ES2271010T3 - Conversion enzimatica de epoxidos. - Google Patents
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Abstract
Un procedimiento para convertir de manera enzimática, un epóxido, opcionalmente sustituido de la fórmula en la que R1 es hidrógeno o un grupo aromático o alifático opcionalmente sustituido, en una mezcla de un epóxido ópticamente enriquecido de fórmula (I) y un alcohol ópticamente enriquecido de fórmula: en la que R2 se elige entre el grupo de I, Cl, Br, CN, N3, NO2, NO3, SCN, OCN, OR'', NHR'', SR'', SnR'', SeR'', PR y CO2R'', en la que R'' se elige entre el grupo de hidrógeno, grupos amino, grupos hidroxilo, grupos alquilo, grupos arilo, grupos aralquilo, alquenilo, y cicloalquilo, o en la que R2 es OR'', estando R'' elegido entre el grupo constituido por grupos amino, grupos hidroxilo, grupos alquilo, grupos arilo, grupos aralquilo, alquenilo, y cicloalquilo, dicho procedimiento comprende hacer reaccionar el epóxido con un nucleófilo aniónico (R2-) en presencia de una halohidrin deshalogenasa.
Description
Conversión enzimática de epóxidos.
La invención se refiere a un procedimiento para
convertir un epóxido en un alcohol. Más específicamente, la
invención se refiere a un procedimiento enzimático para convertir un
epóxido en un alcohol mediante sustitución nucleófila.
Una reacción en la que un epóxido se convierte
en un alcohol mediante sustitución nucleófila se puede mostrar como
sigue:
En este esquema de reacción, R puede representar
un amplio intervalo de grupos, tales como varios grupos alquilo
sustituidos o no sustituidos, mientras que X representa un
nucleófilo. El producto de esta conversión puede ser un bloque muy
útil de conversión en la preparación de diversos productos químicos
refinados, tales como ciertos productos farmacéuticos. La reacción
puede producir dos diferentes enantiómeros. Como a menudo los
productos se usan para aplicaciones en las que la pureza
enantiomérica se de gran importancia, se han reseñado muchos
intentos para encontrar formas enantioselectivas de llevar a cabo
esta reacción.
Un ejemplo de tal reacción es la apertura de un
anillo enantioselectiva de un epóxido mediante un anión azida
(N_{3}), se puede denominar azidólisis. El producto de la
reacción, un alcohol azido ópticamente activo es un precursor de
compuestos farmacéuticos biológicamente activos tales como amino
alcoholes. Se ha descrito una azidólisis altamente enantioselectiva
de meso-epóxidos y diversos epóxidos terminales que
usan complejos quirales se han descrito por el grupo de Jacobsen
(Martínez y col., J. Am. Chem. Soc., 1995, 117, 5897; Farrow y
col., J. Am. Chem. Soc., 1996, 118, 7420). Las preparaciones los
azidoalcoholes aromáticos ópticamente activos mediante una
reacción biocatalizada se han reseñado también: por ejemplo,
mediante reducción de una \alpha-azidocetona
(Bese y col., J. Org. Chem., 1994, 59, 8288), resolución catalizada
por lipasa (Foelsche y col., J. Org. Chem., 1990, 55, 1749), o
monohidrohilación (Boyd y col., Tetrahedron: Asymetry, 1996, 7,
1559).
La reacción inversa, es decir, la formación de
un epóxido a partir de por ejemplo, un haloalcohol, usando una
reacción catalizada enzimáticamente, ha proporcionado mucha atención
en la bibliografía, en particular usando la halohidrin
deshalogenasa. Todas estas reacciones implicaban halohidrinas
alifáticas, tales como 1,3-dihalopropanol,
2,3-dihalopropanol, y
3-halo-1,2-propanodiol,
para producir halohidroinas y epóxidos ópticamente puros (Kasai y
col., J. Mol. Cat: B, 1998, 4, 237). En general, una halohidrin
deshalogenasa (también llamada haloin
hidrogen.haluro-liasa, halohidrin epoxidasa o halo
alcohol deshalogenasa) cataliza el cierre del anillo de una
halohidrina a un epóxido. Para un número limitado de halohidrinas,
se ha descrito que una halohidrin deshalogenasa también puede
catalizar la reacción inversa. El equilibrio de ambas reacciones
también se puede mostrar como sigue:
en la que R se puede elegir entre
un amplio intervalo de grupos, tales como diversos grupos arilo o
alquilo sustituidos o no sustituidos y en la que X representa un
halógeno tal como bromuro, cloruro o
yoduro.
Un ejemplo que usa la halohidrin deshalogenasa y
un nucleófilo diferente de un haluro se ha descrito por Nakamura y
col., Tetrahedron, 1994, 50, 11821. En este reacción, una halohidrin
deshalogenasa de Corynebacterium sp. cepa
N-1074 se usó para abrir un epóxido con cianuro para
producir un \beta-hidroxi nitrilo.
