ES2343271T3 - Proteina de resistencia autoactivada. - Google Patents
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Abstract
Proteína de resistencia autoactivada para la producción de una resistencia contra patógenos en plantas, caracterizada porque la proteína de resistencia es codificada por un ácido nucleico que presenta una parte limitada de un gen de resistencia NBS-LRR, que se extiende desde el extremo 5'' de la zona codificante del gen de resistencia NBS-LRR descendente hasta el inicio del dominio NBS del gen de resistencia NBS-LRR y no comprende ningún bucle P, no siendo el gen de resistencia NBS-LRR un gen de resistencia TIR-NBS-LRR.
Description
Proteína de resistencia autoactivada.
La presente invención se refiere a una proteína
de resistencia autoactivada para la producción de una resistencia
contra patógenos en plantas, a un procedimiento para la preparación
de una planta transgénica, así como a plantas transgénicas.
Debido a las enfermedades de las plantas
causadas por hongos, virus, nematodos y bacterias se producen en
todo el mundo grandes pérdidas de cultivos, afecta a la calidad de
los productos cultivados y hace necesario un empleo extendido de
pesticidas químicos, porque las medidas defensivas naturales de las
plantas, con cuya ayuda pueden combatir la mayoría de agentes
patógenos potenciales o retardar y limitar su propagación, a menudo
no son suficientes. A estas medidas defensivas pertenecen la
reacción hipersensitiva, la muerte celular controlada del tejido
huésped en el lugar de la infección, el refuerzo de la pared celular
vegetal mediante lignificación y formación de calosa, la formación
de fitoalexinas y la producción de proteínas PR (relacionadas con la
patogénesis, del inglés patogénesis-related). Las
moléculas clave para la activación de las medidas defensivas
inducidas son los genes de resistencia vegetales (genes R). Según
la hipótesis "gen por gen" de Flohrschen, la proteína de un
gen R interacciona con la correspondiente proteína de un gen
avirulencia microbiano (gen Avr) y desencadena de este modo la
reacción defensiva inducida.
La mayoría de los genes R se pueden clasificar
en 5 clases según la formación de la proteína R codificada por
ellos (Martin et al, 2003). La clase 1 comprende sólo el gen
Pto del tomate, que codifica para una serina/treonina quinasa. Sin
embargo, la mayoría de los genes R vegetales pertenecen a la
superfamilia de los genes NBS-LRR, que codifican
para un "sitio de unión de nucleótidos" (NBS, del inglés
"nucleotide binding site" y una "repetición rica en
leucina" (LRR, del inglés "Leucine rich repeat"). Los genes
NBS-LRR, que en su terminal N presentan una
estructura de "super hélice" (CC, del inglés
"coiled-coil"), como por ejemplo una
"cremallera de leucina", se clasifican como genes
CC-NBS-LRR de clase 2. Los genes R
del tipo CC-NBS-LRR se encuentran en
angiospermas extraños. En la clase 3 se encuentran los genes R del
tipo TIR-NBS-LRR, que en el terminal
N llevan una secuencia con homología con la región TIR (del inglés
"toll-interleukin-1-receptor",
receptor interleuquina-1/toll) animal, en lugar de
un dominio CC. Los genes TIR-NBS-LRR
representan un 75% de los genes R en Arabidopsis thaliana,
aunque no se encuentran en céspedes y remolacha azucarera (Tian
et al., 2004).
Los genes Cf forman la clase 4 de los genes R.
Las proteínas CF no tienen ningún dominio NBS, pero tienen un
dominio transmembrana (TM) y un LRR extracelular. A la clase 5
pertenece la proteína Xa21 del arroz, que está formada por un
dominio LRR extracelular, un dominio transmembrana y un dominio de
quinasas intracelulares.
Mientras que los genes R se expresan sólo
débilmente a través de los promotores del gen R, una fuerte
expresión constitutiva de los genes R de la clase 1, 2 y 3 conduce a
una activación de la propia defensa contra patógenos vegetal en
ausencia del correspondiente producto del gen avirulencia y por
tanto conduce a la autoactivación de la proteína R (Tang et
al., 1999; Oldroyd y Staskawicz, 1998; Bendahmane et al.,
2002).
Sin embargo, en general la sobreexpresión
constitutiva de los genes R en plantas transgénicas se relaciona
con propiedades agronómicas indeseadas, como micronecrosis (Tang
et al., 1999) o crecimiento reducido de las plantas (Frost
et al., 2004).
Otra posibilidad de la autoactivación de
proteínas R de clase 2 y 3 es la mutagénesis de motivos de
aminoácido conservados especiales en las proteínas completas
CC-NBS-LRR o
TIR-NBS-LRR. La mutagénesis de
secuencias en el dominio NBS o LRR del gen Rx de la patata
(Bendahmane et al., 2002) y el dominio NBS del gen L6 del
lino (Howles et al., 2005) conduce a mutantes, que en
ausencia del correspondiente gen de avirulencia tras la expresión
transitoria desencadenan la muerte celular.
Los experimentos de deleción con el gen Rx
mostraron que los productos de deleción compuestos por el dominio
CC y partes del dominio NBS tras su sobreexpresión transitoria
también pueden desencadenar una muerte celular que se inicia más
rápidamente que usando el gen R de longitud completa. Estos
productos de deleción, además del dominio CC necesitan también el
bucle P, la quinasa-2 y la
quinasa-3a completa del dominio NBS. En cambio,
otra reducción del dominio NBS conduciría a una activación HR más
lenta en comparación con el gen R de longitud completa (Bendahmane
et al. 2002).
Una autoactivación del gen L10 del lino, un gen
R de clase 3, se podría conseguir mediante la formación de una
proteína TIR-NBS-LRR reducida, que
consta del dominio TIR y 34 aminoácidos del dominio NBS adyacente,
incluido el bucle P (Frost et al., 2004).
Aunque se conocen varios métodos de
autoactivación de genes R, hasta ahora no se han descrito plantas
transgénicas en las cuáles la autoactivación de proteínas R conduzca
a una elevada resistencia a los hongos sin perjudicar al mismo
tiempo sus propiedades agronómicas. Los intentos de transformar de
forma estable en el lino dos variantes autoactivadas de longitud
completa del gen L6 bajo el control respectivo del promotor del gen
de resistencia L6 nativo o un promotor inducido por hongos,
condujeron a plantas de crecimiento normal sensibles a los hongos o
bien a plantas de crecimiento reducido resistentes a los hongos
(Howles et al., 2005).
Por consiguiente, es objetivo de la presente
invención modificar la capacidad defensiva de una planta contra
patógenos, de manera que las reacciones defensivas de la planta se
activen de forma fiable en ataques patógenos, pero sin influir
negativamente en las propiedades agronómicas de la planta.
Según la invención, se alcanza el objetivo
propuesto mediante una proteína de resistencia autoactivada que es
codificada por un ácido nucleico que presenta una parte limitada de
un gen de resistencia NBS-LRR, que se extiende
desde el extremo 5' de la zona codificante del gen de resistencia
NBS-LRR de forma descendente hasta el inicio del
dominio NBS del gen de resistencia NBS-LRR y no
comprende ningún bucle P, no siendo el gen de resistencia
NBS-LRR un gen de resistencia
TIR-NBS-LRR.
La parte limitada del gen de resistencia
NBS-LRR empieza por el codón de inicio para la
translación (codón ATG) y llega hasta el dominio NBS, caracterizado
fundamentalmente por el bucle P (motivo quinasa-1a).
Para la función de esta parte del gen de resistencia
NBS-LRR, no puede contener el bucle P. Tampoco
deberían estar disponibles otras secciones del dominio NBS y del
dominio LRR del gen de resistencia NBS-LRR. Por
supuesto pueden permanecer nucleótidos individuales del dominio NBS
incluido el bucle P, siempre que éstos no perjudiquen la
activación
de HR.
de HR.
Se entiende por proteína de resistencia
autoactivada una proteína tal, que en ausencia de un producto del
gen de avirulencia correspondiente conduce a una activación de las
defensas vegetales contra patógenos. Así, la invención tiene la
ventaja que para la formación de una resistencia contra patógenos no
es necesaria ninguna interacción entre una proteína de resistencia
y una proteína de avirulencia, por lo que las reacciones defensivas
de la planta pueden transcurrir esencialmente de forma más directa y
finalmente de forma más fiable.
Una autoactivación se puede conseguir, por
ejemplo, mediante una sobreexpresión transitoria del gen de
resistencia. Sobreexpresión significa que se supera la fuerza de
expresión del promotor natural del gen R hasta que se activa la
cascasda de transducción de la señal regulada por la proteína R en
ausencia del correspondiente producto del gen de avirulencia
microbiano. Por consiguiente se produce la activación de la defensa
contra patógenos que se traduce en una resistencia parcial o total
a la enfermedad.
Sin embargo, se puede conseguir una
autoactivación de la proteína de resistencia mediante la reducción
de la longitud completa del gen R BvKWS3_165, BvKWS3_135, Bv13033 y
Bv12069 de la remolacha azucarera, así como del gen StR3a de la
patata en la zona 5', que sólo codifica para el terminal N libre de
los dominios NBS y LRR de la proteína, incluido un eventual dominio
CC. En este contexto, el terminal N libre del dominio NBS
representa que el extremo 5' de la zona codificante del gen de
resistencia NBS-LRR sólo se extiende hasta el
extremo 3' si no comprende en su estructura efectiva el bucle P del
gen de resistencia NBS-LRR. En casos sencillos el
bucle P está completamente alejado. Sin embargo, aún pueden quedar
nucleótidos individuales del bucle P en el gen de resistencia
reducido, siempre que por ellos no se ralentice la activación de HR.
Con la reducción del gen de resistencia NBS-LRR en
el terminal N se suprimen también los motivos
quinasa-2, quinasa-3, GLPC y MHD,
incluídos los aminoácidos flanqueantes según las informaciones de
las bases de datos Prosite (Bairoch et al., 1996) y Pfam
(Sonnhammer et al., 1997), así como las definiciones de
motivo indicadas por Bendahmane et al. (2002).
El uso de los genes reducidos 165_#176,
135_#147, 13033-#159 y Bv12069 y StR3a-#1-155
conduce, en comparación con los genes R de longitud completa, a una
activación más rápida de la muerte celular en el tejido vegetal. En
combinación con un promotor inducible por patógenos se puede
provocar una defensa inducida mejorada contra patógenos. Esto
también es válido para aquellas proteínas R que mediante mutaciones
conocidas en los dominios MHD o VHD no se pueden autoactivar, como
muestra la expresión de los genes 135_#147 y
BvKWS3_135-D480V.
