ES2272333T3 - Procedimiento para aumentar el nivel de una sustancia de fermentacion. - Google Patents
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Abstract
Un procedimiento para aumentar el nivel de al menos una sustancia de fermentación en un producto de fermentación, comprendiendo el procedimiento la etapa de fermentar un material inicial de fermentación que contiene glucosa derivado de una planta mediante una célula de levadura, sobreexpresando dicha planta una construcción de ácido nucleico que incluye un polinucleótido genómico, complementario o compuesto que codifica un polipéptido que tiene una secuencia de aminoácidos como la que se muestra en la ID SEC Nº 2, teniendo dicho polipéptido una actividad catalítica beta-glucosidasa, aumentando de este modo, el nivel de la al menos una sustancia de fermentación en el producto de fermentación.
Description
Procedimiento para aumentar el nivel de una
sustancia de fermentación.
La presente invención se refiere a un
procedimiento para aumentar el nivel de al menos una sustancia de
fermentación en un producto de fermentación según las
reivindicaciones 1 y 10, un procedimiento para aumentar el nivel de
al menos una sustancia aromática en un producto derivado de una
planta según las reivindicaciones 2 y 12, un procedimiento para
aumentar el nivel de glucosa libre en un material inicial de
fermentación que contiene glucosa derivado de una planta según las
reivindicaciones 4 y 15, un procedimiento para aumentar el nivel de
glucosa libre en una planta según las reivindicaciones 5 y 17, un
procedimiento para producir un alcohol según las reivindicaciones 6
y 19, un procedimiento para producir una planta aromática según
las reivindicaciones 7 y 21.
Las abreviaturas usadas en este documento
incluyen: BGL1 - \beta-glucosidasa de
Aspergillus niger B1, bgl1 - un ADNc que codifica ésta,
2FGlcF - fluoruro de
2-desoxi-2-fluoro-\beta-glucosilo,
DNP - 2,4,-dinitrofenol; DNPGlc - 2,4-dinitrofenil
\beta-D-glucopiranósido; pNP -
p-nitrofenol; pNPGlc - p-nitrofenil
\beta-D-glucopiranósido; MUGlc -
4-metilumbeliferil-\beta-D-glucopiranósido;
YNB - base de nitrógeno para levaduras sin aminoácidos; y
X-glu -
5-bromo-4-cloro-3-indolil
\beta-D-glucopiranósido.
Las \beta-glucosidasas (EC
3.2.1.21; \beta-D-glucósido
glucohidrolasa) juegan varios papeles importantes diferentes en
biología, que incluyen la degradación de la biomasa celulósica por
hongos y bacterias, la degradación de glucolípidos en lisosomas de
mamíferos y la escisión de flavonoides glicosilados en plantas.
Estas enzimas son, por tanto, de considerable interés industrial,
no sólo como constituyentes de los sistemas de degradación de
celulosa, sino también en la industria alimentaria (2,3).
Se sabe que las especies de Aspergillus
son fuentes útiles de \beta-glucosidasas
(4-6), y Aspergillus niger es con diferencia
el productor más eficaz de \beta-glucosidasa
entre los microorganismos investigados (4). Shoseyov y col. (7) han
descrito previamente una \beta-glucosidasa de
Aspergillus niger B1 (CMI CC 324626) que es activa a pH
bajos, así como en presencia de elevadas concentraciones de etanol.
Esta enzima hidroliza de forma eficaz glucósidos de compuestos
aromáticos en ciertos productos a pH bajo, tales como el vino y el
zumo de maracuyá, potenciando así su sabor (8-12),
y es especialmente atractivo para su uso en la industria
alimentaria, ya que A. niger se considera como no tóxico
(3). Además, se encontró que la \beta-glucosidasa
era útil en la síntesis enzimática de glucósidos
(13-15). También se han purificado otras
\beta-glucosidasas de A. niger
(16-18), sin embargo, se han descrito diferencias
entre sus propiedades, incluyendo intervalos de pesos moleculares
(116-137 kDa), puntos isoeléctricos (valores de pI
de 3,8-4) y pH óptimos (3,4-4,5). De
hecho, se han identificado al menos dos
\beta-glucosidasas, con especificidades de
sustrato diferentes en preparaciones comerciales de
\beta-glucosidasa de A. niger. Previamente
se han descrito intentos de aclarar esta confusión clonando y
expresando un gen funcional de \beta-glucosidasa
de A. niger en S. cerevisiae (20), sin embargo, no se
ha caracterizado la proteína y no se ha publicado la
secuencia.
Las glucosidasas se han asignado a familias en
función de las similitudes de secuencia, existiendo ahora unas 77
familias diferentes definidas que contienen más de 2.000 enzimas
diferentes (21, véase también
http://afmb.cnrs-mrs.fr/-pedro/CAZY/db.html). Con la
excepción de las glucosilceramidasas (Familia 30), todas las
\beta-glucosidasas sencillas pertenecen a las
Familias 1 ó 3. La Familia 1 contiene enzimas de bacterias, plantas
y mamíferos, que incluyen también a las
6-fosfoglucosidasas y a las tioglucosidasas. Además,
la mayoría de las enzimas de la Familia 1 también tienen una
actividad galactosidasa significativa. La Familia 3 contiene
\beta-glucosidasas y hexosaminidasas de origen
fúngico, bacteriano y vegetal. Las enzimas de ambas familias
hidrolizan sus sustratos con la retención neta de la configuración
anomérica, presumiblemente a través de un mecanismo en dos etapas
de desplazamiento doble, que implica a dos restos de ácido
carboxílico claves del centro activo (para revisiones del
mecanismo, véanse 22-24). En la primera etapa, uno
de los ácidos carboxílicos (el nucleófilo) ataca al centro
anomérico del sustrato, mientras que el otro (el catalizador
ácido/base) protona el oxígeno glucosídico, ayudando de este modo a
la salida de la aglucona. Esto da lugar a la formación de un
intermedio covalente
\alpha-glucosil-enzima. En una
segunda etapa este intermedio se hidroliza mediante el ataque
general catalizado por una base del agua en el centro anomérico del
glucosil-enzima, para liberar el producto
\beta-glucosa y regenerar la enzima libre. Tanto
la formación como la hidrólisis de este intermedio tienen lugar a
través de estados de transición con un carácter sustancial de ión
oxocarbenio.
Ya que la Familia 3 contiene enzimas fúngicas de
masa similar, incluyendo las de otros Aspergillus sp., es
probable que la \beta-glucosidasa de
Aspergillus niger pudiera ser miembro de esta familia. La
información mecanicista sobre esta familia es relativamente escasa,
siendo la mejor caracterizada la
\beta-glucosidasa de 170 kDa glucosilada de
Aspergillus wentii. Marcando el centro activo con epóxido de
conduritol B, se demostró que esta enzima lleva a cabo la
hidrólisis, con retención neta de la configuración anomérica. Este
estudio ha demostrado que el resto de ácido aspártico marcado era
el mismo que el que se derivatizaba mediante el sustrato lento
D-glucal (1, 25). Además, se ha demostrado que el
2-desoxiglucosil-enzima, atrapado
mediante el uso del D-glucal, era cinéticamente
idéntico al formado durante la hidrólisis de
PNP-2-desoxi-\beta-D-glucopiranósido
(26). Legler y col. (27), realizaron análisis cinéticos más
detallados de la enzima, que incluían medidas de relaciones de
Hammett, efectos isotópicos cinéticos y estudios de la unión de
potentes inhibidores reversibles, tales como gluconolactona y
nojirimicina.
Reduciendo la presente invención a la práctica,
la proteína \beta-glucosidasa se aisló de
Aspergillus niger, se purificó, clonó, secuenció, expresó en
células hospedadoras de levaduras y se caracterizó su función
enzimática. Además, la proteína, así como el péptido señal
fusionado con ésta y, opcionalmente, un péptido de retención en el
retículo endoplásmico fusionado con ésta, se expresaron en plantas
transgénicas y se controló la liberación de sustancias aromáticas a
partir de éstas tras la homogeneización. La enzima codificada por
el gen aislado, según se describe anteriormente, es de utilidad
conocida en la planta y/o en productos de la planta, así como en
procedimientos biotecnológicos, que incluyen a la industria
alimentaria. Se descubrieron varias ventajas inesperadas que
incluían, pero sin limitaciones, la estabilidad de pH y temperatura
de la \beta-glucosidasa de Aspergillus
niger y el requerimiento de un péptido señal para obtener
actividad catalítica cuando se expresa en plantas. La ventaja de un
péptido de retención endoplásmica o de su carencia cuando se
expresa en plantas depende de la aplicación.
Pentilla y col., 1984; Cloning of Aspergillus
niger genes in yeast; Expression of the gene coding
Aspergillus beta-glucosidase, Mol Gen. Genet.
194:494-499; describen la posibilidad de clonar
genes de hongos filamentosos mediante la expresión en la levadura
Saccharomyces cerevisiae. Se hizo un banco genómico de
Aspergillus niger en E. coli usando un vector
lanzadera de cósmidos de levadura y se aislaron individualmente
aproximadamente 10.000 clones cósmidos diferentes. Se analizó la
expresión de los genes de las glicoproteínas,
\beta-glucosidasas y amiloglucosidasa fúngicas
secretadas en los transformantes de levaduras portadores del ADN de
Aspergillus y la expresión de los genes fúngicos que
complementan las mutaciones ura3 y leu2 de levadura.
De los cinco genes de Aspergillus
estudiados, se descubrió que sólo uno, la
\beta-glucosidasa, se expresaba en levadura y
esto a un nivel bajo. Esto sugiere que hay diferencias esenciales
entre los genes de levadura y los de hongos filamentosos.
Iwashita y col., 1997, número de acceso del
EMBL: AB003470 se refiere al "gen bg1A de Aspergillus
kawachii que codifica tanto beta-glucosidasas
extracelulares como unidas a la pared celular".
Bhat M. K. y col., 1997: Cellulose degrading
enzymes and their potencial industrial applications; Biotechnology
Advances 15:583-620; describen la bioconversión de
la celulosa en azúcares solubles y en glucosa catalizada por un
grupo de enzimas denominadas celulasas. Los microorganismos que
incluyen hongos, bacterias y actinomicetos producen principalmente
tres tipos de componentes celulasas
(endo-1,4-\beta-D-glucanasa,
exo-1,4-\beta-D-glucanasa
y \beta-glucosidasa) por separado o en forma de
complejo. En las últimas décadas, las celulasas se han entendido
mejor a nivel básico; sin embargo, queda mucho por aprender. El
tremendo potencial comercial de las celulasas en diversas
aplicaciones permanece como la fuerza motriz para la investigación
en este área. Esta revisión resume el estado del conocimiento actual
sobre las celulasas microbianas y sus aplicaciones.
Dekker R. F. H. 1986,
28:1438-1442, describe las propiedades cinéticas de
inhibición y estabilidad de una preparación comercial de celobiasa,
\beta-d-glucosidasa de
Aspergillus niger y su idoneidad para la hidrólisis de la
lignocelulosa, biotecnología y biomanipulación genética.
Zhou S. y col., 1999: Engineering
endoglucanase-secreting strains of ethanologenic
Klebsiella oxytoca P2. Journal of Industrial Microbiology
and Biotechnology, 22:600-607 se refiere a la
Klebsiella oxytoca P2 recombinante desarrollada como un
biocatalizador para la sacarificación y fermentación simultáneas
(SFS) de la celulosa mediante la integración cromosómica de genes
de Zymomonas mobilis (pdc, adhB) que codifican la ruta del
etanol. Esta cepa contiene la capacidad nativa para transportar y
metabolizar la celobiosa, eliminando la necesidad de suplementar
con \beta-glucosidasa durante la SFS. Para
aumentar la utilidad de este biocatalizador, ahora hemos integrado
cromosómicamente el gene ceIZ que codifica la endoglucanasa
principal de Erwinia chrysantemi. Este gen se expresaba a
niveles elevados sustituyendo el promotor nativo por un promotor
sustituto derivado del ADN de Z. mobilis. Con la adición de
genes externos que codifican el sistema de secreción de proteínas
de tipo II de E. chrysanthemi, más de la mitad de la
endoglucanasa activa (EGZ) se secretaba al medio extracelular. Las
dos cepas más activas, SZ2(pCPP2006) y SZ6(pCPP2006),
producían aproximadamente 24.000 U.l^{-1} de actividad CMCasa,
equivalente al 5% de la proteína celular total. La EGZ recombinante
despolimerizaba parcialmente la celulosa empapada en ácido y
permitía la producción de pequeñas cantidades de etanol por
SZ6(pCPP2006) sin la adición de celulosa fúngica. Sin
embargo, se requerirán actividades endoglucanasa adicionales para
completar la despolimeración de la celulosa en pequeños productos
solubles que puedan ser metabolizados de forma eficaz a etanol.
Shoseyov y col., 1990; Immobilized
endo-beta-glucosidase enriches
flavor of wine and passion fruit juice, Journal of Agricultural and
Food Chemistry, 38:1387-1390, se refieren a una
endo-\beta-glucosidasa de
Aspergillus niger inmovilizada en perlas acrílicas, así como
en partículas de celulosa de hojas y troncos de maíz. La eficacia
de la inmovilización a pH 6,5 en las partículas acrílicas, con
respecto a la actividad era mayor que la de la celulosa, pero
seguía siendo baja (10%). Sin embargo, se lograba una eficacia de
inmovilización mayor para la celulosa (30%) a pH 4,5. La
estabilidad térmica de la enzima se mejoraba mediante su
inmovilización por ambos procedimientos. Se usaron
endo-\beta-glucosidasas libres e
inmovilizadas para tratar vino Muscat Roy y zumo de maracuyá (pH
2,45). El análisis por CG-EM, así como la
evaluación sensorial, indicaba un aumento significativo en los
compuestos aromáticos, en alcoholes monoterpernos y en óxidos de
linalool del benzaldehido, que es un glucósido cianogénico como
evidencia de la evolución de la cianida que sigue al tratamiento
enzimático.
El procedimiento para aumentar el nivel de al
menos una sustancia de fermentación en un producto de fermentación
se define en las reivindicaciones 1 y 10, un procedimiento para
aumentar el nivel de al menos una sustancia aromática en un
producto derivado de una planta se define en las reivindicaciones 2
y 12, un procedimiento para aumentar el nivel de glucosa libre en
un material inicial de fermentación que contiene glucosa derivado
de una planta se define en las reivindicaciones 4 y 15, un
procedimiento para aumentar el nivel de glucosa libre en una planta
se define en las reivindicaciones 5 y 17, un procedimiento para
producir un alcohol se define en las reivindicaciones 6 y 19, un
procedimiento para producir una planta aromática se define en las
reivindicaciones 7 y 21.
Según aspectos adicionales en realizaciones
preferidas de la invención descrita a continuación, el
polinucleótido es como se nuestra en las ID SEC Nº 1, 3 o una
porción de las mismas.
Según aún aspectos adicionales en las
realizaciones preferidas descritas, la construcción de ácido
nucleico además comprende al menos un elemento de control que
actúa en cis para regular la expresión del
polinucleótido.
Según aún aspectos adicionales en las
realizaciones preferidas descritas, la célula hospedadora se
selecciona entre el grupo constituido por una célula procariota y
una célula eucariota.
Según aún aspectos adicionales en las
realizaciones preferidas descritas la célula procariota es E.
coli.
Según aún aspectos adicionales en las
realizaciones preferidas descritas, la célula eucariota se
selecciona entre el grupo constituido por una célula de levadura,
una célula fúngica, una célula vegetal y una célula animal.
Según aún aspectos adicionales en las
realizaciones preferidas descritas, el polipéptido es como se
muestra en la ID SEC Nº 2 o una porción de la misma que tiene la
actividad catalítica \beta-glucosidasa.
Según un aspecto adicional de la presente
invención, se proporciona un procedimiento para producir
\beta-glucosidasa recombinante, comprendiendo el
procedimiento la etapa de introducir, en una forma expresable, una
construcción de ácido nucleico en una célula hospedadora,
incluyendo la construcción de ácido nucleico un polinucleótido
genómico, complementario o compuesto, derivado preferiblemente de
Aspergillus niger, que codifica un polipéptido que tiene una
actividad catalítica \beta-glucosidasa y
preferiblemente además codifica, en fase, un péptido señal y un
péptido de retención en el retículo endoplásmico.
Según aspectos adicionales en realizaciones
preferidas de la invención descrita a continuación, el
procedimiento además comprende la etapa de extraer el polipéptido
que tiene actividad catalítica
\beta-glucosidasa.
Según aún un aspecto adicional de la presente
invención, se proporciona un procedimiento para producir una célula
que sobreexpresa \beta-glucosidasa recombinante,
comprendiendo el procedimiento la etapa de introducir, en una forma
expresable, una construcción de ácido nucleico en una célula
hospedadora, incluyendo la construcción de ácido nucleico un
polinucleótido genómico, complementario o compuesto, derivado
preferiblemente de Aspergillus niger, que codifica un
polipéptido que tiene una actividad catalítica
\beta-glucosidasa y, preferiblemente además
codifica, en fase, un péptido señal y un péptido de retención en el
retículo endoplásmico.
Según aún un aspecto adicional de la presente
invención, se proporciona un procedimiento para aumentar el nivel
de al menos una sustancia de fermentación en un producto de
fermentación, comprendiendo el procedimiento la etapa de fermentar
un material inicial de fermentación que contiene glucosa mediante
una célula de levadura que sobreexpresa una construcción de ácido
nucleico que incluye un polinucleótido genómico, complementario o
compuesto, derivado preferiblemente de Aspergillus niger, que
codifica un polipéptido que tiene actividad catalítica
\beta-glucosidasa y preferiblemente además
codifica, en fase, un péptido señal y un péptido de retención en el
retículo endoplásmico, aumentando, de este modo, el nivel de la al
menos una sustancia de fermentación en el producto de
fermentación.
fermentación.
Según un aspecto adicional de la presente
invención, se proporciona un procedimiento para aumentar el nivel
de al menos una sustancia de fermentación en un producto de
fermentación, comprendiendo el procedimiento la etapa de fermentar
un material inicial de fermentación que contiene glucosa derivado
de una planta mediante una célula de levadura, sobreexpresando la
planta una construcción de ácido nucleico que incluye un
polinucleótido genómico, complementario o compuesto,
preferiblemente derivado de Aspergillus niger, que codifica
un polipéptido que tiene actividad catalítica
\beta-glucosidasa y preferiblemente además
codifica, en fase, un péptido señal y un péptido de retención en el
retículo endoplásmico, aumentando, de este modo, el nivel de la al
menos una sustancia de fermentación en el producto de
fermentación.
Según un aspecto adicional de la presente
invención, se proporciona un procedimiento para aumentar el nivel
de al menos una sustancia aromática en un producto derivado de una
planta, comprendiendo el procedimiento la etapa de incubar un
material inicial de una planta que contiene glucosa con una célula
de levadura que sobreexpresa una construcción de ácido nucleico que
incluye un polinucleótido genómico, complementario o compuesto,
preferiblemente derivado de Aspergillus niger, que codifica
un polipéptido que tiene actividad catalítica
\beta-glucosidasa y preferiblemente además
codifica, en fase, un péptido señal y un péptido de retención en el
retículo endoplásmico, aumentando, de este modo, el nivel de la al
menos una sustancia aromática en el producto derivado de la
planta.
Según aún un aspecto adicional de la presente
invención, se proporciona un procedimiento para aumentar el nivel
de al menos una sustancia aromática en un producto derivado de una
planta, comprendiendo el procedimiento la etapa de incubar un
material inicial de una planta que contiene glucosa con una célula
de levadura, sobreexpresando dicha planta una construcción de
ácido nucleico que incluye un polinucleótido genómico,
complementario o compuesto, preferiblemente derivado de
Aspergillus niger, que codifica un polipéptido que tiene
actividad catalítica \beta-glucosidasa y
preferiblemente además codifica, en fase, un péptido señal y un
péptido de retención en el retículo endoplásmico, aumentado de
este modo el nivel de al menos una sustancia aromática en el
producto derivado de la planta.
