ES2201060T3 - Virus del herpes equino recombinante. - Google Patents
Virus del herpes equino recombinante.Info
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Abstract
LA INVENCION SE REFIERE A UN VIRUS DEL HERPES EQUINO RECOMBINANTE, QUE NO SE PRODUCE DE FORMA NATURAL. LA INVENCION TAMBIEN SE REFIERE A UN VIRUS DEL HERPES EQUINO RECOMBINANTE CAPAZ DE REPLICARSE QUE COMPRENDE DNA VIRAL DE ESPECIES DEL VIRUS DEL HERPES EQUINO Y DNA AJENO, EL DNA AJENO SE INSERTA EN EL DNA VIRAL DEL HERPES EQUINO EN UNA ZONA QUE NO SEA ESENCIAL PARA LA REPLICACION DEL VIRUS DEL HERPES EQUINO. LA INVENCION TAMBIEN SE REFIERE AL DNA QUE CODIFICA LA PROTEINA US2 DE UN VIRUS DEL HERPES EQUINO. LA INVENCION SE REFIERE A LOS VECTORES DE HOMOLOGIA PARA PRODUCIR VIRUS DEL HERPES EQUINO RECOMBINANTES QUE PRODUCEN VIRUS DEL HERPES EQUINO RECOMBINANTES INSERTANDO DNA AJENO EN EL DNA VIRAL DEL HERPES EQUINO. LA INVENCION ADEMAS SE REFIERE A UN METODO PARA PRODUCIR UN VIRUS DEL HERPES EQUINO RECOMBINANTE VIVO, Y SEGURO PARA EL FETO.
Description
Virus del herpes equino recombinante.
En esta solicitud, se hace referencia a varias
publicaciones mediante números arábigos entre paréntesis. Las
citaciones completas de estas referencias pueden encontrarse al
final de la memoria descriptiva, inmediatamente antes de las
reivindicaciones. Las descripciones de estas publicaciones describen
el estado de la técnica a la que pertenece esta invención.
La presente invención implica virus del herpes
equino recombinantes vivos que comprenden el DNA genómico del virus
del herpes equino 1 (EHV-1) ó 4
(EHV-4) del cual se ha suprimido una secuencia de
DNA del gen US2, que se muestra para el EHV-1 en la
SEC ID Nº 1 y para el EHV-4 en la SEC ID Nº 3,
inactivando dicho gen US2. Son útiles para la preparación de vacunas
para proteger a los caballos de varias especies de virus del herpes
equino infecciosos existentes en la naturaleza. El virus del herpes
equino es un miembro de la familia herpesviridiae, que se conocen
comúnmente como virus del herpes.
Generalmente, los virus del herpes contienen de
100000 a 200000 pares de bases de DNA como material genético, y se
han identificado varias áreas de los genomas de varios miembros que
no son esenciales para la replicación del virus in vitro en
cultivo celular. Se sabe que las modificaciones de estas regiones
del DNA disminuyen la patogenicidad del virus, esto es, atenúan el
virus cuando éste infecta una especie animal. Por ejemplo, la
inactivación del gen de la timidina quinasa del virus simple del
herpes humano (29) o del virus de la pseudorrabia en cerdos (38)
hace que estos virus sean menos patogénicos.
La eliminación de regiones específicas de la
región de repetición del virus simple del herpes humano ha mostrado
que hace al virus menos patogénico (32, 39). Además, en el virus de
la enfermedad de Marek se ha identificado una región de repetición
que está asociada con la oncogenicidad viral (13). Una región en el
virus del herpes saimiri se ha correlacionado de manera similar con
la oncogenicidad (21). La eliminación de una región específica de
la región de repetición hace que el virus de la pseudorrabia sea
menos patogénico (Patente de los EE.UU. Nº 4877737). Se ha mostrado
la deleción de una región del virus de la pseudorrabia en cepas que
actúan como vacunas existentes en la naturaleza (22). Estas
deleciones son, al menos en parte, responsables de la falta de
patogenicidad de estas cepas.
Se está generalmente de acuerdo en que los virus
del herpes contienen regiones de DNA no esenciales en varias partes
del genoma, y que la modificación de estas regiones puede atenuar el
virus, conduciendo a una cepa no patogénica a partir de la cual
puede derivar una vacuna. Se ha descrito una vacuna del
EHV-4 atenuado con una deleción y/o una inserción
en el gen de la timidina quinasa (53). El grado de atenuación del
virus es importante para la utilidad del virus como vacuna. Las
deleciones que causen demasiada atenuación del virus darán como
resultado una vacuna que no surtirá efecto en la manifestación de
una respuesta inmune adecuada. Aunque se conocen varios ejemplos de
deleciones atenuantes, la combinación apropiada de deleciones para
cualquier virus del herpes no resulta fácilmente evidente.
Las principales pérdidas económicas en la
industria equina son resultado de la infección por dos especies del
virus del herpes equino (17). Estas dos especies de virus del
herpes equino, actualmente identificadas en la bibliografía como
EHV-1 y EHV-4, pertenecen a la
subfamilia de alfa-virus del herpes de los virus del
herpes, y se caracterizan por su genoma de clase D (33). Al
principio, ambas especies se identificaron como
EHV-1 y a continuación se diferenciaron como
EHV-1 subtipo 1 (EHV-1) y
EHV-1 subtipo 2 (EHV-4),
respectivamente. El EHV-1 es la causa principal de
aborto en yeguas preñadas y el EHV-4 es la causa
principal de enfermedad respiratoria en potros y "yearlings".
Los productos disponibles actualmente no están diseñados para
abordar ambos síndromes, con el resultado de que estos productos
son marginalmente eficaces.
El EHV-1 y el
EHV-4 se han analizado a nivel molecular. Se han
publicado mapas de restricción de los genomas del
EHV-1 y el EHV-4 (42 y 8).
Aunque varios de los virus del herpes se han
modificado por ingeniería genética, no se han publicado ejemplos de
EHV recombinante.
El EHV puede volverse latente en animales sanos,
lo que los hace portadores potenciales del virus. Por esta razón,
resulta claramente ventajoso ser capaz de distinguir los animales
vacunados con virus no virulentos de los animales infectados con
virus salvajes o existentes en la naturaleza causantes de
enfermedades. El desarrollo de vacunas diferenciales y su
acompañamiento con ensayos diagnósticos ha probado ser válido en el
manejo de la enfermedad de la pseudorrabia (Registro Federal, Vol.
55, Nº 90, pp. 19245-19253). Una vacuna marcadora
diferencial similar sería de gran valor en el manejo de la
enfermedad causada por el EHV.
La presente invención proporciona un método para
producir un virus EHV recombinante vivo, seguro para el feto, que
comprende tratar el DNA viral de un EHV vivo existente en la
naturaleza de tal forma que se suprima de dicho DNA viral, DNA
correspondiente al gen US2 del EHV existente en la naturaleza. La
presente invención proporciona también virus en los que (a) se ha
suprimido DNA correspondiente al gen US2, y (b) se ha alterado o
suprimido DNA que codifica gpG, gpE, y/o TK. Tales virus son útiles
para la creación de vacunas que requieran marcadores diagnósticos y
seguridad en animales preñados.
La capacidad de modificar por ingeniería genética
el DNA de virus con grandes genomas, tales como el virus de la
viruela vacuna y los virus del herpes, ha llevado a la conclusión
de que estos virus recombinantes pueden utilizarse como vectores
para suministrar antígenos de vacunas y agentes terapéuticos en
animales. Los virus del herpes son candidatos atractivos para su
desarrollo como vectores porque su gama de hospedantes está
limitada principalmente a una única especie diana (16) y tienen la
capacidad de establecer infección latente (7) que podría
proporcionar una expresión in vivo estable de un gen ajeno.
Aunque se han modificado por ingeniería genética varias especies de
virus del herpes para expresar productos génicos ajenos, no se han
construido virus del herpes equino recombinantes que expresen
productos génicos ajenos. Los virus del herpes equino descritos
arriba pueden utilizarse como vectores para el suministro de
antígenos de vacunas de microorganismos causantes de enfermedades
equinas importantes. Tales virus recombinantes multivalentes
podrían proteger del EHV así como de otras enfermedades. De modo
similar, los virus del herpes equino pueden utilizarse como vectores
para el suministro de agentes terapéuticos. El agente terapéutico
que se suministra mediante un vector viral de la presente invención
debe ser una molécula biológica que sea un subproducto de la
replicación del virus del herpes equino. Esto limita el agente
terapéutico en un primer análisis bien a DNA, RNA o proteína.
Existen ejemplos de agentes terapéuticos de cada una de estas
clases, de compuestos en forma de DNA antisentido, RNA antisentido
(19), ribozimas (41), tRNAs supresores (3), RNA de cadena doble
inductor de interferones y numerosos ejemplos de agentes
terapéuticos proteicos, desde hormonas, por ejemplo, insulina, a
linfoquinas, por ejemplo, interferones e interleuquinas, a opiatos
naturales. El descubrimiento de estos agentes terapéuticos y la
elucidación de su estructura y función no hace posible
necesariamente, sin embargo, su utilización en un sistema de
suministro mediante un vector viral, debido a la experimentación
necesaria para determinar si existe un sitio de inserción
apropiado.
La invención proporciona un virus del herpes
equino recombinante vivo que comprende el DNA genómico del virus del
herpes equino 1 (EHV-1) ó 4 (EHV-4)
del que se ha suprimido una secuencia de DNA del gen US2, que se
muestra para el EHV-1 en la SEC ID Nº 1 y para el
EHV-4 en la SEC ID Nº 3, inactivando dicho gen US2.
La invención describe el DNA aislado que codifica la proteína US2 de
un virus del herpes equino.
La invención proporciona un virus del herpes
equino recombinante como se define arriba capaz de replicarse, que
contiene además una secuencia de DNA insertada en él. Este virus
del herpes comprende DNA viral de las especies del virus del herpes
equino 1 ó 4 existentes en la naturaleza con las deleciones
indicadas arriba, y DNA ajeno que codifica RNA no existente en la
naturaleza en un animal en el cual se introduce el virus del herpes
equino recombinante, insertándose el DNA ajeno en el DNA del virus
del herpes equino recombinante en un sitio que no es esencial para
la replicación del virus del herpes equino.
La invención describe un vector de homología para
producir el virus del herpes equino recombinante de la presente
invención mediante la inserción de DNA ajeno en el genoma de un
virus del herpes equino, que comprende una molécula de DNA de
cadena doble que consiste esencialmente en: a) una secuencia de DNA
ajeno de cadena doble que codifica RNA no existente en la
naturaleza en un animal en el cual se introduce el virus del herpes
equino recombinante; b) en un extremo de la secuencia de DNA ajeno,
DNA del virus del herpes equino de cadena doble homólogo al DNA
genómico situado en uno de los lados de un sitio del genoma que no
es esencial para la replicación del virus del herpes equino; y c)
en el otro extremo del DNA ajeno, DNA del virus del herpes equino
de cadena doble homólogo al DNA genómico situado en el otro lado
del mismo sitio del genoma.
La invención expone un método para producir el
virus del herpes equino recombinante vivo, seguro para el feto, de
la presente invención, que comprende tratar el DNA viral de un
virus del herpes equino vivo existente en la naturaleza de tal
forma que se suprima del virus DNA de la región US2 del virus del
herpes equino existente en la naturaleza.
Figura 1 Detalles de la Cepa Dutta del EHV1.
Diagrama del DNA genómico del EHV1 mostrando las regiones única
larga, de repetición interna, única corta, y de repetición
terminal. Se indica un mapa de restricción para la enzima
BamHI (42). Los fragmentos se nombran con letras en orden
decreciente del tamaño. La región única corta y la región timidina
quinasa están ampliadas mostrando las situaciones de los fragmentos
BglII b, EcoRI d, k y c. Se indica la situación de
varios genes, éstos son timidina quinasa (Tk), único corto 2 (US2),
glicoproteínas G (gpG), D (gpD), I (gpI) y E (gpE) (1).
Figura 2 Detalles de la Cepa Dutta del EHV4.
Diagrama del DNA genómico del EHV4 mostrando las regiones única
larga, de repetición interna, única corta, y de repetición
terminal. Se indican los mapas de restricción para las enzimas
EcoRI, PacI y PmeI. Los fragmentos se nombran
con letras en orden decreciente del tamaño. La región única corta y
la región timidina quinasa están ampliadas mostrando las
situaciones de los fragmentos BamHI c, d. Se indica también
la situación de dos genes, éstos son timidina quinasa (Tk) (27, 28)
y único corto 2 (US2).
Figura 3 Homología entre las proteínas US2 de los
virus del herpes equino y las proteínas US2 del
HSV-1, PRV, HSV-2, y MDV. (a)
Representación tipo matriz de la secuencia de aminoácidos de la
proteína US2 del EHV-4 (324 aminoácidos) (SEC ID Nº
4) frente a la secuencia de aminoácidos de la proteína US2 del
HSV-1 (291 aminoácidos) (24). (b) Alineamiento de la
región conservada (SEC ID Nº 7) entre la proteína US2 del
EHV-1 (303 aminoácidos) (SEC ID Nº 2), la proteína
US2 del EHV-4 (SEC ID Nº 8), la proteína US2 del
HSV-1 (SEC ID Nº 9), la proteína US2 del PRV (SEC ID
Nº 11) (256 aminoácidos) (49), la proteína US2 del
HSV-2 (SEC ID Nº 10) (291 aminoácidos) (25), la
proteína US2 del MDV (SEC ID Nº 12) (270 aminoácidos) (4), y US2 de
IBR (SEC ID Nº 13).
\newpage
Figura 4 Descripción detallada de la inserción de
DNA en el Vector de Homología 450-46.B4. El
diagrama muestra la orientación de los fragmentos de DNA ensamblados
en el plásmido 450-46.B4. El origen de cada
fragmento se describe en la sección de Materiales y Métodos. Se
muestran las secuencias situadas en los empalmes entre cada
fragmento, incluyendo el empalme A (SEC ID Nº 14), el empalme B (SEC
ID Nº 15), y el empalme C (SEC ID Nº 17). Se describen para cada
empalme los sitios de restricción utilizados para generar cada
fragmento así como las secuencias de enlace sintéticas que se
utilizaron para unir los fragmentos. Las secuencias de enlace
sintéticas están subrayadas por una línea doble. Se proporciona
también la situación de varias regiones codificantes de genes y
elementos de regulación. Se utilizan los siguientes dos
convencionalismos: los números entre paréntesis () se refieren a
aminoácidos, y los sitios de restricción entre corchetes [] indican
los restos de sitios que se destruyeron durante la construcción. Se
utilizan las siguientes abreviaturas: virus del herpes equino 1
(EHV1), timidina quinasa (TK), glicoproteína H (gpH), y señal de
poliadenilación (pA).
Figura 5 Descripción detallada de la inserción de
DNA en el Vector de Homología 467-21.19. El
diagrama muestra la orientación de los fragmentos de DNA ensamblados
en el plásmido 467-21.19. El origen de cada
fragmento se describe en la sección de Materiales y Métodos. Se
muestran las secuencias situadas en los empalmes entre cada
fragmento, incluyendo el empalme A (SEC ID Nº 19), el empalme B (SEC
ID Nº 20), y el empalme C (SEC ID Nº 23). Los sitios de restricción
utilizados para generar cada fragmento se indican en el empalme
correspondiente. Se proporciona también la situación de la región
que codifica el gen US2. Se utilizan los siguientes dos
convencionalismos: los números entre paréntesis () se refieren a
aminoácidos, y los sitios de restricción entre corchetes [] indican
los restos de sitios que se destruyeron durante la construcción. Se
utilizan las siguientes abreviaturas: virus del herpes equino 1
(EHV1) y única corta 2 (US2).
Figura 6 Descripción detallada de la inserción de
DNA en el Vector de Homología 536-85.30. El
diagrama muestra la orientación de los fragmentos de DNA ensamblados
en el plásmido 536-85.30. El origen de cada
fragmento se describe en la sección de Materiales y Métodos. Se
muestran las secuencias situadas en los empalmes entre cada
fragmento, incluyendo el empalme A (SEC ID Nº 24), el empalme B (SEC
ID Nº 25), y el empalme C (SEC ID Nº 26). Los sitios de restricción
utilizados para generar cada fragmento se indican en el empalme
correspondiente. Se proporciona también la situación de las
regiones codificantes del gen gpD, MGP, y US3. Los sitios de
restricción entre corchetes [] indican los restos de sitios que se
destruyeron durante la construcción. Se utilizan las siguientes
abreviaturas: virus del herpes equino 1 (EHV1), glicoproteína de
membrana (MGP), único corto 3 (US3) y glicoproteína D (gpD).
Figura 7 Descripción detallada de la inserción de
DNA en el Vector de Homología 495-61.39. El
diagrama muestra la orientación de los fragmentos de DNA ensamblados
en el plásmido 495-61.39. El origen de cada
fragmento se describe en la sección de Materiales y Métodos. Se
muestran las secuencias situadas en los empalmes entre cada
fragmento, incluyendo el empalme A (SEC ID Nº 27), el empalme B (SEC
ID Nº 28), y el empalme C (SEC ID Nº 31). Se describen para cada
empalme los sitios de restricción utilizados para generar cada
fragmento así como las secuencias de enlace sintéticas que se
utilizaron para unir los fragmentos. Las secuencias de enlace
sintéticas están subrayadas por una línea doble. Se proporciona
también la situación de las regiones que codifican los genes TK y
gpH. Se utilizan los siguientes dos convencionalismos: los números
entre paréntesis () se refieren a aminoácidos, y los sitios de
restricción entre corchetes [] indican los restos de sitios que se
destruyeron durante la construcción. Se utilizan las siguientes
abreviaturas: virus del herpes equino 4 (EHV4) y glicoproteína H
(gpH).
Figura 8 Descripción detallada de la inserción de
DNA en el Vector de Homología 523-38.9. El diagrama
muestra la orientación de los fragmentos de DNA ensamblados en el
plásmido 523-38.9. El origen de cada fragmento se
describe en la sección de Materiales y Métodos. Se muestran las
secuencias situadas en los empalmes entre cada fragmento,
incluyendo el empalme A (SEC ID Nº 33), el empalme B (SEC ID Nº 34),
y el empalme C (SEC ID Nº 36). Los sitios de restricción utilizados
para generar cada fragmento se indican en el empalme
correspondiente. Se proporciona también la situación de la región
que codifica el gen US2. Se utilizan los siguientes dos
convencionalismos: los números entre paréntesis () se refieren a
aminoácidos, y los sitios de restricción entre corchetes [] indican
los restos de sitios que se destruyeron durante la construcción. Se
utilizan las siguientes abreviaturas: virus del herpes equino 4
(EHV4) y único corto 2 (US2).
Figura 9 Descripción detallada de la inserción de
DNA en el Vector de Homología 580-57.25. El
diagrama muestra la orientación de los fragmentos de DNA ensamblados
en el plásmido 580-57.25. El origen de cada
fragmento se describe en la sección de Materiales y Métodos. Se
muestran las secuencias situadas en los empalmes entre cada
fragmento, incluyendo el empalme A (SEC ID Nº 37), el empalme B (SEC
ID Nº 38), y el empalme C (SEC ID Nº 39). Los sitios de restricción
utilizados para generar cada fragmento se indican en el empalme
correspondiente. Se proporciona también la situación de la región
que codifica el gen US9. Se utilizan los siguientes dos
convencionalismos: los números entre paréntesis () se refieren a
aminoácidos, y los sitios de restricción entre corchetes [] indican
los restos de sitios que se destruyeron durante la construcción. Se
utilizan las siguientes abreviaturas: virus del herpes equino 4
(EHV4) y único corto 9 (US9).
Figura 10 Descripción detallada de la inserción
del gen marcador en el Vector de Homología
467-22.A12. El diagrama muestra la orientación de
los fragmentos de DNA ensamblados en el gen marcador. El origen de
cada fragmento se describe en la sección de Materiales y Métodos. Se
muestran las secuencias situadas en los empalmes entre cada
fragmento y en los extremos del gen marcador, incluyendo el empalme
A (SEC ID Nº 40), el empalme B (SEC ID Nº 41), el empalme C (SEC ID
Nº 43) y el empalme D (SEC ID Nº 43). Los sitios de restricción
utilizados para generar cada fragmento se indican en el empalme
correspondiente. Se proporciona también la situación de la región
que codifica el gen lacZ. Se utilizan los siguientes dos
convencionalismos: los números entre paréntesis () se refieren a
aminoácidos, y los sitios de restricción entre corchetes [] indican
los restos de sitios que se destruyeron durante la construcción. Se
utilizan las siguientes abreviaturas: virus de la pseudorrabia
(PRV), gen Z del operón lactosa (lacZ), Escherichia coli
(E. coli), señal de poliadenilación (pA), y glicoproteína X
(gpX).
Figura 11 Descripción detallada de la inserción
del gen marcador en el Vector de Homología
523-42.A18. El diagrama muestra la orientación de
los fragmentos de DNA ensamblados en el gen marcador. El origen de
cada fragmento se describe en la sección de Materiales y Métodos. Se
muestran las secuencias situadas en los empalmes entre cada
fragmento y en los extremos del gen marcador, incluyendo el empalme
A (SEC ID Nº 46), el empalme B (SEC ID Nº 47), el empalme C (SEC ID
Nº 49) y el empalme D (SEC ID Nº 51). Los sitios de restricción
utilizados para generar cada fragmento se indican en el empalme
correspondiente. Se proporciona también la situación de la región
que codifica el gen lacZ. Se utilizan los siguientes dos
convencionalismos: los números entre paréntesis () se refieren a
aminoácidos, y los sitios de restricción entre corchetes [] indican
los restos de sitios que se destruyeron durante la construcción. Se
utilizan las siguientes abreviaturas: virus de la pseudorrabia
(PRV), gen Z del operón lactosa (lacZ), Escherichia coli
(E. coli), señal de poliadenilación (pA), y glicoproteína X
(gpX).