Como los genes R reducidos son capaces de
desencadenar la muerte celular claramente antes, en comparación con
los genes R de longitud completa, para los genes R reducidos es
suficiente una expresión menor para conseguir una concentración de
proteína crítica para la defensa patógena, como se muestra para el
gen R 135_#147.
El bucle P o el motivo quinasa-1
a, junto al motivo quinasa-2 y
quinasa-3, es característico de las proteínas que
hidrolizan ATP o GTP (Traut, 1994) y se encuentra en el dominio NBS
de los genes NBS-LRR. El bucle P caracteriza las
zonas N terminales del dominio NBS (Bendahmane et al., 2002).
La secuencia consenso del bucle P para los genes R Prf, Rx, Rpm1,
BvKWS3_135, BvKWS3_133 y BvKWS3_165 es: (I/V)VG(M/I)
GG(L/I/S)GKTT(L/V).
De forma sorprendente ha resultado que es
posible una autoactivación particularmente buena con ácidos
nucleicos que codifican para una secuencia de aminoácidos con un
motivo de secuencia DAE. En particular los ácidos nucleicos
codifican para el motivo de secuencia AVLXDAE. Los motivos de
secuencia DAE y AVLXDAE se encuentran, por ejemplo, en las SEC. ID.
Nº 13 y 15.
Son secuencias de ácidos nucleicos preferidas
las de los grupos siguientes:
- a)
- Secuencia de nucleótidos según SEC. ID. Nº 1 o una secuencia de nucleótidos complementaria a la secuencia de nucleótidos según SEC. ID. Nº 1 o una secuencia de nucleótidos que se hibrida con la secuencia de nucleótidos según SEC. ID. Nº 1 o una secuencia de nucleótidos complementaria a la secuencia de nucleótidos según SEC. ID. Nº 1;
- b)
- Secuencia de nucleótidos según SEC. ID. Nº 2 o una secuencia de nucleótidos complementaria a la secuencia de nucleótidos según SEC. ID. Nº 2 o una secuencia de nucleótidos que se hibrida con la secuencia de nucleótidos según SEC. ID. Nº 2 o una secuencia de nucleótidos complementaria a la secuencia de nucleótidos según SEC. ID. Nº 2;
- c)
- Secuencia de nucleótidos según SEC. ID. Nº 3 o una secuencia de nucleótidos complementaria a la secuencia de nucleótidos según SEC. ID. Nº 3 o una secuencia de nucleótidos que se hibrida con la secuencia de nucleótidos según SEC. ID. Nº 3 o una secuencia de nucleótidos complementaria a la secuencia de nucleótidos según SEC. ID. Nº 3;
- d)
- Secuencia de nucleótidos según SEC. ID. Nº 4 o una secuencia de nucleótidos complementaria a la secuencia de nucleótidos según SEC. ID. Nº 4 o una secuencia de nucleótidos que se hibrida con la secuencia de nucleótidos según SEC. ID. Nº 4 o una secuencia de nucleótidos complementaria a la secuencia de nucleótidos según SEC. ID. Nº 4,
- e)
- Secuencia de nucleótidos según SEC. ID. Nº 16 o una secuencia de nucleótidos complementaria a la secuencia de nucleótidos según SEC. ID. Nº 16 o una secuencia de nucleótidos que se hibrida con la secuencia de nucleótidos según SEC. ID. Nº 16 o una secuencia de nucleótidos complementaria a la secuencia de nucleótidos según SEC. ID. Nº 16;
La parte limitada del gen de resistencia
NBS-LRR se extiende en las secuencias de nucleótidos
preferidas siguientes, como sigue:
SEC. ID. Nº 1 de pos.
124-654
SEC. ID. Nº 2 de pos.
155-598
SEC. ID. Nº 3 de pos. 94-573
SEC. ID. Nº 4 de pos.
194-694
El término aquí empleado "hibridar"
significa hibridar bajo condiciones habituales, como las decritas
en Sambrook et al. (1989), preferiblemente bajo condiciones
astringentes. Por ejemplo, son condiciones de hibridación
astringentes: hibridación en 4 x SSC a 65ºC y a continuación lavado
múltiple en 0,1 x SSC a 65 ºC durante aproximadamente 1 hora en
total. Por ejemplo, son condiciones de hibridación poco
astringentes: hibridación en 4 x SSC a 37ºC y a continuación lavado
múltiple en 1 x SSC a temperatura ambiente. "Condiciones de
hibridación astringentes" también puede significar: hibridar a
68ºC en fosfato sódico 0,25 M, pH 7,2, SDS 7%, EDTA 1 mM y BSA 1%
durante 16 horas y a continuación lavar dos veces con 2 x SSC y SDS
0,1% a 68ºC.
De forma preferible el gen de resistencia que
codifica para una proteína de resistencia autoactivada procede de
remolacha azucarera o patata.
De forma más preferible el ácido nucleico
codifica para una secuencia de aminoácidos con una de las
secuencias consenso según SEC. ID. Nº 13 a 15. Dentro de las
secuencias consenso se pueden intercambiar entre sí aminoácidos
funcionalmente equivalentes, por ejemplo Asp por Glu, Leu por Ile,
Ala o Val, Arg por Lys, Phe por Trp.
Las dos secuencias consenso según SEC. ID. Nº 13
y 14 representan dos bloques funcionales que se pueden disponer
entre sí a una distancia no fijada. Una distancia preferible entre
ambos bloques resulta de la secuencia consenso según SEC. ID. Nº
15, así como de la secuencia consenso según la Fig. 10.
El ácido nucleico se puede combinar
preferiblemente con un promotor inducible por patógenos. En reacción
a la infección del tejido huésped, un promotor inducible por
patógenos se activa por un agente patógeno de la enfermedad, por
ejemplo un hongo dañino, una bacteria, un virus o un nematodo.
Durante el intento de infección o la infección exitosa del tejido
vegetal el promotor inducible por patógenos es más activo que en el
tejido vegetal no infectado.
Los promotores inducibles por patógeno son
conocidos fundamentalmente por el especialista. Son ejemplos de
promotores inducibles por patógenos un promotor quitinasa (Samac y
Shah 1991), un promotor glucanasa (Hennig et al., 1993) y el
promotor prp-1 (Martini et al., 1993).
Mediante la sobreexpresión del gen R inducida
por patógeno se evitan consecuencias negativas de una expresión
constitutiva, como por ejemplo crecimiento reducido o bajo
rendimiento de las plantas.
Los promotores sintéticos han resultado ser
promotores particularmente adecuados. Se trata de promotores
preparados mediante técnicas de trabajo de biología molecular, que
no se encuentran en la naturaleza en esta configuración. Un
promotor sintético es un promotor minimalista que junto a un
promotor mínimo contiene tan sólo uno o varios elementos cis
definidos y seleccionados. Estos elementos cis son sitios de unión
para proteínas de unión de ADN como factores de transcripción y se
aislan a partir de promotores naturales, derivan de elementos cis
ya aislados o son producidos por técnicas de recombinación
orientadas aleatoriamente y se seleccionan mediante procedimientos
apropiados. En comparación con un promotor natural, un promotor
sintético, debido a su construcción poco compleja, se activa sólo
mediante pocos factores exógenos y endógenos y por tanto se regula
específicamente.
El promotor mínimo o promotor "Core" es una
secuencia de ácidos nucleicos que contiene los sitios de unión para
el complejo del factor de transcripción basal y permite la
iniciación precisa de la transcripción mediante la
ARN-polimerasa II. Los motivos de secuencia
característicos del promotor mínimo son la caja TATA, el elemento
iniciador (Inr), el "elemento de reconocimiento TFBII" (BRE,
del inglés "TFBII recognition element") y el "elemento
promotor núcleo descendente" (DPE, del inglés "downstream core
promoter element"). Estos elementos pueden encontrarse en el
promotor mínimo individualmente o combinados. El promotor mínimo o
sus motivos de secuencia se pueden obtener de cualquier gen vegetal
o viral.
En el marco de la presente invención se han
desarrollado nuevos promotores sintéticos que junto con genes de
resistencia conocidos, que no codifican forzosamente para una
proteína de resistencia autoactivada, se pueden emplear para la
preparación de una planta resistente a los patógenos. Así, se trata
de promotores del tipo promotor mínimo nxS-mxD,
promotor mínimo nxW2-mxD y promotor mínimo
nxGst1-mxD, de manera que el promotor sintético
comprende una o varias de las combinaciones de elementos cis
siguientes:
- a)
- una caja nxS-mxD
- b)
- una caja nxW2-mxD
- c)
- una caja nxGst1-mxD
(en las que n y m representan un número natural
de 1...10).
La caja S (CAGCCACCAAAGAGGACCCAGAAT) con la
secuencia de nucleótidos SEC. ID. Nº 6, la caja W2
(TTATTCAGCCATCAAAAGTTGACCAATAAT) con la secuencia de nucleótidos
SEC. ID. Nº 7, la caja D (TA
CAATTCAAACATTGTTCAAACAAGGAACC) con la secuencia de nucleótidos SEC. ID. Nº 8 y la caja Gst (TTC
TAGCCACCAGATTTGACCAAAC) con la secuencia de nucleótidos SEC. ID. Nº 9 son descritas por Rushton et al., 2002, incluidas las secuencias núcleo importantes para su función.
CAATTCAAACATTGTTCAAACAAGGAACC) con la secuencia de nucleótidos SEC. ID. Nº 8 y la caja Gst (TTC
TAGCCACCAGATTTGACCAAAC) con la secuencia de nucleótidos SEC. ID. Nº 9 son descritas por Rushton et al., 2002, incluidas las secuencias núcleo importantes para su función.
Los promotores se diferencian según la selección
de elementos (nxS-mxD, nxW2-mxD o
nxGst1-mxD) en su actividad básica, inducibilidad
por patógenos, cinética de activación y fuerza del promotor, como se
muestra por ejemplo para los promotores con las combinaciones de
elementos cis
- 2xS-2xD con la secuencia de nucleótidos de SEC. ID. Nº 10,
- 2xW2-2xD con la secuencia de nucleótidos de SEC. ID. Nº 11 y
- 2xGstl-2xD con la secuencia de nucleótidos de SEC. ID. Nº 12.