La apertura de un anillo asimétrico de un
epóxido mediante azida se ha descrito usando una preparación de
enzima bruta de Rhodococcus sp. (véase Faber y col.,
Tetrahedron Letters, 1994, 35, 81). La enzima responsable de la
reacción se sugiere que sea una epóxido hidrolasa mejor que una
halohidrin deshalogenasa.
Cuando se compara con las reacciones
químicamente catalizadas, las reacciones catalizadas mediante el uso
de enzimas implican el uso de menos disolventes orgánicos, u otros
reactivos se podría pensar que fueran sospechosos ambientalmente
tales como complejos metálicos y similares. Por ejemplo, la
azidolisis catalítica química de epóxidos se realiza típicamente
usando metales que no reúnen las condiciones ambientales, tales como
complejos de cromo, cobalto o titanio, en disolventes orgánicos,
tales como diclorometano, acetonitrilo o dimetilformamida. Además,
las enzimas son a menudo catalizadores más selectivos y eficaces que
sus parejas químicas diseñadas por el hombre, por ejemplo, Archer,
Tetrahedron vol, 53 nº 46 (1997) p. 15617-15662
proporciona una visión de de conversiones que se llevan a cabo
usando una epóxido hidrolasa. El documento EP-A 879
890 describe una epóxido hidrolasa recombinante obtenida a parir de
Agrobacterium Radiobacter B101. Para una visión más completa
de las ventajas de la catálisis enzimática, se hace referencia a
Faber, Biotransformations on Organic Chemistry, edición 3ª,
Springer-Verlag, Nueva York, 1997.
En la industria refinada química, las
halohidrinas ópticamente puras y epóxidos se usan como bloques de
construcción para diversos productos farmacéuticos. Las
halohidrinas se consideran a menudo como precursores directos se
los epóxidos. El cierre del anillo y una halohidrina ópticamente
pura conduce a un epóxido ópticamente puro que generalmente conduce
a un epóxido ópticamente puro. Recientemente, se ha descrito una
resolución cinética de una halohidrina que contiene un grupo
aromático, tal como
2-cloro-1-feniletanol,
con una halohidrin deshalogenasa de Agrobacterium
radiobacter AD1 (Lutje Spelberg y col., Tetrahedron: Asymmetry,
1999, 10, 2863).
La presente invención proporciona un
procedimiento en el que, los epóxidos, opcionalmente sustituidos se
pueden convertir a alcoholes de una manera altamente
enantioselectiva. Se ha encontrado que la enantioselectividad
deseada se puede llevar a cabo convirtiendo enzimáticamente un
epóxido, opcionalmente sustituido, de la fórmula:
en la que R_{1} es hidrógeno o un
grupo aromático o alifático opcionalmente sustituido, en una mezcla
de de un epóxido ópticamente enriquecido de fórmula (I) y un
alcohol ópticamente enriquecido de
fórmula:
en la que R_{2} se elige entre el
grupo de I, Cl, Br, CN, N_{3}, NO_{2}, NO_{3}, SCN, OCN, OR',
NHR', SR', SnR', SeR', PR y CO_{2}R', el la que R' se elige entre
el grupo de hidrógeno, grupos amino, grupos hidroxilo, grupos
alquilo, grupos arilo, grupos aralquilo, alquenilo, y cicloalquilo,
dicho procedimiento comprende hacer reaccionar el epóxido con un
nucleófilo aniónico (R_{2}') en presencia de una halohidrin
deshalogenasa.
Sorprendentemente, se ha encontrado que
convirtiendo un epóxido de acuerdo a la invención se puede obtener
un exceso muy alto enantiomérico. Incluso cuando el material de
parida es una mezcla racémica de ambos enantiómeros del epóxido,
principalmente, si no solamente, se obtiene uno de los posibles
enantiómeros se los productos. De acuerdo con lo anterior, la
invención permite no solamente una forma muy enantioselectiva de
producir un alcohol, sino también una resolución enantioselectiva
cinética del epóxido. Por ejemplo, en el caso de una reacción de
(óxido de estireno sustituidos con una azida, se forma el
(R)-enantiómero del azidoalcohol, dejando atrás el
(S)-enantiómero que no ha reaccionado del
epóxido.
Además, el presente procedimiento es altamente
regioespecífico. Tras la apertura del anillo del epóxido, se pueden
formar dos productos diferentes: uno de los cuales de los grupos -OH
está presente en el átomo de carbono adyacente al grupo R_{1}, y
uno en el que el grupo -OH está presente en el átomo de carbono
sobre el extremo distal del grupo R_{1}. En un procedimiento de
acuerdo con la invención, principalmente, si no solamente, se forma
el isómero con el grupo -OH en el átomo de carbono adyacente al
R_{1}.
