ES2360188T3 - Producción de ácido hialurónico de bajo peso molecular. - Google Patents
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Abstract
Método para la producción de un ácido hialurónico con un peso molecular promedio bajo mediante fermentación controlada de temperatura, incluyendo el método los pasos de: (a) cultivo de una célula huésped recombinante de Bacillus a una primera temperatura propicia para su crecimiento, donde la célula huésped de Bacillus comprende un constructo de ácidos nucléicos que comprende una secuencia codificante de hialuronano sintasa operativamente enlazada a una secuencia promotora exógena a la secuencia codificante de hialuronano sintasa; (b) a continuación, cultivo de la célula huésped recombinante de Bacillus del paso (a) a una segunda temperatura superior a la primera temperatura del paso (a) según condiciones adecuadas para la producción del ácido hialurónico, donde la segunda temperatura es del orden de 40ºC-52ºC y al menos 5ºC superior a la primera temperatura, por lo cual la célula huésped de Bacillus produce ácido hialurónico con un peso molecular promedio deseado en la gama seleccionada del grupo de las gamas de peso molecular que consisten en 300-400 kDa, 400-500 kDa, 500-600 kDa, 600-700 kDa, 700-800 kDa; y (c) recuperación del ácido hialurónico.
Description
Producción de ácido hialurónico de bajo peso
molecular.
La presente invención se refiere a métodos para
la producción recombinante de ácido hialurónico (HA o hialuronano)
con un peso molecular (PM) promedio bajo en una célula huésped de
Bacillus mediante fermentación de temperatura controlada. La
célula huésped productora de HA se fermenta previamente a una
temperatura propicia para su crecimiento y a continuación se cambia
a una temperatura más alta favorable para la producción de HA del PM
bajo deseado. La temperatura y el pH favorable para la producción de
HA de PM bajo puede en alguna situación diferir incluso de las gamas
de pH y temperatura consideradas normalmente favorables para el
crecimiento del microorganismo que se fermenta.
Los heteropolisacáridos más abundantes del
cuerpo son los glicosaminoglicanos. Los glicosaminoglicanos son
polímeros de carbohidratos de cadena recta que consisten en repetir
unidades de disacáridos (sólo el queratán sulfato se ramifica en la
región de núcleo de los carbohidratos). Las unidades de disacáridos
generalmente comprenden, como primera unidad sacárida, uno de los
dos azúcares modificados N-acetilgalactosamina
(GalNAc) o N-acetilglucosamina (GlcNAc). La segunda
unidad es normalmente un ácido urónico, tal como un ácido
glucurónico (GlcUA) o iduronato.
Los glicosaminoglicanos son moléculas de carga
negativa y tienen una conformación extendida que proporciona una
alta viscosidad en solución. Los glicosaminoglicanos se localizan
principalmente en la superficie de las células o en la matriz
extracelular. Los glicosaminoglicanos también tienen una
comprimibilidad baja en solución y, como resultado, son ideales como
fluido de lubricación fisiológico, por ejemplo, para las
articulaciones. La rigidez de los glicosaminoglicanos proporciona
integridad estructural a las células y proporciona vías de paso
entre las células, teniendo en cuenta la migración celular. Los
glicosaminoglicanos de mayor importancia fisiológica son el
hialuronano, el sulfato de condroitina, heparina, heparán sulfato,
dermatán sulfato y queratán sulfato. Muchos glicosaminoglicanos
enlazan de manera covalente con una proteína del núcleo de
proteoglicanos mediante estructuras específicas de oligosacáridos.
El hialuronano forma grandes agregados con determinados
proteoglicanos, pero es una excepción, ya que las cadenas de
carbohidratos libres forman complejos no covalentes con
proteoglicanos.
El ácido hialurónico se define aquí como un
glicosaminoglicano no sulfatado compuesto mediante la repetición de
unidades de disacárido de N-Acetilglucosamina
(GlcNAc) y ácido glucurónico (GlcUA) enlazadas alternando enlaces
glicosídicos beta-1,4 y beta-1,3. El
ácido hialurónico es también conocido como hialuronano, hialuronato
o HA. Los términos hialuronano y ácido hialurónico se usan aquí de
forma intercambiable.
Numerosas funciones del hialuronano en el cuerpo
han sido identificadas (ver, Laurent T. C. y Fraser J. R. E., 1992,
FASEB J. 6: 2397-2404; y Toole B.P., 1991,
"Proteoglycans and hyaluronan in morphogenesis and
differentiation". en: Cell Biology of the Extracellular Matrix,
págs. 305-341, Hay E. D., ed., Plenum, Nueva York).
El hialuronano está presente en el cartílago hialino, en el líquido
sinovial de las articulaciones y en los tejidos de la piel, tanto
dermis como epidermis. Se cree que el hialuronano desarrolla también
un papel en numerosas funciones fisiológicas, tales como adhesión,
desarrollo, motilidad celular, cáncer, angiogénesis y cicatrización
de una herida. Debido a las propiedades biológicas y físicas únicas
del hialuronano, se emplea en cirugía ocular y articular, y está
siendo probado en otros procedimientos médicos. También se han
desarrollado productos de hialuronano para su uso en ortopedia,
reumatología, y dermatología.
Las crestas de gallo son una fuente comercial
significativa de hialuronano. Los microorganismos son una fuente
alternativa. La patente estadounidense nº. 4.801.539 divulga un
método de fermentación para preparar ácido hialurónico que incluye
una cepa de Streptococcus zooepidemicus con rendimientos
proporcionados de aproximadamente 3,6 g de ácido hialurónico por
litro. La patente europea nº. EP0694616 divulga procesos de
fermentación usando una cepa mejorada de Streptococcus
zooepidemicus con rendimientos registrados de aproximadamente
3,5 g de ácido hialurónico por litro.
Los microorganismos usados para la producción de
ácido hialurónico por fermentación son cepas de bacterias patógenas,
siendo las más importantes entre éstas diferentes Streptococcus
spp. El grupo A y el grupo C de estreptococos se rodean ellos
mismos con una cápsula no antigénica compuesta por hialuronano, que
tiene una composición idéntica a la encontrada en el tejido
conjuntivo y las articulaciones. Pasteurella multocida, otra
bacteria que encapsula patógenos, también circunda sus células con
hialuronano.
Hialuronano sintasas han sido descritas a partir
de vertebrados, patógenos bacterianos y virus de algas (DeAngelis,
P. L., 1999, Cell. Mol. Life Sci. 56: 670-682). WO
99/23227 divulga un Grupo I de hialuronano sintasa de
Streptococcus equisimilis. WO 99/51265 y WO 00/27437 describen un Grupo II de hialuronano sintasa de Pasteurella multocida. Ferretti et al. revelan el operón de hialuronano sintasa de Streptococcus pyogenes, que está compuesto de tres genes, hasA, hasB, y hasC, que codifican hialuronano sintasa, UDP-glucosa deshidrogenase y UDP-glucosa pirofosforilasa respectivamente (Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 98, 4658-4663, 2001). WO 99/51265 describe un segmento de ácido nucleico con una región codificante para una hialuronato sintasa de Streptococcus equisimilis.
Streptococcus equisimilis. WO 99/51265 y WO 00/27437 describen un Grupo II de hialuronano sintasa de Pasteurella multocida. Ferretti et al. revelan el operón de hialuronano sintasa de Streptococcus pyogenes, que está compuesto de tres genes, hasA, hasB, y hasC, que codifican hialuronano sintasa, UDP-glucosa deshidrogenase y UDP-glucosa pirofosforilasa respectivamente (Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 98, 4658-4663, 2001). WO 99/51265 describe un segmento de ácido nucleico con una región codificante para una hialuronato sintasa de Streptococcus equisimilis.
La producción de ácido hialurónico,
particularmente de peso molecular promedio bajo, tal como, inferior
a 1 MDa, se consigue más frecuentemente aislando inicialmente el
material de peso molecular más alto (>1MDa) del caldo de
fermentación o de las fuentes animales. La reducción deseada en peso
molecular se consigue entonces, típicamente, mediante el
fraccionamiento mediante medios mecánicos/físicos o por medios
químicos.
El fraccionamiento ha sido realizado sobre una
membrana de tamaño selectivo con las fracciones resultantes de un
peso molecular medio del orden de 30.000-730.000
Dalton, siendo las moléculas más grandes retenidas por la membrana.
También se establece correctamente una precipitación solvente, las
moléculas más grandes son precipitadas primero, pero este método
carece de la resolución de fraccionamiento de membrana. En general,
los métodos de fraccionamiento tienden a ser favorables para aislar
moléculas más grandes y no son realmente adecuados para la
producción de moléculas pequeñas.
Usando medios mecánicos, las moléculas se
someten a una tensión de cizallamiento suficiente para causar
rotura. Por ejemplo, material de HA de 1.700.000 Da se puede reducir
por debajo de 500.000 Da en un homogenizador de alta presión
(WO9104279-A). El método se puede aumentar
proporcionalmente con, por ejemplo, máquinas tipo
Manton-Gaulin, estando éstas disponibles en varias
escalas y siendo capaces de procesar material a índices de 10 1/h
hasta del orden de varios m^{3}/h.
Se ha comprobado que medios físicos, tales como
la exposición a ultrasonidos, también funcionan, pero resulta
difícil implementar tales métodos para algo mucho más grande que la
escala de laboratorio (Orvisky et al. 1993. Size exclusión
chromatographic characterization of sodium hyaluronate fractions
prepared by high energetic sonication. Chromatographia vol. 37
(1-2): 20-22).
Medios químicos, tales como hidrólisis a los
valores extremos de pH, también han sido descritos, o en presencia
de otros productos químicos. Tales métodos pueden ser inadecuados si
el mediador de pH o químico no debe estar presente en el producto
final, o si es necesario un control fino para iniciar y detener el
proceso; índices de mezcla pueden estar limitando a gran escala.
Cuando se aísla el HA de fuentes animales, no
existe ningún control sobre el PM inicial, es casi siempre de orden
alto (>5Da). El HA fermentado a partir de microorganismos de tipo
salvaje tiene más frecuentemente un PM inferior que el de fuentes
animales, pero sigue siendo superior a 1 MDa.
Se ha citado frecuentemente que el HA de
fermentaciones de Streptococcus de tipo salvaje tiene un peso
molecular medio del orden de 1.5 MDa a 3.2 MDa. Se informó de que
Streptococcus zooepidemicus que fue cultivado en una
instalación donde había un índice de crecimiento específico máximo a
40ºC producía ácido hialurónico con un peso molecular cada vez más
alto cuando la temperatura de fermentación fue reducida de 40ºC a
32ºC. Se sugirió que esto era el resultado de un índice de
crecimiento específico de disminución (Armstrong & Johns. 1997.
