ES2301262B1 - Generacion de adhesion especifica en bacterias gram negativas mediante el anclaje de monodominos de inmunoglobulinas en su superficie con autotransportadores. - Google Patents

Generacion de adhesion especifica en bacterias gram negativas mediante el anclaje de monodominos de inmunoglobulinas en su superficie con autotransportadores. Download PDF

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Abstract

Generación de adhesión específica en bacterias Gram negativas mediante el anclaje de monodominios de inmunoglobulinas en su superficie con autotransportadores.
La presente invención se refiere a un vector de expresión para bacterias Gram negativas que permite la producción de proteínas híbridas entre anticuerpos recombinantes monodominio y un dominio transportador de la familia de los autotransportadores, caracterizado porque comprende un promotor de transcripción bacteriana (P), un péptido señal (sp), la secuencia que codifica para uno o varios anticuerpos recombinantes monodominio (V) y el dominio C-terminal de un sistema transportador de la familia de los autotransportadores (AT). Esta invención se refiere también a un procedimiento para la expresión de dichas proteínas híbridas en bacterias permitiendo el anclaje de anticuerpos monodominio en la superficie de la membrana externa bacteriana y a un método de adhesión bacteriana específica a una superficie que contenga un antígeno concreto.

Description

Generación de adhesión específica en bacterias Gram negativas mediante el anclaje de monodominios de inmunoglobulinas en su superficie con autotransportadores.
Campo de la técnica
La presente invención se refiere al empleo de herramientas genéticas que permitan expresar distintas proteínas sobre la superficie de bacterias Gram-negativas. En particular la presente invención se refiere al empleo de autotransportadores (AT) como vehículos para la presentación de anticuerpos recombinantes con unión especifica hacía antígenos conocidos y así redirigir la adhesión bacteriana.
Estado de la técnica anterior
Las proteínas localizadas sobre la superficie de las bacterias, o secretadas al medio extracelular, son necesarias para numerosos fenómenos biológicos, como el reconocimiento celular, la adherencia e invasión de células hospedadoras, la conjugación, el ensamblaje de bacteriófagos y la movilidad celular, entre otros (Buttner y Bonas, Trends Microbiol 2002, 10, 186-192; Cabanes y col., Trends Microbiol 2002, 10, 238-245; Cao y Saier, Microbiology 2001, 147, 3201-3214; Christie, Mol Microbiol 2001, 40, 294-305; Fernández y Berenguer, FEMS Microbiol Rev 2000, 24, 21-44; Finlay y Falkow, Microbiology and Molecular Biology Reviews 1997, 61, 136-169; Giron y col., Mol Microbiol 2002, 44, 361-379; Hueck, Microbiol Mol Biol Rev 1998, 62, 379-433; Lee y Schneewind, Genes Dev 2001, 15, 1725-1752; Soto y Hultgren, J Bacteriol 1999, 181, 1059-1071).
La secreción de proteínas es especialmente compleja en las bacterias Gram-negativas, pues han de atravesar dos membranas lipídicas. Para llevar a cabo esta empresa las bacterias Gram-negativas han desarrollado una batería de sistemas de secreción clasificados en cinco grandes grupos dependiendo de la naturaleza molecular de la maquinaria de transporte.
Además cabe destacar la existencia de sistemas especializados en la secreción de fimbrias (chaperona/usher). Mecanísticamente estos sistemas se dividen en dos grandes grupos: aquellos en los que no existe un intermediario periplásmico (sec-independientes), aquellos con secreción con una etapa en el periplasma (sec-dependientes).
Los autotransportadores (AT) se describieron inicialmente como una familia de proteínas secretoras, toda la información necesaria para su traslocación a través de la membrana externa (ME) reside en el polipéptido que es exportado. La región C-terminal de los AT actúa como maquinaria de secreción traslocando el dominio N-terminal a través de la ME sin la ayuda de ninguna otra proteína conocida (Henderson, y col., Trends Microbiol 2000, 8 (12): 529-532.; Henderson, y col., Trends Microbiol 1998, 6 (9): 370-8; Holland, Trends Microbiol 1998, 6 (10): 388-9; Pohlner, y col., Nature 1987, 325 458-462). Los AT son una familia ampliamente distribuida entre las bacterias Gram-negativas. Se han identificado hasta la fecha unos 120 miembros pertenecientes a 20 géneros distintos de \alpha-, \beta-, \gamma-, y \varepsilon-proteobacterias y clamidias (Yen, y col., Biochim Biophys Acta 2002, 1562 (1-2): 6-31.).
Algunos ejemplos de AT como factores de virulencia presentes en patógenos de humanos son las IgA proteasas de N. gonorrhoeae, N. meningitidis y Haemophilus influenzae (Pohlner, y col., Nature 1987, 325 458-462; Lomholt, y col., Mol. Microbiol. 1995, 15 495-506), el factor de polimerización de actina IcsA de S. flexnerii (Suzuki, y col., J. Biol. Chem. 1995, 270 30874-30880), la adhesina AIDA-I de cepas patógenas de E. coli (Benz y Schmidt, Mol Micriobiol 1992, 6, 1539-1546; Suhr y col., Mol Microbiol 1996, 22, 31-42), el factor de resistencia al complemento BrkA de B. pertussis (Fernández y Weiss, Infect. Immun. 1994, 62 4727-4738), y la citotoxina VacA de H. pylori (Schmitt y Haas, Mol. Microbiol. 1994, 12 307-319).
