ES2324948T3 - Vector virico adeno-asociado para realizar un salto de exones en un gen que codifica una proteina con campos prescindibles. - Google Patents
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Abstract
Vector vírico adeno-asociado, que comprende: - una secuencia ARNsn modificada de tipo U7; - el promotor nativo de U7; - por lo menos una secuencia antisentido dirigida contra por lo menos un sitio de corte y empalme de por lo menos un exón, codificando dicho exón un dominio prescindible de la distrofina.
Description
Vector vírico adeno-asociado
para realizar un salto de exones en un gen que codifica una proteína
con campos prescindibles.
La presente invención se refiere al uso de
vectores víricos adeno-asociados o vector AAV, para
suministrar a unas células dianas, unas secuencias antisentido
dirigidas contra unos sitios de corte y empalme de un gen que
codifica una proteína de campos prescindibles, así como a sus
aplicaciones terapéuticas, en particular en el tratamiento de la
enfermedad de Duchenne.
Así, unas secuencias seleccionadas de forma
juiciosa introducidas en un vector según la invención son capaces
de dar lugar a unos transcritos que producen una proteína distrofina
más corta, pero funcional, que corrige ciertas formas de la
enfermedad de Duchenne.
La distrofia muscular de Duchenne (DMD) es una
enfermedad genética contenida en el cromosoma X y que afecta
aproximadamente a 1 joven de cada 3.500. Esta enfermedad se
caracteriza por la ausencia de una proteína de 427 kilodaltons, la
distrofina citoesquelética, lo que tiene por consecuencia la muerte
de las fibras musculares, correlacionada con un deterioro muscular
severo y progresivo.
La distrofina es una proteína modular que
presenta una región central compuesta por 24 dominios repetidos de
tipo "spectrin-like". Unas proteínas
desprovistas de algunas de estas secuencias repetidas pueden sin
embargo ser perfectamente funcionales o por lo menos sólo
parcialmente defectivas, tal como se observa en las formas
atenuadas (Becker) de DMD.
Por el contrario, la mayoría de las mutaciones
graves del gen de la distrofina consiste en unas deleciones de uno
o más exones que perturban el cuadro de lectura del mensaje final o
bien unas mutaciones puntuales, presentes en las regiones
codificantes o exones, que introducen unos codones stop o unos
desajustes de la fase de lectura. En los dos casos, estas
mutaciones se traducen por la ausencia de distrofina.
A título ilustrativo, un gran número de casos
clínicos de la enfermedad de Duchenne está relacionado con unas
deleciones multiexónicas (genotipos DMD severos:
\Delta45-50; \Delta47-50;
\Delta48-50A 49-50: \Delta50;
\Delta) cuyo cuadro de lectura podría ser restablecido mediante la
supresión del exón 51 (genotipos BMD ligeros:
\Delta45-51; \Delta47-51;
\Delta48-51A; 49-51 \Delta
51-52).
Se han previsto diferentes estrategias y
técnicas para intentar "reparar" los genes mutados de la
distrofina.
La sustitución del gen de la distrofina en las
fibras musculares enfermas, o la compensación mediante unos
injertos de células sanas de las células necrosadas, reveló unas
dificultades considerables.
La tercera vía prevista, actualmente la más
usada, consiste en intentar reparar el ADN mutado gracias al uso de
oligonucleótidos antisentido (o AON) que permiten saltar ciertos
exones y conseguir así la expresión de una proteína truncada pero
funcionalmente eficaz. Esta técnica denominada "salto de exón"
o "exon skipping" preconiza el uso de oligonucleótidos
complementarios de unas secuencias implicadas en el corte y empalme
de los exones a
enmascarar.
enmascarar.
Los estudios actualmente llevados a cabo sobre
esta vía están realizados esencialmente en unos ratones mdx
que padecen dicha enfermedad, debido a una mutación
no-sentido que introduce un codón stop en el exón 23
del gen murino de la distrofina.
La principal dificultad de esta tecnología
consiste en introducir de manera estable y duradera un
oligonucleótido (AON) no degradado en las fibras musculares
enfermas, en particular in vivo.
En un primer tiempo, se ha previsto inyectar
directamente dichos oligonucleótidos, eventualmente en asociación
con un detergente sintético tal como el agente F127. Así, unas
secuencias ventajosas a administrar por esta vía para enmascarar el
exón 19 ó 45 del gen humano de la distrofina se describen, por
ejemplo, en las solicitudes de patente EP 1 054 058 y EP 1 191 098,
respectivamente. Sin embargo, a la vista de la corta duración de
vida de estos oligonucleótidos en el músculo, este modo de
tratamiento necesita unas inyecciones regulares, relativamente
apremiantes.
Por otro lado, se ha intentado introducir estas
secuencias en unos vectores para vehicularlos en las células diana.
En la actualidad, sólo se han realizado unos ensayos in
vitro: las construcciones usadas se basan en el uso de
retrovirus y se ensayan únicamente sobre unos cultivos celulares.
Los resultados reportados resultan ser poco concluyentes, o por lo
menos insuficientes para prever una transcripción in
vivo.
Por ejemplo, el documento WO 02/24906 ilustra el
uso de estos dos métodos distintos para excluir el exón 46 en unas
células humanas.
\newpage
El conjunto de los trabajos realizados sobre la
transferencia vectorial de los AON ha revelado principalmente
que:
- i)
- la presencia de pequeñas secuencias de tipo ARNsn (smal nuclear RNA) permite una mejor translocación a nivel del núcleo de las células diana y una mejor transcripción de las secuencias. Así, el documento WO 03/095647preconiza la selección ventajosa de los ARNsn de tipo U2 y U3;
- ii)
- la presencia simultánea de dos secuencias diana implicadas en el corte y empalme de un mismo exón mejora la eficacia del salto de dicho exón (1, 2).
Sin embargo, en la actualidad, no se ha
propuesto ninguna solución para realizar salto de exones in
vivo, salvo la inyección de oligonucleótidos con los
inconvenientes mencionados anteriormente.
Por primera vez, los inventores proponen una
construcción que proporciona unos resultados in vivo notables
en cuanto a la restauración de la actividad de la proteína
distrofina en el contexto de la enfermedad de Duchenne.
Con este fin, la invención propone construir un
vector vírico adeno-asociado que comprende:
- -
- una secuencia ARNsn modificada de tipo U7;
- -
- el promotor nativo de U7;
- -
- por lo menos una secuencia antisentido dirigida contra por lo menos un sitio de corte y empalme de por lo menos un exón, codificando dicho exón un dominio prescindible de la distrofina.
En la continuación de la descripción, el
conjunto constituido por estas tres entidades (secuencia
ARNsn/promotor U7/secuencia(s) antisentido(s)) se
denomina "casete U7".
Entre la multitud de vectores disponibles, el
solicitante ha seleccionado ventajosamente un vector de origen
vírico, a saber, un derivado de los virus
adeno-asociados o AAV.
