ES2242191T3 - Vacuna contra una infeccion por estreptococos del grupo a. - Google Patents

Vacuna contra una infeccion por estreptococos del grupo a.

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ES2242191T3 ES95932518T ES95932518T ES2242191T3 ES 2242191 T3 ES2242191 T3 ES 2242191T3 ES 95932518 T ES95932518 T ES 95932518T ES 95932518 T ES95932518 T ES 95932518T ES 2242191 T3 ES2242191 T3 ES 2242191T3
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Abstract

SE PROPORCIONAN METODOS Y COMPOSICIONES PARA IDENTIFICAR UN ESTREPTOCOCO DEL GRUPO A EN CUALQUIERA DE UNA VARIEDAD DE MUESTRAS FISIOLOGICAS, COMO SANGRE, SALIVA, ESPUTOS, FLUIDO CEREBROESPINAL, MATERIAL DE LAVADO BRONQUIAL, Y MATERIAL DE BIOPSIA. LAS COMPOSICIONES UTILIZADAS INCLUYEN UNA PROTEASA DE CISTEINA EXTRACELULAR O UN FRAGMENTO DE LA MISMA, OBTENIBLE DE S. PYOGENES Y QUE CONTIENE AL MENOS UN EPITOPE CONSERVADO, O ACIDO NUCLEICO QUE CODIFICA LA PROTEASA DE CISTEINA O FRAGMENTO DE LA MISMA. LAS COMPOSICIONES TAMBIEN ENCUENTRAN USO EN LA PRODUCCION DE UNA RESPUESTA INMUNE PROTECTORA FRENTE A UNA INFECCION POR ESTREPTOCOCO DEL GRUPO A.

Description

Vacuna contra una infección por estreptococos del Grupo A.
Campo técnico
La presente invención se refiere de manera general a los campos de la bacteriología molecular y de las enfermedades infecciosas. Más específicamente, la presente invención se refiere a vacunas para proteger frente a la infección por estreptococos del Grupo A, a proteínas exotoxinas B estreptocócicas (SPEB) no proteolíticas y a la utilización de tales proteínas para la producción de vacunas.
Antecedentes
Streptococcus pyogenes es una bacteria Gram positiva que es el agente etiológico de varias enfermedades en humanos, incluyendo faringitis y/o amigdalitis, infecciones cutáneas (impétigo, erisipelas y otras formas de piodermas), fiebre reumática aguda (ARF), escarlatina (SF), glomerulonefritis post-estreptocócica (PSGN) y un síndrome similar al choque tóxico (TSLS). Globalmente, la ARF es la causa más común de las enfermedades cardíacas pediátricas. Por ejemplo, se estima que en la India más de seis millones de niños en edad escolar padecen enfermedad cardíaca reumática. En los Estados Unidos, el "dolor de garganta" es la tercera razón más habitual de las visitas a las consultas del médico y se recupera S. pyogenes del 30% aproximadamente de los niños con este padecimiento. Hay alrededor de 25-35 millones de casos de faringitis estreptocócica por año en los Estados Unidos, responsables de 1-2 billones de dólares por año aproximadamente en costes de asistencia sanitaria.
En los años recientes, ha tenido lugar por razones desconocidas un incremento intercontinental de la frecuencia y la gravedad de las enfermedades estreptocócicas, aunque han sido implicadas dos moléculas variantes de la exotoxina A pirogénica (SPEA). Los residuos de aminoácidos que caracterizan a las moléculas de SPEA mutantes están localizados en un área de la toxina que, sobre la base de la estructura cristalina tridimensional recientemente publicada de la enterotoxina B de Staphylococcus aureus relacionada, forma la hendidura de unión al receptor de células
T.
S. pyogenes sintetiza un zimógeno extracelular de 371 aminoácidos (40.314 kDa) que puede ser transformado en una proteasa enzimáticamente activa de 253 aminoácidos (27.588 kDa) por conversión autocatalítica. El zimógeno contiene uno o más epítopos no asociados con el enzima truncado. El zimógeno y la proteasa activa contienen ambos una única media cisteína por molécula que es susceptible a los antagonistas del sulfhidrilo. En cultivos en caldo, el precursor inactivo se acumula extracelularmente durante la multiplicación bacteriana y alcanza una concentración máxima al final del crecimiento logarítmico. Algunas cepas producen hasta 150 mg/litro de zimógeno, y la molécula es una proteína extracelular fundamental. Por tanto, la proteasa de cisteína estreptocócica se asemeja a muchos factores de virulencia como son las proteasas extracelulares secretadas por las bacterias en cuanto a que tiene un péptido señal específico y una prosecuencia que es eliminada de manera autocatalítica para generar un enzima totalmente
activo.
La gran morbilidad y mortalidad continuas causadas por S. pyogenes en las naciones en desarrollo, la carga financiera significativa para la asistencia sanitaria atribuible a los estreptococos del grupo A en los Estados Unidos y los niveles crecientes de resistencia a los antibióticos en este patógeno, ponen de relieve la necesidad de un conocimiento más completo de la de la patogénesis molecular de la infección estreptocócica. Además, el reciente incremento de estas enfermedades resalta la falta de una vacuna eficaz, a pesar de la inclusión repetida de S. pyogenes en las listas de patógenos humanos importantes para los que se necesitan vacunas.
Se cree que la protección contra la infección estreptocócica sistémica es debida predominantemente a una IgG anti-proteína M opsónica específica de tipo. Como consecuencia, se ha llevado a cabo una investigación sobre inmunoprofilaxis casi exclusivamente en el contexto de formular una vacuna de proteína M. Sin embargo, dos problemas teóricos y prácticos muy importantes han dificultado este esfoque. En primer lugar, se han descrito más de 100 tipos de proteína M distintos sobre la base de estudios serológicos y de secuenciación génica. La aparición de esta extensa serie de variantes serotípicas indica que una vacuna de proteína M eficaz debe ser heterogénea en composición o bien que deben utilizarse elementos de la proteína M protectores conservados. La formulación de una vacuna altamente polivalente ha generado poco entusiasmo y tiene que identificarse todavía un fragmento de proteína M pan-protector conservado. Un segundo problema que ha asolado a la investigación de vacunas de proteína M es la observación de que las proteínas M contienen epítopos que reaccionan de manera cruzada con el tejido cardíaco y otros tejidos humanos. Este hecho, junto con los supuestos aspectos autoinmunes de varias enfermedades estreptocócicas, ha dificultado también el desarrollo de vacunas de proteína M. La detección de infecciones estreptocócicas del Grupo A ha estado impedida por el hecho de que los ensayos actualmente disponibles se han basado en la detección del antígeno proteína M estreptocócica del Grupo A. Sería por tanto de interés el desarrollar una vacuna eficaz para la prevención profiláctica inmune de la infección por estreptococos del Grupo A basada en una proteína distinta de la proteína M y un método eficaz para inmunizar a un ser humano frente a las infecciones por estreptococos del Grupo A. La proteasa extracelular, y los anticuerpos generados contra la misma, pueden proporcionar la base para ensayos de selección. De igual modo, pueden utilizarse ensayos basados en PCR para la detección de secuencias de ácido nucleico que codifiquen la proteasa extracelular. Es por tanto de interés identificar epítopos conservados, particularmente epítopos inmunodominantes conservados en la molécula de proteasa de cisteína, para el desarrollo
de composiciones y métodos que puedan ser utilizados para someter a selección organismos estreptocócicos del Grupo A.
Literatura relevante
Se ha descrito que anticuerpos hacia moléculas distintas de las proteínas M proporcionan protección contra la infección por S. pyogenes según se revela en las referencias siguientes. Chappell y Stuart (Vaccine (1993) 11:643-8) encontraron que la inoculación intraperitoneal de cultivos bacterianos lavados de un aislado M-negativo protegían a ratones frente al desafío letal con cepas de S. pyogenes que expresaban las moléculas de superficie M3, M18 o la molécula de superficie de tipo 28. La inmunidad no específica de un tipo fue atribuida a la presencia de anticuerpos contra tres proteínas de M_{r} 32, 43 y 46 kDa. Stjernquist-Desatnik y col. (Vaccine (1990) 8:150-2) mostraron que la vacunación intranasal con aislados destruidos por calor de cepas M-negativas de S. pyogenes protegía contra el desafío intranasal con un aislado que expresaba el serotipo M50. Rotta y col. (J. Exp. Med. (1965) 122:877-90) demostraron una inmunidad protectora heteróloga en ratones inmunizados por vía intraperitoneal con preparaciones de la pared celular estreptocócica o con material enriquecido en peptidoglicano, un componente de la pared celular de los estreptococos del Grupo A.
O'Connor y colaboradores (J. Infect. Dis. (1991) 163:109-16) han sugerido que anticuerpos neutralizantes dirigidos contra el enzima de la superficie de las células estreptocócicas, peptidasa C5a, podrían proporcionar protección frente a la colonización estreptocócica, pero no han analizado directamente esta hipótesis. Un estudio reciente de Dale y col. (J. Infect. Dis. (1994) 169:319-23) sugería que organismos pretratados con anticuerpos hacia la molécula de superficie de estreptococos del Grupo A, ácido lipoteicoico (LTA), están atenuados significativamente en un modelo de infección en ratón. Sin embargo, debido a la falta de la inclusión de un anticuerpo control no específico en ese estudio, no es posible determinar si el efecto protector de los anticuerpos era debido a una interacción con LTA, o era debido simplemente a la unión no específica de la inmunoglobulina a la superficie bacteriana.
Sobrenadantes del cultivo de S. pyogenes contienen una proteasa que tiene actividad fibrinolítica (Elliot (1945) J. Exp. Med. 81:573-92). El enzima fue purificado, mostrándose que era una proteasa de cisteína (Liu y col. (1963) 238:251-6) y encontrándose que era idéntico a, o que era una variante alélica de, la exotoxina B pirogénica de estreptococos (SPEB) (Gerlach y col. (1983) Zbl. Batk. Hyg. 255:221-3; Hauser y Schlievert (1990) J. Bacteriol. 172:4536-42).
Resumen de la invención
Se proporcionan vacunas para proteger frente a la infección por estreptococos del Grupo A. Las vacunas inhiben la replicación del Streptococcus y de este modo impiden o disminuyen los efectos clínicos adversos causados por las infecciones estreptocócicas. Las vacunas incluyen una exotoxina B pirogénica de estreptococos (SPEB) no proteolítica purificada que confiere inmunidad a un mamífero frente a la infección por estreptococos del Grupo A, en la que la SPEB contiene al menos una sustitución de aminoácidos en Cys-192 o His-340. La vacuna puede contener además un antígeno proteína M estreptocócica. La invención proporciona también una proteína exotoxina B pirogénica estreptocócica (SPEB) no proteolítica purificada que contiene al menos una sustitución de aminoácidos en Cys-192 o His-340. La invención proporciona además la utilización de una proteína exotoxina B pirogénica estreptocócica (SPEB) no proteolítica purificada que contiene al menos una sustitución de aminoácidos en Cys-192 o His-340, para la fabricación de una vacuna para conferir inmunidad a un mamífero frente a la infección por estreptococos del Grupo A.
Breve descripción de las figuras
Las figuras no están necesariamente a escala. Ciertas características de la invención pueden estar exageradas en escala o ser mostradas en forma esquemática por razones de claridad y concisión.
La Figura 1 muestra los resultados de la purificación de la proteasa de cisteína estreptocócica. La proteasa de cisteína estreptocócica fue purificada de la cepa MGAS 1719 utilizando el método descrito en el Ejemplo 2 y resuelta mediante electroforesis en gel de dodedil sulfato de sodio-poliacrilamida (SDS-PAGE). Calle 1: 2 \mug de la proteasa purificada; Calle 2: estándares de peso molecular.
La Figura 2 muestra los resultados del corte del precursor de la interleuquina-1\beta (IL-1\beta) humana por la proteasa de cisteína estreptocócica. La Figura 2A muestra la pIL-1\beta marcada con [^{35}S]metionina (Calle 1) sintetizada en un sistema de lisado de reticulocitos de conejo e incubada con 250 ng de proteasa de cisteína purificada (Calle 2), o de proteasa de cisteína llevada a ebullición (Calle 3) durante 1 hora. Un mutante Asp-116 \rightarrow Ala-116 de pIL-1\beta humana fue también cortado por la proteasa de cisteína (Calle 4). La Figura 2B muestra el análisis de inmunotransferencia Western de los productos de corte de la pIL-1\beta madura y recombinante. Calle 1: mIL-1\beta sola; Calle 2: mIL-1\beta más la proteasa de cisteína; Calle 3: pIL-1\beta sola; Calle 4: pIL-1\beta más la proteasa de cisteína. Las incubaciones se llevaron a cabo durante 30 minutos a 37ºC. Los productos de corte fueron resueltos por SDS-PAGE, transferidos a nitrocelulosa y sondados con la proteasa de cisteína carboxiterminal; Calle 3: pIL-1\beta sola; Calle 4: pIL-1\beta más el anticuerpo monoclonal específico (específico para IL-1\beta). El producto de \sim 18,5 kDa fue convertido en la forma de menor peso molecular después de una incubación adicional. Las proteínas inmunorreactivas mayores y menores de \sim 33 kDa de la Calle 3 son producidas en el proceso de fermentación utilizado para producir pIL-1\beta.
