ES2341371T3 - Metodo relacionado con el receptor de quimiocinas 88c. - Google Patents
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Abstract
Método para identificar un ligando capaz de interactuar con el receptor de quimiocinas 88C, que se caracteriza por la secuencia de aminoácidos SEQ ID NO:2, comprendiendo dicho método las etapas de: (a) proporcionar una célula huésped que expresa dicho receptor, o una preparación de membrana que incluye dicho receptor, (b) poner en contacto e incubar dicho receptor, con un ligando del mismo, y (c) identificar la presencia de un ligando interactuado específicamente con dicho receptor.
Description
Método relacionado con el receptor de
quimiocinas 88C.
La presente invención se refiere en general a
vías de transducción de señales. Especialmente, la presente
invención se refiere a receptores de quimiocinas, ácidos nucleicos
que codifican receptores de quimiocinas, ligandos de receptores de
quimiocinas, moduladores de la actividad del receptor de
quimiocinas, anticuerpos que reconocen las quimiocinas y receptores
de quimiocinas, métodos para identificar los moduladores y ligandos
de receptores de quimiocinas, métodos para producir receptores de
quimiocinas, así como métodos para producir anticuerpos que
reconocen los receptores de quimiocinas.
Recientes avances en la biología molecular
condujeron a una apreciación del papel central que desempeñan las
vías de transducción de señales en los procesos biológicos. Estas
vías comprenden un medio central por el cual las células
individuales en un organismo multicelular se comunican, coordinando
por este medio los procesos biológicos. Véase Springer, Cell
76:301-314 (1994), Tabla I como modelo. Una
ramificación de las vías de transducción de señales, definida por la
participación intracelular de proteínas de unión al nucleótido de
guanina (proteínas-G), afecta a un amplio rango de
procesos biológicos.
Lewin, GENES V319-348
(1994)exponen en general vías de transducción de señales a
proteína G que implican, como mínimo, los siguientes componentes:
una señal extracelular (por ejemplo, neurotransmisores, hormonas
peptídicas, moléculas orgánicas, luz, u odorantes), receptor
reconocedor de señales (receptor acoplado a proteína G, revisado en
Probst y col., DNA and Cell Biology 11:1-20 [1992] y
conocido también por GPR o GPCR), y una proteína intracelular,
heterotrimérica de unión a GTP, o proteína G. En particular, estas
vías son de gran interés debido a su papel en la regulación de
glóbulos blancos o tráfico leucocitario.
Los leucocitos comprenden un grupo de tipos de
células sanguíneas móviles que incluyen los granulocitos (es decir,
neutrófilos, basófilos y eosinófilos), linfocitos y monocitos.
Cuando se movilizan y activan, estas células están involucradas
esencialmente en la defensa del cuerpo contra una materia extraña.
Esta tarea es complicada por la diversidad de procesos normales y
patológicos en los que participan los leucocitos. Por ejemplo, la
función de los leucocitos en la respuesta inflamatoria normal a la
infección. Los leucocitos también intervienen en varias
inflamaciones patológicas. Como resumen, véase Schall y col., Curr.
Opin. Immunol. 6:865-873 (1994). Además, cada uno de
estos procesos puede involucrar contribuciones únicas, en grado,
tipo y duración, de parte de cada uno de los tipos de células
leucocitarias.
Al estudiar estas reacciones inmunes, los
investigadores se concentraron inicialmente en las señales que
actúan sobre los leucocitos, razonando que se pediría una señal para
obtener cualquier forma de respuesta. Murphy, Ann. Rev. Immunol.
12:593-633 (1994) ha revisado los miembros de un
grupo importante de señales leucocitarias, las señales peptídicas.
Un tipo de señal peptídica comprende las quimiocinas (citocinas
quimioatractivas) denominadas intercrinas en Oppenheim y col., Anni.
Rev. Immunol. 9:617-648 (1991). Además de Oppenheim
y col., Baggiolini y col., Advances in Immunol.
55:97-179 (1994), documentan el número creciente de
quimiocinas que han sido identificadas y sometidas a análisis
genéticos y bioquímicos.
Comparaciones de las secuencias de aminoácidos
de las quimiocinas conocidas condujeron a un esquema de
clasificación que divide las quimiocinas en dos grupos: el grupo
\alpha, caracterizado por un solo aminoácido que separa las dos
primeras cisteinas (CXC; terminal N como referente) y el grupo
\beta, en el que estas cisteinas son adyacentes (CC). Véase
Baggiolini y col., más arriba. Se han descubierto correlaciones
entre las quimiocinas y los tipos particulares de células
leucocitarias que responden a aquellas señales. Schall y col., tal
como se menciona anteriormente, han reportado que la quimiocinas
CXC afectan en general a los neutrófilos; las quimiocinas CC tienden
a afectar a los monocitos, linfocitos, basófilos y eosinófilos. Por
ejemplo, Baggiolini y col., mencionados más arriba, expusieron que
RANTES, una quimiocina CC, funciona como quimioatractivo para los
monocitos, linfocitos (es decir, células T de memoria), basófilos,
y eosinófilos, pero no para los neutrófilos, aunque provoca la
liberación de la histamina de los
basófilos.
basófilos.
Cocchi y col., Science, 270:
1811-1815 (1995) demostraron recientemente que las
quimiocinas son supresores de la proliferación del VIH. Cocchi y
col., demostraron que RANTES, MIP-1\alpha, y
MIP-1\beta suprimían el VIH-1,
VIH-2 e infección por VIS de una línea celular
CD4^{+} designada PM1 y de las células mononucleares primarias de
sangre periférica humana.
Sin embargo, recientemente, la atención se ha
vuelto hacia los receptores celulares que unen las quimiocinas,
debido a que las quimiocinas extracelulares parecen contactar las
células de forma indiscriminada, y por lo tanto carecen de la
especificidad necesaria para regular los tipos individuales de
células leucocitarias.
Murphy, tal como se menciona anteriormente,
reportó que la superfamilia GPCR de receptores incluye la familia de
receptores de quimiocinas. La estructura típica de receptores de
quimiocinas incluye un dominio de unión de quimiocinas
extracelulares localizado cerca del terminal N, seguido de siete
regiones espaciadas de aminoácidos predominantemente hidrofóbicos
capaces de formar hélices \alpha transmembrana. Entre cada uno de
los dominios \alpha-helicoidales se encuentran
dominios hidrofilicos localizados, de forma alterna, en los
espacios intra o extra celulares. Estas características dan una
conformación de serpentina al receptor de quimiocinas incrustado en
la membrana. El tercer bucle intracelular interactúa típicamente con
las proteínas G. Murphy, tal como se menciona anteriormente, notó
que el terminal carboxilo intracelular es capaz también de
interactuar con las proteínas G.
Los primeros receptores de quimiocinas que
tuvieron que ser analizados por técnicas de clonación molecular
fueron los dos receptores de neutrófilos para la IL8 humana, una
quimiocina CXC. Holmes y col., Science 253:178-1280
(1991) y Murphy y col., Science 253:1280-1283
(1991), reportaron la clonación de estos dos receptores para la IL8.
Lee y col., J. Biol. Chem. 267: 16283-16287 (1992),
analizaron los ADNc que codifican estos receptores y encontraron un
77% de identidad de aminoácidos entre los receptores codificados,
con cada receptor que mostraba características de la familia de
receptores acoplados a proteína G. Uno de estos receptores es
especifico de la IL-8, mientras que el otro se une y
hace señales en respuesta a IL-8, gro/MGSA, y
NAP-2. La manipulación genética de los genes que
codifican los receptores de IL-8 ha contribuido a
nuestra comprensión de los papeles biológicos desempeñados por estos
receptores. Por ejemplo, Cacalano y col., Science
265:682-684 (1994) reportaron que la deleción del
homólogo del receptor de IL-8 en el ratón resultaba
en un fenotipo pleiotrópico que implicaba linfadenopatia y
esplenomegalia. Además, un estudio sobre mutaciones de sentido
erróneo descritas en Leong y col., J. Biol. Chem.
269:19343-19348 (1994) descubrió aminoácidos en el
receptor de IL-8 que eran críticos para la unión de
IL-8. Experimentos de intercambio de dominios
expuestos en Murphy, tal como se menciona más arriba, implicaban el
dominio extracelular amino terminal como un determinante de la
especificidad de unión.
Varios receptores para las quimiocinas CC
también han sido identificados y clonados. CCCKR1 se une tanto a
MIP-1\alpha como a RANTES y provoca el flujo de
iones de calcio intracelular en respuesta a ambos ligandos. Charo y
col., Proc. Natl. Acad. Sci. (USA) 91:2752-2756
(1994) reportaron que otro receptor de quimiocina CC, el
MCP-R1 (CCCKR2), es codificado por un único gen que
produce dos variantes de empalme que difieren en sus dominios
carboxilo terminal. Este receptor se une y responde a
MCP-3 además de MCP-1.
Se ha identificado también un receptor promiscuo
que se une a las quimiocinas tanto CXC como CC. Este receptor se
identificó originalmente en células de glóbulos rojos y Horuk y
col., Science 261:1182-1184 (1993) reporta que se
une a IL-8, NAP-2, GRO\alpha,
RANTES y MCP-1. El receptor de quimiocinas de los
eritrocitos comparte aproximadamente el 25% de identidad con otros
receptores de quimiocinas y puede ayudar a regular los niveles
circulantes de quimiocinas o ayudar en la presentación de
quimiocinas a sus dianas. Además de unir quimiocinas, se ha
demostrado también que el receptor de quimiocinas de los
eritrocitos es el receptor para el plasmodium vivax, mayor causa de
malaria (id.). Otro receptor acoplado a proteína G que está
estrechamente relacionado con los receptores de quimiocinas,
receptor del factor de activación plaquetaria, ha demostrado ser
también el receptor de un patógeno humano, la bacteria
Streptococcus pneumoniae (Cundell y col., Nature
377:435-438 (1995)).
Además de los receptores de quimiocinas de
mamíferos, se han identificado dos homólogos de receptores de
quimiocinas virales. Ahuja y col., J. Biol. Chem.
268:20691-20694 (1993) describen un producto
genético procedente de Herpesvirus saimiri que comparte
aproximadamente un 30% de identidad con los receptores de
IL-8 y se une a quimiocinas CXC. Neote y col., Cell,
72:415-425 (1993) reporta que el citomegalovirus
humano contiene un gen que codifica un receptor que comparte
aproximadamente un 30% de identidad con los receptores de
quimiocinas CC, el cual se une a MIP-1\alpha,
MIP-1\beta, MCP-1, y RANTES. Estos
receptores virales pueden afectar al papel normal de las quimiocinas
y proporcionan una ventaja patológica selectiva para el virus.
Debido a la amplia diversidad de las quimiocinas
y sus actividades, existen numerosos receptores para las
quimiocinas. Los receptores que han sido caracterizados representan
solamente una fracción del complemento total de los receptores de
quimiocinas. Por lo tanto sigue existiendo una necesidad en la
técnica en la identificación de receptores adicionales de
quimiocinas. La disponibilidad de estos nuevos receptores
proporcionará herramientas para el desarrollo de moduladores
terapéuticos de la quimiocina o de la función de los receptores de
quimiocinas. La presente invención considera que dichos moduladores
son útiles como productos terapéuticos para el tratamiento de la
ateroesclerosis, artritis reumatoide, supresión de crecimiento
tumoral, asma, infecciones virales, y otros estados inflamatorios.
Como alternativa, se consideran como productos terapéuticos,
fragmentos o variantes de los receptores de quimiocinas, o
anticuerpos que reconocen aquellos receptores.
Se descubren ácidos nucleicos purificados y
aislados que codifican receptores de quimiocinas que intervienen en
el tráfico leucocitario. Los polinucleótidos (hebras tanto sentido
como antisentido de los mismos) incluyen los ADN, ADNc y ARN
genómicos así como los ácidos nucleicos completa o parcialmente
sintéticos. Los polinucleótidos preferentes incluyen el ADN que
codifica el receptor de quimiocinas 88-2B que se
expone en la SEQ ID NO: 1, y los ADN que se hibridizan con aquellos
ADN bajo condiciones de hibridación astringentes estándar, o que se
hibridizarian pero para la redundancia del código genético. Los
ejemplos de condiciones de hibridación astringentes son como sigue:
hibridación a 42ºC en formamida al 50%, 5X SSC, fosfato de sodio 20
mM, pH 6,8 y lavado en 0,2 X SSC a 55ºC. Los especialistas en la
técnica entienden que variaciones de estas condiciones tienen lugar
sobre la base de la longitud y del contenido en nucleótidos GC de
las secuencias que deben ser hibridizadas. Fórmulas estándar en la
técnica son adecuadas para determinar las condiciones exactas de
hibridación. Véase Sambrook y col., \NAK\NAK
9,47-9,51 en Molecular Cloning: A Laboratory Manual,
Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor, New York
(1989). Se descubren asimismo polinucleótidos que codifican los
dominios de 88-2B o 88C, por ejemplo,
polinucleótidos que codifican uno o más dominios extracelulares de
una proteína o de otros fragmentos biológicamente activos de la
misma. Los dominios extracelulares 88-2B
corresponden a la SEQ ID NO:3 y SEQ ID NO:4 en los residuos de
aminoácidos 1-36, 93-107,
171-196 y 263-284. Los dominios
extracelulares de 88-2B son codificados por
secuencias de polinucleótidos que corresponden a la SEQ ID NO: 3 en
los nucleótidos 362-469, 638-682,
872-949 y 1148-1213. Los dominios
extracelulares de 88C corresponden a la SEQ ID NO:1 y SEQ ID NO:2 en
los residuos de aminoácidos 1-32,
89-112, 166-191 y
259-280. Los dominios extracelulares 88C son
codificados por secuencias de polinucleótidos que corresponden a la
SEQ ID NO:1 en los nucleótidos 55-150,
319-390, 550-627 y
829-894. Se descubren también polinucleótidos que
codifican dominios intracelulares de estos receptores de
quimiocinas. Los dominios intracelulares de 88-2B
incluyen los aminoácidos 60-71,
131-151, 219-240 y
306-355 de la SEQ ID NO:3 y SEQ ID NO:4. Aquellos
dominios son codificados por secuencias de polinucleótidos que
corresponden a la SEQ ID NO:3 en los nucleótidos
539-574, 752-814,
1016-1081 y 1277-1426,
respectivamente. Los dominios intracelulares 88C incluyen los
residuos de aminoácidos 56-67,
125-145, 213-235 y
301-352 de la SEQ ID NO:1 y SEQ ID NO:2. Los
dominios intracelulares de 88C son codificados por secuencias de
polinucleótidos que corresponden a la SEQ ID NO: en los nucleótidos
220-255, 427-489,
691-759 y 955-1110. Los péptidos que
corresponden a uno o más de los dominios extracelulares o
intracelulares, o los anticuerpos contra aquellos péptidos, se
consideran como moduladores de las actividades del receptor,
especialmente actividades de unión a proteína G y del ligando de
los receptores.
