ES2332484T3 - Resistencia al estres inducida por un inductor de respuesta hipersensible. - Google Patents

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Abstract

Un procedimiento para conferir a las plantas resistencia al estrés que comprende: aplicar una proteína o un polipéptido inductor de la respuesta hipersensible en una forma no infecciosa a una planta o semilla de planta bajo condiciones eficaces para conferir resistencia frente al estrés por contaminación del aire, estrés químico, estrés nutricional o frente al estrés relacionado con el clima seleccionado del grupo constituido por las heladas, la temperatura fría, la temperatura elevada, la luz excesiva y la luz insuficiente.

Description

Resistencia al estrés inducida por un inductor de respuesta hipersensible.
Campo de la invención
La presente invención se refiere a conferir a las plantas resistencia al estrés con un inductor de respuesta hipersensible.
Antecedente de la invención
Bajo condiciones naturales y de agricultura, las plantas están expuestas a diversas formas de estrés ambiental. El estrés se mide principalmente con respecto al crecimiento (es decir la acumulación de biomasa) o con respecto a los principales procedimientos de asimilación (es decir la captación de dióxido de carbono y minerales). El déficit de agua de la tierra, las temperaturas subóptimas y supraóptimas, la salinidad y la mala aireación de las tierras pueden causar algunas restricciones del crecimiento durante la estación de crecimiento, de manera que el rendimiento de las plantas al final de la estación expresa solamente una pequeña fracción de su potencial genético. De hecho, se estima que en los Estados Unidos el rendimiento de los cultivos en los campos cultivados es sólo del 22% del potencial genético. Los mismos factores fisicoquímicos pueden volverse extremos en algunos hábitats, tales como desiertos o pantanos, y solamente la vegetación especialmente adaptada puede completar su ciclo vital en las condiciones inusualmente hostiles. En los entornos menos extremos, las plantas individuales pueden aclimatarse a los cambios en el agua potencial, la temperatura, la salinidad y la carencia de oxígeno de manera que mejore su aptitud para esos entornos. Algunas especies son más capaces de adaptarse que otras, y diversos mecanismos anatómicos, estructurales y bioquímicos explican la aclimatación.
Bajo condiciones naturales y de agricultura, las plantas deben soportar constantemente el estrés. Algunos factores ambientales pueden volverse estresantes en un período de tiempo muy corto (por ejemplo, la temperatura alta o baja) o pueden tardar períodos de tiempo prolongados en provocar estrés en las plantas (por ejemplo, el contenido de agua o nutrientes minerales en la tierra). En general, el estrés ambiental que afecta a las plantas puede estar en la forma de estrés relacionado con el clima, estrés de la contaminación del aire, estrés químico y estrés nutricional. Los ejemplos de estrés relacionado con el clima incluyen la sequía, el agua, la escarcha, la temperatura baja, la temperatura alta, la luz excesiva y la luz insuficiente. El estrés de la contaminación del aire puede estar en la forma de dióxido de carbono, monóxido de carbono, dióxido de azufre, NOx, hidrocarburos, ozono, radiación ultravioleta y lluvia ácida. El estrés químico puede ser el resultado de la aplicación de insecticidas, fungicidas, herbicidas y de metales pesados. El estrés nutricional puede estar causado por los fertilizantes, los micronutrientes y los macronutrientes.
Para la mayoría de las plantas, el agua es esencial para el crecimiento. Algunas plantas son capaces de conservar algo de agua en la tierra para uso más tardío, mientras que otras completan sus ciclos vitales durante una estación húmeda antes del comienzo de cualquier sequía. Otras plantas son capaces de consumir agresivamente el agua para protegerse provocando la privación del agua para otras plantas en esa ubicación. Las plantas que carecen de cualquiera de estas capacidades quedan seriamente impedidas por la ausencia de agua.
Las lesiones por heladas aparecen en las especies sensibles a temperaturas que son demasiado bajas para el crecimiento normal pero no suficientemente bajas para formar hielo. Tales lesiones aparecen típicamente en especies de origen tropical o subtropical. Cuando tiene lugar la helada, aparece decoloración o lesiones en las hojas que les dan un aspecto empapado de agua. Si se hielan las raíces, las plantas pueden marchitarse. Por otra parte, las temperaturas de congelación y la formación asociada de cristales de hielo pueden ser letales para las plantas si los cristales de hielo se extienden en los protoplastos o permanecen durante períodos largos.
El estrés también es causado por los otros extremos de temperatura con pocas plantas capaces de resistir las temperaturas altas. Cuando las células o los tejidos de las plantas superiores se deshidratan o no están creciendo, pueden resistir temperaturas más elevadas que las células que están hidratadas, son vegetativas y están en crecimiento. Los tejidos que están creciendo activamente rara vez pueden resistir a temperaturas superiores a 45ºC.
Las altas concentraciones de sal son otra forma de estrés ambiental que puede afectar a las plantas. En condiciones naturales, tales concentraciones altas de sal se encuentran cerca de la orilla del mar y en los estuarios. Más tierra adentro, la sal natural puede filtrar desde los depósitos geológicos adyacentes a las áreas agrícolas. Además, la sal puede acumularse en el agua de riego cuando el agua pura se evapora o transpira desde la tierra. Aproximadamente 1/3 de todas las tierras de labranza irrigadas están afectadas por concentraciones elevadas de sal. El alto contenido de sal no sólo daña las plantas sino que degrada la estructura de la tierra disminuyendo la porosidad y la permeabilidad del agua.
La contaminación del aire en la forma de ozono, dióxido de carbono, monóxido de carbono, dióxido de azufre, NO_{X} e hidrocarburos pueden tener efectos adversos en el crecimiento de las plantas al crear niebla tóxica y el calentamiento ambiental.
El documento WO98/32844 se refiere a un procedimiento para mejorar el crecimiento de las plantas. Esto implica aplicar un polipéptido o proteína que induce la respuesta hipersensible en una forma no infecciosa a una planta o semilla de planta bajo condiciones eficaces para mejorar el crecimiento de la planta o plantas producidas a partir de semillas de plantas.
La presente invención está dirigida a superar diversas formas de estrés ambiental y a conferir resistencia en las plantas frente a tal estrés.
Resumen de la invención
La presente invención se refiere al uso de una proteína o un polipéptido que induce la respuesta hipersensible para conferir resistencia al estrés a las plantas, en la que el estrés abarca factores ambientales que tienen efectos adversos en la fisiología y el desarrollo de la planta que son el estrés relacionado con el clima (es decir, escarcha, temperatura baja, temperatura alta, luz excesiva y luz insuficiente), el estrés de la contaminación del aire (por ejemplo, dióxido de carbono, monóxido de carbono, dióxido de azufre, NO_{X}, hidrocarburos, ozono, radiación ultravioleta, lluvia ácida), de los productos químicos (por ejemplo, insecticidas, fungicidas, herbicidas, metales pesados), y el estrés nutricional (por ejemplo, fertilizantes, micronutrientes, macronutrientes). En una forma de realización de la presente invención, la proteína o el polipéptido que induce la respuesta hipersensible se aplica a las plantas o semillas de plantas bajo condiciones eficaces para conferir resistencia al estrés. Como alternativa, la resistencia al estrés se confiere proporcionando una planta o semilla de planta transgénica transformada con una molécula de ADN que codifica una proteína o un polipéptido que induce la respuesta hipersensible y cultivando la planta o plantas transgénicas producidas a partir de semillas transgénicas de plantas bajo condiciones eficaces para conferir resistencia al estrés.
Los solicitantes han encontrado que el uso de inductores de respuesta hipersensible según la presente invención confiere resistencia a las plantas contra tales formas de estrés ambiental.
Descripción detallada de la invención
La presente invención se refiere al uso de una proteína o un polipéptido que induce la respuesta hipersensible para conferir resistencia al estrés a las plantas. En una forma de realización de la presente invención, el polipéptido o proteína que induce la respuesta hipersensible se aplica a las plantas o a las semillas de plantas bajo condiciones eficaces para conferir resistencia al estrés. Como alternativa, la resistencia al estrés se confiere proporcionando una planta o semilla de planta transgénica transformada con una molécula de ADN que codifica una proteína o un polipéptido inductor de respuesta hipersensible y cultivando la planta transgénica o las plantas producidas a partir de las semillas transgénicas de la planta bajo condiciones eficaces para conferir resistencia al estrés.
Los polipéptidos o proteínas que inducen la respuesta hipersensible según la presente invención derivan de proteínas o polipéptidos inductores de respuesta hipersensible de una amplia diversidad de patógenos fúngicos y bacterianos. Tales polipéptidos o proteínas son capaces de inducir la necrosis local en el tejido vegetal en contacto con el inductor. Los ejemplos de fuentes bacterianas adecuadas de polipéptidos o proteínas inductores incluyen especies de Erwinia, Pseudomonas y Xanthamonas (por ejemplo, las siguientes bacterias: Erwinia amylovora, Erwinia chrysanthemi, Erwinia stewartii, Erwinia carotovora, Pseudomonas syringae, Pseudomonas solancearum, Xanthomonas campestris, y sus mezclas). Además de los inductores de respuesta hipersensible de estas bacterias gram negativas, es posible usar inductores de bacterias gram positivas. Un ejemplo es Clavibacter michiganensis subespecie sepedonicus.
