ES2444438T3 - Compuestos de diadenosina antibacterianos - Google Patents
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Abstract
Compuesto de la formula (I):**Fórmula** en donde R1 es H, alquilo C2-C6, alquenilo, o alquinilo C2-C6, donde dicho alquilo, alquenilo o alquinilo es opcionalmentesustituido por SR5, NR5R5A o OR5; R2 es H, F, Cl, Br, I, OR6, o NHR7; R3 es H, Cl, Br, F, I, OR8, o NHR9; R4 es H, Cl, Br, F, I, CH3, SCH2COOH, SR10, SeR11, CH2R12, CCR13, o CH>=CHR14; X1 es -S-, -Se-, -CH2-, -CH>=CH-, o -CC-; X2 es alquileno C1-C4, alquenileno C2-C4, o alquinileno C2-C4; X3 es -NHC(>=O)-, -C(>=O)NH-, -NR15-, -SO2NH- -NHSO2- -CH2-, -O-, - S-; Z es R5, R5A, R6, R7, R8, R9, R15 se seleccionan, cada uno independientemente, de H, alquilo C1-C6, alquenilo C2-C6, oalquinilo C2-C6; R10, R11, R12, R13 y R14 se seleccionan, cada uno independientemente, de alquilo C1-C6, alquenilo C2-C6, o alquiniloC2-C6; R16 es OH, NH2, N3 o OCH2CCH; y las formas tautomericas, esteroisomericas, mezclas de formas esteroisomericas o formas de salesfarmaceuticamente aceptables de los mismos.
Description
Compuestos de diadenosina antibacterianos
La presente invención hace referencia a compuestos para su uso en la prevención y/o tratamiento de infecciones bacterianas, composiciones farmacéuticas que los comprenden, y procesos para la preparación de los mismos.
La búsqueda de nuevos compuestos antibacterianos se ha convertido en algo cada vez más importante con la aparición de la resistencia a los antibióticos a nivel mundial (1).
A este respecto, las NAD quinasas (NADKs, EC 2.7.1.23) representan una diana farmacológica novedosa y atractiva para el descubrimiento de antibióticos. Las NDKs son enzimas ubicuas implicadas en la última etapa de la biosíntesis de NADP que cataliza la transferencia de un grupo fosfato en el sustrato NAD para producir NADP en presencia tanto de ATP como de Mg2+. Las NADK están también implicadas en la estrecha regulación de la relación NADH/NADPH (8). Tanto el NAD(P) como el NAD(P)H son cofactores esenciales para un gran número de enzimas implicadas en diversas vías metabólicas, tales como las oxidorreductasas. Por lo tanto, no resulta sorprendente que se haya mostrado recientemente que las NADK son esenciales para el crecimiento de muchas bacterias (2-4), incluyendo diversos patógenos humando tales como Mycobacterium tuberculosis (5), Staphylococcus aureus (6), Streptococcus pneumoniae (7), Salmonella entérica (8), y Pseudomonas aeruginosa. Además, aunque la actividad de las NADK se ha conocido bien durante décadas, no ha sido hasta hace poco que sus genes fueron clonados (9), lo que ha conducido posteriormente a la rápida identificación de ortólogos de NADK en diversos organismos de bacterias, arqueas, plantas, y humanos (Pfam PF01513). De manera ventajosa, se ha mostrado que las enzimas bacterianas y humanas muestran divergencias secuenciales y funcionales significativas, y la actividad de NDAK en células humanas es baja (10). Los inhibidores de las NADK, por lo tanto, resultarían ser de utilidad como antibióticos, justificando de ese modo la búsqueda de tales inhibidores.
Se ha informado, así, recientemente que la di-5’-tioadenosina (DTA) es un inhibidor sintético de la NADk de la Listeria monocytogenes (11). Este compuesto inhibe la NADK con una afinidad micromolar (Ki " 0.02 mM). Sin embargo, su actividad antibacteriana, y por lo tanto su potencial eficacia, como antibiótico no ha sido evaluada.
Por consiguiente, es un objeto de la presente invención proporcionar compuestos alternativos útiles para el tratamiento de infecciones bacterianas.
La presente invención por tanto se dirige, en un aspecto, a diversos compuestos de la estructura:
y sus formas tautoméricas, esteroisómeras, mezclas de formas esteroisómeras, o formas de sales farmacéuticamente aceptables de las mismas, en donde los elementos constituyentes se definen como infra.
Otro objeto de la presente invención es proporcionar composiciones farmacéuticas que comprenden los compuestos de la presente invención, en donde las composiciones comprenden uno o más excipientes farmacéuticamente aceptables y una cantidad terapéuticamente efectiva de al menos uno de los compuestos de la presente invención, o una sal farmacéuticamente aceptable de los mismos.
Otro objeto de la presente invención es proporcionar compuestos de la fórmula (I) para su uso en la prevención y/o tratamiento de infecciones bacterianas.
Otro objeto de la presente invención es proporcionar métodos para el tratamiento o la prevención de infecciones bacterianas que comprenden la administración de una cantidad terapéuticamente efectiva de un compuesto de la fórmula (I) a un paciente en necesidad del mismo.
Estos y otros objetos, características y ventajas de los compuestos de la fórmula (I) se revelarán en la siguiente descripción detallada de la revelación de la patente.
Compuestos de la fórmula (I)
En un primer objeto, la presente invención proporciona compuestos de la fórmula (I):
en donde
10 R1 es H, alquenilo C1-C6, o alquinilo C2-C6, donde dicho alquilo, alquenilo o alquinilo es opcionalmente sustituido por SR5, NR5R5A o OR5; R2 es H, F, Cl, Br, I, OR6, o NHR7; R3 es H, Cl, Br, F, I, OR8, o NHR9; R4 es H, Cl, Br, F, I, CH3, SCH2COOH, SR10, SeR11, CH2R12, C=CR13, o CH=CHR14;
15 X1 es -S-, -Se-, -CH2-, -CH=CH-, o -C=C-; X2 es alquileno C1-C4, alquenileno C2-C4, o alquinileno C2-C4; X3 es -NHC(=O)-, -C(=O)NH-, -NR15-, -SO2NH- -NHSO2- -CH2-, -O-, - S-; Z es
R10, R11, R12, R13 y R14 se seleccionan, cada uno independientemente, de H, alquilo C1-C6, alquenilo C2-C6, o alquinilo C2-C6;
R16 es H, F, Cl, Br, I, OH, NH2, N3 o OCH2C=CH;
y las formas tautoméricas, esteroisoméricas, mezclas de formas esteroisoméricas o formas de sales
farmacéuticamente aceptables de los mismos.
