ES2244955T3 - Factor derivado del estroma humano. - Google Patents
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Abstract
La presente invención está relacionada con polipéptidos que poseen el aminoácido mostrado en la SEC. ID. Nº 1 o 5, y con el ADN que codifica un polipéptido de este tipo. Más particularmente, la presente invención está relacionada con ADN que posee la secuencia nucleotídica mostrada en la SEC. ID. Nº 2 o 3, y 6 o 7. Una realización adicional de la invención proporciona vectores de replicado y expresión comprendiendo ADN conforme a la invención. Los vectores pueden ser, por ejemplo, vectores plásmido, virus o fago, provistos de un origen de replicado, opcionalmente un promotor para la expresión de dicho ADN y, opcionalmente, un regulador del promotor. El vector puede contener uno o más genes marcadores seleccionables, por ejemplo un gen de resistencia a la ampicilina. El vector puede ser utilizado in vitro, por ejemplo, en la producción de ARN correspondiente al ADN, o ser utilizado para transfectar o transformar una célula huésped. Otra realización adicional de la invención proporciona células huésped transformadas o transfectadas con los vectores para el replicado y expresión del ADN conforme a la invención, incluyendo las SEC. ID. Núms. 2 o 3, y 6 o 7 de ADN, o el marco de lectura abierto de las mismas. Las células serán escogidas para ser compatibles con el vector y, por ejemplo, pueden ser procedentes de bacterias, levadura, insecto o mamífero. Otra realización adicional de la invención proporciona un método para la producción de un polipéptido, el cual comprende el cultivo de células huésped de la presente invención bajo condiciones efectivas para la expresión de un polipéptido de la invención. Preferiblemente, además, tal método es llevado a cabo bajo condiciones en las que el polipéptido de la invención es expresado y, a continuación, es producido por las células huésped.
Description
Factor derivado del estroma humano.
Nuevos Polipéptidos y ADNs que los codifican.
La presente invención está relacionada con nuevos
polipéptidos producidos de la línea celular humana
pro-B y con ADNs que los codifican.
EP-A-O 607 054,
el cual es un documento sobre antecedentes en este campo, en el
Artículo 54(3) y en (4) EPC, describe un proceso para la
construcción de una librería de ADNc, la cual posee una
selectividad para los péptidos señal que hace posible el
identificar eficientemente un polipéptido desconocido y útil que
comprenda un péptido señal. Ha sido identificado utilizando dicho
proceso un nuevo polipéptido, consistente en 89 aminoácidos
(incluyendo un péptido señal) producido por una línea celular
estromal, el cual es útil como un agente para la prevención o
tratamiento de, por ejemplo, la anemia, la leucopenia o infecciones,
y similares, y ADNs que codifican para dicho polipéptido.
Science 261, pag. 600-603 (1993)
describe un método para clonar -sin utilizar ensayos funcionales
específicos- ADNs complementarios (ADNcs) que llevan secuencias
señal aminoterminal específicas, tales como las que codifican
moléculas transductoras de señal intercelular y receptores. El
vector utilizado en este sistema dirigió la expresión de la
superficie celular de las proteínas de fusión receptoras de
interleukin-2 cuando fueron clonados insertos con
secuencias señal con el armazón y orientación correctos. Fue
construida una librería de expresión ADNc partiendo de una línea
celular estromal de médula espinal, la cual contenía ADNcs
enriquecidos con la porción 5' (el tamaño medio fue de 400 pares de
bases). Fueron clonados dos ADNcs que codificaban moléculas de
citoquina putativas, factor 1\alpha derivado de célula estromal
(SDF-1\alpha) y SDF-1\beta, los
cuales pertenecen a la superfamilia de la proteína inflamatoria
macrofágica-intercrine.
En Proc. Natl. Acad. Sci., USA, Vol. 91, pag.
2305-2309 (1994) es indicado que se sabe que la
generación y proliferación de progenitores de células B tempranas
requiere de moléculas derivadas de célula estromal. Se descubrió que
una línea celular estromal, PA6, produce un mediador soluble, el
cual era diferente del interleukin 7 (IL-7), y
factor de células madre, y ayudaba a la proliferación de un clon
de célula pre-B dependiente de célula estromal, el
DW34. Fue aislado por medio de clonaje de expresión un clon de ADNc
codificante de este factor estimulador de crecimiento DW34. La
secuencia nucleotídica contenía un marco de lectura abierto único
substancial de 267 nucleótidos, codificando un polipéptido de 89
aminoácidos. La secuencia aminoacídica de esta citoquina, llamada
factor estimulador de crecimiento de célula pre-B
(PBSF), reveló que es un miembro de la subfamilia de la
"intercrine". El PBSF recombinante estimuló por sí mismo la
proliferación de células DW34 y, además, aumento sinérgicamente el
crecimiento de DW34, así como de los progenitores de células en la
médula espinal en presencia de IL-7.
La presente invención está relacionada con nuevos
polipéptidos producidos por células hematopoyéticas y con ADNs que
los codifican. Se sabe que existen muchos tipos de factores de
crecimiento y diferenciación, tales como el interleukin (IL) de
células hematopoyéticas.
Este hecho sugiere que los factores que poseen
funciones similares o nuevas podrían ser secretados por las mismas,
adicionalmente a los factores secretados conocidos ya
descubiertos.
Los presentes inventores han prestado atención a
este punto y han intentado encontrar un nuevo factor (polipéptido)
producido por las células hematopoyéticas. La presente invención
fue seleccionada por medio de hibridización cruzada utilizando ADNc
de SDF-1 murino (Factor Derivado Estromal 1;
descrito en la Solicitud de Patente japonesa nº
5-22098) como una sonda y, de esta forma, se obtuvo
SDF-1 humano (2 tipos, \alpha y \beta) producido
de células humanas pro-B y, a continuación, se
completó la presente invención.
Cuando son buscados con un ordenador polipéptidos
que posean secuencias idénticas o altamente homólogas con las del
polipéptido de la presente invención y los ADNs que los codifican,
no se encuentra ninguno. De esta forma, ha sido probado que el
polipéptido de la presente invención y el ADN que codifica para el
mismo son nuevos.
(1) un polipéptido poseyendo una secuencia
aminoacídica mostrada en la SEC. ID. Nº 1.
(2) un ADN que posee una secuencia nucleotídica
mostrada en la SEC. ID. Nº 2, y
(3) un ADN poseyendo una secuencia nucleotídica
mostrada en la SEC. ID. Nº 3.
(4) un polipéptido poseyendo una secuencia
aminoacídica mostrada en la SEC. ID. Nº 5.
(5) un ADN poseyendo una secuencia nucleotídica
mostrada en la SEC. ID. Nº 6 y,
(6) un ADN poseyendo una secuencia nucleotídica
mostrada en la SEC. ID. Nº 7.