Todos los AT presentan la misma estructura modular (ver Figura 1). Desde el N-terminal: I, un péptido señal que dirige la translocación de la pre-proteína hacia el periplásma a través de la membrana interna (MI) (Henderson y col., Trends Microbiol 1998, 6, 370-378; Pohlner y col., Nature 1987, 325, 458-462; Sijbrandi y col., J Biol Chem 2002, 3, 3); II, un dominio pasajero de tamaño variable (0->250 kDa), que es translocado a través de la ME y es el responsable del papel biológico extracelular; III, un dominio transportador (\beta) situado en el C-terminal, conservado entre los miembros de la familia, y que dirige la secreción a través de la membrana externa (ME) del dominio pasajero (Pohlner, y col., Nature 1987, 325 458-462; Klauser, y col., J. Mol. Biol. 1993, 234 579-593; Maurer, y col., J Bacteriol 1999, 181 (22): 7014-20.).
El dominio pasajero puede ser procesado y liberado al medio (IgA proteasa de N. gonorrhoeae), puede procesarse y permanecer asociado a la ME (adhesina Ag43 de E. coli) o puede no procesarse y permanecer expuesto hacia el exterior (adhesina Hia de H. Influenzae).
Diferentes miembros de la familia de los autotransportadores, han sido empleados para la exposición de diversos polipéptidos fusionados al dominio \beta de estos, como por ejemplo la metalotioneína de rata (Valls y col., Nat. Biotechnol. 2000, 18: 661-5), la subunidad B de la toxina del cólera (Maurer y col., J. Bacteriol. 1997, 794-804), \beta-lactamasa (Lattemann y col., J. Bacteriol. 2000, 182: 3726-33), la adrenotoxina bovina (Jose y col., J. Biotechnol. 2002, 95: 257-68), la carboxilesterasa EstA de Burkholderia gladioli (J. Mol. Catal. B: Enzymatic 2002, 18: 89-97), la proteína fimbrial FimH (Kjaergaard, y col., J. Bacteriol. 2002, 184: 4197-204), entre otros.
Los trabajos dirigidos hacia la exposición en la superficie bacteriana de polipéptidos mediante el empleo de diferentes miembros de la familia de los autotransportadores indican la necesidad de evitar sistemas con puentes disulfuro (Jose, J. y col., 1996, 178 (107-110); (Klauser, T. y col., 1992, 11 (2327-2335)). Este hecho quedó también claramente constatado en el trabajo de Veiga y col. (Mol. Microbiol. 1999, 33(6): 1232-1243) donde se describe la secreción y traslocación como dominio pasajero de un scFV (el cual presenta dos puentes disulfuro intramoleculares que estabilizan su estructura terciaria y son requeridos para que los scFV sean funcionales), esta traslocación se consigue con una baja tasa de eficiencia, presentando problemas de proteolisis de
\hbox{la fusión además de problemas de toxicidad para la 
bacteria.}
Los minianticuerpos o anticuerpos recombinantes, son fragmentos derivados de los anticuerpos construidos por tecnología del ADN recombinante, y pese a su menor tamaño conservan la capacidad de unión al antígeno ya que mantienen los dominios variables (V) de inmunoglobulina (Ig), donde residen las zonas de unión a los antígenos.
Un tipo de minianticuerpos son los llamados scFv (Plückthun, y col., Antibody Engineering: A Practical Approach 1996, 203-252). Estos scFv son proteínas quiméricas de \sim30 kDa resultado de la fusión en la misma cadena polipeptídica de los dominios variables (V_{H} y V_{L}) de las cadenas pesada (H) y ligera (L) de un anticuerpo a través de un péptido flexible (usualmente repeticiones de glicinas y serinas de 20 aa) que permite que se conserven las interacciones cuaternarias entre ambos dominios Ig. La capacidad de unión de estos scFV reside en la superficie generada por la interacción de los dos dominios variables. Estos scFV presentan dos puentes disulfuro intramoleculares que estabilizan su estructura terciaria y son requeridos para que los scFV sean funcionales.
Otros minianticuerpos expresados con éxito en E. coli son los llamados V_{HH} (Nguyen, y col., Adv Immunol 2001, 79 261-96.; Nguyen, y col., Embo J 2000, 19 (5): 921-30.; Sheriff y Constantine, Nat Struct Biol 1996, 3 (9): 733-6.). En especies de camélidos (camellos, dromedarios, llamas etc) una parte de sus anticuerpos carece de cadena ligera (Hamers-Casterman, y col., Nature 1993, 363 (6428): 446-8.; Muyldermans, y col., Protein Eng 1994, 7 (9): 1129-35.), estando la zona de reconocimiento de los antígenos constituida únicamente por el dominio V_{H} (Desmyter, y col., J Biol Chem 2001, 276 (28): 26285-90.; Desmyter, y col., J Biol Chem 2002, 277 (26): 23645-50; Desmyter, y col., Nat Struct Biol 1996, 3 (9): 803-11.). Este dominio V_{H} se diferencia de los dominios V_{H} de otros anticuerpos en el sentido que sus zonas de reconociendo del antígeno está formada por bucles de mayor tamaño. Así, a los dominios V_{H} de anticuerpos de camélidos se les denomina V_{HH}. Este dominio (V_{HH}) de \sim15 kDa puede expresarse en el periplasma de E. coli manteniendo la capacidad de unión a su antígeno. Los V_{HH} son moléculas más estables que los scFv, y al contrario que estos raramente agregan (J Immunol. Methods 1999, 231: 25-38).