En ciertos aspectos, se incluyen compuestos de la fórmula (Ia):
en donde R1, R2, R3, R7, R4, X2, X3 y Z son tal como se han definido anteriormente. En otro aspecto, se incluyen compuestos de la fórmula (Ia) en donde X3 es –O- o –NH-. En aún otro aspecto, se incluyen compuestos de la fórmula (Ib):
10 En donde R1, R2, R3, R4, X2, y Z son tal como se define anteriormente.
En un aspecto preferido, se incluyen compuestos de la fórmula (I) en donde X2 es alquileno C1-C4, más preferentemente -CH2-. En otros aspectos de la presente invención, se incluyen compuestos de la fórmula (I) en donde Z es
15 En otros aspectos de la presente invención, se incluyen compuestos de la fórmula (I) en donde R16 es OH o NH2, en particular NH2.
En aspectos adicionales de la presente invención, se incluyen compuestos de la fórmula (I) en donde R1 es H.
En ciertos aspectos, se incluyen compuestos de la fórmula (I) en donde R3 es H.
En otros aspectos de la presente invención, se incluyen compuestos de la fórmula (I) en donde R2 es H.
En otros aspectos de la presente invención, se incluyen compuestos de la fórmula (I) en donde R4 es H.
Preferiblemente, el compuesto de la fórmula (I) para su uso en la prevención o tratamiento de infecciones bacterianas se selecciona de:
- -
- 5’-amino-5’-desoxiadenosin-8-il-tio-N-[(5’-amino-5’-desoxiadenosina)metil]acetamida;
-8-[3-N-(5’-desoxiadenosil)aminoprop-1-inil]adenosina ;
- 8-[3-(5’-desoxiadenosil)metoxiprop-1-inil]adenosina.
Composiciones farmacéuticas
En otro objeto, la presente invención hace referencia a una composición farmacéutica que comprende un compuesto de la fórmula (I) tal como se ha definido anteriormente, en mezcla con uno o más excipientes farmacéuticamente aceptables.
Compuestos de la fórmula (I) para su uso en el tratamiento y/o la prevención de infecciones bacterianas
En otro objeto, la presente invención hace referencia a un compuesto de la fórmula (I) para su uso en la prevención y/o tratamiento de infecciones bacterianas, principalmente infecciones Gram positivas, en particular infecciones por coco Gram positivo.
Método para la preparación de compuestos de la fórmula (I)
Los compuestos de la presente invención pueden prepararse en una cantidad de métodos bien conocidos para aquellos que sean expertos en el arte, que incluyen, pero sin limitarse a los descritos a continuación, o a través de modificaciones de estos métodos aplicando técnicas estándar conocidas por aquellos expertos en el arte de la síntesis orgánica. Los reactivos y los materiales de partida se encuentran comercialmente disponibles, o son fácilmente sintetizados mediante técnicas bien conocidas por una persona experta en el arte. Todos los sustituyentes, a menos que se indique de otra forma, son tal como se han definido previamente. Todos los procesos revelados en asociación con la presente invención están contemplados para ser practicados a cualquier escala, incluyendo miligramos, gramos, multigramos, o a una escala industrial comercial.
Se podrá apreciar que los compuestos de la presente invención pueden contener uno o más átomos de carbono sustituidos asimétricamente, y pueden ser aislados en formas ópticamente activas o racémicas. Por tanto, se proponen todas las formas quirales, diastereoméricas, racémicas y todas las formas isoméricas geométricas de una estructura, a menos que la forma específica estereoquímica o isomérica esté específicamente indicada. Se conoce bien en el arte cómo preparar tales formas ópticamente activas. Por ejemplo, pueden separarse mezclas de estereoisómeros mediante técnicas estándar que incluyen, pero no se limitan a, resolución de formas racémicas, cromatografía normal, de fase inversa, y quiral, formación preferencial de sales, recristalización, y similares, o mediante síntesis quiral bien a partir de materiales de partida activos o mediante síntesis quiral deliberada de centros diana.
Tal como puede entenderse fácilmente, los grupos funcionales presente en los compuestos de la Fórmula I pueden contener grupos protectores. Los grupos protectores se conocen per se como grupos funcionales químicos que pueden ser añadidos a y eliminados de funcionalidades, tales como grupos hidroxilo y grupos carboxilo. Estos grupos están presentes en un compuesto químico para volver tal funcionalidad inerte a las condiciones de reacciones químicas a las que el compuesto está expuesto. Cualquier variedad de grupos protectores puede ser empleada con la presente invención. Otros grupos protectores preferidos según la presente invención pueden encontrarse en T.W. and Wuts, P.G.M., "Protective Groups in Organic Synthesis" 2d. Ed., Wiley & Sons, 1991, or in
P.J. Kocienski, "Protecting Groups", 3rd. Ed., Thieme, Stuttgart, NY, 2004.
El compuesto preparado de este modo puede ser recuperado de la mezcla de reacción mediante medios convencionales. Por ejemplo, los compuestos pueden ser recuperados mediante la separación por destilación del disolvente de la mezcla de reacción o, si fuera necesario después de separar por destilación el disolvente de la mezcla de reacción, vertiendo el residuo en agua seguido de la extracción con un disolvente orgánico no miscible en agua y de la separación por destilación del disolvente del extracto. De manera adicional, el producto puede además, si se desea, purificarse mediante diversas técnicas bien conocidas, tales como la recristalización, reprecipitación o las diversas técnicas de cromatografía, en particular Cromatografía Líquida de Alta Eficacia (HPLC, por sus siglas en inglés).
En otro objeto, la presente invención hace referencia a un método para la preparación de un compuesto de la fórmula (Ia) tal como se ha definido anteriormente, donde dicho método comprende las etapas de:
i. Acoplamiento de un compuesto de la fórmula (IIa) con un compuesto de la fórmula (IIIa),
en donde
R1, R2, R3, R4, X2, X3 y Z son tal como se han definido anteriormente,
Hal es Br, I, o Cl,
10 donde los grupos hidroxilo, cuando están presente, están protegidos por un grupo protector de hidroxilos (Pr),
ii. Desprotección de los grupos hidroxilos del compuesto obtenido; y opcionalmente
iii. Recuperar el compuesto obtenido de la fórmula (Ia).
En un aspecto preferido, la etapa i) es un acoplamiento de Sonogashira cuyo método es bien conocido para aquellas personas expertas en el arte. En particular, este acoplamiento puede ser realizado en presencia de trietilamina
15 (TEA), Cul y Pd(PPh3)4 en un disolvente aprótico polar tal como THF.