Appl. Envir. Microbiol. vol. 63: 2759-2764). Otros
autores han confirmado la existencia de una correlación entre el
índice de crecimiento específico de S. zooepidemicus y su
productividad de HA, así como el peso molecular del HA que produce
(Chong B.F., et al. 2005. Microbial hyaluronic acid
production. Appl. Microbiol. and Biotech. vol. 66(4):
341-351). No obstante, la bibliografía en el tema de
la producción de HA microbiano está completamente focalizada en
maximizar el peso molecular del HA, no en reducirlo.
Producción de HA en Bacillus subtilis ha
sido descrita también (Widner et al. 2005. Appl. Envir.
Microbiol. vol 71: 3747-3752).
Los bacilos están bien establecidos como
sistemas de célula huésped para la producción de proteínas nativas y
recombinantes, incluyendo expresión recombinante de enzimas de ácido
hialurónico sintasa exógenas que permiten a la célula huésped
producir ácido hialurónico (WO 2003054163). Es un objetivo de la
presente invención proporcionar métodos para producir un ácido
hialurónico con un peso molecular promedio deseado bajo, del orden
de 300.000-800.000 Dalton, en una célula huésped de
Bacillus.
Como se ha mencionado anteriormente, la
producción de ácido hialurónico con un peso molecular promedio bajo,
tal como inferior a 800,000 Da, se consigue más frecuentemente
aislando en primer lugar el material de PM más alto (>1MDa) y
luego reduciendo el peso molecular, típicamente, mediante
fraccionamiento, por medios mecánicos/físicos o por medios
químicos.
La presente invención proporciona un método de
fermentación con una célula huésped recombinante que produce
directamente HA con el PM promedio bajo deseado inferior a 800,000
Da, que a su vez proporciona numerosos beneficios de procesamiento
de flujo descendente.
Cuando un material HA se produce directamente
con un PM bajo cercano al deseado, entonces cada paso del proceso de
producción, incluyendo la fermentación y las operaciones de unidades
de recuperación, se benefician de una viscosidad inferior. Además,
se vuelve posible operar a una concentración global de HA más alta
que con moléculas de un PM más alto. Esto libera capacidad de
producción, permite un rendimiento más rápido y resulta en un
proceso más eficiente que es más fácil de controlar. También se
obtienen beneficios en el control de la calidad.
Por consiguiente, en un primer aspecto, la
invención se refiere a un método para la producción de un ácido
hialurónico con un peso molecular promedio deseado del orden de
300.000-800.000 Dalton, incluyendo el método los
pasos de:
(a) cultivo de una célula huésped recombinante
de Bacillus a una primera temperatura propicia para su
crecimiento, donde la célula huésped de Bacillus comprende un
constructo de ácidos nucleicos que comprende una secuencia de
codificación de hialuronano sintasa operativamente enlazada a una
secuencia promotora ajena a la secuencia de codificación de
hialuronano sintasa;
(b) a continuación, cultivo de la célula huésped
recombinante de Bacillus del paso (a) a una segunda
temperatura superior a la primera temperatura del paso (a) según
condiciones adecuadas para la producción del ácido hialurónico,
donde la segunda temperatura es del orden de
40ºC-52ºC y al menos 5ºC superior a la primera
temperatura, mediante lo cual la célula huésped de Bacillus
produce ácido hialurónico con un peso molecular promedio deseado en
la gama seleccionada del grupo de gama de peso molecular que
consiste en 300-400 kDa, 400-500
kDa, 500-600 kDa, 600-700 kDa,
700-800 kDa; y (c) recuperación del ácido
hialurónico.
La Figura 1 muestra la tendencia para el peso
molecular medio al final de las fermentaciones como una función de
la temperatura final de fermentación, como determina
GPC-MALLS. La figura muestra que un PM deseado puede
ser seleccionado mediante la manipulación de la temperatura de
fermentación. Existe un máximo a temperaturas bajas finales de 17ºC,
y un mínimo a temperaturas de fermentación altas de 52ºC. La
identidad del máximo real ha sido protegida seleccionando un origen
distinto de cero para el peso molecular.
La presente invención se refiere a métodos para
producir un ácido hialurónico con un peso molecular promedio deseado
del orden de 300.000-800.000 Dalton, incluyendo los
métodos los pasos de:
(a) cultivo de una célula huésped recombinante
de Bacillus a una primera temperatura propicia para su
crecimiento, donde la célula huésped de Bacillus comprende un
constructo de ácidos nucleicos que comprende una secuencia de
codificación de hialuronano sintasa operativamente enlazada a una
secuencia promotora ajena a la secuencia de codificación de
hialuronano sintasa;
(b) a continuación, cultivo de la célula huésped
recombinante de Bacillus del paso (a) a una segunda
temperatura superior a la primera temperatura del paso (a) bajo
condiciones adecuadas para la producción del ácido hialurónico,
donde la segunda temperatura es del orden de
40ºC-52ºC y al menos 5ºC superior a la primera
temperatura, por lo cual la célula huésped de Bacillus
produce ácido hialurónico con un peso molecular promedio deseado en
la gama seleccionada del grupo de gama de peso molecular que
consiste en 300-400 kDa, 400-500
kDa, 500-600 kDa, 600-700 kDa,
700-800 kDa; y (c) recuperación del ácido
hialurónico.
Los métodos de la presente invención representan
una mejora respecto a la producción de hialuronano de un patógeno,
encapsulando bacterias con los posteriores pasos del proceso para
reducir el peso molecular. Al encapsular las bacterias, se produce
una gran cantidad de hialuronano en la cápsula. En el procesamiento
y depuración del hialuronano de tales fuentes, es necesario en
primer lugar eliminar el hialuronano de la cápsula mediante el uso,
por ejemplo, de un tensioactivo o detergente, tal como SDS. Esto
crea una complicación en la producción comercial de hialuronano, ya
que el tensioactivo debe ser adicionado para liberar una parte
grande del hialuronano, y posteriormente dicho tensioactivo debe ser
eliminado antes de la purificación final.
La presente invención permite la producción de
una gran cantidad de hialuronano de PM bajo, que se produce en una
célula huésped no encapsulada segura, como hialuronano libre.
Puesto que el hialuronano de la célula
recombinante de Bacillus se expresa directamente al medio de
cultivo, se puede utilizar un proceso simple para aislar el
hialuronano del medio de cultivo. Primero, las células de
Bacillus y el detrito celular se eliminan físicamente del
medio de cultivo. El medio de cultivo puede ser diluido primero, si
se desea, para reducir la viscosidad del medio. Muchos métodos son
conocidos por los expertos en la materia para la eliminar las
células del medio de cultivo, tales como centrifugado o micro
filtración. Si se desea, el sobrenadante restante puede luego ser
filtrado, por ejemplo mediante ultrafiltración, para concentrar y
eliminar pequeños contaminantes moleculares del hialuronano. Después
de la eliminación de las células y el detrito celular, se realiza
una precipitación simple del hialuronano desde el medio mediante
mecanismos conocidos. Sal, alcohol, o combinaciones de sal y alcohol
se pueden utilizar para precipitar el hialuronano del filtrado. Una
vez reducido a un precipitado, el hialuronano puede ser fácilmente
aislado de la solución mediante medios físicos. Alternativamente, el
hialuronano se puede secar o concentrar a partir de la solución
filtrada usando técnicas vaporizables conocidas en la técnica, tal
como secado por atomización.
Los métodos de la presente invención representan
por tanto una mejora sobre las técnicas existentes para producir
comercialmente hialuronano por fermentación, al no requerir el uso
de un tensioactivo en la purificación de hialuronano de células en
cultivo.
En los métodos de la invención, el huésped de
Bacillus se cultiva a una primera temperatura propicia para
su crecimiento con el fin de desarrollar una gran cantidad de
biomasa activa para la posterior síntesis de HA. Los bacilos son
capaces de crecer con una amplia gama de temperaturas, siempre que
no existan otros factores que lo limiten. Por ejemplo, en medios de
cultivo ricos, hay que asegurar una aireación suficiente a
temperaturas más altas para conseguir un alto índice de crecimiento
específico.
Por consiguiente, una forma de realización
preferida se refiere al método del primer aspecto, donde la primera
temperatura es del orden de 10ºC-60ºC,
preferiblemente 20ºC-50ºC, y más preferiblemente del
orden de 30ºC-45ºC, de la forma más preferible del
orden de 34ºC-40ºC.
Una vez la cantidad deseada de biomasa ha sido
establecida, el huésped de Bacillus se cultiva a una segunda
temperatura que se fija al menos 5ºC superior a la primera
temperatura durante la construcción de la biomasa, y bajo
condiciones adecuadas para la producción del ácido hialurónico.
Precisamente cómo de alta se fije la segunda temperatura, depende
del PM deseado de HA a producir. Cuanto más bajo sea el PM deseado,
más alta deberá lijarse la temperatura.
Así, la segunda temperatura es del orden de
40ºC-52ºC. Naturalmente, las gamas preferidas de la
primera temperatura de cultivo se deben combinar con las gamas
adecuadas preferidas de la segunda temperatura de cultivo en el
método de la invención.
La segunda temperatura es al menos 5ºC superior
a la primera temperatura, preferiblemente la segunda temperatura es
de al menos 6ºC, 7ºC, 8ºC, 9ºC, 10ºC, 11ºC, 12ºC, 13ºC, 14ºC, 15ºC,
16ºC, 17ºC, 18ºC, 19ºC, 20ºC, 21ºC, 22ºC, 23ºC, 24ºC, 25ºC, 26ºC,
27ºC, 28ºC, 29ºC, y de la forma más preferible al menos 30ºC
superior a la primera temperatura.
La duración del paso de cultivo a la primera
temperatura en los métodos de la invención, donde la biomasa es
incrementada, depende de varios factores, incluyendo las condiciones
de cultivo, el volumen de fermentación, la cepa de Bacillus
particular elegida, etc. y, por supuesto, también la primera
temperatura. La duración del paso de cultivo a la segunda
temperatura, que es cuando se produce el HA de PM bajo, también
depende de distintos factores. Consecuentemente, el tiempo total de
cultivo, que es definido como la duración de ambos pasos de cultivo,
no se determina fácilmente. No obstante, en una forma de realización
preferida, el paso de cultivo a la segunda temperatura requiere al
menos un 20% del total de tiempo de cultivo, preferiblemente el paso
de cultivo a la segunda temperatura requiere al menos un 30%, 40%,
50%, 60%, 70%, 80%, o de la forma más preferible al menos un 90% del
total de tiempo de cultivo.
