ES2263652T3 - Sistema de transfeccion potenciada. - Google Patents

Sistema de transfeccion potenciada.

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ES2263652T3 ES01968864T ES01968864T ES2263652T3 ES 2263652 T3 ES2263652 T3 ES 2263652T3 ES 01968864 T ES01968864 T ES 01968864T ES 01968864 T ES01968864 T ES 01968864T ES 2263652 T3 ES2263652 T3 ES 2263652T3
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Abstract

Una composición que comprende un plásmido, comprendiendo el plásmido (a) un elemento oriP y ácido nucleico que codifica EBNA 1, (b) promotor/potenciador CMV (c) ácido nucleico que codifica TAT y TAR; y (d) ADN que codifica una proteína heteróloga.

Description

Sistema de transfección potenciada.
Campo
Esta invención se refiere en general a una mejora en los sistemas de expresión de células de mamífero y específicamente se refiere a un sistema vector de expresión génica de células de mamíferos que incluye un sistema de mantenimiento episomal, un potente promotor/potenciador, un sistema de transactivación de proteínas y ADN que codifica una proteína heteróloga.
Antecedentes
Se sabe bien que diversos huéspedes celulares, tales como células microbianas, células de levadura, células de insecto y células de mamífero son capaces de producir pequeñas cantidades (cantidades en miligramos) de proteínas específicas en periodos de tiempo relativamente cortos. También, se sabe que las proteínas de diferentes sistemas de células huésped manipuladas genéticamente, generan proteínas que tienen diferentes perfiles de glucosilación, dependiendo de la célula usada. Para aplicaciones farmacéuticas, en algunos casos es deseable producir proteínas que tienen perfiles de glucosilación que son similares a los que se encuentran en seres humanos. Estos normalmente se realiza usando un sistema de células de mamífero, puesto que dichos sistemas producen proteínas con glucosilaciones que son compatibles con aplicaciones clínicas. La desventaja de usar células de mamífero es que típicamente requieren un periodo de tiempo más largo para producir una cantidad equivalente de proteínas. Por tanto, sería muy deseable tener un sistema de expresión de células de mamífero manipuladas genéticamente (para expresar proteínas heterólogas) que pueda expresar grandes cantidades de la proteína en cortos periodos de tiempo.
Se sabe que diversos elementos de mantenimiento episomal pueden introducirse en un vector en un sistema de expresión génica para asegurar la replicación. También se sabe bien que los sistemas manipulados genéticamente pueden y, en algunos casos, deben incluir sistemas promotor/potenciador potentes. Además, se sabe bien que las líneas celulares manipuladas genéticamente pueden incluir sistemas de transactivación de proteínas para potenciar la expresión de proteínas de ADN que codifica una proteína heteróloga, que también se incorpora en el sistema. En contraste con estos antecedentes, no se conoce ningún intento o sugerencia para incorporar los cuatro elementos o sistemas anteriores, en un único sistema de expresión de células de mamífero de modo que las ventajas combinadas de todos los elementos estén presentes en un único sistema que funciona y que expresa proteínas heterólogas. Sorprendentemente, cuando la combinación anterior se realizó usando las técnicas descritas a continuación se descubrió lo que parece ser un efecto sinérgico sobre la expresión de proteínas. Ejemplos representativos para dos proteínas heterólogas (denominadas
IL-2SA e IL-4SA) se describen a continuación.
El documento WO 0028060 se refiere a células que pueden usarse para la producción de vectores adenovirales dependientes de auxiliares en ausencia de auxiliares adicionales, puesto que contienen unidades génicas capaces de expresar las funciones necesarias para completar el ciclo viral, que están ausentes en dichos vectores.
El documento de Tsang TC y col (International Journal of Molecular Medicine 5(3): 295-300, 2000.) se refiere a la Construcción de nuevos vectores amplificadores de expresión para niveles altos de expresión génica de IL-2.
Ninguna de las citas mencionan el plásmido de la presente invención.
Sumario de la invención
El sistema de vector de expresión génica de células de mamífero comprende:
(a)
un sistema de mantenimiento episomal,
(b)
un potente promotor/potenciador,
(c)
un sistema de transactivación de proteínas, y
(d)
ADN que codifica proteína heteróloga.
El sistema de mantenimiento episomal y el sistema de transactivación de proteínas pueden incluir sub-elementos que se sitúan en el mismo o en diferentes plásmidos dentro del sistema de expresión de células de mamífero. En un sistema preferido, el sistema de mantenimiento episomal comprende un elemento oriP y un gen que expresa EBNA1. Un potenciador/promotor potente preferido, es CMV y el sistema de transactivación de proteínas preferido incluye los elementos TAT y TAR. Una secuencia codificante de ADN preferida para las proteínas heterólogas, incluye ADN que codifica sustancias (descritas con más detalle a continuación) conocidas como IL-2SA e IL-4SA. Una línea celular de mamífero preferida proviene de un primate, aunque pueden usarse otras líneas celulares de mamífero. Debe observarse, sin embargo, que las líneas celulares preferidas no deben ser de roedor por razones que se dan a continuación.
Los componentes usados para demostrar el sistema se describen a continuación.