La presente invención está relacionada con
polipéptidos que poseen el aminoácido mostrado en la SEC. ID. Nº 1 o
5, y con el ADN que codifica un polipéptido de este tipo. Más
particularmente, la presente invención está relacionada con ADN que
posee la secuencia nucleotídica mostrada en la SEC. ID. Nº 2 o 3, y
6 o 7.
Una realización adicional de la invención
proporciona vectores de replicado y expresión comprendiendo ADN
conforme a la invención. Los vectores pueden ser, por ejemplo,
vectores plásmido, virus o fago, provistos de un origen de
replicado, opcionalmente un promotor para la expresión de dicho ADN
y, opcionalmente, un regulador del promotor. El vector puede
contener uno o más genes marcadores seleccionables, por ejemplo un
gen de resistencia a la ampicilina. El vector puede ser utilizado
in vitro, por ejemplo, en la producción de ARN
correspondiente al ADN, o ser utilizado para transfectar o
transformar una célula huésped.
Otra realización adicional de la invención
proporciona células huésped transformadas o transfectadas con los
vectores para el replicado y expresión del ADN conforme a la
invención, incluyendo las SEC. ID. Núms. 2 o 3, y 6 o 7 de ADN, o
el marco de lectura abierto de las mismas. Las células serán
escogidas para ser compatibles con el vector y, por ejemplo, pueden
ser procedentes de bacterias, levadura, insecto o mamífero.
Otra realización adicional de la invención
proporciona un método para la producción de un polipéptido, el cual
comprende el cultivo de células huésped de la presente invención
bajo condiciones efectivas para la expresión de un polipéptido de
la invención. Preferiblemente, además, tal método es llevado a cabo
bajo condiciones en las que el polipéptido de la invención es
expresado y, a continuación, es producido por las células
huésped.
El ADN conforme a la invención puede ser
insertado también en los vectores descritos más arriba con una
orientación antisentido, con el fin de ser válido para la
producción de ARN antisentido. El ARN antisentido puede ser
producido también por medios sintéticos. Tal ARN antisentido puede
ser utilizado en un método de control de los niveles de un
polipéptido de la invención en una célula.
Son descritos anticuerpos monoclonales o
policlonales para un polipéptido conforme a la invención. Además, se
describe un proceso para la producción de anticuerpos monoclonales o
policlonales para los polipéptidos de la invención. Los anticuerpos
monoclonales pueden ser preparados por medio de tecnología del
hibridoma convencional, utilizando un polipéptido de la invención, o
un fragmento del mismo, como un inmunogen. Lo anticuerpos
policlonales pueden ser preparados también por medios
convencionales, los cuales comprenden la inoculación en un animal
huésped -por ejemplo, una rata o un conejo- de un polipéptido de la
invención y la recuperación del suero inmune.
La presente invención proporciona también
composiciones farmacéuticas conteniendo un polipéptido de la
invención, junto con un diluyente y/o portador farmacéuticamente
aceptable.
El polipéptido de la presente invención incluye
uno, al cual le falta una parte de su secuencia de aminoácido (por
ejemplo, un polipéptido que comprende la única secuencia esencial
que revela una actividad biológica en una secuencia aminoacídica
mostrada en la SEC. ID. Num. 1 o 5), uno en el cual una parte de su
secuencia aminoacídica es reemplazada por otros aminoácidos (por
ejemplo, aquéllos reemplazados por un aminoácido que posee una
propiedad similar), y uno en el cual son añadidos o insertados
otros aminoácidos en una parte de su secuencia aminoacídica, así
como aquéllos que poseen la secuencia aminoacídica mostrada en las
SEC. ID. Num. 1 o 5.
Como es bien sabido, existen de uno a seis tipos
de codones para codificar un aminoácido (por ejemplo, son conocidos
un tipo de codón para Met, y seis tipos de codón para leucina
(Leu)). Por lo tanto, la secuencia nucleotídica de ADN puede ser
cambiada con el fin de codificar el polipéptido que posea la misma
secuencia aminoacídica.
El ADN especificado en (2) y (5) son la secuencia
en su forma natural.
El ADN mostrado en (3) y (6) indica la secuencia
de ADN especificada en (2) y (5) con una región no traducida.
Un péptido señal es una región hidrofóbica
situada inmediatamente aguas abajo del aminoácido Met señalizador
del comienzo de traducción. Se da por sentado que el péptido señal
en el polipéptido de la presente invención reside en una región que
va desde Met en la posición 1 a Gly en la posición 21 en la
secuencia aminoacídica representada por la SEC. ID. Num. 1 o 5. La
región esencialmente responsable de la expresión de actividad
biológica corresponde a la parte de las secuencias aminoacídicas de
las SEC. ID. Nums. 1 y 5 a las que les faltan los péptidos señal, es
decir, la parte de proteína madura. De esta forma, los péptidos
señal nunca están relacionados con la actividad.
El ADN que posee una secuencia nucleotídica
mostrada en la SEC. ID. Num. 3 o 7 puede ser preparado conforme a
los siguientes métodos, es decir:
(i) el aislamiento del ARNm de una célula, la
cual produce el polipéptido de la presente invención (por ejemplo,
la línea celular humana pro-B),
(ii) la preparación de una primera hebra (ADNc de
hebra sencilla) del ARNm así obtenido, seguido de la preparación de
una segunda hebra (ADNc de hebra doble) (síntesis de ADNc);
(iii) la inserción del ADNc así obtenido en un
vector fago apropiado,
(iv) la transfección del fago recombinante en
células huésped (construcción de librería de ADNc),
(v) el escrutinio mediante hibridación en placa
de una librería de ADNc, utilizando ADNc de SDF-1
murino como una sonda,
(vi) la preparación de ADN del fago conteniendo
el clon positivo obtenido, seguido del subclonaje del ADNc, el cual
es cortado en un vector plásmido, y seguido de la preparación del
mapa de restricción enzimática,
(vii) la determinación de la secuencia
nucleotídica de cada fragmento cortado con la enzima de
restricción, seguido del ensamblaje de la secuencia en su longitud
total.
Explicada en detalle, la fase (i) puede ser
llevada a cabo siguiendo el método de Okayama, H. et al
(descrito en Method in Enzymology, vol. 154, p. 3, 1987) después de
que una línea celular humana pro-B es estimulada por
medio de un estimulante apropiado (por ejemplo,
IL-1, etc.) o sin estimulación.
Un ejemplo de células que secretan los
polipéptidos de la presente invención es, preferiblemente, la línea
celular humana pro-B FLEB14. Esta línea celular
humana FLEB14 puede ser proporcionada por 1st Lecture Medicinal
Chemistry, School of Medicine, Kyoto University.