Figura 12 Descripción detallada de la inserción
del gen marcador en el Vector de Homología
552-45.19. El diagrama muestra la orientación de los
fragmentos de DNA ensamblados en el gen marcador. El origen de cada
fragmento se describe en la sección de Materiales y Métodos. Se
muestran las secuencias situadas en los empalmes entre cada
fragmento y en los extremos del gen marcador, incluyendo el empalme
A (SEC ID Nº 52), el empalme B (SEC ID Nº 53), el empalme C (SEC ID
Nº 55) y el empalme D (SEC ID Nº 57). Los sitios de restricción
utilizados para generar cada fragmento se indican en el empalme
correspondiente. Se proporciona también la situación de la región
que codifica el gen uidA. Se utilizan los siguientes dos
convencionalismos: los números entre paréntesis () se refieren a
aminoácidos, y los sitios de restricción entre corchetes [] indican
los restos de sitios que se destruyeron durante la construcción. Se
utilizan las siguientes abreviaturas: virus de la pseudorrabia
(PRV), gen A de la uronidasa (uidA), Escherichia coli (E.
coli), virus simple del herpes tipo 1 (HSV-1),
señal de poliadenilación (pA), y glicoproteína X (gpX).
Figura 13 Descripción detallada de la inserción
del gen marcador en el Vector de Homología
593-31.2. El diagrama muestra la orientación de los
fragmentos de DNA ensamblados en el gen marcador. El origen de cada
fragmento se describe en la sección de Materiales y Métodos. Se
muestran las secuencias situadas en los empalmes entre cada
fragmento y en los extremos del gen marcador, incluyendo el empalme
A (SEC ID Nº 58), el empalme B (SEC ID Nº 59), el empalme C (SEC ID
Nº 61) y el empalme D (SEC ID Nº 63). Los sitios de restricción
utilizados para generar cada fragmento se indican en el empalme
correspondiente. Se proporciona también la situación de la región
que codifica el gen lacZ. Se utilizan los siguientes dos
convencionalismos: los números entre paréntesis () se refieren a
aminoácidos, y los sitios de restricción entre corchetes [] indican
los restos de sitios que se destruyeron durante la construcción. Se
utilizan las siguientes abreviaturas: virus de la pseudorrabia
(PRV), gen Z del operón lactosa (lacZ), Escherichia coli
(E. coli), señal de poliadenilación (pA), y glicoproteína X
(gpX).
La presente invención proporciona un virus del
herpes equino recombinante no existente en la naturaleza. Así, este
virus del herpes equino recombinante es de las especies
EHV-1 y EHV-4. Más específicamente,
la presente invención proporciona un virus del herpes equino
recombinante vivo que comprende el DNA genómico del virus del
herpes equino 1 (EHV-1) ó 4 (EHV-4)
del cual se ha suprimido una secuencia de DNA del gen US2, que se
muestra para el EHV-1 en la SEC ID Nº 1 y para el
EHV-4 en la SEC ID Nº 3, inactivando dicho gen
US2.
Para los propósitos de esta invención, el término
"virus del herpes equino" incluye las especies
EHV-1 y EHV-4, aunque también
podrían ser utilizables otras especies. A estas especies se hizo
referencia previamente en la bibliografía como
EHV-1, subtipo 1 y EHV-1 subtipo 2,
respectivamente.
La invención proporciona así un virus del herpes
equino recombinante en el que una secuencia de DNA que no es
esencial para la replicación del virus se ha suprimido del DNA
genómico del virus.
Para los propósitos de esta invención, "una
secuencia de DNA que no es esencial para la replicación del
virus" es una secuencia situada en el genoma donde no cumple una
función necesaria para la replicación viral. Ejemplos de secuencias
necesarias incluyen las siguientes: secuencias de unión de proteínas
de complejos, secuencias que codifican la transcriptasa inversa o
una glicoproteína esencial, secuencias de DNA necesarias para la
encapsidación, etc.
En la presente invención, la secuencia suprimida
se suprime del gen US2 del virus. La presente invención proporciona
un ejemplo de un virus del herpes equino recombinante de este tipo
designado S-1EHV-002. El virus
S-1EHV-002 se ha depositado el 12 de
marzo de 1992, de conformidad con el Tratado de Budapest, en el
Depósito Internacional de Microorganismos para los Propósitos de
Procedimiento de Patentes con el Depósito de Cultivos de Patentes
de la Colección Americana de Cultivos Tipo, 12301 Parklawn Drive,
Rockville, Maryland 20852, EE.UU., con el Nº de Acceso ATCC VR 2358.
La presente invención proporciona además virus del herpes equino
recombinantes vivos como se describe arriba que comprenden al menos
una deleción más de una secuencia de DNA del virus. La secuencia de
DNA suprimida se suprime del gen que codifica la glicoproteína gpG,
el que codifica la glicoproteína gpE, del gen de la timidina
quinasa y/o del gen que codifica la glicoproteína grande de
membrana (MGP). La presente invención describe un virus del herpes
equino recombinante con una deleción en el gen TK designado
S-1EHV-001. El
S-1EHV-001 se ha depositado el 12 de
marzo de 1992, de conformidad con el Tratado de Budapest, en el
Depósito Internacional de Microorganismos para los Propósitos de
Procedimiento de Patentes con el Depósito de Cultivos de Patentes de
la Colección Americana de Cultivos Tipo, 12301 Parklawn Drive,
Rockville, Maryland 20852, EE.UU., con el Nº de Acceso ATCC VR 2357.
Otro virus del herpes equino recombinante con una deleción en el gen
TK se designa S-4EHV-001. El
S-4EHV-001 se ha depositado el 12
de marzo de 1992, de conformidad con el Tratado de Budapest, en el
Depósito Internacional de Microorganismos para los Propósitos de
Procedimiento de Patentes con el Depósito de Cultivos de Patentes
de la Colección Americana de Cultivos Tipo, 12301 Parklawn Drive,
Rockville, Maryland 20852, EE.UU., con el Nº de Acceso ATCC VR 2361.
Sin embargo, debe recalcarse que los dos virus del herpes
específicos mencionados arriba no forman parte de la presente
invención.
Así, la invención proporciona un virus del herpes
equino recombinante con una secuencia de DNA suprimida del gen de
la timidina quinasa del virus, además de la secuencia de DNA
suprimida del gen US2 del virus. La presente invención proporciona
un ejemplo de un virus del herpes equino recombinante de este tipo
designado S-1EHV-004. El virus
S-1EHV-004 se ha depositado el 12 de
marzo de 1992, de conformidad con el Tratado de Budapest, en el
Depósito Internacional de Microorganismos para los Propósitos de
Procedimiento de Patentes con el Depósito de Cultivos de Patentes
de la Colección Americana de Cultivos Tipo, 12301 Parklawn Drive,
Rockville, Maryland 20852, EE.UU., con el Nº de Acceso ATCC VR 2360.
La presente invención proporciona un ejemplo de un virus del herpes
equino recombinante de este tipo designado
S-4EHV-002. El virus
S-4EHV-002 se ha depositado el 12 de
marzo de 1992, de conformidad con el Tratado de Budapest, en el
Depósito Internacional de Microorganismos para los Propósitos de
Procedimiento de Patentes con el Depósito de Cultivos de Patentes
de la Colección Americana de Cultivos Tipo, 12301 Parklawn Drive,
Rockville, Maryland 20852, EE.UU., con el Nº de Acceso ATCC VR 2362.
La presente invención proporciona un ejemplo más de un virus del
herpes equino recombinante de este tipo designado
S-4EHV-023. El virus
S-4EHV-023 se ha depositado el 5 de
agosto de 1993, de conformidad con el Tratado de Budapest, en el
Depósito Internacional de Microorganismos para los Propósitos de
Procedimiento de Patentes con el Depósito de Cultivos de Patentes de
la Colección Americana de Cultivos Tipo, 12301 Parklawn Drive,
Rockville, Maryland 20852, EE.UU., con el Nº de Acceso ATCC VR.
La invención proporciona también un virus del
herpes equino recombinante con una secuencia de DNA suprimida del
gen de la timidina quinasa del virus, además de la secuencia de DNA
suprimida del gen US2 del virus, en el que una tercera secuencia
que no es esencial para la replicación del virus se suprime del DNA
genómico del virus. Una realización de esta invención es un virus
del herpes equino recombinante en el que la tercera secuencia de
DNA suprimida se suprime del gen gpG del virus. La presente
invención proporciona un ejemplo de un virus del herpes equino
recombinante de este tipo designado
S-1EHV-003. El virus
S-1EHV-003 se ha depositado el 12 de
marzo de 1992, de conformidad con el Tratado de Budapest, en el
Depósito Internacional de Microorganismos para los Propósitos de
Procedimiento de Patentes con el Depósito de Cultivos de Patentes
de la Colección Americana de Cultivos Tipo, 12301 Parklawn Drive,
Rockville, Maryland 20852, EE.UU., con el Nº de Acceso ATCC VR 2359.
Una realización más de esta invención es un virus del herpes equino
recombinante en el que la tercera secuencia de DNA suprimida se
suprime del gen gpE del virus.
La presente invención describe el DNA aislado que
codifica la proteína US2 del virus del herpes equino procesado en
la presente.
La presente invención proporciona el virus del
herpes equino recombinante descrito arriba capaz de replicarse que
comprende DNA viral de una forma mutada de una especie del virus
del herpes equino 1 ó 4 existente en la naturaleza y DNA ajeno que
codifica RNA no existente en la naturaleza en un animal en el que se
introduce el virus del herpes equino recombinante, insertándose el
DNA ajeno en el DNA del virus del herpes equino existente en la
naturaleza en un sitio que no es esencial para la replicación del
virus del herpes equino.
Para los propósitos de esta invención, "un
virus del herpes equino recombinante capaz de replicarse" es un
virus del herpes equino vivo que se ha generado mediante los
métodos de recombinación bien conocidos por los expertos en la
técnica, por ejemplo, los métodos descritos en el PROCEDIMIENTO DE
RECOMBINACIÓN HOMÓLOGA PARA GENERAR EHV RECOMBINANTE en Materiales y
Métodos, y del que no se ha suprimido material genético esencial
para la replicación del virus del herpes equino recombinante.
Para los propósitos de esta invención, "un
sitio de inserción que no es esencial para la replicación del virus
del herpes equino" es un lugar del genoma en el que una
secuencia de DNA no es necesaria para la replicación viral. Ejemplos
de secuencias de DNA que son esenciales incluyen las siguientes:
secuencias de unión de proteínas de complejos, secuencias que
codifican la transcriptasa inversa o una glicoproteína esencial,
secuencias de DNA necesarias para la encapsidación, etc.
La invención describe además DNA ajeno que
codifica RNA que codifica un polipéptido. Preferiblemente, el
polipéptido es antigénico en un animal en el que se introduce el
virus del herpes equino recombinante. En una realización del
polipéptido, el polipéptido es un marcador detectable.
Preferiblemente, el polipéptido es la
\beta-galactosidasa de E. coli.
Preferiblemente, el polipéptido es la
\beta-glucuronidasa de E. coli. La presente
invención proporciona un ejemplo de un virus del herpes equino
recombinante de este tipo designado
S-4EHV-004.
Para los propósitos de esta invención, este
polipéptido antigénico es un polímero linear de más de 10
aminoácidos unidos mediante enlaces peptídicos que estimula al
animal para que produzca anticuerpos.
\newpage
En una realización del polipéptido, el
polipéptido es un polipéptido producido normalmente por un virus
del herpes equino, una bacteria Streptococcus equi, un Virus
de la Anemia Infecciosa, un virus de la gripe equina o un virus de
la encefalitis equina. Preferiblemente, el virus del herpes equino
existente en la naturaleza es el EHV-1 y el DNA
ajeno procede del EHV-4. Preferiblemente, el virus
del herpes equino existente en la naturaleza es el
EHV-4 y el DNA ajeno procede del
EHV-1. Preferiblemente, el DNA ajeno codifica una
glicoproteína gpB, gpC, gpD o gpH.
En una realización de la presente invención, el
virus del herpes equino existente en la naturaleza es el
EHV-4 y el polipéptido antigénico es del gen gpD o
gpB de la especie EHV-1 del virus del herpes
equino. La presente invención proporciona un ejemplo de un virus del
herpes equino recombinante de este tipo designado
S-4EHV-010.
En otra realización de la presente invención, el
virus del herpes equino existente en la naturaleza es el
EHV-4 y el polipéptido antigénico es del gen de la
hemaglutinina o de la neuraminidasa de un subtipo del virus A de la
gripe equina. Preferiblemente, el subtipo del serotipo de del virus
A de la gripe equina es el A1. Preferiblemente, el subtipo se
caracteriza además como un aislado del subtipo A1 del virus A de la
gripe equina. Preferiblemente, el aislado es Influenza
A/equine/Prague/56. La presente invención proporciona un ejemplo de
un virus del herpes equino recombinante de este tipo designado
S-4EHV-011.
En otra realización de la presente invención, el
subtipo del virus A de la gripe equina es el A2. Preferiblemente,
el subtipo se caracteriza además como un aislado del subtipo A2 del
virus A de la gripe equina. Preferiblemente, el aislado es
Influenza A/equine/Miami/63. Preferiblemente, el aislado es
Influenza A/equine/Kentucky/81. Preferiblemente, el aislado es
Influenza A/equine/Alaska/91. La presente invención proporciona
ejemplos de virus del herpes equino recombinantes de esos tipos
designados S-4EHV-012,
S-4EHV-013 y
S-4EHV-014, respectivamente.
La presente invención describe un vector de
homología para producir un virus del herpes equino recombinante de
la presente invención mediante la inserción de DNA ajeno en el
genoma de un virus del herpes equino, que comprende una molécula de
DNA de cadena doble que consiste esencialmente en: a) una secuencia
de DNA ajeno de cadena doble que codifica RNA no existente en la
naturaleza en un animal en el cual se introduce el virus del herpes
equino recombinante; b) en un extremo de la secuencia de DNA ajeno,
DNA del virus del herpes equino de cadena doble homólogo al DNA
genómico situado en un lado de un sitio del genoma que no es
esencial para la replicación del virus del herpes equino; y c) en el
otro extremo de la secuencia de DNA ajeno, DNA del virus del herpes
equino de cadena doble homólogo al DNA genómico situado en el otro
lado del mismo sitio del genoma. En una realización del vector de
homología, el virus del herpes equino es el
EHV-1.
En otra realización del vector de homología, el
virus del herpes equino es el EHV-4. Así, el sitio
del genoma que no es esencial para la replicación está presente
dentro de una secuencia de DNA incluida dentro del gen US2 y
posiblemente además dentro del gen TK, gpG, gpE y/o MGP. En una
realización del vector de homología, el DNA de cadena doble del
virus del herpes equino es homólogo al DNA genómico presente dentro
del fragmento de restricción BglII b del
EHV-1. Preferiblemente, el DNA de cadena doble del
virus del herpes equino es homólogo a un subfragmento de restricción
Sau3A y a un subfragmento de restricción entre BstEII
y PstI. En otra realización del vector de homología, el DNA
de cadena doble del virus del herpes equino es homólogo al DNA
genómico presente dentro del fragmento de restricción BamHI n
del EHV-1. Preferiblemente, el DNA de cadena doble
del virus del herpes equino es homólogo al DNA genómico presente
dentro del subfragmento de restricción entre BamHI y
NcoI y el subfragmento de restricción entre EcoRI y
PstI. En otra realización del vector de homología, el DNA de
cadena doble del virus del herpes equino es homólogo al DNA genómico
presente dentro del fragmento de restricción EcoRI k del
EHV-1. Preferiblemente, el DNA de cadena doble del
virus del herpes equino es homólogo al DNA genómico presente dentro
del subfragmento de restricción entre EcoRI y PvuII y
el subfragmento de restricción entre PstI y BamHI. En
otra realización del vector de homología, el DNA de cadena doble del
virus del herpes equino es homólogo al DNA genómico presente dentro
del fragmento de restricción BamHI c del
EHV-4. Preferiblemente, el DNA de cadena doble del
virus del herpes equino es homólogo al DNA genómico presente dentro
del subfragmento de restricción entre PvuII y FspI y
el subfragmento de restricción entre PvuII y SmaI. En
otra realización del vector de homología, el DNA de cadena doble del
virus del herpes es homólogo al DNA genómico presente dentro del
fragmento de restricción BamHI d del EHV-4.
Preferiblemente, el DNA de cadena doble del virus del herpes es
homólogo al DNA genómico presente dentro del subfragmento de
restricción entre XbaI y PstI y el subfragmento de
restricción entre PstI y HindIII. En otra realización
del vector de homología, el DNA de cadena doble del virus del herpes
es homólogo al DNA genómico presente dentro del fragmento de
restricción EcoRI j del EHV-4.
Preferiblemente, el DNA de cadena doble del virus del herpes es
homólogo al DNA genómico presente dentro del subfragmento de
restricción entre EcoRI y AatII y el subfragmento de
restricción entre FspI y FspI.
La presente invención describe también un vector
de homología en el que el DNA ajeno que se inserta corresponde al
DNA que codifica el gen gpH, gpB, gpD o gpC de una especie del virus
del herpes equino EHV-1. La presente invención
describe también un vector de homología en el que el DNA ajeno que
se inserta corresponde al DNA que codifica la glicoproteína gpH,
gpB, gpD o gpC de una especie del virus del herpes equino
EHV-4.
La presente invención describe también una vacuna
que comprende una cantidad inmunizante eficaz de un virus del
herpes equino recombinante de la presente invención y un vehículo
adecuado.
Vehículos adecuados para el virus del herpes
equino, que podrían ser apropiados para utilizar con el virus del
herpes equino recombinante de la presente invención, son bien
conocidos en la técnica, e incluyen proteínas, azúcares, etc. Un
ejemplo de un vehículo aceptable de este tipo es un medio de
cultivo fisiológicamente equilibrado que contenga uno o más
azúcares estabilizantes tales como proteínas hidrolizadas
estabilizadas, lactosa, etc.
Para los propósitos de esta invención, una
"cantidad inmunizante eficaz" del virus del herpes equino
recombinante de la presente invención, es una cantidad necesaria
para estimular la producción de anticuerpos por el equino en el que
se ha introducido el virus en cantidad suficiente para proteger al
equino de una infección si se enfrentara a un virus del herpes
equino salvaje u otro virus del herpes equino al que el virus del
herpes equino recombinante esté dirigido.
La presente invención describe también un método
para inmunizar un equino que comprende la administración de una
dosis inmunizante eficaz de la vacuna descrita en la presente
invención.
Para los propósitos de esta invención, la vacuna
puede administrarse por cualquiera de los métodos conocidos por los
expertos en la técnica, por ejemplo, mediante inyección
intramuscular, subcutánea, intraperitoneal o intravenosa.
Alternativamente, la vacuna puede administrarse intranasalmente u
oralmente.
La presente invención describe también un método
de ensayo en un equino para determinar si el equino ha sido
vacunado con la vacuna descrita en la presente invención o
infectado con un virus del herpes equino existente en la naturaleza,
que comprende: (a) obtener del equino a ensayar una muestra de
fluido corporal adecuado; (b) detectar en la muestra la presencia
de anticuerpos contra el virus del herpes equino, indicando la
ausencia de tales anticuerpos que el equino no ha sido vacunado ni
infectado; y (c) en el equino en el que están presentes anticuerpos
contra el virus del herpes equino, detectar en la muestra la
ausencia de anticuerpos contra antígenos del virus del herpes
equino que están presentes normalmente en el fluido corporal de un
equino infectado por un virus del herpes equino existente en la
naturaleza pero que no están presentes en un equino vacunado,
indicando la ausencia de tales anticuerpos que el equino fue
vacunado y no está infectado. En una realización del método, el
antígeno del virus del herpes equino que no está presente en el
equino vacunado es la glicoproteína gpE.
La presente invención describe un método para
producir el virus del herpes equino recombinante vivo, seguro para
el feto, de la presente invención que comprende tratar el DNA viral
de un virus del herpes equino vivo existente en la naturaleza, que
comprende el DNA genómico del EHV-1 ó -4, de tal
forma que se suprima del virus DNA correspondiente a la región US2
del virus del herpes equino existente en la naturaleza.
La presente invención describe también un célula
hospedante infectada con el virus del herpes equino recombinante de
la presente invención. En una realización, la célula hospedante es
una célula de mamífero. Preferiblemente, la célula de mamífero es
una célula Vero.
Para los propósitos de esta invención, una
"célula hospedante" es una célula utilizada para propagar un
vector y su inserto. La infección de las células se llevó a cabo
mediante métodos bien conocidos por los expertos en la técnica, por
ejemplo, como se expone en el PROCEDIMIENTO DE
INFECCIÓN-TRANSFECCIÓN en los Materiales y
Métodos.
A continuación se detallan los métodos para
construir, seleccionar y purificar los virus del herpes equino
recombinantes.
