ES2284864T3 - Metodo dielectroforetico y aparato para seleccion de alto rendimiento. - Google Patents
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Abstract
Método de realización de pruebas y ensayos de alto rendimiento y elevado valor biológico en una muestra que contiene material químico/biológico que consiste en entidades desconocidas caracterizado porque comprende las etapas de: (a)- introducir la muestra que incluye dichas entidades desconocidas dentro de una primera cámara de un dispositivo de pruebas que comprende al menos una serie de primeros electrodos excitables y direccionables de forma selectiva y al menos un segundo electrodo colocado enfrente de y orientado hacia los primeros electrodos, (b)- introducir material químico/biológico dentro de una primera cámara de dicho dispositivo de pruebas, que consiste en entidades conocidas identificables en el interior de dicho dispositivo de pruebas y que tienen una supuesta afinidad por las entidades desconocidas; (c)- crear de forma selectiva primer y segundo compartimentos de potencial dielectroforético móviles cerrados en el interior de dicha primera cámara generados mediante dichos primeros electrodos y segundo electrodo y atrapar al menos una parte de dichas entidades desconocidas en el interior de los primeros compartimentos móviles y al menos una parte de dichas entidades conocidas en el interior de los segundos compartimentos móviles; (d)- mover al menos uno dichos segundos compartimentos móviles que contienen las entidades conocidas hacia dichos primeros compartimentos móviles que contienen dichas entidades desconocidas y hacer que al menos una entidad desconocida interaccione con al menos una entidad conocida de al menos un primer tipo ocasionando la fusión de al menos un primer compartimento móvil y un segundo compartimento móvil que contienen las entidades relativas; (e)- verificar la creación o de otra manera un enlace estable entre dicha al menos una entidad desconocida y dicha al menos una entidad conocida del primer tipo para determinar si existe afinidad entre las dos e identificar en consecuencia dicha al menos una entidad desconocida.
Description
Método dielectroforético y aparato para
selección de alto rendimiento.
La presente invención se refiere a un método de
manipulación de partículas que utiliza fuerzas dielectroforéticas
para procedimientos de selección de elevado valor biológico
realizadas sobre compuestos farmacéuticos posibles, aplicable al
análisis diagnóstico y agroalimentario. La invención también se
refiere a un dispositivo para la ejecución del método descrito.
En un campo de la técnica en expansión que
abarca el descubrimiento de nuevos fármacos y la química
combinatoria usada en la preparación de nuevos compuestos
candidatos, sería especialmente ventajoso poder examinar un gran
número de sustancias por medio de un procedimiento que proporcione
un alto rendimiento, con el fin de observar su impacto fisiológico
sobre animales y sobre seres humanos. Antes de probar la eficacia de
un fármaco candidato "parcialmente satisfactorio" en animales,
debe someterse a prueba la sustancia para determinar su posible
toxicidad con respecto a las células vivas. Por el contrario, la
práctica habitual es que los compuestos prometedores se sometan a
prueba casi inmediatamente en estudios extensos sobre modelos
animales, estudios que son al mismo tiempo largos y costosos.
Además, la práctica de pruebas extensas sobre animales está
volviéndose cada vez menos aceptable culturalmente en los Estados
Unidos y en Europa. Si se someten a prueba compuestos farmacéuticos
posibles para observar sus interacciones con células vivas antes de
que se realicen los estudios en modelos animales, esto puede
reducir el número de animales necesarios para los ensayos
posteriores eliminando muchos de los candidatos antes de que se
alcance la fase de pruebas sobre animales.
Los procedimientos actuales para el análisis de
la interacción célula-fármaco no permiten ni un alto
rendimiento ni un elevado valor biológico, debido al número
limitado de células y compuestos que pueden analizarse en un
periodo de tiempo dado, la escasa practicidad de los métodos
necesarios para administrar los compuestos, y los volúmenes
considerables del compuesto requeridos.
Por consiguiente, se han realizado esfuerzos
para superar estos inconvenientes estudiando métodos alternativos
para el análisis de las interacciones entre células y fármacos, o
más generalmente entre muestras biológicas y agentes biológicamente
activos, tales como los indicados más adelante a modo de
ejemplo.
Se han descrito varios métodos para producir
matrices celulares micromodeladas uniformemente, por ejemplo, la
fotolitografía (Mrksich & Whitesides, Ann. Rev. Biophys. Biomol.
Struc. 25:55-78, 1996). Según este método, que usa
una placa de vidrio, se emplean un material fotosensible y una
máscara para obtener una placa que presenta una matriz de puntos
hidrófilos o reactivos sobre una superficie que por el contrario es
hidrófoba. La matriz de grupos hidrófilos proporciona un sustrato
sobre el que se obtiene un enlace no específico y no covalente de
ciertos tipos de células, incluyendo las de origen neuronal
(Kleinfeld et al., J. Neurosci.
8:4098-4120,1988).
En otro método basado en interacciones
específicas pero no covalentes, se usa la fotoimpresión para
producir una superficie dorada que presenta puntos de laminina, una
proteína de unión a células que se encuentra normalmente en la
matriz extracelular (Singhvi et al., Science 264:
696-698, 1994).
Puede obtenerse un enlace uniforme más
específico entrecruzando moléculas específicas, tales como
proteínas, en los sitios reactivos del sustrato modelado (Aplin
& Hughes, Analyt. Biochem. 113: 144-148,
1981).
Otro desarrollo de un sistema óptico para
modelar un sustrato y crear puntos reactivos se basa en el uso de
rayos UV profundos dirigidos a través de una máscara óptica, para
obtener sitios activos que consisten en grupos de silanol polares.
Estos grupos constituyen los puntos de la matriz y se modifican
adicionalmente emparejándolos con otros grupos reactivos, tal como
se describe en la patente estadounidense número 5.324.591. Este
método óptico de formar matrices celulares uniformes sobre un
sustrato requiere menos etapas que el método de fotolitografía,
pero requiere luz ultravioleta de alta intensidad, y las fuentes de
luz adecuadas son muy costosas.
Además en todos estos métodos, la matriz celular
resultante es uniforme, ya que las moléculas bioquímicamente
específicas están unidas a las matrices químicamente micromodeladas.
Con el método de fotolitografía, las células se unen a matrices de
puntos hidrófilos y/o a moléculas específicas unidas a los puntos
que se unen a las células. Por consiguiente, las células se unen a
todos los puntos de la matriz de la misma forma. Con el método
óptico, las células se unen mediante adhesión a matrices que
contienen puntos de grupos de aminoácidos libres. Hay muy poca o
ninguna diferencia entre estos puntos. Aquí de nuevo, las células se
unen a todos los puntos de la misma forma y sólo es posible
estudiar un tipo dado de interacción celular usando estas matrices,
ya que cualquier punto es esencialmente el mismo que el
anterior.
\newpage
Por tanto, este tipo de matrices carece de
flexibilidad como instrumento para el análisis de una única variedad
específica de célula o interacción. En consecuencia, surge la
necesidad de producir matrices celulares que no estén uniformemente
micromodeladas, de modo que se aumente el número de células o
interacciones que pueden analizarse simultáneamente.
Las solicitudes de patente internacionales WO
00/39587 y WO 00/47996 ilustran un sistema de detectores y métodos
para preparar matrices, de material compuesto o de otro modo, de
perlas o células ordenadas aleatoriamente en los extremos de haces
de fibras ópticas. Mientras que por un lado los métodos descritos en
estas solicitudes ofrecen un gran potencial analítico,
especialmente en el caso de proteínas y ácidos nucleicos, existe el
inconveniente de que no permiten al experimentador ni separar ni
mucho menos recuperar poblaciones de interés que puedan
identificarse.
Realizar un ensayo de alto rendimiento sobre
muchos miles de compuestos requiere la manipulación en paralelo y
el tratamiento de muchos compuestos y de los reactivos incluidos en
el ensayo; además, debe haber un método de identificación y
medición de los resultados del experimento de la forma más sencilla
posible. Los ensayos más comunes usan combinaciones homogéneas de
compuestos y reactivos biológicos junto con al menos un compuesto
marcador, cargados en una placa de microtitulación de 96 o 386
pocillos convencional (Kahl et al., J. Biomol. Scr.
2:33-40, 1997). Las señales medidas de cada pocillo,
ya sean emisiones de fluorescencia, densidad óptica o
radiactividad, se integran con la señal de todo el material que
ocupa el pocillo para dar un promedio general de la población de
todas las moléculas en el pocillo. Este tipo de ensayo se denomina
comúnmente ensayo homogéneo.
Ya que la fluorescencia se encuentra entre los
sistemas más ampliamente usados, se han desarrollado diversos
métodos para generar imágenes de células fluorescentes con un
microscopio y extraer información sobre la distribución espacial y
los cambios que se producen a lo largo del tiempo en estas células.
Muchos de estos métodos y sus aplicaciones se describen en un
artículo de Taylor et al., Am. Scientist 80:
322-335,1992.
Los métodos propuestos se han diseñado y
optimizado con la preparación de un pequeño número de muestras de
manera que puede medirse la distribución, cantidad y perfil
bioquímico de moléculas indicadoras fluorescentes presentes en las
células obteniendo un elevado nivel de resolución espacial y
temporal.
Los métodos útiles de detección incluyen tratar
las células con reactivos colorantes y fluorescentes para obtener
imágenes y/o modificar genéticamente las células de tal forma que
produzcan proteínas fluorescentes, como proteína fluorescente verde
(GFP) modificada. El uso de GFP en el estudio de la expresión génica
y la localización de proteínas se trata en detalle por Chalfic
et al., in Science 263: 803-805.
No obstante, estos métodos son complejos,
costosos y lentos, y sólo pueden usarse para estudiar células en
grupos, no individualmente.
La dielectroforesis se refiere al fenómeno
físico mediante el cual partículas dieléctricas sometidas a campos
eléctricos c.c. y/o c.a. no uniformes espacialmente experimentan una
fuerza neta dirigida hacia aquellas regiones del espacio
caracterizadas por una intensidad de campo creciente (pDEP) o
decreciente (nDEP). Si la intensidad de las fuerzas resultantes es
comparable a la fuerza de la gravedad, en esencia es posible crear
un equilibrio de fuerzas que permite la levitación de partículas
pequeñas. La intensidad, dirección y orientación de la fuerza
dielectroforética dependen en gran medida de las propiedades
conductoras y dieléctricas del cuerpo y del medio en el que está
inmerso, y a su vez, estas propiedades varían con la frecuencia.
Los estudios que analizan los efectos de las
fuerzas dielectroforéticas sobre microorganismos o materia biológica
en general (células, bacterias, virus, ADN, etc.), y sobre materia
inorgánica, han sugerido durante algún tiempo la idea de explotar
estas fuerzas como un medio para seleccionar un cuerpo particular a
partir de una muestra que contiene una pluralidad de
microorganismos, caracterizando las propiedades físicas de los
microorganismos y en general permitiendo su manipulación.
A modo de ejemplo, la solicitud de patente
internacional WO 00/47322 enseña la manipulación de "paquetes"
genéricos de sustancias (líquidas, sólidas o gaseosas) utilizando
fuerzas dielectroforéticas generadas entre electrodos contiguos de
una serie direccionable. Sin embargo, el método descrito en esta
referencia no es adecuado para realizar un estudio de elevado valor
biológico sobre células y más generalmente sobre microorganismos o
partes de los mismos (secuencias de ADN y ARN, plásmidos, etc.), ya
que por un lado se somete el "paquete" a voltajes
significativos para permitir su manipulación mediante
dielectroforesis, y por otro lado, se somete más generalmente a la
fricción contra la superficie de reacción que lleva la serie de
electrodos.