Las fases (ii), (iii) y (iv) son una serie de
fases para la preparación de una librería de ADNc, y pueden ser
llevadas a cabo siguiendo el método de Glubler & Hoffman (Gene,
vol. 25, pp. 263, 1983) con una ligera modificación.
Como ejemplos del vector utilizado en la fase
(iii), son conocidos muchos vectores plásmidos (por ejemplo, pB322,
pBluescript, etc.), vectores fago (por ejemplo, \lambdagt10,
\lambdaDASH II, etc.), y es preferido un vector fago
\lambdagt10 (43,3 kpb, Stratagene).
La célula huésped utilizada en la fase (iv) es
preferiblemente la E.coli NM514 (Stratagene).
Las fases (v) y (vi) pueden ser llevadas a cabo
conforme al método descrito en Molecular Cloning (escrito por Sam
Brook, Fritsh, E.F. y Maniatis, T., publicado por Cold Spring
Harbor Laboratory Press en 1989).
La secuenciación en la fase (vii) puede ser
llevada a cabo conforme al método de Maxam-Gilbert,
o al método de terminación dideoxi.
Es necesario el confirmar que el ADNc obtenido
cubre la longitud total o casi total del ARNm intacto. Esta
confirmación puede ser llevada a cabo por medio del análisis
Northern, utilizando el ADNc como una sonda (ver Molecular
Cloning).
Si el tamaño del ARNm obtenido de la banda
hibridizada y el tamaño del ADNc son casi iguales, se pensará que el
ADNc es de casi la longitud total.
Una vez que son determinadas las secuencias
nucleotídicas mostradas en las SEC. ID. Nums. 2, 3, 6, 7, puede ser
obtenido el ADN de la presente invención por medio de síntesis
química, del método de PCR, o por hibridización, haciendo uso de un
fragmento del ADN de la presente invención como una sonda.
Adicionalmente, el ADN de la presente invención puede ser obtenido
en una cantidad deseada al transformar con un vector ADN insertado
-un ADN de la presente invención- en un huésped adecuado, seguido
del cultivo del transformante.
Los polipéptidos de la presente invención
(mostrados en las SEC. ID. Num. 1 o 5) pueden ser preparados por
medio de:
(1) el aislamiento y purificación de un organismo
o de una célula cultivada,
(2) la síntesis química, o
(3) la utilización de una técnica
biotecnológica,
preferiblemente, por medio del método descrito en
(3).
Ejemplos de sistemas de expresión a la hora de
preparar un polipéptido utilizando una técnica biotecnológica es,
por ejemplo, el sistema de expresión de la bacteria, levadura,
célula de insecto o célula de mamífero.
Por ejemplo, la expresión en E.coli puede
ser llevada a cabo añadiendo el codón iniciador (ATG) al extremo 5'
de un ADN que codifica la proteína madura, conectando el ADN así
obtenido aguas abajo de un promotor adecuado (por ejemplo, el
promotor trp, el promotor lac, el promotor IPL, el promotor T7,
etc.) y, a continuación, insertándolo en un vector (por ejemplo,
pBR322, pUC18, pUC19, etc.), el cual funciona en una hebra de
E.coli para preparar un vector de expresión.
Cuando es utilizado un péptido señal de bacteria
(por ejemplo, el péptido señal de pel B), el polipéptido deseado
puede ser producido también en periplasma. Además, una proteína de
fusión puede ser también producida fácilmente con otros
polipéptidos.
Además, la expresión en una célula de mamífero
puede ser llevada a cabo, por ejemplo, insertando el ADN mostrado en
la SEC. ID. Num. 3 o 6 aguas abajo de un promotor adecuado (por
ejemplo, el promotor SV40, el promotor LTR, el promotor de
metalotioneina, etc.) en un vector apropiado (por ejemplo, el vector
de retrovirus, el vector del virus del papiloma, el vector del
virus vaccinia, el vector SV40, etc.) con el fin de obtener un
vector de expresión, y transfectando una célula de mamífero
adecuada (por ejemplo, célula COS7 de mono, célula CHO de hámster
chino, célula L murina, etc.) con el vector de expresión así
obtenido y, a continuación, cultivando el transformante en un medio
apropiado para conseguir un polipéptido deseado en el medio de
cultivo. El polipéptido así obtenido puede ser aislado y purificado
por medio de métodos bioquímicos convencionales.
El polipéptido de la presente invención es
producido y secretado en células pro-B, de tal forma
que puede ser utilizado para enfermedades relacionadas con un bajo
crecimiento o una proliferación anormal de células hematopoyéticas,
mejora neuronal o depresión, mejora inmunológica y depresión, por
ejemplo, enfermedades inflamatorias (artritis reumatoide, colitis
ulcerativa, etc.), citopenia de células madre hematopoyéticas
después de transplante de médula ósea, leucocitopenia,
trombocitopenia, linfopenia B y linfopenia T después de
quimioterapia, anemia, enfermedades infecciosas, cáncer,
leucocitosis, SIDA, enfermedades neurodegenerativas (Alzheimer,
esclerosis múltiple, etc.), prevención y tratamiento del daño
neuronal, prevención o tratamiento del desorden en el metabolismo
de la médula (osteoporosis, etc.) o reparación de tejido.
En las actividades anteriores fue confirmado que
el SDF-1\alpha de ratón estimuló la proliferación
de la línea celular progenitora mieloide murina DA1G en la prueba
de laboratorio. Se sugirió que el SDF-1\alpha
humano tiene también la misma actividad.
Adicionalmente, los anticuerpos policlonales o
monoclonales contra el polipéptido de la presente invención pueden
ser utilizados en la determinación de la cantidad de dicho
polipéptido en el organismo y, por lo tanto, pueden ser utilizados
a la hora de investigar la relación entre dicho polipéptido y las
enfermedades, o para diagnosticar enfermedades, y similares. El
anticuerpo policlonal o monoclonal del mismo puede ser preparado
por medio de métodos convencionales utilizando dicho polipéptido, o
el fragmento del mismo, como un antígeno.
El ADN de la presente invención puede ser
utilizado como un templete importante y esencial a la hora de
preparar el polipéptido de la presente invención, del cual se
espera que posea distintos usos para el diagnóstico y en el
tratamiento de enfermedades genéticas (el tratamiento de enfermedad
causada por defecto génico, y el tratamiento a través de inhibición
de la expresión del polipéptido por medio de ADN antisentido (ARN),
y similares). Además, el ADN genómico puede ser aislado utilizando
el ADN de la presente invención como una sonda. De forma similar, es
posible aislar genes que poseen una alta homología con el ADN de la
presente invención en humanos, o aquéllos de otras especies.