Los siguientes Ejemplos no sólo describen métodos
para producir los virus del herpes equino recombinantes de la
presente invención con una deleción de secuencias de DNA del gen
US2 y posiblemente además del gen TK, gpE, gpG y/o MPG, sino también
métodos para producir virus del herpes equino recombinantes con
deleciones en genes o combinaciones de genes que no comprende la
presente invención, que, sin embargo, satisfacen los propósitos de
la presente invención. Estos Ejemplos no están dentro del alcance
de la presente invención. Se mantienen por propósitos ilustrativos
y como base para entender y realizar la presente invención.
S-1EHV-000 y
S-4EHV-000 son aislados frescos del
EHV-1 y EHV-4, respectivamente, y
se obtuvieron del Dr. S. K. Dutta (College of Veterinary Medicine,
University of Maryland, College Park, MD 20742). Las muestras de
reserva del virus EHV se prepararon infectando células Vero a una
proporción de infección de 0,01 PFU/célula (PFU: unidades de
formación de colonias, del inglés "plaque forming units") en
Medio Eagle Modificado de Dulbecco (DMEM) que contenía glutamina 2
mM, 100 unidades/ml de penicilina, 100 unidades/ml de estreptomicina
(estos componentes se obtuvieron de Irvine Scientific o un
proveedor similar, y se denominan en lo sucesivo medio DME
completo) con suero bovino fetal al 1%. Una vez completado el efecto
citopático, se recogieron el medio y las células y las células se
sedimentaron a 3000 rpm durante 5 minutos en una centrífuga
clínica. Las células se resuspendieron en un décimo del volumen
original de medio, y se añadió un volumen igual de leche desnatada
(leche desnatada en polvo al 9% peso/volumen en H_{2}O). Las
muestras de virus se congelaron a -70ºC. Los títulos fueron
aproximadamente 10^{8} PFU/ml para el EHV-1 y
aproximadamente 10^{7} PFU/ml para el EHV-4.
Para la preparación de DNA del virus del herpes,
se infectó una monocapa confluente de células Vero en un matraz de
25 cm^{3} o una placa petri de 60 mm con 100 \mul de muestra de
virus. Después de incubar durante una noche, o cuando las células
mostraron un 100% de efecto citopático, las células se rasparon
dentro del medio. Las células y el medio se centrifugaron a 3000
rpm durante 5 minutos en una centrífuga clínica. El medio se
decantó, y el sedimento de células se resuspendió suavemente en 0,5
ml de una solución que contenía NONIDET P-40™ al
0,5% (condensado de octilfenol y óxido de etileno que contiene una
media de 9 moles de óxido de etileno por molécula)
(NP-40, adquirido de Sigma Chemical Co., St. Louis,
MO.). La muestra se incubó a temperatura ambiente durante 10
minutos. Se añadieron 10 \mul de una solución de reserva de RNAsa
A (Sigma) (la solución de reserva era 10 mg/ml, hervida durante 10
minutos para inactivar la DNAsa). La muestra se centrifugó para
sedimentar los núcleos. El sedimento de DNA se retiró con una
pipeta pasteur o un palillo de madera y se desechó. El fluido
sobrenadante se decantó en un tubo Eppendorf de 1,5 ml que contenía
25 \mul de dodecilsulfato sódico al 20% (Sigma) y 25 \mul de
proteinasa-K (10 mg/ml; Boehringer Mannheim). La
muestra se mezcló e incubó a 37ºC durante 30-60
minutos. Se añadió un volumen igual de fenol saturado con agua y la
muestra se mezcló brevemente. La muestra se centrifugó en una
minifuga Eppendorf durante 5 minutos a máxima velocidad. Se retiró
la fase acuosa superior a un nuevo tubo Eppendorf, y se añadieron
dos volúmenes de etanol absoluto, y el tubo se puso a -20ºC durante
30 minutos para precipitar el ácido nucleico. La muestra se
centrifugó en una minifuga Eppendorf durante 5 minutos. El
sobrenadante se decantó, y el sedimento se dejó secar al aire y se
rehidrató en \sim16 \mul de H_{2}O. Para la preparación de
cantidades mayores de DNA, el procedimiento se escaló para empezar
con un frasco sobre rodillos de 850 cm^{3} de células Vero. El
DNA se almacenó en Tris 0,01 M pH 7,5, EDTA 1 mM a 4ºC.
Las técnicas para la manipulación de bacterias y
DNA, incluyendo aquellos procedimientos como la digestión con
endonucleasas de restricción, electroforesis en gel, extracción de
DNA de los geles, ligación, fosforilación con quinasa, tratamiento
con fosfatasa, crecimiento de cultivos bacterianos, transformación
de bacterias con DNA, y otros métodos de biología molecular se
describen en Maniatis et al. (1982) y Sambrook et al.
(1989). La reacción en cadena de la polimerasa (PCR) se utilizó para
introducir sitios de restricción convenientes para la manipulación
de varios DNAs. Los procedimientos utilizados se describen en Innis
et al. (1990). En general, los fragmentos amplificados
fueron menores de 500 pares de bases en tamaño, y las regiones
críticas de los fragmentos amplificados se confirmaron mediante
secuenciación de DNA. Excepto que se indique, estas técnicas se
utilizaron con variaciones mínimas.
El DNA se unió por acción de la enzima DNA ligasa
de T4 (BRL). Las reacciones de ligación contenían cantidades
variables de DNA (de 0,2 a 20 \mug), Tris 20 mM pH 7,5,
MgCl_{2} 10 mM, ditiotreitol (DTT) 10 mM, ATP 200 \muM y 20
unidades de DNA ligasa de T4 en un volumen final de reacción de
10-20 \mul. La ligación tuvo lugar durante
3-16 horas a 15ºC.
La secuenciación se realizó utilizando el USB
Sequenase Kit y ^{35}S-dATP (NEN). Se llevaron a
cabo reacciones utilizando las mezclas de dGTP y las mezclas de
dITP para clarificar las áreas de compresión. Alternativamente, las
áreas comprimidas se resolvieron en geles de formamida. Los moldes
fueron subclones de plásmido de cadena doble o subclones de M13 de
cadena sencilla, y los cebadores se prepararon tanto para el vector
justo fuera del inserto a secuenciar, o para una secuencia
previamente obtenida. La secuencia obtenida se ensambló y se comparó
utilizando el software Dnastar. La manipulación y comparación de
las secuencias obtenidas se llevó a cabo con los programas
Superclone y Supersee de Coral Software.
El procedimiento general de transferencia
Southern se tomó de Maniatis et al. El DNA se transfirió a
filtros de nitrocelulosa y se hibridó con sondas de DNA marcadas
apropiadas. Las sondas para las transferencias Southern se
prepararon utilizando bien el Nonradioactive DNA Labelling and
Detection Kit de Boehringer Mannheim o el Nick Translation Kit de
Bethesda Research Laboratories (BRL). En ambos casos se siguieron
los procedimientos recomendados por los fabricantes.
El método se basa en el procedimiento del fosfato
de calcio de Graham y Van der eb (1973) con las siguientes
modificaciones. El DNA del virus y/o el plásmido se diluyó hasta
298 \mul en Tris 0,01 M pH 7,5, EDTA 1 mM. Se añadieron 40 \mul
de CaCl_{2} 2 M seguidos de un volumen igual de solución salina
tamponada con HEPES 2X (10 g de ácido
N-2-hidroxietilpiperazin-N'-2-etanosulfónico
(HEPES), 16 g de NaCl, 0,74 g de KCl, 0,25 g de
Na_{2}HPO_{4}\cdot2H_{2}O, 2 g de dextrosa por litro de
H_{2}O y tamponado con NaOH a pH 7,4). La mezcla se incubó a
continuación en hielo durante 10 minutos, y a continuación se
añadió gota a gota a una monocapa confluente al 80% de células Vero
que crecían en una placa petri de 60 mm bajo 5 ml de medio (DME con
suero bovino fetal al 1%). Las células se incubaron 4 horas a 37ºC
en un incubador humidificado que contenía CO_{2} al 5%. Las
células se lavaron a continuación una vez con 5 ml de PBS 1X (1,15
g de Na_{2}HPO_{4}, 0,2 g de KH_{2}PO_{4}, 0,89 g de NaCl,
0,2 g de KCl por litro de H_{2}O), una vez con 5 ml de glicerol
al 20%/PBS (v/v), una vez más con 5 ml de PBS 1X, y a continuación
se les suministró 5 ml de medio (DME con suero bovino fetal al 2%).
Las células se incubaron a 37ºC como antes durante
3-7 días hasta que el efecto citopático del virus
era del 50-100%. El virus se recogió como se
describió anteriormente para la preparación de las soluciones de
reserva de virus. Esta solución de reserva se denominó solución de
reserva de transfección y subsiguientemente se sometió a escrutinio
para buscar virus recombinantes mediante el ESCRUTINIO PARA BUSCAR
VIRUS DEL HERPES RECOMBINANTE QUE EXPRESE LOS GENES DE MARCADORES
ENZIMÁTICOS.
Este método se basa en la recombinación homóloga
entre el DNA del virus del herpes y el DNA del vector de homología
plásmidico que tiene lugar en células de cultivo de tejidos
cotransfectadas con estos elementos. Se mezclaron entre 0,1 y 1
\mug de DNA plasmídico que contenía DNA ajeno flanqueado por
secuencias apropiadas clonadas del virus del herpes (el vector de
homología) con aproximadamente 0,3 \mug de DNA del virus del
herpes intacto. Los DNAs se diluyeron hasta 298 \mul en Tris 0,01
M pH 7,5, EDTA 1 mM, y se utilizaron para la transfección células
Vero conforme a la TRANSFECCIÓN DE DNA PARA GENERAR VIRUS
RECOMBINANTE (véase arriba).
En lugar de utilizar vectores de homología y
basarse en la recombinación homóloga para generar virus
recombinante, hemos desarrollado también la técnica de ligación
directa para crear virus del herpes mediante ingeniería genética.
En este caso, un gen ajeno clonado no requería secuencias de DNA
del virus del herpes flanqueantes, sino que solamente se requería
que tuviera sitios de restricción disponibles para cortar el
fragmento del gen ajeno del vector plasmídico. Se utilizó una
enzima de restricción compatible para cortar el DNA del virus del
herpes. Un requerimiento de la técnica es que la enzima de
restricción utilizada para cortar el DNA del virus del herpes debe
cortar en un número limitado de sitios. Para el
EHV-4, serían apropiadas las enzimas de restricción
PmeI o PacI (véase la Figura 2). También pueden
utilizarse sitios de restricción previamente introducidos en el
virus del herpes por otros métodos. El DNA del virus del herpes se
mezcla con un exceso molar de 30 veces de DNA plasmídico
(típicamente 5 \mug de DNA del virus frente a 10 \mug del DNA
plasmídico), y la mezcla se somete a corte con la enzima de
restricción apropiada. La mezcla de DNA se extrae con fenol y se
precipita con etanol para retirar las enzimas de restricción, y se
somete a ligación conforme al procedimiento de ligación detallado
arriba. La mezcla de DNA ligado se resuspende a continuación en 298
\mul de Tris 0,01 M pH 7,5, EDTA 1 mM y se utiliza para la
transfección células Vero conforme a la TRANSFECCIÓN DE DNA PARA
GENERAR VIRUS RECOMBINANTE (véase arriba).
La capacidad para generar virus del herpes
mediante cotransfección de fragmentos subgenómicos solapantes
clonados se ha demostrado para el virus de la pseudorrabia (48) y
para el virus del herpes de los pavos (47). Si se generan deleciones
y/o inserciones mediante ingeniería genética directamente dentro de
los fragmentos subgenómicos antes de la cotransfección, este
procedimiento da como resultado una alta frecuencia de virus que
contienen la alteración genómica, reduciendo enormemente la
cantidad de escrutinios necesarios para purificar el virus
recombinante. Nosotros nos anticipamos utilizando esta técnica para
generar mediante ingeniería genética inserciones de genes ajenos
dentro de deleciones atenuantes específicas (US2, TK y gpE) en el
EHV-4. En el primer paso de este procedimiento se
introducen deleciones en virus separados mediante recombinación
homóloga con genes de marcadores enzimáticos como se describe más
abajo. El vector de homología utilizado en este paso se construye
de tal forma que el gen del marcador enzimático esté flanqueado por
un sitio de una enzima de restricción que no corte el
EHV-4 en la región de DNA a suprimir. En el segundo
paso, se construye una genoteca de fragmentos subgenómicos
solapantes, capaces de regenerar el virus salvaje, a partir del DNA
4EHV-000 cortado al azar. En el tercer paso, los
fragmentos subgenómicos se clonan a partir de cada uno de los virus
recombinantes individuales que contienen las deleciones
atenuantes/inserciones del gen marcador que se generaron en el
primer paso. En cada caso el fragmento subclonado se corresponde en
tamaño y situación con uno de los fragmentos subgenómicos salvajes
construidos en el segundo paso. Esto se lleva a cabo mediante el
escrutinio de una genoteca de subclones de DNA del virus
recombinante cortado al azar con sondas generadas a partir de los
extremos del fragmento subgenómico salvaje apropiado. Los sitios de
restricción que habían sido generados mediante ingeniería genética
para flanquear los genes marcadores en el primer paso se utilizan
ahora para reemplazar los genes marcadores en cada fragmento
subgenómico con varios genes ajenos (tales como gpB del
EHV-1, gpD del EHV-1, HA de la gripe
equina, o NA de la gripe equina). En el cuarto paso, la
cotransfección de los fragmentos subgenómicos solapantes salvajes y
derivados de la deleción/inserción apropiados permite la generación
de virus EHV-4 recombinantes que incorporan
cualquier combinación deseada de deleciones y/o inserciones.
Cuando se incorporó el gen marcador de la
\beta-galactosidasa (lacZ) o la
\beta-glucuronidasa (uidA) de E. coli en un
virus recombinante, las colonias que contenían los recombinantes se
visualizaron mediante un simple ensayo. Durante el ensayo de las
colonias, se incorporó el sustrato enzimático (300 \mug/ml) en la
capa superior de agarosa. Para el gen marcador lacZ se utilizó el
sustrato BLUOGAL™
(indolil-\beta-D-galactosidasa
halogenada, GIBCO-Bethesda Research Labs). Para el
gen marcador uidA se utilizó el sustrato X-Glucuro
Chx (sal de ciclohexilamonio del ácido
5-bromo-4-cloro-3-indolil-\beta-D-glucurónico,
Biosynth AG). Las colonias que expresaban la enzima marcadora
activa se volvieron azules. Las colonias azules se recogieron a
continuación y depositaron sobre células Vero frescas y se
purificaron mediante un nuevo aislamiento de colonias azules. En
las estrategias de virus recombinantes en las que se retira el gen
del marcador enzimático, el ensayo implica la purificación de
colonias blancas a partir de un fondo de colonias azules
parenterales. En ambos casos los virus se purificaron típicamente
con tres rondas de purificación de colonias.
Muchos análogos de los nucleósidos inhiben la
replicación de alfa-virus del herpes. Un fármaco
antiviral de este tipo es la arabinosiltimina
(Ara-T; Rayo Chemicals, Canada). La resistencia de
los mutantes del EHV a Ara-T se debe a mutaciones en
el TK viral, de tal forma que se seleccionan los virus TK negativos
(TK-). Las soluciones de transfección de reserva se cultivaron
sobre células Vero en presencia de 200 \mug/ml de
Ara-T en medio DME completo con suero bovino fetal
al 1%. La selección se repitió entre una y dos veces. Los virus de
reserva generados a partir de la selección con Ara-T
se sometieron a ensayo mediante autorradiografía de colonias con
timidina (37, 38). Las colonias seleccionadas a partir de las
reservas positivas se sometieron a ensayo relativo a la deleción
del TK mediante el procedimiento de TRANSFERENCIA SOUTHERN DE DNA.
Obsérvese que los virus TK negativos construidos utilizando la
selección con Ara-T
(S-1EHV-001 y
S-4EHV-001) exhibieron cambios en
fragmentos de restricción no relacionados con el sitio TK. Se
observaron diferencias en los fragmentos BamHI c, d y g en
S-4EHV-001 y en el fragmento p en
S-1EHV-001. Puesto que no se
observaron cambios similares en
S-4EHV-004, en el que la deleción
del TK se introdujo sin la selección con Ara-T,
creemos que este procedimiento es un procedimiento menos deseable
para la selección de virus recombinantes.
La estrategia utilizada para construir virus con
deleciones implicó la utilización de las técnicas de recombinación
homóloga y/o ligación directa. Inicialmente, se construyó un virus
mediante recombinación homóloga, en el que el DNA a suprimir se
reemplazó por un gen marcador tal como la
\beta-galactosidasa (lacZ) o la
\beta-glucuronidasa (uidA) de E. coli. A
continuación se construyó un segundo virus en el que se suprimió el
gen marcador, bien mediante recombinación homóloga o mediante
ligación directa. La ventaja de esta estrategia es que ambos virus
pueden purificarse mediante el ESCRUTINIO PARA BUSCAR VIRUS DEL
HERPES RECOMBINANTE QUE EXPRESE LOS GENES DE MARCADORES ENZIMÁTICOS.
El primer virus se purifica seleccionando las colonias azules de un
fondo de colonias blancas, el segundo virus se purifica
seleccionando las colonias blancas de un fondo de colonias
azules.
Los genes de la hemaglutinina (HA) y la
neuraminidasa (NA) del virus de la gripe equina pueden clonarse
esencialmente como se describe en Katz et al. para el gen HA
del virus de la gripe humana. El RNA viral preparado a partir del
virus cultivado en células MDBK se convierte primero a cDNA
utilizando un oligonucleótido cebador específico para el gen diana.
El cDNA se utiliza a continuación como molde para la clonación por
PCR (51) de la región del gen diana. Los cebadores para la PCR se
diseñan para incorporar sitios de restricción que permitan la
clonación de las regiones codificantes amplificadas en vectores que
contengan las señales apropiadas para la expresión en el EHV. Se
requiere un par de oligonucleótidos cebadores para cada región
codificante. Las regiones codificantes del gen HA de los virus con
serotipo 2 (H3) (Influenza A/equine/Miami/63, Influenza
A/equine/Kentucky/81, e Influenza A/equine/Alaska/91) podrían
clonarse utilizando los siguientes cebadores
5'-GGGTCGACATGACAGACAACCATTATTTTGATAC-3'
(SEC ID Nº 64) para cebar el cDNA y combinado con
5'-GGGTCGACTCAAATGCAAATGTTGCATCTGAT-3'
(SEC ID Nº 65) para la PCR. La región codificante del gen HA del
virus con serotipo 1 (H7) (Influenza A/equine/Prague/56) podría
clonarse utilizando los siguientes cebadores 5'-
GGGATCCATGAACACTCAAATTCTAATATTAG-3' (SEC ID Nº 66)
para cebar el cDNA y combinado con
5'-GGGATCCTTATATACAAATAGTGCACCGCA-3'
(SEC ID Nº 67) para la PCR. Las regiones codificantes del gen NA de
los virus con serotipo 2 (N8) (Influenza A/equine/Miami/63,
Influenza A/equine/Kentucky/81, e Influenza A/equine/Alaska/91)
podrían clonarse utilizando los siguientes cebadores
5'-GGGTCGACATGAATCCAAATCAAAAGATAA-3'
(SEC ID Nº 68) para cebar el cDNA y combinado con
5'-GGGTCGACTTACATCTTATCGATGTCAAA-3'
(SEC ID Nº 69) para la PCR. La región codificante del gen NA del
virus con serotipo 1 (N7) (Influenza A/equine/Prague/56) podría
clonarse utilizando los siguientes cebadores
5'-GGGATCCATGAATCCTAATCAAAAACTCTTT-3'
(SEC ID Nº 68) para cebar el cDNA y combinado con
5'-GGGATCCTTACGAAAAGTATTTAATTTGTGC-3'
(SEC ID Nº 71) para la PCR. Obsérvese que esta estrategia general
puede utilizarse para clonar las regiones codificantes de los genes
HA y NA de otras cepas del virus A de la gripe equina.
El plásmido 450-46.B4 se
construyó con el propósito de suprimir una porción del gen de la
timidina quinasa del EHV-1. Puede utilizarse
también para insertar DNA ajeno en el EHV-1.
Contiene un único sitio para la enzima de restricción XbaI
en el que puede insertarse el DNA ajeno. Puede construirse
utilizando técnicas de DNA recombinante estándar (23 y 34), uniendo
fragmentos de restricción de las siguientes fuentes con las
secuencias de DNA sintéticas que se indican en la Figura 4. El
vector plasmídico proviene de un fragmento de restricción entre
BamHI y HindIII de aproximadamente 2978 pares de bases
de pSP65 (Promega). El fragmento 1 es un subfragmento de
restricción Sau3A de aproximadamente 779 pares de bases del
fragmento de restricción BglII b del EHV-1
(42). El fragmento 2 es un subfragmento de restricción entre
BstEII y PstI de aproximadamente 1504 pares de bases
del fragmento de restricción BglII b del
EHV-1 (42).
\newpage
El plásmido 467-21.19 se
construyó con el propósito de suprimir una porción del gen único
corto 2 del EHV-1. Puede utilizarse también para
insertar DNA ajeno en el EHV-1. Contiene un único
sitio para la enzima de restricción EcoRI en el que puede
insertarse el DNA ajeno. Puede construirse utilizando técnicas de
DNA recombinante estándar (23, 34), uniendo fragmentos de
restricción de las siguientes fuentes como se indica en la Figura 5.