Una forma de realización preferida se refiere al
método del primer aspecto, donde la segunda temperatura es
suficientemente superior a la primera temperatura para permitir a la
célula huésped de Bacillus producir ácido hialurónico con un
peso molecular promedio deseado en una gama seleccionada del grupo
de gamas de peso molecular que consiste en 300-350
kDa, 350-400 kDa, 400-450 kDa,
450-500 kDa, 500-550 kDa,
550-600 kDa, 600-650 kDa,
650-700 kDa, 700-750 kDa, y
750-800 kDa.
Otra forma de realización preferida se refiere
al método del primer aspecto, donde la segunda temperatura es
suficientemente superior a la primera temperatura para permitir a la
célula huésped de Bacillus producir ácido hialurónico con un
peso molecular promedio deseado en una gama seleccionada del grupo
de gamas de peso molecular que consiste en 300-400
kDa, 400-500 kDa, 500-600 kDa,
600-700 kDa, 700-800 kDa.
El nivel de ácido hialurónico producido por una
célula huésped de Bacillus de la presente invención se puede
determinar según el método del carbazol modificado (Bitter y Muir,
1962 Anal Biochem. 4: 330-334). Por otra parte, el
peso molecular medio del ácido hialurónico puede ser determinado
usando métodos estándar de la técnica, tales como los descritos por
Ueno et al., 1988, Chem. Farm. Bull. 36,
4971-4975; Wyatt, 1993, Anal. Chim. Acta 272:
1-40; y Wyatt Technologies, 1999, "DAWN EOS
Manual" y "Light Scattering University DAWN Course Manual"
Wyatt Technology Corporation, Santa Barbara, California.
El ácido hialurónico obtenido mediante los
métodos de la presente invención se puede someter a varias técnicas
conocidas en la técnica para modificar el ácido hialurónico, como la
reticulación, como se describe, por ejemplo, en las patentes
estadounidenses Nºs. 5.616.568, 5.652.347 y 5.874.417. Por otra
parte, el peso molecular del ácido hialurónico puede ser alterado
usando técnicas conocidas en la técnica.
\vskip1.000000\baselineskip
En los métodos de la presente invención, la
célula huésped de Bacillus puede ser cualquier célula de
Bacillus adecuada para la producción recombinante de ácido
hialurónico. La célula huésped de Bacillus puede ser una
célula de Bacillus de tipo salvaje o un mutante de la misma.
Células de Bacillus útiles en la práctica de la presente
invención incluyen, pero no se limitan a, células de Bacillus
agaraderhens, Bacillus alkalophilus, Bacillus amyloliquefaciens,
Bacillus brevis, Bacillus circulans, Bacillus clausii, Bacillus
coagulans, Bacillus firmus, Bacillus lautus, Bacillus lentus,
Bacillus licheniformis, Bacillus megaterium, Bacillus pumilus,
Bacillus stearothermophilus, Bacillus subtilis, y Bacillus
thuringiensis. Células de Bacillus subtilis mutantes
particularmente adaptadas para la expresión recombinante son
descritas en WO 98/22598. Células de Bacillus no encapsuladas
son particularmente útiles en la presente invención.
En una forma de realización preferida, la célula
huésped de Bacillus es una célula de Bacillus
amyloliquefaciens, Bacillus clausii, Bacillus lentus, Bacillus
licheniformis, Bacillus stearothermophilus o Bacillus
subtilis. En una forma de realización más preferida, la célula
de Bacillus es una célula de Bacillus
amyloliquefaciens. En otra forma de realización más preferida,
la célula de Bacillus es una célula de Bacillus
clausii. En otra forma de realización más preferida, la célula
de Bacillus es una célula de Bacillus lentus. En otra
forma de realización más preferida, la célula de Bacillus es
una célula de Bacillus licheniformis. En otra forma de
realización más preferida, la célula de Bacillus es una
célula de Bacillus subtilis. En una forma de realización más
preferida, la célula huésped de Bacillus es Bacillus
subtilis A164A5 (ver patente estadounidense nº. 5.891.701) o
Bacillus subtilis 168\Delta4.
La transformación de la célula huésped de
Bacillus con un constructo de ácidos nucléicos de la presente
invención puede, por ejemplo, ser efectuada mediante transformación
del protoplasto (ver, por ejemplo, Chang y Cohen, 1979, Molecular
General Genetics 168:111-115), usando células
competentes (ver, por ejemplo, Young y Spizizen, 1961, Journal of
Bacteriology 81: 823-829, o Dubnau y
Davidoff-Abelson, 1971, Journal of Molecular Biology
56: 209-221), por electroporación (ver, por ejemplo,
Shigekawa y Dower, 1988 Biotechniques 6: 742-751), o
por conjugación (ver, por ejemplo, Koehler y Torne, 1987, Journal of
Bacteriology 169: 5271-5278).
\vskip1.000000\baselineskip
"Constructo de ácidos nucleicos" es
definido aquí como una molécula de ácido nucleico, ya sea mono o
bicatenaria, que se aísla de un gen de origen natural o que ha sido
modificada para contener segmentos de ácido nucleico que se combinan
y yuxtaponen de un modo tal que de lo contrario no existirían en la
naturaleza. El término constructo de ácidos nucléicos puede ser
sinónimo del término cassette de expresión cuando el constructo de
ácidos nucleicos contiene todas las secuencias de control requeridas
para la expresión de una secuencia codificante. El término
"secuencia codificante" es definido aquí como una secuencia que
es transcrita en ARNm y traducida en una enzima de interés cuando se
coloca bajo el control de las secuencias de control mencionadas más
abajo. Los bordes de la secuencia codificante están generalmente
determinados por un sitio de unión al ribosoma localizado justo
arriba del marco de lectura abierto en el extremo 5' del ARNm y una
secuencia de terminación de la transcripción localizada justo abajo
del marco de lectura abierto en el extremo 3' del ARNm. Una
secuencia codificante puede incluir, pero no se limita a, ADN, ADNc
y secuencias de ácidos nucleicos recombinantes.
Las técnicas usadas para aislar o clonar una
secuencia de ácidos nucléicos que codifican un polipéptido se
conocen bien en la técnica e incluyen, por ejemplo, aislamiento del
ADN genómico, preparación del ADNc o una combinación de ambas. La
clonación de las secuencias de ácidos nucleicos de tal ADN genómico
puede ser efectuada, por ejemplo, usando una selección de
anticuerpos de bibliotecas de expresión para detectar fragmentos de
ADN clonados con características estructurales compartidas o la
conocida reacción en cadena de polimerasa (PCR). Ver, por ejemplo,
Innis et al., 1990, PCR Protocols: Guide to Methods and
Application, Academic Press, Nueva York. Otros procedimientos de
amplificación de ácidos nucleicos tales como la reacción en cadena
de la ligasa, transcripción activada ligada y amplificación basada
en las secuencias de ácidos nucleicos pueden ser utilizados. Los
procedimientos de clonación pueden implicar escisión y aislamiento
de un fragmento deseado de ácido nucleico que comprende la secuencia
de ácidos nucleicos que codifica el polipéptido, la inserción del
fragmento en una molécula de vector, e incorporación del vector
recombinante en una célula de Bacillus donde clones de la
secuencia de ácidos nucléicos serán replicados. La secuencia de
ácidos nucléicos puede ser de origen genómico, ADNc, ARN,
semisintético, sintético o de cualquier combinación de los
mismos.
Una secuencia de ácidos nucléicos aislada que
codifica una enzima puede ser manipulada de varias maneras con el
fin de mantener la expresión de la enzima. La manipulación de la
secuencia de ácidos nucléicos antes de su inserción en un constructo
o vector puede ser deseable o necesaria dependiendo del vector de
expresión o célula huésped de Bacillus. Las técnicas para
modificar secuencias de ácidos nucleicos utilizando métodos de
clonación son conocidas en la técnica. Se entenderá que la secuencia
de ácidos nucleicos puede también ser manipulada in vivo en
la célula huésped usando métodos conocidos en la técnica.
Varias enzimas intervienen en la biosíntesis de
ácido hialurónico. Estas enzimas incluyen sintasa de hialuronano,
UDP-glucosa 6-deshidrogenasa,
UDP-glucosa pirofosforilasa,
UDP-N-acetilglucosamina
pirofosforilasa,
glucosa-6-fosfato-isomerasa,
hexoquinasa, fosfoglucomutasa, amidotransferasa, mutasa, y
acetiltransferasa. La hialuronano sintasa es la enzima clave en la
producción de ácido hialurónico.
La "hialuronano sintasa" es definida aquí
como una sintasa que cataliza el alargamiento de una cadena de
hialuronano mediante la adición de azúcares precursores GlcUA y
GlcNAc. Las secuencias de aminoácidos de hialuronano sintasas
estreptocócicas, hialuronano sintasas vertebradas y la hialuronano
sintasa vírica son diferentes a la hialuronano sintasa de
Pasteurella, y se ha propuesto que se clasifiquen como Grupo
I y Grupo II de hialuronano sintasas, incluyendo el Grupo I de
hialuronano sintasas las hialuronano sintasas estreptocócicas
(DeAngelis, 1999). Para la producción de hialuronano en células
huéspedes de Bacillus, las hialuronano sintasas de origen
eucariota, tales como hialuronano sintasas de células de mamíferos,
son menos preferidas.
La secuencia de codificación de hialuronano
sintasa puede ser cualquier secuencia de ácidos nucleicos capaz de
ser expresada en una célula huésped de Bacillus. La secuencia
de ácidos nucleicos puede ser de cualquier origen. Genes de
hialuronano sintasa preferidos incluyen cualquiera del Grupo I o
Grupo II, tales como genes de hialuronano sintasa del Grupo I a
partir de Streptococcus equisimilis, Streptococcus pyogenes,
Streptococcus uberis, y Streptococcus equi subesp.
zooepidemicus, o genes de hialuronano sintasa del Grupo II de
Pasteurella multocida.
Los métodos de la presente invención también
incluyen constructos mediante los que se suministran azúcares
precursores de hialuronano a la célula huésped, bien al medio de
cultivo, o estando codificados por genes endógenos, por genes no
endógenos, o por una combinación de genes endógenos y no endógenos
en la célula huésped de Bacillus. El azúcar precursor puede
ser ácido D-glucurónico o
N-acetil-glucosamina.