Las secuencias de nucleótidos se pueden utilizar
también para designar los oligonucleótidos a utilizar como sondas
marcadas para aislar los ADN genómicos que codifican
88-2B o 88C en condiciones de hibridación
astringentes (es decir, por análisis Southern y metodologías de
Reacción en Cadena de la Polimerasa). Además, estas sondas de
oligonucleótidos se pueden utilizar para detectar alelos
particulares de los genes que codifican 88-2B o 88C,
facilitando tanto el diagnóstico como los tratamientos por terapia
génica de estados de enfermedad asociados a alelos particulares.
Además, estos oligonucleótidos se pueden utilizar para cambiar la
genética del receptor de quimiocina para facilitar la identificación
de los moduladores del receptor de quimiocina. Asimismo, las
secuencias de nucleótidos se pueden utilizar para diseñar elementos
genéticos antisentido de uso en la exploración o modificación de la
genética y expresión de 88-2B o 88C. Se descubren
además réplicas biológicas (es decir, copias de ADN aislados
elaborados in vivo o in vitro) y transcripciones de
ARN de los ADN mencionados aquí. Se descubren también construcciones
recombinantes de replicación autónoma tales como plásmido, vectores
de ácidos nucleicos virales y cromosomales (por ejemplo, YAC) que
incorporan efectivamente los polinucleótidos 88-2B o
88C, y, en particular, vectores en los que el ADN que codifica
eficazmente 88-2B o 88C está enlazado de forma
operativa a una o más secuencias de control de expresión endógena o
heteróloga.
Los receptores 88-2B y 88C se
pueden producir de forma natural, recombinante o sintética. Las
células huésped (procarióticas o eucarióticas) transformadas o
transfectadas con los polinucleótidos de la invención por medio de
métodos estándar se pueden utilizar para expresar los receptores de
quimiocinas 88-2B y 88C. Más allá de los productos
genéticos intactos 88-2B o 88C, se descubren
fragmentos biológicamente activos de 88-2B o 88C,
análogos de 88-2B o 88C, y péptidos sintéticos
procedentes de las secuencias de aminoácidos de
88-2B, establecidos en la SEQ ID NO: 4, o de 88C,
establecidos en la SEQ ID NO:2. Además, el producto genético
88-2B o 88C, o un fragmento biológicamente activo de
ambos productos genéticos, cuando se produce en una célula
eucariótica, puede ser modificado de forma postranslacional (por
ejemplo, a través de la formación del enlace disulfuro,
glicosilación, fosforilación, miristoilación, palmitoilación,
acetilación, etc.). Se descubren además los productos genéticos
88-2B y 88C, o los fragmentos biológicamente activos
de los mismos, en conformaciones monoméricas, homomultiméricas o
heteromultiméricas.
Se descubren también productos de anticuerpos
capaces de unirse específicamente a los receptores de quimiocinas
88-2B o 88C. Los productos de anticuerpos son
generados por medio de métodos estándar en la técnica que utilizan
los receptores recombinantes 88-2B o 88C, péptidos
sintéticos o fragmentos de péptidos de los receptores
88-2B o 88C, células huésped que expresan
88-2B o 88C en sus superficies, o receptores
88-2B o 88C purificados a partir de fuentes
naturales como los inmunógenos. Los productos de anticuerpos pueden
incluir anticuerpos monoclonales o anticuerpos policlonales de
cualquier fuente o subtipo. Además, se descubren anticuerpos
monoméricos, homomultiméricos y heteromultiméricos, así como los
fragmentos de los mismos. Además, se descubren anticuerpos
injertados en CDR, anticuerpos "humanizados", y otros productos
de anticuerpos modificados que conservan la capacidad de unirse
específicamente a un receptor de quimiocina.
Se descubre también el uso de productos de
anticuerpos para la detección del producto genético
88-2B o 88C, sus análogos, o los fragmentos
biológicamente activos del mismo. Por ejemplo, se pueden utilizar
los productos de anticuerpos en procedimientos de diagnóstico
diseñados para revelar correlaciones entre la expresión de
88-2B o de 88C, así como varios estados normales o
patológicos. Además, los productos de anticuerpos se pueden emplear
para diagnosticar variaciones especificas de los tejidos en la
expresión de 88-2B o 88C, sus análogos o los
fragmentos biológicamente activos de los mismos. Los productos de
anticuerpos específicos de los receptores de quimiocina
88-2B y 88C pueden actuar también como moduladores
de las actividades del receptor. En otro aspecto, los anticuerpos
para los receptores 88-2B o 88C son útiles en
propósitos terapéuticos.
Se proporcionan ensayos de ligandos capaces de
interactuar con los receptores de quimiocinas tal como se descubren
aquí. Estos ensayos pueden implicar la detección directa de la
actividad del receptor de quimiocinas, por ejemplo, controlando la
unión de un ligando marcado al receptor. Además, estos ensayos se
pueden utilizar para evaluar indirectamente la interacción del
ligando con el receptor de quimiocinas. Tal como se emplea aquí, el
término "ligando" comprende moléculas que son agonistas y
antagonistas de 88-2B o 88C, y otras moléculas que
se unen a los receptores.
La detección directa de la unión del ligando a
un receptor de quimiocina puede lograrse mediante el ensayo
siguiente. Los compuestos de la prueba (es decir, ligandos
putativos) están marcados de forma detectable (por ejemplo,
radioyodados). Los compuestos de la prueba marcados de forma
detectable se ponen entonces en contacto con preparaciones de
membranas que contienen un receptor de quimiocina de la invención.
Preferentemente, las membranas se preparan a partir de células
huésped que expresan los receptores de quimiocinas de la invención
procedentes de vectores recombinantes. Después de un periodo de
incubación para facilitar el contacto entre los receptores de
quimiocinas incrustados en la membrana y los compuestos de prueba
marcados de forma detectable, se recoge el material de membrana en
filtros por medio de la filtración al vacío. Entonces se cuantifica
el marcador detectable asociado a los filtros. Por ejemplo, los
radiomarcadores se cuantifican utilizando la espectrofotometría de
escintilación líquida. Por medio de esta técnica, se identifican
los ligandos que se unen a los receptores de quimiocina. Para
confirmar la identificación de un ligando, se expone un compuesto de
prueba marcado de forma detectable a una preparación de membrana
que exhibe un receptor de quimiocinas en presencia de cantidades
crecientes del compuesto de prueba en un estado no marcado. Una
reducción progresiva en el nivel de marca asociada a filtro a medida
que uno añade cantidades crecientes de compuesto de prueba no
marcado confirma la identificación de aquel ligando.
Los agonistas son ligandos que se unen al
receptor y provocan la transducción de señales intracelulares y los
antagonistas son ligandos que se unen al receptor pero que no
provocan la transducción de señales intracelulares. La determinación
en cuanto a saber si un ligando particular es un agonista o un
antagonista se puede realizar, por ejemplo, por medio del ensayo de
las vías de transducción de señales acopladas a proteína G. La
activación de estas vías se puede determinar midiendo el flujo
intracelular de Ca^{++}, la actividad de fosfolipasa C o la
actividad de adenilil ciclasa, además de otros ensayos (véase los
Ejemplos 5 y 6).
Tal como se expone en detalle en los Ejemplos
incluidos aquí, las quimiocinas que se unen al receptor 88C incluyen
RANTES, MIP-1\alpha y
MIP-1\beta y las quimiocinas que se unen al
receptor 88-2B incluyen los ensayos RANTES,
similares a los que se utilizan para identificar ligandos. La
preparación de membrana que exhibe un receptor de quimiocinas se
expone a una cantidad constante y conocida de un ligando funcional
marcado de forma detectable. Además, el receptor de quimiocinas
unido a membrana se expone también a una cantidad creciente de un
compuesto de prueba susceptible de modular la actividad de aquel
receptor de quimiocinas. Si los niveles del marcador asociado a
filtro están en correlación con la cantidad de compuesto de prueba,
aquel compuesto es un modulador de la actividad del receptor de
quimiocinas. Si el nivel del marcador asociado a filtro aumenta con
las cantidades crecientes del compuesto de prueba, se ha
identificado un activador. Por otro lado, si el nivel de marcador
asociado a filtro varia inversamente a la cantidad de compuesto de
prueba, se ha identificado un inhibidor de la actividad del receptor
de quimiocinas. De esta forma, las pruebas de moduladores de la
unión de receptores permite la exploración rápida de numerosos
moduladores putativos, lo mismo que los grupos conteniendo muchos
moduladores potenciales se pueden someter a prueba simultáneamente
en la misma reacción.
Los ensayos indirectos para la unión del
receptor implican mediciones de la concentración o del nivel de
actividad de cualquiera de los componentes encontrados en la vía
relevante de transducción de señales. La activación del receptor de
quimiocinas se asocia a menudo a un flujo intracelular de
Ca^{++}. Las células que expresan receptores de quimiocinas se
pueden cargar con un tinte sensible al calcio. A la activación del
receptor expresado, un flujo de Ca^{++} seria detectable de forma
espectrofotométrica por el tinte. Como alternativa, el flujo de
Ca^{++} podría ser detectado microscópicamente. Se pueden realizar
ensayos paralelos, mediante cualquiera de estas técnicas, en
presencia y ausencia de ligandos putativos. Por ejemplo, por medio
del ensayo microscópico para el flujo de Ca^{++}, RANTES, se
identificó una quimiocina CC como ligando del receptor de
quimiocina 88-2B. Los especialistas en la técnica
reconocerán que estos ensayos sirven también para identificar y
controlar la purificación de los moduladores de actividad del
receptor. Los activadores e inhibidores del receptor activarán o
inhibirán, respectivamente, la interacción de los receptores con sus
ligandos en estos ensayos.
Como alternativa, la asociación de los
receptores de quimiocinas a las proteínas G da la oportunidad de
evaluar la actividad de los receptores mediante el control de las
actividades de la proteína G. Una actividad característica de las
proteínas G, la hidrólisis del GTP, se puede controlar utilizando,
por ejemplo, GTP marcado ^{12}P.
Las proteínas G afectan también a una variedad
de otras moléculas a través de su participación en las vías de
transducción de señales. Por ejemplo, las moléculas efectoras de
proteínas G incluyen la adenilil ciclasa, fosfolipasa C, canales
iónicos, y fosfodiesterasas. Se pueden utilizar ensayos centrados
en cualquiera de estos efectores para controlar la actividad del
receptor de quimiocinas inducida por la unión del ligando en una
célula huésped que expresa tanto el receptor de quimiocinas de
interés como que se pone en contacto con un ligando apropiado. Por
ejemplo, un método mediante el cual la actividad de los receptores
de quimiocinas puede ser detectada implica la medición de la
actividad fosfolipasa C. En este ensayo, se detecta la producción
de fosfatos radiomarcados de inositol por células huésped que
expresan un receptor de quimiocinas en presencia de un agonista. La
detección de la actividad fosfolipasa puede necesitar la
cotransfección con ADN que codifica una proteína G exógena. Cuando
se requiere la cotransfección, este ensayo se puede realizar por
cotransfección del ADN con la proteína G quimérica, por ejemplo,
Gqi5 (Conklin y col., Nature 363:274-276 (1993), con
ADN de 88-2B o 88C y la detección de la producción
de fosfoinositol cuando la célula cotransfectada está expuesta a un
agonista del receptor 88-2B o 88C. Los especialistas
en la técnica reconocerán que los ensayos centrados en moléculas
efectoras de proteínas G sirven también para identificar y controlar
la purificación de moduladores de la actividad del receptor. Los
activadores e inhibidores del receptor activarán o inhibirán,
respectivamente, la interacción de los receptores con sus ligandos
en estos ensayos. En particular, se plantean en la presente
invención métodos según se definen en las reivindicaciones.
