Den kan imidlertid kun løses med held ved genteknologiske metoder, når man har et plasmid til rådighed, der ikke straks igen elimineres fra den som værtscelle anvendte Streptomyces-art, som det hyppigt observeres ved arter, der 20 ikke er beslægtet med hinanden.
Det har derfor været opgaven at fremstille tilstrækkelige mængder af et plasmid, der er egnet som vektor til genetisk forbedring af Streptomyces ghanaensis-stammer.
Det har nu ifølge opfindelsen vist sig, at denne 25 opgave løses med plasmidet p SG 2, der er ejendommeligt ved, at det kan fremstilles ud fra en kultur af Streptomyces ghanaensis ATCC 14 672 og har en konturlængde på 4,58 /m og en molekyllængde på ca. 13,8 kilobaser (kb), og at det ikke fragmenteres af restriktions-endonucleaserne EcoR I, BamH 30 I, Sal I, Hpa I og Hind II, men spaltes af restriktions— endonucleasen Hind III til et fragment med en længde på ca. 14 kb, af Cla I til to fragmenter med længderne 10,15 kb og 3,65 kb og af Pst I til to fragmenter med længderne 10,85 kb og 3,0 kb, af Bgl II til to fragmenter med længderne 35 11,25kb og 2,6 kb, samt af Bel I til tre fragmenter med længderne 11,6 kb, 1,25 kb og 1,0 kb.
2
DK 160565 B
Opfindelsen angår også en fremgangsmåde til fremstilling af plasmidet p SG 2, hvilken fremgangsmåde er ejendommelig ved, at en kultur af Streptomyces ghanaensis ATCC 14 672 lyseres, og plasmidet isoleres.
5 Opfindelsen angår endelig også anvendelsen af plasmid p SG 2 til konstruktion af vektorpiasmider.
Den her anvendte stamme af Streptomyces ghanaensis er beskrevet i enkeltheder i DE-patentskrift nr. 1.113.791 og betegnes dér S. ghanaensis nov. sp. 4092. I en kultur af 10 Streptomyces ghanaensis foreligger der pr. celle ca. 10-20 kopier af plasmidet p SG 2. Dette plasmid er således et egnet udgangsplasmid til anvendelse af genteknologiske metoder på både stammen Streptomyces ghanaensis selv og på andre Streptomyces-arter.
15 Plasmidet p SG 2 har en molekylvægt på ca. 9,2 mega- dalton og en molekyllængde på ca. 13,8 kilobaser. Dette er påvist ved agarose-gelelektroforese af molekylet selv og dets spaltningsstykker. Bestemmelsen af længden til 4,58 ± 0,09 /im er fremkommet ved elektronmikroskopisk udmåling af 20 27 plasmidmolekyler. Intensiteten af plasmidbåndene ved elektroforesen tillader en vurdering af kopiantallet pr. celle til ca. 10-20. Ved fragmentering af plasmidet p SG 2 med et større antal kendte restriktions-endonucleaser er spaltningsstederne og fragmentlængderne bestemt, og de 25 er sammenfattet i den følgende tabel.
O
3 DK 160565B
Restriktionsforhold for p SG 2 ved behandling af forskellige enzymer: 5 Restriktions- Antal spalt- Længde af Totallængde enzym__ningssteder fragmenter__
EcoRI
BamHI
Sall 10
Hpal Hindi I
Hindlll 1 ^14 kb ^14 kb
Bglll 2 11,25 kb 13,85 kb 2,6 kb 15 Clal 2 10,15 kb 13,8 kb 3,65 kb
PstI 2 10,85 kb 13,85 kb 3.0 kb 20 Bell 3 11,6 kb 13,85 kb 1,25 kb 1.0 kb
BstEII 8 3,8 kb 13,65 kb 2,45 kb 25 1,9 kb 1.15 kb 1.15 kb 1.0 kb 0,9 kb 30____0,8 kb____
Smal 10
Xhol 10 ikke be-·
Sau3A__10___stemt____ 35
O
4 DK 160565 B