La técnica anterior abarca otro sistema basado
en la creación de compartimentos de manipulación celular
tridimensionales construyendo microoctopolos (T. Schnelle et
al., en Biochimica et Biophysica Acta,
1157:127-140); en este caso, se hace levitar el
material celular y por tanto no se ve afectado por estrés por
fricción u otro estrés mecánico, particularmente en el caso en el
que las dimensiones de los sistemas de manipulación adoptados son
comparables con aquellas de las partículas que están manipulándose,
reduciendo así el orden de magnitud de los voltajes usados para
crear las distribuciones de campo necesarias cuando aparecen efectos
no deseables (Washizu & Kurosawa, Trans. Ind. Appl.
26:1165-1172, 1990; Washizu et al., Trans.
Ind. Appl. 30:835-843, 1994).
Sin embargo, las estructuras propuestas en la
bibliografía encuentran problemas de realización cuando las
dimensiones de los compartimentos previstos se aproximan a las de
las células reales (con el fin de atrapara una célula individual).
En este caso, los problemas consisten en alinear las dos estructuras
que, montadas entre sí a una escala micrométrica, constituyen el
octopolo.
Este problema particular se resuelve según la
solicitud de patente internacional WO 00/69565, que describe un
aparato y un método para la manipulación de partículas (el término
"partículas" se usa a continuación en el presente documento
para referirse a elementos manipulados de forma dielectroforética
utilizados en experimentos, ya sean entidades biológicas,
sustancias combinadas con un agente de administración, o ambas; a
partir del contexto podrá apreciarse cual de los tres casos se
pretende) utilizando compartimentos de potencial dielectroforético
cerrados. Se conocen más métodos a partir de los documentos WO
00/32774, EP-A-1088592, WO 99/38612,
EPA-0915942 y WO 00/47322.
En cualquier caso, estos últimos métodos de
manipulación basados en la levitación dielectroforética del material
para análisis están actualmente limitados a la separación y/o
recuento de las partículas manipuladas permitido mediante
reconocimiento de las propias partículas usando detectores adecuados
de tipo específico preparados e integrados en la serie de
electrodos y/o dispuestos en el interior o el exterior de la cámara
en la que tiene lugar la manipulación por levitación. Esto
significa que tales métodos sólo pueden usarse para partículas con
características distintivas intrínsecas (diferenciadas basándose en
el tamaño, por ejemplo) detectables con detectores específicos, que
deben prepararse según cada caso.
El objeto la invención es superar los diversos
inconvenientes encontrados en los métodos de la técnica anterior
tal como se resumió anteriormente para la manipulación de células y
más generalmente de material químico/biológico, con el fin de que
los ensayos químicos y farmacológicos de alto rendimiento puedan
realizarse de manera rápida, eficaz, económica, con precisión y sin
la necesidad (al menos inicialmente) de usar animales como
cobayas.
Material químico/biológico, en particular, aquí
y a lo largo de la memoria descriptiva, significa cualquier
"entidad" dada ya consista en un "compuesto" o una
"unidad compuesta" tal como se define a continuación, o en una
célula.
Aquí y a lo largo de la memoria descriptiva, se
entiende que el término "compuesto" quiere decir cualquier
sustancia dada que probablemente puede tener actividad farmacéutica,
concretamente ADN posiblemente transformante o una sustancia
química, tal como se encuentre o si es necesario inmovilizada
adecuadamente sobre la superficie de microperlas o microencapsulada
en una bicapa lipídica o liposoma, o en un virus, genéticamente
modificado o por de otro modo, que puede funcionar como un vector
para material genético. Aquí y a lo largo de la memoria descriptiva
se entiende que el término "unidad compuesta" quiere decir un
liposoma que contiene una cantidad predeterminada de un compuesto
tal como se definió anteriormente, o un virus vector único. En el
caso de que se usen sustancias químicas para recubrir una
microperla, se entiende que "unidad compuesta" significa una
microperla que tiene una cantidad de compuesto predeterminada
inmovilizada sobre su superficie.
Teniendo presentes las anteriores definiciones,
un primer objeto de la presente invención es proporcionar un método
para realizar pruebas y ensayos de alto rendimiento y elevado valor
biológico sobre entidades que consisten en células individuales o
en unidades compuestas, cuya naturaleza puede incluso desconocerse
en un principio, de forma que permitirá la identificación de
células o unidades compuestas de naturaleza desconocida en una
población inicialmente mixta y posiblemente separar después las
células y/o unidades compuestas identificadas de la población
inicial.
Un segundo objeto de la invención es
proporcionar un método para realizar pruebas y ensayos de alto
rendimiento y elevado valor biológico sobre células individuales,
que permitirá identificar la actividad biológica de uno o más
compuestos seleccionados sobre las células individuales,
administrados posiblemente mediante una o más unidades compuestas
identificables individualmente, monitorizando la respuesta de la
célula a la administración de tales compuestos. Preferiblemente,
también es un objeto de la invención proporcionar un método del tipo
propuesto para someter a ensayo la actividad biológica que
permitirá administrar un compuesto cada vez a las células,
empleando preferiblemente dosificaciones ajustables y
predeterminadas.
Un tercer objeto de la invención es proporcionar
a dispositivo de pruebas que hace uso de la manipulación
dielectroforética y que será adecuado para poner en práctica los
métodos indicados anteriormente, permitiendo la levitación estable
de partículas dieléctricas neutras o partículas cargadas
eléctricamente (células o compuestos), con el fin de verificar y
controlar la posición de cada célula individual y compuesto presente
en el dispositivo.
Finalmente, un objeto adicional de la invención
es proporcionar un método sencillo, rápido, eficaz y fiable para
administrar compuestos o unidades compuestas a células o
microorganismos. Considerando un primer aspecto de la descripción,
la invención se refiere a un método para realizar pruebas y ensayos
alto rendimiento y elevado valor biológico sobre una muestra que
contiene material químico/biológico que consiste en entidades
desconocidas, tal como se reivindica en la reivindicación 1. En
particular tal método comprende las etapas de:
- (a)-
- introducir la muestra que incluye las entidades desconocidas dentro de una primera cámara de un dispositivo de pruebas que comprende al menos una serie de primeros electrodos excitables y direccionables de forma selectiva y al menos un segundo electrodo colocado enfrente de y orientado hacia los primeros electrodos;
- (b)-
- introducir material químico/biológico dentro de la primera cámara del dispositivo de pruebas, que consiste en entidades conocidas identificables en el interior de dicho dispositivo de pruebas y que tienen una supuesta afinidad con las entidades desconocidas;
- (c)-
- crear de forma selectiva compartimentos de potencial móviles cerrados en el interior de la primera cámara por medio de fuerza dielectroforética generada por los electrodos enfrentados y atrapar al menos una parte de las entidades desconocidas en el interior de los compartimentos móviles;
- (d)-
- mover al menos uno de los compartimentos móviles que contienen las entidades conocidas hacia los compartimentos móviles que contienen las entidades desconocidas y hacer que al menos una entidad desconocida interaccione con al menos una entidad conocida de al menos un primer tipo ocasionando la fusión de al menos un par de compartimentos móviles que contienen las entidades relativas;
- (e)-
- verificar la creación o de otro modo de un enlace estable entre al menos una entidad desconocida y al menos una ha entidad conocida del primer tipo, con el fin de determinar si existe afinidad entre las dos e identificar en consecuencia la al menos una entidad desconocida.
Las entidades desconocidas identificadas de esta
manera se recuentan y se separan preferiblemente de las entidades
restantes y se recuperan en el exterior del dispositivo de pruebas
tras transferirse a una segunda cámara del dispositivo de
pruebas.
De esta forma, y en particular utilizando
microperlas como entidades conocidas (funcionalizadas por ejemplo
con anticuerpos especiales o con un ligando), puede utilizarse el
método según la invención en el campo del diagnóstico para
identificar y posiblemente recontar un microorganismo dado en una
muestra, para separar células basándose en las características
antigénicas, por ejemplo tal como para separar células neoplásicas
de células normales, o para estudiar la respuesta celular activada
por la unión de un ligando a su receptor específico.
Considerando un segundo aspecto de la
descripción, la invención se refiere a un método de realizar pruebas
y ensayos de alto rendimiento y elevado valor biológico sobre una
pluralidad de primeras entidades seleccionadas de un grupo que
incluye células, virus, microorganismos, ácidos nucleicos y
combinaciones de las mismas, y una pluralidad de segundas entidades
que consisten en compuestos o unidades compuestas que van a
someterse a prueba para determinar su actividad biológica sobre las
primeras entidades tal como se reivindica en la reivindicación 20;
en particular tal método comprende las etapas de:
- (a)-
- introducir las primeras y segundas entidades dentro de una primera cámara de un dispositivo de pruebas que comprende al menos una serie de primeros electrodos excitables y direccionables de forma selectiva y al menos un segundo electrodo colocado enfrente de y orientado hacia los primeros electrodos;
- (b)-
- crear de forma selectiva compartimentos de potencial móviles cerrados en el interior de la primera cámara por medio de fuerza dielectroforética generada por los electrodos enfrentados y atrapar al menos una parte de las entidades en el interior de los compartimentos móviles;
- (c)-
- mover al menos uno de los compartimentos móviles que contienen las primeras entidades hacia los compartimentos móviles que contienen las segundas entidades y hacer que al menos una primera entidad interaccione con al menos una segunda entidad de al menos un primer tipo ocasionando la fusión de al menos un par de compartimentos móviles que contienen las entidades relativas;
- (d)-
- verificar la actividad biológica de la segunda entidad sobre la primera entidad analizando la interacción resultante utilizando detectores que pueden de detectar cualquier prueba en la primera entidad de al menos uno de un grupo seleccionado de efectos, concretamente citostáticos, citotóxicos, mitóticos y expresión de un marcador.
Más exactamente, los efectos mitóticos,
citotóxicos y citostáticos anteriormente mencionados se detectan
verificando la presencia y/o la presencia cambiada de las primeras
entidades en los compartimentos móviles creados a su alrededor y/o
en proximidad a una pluralidad de primeros electrodos colocados
inmediatamente adyacentes a los compartimentos móviles que
contienen las primeras entidades y, previamente a la ejecución de la
etapa (c) anteriormente mencionada, se dejan vacíos u ocupados por
compartimentos móviles.
Así, se hace posible realizar muchos miles de
experimentos en paralelo en el interior del mismo dispositivo.
Pueden tratarse células del mismo tipo con una combinación de
compuestos diferentes, o alternativamente puede tratarse una
combinación de células con un compuesto, o también, puede utilizarse
una combinación de ambas soluciones. El número de experimentos
posibles con este método puede aumentarse adicionalmente haciendo
variar la "dosificación" de los compuestos administrados a
cada célula individual, o la cantidad de cierto tipo de
compuesto.
Además de la ventaja del alto rendimiento, el
método permite que se realicen experimentos a elevadas velocidades
gracias al uso de volúmenes de reacción pequeños, es decir pequeñas
cantidades de compuestos, también de tampones y otros reactivos. En
efecto, la acción de colocar las partículas mediante levitación
dielectroforética tiene el efecto de minimizar la manipulación del
líquido usando sistemas microfluidos costosos e incómodos.
