ES2341270T3 - Complejos rhigf-i/rhigfbp-3 purificados y procedimientos de fabricacion de los mismos. - Google Patents

Complejos rhigf-i/rhigfbp-3 purificados y procedimientos de fabricacion de los mismos. Download PDF

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Abstract

Una proteína aislada que comprende un complejo de factor de crecimiento semejante a insulina I (IGF-I) y proteína 3 de unión al factor de crecimiento semejante a insulina (IGFBP-3), teniendo dicha proteína una pureza de al menos un 96% como se mide por CM-HPLC analítica.

Description

Complejos rhIGF-I/rhIGFBP-3 purificados y procedimiento de fabricación de los mismos.
Campo de la invención
La presente invención se refiere a composiciones que comprenden complejos ultrapuros de factor de crecimiento semejante a insulina I y proteína-3 de unión a factor de crecimiento semejante a insulina, y a procedimientos para fabricarlas.
Descripción de la técnica relacionada
IGF-I/IGFBP-3 es un complejo proteico de factor de crecimiento semejante a insulina-I ("IGF-I") y proteína-3 de unión a factor de crecimiento semejante a insulina ("IGFBP-3"). IGF-I es un pequeño polipéptido con fuerte homología estructural y funcional con la pro-insulina. Como tal, el IGF-I induce muchos de los efectos fisiológicos de la insulina.
Pueden usarse complejos IGF-I/IGFBP-3 para el tratamiento de una amplia serie de trastornos (véanse, por ejemplo, las patentes de Estados Unidos Nº 5.681.818, 5.723.441, 5.948.757, 6.015.786, 6.017.885, 6.025.332, 6.025.368, 6.514.937 y 6.518.238). En individuos sanos, el IGF-I puede encontrarse dentro de la circulación sanguínea unido a otras proteínas. Por ejemplo, el IGF-I se encuentra con frecuencia unido a IGFBP-3, la proteína de unión a IGF-I más abundante. El complejo IGF-I/IGFBP-3 se asocia con una proteína de subunidad susceptible a ácidos, formando un complejo de 150 kD. Véase Adams y col., Prog. Growth Factor Res. 6(2-4):347-56 (1995). Este complejo ternario grande sirve como reservorio circulatorio de IGF-I ya que los complejos IGF-I/IGFBP-3 presentan una mayor semivida y mejor estabilidad que el IGF-I libre. Véase Adams y col., supra, y Blum y col. (1991), Plasma IGFBP-3 Levels as Clinical Indicators, en Modern Concepts of Insulin-like Growth Factors, pág. 381-93, E.M. Spencer, ed., Elsevier, New York.
IGF-I, IGFBP-3 y los complejos IGF-I/IGFBP-3 pueden obtenerse a partir de fuentes naturales o por técnicas recombinantes. Puede usarse tecnología recombinante para producir IGF-I, IGFBP-3 y complejos IGF-I/IGFBP-3 en organismos eucariotas y procariotas (véanse, por ejemplo, las patentes de Estados Unidos Nº 5.200.509, 5.670.341, 5.789.547 y 6.417.330). IGF-I, IGFBP-3 y los complejos IGF-I/IGFBP-3 recombinantes pueden cultivarse en formatos discontinuos o continuos, recogiéndose el sobrenadante de cultivo celular o las propias células recombinantes.
IGF-I, IGFBP-3 y los complejos IGF-I/IGFBP-3 típicamente se purifican después de la expresión en sistemas recombinantes usando técnicas tales como cromatografía de exclusión molecular, cromatografía de interacción hidrófoba y cromatografía de intercambio iónico. Sin embargo, estas técnicas no pueden eliminar todas las impurezas. Por ejemplo, los complejos IGF-I/IGFBP-3 típicamente están presentes en preparaciones parcialmente purificadas que contienen agregados de proteína. Además, se han descubierto nuevas impurezas tales como variantes de masa y de carga de IGFBP-3 que no se eliminan por procedimientos de la técnica anterior. La Figura 1 proporciona un gráfico de intercambio catiónico obtenido a partir de la cromatografía de intercambio iónico con carboximetilo ("CM-IEX") en gradiente lineal de muestras que comprenden complejos IGF-I/IGFBP-3 y agregados de proteína. La Figura 2 proporciona un análisis de CL/EM de complejos IGF-I/IGFBP-3 purificados usando CM-IEX de gradiente lineal que muestra variantes de masa y de carga descubiertas recientemente. La Patente de Estados Unidos Nº 5.789.547 describe un procedimiento para replegar el factor de crecimiento semejante a insulina I (IGF-I) y la proteína de unión a factor de crecimiento semejante a insulina 3 (IGFBP-3). El procedimiento descrito incluye el co-plegamiento de las dos proteínas purificadas y desnaturalizadas, expresadas por separado, para solucionar problemas relacionados con la expresión recombinante, es decir, un mal plegamiento y una baja solubilidad. La Patente de Estados Unidos Nº 6.417.330 se refiere a variantes de IGFBP, particularmente a variantes de IGFBP-3 que son resistentes a la hidrólisis, tienen secuencias de localización nuclear alteradas o tienen extensiones N-terminales. Las variantes de proteínas se obtienen por expresión recombinante y purificación por cromatografía de intercambio catiónico y se describe que puede ayudarse al plegamiento correcto de estas proteínas por una reacción de co-plegamiento con IGF.
En las técnicas farmacéuticas está bien establecido que es muy deseada la pureza de un fármaco y que incluso pequeñas mejoras en la pureza del fármaco son mejoras importantes. Esto se debe al hecho de que las impurezas pueden tener un impacto imprevisto sobre la estabilidad, seguridad o eficacia del fármaco. Por consiguiente, son intrínsecamente útiles y se necesitan procedimientos mejorados para purificar complejos IGF-I/IGFBP-3.
Sumario
En una realización, la presente invención se refiere a una proteína aislada que comprende un complejo de factor de crecimiento semejante a insulina I ("IGF-I") y proteína de unión a factor de crecimiento semejante a insulina 3 ("IGFBP-3"), teniendo la proteína aislada una pureza de al menos el 96%, una pureza de al menos el 97%, una pureza de al menos el 98% o una pureza de al menos el 99%, como se mide por CM-HPLC analítica.
