ES2256855T3 - Vih - 1 del grupo o, secuencias de dichos virus y sus aplicaciones. - Google Patents

Vih - 1 del grupo o, secuencias de dichos virus y sus aplicaciones.

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ES2256855T3
ES2256855T3 ES96904904T ES96904904T ES2256855T3 ES 2256855 T3 ES2256855 T3 ES 2256855T3 ES 96904904 T ES96904904 T ES 96904904T ES 96904904 T ES96904904 T ES 96904904T ES 2256855 T3 ES2256855 T3 ES 2256855T3
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Francois Simon
Sentob Saragosti
Ibtissam Loussert-Ajaka
Thoai-Duong Ly
Marie-Laure Chaix-Baudier
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Abstract

CEPAS DE RETROVIRUS VIH LAS CEPAS LLAMADAS BCF02, BCF01, BCF06, BCF07, BCF08, BCF11, BCF03, BCF09, BCF12, BCF13 Y BCF14, FRAGMENTOS DE DICHOS RETROVIRUS, ASI COMO SUS APLICACIONES, COMO REACTIVO DE DIAGNOSTICO Y COMO AGENTE INMUNOGENO.

Description

VIH-1 de grupo O, fragmentos de dichos virus, así como sus aplicaciones.
La presente invención se refiere a cepas de retrovirus del grupo VIH-1, grupo O, y particularmente a las cepas denominadas BCF02 (ESS), BCF01 (FAN), BCF06 (LOB), BCF07 (MAN), BCF08 (NKO), BCF11 (NAN) y BCF03 (POC), a fragmentos de dichos retrovirus, así como a sus aplicaciones como reactivo de diagnóstico y como agente inmunogénico.
Se han descrito dos tipos distintos de VIH (virus de la inmunodeficiencia humana: VIH-1 y VIH-2) y son los agentes responsables del SIDA. El análisis de su secuencia de ácido nucleico ha permitido identificar diferentes subtipos de VIH-1, aunque no se ha podido establecer ninguna correlación entre la variabilidad y la patogenicidad. De manera similar, el VIH-2 presenta una diversidad genética y biológica mayor que la anteriormente prevista.
El análisis de los fragmentos nucleotídicos de diferentes aislamientos de VIH-1 ha mostrado la existencia, mediante el análisis del gen env, de al menos 7 subtipos diferentes, denominados A a G (MYERS, G. et al., "Human retro-viruses and AIDS", 1993, Los Alamos Nat. Lab.).
Más recientemente, se han aislado igualmente otros dos aislamientos, considerados como claramente más distantes de los otros 7 subtipos, es decir, cuya homología de secuencia es la más distante de la de las cepas de referencia VIH-1: VIH-1ANT70 y VIH-1MVP5180, obtenidos a partir de pacientes cameruneses, y se han incorporado a un nuevo grupo de VIH-1, el grupo O, en contraposición al grupo M correspondiente a los 7 subtipos A-G anteriormente citados, teniendo en cuenta su organización genómica (5' LTR Gag Pol Vif Vpu Vpr Tat Rev Env Nef LTR 3'). (Solicitud de pa-
tente WO 98/12094, solicitud de patente europea nº 0.591.914, GÜRTLER L.G., et al., J. Virol., 1994, 68, 1581-1585).
El análisis de las secuencias de ADN ha mostrado 65-70% de similitud con VIH-1 y 56% con VIH-2.
Chameau et al., (Virology, 1994, 205, pág. 247-253) describen el aislamiento de la cepa VAU del VIH-1 de tipo O y la comparan con las cepas ANT70 y MVP5180. Nkengasong et al. (AIDS 1994, 8, pág. 1405-1412) describen el aislamiento de otra cepa clasificada en el tipo O basándose en una secuencia parcial del gen pol.
Al emplear un procedimiento de inmunotransferencia competitiva, utilizando un péptido V3 de MVP5180, se ha encontrado una prevalencia de 7-8% en Yaundé. Esta prevalencia podría estar subestimada, en la medida en que el bucle V3 es conocido en todos los subtipos de VIH-1 por ser una región altamente variable. Los estudios moleculares indican igualmente la presencia de virus de grupo O en Gabón, en Francia, en España y en Alemania.
Los estudios serológicos en curso ponen en evidencia infecciones por los VIH-1 de grupo O en Nigeria, Níger y Senegal.
El conocimiento de estos diferentes grupos y subtipos es particularmente importante para poner a punto:
-
reactivos de prevención de infecciones por VIH suficientemente sensibles y específicas, es decir, que no conduzcan a resultados falsos negativos o falsos positivos; y
-
composiciones protectoras frente a todos los subtipos existentes, comprendiendo el conjunto de virus del grupo O.
Efectivamente, se ha mostrado particularmente que ciertos reactivos de detección no eran suficientemente sensibles y no permitían detectar siempre las infecciones por VIH-1, grupo O (LOUSSERT-AJAKA, I. et al., Lancet, 1994, 343, 1393-1394), lo que ha conducido a la retirada de tres kits de prevención y a la desclasificación de otros dos en el mercado francés.
Los resultados revelan que los virus de grupo O están muy distantes de los subtipos del grupo M de VIH-1. Estos resultados indican que los virus VIH-1 deberían clasificarse en dos grupos diferentes, a saber: VIH-1 M y VIH-1 O. Los virus del grupo O parecen poder transmitirse por vías horizontales y verticales, lo que conduce a una distribución muy amplia de esta infección. La patogenicidad de estos virus está en curso de estudio. La divergencia de estos virus debe tenerse en cuenta en la sensibilidad de los ensayos de diagnóstico y en el desarrollo de vacunas.
En consecuencia, la Solicitante ha tenido como objetivo proporcionar fragmentos, obtenidos de cepas seleccionadas de VIH-1 del grupo O, aptos para permitir al mismo tiempo una detección del conjunto de virus VIH-1 de grupo O y una diferenciación específica intragrupo O, e igualmente susceptibles de inducir una protección frente al conjunto de los subtipos de VIH-1, comprendiendo el grupo O, permitiendo dichos fragmentos evitar la obtención de resultados falsos negativos o falsos positivos. Para esto, los inventores han seleccionado un conjunto de cepas y de secuencias, obtenidas esencialmente de una región del gen env, especialmente al nivel de un fragmento hipervariable situado en el bucle V3 (C2V3) o al nivel de la gp41 de una región del gen gag.
La presente invención tiene como objeto cepas de VIH-1 de grupo O que presentan las características morfológicas e inmunológicas de uno de los retrovirus depositados en la "Collection Nationale de Cultures de Microorganismes", mantenida por el Instituto Pasteur, con los números I-1544 (denominada BCF02 (ESS)), I-1543 (denominada BCF01) (FAN)), I-1546 (denominada BCF07 (MAN)), I-1547 (denominada BCF08) (NKO)), I-545 (denominada BCF03 (POC)), con fecha 24 de febrero de 1995.