Se han relacionado las quimiocinas con muchas
enfermedades inflamatorias, tales como la psoriasis, artritis,
fibrosis pulmonar y ateroesclerosis. Véase Baggiolini y col.,
mencionados anteriormente. Los inhibidores de la acción de
quimiocinas pueden ser útiles para tratar estas condiciones. En un
ejemplo, Broaddus y col., J. of Immunol.
152:2960-2967 (1994), describen un anticuerpo contra
la IL-8 que puede inhibir el reclutamiento de
neutrófilos en la pleuresía inducida por endotoxina, modelo de
inflamación aguda en el pulmón de conejo. Se considera también que
el ligando o modulador que se une a, o la activación del, receptor
de 88C puede servir en el tratamiento de la infección por VIH y
estados de enfermedades relacionadas con el VIH. Los moduladores de
quimiocinas que se unen a receptores específicos previstos por le
invención, pueden incluir anticuerpos dirigidos hacia una quimiocina
o un receptor, pequeñas moléculas biológicas o químicas, o péptidos
sintéticos que corresponden a fragmentos de la quimiocina o del
receptor.
Es posible la administración de composiciones
que contienen moduladores de 88-2B o 88C a sujetos
mamíferos, con el propósito de controlar o remediar reacciones
inmunes normales o patológicas así como infecciones virales
incluida la infección por retrovirus como VIH-1,
VIH-2 y VIS. En particular, esto comprende la
mitigación de respuestas inflamatorias, procesos hematopoyéticos
anormales, e infecciones virales mediante el suministro de una
cantidad farmacéuticamente aceptable de moduladores de receptores
de quimiocinas 88-2B o 88C. Esto comprende además el
suministro de estas sustancias activas en composiciones
farmacéuticamente aceptables que comprenden vehículos, diluyentes o
medicamentos. Varias vías de administración son adecuadas. Por
ejemplo, las sustancias activas se pueden administrar por las
siguientes vías: intravenosa, subcutánea, intraperitoneal,
intramuscular, oral, anal (es decir, por formulaciones en
supositorio), o pulmonar (es decir, por inhaladores, atomizadores,
nebulizadores, etc.).
En otro aspecto, la información sobre la
secuencia de ADN descubierta aquí, posibilita el desarrollo,
mediante recombinación homologa de estrategias de "knockout"
(interrupción de genes) [véase, por ejemplo, Kapecchi, Science,
244:1288-1292 (1989)], de roedores que dejan de
expresar un receptor funcional de quimiocinas 88-2B
o 88C o que expresan una variante del receptor. Como alternativa,
los ratones transgénicos que expresan un receptor
88-2B o 88C clonado se pueden preparar mediante
técnicas de laboratorio bien conocidas (Manipulating the Mouse
Embryo: A Laboratory Manual, Brigid Hohan, Frank Costantini e
Elizabeth Lacy, eds. (1986) Cold Spring Harbor Laboratory ISBN
0-87969-175-1).
Dichos roedores son útiles como modelos para estudiar in vivo
las actividades de los receptores 88-2B o 88C.
Otros aspectos y ventajas de la presente
invención serán evidentes para un especialista en la técnica al
considerar los siguientes ejemplos.
Los ejemplos siguientes ilustran la invención.
El Ejemplo 1 describe el aislamiento de ADN genómicos que codifican
los receptores de quimiocinas 88-2B y 88C. El
Ejemplo 2 presenta el aislamiento y secuenciación de ADNc que
codifican los 88-2B y 88C humanos y 88C de macaco.
El Ejemplo 3 proporciona una descripción de análisis Northern que
revelan modelos de expresión de los receptores 88-2B
y 88C en varios tejidos. El Ejemplo 4 detalla la expresión
recombinante de los receptores 88-2B y 88C. El
Ejemplo 5 describe ensayos de flujo de Ca^{++}, ensayos de
hidrólisis del fosfoinositol, y ensayos de unión para la actividad
de los receptores 88-2B y 88C en respuesta a varios
ligandos potenciales. Se presentan en los Ejemplos 6 y 7
experimentos que describen el papel de 88-2B y 88C
como correceptores para el VIH. Se describen en el Ejemplo 8 la
preparación y caracterización de anticuerpos monoclonales y
policlonales inmunorreactivos con 88C. El Ejemplo 9 describe ensayos
adicionales diseñados para identificar ligandos o moduladores de
88-2B o 88C.
\vskip1.000000\baselineskip
Clones genómicos parciales que codifican los
nuevos genes receptores de quimiocinas de esta invención fueron
aislados por PCR basándose en secuencias conservadas encontradas en
genes previamente identificados y basándose en un agrupamiento de
estos genes receptores de quimiocinas dentro del genoma humano. Se
amplificó el ADN genómico mediante métodos de PCR estándar
utilizando oligonucleótidos iniciadores degenerados.
Las plantillas para amplificaciones mediante PCR
fueron miembros de una fuente comercialmente disponible de ADN
genómico recombinante humano clonado en Cromosomas Artificiales de
Levadura (es decir, YAC). (Research Genetics, Inc., Huntsville, AL.
YAC Library Pools, catalog no. 95011 B). Un vector de YAC puede
acomodar insertos de 500-1000 en pares de kilobases.
Inicialmente, se exploraron por PCR grupos de ADN de clones YAC
utilizando iniciadores específicos para el gen que codifica CCCKR1.
En particular, CCCKR(2)-5', iniciador de
hebra sentido (correspondiente a la hebra sentido de CCCKR1), se
presenta en la SEQ ID NO:15. El iniciador
CCCKR(2)-5' se componía de la secuencia
5'-CGTAAGCTTAGAGAAGCCGGGATGGGAA-3',
en la que los nucleótidos subrayados son el codón de inicio de la
traducción para CCCKR1. El iniciador de hebra antisentido fue
CCCKR-3' (correspondiente a la hebra antisentido de
CCCKR1) y su secuencia se presenta en la SEQ ID NO:16. La secuencia
de CCCKR-3',
5'-GCCTCTAGAGTCAGAGACCAGCAGA-3',
contiene el complemento inverso del codón de parada de la traducción
de CCCKR1 (subrayado). Los grupos de ADN de clones YAC que producen
productos de PCR detectables (es decir, bandas de ADN sobre
electrofóresis de gel) identificaron subgrupos apropiados de clones
YAC, basándose en un esquema de identificación del propietario.
(Research Genetics, Inc., Huntsville, AL). Las reacciones de PCR se
iniciaron con una incubación a 94ºC durante cuatro minutos. Las
amplificaciones de secuencias se obtuvieron mediante 33 ciclos de
desnaturación a 94ºC durante un minuto, alineamiento a 55ºC durante
un minuto, y extensión a 72ºC durante dos minutos.
Los subgrupos de ADN de clones YAC se sometieron
entonces a una segunda vuelta de reacciones de PCR utilizando las
condiciones e iniciadores que se utilizaron en la primera vuelta de
PCR. Los resultados procedentes de exploraciones de los subgrupos
identificaron clones individuales capaces de soportar las reacciones
de PCR con los iniciadores específicos de CCCKR. Un clon, 881F10,
contenía 640 kb de ADN genómico humano del cromosoma 3p21 que
incluía los genes para CCCKR1 y CCCKR2, tal como lo determinan la
PCR y la hibridación. Un clon YAC en solapamiento, 941A7, contenía
700 kb de ADN genómico humano y contenía asimismo los genes para
CCCKR1 y CCCKR2. Por consiguiente, se emprendieron otros estudios de
mapeo utilizando estos dos clones YAC. Análisis Southern revelaron
que CCCKR1 y CCCKR2 se localizaban aproximadamente a 100 kb uno de
otro.
La estrecha proximidad de los genes CCCKR1 y
CCCKR2 sugirió que nuevos genes relacionados podían estar enlazados
a CCCKR1 y CCCKR2. Por medio de ADN procedente de levadura que
contenía los clones YAC 881F10 y 941A7 como plantillas, se
realizaron reacciones de PCR para amplificar todo gen receptor
enlazado. Los oligodesoxirribonucleótidos degenerados se diseñaron
como iniciadores de PCR. Estos oligonucleótidos correspondían a
regiones que codifican el segundo bucle intracelular y el sexto
dominio transmembrana de los receptores de quimiocinas CC, según se
deduce de comparaciones de secuencias alineadas de CCCKR1, CCCKR2, y
V28. Se utilizó V28 debido a que es un receptor huérfano que
muestra las características de un receptor de quimiocinas. V28 se
ha mapeado también como cromosoma humano 3. Raport y col., Gene
163:295-299 (1995). Se debe tomar nota además que
las dos variantes de empalme de CCCKR2, CCCKR2A y CCCKR2B, son
idénticas en las regiones del segundo bucle intracelular y del
sexto dominio transmembrana utilizadas en el análisis. El iniciador
5', designado por V28degf2, contiene un sitio interno BamHI (ver a
continuación); su secuencia se presenta en la SEQ ID NO:5. La
secuencia del iniciador V28degf2 corresponde al ADN que codifica la
región del segundo bucle intracelular de la estructura canónica del
receptor. Véase Probst y col., más arriba. El iniciador 3',
designado por V28degr2 contiene un sitio interno HindIII (ver más
abajo); su secuencia se presenta en la SEQ ID NO:6. La secuencia del
iniciador V28degr2 corresponde al ADN que codifica el sexto domino
transmembrana de la estructura canónica del receptor.
El ADN amplificado por PCR fue digerido
posteriormente con BamHI e HindIII para generar fragmentos de
aproximadamente 390 bp, coherente con el tamaño de fragmento
previsto a partir de la inspección de la secuencia canónica. Después
de la digestión con endonucleasa, estos fragmentos de PCR fueron
clonados en pBluescript (Stratagene Inc., LaJolla, CA). Un total de
54 fragmentos clonados se sometieron a análisis automatizados de
secuencias de nucleótidos. Además de las secuencias procedentes de
CCCKR1 y CCCKR2, se identificaron las secuencias procedentes de los
dos nuevos genes receptores de quimiocinas de la invención. Estos
dos nuevos genes receptores de quimiocinas se designaron por
88-2B y 88C.
Se utilizaron el mapeo de endonucleasa de
restricción y la hibridación para mapear las posiciones relativas de
los genes que codifican los receptores 88C, 88-2B,
CCCKR1 y CCCKR2. Estos cuatro genes están estrechamente enlazados,
ya que el gen para 88C está aproximadamente a 18 KBP del gen CCCKR2
en el cromosoma humano 3p21.
\vskip1.000000\baselineskip
ADNc de longitud total de 88-2B
y 88C se aislaron de una librería de ADNc de macrófagos mediante el
procedimiento siguiente. Inicialmente, una librería de ADNc,
descrita en Tjoelker y col., Nature 374:549-553
(1995), se construyó en pRc/CMV (Invitrogen Corp., San Diego, CA) a
partir de ARNm de macrófagos humanos. Se exploró la librería de ADNc
en busca de la presencia de clones de ADNc de 88-2B
y 88C por PCR utilizando únicos pares de iniciadores
correspondientes a 88-2B o 88C. El protocolo de PCR
implicaba un desnaturación inicial a 94ºC durante cuatro minutos.
Entonces se amplificaron los polinucleótidos utilizando 33 ciclos de
PCR en las siguientes condiciones: desnaturación a 94ºC durante un
minuto, alineamiento a 55ºC durante un minuto, y extensión a 72ºC
durante dos minutos. El primer iniciador especifico de
88-2B fue el iniciador
88-2B-f1, presentado en la SEQ ID
NO: 11. Corresponde a la hebra sentido de la SEQ ID NO: 3 en los
nucleótidos 844-863. El segundo iniciador de PCR
especifico del gen que codifica 88-2B fue el
iniciador 88-2B-r1, presentado en la
SEQ ID NO: 12; la secuencia de
88-2B-r1 corresponde a la hebra
antisentido de la SEQ ID NO: 3 en los nucleótidos
1023-1042. De forma similar, la secuencia del
primer iniciador especifico del gen que codifica 88C, el iniciador
88C-f1, se presenta en la SEQ ID NO:13 y
corresponde a la hebra sentido de la SEQ ID NO:1 en los nucleótidos
453-471. El segundo iniciador especifico del gen
que codifica 88C es el iniciador 88C-r3, presentado
en la SEQ ID NO:14; la secuencia de 88C-r3
corresponde a la hebra antisentido de la SEQ ID NO:1 en los
nucleótidos 744-763.
La exploración identificó el clon 777, un clon
de ADNc de 88-2B. El clon 777 contenía un inserto de
ADN de 1915 bp que incluía la secuencia de codificación de longitud
total de 88-2B según lo determinan los siguientes
criterios: el clon contenía un largo marco de lectura abierta que
empezaba por un codón ATG, exhibía una secuencia Kozak y tenia aguas
arriba un codón de parada dentro del marco. El ADN y secuencias de
aminoácidos deducidas del inserto del clon 777 se presentan
respectivamente en la SEQ ID NO:3 y SEQ ID NO:4. La transcripción de
88-2B era relativamente poco frecuente en la
librería de ADNc de macrófagos. Durante la exploración de la
librería, se identificaron solamente tres clones de
88-2B a partir de un total estimado en tres millones
de clones.