En los métodos de la presente invención, el
constructo de ácidos nucleicos puede comprender además uno o más
genes que codifican enzimas en la biosíntesis de un azúcar precursor
de un hialuronano. Alternativamente, la célula huésped de
Bacillus puede comprender además uno o más segundos
constructos de ácidos nucleicos que comprenden uno o más genes que
codifican enzimas en la biosíntesis del azúcar precursor. La
producción de hialuronano se mejora mediante el uso de constructos
con una secuencia de ácidos nucleicos o secuencias que codifican un
gen o genes que dirigen un paso en la vía de síntesis del azúcar
precursor de hialuronano. Por "dirigir un paso en la vía de
síntesis del azúcar precursor de hialuronano" se entiende que la
proteína expresada del gen tiene un papel activo en la formación de
N-acetil-glucosamina o ácido
D-glucurónico, o un azúcar que es un precursor tanto
de N-acetil-glucosamina como de
ácido D-glucurónico.
En un método preferido para suministrar azúcares
precursores, se dispone de constructos para mejorar la producción de
hialuronano en una célula huésped con una hialuronano sintasa,
mediante el cultivo de una célula huésped con un constructo
recombinante con una región promotora heteróloga operativamente
enlazada a una secuencia de ácidos nucleicos que codifica un gen que
dirige un paso en la vía de síntesis de un azúcar precursor de
hialuronano. En un método preferido la célula huésped también
comprende un constructo recombinante con una región promotora
operativamente enlazada a una hialuronano sintasa, que puede usar la
misma región promotora o una diferente a la secuencia de ácidos
nucleicos para una sintasa implicada en la biosíntesis de
N-acetil-glucosamina. En otra forma
de realización preferida, la célula huésped puede tener un
constructo recombinante con una región promotora operativamente
enlazada a secuencias de ácidos nucleicos diferentes que codifican
un segundo gen implicado en la síntesis de un azúcar precursor de
hialuronano.
Así, la presente divulgación también se refiere
a constructos para mejorar la producción de hialuronano mediante el
uso de constructos con una secuencia de ácidos nucleicos que
codifican un gen que dirige un paso en la vía de síntesis de un
azúcar precursor de hialuronano. La secuencia de ácidos nucléicos al
azúcar precursor se puede expresar desde el mismo promotor que la
secuencia de ácidos nucléicos que codifica la hialuronano sintasa, o
uno diferente.
Los genes implicados en la biosíntesis de
azúcares precursores para la producción de ácido hialurónico
incluyen un gen de UDP-glucosa
6-deshidrogenasa, gen de UDP-glucosa
pirofosforilasa, gen de
UDP-N-acetilglucosamina
pirofosforilasa, gen de
glucosa-6-fosfato-isomerasa,
gen de hexoquinasa, gen de fosfoglucomutasa, gen de
amidotransferasa, gen de mutasa y gen de acetil transferasa.
En una célula que contiene una hialuronano
sintasa, cualquiera o una combinación de dos o más genes de
hasB, hasC y hasD, o sus homólogos, tales como
el Bacillus subtilis tuaD, gtaB, y gcaD,
respectivamente, al igual que hasE, se pueden expresar para
aumentar los depósitos de azúcares precursores disponibles para la
hialuronano sintasa. El genoma de Bacillus es descrito en
Kunst et al., Nature 390, 249-256, "The
complete genome sequence of the Gram-positive
bacterium Bacillus subtilis" (20 Noviembre 1997). En
algunos ejemplos, tales como donde la célula huésped no tiene una
actividad nativa de hialuronano sintasa, el constructo puede incluir
el gen hasA.
La secuencia de ácidos nucleicos que codifica
las enzimas biosintéticas pueden ser nativas para la célula huésped,
mientras que en otros casos se puede utilizar una secuencia
heteróloga. Si dos o más genes son expresados, puede que sean genes
que se asocian el uno con el otro en un operón nativo, tal como los
genes del operón HAS de Streptococcus equisimilis, que
comprenden hasA, hasB, hasC y hasD. En otros ejemplos,
se puede desear el uso de alguna combinación de las secuencias del
gen precursor, sin incluir cada elemento del operón. También se
puede preferir en otros casos el uso de algunos genes nativos para
la célula huésped y otros que sean exógenos. La elección dependerá
de los depósitos disponibles de azúcares en una célula huésped, de
la capacidad de la célula para alojar sobreproducción sin interferir
con otras funciones de la célula huésped y de si la célula regula la
expresión de sus genes nativos de manera diferente a la de los genes
exógenos.
Como ejemplo, dependiendo de los requisitos
metabólicos y condiciones de crecimiento de la célula, y de los
depósitos de azúcar precursor disponibles, puede ser deseable
aumentar la producción de
N-acetil-glucosamina mediante
expresión de una secuencia de ácidos nucleicos que codifique
UDP-N-acetilglucosamina
pirofosforilasa, tal como el gen hasD, el gen gcaD de
Bacillus, y homólogos de los mismos. Alternativamente, el
azúcar precursor puede ser ácido D-glucurónico. En
tal forma de realización, la secuencia de ácidos nucleicos codifica
UDP-glucosa 6-deshidrogenasa. Tales
secuencias de ácidos nucleicos incluyen el gen tuaD de
Bacillus, el gen hasB de Streptococcus y
homólogos de los mismos. La secuencia de ácidos nucléicos, puede
también codificar UDP-glucosa pirofosforilasa, tal
como en el gen gtaB Bacillus, el gen hasC de
Streptococcus y homólogos de los mismos.
En los métodos de la presente invención, el gen
de UDP-glucosa 6-dehidrogenasa puede
ser un gen hasB o un gen tuaD; u homólogos de los
mismos.
En los métodos de la presente invención, el gen
de UDP-glucosa pirofosforilasa puede ser un gen
hasC o un gen gtaB; u homólogos de los mismos.
En los métodos de la presente invención, el gen
de UDP-N-acetilglucosamina
pirofosforilasa puede ser un gen hasD o gcaD; u
homólogos de los mismos.
En los métodos de la presente invención, el gen
de
glucosa-6-fosfato-isomerasa
puede ser un gen hasE u homólogo del mismo.
En los métodos de la presente invención, el gen
de hialuronano sintasa y uno o más genes que codifican un azúcar
precursor están bajo el control del mismo promotor.
Alternativamente, uno o más genes que codifican un azúcar precursor
están bajo el control del mismo promotor, pero un promotor diferente
dirige el gen de hialuronano sintasa. Otra alternativa es que el gen
de hialuronano sintasa y cada uno de los genes que codifican un
azúcar precursor estén bajo el control de diferentes promotores. En
una forma de realización preferida, el gen de hialuronano sintasa y
uno o más genes que codifican un azúcar precursor están bajo el
control del mismo promotor.
En algunos casos, la célula huésped tendrá un
constructo recombinante con una región promotora heteróloga
operativamente enlazada a una secuencia de ácidos nucleicos que
codifica un gen que dirige un paso en la vía de síntesis de un
azúcar precursor de hialuronano, que puede estar conjuntamente con
la expresión de hialuronano sintasa de un constructo recombinante.
La hialuronano sintasa se puede expresar de la misma región
promotora o una diferente que la secuencia de ácidos nucléicos que
codifica una enzima implicada en la biosíntesis del precursor. En
otra forma de realización preferida, la célula huésped puede tener
un constructo recombinante con una región promotora operativamente
enlazada a una secuencia de ácidos nucléicos diferente que codifica
un segundo gen implicado en la síntesis de un azúcar precursor de
hialuronano.
La secuencia de ácidos nucléicos que codifica
las enzimas implicadas en la biosíntesis del/los azúcar(es)
precur-
sor(es) se puede expresar del mismo promotor o uno diferente como la secuencia de ácidos nucleicos que codifica la hialuronano sintasa. En el sentido primero, los "operones artificiales" son constructos que pueden imitar al operón de Streptococcus equisimilis en tener cada uno hasA, hasB, hasC y hasD, u homólogos de los mismos, o, alternativamente, pueden utilizar menos que el complemento completo presente en el operón de Streptococcus equisimilis. Los operones artificiales pueden comprender también un gen de glucosa-6-fosfato-isomerasa (hasE) al igual que uno o más genes seleccionados del grupo que consiste en un gen de hexoquinasa, gen de fosfoglucomutasa, gen de amidotransferasa, gen de mutasa y gen de acetil transferasa. En el operón artificial, al menos uno de los elementos es heterólogo a otro de los elementos, tal como la región promotora que es heteróloga a las secuencias codificantes.
sor(es) se puede expresar del mismo promotor o uno diferente como la secuencia de ácidos nucleicos que codifica la hialuronano sintasa. En el sentido primero, los "operones artificiales" son constructos que pueden imitar al operón de Streptococcus equisimilis en tener cada uno hasA, hasB, hasC y hasD, u homólogos de los mismos, o, alternativamente, pueden utilizar menos que el complemento completo presente en el operón de Streptococcus equisimilis. Los operones artificiales pueden comprender también un gen de glucosa-6-fosfato-isomerasa (hasE) al igual que uno o más genes seleccionados del grupo que consiste en un gen de hexoquinasa, gen de fosfoglucomutasa, gen de amidotransferasa, gen de mutasa y gen de acetil transferasa. En el operón artificial, al menos uno de los elementos es heterólogo a otro de los elementos, tal como la región promotora que es heteróloga a las secuencias codificantes.
En una forma de realización preferida del
método, el constructo de ácidos nucleicos comprende hasA,
tuaD, y gtaB. En otra forma de realización preferida, el
constructo de ácidos nucleicos comprende hasA, tuaD, gtaB, y
gcaD. En otra forma de realización preferida, el constructo
de ácidos nucleicos comprende hasA y tuaD. En otra
forma de realización preferida, el constructo de ácidos nucleicos
comprende hasA. En otra forma de realización preferida, el
constructo de ácidos nucleicos comprende hasA, tuaD, gtaB,
gcaD, y hasE. En otra forma de realización preferida, el
constructo de ácidos nucleicos comprende hasA, hasB, hasC, y
hasD. En otra forma de realización preferida, el constructo
de ácidos nucleicos comprende hasA, hasB, hasC, hasD, y
hasE. Basándose en las formas de realización anteriores
preferidas, los genes notados se pueden sustituir con homólogos de
los mismos.