En una realización, el complejo comprende IGF-I e IGFBP-3 en una relación molar de aproximadamente 0,8:1 a aproximadamente 1,2:1. En otra realización, la relación molar es aproximadamente 1:1.
También se proporcionan composiciones farmacéuticas que comprenden una proteína aislada que comprende un complejo de IGF-I e IGFBP-3 y un vehículo farmacéuticamente aceptable, teniendo la proteína una pureza de al menos el 96%, al menos el 97%, al menos el 98% o al menos el 99% como se mide por CM-HPLC analítica.
Se proporcionan procedimientos para purificar un complejo de IGF-I e IGFBP-3 que comprenden obtener un complejo de IGF-I e GFBP-3, purificar parcialmente el complejo IGF-I/IGFBP-3, adsorber el complejo en una fase estacionaria, desorber el complejo usando una multiplicidad de fases móviles, comprendiendo las fases móviles una serie de fuerzas iónicas secuencialmente crecientes, y recuperar el complejo de IGF-I e IGFBP-3 purificado. En una realización, la fase estacionaria es una resina de intercambio catiónico. En otra realización, la resina de intercambio catiónico contiene grupos carboximetilo funcionales. El complejo rhIGF-I/rhIGFBP-3 es un complejo proteico cargado, pero pueden producirse modificaciones sutiles en el complejo proteico que reducen la carga del complejo en 1 a 5 unidades positivas. Esto puede conseguirse por neutralización de una o más cargas positivas o por introducción de una o más cargas negativas. Los ejemplos de modificaciones que pueden cambiar la carga total en una manera de carga positiva incluyen, pero sin limitación, conjugación de amina N-terminal, conjugado de lisina, conjugación con arginina y desamidación. Al establecer dos condiciones tamponantes isocráticas, se puede separar el complejo rhIGF-I/rhIGFBP-3 nativo de un complejo rhIGF-I/rhIGFBP-3 de carga positiva reducida. El primer tampón isocrático tiene una fuerza iónica suficiente para desorber el complejo rhIGF-I/rhIGFBP-3 de carga positiva reducida mientras que queda retenido el complejo rhIGF-I/rhIGFBP-3 nativo. El segundo tampón isocrático tiene una fuerza iónica suficiente para desorber el complejo rhIGF-I/rhIGFBP-3 nativo mientras que retiene otras impurezas tales como agregados de rhIGF-I/rhIGFBP-3 y formas mal plegadas de rhIGFBP-3. La Figura 6 representa dos separaciones, usando la figura superior una resina preparativa y usando la inferior una resina analítica. La identidad de los componentes se indica encima del gráfico UV para los picos. Como alternativa, el procedimiento puede realizarse con un solo tampón que desorbe tanto el complejo rhIGF-I/rhIGFBP-3 de carga positiva reducida y el complejo rhIGF-I/rhIGFBP-3 nativo, consiguiéndose la separación durante el único tampón isocrático. Este procedimiento generalmente se usa para análisis analítico y generalmente no se usa para análisis preparativo debido al gran volumen de tampón que se necesita para conseguir la separación. Puede realizarse otro procedimiento alternativo con un primer tampón isocrático para desorber el complejo rhIGF-I/rhIGFBP-3 de carga positiva reducida seguido de un gradiente de fuerzas iónicas crecientes para eluir el complejo rhIGF-I/rhIGFBP-3 nativo y otras impurezas.
Se proporcionan procedimientos en los que la multiplicidad de fases móviles comprende una primera fase móvil y una segunda fase móvil. La primera fase móvil puede tener una concentración de NaCl al menos aproximadamente 20 mM menor que la segunda fase móvil, al menos aproximadamente 30 mM menor que la segunda fase móvil, o al menos aproximadamente 40 mM menor que la segunda fase móvil, o al menos aproximadamente 50 mM menor que la segunda fase móvil, o al menos aproximadamente 60 mM menor que la segunda fase móvil. En otra realización, la primera fase móvil comprende NaCl de aproximadamente 160 mM a aproximadamente 185 mM y la segunda fase móvil comprende NaCl de aproximadamente 200 mM a aproximadamente 250 mM. La segunda fase móvil también puede comprender NaCl aproximadamente 225 mM. La elección de la fase móvil se basa en gran medida en la cantidad de complejo rhIGF-I/rhIGFBP-3 de carga positiva reducida que se necesita eliminar para conseguir la pureza deseada y la retención relativa de la resina de intercambio catiónico.
Además, se proporcionan procedimientos para purificar un complejo parcialmente purificado de IGF-I e IGFBP-3 que comprenden adsorber el complejo IGF-I/IGFHP-3 en una resina de intercambio catiónico y desorber el complejo usando una serie de fases móviles por etapas. En una realización, las fases móviles comprenden una primera fase móvil que tiene un sistema tamponante de acetato sódico a aproximadamente pH 5,4 - 5,6 que contiene NaCl de aproximadamente 160 mM a aproximadamente 185 mM y una segunda fase móvil que tiene un sistema tamponante de acetato sódico a aproximadamente pH 5,4 - 5,6 que contiene NaCl de aproximadamente 200 mM a aproximadamente 250 mM. En otra realización, la segunda fase móvil comprende NaCl aproximadamente 225 mM.
En los procedimientos de la presente invención, las etapas de la elución isocrática por etapas se emplean usando 5-15 volúmenes de columna de fase móvil por etapa. En una realización, la primera etapa isocrática usa 5-10 volúmenes de columna de fase móvil.
Otros objetos, características y ventajas de la presente invención se harán evidentes tras la siguiente descripción detallada. La descripción detallada y los ejemplos específicos se proporcionan sólo con fines ilustrativos. Además, los ejemplos demuestran el principio de la invención.