Los grupos hidroxilo pueden protegerse mediante grupos acetilo (Ac). Después del acoplamiento de acuerdo con la etapa i), estos grupos protectores pueden ser extraídos poniendo en contacto el producto obtenido con amoníaco en metanol, a 50ºC.
En aún aspectos adicionales, el compuesto de la fórmula (IIIa) puede ser obtenido del correspondiente compuesto 20 de la fórmula (IVa):
en donde R1, X2, R4 y X3 son tal como se ha definido anteriormente,
En general, la reacción de conversión de (IVa) en (IIIa) se realiza en presencia de HC=C-X2-Br, tal como bromuro de propargilo, una base, en un disolvente aprótico.
En otro objeto, la invención hace referencia a un método para la preparación de un compuesto de la fórmula (Ib) tal como se ha definido anteriormente, donde dicho método comprende las etapas de:
i. Acoplamiento de un compuesto de la fórmula (IIb) con un compuesto de la fórmula (IIIb),
en donde
10 R1 es OR18, o Hal,
Hal es Br, Cl, o I, preferiblemente Cl,
R18 es H, alquilo C1-C6, o es de tal manera que C(=O)OR18 forma un éster activado;
Z es tal como se ha definido anteriormente, donde los grupos hidroxilo, cuando están presente, están protegidos por un grupo protector de hidroxilos;
15 i. Desprotección de los grupos hidroxilo del producto obtenido; y opcionalmente
ii. Recuperar el compuesto obtenido de la fórmula (Ib).
Tal como se utiliza en la presente patente, “éster activado” significa un éster que pueda experimentar un acoplamiento peptídico con la amina de la fórmula (IIIb). Por tanto, para aumentar la electrofilicidad del correspondiente grupo carboxilado, el oxígeno cargado negativamente es primero “activado” en un grupo saliente 20 más adecuado. Un éster activado de ese tipo puede obtenerse de acuerdo con métodos bien conocidos por los expertos en el arte, en particular haciendo reaccionar el compuesto carboxilado con un agente de activación. Como ejemplos de agentes de activación, puede hacerse mención en particular a las carbodiimidas, tales como la
diciclohexilcarbodiimida (DCC), hidrocloruro de 1-etil-3-(3-dimetilaminopropil)carbodiimida (EDC.HCl), o triazoles, tales como 1-hidroxi-benzotriazol (HOBt) o 1-hidroxi-7-azabenzotriazol (HOAt).
De acuerdo a un aspecto adicional, el compuesto de la fórmula (IIb) puede obtenerse del correspondiente compuesto de la fórmula (IVb):
En donde R3 y Z son tal como se ha definido anteriormente, y Hal es Cl, Br o I.
En general, la reacción se lleva a cabo en presencia de ácido tioglicólico, NaH, en un disolvente aprótico polar tal como como DMF, a temperatura ambiente, es decir entre 20 – 25 ºC.
En aún otros aspectos adicionales de la presente invención, el compuesto de la fórmula (IVb) puede ser obtenido a 10 partir del correspondiente compuesto de la fórmula (Vb):
En donde, R3 y Z son tal como se ha definido anteriormente.
En general, la reacción para convertir el compuesto (Vb) en (IVb) se lleva a cabo en presencia de NBS en un disolvente aprótico polar, tal como DMF.
15 Las reacciones anteriores pueden llevarse a cabo por la persona experta en el arte mediante la aplicación o la adaptación de los métodos ilustrados a continuación.
Sondas químicas y método de cribado
En otro objeto, la invención además hace referencia a una sonda química que comprende un compuesto de la fórmula (I) tal como se ha definido anteriormente, acoplado a un marcador detectable.
20 Preferiblemente, el compuesto de la fórmula (I) es un compuesto en donde R16 es NH2 o N3.
Una amplia variedad de marcadores detectables pueden ser utilizados, tales como aquellos revelados en particular en "The Molecular Probes® Handbook", 11th. Edition. Por tanto, el compuesto de la fórmula (I) puede estar acoplado a una molécula fluorescente, tal como la fluoresceína o rodamina, bien directa o indirectamente a través de un conector homo- o heterobifuncional tal como la biotina.
25 El marcador detectable se acopla preferiblemente al compuesto de la fórmula (I) a través de un enlace covalente, bien directa o indirectamente a través de un agente homo- o heterobidifuncional, por ejemplo a través de glutaraldehído. Este enlace covalente puede ser en particular un enlace -NH-C(=O)-.
En otro objeto, la invención además hace referencia a un método para el cribado de moléculas que incluyen la NAD quinasa, donde dicho método comprende las etapas de:
i. poner en contacto la NAD quinasa con una sonda química tal como se ha definido anteriormente con una molécula a ser cribada;
ii. determinar la cantidad de sonda química enlazada o no enlazada a dicha NAD quinasa; y
iii. deducir a partir de la misma si la molécula cribada es un inhibidor de dicha NAD quinasa.
Definiciones
Los siguientes términos y expresiones contenidos en la presente patente se definen como sigue a continuación:
Tal como se utiliza en la presente patente, el término “alquilo” hace referencia a una cadena recta, o grupo alquilo ramificado que tiene 1 a 8 átomos de carbono, tales como metilo, etilo, propilo, isopropilo, butilo, isobutilo, sec-butilo, terc-butilo, pentilo, isoamilo, neopentilo, 1-etilpropilo, 3-metilpentilo, 2,2-dimetilbutilo, 2,3-dimetilbutilo, hexilo, octilo, etc. la fracción de alquilo de los grupos que contienen alquilo, tales como los grupos alcoxi, alcoxicarbonilo, y alquilaminocarbonilo, tienen el mismo significado que el alquilo definido anteriormente. Los grupos alquilo inferiores, los cuales se prefieren, son grupos alquilo tal como se ha definido anteriormente que contienen 1 a 4 carbonos. Una designación tal como “C1-C6 alquilo” hace referencia a un radical alquilo que contiene de 1 a 6 átomos de carbono.
Tal como se utiliza en la presente patente, el término “alquenilo” hace referencia a una cadena recta, o cadenas de hidrocarburos ramificadas de 2 a 6 átomos de carbono que tienen al menos un doble enlace de carbono-carbono. Una designación “alquenilo C2-C6” hace referencia a un radical alquenilo que contiene de 2 a 6 átomos de carbono. Ejemplos incluyen etinilo, propinilo, isopropinilo. Se prefiere particularmente “C2-C6 alquinilo”.
Tal como se utiliza en la presente patente, el término “alquileno” hace referencia a un hidrocarburo de 1 a 4 átomos de carbono de cadena recta o ramificada, sustituido o no sustituido, que se forma mediante la eliminación de dos átomos de hidrógeno. Ejemplos incluyen metileno (-CH2-9, propilideno (CH3CH2CH=), 1,2-etandilo (-CH2CH2-), etc.