Al igual que los dominios V_{L} y V_{H} de ratón, los dominios V_{HH} poseen un S-S intramolecular que estabiliza su estructura terciaria y es necesario para su correcto plegamiento (Desmyter, y col., J Biol Chem 2002, 277 (26): 23645-50; Desmyter, y col., Nat Struct Biol 1996, 3 (9): 803-11.).
En Veiga y col. (Mol Microbiol 1999, 33: 1232-1243), se describe la secreción de un minianticuerpo scFv (el cual presenta dos puentes disulfuro intramoleculares que estabilizan su estructura terciaria) como pasajero fusionado al dominio C-terminal de la IgA proteasa de N. gonorroheae (C-IgAP) con una eficiencia de aproximadamente 20%, presentando además problemas de proteolisis de la fusión y de toxicidad para la bacteria.
Explicación de la invención
De modo inesperado, de acuerdo con la presente invención, se ha conseguido el anclaje y expresión de anticuerpos recombinantes con un dominio único (monodominio) de inmunoglobulina en la superficie bacteriana empleando un dominio transportador de la familia de los autotransportadores, con una eficiencia notablemente superior a lo esperado y disminuyendo los problemas tanto de proteolisis de la fusión como de toxicidad para la bacteria, a pesar de que dichos anticuerpos presenten en su estructura terciaria puentes disulfuro.
Por lo tanto, de acuerdo con un primer aspecto de la presente invención, se describe el anclaje y expresión de anticuerpos recombinantes monodominio en la superficie bacteriana, secretados por un dominio transportador de la familia de los autotransportadores.
De acuerdo con un modo de realización particular de la presente invención, se proporciona un vector de expresión para bacterias Gram negativas que permite la producción de proteínas híbridas entre anticuerpos recombinantes monodominio y un dominio transportador de la familia de los autotransportadores.
De acuerdo con otra realización preferida de la presente invención, se proporciona un vector de expresión para bacterias Gram negativas que permite la producción de proteínas híbridas entre anticuerpos recombinantes monodominio y el dominio \beta-autotransportador de la proteasa IgA de Neisseria gonorrhoeae.
De acuerdo con otro modo de realización particular de la presente invención, la estructura de los vectores de expresión derivados de la IgA proteasa de N. Gonorrhoeae es la siguiente, empezando desde el N-terminal: un promotor de transcripción bacteriana inducible o constitutivo, un péptido señal (que es el que dirige el paso de las proteínas híbridas hacia el periplasma), el anticuerpo recombinante monodominio y/o dominio tipo inmunoglobulina con capacidad de unión y reconocimiento independiente o mezcla de estos como dominio pasajero y el dominio C-terminal del sistema transportador de la IgA proteasa de N. Gonorrhoeae (que dirige la secreción del dominio pasajero hacia el medio extracelular). En la Figura 2 se representa la estructura de éstos.
De acuerdo con otro modo de realización preferido, los vectores de expresión presentan en su estructura un epítopo que permita su inmunodetección.
De acuerdo con la presente invención, la expresión de los vectores descritos en la membrana externa está controlada por un promotor, que bien puede ser inducible (por ejemplo el promotor tetA que es inducido por anhidrotetraciclina (Skerra A., Gene 1994, 151 131-135); el promotor P_{BAD} que es inducido por arabinosa (Guzman L.M. y col., J Bacteriol 1995, 177(14) 4121-4130); el promotor del operon lac de E. coli Plac, o su derivado Ptac, ambos inducidos por IPTG, lactosa y otros análogos de la lactosa (Miller, The Operon 1978); el promotor Pm que es inducido por 3-metil-benzoato y otros análogos de benzoato (Ramos, J.L. y col., Annu Rev Microbiol 1997, 51 (3) 341-73) o constitutivo (por ejemplo el promotor de \beta-lactamasa de E. coli (Klotsky, R.A. y col., Gene 1987, 55 (1) 141-6).
Según un modo de realización preferido, la expresión de los vectores descritos en la presente invención en la membrana externa está controlada por el promotor del operon lac de E. coli (Plac), por lo que dicha inducción puede conseguirse añadiendo IPTG (isopropil-beta-D-tiogalactopiranosido), lactosa u otro análogo de lactosa al medio de cultivo.
De acuerdo con la presente invención, el péptido señal que dirige el paso del vector hacia el periplasma puede ser el péptido señal de PelB (ss) (Keen, N.T. y col., J Bacteriol 1986, 168 (2) 595-606), de OmpA (Movva, N.R. y col., J Biol Chem 1980, 255 (1) 27-9), de la proteína 3 del bacteriofago M13 (Parmley, S.F. y col., Adv Exp Med Biol 1989, 251 (215-8), de la proteína de unión a maltosa (MBP) (Bedouelle, H. y col., Eur J Biochem 1988, 171 (3) 541-9), o cualquier otro péptido señal de los empleados habitualmente con sistemas autotransportadores.
