ES2331109T3 - Proteinas fluorescentes. - Google Patents
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Abstract
Una proteína fluorescente derivada de la Proteína Fluorescente Verde (GFP), que comprende una secuencia de aminoácidos en la que el aminoácido de la posición que se corresponde con la posición 65 del Identificador de Secuencia núm.: 4 ha sido sustituida por un aminoácido alifático y en la que el ácido glutámico de la posición que se corresponde con la posición 223 del Identificador de Secuencia núm.: 4 ha sido sustituido por un aminoácido seleccionado entre el grupo que consta de G, A, V, I, F, S, T, N y Q, que se caracteriza porque dicha GFP mutada tiene un máximo de excitación a una longitud de onda mayor y la fluorescencia se incrementa cuando la GFP mutada se expresa en células incubadas a una temperatura de 30ºC o superior en comparación con la GFP de tipo natural.
Description
Proteínas fluorescentes.
La presente invención se refiere a nuevas
variantes de la proteína fluorescente GFP que tienen propiedades de
fluorescencia mejoradas.
El descubrimiento de que la Proteína
Fluorescente Verde (GFP) obtenida de la medusa A. victoria
conserva sus propiedades fluorescentes cuando se expresa en células
heterólogas ha propiciado una investigación biológica con una
nueva, única y potente herramienta (Chalfie y asociados (1191)
Science 263:802; Prasher (1995) Trends in genetics 11:320; WO
95/07463). Un aspecto muy importante del uso de las proteínas
fluorescentes recombinantes en el estudio de las funciones
celulares es la naturaleza no invasiva del ensayo. Esto permite la
detección de eventos celulares en células vivas intactas.
El espectro de excitación de la proteína
fluorescente verde obtenida de la Aequorea victoria muestra
dos picos: un pico principal a 396 nm, que está en la banda de los
UV potencialmente dañinos para las células, y un pico menor a 475
nm, que está en una banda de excitación mucho menos peligrosa para
las células.
Para mejorar la GFP de tipo natural, se ha
descrito una gama de mutaciones. Heim (GFP (Heim y colaboradores
(1994) Proc. Natl. Acad. Sci. 91:12501) describió el descubrimiento
de una variante fluorescente azul que aumenta enormemente las
potenciales aplicaciones de uso de sondas recombinantes
fluorescentes para monitorizar eventos o funciones celulares ya que
la capacidad de las sondas de tener diferentes espectros de
excitación y emisión permite la monitorización simultanea de más de
un proceso. Sin embargo, la variante fluorescente azul descrita por
Heim y colaboradores, Y66H-GFP, sufre de ciertas
limitaciones: La fluorescencia azul es débil (máximo de emisión a
448 nm), haciendo así difícil la detección y necesitándose la
excitación prolongada de las células que expresan la
Y66H-GFP. Además, el periodo prolongado de
excitación es dañino para las células, especialmente a causa de que
la longitud de onda de excitación está en la banda de los UV, 360 nm
- 390 nm.
Heim y colaboradores (1995) Nature, Vol. 373,
pág. 663 - 4, presentan una mutación Ser65Thr de la GFP (S65T) que
tiene longitudes de onda de excitación y emisión, 490 nm y 510 nm,
respectivamente, mayores que la GFP de tipo natural y en la que la
formación de fluoróforos avanza aproximadamente el cuádruple de
rápido que en la GFP de tipo natural.
Ehrig y colaboradores (1995) FEBS Letters 367,
163 - 166, presentan un mutante E222G de la proteína fluorescente
verde de la Aequorea. Esta mutación tiene un máximo de
excitación de 481 nm y un máximo de emisión a 506 nm.
La expresión de la GFP o de sus variantes
fluorescentes en células vivas proporciona una herramienta valiosa
para estudiar eventos celulares y es bien conocido que muchas
células, incluyendo células de mamíferos, se incuban a
aproximadamente 37ºC para asegurar un crecimiento óptimo y/o
fisiológicamente relevante. Las líneas de células que se originan
de organismos o tejidos diferentes pueden tener temperaturas
relevantes que oscilan desde aproximadamente 35ºC para los
fibroblastos hasta a aproximadamente 38º - 39ºC para las células
\beta del ratón. Sin embargo, la experiencia ha demostrado que la
señal fluorescente de las células que expresan GFP es débil o
ausente cuando dichas células se incuban a temperaturas por encima
de la temperatura ambiente véase Webb, C.D. y colaboradores,
Journal of Bacteriology, octubre 1995, pág. 5906 - 5911; Ogawa H. y
colaboradores, Proc. Natl. Acad. Sci. USA, Vol. 92, pág. 11899 -
11903, diciembre 1995, y Lim y colaboradores J. Biochem, 118, 13 -
17 (1995). La variante S65T fluorescente mejorada descrita por Heim
y asociados (1995) ut supra también muestra una
fluorescencia muy baja cuando se incuba bajo condiciones de cultivo
normales (37ºC), véase Kaether y Gerdes FEBS Letters 369 (1995)
pág. 267 - 271. Muchos procedimientos que comprenden el estudio del
metabolismo celular dependen de la posibilidad de incubar las
células a temperaturas fisiológicamente relevantes, es decir,
temperaturas de aproximadamente 37ºC.
Trastrup y asociados (1997) EP 0 851 874
describen proteínas fluorescentes que exhiben alta fluorescencia en
las células que las expresan cuando dichas células se incuban a una
temperatura de 30ºC o superior. Esto se obtiene mutando el
aminoácido en la posición 1 que precede al cromóforo. Ejemplos de
tales mutaciones son F64L, F641, F64V, F64A y F64G.
Varios autores han experimentado con
combinaciones de mutaciones. Una de tales combinaciones es la GFP
F64L, S65T (EGFP). La EGFP exhibe alta fluorescencia cuando se
expresa a 30ºC o más y tiene un máximo de excitación a 488 nm.
La presente invención suministra nuevas
proteínas fluorescentes, tales como F64L - E222G - GFP que dan como
resultado una fluorescencia celular que excede de lejos la
fluorescencia celular cuando se expresan a 37ºC y cuando se excitan
a entre 450 y 500 nm en comparación con las proteínas padres, es
decir, la GFP, la variante azul Y66H-GFP, la
variante S65T-GFP y la F64L-GFP.
Esto mejora enormemente la utilidad de las proteínas fluorescentes
en el estudio de las funciones celulares en células vivas.
Se muestra que la GFP mutada en la posición 64
entre F y L (F64L) y en la posición 222 entre E y G (E222G) tiene
propiedades remarcables. Primero se muestra que la
F64L,E222G-GFP tiene un espectro completamente
diferente al de la F64L,S65T-GFP (ejemplo 2). En
contraste, no hay diferencia substancial entre las características
de pliegue (medidas como el momento cuando se observa la
fluorescencia entre dos GP (ejemplo 3)). De forma similar, no había
diferencias entre la sensibilidad al pH de las dos GFP (ejemplo 4).