El producto de la reacción, el alcohol con la
fórmula (II), es un bloque de construcción para una amplia
diversidad de compuestos farmacéuticos. Por ejemplo,
2-azido-1-feniletanol,
que se puede formar mediante la reacción enzimática de azida de
sodio y óxido de estireno, se puede convertir en el
2-aminofenil etanol biológicamente activo mediante
hidrogenación catalítica.
En principio, se puede convertir cualquier tipo
de epóxido de acuerdo con la invención. Como se ha mencionado, el
grupo R_{1} es hidrógeno o un grupo aromático o alifático
opcionalmente sustituido, que preferiblemente contiene entre 1 y 20
átomos de carbono. Preferiblemente, R_{1} se elige entre los
grupos de alquilo, arilo, aralquilo, alquenilo, cicloalquilo, y
alcoxi opcionalmente sustituido.
Los ejemplos preferidos del grupo alquilo
representados por R_{1} incluyen grupos alquilo que tienen de 1 a
15 átomos de carbono tales como un grupo metilo, grupo etilo, grupo
propilo, grupo isopropilo, grupo butilo, grupo pentilo, grupo
hexilo, grupo heptilo o grupo dodecilo. Los epóxidos representativos
de este grupo incluyen 1,2-epoxi propano,
1,2-epoxi-3-metilpentano
y 1,2-epoxi hexano. El grupo alquilo puede tener
sustituyentes tales como un átomo de halógeno, que conduce por
ejemplo a epiclorohidrina, epifluorohidrina o epibromohidrina. El
grupo alquilo puede tener un sustituyente tal como un grupo
hidroxilo, por ejemplo, glicidol. El grupo alquilo puede tener un
grupo amino no sustituido o sustituido tal como amino, metilamino o
dimetilamino. Los ejemplos de grupos arilo representados por
R_{1} incluyen los grupos fenilo y naftilo.Óxido de estireno u
óxidos de estireno que tienen un sustituyente o múltiples
sustituyentes en el anillo aromático del grupo fenilo. Los ejemplos
representativos de epóxidos son óxido de estireno, óxido de
4-nitroestireno, óxido de
2-nitroestireno, óxido de
3-nitroestireno, óxido de
3-cloroestireno, óxido de
4-cloroestireno u óxido de
2,3-dicloroestireno. Los ejemplos de grupos
aralquilo representados por R_{1} incluyen un grupo bencilo, grupo
2-feniletilo y un grupo
1-naftilmetilo. Los ejemplos de grupos alquileno
representados por R_{1} incluyen un grupo vinilo, grupo alilo y
grupo 5-hexenilo. Los ejemplos de grupos
cicloalquilo representados por R_{1} incluyen un grupo
ciclopropilo, grupo ciclobutilo, grupo ciclopentilo y grupo
ciclohexilo. Los ejemplos de grupos alcoxi representados por
R_{1} incluyen un grupo fenoxi, grupo
4-nitrofenoxi, grupo naftiloxi, grupo hexiloxi y
grupo vinil oxi.
Una clase preferida de epóxidos que se pueden
convertir tiene la siguiente fórmula:
Esta clase de epóxidos se puede sustituir en el
átomo de carbono que lleva el grupo R_{1} por un grupo
-CH_{2}R_{4}, en la que el grupo R_{4} se puede elegir
independientemente entre Cl, Br y I. Los ejemplos preferidos de
esta clase de epóxidos son epiclorhidrina, epibromohidrina y
2-(clorometil)-2-metiloxirano. Se ha
encontrado que durante la conversión a un alcohol, particularmente
cuando se usa azida como el nucleófilo, el enantiómero del epóxido
que no se convierte forma racémicos. Debido a esta formación de
racémicos se logra una total conversión de epiclorohidrina y se
obtiene el producto con una alta pureza óptica. Normalmente, en una
resolución cinética el máximo rendimiento del producto se limita al
50%, pero debido a la racemización se puede lograr un rendimiento
mayor que el 50%. Otra ventaja de este procedimiento, además del
incremento de rendimiento, es una recuperación de producto mucho
más simple ya que una separación del producto del sustrato estante
no es necesaria.
En otra realización preferida, el epóxido es un
óxido de estireno, que puede o no puede estar sustituido. Cuando se
lleva a cabo esta conversión de manera química, es decir, en
ausencia de una halohidrin deshalogenasa de acuerdo con la
invención, el producto obtenido será una mezcla de dos compuestos
que tienen la funcionalidad alcohol en su átomo de carbono \alpha
o \beta en el anillo aromático. Por ejemplo, la apertura del
anillo químico no catalizado de óxido de estireno por azida de
sodio producirá una mezcla de regioisómeros con la funcionalidad
alcohol en la posición \alpha y en la \beta en una relación
molar de 2:98 (\alpha \beta). Sorprendentemente, cuando se
convierte un óxido de estireno de acuerdo con la invención, el otro
regioisómero (es decir, en el que la funcionalidad alcohol está
presente en el átomo de carbono \alpha. El átomo de carbono
\alpha del anillo aromático es el átomo de carbono dentro del
epóxido que lleva el anillo aromático sustituido). Se obtiene de
manera selectiva. Una separación de los dos posibles regioisómeros
es muy difícil, esta regioespecificidad es una gran ventaja de la
invención.