En el marco de la presente invención, se entiende por anticuerpos recombinantes monodominio y/o dominios tipo inmunoglobulina con capacidad de unión y reconocimiento independiente tanto a los dominios variables de cadena pesada (VH), a los dominios variables de cadena ligera (VL), a los anticuerpos recombinantes de camelidos (V_{HH}), los anticuerpos recombinantes de camelidos humanizados, los anticuerpos recombinantes de otras especies camelizados, los anticuerpos monodominio IgNAR de peces cartilaginosos; es decir, que se incluyen tanto dominios que de forma natural son monodominio (caso de V_{HH} e IgNAR), como anticuerpos que por ingeniería se han alterado para que por sí solos sean capaces de interaccionar con el antígeno (VLMB10) y mejorar sus propiedades d estabilidad y
solubilidad.
De acuerdo con un modo particular de realización de la presente invención, se emplean uno o varios dominios variables sencillos de inmunoglobulina simultaneamente, como dominios pasajeros para ser secretados por el sistema autotransportador de la IgA proteasa de N. Gonorroheae.
Según un modo particular de realización de la presente invención, se emplea un único anticuerpo recombinante monodominio o dominio tipo inmunoglobulina con capacidad de unión y reconocimiento independiente como dominio pasajero del sistema autotransportador.
De acuerdo con otro modo particular de realización de la presente invención, se emplean hasta 3 repeticiones de anticuerpos recombinantes monodominio y/o dominios tipo inmunoglobulina con capacidad de unión y reconocimiento independiente como dominios pasajeros del sistema autotransportador. En tal caso, es posible emplear combinaciones de diferentes tipos de anticuerpos monodominio.
Se empleó un V_{HH} que reconoce \alpha-amilasa (V_{amy}) como representativo de anticuerpo recombinante monodominio natural, mientras que como representativo de anticuerpo recombinante monodominio diseñado por ingeniería para que por sí solo sea capaz de interaccionar con el anticuerpo y mejorar sus propiedades de estabilidad y solubilidad, se empleó un VL de origen humano (clon MB10) frente al marcador de superficie celular B7.1 (van den Beucken y col., J. Mol. Biol. (2001) 310, 591-601).
Se empleó un V_{HH} que reconoce \alpha-amilasa (V_{amy}), el cual al contener un solo dominio Ig su tamaño es la mitad (\sim15 kDa) del correspondiente a los scFvs (\sim30 kDa). Al igual que los dominios V_{L} y V_{H} de ratón, los dominios V_{HH} poseen un S-S intramolecular que estabiliza su estructura terciaria y es necesario para su correcto plegamiento (Desmyter, y col., J Biol Chem 2002, 277 (26): 23645-50; Desmyter, y col., Nat Struct Biol 1996, 3 (9): 803-11.).
A la proteína híbrida formada por el dominio V_{amy} fusionado al dominio C-IgAP se le llamó V_{amy}\beta. En la Figura 3 se muestra la organización modular de V_{amy}\beta. El péptido señal de PelB dirige la secreción de estas proteínas a través de la membrana interna (MI). Los fragmentos de ADN que codifican estas proteínas híbridas, se clonaron en pF11\beta (Cm^{R}) (Veiga, y col., Mol Microbiol 1999, 33 (6): 1232-43), bajo el control del promotor Plac, dando lugar al plásmido pV_{amy}\beta (SEQ ID NO 1), y en el vector pVLT35 (SpR) (20 copias por célula) (de Lorenzo, y col., Gene 1993, 123 (1): 17-24.), bajo el control de Ptac, dando lugar a pVV_{amy}\beta, que se usó en los experimentos que se describen a continuación. En el caso del dominio VLMB10, se construyó el plásmido pVLMB10\beta (SEQ ID NO 2) el cual expresa el híbrido VLMB10\beta bajo el control del promotor Plac.
En Veiga y col. (Mol Microbiol 1999, 33: 1232-1243) se describe la proteína híbrida formada entre el scFv 3D5 que reconoce secuencias de polihistidinas en el C-terminal de proteínas y el dominio C-IgAP se le llamó FvH\beta, la cual contiene el péptido señal de PelB que permite su secreción al periplasma. FvH\beta contiene además dos epítopos para su detección en inmunoensayos: el epítopo FLAG en el extremo N-terminal del dominio V_{L} y el E-Tag en la zona de unión entre el scFv y el C-IgAP. La fusión FvH\beta esta bajo el control de Plac, con lo que su expresión se puede inducir con IPTG.
Como control negativo empleado en algunos experimentos, se empleó una proteína de fusión (HE\beta) la cual consiste en un segmento de poli-His fusionado a un dominio \beta de la proteasa IgA (Veiga, E. y col., 2002, 21 (9) 2122-31).
Breve descripción de los dibujos
Figura 1. Representación de la organización modular de los AT. Se indican los extremos N y C terminales, así como el péptido señal (sp), el dominio pasajero translocado y el dominio \beta.
Figura 2. Representación de la estructura básica de un vector de expresión de fusiones entre dominios V de inmunoglobulinas y dominios de autotransporte. El DNA codificante del dominio V se encuentra entre secuencias codificantes de un péptido señal (PS) y el dominio de autotransporte (AT). Idealmente el dominio V se encuentra flanqueado por dos sitios de restricción únicos (R1, R2) y la fusión V-AT contiene un epítopo (E) para su detección mediante un anticuerpo específico. El vector contiene, además, los siguientes elementos: un origen de replicación (ori), un gen marcador (M) para su selección, y secuencias promotoras (P) para la transcripción de la fusión
V-AT.