En los métodos de la presente invención, los
constructos de ácidos nucleicos comprenden una secuencia codificante
de hialuronano sintasa operativamente enlazada a una secuencia
promotora externa a la secuencia de codificación de hialuronano
sintasa. La secuencia promotora puede ser, por ejemplo, un único
promotor o un promotor en serie.
Un "promotor" se define aquí como una
secuencia de ácidos nucleicos implicada en la unión de
RNA-polimerasa dirigida por ADN para iniciar la
transcripción de un gen. "Promotor tándem" es definido aquí
como dos o más secuencias promotoras, cada una de las cuales está
operativamente enlazada a una secuencia codificante y media la
transcripción de la secuencia codificante en ARNm. "Operativamente
enlazado" se define aquí como una configuración en la que una
secuencia de control, por ejemplo, una secuencia promotora, está
apropiadamente colocada en una posición en relación a una secuencia
codificante de manera que la secuencia de control dirige la
producción de un polipéptido codificado por la secuencia
codificante. Como se ha apuntado anteriormente, una "secuencia
codificante" es definida aquí como una secuencia de ácidos
nucléicos que es transcrita en ARNm y traducida en un polipéptido
colocado bajo el control de las secuencias de control apropiadas.
Los bordes de la secuencia codificante están generalmente
determinados por un sitio de unión al ribosoma localizado justo
encima del marco de lectura abierto en el extremo 5' del ARNm y una
secuencia del terminador de transcripción localizada justo abajo del
marco de lectura abierto en el extremo 3' del ARNm. Una secuencia
codificante puede incluir, pero no se limita a, ADN genómico, ADNc,
semisintético, sintético y secuencias de ácidos nucleicos
recombinantes.
En una forma de realización preferida del
método, las secuencias promotoras se pueden obtener de una fuente
bacteriana. En una forma de realización más preferida, las
secuencias promotoras se pueden obtener de una bacteria gram
positiva tal como una cepa de Bacillus, por ejemplo, una cepa
de Bacillus agaradherens, Bacillus alkalophilus, Bacillus
amyloliquefaciens, Bacillus brevis, Bacillus circulans, Bacillus
clausii, Bacillus coagulans, Bacillus firmus, Bacillus lautus,
Bacillus lentus, Bacillus licheniformis, Bacillus megaterium,
Bacillus pumilus, Bacillus stearothermophilus, Bacillus
subtilis, o Bacillus thuringiensis; o una cepa de
Streptomyces, por ejemplo, Streptomyces lividans o
Streptomyces murinus; o de una bacteria gram negativa, por
ejemplo, E. coli o Pseudomonas sp.
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Ejemplos de promotores adecuados para dirigir la
transcripción de una secuencia de ácidos nucleicos en los métodos de
la presente invención son los promotores obtenidos del operón lac en
E. coli, gen de agarasa de Streptomyces coelicolor
(dagA), gen de proteasa alcalina (aprH) de Bacillus
lentus o Bacillus clausii, gen de proteasa alcalina de
Bacillus licheniformis (gen de subtilisina Carlsberg), gen de
levansucrasa (sacB) de Bacillus subtilis, gen de
alfa-amilasa (amyE) de Bacillus
subtilis, gen de alfa-amilasa (amyL) de
Bacillus licheniformis, gen de amilasa maltogénica
(amyM) de Bacillus stearothermophilus, gen de
alfa-amilasa de Bacillus amyloliquefaciens
(amyQ), gen de penicilinasa de Bacillus licheniformis
(penP), genes xylA y xylB de Bacillus
subtilis, gen CryIIIA de Bacillus thuringiensis
subesp. tenebrionis (cryIIIA) o partes del mismo, gen
procariota de beta-lactamasa
(Villa-Kamaroff et al., 1978, Proceedings of
the National Academy of Sciences USA 75: 3727-3731).
Otros ejemplos son el promotor del bacteriófago spo1 y el promotor
tac (DeBoer et al., 1983, Proceedings of the National Academy
of Sciences USA 80:21-25). Otros promotores son
descritos en "Useful proteins from recombinant bacteria" en
Scientific American, 1980, 242:74-94; y en Sambrook,
Fritsch, y Maniatus, 1989, Molecular Cloning, A Laboratory Manual,
2a edición, Cold Spring Harbor, Nueva York.
El promotor puede también ser un promotor de
"consenso" que tiene la secuencia TTGACA para la región
"-35" y TATAAT para la región "-10". El promotor de
consenso se puede obtener de cualquier promotor que pueda funcionar
en una célula huésped de Bacillus. La construcción de un
promotor de "consenso" se puede realizar mediante mutagénesis
dirigida para crear un promotor que se ajuste más perfectamente a
las secuencias de consenso establecidas para las regiones "-10"
y "-35" de los promotores vegetativos "tipo sigma A" para
Bacillus subtilis (Voskuil et al., 1995, Molecular
Microbiology 17: 271-279).
En una forma de realización preferida, el
promotor de "consenso" se obtiene de un promotor obtenido del
operón lac de E. coli, gen de agarasa (dagA) de
Streptomyces coelicolor, Bacillus clausii o gen de proteasa
alcalina (aprH) de Bacillus lentus, gen de proteasa
alcalina de Bacillus licheniformis (gen de subtilisina
Carlsberg), gen de levansucrasa (sacB) de Bacillus
subtilis, gen de alfa-amilasa de Bacillus
subtilis (amyE), gen de alfa-amilasa
(amyL) de Bacillus licheniformis, gen de amilasa
maltogénica (amyM) de Bacillus stearothermophilus, gen
de alfa-amilasa (amyQ) de Bacillus
amyloliquefaciens, gen de penicilinasa (penP) de
Bacillus licheniformis, genes xylA y xylB de
Bacillus subtilis, gen CryIIIA de Bacillus
thuringiensis subsp. tenebrionis (cryIIIA) o partes de los
mismos, o gen de beta-lactamasa procariótica del
promotor de bacteriófago spo1. En una forma de realización más
preferida, el promotor de "consenso" se obtiene de genes de
alfa-amilasa (amyQ) de Bacillus
amyloliquefaciens.
Widner, et al., patentes estadounidenses
Nos. 6.255.076 y 5.955.310 describen promotores tándem y constructos
y métodos para su uso en la expresión en células de Bacillus,
incluyendo el promotor de consenso corto amyQ (también
llamado scBAN). También se describe en estos documentos el uso de la
secuencia estabilizadora cryIIIA y constructos que usan la secuencia
para una producción mejorada en Bacillus.
Cada secuencia promotora del promotor tándem
puede ser cualquier secuencia de ácidos nucleicos que muestra
actividad transcripcional en la célula de Bacillus a elegir
incluyendo un promotor mutante, truncado e híbrido, y se pueden
obtener de genes que codifican polipéptidos extracelulares o
intracelulares, bien homólogos o heterólogos a la célula de
Bacillus. Cada secuencia promotora puede ser nativa o externa
a la secuencia de ácidos nucléicos que codifica el polipéptido y
nativa o externa a la célula de Bacillus. Las secuencias
promotoras pueden ser las mismas secuencias promotoras o secuencias
promotoras diferentes.
Las dos o más secuencias promotoras del promotor
tándem pueden promover simultáneamente la transcripción de la
secuencia de ácidos nucléicos. Alternativamente, una o más
secuencias promotoras del promotor tándem pueden promover la
transcripción de la secuencia de ácidos nucléicos a estadios
diferentes de crecimiento de la célula de bacillus.
En una forma de realización preferida, el
promotor en serie contiene al menos el promotor amyQ del gen
de alfa-amilasa de Bacillus
amyloliquefaciens. En otra forma de realización preferida, el
promotor en serie contiene al menos un promotor de "consenso"
que tiene la secuencia TTGACA para la región "-35" y TATAAT
para la región "-10". En otra forma de realización preferida,
el promotor tándem contiene al menos el promotor de amyL del
gen alfa-amilasa de Bacillus licheniformis.
En otra forma de realización preferida, el promotor tándem contiene
al menos el promotor cryIIIA o partes del mismo (Agaisse y
Lereclus, 1994, Molecular Microbiology
13:97-107).
En una forma de realización más preferida, el
promotor tándem contiene al menos el promotor amyL y el
promotor cryIIIA. En otra forma de realización más preferida,
el promotor en serie contiene al menos el promotor amyQ y el
promotor cryIIIA. En otra forma de realización más preferida,
el promotor en serie contiene al menos un promotor de
"consenso" que tiene la secuencia TTGACA para la región
"-35" y TATAAT para la región "-10", y el promotor
cryIIIA. En otra forma de realización más preferida, el
promotor tándem contiene al menos dos copias del promotor de
amyL. En otra forma de realización más preferida, el promotor
en serie contiene al menos dos copias del promotor amyQ. En
otra forma de realización más preferida, el promotor en serie
contiene al menos dos copias de un promotor de "consenso" que
tiene la secuencia TTGACA para la región "-35" y TATAAT para la
región "-10". En otra forma de realización más preferida, el
promotor tándem contiene al menos dos copias del promotor
cryIIIA.
\global\parskip1.000000\baselineskip
"Una secuencia de procesamiento/estabilizadora
de ARNm" es definida aquí como una secuencia localizada en
sentido descendente de una o más secuencias promotoras y en sentido
ascendente de una secuencia codificante a la que cada secuencia
promotora, una o más, están operativamente enlazadas de manera que
todos los ARNms sintetizados de cada secuencia promotora se pueden
procesar para generar transcritos de ARNm con una secuencia
estabilizadora en el extremo 5' de los transcritos. La presencia de
tal secuencia estabilizadora en el extremo 5' en los transcritos de
ARNm aumenta su vida media (Agaisse y Lereclus, 1994, supra,
Hue et al., 1995, Journal of Bacteriology 177:
3465-3471). La secuencia de
procesamiento/estabilizadora de ARNm es complementaria al extremo 3'
de un ARN ribosómico 16S bacteriano. En una forma de realización
preferida del método, la secuencia de procesamiento/estabilizadora
de ARNm genera esencialmente transcritos monotamaño con una
secuencia estabilizante en el extremo 5' de los transcritos. La
secuencia de procesamiento/estabilizante de ARNm es preferiblemente
una, que es complementaria al extremo 3' de un ARN ribosómico 16S
bacteriano. Ver patentes estadounidenses n.05 6.255.076 y
5.955.310.