Según otras características adicionales en las
realizaciones preferidas descritas, el producto derivado de la
planta es un producto de fermentación, tal como, pero sin
limitaciones, una bebida alcohólica.
Según aún un aspecto adicional de la presente
invención, se proporciona un procedimiento para aumentar el nivel
de glucosa libre en un material inicial de fermentación que
contiene glucosa, comprendiendo el procedimiento la etapa de
fermentar el material inicial de fermentación que contiene glucosa
mediante una célula que sobreexpresa una construcción de ácido
nucleico que incluye un polinucleótido genómico, complementario o
compuesto, preferiblemente derivado de Aspergillus niger,
que codifica un polipéptido que tiene una actividad catalítica
\beta-glucosidasa y preferiblemente además
codifica, en fase, un péptido señal y un péptido de retención en el
retículo endoplásmico, aumentado de este modo el nivel de la
glucosa libre en el material inicial de fermentación que contiene
glucosa.
Según otro aspecto de la presente invención, se
proporciona un procedimiento para aumentar el nivel de glucosa
libre en un material inicial de fermentación que contiene glucosa
derivado de una planta, comprendiendo el procedimiento la etapa de
fermentar el material inicial de fermentación que contiene glucosa
derivado de una planta mediante una célula, sobreexpresando la
planta una construcción de ácido nucleico que incluye un
polinucleótido genómico, complementario o compuesto,
preferiblemente derivado de Aspergillus niger, que codifica
un polipéptido que tiene una actividad catalítica
\beta-glucosidasa y preferiblemente además
codifica, en fase, un péptido señal y un péptido de retención en el
retículo endoplásmico, aumentando, de este modo, el nivel de
glucosa libre en la planta.
Según todavía otro aspecto de la presente
invención, se proporciona un procedimiento para aumentar el nivel
de glucosa libre en una planta, comprendiendo el procedimiento la
etapa de sobreexpresar en la planta una construcción de ácido
nucleico que incluye un polinucleótido genómico, complementario o
compuesto, preferiblemente derivado de Aspergillus niger,
que codifica un polipéptido que tiene una actividad catalítica
\beta-glucosidasa y preferiblemente además
codifica, en fase, un péptido señal y un péptido de retención en el
retículo endoplásmico, aumentando, de este modo, el nivel de
glucosa libre en la planta.
Según aún otro aspecto de la presente invención,
se proporciona un procedimiento para producir un alcohol,
comprendiendo el procedimiento la etapa de fermentar un material
inicial de fermentación que contiene glucosa mediante una célula
que sobreexpresa una construcción de ácido nucleico que incluye un
polinucleótido genómico, complementario o compuesto, derivado
preferiblemente de Aspergillus niger, que codifica un
polipéptido que tiene una actividad catalítica
\beta-glucosidasa y, preferiblemente, además
codifica, en fase, un péptido señal y un péptido de retención en el
retículo endoplásmico, y extraer el alcohol de la misma.
Según un aspecto adicional de la presente
invención, se proporciona un procedimiento para producir un
alcohol, comprendiendo el procedimiento la etapa de fermentar un
material inicial de fermentación que contiene glucosa derivado de
una planta, sobreexpresando la planta una construcción de ácido
nucleico que incluye un polinucleótido genómico, complementario o
compuesto, derivado preferiblemente de Aspergillus niger,
que codifica un polipéptido que tiene una actividad catalítica
\beta-glucosidasa y preferiblemente, además
codifica, en fase, un péptido señal y un péptido de retención en el
retículo endoplásmico, y extraer el alcohol de la misma.
Según un aspecto adicional de la presente
invención, se proporciona un procedimiento para producir una planta
aromática, comprendiendo el procedimiento la etapa de
sobreexpresar en la planta una construcción de ácido nucleico que
incluye un polinucleótido genómico, complementario o compuesto,
derivado preferiblemente de Aspergillus niger, que codifica
un polipéptido que tiene una actividad catalítica
\beta-glucosidasa y, preferiblemente además
codifica, en fase, un péptido señal y un péptido de retención en el
retículo endoplásmico, aumentando, de este modo, el aroma que
difunde la planta.
Según características adicionales en
realizaciones preferidas de la invención descritas a continuación,
la sobreexpresión de la construcción de ácido nucleico se realiza
de manera específica de tejido.
Según otras características adicionales de las
realizaciones preferidas descritas, la sobreexpresión de la
construcción de ácido nucleico se limita a al menos un tejido
seleccionado entre el grupo constituido por la flor, el fruto, la
semilla, la raíz, el tronco, el polen y las hojas.
Las presente invención aborda con éxito las
deficiencias de las configuraciones actualmente conocidas
proporcionando un polipéptido que tiene actividad enzimática
\beta-glucosidasa, un polinucleótido que codifica
el polipéptido, construcciones de ácido nucleico que llevan el
polinucleótido, células transformadas o infectadas, tales como
células de levadura, y organismos que expresan el polinucleótido y
diversos usos del polipéptido, el polinucleótido, las células y/u
organismos, que incluyen, pero sin limitaciones, la producción de
un polipéptido recombinante que tiene actividad enzimática
\beta-glucosidasa, aumentar el nivel de
compuestos aromáticos en las bebidas alcohólicas, así como en otros
productos de fermentación de material de la planta, hidrolizar la
celobiosa y, de este modo, aumentar el nivel de glucosa fermentable
y/o libre, para aumentar la producción de un producto de
fermentación, tal como el etanol a partir de material de la planta,
aumentado el aroma que se libera de una planta o de un producto de
la planta, y la hidrólisis o transglicosilación de glucósidos.
La invención se describe en este documento, sólo
a modo de ejemplo, en referencia a los dibujos que la acompañan.
Ahora, con referencia específica a los dibujos en detalle, se
enfatiza que los detalles mostrados son a modo de ejemplo y sólo
con el fin de ilustrar la descripción de las realizaciones
preferidas de la presente invención, y se presentan por el hecho de
proporcionar lo que se cree que es la descripción más útil y fácil
de entender de los principios y aspectos conceptuales de la
invención. A este respecto, no se pretende mostrar detalles
estructurales de la invención en más detalle que lo necesario para
un entendimiento básico de la invención, haciendo aparente a los
expertos en la materia la descripción con los dibujos de como
pueden expresarse en la práctica las diversas formas de la
invención.
invención.
En los dibujos:
Las Figuras 1a-c muestran los
mapas de los plásmidos empleados como vectores de expresión para el
ADNc de bgl1. Figura 1a - vector de expresión de E. coli que
contiene el ADNc de bgl1 insertado en los sitios
NcoI/BamHI de pET3d. Figura 1b - vector de expresión
de S. cerevisiae que contiene el ADNc de bgl1 insertado en
los sitios HindIII/BamHI del plásmido
pYES2-bgl1. Figura 1c - vector de expresión de
P. pastoris que contiene el ADNc de bgl1 insertado en los
sitios EcoRI/BamHI de pHIL-S1.
Las Figuras 2a-b muestran el
análisis en SDS-PAGE de las muestras de proteína
activa eluidas de una columna Mono-Q, teñidas con
azul de Coomassie (Figura 2a) o el zimograma de
\beta-glucosidasa (Figura 2b) usando como
sustrato MUGlc. Carriles (para ambas Figuras, 2a y 2b): 1 - banda
de BGL1 electroeluida a partir de fragmentos de un gel
SDS-PAGE preparativo; 2, 3, 4, 5 - precipitados con
acetona de la separación en Mono-Q de BGL1.
La Figura 3 muestra el análisis por
SDS-PAGE de la \beta-glucosidasa
purificada mediante Mono-Q y
Resource-S. Carriles: 1. - extracto en bruto (27,5
\mug de proteína); 2- fracción activa después de
Mono-Q (7 \mug de proteína); y 3 - fracción
activa después de Resource-S (10 \mug de
proteína).
La Figura 4 muestra el análisis por
SDS-PAGE de la \beta-glucosidasa
desglicosilada con N-glicosidasa-F.
Carriles: 1 -
marcadores de peso molecular; 2 - \beta-glucosidasa nativa y 3 - proteína desglicosilada.
marcadores de peso molecular; 2 - \beta-glucosidasa nativa y 3 - proteína desglicosilada.
La Figura 5a muestra las secuencias de ADN y de
aminoácidos de bgl1. Se subrayan las secuencias de aminoácidos
determinadas mediante degradación de Edman. Se subrayan las
secuencias de ADN de los intrones. El péptido señal se indica con
letras cursivas.
La Figura 5b muestra la organización del gen
bgl1. Los exones (E1-7) se indican mediante
recuadros rellenos, los intrones mediante líneas continuas, los
sitios de restricción y el codón de parada mediante flechas.
La Figura 6a muestra un análisis por
inmunotransferencia del BGL1 recombinante expresada en S.
cerevisiae. Carriles: 1 - BGL1 nativo (control positivo); 2 -
extracto de proteína total de S. cerevisiae que expresa la
BGL1 recombinante; 3 - extracto de proteína total de S.
cerevisiae sin el vector de expresión de bgl1 (control
negativo).
La Figura 6b muestra un análisis por
inmunotransferencia de la BGL1 recombinante secretada a partir de
P. pastoris. Carriles: 1- marcadores de peso molecular; 2 -
sobrenadante del medio de P. pastoris que expresa la BGL1
recombinante; 3 - sobrenadante del medio del huésped P.
pastoris sin el vector (control negativo).
La Figura 7 muestra un espectro de RMN de
protón, que ilustra el curso estereoquímico de la hidrólisis de
pNPGlc por la \beta-glucosidasa de A.
niger. Los espectros son de la región del protón anomérico del
sustrato a diferentes intervalos de tiempo con respecto a la
adición de la enzima.
La Figura 8 muestra la inactivación de BGL1
recombinante por 2FGlcF. La enzima pura se incubó en presencia de
diversas concentraciones del inactivador y se determinó la
actividad enzimática residual a diferentes intervalos de tiempo. Se
presenta la actividad residual, semilogarítmicamente, frente al
tiempo, en presencia de las concentraciones indicadas de
inactivador.
La Figura 9 muestra la reactivación de
2-desoxi-2-fluoroglucosil
- BGL1 recombinante por linamarina. La actividad se representa
frente al tiempo de incubación en presencia de las concentraciones
indicadas de linamarina.
La Figura 10 muestra la estabilidad de la
\beta-glucosidasa recombinante de A. niger
a diversas temperaturas. La actividad se calcula como el porcentaje
de una solución de enzima recombinante mantenida a 4ºC.
Las Figuras 11a-c muestran
esquemas de los casetes de expresión usados para la expresión de la
\beta-glucosidasa de A. niger en plantas
de tabaco. Figura 11a - un casete que codifica BGL1 sin péptido
señal (véase, la ID SEC Nº 13 para la secuencia de nucleótidos y la
ID SEC Nº 14 para la secuencia de aminoácidos); Figura 11b - un
casete que codifica una BGL1 fusionada con un péptido señal Cel1
para la secreción dentro del apoplasto (véase, la ID SEC Nº 15 para
la secuencia de nucleótidos y la ID SEC Nº 16 para la secuencia de
aminoácidos) y Figura 11c - un casete que codifica una BGL1
fusionada con el péptido señal Cel1 como en la Figura 11b y además
con el péptido de retención en el RE, HDEL (ID SEC Nº 17) en el
extremo C-terminal para la acumulación en el RE
(véase, la ID SEC Nº 18 para la secuencia de nucleótidos y la ID
SEC Nº 19 para la secuencia de aminoácidos).
La Figura 12 muestra los resultados de la
amplificación por PCR del ADNc de bgl1 que indica la presencia del
ADNc de bgl1 en las plantas transgénicas. CB10 y CB11 - plantas
transgénicas transformadas con bgl1 y con el péptido señal Cel1 sin
el péptido de retención en el RE, HDEL. CBT3, CBT8 y CBT15 -
diferentes líneas transgénicas transformadas con bgl1, péptido
señal Cel1 y HDEL. B1 - plantas transgénicas transformadas con
bgl1. 1 kb - marcador de ADN de 1 kb. TS - planta de tipo natural
no transgénica. pETB1 - ADN plasmídico de bgl1.
Las Figuras 13a-b muestran los
análisis por inmunoelectroforesis de plantas transgénicas que
contiene BGL1 sin el péptido señal (13a), y BGL1 con el péptido
señal Cel1 (13b), con y sin el péptido de retención en el RE, HDEL.
An gluco - \beta-glucosidasa de A. niger
purificada. TS - planta no transgénica control. B1, B15, B16, B20,
B27, B33 y
B34 - diferentes líneas transgénicas transformadas con bgl1. CBT1, CBT3, CBT7 y CBT8 - diferentes líneas transgénicas transformadas con bgl1, el péptido señal Cel1 y HDEL. CB10 y CB12 - plantas transgénicas transformadas con bgl1 y el péptido señal Cel1 sin el péptido de retención en el RE, HDEL.
B34 - diferentes líneas transgénicas transformadas con bgl1. CBT1, CBT3, CBT7 y CBT8 - diferentes líneas transgénicas transformadas con bgl1, el péptido señal Cel1 y HDEL. CB10 y CB12 - plantas transgénicas transformadas con bgl1 y el péptido señal Cel1 sin el péptido de retención en el RE, HDEL.
La Figura 14 muestra el análisis en gel de la
actividad de extractos de plantas transgénicas de tabaco en
SDS-PAGE incubado con MUGlu. TS - planta no
transgénica control. CB10 y CB11 - dos líneas independientes de
plantas transgénicas que expresan BGL1 fusionada con el péptido
señal Cel1 (sin HDEL). CBT3, CBT8 y CBT15 - líneas independientes
de plantas transgénicas que expresan BGL1 fusionada con el péptido
señal Cel1 en el extremo N-terminal y con el péptido
de retención en el RE, HDEL, en el extremo
C-terminal. B1 y B34 - plantas transgénicas que
expresan BGL1 sin péptido señal o péptido de retención en el RE,
HDEL, y que eran positivas para la proteína BGL1 en el análisis por
inmunotransferencia. An gluco - control de
\beta-glucosidasa nativa de A. niger.
La Figura 15 muestra el nivel de actividad BGL1
en diferentes plantas transgénicas. TS - planta no transgénica
control. B1 y B2 - plantas transgénicas que expresan BGL1 sin el
péptido señal o el péptido de retención en el RE, HDEL y que eran
positivos para BGL1 en el análisis por inmunoelectroforesis. CBT8,
CBT21, CBTO y CBT15 - líneas independientes de plantas
transgénicas que expresan BGL1 fusionada con el péptido señal Cel1
en el extremo N-terminal y con el péptido de
retención en el RE, HDEL en el extremo C-terminal.
CB12, CB13, CB14 y CB15 -
cuatro líneas independientes de plantas transgénicas que expresan BGL1 fusionada con el péptido señal Cel1 (sin HDEL).
cuatro líneas independientes de plantas transgénicas que expresan BGL1 fusionada con el péptido señal Cel1 (sin HDEL).
Los principios y el funcionamiento de la
presente invención pueden entenderse mejor con referencia a los
dibujos y descripciones que la acompañan.
Antes de explicar en detalle al menos una
realización de la invención, debe entenderse que la invención no
está limitada en su aplicación a los detalles de los componentes
mostrados en la siguiente descripción o ilustrados en los
siguientes ejemplos. La invención es apta para otras realizaciones
o para ponerse en práctica o realizarse de diversas formas.
También, se entenderá que la fraseología y terminología empleadas
en este documento es para los fines de la descripción y no debe
considerarse como limitante.
Según un aspecto de la presente invención, se
proporciona un ácido nucleico aislado que comprende un
polinucleótido genómico, complementario o compuesto que codifica un
polipéptido que tiene una actividad catalítica
\beta-glucosidasa. Preferiblemente, el
polinucleótido deriva de Aspergillus niger, sin embargo
puede aplicarse a otras fuentes. Estas incluyen todos los
polinucleótidos aislados que codifican polipéptidos que tiene
actividad catalítica \beta-glucosidasa. Estos
polinucleótidos y polipéptidos identificados mediante sus números
de Acceso a GenBank, se enumeran en la Tabla 1 a continuación,
todos los cuales pueden usarse en el desarrollo de la
presente
invención.
invención.
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Según se usa en este documento en la memoria
descriptiva y en la sección de reivindicaciones que sigue, el
término "aislado" se refiere a un componente biológico (tal
como un ácido nucleico o proteína u orgánulo) que se ha separado o
purificado sustancialmente de otros componentes biológicos de la
célula del organismo en el que el componente aparece de forma
natural, es decir, otros ADN y ARN cromosómicos y
extracromosómicos, proteínas y orgánulos. Los ácidos nucleicos y
proteínas que se han "aislado" incluyen ácidos nucleicos y
proteínas purificadas mediante procedimientos de purificación
convencionales. El término también incluye a ácidos nucleicos y
proteínas preparados mediante expresión recombinante en una célula
hospedadora así como ácidos nucleicos sintetizados
químicamente.
Según se usa en este documento y en la sección
de reivindicaciones que sigue, los términos y expresiones
"polinucleótido" y "secuencia polinucleotídica" se usan
de forma indistinta y se refieren a una secuencia de nucleótidos
que puede ser ADN o ARN de, por ejemplo, origen genómico o
sintético, que puede ser de cadena sencilla o doble y que puede
representar la cadena sentido o la complementaria. De forma
similar, las expresiones "polipéptido" y "secuencia
polipeptídica" se usan de forma indistinta en este documento y
se refieren a una secuencia de aminoácidos de cualquier
longitud.
Según se usa en la memoria descriptiva y en la
sección de reivindicaciones que sigue, la expresión "secuencia
polinucleotídica complementaria" incluye secuencias, que
originalmente proceden de la transcripción inversa de un ARN
mensajero usando una transcriptasa inversa o cualquier otra ADN
polimerasa dependiente de ARN. Estas secuencias pueden amplificarse
posteriormente in vivo o in vitro usando una ADN
polimerasa dependiente de ADN.
Según se usa en la memoria descriptiva y en la
sección de reivindicaciones que sigue, la expresión "secuencia
polinucleotídica genómica" incluye secuencias que originalmente
derivan de un cromosoma y reflejan una porción contigua de un
cromosoma.
Según se usa en este documento en la memoria
descriptiva y en la sección de reivindicaciones que sigue, la
expresión "secuencia polinucleotídica compuesta" incluye
secuencias que son al menos parcialmente complementarias y al menos
parcialmente genómicas. Una secuencia compuesta puede incluir
algunas secuencias exónicas requeridas para codificar el
polipéptido que tiene la actividad catalítica
\beta-glucosidasa, así como algunas secuencias
intrónicas interpuestas entre ellas. Las secuencias intrónicas
pueden ser de cualquier fuente, incluyendo de otros genes, y
típicamente incluirán secuencias señales de empalme conservadas.
Estas secuencias intrónicas pueden además incluir elementos
reguladores de la expresión que actúan en cis, como se
describen más adelante en este documento.
Según se usa en este documento en la memoria
descriptiva y en la sección de reivindicaciones que sigue, la
expresión "que tiene una actividad catalítica
\beta-glucosidasa " se refiere a una secuencia
polipeptídica, proteína o fragmentos de la misma capaces de servir
como catalizadores de una reacción química que implica la
hidrólisis del enlace O-glucosídico de los
glucósidos, cuyo resultado es la liberación de restos
\beta-D-glucosa o una aglucona,
además del resto \beta-D-glucosa.