Tal como se utiliza en la presente patente, “alquenileno” hace referencia a un grupo divalente derivado de un hidrocarburo de cadena recta o ramificada que contiene al menos un enlace doble de carbono-carbono. Ejemplos de alquenileno incluyen -CH=CH-, -CH2CH=CH-, -C(CH3)=CH-, -CH2 CH=CHCH2-, y similares.
Tal como se utiliza en la presente patente, “alquinileno” hace referencia a un grupo divalente derivado de la eliminación de dos átomos de hidrógeno de un grupo hidrocarburo acíclico de cadena ramificada o recta que contiene un enlace triple de carbono-carbono.
Tal como se utiliza en la presente patente, el término “arilo” hace referencia a un sistema de anillos aromáticos de hidrocarburo mono- o bicíclico, sustituido o no sustituido, que tiene anillos de 6 a 10 átomos de carbono. Ejemplos incluyen fenilo y naftilo.
Tal como se utiliza en la presente patente, el término “heteroarilo” hace referencia a un grupo aromático que contiene anillos de 5 a 10 átomos de carbono, preferiblemente 5 a 7, en los que uno o más átomos de carbono del anillo son reemplazados por al menos un átomo hetero tal como -O-, -N-, o -S-. Ejemplos de grupos heteroarilo incluyen pirrolilo, furanilo, tienilo, pirazolilo, imidazolilo, tiazolilo, isotiazolilo, isoxazolilo, oxazolilo, oxatiolilo, oxadiazolilo, triazolilo, oxatriazolilo, furazanilo, tetrazolilo, piridilo, pirazinilo, pirimidinilo, piridazinilo, triazinilo, indolilo, isoindolilo, indazolilo, benzofuranilo, isobenzofuranilo, purinilo, quinazolinilo, quinolilo, isoquinolilo, benzoimidazolilo, benzotiazolilo, benzotiofenilo, tianaftenilo, benzoxazolilo, benzisoxazolilo, cinnolinilo, ftalazinilo, naftiridinilo, y quinoxalinilo. Incluidos dentro de la definición de “heteroarilo” se encuentran sistemas de anillos fusionados, por ejemplo, sistemas de anillos en los que un anillo aromático está fusionado con un anillo heterocicloalquílico, Ejemplos de tales sistemas de anillos fusionados incluyen, por ejemplo, ftalamida, anhídrido ftálico, indolina, isoindolina, tetrahidroisoquinolina, cromano, isocromano, cromeno, e isocromeno.
Tal como se utiliza en la presente patente, el término “sujeto” hace referencia a un animal de sangre caliente tal como un mamífero, preferiblemente un humano, o un humano niño, que está aquejado de, o tiene el potencial de estar aquejado de una o más enfermedades o condiciones descritas en la presente patente.
Tal como se utiliza en la presente patente, una “cantidad terapéuticamente efectiva” hace referencia a una cantidad de un compuesto de la presente invención efectiva para evitar o tratar los síntomas de un trastorno en particular. Tales trastornos incluyen, pero no están limitados a, aquellos trastornos patológicos o neurológicos asociados con la actividad aberrante de los receptores descritos en la presente patente, en donde el tratamiento o la prevención comprende inhibir, inducir o aumentar la actividad de los mismos poniendo en contacto el receptor con un compuesto de la presente invención.
Tal como se utiliza en la presente, el término “farmacéuticamente aceptable” hace referencia a aquellos compuestos, materiales, composiciones, y/o formas de dosificación que son, dentro del alcance de un juicio médico fiable, adecuados para entrar en contacto con tejidos humanos y animales sin una excesiva toxicidad, irritación, respuesta alérgica u otras complicaciones problemáticas en proporción a una relación beneficio/riesgo razonable.
Los significados de todos los demás términos utilizados en la descripción de la presente invención son bien conocidos en el arte.
En otro aspecto, la presente invención está dirigida a sales farmacéuticamente aceptables de los compuestos descritos anteriormente. Tal como se utiliza en la presente patente, “sales farmacéuticamente aceptables” incluyen sales de compuestos de la presente invención derivados de la combinación de tales compuestos con sales de adición ácidas o básicas no tóxicas.
Las sales de adición ácidas incluyen ácidos inorgánicos tales como ácido clorhídrico, bromhídrico, yodhídrico, sulfúrico, nítrico y fosfórico, además de ácidos orgánicos tales como ácido acético, cítrico, propiónico, tartárico, glutámico, salicílico, oxálico, metanosulfónico, paratoluensulfónico, succínico, y benzoico, y ácidos orgánicos e inorgánicos relacionados.
Las sales de adición básicas incluyen aquellas derivadas de bases inorgánicas tales como hidróxidos de metales alcalinos y alcalinotérreos, carbonatos, bicarbonatos, y similares, además de sales derivadas de aminas orgánicas básicas tales como aminas alifáticas y aromáticas, diaminas alifáticas, hidroxi alcaminas, y similares. Tales bases útiles en la preparación de sales de la presente invención por tanto incluyen hidróxido amónico, carbonato potásico, bicarbonato sódico, hidróxido cálcico, metilamina, dietilamina, etilendiamina, ciclohexilamina, etanolamina y similares.
Además de las sales farmacéuticamente aceptables, otras sales se incluyen en la invención. Pueden servir como intermediarios en la purificación de compuestos, en la preparación de otras sales, o en la identificación y caracterización de los compuestos o intermediarios.
Otras características de la invención serán evidentes en el transcurso de las siguientes descripciones de ejemplos de modos de realización. Estos ejemplos se proporcionan para ilustrar la invención y no están destinados a ser limitativos de la misma.
Figuras
Figuras 1 a 3. Efecto antibacteriano de los inhibidores de NADK 17, 19 y 22 sobre S. aureus.
Suspensiones de 100 μL de S. aureus correspondientes a 2,103 de bacterias se incubaron durante la noche a 37 ºC con concentraciones cada vez mayores del inhibidor (1 a 100 μg/mL). La muerte bacteriana (porcentaje) se determinó como la relación de las unidades de formación de la colonia tras la incubación con el inhibidor con la de las unidades de formación de la colonia tras la incubación con únicamente la solución tampón. Los datos son valores de media de ± DE (desviación estándar) de los tres experimentos por separado. * indica una significancia estadística en la prueba t de Student de p < 0,05.