El polipéptido de la presente invención es
producido y secretado en células pro-B, de tal forma
que puede ser utilizado en enfermedades relacionadas con un bajo
crecimiento o una proliferación anormal de células hematopoyéticas,
mejora neuronal o depresión, mejora inmunológica y depresión, por
ejemplo, enfermedades inflamatorias (artritis reumatoide, colitis
ulcerativa, etc.), citopenia de células madre hematopoyéticas
después de transplante de médula ósea, leucocitopenia,
trombocitopenia, linfopenia B y linfopenia T después de
quimioterapia, anemia, enfermedades infecciosas, cáncer,
leucocitosis, SIDA, enfermedades neurodegenerativas (Alzheimer,
esclerosis múltiple, etc.), prevención y tratamiento del daño
neuronal, prevención o tratamiento del desorden en el metabolismo
de la médula (osteoporosis, etc.) o reparación de tejido.
Los polipéptidos de la presente invención pueden
ser administrados normalmente de forma sistemática o parcial,
usualmente por medio de administración oral o parenteral,
preferiblemente oralmente, intravenosamente o
intraventricularmente.
Las dosis a ser administradas son determinadas
dependiendo de la edad, peso corporal, síntomas, el efecto
terapéutico deseado, la ruta de administración, y la duración del
tratamiento, etc. En el humano adulto las dosis por persona y dosis
son generalmente de entre 100 \mug y 100 mg, por medio de
administración oral, hasta varias veces por día, y de entre 10
\mug y 100 mg, por medio de administración parenteral, hasta
varias veces por día.
Conforme es mencionado anteriormente, las dosis a
ser utilizadas dependen de distintas condiciones. Por lo tanto,
existen casos en los cuales pueden ser utilizadas dosis inferiores o
superiores a los rangos anteriormente especificados.
La administración de los compuestos de la
presente invención puede ser como composiciones sólidas,
composiciones líquidas u otras composiciones para administración
oral, como inyecciones, linimentos o supositorios, etc. para
administración parenteral.
Las composiciones sólidas para administración
oral incluyen tabletas comprimidas, píldoras, cápsulas, polvos
dispersables, gránulos. Las cápsulas incluyen cápsulas blandas y
cápsulas duras.
En tales composiciones, uno o más de los
compuestos activos son mezclados con, al menos, un diluyente inerte
(como la lactosa, el manitol, la glucosa, la celulosa de
hidroxipropilo, la celulosa microcristalina, el almidón, la
polivinilpirrolidona, el aluminato metasilicato de magnesio, etc.).
Las composiciones pueden comprender también, como una práctica
normal, substancias adicionales distintas a los diluyentes inertes:
por ejemplo, agentes lubricantes (tales como el estearato
magnésico, etc.), agentes desintegrantes (tales como la celulosa
glicolato de calcio, etc.), agentes estabilizadores (tales como
albúmina sérica humana, lactosa, etc.), y agentes que ayudan a la
disolución (tales como la arginina, el ácido asparagínico,
etc.).
Las tabletas o píldoras pueden estar recubiertas,
si se desea, con una película de material gástrico o entérico (como
el azúcar, la gelatina, la celulosa de hidroxipropilo o el ftalato
de celulosa de hidroxipropilmetilo, etc.), o estar recubiertas con
más de dos películas. Y, además, el recubrimiento puede incluir el
estar contenidas dentro de cápsulas o materiales absorbibles, tales
como la gelatina.
Otras composiciones para administración oral
incluyen composiciones en spray, las cuales pueden ser preparadas
por medio de métodos conocidos y que comprenden uno o más de los
compuestos activos. Las composiciones en spray pueden comprenden
substancias adicionales distintas de los diluyentes inertes: por
ejemplo, agentes estabilizadores (sulfito sódico, etc.), tampón
isotónico (cloruro sódico, citrato sódico, ácido cítrico, etc.).
Para la preparación de tales composiciones en spray, por ejemplo,
puede ser utilizado el método descrito en la Patente Americana Num.
2.868.691 o 3.095.355 (incorporadas aquí en su totalidad como
referencia).
Las inyecciones pueden comprender substancias
adicionales distintas de los diluyentes inertes: por ejemplo,
agentes preservantes, agentes humectantes, agentes emulsificadores,
agentes dispersantes, agentes estabilizadores (tales como la
albúmina sérica humana, la lactosa, etc.), y agentes de ayuda, tales
como agentes que ayudan a la disolución (la arginina, el ácido
asparagínico, etc.).
Pueden ser esterilizadas, por ejemplo, por medio
de filtrado a través de un filtro de retención de bacterias, por
medio de la incorporación de agentes esterilizantes en las
composiciones, o por irradiación. Pueden ser producidas también en
forma de composiciones sólidas estériles, por ejemplo, por medio de
liofilización, y pueden ser disueltas en agua estéril o en alguno de
los otros diluyentes estériles para inyección, inmediatamente antes
de ser usadas.
Otras composiciones para administración
parenteral incluyen líquidos para uso externo, y linimentos
endérmicos (ungüentos, etc.), supositorios para administración
rectal y pesarios, los cuales comprenden uno o más de los compuestos
activos y pueden ser preparados por medio de métodos conocidos.
Los siguientes ejemplos son ilustrativos, pero no
limitan la presente invención.
Fueron homogenadas células de la línea celular
pro-B humana FLEB14 (ver Katamine, S., et al.
Nature, 309, 369 (1984)). El homogenado fue incubado con celulosa
oligo-dT. Fue eluído ARN poli(A) después del
lavado (Vennstorm, B. et al. Cell, 28, 135 (1982)). Fue
sometida a electrofóresis 1 \mug de ARN poli(A) en un gel
de agarosa al 1,0% y, a continuación, inmunotransferida a una
membrana de nitrocelulosa.
La membrana fue hibridizada con el ADNc de
SDF-1 murino marcado con 32P (descrito como SEC. ID.
Nº 3 en la Solicitud de Patente japonesa Nº 5-22098;
la secuencia es mostrada en la SEC. ID. Nº 9; el factor es llamado
ahora SDF- 1\alpha, ya que fue descubierto otro
SDF-1 procedente de ratón), con formamida 50%, SSC
5X, SDC 0,1%, SDS 0,1%, solución de Denhardt 5X, 0,1 mg/ml de ADN de
esperma de salmón, a 39ºC, y lavada con 0,3 M de NaCl, 30 mM de
citrato sódico, SDS 0,1%, a 50ºC y, a continuación, sometida a
autoradiograma. Fueron hibridizados ARNms de 3,5 kpb y de 1,9
kpb.