Breve descripción de los dibujos
Figura 1 - (Superior) Purificación de rhIGF-I/rhIGFBP-3 parcialmente purificado usando una resina ToyoPearl CM-650 con un gradiente lineal de NaCl. (Inferior) Análisis de CM-HPLC analítica de las fracciones reunidas (40-47) procedentes de la purificación lineal. Por medio de este análisis, el rhIGF nativo tiene una pureza del 73,1% con respecto a otras formas variantes de carga del complejo rhIGF-I/rhIGFBP-3.
Figura 2 - (Superior) Purificación de rhIGF-I/rhIGFBP-3 parcialmente purificado usando una resina ToyoPearl CM-650 con una elución isocrática por etapas de NaCl. (Inferior) Análisis de CM-HPLC analítica de las fracciones reunidas (68-90) procedentes de la purificación isocrática. Por medio de este análisis, el rhIGF nativo tiene una pureza del 99% con respecto a otras formas variantes de carga del complejo rMGF-I/rhIGFBP-3.
Figura 3 - Purificación de rhIGF-I/rhIGFBP-3 parcialmente purificado usando una resina ToyoPearl CM-650 (Lote Nº 1) con una elución isocrática por etapas con NaCl 175 mM y 225 mM.
Figura 4 - Purificación de rhIGF-I/rhIGFBP-3 parcialmente purificado usando una resina ToyoPearl CM-650 (Lote Nº 2) con una elución isocrática por etapas con NaCl 185 mM y 225 mM. Los encartes son un análisis espectrofotométrico de masas de un agrupamiento de iones de IGFHP-3 encontrado en las fracciones reunidas; véase también la Figura 8.
Figura 5 - Purificación de rhIGF-I/rhIGFBP-3 parcialmente purificado usando una resina ToyoPearl CM-650 (Lote Nº 3) con una elución isocrática por etapas de NaCl 165 mM y 225 mM.
Figura 6 - Comparación de los perfiles de elución observados usando una resina CM preparativa (ToyoPearl CM-650) en comparación con una resina CM analítica (Tosho BioSep TSK Gel CM-5PW).
Figura 7 - (Superior) Cromatograma de conjunto de variantes de masa Nº 2 e (Inferior) conjunto de variantes de masa Nº 1 por RP-HPLC.
Figura 8 - (Superior) Espectros sumados para el pico de IGFBP-3 para el conjunto de variantes de masa Nº 2, (Central), conjunto de variantes de masa Nº 1, e (Inferior) rhIGF-I/rhIGFBP-3 nativo. Se muestra el agrupamiento de iones correspondiente al estado de carga + 18 de IGFBP-3.
Figura 9 - MaxEnt del pico de IGFBP-3 para el conjunto de variantes de masa Nº 2. La forma de variante de masa de IGFBP-3 presenta una masa de 28.988.
Figura 10 - MaxEnt del pico de IGFBP-3 para el conjunto de variantes de masa Nº 1. La variante de masa de IGFBP-3 presenta una masa de 28.909.
Figura 11 - Espectros de péptido N-terminal de IGFBP-3 para el conjunto de variantes de masa Nº 1 en comparación con el patrón de referencia rhIGF-I/rhIGFBP-3. El conjunto de variantes de masa Nº 1 presenta dos masas de péptidos N-terminales de IGFBP-3 observadas. La forma de variante de masa de IGFBP-3 tiene una masa observada de 1608,7576 frente al péptido no modificado que presenta una masa de 1502,6,997 amu.
Descripción detallada
Se proporcionan complejos de IGF-I e IGFBP-3 con nuevos niveles de pureza. Se han desarrollado técnicas cromatográficas que eliminan contaminantes, tales como variantes de masa y carga de IGFBP-3. Las nuevas técnicas permiten la producción de composiciones farmacéuticas de alta calidad que comprenden complejos IGF-I/IGFBP-3.
Sorprendentemente, se descubrió que los procedimientos previos de fabricación producían composiciones de la técnica anterior de complejos IGF-I/IGFBP-3 parcialmente purificados que contenían variantes de masa y carga de IGFBP-3. La Figura 1 (superior) demuestra el procedimiento de purificación de la técnica anterior del complejo rhIGF-I/rhIGFBP-3 usando un gradiente lineal de NaCl para desorber el complejo proteico. La Figura 1 (inferior) muestra un análisis de las fracciones reunidas a partir del gradiente lineal mostrado en la Figura 1 (superior). Como se ve en la Figura 1 (inferior), pueden detectarse varias formas variantes de carga del complejo usando un perfil de elución isocrático, cuyo procedimiento se describe en el presente documento. La pureza global de este material es sólo del 73% comparando el rhIGF-I/rhIGFBP-3 nativo con el de otras formas variantes de carga. Por lo tanto, el procedimiento de purificación de gradiente lineal no fue suficientemente sólido para resolver variantes de formas de carga minoritarias o el complejo rhIGF-I/rhIGFBP-3. Se crearon procedimientos cromatográficos para eliminar estas variantes y agregados. Los nuevos procedimientos implican, por ejemplo, adsorber un complejo IGF-I/IGFBP-3 parcialmente purificado en una resina de intercambio catiónico y desorber el complejo usando una técnica de elución de dos etapas. Como se ve en la Figura 2 (superior), el procedimiento isocrático preparativo de los complejos IGF-I/IGFBP-3 parcialmente purificados produce un perfil de elución que imita estrechamente los resultados observados usando un procedimiento analítico. Las fracciones reunidas del pico que eluyó durante la 2ª etapa isocrática (complejo nativo marcado) proporcionaron una pureza del 99% por el procedimiento analítico de CM (mostrado en la Figura 2 (inferior).
Definiciones
A menos que se limite de otra manera por una mención específica en el presente documento, los siguientes términos tienen los siguientes significados:
"IGF-I" se refiere al factor de crecimiento semejante a insulina I, incluyendo, sin limitación, el IGF-I natural (es decir, "nativo"), análogos o variantes del mismo, y fusiones entre IGF-I y otras secuencias de aminoácidos.