1. Un vector de expresión basado en pBR322 se suplementó con un elemento potenciador/promotor CMV humano y 5'-IS para expresión de células de mamífero. Este plásmido es pSM97 (descrito en la Patente de Estados Unidos Nº 5.854.021).
2. Los elementos EBNA1 y oriP, que pueden apoyar el mantenimiento del plásmido de ADN en forma de estructura episomal (Yates y col., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 81:3806:3810 y Patente de Estados Unidos Nº 4.686.186), se añadieron al vector de expresión anterior.
3. Elementos TAT (gen transactivador) y TAR (secuencia sensible a transactivación), que pueden apoyar la función de transactivación de la proteína TAT (descrita en la Patente de Estados Unidos Nº 5.801.056), denominados en este documento como elementos TAT/TAR, se añadieron al vector de expresión para dar como resultado un vector de expresión de oriP combinado con los elementos TAT/TAR.
4. El transactivador BMLF1 (Lieberman y col., J Virol 60:140-148, 1986, Kenney y col., J Virol, 63:3890-3877, 1989, y Ruvolo y col., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 95: 8852-8857) originado a partir de virus Epstein-Barr, se insertó en el vector.
Breve descripción de las figuras
Las Figuras 1-1 y 1-2 muestran mapas físicos de vectores de expresión de una muteína de Interleuquina-2 (denominada IL-2SA), usados para el estudio de transfección de la optimización de vectores de expresión, que incluyeron elementos combinados oriP y TAT/TAR.
La Figura 2 muestra mapas físicos de vectores de expresión usados para el estudio de transfección del efecto de transactivación de BMLF.
La Figura 3 es una diagrama que muestra la potenciación de la secreción de IL-2SA en ensayos de transfección transitoria usados para identificar y comparar el efecto de oriP, el efecto de transactivación de TAT/TAR, y los efectos de transactivación TAT/TAR más oriP. Obsérvese que se supone el pSS179 linealizado como punto de referencia del nivel de expresión de IL-2SA porque la función de oriP debe suprimirse después de la linealización, usando una enzima de restricción y de forma similar con el pSS185 linealizado.
La Figura 4 muestra los efectos de transactivación de BMLF1 sobre la secreción de IL-2SA a partir de células CHO en un periodo de cultivo prolongado. A los 3 dpt, las células se trataron con tripsina y se sembró la misma cantidad de células en un pocillo con un medio fresco suplementado con FBS al 5%. Los niveles de secreción de IL-2SA de células CHO transfectadas con pSS179 se mantuvieron a lo largo de 4-7 dpt de forma similar a los de 3 dpt. Sin embargo, los niveles de expresión de IL-2SA de células CHO transfectadas con pSS212, 213 y 214 después de 4 dpt no mostraron ningún efecto potenciado de actividad de transfección de BMLF1 que se mostró en 3 dpt.
La Figura 5 muestra los efectos de transactivación de BMLF1 sobre la secreción de IL-2SA de células HKB11 en un periodo de cultivo prolongado en selección con fármaco. Los efectos de transactivación de BMLF1 observados a los 3 dpt, de células HKB11 transfectadas con pSS212, 213 y 214, se suprimieron después de añadir HygB, aunque el efecto de TAT/TAR se mantuvo en selección con fármaco como se muestra en la Figura 6.
La Figura 6 muestra los efectos de transactivación de TAT/TAR en la secreción de IL-2SA de células HKB11 en selección con higromicina B. Las células transfectadas se mantuvieron como se describe en el texto.
La Figura 7 muestras mapas físicos de vectores de expresión usados para estudio de cotransfección para expresión de alta producción.
Realizaciones específicas Materiales y Procedimientos Células
Células embrionarias de riñón humano (293) (ATTC CRL-1573) de 293 EBNA (células 293 que expresan EBNA1) obtenidos de Invitrongen (Carlsbad, CA).
Las células CHO (de Ovario de Hámster Chino) negativas para dihidrofolato reductasa (dhfr) se obtuvieron de Genentech Inc.
HKB11 (ATCC, CRL-12568) es una línea celular híbrida somática de seres humanos (Solicitud de Patente de Estados Unidos Nº 09/209.920) obtenida de la fusión celular de células embrionarias de riñón humano (293S) y células de origen del linfoma de Burkitt (P3HR-1).
Construcción de plásmidos
La IL-2SA es una muteína de IL-2 que tiene una única sustitución de aminoácidos (N88R), como se ha descrito en el documento WO 99/60128. Una breve descripción de los vectores de expresión individuales de las Figuras 1-1 y
1-2 es la siguiente.
pSL160N: la secuencia que codifica IL-2SA se insertó en el sitio PvuII de pSM97 y se modificó adicionalmente añadiendo el elemento HSAG1 (fragmento EcoRI y XbaI; 1447 pb) descrito en el documento de McArthur y Stanners (J Biol Chem 266:6000-6005, 1991) en el sitio SpeI de pSM97, y EBV-TR (Cho y col., Solicitud de Patente de Estados Unidos Nº 09/209.915) en el sitio NaeI de pSM97.
pSS179: La secuencia que codifica IL-2SA se insertó en el sitio BamHI/XhoI de pCEP4.
pSS178: El elemento TAR (82 pb) se sitúa cadena arriba de la IL-2SA de pSS179.
pSS185: Un elemento TAT funcional, descrito en la construcción del plásmido, se insertó en el sitio NruI (sitio cadena arriba del promotor TK) de pSS178.
pSH201: Una secuencia intrónica, MIS (\sim270 pb) se situó en el extremo 3' de la secuencia TAR (NotI/HindIII) de pSS185.
pSC221: El elemento HSAG de pSL160N se suprimió, y el elemento TAR se situó en el extremo 3' de CMVe/p y en el extremo 5' de MIS.
pSS225: Los segmentos que expresaba EBNA1 y TAT funcional y hph, se eliminaron de pSH201.
pSS226: Un elemento que expresaba TAT funcional se insertó en el extremo 5' de un gen amp-r de pSS225.