Entre los 8 estereotipos identificados, el AAV
usado en el contexto particular de la DMD es preferentemente un
AAV1, es decir, que está compuesto por una cápside del serotipo 1.
En efecto, el AAV1 parece transducir más eficazmente las células
musculares.
Por el contrario, las secuencias de origen
viral, en particular las ITR, asociadas al transgén proceden
ventajosamente de AAV2. Resulta de ello que el vector viral
adeno-asociado final es, según un modo ventajoso de
realización, un pseudotipo 2/1.
Dicho vector contiene además una secuencia ARNsn
modificada. Los ARNsn o small nuclear RNA son unos ARN de tamaño
pequeño, presentes en el núcleo de las células e implicados en
ciertas etapas de maduración de los pre-ARNm. Se
denominan U1, U2...U10.
Entre estos diferentes tipos de ARNsn, el del
tipo U7 implicado normalmente en la maduración de los ARN
premensajeros que codifican las histonas se usa preferentemente como
vehículo.
El ARNsn en cuestión puede ser tanto de origen
humano como murino, en la medida en que estas pequeñas secuencias
están altamente conservadas entre las diferentes especies.
Preferentemente, el ARNsn usado en la invención es el de ratón.
Mediante la expresión "ARNsn modificado" se
entiende un ARN en el que las secuencias implicadas en la función
inicial del ARNsn están desactivadas. Estas secuencias pueden ser
asimismo modificadas de manera que aumentan el nivel de expresión
de dicho ARNsn.
Por ejemplo, en el caso de U7, la secuencia del
sitio de fijación de la "small nuclear ribonucleoproteine" (o
Sm proteine) se modifica de manera que desactiva la maduración de
los ARN premensajeros que codifican las histonas y paralelamente
que aumenta la concentración nuclear en U7ARNsn. Por otro lado, la
secuencia de 18 nucleótidos complementarios del sitio 3' de
maduración de los ARN premensajeros que codifican las histonas se
sustituye por las secuencias antisentido de interés.
En la práctica, estas modificaciones se pueden
introducir mediante la mutagénesis dirigida por PCR.
El gen ARNsn así modificado se clona a
continuación en el vector AAV, preferentemente entre sus dos
secuencias ITR.
La presente invención podría realizarse asimismo
con unas secuencias U1 o U2, pero por medio de más modificaciones y
para una eficacia menor.
\newpage
Un vector según la invención comprende asimismo
un promotor que permite expresar las secuencias antisentido a un
nivel suficiente para asegurar su actividad biológica y terapéutica.
Numerosos promotores susceptibles de ser utilizados en el contexto
de los AAV son conocidos por el experto en la materia. Sin embargo,
según un modo privilegiado de realización, la expresión de las
secuencias antisentido se dispone bajo el control del promotor
nativo del ARNsn usado en la construcción. En el caso en el que se
prefiere el U7, es por lo tanto el promotor de U7 quien asegura la
transcripción de las secuencias antisentido.
El vector según la invención comprende asimismo
por lo menos una secuencia antisentido dirigida contra por lo menos
un sitio de corte y empalme de por lo menos un exón, es decir, capaz
de interferir con el corte y empalme de dicho exón. La secuencia
antisentido es preferentemente una secuencia complementaria de por
lo menos una secuencia seleccionada de entre el grupo siguiente:
sitio de corte y empalme 5' (donante); sitio de corte y empalme 3'
(aceptor); secuencia intrónica BP (Branching Point); y eventualmente
unas regiones internas ricas en purina, más específicamente unos ESE
(Exon-internal Splicing Enhancer).
Ventajosamente, para asegurar la exclusión de un
mismo exón, dos secuencias antisentido que tienen unas dianas
distintas, preferentemente el sitio 5' donante y la secuencia BP, se
introducen en un mismo vector recombinante según la invención.
Asimismo, se pueden asociar en una misma
construcción unas secuencias antisentido dirigidas contra unos
sitios de corte y empalme de por lo menos dos exones distintos.
Alternativamente, es posible usar varias
construcciones, conteniendo cada una una secuencia antisentido
distinta, siendo dichas secuencias dirigidas contra uno o más
exones.
En la práctica, cuando se asocian varias
secuencias antisentido (dirigidas contra el mismo exón o varios
exones distintos), se pueden presentar los diferentes casos de
figura siguientes:
- -
- las secuencias antisentido están integradas en un mismo casete U7, contenido por un único vector AAV; o
- -
- las secuencias antisentido están integradas en diferentes casetes U7, contenidos por un único vector AAV; o
- -
- las secuencias antisentido están integradas en diferentes casetes U7; cada uno contenido por un vector AAV.
En el marco de la invención, las secuencias
antisentido son específicas de los diferentes sitios de corte y
empalme de los exones que constituyen el gen de la distrofina, sea
cual sea su origen.
El gen murino de la distrofina presenta un
interés evidente puesto que el ratón constituye un modelo animal
experimental de calidad. Así, un ratón mdx, que contiene una
mutación en el exón 23 del gen murino de la distrofina y que
produce una proteína truncada desactivada, presenta los síntomas de
la DMD. En este contexto, las secuencias antisentido están por lo
tanto dirigidas contra las secuencias implicadas en el corte y
empalme del exón 23.
Más particularmente, un vector según la
invención comprende una secuencia SEC ID nº 1 que comprende un gen
U7ARNsn modificado tal como se ha descrito anteriormente, y que
integra unas secuencias antisentido dirigidas contra el sitio 5'
donante (SEC ID nº 2) y la secuencia BP (SEC ID nº 3) del exón 23
del gen murino de la distrofina dispuestas bajo el control del
promotor U7, introducido entre las 2 secuencias ITR del vector
AAV.
De manera muy interesante, la funcionalidad de
dichos vectores ha sido validada por el solicitante en un animal de
gran tamaño, a saber, el perro. En efecto, existen unos perros que
padecen naturalmente miopatías debido a una mutación en el sitio
aceptor de corte y empalme del intrón 6 de manera que no tener en
cuenta del exón 7 en el ARNm final anula el cuadro de lectura, no
estando los exones 6 y 8 en fase. El salto simultáneo de los exones
6 y 8 permite teóricamente restaurar un cuadro de lectura
operacional, estando entonces el ARNm final desprovisto de los
exones 6, 7 y 8. Así, la asociación de vectores según la invención,
que comprende las secuencias antisentido SEC ID 27 y 28, dirigidas
contra unas regiones ESE de los exones 6 y 8, respectivamente,
resultó eficaz.
Con vistas a la terapia humana, las secuencias
antisentido seleccionadas son dirigidas contra por lo menos un
sitio de corte y empalme de por lo menos un exón del gen humano de
la distrofina, cuya exclusión genera una proteína truncada pero
activa.
Tal como se ha expuesto anteriormente, el exón
51 del gen humano de la distrofina, y más particularmente las
secuencias implicadas en su corte y empalme, son unas dianas
ventajosas en el marco de la invención. Así, su exclusión del
transcrito que codifica la distrofina podría ser beneficiosa en el
tratamiento de aproximadamente 20% de los casos clínicos
genotipados de la enfermedad de Duchenne catalogados en la
actualidad.