Específicamente, la hidrólisis mediante enzimas de retención se
realiza mientras que se mantiene la configuración \beta del
centro anomérico del hidrato de carbono. Existe una amplia
especificidad por \beta-glucósidos, de este modo,
algunos ejemplos también hidrolizan uno o más de los siguientes:
\beta-D-galactósidos,
\alpha-L-arabinósidos,
\beta-D-xilósidos y
\beta-D-fucósidos.
Según se usa en este documento, el término
"catalizador" se refiere a una sustancia que acelera una
reacción química, pero no se consume o cambia de forma permanente
por ella.
Según se usa en este documento, el término
"glucósido" se refiere a un compuesto de al menos dos
monómeros, al menos uno de los cuales es una glucosa, que incluye
un enlace glucósido. Los ejemplos de glucósidos incluyen, pero sin
limitaciones, esqueletos que contienen glucosa, tales como la
diglucosa celobiosa y el polímero de glucosa, celulosa.
Según las realizaciones preferidas, el
polinucleótido según este aspecto de la presente invención codifica
un polipéptido como se muestra en la ID SEC Nº 2 o una porción de
la misma que retiene la actividad catalítica
\beta-glucosidasa.
Alternativa o adicionalmente, el polinucleótido
según este aspecto de la presente invención es como se muestra en
las ID SEC Nº 1, 3 o una porción de las mismas, la porción codifica
un polipéptido que retiene la actividad catalítica
\beta-glucosidasa.
En un aspecto más amplio, los polinucleótidos
según la presente invención codifican un polipéptido que es al
menos el 75%, al menos el 80%, al menos el 85%, al menos el 90%, al
menos el 95% o más, es decir el 95%-100% homólogo con la ID SEC Nº
2 según se determina usando el programa BestFit del paquete de
análisis de secuencia de Wisconsin, utilizando el algoritmo de
Smith y Waterman, en el que la penalización por creación de huecos
es igual a 8 y la penalización por extensión de huecos es igual a
2.
Según las realizaciones preferidas, los
polinucleótidos según el aspecto más amplio de la presente
invención codifican un polipéptido como se muestra en las ID SEC Nº
1 ó 3 o una porción de las mismas que retiene la actividad.
Alternativa o adicionalmente, los
polinucleótidos según este aspecto más amplio de la presente
invención se hidrolizan con las ID SEC Nº 1 ó 3.
La hibridación para ácidos nucleicos largos (por
ejemplo, de más de 200 pb de longitud) se lleva a cabo según
realizaciones preferidas de la presente invención mediante
hibridación rigurosa o moderada, en la que la hibridación rigurosa
se lleva a cabo mediante una solución de hibridación que contiene
sulfato de dextrano al 10%, NaCl 1 M, SDS al 1% y 5 x 10^{6} cpm
de sonda marcada con ^{32}P, a 65ºC, con una solución de lavado
final de 0,2 x SSC y SDS al 0,1% y un lavado final a 65ºC,
mientras que la hibridación moderada se lleva a cabo mediante una
solución de hibridación que contiene sulfato de dextrano al 10%,
NaCl 1 M, SDS al 1% y 5 x 10^{6} cpm de sonda marcada con
^{32}P, a 65ºC, con una solución de lavado final de 1 x SSC y SDS
al 0,1%, y un lavado final a 50ºC.
Además alternativa o adicionalmente, los
polinucleótidos según este amplio aspecto de la presente invención
son preferiblemente al menos el 70%, al menos el 75%, al menos el
80%, al menos el 85%, al menos el 90%, al menos el 95% o más, es
decir el 95%-100%, idénticas a la ID SEC Nº 1 ó 3 según se
determina usando el programa BestFit del paquete de análisis de
secuencia de Wisconsin, utilizando el algoritmo de Smith y
Waterman, en el que el peso del hueco es igual a 50, el peso de la
longitud es igual a 3, la coincidencia media es igual a 10 y la
falta de coincidencia media es igual a -9.
De ese modo, este amplio aspecto de la presente
invención abarca (i) polinucleótidos como se muestra en las ID SEC
Nº 1 ó 3; (ii) fragmentos de los mismos; (iii) secuencias
hibridables con éstas; (iv) secuencias homólogas a éstas; (v)
secuencias que codifican polipéptidos similares con un uso de
codones diferente; (vi) secuencias alteradas caracterizadas por
mutaciones, tales como deleción, inserción o sustitución de uno o
más nucleótidos, naturales o inducidos por el hombre, aleatorios o
de manera dirigida.
Según otro aspecto de la presente invención, se
proporciona una construcción de ácido nucleico que comprende el
ácido nucleico aislado descrito en este documento.
Según una realización preferida, la construcción
del ácido nucleico según este aspecto de la presente invención
además comprende al menos un elemento de control (regulador) que
actúa en cis para regular la expresión del ácido nucleico
aislado. Estos elementos reguladores que actúan en cis
incluyen, por ejemplo, promotores que se sabe son elementos de
secuencia requeridos para la transcripción ya que sirven para
unirse a la ARN polimerasa dependiente de ADN, que transcribe las
secuencias después del extremo 3' de ésta. Detalles adicionales
relativos a diversos elementos reguladores se describen más
adelante en este documento.
Mientras que el ácido nucleico aislado descrito
en este documento es un elemento esencial de la invención, éste es
modular y puede usarse en diferentes contextos. El promotor elegido
que se usa junto con esta invención es de importancia secundaria y
comprenderá cualquier promotor adecuado. Sin embargo, un experto en
la materia apreciará que es necesario asegurarse de que los sitios
de inicio de la transcripción estén localizados antes del extremo
5' de una fase de lectura abierta. En una realización preferida de
la presente invención, el promotor que se selecciona comprende un
elemento que está activo en las células hospedadoras en particular
de interés. Estos elementos pueden seleccionarse a partir de
reguladores transcripcionales que activan la transcripción de genes
esenciales para la supervivencia de estas células en condiciones de
estrés o falta de nutrientes, incluyendo las proteínas de choque
térmico.
Una construcción según la presente invención
preferiblemente incluye además un marcador seleccionable apropiado.
En una realización más preferida según la presente invención, la
construcción además incluye un origen de replicación. En otra
realización más preferida según la presente invención, la
construcción es un vector lanzadera, que puede tanto propagarse en
E. coli (en la que la construcción comprende un marcador
seleccionable y un origen de replicación apropiados) como ser
compatible para su propagación en células, o integración en el
genoma de un organismo de elección, como una planta. Según este
aspecto de la presente invención, la construcción puede ser, por
ejemplo, un plásmido, un bácmido, un fagémido, un cósmido, un fago,
un virus o un cromosoma artificial.
Según un aspecto adicional de la presente
invención, se proporciona una proteína recombinante que comprende
una proteína recombinante que comprende un polipéptido que tiene
actividad catalítica \beta-glucosidasa. El
polipéptido preferiblemente deriva de un Aspergillus niger
y, preferiblemente, incluye un péptido señal y opcionalmente un
péptido de retención en el retículo endoplásmico.
Según realizaciones preferidas, el polipéptido
según este aspecto de la presente invención es como se muestra en
la ID SEC Nº 2 o una porción del mismo que retiene la actividad
catalítica \beta-glucosidasa.
La ID SEC Nº 2 de la
\beta-glucosidasa de A. niger es similar
a la secuencia de aminoácidos de la
\beta-glucosidasa de A. kawachii. Sin
embargo, mientras que la primera es muy estable a un amplio
intervalo de temperaturas y tratamientos de pH, la última es
relativamente inestable y, por tanto, tiene ciertas desventajas,
que hacen que su uso, para el fin de la presente invención según se
detalla a continuación y se describe a partir de aquí, sea inviable
y/o mucho menos atractivo.
Recientemente, Iwashita y colaboradores han
publicado la secuencia de una \beta-glucosidasa
(GenBank/EMBL AB003470) obtenida de la cepa IF04308 de
Aspergillus kawachii. La comparación de secuencias entre la
\beta-glucosidasa de Aspergillus kawachii y
la \beta-glucosidasa de A. niger reveló
que las dos comparten un 98% de homología.
Las enzimas de los dos Aspergillus sp.,
contienen siete restos de cisteína y un número idéntico de sitios
de glucosilación, mientras que difieren en su grado de
glucosilación (35).
Se describieron las propiedades físicas y
cinéticas de tres \beta-glucosidasas de
Aspergillus kawachii (35) y se demostró que las tres son
productos del mismo gen, que difieren únicamente en el grado de
glucosilación. Las tres \beta-glucosidasas
purificadas de A. kawachii se inactivaban fácilmente,
incluso en condiciones de pH y temperatura moderadas. En clara
distinción, el examen de la estabilidad de la
\beta-glucosidasa recombinante de A. niger
según la presente invención en condiciones idénticas a las
descritas por Iwashita y col. y como se describe a continuación en
este documento en la sección de Ejemplos, reveló que la enzima es
muy estable, reteniendo la mayoría de la actividad enzimática
incluso tras 1 hora de incubación a 60ºC (el 68% de actividad,
definido por el porcentaje de actividad de una enzima mantenida a
4ºC).
De este modo, a pesar de la similitud entre las
\beta-glucosidasas de A. kawachii y de
A. niger, la enzima de A. niger mostraba de forma
inesperada una estabilidad térmica y de pH significativamente
mayor.
Según aún otro aspecto de la presente invención,
se proporciona una célula hospedadora que comprende una
construcción de ácido nucleico como se describe en este documento.
La expresión "célula hospedadora" se refiere al receptor de un
ácido nucleico heterólogo, esta célula hospedadora puede ser una
célula procariota, tal como E. coli, o una célula eucariota,
tal como una célula de levadura, una célula de un hongo
filamentoso, una célula vegetal o una célula animal. Ejemplos de
célula de levadura incluyen, pero sin limitaciones, Pichia
sp., tal como P. pastoris, y Saccharomyces sp.,
tal como S. cerevisiae.
Según se usa en este documento y en la sección
de reivindicaciones que sigue, el término "heterólogo" cuando
se usa en el contexto de una secuencia de ácido nucleico o de una
proteína encontrada en una planta, tejido derivado de una planta o
en células de una planta, o alternativamente, en una célula
eucariota, tal como una levadura, o en una célula procariota, tal
como bacterias, se refiere a secuencias de ácido nucleico o de
aminoácidos generalmente no nativos de la planta, del tejido
derivado de la planta o de las células de la planta, o
alternativamente, de la célula eucariota, tal como una levadura, o
de la célula procariota, tal como bacterias. De forma indistinta,
las secuencias de ácido nucleico o de aminoácidos generalmente no
nativas de la planta, del tejido derivado de la planta o de las
células de la planta, o alternativamente, de la célula eucariota,
como una levadura, o de la célula procariota, como bacterias, se
denominan "ácido nucleico recombinante" y "proteína
recombinante", respectivamente. De este modo, un ácido nucleico
recombinante es aquel que tiene una secuencia que no aparece de
forma natural o que tiene una secuencia que se hace mediante una
combinación artificial de cualesquiera otros dos segmentos de
secuencia separados. Esta combinación artificial a menudo se logra
mediante síntesis química o, más frecuentemente, mediante la
manipulación artificial de segmentos aislados de ácidos nucleicos,
por ejemplo, mediante técnicas de ingeniería genética.
Según se usa en este documento en la memoria
descriptiva y en la sección de reivindicaciones que sigue, la
expresión "célula eucariota" se refiere a una célula que
contiene un genoma diploide durante al menos una porción de su
ciclo vital, teniendo un núcleo rodeado de una membrana con
cromosomas compuestos de ADN, con una división celular que implica
una forma de mitosis en la que están implicados husos. La posesión
de un tipo eucariota de célula es característica de los cuatro
reinos, Protoctista, Fungi, Plantae y Animalia.
Según se usa en este documento en la memoria
descriptiva y en la sección de reivindicaciones que sigue, la
expresión "célula procariota" se refiere a diversas bacterias
y algas verdeazuladas, caracterizadas por la ausencia de la
organización nuclear, capacidades mitóticas y orgánulos complejos
que tipifican al superreino eucariota. Ejemplos de células
procariotas según la presente invención son las bacterias, tales
como, pero sin limitaciones, E. coli.
Según aún otro aspecto de la presente invención,
se proporciona un organismo que comprende una construcción de
ácido nucleico según se describe en este documento, tal como, pero
sin limitaciones, una planta. Se dice que este organismo está
transformado o infectado por un virus.
Según se usa en este documento, el término
"transformado" y sus conjugaciones, tales como transformación,
transformando y transformar, se relacionan todas con el
procedimiento de introducción de secuencias de ácido nucleico
heterólogo en una célula o en un organismo, de modo que estas
secuencias de nucleótidos se propagan a la descendencia. De este
modo, el término incluye, por ejemplo, "modificado
genéticamente", "transgénico" y "transfectado", el cual
puede usarse en este documento para describir adicionalmente y/o
reivindicar la presente invención. El término se refiere a la
introducción de una secuencia de ácido nucleico heterólogo en el
genoma de un organismo y/o en el geno-
ma de un orgánulo de éste que contiene ácido nucleico, tal como en el genoma de un cloroplasto o una mitocondria.
ma de un orgánulo de éste que contiene ácido nucleico, tal como en el genoma de un cloroplasto o una mitocondria.
Según se usa en este documento, la expresión
"infectado por virus" incluye la infección por un virus
portador de una secuencia de ácido nucleico heterólogo.
Típicamente, esta infección da lugar a una expresión transitoria de
la secuencia de ácido nucleico, cuya secuencia de ácido nucleico
generalmente no está integrada en un genoma y, por tanto, no se
propaga a la descendencia, a no ser que esta descendencia
experimente una infección adicional.
Hay diversos procedimientos para introducir
genes extraños tanto en plantas monocotiledóneas como
dicotiledóneas (Potrykus, I., Annu. Rev. Plant. Physiol., Plant.
Mol. Biol. (1991) 42:205-225; Shimamoto y col.,
Nature (1989) 338:274-276). Los procedimientos
principales para provocar una integración estable del ADN exógeno
en el ADN genómico incluyen dos aproximaciones principales:
(i) transferencia génica mediada por
Agrobacterium: Klee y col. (1987) Annu. Rev. Plant Physiol.
38:467-486; Klee y Rogers en Cell Culture and
Somatic Cell Genetics of Plants, Volumen 6, Molecular Biology of
Plant Nuclear Genes, editores Schell, J. y Vasil, L. K., Academic
Publishers, San Diego, Calif. (1989) pág. 2-25;
Gatenby, en Plant Biotechnology, editores Kung, S. y Arntzen, C.
J., Butterworth Publishers, Boston, Mass. (1989) pág.
93-112.
(ii) captación directa del ADN: Paszkowski y
col., en Cell Culture and Somatic Cell Genetics of Plants, Volumen
6, Molecular Biology of Plant Nuclear Genes editores Schell, J. y
Vasil, L. K., Academic Publishers, San Diego, Calif. (1989) pág.
52-68; que incluye los procedimientos para la
captación directa del ADN dentro de los protoplastos, Toriyama, K.
y col. (1988) Bio/Technology 6:1072-1074. La
captación del ADN inducida por un choque eléctrico breve de las
células de la planta: Zhang y col. Plant Cell Rep. (1988)
7:379-384. Fromm y col. Nature (1986)
319:791-793. Inyección de ADN en las células o
tejidos de la planta mediante bombardeo de partículas, Klein y col.
Bio/Technology (1988) 6:559- 563; McCabe y col. Bio/Technology
(1988) 6:923-926; Sanford, Physiol. Plant. (1990)
79:206-209; mediante el uso de sistemas de
micropipetas: Neuhaus y col., Theor. Appl. Genet. (1987)
75:30-36; Neuhaus y Spangenberg, Physiol. Plant.
(1990) 79:213-217; o mediante la incubación directa
del ADN con polen en germinación, DeWet y col en Experimental
Manipulation of Ovule Tissue, editores Chapman, G. P. Mantell, S.
H. y Daniels, W. Longman, London, (1985) pág.
197-209; y Ohta, Proc. Natl. Acad. Sci. USA (1986)
83:715-719.
El sistema de Agrobacterium incluye el
uso de vectores plasmídicos que contienen segmentos de ADN
definidos que se integran en el ADN genómico de la planta. Los
procedimientos de inoculación del tejido de la planta varían
dependiendo de la especie vegetal y del sistema de suministro de
Agrobacterium. Una aproximación ampliamente usada es el
procedimiento de discos de hojas, que puede realizarse con
cualquier explante de tejido que proporcione una buena fuente para
iniciar la diferenciación de la planta completa. Horsch y col., en
Plant Molecular Biology Manual A5, Kluwer Academia Publishers,
Dordrecht (1988) pág. 1-9. Una aproximación
complementaria emplea el sistema de suministro de
Agrobacterium en combinación con una infiltración al vacío.
El sistema de Agrobacterium es especialmente viable para la
creación de plantas dicotiledóneas transgénicas.
Hay diversos procedimientos para la
transferencia directa de ADN dentro de las células de la planta. En
la electroporación, los protoplastos se exponen brevemente a un
potente campo eléctrico. En la microinyección, el ADN se inyecta de
forma mecánica directamente dentro de las células usando
micropipetas muy pequeñas. En el bombardeo de micropartículas, el
ADN se adsorbe en microproyectiles, tales como cristales de sulfato
de magnesio o partículas de wolframio, y los microproyectiles se
aceleran físicamente dentro de los tejidos o células de la
planta.
planta.
Tras la transformación se pone en práctica la
propagación de la planta. El procedimiento más común de propagación
de una planta es por semillas. La regeneración mediante propagación
por semillas, sin embargo, tiene la deficiencia de que debido a la
heterocigosis el cultivo carece de uniformidad, ya que las plantas
producen semillas según las varianzas genéticas regidas por las
leyes de Mendel. Básicamente, cada semilla es genéticamente
diferente y cada una crecerá con sus propios rasgos específicos.
Por tanto, se prefiere que las plantas transformadas se produzcan
de modo que la planta regenerada tenga rasgos y características
idénticas a la planta transgénica parental. Por tanto, se prefiere
que la planta transformada se regenere mediante micropropagación,
que proporciona una reproducción rápida y uniforme de las plantas
transformadas.
La micropropagación es un procedimiento de
crecimiento de plantas de nueva generación a partir de un único
fragmento de tejido que se ha cortado de una planta o cultivo
parental seleccionado. Este procedimiento permite la reproducción
en masa de plantas que tienen el tejido preferido que expresa la
proteína. Las plantas de nueva generación que se producen son
genéticamente idénticas y tienen todas las características de la
planta original. La micropropagación permite la producción en masa
de material vegetal de calidad en un corto periodo de tiempo y
ofrece una multiplicación rápida de los cultivos seleccionados para
preservar las características de la planta transgénica o
transformada original. Las ventajas de la clonación de plantas son
la velocidad de la multiplicación de la planta y la calidad y
uniformidad de las plantas producidas.
La micropropagación es un procedimiento por
etapas que requieren la alteración del medio de cultivo o de las
condiciones de crecimiento entre las etapas. De este modo, el
procedimiento de micropropagación implica cuatro etapas básicas:
etapa uno, cultivo inicial del tejido; etapa dos, multiplicación
del cultivo tisular; etapa tres, diferenciación y formación de la
planta; y etapa cuatro, cultivo y endurecimiento en un invernadero.
Durante la etapa uno, cultivo inicial del tejido, se establece el
cultivo tisular y se certifica que está libre de contaminaciones.
Durante la etapa dos, el cultivo tisular inicial se multiplica
hasta que se produce un número suficiente de muestras de tejido
para alcanzar los objetivos de producción. Durante la etapa tres,
las muestras de tejido crecidas en la etapa dos se dividen y
cultivan como plántulas individuales. En la etapa cuatro, las
plántulas transformadas se transfieren a un invernadero para su
endurecimiento en el que se aumenta gradualmente la tolerancia de
las plantas a la luz de modo que puedan cultivar en un ambiente
natural.