"IGFBP-3" se refiere a la proteína de unión al factor de crecimiento semejante a insulina humano 3. En el presente documento, IGFBP-3 también puede referirse a análogos de IGFBP-3, variantes alélicas naturales y fusiones entre IGFBP-3 y otras secuencias de aminoácidos.
"Complejo" se refiere a un grupo de dos o más proteínas asociadas. Las proteínas de un complejo se asocian a través de cualquiera de una multiplicidad de interacciones no-covalentes que incluyen, sin limitación, enlaces iónicos, enlaces de hidrógeno, fuerzas de van der waals, e interacciones hidrófobas. IGF-I e IGFBP-3 están presentes en un complejo en diversas relaciones molares. Un complejo puede comprender IGF-I e IGFBP-3 en una relación molar de aproximadamente 0,8:1 a aproximadamente 1,2:1. Además, un complejo puede comprender IGF-I e IGFBP-3 en una relación molar de aproximadamente 1:1.
"Parcialmente purificado" se refiere a un complejo de IGF-I e IGFBP-3 que, en alguna medida, se ha liberado de contaminantes celulares o de fermentación, y/o concentrado y/o desalificado. "Parcialmente purificado" también se refiere a un complejo de IGF-I e IGFBP-3 que ha experimentado una o más etapas de purificación previas, incluyendo sin exclusión técnicas tales como cromatografía de exclusión molecular, cromatografía de interacción hidrófoba o purificación por intercambio iónico. "Purificación parcial" se refiere a someter a un complejo de IGF-I e IGFBP-3 a una o más etapas de purificación. "Parcialmente purificado" también se refiere a un complejo de IGF-I e IGFBP-3 que está sustancialmente purificado pero requiere un "refinamiento" para eliminar las formas agregadas de rhIGF-I/rhIGFBP-3, IGFBP-3 mal plegada o formas variantes de masa/carga del complejo rhIGF-I/
rhIGFBP-3.
"Cromatografía preparativa" se refiere a la preparación de productos puros o parcialmente puros a una escala técnica.
"Elución en gradiente o elución lineal" se refiere a la práctica de cambiar continuamente la composición de la fase móvil a lo largo de todo el análisis cromatográfico.
"Elución isocrática" e "isocráticamente" se refiere a la práctica de mantener los constituyentes de la fase móvil constantes durante un período de tiempo.
"Fase móvil" se refiere a soluciones acuosas de capacidad tamponante y fuerza iónica especificadas. En la fabricación de rhIGF-I/rhIGFBP-3 se emplean sales tamponantes farmacéuticamente aceptables. Para afectar a la fuerza iónica se usan cationes farmacéuticamente aceptables, tales como sodio. La fase móvil puede incorporar disolventes miscibles con agua.
"Fase estacionaria" se refiere a materiales de cromatografía poliméricos orgánicos que son eficaces para unirse a (es decir, adsorber) un analito en condiciones de fase móvil seleccionadas y liberar el analito en otras condiciones de fase móvil seleccionadas.
Los "materiales de cromatografía poliméricos orgánicos" incluyen resinas de intercambio catiónico. Estos materiales incluyen resinas de intercambio catiónico débiles y resinas que poseen grupos carboxilato funcionales. Los "grupos carboxilato funcionales" se ejemplifican, por ejemplo, por compuestos carboxilo y carboximetilo.
"Elución en etapas" y "elución por etapas" se refiere a la práctica de cambiar las condiciones de fase móvil desde una fase móvil isocrática a una segunda fase móvil isocrática, típicamente aumentando la fuerza iónica entre cada etapa. La elución (o desorción) de la proteína de interés se consigue seleccionando una fase móvil isocrática que desorbe selectivamente la proteína durante la etapa isocrática.
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Análisis
Los complejos de IGF-I e IGFBP-3 se aíslan a nuevos niveles de pureza usando técnicas cromatográficas diseñadas para eliminar variantes tanto de masa como de carga de IGFBP-3 y agregados de complejos IGF-I/IGFBP-3. Estas técnicas cromatográficas son adecuadas para cromatografía analítica, semi-preparativa y preparativa.
Un procedimiento para purificar un complejo de IGF-I e IGFBP-3 comprende obtener un complejo de IGF-I e IGFBP-3, purificar parcialmente el complejo, adsorber el complejo en una fase estacionaria, desorber el complejo usando una multiplicidad de fases móviles, siendo las fases móviles una serie de fuerzas iónicas secuencialmente crecientes, y recuperar el complejo purificado.
Además, un procedimiento para purificar un complejo parcialmente purificado de IGF-I e IGFBP-3 comprende adsorber el complejo de IGF-I e IGFBP-3 en una fase estacionaria y desorber el complejo usando una serie por etapas de fases móviles, obteniéndose de esta manera el complejo purificado.
En otra realización, se proporciona un procedimiento para purificar un complejo parcialmente purificado de IGF-I e IGFBP-3 por cromatografía de intercambio iónico usando una resina de carboximetilo, comprendiendo la mejora desorber dicho complejo de la resina de carboximetilo mediante la aplicación de una primera fase móvil que comprende NaCl de aproximadamente 160 mM a aproximadamente 185 mM seguido de la aplicación de una segunda fase móvil que comprende NaCl de aproximadamente 200 mM a aproximadamente 250 mM, recuperándose de esta manera un complejo purificado de IGF-I e IGFBP-3 en la segunda fase móvil.
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Estas técnicas usan una diversidad de fases estacionarias. Las fases estacionarias útiles incluyen materiales de cromatografía poliméricos orgánicos tales como resinas de intercambio catiónico. Las fases estacionarias útiles también incluyen resinas de intercambio catiónico débiles que poseen grupos carboxilato funcionales, tales como grupos carboximetilo funcionales.
