ES2277018T3 - Metodo, ensayo y equipo para la cuantificacion de inhibidores de la proteasa del vih. - Google Patents

Metodo, ensayo y equipo para la cuantificacion de inhibidores de la proteasa del vih. Download PDF

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Abstract

Un método para cuantificar un inhibidor de la proteasa del VIH en una muestra, que incluya los siguientes pasos: combinar una proteasa del VIH, un conjugado que contenga un análogo de un inhibidor de la proteasa del VIH y una muestra que se sospecha que contiene un inhibidor de la proteasa del VIH, en la que la proteasa del VIH y el conjugado forman un complejo detectable; medir la cantidad de dicho complejo; relacionar la cantidad del mismo con una concentración de inhibidor de la proteasa del VIH de la muestra.

Description

Método, ensayo y equipo para la cuantificación de inhibidores de la proteasa del VIH.
La atención médica de pacientes que tienen el síndrome de la inmunodeficiencia adquirida (SIDA) ha mejorado sustancialmente gracias a la introducción de compuestos que funcionan como inhibidores potentes y específicos de la proteasa del VIH. Se cree que el virus de la inmunodeficiencia humana (VIH) es el agente causal responsable del SIDA, y que la enzima proteasa del VIH es responsable de catalizar procesos de escisión específicos en los polipéptidos gag y gag-pol del VIH. Un virus que sintetiza una proteasa inactivada por mutación generalmente no forma viriones infecciosos. La proteasa del VIH es, por lo tanto, una diana importante para la que se pueden diseñar fármacos contra el SIDA. Los inhibidores de la VIH proteasa pueden provocar una reducción o un cese de la actividad de la proteasa del VIH.
Actualmente, existen seis tipos de inhibidores de la proteasa del VIH aprobados por la Food and Drug Administration (FDA) para el tratamiento de pacientes con SIDA - amprenavir, indinavir, lopinavir, nelfinavir, ritonavir y saquinavir. Los tratamientos combinados que implican inhibidores de la proteasa del VIH y también inhibidores de la transcriptasa inversa del VIH son los fundamentos de los tratamientos recomendados actualmente para la infección por VIH. No todos los pacientes con SIDA muestran la misma respuesta óptima al régimen de tratamiento combinado. Puede haber gran variabilidad en la respuesta farmacológica entre los distintos pacientes. La relación entre la exposición sistémica a los inhibidores de la proteasa y el efecto antiviral ha sido respaldada por la acumulación de información clínica. Cuando se administra un régimen de tratamiento combinado a un paciente, las interacciones farmacocinéticas potenciales fármaco-fármaco pueden mejorar o debilitar el tratamiento. El cumplimiento del paciente, cuando se relaciona directamente con el mantenimiento de los niveles de fármaco adecuados, también puede afectar al resultado del tratamiento.
Por lo tanto, es deseable medir las concentraciones de los inhibidores de la proteasa del VIH en los pacientes con SIDA para asegurar que la exposición al fármaco es suficiente para mantener actividad antiviral. Además, la cuantificación de los inhibidores de la proteasa del VIH en muestras biológicas de los individuos en estudio es crucial en el proceso de desarrollo del fármaco. Otras mediciones de interés en el tratamiento del VIH incluyen la medición de los metabolitos de los inhibidores de la proteasa del VIH, y la medición de los anticuerpos anti-proteasa del VIH. La presencia y cantidad de metabolitos pueden proporcionar información respecto a la efectividad del tratamiento terapéutico. La presencia de anticuerpos anti-proteasa del VIH indica infección de un paciente por VIH, y la detección de los anticuerpos puede ser, por lo tanto, utilizada para diagnosticar la posible infección.
Normalmente, se cuantifican los inhibidores de la proteasa del VIH en muestras del paciente mediante métodos de ensayo que requieren instrumentos sofisticados y costosos, que hacen que el análisis sea difícil de realizar en un entorno clínico. Por ejemplo, las muestras de plasma pueden analizarse simultáneamente para la presencia de numerosos compuestos inhibidores de la proteasa del VIH utilizando métodos cromatográficos como la cromatografía líquida de alta resolución (del inglés, HPLC, high-performance liquid chromatography) unida a la espectrometría de masas en tándem (HPLC/EM/EM). Véase, por ejemplo, Poirier, J.M., et al., Ther. Drug Monit. 22:465-473 (2000); Marzonlini, C., et al., J. Chromatogr. 740:43-58 (2000); y Remmel, R.P., et al., Clin. Chem. 46(1):73-81 (2000). Las muestras de plasma normalmente están sujetas a procedimientos de extracción de fase sólida previos al examen. Por tanto, el plasma no se analiza directamente sino que debe ser modificado, añadiendo complejidad y costes al
análisis.
Los radioinmunoensayos normalmente implican la interacción competitiva entre un conjugado radiomarcado que contiene un análogo de un inhibidor de la proteasa del VIH y cualquier inhibidor de la proteasa del VIH libre en la muestra. El receptor es normalmente un anticuerpo para el inhibidor de la proteasa del VIH en cuestión. En un ejemplo de radioinmunoensayo, se observa que un análogo de un inhibidor de la proteasa del VIH marcado con yodo-125 compite con cualquier compuesto inhibidor del VIH en una muestra de plasma de un paciente para la unión con un anticuerpo. Se analiza el nivel de radiactividad de los complejos de anticuerpos precipitados para determinar la concentración del compuesto inhibidor de la proteasa del VIH. Véase, por ejemplo, Wiltshire, H.R., et al. Analyt. Biochem. 281:40 105-114 (2000). En un ejemplo de un ensayo que utiliza indirectamente un radioinmunoensayo, la proteasa del VIH se puede añadir a la muestra juntamente con el sustrato para la proteasa del VIH. La escisión del sustrato puede medirse mediante radioinmunoensayo utilizando un anticuerpo que específicamente se una a los productos de escisión. Una ausencia de productos de escisión indica la presencia de anticuerpos anti-proteasa del VIH. Véase, por ejemplo, la patente estadounidense núm. 5 171 662. La patente europea núm. EP-A2-1 207 394 revela un inmunoensayo para los inhibidores de la proteasa del VIH en el que un anticuerpo selectivo para un inhibidor de la proteasa concreto se utiliza como receptor para el inhibidor de la proteasa del VIH.
Todos estos métodos para medir inhibidores o sus metabolitos han obtenido un éxito limitado. Hay, por lo tanto, la necesidad de hallar un método mejorado para cuantificar los inhibidores de la proteasa del VIH o sus metabolitos de una muestra biológica. Es deseable que dicho método pueda llevarse a cabo de manera fácil y rápida con los instrumentos analíticos actualmente disponibles en entornos clínicos.
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Resumen
En un aspecto de la invención, existe un método para cuantificar un inhibidor de la proteasa del VIH en una muestra que consiste en combinar una proteasa del VIH, un conjugado que conste de un análogo de un inhibidor de la proteasa del VIH y una muestra que se sospecha que contiene un inhibidor de la proteasa del VIH. Entonces la proteasa del VIH y el conjugado forman un complejo detectable, se mide la cantidad del complejo detectable, y se relaciona la cantidad de dicho complejo detectable con la concentración de inhibidor de proteasa del VIH en la muestra.
En otro aspecto de la invención, existe un método para cuantificar un inhibidor de la proteasa del VIH en una muestra que consiste en combinar una proteasa del VIH, un conjugado que conste de un transportador y al menos dos análogos de inhibidores unidos al transportador, y una muestra que se sospecha que contiene un inhibidor de la proteasa del VIH. Entonces, la proteasa del VIH, que está inmovilizada en la superficie de una micropartícula, y el conjugado experimentan un proceso de aglutinación, se mide la aglutinación y se relaciona el nivel de aglutinación con una concentración del inhibidor de la proteasa del VIH en la muestra.