Un ejemplo de una fuente fúngica de proteína o polipéptido inductor de respuesta hipersensible es Phytophthora. Las especies adecuadas de Phytophthora incluyen Phytophthora parasitica, Phytophthora cryptogea, Phytophthora cinnamomi, Phytophthora capsici, Phytophthora megasperma y Phytophthora citrophthora.
El polipéptido o la proteína que induce la respuesta hipersensible de Erwinia chrysanthemi tiene una secuencia de aminoácidos que corresponde a la SEC. ID Nº 1 siguiente:
1
2
\newpage
Este polipéptido o proteína que induce la respuesta hipersensible tiene un peso molecular de 34 kDa, es termoestable, tiene un contenido de glicina mayor del 16%, y no contiene sustancialmente cisteína. El polipéptido o proteína que induce la respuesta hipersensible de Erwinia chrysanthemi está codificado por una molécula de ADN que tiene una secuencia de nucleótidos que corresponde a la SEC. ID Nº 2 siguiente:
3
4
\vskip1.000000\baselineskip
El polipéptido o proteína que induce la respuesta hipersensible de Erwinia amylovora tiene una secuencia de aminoácidos que corresponde a la SEC. ID Nº 3 siguiente:
5
6
\newpage
Este polipéptido o proteína que induce la respuesta hipersensible tiene un peso molecular de aproximadamente 39 kDa, tiene un pI de aproximadamente 4,3, y es termoestable a 100ºC durante al menos 10 minutos. Este polipéptido o proteína que induce la respuesta hipersensible no tiene sustancialmente cisteína. El polipéptido o proteína que induce la respuesta hipersensible derivado de Erwinia amylovora se describe más detalladamente en Wei, Z.-M., R. J. Laby, C. H. Zumoff, D. W. Bauer, S.-Y. He, A. Collmer, and S. V. Beer, "Harpin, Elicitor of the Hypersensitive Response Produced by the Plant Pathogen Erwinia amylovola", Science 257: 85-88 (1992). La molécula de ADN que codifica este polipéptido o proteína tiene una secuencia de nucleótidos que corresponde a la SEC. ID Nº 4 siguiente:
7
\newpage
Otro inductor de respuesta hipersensible potencialmente adecuado de Erwinia amylovora se da a conocer en la Solicitud de Patente de EEUU Nº de serie 09/120.927. La proteína está codificada por una molécula de ADN que tiene una secuencia de ácido nucleico de la SEC. ID Nº 5 siguiente:
8
\vskip1.000000\baselineskip
Véase GenBank Nº de acceso U94513. La molécula de ADN aislada de la presente invención codifica una proteína o un polipéptido inductor de respuesta hipersensible que tiene una secuencia de aminoácidos de la SEC. ID Nº 6 siguiente:
9
10
11
\vskip1.000000\baselineskip
Este polipéptido o proteína es ácido, rico en glicina y serina, y carece de cisteína. También es termoestable, sensible a la proteasa, y es suprimido por inhibidores del metabolismo de la planta. La proteína o el polipéptido de la presente invención tienen un tamaño molecular predicho de ca. 4,5 kDa.
Otro inductor de respuesta hipersensible potencialmente adecuado de Erwinia amylovora se da a conocer en la Solicitud de Patente de EEUU Nº de serie 09/120.663. La proteína está codificada por una molécula de ADN que tiene una secuencia de ácido nucleico de la SEC. ID Nº 7 siguiente:
12
13
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15
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Esta molécula de ADN se conoce como el gen dspE para Erwinia amylovora. Esta molécula de ADN aislada de la presente invención codifica una proteína o un polipéptido que inducen una respuesta hipersensible de un patógeno de la planta que tiene una secuencia de aminoácidos de SEC. ID Nº 8 siguiente:
16
17
18
19
20
21
\vskip1.000000\baselineskip
Esta proteína o polipéptido tiene aproximadamente 198 kDa y tiene un pI de 8,98.
\newpage
La presente invención se refiere a una molécula de ADN aislada que tiene una secuencia de nucleótidos de la SEC. ID Nº 9 siguiente:
22
\vskip1.000000\baselineskip
Ésta se conoce como el gen dspF. Esta molécula de ADN aislada de la presente invención codifica una proteína o un polipéptido que inducen la respuesta hipersensible que tiene una secuencia de aminoácidos de la SEC. ID Nº 10 siguiente:
23
Esta proteína o polipéptido tiene aproximadamente 16 kDa y tiene un pI de 4,45.
El polipéptido o proteína que induce la respuesta hipersensible derivado de Pseudomonas syringae tiene una secuencia de aminoácidos que corresponde a la SEC. ID Nº 11 siguiente:
24
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26
\vskip1.000000\baselineskip
Este polipéptido o proteína que induce la respuesta hipersensible tiene un peso molecular de 34-35 kDa. Es rico en glicina (aproximadamente 13,5%) y carece de cisteína y tirosina.
Más información sobre el inductor de la respuesta hipersensible derivado de Pseudomonas syringae se encuentra en, S. Y., H. C. Huang, and A. Collmer, "Pseudomonas syringae pv. syringae HarpinPss: a Protein that is Secreted via the Hrp Pathway and Elicits the Hypersensitive Response in Plants", Cell 73: 1255-1266 (1993). La molécula de ADN que codifica los inductores de respuesta hipersensible de Pseudomonas syringae tiene una secuencia de nucleótidos que corresponde a la SEC. ID Nº 12 siguiente:
27
\newpage
Otro inductor de la respuesta hipersensible potencialmente adecuado de Pseudomonas syringae se da a conocer en la Solicitud de Patente de EEUU Nº de serie 09/120.817. La proteína tiene una secuencia de nucleótidos de la SEC. ID Nº 13 siguiente;
28
\newpage
Esta molécula de ADN se conoce como el gen dspE para Pseudomonas syringae. Esta molécula de ADN aislada de la presente invención codifica una proteína o un polipéptido que induce la respuesta hipersensible de un patógeno de la planta que tiene una secuencia de aminoácidos de la SEC. ID Nº 14 siguiente:
29
30
Esta proteína o polipéptido tiene aproximadamente 42,9 kDa.
El polipéptido o proteína que induce la respuesta hipersensible derivado de Pseudomonas solanacearum tiene una secuencia de aminoácidos que corresponde a la SEC. ID Nº 15 siguiente:
31
32
\newpage
Está codificado por una molécula de ADN que tiene una secuencia de nucleótidos que corresponde a la SEC. ID Nº 16 siguiente:
33
\vskip1.000000\baselineskip
Más información con respecto al polipéptido o proteína que induce la respuesta hipersensible derivado de Pseudomonas solanacearum se presenta en Arlat, M., F. Van Gijsegem, J. C. Huet, J. C. Pemollet, and C. A. Boucher, "PopA1, a Protein which Induces a Hypersensitive-like Response in Specific Petunia Genotypes, is Secreted via the Hrp Pathway of Pseudomonas solanacearum", EMBO J. 13: 543-533 (1994).
El polipéptido o proteína que induce la respuesta hipersensible de Xanthomonas campestris pv. glicinas tienen una secuencia de aminoácidos que corresponde a la SEC. ID Nº 17 siguiente:
34
Esta secuencia es una secuencia amino terminal que tiene solamente 26 residuos del polipéptido o proteína que induce la respuesta hipersensible de Xanthomonas campestris pv. glicinas. Coincide con las proteínas de subunidades fimbriales determinadas en otros patovares de Xanthomonas campestris.
\newpage
El polipéptido o proteína que induce la respuesta hipersensible de Xanthomonas campestris pv. pelagonii es termoestable, sensible a proteasas, y tiene un peso molecular de 20 kDa. Incluye una secuencia de aminoácidos que correspondiente a la SEC. ID Nº 18 siguiente:
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El aislamiento de la proteína o polipéptido que induce la respuesta hipersensible de Erwinia carotovora está descrito en Cui y col., "The RsmA Mutants of Erwinia carotovora subsp. carotovora Strain Ecc71 Overexpress hrp NEcc and Elicit a Hypersensitive Reaction-like Response in Tobacco Leaves", MPMI, 9(7): 565-573 (1996). La proteína o el polipéptido que induce la respuesta hipersensible de Erwinia stewartii se presenta en Ahmad y col., "Harpin is Not Necessary for the Pathogenicity of Erwinia stewartii on Maize", 8th Int'l. Cong. Molec. Plant-Microobe Interact., 14-19 de julio, 1996 y Ahmad, y col., "Harpin is Not Necessary for the Pathogenicity of Erwinia stewartii on Maize", Ann. Mtg. Am, Phytopath. Soc., 27-31 de julio, 1996.
Las proteínas o polipéptidos que inducen la respuesta hipersensible de Phytophthora parasitica, Phytophthora cryptogea, Phytophthora cinnamoni, Phytophthora capsici, Phytophthora megasperma y Phytophora citrophthora están descritos en Kaman, y col., "Extracellular Protein Elicitors from Phytophtora: Most Specificity and Induction of Resistance to Bacterial and Fungal Phytopathogens", Molec. Plant-Microbe Interact., 6(1): 15-25 (1993), Ricci y col., "Structure and Activity of Protein from Pathogenic Fungi Phytophtora Eliciting Necrosis and Acquired Resistance in Tobacco", Eur. J. Biochem., 183: 555-563 (1989), Ricci y col., "Differential Production of Parasiticein, and Elicitor of Necrosis and Resistance in Tobacco, by Isolates of Phytophthera parasitica", Plant Path. 41: 298-307 (1992), Baillreul y col., "A New Elicitor of the Hypersensitive Response in Tobacco: A Fungal Glycoprotein Elicit Cell Death, Expression of Defence Genes, Production of Salicylic Acid, and Induction of Systemic Acquired Resistance", Plant J., 8(4): 551-560 (1995), y Bonnet y col., "Acquired Resistance Triggered by Elicitors in Tobacco and Other Plants", Eur. J, Plant Path., 102: 181-192 (1996).