Esto también tiene un impacto positivo obvio y
adicional sobre el coste de realización del experimento, ya que es
posible reducir la necesidad de grandes cantidades de compuestos que
son particularmente costosos y/o difíciles de obtener mediante
síntesis.
Al contrario que los sistemas
"tradicionales" para inmovilizar células (basados en una unión
química (específica o de otro modo) con un sustrato), la
disposición de las células según la presente invención se logra por
medio de levitación dielectroforética, de forma que no hay contacto
ni unión en absoluto entre el material y el dispositivo, y esto
garantiza que la respuesta fisiológica es más natural.
En comparación con los sistemas basados en
cámaras múltiples (microtítulos, etc) una diferencia y ventaja
adicional consiste en el hecho de que las interacciones
célula-compuesto pueden producirse todas en la misma
cámara de un dispositivo, y en la práctica, de forma simultánea.
Esto reduce la incidencia de errores en el análisis que se producen
con aparatos que tienen cámaras o pocillos separados, ya que las
condiciones en las que se realiza el experimento se caracterizan
por su mayor uniformidad.
El método descrito también permite analizar la
respuesta de una célula individual y no sólo la de la media
estadística en una población de células homogéneas, tal como se
produce en casi todos los métodos propuestos hasta ahora. Esto se
hace posible mediante la adopción de sistemas detectores de tipo
capacitivo u óptico integrados, que permiten prescindir de los
engorrosos instrumentos usados tradicionalmente con este objetivo
en este campo (cámara de TV, microscopio), si bien es cierto que
tales instrumentos pueden utilizarse igualmente bien para la
monitorización visual de los acontecimientos que se producen en el
interior del dispositivo, o simplemente si se prefiere por
cualquier razón. Además, pueden emplearse técnicas de control de
retroalimentación convencionales, tratando la información devuelta
por los detectores integrados dentro del dispositivo, para realizar
series de operaciones complejas de un modo completamente automático,
tal como la recuperación selectiva de ciertas partículas que están
sometiéndose a
análisis.
análisis.
Puede automatizarse y controlarse
electrónicamente casi todo el método, volviéndolo particularmente
adaptable a los diversos requisitos del usuario. El alto nivel de
automatización que puede obtenerse también limita la incidencia de
error asociado comúnmente con las operaciones manuales repetitivas
realizadas en otros procedimientos de selección.
Además, el método descrito puede utilizarse para
administrar no sólo posibles compuestos farmacéuticos,
microencapsulados o de otro modo, sino también microperlas
oportunamente funcionalizadas.
Tales perlas pueden ser de dimensiones
comparables a las de las células o de hecho mucho más pequeñas, y
recubiertas mediante métodos convencionales por ejemplo con
anticuerpos (Ac) u otras sustancias que pueden interaccionar con
los receptores celulares.
Las microperlas recubiertas oportunamente con
ADN (o ARN) sonda pueden hacerse interaccionar con otras recubiertas
con ADN (o ARN) diana como parte de una prueba de hibridación, por
ejemplo para identificar la diana (diagnóstico molecular) o en
análisis de polimorfísmos de un único nucleótido (SNP).
Considerando un tercer aspecto de la
descripción, la invención se refiere a un dispositivo de pruebas
multifuncional compuesto por un primer módulo que comprende una
serie de primeros electrodos, excitables y direccionables de forma
selectiva e individual, al menos en parte, dispuestos sobre un
soporte aislante; un segundo módulo que comprende al menos un
segundo electrodo colocado enfrente de y orientado hacia los
primeros electrodos y una estructura de soporte superior; también
un elemento espaciador dispuesto entre el primer y segundo módulo y
que delimita un entorno líquido o semilíquido durante el
funcionamiento, caracterizado porque el elemento espaciador está
realizado de tal manera que establece una primera cámara y al menos
una segunda cámara en el interior del dispositivo, interconectadas
hidráulicamente mediante al menos un paso estrecho y que delimita
el entorno líquido o semilíquido, que se divide así mediante el al
menos un paso estrecho en al menos dos entornos parciales no
influidos hidráulicamente entre sí y que coinciden con las al menos
dos cámaras.
Las dos cámaras están equipadas con orificios
que pueden abrirse de forma selectiva y controlada que funcionan
como entradas y salidas respectivas, mientras que la serie de
primeros electrodos funciona como el fondo de las cámaras y del al
menos un paso estrecho que permite la comunicación entre las
cámaras.
Con esta solución, se hace posible realizar
pruebas y operaciones en números que hasta ahora no podían manejarse
con un único dispositivo de pruebas, ejecutadas de forma rápida y
fiable, con facilidad y bajo coste (dado que los procedimientos
pueden ponerse todos en práctica sin dificultad mediante
programación electrónica). En efecto, las soluciones de la técnica
anterior propuestas hasta ahora en el campo de la química
combinatoria revelan varios problemas, muchos de los cuales pueden
superarse con el dispositivo según la invención en virtud de su
capacidad para crear una distribución espacial de partículas, o más
sencillamente controlar su posición, empleando una distribución
seleccionada como objetivo de campos eléctricos diseñados para crear
compartimentos de potencial cerrados por medio de fuerza
dielectroforética. Estos compartimentos pueden manipularse de tal
manera se hace que una partícula atrapada en el interior de un
compartimento correspondiente cubra distancias apreciables en el
interior del dispositivo.
Finalmente, la invención se refiere a un método
de administrar primeras entidades que consisten en compuestos o
unidades compuestas, a segundas entidades, tal como se reivindica en
la reivindicación 40, tal método comprende las etapas de:
- (a)-
- introducir las primeras y segundas entidades dentro de una cámara de un dispositivo de pruebas que comprende al menos una serie de primeros electrodos excitables y direccionables de forma selectiva y al menos un segundo electrodo colocado enfrente de y orientado hacia los primeros electrodos;
- (b)-
- crear de forma selectiva compartimentos de potencial móviles cerrados en el interior de la cámara mediante la fuerza dielectroforética generada por los electrodos enfrentado y atrapar al menos una parte de las entidades en el interior de los compartimentos móviles.
- (c)-
- identificar y seleccionar los compartimentos que contienen primeras entidades;
- (d)-
- mover al menos uno de los compartimentos móviles que contienen las primeras entidades hacia los compartimentos móviles que contienen las segundas entidades;
- (e)-
- hacer que al menos un compartimento móvil que contiene una primera entidad se fusione con un compartimento móvil que contiene una segunda entidad.
El método proporciona así la facilidad de poner
en contacto sustancias seleccionadas con otras sustancias
seleccionadas u organismos de forma controlada, rápida y
eficazmente, no sólo con el fin de realizar pruebas sino también de
inducir cambios o reacciones de forma intencionada mientras se
mantienen los productos de reacción "dentro de unos límites",
por ejemplo para producir alteraciones genéticas en microorganismos
que posteriormente pueden recuperarse fácilmente.
Otras características y ventajas de la invención
surgirán más claramente a partir de la siguiente descripción de
ciertas realizaciones a modo de ejemplo, y que no implican
limitación, con la ayuda de los dibujos adjuntos
- La figura 1 ilustra parte de un dispositivo
convencional para la manipulación de muestras mediante
dielectroforesis, visto de forma esquemática y en perspectiva;
- La figura 2 es una vista tridimensional
esquemática del dispositivo realizado según la presente
invención;
- La figura 3 es una ilustración esquemática que
muestra una de las estrategias de ordenación posibles que podrían
utilizarse en el método según la invención, que consiste en la
introducción y colocación puesta en práctica secuencialmente para
los diferentes tipos de células;
- La figura 4 ilustra una estrategia de
ordenación que consiste en la introducción simultánea de varias
especies y la colocación selectiva de diferentes especies;
- La figura 5 muestra la curva descrita por la
fuerza dielectroforética en condiciones de variación de frecuencia,
para células (BIO) y para microperlas (PERLA);
- La figura 6 ilustra el funcionamiento del
sistema dielectroforético utilizado según la invención cuando se
fusionan dos compartimentos, uno que contiene una célula para
análisis y otro que contiene una microperla recubierta con
anticuerpos, de dimensiones comparables a las de la célula. En el
caso de un emparejamiento (6a) y sin emparejamiento (6b) entre
antígeno y anticuerpo;
- La figura 7 ilustra el funcionamiento del
sistema dielectroforético utilizado según la invención cuando se
fusionan dos compartimentos, uno que contiene una célula para
análisis y otro que contiene microperlas recubiertas con
anticuerpos, de dimensiones menores a las de la célula, en caso de
emparejamiento entre antígeno y anticuerpo con una fuerza
dielectroforética positiva predominante (7a), emparejamiento con una
fuerza dielectroforética negativa predominante (7b) y sin
emparejamiento (7c);
- La figura 8 incluye un gráfico que muestra
varios mínimos de potencial, e ilustra el desplazamiento de una
célula generada recientemente desde el mínimo ocupado por la célula
original hacia el mínimo adyacente;
- la figura 9 ilustra las etapas de analizar y
seleccionar células específicas utilizando microperlas
funcionalizadas con anticuerpos específicos.
Con referencia a las figuras 1 y 2, la presente
invención se basa en el uso de un dispositivo de pruebas que
realiza una tecnología descrita en la solicitud de patente
internacional WO 00/69565, presentada por el mismo solicitante,
cuyo contenido se incorpora aquí en la medida que proporciona
referencia útil para los fines de la presente descripción; en
efecto, el dispositivo descrito en el presente documento incorpora
características estructurales originales y nuevas no mencionadas en
la solicitud mencionada anteriormente, diseñado especialmente de
tal forma que los métodos de prueba y ensayo según la presente
invención pueden realizarse de forma sencilla, eficaz, económica y
con un uso racional del espacio.
El dispositivo propuesto, ilustrado
esquemáticamente en la figura 1, comprende dos módulos principales,
de los cuales el primero consiste en una serie M1 de electrodos LIJ
dispuestos en filas ordenadas sobre una estructura A1 de soporte
aislante. Los electrodos LIJ pueden prepararse a partir de cualquier
material conductor dado, seleccionado preferiblemente de los
metales compatibles con la tecnología de integración electrónica,
mientras que el medio aislante de la estructura A1 de soporte puede
ser óxido de silicona o de hecho cualquier otro material
aislante.
La forma de los electrodos LIJ que constituyen
la serie M1 puede seleccionarse de varios tipos; en la figura 1 los
electrodos LIJ son cuadrados, si bien es cierto que esto no implica
limitación. Cada elemento de la serie M1 consiste en un único
electrodo LIJ que sirve para generar un compartimento S1
dielectroforético por medio del cual se manipula una muestra BIO
biológica en el interior de un entorno L líquido o semilíquido
delimitado por un elemento A3 espaciador.
Una región C bajo los electrodos sirve para
colocar circuitos detectores integrados que pueden integrarse al
dispositivo, es decir detectores de realización convencional (no
ilustrados con el fin de simplificar), seleccionados de varios
tipos, de forma que detectarán la presencia de una entidad que va a
manipularse en el interior de los compartimentos S1 de potencial
generados por los electrodos. En una realización preferida del
dispositivo, el segundo módulo principal consiste sustancialmente en
un único electrodo M2 grande, que cubre el dispositivo en su
totalidad. Finalmente, el dispositivo también puede incluir una
estructura A2 de soporte superior, que funciona como tapa para el
dispositivo y que encierra el entorno L líquido o semilíquido.
