ES2283399T3 - Peptidomimetico de gd3. - Google Patents
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Abstract
. Un peptidomimético de GD3 que comprende (i) la secuencia de aminoácidos representada por el SEQ ID NO: 4; (ii) una secuencia de aminoácidos derivada del SEQ ID NO: 4 por sustitución, deleción, adición, o inserción de un resto aminoácido; (iii) una secuencia de aminoácidos que consiste en 9 a 14 restos aminoácido continuos contenidos en la secuencia de aminoácidos del SEQ ID NO: 4; o (iv) una secuencia de aminoácidos derivada del SEQ ID NO: 4 y que tiene una homología del 80% más con el SEQ ID NO: 4, siendo capaz dicho peptidomimético de GD3 de unirse a un anticuerpo anti-GD3 y siendo capaz de inducir una respuesta inmunitaria anti-GD3.
Description
Peptidomimético de GD3.
La presente invención se refiere a
peptidomiméticos de GD3, y más concretamente a péptidos novedosos
que se considera que imitan estructuralmente a GD3, que son
conocidos como antígenos asociados a tumores encontrados en tumores
tales como el melanoma.
GD3 es una forma de
sialosil-esfingoglicolípidos; G representa el
gangliósido (sialosil-esfingoglicolípido) y D
representa disialo. GD3, como otros antígenos asociados a tumores
tales como GM2, GM3, GD2, y GT3, es conocido por ser expresado en
células tumorales tales como las del melanoma humano. La fórmula
estructural de GD3 está representada por NeuAc
\alpha2-8 NeuAc \alpha2-3 Gal
\beta1-4 Glc \beta1-1 Cer.
Los informes previos referentes a GD3 han
revelado, entre otros descubrimientos, que el desarrollo de un tumor
se corresponde con la expresión de GD3, que GD3 es altamente
expresado en células de melanoma, y que la administración de
anticuerpo monoclonal anti-GD3 de ratón suprime el
crecimiento de los tumores en pacientes con melanoma. Basándose en
estos descubrimientos, GD3 se ha vuelto del máximo interés en la
inmunoterapia de estos tipos de tumores.
De este modo, se espera que la respuesta
inmunitaria humana frente a GD3 proporcione efectos beneficiosos
durante el curso clínico de las condiciones patológicas; de hecho,
se han realizado una variedad de ensayos clínicos en el campo
técnico de las vacunas. No obstante, todavía no se ha informado
sobre resultados exitosos que satisfagan la expectación anterior
(véase, por ejemplo, Cheresh, D. A., et al., Proc. Natl.
Acad. Sci., USA., 81, 5767-5771 (1984): Herlyn, M.,
et al., Cancer Res., 45, 5670-5676 (1985):
Houghton, A. N., et al., Proc. Natl. Acad. Sci., USA., 82,
1242-1246 (1985): Livingston, P. O., Immunological
Rev., 145, 147-163 (1995): Livingston, P. O., et
al., Cancer Immunol. Immunother., 45, 1-9
(1997)).
Los gangliósidos, que se ha descubierto que
están asociados con tumores, son conocidos de este modo por servir
como diana útil en el ataque inmunológico contra el cáncer. No
obstante, son reconocidos por tener una escasa inmunogenicidad.
Con el fin de superar esta desventaja, se ha
desarrollado y descrito una composición de vacuna contra el cáncer
para inducir o estimular la respuesta inmunitaria de los anticuerpos
frente a los gangliósidos (Solicitud de Patente Japonesa Abierta a
la Inspección Pública (kokai) Núm. 8-53366).
Esta composición es un producto N-glicosilado de
gangliósido (esto es, N-glicosil GM3).
De un modo similar, en la Patente de los
Estados Unidos Núm. 5.102.663 se describe un producto
9-O-acetilado de gangliósido (GD3
9-O-acetilado).
Por otra parte, en la Publicación Japonesa
Kohyo Núm. 8-508978 se describe que una vacuna
para el cáncer similar, la vacuna de complejo de GD3 (complejo
GD3-hemocianina de lapa ojo de cerradura), muestra
respuestas de anticuerpos significativamente mejoradas. Según la
descripción de esta publicación, un doble enlace del esqueleto de
ceramida de GD3 es escindido con ozono para la modificación
química, introduciendo de este modo un grupo aldehído, y haciendo
que el grupo aldehído se una al grupo aminolisilo de la proteína por
medio de una aminación reductiva, para construir de ese modo un
complejo con un péptido multi-antigénico sintetizado
que presenta repeticiones de epítopos de las células T de la
malaria, proteína de la envuelta de Neisseria meningitidis
(OMP), seralbúmina bovina cationizada (cBSA), hemocianina de lapa
ojo de cerradura (KLH) y polilisina. Esta publicación también
describe que el coadyuvante inmunológico más eficaz es
QS-21, obtenido por medio de la extracción de la
corteza de un árbol encontrado en Sudamérica y denominado
Quillajasaponaria Molina (Aquila Pharmaceuticals, Worcester,
MA, U.S.A.: Kensil, C. R. et al., J. Immunol., 146, 431
(1991)).
Las vacunas convencionales preparadas a través
del empleo de GD3 per se como un antígeno muestran solamente
respuestas inmunitarias débiles y sus efectos son transitorios. Por
otra parte, tienen desventajas, ya que el GD3 materia prima no es
fácilmente asequible. Esto es, generalmente, la producción en masa
de un gangliósido deseado a partir de un organismo vivo es muy
difícil. Asimismo, la síntesis de un gangliósido a través de la
síntesis química o la ingeniería genética es muy difícil.
Cuando se preparan vacunas por medio de una
variedad de modificaciones químicas de GD3, concretamente en el
tratamiento químico realizado para mejorar la antigenicidad o en la
preparación de complejos, se encuentran desventajas en términos del
procedimiento intrincado en relación con la consecución, la
preparación, síntesis, etc. de las materias primas para los
antígenos y complejos, y la necesidad de selección de los
inmunocoadyuvantes.
Entretanto, en los últimos años, se han empleado
mecanismos biológicos moleculares en los campos técnicos de los
sacáridos complejos, y ahora se encuentran en desarrollo mecanismos
para remplazar la cadena de azúcar por un péptido. Previamente, los
autores de la presente invención han obtenido con éxito, a partir de
una biblioteca de péptidos de presentación en fagos al azar por
medio de inmunopurificación ("panning") utilizando un
anticuerpo monoclonal contra una cadena de azúcar, un péptido que
muestra una unión específica a un anticuerpo contra una forma de
gangliósido, GD1\alpha.
Se ha encontrado que este péptido (15 meros)
imita la estructura de la cadena de azúcar de un glicolípido
complejo (y por tanto se denomina péptido
glico-réplica), para unirse, con especificidad, a un
anticuerpo monoclonal contra el glicolípido GD1\alpha, y para
inhibir la unión de un anticuerpo al GD1\alpha antigénico.
Los autores de la presente invención también han
producido este péptido por medio de síntesis química, y han
confirmado que el péptido reacciona con un anticuerpo monoclonal
para GD1\alpha, que un péptido réplica de GD1\alpha
(sintetizado químicamente) inhibe la adherencia celular de las
células cancerosas de líneas celulares cancerosas altamente
metastásicas, y que el péptido réplica inhibe la metástasis de las
células cancerosas (Solicitud de Patente Japonesa Abierta a la
Inspección Pública (kokai) Núm.
10-237099).
Además, los autores de la presente invención han
tenido éxito al obtener, a partir de una biblioteca de péptidos al
azar, un péptido que muestra modulación de la actividad glicosidasa
y reacciona con especificidad con un anticuerpo contra
lactotetraosil-ceramida o
lactoneotetraosil-ceramida (véanse la Solicitud de
Patente Japonesa Abierta a la Inspección Pública (kokai)
Núm. 10-237098 y Saibo Kogaku, Dai Ishikawa y
Takao Taki, 16 (12) 1821-1828 (1997)).
Un informe publicado recientemente describe
resultados de estudios similares a los descritos antes por los
autores de la presente invención. Específicamente, Qiu, J., et
al. han descrito en Hybridoma 18(1)
103-112 (1999) que un péptido de
15-16 meros que contiene una secuencia
Trp-Arg-Tyr y obtenido de una
biblioteca de péptidos de presentación en fagos por medio del uso
de un anticuerpo contra un antígeno GD2/GD3 muestra reacción
cruzada con el
anticuerpo.
anticuerpo.
Willers, J., et al. describen que han
obtenido, a partir de dos bibliotecas de péptidos de presentación en
fagos de fagos que muestran péptidos de 15-meros y
8-meros, cuatro péptidos presentados en fagos
capaces de unirse a anticuerpos monoclonales
anti-GD3 MB3.6, MG22, y MG21 (Peptides, 20,
1021-1026 (1999)). Según esta publicación, se
encontró que estos péptidos mostraban la capacidad de unirse al
anticuerpo anti-GD3 empleado para la selección, y
esta capacidad de unión era inhibida por GD3, pero no se observaba
la inmunogenicidad deseada para ninguno de los péptidos.
Un objeto de la presente invención es
proporcionar un péptido novedoso que imita la estructura de la
cadena de azúcar del gangliósido GD3 y muestra elevada afinidad con
el anticuerpo anti-GD3.
Otro objeto de la presente invención es
proporcionar un péptido inmunogénico capaz de producir un anticuerpo
específico de GD3; en particular, un péptido que tenga un rasgo
característico de manera que el anticuerpo producido por la
inmunización con un inmunógeno que comprende el péptido presente
reacción cruzada con GD3, y por lo tanto, tenga utilidad como
vacuna que remplaza a GD3.
Otro objeto adicional de la presente invención
es proporcionar una secuencia de ADN que codifica el péptido
mencionado antes, un vector de expresión recombinante en el cual se
ha integrado la secuencia, una célula anfitriona que alberga el
vector, y un producto de expresión recombinante producido por la
célula.
Un objeto adicional más de la presente invención
es proporcionar una composición farmacéutica que contiene como
ingrediente activo el péptido mencionado antes o el vector de
expresión recombinante.
Los autores de la presente invención han llevado
a cabo estudios extensos, y han descubierto una secuencia de
aminoácidos novedosa que muestra una elevada afinidad por el
anticuerpo anti-GD3. Los autores de la invención
también han descubierto que un antisuero obtenido por inmunización
con un peptidomimético de GD3 que comprende un péptido que contiene
la secuencia de aminoácidos muestra reactividad cruzada con GD3, y
que el peptidomimético de GD3 encuentra utilidad como vacuna que
remplaza a GD3. La presente invención se ha completado basándose en
estos descubrimientos.
Por consiguiente, la presente invención
proporciona un peptidomimético de GD3 que contiene una secuencia de
aminoácidos representada por el SEQ ID NO: 4 o una secuencia de
aminoácidos derivada de allí como se define en la reivindicación 1.
El peptidomimético de GD3 muestra especificidad de unión para un
anticuerpo anti-GD3.
En particular, la presente invención proporciona
un peptidomimético de GD3 que está en una forma fusionada de un
péptido - fusionado con una proteína portadora capaz de intensificar
la inmunogenicidad - y el peptidomimético de GD3, donde la proteína
portadora es la hemocianina de lapa ojo de cerradura; un
peptidomimético de GD3 multi-antigénico que
contiene al menos una especie del peptidomimético de GD3; un
peptidomimético de GD3 inmunogénico que tiene la capacidad de
producir un anticuerpo específico de GD3; y un peptidomimético de
GD3 que tiene una secuencia de aminoácidos representada por el SEQ
ID NO: 4.
La presente invención también proporciona una
composición farmacéutica que contiene, como ingrediente activo, el
peptidomimético de GD3.
La presente invención abarca, entre otras, las
siguientes realizaciones:
(1) una secuencia de ADN que codifica el
peptidomimético de GD3 de la presente invención, concretamente una
secuencia de ADN que codifica una secuencia de aminoácidos
representada por el SEQ ID NO: 4;
(2) una secuencia de ADN como se ha descrito
antes, que tiene una secuencia de ADN representada por el SEQ ID
NO: 8;
(3) un vector de expresión recombinante en el
cual ha sido insertada al menos una de estas secuencias de ADN;
(4) una célula anfitriona en la cual ha sido
incorporado el vector de expresión recombinante anterior;
(5) una composición farmacéutica que contiene,
como ingrediente activo, el vector de expresión recombinante;
(6) el uso de la composición farmacéutica de la
presente invención como vacuna para estimular la inducción de un
anticuerpo capaz de reconocer el GD3 o para potenciar la producción
del anticuerpo;
(7) el uso de la composición farmacéutica de la
presente invención como fármaco para suprimir un tumor o cáncer o
para inhibir la metástasis cancerosa; y
(8) una composición farmacéutica que es una
preparación de fármaco en liposomas.
El fármaco puede ser utilizado para tratar los
tumores que expresan GD3 o el cáncer, concretamente las condiciones
patológicas seleccionadas del grupo que consiste en el melanoma, el
cáncer de intestino grueso, el cáncer de ovario, el cáncer de
hígado, el cáncer de mama, el tumor cerebral, el cáncer de riñón, el
cáncer de páncreas, el cáncer cervical, el cáncer de esófago, el
cáncer de pulmón, y el cáncer de estómago.
Según se utiliza en la presente memoria, las
abreviaturas de los aminoácidos, péptidos, secuencias de
nucleótidos, ácidos nucleicos, etc. están de acuerdo con los
patrones de la IUPAC; patrones IUB; "Guidelines for Drafting
Specifications or Similar Materials Containing a Nucleotide Sequence
or an Amino Acid Sequence", (editado por la Japanese Patent
Office); y los símbolos empleados rutinariamente en la técnica.
La Fig. 1 es un gráfico que muestra la afinidad
de unión, determinada mediante el método descrito en relación con
el Ejemplo 2, de los péptidos inmunogénicos según la presente
invención y el anticuerpo anti-GD3. La Fig. 2
muestra secuencias de péptidos multi-antigénicos
empleados en el Ejemplo 5. La Fig. 3 es un gráfico que muestra la
afinidad de unión de los peptidomiméticos de GD3 y el anticuerpo
monoclonal anti-GD3. La Fig. 4 es un gráfico que
muestra el efecto inhibidor ejercido por los peptidomiméticos de GD3
inmovilizados frente a la unión entre GD3 y 4F6 (anticuerpo
anti-GD3). La Fig. 5 es un gráfico que muestra el
efecto inhibidor ejercido por peptidomiméticos de GD3 añadidos
exógenamente contra la unión entre GD3 y 4F6. La Fig. 6 es un
gráfico que muestra el efecto inhibidor ejercido por
peptidomiméticos de GD3 añadidos exógenamente (nueve restos) frente
a la unión entre GD3 y 4F6. La Fig. 7 es un gráfico que muestra la
relación entre el factor de dilución de muestras de suero de
ratones inmunizados con el péptido R4 y los resultados del ELISA
sobre GD3. La Fig. 8 es un gráfico que muestra la relación entre el
factor de dilución de muestras de suero de ratones inmunizados con
R4MAP durante dos meses y los resultados del ELISA sobre GD3. La
Fig. 9 es un gráfico que muestra la relación entre el factor de
dilución de muestras de suero de ratones inmunizados con R4MAP
durante dos meses y los resultados del ELISA realizado sobre el
péptido R4MAP.
Los peptidomiméticos de GD3 de la presente
invención se describirán a continuación con detalle.