Se recomiendan secuencias adecuada que permitan
la integración de la secuencia heteróloga en el genoma de la
planta. Estas podrían incluir secuencias de transposones y
similares para la recombinación homóloga, así como secuencias Ti
que permiten la inserción aleatoria de un casete de expresión
heteróloga en el genoma de una planta.
Los marcadores seleccionables de procariotas
adecuados incluyen la resistencia a antibióticos, tales como
ampicilina o tetraciclina. Como se conoce en la técnica, el vector
también puede presentar otras secuencias de ADN que codifican
funciones adicionales.
Las construcciones de la presente invención
incluirán un casete de expresión para la expresión de la proteína
de interés. Normalmente, tendrán sólo un casete de expresión,
aunque son viables dos o más. El casete de expresión recombinante
contendrá además de la secuencia heteróloga uno o más de los
elementos de secuencia siguientes, una región promotora, secuencias
no traducidas 5' de la planta que pueden incluir elementos
reguladores, codón de inicio dependiendo o no de que el gen
estructural venga equipado con uno, y una secuencia de terminación
de la transcripción y de la traducción. Los sitios de restricción
únicos en los extremos 5' y 3' del casete permiten una inserción
fácil en un vector preexistente.
Según se usa en este documento, la expresión
"elemento regulador" se refiere a una secuencia de nucleótidos
que típicamente se incluye en el casete de expresión y funciona
regulando (es decir, potenciando o inhibiendo) la expresión de una
secuencia codificadora de ésta. Esta regulación puede afectar a las
etapas de transcripción o de traducción. Los ejemplos de elementos
reguladores incluyen, pero sin limitaciones, potenciadores,
supresores y terminadores de la transcripción.
\newpage
Según se usa en este documento, el término
"promotor" se refiere a una secuencia de nucleótidos que
pueden dirigir la expresión génica en las células. Este promotor
puede derivar de una planta, un virus vegetal o de cualquier otro
organismo vivo incluyendo bacterias y animales.
Un promotor vegetal puede ser un promotor
constitutivo, tal como, pero sin limitaciones, los promotores
CaMV35S y CaMV19S, el promotor FMV34S, el promotor del badnavirus
baciliforme de la caña de azúcar, el promotor CsVMV, el promotor de
la actina ACT2/ACT8 de Arabidopsis, el promotor UBQ1 de la
ubiquitina de Arabidopsis, el promotor BTH6 de la tionina de
hojas de cebada y el promotor de la actina de arroz.
Alternativamente, el promotor puede ser un
promotor específico de tejido. Los ejemplos de promotores de
plantas específicos de tejido incluyen, sin limitaciones, el
promotor de la proteína de almacenamiento de judías, la faseolina,
el promotor DLEC, promotor PHS\beta, el promotor de la proteína
zeína, el promotor de la conglutina gamma de soja, el promotor del
gen AT2S1, el promotor de la actina ACT11 de Arabidopsis, el
promotor napA de Brassica napus, el promotor del gen
patatina de la patata y el promotor Tob.
El promotor también puede ser un promotor que se
activa en una etapa específica del desarrollo del ciclo vital de
una planta, por ejemplo, un promotor activo en la embriogénesis
tardía, tal como: el promotor LEA; el promotor de expresión
específico de Endosperma (la prolamina de almacenamiento en
semillas de arroz se expresa en semillas de tabaco durante la etapa
del desarrollo aproximadamente 20 días después de la floración) o
el promotor que controla el gen FbL2A durante las etapas de
síntesis de la pared de fibra.
En el caso de un promotor específico de tejido,
se asegura que la proteína heteróloga se expresa sólo en el tejido
deseado, por ejemplo, sólo en la flor, el fruto, la raíz, la
semilla, etc.
Tanto los promotores específicas de tejido como
los no específicos pueden ser constitutivos, es decir, pueden dar
lugar a una expresión continua de la proteína heteróloga.
El promotor también puede ser un promotor
inducible, es decir, un promotor que se activa en presencia de un
agente inductor y sólo tras dicha activación, da lugar a la
expresión de la proteína heteróloga. Un agente inductor puede ser,
por ejemplo, la luz, agentes químicos, sequía, salinidad elevada,
choque osmótico, condiciones oxidantes o en caso de patogenicidad,
e incluye, sin limitaciones, el promotor inducible por la luz
derivado del gen rbcS de guisante, el promotor del gen rbcS de la
alfalfa, los promotores DRE, MYC y MYB activos durante la sequía;
los promotores INT, INPS, prxEa, Ha hps17.7GA y RD21 activos con
salinidad elevada y estrés osmótico, los promotores hsr303J y
str246C activos con estrés patogénico, el sistema de expresión
génica controlable por cobre y el sistema génico inducible por
esteroides.
Alternativamente, un agente inductor puede ser
un agente endógeno que normalmente está presente sólo en ciertos
tejidos de la planta o se produce sólo en ciertos periodos de
tiempo del ciclo vital de la planta, tales como etileno o
esteroides. Usando estos agentes endógenos inductores específicos
de tejido, es posible controlar la expresión a partir de estos
promotores inducibles sólo en aquellos tejidos específicos. Usando
un agente inductor producido sólo durante un periodo específico del
ciclo vital, es posible controlar la expresión a partir de un
promotor inducible en la fase específica del ciclo vital en el que
se produce el agente inductor.
En la técnica son bien conocidos los promotores
derivados de bacterias y levaduras.
Los virus son una clase única de agentes
infecciosos cuyas características distintivas son su organización
sencilla y su mecanismo de replicación. De hecho, una partícula
viral completa, o virión, puede considerarse principalmente como un
bloque de material genético (de ADN o ARN) con capacidad de
replicación autónoma, rodeado de una cubierta proteica y, algunas
veces, por una envuelta membranosa adicional, tal como en el caso
de los virus alfa. La cubierta protege al virus del ambiente y le
sirve como vehículo para la transmisión de una célula hospedadora a
otra.
Los virus que se han mostrado útiles para la
transformación de plantas hospedadoras incluyen CaV, TMV y BV. La
transformación de plantas usando virus vegetales se describe en la
Patente de EE.UU. Nº 4.855.237 (BGV), documento
EP-A 67.553 (TMV), publicación de la solicitud
japonesa Nº 63-14693 (TMV), documento EPA 194.809
(BV), documento EPA 278.667 (BV) y Gluzman, Y. y col.,
Communications in Molecular Biology: Viral Vectors, Cold Spring
Harbor Laboratory, Nueva York, pág. 172-189 (1988).
Las partículas de pseudovirus para su uso en la expresión de ADN
extraño en muchos hospedadores, incluyendo plantas, se describen en
el documento WO 87/06261.
La construcción de virus vegetales de ARN para
la introducción y expresión de genes extraños no virales en
plantas se demuestra por las referencias anteriores así como por
Dawson, W.O. y col., Virology (1989) 172:285-292;
Takamatsu y col. EMBO J. (1987) 6:307-311; French y
col. Science (1986) 231:1294-1297, y Takamatsu y
col. FEBS Letters (1990) 269:73-76.
Cuando el virus es un virus de ADN, las
construcciones pueden hacerse a partir del propio virus.
Alternativamente, el virus puede clonarse primero en un plásmido
bacteriano para facilitar la construcción del vector viral deseado
con el ADN extraño. A continuación, el virus n se escinde del
plásmido. Si el virus es un virus de ADN, puede unirse al ADN viral
un origen bacteriano de replicación, que a continuación se replica
en la bacteria. La transcripción y traducción de este ADN producirá
la proteína de la cubierta que encapsulará al ADN viral. Si el
virus es un virus de ARN, generalmente el virus se clona como un
ADNc y se inserta en un plásmido. A continuación, el plásmido se
usa para hacer todas las construcciones. Entonces el virus de ARN
se produce transcribiendo la secuencia viral del plásmido y
traduciendo los genes virales para producir las proteínas de la
cubierta que encapsulan al ARN viral.
La construcción de virus de ARN vegetales para
la introducción y expresión de genes extraños no virales en
plantas se demuestra mediante las referencias anteriores así como
en la patente de EE.UU. Nº 5.316.931.
En una realización, se proporciona un ácido
nucleico de virus vegetal en el que la secuencia que codifica la
proteína nativa de la cubierta se ha delecionado del ácido nucleico
viral y se ha insertado una secuencia que codifica una proteína de
la cubierta del virus vegetal no nativa y un promotor no nativo,
preferiblemente el promotor subgenómico de la secuencia que
codifica la proteína de la cubierta no nativa, capaz de expresarse
en la planta hospedadora, empaquetar el ácido nucleico del virus
vegetal recombinante y asegurar una infección sistémica del
hospedador por el ácido nucleico del virus vegetal recombinante.
Alternativamente, el gen de la proteína de la cubierta puede
inactivarse mediante la inserción en él de la secuencia del ácido
nucleico no nativo, de modo que se produzca esa proteína. El ácido
nucleico del virus vegetal recombinante puede contener uno o más
promotores subgenómicos no nativos adicionales. Cada promotor
subgenómico no nativo es capaz de transcribir o expresar genes o
secuencias de ácido nucleico adyacentes en la planta hospedadora e
incapaz de recombinación entre sí y con promotores subgenómicos
nativos. Pueden insertarse secuencias de ácido nucleico no nativo
(extraño) adyacentes al promotor subgenómico del virus vegetal
nativo o a los promotores subgenómicos del virus vegetal nativos y
no nativos si se incluyen más de una secuencia de ácido nucleico.
Las secuencias de ácido nucleico no nativas se transcriben o
expresan en la planta hospedadora bajo el control del promotor
subgenómico para producir los productos deseados.
En una segunda realización, se proporciona un
ácido nucleico de virus vegetal recombinante como en la primera
realización excepto porque la secuencia que codifica la proteína
nativa de la cubierta se sitúa junto a uno de los promotores
subgenómicos de la proteína no nativa de la cubierta en lugar de
una secuencia que codifica la proteína no nativa de la
cubierta.
En una tercera realización, se proporciona un
ácido nucleico de virus vegetal recombinante en el que el gen de
la proteína nativa de la cubierta está junto a su promotor
subgenómico y se han insertado uno o más promotores subgenómicos no
nativos en el ácido nucleico viral. Los promotores subgenómicos no
nativos insertados son capaces de transcribir o expresar genes
adyacentes en una planta hospedadora y son incapaces de recombinar
entre sí y con promotores subgenómicos nativos. Pueden insertarse
secuencia de ácido nucleico no nativas adyacentes a los promotores
subgenómicos no nativos de virus vegetales de modo que dichas
secuencias se transcriban o expresen en la planta hospedadora bajo
el control de los promotores subgenómicos para producir el
producto deseado.
En una cuarta realización, se proporciona un
ácido nucleico de virus vegetal como en la tercera realización
excepto porque la secuencia que codifica la proteína de la cubierta
nativa se sustituye por una secuencia que codifica la proteína no
nativa de la cubierta.
Los vectores virales se encapsulan con las
proteínas de la cubierta codificadas por el ácido nucleico de virus
vegetal recombinante para producir un virus vegetal recombinante.
El ácido nucleico de virus vegetal recombinante o el virus vegetal
recombinante se usan para infectar plantas hospedadoras adecuadas.
El ácido nucleico de virus vegetal recombinante es capaz de
replicarse en el hospedador, difundirse sistémicamente en el
hospedador y transcribir o expresar genes extraños en el hospedador
para producir la proteína deseada.
En muchos casos, es deseable dirigir la
expresión de una proteína recombinante. Esta dirección puede ser
dentro de un orgánulo celular o fuera de la célula. Esto puede
realizarse, como se conoce bien en la técnica, mediante péptidos
señal apropiados que se fusionan con el polipéptido que va a ser
dirigido, típicamente, en el extremo
N-terminal.
De este modo, según se usa en este documento y
en la sección de reivindicaciones que sigue, la expresión
"péptido señal" se refiere a una extensión de aminoácidos que
es eficaz para dirigir a una proteína expresada en una célula a una
localización diana. Diferentes péptidos señal, que son conocidos en
la técnica, son eficaces para secretar una proteína a partir de
células de bacterias, levaduras, plantas y animales.
Debe apreciarse a este respecto que los péptidos
señal sirven a la función de la translocación de la proteína
producida a través de la membrana del retículo endoplásmico. De
forma similar, los segmentos transmembranales detienen la
translocación y proporcionan el anclaje de la proteína a la
membrana plasmática, véase, Johnson y col. The Plant Cell (1990)
2:525-532; Sauer y col. EMBO J. (1990)
9:3045-3050; Mueckler y col. Science (1985)
229:941-945. Para señales diana de mitocondrias,
núcleo, cloroplasto o vacuolas que expresan correctamente la
proteína en el orgánulo correspondiente a través de la ruta
secretora, véase, Von Heijne, Eur. J. Biochem. (1983)
133:17-21; Yon Heijne, J. Mol. Biol. (1986)
189:239-242; Iturriaga y col. The Plant Cell (1989)
1:381-390; McKnight y col., Nucl. Acids Res. (1990)
18:4939-4943; Matsuoka y Nakamura, Proc. Natl.
Acad. Sci. USA (1991) 88:834-838. Un reciente libro
de Cunninghan y Porter (Recombinant proteins from plants, editores
C. Cunningham y A.J.R. Porter, 1998 Humana Press Totowa, N. J.),
describen procedimientos para la producción de proteínas
recombinantes en plantas y procedimientos para dirigir las
proteínas a diferentes compartimentos de la célula vegetal. En
especial, dos capítulos del mismo (14 y 15) describen diferentes
procedimientos para introducir secuencias dirigidas que dan lugar a
la acumulación de proteínas recombinantes en compartimentos tales
como el RE, vacuolas, plástidos, núcleo y citoplasma. El libro de
Cunningham y Porter se incorpora a este documento por referencia.
Actualmente, el sitio preferido de acumulación de la proteína de
fusión según la presente invención es el RE usando un péptido
señal, tal como Cel1 o el péptido señal de la amilasa de arroz en
el extremo N-terminal y un péptido de retención en
el RE (HDEL, ID SEC Nº 17 o KDEL, ID SEC Nº 24) en el extremo
C-terminal.
Según un aspecto adicional de la presente
invención, se proporciona un procedimiento para producir
\beta-glucosidasa recombinante. El procedimiento
según este aspecto de la presente invención se lleva a cabo
introduciendo, en una forma expresable o sobreexpresable, una
construcción de ácido nucleico en una célula hospedadora. La
construcción de ácido nucleico incluye un polinucleótido genómico,
complementario o compuesto preferiblemente derivado de
Aspergillus niger y que codifica un polipéptido que tiene
actividad catalítica \beta-glucosidasa.
Preferiblemente, el polinucleótido además codifica un péptido señal
en fase con el polipéptido. Todavía preferiblemente, el
polinucleótido además codifica un péptido de retención en el
retículo endoplásmico en fase con el polipéptido.
Según se usa en este documento, el término
"introduciendo" se refiere tanto a la transformación como a la
infección vírica, según se definen adicionalmente estos términos
previamente en este documento. Según se usa en este documento, las
expresiones "forma expresable" y "forma sobreexpresable"
se refieren a una forma recombinante que incluye los elementos
reguladores requeridos para llevar a cabo la expresión o
sobreexpresión de una región codificadora, todo como se ha
detallado además previamente en este documento.
Según una realización preferida de este aspecto
de la presente invención, después de que se ha detectado
suficiente expresión, el polipéptido que tiene la actividad
catalítica \beta-glucosidasa se extrae a partir
de la célula hospedadora que lo expresa.
De este modo, las células hospedadoras que
expresan el polipéptido según la presente invención, proporcionan
una fuente inmediata, fácil e indefinida del polipéptido.
Puede usarse cualquier referencia de medio de
cultivo líquido o sólido bien conocido para cultivar apropiadamente
las células hospedadoras de la presente invención, aunque se
prefiere el cultivo en medios líquidos, ya que la secreción del
polipéptido al medio simplifica la recuperación de polipéptido. Como
se detalla además previamente en este documento, esta secreción
puede llevarse a cabo mediante la incorporación de un péptido señal
adecuado. La \beta-glucosidasa puede aislarse o
separarse o purificarse a partir de las preparaciones de la célula
hospedadora usando técnicas bien conocidas en la materia, tales
como, pero sin limitaciones, centrifugación, filtración,
cromatografía, electroforesis y diálisis. La concentración y/o
purificación adicionales de la \beta-glucosidasa
puede llevarse a cabo usando técnica convencionales que incluyen,
pero sin limitaciones, ultrafiltración, diálisis adicional,
cromatografía de intercambio iónico, HPLC, cromatografía de
exclusión molecular, cromatografía de afinidad a
celobiosa-sefarosa y electroforesis, tal como
electroforesis en gel de poliacrilamida (PAGE). Usando estas
técnicas, puede recuperarse la \beta-glucosidasa
en forma pura o sustancialmente pura.
Según un aspecto adicional de la presente
invención, se proporciona un procedimiento para aumentar el nivel
de al menos una sustancia de fermentación en un producto de
fermentación. El procedimiento según este aspecto de la presente
invención se lleva a cabo fermentando un material inicial de
fermentación que contiene glucosa mediante una célula de levadura
que sobreexpresa una construcción de ácido nucleico que incluye un
polinucleótido genómico, complementario o compuesto derivado
preferiblemente de Aspergillus niger y que codifica un
polipéptido que tiene una actividad catalítica
\beta-glucosidasa, aumentado así el nivel de al
menos la sustancia de fermentación en el producto de fermentación.
Preferiblemente, el polinucleótido además codifica un péptido señal
en fase con el polipéptido. Todavía preferiblemente, el
polinucleótido además codifica un péptido de retención en el
retículo endoplásmico en fase con el polipéptido.
Según un aspecto alternativo de la presente
invención, se proporciona un procedimiento para aumentar el nivel de
al menos una sustancia de fermentación en un producto de
fermentación. El procedimiento según este aspecto de la presente
invención se lleva a cabo fermentando un material inicial de
fermentación que contiene glucosa derivado de una planta mediante
una célula de levadura, sobreexpresando la planta una construcción
de ácido nucleico que incluye un polinucleótido genómico,
complementario o compuesto derivado preferiblemente de
Aspergillus niger y que codifica un polipéptido que tiene
una actividad catalítica \beta-glucosidasa,
aumentado así el nivel de al menos la sustancia de fermentación en
el producto de fermentación. Preferiblemente, el polinucleótido
además codifica un péptido señal en fase con el polipéptido.
Todavía preferiblemente, el polinucleótido además codifica un
péptido de retención en el retículo endoplásmico en fase con el
polipéptido.
Según se usa en este documento en la memoria
descriptiva y en la sección de reivindicaciones que sigue, el
término "fermentación" se refiere a un cambio químico inducido
en un compuesto orgánico complejo por la acción de una enzima, por
lo cual la sustancia se divide en compuestos más simples.
Específicamente, el término "fermentación" incluye la
desasimilación anaeróbica de sustratos con la producción de energía
y de compuestos reducidos, los productos finales de éstos son
ácidos orgánicos, alcoholes, tales como etanol, isopropanol,
butanol, etc., y CO_{2}. Típicamente, estos productos se secretan
y cada uno de ellos se denominan en este documento como una
"sustancia de fermentación", es decir, cualquier resultante de
fermentación conocido de fermentación microbiana o de
levadura.
levadura.
Según se usa en este documento en la memoria
descriptiva y en la sección de reivindicaciones que sigue, la
expresión "producto de fermentación" se refiere al material
resultante de un proceso de fermentación. Los ejemplos incluyen,
pero sin limitaciones, medio de fermentación que contiene alcohol y
bebidas alcohólicas, tales como, pero sin limitaciones, bebidas que
contiene alcohol a base de frutas, vinos y cervezas.