La forma más sencilla para el segundo electrodo
M2 es la de una superficie totalmente plana y uniforme; son
posibles otras formas de mayor o menor complejidad (por ejemplo una
rejilla de un tamaño de malla dado a través de la cual puede pasar
la luz). El material más adecuado para el electrodo M2 superior será
un material conductor transparente depositado sobre una estructura
A2 de soporte de vidrio. Además de permitir la inclusión de
circuitos detectores tal como se resumió anteriormente, esta
solución también permitirá el uso de medios de inspección ópticos
tradicionales (microscopio y cámara de TV) colocados sobre el
dispositivo.
El diagrama esquemático de la figura 2
representa un dispositivo DE realizado según la invención y derivado
del dispositivo de la figura 1, y por consiguiente, los detalles
que parecen similares o idénticos en los dos dibujos se indican con
el fin de simplificar usando las mismas referencias.
El dispositivo DE comprende un módulo A2
superior que soporta un único electrodo M2 (no indicado con el
interés de simplificar), un módulo C inferior que lleva una serie
M1 de electrodos LIJ excitables y direccionables de forma selectiva
(no ilustrados), también un espaciador A3 interpuesto entre los dos
módulos A2 y C principales y que abarca un entorno L líquido o
semilíquido que en el funcionamiento consistirá en soluciones tampón
adecuadas. Sin embargo, en este caso, según la invención el
espaciador A3 está preparado de tal manera que se crean dos cámaras
F y FL internas, interconectadas hidráulicamente por medio de al
menos un paso D estrecho y delimitando el entorno L, que se divide
así por el paso D en dos entornos parciales o influidos
hidráulicamente entre sí y que coinciden con las dos cámaras F y
FL. Cada cámara F y FL está equipada además con orificios que pueden
abrirse de forma controlada y selectiva que funcionan como entradas
y salidas, denominadas I1 y O1 (cámara F) e I2 y O2 (cámara FL)
respectivamente, la serie M1 de electrodos LIJ funciona como el
fondo de ambas cámaras F y FL y del paso D estrecho de
interconexión.
El dispositivo así realizado se utiliza, según
la invención, de la manera que se describe a continuación.
En el método según la presente invención, el
experimentador puede introducir la muestra (ya sean células,
posibles compuestos farmacéuticos microencapsulados o microperlas
funcionalizadas) a través de la entrada I1 relativa (figura 2) y
dentro del entorno de manipulación, usando instrumentos
convencionales familiares para un experto en la técnica (bombas
peristálticas, pipeteadores, jeringas Hamilton, etc), empleando un
procedimiento que puede ser completamente automático o procediendo
manualmente, según los requisitos. La muestra se somete a una
fuerza dielectroforética de intensidad adecuada, de tal manera que
la atrape dentro de un mínimo de potencia y haga que se desplace
distancias mayores o menores en el interior del dispositivo. Antes
de que puedan comenzar estas operaciones, en cualquier caso, las
cámaras F y FL (figura 2) del dispositivo deben llenarse con una
solución tampón adecuada por medio de los orificios I1 e I2. Durante
esta etapa, los orificios O1 y O2 en el lado opuesto de las cámaras
se dejan abiertos para evitar la formación de burbujas de aire que
evitarían que el dispositivo DE funcionara correctamente.
El hecho de poder desplazar partículas que
levitan únicamente mediante la fuerza de dielectroforesis tiene un
papel decisivo en minimizar la manipulación del líquido usando
sistemas fluidodinámicos costosos e incómodos (microfluidos). Las
partículas seleccionadas pueden reunirse en la zona F de entrada (en
la que hay transitoriamente un flujo elevado y posibles
turbulencias), después se dirigen a través del paso D estrecho en el
separador central y dentro de la cámara FL adyacente normalmente
sin flujo, moviendo las partículas en lugar del líquido y evitando
así el estrés por fricción y contacto. De esta forma las partículas
pueden disponerse en una matriz ordenada o de forma más sencilla se
permite que mantengan la posición que asumieron espontáneamente
dentro de la cámara.
Habiendo generado y/o mantenido la colocación
requerida, entonces es posible desplazar otras partículas, sean
células o compuestos que se van a someter a ensayo, y ponerlas en
contacto con las que van a analizarse.
Por tanto, es posible realizar miles de
experimentos paralelos en el interior del mismo dispositivo. Pueden
tratarse células del mismo tipo con una combinación de compuestos
diferentes o alternativamente una combinación de células puede
tratarse con un compuesto. También es posible tratar distintas
células con distintos compuestos en el transcurso de un
experimento. El número de experimentos posibles con este método
puede aumentar además haciendo variar la "dosificación" de los
compuestos administrados a cada célula individual, es decir, el
número de unidades de un cierto tipo de compuestos, o incluso
administrar distintos compuestos en sucesión a cada célula.
Esto se ilustra mediante la siguiente
fórmula:
N_{E} = n
\cdot 2^{(c \cdot
p)}
En la que NE es el número de experimentos
individuales que pueden realizarse dentro del experimento global, n
es el número de células diferentes utilizadas, c el número de
compuestos diferentes utilizados y p la dosificación de los
compuestos.
La manera en la que se van a administrar las
sustancias a las células de interés dependerá en primer lugar y de
manera más importante, de dónde tenga lugar la acción, en otras
palabras, si la sustancia debe entrar en la célula o si puede
interaccionar con un receptor en el exterior de la célula, así como
de las propiedades físicas y químicas de la sustancia que está
sometiéndose a prueba.
En los casos en los que la sustancia debe
introducirse dentro de la célula para realizar su actividad
hipotética, los métodos de administración cambiarán
significativamente según las propiedades químicas y físicas de la
propia sustancia:
- Esta categoría comprende todas aquellas sustancias que pueden atravesar los límites celulares de forma natural (membrana, y pared si la hay), en otras palabras sustancias ampliamente apolares que generalmente forman una fase separada en soluciones acuosas (a excepción de algunas sustancias polares que se incorporan espontáneamente a la célula mediante proteínas transportadoras de membrana). Para muchas de estas sustancias apolares es suficiente producir emulsiones, usando métodos de la técnica anterior, en los que el diámetro de las perlas de sustancia en la emulsión son compatibles con las dimensiones de los compartimentos dielectroforéticos en los que van a manipularse. Otras (por ejemplo, ácidos retinóicos) se administran mediante un liposoma, intercalado con fosfolípidos como constituyentes de la capa de lípidos del liposoma.
- Esta categoría engloba todas las sustancias polares que deben entrar en la célula para realizar su acción pero que se disuelven en soluciones acuosas (incluyendo ácidos nucleicos). Para entrar en la célula, estas sustancias necesitan estar microencapsuladas, por ejemplo, incrustadas en una bicapa de fosfolípidos (liposomas). Fusionándose con la pared de la célula diana, el liposoma puede administrar su contenido al citoplasma. También es posible usar microperlas impregnadas con la sustancia de interés, que absorberá la célula.
- Alternativamente, tal como es el caso de los ácidos nucleicos, por ejemplo, pueden introducirse sustancias usando virus o como vectores, modificados genéticamente según sea apropiado mediante métodos convencionales. Aunque los virus son significativamente más pequeños que las células, la acción de manipularlos mediante dielectroforesis cae, sin embargo, dentro del alcance de la técnica anterior en este campo.
Esta categoría incluye todas aquellas sustancias
cuya acción corresponde a un mecanismo
receptor-ligando. A menos que se trate de moléculas
pequeñas solubles en el tampón seleccionado, deben administrarse con
la ayuda de microperlas, es decir, recubrir microperlas de un
material adecuado con estas mismas sustancias. Otros tipos de
moléculas también pueden administrarse sobre la superficie de
liposomas. Finalmente, otras células pueden administrar por sí
mismas el ligando.
Con el fin de realizar experimentos empleando el
método descrito, el experimentador debe poder conocer necesariamente
la posición y el tipo de cada célula y/o compuesto utilizado. Las
estrategias para ordenar las células y compuestos se agrupan
esencialmente en dos categorías:
- Un procedimiento posible es introducir las células y/o compuestos dentro del dispositivo secuencialmente. La figura 3 muestra un ejemplo de como se ordenan las células secuencialmente. En este caso, el tipo de células se conoce obviamente de antemano, y es suficiente disponer detectores de proximidad alineados con al menos una cavidad de electrodo del dispositivo. Los compartimentos que se mueven sobre esta cavidad pueden caracterizarse según la presencio o ausencia de la partícula. Si se detecta la presencia, se coloca la partícula en la serie; si no, se ignora el compartimento y se detecta el siguiente compartimento en secuencia. El procedimiento propuesto puede ponerse en práctica usando detectores externos tales como cámaras de TV conectadas a un microscopio, o alternativamente la estructura A1 de soporte puede incorporar tanto los electrodos que sirven para manipular las partículas biológicas como los dispositivos que sirven para detectarlas. Los detectores pueden ser de tipo capacitivo u óptico. Una vez introducidos mediante la entrada I1 (figura 3) dentro de la cámara F de flujo del dispositivo, los elementos o partículas biológicos se colocan en una disposición R2 ordenada en la cámara FL sin flujo, en la que puede haber ya otros tipos R1 de células, introducidos y ordenados previamente e incluidos en el mismo experimento. Si por otro lado, todas las cavidades están equipadas con detectores, entonces se simplifica la situación. Los compartimentos que contienen partículas se identifican en la cámara F de flujo inmediatamente tras la introducción de la nueva especie, y se mueven a las posiciones seleccionadas en la cámara FL sin flujo.
- Pueden eliminarse las partículas en exceso introduciendo más líquido a través del orificio I1 de entrada de la cámara de flujo, purgando así las partículas de la cámara junto con el exceso de líquido por medio de la salida relativa O1.
Se usan detectores que pueden identificar el
tipo de célula o sustancia.
Más que introducir células o compuestos en
secuencias ordenadas, existe la facilidad de, con un dispositivo
que incorpora detectores que pueden detectar no solo la presencia
sino también el tipo de célula o compuesto que puede estar atrapado
en un compartimento, introducir las células aleatoriamente y dejar
que el dispositivo las disponga automáticamente (tal como se
describe en la patente PCT/WO00/69565). Del mismo modo, en este
caso el procedimiento se realiza con la ayuda de o bien detectores
ubicados en el exterior o bien de detectores capacitivos u ópticos
integrados dentro del dispositivo.
La figura 4 muestra un ejemplo de esta solución.
Las partículas biológicas se introducen por medio de la entrada I1
dentro de la primera cámara F del dispositivo activando un flujo
temporal. Aquí se identifican según el tipo mediante los detectores
de diferenciación. Después, cada partícula individual se ordena
según el tipo en la cámara FL sin flujo junto con las otras de su
tipo R1 y R2. Un detector diferenciador de tipo puede ubicarse por
debajo de cada cavidad o incluso bajo una única cavidad. En el
último caso, será ventajoso ubicar el detector bajo una cavidad
cerca del paso D entre las dos cámaras a través del cual se
dirigirán los compartimentos necesariamente.
En lo que respecta a la versión del método que
implica el uso de microperlas funcionalizadas, el problema de
ordenar las partículas incluidas en la prueba, y más especialmente
de su identificación, se facilita en parte por las características
de las microperlas. Una vez se ha generado y/o mantenido la
disposición deseada de las células utilizando una de las
estrategias descritas, el experimentador puede sencillamente
introducir una mezcla de microperlas funcionalizadas con diferentes
anticuerpos dentro del dispositivo, sin necesidad de adoptar un
procedimiento secuencial. Es suficiente con que las sustancias
tengan pares homogéneos de características físicas e inmunológicas,
en otras palabras, que cada tipo específico de anticuerpo se
empareje mediante características diferentes de la partícula
mediante la cual se administra. Un ejemplo de esto se muestra en la
tabla 1: se usar tres anticuerpos (Acm específicos) para tres
antígenos diferentes de tres organismos diferentes para recubrir
tres tipos de partículas, que se diferencian por un lado en cuanto
al color y por otro lado en cuanto a la constante dieléctrica.