Así, los inventores han demostrado que una
construcción adaptada en el marco de la invención comprendía la
secuencia SEC ID nº 4, que asocia dos secuencias antisentido SEC ID
nº 5 y SEC ID nº 6 dirigidas contra unas regiones internas ricas en
purinas del exón 51 del gen humano de la distrofina, en lugar de las
secuencias SEC ID nº 2 y nº 3 en la secuencia SEC ID nº 1.
Otras secuencias antisentido humanas, que se
pueden utilizar en el marco de la invención, son las siguientes:
- -
- DA5' de secuencia SEC ID nº 7 dirigida contra el sitio 5' del exón 51;
- -
- DA3' de secuencia SEC ID nº 8 dirigida contra el sitio 3' del exón 51;
- -
- G5' de secuencia SEC ID nº 9 dirigida contra el sitio 5' del exón 51;
- -
- GBP de secuencia SEC ID nº 10 dirigida contra el sitio BP del exón 51;
- -
- ESE4, ESE16 y ESE28 de secuencias SEC ID nº 11, nº 12, y nº 13, respectivamente, dirigidas contra unos sitios de tipo ESE del exón 51;
- -
- Ex51AONlong1 de secuencia SEC ID nº 25;
- -
- Ex51AONlong2 de secuencia SEC ID nº 26.
Estas secuencias están preferentemente asociadas
en tándem en un vector según la invención. Preferentemente, se
asocian DA5' (SEC ID nº 7) y DA3' (SEC ID nº 8) o G5' (SEC ID nº 9)
y GBP (SEC ID nº 10).
Las secuencias SEC ID nº 25 y SEC ID nº 26
corresponden a las secuencias SEC ID nº 5 y SEC ID nº 6 más largas.
Preferentemente, éstas se asocian. Debido a su gran tamaño, cada una
está ventajosamente integrada en un casete U7 contenido o bien por
el mismo vector AAV, o bien por dos vectores AAV distintos para usar
en tándem.
Por lo tanto, forma parte asimismo de la
invención cualquier tipo de célula transfectada por el vector
recombinante, y en particular unas células musculares, en
particular de tipo fibras musculares (miotubos), precursores
musculares (mioblastos) o cualquier célula capaz de diferenciación
muscular. No están previstas por la presente invención las células
cepas humanas embrionarias y su uso.
Un tejido muscular o un organismo no humano
transfectado por dicho vector están asimismo comprendidos en el
alcance de la protección buscada. Entre los organismos no humanos,
se prefieren los animales, en particular los ratones.
La presente solicitud describe por primera vez
un potencial terapéutico para los vectores reivindicados. La
presente invención se refiere por lo tanto asimismo a unas
composiciones farmacéuticas que comprenden como principio activo
por lo menos un vector tal como se define en la presente solicitud,
así como al uso de este vector como medicamento. Además, tal como
se ha mencionado anteriormente en lo referente a los vectores
lentivíricos, unas células transfectadas pueden asimismo tener un
potencial terapéutico en el ámbito de injertos.
Una composición farmacéutica según la invención
contiene el vector o las células reivindicados, asociados con un
vehículo farmacéuticamente aceptable e inerte.
Cuando los vectores según la invención son para
inyectar a nivel de los músculos enfermos, la composición
farmacéutica se presenta preferentemente en forma líquida. La
concentración en vector, la cantidad a inyectar y la frecuencia de
las inyecciones son fácilmente determinadas por el experto en la
materia.
A la vista de los efectos notables observados
in vivo sobre la restauración de la distrofina en las fibras
musculares que padecen DMD, se reivindica asimismo el uso del vector
o de las células según la invención para la preparación de un
medicamento destinado al tratamiento de la enfermedad de
Duchenne.
Excepto el mal funcionamiento de la distrofina
asociado a la enfermedad de Duchenne ilustrado en este caso,
algunas miopatías están relacionadas por ejemplo con un mal
funcionamiento de la proteína de campos prescindibles que es la
disferlina y por lo tanto pueden ser tratadas con un vector según la
invención.
En su uso in vivo, unos vectores según la
invención resultaron ser estables, tener una localización subcelular
específica y producir unas cantidades terapéuticamente activas y
permanentes de antisentido.
Más generalmente, la presente solicitud
demuestra el potencial del sistema AAV-U7ARNsn como
herramienta para la desactivación o la modificación de ARNm en los
animales.
La invención y las ventajas que se desprenden de
la misma se pondrán más claramente de manifiesto a partir de los
ejemplos de realización siguientes con el apoyo de las figuras
adjuntas.
Figura
1
- (A)
- El diagrama de arriba muestra una ilustración esquemática de la estructura de la distrofina intacta (427 kDa). Está compuesta por varios dominios: un dominio de unión a la actina (ABD) en N-terminal, un dominio central en forma de bastoncillo constituido por 24 motivos repetidos "spectrine-like" (R) así como 4 segmentos charnela (H) capaces de conferir flexibilidad, y un dominio rico en cisteínas (CR) que fija el \beta-distroglicano y otros elementos del complejo asociado a la distrofina, en la proximidad del extremo C-terminal. El diagrama del centro representa el ARNm de la distrofina (aproximadamente 14.000 bases) constituido por 79 exones. En los ratones mdx, la sustitución de una citosina por una timidina en el exón 23 en la posición 3185 de la secuencia codificante crea un codón stop prematuro. El diagrama de abajo muestra las secuencias diana a nivel de la secuencia BP (branch point; PB22; SEC ID nº 3) corriente arriba del exón 23 y corriente abajo del sitio donante de corte y empalme (SD23; SEC ID nº 2) para forzar la maquinaria encargada del corte y empalme a saltar el exón mutado manteniendo al mismo tiempo un cuadro de lectura abierto.
- (B)
- Estructura del vector AAV(U7-SD23/BP22). El casete U7-SD23/BP22 está constituido por el promotor U7 (posición -267 a +1, caja rayada), la secuencia U7 ARNsn modificada (caja gris y secuencia correspondiente por debajo) y las secuencias corriente abajo de la posición 116 (caja abierta). Este casete ha sido dispuesto entre dos secuencias invertidas repetidas terminales (ITR) de AAV2 (SEC ID nº 1).
Figura
2
- (A)
- Detección del ARNsn modificado U7-SD23/BP22 (a) y del ARNsn U7 endógeno (b) tras la inyección intramuscular del vector AAV. Se analizaron unas muestras de ARN totales a 0, 15 y 30 días (columna 1, 2 y 3, respectivamente) por RT-PCR. Los productos correspondientes de 60 pb han sido visualizados sobre gel de agarosa. Detección del ARNm de la distrofina con el salto del exón 23. Unas muestras de ARN totales han sido analizadas a 0, 15 y 30 días mediante RT-PCR anidada, usando unos pares de cebadores en el exón 20 y 26. La banda de 901 pb que corresponde al ARNm sin salto (*) es la única especie detectada el día 0 (columna 1), y está progresivamente sustituida por un fragmento de 688 pb (**) que corresponde al ARNm que ha perdido el exón 23.