La Figura 3 muestra los resultados de la estimulación de la actividad de la sintasa del óxido nítrico (NO) por la proteasa de cisteína y pIL-1\beta en células de músculo liso de aorta de rata. Las células fueron tratadas durante 24 horas con medio sin suero (SFM) (1), pIL-1\beta madura (3 ng/ml) (2), proteasa de cisteína (4 mg/ml) (3), pIL-1\beta
(\sim 200 ng/ml) (4), o con proteasa de cisteína más pIL-1\beta (5). La concentración de nitrito en las muestras de medio condicionado procedente de las células tratadas fue determinada por comparación con una curva estándar de nitrito de sodio.
La Figura 4 muestra los resultados del corte de pIL-1\beta por variantes alélicas de la proteasa de cisteína estreptocócica. Un lisado de reticulocitos de conejo que contenía pIL-1\beta marcada con [^{35}S]metionina (Calle 1) fue incubado con proteasa de cisteína purificada de la cepa MGAS 279 (Calle 2) o MGAS 289 (Calle 3) según se describió para la Figura 2A.
La Figura 5 muestra los resultados del corte de proteínas purificadas de la matriz extracelular (ECM).
La Figura 6 muestra la inducción de efecto citopático y del corte de fibronectina en cultivos de células endoteliales de la vena umbilical humana (HUVEC).
La Figura 7 muestra la producción de SPEB por cepas de S. pyogenes.
La Figura 8 muestra los sitios de procesamiento, la localización de las variaciones de aminoácidos encontradas en las proteínas producidas por los alelos speB2 y speB4 y los aminoácidos que son diana para una mutación.
La Figura 9 muestra la producción de mutaciones aleatorias en speB.
La Figura 10 muestra alelos de speB. Se muestran los sitios polimórficos dentro de la región no codificadora corriente arriba de 160 pb y de la región codificadora de 1197 pb del gen speB. La secuencia descrita por Hauser y Schlievert (J. Bacteriol. (1990) 172:4536-42) fue denominada arbitrariamente SpeB1, y la numeración de los nucleótidos y codones es afín a esa secuencia. Se muestran solamente aquellos nucleótidos de los otros alelos que difieren de la secuencia de speB1. La posición de cada sitio de los nucleótidos polimórficos está mostrada sobre los 39 alelos y está numerada en formato vertical. Los cambios de nucleótidos no sinónimos están subrayados y las posiciones de los cambios de codificación están representadas por un asterisco encima de los sitios polimórficos de la región codificadora. Los siete sitios de nucleótidos polimórficos en la región codificadora corriente arriba están mostrados a la izquierda de la figura, y el asterisco en speB6 indica una deleción de un residuo de adenina. El codón (numerado en formato vertical) que contiene los sitios de nucleótidos polimórficos está mostrado debajo de los 39 alelos. Los datos de la secuencia de ADN de speB2-speB39 están disponibles en EML/GenBank/DDBJ bajo los números de acceso L26125-L26162. Los datos de la secuencia de ADN de speB1 fueron publicados en Hauser y Schlievert, J. Bacteriol. (1990) 172:4536-42.
La Figura 11 muestra los resultados de la inmunización activa de ratones con la proteasa de cisteína estreptocócica que protege frente al desafío letal con S. pyogenes heterólogo. Los datos muestran que la inmunización intraperitoneal con proteasa de cisteína estreptocócica purificada conferían una protección significativa (análisis de rangos logarítmicos X^{2}; P<0,01) frente al desafío letal con el aislado MGAS 315 altamente virulento de S. pyogenes.
Breve descripción de la invención
Un mamífero puede ser inmunizado contra la infección por estreptococos del Grupo A mediante la administración al mamífero de una vacuna de la invención en una cantidad suficiente para conferir inmunidad frente a la infección por estreptococos del Grupo A. Los métodos de inmunización inhibirán la replicación de las especies de Streptococcus en el mamífero y disminuirán los síntomas que están asociados con la enfermedad. La vacuna puede ser adaptada para que confiera inmunidad frente a faringitis, amigdalitis, infecciones cutáneas, fiebre reumática aguda, escarlatina, glomerulonefritis post-estreptocócica, sepsis y síndrome similar al choque tóxico.
La vacuna puede ser adaptada para ser administrada mediante administración parenteral. En particular, la vacuna puede ser adaptada para administración subcutánea o intramuscular, o para ser administrada oralmente. La vacuna puede ser adaptada para ser administrada en múltiples dosis y puede ser adaptada además para ser administrada a un humano.
Una vacuna basada en el producto del gen speB ofrece varias ventajas sobre las que están basadas en la proteína M. Por ejemplo, se sabe que los anticuerpos hacia las proteínas M reaccionan de manera cruzada con varios tejidos del huésped, y preocupa considerablemente que una vacuna basada en la proteína M pueda provocar una enfermedad autoinmune humana debido al hecho de que comparten epítopos. Los más de 100 tipos de proteína M identificados inducen una inmunidad predominantemente específica de un tipo. De este modo, una vacuna eficaz basada en la proteína M necesitaría ser altamente polivalente o estar dirigida contra epítopos de la proteína M pan-protectores conservados todavía no identificados. La vacuna de la presente invención no es específica de un tipo y por tanto es útil en la prevención de cualquier infección por estreptococos del Grupo A. No se conoce que los anticuerpos hacia la proteasa de cisteína o su zimógeno reaccionen de manera cruzada con los tejidos del hués-
ped.
Streptococcus pyogenes es un coco gram positivo que es \beta-hemolítico, expresa un antígeno del Grupo A y es susceptible a bacitracina. Para esta descripción, se considera que un microorganismo es igual o equivalente a Streptococcus pyogenes si en su genoma hay una secuencia codificadora de una proteasa extracelular que está implicada en la patogénesis del microorganismo. Con el fin de acomodar las variaciones cepa a cepa entre los diferentes aislados, pueden realizarse ajustes para sustituciones conservadoras y selección entre las alternativas en las que están implicadas sustituciones no conservadoras.
La proteína codificada por el gen speB codifica un zimógeno y una proteasa de cisteína extracelular que corta el precursor de la interleuquina 1\beta humana para formar IL-1\beta biológicamente activa, una citoquina muy importante que media la inflamación y el shock. La proteasa purificada corta la fibronectina y degrada rápidamente la vitronectina. La proteína no tiene actividad sustancial contra la laminina. La proteasa de cisteína corta también la fibronectina procedente de células endoteliales de la vena umbilical humana cultivadas in vitro. Otros organismos que producen proteasas extracelulares que están implicadas en la patogénesis del organismo huésped pueden ser utilizadas también como fuente del enzima o de fragmentos del mismo, y como fuente de material genético para ser utilizado en la presente invención.
Varias bacterias patógenas humanas expresan proteasas extracelulares capaces de degradar proteínas de la ECM. Entre estos organismos están Pseudomonas aeruginosa, (Morihara Kamp Homma, En: Holder, I.A., ed., Bacterial enzymes and virulence, FL CRC Press, 1985; 41-75) y Porphyromonas (Bacteriodes) gingivalis, (Lantz y col., J. Bacteriol. 1991, 173:495-504; y Otogoto y Kuramitsu, Infect. Immun. 1993; 61:117-23), dos especies bacterianas que producen la destrucción de tejidos del huésped por degradación del colágeno y de la fibronectina, respectivamente. Es también destacable que Trypanosoma cruzi, el flagelado parásito que origina la tripanosomiasis americana (Enfermedad de Chagas), expresa una proteasa de cisteína en la superficie celular que es un antígeno fundamental en humanos (Gazzinelli y col., Infect. Immun. 1990; 58:1437-44; y Murta, A.C.M. y col., Molec. Biochem. Parasitol. 1990; 43:27-38) y se cree que es un factor de virulencia importante (Eakin, E.A. y col., J. Biol. Chem. 1992; 267:7411-20). El enzima (cruzipaína) corta moléculas de inmunoglobulina G e hidroliza el fragmento Fc (Murta, A.C.M. y col., Molec. Biochem. Parasitol. 1990; 43:27-38), ayudando de este modo al organismo a evadir las consecuencias inmunológicas de la unión al anticuerpo. Entamoeba histolytica, la causa de la amebiasis, produce también una proteasa de cisteína extracelular que muchos creen que es un factor de virulencia muy importante (Keene, W.E. y col., J. Exp. Med. 1986; 163:536-49). Igual que la proteasa de cisteína estreptocócica, el enzima de E. histolytica degrada varias proteínas de la ECM, incluyendo el colágeno de tipo I, la fibronectina y la laminina (Keene, W.E. y col., J. Exp. Med. 1986; 163:536-49). La proteasa produce también un efecto citopático sobre monocapas de cultivo celular (Keene, W.E. y col., Exp. Parasitol. 1990; 71:199-206) y está implicada en la producción de necrosis tisular en modelos de amebiasis aguda en rata (Becker, I. y col., Exp. Parasitol. 1988; 67:268-80).
SEC ID Nº: 5
1
Pueden emplearse mutagénesis dirigida a un sitio y mutagénesis aleatoria para identificar los residuos que alteran la función de la proteasa de cisteína y el procesamiento del zimógeno, y para crear mapas de las regiones que constituyen los dominios antigénicos de la proteína. La Figura 8 muestra los lugares de procesamiento, las posiciones de las variaciones de aminoácidos encontradas en las proteínas producidas por los alelos speB y speB4 y los aminoácidos que son diana para la mutación. Las dianas para la sustitución de aminoácidos funcionales están basadas en el análisis bioquímico de la proteasa de cisteína (Tai y col., J. Biol. Chem. (1976) 251:1955-91) y por analogía con residuos similares de la proteasa de cisteína eucariótica.
Con el fin de crear un zimógeno estable para facilitar los estudios cristalográficos y generar una proteasa enzimáticamente deficiente o inactiva para estudios de estructura-función, se producen y caracterizan formas mutantes de la proteína proteasa de cisteína. Un esquema de mutagénesis dirigida crea cambios que: (i) alteran la actividad de la proteasa; (ii) impiden el procesamiento del zimógeno; (iii) impiden la unión al sustrato y (iv) alteran la inmunorreactividad. Los aminoácidos son cambiados por alanina estructuralmente neutra. Como ejemplo, una proteína mutante que carezca de actividad proteasa pero que conserve su antigenicidad, puede ser generada por mutagénesis del único residuo de cisteína (Cys-192 \rightarrow Ala-192) en el sitio catalítico de la molécula. Se someten también a mutagénesis His-340 y Gln-185 y Asn-356. Estos tres cambios son epistáticos respecto a la mutación de Cys-192, pero solos pueden presentar una actividad alterada. Trp-357, que se cree que está implicado en la unión al sustrato y está situado de manera similar dentro de la papaína, va a ser también convertido en diana.
Se crea también un precursor estable del zimógeno mediante la mutación de los residuos que rodean el sitio de corte de la proteasa en Lys-2145. Además, la mutagénesis de Cys-192 puede impedir la autoproteolisis, como ocurría con un mutante Cys \rightarrow Ser de la papaína, la proteasa de cisteína prototipo. Otras dianas para mutagénesis incluyen un supuesto dominio de unión a nucleótidos (GVGKVG) (SEC ID Nº:6) y una región potencial de ensamblaje del colágeno [(GXX)_{3}] en la porción carboxi-terminal de la proteína. Se utiliza mutagénesis dirigida a un sitio, mediante el método de barrido para cambiar aminoácidos cargados por alanina, con el fin de sustituir aminoácidos cargados positivamente y negativamente (implicados a menudo en el reconocimiento y la actividad) por alanina. Se espera que muchos de los residuos cargados (14 residuos de lisina, 7 de arginina, 12 de aspartato y 7 de glutamato en el péptido maduro) residan en la superficie de la estructura de la proteasa de cisteína, y se espera que algunos definan epítopos en la molécula. En particular, se examina una región de aminoácidos cargados, desde el 307 al 321 (8/15 cargados); esta región incluye el sitio de las sustituciones de aminoácidos de speB2 y speB4. Están también mutados residuos de las regiones antigénicas identificadas en los estudios de creación de mapas epitópi-
cos.