La presente invención tiene igualmente como objeto un fragmento de ácido nucleico, caracterizado porque su secuencia nucleotídica se elige entre las que están contenidas en una de las secuencias nucleotídicas comprendidas en los genes env o gag de las cepas de VIH-1 de grupo O y sus variantes, y comprende:
-
o bien una de las secuencias siguientes, incluida en el fragmento del gen C2V3-env (bucle hipervariable de la gp120): SEC Nº ID 1 (BCF02 (ESS)), SEC Nº ID 2 (BCF08 (NKO))), SEC Nº ID 3 (BCF03 (POC)), SEC Nº ID 4 (BCF06 (LOB)), SEC Nº ID 5 (BCF07 (MAN)), SEC Nº ID 6 (BCF01 (FAN)), SEC Nº ID 7 (BCF11 (NAN)), SEC Nº ID 50 (BCF09), SEC Nº ID 51 (BCF12), SEC Nº ID 52 (BCF13), SEC Nº ID 53 (BCF14);
-
o bien una de las secuencias siguientes, incluida en el fragmento gp41 del gen env: SEC Nº ID 8 (BCF02 (ESS)), SEC Nº ID 9 (BCF08 (NKO)), SEC Nº ID 10 (BCF03 (POC)), SEC Nº ID 11 (BCF06 (LOB)), SEC Nº ID 12 (BCF07 (MAN)), SEC Nº ID 13 (BCF01 (FAN)), SEC Nº ID 14 (BCF11 (NAN)), SEC Nº ID 54 (BCF09), SEC Nº ID 55 (BCF12), SEC Nº ID 56 (BCF13), SEC Nº ID 57 (BCF14);
-
o bien una de las secuencias siguientes, incluida en el gen gag: SEC Nº ID 15 (BCF02 (ESS)), SEC Nº ID 16 (BCF08 (NKO)), SEC Nº ID 17 (BCF03 (POC)), SEC Nº ID 18 (BCF06 (LOB)), SEC Nº ID 19 (BCF07 (MAN)), SEC Nº ID 20 (BCF01 (FAN)), SEC Nº ID 21 (BCF11 (NAN)), SEC Nº ID 58 (BCF09), SEC Nº ID 59 (BCF12), SEC Nº ID 60 (BCF13), SEC Nº ID 61 (BCF14),
-
o bien, si la secuencia no es idéntica a una de las secuencias nucleotídicas anteriores, o no es complementaria de una de estas secuencias, es sin embargo susceptible de hibridar con una secuencia nucleica obtenida de un virus VIH-1 de grupo O.
En el sentido de la presente invención, se entiende por secuencia nucleica las secuencias tales como se precisan anteriormente y sus secuencias complementarias, así como las secuencias que las contienen.
Dichas secuencias encuentran aplicación al mismo tiempo en la identificación específica de un VIH-1 de grupo O, como reactivo de diagnóstico, solas o en combinación con otros reactivos, para la identificación de cualquier VIH-1, o bien, según el caso, como reactivo de diferenciación intragrupo O.
Estas secuencias pueden emplearse especialmente en ensayos de diagnóstico que comprenden o bien una hibridación directa con la secuencia viral que se va a detectar, o bien una amplificación de dicha secuencia viral, utilizando como cebadores un oligonucleótido incluido en una cualquiera de las secuencias anteriores, y especialmente una de las secuencias siguientes:
\bullet secuencias gag
GAG/5'CAM o G5: CAGGGACAAATGGTACATCA (posiciones 1250-1269) (SEC Nº ID 74),
GAG/3'CAM o G3: AGTAGCTTGCTCAGCTCTTAAT (posiciones 1768-1747) (SEC Nº ID 75),
\bullet secuencias gp41
-
SEC Nº ID 22 (gp41/5'CAM-1): AGRGAAAAAAGAGCAGTAGGAT (posiciones 7800-7821),
-
SEC Nº ID 23 (gp41/5'CAM-2): TCTAAGTGCAGCAGGTAGCACTAT (posiciones 7843-7866),
-
SEC Nº ID 24 (gp41/3'CAM-2): CTAAGTTGCTCAAGAGTGGTA (posiciones 8594-8573),
-
SEC Nº ID 25 (gp41/3'CAM-1): GTTGCTCAAGAGGTGGTAAGT (posiciones 8590-8570),
\bullet Secuencias C2V3:
C2V3/5'CAM o V3L5: TRGTTACTTGTACACATGGCAT (posiciones 6991-7012) (SEC Nº ID 76),
C2V3/3'CAM o V3L3: ACAATAAAAGAATTCTCCATGACAGT (posiciones 7421-7396) (SEC Nº ID 77).
Las posiciones citadas anteriormente corresponden a aquellas de la secuencia Ant70 (Myers, Korber et al., anteriormente citado).
La presente invención tiene igualmente como objeto cepas de VIH-1 de grupo O, caracterizadas porque comprenden al menos una de las secuencias seleccionadas del grupo constituido por las secuencias SEC Nº ID 1 a SEC Nº ID 7 o SEC Nº ID 50 a SEC Nº ID 53, al menos una de las secuencias seleccionadas del grupo constituido por las secuencias SEC Nº ID 8 a SEC Nº ID 14 o SEC Nº ID 54 a SEC Nº ID 57, y al menos una de las secuencias seleccionadas del grupo constituido por las secuencias SEC Nº ID 15 a SEC Nº ID 21 o SEC Nº ID 5 a SEC Nº ID
61.
Según un modo de realización ventajoso de dicha cepa, comprende las secuencias SEC Nº ID 50, SEC Nº ID 54, SEC Nº ID 58; esta cepa se ha denominado BCF09.
Según otro modo de realización ventajoso de dicha cepa, comprende las secuencias SEC Nº ID 51, SEC Nº ID 55, SEC Nº ID 59; esta cepa se ha denominado BCF12.
Según aún otro modo de realización ventajoso de dicha cepa, comprende las secuencias SEC Nº ID 52, SEC Nº ID 56, SEC Nº ID 60; esta cepa se ha denominado BCF13.
Según aún otro modo de realización ventajoso de dicha cepa, comprende las secuencias SEC Nº ID 53, SEC Nº ID 57, SEC Nº ID 61; esta cepa se ha denominado BCF14.
Según otro modo de realización ventajoso de dicha cepa, comprende las secuencias SEC Nº ID 7, SEC Nº ID 14, SEC Nº ID 21; esta cepa se ha denominado BCF11.
Según aún otro modo de realización ventajoso de dicha cepa, comprende las secuencias SEC Nº ID 4, SEC Nº ID 11, SEC Nº ID 18; esta cepa se ha denominado BCF06.
La invención tiene igualmente como objeto la utilización de las secuencias descritas anteriormente para el empleo de un procedimiento de hibridación o de amplificación génica de secuencias nucleicas del tipo VIH-1, siendo aplicables estos procedimientos al diagnóstico in vitro de la infección potencial de un individuo por un virus del tipo VIH-1, comprendiendo el grupo O.
Este procedimiento de diagnóstico in vitro se realiza a partir de una muestra biológica (suero, linfocitos en circulación) y comprende:
-
una etapa de extracción del ácido nucleico que se va a detectar, que pertenece al genoma del virus del tipo VIH-1, eventualmente presente en la muestra biológica, y dado el caso una etapa de tratamiento del ácido nucleico con ayuda de una transcriptasa inversa, si éste último está en forma de ARN,
-
al menos un ciclo que comprende las etapas de desnaturalización del ácido nucleico, hibridación con al menos una secuencia según la invención y extensión del híbrido formado, en presencia de reactivos convenientes (agente de polimerización tal como ADN polimerasa y dNTP), y
-
una etapa de detección de la eventual presencia del ácido nucleico que pertenece al genoma de un virus de tipo VIH-1 de grupo O (especificidad de grupo).
La invención tiene igualmente como objeto un péptido, caracterizado porque se expresa por una secuencia nucleotídica tal como la definida anteriormente.
Entre estos péptidos, se pueden citar, particularmente:
-
aquellos expresados por el fragmento del gen C2V3-env según la invención, a saber: SEC Nº ID 26 (BCF02 (ESS)), SEC Nº ID 27 (BCF01 (FAN)), SEC Nº ID 28 (BCF01 (FAN)), SEC Nº ID 29 (BCF06 (LOB)), SEC Nº ID 30 (BCF07 (MAN)), SEC Nº ID 31 (BCF11 (NAN)), SEC Nº ID 32 (BCF08 (NKO)), SEC Nº ID 33 (BCF08 (NKO)), SEC Nº ID 34 (BCF03 (POC)), SEC Nº ID 35 (BCF03 (POC)), SEC Nº ID 62 (BCF09), SEC Nº ID 63 (BCF12), SEC Nº ID 64 (BCF13), SEC Nº ID 65 (BCF14),
-
aquellos expresados por el fragmento del gen gp41 env según la invención, a saber: SEC Nº ID 36 (BCF02 (ESS)), SEC Nº ID 37 (BCF01 (FAN)), SEC Nº ID 38 (BCF06 (LOB)), SEC Nº ID 39 (BCF07 (MAN)), SEC Nº ID 40 (BCF09 (NKO)), SEC Nº ID 41 (BCF03 (POC)), SEC Nº ID 42 (BCF11 (NAN)), SEC Nº ID 66 (BCF09), SEC Nº ID 67 (BCF12), SEC Nº ID 68 (BCF13), SEC Nº ID 69 (BCF14),
-
aquellos expresados por el fragmento del gen gag según la invención, a saber, SEC Nº ID 43 (BCF02 (ESS)), SEC Nº ID 44 (BCF01 (FAN)), SEC Nº ID 45 (BCF06 (LOB)), SEC Nº ID 46 (BCF07 (MAN)), SEC Nº ID 47 (BCF11 (NAN)), SEC Nº ID 48 (BCF08 (NKO)), SEC Nº ID 49 (BCF03 (POC)), SEC Nº ID 70 (BCF09), SEC Nº ID 71 (BCF12), SEC Nº ID 72 (BCF13), SEC Nº ID 73 (BCF14).