Otro inductor de la respuesta hipersensible según con la presente invención es de Clavibacter michiganensis subsp. sepedonicus que se describe en detalle en la Solicitud de Patente de EEUU Nº de serie 09/136.625.
Los inductores anteriores son de ejemplo. Pueden identificarse otros inductores cultivando hongos o bacterias que inducen una respuesta hipersensible bajo condiciones en que se expresan los genes que codifican los inductores. La actividad de inductor (es decir, necrosis local) de las preparaciones libres de células de sobrenadantes de cultivos se prueba usándolas para infiltrar tejidos adecuados de plantas.
Los fragmentos de los polipéptidos o proteínas que inducen la respuesta hipersensible así como los fragmentos de los inductores de longitud total de otros patógenos están abarcados por el procedimiento de la presente invención.
Pueden producirse fragmentos adecuados por varios medios. En el primero, se producen subclones del gen que codifica una proteína inductora conocida por medio de manipulación genética molecular convencional subclonando los fragmentos del gen. A continuación se expresan los subclones in vitro o in vivo en células bacterianas para dar una proteína o polipéptido más pequeño en el que puede probarse la actividad inductora según el procedimiento que se describe a continuación.
Como una alternativa, pueden producirse fragmentos de una proteína inductora por digestión de una proteína inductora de longitud total con enzimas proteolíticas como quimotripsina o proteinasa A de Staphylococcus, o tripsina. Las diferentes enzimas proteolíticas tienen posibilidad de escindir las proteínas inductoras en diferentes sitios en base a la secuencia de aminoácidos de la proteína inductora. Algunos de los fragmentos que surgen como resultado de la proteolisis pueden ser inductores activos de resistencia.
En otro enfoque, en base al conocimiento de la estructura primaria de la proteína, pueden sintetizarse fragmentos del gen de la proteína inductora usando la técnica de PCR junto con series específicas de cebadores elegidos para representar las porciones particulares de la proteína. Estos se clonarán a continuación en un vector adecuado para la expresión de un péptido o proteína truncado.
Un ejemplo de fragmentos adecuados de un inductor de respuesta hipersensible que no inducen una respuesta hipersensible incluye fragmentos de Erwinia. Los fragmentos adecuados incluyen un fragmento del extremo C terminal de la secuencia de aminoácidos de SEC. ID Nº 3, un fragmento del extremo N terminal de la secuencia de aminoácidos de SEC. ID Nº 3, o un fragmento interno de la secuencia de aminoácidos de SEC. ID Nº 3. El fragmento del extremo C terminal de la secuencia de aminoácidos de SEC. ID Nº 3 puede abarcar los siguientes aminoácidos de la SEC. ID Nº 3: 169 y 403, 210 y 403, 267 y 403, ó 343 y 403. El fragmento interno de la secuencia de aminoácidos de SEC. ID Nº 3 puede abarcar los siguientes aminoácidos de SEC. ID Nº 3: 105 y 179, 137 y 166, 121 y 150, ó 137 y 156. Pueden identificarse otros fragmentos adecuados según la presente invención.
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Otro ejemplo de fragmentos adecuados de un inductor de respuesta hipersensible que no inducen una respuesta hipersensible son fragmentos de Erwinia amylovora que incluyen un fragmento del extremo C terminal de la secuencia de aminoácidos de SEC. ID Nº 3, un fragmento del extremo N terminal de la secuencia de aminoácidos de SEC. ID Nº 3, o un fragmento interno de la secuencia de aminoácidos de SEC. ID Nº 3. El fragmento del extremo C terminal de la secuencia de aminoácidos de SEC. ID Nº 3 puede abarcar los aminoácidos 105 y 403 de la SEC. ID Nº 3. El fragmento del extremo N terminal de la secuencia de aminoácidos de SEC. ID Nº 3 puede abarcar los siguientes aminoácidos de SEC. ID Nº 3: 1 y 98, 1 y 104, 1 y 122, 1 y 168, 1 y 218, 1 y 266, 1 y 342, 1 y 321, y 1 y 372. El fragmento interno de la secuencia de aminoácidos de SEC. ID Nº 3 puede abarcar los siguientes aminoácidos de SEC. ID Nº 3: 76 y 209, 105 y 209, 99 y 209, 137 y 204, 137 y 200, 109 y 204, 109 y 200, 137 y 180, y 105 y 180.
Las moléculas de ADN adecuadas son las que hibridan a la molécula de ADN que comprende una secuencia de nucleótidos de SEC. ID Nº 2, 4, 5, 7, 9, 12, 13 y 16 bajo condiciones rigurosas. Un ejemplo de condiciones de alta rigurosidad adecuadas es cuando la hibridación se realiza a 65ºC durante 20 horas en un medio que contiene NaCl 1M, Tris-HCl 50 mM, pH 7,4, EDTA 10 mM, dodecilsulfato de sodio al 0,1%, ficoll al 0,2%, polivinilpirrolidona al 0,2%, albúmina sérica de ternera al 0,2%, ADN de E. coli 50 \mumg/ml.
Las variantes pueden generarse, por ejemplo, por deleción o adición de aminoácidos que tengan mínima influencia en las propiedades, la estructura secundaria y la naturaleza hidropática del polipéptido. Por ejemplo, un polipéptido puede conjugarse a una secuencia señal (o líder) en el extremo N terminal de la proteína que de manera cotraduccional o postraduccional dirige la transferencia de la proteína. El polipéptido puede también conjugarse a un conector o a otra secuencia para facilitar la síntesis, la purificación, o la identificación del polipéptido.
El inductor de la respuesta hipersensible de la presente invención está de preferencia en una forma aislada (es decir, separado del organismo huésped) y de más preferencia se produce en forma purificada (de preferencia al menos aproximadamente al 60%, de más preferencia al 80% de pureza) por medio de técnicas convencionales. Típicamente, el inductor de la respuesta hipersensible de la presente invención se produce pero no se secreta en el medio de cultivo de las células huésped recombinantes. Como alternativa, la proteína o el péptido de la presente invención se secreta en el medio de cultivo. En el caso de la proteína no secretada, para aislar la proteína, se propaga la célula huésped (por ejemplo, E. coli) que porta un plásmido recombinante, se lisa por medio de ultrasonido, calor o tratamiento químico, y el homogeneizado se centrifuga para retirar los residuos celulares. A continuación, se somete el sobrenadante a tratamiento con calor y el inductor de la respuesta hipersensible se separa por centrifugación. La fracción del sobrenadante que contiene el inductor de la respuesta hipersensible se somete a una filtración en gel en una columna de dextrano o poliacrilamida del tamaño adecuado para separar los fragmentos. Si es necesario, la fracción de proteínas puede purificarse más por intercambio iónico o por HPLC.
La molécula de ADN que codifica el polipéptido o proteína inductor de la respuesta hipersensible puede introducirse en las células usando la tecnología de ADN recombinante convencional. Generalmente, esto implica insertar la molécula de ADN en un sistema de expresión heterólogo respecto a la molécula de ADN (es decir, que normalmente no está presente). La molécula de ADN heterólogo se inserta en el vector o sistema de expresión orientada en el sentido apropiado y en el marco de lectura correcto. El vector contiene los elementos necesarios para la transcripción y la traducción de las secuencias insertadas que codifican la proteína.
La Patente de EEUU Nº 4.237.224 de Cohen y Boyer describe la producción de sistemas de expresión en la forma de plásmidos recombinantes utilizando escisión con enzimas de restricción y unión con ADN ligasa. Posteriormente, estos plásmidos recombinantes se introducen por medio de una transformación y se replican en cultivos unicelulares que incluyen los organismos procariotas y las células eucariotas que crecen en cultivos de tejidos.
Los genes recombinantes también pueden introducirse en virus, tales como el virus vacunal. Los virus recombinantes pueden generarse por medio de la transfección de los plásmidos en las células infectadas con el virus.
Los vectores adecuados incluyen, pero no se limitan a, los siguientes vectores virales tales como los sistemas vectores de lambda gt11, gt WES.tB, Charon 4 y vectores plasmídicos tales como pBR322, pBR325, pACYC177, pACYC184, pUC8, pUC9, pUC18, pUC19, pLG339, pR290, pKC37, pKC101, SV 40, pBluescript II SK +/- o KS +/- (véase el catálogo de "Sistemas de clonación de Stratagene" de Stratagene, La Jolla, California), pQE, pIH821, pGEX, la serie pET (véase F. W. Studier y col., "Use of T7 RNA Polymerase to Direct Expression of Cloned Genes", Gene Expression Technology vol. 185 (1990)) y cualquiera de sus derivados. Las moléculas recombinantes pueden introducirse en las células a través de la transformación, particularmente de la transducción, conjugación, movilización o electroporación. Las secuencias de ADN se clonan en el vector usando procedimientos de clonación convencionales conocidos en la técnica, como está descrito por Sambrook y col., Molecular Cloning: A Laboratory Manual, Cold Springs Laboratory, Cold Springs Harbor, Nueva York (1989).