En otro aspecto más de la invención, existe un método para cuantificar un inhibidor de la proteasa del VIH en una muestra que consiste en combinar un transportador multivalente que consta de, al menos, dos enzimas proteasa del VIH, un conjugado que consta de una micropartícula y de un análogo de un inhibidor de la proteasa del VIH, y una muestra que se sospecha que contiene un inhibidor de la proteasa del VIH. Entonces, la proteasa del VIH y el conjugado experimentan un proceso de aglutinación, siendo la muestra suero o plasma humano; se mide la aglutinación; y se relaciona el nivel de aglutinación con una concentración del inhibidor de la proteasa del VIH en la muestra.
En otro aspecto más de la invención, existe un método para cuantificar un inhibidor de la proteasa del VIH en una muestra que consiste en combinar una proteasa del VIH, un conjugado que conste de un marcador y un análogo de un inhibidor de la proteasa del VIH unido al marcador, y una muestra que se sospecha que contiene un inhibidor de la proteasa del VIH. Entonces, la proteasa del VIH y el conjugado forman un complejo detectable, se mide la cantidad de complejo detectable mediante la monitorización de los cambios en la polarización de la fluorescencia, y se relaciona la cantidad del complejo detectable con una concentración del inhibidor de la proteasa del VIH en la muestra.
Breve descripción de las figuras
La Figura 1 es un gráfico de absorbancia en forma de función de la concentración de un conjugado de amprenavir/aminodextrano que contiene un promedio de 3,75 porciones de análogo de amprenavir por aminodextrano.
La Figura 2 es un gráfico de absorbancia en forma de función de la concentración de un conjugado de amprenavir/aminodextrano que contiene un promedio de 2,15 porciones de análogo de amprenavir por aminodextrano.
La Figura 3 es un gráfico de absorbancia en forma de función de la concentración de amprenavir a distintas concentraciones en suero humano normal, que utiliza un ensayo competitivo que incluye el conjugado de la Figura 1.
Descripción detallada
La presente invención se refiere a métodos para la cuantificación de un inhibidor de la proteasa del VIH en una muestra que incluyen un sistema de ensayo para determinar la concentración de inhibidores de la proteasa del VIH (VIH-IP) en la muestra. El sistema incluye enzima proteasa del VIH (VIH-PR), un conjugado y una muestra que se sospecha que contiene VIH-IP. De acuerdo con la invención, el conjugado y los VIH-IP presentes en la muestra compiten por la unión a la VIH-PR. Al entrar en contacto la VIH-PR con el conjugado en el caso de ser una muestra que contiene VIH-IP, se observa un cambio en los niveles de VIH-PR unida al conjugado, y esto se puede medir y correlacionar con la concentración de VIH-IP en la muestra.
El término "proteasa del VIH" (VIH-PR) se refiere a una enzima responsable del procesamiento postraduccional de los polipéptidos gag y gag-pol del VIH. VIH-1 y VIH-2 son dos tipos de VIH que codifican para VIH-PR. VIH-1 es un virus altamente variable que muta muy fácilmente, dando como resultado muchos tipos de VIH-1. Estas variedades se pueden clasificar en distintos grupos (por ejemplo, M y O) y en distintos los subtipos. Así, como ejemplos de la proteasa del VIH se incluyen la VIH-1 PR y la VIH-2 PR, así como VIH-PR sintéticas.
El término "inhibidor de la proteasa del VIH" (VIH-IP) incluye compuestos inhibidores de la proteasa del VIH, metabolitos activos de compuestos inhibidores de la proteasa del VIH y anticuerpos anti-proteasa del VIH. Como ejemplos de compuestos inhibidores de la proteasa del VIH y metabolitos de los mismos se incluyen péptidos, compuestos orgánicos, compuestos organometálicos y complejos metálicos, que pueden reducir o eliminar la actividad de la proteasa del VIH. Ejemplos específicos de compuestos inhibidores de la proteasa del VIH incluyen los compuestos actualmente aprobados por la FDA para el tratamiento de pacientes con SIDA; a saber, amprenavir, indinavir, lopinavir, nelfinavir, ritonavir y saquinavir. Un anticuerpo anti-proteasa del VIH es un anticuerpo que tiene una afinidad de unión específica por la enzima de la proteasa del VIH excluyendo otras sustancias. El término "anticuerpo" incluye anticuerpos policlonales, anticuerpos monoclonales y fragmentos de anticuerpos.
El término "analito" se refiere a una sustancia o grupo de sustancias de las que se determina su presencia o cantidad en una muestra, incluyendo cualquier fármaco o derivado, hormona, antígeno proteico u oligonucleótido. En el presente sistema de ensayo, el analito es un inhibidor de la proteasa del VIH, incluyendo un compuesto inhibidor de la proteasa del VIH, un metabolito de un compuesto inhibidor de la proteasa del VIH o un anticuerpo anti-proteasa del VIH.
El término "receptor" se refiere a una pareja de unión específica de un analito, y se propone incluir cualquier sustancia, o grupo de sustancias, que tengan una afinidad de unión específica por el analito excluyendo otras sustancias. Ejemplos de receptores incluyen enzimas y anticuerpos. En el presente sistema de ensayo, la proteasa del VIH actúa como receptor para un VIH-IP o para un conjugado que contenga un análogo de un VIH-IP.
El término "análogo de un VIH-IP" se refiere a una sustancia, o grupo de sustancias, que se comportan esencialmente de la misma manera que un inhibidor de la proteasa del VIH con respecto a la afinidad de unión por la proteasa del VIH. Un análogo de un VIH-IP normalmente es un VIH-IP que se ha modificado o del que se ha obtenido un derivado de manera que imita la interacción del VIH-IP con VIH-PR. Un análogo de un VIH-IP por lo tanto incluye cualquier modificación de un VIH-IP. Por ejemplo, un análogo de un VIH-IP puede ser idéntico al VIH-IP excepto por la presencia de una unión entre el VIH-IP y otra sustancia, como un átomo, un grupo de unión, un marcador o una sustancia transportadora. Ejemplos de análogos de VIH-IP incluyen análogos de compuestos inhibidores de la proteasa del VIH, análogos de metabolitos de compuestos inhibidores de la proteasa del VIH y análogos de anticuerpos anti-proteasa del VIH.
El término "conjugado" se refiere a una composición formada por un análogo de un VIH-IP unido a otra sustancia, por ejemplo un transportador, un marcador o una fase sólida, y es capaz de unirse específicamente a un receptor. Por ejemplo, un conjugado que contenga un análogo de VIH-IP puede unirse específicamente a VIH-PR a través del análogo. Se puede preparar un conjugado que contenga un análogo de un VIH-IP como se describe, por ejemplo, en la solicitud co-dependiente con número de serie 10/192 052 presentada el 7 de julio de 2002.
El término "marcador" se refiere a una sustancia identificativa que, cuando se une a un análogo de un VIH-IP como parte de un conjugado, se puede utilizar para detectar la unión del conjugado con el receptor apropiado. Un marcador puede estar unido al análogo de un VIH-IP directamente o indirectamente a través de una región de unión o puente. Ejemplos de marcadores utilizados habitualmente incluyen marcadores fluorescentes, como las fluoresceínas y rodaminas; compuestos luminiscentes, como los dioxetanos y la luciferina; isótopos radiactivos, como el ^{125}I; marcadores quimioluminiscentes, como los ésteres de acridina; marcadores electroquimioluminiscentes, como el rutenio bipiridilo; enzimas, como las peroxidasas y las beta-galactosidasas; y marcadores de sustrato enzimático.