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Una descripción individual del vector de expresión de la Figura 2 es la siguiente.
pSS210: El plásmido oriP que expresa BMLF1 y hph se describió en una parte de construcción de plásmidos.
pSS212: La secuencia que codifica IL-2SA se situó en el extremo 3' de CMVe/p de pSS210.
pSS213: Un elemento TAR se sitúa en el extremo 5' de IL-2SA de pSS212.
pSS214: Una secuencia intrónica, MIS, se añade adicionalmente en el extremo 5' de IL-2SA de pSS213.
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Una breve descripción de la estructura individual de los plásmidos de la Figura 7 es la siguiente.
pSS223: Este plásmido es básicamente el mismo que pSS225 pero saltando la secuencia que codifica IL-2SA.
pSC186: Una secuencia que codifica TAT se situó en extremo 3' de CMVe/p de pCEP4 y se delecionó el sistema de expresión de hph funcional.
pSS240: La secuencia que codifica IL-2SA se insertó en el sitio PvuII de pSS223.
pSS241: La secuencia que codifica IL-4 se insertó en el sitio PvuII de pSS223.
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El vector de expresión en células de mamíferos basado en pBR322 con una expresión génica de dhfr funcional (pSM97; Cho y col., Patente de Estados Unidos Nº 5.854.021). El vector pCEP4 constituido por oriP, EBNA1, y la expresión génica de hph funcional en base a pBR322 se obtuvo de Invitrogen (Carlsbad, CA).
Ochenta y dos pares de bases de un elemento TAR se prepararon mediante PCR usando pBennCAT (Gendelman H.E. y col., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 82:9759-9763, 1986) como plantilla. Se fabricaron dos cebadores añadiendo un sitio KpnI en el extremo 5' de TAR y un sitio HindIII en el extremo 3' de TAR. El producto de PCR resultante se digirió con HindIII y KpnI y se insertó en pCEP4 después de digerir pCEP4 con KpnI y HindIII. El segmento que expresa el gen TAT funcional, se preparó de pSVTAT (Peterlin B.M. y col., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 83: 9734-9738, 1986) digiriéndolo con BamHI (modificado con fragmento de Klenow) y HpaI.
Este fragmento se insertó a pSV_{2}neo después de digerir con PvuII y HpaI. Este segmento que expresaba TAT funcional puede eliminarse fácilmente digiriendo con PvuII y BamHI para insertarlo en cualquier otro vector de expresión, como se muestra en la Figura 1 (pSS185 y pSC221). La secuencia que codifica BMLF1 y el área de señal de poliA se prepararon de B95-8 EBV abarcando secuencias de ADN de 84301 (NheI) a 82180 (HindIII) de los datos de secuencia B95/8 EBV (P.J. Farrell, "Epstein-Barr Virus Genome" en Advanced Viral Oncology; editado por G. Klein; Ravens Press, Ltd.: Nueva York 1989, págs. 103-132) y se insertaron en el sitio PvuII de pCEP4, un vector con CMVe/p. Esta expresión de BMLF1 está ahora bajo el control de CMVe/p.
El segmento de expresión de BMLF1 funcional se retiró mediante digestión con SpeI y NheI de este vector y se construyó un nuevo vector de expresión. Este plásmido resultante pSS210 mostrado en la Figura 2. La muteína de interleuquina-2 (N88R) conocida como IL-2SA (Archivo de Solicitud de Patente Nº WO9960128, IL-2 Selective Agonists and Antagonists) se usó como gen informador.
Transfección
Se realizaron las transfecciones estacionarias usando las células cultivadas de modo dependiente de anclaje. Células HKB11 cultivadas en crecimiento logarítmico (1,5 x 10^{6} células) en 4 ml de medio fresco con FBS al 5% o sin suero, se sembraran en un pocillo de una placa de cultivo tisular de formato de 6 pocillos (Corning Inc., Corning, NY) y se les permitió unirse al fondo de la placa durante dos o más horas en una incubadora de CO_{2} humidificada a 37ºC. Se preparó un cóctel (1 ml) constituido por 5 \mug de ADN y 20 \mul de reactivo DMRIE-C (Life Technologies, Rockville, MD) de acuerdo con el protocolo del fabricante y se añadió al pocillo y se mezcló suavemente. Las placas se incubaron en la incubadora de CO_{2}.