La invención tiene igualmente como objeto composiciones inmunogénicas que comprenden uno o varios productos de traducción de las secuencias nucleotídicas según la invención o un fragmento de estos y/o al menos uno de los péptidos tales como los definidos anteriormente.
\newpage
La invención tiene igualmente como objeto los anticuerpos dirigidos contra uno o varios de los péptidos descritos anteriormente y su utilización para el empleo de procedimientos de diagnóstico in vitro de la infección de un individuo por un virus de tipo VIH-1, según procedimientos conocidos por el experto en la técnica.
A modo de ilustración, uno de dichos procedimientos de diagnóstico in vitro según la invención comprende la puesta en contacto de una muestra biológica extraída de un paciente con anticuerpos según la invención, y la detección con ayuda de cualquier procedimiento apropiado, especialmente con la ayuda de inmunoglobulinas marcadas, de complejos inmunogénicos formados entre los antígenos de virus del tipo VIH-1 eventualmente presentes en la muestra biológica y dichos anticuerpos.
La presente invención tiene igualmente como objeto un procedimiento de cribado y de tipificación de VIH-1, grupo O, caracterizado porque comprende la puesta en contacto de uno cualquiera de los fragmentos nucleotídicos según la invención con el ácido nucleico del virus que se va a tipificar y la detección del híbrido formado.
Además de las disposiciones precedentes, la invención comprende aún otras disposiciones que surgirán de la descripción siguiente, que se refiere a ejemplos de empleo del procedimiento objeto de la presente invención, así como a los dibujos adjuntos, en los que:
- la figura 1 representa las secuencias comparadas de aminoácidos expresadas por el fragmento del gen env C2V3;
- la figura 2 representa las secuencias comparadas de aminoácidos expresadas por el fragmento del gen gag;
- la figura 3 ilustra los resultados obtenidos con las 7 cepas BCF02 (ESS), BCF01 (FAN), BCF07 (MAN), BCF11 (NAN), BCF08 (NKO), BCF03 (POC) y BCF06 (LOB) sobre gel de agarosa de una PCR realizada con los cebadores C2V3 citados anteriormente;
- la figura 4 ilustra los resultados obtenidos con las 7 cepas BCF02 (ESS), BCF01 (FAN), BCF07 (MAN), BCF11 (NAN), BCF08 (NKO), BCF03 (POC) y BCF06 (LOB) sobre gel de agarosa de una PCR realizada con los cebadores Gag citados anteriormente;
- la figura 5 representa los marcadores utilizados en las figuras 3 y 4;
- la figura 6 ilustra la reactividad del suero correspondiente a las cepas según la invención, con relación a la organización fenética de estas variantes;
- la figura 7 ilustra un análisis filogenético basado en la región gag.
Debe entenderse, sin embargo, que estos ejemplos se dan únicamente a modo de ilustración del objeto de la invención, del que no constituyen en manera alguna una limitación.
Ejemplo 1 Obtención de secuencias según la invención Pacientes
Se incluyen en este estudio siete pacientes cameruneses atendidos u hospitalizados en los hospitales de París.
En el momento del diagnóstico de la seropositividad, cuatro pacientes están en la etapa del SIDA (CDC IVA n= 1, CDC IVC1 n= 3) y tres pacientes son asintomáticos (CDC II). El intervalo de edad varía entre 22 y 44 años para los pacientes sintomáticos y se extiende de 22 a 68 años para los pacientes asintomáticos.
Cuatro pacientes tienen una tasa de CD4+ < 200 x 10^{6}/\mul (10, 19, 91, 97), dos pacientes tienen CD4+ comprendido entre 200 y 500 x 10^{6}/\mul (384, 420) y un paciente tiene CD4+> 500 x 10^{6}/\mul (575).
Cultivos
Se han recogido de 10 a 20 ml de sangre total con heparina de litio para estos siete pacientes. Se aíslan las células mononucleares de sangre periférica (CMSP) con un gradiente de centrifugación Ficoll-Hypaque (Pharmacia). El sedimento celular obtenido se lava 2 veces con RPMI 1640 y se resuspende en medio de cultivo a una concentración de 2 x 10^{6} células/ml. Este medio de cultivo contiene RPMI 1640 completado con 20% de suero de ternera fetal, 10% de interleuquina humana, 150 \mug/ml de estreptomicina, 250 unidades/ml de penicilina G y 5% de L-glutamina. Se cocultivan por duplicado un millón de células del paciente con un millón de células de donantes estimuladas con PHA en placas de cultivo de 24 pocillos (Costar). Se cambia el medio de cultivo dos veces por semana, y se añaden 3 x 10^{5} células de donantes a cada pocillo los días 7, 14 y 21.
Se controla la replicación viral en los sobrenadantes de cultivo durante 28 días, simultáneamente mediante una microtécnica (medida de la actividad transcriptasa inversa) y la detección del antígeno p24 (ELAVIA® p24 Ag, Sanofi Diagnostic Pasteur). Se recogen los sobrenadantes de los cultivos positivos y se guardan a -80ºC para las reinoculaciones.
Preparación del ADN
Se realiza una PCR a partir del ADN de linfocitos recientes extraídos de un paciente, o de linfocitos después de 6 días de cocultivo, o de plasma después de RT. A partir de 100 \mul de una mezcla de reacción que contiene Tris-HCl 10 mmol/l, pH 8,3, KCl 50 mmmol/l, MgCl_{2} 2 mmol/l, 0,2 mmol/l de cada dNTP, 40 pmol de cada cebador, 2,5 U de polimerasa Taq (Perkin Elmer Cetus, St. Quentin Yvelines, Francia) y 1 \mug de ADN celular. Los cebadores utilizados son aquellos precisados anteriormente, a saber:
\bullet secuencias gag
GAG/5'CAM: CAGGGACAAATGGTACATCA (posiciones 1250-1269) (SEC Nº ID 74),
GAG/3'CAM: AGTAGCTTGCTCAGCTCTTAAT (posiciones 1768-1747) (SEC Nº ID 75),
\bullet secuencias gp41
-
gp41/5'CAM-1: AGRGAAAAAAGAGCAGTAGGAT (posiciones 7800-7821) SEC Nº ID 22),
-
gp41/5'CAM-2: TCTAAGTGCAGCAGGTAGCACTAT (posiciones 7843-7866) (SEC Nº ID 23),
-
gp41/3'CAM-2: CTAAGTTGCTCAAGAGTGGTA (posiciones 8594-8573) (SEC Nº ID 24),
-
gp41/3'CAM-1: GTTGCTCAAGAGGTGGTAAGT (posiciones 8590-8570) (SEC Nº ID 25),
\bullet o bien una de las secuencias siguientes: SEC Nº ID 76 y SEC Nº ID 77 para la región env y SEC Nº ID 74 y SEC Nº ID 75 para la región gag, correspondientes respectivamente a los nucleótidos 6991-7012, 7421-7396 y 1250-1269, 1768-1747 de la secuencia HIV1^{Ant70}.