Por tanto, en una realización la invención proporciona una proteína exotoxina B pirogénica estreptocócica (SPEB) no proteolítica purificada que contiene al menos una sustitución de aminoácidos en Cys-192 o His-340. En particular, la sustitución de aminoácidos puede ser Cys-192 \rightarrow Ala-192, Cys-192 \rightarrow Ser-192 o His-340 \rightarrow Ala-340.
Con el fin de crear proteínas de speB mutantes, como ejemplo, el gen speB es primeramente amplificado a partir de una cepa de S. pyogenes, con PCR, y el producto es clonado en un vector filámido de múltiples copias tal como pBluescript (Stratagene, La Jolla, CA). Este vector es elegido porque lleva el promotor de lac regulado y puede ser replicado como una molécula de hebra sencilla para mutagénesis dirigida a un sitio. El clonaje es diseñado para colocar en el vector el promotor, el sitio de unión de ribosomas y el marco de lectura de speB 3' respecto a un promotor inducible, tal como un promotor de lac, de tal manera que la proteína pueda ser sobreexpresada condicionalmente en un huésped bacteriano cuando se añada al caldo de cultivo un inductor del promotor inducible. Por ejemplo, con el promotor de lac, en E. coli cuando pueda añadirse el inductor de lac IPTG. El promotor de speB está incluido requiriendo la expresión en S. pyogenes. Extractos de células completas y productos periplásmicos derivados de un shock de células de E. coli que llevan este clon primario de speB son examinados para determinar la presencia de la proteína proteasa de cisteína mediante SDS-PAGE y mediante transferencia Western con un anticuerpo anti-proteasa de cisteína. El plásmido resultante es la diana para la mutagénesis.
Se crean mutaciones dirigidas por oligonucleótidos, tales como sustituciones, deleciones y pequeñas inserciones, en moldes de hebra sencilla que contengan uracilo mediante el método de Kunkel (Kunkel, 1985). Cuando es posible, se diseñan cebadores mutagénicos con el fin de incorporar un único sitio de restricción en el gen speB para la creación de mapas y la selección de mutantes. Se crean sustituciones por alanina individuales y múltiples en los residuos anteriormente indicados. Una vez que se han identificado los residuos críticos para la función, pequeñas regiones que rodean los mismos son eliminadas o sustituidas mediante la utilización de los mismos métodos, con el fin de caracterizar adicionalmente la región y de impedir la reversión. Cuando están disponibles datos cristalográficos, se mutan aminoácidos adicionales.
Puede emplearse también un esquema de mutagénesis aleatoria. Las proteínas variantes creadas por este método son muy útiles para la selección de epítopos, aunque pueden recuperarse también moléculas con una cinética alterada y con un reconocimiento alterado del sustrato. Regiones de la secuencia de speB son aleatorizadas con oligonucleótidos mixtos en el protocolo de mutagénesis estimulada, o se crean deleciones en marco cortas dentro del gen con una modificación del protocolo de inserción/deleción de un adaptador con ADNasa I de Palzkill y Bostein (Palzkill y Bostein, 1991).
Para identificar mutaciones negativas en la proteasa, células huésped bacterianas productoras de proteínas mutantes potenciales son sometidas a selección primeramente por la actividad proteasa en placas de agar caseína. Como se espera la secreción de la proteasa de cisteína al periplasma, puede observarse la actividad proteasa en las placas. Si esta estrategia de selección tiene éxito, miles de colonias son examinadas rápidamente para detectar mutaciones funcionales en la proteasa de cisteína. Si la proteasa de cisteína debe ser secretada completamente por E. coli para presentar actividad, los productos del choque osmótico de cada supuesta cepa mutante son analizados para determinar actividad proteasa.
Alternativamente, puede emplearse la tecnología de ADN híbrido mediante la cual puede prepararse un gen sintético empleando hebras sencillas que codifiquen el polipéptido o hebras sustancialmente complementarias de las mismas, donde las hebras sencillas se solapan y pueden ser puestas en contacto en un medio de hibridación con el fin de que hibriden. Las hebras hibridadas pueden ser ligadas posteriormente para formar el gen completo y, mediante la elección de los extremos apropiados, el gen puede ser insertado en un vector de expresión. Alternativamente, la región del genoma bacteriano que codifica el péptido puede ser clonada mediante técnicas convencionales de ADN recombinante y expresada. Un ejemplo de una secuencia codificadora de ADN que puede ser utilizada para expresar la proteasa de cisteína es según sigue (SEC ID Nº:7):
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2
3
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Las proteínas SPEB mutantes de la invención pueden ser utilizadas para generar una respuesta inmune protectora y en vacunas, particularmente para humanos, pero también en animales comercialmente valiosos tales como el visón, que son susceptibles a la infección por estreptococos del Grupo A, o en otros animales tales como ratones. Por consiguiente, la invención proporciona la utilización de una proteína exotoxina B pirogénica estreptocócica (SPEB) no proteolítica purificada que contiene al menos una sustitución de aminoácidos en Cys-192 o His-340, para la fabricación de una vacuna para conferir inmunidad a un mamífero frente a la infección por estreptococos del Grupo A. La vacuna puede ser adaptada para que confiera inmunidad frente a una infección seleccionada de entre faringitis, amigdalitis, infecciones cutáneas, fiebre reumática aguda, escarlatina, glomerulonefritis post-estreptocócica, sepsis y síndrome similar al choque tóxico. La vacuna puede ser adaptada también para ser administrada a un
humano.
Las proteínas son formuladas de manera conveniente, generalmente a concentraciones en el rango de 1 \mug a 20 mg/kg. Pueden utilizarse como vehículos medios fisiológicamente aceptables tales como agua estéril, solución salina, solución salina tamponada con fosfato y similares. Pueden emplearse adyuvantes tales como gel de hidróxido de aluminio y similares. La administración puede ser mediante inyección, por ejemplo intramuscularmente, intraperitonealmente, subcutáneamente, intravenosamente, etc. Por consiguiente, la vacuna puede ser adaptada para ser administrada mediante administración parenteral, subcutánea, intramuscular u oral. La administración puede ser de una vez o en varias veces, normalmente a intervalos de una a cuatro semanas. Por tanto, la vacuna puede ser adaptada para que sea administrada en múltiples dosis. Además, la eficacia de la vacuna puede ser incrementada por la adición de un antígeno proteína M estreptocócica. En esta vacuna, el dominio conservado de la proteína M estreptocócica es combinado con la proteasa de cisteína. Preferiblemente, la proteína M que es utilizada no reacciona inmunológicamente de manera cruzada con los tejidos del huésped. La producción de anticuerpos puede ser utilizada como protección frente a Streptococcus del Grupo A, donde la protección puede retrasar la aparición de la muerte o prevenir la mortalidad debida a la infección.
La proteasa de cisteína purificada tiene varios usos, incluyendo la utilización como sustituta de la tripsina o de otras proteasas en la obtención de células aisladas, particularmente de aquéllas que están en una matriz proteica, por ejemplo una matriz de colágeno, tal como un espécimen de biopsia, o adheridas a una placa de cultivo de tejidos o a una placa Petri, o unidas a una columna de afinidad a través de un brazo proteico. La proteasa es también útil para eliminar el exceso de tejido en una cicatriz y para limpiar el tejido de un sustrato biológico tal como el
hueso.
Los ejemplos siguientes se presentan con el fin de ilustrar varias realizaciones de los métodos de la presente invención y no están destinados a limitar de ninguna manera la presente invención.
Ejemplo 1 Aislados Bacterianos
La Tabla 1 muestra las 68 cepas estudiadas de S. pyogenes. MGAS 1719 es idéntica a la cepa B220, la denominación asignada por el Dr. R. Lancefield a la cepa 5797. La cepa expresa el antígeno T de tipo 8 pero no es tipificable serológicamente por la proteína M.
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(Tabla pasa a página siguiente)
TABLA 1 Propiedades de 68 cepas de S. pyogenes que representan 50 ETs^{a}
4
5
6
^{a} ET, tipo electroforético.
^{b} NT, no tipificable por serotipo de proteína M.
^{c} MGAS, número de referencia del Streptococcus de Grupo A de Musser. Las fuentes de las cepas y las denominaciones originales son según sigue: J.C. Huang, Laboratory Centre for Disease Control, Ottawa, Canadá, MGAS 579 (11111), 587 (9378), 590 (11078), 2075 (DC 11435); J.E. Peters, Wilford Hall Medical Center, San Antonio, Texas, MGAS 1991 (BB6672-3), 1990 (BA9812-4); P.M. Schlievert, University of Minnesota, Minneapolis, Minnesota, MGAS 1253 (119/6, conocida también como SF130/13), MGAS 1251 (C203S), 166 (Reineke), 285 (195), 325 (89.5.5612), 157 (Zinke), 315 (Soldier 1), 282 (192), 289 (199), 262 (Cal 17), 168 (Reinary), 302 (Lambert), 321 (Weckmuller), 156 (Wilson), 300 (Kluss), 303 (Lundeen), 162 (Cygan), 165 (Wicks), 317 (Timmers); E.L. Kaplan, University of Minnesota, MGAS 480 (90-441); M.A. Kehoe, University of Newcastle upon Tyne, Newcastle upon Tyne, Inglaterra, MGAS 1841 (M41), 1871 (PT5757), 1893 (PT4854), 1882 (M59), 1842 (M43), 1901 (M23), 1898 (M15), 1864 (M56), 1896 (M10), 1911 (M75), 1881 (M62), 1870 (PT4931), 1872 (TR2612), 1838 (M27), 1914A (TR2233); D. LeBlanc, University of Texas Health Science Center en San Antonio, Texas, MGAS 1222 (Cole 36XA87), 1226 (Cole 40XF1), 1233 (Cole 45XA9); K.H. Johnston, Louisiana State University Medical Center, New Orleans, Louisiana, MGAS 1719 (B220); D.E. Bessen, Yale University, New Haven, Connecticut, MGAS 1832 (CS110), 1294 (IRP232), 1289 (IRP144); S.K. Hollingshead, Departamento de Microbiología, University of Alabama School of Medicine, Birmingham, Alabama, MGAS 660 (D469), 789 (IGL100), 807 (D323), 429 (C256/86/3), 684 (IRP284), 694 (D470), 427 (J137/69/1), 366 (AGL130), 719 (D938), 686 (D316), 800 (A724), 758 (86-809), 796 (D339), 650 (D691), 659 (D474). Todas las demás cepas son de la colección de J.M.M.
^{d} TSLS, síndrome similar al choque tóxico; SID, enfermedad invasiva grave; ARF, fiebre reumática aguda; NP, nasofaringe.
Ejemplo 2 Purificación de la Proteasa de Cisteína
Las bacterias fueron cultivadas durante una noche a 37ºC en un 5% de CO_{2} en agar con una infusión de cerebro-corazón (BHI). El cultivo de una noche fue utilizado para inocular 200 ml de medio líquido BHI, y el cultivo fue incubado durante 12-14 horas a 37ºC en un 5% de CO_{2}. Una alícuota de 50 ml del cultivo de una noche fue añadida a 2 litros de medio definido químicamente (JRH Bioscience, Lenexa, KS), pH 6,0, y el cultivo fue incubado a 37ºC en un 5% de CO_{2}. El caldo fue mantenido a pH 5,5-6,0 por la adición de bicarbonato de sodio estéril (10% p/v). Después de 8-9 horas, las células fueron retiradas por centrifugación y el sobrenadante fue concentrado hasta 250 ml por el pase a través de un cartucho de ultrafiltración espiral de 10 kDa de corte (Amicon). El cambio de tampón (> 99%) por diafiltración se llevó a cabo con 1,5 litros de etanol 20% - Tris-HCl 20 mM, pH 7,0 (tampón A) a 4ºC, y el material fue almacenado durante una noche a 4ºC. La solución diafiltrada fue pasada a través de una columna Matrix Gel Red A (Amicon) (1,5 cm x 15 cm) equilibrada con tampón A. La columna fue lavada con tampón A hasta que la absorción (280 nm) regresó a la línea base, y la proteína fue eluida con tampón A conteniendo NaCl 2 M. El material eluido fue recogido como una fracción y concentrado hasta 3 ml por ultrafiltración (Centriprep 10, Amicon) y el tampón fue intercambiado con PBS, pH 7,2, mediante cromatografía de filtración en gel (BioRad).
La secuenciación aminoterminal de la proteína purificada derivada de la cromatografía de afinidad por un ligando-colorante (Figura 1) revela una secuencia -QPVVKSLLDSK- (SEC ID Nº:8), correspondiente a los aminoácidos 146 -
156, confirmando de este modo la identidad del material purificado como la forma activa madura truncada de la proteinasa de cisteína estreptocócica. El enzima es estable durante al menos varios meses a -20ºC. Se han purificado tres variantes alélicas características de speB (identificadas mediante estudios de secuenciación). La forma zimógeno puede ser purificada con un protocolo muy similar, excepto en que se omite la cisteína del medio y el cultivo es incubado en ausencia de CO_{2} suplementario.