Las propiedades de un promotor sintético se
pueden modificar también mediante la variación del número de
elementos cis (n, m = 1...10) correspondiente a las necesidades de
la expresión del gen. La comparación del promotor
2xS-2xD con las variantes 2xS-4xD,
4xS-2xD y 4xS-4xD muestra que la
fuerza promedio del promotor se incrementa mediante el uso de
tetrámeros, en comparación con el promotor construido a partir
dímeros. Además, la inducibilidad por patógenos aumenta desde el
promotor dímero (2xS-2xD) pasando por los promotores
tetrámero-dímero y dímero-tetrámero
(4xS-2xD, 4xS-2xD) hasta el promotor
tetrámero-tetrámero (4xS-4xD) para
todos los tiempos de medida. Paralelamente al aumento de la fuerza
del promotor y de la inducibilidad por patógenos, en el caso del
ejemplo descrito se produce también un aumento de la actividad
básica de los promotores que contienen tetrámeros. Este ejemplo
muestra que las propiedades importantes del promotor se regulan
mediante la cantidad de elementos cis y para la correspondiente
transformación técnica se pueden obtener e identificar variantes
óptimas del pro-
motor.
motor.
Sin embargo, se pueden obtener los resultados
correspondientes con combinaciones de elementos cis que presentan
derivados o la secuencia de nucleótidos de SEC. ID. Nº 10, SEC. ID.
Nº 11 o SEC. ID. Nº 12 y disponen de propiedades comparables con la
combinación de elementos cis de la SEC. ID. Nº 10, SEC. ID. Nº 11 o
SEC. ID. Nº 12.
Los promotores promotor mínimo
2xS-2xD y promotor mínimo 2xW2-2xD
se han combinado respectivamente por ejemplo con los cuatro genes R
de longitud completa BvKWS3_133, BvKWS3_123, BvKWS3_135 y BvKWS3_165
y se han transformado en la remolacha azucarera. Un ensayo de la
resistencia de las plantas transgénicas frente a los hongos
realizado con el hongo dañino más importante de la remolacha
azucarera, Cercospora beticola, el patógeno de la enfermedad
de la viruela de la hoja, condujo con cada construcción a una
resistencia mejorada contra el hongo, sin que la planta transgénica
se diferenciara de la planta no transgénica en su crecimiento u
otras propiedades agronómicas. Estos resultados muestran que usando
un promotor inducible por patógenos es esencialmente posible
conseguir una sobreexpresión del gen R que desencadena la muerte
celular y por tanto una resistencia mejorada a la enfermedad, sin
influir negativamente en el desarrollo de la planta. Mediante el
uso de promotores optimizados por selección de la cantidad apropiada
de repeticiones del elemento cis se puede mejorar aún más la
resistencia a enfermedades.
La presente invención se refiere también a
plantas transgénicas que han sido transformadas con la nueva
construcción de ácidos nucleicos, en particular plantas de remolacha
azucarera, partes y semillas o simientes de dichas plantas, así
como el uso de la nueva construcción de ácidos nucleicos para la
preparación de una planta transgénica.
La invención se explica más detalladamente a
continuación, con referencia a las figuras y ejemplos.
La invención descrita a modo de ejemplo para la
remolacha azucarera se puede aplicar también sin problemas a otros
cultivos a partir de los cuales se puedan aislar genes de
resistencia.
La Fig. 1 muestra el mapa del vector binario
pER-35Sluci que se ha empleado para la expresión
transitoria de los genes R mediada por Agrobacterium
tumefaciens en las hojas de la remolacha azucarera. El vector
lleva un gen Luciferasa de Photinus pyralis interrumpido por
un intrón, que no se puede expresar en A. tumefaciens.
La Fig. 2 muestra la activación de la muerte
celular en las hojas de remolacha azucarera tras la expresión
transitoria del gen R BvKWS3_133 por Agrobacterium
tumefaciens. Mientras la expresión transitoria de la
construcción pER-35Sluci conduce a una fuerte
actividad del gen reportero en las hojas de la remolacha, la
expresión de la construcción pER133-35Sluci activa
la muerte celular, de manera que no se puede medir ninguna
actividad del gen reportero.
La Fig. 3 muestra el vector
pCaMV-2 que se ha empleado para la transformación
biolística transitoria de las hojas de la remolacha azucarera. Los
genes R reducidos y de longitud completa se han preparado como se
describe, bajo los controles del promotor 35S doble de este
vector.
La Fig. 4 muestra la activación de la muerte
celular en las hojas de remolacha azucarera tras la expresión
transitoria de los genes R BvKWS3_123, BvKWS3_133 y BvKWS3_165
mediante transformación biolística. Los genes BvKWS3_123,
BvKWS3_133 y BvKWS3_165 quedan bajo el control del promotor 35S
doble (d35S) y han sido co-transformados con la
construcción del gen reportero p70S-luc. La
actividad del gen reportero se midió 20 h después de la
transformación. Mediante la activación de una reacción
hipersensitiva se reduce la actividad del gen reportero en
comparación con los controles (vector vacío pCaMV-2
y p70S-luc). Se representa el valor promedio de 3
repeticiones independientes del ensayo con 9 experimentos
individuales por cada construcción. Las barras de error indican el
error estándar.
La Fig. 5 muestra una activación reforzada de la
muerte celular mediante la expresión de la zona
5'-terminal del gen R BvKWS3_165 en comparación con
la expresión del gen R de longitud completa BvKWS3_165. La zona
N-terminal y el gen R de longitud completa se han
co-transformado bajo el control del promotor d35S
(p70S-165_#175 y p70S-BvKWS3_165)
con la construcción p70S-luc por transformación
biolística en las hojas de la remolacha azucarera. Se representa el
valor promedio de 3 repeticiones independientes del ensayo con
9-12 experimentos individuales por cada
construcción.
La Fig. 6 muestra una activación de la muerte
celular mediante la expresión del gen R de longitud completa
BvKWS3_135 y en comparación con ella una activación reforzada de la
muerte celular mediante la zona 5'-terminal
135_#147 del gen R BvKWS3_135. El gen R de longitud completa y la
zona N-terminal 135_#147 se han
co-transformado bajo el control del promotor d35S
(p70S-BvKWS3_135 y p70S-135_#147)
con la construcción p70S-luc mediante
transformación biolística en las hojas de la remolacha azucarera. Se
representa el valor promedio de 2 repeticiones independientes del
ensayo con 9-12 experimentos individuales por cada
construcción.
La Fig. 7 muestra una activación reforzada de la
muerte celular mediante la expresión de la zona
5'-terminal 13033_#159 del gen R Bv13033 en
comparación con la expresión del gen R de longitud completa Bv13033.
El gen R de longitud completa y la zona N-terminal
13033_#159 se han co-transformado bajo el control
del promotor d35S (p70S-13033 y
p70S-13033_#159) con la construcción
p70S-luc mediante transformación biolística en las
hojas de la remolacha azucarera. Se representa el valor promedio de
2 repeticiones independientes del ensayo con 9-12
experimentos individuales por cada construcción.
La Fig. 8 muestra la activación de la muerte
celular mediante la expresión del gen R Bv12069.
La Fig. 9 muestra la autoactivación de la
proteína BvKWS3_135 mediante reducción en la zona 5' del clon
135_#147 de ADNc en comparación con la mutación del motivo VHD del
dominio NBS.
Las Fig. 10a)-c) muestran
comparaciones de las secuencias de aminoácidos de las proteínas
autoactivas reducidas Bv12069, Bv13033_#159, BvKWS135_#147,
BvKWS3_165_#175 y StR3a-#1-155 entre sí y con las
secuencias de comparación de proteínas de resistencia reducidas no
autoactivas de patata (RX-160) y StR1
(355-540) así como proteínas R completas del tipo
NBS-LRR de Arabidopsis thaliana (AtAB028617),
haba (PvulgarisJ71), arroz (OsativaAP003073), haba de soja
(GmaxKR4) y tomate (Tomato-I2). Las secuencias
consenso están subrayadas.
La Fig. 11 muestra que la deleción de los
aminoácidos 147-175 reduce claramente la capacidad
de autoactivación de la proteína 165_#175.
La Fig. 12 muestra la activación del promotor
sintético 2xS-2xD en remolacha azucarera transgénica
tras el ataque de Cercospora beticola.
La Fig. 13 muestra la activación del promotor
sintético 2xW2-2xD en remolacha azucarera
transgénica tras el ataque de Cercospora beticola.
La Fig. 14 muestra la comparación de la
actividad del gen reportero de los promotores
2xS-2xD, 4xS-2xD,
2xS-4xD y 4xS-4xD en remolacha
azucarera transgénica tras el ataque de Cercospora
beticola.
Las Fig. 15 y 16 muestran combinaciones de los
genes R de longitud completa 123, 133, 135, 165 con el promotor
sintético 2xS-2xD.
Las Fig. 17 y 18 muestran combinaciones de los
genes R de longitud completa 123, 133, 135, 165 con el promotor
sintético 2xW_{2}-2xD.
La Fig. 19 muestra el aumento de la resistencia
de la línea transgénica PR68-6 de la remolacha
azucarera frente al hongo dañino Cercospora beticola en
comparación con el control no transgénico 3DC4156.
La Fig. 20 muestra el aumento de la resistencia
de la línea transgénica PR70-32 de la remolacha
azucarera frente al hongo dañino Cercospora beticola en comparación
con el control no transgénico 3DC4156.
Las Fig. 21 y 22 muestran la combinación de las
zonas N-terminales de los genes R, 165_#176 y 12069
con los promotores sintéticos 2xS-2xD y
2xW_{2}-2xD.