Las muestras se someten a 40 ciclos de amplificación, comprendiendo cada ciclo las tres etapas siguientes: desnaturalización a 94ºC durante 1 minuto, hibridación de los cebadores a 50ºC para la secuencia gag y a 55ºC para la secuencia env, durante un minuto, y extensión a 72ºC durante un minuto. En el primer ciclo, se realiza la desnaturalización durante 4 minutos, y para el último ciclo se realiza la extensión durante 5 minutos. Se someten los productos amplificados a una digestión enzimática (Xho1, EcoRI), se purifican y se clonan en un vector M13mp18, digerido mediante las enzimas de restricción SalI y EcoRI.
Para cada paciente, se secuencian entre 3 y 4 clones (Applied 373A Sequencer) en una región de 406 pb del gen gag, en una región de 320 pb del gen env comprendida en la región V3, y al nivel de la región que codifica la gp41.
Ejemplo 2 Inmunodetección de un VHI-1 de grupo O
Se realizan ensayos ELISA en placas de microvaloración (Falcon 3912, Microtest III®, Becton Dickinson).
Se recubren los pocillos con 100 \mul de uno de los péptidos V3 definidos anteriormente: BCF08 (NKO): R T I Q E I H S G P M A W Y S L G L K R N T T V R (SEC Nº ID 33); BCF01 (FAN): R S V Q E M K I G P L S W S Y M G L A A N S S I K (SEC Nº ID 28); BCF03 (POC): R I K Q I G I G P M S V Y S G S L A D L G N N N (SEC Nº ID 35), diluido a 10 \mug/ml en un tampón carbonato 0,05 M, pH 9,6 mediante incubación durante una noche a 4ºC.
Se lavan a continuación las placas tres veces con un tampón PBS que contiene Tween® 20 (Prolabo, Francia), (PBS-Tween®) al 0,1%, después se saturan con PBS suplementado con leche al 1% (Gloria Co., Francia) durante 1 h a 37ºC.
Se incuban los sueros diluidos (1/100) en una mezcla de PBS-leche que contiene Tween® 20 al 0,1% (PBS-leche-Tween® 20) durante 2 h a 37ºC.
Después de tres lavados, se añaden anticuerpos polivalentes antihumanos, conjugados con fosfatasa alcalina (Sigma) diluidos a 1:10.000 en PBS-leche-Tween, y se incuba durante 1 h a 37ºC. Después del último lavado, se desarrolla la reacción coloreada a 37ºC con un sustrato de fosfatasa alcalina, el fosfato de p-nitrofenilo (Sigma), diluido en un tampón carbonato 0,05 M, pH 9,5 que contiene MgCl_{2} 2 mM, para obtener una concentración de 1 mg/ml. Se registra la absorbancia, medida a 405 nM (A_{405}) con un aparato (MR 5000, Dynatech). Se determina un umbral de corte para cada suero ensayado y corresponde a tres veces el valor de A_{405} obtenido con el péptido E19S, derivado de Plasmodium malariae.
La tabla I siguiente muestra los resultados obtenidos.
Las secuencias consenso y FR 15-1 corresponden a las obtenidas a partir del subtipo B, encontrado en Francia.
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1
\newpage
Esta Tabla I muestra la especificidad de los péptidos según la invención.
Ejemplo 3 Particularidades serotípicas, fenotípicas y genotípicas de las cepas según la invención
Se ilustran estas particularidades en las tablas II y III a continuación.
TABLA II
2
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TABLA III
3
4
El análisis serotípico en un conjunto de ensayos comercializados (tabla II) (con excepción del ensayo nº 6, EIA Ag V3 ANT70, producto de investigación no comercializado) pone en evidencia la gran diversidad de respuesta de anticuerpos frente a los antígenos del subtipo B dominantes en Occidente y con relación al antígeno del bucle V3 de la cepa ANT70. Los sueros, correspondientes a cada uno de los aislamientos según la invención, presentan un perfil único y característico. BCF01 es el único positivo para el ensayo 2 (Clonatec®). BCF02 es completamente negativo para los antígenos de subtipo B. A la inversa, BCF03 reacciona con el subtipo B, pero es negativo para los antígenos ANT70. BCF07 es el único negativo para los ensayos nº 2 (Clonatec) y nº 3 (Abbott 3º), pero es reactivo para el conjunto de los demás ensayos con antígeno del grupo M. BCF08 es estrictamente negativo para el ensayo EIA V3 ANT70, pero como BCF11, débilmente reactivo para este antígeno por el ensayo 7 (InnoLIA). En comparación, el suero correspondiente a la cepa VAU, que se ha caracterizado molecularmente por CHARNEAU et al. (Virology, 1994, 205, 247-253), es positivo para todos estos antígenos con excepción del ensayo 2 (Clonatec®). Esta diversidad de respuesta de anticuerpos ha de interpretarse como el reflejo de la diversidad antigénica de estas cepas. Está excluido un nexo con la inmunodepresión, al ser completamente asintomáticos los pacientes de BCF07, 08 y 11 con un número de CD4>400/ml. La figura 6 indica la reactividad de los sueros correspondientes a las cepas según la invención con relación a la organización fenética de estas variantes.
La caracterización fenotípica de los aislamientos según la invención muestra la importancia y la necesidad de disponer de un gran número de reactivos sensibles. Todos son resistentes naturalmente a la molécula Tibo Ro82913 (tabla III) como ya se ha reseñado para VIH-2. Una ausencia de actividad inhibidora del crecimiento in vitro, además de un tratamiento para Ro82913, no se había reseñado nunca para VIH-1 hasta el momento. En contraposición, la cepa VAU es perfectamente sensible a Ro82913.
Las cepas son igualmente resistentes a otro inhibidor no nucleosídico, la delaverdina, con la excepción de la cepa BCF11, que es sensible.
A la inversa, esta cepa es resistente al saquinavir, una antiproteasa, mientras que las demás cepas son sensibles al mismo.
Esta diversidad de respuestas a los anti-retrovirales refuerza la noción de una gran dispersión en el seno mismo de las variantes de Camerún.
Además, los resultados de formación de sincitio en la línea continua MT2 complican cualquier clasificación, ya que no tienen correlación con los resultados serotípicos o genotípicos precedentes ni relación con el estado clínico. Estas cepas no inducen la formación sincitial, mientras que la detección del antígeno p24 en los sobrenadantes confirma la replicación en esta línea.
Finalmente, al nivel genotípico, todas las amplificaciones de los genomas de cepas según la invención son negativas para PCR utilizando un kit comercializado por Roche Diagnostics que utiliza cebadores y sondas correspondientes a una región conservada del gen gag de VIH-1; era igualmente posible una negatividad en este ensayo en los subtipos A de VIH-1 (LOUSSERT-AJAKA et al., 1985, Lancet, 346, 912-913; LOUSSERT-AJAKA et al., 1995, 346, 1489). Esta negatividad en el seno de los aislamientos de variantes de Camerún, pero también en el seno de los subtipos A, refuerza esta noción de gran variabilidad de VIH-1 y muestra la necesidad para la detección de los ácidos nucleicos de VIH-1 de utilizar un gran panel de secuencias, y particularmente, aquellas según la presente invención.
Las figuras 6 y 7 corresponden a un análisis filogenético basado en la región de gag.
La filogenia de los genes gag confirma la dispersión de estas variantes y la dificultad de reagruparlas en subtipos, siquiera en un grupo de exclusión, y muestra la necesidad de una selección de variantes que presenten caracteres fenéticos y genéticos particulares y cuyos sueros correspondientes tengan perfiles de reactividad o de no reactividad característicos, aptos para permitir la detección de VIH-1 en los sueros considerados precedentemente como falsos negativos.