El número de partículas también puede aumentarse
adoptando combinaciones de características físicas. Se muestra un
ejemplo de esto en la tabla 2.
Además del color, pueden determinarse fácilmente
otras características tales como reflectancia y posiblemente
fluorescencia con la ayuda de un detector externo adecuado. Pueden
detectarse transparencia y diferencias en la constante dieléctrica
con detectores integrados de tipo óptico y capacitivo,
respectivamente.
De forma similar, los complejos formados por la
interacción antígeno-anticuerpo entre la célula y
las perlas, identificados simplemente mediante el emparejamiento
entre las características físicas e inmunológicas de las
microperlas, pueden tratarse en este punto adicionalmente según la
invención, tal como se describió en su momento. Puede usarse
discriminación basándose en las características físicas, usando
fluorescencia en particular, para identificar partículas que
consisten no sólo en microperlas funcionalizadas, sino también en
liposomas que llevan compuestos dados o bien en el interior o bien
sobre la superficie.
Es posible explotar el modo en el que el
comportamiento de las partículas en el dispositivo cambia con la
variación en la frecuencia de los campos eléctricos aplicados. En
efecto, según varía la frecuencia las células pueden experimentar
un cambio en la dirección y/o intensidad de la fuerza
dielectroforética neta que las conduce a regiones del dispositivo
con una intensidad de campo decreciente (nDEP) o hacia regiones con
intensidad de campo creciente (pDEP). Células diferentes tienen
curvas de transición diferentes, dependiendo de sus propiedades
conductoras y dieléctricas (sus denominadas "firmas
espectrales"). En la práctica, este fenómeno puede utilizarse
para atrapar y mover una especie celular individual (tal como se
describe en la patente PCT/WO 00/69565) y separar así diversas
especies a partir de un conjunto de organismos. En este caso,
conociendo como migrarán las células a la frecuencia seleccionada y
teniendo detectores que puedan detectar la presencia de la célula,
el experimentador introduce una mezcla de organismos dentro de la
cámara que se separarán después directamente mediante el
dispositivo. De nuevo, puede detectarse la presencia de detectores
mediante detectores que funcionan en el exterior o integrados
dentro del dispositivo (ópticos o capacitivos).
Durante el transcurso de estas operaciones, la
información devuelta por los detectores puede usarse para modificar
el control y las operaciones que van a realizarse según el estado
del sistema, y para cambiar o ajustar la programación del
dispositivo. También es posible generar una representación virtual
(gráfica, por ejemplo) del estado del sistema con el fin de
optimizar la interfaz entre el dispositivo y el usuario con fines de
programación y análisis de los resultados.
En la práctica, este tipo de experimento
consiste en generar o mantener en todos los casos una disposición
ordenada de las células (o compuestos) y hacer que interaccionen con
los compuestos (o células) que están sometiéndose a ensayo. Esto se
consigue simplemente haciendo que se fusionen juntos los
compartimentos de potencial dielectroforético que
contienen/transportan las células y compuestos. En caso de
compuestos apolares microemulsionados (por ejemplo, esteroides o
triglicéridos), estos atraviesan espontáneamente los límites
celulares y por tanto pueden ejercer su acción, si la tienen, dentro
de la célula. En el caso de compuestos microencapsulados en
liposomas, la bolsa de fosfolípidos se fusiona con la membrana
celular liberando el compuesto dentro de la célula en la que
producirá su acción, si la tiene. Cuando las partículas se asocian a
vectores víricos modificados genéticamente, se inserta el gen de la
sustancia que está sometiéndose a prueba dentro del ADN del virus
mediante un procedimiento convencional. Mediante la acción de
mecanismos particulares peculiares a él, el virus introducirá su
material genético dentro de la célula en la que después producirá su
acción, si la tiene.
Las microperlas funcionalizadas con anticuerpos
se usan en todos los casos en los que hay necesidad de diferenciar
una célula basándose en moléculas características (antígenos)
expuestas sobre su superficie (pared o membrana). Los ejemplos
típicos son aplicaciones de diagnóstico y procedimientos
relacionados con la separación de poblaciones particulares de
células de otras que de otro modo no pueden distinguirse.
Las perlas funcionalizadas con anticuerpos
pueden administrarse por medio de un compartimento de potencial
dielectroforético a la célula y ponerse en contacto con la célula
simplemente haciendo que el compartimento que contiene la perla se
fusione con el compartimento que contiene la célula. Entre las
características singulares del método según la invención está que
puede usarse para realizar una comprobación de la unión entre el
anticuerpo y el antígeno identificado.
El experimentador puede tratar de separar las
células de las microperlas funcionalizadas, y por tanto llevar a
cabo una verificación dependiente de la intensidad de la unión entre
antígeno y anticuerpo, adoptando una de las siguientes
estrategias:
A frecuencia constante, con la célula y las
microperlas expuestas ambas a nDEP, el experimentador puede
comprobar la intensidad de la fuerza de unión entre el anticuerpo
que recubre la perla y el antígeno presente sobre la superficie de
la partícula biológica, verificando la resistencia del complejo
antígeno-anticuerpo frente a la fuerza de
separación cuando se atraen dentro de dos compartimentos distintos
haciendo variar la intensidad de
\nabla(E_{rms})^{2}, es decir, la intensidad de
la fuerza dielectroforética, que es:
<F>
\propto Re[Fcm(\omega)] \nabla
(Erms)^{2}
en otras palabras, proporcional a
\nabla(E_{rms})^{2}. Aumentando los voltajes de
los electrodos, es decir, aumentando la amplitud del voltaje
aplicada entre los electrodos, también es posible aumentar la
intensidad de la fuerza dielectroforética atrayendo las dos
partículas dentro de compartimentos
distintos.
La respuesta de la frecuencia de la fuerza
dielectroforética (Re[fcm] en la figura 5) generalmente es
diferente en microperlas y células respectivamente. En efecto,
hacer variar la frecuencia tiene el efecto de influir en el factor
de fuerza fcm(\omega). Esto tiene poco efecto sobre las
microperlas (PERLA en la figura 5), por lo que la fuerza
dielectroforética permanece sustancialmente constante en el sector
negativo (nDEP). En la práctica, las perlas siguen estando atraídas
hacia el centro de los compartimentos de potencial
dielectroforético. Para las células, en cambio (BIO en la figura
5), la fuerza dielectroforética cambia de negativa a positiva con
la variación de frecuencia entre los electrodos. El efecto de esto
en la práctica es que las células tienden a estar atraídas desde el
centro de los compartimentos hacia los electrodos en los que el
campo eléctrico es el más intenso.
También es posible comprobar el emparejamiento
de la unión entre antígeno y anticuerpo basándose en los dos
parámetros mencionados anteriormente, haciendo variar tanto la
frecuencia del campo eléctrico, es decir, la fuerza
dielectroforética decreciente (nDEP) o creciente (pDEP), y la
intensidad del campo eléctrico, es decir, el módulo del campo de la
fuerza dielectroforética.
Las situaciones que surgen dependen en gran
medida de las dimensiones de las microperlas, de la fuerza
dielectroforética predominante positiva o negativa, y de la
existencia o de otro modo, de un enlace entre antígeno y
anticuerpo:
El siguiente método es particularmente adecuado
en el caso de perlas que son de dimensiones comparables a las de la
partícula BIO y del compartimento.
Inicialmente (tiempo T1 en la figura 6a), la
célula BIO y la microperla PERLA funcionalizada ocupan dos
compartimentos adyacentes. Los compartimentos se indican
esquemáticamente mediante líneas S1 difusas relativas, indicando
cada una la parte del espacio en la que se genera una fuerza
dielectroforética significativa. A continuación (tiempo T2 en la
figura 6a), se genera un compartimento más grande según convergen
las dos partículas y entran por último en contacto físico en el
interior de este mismo compartimento. En caso de emparejamiento, los
anticuerpos sobre la microperla reconocen su antígeno específico y
se unen a él. Después de esto (tiempo T3 en la figura 6a), vuelven
a establecerse los compartimentos iniciales, pero la microperla
continúa anclada a la célula a causa del enlace
antígeno-anticuerpo y los dos siguen ocupando el
mismo compartimento.
Inicialmente (tiempo T1 en la figura 6b,) la
célula y la microperla funcionalizada ocupan dos compartimentos
adyacentes. A continuación (tiempo T2 en la figura 6b), se genera un
compartimento más grande según convergen las dos partículas y
entran por último en contacto físico en el interior de este mismo
compartimento. Sin embargo, si no hay emparejamiento, los
anticuerpos sobre la microperla no reconocen ningún antígeno
específico y por consiguiente no se unirán a la célula. Después de
eso (tiempo T3 en la figura 6b), vuelven a establecerse los
compartimentos iniciales y la microperla y la célula vuelven a
ocupar sus posiciones originales.
El siguiente método es adecuado en el caso de
perlas que son o bien de dimensiones más pequeñas que las de la
célula BIO o bien de dimensiones comparables a las de la célula
BIO.
Inicialmente (tiempo T1/emparejamiento y pDEP
predominante en la figura 7a), la célula BIO y varias microperlas
PERLA funcionalizadas ocupan dos compartimentos adyacentes. Se hacen
converger los compartimentos cambiando la polaridad de los
electrodos en la serie M1 (véase la figura 7a). Como resultado
(tiempo T2/emparejamiento y pDEP predominante en la figura 7a), las
perlas entran en contacto físico con la célula y se agrupan
alrededor de su superficie. En caso de que haya emparejamiento, los
anticuerpos sobre las microperlas reconocen sus antígenos
específicos y se unen a ellos. Ahora se aplica un cambio de
frecuencia, cuyo efecto es someter la célula a la fuerza
dielectroforética positiva y hacer que el complejo
célula-microperlas caiga dentro de una zona de
potencial máximo, o entre los electrodos (tiempo T3/emparejamiento y
pDEP predominante en la figura 7a). Se manipulan los compartimentos
en un intento de separar la célula de las perlas, pero estas siguen
aferradas a la célula como resultado de una fuerza de unión
antígeno-anticuerpo (tiempo T4/emparejamiento y pDEP
predominante en la figura 7a). Después de eso, se evalúa la
situación verificando la presencia de partículas en la proximidad
del electrodo L100 y la ausencia de partículas en la proximidad del
electrodo L200 (tiempo T5/emparejamiento y pDEP predominante en la
figura 7a). Esto puede lograrse usando detectores ópticos
(integrados o de otro modo) o detectores capacitivos.