La secuencia de aminoácidos publicada para la proteasa de cisteína, incluyendo la configuración del supuesto sitio activo, es incorrecta. La secuencia de aminoácidos pronosticada codificada por esta secuencia no es afín a la secuencia publicada de la proteasa de cisteína. En su lugar, la secuencia de nucleótidos se asemeja a, pero es distinta de, el alelo descrito por Hauser y Schlievert.
Sin embargo, la configuración de aminoácidos alrededor del residuo de cisteína activo es idéntica en la cepa B220 y en todas las cepas caracterizadas hasta ahora. Por tanto, la propuesta de Hauser y Schlievert (1990) de que la falta de actividad proteasa asociada con la SPEB purificada de su cepa M12 86-858 es una consecuencia de la diferencia en la secuencia de aminoácidos alrededor del residuo de Cys, es incorrecta.
Ejemplo 3 Corte de npIL-1\beta por la Proteasa de Cisteína Estreptocócica
Se utilizó un ensayo que empleaba pIL-1\beta radiomarcada producida en un sistema de transcripción-traducción de reticulocitos de conejo. La proteasa de cisteína producía un producto de corte de 18 kDa aproximadamente, un tamaño muy similar al peso molecular aparente de la mIL-1\beta (Figura 2A). El análisis de transferencia Western de los productos de corte generados a partir de pIL-1\beta recombinante producida en E. coli confirmó este resultado (Figura 2B).
La proteasa de cisteína cortaba un mutante de la pIL-1\beta humana (Asp-116 \rightarrow Ala-116, creando un enlace Ala-116 -Ala-117) que no es degradado por ICE. Según se observó con la pIL-1\beta de tipo salvaje, la proteasa de cisteína cortaba el sustrato mutante para formar un producto con un peso molecular aparente de \sim 18 kDa (Figura 2A). Por tanto, el sitio de corte primario para la proteasa de cisteína no era el sitio proteolítico de ICE.
Con el fin de determinar exactamente el lugar en el que la proteasa de cisteína cortaba pIL-1, se secuenciaron los 10 residuos de aminoácidos aminoterminales del producto de \sim 18 kDa producido por degradación de la pIL-1\beta recombinante. La proteasa de cisteína cortaba pIL-1\beta entre His-115 - Asp-116 para crear una molécula un residuo de aminoácido más larga que mIL-1\beta.
Ejemplo 4 Actividad Biológica Normal del Producto de Corte IL-1\beta Madura
Como se describió una forma muy activa de mIL-1\beta con Asp-116 en el extremo amino en el curso de la caracterización de una metaloproteasa encontrada en células mononucleares de sangre periférica humana, la proteasa de cisteína estaba procesando la pIL-1\beta inactiva para dar IL-1\beta biológicamente activa. La IL-1\beta madura es un potente inductor de la actividad sintasa del óxido nítrico (NOS) en células de músculo liso vascular (SMC). La proteasa de cisteína fue añadida en presencia o ausencia de pIL-1\beta a cultivos confluentes de SMC y se analizó la actividad NOS midiendo los niveles del anión nitrito en el medio después de 24 horas. Ni la proteasa de cisteína sola ni la pIL-1\beta sola producían un incremento significativo de los niveles de nitrito. En contraste, la adición de proteasa de cisteína y pIL-1\beta juntas causó un incremento de 60 veces aproximadamente de la acumulación de nitrito (Figura 3).
Se encontró también que la IL-1\beta generada por el corte de la pIL-1\beta por la proteasa de cisteína era activa en el ensayo con la línea celular A375. En un ensayo en el que 500 ng/ml aproximadamente de pIL-1\beta intacta eran inactivos, un digesto de este material por la proteasa de cisteína producía 6,1 x 10^{4} unidades/ml de actividad; 500 ng/ml de IL-1\beta auténtica correspondían a 1,1 x 10^{5} unidades en este ensayo.
Ejemplo 5 Actividad de Corte de Enzimas Proteasa de Cisteína Variantes
Dos variantes alélicas adicionales de la proteasa de cisteína que existen de manera natural (SPE B2 y SPE B11) producían también un fragmento de IL-1\beta con un peso molecular aparente idéntico al del producido por SPE B7 purificada a partir de MGAS 1719 (Figura 4).
Ejemplo 6 Secuenciación de speB
El gen speB fue amplificado por la reacción en cadena de la polimerasa (PCR), con oligonucleótidos sintéticos.
El fragmento de ADN estudiado (1.437 pb) representa la región codificadora completa (1.197 pb) y 160 pb de la secuencia corriente arriba y 80 pb de la secuencia corriente abajo. Para alrededor de un tercio de las cepas, se preparó ADN de hebra sencilla por el método de la exonucleasa de lambda y se secuenció en ambas orientaciones con Sequenase versión 2.0. Los alelos variantes fueron secuenciados de nuevo con el fin de confirmar los cambios de nucleótidos.
Básicamente, la secuenciación del gen estructural de la proteasa de cisteína fue según sigue. El gen estructural de la proteasa de cisteína fue amplificado mediante la reacción en cadena de la polimerasa (PCR), con oligonucleótidos sintéticos. Los cebadores oligonucleotídicos utilizados para amplificar speB y las regiones flanqueantes fueron los siguientes:
SPEB-X (SEC ID Nº:9), 5'-GTTGTCAGTGTCAACTAACCGT-3'; y
SPEB-2 (SEC ID Nº:10), 5'-ATCTGTGTCTGATGGATAGCTT-3'.
Los cuatro oligonucleótidos siguientes fueron utilizados como cebadores de secuenciación internos:
SPEB-1 (SEC ID Nº:11), 5'-CTTTCTGGCTCTAATATGTATGT-3';
SPEB-3 (SEC ID Nº:12), 5'-GTTATTGAAAAAGTAAAACC-3';
SPEB-4 (SEC ID Nº:13), 5'-TTTTCAATAACAGGTGTCAA-3'; y
SPEB-Y (SEC ID Nº:14), 5'-TCTCCTGAAACGATAACAAA-3'.
La amplificación por PCR de 1 \mul de ADN cromosómico fue realizada en 100 \mul de una mezcla que contenía KCl 50 mM, Tris-HCl 10 mM, pH 8,3, MgCl_{2} 1,5 mM, gelatina 0,001%, 200 \muM de cada uno de dATP, dCTP, dGTP y dTTP, 200 nM de cada uno de SPEB-X y SPEB-2 y 2,5 unidades de ADN polimerasa AmpliTaq. Los parámetros de los ciclos térmicos fueron: desnaturalización a 94ºC durante 1 minuto, hibridación a 55ºC durante 2 minutos y extensión a 72ºC durante 2,5 minutos en un total de 30 ciclos. Se utilizó una extensión final a 72ºC durante 15 minutos.
El fragmento de ADN (1.437 pb) representa la región codificadora completa (1.197 pb) y 160 pb de la secuencia corriente arriba y 80 pb de la secuencia corriente abajo. Para un tercio aproximadamente de las cepas, se preparó ADN de hebra sencilla mediante el método de la exonucleasa de lambda y se secuenció en ambas orientaciones con Sequenase versión 2.0. Los alelos variantes fueron secuenciados de nuevo con el fin de confirmar los cambios de nucleótidos.
El gen de la proteasa fue caracterizado en dos tercios aproximadamente de las cepas mediante secuenciación automatizada del ADN con un instrumento de Applied Biosystems, Inc., Modelo 373A. Para el procedimiento automatizado, el gen fue amplificado por PCR (Tris-HCl 10 mM, pH 8,3; KCl 50 mM; MgCl_{2} 1,5 mM; 2,5 unidades de polimerasa Taq; 20 picomoles de cada cebador; 1 \mul de ADN cromosómico molde), con los parámetros siguientes del termociclador: desnaturalización a 94ºC durante 4 minutos, 30 ciclos de desnaturalización a 94ºC durante 1 minuto, hibridación de los cebadores a 55ºC durante 2 minutos, extensión a 72ºC durante 2 minutos y una extensión final a 72ºC durante 5 minutos. Los nucleótidos y cebadores no incorporados fueron eliminados por filtración a través de microconcentradores Microcon 100 (Amicon Inc., MA). Se llevaron a cabo reacciones de secuenciación con el kit de secuenciación "Taq DyeDeoxy Terminator Cycle Sequencing Kit" (Applied Biosystems, Inc., CA) con 7 \mul de ADN amplificado por PCR como molde y 3,2 picomoles de cebador. Los terminadores con colorante y los cebadores no incorporados fueron separados de los productos de extensión mediante purificación en una columna de centrifugación (Centri-Sep, Princeton Separations, Inc., NJ). La muestra fue secada en una centrífuga de vacío. Antes de la carga en el gel, la muestra fue resuspendida en 4 \mul de tampón de carga de muestra (formamida desionizada 5:1; EDTA 50 mM, pH 8,0) y desnaturalizada por calor durante 2 minutos a 90ºC. Los datos fueron recopilados y editados con los programas EDITSEQ, ALIGN y SEQMAN (DNASTAR, WI).
Ejemplo 7 Estimación de las Relaciones Genéticas entre los Clones
Los métodos para estimar relaciones genéticas entre los clones de S. pyogenes mediante electroforesis de enzimas multilocus fueron como los descritos por Musser y col., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 88:2668-72 (1991). Treinta y seis ETs no identificados previamente fueron numerados arbitrariamente como ET 34 - ET 53.
Ejemplo 8 Alelo de speB en la Cepa B220 (Elliott 5797)
El gen spe B ( spe B7) de la cepa MGAS 1719 no codifica una proteína con la secuencia de aminoácidos presentada previamente. Hay discrepancias entre la secuencia de la proteína de la cepa B220 y un alelo de speB (denominado en la presente speB1) en una cepa de serotipo M12 (86-858).
Ejemplo 9 Alelos de speB y Tipo de Enfermedad
La presente invención demuestra que clones estreptocócicos con el mismo alelo de speB, y la combinación alelo de speB - proteína M, están asociados con varias enfermedades diferentes. Por ejemplo, cepas de ET 1 - M1 - speB2 fueron cultivadas de pacientes con faringitis, escarlatina, celulitis y TSLS; y se recuperaron organismos ET 2 - M3 - speB3 de casos de faringitis, escarlatina y TSLS. De manera similar, cepas cultivadas procedentes de individuos con fiebre reumática aguda tenían seis alelos de speB distintos. Por tanto, no había una asociación preferencial aparente entre el alelo de speB y el tipo de enfermedad.
La identificación del alelo de speB en una cepa (MGAS 789) recuperada en los años 1940 y que expresaba la proteína M1, pero que se asignó al ET 36 en lugar de al ET 1 como las cepas M1 contemporáneas, sugiere esa variación de las asociaciones alelo de speB - genotipo del enzima multilocus - proteína M producida por un factor que contribuye a los cambios temporales de la frecuencia y la gravedad de la enfermedad estreptocócica.
Ejemplo 10 Variación de speB, Clase de Proteína M, Fenotipo del Factor de Opacidad y Arquitectura del Regulón vir
La presente invención no ha encontrado una evidencia convincente de diferenciación análoga de las variantes alélicas de speB. Las cepas asignadas a cada una de dos clases distintas sobre la base de la reactividad con un panel de anticuerpos monoclonales hacia la proteína M, no tenían diferencias consistentes en la secuencia y en varios casos se encontró un alelo de speB idéntico en cepas de dos clases de proteína M. Por ejemplo, el alelo speB3 estaba presente en las cepas de clase I (M3 y M12) y de clase II (M2) y, de manera similar, se identificó el alelo speB5 en cepas que expresaban M1 y M4 asignadas a la clase I y a la clase II, respectivamente (Tabla I). De manera similar, no había una simple relación congruente entre el alelo de speB y la arquitectura del regulón vir o el fenotipo del factor de opacidad. Las cepas M2, M3 y M12 tenían todas el alelo speB3, pero M3 y M12 son negativas para el factor de opacidad y M2 es positiva para el factor de opacidad. La falta de una correlación significativa entre la clase de serotipo M y la filogenia de speB podría estar causada también por acontecimientos de transferencia lateral relativamente frecuentes que implican a parte de, o a todos, los genes emm y speB.