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77
78
79
(1) INFORMACIONES GENERALES
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
SOLICITANTE:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
NOMBRE: INSTITUT NATIONAL DE LA RECHERCHE MEDICALE- INSERM
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CALLE: 101 RUE DE TOLBIAC
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
CIUDAD: PARÍS
\vskip0.500000\baselineskip
(E)
PAÍS: FRANCIA
\vskip0.500000\baselineskip
(F)
CÓDIGO POSTAL: 75654 CEDEX 13
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
NOMBRE: ASSISTANCE PUBLIQUE- HOPITAUX DE PARIS
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CALLE: 3 AVENUE VICTORIA
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
CIUDAD: PARÍS
\vskip0.500000\baselineskip
(E)
PAÍS: FRANCIA
\vskip0.500000\baselineskip
(F)
CÓDIGO POSTAL: 75004
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
NOMBRE: SIMON, François
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CALLE: 8 rue Germain Pilon
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
CIUDAD: PARÍS
\vskip0.500000\baselineskip
(E)
PAÍS: FRANCIA
\vskip0.500000\baselineskip
(F)
CÓDIGO POSTAL: 75018
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
NOMBRE: SARAGOSTI, Sentob
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CALLE: 69 rue de Billancourt
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
CIUDAD: BOULOGNE-BILLANCOURT
\vskip0.500000\baselineskip
(E)
PAÍS: FRANCIA
\vskip0.500000\baselineskip
(F)
CÓDIGO POSTAL: 92100
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
NOMBRE: LOUSSERT-AJAKA Ibtissam
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CALLE: 26 avenue de la REPUBLIQUE
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
CIUDAD: SARTROUVILLE
\vskip0.500000\baselineskip
(E)
PAÍS: FRANCIA
\vskip0.500000\baselineskip
(F)
CÓDIGO POSTAL: 78500
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
NOMBRE: LY Thoai-Duong
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CALLE: 22 rue PERREIRE
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
CIUDAD: RUEIL-MALMAISON
\vskip0.500000\baselineskip
(E)
PAÍS: FRANCIA
\vskip0.500000\baselineskip
(F)
CÓDIGO POSTAL: 92500
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
NOMBRE: CHAIX-BAUDIER, Marie-Laure
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CALLE: 37 rue Godefroy Cavaignac
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
CIUDAD: PARÍS
\vskip0.500000\baselineskip
(E)
PAÍS: FRANCIA
\vskip0.500000\baselineskip
(F)
CÓDIGO POSTAL: 75011
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TÍTULO DE LA INVENCIÓN: VIH-1 DE GRUPO O, FRAGMENTOS DE DICHOS VIRUS Y SUS APLICACIONES
\vskip0.800000\baselineskip
(iii)
NÚMERO DE SECUENCIAS: 77
\vskip0.800000\baselineskip
(iv)
FORMA LEGIBLE INFORMÁTICAMENTE:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
TIPO DE SOPORTE: disquete
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
ORDENADOR: Compatible con PC de IBM
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
SISTEMA OPERATIVO: PC-DOS/MS-DOS
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
SOFTWARE: PatentIn Release nº 1.0, versión nº 1.30 (OEP)
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
DATOS DE LA SOLICITUD ANTERIOR
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
NÚMERO DE LA SOLICITUD: FR 9502236
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
FECHA DE LA PRESENTACIÓN: 27 de febrero de 1995
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIONES PARA LA SEC Nº ID 1:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 291 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: nucleótido
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
NÚMERO DE CADENAS: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
CONFIGURACIÓN: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC Nº ID 1:
\vskip1.000000\baselineskip
5
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIONES PARA LA SEC Nº ID 2:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 294 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: nucleótido
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
NÚMERO DE CADENAS: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
CONFIGURACIÓN: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC Nº ID 2
\vskip1.000000\baselineskip
6
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIONES PARA LA SEC Nº ID 3:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 297 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: nucleótido
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
NÚMERO DE CADENAS: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
CONFIGURACIÓN: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC Nº ID 3
\vskip1.000000\baselineskip
7
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIONES PARA LA SEC Nº ID 4:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 294 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: nucleótido
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
NÚMERO DE CADENAS: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
CONFIGURACIÓN: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC Nº ID 4
\vskip1.000000\baselineskip
8
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIONES PARA LA SEC Nº ID 5:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 291 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: nucleótido
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
NÚMERO DE CADENAS: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
CONFIGURACIÓN: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC Nº ID 5:
\vskip1.000000\baselineskip
9
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIONES PARA LA SEC Nº ID 6:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 291 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: nucleótido
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
NÚMERO DE CADENAS: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
CONFIGURACIÓN: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC Nº ID 6:
\vskip1.000000\baselineskip
10
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIONES PARA LA SEC Nº ID 7:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 296 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: nucleótido
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
NÚMERO DE CADENAS: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
CONFIGURACIÓN: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC Nº ID 7:
\vskip1.000000\baselineskip
11
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIONES PARA LA SEC Nº ID 8:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 120 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: nucleótido
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
NÚMERO DE CADENAS: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
CONFIGURACIÓN: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC Nº ID 8:
\vskip1.000000\baselineskip
12
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIONES PARA LA SEC Nº ID 9:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 120 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: nucleótido
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
NÚMERO DE CADENAS: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
CONFIGURACIÓN: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC Nº ID 9:
\vskip1.000000\baselineskip
13
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIONES PARA LA SEC Nº ID 10:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 120 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: nucleótido
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
NÚMERO DE CADENAS: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
CONFIGURACIÓN: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC Nº ID 10:
\vskip1.000000\baselineskip
14
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIONES PARA LA SEC Nº ID 11:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 120 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: nucleótido
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
NÚMERO DE CADENAS: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
CONFIGURACIÓN: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC Nº ID 11:
\vskip1.000000\baselineskip
15
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIONES PARA LA SEC Nº ID 12:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 120 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: nucleótido
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
NÚMERO DE CADENAS: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
CONFIGURACIÓN: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC Nº ID 12:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
16
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIONES PARA LA SEC Nº ID 13:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 120 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: nucleótido
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
NÚMERO DE CADENAS: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
CONFIGURACIÓN: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC Nº ID 13:
17
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIONES PARA LA SEC Nº ID 14:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 120 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: nucleótido
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
NÚMERO DE CADENAS: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
CONFIGURACIÓN: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC Nº ID 14:
18
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIONES PARA LA SEC Nº ID 15:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 399 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: nucleótido
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
NÚMERO DE CADENAS: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
CONFIGURACIÓN: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC Nº ID 15:
19
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIONES PARA LA SEC Nº ID 16:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 399 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: nucleótido
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
NÚMERO DE CADENAS: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
CONFIGURACIÓN: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC Nº ID 16:
20
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIONES PARA LA SEC Nº ID 17:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 399 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: nucleótido
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
NÚMERO DE CADENAS: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
CONFIGURACIÓN: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC Nº ID 17:
21
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIONES PARA LA SEC Nº ID 18:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 399 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: nucleótido
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
NÚMERO DE CADENAS: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
CONFIGURACIÓN: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC Nº ID 18:
\vskip1.000000\baselineskip
22
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIONES PARA LA SEC Nº ID 19:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 399 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: nucleótido
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
NÚMERO DE CADENAS: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
CONFIGURACIÓN: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC Nº ID 19:
\vskip1.000000\baselineskip
23
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIONES PARA LA SEC Nº ID 20:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 399 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: nucleótido
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
NÚMERO DE CADENAS: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
CONFIGURACIÓN: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC Nº ID 20:
\vskip1.000000\baselineskip
24
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIONES PARA LA SEC Nº ID 21:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 399 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: nucleótido
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
NÚMERO DE CADENAS: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
CONFIGURACIÓN: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC Nº ID 21:
\vskip1.000000\baselineskip
25
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIONES PARA LA SEC Nº ID 22:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 22 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: nucleótido
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
NÚMERO DE CADENAS: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
CONFIGURACIÓN: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: Otro ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
DESCRIPCIÓN: /desc= "cebador"
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC Nº ID 22:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
AGRGAAAAAA GAGCAGTAGG AT
\hfill
22
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIONES PARA LA SEC Nº ID 23:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 24 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: nucleótido
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
NÚMERO DE CADENAS: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
CONFIGURACIÓN: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: Otro ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
DESCRIPCIÓN: /desc= "cebador"
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC Nº ID 23:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