Para expresar la(s) secuencia(s) que codifican proteína(s) puede utilizarse una diversidad de sistemas vector-huésped. En primer lugar, el sistema vector debe ser compatible con la célula huésped utilizada. Los sistemas vector-huésped incluyen, pero no se limitan a, los siguientes: bacterias transformadas con ADN de bacteriófagos, ADN de plásmidos o ADN de cósmidos; microorganismos tales como levaduras que contienen vectores de levaduras; sistemas de células de mamíferos infectadas con virus (por ejemplo, virus vacunal, adenovirus, etc.); sistemas de células de insectos infectadas con virus (por ejemplo, baculovirus); y células vegetales infectadas por bacterias. Los elementos de expresión de estos vectores varían en su intensidad y su especificidad. Según el sistema vector-huésped utilizado, puede usarse uno cualquiera de una serie de elementos de transcripción y traducción adecuados.
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Diferentes acontecimientos de señales genéticas y procesamiento controlan en muchos niveles la expresión genética (por ejemplo, la transcripción del ADN y la traducción del ARN mensajero (ARNm)).
La transcripción del ADN es dependiente de la presencia de un promotor que es una secuencia de ADN que dirige la unión de la ARN polimerasa y, por consiguiente, promueve la síntesis del ARNm. Las secuencias de ADN de los promotores eucariotas difieren de las de los promotores procariotas. Además, los promotores eucariotas y las señales genéticas que los acompañan pueden no ser reconocidas o pueden no funcionar en un sistema procariota y, además, los promotores procariotas no son reconocidos y no funcionan en las células eucariotas.
De manera similar, la traducción del ARNm en los procariotas depende de la presencia de las señales procariotas adecuadas, que difieren de las de los eucariotas. La traducción eficaz del ARNm en los procariotas requiere un sitio de unión al ribosoma, denominado secuencia de Shine-Dalgarno ("SD"), en el ARNm. Esta secuencia es una secuencia de nucleótidos corta del ARNm que está localizada antes del codón de inicio, usualmente AUG, que codifica la metionina del extremo amino terminal de la proteína. Las secuencias de SD son complementarias al extremo 3' del ARNr (ARN ribosómico) 16S y, probablemente, promueven la unión de un ARNm a los ribosomas mediante la formación de una doble cadena con el ARNr para permitir la colocación correcta del ribosoma. Para una revisión sobre la maximización de la expresión genética, véase Roberts and Lauer, Methods in Enzymology, 68: 473 (1979).
Los promotores varían por su "fuerza" (es decir, su capacidad para promover la transcripción). Para los propósitos de expresar un gen clonado, es deseable usar promotores fuertes para obtener un nivel elevado de transcripción y, por consiguiente, de expresión del gen. Según el sistema de célula huésped utilizado, puede usarse uno cualquiera de una serie de promotores adecuados. Por ejemplo, cuando se clona en E. coli, los promotores de sus bacteriófagos, o plásmidos, tales como el promotor del fago T7, el promotor de lac, el promotor de trp, el promotor de recA, el promotor del ARN ribosómico, los promotores P_{R} y P_{L} del colifago lambda y otros, incluidos, pero no limitados a, lacUV5, ompF, bla, lpp y similares, pueden usarse para dirigir un nivel elevado de transcripción de los segmentos de ADN adyacentes. Además, puede usarse un promotor híbrido trp-lacUV5 (tac) u otros promotores de E. coli producidos por medio de ADN recombinante u otras técnicas de ADN sintético para proporcionar la transcripción del gen insertado.
Las cepas bacterianas de células huésped y los vectores de expresión pueden escogerse para inhibir la acción del promotor a menos que se induzca específicamente. En determinadas operaciones, es necesaria la adición de inductores específicos para la transcripción eficaz del ADN insertado. Por ejemplo, el operón lac se induce por la adición de lactosa o IPTG (isopropiltio-beta-D-galactósido). Una diversidad de otros operones, tales como trp o pro, etc. se encuentran bajo controles diferentes.
Las señales específicas de iniciación también son necesarias para la transcripción y la traducción genética eficaces en las células procariotas. Estas señales de iniciación de la transcripción y la traducción pueden variar en "fuerza" en función de la medición de la cantidad de ARN mensajero específico del gen y la cantidad de proteína sintetizada, respectivamente. El vector de expresión del ADN, que contiene un promotor, también puede contener una combinación de varias diversas señales "fuertes" de iniciación de la transcripción y/o traducción. Por ejemplo, la traducción eficaz en E. coli requiere una secuencia de SD de aproximadamente 7-9 bases en posición 5' del codón de iniciación ("ATG") para proporcionar un sitio de unión al ribosoma. Por consiguiente, puede usarse cualquier combinación SD-ATG que pueda ser utilizada por los ribosomas de la célula huésped. Tales combinaciones incluyen, pero no se limitan a, la combinación SD-ATG derivada del gen cro o el gen N del colifago lambda, o derivados de los genes E, D, C, B o A del triptofano de E. coli. Además, puede usarse cualquier combinación SD-ATG producida por ADN recombinante u otras técnicas que implican la incorporación de nucleótidos sintéticos.
Una vez que se ha clonado en un sistema de expresión, la molécula de ADN aislada que codifica el polipéptido o proteína que induce la respuesta hipersensible está lista para ser incorporada en una célula huésped. Tal incorporación puede llevarse a cabo por medio de las diversas formas de transformación indicadas anteriormente, dependiendo del sistema vector/célula huésped. Las células huésped adecuadas incluyen, pero no se limitan a, bacterias, virus, levaduras, células de mamíferos, de insectos, vegetales y similares.
El procedimiento de la presente invención de conferir resistencia al estrés a las plantas puede implicar la aplicación del polipéptido o proteína inductor de la respuesta hipersensible en una forma no infecciosa a toda o parte de una planta o semilla de planta bajo condiciones eficaces para que el inductor confiera resistencia al estrés. Como alternativa, la proteína o el polipéptido inductor de la respuesta hipersensible puede aplicarse a las plantas de manera tal que las semillas recuperadas de tales plantas son por sí mismas capaces de conferir resistencia al estrés en las plantas.
Como una alternativa para aplicar el polipéptido o proteína que induce la respuesta hipersensible a las plantas o semillas de plantas para conferir resistencia al estrés en las plantas o plantas cultivadas a partir de las semilla, pueden utilizarse plantas o semillas de plantas transgénicas. Cuando se utilizan plantas transgénicas, esto implica proporcionar una planta transgénica transformada con una molécula de ADN que codifica un polipéptido o proteína que induce la respuesta hipersensible y cultivar la planta bajo condiciones eficaces para permitir que la molécula de ADN confiera resistencia al estrés a las plantas. Como alternativa, puede suministrarse y plantarse en la tierra una semilla de planta transgénica con una molécula de ADN que codifica un polipéptido o proteína que induce la respuesta hipersensible. Posteriormente, se propaga una planta a partir de la semilla plantada bajo condiciones eficaces para permitir que la molécula de ADN confiera resistencia al estrés a las plantas.
La forma de realización de la presente invención en la que se aplica un polipéptido o proteína que induce la respuesta hipersensible a la planta o semilla de planta puede llevarse a cabo en una serie de manera, que incluyen: 1) aplicación de un inductor de la respuesta hipersensible aislado o 2) aplicación de bacterias que no causan enfermedad y que están transformadas con genes que codifican el inductor. En la última forma de realización, el inductor puede aplicarse a las plantas o semillas de plantas aplicando las bacterias que contienen la molécula de ADN que codifica un polipéptido o proteína que induce la respuesta hipersensible. Tal bacteria debe ser capaz de secretar o exportar el inductor de manera que el inductor pueda contactar las células de la planta las semillas de la planta. En estas formas de realización, el inductor es producido por las bacterias in planta o en las semillas o justo antes de la introducción de las bacterias a las plantas o semillas de plantas.
Los procedimientos de la presente invención pueden utilizarse para tratar una gran diversidad de plantas o sus semillas para conferir resistencia al estrés. Las plantas adecuadas incluyen monocotiledóneas y dicotiledóneas. Más particularmente, las plantas de cultivo útiles pueden incluir: alfalfa, arroz, trigo, cebada, centeno, algodón, girasol, cacahuete, maíz, patata, boniato, judía, guisante, achicoria, lechuga, endivia, col, col de Bruselas, remolacha, chirivía, coliflor, brécol, nabo, rábano, espinaca, cebolla, ajo, berenjena, pimiento, apio, zanahoria, calabacín, calabaza, calabacín zucchini, pepino, manzana, pera, melón, cítricos, fresa, uva, frambuesa, piña, soja, tabaco, tomate, sorgo y caña de azúcar. Los ejemplos de plantas ornamentales adecuadas son: Arabidopsis thaliana, Saintpaulia, petunia, pelargonio, flor de pascua, crisantemo, clavel y zinnia.
Según la presente invención, el término "estrés" se refiere a sal, temperaturas frías (por ejemplo, helada), tratamiento químico (por ejemplo, insecticidas, fungicidas, herbicidas, fertilizantes), luz excesiva, y luz insuficiente.