Cuando se usa junto con, por ejemplo, una
\beta-glucanasa, la
\beta-glucosidasa hidroliza eficazmente diversos
materiales que contienen celulosa para dar glucosa. La glucosa
producida mediante la hidrólisis enzimática de la celulosa y otros
sacáridos que contienen glucosa, puede recuperarse y conservarse, o
puede fermentarse posteriormente para dar etanol usando técnicas
convencionales. Se conocen bien muchos procesos para la
fermentación de glucosa generada a partir de celulosa y son
adecuados para su uso en este documento. Brevemente, el hidrolizado
que contiene la glucosa de la reacción enzimática se pone en
contacto con un microorganismo apropiado en condiciones eficaces
para la fermentación de la glucosa a etanol. Esta fermentación
puede separarse y seguir a la hidrólisis enzimática de la celulosa
(procesada secuencialmente) o la hidrólisis y la fermentación
pueden ser simultánea y realizarse en el mismo recipiente (procesada
simultáneamente). Los detalles de las diversas técnicas de
fermentación, condiciones y microorganismos adecuados se han
descrito, por ejemplo, en Wyman (1994, Bioresource Technol.,
50:3-16) o en Olsson y Hahn-Hagerdal
(1996, Enzyme Microbial Technol., 18:312-331),
cuyos contenidos se incorporan en este documento por referencia.
Tras completar una fermentación, el alcohol puede recuperarse
mediante extracción y opcionalmente purificarse, por ejemplo,
mediante destilación.
De este modo, según aún otro aspecto de la
presente invención, se proporciona un procedimiento para producir
un alcohol. El procedimiento según este aspecto de la presente
invención se lleva a cabo fermentando un material inicial de
fermentación que contiene glucosa con una célula que sobreexpresa
una construcción de un ácido nucleico que incluye un polinucleótido
genómico, complementario o compuesto, preferiblemente derivado de
Aspergillus niger, que codifica un polipéptido que tiene una
actividad catalítica \beta-glucosidasa, y extraer
el alcohol de la misma. Preferiblemente, el polinucleótido además
codifica un péptido señal en fase con el polipéptido. Todavía
preferiblemente, el polinucleótido además codifica un péptido de
retención en el retículo endoplásmico en fase con el
polipéptido.
Según un aspecto adicional de la presente
invención, se proporciona un procedimiento para producir un
alcohol. El procedimiento según este aspecto de la presente
invención se lleva a cabo fermentando un material inicial de
fermentación que contiene glucosa derivado de una planta mediante
una célula, sobreexpresando la planta una construcción de ácido
nucleico que incluye un polinucleótido genómico, complementario o
compuesto, preferiblemente derivado de Aspergillus niger,
que codifica un polipéptido que tiene una actividad catalítica
\beta-glucosidasa, y extraer el alcohol de la
misma. Preferiblemente, el polinucleótido además codifica un
péptido señal en fase con el polipéptido. Todavía preferiblemente,
el polinucleótido además codifica un péptido de retención en el
retículo endoplásmico en fase con el polipéptido.
En las plantas que contienen compuestos de aroma
y sabor de naturaleza glucosídica, sus propiedades aromáticas
inherentes pueden liberarse mediante degradación enzimática,
transformando un compuesto aromático no volátil en su forma
volátil. De este modo, por ejemplo, las
\alpha-L-arabinofuranosidasas
ayudan a la liberación de compuestos aromáticos a partir de
sustratos tales como zumos o vinos, como se describe en Gunata y
col. (solicitud de patente europea Nº 332.281, 1989; y
"purification and some properties of an
alpha-L-arabinofuranosidase from
A. niger action on grape monoterpenyl
arabinofuranosylglucosides". J. Agric. Food Chem.
38:772-776, 1990). Este resultado se obtiene, por
ejemplo, en un proceso en dos etapas en el que la primera etapa
comprende el uso de una
\alpha-L-arabinofuranosidasa,
para catalizar la liberación de restos de arabinosa de monoterpenil
\alpha-L-arabinofuranosil
glucósidos contenidos, por ejemplo, en el zumo de frutas o
vegetales, mediante la escisión del enlace (1\rightarrow6) entre
una unidad arabinofuranosilo terminal y la glucosa intermedia de un
monoterpenil
\alpha-L-arabinofuranosil
glucósido. La
\alpha-L-arabinofuranosidasa
preferiblemente está en forma purificada para evitar así la
degradación no deseada de otros componentes del zumo que podría ser
perjudicial para su calidad final. En la segunda etapa, se requiere
la \beta-glucosidasa para producir el terpenol
libre a partir del monoterpenil glucósido desarabinosilado. Si se
desea, ambas etapas de la reacción pueden realizarse en el mismo
recipiente de reacción sin la necesidad de aislar los productos
intermedios (Gunata y col. (1989), supra). De este modo, la
\beta-glucosidasa es una contribución esencial
cuando se desea la liberación de estos compuestos aromáticos para
mejorar el aroma del zumo o del vino. Además, en el caso del vino,
el control de la liberación de compuestos aromáticos proporciona
vinos con un aroma más consistente, reduciendo o eliminando, de
este modo, el efecto no deseado de "años de mala cosecha".
Aparece información adicional en: "Cloning and expression of DNA
molecules encoding arabinan degrading enzyme of fungal origin",
Patente de EE.UU. Nº 5.863.783; Y. Gueguen, y col. "A Very
Efficient \beta-Glucosidase Catalyst for the
Hydrolysis of Flavor Precursors of Wines and Fruit Juices", J.
Agric. Food Chem. 44:2336-2340, 1996, cuya
descripción se incorpora en este documento por referencia.
De este modo, según un aspecto adicional de la
presente invención, se proporciona un procedimiento para aumentar
el nivel de al menos una sustancia aromática en un producto
derivado de una planta, tal como, pero sin limitaciones, una bebida
alcohólica. El procedimiento según este aspecto de la presente
invención se lleva a cabo incubando un material inicial de una
planta que contiene glucosa con una célula de levadura que
sobreexpresa una construcción de ácido nucleico que incluye un
polinucleótido genómico, complementario o compuesto,
preferiblemente derivado de Aspergillus niger, que codifica
un polipéptido que tiene una actividad catalítica
\beta-glucosidasa, aumentado así el nivel de al
menos una sustancia aromática en el producto derivado de la planta.
Preferiblemente, el polinucleótido además codifica un péptido señal
en fase con el polipéptido. Todavía preferiblemente, el
polinucleótido además codifica un péptido de retención en el
retículo endoplásmico en fase con el polipéptido.
Reduciendo la presente invención a la práctica,
se ha descubierto que para obtener la actividad de una
\beta-glucosidasa en una planta transgénica, la
construcción de expresión deberá incluir un péptido señal. Además,
se ha descubierto que la retención de la enzima en el retículo
endoplásmico da lugar a una liberación mayor de compuestos
aromáticos tras la homogeneización e incubación. Se asume que la
compartimentalización de la enzima, por ejemplo en el RE, evita que
ésta interaccione con sus sustratos que están principalmente fuera
de las células, limitando esta interacción tras la homogeneización.
De hecho, la dirección de la enzima hacia el apoplasto da lugar a
un aumento de la liberación de aroma in vivo. De este modo,
dependiendo de la aplicación específica, se puede elegir incluir o
no en la construcción un péptido de retención en el retículo
endoplásmico.
Según aún un aspecto adicional de la presente
invención, se proporciona un procedimiento para aumentar el nivel
de al menos una sustancia aromática en un producto derivado de una
planta, tal como, pero sin limitaciones, una bebida alcohólica. El
procedimiento según este aspecto de la presente invención se lleva
a cabo incubando un material inicial de una planta que contiene
glucosa con una célula de levadura, sobreexpresando dicha planta
una construcción de ácido nucleico que incluye un polinucleótido
genómico, complementario o compuesto preferiblemente derivado de
Aspergillus niger, que codifica un polipéptido que tiene una
actividad catalítica \beta-glucosidasa, aumentado
así el nivel de al menos una sustancia aromática en el producto
derivado de la planta. Preferiblemente, el polinucleótido además
codifica un péptido señal en fase con el polipéptido. Todavía
preferiblemente, el polinucleótido además codifica un péptido de
retención en el retículo endoplásmico en fase con el
polipéptido.
Según se usa en este documento en la memoria
descriptiva y en la sección de reivindicaciones que sigue, la
expresión "material inicial que contiene glucosa" se refiere a
cualquier fuente de energía, en forma de compuestos que contienen
glucosa, distintos de glucosa libre, que incluye, pero sin
limitaciones, material de una planta, planta o porciones de la
misma machacado, picado, cortado en dados o extraído, tales como
frutos, ejemplos de los cuales son las frutas tropicales y
uvas.
Según un aspecto adicional de la presente
invención, se proporciona un procedimiento para producir una planta
aromática. Según se usa en este documento en la memoria descriptiva
y en la sección de reivindicaciones que sigue, la expresión
"planta aromática" se refiere sustancialmente a cualquier
parte de una planta en la que se generan compuestos volátiles por
la actividad catalítica del polipéptido
\beta-glucosidasa de la presente invención,
liberando compuestos volátiles de ésta que se perciben por el
sistema olfativo de un organismo, tal como un humano.
El procedimiento según este aspecto de la
presente invención se lleva a cabo mediante la sobreexpresión en
la planta de una construcción de ácido nucleico que incluye un
polinucleótido genómico, complementario o compuesto derivado de
Aspergillus niger, que codifica un polipéptido que tiene una
actividad catalítica \beta-glucosidasa,
aumentando, de este modo, el aroma que difunde la planta. Esta
sobreexpresión se realiza preferiblemente de forma específica de
tejido empleando, por ejemplo, un promotor específico de tejido,
como se ha descrito anteriormente en este documento, para
sobreexpresar así una proteína heteróloga en una porción
seleccionada de la planta. El tejido en el que se lleva a cabo esta
sobreexpresión se selecciona según la disponibilidad en ésta de
sustratos aromáticos no volátiles que contengan glucosa. De este
modo, esta sobreexpresión causará la liberación de un constituyente
volátil y aromático del sustrato. De este modo, según realizaciones
preferidas, la sobreexpresión de la construcción de ácido nucleico
se limita al menos a un tejido, tal como una flor, un fruto, una
semilla, una raíz, un tallo, polen y hojas.
Según otro aspecto adicional de la presente
invención, se proporciona un procedimiento para aumentar el nivel
de glucosa libre en un material inicial de fermentación que
contiene glucosa. El procedimiento según este aspecto de la presente
invención se lleva a cabo fermentando el material inicial de
fermentación que contiene glucosa con una célula que sobreexpresa
una construcción de ácido nucleico que incluye un polinucleótido
genómico, complementario o compuesto derivado preferiblemente de
Aspergillus niger, que codifica un polipéptido que tiene una
actividad catalítica \beta-glucosidasa,
aumentando, de este modo, el nivel de la glucosa libre en el
material inicial de fermentación que contiene glucosa.
Preferiblemente, el polinucleótido además codifica un péptido señal
en fase con el polipéptido. Todavía preferiblemente, el
polinucleótido además codifica un péptido de retención en el
retículo endoplásmico en fase con el polipéptido.
Según otro aspecto de la presente invención, se
proporciona un procedimiento para aumentar el nivel de glucosa
libre en un material inicial de fermentación que contiene glucosa
derivado de una planta. El procedimiento según este aspecto de la
presente invención se lleva a cabo fermentando el material inicial
de fermentación que contiene glucosa derivado de la planta mediante
una célula, sobreexpresando la planta una construcción de ácido
nucleico que incluye un polinucleótido genómico, complementario o
compuesto preferiblemente derivado de Aspergillus niger, que
codifica un polipéptido que tiene una actividad catalítica
\beta-glucosidasa, aumentado así el nivel de la
glucosa libre en la planta. Preferiblemente, el polinucleótido
además codifica un péptido señal en fase con el polipéptido.
Todavía preferiblemen-
te, el polinucleótido además codifica un péptido de retención en el retículo endoplásmico en fase con el polipéptido.
te, el polinucleótido además codifica un péptido de retención en el retículo endoplásmico en fase con el polipéptido.
Según se usa en este documento en la memoria
descriptiva y en la sección de reivindicaciones que sigue, la
expresión "glucosa libre" se refiere a restos de glucosa en
forma de monosacárido, cuyos niveles aumentan mediante la actividad
catalítica de la \beta-glucosidasa.
Según se usa en este documento en la memoria
descriptiva y en la sección de reivindicaciones que sigue, la
expresión "material inicial de fermentación que contiene
glucosa" se refiere a cualquier fuente de energía, en forma de
compuestos que contienen glucosa, distintos de glucosa libre, que
incluye, pero sin limitaciones, material de una planta, planta o
porciones de la misma prensado, picado, cortado en dados o extraído
usado en procesos de fermentación industrial.
Según aún otro aspecto de la presente invención,
se proporciona un procedimiento para aumentar el nivel de glucosa
libre extra o intracelular en una planta. El procedimiento según
este aspecto de la presente invención se lleva a cabo mediante la
sobreexpresión en la planta de una construcción de ácido nucleico
que incluye un polinucleótido genómico, complementario o compuesto
derivado de Aspergillus niger, que codifica un polipéptido
que tiene una actividad catalítica
\beta-glucosidasa, aumentando, de este modo, el
nivel de glucosa libre en la planta. De este modo, pueden
producirse frutas más dulces. Preferiblemente, el polinucleótido
además codifica un péptido señal en fase con el polipéptido. Todavía
preferiblemente, el polinucleótido además codifica un péptido de
retención en el retículo endoplásmico en fase con el
polipéptido.
Las glucosidasas, incluyendo la
\beta-glucosidasa, catalizan reacciones que
implican la hidrólisis del enlace O-glucosídico de
los glucósidos y sintetizan oligosacáridos cuando la reacción se
desarrolla en dirección inversa a la normal, un resultado logrado,
por ejemplo, mediante mutagénesis dirigida a sitio e inversión de
Km. Como se describe anteriormente en este documento en la sección
de Antecedentes, el mecanismo de reacción de hidrólisis de las
glucosidasas implica dos etapas catalíticas, la segunda de las
cuales implica un ataque con H_{2}O catalizado por una base,
dando lugar a la regeneración de la enzima y la liberación del
resto sacárido. De este modo, además, puede conseguirse la
síntesis del oligosacárido añadiendo un segundo sacárido a la
mezcla de reacción, que compite con la molécula de H_{2}O, y
reacciona en este lugar con el primer sacárido en lo que se conoce
como una reacción de transglucosilación. Por tanto, ya que las
glucosidasas generalmente están disponibles y se manejan
fácilmente, estas enzimas tienen potencial para catalizar la
producción de muchos productos diferentes usando sustratos baratos.
Para más detalles, véase la patente de EE.UU. Nº 5.716.812, que se
incorpora en este documento por referencia.
Por tanto, según aún un aspecto adicional de la
presente invención, se proporciona un procedimiento para sintetizar
oligosacáridos. El procedimiento según este aspecto de la presente
invención se lleva a cabo mezclando un polipéptido que tiene una
actividad catalítica \beta-glucosidasa con las
moléculas primera y segunda de sacárido para unir así las moléculas
primera y segunda de sacárido en un oligosacárido.
Objetivos adicionales, ventajas y
características nuevas de la presente invención serán aparentes a
un experto en la materia tras examinar los siguientes ejemplos,
que no pretenden ser limitantes. Adicionalmente, cada una de las
diversas realizaciones y aspectos de la presente invención como se
apunta anteriormente en este documento y como se reivindica a
continuación en la sección de reivindicaciones encuentra apoyo
experimental en los ejemplos siguientes.
Ahora se hace referencia a los siguientes
ejemplos, que junto con las descripciones anteriores, ilustran la
invención de forma no limitante.
Generalmente, la nomenclatura usada en este
documento y los procedimientos de laboratorio utilizados en la
presente invención incluyen técnicas moleculares, bioquímicas,
microbiológicas y de recombinación de ADN. Estas técnicas se
explican ampliamente en la literatura. Véase, por ejemplo,
"Molecular Cloning: A laboratory Manual" Sambrook y col.,
(1989); "Current Protocols in Molecular Biology" Volúmenes
I-III Ausubel, R.M., editor (1994); Ausubel y col.,
"Current Protocols in Molecular Biology", John Wiley e Hijos,
Baltimore, Maryland (1989); Perbal, "A Practical Guide to
Molecular Cloning", John Wiley e Hijos, Nueva York (1988);
Watson y col., "Recombinant DNA", Scientific American Books,
Nueva York; Birren y col.(editores) "Genome Analysis: A
Laboratory Manual Series", Volúmenes 1-4, Cold
Spring Harbor Laboratory Press, Nueva York (1998); metodologías
como se explican en las Patentes de EE.UU. Nº 4.666.828; 4.683.202;
4.801.531; 5.192.659 y 5.272.057; "Cell Biology: A Laboratory
Handbook", Volúmenes I-III Cellis, J. E., editor
(1994); "Current Protocols in" Volúmenes I-III
Coligan J. E., editor (1994); Stites y col. (editores), "Basic
and Clinical Immunology" (8ª edición), Appleton y Lange,
Norwalk, CT (1994); Mishell y Shiigi (editores), "Selected
Methods in Cellular Immunology", W. H. Freeman y Co., Nueva York
(1980); los inmunoensayos disponibles se describen ampliamente en
la literatura de patentes y científica, véase, por ejemplo, las
patentes de EE.UU. Nº 3.791.932; 3.839.153; 3.850.752; 3.850.578;
3.853.987; 3.867.517; 3.879.262; 3.901.654; 3.935.074; 3.984.533;
3.996.345; 4.034.074; 4.098.876; 4.879.219; 5.011.771 y 5.281.521;
"Oligonucleotide Synthesis" Gait, M. J., editor (1984);
"Nucleic Acid Hybridization" Hames, B. D., y Higgins S. J.,
editores (1985); "Transcription and Translation" Hames, B. D.,
y Higgins S. J., editores (1984); "Animal Cell Culture"
Freshney, R. I., editor (1986); "Immobilized Cells and
Enzymes" IRL Press, (1986); "A Practical Guide to Molecular
Cloning" Perbal, B., (1984) y "Methods in Enzymology"
Volumen 1-317, Academic Press; "PCR Protocols: A
Guide To Methods And Application", Academic Press, San Diego, CA
(1990); Marshak y col., "Strategies for Protein Purification and
Characterization - A Laboratory Course Manual" CSHL Press
(1996); todas las cuales se incorporan por referencia como si se
explicaran completamente en este documento. A lo largo de este
documento se proporcionan otras referencias generales. Los
procedimientos en éste se cree que son bien conocidos en la técnica
y se proporcionan para la conveniencia del lector. Toda la
información contenida en él se incorpora en este documento como
referencia.
Se obtuvo una preparación en bruto de
\beta-glucosidasa de A. niger B1 (CMI CC
324626) de Shaligal Ltd. (Tel-Aviv, Israel). Se
diafiltró primero una muestra (10 ml) del extracto enzimático (140
unidades/ml) a través de una membrana Amicon de 50 kDa de punto de
corte (Amicon Corp., Danvers, MA), con tampón citrato 20 mM, pH=5.
Las proteínas se separaron a continuación en un FPLC equipado con
una columna Mono-Q RH 5/5 (Amersham Pharmacia
Biotech AB, Uppsala, Suecia), equilibrada con el mismo tampón. La
enzima se eluyó con un gradiente lineal de NaCl de 0 a 350 mM. Se
controlaron y mezclaron (entre NaCl 80-110 mM) las
fracciones activas (véase más adelante, ensayos enzimáticos). Se
dializó la enzima parcialmente purificada frente a tampón citrato
20 mM, pH=3,5, se aplicó a una columna Resource-S
equilibrada con el mismo tampón y se eluyó con un gradiente de NaCl
0-1 mM. La enzima purificada (eluida con NaCl 155
mM) se concentró mediante untrafiltración (membrana de 50 kDa de
punto de corte, Amicon).