Ejemplos
I. Síntesis química
A. general
Los reactivos y disolventes para la síntesis fueron obtenidos de proveedores comerciales y se utilizaron sin una purificación adicional. Los nucleósidos y nucleótidos estándar fueron obtenidos de proveedores comerciales. 5'desoxi-5'-metiltioadenosina (MTA, 1) estaba comercialmente disponible. Se realizó cromatografía flash utilizando gel de sílice 60 (Merck) y las mezclas de disolventes indicados. Se llevó a cabo HPLC analítica y preparativa sobre unsistema de Agilent (serie 1100) utilizando una columna de fase reversa C18 (Kromasil, 5μ 100Å) a una tasa de flujo de 4,0 ml/min y un gradiente lineal de CH3CN en un tampón de 20 mM de acetato de trietilamonio (TEEA) a un pH 7,0 durante 20 min. Los espectros de RMN 1H y 13C se registraron en un espectrómetro Bruker Avance 400. Que opera a 400.13 MHz y 100.62 MHz, respectivamente. Los desplazamientos químicos se proporcionan en ppm (8), constantes de acoplamiento (J) se muestran en hercios y se utilizan las abreviaturas habituales. Los espectros de masa de alta resolución se registraron en un instrumento de Waters Q-TOF micro MS, utilizando una fase móvil de acetonitrilo/agua con 0,1 % de ácido fórmico.
B. Síntesis de bloques monoméricos Se sintetizó 5’-bromo-5’-desoxiadenosina (2) mediante halogenación directa de adenosina [12]. Se preparó 5’-fluoro5’-desoxiadenosina (3) [13] y 5’-azido-5’-desoxiadenosina (6) comenzando a partir de 2’,3’-O-isopropilidenadenosina. Se obtuvo 5’-Amino-5’-desoxiadenosina (7) mediante hidrogenación catalítica de 5’-azido-5’
5 desoxiadenosina (6). Se obtuvieron nucleósidos 8-bromo 8 y 9 haciendo reaccionar 6 y 7 con NBS en DMF anhidro. Se obtuvo el derivado 5’-O-propargílico 4 haciendo reaccionar bromuro de propargilo en presencia de NaH con N6benzoil-2’,3’-O-isopropiliden-adenosina de acuerdo al procedimiento mostrado [14], seguido por la eliminación de los grupos protectores.
5’-N-Propargilamino-5’-desoxiadenosina (5)
Esquema 1: 1) NH2NH2H2O, abs. EtOH, 80ºC, 90 min; 2) bromuro de propargilo, DIEA, DMF, 0ºC, 18 h; 3) 80% ácido fórmico, 30 ºC, durante la noche.
La síntesis del compuesto 5 se resume en el Esquema 1. Se sintetizó el amino 12 en dos etapas a partir de 2’,3’-O
15 isopropiliden-adenosina a través de ftalimidoadenilato 11 de acuerdo con Kolb y colaboradores [15]. A una solución de 12 (0,31 g, 0,8 mmol) en DMF anhidro (8mL) se añadió bromuro de propargilo (80% en tolueno) (1,1 eq.) y DIEA (4 eq.) a 0ºC. Después de agitarla durante la noche a 4ºC, la mezcla de reacción se evaporó hasta que se secó y se purificó mediante cromatografía flash (CH2Cl2/MeOH, 9/1), se obtuvo 13 (0,18 g, 65%). El tratamiento de 13 (90 mg, 0,26 mmol) con 80% de ácido fórmico en agua (3 mL) a 30ºC durante la noche proporcionó 5 (68 mg, 85%) tras
20 purificación mediante cromatografía flash (CH2Cl2/MeOH/NH4OH, 90/10/1). 1H RMN (MeOD) 5 2.73 (t, 1H, CH), 3.10 (d, 2H, H5’ y H5’), 3.53 (t, 2H, NCH2), 4.24 (m, 1H, H4’), 4.34 (t, 1H, H3’), 4.87 (t, 1H, H2’), 5.98 (d, 1H, H1’, J = 4.4 Hz), 8.25 (s, 1H, H2), 8.29 (s, 1H, H8); 13C RMN (MeOD) 5 37.17 (NCH2), 49.85 (C5’), 71.95 (C3’), 72.60 (CH), 73.20 (C2’), 79.90 (Cq), 83.48 (C4’), 89.51 (C1’), 119.48 (C5), 140.63 (C8), 149.06 (C4), 152.44 (C2), 155.96 (C6); HRMS (ESI-TOF) m/z calcd para C13H16N6O3 (M+H) 305.1362; hallado 305.1348.
25 8-Carboximetiltio-5’-azido-5’-desoxiadenosina (10).
Una solución de ácido tioglicólico (0,2 mmol) y NaH (0,4 mmol, 60% en aceite) en DMF anhidro (2 mL) se agitó durante 10 min, entonces 8-bromo-5’-azido-5’-desoxiadenosina (8) (50 mg, 0,13 mmol) en DMF (1mL) se añadió a 0ºC. Después de 8 h a temperatura ambiente, se añadió más tioglicolato (0,2 mmol) en DMF. Tras agitar durante la noche, la mezcla de reacción se concentró hasta que se secó y el residuo se purificó mediante HPLC de fase reversa (10-30% ACN en TEAA durante 20 min) para obtener 10 (28 mg, 56%); UV A max 279 nm; HRMS /ESI-TOF) m/z calcd para C12H14N8O5S (M+H) 383.0886; hallado 383.0890.
C. Síntesis de ligandos 17, 19 y 21
5’-Amino-5’-desoxiadenosin-8-il-tio-N-[(5’-amino-5’-desoxi-adenosin)metil] acetamida (17).
Esquema 2: 1) NBS, DMF, rt, 2 días; 2) ácido tioglicólico, NaH, DMF, rt, 18 h; 3) 12, PyBOP, DIEA, DMF, rt, 18 h; 4) NH2NH2H2O, 80ºC, 90 min; entonces 80% de ácido fórmico, 30 ºC, 5h.