El procedimiento de la presente invención que implica la aplicación del polipéptido o proteína que induce la respuesta hipersensible puede llevarse a cabo a través de una diversidad de procedimientos cuanto se trata toda o parte de la planta, incluidas las hojas, los tallos, las raíces, los propágulos (por ejemplo, esquejes), etc. Estos pueden (pero no necesariamente) implicar la infiltración del polipéptido o proteína que induce la respuesta hipersensible en la planta. Los procedimientos de aplicación adecuados incluyen la pulverización a presión alta o baja, la inyección, y la abrasión de la hoja próxima cuando tiene lugar la aplicación del inductor. Cuando se tratan semillas de plantas o propágulos (por ejemplo, esquejes), según la forma de realización de aplicación de la presente invención, la proteína o el polipéptido que induce la respuesta hipersensible, según la presente invención, puede aplicarse por pulverización a presión baja o alta, recubrimiento, inmersión o inyección. Los expertos en la técnica pueden imaginar otros procedimientos de aplicación adecuados con la condición de que sean capaces de contactar el inductor con las células de la planta o semillas de la planta. Una vez tratadas con el inductor de la respuesta hipersensible de la presente invención, las semillas pueden plantarse en tierra natural o artificial y cultivarse usando procedimientos convencionales para producir plantas. Una vez que las plantas se hayan propagado a partir de semillas tratadas según la presente invención, las plantas pueden tratarse con una o más aplicaciones de la proteína o el polipéptido que induce la respuesta hipersensible para conferir a las plantas resistencia al estrés.
El polipéptido o proteína que induce la respuesta hipersensible, según la presente invención, puede aplicarse a las plantas o semillas de plantas solo o en una mezcla con otros materiales. Como alternativa, el polipéptido o proteína que induce la respuesta hipersensible puede aplicarse por separado a las plantas con otros materiales a aplicar en diferentes momentos.
Una composición adecuada para tratar plantas o semillas de plantas según la forma de realización de aplicación de la presente invención contiene un polipéptido o proteína que induce la respuesta hipersensible en un vehículo. Los vehículos adecuados incluyen agua, disoluciones acuosas, suspensiones o polvos secos. En esta forma de realización, la composición contiene más de 500 nM del inductor.
Aunque no es necesario, esta composición puede contener otros aditivos, incluidos fertilizantes, insecticidas, fungicidas, nematicidas y sus mezclas. Los fertilizantes adecuados incluyen (NH_{4})_{2}NO_{3}. Un ejemplo de un insecticida adecuado es Malathion. Los fungicidas útiles incluyen el Captan.
Otros aditivos adecuados incluyen agentes tamponadores, agentes humectantes, agentes de recubrimiento y agentes abrasivos. Estos materiales pueden usarse para facilitar el proceso de la presente invención. Además, el inductor de la respuesta hipersensible puede aplicarse a las semillas de plantas con otra formulación y materiales de tratamiento convencionales, incluidos arcillas y polisacáridos.
En la forma de realización alternativa de la presente invención que implica el uso de plantas transgénicas y de semillas transgénicas, no es necesario aplicar de manera tópica un inductor de la respuesta hipersensible a las plantas o semillas. En su lugar, se producen plantas transgénicas transformadas con una molécula de ADN que codifica uno de tales inductores según los procedimientos bien conocidos en la técnica.
El vector descrito anteriormente puede microinyectarse directamente en las células vegetales por medio de micropipetas para transferir mecánicamente el ADN recombinante. Crossway, Mol. Gen. Genetics, 202: 179-185 (1985). El material genético puede también transferirse a la célula vegetal usando polietilenglicol. Krens, y col., Nature, 296: 72-74 (1982).
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Otro enfoque para transformar las células vegetales con un gen es el bombardeo de partículas (también conocido como transformación biolística) de la célula huésped. Este puede realizarse en una de varias maneras. La primera implica propulsar partículas inertes o biológicamente activas en las células. Esta técnica se da a conocer en las Patentes de EEUU Nº 4.945.050, 5.036.006 y 5.100.792, todas de Sanford y col.
En general, este procedimiento implica propulsar partículas inertes o biológicamente activas en las células bajo condiciones eficaces para penetrar la superficie exterior de la célula y para quedar incorporadas en el interior de las mismas. Cuando se utilizan partículas inertes, el vector puede introducirse en la célula recubriendo las partículas con el vector que contiene el ADN heterólogo. Como alternativa, la célula diana puede ser rodeada por el vector de modo que el vector es llevado dentro de la célula por la estela de la partícula. Las partículas biológicamente activas (por ejemplo, células bacterianas secadas que contienen el vector y el ADN heterólogo) también pueden propulsarse en las células vegetales.
Aún otro procedimiento de introducción es la fusión de protoplastos con otras entidades, ya sea minicélulas, células, lisosomas, u otros cuerpos con superficie de lípidos fusionables. Fraley, y col., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 79: 1859-1863 (1982).
La molécula de ADN puede introducirse también en las células vegetales por electroporación. Fromm y col., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 82: 5824 (1985). En esta técnica, los protoplastos de la planta se electroporan en presencia de los plásmidos que contienen la casete de expresión. Los impulsos eléctricos de intensidad de campo elevada permeabilizan de manera reversible las biomembranas permitiendo la introducción de los plásmidos. Los protoplastos de la planta electroporados reforman la pared celular, se dividen y regeneran.
Otro procedimiento para introducir la molécula de ADN en las células vegetales es infectar una célula de la planta con Agrobacterium tumefaciens o A. rhizogenes transformados previamente con el gen. Bajo condiciones adecuadas conocidas en la técnica, las células de la planta transformadas se cultivan para formar brotes o raíces, y se desarrollan más formando plantas. En general, este procedimiento implica inocular el tejido de la planta con una suspensión de bacterias e incubar el tejido durante 48 a 72 horas en medio de regeneración sin antibióticos a 25-28ºC.
El Agrobacterium es un género representativo de la familia gram negativa Rhizobiaceae. Sus especies son responsable de la enfermedad de los tumores en el cuello (A. tumefaciens) y de la raíz vellosa (A. rhizogenes). Las células vegetales en los tumores del cuello y las raíces vellosas son inducidas a producir derivados de aminoácidos conocidos como opinas, que son catabolizados solamente por las bacterias. Los genes bacterianos responsables de la expresión de opinas son una fuente conveniente de elementos de control para las casetes de expresión quiméricas. Además, el análisis de la presencia de opinas puede usarse para identificar el tejido transformado.
La secuencia genética heteróloga puede introducirse en las células vegetales adecuadas por medio del plásmido Ti de A. tumefaciens o el plásmido Ri de A. rhizogenes. El plásmido Ti o Ri se transmite a las células de la planta en la infección por Agrobacterium y se integra de manera estable en el genoma de la planta. J. Schell, Science, 237: 1176-1183 (1987).
Después de la transformación, las células de la planta transformada deben regenerarse.
La regeneración de la planta a partir de protoplastos cultivados está descrita en Evans y col., Handbook of Plant Cell Cultures, Vol. 1: (MacMillan Publishing Co., Nueva York, 1983); y Vasil I. R. (ed.), Cell Culture and Somatic Genetics of Plants, Acad. Press, Orlando, Vol. 1, 1984, y Vol. III (1986).
Se sabe que prácticamente todas las plantas pueden regenerarse a partir de las células o los tejidos cultivados, incluidos pero no limitados a, todas las especies principales de caña de azúcar, remolacha azucarera, algodón, árboles frutales y legumbres.
El medio para la regeneración varía entre las especies de plantas, pero por lo general se proporciona primero una suspensión de protoplastos transformados o una placa de petri que contiene explantes transformados. Se forma el tejido del callo y los brotes pueden inducirse del callo y posteriormente formar raíces. Como alternativa, puede inducirse la formación de embriones en el tejido del callo. Estos embriones germinan como embriones naturales para formar las plantas. El medio de cultivo contiene generalmente diversos aminoácidos y hormonas, tales como auxina y citocininas. Es también ventajoso añadir ácido glutámico y prolina al medio, especialmente para las especies tales como el maíz y la alfalfa. La regeneración eficaz dependerá del medio, del genotipo y de la historia del cultivo. Si se controlan estas tres variables, entonces la regeneración es usualmente reproducible y repetible.
Una vez que la casete de expresión queda incorporada de manera estable en las plantas transgénicas, puede transferirse a otras plantas por cruzamiento sexual. Puede usarse cualquiera de una serie de técnicas de reproducción convencionales, dependiendo de las especies a cruzar.
Una vez producidas las plantas transgénicas de este, las mismas plantas pueden cultivarse de acuerdo con los procedimientos convencionales con la presencia del gen que codifica el inductor de la respuesta hipersensible dando como resultado para la planta la resistencia al estrés. Como alternativa, se recuperan las semillas transgénicas o propágulos (por ejemplo, los esquejes) de las plantas transgénicas. Las semillas pueden plantarse entonces en la tierra y cultivarse usando los procedimientos convencionales para producir plantas transgénicas. Las plantas transgénicas se propagan a partir de las semillas transgénicas plantadas bajo condiciones eficaces para impartir resistencia al estrés a las plantas. Sin tener la intención de estar ligados a la teoría, tal resistencia al estrés puede estar mediada por el ARN o puede ser el resultado de la expresión del polipéptido o proteína inductor.