El término "transportador" se refiere a una sustancia, normalmente una proteína, que puede unirse con uno o más análogos de un VIH-IP y así permitir la detección de cualquier unión del análogo del VIH-IP con un receptor. Ejemplos de transportadores incluyen proteínas como la albúmina sérica bovina (del inglés, BSA), polisacaridasas naturales o sintéticas, y polímeros como el aminodextrano (AMD).
El término "complejo detectable" se refiere a un complejo formado por un receptor y un conjugado, cuya cantidad puede medirse mediante la monitorización de los cambios en la señal del complejo o de sus alrededores. El cambio en la señal puede ser, por ejemplo, la formación de un precipitado medible; un cambio en una característica de una absorbancia, emisión, luminiscencia o fluorescencia espectroscópicas; o un cambio en las propiedades eléctricas.
El término "péptido" se refiere a cualquier compuesto formado por la unión de dos o más aminoácidos mediante enlaces amida (peptídico), normalmente un polímero de \alpha-aminoácidos en los que el grupo \alpha-amino de cada residuo de aminoácido (excepto el NH_{2} terminal) está unido al grupo \alpha-carboxilo del siguiente residuo en cadena lineal. Los términos péptido, polipéptido y poli(aminoácido) se utilizan como sinónimos en este documento para referirse a este tipo de compuestos sin restricción de tamaño. A los mayores miembros de esta clase se les denomina proteínas.
El término "enlace covalente" se refiere a un enlace químico entre dos especies, y puede incluir enlaces simples o múltiples. Por otra parte, el término "enlace no covalente" se refiere a interacciones químicas o físicas que no forman enlaces químicos. Por lo tanto, los enlaces no covalentes incluyen interacciones hidrófobas/hidrófilas, enlaces de hidrógeno, interacciones de van der Waals y, también, interacciones metálicas o iónicas. Por ejemplo, la adsorción de una sustancia a una superficie es no covalente, mientras que la unión de una sustancia a una superficie, p. ej. a través de uniones carbodiimida o N-hidroxi succinimida (NHS), es covalente.
El término "muestra biológica" se refiere a un líquido corporal obtenido de un organismo vivo. Una muestra biológica es preferiblemente una mezcla acuosa, por ejemplo orina, sangre total, plasma, suero, saliva, semen, heces, esputo, líquido cefalorraquídeo, lágrimas, mucosidad o similares, pero preferiblemente plasma o suero, y más preferiblemente plasma humano o suero humano. Cualquier muestra que se sospecha que contiene un VIH-IP puede analizarse por el método de la presente invención. Si se desea, se puede pretratar la muestra, incluyendo pretratamientos por disolución, filtración o centrifugación. La muestra se puede preparar en cualquier medio conveniente que no interfiera con el ensayo, y se prefiere que sea un medio acuoso.
El término "material de calibrado" se refiere a cualquier material estándar o de referencia que contiene una cantidad conocida del analito a medir. La muestra que se sospecha que contiene el analito y el material de calibrado se deben ensayar bajo unas condiciones lo más parecidas posibles. La concentración de analito se calculará por comparación de los resultados obtenidos con la muestra desconocida con los resultados obtenidos con el estándar.
El término "fase sólida" se refiere a una sustancia no fluida, que incluye partículas (incluyendo micropartículas y microesferas) hechas de materiales como polímero, metal (partículas ferromagnéticas, paramagnéticas), vidrio o cerámica; geles como el gel de sílice, de alúmina o geles poliméricos; capilares, que pueden estar formados por polímero, metal, vidrio o cerámica; zeolitas y otras sustancias porosas; electrodos; placas de microtitulación; tiras sólidas; y cubetas, tubos o bien otros recipientes para muestras de espectrometría. Un componente de fase sólida de un ensayo se distingue de las superficies sólidas inertes con las que el ensayo puede estar en contacto en que una "fase sólida" contiene al menos una región en su superficie que está destinada a interaccionar con uno o más de los componentes de la mezcla de ensayo.
Un sistema de ensayo para determinar la concentración de inhibidores de la proteasa del VIH (VIH-IP) en una muestra puede incluir VIH-PR y un conjugado que contenga un análogo de un VIH-IP. El conjugado se puede unir a la VIH-PR para formar un complejo detectable; sin embargo, cualquier VIH-IP presente también podrá unirse a la VIH-PR, compitiendo por tanto con el conjugado. Cuando entra en contacto la VIH-PR con el conjugado y una muestra que contiene VIH-IP, los niveles de VIH-PR unidos al conjugado cambian, y este cambio se puede medir y correlacionar con la concentración de los VIH-IP en la muestra.
En este formato de ensayo, la enzima proteasa del VIH actúa como receptor para el conjugado y para los inhibidores de la proteasa del VIH de la muestra. Normalmente, un inmunoensayo convencional utiliza un anticuerpo que se una específicamente al analito y a la porción análoga del analito de un conjugado. Véase, por ejemplo, la solicitud de publicación de patente europea EP 1 207 394 A2. Este método puede requerir la preparación de anticuerpos únicos para cada variedad de VIH-IP a analizar. Mediante la utilización de VIH-PR como receptor, cualquier tipo de VIH-IP puede cuantificarse utilizando un único sistema de ensayo, ya que la VIH-PR será inhibida por cualquier VIH-PI de una muestra. Este formato puede aportar características de ensayo diagnóstico ventajosas. Por ejemplo, una muestra que contenga una variedad de VIH-IP distintos puede analizarse en un solo ensayo, permitiendo la cuantificación oportuna de los niveles globales de VIH-IP de la muestra. Además, se puede utilizar un único tipo de conjugado para analizar una variedad de VIH-IP, lo que contribuye a la simplicidad del ensayo.
La VIH-PR puede estar presente en una mezcla de ensayo en forma de enzima libre, o puede estar unida a otras sustancias, como una superficie de una fase sólida o a un transportador. La utilización de VIH-PR como receptor puede aplicarse tanto en ensayos homogéneos como en heterogéneos. En un ensayo heterogéneo, un componente de fase sólida del ensayo se separa del resto de la mezcla líquida del ensayo antes de realizar la medición de interés. Por el contrario, un ensayo homogéneo permite que se obtengan mediciones de la mezcla de ensayo completa, incluyendo la muestra.
La utilización de una fase sólida en un ensayo diagnóstico puede aportar una manera conveniente para localizar o separar componentes concretos de la mezcla de ensayo de manera que se obtengan las mediciones de interés. Se conoce una gran variedad de configuraciones de ensayo que incluyen la utilización de un componente de fase sólida, y éstos se pueden clasificar aproximadamente en heterogéneos u homogéneos. Los componentes de fase sólida, tanto en formato homogéneo u heterogéneo, pueden contener VIH-PR como fracción activa en la superficie de la fase sólida. Por lo tanto, la VIH-PR puede actuar como receptor capaz de unirse tanto a los VIH-IP como a los conjugados detectables.
La superficie de un componente de fase sólida se puede modificar para incluir VIH-PR por distintos métodos. Por ejemplo, la VIH-PR puede adsorberse a una superficie poniendo en contacto dicha superficie con una mezcla líquida que contenga la enzima VIH-PR. En otro ejemplo, un anticuerpo que se una a VIH-PR sin ocultar lugares de unión cruciales de la enzima, se puede adsorber o unir a la superficie, y la VIH-PR posteriormente inmovilizarse en la superficie a través de su interacción con el anticuerpo. En otro ejemplo más se puede utilizar biotina, avidina o estreptavidina para inmovilizar una VIH-PR modificada que contenga la pareja de unión apropiada. En este ejemplo, puede ser conveniente modificar la VIH-PR con la fracción de biotina más pequeña y modificar la superficie sólida con avidina o estreptavidina. En otro ejemplo más, la VIH-PR se puede inmovilizar mediante uniones covalentes, como enlaces carbodiimida; enlaces tipo éster N-hidroxi succinimida (NHS); o bien por otras técnicas de uniones químicas. Véase, por ejemplo, Markgren, P.-O. et al., Analytical Biochemistry 265, 340-350 (1998).