El brillo observado de la E222G frente a las
F64L-GFP mutadas en S65T depende de las condiciones
de prueba (ejemplo 5).
Un aspecto de la presente invención se refiere a
una proteína fluorescente derivada de la proteína fluorescente
verde (GFP) o a cualquier análogo funcional, en el que el aminoácido
de la posición 1 que precede al cromóforo se ha mutado y en el que
el ácido glutámico de la posición 222 se ha mutado, dicha GFP mutada
tiene un máximo de excitación a una longitud de onda mayor en
comparación con la F64L-GFP y la fluorescencia
aumenta cuando la GFP mutada se expresa en células incubadas a una
temperatura de 30ºC o superior en comparación con la GFP de tipo
natural.
Las características de excitación y emisión de
la F64L,E222G-GFP se diferencia significativamente
de la GFP de tipo natural y de la EGFP. Las proteínas fluorescentes
existentes han demostrado su utilidad en aplicaciones de
investigación tales como la microscopía de fluorescencia
cuantitativa (Patterson, G.H. y colaboradores (1997). Biophysical
J. 73:2782 - 2790; Piston, D.W. y colaboradores (1999) Meth. Cell
Biol. 58:31 - 48). Sin embargo, ahora está claro que las
características óptimas de las proteínas fluorescentes para las
aplicaciones de selección de alto rendimiento (HTS) en la búsqueda
de medicamentos se diferencian un tanto de aquellas para las
aplicaciones de investigación (Kain, S. R. (1999) Drug Discovery
Today 4:304 - 312). Por ejemplo, factores tales como una óptima
relación de señal/ruido son más importantes para las aplicaciones de
HTS en la investigación de medicamentos que el brillo absoluto de
sondas tales como las proteínas fluorescentes. La
F64L,E222G-GFP descrita en esta solicitud de patente
tiene un máximo de excitación a 470 nm y un máximo de emisión a 505
nm (consulte la figura 3), en comparación con los respectivos
máximos de excitación y emisión de 490 nm y 510 nm para la EGFP.
Esto da como resultado un desplazamiento de Stokes de 35 nm para la
F64L,E222G-GFP, en comparación con los 20 nm para
la EGFP. Esto da como resultado un aumento significativo de la banda
de excitación - emisión para la F64L,E222G-GFP con
relación a la EGFP con varias implicaciones para el uso de la
F64L,E222G-GFP en la selección de alto rendimiento.
Algunos de estos factores se relacionan a continuación:
- 1.
- El desplazamiento de Stokes incrementado para la F64L,E222G-GFP da como resultado una resolución espectral mayor de sus picos de excitación y emisión. Esto hace posible una separación de banda más completa usando un divisor de rayo dicroico convencional, y una señal de fondo menor para ensayos que incorporen la F64L,E222G-GFP con relación a los ensayos basados en la EGFP.
- 2.
- La fluorescencia de la F64L,E222G-GFP puede excitarse mediante fuentes de luz convencionales usando filtros de banda estrecha o líneas de producción láser comercialmente disponibles a 472 nm. En cualquier caso, el mayor desplazamiento de Stokes de la F64L,E222G-GFP da como resultado menores interferencias de la luz de excitación para el vértice del espectro de emisión.
- 3.
- El máximo de excitación para la F64L,E222G-GFP cae a medio camino entre la variante de la proteína fluorescente cian (ECFP, máximo de excitación a aproximadamente 433 nm) y la variante de la proteína fluorescente amarilla (EYFP, máximo de excitación a aproximadamente 513 nm). A causa de ello, permitirá una separación de banda más limpia cuando se use junto con esas sondas y se optimiza para aplicaciones de ensayo en las cuales serán multiplexados varios componentes etiquetados con GFP.
\vskip1.000000\baselineskip
Existen muchas fuentes de GFP. Son ejemplos la
GFP derivada de la Aequorea victoria y la GFP derivada de la
Renilla. Se han aislado diferentes GFP a partir de la
Renilla, son ejemplos la reniformis y la
mulleri. Tal como se describe en los ejemplos y en los de
Identificadores de Secuencias Núm. 3 y 4, el cromóforo en la
Aequorea victoria está en la posición 65 - 67 de la secuencia
de aminoácidos primaria predicha de la GFP. Así, en una realización
preferida, la GFP se deriva de la Aequorea victoria.
Es preferible que la mutación en F64 sea una
mutación en un aminoácido alifático. Son ejemplos la F64L, F641,
F64V, F64A y F64G, de las que la preferida es la sustitución F64L.
Sin embargo, en la invención también se incluyen otras mutaciones,
por ejemplo deleciones, inserciones o modificaciones
post-traduccionales que preceden de forma inmediata
al cromóforo, teniendo en cuenta que dan como resultado propiedades
de fluorescencia mejoradas de las diferentes proteínas
fluorescentes. Debe observarse que las deleciones extensivas pueden
dar como resultado la pérdida de las propiedades de fluorescencia
de la GFP.
Se prefieren las sustituciones E222G, E222A,
E222V, E222L, E2221, E222F, E222S, E222T, E222N, E222Q, siendo la
preferida la sustitución E222G (que es una sustitución para la
glicina).
\newpage
Una secuencia preferida del gen que codifica la
GFP derivada de la Aequorea victoria se presenta en el
Identificador de Secuencia Núm. 3 (mejorada) y en el Identificador
de Secuencia Núm. 7 (medusa). El Identificador de Secuencia Núm. 1
muestra la secuencia de nucleótidos de la F64L-GFP
con codón humanizado. El Identificador de Secuencia Núm. 5 muestra
la secuencia de nucleótidos de la F64L-GFP con codón
de medusa. Además, las nuevas proteínas fluorescentes también
pueden derivarse de otras proteínas fluorescentes tal como se
mencionó anteriormente.
De aquí en adelante las abreviaturas usadas para
los aminoácidos son aquellas establecidas en J. Biol. Chem. 243
(1968), 3558.
Un aspecto de la invención se refiere a una
secuencia que codifica la proteína fluorescente
F64L-E222G-GFP. Un ejemplo de dicha
F64L-E222G-GFP se muestra en la
lista 2. En un aspecto preferido la secuencia de nucleótidos tiene
la forma de una secuencia de ADN.
El constructo de ADN de la invención que
codifica las nuevas proteínas fluorescentes puede prepararse
sintéticamente mediante procedimientos estándar establecidos, por
ejemplo el procedimiento de las fosfoamiditas descrito por Beaucage
y Caruthers, Tetrahedron Letters 22 (1981), 1859 - 1869, o el
procedimiento descrito por Matthes y colaboradores, EMBO Journal 3
(1984), 801 - 805. De acuerdo con el procedimiento de las
fosfoamiditas, se sintetizan oligonucleótidos, por ejemplo en un
sintetizador de ADN automático, se purifican, se hibridizan, se
ligan y se clonan en vectores adecuados.