Los peptidomiméticos de GD3 de la invención son
capaces de unirse a un anticuerpo para GD3 (anticuerpo
anti-GD3) con especificidad. Adicionalmente se
describen aquí peptidomiméticos de GD3 caracterizados por contener
una secuencia de aminoácidos representada por uno cualquiera de los
SEQ ID NOS: 1 a 3 o una secuencia de aminoácidos derivada de allí
por sustitución, deleción, adición, o inserción de uno o más restos
aminoácido y por ser capaces de unirse a un anticuerpo para GD3
(anticuerpo anti-GD3) con especificidad.
Según se utiliza en la presente memoria,
"anticuerpo anti-GD3" es un término empleado
generalmente en la técnica y se define como un anticuerpo
específico capaz de reconocer GD3 (esto es, unirse a GD3). El
anticuerpo no muestra preferiblemente reactividad cruzada con otros
gangliósidos relacionados con GD3 y es particularmente
preferiblemente un anticuerpo monoclonal.
La secuencia de aminoácidos representada por uno
cualquiera de los SEQ ID NOS: 1 a 4 se caracteriza por imitar la
estructura de cadena de azúcar de GD3. De este modo, un péptido que
contiene la secuencia de aminoácidos, que muestra una unión
específica con el anticuerpo anti-GD3, es un ejemplo
preferido de los peptidomiméticos de GD3 de la presente
invención.
La secuencia de aminoácidos específica
mencionada anteriormente puede ser una secuencia de aminoácidos
derivada por modificación de una porción de restos aminoácido o una
porción de la secuencia con tal que la característica estructural;
esto es, la imitación de la estructura de la cadena de azúcar de
GD3, se mantenga o esté presente.
No se impone una limitación concreta sobre el
grado y la posición de la modificación (esto es, sustitución,
deleción, adición, o inserción) de la secuencia de aminoácidos, con
tal que la secuencia de aminoácidos modificada sea equivalente en
términos del efecto y muestre características similares a las de la
secuencia de aminoácidos representada por uno cualquiera de los SEQ
ID NOS: 1 a 4; es decir, la imitación de la estructura de la cadena
de azúcar de GD3, se mantenga o esté presente.
La modificación se puede efectuar generalmente
en un grado de homología del 80% o más, preferiblemente una
homología del 90% o más.
Entre estos péptidos, se considera que un
péptido que tiene al menos dos restos cisteína; p. ej., un péptido
que tiene una secuencia de aminoácidos representada por el SEQ ID
NO: 2, se cicla espontáneamente. Semejante péptido cíclico es
activo (muestra unión específica a un anticuerpo
anti-GD3) incluso cuando el péptido está presente
en una forma de cadena lineal. Por lo tanto, uno o ambos restos
cisteína incluidos en el péptido o una porción de la secuencia de
aminoácidos emparedada por estos dos restos cisteína puede ser
suprimida sin afectar mucho las características estructurales de
imitación de la estructura de la cadena de azúcar de GD3. Este
fenómeno es apoyado por la literatura (p. ej., Koivunen, et
al., J. Biol. Chem., 268, 20205-20210
(1993)).
Los ejemplos de la secuencia de aminoácidos
suprimida mencionada antes incluyen una secuencia de nueve restos
aminoácido (PHFDSLLYP) que reside en el extremo N de GD3R2.
Cualquiera de los peptidomiméticos de GD3 de la
presente invención está formado por un péptido que contiene una de
las secuencias de aminoácidos específicas mencionadas antes que caen
dentro del alcance de la presente invención. De este modo, la
característica estructural; esto es, la imitación de la estructura
de la cadena de azúcar de GD3, se mantiene o está presente, y el
peptidomimético de GD3 se caracteriza por la unión específica a un
anticuerpo anti-GD3.
Desde el punto de vista de la inmunogenicidad y
de otras propiedades, los péptidos mencionado antes que contienen
una cualquiera de las secuencias de aminoácidos específicas tiene un
número de restos aminoácido de al menos 5, preferiblemente 8 a 60,
más preferiblemente 8 a 30, aún más preferiblemente 10 a 20.
Los peptidomiméticos de GD3 de la presente
invención tienen preferiblemente una secuencia de aminoácidos
representada por el SEQ ID NO: 4. Alternativamente, los
peptidomiméticos de GD3 tienen preferiblemente una secuencia de
aminoácidos derivada de una secuencia de aminoácidos representada
por el SEQ ID NO: 4 mediante sustitución, deleción, adición, o
inserción de un resto aminoácido.
Más preferiblemente, los peptidomiméticos de GD3
de la presente invención son péptidos inmunogénicos que son capaces
de producir un anticuerpo específico de GD3. En otras palabras, los
péptidos pueden inducir un anticuerpo específico
anti-GD3.
Los peptidomiméticos de GD3 que están
caracterizados por contener una secuencia de aminoácidos
representada por uno cualquiera de los SEQ ID NOS: 1 a 4, tienen
per se la capacidad de producir un anticuerpo específico de
GD3, y por lo tanto, tales péptidos son preferidos como péptidos
inmunogénicos de la presente invención.
Los péptidos inmunogénicos de la presente
invención también abarcan péptidos que empiezan a tener una
inmunogenicidad deseada por medio de la transformación en formas
con la inmunogenicidad intensificada, así como los péptidos de las
formas con una inmunogenicidad intensificada.
De este modo, los péptidos inmunogénicos que
tienen capacidad para producir un anticuerpo específico de GD3,
cuyos péptidos son realizaciones preferidas de la presente
invención, abarcan los péptidos no modificados per se y las
formas de inmunogenicidad intensificada de los peptidomiméticos de
GD3 tales como una forma de un péptido fusionado a una proteína
portadora común para intensificar la inmunogenicidad y una forma de
un péptido multi-antigénico, cayendo estas dos
formas dentro del alcance de la presente invención.
Que los peptidomiméticos de GD3 de la presente
invención mantengan o presenten la característica estructural de
imitar la estructura de la cadena de azúcar de GD3 (esto es,
muestren unión específica a un anticuerpo anti-GD3)
puede ser confirmado verificando la reactividad con el anticuerpo
anti-GD3 por medio de un método de ensayo
rutinario. Además, que los peptidomiméticos de GD3 de la presente
invención sean péptidos inmunogénicos que tengan la capacidad de
producir un anticuerpo anti-GD3 puede ser confirmado
verificando, por medio de un método de ensayo rutinario, la
reactividad cruzada de los anticuerpos inducidos con GD3.
\newpage
La detección de la especificidad de unión de los
peptidomiméticos de GD3 de la presente invención a un anticuerpo
monoclonal anti-GD3 y la reactividad de GD3 con un
anticuerpo inducido por un péptido inmunogénico se describirán
específicamente en los Ejemplos descritos más abajo.
Los peptidomiméticos de GD3 de la presente
invención abarcan las siguientes realizaciones.
(a) un peptidomimético de GD3 que comprende un
péptido que contiene una secuencia de aminoácidos formada por medio
de la fusión o conexión de una pluralidad de miembros de al menos
una especie de las secuencias de aminoácidos específicas
mencionadas antes;
(b) un peptidomimético de GD3 en una forma de
péptido multiantigénico que comprende un péptido que contiene al
menos una especie de la secuencia de aminoácidos específica
mencionada antes; y
(c) un peptidomimético de GD3 en forma de un
péptido de fusión fusionado con una proteína o un péptido portador
que puede intensificar la inmunogenicidad o promover la respuesta
inmunitaria.
Estos ejemplos específicos de los
peptidomiméticos de GD3 de la presente invención se describirán a
continuación con más detalle.
En los Ejemplos descritos más abajo, los
péptidos representados por GD3R1, GD3R2, GD3R3, y GD3R4 indican
péptidos que tiene secuencias de aminoácidos representadas por los
SEQ ID NOS: 1 a 4, respectivamente. Estos péptidos son ejemplos
preferidos de los peptidomiméticos de GD3 de la presente invención.
También son preferidos los péptidos formados de 9 a 14 restos
aminoácido arbitrariamente continuos contenido en una secuencia de
aminoácidos representada por uno cualquiera de los SEQ ID NOS: 1 a
4. De estos, los péptidos formados de 9 a 14 restos aminoácido
N-terminales o C-terminales
contenidos en una secuencia e aminoácidos representada por uno
cualquiera de los SEQ ID NOS: 1 a 4 son más preferidos. Los
péptidos formados de nueve restos aminoácido
N-terminales o C-terminales
contenidos en una secuencia de aminoácidos representada por uno
cualquiera de los SEQ ID NOS: 1 a 4 son particularmente preferidos.
Como se muestra en los Ejemplos, estos péptidos fueron obtenidos
seleccionando péptidos que muestran una unión específica a un
anticuerpo
\hbox{anti-GD3 mediante el uso de
bibliotecas de presentación en fagos.}
No es necesario repetir la etapa de escrutinio
para producir los peptidomiméticos de GD3 de la presente invención.
Si se desea, el escrutinio se realiza, por ejemplo, de la siguiente
manera.
Específicamente, se produce una gran población
de moléculas (biblioteca), y se identifican los péptidos de interés
por medio del escrutinio de la biblioteca de moléculas. Se puede
emplear una biblioteca de presentación en fagos para el escrutinio.
El método para producir la biblioteca y el método de escrutinio se
describen en la literatura (p. ej., Scott, J. M. y Smith, G.P.,
Science, 249, 386-390 (1990); Smith, G. P. y Scott,
J. K., Methods in Enzymology, 217, 228-257 (1993)).
Los ejemplos de los métodos preferibles para identificar los
peptidomiméticos de GD3 de la presente invención incluyen los
métodos para identificar peptidomiméticos de la cadena de azúcar de
un glicolípido descritos, por ejemplo, en las Solicitudes de Patente
Japonesas Abiertas a la Inspección Pública (kokai) Núms.
10-237099 y 10-237098, y Dai
ISHIKAWA y Takao TAKI, Cell Engineering, 16 (12)
1821-1828 (1997).
Los clones de fagos que presentan un péptido de
interés pueden ser escrutados y seleccionados por medio de un
ensayo de unión (a un anticuerpo) mediante el uso de un anticuerpo
que reconozca GD3, preferiblemente un anticuerpo monoclonal que
tenga una elevada especificidad para GD3.
Determinando las secuencias de ADN de los clones
de fagos seleccionados, se puede identificar un peptidomimético de
GD3 de interés. Las secuencias de ADN pueden ser determinadas
fácilmente por medio de cualquier método conocido en la técnica; p.
ej., el método didesoxi [Proc. Natl. Acad. Sci. USA., 74,
5463-5467 (1977)] o el método de
Maxam-Gilbert [Method in Enzymology, 65, 499
(1980)]. Se puede emplear convenientemente un kit de secuenciación
comercial o un medio similar para determinar las correspondientes
secuencias de nucleótidos.
Los peptidomiméticos de GD3 de la presente
invención pueden ser producidos según sus secuencias de aminoácidos
por medio de cualquier método de síntesis química rutinario, tales
como los métodos de síntesis de péptidos en fase líquida o en fase
sólida típicos.
Más específicamente, los métodos de síntesis de
péptidos incluyen un método de elongación por etapas en el que los
respectivos aminoácidos se conectan sucesivamente según la
información de la secuencia de aminoácidos, para de ese modo
prolongar la cadena; y un método de condensación de fragmentos en el
que los fragmentos son sintetizados de manera preliminar a partir
de diversos aminoácidos y los fragmentos son acoplados. Los
peptidomiméticos de GD3 de la presente invención pueden ser
sintetizados por medio de cualquier método.
Se puede emplear cualquier método de
condensación para la síntesis de péptidos anterior. Los ejemplos de
los mismos incluyen el método de la azida, el método del anhídrido
de ácido mixto, el método de la DCC, el método del éster activo, el
método redox, el método de la DPPA (difenilfosforilazida), el método
de DCC + aditivo (p. ej., 1-hidroxibenzotriazol,
N-hidroxisuccinimida, o
N-hidroxi-5-norborneno-2,3-dicarboximida),
y el método del Woodward.
El disolvente empleable en estos métodos se
selecciona apropiadamente entre los disolventes acostumbrados bien
conocidos por ser utilizables en una variedad de reacciones de
condensación de péptidos. Los ejemplos incluyen dimetilformamida
(DMF), dimetilsulfóxido (DMSO), hexafosforamida, dioxano,
tetrahidrofurano (THF), acetato de etilo, y mezclas de los
mismos.
Tras la reacción de síntesis de péptidos
anterior, los grupos carboxilo de los aminoácidos y péptidos cuyos
grupos no están implicados en la reacción pueden ser generalmente
protegidos por medio de esterificación para formar de ese modo un
éster alquílico inferior (p. ej., éster metílico, éster etílico, o
éster t-butílico); o un éster aralquílico (p. ej.,
éster bencílico, éster p-metoxibencílico, o éster
p-nitrobencílico). Un grupo funcional de la cadena
lateral de un aminoácido; p. ej., el grupo hidroxilo de Tyr, puede
ser protegido por un grupo tal como acetilo, bencilo,
benciloxicarbonilo, o tert-butilo, pero la
protección no es esencial. El grupo guanidinio de Arg puede ser
protegido por un grupo protector apropiado tal como nitro, tosilo,
2-metoxibencenosulfonilo, metanosulfonilo,
benciloxi-carbonilo, isoborniloxicarbonilo, o
adamantiloxi-carbonilo.
La reacción de desprotección de los grupos
protectores de los aminoácidos, péptidos, y los péptidos
inmunogénicos obtenidos finalmente de la presente invención que
tienen los grupos protectores anteriores puede ser realizada por
medio de cualquier método empleado rutinariamente. Por ejemplo, se
puede realizar una reducción catalítica y una desprotección química
mediante el uso de un agente tal como amoníaco líquido/sodio,
fluoruro de hidrógeno, bromuro de hidrógeno, cloruro de hidrógeno,
ácido trifluoroacético, ácido acético, ácido fórmico, o ácido
metanosulfónico.
La purificación de los peptidomiméticos de GD3
de la presente invención obtenidos de este modo se puede realizar
apropiadamente a través de un método rutinario tal como el método de
la resina de intercambio iónico, la cromatografía de reparto, la
cromatografía en gel, la cromatografía de afinidad, la cromatografía
líquida de alta resolución (HPLC), o la distribución
contracorriente, que son empleados rutinariamente en el campo de la
química de los péptidos.
Alternativamente, los peptidomiméticos de GD3 de
la presente invención pueden ser producidos por medio de una
técnica de ingeniería genética que emplea las secuencias de ADN
según la presente invención que codifican los péptidos.
El procedimiento anterior se lleva a cabo a
través de un método rutinario. Por ejemplo, la síntesis de ADN, la
producción de un vector de expresión que puede expresar el ADN, y el
método de expresión del vector en las células anfitrionas se pueden
llevar a cabo según los mecanismos de ingeniería genética empleados
generalmente (Véase Molecular Cloning 2d. Ed., Cold Spring Harbor
Lab. Press (1989); Zoku-Seikagaku Jikken Koza
"Gene study I, II, y III", editado por The Japanese
Biochemical Society (1986); etc.).
El ADN que codifica un peptidomimético de GD3 de
la presente invención puede ser preparado por medio de un método
rutinario basándose en la información de la secuencia de aminoácidos
del peptidomimético de GD3 proporcionada por la presente invención
(p. ej., Science, 224, 1431 (1984); y Biochem. Biophys. Res. Comm.,
130, 692 (1985); Proc. Natl. Acad. Sci., USA., 80, 5990
(1983)).
Más específicamente, el ADN puede ser
sintetizado químicamente por medio del método de la fosforamidita o
el método del triéster. La síntesis se puede realizar mediante el
uso de un sintetizador de oligonucleótidos automatizado asequible
comercialmente. Los fragmentos de doble hebra pueden ser producidos
a partir de un producto de hebra sencilla producido mediante
síntesis química incluyendo la síntesis de hebras complementarias y
la hibridación de las hebras en condiciones apropiadas; o mediante
la adición de hebras complementarias a una secuencia cebadora
apropiada mediante el uso de una ADN polimerasa.