Estas técnicas también usan una diversidad de fases móviles. Estas técnicas cromatográficas usan al menos dos fases móviles, pero pueden emplear las fases móviles que sean necesarias para obtener un analito purificado o una pluralidad de analitos de interés purificados. Las fases móviles están constituidas por diversas fuerzas iónicas de las que cada una se aplica a la fase estacionaria de una manera por etapas (en lugar de la aplicación en un gradiente) como se conoce algunas veces por los expertos en la materia como "elución por etapas". De forma similar, después de obtener el analito o analitos purificados, no se necesita aplicación por etapas y, por ejemplo, puede usarse un gradiente hasta una alta concentración salina para limpiar, aclarar o regenerar la fase estacionaria. Como alternativa, la aplicación de una sola fase móvil de una alta concentración salina tal como NaCl 1 M, después de obtener el analito purificado, también puede limpiar, aclarar o regenerar la fase estacionaria.
La densidad de la fase móvil puede variarse ajustando la concentración de sal de las soluciones acuosas. Las fases móviles útiles tienen una concentración de NaCl al menos aproximadamente 60 mM menor que una segunda fase móvil inmediatamente posterior. Las fases móviles también tienen concentraciones de NaCl al menos aproximadamente 50 mM menores que una segunda fase móvil inmediatamente posterior, o al menos aproximadamente 40 mM menores que una segunda fase móvil inmediatamente posterior o al menos aproximadamente 30 mM menores que una segunda fase móvil inmediatamente posterior, o al menos aproximadamente 20 mM menores que una segunda fase móvil inmediatamente posterior o al menos aproximadamente 10 mM menores que una segunda fase móvil inmediatamente posterior. Para la resina catiónica preparativa, las primeras fases móviles tienen NaCl de aproximadamente 160 mM a aproximadamente 185 mM. Las segundas fases móviles pueden aplicarse a la fase estacionaria inmediatamente después que las primeras fases móviles. Para resinas catiónicas preparativas, las segundas fases móviles pueden tener NaCl de aproximadamente 200 mM a aproximadamente 250 mM. Las segundas fases móviles también pueden tener NaCl aproximadamente 225 mM.
Estos procedimientos producen proteínas puras que comprenden complejos de IGF-I e IGFBP-3. Los complejos de IGF-I e IGFBP-3 pueden tener una pureza de al menos aproximadamente el 96%. Los complejos también pueden tener una pureza de al menos aproximadamente el 97%, al menos aproximadamente el 98%, o al menos aproximadamente el 99%. Una proteína aislada puede comprender complejos de IGF-I e IGFBP-3 en una relación molar de aproximadamente 0,8:1 a aproximadamente 1,2:1. Además, una proteína aislada puede comprender complejos de IGF-I e IGFBP-3 en una relación molar de aproximadamente 1:1.
Estas proteínas aisladas son útiles para el tratamiento de los trastornos descritos, por ejemplo, en las Patentes de Estados Unidos Nº 5.681.818, 5.723.441, 5.948.757, 6.015.786, 6.017.885, 6.025.332, 6.025.368, 6.514.937 y 6.518.238. Una composición farmacéutica puede comprender una proteína aislada que comprende un complejo de IGF-I e IGFBP-3 y un vehículo farmacéuticamente aceptable, en la que la proteína tiene una pureza de al menos aproximadamente el 96%. En otras realizaciones, la composición farmacéutica puede tener una proteína con una pureza de al menos aproximadamente el 97%, una pureza de al menos aproximadamente el 98%, o una pureza de al menos aproximadamente el 99%. Una composición farmacéutica puede comprender una proteína aislada de complejos de IGF-I e IGFBP-3 en una relación molar de aproximadamente 0,8:1 a aproximadamente 1,2:1. Además, una composición farmacéutica puede comprender una proteína aislada de complejos de IGF-I e IGFBP-3 en una relación molar de aproximadamente 1:1.
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Ejemplos
Los siguientes ejemplos son ilustrativos de la presente invención y no deben considerarse limitaciones de la misma.
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Ejemplo Nº 1
Procedimientos de purificación Purificación preparativa por CM
Se realizaron experimentos usando tres lotes de resina de fabricante de resina Toyopearl^{TM} CM-650M (Tosoh Bioscience LLC, Montgomeryville, PA, Nº de Catálogo 14696). El procedimiento general para la cromatografía se define a continuación. La fuerza iónica del primer tampón de elución isocrática se adaptó para conseguir el perfil de separación deseado. En las Figuras 3, 4 y 5 se muestran cromatogramas preparativos.
Tampón de carga - acetato sódico 50 mM, NaCl 50 mM, pH 5,5
Tampón de lavado - acetato sódico 50 mM, NaCl 125 mM, pH 5,5
Primer tampón isocrático - acetato sódico 50 mM, NaCl 165-185 mM, pH 5,5
Segundo tampón isocrático - acetato sódico 50 mM, NaCl 225 mM, pH 5,5
Gradiente - mezcla de acetato sódico 50 mM, NaCl 225 mM, pH 5,5 a NaCl 1 M.
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La primera etapa isocrática se aplicó para 6 - 9,5 CV dependiendo del ensayo. La segunda etapa isocrática se aplicó hasta que el nativo de rhIGF-I/rhIGFBP-3 nativo volvió a la absorbancia basal \pm5%. El gradiente entre NaCl 225 mM y NaCl 1 M se realizó para regenerar la resina.
El lote Nº 1 de resina requería NaCl 175 mM para eluir las formas variantes de masa/carga del complejo rhIGF-I/rhIGFBP-3. El lote de resina Nº 2 requería NaCl 185 mM para eluir las formas variantes de masa/carga del complejo rhIGF-I/rhIGFBP-3. El lote de resina Nº 3 requería NaCl 165 mM para eluir las formas variantes de masa/carga del complejo rhIGF-I/rhIGFBP-3.
Todos los lotes desorbieron eficazmente el complejo rhIGF-I/rhIGFBP-3 nativo a NaCl 225 mM en un volumen mínimo deseado. Además, ninguna de las impurezas que eluyó durante el gradiente de sal eluyó durante la etapa de NaCl 225 mM en ninguno de los 3 lotes de resina.
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CM-HPLC Analítica Reactivos
Columna: Tosoh Biosep TSK Gel CM-5PW, 10 \mu, 100 A, 7,5 mm x 7,5 cm, (Parte Nº 13068).