El constructo de ADN también puede prepararse
mediante la reacción de la cadena de polimerasa (PCR) usando
cebadores específicos, por ejemplo tal como se describe en el
documento US 4.683.202 o por Saiki y colaboradores, Science 239
(1988), 487 - 491. Una revisión más reciente de los procedimientos
de la PCR pueden encontrarse en PCR Protocols, 1990, Academic
Press, San Diego, California, EE.UU.
El constructo de ADN de la invención puede
insertarse dentro de un vector recombinante que puede ser cualquier
vector que pueda exponerse de forma adecuada a procedimientos
recombinantes de ADN. La selección del vector depende a menudo de
la célula anfitriona dentro de la cual tiene que introducirse. Así,
el vector puede ser un vector de replicación autónoma, es decir un
vector que exista como una entidad extracromosómica, cuya
replicación depende de la replicación cromosómica, por ejemplo un
plásmido. Alternativamente, el vector puede ser uno que, cuando se
introduce dentro de una célula anfitriona, se integra dentro del
genoma de la célula anfitriona y se replica junto con los
cromosomas dentro de los cuales se ha integrado.
El vector es preferiblemente un vector de
expresión en el cual la secuencia de ADN que codifica la proteína
fluorescente de la invención está operativamente enlazada con
segmentos adicionales necesarios para la transcripción del ADN. En
general, la expresión vector se deriva de ADN plásmido o viral o
puede contener elementos de ambos. El término "operativamente
enlazado" indica que los segmentos están dispuestos de manera que
funcionan de acuerdo con los propósitos previstos, por ejemplo la
transcripción se inicia en un promotor y continúa a través de la
secuencia de ADN que codifica la proteína fluorescente de la
invención.
El promotor puede ser cualquier secuencia de ADN
que muestre actividad transcripcional en la célula anfitriona de
elección y puede derivarse de los genes que codifican proteínas bien
homólogas o bien heterólogas para la célula anfitriona, incluyendo
los genes nativos de la GFP de la Aequorea.
Ejemplos de promotores adecuados para dirigir la
transcripción de la secuencia de ADN que codifica la proteína
fluorescente de la invención en células de mamíferos son el promotor
SV40 (Subramani y colaboradores, Mol. Cell Biol. 1 (1981), 854 -
864), el promotor MT-1 (gen de la metalotioneina)
(Palmiter y colaboradores, Science 222 (1983), 809 - 814) o el
principal promotor tardío del adenovirus 2.
Un ejemplo de un promotor adecuado para su uso
en células de insectos es el promotor de la polihedrina (US
4.745.051; Vasuvedan y colaboradores, FEBS Lett. 311, (1992) 7 -
11), el promotor del P10 (J.M. Vlak y colaboradores, J. Gen.
Virology 69 1998, pág. 765 - 776), el promotor de la proteína básica
del virus de la polihedrosis, Autographa californica (EP 397
485), el promotor del gen 1 temprano inmediato del baculovirus (US
5.155.037; US 5.162.222) o el promotor del gen retrasado - temprano
39K del baculovirus (US 5.155.037; US 5.162.222).
Ejemplos de promotores adecuados en células
anfitrionas de levadura incluyen promotores de los genes
glicolíticos de la levadura (Hitzeman y colaboradores, J. Biol.
Chem. 255 (1980), 12073 - 12080; Alber y Kawasaki, J. Mol. Appl.
Gen 1 (1982), 419 - 434) o los genes de la dehidrogenasa del alcohol
(Young y colaboradores, en Genetic Engineering of Microorganisms
for Chemicals (Hollaender y colaboradores, eds.), Plenum Press,
Nueva York, 1982) o los promotores del TP11 (US 4.599.311) o
del ADH2-4c (Russell y colaboradores, Nature
304 (1983), 652 - 654).
Ejemplos de promotores adecuados para su uso en
células anfitrionas de hongos filamentosos son, por ejemplo, el
promotor del ADH3 (McKnight y colaboradores, the EMBO J.4
(1985), 2093 - 2099) o el promotor del tpiA. Ejemplos de
otros promotores adecuados son aquellos derivados del gen que
codifica la TAKA amilasa del A. oryzae, la proteinasa
aspártica del Rhizomucor miehei, la
\alpha-amilasa neutra del A. Níger, la
\alpha-amilasa estable al ácido del A.
Níger, la glucoamilasa (gluA) del A. Níger o del A.
awamori, la lipasa del Rhizomucor miehei, la proteasa
alcalina del A. oryzae, la isomerasa de fosfato de triosa
del A. oryzae o la acetamidasa del A. nidulans. Se
prefieren los promotores de la TAKA amilasa y de la gluA.
Ejemplos de promotores adecuados para su uso en
células anfitrionas bacterianas incluyen el promotor del gen de la
amilasa maltogénica del Bacillus stearothermopohilus, el gen
de la \alpha-amilasa del Bacillus
licheniformis, el gen de la BAN - amilasa del Bacillus
amyloliquefaciens, el gen de la proteasa alcalina del
Bacillus subtilis, o el gen de la xilosidasa del Bacillus
pumilus o por los promotores Lambda P_{R} o P_{L} del
fago o los promotores lac, trp o tac del
E. coli.
E. coli.
La secuencia de ADN, que codifica las nuevas
proteínas fluorescentes de la invención, si fuera necesario, puede
estar también operativamente conectada con un terminador adecuado,
tal como un terminador de la hormona humana del crecimiento
(Palmiter y colaboradores, obra citada) y (para anfitriones
fungales) los terminadores TPl1 (Alber y Kawasaki, obra
citada) o ADH3 (McKnight y colaboradores, obra
citada). El vector puede comprender además elementos tales como
señales de poliadenilación (por ejemplo a partir de SV40 o de la
región Elb del adenovirus 5), secuencias potenciadoras
transcripcionales (por ejemplo el potenciador del SV40) y secuencias
potenciadoras traduccionales (por ejemplo las que codifican ARN del
adenovirus VA).
El vector recombinante puede comprender además
una secuencia de ADN que posibilite la replicación del vector en la
célula anfitriona en cuestión. Un ejemplo de dicha secuencia (cuando
la célula anfitriona es una célula de mamífero) es el origen SV40
de replicación.
Cuando la célula anfitriona es una célula de
levadura, las secuencias adecuadas que posibilitan la replicación
del vector son los genes REP 1 - 3 de replicación de plásmidos
2\mu de la levadura y el origen de la replicación.
El vector también puede comprender un marcador
selectivo, por ejemplo un gen cuyo producto complemente un defecto
en la célula anfitriona, tal como el gen que codifica la reductasa
de dihidrofolato (DHFR) o el gen TPI del Schizosaccharomyces
pombe (descrito por P.R. Russell, Gene 40, 1985, pág. 125 - 130)
o uno que confiera resistencia a un medicamento, por ejemplo la
ampicilina, la kanamicina, la tetraciclina, el cloramfenicol, la
neomicina o la higromicina. Para los hongos filamentosos, los
marcadores selectivos incluyen amdS, pyrG, argB, niaD,
sC.