Fue construída una librería de ADNc tomando
células FLEB14 de la línea celular humana pro-B por
medio de un método convencional (ver Molecular Cloning; Sambrook,
J., Fritsh, E.F., & Maniatis, T., Cold Spring Harbor Laboratory
Press (1989)). El ADNc fue sintetizado utilizando el kit de síntesis
de ADNc Time Saver (Pharmacia).
La primera hebra fue sintetizada tomando ARN
poli(A) de FLEB14 (5 \mug) utilizando una transcriptasa
reversa y un iniciador oligo-dT. Y utilizando una
ADN polimerasa I fue sintetizado el ADNc de doble hebra.
Al ADNc le fue ligado un adaptador
EcoRI-Notl:
| AATTCGCGGCCGCT | (SEC. ID. Nº 10) |
| GCGCCGGCGAp | (SEC. ID. Nº 11) |
y, a continuación, fue fosforilado. Fueron
recuperados los ADNc mayores de 800 pb de un gel de agarosa 0,8%
con un polvo de cristal (kit de purificación de ADN Geneclean II,
disponible en Bio101).
El ADNc obtenido fue ligado a un vector fago
\lambdagt10 (disponible en Stratagene), el cual posee el brazo
EcoRI tratado con fosfatasa.
Se siguió con el empaquetado in vitro, por
medio del protocolo del kit de empaquetado in vitro LAMDA INN
(disponible en Nihon gene). Los fagos recombinantes fueron
transfectados a células huésped E. Coli NM514 (disponibles
en Stratagene). Fue obtenida una librería de ADNc conteniendo 1 x
10^{6} placas. Fueron transfectadas 1 x 10^{6} placas de fago
\lambdagt10 de la librería de ADNc a membranas de nitrocelulosa.
Las membranas fueron hibridizadas con el ADNc de
SDF-1\alpha murino marcado con 32P (mostrado en la
SEC. ID. Nº 9, el mismo ADNc utilizado en el Ejemplo 1) en
formamida 50%, SSD 5X, SDS 0,1%, Solución Denhart 5X, 0,1 mg/ml de
ADN de esperma de salmón, a 39ºC, y lavadas en 0,3 M de NaCl, 30 mM
de citrato sódico, SDS 0,1%, a 50ºC, y sometidas a autoradiograma.
Fueron obtenidos 40 clones positivos.
Fue preparado ADN del fago, procedente de 9
clones positivos, por medio del método convencional (ver Cell
Technology Experimental Protocol, pp. 8, publicado por
Shuujun-sha). El ADN del fago fue digerido en Not I.
La longitud del inserto de ADNc fue medida por medio de
electrofóresis en gel de agarosa. La longitud de los 8 clones fue
de 1,9 kpb, y la longitud de un clon fue de 3,5 kpb. Se pensó que
estos dos tipos de clones son casi de la longitud total del ADNc del
SDF-1\alpha y del SDF-\beta
humanos, dado el resultado del análisis Northern.
El ADNc de un clon fue tomado de entre los 8
clones de 1,9 kpb de longitud y de un clon de 3,5 kpb de longitud,
fueron digeridos en Not I, fueron sometidos a electrofóresis en gel
de agarosa, y los fragmentos fueron cortados y subclonados en el
sitio Not I del plásmido pBluescript.
Fue preparado un mapa de restricción enzimático
del SDF-1 humano (1,9 kpb) (mostrado en la Fig. 1).
Cada fragmento de ADNc de la enzima de restricción fue subclonado en
pBluescript, seguido de la determinación de secuencias
nucleotídicas de alrededor de 300 pb en ambos extremos de cada
inserto. Uniendo estas secuencias, fueron determinadas secuencias
nucleotídicas de longitud total (mostrado en la SEC. ID. Nº 3).
Fueron determinados un marco de lectura abierto y
una secuencia aminoacídica de la secuencia nucleotídica del ADNc de
longitud total, con los resultados mostrados en la SEC. ID. Nº 1. En
comparación con péptidos señal conocidos, fueron comparados
30-40 aminoácidos del terminal N obtenidos con un
péptido señal conocido, se descubrió un péptido señal de los
polipéptidos de la presente invención, y se obtuvo la secuencia
mostrada en la SEC. ID. Nº 4 (ver Von Heuane, G. Nucleic Acids Res.
14, 4683 (1986)).
Por medio del mismo procedimiento que se ha
descrito mas arriba, fueron obtenidos un mapa de restricción
enzimático (mostrado en la Figura 2), secuencias nucleotídicas
completas (mostradas en la SED. ID. Nº 7), un marco de lectura
abierto (mostrado en la SEC. ID. Nº 6), una secuencia aminoacídica
(mostrada en la SEC. ID. Nº 5) y una secuencia mostrada con el
péptido señal (mostrada en la SEC. ID. Nº 8) del clon de 3,5
kpb.
Las secuencias aminoacídicas deducidas del clon
de 3,5 kpb y del clon de 1,9 kpb fueron muy similares entre sí, de
tal forma que el clon de 1,9 kpb fue llamado
SDF-1\alpha y el clon de 3,5 kpb fue llamado
SDF-1\beta.
Las secuencias nucleotídicas fueron determinadas
por medio del método de secuencia de ciclo, utilizando un
determinador de fluorescencia (suministrado por Applied Biosystem
Inc.). La lectura de las secuencias nucleotídicas fue llevada a
cabo por medio de un secuenciador de ADN (Modelo 373, suministrado
por Applied Biosystem Inc.).
Las secuencias nucleotídicas y las secuencias
aminoacídicas deducidas del SDF-1\alpha y del
1\beta fueron sometidas a búsqueda de homología por medio de un
ordenador en una base de datos (GENBANK y EMBL para ADN, NBRF y
SWISSPROT para la secuencia aminoacídica). Fue confirmado que los
ADNcs de la presente invención son codificadores de nuevos
péptidos.
Como un vector de expresión, fue utilizado el
derivado pUC-SR\alphaML-1 (este
vector es descrito así como su preparación en la publicación de
Patente europea Nº 559428). Este derivado fue construido para
insertar dos tipos de fragmentos, conforme es mostrado más
abajo:
- fragmento T7
- 5' GTAATACGACTCACTATAGGGGAGAGCT 3' (SEC. ID. Nº 12)
- \quad
- 3' ACGTCATTATGCTGAGTGATATCCCCTC 5' (SEC. ID. Nº 13)
entre PstI y SacI y
- fragmento SP6
- 5' CTAGTCTATAGTGTCACCTAAATCGTGGGTAC 3' (SEC. ID. Nº 14)
- \quad
- 3' AGATATCACAGTGGATTTAGCAC 5' (SEC. ID. Nº 15)
entre los sitios SpeI y KpnI en el sitio de
multiclonaje, respectivamente.