Se controló la actividad enzimática de
\beta-glucosidasa usando un ensayo en placa como
sigue. Se disolvió
4-metil-umbeliferil
\beta-D-glucopiranósido (MUGlc,
Sigma Chemical Inc. San Luis, Missouri) a una concentración final
de 0,5 mM en tampón PC (fosfato 50 mM, ácido cítrico 12 mM, pH=3,4)
a 45ºC. La solución se mezcló con agar al 3% en agua, previamente
llevado a ebullición y luego enfriado a 45ºC. La solución
resultante (20 ml) se vertió sobre una placa petri y tras
solidificar, se depositaron 10 \mul de las muestras de enzima.
Las placas se incubaron a 50ºC durante una hora y a continuación se
iluminaron con UV de onda larga. Una fluorescencia intensa
indicaba actividad \beta-glucosidasa.
La detección de
\beta-glucosidasa en los geles de poliacrilamida
se realizó lavando el gel de SDS-poliacrilamida con
1:1 de isopropanol:tampón PC para eliminar el SDS y renaturalizar
la proteína. El gel se lavó una vez en tampón PC y se incubó en una
capa fina de una solución de MUGlc 0,5 mM. Después de incubar a
50ºC durante una hora, se visualizó la banda de proteína activa
con luz UV.
Los ensayos cuantitativos se realizaron usando
pNPGlc como sustrato, según Shoseyov (7).
Se disolvió enzima recombinante (40 \mug/ml)
en tampón citrato-fosfato 20 mM, pH=5. Cada muestra
analizada
(8 \mul) se cubrió con 15 \mul de aceite mineral. La actividad se determinó mediante el ensayo pNPGlc convencional (7).
(8 \mul) se cubrió con 15 \mul de aceite mineral. La actividad se determinó mediante el ensayo pNPGlc convencional (7).
Se incubó una mezcla de reacción de
N-glicosidasa-F (Boehringer
Mannheim, Mannheim, Alemania) que contenía 0,125 \mug de
\beta-glucosidasa pura (previamente
desnaturalizada mediante 3 minutos de ebullición en SDS al 1% y
\beta-mercaptoetanol al 5%), 0,2 unidades de
N-glicosidasa-F, tampón fosfato
sódico (50 mM, pH=7,5), EDTA (25 mM), Triton X-100
al 1% y azida sádica al 0,02%, en un volumen total de 12,5 \mul
durante 4 horas a 37ºC. La reacción se detuvo mediante la adición
de tampón de aplicación de la muestra en PAGE, seguido por 3
minutos de ebullición.
La proteolisis enzimática parcial con proteasa
V8 de Staphylococcus aureus se realizó como describe
Cleveland (28). Brevemente, se concentró la
\beta-glucosidasa purificada por FPLC (5 \mug)
mediante precipitación con acetona. La proteína se separó en un gel
SDS-PAGE al 10% preparativo. Se tiñó el gel con
azul de Coomassie, de destiñó y se lavó con agua fría, y se
escindió la banda de proteína \beta-glucosidasa.
El fragmento resultante del gel se aplicó a un segundo gel
SDS-PAGE (15% de acrilamida) y se cubrió con
proteasa V8 de Staphylococcus aureus. La digestión se
realizó en el gel concentrador desconectando la corriente durante
30 min. Cuando el colorante azul de bromofenol estaba cerca del
final del gel concentrador, se restableció la corriente. Los
productos escindidos sometidos a electroforesis se
electrotransfirieron a membranas de PVDF. La proteína nativa se
transfirió a PVDF en paralelo. La secuencia
N-terminal de la proteína nativa y dos de los
numerosos productos escindidos se analizaron mediante la
degradación de Edman usando un secuenciador de proteínas de fase
gaseosa (microsecuenciador modelo 475A de Applied
Biosystems).
Biosystems).
Aislamiento del ARN total: El ARN total
se aisló de Aspergillus niger B1 como sigue: se cultivó
A. niger B1 en cultivo líquido compuesto por medio mineral
(NH_{4})_{2}SO_{4}\cdot3H_{2}O (0,5 g/l),
KH_{2}PO_{4} (0,2 g/l), MgSO_{4} (0,2 g/l),
CaCl_{2}\cdotH_{2}O (0,1 g/l), FeSO_{4}\cdot6H_{2}O
(0,001 g/l), ZnSO_{4}\cdot7H_{2}O (0,001 g/l) y ácido cítrico
2 mM, a pH=3,5 con 1% p/v de salvado como fuente de carbono. El
medio se esterilizó en autoclave, se enfrió y se inoculó con A.
niger B1 (10^{6} esporas/ml). Se usaron matraces con
deflectores con agitación constante (200 RPM) a 37ºC. Se controló la
aparición de actividad \beta-glucosidasa
colocando 5 \mul de medio de cultivo sobre placas con agar al 1%
que contenían MUGlc 0,5 mM, como se describe anteriormente. La
actividad se detectó después de 15 horas de incubación. El micelio
se recogió después de un periodo de crecimiento de 24 horas y se
eliminó el medio mediante filtración a través de microfibra de
vidrio GFA (Whatman Inter. Ltd., Maidstone, Inglaterra). A
continuación se congeló el micelio en nitrógeno líquido y se
trituró con un mortero hasta conseguir un polvo fino. El ARN total
se extrajo a partir de este polvo mediante el procedimiento del
tiocianato de guanidina (TriReagent^{TM}) (Molecular Research
Center, Inc.).
Reacción de transcripción inversa de ARN:
El ADNc se obtuvo por transcripción inversa del ARN total (10
\mug) usando el kit Stratagene RT-PCR
(Stratagene, La Jolla, CA). La mezcla de reacción (50 \mul)
estaba compuesta adicionalmente de: oligo dT18 (1 \mug),
inhibidor de la ribonucleasa RNasa Block (20 unidades), tampón 1x
(Tris HC1 50 mM, pH=8,3, KCl 75 mM, DTT 10 mM, MgCl_{2} 3 mM),
dNTP (500 \muM cada uno) y transcriptasa inversa (300 unidades).
Se desnaturalizó inicialmente el ARN total a 70ºC, se dejó enfriar
a temperatura ambiente (para la hibridación de los cebadores) y se
añadió a la mezcla de reacción. La mezcla de reacción se incubó
durante 1 hora a 37ºC, seguido por el calentamiento (95ºC, 5
minutos) y conservación a -70ºC hasta su uso adicional.
Amplificación de ADN: Se sintetizaron
cebadores degenerados para la reacción de amplificación de ADN por
procedimientos de PCR, basados en parte en la secuencia
N-terminal de aminoácidos y en una secuencia
interna, como se determinó por la degradación de Edman, siguiendo
la proteolisis con V8 (más adelante en este documento, resultados
experimentales). La secuencia parcial de la secuencia de
aminoácidos derivada del extremo N-terminal de
\beta-glucosidasa era
Ser-Pro-Pro-Tyr-Tyr-Pro
(ID SEC Nº 4), produciendo el siguiente cebador: 5'-
(C/G)(A/C/G/T)CC(A/C/G/T)CC(A/C/G/T)TA(C/T)
TA(C/T)CC-3' (ID SEC Nº 5). La
secuencia parcial de la secuencia de aminoácidos del producto de
escisión interna E2 era
Gln-Pro-Ile-Leu-Pro-Ala-Gly-Gly
(ID SEC Nº 6), produciendo el siguiente cebador: 5'-
TCCIGC(T/G/C/A)GG(T/G/C/A)A(G/A)(T/G/A)AT(T/G/C/A)GG(T/C)
TG-3' (ID SEC Nº 7).
La mezcla de reacción de amplificación de ADN
(25 \mul) contenía: el producto de reacción de la transcriptasa
inversa (1 \mul), tampón de PCR 10x (2,5 \mul, Promega Corp.,
Madison, WI), dNTP (250 \muM cada uno), MgCl_{2} (2,0 mM),
cebadores degenerados (250 pmol cada uno), ADN polimerasa (3
unidades, Stratagene, La Jolla, CA) y cubierto con aceite mineral
(25 \mul). La reacción se realizó en un bloque calentador
automático (controlador térmico programable, MJ Research, Inc.).
Las condiciones de los ciclos de PCR fueron desnaturalización
durante 30 segundos a 94ºC, hibridación durante 60 segundos a 50ºC
y elongación durante 150 segundos a 72ºC, repetido 36 veces. El
producto amplificado resultante se sometió a electroforesis en un
gel de agarosa al 1,2% (p/v)/TBE, dando lugar a un fragmento génico
de ADNc de 2,2 kb, que fue adicionalmente aislado usando el kit de
extracción de gel (QIAGEN; Hilden, Alemania) y clonado directamente
en el sitio de inserción único 3'-T PCR del vector
de clonación pGEM-T (Promega Corp., Madison,
WI).
Preparación de sondas: El ADNc parcial de
2,2 kb se digirió con PstI para producir una sonda del
fragmento de ADN de 1,2 kb. Una muestra (25 ng) del fragmento se
marcó con [^{32}]dCTP usando el sistema de marcaje de ADN
Rediprime con nanonucleótido de secuencia aleatoria (Amersham
Pharmacia Biotech AB, Buckinghamshire, Inglaterra).
Preparación de la biblioteca plasmídica del
ADN genómico: Se construyó una biblioteca genómica de A.
niger B1 en el vector lanzadera de levadura/E. coli
pYEAUra3 (Clontech Lab. Inc., Palo Alto, CA). Se cultivó A.
niger B1 en cultivo líquido como se describe anteriormente, el
micelio se recogió después de 48 horas de crecimiento, se congeló
en nitrógeno líquido y se trituró. El micelio en polvo se usó para
extraer el ADN genómico por el procedimiento CTAB de Murray y
Thompson (29). La biblioteca se construyó a partir del ADN
genómico digerido parcialmente con Sau3, clonado en el sitio
BamHI del vector lanzadera de levadura pYEUra3 (Clontech
Lab. Inc., Palo Alto, CA). El vector lanzadera de levadura/E.
coli pYEAUra3 se digirió con BamHI y se desfosforiló con CIP
para prevenir el autoligamiento. El ADN genómico parcialmente
digerido se clonó en el vector lanzadera con ligasa de T4 y se usó
para transformar células electrocompetentes TOP10 de E.
coli, que a continuación se sembraron sobre una placa de
LB-agar que contenía ampicilina (50 \mug/ml). Un
total de 4 x 10^{4} colonias crecidas en placas de
LB-agar se transfirieron a membranas
Hybond-N (Amersham Pharmacia Biotech AB,
Buckinghamshire, Inglaterra) y se analizaron usando la sonda de 1,2
kb descrita anteriormente. Los clones positivos se subclonaron en
pUC18 y se secuenciaron (Biological Services, The Weizmann Institute
of Science, Rehovot, Israel).
Se diseñaron dos cebadores específicos de
acuerdo a las secuencias 5' y 3', correspondientes a la región
N-terminal y C-terminal de la
proteína madura: cebador sentido: 5'- (ID SEC Nº 8). Cebador
complementario: 5'- AAAG
GATCCTTAGTGAACAGTAGGCAGAGACGC-3' (ID SEC Nº 9). El ADNc aislado se digirió con NcoI y BamHI y se clonó en el vector de expresión pET3d (Figura 1A, Novagen Inc., Madison, WI). Las colonias de E. coli BL21(DE3) pLysS positivas, que contenían el ADNc de bgl1 se confirmaron mediante digestión con enzimas de restricción y análisis de secuencia. La BGL1 recombinante se expresó según el protocolo del fabricante.
GATCCTTAGTGAACAGTAGGCAGAGACGC-3' (ID SEC Nº 9). El ADNc aislado se digirió con NcoI y BamHI y se clonó en el vector de expresión pET3d (Figura 1A, Novagen Inc., Madison, WI). Las colonias de E. coli BL21(DE3) pLysS positivas, que contenían el ADNc de bgl1 se confirmaron mediante digestión con enzimas de restricción y análisis de secuencia. La BGL1 recombinante se expresó según el protocolo del fabricante.
Se usó el vector pYES2 (Invitrogen Inc., San
Diego, CA) para clonar eficazmente el gen de ADNc de bgl1 en los
sitios HindIII/BamHI del plásmido
pYES2-bgl1 (Figura 1b) y transformar
Saccharomyces cerevisiae usando el procedimiento del acetato
de litio (30). La BGL1 se expresó induciendo el promotor Gal1 según
el protocolo del fabricante. La cepa INVSc2 de Saccharomyces
cerevisiae (MATa, his3-D200,
ura3-167) se usó como hospedador. La cepa GS115 de
Pichia pastoris (mutante his4) se usó como hospedador para
el vector plasmídico lanzadera y de expresión
pHIL-S1 (Invitrogen Inc., San Diego, CA). El ADNc
de bgl1 se clonó en los sitios EcoRI/BamHI de
pHIL-S1, produciendo el vector de expresión y
secreción pHIL-S1-bgl1 (Figura 1c).
La expresión en P. pastoris de realizó según el protocolo
del fabricante. La selección de clones que expresaban
\beta-glucosidasa se hizo mediante
top-agar que contenía 50 mg de
X-Glc, 30 ml de metanol y agar al 1% por litro. El
color azul indicaba una colonia productora de
\beta-glucosidasa activa.
Los anticuerpos se obtuvieron a partir de suero
de conejo 36 días después de una segunda inyección de 100 \mug
de proteína purificada y adyuvante (AniLab Biological Services,
Tal-Sachar, Israel). El marcador de peso molecular
alto era de Sigma Chemical Inc., San Luis, Missouri. Las
condiciones de la inmunotransferencia se describen en la referencia
36.
El procedimiento fue esencialmente como
describen Wong y col. (31). Se disolvieron PNPGlc (10 \mumoles)
en 0,5 ml de tampón acetato 25 mM pH=3,5 en D2O en un tubo de RMN.
Se liofilizó la \beta-glucosidasa y se redisolvió
en 100 \mul de D20 (35 unidades/ml). Se registró el espectro de
RMN-^{1}H del sustrato, se añadió la enzima (10
\mul) y se registró el espectro a intervalos especificados de
tiempo en un Bruker AMX400 a 25ºC.
Se incubó la enzima
\beta-glucosidasa de A. niger pura (0,47
mg/ml) en presencia de diversas concentraciones de fluoruro de
2-deoxi-2-fluoro-\beta-glucosilo
(2FGlcF, 0,5-6 mM) en tampón citrato 30 mM pH=4,8 a
50ºC. Se determinó la actividad enzimática residual a diferentes
intervalos de tiempo mediante la adición de una alícuota (10
\mul) de la mezcla de inactivación, a una solución que contenía
tampón citrato (30 mM, pH=4,8), BSA (8 \mug) y
2,4-dinitrofenil
\beta-D-glucopiranósido (DNPGlc,
0,625 mM, 830 \mul). La liberación de DNP se determino
espectrofotométricamente midiendo la absorbancia a 400 nm un minuto
después de la adición del sustrato.
Las velocidades de reactivación se determinaron
como sigue: se preincubó la \beta-glucosidasa de
A. niger pura (0,34 mg/ml) con 2FGlcF (5 mM) durante 15 min,
tras lo cual se diafiltró el exceso de inactivador mediante
concentradores de centrífuga de punto de corte de 20 kDa de peso
molecular nominal (Sartorius Inc., Goettingen, Alemania). Las
muestras de la enzima purificada inactivada se incubaron en
presencia de linamarina (0-16 mM) en tampón citrato
(30 mM, pH=4,8) a 50ºC durante 0, 10, 20 y 30 minutos y se
determinó la actividad de cada muestra usando
p-nitrofenil
\beta-D-glucopiranósido (pNPGlc)
como sustrato.
Se clonó el ADNc de bgl1 en pETB1 (37). Se
usaron pJD330 y pBINPlus (38) como vector intermedio y binario,
respectivamente. La secuencia señal Cel1, así como el fragmento Q
de 35S plus se recuperaron a partir de pB21, pBluescript SK
modificado (39). Se usó Nicotiana tobacum cv. Samson como
planta modelo para la transformación génica. Se emplearon tres
construcciones génicas (Figuras 11a-c): (i) bgl1
sin ningún péptido señal que sirvió para la expresión citoplásmica
(Figura 11a, plásmido pJDB1); (ii) bgl1 que incluye un péptido
señal Cel1 en el extremo N-terminal para la
secreción en el apoplasto (Figura 11b, plásmido pJDCB1) y (iii)
bgl1 que incluye el péptido señal Cel1 y el péptido de retención en
el RE, KDEL (ID SEC Nº 24)en el extremo
C-terminal para la acumulación en el RE (Figura
11c, plásmido pJDCB1T).
Con este fin, se liberó el ADNc de bgl1 (2,5 kb)
de pETB1 (37) con NcoI y BamHI y se insertó en pJD330
entre el fragmento \Omega del promotor 35S y el terminador
nos, eliminando el gen gus, dando lugar al plásmido
pJDB1. Se sintetizó el tetrapéptido señal de retención en el
retículo endoplásmico, HDEL (ID SEC Nº 17) y se fusionó con
bgl1 en el extremo C-terminal en pJDB1
mediante una reacción de PCR de alta fidelidad con el siguiente par
de cebadores: cebador sentido (23 mer), comenzando desde el
nucleótido 1.248 del ADNc de bgl1 5'-(1.248)-
CAGTGACCGTGGATGCGACAATG-(1.270')-3' (ID SEC Nº 20);
cebador complementario (40 mer), comenzando en el nucleótido 2.506
del ADNc de bgl1 que codifica también el péptido HDEL (ID SEC Nº 17)
5'-(2.506)- AGA
GACGGATGACAAGTACTACTTGAAATTGGGCCCAAAA-3' (ID SEC Nº 21). Para pJDCB1T (35S \Omega + Cel1 + bgl1 + HDEL), el fragmento \Omega de 35S de pJDB1 se sustituyó por un fragmento 35S \Omega + Cel1 digerido a partir de pB21 con BamHI y XbaI. Para pJDCB1 (35S \Omega + Cel1 + bgl1), el fragmento que contenía 35S \Omega y Cel1, así como parte de bgl1, se cortaron de pJDCB1T con HindIII y NruI y se ligaron con el vector de pJDB1 digerido con el mismo par de enzimas de restricción. La secuencia nucleotídica de todas las construcciones genéticas se confirmó mediante secuenciación de ADN.
GACGGATGACAAGTACTACTTGAAATTGGGCCCAAAA-3' (ID SEC Nº 21). Para pJDCB1T (35S \Omega + Cel1 + bgl1 + HDEL), el fragmento \Omega de 35S de pJDB1 se sustituyó por un fragmento 35S \Omega + Cel1 digerido a partir de pB21 con BamHI y XbaI. Para pJDCB1 (35S \Omega + Cel1 + bgl1), el fragmento que contenía 35S \Omega y Cel1, así como parte de bgl1, se cortaron de pJDCB1T con HindIII y NruI y se ligaron con el vector de pJDB1 digerido con el mismo par de enzimas de restricción. La secuencia nucleotídica de todas las construcciones genéticas se confirmó mediante secuenciación de ADN.
Los casetes génicos en los vectores intermedios
de pJDB1, pJDCB1 y pJDCB1T se aislaron adicionalmente con
HindIII y EcoRI y se insertaron en sitios de clonación
múltiples del vector binario pBINPlus. Se transformó
Agrobacterium LB4404 desactivado con pBINPlus con casetes
génicos de bgl1.