Los componentes de fase sólida para ensayos heterogéneos pueden ser componentes estacionarios, como un tubo, tira, cubeta o placa de microtitulación, o puede ser un componente no estacionario, como microesferas y micropartículas. Las micropartículas también se pueden utilizar como fase sólida para formatos de ensayo homogéneos. Se puede utilizar una variedad de micropartículas que permitan la unión covalente o no covalente de proteínas o de otras sustancias. Dichas partículas incluyen partículas de polímero como poliestireno y polimetilmetacrilato, partículas de oro como nanopartículas de oro y coloides de oro, y partículas de cerámica como partículas de sílice, vidrio y óxidos de metal. Véase, por ejemplo, C.R. Martin et al. Analytical Chemistry - News & Features, May 1, 1998, 322A-327A.
Por ejemplo, los reactivos de micropartículas útiles se pueden formar por adsorción de la VIH-PR a la superficie de las micropartículas. Las micropartículas preferidas incluyen micropartículas de látex de poliestireno con un diámetro entre 0,1 y 1,0 micrómetros (\mum). La superficie de las micropartículas puede incluir grupos carboxilato (-COO^{-} y -COOH). Los grupos carboxilato se pueden introducir en superficies mediante, por ejemplo, reacciones de hidrólisis, tratamientos con un reactivo carboxilante, o mediante formación de monocapas autoensambladas (del inglés, self-assembled monolayers, SAMs) que contienen grupos carboxilato. Véase, por ejemplo, J.G. Chapman et al. J. Am. Chem. Soc., 122, 8303-8304 (2000). Por ejemplo, las micropartículas pueden contener grupos carboxilato en concentraciones que proporcionen un área de estacionamiento en la superficie de carboxilatos de 5 a 200 \ring{A}^{2}, o preferiblemente de 10 a 120 \ring{A}^{2}, que se define como el área de superficie de la micropartícula dividida entre el número total de grupos carboxilato de la superficie.
En un ejemplo de inmovilización de la VIH-PR, la enzima se adsorbe a las micropartículas de látex modificadas en los grupos carboxilato. Las micropartículas que contienen VIH-PR unida se separan de la mezcla de adsorción y se someten a ciclos continuos de lavado y centrifugación. Estas partículas modificadas se pueden almacenar a temperaturas reducidas, por ejemplo a 4ºC durante un máximo de dos semanas. Las mezclas acuosas utilizadas para la adsorción, lavado, o preparación de mezclas madre están tamponadas, preferiblemente a un pH entre 3,5 y 6,5. Si se utiliza una VIH-PR sintética más robusta, las condiciones de manejo y almacenamiento podrán ser más flexibles.
Un material de fase sólida, ya sea estacionario o no estacionario, que posea VIH-PR unida a su superficie, se puede utilizar en un ensayo competitivo para cuantificar los VIH-IP de una muestra. En un formato de ensayo competitivo, los VIH-IP de la muestra compiten con un conjugado por la unión con la VIH-PR inmovilizada, que funciona como receptor. La unión de la VIH-PR al conjugado da como resultado la formación de un complejo detectable. La medición de la cantidad de enzima unida, si solamente está el conjugado, en comparación con la cantidad unida en presencia de algún VIH-IP, se puede correlacionar con la cantidad de VIH-IP de la muestra que compite con el conjugado.
Un ejemplo de ensayo homogéneo que utiliza la enzima VIH-PR libre como receptor es la polarización de fluorescencia. En los ensayos de polarización de fluorescencia, el conjugado incluye un indicador fluorescente unido al análogo del VIH-IP. Este conjugado fluorescente compite con el VIH-IP de una muestra por la unión a la VIH-PR. Un conjugado que está unido a la VIH-PR muestra una polarización de fluorescencia diferente de la mostrada por un conjugado no unido. Por lo tanto, el complejo detectable se cuantifica o se mide mediante la monitorización del cambio en la polarización de fluorescencia de la mezcla de ensayo. El cambio en la señal de polarización de fluorescencia debido a la presencia de los VIH-IP se puede correlacionar con la cantidad de VIH-IP en la muestra. Véase, por ejemplo, Biochem. Biophys. Res. Comm. 5:299, 1961.
En general, las técnicas de polarización de fluorescencia se basan en el principio de que cuando un compuesto marcado con fluoresceína se excita mediante luz polarizada linealmente, emitirá fluorescencia en un grado de polarización inversamente relacionado con su tasa de rotación. Se conocen varios derivados de la fluoresceína a partir de los que se pueden preparar indicadores marcados con fluoresceína y están comercializados. La mayoría de derivados de fluoresceína derivan de la posición 5 o 6 de la fluoresceína (también se conocen como isómero I para la posición 5 e isómero II para la posición 6) e incluyen 5- o 6-N-hidroxisuccinimidilcarboxifluoresceína, 5-aminometilfluo-resceína y 5- o 6-dicloro-1,3,5-triazin-2-il-aminofluoresceína (DTAF). La señal de los inmunoensayos de polarización de fluorescencia se puede cuantificar en términos de unidades de milipolarización (mP), a partir de las que se puede determinar una curva de calibrado. La polarización de fluorescencia disminuye de manera regular cuando la concentración del analito aumenta, y la concentración del analito en la muestra se puede determinar por comparación con la curva de calibrado estándar. Los ensayos de polarización de fluorescencia, incluyendo procedimientos, instrumental y reactivos, se describen en las patentes estadounidenses de núm. 5 986 094, 5 070 025 y 4 868 132, y en la solicitud de patente europea núm. EP 0 745 602 A1.
En los ensayos de polarización de fluorescencia de los VIH-IP, la polarización de fluorescencia es una función de la concentración del analito, y, por lo tanto, es adecuada para cuantificar los compuestos inhibidores de la proteasa del VIH, metabolitos de los compuestos inhibidores de la proteasa del VIH y anticuerpos anti-proteasa del VIH. Cuando el conjugado y la VIH-PR se mezclan en ausencia de VIH-IP libres, la mayoría del conjugado se une a la VIH-PR. Como resultado, cuando el indicador unido se excita con luz polarizada en una longitud de onda de absorción determinada, la luz emitida a la longitud de onda de emisión permanece altamente polarizada. Sin embargo, si los VIH-IP están presentes en la muestra, estos competirán con el conjugado por unirse a la VIH-PR unida a las partículas. Por tanto, habrá más cantidad de indicador libre y la luz emitida será menos polarizada. En un ejemplo de ensayo de polarización de fluorescencia para VIH-IP, el conjugado incluye un análogo de VIH-IP unido a fluoresceína. La detección del complejo de VIH-PR y el conjugado incluye irradiar la muestra con luz a 489 nm y medir la polarización de la luz emitida a 520 nm.