Los procedimientos utilizados para ligar las
secuencias de ADN que codifican la proteína fluorescente de la
invención, el promotor y opcionalmente el terminador y/o la
secuencia de la señal secretora, respectivamente, y para
insertarlas dentro de vectores adecuados que contengan la
información necesaria para la replicación, son bien conocidos por
las personas expertas en la materia (consulte, por ejemplo, Sambrook
y colaboradores, obra citada).
La célula anfitriona dentro de la cual se
introduce el constructo de ADN o el vector recombinante de la
invención puede ser cualquier célula que sea capaz de expresar el
presente constructo de ADN e incluye bacterias, levaduras, hongos y
células eucarióticas mayores.
Ejemplos de células anfitrionas bacterianas que,
mediante cultivo, son capaces de expresar el constructo de ADN de
la invención son las bacterias gram positivas, por ejemplo cepas de
Bacillus, tales como B. subtilis, B. licheniformis, B.
lentus, B. brevis, B. stearothermophilus, B. alkalophilus, B.
amyloliquefaciens, B. coagulans, B. cirulans, B. lautus, B.
megatherium o B. thurigiensis, cepas del
Streptomyces, tal como el S. lividans o S. murinus, o
bacterias gram negativas tales como el Scherichia coli. La
transformación de la bacteria puede efectuarse mediante
transformación de protoplastos o mediante el uso de células
competentes de una manera conocida per se (consulte,
Sambrook y colaboradores, supra).
Ejemplos de líneas de células de mamíferos
adecuadas son la HEK293 y las líneas de células primarias y las
líneas de células COS (por ejemplo ATCC CRL 1650), BHK (por ejemplo,
ATCC CRL 1632, ATCC CCL 10), CHL (por ejemplo, ATCC CCL39) o CHO
(por ejemplo, ATCC CCL 61). Procedimientos para transfectar células
de mamíferos y expresar secuencias de ADN introducidas en las
células se describen, por ejemplo en Kaufman y Sharp, J. Mol. Biol.
159 (1982), 601 - 621; Southern y Berg, J. Mol. Appl. Genet, 1
(1982), 327 - 341; Loyter y colaboradores, Proc, Natl. Acad. Sci.
USA 79 (1982), 422 - 426, Wigler y colaboradores, Cell 14 (1978),
725; Corsaro y Pearson, Somatic Cell Genetics 7 (1981), 603, Graham
y van der Eb, Virology 52 (1973), 456; y Neumann y colaboradores,
EMBO J. 1 (1982), 841 - 845.
Ejemplos de células de levadura adecuadas
incluyen las células del Saccharomyces spp. O
Schizosaccharomyces spp., en particular cepas del
Saccharomyces cerevisiae o Saccharomyces kluyveri.
Procedimientos para transformar células de levadura con ADN
heterólogo y producir polipéptidos heterólogos a partir de las
mismas se describen, por ejemplo, en los documentos US 4.599.311,
US 4.931.373, US 4.870.008, US 5.037.743 y US 4.845.075, todos los
cuales se incorporan aquí por referencia. Las células transformadas
se seleccionan mediante un fenotipo determinado mediante un
marcador seleccionable, comúnmente resistente a los medicamentos o
mediante la habilidad de crecer en la ausencia de un nutriente en
particular, por ejemplo la leucina. Un vector preferido para su uso
en la levadura es el POT1 desvelado en el documento US 4.931.373. La
secuencia de ADN que codifica la proteína fluorescente de la
invención puede estar precedida por una secuencia de señal y
opcionalmente una secuencia guía, por ejemplo según se ha descrito
anteriormente. Además, ejemplos de células de levadura adecuadas
son las cepas del Kluveromyces, tal como K. lactis, de
la Hansenula, por ejemplo la H. polymorpha, o del
Pichia, por ejemplo P. patoris (Consulte Gleeson y
colaboradores, J. Gen. Microbiol. 132. 1986, pág. 3459 - 3465, y el
documento
US 4.882.279).
US 4.882.279).
\newpage
Ejemplos de otras células fungales son las
células de hongos filamentosos, por ejemplo el Aspergillus
spp., el Neurospora spp., el Fusarium spp. o el
Trichoderma spp., en particular cepas del A. oryzae,
del A. nidulans o del A. Níger. El uso del
Aspergillus spp. para la expresión de proteínas se describe,
por ejemplo, en los documentos EP 272 277, EP 230 023, EP 184
438.
Cuando se usa un hongo filamentoso como célula
anfitriona, puede estar transformado con el constructo de ADN de la
invención, de forma adecuada integrado el constructo de ADN en el
cromosoma anfitrión para obtener una célula anfitriona
recombinante. Generalmente esta integración se considera una ventaja
ya que la secuencia de ADN probablemente se mantendrá estable en la
célula. La integración de los constructos de ADN dentro del
cromosoma anfitrión puede realizarse de acuerdo con procedimientos
convencionales, por ejemplo mediante recombinación homóloga o
heteróloga.
La transformación de células de insectos y la
producción de polipéptidos heterólogos en las mismas pueden
realizarse según se describe en los documentos US 4.745.051, US
4.879.236, US 5.155.037, 5.162.222, EP 397.485, todos los cuales se
incorporan aquí por referencia. La línea de células de insectos
utilizada como anfitriona puede ser de forma adecuada una línea de
células del Lepidoptera tales como células del
Spodoptera frugiperda o células del Trichoplusia
ni (consulte el documento US 5.077.214). Las condiciones de
cultivo pueden ser de forma adecuada como las descritas, por
ejemplo, en los documentos WO 89/01029 o WO 89/01028 o en
cualquiera de las referencias antes mencionadas.
Un aspecto de la invención se refiere a un
anfitrión transformado con un constructo de ADN de acuerdo con
cualquiera de los aspectos precedentes. La célula anfitriona
transformadas o transfectada descrita anteriormente se cultiva
entonces en un medio nutriente adecuado bajo condiciones que
permitan la expresión del constructo de ADN presente, después de lo
cual las células pueden utilizarse en el procedimiento de selección
de la invención. Alternativamente, las células pueden ser alteradas
después de lo cual los extractos y/o los sobrenadantes de células
pueden utilizarse para el análisis de fluorescencia.
El medio utilizado para cultivar las células
puede ser cualquier medio convencional adecuado para el crecimiento
de las células anfitrionas, tal como un medio mínimo o complejo que
contenga suplementos adecuados. Medios adecuados están disponibles
en proveedores comerciales o pueden prepararse de acuerdo con las
fórmulas publicadas (por ejemplo en catálogos de la American Type
Culture Collection).
En el procedimiento de la invención, la
fluorescencia de las células transformadas o transfectadas con el
constructo de ADN de la invención pueden detectarse de forma
adecuada en un espectrómetro o en un microscopio de fluorescencia
donde pueden determinarse las propiedades espectrales de las células
en el cultivo líquido como estudios de excitación y emisión de
luz.