La sobreexpresión transitoria del clon de ADNc
de longitud completa del gen BvKWS3_133 en hojas de remolacha
azucarera por Agrobacterium tumefaciens desencadena una
muerte celular rápida sin formación de necrosis visible. El clon de
ADNc BvKWS3_133 se combinó con el promotor d35S y se insertó en el
vector binario pER-35Sluci (Fig. 1). El vector
formado lleva la denominación pER133-35Sluci. Los
vectores pER-35Sluci y
pER133-35Sluci se transformaron en la cepa C58C1 de
Agrobacterium (An 1987). Las agrobacterias positivas para la
expresión transitoria se sometieron durante 4-5 h a
50 ml de medio LB con espectinomicina 100 mg/ml y acetosiringona 20
\muM. A continuación las bacterias se centrifugaron y el sedimento
se recogió en una solución de MgCl_{2} 10 mM, MES 10 mM,
acetosiringona 100 \muM y se ajustó una densidad de bacterias de
OD600 = 0,1. La suspensión de bacterias se agitó 2-3
h y después con ayuda de una jeringa de 2,5 ml se inyectó sobre el
dorso de la hoja de remolacha azucarera de 10 semanas de edad. Tras
la incubación a 25ºC en una incubadora, el día 1, 2 y 3 tras la
inoculación de Photinus pyralis se midió la actividad del gen
reportero Luciferasa en las hojas transformadas. Para ello, la
actividad Luciferasa se determinó con el Luciferase Assay System
(Promega, Mannheim, Alemania) en un luminómetro Sirius (Berthold
Detection System GmbH, Pforzheim, Alemania) según las indicaciones
del fabricante. Para la obtención de un extracto enzimático
apropiado para la medición se definieron dos discos de hoja por
cada punto de medición. Para cada construcción se tomaron 8 puntos
de medida cada día. Las muestras de hoja se homogeneizaron en un
mortero añadiendo arena con 10 veces el volumen (v/p) de tampón de
lisis pasiva (PLB, del inglés Passive Lysis Buffer). El sobrenadante
líquido se transfirió a un recipiente Eppendorf de 1,5 ml y se
centrifugó 5 min a 4ºC y 20.000 g. El residuo claro se extrajo y se
emplearon 10 \mul de extracto crudo para cada medición de la
actividad Luciferasa-Photinus. Las hojas de
remolacha azucarera que se transformaron con la construcción control
pER-35Sluci mostraron el día 1 una baja actividad
Luciferasa y el día 2 y 3 una actividad Luciferasa de 124.000 y
116.000 RLU/mg de tejido de hoja. Las hojas de remolacha que se
transformaron con la construcción pER133-35Sluci no
mostraron en los 3 puntos de medida una actividad mayor que la de
las hojas inoculadas de MgCl_{2} (Fig. 2). Con ello la expresión
transitoria del clon BvKWS3_133 de ADNc desencadena una muerte
celular muy rápida en las hojas de remolacha inoculadas.
El gen R BvKWS3_133, así como el gen R
BvKWS3_165 con la secuencia de nucleótidos según SEC. ID. Nº 5 y el
gen R BvKWS3_123 se combinaron con el promotor 35S doble del vector
pCaMV-2 (Fig. 3). Los vectores formados se
denominan p70S-BvKWS3_133,
p70S-BvKWS3_165 y p70S-BvKWS3_123.
Para comprobar la funcionalidad de los genes R, las construcciones
p70S-BvKWS3_133, p70S-BvKWS3_165 y
p70S-BvKWS3_123 se expresaron transitoriamente con
el vector del gen reportero p70S-luc en las hojas de
remolacha azucarera mediante transformación biolística según
Schmidt et al., 2004. Como control positivo se empleó el
vector vacío pCaMV-2 en combinación con el vector
del gen reportero p70S-luc. A diferencia de Schmidt
et al. (2004), se renunció al empleo de un vector de
normalización. La actividad Luciferasa se determinó con el
Luciferase Assay System (Promega, Mannheim, Alemania) 20 h después
de la transformación. Los experimentos de transformación se
repitieron tres veces, comprendiendo cada experimento 9
repeticiones del ensayo por cada construcción. La formación del
valor promedio de los 3 experimentos mostró que en comparación con
la actividad Luciferasa del control positivo (vector vacío) fijada
en el 100%, la actividad del gen reportero ascendió sólo al 37,7%
para p70S-BvKWS3_133, al 66% para
p70S-BvKWS3_165 y al 68,7% para
p70S-BvKWS3_123 (Fig. 4). La fuerte expresión de los
genes R BvKWS3_133, BvKWS3_165 y BvKWS3_123 mediante el promotor
d35S desencadena por tanto la muerte celular o una reacción
hipersensitiva en una parte de las células transformadas, que
impide una co-expresión del vector del gen reportero
transformado conjuntamente. Con ello se mostró que la fuerte
expresión de los tres genes R conduce a muerte celular o HR en
ausencia de un producto del gen de avirulencia correspondiente.
Partiendo del clon BvKWS3_165 de ADNc de
longitud completa con la secuencia de nucleótidos según SEC. ID. Nº
5, en la construcción p70S-BvKWS3_165 se amplificó
la zona 5' del gen con ayuda de la polimerasa Pfu (Stratagene)
usando el cebador S316 (CTGGAGAATTCGAGCTCCACCGCGG) y S318
(CTGGATCCTCACCTCCGTTC
TTCATGTTGCTCTACC) y al mismo tiempo se introdujo un codón de parada en la zona codificante. La zona amplificada corresponde a la secuencia de nucleótidos según SEC. ID. Nº 1 y codifica para la secuencia de aminoácidos 1-175 de BvKWS3_165 (Fig. 10). La secuencia de aminoácidos comprende sólo la zona N-terminal de BvKWS3_165 y no contiene ningún dominio NBS ni LRR (Fig. 10). El producto de PCR se cortó con los enzimas de restricción SacII y BamHI y se clonó en el vector pCaMV-2. El vector resultante se denomina p70S-165_#175. La capacidad de las construcciones p70S-BvKWS3_165 y p70S-165_#175 de desencadenar la muerte celular en las hojas de remolacha azucarera se ensayó cuantitativamente mediante transformaciones biolísticas transitorias. Para ello se co-transformó cada vector con el vector del gen reportero p70S-luc. Como control positivo se empleó el vector vacío pCaMV-2 en combinación con el vector reportero p70S-luc.
TTCATGTTGCTCTACC) y al mismo tiempo se introdujo un codón de parada en la zona codificante. La zona amplificada corresponde a la secuencia de nucleótidos según SEC. ID. Nº 1 y codifica para la secuencia de aminoácidos 1-175 de BvKWS3_165 (Fig. 10). La secuencia de aminoácidos comprende sólo la zona N-terminal de BvKWS3_165 y no contiene ningún dominio NBS ni LRR (Fig. 10). El producto de PCR se cortó con los enzimas de restricción SacII y BamHI y se clonó en el vector pCaMV-2. El vector resultante se denomina p70S-165_#175. La capacidad de las construcciones p70S-BvKWS3_165 y p70S-165_#175 de desencadenar la muerte celular en las hojas de remolacha azucarera se ensayó cuantitativamente mediante transformaciones biolísticas transitorias. Para ello se co-transformó cada vector con el vector del gen reportero p70S-luc. Como control positivo se empleó el vector vacío pCaMV-2 en combinación con el vector reportero p70S-luc.
En comparación con la transformación del vector
vacío (pCaMV-2), la transformación de
p70S-BvKWS3_165 conduce a una actividad medible del
gen reportero del 65% y la transformación de
p70S-165_#175 conduce a una actividad medible del
gen reportero de sólo el 38% (Fig. 5). Este resultado muestra que la
expresión exclusiva del terminal N de 165_#175 de 175 aminoácidos
de tamaño conduce a una activación más intensa de la muerte celular
en las hojas de remolacha azucarera transformadas que el uso de la
proteína de longitud completa BvKWS3_165 de 1066 aminoácidos de
tamaño. Mediante la expresión de 165_#175 mueren más células de hoja
transformadas que en el caso de la expresión de BvKWS3_165. La
causa de esta diferencia es una nueva forma más intensa de
autoactivación de la proteína R mediante una reducción en el
terminal N.
Partiendo del clon BvKWS3_135 de ADNc de
longitud completa, en la construcción
p70S-BvKWS3_135 se amplificó la zona 5' del gen con
ayuda de la polimerasa Pfu (Stratagene) usando el cebador S316
(CTGGAGAATTC
GAGCTCCACCGCGG) y S330 (CTGGATCCTCAGGGAGAACTCCATCTGGGTGGTCC) y al mismo tiempo se introdujo un codón de parada en la zona codificante. La zona amplificada corresponde a la secuencia de nucleótidos según SEC. ID. Nº 2 y codifica para la secuencia de aminoácidos 1-147 de BvKWS3_135 (Fig. 10). La secuencia de aminoácidos comprende sólo la zona N-terminal de BvKWS3_135 y no contiene ningún dominio NBS ni LRR ni motivos de estos dominios. El producto de PCR se cortó con los enzimas de restricción SacII y BamHI y se clonó en el vector pCaMV-2. El vector resultante se denomina p70S-135_#147. La capacidad de las construcciones p70S-BvKWS3_135 y p70S-135_#147 de desencadenar la muerte celular en las hojas de remolacha azucarera se ensayó cuantitativamente mediante transformaciones biolísticas transitorias. Para ello se co-transformó cada vector con el vector del gen reportero p70S-luc. Como control positivo se empleó el vector vacío pCaMV-2 en combinación con el vector reportero p70S-luc. En comparación con la transformación del vector vacío (pCaMV-2), la transformación de p70S-BvKWS3_135 conduce a una actividad medible del gen reportero del 74,5% y la transformación de p70S-135_#147 conduce a una actividad medible del gen reportero de sólo el 58,5% (Fig. 6). Los resultados muestran que la expresión del clon de longitud completa BvKWS3_135 conduce a la activación de la muerte celular en el tejido transformado. Por supuesto la expresión exclusiva del terminal N de 135_#147 de 147 aminoácidos de tamaño tiene como resultado una muerte celular más intensa en las hojas de remolacha azucarera transformadas que el uso de la proteína BvKWS3_135 de 844 aminoácidos de tamaño. Mediante la expresión de 135_#147 mueren más células de hoja transformadas que en el caso de la expresión de BvKWS3_135. La causa de esta diferencia es una nueva forma más intensa de autoactivación de la proteína R mediante una reducción en el terminal N.