La exploración en busca de clones de ADNc que
codifican el receptor de quimiocinas 88C identificó los clones 101 y
134 que, según parece, contenían toda la región de codificación de
88C, incluido un codón de iniciación putativo. Sin embargo, estos
clones carecían de la secuencia 5' adicional necesaria para
confirmar la identidad del codón de iniciación. La transcripción de
88C era relativamente abundante en la librería de ADNc de
macrófagos. Durante la exploración de la librería, se estimó que 88C
estaba presente en una cantidad de uno cada 3000 transcripciones
(en un total de aproximadamente tres millones de clones en la
librería).
Se llevó a cabo una RACE (Amplificación Rápida
de Extremos de ADNc) por PCR para ampliar las secuencias existentes
de clones de 88C, facilitando por este medio la caracterización
exacta del extremo 5' del ADNc de 88C. Se compró ADNc
5'-RACE-ready de bazo humano a
Clontech Laboratories, Inc., Palo Alto, CA, y se utilizó de acuerdo
con las recomendaciones del fabricante. El ADNc se habla elaborado
como "5'-RACE-ready" ligando
una secuencia ancla a los extremos 5' de los fragmentos de ADNc. La
secuencia ancla es complementaria de un iniciador ancla
suministrado por Clontech Laboratories, Inc., Palo Alto, CA. El
polinucleótido del dúplex secuencia ancla-iniciador
ancla contiene un sitio EcoRI. Se eligió ADNc de bazo humano como
ADN plantilla debido a que los Northern blots hablan revelado que se
expresaba 88C en este tejido. Las reacciones de PCR empezaron por la
desnaturación de muestras a 94ºC durante cuatro minutos.
Posteriormente, se amplificaron las secuencias utilizando 35 ciclos
que implicaban la desnaturación a 94ºC durante un minuto, el
alineamiento a 60ºC durante 45 segundos, y la extensión a 72ºC
durante dos minutos. La primera vuelta de PCR se realizó en mezclas
de reacción que contenían 2 \mul de ADNc
5'-RACE-ready de bazo, 1 \mul del
iniciador ancla, y 1 \mul de iniciador 88c-r4 (100
ng/\mul) en un volumen total de reacción de 50 \mul. El
iniciador especifico de 88C, el iniciador 88c-r4
(5'-GATAAGCCTCACAGCCCTGTG-3'), se
presenta en la SEQ ID NO:7. La secuencia del iniciador
88c-r4 corresponde a la hebra antisentido de la SEQ
ID NO:1 en los nucleótidos 745-765. Una segunda
vuelta de PCR se llevó a cabo en mezclas de reacción que incluían 1
\mul de la primera reacción de PCR con 1 \mul de iniciador ancla
y 1 \mul de iniciador 88C-r1b (700 ng/\mul) que
contenía la secuencia siguiente
(5'-GCTAAGCTTGATGACTATCTTTAATGTC-3')
y se presentaba en la SEQ ID NO.8. La secuencia del iniciador
88C-r1b contiene un sitio de clonación interno
HindIII (subrayado). La secuencia 3' del sitio HindIII corresponde
a la hebra antisentido de la SEQ ID NO:1 en los nucleótidos
636-654. El producto resultante de la PCR fue
digerido con EcoRI e HindIII y fraccionado en un gel de agarosa al
1%. Se aisló el fragmento de aproximadamente 700 bp y se clonó en
pBluescript. Se secuenciaron los clones con los insertos más
grandes. Como alternativa, el producto intacto de PCR fue ligado en
el vector pCR utilizando un kit comercial de clonación TA
(Invitrogen Corp., San Diego, CA) para determinaciones posteriores
de secuencias de nucleótidos.
Los ADNc de 88-2B y 88C se
secuenciaron por medio del Kit de Secuenciación por Ciclo de
Terminación PRISM "Ready Reaction DyeDeoxy" (Perkin Elmer
Corp., Foster City, CA) y un Secuenciador de ADN 373A de Applied
Biosystems. El inserto del clon 777 proporcionó la plantilla de
doble hebra para las reacciones de secuenciación utilizadas para
determinar la secuencia de ADNc de 88-2B. La
secuencia del inserto en su totalidad del clon 777 se determinó y se
presenta como secuencia de ADNc de 88-2B así como la
secuencia de aminoácidos deducida en la SEQ ID NO: 3. La secuencia
tiene una longitud de 1915 bp, incluidos 361 bp del ADN no traducido
5' (correspondiente a la SEQ ID NO:3 en los nucleótidos
1-361), región de codificación de 1065 bp
(correspondiente a la SEQ ID NO:3 en los nucleótidos
362-1426), y 489 bp del ADN no traducido 3'
(correspondiente a la SEQ ID NO: 3 en los nucleótidos
1427-1915). El ADN genómico de
88-2B, descrito en el Ejemplo 1 anterior,
corresponde a la SEQ ID NO:3 en los nucleótidos
746-1128. La secuencia de ADNc de 88C, así como la
secuencia de aminoácidos deducida, se presenta en la SEQ ID NO:1.
La secuencia de ADNc de 88C es un compuesto de secuencias obtenido
de ADNc por PCR-RACE, el clon 134 y el clon 101. Se
utilizó el ADNc por PCR-RACE como plantilla de
secuenciación para determinar los nucleótidos 1-654
en la SEQ ID NO:1, incluida la única identificación de 9 bp de la
secuencia de ADNc no traducida 5' en la SEQ ID NO:1 en los
nucleótidos 1-9. La secuencia obtenida del ADNc por
PCR-RACE confirmó la posición del primer codón de
metionina en los nucleótidos 55-57 en la SEQ ID
NO:1, y corrobora la conclusión de que el clon 134 y el clon 101
contenían copias de longitud total de la región de codificación de
88C. El clon 134 contenía 45 bp del ADNc no traducido 5'
(correspondiente a la SEQ ID NO:1 en los nucleótidos
10-54), la región de codificación de 88C de 1056 bp
(correspondiente a la SEQ ID NO:1 en los nucleótidos
55-1110), y el ADNc no traducido 3' de 492 bp
(correspondiente a la SEQ ID NO:1 en los nucleótidos
1111-1602). El clon 101 contenía 25 bp del ADNc no
traducido 5' (correspondiente a la SEQ ID NO:1 en los nucleótidos
30-54), la región de codificación de 88C de 1056 bp
(correspondiente a la SEQ ID NO:1 en los nucleótidos
55-1110), y el ADNc no traducido 3' de 2273 bp
(correspondiente a la SEQ ID NO:1 en los nucleótidos
1111-3383). El ADN genómico de 88C descrito en el
Ejemplo 1 anterior, corresponde a la SEQ ID NO:1 en los nucleótidos
424-809.
Las secuencias de aminoácidos deducidas de
88-2B y 88C revelaron perfiles de hidrofobicidad
característicos de los GPCR, incluidos siete dominios hidrofóbicos
que corresponden a los dominios transmembrana del GPCR. Las
comparaciones de secuencias con otros GPCRs revelaron también un
grado de identidad. De forma significativa, las secuencias de
aminoácidos deducidas tanto de 88-2B como de 88C
tenían mayor identidad con las secuencias de los receptores de
quimiocinas. La Tabla 1 presenta los resultados de estas
comparaciones de secuencias de
aminoácidos.
aminoácidos.
La Tabla 1 muestra que 88-2B es
el más parecido a CCCKR1 (idéntico en un 62% al nivel de
aminoácidos) y 88C es el más parecido a CCCKR2 (idéntico en un 72%
al nivel de aminoácidos).
Las secuencias de aminoácidos deducidas de
88-2B y 88C revelaron también dominios
intracelulares y extracelulares característicos de los GPCR. Los
dominios extracelulares de 88-2B corresponden a la
secuencia de aminoácidos proporcionada en la SEQ ID NO:3, así como
en la SEQ ID NO:4, en los residuos de aminoácidos
1-36, 93-107,
171-196 y 263-284. Los dominios
extracelulares de 88-2B son codificados por
secuencias de polinucleótidos que corresponden a la SEQ ID NO:3 en
los nucleótidos 362-469, 638-682,
872-949, y 1148-1213. Los dominios
extracelulares de 88C incluyen los residuos de aminoácidos
1-32, 89-112,
166-191 y 259-280 en la SEQ ID NO:1
y en la SEQ ID NO:2. Los dominios extracelulares de 88C son
codificados por secuencias de polinucleótidos que corresponden a la
SEQ ID NO:1 en los nucleótidos 55-150,
319-390, 550-627 y
829-894. Los dominios intracelulares de
88-2B incluyen los aminoácidos
60-71, 131-151,
219-240, y 306-355 de la SEQ ID NO:
3 y la SEQ ID NO: 4. Dichos dominios son codificados por secuencias
de polinucleótidos que corresponden a la SEQ ID NO:3 en los
nucleótidos 539-574, 752-814,
1016-1081, y 1277-1426
respectivamente. Los dominios intracelulares de 88C incluyen los
residuos de aminoácidos 56-67,
125-145, 213-235 y
301-352 de la SEQ ID NO:1 y la SEQ ID NO:2. Los
dominios intracelulares de 88C son codificados por secuencias de
polinucleótidos que corresponden a la SEQ ID NO:1 en los
nucleótidos 220-255, 427-489,
691-759 y 955-1110.
Además, se amplificó un ADN de 88C de macaco
mediante PCR, procedente de ADN genómico de macaco utilizando
iniciadores que correspondían a las regiones flanqueantes 5' y 3'
del ADNc de 88C humano. El iniciador 5' correspondía a la región
inmediatamente aguas arriba de, e incluyendo el codón iniciador
Met. El iniciador 3' era complementario de la región inmediatamente
aguas abajo del codón de terminación. Los iniciadores incluían
sitios de restricción para la clonación dentro de vectores de
expresión. La secuencia del iniciador 5' fue
GACAAGCTTCACAGGGTGG AACAAGATG (con el sitio HindIII
subrayado) (SEQ ID NO:17) y la secuencia del iniciador 3' fue
GTCTCTAGACCACTTGAGTCCGTGTCA (con el sitio XbaI subrayado)
(SEQ ID NO:18). Las condiciones de amplificación por PCR fueron de
94ºC durante ocho minutos, después 40 ciclos de 94ºC durante un
minuto, 55ºC durante cuarenta y cinco segundos, y 72ºC durante un
minuto. Los productos amplificados se clonaron en los sitios
HindIII y XbaI de pcADN3 y se obtuvo y secuenció un clon. El ADNc de
macaco de longitud total y las secuencias de aminoácidos deducidas
se presentan en las SEQ ID NO:19 y 20, respectivamente. La secuencia
de nucleótidos de 88C de macaco es idéntica en un 98% a de 88C
humana. Las secuencias de aminoácidos deducidas son idénticas en un
97%.
\vskip1.000000\baselineskip
Se determinaron modelos de expresión de ARNm de
88-2B y 88C mediante análisis de Northern blot.
Los Northern blots que contenían
poli(A^{+})-ARN inmovilizado procedente de
varios tejidos humanos se compraron a Clontech Laboratories, Inc.,
Palo Alto, CA. En particular, se examinaron los tejidos siguientes:
corazón, cerebro, placenta, pulmón, hígado, músculo esqueletal,
riñón, páncreas, bazo, timo, próstata, testículo, ovario, intestino
delgado, colón y leucocitos de sangre periférica.
Se generó una sonda especifica de secuencias de
nucleótidos de 88-2B a partir del clon 478 de ADNc.
El inserto de ADNc en el clon 478 contiene la secuencia que
corresponde a la SEQ ID NO:3 en los nucleótidos
641-1915. Para generar una sonda, el clon 478 fue
digerido y el fragmento de ADN insertado se aisló después de
electroforesis en gel. El fragmento de inserto aislado entonces fue
radiomarcado con los nucleótidos marcados ^{32}P, por medio de
técnicas conocidas en el arte.
Se generó una sonda especifica de secuencias de
nucleótidos de 88C mediante aislamiento y radiomarcado del fragmento
de ADN insertado encontrado en el clon 493. El fragmento insertado
procedente del clon 493 contiene la secuencia que corresponde a la
SEQ ID NO:1 en los nucleótidos 421-1359. De nuevo,
para generar la sonda, se utilizaron técnicas convencionales que
implicaban los nucleótidos marcados ^{32}P.
Los Northern blots sondeados con
88-2B revelaron un ARNm de aproximadamente 1,8 kb en
los leucocitos de sangre periférica. Los Northerns de 88C mostraron
un ARNm de aproximadamente 4 kb en varios tejidos humanos, incluida
una fuerte señal cuando se sondeó el tejido de bazo o de timo y
señales menos intensas cuando se analizó el ARNm procedente de
leucocitos de sangre periférica y del intestino delgado. Se detectó
una señal relativamente débil para 88C en tejido de pulmón y en
tejido de ovario.
La expresión de 88C en células-T
humanas y en líneas celulares hematopoyéticas se determinó también
mediante análisis Northern blot. Los niveles de 88C en las
células-T CD4^{+} y CD8^{+} eran muy altos. La
transcripción estaba presente a niveles relativamente altos en las
líneas celulares mieloides THP1 h HL-60 y se
encontró también en la línea celular B Jijoye. Además, el ADNc era
una transcripción relativamente abundante en una librería de ADNc
de macrófagos humanos basada en la amplificación por PCR de
subfracciones de la librería.
\vskip1.000000\baselineskip
Los ADN de 88-2B y 88C se
expresaron mediante métodos recombinantes en células de
mamíferos.
Para experimentos de transfección transitoria,
se subclonó 88C dentro del vector pBJ1 de expresión de células de
mamíferos (Ishi, K. y col., J. Biol. Chem.