La síntesis del bi-ligando 17 se resume en el esquema 2. La reacción de ftalimidoadenilato 114 con NBS (2 eq.) en DMF anhidro a temperatura ambiente durante 2 días proporcionó 14 en 40% de producción tras la purificación 15 mediante cromatografía flash (CH2Cl2/MeOH, 95/5). A una solución agitada de ácido tioglicólico (2 mmol) y NaH (60% en aceite, 4 mmol) en DMF anhidro (10 mL) se añadió el compuesto 14 (0,51 g, 1 mmol) en DMF (1 mL). Después de agitar durante la noche a temperatura ambiente, la mezcla de reacción se concentró hasta que se secó. El residuo fue recuperado en agua y extraído con AcOEt (3 veces). Las capas orgánicas se secaron, concentraron y purificaron mediante cromatografía flash (CH2Cl2/MeOH) para obtener 15 (0,27 g, 51%). Se añadió PyPOB (29 mg, 1 20 eq.) y DIEA (3 eq.) al compuesto 15 (29 mg) y 5’-amino-2’,3’-O-isopropiliden-adenosina (12) (22 mg, 1,3 eq.) en DMF anhidro (2 mL). Tras agitar toda la noche a temperatura ambiente, la mezcla de reacción se concentró hasta que se
secó. El residuo se purificó mediante cromatografía flash (CH2Cl2/MeOH, 95/5) para obtener 16 (38 mg, 85%). El compuesto 16 (34 mg) se trató con hidrato de hidrazina (0,02 mL, 16 eq.) en etanol abs. (2mL). Después de 90 min a 80ºC, la reacción se completó y el disolvente se eliminó mediante evaporación. El residuo se recuperó en agua, se añadió ácido acético hasta un pH 4, entonces la mezcla de reacción fue liofilizada. El producto crudo (30 mg) se trató con 80% ácido fórmico acuoso (1,5 mL) a 30ºC durante 5 h. La mezcla de reacción se neutralizó mediante la adición de amoniaco acuoso y entonces fue liofilizada. La purificación mediante HPLC de fase reversa (5-40% ACN en TEAA durante 20 min) proporcionó el compuesto 17 (10 mg, 38% dos etapas). Rt (5 a 40% ACN en TEAA en 20 min) 5.1 min; 1H NMR (DMSO-d6) 5: 2.82 (m, 2H, H5’a y H5"a), 3.47 (m, 2H, H5’b y H5"b), 3.88 (m, 1H, H4’a), 4.01 (m, 1H, H4’b), 4.12 (m, 3H, H3’b y CH2), 4.21 (dd, 2H, H3’a), 4.71 (t, 1H, H2’b), 5.04 (t, 1H, H2’a), 5.77 (d, 1H, H1’a, J = 6.2Hz), 5.87 (d, 1H, H1’b, J = 6.0 Hz), 7.07 (bs, 2H, NH2), 7.28 (bs, 2H, NH2), 8.08 (s, 1H, H2), 8.28 (s, 1H, H2),
8.33 (s, 1H, H8), 8.63 (bs, 1H, NH); 13C RMN (DMSO-d6) 5: 36.61 (CH2), 41.97 (C5’a), 44.11 (C5’b), 70.75 (CH2),
71.26 (C3’b), 71.47 (C2’b), 71.70 (C3’a), 73.15 (C2’a), 83.77 (C4’a), 86.48 (C4’b), 88.64 (C1’a), 89.05 (C1’b), 119.71 y 119.99 (C5), 140.87 (CH8), 148.81, 149.65 y 151.69 (C8, C4), 152.17 y 153.15 (C2), 154.73 y 156.63 (C6), 167.47 (CO); UV Amax 287 nm; HRMS (ESI-TOF) m/z calcd para C22H29N12O7S (M+H) 604.2030; hallado 604.2012.
Esquema 3: 1) NH2NH2H2O, abs. EtOH, 80ºC, 90 min; 2) bromuro de propargilo, DIEA, DMF, 4ºC, 18 h; 3) 8-bromo-2’,3’,5’ –tri-O-acetil-adenosina, Cul, Pd(PPh3)4, THF, 60 ºC; 4) 36% NH4OH, meOH, 50ºC, 3 h; 5) 80% ácido fórmico, 30ºC, 7 h.
8-[3-N-(5’-Desoxiadenosin-5’-il)aminoprop-1-in-1-il]adenosina (19)
El tratamiento de 8-bromo-adenosina con anhídrido acético (4 eq.) en piridina produjo tras la cromatografía flash (CH2Cl2 /MeOH) 8-bromo-2’,3’,5’-tri-O-acetil-adenosina en una producción del 62%. Se añadió Cul (10% mol) y Pd(PPh3)4 (5% mol) a una solución desgasificada (3 veces) del derivado de bromo (0,21 g, 0,45 mmol), alquilino 13 (0,20 g, 0,58 mmol) y trietilamina (3 eq.) en THF (10 mL). Tras agitar bajo Ar a 60ºC durante la noche, el disolvente fue evaporado bajo presión reducida. El residuo se purificó mediante cromatografía flash (CH2Cl2 /MeOH) para obtener el producto de acoplamiento 18 (0,17 g, 52%). Una solución de 18 (0,13 g, 0,18 mmol) en MeOH (4 mL) y 36% de amoniaco acuoso (2 mL) se calentó a 50ºC. Después de 3 h la reacción se completó y el disolvente se evaporó bajo presión reducida. La purificación mediante cromatografía flash (CH2Cl2 /MeOH) proporcionó producto deacetilado (58 mg, 51% de producción). Este compuesto (48 mg) fue tratado con 80% de ácido fórmico acuoso (1 mL) a 30ºC. Tras 7 h, la reacción se completó y la mezcla de reacción se neutralizó mediante la adición de amoniaco acuoso antes de la liofilización. El producto crudo se purificó mediante HPLC de fase reversa para obtener 19(6 mg, 16%) como un polvo de color blanco. Rt (5-25% ACN en 20 mM de tampón de TEAA) 12.3 min; 1H RMN (DMSO-d6)
5: 2.88 (m, 1H, H5’a), 3.01 (m, 1H, H5’a), 3.53 (m, 1H, H5’b), 3.70 (m, 1H, H5’b), 3.76 (d, 2H, NCH2), 3.98 (m, 1H, H4’b), 4.06 (m, 1H, H4’a), 4.17 (m, 1H, H3’a), 4.21 (m, 1H, H3’b), 4.72 (m, 1H, H2’a), 4.99 (m, 1H, H2’b), 5.18 (bs, 2H, OH), 5.40 (bs, 2H, OH), 5.50 (bs, 1H, OH), 5.86 (d, 1H, H1’a, J = 6.1 Hz), 5.96 (d, 1H, H1’b, J = 6.7 Hz), 7.24 (bs, 2H, NH2), 7.57 (bs, 2H, NH2), 8.15 (s, 1H, H2), 8.17 (s, 1H, H2), 8.35 (s, 1H, H8); UV Amax 262 nm, 279 nm; 1HRMS (ESI-TOF) m/z calcd para C23H28N11O7 (M+H) 570.2173; hallado 570.2174.
Esquema 4: 1) bromuro de propargilo, NaH, THF, 4ºC, 18 h; 2) 8-bromo-2’,3’,5’-tri-O-acetil-adenosina, Cul, 5 Pd(PPh3)4, THF, 60ºC; 3) ac. 36% NH4OH, MeOH, rt, 18 h; 4) 80% ácido fórmico, 30ºC, 2 h.