El vector plasmídico proviene de un fragmento de restricción entre
BamHI y PstI de aproximadamente 2983 pares de bases de
pSP65 (Promega). Obsérvese que el sitio EcoRI ha sido
eliminado del vector plasmídico por digestión con la nucleasa S1.
El fragmento 1 es un subfragmento de restricción entre BamHI
y NcoI de aproximadamente 767 pares de bases del fragmento de
restricción BamHI n del EHV-1 (42). El
fragmento 2 es un subfragmento de restricción entre EcoRI y
PstI de aproximadamente 1283 pares de bases del fragmento de
restricción BamHI n del EHV-1 (42).
El plásmido 536-85.30 se
construyó con el propósito de suprimir el gen de la glicoproteína G
del EHV-1. Se utilizó para insertar DNA ajeno en el
EHV-1. Contiene un par de sitios para la enzima de
restricción SalI en el que puede insertarse el DNA ajeno.
Puede construirse utilizando técnicas de DNA recombinante estándar
(23 y 34), uniendo fragmentos de restricción de las siguientes
fuentes como se indica en la Figura 6. El vector plasmídico proviene
de un fragmento de restricción entre EcoRI y PstI de
aproximadamente 2643 pares de bases de pNEB193 (New England
Biolabs). El fragmento 1 es un subfragmento de restricción entre
EcoRI y PvuII de aproximadamente 2292 pares de bases
del fragmento de restricción EcoRI k del
EHV-1 (42). El fragmento 2 es un subfragmento de
restricción entre PstI y BamHI de aproximadamente 1077
pares de bases del fragmento de restricción EcoRI k del
EHV-1 (42).
El plásmido 495-61.39 se
construyó con el propósito de suprimir una porción del gen de la
timidina quinasa del EHV-4. Puede utilizarse
también para insertar DNA ajeno en el EHV-4.
Contiene un único sitio para la enzima de restricción XbaI
en el que puede insertarse el DNA ajeno. Puede construirse
utilizando técnicas de DNA recombinante estándar (23, 34), uniendo
fragmentos de restricción de las siguientes fuentes con las
secuencias de DNA sintéticas que se indican en la Figura 7. El
vector plasmídico proviene de un fragmento de restricción entre
SmaI y HincII de aproximadamente 2988 pares de bases
de pSP65 (Promega). El fragmento 1 es un subfragmento de restricción
entre PvuII y FspI de aproximadamente 830 pares de
bases del fragmento de restricción BamHI c del
EHV-4 (8). El fragmento 2 es un subfragmento de
restricción entre PvuII y SmaI de aproximadamente
1220 pares de bases del fragmento de restricción BamHI c del
EHV-4 (8).
El plásmido 523-38.9 se construyó
con el propósito de suprimir una porción del gen único corto 2 del
EHV-4. Puede utilizarse también para insertar DNA
ajeno en el EHV-4. Contiene un único sitio para la
enzima de restricción PstI en el que puede insertarse el DNA
ajeno. Puede construirse utilizando técnicas de DNA recombinante
estándar (23, 34), uniendo fragmentos de restricción de las
siguientes fuentes como se indica en la Figura 8. El vector
plasmídico proviene de un fragmento de restricción entre
XbaI y HindIII de aproximadamente 2984 pares de bases
de pSP65 (Promega). El fragmento 1 es un subfragmento de restricción
entre XbaI y PstI de aproximadamente 1098 pares de
bases del fragmento de restricción EcoRI g del
EHV-4 (8). El fragmento 2 es un subfragmento de
restricción entre PstI y HindIII de aproximadamente
2799 pares de bases del fragmento de restricción BamHI d del
EHV-4 (8).
El plásmido 580-57.25 se
construyó con el propósito de suprimir el gen gpE del
EHV-4. Puede utilizarse también para insertar DNA
ajeno en el EHV-4. Contiene un único sitio para la
enzima de restricción BamHI en el que puede insertarse el
DNA ajeno. Puede construirse utilizando técnicas de DNA
recombinante estándar (23, 34), uniendo fragmentos de restricción de
las siguientes fuentes como se indica en la Figura 9. El vector
plasmídico proviene de un fragmento de restricción entre
EcoRI y HincII de aproximadamente 2973 pares de bases
de pSP65 (Promega). El fragmento 1 es un subfragmento de restricción
entre EcoRI y AatII de aproximadamente 2046 pares de
bases del fragmento de restricción EcoRI j del
EHV-4 (8). El fragmento 2 es un subfragmento de
restricción entre FspI y FspI de aproximadamente 1976
pares de bases del fragmento de restricción EcoRI j del
EHV-4 (8).
El plásmido 467-22.A12 se
construyó con el propósito de suprimir una porción de la región
codificante del gen US2 del virus EHV-1. Incorpora
un gen marcador de la \beta-galactosidasa (lacZ)
de E. coli flanqueado por el DNA del virus
EHV-1. El gen marcador lacZ se insertó en el vector
de homología 467-21.19 en el único sitio
EcoRI. El gen marcador está orientado de forma opuesta al
gen US2 en el vector de homología. En la Figura 10 se da una
descripción detallada del gen marcador. Puede construirse utilizando
técnicas de DNA recombinante estándar (23, 34), uniendo fragmentos
de restricción de las siguientes fuentes con las secuencias de DNA
sintéticas que se indican en la Figura 10. El fragmento 1 es un
subfragmento de restricción entre SalI y BamHI de
aproximadamente 413 pares de bases del fragmento de restricción
BamHI 10 del PRV (22). El fragmento 2 es un fragmento de
restricción entre BamHI y PvuII de aproximadamente
3010 pares de bases del plásmido pJF751 (11). El fragmento 3 es un
subfragmento de restricción entre NdeI y SalI de
aproximadamente 754 pares de bases del fragmento de restricción
BamHI #7 del PRV (22).
El plásmido 588-81.13 se
construyó con el propósito de suprimir una porción de la región
codificante del gen US2 del virus EHV-4. Incorpora
un gen marcador de la \beta-galactosidasa (lacZ)
de E. coli flanqueado por el DNA del virus
EHV-4. El gen marcador lacZ se insertó como un
fragmento de restricción PstI en el vector de homología
523-38.9 en el único sitio PstI. El gen
marcador está orientado en dirección opuesta al gen US2 en el vector
de homología. En la Figura 11 se da una descripción detallada del
gen marcador. Se construyó utilizando técnicas de DNA recombinante
estándar (23, 34), uniendo fragmentos de restricción de las
siguientes fuentes con las secuencias de DNA sintéticas que se
indican en la Figura 11. El fragmento 1 es un subfragmento de
restricción entre SalI y BamHI de aproximadamente 413
pares de bases del fragmento de restricción BamHI 10 del PRV
(22). El fragmento 2 es un fragmento de restricción entre
BamHI y PvuII de aproximadamente 3010 pares de bases
del plásmido pJF751 (11). El fragmento 3 es un subfragmento de
restricción entre NdeI y SalI de aproximadamente 754
pares de bases del fragmento de restricción BamHI #7 del PRV
(22).
El plásmido 552-45.19 se
construyó con el propósito de suprimir una porción de la región
codificante del gen TK del virus EHV-4. Incorpora
un gen marcador de la \beta-glucuronidasa (uidA)
de E. coli flanqueado por el DNA del virus
EHV-4. El gen marcador uidA se insertó en el vector
de homología 495-61.39 en el único sitio
XbaI. El gen marcador está orientado de forma opuesta al gen
TK en el vector de homología. En la Figura 12 se da una descripción
detallada del gen marcador. Puede construirse utilizando técnicas de
DNA recombinante estándar (23, 34), uniendo fragmentos de
restricción de las siguientes fuentes con las secuencias de DNA
sintéticas que se indican en la Figura 12. El fragmento 1 es un
subfragmento de restricción entre SalI y EcoRI de
aproximadamente 404 pares de bases del fragmento de restricción
BamHI #10 del PRV (22). Obsérvese que el sitio EcoRI
se introdujo en el lugar indicado en la Figura 12 mediante clonación
por PCR. El fragmento 2 es un fragmento entre EcoRI y
SmaI de aproximadamente 1823 pares de bases del plásmido
pRAJ260 (Clonetech). Obsérvese que los sitios EcoRI y
SmaI se introdujeron en las los lugares indicados en la
Figura 12 mediante clonación por PCR. El fragmento 3 es un
subfragmento de restricción entre SmaI y SmaI de
aproximadamente 784 pares de bases del fragmento de restricción
BamHI Q del HSV-1 (24). Obsérvese que este
fragmento está orientado de tal forma que la secuencia de
poliadenilación (AATAAA) se sitúe lo más cerca posible del empalme
C.
El plásmido 593-31.2 se construyó
con el propósito de suprimir la región codificante del gen gpE del
virus EHV-4. Incorpora un gen marcador de la
\beta-galactosidasa (lacZ) de E. coli
flanqueado por el DNA del virus EHV-4. El gen
marcador lacZ se insertó en el vector de homología
580-57.25 en el único sitio BamHI. El gen
marcador está orientado igual que el gen gpE suprimido en el vector
de homología. En la Figura 13 se da una descripción detallada del
gen marcador. Puede construirse utilizando técnicas de DNA
recombinante estándar (23, 34), uniendo fragmentos de restricción
de las siguientes fuentes con las secuencias de DNA sintéticas que
se indican en la Figura 10. El fragmento 1 es un subfragmento de
restricción entre SalI y BamHI de aproximadamente 413
pares de bases del fragmento de restricción BamHI 10 del PRV
(22). El fragmento 2 es un fragmento de restricción entre
BamHI y PvuII de aproximadamente 3010 pares de bases
del plásmido pJF751 (11). El fragmento 3 es un subfragmento de
restricción entre NdeI y SalI de aproximadamente 754
pares de bases del fragmento de restricción BamHI #7 del PRV
(22).
El plásmido 616-40 se construyó
con el propósito de suprimir una porción del gen de la timidina
quinasa del EHV-4. Se utiliza también para insertar
DNA ajeno en el EHV-4. Contiene un único sitio
NotI en el que se inserta el DNA ajeno. El vector de
homología 616-40 proviene de una genoteca de
cósmidos preparada con DNA cortado del virus
4EHV-004. Se generó una genoteca de subclones que
contenían fragmentos subgenómicos del EHV solapantes como sigue. El
DNA del 4EHV-004 se cortó y a continuación se
seleccionó por tamaños en un gradiente de glicerol como se ha
descrito (48), eligiéndose los fragmentos de 40-50
kb como población de insertos. Las fracciones combinadas se
diluyeron al doble con TE, se añadieron un décimo del volumen de
NaAc 3 M y 2,5 volúmenes de etanol, y el DNA se precipitó a 30000
rpm en un rotor Beckman SW41 durante 1 hora. Los fragmentos cortados
se pulieron para proporcionar extremos romos, mediante tratamiento
inicial con DNA polimerasa de T4, utilizando concentraciones bajas
de dNTP para propiciar la eliminación de los extremos 3' colgantes,
seguido del tratamiento con polimerasa Klenow para rellenar los
extremos 3' retraídos. Estos fragmentos de inserto se ligaron a
continuación con el 384-94. El vector de tipo
cósmido 384-94 es un derivado de pHC79 de Gibco
BRL, Inc. del que se suprimió el gen de resistencia a tetraciclina
por digestión mediante endonucleasas de restricción con
HindIII y AvaI, y se insertó un enlazador de DNA que
contenía los sitios de restricción
NotI-BamHI-NotI. El vector de tipo cósmido
384-94 se sometió a digestión con BamHI, los
extremos se volvieron romos mediante tratamiento con polimerasa
Klenow y se trató con fosfatasa intestinal de ternera. La mezcla de
ligación que contenía el vector de tipo cósmido
384-94 y los fragmentos de DNA genómico del
4EHV-004 se encapsidó a continuación utilizando
extractos de encapsidación Gigapack XL (Stratagene). La ligación y
encapsidación fueron como recomienda el fabricante. Las colonias se
hicieron crecer en cultivos durante una noche y se extrajo el DNA
de tipo cósmido (23, 34). El DNA de tipo cósmido se analizó por
digestión mediante endonucleasas de restricción con NotI. Los
clones de DNA de tipo cósmido se sometieron a escrutinio para
buscar la presencia de un fragmento NotI de 3,0 kb que
indicaba la presencia del promotor gX del
PRV-inserto del gen ajeno uidA en un sitio
NotI dentro de la deleción del gen TK. Se aisló un cósmido,
607-21.16, que contenía la deleción del gen TK con
una inserción del gen uidA. El cósmido, 607-21.16,
se sometió a digestión con NotI para eliminar el promotor
gX/gen uidA y se sometió a una nueva ligación para obtener el
vector de homología, 616-40. El vector de homología,
616-40, contiene secuencias de DNA que rodean el gen
TK de aproximadamente 22600 pares de bases que incluye
aproximadamente 4000 pares de bases del fragmento EcoRI e,
aproximadamente 600 pares de bases del fragmento EcoRI q
entero y aproximadamente 18000 pares de bases del fragmento
EcoRI a. El vector proviene de un fragmento de restricción
BamHI de aproximadamente 4430 pares de bases del vector de
tipo cósmido 384-94 (derivado de pHC79 de
Gibco-BRL). El vector de homología
616-40 contiene la deleción de 653 pares de bases en
el gen TK con un único sitio NotI y sin un gen marcador
adicional insertado.
El plásmido 593-20.5 se construyó
con el propósito de suprimir el gen gpE del virus
EHV-4 e insertar el gen marcador de la
\beta-glucuronidasa (uidA) bajo el control del
promotor gX del PRV. Se utiliza también para insertar otro DNA
ajeno, incluyendo los genes HA y NA de la gripe equina en el
EHV-4. Se construyó utilizando técnicas de DNA
recombinante estándar (23, 34), uniendo fragmentos de restricción
de las siguientes fuentes. El plásmido proviene de un fragmento de
restricción entre EcoRI y HincII de aproximadamente
2973 pares de bases de pSP65 (Promega). El fragmento 1 es un
subfragmento de restricción entre EcoRI y AatII de
aproximadamente 2046 pares de bases del fragmento de restricción
EcoRI j del EHV-4 (8). El fragmento 2 es un
fragmento BamHI de aproximadamente 3011 pares de bases que
contiene el promotor gX del PRV, el gen uidA, y el sitio de
poliadenilación del HSV-1. El fragmento 3 es un
subfragmento de restricción entre FspI y FspI de
aproximadamente 1976 pares de bases del fragmento de restricción
EcoRI j del EHV-4.
La deleción del gen US2 en un virus del herpes
equino hace que un virus del herpes equino recombinante sea seguro
para su utilización en equinos preñados, esto es, hace que el virus
sea incapaz de causar el aborto del feto.
Hemos caracterizado las regiones únicas cortas
del EHV-1 y EHV-4 mediante análisis
de secuencia de DNA. La SEC ID Nº 1 muestra la secuencia de las
primeras 1322 bases del fragmento BamHI n (véase la Figura 1)
que se leen desde el empalme BamHI n - BamHI d. Esta
secuencia contiene un ORF (del inglés, "open reading frame",
marco de lectura abierto) de 303 aminoácidos que presenta homología
con algunos genes US2 de otros virus del herpes (véase la Figura 3).
La SEC ID Nº 3 muestra las 1252 bases de la secuencia que comienza
198 bases corriente arriba del sitio HindIII situado
aproximadamente en el medio del fragmento EcoRI g del
EHV-4 (véase la Figura 2). La secuencia se lee hacia
atrás en dirección al empalme EcoRI g - EcoRI b y
contiene un ORF de 324 aminoácidos. Después de secuenciar la región
única corta, encontramos que contenía un gen US2 que presentaba
homología con varios genes US2 de otros virus del herpes (véase la
Figura 5). Puesto que determinamos la posición y secuencia del gen
US2 en el virus del herpes equino, podemos suprimir el gen US2 del
EHV-1 y el EHV-4 y atenuar, así como
hacer que el virus sea seguro para su utilización en caballos
preñados.
El vector de homología 450-46.B4
es un plásmido utilizado para atenuar el EHV-1 a
través de la inactivación del gen TK. La inactivación del gen TK se
lleva a cabo mediante la deleción de DNA que codifica la TK del
EHV-1. El plásmido 450-46.B4 lleva
una copia del gen TK (31) en el que se ha introducido una deleción
de aproximadamente 202 pares de bases entre los aminoácidos 115 y
182. El plásmido, utilizado conforme al PROCEDIMIENTO DE
RECOMBINACIÓN HOMÓLOGA PARA GENERAR VIRUS DEL HERPES RECOMBINANTE y
a la SELECCIÓN DE VIRUS RESISTENTE A ARA-T, genera
un EHV-1 que contiene un gen TK suprimido.
El plásmido 450-46.B4 es
utilizable también para insertar DNA ajeno en el
EHV-1. El plásmido contiene un único sitio de
restricción XbaI situado en el sitio de la deleción. El DNA
ajeno clonado en este sitio da como resultado un plásmido que
podría utilizarse conforme al PROCEDIMIENTO DE RECOMBINACIÓN
HOMÓLOGA PARA GENERAR VIRUS DEL HERPES RECOMBINANTE para generar un
EHV-1 que contenga DNA ajeno. Obsérvese que si se
inserta un gen marcador apropiado (por ejemplo, lacZ de E.
coli) en el vector de homología, entonces se genera un virus
recombinante sin la SELECCIÓN DE VIRUS RESISTENTE A
ARA-T.
Para que los procedimientos descritos arriba
resulten exitosos, es importante que el sitio de deleción/inserción
esté en una región que no sea esencial para la replicación del
EHV-1 y que el sitio esté flanqueado con DNA del
virus del herpes equino apropiado para mediar la recombinación
homóloga entre los DNAs del virus y el plásmido. Obsérvese que la
deleción se diseñó de tal forma que esté limitada a una porción
específica de la región codificante de la TK. Esta región contiene
aminoácidos importantes para la actividad enzimática de la TK. La
deleción no elimina secuencias que estén implicadas con genes
flanqueantes que sean importantes para un crecimiento viral
eficiente (12). Hemos demostrado que el sitio de inserción/deleción
en el vector de homología 450-46.B4 inserta DNA
ajeno en el EHV-1, como queda representado por los
dos virus EHV-1 recombinantes de los Ejemplos 7 y
9.
El vector de homología 467-21.19
es un plásmido utilizado para atenuar el EHV-1 a
través de la inactivación del gen US2. La inactivación del gen US2
se lleva a cabo mediante la deleción de DNA que codifica la US2 del
EHV-1. El plásmido 467-21.19 lleva
una copia del gen US2 en el que se ha introducido una deleción de
aproximadamente 93 pares de bases entre los aminoácidos 174 y 205.
El plásmido podría utilizarse conforme a la CONSTRUCCIÓN DE VIRUS
CON DELECIONES para generar un EHV-1 que contenga un
gen US2 suprimido.
El plásmido 467-21.19 es
utilizable también para insertar DNA ajeno en el
EHV-1. El plásmido contiene un único sitio de
restricción EcoRI situado en el sitio de la deleción. El DNA
ajeno clonado en este sitio da como resultado un plásmido que
podría utilizarse conforme al PROCEDIMIENTO DE RECOMBINACIÓN
HOMÓLOGA PARA GENERAR VIRUS DEL HERPES RECOMBINANTE para generar un
EHV-1 que contenga DNA ajeno.
Para que los procedimientos descritos arriba
resulten exitosos, es importante que el sitio de deleción/inserción
esté en una región que no sea esencial para la replicación del
EHV-1 y que el sitio esté flanqueado con DNA del
virus del herpes equino apropiado para mediar la recombinación
homóloga entre los DNAs del virus y el plásmido. Obsérvese que la
deleción se diseñó de tal forma que esté limitada a la región única
corta y no elimine secuencias de las repeticiones interna o
terminal. Hemos demostrado que el sitio de inserción/deleción en el
vector de homología 467-21.19 inserta DNA ajeno en
el EHV-1, como queda representado por los dos virus
EHV-1 recombinantes de los Ejemplos 7 y 9.
El vector de homología 536-85.30
es un plásmido utilizado para atenuar el EHV-1 a
través de la eliminación del gen de la glicoproteína G (gpG) y una
porción del gen de la glicoproteína grande de membrana (MGP) de la
región única corta. El plásmido 536-85.30 lleva una
porción de la región única corta en la que se ha generado mediante
ingeniería genética una deleción de aproximadamente 2384 pares de
bases que elimina toda la región codificante de la gpG y los 307
aminoácidos del extremo N-terminal de la MGP. El
plásmido puede utilizarse conforme a la CONSTRUCCIÓN DE VIRUS CON
DELECIONES para generar un EHV-1 con una deleción en
gpG/MGP.
El plásmido 536-85.30 es
utilizable también para insertar DNA ajeno en el
EHV-1. El plásmido contiene un par de sitios de
restricción SalI situados en el sitio de la deleción. El DNA
ajeno clonado en estos sitios da como resultado un plásmido que
podría utilizarse conforme al PROCEDIMIENTO DE RECOMBINACIÓN
HOMÓLOGA PARA GENERAR VIRUS DEL HERPES RECOMBINANTE para generar un
EHV-1 que contenga DNA ajeno.