Disolvente A = acetato sódico 50 mM/cloruro sódico 50 mM, pH 5,5, 27,2 g de acetato sódico + 11,69 g de cloruro sódico + 4 l de agua, pH 5,5.
Disolvente B = acetato sódico 50 mM/cloruro sódico 550 mM, pH 5,5, 27,2g de acetato sódico + 128,6 g de cloruro sódico + 4 l de agua, pH 5,5.
Disolvente C = acetato sódico 50 mM/cloruro sódico 1000 mM, pH 5,5, 27,2 g de acetato sódico + 233,76 g de cloruro sódico + 4 l de agua, pH 5,5.
Los tampones se preparan añadiendo primero la cantidad prescrita de sales al agua y mezclando hasta que se disuelva. Después, el pH se ajusta a 5,5 ~ 5,6 usando ácido acético. Después de obtener un pH estable, la solución se enrasa con agua y se confirma el pH. Todas las soluciones se filtran usando un filtro de 0,22 \mu o 0,45 \mu antes del uso.
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Condiciones de LC Detector
\bullet Longitud de onda = 276 nm
\bullet AUFS = 2
\bullet Constante de tiempo = 1
Bomba
Caudal = 1 ml/min
Disolvente A = acetato sódico 50 mM, NaCl 50 mM, pH 5,5
Disolvente B = acetato sódico 50 mM, NaCl 550 nM, pH 5,5
Disolvente C = acetato sódico 50 mM, NaCl 1000 mM, pH 5,5
Disolvente D = Agua
1
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Comparación entre separación por CM analítica y separación por CM preparativa. La Figura 6 (inferior) muestra un cromatograma de un ensayo de CM-HPLC analítica con los picos identificados como sus componentes. Como puede verse comparando la separación por CM preparativa (superior) con la separación por CM analítica (inferior) se apreciará que los mismos componentes eluyen en el mismo orden de retención y pueden identificarse basándose en esto.
La Figura 1 (inferior) y la Figura 2 (inferior) muestran resultados de CM-HPLC analítica para muestras que contienen formas variantes de masa/carga del complejo rhIGF-I/rhIGFBP-3 (Figura 1) y una muestra que contiene formas variantes de masa/carga pequeñas del complejo rhIGF-I/rhIGFBP-3 (Figura 2).
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Ejemplo Nº 2 Caracterización de formas variantes de masa/carga de rhIGF-I/rhIGFBP-3 HPLC de fase inversa C18 (Procedimiento Vydac) +/- Detección EM Condiciones de CL
Columna:
Vydac 218 TP de fase inversa C 18 4,6 x 250 mm di
Eluyente A:
acetonitrilo al 50%, TFA al 0,1%
Eluyente B:
TFA al 0,1%
Eluyente C:
Acetonitrilo al 100%, TFA al 0,1%
Caudal:
0,9 ml/min
Volumen de inyección hasta
100 \mu
Temperatura de la columna
ambiente
Longitud de onda de detección
210 nm
Tiempo de ensayo
95 minutos
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TABLA DE GRADIENTE
3
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Los análisis CLEM se realizaron usando el sistema de HPLC Waters Alliance 2695 acoplado a un espectrómetro de masas MicroMass LCT (TOF) y un detector de matriz de fotodiodos Waters 2996 (PDA). La separación cromatográfica se realizó usando una columna de fase inversa Vydac 218TP (250 x 4,6 mm, 300A) C18 eluyendo con un gradiente de H_{2}O- acetonitrilo que contenía ácido trifluoroacético (TFA) al 0,1% (v/v). La corriente de eluyente de la columna de fase inversa se dividió (4 a 1) con la mayor parte de la corriente dirigida al detector de PDA y el resto a la fuente de electronebulización.
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CLEM de Mapa de AspN-Péptido
Se analizaron muestras del conjunto de variantes de masa/carga Nº 1 por digestión de péptidos seguido de análisis de RP-CL/EM. Los fragmentos proteolíticos se separaron usando una columna de RP-HPLC Cadenza (Nº de Cat. CD026) 1 \mum (2 x 250 mm) C 18 a un caudal de 0,2 ml/min durante un intervalo de acetonitrilo al 2% a acetonitrilo al 98%. Los picos se detectaron usando absorbancia de la corriente de eluato a 210 nm en un detector de matriz de fotodiodos, que después se infundió en un espectrómetro de masas MicroMass LCT que funcionaba en el modo de ionización electronebulización de ion positivo. El patrón de picos de péptido (es decir, el mapa de péptidos) se comparó con un patrón de referencia para establecer la identidad. Posteriormente, los picos se identificaron sumando la corriente iónica total bajo cada pico y midiendo los iones monoisotópicos, M2+ o M3+.
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Muestras y parámetros de inyección
Se extrajeron muestras en proceso durante el transcurso de una campaña de fabricación. Las muestras se congelaron y se almacenaron a -20ºC hasta el análisis.
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Impurezas de etapa de lavado isocrática
Se tomaron muestras durante la etapa de lavado isocrática antes de la elución del complejo nativo del ensayo mostrado en la Figura 4. Se reunieron muestras que representaban dos picos anchos que eluyeron durante esta etapa. Se combinaron volúmenes iguales de cada fracción para formar el conjunto y los conjuntos se concentraron usando membranas de ultrafiltración de 10 kD (Centricon YM-10, Amicon, Nº de Cat. 4206).
Con fines comparativos, también se tomó una fracción de la parte superior del pico durante la elución del complejo rhIGF-I/rhIGFBP-3 nativo durante la etapa de elución isocrática 225 mM. También se tomó una muestra de un saliente del pico isocrático 225 mM (que se provocó por flujo a corto plazo en la conductividad durante la etapa del tampón). Estas muestras se usaron para el análisis por CLEM y una muestra se analizó por mapeo de péptidos.
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Resultados para muestras de impurezas de etapa de lavado isocrática RP-HPLC con caracterización por EM
La Figura 7 muestra cromatogramas del conjunto de variantes de masa Nº 2 y el conjunto de variantes de masa Nº 1 medidos por RP-HPLC Vydac. En la Figura 1, el IGF-I nativo eluye como un pico a 41,8 - 42 minutos, eluyendo el IGF-I oxidado inmediatamente antes del pico de IGF-I nativo.