- (B)
- Secuencia en ADN de la banda de 688 pb después de la purificación sobre gel.
- (C)
- Inmunodetección de las proteínas totales extraídas de los músculos tibiales anteriores, teñidas con unos anticuerpos monoclonales anti-distrofina Dysl (las flechas indican la distrofina completa de 427 kDa: columna 1, mdx, no inyectado; columna 2, mdx, 2 semanas después de la inyección; columna 3, mdx, 1 mes después de la inyección; columna 4, C57B16). Cada columna se cargó con una cantidad total de proteína de 40 gg. Se ha observado el mismo perfil con unos anticuerpos Dys2 (resultados no mostrados).
Figura 3: Restauración de la distrofina en unos
ratones mdx después de la administración de
AAV(U7-SD23/BP22). Coloración inmunológica
con Dys2-Ab de secciones transversales completas del
compartimiento "hind limb anterior" (músculo tibial anterior =
TA y extensor digitorum longus* = EDL) de (A) C57B 16 normal,
(B) mdx no tratados, (C-E) ratones
mdx después de 2, 4 y 12 semanas tras la inyección
intramuscular, y (F) mdx 4 semanas después de la liberación
vectorial intraarterial. Escalas (A-D): 0,5 mm;
(E-F): 1 mm.
Figura 4: Restauración del complejo proteico
asociado a la distrofina en unos músculos mdx tratados. Las
columnas de la izquierda, central y de la derecha muestran unas
secciones del músculo tibial anterior de C57B 16 normal, mdx
no tratados y ratones mdx después del tratamiento,
respectivamente. Las secciones han sido inmunoteñidas frente a la
distrofina (A, B, C), el \alpha-sarcoglicano (D,
E, F), el \beta-sarcoglicano (G, H, I) y el
\beta-distroglicano (J, K, L). El mismo lote de
fibras inversoras (*), que presentan una distrofina así como el
complejo proteico asociado, se muestra en las series de secciones de
los ratones no tratados.
Figura 5: La restauración de la distrofina en
unos músculos mdx tratados restablece la susceptibilidad
normal al daño inducido por el ejercicio. (A) Registros superpuestos
de la tensión producida por los músculos EDL de a) C57B16, b)
mdx no tratados y c) ratones mdx: después de 45 días
de tratamiento, durante 5 contracciones tónicas con extensión
forzada. Los músculos aislados han sido sometidos a unas
estimulaciones repetitivas (125 Hz) durante 360 ms, en unos
intervalos de 3 min. Durante los primeros 160 ms, la tensión se
desarrolla isométricamente, y después una extensión forzada que
corresponde a 10% de la longitud L_{0} para la cual el músculo
produce una fuerza máxima se ha impuesto a una velocidad de 1
longitud de fibra por segundo. Después de la relajación, el músculo
ha vuelto a su longitud de reposo. La caída de la fuerza ha sido
cuantificada por (F_{1}-F_{5})/F_{1},
representando F_{1} la fuerza isométrica desarrollada justo antes
de la extensión en el primer tétanos, y F_{5} la del quinto. La
caída de la fuerza alcanzó como media 15% para unos músculos C57B16
contra 65% en mdx. Para los mdx mostrados en c), la
reducción de la caída de la fuerza ha sido de 17%, lo que indica
una plena readquisición de las propiedades mecánicas de las fibras
musculares. (B y C) Detección con azul de Evans de las fibras
musculares dañadas por el ejercicio en los tibiales anteriores de
las patas no tratadas (B) o tratadas (C) de un solo animal
mdx, 60 días después de la administración del tratamiento.
Las fibras dañadas incorporan el azul de Evans, cuya fluorescencia
se detecta en el canal rojo. La distrofina ha sido teñida
inmunológicamente con Ab-dys2 (verde).
Figura
6
- (A)
- Secuencia de la región intrón 5-intrón 8 en el perro GRMD. La mutación responsable del fenótipo está identificada.
- (B)
- Esquema del corte y empalme del ARNm en el perro GRMD.
- (C)
- Esquema de la interrupción de la fase de lectura al final del exón 6 que llega a una distrofina atrofiada.
Figura
7
- (A)
- Localización de las secuencias dianas situadas en las secuencias ESE del exón 6 (C6ESE2; SEC ID nº 27) y del exón 8 (C8ESE1; SEC ID nº 28).
- (B)
- Esquema del corte y empalme del ARNm en el perro GMRD, después del salto de exones múltiples realizado con las secuencias antisentido C6ESE2 y C8ESE1.
- (C)
- Esquema de la secuencia proteica de la distrofina sintetizada tras el salto de exones múltiples.
Figura 8: Restauración de la distrofina en unos
perros GRMD adultos, obtenida 2 meses después de una única
inyección intramuscular de una preparación que contiene los vectores
AAV(U7-ex6) que integran la secuencia
antisentido SEC ID nº 27 y AAV(U7-ex8) que
integran la secuencia antisentido SEC ID nº 28. Coloración
inmunológica con Dys2-Ab de secciones transversales
completas. Escala 1 mm.
Figura 9: Inmunodetección de las proteínas
totales extraídas de los músculos tibiales anteriores, teñidas con
unos anticuerpos monoclonales anti-distrofina Dys2:
columna 1, distrofina humana en sujeto sano; Columna 2, distrofina
en perro sano; columna 3, perro GRMD 2 meses después del
tratamiento; columna 4, perro GRMD no tratado. Cada columna ha sido
cargada con una cantidad total de proteína de 40 \mug.
Figura
10
- (A)
- Localización de las secuencias dianas que permiten el salto del exón 51 en el gen humano de la distrofina: la secuencia antisentido H51a tiene la secuencia SEC ID nº 6 y la secuencia antisentido H51b tiene la secuencia SEC ID nº 5. Las secuencias antisentido AS y DS son tal como se describen por DeAngelis (1).
- (B)
- Esquema de la integración del casete U7 en el vector lentiviral.
- (C)
- Detección del ARNm de la distrofina humana con el salto del exón 51. Las muestras de ARN totales han sido analizadas por RT-PCR anidada. La flecha negra corresponde al ARNm sin salto (*), mientras que la flecha blanca indica el ARNm desprovisto del exón 51.
Figura 11: Restauración de la distrofina en unos
ratones SCID-mdx, obtenida 1 mes y medio después de
la inyección en los músculos tibiales anteriores de células cepas
delta 49-50 transducidas por el vector
Lent(U7-H51ab) que integra las secuencias
antisentido SEC ID nº 5 y nº 6. Coloración inmunológica con
Dys3.