El vector de homología 495-61.39
es un plásmido utilizado para atenuar el EHV-4 a
través de la inactivación del gen TK. La inactivación del gen TK se
lleva a cabo mediante la deleción de DNA que codifica la TK del
EHV-4. El plásmido 495-61.39 lleva
una copia del gen TK (27) en el que se ha generado mediante
ingeniería genética una deleción de aproximadamente 653 pares de
bases entre los aminoácidos 98 y 317. El plásmido se utiliza
conforme al PROCEDIMIENTO DE RECOMBINACIÓN HOMÓLOGA PARA GENERAR
VIRUS DEL HERPES RECOMBINANTE y a la SELECCIÓN DE VIRUS RESISTENTE A
ARA-T para generar un EHV-4 con una
deleción en el gen que codifica la TK.
El plásmido 495-61.39 es
utilizable también para insertar DNA ajeno en el
EHV-4. El plásmido contiene un único sitio de
restricción XbaI situado en el sitio de la deleción. El DNA
ajeno clonado en este sitio da como resultado un plásmido que
podría utilizarse conforme al PROCEDIMIENTO DE RECOMBINACIÓN
HOMÓLOGA PARA GENERAR VIRUS DEL HERPES RECOMBINANTE para generar un
virus EHV-4 que contenga DNA ajeno. Obsérvese que si
se inserta un gen marcador apropiado (por ejemplo, lacZ de E.
coli) en el vector de homología, entonces se genera un virus
recombinante sin la SELECCIÓN DE VIRUS RESISTENTE A
ARA-T.
Para que los procedimientos descritos arriba
resulten exitosos, es importante que el sitio de deleción/inserción
esté en una región que no sea esencial para la replicación del
EHV-4 y que el sitio esté flanqueado con DNA del
virus del herpes equino apropiado para mediar la recombinación
homóloga entre los DNAs del virus y el plásmido. Obsérvese que la
deleción se diseñó de tal forma que esté limitada a una porción
específica de la región codificante de la TK. Esta región contiene
aminoácidos importantes para la actividad enzimática de la TK. La
deleción no elimina secuencias que estén implicadas con genes
flanqueantes que sean importantes para un crecimiento viral
eficiente (18, 12).
El vector de homología 523-38.9
es un plásmido utilizado para atenuar el EHV-4 a
través de la inactivación del gen US2. La inactivación del gen US2
se lleva a cabo mediante la deleción de DNA que codifica la US2 del
EHV-4. El plásmido 523-38.9 lleva
una copia del gen US2 en el que se ha generado mediante ingeniería
genética una deleción de aproximadamente 711 pares de bases entre
los aminoácidos 131 y 324. El plásmido podría utilizarse conforme a
la CONSTRUCCIÓN DE VIRUS CON DELECIONES para generar un
EHV-4 con una deleción en el gen que codifica la
US2.
El plásmido 523-38.9 es
utilizable también para insertar DNA ajeno en el
EHV-4. El plásmido contiene un único sitio de
restricción PstI situado en el sitio de la deleción. El DNA
ajeno clonado en este sitio da como resultado un plásmido que
podría utilizarse conforme al PROCEDIMIENTO DE RECOMBINACIÓN
HOMÓLOGA PARA GENERAR VIRUS DEL HERPES RECOMBINANTE para generar un
EHV-4 que contenga DNA ajeno.
Para que los procedimientos descritos arriba
resulten exitosos, es importante que el sitio de deleción/inserción
esté en una región que no sea esencial para la replicación del
EHV-4 y que el sitio esté flanqueado con DNA del
virus del herpes equino apropiado para mediar la recombinación
homóloga entre los DNAs del virus y el plásmido. Obsérvese que la
deleción se diseñó de tal forma que esté limitada a la región única
corta y no elimine secuencias de las repeticiones interna o
terminal. Hemos demostrado que el sitio de inserción/deleción en el
vector de homología 523-38.9 inserta DNA ajeno en
el EHV-4, como queda representado por los dos virus
EHV-4 recombinantes de los Ejemplos 13 y 14.
Hemos determinado que la deleción del gen de la
glicoproteína E del virus del herpes equino resulta útil para
atenuar el virus para su utilización en una vacuna para caballos y
para proporcionar un marcador serológico negativo.
El vector de homología 580-57.25
es un plásmido utilizado para atenuar el EHV-4 a
través de la eliminación del gen de la glicoproteína E (gpE) (8 y
SEC ID Nºs 5 & 6). El plásmido 580-57.25 lleva
una porción de la región única corta en la que se ha generado
mediante ingeniería genética una deleción de aproximadamente 1694
pares de bases que elimina toda la región codificante de la gpE. El
plásmido puede utilizarse conforme a la CONSTRUCCIÓN DE VIRUS CON
DELECIONES para generar un virus EHV-4 con una
deleción en el gen que codifica la gpE.
El plásmido 580-57.25 es
utilizable también para insertar DNA ajeno en el
EHV-4. El plásmido contiene un único sitio de
restricción BamHI situado en el sitio de la deleción. El DNA
ajeno clonado en este sitio da como resultado un plásmido que
podría utilizarse conforme al PROCEDIMIENTO DE RECOMBINACIÓN
HOMÓLOGA PARA GENERAR VIRUS DEL HERPES RECOMBINANTE para generar un
EHV-4 que contenga DNA ajeno.
El S-1EHV-001 es
un virus de tipo 1 (EHV-1) del virus del herpes
equino que tiene una deleción de aproximadamente 202 pares de bases
en el gen TK. El virus del herpes equino
S-1EHV-001 se depositó el 12 de
marzo de 1992, de conformidad con el Tratado de Budapest, en el
Depósito Internacional de Microorganismos para los Propósitos de
Procedimiento de Patentes con el Depósito de Cultivos de Patentes
de la Colección Americana de Cultivos Tipo, 12301 Parklawn Drive,
Rockville, Maryland 20852, EE.UU., con el Nº de Acceso ATCC VR
2357.
El S-1EHV-001 se
obtuvo a partir del S-1EHV-000 (cepa
Dutta). Esto se llevó a cabo utilizando el vector de homología
450-46.B4 (véase Materiales y Métodos) y el virus
S-1EHV-000 en el PROCEDIMIENTO DE
RECOMBINACIÓN HOMÓLOGA PARA GENERAR VIRUS DEL HERPES RECOMBINANTE.
La solución de transfección de reserva se seleccionó conforme a la
SELECCIÓN DE VIRUS RESISTENTE A ARA-T. Se
seleccionaron clones individuales después de dos rondas de selección
y se sometieron a ensayo mediante autorradiografía de colonias con
timidina (37, 38). Las colonias seleccionadas de las solución de
reserva TK negativas se sometieron a ensayo relativo a la deleción
en TK mediante el procedimiento de TRANSFERENCIA SOUTHERN DE DNA. Se
seleccionó una colonia que resultó ser TK menos mediante el ensayo
de incorporación de timidina así como en el análisis Southern y se
designó S-1EHV-001.
La construcción de este virus establece que el
gen de la timidina quinasa del EHV-1 no es un gen
esencial y es un sitio viable para la inserción de DNA ajeno. Este
virus resulta útil porque la inactivación del gen TK atenúa el
virus.
El S-1EHV-002 es
un virus de tipo 1 (EHV-1) del virus del herpes
equino que tiene dos deleciones en la región única corta del
genoma. La primera deleción es de aproximadamente 93 pares de bases
y elimina los aminoácidos 174 a 205 del gen US2 (SEC ID Nº 1). La
segunda deleción es de aproximadamente 2283 pares de bases y elimina
porciones de los genes gpG y MGP de la región única corta. El gen de
la \beta-galactosidasa (gen lacZ) de E.
coli se insertó en la deleción del gen US2 y está bajo el
control del promotor gpX del PRV. El virus del herpes equino
S-1EHV-002 se depositó el 12 de
marzo de 1992, de conformidad con el Tratado de Budapest, en el
Depósito Internacional de Microorganismos para los Propósitos de
Procedimiento de Patentes con el Depósito de Cultivos de Patentes
de la Colección Americana de Cultivos Tipo, 12301 Parklawn Drive,
Rockville, Maryland 20852, EE.UU., con el Nº de Acceso ATCC VR
2358.
El S-1EHV-002 se
obtuvo a partir del S-1EHV-000 (cepa
Dutta). Esto se llevó a cabo utilizando el vector de homología
467-22.A12 (véase Materiales y Métodos) y el virus
S-1EHV-000 en el PROCEDIMIENTO DE
RECOMBINACIÓN HOMÓLOGA PARA GENERAR VIRUS DEL HERPES RECOMBINANTE.
La solución de transfección de reserva se sometió a escrutinio
mediante el ESCRUTINIO PARA BUSCAR VIRUS DEL HERPES RECOMBINANTE QUE
EXPRESE LOS GENES DE MARCADORES ENZIMÁTICOS. El resultado final de
la purificación de colonias azules fue el virus recombinante
designado S-1EHV-002. Este virus se
caracterizó mediante elaboración de mapas de restricción y el
procedimiento de TRANSFERENCIA SOUTHERN DE DNA. Este análisis
confirmó la inserción del gen marcador de la
\beta-galactosidasa (lacZ) y la deleción de
aproximadamente 93 pares de bases en el gen US2. Para caracterizar
la segunda deleción de la región única corta, el fragmento
EcoRI k suprimido del
S-1EHV-002 se subclonó y se sometió
a análisis de secuencia de DNA. Este análisis confirmó una deleción
que comienza con el aminoácido 14 del gen gpG y continúa hasta el
aminoácido 303 del gen MGP. La deleción tuvo lugar de tal forma que
los 13 aminoácidos restantes del gen gpG están en el mismo marco de
lectura que los 494 aminoácidos restantes del gen MGP.
La construcción de este virus establece que los
genes US2 y gpG del EHV-1 no son genes esenciales y
son sitios viables para la inserción de DNA ajeno. Este virus
resulta útil porque la inactivación del gen US2 atenúa el virus y la
deleción en el gen de la glicoproteína G del virus proporciona un
marcador serológico negativo para diferenciarlo del
EHV-1 salvaje.
El S-1EHV-003 es
un virus de tipo 1 (EHV-1) del virus del herpes
equino que tiene dos deleciones en la región única corta y una
deleción en la región única larga del genoma. La primera deleción
es una deleción de aproximadamente 202 pares de bases del gen TK.
La segunda deleción es de aproximadamente 93 pares de bases y
elimina los aminoácidos 174 a 205 del gen US2 (SEC ID Nº 1). La
tercera deleción es de aproximadamente 2283 pares de bases y elimina
porciones de los genes gpG y MGP de la región única corta. El gen
de la \beta-galactosidasa (gen lacZ) de E.
coli se insertó en la deleción del gen US2 y está bajo el
control del promotor gpX del PRV. El virus del herpes equino
S-1EHV-003 se depositó el 12 de
marzo de 1992, de conformidad con el Tratado de Budapest, en el
Depósito Internacional de Microorganismos para los Propósitos de
Procedimiento de Patentes con el Depósito de Cultivos de Patentes
de la Colección Americana de Cultivos Tipo, 12301 Parklawn Drive,
Rockville, Maryland 20852, EE.UU., con el Nº de Acceso ATCC VR
2359.
El S-1EHV-003 se
obtuvo a partir del S-1EHV-002
(véase el Ejemplo 9). Esto se llevó a cabo utilizando el vector de
homología 450-46.B4 (véase Materiales y Métodos) y
el virus S-1EHV-002 en el
PROCEDIMIENTO DE RECOMBINACIÓN HOMÓLOGA PARA GENERAR VIRUS DEL
HERPES RECOMBINANTE. La solución de transfección de reserva se
seleccionó conforme a la SELECCIÓN DE VIRUS IBR RESISTENTE A
ARA-T. Se seleccionaron clones individuales después
de dos rondas de selección y se sometieron a ensayo mediante
autorradiografía de colonias con timidina (37, 38). Las colonias
seleccionadas de las solución de reserva TK negativas se sometieron
a ensayo relativo a la deleción en TK mediante el procedimiento de
TRANSFERENCIA SOUTHERN DE DNA. Se seleccionó una colonia que resultó
ser TK menos mediante el ensayo de incorporación de timidina así
como en el análisis Southern y se designó
S-1EHV-003.
La construcción de este virus establece que
pueden realizarse deleciones múltiples que inactiven los genes TK y
US2 y eliminen los genes gpG en un único virus
EHV-1. Este virus resulta útil porque la
inactivación de los genes TK y US2 atenúa el virus y la deleción de
la región que codifica la glicoproteína G de este virus proporciona
un marcador serológico negativo para diferenciarlo del
EHV-1 salvaje.
\newpage
El S-1EHV-004 es
un virus de tipo 1 (EHV-1) del virus del herpes
equino que tiene una deleción en la región única larga y una
deleción en la región única corta del genoma. La primera deleción
es una deleción de aproximadamente 202 pares de bases del gen TK.
La segunda deleción es de aproximadamente 93 pares de bases y
elimina el DNA que codifica los aminoácidos 174 a 205 del gen US2
(SEC ID Nº 1). El gen de la \beta-galactosidasa
(gen lacZ) de E. coli se insertó en la deleción del gen US2
y está bajo el control del promotor gpX del PRV. El virus del herpes
equino S-1EHV-004 se depositó el 12
de marzo de 1992, de conformidad con el Tratado de Budapest, en el
Depósito Internacional de Microorganismos para los Propósitos de
Procedimiento de Patentes con el Depósito de Cultivos de Patentes
de la Colección Americana de Cultivos Tipo, 12301 Parklawn Drive,
Rockville, Maryland 20852, EE.UU., con el Nº de Acceso ATCC VR
2360.
El S-1EHV-004 se
obtuvo a partir del S-1EHV-001
(véase el Ejemplo 8). Esto se llevó a cabo utilizando el vector de
homología 467-22.A12 (véase Materiales y Métodos) y
el virus S-1EHV-001 en el
PROCEDIMIENTO DE RECOMBINACIÓN HOMÓLOGA PARA GENERAR VIRUS DEL
HERPES RECOMBINANTE. La solución de transfección de reserva se
sometió a escrutinio mediante el ESCRUTINIO PARA BUSCAR VIRUS DEL
HERPES RECOMBINANTE QUE EXPRESE LOS GENES DE MARCADORES ENZIMÁTICOS.
El resultado final de la purificación de colonias azules fue el
virus recombinante designado
S-1EHV-004. Este virus se
caracterizó mediante elaboración de mapas de restricción y el
procedimiento de TRANSFERENCIA SOUTHERN DE DNA. Este análisis
confirmó la inserción del gen marcador de la
\beta-galactosidasa (lacZ), la deleción de
aproximadamente 93 pares de bases en el gen US2, y la deleción de
aproximadamente 202 pares de bases en el gen TK.
La construcción de este virus establece que los
genes US2 y TK del EHV-1 no son esenciales y son
sitios viables para la inserción de DNA ajeno. Este virus resulta
útil porque la inactivación de los genes TK y US2 atenúa el
virus.
El S-4EHV-001 es
un virus de tipo 4 (EHV-4) del virus del herpes
equino que tiene una deleción de aproximadamente 202 pares de bases
en el gen TK. El virus del herpes equino
S-4EHV-001 se depositó el 12 de
marzo de 1992, de conformidad con el Tratado de Budapest, en el
Depósito Internacional de Microorganismos para los Propósitos de
Procedimiento de Patentes con el Depósito de Cultivos de Patentes
de la Colección Americana de Cultivos Tipo, 12301 Parklawn Drive,
Rockville, Maryland 20852, EE.UU., con el Nº de Acceso ATCC VR
2361.
El S-4EHV-001 se
obtuvo a partir del S-4EHV-000 (cepa
Dutta). Esto se llevó a cabo utilizando el vector de homología
450-46.B4 (véase Materiales y Métodos) y el virus
S-4EHV-000 en el PROCEDIMIENTO DE
RECOMBINACIÓN HOMÓLOGA PARA GENERAR VIRUS DEL HERPES RECOMBINANTE.
La solución de transfección de reserva se seleccionó conforme a la
SELECCIÓN DE VIRUS IBR RESISTENTE A ARA-T. Se
seleccionaron clones individuales después de dos rondas de selección
y se analizaron mediante el procedimiento de TRANSFERENCIA SOUTHERN
DE DNA. Se seleccionó una colonia que resultó ser TK menos mediante
el análisis Southern y se designó
S-4EHV-001.
La construcción de este virus establece el gen de
la timidina quinasa del EHV-4 como un gen no
esencial y un sitio viable para la inserción de DNA ajeno. Este
virus resulta útil porque la inactivación del gen TK atenúa el
virus. La construcción de este virus demuestra también que un
vector de homología derivado del EHV-1 puede
generar mediante ingeniería genética un EHV-4 de
manera análoga.
Preparación del virus del herpes equino
recombinante designado
S-4EHV-002
El S-4EHV-002 es
un virus de tipo 4 (EHV-4) del virus del herpes
equino que tiene una deleción en la región única larga y una
deleción en la región única corta del genoma. La primera deleción
es una deleción de aproximadamente 202 pares de bases en el gen TK.
La segunda deleción es de aproximadamente 705 pares de bases y
elimina los aminoácidos 131 a 324 del gen US2 (SEC ID Nº 3). El gen
de la \beta-galactosidasa (gen lacZ) de E.
coli se insertó en la deleción del gen US2 y está bajo el
control del promotor gpX del PRV. El virus del herpes equino
S-4EHV-002 se depositó el 12 de
marzo de 1992, de conformidad con el Tratado de Budapest, en el
Depósito Internacional de Microorganismos para los Propósitos de
Procedimiento de Patentes con el Depósito de Cultivos de Patentes
de la Colección Americana de Cultivos Tipo, 12301 Parklawn Drive,
Rockville, Maryland 20852, EE.UU., con el Nº de Acceso ATCC VR
2362.
El S-4EHV-002 se
obtuvo a partir del S-4EHV-001
(véase el Ejemplo 12). Esto se llevó a cabo utilizando el vector de
homología 523-42.A18 (véase Materiales y Métodos) y
el virus S-4EHV-001 en el
PROCEDIMIENTO DE RECOMBINACIÓN HOMÓLOGA PARA GENERAR VIRUS DEL
HERPES RECOMBINANTE. La solución de transfección de reserva se
sometió a escrutinio mediante el ESCRUTINIO PARA BUSCAR VIRUS DEL
HERPES RECOMBINANTE QUE EXPRESE LOS GENES DE MARCADORES ENZIMÁTICOS.
El resultado final de la purificación de colonias azules fue el
virus recombinante designado
S-4EHV-002. Este virus se
caracterizó mediante elaboración de mapas de restricción y el
procedimiento de TRANSFERENCIA SOUTHERN DE DNA. Este análisis
confirmó la inserción del gen marcador de la
\beta-galactosidasa (lacZ), la deleción de
aproximadamente 705 pares de bases en el gen US2, y la deleción de
aproximadamente 202 pares de bases en el gen TK.
La construcción de este virus establece los genes
US2 y TK del EHV-4 como genes no esenciales y como
sitios viables para la inserción de DNA ajeno. Este virus resulta
útil porque la inactivación de los genes TK y US2 atenúa el
virus.
El S-4EHV-003 es
un virus de tipo 4 (EHV-4) del virus del herpes
equino que tiene una deleción en la región única corta del genoma.
La deleción es de aproximadamente 705 pares de bases y elimina los
aminoácidos 131 a 324 del gen US2 (SEC ID Nº 3). El gen de la
\beta-galactosidasa (gen lacZ) de E. coli
se insertó en la deleción del gen US2 y está bajo el control del
promotor gpX del PRV. El virus del herpes equino
S-4EHV-003 se depositó el 12 de
marzo de 1992, de conformidad con el Tratado de Budapest, en el
Depósito Internacional de Microorganismos para los Propósitos de
Procedimiento de Patentes con el Depósito de Cultivos de Patentes
de la Colección Americana de Cultivos Tipo, 12301 Parklawn Drive,
Rockville, Maryland 20852, EE.UU., con el Nº de Acceso ATCC VR
2363.
El S-4EHV-003 se
obtuvo a partir del S-4EHV-000 (cepa
Dutta). Esto se llevó a cabo utilizando el vector de homología
523-42.A18 (véase Materiales y Métodos) y el virus
S-4EHV-000 en el PROCEDIMIENTO DE
RECOMBINACIÓN HOMÓLOGA PARA GENERAR VIRUS DEL HERPES RECOMBINANTE.
La solución de transfección de reserva se sometió a escrutinio
mediante el ESCRUTINIO PARA BUSCAR VIRUS DEL HERPES RECOMBINANTE QUE
EXPRESE LOS GENES DE MARCADORES ENZIMÁTICOS. El resultado final de
la purificación de colonias azules fue el virus recombinante
designado S-4EHV-003. Este virus se
caracterizó mediante elaboración de mapas de restricción y el
procedimiento de TRANSFERENCIA SOUTHERN DE DNA. Este análisis
confirmó la inserción del gen marcador de la
\beta-galactosidasa (lacZ) y la deleción de
aproximadamente 705 pares de bases del gen US2.
La construcción de este virus establece el gen
US2 del EHV-4 como no esencial y como un sitio
viable para la inserción de DNA ajeno. Este virus resulta útil
porque la inactivación del gen US2 atenúa el virus.
El S-4EHV-004 es
un virus de tipo 4 (EHV-4) del virus del herpes
equino que tiene una deleción de aproximadamente 653 pares de bases
entre los aminoácidos 98 y 317 del gen de la timidina quinasa (28).
El gen de la \beta-glucuronidasa (gen uidA) de
E. coli se insertó en la deleción del gen TK y está bajo el
control del promotor gpX del PRV.