270:16435-16440 (1995)). La construcción incluía
secuencias que codificaban una secuencia de señales de prolactina
para una expresión eficaz en la superficie celular y un epítopo FLAG
en el amino terminal de 88C para facilitar la detección de la
proteína expresada. El epítopo FLAG se compone de la secuencia
"DYKDDDD". Células COS-7 fueron transfectadas
transitoriamente con el plásmido de expresión de 88C utilizando
Lipofectamina (Life Technology, Inc., Grand Island, NY) siguiendo
las instrucciones del fabricante. Brevemente, se sembraron las
células en placas de 24 pocillos a una densidad de 4 x 10^{4}
células por pocillo y se cultivaron durante toda la noche.
Entonces, se lavaron las células con PBS, y se añadieron en cada
pocillo 0,3 mg de ADN mezclado con 1,5 \mul de lipofectamina en
0,25 ml de Opti-MEM. Después de 5 horas a 37ºC, el
medio se sustituyó por un medio que contenía un 10% de FCS. Un ELISA
cuantitativo confirmó que se expresaba el 88C en la superficie
celular en células COS-7 transfectadas
transitoriamente utilizando el anticuerpo MI especifico del epítopo
FLAG (Eastman Co., New Haven, CT).
El receptor de 88C marcado con FLAG fue
transfectado también de forma estable dentro de células
HEK-293, línea celular de riñón embrionario humano,
utilizando el reactivo de transfección DOTAP
(N-[1-[(2,3-dioleoiloxi)propil]-N,N,N-trimetilamonio-metilsulfato,
Boehringer-Mannheim, Inc., Indianapolis, IN) de
acuerdo con las recomendaciones del fabricante. Se seleccionaron
líneas estables en presencia del medicamento G418. Se evaluaron las
células transfectadas HEK-293 en cuanto a la
expresión de 88C en la superficie celular por medio de ELISA,
utilizando el anticuerpo MI al epítopo FLAG. ELISA mostró que el 88C
marcado con el epítopo FLAG se expresaba en la superficie celular de
células HEK-293 transformadas de forma estable.
Se utilizaron los ADNc de 88-2B
y 88C para estabilizar los transfectantes de
HEK-293. El ADNc del receptor 88-2B
se clonó detrás del promotor del citomegalovirus en pRc/CMV
(Invitrogen Corp., San Diego, CA) utilizando una estrategia basada
en PCR. La plantilla para la reacción PCR fue el inserto de ADNc en
el clon 777. Los iniciadores de PCR fueron
88-2B-3 (que contenía un sitio
interno XbaI) y 88-2B-5 (que
contenía un sitio interno HindIII). La secuencia de nucleótidos del
iniciador 88-2B-3 se presenta en la
SEQ ID NO:9; la secuencia de nucleótidos del iniciador
88-2B-5 se presenta en la SEQ ID
NO:10. Se amplificó una región de 1104 bp de ADNc. Después de la
amplificación, el ADN fue digerido con XbaI e HindIII y fue clonado
en pRc/CMV digerido de forma similar. El plásmido resultante se
denominó 777XP2, que contiene 18 bp de la secuencia no traducida 5',
la totalidad de la región de codificación de 88-2B y
3 bp de la secuencia no traducida 3'. Para la secuencia de 88C, el
inserto de ADNc de longitud total en el clon 134 no se modificó más
antes de la transfección de las células HEK-293.
Para crear líneas celulares transformadas
establemente, clones recombinantes de pRc/CMV fueron transfectados
utilizando el reactivo de transfección DOTAP
(N-[1-[(2,3-dioleoiloxi)propil]-N,N,N-trimetilamoniometil
sulfato, Boehringer-Mannheim, Inc., Indianapolis,
IN) de acuerdo con las recomendaciones del fabricante, en células
HEK-293, línea celular del riñón embrionario
humano. Se seleccionaron líneas estables en presencia del
medicamento G418. Se realizaron procedimientos estándar de
exploración (es decir, análisis Northern blot) para identificar
líneas celulares estables que expresan los niveles más altos de ARNm
de 88-2B y 88C.
\vskip1.000000\baselineskip
Para analizar la expresión de los polipéptidos,
se empleó un ensayo funcional en busca de la actividad receptora de
quimiocinas. Una característica común de la señalización a través
de los receptores conocidos de quimiocinas es que la transducción
de la señal está asociada a la liberación de cationes de calcio
intracelular. Por lo tanto, la concentración de Ca^{++}
intracelular en las células transfectadas HEK-293 se
sometió a ensayo para determinar si los receptores
88-2B o 88C respondían a cualquiera de las
quimiocinas conocidas.
Las células HEK-293,
transfectadas establemente con 88-2B, 88C (sin la
secuencia del epítopo FLAG), o una región de codificación de
control (que codifica IL8R o CCCKR2, véase más abajo) tal como se
ha descrito anteriormente, se cultivaron en matraces T75 hasta una
confluencia aproximadamente del 90% en MEM + 10% de suero. Después,
se lavaron las células, se cosecharon con verseno (0,6 mM de EDTA,
10 mM de Na_{2}HPO_{4}, 0,14 M de NaCl, 3 mM de KCl, y 1 mM de
glucosa), y se incubaron en MEM + 10% de suero + 1 \muM de
Fura-2 AM (Molecular Probes, Inc., Eugene, OR)
durante 30 minutos a temperatura ambiente. Fura-2 AM
es un tinte sensible a Ca^{++}. Las células se resuspendieron en
una solución salina tamponada con fosfato de Dulbecco que contenía
0,9 mM de CaCl_{2} y 0,5 mM de MgCl_{2} (D-PBS)
a una concentración de aproximadamente 10^{7} células/ml y los
cambios en la fluorescencia se controlaron mediante un
espectrofotómetro de fluorescencia (Modelo F-4010 de
Hitachi). Se suspendieron aproximadamente 10º células en 1,8 ml de
D-PBS en una cubeta mantenida a 37ºC. Las longitudes
de ondas de excitación alternaban entre 340 y 380 nm a intervalos
de 4 segundos; la longitud de onda de emisión fue de 510 nm. Se
añadieron composiciones de prueba a la cubeta a través de un
orificio de inyección; se midió el flujo máximo de Ca^{++} al
añadir ionomicina.
Se observaron respuestas positivas en las
células que expresaban IL-8RA cuando se estimulaban
con IL-8 y también cuando CCCKR2 se estimulaba con
MCP-1 o MCP-3. Sin embargo, las
células HEK-293 que expresaban 88-2B
o 88C dejaron de mostrar un flujo en la concentración de Ca^{++}
intracelular cuando se exponían a cualquiera de las siguientes
quimiocinas: MCP-1, MCP-2,
MCP-3, MIP-1\alpha,
MIP-1\beta, IL8, NAP-2, gro/MGSA,
IP-10, ENA-78, o
PF-4. (Peprotech, Inc., Rocky Hill, NJ).
Por medio de un ensayo más sensible, se observó
microscópicamente una respuesta del flujo de Ca^{++} a RANTES en
células cargadas con Fura-2 AM que expresan
88-2B. El ensayo implicaba células y reactivos
preparados tal como se describió anteriormente. RANTES (Regulado
sobre Activación. Célula T Normal Expresada y Secretada) es una
quimiocina CC que ha sido identificada como quimioatractivo y
activador de eosinófilos. Véase Neote y col, mencionado más arriba.
Esta quimiocina media también la liberación de la histamina por los
basófilos y se ha demostrado que funciona como quimioatractivo para
las células T de memoria in vitro. Se considera por lo tanto
que la modulación de las actividades del receptor
88-2B es útil en la modulación de la activación de
leucocitos.
El receptor 88C marcado con FLAG se expresó en
células HEK-293 y se sometió a prueba en busca de
interacciones de quimiocinas en el ensayo de flujo de Ca^{++}. La
expresión de 88C en la superficie celular se confirmó por ELISA y
por análisis FACScan utilizando el anticuerpo Mi. Las quimiocinas
RANTES, MIP-1\alpha, y
MIP-1\beta provocaron todas un flujo de Ca^{++}
en las células transfectadas de 88C cuando se añadían a una
concentración de 100 nM.
Se pueden diseñar también ensayos de flujo de
Ca^{++} para identificar moduladores de la unión de receptores a
quimiocinas. Los ensayos fluorimétricos o microscópicos anteriores
se llevan a cabo en presencia de compuestos de prueba. Si se aumenta
el flujo de Ca^{++} en presencia de un compuesto de prueba, dicho
compuesto es un activador de la unión del receptor a quimiocinas.
Por otra parte, un flujo reducido de Ca^{++} identifica el
compuesto de prueba como un inhibidor de la unión del receptor a
quimiocinas.
\vskip1.000000\baselineskip
Otro ensayo dirigido a ligandos o moduladores
implica la actividad de la fosfolipasa C, tal como se describe en
Hung y col., Chem. 116:827-832 (1992). Inicialmente,
las células huésped que expresan un receptor de quimiocina se
cargan con ^{3}H-inositol durante 24 horas.
Entonces se añaden los compuestos de prueba (es decir, los ligandos
potenciales) a las células y se incuban a 37ºC durante 15 minutos.
Entonces, se exponen las células a ácido fórmico 20 mM para
solubilizar y extraer metabolitos hidrolizados del metabolismo del
fosfoinositol (es decir, los productos de hidrólisis mediada por la
fosfolipasa C). El extracto se somete a una cromatografía de
intercambio aniónico utilizando una columna de intercambio aniónico
AG1X8 (forma del formato). Se eluyen los fosfatos de inositol con
formato de amonio 2M/ácido fórmico 0,1M y el ^{3}H asociado a los
compuestos se determina por medio de espectrofotometría de
escintilación liquida. Se puede explotar también el ensayo con
fosfolipasa C para identificar moduladores de la actividad del
receptor de quimiocinas. El ensayo antes mencionado se realiza tal
como se describe, pero con la adición de un modulador potencial.
Niveles elevados de marcado detectable indicarían que el modulador
es un activador; niveles bajos del marcado indicarían que el
modulador es un inhibidor de la actividad del receptor de
quimiocinas.
El ensayo con fosfolipasa C se realizó para
identificar ligandos de quimiocinas del receptor 88C marcado con
FLAG. Aproximadamente 24 horas después de la transfección, las
células COS-7 que expresan 88C se marcaron durante
20-24 horas con
myo-[2-^{3}H]inositol (1 \muCi/m) en un
medio exento de inositol que contenía FCS dializado al 10%. Se
lavaron las células marcadas con DMEM exento de inositol que
contenía 10 mM de LiCl y se incubaron a 37ºC durante 1 hora con DMEM
exento de inositol que contenía 10 mM de LiCl y una de las
siguientes quimiocinas: RANTES, MIP-1\beta,
MIP-1\alpha, MCP-1,
IL-8, o el homólogo JE de MCP-1
murino. Se sometió a prueba la formación de fosfato de inositol
(IP) tal como se describe en el párrafo anterior. Después de la
incubación con quimiocinas, se aspiró el medio y se Usaron las
células mediante la adición de 0,75 ml de ácido fórmico 20 mM
helado (30 min). Se cargaron fracciones de sobrenadante en columnas
AG1-X8 Dowex (Biorad. Hercules, CA), seguido de la
adición inmediata de 3 mi de NH_{4}OH 50 mM. Entonces se lavaron
las columnas con 4 ml de formato de amonio 40 mM, seguido de la
elución con formato de amonio 2M. Los fosfatos de inositol totales
se cuantificaron mediante conteo de emisiones beta.
Como se ha demostrado que algunos receptores de
quimiocinas, tales como IL8RA e IL8RB requieren una cotransfección
con una proteína G exógena antes de que se puedan detectar señales
en las células COS-7, el receptor 88C se
co-expresó con la proteína G quimérica Gqi5
(Conklin y col., Nature 363:274-276, (1993). La Gqi5
es una proteína G cuyos cinco aminoácidos carboxilo terminales de
Gi (que se une al receptor) se empalman sobre G\alphaq. La
cotransfección con Gqi5 potencia significativamente la señalización
por CCCKR1 y CCKR2B. La cotransfección con Gqi5 reveló que 88C mandó
bien las señales en respuesta a RANTES,
MIP-1\beta y MIP-1\alpha, pero
no en respuesta a MCP-1, IL-8 o el
homólogo de MCP-1 murino JE. Las curvas
dosis-respuesta revelaron valores EC_{50} de 1 nM
para RANTES, de 6 nM para MIP-1\beta, y de 22 nM
para MIP-1\alpha.
88C es el primer receptor humano clonado con una
respuesta por señales a MIP-1\beta. En comparación
con otras quimiocinas CC, MIP-1\beta tiene
claramente un único modelo de activación celular. Parece que activa
las células T pero no los monocitos (Baggiolini y col, mencionados
más arriba) lo que es coherente con los estudios de estimulación de
receptores. Por ejemplo, mientras MIP-1\beta se
une a CCCKR1, no induce el flujo de calcio (Neote y col, mencionados
anteriormente). Por otra parte, MIP-1\alpha y
RANTES se unen a, y provocan, señales en CCCKR1 y CCCKR5 (RANTES
provoca también la activación de CCCKR3). Por lo tanto, parece que
MIP-1\beta es mucho más selectiva que otras
quimiocinas de la familia de quimiocinas CC. Dicha selectividad es
de importancia terapéutica debido a que se puede estimular una
actividad ventajosa específica (tal como la supresión de la
infección por VIH) sin estimular múltiples poblaciones leucocitarias
que resultan en general de actividades proinflamatorias.