Si se desea, la secuencia de aminoácidos
codificadora del ADN anteriormente mencionado puede ser modificada
mediante cualquier método conocido, tal como la introducción de una
variación específica del sitio empleando un oligonucleótido
(Zoller, M., et al., Nucl. Acids Res., 10,
6487-6500 (1982)), o la mutagénesis con una casete
(Well, J., et al., Gene, 34, 315-323
(1985)).
La producción y expresión de un péptido de
interés mediante el uso del ADN se puede llevar a cabo por cualquier
método conocido en la técnica (p. ej., Science, 224, 1431 (1984);
Biochem. Biophys. Res. Comm., 130, 692 (1985); y Proc. Natl. Acad.
Sci. USA., 80, 5990 (1983)). La producción y expresión de péptidos y
proteínas fusionados se puede realizar según el método de Ohno
et al. "Protein Experiment Protocol 1, function analysis,
separate vol. of Cell Engineering, Experiment Protocol Series
(1997), Shujun-sha" u otros métodos.
Los péptidos de interés obtenidos de este modo
pueden ser aislados y purificados mediante una variedad de
procedimiento de separación basándose en las propiedades físicas,
químicas, y otras propiedades (p. ej., "Biochemistry Data Book
II", 1175-1259, 1ª edición, 1^{er} punto, 23
Junio, 1980, Tokyo Kagaku Dojin; Biochemistry, 25 (25),
8274-8277 (1986); y Eur. J. Biochem., 163,
313-321 (1987)). Los ejemplos de los procedimientos
de separación incluyen el tratamiento de reconstrucción general; el
tratamiento mediante el uso de un agente de precipitación de
proteínas (precipitación por adición de sal); centrifugación;
procedimiento de choque osmótico; trituración ultrasónica;
ultrafiltración; mecanismos de cromatografía líquida tales como
cromatografía de tamiz molecular (filtración en gel), cromatografía
de adsorción, cromatografía de intercambio iónico, cromatografía de
afinidad, y cromatografía líquida de alta resolución (HPLC);
diálisis; y combinaciones de los mismos.
Los peptidomiméticos de GD3 de la presente
invención son más preferiblemente péptidos inmunogénicos que tienen
la capacidad de producir un anticuerpo específico de GD3, que puede
ser una forma de inmunogenicidad intensificada tal como una forma
de un péptido de fusión, un péptido fusionado con una proteína
portadora, para intensificar la inmunogenicidad, o una forma de
péptido multi-antigénico.
Los peptidomiméticos de GD3 de la presente
invención en forma de fusión, fusionados con una proteína portadora
para intensificar la inmunogenicidad, son obtenidos uniendo
cualquiera de los péptidos según la presente invención con una
proteína portadora rutinaria para intensificar la
inmunogenicidad.
No se impone ninguna limitación concreta sobre
el tipo de proteína portadora, con tal que pueda intensificar la
inmunogenicidad, y se pueden emplear como proteína portadora una
variedad de proteínas y péptidos que confieran una inmunogenicidad
superior basándose en el efecto portador o que promuevan la
respuesta inmunitaria de los organismos vivos. La proteína
portadora puede ser una proteína o péptido que ejerza adicionalmente
un efecto farmacéutico tal como una actividad
anti-tumoral.
Cuando los peptidomiméticos de GD3 de la
presente invención se utilizan como profármacos, la proteína
portadora se selecciona entre las proteínas y péptidos
farmacéuticamente aceptables. Los ejemplos de las proteínas
portadoras preferibles incluyen la hemocianina de lapa ojo de
cerradura (KLH) y las citocinas tales como IL-12 y
GM-CSF. Los ejemplos de las proteínas y péptidos
anteriormente mencionados que ejercen un efecto farmacéutico
incluyen IFN-\alpha, IFN-\beta,
IFN-\gamma, IL-1,
IL-2, TNF, TGF-\beta,
angiostatina, trombospondina, y endostatina.
La unión del péptido anterior y la proteína
portadora se puede llevar a cabo a través del método de síntesis de
péptidos mencionado anteriormente.
La unión también se puede llevar a cabo mediante
el uso del ADN o los genes del mismo por medio de la tecnología
recombinante mencionada anteriormente.
De este modo, se puede obtener los
peptidomiméticos de GD3 de la presente invención en forma
fusionada.
Los peptidomiméticos de GD3 de la presente
invención pueden ser péptidos multi-antigénicos
(MAP). Estos péptidos se caracterizan porque una pluralidad de los
peptidomiméticos de GD3 según la presente invención son presentados
sobre una molécula base.
La forma MAP de los peptidomiméticos de GD3 de
la presente invención puede ser producida preferiblemente mediante
el uso de un dendrímero que sirve como molécula base o
esqueleto.
Como es sabido generalmente, un dendrímero es
una molécula (p. ej., molécula esférica) de una configuración de
tipo estrella o dendrítica, cuya molécula tiene ramas (unidades
repetitivas) que tienen una pluralidad de grupos funcionales
(véanse, p. ej., la Publicación de Patente Japonesa Kohyo
Núm. 60-500295; las Solicitudes de Patente
Japonesas Abiertas a la Inspección Pública (kokai) Núms.
63-99233 y 3-263431; las Patentes
de los Estados Unidos Núms. 4507466 y 4568737; Polymer Journal, 17,
p. 117 (1985); Angewandte Chem. Int. Engl., 29,
138-175 (1990); y Macromolecules, 25, p. 3247
(1992)).
No se impone ninguna limitación concreta sobre
el dendrímero empleado en la presente invención, y el dendrímero
puede estar formado por un núcleo que sirve como sitio de inicio de
la polimerización; una capa interna (generación) que comprende
unidades repetitivas conectadas al núcleo de inicio; y una
superficie externa formada por grupos funcionales conectados a las
ramas.
Las características tales como las dimensiones,
la morfología, y la reactividad del dendrímero pueden ser reguladas
modificando el núcleo de inicio, el número de generaciones, y el
tipo de unidades repetitivas empleadas en cada generación.
Específicamente, las dimensiones de un dendrímero pueden ser
incrementadas fácilmente incrementando el número de generaciones a
incluir (véase, p. ej., la Patente de los Estados Unidos Núm.
4694064).
Los ejemplos de las formas MAP típicas de los
peptidomiméticos de GD3 de la presente invención incluyen un
dendrímero que comprende un átomo de nitrógeno que sirve como sitio
núcleo de inicio; un fragmento -CH_{2}CH_{2}CONH
CH_{2}CH_{2}- que sirve como unidad repetitiva (rama) que conecta con cada sitio núcleo; y una pluralidad de peptidomiméticos de GD3 conectados a los terminales más externos de las ramas del dendrímero; y un dendrímero que comprende un aminoácido (p. ej., Lys, Arg, Glu, o Asp) que sirve como sitio núcleo de inicio, sirviendo el mismo aminoácido como unidad repetitiva conectada directamente a cada sitio núcleo, y una pluralidad de peptidomiméticos de GD3 conectados a terminales de las ramas de una manera similar.
CH_{2}CH_{2}- que sirve como unidad repetitiva (rama) que conecta con cada sitio núcleo; y una pluralidad de peptidomiméticos de GD3 conectados a los terminales más externos de las ramas del dendrímero; y un dendrímero que comprende un aminoácido (p. ej., Lys, Arg, Glu, o Asp) que sirve como sitio núcleo de inicio, sirviendo el mismo aminoácido como unidad repetitiva conectada directamente a cada sitio núcleo, y una pluralidad de peptidomiméticos de GD3 conectados a terminales de las ramas de una manera similar.
El dendrímero anteriormente mencionado que tiene
un átomo de nitrógeno que sirve como sitio núcleo de inicio puede
ser producido mediante un método rutinario u obtenido en forma de un
producto comercial (Polysciences, Inc., 400 Vally Road, Warrington,
PA, 18976 U.S.A.). El dendrímero anteriormente mencionado que tiene
un aminoácido que sirve como sitio núcleo de inicio y el mismo
aminoácido que sirve como unidad repetitiva conectada directamente
a cada sitio núcleo de inicio puede ser producido por medio del
método de síntesis de péptidos mencionado anteriormente. Además,
también se pueden utilizar los productos comerciales tales como la
resina
Fmoc_{8}-Lys_{4}-Lys_{2}-Lys-\betaAla-Alko
(producto de Watanabe Kagaku Kogyo).
Más específicamente, los dendrímeros mencionados
anteriormente pueden ser producidos por medio de la condensación de
\alpha,\omega-diaminoácidos que sirven como
unidades repetitivas y una resina para sintetizar un péptido en
fase sólida, donde dos grupos amino de cada aminoácido han sido
protegidos por grupos protectores, que son idénticos o diferentes
entre sí, en presencia o ausencia de un espaciador; y la repetición
de la separación de los grupos protectores.
Las resinas empleadas típicamente para la
síntesis de péptidos pueden ser empleadas como resina para
sintetizar un péptido en fase sólida. Los ejemplos incluyen resina
de poliestireno, resina de poliacrilamida, resina de
poliestireno-polietilenglicol, estando protegidos
terminalmente los grupos terminales de estas resinas con un grupo
funcional tal como clorometilo, 4-(hidroximetil)fenoxi, o
4-((\alpha-2',4'-dimetoxifenil)-9-fluorenilmetoxicarbonilaminometil)-fenoxi.
Se pueden emplear uno o más aminoácidos como espaciadores.
Los ejemplos de
\alpha,\omega-diaminoácidos incluyen lisina,
ornitina, ácido 1,4-diaminobutírico, y ácido
1,3-diaminopropiónico. La separación de los grupos
protectores se puede realizar por medio del método de síntesis de
péptidos anteriormente mencionado. Los ejemplos de los grupos
funcionales incluyen un grupo amino, un grupo carboxilo, y un grupo
hidroxilo.
El número de capas de las ramas se ajusta a 2n
realizando la condensación de una unidad repetitiva y la separación
de los grupos protectores n veces en total. Específicamente, el
número puede caer dentro de un intervalo de 2 a 16.
Mediante la unión de los peptidomiméticos de GD3
según la presente invención a los grupos funcionales conectados a
los terminales de las ramas del dendrímero, se puede obtener un MAP
de interés. El procedimiento se puede realizar según el método de
síntesis de péptidos anteriormente mencionado.
El MAP producido de este modo puede ser
purificado mediante cromatografía o un método similar de una manera
rutinaria utilizando una resina que obtenga una exclusión por
tamaños en una matriz tal como Sephacryl S-300
(producto de Pharmacia).
Los peptidomiméticos de GD3 según la presente
invención que se han unido a los terminales de las ramas del MAP
según la presente invención no son necesariamente idénticos entre
sí, y se pueden combinar arbitrariamente. Los ejemplos de las
combinaciones de diferentes peptidomiméticos de GD3 incluyen una
combinación de SEQ ID NOS: 1, 3, y 4; y una combinación de un
péptido que tenga una secuencia de aminoácidos de 15 restos
aminoácido mostrada en el SEQ ID NO: 4 y un péptido que tenga una
secuencia de aminoácidos de nueve restos aminoácido mostrada en la
Fig. 2. Semejante MAP complejo intensifica la estabilidad del mismo
en la sangre y los tejidos de la diana a la cual se administra MAP,
e intensifica la inmunogenicidad u otras propiedades de la molécula
a la cual se ha unido MAP. De este modo, se puede promover la
producción de un anticuerpo para GD3 por medio de cualquiera de los
peptidomiméticos de GD3 de la presente invención.
Cualquiera de los MAP de la presente invención
puede ser transformado en un MAP complejo en el que la proteína
portadora anteriormente mencionada (p. ej. polipéptido que promueve
la respuesta inmunitaria tal como IL-12 o
GM-CSF) para intensificar la inmunogenicidad está
unida en forma de una porción del peptidomimético de GD3 de la
presente invención o a un sitio núcleo de inicio. También se pueden
emplear otros gangliósidos que son expresados en células tumorales
distintas de los peptidomiméticos de GD3 de la presente invención,
tales como uno o más peptidomiméticos (p. ej., GM2, GM3, GD1, GD2,
GD3, y GT3), como constituyentes del MAP combinados con cualquiera
de los peptidomiméticos de GD3 de la presente invención. Los
ejemplos de los MAP complejos incluyen una combinación de al menos
un péptido que contiene una secuencia de aminoácidos representada
por el SEQ ID NO: 4 o una secuencia de aminoácidos de GD3R4
mostrada en la Fig. 2 con un péptido réplica que imita GD1\alpha
descrito en la Solicitud de Patente Japonesa Abierta a la
Inspección Pública (kokai) Núm. 10-237099
anteriormente
mencionada.
mencionada.
Las formas de MAP producidas de este modo de los
peptidomiméticos de GD3 de la presente invención muestran una
excelente inmunogenicidad y, por lo tanto, pueden ejercer los
efectos deseados; esto es, inducir la producción de un anticuerpo
anti-GD3 o aumentar la producción del
anticuerpo.
Los peptidomiméticos de GD3 de la presente
invención en forma MAP ejercen efectos deseados para una vacuna;
esto es, un efecto carcinostático y un efecto inhibidor de la
metástasis cancerosa. Además, se incorpora a los MAP un fármaco
arbitrario tal como un fármaco que promueve la respuesta inmunitaria
a los MAP y los MAP modificados de este modo pueden ser
administrados. Así, los MAP son ventajosos ya que se puede promover
la inducción de un anticuerpo diana, se puede incrementar
adicionalmente la producción de un anticuerpo, y se pueden
intensificar otros efectos.
La presente invención proporciona una
composición farmacéutica para seres humanos y animales que contiene,
como ingrediente activo, cualquiera de los peptidomiméticos de GD3
de la presente invención.
La composición farmacéutica es útil, como agente
de diagnóstico para el cáncer basándose en el efecto de que el
ingrediente activo se une a un anticuerpo para un antígeno GD3
relacionado con el cáncer, entre otros.
Preferiblemente, la composición farmacéutica de
la presente invención contiene, como ingrediente activo, cualquiera
de los peptidomiméticos de GD3 de la presente invención, en forma de
un péptido inmunogénico que tiene la capacidad de producir un
anticuerpo específico de GD3.
Los peptidomiméticos de GD3 de la presente
invención en forma del péptido inmunogénico anterior imitan la
estructura de GD3 y muestran una inmunogenicidad similar a la del
GD3. De este modo, los péptidos muestran un efecto
anti-tumoral basándose en la activación de los
efectos citotóxicos que dependen de un complemento o de un
anticuerpo inducido o producido o de la activación de las células T
citotóxicas; y un efecto inhibidor de la adherencia intercelular
por mediación de GD3 en las células tumorales que expresan GD3. Los
péptidos son útiles para una variedad de usos farmacéuticos.
Los ejemplos de los usos de los fármacos
proporcionados por la composición farmacéutica incluyen una vacuna
para estimular la inducción de un anticuerpo que reconoce GD3 o
intensificar la producción del anticuerpo; el uso
anti-tumoral, el uso carcinostático, o el uso
inhibidor de la metástasis cancerosa; y el tratamiento de los
tumores o los cánceres que expresan GD3, concretamente las
enfermedades seleccionadas del grupo que consiste en melanoma,
cáncer de intestino grueso, cáncer de ovario, cáncer de hígado,
cáncer de mama, cáncer de cerebro, cáncer de riñón, cáncer de
páncreas, cáncer cervical, cáncer esofágico, cáncer de pulmón, y
cáncer de estómago.