8-[3-(Adenosin-5’-il)metoxiprop-1-in-1-il]adenosina (22)
A una solución desgasificada (3 veces) de 8-bromo-2’,3’,5’-tri-O-acetil-adenosina (0,14 g, 0,30 mmol), alquino 20 [3] (0,20 g, 0,44 mmol) y trietilamino (3 eq.) en THF (10mL) se añadió Cul (10% mol) y Pd(PPh3)4 (5% mol). Después de agitarla bajo Ar a 60ºC durante la noche, el disolvente fue evaporado bajo presión reducida. El residuo se purificó 10 mediante cromatografía flash (CH2Cl2 /MeOH) para obtener 21 (0,15 g, 61%) y el compuesto dialquino como un producto secundario (25%). El compuesto 21 (54 mg) se hizo reaccionar con 36% de amoniaco acuoso (2 mL) en metanol (2 mL) a temperatura ambiente durante la noche. Tras la evaporación del disolvente, el producto crudo se trató con 80% de ácido fórmico acuoso (1,5 ml) a 30ºC. Tras 2h la reacción se completó, la mezcla de reacción se neutralizó mediante la adición de ácido acético diluido, y a continuación se liofilizó. La purificación, mediante HPLC 15 de fase reversa (13% isocrático) del producto crudo produjo el bi-ligando 22 en un 46%. Rt (5 a 40% A en TEAA en 20 min) 13.0 min. 1H RMN (DMSO-d6) 5: 3.54 (m, 1H, H5’a), 3.67 (m, 1H, H5"a), 3.77 (m, 1H, H5’b), 3.85 (m, 1H, H5"b), 4.00 (m, 1H, H4’a), 4.10 (m, 1H, H4’b), 4.21 (m, 2H, H3’a y H3’b), 4.60 (m, 2H, CCH2), 4.62 (m, 1H, H2’a),
5.00 (m, 1H, H2’b), 5.50 (bs, 5H, OH), 5.92 (d, 1H, H1’a, J = 5.3 Hz), 5.95 (d, 1H, H1’b, J = 6.7 Hz), 7.23 (bs, 4H, NH2), 7.63 (bs, 2H, NH2), 8.17 y 8.16 (cada s, 2H, 2 H2), 8.32 (s, 1H, H8); 13C NMR (DMSO-d6) 5: 58.75 (C5’a),
20 62.65 (C5’b), 70.75 (CH2), 71.03 y 71.44 (C4’a, C4’b), 72.15 (C2’a), 73.71 (C2’b), 83.30 (C4’a), 87.18 (C4’b), 87.94 (C1’b), 89.94 (C1’a), 119.50 y 119.84 (C5), 133.43 (C8), 139.83 (CH8), 148.90 and 149.96 (C4), 153.19 y 153.90 (C2), 154.73 y 156.64 (C6); UV Amax 265 nm, 279 nm; HRMS (ESI-TOF) m/z calcd para C23H27N10O8 (M+H) 571.2013; hallado 571.1993.
II. Evaluación bioquímica
25 A. Materiales y métodos.
Ensayo de expresión, purificación y actividad. LmNADK1 marcado con His de tipo silvestre y SaNADK marcado con His se expresaron y purificaron sobre resinas IMAC basadas en cobalto (Clontech) tal como se ha publicado previamente13. La actividad NAD quinasa fue determinada mediante la medición de la absorbancia a 340 nm para seguir la formación de NADP reducida mediante una enzima de acoplamiento (glucosa-6-fosfato deshidrogenasa de
la levadura). La enzima de acoplamiento y su sustrato fueron adquiridas de Sigma-Aldrich. El ensayo se llevó a cabo en una muestra de 0,5 mL de (50 mM Tris-HCl pH 7.4, 10 mM MgCl2, 1mM glucosa-6-fosfato, 2mM citrato de sodio) que contiene glucosa-6-fosfato deshidrogenasa y NADK a 30ºC utilizando un espectrofotómetro Eppendorf ECOM 6122.
Potencia inhibidora de los ligandos de NADK
Para los ensayos de los inhibidores se determinó el IC50 en presencia de 1 mM NAD y 4 mM ATP (para LmNADK1)
o 2mM ATP (para SaNADK). Los gráficos de Dixon se utilizaron para determinar KI en presencia de 4 mM ATP (para LmNADK1) o 2mM ATP (para Sa NADK) y tres concentraciones de NAD (0,2 y 1 mM). También se revisó que los inhibidores no tenían ningún efecto sobre la actividad de la enzima de acoplamiento.
Ensayo de actividad bactericida
La cepa de Staphylococcus aureus S25, un aislado clínico humano, se cultivó durante la noche en un caldo infusión cerebro-corazón (BHI, por sus siglas en inglés) a 200 rpm y 37ºC. Los cultivos se diluyeron durante la noche a OD600nm= 0,05 en tampón de fosfato salino-BHI (25% v/v). Las bacterias se cultivaron a 200 rpm y 37ºC hasta que los cultivos alcanzaron OD600nm=0,5. Las suspensiones bacterianas se ajustaron a una concentración de 2.105 bacterias/mL. En una placa microtitulación, 2,103 bacterias fueron incubadas durante la noche a 200 rpm y 37ºC durante 24h a 48h y se determinó el número de unidades de formación de colonias.
Citotoxicidad de las células humanas
Las células HeLa de carcinoma cervical humano se mantuvieron en una atmósfera humidificada a 37 ºC en 5% de CO2 en 75-cm2 de matraces de plástico en medio Eagle modificado por Dulbecco (DMEM, Gibco) complementado con 10% de suero fetal bovino (FBA, APP), 100 U/mL de penicilina, y 10 μg/mL de estreptomicina. Para evaluar la citoxicidad de los compuestos químicos, se sembraron células HeLa en placas de 96 pocillos a baja densidad en presencia de DMEM complementado con 10% de FBS y tratado con diferentes compuestos a 10 μM durante 96h. La concentración final de DMSO en el medio de cultivo se situó en 0,1 % (v/v) para evitar la toxicidad del disolvente. La forma y la adherencia celular se monitorizaron y todos los ensayos se llevaron a cabo por duplicado. Se utilizó DMSO como control negativo.
B. Resultados
Inhibición de LmNADK1
Los derivados de adenosina 1-10 se sometieron a prueba en la enzima purificada como se ha descrito anteriormente [11]. Sólo el compuesto 9 mostró una inhibición muy débil (valor de IC50 de 0,3 mM).
En contraste, las inhibiciones en el rango micromolar se detectaron con los bi-ligandos 17, 19 y 22 (ver tabla 1). Estos compuestos aparecen por tanto como los mejores inhibidores de una NAD quinasa bacteriana descritos hasta ahora.