Cuando se usan plantas y semillas de plantas transgénicas según la presente invención, éstas pueden tratarse además con los mismos materiales que se usan para tratar las plantas y las semillas a las que se aplica un inductor de la respuesta hipersensible según la presente invención. Estos otros materiales, incluido un inductor de la respuesta hipersensible según la presente invención, pueden aplicarse a las plantas transgénicas y a las semillas de plantas por medio de los procedimientos indicados anteriormente, incluidos la vaporización a presión alta o baja, la inyección, el recubrimiento y la inmersión. De manera similar, después de que las plantas se hayan propagado a partir de las semillas de la planta transgénica, las plantas pueden tratarse con una o más aplicaciones del inductor de la respuesta hipersensible según la presente invención para conferir resistencia al estrés. Tales plantas pueden también tratarse con agentes convencionales de tratamiento de plantas (por ejemplo, insecticidas, fertilizantes, etc.).
Ejemplos Ejemplo 1 El algodón tratado con inductor de respuesta hipersensible es más resistente al daño causado por el estrés por insecticidas
Los áfidos (Aphids gossypii) infectan el algodón durante toda la estación de crecimiento. El daño de la infección por los áfidos varía desde el depósito de melaza que contamina la pelusa y reduce el valor del cultivo hasta el deshoje que reduce o destruye los cultivos. Para proteger las plantas de la infección por áfidos, el algodón se pulveriza por lo general con insecticidas, por ejemplo Asana XL cuando la presión de la infección no es muy alta, y Admire cuando la presión de la infestación es alta. El efecto de un inductor de respuesta hipersensible sobre los áfidos en el algodón se estudió por medio de un ensayo que incluía un diseño de bloque completo aleatorizado. Éste implicaba el tratamiento con el inductor de respuesta hipersensible de Erwinia amylovora (es decir, HP-1000^{TM}) a 20, 60 y 80 ppm y un insecticida químico, Asana XL, a 561 g/ha (8 oz./ac). Cada tratamiento incluía la aplicación foliar comenzando en el cotiledón hasta tres hojas verdaderas y a partir de entonces en intervalos de 14 días usando un pulverizador de mochila. Se realizaron los recuentos de áfidos y el crecimiento global del algodón inmediatamente antes de la aplicación de la pulverización a los 14, 28, 35 y 42 días después del primer tratamiento ("DAT 1"). Se recogieron veinticinco hojas seleccionadas aleatoriamente por parcela en las primeras tres fechas de muestreo y las hojas por parcela en la fecha final de muestreo.
Resultados
1. Control de áfidos: El número de áfidos en el algodón tratado con inductor de respuesta hipersensible se redujo significativamente con respecto al algodón tratado químicamente (véase Tabla 1).
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TABLA 1 Recuento de áfidos por hoja en el algodón tras el tratamiento con Asana XL® o HP-1000^{TM}
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A los 14 días tras DAT 1, los recuentos de áfidos fueron relativamente bajos a través de todos los tratamientos, pero a los 28 días tras DAT 1 (momento en el que se habían aplicado dos pulverizaciones), el número de áfidos por hoja fue significativamente mayor en las plantas tratadas con Asana XL comparado con los algodones tratados con inductor de respuesta hipersensible. A los 35 días tras DAT 1 (momento en el que se habían aplicado tres pulverizaciones), los recuentos de áfidos habían subido para todos los tratamientos, con todo, los recuentos de áfidos por hoja todavía eran significativamente más bajos para el algodón tratado con inductor de respuesta hipersensible comparado con el tratamiento con Asana XL. Finalmente, a los 42 días tras DAT 1 (momento en el que se habían aplicado cuatro pulverizaciones), el número de áfidos por hoja había aumentado hasta un nivel que amenazaba vencer a las plantas incluso cuando se trataban con el insecticida químico convencional. Para salvar el ensayo, se aplicó otro producto químico, Pravado (Admire), a todas las parcelas para erradicar los áfidos del campo.
2. El algodón tratado con inductor de respuesta hipersensible fue más resistente al daño causado por Pravado (Admire) y Asana. Después de la segunda pulverización química, se observó que las plantas de algodón sufrían estrés por los insecticidas. Las plantas de algodón tratadas previamente con Asana y las de control no tratadas quedaron deshojadas. En la mayoría de las plantas de algodón tratadas con producto químico, no había hojas, o había muy pocas hojas, en la parte más baja de las plantas. Sin embargo, las plantas tratadas con el inductor de respuesta hipersensible, especialmente en la parcela donde el inductor de respuesta hipersensible se aplicó a 80 ppm, no tenían deshoje y las plantas de algodón eran vigorosas y sanas. Por el recuento del número de bolas maduras, se mostró claramente que las plantas tratadas con el inductor de respuesta hipersensible (a 80 ppm) tenían más grupos de bolas que las tratadas con producto químico y las de control sin tratar (Tabla 2), indicando que las plantas tratadas con el inductor de respuesta hipersensible eran más tolerantes al estrés provocado por el insecticida.
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TABLA 2 Número de bolas de algodón formadas contadas en diez plantas en cada una de cuatro repeticiones por tratamiento
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Ejemplo 2 Los pepinos tratados con inductor de respuesta hipersensible son más resistentes a la sequía (sólo ejemplo comparativo)
Se creó un ensayo de campo de pepinos para probar el efecto del inductor de respuesta hipersensible de Erwinia amylovora en el control de la enfermedad, la tolerancia al estrés por la sequía y el rendimiento. Se probaron tres diferentes tasas, a 15, 30 y 60 \mug/ml. Además del tratamiento con el inductor de respuesta hipersensible, había un control sin tratamiento. Cada tratamiento contenía tres parcelas por duplicado. Al brotar la primera hoja verdadera, se pulverizó el inductor de respuesta hipersensible con un pulverizador de mochila. La segunda pulverización se aplicó diez días después de la primera pulverización. La tercera aplicación fue justo después de la recuperación de las plántulas de pepino después del trasplante en el campo. El tratamiento individual se asignó aleatoriamente en el campo.
Cuando brotó la primera hoja verdadera (Día 0), se pulverizó una primera aplicación. Usualmente, las plántulas del pepino se trasplantan cuando las plántulas muestran dos hojas verdaderas. Se ha sabido que la tasa de recuperación después del trasplante está estrechamente relacionada con los tamaños de las plántulas. Debido a la sequía, las plántulas se mantuvieron en el vivero durante diez días más y la segunda pulverización se aplicó en el Día 10. Dos días después de la segunda pulverización, las plantas se trasplantaron en los campos y se cubrieron con láminas de plástico. Las plantas tenían 4-5 hojas verdaderas.
Resultado
La tasa de recuperación de las plántulas de pepino trasplantadas fue más alta para las plantas tratadas con el inductor de respuesta hipersensible que para el control sin tratar. Más del 80% de las plántulas de pepino tratadas con el inductor de respuesta hipersensible sobrevivieron, mientras que sólo sobrevivió el 57% de las plantas no tratadas.
A lo largo de la estación de crecimiento hubo un serio problema de sequía. Las visitas tempranas a los campos indicaron que las plantas tratadas con el inductor de respuesta hipersensible tenían más masa de raíces y mejor crecimiento global. El pepino tratado con el inductor de respuesta hipersensible comenzó a florecer 14 días antes que el pepino de control no tratado. La floración temprana dio como resultado una cosecha más temprana. En la primera cosecha, se recogieron más de 0,4 kilogramos de frutos de pepino por planta de los pepinos tratados con el inductor de respuesta hipersensible; sin embargo, virtualmente no se recogieron frutos de los controles no tratados. Al final de la estación, las plantas no tratadas murieron por la sequía grave, pero las plantas tratadas con el inductor de respuesta hipersensible aún estaban vivas y tuvieron una cosecha más.
El rendimiento final fue significativamente diferente entre las plantas tratadas con el inductor de respuesta hipersensible y las plantas sin tratar. El inductor de respuesta hipersensible administrado en una tasa de 30 ppm produjo un rendimiento tres veces mayor que las plantas de control (Tabla 3).
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TABLA 3 Aumento del rendimiento de fruto del pepino a partir de plantas tratadas con el inductor de respuesta hipersensible
38
El mayor rendimiento se atribuyó parcialmente a la mejora del crecimiento inducida por el inductor de respuesta hipersensible y resultó parcialmente de una mayor tolerancia del pepino tratado con el inductor de respuesta hipersensible a la sequía, porque usualmente el aumento del rendimiento por la mejora del crecimiento inducida por el inductor de respuesta hipersensible es de entre 10 y 40%.
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Ejemplo 3 El pimiento tratado con inductor de respuesta hipersensible es más tolerante al estrés por herbicidas
Las plántulas de pimiento se empaparon con inductor de respuesta hipersensible a 20 ppm siete días antes del trasplante, se pulverizaron siete días después del trasplante, y a continuación, se pulverizaron cada catorce días. Se usaron los productos químicos convencionales, Brave, Maneb, Kocide y Admire, para el resto del tratamiento. Además de la mejora temprana del crecimiento, que dio como resultado un rendimiento más alto, un fruto más grande, y resistencia a varias enfermedades, el pimiento tratado con inductor de respuesta hipersensible fue más tolerante al daño por herbicidas. El campo de pimientos recibió la aplicación del herbicida SENCOR que no está etiquetado para el pimiento. Se sabe que este herbicida provoca daño foliar grave al pimiento en plantas tratadas con productos químicos pero no con las plantas tratadas con inductor de respuesta hipersensible.