El vector
pUC-SR\alphaML-1 fue digerido con
PstI y SacI y el digesto resultante fue sometido a electrofóresis
en gel de agarosa, con el fin de preparar y recuperar un fragmento
de alrededor de 4,1 kpb y, después, eliminar el grupo de ácido
fosfórico del extremo 5' por medio de tratamiento con BAP
(fosfatasa alcalina bacteriana). El fragmento fosforilado T7 de ADN
fue ligado con el fragmento de alrededor de 4,1 kpb así preparado
procedente de pUC-SR\alphaML-1,
para hacer que tomaran forma circular. El vector resultante,
además, fue digerido con SpeI y KpnI, y el digesto resultante fue
sometido a electrofóresis en gel de agarosa, con el fin de preparar
y recuperar un fragmento de alrededor de 4,1 kpb y, después,
eliminar el grupo de ácido fosfórico del extremo 5' por medio de
tratamiento con BAP (fosfatasa alcalina bacteriana). El fragmento
fosforilado Sp6 de ADN fue ligado con el fragmento de alrededor de
4,1 kpb así preparado, con el fin de que tomaran forma circular. El
vector plásmido construído de esta manera fue llamado pUC-
SR\alphaML-2 (ver Figura 3).
En relación con hSDF-1\alpha,
fueron sintetizados los iniciadores X, Y e YH. Las secuencias de
los iniciadores X, Y e YH son las siguientes:
Iniciador X
- 5'-A ATA TAG TCG ACC ACC ATG AAC GCC AAG GTC GTG GTC GTG CTG G-3' (SEC. ID. Nº 16)
Iniciador Y
- 5'-CGG CGG ACT AGT TTA CTT GTT TAA AGC TTT CTC CAG G-3' (SEC. ID. Nº 17)
Iniciador YH
- 5'-GCC GCC ACT AGT TTA GTG GTG GTG GTG GTG GTG CTT GTT TAA AGC TTT CTC CAG G-3' (SEC. ID. Nº 18)
El plásmido hSDF-1\alpha fue
sometido a PCR, utilizando los oligonucleótidos así sintetizados X
e Y como iniciadores. El fragmento PCR así obtenido contiene una
secuencia situada adyacente al 5' del codón de iniciación, que
corresponde a la secuencia Kozac -la cual es conocida entre los
expertos en este campo- y ADNc, el cual codifica una molécula de
proteína consistente en la proteína hSDF-1\alpha.
El fragmento PCR fue digerido con SalI y SpeI, y el digesto
resultante fue separado y purificado y, a continuación, insertado en
el sitio SalI-SpeI del
pUC-SR\alphaML2 preparado en el ejemplo 6, con el
fin de obtener un vector de expresión
pUC-SR\alphaML2 -
hSDF-1\alphaA.
Además, el plásmido
hSDF-1\alpha fue sometido a PCR utilizando los
oligonucleótidos sintetizados X e YH como iniciadores. El fragmento
PCR así obtenido contiene una secuencia situada adyacente al 5' del
codón de iniciación, que corresponde a la secuencia Kozac -la cual
es conocida entre los expertos en este campo- y ADNc, el cual
codifica una molécula de proteína consistente en la proteína
hSDF-1\alpha y seis residuos de histidina (His)
adicionales unidos a su extremo C-terminal. El
fragmento PCR fue digerido con SalI y SpeI, y el digesto resultante
fue separado y purificado y, a continuación, insertado en el sitio
SalI-SpeI del pUC-SR\alphaML2
preparado en el ejemplo 6, con el fin de obtener un vector de
expresión pUC-SR\alphaML2 -
hSDF-1\alphaB.
En cuanto al hSDF-1\beta,
fueron sintetizados los iniciadores Z y ZH. Las secuencias de los
iniciadores Z y ZH son las siguientes:
Iniciador Z
- 5'- CGG CGG ACT AGT TCA CAT CTT GAA CCT CTT GTT TAA AGC -3' (SEC. ID. Nº 19)
Iniciador ZH
- 5'- GCC GCC ACT AGT TCA GTG GTG GTG GTG GTG GTG CAT CTT GAA CCT CTT GTT TAA AGC -3' (SEC. ID. Nº 20)
El plásmido hSDF-1\beta fue
sometido a PCR, utilizando los oligonucleótidos así sintetizados X
y Z como iniciadores. El fragmento PCR así obtenido contiene una
secuencia situada adyacente al 5' del codón de iniciación, que
corresponde a la secuencia Kozac -la cual es conocida entre los
expertos en este campo- y ADNc, el cual codifica una molécula de
proteína consistente en la proteína hSDF- 1\beta. El fragmento PCR
fue digerido con SalI y SpeI, y el digesto resultante fue separado
y purificado y, a continuación, insertado en el sitio
SalI-SpeI del pUC-SR\alphaML2
preparado en el ejemplo 6, con el fin de obtener un vector de
expresión pUC-SR\alphaML2 -
hSDF-1\betaA.
Además, el plásmido hSDF-1\beta
fue sometido a PCR utilizando los oligonucleótidos sintetizados X y
ZH como iniciadores. El fragmento PCR así obtenido contiene una
secuencia situada adyacente al 5' del codón de iniciación, que
corresponde a la secuencia Kozac -la cual es conocida entre los
expertos en este campo- y ADNc, el cual codifica una molécula de
proteína consistente en la proteína hSDF-1\beta y
seis residuos de histidina (His) adicionales unidos a su extremo
C-terminal. El fragmento PCR fue digerido con SalI y
SpeI, y el digesto resultante fue separado y purificado y, a
continuación, insertado en el sitio SalI-SpeI del
pUC-SR\alphaML2 preparado en el ejemplo 6, con el
fin de obtener un vector de expresión
pUC-SR\alphaML2 -
hSDF-1\betaB.
Cada uno de los plásmidos así construidos
pUC-SR\alphaML2-hSDF-1\alphaA,
pUC-SR\alphaML2-hSDF-1\alphaB,
pUC-SR\alphaML2-hSDF-1\betaA
y
pUC-SR\alphaML2-hSDF-1\betaB,
fueron transfectados en una cepa DH5 de E.coli, fueron
recuperados de un cultivo de 100 ml del transformante resultante y,
a continuación, purificados dos veces por medio de centrifugación
por gradiente de densidad de CsCl.
Cada una de las preparaciones de ADN plásmido
pUC-SR\alphaML2,
pUC-SR\alphaML2-hSDF-1\alphaA,
pUC-SR\alphaML2-hSDF-1\alphaB,
pUC-SR\alphaML2-hSDF-1\betaA
y
pUC-SR\alphaML2-hSDF-1\betaB
fueron introducidas en células COS-7 (Cell, vol.
23, p. 175, 1981) por medio del método de dietilaminoetil (DEAE)
dextran (J. Immunology, vol. 136, p. 4291,
1986).