Un aspecto de la invención se refiere a un
compuesto de fusión que consta de una proteína fluorescente
(F64L-E222G-GFP), en el que la
F64L-E222G-GFP está enlazada con un
polipétido. Un Ejemplo de dicho polipéptido es la quinasa,
preferiblemente la subunidad catalítica de la proteína quinasa A o
de la proteína quinasa C o de la Erk1, o de un elemento
citoesquelético.
La invención se refiere además a un proceso para
preparar un polipéptido, que comprende el cultivo de un anfitrión
de acuerdo con cualquiera de los aspectos precedentes y la obtención
a partir del mismo del polipéptido expresado por dicha secuencia de
nucleótidos.
Los diferentes aspectos de la invención tienen
gran cantidad de usos. Algunos de los cuales se describe a
continuación:
Uso de la F64L- 222G-GFP en un
ensayo in vitro para la medición de la actividad de la
proteína quinasa o de la actividad de desfosforilación o para la
medición de la redistribución de proteínas.
Uso de la
F64L-E222G-GFP como una etiqueta de
proteínas en células vivas y fijadas. Debido a la fuerte
fluorescencia, las nuevas proteínas son etiquetas adecuadas para
proteínas presentes en bajas concentraciones. Ya que no se necesita
un substrato y la visualización de las células no daña a la células,
pueden realizarse análisis dinámicos.
Uso como una etiqueta de orgánulos. Puede
etiquetarse más de un orgánulo y visualizarse simultáneamente en
células vivas, por ejemplo el retículo endoplásmico y el
citoesqueleto.
Uso como marcador de secreción. Mediante la
fusión de la F64L-E222G-GFP con un
péptido señal o un péptido a ser secretado, puede seguirse en línea
la secreción en células vivas. Una condición previa para ello es
que la maduración de un número detectable de moléculas de la nueva
proteína fluorescente se produzca más rápido que la secreción.
Uso como indicador genético o etiqueta de
proteínas en animales transgénicos. Debido a la fuerte florescencia
de las nuevas proteínas, son adecuadas como etiquetas para proteínas
y para la expresión genética, ya que la relación señal/ruido está
significativamente mejorada en relación con las proteínas de la
técnica anterior, tales como las GFP de tipo natural.
Uso como un marcador de la integridad de una
célula o de un orgánulo. Mediante la coexpresión de dos de las
nuevas proteínas, una etiquetada en un orgánulo y la otra expresada
en el citosol, es posible calcular la pérdida relativa de la
proteína citosilíca y utilizar esto como una medición de la
integridad de la célula.
Uso como marcador de cambios en la morfología
celular. La expresión de las nuevas proteínas en las células
permite la fácil detección de cambios en la morfología de las
células, por ejemplo la vesiculación, provocada por agentes
citotóxicos o la apoptosis. Dichos cambios morfológicos son
difíciles de visualizar en células intactas sin el uso de sondas
fluorescentes.
Uso como marcador de transfección y como un
marcador a utilizar en combinación con la clasificación FACS.
Debido al incremento de brillo de las nuevas proteínas, puede
mejorarse significativamente la calidad de la detección y
clasificación de las células.
Uso como sonda en tiempo real que funciona en
concentraciones casi fisiológicas. Ya que la
F64L-E222G-GFP es
significativamente más brillante que la GFP de tipo natural y que la
F64L-GFP cuando se expresa en células a
aproximadamente 37ºC y se excita con luz a aproximadamente 490 nm,
puede disminuirse la concentración necesaria para la visualización.
Los sitios diana para enzimas genéticamente modificadas dentro de
las nuevas proteínas, por ejemplo la
F64L-E222G-GFP, pueden estar por lo
tanto presentes en la célula a bajas concentraciones en células
vivas. Esto es importante por dos razones: (1) la sonda debe
interferir lo menos posible con el proceso intracelular que está
siendo estudiado; (2) debe estresarse mínimamente el aparato
traduccional y transcripcional.
Las nuevas proteínas pueden utilizarse como
marcadores para monitorizar la biomasa viva/muerta de organismos,
tales como los hongos. Mediante la expresión constitutiva de la
F64L-E222G-GFP en los hongos, puede
alumbrarse la biomasa viable.
Puede realizarse la mutagénesis de vectores de
transposón usando las nuevas proteínas como marcadores en fusiones
transcripcionales y traduccionales.
Los transposones pueden utilizarse en
microorganismos que codifican las nuevas proteínas. Los transposones
pueden construirse mediante fusiones traduccionales y
transcripcionales. Se utilizan para la selección de promotores.
Los vectores de transposones que codifican las
nuevas proteínas, tales como la
F64L-E222G-GFP, pueden utilizarse
para etiquetar plásmidos y cromosomas.
Uso como marcador para la detección bacteriana
mediante la introducción de las nuevas proteínas dentro del genoma
de bacteriófagos.
Modificando genéticamente las nuevas proteínas,
por ejemplo la F64L-E222G-GFP,
dentro del genoma de un fago puede diseñarse una herramienta de
diagnóstico. La F64L-E222G-GFP se
expresará solamente una vez efectuada la transfección del genoma
dentro de un anfitrión vivo. La especificidad del anfitrión viene
definida por el bacteriófago.
La invención se ilustra adicionalmente en los
siguientes ejemplos con referencia a las relaciones de secuencias
adjuntas.
Los códigos PS se explican en la Tabla 2.
Espectro de excitación de PS1189 (máximo de
excitación a 492 nm), PS1191 (máximo de excitación a 468 nm),
PS1185 (máximo de excitación a 490 nm) y PS1186 (máximo de
excitación a 473 nm). Las emisiones se grabaron a 560 nm. Las
muestras de PS1189 y PS1191 fueron diluidas dos veces y las muestras
de PS1185 y PS1186 fueron diluidas diez veces.
Espectro de emisión de PS1189 (máximo de de
emisión a 509 nm), PS1191 (máximo de emisión a 505 nm), PS1185
(máximo de emisión a 510 nm) y PS1186 (máximo de emisión a 506 nm).
La excitación estaba a 430 nm. Las muestras de PS1189, PS1191 y
PS1185 se diluyeron dos veces y la muestra de PS1186 se diluyó 10
veces. Las curvas para PS1189 y PS1191 se relacionan con el eje y
primario mientras que las curvas para PS1185 y PS1186 se relacionan
con el eje y secundario.
Superposición de espectros de excitación (Ex) y
emisión (Em) de PS1189 (panel A), PS1191 (panel B), PS1185 (panel
C)y PS1186 (panel D). La curva de excitación a la izquierda y
la curva de excitación a la derecha se relacionan con los ejes y
primario y secundario, respectivamente.
Esta figura muestra las imágenes recogidas
después de la transfección con Lipofectamine 2000. La eF64L,E222G
(PS699) está en la parte superior de la columna de la derecha
denominada E222G, la eF64L,S65T-GFP (PS279) está en
la parte superior de la columna de la izquierda denominada EGFP.
Comparación de la sensibilidad al pH de la EGFP
(PS279) y la eF64L,E222G-GFP (PS699).