En una forma de realización más preferida, la
secuencia de procesamiento/estabilizadora de ARNm es la secuencia de
procesamiento/estabilizadora de ARNm cryIIA de Bacillus
thuringiensis descrita en WO 94/25612 y Agaisse y Lereclus,
1994, supra, o partes de las mismas que retienen la función
de procesamiento/estabilizante del ARNm. En otra forma de
realización más preferida, la secuencia de
procesamiento/estabilizante del ARNm es la secuencia de
procesamiento/estabilizante de ARNm SP82 de Bacillus subtilis
descrita en Hue et al., 1995, supra, o partes de las
mismas que retienen la función de procesamiento/estabilizante del
ARNm.
Cuando el promotor cryIIIA y su secuencia
de procesamiento/estabilizante de ARNm se emplean en los métodos de
la presente invención, se puede utilizar un fragmento de ADN que
contiene la secuencia descrita en WO 94/25612 y Agaisse y Lereclus,
1994, supra, o partes de las mismas que retienen el promotor
y funciones de procesamiento/estabilizante del ARNm. Además, se
pueden preparar fragmentos de ADN que contienen sólo el promotor
cryIIIA o sólo la secuencia cryIIIA de
procesamiento/estabilizante de ARNm usando métodos conocidos en la
técnica para construir varios promotores tándem y combinaciones de
secuencia de procesamiento/estabilizante de ARNm. En esta forma de
realización, el promotor cryIIIA y su secuencia de
procesamiento/estabilizante de ARNm se colocan preferiblemente en
sentido descendente de la(s) otra(s)
secuencia(s) promotora(s) constituyendo el promotor
tándem y en sentido ascendente de la secuencia codificante del gen
de interés.
La secuencia de ácidos nucleicos aislada que
codifica la(s) enzima(s) deseada(s)
implicada(s) en la producción de ácido hialurónico puede
entonces ser manipulada posteriormente para mejorar la expresión de
la secuencia de ácidos nucleicos. Se entenderá que la expresión
incluye cualquier paso implicado en la producción del polipéptido,
incluyendo, pero sin limitarse a, transcripción, modificación
postranscripcional, traducción, modificación postraduccional y
secreción. Las técnicas para modificar secuencias de ácidos
nucleicos utilizando métodos de clonación son bien conocidas en la
técnica.
Un constructo de ácidos nucléicos que comprende
una secuencia de ácidos nucleicos que codifica una enzima puede
estar operativamente enlazado a una o más secuencias de control
capaces de dirigir la expresión de la secuencia codificante en una
célula de Bacillus en condiciones compatibles con las
secuencias de control.
El término "secuencias de control" se
define aquí incluyendo todos los componentes que son necesarios o
ventajosos para la expresión de la secuencia codificante de una
secuencia de ácidos nucleicos. Cada secuencia de control puede ser
nativa o externa a la secuencia de ácidos nucleicos que codifica la
enzima. Además de las secuencias promotoras anteriormente descritas,
tales secuencias de control incluyen, pero no se limitan a, una
secuencia líder, una secuencia señal y un terminador de
transcripción. Como mínimo, las secuencias de control incluyen un
promotor y señales de parada traduccionales y transcripcionales. Las
secuencias de control pueden estar provistas de enlazadores con el
propósito de introducir sitios de restricción específicos que
faciliten la ligadura de las secuencias de control con la región
codificante de la secuencia de ácidos nucleicos que codifica una
enzima.
La secuencia de control puede también ser una
secuencia del terminador de transcripción adecuada, una secuencia
reconocida por una célula de Bacillus para terminar la
transcripción. La secuencia del terminador está operativamente
enlazada al extremo 3' de la secuencia de ácidos nucleicos que
codifica la enzima o la última enzima de un operón. Cualquier
terminador que sea funcional en la célula de Bacillus elegida
se puede utilizar en la presente invención.
La secuencia de control puede también ser una
secuencia guía adecuada, una región no traducida de un ARNm que sea
importante para la traducción por la célula de Bacillus. La
secuencia guía está operativamente enlazada al extremo 5' de la
secuencia de ácidos nucleicos que codifica la enzima. Cualquier
secuencia guía que sea funcional en la célula de Bacillus
elegida se puede utilizar en la presente invención.
La secuencia de control puede también ser una
región codificante del péptido señal, que codifica una secuencia de
aminoácidos enlazados al amino terminal de un polipéptido que puede
dirigir el polipéptido expresado en la vía secretora de la célula.
La región codificante del péptido señal puede ser nativa al
polipéptido o se puede obtener de fuentes externas. El extremo 5' de
la secuencia codificante de la secuencia de ácidos nucleicos puede
contener intrínsecamente una región codificante del péptido señal
naturalmente enlazado en el marco de lectura de traducción con el
segmento de la región codificante que codifica el polipéptido
segregado. Alternativamente, el extremo 5' de la secuencia
codificante puede contener una región codificante del péptido señal
que es externa a esa parte de la secuencia codificante que codifica
el polipéptido segregado. La región codificante del péptido señal
exógeno puede ser requerida cuando la secuencia codificante no
contiene normalmente una región codificante del péptido señal.
Alternativamente, la región codificante del péptido señal externo
puede simplemente reemplazar la región codificante del péptido señal
natural para obtener una secreción mejorada del polipéptido en
relación con la región codificante del péptido señal natural
normalmente asociada a la secuencia codificante. La región
codificante del péptido señal se puede obtener de un gen amilasa o
proteasa de una especie de Bacillus. No obstante, cualquier
región codificante del péptido señal capaz de dirigir el polipéptido
expresado en la vía secretora de una célula de Bacillus a
elegir se puede utilizar en la presente invención.
Una región codificante del péptido señal eficaz
para células de Bacillus es la región codificante del péptido
señal obtenida del gen de amilasa maltogénica de Bacillus
NCIB 11837, el gen de alfa-amilasa de Bacillus
stearothermo- philus, el gen de subtilisina de
Bacillus licheniformis, el gen de
beta-lactamasa de Bacillus licheniformis, los
genes de proteasas neutras de Bacillus stearothermophilus
(nprT, nprS, nprM) y el gen prsA de Bacillus
subtilis. Además péptidos señal son descritos por Simonen y
Palva, 1993, Microbiological Reviews 57:109-137.
La secuencia de control puede también ser una
región codificante del propéptido que codifica una secuencia de
aminoácidos situada en el amino terminal de un polipéptido. El
polipéptido resultante es conocido como proenzima o propolipéptido
(o zimógeno en algunos casos). Un propolipéptido está generalmente
inactivo y se puede convertir en un polipéptido maduro activo
mediante la escisión catalítica o autocatalítica del propéptido del
propolipéptido. La región codificante del propéptido se puede
obtener de los genes para proteasa alcalina de Bacillus
subtilis (aprE) y proteasa neutra de Bacillus
subtilis (nprT).
Cuando ambos péptidos señal y regiones de
propéptido están presentes en el amino terminal de un polipéptido,
la región del propéptido está situada junto al amino terminal de un
polipéptido y la región de péptido señal está situada junto al
término amino de la región del propéptido.
También se puede desear añadir secuencias
reguladoras que permitan la regulación de la expresión del
polipéptido en relación al crecimiento de la célula huésped.
Ejemplos de sistemas reguladores son aquellos que causan la
expresión del gen para ser activado o desactivado en respuesta a un
estímulo físico o químico, incluyendo la presencia de un compuesto
regulador. Sistemas reguladores en sistemas procariotas incluyen los
sistemas operadores lac, tac, y trp.
\vskip1.000000\baselineskip
En los métodos de la presente invención, un
vector de expresión recombinante que comprende una secuencia de
ácidos nucleicos, un promotor y señales de parada traduccionales y
transcripcionales se puede utilizar para la producción recombinante
de una enzima implicada en la producción de ácido hialurónico. Las
diferentes secuencias de ácidos nucleicos y de control anteriormente
descritas se pueden unir para producir un vector de expresión
recombinante que puede incluir uno o más sitios de restricción
convenientes para permitir la inserción o sustitución de la
secuencia de ácidos nucleicos que codifica el polipéptido o enzima
en tales sitios. Alternativamente, la secuencia de ácidos nucleicos
se puede expresar mediante la inserción de la secuencia de ácidos
nucleicos o de un constructo de ácidos nucleicos que comprende la
secuencia en un vector apropiado para la expresión. Al crear el
vector de expresión, la secuencia codificante se localiza en el
vector de modo que la secuencia codificante está operativamente
enlazada con las secuencias de control apropiadas para la expresión
y posible secreción.
El vector de expresión recombinante puede ser
cualquier vector que puede ser convenientemente sometido a
procedimientos de ADN recombinante y pueden provocar la expresión de
la secuencia de ácidos nucleicos. La elección del vector dependerá
típicamente de la compatibilidad del vector con la célula de
Bacillus en la que se ha de introducir el vector. Los vectores
pueden ser plásmidos circulares, lineales o cerrados. El vector
puede ser un vector de replicación autónoma, es decir, un vector que
existe como entidad extracromosómica cuya replicación es
independiente de la replicación cromosómica, por ejemplo, un
plásmido, un elemento extracromosómico, un minicromosoma o un
cromosoma artificial. El vector puede contener cualquier medio para
asegurar la autorreplicación. Alternativamente, el vector puede ser
uno que, cuando se introduce en la célula de Bacillus, se
integra en el genoma y se replica junto con el/los
cromosoma(s) en el/los que ha sido integrado. El sistema de
vectores lo puede componer un único vector o plásmido, o dos o más
vectores o plásmidos que juntos contienen el ADN total a introducir
en el genoma de la célula de Bacillus, o se puede usar un
transposón.
Los vectores contienen preferiblemente
un(os) elemento(s) que permite(n) la
integración del vector en el genoma de la célula huésped de
Bacillus o la replicación autónoma del vector en la célula
independiente del genoma.
Para la integración en el genoma de la célula
huésped, el vector puede depender de la secuencia de ácidos
nucleicos que codifica el polipéptido o cualquier otro elemento del
vector para la integración del vector en el genoma mediante
recombinación homóloga o no homóloga. Alternativamente, el vector
puede contener secuencias de ácidos nucleicos adicionales para
dirigir la integración mediante recombinación homóloga en el genoma
de la célula de Bacillus. Las secuencias de ácidos nucleicos
adicionales permiten al vector integrarse en el genoma celular de
Bacillus en una ubicación precisa dentro del cromosoma. Para
aumentar la probabilidad de integración en una ubicación precisa,
los elementos integracionales deberían contener preferiblemente un
número suficiente de ácidos nucleicos, tal como de 100 a 1.500 pares
de bases, preferiblemente de 400 a 1.500 pares de bases, y de la
forma más preferible de 800 a 1.500 pares de bases, que son
altamente homólogos a la secuencia objetivo correspondiente para
mejorar la probabilidad de recombinación homóloga. Los elementos
integracionales pueden ser cualquier secuencia que sea homóloga a la
secuencia objetivo en el genoma de la célula de Bacillus.