Particularmente preferida es una realización en
la que el epóxido tiene la fórmula
en la que R_{1} es un
sustituyente orto-, meta-, o para- elegido entre el grupo de
-NO_{2}, -NH_{2}, -CH_{3}, -OCH_{3}, -OCH_{2}CH_{3},
-OH, -F, -Cl, -Br, -I, -COOH y -CN. Se he encontrado que la
regioespecificidad es particularmente alta para la conversión de
estos
epóxidos.
El epóxido puede estar presente en una forma
solubilidad en una concentración de 1 a 300 mM o una segunda fase
sólida o líquida en una concentración de hasta 300 mM en el medio de
reacción. El propio epóxido puede ser la segunda fase o se puede
disolver en una segunda fase orgánica. Esto se puede hacer
disolviendo el epóxido en un disolvente orgánico que es inmiscible
con agua, tal como hexano u octano. La solución obtenida después se
pone en contacto con la fase acuosa que contiene la enzima y las dos
fases se mezclan vigorosamente. El uso de tal segunda fase tiene la
ventaja de que la separación del epóxido y el alcohol después de la
reacción se puede simplificar. En general, el alcohol se espera que
permanezca solubilizado en la fase acuosa y el epóxido se puede
recuperar típicamente a partir de la fase orgánica. Preferiblemente,
el epóxido es anterior a su conversión en un medio acuoso en el que
preferiblemente estará presente en una cantidad de 0,01 a 20% en
peso, basándose en los pesos combinados del medio acuoso y el
epóxido.
La naturaleza del nucleófilo elegido para
convertir el epóxido en un procedimiento de acuerdo con la invención
dependerá normalmente de la naturaleza del producto objetivo. Los
nucleófilos adecuados incluyen I, Cl, Br, CN, N_{3}, NO_{2},
NO_{3}, SCN, OCN, OR', NHR', SR', SnR, SeR', PR' y CO_{2}R, en
los que R' se elige entre hidrógeno, grupos amino, grupos
hidroxilo, grupo alquilo, grupos arilo, aralquilo, alquenilo y
grupos cicloalquilo. De hecho, los grupos alquilo, grupos arilo,
aralquilo, alquenilo y grupos cicloalquilo también están abarcados.
Cuando R' es un grupo alquilo, contiene preferiblemente entre 1 y
15, más preferiblemente entre 1 y 6 átomos de carbono. Cuando R' es
un grupo arilo, es preferiblemente un grupo fenilo o uno naftilo.
Los grupos aralquilo preferidos que se pueden representar por R'
incluyen grupos bencilo, 2-feniletilo y
1-naftilmetilo. Los grupos alquenilo preferidos a
partir de los que R' se pueden elegir son grupos vinilo y alilo.
Cuando R' es un grupo cicloalquilo, puede ser adecuado tener entre 3
y 12 átomos de carbono. Los grupos cicloalquilo preferidos son
ciclopropilo, ciclobutilo, ciclopentilo, y ciclohexilo.
Preferiblemente, particularmente cuando el
epóxido es un óxido de estireno un óxido de estireno sustituido, el
nucleófilo es NO_{2}^{-} o N_{3}^{-}. El nucleófilo se puede
emplear en la forma de una sal, por ejemplo como una sal de sodio o
potasio. Un exceso del reactivo nucleófilo puede conducir a la
formación no enantioselectiva del regioisómero no deseado del
producto objetivo. Esto se puede evitar o bien realizando la
reacción en un tiempo más corto, realizando la reacción a una
temperatura más baja, empleando una mayor cantidad de la enzima,
añadiendo el reactivo nucleófilo a la mezcla de reacción de una
manera más lenta. Típicamente, el nucleófilo se usará en una
cantidad de 0,6 a 100 equivalentes molares con respecto al epóxido,
dependiendo de la posición del equilibrio entre el epóxido y el
alcohol. Por ejemplo, en el caso de azida de sodio como nucleófilo
0,6 equivalentes molares suficientes para lograr una resolución
cinética suficientemente completa ya que la posición de equilibrio
favorece la formación del alcohol sobre el epóxido. En el caso de
cloruro de sodio como neutrófilo, un exceso (50-100
equivalentes molares) se añaden preferiblemente para favorecer la
formación del alcohol.
Se prefiere que la reacción se lleve a cabo en
un medio acuoso tamponado en el que el epóxido se solubiliza o se
añade como una segunda fase sólida o líquida. Los tampones adecuados
son por ejemplo, tampón tris
(2-amino-2-(hidroximetil)-1,3
propanodiol ajustado hasta un pH deseado con H_{2}SO_{4}),
tampón glicina (glicina ajustada hasta un pH deseado mediante
NaOH), tampón fosfatos o tampón MOPS (ácido
4-niorfolinapropanosulfónico ajustado hasta un pH
deseado con NaOH). Usan preferiblemente una concentración de 50 a
250 mM.