Et restriktions-endonuclease-spaltningsbillede af p SG 2 er vist på den vedføjede tegning. På denne kan ses et langt og et kort PstI- hhv. Clal- og Bglll-frag-ment samt et langt og to korte BclI-f ragmen ter. Spaltnings-5 stedernes position i forhold til hinanden er bestemt ved del- og dobbelt-enzymbehandlinger.
Plasmidet p SG 2 angribes altså overhovedet ikke af restriktions-endonucleaserne EcoR I, BamH I, Sal I, Hpa I og Hind II, men af restriktions-endonucleasen Hind III spaltes til Ί0 et fragment med en længde på ca. 14 kb, af Cla I til to fragmen ter med længderne 10,15 og 3,65 kb og af Pst I til to fragmenter med længderne 10,85 og 3,0 kb, af Bgl II til to fragmenter med længderne 11,25 kb og 2,6 kb samt af Bel I i tre fragmenter med længderne 11,6 kb, 1,25 kb og 1,0 kb.
15 Dette mønster tydeliggør, at plasmidet p SG 2 kan anvendes til konstruktion af et vektorplasmid. Ved arbejdet på genetisk ændring af dette plasmid kan der anvendes de samme metoder, som med held er blevet anvendt ved Escherichia coli-plasmider og f.eks. er beskrevet af 20 M. Bibb, J.C. Schottel og S.N. Cohen, Nature 284, 526-531 (1980), og C.J. Thompson, J.M. Ward og D.A. Hopwood,
Nature 286, 525-527 (1980).
Således kan der i Hind III-, Cla I-, Bgl II-,
Pst I- og Bel I-spaltningsstederne uden videre indføres 25 antibiotika-resistenser. Endvidere synes det muligt at indføre gener i plasmidet p SG 2, som hos Streptomyces ghanaensis fører til en forøgelse af antibiotikaproduktionen. På tale kommer herved både gener for biosyntesevejen og reguleringsgener. Således modificerede p SG 2-30 -plasmider er ifølge alle indtil nu foreliggende iagttagelser lige så leve- og formeringsdygtige som udgangsplasmidet.
Plasmidet p SG 2 fås ud fra en kultur af Streptomyces ghanaensis ATCC 14 672 ved dyrkning af kulturen på et egnet medium, fragmentering af myceliet, inkubering 35 af det fragmenterede mycelium, høstning af kulturen og påfølgende lysering af myceliet. Isoleringen af plasmidet
s DK 160565 B
0 fra lysatet lykkes ved en alkalisk denaturering, hvorved man lader en ca. 0,1-0,5N natriumhydroxidopløsning, til hvilken der hensigtsmæssigt er sat ca. 1% natriumdodecyl-sulfat, indvirke på lysatet ved ca. 0°C i indtil 10 minutter.
5 Derefter indstilles der igen til en svagt sur pH-værdi ved tilsætning af en pufferopløsning og opnås derved en renaturering. Derpå centrifugeres blandingen, og ud fra den ovenstående væske fremstilles ved tilsætning af et overskud af ethanol ved -20°C og påfølgende centri-10 fugering en pellet. Denne pellet optages derpå i en puffer opløsning og underkastes i en cæsiumchlorid-ethidiumbromid-opløsning en isopyknisk vægtfyldegradientcentrifugering i en ultracentrifuge. Derefter udtages plasmiderne fra gradienten ved punktering, renses chromatografisk og karakteriseres i 15 agarosegel og i elektronmikroskop. Der er her tale om kendte metoder (jfr. R. Radloff, W. Bauer, J. Vinograd. Proc.
Nati. Acad. Sci. USA, 57, 1514-1521 (1967) og A.A.
Szalay, C.J. Mackey, H.W.R. Langridge, Enzyme Microb.
Techno1. 1, 154-164 (1976).
20 Her og i det følgende er procentangivelserne efter vægt, hvis der ikke er angivet andet.
Eksempel 1
Til fremstilling af plasmidet p SG 2 gås der 25 frem på følgende måde:
En kultur af Streptomyces ghanaensis ATCC 14 672 dyrkes i 3-5 dage ved 30°C i 100 ml af et næringsmedium med følgende sammensætning: 30 glucose 1 g pepton 0,4 g gærekstrakt 0,4 g