La composición farmacéutica de la presente
invención puede ser preparada en forma de una composición que
contiene una cantidad farmacéuticamente eficaz de cualquiera de los
peptidomiméticos de GD3 de la presente invención y un portador
farmacéuticamnete aceptable.
Los portadores farmacéuticamente aceptables
empleados en la presente invención son conocidos en la técnica y se
seleccionan apropiadamente según la forma de la composición que se
vaya a preparar. Cuando la composición que se va a preparar es una
solución acuosa, se pueden utilizar portadores tales como agua y
tampones fisiológicos sin limitación alguna, y también se pueden
utilizar glicol, glicerol, y ésteres orgánicos inyectables tales
como aceite de oliva.
La composición farmacéutica de la presente
invención puede contener adicionalmente otro ingrediente activo y
un ingrediente arbitrario para estabilizar la absorción del
ingrediente activo y potenciar la absorción. Los ejemplos de los
ingredientes arbitrarios incluyen hidrocarburos tales como glucosa,
sacarosa, y dextrano; antioxidantes tales como ácido ascórbico y
glutatión; agentes quelantes; estabilizantes tales como proteínas
de bajo peso molecular y albúmina; y vehículos.
En la composición farmacéutica de la presente
invención, se pueden incorporar apropiadamente aditivos arbitrarios
para diseñar preparaciones de fármacos. Los ejemplos incluyen una
variedad de aditivos empleados generalmente tales como agentes
antisépticos, agentes de para conferir tonicidad, tampones,
estabilizantes, solubilizadores, y promotores de la absorción. Los
ejemplos de agentes antisépticos incluyen aquellos eficaces para
hongos y bacterias tales como cloruro de benzalconio, cloruro de
benzetonio, clorhexidina, parabenos (p. ej., metilparabeno,
etilparabeno), y timerosal. Los ejemplos de los agentes para
conferir tonicidad incluyen alcoholes polihidroxilados tales como
D-manitol, D-sorbitol,
D-xilitol, glicerina, glucosa, maltosa, sacarosa, y
propilenglicol; y electrolitos tales como cloruro de sodio. Los
ejemplos de los estabilizadores incluyen tocoferol,
butilhidroxianisol, butilhidroxitolueno, sales de ácido
etilenediamino-tetraacético (EDTA), y cisteína.
Una forma de la composición farmacéutica de la
presente invención es una preparación de liposomas. Esta preparación
se describirá a continuación con detalle. La preparación puede ser
producida haciendo que cualquiera de los peptidomiméticos de GD3 de
la presente invención sea mantenido en liposomas que comprendan,
como ingrediente formador de la membrana, fosfolípidos ácidos o que
comprendan, como ingredientes formadores de la membrana,
fosfolípidos neutros y fosfolípidos ácidos.
No se impone ninguna limitación concreta sobre
el tipo de fosfolípido neutro y fosfolípido ácido que sirve como
ingredientes formadores de la membrana, y se pueden utilizar las
especies de lípidos que se utilizan rutinariamente en semejantes
preparaciones de liposomas solas o en combinaciones de dos o más
especies.
La membrana del liposoma se forma mediante el
método habitual mediante el uso de fosfolípidos ácidos como
ingredientes formadores de la membrana o mediante el uso de
fosfolípidos neutros y fosfolípidos ácidos combinados como
ingrediente formadores de la membrana. El contenido en fosfolípidos
ácidos es de aproximadamente 0,1 a aproximadamente 100% en moles
basándose en la cantidad total de ingredientes formadores de la
membrana del liposoma, preferiblemente de aproximadamente 1 a
aproximadamente 90% en moles, más preferiblemente de aproximadamente
10 a aproximadamente 50% en moles.
Tras la preparación de la membrana del liposoma,
se pueden incorporar aditivos tales como colesterol al fosfolípido,
para controlar de ese modo la fluidez, facilitando de este modo la
preparación de la membrana de los liposomas. La cantidad de
colesterol incorporada al fosfolípido es equivalente generalmente a
la del fosfolípido o menor, preferiblemente 0,5-1
equivalentes.
La proporción de fosfolípidos ácidos con
respecto al ingrediente o los ingredientes activos contenidos en
una dispersión de liposomas es de aproximadamente 0,5 a
aproximadamente 100 equivalentes, preferiblemente de
aproximadamente 1 a aproximadamente 60 equivalentes, más
preferiblemente de aproximadamente 1,5 a aproximadamente 20
equivalentes. La cantidad de cualquiera de los peptidomiméticos de
GD3 de la presente invención es de un pequeño% en moles a algunas
decenas% en moles basándose en la especie de lípidos totales,
preferiblemente de aproximadamente 5 a aproximadamente 10% en
moles, empleándose típicamente aproximadamente un 5% en moles.
La preparación, concentración, control del
tamaño de partículas, y otros procedimientos del liposoma se pueden
realizar mediante un método rutinario. Los diversos aditivos
anteriormente mencionados pueden ser incorporados a la preparación
de liposomas conforme a las necesidades.
Tras la producción del liposoma, se puede unir
un ácido graso (p. ej., ácido behénico, ácido esteárico, ácido
palmítico, ácido mirístico, u ácido oleico), un grupo alquilo, un
grupo colesterilo, o un grupo similar a cualquiera de los
peptidomiméticos de GD3 de la presente invención. La producción de
una preparación de liposomas mediante el uso de semejante péptido
modificado se puede realizar mediante un método rutinario (p. ej.,
Long Circulating Liposomes: Old drugs, New therapeutics., M. C.
Woodle, G. Storm, Eds: Springer-Verlag Berlin
(1998)).
No se impone ninguna limitación concreta sobre
la cantidad de ingredientes activos contenida en la composición
farmacéutica (preparación de fármaco) de la presente invención, y la
cantidad se puede seleccionar de un amplio intervalo, con tal que
sea farmacéuticamente eficaz.
Generalmente, cualquiera de los peptidomiméticos
de GD3 de la presente invención está contenido en una preparación
de fármacos en una cantidad de aproximadamente 0,00001 a
aproximadamente 70% en peso, preferiblemente de aproximadamente
0,0001 a aproximadamente 5% en peso. No se impone ninguna limitación
concreta sobre la cantidad de administración de la preparación de
fármaco, y la cantidad se selecciona apropiadamente de un amplio
intervalo según los efectos terapéuticos deseados, el método de
administración (vía), el período de la terapia, y la edad, el sexo,
y otras condiciones de los pacientes. Generalmente, la dosis diaria
por paciente por peso corporal (kg) cae preferiblemente en el
intervalo de aproximadamente 0,01 \mug a aproximadamente 10 mg
reducido a los ingredientes activos, preferiblemente de
aproximadamente 0,1 \mug a aproximadamente 1 mg. La preparación de
fármaco puede ser administrada una vez al día o de manera
dividida.
La composición farmacéutica de la presente
invención se emplea preferiblemente en forma de la composición de
vacuna mencionada anteriormente. En el uso como composición de
vacuna, la composición de la presente invención se administra
preferiblemente junto con una cantidad farmacéuticamente eficaz de
un coadyuvante combinado con el fin de potenciar su efecto
anti-tumoral.
No se impone una limitación concreta sobre el
tipo de coadyuvante, y los ejemplos incluyen coadyuvante completo
de Freund, muramildipéptido, BCG, IL-12,
N-acetilmuramin-L-alanil-D-isoglutamina
(MDP), timosina \alpha1, y QS-21. Aunque la
cantidad de coadyuvante que se va a administrar está limitada
dependiendo del tipo de condiciones patológicas del ser humano y
los animales causadas, tras la administración, por la reacción
inmunitaria tales como malestar, dolor, y eritema de la piel;
fiebre; dolor de cabeza; o dolores musculares, la dosis diaria de
coadyuvante por paciente (kg) es generalmente de aproximadamente 0,1
\mug a aproximadamente 1.000 \mug, preferiblemente de
aproximadamente 1 \mug a varios cientos de \mug.
La composición farmacéutica de la presente
invención puede ser utilizada combinada con otros fármacos, tales
como péptidos promotores de la respuesta inmunitaria y agentes
quimioterapéuticos para el cáncer (agentes
anti-cancerosos). La cantidad de fármaco
administrado combinado se determina apropiadamente según la cantidad
farmacéuticamente eficaz del fármaco. Por ejemplo, cuando se
utiliza GM-CSF, la dosis diaria del mismo por peso
corporal (kg) del paciente es generalmente de aproximadamente 0,1
\mug a aproximadamente 1.000 \mug, preferiblemente de
aproximadamente 1 \mug a algunos cientos de \mug.
Los ejemplos de los fármacos anteriormente
mencionados utilizados en la combinación incluyen agentes
quimioterapéuticos que incluyen 5-fluorouracilo
(5-FU), tales como agentes alquilantes, antagonistas
del metabolismo, preparaciones de antibióticos
anti-tumorales, preparaciones de origen vegetal
anti-tumorales; y las citocinas anteriormente
mencionadas que tienen una actividad
anti-tumoral.
En el uso combinado, se puede incorporar un
fármaco a los peptidomiméticos de GD3 en forma de MAP de la presente
invención de la manera mencionada antes. Además, también se puede
utilizar una sustancia de liberación de fármaco tal como un
microdispositivo que tenga una microcámara que pueda alojar otros
fármacos y que aloje los peptidomiméticos de GD3 de la presente
invención. Los ejemplos de tales sustancias de liberación de
fármacos incluyen sustancias biológicas tales como liposomas,
microcápsulas que tienen membranas permeables o
semi-permeables, y otros microdispositivos que
tienen microcámaras. Estas sustancias no son tóxicas y pueden ser
biodegradables.
La unión de estas sustancias de liberación de
fármacos y el peptidomimético de GD3 de la presente invención se
puede realizar mediante un método rutinario (p. ej., Harlow y Lane,
Antibodies: A laboratory manual, Cold Spring Harbor Lab. Press
(1988); y Hermanson, Bioconjugate Techniques, Academic Press
(1996)). Mediante un método conocido (p. ej., Liposomal application
to cancer therapy, Y. Namba, N. Oku, J., Bioact. Compat. Polymers,
8, 158-177 (1993)) se produce una composición
farmacéutica que contiene una sustancia tal como una citocina que
contiene un carcinostático y que ejerce una actividad
anti-tumoral.
Cuando la composición farmacéutica de la
presente invención se emplea como agente de diagnóstico, cualquiera
de los peptidomiméticos de GD3 de la presente invención - el
ingrediente activo - puede ser marcado para su detección. El
marcaje se puede realizar mediante un método rutinario, y se pueden
utilizar materiales tales como compuestos radiactivos, sustancias
fluorescentes, enzimas, biotina, y medios de contraste.
Mediante el empleo de semejante agente de
diagnóstico, se puede detectar un anticuerpo
anti-GD3 contenido en una variedad de muestras
tales como tejidos y células cancerosos y fluidos corporales tales
como sangre. De este modo, el agente de diagnóstico es útil para la
diagnosis del cáncer, el control de las condiciones patológicas,
etc.
La presente invención proporciona ADN que
comprende una secuencia que codifica cualquiera de los
peptidomiméticos de GD3 de la presente invención. El ADN es útil en
la producción anteriormente mencionada de los peptidomiméticos de
GD3 de la presente invención a través de un mecanismo de ingeniería
genética. El ADN es utilizado adecuadamente para producir una
vacuna de ADN que contiene el ADN como ingrediente activo.
Como se ha mencionado antes, el ADN que codifica
los peptidomiméticos de GD3 de la presente invención es
preferiblemente un ADN que codifica péptidos inmunogénicos que
tienen la capacidad de producir un anticuerpo específico de GD3
cuyos péptidos inmunogénicos son realizaciones de los
peptidomiméticos de GD3 de la presente invención. Además, el ADN
puede codificar las formas anteriormente mencionadas de los
peptidomiméticos de GD3 de la presente invención.
La vacuna mencionada anteriormente comprende una
composición farmacéutica que contiene, como ingrediente activo, el
ADN que codifica péptidos inmunogénicos que tienen la capacidad de
producir un anticuerpo específico de GD3 cuyos péptidos
inmunogénicos son realizaciones de los peptidomiméticos de GD3 de la
presente invención o un vector de expresión recombinante que puede
expresar el ADN.
La composición farmacéutica es útil para una
vacuna de ADN que se dirige a células o tejidos cancerosos de
mamíferos incluyendo los seres humanos, y los usos de la composición
farmacéutica son similares a los descritos en relación a la
composición farmacéutica que contiene, como ingrediente activo,
cualquiera de los peptidomiméticos de GD3 de la presente
invención.
La vacuna de ADN anteriormente mencionada puede
ser preparada en forma de una composición farmacéutica mediante el
método acostumbrado utilizando un portador farmacéuticamente
aceptable. Preferiblemente, la vacuna contiene una solución
fisiológicamente aceptable tal como solución salina fisiológica
esterilizada o solución salina fisiológica tamponada esterilizada.
De un modo similar al caso de la composición farmacéutica
anteriormente mencionada que contiene, como ingrediente activo,
cualquiera de los peptidomiméticos de GD3 de la presente invención,
la composición puede ser una preparación de fármaco en liposomas y
se puede utilizar combinada con un coadyuvante o un material
similar.
La composición farmacéutica puede contener un
fármaco arbitrario y aditivos. Los ejemplos del fármaco incluyen un
fármaco tal como iones calcio que promueven la incorporación del ADN
a las células, y los ejemplos de los aditivos incluyen materiales
para facilitar la transfección, tales como los liposomas
anteriormente mencionados, las emulsiones de fluorocarbonos, los
cocleatos, los túbulos, las partículas de oro, las microesferas
biodegradables, y los polímeros catiónicos.
La cantidad del ADN que puede ser expresado y es
introducido en un anfitrión de vacunación o la cantidad del ARN
transcrito que es introducido en un anfitrión de vacunación se
selecciona de un amplio intervalo de cantidades de administración.
La cantidad varía, por ejemplo, de acuerdo con la capacidad de los
promotores de la transcripción y la traducción empleados. La
intensidad de la respuesta inmunitaria varía de acuerdo con el nivel
de expresión de proteína y la inmunogenicidad de los productos
génicos expresados. Generalmente, la vacuna se administra
parenteralmente en una cantidad eficaz de aproximadamente 1 ng a
aproximadamente 5 mg basándose en el ADN, preferiblemente de
aproximadamente 100 ng a aproximadamente 2,5 mg, más preferiblemente
de aproximadamente 1 \mug a aproximadamente 750 \mug, aún más
preferiblemente de aproximadamente 10 \mug a 300 \mug.
Generalmente, la vacuna se administra directamente a los tejidos
musculares. Alternativamente, también se pueden emplear otros
métodos de administración tales como la inyección hipodérmica, la
introducción en el corion, la impresión cutánea, la administración
intraperitoneal, la administración intravenosa, y la inhalación.
En general, la vacuna no es administrada de una
vez, sino que se efectúa una vacunación de refuerzo una o más veces
de manera que se intensifique el efecto de la vacuna mientras se
controlan las condiciones de los especímenes a los que se ha
administrado. Alternativamente, la vacunación de ADN puede estar
seguida de un refuerzo mediante el uso de la composición
farmacéutica anteriormente mencionada que comprende el
peptidomimético de GD3 de la presente invención. Además, las
combinaciones anteriormente mencionadas pueden potenciar la eficacia
de la terapia.