\vskip1.000000\baselineskip
El gen completo U7 ARNsn (445 pb) ha sido
obtenido por PCR sobre el ADN genómico del ratón con los
oligonucleótidos:
5'-TAACAACATAGGAGCTGTG-3' (SEC ID nº
14) y 5'-CAGATACGCGTTTCCTAGGA-3'
(SEC ID nº 15). El dominio Sm (AATTTGTCTAG; SEC ID nº 16) ha sido
optimizado en smOPT (AATTTTTGGAG; SEC ID nº 17), tal como se ha
descrito anteriormente (3), y la región del U7 capaz de enlazarse
con el pre-ARNm ha sido intercambiada con una
secuencia de 44 nucleótidos complementarios al mismo tiempo de la
región que cubre la secuencia BP (branch point) corriente arriba del
exón 23 del gen de la distrofina (BP22:
5'-AAATAGAAGTT
CATTTACACTAAC-3'; SEC ID nº 3) y la región corriente abajo del sitio donante de corte y empalme (SD23: 5'-GGCCAAACCTCGGCTTACCT-3'; SEC ID nº 2). El fragmento resultante U7smOPT-SD23/BP22 se insertó a continuación entre 2 secuencias invertidas repetidas terminales de AAV2 (SEC ID nº 1).
CATTTACACTAAC-3'; SEC ID nº 3) y la región corriente abajo del sitio donante de corte y empalme (SD23: 5'-GGCCAAACCTCGGCTTACCT-3'; SEC ID nº 2). El fragmento resultante U7smOPT-SD23/BP22 se insertó a continuación entre 2 secuencias invertidas repetidas terminales de AAV2 (SEC ID nº 1).
Se han preparado unos vectores recombinantes
pseudotipados AAV2/1 en unas células 293, tal como ya se ha descrito
(4), cotransfectando 3 plásmidos: pAAV2
(U7smOPT-SD23/BP22) que codifican el genoma rAAV2,
pXX6 que ostenta las funciones "adenovirus helper" y
pAAV1plTRC02 que suplen los genes rep y cap de AAV1.
Los títulos en vectores han variado entre 10^{12} y 10^{13}
genomas de vector (vg) ml^{-1}.
Todos los procedimientos animales han sido
ejecutados según el protocolo aprobado por la institución y en unas
condiciones estrictas de confinamiento biológico. Un primer grupo de
ratones mdx (de 8 semanas de edad) ha recibido mediante
inyección 50 \mul de PBS (tampón salino fosfato) que contiene
10^{12} (vg) AAV(U7-SD23/BP22) en los
músculos tibiales anteriores de las patas posteriores derechas. Los
músculos contra-laterales han sido usados como
controles. Un segundo grupo de ratones mdx de la misma edad
han sido sometidos a una perfusión intra-arterial
de 2x10^{-3} vectores a través de la arteria femoral. Los ratones
han sido sacrificados en tiempos determinados, los músculos han
sido congelados en isopentano enfriado con nitrógeno líquido y
almacenados a -80ºC.
Unos cortes transversales (8 \mum) en serie,
realizados a intervalos de 200 \mum sobre la longitud del
músculo, han sido examinados para la distrofina
(NCL-DYS2; anticuerpos monoclonales murinos contra
el dominio C-terminal; NovoCastra) y las proteínas
asociadas a la distrofina \beta-distroglicano,
\alpha y \beta-sarcoglicano; Novocastra)
mediante detección inmunológica, según las instrucciones del
fabricante. Los anticuerpos monoclonales han sido detectados con la
ayuda de anticuerpos biotinilados seguidos por
avidina-FITC (M.O.M. kit, Vector Laboratories). Los
cortes preparados han sido analizados mediante miscroscopía confocal
con láser (Leica). Los tejidos intermedios han sido recolectados
para unos análisis ulteriores de proteínas y de ARN.
Las secciones de las capas intermedias han sido
recolectadas y extraídas con un tampón de lisis que contiene 4% de
SDS, 125 mM de Tris-HCl, pH 6,4, 4 M de urea, 10% de
\beta-mercaptoetanol, 10% de glicerol, 0,001% de
azul de bromofenol. Después de la separación mediante
centrifugación, el contenido en proteínas se midió con la ayuda del
ensayo Bio-Rad "Protein Assay". Las muestras,
ajustadas a 40 \mug de proteínas, han sido cargadas sobre unos
geles de poliacrilamida al 6%, sometidas a electroforesis y
transferidas sobre unas membranas de nitrocelulosa que han sido
incubadas con NCL-DYS1 (anticuerpos monoclonales
murinos contra la secuencia repetida R8 del dominio
"spectrine-like" en bastoncillo de la
distrofina; NovoCastra) o NCL-DYS2, diluido al
1:100, seguido de una incubación con unos anticuerpos secundarios de
rábano picante conjugados con la peroxidasa (1:1000) y un sistema de
análisis "ECL Analisis System" (Amersham).
Los ARN totales han sido aislados de un pool de
cortes intermedios usando el agente reactivo TRIZOL (Life
Technologies). Para detectar U7 y U7smOPT-SD23/BP22,
se ha realizado la transcripción inversa en primer lugar sobre los
ARN totales con Supercript II reverse transcriptase en presencia de
hexámeros aleatorios (In vitrogen). Después, los ADNc han sido
amplificados gracias a la Taq polimerasa (Promega) con
5'-AAGTGTTACAGCTCTTTTAG-3' (SEC ID
nº 18 localizada en el U7 salvaje) o
5'-AAGGCCAAACCTCGGCTTAC-3' (SEC ID
nº 19 localizada en el U7smOPT-SD23/BP22) y
5'-AGGGGTTTTCCGACCGAAG-3' (SEC ID nº
20) para 30 ciclos (94ºC/30 s; 55ºC/30 s; 72ºC/30 s). Los productos
de PCR han sido analizados sobre geles de agarosa al 2%. Para
detectar el ARNm de la distrofina, se ha realizado una
RT-PCR anidada con 200 ng de ARN totales. La primera
reacción tuvo lugar con los cebadores Ex20ext (SEC ID nº 21;
5'-CAGAATTCTGCCAATTGCTGAG-3') y
Ex26ext (SEC ID nº 22;
5'-TTCTT
CAGCTTGTGTCATCC-3') durante 30 ciclos (94ºC/30 s; 55ºC/1 min; 72ºC/2 min). Después, se han amplificado 2 \mul de la primera reacción durante 23 ciclos con Ex20int (SEC ID nº 23; 5'-CCCAGTCTACCACCCTATCAGAGC-3') y Ex26int (SEC ID nº 24; 5'-CCTGCCTTTAAGGCTTCCTT-3'). Los productos de PCR han sido analizados sobre unos geles de agarosa al 2%, y se han purificado unas bandas específicas para el análisis de secuencia.