Además, los elementos integracionales pueden ser codificantes o no
codificantes de secuencias de ácidos nucleicos. En cambio, el vector
se puede integrar en el genoma de la célula huésped mediante
recombinación no homóloga.
Para la replicación autónoma, el vector puede
comprender además un origen de replicación que permita al vector
replicarse de manera autónoma en la célula de Bacillus en
cuestión. Ejemplos de orígenes bacterianos de replicación son los
orígenes de replicación de los plásmidos pUB110; pE194; pTA1060, y
pAMB1 que permiten la replicación en Bacillus. El origen de
replicación puede ser uno que tenga una mutación para realizar su
función termosensible en la célula de Bacillus (ver, por
ejemplo, Ehrlich, 1978, Proceedings of the National Academy of
Sciences EEUU 75:1433).
Los vectores contienen preferiblemente uno o más
marcadores seleccionables que permiten una selección fácil de
células transformadas. Un marcador seleccionable es un gen cuyo
producto proporciona resistencia biocida, resistencia a metales
pesados, prototrofía a auxótrofos y similares. Ejemplos de
marcadores seleccionables bacterianos son los genes dal de
Bacillus subtilis o Bacillus licheniformis, o
marcadores que confieren resistencia antibiótica tales como
ampicilina, canamicina, cloranfenicol o resistencia a la
tetraciclina. Además, la selección se puede realizar mediante
cotransformación, por ejemplo, como se describe en WO 91/09129,
donde el marcador seleccionable está en un vector separado.
Más de una copia de una secuencia de ácidos
nucleicos se puede insertar en la célula huésped para aumentar la
producción del producto genético. Un aumento en el número de copias
de la secuencia de ácidos nucleicos se puede obtener integrando al
menos una copia adicional de la secuencia en el genoma de la célula
huésped o incluyendo un gen marcador seleccionable amplificable con
la secuencia de ácidos nucléicos, donde las células contienen copias
amplificadas del gen marcador seleccionable, y así se pueden
seleccionar copias adicionales de la secuencia de ácidos nucléicos
para cultivar las células en presencia del agente seleccionable
apropiado. Un método conveniente para conseguir la amplificación de
secuencias de ADN genómico se describe en WO 94/14968.
Los procedimientos usados para enlazar los
elementos anteriormente descritos para construir los vectores de
expresión recombinantes son conocidos por los expertos en la materia
(ver, por ejemplo, Sambrook et al., 1989, supra).
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En los métodos de la presente invención, las
células huéspedes de Bacillus se cultivan en un medio
nutritivo adecuado para la producción del ácido hialurónico usando
métodos conocidos en la técnica. Por ejemplo, la célula se puede
cultivar mediante cultivo en matraz de agitación, fermentación a
pequeña escala o gran escala (incluyendo fermentación continua, en
lote, en flujo discontinuo o en estado sólido) en fermentadores de
laboratorio o industriales realizados en un medio adecuado y en
condiciones que permitan la expresión de las enzimas implicadas en
la síntesis del ácido hialurónico y la separación del ácido
hialurónico. El cultivo se desarrolla en un medio nutritivo adecuado
que comprende fuentes de nitrógeno y carbono y sales inorgánicas,
usando procedimientos conocidos en la técnica. Medios adecuados
están disponibles de proveedores comerciales o se pueden preparar
según composiciones publicadas (p. ej., en catálogos de la American
Type Culture Collection). El ácido hialurónico segregado puede ser
recuperado directamente del medio.
El ácido hialurónico resultante se puede aislar
mediante métodos conocidos en la técnica. Por ejemplo, el ácido
hialurónico puede ser aislado del medio nutritivo mediante
procedimientos convencionales incluyendo, pero sin limitarse a,
centrifugado, filtración, extracción, secado por pulverización,
evaporación o precipitación. El ácido hialurónico aislado puede ser
además purificado posteriormente mediante una variedad de
procedimientos conocidos en la técnica incluyendo, pero sin
limitarse a, cromatografía (p. ej., intercambio iónico, de afinidad,
hidrofóbico cromatoenfoque y de exclusión de tamaño), procedimientos
electroforéticos (p. ej., isoelectroenfoque preparatorio),
solubilidad diferencial (p. ej., precipitación de sulfato amónico) o
extracción (ver, por ejemplo, Protein Purification, J.-C. Janson y
Lars Ryden, editors, VCH Publishers, Nueva York, 1989).
En los métodos de la presente invención, las
células huéspedes de Bacillus producen más de aproximadamente
4 g de ácido hialurónico por litro, preferiblemente más de
aproximadamente 6 g, más preferiblemente más de aproximadamente 8 g,
incluso más preferiblemente más de aproximadamente 10 g, y de la
forma más preferible más de aproximadamente 12 g de ácido
hialurónico por litro.
\vskip1.000000\baselineskip
La deleción o técnicas de sustitución de genes
se pueden utilizar para la eliminación completa de un gen marcador
seleccionable u otro gen indeseable. En tales métodos, la deleción
del gen marcador seleccionable puede ser realizada mediante
recombinación homóloga usando un plásmido que ha sido construido
para contener de manera contigua las regiones 5' y 3' que flanquean
el gen marcador seleccionable. Las regiones contiguas 5' y 3' se
pueden introducir en una célula de Bacillus en un plásmido
termosensible, por ejemplo, pE194, en asociación con un segundo
marcador seleccionable a una temperatura permisiva para permitir al
plásmido establecerse en la célula. La célula se desplaza luego a
una temperatura no permisiva para seleccionar las células que tienen
el plásmido integrado en el cromosoma en una de las regiones
flanqueantes homólogas. La selección para la integración del
plásmido se efectúa mediante la selección de un segundo marcador
seleccionable. Después de la integración, se fomenta un evento de
recombinación en la segunda región flanqueante homóloga mediante el
desplazamiento de las células a la temperatura permisiva para
diferentes generaciones sin selección. Las células son blindadas
para obtener colonias individuales y las colonias son examinadas
para la pérdida de ambos marcadores seleccionables (ver, por
ejemplo, Perego, 1993, en A.L. Sonneshein, J.A. Hoch, y R. Losick,
editors, Bacillus subtilis and Other Gram-Positive
Bacteria, Capítulo 42, American Society of Microbiology, Washington,
D.C., 1993).
Un gen marcador seleccionable puede también ser
eliminado mediante recombinación homóloga introduciendo en la célula
mutante un fragmento de ácido nucleico que comprenda las regiones 5'
y 3' del gen defectuoso, pero sin el gen marcador seleccionable, y a
continuación seleccionando el medio de contraselección. Mediante la
recombinación homóloga, el gen defectuoso que contiene el gen
marcador seleccionable es sustituido con el fragmento de ácido
nucleico que no tiene el gen marcador seleccionable. Otros métodos
conocidos en la técnica también pueden ser usados.
La patente estadounidense n.º 5.891.701 divulga
técnicas para eliminar diferentes genes incluyendo spoIIAC, aprE,
nprE, y amyE.
Otros compuestos biológicos indeseables pueden
también ser eliminados mediante los métodos descritos anteriormente
tales como el pigmento rojo sintetizado por cypX (n.º de
acceso BG12580) y/o yvmC (n.º de acceso BG14121).
En una forma de realización preferida, la célula
huésped de Bacillus se desmarca con cualquier marcador
seleccionable heterólogo o exógeno. En otra forma de realización
preferida, la célula huésped de Bacillus no produce ningún
pigmento rojo sintetizado por cypX y yvmC.
\vskip1.000000\baselineskip
Una cepa de Bacillus recombinante fue
construida como se describe en detalle en WO 2003054163. Esta cepa
fue luego cultivada de la siguiente manera: primero una fase de
semilla en agar a una temperatura constante, luego una fase de
semilla en un tanque agitado a temperatura constante y finalmente
una fermentación principal de flujo continuo en un tanque agitado a
una temperatura inicial favorable para el crecimiento de la cepa de
Bacillus, por ejemplo a 37ºC. Más tarde, después de la
iniciación, la temperatura de fermentación se aumentó o disminuyó en
experimentos separados a otras temperaturas varias de conjunto en la
gama de 17-52ºC. La temperatura se mantuvo luego
constante durante un periodo de 7 h, siguiendo la iniciación de la
fase de flujo continuo.
La cepa de Bacillus fue fermentada en
pequeños fermentadores estándar en un medio que por litro contenía
6,5 g de KH2PO4, 4,5 g de Na2HPO4, 3,0 g de (NH4)2SO4, 2,0 g
de Na3-citrato-2H2O, 3,0 g de MgSO4,
7H2O, 6,0 ml de Mikrosoy-2, 0,15 mg de biotina (1 ml
de 0,15 mg/ml etanol), 15,0 g de sacarosa, 1,0 ml de SB 2066, 2,0 ml
de P2000, 0,5 g de CaCl2\cdot2H2O. El medio fue pH 6.3 a 6.4 (sin
ajustar) antes de la autoclavizacíón. El CaCl2\cdot2H2O fue
añadido después del sometimiento a autoclave.
El medio de semilla usado fue
B-3, es decir, Agar-3 sin agar, o
medio "S/S-1". El medio Agar-3
contenía por litro 4,0 g de caldo nutritivo, 7,5 g de proteína
hidrolizada, 3,0 g de extracto de levadura, 1,0 g de glucosa y 2% de
agar. El pH no fue ajustado; el pH antes del sometimiento a
autoclave era aproximadamente 6.8; después del sometimiento a
autocalve era un pH 7.7 aproximadamente.
El medio de matraz de semilla de sacarosa/soja
(S/S-1) estaba compuesto por cada litro de 65 g de
sacarosa, 35 g de harina de soja, 2 g de
Na3-citrato-2H2O, 4 g de KH2PO4, 5 g
de Na2HPO4, y 6 ml de elementos traza. El medio fue ajustado a pH de
aproximadamente 7 con NaOH; después de la distribución del medio a
matraces, se añadió un 0,2% de aceite vegetal para suprimir la
formación de espuma. Los elementos traza estaban compuestos por
litro de 100 g de H2O ácido cítrico, 20 g de FeSO4\cdot7H2O, 5 g
de MnSO4 H2O, 2 g de CuSO4\cdot5H2O, y 2 g de ZnCl2.