MgS04, 7H20 0,05 g KH2P04 0,2 g 35 K2HP04 0,4 g glycin 2 g aq. dest. ad 100 g
6 DK 160565 B
O
Kulturens ovenstående væske fjernes derefter, og restkulturen homogeniseres og centrifugeres derpå i 5 minutter. Efter to ganges vask i en pufferopløsning bestående af 10 mmol tris-HCl og 1 mmol ethylendiamintetra- 5 eddikesyre (pH-værdi 7,5), til hvilken der yderligere er sat 10% saccharose, resuspenderes der i 10 ml af en opløsning med følgende sammensætning.
50 mmol glucose 10 10 mmol EDTA
25 mmol tris-HCl (tris-(hydroxymethyl)-aminomethan) 2 mg/ml lysozym
Denne opløsning har en pH-værdi på 8.
15 o o
Efter en inkubationstid ved 32 C pa 30 til 60
minutter tilsættes der 20 ml frisk fremstillet 0,2N
natriumhydroxidopløsning, hvortil der yderligere er sat
1% natriumdodecylsulfat, og blandingen henstilles ved 0°C
i 5 minutter. Efter tilsætning af 15 ml af en 3M natrium- 20 acetatopløsning med en pH-værdi pa 4,8 blandes der pa ny og inkuberes i 1 time ved 0°C. Efter fornyet centrifugering sættes der ved -20°C det tredobbelte volumen ethanol (96%) til den ovenstående væske. Bundfaldet fraskilles ved centrifugering, tørres i vakuum og optages derefter i 25
6 ml af en puffer af 10 mmol tris-HCl og 1 mmol EDTA
(pH-værdi 7,5). Derpå centrifugeres der i 2 dage ved 34.000 o/m i en cæsiumchlorid/ethidiumbromid-gradient. Den fraktion, der indeholder plasmiderne, chromatograferes derefter også på apatit.
30 På denne måde isoleres plasmidet p SG 2 i ren form. Eksempel 2
Plasmidet p SG 2 kan også fremstilles på følgende måde: 1 g mycelium af Streptomyces ghanaensis ATCC 14 672 dyrkes i 3-5 dage ved 30°C i det samme medium som beskrevet i eksempel 1. Også her frahældes kulturens ovenstående 35
O
DK 160565 B
væske, hvorefter der homogeniseres, og cellematerialet fraskilles ved centrifugering. Derpå vaskes der to gange med en puffer, der består af 10 mmol tris-HCl og 140 mmol NaCl (pH-værdi 8,0). Derefter resuspenderes der i 5 ml af 5 en puffer bestående af 100 mmol tris-HCl, 20 mmol EDTA og 25% saccharose. Derpå tilsættes der 0,1 ml af en lysozym-opløsning (30 mg/ml) og inkuberes i 20 minutter ved 25°C. Efter afkøling til 0°C og tilsætning af 6 ml iskoldt vand tilsættes 1 ml af en 1%'s opløsning af 10 natriumdodecylsulfat, og efter tilsætning af yderligere 3,4 ml af en 5M natriumchloridopløsning blandes der forsigtigt. Blandingen henstilles derefter ved 4°C.
Efter at udfældningen ved 4°C er tilendebragt, centrifugeres der i 1 time ved 0°C og 16.000 o/m. Til 15 den ovenstående væske sættes en trediedel af dens volumen af en 42%'s polyethylenglycolopløsning (molekylvægt af polyethylenglycolen:6000), hvorved der fremkommer et bundfald. Efter at udfældningen ved en temperatur på 4°C er tilendebragt, fraskilles plasmiderne ved centrifugering ved 20 16.000 o/m i 15 minutter, hvorefter den dannede pellet forsigtigt optages i 1 ml af en 0,4%'s opløsning af Sarkosyl (N-lauroyl-sarkosid) i en puffer bestående af 10 mmol tris-HCl og 1 mmol EDTA (pH-værdi 7,5). Med den samme puffer fyldes der til slut op til 5 ml og centrifugeres i cæsium-25 chlorid-ethidiumbromid-gradient i en ultracentrifuge. Derefter arbejdes der videre som i eksempel 1.
30 35