Se escindieron las hojas jóvenes de plántulas
crecidas in vitro y se cortaron en trozos de 0,5 cm^{2} y
posteriormente se sumergieron durante 5 minutos en un medio de
cultivo de una noche de Agrobacterium. Después de secarlas
con papel de filtro Whatman estéril, las hojas infectadas se
cocultivaron durante 2 días con Agrobacterium en medio MS
más 2,0 mg/l de Zeatin y 0,1 mg/l de AIA, así como 0,35% (p/v) de
fitagel y a continuación se transfirieron al mismo medio pero con
300 mg/l de kanamicina y 300 mg/l de carbenicilina. Los
regenerados se transfirieron entonces a medios de enraizamiento que
contenían sólo sales de MS, vitaminas y los mismos antibióticos. Las
plantas enraizadas se transfirieron a un invernadero tras el
análisis por PCR.
Se extrajeron el ADN y las proteínas de las
plantas según Nagy y col. (40). La verificación por PCR de la
inserción génica en el genoma de la planta se realizó con el
siguiente par de cebadores, que cubrían el fragmento de ADN desde
la posición 1.248 hasta el final de bgl1:
5'-CAGTGACCGTGGATGCGACAATG-3' (ID
SEC Nº 22) y 5'-
AAAGGATCCTTAGTGAACAGTAGGCAGAGACGC-3' (ID SEC Nº
23).
Se emplearon la inmunotransferencia (40) y la
tinción del gel de SDS-PAGE por actividad (37) para
seleccionar las líneas transgénicas con éxito, usando la proteína
BGL1 de A. niger purificada como controles positivos y una
planta no transgénica como control negativo.
Se estudió el efecto de bgl1 en la evolución y
composición de compuestos aromáticos. Se escindieron las hojas
frescas de las plantas transgénicas y de plantas control de tipo
natural y se trituraron en nitrógeno líquido. Se añadió tampón de
extracción enfriado en hielo, que contenía EDTA 10 mM, DTT 4 mM en
tampón fosfato 50 mM, pH 4,3, a una relación 1:3 p/p. A
continuación se agitó la mezcla durante 0,5 horas. Se tomaron 0,75
ml del sobrenadante de cada una de las mezclas centrifugadas en un
vial de vidrio. Todas las manipulaciones se realizaron a 4ºC.
Después de 9 horas de incubación a 37ºC, se analizaron los
compuestos volátiles del vial según Clark y col. (41) usando
un aparato de MEFS-CG/EM Saturn Varian 3800
equipado con una columna capilar DB-5. La
temperatura de las inyecciones no fraccionadas era de 250ºC y la
línea de transferencia se mantenía a 280ºC. Se utilizo helio como
gas portador. El horno se programó como sigue: 1 minuto a 40ºC con
calentamiento gradual hasta 250ºC a una velocidad de
5ºC/minuto.
Se purificó una preparación enzimática de
\beta-glucosidasa de A. niger mediante FLPC
con Mono-Q. Las muestras de proteína activa eluidas
de la columna Mono-Q se separaron en un gel de
SDS-PAGE al 10%, se tiñeron con azul de Coomassie y
se incubaron en presencia de MUGlc para demostrar la actividad de
la enzima. En esta etapa de purificación, se pudo detectar una
banda discreta que tenía una masa molecular aparente de
aproximadamente 160 kDa y actividad
\beta-glucosidasa (Figura 2b, líneas
1-5: 1, banda electroeluida de BGL1 procedente del
fragmento de gel de SDS-PAGE preparativo;
2-5, precipitados con acetona procedentes de la
separación en Mono-Q de BGL1). Sin embargo, la masa
aparente de la enzima desnaturalizada (llevada a ebullición durante
10 minutos en presencia de \beta-mercaptoetanol),
se demostró que era de 120 kDa en SDS-PAGE 10%
(Figura 2a). La enzima designada BGL1 se purificó adicionalmente
hasta la homogeneidad en una columna Resource-S
(Figura 3). La desglicosilación de la
\beta-glucosidasa de A. niger se realizó
con N-glicosidasa-F. Como se
demuestra en la Figura 4, el análisis en SDS-PAGE
indicaba que
aproximadamente 20 kDa de la masa de la \beta-glucosidasa de A. niger pueden atribuirse a carbohidratos unidos en N.
aproximadamente 20 kDa de la masa de la \beta-glucosidasa de A. niger pueden atribuirse a carbohidratos unidos en N.
Se llevó a cabo la proteolisis enzimática
parcial de BGL1 purificada con la proteasa V8 de Staphylococcus
aureus. La proteína sin digerir y los productos de escisión se
separaron mediante SDS-PAGE, seguido por la
electrotransferencia en membranas de PVDF y la determinación de la
secuencia N-terminal de la proteína nativa y de dos
de los productos escindidos. Las secuencias de aminoácidos
obtenidas eran las siguientes:
Proteína nativa N-terminal:
Asp-Glu-Leu-Ala-Tyr-Ser-Pro-Pro-Tyr-Tyr-Pro-Ser-Pro-Trp-Ala-Asn-Gly-Gln-Gly-Asp
(ID SEC Nº 10). La parte subrayada representa la ID SEC Nº 4.
Producto de escisión interna: polipéptido El:
Val-Leu-Lys-His-Lys-Asn-Gly-Val-Phe-Thr-Ala-Thr-Asp-Asn-Trp-Ala-Ile-Asp-Gln-Ile-Glu-Ala-Leu-Ala-Lys
(ID SEC Nº 11).
Producto de escisión interna: polipéptido E2:
Gly-Ala-Thr-Asp-Gly-Ser-Ala-Gln-Pro-Ile-Leu-Pro-Ala-Gly-Gly-Gly-Pro-Gly-Gly-Asn-Pro
(ID SEC Nº 12). La parte subrayada representa la ID SEC Nº 6.
El análisis con FastA (32) indicaba que la
secuencia N-terminal, así como las secuencias
internas tienen similitudes de secuencia con secuencias de la
\beta-glucosidasa de la levadura Saccharomyces
fibuligera que pertenece a la familia 3 de las glicosil
hidrolasas.
Con el fin de clonar el gen de la
\beta-glucosidasa de A. niger, se
diseñaron cebadores degenerados según la secuencia de los
fragmentos digeridos del polipéptido. Estos oligonucleótidos se
usaron para amplificar un fragmento de ADNc del gen de la
\beta-glucosidasa mediante
RT-PCR. Se escindió una sonda de 1,2 kb a partir del
producto de amplificación de 2,2 kb resultante, y se usó para
analizar una biblioteca genómica construida en el vector lanzadera
de levadura/E.coli pYEUra3. Los clones positivos se
subclonaron y secuenciaron con éxito, dando lugar a una secuencia
genómica de bgl1 de longitud completa (ID SEC Nº 3, Figura 5a). A
continuación se generaron cebadores de amplificación, según la
secuencia de ADN genómico, correspondientes a los extremos N y
C-terminales de la proteína madura. Se usó entonces
la RT-PCR para amplificar la secuencia de ADNc de
\beta-glucosidasa de longitud completa (ID SEC Nº
1, Figura 5a, Nº de acceso del GenBank, AJ132386). La secuencia de
ADNc coincidía perfectamente con la secuencia de ADN de los exones
combinados. Se encontró que la fase de lectura abierta codificaba
un polipéptido con un peso molecular predicho de 92 kDa. El gen
incluye 7 exones interrumpidos por 6 intrones (Figura 5b). El
análisis de la secuencia de ADN antes de la secuencia que codifica
la proteína madura reveló una probable secuencia líder,
interrumpida por un intrón de 82 pb.
La proteína BGL1 recombinante se sobreexpresó en
E. coli. No se pudo detectar actividad
\beta-glucosidasa aparente en los extractos de
E. coli, sin embargo, el análisis en
SDS-PAGE reveló una banda de proteína relativamente
intensa expresada con el peso molecular esperado. El análisis por
inmunotransferencia usando anticuerpos policlonales de conejo
anti-BGL1 nativa (AniLab Biological Services,
Tal-Sachar, Israel), identificó positivamente la
banda de proteína de 90 kDa (no mostrado). Un análisis adicional
reveló que la proteína se acumulaba en los cuerpos de inclusión. Se
realizaron varios experimentos de replegamiento, sin embargo, los
esfuerzos para producir la proteína activa a partir de E.
coli no tuvieron éxito (no mostrado).
La proteína BGL1 recombinante se expresó
eficazmente tanto en S. cerevisiae como en P.
pastoris, En S. cerevisiae se encontró un nivel
relativamente bajo de expresión. La proteína recombinante se
detectó mediante un análisis por inmunotransferencia (Figura 6a).
El extracto proteico total de S. cerevisiae que expresaba el
ADNc de bgl1 tenía una actividad \beta-glucosidasa
de 1,9 unidades/mg de proteína. No se detectó actividad
\beta-glucosidasa en S. cerevisiae control,
transformada sólo con vector, en las mismas condiciones de ensayo.
Sin embargo, no se pudo detectar ninguna banda de proteína
correspondiente a la proteína BGL1 recombinante mediante tinción
con azul de Coomassie. P. pastoris transformada con bgl1
secretaba niveles relativamente altos de BGL1 recombinante al medio
(aproximadamente 0,5 g/l), que aparecía como una proteína casi pura
en el sobrenadante del cultivo (Figura 6b). Esta enzima
recombinante era muy activa (124 unidades/mg de proteína) y sin
purificación adicional, producía una actividad específica similar a
la de la enzima nativa pura.
El espectro de RMN-^{1}H de
una mezcla de reacción que contenía pNPGlc y BGL1 reveló que el
anómero beta de glucosa se formaba primero (H-1 =
4,95 ppm), con aparición retardada del anómero alfa
(H-1, 5,59 ppm), consecuencia de la mutarrotación
(Figura 7). Por tanto, BGL1 es de hecho, una glucosidasa de
retención, como se ha observado para otros miembros de la familia
(33, 34).
Se incubó la enzima en presencia de varias
concentraciones de 2FGlcF y se controló la actividad enzimática
residual a diferentes intervalos de tiempo. La actividad enzimática
disminuía de manera dependiente del tiempo, según una cinética de
pseudoprimer orden, permitiendo la determinación de las constantes
de velocidad de pseudoprimer orden: K_{i} = 4,5 min^{-1} y
K_{I} = 35,4 mM, para la inactivación a cada concentración de
inactivador (0, 0,5, 1, 2, 4 y 6 mM, Figura 8).
Las velocidades de reactivación de
2-deoxi-2-fluoroglucosil-BGL1
se determinaron en presencia de diferentes concentraciones de
linamarina controlando la recuperación de actividad después de 0,
10, 20 y 30 min (Figura 9). La recuperación de actividad seguía un
proceso de primer orden a cada concentración de linamarina.
Se evaluó la estabilidad térmica de la enzima
recombinante a diferentes temperaturas, presentándose como el
porcentaje de actividad enzimática respecto a una solución
enzimática mantenida a 4ºC. Los resultados obtenidos se resumen en
la Tabla 2 y se ilustran en la Figura 10. La enzima purificada
mostraba una alta estabilidad térmica, manteniéndose la mayoría
(aproximadamente el 50%) de la actividad a una temperatura que
oscilaba de 4-60ºC.
| Temp. ºC | % de actividad |
| 4 | 100 |
| 50 | 91,5 |
| 55 | 83,5 |
| 60 | 68 |
| 65 | 17,8 |
La transformación de discos de hoja mediada por
Agrobacterium dio lugar a plantas transgénicas de tabaco,
como se demostró por PCR (Figura 12) para la presencia del
transgen, por inmunotransferencia (Figura 13a-b)
para la presencia de la proteína y por ensayos de actividad
(Figura 14 y 15) para la presencia de actividad proteica. La tabla
3 a continuación resume los resultados.
| Construcción génica | BGL1 | Célula + BGL1 + HDEL | Célula + BGL1 |
| Número de regenerados | 33 | 14 | 27 |
| Positivos por PCR | 29 | 9 | 23 |
| Positivos en inmunotransferencia | 4 | 9 | 18 |
| Actividad positiva en gel | 0 | 9 | 18 |
De los 29 regenerados positivos por PCR
transformados con el ADNc que codifica BGL1, los cuales no
codifican un péptido señal, sólo en 4 la proteína BGL1 era
detectable por medio de inmunotransferencia, sin embargo, no se
detectaba actividad de BGL1 en ninguno de ellos. Se encontró que
BGL1 era más pequeña en peso molecular en comparación con la
beta-glucosidasa de A. niger de tipo natural
y que la BGL1 recombinante procesada que contenía un péptido señal.
Su tamaño aparente de aproximadamente 95 kDa está muy próximo a 92
kDa que es el peso molecular calculado de la
beta-glucosidasa de A. niger sin glicosilar.
Este resultado coincide con el hecho de que una proteína sin
péptido señal se espera que se libere desde los ribosomas y
permanezca en el citoplasto (42) sin glicosilar, ya que la
glicosilación de la proteína se lleva a cabo en el lumen del
retículo endoplásmico (43).
De los 9 regenerados positivos por PCR
transformados con un ADNc que codifica BGL1 y el péptido señal Cel1
y que además codifica el péptido de retención en el RE, HDEL,
todas las plantas expresaban cantidades detectables de proteína y
actividad BGL1.
De los 23 regenerados positivos por PCR
transformados con un ADNc que codifica la proteína BGL1 y el
péptido señal Cel1, pero no el péptido de retención en el RE, HDEL,
18 plantas expresaban cantidades detectables de proteína y
actividad BGL1.
Se incubaron extractos de plantas transgénicas
(CB14 y CBT21 con similar actividad BGL1, véase la Figura 15)
durante 9 horas a 37ºC, y se analizaron los compuestos aromáticos
mediante MEFS-CG/EM. Los resultados, que se resumen
en la Tabla 4 a continuación, muestran que con excepción del
alcohol oleico, la concentración de los diferentes compuestos
aromáticos aumenta en plantas transgénicas que expresan BGL1 activa
en comparación con el control. Además, parece que la
compartimentalización de BGL1 en el RE (o en realidad, cualquier
otro orgánulo subcelular), antes que su secreción al apoplasto, da
como resultado la mayor liberación de los compuestos aromáticos.
Es probable que esto sea el resultado de la localización de muchos
compuestos aromáticos en el apoplasto, de este modo, la secreción
de BGL1 al apoplasto provoca la liberación in vivo de
compuestos aromáticos, mientras que la compartimentalización de
BGL1 en el RE da como resultado la liberación de compuestos
aromáticos sólo en caso de rotura y descompartimentalización de la
célula.
CB14 - planta transgénica con
péptido señal Cel1 +
BGL1;
CBT21 - planta transgénica con
péptido señal Cel1 + BGL1 + péptido de retención en el RE, HDEL. a
- "-" significa que no hay diferencia significativa en la
concentración en comparación con el tipo natural. b - "+"
significa un incremento significativo en comparación con el tipo
natural. c - "- -" significa un descenso significativo en
comparación con el tipo natural, d - "++" significa un
incremento significativo en comparación con la respectiva marca
"+". ? - compuesto
desconocido.
\vskip1.000000\baselineskip
Aunque la invención se ha descrito junto con
realizaciones específicas de la misma, es evidente que serán
aparentes muchas alternativas, modificaciones y variaciones a los
expertos en la materia. Por consiguiente, se pretende abarcar todas
estas alternativas, modificaciones y variaciones que caen dentro del
espíritu y amplio alcance de las reivindicaciones adjuntas. Todas
las publicaciones, patentes, solicitudes de patente y secuencias
identificadas por los números de acceso del GenBank mencionados en
esta memoria descriptiva se incorporan en este documento en su
totalidad por referencia en la memoria descriptiva, al mismo grado
como si cada publicación, patente, solicitud de patente o secuencia
individual se indicara específica o individualmente para ser
incorporada en este documento mediante referencia. Además, la cita
o identificación de cualquier referencia en esta solicitud no se
interpretará como una admisión de que esta referencia está
disponible como técnica anterior a la presente invención.
1. Bause, E., y Legler, G.
(1974) Hoppe-Seyler's Z. Physiol.
Chem. 355, 438-442.
2. Beguin, P. y Aubert, J. P.
(1994) FEMS Microbiol. Rev. 13,
25-58.
3. Rombouts, F. M. y Pilnik, W.
(1978), Proc. Biochem. 8, 9-13.
4. Sternberg, D., Vijayakumar, P.
y Reese, E. T. (1977), Can. J. Microbiol. 23,
139-147.
5. Woodward, J. y Wiseman, A.
(1982), Enz. Microbiol. Technol. 4,
73-79.
6. Kerns, G., Dalchow, E.,
Klappach, G. y Meyer, D. (1986), Acta.
Biotechnol. 6 (4), 355-359.
7. Shoseyov, O., Bravdo, B.,
kan, R. y Chet, 1. (1988), Phytochem.
27 (7), 1973-1976.
8. Shoseyov, O., Bravdo, B.,
Siegel, D., Goldman, A., Cohen, S. y
Shoseyov, L. (1990), J. Agric. Food. Chem. 39,
1387-1390.
9. Dekker, R. F. H. (1986),
Biotechnol. Bioengin. 26, 1438-1442.
10. Kitpreechavanich, V. M.,
Hayashi, M. y Nagai, S. (1986), Agric.
Biol. Chem. 50,1703-1711.
11. Yeoh, H. H., Tan, T. K. y
Koh, S. K. (1986), Appl. Microbiol.
Biotechnol. 25, 25-28.
12. Crouzet, J. y Chassagne, D.
(1999) in Naturally Occurring Glycosides (Ikan. R., editor)
pág. 225-274, Wiley Press.
13. Prade, H., L. F. Mackenzie y
S. G. Withers (1998) Carbohyd. Res. 305,
371-381.
14. Zarevucka M., Vacek, M.,
Wimmer, Z., Demnerova, K. y Mackova, M.
(1998) Chirality 10, 676-68.
15. Yi, Q., Sarney, D. B.,
Khan, J. A. y Vulfson, E. N. (1998)
Biotechnol. Bioeng. 60, 385-390.
16. McCleary, B. V. y Harrington,
J. (1988), Methods Enzymology, 160,
575-583.
17. Watanabe, T., Sato, T.,
Yoshioka, S., Koshijima, T. y Kuwahara, M.
(1992), Eur. J. Biochem. 209,
651-659.
18. Unno, T., Ide, K.,
Yazaki, T., Tanaka, Y., Nakakuki, T. y
Okada, G. (1993), Biosci. Biotech. Biochem. 57
(12), 2172-2173.
19. Le Traon, M. M. P. y Pellerin
P., (1998) Enz. Micro. Technol., 22 (5)
374-382.
20. Penttila, M. E., Nevalainen,
H. K. M., Raynal, A. y Knowles, J. K. C.,
(1984), Mol. Gen. Genet. 194,
494-499.
494-499.
21. Henrissat, B. y Bairoch, A.
(1996) Biochem. J. Lett. 316,
695-696.
22. Sinnott, M. L. (1990) Chem.
Rev. 90,1171-1202.
23. McCarter, J. y Withers, S. G.
(1994) Curr. Opin. Struct. Biol. 4,
885-892.
24. Davies, G., Sinnott, M. L. y
Withers, S. G. (1998) en Biological Catalysis
(Sinnott, M. L., editor) Volumen 1, pág. 119-208,
Academic Press.
25. Legler, G., Roeser, K. R. e
Illig, H. K. (1979) Eur. J. Biochem. 101,
85-92.
26. Roeser, K. R. y Legler, G.
(1981) Biochem. Biophys. Acta. 657,
321-333.
27. Legler, G., Sinnott, M. L. y
Withers, S. G. (1980) J. Chem. Soc., Perkin
Trans. II, 1376-1383.
28. Cleveland, D. W., Fischer, S.
G., Kirschner, M. W. y Laemmli, U. K. (1977),
J. Biol. Chem. 252 (3),
1102-1106.
1102-1106.
29. Murray, M. G. y Thompson, W.
F. (1980), Nucl. Acids Res. 8,
4321-4325.