GAGCTCCACCGCGG) y S330 (CTGGATCCTCAGGGAGAACTCCATCTGGGTGGTCC) y al mismo tiempo se introdujo un codón de parada en la zona codificante. La zona amplificada corresponde a la secuencia de nucleótidos según SEC. ID. Nº 2 y codifica para la secuencia de aminoácidos 1-147 de BvKWS3_135 (Fig. 10). La secuencia de aminoácidos comprende sólo la zona N-terminal de BvKWS3_135 y no contiene ningún dominio NBS ni LRR ni motivos de estos dominios. El producto de PCR se cortó con los enzimas de restricción SacII y BamHI y se clonó en el vector pCaMV-2. El vector resultante se denomina p70S-135_#147. La capacidad de las construcciones p70S-BvKWS3_135 y p70S-135_#147 de desencadenar la muerte celular en las hojas de remolacha azucarera se ensayó cuantitativamente mediante transformaciones biolísticas transitorias. Para ello se co-transformó cada vector con el vector del gen reportero p70S-luc. Como control positivo se empleó el vector vacío pCaMV-2 en combinación con el vector reportero p70S-luc. En comparación con la transformación del vector vacío (pCaMV-2), la transformación de p70S-BvKWS3_135 conduce a una actividad medible del gen reportero del 74,5% y la transformación de p70S-135_#147 conduce a una actividad medible del gen reportero de sólo el 58,5% (Fig. 6). Los resultados muestran que la expresión del clon de longitud completa BvKWS3_135 conduce a la activación de la muerte celular en el tejido transformado. Por supuesto la expresión exclusiva del terminal N de 135_#147 de 147 aminoácidos de tamaño tiene como resultado una muerte celular más intensa en las hojas de remolacha azucarera transformadas que el uso de la proteína BvKWS3_135 de 844 aminoácidos de tamaño. Mediante la expresión de 135_#147 mueren más células de hoja transformadas que en el caso de la expresión de BvKWS3_135. La causa de esta diferencia es una nueva forma más intensa de autoactivación de la proteína R mediante una reducción en el terminal N.
Partiendo del clon Bv13033 de ADNc de longitud
completa en la construcción p70S-13033 se amplificó
la zona 5' del gen con ayuda de la polimerasa Pfu (Stratagene)
usando el cebador S316 (CTGGAGAATTCGAGCTC
CACCGCGG) y S333 (CTGGATCCTCAAGAACAAGTCTCAGGCCTTCTGTT) y al mismo tiempo se introdujo un codón de parada en la zona codificante. La zona amplificada corresponde a la secuencia de nucleótidos según SEC. ID. Nº 3 y codifica para la secuencia de aminoácidos 1-159 de Bv13033 (Fig. 10). La secuencia de aminoácidos comprende sólo la zona N-terminal de Bv13033 y no contiene ningún dominio NBS ni LRR o motivos de estos dominios. El producto de PCR se cortó con los enzimas de restricción SacII y BamHI y se clonó en el vector pCaMV-2. El vector resultante se denomina p70S-13033_#159. La capacidad de las construcciones p70S-13033 y p70S-13033_#159 de desencadenar la muerte celular en las hojas de remolacha azucarera se ensayó cuantitativamente mediante transformaciones biolísticas transitorias. Para ello se co-transformó cada vector con el vector del gen reportero p70S-luc. Como control positivo se empleó el vector vacío pCaMV-2 en combinación con el vector reportero p70S-luc. En comparación con la transformación del vector vacío (pCaMV-2), la transformación de p70S-13033 conduce a una actividad medible del gen reportero del 95% y la transformación de p70S-165_#175 conduce a una actividad medible del gen reportero de sólo el 68% (Fig. 7). Estos resultados muestran que la expresión del clon de longitud completa Bv13033 sólo conduce a la activación de una muerte celular débil en el tejido transformado. Por el contrario, la expresión exclusiva del terminal N de 13033_#159 de 159 aminoácidos de tamaño tiene como resultado una muerte celular intensa en las hojas de remolacha azucarera transformadas. La causa de esta diferencia es una nueva forma más intensa de autoactivación de la proteína R mediante una reducción en el terminal N.
CACCGCGG) y S333 (CTGGATCCTCAAGAACAAGTCTCAGGCCTTCTGTT) y al mismo tiempo se introdujo un codón de parada en la zona codificante. La zona amplificada corresponde a la secuencia de nucleótidos según SEC. ID. Nº 3 y codifica para la secuencia de aminoácidos 1-159 de Bv13033 (Fig. 10). La secuencia de aminoácidos comprende sólo la zona N-terminal de Bv13033 y no contiene ningún dominio NBS ni LRR o motivos de estos dominios. El producto de PCR se cortó con los enzimas de restricción SacII y BamHI y se clonó en el vector pCaMV-2. El vector resultante se denomina p70S-13033_#159. La capacidad de las construcciones p70S-13033 y p70S-13033_#159 de desencadenar la muerte celular en las hojas de remolacha azucarera se ensayó cuantitativamente mediante transformaciones biolísticas transitorias. Para ello se co-transformó cada vector con el vector del gen reportero p70S-luc. Como control positivo se empleó el vector vacío pCaMV-2 en combinación con el vector reportero p70S-luc. En comparación con la transformación del vector vacío (pCaMV-2), la transformación de p70S-13033 conduce a una actividad medible del gen reportero del 95% y la transformación de p70S-165_#175 conduce a una actividad medible del gen reportero de sólo el 68% (Fig. 7). Estos resultados muestran que la expresión del clon de longitud completa Bv13033 sólo conduce a la activación de una muerte celular débil en el tejido transformado. Por el contrario, la expresión exclusiva del terminal N de 13033_#159 de 159 aminoácidos de tamaño tiene como resultado una muerte celular intensa en las hojas de remolacha azucarera transformadas. La causa de esta diferencia es una nueva forma más intensa de autoactivación de la proteína R mediante una reducción en el terminal N.
El gen R Bv12069 con la secuencia de nucleótidos
SEC. ID. Nº 4 codifica para el terminal N de 166 aminoácidos de
tamaño de una proteína R. La proteína Bv12069 no contiene dominios
NBS ni LRR, pero muestra una clara analogía con los terminales N de
175, 147 y 159 aminoácidos de tamaño de las proteínas R
autoactivadas 165_#175, 135_#147, 13033_#159 (Fig. 10). El clon de
ADNc se combinó con el promotor 35S doble del vector
pCaMV-2 (Fig. 3) dando el vector
p70S-12069. Para comprobar la funcionalidad del gen
Bv12069, la construcción p70S-12069 en combinación
con el vector del gen reportero p70S-luc se expresó
de forma transitoria en hojas de remolacha azucarera mediante
transformación biolística. La actividad del gen reportero en las
hojas transformadas con p70S-12069 y
p70S-luc en tres ensayos independientes ascendió
sólo al 51% de la actividad que se pudo medir en los controles
positivos (vector vacío pCaMV-2 y
p70S-luc) (Fig. 8). Así, la expresión de la proteína
Bv12069 de 166 aminoácidos de tamaño desencadena la muerte celular
en las células de remolacha azucarera.
El mecanismo según la invención de la
autoactivación mediante la reducción de una proteína R del tipo
NBS-LRR en el terminal N libre de NBS y LRR se
comparó con el método de autoactivación por mutagénesis del motivo
MHD: la mutagénesis del motivo MHD del gen Rx de la patata y del gen
L6 del lino condujo a una autoactivación de los genes mencionados
(Bendahmane et al., 2002; Howles et al., 2005). El
clon BvKWS3_135 de ADNc codifica para el motivo VHD correspondiente
al motivo MHD, un motivo que junto al motivo MHD se encuentra a
menudo en los genes R (Howles et al., 2005). La mutación
correspondiente se introdujo en el clon BvKWS3_135 de longitud
completa, como se describe en Bendahmane et al. (2002). Para
ello el aminoácido aspartato se sustituyó por el aminoácido valina
en el motivo VHD del gen BvKWS3_135. El gen formado se denomina
BvKWS3_135_D480V. La eficacia de los genes 135_#147,
BvKWS3_135_D480V y del gen no modificado BvKWS3_135 se comprobó
mediante la sobreexpresión transitoria mediada por Agrobacterium
tumefaciens en las hojas de remolacha azucarera. Para ello el
clon BvKWS3_135 de ADNc se combinó con el promotor d35S y se insertó
en el vector binario pER-35Sluci. El vector formado
se denomina pER135-35Sluci. Se procedió
respectivamente con el clon 135_#147 de ADNc reducido con la
secuencia de nucleótidos según SEC. ID. Nº 2, así como con el clon
BvKWS3_135_D480V de ADNc mutagenizado. Los vectores formados se
denominan pER135 #147-35Sluci y
pER135_D480V-35Sluci. Los vectores se transformaron
como se describe en la cepa C58C1 de Agrobacterium y se inyectaron
en las hojas de remolacha azucarera junto con el control positivo
pER-35Sluci. La actividad del gen reportero
Luciferasa de Photinus pyralis se midió 1, 2 y 3 días
después de la inoculación en las hojas transformadas. Las hojas de
remolacha azucarera que fueron transformadas con la construcción
control pER-35Sluci mostraron el día 1 una actividad
Luciferasa baja y el día 2 y 3 una actividad Luciferasa de 299.000
y 433.000 RLU/mg de tejido de hoja. Las hojas de remolacha que
fueron transformadas con la construcción pER-35Sluci
mostraron el día 2 y 3 una actividad Luciferasa de 190.000 y
245.000 RLU/mg de tejido de hoja y por tanto una muerte celular
medible en comparación con el control positivo
pER-35Sluci. La actividad del gen reportero de la
construcción pER_135_D480V-35Sluci el día 2 y 3
ascendió a 188.000 y 206.000 RLU/mg (Fig. 9). Por consiguiente, la
introducción de la mutación MHD en el gen BvKWS3_135 no condujo a
ninguna autoactivación o a una autoactivación apenas medible. Por el
contrario, el gen R 135#147 reducido correspondiente a este
procedimiento mostró el día 2 y 3 una actividad del gen reportero
de 90.000 y 63.000 RLU/mg (Fig. 9) y por tanto una autoactivación y
desencadenamiento de la muerte celular claramente más fuerte que
las construcciones pER135-35Sluci y
pER_135_D480V-35Sluci.
Para identificar motivos de secuencia comunes se
llevó a cabo una comparación de homología entre los terminales N de
las proteínas R BvKWS3_165, BvKWS3_135, Bv13033 y Bv12069 de 175,
147, 159 y 166 aminoácidos de tamaño y el terminal N del gen R3a de
la patata, de 155 aminoácidos de tamaño (Huang et al., 2005).
La comparación condujo a la identificación de varias secuencias
consenso en los terminales N de las proteínas R autoactivadas. Los
motivos de secuencia comunes se subrayan como secuencias consenso en
la Fig. 10a).
Una secuencia consenso se corresponde con la
secuencia de aminoácidos según SEC. ID. Nº 13: AVLXDAEXKQ
XX XXXLXXWLXD LKDXVYDXDD ILDE. Otra secuencia consenso se corresponde con la secuencia de aminoácidos según SEC. ID. Nº 14: IXEIXXKLDD L.