Se realizaron las transfecciones con agitación usando células adaptadas a condiciones de suspensión libre de suero. Células HKB11 cultivadas en crecimiento logarítmico (5 x 10^{6} células) en 4 ml de medio fresco, se mezclaron con un ml del complejo ADN/DMRIE-C como en la transfección estacionaria anterior. Estos 5 ml de células transfectadas en un formato de 6 pocillos se incubaron a un agitador (90-100 rpm) en una incubadora de CO_{2} humidificada. Las células transfectadas se sub-cultivaron en 3 y 7 días después de la transfección (dpt) dividiéndolas a 1:4 o 1:5. El volumen total de cultivo aumentó del volumen inicial de transfección hasta 20 veces en el día 10 dpt. El sobrenadante del cultivo tisular se analizó mediante un ELISA para determinar los niveles de secreción de proteínas.
ELISA
Para la detección de IL-2SA, se revistieron placas Dynatech Immulo-2 de fondo redondo, con 1 \mug/ml de IL-2 antihumana de rata purificada (PharMingen, San Diego, CA) usando tampón NaHCO_{2} 0,1 M (pH 8,2), incubado a 37ºC durante 3 horas en una cámara humidificada, se lavó con PBS/Tween 20 al 0,05% (Sigma P-1379, St Louis, MO) y se bloqueó con PBS/BSA al 1% durante una hora a temperatura ambiente. Los sobrenadantes del cultivo que contenían IL-2SA y un patrón de IL-2SA purificada (como una curva patrón) se diluyeron en serie con PBS/BSA al 1% (50 \mul/pocillo) y se incubaron a temperatura ambiente durante dos horas. La IL-2SA capturada se detectó usando IL-2 antihumana de ratón biotinilada (62,5 ng/ml, PharMingen, San Diego, CA) seguida de incubación con estreptavidina-HRP (125 ng/ml; Zymed Laboratories Inc. Nº 43-4323, South San Francisco, CA). Entre todas las incubaciones (cada una, una hora de incubación a temperatura ambiente), las placas se lavaron con PBS/Tween 20. Las placas se revelaron usando la solución de sustrato de tetrametilbencidina (TMB; Kirkegaard & Perry Laboratories, Inc. Producto Nº 50-65-00 y 50-76-01, Gaithersburg, MD) y la reacción se interrumpió con HCL 1 N. La densidad óptica (OD) se midió a 450 nm/570 nm usando un lector cinético de microplacas Molecular Device de Vmax (S/N 04514, Sunnyvale, CA) y el programa Softmax proporcionado por Molecular Devices. La concentración de IL-2SA en el sobrenadante del cultivo tisular se determinó comparándola con la OD de una curva patrón de IL-2SA purificada.
Para medir la secreción de interleuquina-4 (IL-4) humana, el ensayo fue similar excepto que se usó anticuerpo de IL-4 antihumano de ratón (PharMingen, Cat. Nº 18651D, San Diego, CA) para revestir la placa, y se usó anticuerpo de IL-4 anti-rata biotinilada (PharMingen, Cat. Nº 18502D, San Diego, CA) como anticuerpo de detección. Una molécula de IL-4 purificada se usó como patrón.
Ejemplo 1 Expresión de proteínas en ensayos de transfección transitoria usando vectores de expresión TAT/TAR-oriP
Vectores de expresión de células de mamífero equipados con CMVe/p en plásmido pBR322 mostraron niveles de expresión y secreción relativamente altos, de entre 1-20 \mug/ml de proteína heteróloga. Sin embargo, algunas proteínas tuvieron mucha dificultad para expresarse, por ejemplo IL-2SA. Por lo tanto, se construyeron diversos vectores de expresión equipados con diferentes elementos potenciadores, principalmente proteínas transactivadoras y el elemento oriP para mantener el plásmido transfectado en forma de episoma. Cada elemento por separado mostró un nivel pequeño de aumentos (3-5 veces) en ensayos de transfección transitoria. Se construyeron dos vectores de expresión, uno con IL-2SA en vector pCEP4 (pSS179) y otro con la adición de elementos transactivadores de TAT/TAR al pSS179 (pSS185). Los dos ADN de plásmidos que expresan IL-2SA (pSS179 y pSS185) se digirieron con enzimas de restricción y se transfectó la misma cantidad de ADN (5 \mug de cada) de los dos, y de plásmidos sin cortar. Se usó en cada transfección una pequeña cantidad de ambos ADN digeridos con enzimas de restricción para confirmar la cantidad de ADN precipitado para asegurar las mismas cantidades y calidad (para observar el 100% de conversión a forma lineal). Las transfecciones se realizaron usando un procedimiento de transfección estacionaria con medio suplementado con FBS al 5%. Los niveles de expresión de cada plásmido se analizaron suponiendo que la forma lineal del plásmido suprimía la función de oriP, porque el ADN lineal no puede replicarse en este estado. Aunque oriP y TAT/TAR tienen un efecto potenciador, cuando se evalúan individualmente bajo la regulación de un promotor CMV, el aumento es considerablemente bajo (3-5 veces) en ensayos de transfección transitoria.
Como se muestra en la Figura 3, los efectos del elemento oriP (pSS179 sin cortar) y transactivación de TAT/TAR (pSS185 cortado) sobre la secreción de IL-2SA fueron 2,7 y 6 veces, respectivamente más altos que los de la forma lineal de pSS179 en 3 dpt. Las veces de aumento en 5 dpt fueron 5,6 y 10, respectivamente. Sin embargo, el pSS185 sin cortar (transactivación de TAT/TAR intacto y función oriP) mostró unos niveles inesperadamente altos (26 veces en 3 dpt y 34 veces en 5 dpt) de secreción de IL-2SA que los de pSS179 cortado.