Claims (5)

1. Plasmid pSG2, kendetegnet ved, at det kan fremstilles ud fra en kultur af Streptomyces ghanaen-sis ATCC 14 672 og har en konturlængde på 4,58 /xm og en 5 molekyllængde på ca. 13,8 kilobaser (kb), og at det ikke fragmenteres af restriktions-endonucleaserne EcoR I, BamH I, Sal I, Hpa I og Hind II, men spaltes af restriktions--endonucleasen Hind III til et fragment med en længde på ca. 14 kb, af Cla I til to fragmenter med længderne 10,15 10 kb og 3,65 kb og af Pst I til to fragmenter med længderne 10,85 kb og 3,0 kb, af Bgl II til to fragmenter med længderne II, 25 kb og 2,6 kb, samt af Bel I til tre fragmenter med længderne 11,6 kb, 1,25 kb og 1,0 kb.
2. Fremgangsmåde til udvinding af plasmidet p SG 2, 15 kendetegnet ved, at en kultur af Streptomyces ghanaensis ATCC 14 672 lyseres og plasmidet isoleres.
3. Fremgangsmåde ifølge krav 2, kendetegnet ved, at plasmidet isoleres fra lysatet ved en alkalisk denaturering med påfølgende renaturering og alkoholfældning.
4. Fremgangsmåde ifølge krav 2 eller 3, kende tegnet ved, at kulturen af Streptomyces ghanaensis ATCC 14 672 lyseres ved en temperatur på ca. 0eC med en detergent i en mængde på ca. 0,1 vægtprocent.
5. Anvendelse af plasmid p SG 2 til konstruktion af 25 vektorplasmider.
DK192482A 1981-04-30 1982-04-29 Plasmid p sg 2, fremgangsmaade til dets fremstilling og dets anvendelse DK160565C (da)