Opcionalmente, se pueden añadir codisolventes
tales como dimetilsulfóxido, tetrahidrofurano o acetonitrilo para
incrementar la solubilidad del epóxido. Los codisolventes se pueden
añadir en cantidades de 5% en volumen hasta 50% en volumen. Un
incremento de porcentaje de codisolvente puede favorecer la
solubilidad del epóxido. Sin embargo, una inactivación desventajosa
de la enzima se puede observar a mayores concentraciones de
codisolvente.
El pH del medio preferiblemente cae entre 3 y
12, más preferiblemente entre 6,5 y 8. La temperatura a la que la
reacción se lleva a cabo preferiblemente cae entre 0 y 60ºC, más
preferiblemente entre 20 y 30ºC.
La enzima usada es una halohidrin deshalogenasa.
Una halohidrin deshalogenasa altamente adecuada es un polipéptido
que tiene una secuencia de aminoácidos como se muestra en la SEQ ID
Nº 2 o un derivado homólogo o funcional del mismo. En el contexto
de la invención, el término homólogo se refiere a una secuencia que
es al menos un 90% homóloga, y preferiblemente al menos 90%
idéntica, a la secuencia de la que es homóloga. Un derivado
funcional es un polipéptido que se ha sometido a una derivación
secundaria o modificación sustancialmente sin afectar de manera
adversa a las propiedades enzimáticas y catalíticas del polipéptido.
Los ejemplos adecuados de enzimas que se pueden usar son la
halohidrin deshalogenasa de Agrobacterium radiobacter (CBS
750.97), Mycobacterium sp. cepa GP1 (Poelarends y col., J.
Bacterial, 1999, 181, 2050) o Arthrobacter sp. cepa AD2 (van
den Wijngaard y col., J. Bacterial., 1991, 124). Se han obtenido
buenos resultados particulares usando una halohidrin deshalogenasa
obtenida de de Agrobacterium radiobacter AD1 depositada en el
Centraal Bureau voor de Schimmelcultures el 7 de mayo de 1997 bajo
el número de depósito CBS 750.97. Otra enzima obtenida de este
organismo se ha descrito de manera extensa en la solicitud de
patente internacional nº 98/53081 para su actividad de la epóxido
hidrolasa.
Se ha de indicar que una enzima usada de acuerdo
con la invención una halohidrin deshalogenasa, se debe distinguir
de las epóxido hidrolasas. Esto último se ha descrito de manera
amplia en Archer, Tetrahedron, 53 (1997), p.
15617-15662. La única característica que ambos de
enzimas de enzimas pueden tener en común es que se pueden aislar a
partir de de Agrobacterium radiobacter cepa AD1. De manera
similar, Lutje Spelberg y col., Tetrahedron: Asymmetry, 9 (1998)),
p. 459-466 y la solicitud de patente europea nº 0
879 890 se refiere a las aplicaciones de una epóxido hidrolasa.
La enzima se puede añadir como células enteras,
en forma liofilizada tal como un extracto bruto o como enzima
purificada. La enzima se puede inmovilizar en unos vehículos
macroscópicos tales como celulosa, sefadex o dextrano. La enzima
también se puede aplicar como cristales de enzima reticulados (CLEC)
o atrapada en micelas inversas. En un experimento típico, una
solución de enzima se mezcla con una solución tampón que contiene
un nucleófilo y un epóxido. Opcionalmente, se pueden añadir aditivos
tales como etanol o glicerol a la mezcla de reacción para
estabilizar la enzima.
Después de la reacción la mezcla de reacción
completa se puede extraer usando disolventes orgánicos tales como
dietil éter, acetato de etilo, diclorometano o tolueno. El epóxido y
el alcohol se pueden separar posteriormente mediante técnicas,
tales como cristalización (en el caso de sustancias sólidas),
destilación fraccionada o cromatografía ultrarrápida sobre sílice
60H usando por ejemplo heptano/acetato de etilo (relación 7:3) como
eluyente. La composición enantiomérica de los epóxidos y alcoholes
se pueden determinar usando cromatografía quiral o HPLC quiral.
La invención se esclarecerá ahora mediante los
siguientes ejemplos no restrictivos.
Una librería génica de A. radiobacter AD1
se construyó en el vector cósmico pLAFR3. Después del
empaquetamiento in vitro, la librería se tradujo a E.
coli HB101. Los transconjugantes de seleccionaron para la
actividad deshalogenasa con
1,3-dicloro-2-propanol.
El gen de la halohidrin deshidrogenasa, llamada hheC, se secuenció
y se amplificó posteriormente mediante PCR y se clonó más atrás del
promotor T7 del vector de expresión pGEF^{+}, produciendo
pGEFhheC. El gen de la halohidrin deshidrogenasa se sobreexpresó
hasta un 30% de la proteína soluble mediante la introducción de
pGEFhheC en E. coli BL21 (DE3). HheC tiene la secuencia
mostrada como la SEQ ID Nº 1.