Se ensayaron también otras construcciones de vector constituidas por el mismo elemento funcional. Los vectores de expresión de IL-2SA, pSC221 (TAT/TAR-dhfr), pSH201 (TAT/TAR-oriP con EBNA1), y pSS226 (TAT/TAR-oriP sin EBNA1) se usaron para transfectar células HKB11 y 293EBNA para comparar dos células huésped y para comparar vectores episomales de TAT/TAR y TAT/TAR-oriP. Véase la Figura 1 para los mapas físicos de los vectores de expresión. Como se muestra en la Tabla 1, el efecto de TAT/TAR-oriP (pSH201) sobre TAT/TAR (pSC221) fue \sim9 veces más alto en células HKB11 y \sim4 veces más alto en células 293EBNA en 3 dpt. Este efecto fue similar (4,4 veces) al que se observó usando pSS185 episomal y lineal (Figura 3). Las células 293EBNA mostraron niveles de secreción de IL-2SA ligeramente más bajos que las células HKB11, sin embargo, estaba claro que el vector TAT/TAR-oriP puede usarse en células diferentes de HKB11, en este documento células 293EBNA, para una producción máxima de proteínas. Se observó que el vector TAT/TAR-oriP equipado con el gen EBNA1 era ligeramente mejor que sin el gen EBNA1. Parece que las células HKB11 y 293EBNA pueden no tener la suficiente proteína EBNA1 para mantener el vector episomal.
Se ensayaron también otras construcciones de vector constituidas por el mismo elemento funcional. Se usaron los vectores de expresión de IL-2SA pSC221 (TAT/TAR-dhfr), pSH201 (TAT/TAR-oriP con EBNA1), y pSS226 (TAT/TAR-oriP sin EBNA1) para transfectar células HKB11 y 293EBNA para comparar dos células huésped y para comparar vectores episomales de TAT/TAR y TAT/TAR-oriP. Véase la Figura 1 para los mapas físicos de los vectores de expresión. Como se muestra en la Tabla 1, el efecto de TAT/TAR-oriP (pSH201) sobre TAT/TAR (pSC221)
fue \sim9 veces más alto en las células HKB11 y \sim4 veces más alto en las células 293EBNA. Estos efectos fueron similares (\sim5 veces) a los observados usando pSS185 episomal y lineal (Figura 2). Las células 293EBNA mostraron niveles de secreción de IL-2SA ligeramente más bajos que las células HKB11, sin embargo, estaba claro que el efecto sinérgico de TAT/TAR-oriP se observó también en células 293EBNA aparte de en células HKB11, para una producción máxima de proteínas. Se observó que el vector TAT/TAR-oriP equipado con el gen EBNA1 era ligeramente mejor que sin el gen EBNA1. Parece que las células HKB11 y 293EBNA pueden no tener la suficiente proteína EBNA1 para mantener el vector episomal.
TABLA 1 Comparación de células HKB11 y 293EBNA transfectadas con TAT/TAR y TAT/TAR-oriP para la secreción de IL-2SA en medio libre de suero en 3 dpt
Vector de expresión HKB11 293EBNA
Título (\mug/ml) Veces de aumento Título (\mug/ml) Veces de aumento
pSC221 0,5 1 0,62 1
pSH201 4,45 8,9 2,55 4,11
pSS226 2,98 5,9 2,27 3,6
Nota: Las veces de aumento de IL-2SA mediante TAT/TAR y TAT/TAR-oriP se calcularon suponiendo
la producción de IL-2SA de pSC221 como 1.
Ejemplo 2 Expresión de proteínas en ensayos de transfección transitoria usando vectores de expresión BMLF1-oriP
BMLF1 se conocía originalmente como un transactivador promiscuo (Lieberman y col., J Virol 60:140-148, 1986). Desde entonces, se ha descubierto que esta proteína es un transactivador post-transcripcional (Kenney y col., J. Virol, 63:3870-3877, 1989), y más recientemente, se ha descrito como un transactivador de expresión de genes sin intrones y como un inhibidor para la expresión de genes unidos a intrones (Ruvolo y col., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 95:8852-8857). Se ensayó la proteína BMLF1 para la función transactivadora de la expresión de genes de mamífero (IL-2SA). La secuencia que codifica IL-2SA sin 5'-IS insertado cadena abajo de CMVe/p de pSS210 es pSS212. La secuencia que codifica la expresión de IL-2SA se modificó añadiendo secuencia TAR en el extremo 5' de IL-2SA (pSS213) y se modificó adicionalmente añadiendo una secuencia intrónica (MIS) en el extremo 5' de IL-2SA de pSS213, dando como resultado el vector pSS214. Véase la Figura 2 para los mapas físicos de los vectores de expresión individuales. Los ensayos de transfección transitoria estacionaria indicaron que la proteína BMFL1 potenció la expresión de IL-2SA independientemente del intrón, en 3-4 veces en células HKB11 (Tabla 2) y en 10-20 veces en células CHO (Tabla 3) usando medio que contenía suero.