El S-4EHV-004 se
obtuvo a partir del S-4EHV-000 (cepa
Dutta). Esto se llevó a cabo utilizando el vector de homología
552-45.19 (véase Materiales y Métodos) y el virus
S-4EHV-000 en el PROCEDIMIENTO DE
RECOMBINACIÓN HOMÓLOGA PARA GENERAR VIRUS DEL HERPES RECOMBINANTE.
La solución de transfección de reserva se sometió a escrutinio
mediante el ESCRUTINIO PARA BUSCAR VIRUS DEL HERPES RECOMBINANTE QUE
EXPRESE LOS GENES DE MARCADORES ENZIMÁTICOS. El resultado final de
la purificación de colonias azules fue el virus recombinante
designado S-4EHV-004. Este virus se
caracterizó mediante elaboración de mapas de restricción y el
procedimiento de TRANSFERENCIA SOUTHERN DE DNA. Este análisis
confirmó la inserción del gen marcador de la
\beta-glucuronidasa (uidA) y la deleción de
aproximadamente 653 pares de bases del gen TK.
La construcción de este virus establece que el
gen TK del EHV-4 no es esencial y es un sitio
viable para la inserción de DNA ajeno. Este virus resulta útil
porque la inactivación del gen TK atenúa el virus.
Los virus EHV-4 recombinantes que
expresan glicoproteínas del EHV-1 se utilizan en
vacunas para proteger frente a la infección por ambos virus
EHV-1 y EHV-4. De manera similar,
los virus EHV-1 recombinantes que expresan
glicoproteínas del EHV-4 se utilizan en vacunas para
proteger frente a la infección por ambos virus
EHV-1 y EHV-4.
El S-4EHV-010, un
EHV-4 recombinante con deleciones en los genes TK,
US2 y gpE y con inserciones de los genes de la gpD y gpB del
EHV-1, en lugar de los genes TK y gpE,
respectivamente, se construye de la siguiente manera. El
S-4EHV-010 proviene del
S-4EHV-004 (véase el Ejemplo 15) a
través de la construcción de cuatro virus intermedios. El primer
virus intermedio, el S-4EHV-005, se
construyó de manera similar al
S-4EHV-003, utilizando el vector de
homología 588-81.13 (véase Materiales y Métodos) y
el virus S-4EHV-004 en el
PROCEDIMIENTO DE RECOMBINACIÓN HOMÓLOGA PARA GENERAR VIRUS DEL
HERPES RECOMBINANTE. La solución de transfección de reserva se
sometió a escrutinio mediante el ESCRUTINIO PARA BUSCAR VIRUS DEL
HERPES RECOMBINANTE QUE EXPRESE LOS GENES DE MARCADORES ENZIMÁTICOS,
para buscar un virus recombinante de colonia azul (sustrato lacZ).
El virus resultante tiene deleciones en los genes TK y US2 e
inserciones de uidA y lacZ en las deleciones de los genes TK y US2,
respectivamente. El segundo virus intermedio,
S-4EHV-006, se construyó utilizando
el vector de homología 523-38.9 (véase Materiales y
Métodos) y el virus S-4EHV-005 en el
PROCEDIMIENTO DE RECOMBINACIÓN HOMÓLOGA PARA GENERAR VIRUS DEL
HERPES RECOMBINANTE. La solución de transfección de reserva se
sometió a escrutinio mediante el ESCRUTINIO PARA BUSCAR VIRUS DEL
HERPES RECOMBINANTE QUE EXPRESE LOS GENES DE MARCADORES ENZIMÁTICOS,
para buscar un virus recombinante de colonia blanca (sustrato
lacZ). El virus resultante tiene deleciones en los genes TK y US2 y
una inserción del gen uidA en la deleción del gen TK. El tercer
virus intermedio, S-4EHV-007, se
construyó utilizando el vector de homología 593-31.2
(véase Materiales y Métodos) y el virus
S-4EHV-006 en el PROCEDIMIENTO DE
RECOMBINACIÓN HOMÓLOGA PARA GENERAR VIRUS DEL HERPES RECOMBINANTE.
La solución de transfección de reserva se sometió a escrutinio
mediante el ESCRUTINIO PARA BUSCAR VIRUS DEL HERPES RECOMBINANTE QUE
EXPRESE LOS GENES DE MARCADORES ENZIMÁTICOS, para buscar un virus
recombinante de colonia azul (sustrato lacZ). El virus resultante
tiene deleciones en los genes TK, US2 y gpE e inserciones de los
genes uidA y lacZ en las deleciones de los genes TK y gpE,
respectivamente. El cuarto virus intermedio,
S-4EHV-009, se construyó utilizando
el vector de homología 580-57.25, en el que se
había insertado el gen gpB del EHV-1, y el virus
S-4EHV-007 en el PROCEDIMIENTO DE
RECOMBINACIÓN HOMÓLOGA PARA GENERAR VIRUS DEL HERPES RECOMBINANTE.
Obsérvese que el gen gpB del EHV-1 está clonado como
un subfragmento entre FspI y ClaI de aproximadamente 3665
pares de bases de un fragmento PstI de aproximadamente 5100
pares de bases del EHV-1 (43). La solución de
transfección de reserva se sometió a escrutinio mediante el
ESCRUTINIO PARA BUSCAR VIRUS DEL HERPES RECOMBINANTE QUE EXPRESE LOS
GENES DE MARCADORES ENZIMÁTICOS, para buscar un virus recombinante
de colonia blanca (sustrato lacZ). El virus resultante tiene
deleciones en los genes TK, US2 y gpE e inserciones de los genes
uidA y gpB del EHV-1 en las deleciones de los genes
TK y gpE, respectivamente. Finalmente, se construye el
S-4EHV-010 utilizando el vector de
homología 495-61.39, en el que se inserta el gen
gpD del EHV-1, y el virus
S-4EHV-009 en el PROCEDIMIENTO DE
RECOMBINACIÓN HOMÓLOGA PARA GENERAR VIRUS DEL HERPES RECOMBINANTE.
Obsérvese que el gen gpD del EHV-1 está clonado como
un subfragmento entre SmaI y EcoRV de aproximadamente
1929 pares de bases del fragmento BamHI D de aproximadamente
10500 pares de bases del EHV-1 (1). La solución de
transfección de reserva se sometió a escrutinio mediante el
ESCRUTINIO PARA BUSCAR VIRUS DEL HERPES RECOMBINANTE QUE EXPRESE LOS
GENES DE MARCADORES ENZIMÁTICOS, para buscar un virus recombinante
de colonia blanca (sustrato uidA). Este virus se utiliza en una
vacuna para proteger a los caballos de la infección con el
EHV-1 y el EHV-4. La deleción del
gen de la glicoproteína E de este virus proporciona un marcador
serológico negativo para diferenciarlo del EHV-1 y
el EHV-4 salvajes.
Se han publicado virus de la viruela
recombinantes que codifican los genes de la hemaglutinina (HA) y la
neuraminidasa (NA) de los virus de la gripe que median inmunidad
protectora frente a la infección con el virus de la gripe homólogo
(5, 44). La liberación de los antígenos HA y NA de varios subtipos
del virus de la gripe equina a través de virus EHV recombinantes se
utiliza para proporcionar inmunidad protectora frente al virus de
la gripe equina además del virus del herpes equino.
El S-4EHV-011, un
EHV-4 recombinante con deleciones en los genes TK,
US2 y gpE y con los genes de la hemaglutinina y neuraminidasa de la
Influenza A/equine/Prague/56 del aislado de la gripe equina
insertados en lugar del gen gpE, se construye de la siguiente
manera. El S-4EHV-011 proviene del
S-4EHV-023 a través de la
construcción de un virus intermedio. El
S-4EHV-023 se construyó utilizando
el vector de homología 616-40 (véase Materiales y
Métodos) y el virus S-4EHV-006 en
el PROCEDIMIENTO DE RECOMBINACIÓN HOMÓLOGA PARA GENERAR VIRUS DEL
HERPES RECOMBINANTE. La solución de transfección de reserva se
sometió a escrutinio mediante el ESCRUTINIO PARA BUSCAR VIRUS DEL
HERPES RECOMBINANTE QUE EXPRESE LOS GENES DE MARCADORES ENZIMÁTICOS,
para buscar un virus recombinante de colonia blanca (sustrato
uidA). El virus intermedio,
S-4EHV-008, se construyó utilizando
el vector de homología 593-20.5 (véase Materiales y
Métodos) y el virus S-4EHV-023 en el
PROCEDIMIENTO DE RECOMBINACIÓN HOMÓLOGA PARA GENERAR VIRUS DEL
HERPES RECOMBINANTE. La solución de transfección de reserva se
sometió a escrutinio mediante el ESCRUTINIO PARA BUSCAR VIRUS DEL
HERPES RECOMBINANTE QUE EXPRESE LOS GENES DE MARCADORES ENZIMÁTICOS,
para buscar un virus recombinante de colonia azul (sustrato uidA).
El virus resultante tiene deleciones en los genes TK, US2 y gpE y
una inserción de uidA en la deleción del gen gpE. Finalmente, se
construye el S-4EHV-011 utilizando
el vector de homología 580-57.25, en el que se
insertaron los genes de la hemaglutinina y la neuraminidasa del
aislado Influenza A/equine/Prague/56 de la gripe equina, y el virus
S-4EHV-008 en el PROCEDIMIENTO DE
RECOMBINACIÓN HOMÓLOGA PARA GENERAR VIRUS DEL HERPES RECOMBINANTE.
Obsérvese que los genes del virus de la gripe se clonaron utilizando
las técnicas descritas en la sección de Materiales y Métodos. El
gen de la hemaglutinina se colocó bajo el control del promotor
temprano inmediato del HCMV y el gen de la neuraminidasa se colocó
bajo el control del promotor gpX del PRV. La solución de
transfección de reserva se sometió a escrutinio mediante el
ESCRUTINIO PARA BUSCAR VIRUS DEL HERPES RECOMBINANTE QUE EXPRESE LOS
GENES DE MARCADORES ENZIMÁTICOS, para buscar un virus recombinante
de colonia blanca (sustrato uidA). Este virus se utiliza en vacunas
para proteger a los caballos de la infección con el
EHV-4 y el virus de la gripe equina. Una vacuna
eficaz requiere antígenos de varias cepas de la gripe diferentes.
Esto se lleva a cabo mediante la construcción de virus
recombinantes múltiples que expresen HA y NA de varias cepas de la
gripe diferentes (véanse los Ejemplos 18-20). Una
vacuna más eficaz se formula mezclando este virus recombinante con
los descritos en los Ejemplos 18-20.
El S-4EHV-012, un
EHV-4 recombinante con deleciones en los genes TK,
US2 y gpE y con los genes de la hemaglutinina y neuraminidasa del
aislado Influenza A/equine/Miami/63 de la gripe equina insertados en
lugar del gen gpE, se construye de la siguiente manera. El
S-4EHV-012 proviene del
S-4EHV-023 (véase el Ejemplo 16) a
través de la construcción de un virus intermedio. El virus
intermedio, S-4EHV-008, se
construyó como se describe en el Ejemplo 17. El
S-4EHV-012 se construye utilizando
el vector de homología 580-57.25, en el que se han
insertado los genes de la hemaglutinina y la neuraminidasa del
aislado Influenza A/equine/Miami/63 de la gripe equina, y el virus
S-4EHV-008 en el PROCEDIMIENTO DE
RECOMBINACIÓN HOMÓLOGA PARA GENERAR VIRUS DEL HERPES RECOMBINANTE.
Obsérvese que los genes del virus de la gripe se clonaron utilizando
las técnicas descritas en la sección de Materiales y Métodos. El
gen de la hemaglutinina se colocó bajo el control del promotor
temprano inmediato del HCMV y el gen de la neuraminidasa se colocó
bajo el control del promotor gpX del PRV. La solución de
transfección de reserva se sometió a escrutinio mediante el
ESCRUTINIO PARA BUSCAR VIRUS DEL HERPES RECOMBINANTE QUE EXPRESE LOS
GENES DE MARCADORES ENZIMÁTICOS, para buscar un virus recombinante
de colonia blanca (sustrato uidA). Este virus se utiliza en una
vacuna para proteger a los caballos de la infección por el
EHV-4 y el virus de la gripe equina. Una vacuna más
eficaz se formula mezclando este virus recombinante con los
descritos aquí en los Ejemplos 17, 19 y 20.
El S-4EHV-013, un
EHV-4 recombinante con deleciones en los genes TK,
US2 y gpE y con los genes de la hemaglutinina y neuraminidasa del
aislado Influenza A/equine/Kentucky/81 de la gripe equina insertados
en lugar del gen gpE, se construye de la siguiente manera. El
S-4EHV-013 proviene del
S-4EHV-023 (véase el Ejemplo 16) a
través de la construcción de un virus intermedio. El virus
intermedio, S-4EHV-008, se
construyó como se describe en el Ejemplo 17. El
S-4EHV-013 se construye utilizando
el vector de homología 580-57.25, en el que se
insertan los genes de la hemaglutinina y la neuraminidasa del
aislado Influenza A/equine/Kentucky/81 de la gripe equina, y el
virus S-4EHV-008 en el PROCEDIMIENTO
DE RECOMBINACIÓN HOMÓLOGA PARA GENERAR VIRUS DEL HERPES
RECOMBINANTE. Obsérvese que los genes del virus de la gripe se
clonaron utilizando las técnicas descritas en la sección de
Materiales y Métodos. El gen de la hemaglutinina se colocó bajo el
control del promotor temprano inmediato del HCMV y el gen de la
neuraminidasa se colocó bajo el control del promotor gpX del PRV. La
solución de transfección de reserva se sometió a escrutinio mediante
el ESCRUTINIO PARA BUSCAR VIRUS DEL HERPES RECOMBINANTE QUE EXPRESE
LOS GENES DE MARCADORES ENZIMÁTICOS, para buscar un virus
recombinante de colonia blanca (sustrato uidA). Este virus se
utiliza en una vacuna para proteger a los caballos de la infección
por el EHV-4 y el virus de la gripe equina. Una
vacuna más eficaz se formula mezclando este virus recombinante con
los descritos aquí en los Ejemplos 17, 18 y 20.
Preparación del virus del herpes equino
recombinante designado
S-4EHV-014
El S-4EHV-014, un
EHV-4 recombinante con deleciones en los genes TK,
US2 y gpE y con los genes de la hemaglutinina y neuraminidasa del
aislado Influenza A/equine/Alaska/91 de la gripe equina insertados
en lugar del gen gpE, se construye de la siguiente manera. El
S-4EHV-014 proviene del
S-4EHV-023 (véase el Ejemplo 17) a
través de la construcción de un virus intermedio. El virus
intermedio, S-4EHV-008, se
construyó como se describe en el Ejemplo 17. El
S-4EHV-014 se construye utilizando
el vector de homología 580-57.25, en el que se
insertaron los genes de la hemaglutinina y la neuraminidasa del
aislado Influenza A/equine/Alaska/91 de la gripe equina, y el virus
S-4EHV-008 en el PROCEDIMIENTO DE
RECOMBINACIÓN HOMÓLOGA PARA GENERAR VIRUS DEL HERPES RECOMBINANTE.
Obsérvese que los genes del virus de la gripe se clonaron utilizando
las técnicas descritas en la sección de Materiales y Métodos. El
gen de la hemaglutinina se colocó bajo el control del promotor
temprano inmediato del HCMV y el gen de la neuraminidasa se colocó
bajo el control del promotor gpX del PRV. La solución de
transfección de reserva se sometió a escrutinio mediante el
ESCRUTINIO PARA BUSCAR VIRUS DEL HERPES RECOMBINANTE QUE EXPRESE LOS
GENES DE MARCADORES ENZIMÁTICOS, para buscar un virus recombinante
de colonia blanca (sustrato uidA). Este virus es utilizable como
vacuna para proteger a los caballos de la infección por el
EHV-4 y el virus de la gripe equina. Una vacuna más
eficaz se formula mezclando este virus recombinante con los
descritos aquí en los Ejemplos 17, 18 y 19.
Se ha mostrado que la proteína M (14) juega un
papel importante en la respuesta inmune a Streptococcus
equi, el agente causante de la enfermedad respiratoria severa
Strangles. La liberación de este antígeno a través de un virus EHV
recombinante daría como resultado una inmunidad fuertemente
protectora sin las secuelas post-vacunales que
acompañan frecuentemente a las bacterinas a base del cultivo
completo o extracto proteico de Streptococcus equi. Se
contempla que los procedimientos que se han utilizado para expresar
los genes marcadores (lacZ y uidA) en
S-1EHV-002,
S-1EHV-003,
S-1EHV-004,
S-4EHV-002,
S-4EHV-003 y
S-4EHV-004 y que se describen en
la presente, son aplicables para la expresión de este y otros
antígenos potenciales de Streptococcus equi.
Los antígenos de los siguientes microorganismos
se utilizan para desarrollar vacunas equinas: virus de la anemia
infecciosa equina, virus de la encefalitis equina, rinovirus
equino, rotavirus equino, artritis viral equina, rabia, adenovirus
equino de la neumonía, enfermedad del caballo africano, exantema
coital equino, papilomatosis equina, citomegalovirus equino,
leptospirosis, tétano, ántrax, colibacilosis, salmonelosis,
pasteurelosis, Ehrlichia risticii, enfermedad asociada a
brucela, actinomicosis, Taylorella equigenitolia, y
enfermedad asociada a micoplasma.
El protocolo se utilizó para generar un virus del
herpes equino recombinante combinando fragmentos genómicos del EHV
clonados en cósmidos y fragmentos genómicos del virus cooperador
salvaje que contenía menos de una unidad de formación de colonias.
La presencia de DNA genómico del EHV salvaje en la mezcla de
transfección aumenta la eficiencia de obtención de un virus del
herpes equino recombinante. Se clonaron fragmentos subgenómicos
solapantes del DNA de los virus 4EHV-000 (salvaje)
y 4EHV-004. El DNA de los subclones de tipo cósmido
del 4EHV000 y el 4EHV-004 se sometieron a digestión
con las endonucleasas de restricción apropiadas para liberar los
insertos del vector de tipo cósmido. La transfección con una mezcla
apropiada de estos cinco fragmentos que cubrían todo el genoma del
EHV y concentraciones muy bajas de DNA del virus salvaje (menos de
una unidad de formación de colonias) dio como resultado la
producción del virus 4EHV-004. El cien por cien de
los virus en la solución de cotransfección de reserva eran virus
recombinantes que llevaban el gen uidA.
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(1989).
31. G. R. Robertson y J.M. Whalley,
Nucleic Acids Research 16,
11303-11317 (1988).
32. B. Roizman, et al., Cold Spring
Harbor Conference on New Approaches to Viral Vaccines (September
1983).
33. B. Roizman, et al., Archives of
Virology 123, 425-449 (1992)
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Cloning: A Laboratory Manual Second Edition, Cold Spring Harbor
Press, Cold Spring Harbor, N.Y. (1989).
35. M. Shih, et al., Proceedings of the
National Academy of Sciences U.S.A. 81,
5867-5870 (1984).
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Proceedings of the National Academy of Sciences U.S.A.
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37. R. B. Tenser, et al., Journal of
General Virology 64, 1369-1373
(1983).
38. R. B. Tenser, et al., Journal of
Clinical Microbiology 17, 122-127
(1983).
39. R. L. Thompson et al., Virology
131, 180-192 (1983).
40. D. R. Thomson, et al., Gene
57, 261-265 (1987).
41. M. Wachsnan, et al., Journal of
General Virology 70, 2513-2520
(1989).
42. J. M. Whalley, et al., Journal of
General Virology 57, 307-323
(1981).
43. J. M. Whalley, et al., Journal of
General Virology 70, 383-394
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44. R. G. Webster, et al., Virology
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47. M. A. Wild, et al., 15th
International Herpesvirus Workshop, Abstract No. 122, Washington,
D.C. (1990).
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(1988).
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52. Katz et al., Journal of
Virology, 64, 1808-1811
(1990).
53. WO 92/01045
(1) INFORMACIÓN GENERAL:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- SOLICITANTE: Cochran Ph.D., Mark D
\vskip0.666000\baselineskip
- (ii)
- TÍTULO DE LA INVENCIÓN: Virus del Herpes Equino Recombinantes
\vskip0.666000\baselineskip
- (iii)
- NÚMERO DE SECUENCIAS: 71
\vskip0.666000\baselineskip
- (iv)
- DIRECCIÓN DE CORRESPONDENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- DESTINATARIO: John P. White
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- CALLE: 30 Rockefeller Plaza
\vskip0.333000\baselineskip
- (C)
- CIUDAD: Nueva York
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- ESTADO: Nueva York
\vskip0.333000\baselineskip
- (E)
- PAÍS: EE.UU.