La situación durante las etapas iniciales
(tiempos T1-T3 en la figura 7b) es la misma que la
descrita anteriormente, con la célula BIO y varias microperlas
PERLA funcionalizadas que ocupan dos compartimentos adyacentes
(tiempo T1/emparejamiento y nDEP predominante en la figura 7b). Del
mismo modo, en este ejemplo los compartimentos se hacen converger
cambiando la polaridad de los electrodos en la serie M1, y las
microperlas entran en contacto físico con la célula, agrupándose
alrededor de su superficie (tiempo T2/emparejamiento y nDEP
predominante en la figura 7b). Esto es de nuevo un ejemplo de
emparejamiento, reconociendo los anticuerpos presentes sobre las
microperlas sus antígenos específicos y uniéndose a ellos. Se aplica
un cambio de frecuencia, como resultado de lo cual se somete la
célula a fuerza dielectroforética positiva, pero dado el nDEP
predominante sobre las microperlas, el complejo
célula-microperlas se mantiene en levitación (tiempo
T3/emparejamiento y nDEP predominante en la figura 7b). Se
manipulan los compartimentos adicionalmente en un intento de separar
la célula de las perlas pero las células siguen aferradas a las
perlas como resultado de la fuerza de la unión
antígeno-anticuerpo (tiempo T4/emparejamiento nDEP
en la figura 7b) de forma que el complejo se mueve como una única
entidad en dentro de un compartimento según dicta la variación en
la polaridad de los electrodos. Finalmente, se evalúa la situación
verificando la ausencia de partículas en la proximidad del electrodo
L100 y la presencia de partículas en la proximidad del electrodo
L200 (tiempo T5/emparejamiento y pDEP predominante en la figura
7b).
Inicialmente (tiempo T1/sin emparejamiento en la
figura 7c), la célula BIO y varias microperlas PERLA funcionalizadas
ocupan dos compartimentos adyacentes. Se hacen converger los
compartimentos cambiando la polaridad de los electrodos en la serie
M1. Las microperlas entran ahora en contacto físico con la célula y
se agrupan alrededor de su superficie (tiempo T2/sin emparejamiento
en la figura 7c). En este ejemplo, los anticuerpos sobre las
microperlas no reconocen ningún antígeno específico. Ahora se aplica
un cambio de frecuencia, como resultado de lo cual las microperlas
permanecen en levitación en el interior de un compartimento mientras
que la célula cae hacia los electrodos, estando sometida a pDEP
(tiempo T3/sin emparejamiento en la figura 7c). Se mueven
adicionalmente los compartimentos, la célula permanece cerca de los
electrodos, mientras que las microperlas se desplazan de
compartimento en compartimento (tiempo T4/sin emparejamiento en la
figura 7c). Finalmente, se evalúa la situación verificando la
presencia de partículas en la proximidad tanto del electrodo L100
como del electrodo L200 (tiempo T5/sin emparejamiento en la figura
7c).
Además de la facilidad de comprobar cada célula
individual con el fin de llevar a cabo una variedad de experimentos,
los métodos según la presente invención proporcionan la ventaja de
que puede analizarse directamente la respuesta fisiológica de las
células, sin tener que recuperarlas del dispositivo de pruebas.
No obstante, sigue siendo posible, dadas las
características del dispositivo, recuperar las células de interés
sin excesiva dificultad en el caso que se desee llevar acabo
experimentos adicionales sobre ellas. Una vez que la cámara F de
flujo del dispositivo se ha limpiado de cualquier partícula residual
con solución tampón, las células de interés pueden devolverse desde
la cámara FL sin flujo a la cámara F de flujo y extraerse bombeando
más solución tampón.
El método propuesto permite esencialmente al
experimentador analizar la respuesta de cada célula individual al
compuesto, mientras que otros métodos generalmente permiten el
análisis de la respuesta sólo en cuanto a un valor medio que
refleja una población de células homogénea.
Los efectos generados por los compuestos pueden
clasificarse ampliamente en 4 tipos:
- \bullet
- citostáticos: el compuesto produce un retraso en el tiempo que tarda en producirse la división celular;
- \bullet
- citotóxicos: el compuesto induce los mecanismos de muerte celular que conducen por último a la lisis celular;
- \bullet
- mitóticos: el compuesto estimula la mitosis celular (división celular), o una reducción en el tiempo que tarda en generarse una célula;
- \bullet
- complejos: respuesta fisiológica multifactorial (inducción de segundos mensajeros, activación de uno o más genes, etc.) cuyos efectos no pueden observarse fácilmente pero no obstante pueden coincidir en última instancia con uno de los anteriores.
Los efectos citotóxicos, citostáticos y
mitóticos pueden observarse con la ayuda de detectores ópticos
externos o detectores integrados. Tales detectores pueden ser de
tipo capacitivo, es decir, que consisten en un circuito que puede
de detectar pequeñas diferencias en la capacitancia entre dos
electrodos de la serie; la presencia o ausencia de la célula o
igualmente su posible lisis o duplicación, alterarán el valor de
capacitancia, permitiendo al experimentador no sólo detectar la
célula sino también determinar el número de células presentes. Del
mismo modo puede utilizarse la detección óptica, en cuyo caso el
factor que permite la diferenciación entre la presencia y ausencia
o la lisis y duplicación de la célula es la cantidad de fotones que
alcanzan un detector colocado por bajo de un mínimo de potencial.
Si una célula queda atrapada en tal mínimo, o vacío, bajo el cual se
ubica un detector, los fotones que inciden sobre el detector serán
menos en el grado en que la célula es menos transparente que el
líquido en el que está suspendida.
En caso de un efecto mitótico, una (o más) de
las células generadas no puede(n) contenerse en el mismo
compartimento que la célula original y por consiguiente cae en un
compartimento adyacente que se deja libre para tal fin, en el que
puede detectarse mediante el detector colocado en el mismo
compartimento. La figura 8 ilustra la secuencia de acontecimientos
anterior mostrada en una representación esquemática del dispositivo
y en una gráfica que indica la variación espacial de la fuerza
dielectroforética desde un momento hasta el siguiente.
Más exactamente, una célula BIO que puede o no
haber recibido un compuesto ocupa un compartimento S1, o mejor una
parte mínima del campo dielectroforético generado por el dispositivo
(tiempo T1 en la figura 8); ya sea estimulada por el efecto del
compuesto o beneficiándose de su ausencia, la célula comienza a
dividirse. Siempre que las dos nuevas células permanezcan
conectadas no escaparán del compartimento (tiempo T2 en la figura
8); con la mitosis terminada, las dos células generadas estarán
atrapadas momentáneamente entre dos compartimentos, en efecto sobre
la parte superior de dos mínimos de potencial adyacentes, en los que
caerán inevitablemente (tiempo T3 en la figura 8); una vez que las
células se han dividido eficazmente, el sistema alcanza una nueva
energía potencial mínima cuando cada célula ha ocupado un
compartimento relativo (tiempo T4 en la figura 8). Monitorizando el
número de compartimentos ocupados se hace posible, utilizando el
presente método, identificar la mitosis completada.
Alternativamente, puede hacerse uso de un detector capacitivo que
produce una respuesta análoga, proporcional al número de células
generadas y, por tanto, tal que permitirá que se cuenten las células
incluso cuando estén atrapadas en el interior del mismo
compartimento.
Para analizar distintas respuestas celulares
fisiológicas y complejos inducidos por un compuesto, o efectos no
macroscópicos o efectos que no son fácilmente identificables, el
método preferido es usar células genéticamente modificadas que
contienen un gen indicador en un punto seleccionado de las rutas
metabólicas que pueden estar influidas por el compuesto, o un gen
que expresa una proteína fácilmente observable, normalmente
fluorescente, tal como la proteína fluorescente verde (GFP), en
lugar de (o junto con, por ejemplo en caso de una proteína de
fusión) el producto génico normal pero no observable fácilmente.
Esta es una técnica actualmente frecuente y utilizada expertos en
el campo técnico de la microbiología. De nuevo en este caso, los
detectores pueden ser integrados o externos, pero obviamente deben
ser sólo de tipo óptico.
La posibilidad de analizar las respuestas
fisiológicas, complejos o de otro modo, se facilita por el hecho de
que puede mantenerse una temperatura seleccionada constante en el
interior del dispositivo, y de forma similar por la libertad de
utilizar diferentes tampones que además de tener las características
dielectroforéticas correctas también incluirán las sustancias que
pueden metabolizarse o de otro modo por las células y que permiten
así a las células sobrevivir en condiciones fisiológicas en el
interior del dispositivo durante el tiempo que sea necesario para
obtener una respuesta.
- La aplicación principal de este método es obviamente la de la investigación básica, en la que la posibilidad de comprobar interacciones relativas a una célula individual abre campos de experimentación completamente nuevos, en particular si el liposoma lleva un ligando específico de receptor sobre su superficie. Otra ventaja en cuanto a la investigación básica es que pueden observarse las interacciones liposoma-liposoma: si un liposoma lleva un ligando sobre su superficie, llevando el otro liposoma el receptor y otras proteínas que se sabe que median la respuesta de la señal, se hace posible reconstruir un sistema de señalización celular mínimo.
- El método encuentra aplicación para aventajar en el campo de la química combinatoria en el que los experimentadores deben examinar bibliotecas de compuestos que comprenden miles de sustancias para verificar sus efectos sobre células de diversos tipos, buscando al mismo tiempo limitar tanto el tiempo como las cantidades de sustancias empleadas en la realización de la prueba. En este ejemplo, el liposoma se fusiona con la célula y libera su contenido dentro del citoplasma. También es posible ocasionar la fusión de dos liposomas que contienen reactivos con el fin de obtener un compuesto dado. Finalmente, puede usarse la interacción entre liposomas y microperlas porosas para transportar una variedad de liposomas dentro de los poros de las microperlas.
Entre las aplicaciones para el método que usa
sustancias que pueden funcionalizar microperlas de diversos tipos,
además de las posibles con liposomas, otras incluyen:
- El método puede usarse para identificar un organismo en una muestra biológica utilizando microperlas funcionalizadas con anticuerpos, por ejemplo anticuerpos monoclonales, para ubicar un antígeno específico del organismo. Las principales ventajas de este método sobre otros métodos inmunológicos son en particular el alto grado de especificidad garantizado por la comprobación de la unión, la facilidad de usar cantidades notablemente pequeñas tanto del anticuerpo como de la muestra que está sometiéndose a prueba y, no menos importante, la elevada velocidad de ejecución que proporcionada mediante el procedimiento gracias a su simplicidad y al nivel de automatización incorporado.
- Una de las posibles aplicaciones para fines de diagnóstico se muestra en la figura 9, que proporciona una ilustración esquemática tanto de la manera de llevar a cabo la prueba de diagnóstico como del procedimiento para efectuar una separación específica de células (descrita en su momento), dado que las etapas iniciales son las mismas en cada caso. El procedimiento puede caracterizarse ampliamente tal como sigue: la muestra biológica que contiene el tipo o tipos de células de interés está mezclado con un, o (si el número de tipos de células que van a identificarse/recuperarse es más de uno), posiblemente más tipos de microperlas funcionalizadas con anticuerpos específicos frente al tipo o tipos de células de interés. Los diferentes tipos de microperlas deben ser fácilmente identificables basándose en sus características físicas. En este punto se introduce la mezcla dentro de una de las cámaras del dispositivo.
- Alternativamente, pueden introducirse las microperlas dentro del dispositivo separadas de la muestra, procediendo secuencialmente si no puede diferenciarse entre los diferentes tipos de microperlas en el interior del dispositivo.
- Las células y microperlas que pueden no haber entrado en contacto cuando se mezclan se ponen juntas mediante una etapa de manipulación dielectroforética inicial (figuras 9a y 9b). Ahora se intenta separar las células de las microperlas (figura 9c). Cuando no pueden separarse los complejos, se supone que los anticuerpos fijados en las microperlas se han unido a los antígenos sobre las células, y estos se identifican en consecuencia. Después se emparejan las células separadas con microperlas de un tipo diferente a aquél con el que estuvieron en contacto anteriormente (figuras 9d y 9e). Se repite la operación hasta que todas las células de interés se hayan identificado y si es posible, enumerado.