\vskip1.000000\baselineskip
Otro ensayo para la interacción de los
receptores con las quimiocinas fue una modificación del ensayo de
unión descrito por Ernst y col., J. Immunol.
152:3541-3549 (1994). Se marcó
MIP-1\beta por medio del reactor de Bolton and
Hunter (diyoduro, NEN, Wilmington, DE) de acuerdo con las
instrucciones del fabricante. Se separó el yoduro no conjugado de
la proteína marcada mediante elución utilizando una columna
PD-10 (Pharmacia) equilibrada con PBS y BSA (1%
peso/volumen). La actividad especifica fue típicamente de 2200
Ci/mmol. La unión en equilibrio se realizó mediante la adición del
ligando marcado ^{125}I con o sin un exceso de 100 veces de
ligando no etiquetado, a 5 x 10^{5} células
HEK-293 tranfectadas con 88C etiquetado con el
epítopo FLAG en tubos de polipropileno en un volumen total de 300
\mul (HEPES 50 mM, pH 7,4, CaCl_{2} 1 mM, MgC_{2}, BSA al
0,5%), y la incubación durante 90 minutos a 27ºC con agitación a
150 r.p.m. Se recogieron las células, utilizando un cosechador de
células Skatron (Skatron Instruments, Inc., Sterling, VA), sobre
filtros de fibra de vidrio en polietilenoimina al 0,3% y BSA al
0,2%. Después del lavado, se quitaron los filtros y se cuantificó el
ligando unido mediante conteo de emisiones gamma. La unión del
ligando por competición con el ligando no marcado se determinó por
incubación de 5 x 10^{5} células tranfectadas (de la misma forma
que anteriormente) con 1,5 nM de ligando radiomarcado y las
concentraciones indicadas de ligando no marcado. Se recogieron las
muestras, se lavaron y se contaron tal como se hizo anteriormente.
Se analizaron los datos por medio del programa PRISMA de ajuste de
la curva (GraphPad, Inc., San Diego, CA) y el programa de regresión
no lineal iterativa, LIGAND (PM220).
En los ensayos de unión en equilibrio, el
receptor 88C se unió al MIP-1\beta radiomarcado de
una forma especifica y saturable. El análisis de estos datos de
unión por el método de Scatchard reveló una constante de disociación
(Kd) de 1,6 nM. Los ensayos de unión por competición utilizando
MIP-1\beta marcado reveló una unión de gran
afinidad de MIP-1\beta (IC_{50} = 7,4 nM)),
RANTES (IC_{50} = 6,9 nM) y MIP-1\alpha
(IC_{50} = 7,4 nM), coherente con los datos sobre señalización
obtenidos en las células COS-7 transfectadas
transitoriamente tal como se ha expuesto en el apartado B
anterior.
\vskip1.000000\baselineskip
Se ha demostrado que las quimiocinas
MIP-1\alpha, MIP-1\beta y RANTES
inhibían la replicación del VIH-1 y
VIH-2 en células mononucleares de sangre periférica
humana y células PM1 (Cocchi y col., más arriba). Considerando este
descubrimiento y a la vista de los resultados descritos en el
Ejemplo 5, la presente invención considera que la activación de, o
la unión del ligando, al receptor 88C puede proporcionar un papel
protector en la infección por VIH.
Se ha reportado recientemente que el receptor
huérfano acoplado a la proteína G, la fusina, puede actuar como
correceptor para la entrada de VIH. La fusina/CXCR4 en combinación
con CD4, principal receptor del VIH, facilita aparentemente la
infección por VIH de las células T cultivadas (Feng y col., Science
272: 872-877 (1996). Sobre la base de la homología
de la fusina con los receptores de quimiocinas y el perfil de unión
a quimiocinas de 88C, y debido a que 88C se expresa
constitutivamente en las células T y se expresa abundantemente en
los macrófagos, es probable que 88C intervenga en la infección
viral y por VIH.
La función de 88C y 88-2B como
correceptores para el VIH se determinó mediante la transfección de
células que expresan CD4 con 88C o 88-2B y retando
las células cotransfectadas con el VIH. Sólo se infectaron las
células que expresan tanto CD4 como un correceptor funcional para el
VIH. Se puede determinar la infección por VIH por medio de varios
métodos. Los ELISA que someten a prueba la expresión de antígenos
del VIH están disponibles comercialmente, por ejemplo el ensayo con
el antígeno FHV-L_{p}24 de Coulter (patente de
Estados Unidos Nº 4.886.742), Coulter Corp., 11800 SW 147th Ave.,
Miami, FL 33196). Como alternativa, las células de prueba se pueden
elaborar para expresar un gen reportero tal como LACZ unido al
promotor LTR del VIH [Kimpton y col., J. Virol.
66:2232-2239 (1992)]. En este método, las células
que están infectadas por VIH, se detectan mediante un ensayo
colorimétrico.
Se transfectó transitoriamente 88C en una línea
celular de gato. CCC [Clapham y col., 181:703-715
(1991)] que habla sido transformada establemente para expresar CD4
humano (CCC-CD4). Estas células normalmente son
resistentes a la infección por cualquier cepa del
VIH-1 debido a que no expresan de forma endógena
88C. En estos experimentos, las células CCC/CD4 fueron transfectadas
transitoriamente con 88C clonado en el vector de expresión pcDNA3.1
(Invitrogen Corp., San Diego, CA) utilizando lipofectamina (Gibco
BRL. Gaithersburg, MD). Dos días después de la transfección, se
retaron las células con el VIH. Tras 4 días de incubación, las
células se fijaron y tiñeron para el antígeno p24 como medición de
la infección por VIH. La expresión de 88C por estas células las
convirtió en susceptibles de infección por varias cepas del
VIH-1. Estas cepas incluían cuatro aislados
principales de VIH-1 no inductores de sincitio (M23,
E80, SL-2 y SF-162) que mostraron
utilizar solamente 88C como correceptor pero no fusina. Varias cepas
principales inductoras de sincitio del VIH-1 (2006,
M13, 2028 y 2076) utilizaron 88C o fusina como correceptor.
Asimismo, dos virus de VIH-1 clonales establecidos
(GUN-1 y 89,6) utilizaron 88C o fusina como
correceptor.
Se ha reportado que algunas cepas del
VIH-2 pueden infectar ciertas líneas celulares
CD4-negativas, implicando de este modo una
interacción directa del VIH-2 con un receptor
distinto del CD4 [Clapham y col., J. Virol.
66:3531-3537 (1992)]. Para algunas cepas del
VIH-2, esta infección está facilitada por la
presencia de CD4 soluble (sCD4). Como 88-2B
comparte alta similitud de secuencias con otros receptores de
quimiocinas que actúan como correceptores del VIH (a saber 88C y
fusina), se consideró que 88-2B era probablemente
correceptor del VIH-2. El papel de
88-2B como correceptor del VIH-2 se
demostró utilizando la cepa de VIH-2 ROD/B. Células
CCC de gato que no expresan de forma endógena CD4 fueron
transfectadas con 88-2B. En estos experimentos, las
células fueron transfectadas con pcDNA3,l que contenía
88-2B por medio de lipofectamina y se infectaron con
VIH-2, 48 horas más tarde. Tres días después de la
infección, las células fueron inmunoterapias en busca de la
presencia de proteínas envolventes del VIH-2. La
presencia de sCD4 durante el reto de VIH-2_{ROD/D}
incrementó en diez veces la infección de estas células. La entrada
del VIH-2 en las células tranfectadas
88-2B pudo ser bloqueada por la presencia de
400-800 ng/ml de azotaina, uno de los ligandos para
88-2B. Los niveles de afectividad en la línea base
de CCC/88-2B (con CD4 no soluble) fueron
equivalentes a las células CCC que no estaban transfectadas con
88-2B.
El papel de 88-2B y 88C como
correceptores para VIH se confirmó con la preparación y reto de
líneas celulares transformadas establemente para expresar 88C o
88-2B con varias cepas de VIH y VIS. Se describen
estos resultados en el Ejemplo 7.
Como alternativa, el papel como correceptor de
88C y 88-2B ha podido ser demostrado mediante un
método experimental que no requiere el uso de virus vivos. En este
método, las líneas celulares que coexpresan 88C o
88-2B, CD4 y un gen reportero LACZ se mezclan con
una línea celular que coexpresa la glicoproteína envolvente (ENV)
del VIH y un factor de transcripción para la construcción del gen
reportero (Nussbaum y col., 1994, J. Virol. 68:5411). Las células
que expresan un correceptor funcional para el VIH se fusionarán con
las células que expresan ENV y por este medio permitirán la
expresión del gen reportero. En este método, la detección del
producto de gen reportero por el ensayo colorimétrico indica que
88C o 88-2B funciona como correceptor para el
VIH.
El mecanismo por el que las quimiocinas inhiben
la infección viral no se ha aclarado todavía. Un posible mecanismo
implica la activación del receptor por la unión de una quimiocina.
La unión de la quimiocina conduce a eventos de transducción de
señales en la célula que convierte la célula en resistente a la
infección viral y/o impide la replicación del virus en la célula.
De forma similar a la inducción del interferón, la célula puede
diferenciarse de modo tal que sea resistente a la infección viral,
o se establezca un estado antiviral. Como alternativa, un segundo
mecanismo implica la interferencia directa con la entrada viral en
células bloqueando el acceso de las glicoproteínas envolventes de
virus al correceptor por unión de las quimiocinas. En este
mecanismo, no es necesaria la señalización de la proteína G para la
supresión de la infección por VIH de las quimiocinas.
Para distinguir entre dos mecanismos por los que
88C o 88-2B pueden funcionar como correceptores
para la infección por VIH o viral, la unión de la quimiocina al
receptor se desacopla de la transducción de señales y se determina
el efecto de la quimiocina sobre la supresión de la infección
viral.
La unión del ligando se puede desacoplar de la
transducción de señales mediante la adición de compuestos que
inhiben la señalización mediada por la proteína G. Estos compuestos
incluyen, por ejemplo, la toxina pertussis y la toxina del cólera.
Además, los polipéptidos efectores aguas abajo pueden ser inhibidos
por otros compuestos como la wortmanina. Si la señalización de la
proteína G interviene en la supresión de la infección viral, la
adición de dichos compuestos impedirla la supresión de la infección
viral por la quimiocina. Como alternativa, los residuos clave o los
dominios receptores del receptor 88C o 88-2B
necesarios para el acoplamiento de la proteína G pueden ser
modificados o suprimidos de modo tal que el acoplamiento de la
proteína G se modifique o se destruya sin que se vea afectada la
unión de la quimiocina.
En estas condiciones, si las quimiocinas no
pueden suprimir la infección por VIH o viral, entonces es necesaria
la señalización a través de una proteína G para suprimir la
infección por VIH o viral. Sin embargo, si las quimiocinas son
capaces de suprimir la infección viral, entonces no es necesaria la
señalización a través de la proteína G para que las quimiocinas
supriman la infección viral y los efectos protectores de las
quimiocinas pueden ser debidos al bloqueo por las quimiocinas de la
disponibilidad del receptor para el virus.
Otra aproximación implica el uso de anticuerpos
dirigidos contra 88C o 88-2B. Los anticuerpos que se
unen a 88C o 88-2B, los cuales muestran no poder
obtener la señalización a través de la proteína G, pueden bloquear
el acceso a la quimiocina o al sitio de unión viral del receptor.
Si, en presencia de anticuerpos contra 88C o 88-2B,
se suprime la infección viral, entonces el mecanismo de los efectos
protectores de las quimiocinas consiste en bloquear el acceso viral
a su receptor. Feng y col, reportaron que los anticuerpos contra el
amino terminal del receptor de fusina suprimieron la infección por
VIH(Feng y col., 1996).
\vskip1.000000\baselineskip
Lineas celulares se transformaron establemente
con 88C o 88-2B para delimitar después el papel de
88C y 88-2B en la infección por VIH. Kimpton y
Emerman, "Detection of Replication-Competent and
Pseudotyped Human Immunodeficiency Virus with a Sensitive Cell Line
on the Basis of Activation of an Integrated
Beta-Galactosidase Gene", J. Virol., 66 (5):
3026-3031 (1992) describieron previamente una línea
celular indicadora, identificada aquí por células
HeLa-MAGI. Las células HeLa-MAGI son
células HeLa que han sido transformadas establemente para expresar
CD4 así como LTR del VIH-1 integrado que conduce la
expresión de un gen para \beta-galactosidasa
nuclear localizada. La integración de un provirus VIH en las células
lleva a la producción del transactivador viral, Tat, el cual
después pone en marcha la expresión del gen para
\beta-galactosidasa. El número de células que se
tiñen de positivas con X-gal para la actividad de
\beta-galactosidasa in situ es
directamente proporcional con el número de células infectadas.
Estas células HeLa-MAGI pueden
detectar aislados adaptados en laboratorio del VIH-1
pero sólo una minoría de aislados primarios [Kimpton y Emerman,
mencionados más arriba] y no pueden detectar la mayoría de aislados
de VIS [Chackerian y col., "Characterization of a
CD4-Expressing Macaque Cell Line that can Detect
Virus After A Single Replication Cycle and can be infected by
Diverse Simian Immunodeficiency Virus Isolates", Virology,
213(2):6499-6505 (1995)].