Figura 3. A. Representación de la organización modular de V_{amy}\beta, se indican los extremos N y C terminales, así como el péptido señal (sp), el dominio pasajero translocado (V_{amy}\beta) y el dominio C-terminal de la IgA proteasa de N. gonorroheae (C-IgAP). B. Representación de la organización modular de V_{LMB10}\beta, se indican los extremos N y C terminales, así como el péptido señal (sp), el dominio pasajero translocado (V_{LMB10}\beta) y el dominio C-terminal de la IgA proteasa de N. gonorroheae (C-IgAP).
Figura 4. A. Inmunodetección por Western-blot usando el mAb anti-E-Tag de las distintas proteínas híbridas (V_{amy}\beta y FvH\beta) a partir de extractos totales de células de E. coli UT5600. En el caso de V_{amy}\beta se observa una única banda correspondiente a 66 kDa mientras que en el caso de FvH\beta se observan varias bandas correspondientes a la proteolisis de la fusión. B. Exposición sobre la superficie de E. coli UT5600 de los híbridos V_{amy}\beta y FvH\beta. Cuando se indica (+) las células se permeabilizaron con 10 mM EDTA, o se incubaron con tripsina (1 \mug/ml) añadida externamente. La presencia en los extractos crudos de las distintas proteínas híbridas se determinó por Western-blot con el mAb anti-E-Tag. La cantidad de OmpA en los mismos extractos (determinada usando un suero policlonal de conejo anti-OmpA) se muestra como control de carga. Para detectar el fragmento de \sim24 kDa (T-OmpA) correspondiente a la degradación tríptica del dominio periplásmico de OmpA se sobreexpusieron las películas
fotográficas.
Figura 5. Ensayo de funcionalidad/plegamiento de los dominios pasajeros de las distintas construcciones derivadas de C-IgAP expuestos hacia el medio extracelular. Se cubrieron placas de ELISA con \alpha-amilasa (Amy) y con albúmina de suero bovino (BSA) como antígeno control. Las células de E. coli UT5600 que expresaban estas proteínas híbridas se añadieron sobre las placas de ELISA y la unión de los pasajeros expuestos sobre la superficie de estas células se detectó con el mAb anti-E-Tag-POD. Las células de E. coli que expresaban la proteína HE\beta se usaron como control negativo.
Figura 6. Exposición sobre la superficie de E. coli UT5600 del híbrido V_{LMB10}\beta. Cuando se indica (+) las células se permeabilizaron con 10 mM EDTA, o se incubaron con tripsina (1 \mug/ml) añadida externamente. La presencia en los extractos crudos de las distintas proteínas híbridas se determinó por Western-blot con el mAb anti-E-Tag. La cantidad de OmpA en los mismos extractos (determinada usando un suero policlonal de conejo anti-OmpA) se muestra como control de carga. Se observa una exposición de más del 90% de la proteína de fusión (banda de 65 kDa), apareciendo además una única banda de degradación proteolítica de aproximadamente 55 kDa.
Figura 7. A. representa la organización modular de 2V_{amy}\beta Y 3V_{amy}\beta. B. Se representa la exposición sobre la superficie de E. coli UT5600 de los híbridos 2V_{amy}\beta y 3V_{amy}\beta. Cuando se indica (+) las células se incubaron con tripsina (1 \mug/ml) añadida externamente. La presencia en los extractos crudos de las distintas proteínas híbridas se determinó por Western-blot con el mAb anti-E-Tag. La cantidad de OmpA en los mismos extractos (determinada usando un suero policlonal de conejo anti-OmpA) se muestra como control de carga.
Figura 8. Ensayo de accesibilidad del peptidoglicano (PG) donde se incluyó las construcciones control (pAKnot), V_{amy}\beta, 2V_{amy}\beta, 3V_{amy}\beta y V_{LMB10}\beta. En todas ellas, sólo aparece un nivel de accesibilidad del PG en torno a 5% máximo e indentico al observado en la cepa control que no expresa ninguna proteína híbrida.
Figura 9. Adhesión específica de células de E. coli a superficie que contiene un antígeno amilasa (Amy) o antígeno control (BSA). La unión de las células de E. coli a las placas se detectó con un suero policlonal anti-E. coli generado en ratones. Las células de E. coli que expresaban la proteína HE\beta se usaron como control negativo.
La presente invención se ilustra mediante los presentes ejemplos no limitativos.
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Ejemplos
Ejemplo 1
Construcción de las proteínas híbridas compuestas por el dominio V_{HH} o VL fusionado a C-IgAP 1.1.- Construcción del híbrido de C-IgAP y V_{amy}
Un fragmento de ADN de aproximadamente 0.4 kb codificando un dominio V_{HH} que reconoce \alpha-amilasa (V_{amy}) fue amplificado por PCR utilizando como plantilla el fagemido A100R3A2 (Dyax Co.) y los oligonucleótidos VHHA1 (5'-CTA TGC GGC CCA GCC GGC CAT GGC TCA GGT GCA GCT GGT GGA GTC TT-3', SEQ ID NO 3) y GEN III-Rev (5'-ACC CTC ATA GTT AGC GTA ACG-3', SEQ ID NO 4) como cebadores. El producto de ADN amplificado fue posteriormente digerido con SfiI y NotI y clonado en un fragmento de aproximadamente 5.2 kb derivado de la digestión con SfiI-NotI de pF11\beta (Cm^{R}) (Veiga, y col., Mol Microbiol 1999, 33 (6): 1232-43), bajo el control del promotor pLac, dando lugar al plásmido p_{Vamy}\beta (SEQ ID NO: 1). Dicho plásmido, pV_{amy}\beta, fue digerido con XbaI-HindIII y el fragmento de aproximadamente 1.9 kb conteniendo el híbrido V_{amy}\beta fue clonado en el plásmido pVLT35 (Sp^{R}) (de Lorenzo y col., Gene 1993, 123: 17-24), bajo el control del promotor pTac, resultando el plásmido pVV_{amy}\beta.