\vskip1.000000\baselineskip
Los plásmidos pEGFP-M1 (núm. de
acceso del GenBank U55762) y pEGFP-C1 (núm. de
acceso del GenBank U55763) contienen ambos un derivado de la GFP en
el cual se ha añadido un aminoácido extra en la posición dos para
administrar una mejor secuencia de inicio traduccional (una
secuencia Kozak) y así el número total de aminoácidos aumenta en
uno hasta 239 en vez de los 238 hallados en la GFP de tipo natural.
Por lo tanto, la denominación de las mutaciones en la GFP en estos
plásmidos de forma estricta debe denominarse, por ejemplo, F65L en
vez de F64L. Sin embargo, para evitar esta fuente de confusión y a
causa de que la GFP habitualmente ha adoptado el sistema de
numeración de la GFP de tipo natural en sus comunicaciones, los
números aquí utilizados se adaptan a la denominación comúnmente
usada de las mutaciones de la GFP de tipo natural. Mutaciones
relevantes a este respecto son F64L, F65T y E222G.
Los plásmidos pEGFP-N1 y
pEGFP-C1 contienen las siguientes mutaciones en el
cromóforo: F64L y F65T. El uso del codón de la secuencia de ADN de
la GFP se ha optimizado para la expresión en células de mamífero. N1
y C1 se refieren a la posición de múltiples sitios de clonación con
relación a la secuencia de la GFP.
Para construir un plásmido combinando F64L y
E222G, pEGFP-N1 y pEGFP-C1 primero
se expusieron a la PCR con los cebadores 9859 y 9860 descritos a
continuación. Los cebadores son complementarios de la secuencia de
ADN alrededor de la región del cromóforo e introducen un punto de
mutación que cambia la treonina en la posición 65 por serina.
Además, los cebadores introducen un único sitio de restricción Spe1
mediante mutación silenciosa. Los productos de la PCR de 4,7 kb
fueron digeridos con Spe1, religados y transformados dentro del
E. colli. Los plásmidos resultantes se denominaron PS399
(contexto N1) y PS401 (contexto C1). Estos plásmidos contienen la
secuencia de cromóforo 64-LSYG-67.
Los plásmidos PS399 y PS401 se expusieron a una mutagénesis
QuickChange (Stratagene) empleando PCR con los cebadores 0225 y
0226 descritos posteriormente. Estos cebadores son complementarios
de las secuencias cercanas al terminal C de la GFP y cambian el
glutamato en la posición 222 por glicina y además introducen un
sitio de restricción Avr2 mediante mutación silenciosa. Los
plásmidos resultantes se denominan PS699 (contexto N1) y PS701
(contexto C1). Combinan un cromóforo de LSYG con E222G con codón
humanizado y se denomina eF64L,E222G (consulte el listado de
secuencias 2) 9859-superior:
5'-TG
TACTAGTGACCACCCTGTCTTACGGCGTGCA-3' 9860-inferior: 5'-CTGACTAGTGTGGGCCAGGGCACGGG
CAGC-3' 0225-inferior: 5'-CCCGGCGGCGGTCACGAACCCTAGGAGGACCATGTGATCGCG-3' 0226-superior: 5'-CGCGATCACATGGTCCTCCTAGGGTTCGTGACCGCCGCCGGG-3'
TACTAGTGACCACCCTGTCTTACGGCGTGCA-3' 9860-inferior: 5'-CTGACTAGTGTGGGCCAGGGCACGGG
CAGC-3' 0225-inferior: 5'-CCCGGCGGCGGTCACGAACCCTAGGAGGACCATGTGATCGCG-3' 0226-superior: 5'-CGCGATCACATGGTCCTCCTAGGGTTCGTGACCGCCGCCGGG-3'
Un plásmido que codifica una GFP directamente
derivada de la medusa con F64L (desvelado en la figura 4 del
documento WO 97/11094) se expuso a la PCR con los cebadores 9840 y
9841 posteriormente descritos. El producto de la PCR fue digerido
con las enzimas de restricción Age1 y Acc65 y se ligó dentro del
pEGFP-N1 digerido con Age y BsrG1. Esto sustituye
la EGFP con F61L-GFP y se introduce un cambio en el
aminoácido L236G cerca del terminal C como consecuencia de unir los
sitios Acc65 y BsrG1. Este plásmido se denomina PS350.
\newpage
Un plásmido que codifica una GFP derivada
directamente de la medusa con F64L, 65T (desvelado en la figura 5
del documento WO 97/11094) se expuso a la PCR con los cebadores 9840
y 9841 posteriormente descritos. El producto de la PCR fue digerido
con las enzimas de restricción Age1 y Acc65 y se ligó dentro del
pEGFP-N1 digerido con Age1 y BsrG1. Esto sustituye
la EGFP con F61L,S65T-GFP e introduce un cambio en
el aminoácido L236G cerca del terminal C como consecuencia de unir
los sitios Acc65 y BsrG1. Este plásmido se denomina PS351.
El plásmido PS350 se expuso a una PCR
QuickChange (Stratagene) con los cebadores 0317 y 0318
posteriormente descritos. Esto introduce E222G por mutación y un
sitio de restricción Avr2 mediante mutación silenciosa. Este
plásmido se denomina PS832.
El plásmido PS832 se expuso a una PCR
QuickChange (Stratagene) con los cebadores 0325 y 0326
posteriormente descritos. Esto introduce L64F por mutación y un
sitio de restricción Psp1406 mediante mutación silenciosa. Este
plásmido se denomina PS845.
Un plásmido que codifica una GFP directamente
derivada de la medusa (desvelado en la figura 2a del documento WO
97/11094) se expuso a una PCR con los cebadores 9840 y 9841
posteriormente descritos. El producto de la PCR fue digerido con
las enzimas de restricción Age1 y Acc65 y se ligó dentro del
pEGFP-N1 digerido con Age1 y BsrG1. Esto sustituye
la EGFP con GFP de tipo natural e introduce un cambio en el
aminoácido L236G cerca del terminal C como consecuencia de unir los
sitios Acc65 y BsrG1. Este plásmido se denomina PS854.
El plásmido PS399 se expuso a una PCR
QuickChange (Stratagene) con los cebadores 0327 y 0328
posteriormente descritos. Esto introduce L64F mediante mutación y
un sitio de restricción Psp1406 mediante mutación silenciosa. Este
plásmido se denomina PS844.
El plásmido PS699 se expuso a una PCR
QuickChange (Stratagene) con los cebadores 0327 y 0328
posteriormente descritos. Esto introduce L64F por mutación y un
sitio de de restricción Psp1406 mediante mutación silenciosa. Este
plásmido se denomina PS846.
Plásmidos que codifican las GFP en un contexto
de codón de medusa (PS350, PS351, PS832, PS845, PS854) se expusieron
a la PCR con los cebadores 1259 y 1260 posteriormente descritos.