Además, Harrington y Geballe
``Co-Factor Requirement for Human Immunodeficiency
Virus Type 1 Entry into a CD4-Expressing Human Cell
Line, J. Virol. 67:5939-5947 (1993) describieron una
línea celular basada en células U373 que hablan sido elaboradas para
expresar CD4 y la misma construcción de
LTR-\beta-galactosidasa. Se
demostró previamente que esta línea celular, identificada aquí por
U373-MAGI; no había podido ser infectada por ninguna
cepa de VIH (M o T-trópico), sino que había podido
convertirse en susceptible de infección por fusión con las células
HeLa [Harrington and Geballe, mencionados más arriba).
Con el fin de construir líneas celulares
indicadoras que pudieran detectar virus trópicos de célula T o de
Macrófagos, 88C o 88-2B etiquetado con epítopo que
codifica el ADN fue transfectado en células
HeLa-MAGI o U373-MAGI mediante
infección con un vector retroviral para generar las líneas celulares
HeLa-MAGI-88C o
U373-MAGI-88C respectivamente. La
expresión de los correceptores en la superficie celular se demostró
mediante inmunotinción de células vivas utilizando el anticuerpo
anti-FLAG M1 y por RT-PCR.
Los genes de 88C y 88-2B
utilizados para construir
HeLa-MAGI-88C y
U373-MAGI-88C incluían secuencias
que codificaban el péptido señal de prolactina seguido de un epítopo
FLAG tal como se ha descrito en el Ejemplo 4. Se insertó este gen en
el vector retroviral pBabe-Puro [Morgenstern and
Land Nucleic Acids Research, 18 (12): 3587-3596
(1990)]. Stocks del vector retroviral de título elevado pseudotipado
con la proteína VSV-G se elaboraron mediante
transfección transitoria tal como se describe en Bartx y col., J.
Virol. 70:2324-2331 (1996), y se utilizaron para
infectar células HeLa-MAGI y
U373-MAGI. Se agruparon células resistentes a 0,6
\mug/ml de puromicina (HeLa) o 1 \mug/ml de puromicina (U373).
Cada grupo contenía al menos 1000 eventos independientes de
transducción. Se utilizó un stock de paso temprano (paso 2) de las
células originales HeLa-MAGI [Kimpton y Emerman,
mencionados anteriormente) para crear células
HeLa-MAGI-88C.
Las infecciones de las líneas celulares
indicadoras con VIH se realizaron en placas de 12 pocillos con
diluciones seriadas en base 10 de 300 \mul de virus en presencia
de 30 \mug/ml de DEAE-Dextran tal como se
describe [Kimpton and Emerman, citados más arriba].
Todas las cepas de VIH-1 y
VIS_{mac239} se obtuvieron todas a partir del Programa de
Reactivos y Referencias del VIH SIDA. Se obtuvieron de B. Hahn
clones moleculares de VIH-2_{7312a} primario [Gao
y col., "Genetic Diversity of Human Immunodeficiency Virus Type 2:
Evidence for Distinct Sequence Subtypes with Differences in Virus
Biology", J. Virol., 68(11):7433-7447
(1992)] y VISsmPbjl.9 [Dewhurst y col., "Sequence Analysis and
Acute Pathogenicity of Molecularly Cloned
VISsinin-PBj14", Nature,
345:636-640 (1990)].
(UAB). Se obtuvieron todos los demás aislados de
VIS_{inne} de Julie Overbaugh (U. Washington. Seattle). Se
elaboraron stocks a partir de provirus clonados mediante
transfección transitoria de 293 células. Se realizaron otros stocks
virales por paso del virus en células mononucleares de sangre
periférica humana o en células CEMxl74 (para los stocks de VIS). Los
stocks virales se normalizaron por ELISA o p24^{gag} (Coulter
Immunology) o p27^{gag} (Coulter Immunology) para el
VIH-1 y VIH-2/VIS, respectivamente,
utilizando estándares proporcionados por el fabricante.
Células U37
3-MAGI-8 8C y células
U373-MAGI (controles) se infectaron con diluciones
limitadoras de una cepa T-trópica de
VIH-1 (VIH_{LAI}), una cepa
M-trópica (VIH_{YU2-}) y un aislado de VIS,
SIV_{MAC}239. Se midió la infectividad mediante conteo del número
de células azules por pocillo por volumen de virus (Tabla 2).
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
Dos días después de la infección, se fijaron las
células y se tiñeron en busca de la actividad de
\beta-galactosidasa con X-gal.
Las células MAGI derivadas de U373 se tiñeron durante 120 minutos a
37ºC y se tiñeron las células MAGI derivadas de HeLa durante 50
minutos a 37ºC. La tinción de fondo de las células no infectadas no
sobrepasó nunca más de aproximadamente tres células azules por
pocillo. Se contaron solamente células de color azul oscuro, y se
contó sinticio con múltiples núcleos como única célula infectada. El
titulo infeccioso es el número de células azules por pocillo
multiplicado por la dilución de virus y normalizado a 1 ml. El
titulo de VIH_{YU-2} en las células
U373-MAGI-88C fue de 2 x 10^{6}.
Por otra parte, el titulo de VIH-I_{LAI} fue
inferior a 100 sobre U373-MAGI-88C.
Por lo tanto, la especificidad de una cepa particular de VIH para
88C variaba en cuatro órdenes de magnitud.
Aunque la infección de VIS_{MAC}239 aumentó a
4 x 10^{5} en U373-MAGI-88C,
infectó también claramente las células U373-MAGI
(Tabla 2).
A continuación, se analizó una serie de cepas no
clonadas de VIH primario y cepas M-trópicas clonadas
de VIH en busca de su capacidad para infectar líneas celulares
indicadores que expresan 88C.
Tal como se ha descrito anteriormente, se
infectaron células HeLa-MAGI y
HeLa-MAGI-88C con diluciones
limitadoras de varias cepas de VIH. Los dos virus
M-trópicos clonados, VIH_{JR-CSF}
y VIH_{YU-2}, infectaron ambos las células
HeLa-MAGI-88C, pero no las
HeLa-MAGI, mostrando que ambas cepas utilizan 88C
como correceptor (Tabla 3. Véase la nota c). Sin embargo, se
observó gran disparidad en la capacidad de cada una de estas dos
cepas virales para infectar las células
HeLa-MAGI-8 8C, 6,2 x 10^{5} IU/ml
para el VIH_{YU-2} y 1,2 x 10^{4} para el
VIH_{JR-CSF}. La infectividad del stock de virus
(Tabla 3) es el número de unidades infecciosas por partícula física
(representado aquí por la cantidad de proteína del núcleo viral).
Además, se observó que la infectividad de estas dos cepas clonadas
virales era diferente en más de 50 unidades en los stocks virales
que se hablan preparado independientemente.
La variabilidad de la infectividad de los
aislados primarios virales se estudió además mediante el análisis
de una colección de doce stocks diferentes de virus no clonado
procedentes de tres ciados diferentes (Tabla 3). Se utilizaron tres
aislados primarios de ciado A, tres de ciado E y tres adicionales
de ciado B procedentes de orígenes geográficamente diversos. Con las
nueve cepas, se pudieron detectar cepas primarias de VIH en las
células HeLa-MAGI-88C, pero no en
las células HeLa-MAGI (Tabla 3). Sin embargo, la
eficacia de infección oscilaba entre cinco unidades infecciosas por
ng de p24^{gag} y más de 100 unidades infecciosas por ng de
p24^{gag} (Tabla 3). Estos resultados indican que la infectividad
absoluta de las cepas M-trópicas varia
considerablemente y es independiente del ciado. Existe una hipótesis
que puede explicar esta diferencia en lo que puede implacar la
afinidad del bucle V3 de cada cepa viral para 88C después de la
unión de CD4 [Trkola y col., Nature, 384 (6605):
184-187 (1996): Wu y col., Nature, 384 (6605):
179-183 (1996)].
\vskip1.000000\baselineskip
Se determinó también la capacidad de las células
HeLa-MAGI-88C para detectar
VIH-2 y otras cepas del VIS. Se ha reportado que
VIH-2_{Rod} utiliza fusina como receptor aún en
ausencia de CD4 [Endres y col., Cell, 87 (4):745-756
(1996)]. VIH-2_{Rod} es capaz de infectar las
células HeLa-MAGI, sin embargo su infectividad
aumenta al menos de 10 veces en
HeLa-MAGI-88C (Tabla 4). Las células
HeLa expresa de forma endógena la fusina. Así, el clon molecular
de VIH-2_{Rod} es trópico doble, y es capaz de
utilizar 88C como uno de sus correceptores además de CXCR4. De forma
similar, una cepa primaria de VIH-2_{7312A}
infectó células HeLa-MAGI-88C y no
células HeLa-MAGI, lo que indica que, como la cepa
primaria del VIH-1, utiliza 88C como receptor.
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Ninguna de las cepas de VIS sometidas a prueba
infectó las células HeLa-MAGI (Tabla 4), y ninguna
célula HeLa-MAGI infectada que exprese
88-2B. Esto indica que un correceptor alternativo
utilizado por VIS en células U373 no se expresa en las células HeLa,
y no es 88-2B. Todas las cepas de VIS sometidas a
prueba infectaron las células
HeLa-MAGI-88C hasta cierto punto
(Tabla 3) lo que indica que todas las cepas de VIS sometidas a
prueba utilizan al menos 88C como uno de sus correceptores.
La clasificación de cepas
M-trópicas y T-trópicas del VIH en
el pasado ha sido puesta en correlación a menudo con otra
designación "no inductoras de sincitio" (NSI) e "inductoras
de sincitio" (SI), respectivamente. Ensayos basados en líneas
celulares descritas aquí son sensibles a la formación de sincitio.
Las células infectadas pueden formar grandes y pequeños focos de
infección que contienen múltiples núcleos [Kimpton y Emerman,
mencionados
anteriormente).
anteriormente).
Los experimentos que utilizan múltiples cepas
virales diferentes y U373-MAGI-88C
o HeLa-MAGI-88c indican que la
designación SI/NSI no es significativa debido a que todas las cepas
virales formaron sincitios si estaba presente el correceptor
correcto. Estos experimentos muestran que la formación de sincitio
es probablemente un marcador de la presencia de un correceptor
apropiado en la célula infectada, más que una indicación de
tropismo. Se reportó en la literatura que la infección de las
células HeLa-MAGI-88C con cepas de
VIS es de cepas no formadoras de sincitio, en particular,
VIS_{MAC}239. VIS_{MNE}c18 y VIS_{MNE}170 fueron notables
debido a que el tamaño de los sincitios inducidos en la monocapa era
mucho más grande que los inducidos por cualquier otra cepa de
VIH.
\newpage
Se prepararon anticuerpos monoclonales de ratón
que reconocen específicamente 88C. Los anticuerpos se produjeron
mediante la inmunización de ratones con un péptido correspondiente a
veinte aminoácidos amino terminales de 88C. El péptido fue conjugado
a Cianina de Megathura Crenulata (lapa californiana)(KLH) de
acuerdo con las instrucciones del fabricante (Pierce, Inject
maleimide activated KLH), emulsionada con adyuvante completo de
Freund e inyectada en cinco ratones. Dos inyecciones adicionales de
péptido conjugado a adyuvante completo de Freund se aplicaron a
intervalos de tres semanas. Diez días después de la última
inyección, se sometió a prueba el suero de cada uno de los cinco
ratones en busca de la inmunorreactividad con el péptido de veinte
aminoácidos por ELISA. Además, la inmunorreactividad de los sueros
se sometió a prueba contra el receptor 88C intacto expresado en la
superficie de 293 células mediante la clasificación de células
activadas por fluorescencia (FACS). Se eligió el ratón con mejor
actividad anti-88C para la fusión de células de bazo
y producción de anticuerpos monoclonales por medio de métodos
estándar de laboratorio. Se establecieron cinco líneas celulares
monoclonales (227K, 227M, 227N, 227P, 227R) las cuales produjeron
anticuerpos que reconocían el péptido por ELISA y la proteína de 88C
en 293 células por FACS. Se mostró que cada anticuerpo reaccionaba
solamente con las 293 células que expresaban 88C, pero no con las
293 células que expresaban el receptor MCP estrechamente
relacionado (CCCKR-2). Se mostró también que cada
anticuerpo reconocía 88C expresado transitoriamente en las células
COS.
Se generaron también anticuerpos policlonales de
conejo contra 88C. Se inyectó a dos conejos el péptido amino
terminal conjugado tal como se ha descrito anteriormente. Los
conejos fueron inmunizados además por cuatro inyecciones adicionales
del péptido amino terminal conjugado. Suero procedente de cada uno
de los conejos (2337J y 2470J) se sometió a prueba por FACS de 293
células que expresaban 88C. Los sueros reconocieron específicamente
88C en la superficie de 293 células.
Se sometieron a prueba los cinco anticuerpos
monoclonales anti-88C en busca de su capacidad para
bloquear la infección de células por VIS, virus de inmunodeficiencia
en simios estrechamente relacionado con el VIH [Lehner y col.,
Nature Medicine, 2:767 (1996)]. Células T de CD4+ de simios, que son
susceptibles normalmente de infección por VIS, se incubaron con el
clon VIS_{mac}32HJ5 en presencia de los sobrenadantes del
anticuerpo monoclonal anti-88C diluidos al 1:5. Se
midió la infección por VIS mediante la determinación de la actividad
de transcriptasa inversa (RT) el día nueve utilizando el método de
detección y cuantificación RT (kit de ensayo
Quan-T-RT, Amersham, Arlington
Heights, IL). Cuatro de los anticuerpos fueron capaces de bloquear
la infección por VIS: el anticuerpo 227K bloqueó en un 53%, 227M en
un 59%, 227N en un 47%, y 227P en un 81%. El anticuerpo 227R no
bloqueó la infección por VIS.