1986).
Esto es, alrededor de 1,8 x 10^{6} células
COS-7 fueron inoculadas en un matraz de 225
cm^{2} de capacidad (fabricado por Corning), junto con 50 ml de
un medio de cultivo líquido (medio MEM modificado por Dulbecco,
suplementado con 10% suero bovino fetal descomplementado). Después
de su incubación durante la noche en un incubador de dióxido de
carbono (37ºC, 5% de CO2) y de la subsiguiente retirada del
sobrenadante del cultivo, fueron añadidos 12 ml de un cocktail de
ADN (medio MEM modificado por Dulbecco suplementado con 15 \mug de
cada ADN plásmido, 50 mM de tampón Tris-HCl (pH
7,4) y 400 \mug/ml de DEAE-dextran) a cada matraz
y el cultivo fue llevado a cabo durante 3 horas a 37ºC en una
atmósfera de 5% de CO2. A continuación, el cocktail de ADN fue
reemplazado por 15 ml de una solución de cloroquina (medio MEM
modificado por Dulbecco suplementado con 150 \muM de cloroquina y
7% suero bovino fetal descomplementado), seguido de 3 horas
adicionales de
cultivo.
cultivo.
Después de eliminar la solución de cloroquina,
fue añadido el medio de cultivo líquido anteriormente mencionado (50
ml) a cada uno de los matraces resultantes, los cuales fueron
incubados, a continuación, a 37ºC en una atmósfera de 5% CO2 durante
72 horas, con el fin de hallar el crecimiento de las células en cada
matraz en forma casi monocapa. Después de retirar el sobrenadante
del cultivo, las células en cada matraz fueron lavadas con un medio
de cultivo líquido libre de suero (nombre comercial,
SFM-101; disponible en Nissui Pharmaceutical Co.,
Ltd.) y, a continuación, se las proporcionaron 75 ml del mismo
medio de cultivo líquido libre de suero, y se continuó con el
cultivo durante otras 72 horas. Después, el sobrenadante del
cultivo resultante fue recuperado y filtrado a través de un filtro
de membrana (nombre comercial, STERIVEX-GS;
disponible en Millipore Corp.) con el fin de eliminar las células y
los restos de célula. Las muestras así obtenidas de sobrenadante de
cultivo fueron almacenadas a 4ºC para un uso futuro. Se espera que
un sobrenadante de cultivo de células COS -las cuales han sido
transformadas con plásmido conteniendo los insertos de ADNc de
hSDF-1\alpha y \beta- contenga restos
expresados y secretados de proteína madura de polipéptidos que
correspondan a hSDF-1\alpha y \beta.
Una porción de 2 ml de cada uno de los
sobrenadantes de cultivo de las células COS transformadas, obtenidas
en el Ejemplo 8, fue concentrada a un volumen de 100 ml utilizando
un filtro de concentración centrífuga (nombre comercial,
Centricon-10; disponible en Millipore Corp.). Una
porción de 1 \mul de cada una de las muestras así concentradas
fue mezclada con el mismo volumen de un tampón de carga (0,125 M de
tampón Tris-HCl (pH 6,8), dodecil sulfato sódico
4%, y glicerol 30%) para utilizar en SDS-PAGE
(electrofóresis en gel de poliacrilamida con dodecil sulfato
sódico), y la mezcla fue tratada a 90ºC durante 3 minutos y, a
continuación, sometida a SDS-PAGE.
En el caso de las proteínas de
hSDF-1\alphaB y \betaB poseyendo el hexámero
His introducido en el C-terminal de las proteínas,
no sólo su correspondiente sobrenadante de cultivo celular COS fue
sometido al análisis SDS-PAGE, sino también sus
productos purificados.
La purificación de la proteína fue llevada a cabo
por medio de una cromatografía de afinidad de metal quelado
(Biotechnology, vol. 9, p. 273, 1991), haciendo uso de la función
de His para formar compuestos complejos con distintos iones de
metal de transición. Es decir, un sobrenadante de cultivo (350 ml)
obtenido de células COS fue mezclado con una solución acuosa de
cloruro sódico en una cantidad tal que la concentración final de la
sal fue de 1 M, y la mezcla resultante fue aplicada a una columna
llena de 4 ml de una Sefarosa quelante ligada a zinc (nombre
comercial, Chelating Sepharose Fast-Flow;
disponible en Pharmacia) para adsorber la proteína a la resina. La
columna fue lavada con 50 mM de tampón fosfato (pH 7,0) conteniendo
1 M de solución acuosa de cloruro sódico (40 ml), y la proteína
retenida en la columna fue eluída con 50 mM de tampón fosfato (pH
7,0) conteniendo 1 M de solución acuosa de cloruro sódico y 0,4 M
de imidazol. Después, el eluído resultante fue concentrado a un
volumen de 100 \mul, y una porción de la muestra concentrada fue
sometida a análisis SDS-PAGE. El análisis
SDS-PAGE fue llevado a cabo utilizando un gradiente
de gel SDS de 10/20 y fue detectado un producto, el cual
corresponde a un peso molecular de hSDF-1\alpha y
hSDF-1\beta, respectivamente.
(1) INFORMACIÓN GENERAL:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- SOLICITANTE:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE: Ohno Pharmaceutical Co., Ltd.
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CALLE: 1-5, Doshomachi 2-chome
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CIUDAD: Chuo-ku, Osaka-shi
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- ESTADO: Osaka
\vskip0.500000\baselineskip
- (E)
- PAIS: Japón
\vskip0.500000\baselineskip
- (F)
- CÓDIGO POSTAL (ZIP): 541
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TÍTULO DE LA INVENCIÓN: Nuevos Polipéptidos y ADNs que los codifican
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- NÚMERO DE SECUENCIAS: 20
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- REQUERIMIENTOS DE ORDENADOR PARA SU LECTURA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- TIPO MEDIO: Disquete
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- ORDENADOR: IBM PC compatible
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- SISTEMA OPERATIVO: PC-DOS/MS-DOS
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- SOFTWARE: PatentIn Release nº 1.0, Versión nº 1.25 (EPO)
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SECUENCIA DE ID. Nº:
1:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 89 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC. ID. Nº: 1:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SECUENCIA DE ID. Nº:
2:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 267 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucléico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADNc para ARMm
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC. ID. Nº: 2:
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SECUENCIA DE ID. Nº:
3:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 1856 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucléico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADNc para ARMm
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC. ID. Nº: 3:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SECUENCIA DE ID. Nº:
4:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 1856 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucléico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADNc para ARMm
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Homo sapiens
\vskip0.500000\baselineskip
- (H)
- LÍNEA CELULAR: FLEB14
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- RASGO:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: CDS
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- SITUACIÓN: 80..349
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- MÉTODO DE IDENTIFICACIÓN: por similaridad con otros patrones
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- RASGO:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: sig_péptido
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- SITUACIÓN: 80..142
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- MÉTODO DE IDENTIFICACIÓN: por similaridad con secuencia conocida en un consenso establecido.