Un ejemplo de ensayo homogéneo en el que el receptor de la VIH-PR está unido a una superficie de una fase sólida es la aglutinación de micropartículas. En los ensayos de aglutinación de micropartículas, el conjugado incluye una pluralidad de análogos del VIH-IP unidos a la sustancia transportadora. Este conjugado multivalente compite con cualquier VIH-IP de la muestra por unirse a una cantidad limitada de VIH-PR unida a micropartículas. Tan solo se pueden utilizar dos análogos de VIH-IP, de igual o distinto origen, unidos a un transportador, pero también puede unirse al transportador una mayor cantidad de análogos de VIH-IP. Los análogos de VIH-IP que se originan a partir de distintos VIH-IP deben ser competidores de los VIH-IP de la muestra. La naturaleza multivalente del conjugado da como resultado reacciones cruzadas y, por lo tanto, aglutinación de las micropartículas cuando el conjugado se une a la VIH-PR inmovilizada. El nivel de aglutinación de micropartículas que tiene lugar en ausencia de los VIH-IP se ve por tanto reducido por la presencia de cualquier VIH-IP en la muestra. El complejo detectable puede medirse o cuantificarse mediante gran variedad de técnicas de medición de la aglutinación que incluyen, por ejemplo, la medición de la turbidez por nefelometría, anisotropía angular y la dispersión cuasielástica de la luz. Las mediciones de turbidez, que pueden realizarse en un espectrofotómetro simple, detectan, por ejemplo, cambios en la absorbancia debido al tamaño de micropartícula relacionado con el grado de aglutinación. Véase, por ejemplo, la patente estadounidense núm. 4 480 042 y la solicitud de patente europea publicada.
Los ensayos de aglutinación de micropartículas también se pueden llevar a cabo utilizando un análogo de VIH-IP unido a la superficie de micropartículas, en combinación con un transportador unido a diversas enzimas VIH-PR. El conjugado en este ensayo contiene el análogo del VIH-IP unido a la micropartícula, y este conjugado compite con cualquier VIH-IP de la muestra para unirse a la enzima VIH-PR en el transportador multivalente. El complejo detectable se puede medir mediante técnicas de aglutinación, como se ha descrito anteriormente. Los análogos de VIH-IP se pueden unir a superficies de fase sólida, por ejemplo, a través de uniones covalentes o mediante la adsorción de un análogo de VIH-IP que está unido a un transportador como sería la albúmina sérica bovina. Los transportadores unidos a VIH-IP y la adsorción de dichos transportadores a superficies de fase sólida para formar conjugados se describen, por ejemplo, en la solicitud co-dependiente de número de serie 09/712 525 presentada el 14 de noviembre de 2000.
Para un ensayo homogéneo de VIH-IP que utiliza la aglutinación de micropartículas, puede ser beneficioso emplear un tampón acuoso que tenga un pH entre 3,5 y 6,5, o preferiblemente entre 4,5 y 5,5. Los tampones útiles pueden incluir cloruro sódico en una concentración entre 0,1 y 1 molar (M), o entre 0,2 y 0,8 M, y también pueden incluir un acelerador de la aglutinación. Los aceleradores de la aglutinación incluyen, por ejemplo, ácido poliacrílico (PAA), polivinilpirrolidona (PVP) y dextrán sulfato sódico, y pueden estar presentes en la muestra a una concentración de entre el 0,5 y el 3% o, preferiblemente, entre el 0,8 y el 2,5%.
Los ensayos heterogéneos se pueden utilizar para cuantificar VIH-IP. Los formatos heterogéneos preferidos incluyen ensayos de receptores en fase sólida unidos a enzimas, en los que el conjugado incluye un análogo de VIH-IP unido a una enzima. Los ensayos de receptores en fase sólida unidos a enzimas se pueden realizar de forma competitiva o no competitiva. En un formato competitivo, el análogo del inhibidor unido a la enzima compite con cualquier analito de una muestra por la unión a una cantidad limitada de receptor que está inmovilizado en una fase sólida. Se pueden utilizar distintas técnicas para la detección de un marcador enzimático. Normalmente, las enzimas son responsables de la conversión de un sustrato en un producto que se pueda detectar fácilmente, ya sea por su color o a través de otra propiedad espectroscópica como la fluorescencia o luminiscencia. En un ejemplo, la fosfatasa alcalina se puede utilizar como marcador enzimático, y la nicotinamida adenina dinucleótido fosfato (NADPH) se puede utilizar como sustrato detectable.
En un ejemplo de ensayo de receptores en fase sólida unidos a enzimas para VIH-IP, la fase sólida puede ser micropartículas. Una muestra que se sospecha que contiene VIH-IP se incuba con un conjugado y micropartículas que contienen VIH-PR inmovilizada. La cantidad de unión entre el conjugado y la VIH-PR unida que tiene lugar en ausencia de VIH-IP se reduce como resultado de la presencia de cualquier VIH-IP que compita en la muestra. Los componentes no unidos de la muestra y el conjugado se eliminan, por ejemplo, por centrifugación y decantación. Las micropartículas pueden también ser capturadas por un filtro que contiene una matriz de fibra de vidrio o una membrana selectiva. Además, las partículas ferromagnéticas se pueden separar mediante la aplicación de un campo magnético, llevando a las partículas a los laterales o a la base del tubo. La solución sobrenadante se puede eliminar por aspiración o decantación. Las micropartículas aisladas de la mezcla de ensayo se pueden tratar con un sustrato para el marcador enzimático unido, y la cantidad de enzima unida a las partículas se puede medir y relacionar con la concentración de VIH-IP en la muestra original.
En otro ejemplo de ensayo de receptor en fase sólida unido a enzimas para VIH-IP, la fase sólida puede ser una fase estacionaria, como una placa de microtitulación. Los materiales de la fase sólida pueden ser vidrios, metales, polímeros, plásticos, papeles o membranas. Los materiales preferidos son plásticos como el poliestireno. En este ejemplo, una muestra que se sospecha que contiene VIH-IP se incuba con un conjugado en presencia de VIH-PR inmovilizada en una placa de microtitulación. La cantidad de unión de VIH-PR que ocurra en ausencia de VIH-IP es reducida como resultado de la competencia de los VIH-IP de la muestra. La porción libre de la muestra, incluyendo cualquier conjugado no unido, se elimina por aspiración, seguida de varios lavados y las posteriores aspiraciones. La placa de microtitulación se puede tratar con un sustrato para el marcador enzimático unido, y la cantidad de enzima unida a la placa se puede medir y relacionar con la concentración de VIH-IP en la muestra original.
En otro ejemplo más de ensayo heterogéneo para cuantificar los VIH-IP, la VIH-PR puede funcionar como receptor sin estar inmovilizada en una superficie de fase sólida. Por ejemplo, un conjugado que sea capaz de inmovilizarse, ya sea directamente (mediante enlaces covalentes o uniones adhesivas) o indirectamente (por ejemplo por formación de complejos con avidina/biotina), puede competir con cualquier VIH-IP de una muestra para unirse a la VIH-PR libre en la mezcla de ensayo. Entonces, esta mezcla de ensayo se combina con una superficie sólida en la que se inmoviliza el conjugado directa o indirectamente. Por lo tanto, cualquier VIH-PR unida al conjugado será inmovilizada en la superficie sólida y se podrá separar del resto de la mezcla del ensayo.