El pH se ajustó a 6.8-7.0 con
amonio antes de la inoculación, y luego fue controlado a pH 7.0 +
0.2 con amonio y H3PO4. La temperatura se mantuvo a 37ºC. La
agitación fue de un máximo de 1300 r.p.m., usando dos turbinas
Rushton de 6 palas y 6 cm de diámetro en un tanque de 3 litros con
un volumen inicial de 1,5 litros. La aireación fue de un máximo de
1,5 MW.
Para la alimentación se usó una solución simple
de sacarosa. La alimentación empezó aproximadamente 4 horas después
de la inoculación, cuando el oxígeno disuelto (O.D.) estaba todavía
siendo conducido abajo (es decir, antes de la depleción de
sacarosa). La temperatura se cambió a una temperatura
preseleccionada más alta del orden de 37-52ºC. El
índice de alimentación se aumentó luego linealmente de 0 a
aproximadamente 6 g de sacarosa/LO-hr durante el
intervalo de tiempo de 7 horas. Un índice de alimentación inferior,
aumentado linealmente de 0 a aproximadamente 2 g de
sacarosa/LO-hr, fue también usado en algunas
fermentaciones.
\newpage
Se eliminaron células diluyendo 1 parte de
cultivo con 3 partes de agua, mezclando bien y centrifugando a
aproximadamente 30.000 x g para producir un claro sobrenadante y
gránulo celular, que se puede lavar y secar.
Ensayos de concentración de ácido hialurónico
fueron realizados usando el método ELISA, basado en una proteína de
enlace de hialuronano (proteína y equipos disponibles comercialmente
de Seikagaku America, Falmout, MA). Concentraciones de ácido
hialurónico fueron determinadas usando el método del carbazol
modificado (Bittery Muir, 1962, Anal Biochem. 4:
330-334).
Los pesos moleculares fueron determinados usando
un ensayo de GPC MALLS. Se reunieron datos de ensayos de GPC MALLS
usando el procedimiento siguiente. GPC-MALLS
(cromatografía de permeación en gel o de exclusión por tamaño unida
a dispersión de luz láser multiángulo) se utiliza generalmente para
calificar los polímeros con un peso molecular (PM) alto. La
separación de polímeros se consigue mediante cromatografía pg,
basada en la subdivisión diferencial de moléculas de diferente PM
entre eluyente y resina. El peso molecular promedio de un polímero
individual se determina mediante MALLS basado en la extensión/ángulo
de dispersión diferencial de moléculas de diferente PM. Los
principios de GPC-MALLS y protocolos adecuados para
el ácido hialurónico son descritos por Ueno et al., 1988,
Chem. Pharm. Bull. 36, 4971-4975; Wyatt, 1993, Anal.
Chim. Acta 272: 1-40; y Wyatt Technologies, 1999,
"Light Scattering University DAWN Course Manual" y "DAWN EOS
Manual" Wyatt Technology Corporation, Santa Barbara, California).
Se usó una HPLC Isocrática Agilent 1100, una columna Tosoh Biosep
G6000 PWxl para la cromatografía pg, y un Wyatt Down EOS para la
MALLS. Un detector de índice de refracción Agilent G1362A fue
enlazado abajo de la MALLS para determinar la concentración eluida.
Varios productos de ácido hialurónico comerciales con pesos
conocidos moleculares sirvieron como estándares.
Los resultados se muestran en la figura 1 como
las tendencias para el peso molecular medio al final de las
fermentaciones, como función de la temperatura de fermentación
final, que se ha mantenido constante durante 7 horas, como determinó
la GPC-MALLS. Sorprendentemente, la figura muestra
que un PM deseado se puede seleccionar mediante una atenta selección
y manipulación de las temperaturas de fermentación. Hay un PM máximo
a temperaturas bajas finales de 17ºC, y un PM mínimo a temperaturas
de fermentación altas finales de 52ºC.
Claims (21)
1. Método para la producción de un ácido
hialurónico con un peso molecular promedio bajo mediante
fermentación controlada de temperatura, incluyendo el método los
pasos de:
- (a)
- cultivo de una célula huésped recombinante de Bacillus a una primera temperatura propicia para su crecimiento, donde la célula huésped de Bacillus comprende un constructo de ácidos nucléicos que comprende una secuencia codificante de hialuronano sintasa operativamente enlazada a una secuencia promotora exógena a la secuencia codificante de hialuronano sintasa;
- (b)
- a continuación, cultivo de la célula huésped recombinante de Bacillus del paso (a) a una segunda temperatura superior a la primera temperatura del paso (a) según condiciones adecuadas para la producción del ácido hialurónico, donde la segunda temperatura es del orden de 40ºC-52ºC y al menos 5ºC superior a la primera temperatura, por lo cual la célula huésped de Bacillus produce ácido hialurónico con un peso molecular promedio deseado en la gama seleccionada del grupo de las gamas de peso molecular que consisten en 300-400 kDa, 400-500 kDa, 500-600 kDa, 600-700 kDa, 700-800 kDa; y
- (c)
- recuperación del ácido hialurónico.
\vskip1.000000\baselineskip
2. Método según la reivindicación 1, donde la
secuencia codificante de hialuronano sintasa codifica un Grupo I de
hialuronano sintasa.
3. Método según la reivindicación 1, donde la
secuencia de codificación de hialuronano sintasa codifica un Grupo
II de hialuronano sintasa.
4. Método según cualquiera de las
reivindicaciones 1-3, donde un azúcar precursor del
ácido hialurónico es suministrado o producido por la célula huésped
de Bacillus.
5. Método según la reivindicación 4, donde el
azúcar precursor es codificado por genes endógenos, por genes no
endógenos o por una combinación de genes endógenos y no endógenos en
la célula huésped de Bacillus.
6. Método según cualquiera de las
reivindicaciones 1-5, donde el constructo de ácidos
nucleicos comprende además uno o más genes que codifican enzimas en
la biosíntesis de un azúcar precursor del ácido hialurónico o la
célula huésped de Bacillus comprende además uno o más
segundos constructos de ácidos nucleicos que comprenden uno o más
genes que codifican enzimas en la biosíntesis de un azúcar precursor
del ácido hialurónico.
7. Método según la reivindicación 6, donde el
gen o genes son seleccionados del grupo que consiste en un gen de
UDP-glucosa 6-deshidrogenasa, gen de
UDP-glucosa pirofosforilasa, gen de
UDP-N-acetilglucosamina
pirofosforilasa, gen de
glucosa-6-fosfato-isomerasa,
gen de hexoquinasa, gen de fosfoglucomutasa, gen de
amidotransferasa, gen de mutasa y gen de acetiltransferasa.
8. Método según la reivindicación 7, donde el
gen de UDP-glucosa 6-deshidrogenasa
es un gen hasB o un gen tuaD; u homólogos de los
mismos.
9. Método según la reivindicación 7, donde el
gen de UDP-glucosa pirofosforilasa es un gen
hasC o un gen gtaB; u homólogos de los mismos.
10. Método según la reivindicación 7, donde el
gen de UDP-N-acetilglucosamina
pirofosforilasa es un gen hasD o un gen gcaD; u
homólogos de los mismos.
11. Método según la reivindicación 7, donde el
gen de
glucosa-6-fosfato-isomerasa
es un gen hasE o un homólogo del mismo.
12. Método según cualquiera de las
reivindicaciones 6-11, donde el gen o genes que
codifican un azúcar precursor están bajo el control del
mismo(s) promotor(es) o uno(s)
diferente(s) que la secuencia codificante de hialuronano
sintasa.
13. Método según la reivindicación 12, donde
la(s) misma(s) o diferente(s)
secuencia(s) promotora(s) es un promotor tándem en el
que cada promotor del promotor tándem está operativamente enlazado a
la secuencia codificante de hialuronano sintasa.
14. Método según cualquiera de las
reivindicaciones 1-13, donde el constructo de ácidos
nucleicos comprende además una secuencia de
procesamiento/estabilizante de ARNm localizada bajo la secuencia
promotora y en sentido ascendente de la secuencia codificante de
hialuronano sintasa.
\newpage
15. Método según la reivindicación 14, donde el
constructo de ácidos nucleicos comprende además una secuencia de
procesamiento/estabilizante de ARNm localizada bajo un promotor
diferente o promotores diferentes del gen o genes que codifican
enzimas en la biosíntesis del azúcar precursor y en sentido
ascendente del gen o genes.
16. Método según cualquiera de las
reivindicaciones 1-15, donde la célula huésped de
Bacillus es seleccionada del grupo que consiste en
Bacillus agaradherens, Bacillus alkalophilus, Bacillus
amyloliquefaciens, Bacillus brevis, Bacillus circulans, Bacillus
clausii, Bacillus coagulans, Bacillus firmus, Bacillus lautus,
Bacillus lentus, Bacillus licheniformis, Bacillus megaterium,
Bacillus pumilus, Bacillus stearothermophilus, Bacillus subtilis
y Bacillus thuringiensis.
17. Método según cualquiera de las
reivindicaciones 1-16, donde el constructo de ácidos
nucleicos comprende un gen de hialuronano sintasa, un gen de
UDP-glucosa 6-deshidrogenasa y un
gen de UDP-glucosa pirofosforilasa operativamente
enlazados a un promotor de "consenso" corto de amyQ que
tiene la secuencia TTGACA para la región "-35" y TATAAT para la
región "-10".
18. Método según cualquiera de las
reivindicaciones 1-17, donde la célula huésped de
Bacillus contiene un gen cypX y/o yvmC
delecionado o alterado .
19. Método según cualquiera de las
reivindicaciones 1-18, donde la primera temperatura
está en la gama de 30ºC-40ºC.
20. Método según cualquiera de las
reivindicaciones 1-19, donde el paso de cultivar a
la segunda temperatura requiere al menos un 20% del total del tiempo
de cultivo.
21. El método según cualquiera de las
reivindicaciones 1-20, donde la segunda temperatura
es suficientemente superior a la primera temperatura para permitir a
la célula huésped de Bacillus producir ácido hialurónico con
un peso molecular promedio deseado en una gama seleccionada del
grupo de gamas de peso molecular que consisten en
300-350 kDa, 350-400 kDa,
400-450 kDa, 450-500 kDa,
500-550 kDa, 550-600 kDa,
600-650 kDa, 650-700 kDa,
700-750 kDa, y 750-800 kDa.
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