El IGFBP-3 eluye como un pico a 48 - 48,7 minutos. No se observan otras impurezas significativas en estas muestras. Los espectros se sumaron sobre el pico para IGFBP-3 en cada una de estas muestras, así como el de una muestra que representa el ápice de la etapa isocrática de NaCl 225 mM. La Figura 8 muestra expansiones de los espectros de masas sumados a través del pico de IGFBP-3, y rhIGF-I/rhIGFBP-3 nativo alrededor de m/z 1597, que corresponde al estado de carga +18 del agrupamiento de iones de IGFBP-3. Esto demuestra que IGFBP-3 esta significativamente modificada en el conjunto de variantes de masa Nº 2 y en las muestras del conjunto de variantes de masa Nº 2, pero está modificado relativamente poco de la IGFBP-3 en el pico de elución de sal 225 mM. Como comentario, estos son los mismos espectros mostrados como encartes en la Figura 4. Hay numerosas modificaciones observadas en la muestra del conjunto de variantes de masa Nº 2, pero se observa un ion prominente a 1611,3 amu. La Figura 9 muestra los espectros MaxEnt de esta muestra, que indica una proteína con un peso molecular de 28988,5313, que es + 257,03 con respecto a la masa calculada de rhIGFBP-3 (28731,5). Hay numerosas modificaciones observadas en la muestra del conjunto de variantes de masa Nº 1, pero se observa un ion prominente a 1606,9 amu. La Figura 10 muestra los espectros de MaxEnt de esta muestra, que indica una proteína con un peso molecular de 28909,5547, que es + 178,05 con respecto a la masa calculada de rhIGFBP-3.
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Mapeo peptídico de del conjunto de variantes de masa Nº1
Se comparó el cromatograma UV del AspN péptido del conjunto de variantes de masa Nº 1 con el patrón de referencia rhIGF-I/rhIGFBP-3 y no hubo aparición o desaparición definida de ningún pico prominente. Por lo tanto, las variantes de masa observadas no produjeron una migración claramente diferente de ninguno de los picos.
Se sumaron los espectros sobre la región del cromatograma cerca de los picos a 46,1 - 46,5 minutos, que corresponde al tiempo de retención del péptido N-terminal para rhIGFBP-3. La Figura 11 muestra los agrupamientos iónicos monoisotópicos correspondientes al péptido en el extremo N de IGFBP-3 (superior) y el patrón de referencia de rhIGF-I/rhIGFBP-3 (inferior). La muestra del conjunto de variantes de masa Nº 1 presenta un agrupamiento iónico a 1502,6997 que corresponde al del péptido N-terminal nativo de IGFBP-3 así como un agrupamiento iónico a 1680,7576 que es + 178,0579 en comparación con el péptido parental. Este aducto de masa observado es coherente con el aducto de masa calculado para la proteína entera por MaxEnt (178,05). De esta manera, esta sola adición de aducto de masa explicaría la modificación en el IGFBP-3. El péptido 1680,7576 no está presente en el patrón de referencia como se observa comparando el gráfico superior del agrupamiento iónico con el gráfico inferior del agrupamiento iónico debido a la falta de sensibilidad del procedimiento de mapeo de péptidos.
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Identidad de variantes de masa de IGFBP-3
En espectros expandidos alrededor del estado de carga +18 de IGFBP-3, las muestras en las que se observaron los iones más prominentes fueron a 1611,3 (grupo de variantes de masa Nº 2) y 1606,9 (grupo de variantes de masa Nº 1) correspondientes a los aductos de masas de aproximadamente 258 y 178 amu respectivamente.
La secuencia peptídica de este péptido es *GASSAGLGPVVRCEPC (SEC ID Nº 1), representando el primer resto de glicina el extremo N de IGFBP-3. La masa monoisotópica calculada de este péptido es 1502,7090.
Se consideraron posibles modificaciones que podrían explicar los aductos de masa en 178 y 258 amu. La posibilidad más probable es la gluconilación N-terminal (178 amu) y la alfa-N-6-fosfogluconilación N-terminal (258 amu). Geoghegan y col. informan sobre la modificación de una proteína expresada en E. coli con una secuencia N-terminal de GSS[His]6 (SEC ID Nº 2) en la que el resto de glicina N-terminal es objeto de una modificación (Geoghegan y col. (1999) Anal. Biochem 267(1) 169-84). La gluconilación N-terminal conjugaría un resto C6H10O6 (178,0477 amu) sobre el péptido con un grupo amina. La masa de la modificación observada es 1680,7576-1502,6997 = 178,0579 amu. De esta manera, el aducto observado es coherente con esta modificación (178,0477 - 178,0579 = 0,0102 amu) que está dentro del error experimental y los límites de este espectrómetro de masas. Hay dos posibles sitios de modificación, el grupo amina N-terminal en el resto de glicina y el grupo guanidinilo de la arginina.
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Ejemplo Nº 3 CM-HPLC analítica de lotes de fabricación históricos de rhIGF-I/rhIGFBP-3
Se detectan variantes de carga de rhIGFBP-3 por separación de formas variantes de masa/carga del complejo rhIGF-I/rhIGFBP-3 usando un gradiente isocrático de cloruro sódico en una columna de intercambio iónico TSK-GEL CM-5PW, 7,5 cm x 7,5 mm DI, 10 \mum, de acuerdo con el procedimiento de ensayo descrito anteriormente.
Estas impurezas no se detectaron previamente en lotes de producto farmacéutico con los procedimientos que estaban disponibles en el momento de su fabricación. Cuando estaban disponibles, las muestras se obtuvieron de material conservado para establecer un intervalo de estas impurezas en las muestras históricas. Los resultados mostrados en la Tabla 1 se presentan como pureza de rhIGF-I/rhIGFBP-3 nativo, estando asociada la diferencia con dos picos que representan dos variantes de masa/carga. El máximo grado de pureza observado por este procedimiento fue del 95,4%.