TABLA 2 Comparación de la producción de IL-2SA (3 dpt) de células HKB11 transfectadas con diversos vectores de expresión de IL-2SA en medio que contenía suero
Vectores de Expresión Títulos de IL-2SA (\mug/ml) Veces de aumento (media)
Exp. I Exp. II Exp. III
pSS179 0,84 1,24 0,27 1
pSS212 3 4,4 1,23 4
pSS213 2,76 4,16 0,81 3,2
pSS214 2,48 3,1 1,1 3,2
\begin{minipage}[t]{160mm} Nota: Las veces de aumento de la producción de IL-2SA mediante BMLF1 se calcularon a partir de la media de 3 experimentos suponiendo la producción de IL-2SA de pSS179 como 1. \end{minipage}
Como se describe en la Figura 3, pSS212, pSS213, y pSS214 tienen segmentos de expresión de IL-2SA equipados en el extremo 5' de la molécula con fragmento sin intrón, fragmento sin intrón con TAR y fragmento TAR-MIS, respectivamente.
TABLA 3 Comparación de la producción de IL-2SA (3 dpt) de células CHO transfectadas con diversos sectores de expresión de IL-2SA en un medio que contenía suero
Vectores de Expresión Títulos de IL-2SA (\mug/ml) Veces de aumento (media)
Exp. I Exp. II Exp. III
pSS179 0,062 0,058 0,042 1
pSS212 0,275 0,77 0,7 11,2
pSS213 0,23 0,88 1,33 16,6
pSS214 0,225 1,46 1,52 21,5
Nota: Veces de aumento y vectores de expresión se describen en la Tabla 2.
Ejemplo 3 Producción de proteínas en ensayos de transfección transitoria prolongada.
Para fabricar mayores cantidades de proteínas, se ensayaron estas proteínas transactivadoras en plásmido oriP en un periodo de tiempo de cultivo después de transfección prolongado hasta 10 días. En este experimento, se usó un vector de expresión de IL-2SA básico (pSL160N), un vector de expresión de IL-2SA suplementado con elementos transactivadores TAT/TAR (pSC221), un vector de expresión de IL-2SA solamente con elemento oriP (pSS225), y un elemento de expresión de IL-2SA tanto con elementos transactivadores TAT/TAR como con elemento oriP (pSS185). Véase la Figura 1 para los mapas físicos de la estructura del plásmidos. Las células HKB11 adaptadas a una suspensión libre de suero se transfectaron con el procedimiento de transfección con agitación como se ha descrito anteriormente. Las células transfectadas se sub-cultivaron usando medio libre de suero dividiéndolas 4-5 veces en 3 dpt y 7 dpt durante un periodo de 10 días después de la transfección. El volumen total de cultivo transfectado aumentó en 20-25 veces.
Se observó que el efecto de oriP y los efectos de transactivación de TAT/TAR (Tabla 4) fueron ligeramente diferentes de los datos mostrados en la Figura 3, lo que podría explicarse por los diferentes estados de plásmido de la forma lineal del ADN del plásmido oriP (por ejemplo, pSS179 y pSS185 linealizados) y la estructura del plásmido sin elemento oriP (por ejemplo, pSL160N y pSS221). Por ejemplo, se suponía que un vector de expresión de referencia de pSS179 lineal mostraría el mismo resultado con pSL160N y se suponía que pSS185 lineal sería el mismo que pSS221 por causa de la función de oriP interrumpida linealizando la estructura del plásmido. Sin embargo, el efecto combinado de TAT/TAR y función oriP fue similar. Durante este periodo de cultivo prolongado, como se muestra en la Tabla 4, el aumento observado en la expresión de proteínas (títulos de IL-2SA) se mantuvo sin niveles de expresión drásticamente disminuidos. El rendimiento total de la producción de IL-2SA de pSS185 (vector de expresión de IL-2SA con TAT/TAR y elementos oriP) en el periodo de transfección transitoria prolongada (10 días) mostró un rendimiento extremadamente alto de la proteína (460,8 \mug) a partir de 5 \mug de ADN transfectado con un número inicial de células de 5 x 10^{6}, mientras que el vector de expresión no optimizado (pSL160N) en 3 días de cultivo usando las mismas cantidades de ADN y células, pudo recoger solamente 28,8 \mug de la proteína en 10 dpt y 1,4 \mug de proteína en 3 dpt usando un vector de expresión convencional.
Este sistema demostró que aumentaba a escala fácilmente para el uso de una producción de proteínas eficaz, por ejemplo, cuando se transfectaron 5 x 10^{6} células HKB11 (50 ml de cultivo) con 50 \mug de pSS185, se pudieron obtener aproximadamente 5 mg de proteína en 10 días después de la transfección con un volumen final de cultivo de un litro. En este experimento, se descubrió que este efecto es proporcional y que esta producción de proteína a partir de 500 \mug de ADN usando un matraz de agitación, era aproximadamente 100 veces mayor que la descubierta en una transfección convencional usando 5 \mug de ADN en formato de 6 pocillos. Este resultado de transfección a gran escala, indica que se puede ahorrar en el coste de preparación de ADN y reactivos de transfección usando este sistema de transfección prolongada a gran escala, cuando se compara con el sistema de transfección convencional que usa de 20-25 veces más materiales iniciales (ADN, reactivo de transfección, y células).