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1.2.- Construcción del híbrido de C-IgAP y 2Vamy\beta
Un fragmento de ADN de aproximadamente 0.4 kb codificando V_{amy} fue amplificado por PCR utilizando los cebadores Linker-A48-V_{amy}A (5' GGC GGT CCG ACT GCT AAC TCT GGA CAG GTG CAG CTG GTG GAG TC 3' SEQ ID NO 5) y Vamy-Not (5' GAG TCA TTC TGC GGC CGC TGA GGA GAC GGT 3', SEQ ID NO 6) del fagémido A100R3A2 (ver 1.1 arriba). El fragmento V_{amy} fue unido al oligonucleótido Linker-A48 (5' ACC CCG TCT CAC AAC TCC CAC CAG GTT CCA TCC GCA GGC GGT CCG ACT GCT AAC TCT GGA 3', SEQ ID NO 7), el cual codifica el péptido flexible de scFv A48III-1 (Proba y col., J. Mol. Biol. 1998, 275(2): 245-253), por una reacción de PCR sin cebadores dado la homología entre las primeras 24 bases del Linker-A48-V_{amy}A y Linker-A48. Esta reacción fue utilizada para la amplificación del producto de la fusión Linker-V_{amy} usando los oligonucleótidos V_{amy}-Not (SEQ ID NO 6, ver arriba) y Linker -A48-V_{amy}-eag1 (5' ATT ACT CGC CGG CCG GTA CCC CGT CTC ACA ACT CCC A 3', SEQ ID NO 8) como cebadores. El producto de la PCR obtenido (Linker-V_{amy}) fue digerido con NotI y clonado en el plásmido pVV_{amy}\beta digerido con la misma enzima. El nuevo plásmido p2V_{amy}\beta codifica para una proteína híbrida compuesta por dos V_{HH} (V_{amy}\beta) unidas por un linker flexible y fusionado al
C-IgAP.
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1.3.- Construcción del híbrido de C-IgAP y 3Vamy\beta
El producto de la PCR anterior Linker-Vamy fue digerido en NotI y clonado en p2V_{amy}\beta digerido con NotI. El nuevo plásmido, denominado p3V_{amy}\beta codificó una proteína híbrida compuesta por tres dominios V_{HH}(V_{amy}\beta) unida por linkers flexibles y fusionados al C-IgAP.
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Ejemplo 2
Construcción de pVLMB10\beta: dominio V_{LMB10} fusionado a C-IgAP
Se realizó una PCR con los oligos VL1 (5'- gagtcatTCTAGAggagccttttttttggagat, SEQ ID NO 9) y VL2 (5'- ctgagatgagtttttgttctgcggcc, SEQ ID NO 10) y empleando como molde el clon pCES1-VLMB10 (van den Beucken y col. J. Mol. Biol. 2001, 310:591-601). El fragmento de DNA de 0,47 kb amplificado, conteniendo el dominio VL, se digirió con XbaI y NotI y se clonó en el plásmido pV_{amy}\beta, digerido con las mismas enzimas, reemplazando al fragmento XbaI - NotI que contiene el dominio V_{amy} en este plásmido. El clon construido pVLMB10\beta (SEQ ID NO 2) que expresa la proteína híbrida V_{LMB10}\beta bajo el control del promotor pLac, se comprobó mediante secuenciación de ADN.
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Ejemplo 3
Expresión de pVV_{amy}\beta en células de E. coli UT5600
La expresión del híbrido V_{amy}\beta en células de E. coli UT5600 se analizó en Western-blots usando el mAb anti-E-Tag (Fig. 4). V_{amy}\beta se expresó de forma estable como proteína de 66 kDa, correspondiente al tamaño esperado para la fusión (Figura 4A, carril 1). Sin embargo, la expresión de FvH\beta (Veiga, y col., Mol Microbiol 1999, 33 (6): 1232-43) dio lugar no sólo a la proteína completa de 80 kDa, sino a diferentes bandas de menor tamaño correspondientes a la degradación proteolítica de la proteína híbrida (Fig. 4A, carril 2).
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Ejemplo 4
Exposición sobre la superficie de E. coli y plegamiento de los dominios pasajeros de V_{amy}\beta
La exposición en la superficie de los dominios pasajeros V_{amy}\beta se comprobó mediante digestión con tripsina de células de E. coli expresando V_{amy}\beta. Las muestras se analizaron en Western-blot usando el mAb anti-E-Tag, o un suero de conejo anti-OmpA. En estos experimentos se comprobó la proteólisis de los híbridos V_{amy}\beta en presencia de tripsina (Figura 4B) lo que indica que estos pasajeros estaban totalmente expuestos sobre la superficie de E. coli. Como se describió anteriormente, el pasajero de la fusión FvH\beta fue digerido muy débilmente por la acción de la tripsina (Figura 4B). La presencia de la proteína OmpA en todos los carriles se muestra como control interno de carga en el experimento. La ausencia de proteolisis de OmpA (figura 4B, carriles 3 y 7) demuestra la integridad de la membrana externa. Cuando la membrana externa se permeabiliza artificialmente con EDTA aparece una banda de aproximadamente 25 kDa de proteolisis de OmpA (T-OmpA) (figura 4B, carriles 4 y 8).