CAGCTTGTGTCATCC-3') durante 30 ciclos (94ºC/30 s; 55ºC/1 min; 72ºC/2 min). Después, se han amplificado 2 \mul de la primera reacción durante 23 ciclos con Ex20int (SEC ID nº 23; 5'-CCCAGTCTACCACCCTATCAGAGC-3') y Ex26int (SEC ID nº 24; 5'-CCTGCCTTTAAGGCTTCCTT-3'). Los productos de PCR han sido analizados sobre unos geles de agarosa al 2%, y se han purificado unas bandas específicas para el análisis de secuencia.
Los músculos extensor digitorum longus
(EDL) de ratones de control o tratados han sido disecados para
evaluar las propiedades contráctiles/mecánicas. Los músculos
aislados han sido conectados por un lado a un arrastrador
electromagnético y por el otro lado a un sensor de fuerza, y han
sido estimulados mediante electrodos dispuestos paralelamente al
músculo. Las contracciones isométricas tónicas y unidas a una
sacudida breve (125 Hz; 360 ms, separadas por unos tiempos de
reposo de 3 min) han sido estudiadas a L_{0} (longitud a la que
se observa la fuerza tónica isométrica máxima). La tensión
isométrica se ha calculado dividiendo la fuerza por la superficie
estimada de la sección (cross-sectional area: CSA)
del músculo. Suponiendo que los músculos tienen una forma
cilíndrica y una densidad de 1,06 mg.mm^{-3}, la CSA corresponde
al peso húmedo del músculo dividido por su longitud de fibras (5).
Las concentraciones excéntricas inducen de manera característica
unos daños musculares correlacionados con una ruptura de membrana.
Aparecen cuando un músculo contraído al máximo se estira con
fuerza, lo que provoca una caída de fuerza. En este caso, los
músculos han sido alargados 10% de la longitud L_{0} para la cual
el músculo produce una fuerza máxima a una velocidad de 1 longitud
de fibra por segundo. Cinco contracciones excéntricas han sido
aplicadas a unos intervalos de 3 min. La caída acumulada de la
fuerza isométrica ha sido cuantificada tal como se ha descrito
anteriormente
(5).
(5).
Se ha modificado un ARN de tipo U7 con el fin de
introducir en el mismo unas secuencias antisentido, apropiadas para
interferir con el proceso de maduración de los ARN mensajeros
(ARNm), en el núcleo. La secuencia del U7ARNsn ha sido optimizada
de manera que transporta unas secuencias antisentido dirigidas
contra los intrones 22 y 23 del gen murino de la distrofina. Las
secuencias en el intrón 22 han sido seleccionadas de manera que
entran en competición con la fijación del U2ARNsn a nivel del sitio
de corte y empalme BP (Branching Point) (BP22; SEC ID nº 3), y de
las secuencias en el intrón 23 que corresponde al sitio de fijación
de U1 a nivel del sitio donante (SD23; SEC ID nº 2) (Figura 1).
Estas secuencias han sido usadas en una estrategia de doble diana,
tal como lo preconiza Brun et al., (2).
El gen U7 modificado, que comprende al mismo
tiempo el promotor y los elementos 3', ha sido dispuesto en una
construcción basada en AAV-2, que se introdujo en la
cápside AAV-1 para obtener una alta eficacia de la
transferencia de genes a los músculos esqueléticos. Unos ratones
mdx adultos (de 8 semanas de edad) han recibido en inyección
en el músculo tibial anterior una única dosis de 10^{10} genomas
de vector y han sido analizados en diferentes tiempos, entre 2 y 16
semanas. El análisis molecular del salto del exón 23 se ha realizado
mediante RT-PCR anidada sobre los ARN totales
preparados a partir de los músculos que han recibido la inyección.
Se ha detectado un transcrito más corto, en el ejemplo desprovisto
del exón 23. Presentaba de 5 a 10% del material amplificado, 2
semanas después de la inyección y se volvía la especie mayoritaria
después de un mes (Figuras 2B y 2C). Esta lenta acumulación de los
transcritos que han sufrido el salto de exón no ha resultado de la
expresión progresiva del transgén durante las primeras semanas tras
la transferencia de genes mediada por AAV, puesto que los niveles
del U7 modificado, medidos a 2 y 4 semanas, resultaron equivalentes
y representaban 5 veces el nivel del U7ARNsn endógeno (Figura 2A).
Esto sugiere más bien una disponibilidad limitada del
pre-ARNm y una rotación lenta del ARNm maduro de la
distrofina en las fibras musculares.
De acuerdo con la generación de transcritos que
han sufrido el salto de exón, la proteína distrofina se ha
detectado al mismo tiempo mediante inmunodetección en unos extractos
musculares, pero también mediante inmunofluorescencia sobre unas
secciones tisulares (Figura 3). Los niveles de distrofina reflejaban
los de los ARNm producidos (de 0,5 a 20% del nivel normal a 2 y 4
semanas, respectivamente). El salto de exón ha generado unas
especies proteicas inmunorreactivas del tamaño esperado, sin
ninguna evidencia de la presencia de múltiples productos de
degradación. Se debe observar que la diferencia en peso molecular
entre la proteína salvaje y la truncada no se puede resolver sobre
el gel mostrado. Virtualmente, todas las fibras del músculo que han
recibido la inyección han sido detectadas positivamente a partir de
4 semanas después de la inyección, y la proteína estaba típicamente
localizada en la periferia de las fibras. Unos cortes histológicos
de los músculos tratados han mostrado de forma distinta la
desaparición del fenotipo distrófico, con unas fibras que han
recuperado su forma poligonal normal y la ausencia de células
inflamatorias.
Un grupo de animales mdx ha recibido el
vector AAV-U7 mediante perfusión
intra-arterial de alta presión en la pata inferior.
Esto provoca, después de un mes, la restauración eficaz de la
distrofina en la mayoría de las fibras, en todos los músculos de la
pata perfundida, incluyendo TA y EDL (Figura 3F). Además de la
distrofina, las proteínas asociadas que incluyen el
\alpha-sarcoglicano, el
\beta-sarcoglicano y el
\beta-distroglicano han sido detectadas en la
periferia de las fibras de los animales tratados (Figura 4). Esto
confirmó que el producto del ARNm que ha sufrido el salto de exón
contiene un dominio C-terminal de fijación del
distroglicano que es esencial para la función de anclaje a la
membrana de la distrofina.
La susceptibilidad a los daños inducidos por el
ejercicio se ha evaluado en los animales tratados, midiendo la
resistencia a las contracciones tónicas seguidas de una elongación
forzada. Para este experimento, los ratones han recibido una única
dosis de AAV-U7 en el músculo EDL y han sido
analizados después de 45 días. Mientras que los músculos de los
animales mdx eran incapaces de soportar unas elongaciones
repetidas, los músculos tratados que expresan una distrofina
restablecida en más del 70% de sus fibras presentaban unos
rendimientos esencialmente equivalentes a los músculos normales con
una caída de fuerza de 17% según 5 estímulos, comparado con el 15%
para los salvajes (Figura 5A). Los daños inducidos por el ejercicio
han sido evaluados asimismo sometiendo a los ratones mdx
inyectados en el músculo tibial anterior a una carrera de gran
envergadura, seguida de una inyección con azul de Evans, un
colorante impermeable a las células. Las lesiones musculares,
demostradas por la entrada del colorante en las fibras, eran
significativas en el músculo tratado (Figura 5B) y ausentes en el
músculo contra-lateral no tratado del mismo animal
(Figura 5C).