\vskip0.333000\baselineskip
- (F)
- CÓDIGO POSTAL: 10112
\vskip0.666000\baselineskip
- (v)
- FORMA LEÍBLE EN ORDENADOR:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- SOPORTE: Disquete
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- ORDENADOR: PC compatible de IBM
\vskip0.333000\baselineskip
- (C)
- SISTEMA OPERATIVO: PC-DOS/MS-DOS
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- SOFTWARE: Patentin Release #1.0, Versión #1.25
\vskip0.666000\baselineskip
- (vi)
- DATOS DE LA SOLICITUD EN CURSO:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- NÚMERO DE SOLICITUD:
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- FECHA DE ARCHIVO:
\vskip0.333000\baselineskip
- (C)
- CLASIFICACIÓN::
\vskip0.666000\baselineskip
- (viii)
- INFORMACIÓN AL ABOGADO/AGENTE:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE: White, John P
\vskip0.666000\baselineskip
- (ix)
- INFORMACIÓN DE TELECOMUNICACIÓN:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- TELÉFONO: (212)977-9550
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TELEFAX: (212)664-0525
\vskip0.333000\baselineskip
- (C)
- TELEX: 422523
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN DE LA SEC ID Nº 1:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 1322 pares de bases
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.333000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: doble
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: linear
\vskip0.666000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: DNA (genómico)
\vskip0.666000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICO: NO
\vskip0.666000\baselineskip
- (iv)
- ANTISENTIDO: NO
\vskip0.666000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Virus del herpes equino 1
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- CEPA: Dutta
\vskip0.333000\baselineskip
- (C)
- AISLADO INDIVIDUAL: S-1 EHV-000
\vskip0.666000\baselineskip
- (vii)
- FUENTE INMEDIATA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- CLON: 432-54.N17
\vskip0.666000\baselineskip
- (viii)
- POSICIÓN EN EL GENOMA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- POSICIÓN EN El MAPA: -83
\vskip0.333000\baselineskip
- (C)
- UNIDADES: %G
\vskip0.666000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: CDS
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- SITUACIÓN: 249.. 1157
\vskip0.333000\baselineskip
- (C)
- OTRA INFORMACIÓN: /codón de iniciación= 249
\hskip3cm/producto= "producto del gen US2"
\hskip3cm/gen= "US2"
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº 1:
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN DE LA SEC ID Nº 2:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 303 aminoácidos
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.333000\baselineskip
- (C)
- TOPOLOGÍA: linear
\vskip0.666000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº 2:
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN DE LA SEC ID Nº 3:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 1252 pares de bases
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.333000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: doble
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: linear
\vskip0.666000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: DNA (genómico)
\vskip0.666000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICO: NO
\vskip0.666000\baselineskip
- (iv)
- ANTISENTIDO: NO
\vskip0.666000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Virus del herpes equino 4
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- CEPA: Dutta
\vskip0.333000\baselineskip
- (C)
- AISLADO INDIVIDUAL: S-4EHV-000
\newpage
\vskip0.666000\baselineskip
- (vii)
- FUENTE INMEDIATA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- CLON: 497-52.53 y 480-18.9
\vskip0.666000\baselineskip
- (viii)
- POSICIÓN EN EL GENOMA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- POSICIÓN EN EL MAPA: -83
\vskip0.333000\baselineskip
- (C)
- UNIDADES: %G
\vskip0.666000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: CDS
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- SITUACIÓN: 153..1124
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- OTRA INFORMACIÓN: /codón de iniciación= 153
\hskip3cm/producto= "producto del gen US2"
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº 3:
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN DE LA SEC ID Nº 4:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 324 aminoácidos
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: linear
\vskip0.666000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº 4:
\newpage
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN DE LA SEC ID Nº 5:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 1149 pares de bases
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.333000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: doble
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: linear
\vskip0.666000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: DNA (genómico)
\vskip0.666000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICO: NO
\vskip0.666000\baselineskip
- (iv)
- ANTISENTIDO: NO
\vskip0.666000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Virus del herpes equino 4
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- CEPA: Dutta
\vskip0.333000\baselineskip
- (C)
- AISLADO INDIVIDUAL: S-4EHV-000
\vskip0.666000\baselineskip
- (vii)
- FUENTE INMEDIATA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- CLON: 467-42.A12
\vskip0.666000\baselineskip
- (viii)
- POSICIÓN EN EL GENOMA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- POSICIÓN EN EL MAPA: -89
\vskip0.333000\baselineskip
- (C)
- UNIDADES: %G
\vskip0.666000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: CDS
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- SITUACIÓN: 271..1149
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- OTRA INFORMACIÓN: /parcial
\hskip3cm/codón de iniciación= 271
\hskip3cm/función= "glicoproteína de membrana"
\hskip3cm/producto= "Extremo N-terminal de la glicoproteína E"
\hskip3cm/gen= "gpE"
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID ND:5:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN DE LA SEC ID Nº 6:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 293 aminoácidos
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.333000\baselineskip
- (C)
- TOPOLOGÍA: linear
\vskip0.666000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº 6:
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN DE LA SEC ID Nº 7:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 18 aminoácidos
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.333000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: doble
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: linear
\vskip0.666000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: DNA (genómico)
\vskip0.666000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICO: NO
\vskip0.666000\baselineskip
- (iv)
- ANTISENTIDO: NO
\vskip0.666000\baselineskip
- (v)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Virus del herpes equino 1
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- CEPA: Dutta
\vskip0.333000\baselineskip
- (C)
- AISLADO INDIVIDUAL: S-1EHV-000
\vskip0.666000\baselineskip
- (viii)
- POSICIÓN EN EL GENOMA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- POSICIÓN EN EL MAPA: -83
\vskip0.333000\baselineskip
- (C)
- UNIDADES: %G
\vskip0.666000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: Región
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- SITUACIÓN: 1..18
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- OTRA INFORMACIÓN: /etiqueta= EHV1-US2
\hskip3cm/nota= "Región conservada del gen US2 que comienza en el aminoácido 123."
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº 7:
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN DE LA SEC ID Nº 8:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 18 aminoácidos
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.333000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: doble
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: linear
\vskip0.666000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: DNA (genómico)
\vskip0.666000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICO: NO
\vskip0.666000\baselineskip
- (iv)
- ANTISENTIDO: NO
\vskip0.666000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Virus del herpes equino 4
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- CEPA: Dutta
\vskip0.333000\baselineskip
- (C)
- AISLADO INDIVIDUAL: S-4ENV-000
\vskip0.666000\baselineskip
- (viii)
- POSICIÓN EN EL GENOMA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- POSICIÓN EN EL MAPA: -83
\vskip0.333000\baselineskip
- (C)
- UNIDADES: XG
\vskip0.666000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: Región
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- SITUACIÓN: 1..18
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- OTRA INFORMACIÓN: /etiqueta= EHV4-US2
\hskip3cm/nota= "Región conservada del gen US2 que comienza en el aminoácido 123."
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº 8:
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN DE LA SEC ID Nº 9:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 18 aminoácidos
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.333000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: doble
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: linear
\vskip0.666000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: DNA (genómico)
\vskip0.666000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICO: NO
\vskip0.666000\baselineskip
- (iv)
- ANTISENTIDO: NO
\vskip0.666000\baselineskip
- (v)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Virus simple del herpes 1
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- CEPA: 17
\vskip0.666000\baselineskip
- (viii)
- POSICIÓN EN EL GENOMA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- POSICIÓN EN EL MAPA: -88
\vskip0.333000\baselineskip
- (C)
- UNIDADES: %G
\vskip0.666000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: Región
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- SITUACIÓN: 1..18
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- OTRA INFORMACIÓN: /etiquetas HSV1-US2
\hskip3cm/nota= "Región conservada del gen US2 que comienza en el aminoácido 124."
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº 9:
\newpage
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN DE LA SEC ID Nº 10:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 18 aminoácidos
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.333000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: doble
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: linear
\vskip0.666000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: DNA (genómico)
\vskip0.666000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICO: NO
\vskip0.666000\baselineskip
- (iv)
- ANTISENTIDO: NO
\vskip0.666000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Virus simple del herpes 2
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- CEPA: NG52
\vskip0.666000\baselineskip
- (viii)
- POSICIÓN EN EL GENOMA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- POSICIÓN EN EL MAPA: -88
\vskip0.333000\baselineskip
- (C)
- UNIDADES: %G
\vskip0.666000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: Región
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- SITUACIÓN: 1..18
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- OTRA INFORMACIÓN: /etiqueta* HSV2-US2
\hskip3cm/nota= "Región conservada del gen US2 que comienza en el aminoácido 123."
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº 10:
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN DE LA SEC ID Nº 11:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 18 aminoácidos
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.333000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: doble
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: linear
\vskip0.666000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: DNA (genómico)
\vskip0.666000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICO: NO
\vskip0.666000\baselineskip
- (iv)
- ANTISENTIDO: NO
\vskip0.666000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Virus de la pseudorrabia
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- CEPA: NIA-3
\vskip0.666000\baselineskip
- (viii)
- POSICIÓN EN EL GENOMA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- POSICIÓN EN EL MAPA: -90
\vskip0.333000\baselineskip
- (C)
- UNIDADES: %G
\vskip0.666000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: Región
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- SITUACIÓN: 1..18
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- OTRA INFORMACIÓN: /etiqueta= PRV-US2
\hskip3cm/nota= "Región conservada del gen US2 que comienza en el aminoácido 148."
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº 11:
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN DE LA SEC ID Nº 12:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 19 aminoácidos
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.333000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: doble
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: linear
\vskip0.666000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: DNA (genómico)
\vskip0.666000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICO: NO
\vskip0.666000\baselineskip
- (iv)
- ANTISENTIDO: NO
\vskip0.666000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: gamma-virus del herpes de la enfermedad de Marek
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- CEPA: RB1B
\vskip0.666000\baselineskip
- (viii)
- POSICIÓN EN EL GENOMA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- POSICIÓN EN EL MAPA: -88
\vskip0.333000\baselineskip
- (C)
- UNIDADES: %G
\vskip0.666000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: Región
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- SITUACIÓN: 1..19
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- OTRA INFORMACIÓN: /etiqueta* NOV-US2
\hskip3cm/nota= "Región conservada del gen US2 que comienza en el aminoácido 132."
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC 10 Nº 12:
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN DE LA SEC ID Nº 13:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 18 aminoácidos
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.333000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: doble
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: linear
\vskip0.666000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: DNA (genómico)
\vskip0.666000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICO: NO
\vskip0.666000\baselineskip
- (iv)
- ANTISENTIDO: NO
\vskip0.666000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Virus del herpes bovino 1
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- CEPA: Cooper
\vskip0.333000\baselineskip
- (C)
- AISLADO INDIVIDUAL: S-IBR-000
\newpage
\vskip0.666000\baselineskip
- (viii)
- POSICIÓN EN EL GENOMA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- POSICIÓN EN EL MAPA: -85
\vskip0.333000\baselineskip
- (C)
- UNIDADES: %G
\vskip0.666000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: Región
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- SITUACIÓN: 1..18
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- OTRA INFORMACIÓN: /etiqueta= IBR-US2
\hskip3cm/nota= "Región conservada del gen US2 que comienza en el aminoácido 115."
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº 13:
2) INFORMACIÓN DE LA SEC ID Nº 14:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 66 pares de bases
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.333000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: doble
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: circular
\vskip0.666000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: DNA (genómico)
\vskip0.666000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICO: NO
\vskip0.666000\baselineskip
- (iv)
- ANTISENTIDO: NO
\vskip0.666000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Plásmido
\vskip0.666000\baselineskip
- (vii)
- FUENTE INMEDIATA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- CLON: 450-46.B4 (Figura 4 Empalme A)
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº 14:
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN DE LA SEC ID Nº 15:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 66 pares de bases
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.333000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: doble
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: circular
\vskip0.666000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: DNA (genómico)
\vskip0.666000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICO: NO
\vskip0.666000\baselineskip
- (iv)
- ANTISENTIDO: NO
\vskip0.666000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Plásmido
\vskip0.666000\baselineskip
- (vii)
- FUENTE INMEDIATA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- CLON: 450-46.B4 (Figura 4 Empalme B)
\vskip0.666000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: CDS
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- SITUACIÓN: 1..66
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- OTRA INFORMACIÓN: /producto= "Región del gen de la timidina quinasa del EHV1 suprimido"
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº 15:
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN DE LA SEC ID Nº 16:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 22 aminoácidos
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.333000\baselineskip
- (C)
- TOPOLOGÍA: linear
\vskip0.666000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº 16:
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN DE LA SEC ID Nº 17:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 66 pares de bases
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.333000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: doble
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: circular
\vskip0.666000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: DNA (genérico)
\vskip0.666000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICO: NO
\vskip0.666000\baselineskip
- (iv)
- ANTISENTIDO: NO
\vskip0.666000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Plásmido
\vskip0.666000\baselineskip
- (vii)
- FUENTE INMEDIATA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- CLON: 450-46.B4 (Figura 4 Empalme C)
\vskip0.666000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: CDS
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- SITUACIÓN: 1..30
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- OTRA INFORMACIÓN: /parcial
\hskip3cm/codón de iniciación= 1
\hskip3cm/producto= "Región del gen de la glicoproteína H del EHV1"
\newpage
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº 17:
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN DE LA SEC ID Nº 18:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 10 aminoácidos
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: linear
\vskip0.666000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº 18:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Tyr Leu Gly His Gly Phe Het Gly Leu
Gin}
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN DE LA SEC ID Nº 19:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 66 pares de bases
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.333000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: doble
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: circular
\vskip0.666000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: DNA (genómico)
\vskip0.666000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICO: NO
\vskip0.666000\baselineskip
- (iv)
- ANTISENTIDO: NO
\vskip0.666000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Plásmido
\vskip0.666000\baselineskip
- (vii)
- FUENTE INMEDIATA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- CLON: 467-21.19 (Figura 5 Empalme A)
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº 19:
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN DE LA SEC ID Nº 20:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 66 pares de bases
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.333000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: doble
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: circular
\vskip0.666000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: DNA (genómico)
\vskip0.666000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICO: NO
\vskip0.666000\baselineskip
- (iv)
- ANTISENTIDO: NO
\vskip0.666000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Plásmido
\vskip0.666000\baselineskip
- (vii)
- FUENTE INMEDIATA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- CLON: 467-21.19 (Figura 5 Empalme B)
\vskip0.666000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: CDS
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- SITUACIÓN: 1..30
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- OTRA INFORMACIÓN: /parcial
\hskip3cm/codón de iniciación= 1
\hskip3cm/producto= "Región del gen US2 del EHV1"
\vskip0.666000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: CDS
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- SITUACIÓN: 33..65
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- OTRA INFORMACIÓN: /parcial
\hskip3cm/codón de iniciación= 33
\hskip3cm/producto= "Región del gen US2 del EHV1"
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº 20:
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN DE LA SEC ID Nº 21:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 10 aminoácidos
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: linear
\vskip0.666000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº 21:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Val Cys Gly Lys Leu Phe Glu Thr Ile
Pro}
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN DE LA SEC ID Nº 22:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 11 aminoácidos
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: linear
\vskip0.666000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº 22:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Asn Ser Leu Val Arg Pro Pro Thr Val Lys
Arg}
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN DE LA SEC ID Nº 23:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 66 pares de bases
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.333000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: doble
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: circular
\vskip0.666000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: DNA (genómico)
\vskip0.666000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICO: NO
\vskip0.666000\baselineskip
- (iv)
- ANTISENTIDO: NO
\vskip0.666000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Plásmido
\vskip0.666000\baselineskip
- (vii)
- FUENTE INMEDIATA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- CLON: 467-21.19 (Figura 5 Empalme C)
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº 23:
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN DE LA SEC ID Nº 24:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 66 pares de bases
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.333000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: doble
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: circular
\vskip0.666000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: DNA (genómico)
\vskip0.666000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICO: NO
\vskip0.666000\baselineskip
- (iv)
- ANTISENTIDO: NO
\vskip0.666000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Plásmido
\vskip0.666000\baselineskip
- (vii)
- FUENTE INMEDIATA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- CLON: 536-85.30 (Figura 6 Empalme A)
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº 24:
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN DE LA SEC ID Nº 25:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 132 pares de bases
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.333000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: doble
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: circular
\vskip0.666000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: DNA (genómico)
\vskip0.666000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICO: NO
\vskip0.666000\baselineskip
- (iv)
- ANTISENTIDO: NO
\vskip0.666000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Plásmido
\vskip0.666000\baselineskip
- (vii)
- FUENTE INMEDIATA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- CLON: 536-85.30 (Figura 6 Empalme B)
\newpage
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº 25:
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN DE LA SEC ID Nº 26:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 66 pares de bases
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.333000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: doble
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: circular
\vskip0.666000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: DNA (genómico)
\vskip0.666000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICO: NO
\vskip0.666000\baselineskip
- (iv)
- ANTISENTIDO: NO
\vskip0.666000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Plásmido
\vskip0.666000\baselineskip
- (vii)
- FUENTE INMEDIATA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- CLON: 536-85.30 (Figura 6 Empalme C)
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº 26:
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN DE LA SEC ID Nº 27:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 66 pares de bases
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.333000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: doble
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: circular
\vskip0.666000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: DNA (genómico)
\vskip0.666000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICO: NO
\vskip0.666000\baselineskip
- (iv)
- ANTISENTIDO: NO
\vskip0.666000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Plásmido
\vskip0.666000\baselineskip
- (vii)
- FUENTE INMEDIATA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- CLON: 495-61.39 (Figura 7 Empalme A)
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº 27:
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN DE LA SEC ID Nº 28:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 66 pares de bases
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.333000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: doble
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: circular
\vskip0.666000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: DNA (genómico)
\vskip0.666000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICO: NO
\vskip0.666000\baselineskip
- (iv)
- ANTISENTIDO: NO
\vskip0.666000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Plásmido
\vskip0.666000\baselineskip
- (vii)
- FUENTE INMEDIATA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- CLON: 495-61.39 (Figura 7 Empalme B)
\vskip0.666000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: COS
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- SITUACIÓN: 1..24
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- OTRA INFORMACIÓN: /parcial
\hskip3cm/codón de iniciación= 1
\hskip3cm/producto= "Región del gen de la timidina quinasa del EHV4 suprimido"
\vskip0.666000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: CDS
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- SITUACIÓN: 46..66
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- OTRA INFORMACIÓN: /parcial
\hskip3cm/codón de iniciación= 46
\hskip3cm/producto= "Región del gen de la timidina quinasa del EHV4 suprimido"
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº 28:
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN DE LA SEC ID Nº 29:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 8 aminoácidos
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: linear
\vskip0.666000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº 29:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Val Asp Asp Ala Ala Leu Ile Thr}
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN DE LA SEC ID Nº 30:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 7 aminoácidos
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: linear
\vskip0.666000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\newpage
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº 30:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Val Val Glu Ser Leu Leu Pro}
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN DE LA SEC ID Nº 31:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 66 pares de bases
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.333000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: doble
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: circular
\vskip0.666000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: DNA (genómico)
\vskip0.666000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICO: NO
\vskip0.666000\baselineskip
- (iv)
- ANTISENTIDO: NO
\vskip0.666000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Plásmido
\vskip0.666000\baselineskip
- (vii)
- FUENTE INMEDIATA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- CLON: 495-61.39 (Figura 7 Empalme C)
\vskip0.666000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: CDS
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- SITUACIÓN: 1..33
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- OTRA INFORMACIÓN: /parcial
\hskip3cm/codón de iniciación= 1
\hskip3cm/producto= "Región del gen de la glicoproteína H del EHV4"
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº 31:
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN DE LA SEC ID Nº 32:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 11 aminoácidos
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: linear
\vskip0.666000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº 32:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Arg Leu Pro Pro Arg Arg Arg Leu Glu Pro
Pro}
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN DE LA SEC ID Nº 33:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 66 pares de bases
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.333000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: doble
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: circular
\vskip0.666000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: DNA (genómico)
\vskip0.666000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICO: NO
\vskip0.666000\baselineskip
- (iv)
- ANTISENTIDO: NO
\vskip0.666000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Plásmido
\vskip0.666000\baselineskip
- (vii)
- FUENTE INMEDIATA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- CLON: 523-38.9 (Figura 8 Empalme A)
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº 33:
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN DE LA SEC ID Nº 34:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 66 pares de bases
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.333000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: doble
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: circular
\vskip0.666000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: DNA (genómico)
\vskip0.666000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICO: NO
\vskip0.666000\baselineskip
- (iv)
- ANTISENTIDO: NO
\vskip0.666000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Plásmido
\vskip0.666000\baselineskip
- (vii)
- FUENTE INMEDIATA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- CLON: 523-38.9 (Figura 8 Empalme B)
\vskip0.666000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: CDS
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- SITUACIÓN: 1..33
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- OTRA INFORMACIÓN: /parcial
\hskip3cm/codón de iniciación= 1
\hskip3cm/producto= "Región del gen US2 del EHV4 suprimido"
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº 34:
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN DE LA SEC ID Nº 35:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 11 aminoácidos
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: linear
\vskip0.666000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº 35:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Arg Pro Tyr His Leu Trp Val Leu Gly Ala
Ala}
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN DE LA SEC ID Nº 36:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 66 pares de bases
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.333000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: doble
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: circular
\vskip0.666000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: DNA (genómico)
\vskip0.666000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICO: NO
\vskip0.666000\baselineskip
- (iv)
- ANTISENTIDO: NO
\vskip0.666000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Plásmido