Los productos de la PCR de 0,8 kb se cortaron con las enzimas de
restricción BspH1 y BamH1 y se ligaron dentro del vector de
expresión del E. coli pTrcHis (de Invitrogen) cortado con
Nco1 y BamH1. Esto coloca las GFP bajo el control del promotor
inducible por ITPG en el vector. El cebador inferior 1260 cambia
también la glicina en la posición 236 de nuevo a leucina. Los
plásmidos resultantes son denominados PS1184
(jf-F64L-E222G), PS1185
(jf-F64L,S65T-GFP), PS1186
(jf-F64L,E222G-GFP), PS1187
(jf-E222G-GFP) y PS
(jf-GFP).
Los plásmidos que codifican las GFP en un
contexto de codón humanizado mejorado (PS279 =
pEGFP-N1 (Clontech), PS399, PS699, PS844, PS846) se
expusieron a una PCR con los cebadores 1261 y 1262 posteriormente
descritos. Los productos de la PCR de 0,8 kb se cortaron con
enzimas de restricción Nco1 y BamH1 y se ligaron dentro del vector
de expresión del E. Coli pTrcHis (de Invitrogen) cortado con
Nco1 y BamH1. Esto sitúa las GFP bajo el control del promotor
inducible por ITPG en el vector. Los plásmidos resultantes son
denominados PS1189 (e-F64L,S65T-GFP
= EGFP), PS1190 (e-E222G-GFP),
PS1191 (e-F64L,E222G-GFP), PS1192
(e-GFP) yPS1193
(e-E222G-GFP).
Los plásmidos anteriormente descritos se
transformaron en la cepa del E. coli DH5alfa (Life
Technologies). Se recogieron colonias simples y se hicieron crecer
a lo largo de la noche a 37ºC en un medio LB que contenía 1 mM de
IPTG. Se granularon 0,5 ml de células y se almacenaron a 20ºC hasta
que fueron analizadas.
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
Se transfectaron plásmidos que expresan EGFP a
partir del plásmido pEGP-N1 (también denominado
PS279) y eF64L,E222G a partir del plásmido PS699 dentro de células
TOP10 (Invitrogen) de E. Coli usando Lipofectamine 2000 (de
Life Technologies) de acuerdo con las recomendaciones del
fabricante. Pasados 5 días se recogieron las células y se
resuspendieron en 5 nM de una solución neutralizante de extracción
TRIS (pH 8,0) con 1 nM de DTT. Las células fueron lisadas mediante
3 ciclos de congelación - descongelación. Se centrifugaron los
deshechos celulares a 10.000 g en un centrifugador refrigerado. Se
añadió NaCl hasta 100 nm.
Los gránulos de células se resuspendieron en
1.000 \mul de H_{2}O cada uno (el doble de dilución con relación
a los volúmenes de los cultivos granulados) y se transfirieron a
cubetas de plástico de 1,0 x 0,5 cm y se grabaron los siguientes
espectros de excitación y emisión sobre un espectrómetro de
luminiscencia Perkin Elmer LS50B:
Espectro de excitación:
- \quad
- Excitación a 350 - 525 nm (ancho de segmento 5 nm). Los datos se presentan en la Figura 1. Emisión 560 nm (ancho de segmento 10 nm).
- \quad
- Espectro de emisión a 430 nm (ancho de segmento 10 nm). Los datos se presentan en la Figura 2. Emisión 450 - 550 nm (ancho de segmento 5 nm).
Utilizando los mismos ajustes, se registraron
los espectros de excitación y emisión de células diluidas dos veces
(200 \mul de células diluidas dos ves mezcladas con 800 \mul de
agua) para las muestras fuertemente fluorescentes expresadas a
partir de ADNc con esqueleto de medusa (PS1185 y PS1186).
En contraste con los niveles de expresión, las
propiedades de fluorescencia de las sondas fueron independientes
del uso del codón. Los espectros registrados para las sondas con
Thr65:E222G (PS1185 y PS1189) fueron muy similares (máximos de
excitación y emisión a 490 - 492 nm y 509 – 510 nm, respectivamente)
y con desplazamientos de Strokes de 17 - 20 nm. De forma similar,
los espectros registrados para las sondas con Ser65:G222 (PS1186 y
PS1191) fueron muy similares (máximos de excitación y emisión a 468
- 473 nm y 505 - 506, respectivamente) y con desplazamientos de
Strokes de 33 - 37 nm.
Tres cámaras de dos alvéolos con células CHOhIR
se transfectaron con plásmido PS279 que expresa EGFP y plásmido
PS699 que expresa eF64L,E222G usando el procedimiento de trasfección
de Lipofectamine.
A intervalos regulares, se comprobó la
fluorescencia de las células después de la transfección.
Se usó el procedimiento de transfección
Lipofectamine 2000 para transfectar EGFp y F64L,E222G en una cámara
de 8 alvéolos con células CHOhIR. A intervalos regulares, se
comprobó la fluorescencia de las células después de la
transfección, según se describió anteriormente. Se tomaron imágenes
desde los mismos campos de células en cada intervalo. Se observaron
tres campos diferentes para cada plásmido. Los ajustes del
microscopio y de la cámara fueron iguales para cada imagen. Se tomó
un tiempo de exposición óptimo a partir de cada cámara de células
con expresión de EGFP completa (transfectada 24 horas antes) para
asegurarse de que la exposición no se saturaba. Las primeras
imágenes se tomaron entre 45 minutos y 1 hora después de la
transfección, posteriormente con un intervalo de 30 minutos durante
las primeras 7,5 horas después de la transfección y se recogió una
imagen 26,5 horas después de la transfección. Se observaron cinco
campos diferentes para cada plásmido. Se detectó fluorescencia no
más tarde de 4 horas después de la transfección. Se detectó
fluorescencia en eF64L,E222G en un campo 2,5 horas después de la
transfección. En los campos restantes, se detectó fluorescencia no
más tarde de 4 horas después de la transfección (Figura 4).
\vskip1.000000\baselineskip
Se comprobó la sensibilidad al pH de muestras de
EGFP semipurificada a partir de PS279 y F64L,E222G a partir de
proteínas PS699 producidas en expresión de células COS7 sobre una
banda de entre pH 4,0 y pH 12,5 con intervalos de 0,5 puntos. Se
realizaron estudios de excitación y emisión de cada proteína en
valores de pH entre 4,0 y 12,5. Los estudios dieron como resultado
que el máximo de excitación se obtuvo a 490 nm y el máximo de
emisión se obtuvo a 540 nm para la EFGP y el máximo de excitación
se obtuvo a 475 nm y el máximo de emisión se obtuvo a 504 nm para
la F64L,E222G. Los diferentes valores del pH no afectaron a los
máximos de excitación y emisión. Se realizaron lecturas simples con
excitación a 470 nm, emisión a 510 nm y con segmentos de 10 nm. Los
resultados no muestran diferencias claras entre la EFFP y la
F64F,E222G con respecto a su sensibilidad al pH, excepto las que
pudieran deberse a fluctuaciones aleatorias (Figura 5). Este
experimento se ha repetido esencialmente con los mismos
resultados.