Como se muestra en la Figura 4 y 5, el transactivador BMLF1 no pudo utilizarse en un sistema de transfección prolongada, porque los títulos de IL-2SA y el número de células disminuyeron drásticamente después de 3 dpt y, la proteína BMLF1 podría ser tóxica, en última instancia, para las células que expresan BMLF1 en el modo de transfección transitoria prolongada.
TABLA 4 Comparación de la producción de IL-2SA en un sistema de transfección transitoria prolongada y aumentada a escala, usando diversos vectores de expresión en estado libre de suero
Vectores de expresión Título (\mug/ml) Rendimientos totales (\mug)
3 dpt 7 dpt 10 dpt 3 dpt 7 dpt 10 dpt
pSL160N 0,28 0,36 0,36 1,4 7,2 28,8
pSS221 0,64 0,68 0,74 3,2 13,6 58,2
pSS225 1,22 1,42 1,31 6,1 28,4 104,8
pSS185 5,08 7,29 5,76 25 145,8 460,8
Nota: Los rendimientos totales indican una multiplicación de los títulos de IL-2SA (\mug/ml) por volumen (ml).
\hskip0,5cm pSL160N: secuencia que codifica IL-2SA en un vector dhfr
\hskip0,5cm pSS221 secuencia que codifica IL-2SA en un vector TAT/TAR
\hskip0,5cm pSS225 secuencia que codifica IL-2SA en un vector oriP
\hskip0,5cm pSS185 secuencia que codifica IL-2SA en un vector TAT/TAR-oriP
Las células se dividieron 1:4 en 3 dpt y 1:5 en 7 dpt.
Ejemplo 4 Expresión de proteínas en selección con fármacos
La expresión de IL-2SA de vectores oriP, pSS178 y pSS179 (véase la Figura 1 para los mapas físicos de los plásmidos), se ensayaron y se compararon con la expresión de IL-2SA de un vector TAT/TAR-oriP, pSS185, en selección con fármaco para obtener células resistentes a fármaco para la producción de proteínas a gran escala durante periodos de tiempo incluso más largos. Células HKB11 cultivadas en un matraz de agitación en estado libre de suero se transfectaron con los tres vectores de expresión usando formato de 6 pocillos. Tres días después de la transfección, las células transfectadas se inocularon en un matraz de agitación, 2 x 10^{6} células en 20 ml de medio que contenía suero (5%) suplementado con 100 \mug/ml de higromicina B (HygB). Las células se sub-cultivaron dos veces por semana usando estos mismos medios de selección. Las células se centrifugaron y se resuspendieron en el mismo volumen de medio fresco en los primeros tres pasos. Después de esta fase de selección inicial, el cultivo celular se sub-cultivó manteniendo la densidad celular de 5 x 10^{5} células/ml. Los títulos de la producción de IL-2SA de cada paso se midieron mediante un ELISA. Cuatro semanas después de la producción, la productividad de IL-2SA de pSS185 se mantenía en títulos más altos que los de pSS178 y pSS179 por encima de 10 veces (Figura 6). Estos resultados indican que los elementos transactivadores TAT/TAR junto con los elementos de oriP (pSS185) en un sistema de selección con fármacos muestran una productividad mucho más alta en comparación con la productividad de IL-2SA de los vectores oriP, pSS178 y pSS179.
Ejemplo 5 Sistema TAT/TAR-oriP para transfección de alta producción
Aunque el vector de expresión TAT/TAR-oriP mostró una expresión inesperadamente alta de proteínas, el tamaño del vector es demasiado grande para usar en clonación de alta producción. Por lo tanto, se separó el vector de expresión en dos grupos funcionales. El vector de clonación principal (5,9 kb) constituido por CMVe/p, TAR, MIS, sitio de clonación (PvuII) y señal poliA en un vector oriP, pSS223. El vector oriP que expresa TAT (8,7 kb) plásmido pSC186 fue un plásmido co-transfectado. En ensayos de transfección transitoria para selección de alta producción, se pueden transfectar 5 \mug de pSS223 con el gen de interés y 1 \mug de plásmido pSS186 oriP que expresa TAT. Como se muestra en la Figura 7, se insertaron las secuencias que codifican IL-2SA e IL-4 en el sitio de clonación PvuII de pSS223. Los plásmidos resultantes son pSS240 y pSS241, respectivamente. Las células HKB11 se co-transfectaron con 5 \mug de pSS240 o pSS241 y 1 \mug de pSS186 en un modo de transfección con agitación en estado libre de suero. Se observó un resultado similar de un aumento de 3-5 veces en ensayos de cotransfección (Tabla 5) al de un vector TAT/TAR-oriP (pSS185) sobre un vector oriP (pSS225) (Tabla 4). Este resultado indica que el procedimiento de cotransfección de los dos plásmidos funcionalmente separados es equivalente al de la transfección del vector de expresión único constituido por los dos elementos TAT/TAR y oriP.