Los resultados obtenidos en el ratón han podido
ser extrapolados a un animal de gran tamaño, a saber, el perro
GRMD. El perro GRMD presenta una mutación puntual en el sitio
aceptor de corte y empalme del intrón 6 (AG transformado en GG;
Fig. 6A), lo que impide la inclusión del exón 7 en el ARNm de la
distrofina (Fig. 6B). El ARNm así formado (delta exón 7) presenta
un desajuste del cuadro de lectura relacionado con el desfase de
los exones 6 y 8 (Fig. 6B y C).
Dos ARN de tipo U7 han sido modificados con el
fin de introducir en los mismos unas secuencias antisentido,
apropiadas para interferir con la maquinaria de corte y empalme en
la proximidad de los exones 6 y 8 (Fig. 7A), de manera que los
exones 6, 7 y 8 no se tengan en cuenta en el ARNm final
(multi-skipping; Fig. 7B). Este ARNm, cuyo cuadro
de lectura está restaurado, permite la producción de una proteína
ligeramente truncada en el dominio ABD (Fig. 7C), pero en teoría
perfectamente funcional.
La eficacia de los vectores
AAV(U7-ex6) que integran la secuencia
antisentido SEC ID nº 27 y AAV(U7-ex8) que
integran la secuencia antisentido SEC ID nº 28 ha sido ensayada
in vivo mediante inyección loco-regional en
unos sujetos GRMD adultos. La figura 8 ilustra el nivel de
distrofina obtenido 2 meses después de una única inyección
intramuscular de una preparación de 500 \mul que contiene una
mezcla de dos vectores (\sim10^{11} partículas víricas). Esta
distrofina es detectable asimismo mediante transferencia Western
(figura 9). Tal como en el ratón, el complejo de proteínas
asociadas a la distrofina es asimismo restaurado, lo que sugiere
indirectamente el buen funcionamiento de la
"casi-distrofina" inducida por salto
multi-exón.
Los inventores han desarrollado un enfoque que
permite combinar los enfoques de terapia celular y de salto de exón
en unas poblaciones de células capaces de participar en la
regeneración muscular in vivo. Para ello, los inventores han
desarrollado unos vectores lentivíricos que vehiculan unos casetes
U7 susceptibles de inducir unos saltos terapéuticos (modelos
murino, canino y humano).
A título de ejemplo, se presentará a
continuación la restauración de distrofina en unas células de un
paciente DMD que presenta una deleción de los exones
49-50.
Se han generado diferentes vectores
Lenti(U7ex51 humanos), conteniendo uno de ellos las
secuencias descritas anteriormente por DeAngelis (1) (Fig. 10A y
B). Los resultados muestran, en unas condiciones de transducción,
de cultivo y de análisis idénticos, que las secuencias dianas
publicadas anteriormente (U7-ASDS) funcionan sólo
muy modestamente y no permiten la restitución de un nivel de
distrofina compatible con un racional terapéutico (Fig. 10C). Por
el contrario, el vector (U7-H51ab), que integra las
secuencias antisentido SEC ID nº 5 y SEC ID nº 6, resulta
extremadamente eficaz y permite la modificación casi completa de los
ARNm distrofina que están en este caso todos liberados del exón 51
apuntado por el vector (Fig. 10C). Unas células cepas AC133+
circulantes (20 x 10^{4}) recientemente extraídas en un paciente
DMD (delta 49-50) han sido transducidas por el
vector Lent(U7-H51ab) que integra las
secuencias antisentido SEC ID nº 5 y SEC ID nº 6, y rápidamente
reinyectadas en los músculos tibiales anteriores de ratones
SCID-mdx con el objetivo de demostrar la posibilidad
de un salto de exón terapéutico in vivo a partir de células
de pacientes DMD.
El análisis histológico, después de un mes y
medio, demuestra de manera concluyente la restauración de distrofina
humana (revelación por anticuerpo DYS3 que no se cruza con la
distrofina murina) en numerosas fibras musculares posiblemente
quimeras hombre/ratón (Fig. 11).
1) De Angelis FG, Sthandier O,
Berarducci B, Toso S, Galluzzi G, Ricci
E, Cossu G, Bozzoni I, "Chimeric snRNA molecules
carrying antisense sequences against the splice junctions of exon 51
of the dystrophin pre-mRNA induce exon skipping and
restoration of a dystrophin synthesis in Delta 48-50
DMD cells", PNAS U.S.A. jul de. 2002 9;9(14):
9456-61.
2) Brun C, Suter D, Pauli
C, Dunant P, Lochmuller H, Burgunder JM,
Schumperli D, Weis J, "U7 snRNAs induce correction
of mutated dystrophin pre-mRNA by exon skipping",
Cell Mol Life Sci. mar. de 2003;
60(3):557-66.
3) Gorman L, Suter D,
Emerick V, Schumperli D, Kole R, "Stable
alteration of pre-mRNA splicing patterns by modified
U7 small nuclear RNA5", PNAS U.S.A. 1998;
95:4929-34.
4) Snyder RO et al., -"Efficient
and stable adeno-associated
virus-mediated transduction in the skeletal muscle
of adult immunocompetent mice", Hum Gene Ther 1997;
8:1891-900.
5) Fougerousse F, Gonin P,
Durand M, Richard I, Raymackers JM, "Force
impairment in calpain 3-deficient mice is not
correlated with mechanical disruption", Muscle Nerve
2003; 27: 616-23.
<110> GENETHON
Centre National de la Recherche Scientifique
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<120> VECTOR VÍRICO
ADENO-ASOCIADO PARA REALIZAR UN SALTO DE EXONES EN
UN GEN QUE CODIFICA UNA PROTEÍNA
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipCON CAMPOS PRESCINDIBLES
\hfill
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<130>
G143-B-21235 PCT
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<150> FRG4.51861
\vskip0.400000\baselineskip
<151>
17-08-2004
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<160> 28
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<170> PatentIn version 3.1
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 1
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 960
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> U7-SD23/BP22
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 1
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 2
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<211> 20
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<212> ADN
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<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> SD23
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 2
\vskip1.000000\baselineskip
\hskip1cm
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 3
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<211> 24
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<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> BP22
\vskip1.000000\baselineskip
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<400> 3
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\hskip1cm
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 4
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<211> 468.