\vskip0.666000\baselineskip
- (vii)
- FUENTE INMEDIATA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- CLON: 523-38.9 (Figura 8 Empalme C)
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº 36:
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN DE LA SEC ID Nº 37:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 66 pares de bases
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.333000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: doble
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: circular
\vskip0.666000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: DNA (genómico)
\vskip0.666000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICO: NO
\vskip0.666000\baselineskip
- (iv)
- ANTISENTIDO: NO
\vskip0.666000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Plásmido
\vskip0.666000\baselineskip
- (vii)
- FUENTE INMEDIATA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- CLON: 530-57.25 (Figura 9 Empalme A)
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº 37:
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN DE LA SEC ID Nº 38:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 66 pares de bases
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.333000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: doble
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: circular
\vskip0.666000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: DNA (genómico)
\vskip0.666000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICO: NO
\vskip0.666000\baselineskip
- (iv)
- ANTISENTIDO: NO
\vskip0.666000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Plásmido
\vskip0.666000\baselineskip
- (vii)
- FUENTE INMEDIATA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- CLON: 580-57.25 (Figura 9 Empalme B)
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº 38:
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN DE LA SEC ID Nº 39:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 66 pares de bases
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.333000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: doble
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: circular
\vskip0.666000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: DNA (genómico)
\vskip0.666000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICO: NO
\vskip0.666000\baselineskip
- (iv)
- ANTISENTIDO: NO
\vskip0.666000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Plásmido
\vskip0.666000\baselineskip
- (vii)
- FUENTE INMEDIATA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- CLON: 580-57.25 (Figura 9 Empalme C)
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº 39:
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN DE LA SEC ID Nº 40:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 66 pares de bases
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.333000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: doble
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: circular
\vskip0.666000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: DNA (genómico)
\vskip0.666000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICO: NO
\vskip0.666000\baselineskip
- (iv)
- ANTISENTIDO: NO
\vskip0.666000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Plásmido
\vskip0.666000\baselineskip
- (vii)
- FUENTE INMEDIATA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- CLON: 467-22.A12 (Figura 10 Empalme A)
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº 40:
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN DE LA SEC ID Nº 41:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 66 pares de bases
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.333000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: doble
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: circular
\vskip0.666000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: DNA (genómico)
\vskip0.666000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICO: NO
\vskip0.666000\baselineskip
- (iv)
- ANTISENTIDO: NO
\vskip0.666000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Plásmido
\vskip0.666000\baselineskip
- (vii)
- FUENTE INMEDIATA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- CLON: 467-22.A12 (Figura 10 Empalme B)
\vskip0.666000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: CDS
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- SITUACIÓN: 16..66
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- OTRA INFORMACIÓN: /parcial
\hskip3cm/codón de iniciación= 16
\hskip3cm/producto= "Péptido N-terminal de proteína híbrida"
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº 41:
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN DE LA SEC ID Nº 42:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 17 aminoácidos
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: linear
\vskip0.666000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº 42:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Het Lys Trp Ala Thr Trp Ile Asp Pro Val Val
Leu Gin Arg Arg Asp Trp}
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN DE LA SEC ID Nº 43:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 132 pares de bases
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.333000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: doble
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: circular
\vskip0.666000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: DNA (genómico)
\vskip0.666000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICO: NO
\vskip0.666000\baselineskip
- (iv)
- ANTISENTIDO: NO
\vskip0.666000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Plásmido
\vskip0.666000\baselineskip
- (vii)
- FUENTE INMEDIATA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- CLON: 467-22.A12 (Figura 10 Empalme C)
\vskip0.666000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: CDS
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- SITUACIÓN: 1..93
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- OTRA INFORMACIÓN: /parcial
\hskip3cm/codón de iniciación= 1
\hskip3cm/función= "Final de traducción de la proteína híbrida"
\hskip3cm/producto= "Péptido C-terminal"
\hskip3cm/nombre estándar= "Traducción de secuencia de DNA sintética"
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº 43:
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN DE LA SEC ID Nº 44:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 31 aminoácidos
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: linear
\vskip0.666000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº 44:
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN DE LA SEC ID Nº 45:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 66 pares de bases
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.333000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: doble
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: circular
\vskip0.666000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: DNA (genómico)
\vskip0.666000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICO: NO
\vskip0.666000\baselineskip
- (iv)
- ANTISENTIDO: NO
\vskip0.666000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Plásmido
\vskip0.666000\baselineskip
- (vii)
- FUENTE INMEDIATA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- CLON: 467-22.A12 (Figura 10 Empalme D)
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº 45:
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN DE LA SEC ID Nº 46:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 66 pares de bases
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.333000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: doble
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: circular
\vskip0.666000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: DNA (genómico)
\vskip0.666000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICO: NO
\vskip0.666000\baselineskip
- (iv)
- ANTISENTIDO: NO
\vskip0.666000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Plásmido
\vskip0.666000\baselineskip
- (vii)
- FUENTE INMEDIATA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- CLON: 523-42.A18 (Figura 11 Empalme A)
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº 46:
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN DE LA SEC ID Nº 47:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 66 pares de bases
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.333000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: doble
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: circular
\vskip0.666000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: DNA (genómico)
\vskip0.666000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICO: NO
\vskip0.666000\baselineskip
- (iv)
- ANTISENTIDO: NO
\vskip0.666000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Plásmido
\vskip0.666000\baselineskip
- (vii)
- FUENTE INMEDIATA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- CLON: 523-42.A18 (Figura 11 Empalme B)
\vskip0.666000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: CDS
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- SITUACIÓN: 16..66
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- OTRA INFORMACIÓN: /parcial
\hskip3cm/codón de iniciación= 16
\hskip3cm/producto= "Péptido N-terminal de proteína híbrida"
\newpage
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº 47:
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN DE LA SEC ID Nº 48:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 17 aminoácidos
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: linear
\vskip0.666000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº 48:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Het Lys Trp Ala Thr Trp Ile Asp Pro Val Val
Leu Gin Arg Arg Asp Trp}
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN DE LA SEC ID Nº 49:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 132 pares de bases
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.333000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: doble
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: circular
\vskip0.666000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: DNA (genómico)
\vskip0.666000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICO: NO
\vskip0.666000\baselineskip
- (iv)
- ANTISENTIDO: NO
\vskip0.666000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Plásmido
\vskip0.666000\baselineskip
- (vii)
- FUENTE INMEDIATA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- CLON: 523-42.A18 (Figura 11 Empalme C)
\vskip0.666000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: CDS
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- SITUACIÓN: 1..93
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- OTRA INFORMACIÓN: /parcial
\hskip3cm/codón de iniciación= 1
\hskip3cm/función= "Final de traducción de proteína híbrida"
\hskip3cm/producto= "Péptido C-terminal"
\hskip3cm/nombre estándar= "Traducción de secuencia de DNA sintética"
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº 49:
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN DE LA SEC ID Nº 50:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 31 aminoácidos
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: linear
\vskip0.666000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº 50:
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN DE LA SEC ID Nº 51:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 66 pares de bases
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.333000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: doble
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: circular
\vskip0.666000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: DNA (genómico)
\vskip0.666000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICO: NO
\vskip0.666000\baselineskip
- (iv)
- ANTISENTIDO: NO
\vskip0.666000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Plásmido
\vskip0.666000\baselineskip
- (vii)
- FUENTE INMEDIATA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- CLON: 523-42.A18 (Figura 11 Empalme D)
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº 51:
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN DE LA SEC ID Nº 52:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 66 pares de bases
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.333000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: doble
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: circular
\vskip0.666000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: DNA (genómico)
\vskip0.666000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICO: NO
\vskip0.666000\baselineskip
- (iv)
- ANTISENTIDO: NO
\vskip0.666000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Plásmido
\vskip0.666000\baselineskip
- (vii)
- FUENTE INMEDIATA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- CLON: 552-45.19 (Figura 12 Empalme A)
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº 52:
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN DE LA SEC ID Nº 53:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 66 pares de bases
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.333000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: doble
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: circular
\vskip0.666000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: DNA (genómico)
\vskip0.666000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICO: NO
\vskip0.666000\baselineskip
- (iv)
- ANTISENTIDO: NO
\vskip0.666000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Plásmido
\vskip0.666000\baselineskip
- (vii)
- FUENTE INMEDIATA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- CLON: 552-45.19 (Figura 12 Empalme B)
\vskip0.666000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: CDS
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- SITUACIÓN: 31..66
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- OTRA INFORMACIÓN: /parcial
\hskip3cm/codón de iniciación= 31
\hskip3cm/producto= "Péptido N-terminal de proteína híbrida"
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº 53:
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN DE LA SEC ID Nº 54:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 12 aminoácidos
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: linear
\vskip0.666000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\newpage
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº 54:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Het Asn Ser Het Leu Arg Pro Val Glu Thr Pro
Thr}
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN DE LA SEC ID Nº 55:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 66 pares de bases
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.333000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: doble
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: circular
\vskip0.666000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: DNA (genómico)
\vskip0.666000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICO: NO
\vskip0.666000\baselineskip
- (iv)
- ANTISENTIDO: NO
\vskip0.666000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Plásmido
\vskip0.666000\baselineskip
- (vii)
- FUENTE INMEDIATA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- CLON: 552-45.19 (Figura 12 Empalme C)
\vskip0.666000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: CDS
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- SITUACIÓN: 1..15
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- OTRA INFORMACIÓN: /parcial
\hskip3cm/codón de iniciación= 1
\hskip3cm/producto= "Péptido C-terminal de proteína híbrida"
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº 55:
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN DE LA SEC ID Nº 56:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 5 aminoácidos
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: linear
\vskip0.666000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº 56:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Gin Gly Gly Lys Gin}
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN DE LA SEC ID Nº 57:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 66 pares de bases
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.333000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: doble
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: circular
\vskip0.666000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: DNA (genómico)
\vskip0.666000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICO: NO
\vskip0.666000\baselineskip
- (iv)
- ANTISENTIDO: NO
\vskip0.666000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Plásmido
\vskip0.666000\baselineskip
- (vii)
- FUENTE INMEDIATA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- CLON: 552-45.19 (Figura 12 Empalme D)
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº 57:
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN DE LA SEC ID Nº 58:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 66 pares de bases
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.333000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: doble
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: circular
\vskip0.666000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: DNA (genómico)
\vskip0.666000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICO: NO
\vskip0.666000\baselineskip
- (iv)
- ANTISENTIDO: NO
\vskip0.666000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Plásmido
\vskip0.666000\baselineskip
- (vii)
- FUENTE INMEDIATA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- CLON: 593-31.2 (Figura 13 Empalme A)
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº 58:
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN DE LA SEC ID Nº 59:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 66 pares de bases
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.333000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: doble
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: circular
\vskip0.666000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: DNA (genómico)
\vskip0.666000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICO: NO
\vskip0.666000\baselineskip
- (iv)
- ANTISENTIDO: NO
\vskip0.666000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Plásmido
\vskip0.666000\baselineskip
- (vii)
- FUENTE INMEDIATA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- CLON: 593-31.2 (Figura 13 Empalme B)
\vskip0.666000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: COS
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- SITUACIÓN: 16..66
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- OTRA INFORMACIÓN: /parcial
\hskip3cm/producto= "Péptido N-terminal de proteína híbrida"
\hskip3cm/gen= "16"
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº 59:
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN DE LA SEC ID Nº 60:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 17 aminoácidos
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: linear
\vskip0.666000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº 60:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Het Lys Trp Ala Thr Trp Ile Asp Pro Val Val
Leu Gin Arg Arg Asp Trp}
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN DE LA SEC ID Nº 61:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 132 pares de bases
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.333000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: doble
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: circular
\vskip0.666000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: DNA (genómico)
\vskip0.666000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICO: NO
\vskip0.666000\baselineskip
- (iv)
- ANTISENTIDO: NO
\vskip0.666000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Plásmido
\vskip0.666000\baselineskip
- (vii)
- FUENTE INMEDIATA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- CLON: 593-31.2 (Figura 13 Empalme C)
\vskip0.666000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: CDS
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- SITUACIÓN: 1..93
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- OTRA INFORMACIÓN: /parcial
\hskip3cm/producto= "Péptido C-terminal de proteína híbrida"
\hskip3cm/gen= "1"
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº 61:
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN DE LA SEC ID Nº 62:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 31 aminoácidos
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: linear
\vskip0.666000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº 62:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN DE LA SEC ID Nº 63:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 33 pares de bases
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.333000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: simple
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: linear
\vskip0.666000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: DNA (genómico)
\vskip0.666000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICO: NO
\vskip0.666000\baselineskip
- (iv)
- ANTISENTIDO: NO
\vskip0.666000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Oligonucleótido cebador sintético
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº 63:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.333000\baselineskip
\dddseqskipGGGTCGACAT GAAGACAACC ATTATTTTGA TAC
\hfill33
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN DE LA SEC ID Nº 64:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 66 pares de bases
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.333000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: doble
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: circular
\vskip0.666000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: DNA (genómico)
\vskip0.666000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICO: NO
\vskip0.666000\baselineskip
- (iv)
- ANTISENTIDO: NO
\vskip0.666000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Plásmido
\vskip0.666000\baselineskip
- (vii)
- FUENTE INMEDIATA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- CLON: 593-31.2 (Figura 13 Empalme D)
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº 64:
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN DE LA SEC ID Nº 65:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 32 pares de bases
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.333000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: simple
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: linear
\vskip0.666000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: DNA (genómico)
\vskip0.666000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICO: NO
\vskip0.666000\baselineskip
- (iv)
- ANTISENTIDO: NO
\vskip0.666000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Oligonucleótido cebador sintético
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº 65:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.333000\baselineskip
\dddseqskipGGGTCGACTC AAATGCAAAT GTTGCATCTG AT
\hfill32
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN DE LA SEC ID Nº 66:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 32 pares de bases
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.333000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: simple
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: linear
\vskip0.666000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: DNA (genómico)
\vskip0.666000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICO: NO
\vskip0.666000\baselineskip
- (iv)
- ANTISENTIDO: NO
\vskip0.666000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Oligonucleótido cebador sintético
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº 66:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.333000\baselineskip
\dddseqskipGGGATCCATG AACACTCAAA TTCTAATATT AG
\hfill32
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN DE LA SEC ID Nº 67:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 30 pares de bases
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.333000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: simple
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: linear
\vskip0.666000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: DNA (genómico)
\vskip0.666000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICO: NO
\vskip0.666000\baselineskip
- (iv)
- ANTISENTIDO: NO
\vskip0.666000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Oligonucleótido cebador sintético
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº 67:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.333000\baselineskip
\dddseqskipGGGATCCTTA TATACAAATA GTGCACCGCA
\hfill30
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN DE LA SEC ID Nº 68:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 30 pares de bases
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 30 pares de bases
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.333000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: simple
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: linear
\vskip0.666000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: DNA (genómico)
\vskip0.666000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICO: NO
\vskip0.666000\baselineskip
- (iv)
- ANTISENTIDO: NO
\vskip0.666000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Oligonucleótido cebador sintético
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº 68:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.333000\baselineskip
\dddseqskipGGGATCCTTA TATACAAATA GTGCACCGCA
\hfill30
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN DE LA SEC ID Nº 69:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 29 pares de bases
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.333000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: simple
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: linear
\vskip0.666000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: DNA (genómico)
\vskip0.666000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICO: NO
\vskip0.666000\baselineskip
- (iv)
- ANTISENTIDO: NO
\vskip0.666000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Oligonucleótido cebador sintético
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº 69:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.333000\baselineskip
\dddseqskipGGGTGGACTT ACATCTTATC GATGTCAAA
\hfill29
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN DE LA SEC ID Nº 70:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 31 pares de bases
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.333000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: simple
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: linear
\vskip0.666000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: DNA (genómico)
\vskip0.666000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICO: NO
\vskip0.666000\baselineskip
- (iv)
- ANTISENTIDO: NO
\vskip0.666000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Oligonucleótido cebador sintético
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº 70:
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN DE LA SEC ID Nº 71:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 31 pares de bases
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.333000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: simple
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: linear
\vskip0.666000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: DNA (genómico)
\vskip0.666000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICO: NO
\vskip0.666000\baselineskip
- (iv)
- ANTISENTIDO: NO
\vskip0.666000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Oligonucleótido cebador sintético
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº 71:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.333000\baselineskip
\dddseqskipGGGATCCTTA CGAAAAGTAT TTAATTTGTG
\hfill31
Claims (33)
1. Un virus del herpes equino recombinante vivo
que comprende el DNA genómico del virus del herpes equino 1
(EHV-1) ó 4 (EHV-4) del cual se ha
suprimido una secuencia de DNA del gen US2, que se muestra para el
EHV-1 en la SEC ID Nº 1 y para el
EHV-4 en la SEC ID Nº 3, inactivando dicho gen
US2.
2. El virus del herpes de la reivindicación 1 que
comprende al menos una deleción más de una secuencia de DNA.
3. El virus del herpes de la reivindicación 2, en
el que la secuencia de DNA se suprime del gen que codifica la
timidina quinasa (TK), del gen que codifica la glicoproteína E
(gpE), del gen que codifica la glicoproteína G (gpG), y/o del gen
que codifica la glicoproteína grande de membrana (MGP).
4. El virus del herpes de la reivindicación
1-3 que contiene además una secuencia de DNA ajeno
insertada en él.
5. El virus del herpes de la reivindicación 4 en
el que la secuencia de DNA ajeno codifica un marcador
detectable.
6. El virus del herpes de la reivindicación 5 en
el que el marcador detectable es la
\beta-galactosidasa.
7. El virus del herpes de la reivindicación 4 en
el que el DNA ajeno es de un virus de la gripe equina.
8. El virus del herpes de la reivindicación 4, en
el que el DNA ajeno es de un gen que codifica la glicoproteína B
(gpB) del virus del herpes equino 1 (EHV-1) o la
glicoproteína D (gpD) del EHV-1.
9. El virus del herpes de la reivindicación 7 en
el que el DNA ajeno es de los genes de la hemaglutinina y la
neuraminidasa del aislado Influenza A/equine/Prague/56 del virus de
la gripe equina.
10. El virus del herpes de la reivindicación 7,
en el que el DNA ajeno es de los genes de la hemaglutinina y la
neuraminidasa del aislado Influenza A/equine/Miami/63 del virus de
la gripe equina.
11. El virus del herpes recombinante vivo de la
reivindicación 7 en el que el DNA ajeno es de los genes de la
hemaglutinina y la neuraminidasa del aislado Influenza
A/equine/Kentucky/81 del virus de la gripe equina.
12. El virus del herpes equino de la
reivindicación 7, en el que el DNA ajeno es de los genes de la
hemaglutinina y la neuraminidasa del aislado Influenza
A/equine/Alaska/91 del virus de la gripe equina.
13. El virus del herpes de la reivindicación 4
que tiene una deleción en el gen US2 y que tiene una secuencia de
DNA que codifica la \beta-galactosidasa de E.
coli insertada en el lugar de la deleción del gen US2.
14. El virus del herpes de la reivindicación 13
que tiene también una deleción en el gen que codifica la TK.
15. El virus del herpes de la reivindicación 13
en el que se suprimen también el gen gpG y una porción del gen
MGP.
16. El virus del herpes de la reivindicación 14
en el que se suprimen también el gen gpG y una porción del gen
MGP.
17. El virus del herpes de la reivindicación 3
que tiene una deleción en el gen que codifica la TK y en el gen que
codifica la gpE.
18. El virus del herpes de la reivindicación 17
que tiene un secuencia de DNA que codifica la gpB del
EHV-1 insertada en el lugar de la deleción del gpE y
la gpD del EHV-1 insertada en el lugar de la
deleción del TK.
19. El virus del herpes de la reivindicación 17
que tiene un secuencia de DNA del gen de la hemaglutinina y la
neuraminidasa de un virus de la gripe equina insertada en el lugar
de la deleción del gpE.
20. El virus del herpes de la reivindicación 19
en el que los genes de la hemaglutinina y la neuraminidasa son del
aislado Influenza A/equine/Prague/56 del virus de la gripe
equina.
21. El virus del herpes de la reivindicación 19
en el que los genes de la hemaglutinina y la neuraminidasa son del
aislado Influenza A/equine/Miami/63 del virus de la gripe
equina.
22. El virus del herpes de la reivindicación 19
en el que los genes de la hemaglutinina y la neuraminidasa son del
aislado Influenza A/equine/Kentucky/81 del virus de la gripe
equina.
23. El virus del herpes de la reivindicación 19
en el que los genes de la hemaglutinina y la neuraminidasa son del
aislado Influenza A/equine/Alaska/91 del virus de la gripe
equina.
24. El virus del herpes de la reivindicación 13
designado por el Nº de Acceso de la ATCC VR 2363
(S-4EHV-003).
25. El virus del herpes de la reivindicación 14
designado por el Nº de Acceso de la ATCC VR 2362
(S-4EHV-002).
26. El virus del herpes de la reivindicación 14
designado por el Nº de Acceso de la ATCC VR 2360
(S-1EHV-004).
27. El virus del herpes de la reivindicación 15
designado por el Nº de Acceso de la ATCC VR 2358
(S-1EHV-002).
28. El virus del herpes de la reivindicación 16
designado por el Nº de Acceso de la ATCC VR 2359
(S-1EHV-003).
29. El virus del herpes de la reivindicación 18
designado S-4EHV-010 construido como
se describe en el Ejemplo 16.
30. El virus del herpes de la reivindicación 20
designado S-4EHV-011 construido como
se describe en el Ejemplo 17.
31. El virus del herpes de la reivindicación 21
designado S-4EHV-012 construido como
se describe en el Ejemplo 18.
32. El virus del herpes de la reivindicación 22
designado S-4EHV-013 construido como
se describe en el Ejemplo 19.
33. El virus del herpes de la reivindicación 23
designado S-4EHV-014 construido como
se describe en el Ejemplo 20.
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