XX XXXLXXWLXD LKDXVYDXDD ILDE. Otra secuencia consenso se corresponde con la secuencia de aminoácidos según SEC. ID. Nº 14: IXEIXXKLDD L.
La mayúscula X representa cualquier
aminoácido.
Ambas secuencias consenso están contenidas en la
forma descrita sólo en aquellos terminales N de proteínas R
CC-NBS-LRR, cuya expresión conduce a
una autoactivación. Así, el dominio CC del gen RX de 160 aminoácidos
de tamaño no es capaz de desencadenar la muerte celular o una
reacción hipersensitiva (Bendahmane et al., 2002). La
expresión transitoria del terminal N del gen R BvKWS3_133_e08 de 177
aminoácidos de tamaño de la remolacha azucarera y del terminal N
del gen R1 de 540 aminoácidos de tamaño de la patata (Ballvora et
al., 2002), en comparación con el gen R BvKWS3_133_e08
completo, no desencadenó una muerte celular reforzada o en el caso
del gen R1, ninguna muerte celular (no se muestran los datos). La
comparación de aminoácidos de los terminales N de las proteínas
autoactivadas BvKWS3_165_#176, BvKWS3_135_#147, Bv13033_#159,
Bv12069 y StR3a-#1-155 con las secuencias de
aminoácidos de los dominios CC de las proteínas Rx, StR1 y
BvKWS3_133_#177 muestra la ausencia de las secuencias consenso
descritas arriba en los terminales N no autoactivados (Fig. 10b).
En particular, el motivo de secuencia DAE es un agente auxiliar
importante para la identificación de proteínas R cuyo terminal N es
autoactivo. Con ayuda del motivo de secuencia DAE en la secuencia
consenso se pueden encontrar en numerosas especies vegetales genes
R adecuados para una autoactivación, como muestra la Fig. 10c para
los ejemplos de Arabidopsis thaliana (AtAB028617), haba
(PvulgarisJ71), arroz (osativaAp003073), haba de soja (GmaxKR4) y
tomate (Tomato-12).
Para identificar en la proteína 165_#175 las
secciones de aminoácidos que son importantes para la autoactivación
del terminal N de las proteínas NBS-LRR se acortó la
zona codificante del clon 165_#175 de ADNc. Los clones 165_#93 y
165_#146 de ADNc codifican para los aminoácidos 1-93
o 1-146 de la proteína 165_#175. El ensayo
biolístico transitorio de las construcciones p70S_165_#93,
p70S_165_#146 y p70S_165_#175 mostró que sólo la proteína 165_#175,
y no las 165_#93 y 165_#146, desencadena una muerte celular intensa
(Fig. 11). Por tanto, la zona de la secuencia
146-175 es esencial para la autoactivación de las
proteínas NBS-LRR. En esta zona se encuentra un
motivo de secuencia conservado entre todas las proteínas estudiadas
(Fig. 10a)).
Para la sobre-expresión inducida
por patógenos de los genes de resistencia completos o parciales son
apropiados en particular promotores sintéticos del tipo
nxS-mxD, nxW2-mxD y
nxGst1-mxD, siendo n=1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10
y m=1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10. A modo de ejemplo se combinaron
promotores del tipo 2xS-2xD según SEC. ID. Nº 10,
2xW2-2xD según SEC. ID. Nº 11 así como
2xGst1-2xD según SEC. ID. Nº 12 con el gen
Luciferasa de Photinus pyralis, se transformaron en remolacha
azucarera y se analizaron en reacción al ataque de hongos.
Para la transformación de plantas se emplearon
los vectores binarios
2xS-2xD-luc-kan,
2xW2-2xD-luc-kan y
2xGst1-2xD-luc-kan.
Los vectores binarios se transformaron en la cepa C58C1 de
Agrobacterium tumefaciens, con el plásmido residente pGV2260
mediante un procedimiento directo de transformación de ADN (An,
1987). La selección de clones recombinantes de A.
tumefaciens se realizó usando el antibiótico canamicina (50
mg/l).
La transformación de la remolacha azucarera se
realizó según Lindsey et al. (1991) usando el antibiótico
canamicina. La transgenicidad de las plantas se comprobó por PCR.
El uso de los cebadores GTGGAGAGGCTATTCGGTA y CCACCATGATATTCGGCAAG
condujo a la amplificación de un fragmento de ADN del gen
nptII de 553 pb de tamaño. El PCR se realizó empleando 10 ng
de ADN genómico, una concentración de cebador de 0,2 \muM a una
temperatura de alineamiento de 55ºC en un multiciclador
PTC-200 (MJ Research, Watertown, EUA).
Para analizar la inducibilidad por patógenos de
los promotores, las remolachas azucareras transgénicas se
infectaron bajo condiciones in vitro con la enfermedad de la
viruela de la hoja de la remolacha azucarera, Cercospora
beticola. Se sumergieron respectivamente 4 plantas de una línea
transgénica en una suspensión de fragmentos de micelio de C.
beticola (400.000 fragmentos/ml) y 4 plantas con finalidad de
control en zumo vegetal diluido. Las plantas infectadas y las
plantas control se incubaron a continuación a 25ºC y 16 horas de
iluminación en una cabina de cultivo. El material de hojas
infectadas y no infectadas se retiró 1, 2, 3, 4 y
6-7 días tras la inoculación y se determinó la
actividad del gen reportero Luciferasa con el Luciferase Assay
System (Promega, Mannheim, Alemania) como se describe.
Tanto el promotor 2xS-2xD como
el 2xW2-2xD mostraron una rápida e intensa
inducibilidad por patógenos en la fase temprana de la infección,
aunque se diferencian en la actividad básica y la fuerza del
promotor (Fig. 12-13). En el caso de las líneas
transgénicas PR39/11, PR39/48 y PR39/49 el promotor
2xS-2xD se indujo muy rápidamente,
11-59 veces ya el día 1 tras la inoculación y
21-380 veces el día 2, en comparación con las
plantas no infectadas (Fig. 12). Mientras el día 1 aún se
caracteriza por un crecimiento de las hifas del hongo en la
epidermis, el día 2 aparece una penetración de las hojas a través de
los estomas y por tanto una introducción en el tejido de la hoja.
En la fase tardía de la infección, con un desarrollo visible de
necrosis, el día 7 se observó una inducción del promotor de
113-792 veces. La actividad básica del promotor
2xS-2xD medida como actividad del gen reportero de
las plantas no infectadas es muy baja y asciende sólo a
1-10 veces la actividad Luciferasa medible en
plantas no transgénicas. La activación del promotor
2xW2-2xD transcurre algo más lenta que la del
promotor 2xS-2xD. El promotor
2xW2-2xD presenta una inducción por patógenos de
sólo 2-17 veces el primer día de la infección y de
5-56 veces el segundo día de infección. Con la
aparición de la necrosis el día 7 se consigue una máxima inducción
por patógenos de 318-672 veces (Fig. 13). La
actividad básica del promotor
2xW2-2-D, con 10-50
veces la actividad del gen reportero medible en plantas no
transgénicas, es mayor que en el caso del promotor
2xS-2xD. Sin embargo, destaca claramente el promotor
2xW2-2xD con una fuerza del promotor unas 10 veces
mayor que el promotor 2xS-2xD.
Las propiedades de un promotor sintético del
tipo nxS-mxD, nxW2-mxD y
nxGstl-mxD con n=1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10 y
m=1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10 se pueden modular y optimizar a
través de la variación de la cantidad de elementos cis en
referencia a las necesidades de la expresión génica. Esto se muestra
a modo de ejemplo para el tipo de promotor nxS-mxD.
Junto al vector binario
2xS-2xD-luc-kan se
prepararon los vectores binarios
4xS-2xD-luc-kan,
2xS-4xD-luc-kan y
4xS-4xD-luc-kan y se
transformaron en remolacha azucarera. Las plantas transgénicas se
infectaron con C. beticola como se describe y se midió
diariamente la actividad del gen reportero tras la inoculación del
hongo. Se promediaron los resultados de la medición de 13 líneas
independientes de 2xS-2xD-luc, 14
líneas independientes de
4xS-2xD-luc, 15 líneas
independientes de 2xS-4xD-luc, así
como 15 líneas independientes de
4xS-4xD-luc y se compararon los
valores promedio de la fuerza del promotor, la inducción por
patógenos y la actividad básica.
La comparación de las propiedades del promotor
2xS-2xD con las variantes 2xS-4xD,
4xS-2xD y 4xS-4xD muestra que la
fuerza promedio del promotor aumenta mediante el uso de tetrámeros
en comparación con el promotor formado a partir de dímeros (Fig.
14). Además, la inducibilidad por patógenos aumenta desde el
promotor dímero-dímero (2xS-2xD),
pasando por los promotores tetrámero-dímero y
dímero-tetrámero (4xS-2xD,
4xS-2xD) hasta el promotor
tetrámero-tetrámero (4xS-4xD) en
todos los instantes de medida (Tabla 1).
Paralelamente al incremento de la fuerza del
promotor y de la inducibilidad por patógenos se produce un aumento
de la actividad básica de los promotores que contienen tetrámeros
(Tabla 2).
\vskip1.000000\baselineskip
Este ejemplo muestra que las propiedades del
promotor importantes en relación con el concepto, como la fuerza
del promotor, la inducibilidad por patógenos y la actividad básica,
se regulan mediante la cantidad de elementos cis y se pueden
conseguir variantes de promotor óptimas para las respectivas
realizaciones técnicas. En el ejemplo estudiado la cantidad óptima
de elementos cis de los promotores inducibles por patógenos, en
referencia a la inducibilidad por patógenos, es mayor que la
solución dímera descrita por Rushton et al., 2002.
\vskip1.000000\baselineskip
Para aumentar la resistencia a los hongos de la
remolacha azucarera los promotores 2xS-2xD o
2xW2-2xD se combinan respectivamente con uno de los
cuatro genes R BvKWS3_123, BvKWS3_133, BvKWS3_135 y BvKWS3_165 y se
transforman en la remolacha azucarera.
Para ello los vectores binarios
2xS-2xD-luc-kan y
2xW2-2xD-luc-kan de
13.959 y 13.969 kb de tamaño se cortaron con SacI y los sitios de
unión se rellenaron mediante el tratamiento con ADN polimerasa T4. A
continuación, los vectores se siguieron cortando con XhoI, se
separaron por electroforesis de gel y los vectores de 12.284 y
12.294 kb de tamaño se separaron y aislaron del gen Luciferasa de
1.675 kb de tamaño.