La diferencia entre el efecto adverso del herbicida en las plantas tratadas con inductor de respuesta hipersensible y en las plantas no tratadas con inductor de respuesta hipersensible es espectacular. Véase Tabla 4 a continuación. Treinta y nueve de las 60 plantas tratadas con inductor mostraron solamente daños menores por el herbicida, las hojas dañadas fueron menos del 20%. En cambio, 53 de las 60 plantas de pimiento tratadas con productos químicos tuvieron daños graves, el 40-57% de las hojas estaban dañadas, y 20 plantas murieron. La capacidad del inductor de respuesta hipersensible para ayudar a los cultivos a resistir los efectos fitotóxicos de un herbicida es una ventaja muy importante en la industria agrícola.
TABLA 4 Los pimientos tratados con inductor de respuesta hipersensible son más tolerantes al daño con herbicidas
39
Clasificación de daños: 1. Sin daños; 2. 0-20% de las hojas dañadas; 3. 20-40% de las hojas dañadas; 4. 40-50% de las hojas dañadas; 6. Más del 75% de las hojas dañadas o planta completa muerta.
Índice de daño = suma de cada clasificación por el número de plantas bajo la escala de clasificación, dividido por el número total de plantas por 6.
Índice de daño para plantas tratadas con inductor de respuesta hipersensible = 1x1 + 2x38 + 3x17 + 4x3 + 5x1 + 6x0 x 100% = 41%
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Ejemplo 4 El pimiento tratado con inductor de respuesta hipersensible es más tolerante al estrés por herbicidas bajo condiciones experimentales controladas
Se realizó un ensayo de campo para probar si el pimiento tratado con inductor de respuesta hipersensible sería más tolerante al estrés por herbicidas. El ensayo contiene 6 tratamientos y 4 repeticiones para cada tratamiento. Los tratamientos se describen de la siguiente manera:
1. Control, los pimientos no se trataron ni con un inductor de respuesta hipersensible ("HR") ni con el herbicida LEXONE^{TM} (DuPont Agricultural Products, Wilmington, Delaware).
2. Pimiento de control con aplicación de 0,168 kg/ha (0,15 libras/acre) del herbicida LEXONE^{TM}.
3. Pimiento de control con aplicación de 0,336 kg/ha (0,3 libras/acre) del herbicida LEXONE^{TM}.
4. Se usó el tratamiento con inductor de HR sin la aplicación del herbicida LEXONE^{TM} usando un producto formulado conocido como biopesticida MESSENGER^{TM} (Eden Bioscience Corporation, Bothell, Washington) que contiene proteína inductora HR al 3%.
5. Tratamiento con inductor HR con la aplicación de 0,168 kg/ha (0,15 libras/acre) del herbicida LEXONE^{TM}.
6. Tratamiento con inductor HR con la aplicación de 0,336 kg/ha (0,3 libras/acre) del herbicida LEXONE^{TM}.
LEXONE^{TM} contiene los mismos compuestos activos que el herbicida SENCOR^{TM} (Bayer, Kansas City, Missouri) usado en el Ejemplo 3. Las plántulas de pimiento se empaparon con disolución de MESSENGER^{TM} a la concentración de la proteína inductora de HR de aproximadamente 20 ppm siete días antes de transplantarlas en el campo y a continuación se vaporizaron cada 14 días después del transplante. Se aplicó LEXONE en niveles altos (0,336 kg/ha (0,3 libras/acre)) y a niveles bajos (0,168 kg/ha (0,15 libras/acre)). Se introdujeron 190 litros (50 galones) de agua y 100 ml de la disolución del herbicida en la zona de la raíz de cada planta en el tratamiento respectivo cinco semanas después del transplante en el campo.
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Se evaluó el porcentaje de clorosis de los tratamientos causado por la aplicación del herbicida LEXONE^{TM} y se evaluó el rendimiento de pimiento. Las plantas tratadas con inductor de HR expuestas a altas tasas de herbicida tuvieron significativamente menos clorosis y produjeron 108% más fruto comparado con las plantas tratadas con inductor de respuesta no hipersensible expuestas a la misma cantidad de herbicida. Véanse Tablas 5 y 6 a continuación. No hubo diferencias significativas en la reducción de clorosis en la tasa de herbicida baja entre los pimientos tratados con el inductor de HR y los sin tratar con el inductor de HR. Sin embargo, las plantas tratadas con el inductor de HR produjeron 15% más de fruto que las plantas de control correspondientes expuestas a la misma cantidad de herbicida. No hubo clorosis ni en las plantas de control ni en las plantas tratadas con inductor de HR que no recibieron el tratamiento con el herbicida LEXONE^{TM}.
Las plantas tratadas con inductor de HR fueron vieron afectadas con mucho menor gravedad por la aplicación del herbicida que las plantas de control respectivas en la tasa de herbicida alta. Sin embargo, la cantidad de clorosis visual fue similar en la tasa baja tanto para las plantas de control como para las tratadas con inductor de HR. De manera importante, los rendimientos tanto de los tratamientos de herbicidas en tasa alta como baja de plantas tratadas con inductor de HR se vieron afectados con menor gravedad por el herbicida que los controles. Estos hallazgos confirman además que los inductores de HR pueden ayudar a que los cultivos resistan los efectos fitotóxicos de los herbicidas y son muy ventajosos para la industria agrícola.
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TABLA 5 Reducción de la clorosis foliar y aumento en el rendimiento en plantas tratadas con inductor de respuesta hipersensible tras la exposición al herbicida LEXONE^{TM}
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TABLA 6 Peso de los pimientos cosechados en plantas tratadas con inductor de respuesta hipersensible tras la exposición al herbicida LEXONE^{TM} comparado con plantas de control
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Ejemplo 5 El algodón tratado con inductor de respuesta hipersensible es más tolerante al estrés por la sequía (sólo ejemplo comparativo)
Un ensayo de algodón sin riego experimentó 26 días consecutivos de sequía. El índice de calor diario medio era de aproximadamente 37,8ºC (100 grados F) o superior, que se añadía al estrés que soportaban las plantas en el campo.
Las observaciones en el campo indicaban que las plantas tratadas con inductor de HR a la concentración de 15 ppm (62,4 g (2,2 onzas) de producto formulado, MESSENGER^{TM} conteniendo el componente activo, proteína inductora de HR, al 3%) eran más vigorosas y tenían menos deshoje que las plantas de control como resultado del estrés por el calor y la sequía. Se recogieron cuidadosamente cantidades iguales de plantas de las parcelas tratadas con MESSENGER^{TM} y sin tratamiento con MESSENGER^{TM} del campo y se analizó el mapa del número de nodos y cápsulas por posición. También se pesaron las plantas en una balanza analítica Metler para determinar el peso de la planta completa, la raíz y los brotes.
Las plantas tratadas con MESSENGER^{TM} sobrevivieron al estrés del calor y la sequía mucho mejor que las plantas sin tratar. Las plantas tratadas con MESSENGER^{TM} tenían una masa de raíz y brotes 37,6% mayor que las plantas de control (Tabla 7). Las plantas tratadas con MESSENGER^{TM} también tenían significativamente más cápsulas de algodón que las plantas de control (Tabla 8). El número de cápsulas de algodón de las posiciones 1 y 2 tiene una contribución significativa al rendimiento global. La Tabla 8 mostró que las plantas tratadas con MESSENGER^{TM} tenían 47% más cápsulas en las posiciones 1 y 2 y 57% más cápsulas de una planta completa comparado con el rendimiento alcanzado usando un tratamiento de crecimiento convencional (es decir sin tratamiento con MESSENGER^{TM}). Una reacción común al estrés en el algodón es que la planta aborte las cápsulas. Los resultados indican que las plantas tratadas con MESSENGER^{TM} son más tolerantes al estrés por la sequía.
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TABLA 7 Peso por planta de algodón no regado después de 26 días de sequía
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TABLA 8 Número de cápsulas por 5 plantas en las posiciones número 1 y 2 y número total de cápsulas de plantas completas en algodón no regado tras 26 días de sequía
44
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Ejemplo 6 El tomate tratado con inductor de respuesta hipersensible es más tolerante a la carencia de calcio
El calcio es un elemento importante para la fisiología y el desarrollo de la planta. Una carencia de calcio puede provocar varias enfermedades en las plantas. Por ejemplo, la podredumbre apical tiene como causa una carencia localizada de calcio en el extremo distal del fruto del tomate. Como el calcio no es un elemento muy móvil, puede aparecer una carencia con una fluctuación en el suministro de agua. En el pasado, los cultivadores del tomate experimentaban niveles más elevados de podredumbre apical durante períodos de condiciones ambientales secas cuando las tormentas de lluvias infrecuentes descargaban mucha agua y posteriormente se volvía con rapidez a una condición de sequedad y calor. Disminuir o aumentar el nivel freático de riego de manera irregular durante una estación de crecimiento seca y caliente también puede aumentar la enfermedad.