TCTAAGTGCA GCAGGTAGCA CTAT
\hfill
24
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIONES PARA LA SEC Nº ID 24:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 21 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: nucleótido
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
NÚMERO DE CADENAS: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
CONFIGURACIÓN: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: Otro ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
DESCRIPCIÓN: /desc= "cebador"
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC Nº ID 24:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
CTAAGTTGCT CAAGAGTGGT A
\hfill
21
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIONES PARA LA SEC Nº ID 25:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 21 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: nucleótido
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
NÚMERO DE CADENAS: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
CONFIGURACIÓN: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: Otro ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
DESCRIPCIÓN: /desc= "cebador"
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC Nº ID 25:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
GTTGCTCAAG AGGTGGTAAG T
\hfill
21
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIONES PARA LA SEC Nº ID 26:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 97 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
NÚMERO DE CADENAS: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
CONFIGURACIÓN: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: Proteína
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC Nº ID 26:
\vskip1.000000\baselineskip
26
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIONES PARA LA SEC Nº ID 27:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 97 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
NÚMERO DE CADENAS: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
CONFIGURACIÓN: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: Proteína
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC Nº ID 27:
\vskip1.000000\baselineskip
27
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIONES PARA LA SEC Nº ID 28:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 25 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
NÚMERO DE CADENAS: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
CONFIGURACIÓN: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: Péptido
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC Nº ID 28:
\vskip1.000000\baselineskip
28
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIONES PARA LA SEC Nº ID 29:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 98 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
NÚMERO DE CADENAS: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
CONFIGURACIÓN: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: Proteína
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC Nº ID 29:
\vskip1.000000\baselineskip
29
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIONES PARA LA SEC Nº ID 30:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 97 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
NÚMERO DE CADENAS: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
CONFIGURACIÓN: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: Proteína
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC Nº ID 30:
\vskip1.000000\baselineskip
30
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIONES PARA LA SEC Nº ID 31:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 99 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
NÚMERO DE CADENAS: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
CONFIGURACIÓN: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: Proteína
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC Nº ID 31:
\vskip1.000000\baselineskip
31
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIONES PARA LA SEC Nº ID 32:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 98 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
NÚMERO DE CADENAS: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
CONFIGURACIÓN: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: Proteína
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC Nº ID 32:
\vskip1.000000\baselineskip
32
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIONES PARA LA SEC Nº ID 33:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 25 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
NÚMERO DE CADENAS: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
CONFIGURACIÓN: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: Péptido
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC Nº ID 33:
\vskip1.000000\baselineskip
33
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIONES PARA LA SEC Nº ID 34:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 99 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
NÚMERO DE CADENAS: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
CONFIGURACIÓN: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: Proteína
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC Nº ID 34:
\vskip1.000000\baselineskip
34
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIONES PARA LA SEC Nº ID 35:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 24 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
NÚMERO DE CADENAS: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
CONFIGURACIÓN: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: Péptido
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC Nº ID 35:
\vskip1.000000\baselineskip
35
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIONES PARA LA SEC Nº ID 36:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 40 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
NÚMERO DE CADENAS: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
CONFIGURACIÓN: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: Péptido
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC Nº ID 36:
\vskip1.000000\baselineskip
36
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIONES PARA LA SEC Nº ID 37:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 40 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
NÚMERO DE CADENAS: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
CONFIGURACIÓN: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: Péptido
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC Nº ID 37:
37
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIONES PARA LA SEC Nº ID 38:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 40 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
NÚMERO DE CADENAS: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
CONFIGURACIÓN: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: Péptido
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC Nº ID 38:
38
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIONES PARA LA SEC Nº ID 39:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 40 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
NÚMERO DE CADENAS: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
CONFIGURACIÓN: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: Péptido
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC Nº ID 39:
39
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIONES PARA LA SEC Nº ID 40:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 40 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
NÚMERO DE CADENAS: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
CONFIGURACIÓN: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: Péptido
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC Nº ID 40:
40
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIONES PARA LA SEC Nº ID 41:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 40 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
NÚMERO DE CADENAS: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
CONFIGURACIÓN: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: Péptido
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC Nº ID 41:
41
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIONES PARA LA SEC Nº ID 42:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 40 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
NÚMERO DE CADENAS: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
CONFIGURACIÓN: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: Péptido
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC Nº ID 42:
\vskip1.000000\baselineskip
42
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIONES PARA LA SEC Nº ID 43:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 133 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
NÚMERO DE CADENAS: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
CONFIGURACIÓN: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: Proteína
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC Nº ID 43:
\vskip1.000000\baselineskip
43
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIONES PARA LA SEC Nº ID 44:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 133 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
NÚMERO DE CADENAS: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
CONFIGURACIÓN: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: Proteína
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC Nº ID 44:
\vskip1.000000\baselineskip
44
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIONES PARA LA SEC Nº ID 45:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 133 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
NÚMERO DE CADENAS: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
CONFIGURACIÓN: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: Proteína
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC Nº ID 45:
\vskip1.000000\baselineskip
45
46
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIONES PARA LA SEC Nº ID 46:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 133 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
NÚMERO DE CADENAS: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
CONFIGURACIÓN: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: Proteína
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC Nº ID 46:
\vskip1.000000\baselineskip
47
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIONES PARA LA SEC Nº ID 47:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 133 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
NÚMERO DE CADENAS: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
CONFIGURACIÓN: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: Proteína
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC Nº ID 47:
\vskip1.000000\baselineskip
48
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIONES PARA LA SEC Nº ID 48:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 133 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
NÚMERO DE CADENAS: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
CONFIGURACIÓN: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: Proteína
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC Nº ID 48:
\vskip1.000000\baselineskip
49
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIONES PARA LA SEC Nº ID 49:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 133 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
NÚMERO DE CADENAS: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
CONFIGURACIÓN: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: Proteína
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC Nº ID 49:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
50
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIONES PARA LA SEC Nº ID 50:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 282 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: nucleótido
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
NÚMERO DE CADENAS: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
CONFIGURACIÓN: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC Nº ID 50:
\vskip1.000000\baselineskip
51
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIONES PARA LA SEC Nº ID 51:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 279 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: nucleótido
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
NÚMERO DE CADENAS: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
CONFIGURACIÓN: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC Nº ID 51:
52
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIONES PARA LA SEC Nº ID 52:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 282 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: nucleótido
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
NÚMERO DE CADENAS: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
CONFIGURACIÓN: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC Nº ID 52:
53
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIONES PARA LA SEC Nº ID 53:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 279 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: nucleótido
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
NÚMERO DE CADENAS: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
CONFIGURACIÓN: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC Nº ID 53:
\vskip1.000000\baselineskip
54
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIONES PARA LA SEC Nº ID 54:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 120 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: nucleótido
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
NÚMERO DE CADENAS: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
CONFIGURACIÓN: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC Nº ID 54:
\vskip1.000000\baselineskip