Para las resoluciones cinéticas descritas se usó
la enzima purificada. Se transformó el AND del plásmido mediante
electroporación a las células de E. coli BL21 (DE3)
competente, que después se colocaron en un medio LB que contiene
tetraciclina y se incubaron durante toda una noche a 30ºC. Se
comenzó un precultivo inoculando 100 ml de medio LB que contiene
tetraciclina con los transformantes de una placa a una DO_{600}
inicial de 0,1. Se incubó el cultivo a 30ºC hasta que se alcanzó
una DO_{600} de 1-2, se diluyó en 11 de medio LB
que contenía tetraciclina y se incubó durante toda una noche a 20ºC.
las células se centrifugaron posteriormente, se lavaron y se
volvieron a suspender. Se preparó un extracto bruto mediante ruptura
ultrasónica y centrifugación de las células. A esto siguió una
etapa de purificación con una columna Resource Q produciendo la
enzima que tiene la SEQ ID Nº 2.
El procedimiento anterior es análogo a un
procedimiento que se ha descrito en más detalle en la solicitud de
patente internacional 98/53801, en la que la enzima que se preparó
era una epóxido hidrolasa.
A 15 ml de tampón Tris-SO_{4}
(50 mM, pH = 7,3) que contenía 2 mM de óxido de para nitro estireno
y 10 mM de NaN_{3}, se añadieron 2,8 mg de la enzima purificada,
obtenida de acuerdo con el ejemplo 1. La reacción se controló
tomando periódicamente 200 \mul de muestras y se extrajeron con 2
ml de dietil éter. La reacción se detuvo cuando se alcanzó un e. e.
mayor que 99% del enantiómero restante y la solución se extrajo dos
veces con dietil éter. La fase orgánica se analizó mediante HPLC
quiral usando una columna quiralpack AS de Daicel. El óxido de
(S)-para-nitro estireno restante se
obtuvo con un e. e. > de 99% y el producto
(R)-2-azido-1-(para-nitrofenil)-etanol
con un e. e. de 94%. El valor de E correspondiente se calculó que
era mayor que 200 a partir del e. e. del epóxido y el azido alcohol
(Straathol y col., Enzyme Microb. Technol. 1997, 21, 559). El
otro
2-azido-2-(para-nitrofenil)-etanol
regio isómero se formó también debido a una reacción lateral
química en una reacción de 1:12 comparada con
(R)-2-azido-2-(para-nitrofenil)-etanol.
A 1 ml de tampón Tris-SO_{4}
(50 mM, pH = 7,3) que contenía 0,25 mM de óxido de para nitro
estireno y 0,5 mM de NaN_{3}, se añadieron 0,7 mg de la enzima
purificada, obtenida de acuerdo con el ejemplo 1. La reacción se
detuvo después de 15 minutos y se extrajo la solución con
dietiléter. La fase orgánica se analizó mediante HPLC quiral. El
óxido de (S)-para-nitro estireno
restante se obtuvo con un e. e. > de 99% y el producto
(R)-2-azido-1-(para-nitrofenil)-etanol
con un e. e. de 96%. El otro
2-azido-2-(para-nitrofenil)-etanol
regio isómero se formó una relación de 1:127 con comparada
(R)-2-azido-2-(para-nitrofenil)-etanol.
A partir de esto se concluyó que la acidolisis enzimática es casi
absolutamente regioselectiva (selectividad \beta > 99%). La
regioselectividad menor observada durante una resolución cinética en
un tiempo mayor se debió la reacción secundaria no deseada.
A 60 ml de tampón MOPS (50 mM, pH = 7,0), se
añadieron 0,47 gramos (3,2 mmoles) de óxido de para nitro estireno
y la suspensión se agitó durante 60 minutos. Se añadió la halohidrin
deshalogenasa, obtenida como se ha descrito en el ejemplo 1, (39 mg
en 6 ml de tampón). Se detuvo la reacción y la suspensión se extrajo
tres veces con dietiléter. Después de separar, la fase orgánica se
secó con MgSO_{4}, y se retiró mediante rotavapor produciendo un
aceite naranja. Esta mezcla se volvió a disolver en dietiléter y se
determinaron la composición y e. e. de los productos mediante HPLC
quiral. La mezcla principalmente consistía en óxido de
(S)-para-nitro estireno con un 45%
de rendimiento (98% de e. e.) y
(R)-2-azido-1-(para-nitrofenil)-etanol
con un 47% de de rendimiento (97% de e. e.). El subproducto químico
2-azido-1-(para-nitrofenil)-etanol
se formó hasta un total de un 4% de la mezcla de reacción. Se formó
el producto se la hidrólisis química del epóxido,
para-nitrofenil etanodiol con un 3%. Todos los
rendimientos mencionados están calculados como rendimientos. La
cromatografía ultrarrápida sobre sílice 60 H que usa heptano/acetato
de etilo (relación 7:3) como eluyente produjo epóxido puro y azido
alcoholes. Los resultados de la RMN eran idénticos a los compuestos
racémicos sintetizados de referencia.