- Una aplicación para el método en el campo del diagnóstico molecular implica el uso de microperlas, que pueden reconocerse o bien por conocerse antes de su introducción en el dispositivo o bien simplemente porque pueden identificarse en el interior del dispositivo basándose en sus características físicas, que están recubiertas adecuadamente con ADN (o ARN) sonda y que se hacen interaccionar por medio de manipulación dielectroforética con otras que tienen un recubrimiento de ADN (o ARN) diana. Este método puede usarse para realizar una prueba de hibridación para identificar el ADN (o ARN) diana, y sin utilizar material radioactivo o fluorescente en la sonda, tal como se requiere, al contrario, en los métodos convencionales. Además, la rigurosidad de las condiciones experimentales se controla fácilmente, y se hace variar si es necesario, por medios electrónicos (es decir, buscando separar las microperlas) y a tiempo real, en otras palabras, sin tener que repetir en procedimiento completo. Esto es particularmente ventajoso por ejemplo en la localización de polimorfismos de un único nucleótido (SNP) típicos de ciertas enfermedades graves.
- Una de las aplicaciones de mayor interés de la presente invención es la de clasificación de células, y más exactamente, el uso de microperlas funcionalizadas con anticuerpos para permitir la selección de una subpoblación homogénea de células a partir de una masa heterogénea.
- En efecto, las características del método son tales como para garantizar una elevada especificidad de reconocimiento, permitiendo distinguir células que difieren incluso mínimamente, y por encima de todo, permitiendo su separación y recuperación de otras de manera sencilla y con un riesgo despreciable de contaminación con la parte no deseada de la población de células. Esta aplicación es de particular interés en el campo médico de la oncología.
- El procedimiento puede caracterizarse ampliamente tal como sigue: la muestra biológica que contiene el tipo o tipos de células de interés se mezcla con un, o (si el número de tipos de células que van a recuperarse es más de uno), posiblemente más tipos de microperlas funcionalizadas con anticuerpos específicos frente al tipo o tipos de células de interés. Los diferentes tipos de microperlas deben ser fácilmente identificables basándose en sus características físicas. En este punto, se introduce la mezcla dentro de una de las cámaras del dispositivo.
- Alternativamente, pueden introducirse las microperlas dentro del dispositivo separadas de la muestra, procediendo secuencialmente si no puede diferenciarse entre los diferentes tipos de microperlas en el interior del dispositivo. Las células y microperlas que pueden no haber entrado en contacto cuando se mezclan se ponen juntas mediante una etapa de manipulación dielectroforética inicial (figuras 9a y 9b). Ahora se intenta separar las células de las microperlas (figura 9c). Cuando no pueden separarse los complejos, se supone que los anticuerpos fijados a las microperlas se han unido a los antígenos de las células, y éstas se identifican en consecuencia. Después las células separadas se emparejas con microperlas de un tipo diferente a aquél con el que estuvieron en contacto anteriormente (figuras 9d y 9e). Se repite la operación hasta que todas las células de interés se hayan identificado. Las células que aún están unidas a las microperlas se mueven secuencialmente a la segunda cámara del dispositivo en grupos homogéneos y se recuperan lavando con solución tampón (figuras 9f y 9g). Alternativamente, se mueven los complejos estables del mismo tipo a la segunda cámara del dispositivo, con lo que se aplica una fuerza de separación haciendo variar la intensidad y/o frecuencia del campo eléctrico entre los electrodos seleccionados, suficiente para separar las microperlas de las células de forma que puedan reutilizarse en la primera cámara. Se recuperan las células del dispositivo lavando con solución tampón.
- Usando microperlas, puede usarse el método para estudiar la respuesta celular activada por la unión de un ligando a su receptor específico. En efecto, las microperlas también pueden funcionalizarse con sustancias distintas a anticuerpos, que a la vez que pueden unirse de forma similar a un receptor (transitoriamente en mayor o menor grado) también desencadenan respuestas fisiológicas en la célula. De hecho muchas respuestas celulares están mediadas por interacciones de este tipo en las que una sustancia que funciona como mensajero, pero que no puede entrar en la célula, encuentra un receptor específico que transmite la señal a través de los límites celulares, sin llevar necesariamente la sustancia a través de ellos. Generalmente los mensajeros activan una cascada de información que producirán en último lugar uno de los cuatro efectos descritos previamente: citostáticos, citotóxicos, mitóticos y complejos.
- Dada la facilidad de funcionalización de microperlas con los tipos de sustancias descritas, el intervalo de fenómenos que pueden estudiarse con el método descrito, puede ampliarse para considerar todas esas sustancias, en efecto la mayoría de aquellas de interés, que o bien no pueden o bien no deben pasar a través de los límites celulares y que sin embargo aún pueden afectar significativamente a la fisiología de la célula.
Por último, las microperlas funcionalizadas
pueden utilizarse en investigación básica, por ejemplo para hacer
que interaccionen con liposomas: si una microperla lleva un ligando
sobre su superficie, y un liposoma el receptor y las otras
proteínas mediante las cuales está mediada la respuesta a la señal,
se hace posible reconstruir un sistema de señalización celular
mínimo. También pueden usarse las microperlas como vector para la
introducción de compuestos o unidades compuestas dentro de células
o dentro de un entorno compartimentalizado, por ejemplo aislado
internamente un liposoma; en efecto, una célula puede internalizar
una microperla funcionalizada cuando se ponen en contacto; esto
también es válido en caso de un liposoma.
En caso de que el objetivo sea introducir un
compuesto o una unidad compuesta dentro de una célula (o liposoma)
este mismo compuesto o unidad compuesta puede llevarlo directamente
una microperla o un liposoma, o puede concebirse sobre la
superficie de otra célula, o contenerse en un vector (un virus, por
ejemplo, si el compuesto es un fragmento de ADN/ARN) diseñado para
penetrar en el interior de una célula o liposoma cuando se pone en
contacto físico con ésta, y el propio vector también pueden llevarlo
células y/o microperlas y/o liposomas.
Claims (43)
1. Método de realización de pruebas y ensayos de
alto rendimiento y elevado valor biológico en una muestra que
contiene material químico/biológico que consiste en entidades
desconocidas caracterizado porque comprende las etapas
de:
- (a)-
- introducir la muestra que incluye dichas entidades desconocidas dentro de una primera cámara de un dispositivo de pruebas que comprende al menos una serie de primeros electrodos excitables y direccionables de forma selectiva y al menos un segundo electrodo colocado enfrente de y orientado hacia los primeros electrodos,
- (b)-
- introducir material químico/biológico dentro de una primera cámara de dicho dispositivo de pruebas, que consiste en entidades conocidas identificables en el interior de dicho dispositivo de pruebas y que tienen una supuesta afinidad por las entidades desconocidas;
- (c)-
- crear de forma selectiva primer y segundo compartimentos de potencial dielectroforético móviles cerrados en el interior de dicha primera cámara generados mediante dichos primeros electrodos y segundo electrodo y atrapar al menos una parte de dichas entidades desconocidas en el interior de los primeros compartimentos móviles y al menos una parte de dichas entidades conocidas en el interior de los segundos compartimentos móviles;
- (d)-
- mover al menos uno dichos segundos compartimentos móviles que contienen las entidades conocidas hacia dichos primeros compartimentos móviles que contienen dichas entidades desconocidas y hacer que al menos una entidad desconocida interaccione con al menos una entidad conocida de al menos un primer tipo ocasionando la fusión de al menos un primer compartimento móvil y un segundo compartimento móvil que contienen las entidades relativas;
- (e)-
- verificar la creación o de otra manera un enlace estable entre dicha al menos una entidad desconocida y dicha al menos una entidad conocida del primer tipo para determinar si existe afinidad entre las dos e identificar en consecuencia dicha al menos una entidad desconocida.
2. Método según la reivindicación 1, en el que
las entidades introducidas dentro de la primera cámara del
dispositivo de pruebas son entidades conocidas de una pluralidad de
tipos diferentes, identificables en el interior del dispositivo, y
se repiten las etapas (d) y (e) de movimiento y verificación para
cada una de dichas entidades desconocidas no unidas de forma
estable a una entidad conocida del primer tipo, haciendo
selectivamente que una entidad conocida de un tipo diferente al
primer tipo interaccione con cada entidad desconocida hasta que se
hayan eliminado todos los tipos de entidades conocidas
introducidas.
3. Método según la reivindicación 1 o 2 que
comprende la etapa adicional, realizada antes de la etapa (d) de
movimiento, de identificar los compartimentos móviles que contienen
dichas entidades desconocidas.
4. Método según la reivindicación 3 en el que la
etapa de identificación se realiza con la ayuda de detectores
localizados en el interior o el exterior de dicho dispositivo de
pruebas o se realiza directamente sobre dichas entidades
desconocidas antes de su introducción en dicho dispositivo de
pruebas.
5. Método según las reivindicaciones anteriores
en el que dichas entidades conocidas son unidades compuestas que
consisten en microperlas o liposomas que llevan un compuesto
seleccionado de un grupo que incluye al menos un anticuerpo para un
antígeno específico y al menos un ligando para un receptor
específico y al menos una sonda de ADN o ARN y combinaciones de los
mismos.
6. Método según las reivindicaciones anteriores
en el que dichas entidades conocidas se introducen dentro de la
primera cámara del dispositivo de pruebas junto con dichas entidades
desconocidas.
7. Método según la reivindicación 6, que
comprende las etapas de crear una mezcla de dichas entidades
conocidas y dichas entidades desconocidas en el exterior de dicha
primera cámara y después introducir dicha mezcla dentro de la
primera cámara.
8. Método según las reivindicaciones 1 a 5 en el
que dichas entidades conocidas y dichas entidades desconocidas se
introducen dentro de la primera cámara separada y sucesivamente.
9. Método según la reivindicación 8, en el que
dichas entidades conocidas se identifican en el interior de la
prueba moviendo los compartimentos móviles en los que están
atrapadas en posiciones predeterminadas que corresponden a dichos
primeros electrodos predeterminados de la serie y memorizando las
mismas posiciones.
10. Método según las reivindicaciones 5 a 8 en
el que dichas entidades conocidas se identifican en el interior del
dispositivo de pruebas basándose en al menos una característica
física detectable por medio de un detector colocado en el interior
o el exterior de dicho dispositivo.
11. Método según la reivindicación 10, en el que
dicha al menos una característica física se selecciona de un grupo
que incluye color, fluorescencia, constante dieléctrica y
combinaciones de las mismas.
12. Método según las reivindicaciones anteriores
que comprende la etapa adicional de contar el número entidades
desconocidas identificadas basándose en su unión estable a las
entidades conocidas.
13. Método según las reivindicaciones anteriores
que comprende las etapas adicionales de
- -
- mover los compartimentos móviles de tal forma que se transfieran solo las entidades desconocidas unidas de forma estable a entidades conocidas de un único tipo homogéneo, y por tanto identificable de ser de un único tipo homogéneo, dentro de una segunda cámara del dispositivo que está en comunicación con la primera cámara por medio de un paso estrecho;
- -
- purgar las entidades que ocupan dicha segunda cámara del dispositivo;
- -
- repetir las etapas de movimiento y purga para todos los otros tipos homogéneos de entidades desconocidas identificadas, secuencialmente.