El aislamiento del gen de resistencia ZR se
realiza a partir de los vectores p70S-BvKWS3_123,
p70S-BvKWS3_
133, p70SBvKWS3_135 y p70S-BvKWS3_165. Para ello en primer lugar los vectores se linealizan con NotI y los sitios de unión se rellenan mediante el tratamiento con Klenow. Después, los vectores se cortan con XhoI y se aíslan los genes R. Los vectores resultantes se denominan 2xS-2xD-BvKWS3_123, 2xS-2xD-BvKWS3_133, 2xS-2xD-BvKWS3_135 y 2xS-2xD-BvKWS3_165 o 2xW_{2}-2xD-BvKWS3_123, 2xW_{2}-2xD-BvKWS3_133, 2xW_{2}-D-BvKWS3_135 y 2xW_{2}-2xD-BvKWS3_165 (Fig. 15-18). Los vectores binarios se emplean, como se describe, para la preparación de remolacha azucarera transgénica.
133, p70SBvKWS3_135 y p70S-BvKWS3_165. Para ello en primer lugar los vectores se linealizan con NotI y los sitios de unión se rellenan mediante el tratamiento con Klenow. Después, los vectores se cortan con XhoI y se aíslan los genes R. Los vectores resultantes se denominan 2xS-2xD-BvKWS3_123, 2xS-2xD-BvKWS3_133, 2xS-2xD-BvKWS3_135 y 2xS-2xD-BvKWS3_165 o 2xW_{2}-2xD-BvKWS3_123, 2xW_{2}-2xD-BvKWS3_133, 2xW_{2}-D-BvKWS3_135 y 2xW_{2}-2xD-BvKWS3_165 (Fig. 15-18). Los vectores binarios se emplean, como se describe, para la preparación de remolacha azucarera transgénica.
\vskip1.000000\baselineskip
La elevada resistencia a los hongos de las
plantas se observó en ensayos de resistencia a los hongos, como se
describe a modo de ejemplo a continuación para el ensayo de
resistencia de la remolacha azucarera frente a Cercospora
beticola.
Para la infección de la remolacha azucarera con
C. beticola, el patógeno de la viruela de la hoja, junto a
las plantas transgénicas se introduce en el invernadero remolacha
azucarera del genotipo 3DC4156 usado para la transformación. Dos
semanas antes de la inoculación planeada, placas de zumo vegetal
(zumo vegetal Albani 40%) con el C. beticola agresivo se
vacunan con aislado Ahlburg y se incuban a 25ºC. Justo antes de la
inoculación se raya el agar donde crecen los hongos con ayuda de un
portaobjetos y algo de agua. La concentración de fragmentos de
micelio y esporas de hongo se determina con ayuda de una cámara de
contaje. La densidad de inóculo se ajusta con agua a una
concentración de 20.000 fragmentos/ml. Para la infección, las
plantas de 10-12 semanas de edad se sumergen de
cabeza en un recipiente de 5 L lleno con el inóculo. Se inoculan 30
plantas por cada línea estudiada y las plantas se sitúan en el
invernadero de forma aleatoria.
Tras la inoculación las plantas se incuban en un
invernadero durante 4 días a 28ºC y 95% de humedad del aire.
Después del cuarto día se reduce la humedad del aire al 60%-70%.
Dos, tres y cuatro semanas tras la inoculación se valora
ópticamente el ataque de las hojas con ayuda del esquema de
evaluación de nueve niveles (1970) (1 = hojas sanas, 9 = 100% hojas
destruidas) de Kleinwanzlebener Saatzucht (KWS). Las líneas
transgénicas que se transformaron con una de las construcciones
2xS-2xDBvKWS3_123,
2xS-2xD-BvKWS3_133,
2xS-2xD-BvKWS3_165,
2xW_{2}-2xD-BvKWS3_123,
2xW_{2}-2xD-BvKWS3_133,
2xW_{2}-2xD=BvKWS3_135 o
2xW_{2}-2xD-BvKWS3_165, mostraron
una elevada resistencia a los hongos en comparación con los
controles (Tabla 3).
El análisis de la evolución en el tiempo del
desarrollo del ataque para los transformantes PR68-6
y PR70-32 en los tres términos de evaluación
muestra que al avanzar la duración del ensayo aumenta la diferencia
en el desarrollo del ataque entre los controles y la línea
transgénica (Fig. 19 y 20). Estos resultados muestran que la
expresión inducida de diferentes genes R de la remolacha azucarera
con ayuda de promotores específicos de patógeno conduce a un
aumento de la resistencia a los hongos.
\vskip1.000000\baselineskip
Para preparar plantas resistentes a los hongos
mediante el uso de fragmentos N-terminales de los
genes R, se combinaron los genes R reducidos 13033_#159, 135_#147,
165_#175 y Bv12069 con los promotores 2xS-2xD y
2xW2-2xD y se transformaron en remolacha azucarera.
Para ello los vectores binarios
2xS-2xD-luc-kan y
2xW2-2xD-luc-kan de
13.959 y 13.969 kb de tamaño se cortaron con SacI y los sitios de
unión se rellenaron mediante tratamiento con ADN polimerasa T4. A
continuación, los vectores se siguieron cortando con XhoI, se
separaron por electroforesis de gel y los vectores de 12.284 y
12.294 kb de tamaño se separaron y aislaron del gen Luciferasa de
1.675 kb de tamaño.
El aislamiento del gen de R reducido se realizó
a partir de los vectores p70S-12069,
p70S-13033_#159, p70S-135_#147 y
p70S-165_#175. En primer lugar los vectores se
linealizaron con XbaI y los extremos de ADN se rellenaron mediante
el tratamiento con Klenow y después los vectores se siguieron
cortando con XhoI. Los fragmentos de gen R aislados se clonaron
entonces en los vectores binarios preparados. Los vectores
resultantes obtenidos se denominan
2xS-2xD-12069,
2xS-2xD-13033_#159,
2xS-2xD-135_#147,
2xS-2xD-165_#175 y
2xW2-2xD-12069;
2xW2-2xD-13033_#159,
2xW2-2xD-135_#147,
2xW2-2x-165_#175 (Fig.
21-22). Los vectores binarios se transformaron, como
se describe, en la remolacha azucarera y las plantas resistentes a
los hongos se identificaron mediante un ensayo de resistencia a
Cercospora beticola.
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| Organización solicitante: |
| Calle: Grimsehlstrasse 31 |
| Ciudad: Einbeck |
| Región: |
| País: Alemania |
| Código postal: D-37555 |
| Teléfono: 0049-5561-311-0 |
| Fax: 0049-5561-311-322 |
| Correo electrónico: info@kws.de |
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<110> Nombre de la organización: KWS SAAT
AG
| Proyecto de la solicitud |
\vskip0.400000\baselineskip
<120> Título: Proteína de resistencia
autoactivada
\vskip0.400000\baselineskip
<130> Referencia del archivo de solicitud:
KWS SAAT AG
\vskip0.400000\baselineskip
<140> Número de solicitud actual:
\vskip0.400000\baselineskip
<141> Fecha de archivo actual:
| Secuencia |
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Nombre del organismo:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> Cadena
pre-secuencia:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<212> Tipo: ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<211> Longitud: 660
| Nombre de la secuencia: secuencia 1 |
| Descripción de la secuencia: |
| Secuencia |
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Nombre del organismo:
\newpage
\vskip0.400000\baselineskip
<400> Cadena
pre-secuencia:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<212> Tipo: ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<211> Longitud: 604
| Nombre de la secuencia: secuencia 2 |
| Descripción de la secuencia: |
| Secuencia |
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<213> Nombre del organismo:
\vskip1.000000\baselineskip
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<400> Cadena
pre-secuencia:
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\vskip0.400000\baselineskip
<212> Tipo: ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<211> Longitud: 580
| Nombre de la secuencia: secuencia 3 |
| Descripción de la secuencia: |
| Secuencia |
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Nombre del organismo:
\newpage
\vskip0.400000\baselineskip
<400> Cadena
pre-secuencia:
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\vskip0.400000\baselineskip
<212> Tipo: ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<211> Longitud: 2047
| Nombre de la secuencia: secuencia 4 |
| Descripción de la secuencia: |
| Secuencia |
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<213> Nombre del organismo:
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<400> Cadena
pre-secuencia:
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<212> Tipo: ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<211> Longitud: 3463
| Nombre de la secuencia: secuencia 5 |
| Descripción de la secuencia: |
| Secuencia |
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<213> Nombre del organismo:
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<400> Cadena
pre-secuencia:
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\hskip-.1em\dddseqskipcagccaccaa agaggaccca gaat
\hfill24
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\vskip0.400000\baselineskip
<212> Tipo: ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<211> Longitud: 24
| Nombre de la secuencia: secuencia 6 |
| Descripción de la secuencia: |
| Secuencia |
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<213> Nombre del organismo:
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<400> Cadena
pre-secuencia:
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\hskip-.1em\dddseqskipttattcagcc atcaaagttg accaataat
\hfill29
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\vskip0.400000\baselineskip
<212> Tipo: ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<211> Longitud: 29
| Nombre de la secuencia: secuencia 7 |
| Descripción de la secuencia: |
| Secuencia |
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<213> Nombre del organismo:
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<400> Cadena
pre-secuencia:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskiptacaattcaa acattgttca aacaaggaac c
\hfill31
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<212> Tipo: ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<211> Longitud: 31
| Nombre de la secuencia: secuencia 8 |
| Descripción de la secuencia: |
| Secuencia |
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<213> Nombre del organismo:
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<400> Cadena
pre-secuencia:
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\hskip-.1em\dddseqskipttctagccac cagatttgac caaac
\hfill25
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\vskip0.400000\baselineskip
<212> Tipo: ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<211> Longitud: 25
| Nombre de la secuencia: secuencia 9 |
| Descripción de la secuencia: |
| Secuencia |
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<213> Nombre del organismo:
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<400> Cadena
pre-secuencia:
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\vskip0.400000\baselineskip
<212> Tipo: ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<211> Longitud: 141
| Nombre de la secuencia: secuencia 10 |
| Descripción de la secuencia: |
| Secuencia |
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<213> Nombre del organismo:
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<400> Cadena
pre-secuencia:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<212> Tipo: ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<211> Longitud: 150
| Nombre de la secuencia: secuencia 11 |
| Descripción de la secuencia: |
| Secuencia |
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<213> Nombre del organismo:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> Cadena
pre-secuencia:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<212> Tipo: ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<211> Longitud: 142
| Nombre de la secuencia: secuencia 12 |
| Descripción de la secuencia: |
| Secuencia |
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<213> Nombre del organismo:
\vskip1.000000\baselineskip
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<400> Cadena
pre-secuencia:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipAVLXDAEXKQ XXXXXLXXWL XDLKDXVYDX DDILDE
\hfill36
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<212> Tipo: PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<211> Longitud: 36
| Nombre de la secuencia: secuencia 13 |
| Descripción de la secuencia: |
| Secuencia |
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<213> Nombre del organismo:
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<400> Cadena
pre-secuencia:
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\hskip-.1em\dddseqskipIXEIXXKLDD I
\hfill11
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\vskip0.400000\baselineskip
<212> Tipo: PRT
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<211> Longitud: 11
| Nombre de la secuencia: secuencia 14 |
| Descripción de la secuencia: |
| Secuencia |
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<213> Nombre del organismo:
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<400> Cadena
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\vskip0.400000\baselineskip
<212> Tipo: PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<211> Longitud: 99
| Nombre de la secuencia: secuencia 15 |
| Descripción de la secuencia: |
| Secuencia |
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<213> Nombre del organismo:
\vskip1.000000\baselineskip
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<400> Cadena
pre-secuencia:
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<212> Tipo: ADN
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<211> Longitud: 468
| Nombre de la secuencia: secuencia 16 |
| Descripción de la secuencia: |
Claims (19)
1. Proteína de resistencia autoactivada para la
producción de una resistencia contra patógenos en plantas,
caracterizada porque la proteína de resistencia es codificada
por un ácido nucleico que presenta una parte limitada de un gen de
resistencia NBS-LRR, que se extiende desde el
extremo 5' de la zona codificante del gen de resistencia
NBS-LRR descendente hasta el inicio del dominio NBS
del gen de resistencia NBS-LRR y no comprende
ningún bucle P, no siendo el gen de resistencia
NBS-LRR un gen de resistencia
TIR-NBS-LRR.