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- RASGO:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: mat_péptido
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- SITUACIÓN: 143..346
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- MÉTODO DE IDENTIFICACIÓN: por similaridad con secuencia conocida en un consenso establecido.
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC. ID. Nº: 4:
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SECUENCIA DE ID. Nº:
5:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 93 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC. ID. Nº: 5:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SECUENCIA DE ID. Nº:
6:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 279 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucléico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADNc para ARNm
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC. ID. Nº: 6:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SECUENCIA DE ID. Nº:
7:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 3526 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucléico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADNc para ARNm
\vskip0.800000\baselineskip
- (x)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC. ID. Nº: 7:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SECUENCIA DE ID. Nº:
8:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 3526 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucléico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADNc para ARMm
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Homo sapiens
\vskip0.500000\baselineskip
- (H)
- LÍNEA CELULAR: FLEB14
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- RASGO:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: CDS
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- SITUACIÓN: 80..361
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- MÉTODO DE IDENTIFICACIÓN: por similaridad con otros patrones.
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix
- ) RASGO:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: sig_péptido
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- SITUACIÓN: 80..142
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- MÉTODO DE IDENTIFICACIÓN: por similaridad con secuencia conocida en un consenso establecido.
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- RASGO:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: mat_péptido
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- SITUACIÓN: 143..358
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- MÉTODO DE IDENTIFICACIÓN: por similaridad con secuencia conocida en un consenso establecido.
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC. ID. Nº: 8:
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SECUENCIA DE ID. Nº:
9:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 1797 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucléico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADNc para ARNm
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC. ID. Nº: 9:
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SECUENCIA DE ID. Nº:
10:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 14 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucléico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: doble
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADNc
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC. ID. Nº: 10:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipAATTCGCGGC CGCT
\hfill
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SECUENCIA DE ID. Nº:
11:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 10 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucléico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: doble
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADNc
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- RASGO:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: rasgo_misc
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- SITUACIÓN: 1
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- OTRA INFORMACIÓN: /marca= fosforilado
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC. ID. Nº: 11:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipAGCGGCCGCG
\hfill
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SECUENCIA DE ID. Nº:
12:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 28 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucléico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: doble
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (sintético)
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC. ID. Nº: 12:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipGTAATACGAC TCACTATAGG GGAGAGCT
\hfill
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SECUENCIA DE ID. Nº:
13:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 28 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucléico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: doble
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (sintético)
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC. ID. Nº: 13:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipCTCCCCTATA GTGAGTCGTA TTACTGCA
\hfill
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SECUENCIA DE ID. Nº:
14:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 32 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucléico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: doble
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (sintético)
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC. ID. Nº: 14:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipCTAGTCTATA GTGTCACCTA AATCGTGGGT AC
\hfill
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SECUENCIA DE ID. Nº:
15:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 23 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucléico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: doble
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (sintético)
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC. ID. Nº: 15:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipCACGATTTAG GTGACACTAT AGA
\hfill
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SECUENCIA DE ID. Nº:
16:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 44 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucléico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (sintético)
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC. ID. Nº: 16:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipAATATAGTCG ACCACCATGA ACGCCAAGGT CGTGGTCGTG CTGG
\hfill
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SECUENCIA DE ID. Nº:
17:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 37 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucléico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (sintético)
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi
- ) DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC. ID. Nº: 17:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipCGGCGGACTA GTTTACTTGT TTAAAGCTTT CTCCAGG
\hfill
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SECUENCIA DE ID. Nº:
18:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 55 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucléico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (sintético)
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC. ID. Nº: 18:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipGCCGCCACTA GTTTAGTGGT GGTGGTGGTG GTGCTTGTTT AAAGCTTTCT CCAGG
\hfill
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SECUENCIA DE ID. Nº:
19:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 39 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucléico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (sintético)
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC. ID. Nº: 19:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipCGGCGGACTA GTTCACATCT TGAACCTCTT GTTTAAAGC
\hfill
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SECUENCIA DE ID. Nº:
20:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 57 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucléico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (sintético)
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC. ID. Nº: 20:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipGCCGCCACTA GTTCAGTGGT GGTGGTGGTG GTGCATCTTG AACCTCTTGT TTAAAGC
\hfill
Claims (16)
1. Un polipéptido poseyendo la secuencia
aminoacídica mostrada en la SEC. ID. Nº 1.
2. ADN que posee la secuencia nucleotídica
mostrada en la SEC. ID. Nº 2.
3. ADN que posee la secuencia nucleotídica
mostrada en la SEC. ID. Nº 3.
4. Un vector de replicado y expresión
comprendiendo ADN conforme a cualquiera de las reivindicaciones 2 o
3.
5. Células huésped transformadas o transfectadas
con un vector de replicado y expresión, conforme a la reivindicación
4.
6. Un método de producción de un polipéptido, el
cual comprende el cultivo de células huésped conforme a la
reivindicación 5, bajo condiciones efectivas para la expresión de
un polipéptido conforme a la reivindicación 1.
7. Una composición farmacéutica conteniendo un
polipéptido conforme a la reivindicación 1, junto con un diluyente
y/o portador farmacéuticamente aceptable.
8. Un polipéptido que posee la secuencia
aminoacídica mostrada en la SEC. ID. Nº 5.
9. ADN que posee la secuencia nucleotídica
mostrada en la SEC. ID. Nº 6.
10. ADN que posee la secuencia nucleotídica
mostrada en la SEC. ID. Nº 7.
11. Un vector de replicado y expresión
comprendiendo ADN conforme a cualquiera de las reivindicaciones 9 o
10.
12. Células huésped transformadas o transfectadas
con un vector de replicado y expresión, conforme a la reivindicación
11.
13. Un método de producción de un polipéptido, el
cual comprende el cultivo de células huésped conforme a la
reivindicación 12, bajo condiciones efectivas para la expresión de
un polipéptido conforme a la reivindicación 8.
14. Una composición farmacéutica conteniendo un
polipéptido conforme a la reivindicación 8, junto con un diluyente
y/o portador farmacéuticamente aceptable.
15. Un polipéptido que presenta una región que
oscila de la posición 22 a la posición 89 en la secuencia
aminoácida mostrada en la SEC ID No. 1.
16. Un polipéptido que presenta una región que
oscila de la posición 22 a la posición 93 en la secuencia
aminoácida mostrada en la SEC ID No. 5.
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