Applications Claiming Priority (2)

Application Number Priority Date Filing Date Title
DE19813117131 DE3117131A1 (de) 1981-04-30 1981-04-30 "plasmid psg 2 und verfahren zu seiner gewinnung"
DE3117131 1981-04-30

Publications (3)

Publication Number Publication Date
DK192482A DK192482A (da) 1982-10-31
DK160565B true DK160565B (da) 1991-03-25
DK160565C DK160565C (da) 1991-09-09

Family

ID=6131159

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
DK192482A DK160565C (da) 1981-04-30 1982-04-29 Plasmid p sg 2, fremgangsmaade til dets fremstilling og dets anvendelse

Country Status (8)

Country Link
US (1) US4621061A (da)
EP (1) EP0066701B1 (da)
JP (1) JPS57185300A (da)
AT (1) ATE37562T1 (da)
AU (1) AU550414B2 (da)
CA (1) CA1187823A (da)
DE (2) DE3117131A1 (da)
DK (1) DK160565C (da)

Families Citing this family (8)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
ZA832526B (en) * 1982-04-16 1984-11-28 Lilly Co Eli Chimeric cloning vectors for use in streptomyces and e.coli
EP0158872B1 (de) * 1984-03-31 1989-01-18 Hoechst Aktiengesellschaft Das Streptomyceten-Plasmid pSG5, Verfahren zu seiner Gewinnung und seine Verwendung
DE3412093A1 (de) * 1984-03-31 1985-10-10 Hoechst Ag, 6230 Frankfurt Hybridplasmide mit einem streptomyceten- und einem escherichia coli-replicon
US7026468B2 (en) * 1996-07-19 2006-04-11 Valentis, Inc. Process and equipment for plasmid purification
US7807822B2 (en) * 1996-08-01 2010-10-05 Robert Bridenbaugh Methods for purifying nucleic acids
JP4258874B2 (ja) * 1999-02-10 2009-04-30 チッソ株式会社 放線菌由来の環状プラスミドdna
WO2004024283A2 (en) * 2002-09-13 2004-03-25 Valentis, Inc. Apparatus and method for preparative scale purification of nucleic acids
JP4737547B2 (ja) * 2006-09-15 2011-08-03 株式会社オーディオテクニカ 単一指向性コンデンサーマイクロホンユニット

Family Cites Families (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
DE1113791B (de) * 1960-02-10 1961-09-14 Hoechst Ag Herstellung und Gewinnung des Antibiotikums Moenomycin
US4273875A (en) * 1979-03-05 1981-06-16 The Upjohn Company Plasmid and process of isolating same

Also Published As

Publication number Publication date
AU8313182A (en) 1982-11-04
JPS57185300A (en) 1982-11-15
US4621061A (en) 1986-11-04
DE3279073D1 (en) 1988-11-03
AU550414B2 (en) 1986-03-20
DK192482A (da) 1982-10-31
ATE37562T1 (de) 1988-10-15
EP0066701A2 (de) 1982-12-15
DK160565C (da) 1991-09-09
EP0066701B1 (de) 1988-09-28
EP0066701A3 (en) 1983-06-22
DE3117131A1 (de) 1982-11-25
CA1187823A (en) 1985-05-28

Similar Documents

Publication Publication Date Title
Stacey et al. nodZ, a unique host-specific nodulation gene, is involved in the fucosylation of the lipooligosaccharide nodulation signal of Bradyrhizobium japonicum
Thompson et al. Cloning of antibiotic resistance and nutritional genes in streptomycetes
US4332900A (en) Construction of co-integrate plasmids from plasmids of Streptomyces and Escherichia
DK160565B (da) Plasmid p sg 2, fremgangsmaade til dets fremstilling og dets anvendelse
JPH0145355B2 (da)
US4649119A (en) Cloning systems for corynebacterium
US4340674A (en) Cointegrate plasmids and their construction from plasmids of Escherichia and Streptomyces
WO1985004898A1 (en) An improved method of cloning double-stranded rna, and its use in the production of viral gene clones
WO2021224152A1 (en) Improving expression in fermentation processes
CA1187824A (en) Plasmid p svh 1 and its use
JP2619855B2 (ja) ストレプトミセス科レプリコンおよび大腸菌レプリコンを有するハイブリツドプラスミド
US4393137A (en) Cloning plasmid for streptomyces
EP0213898B1 (en) A host-vector system
Ramakrishnan et al. Molecular cloning and expression of Rhizobium fredii USDA 193 nodulation genes: extension of host range for nodulation
KR920007401B1 (ko) 다발성 절단부위를 지닌 대장균과 코리네형 세균에서 발현 가능한 신규 셔틀벡터
US4506014A (en) Plasmid pAC 1, a process for obtaining it and its use
EP0035914A2 (en) Plasmid vectors, plasmids and their preparation, and cloning processes using them
da Silva et al. Use of Agrobacterium tumefaciens-mediated transformation for the inactivation of pectinase genes in Colletotrichum lindemuthianum
JP3240052B2 (ja) アントラサイクリン抗生物質に対して耐性の遺伝子の単離及び特徴付け
KR0164284B1 (ko) 로도구균으로 부터 분리한 원형 플라즈미드
JPS6279794A (ja) 殺虫用リゾビウム科菌体
US4460691A (en) Streptomyces plasmid prophage pUC13
JPS6181787A (ja) 新規なプラスミドベクタ−
GB2045251A (en) A plasmid and its microbiological preparation
JPH0691825B2 (ja) 放線菌コスミドベクタ−

Legal Events

Date Code Title Description
PBP Patent lapsed