Ejemplo 11 Corte de Proteínas de la Matriz Extracelular (ECM) Purificadas
La proteasa de cisteína estreptocócica degrada rápidamente la vitronectina (VN) purificada (Figura 5). Después de cinco minutos de incubación de la proteasa con VN, no pudieron identificarse productos de degradación ni por tinción con Azul de Coomassie ni por inmunotransferencia con anticuerpos policlonales anti-VN. De manera similar, la proteasa estreptocócica cortaba inmediatamente la fibronectina (FN), según se mostró por la rápida aparición de productos de menor peso molecular (Figura 5). Sin embargo, en contraste con la degradación de VN, el corte de FN tenía lugar aparentemente en un número limitado de sitios específicos (Figura 5 del manuscrito). La incubación de FN con la prote-
asa durante un tiempo de hasta 12 horas no tuvo como resultado la formación de productos de degradación adicionales.
No se observó un corte significativo de la laminina (LN) humana bajo las condiciones experimentales ensayadas (Figura 5), o cuando se utilizaron 10 \mug de proteasa y 2 \mug de sustrato LN.
Ejemplo 12 Inducción de Efecto Citopático y Corte de la Fibronectina en Cultivos de Células Endoteliales de la Vena Umbilical Humana (HUVEC)
Debido a que los pacientes con episodios invasivos de S. pyogenes tienen frecuentemente sepsis bacteriana con daño a las células endoteliales, se examinó la capacidad de la proteasa de cisteína estreptocócica para cortar directamente FN procedente de HUVECs crecidas en cultivo. El análisis de inmunotransferencia Western de las células en ausencia de proteasa, o de las células tratadas con proteasa llevada a ebullición durante un tiempo de hasta 8 horas, no mostró una degradación detectable de FN (Figura 6). En contraste, células incubadas con tan solo 6 \mug/ml de proteasa estreptocócica por pocillo durante 2 horas, conservaban solamente una pequeña fracción de FN nativa intacta. Por tanto, la proteasa estreptocócica corta FN de manera dependiente de la dosis y del tiempo en el complejo entorno de células que crecen en cultivo de tejidos.
Y lo que es más interesante, el tratamiento de HUVECs con la proteasa estreptocócica inducía rápidamente sorprendentes efectos citopáticos (Figura 6). Alrededor de 3 horas después de la adición de la proteasa, aparecían en la monocapa celular zonas despejadas. Este efecto estaba seguido por la pérdida de la adherencia celular a la matriz y la eliminación de la morfología de adoquín característica. El corte de FN fue detectable por análisis de inmunotransferencia antes de la aparición del efecto citopático. No se observaron bandas correspondientes a la VN humana nativa ni en el control solubilizado ni en HUVECs tratadas mediante análisis de inmunotransferencia Western, debido presumiblemente al bajo nivel de expresión, o a la falta de expresión, de VN por estas células.
Ejemplo 13 Producción de Proteasa de Cisteína por Cepas de S. pyogenes
Virtualmente todos los aislados clínicos de estreptococos del Grupo A producen SPEB/proteasa de cisteína, y los pacientes infectados con estreptococos del Grupo A desarrollan anticuerpos anti-proteinasa. Se utilizó el análisis de inmunotransferencia de sobrenadantes de cultivo para determinar la producción de SPEB/proteasa estreptocócica por cepas de S. pyogenes, y de un aislado de serotipo M11 que existe de forma natural (MGAS 2075) del que se había descrito que carecía de speB. Con la excepción de las tres cepas, los demás 64 aislados examinados producían todos proteasa de cisteína, un resultado consistente con la noción de que virtualmente todas las cepas de S. pyogenes expresan la molécula extracelularmente (Figura 7 y Tabla I). Las tres cepas tenían los alelos speB3, speB13 y speB16, pero otros aislados con estos mismos alelos producían la proteasa. Por tanto, los 39 alelos de speB pueden ser todos expresados por las cepas estreptocócicas del Grupo A bajo condiciones apropiadas. El sitio polimórfico de los 39 alelos dentro de la región no codificadora corriente arriba de 160 pb y la región codificadora de 1197 pb del gen speB se muestran en la Fig. 10.
Ejemplo 14 Anticuerpos Dirigidos Contra la Proteasa de Cisteína
La protección inmunoprofiláctica de la proteasa de cisteína se observa mediante la utilización de dos modelos. En primer lugar, se utiliza el modelo de inmunización intranasal según fue desarrollado por Bessen y Fischetti (1988) para evaluar el efecto de la inmunización con proteasa de cisteína sobre la colonización mucosal por S. pyogenes. En segundo lugar, se utiliza un modelo de infección cutánea en ratón (Bunce y col., 1992) frente a un desafío bacteriano subcutáneo. Brevemente, los animales son inyectados s.c. con proteasa en el flanco y observados diariamente, incluyendo medidas del peso. Se calculan los volúmenes de los abscesos y el área de dermonecrosis y se determinan curvas del tamaño de las lesiones.
Ejemplo 15 Creación de Proteínas de speB Mutantes
La Figura 8 muestra los lugares de procesamiento, las posiciones de las variaciones de aminoácidos encontradas en las proteínas producidas por los alelos speB2 y speB4, y los aminoácidos que son diana para la mutación. Se emplean esquemas de mutagénesis dirigida a un sitio y de mutagénesis aleatoria para identificar residuos que alteren la función de la proteasa de cisteína y el procesamiento del zimógeno, y para generar mapas de las regiones que constituyen los dominios antigénicos de la proteína. Las dianas para una sustitución de aminoácidos funcionales están basadas en el análisis bioquímico de la proteasa de cisteína (Tai y col., 1976) y por analogía con residuos similares de la proteasa de cisteína eucariótica.
Con el fin de crear un zimógeno estable para facilitar los estudios cristalográficos y generar una proteasa enzimáticamente deficiente o inactiva para los estudios de estructura-función, se produjeron y caracterizaron formas mutantes de la proteína proteasa de cisteína. Un esquema de mutagénesis dirigida crea cambios que: (i) alteran la actividad proteasa; (ii) impiden el procesamiento del zimógeno; (iii) impiden la unión al sustrato y (iv) alteran la inmunorreactividad. Los aminoácidos son cambiados por alanina estructuralmente neutra. Una proteína mutante que carece de actividad proteasa pero que conserva su antigenidad, es generada mediante mutagénesis del único residuo de cisteína (Cys-192 \rightarrow Ala-192) en el sitio catalítico de la molécula. Son también mutados His-340 y Gln-185 y Asn-356. Estos tres cambios son epistáticos respecto a la mutación de Cys-192, pero solos pueden presentar una actividad alterada. Trp-357, que se cree que está implicado en la unión al sustrato y está situado de forma similar en la papaína, es también convertido en diana. Se crea también un precursor estable del zimógeno mediante la mutación de los residuos que rodean el sitio de corte de la proteasa en Lys-145. Además, la mutagénesis de Cys-192 puede impedir la autoproteolisis, como ocurría con un mutante Cys \rightarrow Ser de la papaína, la proteasa de cisteína prototipo. Otras dianas para mutagénesis incluyen un supuesto dominio de unión a nucleótidos (GVGKVG) y una región potencial de ensamblaje del colágeno [(GXX)_{3}] en la porción carboxiterminal de la proteína. Se utiliza mutagénesis dirigida a un sitio, mediante el método de barrido para cambiar aminoácidos cargados por alanina, con el fin de sustituir aminoácidos cargados positivamente y negativamente (implicados a menudo en el reconocimiento y la actividad) por alanina. Se espera que muchos de los residuos cargados (14 residuos de lisina, 7 de arginina, 12 de aspartato y 76 de glutamato en el péptido maduro) estén en la superficie de la estructura de la proteasa de cisteína, y se espera que algunos definan epítopos en la molécula. En particular, se examinó una región de aminoácidos cargados, desde el 307 al 321 (8/15 cargados); esta región incluye el sitio de las sustituciones de aminoácidos de speB y speB4. Son mutados también residuos de las regiones antigénicas identificadas en los estudios de creación de mapas de los epítopos.
En primer lugar, el gen speB es amplificado por PCR a partir de una cepa de S. pyogenes ET1/M1, y el producto es clonado en un vector filámido de múltiples copias tal como pBluescript (Stratagene, La Jolla, CA). Este vector es elegido porque lleva el promotor de lac regulado y puede ser replicado como una molécula de hebra sencilla para mutagénesis dirigida a un sitio. El clonaje es diseñado para colocar el promotor, el sitio de unión de ribosomas y el marco de lectura de speB 3' respecto al promotor de lac inducible en el vector, de tal manera que la proteína puede ser sobreexpresada condicionalmente en E. coli cuando se añade el inductor de lac, IPTG. Está incluido el promotor de speB requerido para la expresión en S. pyogenes. Extractos de células completas y productos periplásmicos derivados de un shock de células de E. coli portadoras de este clon de speB primario, son examinados para detectar la presencia de la proteína proteasa de cisteína por SDS-PAGE y por transferencia Western con un anticuerpo anti-proteasa de cisteína. El plásmido resultante es la diana para la mutagénesis.
Se crean mutaciones dirigidas por oligonucleótidos, tales como sustituciones, deleciones y pequeñas inserciones, en moldes de hebra sencilla que contienen uracilo mediante el método de Kunkel (Kunkel, 1985). Cuando es posible, se diseñan cebadores mutagénicos para incorporar un único sitio de restricción en el gen speB para la generación de mapas y la selección de mutantes. Se crean sustituciones de alanina individuales y múltiples en los residuos indicados anteriormente. Una vez que se han identificado los residuos críticos para la función, pequeñas regiones que rodean los mismos son eliminadas o sustituidas mediante la utilización de los mismos métodos para caracterizar adicionalmente la región e impedir la reversión. Cuando están disponibles datos cristalográficos, se mutan aminoácidos adicionales.
Se emplea también un esquema de mutagénesis aleatoria. Las proteínas variantes creadas por este método son muy útiles para la selección de epítopos, aunque pueden recuperarse también moléculas con una cinética alterada y con un reconocimiento del sustrato alterado. Regiones de la secuencia de speB son aleatorizadas con oligonucleótidos mixtos en el protocolo de mutagénesis estimulada, o se crean deleciones en marco, cortas, dentro del gen con una modificación del protocolo de inserción/deleción de un adaptador con ADNasa I de Palzkill y Bostein (Palzkill y Bostein, 1991). En el mismo, "adaptadores de escisión" sintéticos son ligados primeramente al ADN diana linealizado aleatoriamente; posteriormente son escindidos con los nucleótidos flanqueantes para crear pequeñas sustituciones o deleciones. Por ejemplo, se utiliza un adaptador con dos copias de la secuencia de reconocimiento para el enzima SapI (GCTCTTC) para crear deleciones de seis bases (tres bases en cada extremo del adaptador) o deleciones de dos aminoácidos aleatorias, a través del gen speB, según se ilustra en la Figura 9. Las bases flanqueantes son también aleatorizadas rellenando los extremos de la secuencia diana después de la escisión del adaptador, insertando luego un segundo adaptador de extremos romos que incluye una secuencia aleatoria en lugar de los Ns. El segundo adaptador es eliminado posteriormente por digestión con SapI y la secuencia diana es ligada para crear sustituciones.
Con el fin de identificar las mutaciones negativas en la proteasa, células E. coli productoras de proteínas mutantes potenciales son primeramente sometidas a selección por la actividad proteasa en placas de agar caseína. Como se espera la secreción de la proteasa de cisteína al periplasma, es posible que la actividad proteasa pueda ser observada en las placas. Si esta estrategia de selección tiene éxito, posteriormente miles de colonias son examinadas rápidamente para detectar mutaciones funcionales de la proteasa de cisteína. Si la proteasa de cisteína debe ser secretada completamente por E. coli para presentar actividad, productos resultantes del choque osmótico de cada supuesta cepa mutante son analizados posteriormente para determinar la actividad proteolítica.
Ejemplo 16 Inmunización de Ratones - Intranasal
Los experimentos de inmunización intranasal se llevan a cabo esencialmente según está descrito por Bessen y Fischetti (1988). Brevemente, se utilizan ratones Swiss CD1 no consanguíneos del mismo género, de 4 a 5 semanas de edad al comienzo de la inmunización. Grupos de 24 ratones son inmunizados intranasalmente (i.n.) con 0 o de 20 a 100 \mug de zimógeno, proteasa activa madura o péptido sintético. Los ratones son inmunizados una vez los días 1, 3 y 5, se dejan descansar durante 3 semanas y se les inyecta un refuerzo i.n. de una única dosis de antígeno (20 ó 40 g). El grupo inicial de 20 ratones inmunizados es distribuido aleatoriamente en dos subgrupos de 10 animales. Cada subgrupo es desafiado con la cepa fuente de la proteasa de cisteína (desafío homólogo) o con una cepa que exprese una variante distinta de la proteasa de cisteína (desafío heterólogo). Se administran a los animales 10 \mul de la suspensión bacteriana por narina 10 días después del refuerzo con la proteasa de cisteína. La vacuna es administrada i.n. a los ratones no anestesiados (10 \mul por narina) mediante una jeringa Hamilton modelo 750 equipada con un dispensador de repetición y una aguja de punta roma. Se realizan frotis de la garganta comenzando 24 horas después del desafío y posteriormente a intervalos de 24 y 48 horas hasta el día 11. Se toman muestras adicionales de la garganta para cultivo el día 15. Los frotis de la garganta son cultivados en placas de agar sangre durante una noche a 37ºC en un incubador de CO_{2} y las colonias betahemolíticas son contadas al día siguiente.