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223>
U7-h51AON2/h51AON1
\vskip1.000000\baselineskip
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<400> 4
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<210> 5
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<211> 23
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<212> ADN
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<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> h51AON2
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 5
\vskip1.000000\baselineskip
\hskip1cm
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<210> 6
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<211> 20
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<212> ADN
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<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> h51AON1
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 6
\vskip1.000000\baselineskip
\hskip1cm
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 7
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 24
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> DA5'
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 7
\vskip1.000000\baselineskip
\hskip1cm
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 8
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 28
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> DA3'
\vskip1.000000\baselineskip
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<400> 8
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\hskip1cm
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\vskip0.400000\baselineskip
<210> 9
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<211> 20
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<212> ADN
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<213> Secuencia artificial
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\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> G5'
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<400> 9
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\hskip1cm
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\vskip0.400000\baselineskip
<210> 10
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<211> 22
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<212> ADN
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<213> Secuencia artificial
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\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> GBP
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<400> 10
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\hskip1cm
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<210> 11
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<211> 26
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<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
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\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> ESE4
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<400> 11
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\hskip1cm
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\vskip0.400000\baselineskip
<210> 12
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<211> 25
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<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
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\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> ESE16
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\vskip0.400000\baselineskip
<400> 12
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\hskip1cm
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<210> 13
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<211> 25
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<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> ESE28
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 13
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\hskip1cm
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\vskip0.400000\baselineskip
<210> 14
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<211> 19
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<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> U7-1 murino
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<400> 14
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\hskip1cm
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<210> 15
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<211> 20
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<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> U7-2 murino
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<400> 15
\vskip1.000000\baselineskip
\hskip1cm
\vskip1.000000\baselineskip
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<210> 16
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<211> 11
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<212> ADN
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<213> Secuencia artificial
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\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Sm
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<400> 16
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\hskip1cm
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<210> 17
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<211> 11
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<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> smoPT
\vskip1.000000\baselineskip
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<400> 17
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\hskip1cm
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<210> 18
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<211> 20
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<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
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<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> primer U7
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<400> 18
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\hskip1cm
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<210> 19
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 20
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<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> primer u7
smOPT-5D23/BP22
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 19
\vskip1.000000\baselineskip
\hskip1cm
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<210> 20
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 19
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Cebador común u7
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\vskip0.400000\baselineskip
<400> 20
\vskip1.000000\baselineskip
\hskip1cm
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 21
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 22
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Ex20ext
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 21
\vskip1.000000\baselineskip
\hskip1cm
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 22
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 20
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Ex26ext
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 22
\vskip1.000000\baselineskip
\hskip1cm
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 23
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 24
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Ex2Oint
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 23
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\hskip1cm
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 24
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 20
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Ex26int
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 24
\vskip1.000000\baselineskip
\hskip1cm
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 25
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 45
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> ex51AONIong1
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 25
\vskip1.000000\baselineskip
\hskip1cm
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 26
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 45
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> ex51AONIong2
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 26
\vskip1.000000\baselineskip
\hskip1cm
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 27
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 41
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> C6ESE2
\newpage
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 27
\vskip1.000000\baselineskip
\hskip1cm
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 28
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 39
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> C8ESE1
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 28
\vskip1.000000\baselineskip
\hskip1cm
Claims (22)
1. Vector vírico adeno-asociado,
que comprende:
- -
- una secuencia ARNsn modificada de tipo U7;
- -
- el promotor nativo de U7;
- -
- por lo menos una secuencia antisentido dirigida contra por lo menos un sitio de corte y empalme de por lo menos un exón, codificando dicho exón un dominio prescindible de la distrofina.
2. Vector según la reivindicación 1,
caracterizado porque el vector AAV está compuesto por una
cápside del serotipo 1.
3. Vector según la reivindicación 2,
caracterizado porque el vector AAV es un pseudotipo 2/1.
4. Vector según una de las reivindicaciones 1 a
3, caracterizado porque el sitio de corte y empalme se
selecciona de entre el grupo constituido por el sitio 5' donante,
el sitio 3' aceptor, la secuencia BP ("Branch Point") y las
secuencias ESE.
5. Vector según una de las reivindicaciones 1 a
4, caracterizado porque el vector comprende dos secuencias
antisentido.
6. Vector según la reivindicación 5,
caracterizado porque las secuencias antisentido están
dirigidas contra el sitio 5' donante y la secuencia BP,
respectivamente.
7. Vector según la reivindicación 6,
caracterizado porque las secuencias antisentido tienen una
secuencia SEC ID nº 2 y SEC ID nº 3, respectivamente.
8. Vector según la reivindicación 7,
caracterizado porque comprende la secuencia SEC ID nº 1.
9. Vector según la reivindicación 4,
caracterizado porque comprende una secuencia antisentido
dirigida contra una secuencia ESE del exón 6 y/o del exón 8 del gen
canino de la distrofina, preferentemente de secuencia SEC ID nº 27
y/o SEC ID nº 28.
10. Vector según una de las reivindicaciones 1 a
6, caracterizado porque por lo menos una secuencia
antisentido está dirigida contra por lo menos un sitio de corte y
empalme de por lo menos un exón del gen humano de la
distrofina.
11. Vector según la reivindicación 10,
caracterizado porque por lo menos un exón es el exón 51.
12. Vector según la reivindicación 11,
caracterizado porque las secuencias antisentido tienen una
secuencia seleccionada de entre el grupo constituido por las
secuencias SEC ID nº 5, SEC ID nº 6, SEC ID nº 7, SEC ID nº 8, SEC
ID nº 9, SEC ID nº 10, SEC ID nº 11, SEC ID nº 12, SEC ID nº 13, SEC
ID nº 25 y SEC ID nº 26.
13. Vector según la reivindicación 12,
caracterizado porque comprende las secuencias SEC ID nº 5 y
SEC ID nº 6, o SEC ID nº 7 y SEC ID nº 8, o SEC ID nº 9 y SEC ID nº
10, o SEC ID nº 25 y SEC ID nº 26, respectivamente.
14. Vector según la reivindicación 13,
caracterizado porque comprende la secuencia SEC ID nº 14.
15. Vector según una de las reivindicaciones 1 a
5 y 9 a 10, caracterizado porque las secuencias antisentido
están dirigidas contra unos sitios de corte y empalme de por lo
menos dos exones distintos.
16. Célula aislada transfectada por un vector
según una de las reivindicaciones 1 a 15, con la exclusión de una
célula cepa humana embrionaria.
17. Célula según la reivindicación 16,
caracterizada porque se trata de una célula muscular.
18. Célula según la reivindicación 17,
caracterizada porque se trata de un mioblasto o de una célula
capaz de diferenciación muscular.
19. Tejido muscular aislado transfectado por un
vector según una de las reivindicaciones 1 a 15.
20. Organismo no humano transfectado por un
vector según una de las reivindicaciones 1 a 15.
21. Composición farmacéutica que comprende un
vector según una de las reivindicaciones 1 a 15 o unas células
según una de las reivindicaciones 16 a 18.
22. Uso de un vector según una de las
reivindicaciones 1 a 15, o de células según una de las
reivindicaciones 16 a 18, para la preparación de un medicamento
destinado a tratar la enfermedad de Duchenne.
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