No se impone ninguna limitación concreta sobre
el tipo de vector de expresión recombinante que puede expresar el
ADN de la vacuna de ADN anteriormente mencionada, y se pueden
emplear los vectores de expresión empleados generalmente en tales
tipos de vacunas de ADN y otros vectores de expresión utilizables.
Estos vectores pueden ser producidos mediante un método
rutinario.
Los peptidomiméticos de GD3 de la presente
invención funcionan como antígenos y producen los correspondientes
anticuerpos. Específicamente, cualquiera de los péptidos que se unen
a GD3 se unen a células tales como las células tumorales malignas
(p. ej., células de melanoma) que expresan GD3, produciendo de ese
modo un anticuerpo (anticuerpo neutralizador) que inhibe la
proliferación de las células y muestra actividad para inhibir la
metástasis de las células. La presente invención también proporciona
semejante anticuerpo.
La confirmación de la producción de semejante
anticuerpo se considera como un ensayo para el diagnóstico de que
el peptidomimético de GD3 de la presente invención es un péptido
inmunogénico que tiene la capacidad de producir un anticuerpo
específico de GD3.
Los anticuerpos según la presente invención
incluyen anticuerpos monoclonales y policlonales. Estos anticuerpos
pueden ser producidos por medio de un mecanismo empleado
rutinariamente mediante el uso del peptidomimético de GD3 como
inmunógeno.
A continuación, se describirá con detalle la
producción del anticuerpo monoclonal. El anticuerpo monoclonal
puede ser producido, por ejemplo, fusionando células de plasma
(inmunocitos) de un mamífero que ha sido inmunizado con el
inmunógeno anterior y células de plasmacitoma (células de mieloma)
del mamífero, para de ese modo producir células fusionadas
(hibridomas); seleccionando un clon que produce el anticuerpo
deseado que reconoce GD3 (anticuerpo monoclonal); y cultivando el
clon. El anticuerpo monoclonal es producido fundamentalmente según
un método rutinario (p. ej., Hanfland, P., Chem. Phys. Lipids, 15,
105 (1975); Hanfland, P., Chem. Phys. Lipids, 10, 201 (1976); y
Koscielak, J., Eur. J. Biochem., 37, 214 (1978)).
No se impone una limitación concreta sobre el
mamífero que es inmunizado con el inmunógeno en el método anterior,
y se utilizan preferiblemente ratones, ratas, etc. desde el punto de
vista de la compatibilidad de las células de plasmacitoma que se
van a fusionar. La inmunización se puede realizar mediante un método
rutinario tal como la administración del inmunógeno anterior a un
mamífero por medio de inyección (p. ej., intravenosa, intradérmica,
hipodérmica, o intraperitoneal).
Más específicamente, cuando se utilizan ratones,
preferiblemente, el inmunógeno se diluye a una concentración
apropiada con un diluyente tal como solución salina fisiológica
tamponada con fosfato (PBS) o solución salina y se administra,
combinado con un coadyuvante rutinario opcional según las
necesidades, a un espécimen animal varias veces a intervalos de 2 a
14 días en una cantidad total de aproximadamente 100 a
aproximadamente 500 \mug/ratón. Los ejemplos del coadyuvante que
se emplea preferiblemente en el procedimiento anterior incluye
vacuna de pertusis, coadyuvante completo de Freund, y ALUM. Los
inmunocitos empleados preferiblemente incluyen células de bazo que
han sido extirpadas aproximadamente tres días después de la
administración final del
inmunógeno.
inmunógeno.
Una variedad de células de plasmacitoma de
mamífero conocidas pueden ser empleadas como células
contra-parentales que se van a fusionar con los
inmunocitos anteriores. La fusión se puede realizar mediante
cualquier método conocido, tal como el método descrito por Milstein
et al. (Method in Enzymology, 73, 3 (1981)). El aislamiento
y la clonación de los hibridomas producidos se pueden realizar
mediante métodos rutinarios.
Las cepas productoras de anticuerpos diana
pueden ser recobradas mediante una variedad de métodos empleados
generalmente para detectar anticuerpos ("Hybridoma Method and
Monoclonal Antibody", expedido por R&D Planning,
30-53, 5 Marzo, 1982). Los ejemplos de los métodos
incluyen el método ELISA (Engvall, E., Meth. Enzymol., 70,
419-439 (1980)), el método en placa, el método de la
aplicación, el método de la aglutinación, el método de Ochterlony,
y el radioinmunoanálisis (RIA). Tras la recuperación, se pueden
emplear el inmunógeno anteriormente mencionado y GD3.
Los hibridomas producidos de este modo que
producen el anticuerpo monoclonal deseado que reconoce GD3 pueden
ser subcultivados en un medio rutinario y conservados durante un
largo período de tiempo en nitrógeno líquido. Los ejemplos de los
métodos para recoger un anticuerpo monoclonal de los hibridomas
incluyen un método que comprende cultivar los hibridomas de una
manera rutinaria y recoger el anticuerpo del sobrenadante de
cultivo; y un método que comprende administrar los hibridomas a un
mamífero compatible con los hibridomas para la proliferación de los
hibridomas y recoger un anticuerpo de la ascitis. El primer método
es adecuado para producir un anticuerpo de gran pureza, mientras el
último método es adecuado para la producción en masa de un
anticuerpo.
El sobrenadante de cultivo y la ascitis de ratón
obtenidos mediante los métodos anteriores y que contienen
hibridomas que producen anticuerpos pueden ser empleados como
líquidos de anticuerpo brutos. Alternativamente, los líquidos
brutos pueden ser purificados mediante un método rutinario; esto es,
un método tal como el fraccionamiento con sulfato de amonio, la
precipitación por adición de sal, la filtración en gel, la
cromatografía de intercambio iónico, o la cromatografía de afinidad
tal como la cromatografía en columna con proteína A, para rendir de
ese modo anticuerpo purificado.
La presente invención se describirá a
continuación con más detalle por medio de ejemplos, que no se deben
considerar limitantes de la invención.
En la presente memoria se emplean las siguientes
abreviaturas.
TBS: Solución salina tamponada con tris
fosfato
TC: tetraciclina
KM: kanamicina
PEG/NaCl: polietilenglicol/cloruro de sodio
TFA: ácido trifluoroacético
\vskip1.000000\baselineskip
Ejemplo
1
Según el procedimiento descrito por Nishi T.,
Saya H., et al. (FEBS Letter, 399, 237-240
(1996)), se insertaron fragmentos de ADN al azar que codificaban
péptidos de 15 restos aminoácido al azar en el gen de la proteína
de la envuelta del fago PIII, para de ese modo preparar bibliotecas
de presentación en fagos de interés que contenían genes capaces de
expresar péptidos de 15 restos aminoácido al azar sobre la
superficie de la cubierta de los respectivos
fagos.
fagos.
Puesto que los fagos contienen un gen resistente
TC, E. coli infectada con los fagos es resistente a TC. Las
bibliotecas de fagos construidas de este modo fueron almacenadas en
una solución de TBS que contenía NaN_{3} al 0,02%.
Los rasgos característicos de las bibliotecas de
presentación en fagos anteriormente mencionadas son descritos por
Scott, J. K. and Smith G. P. (Science, 249, 386-390
(1990)).
El anticuerpo anti-GD3 empleado
es un anticuerpo monoclonal anti-GD3 4F6 (referido
en adelante como anticuerpo de GD3 4F6). El anticuerpo de GD3 4F6
es un anticuerpo monoclonal de ratón (IgG) contra GD3 (Thomas C. P.,
et al., Glycoconj. J., 13 (3), 377-384
(1996)), que es proporcionado amablemente por el Dr. Jacques
Portoukalian (INSERM, France).
Una suspensión de proteína A Sepharose
recombinante (50 \muL) (Protein A Sepharose Fast Flow; producto de
Pharmacia Biotech K.K., Código Núm:
17-1279-01, Lote Núm: 237393) fue
transferida a un tubo Eppendorf de 0,5 mL, y a este se añadió TBS
(400 \muL). Con posterioridad, se añadió el anticuerpo de GD3 4F6
(1 mL), y la mezcla se dejó reaccionar durante la noche a 4°C con
agitación cuidadosa. Una vez completada la reacción, la mezcla se
centrifugó a 3.000 rpm durante 5 minutos, se descartó el
sobrenadante, se añadió TBS (0,5 mL) al residuo, y la mezcla se
agitó cuidadosamente. La mezcla resultante se transfirió a un tubo
Eppendorf de 1,5 mL. A esto se añadió TBS (0,5 mL), la mezcla se
centrifugó a 3.000 rpm durante 5 minutos, y el sobrenadante se
descartó. Con posterioridad, se añadió TBS (1 mL) al residuo, la
mezcla se centrifugó a 3.000 rpm durante 5 minutos, y el
sobrenadante se separó. Se añadió TBS (100 \muL) al residuo, para
producir de ese modo una suspensión; esto es, una suspensión de
proteína A Sepharose (100 \muL) unida a anticuerpo de GD3 4F6, que
se almacenó a 4°C hasta su uso.
Una alícuota de la suspensión de proteína A
Sepharose recombinante así obtenida (50 \muL) fue transferida a
un tubo Eppendorf de 1,5 mL, y a esto se añadió TBS (900 \muL).
Con posterioridad, se añadieron 12 mg/mL suero patrón con
inmunoglobulina de ratón (Núm. de Código:
RS10-101-2; producto de Bethyl;
adquirido de Cosmo Bio Co., Ltd.) en TBS (volumen total de la
solución resultante: 100 \muL), y la mezcla se dejó reaccionar
durante la noche a 4ºC con agitación cuidadosa. (La proteína A se
hizo reaccionar con una cantidad excesiva de IgG con el fin de
minimizar la cantidad de proteína A que permanecía sin reaccionar).
Una vez completada la reacción, la mezcla se centrifugó a 3.000 rpm
durante 5 minutos, el sobrenadante se separó, se añadió TBS (1 mL)
al residuo, y la mezcla se agitó cuidadosamente. La mezcla
resultante se transfirió a un tubo Eppendorf de
1,5-mL. La mezcla se centrifugó a 3.000 rpm durante
5 minutos, y el sobrenadante se separó. Después de repetir este
procedimiento tres veces, se añadió TBS (100 \muL) al residuo,
para preparar de ese modo una suspensión; esto es, una suspensión
de proteína A Sepharose recombinante (100 \muL) unida a IgG de
ratón (250 \mug), que se almacenó a 4ºC hasta su uso.
La E. coli empleada como anfitriona del
fago es E. coli K91KAN (cepa resistente a la kanamicina;
amablemente proporcionada por el Profesor SAYA, Hideyuki, Department
of Tumor Genetics and Biology of Kumammoto University).
Mediante la utilización de un asa de platino
desechable, se inoculó E. coli K91KAN en una placa NZY que
contenía 100 \mug/mL de kanamicina (producto de Wako Pure
Chemicals Industries, Ltd.) para la incubación a 37ºC durante la
noche. Al día siguiente, la placa se separó de la incubadora y se
almacenó a 4ºC hasta su uso.
El día antes de que E. coli fuera
infectada con los fagos, se recogió una pequeña cantidad de la E.
coli que se había almacenado a 4ºC en la placa utilizando un
asa de platino, y se inoculó en medio NZY (5 mL) que contenía 100
\mug/mL de kanamicina, seguido de cultivo con sacudimiento a 200
rpm a 37ºC durante la noche (pre-cultivo). Al día
siguiente, la mezcla cultivada (100 \muL) fue transferida a un
medio NZY reciente (10 mL), seguido de cultivo con sacudimiento a
37ºC durante 4 horas. Después de eso, con el fin de que las células
desarrollen cilios, se detuvo el sacudimiento, y se dejó que las
células reposaran durante 30 minutos. Las células de E. coli
preparadas de este modo se infectaron con fagos como se describe más
abajo.
El medio NZY anteriormente mencionado se obtuvo
por medio de las siguientes etapas: Se disolvieron NZ amina A
(producto de Wako Pure Chemicals Industries, Ltd.; Núm. de Código:
541-00241) (10 g), extracción de levadura cervecera
(nombre de fábrica: EBIOS, producto de Asahi Breweries, Ltd.) (5 g),
y NaCl (5 g) en agua destilada (1 L); a esto se añadió NaOH 5 N (1
mL); el pH de la mezcla se ajustó a 7,5; la mezcla se esterilizó en
un autoclave; y la mezcla resultante se almacenó a la temperatura
ambiente hasta su uso.
Las células anfitrionas de E. coli fueron
infectadas con los fagos preparados en el procedimiento descrito en
el apartado (1).
Brevemente, se colocaron E. coli K91KAN
(10 \muL) y una preparación de fago diluida (10 \muL) en un tubo
de centrífuga de 15 mL, y la mezcla se dejó reaccionar a la
temperatura ambiente durante 15 minutos. Se añadió medio NZY (que
contenía 0,2 \mug/mL de TC) (1 mL) que se había calentado de
antemano a 37ºC a la mezcla, seguido de cultivo con sacudimiento a
2.000 rpm a 37°C durante 40 minutos. Se inoculó una alícuota (200
\muL) de la mezcla resultante en una placa con NZY (que contenía
20 \mug/mL de TC y 100 \mug/mL de KM) para la incubación a 37ºC
durante la noche. Al día siguiente, se contó el número de
colonias.
Se preparó un control negativo añadiendo E.
coli K91KAN (10 \muL) al líquido de dilución (10 \muL).
Puesto que esta mezcla permanecía sensible a TC, no se produjo la
amplificación de los fagos de la placa con NZY que contenía TC.
La amplificación de los fagos que fueron
recuperados mediante bioinmunopurificación ("biopanning"), que
se describirá en la presente memoria más adelante, se realizó de la
siguiente manera.
La cantidad completa de la solución de fago,
exceptuando la cantidad (2 \muL) que se iba a utilizar para la
medición del título, se colocó en un tubo Eppendorf de
1,5-mL, y a esto se añadió la E. coli K91KAN
(100 \muL) preparada antes, seguido de reacción a la temperatura
ambiente durante 15 minutos. Una vez completada la reacción, se
añadió toda la cantidad de la mezcla a un medio con NZY con
suplemento de TC (20 mL; la cantidad de TC: 0,2 \mug/mL) que se
había calentado de antemano a 37ºC en un tubo de centrífuga de de 50
mL, seguido de cultivo con sacudimiento a 200 rpm a 37ºC durante 40
minutos. Se añadieron 20 mg/mL de TC (20 \muL), y la mezcla se
sometió de nuevo a cultivo con sacudimiento a 37°C durante la noche.
Al día siguiente, la mezcla resultante se centrifugó a 3.000 rpm
durante 10 minutos. El sobrenadante se transfirió a un tubo de
centrífuga Oakridge y se centrifugó a 12.000 rpm durante 10
minutos, para de ese modo separa completamente las células de E.
coli. El sobrenadante se transfirió a otro tubo de centrífuga
Oakridge, y se añadió PEG/NaCl (3 mL) a esto, seguido de agitación.
La mezcla resultante se dejó estar a 4ºC durante 4 horas o más.
Con posterioridad, se realizó la centrifugación
a 12.000 rpm durante 10 minutos para ocasionar la sedimentación de
los fagos amplificados. El sobrenadante se separó, y el sedimento de
fagos se suspendió en TBS (1 mL). La suspensión se transfirió a un
tubo Eppendorf de 1,5-mL Eppendorf y se centrifugó a
15.000 rpm durante 10 minutos, para separar de ese modo las
sustancias insolubles. El sobrenadante se transfirió a otro tubo
Eppendorf, a esto se añadió PEG/NaCl (150 \muL), y la mezcla se
agitó cuidadosamente y se dejó estar a 4°C durante 1 hora o
más.