Ejemplo 17 Desafío Bacteriano (Intranasal)
El grupo inicial de 24 ratones inmunizados es dividido aleatoriamente en dos subgrupos de 12 animales. Cada subgrupo es desafiado posteriormente con la cepa fuente de la SPEB (desafío homólogo) o con una cepa que exprese una variante distinta de la SPEB (desafío heterólogo). Las cepas utilizadas para el desafío son seleccionadas por su resistencia a 200 \mug/ml de estreptomicina con el fin de facilitar la recuperación después del desafío y, si es necesario, son pasadas de manera seriada mediante inyecciones i.p. repetidas a ratones para incrementar su capacidad para colonizar e infectar ratones. Se prepara una única solución madre de cada organismo de desafío que expresa SPEB a partir del cultivo de una noche, se concentra 10 veces y se almacena a -80ºC. Las soluciones madre son diluidas 1:500 y cultivadas durante una noche a 37ºC en caldo BHI, diluidas 1:20 en medio de crecimiento nuevo y cultivadas hasta una D.O._{650} de 0,5. Las células son recogidas por centrifugación y suspendidas en solución salina a 2,5 x 10^{5} UFC/ml aproximadamente. En vista de que las cepas de estreptococos difieren en su capacidad para colonizar ratones intranasalmente, se utiliza una dosis de desafío que coloniza de manera reproducible más del 25% de una población de ratones no inmunes. Los animales son alojados seis por jaula por cohorte. Los ratones reciben 10 \mul de la suspensión bacteriana por narina 10 días después del refuerzo con la proteasa de cisteína. Se toman frotis de la garganta comenzando 24 horas después del desafío y posteriormente a intervalos de 24 a 48 horas hasta el día 11. El día 15 se toman muestras de la garganta para cultivos adicionales. Los frotis de la garganta son cultivados en placas de agar sangre con 200 \mug/ml de estreptomicina, cultivados durante una noche a 37ºC en un incubador de CO_{2} y las colonias betahemolíticas son contadas al día siguiente.
Ejemplo 18 Inmunización de Ratones - Subcutánea
Se llevan a cabo experimentos de inmunización en ratones sin pelo, inmunocompetentes, no consanguíneos de 4 a 5 semanas de edad (cepa Cr1:SKH1 (hrhr)Br; Clarles River) del mismo género. Estos ratones son utilizados porque el tamaño y el carácter de las lesiones son fácilmente valorados y los animales no necesitan ser afeitados. Grupos de 24 ratones son inmunizados subcutáneamente (s.c.) con 0, 20 ó 40 \mug de zimógeno o de proteasa activa madura. Los ratones son inmunizados una vez los días 1, 7, 14 y 21, se dejan descansar durante 3 semanas y se refuerzan con una única dosis de proteasa (20 ó 50 \mug). Los animales son analizados para determinar la seroconversión mediante un ELISA específico de la proteasa de cisteína.
Ejemplo 19 Desafío Bacteriano - Subcutáneo
Los ratones inmunizados son divididos aleatoriamente en dos grupos de 12 animales. Cada grupo es desafiado posteriormente con la cepa origen de la proteasa de cisteína (desafío homólogo) o con una cepa que exprese una variante distinta de la proteasa de cisteína (desafío heterólogo). Se prepara una única solución madre de cada organismo de desafío que expresa la proteasa de cisteína a partir de un cultivo de una noche y se ajusta a 10^{6} UFC/ml. Se administran a los ratones (alojados seis por jaula por cohorte) 100 \mul de la suspensión bacteriana mezclada con un volumen igual de esferas de dextrano estériles. Los animales son inoculados s.c. en el flanco derecho con una jeringa de tuberculina. Las diluciones bacterianas son preparadas en el momento del desafío con el fin de determinar el número exacto de UFC utilizado. Los animales control negativo consisten en un grupo de 12 ratones inmunizados de manera ficticia. Estos ratones son "desafiados" solamente con medio estéril más las esferas de dextrano.
Ejemplo 20 Ensayos Inmunológicos
Se recoge saliva y suero de todos los ratones inmunizados y control. La saliva completa es recogida mediante estimulación con pilocarpina (920 \mug/ratón, subcutánea) y centrifugada a 15.000 x g durante 20 minutos. El material es dividido y se añaden inhibidores de proteasa a una de las alícuotas. El almacenamiento es a -80ºC. El suero es recogido mediante extracción de sangre de la vena de la cola. Saliva y suero individuales y agrupados procedentes de los ratones asignados a cada cohorte, y de los ratones control, son analizados para determinar anticuerpos específicos hacia la proteasa de cisteína mediante ELISA.
Ejemplo 21 Análisis de los Datos
Los animales son pesados inmediatamente antes del desafío y cada 24 horas después del desafío. Se calcularán los volúmenes de los abscesos y el área de dermonecrosis, y se determinará una curva del tamaño de las lesiones. Los tamaños medios de las lesiones son comparados estadísticamente entre los grupos mediante un análisis de varianza (ANOVA).
Ejemplo 22 Inmunización Activa de los Ratones
Ratones macho no consanguíneos Swiss CD1 fueron inoculados con PBS (n= 10) o con 20 \mug de proteasa de cisteína estreptocócica purificada en PBS (n=9) subcutáneamente el día 1, seguido por inoculaciones intraperitoneales de los mismos tratamientos los días 7, 14, 21, 42, 50, 57, 63 y 79, en un total de nueve inmunizaciones. Se analizaron los niveles séricos de anticuerpos hacia la proteasa de cisteína mediante ELISA los días 29, 71 y 84, y los ratones fueron desafiados con la cepa MGAS 315 el día 93, dos semanas después de la última inmunización. Los ratones fueron monitarizados a intervalos de 3 horas, se registró la mortalidad y se representaron gráficamente curvas de supervivencia de Kaplan-Meier y se analizaron según se describió anteriormente. Los resultados (Fig. 11) muestran que la inmunización intraperitoneal con proteasa de cisteína estreptocócica purificada confería también una protección significativa (análisis de rangos logarítmicos; X^{2}; P < 0,01) frente al desafío letal con el aislado MGAS 315 altamente virulento de S. pyogenes. Es de resaltar que la inmunización con la proteasa de cisteína confería también una protección significativa frente a la mortalidad temprana inducida por S. pyogenes en los ratones. Por ejemplo, los 10 ratones del grupo control habían muerto todos 28 horas después del desafío, pero murieron solamente 4 de 9 ratones en el grupo inmunizado con la proteasa (diferencia de proporciones; z; P < 0,003). Además, a la finalización del experimento a las 120 horas, sobrevivieron 2 de 9 ratones en el grupo tratado con la proteasa pero no sobrevivió ninguno de los 10 ratones del grupo control (diferencia de proporciones; z; P < 0,059). Por tanto, la inmunización activa con la proteasa de cisteína estreptocócica confería una protección significativa frente a la infección letal por estreptococos del Grupo A.
Todas las patentes y publicaciones mencionadas en esta especificación son indicativas de los niveles de aquellas personas expertas en la técnica a la que pertenece la invención.
Una persona experta en la técnica apreciará fácilmente que la presente invención está bien adaptada para llevar a cabo los objetos y obtener las finalidades y ventajas mencionadas, además de las inherentes a la misma. Los presentes ejemplos, junto con los métodos, procedimientos, tratamientos, moléculas y compuestos específicos descritos en la presente son actualmente representativos de las realizaciones preferidas, son ejemplares y no están concebidos como limitaciones del ámbito de la invención. A los expertos en la técnica se les ocurrirán cambios de la presente y otras utilizaciones que están incluidas dentro del espíritu de la invención según está definida por el ámbito de las reivindicaciones.
(1) INFORMACIÓN GENERAL:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
SOLICITANTE: Musser, M.D., James M.
\hskip3.9cm
Kapur, M.D., Vivek
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TÍTULO DE LA INVENCIÓN: Métodos y Composiciones para la Identificar Streptococcus
\vskip0.800000\baselineskip
(iii)
NÚMERO DE SECUENCIAS: 58
\vskip0.800000\baselineskip
(iv)
DIRECCIÓN PARA CORRESPONDENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
DESTINATARIO: LAW OFFICES OF BARBARA RAE-VENTER
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CALLE: P.O. Box 60039
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
CIUDAD: Palo Alto
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
ESTADO: CA
\vskip0.500000\baselineskip
(E)
PAÍS: EE.UU.
\vskip0.500000\baselineskip
(F)
ZIP: 94306
\vskip0.800000\baselineskip
(v)
FORMA LEGIBLE POR ORDENADOR:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
TIPO DE MEDIO: Disco magnético flexible
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
ORDENADOR: IBM PC compatible
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
SISTEMA OPERATIVO: PC-DOS/MS-DOS
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
PROGRAMA: PatentIn Release #1.0, Versión #1.30
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
DATOS DE LA SOLICUTUD ACTUAL:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
NÚMERO DE SOLICITUD: (A Ser Asignado)
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
FECHA DE REGISTRO: 14-SEP-1995
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
CLASIFICACIÓN:
\vskip0.800000\baselineskip
(vii)
DATOS DE LA SOLICITUD ANTERIOR:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
NÚMERO DE SOLICITUD: US 08/306.542
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
FECHA DE REGISTRO: 14-SEP-1994
\vskip0.800000\baselineskip
(viii)
INFORMACIÓN SOBRE EL REPRESENTANTE/AGENTE:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
NOMBRE: Rae-Venter Ph. D., Barbara
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
NÚMERO DE REGISTRO: 32.750
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
NÚMERO DE REFERENCIA/EXPEDIENTE: BAYL-004/03WO
\vskip0.800000\baselineskip
(ix)
INFORMACIÓN PARA TELECOMUNICACIÓN:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
TELÉFONO: (415) 926-6205
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TELEFAX: (415) 424-8760
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID Nº:1:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 16 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: péptido
\vskip0.800000\baselineskip
(iii)
HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
(iv)
ANTISENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
(v)
TIPO DE FRAGMENTO: interno
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: Streptococcus pyogenes
\vskip0.800000\baselineskip
(viii)
POSICIÓN EN EL GENOMA:
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
POSICIÓN EN EL MAPA: 171
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº:1:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Pro Val Ile Glu Lys Val Lys Pro Gly Glu Gln Ser Phe Val Gly}
\sac{Gln}
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID Nº:2:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 16 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: péptido
\vskip0.800000\baselineskip
(iii)
HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
(iv)
ANTISENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
(v)
TIPO DE FRAGMENTO: interno
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: Streptococcus pyogenes
\vskip0.800000\baselineskip
(viii)
POSICIÓN EN EL GENOMA:
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
POSICIÓN EN EL MAPA: 203
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº:2:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Tyr His Asn Tyr Pro Asn Lys Gly Leu Lys Asp Tyr Thr Tyr Thr}
\sac{Leu}
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID Nº:3:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 15 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: péptido
\vskip0.800000\baselineskip
(iii)
HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
(iv)
ANTISENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
(v)
TIPO DE FRAGMENTO: interno
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: Streptococcus pyogenes
\vskip0.800000\baselineskip
(viii)
POSICIÓN EN EL GENOMA:
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
POSICIÓN EN EL MAPA: 247
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº:3:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Pro Thr Tyr Ser Gly Arg Glu Ser Asn Val Gln Lys Met Ala Ile}
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID Nº:4:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 11 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: péptido
\vskip0.800000\baselineskip
(iii)
HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
(iv)
ANTISENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
(v)
TIPO DE FRAGMENTO: interno
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: Streptococcus pyogenes
\vskip0.800000\baselineskip
(viii)
POSICIÓN EN EL GENOMA:
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
POSICIÓN EN EL MAPA: 344
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº:4:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Ile Asp Gly Ala Asp Gly Arg Asn Phe Tyr His}
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID Nº:5:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 398 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.800000\baselineskip
(iii)
HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
(iv)
ANTISENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
(v)
TIPO DE FRAGMENTO: N-terminal
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: Streptococcus pyogenes
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CEPA: MGAS 1719
\vskip0.800000\baselineskip
(vii)
FUENTE INMEDIATA:
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CLON: SPEB7 (proteasa de cisteína)
\vskip0.800000\baselineskip
(x)
INFORMACIÓN SOBRE LA PUBLICACIÓN:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
AUTORES: Kapur, V.