55
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIONES PARA LA SEC Nº ID 55:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 120 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: nucleótido
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
NÚMERO DE CADENAS: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
CONFIGURACIÓN: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC Nº ID 55:
\vskip1.000000\baselineskip
56
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIONES PARA LA SEC Nº ID 56:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 119 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: nucleótido
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
NÚMERO DE CADENAS: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
CONFIGURACIÓN: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC Nº ID 56:
\vskip1.000000\baselineskip
57
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIONES PARA LA SEC Nº ID 57:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 120 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: nucleótido
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
NÚMERO DE CADENAS: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
CONFIGURACIÓN: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC Nº ID 57:
\vskip1.000000\baselineskip
58
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIONES PARA LA SEC Nº ID 58:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 399 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: nucleótido
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
NÚMERO DE CADENAS: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
CONFIGURACIÓN: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC Nº ID 58:
\vskip1.000000\baselineskip
59
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIONES PARA LA SEC Nº ID 59:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 399 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: nucleótido
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
NÚMERO DE CADENAS: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
CONFIGURACIÓN: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC Nº ID 59:
\vskip1.000000\baselineskip
60
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIONES PARA LA SEC Nº ID 60:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 397 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: nucleótido
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
NÚMERO DE CADENAS: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
CONFIGURACIÓN: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC Nº ID 60:
\vskip1.000000\baselineskip
61
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIONES PARA LA SEC Nº ID 61:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 399 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: nucleótido
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
NÚMERO DE CADENAS: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
CONFIGURACIÓN: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC Nº ID 61:
\vskip1.000000\baselineskip
62
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIONES PARA LA SEC Nº ID 62:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 94 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
NÚMERO DE CADENAS: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
CONFIGURACIÓN: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: Proteína
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC Nº ID 62:
\vskip1.000000\baselineskip
63
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIONES PARA LA SEC Nº ID 63:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 93 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
NÚMERO DE CADENAS: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
CONFIGURACIÓN: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: Proteína
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC Nº ID 63:
\vskip1.000000\baselineskip
64
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIONES PARA LA SEC Nº ID 64:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 94 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
NÚMERO DE CADENAS: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
CONFIGURACIÓN: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: Proteína
\newpage
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC Nº ID 64:
65
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIONES PARA LA SEC Nº ID 65:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 93 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
NÚMERO DE CADENAS: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
CONFIGURACIÓN: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: Proteína
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC Nº ID 65:
\vskip1.000000\baselineskip
66
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIONES PARA LA SEC Nº ID 66:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 42 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
NÚMERO DE CADENAS: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
CONFIGURACIÓN: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: Péptido
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC Nº ID 66:
\vskip1.000000\baselineskip
67
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIONES PARA LA SEC Nº ID 67:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 41 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
NÚMERO DE CADENAS: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
CONFIGURACIÓN: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: Péptido
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC Nº ID 67:
\vskip1.000000\baselineskip
68
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIONES PARA LA SEC Nº ID 68:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 40 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
NÚMERO DE CADENAS: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
CONFIGURACIÓN: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: Péptido
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC Nº ID 68:
\vskip1.000000\baselineskip
69
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIONES PARA LA SEC Nº ID 69:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 41 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
NÚMERO DE CADENAS: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
CONFIGURACIÓN: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: Péptido
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC Nº ID 69:
\vskip1.000000\baselineskip
70
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIONES PARA LA SEC Nº ID 70:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 133 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
NÚMERO DE CADENAS: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
CONFIGURACIÓN: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: Proteína
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC Nº ID 70:
71
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIONES PARA LA SEC Nº ID 71:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 133 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
NÚMERO DE CADENAS: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
CONFIGURACIÓN: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: Proteína
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC Nº ID 71:
72
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIONES PARA LA SEC Nº ID 72:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 133 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
NÚMERO DE CADENAS: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
CONFIGURACIÓN: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: Proteína
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC Nº ID 72:
73
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIONES PARA LA SEC Nº ID 73:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 133 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
NÚMERO DE CADENAS: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
CONFIGURACIÓN: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: Proteína
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC Nº ID 73:
\vskip1.000000\baselineskip
74
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIONES PARA LA SEC Nº ID 74:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 20 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: nucleótido
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
NÚMERO DE CADENAS: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
CONFIGURACIÓN: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: Otro ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
DESCRIPCIÓN: /desc= "cebador"
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC Nº ID 74:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
CAGGGACAAA TGGTACATCA
\hfill
20
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIONES PARA LA SEC Nº ID 75:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 22 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: nucleótido
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
NÚMERO DE CADENAS: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
CONFIGURACIÓN: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: Otro ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
DESCRIPCIÓN: /desc= "cebador"
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC Nº ID 75:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
AGTAGCTTGC TCAGCTCTTA AT
\hfill
22
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIONES PARA LA SEC Nº ID 76:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 22 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: nucleótido
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
NÚMERO DE CADENAS: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
CONFIGURACIÓN: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: Otro ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
DESCRIPCIÓN: /desc= "cebador"
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC Nº ID 76:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
TRGTTACTTG TACACATGGC AT
\hfill
22
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIONES PARA LA SEC Nº ID 77:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 26 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: nucleótido
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
NÚMERO DE CADENAS: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
CONFIGURACIÓN: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: Otro ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
DESCRIPCIÓN: /desc= "cebador"
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC Nº ID 77:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
ACAATAAAAG AATTCTCCAT GACAGT
\hfill
26

Claims (12)

1. Cepas de VIH-1 de grupo O, caracterizadas porque comprenden al menos una de las secuencias seleccionadas del grupo constituido por las secuencias SEC Nº ID 1 a SEC Nº ID 7 o SEC Nº ID 50 a SEC Nº ID 53, al menos una de las secuencias seleccionadas del grupo constituido por las secuencias SEC Nº ID 8 a SEC Nº ID 14 o SEC Nº ID 54 a SEC Nº ID 57 y al menos una de las secuencias seleccionadas del grupo constituido por las secuencias SEC Nº ID 15 a SEC Nº ID 21 o SEC Nº ID 58 a SEC Nº ID 61.
2. Cepas de VIH-1 de grupo O según la reivindicación 1, caracterizadas porque se seleccionan del grupo constituido por:
-
la cepa que comprende las secuencias SEC Nº ID 1, SEC Nº ID 8 y SEC Nº ID 15, denominada BCF02;
-
la cepa que comprende las secuencias SEC Nº ID 2, SEC Nº ID 9 y SEC Nº ID 16, denominada BCF08;
-
la cepa que comprende las secuencias SEC Nº ID 3, SEC Nº ID 10 y SEC Nº ID 17, denominada BCF03;
-
la cepa que comprende las secuencias SEC Nº ID 4, SEC Nº ID 11 y SEC Nº ID 18, denominada BCF06;
-
la cepa que comprende las secuencias SEC Nº ID 5, SEC Nº ID 12 y SEC Nº ID 19, denominada BCF07;
-
la cepa que comprende las secuencias SEC Nº ID 6, SEC Nº ID 13 y SEC Nº ID 20, denominada BCF01;
-
la cepa que comprende las secuencias SEC Nº ID 7, SEC Nº ID 14 y SEC Nº ID 21, denominada BCF11;
-
la cepa que comprende las secuencias SEC Nº ID 50, SEC Nº ID 54 y SEC Nº ID 58, denominada BCF09;
-
la cepa que comprende las secuencias SEC Nº ID 51, SEC Nº ID 55 y SEC Nº ID 59, denominada BCF12;
-
la cepa que comprende las secuencias SEC Nº ID 52, SEC Nº ID 56 y SEC Nº ID 60, denominada BCF13;
-
la cepa que comprende las secuencias SEC Nº ID 53, SEC Nº ID 57 y SEC Nº ID 61, denominada BCF14.
3. Cepas de VIH-1 de grupo O según la reivindicación 2, depositadas en la "Collection Nationale de Cultures de Microorganismes" mantenida por el Instituto Pasteur con los números I-1544 (denominada BCF02 (ESS)), I-1543 (denominada BCF01) (FAN)), I-1546 (denominada BCF07 (MAN)), I-1547 (denominada BCF08) (NKO)), I-545 (denominada BCF03 (POC)), con fecha 24 de febrero de 1995.
4. Fragmento de ácido nucleico obtenido de un VIH-1 de grupo O, caracterizado porque su secuencia nucleotídica se elige entre las que están contenidas en una de las secuencias nucleotídicas comprendidas en los genes env o gag, y comprende:
-
o bien una de las secuencias SEC Nº ID 1, SEC Nº ID 2, SEC Nº ID 3, SEC Nº ID 4, SEC Nº ID 5, SEC Nº ID 6, SEC Nº ID 7, SEC Nº ID 50, SEC Nº ID 51, SEC Nº ID 52, SEC Nº ID 53, incluida en el fragmento de gen C2V3-env (bucle hipervariable de la gp120);
-
o bien una de las secuencias SEC Nº ID 8, SEC Nº ID 9, SEC Nº ID 10, SEC Nº ID 11, SEC Nº ID 12, SEC Nº ID 13, SEC Nº ID 14, SEC Nº ID 54, SEC Nº ID 55, SEC Nº ID 56, SEC Nº ID 57, incluida en el fragmento gp41 del gen env;
-
o bien una de las secuencias SEC Nº ID 15, SEC Nº ID 16, SEC Nº ID 17, SEC Nº ID 18, SEC Nº ID 19, SEC Nº ID 20, SEC Nº ID 21, SEC Nº ID 58, SEC Nº ID 59, SEC Nº ID 60, SEC Nº ID 61, incluida en el gen gag.