A 20 ml de tampón Tris-SO_{4}
(50 mM, pH = 7,3) que contenía 2 mM de óxido de para cloro estireno
y 1,2 mM de NaN_{3}, se añadieron 1,0 mg de la enzima purificada,
obtenida como se describe en el ejemplo 1. La fase orgánica se
analizó mediante CG quiral. Se obtuvo el óxido de
(S)-para-cloro estireno con un e. e.
mayor que el 99% y
(R)-2-azido-1-(para-clorofenil)-etanol
con un e. e. de 98%.
A 20 ml de tampón Tris-SO_{4}
(50 mM, pH = 7,3) que contenía 2 mM de óxido de para cloro estireno
y 1,2 mM de NaNO_{2}, se añadieron 1,0 mg de la enzima
purificada, obtenida como se describe en el ejemplo 1. Se detuvo la
reacción al 58% de conversión y la solución se extrajo con
dietiléter. La fase orgánica se analizó mediante CG quiral. Se
obtuvo el óxido de (S)-para-cloro
estireno con un e. e. mayor que el 99%.
A 20 ml de tampón Tris-SO_{4}
(50 mM, pH = 7,3) que contenía 2 mM de epiclorohidrina y 20 mM de
NaN_{3}, se añadieron 1,0 mg de la enzima purificada. Se detuvo
la reacción al 66% de conversión y la solución se extrajo con
dietiléter. La fase orgánica se analizó mediante CG. Además de la
epiclorohidrina restante, la mezcla consistía en
1-azido-3-cloro-2-propanol
con un 92% de e. e.,
2-azidometil-oxirano con un 92% de
e. e. y el
1,3-dicloro-2-propanol
no quiral.
A 20 ml de tampón Tris-SO_{4}
(50 mM, pH = 7,3) que contenía 2 mM de epiclorohidrina y 20 mM de
NaN_{3}, se añadieron 1,0 mg de la enzima purificada. Se detuvo
la reacción a una conversión total de la epiclorohidrina y la
solución se extrajo con dietiléter. La fase orgánica se analizó
mediante CG quiral. El producto consistía en una mezcla de
1-azido-3-cloro-2-propanol
con un 92% de e. e., y
2-azidometil-oxirano con un 92% de
e. e. (Adición de una pequeña cantidad de NaOH proporcionó
2-azidometil-oxirano en forma de un
sólo producto con un 92% de e. e.).
A 20 ml de tampón Tris-SO_{4}
(50 mM, pH = 6,5) que contenía 20 mM de epibromohidrina, 30 mM de
NaN_{3}, 50 mM NaBr, se añadieron 1,0 mg de la enzima
purificada. Después de la finalización de la reacción, la mezcla
obtenida se extrajo con dietiléter y la fase orgánica se analizó
mediante CG quiral. Se obtuvo el producto
1-azido-3-bromo-2-propanol
con > 99% de e. e., y 75% de rendimiento.
<110> Enzis Patent B. V.
\vskip0.400000\baselineskip
<120> Conversión enzimática de
epóxidos
\vskip0.400000\baselineskip
<130> documento P53029EP10
\vskip0.400000\baselineskip
<140> 01934641.0
\vskip0.400000\baselineskip
<141> 13 - 12 - 2002
\vskip0.400000\baselineskip
<150> documento EP 00201874.5
\vskip0.400000\baselineskip
<151> 25 - 05 - 2000
\vskip0.400000\baselineskip
<150> documento PCT/NL01/00403
\vskip0.400000\baselineskip
<151> 23 - 05 - 2001
\vskip0.400000\baselineskip
<160> 2
\vskip0.400000\baselineskip
<170> PatentIn Ver. 2.1
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 1
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 880
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la secuencia
artificial: pGEhheC, que comprende la secuencia de ADN del gen de la
halohidrin deshalogenasa de AD1.
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> misc _ característica
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1) .. (880)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> /nota = ``Posición 1 a 49 y 815 a
880 es una parte de pGEF +, posición 50 a 814 es un gen de la
halohidrin deshalogenasa de AD1.
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 1
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 2
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 254
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Agrobacterium radiobacter
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> SITIO
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1) .. (254)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> /nota = "Secuencia de aminoácidos
de la halohidrin deshalogenasa".