La mezcla se centrifugó a 15.000 rpm durante 10
minutos, para permitir de este modo que precipitaran los fagos. El
sobrenadante se separó, y el sedimento de fagos precipitados se
resuspendió en TBS (200 \muL) que contenía 0,02% de NaN_{3}. La
suspensión se centrifugó a 15.000 rpm durante 10 minutos, para
sedimentar de ese modo las sustancias insolubles. El sedimento se
transfirió a un tubo Eppendorf de 500 \muL para su almacenamiento
a 4ºC, y se empleó como fuente de "fago amplificado" en cada
ronda de inmunopurificación.
Los fagos fueron titulados de la siguiente
manera.
Para la titulación de los fagos recuperados en
cada ronda, se utilizaron preparaciones de fagos diluidas 10^{2},
10^{3}, y 10^{4}, mientras para la titulación de los fagos
amplificados, se utilizaron preparaciones diluidas 10^{7},
10^{8}, y 10^{9}. Se empleó TBS/gelatina (producto de Wako Pure
Chemicals Industries, Ltd.) como solución de dilución, y la
dilución se realizó según el siguiente esquema de dilución.
dilución \times10^{2}: solución de fago (2
\muL) + TBS/gelatina (198 \muL)
dilución \times10^{3}: solución de fago
diluida 10^{2} (10 \muL) + TBS/gelatina (90 \muL)
dilución \times10^{4}: solución de fago
diluida 10^{2} (2 \muL) + TBS/gelatina (198 \muL)
dilución \times10^{6}: solución de fago
diluida 10^{4} (2 \muL) + TBS/gelatina (198 \muL)
dilución \times10^{7}: solución de fago
diluida 10^{6} (10 \muL) + TBS/gelatina (90 \muL)
dilución \times10^{8}: solución de fago
diluida 10^{6} (2 \muL) + TBS/gelatina (198 \muL)
dilución \times10^{9}: solución de fago
diluida 10^{8} (10 \muL) + TBS/gelatina (90 \muL)
El título de fago se calculó a partir de la
siguiente ecuación.
\text{Título/mL} = colonia\ x\ 1
. 020\ (\mu L)/200\ (\mu L)\ x\ 1 . 000\ (\mu L)/10\ (\mu L)\ x\
factor\ de\
dilución
El título total de los fagos recuperados se
calculó multiplicando el valor anterior por el volumen total (mL)
de la solución de fago recuperada.
Puesto que los fagos empleados para la reacción
tienen un título de 6,2 x 10^{10} la tasa de recuperación (%) se
define como el "título total de fagos recuperados/6,2 x
10^{10}" X 100.
En el escrutinio (bioinmunopurificación) de los
clones de fagos que expresan péptidos capaces de unirse al
anticuerpo de GD3 4F6 con especificidad, con el fin de escrutar
eficazmente los fagos capaces de unirse a la región Fab del
anticuerpo de GD3 4F6, se hizo reaccionar el anticuerpo de GD3 4F6
con la biblioteca de fagos de la cual se habían excluido de
antemano los fagos que se unen a IgG de ratón y/o proteína A
Sepharose recombinante.
Específicamente, la bioinmunopurificación se
realizó mediante el siguiente procedimiento.
Ronda
1
Se disolvieron IgG de ratón normalizada -
proteína A Sepharose recombinante (10 \muL) y A Sepharose
recombinante (50 \muL) en PBS (340 \muL), y a esto se añadió
una biblioteca de fagos (10 \muL) (título 6,2 \times 10^{10}).
La mezcla se dejó reaccionar en un tubo Eppendorf de 500 \muL a
4ºC durante la noche, seguido de centrifugación a 30.000 rpm
durante 3 minutos, para separar de ese modo las partículas de fago
unidas a IgG de ratón normalizada y/o proteína A Sepharose
recombinante.
El sobrenadante (380 \muL) y el anticuerpo
para GD3 4F6 - proteína A recombinante Sepharose (50 \muL)
preparado en la etapa (2) anterior se transfirieron a un tubo
Eppendorf de 500 \muL y se dejaron reaccionar a 4ºC durante 5
horas, seguido de centrifugación a 3.000 rpm durante 3 minutos.
El sobrenadante se descartó, y se añadió PBS
(0,5 mL) al sedimento, para preparar de ese modo una suspensión. La
suspensión se transfirió después a un tubo Eppendorf de 1,5 mL,
seguido de centrifugación a 3.000 rpm durante 3 minutos. Después de
repetir dos veces este procedimiento, se descartó el sobrenadante, y
se añadió PBS (500 \muL) al sedimento, con lo que se obtuvo una
suspensión. La suspensión se transfirió a un tubo Eppendorf de 500
\muL, seguido de centrifugación a 3.000 rpm durante 3 minutos. El
sobrenadante se descartó, y se añadió tampón de extracción (50
\muL) al sedimento, y la mezcla se dejó estar a la temperatura
ambiente durante 15 minutos con agitación suave realizada cada 3
minutos, seguido de centrifugación a 3.000 rpm durante 3 minutos.
El sobrenadante se transfirió a un concentrador (CentriconTM 30
Concentrator: producto de Amicon Corporation) y se neutralizó con
Tris 1 M (pH 9,1) (75 \muL), y después se añadió a esto TBS (2
mL).
La mezcla se centrifugó a 5.000 rpm durante 20
minutos, se añadió TBS (2 mL), y la centrifugación se realizó a
5.000 rpm durante 20 minutos.
La solución de fago que quedaba en el filtro se
transfirió a un tubo Eppendorf de 1,5 mL. El filtro se lavó con TBS
(50 \muL), y los lavados se añadieron al tubo Eppendorf (volumen
total: 470 \muL). Los fagos obtenidos fueron amplificados
(4).
Ronda
2
Los fagos amplificados (100 \muL) preparados
en la Ronda 1 e IgG de ratón normalizada - proteína A Sepharose
recombinante (10 \muL; 25 \mug) se disolvieron en PBS (350
\muL), y la mezcla se transfirió a un tubo Eppendorf de 500
\muL para la reacción a 4ºC durante la noche. Con posterioridad,
se añadió proteína A Sepharose recombinante (50 \muL), y la
mezcla se dejó reaccionar a 4ºC durante la noche y después se
centrifugó a 3.000 rpm durante 3 minutos, rindiendo un sobrenadante
(500 \muL).
El sobrenadante (500 \muL) se transfirió a un
tubo Eppendorf de 1,5 mL, a esto se añadió una solución de
anticuerpo anti-GD3 (1 mL), y la mezcla se dejó
reaccionar a 4ºC durante la noche, seguido de separación centrífuga
a 3.000 rpm durante 3 minutos.
Con posterioridad, se añadió a esto proteína A
Sepharose recombinante (50 \muL), y la mezcla se dejó reaccionar
a 4ºC durante 3 horas, después se centrifugó a 3.000 rpm durante 3
minutos. El sobrenadante se descartó, y se añadió TBS (1 mL) al
sedimento, para preparar de ese modo una suspensión. La suspensión
se transfirió a un tubo Eppendorf de 1,5 mL y después se centrifugó
a 3.000 rpm durante 3 minutos. Después de repetir este
procedimiento dos veces, el sobrenadante se descartó, se añadió al
sedimento tampón de extracción (50 \muL), y la mezcla se dejó
estar a la temperatura ambiente durante 15 minutos con agitación
suave realizada cada 3 minutos, seguido de centrifugación a 3.000
rpm durante 3 minutos. El sobrenadante se transfirió a un
concentrador y se neutralizó con Tris 1 M (pH 9,1) (75 \muL), y
después se añadió a esto TBS (2 mL). La mezcla se centrifugó a
5.000 rpm durante 20 minutos, se añadió TBS (2 mL), y la
centrifugación se realizó a 5.000 rpm durante 20 minutos. La
solución de fago que quedaba en el filtro del Centricon se
transfirió a un tubo Eppendorf de 1,5 mL. El filtro se lavó con TBS
(50 \muL), y los lavados se añadieron al tubo Eppendorf (volumen
total: 230 \muL). Los fagos obtenidos fueron
amplificados.
amplificados.
Ronda
3
Se repitió el procedimiento general empleado en
la Ronda 1 utilizando los fagos amplificados (100 \muL) preparados
en la Ronda 2. De este modo, por medio de la reacción de los fagos
con la solución de anticuerpo anti-GD3, se
obtuvieron fagos amplificados. Los fagos obtenidos de este modo se
centrifugaron utilizando un Centricon, por medio de lo cual se
recuperó el eluato en un volumen total de 110 \muL.
Los resultados de las 3 rondas anteriores de
inmunopurificación (tasas de recuperación de clones de fagos de las
respectivas rondas) se muestran en la Tabla 1.
\vskip1.000000\baselineskip
En la Tabla 1, "fd tipo salvaje" hace
referencia a la cepa de fago de tipo salvaje de prototipo no
peptídico que está siendo insertada - que fue proporcionada para
construir bibliotecas de fagos en el Ejemplo 1. Los fagos prototipo
fueron preparados mediante el siguiente procedimiento y empleados en
el presente ensayo. Brevemente, los vectores de fago formados de
moléculas de ADN de los fagos que constituyen la biblioteca de
péptidos de fagos fueron escindidos para la separación de los
sitios de inserción de los péptidos, y los fragmentos de vectores
restantes fueron ligados. Los vectores reconstruidos de este modo
fueron utilizados para transformar E. coli JM109 (adquirida
de Takara), los transformantes resultantes fueron cultivados con
medio NZY durante la noche, y los fagos amplificados fueron
recuperados.
La secuenciación de los péptidos expresados por
los clones de fagos preparados por medio de las 3 rondas de
inmunopurificación descritas antes se realizó como sigue.
A partir de cada una de las placas obtenidas
mediante la medición del título descrita antes realizada después de
completar las 3 rondas de bioinmunopurificación, se seleccionaron al
azar 32 colonias arbitrarias, se inocularon en una nueva placa con
NZY, y se incubaron a 37ºC durante la noche. La placa resultante,
que servía como placa maestra, se almacenó a 4ºC.
En un medio NZY (20 mL, que contenía 20
\mug/ml de TC) dispuesto en un tubo de centrífuga de
50-mL, se suspendió cada colonia de la placa
maestra, seguido de cultivo con sacudimiento a 200 rpm a 37ºC
durante la
noche.
noche.
El cultivo se sometió a separación centrífuga a
3.000 rpm durante 10 minutos. El sobrenadante se transfirió a un
tubo de centrífuga Oakridge y se centrifugó a 12.000 rpm durante 10
minutos, para separar de ese modo las células de E. coli. El
sobrenadante se transfirió a otro tubo de centrífuga Oakridge, y a
esto se añadió PEG6000/NaCl (3 mL; PEG = polietilenglicol), seguido
de agitación cuidadosa. La mezcla resultante se dejó estar a 4ºC
durante 4
horas.
horas.
Con posterioridad, se realizó la centrifugación
a 12.000 rpm durante 10 minutos para ocasionar la sedimentación de
los fagos. El sobrenadante se separó, y el sedimento de fagos se
suspendió en TBS (1 mL). La suspensión se transfirió a un tubo
Eppendorf de 1,5 ml y se centrifugó a 15.000 rpm durante 10 minutos,
para separar de ese modo las sustancias insolubles. El sobrenadante
se transfirió a otro tubo Eppendorf, a esto se añadió PEG/NaCl (150
\muL), y la mezcla se agitó cuidadosamente y se dejó estar a 4ºC
durante 1 hora.
La mezcla se centrifugó a 15.000 rpm durante 10
minutos, para permitir de ese modo que los fagos precipitaran. El
sobrenadante se separó, y el sedimento de fagos precipitados se
resuspendió en TBS (200 \muL). La suspensión se centrifugó a
15.000 rpm durante 10 minutos, para sedimentar de ese modo las
sustancias insolubles. El sedimento se transfirió a un tubo
Eppendorf de 0,5 mL para el almacenamiento de los clones de fagos a
4°C.
La extracción de ADN de los clones de fagos así
obtenidos se realizó de la siguiente manera. Los clones de fagos,
TBS, y fenol saturado con TE (producido por Nippon Gene Co., Ltd.)
se colocaron en un tubo Eppendorf de 1,5 mL en cantidades de 100
\muL, 100 \muL, y 200 \muL, respectivamente, y la mezcla se
agitó violentamente durante 10 minutos, después se sometió a
separación centrífuga a 15.000 rpm durante 10 minutos. Con
posterioridad, se añadieron fenol saturado con TE (200 \muL) y
cloroformo (200 \muL) al sobrenadante (fase acuosa; 200 \muL), y
la mezcla se agitó violentamente durante 10 minutos, seguido de
separación centrífuga a 15.000 rpm durante 10 minutos. Se añadieron
TE (250 \muL), acetato de sodio 3 M (40 \muL), 20 mg/mL de
glicógeno (producto of Boehringer Mannheim; 1 \muL), y etanol (1
ml) al sobrenadante (fase acuosa; 150 \muL), y la mezcla se dejó
estar a -20ºC durante una hora en un tubo Eppendorf de 1,5 mL,
seguido de separación centrífuga a 15.000 rpm durante 10 minutos.
El sobrenadante se descartó, se añadió suavemente etanol del 80%
(-20°C; 1 mL) al residuo, y las sales restantes se separaron por
medio de separación centrífuga a 15.000 rpm durante 10 minutos. El
sobrenadante se descartó, se evaporó la humedad del tubo, y el ADN
que precipitó se disolvió en agua destilada esterilizada (10
\muL) para el almacenamiento
4°C.
4°C.
Los ADN de fagos obtenidos de este modo se
sometieron a secuenciación de aminoácidos de los péptidos.
La secuencia de aminoácidos de un péptido
codificado por el ADN del fago fue determinada mediante el método
de terminación con colorante utilizando un kit de secuenciación de
ADN (producido por Perkin Elmer, Código; 402079, Lote; A6L015)
según el manual anexado al kit. La secuencia de ADN del cebador,
mostrada como SEQ ID NO: 10, fue sintetizada con un sintetizador de
ADN automático.
La reacción de elongación para el ADN se realizó
mediante el uso de un ciclador térmico (Modelo 9600, Perkin Elmer,
25 ciclos, consistiendo un ciclo en 96°C durante 10 segundos, 50°C
durante 5 segundos, y 60°C durante 4 minutos). Para secuenciar el
ADN, se empleó una secuenciador de ADN (ABIPRISMTM 377, producto de
ABI).
De los 32 clones, las secuencias de ADN de 27
clones fueron determinadas con éxito y clasificadas en 4 tipos.
Estos 4 tipos de péptidos, tomados como peptidomiméticos de GD3,
fueron denominados "GD3R1", "GD3R2", "GD3R3", y
"GD3R4" (desde la aparición más alta a la más baja).
Las secuencias de aminoácidos de las cuatro
especies de peptidomiméticos de GD3 determinadas de este modo están
representadas por los SEQ ID NO: 1, 2, 3, y 4, y las secuencias de
ADN que codifican estas 4 especies de aminoácidos están
representadas por los SEQ ID NO: 5, 6, 7, y 8.
\vskip1.000000\baselineskip
Ejemplo
2
Se añadió una solución de NaHCO_{3} 0,1 M que
contenía cada uno de los clones de fagos obtenidos en el Ejemplo 1
(título 10^{11}, 10^{10}, o 10^{9}/100 \muL) a los pocillos
de una placa de microtitulación de 96 pocillos (producto de Nunc),
para la inmovilización de los clones de fagos a la temperatura
ambiente durante una hora. El sobrenadante se separó, después los
pocillos se sometieron a bloqueo mediante el uso de una solución de
bloqueo (400 mL; TBS que contiene 1% de BSA, 0,1% de leche
desnatada, y 0,02% de Tween 20; pH 7,5) a 37°C durante cuatro
horas.