Para conocer el estado de plegamiento de estos dominios pasajeros quiméricos expuestos hacia el medio extracelular, se empleó la capacidad de unión específica a su antígeno de los dominios Ig. Para ensayar la actividad de unión, se cubrieron placas de ELISA con antígenos reconocidos del dominio pasajero de V_{amy}\beta (\alpha-amilasa). Se usó BSA como antígeno control. Células de E. coli que expresaban los híbridos a C-IgAP se incubaron en placas de ELISA y se detectó la unión del pasajero Ig mediante el mAb anti-E-Tag conjugado con POD. Como se muestra en la Figura 5, el dominio Ig pasajero de V_{amy}\beta expuesto hacia el medio extracelular exhibía actividad específica de unión a su antígeno, lo que indica que estaba correctamente plegado. Como control negativo de estos experimentos se utilizaron células de E. coli que expresaban el híbrido HE\beta.
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Ejemplo 5
Translocación de los híbridos 2V_{amy}\beta y 3V_{amy}\beta
Se construyeron los híbridos 2V_{amy}\beta y 3V_{amy}\beta, tal y como se muestra en la figura 7A, mediante ensayos de proteolisis con tripsina, se determinó la translocación de los dominios pasajeros (2V_{amy} y 3V_{amy}). Encontrándose que la translocación del dominio pasajero 2V_{amy}\beta y 3V_{amy}\beta fue completa.
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Ejemplo 6
Expresión de pV_{LMB10}\beta en células de E. coli UT5600
Se transformó células E. coli UT5600 con pV_{LMB10}\beta y se crecieron a 30°C en placas LB-agar (1,5% p/v) conteniendo cloranfenicol (40 \mug/ml) y glucosa (2% p/v). Se inocularon posteriormente cultivos líquidos de LB conteniendo cloranfenicol (40 \mug/ml), glucosa (2% p/v) con estos clones transformados y se crecieron a 30°C hasta que la DO_{600} \sim0.5. Entonces se recogieron las células por centrifugación (4000xg, 5 m) y se resuspendieron en medio líquido LB conteniendo cloranfenicol (40 \mug/ml) e IPTG 0.1 mM para la inducción del promotor lac. Tras 3 h de incubación a 30°C las células inducidas se recogieron por centrifugación y se analizaron mediante proteolisis con tripsina y Western blot con anti-E-tag-POD.
En la figura 6 se muestra una digestión con Tripsina revelada con anti-Etag y OmpA (fijarse que el carril tripsina es el 2). Se observó una exposición de más del 90% de la proteína de fusión VL-beta (de 65 kDa). Apareciendo además una única banda de degradación proteolítica de aprox 55 kDa.
También se realizó un ensayo de accesibilidad del peptidoglicano (PG) donde se incluyeron las construcciones control (pAKnot), Vamyb, 2Vamyb, 3Vamyb y VLMB10. En todas ellas, sólo apareció un nivel de accesibilidad del PG en torno a 5% máximo e indentico al observado en la cepa control (ver figura 8) sin expresión de ninguna proteína híbrida.
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Ejemplo 7
Ensayo de adhesión específica a una superficie que contiene un antígeno concreto
Para estudiar la capacidad de adhesión específica de células de E. coli que expresaban los híbridos a C-IgAP en placas de ELISA recubiertas con antígenos reconocidos del dominio pasajero del híbrido a C-IgAP, se incubaron células de E. coli UT5600 que expresaban el híbrido V_{amy}\beta en placas de ELISA que previamente se habían recubierto con antígeno amilasa o antígeno control (BSA) y se reveló la unión de las células con un antígeno policlonal anti-E. coli generado en ratones y se detectó la unión de estos anticuerpos con un anticuerpo frente a IgGs de ratón conjugado a la peroxidasa. Ver figura 9. Como control negativo se utilizó células de E. coli que expresaban el híbrido HE\beta.
<110> Consejo Superior de Investigaciones Científicas
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<120> GENERACIÓN DE ADHESIÓN ESPECÍFICA EN BACTERIAS GRAM NEGATIVAS MEDIANTE EL ANCLAJE DE MONODOMINIOS DE INMUNOGLOBULINAS EN SU SUPERFICIE CON AUTOTRANSPORTADORES
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<160> 10
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<170> PatentIn version 3.1
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<210> 1
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<211> 5587
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<212> DNA
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<213> Artificial
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<223> Secuencia ADN del plásmido pVamybeta
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<400> 1
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10
11
12
13
14
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<210> 2
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<211> 5563
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<212> DNA
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<213> Artificial
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<223> Secuencia ADN del plásmido pVLMB10beta
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<400> 2
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15
16
17
18
19
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<210> 3
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<211> 47
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<212> DNA
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<213> Artificial
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<223> Cebador VHHA1
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<400> 3
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\hskip-.1em\dddseqskip
ctatgcggcc cagccggcca tggctcaggt gcagctggtg gagtctt
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47
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<210> 4
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<211> 21
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<212> DNA
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<213> Artificial
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<223> Cebador GEN III-Rev
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<400> 4
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\hskip-.1em\dddseqskip
accctcatag ttagcgtaac g
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21
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<210> 5
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<211> 44
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<212> DNA
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<213> Artificial
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<223> Cebador Linker-A48-VamyA
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<400> 5
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ggcggtccga ctgctaactc tggacaggtg cagctggtgg agtc
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44
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<210> 6
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<212> DNA
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<213> Artificial
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<223> Cebador Vamy-Not
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gagtcattct gcggccgctg aggagacggt
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30
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<210> 7
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<211> 60
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<212> DNA
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<213> Artificial
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<223> Cebador Linker-A48
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accccgtctc acaactccca ccaggttcca tccgcaggcg gtccgactgc taactctgga
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<210> 8
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<211> 37
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<212> DNA
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<213> Artificial
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<223> Cebador Linker -A48-Vamy-eagl
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attactcgcc ggccggtacc ccgtctcaca actccca
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<223> Cebador VL1
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gagtcattct agaggagcct tttttttgga gat
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<212> DNA
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ctgagatgag tttttgttct gcggcc
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26
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Claims (15)

1. Vector de expresión de anticuerpos recombinantes monodominio en la superficie de la membrana externa bacteriana, caracterizado porque comprende la secuencia que codifica para un dominio transportador de la familia de los autotransportadores.