Se diseñó un ensayo de campo para probar si el tomate tratado con proteína inductora de HR podía ser más tolerante a la carencia de calcio bajo una estación de crecimiento seca y caliente. Para el ensayo se usó MESSENGER^{TM}, el producto formulado que contiene inductor de HR al 3%. La tasa de aplicación del MESSENGER^{TM} fue de 159 g/ha (2,27 oz. por acre). La primera pulverización de MESSENGER^{TM} se realizó 7 días antes del trasplante y posteriormente cada 14 después de trasplantar. Se compararon los tomates tratados con MESSENGER^{TM} con un tratamiento de crecimiento convencional sin utilizar MESSENGER^{TM}. Cada tratamiento tuvo 4 repeticiones.
Se contó la cantidad de frutos infectados de un campo de 9,29 metros cuadrados (100 pies cuadrados). La podredumbre comienza típicamente con lesiones de color canela claro empapadas de agua, que posteriormente aumentan, y a continuación se vuelven negras. En un sondeo, aproximadamente el 20% de los frutos estaban infectados. En el tratamiento convencional aparecieron síntomas de podredumbre apical grave; sin embargo, un promedio de solamente 2,5% de los frutos estaban infectados en las plantas tratadas con MESSENGER^{TM}. Los datos de la cosecha mostraron que las plantas tratadas con MESSENGER^{TM} tenían 8% más de fruto comercializable (Tabla 9). Los resultados de la prueba demostraron que el tratamiento con MESSENGER^{TM} puede reducir el estrés resultante de la carencia de calcio y aumentar la resistencia de la planta a la podredumbre apical.
TABLA 9 El tratamiento con inductor de respuesta hipersensible redujo la podredumbre apical y aumentó el rendimiento del fruto del tomate
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<110> Eden Bioscience Corporation
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<120> RESISTENCIA AL ESTRÉS INDUCIDA POR UN INDUCTOR DE RESPUESTA HIPERSENSIBLE
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<130> 21829/42
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<140>
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<141>
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\vskip0.400000\baselineskip
<150> 60/107.243
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<151> 05-11-1998
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<160> 18
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<170> PatentIn Ver. 2.0
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<210> 1
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<211> 338
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<212> PRT
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<213> Erwinia chrysanthemi
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<400> 1
46
47
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<210> 2
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<211> 2141
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<212> ADN
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<213> Erwinia chrysanthemi
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<400> 2
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48
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<210> 3
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<211> 403
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<212> PRT
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<213> Erwinia amylovora
\newpage
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<400> 3
49
50
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<210> 4
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<211> 1288
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<212> ADN
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<213> Erwinia amylovora
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<400> 4
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51
52
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<210> 5
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<211> 1344
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<212> ADN
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<213> Erwinia amylovora
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<400> 5
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53
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<210> 6
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<211> 447
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<212> PRT
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<213> Erwinia amylovora
\newpage
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<400> 6
54
55
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<210> 7
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<211> 5517
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<212> ADN
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<213> Erwinia amylovora
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<400> 7
56
57
58
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<210> 8
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<211> 1838
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<212> PRT
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<213> Erwinia amylovora
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\vskip0.400000\baselineskip
<400> 8
59
60
61
62
63
64
65
66
\hskip0.8cm
67
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<210> 9
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<211> 420
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<212> ADN
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<213> Erwinia amylovora
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<400> 9
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68
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<210> 10
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<211> 139
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<212> PRT
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<213> Erwinia amylovora
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<400> 10
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69
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<210> 11
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<211> 341
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<212> PRT
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<213> Pseudomonas syringae
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<400> 11
70
71
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<210> 12
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<211> 1026
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<212> ADN
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<213> Pseudomonas syringae
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<400> 12
72
73
\vskip1.000000\baselineskip
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<210> 13
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<211> 1729
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<212> ADN
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<213> Pseudomonas syringae
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<400> 13
74
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<210> 14
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<211> 424
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<212> PRT
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<213> Pseudomonas syringae
\newpage
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 14
75
76
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<210> 15
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<211> 344
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
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<213> Pseudomonas solanacearum
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<400> 15
77
78
79
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<210> 16
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<211> 1035
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<212> ADN
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<213> Pseudomonas solanacearum
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 16
80
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<210> 17
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<211> 26
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<212> PRT
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<213> Xanthomonas campestris pv. glycines
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<400> 17
81
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<210> 18
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 20
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
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<213> Xanthomonas campestris pv. pelargonii
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 18
82

Claims (18)

1. Un procedimiento para conferir a las plantas resistencia al estrés que comprende:
aplicar una proteína o un polipéptido inductor de la respuesta hipersensible en una forma no infecciosa a una planta o semilla de planta bajo condiciones eficaces para conferir resistencia frente al estrés por contaminación del aire, estrés químico, estrés nutricional o frente al estrés relacionado con el clima seleccionado del grupo constituido por las heladas, la temperatura fría, la temperatura elevada, la luz excesiva y la luz insuficiente.
2. Un procedimiento para conferir a las plantas resistencia al estrés que comprende:
suministrar una planta o semilla de planta transgénica transformada con una molécula de ADN que codifica una proteína o un polipéptido inductor de la respuesta hipersensible y
cultivar la planta o plantas transgénicas producidas a partir de las semillas de plantas transgénicas bajo condiciones eficaces para conferir resistencia frente estrés por contaminación del aire, estrés químico, estrés nutricional o frente al estrés relacionado con el clima seleccionado del grupo constituido por las heladas, la temperatura fría, la temperatura elevada, la luz excesiva y la luz insuficiente.
3. Un procedimiento según la reivindicación 2, en el que dicho suministro se lleva a cabo suministrando una planta transgénica.
4. Un procedimiento según la reivindicación 2, en el que dicho suministro se lleva a cabo suministrando una semilla de planta transgénica, comprendiendo dicho procedimiento además:
plantar las semillas transgénicas en tierra natural o artificial y
propagar las plantas a partir de las semillas plantadas en la tierra.
5. Un procedimiento según una cualquiera de las reivindicaciones anteriores, en el que el estrés es estrés químico donde el producto químico se selecciona del grupo constituido por insecticidas, fungicidas, herbicidas y metales pesados.
6. Un procedimiento según una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 4, en el que el estrés es estrés relacionado con el clima seleccionado del grupo constituido por heladas, temperatura fría, temperatura elevada, luz excesiva y luz insuficiente.
7. Un procedimiento según una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 4, en el que el estrés es estrés por contaminación del aire seleccionado del grupo constituido por dióxido de carbono, monóxido de carbono, dióxido de azufre, NO_{x}, hidrocarburos, ozono, radiación ultravioleta y lluvia ácida.
8. Un procedimiento según una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 4, en el que el estrés es estrés nutricional donde el estrés nutricional está causado por fertilizantes, micronutrientes o macronutrientes.
9. Un procedimiento según una cualquiera de las reivindicaciones anteriores, en el que la proteína o el polipéptido inductor de la respuesta hipersensible deriva de Erwinia, Pseudomonas, Xanthomonas, Phytophthora o Clavibacter.
10. Un procedimiento según una cualquiera de las reivindicaciones anteriores, en el que la proteína o el polipéptido inductor de la respuesta hipersensible deriva de Erwinia amylovora, Erwinia carotovora, Erwinia chrysanthemi y Erwinia stewartii.
11. Un procedimiento según una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 9, en el que la proteína o el polipéptido inductor de la respuesta hipersensible deriva de Pseudomonas syringae o Pseudomonas solancearum.
12. Un procedimiento según una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 9, en el que la proteína o el polipéptido inductor de la respuesta hipersensible deriva de una especie de Xanthomonas.
13. Un procedimiento según una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 9, en el que la proteína o el polipéptido inductor de la respuesta hipersensible deriva de una Phytophthora.
14. Un procedimiento según una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 9, en el que la proteína o el polipéptido inductor de la respuesta hipersensible deriva de Clavibacter michiganensis subsp. sepedonicus.
15. Un procedimiento según una cualquiera de las reivindicaciones anteriores, en el que dicha aplicación se lleva a cabo aplicando la proteína o el polipéptido inductor de la respuesta hipersensible a la planta en una forma no infecciosa.
16. Un procedimiento según una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 14, en el que dicha aplicación se lleva a cabo aplicando la proteína o el polipéptido inductor de la respuesta hipersensible a una semilla de planta en una forma no infecciosa, comprendiendo dicho procedimiento además:
plantar las semillas tratadas con la proteína o el polipéptido inductor de la respuesta hipersensible en tierra natural o artificial y
propagar las plantas a partir de las semillas plantadas en la tierra.
17. Un procedimiento según una cualquiera de las reivindicaciones anteriores, en el que la planta se selecciona del grupo constituido por alfalfa, arroz, trigo, cebada, centeno, algodón, girasol, cacahuete, maíz, patata, boniato, judía, guisante, achicoria, lechuga, endivia, col, col de Bruselas, remolacha, chirivía, coliflor, brécol, nabo, rábano, espinaca, cebolla, ajo, berenjena, pimiento, apio, zanahoria, calabacín, calabaza, calabacín zucchini, pepino, manzana, pera, melón, cítricos, fresa, uva, frambuesa, piña, soja, tabaco, tomate, sorgo y caña de azúcar.
18. Un procedimiento según una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 16, en el que la planta se selecciona del grupo constituido por Arabidopsis thaliana, Saintpaulia, petunia, pelargonio, flor de pascua, crisantemo, clavel y zinnia.
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