El sobrenadante se separó, después se añadió el
anticuerpo para GD3 4F6 (100 \muL), que servía como anticuerpo
primario, a cada pocillo para la reacción con sacudimiento a la
temperatura ambiente durante dos horas. Una vez completada la
reacción, el sobrenadante se separó, después se lavaron los pocillos
seis veces con una solución de lavado (400 \muL para cada
pocillo, TBS que contenía 0,05% de Tween 20). Con posterioridad, se
añadió a los pocillos un anticuerpo secundario
(anti-IgG-HRP de ratón, producto de
Santa Cruz Biotechnology, Núm. de catálogo SC-2031,
Lote. Núm. C089) que se diluyó 5.000 veces utilizando una solución
de bloqueo preparada de antemano a los pocillos (100 \muL a cada
pocillo) para la reacción con sacudimiento a la temperatura ambiente
durante una hora. Una vez completada la reacción, los pocillos se
lavaron cuatro veces con una solución de lavado (400 \muL para
cada pocillo), después se añadió un reactivo de detección (TMB
Microwell; producto de KPL, Núm. Catálogo
50-76-04, Lote Núm. WF075) a los
pocillos (100 \muL a cada pocillo), y se dejó estar la mezcla
durante cinco minutos a la temperatura ambiente.
Se añadió ácido clorhídrico (100 \muL) a cada
pocillo para detener la reacción. La absorbancia de cada pocillo se
midió a 450 nm y a 620 nm, y se calculó "DO450 - DO620". Se
utilizó un Multiscan (producto de Labosystems) en la medición de la
absorbancia. Un pocillo en el que no se habían inmovilizado fagos
sirvió como blanco, y se determinó la absorbancia de cada pocillo
restando el valor del blanco de valor "medido".
Los resultados se muestran en la Fig. 1.
En la Fig. 1 se muestra que GDR4 muestra la
afinidad de unión más fuerte por el anticuerpo de GD3 4F6.
\vskip1.000000\baselineskip
Ejemplo
3
Las cuatro especies de peptidomimético de GD3
obtenidas en el Ejemplo 1 fueron sintetizadas mediante el siguiente
método.
Brevemente, mediante el uso de un sintetizador
de péptidos automático (ACT357, producto de Advanced Chemtech)
junto con el soporte lógico de la misma compañía, se realizó la
síntesis en fase sólida de los respectivos sólidos a través de
Fmoc/NMP, método de HOBt (Fmoc:
9-fluorenilmetoxicarbonilo, NMP:
N-metilpirrolidona, HOBt:
1-hidroxibenzotriazol).
Según el programa de síntesis, se diseñaron los
péptidos libres del extremo C (OH) con referencia a las secuencias
de aminoácidos de los SEQ ID NOS: 1-4.
Específicamente, a 0,25 mmoles de "resina Fmoc - aminoácido -
Alko", que correspondía al aminoácido del extremo C del péptido
de interés, se añadieron sucesivamente Fmoc - aminoácidos
correspondientes al segundo aminoácido (para el extremo C) y a los
siguientes aminoácidos para la elongación de la cadena.
Asimismo, se diseñaron como sigue péptidos que
tenían cada uno una amida C-terminal. Según el
programa de síntesis, "Fmoc - aminoácido", que correspondía al
aminoácido del extremo C del péptido de interés, era añadido a 0,25
mmoles de "Fmoc - NH - SAL resina", para inducir de ese modo la
reacción entre ellos, y con posterioridad se hizo que se anclaran
sucesivamente, Fmoc - aminoácidos que correspondían al segundo
aminoácido (para el extremo C) y a los aminoácidos posteriores por
medio de una reacción de condensación para la elongación de
la
cadena.
cadena.
Una vez completada la reacción, el grupo Fmoc
N-terminal fue desprotegido según el programa.
Cada una de las resinas peptídicas obtenidas de
este modo fue recogida en una minicolumna (producto de Assist)
hecha de polipropileno, seguido de lavado con metanol y secado a
vacío. Mediante el siguiente procedimiento, el péptido se escindió
de la resina, y también se separaron los grupos protectores de las
cadenas laterales del péptido. Brevemente, se añadió Reactivo K
(82,5% de TFA, 5% de fenol, 5% de H_{2}O, 5% de tioanisol, y 2,5%
de etanoditiol) (2 mL) a la resina, y la reacción se dejó continuar
en la minicolumna durante 60 minutos.
Con posterioridad, la mezcla de reacción se
añadió gota a gota a éter dietílico frío (8 mL), para de ese modo
detener la reacción y permitir que el péptido precipite. Después de
eso, la mezcla de la minicolumna se lavó con TFA (2 mL), se añadió
éter dietílico frío (5 mL) a la mezcla, la mezcla se centrifugó, y
el sedimento precipitado se lavó con éter dietílico (10 mL) cuatro
veces. Después el péptido se solubilizó con acetonitrilo al 50%
(aproximadamente 5 mL) y se liofilizó. Este procedimiento
(solubilización y liofilización) se repitió dos veces, con lo que
se obtuvo un producto liofilizado bruto de interés.
El producto liofilizado se fraccionó por medio
de una cromatografía de líquidos de alta resolución en fase reversa
(HPLC) empleando una Octadecyl Column (20 (diámetro) \times 250
mm, producto de YMC), para aislar de ese modo el péptido de
interés.
Las resinas y el derivado de aminoácido que se
utilizaron en el procedimiento descrito antes son productos de
Watanabe.
Los péptidos respectivos aislados de este modo
fueron identificados mediante secuenciación de aminoácidos y
medición del peso molecular por espectrometría de masas.
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Los péptidos multi-antigénicos
de los peptidomiméticos de GD3 obtenidos antes (MAP) fueron
sintetizados mediante el uso de la resina Fmoc - MAP -Alko
(producto de Watanabe).
La reacción entre la resina Fmoc - MAP - Alko
(Fmoc_{8} -
Lys_{4}-Lys_{2}-Lys-\betaAla
- Alko resina) y cada uno de los peptidomiméticos de GD3 continuó
de la misma manera que en el método de síntesis en fase sólida
descrito
antes.
antes.
Las estructuras de los MAP obtenidos de este
modo, mostradas mediante una representación de una letra de los
restos aminoácido, son las siguientes.
\vskip1.000000\baselineskip
MAP del SEQ ID NO: 1 péptido:
- (LAPPRPRSELVFLSV)_{8}-Lys_{4}-Lys_{2}-Lys-\betaAla
MAP del SEQ ID NO: 2 péptido:
- (PHFDSLLYPCELLGC)_{8}-Lys_{4}-Lys_{2}-Lys-\betaAla
MAP del SEQ ID NO: 3 péptido:
- (GLAPPDYAERFFLLS)_{8}-Lys_{4}-Lys_{2}-Lys-\betaAla
MAP del SEQ ID NO: 4 péptido:
- (RHAYRSMAEWGFLYS)_{8}-Lys_{4}-Lys_{2}-Lys-\betaAla
\vskip1.000000\baselineskip
Se añadió una solución de NaHCO_{3} 0,1 M que
contenía un peptidomimético de GD3 de la invención de la forma MAP
anterior (100 ng/100 \muL) a los pocillos de una placa de
microtitulación de 96 pocillos, para la inmovilización a la
temperatura ambiente durante una hora.
Con posterioridad, de una manera similar al
método ELISA empleado en el Ejemplo 2, se investigó la afinidad de
unión del peptidomimético de GD3 al anticuerpo de GD3 4F6.
Se utilizaron anticuerpo
anti-GD2 y anticuerpo anti-OAcGD3
(Cerato, E., et al., Hybridoma, 16(4),
307-316 (1997)) como controles (estos anticuerpos
fueron amablemente proporcionados por el Dr. Portoukalian).
Los resultados se muestran en la siguiente Tabla
2.
Como resulta evidente a partir de la Tabla 2,
entre otros peptidomiméticos, GD3R3 y GD3R4 muestran una unión más
fuerte al anticuerpo anti-GD3. Además, se encontró
que todos los péptidos se unen al anticuerpo
anti-GD3 más fuerte que a los anticuerpos de
control.
Los péptidos de fusión - fusionados con KLH -
fueron preparados utilizando cada uno de los peptidomiméticos de
GD3 obtenidos antes o un MAP de los mismos.
Brevemente, cada uno de los péptidos
sintetizados antes, o un MAP de los mismos, y la KLH fueron añadidos
a una solución de PBS (pH 7,4) que contenía 0,25% de glutaraldehído
a una razón en peso de 1:10, y la mezcla se dejó reaccionar durante
la noche a la temperatura ambiente, para sintetizar de ese modo un
péptido de fusión.
Ejemplo
4
Se disolvieron cuatro especies de
peptidomimético de GD3 (MAP) obtenidos en el Ejemplo 3 (2) en PBS
con el fin de lograr una concentración de 200 \mug/mL. La
solución se añadió a coadyuvante completo de Freund (o incompleto)
(1:1, en volumen), para preparar de ese una emulsión.
Se inmunizaron ocho ratones (C57BL/6) mediante
administración subcutánea de la emulsión anterior (0,2 mL/
ratón, en una administración, 5 \mug de péptido por ratón). La administración se realizó cada dos semanas (para la segunda administración y administraciones siguientes, se utilizó coadyuvante incompleto de Freund). Al cabo de una semana de las respectivas administraciones, se recogió sangre de la cola de cada ratón, para producir de ese modo antisuero.
ratón, en una administración, 5 \mug de péptido por ratón). La administración se realizó cada dos semanas (para la segunda administración y administraciones siguientes, se utilizó coadyuvante incompleto de Freund). Al cabo de una semana de las respectivas administraciones, se recogió sangre de la cola de cada ratón, para producir de ese modo antisuero.
El antisuero obtenido directamente después de la
primera administración será referido como "1º", el obtenido
después de la segunda administración será referido como "2º", y
el obtenido después de la tercera administración será referido como
"3º".
El título, frente a GD3, de cada una de las
muestras de antisuero (3 \times 8 ratones = 24 muestras) obtenido
en el apartado (1) anterior fue medido por medio de ELISA como se
describe más abajo.
El GD3 empleado en el ensayo fue proporcionado
amablemente por el Dr. Portoukalian, y era un producto extraído de
melanoma y purificado (J. Portoukalian et al., Int. Cancer,
49, 893-899 (1991)). El GD3 fue purificado por
medio de HPLC empleando una columna de gel de sílice (Si60)
(producto de Merck, U.S.A.) en un cromatograma (Hitachi
L-6200). El GD3 que se había adsorbido en la columna
se hizo eluir con una mezcla de isopropanol/hexano/agua purificada
(con un gradiente de 55/35/12 a 55/30/15 en volumen). La velocidad
de flujo de la columna era de 4 mL por minuto.
El GD3 purificado obtenido de este modo se
disolvió en metanol, por medio de lo cual se preparó una solución
de GD3 que tenía una concentración de 10 \mug/mL. La solución de
GD3 se añadió a los pocillos de una placa de microtitulación de 96
pocillos en cantidades de 10 \muL por pocillo (que corresponde a
100 ng de GD3 por pocillo), y se evaporó el metanol. Con
posterioridad, se añadió una solución de bloqueo (TBS suplementado
con 1% de BSA) a los pocillos en cantidades de 50 \muL por
pocillo, para bloquear a 37ºC durante 4 horas.
El sobrenadante se descartó. Cada una de las
muestras de antisuero obtenidas en el apartado (1) anterior fue
diluida 100 veces, 400 veces, o 1.600 veces con la solución de
bloqueo mencionada antes. El antisuero diluido (50 \muL) se
añadió a cada pocillo para que reaccionaran a 4ºC durante la noche.
El pocillo se lavó seis veces con TBS, y después de eso, se añadió
anticuerpo IgG de ratón marcado con HRP diluido 5.000 veces con la
solución de bloqueo (50 \muL por pocillo) para que reaccionaran
durante 2 horas a la temperatura ambiente. El pocillo se lavó
cuatro veces con TBS, y después de eso, se detectó la actividad
enzimática (peroxidasa) del pocillo con solución de TMB (50
\muL). La reacción se detuvo con HCl 1 N (50 \muL), y se calculó
el valor correspondiente para "420 nm - 620 nm".
Se preparó una muestra de control como sigue. En
primer lugar, se sintetizó un péptido irrelevante (esto es, un
péptido de 15 restos aminoácido que es diferente de cualquiera de
los cuatro péptidos obtenidos en el Ejemplo 1 y que no tiene
afinidad de unión para el anticuerpo anti-GD3; la
secuencia está representada por el SEQ ID NO: 10) de una manera
similar a la empleada en el Ejemplo 3. El péptido sintetizado se
administró a un ratón para la inmunización, y el antisuero obtenido
sirvió muestra de control. El título de la muestra de control se
obtuvo de una manera similar a la descrita antes. (No obstante, el
número de ratones proporcionado fue de cinco, y solamente se
utilizó una solución diluida 100veces). Esta muestra de péptido de
control también se utilizó en forma de MAP como se ha descrito
antes.
Los datos de l reactividad de las respectivas
muestras de antisuero con GD3 se resumen en las Tablas 3 a 5
siguientes.
Como resulta evidente a partir de las Tablas 3 a
5, las muestras de antisuero obtenidas mediante el uso, como
inmunógeno, de un peptidomimético de GD3 de la presente invención,
presentan reacción cruzada con GD3; en particular, aquellos
obtenidos mediante el uso, como inmunógeno, de un GD3R4 de la
presente invención muestra reacción cruzada con GD3. En contraste,
se encontró que las muestras de antisuero obtenidas mediante el uso
del péptido de control mostraban una reactividad débil con GD3, y
tomados juntos, se sugiere que los antisueros obtenidos mediante el
uso de un peptidomimético de GD3 de la presente invención presentan
reacción cruzada con GD3.
Los resultados anteriores sugieren que los
peptidomiméticos de GD3 de la presente invención, en particular
GD3R4, imitan una porción de la estructura de GD3; esto es, una
porción estructural reconocida por el anticuerpo
anti-GD3 4F6.
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Ejemplo
5
(1) De una manera similar a la descrita en el
Ejemplo 3, los péptidos de los 9 restos aminoácido
N-terminales o los 9 restos aminoácido
C-terminales de GD3R1, GD3R2, GD3R3, o GD3R4. La
nomenclatura y las secuencias de los respectivos péptidos empleados
en el presente ensayo se muestran en la Fig. 2. Estos fueron
empeladas como péptidos multi-antigénicos
(MAP).
(2) Con el fin de ampliar la búsqueda del enlace
entre el anticuerpo anti-GD3 4F6 y cada uno de los
peptidomiméticos de GD3 mostrados en la Fig. 1, se sometieron los
péptidos multi-antigénicos (MAP) a ELISA. Se
proporcionaron las muestras de los MAP que tenían una variedad de
concentraciones mostradas en el eje de las X en la Fig. 3, y cada
muestra fue inmovilizada en los pocillos de una placa de 96
pocillos. Con posterioridad, los pocillos fueron bloqueados con una
solución de bloqueo (TBS suplementado con 1% de BSA, 0,1% de leche
desnatada, y 0,02% de Tween 20) a 4°C durante la noche. Se añadió
4F6 (sobrenadante de hibridoma: utilizado en forma pura) (100
\muL/pocillo) para la reacción a la temperatura ambiente durante 2
horas. Una vez completada la reacción, se descartó el sobrenadante,
y los pocillos se lavaron con solución de lavado (TBS con un
suplemento de 1% de FBS y 0,05% de Tween 20) seis veces. Con
posterioridad, se dejó que los pocillos reaccionaran con IgG
anti-ratón marcada con peroxidasa (diluida 1.000
veces con solución de bloqueo) a la temperatura ambiente durante 2
horas. Los pocillos se lavaron de nuevo con una solución de lavado
cuatro veces, y se detectó la cantidad de enzima peroxidasa
restante en cada pocillos y se determinó cuantitativamente con el
sustrato TMB, por medio de lo cual se investigó la unión de MAP a
4F6. El ensayo se realizó por triplicado, y los valores del gráfico
son "media \pm DT".