Tabla 1: ki de inhibidores 22 17 y 19 de NADk de Lysterua monocytogenes (Lm) y Staphylococcus aureus (Sa)
Inhibidor 22 Inhibidor 17 Inhibidor 19
NADK de Lm 20 μm 30 μm 10 μm
NADK de Sa 15 μm 50 μm 5 μm
Los inhibidores de NADK 17, 19 y 22 se evaluaron para su actividad bactericida contra una cepa patogénica humana de S. aureus.
Puede verse a partir de las Figuras 1 a 3 que estos inhibidores de NADK, presenten una actividad bactericida significativa en 1 μg/mL para los inhibidores 17 y 22, y a 10 μg/mL para el inhibidor 19. Además, el aumento adicional de la concentración de los inhibidores no conduce a ningún aumento en la actividad bactericida. Esta efectividad se compara favorablemente con la de los compuestos de referencia tales como vancomiciona (8 μg/mL).
Citotoxicidad En paralelo, se evaluó la citotoxicidad en las células Hela en cultivos durante 96 hrs. No se observó ningún cambio en la forma de la célula y la tasa de multiplicación cuando se sometió a prueba en 10 micromolar.
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Claims (14)
- REIVINDICACIONES1. Compuesto de la fórmula (I):en donde5 R1 es H, alquilo C2-C6, alquenilo, o alquinilo C2-C6, donde dicho alquilo, alquenilo o alquinilo es opcionalmente sustituido por SR5, NR5R5A o OR5; R2 es H, F, Cl, Br, I, OR6, o NHR7; R3 es H, Cl, Br, F, I, OR8, o NHR9; R4 es H, Cl, Br, F, I, CH3, SCH2COOH, SR10, SeR11, CH2R12, C=CR13, o CH=CHR14;10 X1 es -S-, -Se-, -CH2-, -CH=CH-, o -C=C-;X2 es alquileno C1-C4, alquenileno C2-C4, o alquinileno C2-C4; X3 es -NHC(=O)-, -C(=O)NH-, -NR15-, -SO2NH- -NHSO2- -CH2-, -O-, - S-; Z es15 R5, R5A, R6, R7, R8, R9, R15 se seleccionan, cada uno independientemente, de H, alquilo C1-C6, alquenilo C2-C6, o alquinilo C2-C6;R10, R11, R12, R13 y R14 se seleccionan, cada uno independientemente, de alquilo C1-C6, alquenilo C2-C6, o alquinilo C2-C6;R16 es OH, NH2, N3 o OCH2C=CH;20 y las formas tautoméricas, esteroisoméricas, mezclas de formas esteroisoméricas o formas de sales farmacéuticamente aceptables de los mismos.
-
- 2.
- Compuesto según la reivindicación 1, que es de la fórmula (Ia):
-
- 3.
- Compuesto según la reivindicación 2, en donde X3 es –O- o –NH-.
-
- 4.
- Compuesto según la reivindicación 1, que es de la fórmula (Ib):
5 5. Compuesto según cualquiera de las reivindicaciones 1 a 4, en donde X2 es –CH2-. -
- 6.
- Compuesto según cualquiera de las reivindicaciones 1 a 5, en donde R16 es NH2 u OH.
-
- 7.
- Compuesto según cualquiera de las reivindicaciones 1 a 6, en donde R2 es H.
-
- 8.
- Compuesto según cualquiera de las reivindicaciones 1 a 7, en donde R1es H.
- 9. Compuesto según cualquiera de las reivindicaciones 1 a 8, en donde R3 es H. 10 10. Compuesto según cualquiera de las reivindicaciones 1 a 9, en donde R4 es H.
- 11. Compuesto según la reivindicación 1 seleccionado de:
- -
- 5’-amino-5’-desoxiadenosin-8-il-tio-N-[(5’-amino-5’-desoxiadenosina)metil]acetamida;
-8-[3-N-(5’-desoxiadenosil)aminoprop-1-inil]adenosina ; y- 8-[3-(5’-desoxiadenosil)metoxiprop-1-inil]adenosina.15 12. Composición farmacéutica que comprende un compuesto de la fórmula (I) según cualquiera de las reivindicaciones 1 a11, en mezcla con uno o más excipientes farmacéuticamente aceptables. - 13. Compuesto de la fórmula (I) según cualquiera de las reivindicaciones 1 a 11, para su uso en la prevención y/o tratamiento de infecciones bacteriana.
- 14. Método para la preparación de un compuesto de la fórmula (Ia) según la reivindicación 2, donde dicho método 20 comprende las etapas de:i. Acoplamiento de un compuesto de la fórmula (IIa) con un compuesto de la fórmula (IIIa),en dondeR1, R2, R3, R4, X2 y X3 son tal como se ha definido en la reivindicación 1, Hal es Br, I, o Cl,5 Z es tal como se ha definido en la reivindicación 1, donde los grupos hidroxilo están protegidos por un grupo protector de hidroxilos (Pr),ii. Desprotección de los grupos hidroxilo del compuesto obtenido, y opcionalmenteiii. Recuperar el compuesto obtenido de la fórmula (Ia).
- 15. Método para la preparación de un compuesto de la fórmula (Ib) según la reivindicación 4, donde dicho método 10 comprende las etapas de:i. Acoplamiento de un compuesto de la fórmula (IIb) con un compuesto de la fórmula (IIIb), en dondeR1, R2, R3, R4, X2, X3 son tal como se ha definido en la reivindicación 1,R17 es OR18, o Hal,R18 es H, alquilo C1-C6, o es tal que C(=O)OR18 forma un éster activado; Z es tal como se ha definido en la 5 reivindicación 1, donde los grupos hidroxilo están protegidos por un grupo protector de hidroxilos;ii. Desprotección de los grupos hidroxilo del producto obtenido; y opcionalmenteiii. Recuperar el compuesto obtenido de la fórmula (Ib).
- 16. Sonda química que comprende un compuesto de la fórmula (I) según se define en cualquiera de las reivindicaciones 1 a11, acoplada a un marcador detectable.10 17. Uso de una sonda química según la reivindicación 16 para el cribado in vitro de inhibidores de NAD quinasas.
- 18. Un método in vitro para el cribado de moléculas que inhiben la NAD quinasa, donde dicho método comprende las etapas de:i. poner en contacto la NAD quinasa con una sonda química según se define en la reivindicación 16 con una molécula a ser cribada;15 ii. determinar la cantidad de sonda química enlazada o no enlazada a dicha NAD quinasa; yiii. deducir a partir de la misma si la molécula es un inhibidor de dicha NAD quinasa.
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