TABLA 5 Comparación de la producción de proteínas (\mug/ml) de un vector TAR-oriP con los de la cotransfección con vector TAT-oriP
Transfección sencilla Cotransfección con pSC186 Veces de aumento
IL-2SA (3 dpt) 4,28 14,2 3,3
IL-2SA (6 dpt) 3,07 15,9 5,1
IL-4 (3 dpt) 13,4 41,6 3,1
IL-4 (6 dpt) 11,6 37,2 3,2
Nota: las veces de aumento se calcularon de los valores de cotransfección sobre los valores de
transfección sencilla.
Discusión
Las proteínas heterólogas expresadas por células de mamífero, normalmente tienen una mejor o más deseables cualidades para caracterizar las proteínas que las proteínas expresadas de células no de mamíferos y, por tanto, se prefieren las células de mamífero. Sin embargo, la cantidad de proteínas fabricada por las células de mamífero es normalmente más pequeña que en otros sistemas. Para compensar los problemas anteriores, se optimizó un sistema de transfección transitoria para producir producción de proteínas "fast track". Los resultados se basan en muchos factores de la siguiente forma:
La célula huésped HKB11 optimizada que se adaptó a un estado de suspensión libre de suero.
1. Procedimientos de transfección con agitación usando medio libre de suero. En este procedimiento, se puede usar una mayor densidad celular inicial en condiciones de cultivo óptimas, lo que puede, posteriormente, producir más proteína. En transfecciones estacionarias, no se podía usar más de 1,5 x 10^{6} células por pocillo para transfección, por causa del estado no óptimo de cultivo de células cultivadas en forma de monocapa. Usando células en monocapa (por ejemplo, células CHO) para
2. Transfección, las condiciones de agitación del cultivo transfectado proporcionaron más secreción de proteína (2-3 veces) que las condiciones de no agitación, por razones no totalmente claras.
3. Los vectores de expresión optimizados usando el elemento oriP, que puede mantener los plásmidos transfectados como epitomas, y los elementos de transactivación, que pueden potenciar la expresión de proteínas, simultáneamente.
4. La parte más crítica y el resultado más inesperado de este sistema de transfección mejorada fue la combinación de elemento oriP y elementos de transactivación TAT/TAR para expresión de proteínas y dicha combinación en un único vector o sistema de transfección no se ha sugerido en la técnica anterior.
El experimento usando células CHO no se prosiguió de forma intensiva después de obtener los datos ineficaces en el sistema de transactivación TAT/TAR-oriP y en base a la siguiente información publicada. Un plásmido oriP no se replica eficazmente (Yates y col., Nature 313:812-815,1985 y Mizuguchi y col., FEBS lett 472:173-178, 2000) en células de roedor y las células CHO carecen de factores celulares para un sistema de transactivación TAT/TAR (Alonso y col., J Virol 66:4617-4621, 1992 y Wimmer y col., Virology 255:182-189, 1999).
Dada la descripción anterior, se entiende que ahora se les ocurrirán variaciones a los especialistas en la técnica. Por consiguiente, se pretende que los ejemplos anteriores deben interpretarse como ilustrativos y que el alcance de las invenciones descritas en este documento esté limitado solamente por las siguientes reivindicaciones.

Claims (12)

1. Una composición que comprende un plásmido, comprendiendo el plásmido
(a)
un elemento oriP y ácido nucleico que codifica EBNA 1,
(b)
promotor/potenciador CMV
(c)
ácido nucleico que codifica TAT y TAR; y
(d)
ADN que codifica una proteína heteróloga.
2. La composición de la reivindicación 1, que comprende además ácido nucleico que codifica BMLF1.
3. La composición de la reivindicación 1, que comprende además proteína BMLF1.
4. La composición de la reivindicación 1, en la que la proteína heteróloga se selecciona entre el grupo constituido por IL-4 e IL-2SA.
5. Una línea celular de mamífero transformada con la composición de la reivindicación 1.
6. Una composición que comprende un primer plásmido y un segundo plásmido, en la que el primer plásmido comprende un elemento oriP, ácido nucleico que codifica EBNA1, y ácido nucleico que codifica TAT, y el segundo plásmido comprende un elemento oriP, ácido nucleico que codifica TAR, y un promotor/potenciador CMV unido de forma operativa a un ADN que codifica una proteína heteróloga.
7. La composición de la reivindicación 6, en la que el primer plásmido comprende además ácido nucleico que codifica BMLF1.
8. La composición de la reivindicación 6, en la que la composición comprende además proteína BMLF1.
9. La composición de la reivindicación 6, en la que la proteína heteróloga se selecciona entre el grupo constituido por IL-4 e IL-2SA.
10. Una línea celular de mamífero transformada con la composición de la reivindicación 6.
11. Un procedimiento para producir una proteína heteróloga a partir de una célula huésped de mamífero, que comprende las etapas de:
(a)
transformar una célula huésped de mamífero con la composición de la reivindicación 1;
(b)
expandir la célula huésped de la etapa (a) en cultivo; y
(c)
aislar la proteína heteróloga del cultivo de la etapa (b).
12. Un procedimiento para producir una proteína heteróloga a partir de una célula huésped de mamífero, que comprende las etapas de:
(a)
transformar una célula huésped de mamífero con la composición de la reivindicación 6;
(b)
expandir la célula huésped de la etapa (a) en cultivo; y
(c)
aislar la proteína heteróloga del cultivo de la etapa (b).
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