\newpage
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 2
Claims (20)
1. Un procedimiento para convertir de
manera enzimática, un epóxido, opcionalmente sustituido de la
fórmula
en la que R_{1} es hidrógeno o un
grupo aromático o alifático opcionalmente sustituido, en una mezcla
de un epóxido ópticamente enriquecido de fórmula (I) y un alcohol
ópticamente enriquecido de
fórmula:
en la que R_{2} se elige entre el
grupo de I, Cl, Br, CN, N_{3}, NO_{2}, NO_{3}, SCN, OCN, OR',
NHR', SR', SnR', SeR', PR y CO_{2}R', en la que R' se elige entre
el grupo de hidrógeno, grupos amino, grupos hidroxilo, grupos
alquilo, grupos arilo, grupos aralquilo, alquenilo, y cicloalquilo,
o en la que R_{2} es OR', estando R' elegido entre el grupo
constituido por grupos amino, grupos hidroxilo, grupos alquilo,
grupos arilo, grupos aralquilo, alquenilo, y cicloalquilo, dicho
procedimiento comprende hacer reaccionar el epóxido con un
nucleófilo aniónico (R_{2-}) en presencia de una halohidrin
deshalogenasa.
2. Un procedimiento de acuerdo con la
reivindicación 1, en el que se recupera el alcohol ópticamente
enriquecido.
3. Un procedimiento de acuerdo con la
reivindicación 1, en el que se recupera el epóxido ópticamente
enriquecido.
4. Un procedimiento de acuerdo con
cualquiera de las reivindicaciones precedentes, en el que la
halohidrin deshalogenasa es un polipéptido que tiene la secuencia
de aminoácidos de la SEQ ID Nº 2, o un homólogo del mismo, teniendo
dicho homólogo una secuencia de aminoácidos que es al menos 90%
homóloga a la secuencia de aminoácidos de la SEQ ID Nº 2.
5. Un procedimiento de acuerdo con la
reivindicación 1, en el que la halohidrin deshalogenasa se deriva
de Agrobacterium radiobacter (CBS 750.97),
Arthrobacter sp., cepa AD2 o Mycobacterium sp. cepa
GP1.
6. Un procedimiento de acuerdo con
cualquiera de las reivindicaciones precedentes, en el que el epóxido
se convierte a partir de una mezcla que comprende ambos
enantiómeros de dicho epóxido.
7. Un procedimiento de acuerdo con la
reivindicación 6, en el que la mezcla es una mezcla racémica.
8. Un procedimiento de acuerdo con
cualquiera de las reivindicaciones precedentes, en el que R_{1}
se elige entre el grupo de grupos alquilo, arilo, aralquilo,
alquenilo, cicloalquilo, y alcoxi opcionalmente sustituidos.
9. Un procedimiento de acuerdo con la
reivindicación 8, en el que R_{1} comprende entre 1 y 20 átomos
de carbono.
10. Un procedimiento de acuerdo con la
reivindicación 8 ó 9 en el que R_{1} comprende un sustituyente
elegido entre el grupo de grupos amino, halógenos, grupos
hidroxilo, grupos ciano, grupos azida, grupos nitro, grupos
haloalquilo, grupos acilo, grupos alcoxi, grupos fenoxi y grupos
carboxilo.
11. Un procedimiento de acuerdo con cualquiera
de las reivindicaciones precedente, en el que el epóxido tiene la
fórmula
en la que R_{4} se elige entre
Cl, Br y
I.
12. Un procedimiento de acuerdo con la
reivindicación 11, en el que el epóxido es epiclorhidrina,
epiyodohidrina, o epibromohidrina.
13. Un procedimiento de acuerdo con la
reivindicación 11 ó 12, en el que el alcohol se obtiene con un
rendimiento mayor que 10%.
14. Un procedimiento de acuerdo con cualquiera
de las reivindicaciones 1-10, en el que R_{1} es
un grupo aromático opcionalmente sustituido.
15. Un procedimiento de acuerdo con la
reivindicación 14, en el que el epóxido tiene la fórmula
en la que R_{3} es un
sustituyente orto-, meta-, o para- elegido entre el grupo de
-NO_{2}, -NH_{2}, -CH_{3}, -OCH_{3}, -OCH_{2}CH_{3},
-OH, -F, -Cl, -Br, -I, -COOH y
-CN.
16. Un procedimiento de acuerdo con la
reivindicación 14 ó 15, en el que el nucleófilo aniónico es
N_{3}-, NO_{3}^{-}, o CN-.
17. Un procedimiento de acuerdo con cualquiera
de las reivindicaciones precedentes, en el que el epóxido se hace
reaccionar en la forma de un sólido, suspensión, solución o
dispersión.
18. Un procedimiento de acuerdo con la
reivindicación 17, en el que el epóxido está presente en un medio
acuoso en una cantidad entre 0,01 y 20% en peso, basado en los pesos
combinados del medio acuoso y el epóxido.
19. Un procedimiento de acuerdo con cualquiera
de las reivindicaciones precedentes, en el que la temperatura está
entre 0 y 60ºC.
20. Un procedimiento de acuerdo con cualquiera
de las reivindicaciones precedentes, en el que el pH está entre 3 y
12.
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