\hskip4.65cm
Topouzis, S.
\hskip4.65cm
Majesky, M.W.
\hskip4.65cm
Li, L.-L.
\hskip4.65cm
Hamrick, M.R.
\hskip4.65cm
Hamill, R.J.
\hskip4.65cm
Patti, J.M.
\hskip4.65cm
Musser, J.M.
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TÍTULO: Una proteasa de cisteína extracelular conservada de Streptococcus pyogenes corta la fibronectina humana y degrada la vitronectina
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
REVISTA: Microb. Pathog.
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
VOLUMEN: 15
\vskip0.500000\baselineskip
(E)
PÁGINAS: 327-346
\vskip0.500000\baselineskip
(G)
FECHA: 1993
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº:5:
\vskip1.000000\baselineskip
7
8
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID Nº:6:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 6 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: péptido
\vskip0.800000\baselineskip
(iii)
HIPOTÉTICA: SI
\vskip0.800000\baselineskip
(iv)
ANTISENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
(v)
TIPO DE FRAGMENTO: interno
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: Streptococcus pyogenes
\vskip0.800000\baselineskip
(vii)
FUENTE INMEDIATA:
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CLON: dominio de unión a nucleótidos de la proteasa de cisteína
\newpage
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº:6:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Gly Val Gly Lys Val Gly}
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID Nº:7:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 1197 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADNc
\vskip0.800000\baselineskip
(iii)
HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
(iv)
ANTISENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: Streptococcus pyogenes
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CEPA: MGAS 1719
\vskip0.800000\baselineskip
(vii)
FUENTE INMEDIATA:
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CLON: speB7 (proteasa de cisteína)
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº:7:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
9
10
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID Nº:8:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 11 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: péptido
\vskip0.800000\baselineskip
(iii)
HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
(iv)
ANTISENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
(v)
TIPO DE FRAGMENTO: interno
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: Streptococcus pyogenes
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CEPA: MGAS 1719
\vskip0.800000\baselineskip
(vii)
FUENTE INMEDIATA:
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CLON: proteasa de cisteína
\vskip0.800000\baselineskip
(viii)
POSICIÓN EN EL GENOMA:
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
POSICIÓN EN EL MAPA: 146-156
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº:8:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Gln Pro Val Val Lys Ser Leu Leu Asp Ser Lys}
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID Nº:9:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 22 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: otro ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
DESCRIPCIÓN: /desc = "Oligonucleótido"
\vskip0.800000\baselineskip
(iii)
HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
(iv)
ANTISENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: Streptococcus pyogenes
\vskip0.800000\baselineskip
(vii)
FUENTE INMEDIATA:
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CLON: SPEB-X
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº:9:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
GTTGTCAGTG TCAACTAACC GT
\hfill
22
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID Nº:10:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 22 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: otro ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
DESCRIPCIÓN: /desc = "Oligonucleótido"
\vskip0.800000\baselineskip
(iii)
HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
(iv)
ANTISENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: Streptococcus pyogenes
\vskip0.800000\baselineskip
(vii)
FUENTE INMEDIATA:
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CLON: SPEB-2
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº:10:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
ATCTGTGTCT GATGGATAGC TT
\hfill
22
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID Nº:11:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 23 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: otro ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
DESCRIPCIÓN: /desc = "Oligonucleótido"
\vskip0.800000\baselineskip
(iii)
HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
(iv)
ANTISENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: Streptococcus pyogenes
\vskip0.800000\baselineskip
(vii)
FUENTE INMEDIATA:
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CLON: SPEB-1
\newpage
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº:11:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
CTTTCTGGCT CTAATATGTA TGT
\hfill
23
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID Nº:12:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 20 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: otro ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
DESCRIPCIÓN: /desc = "Oligonucleótido"
\vskip0.800000\baselineskip
(iii)
HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
(iv)
ANTISENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: Streptococcus pyogenes
\vskip0.800000\baselineskip
(vii)
FUENTE INMEDIATA:
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CLON: SPEB-3
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº:12:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
GTTATTGAAA AAGTAAAACC
\hfill
20
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID Nº:13:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 20 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: otro ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
DESCRIPCIÓN: /desc = "Oligonucleótido"
\vskip0.800000\baselineskip
(iii)
HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
(iv)
ANTISENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: Streptococcus pyogenes
\vskip0.800000\baselineskip
(vii)
FUENTE INMEDIATA:
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CLON: SPEB-4
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº:13:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
TTTTCAATAA CAGGTGTCAA
\hfill
20
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID Nº:14:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 20 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: otro ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
DESCRIPCIÓN: /desc = "Oligonucleótido"
\vskip0.800000\baselineskip
(iii)
HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
(iv)
ANTISENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: Streptococcus pyogenes
\vskip0.800000\baselineskip
(vii)
FUENTE INMEDIATA:
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CLON: SPEB-Y
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº:14:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
TCTCCTGAAA CGATAACAAA
\hfill
20
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID Nº:15:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 20 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: péptido
\vskip0.800000\baselineskip
(iii)
HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
(iv)
ANTISENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
(v)
TIPO DE FRAGMENTO: interno
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: Streptococcus pyogenes
\vskip0.800000\baselineskip
(vii)
FUENTE INMEDIATA:
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CLON: Péptido 1
\vskip0.800000\baselineskip
(viii)
POSICIÓN EN EL GENOMA:
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
POSICIÓN EN EL MAPA: 303
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº:15:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{His Gln Ile Asn Arg Ser Asp Phe Ser Lys Gln Asp Trp Glu Ala}
\sac{Gln Ile Asp Lys Glu}
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID Nº:16:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 19 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: péptido
\vskip0.800000\baselineskip
(iii)
HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
(iv)
ANTISENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
(v)
TIPO DE FRAGMENTO: interno
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: Streptococcus pyogenes
\vskip0.800000\baselineskip
(vii)
FUENTE INMEDIATA:
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CLON: Péptido 2
\vskip0.800000\baselineskip
(viii)
POSICIÓN EN EL GENOMA:
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
POSICIÓN EN EL MAPA: 304
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº:16:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{His Gln Ile Asn Gly Asp Phe Ser Lys Gln Asp Trp Glu Ala Gln}
\sac{Ile Asp Lys Glu}
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID Nº:17:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 19 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: péptido
\vskip0.800000\baselineskip
(iii)
HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
(iv)
ANTISENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
(v)
TIPO DE FRAGMENTO: interno
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: Streptococcus pyogenes
\vskip0.800000\baselineskip
(vii)
FUENTE INMEDIATA:
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CLON: Péptido 3
\vskip0.800000\baselineskip
(viii)
POSICIÓN EN EL GENOMA:
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
POSICIÓN EN EL MAPA: 304
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº:17:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{His Gln Ile Asn Ser Asp Phe Ser Lys Gln Asp Trp Glu Ala Gln}
\sac{Ile Asp Lys Glu}
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID Nº:18:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 10 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: péptido
\vskip0.800000\baselineskip
(iii)
HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
(iv)
ANTISENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
(v)
TIPO DE FRAGMENTO: interno
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: Streptococcus pyogenes
\vskip0.800000\baselineskip
(viii)
POSICIÓN EN EL GENOMA:
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
POSICIÓN EN EL MAPA: 304
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº:18:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Gln Ile Asn Arg Ser Asp Phe Ser Lys Gln}
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID Nº:19:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 10 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: péptido
\vskip0.800000\baselineskip
(iii)
HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
(iv)
ANTISENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
(v)
TIPO DE FRAGMENTO: interno
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: Streptococcus pyogenes
\vskip0.800000\baselineskip
(viii)
POSICIÓN EN EL GENOMA:
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
POSICIÓN EN EL MAPA: 304
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº:19:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Gln Ile Asn Arg Gly Asp Phe Ser Lys Gln}
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID Nº:20:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 45 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADNc
\vskip0.800000\baselineskip
(iii)
HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
(iv)
ANTISENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: Streptococcus pyogenes
\vskip0.800000\baselineskip
(vii)
FUENTE INMEDIATA:
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CLON: speB1
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº:20:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
ACAGCAAAGT GCCCCCGCCC CTCCCCAATA CGACTACTAC CAGGA
\hfill
45
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID Nº:21:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 45 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
(iii)
HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
(iv)
ANTISENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: Streptococcus pyogenes
\vskip0.800000\baselineskip
(vii)
FUENTE INMEDIATA:
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CLON: speB2
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº:21:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
ACAGCAAGGT GCCCCCGCCT CTCTCCAACG CGACTACTAC CAGGA
\hfill
45
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID Nº:22:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 45 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
(iii)
HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
(iv)
ANTISENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: Streptococcus pyogenes
\vskip0.800000\baselineskip
(vii)
FUENTE INMEDIATA:
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CLON: speB3
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº:22:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
ACAGCAAAGT GCCCCCGCCT CTCCCCAACA CGACTACTAC CAGGA
\hfill
45
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID Nº:23:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 45 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
(iii)
HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
(iv)
ANTISENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: Streptococcus pyogenes
\vskip0.800000\baselineskip
(vii)
FUENTE INMEDIATA:
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CLON: speB4
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº:23:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
ACAGCAAAGT GCTCCCGCCT CTCCCCAACA CTACTACTAC CAGGA
\hfill
45
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID Nº:24:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 45 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
(iii)
HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
(iv)
ANTISENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: Streptococcus pyogenes
\vskip0.800000\baselineskip
(vii)
FUENTE INMEDIATA:
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CLON: speB5
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº:24:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
ACAGCAAAGT GCCCCCGCCT CTCCCCAATA CGACTACTAC CAGGA
\hfill
45
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID Nº:25:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 45 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
(iii)
HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
(iv)
ANTISENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: Streptococcus pyogenes
\vskip0.800000\baselineskip
(vii)
FUENTE INMEDIATA:
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CLON: speB6
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº:25:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
ACAGCAAAGT GCCCCCGCCC CTCCCTAACA CGACTACTAC CAGGA
\hfill
45
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID Nº:26:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 45 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
(iii)
HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
(iv)
ANTISENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: Streptococcus pyogenes
\vskip0.800000\baselineskip
(vii)
FUENTE INMEDIATA:
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CLON: speB7
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº:26:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
ACAGCAAAGT GCTCCCGCCC CTCTCCAACG CGACTACTAT CAGGA
\hfill
45
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID Nº:27:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 45 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
(iii)
HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
(iv)
ANTISENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: Streptococcus pyogenes
\vskip0.800000\baselineskip
(vii)
FUENTE INMEDIATA:
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CLON: speB8
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº:27:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
ACAGCAAAGT GCTCCCGCCT CTCCCCAACA CGACTACTAC CAGGA
\hfill
45
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID Nº:28:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 45 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
(iii)
HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
(iv)
ANTISENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: Streptococcus pyogenes
\vskip0.800000\baselineskip
(vii)
FUENTE INMEDIATA:
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CLON: speB9
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº:28:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
ACGGCAAAGT GCCCCCGCCT CTCCCCAACA CGACTACTAC CAGGA
\hfill
45
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID Nº:29:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 45 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
(iii)
HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
(iv)
ANTISENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: Streptococcus pyogenes
\vskip0.800000\baselineskip
(vii)
FUENTE INMEDIATA:
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CLON: speB10
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº:29:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
ACAGCAAAGC GCCCCCGCCT CTCCCCAACA CGACCACTAC CAGGA
\hfill
45
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID Nº:30:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 45 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
(iii)
HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
(iv)
ANTISENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: Streptococcus pyogenes
\vskip0.800000\baselineskip
(vii)
FUENTE INMEDIATA:
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CLON: speB11
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº:30:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
ACGGTAAAGT GCCCTCGCCC CTCCCCAACA TTACTACTAC CAGGA
\hfill
45
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID Nº:31:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 45 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
(iii)
HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
(iv)
ANTISENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: Streptococcus pyogenes
\vskip0.800000\baselineskip
(vii)
FUENTE INMEDIATA:
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CLON: speB12
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº:31:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
ACAACAAAGT GCCCCCACCC CTCCCCAATA CGACTACTAC CAGGA
\hfill
45
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID Nº:32:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 45 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
(iii)
HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
(iv)
ANTISENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: Streptococcus pyogenes
\vskip0.800000\baselineskip
(vii)
FUENTE INMEDIATA:
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CLON: speB13
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº:32:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