En un ejemplo de este tipo de ensayo heterogéneo, un análogo de VIH-IP unido a biotina puede competir con cualquier VIH-IP libre en una muestra para unirse a la VIH-PR libre en la mezcla de ensayo. Las micropartículas que contienen avidina o estreptavidina en la superficie se pueden combinar con esta mezcla de ensayo, permitiendo la complejación de la biotina con la avidina o estreptavidina unida. De este modo, cualquier VIH-PR unida al análogo se inmovilizará en las micropartículas. De manera similar, una fase sólida estacionaria que contenga avidina o estreptavidina unida a la superficie puede combinarse con la mezcla del ensayo, permitiendo la inmovilización de la VIH-PR a través de la complejación de la biotina con la avidina o estreptavidina. Los componentes de la muestra que no están unidos a la fase sólida, incluyendo cualquier VIH-PR que esté inhibida de manera competitiva por un VIH-IP libre, serán eliminados utilizando técnicas estándar de ensayo heterogéneo. Si el análogo de VIH-IP se une a un marcador, la fase sólida aislada se puede analizar utilizando técnicas espectroscópicas. Si el análogo de VIH-IP no está unido a un marcador, la fase sólida aislada se puede poner en contacto con un anticuerpo anti-proteasa del VIH marcado para facilitar el análisis espectroscópico. La VIH-PR libre también se puede modificar antes del ensayo, por ejemplo para incluir un marcador espectroscópico o un marcador electroquimioluminiscente. Por ejemplo, la VIH-PR unida a la fracción de rutenio bipiridilo se puede unir a la superficie de un electrodo que contenga estreptavidina a través de su interacción con un conjugado que contiene biotina y un análogo de VIH-IP. A continuación, el electrodo se puede separar, tratar con tripropilamina y utilizar para el análisis electroquimioluminiscente.
Preferiblemente, los ensayos homogéneos y heterogéneos para los VIH-IP se pueden realizar en analizadores espectroscópicos automatizados comerciales para proporcionar un análisis clínico exhaustivo. Son ejemplos de los analizadores espectroscópicos automatizados disponibles el COBAS/HITACHI y el COBAS INTEGRA (ROCHE DIAGNOSTICS SYSTEMS, Indianápolis). Una vez se ha calibrado el analizador espectroscópico para uno o más VIH-IP de interés, se puede analizar una muestra de concentración desconocida de uno o más VIH-IP, y la señal espectroscópica resultante se correlaciona con la concentración de los VIH-IP de la muestra. Ejemplos de analizadores espectroscópicos incluyen los espectrofotómetros UV-Visible, fluorómetros, luminómetros e instrumentos de RMN. Preferiblemente, la concentración medida de VIH-IP en la muestra debe tener un valor situado entre las concentraciones mínima y máxima utilizadas para el calibrado.
El método de la presente invención se puede utilizar para cuantificar los VIH-IP de muestras biológicas. Las muestras biológicas incluyen muestras de líquidos de un organismo, por ejemplo: orina, sangre total, plasma, suero, saliva, semen, heces, esputo, líquido cefalorraquídeo, lágrimas, mucosidad y similares. Dichos líquidos incluyen normalmente una variedad de componentes además del agua y el VIH-IP de interés, que incluyen varios péptidos, lípidos, sales y otros compuestos o anticuerpos. Estos componentes no esenciales para el ensayo pueden interferir en la interacción entre la VIH-PR y tanto el conjugado como los VIH-IP, o con ambos. Por ejemplo, el conjugado o el VIH-IP pueden adsorberse a uno o más de los componentes no esenciales o reaccionar con ellos. La VIH-PR también puede ser inhibida no específicamente por otros péptidos presentes en el líquido. Es inesperado y sorprendente que, dada la posibilidad de interferencia en los ensayos realizados con líquidos corporales, los VIH-IP se puedan cuantificar en muestras biológicas mediante el uso de la VIH-PR como receptor.
El método de la presente invención puede utilizarse, por tanto, para monitorizar los niveles de los compuestos inhibidores de la proteasa del VIH en pacientes a los que se les han administrado dosis terapéuticas. La valoración de los niveles de compuestos inhibidores de la proteasa del VIH y la correlación con síntomas positivos o negativos pueden utilizarse para modificar el tratamiento de pacientes con SIDA. Las mediciones de compuestos inhibidores de la proteasa del VIH también se pueden utilizar para evaluar la efectividad de tales compuestos o de las combinaciones de dichos compuestos. El método de la presente invención también se puede utilizar para monitorizar en pacientes los niveles de anticuerpos anti-proteasa del VIH. Las determinaciones de la presencia de anticuerpos pueden ser de ayuda en el diagnóstico de la infección por VIH, y las determinaciones de los niveles de anticuerpos pueden ser útiles en la valoración de la respuesta del paciente frente al virus o los tratamientos antivirales.
Ejemplos
Los siguientes ejemplos se aportan a modo de ilustración.
Materiales
La enzima proteasa del VIH-1 (0,65 miligramos por mililitro (mg/ml), 16 Unidades Internacionales por miligramo (UI/mg)) se obtuvo de BACHEM AMERICAS (King of Prussia, Pensilvania).
Ejemplo 1 Síntesis de conjugados
Se preparó un conjugado de VIH-IP que contiene un análogo de amprenavir tal y como se describe en una solicitud de patente co-dependiente con número de serie 10/192 052 presentada el 10 de julio de 2002.
1. Síntesis de N-(succinimido-oxicarbonil-butiril)-amprenavir
Se agitaron durante la noche amprenavir (0,1517 g) y cloruro de succinimido-oxicarbonil-butirilo (0,0817 g) en dimetilformamida anhidra (DMF) (3 ml) a 50ºC. La mezcla se secó por evaporación bajo presión reducida y se purificó directamente mediante cromatografía en gel de sílice (15% de tetrahidrofurano (THF) en una elución de acetato de etilo) para dar N-(succinimido-oxicarbonil-butiril)-amprenavir en forma de sólido blanco (0,1395 g; rendimiento del 61%). Espectrometría de masas: M+Na 739,2. Los datos espectrales (^{1}H-NMR) fueron compatibles con la funcionalización del nitrógeno de la anilina.
2. Síntesis de N-(succinimidil-oxicarbonil-propilamino-^{co}glicil-glicil-glutaril)-amprenavir
(a) Se agitaron N-(succinimido-oxicarbonil-butiril)-amprenavir (131,5 mg) y ácido glicil-glicil-4-aminobutírico (43,4 mg, Bachem California Inc., CA) durante 7 horas en borato acuoso al 25% (pH 10) en THF (5 ml). La mezcla se secó por evaporación bajo presión reducida y se purificó directamente mediante HPLC preparativa de fase inversa (45% de acetonitrilo-agua, conteniendo un 0,1% de ácido trifluoroacético) para dar N-(3-carboxipropilamino-^{co}glicil-glicil-glutaril)-amprenavir en forma de sólido blanco (98,2 mg; rendimiento del 65%). Espectrometría de masas: M+H 817,4.
(b) Se agitan dar N-(3-carboxipropilamino-^{co}glicil-glicil-glutaril)-amprenavir (40,9 mg), N-hidroxisuccinimida (11,5 mg) y etil dimetilaminopropil carbodiimida (19,2 mg) durante 5 horas en DMF anhidra al 20% en cloruro de metileno (2,5 ml). La mezcla se secó por evaporación bajo presión reducida y se purificó directamente mediante cromatografía en gel de sílice (12% de metanol en una dilución de cloroformo) para dar N-(succinimidil-oxicarbonil-propil-amino-^{co}glicil-glicil-glutaril)-amprenavir en forma de espuma blanca (37,9 mg; rendimiento del 83%). Espectrometría de masas: M+H 938,4.
Ejemplo 2 Preparación de reactivos de amprenavir 1. Preparación de conjugados
El derivado de APV utilizado en la preparación de conjugados fue N-(succinimidil-oxicarbonil-propilamino-^{co}gli-cil-glicil-glutaril)-amprenavir, que tiene la siguiente estructura:
100
Se preparó una solución madre de un transportador de aminodextrano (AMD; 40 kDa de pm; 5,7 aminas por molécula) mediante disolución de 80 mg de AMD en 4 ml de dimetil sulfóxido (DMSO), para una concentración final de 20 mg/ml. Se preparó una solución madre con 20 mg/ml de derivado de APV, disolviendo 22 mg de derivado de APV en 1,1 ml de DMSO. El producto liofilizado se preparó añadiendo gota a gota 0,183 ml de solución madre de derivado de APV (relación molar de 4:1 de derivado de APV respecto a AMD) o 0,366 ml de solución madre de derivado de APV (relación molar de 8:1 de derivado de APV respecto a AMD) mientras se agitaban 2 ml de solución madre de AMD a temperatura ambiente. Se dejó la mezcla de reacción en agitación durante 24 horas a temperatura ambiente. La solución de la reacción se dializó posteriormente frente a DMSO al 80, 60, 40 y 20% y agua desionizada. La solución dializada se liofilizó y se mantuvo a -20ºC.