\vskip1.000000\baselineskip
Se construyeron 10 plásmidos que combinan
algunas de las siguientes características:
- -
- F o L en la posición 64.
- -
- S o T en la posición 65.
- -
- E o G en la posición 222.
- -
- Esqueleto de la GFP de "medusa" o "humanizado mejorado".
Los plásmidos se transfectaron dentro de células
CHO. Uno, dos o cuatro días más tarde las células fueron
visualmente inspeccionadas en un microscopio de fluorescencia por
dos personas. La excitación fue 475/40 = luz azul y la emisión 510
- 560 = luz verde. Las células se calificaron sobre una escala de
"verdes" oscilando entre básicamente negro y extremadamente
brillante (Tabla 3). Los resultados no variaron mucho con el
tiempo.
\vskip1.000000\baselineskip
Los plásmidos también fueron transfectados
dentro de células HeLa. Después de una transfección de 24 horas,
las células se dispusieron sobre un citómetro de flujo Calibur FACS
para la caracterización de la totalidad de la fluorescencia de las
células, con excitación a 488 nm y emisión observada con filtro de
fluorescencia fijado en 530/30 nm (entre 515 y 545 nm). Se
recopilaron 10.000 eventos para cada transfección y se llevaron a
cabo 2 replicas para cada constructo. Se obtuvieron las intensidades
medias de la fluorescencia a partir del análisis FACS como media
geométrica (fluorescencia media en escala logarítmica) y los
resultados se muestran en la Tabla 4.
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
Queda claro a partir de la tabla anterior que,
cuando se expresan en la célula HeLa de mamífero, las GFP con codón
humanizado son mucho más brillantes que las GFP con codón de medusa,
siendo las más brillantes la EGFP y la e-BioE222G.
No sorprende que la EGFP sea aproximadamente el doble de brillante
que la E-BioE222G bajo estas condiciones. La
excitación en FACS está en 488 nm, muy cerca del máximo de
excitación de la EGFP en 490 nm. Según se ilustra en la Tabla 5, se
captará por debajo del 97% de la emisión de la EGFP, mientras que
sólo el 86% de la e-BioE222G. Además, la diferencia
entre la intensidad de la EGFP y la e-BioE222G
cuando se excitan en el máximo de excitación de la
e-BioE222G de 470 nm, no es tan pronunciada.
En células de mamífero las GFP mejoradas fueron
más brillantes que las GFP de medusa. En el E. Coli, las GFP
de la medusa fueron más brillantes que las GFP mejoradas. Así,
merece la pena seleccionar con cuidado el esqueleto de la GFP de
acuerdo con el subsiguiente anfitrión.
<110> Biolmage A/S
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<120> Nuevas proteínas fluorescentes
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<130> 25158PC1
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<160> 8
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<170> FastSEQ para Windows versión 3.0
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 1
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 720
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Aequoria Victoria
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> CDS
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)...(717)
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 1
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 2
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 239
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Aequoria Victoria
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 2
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 3
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 720
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Aequoria Victoria
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> CDS
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)...(717)
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 3
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 4
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 239
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Aequoria Victoria
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 4
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 5
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 717
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Aequoria Victoria
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> CDS
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)...(714)
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 5
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 6
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 238
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Aequoria Victoria
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 6
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 7
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 717
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Aequovia Victoria
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> CDS
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)...(717)
\newpage
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 7
\newpage
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 8
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 238
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Aequovia Victoria
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 8
Claims (15)
1. Una proteína fluorescente derivada de la
Proteína Fluorescente Verde (GFP), que comprende una secuencia de
aminoácidos en la que el aminoácido de la posición que se
corresponde con la posición 65 del Identificador de Secuencia núm.:
4 ha sido sustituida por un aminoácido alifático y en la que el
ácido glutámico de la posición que se corresponde con la posición
223 del Identificador de Secuencia núm.: 4 ha sido sustituido por un
aminoácido seleccionado entre el grupo que consta de G, A, V, I, F,
S, T, N y Q, que se caracteriza porque dicha GFP mutada
tiene un máximo de excitación a una longitud de onda mayor y la
fluorescencia se incrementa cuando la GFP mutada se expresa en
células incubadas a una temperatura de 30ºC o superior en
comparación con la GFP de tipo natural.
2. La proteína fluorescente de la reivindicación
1, derivándose dicha proteína de la Aequoria victorea o
Renilla.
3. La proteína fluorescente de acuerdo con una
cualquiera de las reivindicaciones precedentes, en la que el
aminoácido F de la posición 65 de la GFP ha sido sustituido por un
aminoácido seleccionado por el grupo que consta de L, I, V, A y
G.
4. La proteína fluorescente de acuerdo con una
cualquiera de las reivindicaciones precedentes, en la que el
aminoácido F de la posición 65 de la GFP ha sido sustituido por
L.
5. La proteína fluorescente de acuerdo con una
cualquiera de las reivindicaciones precedentes, en la que el
aminoácido E de la posición 223 de la GFP ha sido sustituido por
G.
6. La proteína fluorescente de acuerdo con una
cualquiera de las reivindicaciones precedentes, en la que el
aminoácido F de la posición 65 de la GFP ha sido sustituido por L y
el aminoácido E de la posición 223 de la GFP ha sido sustituido por
G.
7. La proteína fluorescente de acuerdo con una
cualquiera de las reivindicaciones precedentes, que tiene la
secuencia de aminoácido desvelada en el Identificador de Secuencia
núm.: 4.
8. Un compuesto de fusión que consta de una
proteína fluorescente (GFP) de acuerdo con cualquiera de las
reivindicaciones precedentes, en el que la GFP está enlazada con un
polipéptido.
9. El compuesto de fusión de la reivindicación
precedente, en el que el polipéptido es una quinasa, preferiblemente
la subunidad catalítica de la proteína quinasa A o Erk1 o un
elemento citoesquelético.
10. Una secuencia de nucleótidos que codifica la
proteína fluorescente de cualquiera de las reivindicaciones
precedentes.
11. La secuencia de nucleótidos de acuerdo con
la reivindicación precedente, mostrada en el Identificador de
Secuencia núm.: 3.
12. La secuencia de nucleótidos de acuerdo con
cualquiera de las reivindicaciones precedentes en forma de una
secuencia de ADN.
13. Un anfitrión transformado con un constructo
de ADN de acuerdo con cualquiera de las reivindicaciones 10 a
12.
14. Un procedimiento para preparar un
polipéptido, que comprende el cultivo de un anfitrión de acuerdo con
la reivindicación 13 y la obtención a partir del mismo del
polipéptido expresado por dichas secuencias de nucleótidos.
15. El uso de la proteína fluorescente de
acuerdo con cualquiera de las reivindicaciones 1 - 9 en un ensayo
in vitro para medir la actividad de la proteína quinasa o la
actividad de la fosforilación o para medir la redistribución de
proteínas.
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