ACAGCAAAGT GCCCCCGCCT CGCCCCAACA CGACTACTAC CAGGA
\hfill
45
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID Nº:33:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 45 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
(iii)
HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
(iv)
ANTISENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: Streptococcus pyogenes
\vskip0.800000\baselineskip
(vii)
FUENTE INMEDIATA:
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CLON: speB14
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº:33:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
ACAGCAAAGT GCCCCCGCCC CTCCCCAACA CGACTACTAC CAGGA
\hfill
45
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID Nº:34:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 45 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
(iii)
HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
(iv)
ANTISENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: Streptococcus pyogenes
\vskip0.800000\baselineskip
(vii)
FUENTE INMEDIATA:
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CLON: speB15
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº:34:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
ACAGCAAAGT GCCCCCGCCT CTCCCCAACG CGACTACTCC CAGGA
\hfill
45
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID Nº:35:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 45 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
(iii)
HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
(iv)
ANTISENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: Streptococcus pyogenes
\vskip0.800000\baselineskip
(vii)
FUENTE INMEDIATA:
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CLON: speB16
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº:35:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
ACAGCAAAGT GCCCCCGCCT CGCCCCAACA CGACTACTAC CAGGA
\hfill
45
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID Nº:36:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 45 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
(iii)
HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
(iv)
ANTISENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: Streptococcus pyogenes
\vskip0.800000\baselineskip
(vii)
FUENTE INMEDIATA:
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CLON: speB17
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº:36:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
ACAGCAAAGT GCCCCCGCCC CTCCCCAACA CTACTACTAC CAGGA
\hfill
45
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID Nº:37:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 45 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
(iii)
HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
(iv)
ANTISENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: Streptococcus pyogenes
\vskip0.800000\baselineskip
(vii)
FUENTE INMEDIATA:
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CLON: speB18
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº:37:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
ACGGTAAAGT GCCCTCGCCT CTCCCCCACA TTACTACTAC CAGGA
\hfill
45
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID Nº:38:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 45 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
(iii)
HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
(iv)
ANTISENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: Streptococcus pyogenes
\vskip0.800000\baselineskip
(vii)
FUENTE INMEDIATA:
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CLON: speB19
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº:38:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
ACAGCAAAGT GTTCCCGCCC TTCCCCAACA TGACTACTAC TAGGA
\hfill
45
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID Nº:39:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 45 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
(iii)
HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
(iv)
ANTISENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: Streptococcus pyogenes
\vskip0.800000\baselineskip
(vii)
FUENTE INMEDIATA:
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CLON: speB20
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº:39:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
ACAGCAAAGT GCTCCCGCCC TTCTCCAACA CGACCACTAC CAGGC
\hfill
45
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID Nº:40:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 45 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
(iii)
HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
(iv)
ANTISENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: Streptococcus pyogenes
\vskip0.800000\baselineskip
(vii)
FUENTE INMEDIATA:
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CLON: speB21
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº:40:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
ACAGCAAAGT GCCCCCGTCC CTCCCCAACA CTACTACTAC CAGGA
\hfill
45
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID Nº:41:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 45 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
(iii)
HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
(iv)
ANTISENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: Streptococcus pyogenes
\vskip0.800000\baselineskip
(vii)
FUENTE INMEDIATA:
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CLON: speB22
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº:41:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
ACAGCAAAGT GCCCCCGCCC CTCCCCAACG CGACTACTAC CAGGA
\hfill
45
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID Nº:42:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 45 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
(iii)
HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
(iv)
ANTISENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: Streptococcus pyogenes
\vskip0.800000\baselineskip
(vii)
FUENTE INMEDIATA:
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CLON: speB23
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº:42:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
ACGGCAAAGT GCCCCTGCCT CTCCCCAACA CGGCTACTAC CAGGA
\hfill
45
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID Nº:43:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 45 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
(iii)
HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
(iv)
ANTISENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: Streptococcus pyogenes
\vskip0.800000\baselineskip
(vii)
FUENTE INMEDIATA:
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CLON: speB24
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº:43:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
ATAGCAAAGT GCTCCCGCCC TTCTCCAACG CGACTACTAC CAGGA
\hfill
45
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID Nº:44:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 45 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
(iii)
HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
(iv)
ANTISENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: Streptococcus pyogenes
\vskip0.800000\baselineskip
(vii)
FUENTE INMEDIATA:
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CLON: speB25
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº:44:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
GCAGCAAAGT ACTCCCGCCC CTCCCCAACA TTACTACCAC CAGGA
\hfill
45
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID Nº:45:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 45 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
(iii)
HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
(iv)
ANTISENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: Streptococcus pyogenes
\vskip0.800000\baselineskip
(vii)
FUENTE INMEDIATA:
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CLON: speB26
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº:45:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
ACAGCAAAGT GCCCCCGCCT CGCCCCAACA CGACTATTAC CGGGA
\hfill
45
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID Nº:46:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 45 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
(iii)
HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
(iv)
ANTISENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: Streptococcus pyogenes
\vskip0.800000\baselineskip
(vii)
FUENTE INMEDIATA:
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CLON: speB27
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº:46:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
ACAGCAAAGT GCCCCCGCCC CTCCTCAATA CGACTACTAC CAGGA
\hfill
45
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID Nº:47:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 45 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
(iii)
HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
(iv)
ANTISENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: Streptococcus pyogenes
\vskip0.800000\baselineskip
(vii)
FUENTE INMEDIATA:
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CLON: speB28
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº:47:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
ACAGCGAAGT GCCCCCGCCT CTCCCCAACA CGACTACTAC CAGGA
\hfill
45
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID Nº:48:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 44 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
(iii)
HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
(iv)
ANTISENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: Streptococcus pyogenes
\vskip0.800000\baselineskip
(vii)
FUENTE INMEDIATA:
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CLON: speB29
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº:48:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
ACAGCAAGTG CCCCCGCCTT TCCCCAACAT GACTACTACC AGGA
\hfill
44
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID Nº:49:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 45 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
(iii)
HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
(iv)
ANTISENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: Streptococcus pyogenes
\vskip0.800000\baselineskip
(vii)
FUENTE INMEDIATA:
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CLON: speB30
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº:49:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
ACAGCAAAGT GCTCCCGCCC CTCTCCAACA CGACTACTAC CAGGA
\hfill
45
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID Nº:50:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 45 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
(iii)
HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
(iv)
ANTISENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: Streptococcus pyogenes
\vskip0.800000\baselineskip
(vii)
FUENTE INMEDIATA:
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CLON: speB31
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº:50:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
ACGGCAAAGT GCCCTCGCCT CTCCCCAACA TGACTACTAC CAGGA
\hfill
45
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID Nº:51:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 45 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
(iii)
HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
(iv)
ANTISENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: Streptococcus pyogenes
\vskip0.800000\baselineskip
(vii)
FUENTE INMEDIATA:
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CLON: speB32
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº:51:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
ACAGCAAAGT GCCCCCGCCT TTCCCCAACA TTACTACTAC CAGGA
\hfill
45
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID Nº:52:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 45 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
(iii)
HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
(iv)
ANTISENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: Streptococcus pyogenes
\vskip0.800000\baselineskip
(vii)
FUENTE INMEDIATA:
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CLON: speB33
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº:52:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
ACAGCAAAGT GCCCCCGCCT CTCTCCAACG CGACTACTAC CAGGA
\hfill
45
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID Nº:53:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 45 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
(iii)
HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
(iv)
ANTISENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: Streptococcus pyogenes
\vskip0.800000\baselineskip
(vii)
FUENTE INMEDIATA:
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CLON: speB34
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº:53:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
ACAGCAAAGT GCCCCCGCCT TTCCCCAACG CGACTACTCC CAAGA
\hfill
45
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID Nº:54:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 45 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
(iii)
HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
(iv)
ANTISENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: Streptococcus pyogenes
\vskip0.800000\baselineskip
(vii)
FUENTE INMEDIATA:
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CLON: speB35
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº:54:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
ACAGCAAAGT GCCCCCGCCC CTCCCCAGTA CGATTACTAT CAGGA
\hfill
45
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID Nº:55:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 45 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
(iii)
HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
(iv)
ANTISENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: Streptococcus pyogenes
\vskip0.800000\baselineskip
(vii)
FUENTE INMEDIATA:
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CLON: speB36
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº:55:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
ACAGCAAAGT GCCCCCGCCT CTTTCCAACG CGACTACTAC CAGGA
\hfill
45
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID Nº:56:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 45 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
(iii)
HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
(iv)
ANTISENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: Streptococcus pyogenes
\vskip0.800000\baselineskip
(vii)
FUENTE INMEDIATA:
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CLON: speB37
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº:56:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
ACAGCAAAGT GCTCCCGCTC CTCTCCAACA CGACTACTAC CAGGA
\hfill
45
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID Nº:57:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 45 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
(iii)
HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
(iv)
ANTISENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: Streptococcus pyogenes
\vskip0.800000\baselineskip
(vii)
FUENTE INMEDIATA:
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CLON: speB38
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº:57:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
ACAGCAAAGT GCCTCCGCCT CTCTCCAACG CGACTACTAC CAGGA
\hfill
45
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID Nº:58:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 45 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
(iii)
HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
(iv)
ANTISENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: Streptococcus pyogenes
\vskip0.800000\baselineskip
(vii)
FUENTE INMEDIATA:
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CLON: speB39
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº:58:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
ACAGCAAAAT GCCCCCGCCC CTCTCCAACA CGACTACTAC CAGGA
\hfill
45

Claims (16)

1. Una vacuna que comprende un vehículo no tóxico fisiológicamente aceptable que contiene una exotoxina B pirogénica estreptocócica (SPEB) no proteolítica purificada que confiere inmunidad a un mamífero frente a la infección por estreptococos del Grupo A, en la que la SPEB contiene al menos una sustitución de aminoácidos en Cys-192 o His-340.
2. Una vacuna como la reivindicada en la reivindicación 1, cuando es adaptada para conferir inmunidad frente a una infección seleccionada de entre faringitis, amigdalitis, infecciones cutáneas, fiebre reumática aguda, escarlatina, glomerulonefritis post-estreptocócica, sepsis y síndrome similar al choque tóxico.
3. Una vacuna como la reivindicada en la reivindicación 1 o en la reivindicación 2, que comprende además un antígeno proteína M estreptocócica purificada.
4. Una vacuna como la reivindicada en cualquiera de las reivindicaciones precedentes, cuando es adaptada para ser administrada mediante administración parenteral.
5. Una vacuna como la reivindicada en cualquiera de las reivindicaciones precedentes, cuando es adaptada para administración parenteral mediante administración subcutánea o administración intramuscular.
6. Una vacuna como la reivindicada en cualquiera de las reivindicaciones 1 a 3, cuando es adaptada para ser administrada oralmente.
7. Una vacuna como la reivindicada en cualquiera de las reivindicaciones precedentes, cuando es adaptada para ser administrada en dosis múltiples.
8. Una vacuna como la reivindicada en cualquiera de las reivindicaciones precedentes, cuando es adaptada para ser administrada a un humano.
9. Una proteína exotoxina B pirogénica estreptocócica (SPEB) no proteolítica purificada, que comprende al menos una sustitución de aminoácidos en Cys-192 o His-340.
10. Una proteína como la reivindicada en la reivindicación 9, en la que la sustitución de aminoácidos es Cys-
192 \rightarrow Ala-192, Cys-192 \rightarrow Ser-192 o His-340 \rightarrow Ala-340.
11. La utilización de una exotoxina B pirogénica estreptocócica (SPEB) no proteolítica purificada según se definió en la reivindicación 9 ó 10, para la fabricación de una vacuna para conferir inmunidad a un mamífero frente a la infección por estreptococos del Grupo A.
12. La utilización según se reivindicó en la reivindicación 11, en la que la vacuna es adaptada para conferir inmunidad frente a una infección seleccionada de entre faringitis, amigdalitis, infecciones cutáneas, fiebre reumática aguda, escarlatina, glomerulonefritis post-estreptocócica, sepsis y síndrome similar al choque tóxico.
13. La utilización según se reivindicó en la reivindicación 11 ó 12, en la que la vacuna comprende además un antígeno proteína M estreptocócica purificada.
14. La utilización según se reivindicó en cualquiera de las reivindicaciones 11 a 13, en la que la vacuna es adaptada para ser administrada mediante administración parenteral, subcutánea, intramuscular u oral.
15. La utilización según se reivindicó en cualquiera de las reivindicaciones 11 a 14, en la que la vacuna es adaptada para ser administrada en múltiples dosis.
16. La utilización según se reivindicó en cualquiera de las reivindicaciones 11 a 15, en la que la vacuna es adaptada para ser administrada a un humano.
ES95932518T 1994-09-14 1995-09-13 Vacuna contra una infeccion por estreptococos del grupo a. Expired - Lifetime ES2242191T3 (es)

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