Como se entiende a partir de la Fig. 3, 4F6 se
une a los peptidomiméticos de GD3 3 o 4 de una manera dependiente
de la dosis. Aunque la unión de GD3 parece haber declinado a partir
de la concentración de 0,8 \mug/pocillo y superior, esto puede
ser atribuido a una cantidad excesiva de GD3 inmovilizado presente
en la placa de ELISA, lo que intensificaba la hidrofobicidad,
inhibiendo de ese modo la unión al anticuerpo.
(3) La afinidad de unión mostrada en la Fig. 3
fue investigada mediante otro método. Brevemente, se proporcionaron
muestras de MAP que tenían una variedad de concentraciones mostrada
en el eje de las X en la Fig. 4. Cada muestra fue inmovilizada
sobre los pocillos de de placa de 96 pocillos, y se dejó que los
pocillos reaccionaran con 4F6 (100 \muL/pocillo) a 4°C durante la
noche. Al día siguiente, se recogió el sobrenadante (80 \muL) y se
añadió a los pocillos de otra placa en la que se había inmovilizado
GD3 de antemano (100 ng/pocillo) para que reaccionaran a la
temperatura ambiente durante 2 horas. Una vez completada la
reacción, se detectó la cantidad de anticuerpo 4F6 que se había
condensado con GD3 (esto es, que no había sido adsorbido por MAP) y
se determinó cuantitativamente por medio del método descrito en el
apartado (2) anterior, por medio de lo cual se investigó el efecto
inhibidor de MAP sobre la unión de GD3 a 4F6. El ensayo se realizó
por triplicado, y los valores del gráfico son la "media
\pm DT".
Como resultado, como se muestra en la Fig. 4,
como en el caso de GD3, se encontró que ambos peptidomiméticos de
GD3 3 y 4 inhibían la unión de GD 3 al anticuerpo, y la inhibición
se producía de una manera dependiente de la cantidad
inmovilizada.
(4) A continuación, se realizó una investigación
en cuanto a si la unión entre GD3R3 o GD3R4 y 4F6 se producía en el
sitio de unión a GD3 de 4F6. A los pocillos de una placa en la que
se había inmovilizado GD3 (100 ng/pocillo), se añadieron
simultáneamente cada una de las muestras de MAP que tenían una
variedad de concentraciones mostrada en el eje de las X de la Fig.
5 y 4F6 (100 \muL/pocillo), por medio de lo cual se realizó un
ensayo inhibidor. El ensayo se realizó por triplicado, y los
valores del gráfico son la "media \pm DT".
Como resultado, como resulta evidente a partir
de la Fig. 5, en el intervalo de concentración empleado en el
presente ensayo, GD3R3, como GD3, mostraba un efecto inhibidor, pero
R4 no. A partir de estos resultados, se deducen los dos
siguientes.
Primero, la fuerza de unión entre 4F6 y los
respectivos MAP disminuye en el orden GD3 > GD3R3 > GD3R4.
Segundo, GD3R3 se une al sitio de unión a GD3, o en las
proximidades, de 4F6.
(5) Mediante el procedimiento descrito antes,
entre otros peptidomiméticos, se ha encontrado que GD3R3 se une
específicamente al dominio de unión a GD3 de 4F6 o un sitio próximo
a este. A continuación, en un intento de determinar el dominio
requerido para establecer la unión al anticuerpo
anti-GD3 4F6 en los peptidomiméticos de GD3, se
sintetizaron un MAP de nueve restos N-terminales del
péptido GD3R3 y un MAP de nueve restos C-terminales
del mismo péptido GD3R3 como se muestra en la Fig. 2, se estudió su
unión a 4F6 mediante ELISA. Se realizó el ELISA por triplicado, y
los valores de los gráficos son la "media \pm DT".
Como resultado, como resulta evidente a partir
de la Fig. 6, se encontró que GD3R3C9 tenía una capacidad comparable
para los 15 restos al inhibir la unión entre GD3 y 4F6, y la
inhibición se producía de una manera dependiente de la cantidad
inmovilizada.
Tomados juntos, está claro que GD3R3 es el más
fuerte en la unión al anticuerpo anti-GD3 4F6, y que
nueve restos del extremo C (GD3R3C9) son críticos en el
establecimiento de la unión.
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Ejemplo
6
Utilizando un péptido de fusión
R4-KLH obtenido en el Ejemplo 3(4) entre
GD3R4 y KLH o un péptido de fusión en forma de MAP
R4MAP-KLH creado entre GD3R4 y KLH, se realizó la
inmunización como se ha descrito en el apartado (1) anterior.
Brevemente, se administró una emulsión mixta con
un coadyuvante (1:1, en volumen) a cada miembro de los grupos de
ratones, constando cada grupo de 3 ratones (CD-1),
en una cantidad de 100 \muL/ratón (para una administración (ip),
30 \mug péptido/ratón) para la inmunización. En el caso de
R4-KLH, la administración se realizó cada semana
durante un mes, y con posterioridad cada dos semanas durante un mes;
y en el caso de R4MAP-KLH, cada semana durante 2
meses. En cualquier caso, 4 días después de la inmunización final,
se recogió sangre para preparar de ese modo muestras de
antisuero.
De un modo similar al caso de la inmunización
con R4-KLH, también se prepararon muestras de
antisuero mediante inmunización con GD3 (30 \mug).
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Utilizando una placa para ELISA en la que se
había inmovilizado GD3 o péptido GD3R4, se repitió el procedimiento
descrito en el Ejemplo 4(2).
Placa con GD3 inmovilizado: se añadió a cada
pocillo GD3 en metanol-PBS (1:1) (0,5 \mug/50
\muL), y la placa se dejó estar durante una hora. Los pocillos se
lavaron con PBS, después se añadió a esto 1% de HSA en PBS (200
\muL/pocillo) para la incubación a 37°C durante 2 horas, por medio
de lo cual se bloquearon los pocillos.
Placa con péptido GD3R4 inmovilizado: Se añadió
a cada pocillo péptido GD3R4 (1 \mug) disuelto en tampón
bicarbonato 0,1 M (pH 9,5), seguido de incubación a 37ºC durante la
noche y lavado con PBS, por medio de lo cual se bloquearon los
pocillos de una manera similar a la anterior.
Las muestras de antisuero obtenidas en lo
anterior fueron diluidas con PBS para rendir de ese modo muestras
de antisuero diluidas de 100 veces a 10.000 veces. Cada una de las
muestras de antisuero diluido resultantes (50 \muL) fue añadida a
cada pocillo y la mezcla se dejó reaccionar durante una hora. Con
posterioridad, se dejó que la reacción continuara con anticuerpo
anti-inmunoglobulina de ratón biotinilado
(anticuerpo específico Ig, IgM, IgG, IgG1, IgG2a, IgG2b o IgG3)
durante una hora, después con estreptavidina-HRP
durante una hora de una manera similar, después de lo cual se
detectó actividad enzimática en cada pocillo como se ha descrito
antes (405 nm).
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El bazo retirado asépticamente de cada uno de
los ratones inmunizados anteriores se desmenuzó en medio RPMI 1640
con suplemento de 10% de FCS. Utilizando una columna de lana de
nailon, se prepararon linfocitos ricos en células T y se contaron
las células. El medio anterior que contenía las células en una
cantidad de 10^{5} células por 150 \muL se añadió a cada uno de
los pocillos de una placa de cultivo. Se añadió PHA con el fin de
obtener una concentración final de 1 \mug/mL. Se añadió un péptido
de la presente invención o cualquiera de los diferentes
gangliósidos en PBS, y la mezcla se incubó durante 96 horas. Se
obtuvo un sobrenadante (100 \muL) de cada pocillo. La actividad
IL-2 del sobrenadante se determinó utilizando
células de ratón dependientes de IL-2, CTLL2.
Brevemente, se añadió a los pocillos el sobrenadante (100 \muL)
diluido de 2 a 50 veces con medio en una cantidad de 10^{4}
células CTLL2/pocillo, seguido de incubación a 37ºC durante 48
horas. Con posterioridad, se añadió a cada pocillo
timidina-H^{3} (0,5 \muCi), seguido de
incubación durante 6 horas. Las células CTLL2 se recuperaron sobre
un papel de filtro y se sometieron a recuento en cuanto a
H^{3}.
\vskip1.000000\baselineskip
Se encontró que las muestras de antisuero
obtenidas de la inmunización con R4-KLH o
R4MAP-KLH contenían anticuerpos específicos que
reaccionaban con el péptido GD3R4 y GD3. Los títulos de los
anticuerpos IgG y los de anticuerpos IgM eran casi los mismos. Los
resultados referentes a la reactividad entre GD3 y antisuero
obtenido de la inmunización con R4-KLH se muestran
en la Fig. 7. La reactividad entre GD3 y antisuero obtenido de la
inmunización con R4MAP-KLH y la reactividad entre
GD3 y antisuero obtenido de la inmunización con GD3R4 se muestran en
las Figs. 8 y 9, respectivamente.
Los linfocitos ricos en células T de ratón
inmunizado con GD3 se consideran o activados, ya que no se detectaba
actividad de IL-2 en presencia de gangliósidos
(Tabla 6). No obstante, en presencia de péptido GD3R4 o péptido
GD3R3, se confirmó la producción de IL-2 (Tabla 6).
En relación con esto, en los ratones inmunizados con
R4-KLH, se ha confirmado que las células T han sido
activadas por el péptido GD3R4 o el péptido GD3R3 (Tabla 7). Estos
resultados indican que los péptidos de la presente invención inducen
la activación de las células T específicas en ratones inmunizados
con GD3.
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Según la presente invención, se proporcionan
secuencias de aminoácidos novedosas que imitan el GD3 que se
expresa en tejidos cancerosos o superficies de células cancerosas.
Los péptidos que imitan GD3 de la presente invención que contienen
una de las secuencias de aminoácidos encuentran utilidad para la
preparación de fármacos, incluyendo agentes de diagnóstico para el
cáncer o vacunas para el cáncer. Se describe en la presente memoria
un método de tratamiento del cáncer, un método de diagnóstico del
cáncer, etc., que contribuyen de este modo a la mejora del efecto
terapéutico de la terapia del cáncer.
<110> Otsuka Pharmaceutical Co., Ltd.
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<120> GD3 mimic peptide
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<170> PatentIn Ver. 2.1
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<211> 15
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<212> PRT
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<213> Biblioteca de presentación en fagos
(GD3R-1)
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<400> 1
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\sa{Leu Ala Pro Pro Arg Pro Arg Ser Glu Leu Val
Phe Leu Ser Val}
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<210> 2
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<212> PRT
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<213> Biblioteca de presentación en fagos
(GD3R-2)
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<400> 2
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\sa{Pro His Phe Asp Ser Leu Leu Tyr Pro Cys Glu
Leu Leu Gly Cis}
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(GD3R-3)
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<400> 3
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\sa{Gly Leu Ala Pro Pro Asp Tyr Ala Glu Arg Phe
Phe Leu Leu Ser}
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<212> PRT
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<213> Biblioteca de presentación en fagos
(GD3R-4)
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<400> 4
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\sa{Arg His Ala Tyr Arg Ser Met Ala Glu Trp Gly
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<210> 5
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<212> ADN
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<213> Biblioteca de presentación en fagos
(GD3R-1)
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<400> 5
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<212> ADN
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<213> Biblioteca de presentación en fagos
(GD3R-2)
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<400> 6
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<212> ADN
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<213> Biblioteca de presentación en fagos
(GD3R-3)
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<400> 7
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<210> 8
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<212> ADN
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<213> Biblioteca de presentación en fagos
(GD3R-4)
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<400> 8
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<211> 24
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<212> ADN
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<213> Secuencia cebadora
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<400> 9
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<213> Biblioteca de presentación en
fagos
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<400> 10
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\sa{Ala Asp Gly Ala Arg Gly Gly Phe Ser Asp Thr
Ser Arg Thr Gly Met}
\sac{Val Ser Val Gly Ala Ala Gly}
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Claims (10)
1. Un peptidomimético de GD3 que comprende
- (i)
- la secuencia de aminoácidos representada por el SEQ ID NO: 4;
- (ii)
- una secuencia de aminoácidos derivada del SEQ ID NO: 4 por sustitución, deleción, adición, o inserción de un resto aminoácido;
- (iii)
- una secuencia de aminoácidos que consiste en 9 a 14 restos aminoácido continuos contenidos en la secuencia de aminoácidos del SEQ ID NO: 4; o
- (iv)
- una secuencia de aminoácidos derivada del SEQ ID NO: 4 y que tiene una homología del 80% más con el SEQ ID NO: 4, siendo capaz dicho peptidomimético de GD3 de unirse a un anticuerpo anti-GD3 y siendo capaz de inducir una respuesta inmunitaria anti-GD3.
2. El peptidomimético de GD3 según la
reivindicación 1, fusionado con una proteína portadora que potencia
la inmunogenicidad.
3. El peptidomimético de GD3 fusionado según la
reivindicación 2, donde la proteína portadora es la hemocianina de
lapa ojo de cerradura.
4. Un peptidomimético de GD3 según cualquiera de
las reivindicaciones 1 a 3, que es un péptido inmunogénico que
tiene la capacidad de producir un anticuerpo específico de GD3.
5. Un peptidomimético de GD3 según a
reivindicación 1, que comprende una secuencia de aminoácidos
derivada del SEQ ID NO: 4 y que tiene una homología del 90% o más
con el SEQ ID NO: 4, siendo capaz dicho peptidomimético de GD3 de
unirse a un anticuerpo anti-GD3 y siendo capaz de
inducir una respuesta inmunitaria anti-GD3.
6. Un peptidomimético de GD3 según la
reivindicación 1, que consiste en la secuencia de aminoácidos
representada por el SEQ NO: 4.
7. Una composición farmacéutica que contiene,
como ingrediente activo, un peptidomimético de GD3 como se cita en
cualquiera de las reivindicaciones 1 a 6.
8. Una secuencia de ADN que codifica el
peptidomimético de GD3 definido en cualquiera de las
reivindicaciones 1 a 6.
9. Un peptidomimético de GD3
multi-antigénico que comprende el peptidomimético de
GD3 definido en la reivindicación 1.
10. El peptidomimético de GD3
multi-antigénico según la reivindicación 9, que
comprende adicionalmente
- (i)
- una secuencia de aminoácidos seleccionada entre cualquiera de los SEQ ID NOS: 1 a 4;
- (ii)
- una secuencia de aminoácidos derivada de uno cualquiera de los SEQ ID NOS: 1 a 4 por sustitución, deleción, adición, o inserción de un resto aminoácido;
- (iii)
- una secuencia de aminoácidos que consiste en 9 a 14 restos aminoácido continuos contenidos en uno cualquiera de los SEQ ID NOS: 1 a 4; o
- (iv)
- una secuencia de aminoácidos derivada de uno cualquiera de los SEQ ID NOS: 1 a 4 y que tiene una homología del 80% o más con los SEQ ID NOS: 1 a 4, respectivamente.
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