Una solución madre con 0,5 mg/ml de conjugado se preparó disolviendo 2 mg del producto liofilizado en 4 ml de Tampón fosfato salino (PBS) 20 mM, pH 7,2. Se realizaron diluciones en serie, con un factor diferencial de dos, en el mismo tampón para un volumen final de 2 ml, dando como resultado las soluciones de conjugado con concentraciones de 0,25 mg/ml y 0,125 mg/ml. Se realizaron las mismas concentraciones de solución madre y las mismas diluciones en serie para AMD. Se obtuvieron las mediciones de absorbancia a 264 nm para las distintas concentraciones de conjugado utilizando las soluciones de AMD a las concentraciones correspondientes como blancos de calibrado. Los datos y resultados de los cálculos de la carga y carga promedio se muestran en la Tabla 1.
TABLA 1 Conjugados de APV-AMD con dos relaciones de carga distintas
Relación de carga APV-AMD \mug/ml Absorbancia promedio APV, mM Carga Carga promedio
125 0,1643 6,5720E-03 2,10
4:1 250 0,3327 1,3308E-02 2,13 2,15
500 0,6909 2,7636E-02 2,21
8:1 125 0,2809 1,1236E-02 3,60
250 0,5849 2,3394E-02 3,74 3,75
500 1,2188 4,8753E-02 3,90
2. Preparación de reactivos de micropartículas A) Prelavado de micropartículas de látex
Se diluyeron 5 ml de suspensión al 10% de micropartículas de látex sólidas modificadas en los grupos carboxilato (0,198 \mum, áreas de estacionamiento de 41 \ring{A}^{2}, fabricada por SERADYN, INC., Indianápolis, IN) hasta el 1% de sólido con agua desionizada. Se centrifugó la suspensión a 32.600 x g durante una hora a 4ºC. El sedimento se recogió y se resuspendió mediante sonicación en agua desionizada. La suspensión se centrifugó a 32.600 x g durante 1 hora a 4ºC. Se recogió el sedimento y se resuspendió mediante sonicación en ácido 2-(N-morfolino)-etanosulfónico (MES) 50 mM, pH 5,5. Las micropartículas de látex se almacenaron a 4ºC.
B) Adsorción de la VIH-PR en las micropartículas de látex
Se añadieron 0,33 ml de MES 50 mM (pH 5,5) y 0,33 ml de suspensión de látex sólido al 1,18% bajo agitación a un tubo de microcentrífuga de 1,7 ml seguido de la adición de 0,33 ml de 0,3 mg/ml de VIH-1 PR (proporcionada en tampón de acetato sódico 0,1 M; pH 5,5; glicerol al 10% (v/v); y de etilenglicol al 5% (v/v)). La solución de reacción se mezcló convenientemente y se incubó durante la noche a 4ºC. Al día siguiente, la mezcla se centrifugó a 32.600 x g durante 1 hora a 4ºC. Se recogió el sedimento y se resuspendió mediante sonicación en 0,5 ml de MES 50 mM (pH 5,5) y se añadieron 0,5 ml de albúmina sérica bovina (BSA) al 2% (disuelta recientemente en MES 50 mM; pH 5,5; NaN_{3} al 0,09%) a la solución resuspendida. La solución se mezcló convenientemente y se incubó durante la noche a 4ºC. Al día siguiente, la mezcla se centrifugó a 32.600 x g durante 1 hora a 4ºC. El sedimento se recogió y se resuspendió mediante sonicación en 1 ml de tampón de ensayo de VIH-PR (acetato de sodio (NaOAc) 50 mM, pH 4,9, cloruro sódico (NaCl) 200 mM, 5 ml de ditiotreitol (DTT) y glicerol al 10%(v/v)). Después, la mezcla se centrifugó a 32.600 x g durante 1 hora a 4ºC. Se recogió el sedimento y se lavó con tampón de ensayo de VIH-PR como se ha descrito anteriormente. Después del lavado final, el sedimento se resuspendió en 1 ml de tampón de ensayo de VIH-PR. Finalmente, la concentración final de micropartículas de látex se determinó por comparación de las micropartículas de látex con las curvas estándar a cinco longitudes de onda distintas (340, 405, 500, 550 y 600 nm) en un ROCHE COBAS MIRA (ROCHE DIAGNOSTICS, Indianápolis, IN).
Ejemplo 3 Análisis de la unión del conjugado
Los reactivos de micropartículas de látex preparados como se ha descrito anteriormente se diluyeron con tampón de ensayo de VIH-PR hasta conseguir una suspensión de látex sólido al 0,08%. Cada uno de los conjugados de APV-AMD 2,15:1 y 3,75:1 a nueve concentraciones diferentes (0; 0,4; 0,8; 1; 2; 3; 4; 5 y 6 \mug/ml) se mezcló con tampón de ensayo de VIH-PR y ácido poliacrílico (PAA) al 2,5%. Se utilizó ROCHE ZERO CALIBRATOR (suero humano normal) (ROCHE DIAGNOSTICS, Indianápolis, IN) como muestra de suero. Las figuras 1 y 2 son gráficos de los resultados obtenidos para los conjugados 3,75:1 y 2,15:1, respectivamente. Estas pruebas de aglutinación se realizaron en ROCHE COBAS MIRA. Los parámetros de ensayo utilizados en el ROCHE COBAS MIRA se muestran en la Tabla 2.
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TABLA 2 Parámetros de ensayo para ROCHE COBAS MIRA
Longitud de onda 600 nm
Temperatura 37ºC
Volumen de la muestra 2 ml
Reactivo de conjugado 100 \mul
Reactivo de micropartículas 95 \mul
Empuje del agua 0
Preincubación Muestra/Conjugado 2,08 min.
Tiempo de lectura 6,25 min.
Ejemplo 4 Preparación de la curva de calibrado para Amprenavir
Se preparó una solución madre de 1 mg/ml de APV mediante la disolución de 1 mg de APV en 1 ml de DMSO. A la solución madre de APV se añadió ROCHE DIAGNOSTICS CALIBRATOR para obtener series de las muestras de suero a concentraciones de 0,5; 1,5; 2,5; 3,5 y 5 \mug/ml. El reactivo de micropartículas se preparó como se describe en el ejemplo 1. El reactivo del conjugado contenía 5 \mug/ml de conjugado APV:AMD (3,75:1) en el tampón de ensayo de VIH-PR y PAA al 2,5%. Las pruebas de inhibición/sustitución de la aglutinación se llevaron a cabo en ROCHE COBAS MIRA utilizando varias concentraciones de APV preparadas en suero humano normal. Los parámetros de ensayo utilizados con ROCHE COBAS MIRA son los mismos que en el ejemplo 2. Los resultados del ensayo de inhibición competitiva medidos mediante la aglutinación de micropartículas a varias concentraciones de APV se muestran en la Figura 3.