5. Procedimiento de detección de un VIH-1 de grupo O mediante hibridación o amplificación génica, realizado a partir de una muestra biológica (suero, linfocitos en circulación), estando caracterizado este procedimiento porque comprende:
-
una etapa de extracción del ácido nucleico que se va a detectar, que pertenece al genoma del virus del tipo VIH-1, eventualmente presente en la muestra biológica, y dado el caso una etapa de tratamiento del ácido nucleico con ayuda de una transcriptasa inversa, si éste último está en forma de ARN,
-
al menos un ciclo que comprende las etapas de desnaturalización del ácido nucleico, hibridación con al menos una secuencia según la reivindicación 4 y extensión del híbrido formado, en presencia de reactivos convenientes (agente de polimerización tal como ADN polimerasa y dNTP), y
-
una etapa de detección de la eventual presencia del ácido nucleico que pertenece al genoma de un virus de tipo VIH-1 de grupo O.
6. Péptido caracterizado porque se expresa por una cepa de VIH-1 según la reivindicación 1 o la reivindicación 2, o codificado por una secuencia nucleotídica según la reivindicación 4, y porque se selecciona del grupo constituido por:
-
aquellos expresados por el fragmento del gen C2V3-env según la invención, a saber: SEC Nº ID 26, SEC Nº ID 27, SEC Nº ID 28, SEC Nº ID 29, SEC Nº ID 30, SEC Nº ID 31, SEC Nº ID 32, SEC Nº ID 33, SEC Nº ID 34, SEC Nº ID 35, SEC Nº ID 62, SEC Nº ID 63, SEC Nº ID 64, SEC Nº ID 65,
-
aquellos expresados por el fragmento del gen gp41 env según la invención, a saber: SEC Nº ID 36, SEC Nº ID 37, SEC Nº ID 38, SEC Nº ID 39, SEC Nº ID 40, SEC Nº ID 41, SEC Nº ID 42, SEC Nº ID 66, SEC Nº ID 67, SEC Nº ID 68, SEC Nº ID 69,
-
aquellos expresados por el fragmento del gen gag según la invención, a saber, SEC Nº ID 43, SEC Nº ID 44, SEC Nº ID 45, SEC Nº ID 46, SEC Nº ID 47, SEC Nº ID 48, SEC Nº ID 49, SEC Nº ID 70, SEC Nº ID 71, SEC Nº ID 72, SEC Nº ID 73.
7. Composiciones inmunogénicas caracterizadas porque comprenden uno o varios productos de traducción de las secuencias nucleotídicas según la reivindicación 4 y/o al menos uno de los péptidos según la reivindicación 6.
8. Anticuerpos dirigidos contra uno o varios de los péptidos según la reivindicación 6.
9. Procedimiento de diagnóstico in vitro de un VIH-1 de grupo O, caracterizado porque comprende la puesta en contacto de una muestra biológica extraída de un paciente con anticuerpos según la reivindicación 8 y la detección de los complejos inmunológicos formados entre los antígenos de VIH-1, eventualmente presentes en la muestra biológica, y dichos anticuerpos.
10. Procedimiento de cribado y tipificación de VIH-1 de grupo O, caracterizado porque comprende la puesta en contacto de uno cualquiera de los fragmentos nucleotídicos según la reivindicación 4 con el ácido nucleico del virus a tipificar y la detección de la forma híbrida formada.
11. Reactivo de diagnóstico de un VIH-1 de grupo O, caracterizado porque comprende una secuencia según la reivindicación 4 ó 6.
12. Reactivo de diagnóstico caracterizado porque se selecciona del grupo constituido por las secuencias de Nº ID 22, 23, 24 y 25, siendo aptas dichas secuencias para servir como cebadores para la amplificación de un fragmento gp41 de un virus VIH-1 de grupo O.
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* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
DE19505262C2 (de) * 1995-02-16 1998-06-18 Behring Diagnostics Gmbh Retrovirus aus der HIV-Gruppe und dessen Verwendung
FR2761993B1 (fr) * 1997-04-09 1999-05-21 Pasteur Sanofi Diagnostics Peptides synthetiques utilisables dans les essais biologiques pour la detection des infections dues aux virus vih 1 groupe 0
CZ300927B6 (cs) * 1997-04-09 2009-09-16 Bio-Rad Pasteur Syntetický peptid monomerního typu, prostredek, který ho obsahuje, zpusob imunologické in vitro kvantifikace a diagnostický kit pro použití v biologických testech pro identifikaci infekcí zpusobených viry HIV
FR2775287B1 (fr) * 1998-02-24 2000-11-24 Pasteur Sanofi Diagnostics Peptides synthetiques consensus utilisables dans les essais biologiques pour la detection des infections dues aux virus vih 1 du groupe o
WO1999004011A2 (en) * 1997-07-18 1999-01-28 Innogenetics N.V. Hiv-1 group o antigens and uses thereof
WO1999038887A1 (en) * 1998-01-28 1999-08-05 Universal Healthwatch, Inc. Divergent hiv-1 peptides
EP0993615A1 (en) * 1998-03-04 2000-04-19 Universal Healthwatch, Inc. Rapid confirmatory test for microbial infections
WO1999062945A2 (en) * 1998-06-05 1999-12-09 Peptide Solutions, Inc. Peptide antigens for detection of hiv, hcv and other microbial infections
CA2676762C (en) * 1998-11-30 2015-12-29 Ortho-Clinical Diagnostics, Inc. Peptides for the detection of hiv-1 group o
NO311807B1 (no) 1999-03-04 2002-01-28 Bionor Immuno As HIV-peptider, antigener, vaksinepreparater, immunoassay- testsett og en metode for påvisning av antistoffer fremkalt av HIV
AU781934B2 (en) * 1999-07-09 2005-06-23 Gen-Probe Incorporated Detection of HIV-1 by nucleic acid amplification
US6582920B2 (en) 2000-09-01 2003-06-24 Gen-Probe Incorporated Amplification of HIV-1 RT sequences for detection of sequences associated with drug-resistance mutations
FR2869045A1 (fr) * 2004-04-16 2005-10-21 Bioalliance Pharma Sa Methode d'etude de la variabilite genetique et fonctionnelle du vih et kit pour sa mise en oeuvre
CA2577320C (en) * 2004-09-14 2019-08-13 Argos Therapeutics, Inc. Strain-independent amplification of pathogens and vaccines thereto
US10113206B2 (en) * 2010-02-24 2018-10-30 Grifols Therapeutics Inc. Methods, compositions, and kits for determining human immunodeficiency virus (HIV)
WO2011119920A2 (en) 2010-03-25 2011-09-29 Oregon Health & Science University Cmv glycoproteins and recombinant vectors
ES2667425T3 (es) 2011-06-10 2018-05-10 Oregon Health & Science University Glucoproteínas y vectores recombinantes de CMV
AU2012216792A1 (en) 2011-09-12 2013-03-28 International Aids Vaccine Initiative Immunoselection of recombinant vesicular stomatitis virus expressing HIV-1 proteins by broadly neutralizing antibodies
EP2679596B1 (en) 2012-06-27 2017-04-12 International Aids Vaccine Initiative HIV-1 env glycoprotein variant
US20150065381A1 (en) 2013-09-05 2015-03-05 International Aids Vaccine Initiative Methods of identifying novel hiv-1 immunogens
EP2873423B1 (en) 2013-10-07 2017-05-31 International Aids Vaccine Initiative Soluble hiv-1 envelope glycoprotein trimers
US10174292B2 (en) 2015-03-20 2019-01-08 International Aids Vaccine Initiative Soluble HIV-1 envelope glycoprotein trimers
EP3072901A1 (en) 2015-03-23 2016-09-28 International Aids Vaccine Initiative Soluble hiv-1 envelope glycoprotein trimers

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CA2214102A1 (fr) 1996-09-06
US6030769A (en) 2000-02-29
US6270975B1 (en) 2001-08-07
EP0812359B1 (fr) 2005-11-09

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