14. Método según la reivindicación 13 que
comprende las etapas adicionales, realizadas en el interior de
dicha segunda cámara y antes a la etapa de purga, de separar las
entidades desconocidas identificadas de dichas entidades conocidas
de un único tipo homogéneo unidas a ellas de forma estable y
devolver las entidades conocidas separadas a la primera cámara por
medio de dichos compartimentos móviles.
15. Método según la reivindicación 14 en el que
dicha etapa de separación se logra por medio de fuerza
dielectroforética, haciendo variar uno de los parámetros de
funcionamiento del dispositivo de pruebas, concretamente la
intensidad del campo eléctrico entre los electrodos seleccionados,
la frecuencia del campo eléctrico entre los electrodos
seleccionados, y combinaciones de las mismas.
16. Método según las reivindicaciones
anteriores, en el que dicha etapa (e) de verificación se realiza
restableciendo un par de compartimentos móviles fusionados
previamente y establecer por medio de detectores ubicados en el
interior o el exterior del dispositivo de pruebas si dichas
entidades están presentes en ambos compartimentos móviles del par o
en uno sólo.
17. Método según la reivindicación 16 en el que
los detectores empleados son ópticos o capacitivos.
18. Método según las reivindicaciones 16 o 17
que comprenden la etapa adicional de comprobar la fuerza de la
unión estable entre dicha al menos una entidad desconocida y dicha
al menos una entidad conocida que se logra haciendo variar uno de
los parámetros de funcionamiento del dispositivo de pruebas
concretamente la amplitud del voltaje entre los electrodos
seleccionados, la frecuencia del voltaje entre los electrodos
seleccionados, y combinaciones de las mismas.
19. Método según las reivindicaciones
anteriores, en el que dichas entidades desconocidas se seleccionan
de un grupo que incluye células, virus, microorganismos y unidades
compuestas por células y/o microperlas y/o liposomas que llevan ADN
y/o ARN diana, usados en la realización de pruebas de
hibridación.
20. Método de realización de pruebas y ensayos
de alto rendimiento y elevado valor biológico entre una pluralidad
de primeras entidades seleccionadas de un grupo que consiste en
células y microorganismos, y una pluralidad de segundas entidades
que consisten en compuestos o unidades compuestas que van a
someterse a prueba para determinar su actividad biológica con
respecto a dichas primeras entidades; caracterizado porque
comprende las etapas de:
- (a)-
- introducir dichas primeras y dichas segundas entidades dentro de una primera cámara de un dispositivo de pruebas que comprende al menos una serie de primeros electrodos excitables y direccionables de forma selectiva y al menos un segundo electrodo colocado enfrente de y orientado hacia los primeros electrodos;
- (b)-
- crear de forma selectiva compartimentos de potencial móviles cerrados en el interior de la primera cámara por medio de fuerza dielectroforética generada por dichos primeros electrodos y segundo electrodo y atrapar al menos una parte de las entidades en el interior de los compartimentos móviles;
- (c)-
- mover al menos uno de compartimentos móviles que contienen dichas primeras entidades hacia compartimentos móviles que contienen dichas segundas entidades y hacer que al menos una primera entidad interaccione con al menos una segunda entidad de al menos un primer tipo ocasionando la fusión de al menos un par de compartimentos móviles que contienen las entidades relativas;
- (d)-
- verificar la actividad biológica de la segunda entidad sobre la primera entidad analizando la interacción resultante utilizando detectores que pueden detectar cualquier prueba en la primera entidad de al menos uno de un grupo seleccionado de efectos, concretamente citostáticos, citotóxicos, mitóticos y expresión de un marcador.
21. Método según la reivindicación 20 en el que
se detectan dichos efectos citostáticos, citotóxicos y mitóticos
verificando la presencia y/o presencia cambiada de dichas primeras
entidades en los compartimentos móviles creados a su alrededor y/o
cerca de una pluralidad de primeros electrodos colocados
inmediatamente adyacentes a dichos compartimentos móviles que
contienen las primeras entidades y, antes de la ejecución de la
etapa (c) de movimiento, se dejan vacíos u ocupados por
compartimentos móviles vacíos.
22. Método según la reivindicación 20 o 21 en el
que dichos detectores se seleccionan de un grupo que incluye
detectores ópticos ubicados en el interior o el exterior del
dispositivo de pruebas, detectores capacitivos, y combinaciones de
los mismos.
23. Método según las reivindicaciones 20 a 22,
que comprende la etapa adicional de reconocer al menos una
pluralidad de entidades seleccionadas de un grupo que consiste
dichas primeras entidades y dichas segundas entidades.
24. Método según la reivindicación 23 en el que
etapa de reconocimiento se realiza antes o después de dicha etapa
de introducir las entidades dentro del dispositivo de pruebas.
25. Método según la reivindicación 24 en el que
dicha etapa de reconocimiento se realiza por medio de detectores
seleccionados de un grupo que incluye detectores de tipo óptico
ubicados en el interior o el exterior del dispositivo y detectores
de tipo capacitivo.
26. Método según la reivindicación 25 en el que
dicha etapa de reconocimiento se realiza dentro de dicho dispositivo
basándose en la respuesta de las entidades de al menos una de dicha
pluralidad de entidades a la fuerza dielectroforética generada en
el interior del dispositivo.
27. Método según las reivindicaciones 23 a 26
que comprende la etapa, realizada antes de las etapas (c) y (d) de
movimiento y verificación, de utilizar dichos compartimentos móviles
para establecer una distribución espacial predeterminada en el
interior del dispositivo de dicha al menos una pluralidad de
entidades de al menos un tipo identificado.
28. Método según las reivindicaciones 20 a 27,
en el que cada uno de los compartimentos móviles que atrapa dicha
pluralidad de primeras entidades contiene al menos una única de
dichas primera entidades.
29. Método según la reivindicación 28, en el que
se atrapa al menos una parte de las primeras entidades en un
compartimento de potencial dielectroforético móvil que tiene
asociado a él un detector que puede de generar una señal
proporcional al número de primeras entidades presentes en el
compartimento.
30. Método según las reivindicaciones 20 a 29,
en el que dicho marcador es una molécula indicadora que se expresa
en el interior de la primera entidad.
31. Método según la reivindicación 30 en el que
dichas unidades compuestas se seleccionan de un grupo que incluye
microperlas, liposomas, y células que llevan un compuesto diseñado
para activar la expresión de dicha molécula indicadora.
32. Método según la reivindicación 31 en el que
se introduce dicho compuesto dentro de dicha primera entidad
durante la etapa de interacción.
33. Método según la reivindicación 31 en el que
dicho compuesto activa la expresión de dicha molécula indicadora
mediante un mecanismo de interacción de tipo
ligando-receptor.
34. Dispositivo de pruebas multifuncional (a
partir de aquí con referencia a las figuras (DE) compuesto por un
primer módulo (C) que comprende una serie (M1) de primeros
electrodos (LIJ) excitables y direccionables de forma selectiva e
individual al menos en parte, dispuestos sobre un soporte (A1)
aislante; un segundo módulo que comprende al menos un segundo
electrodo (M2) colocado enfrente de y orientado hacia los primeros
electrodos (LIJ) y una estructura (A2) de soporte superior; también
un elemento (A3) espaciador dispuesto entre el primer y segundo
módulo y que delimita un entorno (L) líquido o semilíquido durante
el funcionamiento, caracterizado porque el elemento (A3)
espaciador se realiza de tal manera que establezca al menos una
primera cámara (F) y al menos una segunda cámara (FL) en el
interior del dispositivo interconectadas de forma hidráulica por al
menos un paso (D) estrecho y que delimita el entorno (L) líquido o
semilíquido, que está por tanto dividido por al menos un paso (D)
estrecho en al menos dos
entornos parciales que no tienen influencia hidráulica entre sí y que coinciden con las al menos dos cámaras (F y FL).
entornos parciales que no tienen influencia hidráulica entre sí y que coinciden con las al menos dos cámaras (F y FL).
35. Dispositivo según la reivindicación 34 en el
que las primeras y segundas cámaras (F y FL) están equipadas con
orificios que pueden abrirse de forma controlada y selectiva que
funcionan como entradas (I1, I2) y salidas (O1, O2) respectivas, y
dicha serie (M1) de primeros electrodos (LIJ) funciona como el fondo
de dichas cámaras (F y FL) y del al menos un dicho paso (D)
estrecho que permite la comunicación entre las cámaras.
36. Dispositivo según la reivindicación 34 o 35,
en el que dicha serie (M1) de primeros electrodos (LIJ) está
diseñada para funcionar junto con dicho segundo electrodo en la
generación de una pluralidad de compartimentos (S1)
dielectroforéticos por medio de los cuales se manipula una muestra
(BIO) biológica.
37. Dispositivo según las reivindicaciones 34 a
36, en el que dicho primer módulo (C) está equipado con al menos un
detector integrado colocado junto o en estrecha cercanía a al menos
uno de los primeros electrodos.
38. Dispositivo según la reivindicación 37 en el
que dicho al menos un detector se coloca para coincidir con dicho
al menos un paso (D) estrecho.
39. Dispositivo según la reivindicación 37 o 38
en el que dicho al menos un detector es de tipo óptico o
capacitivo.
40. Método de transporte de las primeras
entidades que consiste en compuestos o unidades compuestas dentro
de las segundas entidades, que comprende las etapas de:
- (a)-
- introducir la primera y segunda entidades dentro de una cámara de un dispositivo de pruebas que comprende al menos una serie de primeros electrodos excitables y direccionables de forma selectiva y al menos un segundo electrodo colocado enfrente de y orientado hacia los primeros electrodos;
- (b)-
- crear de forma selectiva compartimentos de potencial móviles cerrados en el interior de dicha cámara por medio de fuerza dielectroforética generada mediante dichos electrodos y atrapar al menos una parte de dichas primeras entidades dentro de los primeros compartimentos móviles y de dichas segundas entidades en el interior de los segundos compartimentos móviles;
- (c)-
- identificar y seleccionar los compartimentos que contienen las primeras entidades;
- (d)-
- mover al menos uno de dichos compartimentos móviles que contienen las primeras entidades hacia dichos compartimentos móviles que contienen las segundas entidades;
- (e)-
- hacer que al menos un compartimento móvil que contiene una primera entidad se fusione con un compartimento móvil que contiene una segunda entidad; caracterizado porque en dichas primera y segunda entidades y dicha etapa de fusión de al menos un compartimento móvil que contiene una primera entidad con un compartimento móvil que contiene una segunda entidad son de tal forma que se provoca que las primeras entidades penetren dentro de las segundas entidades cuando ponen contacto físico con éstas últimas.
41. Método según la reivindicación 40, en el que
dichas segundas entidades se seleccionan de un grupo que incluye
células, microorganismos, liposomas, microperlas y similares, y se
atrapan en compartimentos móviles.
42. Método según la reivindicación 41, en el que
dichas segundas entidades que consisten en células o microorganismos
se fijan a microperlas y/o se llevan en la superficie o en el
interior de liposomas.
43. Método según las reivindicaciones 40 a 42,
en el que dichas primeras entidades que consisten en dichos
compuestos o dichas unidades compuestas se llevan directamente por
células y/o microperlas y/o liposomas, o mediante vectores
diseñados para penetrar en el interior de dichas segundas entidades
una vez que se han puesto en contacto físico con las mismas
segundas entidades, pudiendo transportarse a s vez el vector vez
por células y/o microperlas y/o liposomas.
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| ITTO01A0411 | 2001-05-02 | ||
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