Ejemplo 5 Determinación de los niveles de VIH-IP en los sujetos control
Las soluciones madre que contienen un conjugado y la VIH-PR unida a micropartículas se preparan como en el ejemplo 1. Una solución madre que contiene inhibidores de la proteasa (sulfato de indinavir, mesilato de nelfinavir, ritonavir y saquinavir) se prepara en metanol como se describe en Remmel et al. Se preparan diferentes soluciones de calibrado mediante dilución de la solución madre, de manera que la concentración final oscila entre 0,05 y 19,4 \mug/ml para indinavir, 0,02 y 8,6 \mug/ml para nelfinavir, 0,05 y 20,0 \mug/ml para ritonavir y 0,02 y 8,8 \mug/ml para saquinavir (Remmel et al). Se prepara a parte una solución madre en metanol para el control de calidad. Las muestras de suero o plasma se obtienen de los voluntarios humanos sanos y se suplementan con una porción de la solución madre de los inhibidores de la proteasa del VIH. Estas muestras suplementadas con VIH-IP se incuban con la solución de micropartículas con VIH-PR y el conjugado. La concentración de los inhibidores de la proteasa se establece mediante monitorización de la aglutinación de micropartículas de VIH-IP en las muestras de suero o plasma. La absorbancia aumentada, debida al aumento de tamaño de las micropartículas por la aglutinación, se mide mediante un espectrofotómetro.
Ya que la concentración de inhibidores de proteasa del VIH es inversamente proporcional al descenso de la absorbancia medida, se calcula la concentración de inhibidores de proteasa en el suero o plasma.
Ejemplo 6 Determinación de los niveles de VIH-IP en pacientes con SIDA
Las soluciones madre que contienen un conjugado y VIH-PR unida a micropartículas se preparan como en el ejemplo 1. Las muestras de suero o plasma se obtienen de pacientes con SIDA 8 horas después de su tratamiento con una dosis por vía oral de inhibidores de la proteasa (VIH-IP). Entonces, las muestras de suero o plasma de los pacientes con SIDA se incuban con la solución de micropartículas de VIH-PR y el conjugado, y la concentración de VIH-IP se establece por la medición de la aglutinación de las micropartículas de VIH-IP en las muestras de suero o plasma. La absorbancia incrementada, debido al aumento de tamaño de las micropartículas por la aglutinación, se mide mediante un espectrofotómetro.
Ya que la concentración de inhibidores de proteasa del VIH es inversamente proporcional al descenso de la absorbancia medida, se calcula la concentración de inhibidores de proteasa en el suero o plasma.
Ejemplo 7 Determinación de los niveles de anticuerpos anti-proteasa del VIH en muestras biológicas
Las soluciones madre que contienen un conjugado y VIH-PR unida a micropartículas se preparan como en el ejemplo 1. Las muestras de suero o plasma se obtienen de pacientes con SIDA dentro del primer año desde el momento del diagnóstico de SIDA, y entonces se incuban con la solución de micropartículas con VIH-PR y el conjugado, y la concentración de VIH-IP se establece por la medición de la aglutinación de las micropartículas de VIH-IP en las muestras de suero o plasma. La absorbancia incrementada, debido al aumento de tamaño de las micropartículas por la aglutinación, se mide mediante un espectrofotómetro.
Ya que la concentración de anticuerpos anti-proteasa del VIH es inversamente proporcional al descenso de la absorbancia medida, se calcula la concentración de anticuerpos anti-proteasa del VIH en el suero o plasma.

Claims (15)

1. Un método para cuantificar un inhibidor de la proteasa del VIH en una muestra, que incluya los siguientes pasos:
combinar una proteasa del VIH, un conjugado que contenga un análogo de un inhibidor de la proteasa del VIH y una muestra que se sospecha que contiene un inhibidor de la proteasa del VIH, en la que la proteasa del VIH y el conjugado forman un complejo detectable; medir la cantidad de dicho complejo; relacionar la cantidad del mismo con una concentración de inhibidor de la proteasa del VIH de la muestra.
2. El método de la reivindicación 1, en el que la proteasa del VIH se inmoviliza en la superficie de una fase sólida.
3. El método de la reivindicación 1, en el que el inhibidor de la proteasa del VIH incluye un miembro seleccionado del grupo formado por un compuesto inhibidor de la proteasa del VIH, un anticuerpo anti-proteasa del VIH y un metabolito de un compuesto inhibidor de la proteasa del VIH.
4. El método de la reivindicación 1, en el que el inhibidor de la proteasa del VIH incluye un miembro seleccionado del grupo formado por amprenavir, indinavir, lopinavir, nelfinavir, ritonavir y saquinavir.
5. El método de la reivindicación 1, en el que el conjugado incluye un marcador.
6. El método de la reivindicación 5, en el que el marcador incluye un miembro seleccionado del grupo formado por un marcador fluorescente, un compuesto luminiscente, un isótopo radiactivo, un marcador quimioluminiscente, una enzima y un sustrato enzimático.
7. El método de la reivindicación 2, en el que el conjugado incluye un transportador y al menos dos análogos de inhibidores de la proteasa del VIH unidos al transportador, y en el que la medición de la cantidad de complejo detectable incluye la medición de la aglutinación.
8. El método de la reivindicación 1, en el que el conjugado incluye un marcador fluorescente, y la medición del complejo detectable incluye la medición de la polarización de la fluorescencia.
9. El método de la reivindicación 2, en el que la fase sólida incluye un miembro seleccionado del grupo formado por una partícula, una placa de microtitulación, una cubeta, un tubo y una tira.
10. El método de la reivindicación 2, en el que la cantidad de complejo detectable incluye la medición de una propiedad espectroscópica de la fase sólida.
11. El método de la reivindicación 1, en el que el conjugado incluye biotina; método que también incluye la inmovilización del complejo detectable en la superficie de una fase sólida, que contiene avidina o estreptavidina.
12. El método de la reivindicación 11, en el que la proteasa del VIH está unida a un marcador.
13. Un método para cuantificar un inhibidor de la proteasa del VIH en una muestra, de acuerdo con la reivindicación 1, que se caracteriza por combinar una proteasa del VIH, un conjugado que incluye un transportador y al menos dos análogos de inhibidores de la proteasa del VIH unidos al transportador y una muestra que se sospecha que contiene un inhibidor de la proteasa del VIH. La proteasa del VIH está inmovilizada en una superficie de una micropartícula, la proteasa del VIH y el conjugado experimentan un proceso de aglutinación, y la muestra es suero humano o plasma humano. Posteriormente se mide la aglutinación y se relaciona el nivel de aglutinación con una concentración de inhibidor de la proteasa del VIH en la muestra.
14. Un método para cuantificar un inhibidor de la proteasa del VIH en una muestra, de acuerdo con la reivindicación 1, que se caracteriza por combinar un transportador multivalente que incluye al menos dos enzimas proteasa del VIH, un conjugado que incluye una micropartícula y un análogo de inhibidor de la proteasa del VIH y una muestra que se sospecha que contiene un inhibidor de la proteasa del VIH. La proteasa del VIH y el conjugado experimentan un proceso de aglutinación, y la muestra es suero humano o plasma humano. Posteriormente se mide la aglutinación y se relaciona el nivel de aglutinación con una concentración de inhibidor de la proteasa del VIH en la muestra.
15. Un método para cuantificar un inhibidor de la proteasa del VIH en una muestra, de acuerdo con la reivindicación 1, que se caracteriza por combinar una proteasa del VIH, un conjugado que incluye un marcador y un análogo de un inhibidor de la proteasa del VIH unido al marcador, y una muestra que se sospecha que contiene un inhibidor de la proteasa del VIH. La proteasa del VIH y el conjugado forman un complejo detectable, y la muestra es suero humano o plasma humano. Posteriormente se mide la cantidad de complejo detectable mediante monitorización de un cambio en la polarización de fluorescencia y se relaciona la cantidad de complejo detectable con una concentración de inhibidor de la proteasa del VIH en la muestra.
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