Los cinco anticuerpos monoclonales contra el
péptido amino terminal 88C humano se sometieron a prueba también en
busca de la reactividad contra 88C de macaco (SEQ ID NO:X) (que
tiene diferencias de dos aminoácidos con respecto al 88C humano
dentro de la región amino terminal peptídica). Las regiones de
codificación de 88C humano y 88C de macaco se clonaron en el vector
de expresión pcADN3 (Invitrogen). Estos plásmidos de expresión se
utilizaron para transfectar las células COS utilizando DEAE. El
vector vacío se utilizó como control negativo. Tres días después de
la transfección, se cosecharon las células, se incubaron con los
cinco anticuerpos monoclonales anti-88C y se
prepararon para FACS. Los resultados mostraron que cuatro de los
cinco anticuerpos (227K, 227M, 227N, 227P) reconocían el 88C de
macaco mientras que uno (227R) no lo hacía. Los cinco anticuerpos
reconocieron 88C humano tranfectado, y ninguno sometido a reacción
cruzada con células transfectadas con el vector solo.
\vskip1.000000\baselineskip
Se pueden utilizar métodos adicionales para
identificar ligandos y moduladores de los receptores de quimiocinas
de la invención.
En una realización, la invención comprende un
ensayo directo de ligandos. Se exponen compuestos de prueba
marcados de forma detectable a preparaciones de membrana que
presentan receptores de quimiocinas en una conformación funcional.
Por ejemplo, células HEK-293 o células de cultivo de
tejido, son transfectadas con un vehículo de expresión que codifica
un receptor de quimiocinas. Se elabora entonces una preparación de
membrana a partir de las células transfectadas que expresan el
receptor de quimiocina. La preparación de membrana se expone a
compuestos de prueba marcados con ^{125}I (por ejemplo,
quimiocinas) y se incuba en condiciones adecuadas (por ejemplo, 10
minutos a 37ºC). Las membranas, con cualquier compuesto de prueba
unido, se cosechan entonces en un filtro mediante filtración al
vacío y se lavan para eliminar los compuestos de prueba no unidos.
La radioactividad asociada al compuesto de prueba unido se
cuantifica entonces sometiendo los filtros a espectrofotometría de
escintilación líquida. La especificidad de la unión del compuesto de
prueba se puede confirmar repitiendo el ensayo en presencia de
cantidades crecientes de compuesto de prueba no marcado y tomando
nota del nivel de competición para la unión al receptor. Estos
ensayos de unión pueden identificar también los moduladores de unión
del receptor a quimiocinas. El ensayo de unión anteriormente
descrito se puede realizar con las siguientes modificaciones.
Además del compuesto de prueba marcado de forma detectable, se
expone un modulador potencial a la preparación de membrana. Un nivel
creciente de la marca asociada a la membrana indica que el modulador
potencial es un activador; un nivel decreciente de la marca
asociada a la membrana indica que el modulador potencial es un
inhibidor de la unión del receptor a quimiocinas.
\newpage
En otra realización, la invención comprende
ensayos indirectos para identificar los ligandos de receptores que
aprovechan el acoplamiento de los receptores de quimiocinas a las
proteínas G. Tal como lo revisan Linder y col., Sci. Am.,
267:56-65 (1992), durante la transducción de
señales, un receptor activado interactúa con una proteína G,
activando a su vez la proteína G. La proteína G se activa mediante
el intercambio de GDP y GTP. La hidrólisis posterior de GTP unido a
proteína G desactiva la proteína G. Un ensayo de la actividad de la
proteína G controla por lo tanto la liberación de ^{32}P de
[\gamma-^{32}P]-GTP. Por
ejemplo, 5 x 10^{7} células HEK-293 que albergan
los plásmidos de la invención se cultivan en MEM + 10% de FCS. El
medio de cultivo es completado por 5 mCi/ml de
[^{32}P]-fosfato de sodio durante 2 horas para
marcar uniformemente los grupos de nucleótidos. Posteriormente se
lavan las células en un tampón bajo en fosfato isotónico. Entonces
se expone una parte alícuota de células lavadas a un compuesto de
prueba mientras se trata de forma similar una segunda parte
alícuota, pero sin exposición al compuesto de prueba. Después de un
periodo de incubación (por ejemplo, 10 minutos), las células se
granulan, se lisan y los compuestos nucleotídicos se fraccionan
utilizando una cromatografía en capa fina desarrollada con 1 M de
LiCl. GTP y GDP marcados son identificados codesarrollando
estándares conocidos. Entonces se cuantifican GTP y GDP marcados por
medio de técnicas autorradiográficas que son estándares en la
técnica. Niveles relativamente altos de GDP marcado con ^{32}P
identifican los compuestos de prueba como ligandos. Este tipo de
ensayo por hidrólisis de GTP es útil también para la identificación
de moduladores de la unión de receptor a quimiocina. El ensayo
mencionado anteriormente se realiza en presencia de un modulador
potencial. Una señal intensificada que resulta de un aumento
relativo en la hidrólisis de GTP, produciendo GDP marcado con
^{32}P, indica un incremento relativo en la actividad receptora.
La señal intensificada identifica por lo tanto el modulador
potencial como activador. A la inversa, una señal relativamente
reducida para GDP marcado con ^{32}P, indicativa de una actividad
receptora reducida, identifica el modulador potencial como
inhibidor de la unión de receptor a quimiocina.
Las actividades de las moléculas efectoras de
proteína G (por ejemplo, adenilil ciclasa, fosfolipasa C, canales
iónicos y fosfodiesterasas) se pueden someter también a ensayo. Se
han descrito anteriormente ensayos de las actividades de estas
moléculas efectoras. Por ejemplo, la adenilil ciclasa, que cataliza
la síntesis del monofosfato de adenosina cíclico (cAMP), es activada
por proteínas G. Por lo tanto, la unión del ligando a un receptor
de quimiocinas que activa una proteína G, que a su vez activa la
adenilil ciclasa, se puede detectar controlando los niveles de cAMP
en una célula huésped recombinante de la invención. Al implementar
controles apropiados que son entendidos en la técnica, un nivel
elevado de cAMP intracelular se puede atribuir a un aumento
inducido por el ligando en la actividad receptora, identificando
por este medio un ligando. De nuevo, al utilizar controles que se
entienden en la técnica, una reducción relativa en la concentración
de cAMP identificarla indirectamente un inhibidor de la actividad
receptora. La concentración de cAMP se puede medir mediante un
inmunoensayo comercial de enzimas. Por ejemplo, el Kit BioTrak
proporciona reactivos para un inmunoensayo competitivo. (Amersham,
Inc., Arlington Heights, IL). Por medio de este kit, de acuerdo con
las recomendaciones del fabricante, se diseña una reacción que
implica hacer competir cAMP no marcado con cAMP conjugado a
peroxidasa de rábano picante. Se puede obtener cAMP no marcado, por
ejemplo, a partir de células activadas que expresan los receptores
de quimiocinas de la invención. Los dos compuestos compiten para la
unión de un anticuerpo anti-cAMP inmovilizado.
Después de la reacción de competición, el conjugado inmovilizado de
cAMP a peroxidasa de rábano picante se cuantifica por el ensayo con
enzimas utilizando un sustrato de único frasco de
tetrametilbenzidina/H_{2}O_{2} con detección de productos de
reacción coloreados que tienen lugar a 450 nm. Los resultados
proporcionan una base para calcular el nivel de cAMP no marcado
utilizando técnicas que son estándares en el arte. Además de
identificar la unión de ligandos a los receptores de quimiocinas, el
ensayo con cAMP se puede utilizar también para identificar
moduladores de la unión de receptores a quimiocinas. Por medio de
las células huésped recombinantes de la invención, se realiza el
ensayo tal como se ha descrito anteriormente, con la adición de un
modulador potencial de la actividad receptora de quimiocinas. Por
el uso de controles que se entienden en la técnica, un aumento o una
reducción relativa en los niveles de cAMP intracelular refleja la
activación o inhibición de la actividad adenilil ciclasa. El nivel
de actividad adenilil ciclasa, a su vez, refleja la actividad
relativa del receptor de quimiocinas en cuestión. Un nivel
relativamente elevado de actividad receptora de quimiocinas
identifica un activador; un nivel relativamente reducido de
actividad receptora identifica un inhibidor de la actividad
receptora de quimiocinas.
Aunque se ha descrito la presente invención en
términos de realizaciones especificas, se entiende que aparecerán
variaciones y modificaciones a los especialistas en la técnica. En
consecuencia, sólo dichas limitaciones tal como aparecen en las
reivindicaciones adjuntas deben formar parte de la invención.
<100> ICOS Corporation
\vskip0.400000\baselineskip
<120> Método y Materiales Receptores de
Quimiocinas
\vskip0.400000\baselineskip
<130> E1 1668EPB/FB685
\vskip0.400000\baselineskip
<140> EP 07013395.4
\vskip0.400000\baselineskip
<141>
20-12-1996
\vskip0.400000\baselineskip
<160> 21
\vskip0.400000\baselineskip
<170> Versión patente 3.3
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 1
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 3383
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo sapiens
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> característica_misc
\vskip0.400000\baselineskip
<223> OTRA INFORMACIÓN: /x "secuencias
de polinucleótidos y aminoácidos de 88C"
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> CDS
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (55)...(1110)
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 1
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 2
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 352
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo sapiens
\newpage
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 2
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 3
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 1915
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo sapiens
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> característica_misc
\vskip0.400000\baselineskip
<223> OTRA INFORMACIÓN: /= "secuencias
de polinucleótidos y aminoácidos de 88-2B"
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> CDS
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (362)...(1426)
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 3
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 4
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 355
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo sapiens
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 4
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 5
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 34
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> iniciador
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 5
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipgacggatcca tygayagrta cctggcyaty gtcc
\hfill34
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 6
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 32
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> iniciador
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 6
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipgctaagcttt trtagggdgt ccayaagagy aa
\hfill32
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 7
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 21
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> iniciador
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 7
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipgataagcctc acagccctgt g
\hfill21
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 8
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 28
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> iniciador
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 8
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipgctaagcttg atgactatct ttaatgtc
\hfill28
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 9
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 27
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> iniciador
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 9
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipccctctagac taaaacacaa tagagag
\hfill27
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 10
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 30
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> iniciador
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 10
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipgctaagctta tcacagggag aagtgaaatg
\hfill30
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 11
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 20
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> iniciador
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 11
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipagtgctagca gctcttcctg
\hfill20
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 12
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 20
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> iniciador
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 12
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipcagcagcgtt ttgatgattc
\hfill20
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 13
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 19
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> iniciador
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 13
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskiptgtgtttgct ttaaaagcc
\hfill19
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 14
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 17
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> iniciador
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 14
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskiptaagcctcac agccctg
\hfill17
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 15
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 28
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> iniciador
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 15
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipcgtaagctta gagaagccgg gatgggaa
\hfill28
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 16
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 25
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> iniciador
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 16
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipgcctctagag tcagagacca gcaga
\hfill25
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 17
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 28
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> iniciador
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 17
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipgacaagcttc acagggtgga acaagatg
\hfill
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 18
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 27
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> iniciador
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 18
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipgtctctagac cacttgagtc cgtgtca
\hfill27
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 19
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 1059
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Esp. macaco
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> CDS
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)...(1056)
\newpage
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 19
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 20
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 352
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Esp. macaco
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 20
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 21
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 352
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo sapiens
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 21
\vskip1.000000\baselineskip
Claims (7)
1. Método para identificar un ligando capaz de
interactuar con el receptor de quimiocinas 88C, que se
caracteriza por la secuencia de aminoácidos SEQ ID NO:2,
comprendiendo dicho método las etapas de:
- (a)
- proporcionar una célula huésped que expresa dicho receptor, o una preparación de membrana que incluye dicho receptor,
- (b)
- poner en contacto e incubar dicho receptor, con un ligando del mismo, y
- (c)
- identificar la presencia de un ligando interactuado específicamente con dicho receptor.
\vskip1.000000\baselineskip
2. Método según la reivindicación 1,
caracterizado porque dicho ligando está marcado.
3. Método según la reivindicación 1 ó 2,
caracterizado porque dicho ligando es un agonista o un
antagonista.
4. Método según una cualquiera de las
reivindicaciones 1 a 3, caracterizado porque dicha
interacción se identifica mediante la medición de la concentración o
nivel de actividad de un componente de una vía de transducción de
señales.
5. Método según la reivindicación 4,
caracterizado porque dicha vía de transducción de señales se
identifica mediante la medición de una actividad seleccionada de
entre el grupo compuesto de: concentración de calcio, hidrólisis de
GTP y actividad de la fosfolipasa C.
6. Método según una cualquiera de las
reivindicaciones 1 a 5, caracterizado porque dicho receptor
se pone en contacto y se incuba con un ligando y otro compuesto de
prueba.
7. Método según una cualquiera de las
reivindicaciones 1 a 6, caracterizado porque dichas células
son células HEK-293 o preparaciones de membrana de
las mismas.
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