2. Proteína de resistencia autoactivada según
la reivindicación 1, que presenta una secuencia de aminoácidos con
un motivo de secuencia DAE.
3. Proteína de resistencia autoactivada según
la reivindicación 1, que presenta una secuencia de aminoácidos con
un motivo de secuencia AV LXDAE.
4. Proteína de resistencia autoactivada según
la reivindicación 1, caracterizada porque los ácidos
nucleicos presentan una secuencia de nucleótidos del grupo
siguiente:
- a)
- Secuencia de nucleótidos según SEC. ID. Nº 1 o una secuencia de nucleótidos complementaria a la secuencia de nucleótidos según SEC. ID. Nº 1 o una secuencia de nucleótidos que se hibrida bajo condiciones astringentes con la secuencia de nucleótidos según SEC. ID. Nº 1 o una secuencia de nucleótidos complementaria a la secuencia de nucleótidos según SEC. ID. Nº 1;
- b)
- Secuencia de nucleótidos según SEC. ID. Nº 2 o una secuencia de nucleótidos complementaria a la secuencia de nucleótidos según SEC. ID. Nº 2 o una secuencia de nucleótidos que se hibrida bajo condiciones astringentes con la secuencia de nucleótidos según SEC. ID. Nº 2 o una secuencia de nucleótidos complementaria a la secuencia de nucleótidos según SEC. ID. Nº 2;
- c)
- Secuencia de nucleótidos según SEC. ID. Nº 3 o una secuencia de nucleótidos complementaria a la secuencia de nucleótidos según SEC. ID. Nº 3 o una secuencia de nucleótidos que se hibrida bajo condiciones astringentes con la secuencia de nucleótidos según SEC. ID. Nº 3 o una secuencia de nucleótidos complementaria a la secuencia de nucleótidos según SEC. ID. Nº 3;
- d)
- Secuencia de nucleótidos según SEC. ID. Nº 4 o una secuencia de nucleótidos complementaria a la secuencia de nucleótidos según SEC. ID. Nº 4 o una secuencia de nucleótidos que se hibrida bajo condiciones astringentes con la secuencia de nucleótidos según SEC. ID. Nº 4 o una secuencia de nucleótidos complementaria a la secuencia de nucleótidos según SEC. ID. Nº 4,
- e)
- Secuencia de nucleótidos según SEC. ID. Nº 16 o una secuencia de nucleótidos complementaria a la secuencia de nucleótidos según SEC. ID. Nº 16 o una secuencia de nucleótidos que se hibrida bajo condiciones astringentes con la secuencia de nucleótidos según SEC. ID. Nº 16 o una secuencia de nucleótidos complementaria a la secuencia de nucleótidos según SEC. ID. Nº 16.
5. Proteína de resistencia autoactivada según
la reivindicación 1, caracterizada porque el gen de
resistencia NBS-LRR es un gen de resistencia de
remolacha azucarera o patata.
6. Proteína de resistencia autoactivada según
la reivindicación 1, que presenta una secuencia de aminoácidos con
una secuencia del grupo siguiente:
- a)
- SEC. ID. Nº 13
- b)
- SEC. ID. Nº 14
- c)
- SEC. ID. Nº 15.
7. Planta transgénica con una proteína de
resistencia autoactivada según una de las reivindicaciones
anteriores.
8. Partes de una planta transgénica según la
reivindicación 7.
9. Semilla transgénica o simiente transgénica
con una proteína de resistencia autoactivada según una de las
reivindicaciones 1 a 6.
10. Procedimiento para la preparación de una
planta transgénica con resistencia incrementada contra patógenos,
así como de semillas transgénicas o simientes transgénicas de una de
tales plantas mediante el uso de ácidos nucleicos, en que los
ácidos nucleicos codifican para una proteína de resistencia
autoactivada y la parte limitada presenta un gen de resistencia
NBS-LRR que se extiende desde el extremo 5' de la
zona codificante del gen de resistencia NBS-LRR de
forma descendente hasta el inicio del dominio NBS del gen de
resistencia NBS-LRR y no comprende ningún bucle P,
no siendo el gen de resistencia NBS-LRR un gen de
resistencia TIR-NBS-LRR.
11. Procedimiento según la reivindicación 10,
caracterizado porque el ácido nucleico codifica para una
secuencia de aminoácidos con un motivo de secuencia DAE.
12. Procedimiento según la reivindicación 10,
caracterizado porque el ácido nucleico codifica para una
secuencia de aminoácidos con un motivo de secuencia AVLXDAE.
13. Procedimiento según la reivindicación 10,
caracterizado porque el ácido nucleico presenta una secuencia
de nucleótidos del grupo siguiente:
- a)
- Secuencia de nucleótidos según SEC. ID. Nº 1 o una secuencia de nucleótidos complementaria a la secuencia de nucleótidos según SEC. ID. Nº 1 o una secuencia de nucleótidos que se hibrida bajo condiciones astringentes con la secuencia de nucleótidos según SEC. ID. Nº 1 o una secuencia de nucleótidos complementaria a la secuencia de nucleótidos según SEC. ID. Nº 1;
- b)
- Secuencia de nucleótidos según SEC. ID. Nº 2 o una secuencia de nucleótidos complementaria a la secuencia de nucleótidos según SEC. ID. Nº 2 o una secuencia de nucleótidos que se hibrida bajo condiciones astringentes con la secuencia de nucleótidos según SEC. ID. Nº 2 o una secuencia de nucleótidos complementaria a la secuencia de nucleótidos según SEC. ID. Nº 2;
- c)
- Secuencia de nucleótidos según SEC. ID. Nº 3 o una secuencia de nucleótidos complementaria a la secuencia de nucleótidos según SEC. ID. Nº 3 o una secuencia de nucleótidos que se hibrida bajo condiciones astringentes con la secuencia de nucleótidos según SEC. ID. Nº 3 o una secuencia de nucleótidos complementaria a la secuencia de nucleótidos según SEC. ID. Nº 3;
- d)
- Secuencia de nucleótidos según SEC. ID. Nº 4 o una secuencia de nucleótidos complementaria a la secuencia de nucleótidos según SEC. ID. Nº 4 o una secuencia de nucleótidos que se hibrida bajo condiciones astringentes con la secuencia de nucleótidos según SEC. ID. Nº 4 o una secuencia de nucleótidos complementaria a la secuencia de nucleótidos según SEC. ID. Nº 4,
- e)
- Secuencia de nucleótidos según SEC. ID. Nº 16 o una secuencia de nucleótidos complementaria a la secuencia de nucleótidos según SEC. ID. Nº 16 o una secuencia de nucleótidos que se hibrida bajo condiciones astringentes con la secuencia de nucleótidos según SEC. ID. Nº 16 o una secuencia de nucleótidos complementaria a la secuencia de nucleótidos SEC. ID. Nº 16.
\vskip1.000000\baselineskip
14. Procedimiento según la reivindicación 10,
caracterizado porque el gen de resistencia
NBS-LRR se trata de un gen de remolacha azucarera o
patata.
15. Procedimiento según la reivindicación 10,
caracterizado porque el ácido nucleico codifica para una
secuencia de aminoácidos con una secuencia seleccionada del grupo
siguiente:
- a)
- SEC. ID. Nº 13
- b)
- SEC. ID. Nº 14
- c)
- SEC. ID. Nº 15.
\vskip1.000000\baselineskip
16. Procedimiento según la reivindicación 10,
caracterizado porque emplea una construcción de ácidos
nucleicos con
- a)
- un promotor inducible por patógenos, así como
- b)
- un ácido nucleico que se encuentra bajo el control del promotor según una de las reivindicaciones 10 a 15.
\vskip1.000000\baselineskip
17. Procedimiento según la reivindicación 16,
caracterizado porque el promotor inducible por patógenos es
un promotor sintético.
18. Procedimiento según la reivindicación 17,
caracterizado porque el promotor sintético comprende una o
varias de las combinaciones de elementos cis siguientes,
representando n y m un número natural de 1...10:
- a)
- una caja nxS-mxD
- b)
- una caja nxW2-mxD
- c)
- una caja nxGst1-mxD.
19. Procedimiento según la reivindicación 18,
caracterizado porque la combinación de elementos cis
comprende
- a)
- una secuencia de nucleótidos de SEC. ID. Nº 10 o
- b)
- una secuencia de nucleótidos de SEC. ID. Nº 11 o
- c)
- una secuencia de nucleótidos de SEC. ID. Nº 12.
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