30. Ito, H., Fukuda, Y.,
Murata, K. y Kimura, A. (1983), J.
Bacteriol. 153(1), 163-168.
31. Wong, A. W., He, S.,
Grubb, J. H., Sly, W. S. y Withers S. G.
(1998), J. Biol. Chem. 273,
34057-34062.
32. Lipman, D. J. y Pearson, W. R.
(1985) Science, 227, 1435-1441.
33. Legler, G. (1968)
Hoppe-Zeyler's Z. Physiol. Chem. 349,
767-774.
34. Hrmova, M. y Fincher, G. B.
(1996) J. Biol. Chem. 271,
5277-5286.
35. Iwashita K., Todoroki, M.,
Kimura, H., Shimoi, H. e Ito, K.(1998)
Biosci. Biotechnol. and Biochem. 62 (10),
1938-1946.
36. Rlow E. y Lane D.
(1988) Antibodies, a laboratory manual. Cold Spring
Harbor Laboratory, Cold Spring Harbor, Nueva York.
37. Siegel D., Marton I.,
Dekel M., Bravdo B. A., He S. M.,
Wither S. G., Shoseyov O., 2000, Cloning,
expression, characterization, and nucleophile identification of
family 3, Aspergillus niger beta-glucosidase.
J. Biol. Chem. 275 (7), 4973-4980.
38. Engelen F. A. V., Molthoff J.
W., Conner A. J., Nap J. P., Pereira A y
Stiekema W., 1995, pBINPLUS: an improved plant
transformation vector based on pBIN19. Transgenic Res. 4,
288-290.
39. Shani Z., Dekel M.,
Tsabary G., Shoseyov, 1997, Cloning and
characterization of elongation specific endo-1
4-beta-glucanase (Cel1) from
Arabidopsis thaliana, Plant Molecular Biol. 34:
837-842.
40. Nagy F., Kay S. A. K., Chua
N. H., 1989, Analysis of gene expression in transgenic
plants. In Plant Molecular Biology: manual editado por Gelvin y
col., Kluwer Academic Publishers.
41. Clark T. J., Bunch J. E.,
1997, Qualitative and quantitative analysis of flavor
additives on tobacco products using
SPME-GC-Mass Spectroscopy. J.
Aagric. Food Chem. 45 (3), 844-849.
42. Lewin B., 1994, The apparatus
for protein localization, en Gene V, Oxford University Press. Pág.:
279-314.
43. Prodi J. A., 2000, The role of
N-oligosaccharide endoplasmic reticulum processing
reactions in glycoprotein folding and degradation. Biochem.
J., 348, 1-13.
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº 1:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 2.583
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: doble
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº 1:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº 2:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 860
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº 2:
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº 3:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 3.885
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: doble
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº 3:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº 4:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 6
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº 4:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Ser Pro Pro Tyr Tyr Pro}
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº 5:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 16
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº 5:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipSNCCNCCNTA YTAYCC
\hfill16
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº 6:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 8
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº 6:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Gln Pro Ile Leo Pro Ala Gly Gly}
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº 7:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 21
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº 7:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipTCCIGCNGGN ARDATNGGYT G
\hfill21
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº 8:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 34
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº 8:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipAAACCATGGC TGATGAATTG GCATACTCCC CACC
\hfill34
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº 9:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 33
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº 9:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipAAAGGATCCT TAGTGAACAG TAGGCAGAGA CGC
\hfill33
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº 10:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 19
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº 10:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Asp Glu Leo Ala Tyr Ser Pro Pro Tyr Tyr Pro
Ser Pro Trp Ala}
\sac{Asn Gly Gln Gly Asp}
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº 11:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 25
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº 11:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Val Leu Lys His Lys Asn Gly Val Pise Thr
Ala Thr Asp Asn Trp}
\sac{Ala Ile Asp Gln Ile Glu Ala Leo Ala
Lys}
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº 12:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 21
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº 12:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Gly Ala Thr Asp Gly Ser Ala Gln Pro Ile Leu
Pro Ala Gly Gly}
\sac{Gly Pro Gly Gly Asn Pro}
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº 13:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 3.212
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: doble
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº 13:
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº 14:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 841
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº 14:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº 15:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 3.329
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: doble
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº 15:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº 16:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 880
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº 16:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº 17:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 4
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº 17:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{His Asp Glu Leu}
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº 18:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 3.338
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: doble
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº 18:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº 19:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 883
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº 19:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº 20:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 23
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº 20:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipCAGTGACCGT GGATGCGACA ATG
\hfill23
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº 21:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 40
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº 21:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipAGAGACGGAT GACAAGTACT ACTTGAAATT GGGCCCAAAA
\hfill40
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº 22:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 23
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº 22:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipCAGTGACCGT GGATGCGACA ATG
\hfill23
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº 23:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 33
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº 23:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipAAAGGATCCT TAGTGAACAG TAGGCAGAGA CGC
\hfill33
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA ID SEC Nº 24:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 4
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: ID SEC Nº 24:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{His Asp Glu Leu}
Claims (24)
1. Un procedimiento para aumentar el nivel de
al menos una sustancia de fermentación en un producto de
fermentación, comprendiendo el procedimiento la etapa de fermentar
un material inicial de fermentación que contiene glucosa derivado
de una planta mediante una célula de levadura, sobreexpresando
dicha planta una construcción de ácido nucleico que incluye un
polinucleótido genómico, complementario o compuesto que codifica un
polipéptido que tiene una secuencia de aminoácidos como la que se
muestra en la ID SEC Nº 2, teniendo dicho polipéptido una actividad
catalítica \beta-glucosidasa, aumentando de este
modo, el nivel de la al menos una sustancia de fermentación en el
producto de fermentación.
2. Un procedimiento para aumentar el nivel de
al menos una sustancia aromática en un producto derivado de una
planta, comprendiendo el procedimiento la etapa de incubar un
material inicial de una planta que contiene glucosa con una célula
de levadura, sobreexpresando dicha planta una construcción de ácido
nucleico que incluye un polinucleótido genómico, complementario o
compuesto que codifica un polipéptido que tiene una secuencia de
aminoácidos como la que se muestra en la ID SEC Nº 2, teniendo
dicho polipéptido una actividad catalítica
\beta-glucosidasa, incrementando, de este modo, el
nivel de la al menos una sustancia aromática en el producto
derivado de la planta.
3. El procedimiento de la reivindicación 2, en
el que dicho producto derivado de la planta es un producto de
fermentación.
4. Un procedimiento para aumentar el nivel de
glucosa libre en un material inicial de fermentación que contiene
glucosa derivado de una planta, comprendiendo el procedimiento la
etapa de fermentar el material inicial de fermentación que contiene
glucosa derivada de planta mediante una célula, sobreexpresando
dicha planta una construcción de ácido nucleico que incluye un
polinucleótido genómico, complementario o compuesto que codifica un
polipéptido que tiene una secuencia de aminoácidos como la que se
muestra en la ID SEC Nº 2, teniendo dicho polipéptido una actividad
catalítica \beta-glucosidasa, incrementando, de
este modo, el nivel de glucosa libre en la planta.
5. Un procedimiento para aumentar el nivel de
glucosa libre en una planta, comprendiendo el procedimiento la
etapa de sobreexpresar en la planta una construcción de ácido
nucleico que incluye un polinucleótido genómico, complementario o
compuesto que codifica un polipéptido que tiene una secuencia de
aminoácidos como la que se muestra en la ID SEC Nº 2, teniendo
dicho polipéptido una actividad catalítica
\beta-glucosidasa, incrementando, de este modo,
el nivel de glucosa libre en la planta.
6. Un procedimiento para producir un alcohol,
comprendiendo el procedimiento la etapa de fermentar un material
inicial de fermentación que contiene glucosa derivado de una planta
mediante una célula, sobreexpresando dicha planta una construcción
de ácido nucleico que incluye un polinucleótido genómico,
complementario o compuesto que codifica un polipéptido que tiene
una secuencia de aminoácidos como la que se muestra en la ID SEC Nº
2, teniendo dicho polipéptido una actividad catalítica
\beta-glucosidasa, y extraer el alcohol de la
misma.
7. Un procedimiento para producir una planta
aromática, comprendiendo el procedimiento la etapa de sobreexpresar
en la planta una construcción de ácido nucleico que incluye un
polinucleótido genómico, complementario o compuesto que codifica un
polipéptido que tiene una secuencia de aminoácidos como la que se
muestra en la ID SEC Nº 2, teniendo dicho polipéptido una actividad
catalítica \beta-glucosidasa, aumentando, de este
modo, el aroma que difunde la planta.
8. El procedimiento de la reivindicación 7, en
el que la sobreexpresión de dicha construcción de ácido nucleico
se realiza de manera específica de tejido.
9. El procedimiento de la reivindicación 7, en
el que la sobreexpresión de dicha construcción de ácido nucleico
se limita a al menos un tejido seleccionado entre el grupo
constituido por la flor, el fruto, la semilla, la raíz, el polen y
las hojas.
10. Un procedimiento para aumentar el nivel de
al menos una sustancia de fermentación en un producto de
fermentación, comprendiendo el procedimiento la etapa de fermentar
un material inicial de fermentación que contiene glucosa derivado
de una planta mediante una célula de levadura, sobreexpresando
dicha planta una construcción de ácido nucleico que incluye un
polinucleótido genómico, complementario o compuesto que codifica un
polipéptido que tiene una actividad catalítica
\beta-glucosidasa y además codifica un péptido
señal que está en fase con dicho polipéptido, aumentando, de este
modo, el nivel de la al menos una sustancia de fermentación en el
producto de fermen-
tación.
tación.
11. El procedimiento de la reivindicación 10, en
el que dicho polinucleótido además codifica un péptido de retención
en el retículo endoplásmico que está en fase con dicho
polipéptido.
12. Un procedimiento para aumentar el nivel de
al menos una sustancia aromática en un producto derivado de una
planta, comprendiendo el procedimiento la etapa de incubar un
material inicial de una planta que contiene glucosa con una célula
de levadura, sobreexpresando dicha planta una construcción de ácido
nucleico que incluye un polinucleótido genómico, complementario o
compuesto que codifica un polipéptido que tiene una actividad
catalítica \beta-glucosidasa y que además
codifica un péptido señal que está en fase con dicho polipéptido,
aumentando, de este modo, el nivel de la al menos una sustancia
aromática en el producto derivado de una planta.
13. El procedimiento de la reivindicación 12, en
el que dicho polinucleótido además codifica un péptido de
retención en el retículo endoplásmico que está en fase con dicho
polipéptido.
14. El procedimiento de la reivindicación 12, en
el que dicho producto derivado de una planta es un producto de
fermentación.
15. Un procedimiento para aumentar el nivel de
glucosa libre en un material inicial de fermentación que contiene
glucosa derivado de una planta, comprendiendo el procedimiento la
etapa de fermentar el material inicial de fermentación que contiene
glucosa derivado de una planta mediante una célula, sobreexpresando
dicha planta una construcción de ácido nucleico que incluye un
polinucleótido genómico, complementario o compuesto que codifica un
polipéptido que tiene una actividad catalítica
\beta-glucosidasa y que además codifica un
péptido señal que está en fase con dicho polipéptido,
incrementando, de este modo, el nivel de glucosa libre en la
planta.
16. El procedimiento de la reivindicación 15, en
el que dicho polinucleótido además codifica un péptido de
retención en el retículo endoplásmico que está en fase con dicho
polipéptido.
17. Un procedimiento para aumentar el nivel de
glucosa libre en una planta, comprendiendo el procedimiento la
etapa de sobreexpresar en la planta una construcción de ácido
nucleico que incluye un polinucleótido genómico, complementario o
compuesto que codifica un polipéptido que tiene una actividad
catalítica \beta-glucosidasa y que además
codifica un péptido señal que está en fase con dicho polipéptido,
incrementando, de este modo, el nivel de glucosa libre en la
planta.
18. El procedimiento de la reivindicación 17, en
el que dicho polinucleótido además codifica un péptido de
retención en el retículo endoplásmico que está en fase con dicho
polipéptido.
19. Un procedimiento para producir un alcohol,
comprendiendo el procedimiento la etapa de fermentar un material
inicial de fermentación que contiene glucosa derivado de una planta
mediante una célula, sobreexpresando dicha planta una construcción
de ácido nucleico que incluye un polinucleótido genómico,
complementario o compuesto que codifica un polipéptido que tiene
una actividad catalítica \beta-glucosidasa y que
además codifica un péptido señal que está en fase con dicho
polipéptido, y extraer el alcohol de la misma.
20. El procedimiento de la reivindicación 19, en
el que dicho polinucleótido además codifica un péptido de
retención en el retículo endoplásmico que está en fase con dicho
polipéptido.
21. Un procedimiento para producir una planta
aromática, comprendiendo el procedimiento la etapa de sobreexpresar
en la planta una construcción de ácido nucleico que incluye un
polinucleótido genómico, complementario o compuesto que codifica un
polipéptido que tiene una actividad catalítica
\beta-glucosidasa y que además codifica un
péptido señal que está en fase con dicho polipéptido,
incrementando, de este modo, el aroma que difunde la planta.
22. El procedimiento de la reivindicación 21, en
el que dicho polinucleótido además codifica un péptido de
retención en el retículo endoplásmico que está en fase con dicho
polipéptido.
23. El procedimiento de la reivindicación 21, en
el que la sobreexpresión de dicha construcción de ácido nucleico
se realiza de manera específica de tejido.
24. El procedimiento de la reivindicación 21, en
el que la sobreexpresión de dicha construcción de ácido nucleico
se limita a al menos un tejido seleccionado entre el grupo
constituido por flor, fruto, semilla, raíz, polen y hojas.
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Families Citing this family (12)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| US7223902B1 (en) * | 1999-11-19 | 2007-05-29 | Yissum Research Development Company Of The Hebrew University Of Jerusalem | Method of producing recombinant Aspergillus niger β-glucosidase and an aroma spreading plant |
| EP1502945A4 (en) * | 2002-04-16 | 2005-10-19 | Amano Enzyme Inc | COMPOSITIONS FOR IMPROVING THE TASTE OF GRAPES MADE OF GRAPES OF ALCOHOLIC BEVERAGES |
| DK1622921T3 (da) | 2003-05-02 | 2010-09-13 | Novozymes Inc | Varianter af beta-glucosidaser |
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| US20070264419A1 (en) * | 2006-05-11 | 2007-11-15 | Virendra Kumar Tuli | Composition and method for translocation of aromatic compounds in plants |
| CN101492661B (zh) * | 2009-01-16 | 2011-06-15 | 江南大学 | 一种β-葡萄糖苷酶基因的克隆、表达及用于龙胆低聚糖的制备 |
| CA2762616C (en) | 2009-06-16 | 2015-08-18 | Codexis, Inc. | Beta-glucosidase variant enzymes and related polynucleotides |
| EP2590498A4 (en) * | 2010-07-09 | 2014-04-16 | Univ Central Florida Res Found | IMPROVED AGRONOMIC PROPERTIES THROUGH GENETICALLY IMPROVED PHYTOHORMONE MIRROR IN PLANTS |
| JP2017524363A (ja) | 2014-08-08 | 2017-08-31 | ザイレコ,インコーポレイテッド | アグリコシル化された酵素およびその使用 |
| CN106811477B (zh) * | 2017-02-06 | 2019-11-22 | 湖北工业大学 | 一种葡糖苷酶多拷贝表达提高里氏木霉纤维素酶酶活的方法 |
| CN108841740B (zh) * | 2018-07-10 | 2021-07-09 | 青岛蔚蓝生物集团有限公司 | 一种高产α-半乳糖苷酶的毕赤酵母菌株 |
| CN119630280A (zh) | 2022-05-14 | 2025-03-14 | 诺维信公司 | 用于预防、处理、抑制和/或消除植物病原性侵染和感染的组合物和方法 |
Family Cites Families (23)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| NL154600B (nl) | 1971-02-10 | 1977-09-15 | Organon Nv | Werkwijze voor het aantonen en bepalen van specifiek bindende eiwitten en hun corresponderende bindbare stoffen. |
| NL154598B (nl) | 1970-11-10 | 1977-09-15 | Organon Nv | Werkwijze voor het aantonen en bepalen van laagmoleculire verbindingen en van eiwitten die deze verbindingen specifiek kunnen binden, alsmede testverpakking. |
| NL154599B (nl) | 1970-12-28 | 1977-09-15 | Organon Nv | Werkwijze voor het aantonen en bepalen van specifiek bindende eiwitten en hun corresponderende bindbare stoffen, alsmede testverpakking. |
| US3901654A (en) | 1971-06-21 | 1975-08-26 | Biological Developments | Receptor assays of biologically active compounds employing biologically specific receptors |
| US3853987A (en) | 1971-09-01 | 1974-12-10 | W Dreyer | Immunological reagent and radioimmuno assay |
| US3867517A (en) | 1971-12-21 | 1975-02-18 | Abbott Lab | Direct radioimmunoassay for antigens and their antibodies |
| NL171930C (nl) | 1972-05-11 | 1983-06-01 | Akzo Nv | Werkwijze voor het aantonen en bepalen van haptenen, alsmede testverpakkingen. |
| US3850578A (en) | 1973-03-12 | 1974-11-26 | H Mcconnell | Process for assaying for biologically active molecules |
| US3935074A (en) | 1973-12-17 | 1976-01-27 | Syva Company | Antibody steric hindrance immunoassay with two antibodies |
| US3996345A (en) | 1974-08-12 | 1976-12-07 | Syva Company | Fluorescence quenching with immunological pairs in immunoassays |
| US4034074A (en) | 1974-09-19 | 1977-07-05 | The Board Of Trustees Of Leland Stanford Junior University | Universal reagent 2-site immunoradiometric assay using labelled anti (IgG) |
| US3984533A (en) | 1975-11-13 | 1976-10-05 | General Electric Company | Electrophoretic method of detecting antigen-antibody reaction |
| US4098876A (en) | 1976-10-26 | 1978-07-04 | Corning Glass Works | Reverse sandwich immunoassay |
| US4879219A (en) | 1980-09-19 | 1989-11-07 | General Hospital Corporation | Immunoassay utilizing monoclonal high affinity IgM antibodies |
| US5011771A (en) | 1984-04-12 | 1991-04-30 | The General Hospital Corporation | Multiepitopic immunometric assay |
| IL82980A (en) * | 1987-06-24 | 1991-09-16 | Yissum Res Dev Co | Endo-beta-glucosidase b1 derived from a.niger b1 used for the hydrolysis of monoterpene glycosides for enhancing flavour and fragrance |
| US5316931A (en) | 1988-02-26 | 1994-05-31 | Biosource Genetics Corp. | Plant viral vectors having heterologous subgenomic promoters for systemic expression of foreign genes |
| US5997913A (en) | 1990-12-10 | 1999-12-07 | Genencor International, Inc. | Method enhancing flavor and aroma in foods by overexpression of β-glucosidase |
| US5863783A (en) | 1991-03-27 | 1999-01-26 | Gist-Brocades, N.V. | Cloning and expression of DNA molecules encoding arabinan-degrading enzymes of fungal origin |
| US5281521A (en) | 1992-07-20 | 1994-01-25 | The Trustees Of The University Of Pennsylvania | Modified avidin-biotin technique |
| NZ328434A (en) * | 1997-07-24 | 1998-05-27 | Univ British Columbia Substitu | Coniferin beta-glucosidase cdna for modifying lignin content in plants |
| US6015703A (en) * | 1998-03-10 | 2000-01-18 | Iogen Corporation | Genetic constructs and genetically modified microbes for enhanced production of beta-glucosidase |
| US7223902B1 (en) * | 1999-11-19 | 2007-05-29 | Yissum Research Development Company Of The Hebrew University Of Jerusalem | Method of producing recombinant Aspergillus niger β-glucosidase and an aroma spreading plant |
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