2. Vector de expresión de acuerdo con la reivindicación anterior caracterizado porque comprende secuencias de anticuerpos recombinantes monodominio y el dominio \beta-autotransportador de un autotransportador de una bacteria Gram-negativa, que permite la producción de proteínas híbridas entre dichos anticuerpos recombinantes monodominio y dicho dominio transportador.
3. Vector de expresión de acuerdo con la reivindicación anterior 2, caracterizado porque el dominio \beta-autotransportador empleado es el dominio \beta-autotransportador de la proteasa IgA de Neisseria gonorrhoeae.
4. Vector de expresión de acuerdo con cualquiera de las reivindicaciones anteriores 1 a 3, caracterizado porque los anticuerpos recombinantes monodominio se seleccionan entre el grupo formado por los dominios variables de cadena pesada naturales o modificados (VH), los dominios variables de cadena ligera naturales o modificados (VL), los anticuerpos recombinantes de camelidos naturales o modificados (VHH), los anticuerpos recombinantes de camélidos humanizados, los anticuerpos recombinantes de otras especies camelizados y los anticuerpos monodominio IgNAR de peces cartilaginosos.
5. Vector de expresión de acuerdo con cualquiera de las reivindicaciones anteriores 1 a 4, caracterizado porque comprende un promotor de transcripción bacteriana inducible o constitutivo, un péptido señal, la secuencia que codifica para uno o varios anticuerpos recombinantes monodominio y el dominio C-terminal del sistema transportador de la familia de los autotransportadores.
6. Vector de expresión de acuerdo con la reivindicación anterior 5, caracterizado porque se emplea un único anticuerpo recombinante monodominio, como dominio pasajero para ser secretado por el sistema autotranspor-
tador.
7. Vector de expresión de acuerdo con la reivindicación anterior 5, caracterizado porque se emplea como dominio pasajero para ser secretado por el sistema autotransportador una combinación de dos anticuerpos recombinantes monodominio.
8. Vector de expresión de acuerdo con la reivindicación anterior 5, caracterizado porque se emplea como dominio pasajero para ser secretado por el sistema autotransportador una combinación de tres anticuerpos recombinantes monodominio.
9. Vector de expresión de acuerdo con cualquiera de las reivindicaciones anteriores 5 a 8, caracterizado porque los vectores de expresión presentan en su estructura un epítopo que permita su inmunodetección.
10. Vector de expresión de acuerdo con cualquiera de las reivindicaciones anteriores 5 a 9, caracterizado porque la expresión de los vectores en la membrana externa de la bacteria está controlada por el promotor del operon lac de E. coli (Plac).
11. Vector de expresión de acuerdo con la reivindicación anterior 10, caracterizado porque la inducción del promotor puede conseguirse añadiendo IPTG (isopropil-beta-D-tiogalactopiranosido), lactosa u otro derivado de lactosa al medio de cultivo.
12. Vector de expresión de acuerdo con cualquiera de las reivindicaciones anteriores 5 a 11, caracterizado porque el péptido señal que dirige el paso del vector hacia el periplasma es el péptido señal de PelB (ss).
13. Método de anclaje y expresión de anticuerpos recombinantes monodominio en la superficie bacteriana, caracterizado porque comprende las etapas de:
a.
disponer de un vector de expresión que comprende un promotor, un péptido señal, el anticuerpo recombinantes monodominio como dominio pasajero y el dominio C-terminal del sistema transportador de la familia de los autotransportadores;
b.
la inducción del promotor, en caso de tratarse de un promotor inducible.
14. Método de adhesión bacteriana específica a una superficie que contenga un antígeno concreto, caracterizado porque comprende las etapas de:
a.
modificar la bacteria para que contenga un vector de expresión de anticuerpos recombinantes monodominio que reconoce al antígeno;
b.
inducir la expresión de dicho vector, en el caso de que el promotor sea inducible;
15. Método de adhesión bacteriana específica de acuerdo con la reivindicación anterior, caracterizado porque se emplea un vector de expresión de acuerdo con cualquiera de las reivindicaciones anteriores 1 a 12.
ES200400073A 2004-01-14 2004-01-14 Generacion de adhesion especifica en bacterias gram negativas mediante el anclaje de monodominos de inmunoglobulinas en su superficie con autotransportadores. Expired - Fee Related ES2301262B1 (es)

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