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TABLA 1 Análisis de Variantes de Masa/Carga de rhIGF-1/rhIGFBP-3 en Lotes Históricos de Producto Farmacéutico
5
<110> SLEEVI, MARK C.
\hskip1cm
KELLEY, GLEN L.
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<120> COMPLEJOS rhIGF-I/rhLIGRBP-3 PURIFICADOS Y PROCEDIMIENTO DE FABRICACIÓN DE LOS MISMOS
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<130> 057491-0870
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\vskip0.400000\baselineskip
<140> 11/311.633
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<141> 20-12-2005
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\vskip0.400000\baselineskip
<150> 60/639.349
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<151> 24-12-2004
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\vskip0.400000\baselineskip
<160> 2
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<170> PatentIn Ver. 3.3
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<210> 1
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<211> 16
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
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<213> Secuencia Artificial
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\vskip0.400000\baselineskip
<220>
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<223> Descripción de Secuencia Artificial: Péptido sintético
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<400> 1
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\hskip1cm
6
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<210> 2
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<211> 9
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<212> PRT
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<213> Secuencia Artificial
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<220>
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<223> Descripción de Secuencia Artificial: Péptido sintético
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<400> 2
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\hskip1cm
7

Claims (23)

1. Una proteína aislada que comprende un complejo de factor de crecimiento semejante a insulina I (IGF-I) y proteína 3 de unión al factor de crecimiento semejante a insulina (IGFBP-3), teniendo dicha proteína una pureza de al menos un 96% como se mide por CM-HPLC analítica.
2. La proteína de la reivindicación 1, en la que dicha proteína tiene una pureza de al menos el 97% como se mide por CM-HPLC analítica.
3. La proteína de la reivindicación 1, en la que dicha proteína tiene una pureza de al menos el 98% como se mide por CM-HPLC analítica.
4. La proteína de la reivindicación 1, en la que dicha proteína tiene una pureza de al menos el 99% como se mide por CM-HPLC analítica.
5. La proteína de la reivindicación 1, en la que dicho complejo comprende IGF-I e IGFBP-3 en una relación molar de aproximadamente 0,8:1 a aproximadamente 1,2:1.
6. La proteína de la reivindicación 1, en la que dicho complejo comprende IGF-I e IGFBP-3 en una relación molar de aproximadamente 1:1.
7. Una composición farmacéutica que comprende una proteína aislada que comprende un complejo de IGF-I e IGFBP-3 y un vehículo farmacéuticamente aceptable, en la que dicha proteína tiene una pureza de al menos el 96% como se mide por CM-HPLC analítica.
8. La composición farmacéutica de la reivindicación 7, en la que dicha proteína tiene una pureza de al menos el 97% como se mide por CM-HPLC analítica.
9. La composición farmacéutica de la reivindicación 7, en la que dicha proteína tiene una pureza de al menos el 98% como se mide por CM-HPLC analítica.
10. La composición farmacéutica de la reivindicación 7, en la que dicha proteína tiene una pureza de al menos el 99% como se mide por CM-HPLC analítica.
11. Un procedimiento para purificar un complejo de IGF-I e IGFBP-3, que comprende
obtener un complejo de IGF-I e IGFBP-3;
purificar parcialmente dicho complejo;
adsorber dicho complejo en una fase estacionaria catiónica;
desorber dicho complejo usando una multiplicidad de fases móviles, comprendiendo dichas fases móviles una serie de fuerzas iónicas secuencialmente crecientes; y
recuperar dicho complejo purificado.
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12. El procedimiento de la reivindicación 11, en el que dicha fase estacionaria es una resina de intercambio catiónico.
13. El procedimiento de la reivindicación 12, en el que dicha resina de intercambio catiónico contiene grupos carboximetilo funcionales.
14. El procedimiento de la reivindicación 11, en el que dicha multiplicidad de fases móviles comprende una primera fase móvil y una segunda fase móvil.
15. El procedimiento de la reivindicación 14, en el que dicha primera fase móvil tiene una concentración de NaCl al menos aproximadamente 10 mM menor que dicha segunda fase móvil.
16. El procedimiento de la reivindicación 14, en el que dicha primera fase móvil tiene una concentración de NaCl al menos aproximadamente 20 mM menor que dicha segunda fase móvil.
17. El procedimiento de la reivindicación 14, en el que dicha primera fase móvil tiene una concentración de NaCl al menos aproximadamente 40 mM menor que dicha segunda fase móvil.
\newpage
18. El procedimiento de la reivindicación 14, en el que dicha primera fase móvil comprende NaCl de aproximadamente 160 mM a aproximadamente 185 mM y dicha segunda fase móvil comprende NaCl de aproximadamente 200 mM a aproximadamente 250 mM.
19. El procedimiento de la reivindicación 14, en el que dicha segunda fase móvil comprende NaCl aproximadamente 225 mM.
20. Un procedimiento para purificar un complejo parcialmente purificado de IGF-I e IGFBP-3, que comprende adsorber dicho complejo en una resina de intercambio catiónico y desorber dicho complejo usando una serie de fases móviles por etapas.
21. El procedimiento de la reivindicación 20, en el que dichas fases móviles comprenden una primera fase móvil que tiene NaCl de aproximadamente 160 mM a aproximadamente 185 mM y una segunda fase móvil que tiene NaCl de aproximadamente 200 mM a aproximadamente 250 mM.
22. Un procedimiento para purificar un complejo parcialmente purificado de IGF-I e IGFBP-3 por cromatografía de intercambio iónico usando una resina de carboximetilo, comprendiendo la mejora desorber dicho complejo de dicha resina de carboximetilo por la aplicación de una primera fase móvil que comprende NaCl de aproximadamente 160 mM a aproximadamente 185 mM seguida de la aplicación de una segunda fase móvil que comprende NaCl de aproximadamente 200 mM a aproximadamente 250 mM, recuperando de esta manera dicho producto purificado.
23. El procedimiento de la reivindicación 22, en el que dicha segunda fase móvil comprende NaCl aproximadamente 225 mM.
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